Neopterygii	DUPLICATION
Neopterygii	DUPLICATION
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	625																ENSGT00940000154813.e.a #22	ENSGT00940000161215	ENSGT00940000162096
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	705																ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000161215	ENSGT00940000162096
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	183	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01000000214789	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000161215	ENSGT00940000162096	ENSGT00500000045140.a.a	ENSGT00530000063743.a	ENSGT00940000164922.g.a
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	203	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000161215
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	2								ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000161215	ENSGT00940000158256.h	ENSGT00940000160433	ENSGT01100000263687	ENSGT00940000156867	ENSGT00510000048008	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000161294	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000004214	ENSGT00940000163471.a	ENSGT00390000001244	ENSGT00940000156964.B
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	5								ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000161215	ENSGT00940000158256.h	ENSGT00940000160433	ENSGT00940000156867	ENSGT00510000048008	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000161294	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000004214	ENSGT00940000163471.a	ENSGT00390000001244	ENSGT00940000156964.B	ENSGT00940000159924.c.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	3								ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000161215	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000163160.b.a.b	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00390000015438	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000167057	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000154883.e.b
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000163852.c.b	ENSGT01030000235138	ENSGT00390000015789	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00990000204060	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00940000163160.b.a.b	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000161103.a
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000177501	ENSGT00940000163852.c.b	ENSGT01030000235138	ENSGT00390000015789	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00940000163160.b.a.b	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000161103.a
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000177501	ENSGT00940000163852.c.b	ENSGT01030000235138	ENSGT00390000015789	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000167057	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00940000163160.b.a.b.b.b	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00940000163160.b.a.b.b.a	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00940000165332.A.d	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00390000008969
Oryzias	DUPLICATION
Oryzias	DUPLICATION
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000004994	ENSGT01100000263476.B.b.b.b.b.d.s.b	ENSGT00940000163160.b.a.b.b.b	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.b	ENSGT00940000163160.b.a.b.b.a.a	ENSGT00940000154813.e.a.b.q.a ##22	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154813.e.a.b.r ##22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT00980000199324	ENSGT00940000154813.e.a.b.q.b #22	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000165332.A.d	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000158256.h	ENSGT00510000048008	ENSGT00940000156867	ENSGT01050000246023	ENSGT01100000263724
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000004994	ENSGT01100000263476.B.b.b.b.b.d.s.b	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00940000163160.b.a.b.b.b	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.b	ENSGT00940000163160.b.a.b.b.a.a	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154813.e.a.b.r ##22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000178079	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00940000154813.e.a.b.q.a ##22	ENSGT00940000154813.e.a.b.q.b #22	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000158256.h	ENSGT00510000048008	ENSGT00940000156867	ENSGT01050000246023	ENSGT01100000263724	ENSGT00390000006930	ENSGT00940000160144
Chinese medaka	MODERN SPECIES	3999																hsp70.1 (ENSOSIG00000013405) #22
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	22	ENSORLG00000000282	JMJD8 (ENSORLG00000000268)	ENSORLG00000000256	ENSORLG00000000252	ENSORLG00000000242	ENSORLG00000021926	ENSORLG00000000238	HSPA2 (ENSORLG00000026984) ##22	ENSORLG00000028255 ##22	ENSORLG00000000228	cdipt (ENSORLG00000000218)	ENSORLG00000025329	nlk1 (ENSORLG00000000204)	ENSORLG00000000200	ENSORLG00000026256 ##22	ENSORLG00000027683 #22	sh2b1 (ENSORLG00000026761)	spns1 (ENSORLG00000025765)	sgf29 (ENSORLG00000027873)	nupr1b (ENSORLG00000027309)	ENSORLG00000000189	ENSORLG00000024186	ENSORLG00000023082	mvp (ENSORLG00000019976)	CASKIN2 (ENSORLG00000023488)	ENSORLG00000026086	mettl23 (ENSORLG00000029016)	jmjd6 (ENSORLG00000018477)	ENSORLG00000022520	si:ch73-366l1.5 (ENSORLG00000029855)	casc3 (ENSORLG00000023125)
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00940000164818.c.b	ENSGT00940000160144	ENSGT01050000246023	ENSGT00940000156867	ENSGT00510000048008	ENSGT00940000158256.h	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00940000165332.A.d	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b.q.b #22	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.q
Indian medaka	DUPLICATION
Indian medaka	MODERN SPECIES	292														zgc:100868 (ENSOMEG00000019963)	HSPA2 (ENSOMEG00000019975) #22	ENSOMEG00000019987 #22	sh2b1 (ENSOMEG00000020014)	spns1 (ENSOMEG00000020050)	ENSOMEG00000020062	sgf29 (ENSOMEG00000020118)	nupr1b (ENSOMEG00000020140)	DOC2A (ENSOMEG00000020145)	ENSOMEG00000020158	ENSOMEG00000020171	mvp (ENSOMEG00000020196)	ENSOMEG00000020220	mettl23 (ENSOMEG00000020235)	jmjd6 (ENSOMEG00000020263)	RAPGEFL1 (ENSOMEG00000020313)	ENSOMEG00000020359	cyt1 (ENSOMEG00000020391)
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Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	8					ENSGT00940000159512	ENSGT00940000163852.c.b.g	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.s.b	ENSGT01030000235138	ENSGT00390000015789	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000012605	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163160.b.a.b.b.a	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00390000007119.f	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000007119.e	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00940000165332.A.d	ENSGT00940000161103.a
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Platyfish	DUPLICATION
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Mangrove rivulus	DUPLICATION
Mangrove rivulus	DUPLICATION
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	1052																ENSKMAG00000017129 #22
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	891													ENSKMAG00000006078	ENSKMAG00000006095	dhrs7ca (ENSKMAG00000006117)	ENSKMAG00000006137 #22
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Clown anemonefish	DUPLICATION
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Orange clownfish	DUPLICATION
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Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156867	ENSGT01100000263724	ENSGT00940000160433	ENSGT00940000158256.h	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000161215.h	ENSGT00940000163160.b.a.b	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00390000015438	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00990000204060	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00940000156895
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.`b.a	ENSGT00940000163009.b.b	ENSGT00390000015789	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000156895	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00990000204060	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000161103.a
Nile tilapia	MODERN SPECIES	16	ENSONIG00000032384	mettl23 (ENSONIG00000009344)	jmjd6 (ENSONIG00000009346)	ST6GALNAC2 (ENSONIG00000009350)	CASKIN2 (ENSONIG00000009354)	ENSONIG00000009361	mvp (ENSONIG00000009362)	ENSONIG00000028269	ENSONIG00000035759	ENSONIG00000011475	nupr1 (ENSONIG00000030313)	sgf29 (ENSONIG00000009377)	spns1 (ENSONIG00000009386)	atxn2l (ENSONIG00000009388)	sh2b1 (ENSONIG00000009394)	hsp70.2 (ENSONIG00000037051) #22	TLCD3B (ENSONIG00000029841)	nlk1 (ENSONIG00000009396)	ENSONIG00000009401	cdipt (ENSONIG00000009405)	ENSONIG00000009407	ENSONIG00000038306	prss60.1 (ENSONIG00000039763)	JMJD8 (ENSONIG00000030339)	ENSONIG00000040304	STUB1 (ENSONIG00000009413)	CAPN15 (ENSONIG00000009415)	amdhd2 (ENSONIG00000035651)	ENSONIG00000038706	ubald2 (ENSONIG00000041837)	ENSONIG00000009423
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.`b.a	ENSGT00940000163852.c.b.e.b.a	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.`b.b.a	ENSGT00940000163852.c.b.e.b.b	ENSGT00390000015789	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000156895	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000161103.a
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	427					zgc:100868 (ENSNBRG00000021141)	ENSNBRG00000021131	ENSNBRG00000021114	eif1 (ENSNBRG00000021093)	srsf2b (ENSNBRG00000021086)	mfsd11 (ENSNBRG00000021065)	ubald2 (ENSNBRG00000021049)	foxj1a (ENSNBRG00000021040)	CAPN15 (ENSNBRG00000020996)	STUB1 (ENSNBRG00000020977)	JMJD8 (ENSNBRG00000020953)	hsp70.1 (ENSNBRG00000020947) #22	ENSNBRG00000020938	ENSNBRG00000020916	cdipt (ENSNBRG00000020904)	ENSNBRG00000020890	nlk1 (ENSNBRG00000020866)	TLCD3B (ENSNBRG00000020855)	atxn2l (ENSNBRG00000020833)	spns1 (ENSNBRG00000020801)	sgf29 (ENSNBRG00000020775)	ENSNBRG00000020766	ENSNBRG00000020748	ENSNBRG00000020731	ENSNBRG00000020711	ENSNBRG00000020692	CASKIN2 (ENSNBRG00000020638)
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.`b.a	ENSGT00940000163852.c.b.e.b.a	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.`b.b.a	ENSGT00940000163852.c.b.e.b.b	ENSGT00390000015789	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000156895	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000161103.a
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.`b.a	ENSGT00940000163852.c.b.e.b.a	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.`b.b.a	ENSGT00940000163852.c.b.e.b.b	ENSGT00390000015789	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000156895	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000161103.a
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000163852.c.b.e.a.b	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.`b.a	ENSGT00940000163852.c.b.e.b.a	ENSGT00940000163852.c.b.e.b.b.b	ENSGT00390000015789	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000156895	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000161103.a
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1107	ENSMZEG00005001879	zgc:100868 (ENSMZEG00005001827)	ENSMZEG00005001798	ENSMZEG00005001780	eif1 (ENSMZEG00005001760)	ENSMZEG00005001748	mfsd11 (ENSMZEG00005001716)	ENSMZEG00005001696	ubald2 (ENSMZEG00005001681)	foxj1a (ENSMZEG00005001622)	amdhd2 (ENSMZEG00005001569)	CAPN15 (ENSMZEG00005001529)	STUB1 (ENSMZEG00005001503)	JMJD8 (ENSMZEG00005001490)	prss60.1 (ENSMZEG00005001473)	hsp70.1 (ENSMZEG00005001469) #22	ENSMZEG00005001418	cdipt (ENSMZEG00005001404)	ENSMZEG00005001384	nlk1 (ENSMZEG00005001352)	TLCD3B (ENSMZEG00005001345)	sh2b1 (ENSMZEG00005001312)	atxn2l (ENSMZEG00005001258)	spns1 (ENSMZEG00005001227)	ENSMZEG00005001214	sgf29 (ENSMZEG00005001194)	nupr1b (ENSMZEG00005001177)	ENSMZEG00005001160	ENSMZEG00005001155	suz12a (ENSMZEG00005001110)	crlf3 (ENSMZEG00005001075)
Eastern happy	MODERN SPECIES	16	zgc:100868 (ENSACLG00000018244)	ENSACLG00000017935	ENSACLG00000017898	eif1 (ENSACLG00000017878)	srsf2b (ENSACLG00000017862)	mfsd11 (ENSACLG00000017705)	ENSACLG00000017619	ENSACLG00000017606	ubald2 (ENSACLG00000017591)	foxj1a (ENSACLG00000017578)	amdhd2 (ENSACLG00000017526)	CAPN15 (ENSACLG00000017501)	STUB1 (ENSACLG00000017473)	JMJD8 (ENSACLG00000017426)	prss60.2 (ENSACLG00000017408)	hsp70.1 (ENSACLG00000017399) #22	ENSACLG00000017373	cdipt (ENSACLG00000017268)	ENSACLG00000017234	nlk1 (ENSACLG00000017185)	TLCD3B (ENSACLG00000017172)	sh2b1 (ENSACLG00000017043)	atxn2l (ENSACLG00000016900)	spns1 (ENSACLG00000016847)	ENSACLG00000016798	nfatc2ip (ENSACLG00000016774)	sgf29 (ENSACLG00000016730)	nupr1b (ENSACLG00000016716)	ENSACLG00000016651	ENSACLG00000016628	ENSACLG00000016614
P. nyererei	DUPLICATION
P. nyererei	MODERN SPECIES	1148																ENSPNYG00000023546 #22
P. nyererei	MODERN SPECIES	497		zgc:100868 (ENSPNYG00000013124)	ENSPNYG00000013100	zgc:100868 (ENSPNYG00000013078)	ENSPNYG00000013062	eif1 (ENSPNYG00000013039)	srsf2b (ENSPNYG00000013014)	mfsd11 (ENSPNYG00000012968)	ubald2 (ENSPNYG00000012928)	foxj1a (ENSPNYG00000012904)	amdhd2 (ENSPNYG00000012862)	CAPN15 (ENSPNYG00000012833)	STUB1 (ENSPNYG00000012805)	JMJD8 (ENSPNYG00000012784)	prss60.2 (ENSPNYG00000012764)	HSPA2 (ENSPNYG00000012752) #22	ENSPNYG00000012701	cdipt (ENSPNYG00000012670)	ENSPNYG00000012636	nlk1 (ENSPNYG00000012597)	TLCD3B (ENSPNYG00000012557)	sh2b1 (ENSPNYG00000012535)	atxn2l (ENSPNYG00000012482)	spns1 (ENSPNYG00000012439)	ENSPNYG00000012406	sgf29 (ENSPNYG00000012353)	nupr1b (ENSPNYG00000012309)	DOC2A (ENSPNYG00000012267)	ENSPNYG00000012247	ENSPNYG00000012233	mvp (ENSPNYG00000012193)
Burton s mouthbrooder	DUPLICATION
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Fugu	DUPLICATION
Fugu	DUPLICATION
Fugu	DUPLICATION
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Fugu	DUPLICATION
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Tetraodon	MODERN SPECIES	18	kat8 (ENSTNIG00000011297)	ENSTNIG00000011298	anapc2 (ENSTNIG00000011299)	ENSTNIG00000011300	ENSTNIG00000011301	arl6ip1 (ENSTNIG00000011302)	fus (ENSTNIG00000011303)	zgc:100868 (ENSTNIG00000011304)	eif1 (ENSTNIG00000011305)	mfsd11 (ENSTNIG00000011306)	ubald2 (ENSTNIG00000011307)	ENSTNIG00000011308	amdhd2 (ENSTNIG00000011309)	CAPN15 (ENSTNIG00000004278)	ENSTNIG00000004279	ENSTNIG00000004281 #22	ENSTNIG00000004283	dcp2 (ENSTNIG00000004284)	ENSTNIG00000003222	nlk1 (ENSTNIG00000003221)	TLCD3B (ENSTNIG00000003220)	mybpc2a (ENSTNIG00000003219)	LRRC4B (ENSTNIG00000002646)	ENSTNIG00000001679	SYT3 (ENSTNIG00000006190)	SHANK1 (ENSTNIG00000014915)	kmt5c (ENSTNIG00000014916)	ppp1caa (ENSTNIG00000014917)	cldni (ENSTNIG00000014918)	coro1a (ENSTNIG00000014919)	paqr4a (ENSTNIG00000014920)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157290	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b	ENSGT01030000235138	ENSGT00390000015789	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00990000204060	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000161103.a
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	1917															ENSLBEG00000005732	HSPA2 (ENSLBEG00000006151) #22	TLCD3B (ENSLBEG00000006169)
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Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157290	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b	ENSGT01030000235138	ENSGT00390000015789	ENSGT01100000263483.E.a.d	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00980000200578	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00510000048008
Stickleback	DUPLICATION
Stickleback	DUPLICATION
Stickleback	DUPLICATION
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Lumpfish	MODERN SPECIES	23	ENSCLMG00005002099	arl6ip1 (ENSCLMG00005002096)	zgc:100868 (ENSCLMG00005002095)	ENSCLMG00005002094	eif1 (ENSCLMG00005002092)	ENSCLMG00005002090	srsf2b (ENSCLMG00005002089)	mfsd11 (ENSCLMG00005002070)	ubald2 (ENSCLMG00005002060)	ENSCLMG00005002050	amdhd2 (ENSCLMG00005001983)	CAPN15 (ENSCLMG00005001458)	STUB1 (ENSCLMG00005001325)	ENSCLMG00005001297	ENSCLMG00005001277	hsp70.1 (ENSCLMG00005001276) #22	ENSCLMG00005001251	cdipt (ENSCLMG00005001249)	ENSCLMG00005001248	nlk1 (ENSCLMG00005001245)	TLCD3B (ENSCLMG00005001239)	sh2b1 (ENSCLMG00005001236)	atxn2l (ENSCLMG00005001230)	spns1 (ENSCLMG00005001173)	ENSCLMG00005001225	nfatc2ip (ENSCLMG00005001172)	sgf29 (ENSCLMG00005001171)	nupr1b (ENSCLMG00005001170)	ENSCLMG00005001169	ENSCLMG00005001168	ENSCLMG00005001166
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Eupecaria_C	DUPLICATION
Eupecaria_C	DUPLICATION
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154813.e.a.b.l #22	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.e.a	ENSGT00940000154813.e.a.b.k.a #22	ENSGT00940000161215.g.b	ENSGT00990000204060	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000015789	ENSGT01030000235138	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b	ENSGT00940000157290	ENSGT00940000154937
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00510000048008	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.e.a	ENSGT00940000154813.e.a.b.k.a #22	ENSGT00940000161215.g.b	ENSGT00990000204060	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000015789	ENSGT01030000235138	ENSGT00940000155138	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b	ENSGT00940000157290
European seabass	DUPLICATION
European seabass	DUPLICATION
European seabass	DUPLICATION
European seabass	MODERN SPECIES	79														ENSDLAG00005034728 #22	ENSDLAG00005028429 #22	ENSDLAG00005021349 #22	ENSDLAG00005033047	ENSDLAG00005001409
