Chordata ANCESTRAL SPECIES 155 ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00390000006284 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 1117 ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00390000006284 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000154895.a.b ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000177316 ENSGT00940000154986 ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000175843 ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000177316 ENSGT00940000154986 ENSGT01020000231454 ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00940000175947 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000175843 ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000177316 ENSGT00940000154986 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT01020000231454 ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00940000175947 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000177316.a ENSGT00940000154986 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT01020000231454 ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Amniota ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Mammalia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00390000016183 ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Theria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.y #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.y #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.y #22 Gorilla MODERN SPECIES 1 DYDC1 (ENSGGOG00000002717) #7 DYDC2 (ENSGGOG00000003755) #8 PRXL2A (ENSGGOG00000013246) #9 TSPAN14 (ENSGGOG00000005770) #10 ENSGGOG00000006297 #11 ENSGGOG00000024160 #12 ENSGGOG00000036412 #13 NRG3 (ENSGGOG00000011517) #14 GHITM (ENSGGOG00000011008) #15 C10orf99 (ENSGGOG00000012510) #16 CDHR1 (ENSGGOG00000012764) #17 LRIT2 (ENSGGOG00000012781) #18 LRIT1 (ENSGGOG00000012795) #19 RGR (ENSGGOG00000012798) #20 CCSER2 (ENSGGOG00000003034) #21 RPS3A (ENSGGOG00000027203) #22 GRID1 (ENSGGOG00000012289) #23 ENSGGOG00000038056 #24 WAPL (ENSGGOG00000015781) #25 OPN4 (ENSGGOG00000013063) #26 LDB3 (ENSGGOG00000013070) #27 BMPR1A (ENSGGOG00000003720) #28 MMRN2 (ENSGGOG00000009082) #29 ENSGGOG00000009093 #30 ADIRF (ENSGGOG00000024607) #31 ENSGGOG00000042297 #32 ENSGGOG00000036535 #33 ENSGGOG00000015764 #34 GLUD1 (ENSGGOG00000015770) #35 ENSGGOG00000043476 #36 ENSGGOG00000042516 #37 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.y #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.y #22 Chimpanzee MODERN SPECIES 18 ANKRD34B (ENSPTRG00000049125) FAM151B (ENSPTRG00000017039) ENSPTRG00000051397 ZFYVE16 (ENSPTRG00000017038) ENSPTRG00000040617 ENSPTRG00000042769 SERINC5 (ENSPTRG00000017032) THBS4 (ENSPTRG00000017031) MTX3 (ENSPTRG00000051488) ENSPTRG00000039087 CMYA5 (ENSPTRG00000023686) TENT2 (ENSPTRG00000017028) HOMER1 (ENSPTRG00000017026) ENSPTRG00000048128 JMY (ENSPTRG00000017025) ENSPTRG00000043319 #22 BHMT2 (ENSPTRG00000017022) DMGDH (ENSPTRG00000017020) ARSB (ENSPTRG00000017019) LHFPL2 (ENSPTRG00000045309) SCAMP1 (ENSPTRG00000047664) AP3B1 (ENSPTRG00000017015) TBCA (ENSPTRG00000017013) OTP (ENSPTRG00000017012) ENSPTRG00000023613 WDR41 (ENSPTRG00000017011) PDE8B (ENSPTRG00000017010) ENSPTRG00000042930 ENSPTRG00000046179 ZBED3 (ENSPTRG00000050050) AGGF1 (ENSPTRG00000017008) Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.x.a ##22 Gibbon MODERN SPECIES ENSNLEG00000005835 NTN4 (ENSNLEG00000005820) USP44 (ENSNLEG00000005816) METAP2 (ENSNLEG00000005813) VEZT (ENSNLEG00000005798) ENSNLEG00000032922 ENSNLEG00000032302 FGD6 (ENSNLEG00000005781) ENSNLEG00000032465 NR2C1 (ENSNLEG00000005775) NDUFA12 (ENSNLEG00000005766) TMCC3 (ENSNLEG00000005764) ENSNLEG00000005763 CEP83 (ENSNLEG00000005742) PLXNC1 (ENSNLEG00000005722) ENSNLEG00000034769 ##22 ENSNLEG00000030035 CRADD (ENSNLEG00000005714) SOCS2 (ENSNLEG00000005710) MRPL42 (ENSNLEG00000005699) ENSNLEG00000005695 ENSNLEG00000005674 EEA1 (ENSNLEG00000005649) ENSNLEG00000029636 ENSNLEG00000005642 ENSNLEG00000005638 ENSNLEG00000005634 ENSNLEG00000005637 BTG1 (ENSNLEG00000029316) DCN (ENSNLEG00000005597) LUM (ENSNLEG00000005594) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.x.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.x.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000183254 ENSGT00940000158701 ENSGT00390000011891 ENSGT00940000156677 ENSGT00940000161523 ENSGT00950000183113.b.a ENSGT00940000162599 ENSGT01050000244866.A.a.b.b ENSGT00390000003582.e.d.a ENSGT01050000244866.A.a.b.a ENSGT01050000244866.A.b ENSGT00390000018016.c ENSGT00900000141074.e.a.b.b.b.a ENSGT00390000016216 ENSGT00440000038181.eb.a.b ENSGT00390000018433.s.a.a.x.b ##22 ENSGT00950000183075.a.a.a.b ENSGT00900000141074.e.a.b.b.b.b ENSGT00940000160367 ENSGT00390000000491 ENSGT00940000155342.l ENSGT00940000164290 ENSGT00390000004927 ENSGT00940000157393 ENSGT00950000182843.a.a.a.a ENSGT00940000157336 ENSGT00940000156092 ENSGT00940000159230 ENSGT00940000159481 ENSGT00530000063596.B ENSGT01030000234606.a.a.a.a Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000183254 ENSGT00940000158701 ENSGT00390000011891 ENSGT00940000156677 ENSGT00940000161523 ENSGT00950000183113.b.a ENSGT00940000162599 ENSGT01050000244866.A.a.b.b ENSGT00390000003582.e.d.a ENSGT01050000244866.A.a.b.a ENSGT01050000244866.A.b ENSGT00390000018016.c ENSGT00900000141074.e.a.b.b.b.a ENSGT00390000016216 ENSGT00440000038181.eb.a.b ENSGT00390000018433.s.a.a.x.b ##22 ENSGT00950000183075.a.a.a.b ENSGT00940000160367 ENSGT00390000000491 ENSGT00940000155342.l ENSGT00940000164290 ENSGT00390000004927 ENSGT00940000157393 ENSGT00950000182843.a.a.a.a ENSGT00940000157336 ENSGT00940000156092 ENSGT00940000159230 ENSGT00940000159481 ENSGT00530000063596.B ENSGT01030000234606.a.a.a.a ENSGT01030000234606.a.a.a.b.a.a Pan ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000009048.a.a.c ENSGT00940000158701 ENSGT00390000011891 ENSGT00940000156677 ENSGT00940000161523 ENSGT00950000183113.b.a ENSGT00940000162599 ENSGT01050000244866.A.a.b.b ENSGT00390000003582.e.d.a ENSGT01050000244866.A.a.b.a ENSGT01050000244866.A.b ENSGT00390000018016.c ENSGT00900000141074.e.a.b.b.b.a ENSGT00390000016216 ENSGT00440000038181.eb.a.b ENSGT00390000018433.s.a.a.x.b ##22 ENSGT00950000183075.a.a.a.b ENSGT00940000160367 ENSGT00390000000491 ENSGT00940000155342.l ENSGT00940000164290 ENSGT00390000004927 ENSGT00940000157393 ENSGT00950000182843.a.a.a.a ENSGT00940000157336 ENSGT00940000156092 ENSGT00940000159230 ENSGT00940000159481 ENSGT00530000063596.B ENSGT01030000234606.a.a.a.a ENSGT01030000234606.a.a.a.b.a.a Chimpanzee MODERN SPECIES 6 ENSPTRG00000006998 ENSPTRG00000052429 PPIP5K1 (ENSPTRG00000022996) MAP1A (ENSPTRG00000006995) TP53BP1 (ENSPTRG00000006994) TUBGCP4 (ENSPTRG00000006993) ZSCAN29 (ENSPTRG00000006992) ADAL (ENSPTRG00000006991) TGM7 (ENSPTRG00000006990) ENSPTRG00000052524 TGM5 (ENSPTRG00000006989) EPB42 (ENSPTRG00000006988) CCNDBP1 (ENSPTRG00000006987) TMEM62 (ENSPTRG00000006986) ENSPTRG00000044632 ENSPTRG00000052090 ##22 UBR1 (ENSPTRG00000006985) TTBK2 (ENSPTRG00000006982) CDAN1 (ENSPTRG00000006981) ENSPTRG00000048274 STARD9 (ENSPTRG00000006980) HAUS2 (ENSPTRG00000006977) LRRC57 (ENSPTRG00000006976) SNAP23 (ENSPTRG00000006975) ZNF106 (ENSPTRG00000006974) CAPN3 (ENSPTRG00000034200) GANC (ENSPTRG00000006973) TMEM87A (ENSPTRG00000006972) VPS39 (ENSPTRG00000006971) PLA2G4F (ENSPTRG00000006970) PLA2G4D (ENSPTRG00000006969) Gorilla MODERN SPECIES 6 ENSGGOG00000004651 ENSGGOG00000039820 MAP1A (ENSGGOG00000004634) TP53BP1 (ENSGGOG00000002588) TUBGCP4 (ENSGGOG00000002882) ZSCAN29 (ENSGGOG00000002879) ADAL (ENSGGOG00000015145) TGM7 (ENSGGOG00000007605) TGM5 (ENSGGOG00000006555) EPB42 (ENSGGOG00000006553) ENSGGOG00000006546 CCNDBP1 (ENSGGOG00000028557) ENSGGOG00000036568 TMEM62 (ENSGGOG00000006542) ENSGGOG00000038492 RPS3A (ENSGGOG00000022640) ##22 ENSGGOG00000009724 ENSGGOG00000041967 ENSGGOG00000014329 CDAN1 (ENSGGOG00000014297) ENSGGOG00000041553 STARD9 (ENSGGOG00000006926) HAUS2 (ENSGGOG00000036248) LRRC57 (ENSGGOG00000009597) SNAP23 (ENSGGOG00000015801) ZNF106 (ENSGGOG00000007774) CAPN3 (ENSGGOG00000012597) GANC (ENSGGOG00000010835) TMEM87A (ENSGGOG00000000376) VPS39 (ENSGGOG00000000372) PLA2G4F (ENSGGOG00000000369) Gibbon MODERN SPECIES 449 ATRX (ENSNLEG00000001144) MAGT1 (ENSNLEG00000001330) ATP7A (ENSNLEG00000001351) ENSNLEG00000001423 TAF9B (ENSNLEG00000001378) CYSLTR1 (ENSNLEG00000002067) ENSNLEG00000002074 LPAR4 (ENSNLEG00000019046) P2RY10 (ENSNLEG00000002088) ENSNLEG00000034148 GPR174 (ENSNLEG00000019047) TBX22 (ENSNLEG00000002116) ENSNLEG00000029546 BRWD3 (ENSNLEG00000002210) ENSNLEG00000034470 ENSNLEG00000034864 ##22 HMGN5 (ENSNLEG00000034708) SH3BGRL (ENSNLEG00000002464) ENSNLEG00000028823 ENSNLEG00000032492 CYLC1 (ENSNLEG00000002527) RPS6KA6 (ENSNLEG00000002544) HDX (ENSNLEG00000002624) APOOL (ENSNLEG00000002634) ZNF711 (ENSNLEG00000002656) POF1B (ENSNLEG00000002694) ENSNLEG00000032608 CHM (ENSNLEG00000002762) ENSNLEG00000027890 DACH2 (ENSNLEG00000002793) ENSNLEG00000002822 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.a #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.a #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.a #22 Drill MODERN SPECIES 871 DDX18 (ENSMLEG00000038065) ENSMLEG00000035866 CCDC93 (ENSMLEG00000029873) INSIG2 (ENSMLEG00000031649) ENSMLEG00000035636 #22 MARCO (ENSMLEG00000034132) C1QL2 (ENSMLEG00000033421) STEAP3 (ENSMLEG00000037794) C2orf76 (ENSMLEG00000039378) DBI (ENSMLEG00000001896) TMEM37 (ENSMLEG00000033060) SCTR (ENSMLEG00000029227) CFAP221 (ENSMLEG00000042134) ENSMLEG00000041704 PTPN4 (ENSMLEG00000040178) ENSMLEG00000039838 EPB41L5 (ENSMLEG00000032344) ENSMLEG00000027991 RALB (ENSMLEG00000008823) ENSMLEG00000042162 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.a #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2438 CCDC93 (ENSRBIG00000043000) INSIG2 (ENSRBIG00000029052) ENSRBIG00000038781 #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.b #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.b #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1359 RNF149 (ENSRBIG00000042294) CNOT11 (ENSRBIG00000006823) TBC1D8 (ENSRBIG00000044656) ENSRBIG00000035177 NPAS2 (ENSRBIG00000014017) ENSRBIG00000028100 ENSRBIG00000028051 NMS (ENSRBIG00000037420) ENSRBIG00000041087 CHST10 (ENSRBIG00000039203) LONRF2 (ENSRBIG00000037046) AFF3 (ENSRBIG00000029993) ENSRBIG00000042889 RGS7 (ENSRBIG00000041312) ENSRBIG00000038076 #22 ENSRBIG00000032971 KMO (ENSRBIG00000041269) OPN3 (ENSRBIG00000034420) ##26 WDR64 (ENSRBIG00000007151) EXO1 (ENSRBIG00000036604) MAP1LC3C (ENSRBIG00000027745) PLD5 (ENSRBIG00000032911) CEP170 (ENSRBIG00000037096) SDCCAG8 (ENSRBIG00000031769) AKT3 (ENSRBIG00000040845) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.w #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000007883 ENSGT00730000111142 ENSGT00390000011475 ENSGT00940000155122.a ENSGT00940000155165.a ENSGT01100000264463 ENSGT00390000007237 ENSGT00940000162236 ENSGT00390000008994 ENSGT00390000018074 ENSGT00940000158691 ENSGT00390000002172.B ENSGT00390000018433.s.a.a.w #22 ENSGT00390000013370 ENSGT00390000004147 ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a ENSGT00940000158903 ENSGT00390000007848.b ENSGT00940000159285 ENSGT00390000015354.d ENSGT00940000154717 ENSGT00390000012719.b ENSGT00390000018674 ENSGT00940000161828 ENSGT01020000230351.D.b ENSGT01020000230351.D.a.a.b.l ENSGT00510000046406.f.a.b Vervet Monkey MODERN SPECIES 2 CCDC62 (ENSCSAG00000002091) DENR (ENSCSAG00000002095) HCAR1 (ENSCSAG00000018949) ENSCSAG00000018948 KNTC1 (ENSCSAG00000002105) RSRC2 (ENSCSAG00000002113) ZCCHC8 (ENSCSAG00000002121) CLIP1 (ENSCSAG00000002132) VPS33A (ENSCSAG00000002138) B3GNT4 (ENSCSAG00000002141) DIABLO (ENSCSAG00000002145) LRRC43 (ENSCSAG00000002152) IL31 (ENSCSAG00000002153) MLXIP (ENSCSAG00000002159) BCL7A (ENSCSAG00000002164) ENSCSAG00000018947 #22 CFAP251 (ENSCSAG00000002175) PSMD9 (ENSCSAG00000002179) HPD (ENSCSAG00000002182) SETD1B (ENSCSAG00000002187) RHOF (ENSCSAG00000002190) TMEM120B (ENSCSAG00000002193) MORN3 (ENSCSAG00000002195) ORAI1 (ENSCSAG00000002198) KDM2B (ENSCSAG00000002201) RNF34 (ENSCSAG00000002204) ANAPC5 (ENSCSAG00000002207) CAMKK2 (ENSCSAG00000002211) P2RX4 (ENSCSAG00000002217) P2RX7 (ENSCSAG00000002219) OASL (ENSCSAG00000002221) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.a 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ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b.b.d.b ENSGT00390000018074 ENSGT00940000158691 ENSGT00390000002172.B ENSGT00390000018433.s.a.a.w #22 ENSGT00390000013370 ENSGT00390000004147 ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a ENSGT00940000158903 ENSGT00390000007848.b ENSGT00940000159285 ENSGT00390000015354.d ENSGT01100000263493.a.b.a.b.a.a.b.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000167556.b.b.a.b.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000154717 ENSGT00390000012719.b ENSGT00390000018674 ENSGT00940000161828 ENSGT01020000230351.D.b Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES 2 HCAR1 (ENSMFAG00000028540) ENSMFAG00000036514 KNTC1 (ENSMFAG00000045398) RSRC2 (ENSMFAG00000036398) ZCCHC8 (ENSMFAG00000045203) ENSMFAG00000060843 CLIP1 (ENSMFAG00000043612) VPS33A (ENSMFAG00000019477) DIABLO (ENSMFAG00000002957) B3GNT4 (ENSMFAG00000032438) LRRC43 (ENSMFAG00000038285) ENSMFAG00000060500 IL31 (ENSMFAG00000040210) MLXIP (ENSMFAG00000030662) BCL7A (ENSMFAG00000045274) ENSMFAG00000043535 #22 CFAP251 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ENSCJAG00000064504 MYO1B (ENSCJAG00000003380) NABP1 (ENSCJAG00000082844) CAVIN2 (ENSCJAG00000065456) TMEFF2 (ENSCJAG00000003484) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 48 CLHC1 (ENSSBOG00000031988) RTN4 (ENSSBOG00000032024) EML6 (ENSSBOG00000024484) SPTBN1 (ENSSBOG00000027662) C2orf73 (ENSSBOG00000033884) ACYP2 (ENSSBOG00000030505) ENSSBOG00000021730 GPR75 (ENSSBOG00000019537) ERLEC1 (ENSSBOG00000022814) ASB3 (ENSSBOG00000034288) CHAC2 (ENSSBOG00000030058) NRXN1 (ENSSBOG00000026811) ENSSBOG00000034030 ENSSBOG00000028134 FSHR (ENSSBOG00000033299) ENSSBOG00000020971 #22 LHCGR (ENSSBOG00000019216) GTF2A1L (ENSSBOG00000023060) STON1 (ENSSBOG00000034719) ENSSBOG00000036123 FOXN2 (ENSSBOG00000025167) ENSSBOG00000032584 FBXO11 (ENSSBOG00000027980) MSH6 (ENSSBOG00000011609) KCNK12 (ENSSBOG00000000094) MSH2 (ENSSBOG00000027484) ENSSBOG00000021194 SOWAHC (ENSSBOG00000020617) ENSSBOG00000027814 SH3RF3 (ENSSBOG00000019575) EDAR (ENSSBOG00000029515) Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 1281 PLEKHM2 (ENSANAG00000037103) SLC25A34 (ENSANAG00000036756) TMEM82 (ENSANAG00000026990) FBLIM1 (ENSANAG00000032942) SPEN (ENSANAG00000034428) ZBTB17 (ENSANAG00000027752) ENSANAG00000018563 SRARP (ENSANAG00000030546) HSPB7 (ENSANAG00000020521) ENSANAG00000023434 FAM131C (ENSANAG00000026130) EPHA2 (ENSANAG00000037528) ARHGEF19 (ENSANAG00000038160) CPLANE2 (ENSANAG00000032645) FBXO42 (ENSANAG00000022274) ENSANAG00000005361 #22 SZRD1 (ENSANAG00000031853) ENSANAG00000029564 CROCC (ENSANAG00000026909) MFAP2 (ENSANAG00000025087) ATP13A2 (ENSANAG00000022398) SDHB (ENSANAG00000037432) PADI2 (ENSANAG00000027403) ENSANAG00000036441 PADI1 (ENSANAG00000000052) PADI3 (ENSANAG00000037603) PADI4 (ENSANAG00000038460) PADI6 (ENSANAG00000033689) RCC2 (ENSANAG00000024788) ARHGEF10L (ENSANAG00000030027) ACTL8 (ENSANAG00000011638) Mas night monkey MODERN SPECIES 658 ZFYVE27 (ENSANAG00000038112) MARVELD1 (ENSANAG00000031120) AVPI1 (ENSANAG00000029881) MORN4 (ENSANAG00000023217) PI4K2A (ENSANAG00000019727) ANKRD2 (ENSANAG00000038359) UBTD1 (ENSANAG00000035205) MMS19 (ENSANAG00000023237) ZDHHC16 (ENSANAG00000032609) EXOSC1 (ENSANAG00000034669) PGAM1 (ENSANAG00000023598) RRP12 (ENSANAG00000037485) ARHGAP19 (ENSANAG00000003403) ENSANAG00000021580 SLIT1 (ENSANAG00000033563) ENSANAG00000037982 #22 LCOR (ENSANAG00000033126) ENSANAG00000033782 PIK3AP1 (ENSANAG00000008972) TM9SF3 (ENSANAG00000028656) TLL2 (ENSANAG00000037945) OPALIN (ENSANAG00000038093) DNTT (ENSANAG00000037070) BLNK (ENSANAG00000027173) ZNF518A (ENSANAG00000037819) ENSANAG00000037354 ENSANAG00000026742 ENSANAG00000019403 ENSANAG00000024392 ENTPD1 (ENSANAG00000029369) TCTN3 (ENSANAG00000030005) Mas night monkey MODERN SPECIES 814 CDKL5 (ENSANAG00000034696) RS1 (ENSANAG00000029033) PPEF1 (ENSANAG00000023404) PHKA2 (ENSANAG00000038435) ADGRG2 (ENSANAG00000034597) PDHA1 (ENSANAG00000030855) MAP3K15 (ENSANAG00000034023) ENSANAG00000030233 ENSANAG00000034832 ENSANAG00000026646 MAP7D2 (ENSANAG00000037417) ENSANAG00000030856 ENSANAG00000025820 RPS6KA3 (ENSANAG00000026591) ENSANAG00000000067 ENSANAG00000019923 #22 CNKSR2 (ENSANAG00000030385) KLHL34 (ENSANAG00000020210) SMPX (ENSANAG00000035900) ENSANAG00000034743 MBTPS2 (ENSANAG00000022738) SMS (ENSANAG00000031156) ENSANAG00000032026 ENSANAG00000030126 PHEX (ENSANAG00000021236) CBLL2 (ENSANAG00000024818) ENSANAG00000023417 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 4445 ENSTSYG00000035467 #22 GALNTL6 (ENSTSYG00000033426) Tarsier MODERN SPECIES 3899 ENSTSYG00000033581 #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 812 TBCE (ENSPCOG00000021439) B3GALNT2 (ENSPCOG00000023952) GNG4 (ENSPCOG00000004047) LYST (ENSPCOG00000019565) NID1 (ENSPCOG00000009614) GPR137B (ENSPCOG00000016957) ERO1B (ENSPCOG00000006144) EDARADD (ENSPCOG00000024505) LGALS8 (ENSPCOG00000028427) HEATR1 (ENSPCOG00000018534) ACTN2 (ENSPCOG00000026369) MTR (ENSPCOG00000027883) ENSPCOG00000003558 RYR2 (ENSPCOG00000016610) ZP4 (ENSPCOG00000024830) ENSPCOG00000027601 #22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 162 CACHD1 (ENSPCOG00000018645) RAVER2 (ENSPCOG00000028379) JAK1 (ENSPCOG00000018189) ENSPCOG00000025120 DNAJC6 (ENSPCOG00000021196) LEPROT (ENSPCOG00000027148) LEPR (ENSPCOG00000017023) ENSPCOG00000016467 KCNMB2 (ENSPCOG00000021563) ZMAT3 (ENSPCOG00000022835) PIK3CA (ENSPCOG00000019539) KCNMB3 (ENSPCOG00000006968) ZNF639 (ENSPCOG00000025183) MFN1 (ENSPCOG00000018204) GNB4 (ENSPCOG00000023050) ENSPCOG00000023805 #22 ACTL6A (ENSPCOG00000027739) MRPL47 (ENSPCOG00000019367) ENSPCOG00000025389 ENSPCOG00000023588 USP13 (ENSPCOG00000000179) ENSPCOG00000028880 PEX5L (ENSPCOG00000002922) TTC14 (ENSPCOG00000027629) CCDC39 (ENSPCOG00000018971) ENSPCOG00000026996 ENSPCOG00000025037 FXR1 (ENSPCOG00000020057) DNAJC19 (ENSPCOG00000022644) Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 389 NPY2R (ENSOGAG00000001832) MAP9 (ENSOGAG00000001837) ENSOGAG00000026965 #22 GUCY1A1 (ENSOGAG00000017072) GUCY1B1 (ENSOGAG00000004323) ASIC5 (ENSOGAG00000004325) TDO2 (ENSOGAG00000004327) CTSO (ENSOGAG00000004328) Bushbaby MODERN SPECIES 271 PAFAH2 (ENSOGAG00000000574) STMN1 (ENSOGAG00000002109) PAQR7 (ENSOGAG00000024814) AUNIP (ENSOGAG00000034108) MTFR1L (ENSOGAG00000002104) ENSOGAG00000024972 MAN1C1 (ENSOGAG00000002102) LDLRAP1 (ENSOGAG00000002101) MACO1 (ENSOGAG00000033230) ENSOGAG00000011983 TMEM50A (ENSOGAG00000028512) RSRP1 (ENSOGAG00000011942) SYF2 (ENSOGAG00000009962) RUNX3 (ENSOGAG00000025633) CLIC4 (ENSOGAG00000014620) ENSOGAG00000025062 #22 ENSOGAG00000030641 SRRM1 (ENSOGAG00000010210) NCMAP (ENSOGAG00000008361) RCAN3 (ENSOGAG00000015460) NIPAL3 (ENSOGAG00000011036) STPG1 (ENSOGAG00000011033) GRHL3 (ENSOGAG00000011027) ENSOGAG00000010712 IL22RA1 (ENSOGAG00000024442) MYOM3 (ENSOGAG00000010702) SRSF10 (ENSOGAG00000015374) PNRC2 (ENSOGAG00000024747) CNR2 (ENSOGAG00000011818) FUCA1 (ENSOGAG00000009383) HMGCL (ENSOGAG00000009381) Bushbaby MODERN SPECIES 231 PRR14L (ENSOGAG00000007564) PISD (ENSOGAG00000034158) ABHD14B (ENSOGAG00000012132) SFI1 (ENSOGAG00000007556) EIF4ENIF1 (ENSOGAG00000012272) DRG1 (ENSOGAG00000012268) ENSOGAG00000030736 ERO1B (ENSOGAG00000015531) GPR137B (ENSOGAG00000027989) NID1 (ENSOGAG00000014737) LYST (ENSOGAG00000000135) GNG4 (ENSOGAG00000007427) B3GALNT2 (ENSOGAG00000007425) TBCE (ENSOGAG00000007422) GGPS1 (ENSOGAG00000013760) ENSOGAG00000006640 #22 ARID4B (ENSOGAG00000012476) RBM34 (ENSOGAG00000012470) TOMM20 (ENSOGAG00000032693) IRF2BP2 (ENSOGAG00000002391) TARBP1 (ENSOGAG00000002379) SLC35F3 (ENSOGAG00000002376) KCNK1 (ENSOGAG00000002272) MAP3K21 (ENSOGAG00000010128) PCNX2 (ENSOGAG00000004635) NTPCR (ENSOGAG00000004633) MAP10 (ENSOGAG00000024613) SIPA1L2 (ENSOGAG00000007607) DISC1 (ENSOGAG00000009237) ENSOGAG00000005575 EGLN1 (ENSOGAG00000033024) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Tree shrew MODERN SPECIES 6242 ENSTBEG00000008523 #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES MRE11 (ENSOCUG00000014899) GPR83 (ENSOCUG00000015502) IZUMO1R (ENSOCUG00000013431) PANX1 (ENSOCUG00000009473) HEPHL1 (ENSOCUG00000009466) ENSOCUG00000029520 VSTM5 (ENSOCUG00000026554) MED17 (ENSOCUG00000012818) C11orf54 (ENSOCUG00000012810) ENSOCUG00000001096 CEP295 (ENSOCUG00000029678) DEUP1 (ENSOCUG00000000199) SLC36A4 (ENSOCUG00000000649) MTNR1B (ENSOCUG00000008196) FAT3 (ENSOCUG00000007427) ENSOCUG00000023399 #22 ENSOCUG00000014147 NAALAD2 (ENSOCUG00000014137) ENSOCUG00000036248 ENSOCUG00000011049 ENSOCUG00000027036 ENSOCUG00000008705 TRIM77 (ENSOCUG00000026390) FOLH1 (ENSOCUG00000026120) NOX4 (ENSOCUG00000016685) TYR (ENSOCUG00000009965) ENSOCUG00000029319 ENSOCUG00000012817 CTSC (ENSOCUG00000014527) ENSOCUG00000014522 ENSOCUG00000032429 Rabbit MODERN SPECIES 5 ENSOCUG00000003966 IFT57 (ENSOCUG00000003973) ENSOCUG00000001452 ENSOCUG00000024027 ENSOCUG00000006159 ENSOCUG00000031726 CIP2A (ENSOCUG00000003095) DZIP3 (ENSOCUG00000003105) ENSOCUG00000026237 TRAT1 (ENSOCUG00000002916) ENSOCUG00000029310 ENSOCUG00000032539 MORC1 (ENSOCUG00000008369) ENSOCUG00000003175 ENSOCUG00000003051 ENSOCUG00000022089 #22 ENSOCUG00000029031 NECTIN3 (ENSOCUG00000000727) ENSOCUG00000017796 ZBED2 (ENSOCUG00000029023) CD96 (ENSOCUG00000001351) PHLDB2 (ENSOCUG00000003962) ABHD10 (ENSOCUG00000003969) TAGLN3 (ENSOCUG00000003970) TMPRSS7 (ENSOCUG00000009920) C3orf52 (ENSOCUG00000009929) GCSAM (ENSOCUG00000009933) SLC9C1 (ENSOCUG00000009937) ENSOCUG00000029264 CD200 (ENSOCUG00000009949) ENSOCUG00000033491 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 142 NR3C2 (ENSODEG00000003225) ENSODEG00000003336 DCLK2 (ENSODEG00000003440) ENSODEG00000004657 MAB21L2 (ENSODEG00000019067) ENSODEG00000004828 ENSODEG00000004947 #22 SH3D19 (ENSODEG00000005021) PRSS48 (ENSODEG00000005073) ENSODEG00000019141 FHIP1A (ENSODEG00000005324) GATB (ENSODEG00000005429) FBXW7 (ENSODEG00000003259) ENSODEG00000003371 TMEM154 (ENSODEG00000003532) TIGD4 (ENSODEG00000018999) ARFIP1 (ENSODEG00000003601) FHDC1 (ENSODEG00000003809) TRIM2 (ENSODEG00000003924) MND1 (ENSODEG00000004042) TMEM131L (ENSODEG00000004133) SFRP2 (ENSODEG00000004384) Degu MODERN SPECIES 161 ENSODEG00000003181 KCNG2 (ENSODEG00000003142) CTDP1 (ENSODEG00000003029) ENSODEG00000002960 NFATC1 (ENSODEG00000002866) ATP9B (ENSODEG00000002792) SALL3 (ENSODEG00000002692) GALR1 (ENSODEG00000002674) MBP (ENSODEG00000002651) ZNF236 (ENSODEG00000003041) ZNF516 (ENSODEG00000002971) ENSODEG00000002953 ENSODEG00000002943 PTGR3 (ENSODEG00000002932) ENSODEG00000002919 ENSODEG00000018901 #22 ENSODEG00000002905 CNDP1 (ENSODEG00000002852) CNDP2 (ENSODEG00000002825) DIPK1C (ENSODEG00000002789) ENSODEG00000002757 ENSODEG00000018841 ENSODEG00000002747 TIMM21 (ENSODEG00000002726) FBXO15 (ENSODEG00000002700) ENSODEG00000002681 Degu MODERN SPECIES 65 HBS1L (ENSODEG00000008959) ENSODEG00000008684 ENSODEG00000019597 ENSODEG00000006953 ENSODEG00000007137 PDE7B (ENSODEG00000007023) MTFR2 (ENSODEG00000006976) ENSODEG00000006806 MAP7 (ENSODEG00000008448) ENSODEG00000008040 ENSODEG00000008240 SLC35D3 (ENSODEG00000006620) IL20RA (ENSODEG00000006756) IL22RA2 (ENSODEG00000007775) ENSODEG00000008408 ENSODEG00000019506 #22 OLIG3 (ENSODEG00000019534) ENSODEG00000019565 TNFAIP3 (ENSODEG00000008925) ENSODEG00000008459 ARFGEF3 (ENSODEG00000008382) ENSODEG00000009708 HEBP2 (ENSODEG00000007586) NHSL1 (ENSODEG00000008039) ENSODEG00000007997 ENSODEG00000009059 ENSODEG00000009581 ENSODEG00000009856 ECT2L (ENSODEG00000011163) REPS1 (ENSODEG00000007604) ENSODEG00000008655 Degu MODERN SPECIES 91 ENSODEG00000019836 PLPP2 (ENSODEG00000011021) ENSODEG00000012210 ENSODEG00000010516 ENSODEG00000012644 ENSODEG00000011468 ENSODEG00000019982 CYP4F8 (ENSODEG00000012418) CYP4F22 (ENSODEG00000011011) ENSODEG00000019784 PGLYRP2 (ENSODEG00000010857) ENSODEG00000011358 WIZ (ENSODEG00000011172) AKAP8L (ENSODEG00000010840) AKAP8 (ENSODEG00000011314) ENSODEG00000010978 #22 BRD4 (ENSODEG00000011937) EPHX3 (ENSODEG00000010791) NOTCH3 (ENSODEG00000011730) ILVBL (ENSODEG00000011511) SYDE1 (ENSODEG00000010751) CASP14 (ENSODEG00000010016) CCDC105 (ENSODEG00000011650) SLC1A6 (ENSODEG00000011064) ENSODEG00000010232 COL1A2 (ENSODEG00000010146) CASD1 (ENSODEG00000010520) ENSODEG00000009551 PEG10 (ENSODEG00000009969) PPP1R9A (ENSODEG00000010739) PON1 (ENSODEG00000009868) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Squirrel MODERN SPECIES 508 ZSCAN23 (ENSSTOG00000004477) ENSSTOG00000025625 GPX6 (ENSSTOG00000015419) ENSSTOG00000015422 ENSSTOG00000022052 #22 TRIM27 (ENSSTOG00000000235) ZNF311 (ENSSTOG00000032887) ENSSTOG00000022034 ENSSTOG00000032966 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 44 Taar5 (ENSJJAG00000017753) Taar4 (ENSJJAG00000002217) Taar3 (ENSJJAG00000003037) Taar2 (ENSJJAG00000022531) ENSJJAG00000002766 Vnn1 (ENSJJAG00000023296) Vnn3 (ENSJJAG00000013692) Slc18b1 (ENSJJAG00000012667) ENSJJAG00000004347 ENSJJAG00000006059 Eya4 (ENSJJAG00000012851) Tcf21 (ENSJJAG00000010513) ENSJJAG00000007350 Slc2a12 (ENSJJAG00000003595) Sgk1 (ENSJJAG00000003911) ENSJJAG00000009072 #22 Aldh8a1 (ENSJJAG00000014136) ENSJJAG00000017024 Myb (ENSJJAG00000023989) Ahi1 (ENSJJAG00000010372) Pde7b (ENSJJAG00000001518) Bclaf1 (ENSJJAG00000011803) Map7 (ENSJJAG00000023344) ENSJJAG00000012639 Pex7 (ENSJJAG00000016195) Slc35d3 (ENSJJAG00000014674) Il20ra (ENSJJAG00000019171) Il22ra2 (ENSJJAG00000007140) Olig3 (ENSJJAG00000001512) ENSJJAG00000020726 Perp (ENSJJAG00000021130) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 910 Spata2 (ENSNGAG00000018425) Rnf114 (ENSNGAG00000017673) Snai1 (ENSNGAG00000017185) Ube2v1 (ENSNGAG00000015973) ENSNGAG00000013302 Cebpb (ENSNGAG00000012015) Ptpn1 (ENSNGAG00000010216) Ripor3 (ENSNGAG00000013334) Pard6b (ENSNGAG00000013685) ENSNGAG00000011839 ENSNGAG00000001117 Mocs3 (ENSNGAG00000011771) Kcng1 (ENSNGAG00000022351) Nfatc2 (ENSNGAG00000010940) ENSNGAG00000006990 #22 Atp9a (ENSNGAG00000000818) Sall4 (ENSNGAG00000017833) Zfp64 (ENSNGAG00000018331) ENSNGAG00000016474 Zfp217 (ENSNGAG00000016391) Bcas1 (ENSNGAG00000015655) Cyp24a1 (ENSNGAG00000013537) Pfdn4 (ENSNGAG00000001025) Dok5 (ENSNGAG00000013135) Cbln4 (ENSNGAG00000000535) Mc3r (ENSNGAG00000002843) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Scly (ENSCGRG00001024710) ENSCGRG00001010672 Ramp1 (ENSCGRG00001024580) Rbm44 (ENSCGRG00001001293) ENSCGRG00001024654 Col6a3 (ENSCGRG00001024539) Cops8 (ENSCGRG00001024515) Ackr3 (ENSCGRG00001010122) ##20 Iqca (ENSCGRG00001024459) Asb18 (ENSCGRG00001024506) Gbx2 (ENSCGRG00001024158) Agap1 (ENSCGRG00001001480) ENSCGRG00001009648 ENSCGRG00001024137 Sh3bp4 (ENSCGRG00001009956) ENSCGRG00001024628 #22 Arl4c (ENSCGRG00001010866) Spp2 (ENSCGRG00001024730) Trpm8 (ENSCGRG00001024258) Hjurp (ENSCGRG00001024392) Mroh2a (ENSCGRG00001000590) Dnajb3 (ENSCGRG00001009691) ENSCGRG00001000882 Usp40 (ENSCGRG00001007804) Dgkd (ENSCGRG00001024793) Sag (ENSCGRG00001024487) Atg16l1 (ENSCGRG00001024596) Inpp5d (ENSCGRG00001023640) NEU2 (ENSCGRG00001023529) Ngef (ENSCGRG00001001643) Snorc (ENSCGRG00001000683) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 226 Rnf150 (ENSCGRG00001022877) ENSCGRG00001023417 ENSCGRG00001014103 Zfp330 (ENSCGRG00001001331) Il15 (ENSCGRG00001010668) Inpp4b (ENSCGRG00001016742) Usp38 (ENSCGRG00001008922) Gab1 (ENSCGRG00001010681) Smarca5 (ENSCGRG00001012719) Hhip (ENSCGRG00001017452) ENSCGRG00001017973 Abce1 (ENSCGRG00001000394) Otud4 (ENSCGRG00001004451) ENSCGRG00001006596 Mmaa (ENSCGRG00001013056) ENSCGRG00001014492 #22 1700011L22Rik (ENSCGRG00001015849) Zfp827 (ENSCGRG00001020514) Lsm6 (ENSCGRG00001017142) Slc10a7 (ENSCGRG00001018803) ENSCGRG00001013716 Pou4f2 (ENSCGRG00001001534) Ttc29 (ENSCGRG00001003512) Ednra (ENSCGRG00001005013) ENSCGRG00001005844 Prmt9 (ENSCGRG00001012400) Arhgap10 (ENSCGRG00001015571) Nr3c2 (ENSCGRG00001008894) Iqcm (ENSCGRG00001013562) Rasd2 (ENSCGRG00001006448) Mcm5 (ENSCGRG00001009878) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Prairie vole MODERN SPECIES 13 Opcml (ENSMOCG00000019238) Spata19 (ENSMOCG00000007560) Igsf9b (ENSMOCG00000019146) Jam3 (ENSMOCG00000000897) Ncapd3 (ENSMOCG00000001819) Vps26b (ENSMOCG00000015004) Thyn1 (ENSMOCG00000010854) Acad8 (ENSMOCG00000021466) Gm1110 (ENSMOCG00000008188) Glb1l2 (ENSMOCG00000020254) B3gat1 (ENSMOCG00000022917) Eepd1 (ENSMOCG00000020176) Septin7 (ENSMOCG00000013002) Herpud2 (ENSMOCG00000014682) ENSMOCG00000005080 ENSMOCG00000005481 #22 Tbx20 (ENSMOCG00000016154) Dpy19l2 (ENSMOCG00000003608) Dpy19l1 (ENSMOCG00000009241) Npsr1 (ENSMOCG00000011218) Bmper (ENSMOCG00000021320) Bbs9 (ENSMOCG00000014729) Rp9 (ENSMOCG00000020161) 9530077C05Rik (ENSMOCG00000017716) Anln (ENSMOCG00000013010) Zfp810 (ENSMOCG00000002039) Zfp599 (ENSMOCG00000023026) ENSMOCG00000022973 ENSMOCG00000018031 Pigyl (ENSMOCG00000017172) Acp5 (ENSMOCG00000015161) Kangaroo rat DUPLICATION Kangaroo rat MODERN SPECIES 326 Akap1 (ENSDORG00000030157) Scpep1 (ENSDORG00000003013) Coil (ENSDORG00000027289) Trim25 (ENSDORG00000012159) Dgke (ENSDORG00000004135) Gm525 (ENSDORG00000000733) Nog (ENSDORG00000029051) ENSDORG00000028536 Ankfn1 (ENSDORG00000007824) Pctp (ENSDORG00000012691) Tmem100 (ENSDORG00000028016) Mmd (ENSDORG00000026049) Hlf (ENSDORG00000026285) Stxbp4 (ENSDORG00000015457) Tom1l1 (ENSDORG00000001206) ENSDORG00000029230 #22 Car10 (ENSDORG00000011701) ENSDORG00000029998 Utp18 (ENSDORG00000005965) ENSDORG00000005964 Nme2 (ENSDORG00000005962) Nme1 (ENSDORG00000029493) Spag9 (ENSDORG00000005649) Tob1 (ENSDORG00000013844) Wfikkn2 (ENSDORG00000027958) Luc7l3 (ENSDORG00000001260) Ankrd40 (ENSDORG00000026320) Abcc3 (ENSDORG00000004963) Cacna1g (ENSDORG00000009130) Spata20 (ENSDORG00000009128) Epn3 (ENSDORG00000009127) Kangaroo rat MODERN SPECIES 441 Dclk2 (ENSDORG00000001007) ENSDORG00000024190 Mab21l2 (ENSDORG00000028902) ENSDORG00000005601 ENSDORG00000024347 #22 Sh3d19 (ENSDORG00000002251) Prss48 (ENSDORG00000010411) Fhip1a (ENSDORG00000010240) Gatb (ENSDORG00000010241) Fbxw7 (ENSDORG00000007531) Tmem154 (ENSDORG00000013371) Tigd4 (ENSDORG00000008170) Arfip1 (ENSDORG00000024563) Fhdc1 (ENSDORG00000015867) Trim2 (ENSDORG00000004512) Mnd1 (ENSDORG00000004514) ENSDORG00000027965 Sfrp2 (ENSDORG00000028019) Dchs2 (ENSDORG00000014105) Plrg1 (ENSDORG00000016294) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Artiodactyla_b DUPLICATION Artiodactyla_b DUPLICATION Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a #22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a #22 Beluga whale MODERN SPECIES 53 SLC10A7 (ENSDLEG00000015846) POU4F2 (ENSDLEG00000015837) TTC29 (ENSDLEG00000015814) EDNRA (ENSDLEG00000015808) ENSDLEG00000015796 ENSDLEG00000015792 TMEM184C (ENSDLEG00000015783) PRMT9 (ENSDLEG00000015745) ENSDLEG00000015737 ARHGAP10 (ENSDLEG00000015639) NR3C2 (ENSDLEG00000015618) DCLK2 (ENSDLEG00000015561) MAB21L2 (ENSDLEG00000015547) LRBA (ENSDLEG00000015473) ENSDLEG00000015456 ENSDLEG00000015435 #22 ENSDLEG00000015422 SH3D19 (ENSDLEG00000015331) FHIP1A (ENSDLEG00000015284) GATB (ENSDLEG00000015234) FBXW7 (ENSDLEG00000015186) ENSDLEG00000015165 TIGD4 (ENSDLEG00000015161) ARFIP1 (ENSDLEG00000015132) FHDC1 (ENSDLEG00000015095) TRIM2 (ENSDLEG00000015055) MND1 (ENSDLEG00000014994) TMEM131L (ENSDLEG00000014921) TLR2 (ENSDLEG00000014910) SFRP2 (ENSDLEG00000014900) ENSDLEG00000014886 Narwhal MODERN SPECIES 307 REELD1 (ENSMMNG00015016914) SLC10A7 (ENSMMNG00015016983) POU4F2 (ENSMMNG00015017044) TTC29 (ENSMMNG00015017062) EDNRA (ENSMMNG00015017085) ENSMMNG00015017155 TMEM184C (ENSMMNG00015017180) PRMT9 (ENSMMNG00015017236) ARHGAP10 (ENSMMNG00015017349) NR3C2 (ENSMMNG00015017740) DCLK2 (ENSMMNG00015017930) LRBA (ENSMMNG00015018026) MAB21L2 (ENSMMNG00015018109) ENSMMNG00015018125 ENSMMNG00015018150 ENSMMNG00015018175 #22 SH3D19 (ENSMMNG00015018299) ENSMMNG00015018587 FHIP1A (ENSMMNG00015018610) GATB (ENSMMNG00015018644) FBXW7 (ENSMMNG00015018727) TMEM154 (ENSMMNG00015018865) ARFIP1 (ENSMMNG00015018903) FHDC1 (ENSMMNG00015018979) TRIM2 (ENSMMNG00015019031) MND1 (ENSMMNG00015019145) TMEM131L (ENSMMNG00015019219) TLR2 (ENSMMNG00015019314) RNF175 (ENSMMNG00015019342) SFRP2 (ENSMMNG00015019388) ENSMMNG00015019414 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a #22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 33 ENSMMSG00000016109 #22 PRSS48 (ENSMMSG00000015964) SH3D19 (ENSMMSG00000015636) FHIP1A (ENSMMSG00000015562) GATB (ENSMMSG00000015487) ENSMMSG00000015447 FBXW7 (ENSMMSG00000015345) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.b #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.a.a.b #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.a.a.b #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.a.a.b #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00910000148620.c.b ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Dolphin MODERN SPECIES 5268 ENSTTRG00000013094 #22 SH3D19 (ENSTTRG00000013099) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.b #22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1202 ENSMMSG00000021528 NAXE (ENSMMSG00000021541) IQGAP3 (ENSMMSG00000021624) MEF2D (ENSMMSG00000021733) RHBG (ENSMMSG00000021854) TSACC (ENSMMSG00000021888) CCT3 (ENSMMSG00000021905) GLMP (ENSMMSG00000021977) TMEM79 (ENSMMSG00000022007) SMG5 (ENSMMSG00000022024) PAQR6 (ENSMMSG00000022081) BGLAP (ENSMMSG00000022141) PMF1 (ENSMMSG00000022165) SLC25A44 (ENSMMSG00000022189) SEMA4A (ENSMMSG00000022204) ENSMMSG00000022232 #22 LMNA (ENSMMSG00000022290) MEX3A (ENSMMSG00000022428) RAB25 (ENSMMSG00000022435) LAMTOR2 (ENSMMSG00000022447) UBQLN4 (ENSMMSG00000022457) SSR2 (ENSMMSG00000022486) ARHGEF2 (ENSMMSG00000022532) RXFP4 (ENSMMSG00000022594) KHDC4 (ENSMMSG00000022609) RIT1 (ENSMMSG00000004820) SYT11 (ENSMMSG00000004948) ENSMMSG00000005075 ENSMMSG00000006603 MSTO1 (ENSMMSG00000006647) DAP3 (ENSMMSG00000006783) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b #22 Yarkand deer MODERN SPECIES 1323 XKRX (ENSCHYG00000024532) NOX1 (ENSCHYG00000024449) CSTF2 (ENSCHYG00000024275) SYTL4 (ENSCHYG00000024186) ENSCHYG00000024160 SERPINA7 (ENSCHYG00000024130) NRK (ENSCHYG00000023940) ENSCHYG00000023902 IL1RAPL2 (ENSCHYG00000023820) ENSCHYG00000023788 FAM199X (ENSCHYG00000023762) ENSCHYG00000023748 ENSCHYG00000023725 ENSCHYG00000023695 ZNF185 (ENSCHYG00000023363) ENSCHYG00000023322 #22 NSDHL (ENSCHYG00000023286) CETN2 (ENSCHYG00000023256) ENSCHYG00000023224 GABRQ (ENSCHYG00000023094) ENSCHYG00000023057 GABRA3 (ENSCHYG00000022962) MAGEA10 (ENSCHYG00000022936) GABRE (ENSCHYG00000022888) ENSCHYG00000022871 CNGA2 (ENSCHYG00000022833) ENSCHYG00000022815 PRRG3 (ENSCHYG00000022752) VMA21 (ENSCHYG00000022693) GPR50 (ENSCHYG00000022662) CD99L2 (ENSCHYG00000022547) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b #22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b #22 Wild yak MODERN SPECIES 19 ENSBMUG00000011065 #22 ENSBMUG00000011087 ENSBMUG00000011112 ENSBMUG00000011121 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000153335.a.b ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.a.b.n.a.a.b.b ENSGT00940000159995 ENSGT00390000014794.b ENSGT00390000004181 ENSGT00940000161078 ENSGT00940000157470 ENSGT00530000063713.a ENSGT00390000014082.b ENSGT00940000158394 ENSGT00390000000984 ENSGT00940000158210 ENSGT00940000158794 ENSGT01030000234543.B.f ENSGT00940000160543 ENSGT00390000018433.s.a.a.b #22 ENSGT00940000159378 ENSGT00940000159406 ENSGT00940000158924 ENSGT00940000153441.a.b ENSGT00940000161556 ENSGT00390000017595 ENSGT00940000157720 ENSGT00940000155595 ENSGT00780000122010 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00940000155901.b ENSGT00940000155043.bb.a.a Goat MODERN SPECIES 20 ARID5B (ENSCHIG00000019296) RTKN2 (ENSCHIG00000011108) ZNF365 (ENSCHIG00000024289) ENSCHIG00000010161 ADO (ENSCHIG00000026433) EGR2 (ENSCHIG00000018766) ENSCHIG00000007340 ENSCHIG00000010873 JMJD1C (ENSCHIG00000022251) ENSCHIG00000010880 REEP3 (ENSCHIG00000015558) ENSCHIG00000016083 LRRTM3 (ENSCHIG00000023535) ENSCHIG00000010807 ENSCHIG00000019480 ENSCHIG00000008056 #22 DNAJC12 (ENSCHIG00000024728) ENSCHIG00000015880 ENSCHIG00000010127 SIRT1 (ENSCHIG00000011027) HERC4 (ENSCHIG00000012304) MYPN (ENSCHIG00000015250) ATOH7 (ENSCHIG00000019874) PBLD (ENSCHIG00000013854) ENSCHIG00000026467 RUFY2 (ENSCHIG00000010345) DNA2 (ENSCHIG00000018956) SLC25A16 (ENSCHIG00000013881) TET1 (ENSCHIG00000009920) CCAR1 (ENSCHIG00000000354) STOX1 (ENSCHIG00000000317) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 17 CDK1 (ENSOARG00020024130) RHOBTB1 (ENSOARG00020024171) TMEM26 (ENSOARG00020024213) CABCOCO1 (ENSOARG00020024239) ARID5B (ENSOARG00020024263) RTKN2 (ENSOARG00020024459) ZNF365 (ENSOARG00020024513) ADO (ENSOARG00020024530) EGR2 (ENSOARG00020024540) NRBF2 (ENSOARG00020024553) JMJD1C (ENSOARG00020024597) REEP3 (ENSOARG00020024896) CTNNA3 (ENSOARG00020006501) ENSOARG00020006636 LRRTM3 (ENSOARG00020006696) ENSOARG00020006759 #22 ENSOARG00020006783 SIRT1 (ENSOARG00020006830) HERC4 (ENSOARG00020007038) MYPN (ENSOARG00020007679) ATOH7 (ENSOARG00020007963) PBLD (ENSOARG00020007987) ENSOARG00020008090 HNRNPH3 (ENSOARG00020008115) RUFY2 (ENSOARG00020008371) DNA2 (ENSOARG00020009086) SLC25A16 (ENSOARG00020009295) TET1 (ENSOARG00020009369) CCAR1 (ENSOARG00020009447) STOX1 (ENSOARG00020009603) DDX50 (ENSOARG00020009681) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b #22 Blue whale MODERN SPECIES 40 ENSBMSG00010021649 ENSBMSG00010021625 MAGEB1 (ENSBMSG00010021617) ENSBMSG00010021614 IL1RAPL1 (ENSBMSG00010021606) ENSBMSG00010021594 ENSBMSG00010021587 ENSBMSG00010021580 ENSBMSG00010021571 PPP4R3C (ENSBMSG00010021567) ENSBMSG00010021566 MAGEB5 (ENSBMSG00010021560) MAGEB18 (ENSBMSG00010021557) ENSBMSG00010021551 ENSBMSG00010021547 ENSBMSG00010021542 #22 ENSBMSG00010021537 ARX (ENSBMSG00010021534) POLA1 (ENSBMSG00010021507) PCYT1B (ENSBMSG00010021451) PDK3 (ENSBMSG00010021431) ENSBMSG00010021424 ENSBMSG00010021421 ENSBMSG00010021408 EIF2S3 (ENSBMSG00010021391) ENSBMSG00010021384 KLHL15 (ENSBMSG00010021380) CXorf58 (ENSBMSG00010021372) ENSBMSG00010021365 APOO (ENSBMSG00010021360) SAT1 (ENSBMSG00010021343) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b #22 Vaquita MODERN SPECIES 5 KDSR (ENSPSNG00000018828) VPS4B (ENSPSNG00000018789) SERPINB5 (ENSPSNG00000018661) ENSPSNG00000018474 SERPINB2 (ENSPSNG00000018420) SERPINB10 (ENSPSNG00000018388) SERPINB8 (ENSPSNG00000018298) CDH7 (ENSPSNG00000018107) CDH19 (ENSPSNG00000017916) ENSPSNG00000017890 DSEL (ENSPSNG00000017875) TMX3 (ENSPSNG00000017796) CCDC102B (ENSPSNG00000017671) DOK6 (ENSPSNG00000017574) CD226 (ENSPSNG00000017461) ENSPSNG00000017429 #22 RTTN (ENSPSNG00000016449) SOCS6 (ENSPSNG00000016372) CBLN2 (ENSPSNG00000016259) NETO1 (ENSPSNG00000016051) FBXO15 (ENSPSNG00000016021) TIMM21 (ENSPSNG00000015973) ENSPSNG00000015834 C18orf63 (ENSPSNG00000015663) DIPK1C (ENSPSNG00000015542) CNDP2 (ENSPSNG00000015447) CNDP1 (ENSPSNG00000015211) ZNF407 (ENSPSNG00000015129) PTGR3 (ENSPSNG00000015074) TSHZ1 (ENSPSNG00000015019) ZNF516 (ENSPSNG00000014900) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b #22 Narwhal MODERN SPECIES 302 TMEFF2 (ENSMMNG00015005588) SLC39A10 (ENSMMNG00015005544) DNAH7 (ENSMMNG00015005467) STK17B (ENSMMNG00015005421) HECW2 (ENSMMNG00015005408) ENSMMNG00015005381 GTF3C3 (ENSMMNG00015005350) C2orf66 (ENSMMNG00015005331) PGAP1 (ENSMMNG00015005302) ANKRD44 (ENSMMNG00015005236) SF3B1 (ENSMMNG00015005194) COQ10B (ENSMMNG00015005170) ENSMMNG00015005160 ENSMMNG00015005152 MOB4 (ENSMMNG00015005131) ENSMMNG00015005118 #22 RFTN2 (ENSMMNG00015009156) MARS2 (ENSMMNG00015009149) ENSMMNG00015009146 PLCL1 (ENSMMNG00015009132) ENSMMNG00015009121 SATB2 (ENSMMNG00015009088) FTCDNL1 (ENSMMNG00015009064) C2orf69 (ENSMMNG00015009051) TYW5 (ENSMMNG00015009041) MAIP1 (ENSMMNG00015009034) SPATS2L (ENSMMNG00015008966) KCTD18 (ENSMMNG00015008930) ENSMMNG00015008923 ENSMMNG00015008917 AOX1 (ENSMMNG00015008883) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 986 ENSMLUG00000010141 GLRA2 (ENSMLUG00000015270) ENSMLUG00000015275 MOSPD2 (ENSMLUG00000015281) ASB9 (ENSMLUG00000017696) ASB11 (ENSMLUG00000017697) PIGA (ENSMLUG00000017698) VEGFD (ENSMLUG00000017699) PIR (ENSMLUG00000017700) BMX (ENSMLUG00000017701) ACE2 (ENSMLUG00000017702) ENSMLUG00000025064 CA5B (ENSMLUG00000009760) ENSMLUG00000009780 AP1S2 (ENSMLUG00000009794) ENSMLUG00000025644 #22 GRPR (ENSMLUG00000007561) ENSMLUG00000010201 ENSMLUG00000027452 S100G (ENSMLUG00000006174) CTPS2 (ENSMLUG00000006158) SYAP1 (ENSMLUG00000006176) TXLNG (ENSMLUG00000006186) RBBP7 (ENSMLUG00000006194) ENSMLUG00000028073 REPS2 (ENSMLUG00000008125) NHS (ENSMLUG00000015408) ENSMLUG00000029397 RAI2 (ENSMLUG00000015416) SCML2 (ENSMLUG00000015450) CDKL5 (ENSMLUG00000006808) Microbat MODERN SPECIES 963 STAR (ENSMLUG00000003732) ASH2L (ENSMLUG00000003723) EIF4EBP1 (ENSMLUG00000007526) ADRB3 (ENSMLUG00000007514) GOT1L1 (ENSMLUG00000007485) RAB11FIP1 (ENSMLUG00000007472) BRF2 (ENSMLUG00000030280) ADGRA2 (ENSMLUG00000022283) PLPBP (ENSMLUG00000007448) ERLIN2 (ENSMLUG00000011778) ZNF703 (ENSMLUG00000011770) ENSMLUG00000025710 ENSMLUG00000026031 ENSMLUG00000028845 UNC5D (ENSMLUG00000005073) ENSMLUG00000024514 #22 ENSMLUG00000027529 DUSP26 (ENSMLUG00000002772) RNF122 (ENSMLUG00000012520) TTI2 (ENSMLUG00000002764) MAK16 (ENSMLUG00000002758) FUT10 (ENSMLUG00000002754) ENSMLUG00000025759 ENSMLUG00000010211 ENSMLUG00000013804 WRN (ENSMLUG00000005863) PURG (ENSMLUG00000024424) ENSMLUG00000024122 ENSMLUG00000016793 ENSMLUG00000008035 TEX15 (ENSMLUG00000014276) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.a.a #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000008828.k ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a.d ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 Red fox MODERN SPECIES 26 TBPL1 (ENSVVUG00000019078) SLC2A12 (ENSVVUG00000000065) SGK1 (ENSVVUG00000000114) ENSVVUG00000000216 ALDH8A1 (ENSVVUG00000000258) HBS1L (ENSVVUG00000000295) MYB (ENSVVUG00000000361) AHI1 (ENSVVUG00000000451) ENSVVUG00000000569 PDE7B (ENSVVUG00000000584) MTFR2 (ENSVVUG00000000593) ENSVVUG00000000603 ENSVVUG00000000623 MAP7 (ENSVVUG00000000652) MAP3K5 (ENSVVUG00000000760) ENSVVUG00000002154 #22 PEX7 (ENSVVUG00000002175) SLC35D3 (ENSVVUG00000002202) IL20RA (ENSVVUG00000002217) IL22RA2 (ENSVVUG00000002229) IFNGR1 (ENSVVUG00000002286) ENSVVUG00000002326 ENSVVUG00000002335 OLIG3 (ENSVVUG00000002352) ENSVVUG00000002359 TNFAIP3 (ENSVVUG00000002369) ENSVVUG00000002382 ARFGEF3 (ENSVVUG00000002408) HEBP2 (ENSVVUG00000002586) NHSL1 (ENSVVUG00000002603) CCDC28A (ENSVVUG00000002636) Canis_lupus DUPLICATION Canis_lupus DUPLICATION Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157028 ENSGT01050000244864.B.b ENSGT01030000234513.B.b.i ENSGT01030000234513.B.b.j ENSGT00390000007182 ENSGT00390000015473 ENSGT00940000161739 ENSGT00390000016366 ENSGT00940000153139.A ENSGT00940000159161 ENSGT00390000003152.j ENSGT00500000045005 ENSGT00390000008171 ENSGT00940000153716.A ENSGT00950000183079.A.b.c.b ENSGT00390000018433.s.a.a.e.a #22 ENSGT00940000160956 ENSGT00940000159187 ENSGT00390000016695 ENSGT00940000153259.a.a.b ENSGT00510000047137.i ENSGT00950000183171.B ENSGT00730000111659 ENSGT00940000154936.qb ENSGT00940000154103.a ENSGT00530000063529.A ENSGT00940000158055 ENSGT00730000111111 ENSGT00940000157332 ENSGT00940000157443 ENSGT00940000165049 Dingo MODERN SPECIES 304 ENSCAFG00020001972 ZMYM2 (ENSCAFG00020001106) GJB2 (ENSCAFG00020000961) GJB6 (ENSCAFG00020000958) CRYL1 (ENSCAFG00020000954) IFT88 (ENSCAFG00020000222) IL17D (ENSCAFG00020000155) EEF1AKMT1 (ENSCAFG00020025480) XPO4 (ENSCAFG00020025455) LATS2 (ENSCAFG00020025447) ENSCAFG00020025445 SKA3 (ENSCAFG00020025442) MRPL57 (ENSCAFG00020025438) ZDHHC20 (ENSCAFG00020025434) MICU2 (ENSCAFG00020025432) ENSCAFG00020025430 #22 FGF9 (ENSCAFG00020025429) SGCG (ENSCAFG00020025426) SACS (ENSCAFG00020025414) TNFRSF19 (ENSCAFG00020025407) ENSCAFG00020025406 MIPEP (ENSCAFG00020025404) ENSCAFG00020025402 ENSCAFG00020025398 ENSCAFG00020025393 ENSCAFG00020025389 AMER2 (ENSCAFG00020025387) MTMR6 (ENSCAFG00020025382) ENSCAFG00020025380 NUP58 (ENSCAFG00020025357) ATP8A2 (ENSCAFG00020025331) Dog MODERN SPECIES 17 ZMYM2 (ENSCAFG00845023531) GJA3 (ENSCAFG00845023462) GJB2 (ENSCAFG00845023429) GJB6 (ENSCAFG00845023360) CRYL1 (ENSCAFG00845023166) IFT88 (ENSCAFG00845022012) IL17D (ENSCAFG00845021741) EEF1AKMT1 (ENSCAFG00845021658) XPO4 (ENSCAFG00845021422) LATS2 (ENSCAFG00845021300) SAP18 (ENSCAFG00845021235) SKA3 (ENSCAFG00845021073) MRPL57 (ENSCAFG00845021002) ZDHHC20 (ENSCAFG00845020710) MICU2 (ENSCAFG00845020415) ENSCAFG00845020344 #22 FGF9 (ENSCAFG00845020297) SGCG (ENSCAFG00845020198) SACS (ENSCAFG00845020013) TNFRSF19 (ENSCAFG00845019643) ENSCAFG00845019573 MIPEP (ENSCAFG00845019295) ENSCAFG00845019187 ENSCAFG00845018985 ENSCAFG00845018801 ENSCAFG00845018627 ENSCAFG00845018528 ENSCAFG00845018481 MTMR6 (ENSCAFG00845018288) NUP58 (ENSCAFG00845017878) ATP8A2 (ENSCAFG00845017077) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00950000182869.e.b.b.o.b ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000003248.a.a.b ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000162325.B.l ENSGT00390000018433.s.a.a.e.b #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00950000183198.c.b.b.g.a.a ENSGT00940000154986 ENSGT00390000008828.k.a ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a.d ENSGT00490000043413 ENSGT00940000154770.ib ENSGT00530000063614.a.b Dingo MODERN SPECIES 277 SLC10A7 (ENSCAFG00020025908) POU4F2 (ENSCAFG00020025916) TTC29 (ENSCAFG00020025920) EDNRA (ENSCAFG00020025935) TMEM184C (ENSCAFG00020025936) PRMT9 (ENSCAFG00020025939) ENSCAFG00020025962 ARHGAP10 (ENSCAFG00020025975) NR3C2 (ENSCAFG00020025992) ENSCAFG00020026009 DCLK2 (ENSCAFG00020026012) LRBA (ENSCAFG00020026144) ENSCAFG00020026662 MAB21L2 (ENSCAFG00020026663) ENSCAFG00020026664 ENSCAFG00020026665 #22 SH3D19 (ENSCAFG00020026668) PRSS48 (ENSCAFG00020026672) ENSCAFG00020026675 FHIP1A (ENSCAFG00020026678) GATB (ENSCAFG00020026686) ENSCAFG00020026719 FBXW7 (ENSCAFG00020026731) ENSCAFG00020026769 ENSCAFG00020026770 TIGD4 (ENSCAFG00020001422) ARFIP1 (ENSCAFG00020001430) FHDC1 (ENSCAFG00020001445) ENSCAFG00020001503 TRIM2 (ENSCAFG00020001512) MND1 (ENSCAFG00020001543) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000159675 ENSGT00940000160165 ENSGT00900000141083.d ENSGT00390000006095 ENSGT00390000007772.y.a ENSGT00390000007772.z ENSGT00390000007772.y.b ENSGT00940000157522 ENSGT00390000007364 ENSGT00390000009029 ENSGT00940000161072 ENSGT00940000156353 ENSGT00940000162486 ENSGT00390000003033 ENSGT00510000047481 ENSGT00390000018433.s.a.a.f #22 ENSGT00510000047981.d ENSGT00940000160898 ENSGT00940000158655 ENSGT00940000160749.b ENSGT00940000170852 ENSGT00510000048354 ENSGT00540000070023.c.b.a.a.b ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d ENSGT00950000182972.a.a.a.b ENSGT00940000157741 ENSGT00390000016814 ENSGT00940000154659.b ENSGT00940000155297 ENSGT00390000002887 Dingo MODERN SPECIES 80 ENSCAFG00020008237 ENSCAFG00020008235 ENSCAFG00020008234 ENSCAFG00020008230 ENSCAFG00020008227 PIK3CB (ENSCAFG00020008199) FAIM (ENSCAFG00020008189) ENSCAFG00020008186 CEP70 (ENSCAFG00020008176) ESYT3 (ENSCAFG00020008113) ENSCAFG00020008091 MRAS (ENSCAFG00020008087) ENSCAFG00020008081 ARMC8 (ENSCAFG00020008068) DBR1 (ENSCAFG00020008060) ENSCAFG00020008057 #22 A4GNT (ENSCAFG00020008054) CLDN18 (ENSCAFG00020008047) SOX14 (ENSCAFG00020008039) ENSCAFG00020008023 IL20RB (ENSCAFG00020008018) ENSCAFG00020008010 NCK1 (ENSCAFG00020007999) SLC35G2 (ENSCAFG00020007989) STAG1 (ENSCAFG00020002071) PCCB (ENSCAFG00020001466) MSL2 (ENSCAFG00020027583) PPP2R3A (ENSCAFG00020027582) EPHB1 (ENSCAFG00020027580) KY (ENSCAFG00020027578) CEP63 (ENSCAFG00020027577) Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 15 MRPS22 (ENSCAFG00845027000) ENSCAFG00845026965 ENSCAFG00845026940 ENSCAFG00845026883 PRR23A (ENSCAFG00845026853) PIK3CB (ENSCAFG00845025921) FAIM (ENSCAFG00845025733) ENSCAFG00845025691 ENSCAFG00845025659 CEP70 (ENSCAFG00845025346) ESYT3 (ENSCAFG00845024743) MRAS (ENSCAFG00845024583) NME9 (ENSCAFG00845024321) ARMC8 (ENSCAFG00845023706) DBR1 (ENSCAFG00845023502) ENSCAFG00845023449 #22 A4GNT (ENSCAFG00845023425) ENSCAFG00845023325 CLDN18 (ENSCAFG00845023238) SOX14 (ENSCAFG00845023200) ENSCAFG00845022964 IL20RB (ENSCAFG00845022899) ENSCAFG00845022866 NCK1 (ENSCAFG00845022785) SLC35G2 (ENSCAFG00845022747) ENSCAFG00845022720 STAG1 (ENSCAFG00845021253) PCCB (ENSCAFG00845020335) MSL2 (ENSCAFG00845020138) PPP2R3A (ENSCAFG00845019705) EPHB1 (ENSCAFG00845019520) Dog MODERN SPECIES 15 TBC1D5 (ENSCAFG00845021936) ENSCAFG00845022287 PLCL2 (ENSCAFG00845022325) DAZL (ENSCAFG00845022414) RFTN1 (ENSCAFG00845022667) OXNAD1 (ENSCAFG00845022998) DPH3 (ENSCAFG00845023089) GALNT15 (ENSCAFG00845023124) ANKRD28 (ENSCAFG00845023341) BTD (ENSCAFG00845024081) ENSCAFG00845024606 EAF1 (ENSCAFG00845026720) SH3BP5 (ENSCAFG00845026935) ENSCAFG00845027174 ENSCAFG00845027371 ENSCAFG00845027616 #22 COL6A5 (ENSCAFG00845027693) COL6A6 (ENSCAFG00845027892) PIK3R4 (ENSCAFG00845028045) ATP2C1 (ENSCAFG00845028382) ASTE1 (ENSCAFG00845028741) NEK11 (ENSCAFG00845028794) NUDT16 (ENSCAFG00845028871) MRPL3 (ENSCAFG00845028932) CPNE4 (ENSCAFG00845029026) ACP3 (ENSCAFG00845029185) DNAJC13 (ENSCAFG00845029276) ACAD11 (ENSCAFG00845029398) ACKR4 (ENSCAFG00845029452) UBA5 (ENSCAFG00845029497) NPHP3 (ENSCAFG00845029572) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Giant Panda MODERN SPECIES 1596 ENSAMEG00000024814 #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 American mink MODERN SPECIES 83 SLITRK4 (ENSNVIG00000022627) ENSNVIG00000022631 LDOC1 (ENSNVIG00000022636) ENSNVIG00000022637 SOX3 (ENSNVIG00000022644) ENSNVIG00000000062 ENSNVIG00000000077 ATP11C (ENSNVIG00000000083) MCF2 (ENSNVIG00000000331) FA9 (ENSNVIG00000000999) FGF13 (ENSNVIG00000001046) ENSNVIG00000001107 ENSNVIG00000001135 #22 ZIC3 (ENSNVIG00000001184) GPR101 (ENSNVIG00000001200) ENSNVIG00000001206 RBMX (ENSNVIG00000001236) ARHGEF6 (ENSNVIG00000001293) CD40LG (ENSNVIG00000001334) ENSNVIG00000001366 HTATSF1 (ENSNVIG00000001372) BRS3 (ENSNVIG00000001386) ADGRG4 (ENSNVIG00000001403) ENSNVIG00000001467 FHL1 (ENSNVIG00000001503) SLC9A6 (ENSNVIG00000001615) MMGT1 (ENSNVIG00000001915) Ferret MODERN SPECIES 224 MMAA (ENSMPUG00000006877) C4orf51 (ENSMPUG00000006910) ZNF827 (ENSMPUG00000006921) LSM6 (ENSMPUG00000006936) ENSMPUG00000006949 SLC10A7 (ENSMPUG00000006955) POU4F2 (ENSMPUG00000006963) TTC29 (ENSMPUG00000006968) ENSMPUG00000006979 EDNRA (ENSMPUG00000006985) TMEM184C (ENSMPUG00000006995) PRMT9 (ENSMPUG00000007003) ARHGAP10 (ENSMPUG00000007012) NR3C2 (ENSMPUG00000007025) ENSMPUG00000007034 ENSMPUG00000007041 #22 DCLK2 (ENSMPUG00000007082) LRBA (ENSMPUG00000007098) MAB21L2 (ENSMPUG00000019989) ENSMPUG00000019992 RPS3A (ENSMPUG00000007139) ##22 ENSMPUG00000019994 SH3D19 (ENSMPUG00000007143) ENSMPUG00000007291 PRSS48 (ENSMPUG00000007310) FHIP1A (ENSMPUG00000007380) GATB (ENSMPUG00000007394) FBXW7 (ENSMPUG00000007404) ENSMPUG00000007417 TMEM154 (ENSMPUG00000007425) TIGD4 (ENSMPUG00000019997) Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Cat MODERN SPECIES ENSFCAG00000045423 XRCC4 (ENSFCAG00000029944) VCAN (ENSFCAG00000023191) HAPLN1 (ENSFCAG00000037432) EDIL3 (ENSFCAG00000002497) ENSFCAG00000050071 ENSFCAG00000022528 COX7C (ENSFCAG00000034705) RASA1 (ENSFCAG00000004825) CCNH (ENSFCAG00000004828) ENSFCAG00000048547 ENSFCAG00000050982 TMEM161B (ENSFCAG00000031564) MEF2C (ENSFCAG00000011595) CETN3 (ENSFCAG00000022808) ENSFCAG00000024204 #22 MBLAC2 (ENSFCAG00000029005) ENSFCAG00000032444 LYSMD3 (ENSFCAG00000029406) ADGRV1 (ENSFCAG00000012405) ARRDC3 (ENSFCAG00000019203) ENSFCAG00000024804 NR2F1 (ENSFCAG00000034642) FAM172A (ENSFCAG00000025443) KIAA0825 (ENSFCAG00000028992) SLF1 (ENSFCAG00000024671) MCTP1 (ENSFCAG00000014397) FAM81B (ENSFCAG00000013183) SKIC3 (ENSFCAG00000010817) ARSK (ENSFCAG00000022411) GPR150 (ENSFCAG00000041866) Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 leopard MODERN SPECIES 6 ENSPPRG00000023608 NR3C2 (ENSPPRG00000000130) ENSPPRG00000000395 #22 IQCM (ENSPPRG00000001385) DCLK2 (ENSPPRG00000003879) MAB21L2 (ENSPPRG00000017133) ENSPPRG00000004503 LRBA (ENSPPRG00000012725) ENSPPRG00000013249 RPS3A (ENSPPRG00000013732) ##22 SH3D19 (ENSPPRG00000001261) ENSPPRG00000017765 FHIP1A (ENSPPRG00000002729) GATB (ENSPPRG00000004993) FBXW7 (ENSPPRG00000006952) TMEM154 (ENSPPRG00000009481) TIGD4 (ENSPPRG00000017931) ARFIP1 (ENSPPRG00000013285) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a #22 Elephant DUPLICATION Elephant MODERN SPECIES 325 RAB4A (ENSLAFG00000000757) CCSAP (ENSLAFG00000003975) ACTA1 (ENSLAFG00000006306) NUP133 (ENSLAFG00000006310) ABCB10 (ENSLAFG00000006318) TAF5L (ENSLAFG00000012480) URB2 (ENSLAFG00000012484) FASLG (ENSLAFG00000013064) SUCO (ENSLAFG00000016383) PIGC (ENSLAFG00000026118) DNM3 (ENSLAFG00000013295) METTL13 (ENSLAFG00000008601) VAMP4 (ENSLAFG00000004038) MYOC (ENSLAFG00000017243) PRRC2C (ENSLAFG00000017227) ENSLAFG00000031524 #22 FMO4 (ENSLAFG00000005836) FMO1 (ENSLAFG00000022265) FMO2 (ENSLAFG00000016530) ENSLAFG00000009092 MROH9 (ENSLAFG00000006740) PRRX1 (ENSLAFG00000007385) GORAB (ENSLAFG00000029502) NTMT2 (ENSLAFG00000001800) KIFAP3 (ENSLAFG00000018434) SCYL3 (ENSLAFG00000018090) C1orf112 (ENSLAFG00000014427) METTL18 (ENSLAFG00000014426) SELE (ENSLAFG00000007166) SELL (ENSLAFG00000007162) SELP (ENSLAFG00000014536) Elephant MODERN SPECIES 388 SAMD7 (ENSLAFG00000006504) SEC62 (ENSLAFG00000006508) PHC3 (ENSLAFG00000013315) PRKCI (ENSLAFG00000004925) SKIL (ENSLAFG00000023277) CLDN11 (ENSLAFG00000011475) SLC7A14 (ENSLAFG00000006924) RPL22L1 (ENSLAFG00000013220) EIF5A2 (ENSLAFG00000013225) SLC2A2 (ENSLAFG00000012114) TNIK (ENSLAFG00000017445) PLD1 (ENSLAFG00000000014) FNDC3B (ENSLAFG00000017259) GHSR (ENSLAFG00000017284) TNFSF10 (ENSLAFG00000014313) ENSLAFG00000026187 #22 NCEH1 (ENSLAFG00000010083) ECT2 (ENSLAFG00000007798) SPATA16 (ENSLAFG00000009211) ENSLAFG00000025798 NLGN1 (ENSLAFG00000010162) TBL1XR1 (ENSLAFG00000021750) KCNMB2 (ENSLAFG00000004923) ZMAT3 (ENSLAFG00000000897) PIK3CA (ENSLAFG00000003071) KCNMB3 (ENSLAFG00000003072) ZNF639 (ENSLAFG00000001733) Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 18511 ENSETEG00000009996 #22 Tenrec MODERN SPECIES 4083 ENSETEG00000017902 #22 Tenrec MODERN SPECIES 8851 TOP3A (ENSETEG00000004392) ENSETEG00000004398 #22 SMCR8 (ENSETEG00000004404) SHMT1 (ENSETEG00000004407) Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 348 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00390000018433.s.a.a #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b Sloth MODERN SPECIES 3735 ENSCHOG00000007238 #22 SH3D19 (ENSCHOG00000007244) Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2027 ENSDNOG00000043976 RC3H2 (ENSDNOG00000014557) ZBTB6 (ENSDNOG00000014591) ZBTB26 (ENSDNOG00000045813) ENSDNOG00000037259 RABGAP1 (ENSDNOG00000013366) STRBP (ENSDNOG00000043330) CRB2 (ENSDNOG00000038587) DENND1A (ENSDNOG00000034926) ENSDNOG00000045998 LHX2 (ENSDNOG00000000465) NEK6 (ENSDNOG00000015320) PSMB7 (ENSDNOG00000015332) ADGRD2 (ENSDNOG00000015410) NR5A1 (ENSDNOG00000040922) ENSDNOG00000032252 #22 NR6A1 (ENSDNOG00000017832) ENSDNOG00000033680 OLFML2A (ENSDNOG00000040474) WDR38 (ENSDNOG00000046480) ENSDNOG00000033968 GOLGA1 (ENSDNOG00000000005) SCAI (ENSDNOG00000000007) PPP6C (ENSDNOG00000045474) RABEPK (ENSDNOG00000015327) HSPA5 (ENSDNOG00000031601) GAPVD1 (ENSDNOG00000009683) MAPKAP1 (ENSDNOG00000038808) PBX3 (ENSDNOG00000043756) Armadillo MODERN SPECIES 1097 SPHKAP (ENSDNOG00000013373) DAW1 (ENSDNOG00000001360) CCL20 (ENSDNOG00000039621) ENSDNOG00000031125 ENSDNOG00000036199 ENSDNOG00000039100 ENSDNOG00000034281 #22 AGFG1 (ENSDNOG00000016360) TM4SF20 (ENSDNOG00000008559) ENSDNOG00000008541 COL4A3 (ENSDNOG00000014502) COL4A4 (ENSDNOG00000000093) RHBDD1 (ENSDNOG00000039149) IRS1 (ENSDNOG00000031407) ENSDNOG00000035388 Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Tenrec MODERN SPECIES 12451 ENSETEG00000001788 ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Goat MODERN SPECIES 30 ENSCHIG00000018808 CD40LG (ENSCHIG00000000168) ARHGEF6 (ENSCHIG00000000132) ENSCHIG00000000095 ENSCHIG00000000060 ENSCHIG00000009593 ENSCHIG00000007648 ZIC3 (ENSCHIG00000021756) ENSCHIG00000018935 FGF13 (ENSCHIG00000016286) F9 (ENSCHIG00000013903) MCF2 (ENSCHIG00000009737) ATP11C (ENSCHIG00000009648) ENSCHIG00000000404 SOX3 (ENSCHIG00000000368) ENSCHIG00000000337 ##22 LDOC1 (ENSCHIG00000019266) ENSCHIG00000000231 ENSCHIG00000000195 ENSCHIG00000018613 SLITRK4 (ENSCHIG00000019228) ENSCHIG00000000062 IGSF1 (ENSCHIG00000008777) ENSCHIG00000024386 ENSCHIG00000020888 ENSCHIG00000018529 OR13H1 (ENSCHIG00000019695) ENSCHIG00000019833 ENOX2 (ENSCHIG00000009635) ENSCHIG00000009925 ENSCHIG00000000453 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 210 ZNF622 (ENSSBOG00000026590) RETREG1 (ENSSBOG00000015734) MYO10 (ENSSBOG00000028705) ENSSBOG00000008808 ##22 ENSSBOG00000029272 CDH18 (ENSSBOG00000020211) Tarsier MODERN SPECIES 5629 CASP12 (ENSTSYG00000003898) ENSTSYG00000011687 ENSTSYG00000009588 ENSTSYG00000030707 GRIA4 (ENSTSYG00000009882) MSANTD4 (ENSTSYG00000029032) KBTBD3 (ENSTSYG00000011191) AASDHPPT (ENSTSYG00000005102) ENSTSYG00000026481 ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 100 ENSJJAG00000000352 ENSJJAG00000020322 ENSJJAG00000020138 ENSJJAG00000019717 Alkbh3 (ENSJJAG00000018577) ENSJJAG00000017944 Hsd17b12 (ENSJJAG00000016592) Ttc17 (ENSJJAG00000015016) ENSJJAG00000012684 ENSJJAG00000011016 ENSJJAG00000013372 ENSJJAG00000007632 ENSJJAG00000017160 ENSJJAG00000017063 Lrrc4c (ENSJJAG00000013472) ENSJJAG00000014713 ##22 ENSJJAG00000013563 ENSJJAG00000013437 ENSJJAG00000013448 ENSJJAG00000012660 ENSJJAG00000012569 ENSJJAG00000011964 ENSJJAG00000011770 ENSJJAG00000013751 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Guinea pig MODERN SPECIES 165 ENSCPOG00000010355 ENSCPOG00000024703 ENSCPOG00000022971 ##22 ZSWIM5 (ENSCPOG00000012994) UROD (ENSCPOG00000024542) HECTD3 (ENSCPOG00000012988) ENSCPOG00000035741 EIF2B3 (ENSCPOG00000002171) PTCH2 (ENSCPOG00000012790) BTBD19 (ENSCPOG00000036128) DYNLT4 (ENSCPOG00000025746) PLK3 (ENSCPOG00000002167) BEST4 (ENSCPOG00000023264) RPS8 (ENSCPOG00000000723) KIF2C (ENSCPOG00000002161) ARMH1 (ENSCPOG00000002158) TMEM53 (ENSCPOG00000012006) RNF220 (ENSCPOG00000011998) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 6 ZNF696 (ENSPCTG00005014299) GLI4 (ENSPCTG00005014326) ZFP41 (ENSPCTG00005014395) LY6H (ENSPCTG00005014505) LY6E (ENSPCTG00005014593) ENSPCTG00005014680 ENSPCTG00005014909 ENSPCTG00005014963 TSNARE1 (ENSPCTG00005014986) ADGRB1 (ENSPCTG00005015167) ARC (ENSPCTG00005015916) JRK (ENSPCTG00005015935) PSCA (ENSPCTG00005015964) THEM6 (ENSPCTG00005015996) SLC45A4 (ENSPCTG00005016157) ENSPCTG00005016197 ##22 ENSPCTG00005016216 PTK2 (ENSPCTG00005016344) AGO2 (ENSPCTG00005017440) ENSPCTG00005017514 CHRAC1 (ENSPCTG00005017581) TRAPPC9 (ENSPCTG00005017633) ENSPCTG00005017670 COL22A1 (ENSPCTG00005017754) FAM135B (ENSPCTG00005018956) KHDRBS3 (ENSPCTG00005019130) ZFAT (ENSPCTG00005019229) TG (ENSPCTG00005019930) PHF20L1 (ENSPCTG00005020226) TMEM71 (ENSPCTG00005020318) LRRC6 (ENSPCTG00005020472) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Tarsier MODERN SPECIES 232 ENSTSYG00000034069 ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Tenrec MODERN SPECIES 10414 ENSETEG00000013950 ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Hyrax MODERN SPECIES 11519 ENSPCAG00000015040 ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Common shrew MODERN SPECIES 3215 ENSSARG00000000717 ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Megabat MODERN SPECIES 6817 ENSPVAG00000015406 ##22 SH3D19 (ENSPVAG00000015408) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Dog MODERN SPECIES 29 GPD2 (ENSCAFG00845025352) ENSCAFG00845025564 ENSCAFG00845025578 GALNT5 (ENSCAFG00845025607) ERMN (ENSCAFG00845025677) CYTIP (ENSCAFG00845025755) ACVR1C (ENSCAFG00845026018) ACVR1 (ENSCAFG00845026311) CCDC148 (ENSCAFG00845026619) PKP4 (ENSCAFG00845026973) DAPL1 (ENSCAFG00845027456) ENSCAFG00845027531 ENSCAFG00845027802 WDSUB1 (ENSCAFG00845027961) BAZ2B (ENSCAFG00845028154) ENSCAFG00845028381 ##22 ENSCAFG00845028418 ENSCAFG00845028511 MARCHF7 (ENSCAFG00845028624) CD302 (ENSCAFG00845028722) LY75 (ENSCAFG00845028773) PLA2R1 (ENSCAFG00845028931) ITGB6 (ENSCAFG00845029158) RBMS1 (ENSCAFG00845029501) TANK (ENSCAFG00845029606) ENSCAFG00845029635 PSMD14 (ENSCAFG00845029657) TBR1 (ENSCAFG00845029675) SLC4A10 (ENSCAFG00845029772) ENSCAFG00845029990 DPP4 (ENSCAFG00845030056) Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 52 CTC1 (ENSVVUG00000028125) PFAS (ENSVVUG00000028138) SLC25A35 (ENSVVUG00000028153) RANGRF (ENSVVUG00000028160) ENSVVUG00000028168 ENSVVUG00000028180 KRBA2 (ENSVVUG00000028186) RPL26 (ENSVVUG00000028189) RNF222 (ENSVVUG00000028195) NDEL1 (ENSVVUG00000028199) MYH10 (ENSVVUG00000028322) CCDC42 (ENSVVUG00000028872) MFSD6L (ENSVVUG00000028874) PIK3R6 (ENSVVUG00000028876) PIK3R5 (ENSVVUG00000028888) ENSVVUG00000028892 ##22 NTN1 (ENSVVUG00000028894) STX8 (ENSVVUG00000028896) USP43 (ENSVVUG00000028904) DHRS7C (ENSVVUG00000028908) ENSVVUG00000028911 GLP2R (ENSVVUG00000028914) RCVRN (ENSVVUG00000028918) GAS7 (ENSVVUG00000028920) MYH13 (ENSVVUG00000029033) ENSVVUG00000029387 ENSVVUG00000029396 ENSVVUG00000029408 ENSVVUG00000029445 MYH1 (ENSVVUG00000029610) ENSVVUG00000029624 Red fox MODERN SPECIES 66 SERPINI1 (ENSVVUG00000000154) ENSVVUG00000000200 ENSVVUG00000000244 GOLIM4 (ENSVVUG00000000297) MECOM (ENSVVUG00000000408) ENSVVUG00000000467 ACTRT3 (ENSVVUG00000000497) MYNN (ENSVVUG00000000510) LRRC34 (ENSVVUG00000000575) LRRIQ4 (ENSVVUG00000000662) LRRC31 (ENSVVUG00000000681) ENSVVUG00000000692 SAMD7 (ENSVVUG00000000702) SEC62 (ENSVVUG00000000766) PHC3 (ENSVVUG00000000912) ENSVVUG00000001040 ##22 PRKCI (ENSVVUG00000001057) SKIL (ENSVVUG00000001083) CLDN11 (ENSVVUG00000001091) SLC7A14 (ENSVVUG00000001102) ENSVVUG00000001121 RPL22L1 (ENSVVUG00000001132) EIF5A2 (ENSVVUG00000001140) ENSVVUG00000001154 SLC2A2 (ENSVVUG00000001163) ENSVVUG00000001177 TNIK (ENSVVUG00000001221) PLD1 (ENSVVUG00000001416) TMEM212 (ENSVVUG00000001592) FNDC3B (ENSVVUG00000001630) GHSR (ENSVVUG00000001716) Red fox MODERN SPECIES 32 TMTC1 (ENSVVUG00000007025) ENSVVUG00000007116 ##22 IPO8 (ENSVVUG00000007129) CAPRIN2 (ENSVVUG00000007217) SINHCAF (ENSVVUG00000007293) DENND5B (ENSVVUG00000007385) ETFBKMT (ENSVVUG00000012506) AMN1 (ENSVVUG00000012511) KIAA1551 (ENSVVUG00000012517) BICD1 (ENSVVUG00000012549) FGD4 (ENSVVUG00000012593) DNM1L (ENSVVUG00000012652) YARS2 (ENSVVUG00000012736) PKP2 (ENSVVUG00000012741) SYT10 (ENSVVUG00000012752) ENSVVUG00000012762 ENSVVUG00000012767 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00390000011576.a ENSGT00390000014876 ENSGT00940000153763.b ENSGT00940000158460 ENSGT00940000155875 American mink MODERN SPECIES 266 ENSNVIG00000009740 ##22 ENSNVIG00000009616 PRSS48 (ENSNVIG00000009457) SH3D19 (ENSNVIG00000009212) FHIP1A (ENSNVIG00000009145) GATB (ENSNVIG00000009094) FBXW7 (ENSNVIG00000008986) TM154 (ENSNVIG00000008959) TIGD4 (ENSNVIG00000008950) ARFIP1 (ENSNVIG00000008921) FHDC1 (ENSNVIG00000008899) TRIM2 (ENSNVIG00000008862) MFAP3L (ENSNVIG00000008842) ENSNVIG00000008836 ENSNVIG00000008830 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 American black bear DUPLICATION American black bear MODERN SPECIES 8911 ENSUAMG00000001612 ##22 American black bear MODERN SPECIES 133 ENSUAMG00000002113 ##22 TBX5 (ENSUAMG00000002094) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Arabian camel MODERN SPECIES 11 C4orf51 (ENSCDRG00005020225) ZNF827 (ENSCDRG00005020126) LSM6 (ENSCDRG00005020097) REELD1 (ENSCDRG00005020091) SLC10A7 (ENSCDRG00005020015) POU4F2 (ENSCDRG00005019973) TTC29 (ENSCDRG00005019850) EDNRA (ENSCDRG00005019808) TMEM184C (ENSCDRG00005019797) PRMT9 (ENSCDRG00005019766) ARHGAP10 (ENSCDRG00005019732) NR3C2 (ENSCDRG00005019699) DCLK2 (ENSCDRG00005019609) MAB21L2 (ENSCDRG00005019587) LRBA (ENSCDRG00005019229) RPS3A (ENSCDRG00005019167) ##22 SH3D19 (ENSCDRG00005018965) PRSS48 (ENSCDRG00005018930) FHIP1A (ENSCDRG00005018885) GATB (ENSCDRG00005018830) FBXW7 (ENSCDRG00005018704) TMEM154 (ENSCDRG00005018674) TIGD4 (ENSCDRG00005018659) ARFIP1 (ENSCDRG00005018580) FHDC1 (ENSCDRG00005018522) TRIM2 (ENSCDRG00005018429) MND1 (ENSCDRG00005018329) TMEM131L (ENSCDRG00005016677) RNF175 (ENSCDRG00005016510) SFRP2 (ENSCDRG00005016484) ENSCDRG00005016436 Alpaca MODERN SPECIES 1904 ENSVPAG00000004226 LRBA (ENSVPAG00000004227) ENSVPAG00000004235 ##22 SH3D19 (ENSVPAG00000004238) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Blue whale DUPLICATION Blue whale MODERN SPECIES 16 ZNF827 (ENSBMSG00010002746) LSM6 (ENSBMSG00010003073) REELD1 (ENSBMSG00010003085) SLC10A7 (ENSBMSG00010003119) POU4F2 (ENSBMSG00010003153) TTC29 (ENSBMSG00010003177) EDNRA (ENSBMSG00010003277) TMEM184C (ENSBMSG00010003315) PRMT9 (ENSBMSG00010003326) ARHGAP10 (ENSBMSG00010003339) NR3C2 (ENSBMSG00010000098) DCLK2 (ENSBMSG00010000211) LRBA (ENSBMSG00010000269) MAB21L2 (ENSBMSG00010000320) ENSBMSG00010000334 ENSBMSG00010000355 ##22 SH3D19 (ENSBMSG00010000484) ENSBMSG00010000685 PRSS48 (ENSBMSG00010000700) FHIP1A (ENSBMSG00010000741) GATB (ENSBMSG00010000775) FBXW7 (ENSBMSG00010000836) ENSBMSG00010000895 TMEM154 (ENSBMSG00010000916) ARFIP1 (ENSBMSG00010000954) FHDC1 (ENSBMSG00010001001) TRIM2 (ENSBMSG00010001046) MND1 (ENSBMSG00010001093) TMEM131L (ENSBMSG00010001155) TLR2 (ENSBMSG00010001186) SFRP2 (ENSBMSG00010001204) Blue whale MODERN SPECIES 7 ENTPD1 (ENSBMSG00010017599) TCTN3 (ENSBMSG00010017781) ALDH18A1 (ENSBMSG00010017908) SORBS1 (ENSBMSG00010018518) ENSBMSG00010021832 ENSBMSG00010021844 HELLS (ENSBMSG00010021861) TBC1D12 (ENSBMSG00010021878) NOC3L (ENSBMSG00010021889) SLC35G1 (ENSBMSG00010021974) LGI1 (ENSBMSG00010021984) FRA10AC1 (ENSBMSG00010022001) PDE6C (ENSBMSG00010022010) RBP4 (ENSBMSG00010022013) ENSBMSG00010022016 ENSBMSG00010022018 ##22 CEP55 (ENSBMSG00010022021) MYOF (ENSBMSG00010022038) CYP26A1 (ENSBMSG00010022052) CYP26C1 (ENSBMSG00010022056) EXOC6 (ENSBMSG00010022075) HHEX (ENSBMSG00010022091) KIF11 (ENSBMSG00010022092) IDE (ENSBMSG00010022094) MARCHF5 (ENSBMSG00010022096) CPEB3 (ENSBMSG00010022099) BTAF1 (ENSBMSG00010022106) FGFBP3 (ENSBMSG00010022112) TNKS2 (ENSBMSG00010022115) PPP1R3C (ENSBMSG00010022118) HECTD2 (ENSBMSG00010022121) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183123.g.b.b.g.a ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000155384.a.h ENSGT00940000157094 ENSGT01060000248806.b ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00980000199387.d.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00940000156357 ENSGT00440000038909 ENSGT00940000159405 ENSGT00950000182995.e.b.c.a ENSGT00390000004263.a ENSGT00390000013853 ENSGT00940000158485 ENSGT00390000018094 ENSGT01030000234881 ENSGT00390000012436.d ENSGT00920000149145 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Vaquita MODERN SPECIES 16 MMAA (ENSPSNG00000014172) ZNF827 (ENSPSNG00000013982) LSM6 (ENSPSNG00000013905) SLC10A7 (ENSPSNG00000013581) POU4F2 (ENSPSNG00000013436) TTC29 (ENSPSNG00000013058) EDNRA (ENSPSNG00000012879) TMEM184C (ENSPSNG00000012807) PRMT9 (ENSPSNG00000012767) ARHGAP10 (ENSPSNG00000012644) NR3C2 (ENSPSNG00000012520) DCLK2 (ENSPSNG00000012086) MAB21L2 (ENSPSNG00000012010) LRBA (ENSPSNG00000011879) ENSPSNG00000011823 ENSPSNG00000011717 ##22 ENSPSNG00000011692 SH3D19 (ENSPSNG00000011168) FHIP1A (ENSPSNG00000010974) GATB (ENSPSNG00000010878) ENSPSNG00000010818 FBXW7 (ENSPSNG00000010559) TMEM154 (ENSPSNG00000010480) TIGD4 (ENSPSNG00000010453) ARFIP1 (ENSPSNG00000010310) FHDC1 (ENSPSNG00000010257) TRIM2 (ENSPSNG00000010022) MND1 (ENSPSNG00000009919) TMEM131L (ENSPSNG00000009760) TLR2 (ENSPSNG00000006991) RNF175 (ENSPSNG00000006939) Sperm whale MODERN SPECIES 18 LSM6 (ENSPCTG00005001901) SLC10A7 (ENSPCTG00005001951) POU4F2 (ENSPCTG00005002032) TTC29 (ENSPCTG00005002054) ENSPCTG00005002142 EDNRA (ENSPCTG00005002154) TMEM184C (ENSPCTG00005002203) PRMT9 (ENSPCTG00005002225) ARHGAP10 (ENSPCTG00005002260) NR3C2 (ENSPCTG00005002287) ENSPCTG00005002306 DCLK2 (ENSPCTG00005002361) LRBA (ENSPCTG00005002441) MAB21L2 (ENSPCTG00005002519) ENSPCTG00005002525 ENSPCTG00005002537 ##22 SH3D19 (ENSPCTG00005002589) PRSS48 (ENSPCTG00005002685) FHIP1A (ENSPCTG00005002716) GATB (ENSPCTG00005002750) FBXW7 (ENSPCTG00005002824) ENSPCTG00005002861 TMEM154 (ENSPCTG00005002881) ENSPCTG00005002902 ARFIP1 (ENSPCTG00005002925) TIGD4 (ENSPCTG00005002959) TRIM2 (ENSPCTG00005003026) TMEM131L (ENSPCTG00005003230) TLR2 (ENSPCTG00005003249) SFRP2 (ENSPCTG00005003256) ENSPCTG00005003270 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1247 WNT5B (ENSMMSG00000014636) ADIPOR2 (ENSMMSG00000014605) ENSMMSG00000014517 LRTM2 (ENSMMSG00000014502) ENSMMSG00000014466 DCP1B (ENSMMSG00000014448) ENSMMSG00000014423 ENSMMSG00000014345 IL17RA (ENSMMSG00000014317) ENSMMSG00000014301 HDHD5 (ENSMMSG00000014272) ADA2 (ENSMMSG00000014193) ATP6V1E1 (ENSMMSG00000013750) ENSMMSG00000013663 BID (ENSMMSG00000013621) ENSMMSG00000018983 ##22 MICAL3 (ENSMMSG00000018708) PEX26 (ENSMMSG00000018617) TUBA8 (ENSMMSG00000018574) CDC42EP1 (ENSMMSG00000018551) LGALS2 (ENSMMSG00000018515) GGA1 (ENSMMSG00000018276) SH3BP1 (ENSMMSG00000018209) PDXP (ENSMMSG00000018187) ENSMMSG00000018156 NOL12 (ENSMMSG00000018131) ENSMMSG00000018107 ENSMMSG00000018048 H1-0 (ENSMMSG00000018029) GCAT (ENSMMSG00000017960) GALR3 (ENSMMSG00000017921) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000155485.a.a.a.b.g.a ENSGT01090000260076.b.b ENSGT00390000013549.a.b.b.o.b ENSGT00940000167876 ENSGT00950000182900.D.d.b ENSGT00390000018199.b.b.b ENSGT00940000163449 ENSGT00950000183066.a.a.a.d.c ENSGT00950000183066.a.a.a.d.d ENSGT01030000235726 ENSGT00940000160633 ENSGT00550000074891 ENSGT00940000156040 ENSGT01030000234646.B.a.b ENSGT00390000013549.a.b.b.o.a.g.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00390000013549.a.b.b.o.a.g.b ENSGT00940000158684 ENSGT00550000074801.g.b.b ENSGT00940000159116 ENSGT00510000048637 ENSGT00530000063666.b ENSGT00950000183121.b.b.b.b ENSGT00390000005330 ENSGT00940000153430.a.a ENSGT00940000157080 ENSGT00940000164183 ENSGT00950000185346 ENSGT00940000157313 ENSGT00870000136506 ENSGT00940000167584 Cow MODERN SPECIES 177 IL1RAPL1 (ENSBTAG00000053869) ENSBTAG00000050834 ENSBTAG00000011750 ENSBTAG00000054034 ENSBTAG00000052068 PPP4R3C (ENSBTAG00000008511) ENSBTAG00000053213 ENSBTAG00000018583 ENSBTAG00000053624 ENSBTAG00000048848 ARX (ENSBTAG00000050504) POLA1 (ENSBTAG00000008170) PCYT1B (ENSBTAG00000016107) PDK3 (ENSBTAG00000017832) ENSBTAG00000006384 ENSBTAG00000006383 ##22 ZFX (ENSBTAG00000007730) EIF2S3 (ENSBTAG00000014337) KLHL15 (ENSBTAG00000020561) CXHXorf58 (ENSBTAG00000010939) APOO (ENSBTAG00000010937) SAT1 (ENSBTAG00000017363) ACOT9 (ENSBTAG00000011258) PRDX4 (ENSBTAG00000006165) PTCHD1 (ENSBTAG00000020987) ENSBTAG00000046635 ENSBTAG00000049480 PHEX (ENSBTAG00000000419) ENSBTAG00000052700 SMS (ENSBTAG00000018382) MBTPS2 (ENSBTAG00000008183) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 315 ENSBIXG00005022231 ENSBIXG00005022260 ENSBIXG00005022280 ENSBIXG00005003800 ENSBIXG00005022382 MAGEB18 (ENSBIXG00005022439) ENSBIXG00005022466 ENSBIXG00005022474 ENSBIXG00005022491 ARX (ENSBIXG00005022524) ENSBIXG00005003841 POLA1 (ENSBIXG00005022900) PCYT1B (ENSBIXG00005023067) PDK3 (ENSBIXG00005023130) ENSBIXG00005003945 ENSBIXG00005023185 ##22 ENSBIXG00005023233 ENSBIXG00005023490 ENSBIXG00005004027 KLHL15 (ENSBIXG00005023551) CXorf58 (ENSBIXG00005023583) APOO (ENSBIXG00005023656) ENSBIXG00005006902 SAT1 (ENSBIXG00005023734) ACOT9 (ENSBIXG00005023796) PRDX4 (ENSBIXG00005023849) PTCHD1 (ENSBIXG00005023943) ENSBIXG00005024020 ENSBIXG00005024079 ENSBIXG00005024121 PHEX (ENSBIXG00005024241) Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Domestic yak MODERN SPECIES 8 SYNM (ENSBGRG00000005981) TTC23 (ENSBGRG00000005798) LRRC28 (ENSBGRG00000005615) MEF2A (ENSBGRG00000005494) LYSMD4 (ENSBGRG00000005456) ADAMTS17 (ENSBGRG00000004987) CERS3 (ENSBGRG00000004770) LINS1 (ENSBGRG00000004716) ASB7 (ENSBGRG00000004639) ENSBGRG00000004632 ALDH1A3 (ENSBGRG00000004521) LRRK1 (ENSBGRG00000004461) CHSY1 (ENSBGRG00000004426) SELENOS (ENSBGRG00000004321) ENSBGRG00000004294 ENSBGRG00000004250 ##22 GABRG3 (ENSBGRG00000004154) GABRA5 (ENSBGRG00000004069) ENSBGRG00000004040 GABRB3 (ENSBGRG00000003940) ENSBGRG00000003908 ATP10A (ENSBGRG00000003850) UBE3A (ENSBGRG00000003821) SNRPN (ENSBGRG00000023848) SNURF (ENSBGRG00000023752) ENSBGRG00000023739 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 8 MMAA (ENSOARG00020024857) C4orf51 (ENSOARG00020024840) ZNF827 (ENSOARG00020024616) POU4F2 (ENSOARG00020024207) TTC29 (ENSOARG00020024092) EDNRA (ENSOARG00020024024) TMEM184C (ENSOARG00020023997) PRMT9 (ENSOARG00020023961) ARHGAP10 (ENSOARG00020023485) NR3C2 (ENSOARG00020023338) ENSOARG00020023315 IQCM (ENSOARG00020023274) DCLK2 (ENSOARG00020022528) MAB21L2 (ENSOARG00020022453) LRBA (ENSOARG00020021581) ENSOARG00020021320 ##22 PRSS48 (ENSOARG00020021133) FHIP1A (ENSOARG00020021013) GATB (ENSOARG00020020844) FBXW7 (ENSOARG00020020349) TMEM154 (ENSOARG00020020174) TIGD4 (ENSOARG00020020159) ARFIP1 (ENSOARG00020019865) FHDC1 (ENSOARG00020019747) ENSOARG00020019717 TRIM2 (ENSOARG00020019393) MND1 (ENSOARG00020019027) TMEM131L (ENSOARG00020017957) RNF175 (ENSOARG00020017703) SFRP2 (ENSOARG00020017587) ENSOARG00020017458 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 28 REELD1 (ENSCHYG00000001740) SLC10A7 (ENSCHYG00000001854) POU4F2 (ENSCHYG00000002171) TTC29 (ENSCHYG00000002186) EDNRA (ENSCHYG00000002219) ENSCHYG00000002240 ENSCHYG00000002250 TMEM184C (ENSCHYG00000002271) PRMT9 (ENSCHYG00000002291) ARHGAP10 (ENSCHYG00000002323) NR3C2 (ENSCHYG00000002397) DCLK2 (ENSCHYG00000002537) LRBA (ENSCHYG00000002706) MAB21L2 (ENSCHYG00000002890) ENSCHYG00000002898 ENSCHYG00000002911 ##22 ENSCHYG00000002979 ENSCHYG00000003142 PRSS48 (ENSCHYG00000003160) ENSCHYG00000003187 FHIP1A (ENSCHYG00000003200) GATB (ENSCHYG00000003235) FBXW7 (ENSCHYG00000003330) TMEM154 (ENSCHYG00000003416) TIGD4 (ENSCHYG00000003442) ENSCHYG00000003448 ARFIP1 (ENSCHYG00000003479) FHDC1 (ENSCHYG00000003520) TRIM2 (ENSCHYG00000003564) MND1 (ENSCHYG00000003669) ENSCHYG00000003717 Yarkand deer MODERN SPECIES 26 MAP3K20 (ENSCHYG00000019464) ENSCHYG00000019193 SP3 (ENSCHYG00000019030) ENSCHYG00000018536 SP9 (ENSCHYG00000018463) CIR1 (ENSCHYG00000018323) ENSCHYG00000018263 GPR155 (ENSCHYG00000018083) ENSCHYG00000017877 CHRNA1 (ENSCHYG00000017619) ENSCHYG00000017575 CHN1 (ENSCHYG00000017015) ATF2 (ENSCHYG00000016575) ATP5MC3 (ENSCHYG00000016464) ENSCHYG00000016417 ENSCHYG00000016391 ##22 LNPK (ENSCHYG00000016125) HOXD13 (ENSCHYG00000015985) HOXD12 (ENSCHYG00000015954) ENSCHYG00000015846 HOXD10 (ENSCHYG00000015831) HOXD9 (ENSCHYG00000015808) HOXD8 (ENSCHYG00000015741) HOXD4 (ENSCHYG00000015683) HOXD3 (ENSCHYG00000015650) HOXD1 (ENSCHYG00000015562) MTX2 (ENSCHYG00000015392) ENSCHYG00000015305 ENSCHYG00000015038 NFE2L2 (ENSCHYG00000024719) AGPS (ENSCHYG00000024578) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 6 LSM6 (ENSOCUG00000017495) REELD1 (ENSOCUG00000034608) SLC10A7 (ENSOCUG00000012552) POU4F2 (ENSOCUG00000012636) TTC29 (ENSOCUG00000021290) ENSOCUG00000031243 EDNRA (ENSOCUG00000001250) TMEM184C (ENSOCUG00000001732) PRMT9 (ENSOCUG00000003110) ARHGAP10 (ENSOCUG00000003124) NR3C2 (ENSOCUG00000003137) ENSOCUG00000025176 IQCM (ENSOCUG00000027563) DCLK2 (ENSOCUG00000008443) LRBA (ENSOCUG00000008453) ENSOCUG00000007011 ##22 ENSOCUG00000022119 PRSS48 (ENSOCUG00000021850) SH3D19 (ENSOCUG00000007014) FHIP1A (ENSOCUG00000002636) GATB (ENSOCUG00000016875) FBXW7 (ENSOCUG00000008440) TMEM154 (ENSOCUG00000029467) TIGD4 (ENSOCUG00000012496) ARFIP1 (ENSOCUG00000014132) FHDC1 (ENSOCUG00000003876) ENSOCUG00000037579 RBM46 (ENSOCUG00000017859) LRAT (ENSOCUG00000017861) ENSOCUG00000011239 FGB (ENSOCUG00000011235) Rabbit MODERN SPECIES 4 NGF (ENSOCUG00000000659) VANGL1 (ENSOCUG00000016240) CASQ2 (ENSOCUG00000010594) SLC22A15 (ENSOCUG00000015370) MAB21L3 (ENSOCUG00000015382) ATP1A1 (ENSOCUG00000001324) IGSF3 (ENSOCUG00000005284) CD2 (ENSOCUG00000008474) PTGFRN (ENSOCUG00000000608) CD101 (ENSOCUG00000000612) TTF2 (ENSOCUG00000000613) TRIM45 (ENSOCUG00000000237) VTCN1 (ENSOCUG00000026343) MAN1A2 (ENSOCUG00000012648) ENSOCUG00000026654 ENSOCUG00000027717 ##22 GDAP2 (ENSOCUG00000007568) WDR3 (ENSOCUG00000007572) SPAG17 (ENSOCUG00000007586) TBX15 (ENSOCUG00000012320) WARS2 (ENSOCUG00000012330) HAO2 (ENSOCUG00000017949) ENSOCUG00000004132 ZNF697 (ENSOCUG00000014070) PHGDH (ENSOCUG00000005759) HMGCS2 (ENSOCUG00000005767) ENSOCUG00000005773 ADAM30 (ENSOCUG00000013791) PDE4DIP (ENSOCUG00000011228) SEC22B (ENSOCUG00000026877) NOTCH2 (ENSOCUG00000016565) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 665 Ptpn2 (ENSMAUG00000012805) Psmg2 (ENSMAUG00000008209) Cep76 (ENSMAUG00000011313) Spire1 (ENSMAUG00000012928) Prelid3a (ENSMAUG00000017262) ENSMAUG00000017978 Tubb6 (ENSMAUG00000000304) Cidea (ENSMAUG00000012752) Impa2 (ENSMAUG00000016787) ENSMAUG00000017689 Chmp1b (ENSMAUG00000016862) ENSMAUG00000011645 Mc4r (ENSMAUG00000016776) ENSMAUG00000017277 Pmaip1 (ENSMAUG00000011163) ENSMAUG00000017643 ##22 Ccbe1 (ENSMAUG00000019440) Lman1 (ENSMAUG00000012020) Cplx4 (ENSMAUG00000014766) Rax (ENSMAUG00000016678) Sec11c (ENSMAUG00000019336) Oacyl (ENSMAUG00000007635) Zfp532 (ENSMAUG00000014049) Malt1 (ENSMAUG00000003952) Alpk2 (ENSMAUG00000011821) Nedd4l (ENSMAUG00000013017) Atp8b1 (ENSMAUG00000008405) Nars (ENSMAUG00000016087) Fech (ENSMAUG00000001873) Onecut2 (ENSMAUG00000009580) St8sia3 (ENSMAUG00000000556) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 14 ENSHGLG00000021239 PRIM2 (ENSHGLG00000017861) ENSHGLG00000045680 ENSHGLG00000033625 RAB23 (ENSHGLG00000013030) ENSHGLG00000018722 ZNF451 (ENSHGLG00000018721) ENSHGLG00000044728 ENSHGLG00000016807 ENSHGLG00000015021 ENSHGLG00000042791 ENSHGLG00000049299 ENSHGLG00000017371 ENSHGLG00000039205 ENSHGLG00000043295 ENSHGLG00000021000 ##22 ENSHGLG00000041746 ENSHGLG00000016044 ENSHGLG00000016555 ENSHGLG00000045218 ENSHGLG00000016253 ENSHGLG00000047769 ENSHGLG00000009668 ENSHGLG00000009488 ENSHGLG00000032934 ENSHGLG00000009673 ENSHGLG00000039274 ENSHGLG00000005827 FANCC (ENSHGLG00000013830) ENSHGLG00000044815 ENSHGLG00000012042 Naked mole-rat female MODERN SPECIES CCR6 (ENSHGLG00000050244) ENSHGLG00000003848 ENSHGLG00000002675 RPS6KA2 (ENSHGLG00000003392) MPC1 (ENSHGLG00000034371) SFT2D1 (ENSHGLG00000002919) ENSHGLG00000049190 ENSHGLG00000032835 ENSHGLG00000040761 ENSHGLG00000041990 TBXT (ENSHGLG00000002638) PDE10A (ENSHGLG00000003609) C6orf118 (ENSHGLG00000040311) ENSHGLG00000002800 ENSHGLG00000033943 ENSHGLG00000020018 ##22 QKI (ENSHGLG00000003074) ENSHGLG00000040590 PACRG (ENSHGLG00000048524) ENSHGLG00000041594 ENSHGLG00000050950 PRKN (ENSHGLG00000006873) ENSHGLG00000034284 AGPAT4 (ENSHGLG00000008163) MAP3K4 (ENSHGLG00000011068) ENSHGLG00000017452 ENSHGLG00000017477 ENSHGLG00000050994 ENSHGLG00000034005 ENSHGLG00000017482 ENSHGLG00000014427 Primates ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413.c.b ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 156 ZNF827 (ENSOGAG00000005635) ENSOGAG00000026665 SLC10A7 (ENSOGAG00000008690) POU4F2 (ENSOGAG00000028626) TTC29 (ENSOGAG00000010351) EDNRA (ENSOGAG00000015817) TMEM184C (ENSOGAG00000015819) PRMT9 (ENSOGAG00000015825) ENSOGAG00000014000 NR3C2 (ENSOGAG00000014008) ENSOGAG00000033581 DCLK2 (ENSOGAG00000003223) ENSOGAG00000003228 MAB21L2 (ENSOGAG00000029639) ENSOGAG00000031521 ENSOGAG00000007634 ##22 SH3D19 (ENSOGAG00000012447) ENSOGAG00000024160 FHIP1A (ENSOGAG00000032830) GATB (ENSOGAG00000014181) FBXW7 (ENSOGAG00000011827) TMEM154 (ENSOGAG00000013516) ENSOGAG00000026906 TIGD4 (ENSOGAG00000005277) ARFIP1 (ENSOGAG00000005278) FHDC1 (ENSOGAG00000032525) TRIM2 (ENSOGAG00000013235) ENSOGAG00000011987 TMEM131L (ENSOGAG00000000832) ENSOGAG00000032650 TLR2 (ENSOGAG00000027703) Bushbaby MODERN SPECIES 224 ENOX2 (ENSOGAG00000003494) ARHGAP36 (ENSOGAG00000000291) IGSF1 (ENSOGAG00000013044) ENSOGAG00000025500 ENSOGAG00000026712 OR13H1 (ENSOGAG00000026372) ENSOGAG00000027130 STK26 (ENSOGAG00000002621) FRMD7 (ENSOGAG00000002622) RAP2C (ENSOGAG00000003141) MBNL3 (ENSOGAG00000003143) HS6ST2 (ENSOGAG00000006658) ENSOGAG00000029621 GPC4 (ENSOGAG00000007022) ENSOGAG00000007481 ENSOGAG00000027754 ##22 ENSOGAG00000033085 ENSOGAG00000028310 CCDC160 (ENSOGAG00000032387) PHF6 (ENSOGAG00000003877) HPRT1 (ENSOGAG00000003881) PLAC1 (ENSOGAG00000013655) PABIR2 (ENSOGAG00000005733) MOSPD1 (ENSOGAG00000005739) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978.n ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413.c.a ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978.n ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413.c.b ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000162999 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 330 AKAP1 (ENSPSMG00000020414) SCPEP1 (ENSPSMG00000020459) COIL (ENSPSMG00000020468) TRIM25 (ENSPSMG00000020499) DGKE (ENSPSMG00000020514) ENSPSMG00000020520 C17orf67 (ENSPSMG00000020529) ENSPSMG00000020534 NOG (ENSPSMG00000020542) ANKFN1 (ENSPSMG00000020557) IQCM (ENSPSMG00000020578) DCLK2 (ENSPSMG00000020757) LRBA (ENSPSMG00000021044) MAB21L2 (ENSPSMG00000021119) ENSPSMG00000021150 ##22 SH3D19 (ENSPSMG00000021327) ENSPSMG00000021366 FHIP1A (ENSPSMG00000021372) GATB (ENSPSMG00000021442) FBXW7 (ENSPSMG00000021518) TMEM154 (ENSPSMG00000021541) TIGD4 (ENSPSMG00000021545) ARFIP1 (ENSPSMG00000021599) FHDC1 (ENSPSMG00000021613) TRIM2 (ENSPSMG00000021653) MND1 (ENSPSMG00000021692) TMEM131L (ENSPSMG00000021736) TLR2 (ENSPSMG00000021752) RNF175 (ENSPSMG00000021767) SFRP2 (ENSPSMG00000021778) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 951 ABHD12B (ENSPCOG00000024199) NIN (ENSPCOG00000008345) SAV1 (ENSPCOG00000017075) ATL1 (ENSPCOG00000015429) MAP4K5 (ENSPCOG00000016345) CDKL1 (ENSPCOG00000023543) DMAC2L (ENSPCOG00000014032) L2HGDH (ENSPCOG00000028342) SOS2 (ENSPCOG00000016272) VCPKMT (ENSPCOG00000020609) ARF6 (ENSPCOG00000000684) NEMF (ENSPCOG00000013328) KLHDC2 (ENSPCOG00000027810) ENSPCOG00000013951 POLE2 (ENSPCOG00000027285) ENSPCOG00000008650 ##22 DNAAF2 (ENSPCOG00000022293) ENSPCOG00000012793 LRR1 (ENSPCOG00000026498) ENSPCOG00000024671 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00950000184824 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154978.h.a ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201.g.b ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00950000184824 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413.a.a.a ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Cebidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154978.h.a ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201.g.b ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00950000184824 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413.a.a.a ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 812 ZNF16 (ENSCCAG00000020536) ENSCCAG00000020238 ZNF250 (ENSCCAG00000029410) COMMD5 (ENSCCAG00000013590) ENSCCAG00000025292 ZNF7 (ENSCCAG00000024294) ZNF517 (ENSCCAG00000019662) ENSCCAG00000032759 ENSCCAG00000023353 ENSCCAG00000018165 RPS3A (ENSCCAG00000023774) ##22 PRSS48 (ENSCCAG00000025335) SH3D19 (ENSCCAG00000021260) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Drill MODERN SPECIES 1565 ENSMLEG00000016739 CAMK1D (ENSMLEG00000003491) CCDC3 (ENSMLEG00000030418) ENSMLEG00000035233 OPTN (ENSMLEG00000026081) ENSMLEG00000037306 MCM10 (ENSMLEG00000037584) UCMA (ENSMLEG00000034904) PHYH (ENSMLEG00000032777) ENSMLEG00000041585 ENSMLEG00000005976 ##22 ENSMLEG00000016771 PRPF18 (ENSMLEG00000031715) ENSMLEG00000038593 ENSMLEG00000042543 ENSMLEG00000004764 FAM107B (ENSMLEG00000041121) CDNF (ENSMLEG00000032491) HSPA14 (ENSMLEG00000039837) ENSMLEG00000044215 DCLRE1C (ENSMLEG00000044355) ENSMLEG00000008746 ACBD7 (ENSMLEG00000027471) ENSMLEG00000039491 NMT2 (ENSMLEG00000041367) FAM171A1 (ENSMLEG00000034787) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 Bonobo MODERN SPECIES 17 POU4F2 (ENSPPAG00000035263) TTC29 (ENSPPAG00000039325) ENSPPAG00000027341 EDNRA (ENSPPAG00000037609) TMEM184C (ENSPPAG00000032567) PRMT9 (ENSPPAG00000043067) ARHGAP10 (ENSPPAG00000003388) NR3C2 (ENSPPAG00000031751) IQCM (ENSPPAG00000041665) DCLK2 (ENSPPAG00000041046) LRBA (ENSPPAG00000042647) ENSPPAG00000044104 MAB21L2 (ENSPPAG00000024444) ENSPPAG00000044106 ENSPPAG00000044108 ENSPPAG00000044109 ##22 ENSPPAG00000044129 PRSS48 (ENSPPAG00000037675) FHIP1A (ENSPPAG00000032398) GATB (ENSPPAG00000041690) FBXW7 (ENSPPAG00000035178) TMEM154 (ENSPPAG00000036040) TIGD4 (ENSPPAG00000012681) ARFIP1 (ENSPPAG00000031157) ENSPPAG00000043551 FHDC1 (ENSPPAG00000028121) TRIM2 (ENSPPAG00000038637) ENSPPAG00000040974 MND1 (ENSPPAG00000032409) TMEM131L (ENSPPAG00000035999) ENSPPAG00000043739 Orangutan MODERN SPECIES 17 REELD1 (ENSPPYG00000038439) SLC10A7 (ENSPPYG00000015106) POU4F2 (ENSPPYG00000015107) TTC29 (ENSPPYG00000015108) EDNRA (ENSPPYG00000015109) TMEM184C (ENSPPYG00000034968) PRMT9 (ENSPPYG00000015111) ARHGAP10 (ENSPPYG00000015112) NR3C2 (ENSPPYG00000015113) IQCM (ENSPPYG00000015114) DCLK2 (ENSPPYG00000015115) LRBA (ENSPPYG00000015116) MAB21L2 (ENSPPYG00000015117) ENSPPYG00000031388 ENSPPYG00000035707 RPS3A (ENSPPYG00000025869) ##22 SH3D19 (ENSPPYG00000015118) PRSS48 (ENSPPYG00000015119) FHIP1A (ENSPPYG00000015120) GATB (ENSPPYG00000015121) FBXW7 (ENSPPYG00000015122) TMEM154 (ENSPPYG00000015124) TIGD4 (ENSPPYG00000015125) ARFIP1 (ENSPPYG00000015126) ENSPPYG00000039750 FHDC1 (ENSPPYG00000015127) TRIM2 (ENSPPYG00000015128) ENSPPYG00000039576 MND1 (ENSPPYG00000015129) TMEM131L (ENSPPYG00000015130) ENSPPYG00000036033 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Glires ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Rodentia ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 22 ENSHGLG00000000816 ENSHGLG00000039844 ENSHGLG00000000948 FNIP2 (ENSHGLG00000001014) C4orf45 (ENSHGLG00000001205) ENSHGLG00000001470 ENSHGLG00000002047 ENSHGLG00000007247 ENSHGLG00000042019 ENSHGLG00000026449 ENSHGLG00000050368 ENSHGLG00000003164 LRBA (ENSHGLG00000000609) ENSHGLG00000050059 MAB21L2 (ENSHGLG00000036891) RPS3A (ENSHGLG00000000392) ##22 SH3D19 (ENSHGLG00000003213) ENSHGLG00000050936 PRSS48 (ENSHGLG00000033152) FHIP1A (ENSHGLG00000000533) GATB (ENSHGLG00000001316) ENSHGLG00000032169 ENSHGLG00000046788 FBXW7 (ENSHGLG00000003387) TMEM154 (ENSHGLG00000049888) TIGD4 (ENSHGLG00000040305) ARFIP1 (ENSHGLG00000033720) FHDC1 (ENSHGLG00000001200) ENSHGLG00000001732 TRIM2 (ENSHGLG00000003722) ENSHGLG00000000557 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 1 PRKDC (ENSHGLG00000013287) MCM4 (ENSHGLG00000018964) UBE2V2 (ENSHGLG00000038834) ENSHGLG00000034089 ENSHGLG00000034668 CLXN (ENSHGLG00000010454) ENSHGLG00000009439 PPDPFL (ENSHGLG00000032230) ENSHGLG00000050331 SNTG1 (ENSHGLG00000005037) ENSHGLG00000044626 ENSHGLG00000048304 ENSHGLG00000045690 PCMTD1 (ENSHGLG00000045944) ENSHGLG00000014452 ENSHGLG00000016233 ##22 ALKAL1 (ENSHGLG00000038780) RB1CC1 (ENSHGLG00000018518) ENSHGLG00000013146 NPBWR1 (ENSHGLG00000021373) ENSHGLG00000015610 ENSHGLG00000003564 ENSHGLG00000046007 Oprk1 (ENSHGLG00000038296) ATP6V1H (ENSHGLG00000018810) ENSHGLG00000050091 ENSHGLG00000045461 ENSHGLG00000043019 TCEA1 (ENSHGLG00000036590) ENSHGLG00000015507 MRPL15 (ENSHGLG00000038800) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000162501 ENSGT00510000047351.b ENSGT00940000156801 ENSGT00940000158403 ENSGT00940000157587 ENSGT00390000016264 ENSGT00390000017043 ENSGT00940000156171 ENSGT00940000157878 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Guinea pig MODERN SPECIES 7 FREM3 (ENSCPOG00000038428) LRAT (ENSCPOG00000034177) GAB1 (ENSCPOG00000031770) USP38 (ENSCPOG00000008971) INPP4B (ENSCPOG00000026234) IL15 (ENSCPOG00000008232) ZNF330 (ENSCPOG00000011875) RNF150 (ENSCPOG00000004096) TBC1D9 (ENSCPOG00000007373) ARHGAP10 (ENSCPOG00000007759) NR3C2 (ENSCPOG00000007770) IQCM (ENSCPOG00000022670) DCLK2 (ENSCPOG00000008193) LRBA (ENSCPOG00000008202) MAB21L2 (ENSCPOG00000034419) RPS3A (ENSCPOG00000015569) ##22 SH3D19 (ENSCPOG00000008883) PRSS48 (ENSCPOG00000000281) FHIP1A (ENSCPOG00000005019) GATB (ENSCPOG00000005023) FBXW7 (ENSCPOG00000003804) TMEM154 (ENSCPOG00000009024) TIGD4 (ENSCPOG00000038321) ARFIP1 (ENSCPOG00000010487) FHDC1 (ENSCPOG00000038337) TRIM2 (ENSCPOG00000006108) MND1 (ENSCPOG00000013275) TMEM131L (ENSCPOG00000000629) TLR2 (ENSCPOG00000025374) SFRP2 (ENSCPOG00000012235) DCHS2 (ENSCPOG00000005282) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 89 ENSGT00940000156801 ENSGT00940000158403 ENSGT00940000157587 ENSGT00390000016264 ENSGT00390000017043 ENSGT00940000156171 ENSGT00940000157878 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 178 USP38 (ENSCLAG00000014109) INPP4B (ENSCLAG00000007216) IL15 (ENSCLAG00000004056) ZNF330 (ENSCLAG00000004258) RNF150 (ENSCLAG00000004503) TBC1D9 (ENSCLAG00000005220) ENSCLAG00000005907 LRAT (ENSCLAG00000006584) ENSCLAG00000006732 ARHGAP10 (ENSCLAG00000007081) NR3C2 (ENSCLAG00000007723) IQCM (ENSCLAG00000008040) DCLK2 (ENSCLAG00000009217) LRBA (ENSCLAG00000009578) MAB21L2 (ENSCLAG00000017837) RPS3A (ENSCLAG00000008053) ##22 SH3D19 (ENSCLAG00000008133) PRSS48 (ENSCLAG00000008636) ENSCLAG00000015260 FHIP1A (ENSCLAG00000017338) GATB (ENSCLAG00000005772) FBXW7 (ENSCLAG00000006777) TMEM154 (ENSCLAG00000004220) TIGD4 (ENSCLAG00000004949) ARFIP1 (ENSCLAG00000005358) ENSCLAG00000006256 TRIM2 (ENSCLAG00000006548) MND1 (ENSCLAG00000013599) TMEM131L (ENSCLAG00000011814) TLR2 (ENSCLAG00000017621) RNF175 (ENSCLAG00000004608) Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 113 TMEM97 (ENSODEG00000016145) ENSODEG00000015253 TNFAIP1 (ENSODEG00000011070) ENSODEG00000011713 TMEM199 (ENSODEG00000011129) SEBOX (ENSODEG00000010900) VTN (ENSODEG00000011194) SARM1 (ENSODEG00000010810) SLC46A1 (ENSODEG00000010157) ENSODEG00000012254 SLC13A2 (ENSODEG00000011361) FOXN1 (ENSODEG00000010852) UNC119 (ENSODEG00000010971) PIGS (ENSODEG00000012021) ENSODEG00000010148 ENSODEG00000020008 ##22 SPAG5 (ENSODEG00000010862) RSKR (ENSODEG00000011417) BLTP2 (ENSODEG00000014063) SDF2 (ENSODEG00000011998) SUPT6H (ENSODEG00000011930) PROCA1 (ENSODEG00000011263) RAB34 (ENSODEG00000012270) ENSODEG00000014995 TLCD1 (ENSODEG00000014753) NEK8 (ENSODEG00000010036) TRAF4 (ENSODEG00000011454) FAM222B (ENSODEG00000010451) ENSODEG00000019697 ERAL1 (ENSODEG00000011337) FLOT2 (ENSODEG00000011801) Degu MODERN SPECIES 245 ENSODEG00000018660 ENSODEG00000000841 ACP1 (ENSODEG00000000890) ALKAL2 (ENSODEG00000000931) TMEM18 (ENSODEG00000000266) TPO (ENSODEG00000000292) SNTG2 (ENSODEG00000000324) MBOAT2 (ENSODEG00000000353) KIDINS220 (ENSODEG00000000415) ID2 (ENSODEG00000000480) RNF144A (ENSODEG00000000489) RSAD2 (ENSODEG00000000506) CMPK2 (ENSODEG00000000539) SOX11 (ENSODEG00000000568) ENSODEG00000000593 ENSODEG00000018607 ##22 Degu MODERN SPECIES 275 NXPH1 (ENSODEG00000001425) ENSODEG00000018727 ##22 ENSODEG00000001385 ENSODEG00000001364 ENSODEG00000001744 UMAD1 (ENSODEG00000001683) RPA3 (ENSODEG00000001607) ENSODEG00000001526 ENSODEG00000001473 ENSODEG00000001444 COL28A1 (ENSODEG00000000965) C1GALT1 (ENSODEG00000000888) ENSODEG00000000873 ENSODEG00000000860 ENSODEG00000000846 TAC1 (ENSODEG00000000835) Degu MODERN SPECIES 94 TRMT9B (ENSODEG00000004422) ENSODEG00000004736 LONRF1 (ENSODEG00000004254) PRAG1 (ENSODEG00000004326) CLDN23 (ENSODEG00000019489) MFHAS1 (ENSODEG00000004525) ERI1 (ENSODEG00000004586) PPP1R3B (ENSODEG00000019115) ENSODEG00000005017 TNKS (ENSODEG00000004893) DUSP4 (ENSODEG00000005526) SARAF (ENSODEG00000005565) LEPROTL1 (ENSODEG00000005881) MBOAT4 (ENSODEG00000006303) ENSODEG00000006428 ENSODEG00000019309 ##22 RBPMS (ENSODEG00000006700) GTF2E2 (ENSODEG00000006742) ENSODEG00000008593 GSR (ENSODEG00000008858) UBXN8 (ENSODEG00000004381) ENSODEG00000004425 ENSODEG00000004553 PURG (ENSODEG00000019280) WRN (ENSODEG00000004076) ENSODEG00000004757 ENSODEG00000005162 ENSODEG00000005245 ENSODEG00000018985 BOC (ENSODEG00000004266) ENSODEG00000004506 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 18 LSM6 (ENSSVLG00005009971) REELD1 (ENSSVLG00005010007) SLC10A7 (ENSSVLG00005010105) POU4F2 (ENSSVLG00005010171) TTC29 (ENSSVLG00005010213) EDNRA (ENSSVLG00005010545) TMEM184C (ENSSVLG00005010646) PRMT9 (ENSSVLG00005010674) ARHGAP10 (ENSSVLG00005010815) NR3C2 (ENSSVLG00005010872) ENSSVLG00005011096 DCLK2 (ENSSVLG00005011376) LRBA (ENSSVLG00005012409) ENSSVLG00005013232 ENSSVLG00005013273 RPS3A (ENSSVLG00005013409) ##22 SH3D19 (ENSSVLG00005013694) ENSSVLG00005013874 ENSSVLG00005013994 FHIP1A (ENSSVLG00005014177) GATB (ENSSVLG00005014243) FBXW7 (ENSSVLG00005014357) ENSSVLG00005014649 TMEM154 (ENSSVLG00005014705) TIGD4 (ENSSVLG00005014754) ARFIP1 (ENSSVLG00005014796) FHDC1 (ENSSVLG00005014939) TRIM2 (ENSSVLG00005014985) ENSSVLG00005015249 ENSSVLG00005015369 TMEM131L (ENSSVLG00005015633) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Alpin marmot MODERN SPECIES 14 MMAA (ENSMMMG00000001552) ZNF827 (ENSMMMG00000001587) LSM6 (ENSMMMG00000001638) REELD1 (ENSMMMG00000001660) SLC10A7 (ENSMMMG00000001688) ENSMMMG00000001799 ENSMMMG00000001810 EDNRA (ENSMMMG00000001819) TMEM184C (ENSMMMG00000001829) PRMT9 (ENSMMMG00000001857) ARHGAP10 (ENSMMMG00000001915) NR3C2 (ENSMMMG00000002054) DCLK2 (ENSMMMG00000002234) LRBA (ENSMMMG00000002285) MAB21L2 (ENSMMMG00000002553) RPS3A (ENSMMMG00000002563) ##22 ENSMMMG00000002583 PRSS48 (ENSMMMG00000002611) ENSMMMG00000002661 FHIP1A (ENSMMMG00000002679) GATB (ENSMMMG00000002702) FBXW7 (ENSMMMG00000002767) ENSMMMG00000002965 TIGD4 (ENSMMMG00000002976) ARFIP1 (ENSMMMG00000002979) FHDC1 (ENSMMMG00000003033) TRIM2 (ENSMMMG00000003057) MND1 (ENSMMMG00000003217) TMEM131L (ENSMMMG00000003263) TLR2 (ENSMMMG00000003813) RNF175 (ENSMMMG00000003821) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 32 DCLK2 (ENSUPAG00010018923) MAB21L2 (ENSUPAG00010018918) LRBA (ENSUPAG00010018745) RPS3A (ENSUPAG00010018732) ##22 PRSS48 (ENSUPAG00010018630) ENSUPAG00010018617 SH3D19 (ENSUPAG00010018552) ENSUPAG00010018537 FHIP1A (ENSUPAG00010018526) GATB (ENSUPAG00010018482) FBXW7 (ENSUPAG00010018370) TMEM154 (ENSUPAG00010018356) TIGD4 (ENSUPAG00010018343) ARFIP1 (ENSUPAG00010018283) ENSUPAG00010018268 ENSUPAG00010018263 TRIM2 (ENSUPAG00010018052) MND1 (ENSUPAG00010018038) TMEM131L (ENSUPAG00010017965) Squirrel DUPLICATION Squirrel MODERN SPECIES 289 DCLK2 (ENSSTOG00000009551) LRBA (ENSSTOG00000009572) MAB21L2 (ENSSTOG00000012240) RPS3A (ENSSTOG00000024203) ##22 SH3D19 (ENSSTOG00000009638) PRSS48 (ENSSTOG00000012642) FHIP1A (ENSSTOG00000026038) GATB (ENSSTOG00000005689) FBXW7 (ENSSTOG00000021503) TMEM154 (ENSSTOG00000030085) TIGD4 (ENSSTOG00000020903) ARFIP1 (ENSSTOG00000025144) ENSSTOG00000025555 FHDC1 (ENSSTOG00000026663) Squirrel MODERN SPECIES 73 GALNT15 (ENSSTOG00000021175) ENSSTOG00000033525 OXNAD1 (ENSSTOG00000000071) RFTN1 (ENSSTOG00000000072) ENSSTOG00000022122 PLCL2 (ENSSTOG00000000749) TBC1D5 (ENSSTOG00000028034) SATB1 (ENSSTOG00000010856) KCNH8 (ENSSTOG00000023006) RAB5A (ENSSTOG00000026229) PP2D1 (ENSSTOG00000012388) KAT2B (ENSSTOG00000002904) SGO1 (ENSSTOG00000003766) ENSSTOG00000031366 ZNF385D (ENSSTOG00000005742) ENSSTOG00000028898 ##22 ENSSTOG00000034552 UBE2E1 (ENSSTOG00000025799) NKIRAS1 (ENSSTOG00000010538) ENSSTOG00000011153 ENSSTOG00000022967 ENSSTOG00000002444 THRB (ENSSTOG00000005197) RARB (ENSSTOG00000007994) TOP2B (ENSSTOG00000008012) NGLY1 (ENSSTOG00000000939) OXSM (ENSSTOG00000004977) LRRC3B (ENSSTOG00000010920) NEK10 (ENSSTOG00000012142) SLC4A7 (ENSSTOG00000012151) ENSSTOG00000023565 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000162999 Kangaroo rat MODERN SPECIES 322 ENSDORG00000001441 Mdm1 (ENSDORG00000001536) Rap1b (ENSDORG00000001086) Nup107 (ENSDORG00000005178) Slc35e3 (ENSDORG00000029538) Mdm2 (ENSDORG00000007222) Cpm (ENSDORG00000008071) Cpsf6 (ENSDORG00000002950) ENSDORG00000004525 ENSDORG00000029604 Yeats4 (ENSDORG00000004942) Frs2 (ENSDORG00000026974) Cct2 (ENSDORG00000010325) Lrrc10 (ENSDORG00000010326) Best3 (ENSDORG00000010327) ENSDORG00000029506 ##22 ENSDORG00000024631 ENSDORG00000027759 Myrfl (ENSDORG00000000849) ENSDORG00000026732 Cnot2 (ENSDORG00000011201) Kcnmb4 (ENSDORG00000027718) Ptprb (ENSDORG00000011204) Ptprr (ENSDORG00000000928) Tspan8 (ENSDORG00000003043) Lgr5 (ENSDORG00000006266) ENSDORG00000028010 ENSDORG00000028837 Thap2 (ENSDORG00000006270) Tmem19 (ENSDORG00000001530) ENSDORG00000004732 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000162999 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 57 ENSJJAG00000013845 ENSJJAG00000019609 Mmaa (ENSJJAG00000012406) ENSJJAG00000019141 Otud4 (ENSJJAG00000011777) Hhip (ENSJJAG00000012058) Prmt9 (ENSJJAG00000022258) Arhgap10 (ENSJJAG00000024127) Nr3c2 (ENSJJAG00000014359) Iqcm (ENSJJAG00000001722) Dclk2 (ENSJJAG00000021674) ENSJJAG00000023104 Mab21l2 (ENSJJAG00000009027) ENSJJAG00000023999 ENSJJAG00000009645 Rps3a1 (ENSJJAG00000021259) ##22 Sh3d19 (ENSJJAG00000022007) Fhip1a (ENSJJAG00000012235) Gatb (ENSJJAG00000016979) Fbxw7 (ENSJJAG00000014251) Tmem154 (ENSJJAG00000022208) Tigd4 (ENSJJAG00000006232) Arfip1 (ENSJJAG00000023351) Fhdc1 (ENSJJAG00000018260) Trim2 (ENSJJAG00000023567) Mnd1 (ENSJJAG00000012078) Tmem131l (ENSJJAG00000023952) Sfrp2 (ENSJJAG00000016453) Dchs2 (ENSJJAG00000022152) ENSJJAG00000023587 Plrg1 (ENSJJAG00000015731) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000162999 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1683 Dclk2 (ENSNGAG00000018789) ENSNGAG00000016914 Mab21l2 (ENSNGAG00000005574) ENSNGAG00000022194 Rps3a1 (ENSNGAG00000007978) ##22 Sh3d19 (ENSNGAG00000022677) Fhip1a (ENSNGAG00000020022) Gatb (ENSNGAG00000002152) ENSNGAG00000008115 Fbxw7 (ENSNGAG00000014171) Tmem154 (ENSNGAG00000021478) Tigd4 (ENSNGAG00000007390) Arfip1 (ENSNGAG00000023842) Fhdc1 (ENSNGAG00000006851) Trim2 (ENSNGAG00000012398) Mnd1 (ENSNGAG00000013459) Tmem131l (ENSNGAG00000017189) Tlr2 (ENSNGAG00000010468) Sfrp2 (ENSNGAG00000018279) Dchs2 (ENSNGAG00000019461) Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.h.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.h.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154225.a ENSGT00440000034367 ENSGT00940000158350 ENSGT00940000162271 ENSGT00940000160963 ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b ENSGT00940000161974 ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a ENSGT00940000155795 ENSGT01100000263475.d.a.h ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b.i ##22 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.h.a ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000162999 Prairie vole MODERN SPECIES Dclk2 (ENSMOCG00000013147) ENSMOCG00000013544 Mab21l2 (ENSMOCG00000008360) ENSMOCG00000006642 ENSMOCG00000020260 ##22 Sh3d19 (ENSMOCG00000012871) Prss48 (ENSMOCG00000020724) Fhip1a (ENSMOCG00000018759) Gatb (ENSMOCG00000017566) Fbxw7 (ENSMOCG00000002987) Tmem154 (ENSMOCG00000014987) Tigd4 (ENSMOCG00000007422) Arfip1 (ENSMOCG00000016057) Fhdc1 (ENSMOCG00000022338) Trim2 (ENSMOCG00000015197) ENSMOCG00000015791 Mnd1 (ENSMOCG00000013449) Tmem131l (ENSMOCG00000013745) Tlr2 (ENSMOCG00000004015) Sfrp2 (ENSMOCG00000006475) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159412 ENSGT00940000154225.a ENSGT00440000034367 ENSGT00940000158350 ENSGT00940000162271 ENSGT00940000160963 ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b ENSGT00940000161974 ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a ENSGT00940000155795 ENSGT01100000263475.d.a.h ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.h.a ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000162999 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 352 Arhgef11 (ENSCGRG00001018844) ENSCGRG00001022805 Etv3 (ENSCGRG00001023444) Fcrl5 (ENSCGRG00001024696) Fcrl1 (ENSCGRG00001002734) Cd5l (ENSCGRG00001024433) ENSCGRG00001010645 Fcrls (ENSCGRG00001023718) Kirrel (ENSCGRG00001019106) ENSCGRG00001024546 ENSCGRG00001001996 Dclk2 (ENSCGRG00001024523) Lrba (ENSCGRG00001011663) Mab21l2 (ENSCGRG00001011307) ENSCGRG00001019518 Rps3a1 (ENSCGRG00001017462) ##22 Sh3d19 (ENSCGRG00001000110) Prss48 (ENSCGRG00001016837) ENSCGRG00001000269 Fhip1a (ENSCGRG00001016327) GATB (ENSCGRG00001024051) Fbxw7 (ENSCGRG00001024605) Tmem154 (ENSCGRG00001020221) Tigd4 (ENSCGRG00001012439) Arfip1 (ENSCGRG00001022813) Fhdc1 (ENSCGRG00001002573) Trim2 (ENSCGRG00001007113) ENSCGRG00001024742 Tmem131l (ENSCGRG00001007404) Tlr2 (ENSCGRG00001013303) Sfrp2 (ENSCGRG00001014141) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.h.a ##22 Rat MODERN SPECIES 2 Mb21d2 (ENSRNOG00000024040) Fgf12 (ENSRNOG00000001931) ENSRNOG00000067098 Ccdc50 (ENSRNOG00000001930) Uts2b (ENSRNOG00000038512) Ostn (ENSRNOG00000030462) Gmnc (ENSRNOG00000038505) Il1rap (ENSRNOG00000001928) Tmem207 (ENSRNOG00000064931) Cldn16 (ENSRNOG00000055138) Cldn1 (ENSRNOG00000001926) P3h2 (ENSRNOG00000055751) Tp63 (ENSRNOG00000001924) Tprg1 (ENSRNOG00000063970) Lpp (ENSRNOG00000031669) LOC100365839 (ENSRNOG00000048109) ##22 Bcl6 (ENSRNOG00000001843) Gm37419 (ENSRNOG00000069169) Rtp2 (ENSRNOG00000022160) Sst (ENSRNOG00000001837) Rtp4 (ENSRNOG00000066242) Masp1 (ENSRNOG00000001827) Rtp1 (ENSRNOG00000021992) St6gal1 (ENSRNOG00000001823) Adipoq (ENSRNOG00000001821) Rfc4 (ENSRNOG00000001816) Eif4a2 (ENSRNOG00000001815) Kng1 (ENSRNOG00000030387) Kng2 (ENSRNOG00000065935) LOC681544 (ENSRNOG00000070559) LOC681544 (ENSRNOG00000001809) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.h.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.h.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.h.b ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 15 Dbil5 (ENSMOCG00000004108) Gemin4 (ENSMOCG00000016454) Mrm3 (ENSMOCG00000018749) Nxn (ENSMOCG00000014329) Timm22 (ENSMOCG00000021862) Abr (ENSMOCG00000017665) ENSMOCG00000004581 Bhlha9 (ENSMOCG00000002327) Trarg1 (ENSMOCG00000020924) Gosr1 (ENSMOCG00000011008) Cpd (ENSMOCG00000011977) ENSMOCG00000008686 Blmh (ENSMOCG00000007175) Slc6a4 (ENSMOCG00000004407) Nsrp1 (ENSMOCG00000019716) ENSMOCG00000016597 ##22 Efcab5 (ENSMOCG00000006093) ENSMOCG00000006899 Coro6 (ENSMOCG00000013111) Ankrd13b (ENSMOCG00000008806) Git1 (ENSMOCG00000011144) Trp53i13 (ENSMOCG00000006130) ENSMOCG00000012497 Abhd15 (ENSMOCG00000020292) ENSMOCG00000002833 Taok1 (ENSMOCG00000007289) Nufip2 (ENSMOCG00000022086) Cryba1 (ENSMOCG00000009961) ENSMOCG00000002378 Myo18a (ENSMOCG00000022942) Pipox (ENSMOCG00000020266) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.h.b ##22 Rat MODERN SPECIES 11 Pear1 (ENSRNOG00000014243) Lrrc71 (ENSRNOG00000014937) Arhgef11 (ENSRNOG00000015026) Etv3l (ENSRNOG00000043511) Etv3 (ENSRNOG00000043095) Fcrl5 (ENSRNOG00000043414) Fcrl1 (ENSRNOG00000034230) Elp4-ps1 (ENSRNOG00000016146) Fcrl2 (ENSRNOG00000016164) Kirrel1 (ENSRNOG00000016408) ENSRNOG00000064959 Cd1d1 (ENSRNOG00000016451) Dclk2 (ENSRNOG00000016550) Mab21l2 (ENSRNOG00000031398) Lrba (ENSRNOG00000023453) Rps3a (ENSRNOG00000011893) ##22 Prss48 (ENSRNOG00000024208) Sh3d19 (ENSRNOG00000011752) Fhip1a (ENSRNOG00000048256) Gatb (ENSRNOG00000037655) ENSRNOG00000070421 AABR07012054.1 (ENSRNOG00000049530) Dear (ENSRNOG00000033147) Fbxw7 (ENSRNOG00000010889) Tmem154 (ENSRNOG00000010866) Tigd4 (ENSRNOG00000010741) Arfip1 (ENSRNOG00000010533) Fhdc1 (ENSRNOG00000024594) Trim2 (ENSRNOG00000010124) Mnd1 (ENSRNOG00000024733) Tmem131l (ENSRNOG00000009837) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159412 ENSGT00940000154225.a ENSGT00440000034367 ENSGT00940000158350 ENSGT00940000162271 ENSGT00940000160963 ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b ENSGT00940000161974 ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a ENSGT00940000155795 ENSGT01100000263475.d.a.h ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.i ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000162999 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159412 ENSGT00940000154225.a ENSGT00440000034367 ENSGT00940000158350 ENSGT00940000162271 ENSGT00940000160963 ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b ENSGT00940000161974 ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a ENSGT00940000155795 ENSGT01100000263475.d.a.h ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.i ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000162999 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.i ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 621 Adat2 (ENSMAUG00000013019) Pex3 (ENSMAUG00000010762) Fuca2 (ENSMAUG00000021938) Phactr2 (ENSMAUG00000022240) Ltv1 (ENSMAUG00000021486) Zc2hc1b (ENSMAUG00000019428) ENSMAUG00000002849 Sf3b5 (ENSMAUG00000008283) Stx11 (ENSMAUG00000002127) ENSMAUG00000006284 Epm2a (ENSMAUG00000020519) Fbxo30 (ENSMAUG00000005075) ENSMAUG00000018968 ENSMAUG00000004780 Grm1 (ENSMAUG00000003741) ENSMAUG00000007708 ##22 ENSMAUG00000012160 Adgb (ENSMAUG00000018683) Stxbp5 (ENSMAUG00000021149) Samd5 (ENSMAUG00000011794) ENSMAUG00000001554 ENSMAUG00000020795 ENSMAUG00000008799 Tab2 (ENSMAUG00000011287) Zc3h12d (ENSMAUG00000015783) Ppil4 (ENSMAUG00000015059) Ginm1 (ENSMAUG00000008067) ENSMAUG00000016471 ENSMAUG00000012301 Lats1 (ENSMAUG00000020092) Nup43 (ENSMAUG00000018659) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160437 ENSGT00940000159412 ENSGT00940000154225.a ENSGT00440000034367 ENSGT00940000158350 ENSGT00940000162271 ENSGT00940000160963 ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b ENSGT00940000161974 ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a ENSGT00940000155795 ENSGT01100000263475.d.a.h ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b.i ##22 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.h.a ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 19 Ntrk1 (ENSPEMG00000002759) Pear1 (ENSPEMG00000009313) Lrrc71 (ENSPEMG00000018998) Arhgef11 (ENSPEMG00000029720) ENSPEMG00000018038 Etv3 (ENSPEMG00000029165) Fcrl5 (ENSPEMG00000007612) Fcrl1 (ENSPEMG00000014268) Fcrls (ENSPEMG00000011018) Kirrel (ENSPEMG00000004718) ENSPEMG00000006771 ENSPEMG00000013831 Dclk2 (ENSPEMG00000011194) Mab21l2 (ENSPEMG00000027560) Lrba (ENSPEMG00000001439) Rps3a1 (ENSPEMG00000002589) ##22 Sh3d19 (ENSPEMG00000012766) Prss48 (ENSPEMG00000016792) Fhip1a (ENSPEMG00000015915) Gatb (ENSPEMG00000011096) Fbxw7 (ENSPEMG00000009071) Tmem154 (ENSPEMG00000027778) Tigd4 (ENSPEMG00000000747) Arfip1 (ENSPEMG00000010707) Fhdc1 (ENSPEMG00000017047) Trim2 (ENSPEMG00000011256) Mnd1 (ENSPEMG00000010374) Tmem131l (ENSPEMG00000027757) Tlr2 (ENSPEMG00000009603) Sfrp2 (ENSPEMG00000005587) Dchs2 (ENSPEMG00000000300) Murinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159412 ENSGT00940000154225.a ENSGT00440000034367 ENSGT00940000158350 ENSGT00940000162271 ENSGT00940000160963 ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b ENSGT00940000161974 ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a ENSGT00940000155795 ENSGT01100000263475.d.a.h ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.i ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000162999 Mus ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159412 ENSGT00940000154225.a ENSGT00440000034367 ENSGT00940000158350 ENSGT00940000162271 ENSGT00940000160963 ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b ENSGT00940000161974 ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a ENSGT00940000155795 ENSGT01100000263475.d.a.h ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.i ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00510000047493.f ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b.a ENSGT00950000183040.A.b.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000161656 ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b Shrew mouse MODERN SPECIES 17 Ntrk1 (MGP_PahariEiJ_G0026583) MGP_PahariEiJ_G0026582 Lrrc71 (MGP_PahariEiJ_G0026581) Arhgef11 (MGP_PahariEiJ_G0026580) Etv3 (MGP_PahariEiJ_G0026579) Fcrl5 (MGP_PahariEiJ_G0026578) Fcrl1 (MGP_PahariEiJ_G0026577) Cd5l (MGP_PahariEiJ_G0026576) Fcrls (MGP_PahariEiJ_G0026575) Kirrel (MGP_PahariEiJ_G0026574) MGP_PahariEiJ_G0026573 MGP_PahariEiJ_G0026572 Dclk2 (MGP_PahariEiJ_G0026571) Mab21l2 (MGP_PahariEiJ_G0026570) Lrba (MGP_PahariEiJ_G0026569) Rps3a1 (MGP_PahariEiJ_G0026568) ##22 Prss48 (MGP_PahariEiJ_G0026567) MGP_PahariEiJ_G0026566 Glt28d2 (MGP_PahariEiJ_G0026565) Fhip1a (MGP_PahariEiJ_G0026564) Gatb (MGP_PahariEiJ_G0026563) Fbxw7 (MGP_PahariEiJ_G0026562) Tmem154 (MGP_PahariEiJ_G0026561) Tigd4 (MGP_PahariEiJ_G0026560) MGP_PahariEiJ_G0026559 Arfip1 (MGP_PahariEiJ_G0026558) Fhdc1 (MGP_PahariEiJ_G0026557) MGP_PahariEiJ_G0026556 Trim2 (MGP_PahariEiJ_G0026555) Mnd1 (MGP_PahariEiJ_G0026554) Tmem131l (MGP_PahariEiJ_G0026553) Mus_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159412 ENSGT00940000154225.a ENSGT00440000034367 ENSGT00940000158350 ENSGT00940000162271 ENSGT00940000160963 ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b ENSGT00940000161974 ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a ENSGT00940000155795 ENSGT01100000263475.d.a.h ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.i ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00510000047493.f ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b.a ENSGT00950000183040.A.b.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000161656 ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b Mus_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159412 ENSGT00940000154225.a ENSGT00440000034367 ENSGT00940000158350 ENSGT00940000162271 ENSGT00940000160963 ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b ENSGT00940000161974 ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a ENSGT00940000155795 ENSGT01100000263475.d.a.h ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.i ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00510000047493.f ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b.a ENSGT00950000183040.A.b.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000161656 ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b Mus_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159412 ENSGT00940000154225.a ENSGT00440000034367 ENSGT00940000158350 ENSGT00940000162271 ENSGT00940000160963 ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b ENSGT00940000161974 ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a ENSGT00940000155795 ENSGT01100000263475.d.a.h ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.i ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00510000047493.f ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b.a ENSGT00950000183040.A.b.