European seabass	MODERN SPECIES	79															ENSDLAG00005034728 #22	ENSDLAG00005028429 #22	ENSDLAG00005021349 #22	ENSDLAG00005033047	ENSDLAG00005001409
European seabass	MODERN SPECIES	79																ENSDLAG00005034728 #22	ENSDLAG00005028429 #22	ENSDLAG00005021349 #22	ENSDLAG00005033047	ENSDLAG00005001409
European seabass	MODERN SPECIES	21	ENSDLAG00005013614	ENSDLAG00005023503	ENSDLAG00005031465	ENSDLAG00005022240	ENSDLAG00005023619	ENSDLAG00005023621	ENSDLAG00005023624	ENSDLAG00005023626	ENSDLAG00005023628	ENSDLAG00005001389	ENSDLAG00005002999 #22	ENSDLAG00005026520	ENSDLAG00005027795	ENSDLAG00005032353	ENSDLAG00005033344	ENSDLAG00005026566 #22	ENSDLAG00005003931	cdipt (ENSDLAG00005031013)	ENSDLAG00005006022	nlk1 (ENSDLAG00005001446)	ENSDLAG00005001646	sh2b1 (ENSDLAG00005001683)	ENSDLAG00005001700	spns1 (ENSDLAG00005030183)	spns1 (ENSDLAG00005032499)	ENSDLAG00005026332	ENSDLAG00005031502	mettl23 (ENSDLAG00005030957)	ENSDLAG00005002100	ENSDLAG00005002110	ENSDLAG00005002128
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	483	fus (ENSLCRG00005004603)	ENSLCRG00005004605	eif1 (ENSLCRG00005004606)	srsf2b (ENSLCRG00005004615)	mfsd11 (ENSLCRG00005004618)	ENSLCRG00005004627	ubald2 (ENSLCRG00005004631)	ENSLCRG00005004632	amdhd2 (ENSLCRG00005004633)	CAPN15 (ENSLCRG00005004638)	STUB1 (ENSLCRG00005004639)	ENSLCRG00005004640	ENSLCRG00005004641	JMJD8 (ENSLCRG00005004643)	ENSLCRG00005004645	hsp70.1 (ENSLCRG00005004647) #22	ENSLCRG00005004661	cdipt (ENSLCRG00005005601)	ENSLCRG00005005603	nlk1 (ENSLCRG00005005609)	ENSLCRG00005005708	sh2b1 (ENSLCRG00005005709)	atxn2l (ENSLCRG00005005710)	spns1 (ENSLCRG00005005724)	ENSLCRG00005005826	ENSLCRG00005005827	sgf29 (ENSLCRG00005005828)	nupr1b (ENSLCRG00005005832)	mettl23 (ENSLCRG00005005833)	jmjd6 (ENSLCRG00005005836)	si:ch73-366l1.5 (ENSLCRG00005005839)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	128															ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b.k.b #22
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b.k.b #22
European seabass	MODERN SPECIES	21	ENSDLAG00005026332	spns1 (ENSDLAG00005032499)	spns1 (ENSDLAG00005030183)	ENSDLAG00005001700	sh2b1 (ENSDLAG00005001683)	ENSDLAG00005001646	nlk1 (ENSDLAG00005001446)	ENSDLAG00005006022	cdipt (ENSDLAG00005031013)	ENSDLAG00005003931	ENSDLAG00005026566 #22	ENSDLAG00005033344	ENSDLAG00005032353	ENSDLAG00005027795	ENSDLAG00005026520	ENSDLAG00005002999 #22	ENSDLAG00005001389	ENSDLAG00005023628	ENSDLAG00005023626	ENSDLAG00005023624	ENSDLAG00005023621	ENSDLAG00005023619	ENSDLAG00005022240	ENSDLAG00005031465	ENSDLAG00005023503	ENSDLAG00005013614	ENSDLAG00005026815	ENSDLAG00005034784	ENSDLAG00005030014	ENSDLAG00005014161	ENSDLAG00005026978
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	15	sgf29 (ENSSAUG00010013944)	nfatc2ip (ENSSAUG00010013935)	ENSSAUG00010013929	spns1 (ENSSAUG00010012995)	atxn2l (ENSSAUG00010012959)	sh2b1 (ENSSAUG00010012956)	nlk1 (ENSSAUG00010012787)	MAZ (ENSSAUG00010012775)	cdipt (ENSSAUG00010012774)	dcp2 (ENSSAUG00010012773)	ENSSAUG00010012654	ENSSAUG00010012646 #22	JMJD8 (ENSSAUG00010012642)	ENSSAUG00010012640	ENSSAUG00010012638	HSPA2 (ENSSAUG00010012636) #22	ENSSAUG00010012632	ENSSAUG00010012630	ENSSAUG00010012627	ENSSAUG00010012624	CAPN15 (ENSSAUG00010012619)	amdhd2 (ENSSAUG00010012610)	ENSSAUG00010012602	ubald2 (ENSSAUG00010021329)	mfsd11 (ENSSAUG00010021318)	srsf2b (ENSSAUG00010021315)	eif1 (ENSSAUG00010021314)	ENSSAUG00010021313	zgc:100868 (ENSSAUG00010021312)	zgc:100868 (ENSSAUG00010021309)	zgc:100868 (ENSSAUG00010021296)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT01030000235138	ENSGT00390000015789	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00990000204060	ENSGT00940000161215.g.b	ENSGT00940000154813.e.a.b.k.a #22	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.e.a	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000154813.e.a.b.l #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00510000048008	ENSGT00940000156867	ENSGT01100000263724
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	15	eif1 (ENSSAUG00010021314)	srsf2b (ENSSAUG00010021315)	mfsd11 (ENSSAUG00010021318)	ubald2 (ENSSAUG00010021329)	ENSSAUG00010012602	amdhd2 (ENSSAUG00010012610)	CAPN15 (ENSSAUG00010012619)	ENSSAUG00010012624	ENSSAUG00010012627	ENSSAUG00010012630	ENSSAUG00010012632	HSPA2 (ENSSAUG00010012636) #22	ENSSAUG00010012638	ENSSAUG00010012640	JMJD8 (ENSSAUG00010012642)	ENSSAUG00010012646 #22	ENSSAUG00010012654	dcp2 (ENSSAUG00010012773)	cdipt (ENSSAUG00010012774)	MAZ (ENSSAUG00010012775)	nlk1 (ENSSAUG00010012787)	sh2b1 (ENSSAUG00010012956)	atxn2l (ENSSAUG00010012959)	spns1 (ENSSAUG00010012995)	ENSSAUG00010013929	nfatc2ip (ENSSAUG00010013935)	sgf29 (ENSSAUG00010013944)	nupr1b (ENSSAUG00010013963)	mettl23 (ENSSAUG00010013965)	jmjd6 (ENSSAUG00010013968)	ENSSAUG00010013984
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000015789	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00990000204060	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00940000163160.b.a.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT00980000199324	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000015229	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000158256.h	ENSGT00940000160433
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Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00510000048008	ENSGT00940000156867	ENSGT01100000263724	ENSGT00940000160433	ENSGT00940000158256.h	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.c.b.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00960000186816	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00390000015438	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000154883.e.b
Siamese fighting fish	DUPLICATION
Siamese fighting fish	DUPLICATION
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Climbing perch	MODERN SPECIES	21	JMJD6 (ENSATEG00000017255)	si:ch73-366l1.5 (ENSATEG00000017298)	ST6GALNAC2 (ENSATEG00000017313)	ENSATEG00000017341	mvp (ENSATEG00000017429)	ENSATEG00000017496	ENSATEG00000027527	ENSATEG00000017522	nupr1b (ENSATEG00000017559)	sgf29 (ENSATEG00000029467)	ENSATEG00000025541	spns1 (ENSATEG00000017627)	atxn2l (ENSATEG00000017689)	sh2b1 (ENSATEG00000017736)	ENSATEG00000017775	ENSATEG00000017966 #22	ENSATEG00000017796	nlk1 (ENSATEG00000017834)	ENSATEG00000017866	cdipt (ENSATEG00000017887)	ENSATEG00000017911	ENSATEG00000017974	ENSATEG00000017983	ENSATEG00000017993	ENSATEG00000018032	ENSATEG00000018060	ENSATEG00000025710	ubald2 (ENSATEG00000028080)	ENSATEG00000018119	ENSATEG00000018144	srsf2b (ENSATEG00000018159)
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	22	ENSMAMG00000019135	ENSMAMG00000019122	ENSMAMG00000019083	ENSMAMG00000019061	ENSMAMG00000027723	ENSMAMG00000026700	ENSMAMG00000018999	ENSMAMG00000018965	ENSMAMG00000024641	ENSMAMG00000018931	ENSMAMG00000026778	ENSMAMG00000018914	ENSMAMG00000027395	ENSMAMG00000026369	ENSMAMG00000025416	ENSMAMG00000018075 #22	ENSMAMG00000018784	cdipt (ENSMAMG00000026556)	ENSMAMG00000018743	nlk1 (ENSMAMG00000025830)	ENSMAMG00000018693	ENSMAMG00000025850	ENSMAMG00000026943	ENSMAMG00000025467	ENSMAMG00000018036	ENSMAMG00000026956	sh2b1 (ENSMAMG00000017997)	atxn2l (ENSMAMG00000017977)	spns1 (ENSMAMG00000017952)	ENSMAMG00000017936	ENSMAMG00000017924
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154937	ENSGT00940000157290	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.p	ENSGT01030000235138	ENSGT00390000015789	ENSGT00940000154883.e.b	ENSGT00390000012918.c	ENSGT00940000161294.f	ENSGT00390000008825.b.b	ENSGT00940000164514.b	ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163160.b.a.b
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	105									ENSGT00390000012605	ENSGT00940000158312.f	ENSGT00930000151045.e	ENSGT00940000163160.b.a.b.c	ENSGT00390000015438	ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a	ENSGT00940000163160.b.a.b.d	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	196																ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000159991.A.a
Greater amberjack	DUPLICATION
Greater amberjack	MODERN SPECIES	253																HSPA2 (ENSSDUG00000004021) #22	TLCD3B (ENSSDUG00000004036)	nlk1 (ENSSDUG00000004054)	ENSSDUG00000004067	cdipt (ENSSDUG00000004100)	ENSSDUG00000004124
Greater amberjack	MODERN SPECIES	151	flii (ENSSDUG00000001845)	rpusd1 (ENSSDUG00000001829)	slc25a17 (ENSSDUG00000001808)	znf598 (ENSSDUG00000001788)	syngr3a (ENSSDUG00000001755)	gfer (ENSSDUG00000001736)	drg2 (ENSSDUG00000001687)	ENSSDUG00000001668	LLGL1 (ENSSDUG00000001561)	ENSSDUG00000001530	JMJD8 (ENSSDUG00000001512)	ENSSDUG00000001003	STUB1 (ENSSDUG00000000938)	CAPN15 (ENSSDUG00000000928)	amdhd2 (ENSSDUG00000000864)	ENSSDUG00000000835 #22
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3256	znf598 (ENSSLDG00000020893)	syngr3a (ENSSLDG00000020920)	gfer (ENSSLDG00000020931)	drg2 (ENSSLDG00000020938)	ENSSLDG00000020971	ENSSLDG00000020977	LLGL1 (ENSSLDG00000020998)	ENSSLDG00000021074	JMJD8 (ENSSLDG00000021085)	ENSSLDG00000021110	ENSSLDG00000021119	ENSSLDG00000021142	STUB1 (ENSSLDG00000021176)	CAPN15 (ENSSLDG00000021217)	amdhd2 (ENSSLDG00000021249)	hsp70.1 (ENSSLDG00000021289) #22	ENSSLDG00000021305	ENSSLDG00000021338	ENSSLDG00000021361	btr30 (ENSSLDG00000021466)	ENSSLDG00000021494	ENSSLDG00000021524	kpnb1 (ENSSLDG00000021549)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	39	fus (ENSLCAG00010011048)	ENSLCAG00010011026	ENSLCAG00010011013	eif1 (ENSLCAG00010011008)	ENSLCAG00010011000	mfsd11 (ENSLCAG00010010995)	ubald2 (ENSLCAG00010010960)	ENSLCAG00010010956	amdhd2 (ENSLCAG00010010950)	ENSLCAG00010010931	CAPN15 (ENSLCAG00010010914)	STUB1 (ENSLCAG00010010904)	ENSLCAG00010010898	JMJD8 (ENSLCAG00010010895)	ENSLCAG00010010891	hsp70.2 (ENSLCAG00010010887) #22	ENSLCAG00010010785	ENSLCAG00010010766	cdipt (ENSLCAG00010010757)	MAZ (ENSLCAG00010010755)	nlk1 (ENSLCAG00010010715)	ENSLCAG00010010705	TLCD3B (ENSLCAG00010010702)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	111										ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.a	ENSGT00940000165613	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000159991.A.a
Tongue sole	MODERN SPECIES	8	ENSCSEG00000010969	stx1b (ENSCSEG00000010796)	ENSCSEG00000010769	si:ch73-366l1.5 (ENSCSEG00000010765)	ENSCSEG00000010751	jmjd6 (ENSCSEG00000010738)	mettl23 (ENSCSEG00000010731)	ENSCSEG00000010716	DOC2A (ENSCSEG00000010693)	mfsd11 (ENSCSEG00000010628)	nupr1b (ENSCSEG00000010613)	spns1 (ENSCSEG00000010599)	ENSCSEG00000010590	sgf29 (ENSCSEG00000010575)	sh2b1 (ENSCSEG00000010548)	hsp70.1 (ENSCSEG00000010538) #22	ENSCSEG00000010532	nlk1 (ENSCSEG00000010513)	ENSCSEG00000010495	cdipt (ENSCSEG00000010486)	ENSCSEG00000010151	ENSCSEG00000010104	RAPGEFL1 (ENSCSEG00000010062)	casc3 (ENSCSEG00000010047)	rnf25 (ENSCSEG00000010034)	anapc2 (ENSCSEG00000009995)	ENSCSEG00000009988	ENSCSEG00000009971	arl6ip1 (ENSCSEG00000009945)	eif1 (ENSCSEG00000009928)	ENSCSEG00000009919
Turbot	MODERN SPECIES	10	ENSSMAG00000014923	ENSSMAG00000035774	ENSSMAG00000032661	ENSSMAG00000015095	ENSSMAG00000025412	ENSSMAG00000032563	ENSSMAG00000016779	ENSSMAG00000027101	ENSSMAG00000030525	nupr1b (ENSSMAG00000016665)	sgf29 (ENSSMAG00000016613)	spns1 (ENSSMAG00000016503)	ENSSMAG00000026927	atxn2l (ENSSMAG00000016365)	sh2b1 (ENSSMAG00000016334)	ENSSMAG00000028984 #22	ENSSMAG00000016241	cdipt (ENSSMAG00000016219)	ENSSMAG00000016191	nlk1 (ENSSMAG00000016150)	ENSSMAG00000016141	ENSSMAG00000016128	ENSSMAG00000016107	ENSSMAG00000016096	ENSSMAG00000016056	ENSSMAG00000030508	ENSSMAG00000015974	ENSSMAG00000015961	ENSSMAG00000037295	cyt1 (ENSSMAG00000015224)	ENSSMAG00000022413
Tiger tail seahorse	DUPLICATION
Tiger tail seahorse	DUPLICATION
Tiger tail seahorse	DUPLICATION
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Atlantic salmon	DUPLICATION
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River trout	DUPLICATION
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Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	119	ENSGT00940000154014.b.a	ENSGT00950000182881.a.a.b.i.b.b	ENSGT00950000182910.b.g.b.i	ENSGT01050000244905.B.m.b	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a.c	ENSGT00940000164828.c	ENSGT00390000014272.f	ENSGT00940000156363.b.c	ENSGT00940000154971.u.b.a	ENSGT00940000158799.g.b.a	ENSGT00940000153173.b.b.l	ENSGT00940000157202.h.d	ENSGT00940000157943.b.b	ENSGT00940000155338.r.f	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.b.b #22	ENSGT00940000154813.e.a.b.hb.b #22	ENSGT00390000007911.q.a	ENSGT00510000048410.b	ENSGT00940000154881.d.j	ENSGT00940000159275.a.d	ENSGT00940000154664.h.i.b	ENSGT00390000012959.a.g.g	ENSGT00940000156331.a.b.d	ENSGT00940000153814.b.e.d	ENSGT00940000159790.c.b.g.a.b	ENSGT00940000165750.c	ENSGT00950000183092.b.a.b.d	ENSGT00940000153845.a.a.a	ENSGT00940000157595.f	ENSGT00940000160871.d.b.f	ENSGT00730000111283.a.f
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000160415.f.d	ENSGT00940000154014.b.a.i	ENSGT00950000182881.a.a.b.i.b.a	ENSGT00950000182910.b.g.b.j	ENSGT01050000244905.B.m.a	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a.d	ENSGT00940000164828.d	ENSGT00390000014272.e	ENSGT00940000156363.b.d	ENSGT00940000154971.u.b.a.c	ENSGT00940000158799.g.b.a.b	ENSGT00940000153173.b.b.l	ENSGT00940000157202.h.d	ENSGT00940000157943.b.b	ENSGT00940000155338.r.f	ENSGT00940000154813.e.a.b.hb.b #22	ENSGT00390000007911.q.a	ENSGT00510000048410.b	ENSGT00940000154881.d.j	ENSGT00940000159275.a.d	ENSGT00940000154664.h.i.b.a	ENSGT00390000012959.a.g.g	ENSGT00940000156331.a.b.d	ENSGT00940000153814.b.e.d	ENSGT00940000159790.c.b.g.b	ENSGT00940000165750.c	ENSGT00950000183092.b.a.b.d	ENSGT00940000153845.a.a.b.b	ENSGT00940000157595.f	ENSGT00940000160871.d.b.f	ENSGT00730000111283.a.f
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	22	HSD17B1 (ENSSSAG00000104290)	ENSSSAG00000003925	ATP6V0A1 (ENSSSAG00000009990)	CAVIN1 (ENSSSAG00000003721)	stat3 (ENSSSAG00000003657)	stat5a (ENSSSAG00000003584)	ENSSSAG00000003548	hcrt (ENSSSAG00000110302)	kcnh4a (ENSSSAG00000003434)	RAB5C (ENSSSAG00000003377)	kat2a (ENSSSAG00000022875)	dhx58 (ENSSSAG00000003156)	ZNF385C (ENSSSAG00000003108)	kbrs2 (ENSSSAG00000003089)	dnjc7 (ENSSSAG00000002849)	ENSSSAG00000086386 #22	odad4 (ENSSSAG00000002763)	ENSSSAG00000002744	ACLY (ENSSSAG00000002610)	KLHL11 (ENSSSAG00000043897)	KLHL10 (ENSSSAG00000002527)	NT5C3B (ENSSSAG00000110455)	FKBP10 (ENSSSAG00000002438)	P3H4 (ENSSSAG00000002386)	ENSSSAG00000044241	42sp43 (ENSSSAG00000002195)	STAC2 (ENSSSAG00000112517)	FBXL20 (ENSSSAG00000001966)	CDK12 (ENSSSAG00000001885)	NEUROD2 (ENSSSAG00000088645)	ppp1r1b (ENSSSAG00000001868)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00940000154014.b.a.g	ENSGT00950000182881.a.a.b.i.b.b.b	ENSGT00950000182910.b.g.b.j	ENSGT01050000244905.B.n.b	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a.d	ENSGT00940000164828.d	ENSGT00390000014272.e	ENSGT00940000156363.b.d	ENSGT00940000154971.u.b.a.b	ENSGT00940000154971.u.b.b	ENSGT00940000158799.g.b.a	ENSGT00940000153173.b.b.l	ENSGT00940000157202.h.d	ENSGT00940000157943.b.b	ENSGT00940000155338.r.f	ENSGT00940000154813.e.a.b.hb.b #22	ENSGT00390000007911.q.a	ENSGT00510000048410.b	ENSGT00940000154881.d.j	ENSGT00940000159275.a.d	ENSGT00940000154664.h.i.b	ENSGT00390000012959.a.g.g.c	ENSGT00940000156331.a.b.d	ENSGT00940000153814.b.e.d	ENSGT00940000159790.c.b.g.a.b	ENSGT00940000165750.c	ENSGT00950000183092.b.a.b.d.d	ENSGT00940000153845.a.a.a.a	ENSGT00940000157595.f	ENSGT00940000160871.d.b.f	ENSGT00730000111283.a.f
Rainbow trout	MODERN SPECIES	3	CAVIN1 (ENSOMYG00000010971)	rbtstat3 (ENSOMYG00000010690)	ENSOMYG00000065499	ENSOMYG00000063312	stat5a (ENSOMYG00000010439)	ENSOMYG00000010226	hcrt (ENSOMYG00000010214)	kcnh4a (ENSOMYG00000010169)	RAB5C (ENSOMYG00000010045)	kat2a (ENSOMYG00000009346)	dhx58 (ENSOMYG00000008998)	ZNF385C (ENSOMYG00000008786)	ENSOMYG00000052193	nkiras2 (ENSOMYG00000008744)	dnajc7 (ENSOMYG00000008602)	hsp70a (ENSOMYG00000008447) #22	odad4 (ENSOMYG00000008409)	ENSOMYG00000008356	ACLY (ENSOMYG00000008240)	KLHL11 (ENSOMYG00000007879)	KLHL10 (ENSOMYG00000007857)	NT5C3B (ENSOMYG00000007704)	FKBP10 (ENSOMYG00000007421)	P3H4 (ENSOMYG00000006648)	ENSOMYG00000006548	42sp43 (ENSOMYG00000006282)	STAC2 (ENSOMYG00000006229)	FBXL20 (ENSOMYG00000005909)	CDK12 (ENSOMYG00000005111)	NEUROD2 (ENSOMYG00000004944)	ppp1r1b (ENSOMYG00000004917)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00940000160415.f.c	ENSGT00940000154014.b.a.g	ENSGT00950000182881.a.a.b.i.b.b.b	ENSGT00950000182910.b.g.b.j	ENSGT01050000244905.B.n.b	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a.d	ENSGT00940000164828.d	ENSGT00390000014272.e	ENSGT00940000156363.b.d	ENSGT00940000154971.u.b.a.b	ENSGT00940000158799.g.b.a	ENSGT00940000153173.b.b.l	ENSGT00940000157202.h.d	ENSGT00940000157943.b.b	ENSGT00940000155338.r.f	ENSGT00940000154813.e.a.b.hb.b #22	ENSGT00390000007911.q.a	ENSGT00510000048410.b	ENSGT00940000154881.d.j	ENSGT00940000159275.a.d	ENSGT00940000154664.h.i.b	ENSGT00390000012959.a.g.g.c	ENSGT00940000156331.a.b.c.b	ENSGT00940000153814.b.e.d	ENSGT00940000159790.c.b.g.a.b	ENSGT00940000165750.c	ENSGT00950000183092.b.a.b.d.d	ENSGT00940000153845.a.a.a.a	ENSGT00940000157595.f	ENSGT00940000160871.d.b.f	ENSGT00730000111283.a.f.c
Chinook salmon	MODERN SPECIES	33	ENSOTSG00005046448	hsd17b1 (ENSOTSG00005046447)	stk17al (ENSOTSG00005046446)	ATP6V0A1 (ENSOTSG00005046382)	CAVIN1 (ENSOTSG00005046381)	stat3 (ENSOTSG00005046354)	stat5a (ENSOTSG00005046351)	ENSOTSG00005046349	hcrt (ENSOTSG00005046346)	kcnh4a (ENSOTSG00005046343)	RAB5C (ENSOTSG00005046339)	kat2a (ENSOTSG00005046336)	ZNF385C (ENSOTSG00005046330)	ENSOTSG00005046329	dnajc7 (ENSOTSG00005045434)	hsp70.1 (ENSOTSG00005045422) #22	odad4 (ENSOTSG00005045411)	ENSOTSG00005045409	ACLY (ENSOTSG00005045371)	KLHL11 (ENSOTSG00005045370)	KLHL10 (ENSOTSG00005045369)	NT5C3B (ENSOTSG00005045368)	FKBP10 (ENSOTSG00005045357)	p3h4 (ENSOTSG00005045356)	ADAM11 (ENSOTSG00005045355)	42sp43 (ENSOTSG00005045354)	ENSOTSG00005045353	hexim1 (ENSOTSG00005045352)	plcd3a (ENSOTSG00005045328)	nmt1a (ENSOTSG00005045226)	RETSAT (ENSOTSG00005045224)
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	264		ENSGT01050000244905.B.m.b	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a.c	ENSGT00940000164828.c	ENSGT00390000014272.f	ENSGT00940000156363.b.c	ENSGT00940000154971.u.b.a	ENSGT00940000158799.g.b	ENSGT00940000153173.b.b	ENSGT00940000157202.h.d	ENSGT00940000157943.b.b	ENSGT00940000157202.h.c	ENSGT00940000157943.b.a	ENSGT00940000155338.r	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.b #22	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.a #22	ENSGT00390000007911	ENSGT00510000048410.b	ENSGT00940000154881.d.j	ENSGT00940000159275.a.d	ENSGT00940000154664.h.i.b	ENSGT00390000012959.a.g.g	ENSGT00940000156331.a.b.d	ENSGT00940000153814.b.e.d	ENSGT00940000159790.c.b.g.b	ENSGT00940000165750.c	ENSGT00950000183092.b.a.b.d	ENSGT00940000153845.a.a.a	ENSGT00940000153845.a.a.b.b	ENSGT00940000157595.f	ENSGT00940000160871.d.b.f
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	77										ENSGT00940000158799.g.b.b	ENSGT00940000153173.b.b.k	ENSGT00940000157202.h.c	ENSGT00940000157943.b.a	ENSGT00940000155338.r.e	ENSGT00390000007911.q.b	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.a #22	ENSGT00940000154813.e.a.b.hb.a.a.b #22	ENSGT00390000007911.r	ENSGT00510000048410.a	ENSGT00940000154881.d.i	ENSGT00940000159275.a.c	ENSGT00940000154664.h.i.a	ENSGT00390000012959.a.g.h	ENSGT00940000156331.a.b.c	ENSGT00940000153814.b.e.c	ENSGT00940000159790.c.b.g.a.a.a	ENSGT00940000165750.d	ENSGT00950000183092.b.a.b.c	ENSGT00940000153845.a.a.b.a	ENSGT00940000157595.e	ENSGT00940000160871.d.b.e
Oncorhynchus	DUPLICATION
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000160415.f.d	ENSGT00940000154014.b.a.h	ENSGT00950000182881.a.a.b.i.b.b.a	ENSGT00950000182910.b.g.b.i	ENSGT01050000244905.B.n.a	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a.c	ENSGT00940000164828.c	ENSGT00390000014272.f	ENSGT00940000156363.b.c	ENSGT00940000154971.u.b.a.a	ENSGT00940000158799.g.b.b	ENSGT00940000153173.b.b.k	ENSGT00940000157202.h.c	ENSGT00940000157943.b.a	ENSGT00940000155338.r.e	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.a.a #22	ENSGT00940000154813.e.a.b.hb.a.a.b #22	ENSGT00390000007911.r	ENSGT00510000048410.a	ENSGT00940000154881.d.i	ENSGT00940000159275.a.c	ENSGT00940000154664.h.i.a	ENSGT00390000012959.a.g.h	ENSGT00940000156331.a.b.c	ENSGT00940000153814.b.e.c	ENSGT00940000159790.c.b.g.a.a.a	ENSGT00940000165750.d	ENSGT00950000183092.b.a.b.d.c	ENSGT00940000153845.a.a.a.b	ENSGT00940000157595.e	ENSGT00940000160871.d.b.e
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000154014.b.a.h	ENSGT00950000182881.a.a.b.i.b.b.a	ENSGT00950000182910.b.g.b.i	ENSGT01050000244905.B.n.a	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a.c	ENSGT00940000164828.c	ENSGT00390000014272.f	ENSGT00940000156363.b.c	ENSGT00940000154971.u.b.a.a	ENSGT00940000158799.g.b.b	ENSGT00940000153173.b.b.k	ENSGT00940000157202.h.c	ENSGT00940000157943.b.a	ENSGT00940000155338.r.e	ENSGT00390000007911.r	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.a.a #22	ENSGT00940000154813.e.a.b.hb.a.a.b #22	ENSGT00390000007911.q.b	ENSGT00510000048410.a	ENSGT00940000154881.d.i	ENSGT00940000159275.a.c	ENSGT00940000154664.h.i.a	ENSGT00390000012959.a.g.h	ENSGT00940000156331.a.b.c.a	ENSGT00940000153814.b.e.c	ENSGT00940000159790.c.b.g.b	ENSGT00940000165750.d	ENSGT00950000183092.b.a.b.d.c	ENSGT00940000153845.a.a.a.b	ENSGT00940000157595.e	ENSGT00940000160871.d.b.e
Coho salmon	DUPLICATION
Coho salmon	DUPLICATION
Coho salmon	MODERN SPECIES	1	ENSOKIG00005046726	hcrt (ENSOKIG00005046722)	kcnh4a (ENSOKIG00005046720)	RAB5C (ENSOKIG00005046711)	kat2a (ENSOKIG00005046272)	dhx58 (ENSOKIG00005046053)	ZNF385C (ENSOKIG00005046024)	nkiras2 (ENSOKIG00005046014)	dnajc7 (ENSOKIG00005045127)	ENSOKIG00005045047 #22	ENSOKIG00005045034 #22	ENSOKIG00005045018 #22	ENSOKIG00005045006 #22	ENSOKIG00005044999 #22	ENSOKIG00005044992 #22	ENSOKIG00005044981 #22	ENSOKIG00005044971 #22	ENSOKIG00005044955 #22	odad4 (ENSOKIG00005044930)	CNP (ENSOKIG00005044907)	ACLY (ENSOKIG00005044632)	KLHL11 (ENSOKIG00005044590)	KLHL10 (ENSOKIG00005044528)	NT5C3B (ENSOKIG00005044338)	FKBP10 (ENSOKIG00005044067)	P3H4 (ENSOKIG00005044014)	ADAM11 (ENSOKIG00005043709)	ENSOKIG00005043678	42sp43 (ENSOKIG00005043548)	STAC2 (ENSOKIG00005043414)	FBXL20 (ENSOKIG00005043296)
Coho salmon	MODERN SPECIES	1	stat5a (ENSOKIG00005046741)	ENSOKIG00005046726	hcrt (ENSOKIG00005046722)	kcnh4a (ENSOKIG00005046720)	RAB5C (ENSOKIG00005046711)	kat2a (ENSOKIG00005046272)	dhx58 (ENSOKIG00005046053)	ZNF385C (ENSOKIG00005046024)	nkiras2 (ENSOKIG00005046014)	dnajc7 (ENSOKIG00005045127)	ENSOKIG00005045047 #22	ENSOKIG00005045034 #22	ENSOKIG00005045018 #22	ENSOKIG00005045006 #22	ENSOKIG00005044999 #22	ENSOKIG00005044992 #22	ENSOKIG00005044981 #22	ENSOKIG00005044971 #22	ENSOKIG00005044955 #22	odad4 (ENSOKIG00005044930)	CNP (ENSOKIG00005044907)	ACLY (ENSOKIG00005044632)	KLHL11 (ENSOKIG00005044590)	KLHL10 (ENSOKIG00005044528)	NT5C3B (ENSOKIG00005044338)	FKBP10 (ENSOKIG00005044067)	P3H4 (ENSOKIG00005044014)	ADAM11 (ENSOKIG00005043709)	ENSOKIG00005043678	42sp43 (ENSOKIG00005043548)	STAC2 (ENSOKIG00005043414)
Coho salmon	DUPLICATION
Coho salmon	MODERN SPECIES	1	hsd17b1 (ENSOKIG00005047319)	ENSOKIG00005047299	ATP6V0A1 (ENSOKIG00005047051)	CAVIN1 (ENSOKIG00005047023)	stat3 (ENSOKIG00005046852)	stat5a (ENSOKIG00005046741)	ENSOKIG00005046726	hcrt (ENSOKIG00005046722)	kcnh4a (ENSOKIG00005046720)	RAB5C (ENSOKIG00005046711)	kat2a (ENSOKIG00005046272)	dhx58 (ENSOKIG00005046053)	ZNF385C (ENSOKIG00005046024)	nkiras2 (ENSOKIG00005046014)	dnajc7 (ENSOKIG00005045127)	ENSOKIG00005045047 #22	ENSOKIG00005045034 #22	ENSOKIG00005045018 #22	ENSOKIG00005045006 #22	ENSOKIG00005044999 #22	ENSOKIG00005044992 #22	ENSOKIG00005044981 #22	ENSOKIG00005044971 #22	ENSOKIG00005044955 #22	odad4 (ENSOKIG00005044930)	CNP (ENSOKIG00005044907)	ACLY (ENSOKIG00005044632)	KLHL11 (ENSOKIG00005044590)	KLHL10 (ENSOKIG00005044528)	NT5C3B (ENSOKIG00005044338)	FKBP10 (ENSOKIG00005044067)
Coho salmon	MODERN SPECIES	1	kcnh4a (ENSOKIG00005046720)	RAB5C (ENSOKIG00005046711)	kat2a (ENSOKIG00005046272)	dhx58 (ENSOKIG00005046053)	ZNF385C (ENSOKIG00005046024)	nkiras2 (ENSOKIG00005046014)	dnajc7 (ENSOKIG00005045127)	ENSOKIG00005045047 #22	ENSOKIG00005045034 #22	ENSOKIG00005045018 #22	ENSOKIG00005045006 #22	ENSOKIG00005044999 #22	ENSOKIG00005044992 #22	ENSOKIG00005044981 #22	ENSOKIG00005044971 #22	ENSOKIG00005044955 #22	odad4 (ENSOKIG00005044930)	CNP (ENSOKIG00005044907)	ACLY (ENSOKIG00005044632)	KLHL11 (ENSOKIG00005044590)	KLHL10 (ENSOKIG00005044528)	NT5C3B (ENSOKIG00005044338)	FKBP10 (ENSOKIG00005044067)	P3H4 (ENSOKIG00005044014)	ADAM11 (ENSOKIG00005043709)	ENSOKIG00005043678	42sp43 (ENSOKIG00005043548)	STAC2 (ENSOKIG00005043414)	FBXL20 (ENSOKIG00005043296)	CDK12 (ENSOKIG00005043218)	NEUROD2 (ENSOKIG00005043206)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	4	stat3 (ENSOMYG00000006439)	ENSOMYG00000069482	ENSOMYG00000063476	ENSOMYG00000071296	stat5 (ENSOMYG00000005855)	ENSOMYG00000005491	hcrt (ENSOMYG00000005337)	kcnh4a (ENSOMYG00000005314)	RAB5C (ENSOMYG00000005290)	kat2a (ENSOMYG00000005099)	dhx58 (ENSOMYG00000053505)	ENSOMYG00000067101	dnajc7 (ENSOMYG00000004578)	ENSOMYG00000067019 #22	ENSOMYG00000050823 #22	ENSOMYG00000004125 #22	ENSOMYG00000075888 #22	nkiras2 (ENSOMYG00000004810)	ENSOMYG00000066882 #22	ENSOMYG00000058146 #22	hsp70b (ENSOMYG00000059422) #22	ENSOMYG00000071516 #22	ENSOMYG00000067311 #22	ENSOMYG00000054855 #22	ENSOMYG00000072249 #22	ENSOMYG00000063171 #22	ENSOMYG00000055694 #22	ENSOMYG00000004088	ENSOMYG00000004059	ACLY (ENSOMYG00000003940)	KLHL11 (ENSOMYG00000003569)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.a.b #22
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.a.b #22
Coho salmon	MODERN SPECIES	1	stat3 (ENSOKIG00005046852)	stat5a (ENSOKIG00005046741)	ENSOKIG00005046726	hcrt (ENSOKIG00005046722)	kcnh4a (ENSOKIG00005046720)	RAB5C (ENSOKIG00005046711)	kat2a (ENSOKIG00005046272)	dhx58 (ENSOKIG00005046053)	ZNF385C (ENSOKIG00005046024)	nkiras2 (ENSOKIG00005046014)	dnajc7 (ENSOKIG00005045127)	ENSOKIG00005045047 #22	ENSOKIG00005045034 #22	ENSOKIG00005045018 #22	ENSOKIG00005045006 #22	ENSOKIG00005044999 #22	ENSOKIG00005044992 #22	ENSOKIG00005044981 #22	ENSOKIG00005044971 #22	ENSOKIG00005044955 #22	odad4 (ENSOKIG00005044930)	CNP (ENSOKIG00005044907)	ACLY (ENSOKIG00005044632)	KLHL11 (ENSOKIG00005044590)	KLHL10 (ENSOKIG00005044528)	NT5C3B (ENSOKIG00005044338)	FKBP10 (ENSOKIG00005044067)	P3H4 (ENSOKIG00005044014)	ADAM11 (ENSOKIG00005043709)	ENSOKIG00005043678	42sp43 (ENSOKIG00005043548)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000154014.b.a.j	ENSGT00950000182881.a.a.b.i.b.b	ENSGT00950000182910.b.g.b.i	ENSGT01050000244905.B.m.b	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a.c	ENSGT00940000164828.c	ENSGT00390000014272.f	ENSGT00940000156363.b.c	ENSGT00940000154971.u.b.a.d	ENSGT00940000158799.g.b.a.a	ENSGT00940000153173.b.b.k	ENSGT00940000157202.h.c	ENSGT00940000157943.b.a	ENSGT00940000155338.r.e	ENSGT00390000007911.q.b	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.a #22	ENSGT00940000154813.e.a.b.hb.a.a.b #22	ENSGT00390000007911.r	ENSGT00510000048410.a	ENSGT00940000154881.d.i	ENSGT00940000159275.a.c	ENSGT00940000154664.h.i.b.b	ENSGT00390000012959.a.g.h	ENSGT00940000156331.a.b.c	ENSGT00940000153814.b.e.c	ENSGT00940000159790.c.b.g.a.a.a	ENSGT00940000165750.d	ENSGT00950000183092.b.a.b.c	ENSGT00940000153845.a.a.b.a	ENSGT00940000157595.e	ENSGT00940000160871.d.b.e
River trout	MODERN SPECIES		stat5a (ENSSTUG00000019660)	ENSSTUG00000019631	hcrt (ENSSTUG00000019627)	kcnh4a (ENSSTUG00000019596)	RAB5C (ENSSTUG00000019573)	kat2a (ENSSTUG00000019448)	dhx58 (ENSSTUG00000019130)	ZNF385C (ENSSTUG00000019103)	nkiras2 (ENSSTUG00000019069)	dnajc7 (ENSSTUG00000018702)	ENSSTUG00000018689 #22	ENSSTUG00000018677 #22	ENSSTUG00000018659 #22	ENSSTUG00000018646 #22	ENSSTUG00000018638 #22	ENSSTUG00000018624 #22	ENSSTUG00000018614 #22	ENSSTUG00000018598	CNP (ENSSTUG00000018576)	ACLY (ENSSTUG00000018400)	KLHL11 (ENSSTUG00000018384)	KLHL10 (ENSSTUG00000018352)	NT5C3B (ENSSTUG00000018334)	FKBP10 (ENSSTUG00000018211)	P3H4 (ENSSTUG00000018200)	ADAM11 (ENSSTUG00000017409)	42sp43 (ENSSTUG00000017386)	STAC2 (ENSSTUG00000017342)	FBXL20 (ENSSTUG00000017240)	CDK12 (ENSSTUG00000017166)	NEUROD2 (ENSSTUG00000009948)
Huchen	MODERN SPECIES	776												ENSHHUG00000028632	ZNF385C (ENSHHUG00000028595)	nkiras2 (ENSHHUG00000028572)	dnajc7 (ENSHHUG00000028546)	ENSHHUG00000028492 #22	odad4 (ENSHHUG00000028478)	CNP (ENSHHUG00000028472)	ACLY (ENSHHUG00000028431)	KLHL11 (ENSHHUG00000028426)	KLHL10 (ENSHHUG00000028418)	NT5C3B (ENSHHUG00000028408)	FKBP10 (ENSHHUG00000028318)	p3h4 (ENSHHUG00000028303)	ADAM11 (ENSHHUG00000028254)	42sp43 (ENSHHUG00000028238)	STAC2 (ENSHHUG00000028225)	FBXL20 (ENSHHUG00000028150)	CDK12 (ENSHHUG00000028120)	NEUROD2 (ENSHHUG00000028115)	ppp1r1b (ENSHHUG00000028109)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	264			ENSGT01050000244905.B.m.b	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a.c	ENSGT00940000164828.c	ENSGT00390000014272.f	ENSGT00940000156363.b.c	ENSGT00940000154971.u.b.a	ENSGT00940000158799.g.b	ENSGT00940000153173.b.b	ENSGT00940000157202.h.d	ENSGT00940000157943.b.b	ENSGT00940000157202.h.c	ENSGT00940000157943.b.a	ENSGT00940000155338.r	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.b #22	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.a #22	ENSGT00390000007911	ENSGT00510000048410.b	ENSGT00940000154881.d.j	ENSGT00940000159275.a.d	ENSGT00940000154664.h.i.b	ENSGT00390000012959.a.g.g	ENSGT00940000156331.a.b.d	ENSGT00940000153814.b.e.d	ENSGT00940000159790.c.b.g.b	ENSGT00940000165750.c	ENSGT00950000183092.b.a.b.d	ENSGT00940000153845.a.a.a	ENSGT00940000153845.a.a.b.b	ENSGT00940000157595.f
Salmoninae_a	DUPLICATION
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.b.a #22
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.b.a #22
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.b.a #22
Coho salmon	MODERN SPECIES	1	CAVIN1 (ENSOKIG00005047023)	stat3 (ENSOKIG00005046852)	stat5a (ENSOKIG00005046741)	ENSOKIG00005046726	hcrt (ENSOKIG00005046722)	kcnh4a (ENSOKIG00005046720)	RAB5C (ENSOKIG00005046711)	kat2a (ENSOKIG00005046272)	dhx58 (ENSOKIG00005046053)	ZNF385C (ENSOKIG00005046024)	nkiras2 (ENSOKIG00005046014)	dnajc7 (ENSOKIG00005045127)	ENSOKIG00005045047 #22	ENSOKIG00005045034 #22	ENSOKIG00005045018 #22	ENSOKIG00005045006 #22	ENSOKIG00005044999 #22	ENSOKIG00005044992 #22	ENSOKIG00005044981 #22	ENSOKIG00005044971 #22	ENSOKIG00005044955 #22	odad4 (ENSOKIG00005044930)	CNP (ENSOKIG00005044907)	ACLY (ENSOKIG00005044632)	KLHL11 (ENSOKIG00005044590)	KLHL10 (ENSOKIG00005044528)	NT5C3B (ENSOKIG00005044338)	FKBP10 (ENSOKIG00005044067)	P3H4 (ENSOKIG00005044014)	ADAM11 (ENSOKIG00005043709)	ENSOKIG00005043678
Rainbow trout	MODERN SPECIES	4	ENSOMYG00000069482	ENSOMYG00000063476	ENSOMYG00000071296	stat5 (ENSOMYG00000005855)	ENSOMYG00000005491	hcrt (ENSOMYG00000005337)	kcnh4a (ENSOMYG00000005314)	RAB5C (ENSOMYG00000005290)	kat2a (ENSOMYG00000005099)	dhx58 (ENSOMYG00000053505)	ENSOMYG00000067101	dnajc7 (ENSOMYG00000004578)	ENSOMYG00000067019 #22	ENSOMYG00000050823 #22	ENSOMYG00000004125 #22	ENSOMYG00000075888 #22	nkiras2 (ENSOMYG00000004810)	ENSOMYG00000066882 #22	ENSOMYG00000058146 #22	hsp70b (ENSOMYG00000059422) #22	ENSOMYG00000071516 #22	ENSOMYG00000067311 #22	ENSOMYG00000054855 #22	ENSOMYG00000072249 #22	ENSOMYG00000063171 #22	ENSOMYG00000055694 #22	ENSOMYG00000004088	ENSOMYG00000004059	ACLY (ENSOMYG00000003940)	KLHL11 (ENSOMYG00000003569)	KLHL10 (ENSOMYG00000003465)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.b.a #22
River trout	MODERN SPECIES	25	stat3 (ENSSTUG00000039277)	ENSSTUG00000039247	ENSSTUG00000039224	ENSSTUG00000039211	stat5a (ENSSTUG00000038983)	ENSSTUG00000038965	hcrt (ENSSTUG00000038961)	kcnh4a (ENSSTUG00000038925)	RAB5C (ENSSTUG00000038913)	kat2a (ENSSTUG00000038769)	dhx58 (ENSSTUG00000038366)	ZNF385C (ENSSTUG00000038305)	nkiras2 (ENSSTUG00000038294)	ENSSTUG00000038286 #22	dnajc7 (ENSSTUG00000037955)	ENSSTUG00000037924 #22	odad4 (ENSSTUG00000037403)	ENSSTUG00000037371	ACLY (ENSSTUG00000037085)	KLHL11 (ENSSTUG00000037064)	KLHL10 (ENSSTUG00000037016)	NT5C3B (ENSSTUG00000036966)	FKBP10 (ENSSTUG00000036880)	p3h4 (ENSSTUG00000036866)	ADAM11 (ENSSTUG00000036530)	42sp43 (ENSSTUG00000036508)	ENSSTUG00000036498	STAC2 (ENSSTUG00000036489)	FBXL20 (ENSSTUG00000036088)	CDK12 (ENSSTUG00000035672)	NEUROD2 (ENSSTUG00000035654)
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	119	ENSGT00940000160415.f.d	ENSGT00940000154014.b.a	ENSGT00950000182881.a.a.b.i.b.b	ENSGT00950000182910.b.g.b.i	ENSGT01050000244905.B.m.b	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a.c	ENSGT00940000164828.c	ENSGT00390000014272.f	ENSGT00940000156363.b.c	ENSGT00940000154971.u.b.a	ENSGT00940000158799.g.b.a	ENSGT00940000153173.b.b.l	ENSGT00940000157202.h.d	ENSGT00940000157943.b.b	ENSGT00940000155338.r.f	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.b.b #22	ENSGT00940000154813.e.a.b.hb.b #22	ENSGT00390000007911.q.a	ENSGT00510000048410.b	ENSGT00940000154881.d.j	ENSGT00940000159275.a.d	ENSGT00940000154664.h.i.b	ENSGT00390000012959.a.g.g	ENSGT00940000156331.a.b.d	ENSGT00940000153814.b.e.d	ENSGT00940000159790.c.b.g.a.b	ENSGT00940000165750.c	ENSGT00950000183092.b.a.b.d	ENSGT00940000153845.a.a.a	ENSGT00940000157595.f	ENSGT00940000160871.d.b.f
Salmo	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.b.b #22
River trout	MODERN SPECIES	25	atp6v0a1a (ENSSTUG00000003835)	CAVIN1 (ENSSTUG00000039605)	stat3 (ENSSTUG00000039277)	ENSSTUG00000039247	ENSSTUG00000039224	ENSSTUG00000039211	stat5a (ENSSTUG00000038983)	ENSSTUG00000038965	hcrt (ENSSTUG00000038961)	kcnh4a (ENSSTUG00000038925)	RAB5C (ENSSTUG00000038913)	kat2a (ENSSTUG00000038769)	dhx58 (ENSSTUG00000038366)	ZNF385C (ENSSTUG00000038305)	nkiras2 (ENSSTUG00000038294)	ENSSTUG00000038286 #22	dnajc7 (ENSSTUG00000037955)	ENSSTUG00000037924 #22	odad4 (ENSSTUG00000037403)	ENSSTUG00000037371	ACLY (ENSSTUG00000037085)	KLHL11 (ENSSTUG00000037064)	KLHL10 (ENSSTUG00000037016)	NT5C3B (ENSSTUG00000036966)	FKBP10 (ENSSTUG00000036880)	p3h4 (ENSSTUG00000036866)	ADAM11 (ENSSTUG00000036530)	42sp43 (ENSSTUG00000036508)	ENSSTUG00000036498	STAC2 (ENSSTUG00000036489)	FBXL20 (ENSSTUG00000036088)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.b.b #22
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.a.b.b #22
Coho salmon	MODERN SPECIES	26	stat3 (ENSOKIG00005037168)	ENSOKIG00005037136	stat5a (ENSOKIG00005036934)	ENSOKIG00005036907	ENSOKIG00005036903	ENSOKIG00005036893	hcrt (ENSOKIG00005036883)	kcnh4a (ENSOKIG00005036751)	RAB5C (ENSOKIG00005036711)	kat2a (ENSOKIG00005034933)	dhx58 (ENSOKIG00005034405)	ZNF385C (ENSOKIG00005034340)	ENSOKIG00005034332	nkiras2 (ENSOKIG00005034312)	dnajc7 (ENSOKIG00005032676)	ENSOKIG00005032572 #22	odad4 (ENSOKIG00005032310)	ENSOKIG00005032262	ACLY (ENSOKIG00005031994)	KLHL11 (ENSOKIG00005031949)	KLHL10 (ENSOKIG00005031871)	NT5C3B (ENSOKIG00005031845)	FKBP10 (ENSOKIG00005031766)	p3h4 (ENSOKIG00005031748)	ADAM11 (ENSOKIG00005031514)	42sp43 (ENSOKIG00005031456)	STAC2 (ENSOKIG00005031446)	FBXL20 (ENSOKIG00005030571)	CDK12 (ENSOKIG00005030323)	NEUROD2 (ENSOKIG00005030313)	ppp1r1b (ENSOKIG00005030296)