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000161656 ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b Steppe mouse MODERN SPECIES 3301 Arhgef11 (ENSMSIG00000022032) ENSMSIG00000022013 Etv3 (ENSMSIG00000021999) Fcrl5 (ENSMSIG00000021749) Fcrl1 (ENSMSIG00000021600) Cd5l (ENSMSIG00000021580) Fcrls (ENSMSIG00000021565) Kirrel (ENSMSIG00000021460) ENSMSIG00000021446 ENSMSIG00000021403 ENSMSIG00000021384 ENSMSIG00000021374 Dclk2 (ENSMSIG00000021032) Mab21l2 (ENSMSIG00000021015) Lrba (ENSMSIG00000020600) Rps3a1 (ENSMSIG00000020554) ##22 Prss48 (ENSMSIG00000020531) Sh3d19 (ENSMSIG00000020467) Glt28d2 (ENSMSIG00000020437) Fhip1a (ENSMSIG00000020416) ENSMSIG00000020354 ENSMSIG00000020319 ENSMSIG00000020316 Fbxw7 (ENSMSIG00000020233) Tmem154 (ENSMSIG00000020217) Tigd4 (ENSMSIG00000020213) Arfip1 (ENSMSIG00000020145) Fhdc1 (ENSMSIG00000020098) ENSMSIG00000020078 Gm6525 (ENSMSIG00000020071) Trim2 (ENSMSIG00000020008) spretus MODERN SPECIES 12 Insrr (MGP_SPRETEiJ_G0026082) Ntrk1 (MGP_SPRETEiJ_G0026081) MGP_SPRETEiJ_G0026080 Lrrc71 (MGP_SPRETEiJ_G0026079) Arhgef11 (MGP_SPRETEiJ_G0026078) Etv3 (MGP_SPRETEiJ_G0026077) Fcrl5 (MGP_SPRETEiJ_G0026076) Fcrl1 (MGP_SPRETEiJ_G0026075) Cd5l (MGP_SPRETEiJ_G0026074) Fcrls (MGP_SPRETEiJ_G0026073) Kirrel (MGP_SPRETEiJ_G0026072) MGP_SPRETEiJ_G0026071 Dclk2 (MGP_SPRETEiJ_G0026070) Mab21l2 (MGP_SPRETEiJ_G0026069) Lrba (MGP_SPRETEiJ_G0026068) Rps3a1 (MGP_SPRETEiJ_G0026067) ##22 Prss48 (MGP_SPRETEiJ_G0026066) MGP_SPRETEiJ_G0026065 Glt28d2 (MGP_SPRETEiJ_G0026064) Fhip1a (MGP_SPRETEiJ_G0026063) Gatb (MGP_SPRETEiJ_G0026062) Fbxw7 (MGP_SPRETEiJ_G0026061) Tmem154 (MGP_SPRETEiJ_G0026060) Tigd4 (MGP_SPRETEiJ_G0026059) MGP_SPRETEiJ_G0026058 Arfip1 (MGP_SPRETEiJ_G0026057) Fhdc1 (MGP_SPRETEiJ_G0026056) Gm6525 (MGP_SPRETEiJ_G0026055) Trim2 (MGP_SPRETEiJ_G0026054) Mnd1 (MGP_SPRETEiJ_G0026053) Tmem131l (MGP_SPRETEiJ_G0026052) Mouse MODERN SPECIES 12 Pear1 (ENSMUSG00000028073) Lrrc71 (ENSMUSG00000023084) Arhgef11 (ENSMUSG00000041977) Etv3l (ENSMUSG00000118505) Etv3 (ENSMUSG00000003382) Fcrl5 (ENSMUSG00000048031) Fcrl1 (ENSMUSG00000059994) Cd5l (ENSMUSG00000015854) Fcrls (ENSMUSG00000015852) Kirrel (ENSMUSG00000041734) Cd1d1 (ENSMUSG00000028076) Cd1d2 (ENSMUSG00000041750) Dclk2 (ENSMUSG00000028078) Mab21l2 (ENSMUSG00000057777) Lrba (ENSMUSG00000028080) Rps3a1 (ENSMUSG00000028081) ##22 Prss48 (ENSMUSG00000049013) Sh3d19 (ENSMUSG00000028082) Glt28d2 (ENSMUSG00000031286) Fhip1a (ENSMUSG00000051000) Gatb (ENSMUSG00000028085) Fbxw7 (ENSMUSG00000028086) Tmem154 (ENSMUSG00000056498) Tigd4 (ENSMUSG00000047819) Gm37240 (ENSMUSG00000102805) Arfip1 (ENSMUSG00000074513) Fhdc1 (ENSMUSG00000041842) Gm6525 (ENSMUSG00000104043) Trim2 (ENSMUSG00000027993) Mnd1 (ENSMUSG00000033752) Tmem131l (ENSMUSG00000033767) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b ##22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 523 ENSOCUG00000037540 ENSOCUG00000032330 ENSOCUG00000024968 ##22 ENSOCUG00000021516 ENSOCUG00000036669 Rabbit MODERN SPECIES 6 PCDH10 (ENSOCUG00000005826) ENSOCUG00000005258 ENSOCUG00000021328 ENSOCUG00000030410 ENSOCUG00000038573 ENSOCUG00000027214 ##22 ENSOCUG00000036708 C4orf33 (ENSOCUG00000015092) SCLT1 (ENSOCUG00000015077) JADE1 (ENSOCUG00000004521) PGRMC2 (ENSOCUG00000002372) LARP1B (ENSOCUG00000013330) ABHD18 (ENSOCUG00000005526) MFSD8 (ENSOCUG00000015003) PLK4 (ENSOCUG00000005009) ENSOCUG00000035820 HSPA4L (ENSOCUG00000027940) SLC25A31 (ENSOCUG00000015617) INTU (ENSOCUG00000001278) FAT4 (ENSOCUG00000008710) ANKRD50 (ENSOCUG00000006096) Rabbit MODERN SPECIES 15 TIMP3 (ENSOCUG00000008310) FBXO7 (ENSOCUG00000008289) ENSOCUG00000008280 PRDM4 (ENSOCUG00000012859) PWP1 (ENSOCUG00000002724) ABTB3 (ENSOCUG00000002716) CRY1 (ENSOCUG00000013721) MTERF2 (ENSOCUG00000009560) TMEM263 (ENSOCUG00000009563) RIC8B (ENSOCUG00000006126) RFX4 (ENSOCUG00000028228) POLR3B (ENSOCUG00000000884) ENSOCUG00000034904 CKAP4 (ENSOCUG00000000187) NUAK1 (ENSOCUG00000004958) ENSOCUG00000022751 ##22 ENSOCUG00000034454 APPL2 (ENSOCUG00000005042) WASHC4 (ENSOCUG00000005030) ALDH1L2 (ENSOCUG00000006962) NOPCHAP1 (ENSOCUG00000006960) Rabbit MODERN SPECIES 1401 ENSOCUG00000010629 ENSOCUG00000010859 ENSOCUG00000010855 BTK (ENSOCUG00000010621) ENSOCUG00000027477 TAF7L (ENSOCUG00000004497) DRP2 (ENSOCUG00000004487) CENPI (ENSOCUG00000011953) TMEM35A (ENSOCUG00000011961) TRMT2B (ENSOCUG00000011945) ENSOCUG00000023605 ENSOCUG00000005963 XKRX (ENSOCUG00000005661) NOX1 (ENSOCUG00000005652) CSTF2 (ENSOCUG00000010468) ENSOCUG00000023695 ##22 SYTL4 (ENSOCUG00000011193) SRPX2 (ENSOCUG00000011186) TSPAN6 (ENSOCUG00000011184) TNMD (ENSOCUG00000011179) PCDH19 (ENSOCUG00000015865) ENSOCUG00000003552 DIAPH2 (ENSOCUG00000007109) ENSOCUG00000038471 ENSOCUG00000030699 ENSOCUG00000033765 ENSOCUG00000025252 ENSOCUG00000013944 ENSOCUG00000029262 ZBTB33 (ENSOCUG00000004331) TMEM255A (ENSOCUG00000004334) Rabbit MODERN SPECIES 14 CA3 (ENSOCUG00000011736) CA2 (ENSOCUG00000011742) ATP6V0D2 (ENSOCUG00000010247) PSKH2 (ENSOCUG00000003992) ENSOCUG00000026370 SLC7A13 (ENSOCUG00000017971) WWP1 (ENSOCUG00000001081) RMDN1 (ENSOCUG00000001086) CPNE3 (ENSOCUG00000017961) CNGB3 (ENSOCUG00000017962) CNBD1 (ENSOCUG00000029386) MMP16 (ENSOCUG00000011230) ENSOCUG00000032504 ENSOCUG00000016091 RIPK2 (ENSOCUG00000001542) ENSOCUG00000025532 ##22 ENSOCUG00000030509 OSGIN2 (ENSOCUG00000009931) NBN (ENSOCUG00000009935) ENSOCUG00000006333 ENSOCUG00000006341 ENSOCUG00000021479 ENSOCUG00000006890 NECAB1 (ENSOCUG00000001277) ENSOCUG00000023574 ENSOCUG00000030280 ENSOCUG00000000723 OTUD6B (ENSOCUG00000000218) LRRC69 (ENSOCUG00000028994) SLC26A7 (ENSOCUG00000012527) ENSOCUG00000027627 Tree shrew DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 6034 LPIN2 (ENSTBEG00000009160) ENSTBEG00000009032 ##22 EMILIN2 (ENSTBEG00000008658) ##29 ENSTBEG00000006736 Tree shrew MODERN SPECIES 313 ENSTBEG00000002963 ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000154978.n ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413.c.a ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000162999 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 27 TMEM109 (ENSMICG00000037640) TMEM132A (ENSMICG00000042560) SLC15A3 (ENSMICG00000027981) CD6 (ENSMICG00000011288) CD5 (ENSMICG00000013628) VPS37C (ENSMICG00000034100) ENSMICG00000013645 VWCE (ENSMICG00000013662) DDB1 (ENSMICG00000013703) TKFC (ENSMICG00000013737) CYB561A3 (ENSMICG00000013766) TMEM138 (ENSMICG00000047581) TMEM216 (ENSMICG00000013785) CPSF7 (ENSMICG00000013788) SDHAF2 (ENSMICG00000013808) ENSMICG00000027025 ##22 PPP1R32 (ENSMICG00000012749) LRRC10B (ENSMICG00000030558) SYT7 (ENSMICG00000013836) DAGLA (ENSMICG00000013847) MYRF (ENSMICG00000013870) TMEM258 (ENSMICG00000013894) ENSMICG00000029413 FADS1 (ENSMICG00000013915) FADS2 (ENSMICG00000004145) FADS3 (ENSMICG00000032887) RAB3IL1 (ENSMICG00000005824) BEST1 (ENSMICG00000005843) ENSMICG00000035165 ENSMICG00000031901 ENSMICG00000044535 Mouse lemur MODERN SPECIES 5 POU4F2 (ENSMICG00000034755) TTC29 (ENSMICG00000036587) EDNRA (ENSMICG00000000581) TMEM184C (ENSMICG00000000582) PRMT9 (ENSMICG00000000584) ARHGAP10 (ENSMICG00000000588) NR3C2 (ENSMICG00000041449) ENSMICG00000027816 IQCM (ENSMICG00000039098) ENSMICG00000036842 DCLK2 (ENSMICG00000006224) MAB21L2 (ENSMICG00000045967) ENSMICG00000044938 LRBA (ENSMICG00000006230) ENSMICG00000045323 ENSMICG00000004921 ##22 SH3D19 (ENSMICG00000004926) FHIP1A (ENSMICG00000027501) GATB (ENSMICG00000004311) FBXW7 (ENSMICG00000012171) TMEM154 (ENSMICG00000012190) ENSMICG00000045022 ARFIP1 (ENSMICG00000009047) FHDC1 (ENSMICG00000031284) ENSMICG00000028535 TRIM2 (ENSMICG00000005722) ENSMICG00000038652 TMEM131L (ENSMICG00000003179) RNF175 (ENSMICG00000003199) SFRP2 (ENSMICG00000038719) DCHS2 (ENSMICG00000038569) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b ##22 Tarsier MODERN SPECIES 2125 ENSTSYG00000035569 RPS3A (ENSTSYG00000031843) ##22 SH3D19 (ENSTSYG00000003764) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00950000184824 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00950000184824 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000003245.i.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00500000044916.g.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000155657.db.a.b Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00950000184824 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000003245.i.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00500000044916.g.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000155657.db.a.b Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 19 HYAL3 (ENSNLEG00000006981) NAA80 (ENSNLEG00000018540) HYAL1 (ENSNLEG00000006983) HYAL2 (ENSNLEG00000006986) TUSC2 (ENSNLEG00000006988) RASSF1 (ENSNLEG00000006991) ZMYND10 (ENSNLEG00000006996) NPRL2 (ENSNLEG00000007003) CYB561D2 (ENSNLEG00000007006) TMEM115 (ENSNLEG00000031055) CACNA2D2 (ENSNLEG00000007008) C3orf18 (ENSNLEG00000035502) HEMK1 (ENSNLEG00000007025) CISH (ENSNLEG00000007030) MAPKAPK3 (ENSNLEG00000007011) ENSNLEG00000034096 ##22 DOCK3 (ENSNLEG00000007031) ENSNLEG00000007033 RBM15B (ENSNLEG00000018541) DCAF1 (ENSNLEG00000007035) RAD54L2 (ENSNLEG00000007038) ENSNLEG00000007040 GRM2 (ENSNLEG00000007044) ENSNLEG00000007047 IQCF3 (ENSNLEG00000007049) IQCF2 (ENSNLEG00000007050) IQCF5 (ENSNLEG00000018542) IQCF1 (ENSNLEG00000007053) RRP9 (ENSNLEG00000007054) PARP3 (ENSNLEG00000007058) ENSNLEG00000007063 Gibbon MODERN SPECIES 22 ENSNLEG00000036026 POU4F2 (ENSNLEG00000005619) TTC29 (ENSNLEG00000005624) EDNRA (ENSNLEG00000005640) ENSNLEG00000005651 PRMT9 (ENSNLEG00000005657) ARHGAP10 (ENSNLEG00000005671) NR3C2 (ENSNLEG00000005677) IQCM (ENSNLEG00000027154) ENSNLEG00000027456 DCLK2 (ENSNLEG00000005691) LRBA (ENSNLEG00000005731) ENSNLEG00000033639 MAB21L2 (ENSNLEG00000035778) ENSNLEG00000032859 ENSNLEG00000005815 ##22 SH3D19 (ENSNLEG00000005818) PRSS48 (ENSNLEG00000005825) FHIP1A (ENSNLEG00000005829) GATB (ENSNLEG00000005836) FBXW7 (ENSNLEG00000005860) TMEM154 (ENSNLEG00000032380) TIGD4 (ENSNLEG00000005902) ARFIP1 (ENSNLEG00000005906) ENSNLEG00000005921 FHDC1 (ENSNLEG00000005922) TRIM2 (ENSNLEG00000005924) ENSNLEG00000005935 ENSNLEG00000030881 MND1 (ENSNLEG00000005936) TMEM131L (ENSNLEG00000005942) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000003245.i.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00500000044916.g.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000155657.db.a.b Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000003245.i.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00500000044916.g.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000155657.db.a.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000003245.i.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00500000044916.g.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000155657.db.a.b Human MODERN SPECIES 16 ZNF827 (ENSG00000151612) LSM6 (ENSG00000164167) REELD1 (ENSG00000250673) SLC10A7 (ENSG00000120519) POU4F2 (ENSG00000151615) TTC29 (ENSG00000137473) EDNRA (ENSG00000151617) TMEM184C (ENSG00000164168) PRMT9 (ENSG00000164169) ARHGAP10 (ENSG00000071205) NR3C2 (ENSG00000151623) IQCM (ENSG00000234828) DCLK2 (ENSG00000170390) LRBA (ENSG00000198589) MAB21L2 (ENSG00000181541) RPS3A (ENSG00000145425) ##22 SH3D19 (ENSG00000109686) PRSS48 (ENSG00000189099) FHIP1A (ENSG00000164142) GATB (ENSG00000059691) FBXW7 (ENSG00000109670) TMEM154 (ENSG00000170006) TIGD4 (ENSG00000169989) ARFIP1 (ENSG00000164144) FHDC1 (ENSG00000137460) TRIM2 (ENSG00000109654) ENSG00000288637 MND1 (ENSG00000121211) TMEM131L (ENSG00000121210) TLR2 (ENSG00000137462) RNF175 (ENSG00000145428) Pan ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000153230.B.b ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000003245.i.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00500000044916.g.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000155657.db.a.b Bonobo MODERN SPECIES 18 KCNN2 (ENSPPAG00000043586) ENSPPAG00000012064 YTHDC2 (ENSPPAG00000018854) MCC (ENSPPAG00000001501) DCP2 (ENSPPAG00000042108) ENSPPAG00000008683 ENSPPAG00000026840 SRP19 (ENSPPAG00000037062) APC (ENSPPAG00000032467) EPB41L4A (ENSPPAG00000040652) ENSPPAG00000042559 ENSPPAG00000039695 ENSPPAG00000031387 STARD4 (ENSPPAG00000039524) CAMK4 (ENSPPAG00000041231) ENSPPAG00000029092 ##22 WDR36 (ENSPPAG00000023560) ENSPPAG00000043068 TSLP (ENSPPAG00000037495) ENSPPAG00000029536 SLC25A46 (ENSPPAG00000042617) TMEM232 (ENSPPAG00000039615) ENSPPAG00000001922 ENSPPAG00000036482 MAN2A1 (ENSPPAG00000037961) PJA2 (ENSPPAG00000039234) ENSPPAG00000035716 ENSPPAG00000043941 FER (ENSPPAG00000039597) ENSPPAG00000035591 ENSPPAG00000028652 Chimpanzee DUPLICATION Chimpanzee MODERN SPECIES 17 EDNRA (ENSPTRG00000016494) TMEM184C (ENSPTRG00000016495) PRMT9 (ENSPTRG00000016496) ENSPTRG00000045979 ARHGAP10 (ENSPTRG00000016497) NR3C2 (ENSPTRG00000016499) IQCM (ENSPTRG00000046099) DCLK2 (ENSPTRG00000016504) LRBA (ENSPTRG00000023095) ENSPTRG00000043716 MAB21L2 (ENSPTRG00000038821) ENSPTRG00000049102 ENSPTRG00000047882 ENSPTRG00000052157 ENSPTRG00000044700 RPS3A (ENSPTRG00000046168) ##22 SH3D19 (ENSPTRG00000016509) PRSS48 (ENSPTRG00000016510) FHIP1A (ENSPTRG00000016512) GATB (ENSPTRG00000016513) FBXW7 (ENSPTRG00000016514) TIGD4 (ENSPTRG00000016518) ARFIP1 (ENSPTRG00000016519) ENSPTRG00000016520 FHDC1 (ENSPTRG00000016521) TRIM2 (ENSPTRG00000016522) ENSPTRG00000043478 MND1 (ENSPTRG00000016524) TMEM131L (ENSPTRG00000016527) ENSPTRG00000052408 TLR2 (ENSPTRG00000016528) Chimpanzee MODERN SPECIES 18 KCNN2 (ENSPTRG00000017144) YTHDC2 (ENSPTRG00000017143) MCC (ENSPTRG00000017140) DCP2 (ENSPTRG00000050185) ENSPTRG00000017138 REEP5 (ENSPTRG00000017137) SRP19 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(ENSGGOG00000001547) ENSGGOG00000010526 FER (ENSGGOG00000010028) FBXL17 (ENSGGOG00000015039) ENSGGOG00000042159 EFNA5 (ENSGGOG00000000371) ENSGGOG00000027503 NUDT12 (ENSGGOG00000023955) MACIR (ENSGGOG00000040406) PPIP5K2 (ENSGGOG00000012250) Gorilla MODERN SPECIES 9 ENSGGOG00000013730 ALPK2 (ENSGGOG00000013746) MALT1 (ENSGGOG00000023405) ZNF532 (ENSGGOG00000026498) SEC11C (ENSGGOG00000007358) ENSGGOG00000038737 GRP (ENSGGOG00000002670) RAX (ENSGGOG00000006747) CPLX4 (ENSGGOG00000006750) LMAN1 (ENSGGOG00000006753) CCBE1 (ENSGGOG00000016394) ENSGGOG00000005394 ENSGGOG00000007170 ENSGGOG00000023935 ENSGGOG00000040955 RPS3A (ENSGGOG00000027455) ##22 MC4R (ENSGGOG00000015011) CDH20 (ENSGGOG00000006915) ENSGGOG00000041434 ENSGGOG00000026693 PIGN (ENSGGOG00000005051) RELCH (ENSGGOG00000015020) TNFRSF11A (ENSGGOG00000004309) ZCCHC2 (ENSGGOG00000002966) PHLPP1 (ENSGGOG00000005176) ENSGGOG00000024193 BCL2 (ENSGGOG00000037403) KDSR (ENSGGOG00000013317) VPS4B (ENSGGOG00000006727) SERPINB5 (ENSGGOG00000025505) ENSGGOG00000041777 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000003245.i.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b.b ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00390000006095.t ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00500000044916.g.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778.t ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000003245.i.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b.b ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00390000006095.t ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00500000044916.g.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000168500 ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 358 MAB21L2 (ENSRBIG00000024882) ENSRBIG00000016420 ENSRBIG00000044387 ENSRBIG00000039102 RPS3A (ENSRBIG00000031506) ##22 SH3D19 (ENSRBIG00000043149) PRSS48 (ENSRBIG00000035216) ENSRBIG00000039614 FHIP1A (ENSRBIG00000032166) GATB (ENSRBIG00000006453) FBXW7 (ENSRBIG00000035783) TMEM154 (ENSRBIG00000039822) TIGD4 (ENSRBIG00000014613) ARFIP1 (ENSRBIG00000027072) ENSRBIG00000043174 FHDC1 (ENSRBIG00000012007) ENSRBIG00000038361 ENSRBIG00000041487 TRIM2 (ENSRBIG00000032464) MND1 (ENSRBIG00000036568) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1678 DCLK2 (ENSRROG00000009020) MAB21L2 (ENSRROG00000005152) ENSRROG00000024313 ENSRROG00000037134 LRBA (ENSRROG00000039728) ENSRROG00000030795 RPS3A (ENSRROG00000041672) ##22 PRSS48 (ENSRROG00000035004) SH3D19 (ENSRROG00000031648) ENSRROG00000043903 FHIP1A (ENSRROG00000031149) GATB (ENSRROG00000041575) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000003245.i.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b.b ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00390000006095.t ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00500000044916.g.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000153377.B.f ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 Vervet Monkey MODERN SPECIES 26 ENSCSAG00000003416 SLC10A7 (ENSCSAG00000003414) POU4F2 (ENSCSAG00000003411) TTC29 (ENSCSAG00000003409) EDNRA (ENSCSAG00000003394) TMEM184C (ENSCSAG00000003385) PRMT9 (ENSCSAG00000003376) ARHGAP10 (ENSCSAG00000003372) ENSCSAG00000003366 DCLK2 (ENSCSAG00000003362) ENSCSAG00000003358 MAB21L2 (ENSCSAG00000000389) LRBA (ENSCSAG00000003355) ENSCSAG00000003348 ENSCSAG00000000388 RPS3A (ENSCSAG00000003344) ##22 SH3D19 (ENSCSAG00000003339) PRSS48 (ENSCSAG00000003331) FHIP1A (ENSCSAG00000003322) GATB (ENSCSAG00000003318) FBXW7 (ENSCSAG00000003313) TMEM154 (ENSCSAG00000003309) ENSCSAG00000000387 TIGD4 (ENSCSAG00000000386) ARFIP1 (ENSCSAG00000003306) FHDC1 (ENSCSAG00000003305) ENSCSAG00000003303 TRIM2 (ENSCSAG00000003302) MND1 (ENSCSAG00000003300) TMEM131L (ENSCSAG00000003293) TLR2 (ENSCSAG00000000385) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT00940000153314.a.a.l.b ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000003245.i.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b.b ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00390000006095.t ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00500000044916.g.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000153377.B.f ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 Macaca ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT00940000153314.a.a.l.b ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b.b ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000153311.a.b.a.fb.a.a.a ENSGT00940000153377.B.f ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b Pig-tailed macaque DUPLICATION Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 152 RIC1 (ENSMNEG00000022609) ERMP1 (ENSMNEG00000028561) MLANA (ENSMNEG00000031276) ENSMNEG00000038006 IL33 (ENSMNEG00000041999) TPD52L3 (ENSMNEG00000033267) UHRF2 (ENSMNEG00000034080) GLDC (ENSMNEG00000032546) ENSMNEG00000033793 ENSMNEG00000031093 KDM4C (ENSMNEG00000029324) DMAC1 (ENSMNEG00000044495) ENSMNEG00000030132 PTPRD (ENSMNEG00000036506) ENSMNEG00000036773 ##22 TYRP1 (ENSMNEG00000035543) LURAP1L (ENSMNEG00000029041) ENSMNEG00000035930 MPDZ (ENSMNEG00000040228) ENSMNEG00000035388 NFIB (ENSMNEG00000039065) ENSMNEG00000005084 ZDHHC21 (ENSMNEG00000033895) CER1 (ENSMNEG00000034249) FREM1 (ENSMNEG00000034773) TTC39B (ENSMNEG00000029192) SNAPC3 (ENSMNEG00000002686) ENSMNEG00000014509 PSIP1 (ENSMNEG00000030633) CCDC171 (ENSMNEG00000042615) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 306 REELD1 (ENSMNEG00000028815) SLC10A7 (ENSMNEG00000033881) POU4F2 (ENSMNEG00000036356) TTC29 (ENSMNEG00000034118) ENSMNEG00000025155 EDNRA (ENSMNEG00000002624) TMEM184C (ENSMNEG00000029579) PRMT9 (ENSMNEG00000031467) ARHGAP10 (ENSMNEG00000045536) NR3C2 (ENSMNEG00000042813) IQCM (ENSMNEG00000034863) DCLK2 (ENSMNEG00000020553) LRBA (ENSMNEG00000021813) MAB21L2 (ENSMNEG00000002873) ENSMNEG00000008812 ENSMNEG00000037276 ##22 SH3D19 (ENSMNEG00000039541) PRSS48 (ENSMNEG00000041329) FHIP1A (ENSMNEG00000036401) GATB (ENSMNEG00000040147) FBXW7 (ENSMNEG00000034815) TMEM154 (ENSMNEG00000043952) TIGD4 (ENSMNEG00000019365) ARFIP1 (ENSMNEG00000032244) FHDC1 (ENSMNEG00000041726) ENSMNEG00000028849 ENSMNEG00000020352 TRIM2 (ENSMNEG00000045339) ENSMNEG00000028298 MND1 (ENSMNEG00000045163) TMEM131L (ENSMNEG00000032766) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT00940000153314.a.a.l.b ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b.b ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT01100000263493.a.a.a.b.a.a.b.a.b.a.a.a.a.b.a.b.d.b ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000161627.a.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000153311.a.b.a.fb.a.a.a ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b Rhesus MODERN SPECIES 15 ENSMMUG00000062288 EDNRA (ENSMMUG00000003659) ENSMMUG00000063624 TMEM184C (ENSMMUG00000004977) PRMT9 (ENSMMUG00000004979) ARHGAP10 (ENSMMUG00000014953) NR3C2 (ENSMMUG00000014955) ENSMMUG00000056077 ENSMMUG00000062670 IQCM (ENSMMUG00000047563) DCLK2 (ENSMMUG00000002211) LRBA (ENSMMUG00000002212) MAB21L2 (ENSMMUG00000039441) ENSMMUG00000059101 ENSMMUG00000030101 RPS3A (ENSMMUG00000002676) ##22 ENSMMUG00000059421 SH3D19 (ENSMMUG00000006026) PRSS48 (ENSMMUG00000009680) FHIP1A (ENSMMUG00000041800) GATB (ENSMMUG00000011048) FBXW7 (ENSMMUG00000020330) ENSMMUG00000064587 ENSMMUG00000050880 TMEM154 (ENSMMUG00000039094) ENSMMUG00000063665 ARFIP1 (ENSMMUG00000018490) FHDC1 (ENSMMUG00000018493) ENSMMUG00000065105 ENSMMUG00000039869 TMEM131L (ENSMMUG00000009001) Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES ENSMFAG00000049451 RPL5 (ENSMFAG00000033619) EVI5 (ENSMFAG00000003592) ENSMFAG00000044701 ENSMFAG00000061073 GFI1 (ENSMFAG00000045801) RPAP2 (ENSMFAG00000031837) GLMN (ENSMFAG00000035560) BTBD8 (ENSMFAG00000003189) EPHX4 (ENSMFAG00000035355) BRDT (ENSMFAG00000044939) ENSMFAG00000047645 TGFBR3 (ENSMFAG00000002239) ENSMFAG00000000474 ENSMFAG00000003649 ENSMFAG00000048501 ##22 ENSMFAG00000060879 ENSMFAG00000062421 ZNF644 (ENSMFAG00000033902) ENSMFAG00000047958 ENSMFAG00000064076 ENSMFAG00000062129 BARHL2 (ENSMFAG00000051984) ENSMFAG00000062941 ENSMFAG00000057050 ZNF326 (ENSMFAG00000044308) LRRC8D (ENSMFAG00000062678) ENSMFAG00000051015 LRRC8C (ENSMFAG00000031732) LRRC8B (ENSMFAG00000026599) ENSMFAG00000035480 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 15 TTC29 (ENSMFAG00000046354) ENSMFAG00000059767 EDNRA (ENSMFAG00000033903) TMEM184C (ENSMFAG00000039107) PRMT9 (ENSMFAG00000033194) ARHGAP10 (ENSMFAG00000039963) NR3C2 (ENSMFAG00000033681) IQCM (ENSMFAG00000045917) ENSMFAG00000049000 ENSMFAG00000057521 DCLK2 (ENSMFAG00000001654) ENSMFAG00000053094 LRBA (ENSMFAG00000003797) MAB21L2 (ENSMFAG00000015102) ENSMFAG00000038836 ENSMFAG00000037658 ##22 ENSMFAG00000062741 SH3D19 (ENSMFAG00000032402) PRSS48 (ENSMFAG00000041886) FHIP1A (ENSMFAG00000035212) GATB (ENSMFAG00000045472) FBXW7 (ENSMFAG00000045981) TMEM154 (ENSMFAG00000003415) ENSMFAG00000061648 TIGD4 (ENSMFAG00000007745) ARFIP1 (ENSMFAG00000003342) FHDC1 (ENSMFAG00000040830) FKBP1C (ENSMFAG00000029622) TRIM2 (ENSMFAG00000033003) MND1 (ENSMFAG00000037778) TMEM131L (ENSMFAG00000002070) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT00940000153314.a.a.l.b ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000003245.i.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b.b ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00390000006095.t ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00500000044916.g.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000153377.B.f ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 Olive baboon MODERN SPECIES 13 REELD1 (ENSPANG00000019816) SLC10A7 (ENSPANG00000019495) POU4F2 (ENSPANG00000045314) TTC29 (ENSPANG00000004758) ENSPANG00000038735 EDNRA (ENSPANG00000006372) TMEM184C (ENSPANG00000005233) PRMT9 (ENSPANG00000019539) ARHGAP10 (ENSPANG00000025442) NR3C2 (ENSPANG00000004756) IQCM (ENSPANG00000008512) ENSPANG00000019538 MAB21L2 (ENSPANG00000044410) LRBA (ENSPANG00000018911) ENSPANG00000032704 RPS3A (ENSPANG00000030994) ##22 PRSS48 (ENSPANG00000021582) ENSPANG00000041232 SH3D19 (ENSPANG00000013406) FHIP1A (ENSPANG00000017864) GATB (ENSPANG00000024036) FBXW7 (ENSPANG00000025492) ENSPANG00000049897 TMEM154 (ENSPANG00000016249) TIGD4 (ENSPANG00000002290) ARFIP1 (ENSPANG00000018884) FHDC1 (ENSPANG00000008667) ENSPANG00000043803 TRIM2 (ENSPANG00000023881) MND1 (ENSPANG00000006139) TMEM131L (ENSPANG00000006232) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT00940000153314.a.a.l.b ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00910000148727 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000003245.i.a ENSGT00940000154568.q.a.a.b.b ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00390000006095.t ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00500000044916.g.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000153377.B.f ENSGT00940000155905.a ENSGT00940000154257.i.a.a ENSGT00490000043413 Drill MODERN SPECIES 391 TTC29 (ENSMLEG00000029380) ENSMLEG00000026540 EDNRA (ENSMLEG00000032003) TMEM184C (ENSMLEG00000040036) PRMT9 (ENSMLEG00000042508) ARHGAP10 (ENSMLEG00000038597) ENSMLEG00000035174 NR3C2 (ENSMLEG00000032090) IQCM (ENSMLEG00000036248) DCLK2 (ENSMLEG00000032964) MAB21L2 (ENSMLEG00000001807) LRBA (ENSMLEG00000029030) ENSMLEG00000043812 RPS3A (ENSMLEG00000044224) ##22 SH3D19 (ENSMLEG00000042981) PRSS48 (ENSMLEG00000031832) ENSMLEG00000042885 FHIP1A (ENSMLEG00000043501) GATB (ENSMLEG00000042135) FBXW7 (ENSMLEG00000035509) TMEM154 (ENSMLEG00000042299) TIGD4 (ENSMLEG00000008774) ARFIP1 (ENSMLEG00000040124) ENSMLEG00000043684 FHDC1 (ENSMLEG00000033276) ENSMLEG00000004649 Sooty mangabey MODERN SPECIES 575 SLC10A7 (ENSCATG00000038830) POU4F2 (ENSCATG00000035415) TTC29 (ENSCATG00000021611) EDNRA (ENSCATG00000041941) TMEM184C (ENSCATG00000044287) PRMT9 (ENSCATG00000025314) ARHGAP10 (ENSCATG00000029679) ENSCATG00000029475 NR3C2 (ENSCATG00000031040) IQCM (ENSCATG00000039219) DCLK2 (ENSCATG00000034887) MAB21L2 (ENSCATG00000015705) ENSCATG00000035565 LRBA (ENSCATG00000036910) ENSCATG00000009094 RPS3A (ENSCATG00000029484) ##22 PRSS48 (ENSCATG00000033095) SH3D19 (ENSCATG00000040234) ENSCATG00000016011 FHIP1A (ENSCATG00000043916) GATB (ENSCATG00000034281) FBXW7 (ENSCATG00000040206) TMEM154 (ENSCATG00000034714) TIGD4 (ENSCATG00000023010) ARFIP1 (ENSCATG00000036832) ENSCATG00000025962 FHDC1 (ENSCATG00000041321) ENSCATG00000022750 ENSCATG00000040320 TRIM2 (ENSCATG00000040189) MND1 (ENSCATG00000041976) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b ##22 Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 269 ENSANAG00000025883 NR3C2 (ENSANAG00000021076) IQCM (ENSANAG00000036171) DCLK2 (ENSANAG00000037979) LRBA (ENSANAG00000036178) MAB21L2 (ENSANAG00000031618) ENSANAG00000026622 RPS3A (ENSANAG00000022955) ##22 SH3D19 (ENSANAG00000025505) ENSANAG00000020141 PRSS48 (ENSANAG00000023765) FHIP1A (ENSANAG00000031939) GATB (ENSANAG00000020953) Mas night monkey MODERN SPECIES 1074 SLC25A38 (ENSANAG00000032913) CX3CR1 (ENSANAG00000035425) XIRP1 (ENSANAG00000023033) CSRNP1 (ENSANAG00000031114) TTC21A (ENSANAG00000035657) GORASP1 (ENSANAG00000025911) WDR48 (ENSANAG00000001805) SCN11A (ENSANAG00000021625) SCN10A (ENSANAG00000031852) SCN5A (ENSANAG00000028084) EXOG (ENSANAG00000025128) ACVR2B (ENSANAG00000034446) XYLB (ENSANAG00000033524) ENSANAG00000031540 ENSANAG00000008213 ##22 SLC22A13 (ENSANAG00000029827) OXSR1 (ENSANAG00000021659) MYD88 (ENSANAG00000023716) ENSANAG00000021999 ACAA1 (ENSANAG00000023775) DLEC1 (ENSANAG00000026994) ENSANAG00000025014 PLCD1 (ENSANAG00000034450) VILL (ENSANAG00000023408) CTDSPL (ENSANAG00000029412) ITGA9 (ENSANAG00000031547) GOLGA4 (ENSANAG00000023104) LRRFIP2 (ENSANAG00000020666) ENSANAG00000028316 EPM2AIP1 (ENSANAG00000031695) Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 624 ZP2 (ENSANAG00000034351) ENSANAG00000022920 DNAH3 (ENSANAG00000035723) LYRM1 (ENSANAG00000019455) DCUN1D3 (ENSANAG00000022919) REXO5 (ENSANAG00000034379) ERI2 (ENSANAG00000035452) ACSM3 (ENSANAG00000032099) ENSANAG00000026882 ENSANAG00000022834 ACSM5 (ENSANAG00000032548) PDILT (ENSANAG00000037890) UMOD (ENSANAG00000028906) GP2 (ENSANAG00000035235) GPR139 (ENSANAG00000025906) ENSANAG00000003708 ##22 GPRC5B (ENSANAG00000030958) IQCK (ENSANAG00000035421) ENSANAG00000034483 VPS35L (ENSANAG00000028975) CCP110 (ENSANAG00000020487) GDE1 (ENSANAG00000033564) TMC5 (ENSANAG00000033685) CLEC19A (ENSANAG00000022307) ENSANAG00000025959 SYT17 (ENSANAG00000035664) ITPRIPL2 (ENSANAG00000007478) COQ7 (ENSANAG00000023469) TMC7 (ENSANAG00000035990) ENSANAG00000033039 SMG1 (ENSANAG00000035898) Mas night monkey MODERN SPECIES 273 TIMM9 (ENSANAG00000024267) TOMM20L (ENSANAG00000022063) ARID4A (ENSANAG00000037559) PSMA3 (ENSANAG00000034210) ACTR10 (ENSANAG00000036574) ARMH4 (ENSANAG00000028979) SLC35F4 (ENSANAG00000023234) ENSANAG00000036820 CCDC198 (ENSANAG00000022556) ENSANAG00000011004 NAA30 (ENSANAG00000025690) ENSANAG00000019497 AP5M1 (ENSANAG00000027663) EXOC5 (ENSANAG00000038073) OTX2 (ENSANAG00000032626) ENSANAG00000030036 ##22 TMEM260 (ENSANAG00000038375) ENSANAG00000016925 PELI2 (ENSANAG00000022899) KTN1 (ENSANAG00000031174) TBPL2 (ENSANAG00000023060) ATG14 (ENSANAG00000024345) DLGAP5 (ENSANAG00000035817) LGALS3 (ENSANAG00000020743) ENSANAG00000037823 SOCS4 (ENSANAG00000004973) WDHD1 (ENSANAG00000033347) GCH1 (ENSANAG00000026548) SAMD4A (ENSANAG00000036651) CGRRF1 (ENSANAG00000036449) GMFB (ENSANAG00000033336) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b ##22 Marmoset DUPLICATION Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 21 ANO2 (ENSCJAG00000000606) NTF3 (ENSCJAG00000000605) KCNA5 (ENSCJAG00000068399) KCNA1 (ENSCJAG00000068371) KCNA6 (ENSCJAG00000061475) ENSCJAG00000075610 ENSCJAG00000001647 ENSCJAG00000001628 FGF6 (ENSCJAG00000001613) FGF23 (ENSCJAG00000069632) TIGAR (ENSCJAG00000040111) CCND2 (ENSCJAG00000001593) ENSCJAG00000001586 ENSCJAG00000021822 PARP11 (ENSCJAG00000001570) ENSCJAG00000082222 ##22 CRACR2A (ENSCJAG00000018917) ENSCJAG00000063173 PRMT8 (ENSCJAG00000018891) ENSCJAG00000018882 TEAD4 (ENSCJAG00000018796) ENSCJAG00000085073 FOXM1 (ENSCJAG00000018781) RHNO1 (ENSCJAG00000018790) TEX52 (ENSCJAG00000018779) NRIP2 (ENSCJAG00000083523) ITFG2 (ENSCJAG00000018765) FKBP4 (ENSCJAG00000018746) ENSCJAG00000006744 ENSCJAG00000076932 ENSCJAG00000064493 Marmoset MODERN SPECIES 5 SLC9A2 (ENSCJAG00000008193) 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DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 73 SPATA5L1 (ENSSBOG00000022681) C15orf48 (ENSSBOG00000032988) SLC30A4 (ENSSBOG00000022298) BLOC1S6 (ENSSBOG00000030222) SQOR (ENSSBOG00000027259) SEMA6D (ENSSBOG00000028001) ENSSBOG00000022686 SLC24A5 (ENSSBOG00000023885) MYEF2 (ENSSBOG00000029634) CTXN2 (ENSSBOG00000013318) SLC12A1 (ENSSBOG00000022213) ENSSBOG00000034018 FBN1 (ENSSBOG00000024272) CEP152 (ENSSBOG00000031306) ENSSBOG00000036086 ENSSBOG00000011389 ##22 SHC4 (ENSSBOG00000011457) SECISBP2L (ENSSBOG00000024354) COPS2 (ENSSBOG00000024019) GALK2 (ENSSBOG00000025258) FGF7 (ENSSBOG00000029304) FAM227B (ENSSBOG00000021531) DTWD1 (ENSSBOG00000009376) ENSSBOG00000020229 ATP8B4 (ENSSBOG00000034767) ENSSBOG00000033334 SLC27A2 (ENSSBOG00000018319) HDC (ENSSBOG00000029959) GABPB1 (ENSSBOG00000023162) USP8 (ENSSBOG00000028249) USP50 (ENSSBOG00000023047) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 69 KDM4C (ENSSBOG00000025118) ENSSBOG00000031698 ENSSBOG00000030559 PTPRD 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ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000153169.A.b.b.a.a.a.b.l ENSGT00940000159336 ENSGT00550000074855 ENSGT00390000005270 ENSGT00940000155328.cb ENSGT00940000154910.b.b ENSGT00390000006367.d ENSGT00950000182922.a.a.