Huchen	MODERN SPECIES	1001													ZNF385C (ENSHHUG00000047544)	nkiras2 (ENSHHUG00000047540)	dnajc7 (ENSHHUG00000047419)	ENSHHUG00000047339 #22	CNP (ENSHHUG00000047204)	ACLY (ENSHHUG00000047150)	KLHL11 (ENSHHUG00000047147)	KLHL10 (ENSHHUG00000047145)	NT5C3B (ENSHHUG00000047135)	FKBP10 (ENSHHUG00000047088)	P3H4 (ENSHHUG00000047083)	ADAM11 (ENSHHUG00000047067)	42sp43 (ENSHHUG00000047062)	STAC2 (ENSHHUG00000047053)	FBXL20 (ENSHHUG00000046886)	CDK12 (ENSHHUG00000046851)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.b #22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.b #22
Salmo	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b.ib.b #22
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	25	stat3 (ENSSSAG00000010060)	stat5a (ENSSSAG00000010616)	ENSSSAG00000010992	hcrt (ENSSSAG00000011089)	kcnh4a (ENSSSAG00000011806)	RAB5C (ENSSSAG00000022042)	kat2a (ENSSSAG00000043811)	dhx58 (ENSSSAG00000037858)	ZNF385C (ENSSSAG00000086421)	nkiras2 (ENSSSAG00000088835)	dnajc7 (ENSSSAG00000039459)	odad4 (ENSSSAG00000041019)	ENSSSAG00000111367 #22	ENSSSAG00000107977 #22	ENSSSAG00000010535	ENSSSAG00000018619 #22	ENSSSAG00000085912 #22	ENSSSAG00000083226 #22	ENSSSAG00000099984 #22	cn37 (ENSSSAG00000041127)	ACLY (ENSSSAG00000041201)	KLHL11 (ENSSSAG00000002537)	KLHL10 (ENSSSAG00000043913)	NT5C3B (ENSSSAG00000090249)	FKBP10 (ENSSSAG00000043973)	P3H4 (ENSSSAG00000044172)	ENSSSAG00000002294	42sp43 (ENSSSAG00000045518)	STAC2 (ENSSSAG00000112015)	ENSSSAG00000045563	CDK12 (ENSSSAG00000045655)
Northern pike	DUPLICATION
Northern pike	MODERN SPECIES	10	ENSELUG00000024246	nlk1 (ENSELUG00000024221)	TLCD3B (ENSELUG00000024181)	mvp (ENSELUG00000024149)	ENSELUG00000024031	ENSELUG00000027254	ENSELUG00000024006	ENSELUG00000023980	nupr1b (ENSELUG00000023903)	sgf29 (ENSELUG00000023888)	ENSELUG00000023841	ENSELUG00000026274	spns1 (ENSELUG00000023792)	atxn2l (ENSELUG00000023740)	sh2b1 (ENSELUG00000023715)	ENSELUG00000023676 #22	HSPA2 (ENSELUG00000023653) #22	rabep2 (ENSELUG00000023638)	atp2a1 (ENSELUG00000023607)	ENSELUG00000023508	nudt9 (ENSELUG00000023446)	mapk3 (ENSELUG00000023431)	gdpd3a (ENSELUG00000023397)	ypel3 (ENSELUG00000023389)	ENSELUG00000028791	ENSELUG00000023340	thoc6 (ENSELUG00000023325)	ENSELUG00000023247	rnf25 (ENSELUG00000023202)	ENSELUG00000023197	kat8 (ENSELUG00000023184)
Northern pike	MODERN SPECIES	10	nlk1 (ENSELUG00000024221)	TLCD3B (ENSELUG00000024181)	mvp (ENSELUG00000024149)	ENSELUG00000024031	ENSELUG00000027254	ENSELUG00000024006	ENSELUG00000023980	nupr1b (ENSELUG00000023903)	sgf29 (ENSELUG00000023888)	ENSELUG00000023841	ENSELUG00000026274	spns1 (ENSELUG00000023792)	atxn2l (ENSELUG00000023740)	sh2b1 (ENSELUG00000023715)	ENSELUG00000023676 #22	HSPA2 (ENSELUG00000023653) #22	rabep2 (ENSELUG00000023638)	atp2a1 (ENSELUG00000023607)	ENSELUG00000023508	nudt9 (ENSELUG00000023446)	mapk3 (ENSELUG00000023431)	gdpd3a (ENSELUG00000023397)	ypel3 (ENSELUG00000023389)	ENSELUG00000028791	ENSELUG00000023340	thoc6 (ENSELUG00000023325)	ENSELUG00000023247	rnf25 (ENSELUG00000023202)	ENSELUG00000023197	kat8 (ENSELUG00000023184)	ENSELUG00000031790
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	313	ENSGT00940000159991.A.a	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.b.a	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	46						ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b	ENSGT00390000014062	ENSGT00940000154169.A.h	ENSGT00940000158525.u	ENSGT00940000165613	ENSGT01010000222313.A.b.b.a.a.b.a	ENSGT00990000204783	ENSGT00940000177150	ENSGT00960000187164	ENSGT00940000158922.d	ENSGT00950000183046.a.b.l
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b #22
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b #22
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b #22
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	2687																hsp70.2 (ENSPNAG00000012386) #22
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007741.a.p	ENSGT00940000157416	ENSGT00950000183070.a.b.b	ENSGT00390000008969	ENSGT00940000161103.a	ENSGT00940000161725.h	ENSGT00990000213837	ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000159141.j.a	ENSGT00530000064242.a	ENSGT00390000015229	ENSGT00390000007119	ENSGT00390000005976.b	ENSGT00940000157795.g.b	ENSGT00950000183191.a.a.f	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000164396	ENSGT00940000160506.b	ENSGT00940000159252.b.b	ENSGT00940000160492	ENSGT00950000183143.c.b	ENSGT00390000014062	ENSGT00390000013260.C.g	ENSGT00940000160874	ENSGT00410000026495.C.b	ENSGT00390000014771.b.a	ENSGT00390000002810	ENSGT00940000160286	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000177692	ENSGT00390000013719
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	269	ENSGT00390000007741.a.p.c	ENSGT00940000157416.f	ENSGT00950000183070.a.b.b.a	ENSGT00390000008969.k	ENSGT00940000161103.a.c	ENSGT01100000263533.a	ENSGT00940000161725.h.a	ENSGT00940000154308.A.a.a.a	ENSGT00940000159141.j.a.b	ENSGT00530000064242.a.c	ENSGT00390000015229.bb	ENSGT00390000007119.b	ENSGT00390000005976.b.d	ENSGT00940000157795.g.b.a	ENSGT00950000183191.a.a.f.a.b	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000164396.c.a	ENSGT00940000160506.b.b	ENSGT00940000159252.b.b.d	ENSGT00940000160492.b	ENSGT00950000183143.c.b.g	ENSGT00390000014062.d	ENSGT00390000010523.c.a.h	ENSGT01090000259987.b.b.a.a.a.a.d	ENSGT00950000182984.b.a.a.c.a.d	ENSGT01050000244842.a.b.b.b.j	ENSGT00940000157020.g.a.d	ENSGT00940000157579.a.c	ENSGT00940000154578.A.c.b.d.l	ENSGT00390000014069.b.l	ENSGT00940000158253.db.a
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	113	ENSGT00390000007741.a.p.c	ENSGT00940000157416.f	ENSGT00950000183070.a.b.b.a	ENSGT00390000008969.k	ENSGT00940000161103.a.c	ENSGT01100000263533.a	ENSGT00940000161725.h.a	ENSGT01100000263505.b.b.a.a.a.b	ENSGT00940000159141.j.a.b	ENSGT00530000064242.a.c	ENSGT00390000015229.bb	ENSGT00390000007119.a	ENSGT00390000005976.b.d	ENSGT00940000157795.g.b.a	ENSGT00950000183191.a.a.f.a.b	ENSGT00940000154813.e.a.b #22	ENSGT00940000164396.c.a	ENSGT00940000160506.b.b	ENSGT00940000159252.b.b.d	ENSGT00940000160492.b	ENSGT00950000183143.c.b.g	ENSGT00390000014062.d	ENSGT00390000010523.c.a.h	ENSGT01090000259987.b.b.a.a.a.a.c.b	ENSGT00940000156059.o	ENSGT00950000182984.b.a.a.c.a.d	ENSGT01050000244842.a.b.b.b.j	ENSGT00940000157020.g.a.d	ENSGT00940000157579.a.c	ENSGT00940000154578.A.c.b.d.l	ENSGT00940000160773.h
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	450	ENSSGRG00000045232	ENSSGRG00000045231	phb (ENSSGRG00000045225)	mvp (ENSSGRG00000045187)	ENSSGRG00000045186	ENSSGRG00000045185	zgc:66474 (ENSSGRG00000045183)	ENSSGRG00000045180	DOC2A (ENSSGRG00000045179)	ENSSGRG00000045177	sgf29 (ENSSGRG00000045153)	nfatc2ip (ENSSGRG00000045151)	spns1 (ENSSGRG00000044540)	atxn2l (ENSSGRG00000044524)	sh2b1 (ENSSGRG00000044522)	ENSSGRG00000044520 #22	pitpnbl (ENSSGRG00000044517)	cabp5b (ENSSGRG00000044515)	ENSSGRG00000044513	SEZ6L2 (ENSSGRG00000043869)	kctd13 (ENSSGRG00000043855)	hirip3 (ENSSGRG00000043853)	rprml (ENSSGRG00000043851)	ENSSGRG00000043850	tlk2 (ENSSGRG00000042590)	MRC2 (ENSSGRG00000042445)	rnd2 (ENSSGRG00000042441)	vat1 (ENSSGRG00000042440)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.b #22
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	11	tardbpa (ENSSFOG00015014029)	ENSSFOG00015031774	kif1b (ENSSFOG00015013753)	ube4b (ENSSFOG00015013643)	RBP7 (ENSSFOG00015013624)	rbp7a (ENSSFOG00015013605)	nmnat1 (ENSSFOG00015013584)	lzic (ENSSFOG00015013506)	clstn1 (ENSSFOG00015013397)	ctnnbip1 (ENSSFOG00015033157)	ENSSFOG00015031365	ENSSFOG00015013359	ENSSFOG00015013344	ENSSFOG00015026899	ENSSFOG00015021046	ENSSFOG00015032924 #22	taf8 (ENSSFOG00015013276)	ENSSFOG00015013230	eps8l3b (ENSSFOG00015013151)	gstm.1 (ENSSFOG00015013114)	AMPD2 (ENSSFOG00015013023)	gnat2 (ENSSFOG00015012972)	gnai3 (ENSSFOG00015022877)	GPR61 (ENSSFOG00015012897)	AMIGO1 (ENSSFOG00015026049)	ENSSFOG00015028867	SORT1 (ENSSFOG00015012853)	ENSSFOG00015026804	AHCYL1 (ENSSFOG00015012786)	ENSSFOG00015012583	ENSSFOG00015012769
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	1056															ENSGT00940000154813.e.a.a.b ##22	ENSGT00940000154813.e.a.a.a ##22
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	810															ENSGT00940000154813.e.a.a.b ##22	ENSGT00940000154813.e.a.a.a ##22
Asian bonytongue	DUPLICATION
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	11	fam50a (ENSSFOG00015023202)	ENSSFOG00015028510	vgll4l (ENSSFOG00015023244)	syn1 (ENSSFOG00015027179)	araf (ENSSFOG00015023274)	imp4 (ENSSFOG00015023293)	srpk1a (ENSSFOG00015023299)	lhfpl5b (ENSSFOG00015023315)	CLPS (ENSSFOG00015023320)	cpne5a (ENSSFOG00015023325)	ENSSFOG00015027319	ENSSFOG00015027285	zgc:195245 (ENSSFOG00015007448)	tmem167b (ENSSFOG00015007434)	HSPA2 (ENSSFOG00015027464) ##22	ENSSFOG00015013305 ##22	ENSSFOG00015021430	ENSSFOG00015031936 ##22	ENSSFOG00015021413	ELAPOR1 (ENSSFOG00015021350)	ENSSFOG00015027320	ENSSFOG00015022512	rpl10a (ENSSFOG00015022494)	fance (ENSSFOG00015032525)	mkrn4 (ENSSFOG00015024848)	PPARD (ENSSFOG00015024815)	def6a (ENSSFOG00015022459)	tmem9 (ENSSFOG00015022443)	cacna1sb (ENSSFOG00015022398)	FGD2 (ENSSFOG00015022370)	ENSSFOG00015022365
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	11	stk38a (ENSSFOG00015033337)	ENSSFOG00015022356	ENSSFOG00015022365	FGD2 (ENSSFOG00015022370)	cacna1sb (ENSSFOG00015022398)	tmem9 (ENSSFOG00015022443)	def6a (ENSSFOG00015022459)	PPARD (ENSSFOG00015024815)	mkrn4 (ENSSFOG00015024848)	fance (ENSSFOG00015032525)	rpl10a (ENSSFOG00015022494)	ENSSFOG00015022512	ENSSFOG00015027320	ELAPOR1 (ENSSFOG00015021350)	ENSSFOG00015021413	ENSSFOG00015031936 ##22	ENSSFOG00015021430	ENSSFOG00015013305 ##22	HSPA2 (ENSSFOG00015027464) ##22	tmem167b (ENSSFOG00015007434)	zgc:195245 (ENSSFOG00015007448)	ENSSFOG00015027285	ENSSFOG00015027319	cpne5a (ENSSFOG00015023325)	CLPS (ENSSFOG00015023320)	lhfpl5b (ENSSFOG00015023315)	srpk1a (ENSSFOG00015023299)	imp4 (ENSSFOG00015023293)	araf (ENSSFOG00015023274)	syn1 (ENSSFOG00015027179)	vgll4l (ENSSFOG00015023244)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	48	ENSPKIG00000015330	taf8 (ENSPKIG00000015306)	ENSPKIG00000015293	ENSPKIG00000015267	ENSPKIG00000015242	AMIGO1 (ENSPKIG00000015236)	GPR61 (ENSPKIG00000015223)	gnai3 (ENSPKIG00000015198)	gnat2 (ENSPKIG00000014538)	AMPD2 (ENSPKIG00000014188)	GSTM4 (ENSPKIG00000014159)	SORT1 (ENSPKIG00000014127)	ngrn (ENSPKIG00000014107)	mad2l2 (ENSPKIG00000014062)	AHCYL1 (ENSPKIG00000013961)	hsp70l (ENSPKIG00000013929) ##22	ENSPKIG00000013922	ENSPKIG00000013910	ctnnbip1 (ENSPKIG00000013900)	clstn1 (ENSPKIG00000013812)	lzic (ENSPKIG00000013762)	nmnat1 (ENSPKIG00000013743)	RBP7 (ENSPKIG00000013677)	kif1b (ENSPKIG00000013528)	pgd (ENSPKIG00000013450)	tardbpa (ENSPKIG00000013415)	ENSPKIG00000013365	ENSPKIG00000013327	ENSPKIG00000013313	ENSPKIG00000013303	CASZ1 (ENSPKIG00000013278)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	928															ENSGT00940000154813.e.a.a.b ##22	ENSGT00940000154813.e.a.a.a ##22
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	897															ENSGT00940000154813.e.a.a.b ##22	ENSGT00940000154813.e.a.a.a ##22
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000166962	ENSGT00390000017613	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.f	ENSGT00390000017837.a.v	ENSGT00940000156993.d	ENSGT00940000157982.a.b	ENSGT00390000003249	ENSGT00390000017405	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00500000045140.a.a	ENSGT00530000063743.a	ENSGT00940000164922.g.a	ENSGT00940000154813.e.a.a.b ##22	ENSGT00940000154813.e.a.a.a ##22	ENSGT00940000160415	ENSGT00940000165444	ENSGT00940000154881.c.b	ENSGT00510000048410	ENSGT00390000007911	ENSGT00940000155338.r	ENSGT00940000157943.b	ENSGT00940000157202.h	ENSGT00940000153173.b.b	ENSGT00940000158799	ENSGT00940000154971.u.a.f	ENSGT00940000156363.b	ENSGT00390000014272	ENSGT00940000164828	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000017613	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.f	ENSGT00390000017837.a.v	ENSGT00940000156993.d	ENSGT00940000157982.a.b	ENSGT00940000163852.c.a.a	ENSGT00940000163009.b.a.a.b.b.eb	ENSGT00390000003249	ENSGT00390000017405	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00500000045140.a.a	ENSGT00530000063743.a	ENSGT00940000164922.g.a	ENSGT00940000154813.e.a.a.a ##22	ENSGT00940000160415	ENSGT00940000165444	ENSGT00940000154881.c.b	ENSGT00510000048410	ENSGT00390000007911	ENSGT00940000155338.r	ENSGT00940000157943.b	ENSGT00940000157202.h	ENSGT00940000153173.b.b	ENSGT00940000158799.e	ENSGT00940000154971.u.a.f	ENSGT00940000156363.b	ENSGT00390000014272	ENSGT00940000164828	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	30																ENSGT00940000154813.e.a.a.a ##22	ENSGT00940000160415	ENSGT00940000165444	ENSGT00940000154881.c.b	ENSGT00510000048410	ENSGT00390000007911	ENSGT00940000155338.r	ENSGT00940000157943.b	ENSGT00940000157202.h	ENSGT00940000153173.b.b	ENSGT00940000158799.e	ENSGT00940000154971.u.a.f	ENSGT00940000156363.b	ENSGT00390000014272	ENSGT00940000164828	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	25																ENSGT00940000154813.e.a.a.a ##22	ENSGT00940000160415	ENSGT00940000165444	ENSGT00940000154881.c.b	ENSGT00510000048410	ENSGT00390000007911	ENSGT00940000155338.r	ENSGT00940000157943.b	ENSGT00940000157202.h	ENSGT00940000153173.b.b	ENSGT00940000158799.e	ENSGT00940000154971.u.a.f	ENSGT00940000156363.b	ENSGT00390000014272	ENSGT00940000164828	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a
Mexicana tetra	DUPLICATION
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	878															ENSAMXG00000042801	ENSAMXG00000043809 ##22	hsd17b1 (ENSAMXG00000017757)	si:ch73-141c7.1 (ENSAMXG00000035530)	ENSAMXG00000030468	aclya (ENSAMXG00000000394)	ENSAMXG00000032037	odad4 (ENSAMXG00000030297)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	11	stat3 (ENSAMXG00000000502)	stat5a (ENSAMXG00000000480)	ENSAMXG00000000476	ENSAMXG00000032517	ENSAMXG00000033555	kcnh4a (ENSAMXG00000000458)	rab5c (ENSAMXG00000043717)	kat2a (ENSAMXG00000041137)	dhx58 (ENSAMXG00000030658)	ZNF385C (ENSAMXG00000000412)	ENSAMXG00000029867	nkiras2 (ENSAMXG00000032340)	dnajc7 (ENSAMXG00000043280)	ENSAMXG00000035369	ENSAMXG00000029544	ENSAMXG00000039796 ##22	atp2a1 (ENSAMXG00000017798)	rabep2 (ENSAMXG00000017807)	ENSAMXG00000017817	ypel3 (ENSAMXG00000037728)	ENSAMXG00000043697	gdpd3a (ENSAMXG00000029825)	mapk3 (ENSAMXG00000017822)	nudt9 (ENSAMXG00000017827)	cln3 (ENSAMXG00000036462)	zgc:100868 (ENSAMXG00000017853)	ENSAMXG00000042175	plcd3a (ENSAMXG00000017880)	nmt1a (ENSAMXG00000017886)	RETSAT (ENSAMXG00000017893)	ENSAMXG00000041717
Channel catfish	MODERN SPECIES	11	zgc:100868 (ENSIPUG00000016407)	CLN3 (ENSIPUG00000016466)	Nudt9 (ENSIPUG00000016564)	mapk3 (ENSIPUG00000016591)	gdpd3a (ENSIPUG00000016630)	ypel3 (ENSIPUG00000016665)	ENSIPUG00000016678	ENSIPUG00000016694	Rabep2 (ENSIPUG00000016716)	atp2a1 (ENSIPUG00000016821)	ENSIPUG00000016938	baxa (ENSIPUG00000016971)	ENSIPUG00000017040	ENSIPUG00000017198	ENSIPUG00000017207	hsp70.1 (ENSIPUG00000017212) ##22	HSD17B1 (ENSIPUG00000017226)	si:ch73-141c7.1 (ENSIPUG00000017247)	Acly (ENSIPUG00000017257)	CNP (ENSIPUG00000017367)	ttc25 (ENSIPUG00000017385)	dnajc7 (ENSIPUG00000017399)	nkiras2 (ENSIPUG00000017444)	znf385c (ENSIPUG00000017483)	dhx58 (ENSIPUG00000019893)	kat2a (ENSIPUG00000019959)	rab5c (ENSIPUG00000020082)	kcnh4a (ENSIPUG00000020159)	hcrt (ENSIPUG00000020199)	ENSIPUG00000020204	STAT5B (ENSIPUG00000020269)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000183198.c.a	ENSGT00390000003014	ENSGT00390000005481	ENSGT00940000155641.g.a	ENSGT00940000156498.g.a	ENSGT00940000153469.a.a.k	ENSGT00930000151040.a.b	ENSGT00390000017405	ENSGT00940000160691	ENSGT00940000160759	ENSGT00940000161514	ENSGT00500000045140.a.a	ENSGT00530000063743.a	ENSGT00940000164922.g.a	ENSGT00940000154813.e.a.a.b ##22	ENSGT00940000154813.e.a.a.a ##22	ENSGT00940000160415	ENSGT00940000165444	ENSGT00940000154881.c.b	ENSGT00510000048410	ENSGT00390000007911	ENSGT00940000155338.r	ENSGT00940000157943.b	ENSGT00940000157202.h	ENSGT00940000153173.b.b	ENSGT00940000158799	ENSGT00940000154971.u.a.f	ENSGT00940000156363.b	ENSGT00390000014272	ENSGT00940000164828	ENSGT01080000257420.C.b.b.c.a
Cyprininae	DUPLICATION
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Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	267	ENSGT00940000164828.f	ENSGT00390000014272.g	ENSGT00940000156363.b.a	ENSGT00940000154971.u.a.f.a.a	ENSGT00940000158799.d.a	ENSGT00940000158799.c	ENSGT00940000153173.b.b.c.b	ENSGT00940000157202.h.e	ENSGT00940000157943.b.d	ENSGT00940000155338.r.g	ENSGT00390000007911.ab	ENSGT00510000048410.c	ENSGT00940000154881.c.b.a	ENSGT00940000165444.c	ENSGT00940000154813.e.a.a.b.a.a.a ##22	ENSGT00940000154813.e.a.a.a.e ##22	ENSGT00940000164922.g.a.a	ENSGT00530000063743.a.i	ENSGT00500000045140.a.a.d	ENSGT00940000161514.d	ENSGT00940000160759.i.a	ENSGT00940000160691.c	ENSGT00390000017405.e	ENSGT00930000151040.a.b.a	ENSGT00940000153469.a.a.k.a	ENSGT00940000156498.g.a.a	ENSGT00940000155641.g.a.b	ENSGT00390000005481	ENSGT00390000003014.g	ENSGT00390000003014.h	ENSGT00950000183198.c.b.b
Common carp reference	DUPLICATION
Common carp reference	DUPLICATION
Common carp reference	MODERN SPECIES	3	stat5a (ENSCCRG00000000563)	ENSCCRG00000070307	kcnh4a (ENSCCRG00000041482)	rab5c (ENSCCRG00000070126)	kat2a (ENSCCRG00000001483)	dhx58 (ENSCCRG00000033653)	ZNF385C (ENSCCRG00000053163)	nkiras2 (ENSCCRG00000062265)	dnajc7 (ENSCCRG00000066828)	odad4 (ENSCCRG00000006537)	ENSCCRG00000006579	aclya (ENSCCRG00000043645)	si:ch73-141c7.1 (ENSCCRG00000043713)	ENSCCRG00000043718	ENSCCRG00000071962 ##22	ENSCCRG00000057243 ##22	ENSCCRG00000074982	rabep2 (ENSCCRG00000043969)	ENSCCRG00000034145	ypel3 (ENSCCRG00000072463)	gdpd3a (ENSCCRG00000034157)	mapk3 (ENSCCRG00000034221)	nudt9 (ENSCCRG00000045075)	ppp4ca (ENSCCRG00000045096)	ENSCCRG00000045147	ENSCCRG00000035627	rhot1a (ENSCCRG00000036369)	zgc:153240 (ENSCCRG00000045205)	ENSCCRG00000054925	rps15a (ENSCCRG00000045214)	xylt1 (ENSCCRG00000021880)
Common carp reference	MODERN SPECIES	3	rps15a (ENSCCRG00000045214)	ENSCCRG00000054925	zgc:153240 (ENSCCRG00000045205)	rhot1a (ENSCCRG00000036369)	ENSCCRG00000035627	ENSCCRG00000045147	ppp4ca (ENSCCRG00000045096)	nudt9 (ENSCCRG00000045075)	mapk3 (ENSCCRG00000034221)	gdpd3a (ENSCCRG00000034157)	ypel3 (ENSCCRG00000072463)	ENSCCRG00000034145	rabep2 (ENSCCRG00000043969)	ENSCCRG00000074982	ENSCCRG00000057243 ##22	ENSCCRG00000071962 ##22	ENSCCRG00000043718	si:ch73-141c7.1 (ENSCCRG00000043713)	aclya (ENSCCRG00000043645)	ENSCCRG00000006579	odad4 (ENSCCRG00000006537)	dnajc7 (ENSCCRG00000066828)	nkiras2 (ENSCCRG00000062265)	ZNF385C (ENSCCRG00000053163)	dhx58 (ENSCCRG00000033653)	kat2a (ENSCCRG00000001483)	rab5c (ENSCCRG00000070126)	kcnh4a (ENSCCRG00000041482)	ENSCCRG00000070307	stat5a (ENSCCRG00000000563)	stat3 (ENSCCRG00000009761)
Common carp reference	MODERN SPECIES	1	xylt1 (ENSCCRG00000023544)	ENSCCRG00000065833	ENSCCRG00000063466	zgc:153240 (ENSCCRG00000067474)	rhot1a (ENSCCRG00000038596)	ENSCCRG00000045175	ENSCCRG00000045161	ppp4ca (ENSCCRG00000068440)	mapk3 (ENSCCRG00000044044)	gdpd3a (ENSCCRG00000044023)	ypel3 (ENSCCRG00000065600)	ENSCCRG00000043993	rabep2 (ENSCCRG00000034115)	atp2a1 (ENSCCRG00000043768)	ENSCCRG00000055692 ##22	ENSCCRG00000061206 ##22	hsd17b1 (ENSCCRG00000034106)	si:ch73-141c7.1 (ENSCCRG00000034099)	aclya (ENSCCRG00000033443)	ENSCCRG00000059111	odad4 (ENSCCRG00000011388)	dnajc7 (ENSCCRG00000076833)	nkiras2 (ENSCCRG00000079169)	ZNF385C (ENSCCRG00000074735)	dhx58 (ENSCCRG00000065109)	dhx58 (ENSCCRG00000066329)	kat2a (ENSCCRG00000042040)	rab5c (ENSCCRG00000067819)	kcnh4a (ENSCCRG00000042484)	ENSCCRG00000079629	stat5a (ENSCCRG00000011375)
Goldfish	MODERN SPECIES	20	xylt1 (ENSCARG00000026366)	ENSCARG00000026308	rhot1a (ENSCARG00000022383)	ENSCARG00000022265	ENSCARG00000022234	ENSCARG00000022227	ppp4ca (ENSCARG00000022216)	nudt9 (ENSCARG00000022199)	mapk3 (ENSCARG00000021557)	gdpd3a (ENSCARG00000021480)	ypel3 (ENSCARG00000021467)	ENSCARG00000021452	rabep2 (ENSCARG00000021437)	atp2a1 (ENSCARG00000021260)	ENSCARG00000021235 ##22	HSPA2 (ENSCARG00000021230) ##22	hsd17b1 (ENSCARG00000021215)	si:ch73-141c7.1 (ENSCARG00000021194)	aclya (ENSCARG00000020899)	ENSCARG00000020866	dnajc7 (ENSCARG00000020669)	nkiras2 (ENSCARG00000020640)	ZNF385C (ENSCARG00000020625)	dhx58 (ENSCARG00000020423)	kat2a (ENSCARG00000019667)	rab5c (ENSCARG00000019616)	kcnh4a (ENSCARG00000019502)	hcrt (ENSCARG00000019481)	ENSCARG00000019474	stat5a (ENSCARG00000016438)	ENSCARG00000016333
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	1852															ENSGT00940000154813.e.a.a.b.a.a.a ##22	ENSGT00940000154813.e.a.a.a.f ##22
Goldfish	MODERN SPECIES	22	ENSCARG00000055764	zgc:153240 (ENSCARG00000055784)	rhot1a (ENSCARG00000055883)	ENSCARG00000057110	ENSCARG00000057530	ENSCARG00000057536	ppp4ca (ENSCARG00000057542)	nudt9 (ENSCARG00000057560)	mapk3 (ENSCARG00000057611)	gdpd3a (ENSCARG00000058572)	ypel3 (ENSCARG00000058708)	ENSCARG00000058745	rabep2 (ENSCARG00000058816)	atp2a1 (ENSCARG00000058851)	ENSCARG00000058921 ##22	ENSCARG00000058956 ##22	hsd17b1 (ENSCARG00000058974)	si:ch73-141c7.1 (ENSCARG00000059038)	aclya (ENSCARG00000059054)	ENSCARG00000059169	odad4 (ENSCARG00000059259)	dnajc7 (ENSCARG00000060234)	nkiras2 (ENSCARG00000061035)	ENSCARG00000061051	ENSCARG00000061084	csnk1da (ENSCARG00000061105)	slc16a3a (ENSCARG00000061291)	scpep1 (ENSCARG00000061359)	coil (ENSCARG00000061522)	rab11fip4a (ENSCARG00000061569)	suz12a (ENSCARG00000061839)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.a.a.f ##22
Common carp reference	MODERN SPECIES	3	tmem11 (ENSCCRG00000079334)	natd1 (ENSCCRG00000064621)	phospho1 (ENSCCRG00000072193)	ENSCCRG00000027597	phb (ENSCCRG00000071295)	mvp (ENSCCRG00000063252)	ENSCCRG00000043521	ENSCCRG00000035137	ENSCCRG00000035159	ENSCCRG00000068744	sgf29 (ENSCCRG00000074953)	nupr1b (ENSCCRG00000063606)	spns1 (ENSCCRG00000072982)	atxn2l (ENSCCRG00000051049)	sh2b1 (ENSCCRG00000080788)	ENSCCRG00000055032 ##22	pitpnbl (ENSCCRG00000051068)	cabp5b (ENSCCRG00000009560)	ENSCCRG00000009567	ENSCCRG00000051107	kctd13 (ENSCCRG00000051112)	hirip3 (ENSCCRG00000051117)	rprml (ENSCCRG00000058144)	itgb3a (ENSCCRG00000049656)	mettl2a (ENSCCRG00000008201)	tlk2 (ENSCCRG00000066124)	MRC2 (ENSCCRG00000011390)	rnd2 (ENSCCRG00000024725)	vat1 (ENSCCRG00000066633)	ENSCCRG00000061047	asb16 (ENSCCRG00000008740)
Zebrafish	DUPLICATION
Zebrafish	DUPLICATION
Zebrafish	DUPLICATION
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Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	1852															ENSGT00940000154813.e.a.a.a.f ##22	ENSGT00940000154813.e.a.a.b.a.a.a ##22
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Goldfish	MODERN SPECIES	20	stat5a (ENSCARG00000016438)	ENSCARG00000019474	hcrt (ENSCARG00000019481)	kcnh4a (ENSCARG00000019502)	rab5c (ENSCARG00000019616)	kat2a (ENSCARG00000019667)	dhx58 (ENSCARG00000020423)	ZNF385C (ENSCARG00000020625)	nkiras2 (ENSCARG00000020640)	dnajc7 (ENSCARG00000020669)	ENSCARG00000020866	aclya (ENSCARG00000020899)	si:ch73-141c7.1 (ENSCARG00000021194)	hsd17b1 (ENSCARG00000021215)	HSPA2 (ENSCARG00000021230) ##22	ENSCARG00000021235 ##22	atp2a1 (ENSCARG00000021260)	rabep2 (ENSCARG00000021437)	ENSCARG00000021452	ypel3 (ENSCARG00000021467)	gdpd3a (ENSCARG00000021480)	mapk3 (ENSCARG00000021557)	nudt9 (ENSCARG00000022199)	ppp4ca (ENSCARG00000022216)	ENSCARG00000022227	ENSCARG00000022234	ENSCARG00000022265	rhot1a (ENSCARG00000022383)	ENSCARG00000026308	xylt1 (ENSCARG00000026366)	ENSCARG00000028042
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.a.b.a.b ##22
Goldfish	MODERN SPECIES	22	natd1 (ENSCARG00000016601)	phospho1 (ENSCARG00000016616)	ENSCARG00000016623	phb (ENSCARG00000016637)	mvp (ENSCARG00000016682)	ENSCARG00000017008	ENSCARG00000017019	ENSCARG00000017027	DOC2A (ENSCARG00000017058)	nupr1b (ENSCARG00000017117)	sgf29 (ENSCARG00000017126)	nfatc2ip (ENSCARG00000017168)	spns1 (ENSCARG00000017187)	atxn2l (ENSCARG00000017283)	sh2b1 (ENSCARG00000017371)	ENSCARG00000017392 ##22	pitpnbl (ENSCARG00000017414)	cabp5b (ENSCARG00000017528)	ASPHD2 (ENSCARG00000017548)	ENSCARG00000017573	kctd13 (ENSCARG00000017803)	hirip3 (ENSCARG00000017817)	rprml (ENSCARG00000017824)	itgb3a (ENSCARG00000017844)	mettl2a (ENSCARG00000017995)	tlk2 (ENSCARG00000018108)	MRC2 (ENSCARG00000018238)	rnd2 (ENSCARG00000018465)	vat1 (ENSCARG00000018475)	ENSCARG00000018487	tmub2 (ENSCARG00000018495)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.a.b.b ##22
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Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.a.b ##22
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.a.a.b ##22
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Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	810															ENSGT00940000154813.e.a.a.a ##22	ENSGT00940000154813.e.a.a.b ##22
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	11	FGD2 (ENSSFOG00015022370)	cacna1sb (ENSSFOG00015022398)	tmem9 (ENSSFOG00015022443)	def6a (ENSSFOG00015022459)	PPARD (ENSSFOG00015024815)	mkrn4 (ENSSFOG00015024848)	fance (ENSSFOG00015032525)	rpl10a (ENSSFOG00015022494)	ENSSFOG00015022512	ENSSFOG00015027320	ELAPOR1 (ENSSFOG00015021350)	ENSSFOG00015021413	ENSSFOG00015031936 ##22	ENSSFOG00015021430	ENSSFOG00015013305 ##22	HSPA2 (ENSSFOG00015027464) ##22	tmem167b (ENSSFOG00015007434)	zgc:195245 (ENSSFOG00015007448)	ENSSFOG00015027285	ENSSFOG00015027319	cpne5a (ENSSFOG00015023325)	CLPS (ENSSFOG00015023320)	lhfpl5b (ENSSFOG00015023315)	srpk1a (ENSSFOG00015023299)	imp4 (ENSSFOG00015023293)	araf (ENSSFOG00015023274)	syn1 (ENSSFOG00015027179)	vgll4l (ENSSFOG00015023244)	ENSSFOG00015028510	fam50a (ENSSFOG00015023202)	alas2 (ENSSFOG00015023189)
Spotted gar	MODERN SPECIES	656	stau1 (ENSLOCG00000003134)	cse1l (ENSLOCG00000003099)	ARFGEF2 (ENSLOCG00000003044)	pard6b (ENSLOCG00000003029)	BCAS4 (ENSLOCG00000003016)	adnpa (ENSLOCG00000002980)	dpm1 (ENSLOCG00000002964)	ENSLOCG00000002951	ENSLOCG00000002918	ENSLOCG00000002883	arfgap1 (ENSLOCG00000002853)	rh50 (ENSLOCG00000002840)	ENSLOCG00000002800	sys1 (ENSLOCG00000002789)	slc35c2 (ENSLOCG00000002748)	hsp70.1 (ENSLOCG00000002736) #22	ELMO2 (ENSLOCG00000002700)	snrpb (ENSLOCG00000002687)	ddx27 (ENSLOCG00000002659)	ZNFX1 (ENSLOCG00000002641)	ENSLOCG00000002624	CDH22 (ENSLOCG00000002614)	ENSLOCG00000002594	cbln4 (ENSLOCG00000002576)	DOK5 (ENSLOCG00000002550)	PFDN4 (ENSLOCG00000002535)	cyp24a1 (ENSLOCG00000002513)	ENSLOCG00000002499	znf217 (ENSLOCG00000002484)	TSHZ2 (ENSLOCG00000002451)	ZFP64 (ENSLOCG00000002444)
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.b ##22
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.b ##22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	119	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000155036	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00390000012644
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00960000189691	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
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Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT01000000217803	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT01000000217803	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975	ENSGT00940000155325.a.a.b
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Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT01000000217803	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975	ENSGT00940000155325.a.b.b
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679.pc	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT01000000217803	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975	ENSGT00940000155325.a.b.b
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679.pc	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT01000000217803	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000158508
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Platyfish	MODERN SPECIES		ENSXMAG00000009883	atp5pb (ENSXMAG00000028165)	eps8l3b (ENSXMAG00000009910)	GSTM4 (ENSXMAG00000009919)	GSTM4 (ENSXMAG00000009961)	AMPD2 (ENSXMAG00000009964)	gnat2 (ENSXMAG00000020846)	gnai3 (ENSXMAG00000010017)	GPR61 (ENSXMAG00000010044)	AMIGO1 (ENSXMAG00000020190)	ENSXMAG00000027150	sort1b (ENSXMAG00000010054)	ngrn (ENSXMAG00000029085)	nfyal (ENSXMAG00000010069)	ahcyl1 (ENSXMAG00000022647)	hspa1b (ENSXMAG00000020191) ##22	KCNC4 (ENSXMAG00000028069)	slc6a17 (ENSXMAG00000010082)	ALX3 (ENSXMAG00000010113)	RBM15 (ENSXMAG00000020192)	slc16a4 (ENSXMAG00000010114)	lamtor5 (ENSXMAG00000027457)	prok1 (ENSXMAG00000024068)	ZNF335 (ENSXMAG00000010129)	mmp9 (ENSXMAG00000010153)	adora1b (ENSXMAG00000010202)	dclre1b (ENSXMAG00000010206)	cpne5a (ENSXMAG00000023235)	lhfpl5b (ENSXMAG00000010289)	srpk1a (ENSXMAG00000010290)	mapk14a (ENSXMAG00000010317)
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Mummichog	MODERN SPECIES	2277	ENSFHEG00000005427	atp5pb (ENSFHEG00000005417)	eps8l3b (ENSFHEG00000005406)	gstm.1 (ENSFHEG00000005390)	GSTM4 (ENSFHEG00000005359)	AMPD2 (ENSFHEG00000005335)	gnat2 (ENSFHEG00000005288)	gnai3 (ENSFHEG00000005261)	GPR61 (ENSFHEG00000005232)	AMIGO1 (ENSFHEG00000005213)	ENSFHEG00000005205	sort1b (ENSFHEG00000005188)	ngrn (ENSFHEG00000005172)	nfyal (ENSFHEG00000005156)	ahcyl1 (ENSFHEG00000005111)	hspa1b (ENSFHEG00000005078) ##22	KCNC4 (ENSFHEG00000005071)	slc6a17 (ENSFHEG00000005060)	ENSFHEG00000005036	RBM15 (ENSFHEG00000005024)	slc16a4 (ENSFHEG00000005013)	lamtor5 (ENSFHEG00000004998)	prok1 (ENSFHEG00000004984)	ZNF335 (ENSFHEG00000004957)	mmp9 (ENSFHEG00000004917)	adora1b (ENSFHEG00000004910)	dclre1b (ENSFHEG00000004898)	cpne5a (ENSFHEG00000004889)	lhfpl5b (ENSFHEG00000004829)	srpk1a (ENSFHEG00000004819)	mapk14a (ENSFHEG00000004796)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	297	ENSCVAG00000013899	ENSCVAG00000000347	znf362b (ENSCVAG00000013839)	ENSCVAG00000013778	GSTM4 (ENSCVAG00000013765)	AMPD2 (ENSCVAG00000013706)	gnat2 (ENSCVAG00000013586)	gnai3 (ENSCVAG00000013555)	GPR61 (ENSCVAG00000013531)	AMIGO1 (ENSCVAG00000013525)	ENSCVAG00000013521	sort1b (ENSCVAG00000013495)	ngrn (ENSCVAG00000013397)	nfyal (ENSCVAG00000013390)	ahcyl1 (ENSCVAG00000013342)	hspa1b (ENSCVAG00000013255) ##22	KCNC4 (ENSCVAG00000013253)	slc6a17 (ENSCVAG00000013219)	ALX3 (ENSCVAG00000013191)	RBM15 (ENSCVAG00000013185)	slc16a4 (ENSCVAG00000013170)	lamtor5 (ENSCVAG00000013158)	prok1 (ENSCVAG00000013149)	ENSCVAG00000013143	ENSCVAG00000013104	mmp9 (ENSCVAG00000013096)	adora1b (ENSCVAG00000013058)	dclre1b (ENSCVAG00000013053)	ENSCVAG00000013049	cpne5a (ENSCVAG00000013042)	lhfpl5b (ENSCVAG00000012886)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000182846.a.a.a.a.b	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975	ENSGT00940000155325.a.b.b
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	41	ENSKMAG00000017049	atp5pb (ENSKMAG00000017065)	eps8l3b (ENSKMAG00000017078)	gstm.1 (ENSKMAG00000017116)	AMPD2 (ENSKMAG00000017234)	gnat2 (ENSKMAG00000017320)	gnai3 (ENSKMAG00000017347)	GPR61 (ENSKMAG00000017365)	ENSKMAG00000017368	AMIGO1 (ENSKMAG00000017376)	ENSKMAG00000017391	sort1b (ENSKMAG00000017406)	ngrn (ENSKMAG00000017423)	nfyal (ENSKMAG00000017441)	ahcyl1 (ENSKMAG00000017489)	hspa1b (ENSKMAG00000017531) ##22	KCNC4 (ENSKMAG00000017589)	slc6a17 (ENSKMAG00000017633)	ALX3 (ENSKMAG00000017675)	RBM15 (ENSKMAG00000017681)	slc16a4 (ENSKMAG00000017689)	lamtor5 (ENSKMAG00000017708)	prok1 (ENSKMAG00000017722)	ZNF335 (ENSKMAG00000017738)	mmp9 (ENSKMAG00000017773)	adora1b (ENSKMAG00000017814)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975	ENSGT00940000155325.a.a.b
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679.nc	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975	ENSGT00940000155325.a.a.b
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	21	atp5pb (ENSORLG00000027488)	ENSORLG00000005876	eps8l3b (ENSORLG00000028416)	gstm.1 (ENSORLG00000005927)	GSTM4 (ENSORLG00000005961)	AMPD2 (ENSORLG00000005987)	gnat2 (ENSORLG00000006010)	gnai3 (ENSORLG00000006031)	GPR61 (ENSORLG00000006038)	AMIGO1 (ENSORLG00000021947)	ENSORLG00000006044	sort1b (ENSORLG00000006051)	ngrn (ENSORLG00000006055)	nfyal (ENSORLG00000006088)	ahcyl1 (ENSORLG00000006126)	hspa1b (ENSORLG00000006132) ##22	ENSORLG00000006154	slc6a17 (ENSORLG00000006181)	ALX3 (ENSORLG00000006191)	RBM15 (ENSORLG00000006197)	slc16a4 (ENSORLG00000006243)	prok1 (ENSORLG00000023050)	lamtor5 (ENSORLG00000006257)	ZNF335 (ENSORLG00000006291)	mmp9 (ENSORLG00000006340)	adora1b (ENSORLG00000006349)	dclre1b (ENSORLG00000006355)	cpne5a (ENSORLG00000006371)	ENSORLG00000023802	lhfpl5b (ENSORLG00000006380)	srpk1a (ENSORLG00000006445)
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975	ENSGT00940000155325.a.a.b
Indian medaka	MODERN SPECIES	23	ENSOMEG00000021393	atp5pb (ENSOMEG00000021374)	eps8l3b (ENSOMEG00000021346)	gstm.1 (ENSOMEG00000021291)	GSTM4 (ENSOMEG00000021265)	AMPD2 (ENSOMEG00000021210)	gnat2 (ENSOMEG00000021113)	gnai3 (ENSOMEG00000021074)	GPR61 (ENSOMEG00000020997)	AMIGO1 (ENSOMEG00000020985)	ENSOMEG00000020972	sort1b (ENSOMEG00000020949)	ngrn (ENSOMEG00000020920)	nfyal (ENSOMEG00000020890)	ahcyl1 (ENSOMEG00000020835)	hspa1b (ENSOMEG00000020771) ##22	KCNC4 (ENSOMEG00000020763)	slc6a17 (ENSOMEG00000020740)	ALX3 (ENSOMEG00000020695)	RBM15 (ENSOMEG00000020683)	slc16a4 (ENSOMEG00000020668)	lamtor5 (ENSOMEG00000020644)	prok1 (ENSOMEG00000020625)	ZNF335 (ENSOMEG00000020613)	mmp9 (ENSOMEG00000020574)	adora1b (ENSOMEG00000020524)	dclre1b (ENSOMEG00000020517)	cpne5a (ENSOMEG00000020486)	lhfpl5b (ENSOMEG00000020410)	srpk1a (ENSOMEG00000020378)	MAPK14 (ENSOMEG00000020288)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT01000000217803	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663.p	ENSGT00940000157663.o	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT01000000217803	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663.p	ENSGT00940000157663.o	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT01000000217803	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663.p	ENSGT00940000157663.o	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT01000000217803	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663.p	ENSGT00940000157663.o	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415.f	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663.p	ENSGT00940000157663.o	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415.f	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663.p	ENSGT00940000157663.o	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415.f	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1103	atp5pb (ENSMZEG00005007072)	ENSMZEG00005007059	ENSMZEG00005007043	GSTM3 (ENSMZEG00005007020)	AMPD2 (ENSMZEG00005006961)	gnat2 (ENSMZEG00005006936)	gnai3 (ENSMZEG00005006906)	GPR61 (ENSMZEG00005006885)	AMIGO1 (ENSMZEG00005006878)	atxn7l2b (ENSMZEG00005006861)	SYPL2 (ENSMZEG00005006813)	sort1b (ENSMZEG00005006789)	ngrn (ENSMZEG00005006770)	nfyal (ENSMZEG00005006732)	ahcyl1 (ENSMZEG00005006659)	hspa1b (ENSMZEG00005006643) ##22	KCNC4 (ENSMZEG00005006634)	slc6a17 (ENSMZEG00005006618)	ALX3 (ENSMZEG00005006605)	RBM15 (ENSMZEG00005006595)	slc16a4 (ENSMZEG00005006575)	lamtor5 (ENSMZEG00005006567)	prok1 (ENSMZEG00005006553)	ENSMZEG00005006526	ZNF335 (ENSMZEG00005006500)	mmp9 (ENSMZEG00005006471)	adora1b (ENSMZEG00005006459)	dclre1b (ENSMZEG00005006454)	cpne5a (ENSMZEG00005006419)	lhfpl5b (ENSMZEG00005006410)	srpk1a (ENSMZEG00005006383)