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00390000018603 ENSGT00390000007975.a ENSGT00940000157523 ENSGT00950000182839.A.d ENSGT00950000182956.b.b.a.a.c.a.l.a ENSGT00950000183194.a.b ENSGT00940000158780 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00390000000221.A ENSGT00940000157223 ENSGT00940000155456 ENSGT00940000162521 ENSGT00940000154675 ENSGT00390000005097 ENSGT00940000154429.w.b ENSGT00530000063722.b ENSGT00530000063822.a.b ENSGT00390000003145 ENSGT00950000183011.c.a.b ENSGT00940000154380.b ENSGT00940000155385 ENSGT00950000183017.b.a ENSGT00940000157939 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153169.A.b.b.a.a.a.b.l ENSGT00940000159336 ENSGT00550000074855 ENSGT00390000005270 ENSGT00940000155328.cb ENSGT00940000154910.b.b ENSGT00390000006367.d ENSGT00950000182922.a.a.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00390000018603 ENSGT00390000007975.a ENSGT00940000157523 ENSGT00950000182839.A.d ENSGT00950000182956.b.b.a.a.c.a.l.a ENSGT00950000183194.a.b ENSGT00940000158780 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00390000000221.A ENSGT00940000157223 ENSGT00940000155456 ENSGT00940000162521 ENSGT00940000154675 ENSGT00390000005097 ENSGT00940000154429.w.b ENSGT00530000063722.b ENSGT00530000063822.a.b ENSGT00390000003145 ENSGT00950000183011.c.a.b ENSGT00940000154380.b ENSGT00940000155385 ENSGT00950000183017.b.a ENSGT00940000157939 Narwhal MODERN SPECIES 314 ENSMMNG00015021034 PDE3B (ENSMMNG00015020953) PSMA1 (ENSMMNG00015020868) COPB1 (ENSMMNG00015020824) ENSMMNG00015020802 SPON1 (ENSMMNG00015020782) FAR1 (ENSMMNG00015020761) ENSMMNG00015020752 PTH (ENSMMNG00015020742) BTBD10 (ENSMMNG00015020698) BMAL1 (ENSMMNG00015020613) RASSF10 (ENSMMNG00015020589) TEAD1 (ENSMMNG00015020545) PARVA (ENSMMNG00015020501) MICAL2 (ENSMMNG00015020388) ENSMMNG00015020342 ##22 DKK3 (ENSMMNG00015020327) USP47 (ENSMMNG00015020112) ENSMMNG00015020000 ENSMMNG00015019981 GALNT18 (ENSMMNG00015019950) ZBED5 (ENSMMNG00015019924) EIF4G2 (ENSMMNG00015019778) CTR9 (ENSMMNG00015019690) ENSMMNG00015019676 IRAG1 (ENSMMNG00015019550) LYVE1 (ENSMMNG00015019456) RNF141 (ENSMMNG00015019418) AMPD3 (ENSMMNG00015019282) ADM (ENSMMNG00015019215) SBF2 (ENSMMNG00015019075) Vaquita MODERN SPECIES 19 ENSPSNG00000005706 PDE3B (ENSPSNG00000005620) PSMA1 (ENSPSNG00000005548) COPB1 (ENSPSNG00000005475) ENSPSNG00000005427 SPON1 (ENSPSNG00000005398) FAR1 (ENSPSNG00000005352) ENSPSNG00000005319 PTH (ENSPSNG00000005298) BTBD10 (ENSPSNG00000005248) BMAL1 (ENSPSNG00000005165) RASSF10 (ENSPSNG00000005115) ENSPSNG00000005077 PARVA (ENSPSNG00000005015) MICAL2 (ENSPSNG00000004843) ENSPSNG00000004681 ##22 DKK3 (ENSPSNG00000004657) USP47 (ENSPSNG00000004502) ENSPSNG00000004358 GALNT18 (ENSPSNG00000004318) ZBED5 (ENSPSNG00000004281) EIF4G2 (ENSPSNG00000004235) CTR9 (ENSPSNG00000004180) ENSPSNG00000004144 IRAG1 (ENSPSNG00000004067) LYVE1 (ENSPSNG00000017631) RNF141 (ENSPSNG00000017558) AMPD3 (ENSPSNG00000017522) ADM (ENSPSNG00000017463) SBF2 (ENSPSNG00000017404) SWAP70 (ENSPSNG00000017297) Pecora ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Yarkand deer MODERN SPECIES 19 APCDD1 (ENSCHYG00000022475) ENSCHYG00000022539 VAPA (ENSCHYG00000022578) PPP4R1 (ENSCHYG00000022849) RALBP1 (ENSCHYG00000022911) TWSG1 (ENSCHYG00000022972) ANKRD12 (ENSCHYG00000023012) ENSCHYG00000023192 MTCL1 (ENSCHYG00000023220) RAB12 (ENSCHYG00000023329) PTPRM (ENSCHYG00000023397) LRRC30 (ENSCHYG00000024222) LAMA1 (ENSCHYG00000024245) ARHGAP28 (ENSCHYG00000024509) EPB41L3 (ENSCHYG00000024994) ENSCHYG00000025521 ##22 ZBTB14 (ENSCHYG00000025527) AKAIN1 (ENSCHYG00000025549) ENSCHYG00000025565 ENSCHYG00000025583 ENSCHYG00000025600 DLGAP1 (ENSCHYG00000025662) TGIF1 (ENSCHYG00000025940) MYL12B (ENSCHYG00000025995) ENSCHYG00000026009 MYOM1 (ENSCHYG00000014067) ENSCHYG00000014825 ENSCHYG00000014880 EMILIN2 (ENSCHYG00000015216) ##29 SMCHD1 (ENSCHYG00000015325) NDC80 (ENSCHYG00000016070) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Bovidae DUPLICATION Bovidae DUPLICATION Bovidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.jb.a ##22 ENSGT00390000018433.s.b.jb.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Bovinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978.w.a ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.jb.a ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Bos ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978.w.a ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.jb.a ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Bos_a ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978.x ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.jb.a ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Wild yak MODERN SPECIES 1411 DCLK2 (ENSBMUG00000020272) LRBA (ENSBMUG00000020346) MAB21L2 (ENSBMUG00000020365) RPS3A (ENSBMUG00000020374) ##22 SH3D19 (ENSBMUG00000020463) PRSS48 (ENSBMUG00000020508) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000154978.w.a ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b.kb ##22 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.jb.a ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 8 ENSBIXG00005008414 POU4F2 (ENSBIXG00005008406) TTC29 (ENSBIXG00005008379) EDNRA (ENSBIXG00005008325) TMEM184C (ENSBIXG00005008291) PRMT9 (ENSBIXG00005008281) ARHGAP10 (ENSBIXG00005008218) ENSBIXG00005008146 NR3C2 (ENSBIXG00005008106) ENSBIXG00005008005 ENSBIXG00005007998 IQCM (ENSBIXG00005029236) DCLK2 (ENSBIXG00005029213) LRBA (ENSBIXG00005001814) MAB21L2 (ENSBIXG00005005193) RPS3A (ENSBIXG00005005190) ##22 SH3D19 (ENSBIXG00005029087) ENSBIXG00005028995 PRSS48 (ENSBIXG00005028978) FHIP1A (ENSBIXG00005002163) GATB (ENSBIXG00005005051) FBXW7 (ENSBIXG00005002309) ENSBIXG00005002357 ENSBIXG00005028668 TIGD4 (ENSBIXG00005002381) ARFIP1 (ENSBIXG00005004937) ENSBIXG00005007791 FHDC1 (ENSBIXG00005028377) TRIM2 (ENSBIXG00005028287) TMEM131L (ENSBIXG00005028029) TLR2 (ENSBIXG00005027951) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.jb.a ##22 Goat MODERN SPECIES 9 ENSCHIG00000018879 ENSCHIG00000025874 TEX101 (ENSCHIG00000003537) CD177 (ENSCHIG00000018582) ENSCHIG00000023941 ENSCHIG00000021407 ENSCHIG00000012997 ENSCHIG00000015831 ENSCHIG00000006753 LYPD4 (ENSCHIG00000022395) DMRTC2 (ENSCHIG00000020158) ENSCHIG00000025321 CD79A (ENSCHIG00000013630) ARHGEF1 (ENSCHIG00000022244) ENSCHIG00000027270 ENSCHIG00000008355 ##22 RABAC1 (ENSCHIG00000023419) ATP1A3 (ENSCHIG00000020539) GRIK5 (ENSCHIG00000025382) ZNF574 (ENSCHIG00000009605) POU2F2 (ENSCHIG00000025522) DEDD2 (ENSCHIG00000020747) ZNF526 (ENSCHIG00000018756) GSK3A (ENSCHIG00000027180) ERF (ENSCHIG00000019624) CIC (ENSCHIG00000015534) PAFAH1B3 (ENSCHIG00000019643) ENSCHIG00000007871 PRR19 (ENSCHIG00000022284) TMEM145 (ENSCHIG00000003376) MEGF8 (ENSCHIG00000015019) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.jb.a ##22 ENSGT00390000018433.s.b.jb.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.jb.b ##22 American bison MODERN SPECIES 3069 TLN2 (ENSBBBG00000007650) VPS13C (ENSBBBG00000002901) RORA (ENSBBBG00000013770) ICE2 (ENSBBBG00000013793) ENSBBBG00000008447 FOXB1 (ENSBBBG00000002959) ENSBBBG00000013838 NR3C2 (ENSBBBG00000002997) IQCM (ENSBBBG00000003010) DCLK2 (ENSBBBG00000003070) MAB21L2 (ENSBBBG00000002892) LRBA (ENSBBBG00000003153) RPS3A (ENSBBBG00000003169) ##22 ENSBBBG00000003199 SH3D19 (ENSBBBG00000003232) FHIP1A (ENSBBBG00000014291) GATB (ENSBBBG00000014330) FBXW7 (ENSBBBG00000003325) TMEM154 (ENSBBBG00000014446) TIGD4 (ENSBBBG00000014451) ARFIP1 (ENSBBBG00000014497) FHDC1 (ENSBBBG00000014518) TRIM2 (ENSBBBG00000007493) MND1 (ENSBBBG00000014564) TMEM131L (ENSBBBG00000003574) TLR2 (ENSBBBG00000014757) RNF175 (ENSBBBG00000003583) SFRP2 (ENSBBBG00000014774) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978.y.b ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.jb.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000164895 Goat MODERN SPECIES 8 ZNF827 (ENSCHIG00000023405) ENSCHIG00000010334 SLC10A7 (ENSCHIG00000008543) POU4F2 (ENSCHIG00000012332) TTC29 (ENSCHIG00000025715) EDNRA (ENSCHIG00000019737) ENSCHIG00000008113 PRMT9 (ENSCHIG00000011275) ARHGAP10 (ENSCHIG00000002829) ENSCHIG00000021047 ENSCHIG00000024151 IQCM (ENSCHIG00000023127) DCLK2 (ENSCHIG00000010393) LRBA (ENSCHIG00000020734) MAB21L2 (ENSCHIG00000007330) ENSCHIG00000016445 ##22 SH3D19 (ENSCHIG00000011594) FHIP1A (ENSCHIG00000011836) GATB (ENSCHIG00000020111) FBXW7 (ENSCHIG00000024373) TMEM154 (ENSCHIG00000026757) TIGD4 (ENSCHIG00000022621) ARFIP1 (ENSCHIG00000015084) FHDC1 (ENSCHIG00000011413) TRIM2 (ENSCHIG00000020210) MND1 (ENSCHIG00000016830) TMEM131L (ENSCHIG00000020096) TLR2 (ENSCHIG00000025899) RNF175 (ENSCHIG00000021987) SFRP2 (ENSCHIG00000022955) PLRG1 (ENSCHIG00000014074) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.kb ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.kb ##22 Goat MODERN SPECIES 23 FEZF1 (ENSCHIG00000012204) CADPS2 (ENSCHIG00000022820) SLC13A1 (ENSCHIG00000014530) IQUB (ENSCHIG00000021401) NDUFA5 (ENSCHIG00000014906) ASB15 (ENSCHIG00000018758) LMOD2 (ENSCHIG00000023924) WASL (ENSCHIG00000016281) HYAL4 (ENSCHIG00000003866) ENSCHIG00000020009 ENSCHIG00000020486 ENSCHIG00000015094 TMEM229A (ENSCHIG00000011201) GPR37 (ENSCHIG00000020618) POT1 (ENSCHIG00000014866) ENSCHIG00000011972 ##22 ENSCHIG00000021887 ENSCHIG00000009077 ZNF800 (ENSCHIG00000018562) GCC1 (ENSCHIG00000013724) ARF5 (ENSCHIG00000018906) FSCN3 (ENSCHIG00000011966) PAX4 (ENSCHIG00000014419) LRRC4 (ENSCHIG00000006081) SND1 (ENSCHIG00000023390) LEP (ENSCHIG00000019616) RBM28 (ENSCHIG00000014146) PRRT4 (ENSCHIG00000019622) ENSCHIG00000017791 IMPDH1 (ENSCHIG00000017941) HILPDA (ENSCHIG00000009991) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.kb ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.kb ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978.w.a ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b.kb ##22 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b.jb.a ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 Cow MODERN SPECIES 8 ZNF827 (ENSBTAG00000012738) LSM6 (ENSBTAG00000014060) REELD1 (ENSBTAG00000054105) SLC10A7 (ENSBTAG00000034522) POU4F2 (ENSBTAG00000005648) TTC29 (ENSBTAG00000004167) ENSBTAG00000049121 EDNRA (ENSBTAG00000013674) TMEM184C (ENSBTAG00000010376) PRMT9 (ENSBTAG00000010381) ARHGAP10 (ENSBTAG00000002531) NR3C2 (ENSBTAG00000027182) DCLK2 (ENSBTAG00000008098) MAB21L2 (ENSBTAG00000047924) LRBA (ENSBTAG00000018546) RPS3A (ENSBTAG00000009908) ##22 PRSS48 (ENSBTAG00000004633) SH3D19 (ENSBTAG00000016813) FHIP1A (ENSBTAG00000025263) GATB (ENSBTAG00000013914) FBXW7 (ENSBTAG00000007953) ENSBTAG00000048983 ARFIP1 (ENSBTAG00000008438) FHDC1 (ENSBTAG00000043963) TRIM2 (ENSBTAG00000008816) MND1 (ENSBTAG00000000281) TMEM131L (ENSBTAG00000016625) TLR2 (ENSBTAG00000008008) RNF175 (ENSBTAG00000019426) SFRP2 (ENSBTAG00000018563) DCHS2 (ENSBTAG00000024545) Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.b.kb ##22 Domestic yak DUPLICATION Domestic yak MODERN SPECIES 69 ENSBGRG00000010944 IL1RAPL1 (ENSBGRG00000011049) ENSBGRG00000011327 ENSBGRG00000011440 PPP4R3C (ENSBGRG00000011595) ENSBGRG00000011648 MAGEB18 (ENSBGRG00000011730) ENSBGRG00000011753 ENSBGRG00000011790 ARX (ENSBGRG00000011822) POLA1 (ENSBGRG00000011903) ENSBGRG00000012409 PCYT1B (ENSBGRG00000012447) PDK3 (ENSBGRG00000012643) ENSBGRG00000013003 ENSBGRG00000013035 ##22 ENSBGRG00000013049 ENSBGRG00000013098 ENSBGRG00000013130 ENSBGRG00000013264 EIF2S3B (ENSBGRG00000013285) KLHL15 (ENSBGRG00000007139) CXorf58 (ENSBGRG00000007185) APOO (ENSBGRG00000007291) SAT1 (ENSBGRG00000007508) ACOT9 (ENSBGRG00000007829) PRDX4 (ENSBGRG00000008322) PTCHD1 (ENSBGRG00000008455) ENSBGRG00000008530 ENSBGRG00000008641 PHEX (ENSBGRG00000008681) Domestic yak MODERN SPECIES 7 POU4F2 (ENSBGRG00000008809) TTC29 (ENSBGRG00000008877) ENSBGRG00000009257 EDNRA (ENSBGRG00000009303) ENSBGRG00000009466 TMEM184C (ENSBGRG00000010666) PRMT9 (ENSBGRG00000010736) ENSBGRG00000010968 ARHGAP10 (ENSBGRG00000011004) NR3C2 (ENSBGRG00000011166) IQCM (ENSBGRG00000011758) DCLK2 (ENSBGRG00000011859) LRBA (ENSBGRG00000012411) ENSBGRG00000012712 MAB21L2 (ENSBGRG00000012737) ENSBGRG00000012777 ##22 ENSBGRG00000012970 SH3D19 (ENSBGRG00000013051) ENSBGRG00000014152 PRSS48 (ENSBGRG00000014226) FHIP1A (ENSBGRG00000014393) GATB (ENSBGRG00000014535) FBXW7 (ENSBGRG00000015456) TMEM154 (ENSBGRG00000015831) TIGD4 (ENSBGRG00000015927) ARFIP1 (ENSBGRG00000015983) FHDC1 (ENSBGRG00000016413) TRIM2 (ENSBGRG00000016560) MND1 (ENSBGRG00000016798) TMEM131L (ENSBGRG00000017247) TLR2 (ENSBGRG00000017549) Suina ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000162999 Pig MODERN SPECIES 16 ENSSSCG00000062405 TTC29 (ENSSSCG00000040272) EDNRA (ENSSSCG00000009031) TMEM184C (ENSSSCG00000030044) PRMT9 (ENSSSCG00000009030) ARHGAP10 (ENSSSCG00000009029) ENSSSCG00000043522 NR3C2 (ENSSSCG00000037766) ENSSSCG00000040704 IQCM (ENSSSCG00000035623) DCLK2 (ENSSSCG00000009023) MAB21L2 (ENSSSCG00000052676) ENSSSCG00000058219 LRBA (ENSSSCG00000009021) ENSSSCG00000048819 RPS3A (ENSSSCG00000009019) ##22 PRSS48 (ENSSSCG00000009017) SH3D19 (ENSSSCG00000009018) ENSSSCG00000057111 ENSSSCG00000053923 FHIP1A (ENSSSCG00000020717) ENSSSCG00000009015 ENSSSCG00000054992 ENSSSCG00000056838 FBXW7 (ENSSSCG00000020879) TMEM154 (ENSSSCG00000009012) TIGD4 (ENSSSCG00000038186) ARFIP1 (ENSSSCG00000009010) FHDC1 (ENSSSCG00000009011) TRIM2 (ENSSSCG00000029200) MND1 (ENSSSCG00000009009) Chacoan peccary MODERN SPECIES 120 C4orf51 (ENSCWAG00000010248) ZNF827 (ENSCWAG00000010322) LSM6 (ENSCWAG00000010564) REELD1 (ENSCWAG00000010608) SLC10A7 (ENSCWAG00000010694) POU4F2 (ENSCWAG00000011402) TTC29 (ENSCWAG00000011446) EDNRA (ENSCWAG00000011919) TMEM184C (ENSCWAG00000012073) PRMT9 (ENSCWAG00000012146) ARHGAP10 (ENSCWAG00000012206) NR3C2 (ENSCWAG00000012270) DCLK2 (ENSCWAG00000012779) LRBA (ENSCWAG00000013328) MAB21L2 (ENSCWAG00000013479) RPS3A (ENSCWAG00000013495) ##22 SH3D19 (ENSCWAG00000013644) PRSS48 (ENSCWAG00000014066) FHIP1A (ENSCWAG00000014155) GATB (ENSCWAG00000014317) FBXW7 (ENSCWAG00000014450) TMEM154 (ENSCWAG00000014757) TIGD4 (ENSCWAG00000014819) ARFIP1 (ENSCWAG00000014843) FHDC1 (ENSCWAG00000014936) TRIM2 (ENSCWAG00000015057) MND1 (ENSCWAG00000015242) TMEM131L (ENSCWAG00000015375) TLR2 (ENSCWAG00000015442) SFRP2 (ENSCWAG00000015456) DCHS2 (ENSCWAG00000015498) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Equus ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Horse MODERN SPECIES 11 C4orf51 (ENSECAG00000034055) ZNF827 (ENSECAG00000021655) REELD1 (ENSECAG00000033467) SLC10A7 (ENSECAG00000026901) POU4F2 (ENSECAG00000020754) TTC29 (ENSECAG00000020287) EDNRA (ENSECAG00000019798) TMEM184C (ENSECAG00000019574) PRMT9 (ENSECAG00000018097) ARHGAP10 (ENSECAG00000016629) NR3C2 (ENSECAG00000016605) IQCM (ENSECAG00000033875) DCLK2 (ENSECAG00000014313) MAB21L2 (ENSECAG00000005046) LRBA (ENSECAG00000010768) RPS3A (ENSECAG00000009573) ##22 ENSECAG00000035042 PRSS48 (ENSECAG00000007494) SH3D19 (ENSECAG00000007542) FHIP1A (ENSECAG00000007395) GATB (ENSECAG00000003539) FBXW7 (ENSECAG00000022582) TMEM154 (ENSECAG00000022568) TIGD4 (ENSECAG00000004395) ARFIP1 (ENSECAG00000022286) FHDC1 (ENSECAG00000021646) TRIM2 (ENSECAG00000020605) MND1 (ENSECAG00000020362) TMEM131L (ENSECAG00000018035) ENSECAG00000033827 TLR2 (ENSECAG00000018028) Donkey MODERN SPECIES 22 ZNF827 (ENSEASG00005001543) LSM6 (ENSEASG00005001533) REELD1 (ENSEASG00005001529) SLC10A7 (ENSEASG00005001510) POU4F2 (ENSEASG00005001506) TTC29 (ENSEASG00005001491) EDNRA (ENSEASG00005001483) TMEM184C (ENSEASG00005001471) PRMT9 (ENSEASG00005001405) ARHGAP10 (ENSEASG00005001168) NR3C2 (ENSEASG00005000984) IQCM (ENSEASG00005028644) DCLK2 (ENSEASG00005000953) MAB21L2 (ENSEASG00005036829) LRBA (ENSEASG00005000458) ENSEASG00005000256 ##22 ENSEASG00005029135 SH3D19 (ENSEASG00005000236) FHIP1A (ENSEASG00005000086) GATB (ENSEASG00005015868) FBXW7 (ENSEASG00005015861) ENSEASG00005026801 TMEM154 (ENSEASG00005015856) TIGD4 (ENSEASG00005015855) ARFIP1 (ENSEASG00005015853) FHDC1 (ENSEASG00005015851) TRIM2 (ENSEASG00005015849) MND1 (ENSEASG00005015846) TMEM131L (ENSEASG00005015844) TLR2 (ENSEASG00005015843) RNF175 (ENSEASG00005015842) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 9 ZNF827 (ENSRFEG00010014952) LSM6 (ENSRFEG00010015332) SLC10A7 (ENSRFEG00010015418) POU4F2 (ENSRFEG00010015642) TTC29 (ENSRFEG00010015692) EDNRA (ENSRFEG00010016295) TMEM184C (ENSRFEG00010016470) PRMT9 (ENSRFEG00010016544) ARHGAP10 (ENSRFEG00010016589) NR3C2 (ENSRFEG00010016644) IQCM (ENSRFEG00010005407) ENSRFEG00010005448 DCLK2 (ENSRFEG00010005563) LRBA (ENSRFEG00010005750) MAB21L2 (ENSRFEG00010005946) RPS3A (ENSRFEG00010005967) ##22 SH3D19 (ENSRFEG00010006184) PRSS48 (ENSRFEG00010006450) FHIP1A (ENSRFEG00010006614) GATB (ENSRFEG00010006680) ENSRFEG00010006737 FBXW7 (ENSRFEG00010006812) TMEM154 (ENSRFEG00010007089) TIGD4 (ENSRFEG00010007111) ENSRFEG00010007138 FHDC1 (ENSRFEG00010007242) TRIM2 (ENSRFEG00010007313) MND1 (ENSRFEG00010007455) TMEM131L (ENSRFEG00010007681) RNF175 (ENSRFEG00010007818) SFRP2 (ENSRFEG00010007919) Microbat MODERN SPECIES 938 ZNF827 (ENSMLUG00000008100) LSM6 (ENSMLUG00000026355) ENSMLUG00000022646 ENSMLUG00000015165 POU4F2 (ENSMLUG00000015174) TTC29 (ENSMLUG00000015176) EDNRA (ENSMLUG00000002880) TMEM184C (ENSMLUG00000014055) PRMT9 (ENSMLUG00000014060) ARHGAP10 (ENSMLUG00000008067) NR3C2 (ENSMLUG00000008108) DCLK2 (ENSMLUG00000016144) ENSMLUG00000016161 MAB21L2 (ENSMLUG00000016197) ENSMLUG00000024397 RPS3A (ENSMLUG00000014788) ##22 SH3D19 (ENSMLUG00000001478) PRSS48 (ENSMLUG00000002370) FHIP1A (ENSMLUG00000008164) GATB (ENSMLUG00000008194) ENSMLUG00000027201 FBXW7 (ENSMLUG00000014672) TIGD4 (ENSMLUG00000028008) ARFIP1 (ENSMLUG00000002725) FHDC1 (ENSMLUG00000002735) TRIM2 (ENSMLUG00000002195) MND1 (ENSMLUG00000002215) TMEM131L (ENSMLUG00000010411) TLR2 (ENSMLUG00000012813) RNF175 (ENSMLUG00000012819) ENSMLUG00000030163 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Felidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00950000182802.B.a.a.b.c ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182980.a.a.p ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Cat MODERN SPECIES 235 REELD1 (ENSFCAG00000046759) ENSFCAG00000028577 SLC10A7 (ENSFCAG00000003048) POU4F2 (ENSFCAG00000003049) TTC29 (ENSFCAG00000012370) EDNRA (ENSFCAG00000045372) TMEM184C (ENSFCAG00000015410) PRMT9 (ENSFCAG00000008695) ARHGAP10 (ENSFCAG00000001820) NR3C2 (ENSFCAG00000027453) IQCM (ENSFCAG00000022342) DCLK2 (ENSFCAG00000009915) MAB21L2 (ENSFCAG00000025743) LRBA (ENSFCAG00000025294) ENSFCAG00000024391 RPS3A (ENSFCAG00000031288) ##22 ENSFCAG00000050463 SH3D19 (ENSFCAG00000011212) ENSFCAG00000039669 FHIP1A (ENSFCAG00000025713) GATB (ENSFCAG00000003207) FBXW7 (ENSFCAG00000000620) TMEM154 (ENSFCAG00000035945) TIGD4 (ENSFCAG00000028877) ENSFCAG00000002796 ARFIP1 (ENSFCAG00000026832) FHDC1 (ENSFCAG00000046337) TRIM2 (ENSFCAG00000031235) MND1 (ENSFCAG00000022084) TMEM131L (ENSFCAG00000003011) TLR2 (ENSFCAG00000029293) Panthera ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00950000182802.B.a.a.b.c ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182980.a.a.p ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Tiger MODERN SPECIES 197 IQCM (ENSPTIG00000020620) DCLK2 (ENSPTIG00000021475) LRBA (ENSPTIG00000006996) MAB21L2 (ENSPTIG00000005332) ENSPTIG00000015637 RPS3A (ENSPTIG00000015777) ##22 SH3D19 (ENSPTIG00000016330) ENSPTIG00000020404 FHIP1A (ENSPTIG00000020718) GATB (ENSPTIG00000021433) FBXW7 (ENSPTIG00000007915) TMEM154 (ENSPTIG00000011311) TIGD4 (ENSPTIG00000005744) ARFIP1 (ENSPTIG00000013262) FHDC1 (ENSPTIG00000017129) TRIM2 (ENSPTIG00000019257) MND1 (ENSPTIG00000020282) TMEM131L (ENSPTIG00000021150) TLR2 (ENSPTIG00000005924) RNF175 (ENSPTIG00000006866) SFRP2 (ENSPTIG00000007692) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00950000182802.B.a.a.b.c ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182980.a.a.p ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b leopard MODERN SPECIES 6 ENSPPRG00000023608 NR3C2 (ENSPPRG00000000130) ENSPPRG00000000395 #22 IQCM (ENSPPRG00000001385) DCLK2 (ENSPPRG00000003879) MAB21L2 (ENSPPRG00000017133) ENSPPRG00000004503 LRBA (ENSPPRG00000012725) ENSPPRG00000013249 RPS3A (ENSPPRG00000013732) ##22 SH3D19 (ENSPPRG00000001261) ENSPPRG00000017765 FHIP1A (ENSPPRG00000002729) GATB (ENSPPRG00000004993) FBXW7 (ENSPPRG00000006952) TMEM154 (ENSPPRG00000009481) TIGD4 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ENSGT00940000163644.g.b ENSGT00940000163644.g.a.b ENSGT00390000010711.j ENSGT00390000001958.f ENSGT00510000049125 ENSGT00550000075071 ENSGT00390000002628 ENSGT00940000156278 ENSGT00390000009825 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00390000015916 ENSGT00940000158623.p ENSGT00940000158623.o ENSGT00940000163447 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000162598 ENSGT00950000183213.a.a.b ENSGT01090000260046.e.b.b.a.b.a.a.a.b.b.a.a.b ENSGT00530000063694.a ENSGT00940000160198 ENSGT00390000006233.c.a.a ENSGT00940000161859 ENSGT00940000156947 ENSGT00390000017359 ENSGT00940000160060 Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 6 SLC10A7 (ENSCAFG00845012862) POU4F2 (ENSCAFG00845013080) TTC29 (ENSCAFG00845013144) EDNRA (ENSCAFG00845013340) TMEM184C (ENSCAFG00845013383) PRMT9 (ENSCAFG00845013422) ARHGAP10 (ENSCAFG00845013505) NR3C2 (ENSCAFG00845013694) IQCM (ENSCAFG00845013775) ENSCAFG00845013810 DCLK2 (ENSCAFG00845013901) LRBA (ENSCAFG00845014163) ENSCAFG00845014213 MAB21L2 (ENSCAFG00845005729) ENSCAFG00845005741 RPS3A (ENSCAFG00845005765) ##22 SH3D19 (ENSCAFG00845005957) PRSS48 (ENSCAFG00845006205) ENSCAFG00845006404 FAM160A1 (ENSCAFG00845006461) ATP5J2 (ENSCAFG00845006554) GATB (ENSCAFG00845006707) ENSCAFG00845006957 FBXW7 (ENSCAFG00845007020) ENSCAFG00845007288 TMEM154 (ENSCAFG00845007673) TIGD4 (ENSCAFG00845007856) ARFIP1 (ENSCAFG00845007940) ENSCAFG00845008099 FHDC1 (ENSCAFG00845008193) TRIM2 (ENSCAFG00845008493) Dog MODERN SPECIES 22 WDR19 (ENSCAFG00845004729) KLHL5 (ENSCAFG00845004801) TMEM156 (ENSCAFG00845004925) FAM114A1 (ENSCAFG00845004930) TLR1 (ENSCAFG00845004950) KLF3 (ENSCAFG00845004980) TBC1D1 (ENSCAFG00845005015) ENSCAFG00845005098 PGM2 (ENSCAFG00845005108) RELL1 (ENSCAFG00845005126) ENSCAFG00845005184 NWD2 (ENSCAFG00845005206) ENSCAFG00845005226 DTHD1 (ENSCAFG00845005244) ARAP2 (ENSCAFG00845005336) ENSCAFG00845005487 ##22 PCDH7 (ENSCAFG00845005515) ENSCAFG00845005559 ENSCAFG00845005572 ENSCAFG00845005634 STIM2 (ENSCAFG00845005670) TBC1D19 (ENSCAFG00845005743) CAR1 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ENSCAFG00020010985 BMP2K (ENSCAFG00020010964) Dingo MODERN SPECIES 172 LRIF1 (ENSCAFG00020009548) DRAM2 (ENSCAFG00020009546) CEPT1 (ENSCAFG00020009537) DENND2D (ENSCAFG00020009529) CHIA (ENSCAFG00020009486) ENSCAFG00020009479 ENSCAFG00020009467 ENSCAFG00020009433 ENSCAFG00020009413 ATP5PB (ENSCAFG00020009409) ENSCAFG00020009357 POLR3K (ENSCAFG00020009353) SNRNP25 (ENSCAFG00020009344) RHBDF1 (ENSCAFG00020009330) MPG (ENSCAFG00020009328) ENSCAFG00020009323 ##22 NPRL3 (ENSCAFG00020009316) ENSCAFG00020009312 ENSCAFG00020009310 HBM (ENSCAFG00020009308) ENSCAFG00020009307 ENSCAFG00020009306 HBQ1 (ENSCAFG00020009300) LUC7L (ENSCAFG00020009297) ENSCAFG00020009273 FAM234A (ENSCAFG00020009271) ENSCAFG00020009264 ARHGDIG (ENSCAFG00020009256) PDIA2 (ENSCAFG00020009242) AXIN1 (ENSCAFG00020009229) MRPL28 (ENSCAFG00020009225) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 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ENSMPUG00000019992 RPS3A (ENSMPUG00000007139) ##22 ENSMPUG00000019994 SH3D19 (ENSMPUG00000007143) ENSMPUG00000007291 PRSS48 (ENSMPUG00000007310) FHIP1A (ENSMPUG00000007380) GATB (ENSMPUG00000007394) FBXW7 (ENSMPUG00000007404) ENSMPUG00000007417 TMEM154 (ENSMPUG00000007425) TIGD4 (ENSMPUG00000019997) ARFIP1 (ENSMPUG00000007441) FHDC1 (ENSMPUG00000007505) TRIM2 (ENSMPUG00000007517) MFAP3L (ENSMPUG00000007527) ENSMPUG00000007531 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559.y.b ENSGT00940000159333 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Giant Panda MODERN SPECIES 15 C4orf51 (ENSAMEG00000024155) ZNF827 (ENSAMEG00000016667) LSM6 (ENSAMEG00000016671) REELD1 (ENSAMEG00000028424) SLC10A7 (ENSAMEG00000016674) POU4F2 (ENSAMEG00000016679) TTC29 (ENSAMEG00000016681) EDNRA (ENSAMEG00000002011) TMEM184C (ENSAMEG00000002013) PRMT9 (ENSAMEG00000002035) ARHGAP10 (ENSAMEG00000002057) NR3C2 (ENSAMEG00000002068) DCLK2 (ENSAMEG00000009231) MAB21L2 (ENSAMEG00000030266) LRBA (ENSAMEG00000018421) RPS3A (ENSAMEG00000018425) ##22 PRSS48 (ENSAMEG00000018430) SH3D19 (ENSAMEG00000018427) FHIP1A (ENSAMEG00000018431) GATB (ENSAMEG00000018434) ENSAMEG00000025136 FBXW7 (ENSAMEG00000018436) ENSAMEG00000029248 TIGD4 (ENSAMEG00000019149) ARFIP1 (ENSAMEG00000023903) FHDC1 (ENSAMEG00000023933) TRIM2 (ENSAMEG00000018443) MND1 (ENSAMEG00000018446) TMEM131L (ENSAMEG00000018447) TLR2 (ENSAMEG00000018451) RNF175 (ENSAMEG00000018453) Ursus ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559.y.b ENSGT00940000159333 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a American black bear MODERN SPECIES 7979 RPS3A (ENSUAMG00000007965) ##22 Polar bear MODERN SPECIES 122 SMAD1 (ENSUMAG00000015575) MMAA (ENSUMAG00000015592) ZNF827 (ENSUMAG00000015618) LSM6 (ENSUMAG00000015727) REELD1 (ENSUMAG00000015729) SLC10A7 (ENSUMAG00000015740) TTC29 (ENSUMAG00000015756) EDNRA (ENSUMAG00000015775) TMEM184C (ENSUMAG00000015782) PRMT9 (ENSUMAG00000015791) ARHGAP10 (ENSUMAG00000015810) NR3C2 (ENSUMAG00000015845) DCLK2 (ENSUMAG00000015931) LRBA (ENSUMAG00000015985) MAB21L2 (ENSUMAG00000016054) RPS3A (ENSUMAG00000016064) ##22 SH3D19 (ENSUMAG00000016073) ENSUMAG00000016093 PRSS48 (ENSUMAG00000016100) ENSUMAG00000016113 FHIP1A (ENSUMAG00000016125) GATB (ENSUMAG00000016157) FBXW7 (ENSUMAG00000016196) ENSUMAG00000016214 TIGD4 (ENSUMAG00000016226) ARFIP1 (ENSUMAG00000016232) FHDC1 (ENSUMAG00000016238) TRIM2 (ENSUMAG00000016262) MND1 (ENSUMAG00000016272) TMEM131L (ENSUMAG00000016274) TLR2 (ENSUMAG00000016289) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 9036 POLG (ENSETEG00000012332) ENSETEG00000012331 ##22 FANCI (ENSETEG00000012325) RLBP1 (ENSETEG00000012324) ENSETEG00000012322 ABHD2 (ENSETEG00000012320) Tenrec MODERN SPECIES 15920 ZNF112 (ENSETEG00000003213) ENSETEG00000003211 ##22 ENSETEG00000003206 ENSETEG00000003203 ENSETEG00000003195 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Elephant DUPLICATION Elephant MODERN SPECIES 1 RFX6 (ENSLAFG00000003465) GPRC6A (ENSLAFG00000003462) FAM162B (ENSLAFG00000003827) KPNA5 (ENSLAFG00000003824) ZUP1 (ENSLAFG00000017345) RSPH4A (ENSLAFG00000003514) ENSLAFG00000028750 ENSLAFG00000026707 ENSLAFG00000008170 CALHM4 (ENSLAFG00000027569) TRAPPC3L (ENSLAFG00000008487) CALHM5 (ENSLAFG00000008490) ENSLAFG00000017416 ENSLAFG00000012702 DSE (ENSLAFG00000009134) ENSLAFG00000027418 ##22 TSPYL4 (ENSLAFG00000010254) COL10A1 (ENSLAFG00000022123) FRK (ENSLAFG00000005589) HS3ST5 (ENSLAFG00000010686) HDAC2 (ENSLAFG00000005566) RFPL4B (ENSLAFG00000021578) ENSLAFG00000029012 LAMA4 (ENSLAFG00000004076) FAM229B (ENSLAFG00000030627) TUBE1 (ENSLAFG00000004073) CCN6 (ENSLAFG00000004071) FYN (ENSLAFG00000002604) TRAF3IP2 (ENSLAFG00000004974) REV3L (ENSLAFG00000005929) ENSLAFG00000015255 Elephant MODERN SPECIES 436 ZNF827 (ENSLAFG00000029831) LSM6 (ENSLAFG00000001952) SLC10A7 (ENSLAFG00000000502) POU4F2 (ENSLAFG00000001505) TTC29 (ENSLAFG00000007613) ENSLAFG00000026497 EDNRA (ENSLAFG00000008408) TMEM184C (ENSLAFG00000030924) PRMT9 (ENSLAFG00000010140) ARHGAP10 (ENSLAFG00000002896) NR3C2 (ENSLAFG00000022550) ENSLAFG00000006909 DCLK2 (ENSLAFG00000014123) MAB21L2 (ENSLAFG00000014147) LRBA (ENSLAFG00000014125) ENSLAFG00000017660 ##22 SH3D19 (ENSLAFG00000017374) PRSS48 (ENSLAFG00000006167) ENSLAFG00000027939 GATB (ENSLAFG00000022607) FBXW7 (ENSLAFG00000016940) TMEM154 (ENSLAFG00000000854) TIGD4 (ENSLAFG00000028471) ARFIP1 (ENSLAFG00000006802) FHDC1 (ENSLAFG00000026101) TRIM2 (ENSLAFG00000018230) MND1 (ENSLAFG00000018238) TMEM131L (ENSLAFG00000005057) TLR2 (ENSLAFG00000005069) RNF175 (ENSLAFG00000005074) SFRP2 (ENSLAFG00000028981) Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 348 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00390000018433.s.a.a #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2701 DCLK2 (ENSDNOG00000008298) MAB21L2 (ENSDNOG00000039997) LRBA (ENSDNOG00000008322) ENSDNOG00000003380 ##22 ENSDNOG00000017179 SH3D19 (ENSDNOG00000019582) ENSDNOG00000045337 FHIP1A (ENSDNOG00000034950) GATB (ENSDNOG00000012683) FBXW7 (ENSDNOG00000049649) TMEM154 (ENSDNOG00000030901) TIGD4 (ENSDNOG00000006525) Armadillo MODERN SPECIES 3684 ENSDNOG00000038540 ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Armadillo MODERN SPECIES 4066 SOX5 (ENSDNOG00000019346) BCAT1 (ENSDNOG00000005608) ENSDNOG00000032383 DNAI7 (ENSDNOG00000000445) ETFRF1 (ENSDNOG00000018534) KRAS (ENSDNOG00000046741) ENSDNOG00000044438 ##22 RASSF8 (ENSDNOG00000048366) SSPN (ENSDNOG00000045508) ITPR2 (ENSDNOG00000005229) INTS13 (ENSDNOG00000012051) FGFR1OP2 (ENSDNOG00000006966) TM7SF3 (ENSDNOG00000010018) MED21 (ENSDNOG00000010041) ENSDNOG00000025573 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Pig MODERN SPECIES 2 CLN5 (ENSSSCG00000031288) ACOD1 (ENSSSCG00000009469) KCTD12 (ENSSSCG00000059342) ENSSSCG00000045335 ENSSSCG00000055141 LMO7 (ENSSSCG00000040184) UCHL3 (ENSSSCG00000009466) TBC1D4 (ENSSSCG00000009464) ENSSSCG00000049910 KLF12 (ENSSSCG00000025130) KLF5 (ENSSSCG00000035101) PIBF1 (ENSSSCG00000024722) DIS3 (ENSSSCG00000009460) BORA (ENSSSCG00000025120) MZT1 (ENSSSCG00000040073) ENSSSCG00000009458 ##22 DACH1 (ENSSSCG00000009457) ENSSSCG00000053888 KLHL1 (ENSSSCG00000009456) ENSSSCG00000051740 ENSSSCG00000044557 ENSSSCG00000043805 ENSSSCG00000059524 PCDH9 (ENSSSCG00000038842) PCDH20 (ENSSSCG00000031955) TDRD3 (ENSSSCG00000009449) DIAPH3 (ENSSSCG00000009448) PCDH17 (ENSSSCG00000009446) ENSSSCG00000035135 OLFM4 (ENSSSCG00000009444) PCDH8 (ENSSSCG00000009445) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Sperm whale DUPLICATION Sperm whale MODERN SPECIES 16 TMEM196 (ENSPCTG00005001717) ITGB8 (ENSPCTG00005001751) ENSPCTG00005001784 SP8 (ENSPCTG00005001801) SP4 (ENSPCTG00005001812) ENSPCTG00005001827 DNAH11 (ENSPCTG00005002062) CDCA7L (ENSPCTG00005002828) RAPGEF5 (ENSPCTG00005002875) IL6 (ENSPCTG00005003017) ENSPCTG00005003031 FAM126A (ENSPCTG00005003061) KLHL7 (ENSPCTG00005003098) NUPL2 (ENSPCTG00005003130) GPNMB (ENSPCTG00005003153) ENSPCTG00005003167 ##22 MALSU1 (ENSPCTG00005003177) IGF2BP3 (ENSPCTG00005003193) TRA2A (ENSPCTG00005003229) ENSPCTG00005003240 ENSPCTG00005003253 CCDC126 (ENSPCTG00005003268) DBF4 (ENSPCTG00005003288) SLC25A40 (ENSPCTG00005003323) RUNDC3B (ENSPCTG00005003383) ENSPCTG00005003512 ABCB1 (ENSPCTG00005003552) ABCB4 (ENSPCTG00005003687) CROT (ENSPCTG00005003742) TMEM243 (ENSPCTG00005003771) DMTF1 (ENSPCTG00005003809) Sperm whale MODERN SPECIES 7 ENSPCTG00005012726 ENSPCTG00005012691 PDE3B (ENSPCTG00005012346) PSMA1 (ENSPCTG00005012167) COPB1 (ENSPCTG00005012104) RRAS2 (ENSPCTG00005012007) SPON1 (ENSPCTG00005011836) FAR1 (ENSPCTG00005011756) PTH (ENSPCTG00005011723) BTBD10 (ENSPCTG00005011536) ARNTL (ENSPCTG00005011154) RASSF10 (ENSPCTG00005011126) ENSPCTG00005011111 PARVA (ENSPCTG00005010894) MICAL2 (ENSPCTG00005010521) ENSPCTG00005010379 ##22 ENSPCTG00005010334 DKK3 (ENSPCTG00005010287) USP47 (ENSPCTG00005009618) ENSPCTG00005009485 GALNT18 (ENSPCTG00005009456) ZBED5 (ENSPCTG00005009433) ENSPCTG00005009350 CTR9 (ENSPCTG00005009276) ENSPCTG00005009229 MRVI1 (ENSPCTG00005008830) LYVE1 (ENSPCTG00005008713) RNF141 (ENSPCTG00005008671) ADM (ENSPCTG00005008638) SBF2 (ENSPCTG00005008269) SWAP70 (ENSPCTG00005008145) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 American bison MODERN SPECIES 3130 CD27 (ENSBBBG00000009087) ENSBBBG00000002403 VAMP1 (ENSBBBG00000012550) MRPL51 (ENSBBBG00000012567) NCAPD2 (ENSBBBG00000012598) GAPDH (ENSBBBG00000012745) IFFO1 (ENSBBBG00000002480) NOP2 (ENSBBBG00000012839) CHD4 (ENSBBBG00000013055) LPAR5 (ENSBBBG00000013073) ACRBP (ENSBBBG00000013082) ENSBBBG00000013090 ZNF384 (ENSBBBG00000013145) PIANP (ENSBBBG00000008904) ENSBBBG00000013164 ENSBBBG00000013172 ##22 MLF2 (ENSBBBG00000013185) PTMS (ENSBBBG00000013194) LAG3 (ENSBBBG00000001644) CD4 (ENSBBBG00000013265) ENSBBBG00000002685 P3H3 (ENSBBBG00000013282) GNB3 (ENSBBBG00000001619) CDCA3 (ENSBBBG00000013314) USP5 (ENSBBBG00000013362) TPI1 (ENSBBBG00000013389) SPSB2 (ENSBBBG00000001570) LRRC23 (ENSBBBG00000001562) ENO2 (ENSBBBG00000013486) ATN1 (ENSBBBG00000013523) C12orf57 (ENSBBBG00000013536) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Goat MODERN SPECIES ASTE1 (ENSCHIG00000021806) ATP2C1 (ENSCHIG00000015474) PSMG1 (ENSCHIG00000005726) ENSCHIG00000022501 BRWD1 (ENSCHIG00000013528) ENSCHIG00000008037 ENSCHIG00000000879 GET1 (ENSCHIG00000008859) LCA5L (ENSCHIG00000013759) SH3BGR (ENSCHIG00000018188) B3GALT5 (ENSCHIG00000003423) ENSCHIG00000010437 PCP4 (ENSCHIG00000026748) DSCAM (ENSCHIG00000010917) ENSCHIG00000025338 ENSCHIG00000015454 ##22 BACE2 (ENSCHIG00000019839) ENSCHIG00000016035 FAM3B (ENSCHIG00000017490) MX2 (ENSCHIG00000014150) MX1 (ENSCHIG00000001865) TMPRSS2 (ENSCHIG00000024477) ENSCHIG00000007612 ENSCHIG00000011563 ENSCHIG00000008117 RIPK4 (ENSCHIG00000012268) PRDM15 (ENSCHIG00000016222) C2CD2 (ENSCHIG00000012559) ZBTB21 (ENSCHIG00000022184) ENSCHIG00000016072 ABCG1 (ENSCHIG00000007254) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 6 LRRC32 (ENSOARG00020007119) ENSOARG00020007148 ENSOARG00020007184 TSKU (ENSOARG00020007221) ACER3 (ENSOARG00020007254) CAPN5 (ENSOARG00020007502) MYO7A (ENSOARG00020007565) ENSOARG00020007670 ENSOARG00020007682 ENSOARG00020007871 ANO3 (ENSOARG00020007896) MUC15 (ENSOARG00020008218) SLC5A12 (ENSOARG00020008429) FIBIN (ENSOARG00020009250) BBOX1 (ENSOARG00020009280) ENSOARG00020009346 ##22 CCDC34 (ENSOARG00020009403) LGR4 (ENSOARG00020009461) LIN7C (ENSOARG00020010086) BDNF (ENSOARG00020010275) KIF18A (ENSOARG00020010335) METTL15 (ENSOARG00020010450) KCNA4 (ENSOARG00020010639) ENSOARG00020010669 ENSOARG00020010717 ENSOARG00020010947 ENSOARG00020010964 ENSOARG00020011017 ENSOARG00020011041 ENSOARG00020011107 ENSOARG00020011133 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 1419 ENSAMEG00000026925 ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 862 ENSAMEG00000028858 ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Red fox MODERN SPECIES 15 NR4A2 (ENSVVUG00000020464) GPD2 (ENSVVUG00000020453) GALNT5 (ENSVVUG00000020446) ERMN (ENSVVUG00000020443) CYTIP (ENSVVUG00000020441) ACVR1C (ENSVVUG00000020440) ACVR1 (ENSVVUG00000020425) CCDC148 (ENSVVUG00000020409) PKP4 (ENSVVUG00000020392) DAPL1 (ENSVVUG00000020389) ENSVVUG00000020388 ENSVVUG00000020386 TANC1 (ENSVVUG00000020115) WDSUB1 (ENSVVUG00000020080) BAZ2B (ENSVVUG00000019442) ENSVVUG00000019352 ##22 ENSVVUG00000019348 MARCH7 (ENSVVUG00000019334) CD302 (ENSVVUG00000019323) LY75 (ENSVVUG00000019299) PLA2R1 (ENSVVUG00000019260) ITGB6 (ENSVVUG00000018745) RBMS1 (ENSVVUG00000018682) ENSVVUG00000018667 TANK (ENSVVUG00000018661) ENSVVUG00000018659 PSMD14 (ENSVVUG00000018654) TBR1 (ENSVVUG00000018643) SLC4A10 (ENSVVUG00000018604) DPP4 (ENSVVUG00000018592) GCG (ENSVVUG00000018587) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000015719.d ENSGT00390000011425.B ENSGT01000000214434.B.b.e.a ENSGT00940000157648.l ENSGT00940000159499 ENSGT00940000154342.C ENSGT00390000002565.k.b ENSGT00390000006223.r ENSGT00940000164247 ENSGT00940000153425.b ENSGT00530000063484.b.b ENSGT00940000165165 ENSGT00940000162492.hb ENSGT00940000163515 ENSGT00390000007560.q.b ENSGT00390000018433.t ##22 ENSGT00940000158538 ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d ENSGT00530000063186.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00940000160244 ENSGT00940000155009 ENSGT00390000015623 ENSGT00940000162492.ib ENSGT00940000158618 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000159616 ENSGT00510000047417.j ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b ENSGT00940000156153 ENSGT00500000044890.a.a Dingo MODERN SPECIES 217 ENSCAFG00020006469 ENSCAFG00020006559 ENSCAFG00020008158 ENSCAFG00020008184 ENSCAFG00020008190 ENSCAFG00020008197 ENSCAFG00020008202 TMEM47 (ENSCAFG00020008209) ENSCAFG00020008220 ENSCAFG00020008228 ENSCAFG00020008243 ENSCAFG00020008267 ENSCAFG00020008268 ENSCAFG00020008269 ENSCAFG00020008283 ENSCAFG00020008286 ##22 PRRG1 (ENSCAFG00020008292) LANCL3 (ENSCAFG00020008345) XK (ENSCAFG00020008356) CYBB (ENSCAFG00020008365) DYNLT3 (ENSCAFG00020008446) ENSCAFG00020008475 ENSCAFG00020008477 SYTL5 (ENSCAFG00020008485) SRPX (ENSCAFG00020008537) ENSCAFG00020008547 OTC (ENSCAFG00020008552) TSPAN7 (ENSCAFG00020008585) MID1IP1 (ENSCAFG00020008603) Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 144 ENSCAFG00845021667 ENSCAFG00845021702 ENSCAFG00845021748 ENSCAFG00845021774 TMEM47 (ENSCAFG00845021814) ENSCAFG00845021898 ENSCAFG00845021959 ENSCAFG00845021989 ENSCAFG00845022160 ENSCAFG00845023215 ENSCAFG00845023269 ENSCAFG00845023302 ENSCAFG00845023324 ENSCAFG00845023351 ENSCAFG00845023375 ENSCAFG00845023392 ##22 PRRG1 (ENSCAFG00845023418) ENSCAFG00845023501 LANCL3 (ENSCAFG00845023634) XK (ENSCAFG00845023672) CYBB (ENSCAFG00845023727) DYNLT3 (ENSCAFG00845023973) SYTL5 (ENSCAFG00845024105) ENSCAFG00845024670 RPGR (ENSCAFG00845024867) OTC (ENSCAFG00845025700) ENSCAFG00845025837 TSPAN7 (ENSCAFG00845025872) MID1IP1 (ENSCAFG00845025983) BCOR (ENSCAFG00845026046) ENSCAFG00845026522 Dog MODERN SPECIES 25 ENSCAFG00845028372 CDKL2 (ENSCAFG00845028424) G3BP2 (ENSCAFG00845028548) USO1 (ENSCAFG00845028789) PPEF2 (ENSCAFG00845029176) ENSCAFG00845029566 ENSCAFG00845029614 ART3 (ENSCAFG00845029743) CXCL10 (ENSCAFG00845029862) CXCL11 (ENSCAFG00845029883) NUP54 (ENSCAFG00845029928) SCARB2 (ENSCAFG00845029992) ENSCAFG00845030118 STBD1 (ENSCAFG00845030147) CCDC158 (ENSCAFG00845030219) ENSCAFG00845014745 ##22 SHROOM3 (ENSCAFG00845014821) SOWAHB (ENSCAFG00845014859) ENSCAFG00845014878 SEPTIN11 (ENSCAFG00845015064) CCNI (ENSCAFG00845015315) ENSCAFG00845015412 CCNG2 (ENSCAFG00845015436) CXCL13 (ENSCAFG00845015471) CNOT6L (ENSCAFG00845015630) ENSCAFG00845015835 MRPL1 (ENSCAFG00845015904) FRAS1 (ENSCAFG00845016022) ENSCAFG00845016133 ENSCAFG00845016158 ANXA3 (ENSCAFG00845016191) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Microbat MODERN SPECIES 975 ENSMLUG00000003005 OR4F15 (ENSMLUG00000003003) ENSMLUG00000023015 ENSMLUG00000015881 ENSMLUG00000023649 NOP10 (ENSMLUG00000002782) SLC12A6 (ENSMLUG00000004754) EMC4 (ENSMLUG00000004744) ENSMLUG00000001532 EMC7 (ENSMLUG00000003784) CHRM5 (ENSMLUG00000008312) ENSMLUG00000004577 RYR3 (ENSMLUG00000004511) ENSMLUG00000001211 ENSMLUG00000016604 ENSMLUG00000010101 ##22 GREM1 (ENSMLUG00000011955) SCG5 (ENSMLUG00000006307) ENSMLUG00000006299 ENSMLUG00000028462 GJD2 (ENSMLUG00000006214) ACTC1 (ENSMLUG00000006218) AQR (ENSMLUG00000006223) ZNF770 (ENSMLUG00000006256) DPH6 (ENSMLUG00000010097) ENSMLUG00000026761 CDIN1 (ENSMLUG00000015068) MEIS2 (ENSMLUG00000012211) ENSMLUG00000028006 TMCO5A (ENSMLUG00000007293) SPRED1 (ENSMLUG00000013930) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 1 KCNC2 (ENSRFEG00010004462) ENSRFEG00010004445 TRHDE (ENSRFEG00010004421) TPH2 (ENSRFEG00010004392) TBC1D15 (ENSRFEG00010004313) RAB21 (ENSRFEG00010004244) TMEM19 (ENSRFEG00010004224) THAP2 (ENSRFEG00010004206) ZFC3H1 (ENSRFEG00010004111) LGR5 (ENSRFEG00010004053) TSPAN8 (ENSRFEG00010004017) PTPRR (ENSRFEG00010003978) PTPRB (ENSRFEG00010003840) ENSRFEG00010003755 CNOT2 (ENSRFEG00010003667) ENSRFEG00010003596 ##22 MYRFL (ENSRFEG00010003520) RAB3IP (ENSRFEG00010003411) BEST3 (ENSRFEG00010003349) LRRC10 (ENSRFEG00010003298) CCT2 (ENSRFEG00010003244) FRS2 (ENSRFEG00010003207) YEATS4 (ENSRFEG00010003171) ENSRFEG00010003140 CPSF6 (ENSRFEG00010003087) CPM (ENSRFEG00010003042) ENSRFEG00010002867 ENSRFEG00010002741 SLC35E3 (ENSRFEG00010002724) ENSRFEG00010002704 NUP107 (ENSRFEG00010002607) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 255 FIBP (ENSOGAG00000016515) CCDC85B (ENSOGAG00000028471) FOSL1 (ENSOGAG00000016518) C11orf68 (ENSOGAG00000031892) DRAP1 (ENSOGAG00000016519) TSGA10IP (ENSOGAG00000016520) SART1 (ENSOGAG00000016523) EIF1AD (ENSOGAG00000016528) BANF1 (ENSOGAG00000016530) CST6 (ENSOGAG00000016534) CATSPER1 (ENSOGAG00000016536) LGALS12 (ENSOGAG00000009408) ENSOGAG00000027568 PLAAT5 (ENSOGAG00000004581) ENSOGAG00000003053 ENSOGAG00000029377 ##22 ENSOGAG00000003051 ENSOGAG00000030634 ENSOGAG00000006579 SLC22A8 (ENSOGAG00000003588) SLC22A6 (ENSOGAG00000003585) CHRM1 (ENSOGAG00000028685) SLC3A2 (ENSOGAG00000027003) WDR74 (ENSOGAG00000015303) STX5 (ENSOGAG00000015298) NXF1 (ENSOGAG00000008901) TMEM223 (ENSOGAG00000024913) TMEM179B (ENSOGAG00000008897) TAF6L (ENSOGAG00000008893) POLR2G (ENSOGAG00000032720) ZBTB3 (ENSOGAG00000011414) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 242 ENSPSMG00000022060 TMEM140 (ENSPSMG00000022065) ENSPSMG00000022068 ENSPSMG00000022074 WDR91 (ENSPSMG00000022093) STRA8 (ENSPSMG00000022105) ENSPSMG00000022117 CNOT4 (ENSPSMG00000022232) NUP205 (ENSPSMG00000022310) STMP1 (ENSPSMG00000022330) SLC13A4 (ENSPSMG00000022349) FAM180A (ENSPSMG00000022353) ENSPSMG00000022359 MTPN (ENSPSMG00000022367) ENSPSMG00000022374 ##22 Mouse lemur MODERN SPECIES 30 XDH (ENSMICG00000012384) SRD5A2 (ENSMICG00000035505) MEMO1 (ENSMICG00000032271) DPY30 (ENSMICG00000027078) ENSMICG00000032136 SPAST (ENSMICG00000015575) ENSMICG00000046776 SLC30A6 (ENSMICG00000016134) YIPF4 (ENSMICG00000042040) ENSMICG00000042221 BIRC6 (ENSMICG00000009525) TTC27 (ENSMICG00000043484) LTBP1 (ENSMICG00000009581) RASGRP3 (ENSMICG00000009609) ENSMICG00000043251 ENSMICG00000037378 ##22 CRIM1 (ENSMICG00000045986) FEZ2 (ENSMICG00000014974) VIT (ENSMICG00000008646) STRN (ENSMICG00000008661) HEATR5B (ENSMICG00000003296) GPATCH11 (ENSMICG00000003312) EIF2AK2 (ENSMICG00000003317) SULT6B1 (ENSMICG00000042050) CEBPZOS (ENSMICG00000046596) CEBPZ (ENSMICG00000003324) NDUFAF7 (ENSMICG00000003335) PRKD3 (ENSMICG00000026704) QPCT (ENSMICG00000002277) CDC42EP3 (ENSMICG00000042894) RMDN2 (ENSMICG00000038134) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 545 CCL27 (ENSANAG00000027074) SIGMAR1 (ENSANAG00000036893) ENSANAG00000021374 ARID3C (ENSANAG00000036899) DCTN3 (ENSANAG00000037331) RPP25L (ENSANAG00000019665) CNTFR (ENSANAG00000023497) ENSANAG00000033213 ENHO (ENSANAG00000017683) FAM219A (ENSANAG00000026500) ENSANAG00000031561 MYORG (ENSANAG00000019296) NUDT2 (ENSANAG00000034212) KIF24 (ENSANAG00000033152) UBAP1 (ENSANAG00000032729) ENSANAG00000030718 ##22 ENSANAG00000020032 DCAF12 (ENSANAG00000019191) UBAP2 (ENSANAG00000024987) ENSANAG00000023431 UBE2R2 (ENSANAG00000037133) NOL6 (ENSANAG00000019320) AQP3 (ENSANAG00000025918) ENSANAG00000033778 NFX1 (ENSANAG00000001809) CHMP5 (ENSANAG00000036781) BAG1 (ENSANAG00000030300) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 193 ENSMNEG00000007339 ENSMNEG00000033956 ENSMNEG00000036514 ##22 ACVR2A (ENSMNEG00000043553) ORC4 (ENSMNEG00000031287) MBD5 (ENSMNEG00000029374) EPC2 (ENSMNEG00000039186) KIF5C (ENSMNEG00000022981) LYPD6B (ENSMNEG00000036224) LYPD6 (ENSMNEG00000014126) MMADHC (ENSMNEG00000036865) ENSMNEG00000033300 RND3 (ENSMNEG00000034976) RBM43 (ENSMNEG00000030900) ENSMNEG00000043989 NMI (ENSMNEG00000036210) TNFAIP6 (ENSMNEG00000005810) RIF1 (ENSMNEG00000031616) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 2 SLC16A9 (ENSPANG00000022036) MRLN (ENSPANG00000034452) CCDC6 (ENSPANG00000022034) ANK3 (ENSPANG00000022032) CDK1 (ENSPANG00000022031) RHOBTB1 (ENSPANG00000022029) ENSPANG00000017636 TMEM26 (ENSPANG00000042705) CABCOCO1 (ENSPANG00000022059) ARID5B (ENSPANG00000022067) RTKN2 (ENSPANG00000022066) ZNF365 (ENSPANG00000022065) ADO (ENSPANG00000016238) EGR2 (ENSPANG00000022064) NRBF2 (ENSPANG00000022063) ENSPANG00000030466 ##22 JMJD1C (ENSPANG00000022061) REEP3 (ENSPANG00000022060) ENSPANG00000041261 ENSPANG00000050030 ENSPANG00000001307 ENSPANG00000047703 ENSPANG00000044789 ENSPANG00000038013 CTNNA3 (ENSPANG00000022081) LRRTM3 (ENSPANG00000022079) ENSPANG00000039119 DNAJC12 (ENSPANG00000022078) SIRT1 (ENSPANG00000022077) HERC4 (ENSPANG00000022076) MYPN (ENSPANG00000022100) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Sooty mangabey DUPLICATION Sooty mangabey MODERN SPECIES 595 SLC16A9 (ENSCATG00000013976) CCDC6 (ENSCATG00000033448) ENSCATG00000045201 ANK3 (ENSCATG00000039015) ENSCATG00000038329 RHOBTB1 (ENSCATG00000042026) TMEM26 (ENSCATG00000043914) CABCOCO1 (ENSCATG00000014612) ARID5B (ENSCATG00000035614) RTKN2 (ENSCATG00000043432) ZNF365 (ENSCATG00000030610) ENSCATG00000036398 ADO (ENSCATG00000016498) EGR2 (ENSCATG00000036150) ENSCATG00000033855 ENSCATG00000030709 ##22 ENSCATG00000033326 JMJD1C (ENSCATG00000040124) REEP3 (ENSCATG00000010425) ENSCATG00000017539 Sooty mangabey MODERN SPECIES 449 ENSCATG00000038318 LGALS8 (ENSCATG00000032807) HEATR1 (ENSCATG00000021120) ACTN2 (ENSCATG00000039988) ENSCATG00000036578 MTR (ENSCATG00000031365) RYR2 (ENSCATG00000037204) ZP4 (ENSCATG00000025480) ENSCATG00000021919 ENSCATG00000034279 FMN2 (ENSCATG00000045060) ENSCATG00000017726 ENSCATG00000042350 GREM2 (ENSCATG00000021508) RGS7 (ENSCATG00000035083) ENSCATG00000044040 ##22 FH (ENSCATG00000044877) KMO (ENSCATG00000037464) OPN3 (ENSCATG00000042188) ##26 WDR64 (ENSCATG00000013569) EXO1 (ENSCATG00000006511) MAP1LC3C (ENSCATG00000031341) PLD5 (ENSCATG00000021605) CEP170 (ENSCATG00000031357) SDCCAG8 (ENSCATG00000039425) ENSCATG00000012672 AKT3 (ENSCATG00000033494) ZBTB18 (ENSCATG00000040414) ENSCATG00000003512 C1orf100 (ENSCATG00000043782) ADSS2 (ENSCATG00000031646) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00400000022679 ENSGT00950000182892.a.b.b.d ENSGT00390000018433.t ##22 ENSGT00390000015066.d Gibbon MODERN SPECIES 19 ENSNLEG00000030394 ENSNLEG00000008123 ALPK2 (ENSNLEG00000008284) MALT1 (ENSNLEG00000008289) ENSNLEG00000032064 SEC11C (ENSNLEG00000032068) ENSNLEG00000035364 GRP (ENSNLEG00000008356) ENSNLEG00000028740 CPLX4 (ENSNLEG00000008370) LMAN1 (ENSNLEG00000008377) CCBE1 (ENSNLEG00000008450) ENSNLEG00000031514 ENSNLEG00000033152 ENSNLEG00000035401 ENSNLEG00000034761 ##22 ENSNLEG00000029313 MC4R (ENSNLEG00000018455) CDH20 (ENSNLEG00000008475) ENSNLEG00000027988 RNF152 (ENSNLEG00000029429) PIGN (ENSNLEG00000008507) RELCH (ENSNLEG00000008586) TNFRSF11A (ENSNLEG00000008614) ENSNLEG00000008618 ENSNLEG00000032069 ENSNLEG00000033457 ENSNLEG00000008641 BCL2 (ENSNLEG00000035984) KDSR (ENSNLEG00000008689) VPS4B (ENSNLEG00000008719) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00400000022679 ENSGT00950000182892.a.b.b.d ENSGT00390000018433.t ##22 ENSGT00390000015066.d Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00400000022679 ENSGT00950000182892.a.b.b.d ENSGT00390000000560.s.d ENSGT00390000018433.t ##22 ENSGT00390000015066.d Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00400000022679 ENSGT00950000182892.a.b.b.d ENSGT00390000000560.s.d ENSGT00390000018433.t ##22 ENSGT00390000015066.d Pan ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162091 #8 ENSGT00940000161199 #9 ENSGT00940000159235 #10 ENSGT00940000159732 #11 ENSGT00390000010045.g.a.b #12 ENSGT00860000136117.a #13 ENSGT00940000156754.a.b #14 ENSGT01050000244940.a.b #15 ENSGT00390000015172 #16 ENSGT00940000155509 #17 ENSGT00940000159143 #18 ENSGT00940000156033 #19 ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b #20 ENSGT00390000016470.d ENSGT00940000153912.A #21 ENSGT00390000018433.t ##22 ENSGT00940000155910 #23 ENSGT00910000147390 #24 ENSGT00390000015768 #25 ENSGT01100000263502.B.a.a #26 ENSGT00940000154877.C #27 ENSGT00940000156225.a #28 ENSGT01030000234633.C.a #29 ENSGT00950000183175.A #30 ENSGT00390000017446 #31 ENSGT00910000147315 #32 ENSGT00910000147005 #33 ENSGT00390000018409 ENSGT00390000009613.a ENSGT00550000074823.a.g ENSGT00940000163053.b Chimpanzee MODERN SPECIES 1 DYDC2 (ENSPTRG00000002684) #8 PRXL2A (ENSPTRG00000002685) #9 TSPAN14 (ENSPTRG00000002686) #10 SH2D4B (ENSPTRG00000002687) #11 ENSPTRG00000051598 #12 ENSPTRG00000043358 #13 NRG3 (ENSPTRG00000002689) #14 GHITM (ENSPTRG00000002691) #15 GPR15LG (ENSPTRG00000002692) #16 CDHR1 (ENSPTRG00000002693) #17 LRIT2 (ENSPTRG00000029854) #18 LRIT1 (ENSPTRG00000002694) #19 RGR (ENSPTRG00000002695) #20 CCSER2 (ENSPTRG00000002697) #21 ENSPTRG00000052496 ENSPTRG00000045771 ##22 GRID1 (ENSPTRG00000002700) #23 ENSPTRG00000051280 #24 WAPL (ENSPTRG00000002702) #25 OPN4 (ENSPTRG00000002704) #26 LDB3 (ENSPTRG00000002705) #27 BMPR1A (ENSPTRG00000002706) #28 MMRN2 (ENSPTRG00000002707) #29 SNCG (ENSPTRG00000002708) #30 ADIRF (ENSPTRG00000002709) #31 ENSPTRG00000049922 #32 ENSPTRG00000047193 #33 ENSPTRG00000043199 ENSPTRG00000002635 FAM25A (ENSPTRG00000046441) #34 GLUD1 (ENSPTRG00000002711) #35 Bonobo DUPLICATION Bonobo MODERN SPECIES 1 DYDC2 (ENSPPAG00000036598) #8 PRXL2A (ENSPPAG00000037245) #9 TSPAN14 (ENSPPAG00000030989) #10 ENSPPAG00000037034 #11 ENSPPAG00000020127 #12 ENSPPAG00000040005 #13 NRG3 (ENSPPAG00000033661) #14 GHITM (ENSPPAG00000014417) #15 GPR15LG (ENSPPAG00000042583) #16 CDHR1 (ENSPPAG00000011798) #17 LRIT2 (ENSPPAG00000029485) #18 LRIT1 (ENSPPAG00000037063) #19 RGR (ENSPPAG00000040412) #20 CCSER2 (ENSPPAG00000030875) #21 ENSPPAG00000039131 ENSPPAG00000037444 ##22 GRID1 (ENSPPAG00000030566) #23 ENSPPAG00000029420 #24 WAPL (ENSPPAG00000040644) #25 OPN4 (ENSPPAG00000041649) #26 LDB3 (ENSPPAG00000038538) #27 BMPR1A (ENSPPAG00000039780) #28 MMRN2 (ENSPPAG00000031202) #29 ENSPPAG00000032223 #30 ADIRF (ENSPPAG00000002928) #31 ENSPPAG00000042052 #32 ENSPPAG00000008830 #33 ENSPPAG00000037710 MINPP1 (ENSPPAG00000043233) PAPSS2 (ENSPPAG00000001750) ATAD1 (ENSPPAG00000043577) Bonobo MODERN SPECIES 9 ENSPPAG00000040741 ENSPPAG00000042494 NEDD4L (ENSPPAG00000028088) ENSPPAG00000026846 MALT1 (ENSPPAG00000037274) ZNF532 (ENSPPAG00000030764) SEC11C (ENSPPAG00000036516) ENSPPAG00000040638 GRP (ENSPPAG00000043111) RAX (ENSPPAG00000035734) CPLX4 (ENSPPAG00000029872) LMAN1 (ENSPPAG00000027366) CCBE1 (ENSPPAG00000031234) ENSPPAG00000031874 ENSPPAG00000031967 ENSPPAG00000032356 ##22 ENSPPAG00000032548 MC4R (ENSPPAG00000032218) CDH20 (ENSPPAG00000033146) ENSPPAG00000034157 ENSPPAG00000032446 RNF152 (ENSPPAG00000032380) PIGN (ENSPPAG00000039389) RELCH (ENSPPAG00000015474) TNFRSF11A (ENSPPAG00000022623) ZCCHC2 (ENSPPAG00000029037) ENSPPAG00000030188 ENSPPAG00000032208 BCL2 (ENSPPAG00000032001) KDSR (ENSPPAG00000032046) VPS4B (ENSPPAG00000033680) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Pika MODERN SPECIES 8686 ENSOPRG00000002848 ##22 Rabbit MODERN SPECIES 1 CCDC126 (ENSOCUG00000012389) STK31 (ENSOCUG00000004738) NPY (ENSOCUG00000010761) PALS2 (ENSOCUG00000014659) GSDME (ENSOCUG00000006691) OSBPL3 (ENSOCUG00000007990) ENSOCUG00000025605 C7orf31 (ENSOCUG00000009523) NPVF (ENSOCUG00000009530) ENSOCUG00000030043 NFE2L3 (ENSOCUG00000003140) ENSOCUG00000026859 ENSOCUG00000002464 SNX10 (ENSOCUG00000004744) SKAP2 (ENSOCUG00000011330) ENSOCUG00000022860 ##22 HOXA1 (ENSOCUG00000015215) HOXA2 (ENSOCUG00000015205) HOXA3 (ENSOCUG00000027405) ENSOCUG00000015190 HOXA5 (ENSOCUG00000029580) HOXA7 (ENSOCUG00000015183) HOXA9 (ENSOCUG00000020585) HOXA10 (ENSOCUG00000029439) HOXA11 (ENSOCUG00000015170) HOXA13 (ENSOCUG00000024694) EVX1 (ENSOCUG00000015159) HIBADH (ENSOCUG00000010349) TAX1BP1 (ENSOCUG00000012730) JAZF1 (ENSOCUG00000012738) ENSOCUG00000026115 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Squirrel MODERN SPECIES 106 ZNF804A (ENSSTOG00000023467) ZC3H15 (ENSSTOG00000006873) ITGAV (ENSSTOG00000003299) FAM171B (ENSSTOG00000004764) ZSWIM2 (ENSSTOG00000021223) CALCRL (ENSSTOG00000002764) TFPI (ENSSTOG00000010154) ENSSTOG00000006451 ##22 GULP1 (ENSSTOG00000026178) COL3A1 (ENSSTOG00000015774) COL5A2 (ENSSTOG00000015795) WDR75 (ENSSTOG00000013166) SLC40A1 (ENSSTOG00000023080) ASNSD1 (ENSSTOG00000013194) ANKAR (ENSSTOG00000000981) OSGEPL1 (ENSSTOG00000000991) ORMDL1 (ENSSTOG00000000995) PMS1 (ENSSTOG00000000998) MSTN (ENSSTOG00000001347) HIBCH (ENSSTOG00000001354) INPP1 (ENSSTOG00000021856) MFSD6 (ENSSTOG00000012467) NEMP2 (ENSSTOG00000028788) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 18 LIN52 (ENSHGLG00000045214) VSX2 (ENSHGLG00000010609) ABCD4 (ENSHGLG00000019040) SYNDIG1L (ENSHGLG00000013920) NPC2 (ENSHGLG00000013107) ISCA2 (ENSHGLG00000049377) LTBP2 (ENSHGLG00000015861) ENSHGLG00000047171 AREL1 (ENSHGLG00000018582) ENSHGLG00000017869 YLPM1 (ENSHGLG00000018654) ENSHGLG00000046547 PROX2 (ENSHGLG00000011710) DLST (ENSHGLG00000009814) RPS6KL1 (ENSHGLG00000013483) ENSHGLG00000013243 ##22 ENSHGLG00000018678 ENSHGLG00000050804 EIF2B2 (ENSHGLG00000016520) MLH3 (ENSHGLG00000015005) ENSHGLG00000040406 ENSHGLG00000014222 ZC2HC1C (ENSHGLG00000012165) ENSHGLG00000011281 TMED10 (ENSHGLG00000009862) Fos (ENSHGLG00000009642) ENSHGLG00000012043 JDP2 (ENSHGLG00000046590) ENSHGLG00000034007 