Eastern happy	MODERN SPECIES	12	atp5pb (ENSACLG00000026462)	eps8l3b (ENSACLG00000001004)	ENSACLG00000001025	GSTM3 (ENSACLG00000001079)	AMPD2 (ENSACLG00000001111)	gnat2 (ENSACLG00000001234)	gnai3 (ENSACLG00000001274)	GPR61 (ENSACLG00000001325)	AMIGO1 (ENSACLG00000001345)	atxn7l2b (ENSACLG00000001348)	SYPL2 (ENSACLG00000001356)	sort1b (ENSACLG00000001383)	ngrn (ENSACLG00000001441)	nfyal (ENSACLG00000001456)	ahcyl1 (ENSACLG00000001491)	hspa1b (ENSACLG00000001564) ##22	KCNC4 (ENSACLG00000001578)	slc6a17 (ENSACLG00000001594)	ALX3 (ENSACLG00000001667)	RBM15 (ENSACLG00000001673)	slc16a4 (ENSACLG00000001768)	lamtor5 (ENSACLG00000001783)	prok1 (ENSACLG00000001795)	ENSACLG00000001801	ZNF335 (ENSACLG00000001847)	mmp9 (ENSACLG00000001873)	adora1b (ENSACLG00000001934)	dclre1b (ENSACLG00000001963)	cpne5a (ENSACLG00000001979)	lhfpl5b (ENSACLG00000002097)	srpk1a (ENSACLG00000002140)
P. nyererei	MODERN SPECIES	344	ENSPNYG00000005862	ENSPNYG00000005839	GSTM3 (ENSPNYG00000005797)	AMPD2 (ENSPNYG00000005752)	ENSPNYG00000005736	gnat2 (ENSPNYG00000005708)	gnai3 (ENSPNYG00000005691)	GPR61 (ENSPNYG00000005679)	AMIGO1 (ENSPNYG00000005674)	atxn7l2b (ENSPNYG00000005666)	SYPL2 (ENSPNYG00000005577)	sort1b (ENSPNYG00000005505)	ngrn (ENSPNYG00000005483)	nfyal (ENSPNYG00000005461)	ahcyl1 (ENSPNYG00000005417)	hspa1b (ENSPNYG00000005394) ##22	KCNC4 (ENSPNYG00000005250)	slc6a17 (ENSPNYG00000005188)	ALX3 (ENSPNYG00000005155)	RBM15 (ENSPNYG00000005143)	slc16a4 (ENSPNYG00000005111)	lamtor5 (ENSPNYG00000005045)	prok1 (ENSPNYG00000005022)	ENSPNYG00000004990
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	277	atp5pb (ENSHBUG00000021727)	ENSHBUG00000021743	ENSHBUG00000021760	GSTM3 (ENSHBUG00000021783)	AMPD2 (ENSHBUG00000021953)	gnat2 (ENSHBUG00000021982)	gnai3 (ENSHBUG00000021995)	GPR61 (ENSHBUG00000021999)	AMIGO1 (ENSHBUG00000022003)	atxn7l2b (ENSHBUG00000022012)	SYPL2 (ENSHBUG00000022019)	sort1b (ENSHBUG00000022122)	ngrn (ENSHBUG00000022131)	nfyal (ENSHBUG00000022163)	ahcyl1 (ENSHBUG00000022174)	hspa1b (ENSHBUG00000022182) ##22	KCNC4 (ENSHBUG00000022183)	slc6a17 (ENSHBUG00000022205)	ALX3 (ENSHBUG00000022212)	RBM15 (ENSHBUG00000022227)	slc16a4 (ENSHBUG00000022243)	lamtor5 (ENSHBUG00000022344)	prok1 (ENSHBUG00000022357)	prok1 (ENSHBUG00000022365)	ENSHBUG00000000682	ZNF335 (ENSHBUG00000022427)	mmp9 (ENSHBUG00000022457)	adora1b (ENSHBUG00000022466)	dclre1b (ENSHBUG00000000905)	cpne5a (ENSHBUG00000000695)	lhfpl5b (ENSHBUG00000022649)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	298	atp5pb (ENSNBRG00000008190)	eps8l3b (ENSNBRG00000008236)	ENSNBRG00000008343	GSTM3 (ENSNBRG00000008352)	ENSNBRG00000008386	gnat2 (ENSNBRG00000008416)	gnai3 (ENSNBRG00000008453)	ENSNBRG00000008479	GPR61 (ENSNBRG00000008497)	AMIGO1 (ENSNBRG00000008504)	ENSNBRG00000008515	SYPL2 (ENSNBRG00000008552)	ngrn (ENSNBRG00000008661)	nfya (ENSNBRG00000008718)	ahcyl1 (ENSNBRG00000008764)	hspa1b (ENSNBRG00000008819) ##22	KCNC4 (ENSNBRG00000008828)	slc6a17 (ENSNBRG00000008836)	RBM15 (ENSNBRG00000008870)	slc16a4 (ENSNBRG00000008880)	lamtor5 (ENSNBRG00000008898)	prok1 (ENSNBRG00000008920)	ENSNBRG00000008944	ZNF335 (ENSNBRG00000008985)	ENSNBRG00000009059	ENSNBRG00000009071	adora1b (ENSNBRG00000009081)	dclre1b (ENSNBRG00000009095)	cpne5a (ENSNBRG00000009118)	lhfpl5b (ENSNBRG00000009219)	srpk1a (ENSNBRG00000009235)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	12	dnase1l1l (ENSONIG00000002457)	ENSONIG00000002460	atp5pb (ENSONIG00000002466)	eps8l3b (ENSONIG00000002469)	eno1a (ENSONIG00000002418)	AMPD2 (ENSONIG00000002491)	gnat2 (ENSONIG00000002498)	gnai3 (ENSONIG00000002502)	GPR61 (ENSONIG00000002508)	ENSONIG00000002509	SYPL2 (ENSONIG00000002511)	sort1b (ENSONIG00000002515)	ngrn (ENSONIG00000002521)	nfyal (ENSONIG00000030510)	ahcyl1 (ENSONIG00000042612)	hspa1b (ENSONIG00000028338) ##22	KCNC4 (ENSONIG00000002522)	slc6a17 (ENSONIG00000002523)	ALX3 (ENSONIG00000002531)	RBM15 (ENSONIG00000002532)	slc16a4 (ENSONIG00000002533)	lamtor5 (ENSONIG00000002539)	prok1 (ENSONIG00000039301)	ENSONIG00000002541	ENSONIG00000033928	ZNF335 (ENSONIG00000011809)	mmp9 (ENSONIG00000011812)	adora1b (ENSONIG00000028739)	dclre1b (ENSONIG00000029854)	CPNE5 (ENSONIG00000011820)	lhfpl5b (ENSONIG00000034910)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	814	atp5pb (ENSACIG00000005414)	ENSACIG00000005381	ENSACIG00000005363	GSTM3 (ENSACIG00000005348)	AMPD2 (ENSACIG00000005318)	gnat2 (ENSACIG00000005299)	gnai3 (ENSACIG00000005272)	GPR61 (ENSACIG00000005265)	AMIGO1 (ENSACIG00000005256)	ENSACIG00000005247	SYPL2 (ENSACIG00000005125)	sort1b (ENSACIG00000004786)	ngrn (ENSACIG00000004760)	nfyal (ENSACIG00000004742)	ahcyl1 (ENSACIG00000004702)	hspa1b (ENSACIG00000004418) ##22	KCNC4 (ENSACIG00000004388)	slc6a17 (ENSACIG00000004362)	ALX3 (ENSACIG00000004355)	RBM15 (ENSACIG00000004343)	slc16a4 (ENSACIG00000004331)	lamtor5 (ENSACIG00000004321)	prok1 (ENSACIG00000004300)	ENSACIG00000004094	ZNF335 (ENSACIG00000004020)	mmp9 (ENSACIG00000003969)	adora1b (ENSACIG00000003958)	dclre1b (ENSACIG00000003939)	cpne5a (ENSACIG00000003829)	lhfpl5b (ENSACIG00000003808)	srpk1a (ENSACIG00000003612)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000165209	ENSGT00940000159662.d	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a.e	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000160258	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a.e	ENSGT00940000159662.d	ENSGT00940000165209	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a
Orange clownfish	MODERN SPECIES	22	ENSAPEG00000021058	atp5pb (ENSAPEG00000021044)	eps8l3b (ENSAPEG00000021015)	GSTM1 (ENSAPEG00000020605)	AMPD2 (ENSAPEG00000020508)	gnat2 (ENSAPEG00000020489)	gnai3 (ENSAPEG00000020464)	GPR61 (ENSAPEG00000020450)	AMIGO1 (ENSAPEG00000020439)	atxn7l2b (ENSAPEG00000020426)	SYPL2 (ENSAPEG00000020414)	sort1b (ENSAPEG00000020394)	ngrn (ENSAPEG00000020381)	nfyal (ENSAPEG00000020324)	ahcyl1 (ENSAPEG00000020242)	hspa1b (ENSAPEG00000020226) ##22	KCNC4 (ENSAPEG00000020218)	slc6a17 (ENSAPEG00000020178)	ENSAPEG00000020159	ENSAPEG00000020149	RBM15 (ENSAPEG00000020077)	slc16a4 (ENSAPEG00000020058)	lamtor5 (ENSAPEG00000020041)	prok1 (ENSAPEG00000020014)	ENSAPEG00000020000	ZNF335 (ENSAPEG00000019914)	mmp9 (ENSAPEG00000019893)	adora1b (ENSAPEG00000019884)	dclre1b (ENSAPEG00000019877)	cpne5a (ENSAPEG00000019725)	srpk1a (ENSAPEG00000019620)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	2057						gnat2 (ENSAOCG00000023711)	gnai3 (ENSAOCG00000023701)	GPR61 (ENSAOCG00000023684)	AMIGO1 (ENSAOCG00000023683)	atxn7l2b (ENSAOCG00000002040)	SYPL2 (ENSAOCG00000001710)	sort1b (ENSAOCG00000023655)	ngrn (ENSAOCG00000023590)	nfyal (ENSAOCG00000001692)	ahcyl1 (ENSAOCG00000023514)	hspa1b (ENSAOCG00000023448) ##22	KCNC4 (ENSAOCG00000023441)	ENSAOCG00000001686
Spiny chromis	MODERN SPECIES	636	ENSAPOG00000002969	atp5pb (ENSAPOG00000002948)	eps8l3b (ENSAPOG00000002933)	gstm.1 (ENSAPOG00000002901)	AMPD2 (ENSAPOG00000002862)	gnat2 (ENSAPOG00000002803)	ENSAPOG00000002784	GPR61 (ENSAPOG00000002762)	AMIGO1 (ENSAPOG00000002751)	atxn7l2b (ENSAPOG00000002745)	SYPL2 (ENSAPOG00000002737)	sort1b (ENSAPOG00000002724)	ngrn (ENSAPOG00000002663)	nfyal (ENSAPOG00000002639)	ahcyl1 (ENSAPOG00000002570)	hspa1b (ENSAPOG00000002509) ##22	KCNC4 (ENSAPOG00000002502)	slc6a17 (ENSAPOG00000002495)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	260	ENSSPAG00000004485	atp5pb (ENSSPAG00000004512)	ENSSPAG00000004541	gstm.1 (ENSSPAG00000004557)	AMPD2 (ENSSPAG00000004594)	gnat2 (ENSSPAG00000004641)	gnai3 (ENSSPAG00000004663)	GPR61 (ENSSPAG00000004684)	AMIGO1 (ENSSPAG00000004692)	atxn7l2b (ENSSPAG00000004696)	SYPL2 (ENSSPAG00000004721)	sort1b (ENSSPAG00000004737)	ngrn (ENSSPAG00000004765)	nfyal (ENSSPAG00000004776)	ahcyl1 (ENSSPAG00000004812)	hspa1b (ENSSPAG00000004891) ##22	KCNC4 (ENSSPAG00000004901)	slc6a17 (ENSSPAG00000004910)	ENSSPAG00000004941	ENSSPAG00000004954	RBM15 (ENSSPAG00000004965)	slc16a4 (ENSSPAG00000004978)	lamtor5 (ENSSPAG00000005011)	prok1 (ENSSPAG00000005026)	ENSSPAG00000005119	ZNF335 (ENSSPAG00000006179)	mmp9 (ENSSPAG00000006357)	adora1b (ENSSPAG00000006385)	dclre1b (ENSSPAG00000006390)	cpne5a (ENSSPAG00000006402)	lhfpl5b (ENSSPAG00000006448)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000239794	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000239794	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000239794	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	18	dnase1l1l (ENSBSLG00000006918)	ENSBSLG00000006846	atp5pb (ENSBSLG00000006786)	eps8l3b (ENSBSLG00000006724)	GSTM4 (ENSBSLG00000006614)	AMPD2 (ENSBSLG00000006187)	gnat2 (ENSBSLG00000006170)	gnai3 (ENSBSLG00000006162)	GPR61 (ENSBSLG00000006156)	AMIGO1 (ENSBSLG00000006154)	ENSBSLG00000006119	sort1b (ENSBSLG00000005957)	ngrn (ENSBSLG00000005942)	nfyal (ENSBSLG00000005919)	ahcyl1 (ENSBSLG00000005073)	hspa1b (ENSBSLG00000004932) ##22	KCNC4 (ENSBSLG00000004872)	slc6a17 (ENSBSLG00000004841)	ENSBSLG00000004818	ENSBSLG00000004799	RBM15 (ENSBSLG00000004783)	slc16a4 (ENSBSLG00000004752)	lamtor5 (ENSBSLG00000004377)	prok1 (ENSBSLG00000004372)	ENSBSLG00000004337	ENSBSLG00000004330	ZNF335 (ENSBSLG00000004324)	mmp9 (ENSBSLG00000004091)	adora1b (ENSBSLG00000004032)	dclre1b (ENSBSLG00000004014)	cpne5a (ENSBSLG00000003796)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3155	ENSSLDG00000001913	atp5pb (ENSSLDG00000001921)	eps8l3b (ENSSLDG00000001960)	gstm.1 (ENSSLDG00000001977)	AMPD2 (ENSSLDG00000002040)	gnat2 (ENSSLDG00000002140)	gnai3 (ENSSLDG00000002190)	GPR61 (ENSSLDG00000002230)	AMIGO1 (ENSSLDG00000002253)	atxn7l2b (ENSSLDG00000002264)	SYPL2 (ENSSLDG00000002287)	sort1b (ENSSLDG00000002341)	ngrn (ENSSLDG00000002359)	nfyal (ENSSLDG00000002390)	ahcyl1 (ENSSLDG00000002459)	hspa1b (ENSSLDG00000002537) ##22	KCNC4 (ENSSLDG00000002559)	slc6a17 (ENSSLDG00000002605)	ALX3 (ENSSLDG00000002667)	RBM15 (ENSSLDG00000002691)	slc16a4 (ENSSLDG00000002714)	lamtor5 (ENSSLDG00000002733)	prok1 (ENSSLDG00000002843)	ENSSLDG00000002880	ZNF335 (ENSSLDG00000002903)	ENSSLDG00000002973	mmp9 (ENSSLDG00000003000)	adora1b (ENSSLDG00000003092)	dclre1b (ENSSLDG00000003115)	cpne5a (ENSSLDG00000003151)	ENSSLDG00000003312
Greater amberjack	MODERN SPECIES	23	ENSSDUG00000008300	atp5pb (ENSSDUG00000008317)	eps8l3b (ENSSDUG00000008339)	gstm.1 (ENSSDUG00000008379)	AMPD2 (ENSSDUG00000008395)	gnat2 (ENSSDUG00000008433)	gnai3 (ENSSDUG00000008457)	GPR61 (ENSSDUG00000008484)	AMIGO1 (ENSSDUG00000008496)	atxn7l2b (ENSSDUG00000008510)	SYPL2 (ENSSDUG00000008524)	sort1b (ENSSDUG00000008537)	ngrn (ENSSDUG00000008565)	nfyal (ENSSDUG00000008581)	ahcyl1 (ENSSDUG00000008638)	hspa1b (ENSSDUG00000008686) ##22	KCNC4 (ENSSDUG00000008699)	slc6a17 (ENSSDUG00000008711)	ALX3 (ENSSDUG00000008743)	RBM15 (ENSSDUG00000008769)	slc16a4 (ENSSDUG00000008780)	lamtor5 (ENSSDUG00000008806)	prok1 (ENSSDUG00000008879)	ENSSDUG00000008954	ZNF335 (ENSSDUG00000009971)	mmp9 (ENSSDUG00000010010)	adora1b (ENSSDUG00000010070)	dclre1b (ENSSDUG00000010085)	cpne5a (ENSSDUG00000010097)	lhfpl5b (ENSSDUG00000010145)	srpk1a (ENSSDUG00000010159)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	102	ENSLCAG00010005383	atp5pb (ENSLCAG00010005402)	eps8l3b (ENSLCAG00010005426)	gstm.1 (ENSLCAG00010005436)	AMPD2 (ENSLCAG00010005462)	gnat2 (ENSLCAG00010005578)	gnai3 (ENSLCAG00010005613)	GPR61 (ENSLCAG00010005645)	AMIGO1 (ENSLCAG00010005649)	atxn7l2b (ENSLCAG00010005651)	SYPL2 (ENSLCAG00010005657)	sort1b (ENSLCAG00010005669)	ngrn (ENSLCAG00010005739)	ENSLCAG00010005744	ahcyl1 (ENSLCAG00010005757)	hspa1b (ENSLCAG00010005781) ##22	KCNC4 (ENSLCAG00010005825)	slc6a17 (ENSLCAG00010005830)	ALX3 (ENSLCAG00010005839)	RBM15 (ENSLCAG00010005842)	slc16a4 (ENSLCAG00010005875)	lamtor5 (ENSLCAG00010005967)	prok1 (ENSLCAG00010005978)	ENSLCAG00010005986	ZNF335 (ENSLCAG00010006065)	mmp9 (ENSLCAG00010006164)	adora1b (ENSLCAG00010006710)	dclre1b (ENSLCAG00010006713)	ENSLCAG00010006715	cpne5a (ENSLCAG00010006766)	lhfpl5b (ENSLCAG00010006826)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000182846.a.a.a.a.b	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Turbot	MODERN SPECIES	2	RBM15 (ENSSMAG00000019106)	ENSSMAG00000019092	slc6a17 (ENSSMAG00000019078)	ENSSMAG00000019061	AMPD2 (ENSSMAG00000019036)	gnat2 (ENSSMAG00000019014)	gnai3 (ENSSMAG00000018989)	GPR61 (ENSSMAG00000018982)	atxn7l2b (ENSSMAG00000018968)	SYPL2 (ENSSMAG00000018946)	sort1b (ENSSMAG00000018900)	ENSSMAG00000034321	ngrn (ENSSMAG00000026491)	nfyal (ENSSMAG00000018854)	ahcyl1 (ENSSMAG00000018832)	hspa1b (ENSSMAG00000032878) ##22	eps8l3b (ENSSMAG00000018816)	ENSSMAG00000018807	ENSSMAG00000018801	dnase1l1l (ENSSMAG00000018786)	ENSSMAG00000018778	ENSSMAG00000018770	SLC25A33 (ENSSMAG00000018767)	gpr157 (ENSSMAG00000018751)	slc2a5 (ENSSMAG00000018715)	ENSSMAG00000018678	eno1a (ENSSMAG00000018646)	RERE (ENSSMAG00000018571)	SAMD11 (ENSSMAG00000018532)	noc2l (ENSSMAG00000018439)	KLHL17 (ENSSMAG00000018403)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000239794	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975	ENSGT00940000155325.a.a.b
Fugu	MODERN SPECIES	15	si:ch211-150o23.2 (ENSTRUG00000028643)	atp5pb (ENSTRUG00000007228)	eps8l3b (ENSTRUG00000006845)	GSTM4 (ENSTRUG00000001751)	AMPD2 (ENSTRUG00000006209)	gnat2 (ENSTRUG00000005471)	gnai3 (ENSTRUG00000020340)	GPR61 (ENSTRUG00000004515)	AMIGO1 (ENSTRUG00000004473)	ENSTRUG00000029016	SYPL2 (ENSTRUG00000004219)	sort1b (ENSTRUG00000004017)	ngrn (ENSTRUG00000003974)	nfyal (ENSTRUG00000003925)	ahcyl1 (ENSTRUG00000003856)	hspa1b (ENSTRUG00000003792) ##22	KCNC4 (ENSTRUG00000003770)	slc6a17 (ENSTRUG00000003091)	ALX3 (ENSTRUG00000003032)	RBM15 (ENSTRUG00000002921)	slc16a4 (ENSTRUG00000001770)	lamtor5 (ENSTRUG00000023554)	prok1 (ENSTRUG00000001689)	ZNF335 (ENSTRUG00000001322)	mmp9 (ENSTRUG00000000827)	adora1b (ENSTRUG00000016343)	dclre1b (ENSTRUG00000025152)	cpne5a (ENSTRUG00000016323)	lhfpl5b (ENSTRUG00000016319)	srpk1a (ENSTRUG00000016288)	ENSTRUG00000016218
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000239794	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	46	ENSLBEG00000020381	atp5pb (ENSLBEG00000020347)	eps8l3b (ENSLBEG00000020302)	gstm.1 (ENSLBEG00000020270)	AMPD2 (ENSLBEG00000020151)	gnat2 (ENSLBEG00000020063)	gnai3 (ENSLBEG00000020024)	GPR61 (ENSLBEG00000020006)	AMIGO1 (ENSLBEG00000020000)	ENSLBEG00000019982	SYPL2 (ENSLBEG00000019945)	sort1b (ENSLBEG00000019915)	ngrn (ENSLBEG00000019879)	nfyal (ENSLBEG00000019830)	ahcyl1 (ENSLBEG00000019742)	hspa1b (ENSLBEG00000019720) ##22	KCNC4 (ENSLBEG00000019695)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000239794	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
European seabass	MODERN SPECIES	14	ENSDLAG00005021879	atp5pb (ENSDLAG00005021874)	gstm.1 (ENSDLAG00005021850)	eps8l3b (ENSDLAG00005029848)	AMPD2 (ENSDLAG00005020491)	gnat2 (ENSDLAG00005020405)	gnai3 (ENSDLAG00005020356)	GPR61 (ENSDLAG00005030501)	AMIGO1 (ENSDLAG00005033617)	atxn7l2b (ENSDLAG00005020343)	SYPL2 (ENSDLAG00005020217)	sort1b (ENSDLAG00005019628)	nfyal (ENSDLAG00005019559)	ngrn (ENSDLAG00005034700)	ahcyl1 (ENSDLAG00005019034)	hspa1b (ENSDLAG00005003022) ##22	ENSDLAG00005019002	slc6a17 (ENSDLAG00005018976)	ENSDLAG00005030194	RBM15 (ENSDLAG00005034411)	slc16a4 (ENSDLAG00005018916)	lamtor5 (ENSDLAG00005033114)	prok1 (ENSDLAG00005018880)	ENSDLAG00005018846	ENSDLAG00005018827	mmp9 (ENSDLAG00005018682)	dclre1b (ENSDLAG00005018673)	cpne5a (ENSDLAG00005018098)	lhfpl5b (ENSDLAG00005026336)	srpk1a (ENSDLAG00005016545)	ENSDLAG00005015989
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	487	ENSLCRG00005020985	atp5pb (ENSLCRG00005020983)	ENSLCRG00005020982	gstm.1 (ENSLCRG00005020978)	AMPD2 (ENSLCRG00005020319)	gnat2 (ENSLCRG00005020283)	gnai3 (ENSLCRG00005020275)	GPR61 (ENSLCRG00005020273)	AMIGO1 (ENSLCRG00005020271)	atxn7l2b (ENSLCRG00005020269)	SYPL2 (ENSLCRG00005020267)	sort1b (ENSLCRG00005020135)	ngrn (ENSLCRG00005020129)	nfyal (ENSLCRG00005020098)	ahcyl1 (ENSLCRG00005020087)	hspa1b (ENSLCRG00005020080) ##22	KCNC4 (ENSLCRG00005020078)	slc6a17 (ENSLCRG00005020074)	ALX3 (ENSLCRG00005020071)	RBM15 (ENSLCRG00005020070)	slc16a4 (ENSLCRG00005020068)	lamtor5 (ENSLCRG00005020062)	prok1 (ENSLCRG00005020061)	ENSLCRG00005020057	ZNF335 (ENSLCRG00005020055)	mmp9 (ENSLCRG00005019979)	adora1b (ENSLCRG00005019975)	dclre1b (ENSLCRG00005019974)	cpne5a (ENSLCRG00005019956)	lhfpl5b (ENSLCRG00005019955)	srpk1a (ENSLCRG00005019847)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	21	ENSSAUG00010001254	atp5pb (ENSSAUG00010001248)	eps8l3b (ENSSAUG00010001242)	gstm.1 (ENSSAUG00010001234)	AMPD2 (ENSSAUG00010000713)	gnat2 (ENSSAUG00010000660)	gnai3 (ENSSAUG00010000651)	GPR61 (ENSSAUG00010000648)	AMIGO1 (ENSSAUG00010000647)	atxn7l2b (ENSSAUG00010000643)	SYPL2 (ENSSAUG00010000642)	sort1b (ENSSAUG00010000628)	ngrn (ENSSAUG00010000614)	nfyal (ENSSAUG00010000597)	ahcyl1 (ENSSAUG00010000449)	hspa1b (ENSSAUG00010026590) ##22	KCNC4 (ENSSAUG00010026588)	slc6a17 (ENSSAUG00010026586)	ALX3 (ENSSAUG00010026585)	RBM15 (ENSSAUG00010026584)	slc16a4 (ENSSAUG00010026583)	lamtor5 (ENSSAUG00010026582)	prok1 (ENSSAUG00010026581)	ENSSAUG00010026579	ZNF335 (ENSSAUG00010026578)	mmp9 (ENSSAUG00010026521)	adora1b (ENSSAUG00010026518)	dclre1b (ENSSAUG00010026517)	cpne5a (ENSSAUG00010026515)	lhfpl5b (ENSSAUG00010026514)	srpk1a (ENSSAUG00010026300)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000239794	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000239794	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Stickleback	MODERN SPECIES	11	eps8l3b (ENSGACG00000007643)	GSTM4 (ENSGACG00000007655)	GSTM4 (ENSGACG00000007674)	AMPD2 (ENSGACG00000007691)	gnat2 (ENSGACG00000007705)	gnai3 (ENSGACG00000007741)	GPR61 (ENSGACG00000007810)	AMIGO1 (ENSGACG00000007812)	ENSGACG00000007814	ENSGACG00000007817	SYPL2 (ENSGACG00000007830)	sort1b (ENSGACG00000007846)	ngrn (ENSGACG00000007860)	nfyal (ENSGACG00000007867)	ahcyl1 (ENSGACG00000007894)	hspa1b (ENSGACG00000007903) ##22	KCNC4 (ENSGACG00000007907)	slc6a17 (ENSGACG00000007913)	RBM15 (ENSGACG00000007932)	slc16a4 (ENSGACG00000007935)	prok1 (ENSGACG00000007944)	ENSGACG00000007950	ZNF335 (ENSGACG00000008023)	mmp9 (ENSGACG00000008035)	adora1b (ENSGACG00000008072)	dclre1b (ENSGACG00000008079)	cpne5a (ENSGACG00000008082)	lhfpl5b (ENSGACG00000008138)	srpk1a (ENSGACG00000008145)	ENSGACG00000008157	ELAPOR1 (ENSGACG00000008195)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	21	ENSCGOG00000010964	atp5pb (ENSCGOG00000010963)	eps8l3b (ENSCGOG00000010948)	gstm.1 (ENSCGOG00000010706)	AMPD2 (ENSCGOG00000008052)	gnat2 (ENSCGOG00000007976)	gnai3 (ENSCGOG00000006663)	GPR61 (ENSCGOG00000006642)	AMIGO1 (ENSCGOG00000006639)	atxn7l2b (ENSCGOG00000006637)	SYPL2 (ENSCGOG00000006635)	sort1b (ENSCGOG00000006244)	ngrn (ENSCGOG00000006235)	nfyal (ENSCGOG00000006207)	ahcyl1 (ENSCGOG00000004644)	hspa1b (ENSCGOG00000004604) ##22	KCNC4 (ENSCGOG00000004602)	zgc:113274 (ENSCGOG00000004599)	slc6a17 (ENSCGOG00000004320)	ALX3 (ENSCGOG00000004304)	RBM15 (ENSCGOG00000004300)	slc16a4 (ENSCGOG00000004288)	lamtor5 (ENSCGOG00000004259)	ENSCGOG00000003879	ZNF335 (ENSCGOG00000024536)	mmp9 (ENSCGOG00000024463)	adora1b (ENSCGOG00000024435)	dclre1b (ENSCGOG00000024434)	cpne5a (ENSCGOG00000024422)	lhfpl5b (ENSCGOG00000024418)	srpk1a (ENSCGOG00000024320)
Pike perch	MODERN SPECIES	7	ENSSLUG00000002700	atp5pb (ENSSLUG00000002703)	eps8l3b (ENSSLUG00000002713)	gstm.1 (ENSSLUG00000002736)	AMPD2 (ENSSLUG00000003196)	gnat2 (ENSSLUG00000005963)	ENSSLUG00000005994	GPR61 (ENSSLUG00000006078)	AMIGO1 (ENSSLUG00000006084)	atxn7l2b (ENSSLUG00000006089)	SYPL2 (ENSSLUG00000006102)	sort1b (ENSSLUG00000006123)	ngrn (ENSSLUG00000006157)	nfyal (ENSSLUG00000006168)	ahcyl1 (ENSSLUG00000006304)	hspa1b (ENSSLUG00000006521) ##22	KCNC4 (ENSSLUG00000006533)	slc6a17 (ENSSLUG00000006544)	ALX3 (ENSSLUG00000006553)	RBM15 (ENSSLUG00000006561)	slc16a4 (ENSSLUG00000006565)	lamtor5 (ENSSLUG00000006572)	prok1 (ENSSLUG00000006578)	ENSSLUG00000006593	ZNF335 (ENSSLUG00000006672)	mmp9 (ENSSLUG00000006747)	adora1b (ENSSLUG00000007074)	dclre1b (ENSSLUG00000007080)	cpne5a (ENSSLUG00000007102)	lhfpl5b (ENSSLUG00000007178)	srpk1a (ENSSLUG00000007198)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	21	ENSMMDG00005000489	atp5pb (ENSMMDG00005000483)	eps8l3b (ENSMMDG00005000468)	gstm.1 (ENSMMDG00005000453)	AMPD2 (ENSMMDG00005000430)	gnat2 (ENSMMDG00005000409)	gnai3 (ENSMMDG00005000378)	GPR61 (ENSMMDG00005000362)	AMIGO1 (ENSMMDG00005000358)	atxn7l2b (ENSMMDG00005000350)	SYPL2 (ENSMMDG00005000343)	sort1b (ENSMMDG00005000219)	ngrn (ENSMMDG00005000162)	nfyal (ENSMMDG00005020504)	ahcyl1 (ENSMMDG00005020464)	hspa1b (ENSMMDG00005020459) ##22	KCNC4 (ENSMMDG00005020457)	slc6a17 (ENSMMDG00005020455)	ALX3 (ENSMMDG00005020451)	RBM15 (ENSMMDG00005020450)	slc16a4 (ENSMMDG00005020448)	lamtor5 (ENSMMDG00005020447)	prok1 (ENSMMDG00005020445)	ENSMMDG00005020442	ZNF335 (ENSMMDG00005020440)	mmp9 (ENSMMDG00005020423)	adora1b (ENSMMDG00005020418)	dclre1b (ENSMMDG00005020415)	cpne5a (ENSMMDG00005020409)	lhfpl5b (ENSMMDG00005020406)	srpk1a (ENSMMDG00005020398)
Cod	MODERN SPECIES		ENSGMOG00000018099	ENSGMOG00000018108	ENSGMOG00000017970	ENSGMOG00000018127	AMPD2 (ENSGMOG00000001039)	gnat2 (ENSGMOG00000001067)	gnai3 (ENSGMOG00000035728)	GPR61 (ENSGMOG00000024990)	AMIGO1 (ENSGMOG00000023759)	atxn7l2b (ENSGMOG00000035977)	SYPL2 (ENSGMOG00000001154)	sort1b (ENSGMOG00000001169)	ngrn (ENSGMOG00000029993)	nfyal (ENSGMOG00000001226)	ahcyl1 (ENSGMOG00000001249)	hspa1b (ENSGMOG00000029290) ##22	ENSGMOG00000001282	ENSGMOG00000028446	slc6a17 (ENSGMOG00000001289)	ENSGMOG00000023215	RBM15 (ENSGMOG00000019941)	slc16a4 (ENSGMOG00000001302)	lamtor5 (ENSGMOG00000028201)	prok1 (ENSGMOG00000034398)	ENSGMOG00000030282	ENSGMOG00000001326	ENSGMOG00000027348	ENSGMOG00000001344	ENSGMOG00000032383	mmp9 (ENSGMOG00000001400)	ENSGMOG00000030635
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00960000189691	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860.b	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00390000012644	ENSGT00990000203541.a.a.b.g
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	145	ENSGT00940000153567.b.b.e.a	ENSGT00950000182998.C.a.k.a	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000234637.a.a.a.a.d	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.d	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714.c.a	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.f	ENSGT00940000154813.e.b.b ##22	ENSGT00940000158860.b.a	ENSGT00940000156542.a.g	ENSGT01030000234637.a.a.a.a.c	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.c	ENSGT00390000015714.c.b	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.e	ENSGT00940000154813.e.b.a ##22	ENSGT00940000158860.b.b	ENSGT00940000156542.a.h	ENSGT00940000160669.c	ENSGT00940000158161.e.b.c	ENSGT00940000158411.c	ENSGT00390000006247.gd	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a.c	ENSGT00940000158508.q	ENSGT00940000157415.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a.c	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a.d	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975.c
Huchen	MODERN SPECIES	3644														ENSHHUG00000049797	ENSHHUG00000049801	hspa1b (ENSHHUG00000049804) ##22	KCNC4 (ENSHHUG00000049807)	slc6a17 (ENSHHUG00000049810)
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000158954.c	ENSGT00940000164042.b	ENSGT00510000050141.a.e	ENSGT00950000182846.a.a.a.a.b	ENSGT00390000001958.dc	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00950000183011.d.c.a	ENSGT00940000158399.v.b	ENSGT00940000153567.b.b.e.a	ENSGT00950000182998.C.a.k.a	ENSGT00950000183146.a.b.b.d	ENSGT01030000234637.a.a.a.a.c	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.c	ENSGT00390000015714.c.b	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.e	ENSGT00940000154813.e.b.a ##22	ENSGT00940000158860.b.b	ENSGT00940000156542.a.h	ENSGT00940000160669.c	ENSGT00940000158161.e.b.c	ENSGT00940000158411.c	ENSGT00390000006247.gd	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a.c.b	ENSGT00940000158508.q	ENSGT00940000157415.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a.c	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a.d	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975.c
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158954.c	ENSGT00510000050141.a.e	ENSGT00950000182846.a.a.a.a.b	ENSGT00990000213453	ENSGT00390000001958.dc	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00950000183011.d.c.a	ENSGT00940000158399.v.b	ENSGT00940000153567.b.b.e.a	ENSGT00950000182998.C.a.k.a	ENSGT00950000183146.a.b.b.d	ENSGT01030000234637.a.a.a.a.c	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.c	ENSGT00390000015714.c.b	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.e	ENSGT00940000154813.e.b.a ##22	ENSGT00940000158860.b.b	ENSGT00940000156542.a.h	ENSGT00940000160669.c	ENSGT00940000158161.e.b.c	ENSGT00940000158411.c	ENSGT00390000006247.gd	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000155036.b	ENSGT00940000158508.q	ENSGT00940000157415.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a.d.b	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a.d	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975.c
River trout	MODERN SPECIES	20	slc25a33 (ENSSTUG00000013027)	si:ch211-150o23.2 (ENSSTUG00000014763)	dnase1l1l (ENSSTUG00000014774)	ENSSTUG00000014781	atp5pb (ENSSTUG00000014801)	eps8l3b (ENSSTUG00000014804)	AMPD2 (ENSSTUG00000014869)	GNAT2 (ENSSTUG00000015170)	ENSSTUG00000015183	GPR61 (ENSSTUG00000015198)	AMIGO1 (ENSSTUG00000015208)	SYPL2 (ENSSTUG00000015215)	sort1b (ENSSTUG00000015231)	nfyal (ENSSTUG00000015373)	ahcyl1 (ENSSTUG00000015390)	hspa1b (ENSSTUG00000015602) ##22	KCNC4 (ENSSTUG00000015635)	slc6a17 (ENSSTUG00000015654)	ENSSTUG00000015664	ALX3 (ENSSTUG00000015667)	RBM15 (ENSSTUG00000015676)	slc16a4 (ENSSTUG00000015689)	lamtor5 (ENSSTUG00000015741)	prok1 (ENSSTUG00000015767)	PGA3 (ENSSTUG00000015775)	ENSSTUG00000015792	ENSSTUG00000015803	mmp9 (ENSSTUG00000015832)	dclre1b (ENSSTUG00000016134)	ENSSTUG00000016143	CPNE5 (ENSSTUG00000016148)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	6	ENSSSAG00000039811	ENSSSAG00000089744	ENSSSAG00000087547	ENSSSAG00000039615	ENSSSAG00000070994	eps8l3b (ENSSSAG00000070977)	AMPD2 (ENSSSAG00000016162)	GNAT2 (ENSSSAG00000040485)	ENSSSAG00000040589	GPR61 (ENSSSAG00000070661)	ENSSSAG00000070658	ENSSSAG00000070656	sort1b (ENSSSAG00000070276)	nfyal (ENSSSAG00000070258)	ahcyl1 (ENSSSAG00000090765)	hspa1b (ENSSSAG00000070162) ##22	ENSSSAG00000069808	slc6a17 (ENSSSAG00000069812)	ENSSSAG00000088423	ENSSSAG00000083608	RBM15 (ENSSSAG00000070154)	slc16a4 (ENSSSAG00000070124)	lamtor5 (ENSSSAG00000098985)	prok1 (ENSSSAG00000094833)	ENSSSAG00000070098	ENSSSAG00000085130	ENSSSAG00000070091	mmp9 (ENSSSAG00000069874)	ENSSSAG00000099241	ENSSSAG00000108337	ENSSSAG00000098999
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.b.a ##22
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.e.b.a ##22
Chinook salmon	MODERN SPECIES	7	DNAJC5 (ENSOTSG00005006387)	trim101 (ENSOTSG00005006385)	tpd52l2b (ENSOTSG00005006380)	ppdpfb (ENSOTSG00005006376)	AMPD2 (ENSOTSG00005006361)	eno1a (ENSOTSG00005006223)	slc2a5 (ENSOTSG00005004363)	ENSOTSG00005004324	gpr157 (ENSOTSG00005004317)	spsb1 (ENSOTSG00005004311)	slc25a33 (ENSOTSG00005004304)	ENSOTSG00005004302	dnase1l1l (ENSOTSG00005004299)	atp5pb (ENSOTSG00005004284)	eps8l3b (ENSOTSG00005004280)	hspa1b (ENSOTSG00005004277) ##22	f8a (ENSOTSG00005004225)	emp1 (ENSOTSG00005004223)	ENSOTSG00005004220	rbfox2 (ENSOTSG00005004213)	pde6ha (ENSOTSG00005004207)	ENSOTSG00005004204	ENSOTSG00005004202	chst10 (ENSOTSG00005004198)	ENSOTSG00005004189	CCNT2 (ENSOTSG00005004178)	ENSOTSG00005004167	RBM15 (ENSOTSG00005004165)	slc16a4 (ENSOTSG00005004161)	lamtor5 (ENSOTSG00005004147)	prok1 (ENSOTSG00005004142)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	145	ENSGT00510000050141.a.e	ENSGT00950000182846.a.a.a.a.b	ENSGT00990000213453	ENSGT00390000001958.dc	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00950000183011.d.c.a	ENSGT00940000158399.v.b	ENSGT00940000153567.b.b.e.a	ENSGT00950000182998.C.a.k.a	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT01030000234637.a.a.a.a.d	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.d	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714.c.a	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.f	ENSGT00940000154813.e.b.b ##22	ENSGT00940000158860.b.a	ENSGT00940000156542.a.g	ENSGT01030000234637.a.a.a.a.c	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.c	ENSGT00390000015714.c.b	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.e	ENSGT00940000154813.e.b.a ##22	ENSGT00940000158860.b.b	ENSGT00940000156542.a.h	ENSGT00940000160669.c	ENSGT00940000158161.e.b.c	ENSGT00940000158411.c	ENSGT00390000006247.gd	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a.c
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000158954.d	ENSGT00940000162108.b.a.b	ENSGT00940000160260.l	ENSGT00390000001958.cc	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c.b	ENSGT00940000158399.v.a	ENSGT00940000153567.b.b.e.b	ENSGT00950000182998.C.a.k.b	ENSGT00950000183146.a.b.b.c	ENSGT01030000234637.a.a.a.a.d	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.d	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714.c.a	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.f	ENSGT00940000154813.e.b.b ##22	ENSGT00940000158860.b.a	ENSGT00940000156542.a.g	ENSGT00390000003194.r.a.b	ENSGT00390000003194.r.b.a	ENSGT00940000160669.d	ENSGT00940000158161.e.b.d	ENSGT00940000158411.d	ENSGT00390000006247.hd	ENSGT00940000162710.c.a.d	ENSGT00940000158508.r	ENSGT00940000157415.a	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a.d.a	ENSGT00940000165402	ENSGT00940000156194.m.a.c	ENSGT00940000166975.d
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160409.o.b	ENSGT00940000158954.d	ENSGT00940000162108.b.a.b	ENSGT00390000001958.cc	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c.b	ENSGT00940000158399.v.a	ENSGT00940000153567.b.b.e.b	ENSGT00950000182998.C.a.k.b	ENSGT00950000183146.a.b.b.c	ENSGT01030000234637.a.a.a.a.d	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.d	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714.c.a	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.f	ENSGT00940000154813.e.b.b ##22	ENSGT00940000158860.b.a	ENSGT00940000156542.a.g	ENSGT00390000003194.r.a.b.b	ENSGT00940000160669.d	ENSGT00940000158161.e.b.d	ENSGT00940000158411.d	ENSGT00390000006247.hd	ENSGT00940000162710.c.a.d	ENSGT00940000158508.r	ENSGT00940000157415.a	ENSGT00940000165402	ENSGT00940000156194.m.a.c	ENSGT00940000166975.d	ENSGT00940000156669.a	ENSGT01000000221579
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160409.o.b	ENSGT00940000158954.d	ENSGT00940000162108.b.a.b	ENSGT00390000001958.cc	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c.b	ENSGT00940000158399.v.a	ENSGT00940000153567.b.b.e.b	ENSGT00950000182998.C.a.k.b	ENSGT00950000183146.a.b.b.c	ENSGT01030000234637.a.a.a.a.d	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.d	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714.c.a	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.f	ENSGT00940000154813.e.b.b ##22	ENSGT00940000158860.b.a	ENSGT00940000156542.a.g	ENSGT00390000003194.r.a.b.b.a	ENSGT00940000160669.d	ENSGT00940000158161.e.b.d	ENSGT00940000158411.d	ENSGT00390000006247.hd	ENSGT00940000162710.c.a.d	ENSGT00940000158508.r	ENSGT00940000157415.a	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a.c.a	ENSGT00940000165402	ENSGT00940000156194.m.a.c	ENSGT00940000166975.d	ENSGT00940000156669.a
Chinook salmon	DUPLICATION
Chinook salmon	MODERN SPECIES	29	slc5a9 (ENSOTSG00005032429)	gclm (ENSOTSG00005032760)	ENSOTSG00005032763	spata6 (ENSOTSG00005032767)	AGBL4 (ENSOTSG00005032773)	bend5 (ENSOTSG00005032775)	elavl4 (ENSOTSG00005032776)	ENSOTSG00005032921	GPR61 (ENSOTSG00005032922)	AMIGO1 (ENSOTSG00005032924)	ENSOTSG00005032925	sort1b (ENSOTSG00005032930)	ENSOTSG00005032933	ENSOTSG00005032934	ahcyl1 (ENSOTSG00005032935)	hspa1b (ENSOTSG00005032936) ##22	ENSOTSG00005032940	dmrta2 (ENSOTSG00005032942)	faf1 (ENSOTSG00005032957)	cdkn2c (ENSOTSG00005032973)	rnf11b (ENSOTSG00005032987)	TTC39A (ENSOTSG00005000312)	ENSOTSG00005000737	tor3a (ENSOTSG00005000744)	osbpl9 (ENSOTSG00005000779)	abl2 (ENSOTSG00005005598)	soat1 (ENSOTSG00005005604)	CACNA1E (ENSOTSG00005005674)	CEP350 (ENSOTSG00005023490)	qsox1 (ENSOTSG00005023513)	lhx4 (ENSOTSG00005023514)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	33	DRP2 (ENSOTSG00005013275)	glra4b (ENSOTSG00005015239)	aifm1 (ENSOTSG00005015259)	nono (ENSOTSG00005017451)	zgc:113208 (ENSOTSG00005017453)	vma21 (ENSOTSG00005017456)	npas2 (ENSOTSG00005017459)	ENSOTSG00005017460	GPR61 (ENSOTSG00005017462)	AMIGO1 (ENSOTSG00005017464)	SYPL2 (ENSOTSG00005017466)	sort1b (ENSOTSG00005017469)	ENSOTSG00005017491	ENSOTSG00005017493	ahcyl1 (ENSOTSG00005017494)	hspa1b (ENSOTSG00005017496) ##22	ENSOTSG00005017497	rnf128a (ENSOTSG00005017501)	tbc1d8b (ENSOTSG00005017519)	ENSOTSG00005022621	ZMYM3 (ENSOTSG00005022623)	gjb1a (ENSOTSG00005022809)	igbp1 (ENSOTSG00005022810)	wnt11f2 (ENSOTSG00005022813)	eda (ENSOTSG00005022834)	nalf2 (ENSOTSG00005022835)	efnb1 (ENSOTSG00005022838)	steep1 (ENSOTSG00005022840)	ENSOTSG00005022844	stard8 (ENSOTSG00005022853)	yipf6 (ENSOTSG00005022875)
Coho salmon	MODERN SPECIES	16	ENSOKIG00005038812	atp5pb (ENSOKIG00005038752)	gstm.1 (ENSOKIG00005038701)	AMPD2 (ENSOKIG00005038617)	GNAT2 (ENSOKIG00005038593)	ENSOKIG00005038551	GPR61 (ENSOKIG00005038542)	ENSOKIG00005038538	AMIGO1 (ENSOKIG00005038527)	ENSOKIG00005038522	SYPL2 (ENSOKIG00005038497)	sort1b (ENSOKIG00005038010)	ngrn (ENSOKIG00005037977)	nfyal (ENSOKIG00005037958)	ahcyl1 (ENSOKIG00005037821)	hspa1b (ENSOKIG00005037751) ##22	KCNC4 (ENSOKIG00005037730)	slc6a17 (ENSOKIG00005037664)	ENSOKIG00005045290	ALX3 (ENSOKIG00005045177)	RBM15 (ENSOKIG00005045173)	ENSOKIG00005045164	slc16a4 (ENSOKIG00005045144)	lamtor5 (ENSOKIG00005045134)	ENSOKIG00005045109	ZNF335 (ENSOKIG00005045090)	mmp9 (ENSOKIG00005043531)	ADORA1 (ENSOKIG00005043417)	ENSOKIG00005043397	ENSOKIG00005043351	ENSOKIG00005043331