ENSHGLG00000032847 BATF (ENSHGLG00000009995) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 68 ENSDORG00000002250 ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 15 Mtus2 (ENSPEMG00000011863) Slc7a1 (ENSPEMG00000006808) Ubl3 (ENSPEMG00000010779) Katnal1 (ENSPEMG00000009164) ENSPEMG00000000834 Uspl1 (ENSPEMG00000003660) Alox5ap (ENSPEMG00000000576) Medag (ENSPEMG00000000331) Tex26 (ENSPEMG00000019024) Wdr95 (ENSPEMG00000016428) Hsph1 (ENSPEMG00000009941) ENSPEMG00000025164 B3glct (ENSPEMG00000015898) Rxfp2 (ENSPEMG00000018554) ENSPEMG00000026224 ENSPEMG00000031372 ##22 ENSPEMG00000029204 ENSPEMG00000030363 ENSPEMG00000011222 Zkscan5 (ENSPEMG00000010963) Zkscan14 (ENSPEMG00000011797) Atp5j2 (ENSPEMG00000013672) Cpsf4 (ENSPEMG00000004508) Ptcd1 (ENSPEMG00000013736) Bud31 (ENSPEMG00000010947) ENSPEMG00000015747 Arpc1b (ENSPEMG00000017147) Arpc1a (ENSPEMG00000013996) Kpna7 (ENSPEMG00000017218) Smurf1 (ENSPEMG00000004784) Trrap (ENSPEMG00000007905) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 661 ENSMAUG00000007368 ##22 ENSMAUG00000007163 Phex (ENSMAUG00000016421) Sms (ENSMAUG00000017854) Yy2 (ENSMAUG00000016161) Mbtps2 (ENSMAUG00000017121) Smpx (ENSMAUG00000016078) Cnksr2 (ENSMAUG00000021259) ENSMAUG00000008169 ENSMAUG00000017351 Rps6ka3 (ENSMAUG00000015390) ENSMAUG00000012396 ENSMAUG00000007856 Map7d2 (ENSMAUG00000016214) ENSMAUG00000009356 Sh3kbp1 (ENSMAUG00000017328) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.t ##22 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 12 Ntrk1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025140) Pear1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025139) Lrrc71 (MGP_CAROLIEiJ_G0025138) Arhgef11 (MGP_CAROLIEiJ_G0025137) Etv3 (MGP_CAROLIEiJ_G0025136) Fcrl5 (MGP_CAROLIEiJ_G0025135) Fcrl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025134) Cd5l (MGP_CAROLIEiJ_G0025133) Fcrls (MGP_CAROLIEiJ_G0025132) Kirrel (MGP_CAROLIEiJ_G0025131) MGP_CAROLIEiJ_G0025130 MGP_CAROLIEiJ_G0025129 Dclk2 (MGP_CAROLIEiJ_G0025128) Mab21l2 (MGP_CAROLIEiJ_G0025127) Lrba (MGP_CAROLIEiJ_G0025126) MGP_CAROLIEiJ_G0025125 ##22 Prss48 (MGP_CAROLIEiJ_G0025124) Sh3d19 (MGP_CAROLIEiJ_G0025123) Glt28d2 (MGP_CAROLIEiJ_G0025122) Fhip1a (MGP_CAROLIEiJ_G0025121) Gatb (MGP_CAROLIEiJ_G0025120) Fbxw7 (MGP_CAROLIEiJ_G0025119) Tmem154 (MGP_CAROLIEiJ_G0025118) Tigd4 (MGP_CAROLIEiJ_G0025117) MGP_CAROLIEiJ_G0025116 Arfip1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025115) Fhdc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025114) Gm6525 (MGP_CAROLIEiJ_G0025113) Trim2 (MGP_CAROLIEiJ_G0025112) Mnd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025111) Tmem131l (MGP_CAROLIEiJ_G0025110) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000164636 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000164636 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000164636 ENSGT00940000155316 Wallaby MODERN SPECIES 5284 RPS3A (ENSMEUG00000014245) #22 ENSMEUG00000014257 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000167877 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b.e ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000164636 ENSGT00940000155316 koala DUPLICATION koala MODERN SPECIES 55 ENSPCIG00000000314 EDNRA (ENSPCIG00000000281) TMEM184C (ENSPCIG00000000216) PRMT9 (ENSPCIG00000000194) ARHGAP10 (ENSPCIG00000000095) ENSPCIG00000031751 ENSPCIG00000017929 DCLK2 (ENSPCIG00000017588) LRBA (ENSPCIG00000011349) ENSPCIG00000017591 MAB21L2 (ENSPCIG00000032257) 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RNF175 (ENSSPUG00000014894) Episquamata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT01040000244608 ENSGT00940000155523 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT01040000244608 ENSGT00940000155523 ENSGT00940000154986 ENSGT00390000016183 ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000164636 Lizard DUPLICATION Lizard MODERN SPECIES 4 TMEM184C (ENSACAG00000003842) PRMT9 (ENSACAG00000003813) ENSACAG00000039469 ARHGAP10 (ENSACAG00000003717) ENSACAG00000043946 NR3C2 (ENSACAG00000003612) ENSACAG00000044995 ENSACAG00000040684 ENSACAG00000026786 ENSACAG00000029401 ENSACAG00000039095 ENSACAG00000035947 DCLK2 (ENSACAG00000003495) MAB21L2 (ENSACAG00000045445) LRBA (ENSACAG00000003023) ENSACAG00000002978 #22 SH3D19 (ENSACAG00000002951) FHIP1A (ENSACAG00000002879) GATB (ENSACAG00000002772) ENSACAG00000040734 FBXW7 (ENSACAG00000002680) ENSACAG00000040191 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SPECIES 9 MMAA (ENSPTXG00000010151) ZNF827 (ENSPTXG00000010174) LSM6 (ENSPTXG00000010189) REELD1 (ENSPTXG00000010192) SLC10A7 (ENSPTXG00000010194) POU4F2 (ENSPTXG00000010196) TTC29 (ENSPTXG00000010197) EDNRA (ENSPTXG00000010207) TMEM184C (ENSPTXG00000010209) PRMT9 (ENSPTXG00000010210) ARHGAP10 (ENSPTXG00000010212) NR3C2 (ENSPTXG00000010241) DCLK2 (ENSPTXG00000010247) LRBA (ENSPTXG00000010916) MAB21L2 (ENSPTXG00000016740) RPS3A (ENSPTXG00000016741) #22 SH3D19 (ENSPTXG00000016745) FHIP1A (ENSPTXG00000016752) GATB (ENSPTXG00000016757) FBXW7 (ENSPTXG00000016759) ARFIP1 (ENSPTXG00000016762) FHDC1 (ENSPTXG00000016764) TRIM2 (ENSPTXG00000016765) MND1 (ENSPTXG00000016767) ENSPTXG00000016768 TMEM131L (ENSPTXG00000016769) UGT8 (ENSPTXG00000016771) ARSJ (ENSPTXG00000016772) ENSPTXG00000016774 ANK2 (ENSPTXG00000016792) LARP7 (ENSPTXG00000017656) Mainland tiger snake MODERN SPECIES 24 MMAA (ENSNSUG00000004963) ZNF827 (ENSNSUG00000004961) ENSNSUG00000004960 REELD1 (ENSNSUG00000004959) SLC10A7 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ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694 ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00940000154986 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00390000006284 ENSGT00730000111168 ENSGT00940000160368 ENSGT00940000157357 ENSGT01050000244968.c ENSGT00390000010950 ENSGT00390000001491.a Turkey MODERN SPECIES 24 SMAD1 (ENSMGAG00000003725) MMAA (ENSMGAG00000003763) ZNF827 (ENSMGAG00000003772) SLC10A7 (ENSMGAG00000003821) LSM6 (ENSMGAG00000022049) REELD1 (ENSMGAG00000003813) TTC29 (ENSMGAG00000003844) EDNRA (ENSMGAG00000003853) TMEM184C (ENSMGAG00000003938) PRMT9 (ENSMGAG00000003975) ARHGAP10 (ENSMGAG00000003991) NR3C2 (ENSMGAG00000004038) ENSMGAG00000017899 DCLK2 (ENSMGAG00000004074) LRBA (ENSMGAG00000004186) RPS3A (ENSMGAG00000004199) #22 FHIP1A (ENSMGAG00000004257) GATB (ENSMGAG00000004276) FBXW7 (ENSMGAG00000004290) ENSMGAG00000022709 TMEM154 (ENSMGAG00000004310) ARFIP1 (ENSMGAG00000004312) FHDC1 (ENSMGAG00000004347) 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ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000175843 ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000177316 ENSGT00940000154986.b ENSGT01020000231454 ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b.a.b ENSGT00940000155905.a ENSGT00490000043413 ENSGT00940000175947 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 248 ENSGT00940000154895.b ENSGT00940000154778.b ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.c ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b.a.b ENSGT00940000155905.a.l ENSGT00490000043413 ENSGT00530000063614.a.b ENSGT00940000156432.a.a ENSGT00940000164636 ENSGT00940000163671.b ENSGT00940000155316 ENSGT00940000158122 ENSGT00940000157467 P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 234 DCLK2 (ENSPKIG00000014202) 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FHDC1 (ENSSFOG00015008598) ENSSFOG00015008641 rnf175 (ENSSFOG00015008678) SFRP2 (ENSSFOG00015008727) plrg1 (ENSSFOG00015008745) fgb (ENSSFOG00015008800) fga (ENSSFOG00015008811) Asian bonytongue MODERN SPECIES 18 uggt1 (ENSSFOG00015007345) HS6ST1 (ENSSFOG00015007332) acvr1l (ENSSFOG00015007275) otomp (ENSSFOG00015007320) d2hgdh (ENSSFOG00015007236) PAK2 (ENSSFOG00015031867) klhl6 (ENSSFOG00015024715) ENSSFOG00015008200 ENSSFOG00015008282 mab21l2 (ENSSFOG00015026793) RPS3A (ENSSFOG00015008477) #22 ENSSFOG00015008509 FHIP1A (ENSSFOG00015008540) ENSSFOG00015032740 ENSSFOG00015008573 RPS3A (ENSSFOG00015033020) #22 ENSSFOG00015033078 FHIP1A (ENSSFOG00015027161) FBXW7 (ENSSFOG00015008564) FHDC1 (ENSSFOG00015008598) ENSSFOG00015008641 rnf175 (ENSSFOG00015008678) SFRP2 (ENSSFOG00015008727) plrg1 (ENSSFOG00015008745) fgb (ENSSFOG00015008800) fga (ENSSFOG00015008811) fgg (ENSSFOG00015008855) syndig1l (ENSSFOG00015008898) abcd4 (ENSSFOG00015030444) DCLK2 (ENSSFOG00015009017) NR3C2 (ENSSFOG00015009037) Asian bonytongue MODERN SPECIES 7 hhip (ENSSFOG00015016659) abce1 (ENSSFOG00015016576) smad1 (ENSSFOG00015016549) mmaa (ENSSFOG00015032323) ZNF827 (ENSSFOG00015026650) lsm6 (ENSSFOG00015016480) POU4F2 (ENSSFOG00015016472) ednrab (ENSSFOG00015016285) tmem184c (ENSSFOG00015016209) prmt9 (ENSSFOG00015016190) arhgap10 (ENSSFOG00015016072) nr3c2 (ENSSFOG00015016030) dclk2a (ENSSFOG00015015945) LRBA (ENSSFOG00015015765) mab21l2 (ENSSFOG00015028365) ENSSFOG00015015700 #22 sh3d19 (ENSSFOG00015015640) FHIP1A (ENSSFOG00015015611) gatb (ENSSFOG00015015565) dctpp1 (ENSSFOG00015025917) FBXW7 (ENSSFOG00015024738) ENSSFOG00015015534 ENSSFOG00015025808 arfip1 (ENSSFOG00015015423) FHDC1 (ENSSFOG00015029113) trim2a (ENSSFOG00015015365) mnd1 (ENSSFOG00015024568) TMEM131L (ENSSFOG00015015308) sfrp2 (ENSSFOG00015015289) ENSSFOG00015015238 fgg (ENSSFOG00015015212) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 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(ENSGMOG00000001911) nr3c2 (ENSGMOG00000001897) ENSGMOG00000001860 LRBA (ENSGMOG00000001715) mab21l2 (ENSGMOG00000034092) rps3a (ENSGMOG00000001707) #22 sh3d19 (ENSGMOG00000030928) FHIP1A (ENSGMOG00000033062) gatb (ENSGMOG00000001575) dctpp1 (ENSGMOG00000019780) FBXW7 (ENSGMOG00000001442) ENSGMOG00000032963 tma16 (ENSGMOG00000001409) ENSGMOG00000023315 ENSGMOG00000032275 ENSGMOG00000029117 ENSGMOG00000025269 tmem192 (ENSGMOG00000001378) ENSGMOG00000001316 uchl1 (ENSGMOG00000001303) anxa5b (ENSGMOG00000001284) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156063.l ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000154895.b ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000154778.d ENSGT00940000178664 ENSGT00940000175843.a ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000177316 ENSGT00940000154986.b ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT01100000266717 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a Pinecone sodierfish MODERN SPECIES hhip (ENSMMDG00005008410) abce1 (ENSMMDG00005008379) smad1 (ENSMMDG00005008345) mmaa (ENSMMDG00005008343) ZNF827 (ENSMMDG00005008340) lsm6 (ENSMMDG00005008336) pou4f2 (ENSMMDG00005008334) ednraa (ENSMMDG00005007979) tmem184c (ENSMMDG00005007946) prmt9 (ENSMMDG00005007933) arhgap10 (ENSMMDG00005007920) nr3c2 (ENSMMDG00005007914) ENSMMDG00005007901 mab21l2 (ENSMMDG00005007883) LRBA (ENSMMDG00005003697) rps3a (ENSMMDG00005003489) #22 ENSMMDG00005003480 FHIP1A (ENSMMDG00005003477) gatb (ENSMMDG00005002964) dctpp1 (ENSMMDG00005002930) ENSMMDG00005002925 FBXW7 (ENSMMDG00005002704) ENSMMDG00005002660 ENSMMDG00005002646 tma16 (ENSMMDG00005002634) ENSMMDG00005002622 ENSMMDG00005015153 ENSMMDG00005015151 tmem192 (ENSMMDG00005015149) ENSMMDG00005015145 ENSMMDG00005015143 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156063.l ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00940000154895.b ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000154778.d ENSGT00940000178664 ENSGT00940000175843.a ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000177316 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 518 ZNF827 (ENSHCOG00000005579) lsm6 (ENSHCOG00000005591) pou4f2 (ENSHCOG00000005600) ednraa (ENSHCOG00000005641) tmem184c (ENSHCOG00000005666) prmt9 (ENSHCOG00000005691) ENSHCOG00000005701 ENSHCOG00000005704 ENSHCOG00000005715 ENSHCOG00000005718 arhgap10 (ENSHCOG00000005821) nr3c2 (ENSHCOG00000005877) ENSHCOG00000005910 ENSHCOG00000005922 LRBA (ENSHCOG00000006142) rps3a (ENSHCOG00000006191) #22 ENSHCOG00000006222 ENSHCOG00000006233 FHIP1A (ENSHCOG00000006264) gatb (ENSHCOG00000006270) dctpp1 (ENSHCOG00000006278) ENSHCOG00000006287 FBXW7 (ENSHCOG00000006299) ENSHCOG00000006306 tma16 (ENSHCOG00000006333) ENSHCOG00000006344 ENSHCOG00000000193 ENSHCOG00000006356 tmem192 (ENSHCOG00000006369) ENSHCOG00000006410 uchl1 (ENSHCOG00000006458) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.l ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000154778.d ENSGT00940000178664 ENSGT00940000175843.a ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000177316 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158660 ENSGT00930000150973.B.f ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000154778.d ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000177316 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158660 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.l ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000154778.d ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000177316 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c Oryzias ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158660 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b 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medaka MODERN SPECIES 276 rps3a (ENSOMEG00000023316) #22 ENSOMEG00000023289 Javanese ricefish MODERN SPECIES hhip (ENSOJAG00000000130) ENSOJAG00000000055 smad1 (ENSOJAG00000022537) mmaa (ENSOJAG00000022520) ZNF827 (ENSOJAG00000022502) lsm6 (ENSOJAG00000022498) pou4f2 (ENSOJAG00000022494) ednraa (ENSOJAG00000022486) tmem184c (ENSOJAG00000022467) prmt9 (ENSOJAG00000022452) arhgap10 (ENSOJAG00000022421) nr3c2 (ENSOJAG00000022359) ENSOJAG00000022281 mab21l2 (ENSOJAG00000022263) LRBA (ENSOJAG00000020451) RPS3A (ENSOJAG00000019998) #22 FHIP1A (ENSOJAG00000019990) dctpp1 (ENSOJAG00000019977) gatb (ENSOJAG00000019750) ENSOJAG00000019723 FBXW7 (ENSOJAG00000019612) ENSOJAG00000019598 tma16 (ENSOJAG00000019590) ENSOJAG00000019571 ENSOJAG00000019548 ENSOJAG00000019534 tmem192 (ENSOJAG00000019520) limch1a (ENSOJAG00000019447) uchl1 (ENSOJAG00000019360) anxa5b (ENSOJAG00000019100) ENSOJAG00000019069 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000158660 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 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LRBA (ENSACIG00000015968) rps3a (ENSACIG00000015940) #22 sh3d19 (ENSACIG00000015883) FHIP1A (ENSACIG00000015856) gatb (ENSACIG00000015827) dctpp1 (ENSACIG00000015822) FBXW7 (ENSACIG00000015737) tma16 (ENSACIG00000015713) ENSACIG00000015701 ENSACIG00000015689 ENSACIG00000015682 tmem192 (ENSACIG00000015624) limch1a (ENSACIG00000015558) uchl1 (ENSACIG00000015539) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158660 ENSGT00930000150973.B.f ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000154778.d ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158660 ENSGT00930000150973.B.f ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT00940000154778.d ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158660 ENSGT00930000150973.B.f ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000154778.d ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 448 smad1 (ENSHBUG00000008544) mmaa (ENSHBUG00000008581) ZNF827 (ENSHBUG00000008606) lsm6 (ENSHBUG00000008618) pou4f2 (ENSHBUG00000000812) ednraa (ENSHBUG00000008640) tmem184c (ENSHBUG00000001089) prmt9 (ENSHBUG00000008686) arhgap10 (ENSHBUG00000008729) nr3c2 (ENSHBUG00000008760) ENSHBUG00000008929 mab21l2 (ENSHBUG00000008958) LRBA (ENSHBUG00000009474) rps3a (ENSHBUG00000009539) #22 sh3d19 (ENSHBUG00000009557) FHIP1A (ENSHBUG00000009588) gatb (ENSHBUG00000009656) dctpp1 (ENSHBUG00000009669) ENSHBUG00000009680 FBXW7 (ENSHBUG00000009752) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158660 ENSGT00930000150973.B.f ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT00940000154778.d ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a P. nyererei MODERN SPECIES 317 hhip (ENSPNYG00000012413) ENSPNYG00000012454 smad1 (ENSPNYG00000012479) mmaa (ENSPNYG00000012505) 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ENSGT00940000154372.a.b.a Barramundi perch MODERN SPECIES 130 frem3 (ENSLCAG00010019552) hhip (ENSLCAG00010019547) smad1 (ENSLCAG00010019542) mmaa (ENSLCAG00010019538) ZNF827 (ENSLCAG00010019531) lsm6 (ENSLCAG00010019526) pou4f2 (ENSLCAG00010019522) ednraa (ENSLCAG00010019419) tmem184c (ENSLCAG00010019383) prmt9 (ENSLCAG00010019378) arhgap10 (ENSLCAG00010019369) nr3c2 (ENSLCAG00010019366) ENSLCAG00010019337 mab21l2 (ENSLCAG00010019320) LRBA (ENSLCAG00010018785) rps3a (ENSLCAG00010018600) #22 ENSLCAG00010018589 FHIP1A (ENSLCAG00010018583) gatb (ENSLCAG00010018523) dctpp1 (ENSLCAG00010018508) FBXW7 (ENSLCAG00010018358) ENSLCAG00010018344 tma16 (ENSLCAG00010018341) ENSLCAG00010018340 ENSLCAG00010018338 ENSLCAG00010018336 tmem192 (ENSLCAG00010018335) limch1a (ENSLCAG00010018324) uchl1 (ENSLCAG00010018318) anxa5b (ENSLCAG00010018188) ENSLCAG00010018174 Seriola ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158660 ENSGT00930000150973.B.f ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000154778.d ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2729 mab21l2 (ENSSLDG00000010588) LRBA (ENSSLDG00000010441) rps3a (ENSSLDG00000010346) #22 sh3d19 (ENSSLDG00000010307) FHIP1A (ENSSLDG00000010276) gatb (ENSSLDG00000010253) dctpp1 (ENSSLDG00000010238) Greater amberjack MODERN SPECIES 13 hhip (ENSSDUG00000020557) ENSSDUG00000020543 smad1 (ENSSDUG00000020517) mmaa (ENSSDUG00000020496) ZNF827 (ENSSDUG00000020473) lsm6 (ENSSDUG00000020459) pou4f2 (ENSSDUG00000020438) ednraa (ENSSDUG00000020409) tmem184c (ENSSDUG00000020385) prmt9 (ENSSDUG00000020371) arhgap10 (ENSSDUG00000020345) nr3c2 (ENSSDUG00000020314) ENSSDUG00000020252 mab21l2 (ENSSDUG00000020226) LRBA (ENSSDUG00000020003) rps3a (ENSSDUG00000019960) #22 sh3d19 (ENSSDUG00000019944) FHIP1A (ENSSDUG00000019896) gatb (ENSSDUG00000019847) dctpp1 (ENSSDUG00000019830) FBXW7 (ENSSDUG00000019774) ENSSDUG00000019751 tma16 (ENSSDUG00000019734) ENSSDUG00000019716 ENSSDUG00000019709 ENSSDUG00000019704 tmem192 (ENSSDUG00000019698) limch1a (ENSSDUG00000019636) uchl1 (ENSSDUG00000019591) anxa5b (ENSSDUG00000019555) ENSSDUG00000019537 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162501 ENSGT00940000158660 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT00940000154778.d ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162501 ENSGT00940000158660 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000154778.d ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a Tetraodon MODERN SPECIES 10 smad1 (ENSTNIG00000017720) mmaa (ENSTNIG00000017721) ZNF827 (ENSTNIG00000017722) ENSTNIG00000017723 ENSTNIG00000017724 lsm6 (ENSTNIG00000017725) tada2b (ENSTNIG00000017726) pou4f2 (ENSTNIG00000017727) ednraa (ENSTNIG00000017728) tmem184c (ENSTNIG00000017729) prmt9 (ENSTNIG00000017730) ENSTNIG00000017731 nr3c2 (ENSTNIG00000017732) ENSTNIG00000017733 LRBA (ENSTNIG00000005417) rps3a (ENSTNIG00000003375) #22 sh3d19 (ENSTNIG00000003376) FHIP1A (ENSTNIG00000003377) gatb (ENSTNIG00000003378) ENSTNIG00000019686 dctpp1 (ENSTNIG00000001626) FBXW7 (ENSTNIG00000018665) obsl1a (ENSTNIG00000018664) tma16 (ENSTNIG00000018663) ENSTNIG00000018662 tmem192 (ENSTNIG00000018661) limch1a (ENSTNIG00000018660) uchl1 (ENSTNIG00000004294) anxa5b (ENSTNIG00000004295) fgfbp2b (ENSTNIG00000004296) prom1b (ENSTNIG00000004297) Fugu MODERN SPECIES 8 frem3 (ENSTRUG00000014228) hhip (ENSTRUG00000014300) smad1 (ENSTRUG00000014344) mmaa (ENSTRUG00000014393) ZNF827 (ENSTRUG00000014413) lsm6 (ENSTRUG00000023398) pou4f2 (ENSTRUG00000003608) ednra (ENSTRUG00000014468) tmem184c (ENSTRUG00000014566) prmt9 (ENSTRUG00000014623) arhgap10 (ENSTRUG00000014670) nr3c2 (ENSTRUG00000014871) ENSTRUG00000014927 mab21l2 (ENSTRUG00000023805) LRBA (ENSTRUG00000015006) rps3a (ENSTRUG00000015126) #22 ENSTRUG00000015161 FHIP1A (ENSTRUG00000015188) gatb (ENSTRUG00000015238) dctpp1 (ENSTRUG00000015271) FBXW7 (ENSTRUG00000015272) ENSTRUG00000025763 tma16 (ENSTRUG00000015324) ENSTRUG00000015335 ENSTRUG00000024940 ENSTRUG00000020278 tmem192 (ENSTRUG00000015356) ENSTRUG00000015361 uchl1 (ENSTRUG00000020388) anxa5b (ENSTRUG00000015464) ENSTRUG00000015541 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162501 ENSGT00940000158660 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT00940000154778.d ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a Ballan wrasse MODERN SPECIES 21 frem3 (ENSLBEG00000018220) hhip (ENSLBEG00000018285) smad1 (ENSLBEG00000018312) mmaa (ENSLBEG00000018336) ZNF827 (ENSLBEG00000018372) lsm6 (ENSLBEG00000018441) pou4f2 (ENSLBEG00000018457) ednraa (ENSLBEG00000018470) tmem184c (ENSLBEG00000018496) prmt9 (ENSLBEG00000018523) arhgap10 (ENSLBEG00000018567) nr3c2 (ENSLBEG00000018678) ENSLBEG00000019022 LRBA (ENSLBEG00000019205) mab21l2 (ENSLBEG00000019386) rps3a (ENSLBEG00000019411) #22 sh3d19 (ENSLBEG00000019446) FHIP1A (ENSLBEG00000019492) gatb (ENSLBEG00000019511) dctpp1 (ENSLBEG00000019532) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162501 ENSGT00940000158660 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT00940000154778.d ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a Perciformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162501 ENSGT00940000158660 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT00940000154778.d ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158660 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978.jb ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00940000154778.d ENSGT00940000178664 ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b Lumpfish MODERN SPECIES frem3 (ENSCLMG00005005089) hhip (ENSCLMG00005005095) smad1 (ENSCLMG00005005097) mmaa (ENSCLMG00005005153) ZNF827 (ENSCLMG00005005160) lsm6 (ENSCLMG00005005166) pou4f2 (ENSCLMG00005005167) ednraa (ENSCLMG00005005170) tmem184c (ENSCLMG00005005174) prmt9 (ENSCLMG00005005201) arhgap10 (ENSCLMG00005005214) nr3c2 (ENSCLMG00005005654) ENSCLMG00005005691 LRBA (ENSCLMG00005006889) ENSCLMG00005010464 rps3a (ENSCLMG00005010465) #22 sh3d19 (ENSCLMG00005010489) FHIP1A (ENSCLMG00005010490) gatb (ENSCLMG00005010491) dctpp1 (ENSCLMG00005010551) FBXW7 (ENSCLMG00005010561) ENSCLMG00005011444 tma16 (ENSCLMG00005011445) ENSCLMG00005011446 ENSCLMG00005011451 tmem192 (ENSCLMG00005011452) ENSCLMG00005011453 ENSCLMG00005011454 ENSCLMG00005011455 uchl1 (ENSCLMG00005011456) anxa5b (ENSCLMG00005011471) Stickleback MODERN SPECIES 4 frem3 (ENSGACG00000017233) hhip (ENSGACG00000017231) smad1 (ENSGACG00000017230) mmaa (ENSGACG00000017228) ZNF827 (ENSGACG00000017225) lsm6 (ENSGACG00000017223) pou4f2 (ENSGACG00000017221) ednraa (ENSGACG00000017219) tmem184c (ENSGACG00000017214) prmt9 (ENSGACG00000017206) arhgap10 (ENSGACG00000017201) nr3c2 (ENSGACG00000017193) ENSGACG00000017187 mab21l2 (ENSGACG00000017185) LRBA (ENSGACG00000017172) rps3a (ENSGACG00000017164) #22 sh3d19 (ENSGACG00000017147) FHIP1A (ENSGACG00000017145) gatb (ENSGACG00000017143) dctpp1 (ENSGACG00000017141) ENSGACG00000017136 tma16 (ENSGACG00000017134) ENSGACG00000017133 tmem192 (ENSGACG00000017130) ENSGACG00000017124 uchl1 (ENSGACG00000017099) anxa5b (ENSGACG00000017044) prom1b (ENSGACG00000017039) tapt1b (ENSGACG00000017035) clrn2 (ENSGACG00000017033) lap3 (ENSGACG00000016990) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162501 ENSGT00940000158660 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT00940000154778.d ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b Channel bull blenny MODERN SPECIES frem3 (ENSCGOG00000006684) hhip (ENSCGOG00000007090) smad1 (ENSCGOG00000007211) mmaa (ENSCGOG00000007267) ZNF827 (ENSCGOG00000007268) lsm6 (ENSCGOG00000007273) pou4f2 (ENSCGOG00000007277) ednraa (ENSCGOG00000007285) tmem184c (ENSCGOG00000007406) prmt9 (ENSCGOG00000007882) arhgap10 (ENSCGOG00000007952) nr3c2 (ENSCGOG00000009569) ENSCGOG00000009920 LRBA (ENSCGOG00000011941) mab21l2 (ENSCGOG00000013197) rps3a (ENSCGOG00000013200) #22 sh3d19 (ENSCGOG00000013235) FHIP1A (ENSCGOG00000013241) gatb (ENSCGOG00000013246) dctpp1 (ENSCGOG00000013318) FBXW7 (ENSCGOG00000013323) ENSCGOG00000013668 tma16 (ENSCGOG00000013675) ENSCGOG00000013679 ENSCGOG00000013682 ENSCGOG00000013685 tmem192 (ENSCGOG00000013686) ENSCGOG00000013690 uchl1 (ENSCGOG00000013704) anxa5b (ENSCGOG00000013773) ENSCGOG00000015166 Pike perch MODERN SPECIES 45 frem3 (ENSSLUG00000008040) hhip (ENSSLUG00000008057) smad1 (ENSSLUG00000008187) mmaa (ENSSLUG00000008201) ZNF827 (ENSSLUG00000008207) lsm6 (ENSSLUG00000008220) pou4f2 (ENSSLUG00000008234) ednraa (ENSSLUG00000008237) tmem184c (ENSSLUG00000008267) prmt9 (ENSSLUG00000008344) arhgap10 (ENSSLUG00000008414) nr3c2 (ENSSLUG00000008588) ENSSLUG00000008618 LRBA (ENSSLUG00000008831) mab21l2 (ENSSLUG00000013650) rps3a (ENSSLUG00000013653) #22 sh3d19 (ENSSLUG00000013662) FHIP1A (ENSSLUG00000013667) gatb (ENSSLUG00000013680) dctpp1 (ENSSLUG00000013761) FBXW7 (ENSSLUG00000013778) ENSSLUG00000013803 tma16 (ENSSLUG00000013808) ENSSLUG00000013883 ENSSLUG00000013888 tmem192 (ENSSLUG00000013895) limch1a (ENSSLUG00000013903) uchl1 (ENSSLUG00000013923) anxa5b (ENSSLUG00000013990) ENSSLUG00000015627 fgfbp2b (ENSSLUG00000015629) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000162501 ENSGT00940000158660 ENSGT00940000154391.a.a ENSGT00390000009908 ENSGT00940000156063.k ENSGT00940000154978 ENSGT00940000160339 ENSGT01100000263512.a.a.b.b ENSGT00940000155201.c ENSGT00940000158472 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333.j ENSGT00940000154895.b ENSGT00940000154778.d ENSGT01050000244827.C.c.b ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00940000155694.g ENSGT00950000182936.a.a.b.a ENSGT00390000016644 ENSGT00390000017709 ENSGT00940000154986.b ENSGT00730000112332 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000159346 ENSGT00940000176937 ENSGT01030000234803 ENSGT00390000013749 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a Gilthead seabream MODERN SPECIES frem3 (ENSSAUG00010008078) hhip (ENSSAUG00010008031) smad1 (ENSSAUG00010008009) mmaa (ENSSAUG00010008007) ZNF827 (ENSSAUG00010008005) lsm6 (ENSSAUG00010008003) pou4f2 (ENSSAUG00010008002) ednraa (ENSSAUG00010008000) tmem184c (ENSSAUG00010007969) prmt9 (ENSSAUG00010007940) arhgap10 (ENSSAUG00010007629) nr3c2 (ENSSAUG00010007622) ENSSAUG00010005678 mab21l2 (ENSSAUG00010005626) LRBA (ENSSAUG00010003158) rps3a (ENSSAUG00010002908) #22 sh3d19 (ENSSAUG00010002869) FHIP1A (ENSSAUG00010026456) gatb (ENSSAUG00010026440) dctpp1 (ENSSAUG00010026438) FBXW7 (ENSSAUG00010026377) ENSSAUG00010026373 tma16 (ENSSAUG00010026371) ENSSAUG00010026368 ENSSAUG00010026367 tmem192 (ENSSAUG00010026366) limch1a (ENSSAUG00010026362) uchl1 (ENSSAUG00010026360) anxa5b (ENSSAUG00010026304) ENSSAUG00010026301 fgfbp2b (ENSSAUG00010026299) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157297 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Ciona ANCESTRAL SPECIES 153 ENSGT00940000170505 ENSGT00940000156305 ENSGT00390000018433 #22 ENSGT00390000006284 ENSGT00550000075136 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 6 ENSCING00000019787 ENSCING00000005282 ENSCING00000019597 ENSCING00000021175 ENSCING00000011527 ENSCING00000005271 ENSCING00000013284 ENSCING00000005248 ENSCING00000019886 ENSCING00000005247 ENSCING00000005240 ENSCING00000005235 ENSCING00000005227 ENSCING00000005231 ENSCING00000005212 ENSCING00000005199 #22 ENSCING00000023436 ENSCING00000005197 ENSCING00000011525 ENSCING00000005193 ENSCING00000020568 ENSCING00000024203 ENSCING00000005183 ENSCING00000005180 ENSCING00000011523 ENSCING00000011522 ENSCING00000005174 thymosin beta (ENSCING00000005172) ENSCING00000005171 ENSCING00000022614 ENSCING00000022821 Ciona savignyi MODERN SPECIES 113 ENSCSAVG00000011486 ENSCSAVG00000011504 ENSCSAVG00000011579 ENSCSAVG00000011582 ENSCSAVG00000011585 ENSCSAVG00000011588 ENSCSAVG00000011592 ENSCSAVG00000011594 ENSCSAVG00000011595 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