Rainbow trout	MODERN SPECIES	7	atp5pb (ENSOMYG00000041531)	gstm.1 (ENSOMYG00000041497)	ENSOMYG00000054614	AMPD2 (ENSOMYG00000041478)	ENSOMYG00000064482	GNAT2 (ENSOMYG00000041466)	ENSOMYG00000069542	GPR61 (ENSOMYG00000041469)	ENSOMYG00000010826	ENSOMYG00000010806	sort1b (ENSOMYG00000010789)	ENSOMYG00000010768	nfyal (ENSOMYG00000010758)	ENSOMYG00000069692	ahcyl1 (ENSOMYG00000010577)	hspa1b (ENSOMYG00000010447) ##22	ENSOMYG00000010421	ENSOMYG00000067325	ENSOMYG00000050084	slc6a17 (ENSOMYG00000010330)	ENSOMYG00000010277	ENSOMYG00000075836	ENSOMYG00000010130	ENSOMYG00000010261	ENSOMYG00000064510	ENSOMYG00000057285	ENSOMYG00000073598	RBM15 (ENSOMYG00000010003)	ENSOMYG00000049471	slc16a4 (ENSOMYG00000009986)	xip (ENSOMYG00000048931)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162108.b.a.b	ENSGT00940000160260.l	ENSGT00390000001958.cc	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c.b	ENSGT00940000158399.v.a	ENSGT00940000153567.b.b.e.b	ENSGT00950000182998.C.a.k.b	ENSGT00950000183146.a.b.b.c	ENSGT01030000234637.a.a.a.a.d	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.d	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714.c.a	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.f	ENSGT00940000154813.e.b.b ##22	ENSGT00940000158860.b.a	ENSGT00940000156542.a.g	ENSGT00390000003194.r.a.b	ENSGT00390000003194.r.b.a	ENSGT00940000160669.d	ENSGT00940000158161.e.b.d	ENSGT00940000158411.d	ENSGT00390000006247.hd	ENSGT00940000162710.c.a.d	ENSGT00940000158508.r	ENSGT00940000157415.a	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a.d.a	ENSGT00940000165402	ENSGT00940000156194.m.a.c	ENSGT01070000256489
River trout	MODERN SPECIES	23	ENSSTUG00000005356	atp5pb (ENSSTUG00000005303)	GSTM4 (ENSSTUG00000005251)	AMPD2 (ENSSTUG00000004267)	GNAT2 (ENSSTUG00000004159)	ENSSTUG00000040414	GPR61 (ENSSTUG00000040401)	ENSSTUG00000040394	AMIGO1 (ENSSTUG00000040391)	SYPL2 (ENSSTUG00000040381)	sort1b (ENSSTUG00000039402)	ngrn (ENSSTUG00000039384)	ENSSTUG00000039382	nfyal (ENSSTUG00000039364)	ahcyl1 (ENSSTUG00000039290)	hspa1b (ENSSTUG00000039280) ##22	ENSSTUG00000039270	slc6a17 (ENSSTUG00000039254)	ENSSTUG00000039240	ENSSTUG00000039206	ENSSTUG00000039164	ALX3 (ENSSTUG00000039154)	RBM15 (ENSSTUG00000039150)	slc16a4 (ENSSTUG00000039142)	lamtor5 (ENSSTUG00000039123)	ENSSTUG00000039106	ENSSTUG00000039101	ZNF335 (ENSSTUG00000039045)	mmp9 (ENSSTUG00000038105)	adora1b (ENSSTUG00000038037)	ENSSTUG00000038031
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	4	ENSSSAG00000056874	ENSSSAG00000056888	atp5pb (ENSSSAG00000038629)	gstm.1 (ENSSSAG00000099717)	AMPD2 (ENSSSAG00000039237)	GNAT2 (ENSSSAG00000070697)	ENSSSAG00000070663	GPR61 (ENSSSAG00000099394)	ENSSSAG00000040635	ENSSSAG00000119038	sort1b (ENSSSAG00000040670)	ENSSSAG00000106249	ngrn (ENSSSAG00000040779)	nfyal (ENSSSAG00000040795)	ahcyl1 (ENSSSAG00000118403)	hspa1b (ENSSSAG00000041837) ##22	ENSSSAG00000095600	ENSSSAG00000099863	slc6a17 (ENSSSAG00000041986)	ENSSSAG00000114286	nattl (ENSSSAG00000092733)	ENSSSAG00000082606	ENSSSAG00000042109	ENSSSAG00000082836	ENSSSAG00000084407	ENSSSAG00000090798	ENSSSAG00000112304	ENSSSAG00000112172	ENSSSAG00000042153	slc16a4 (ENSSSAG00000086639)	ENSSSAG00000042307
Northern pike	MODERN SPECIES	11	ENSELUG00000016634	atp5pb (ENSELUG00000016616)	eps8l3b (ENSELUG00000016579)	gstm3 (ENSELUG00000016549)	AMPD2 (ENSELUG00000016491)	GNAT2 (ENSELUG00000029164)	ENSELUG00000016451	GPR61 (ENSELUG00000016412)	AMIGO1 (ENSELUG00000016395)	atxn7l2b (ENSELUG00000016385)	SYPL2 (ENSELUG00000016367)	sort1b (ENSELUG00000016352)	ngrn (ENSELUG00000028321)	nfyal (ENSELUG00000016302)	ahcyl1 (ENSELUG00000016277)	hspa1b (ENSELUG00000000615) ##22	ENSELUG00000016204	slc6a17 (ENSELUG00000016171)	ALX3 (ENSELUG00000016103)	RBM15 (ENSELUG00000016087)	slc16a4 (ENSELUG00000016075)	lamtor5 (ENSELUG00000016056)	prok1 (ENSELUG00000025588)	ENSELUG00000015905	ENSELUG00000015670	ENSELUG00000016001	PGA3 (ENSELUG00000015506)	ZNF335 (ENSELUG00000014890)	mmp9 (ENSELUG00000000542)	adora1b (ENSELUG00000014300)	dclre1b (ENSELUG00000014288)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	171	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.b	ENSGT01030000234637.a.a.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000155036	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00390000012644
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.b	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000155036	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT00940000165930.B	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c.i	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.b	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000162710.c.a	ENSGT00940000155036.c.b	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT00940000165930.B	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000160260	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000157663	ENSGT00950000183011.d.c.i	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.b	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000155036.c.a	ENSGT00940000155036.d	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT00940000165930.B	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	109					ENSGT00950000183011.d.d	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.b	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000155036.c.a	ENSGT00940000155036.c.b	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT00940000165930.B	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	21	slc5a9 (ENSAMXG00000015433)	zgc:171480 (ENSAMXG00000043839)	paox1 (ENSAMXG00000015493)	bcar3 (ENSAMXG00000031215)	fnbp1l (ENSAMXG00000029673)	abl2 (ENSAMXG00000002300)	tmem51a (ENSAMXG00000032721)	kazna (ENSAMXG00000030117)	ENSAMXG00000039285	ENSAMXG00000000036	rimkla (ENSAMXG00000000034)	zmynd12 (ENSAMXG00000032499)	slc16a1b (ENSAMXG00000000023)	nfyal (ENSAMXG00000033899)	ahcyl1 (ENSAMXG00000040818)	hspa1b (ENSAMXG00000026104) ##22	KCNC4 (ENSAMXG00000002515)	slc6a17 (ENSAMXG00000002507)	ALX3 (ENSAMXG00000040005)	RBM15 (ENSAMXG00000026103)	slc16a4 (ENSAMXG00000007749)	lamtor5 (ENSAMXG00000007747)	prok1 (ENSAMXG00000035592)	ENSAMXG00000007744	ENSAMXG00000007743	ZNF335 (ENSAMXG00000007732)	mmp9 (ENSAMXG00000037117)	mmp9 (ENSAMXG00000007722)	zgc:110353 (ENSAMXG00000042969)	ENSAMXG00000035960	adora1b (ENSAMXG00000007715)
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	449					ENSPNAG00000007561	gnat2 (ENSPNAG00000007558)	gnai3 (ENSPNAG00000007554)	GPR61 (ENSPNAG00000000298)	AMIGO1 (ENSPNAG00000000293)	atxn7l2b (ENSPNAG00000007546)	sypl2b (ENSPNAG00000007538)	sort1b (ENSPNAG00000000276)	ngrn (ENSPNAG00000007524)	nfyal (ENSPNAG00000000266)	ahcyl1 (ENSPNAG00000007517)	hspa1b (ENSPNAG00000000249) ##22	KCNC4 (ENSPNAG00000007508)	slc6a17 (ENSPNAG00000007505)	ALX3 (ENSPNAG00000000239)	RBM15 (ENSPNAG00000007496)	slc16a4 (ENSPNAG00000000231)	lamtor5 (ENSPNAG00000007489)	prok1 (ENSPNAG00000007486)	ENSPNAG00000007478
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000001958	ENSGT00940000157663.w	ENSGT00940000158169.b	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c	ENSGT00940000158399	ENSGT00940000153567.b.b	ENSGT00950000182998.C.a.k	ENSGT00950000183146.a.b.b	ENSGT00940000159736.a	ENSGT01030000234637.a.a.b	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a	ENSGT00390000014472	ENSGT00390000015714	ENSGT00950000182981.b.f.b.b	ENSGT00940000154813.e.b ##22	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000156542.a	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000158161.e.b	ENSGT00940000158411	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935	ENSGT00940000158508	ENSGT00940000157415	ENSGT00940000165930.B	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158175	ENSGT00940000156194.m.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g	ENSGT00940000166975
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000158169.b.k.a.a	ENSGT00940000157663.w.a.b	ENSGT00940000158169.b.k.b	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c.g	ENSGT00940000158399.j	ENSGT00940000153567.b.b.d	ENSGT00950000182998.C.a.k.c	ENSGT00950000183146.a.b.b.b	ENSGT00940000159736.a.c	ENSGT01030000234637.a.a.b.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.b	ENSGT00390000014472.a	ENSGT00390000015714.p.a	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.c	ENSGT00940000154813.e.b.c ##22	ENSGT00940000158860.g	ENSGT00940000156542.a.a	ENSGT00940000160669.a.a	ENSGT00940000158161.e.b.e	ENSGT00940000158411.b	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935.a	ENSGT00940000158508.j	ENSGT00940000157415.h	ENSGT00940000165930.B.t	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000158175.b	ENSGT00940000156194.m.a.b	ENSGT00940000166935.b	ENSGT00940000158508.i
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000160260.n	ENSGT00390000001958.bc	ENSGT00940000158169.b.k.b	ENSGT00940000154679	ENSGT00950000183011.d.c.g	ENSGT00940000158399.j	ENSGT00940000153567.b.b.d	ENSGT00950000182998.C.a.k.c	ENSGT00950000183146.a.b.b.b	ENSGT00940000159736.a.c	ENSGT01030000234637.a.a.b.a.a	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.b	ENSGT00390000014472.a	ENSGT00390000015714.p.a	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.c	ENSGT00940000154813.e.b.c ##22	ENSGT00940000158860.g	ENSGT00940000156542.a.a	ENSGT00940000160669.a.a	ENSGT00940000158161.e.b.e	ENSGT00940000158411.b	ENSGT00390000006247	ENSGT00940000166935.b	ENSGT00940000158508.i	ENSGT00940000157415.g	ENSGT00940000165930.B.s	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158175.a	ENSGT00940000156194.m.a.a	ENSGT00990000203541.a.a.b.g.d	ENSGT00940000166975.h
Common carp reference	MODERN SPECIES	23	ENSCCRG00000021800	atp5pb (ENSCCRG00000054042)	eps8l3b (ENSCCRG00000001873)	GSTM4 (ENSCCRG00000021819)	AMPD2 (ENSCCRG00000026998)	gnat2 (ENSCCRG00000080572)	gnai3 (ENSCCRG00000026983)	GPR61 (ENSCCRG00000061349)	AMIGO1 (ENSCCRG00000065377)	atxn7l2b (ENSCCRG00000029132)	sypl2b (ENSCCRG00000056828)	sort1b (ENSCCRG00000029151)	ngrn (ENSCCRG00000072813)	nfyal (ENSCCRG00000076302)	ahcyl1 (ENSCCRG00000030293)	hspa1b (ENSCCRG00000071374) ##22	ENSCCRG00000056422	ENSCCRG00000059107	slc6a17 (ENSCCRG00000029285)	ENSCCRG00000028298	RBM15 (ENSCCRG00000029370)	slc16a4 (ENSCCRG00000028285)	lamtor5 (ENSCCRG00000070860)	prok1 (ENSCCRG00000028271)	ENSCCRG00000066767	mmp9 (ENSCCRG00000027829)	zgc:110353 (ENSCCRG00000028268)	ENSCCRG00000055657	adora1b (ENSCCRG00000071109)	dclre1b (ENSCCRG00000025460)	cpne5a (ENSCCRG00000055259)
Goldfish	MODERN SPECIES	48	eps8l3b (ENSCARG00000001949)	ENSCARG00000001964	gstm.3 (ENSCARG00000001989)	gstm.3 (ENSCARG00000002036)	AMPD2 (ENSCARG00000002305)	gnat2 (ENSCARG00000002924)	gnai3 (ENSCARG00000002946)	GPR61 (ENSCARG00000002957)	AMIGO1 (ENSCARG00000002962)	atxn7l2b (ENSCARG00000002969)	sypl2b (ENSCARG00000002981)	sort1b (ENSCARG00000003018)	ngrn (ENSCARG00000003115)	nfyal (ENSCARG00000003127)	ahcyl1 (ENSCARG00000003231)	hspa1b (ENSCARG00000003783) ##22	KCNC4 (ENSCARG00000003787)	slc6a17 (ENSCARG00000003801)	ALX3 (ENSCARG00000003816)	RBM15 (ENSCARG00000003833)	slc16a4 (ENSCARG00000003853)	lamtor5 (ENSCARG00000003882)	prok1 (ENSCARG00000003886)	ZNF335 (ENSCARG00000003905)	mmp9 (ENSCARG00000004134)	zgc:110353 (ENSCARG00000005133)	adora1b (ENSCARG00000005141)	dclre1b (ENSCARG00000005149)	cpne5a (ENSCARG00000005201)	srpk1a (ENSCARG00000005839)	ENSCARG00000006124
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00390000001958.ac	ENSGT00940000158169.b.l	ENSGT00940000157663.w.b	ENSGT00950000183011.d.c.h	ENSGT00940000158399.i	ENSGT00940000153567.b.b.c	ENSGT00950000182998.C.a.k.d	ENSGT00950000183146.a.b.b.a	ENSGT00940000159736.a.d	ENSGT01030000234637.a.a.b.b	ENSGT01030000234637.a.a.b.a.b	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.a	ENSGT00390000014472.b	ENSGT00390000015714.p.b	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.d	ENSGT00940000154813.e.b.d ##22	ENSGT00940000158860.h	ENSGT00940000156542.a.b	ENSGT00940000160669.a.b	ENSGT00940000158161.e.b.f	ENSGT00940000158411.a
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00940000157663.w.a.b	ENSGT00940000157663.w.b	ENSGT00940000158169.b.l	ENSGT00950000183011.d.c.h	ENSGT00940000158399.i	ENSGT00940000153567.b.b.c	ENSGT00950000182998.C.a.k.d	ENSGT00950000183146.a.b.b.a	ENSGT00940000159736.a.d	ENSGT01030000234637.a.a.b.b	ENSGT01030000234637.a.a.b.a.b	ENSGT01030000234563.a.a.c.b.a.a	ENSGT00390000014472.b	ENSGT00390000015714.p.b	ENSGT00950000182981.b.f.b.b.d	ENSGT00940000154813.e.b.d ##22	ENSGT00940000158860.h	ENSGT00940000156542.a.b	ENSGT00940000160669.a.b	ENSGT00940000158161.e.b.f	ENSGT00940000158411.a
Common carp reference	MODERN SPECIES	17	ENSCCRG00000021678	atp5pb (ENSCCRG00000021686)	eps8l3b (ENSCCRG00000021792)	gstm.3 (ENSCCRG00000027424)	AMPD2 (ENSCCRG00000027416)	gnat2 (ENSCCRG00000026969)	gnai3 (ENSCCRG00000065198)	GPR61 (ENSCCRG00000073898)	AMIGO1 (ENSCCRG00000052795)	atxn7l2b (ENSCCRG00000042829)	sypl2b (ENSCCRG00000042701)	sort1b (ENSCCRG00000026228)	ENSCCRG00000076832	nfyal (ENSCCRG00000029217)	ahcyl1 (ENSCCRG00000029242)	hspa1b (ENSCCRG00000072010) ##22	ENSCCRG00000069246	slc6a17 (ENSCCRG00000057073)	ENSCCRG00000056752	ENSCCRG00000073064	slc16a4 (ENSCCRG00000029373)	lamtor5 (ENSCCRG00000010391)	prok1 (ENSCCRG00000036795)	ENSCCRG00000077083	mmp9 (ENSCCRG00000025804)	zgc:110353 (ENSCCRG00000027790)	adora1b (ENSCCRG00000057125)	dclre1b (ENSCCRG00000017101)	cpne5a (ENSCCRG00000010993)	lhfpl5b (ENSCCRG00000001353)	srpk1a (ENSCCRG00000050970)
Zebrafish	MODERN SPECIES	23	eps8l3b (ENSDARG00000005704)	gstm.3 (ENSDARG00000088116)	gstm.2 (ENSDARG00000029473)	gstm.1 (ENSDARG00000042533)	AMPD2 (ENSDARG00000029952)	gnat2 (ENSDARG00000042529)	GPR61 (ENSDARG00000055570)	gnai3 (ENSDARG00000030644)	AMIGO1 (ENSDARG00000079620)	atxn7l2b (ENSDARG00000056268)	sypl2b (ENSDARG00000000690)	sort1b (ENSDARG00000056252)	ngrn (ENSDARG00000061314)	nfyal (ENSDARG00000001621)	ahcyl1 (ENSDARG00000056331)	hspa1b (ENSDARG00000056210) ##22	kcnc4 (ENSDARG00000061288)	slc6a17 (ENSDARG00000068787)	ENSDARG00000111246	RBM15 (ENSDARG00000073847)	slc16a4 (ENSDARG00000042807)	lamtor5 (ENSDARG00000090194)	prok1 (ENSDARG00000073948)	ENSDARG00000114278	ENSDARG00000110283	ENSDARG00000114843	ENSDARG00000114493	ZNF335 (ENSDARG00000076920)	mmp9 (ENSDARG00000042816)	zgc:110353 (ENSDARG00000039443)	adora1b (ENSDARG00000075694)
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	145	atp5pb (ENSSGRG00000031911)	eps8l3b (ENSSGRG00000031912)	ENSSGRG00000031914	gstm.3 (ENSSGRG00000031916)	AMPD2 (ENSSGRG00000031925)	gnat2 (ENSSGRG00000031926)	gnai3 (ENSSGRG00000031972)	GPR61 (ENSSGRG00000032801)	AMIGO1 (ENSSGRG00000032802)	atxn7l2b (ENSSGRG00000032803)	ENSSGRG00000032804	sort1b (ENSSGRG00000032805)	ngrn (ENSSGRG00000032924)	nfyal (ENSSGRG00000032925)	ahcyl1 (ENSSGRG00000032952)	ENSSGRG00000033673 ##22	KCNC4 (ENSSGRG00000033674)	slc6a17 (ENSSGRG00000033675)	ENSSGRG00000033677	RBM15 (ENSSGRG00000033678)	prok1 (ENSSGRG00000033684)	ZNF335 (ENSSGRG00000033687)	mmp9 (ENSSGRG00000033699)	zgc:110353 (ENSSGRG00000034003)	adora1b (ENSSGRG00000034004)	cpne5a (ENSSGRG00000034007)	lhfpl5b (ENSSGRG00000034009)	srpk1a (ENSSGRG00000034025)	MAPK14 (ENSSGRG00000034544)	ELAPOR1 (ENSSGRG00000037713)	zgc:195245 (ENSSGRG00000038024)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Huchen	MODERN SPECIES	264											lim2.1 (ENSHHUG00000051569)	bsx (ENSHHUG00000051568)	ENSHHUG00000051561	hspa8 (ENSHHUG00000051072)	ENSHHUG00000051060	ENSHHUG00000051054 ##22	HSPA8 (ENSHHUG00000051052)	zpr1 (ENSHHUG00000051004)	h2ax1 (ENSHHUG00000050985)	hyou1 (ENSHHUG00000050786)	vps11 (ENSHHUG00000050754)	ift46 (ENSHHUG00000050741)	BBX (ENSHHUG00000050727)	B3GAT1 (ENSHHUG00000050725)	ENSHHUG00000050724	micu2 (ENSHHUG00000050712)	IRF2BP1 (ENSHHUG00000050711)	hnrnpl (ENSHHUG00000050668)	actb1 (ENSHHUG00000050662)	ENSHHUG00000050652	ENSHHUG00000050650
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	232	ENSHCOG00000002650	olfcq3 (ENSHCOG00000002644)	ENSHCOG00000002633	PLCH1 (ENSHCOG00000002619)	c18h3orf33 (ENSHCOG00000002587)	med13b (ENSHCOG00000002558)	zgc:112083 (ENSHCOG00000002493)	ENSHCOG00000002478	thap12b (ENSHCOG00000002469)	dyrk1ab (ENSHCOG00000002462)	alcamb (ENSHCOG00000002436)	ZPLD1 (ENSHCOG00000002420)	picalmb (ENSHCOG00000002408)	ENSHCOG00000002372	ENSHCOG00000002339	ENSHCOG00000002326 ##22	lim2.3 (ENSHCOG00000002311)	zgc:77784 (ENSHCOG00000002300)	ENSHCOG00000002285	acad8 (ENSHCOG00000002276)	thyn1 (ENSHCOG00000002266)	ENSHCOG00000002260	JAM3 (ENSHCOG00000002235)	JAM3 (ENSHCOG00000002180)	ENSHCOG00000002147	ENSHCOG00000002106	ENSHCOG00000002097	cadm1b (ENSHCOG00000002090)	ncam1b (ENSHCOG00000001999)	ZBTB16 (ENSHCOG00000001662)	TMPRSS5 (ENSHCOG00000001641)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Seriola	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154813.f ##22
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	500																ENSSLDG00000000592 ##22
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162782.g.b	ENSGT00940000165453.j.b	ENSGT00940000165453.i	ENSGT00940000157185	ENSGT00390000004493	ENSGT00390000013680.b.b	ENSGT00870000136508.c.b	ENSGT00530000063947.C.c	ENSGT00530000063516.a.a.a.b	ENSGT00940000157408.a.b	ENSGT00940000156881.g	ENSGT00940000156527.d	ENSGT00950000183068.a.b.d	ENSGT00940000166822	ENSGT00940000164443.b.b	ENSGT00940000154813.f ##22	ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a	ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a	ENSGT00940000155457.a.b	ENSGT00940000157231.a.b	ENSGT00940000157590	ENSGT00390000013297	ENSGT00950000183064.a.b.a.a	ENSGT00940000156937.a.b	ENSGT00940000155900.j	ENSGT00940000154313.c.b	ENSGT00940000156093.e.b	ENSGT00940000155743.a	ENSGT00940000154616.a.b	ENSGT00940000159163	ENSGT00510000048581
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