Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000000022.b #9	ENSGT00390000002918.a.b #10	ENSGT00730000111100 #11	ENSGT00940000153239.B.j.b #12	ENSGT00550000074840.y.b.b #13	ENSGT00390000002077 #14	ENSGT00390000020164 #15	ENSGT00940000157339 #16	ENSGT00940000163233 #17	ENSGT00940000154485.A #18	ENSGT00390000017504 #19	ENSGT00420000030724.a #20	ENSGT00910000147647	ENSGT00420000030724.b ##20	ENSGT00940000158004 #21	ENSGT00530000063718.a.b #22	ENSGT00390000008751.a #23	ENSGT00940000162686 #24	ENSGT00390000017489 #25	ENSGT00390000018898 #26	ENSGT00940000153331.hb #28	ENSGT00940000153331.ib #29	ENSGT00940000157896 #30	ENSGT00390000000787 #31	ENSGT00530000063960 #33	ENSGT00390000018482 #34	ENSGT00390000018868.A.c.a #35	ENSGT00940000153962.b #36	ENSGT00510000047981.c #37	ENSGT00940000158466	ENSGT00950000182973.a.c.b
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00390000000022.b #9	ENSGT00390000002918.a.b #10	ENSGT00730000111100 #11	ENSGT00940000153239.B.j.a.a.b ##12	ENSGT00940000153239.B.j.b #12	ENSGT00550000074840.y.b.b #13	ENSGT00390000002077 #14	ENSGT00390000020164 #15	ENSGT00940000157339 #16	ENSGT00940000163233 #17	ENSGT00940000154485.A #18	ENSGT00390000017504 #19	ENSGT00420000030724.a #20	ENSGT00910000147647	ENSGT00940000158004 #21	ENSGT00530000063718.a.b #22	ENSGT00390000008751.a #23	ENSGT00940000162686 #24	ENSGT00390000017489 #25	ENSGT00390000018898 #26	ENSGT00940000153331.hb #28	ENSGT00940000153331.ib #29	ENSGT00940000157896 #30	ENSGT00390000000787 #31	ENSGT00530000063960 #33	ENSGT00390000018482 #34	ENSGT00390000018868.A.c.a #35	ENSGT00940000153962.b #36	ENSGT00510000047981.c #37	ENSGT00940000158466	ENSGT00950000182973.a.c.b
Marmoset	MODERN SPECIES		ATF4 (ENSCJAG00000002594) #7	MIEF1 (ENSCJAG00000002588) #8	CSDC2 (ENSCJAG00000085773) #9	PMM1 (ENSCJAG00000002559) #10	DESI1 (ENSCJAG00000018941) #11	ENSCJAG00000045512 #12	SNU13 (ENSCJAG00000070172) #13	MEI1 (ENSCJAG00000002425) #14	CCDC134 (ENSCJAG00000002415) #15	SREBF2 (ENSCJAG00000002378) #16	SHISA8 (ENSCJAG00000014945) #17	TNFRSF13C (ENSCJAG00000002372) #18	CENPM (ENSCJAG00000002359) #19	SMIM45 (ENSCJAG00000044184) #20	SEPTIN3 (ENSCJAG00000043636) #21	WBP2NL (ENSCJAG00000002344) #22	NAGA (ENSCJAG00000002338) #23	PHETA2 (ENSCJAG00000002334) #24	SMDT1 (ENSCJAG00000002333) #25	NDUFA6 (ENSCJAG00000074627) #26	ENSCJAG00000033546 #27	CYP2D19 (ENSCJAG00000002321) #28	ENSCJAG00000037046 #29	TCF20 (ENSCJAG00000002308) #30	ENSCJAG00000006644 #31	ENSCJAG00000084345 #32	SERHL2 (ENSCJAG00000081818) #33	RRP7A (ENSCJAG00000009668) #34	POLDIP3 (ENSCJAG00000009628) #35	CYB5R3 (ENSCJAG00000009596) #36	A4GALT (ENSCJAG00000022137) #37
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00390000004383	ENSGT00390000000022.b #9	ENSGT00390000002918.a.b #10	ENSGT00730000111100 #11	ENSGT00940000153239.B.j.a.a.b ##12	ENSGT00550000074840.y.b.b #13	ENSGT00390000002077 #14	ENSGT00390000020164 #15	ENSGT00940000157339 #16	ENSGT00940000163233 #17	ENSGT00940000154485.A #18	ENSGT00390000017504 #19	ENSGT00420000030724.a #20	ENSGT00910000147647	ENSGT00940000158004 #21	ENSGT00530000063718.a.b #22	ENSGT00390000008751.a #23	ENSGT00390000017489 #25	ENSGT00390000018898.y #26	ENSGT00940000153331.hb #28	ENSGT00940000153331.ib #29	ENSGT00940000157896 #30	ENSGT00390000000787 #31	ENSGT00530000063960 #33	ENSGT00390000018482 #34	ENSGT00390000018868.A.c.a #35
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	94	POLR3H (ENSSBOG00000020652)	CSDC2 (ENSSBOG00000035590) #9	PMM1 (ENSSBOG00000035346) #10	DESI1 (ENSSBOG00000023969) #11	ENSSBOG00000024724 ##12	ENSSBOG00000024134 ##13	MEI1 (ENSSBOG00000026823) #14	CCDC134 (ENSSBOG00000030156) #15	SREBF2 (ENSSBOG00000032953) #16	SHISA8 (ENSSBOG00000031370) #17	TNFRSF13C (ENSSBOG00000030226) #18	CENPM (ENSSBOG00000031289) #19	SMIM45 (ENSSBOG00000018953) #20	ENSSBOG00000034678	ENSSBOG00000024825 #21	ENSSBOG00000029774 #22	NAGA (ENSSBOG00000019954) #23	SMDT1 (ENSSBOG00000031212) #25	ENSSBOG00000021327 #26	CYP2D6 (ENSSBOG00000028747) #29	TCF20 (ENSSBOG00000003000) #30	NFAM1 (ENSSBOG00000032935) #31	SERHL2 (ENSSBOG00000026990) #33	RRP7A (ENSSBOG00000009234) #34	ENSSBOG00000021779 #35	ENSSBOG00000033266	ACR (ENSSBOG00000027884)	SHANK3 (ENSSBOG00000012932)	ARSA (ENSSBOG00000025351)	MAPK8IP2 (ENSSBOG00000028182)	CHKB (ENSSBOG00000015516)
Capuchin	DUPLICATION
Capuchin	MODERN SPECIES	435	ACO2 (ENSCCAG00000028378)	POLR3H (ENSCCAG00000025802)	CSDC2 (ENSCCAG00000029849) #9	PMM1 (ENSCCAG00000034441) #10	DESI1 (ENSCCAG00000037020) #11	ENSCCAG00000030468 ##12	ENSCCAG00000031213 #13	MEI1 (ENSCCAG00000033076) #14	CCDC134 (ENSCCAG00000019608) #15	SREBF2 (ENSCCAG00000025566) #16	SHISA8 (ENSCCAG00000029382) #17	TNFRSF13C (ENSCCAG00000036813) #18	CENPM (ENSCCAG00000032494) #19	SMIM45 (ENSCCAG00000005363) #20	ENSCCAG00000022439 #21	ENSCCAG00000037760 #22	NAGA (ENSCCAG00000037174) #23	SMDT1 (ENSCCAG00000024549) #25	ENSCCAG00000036946 #26	CYP2D6 (ENSCCAG00000020990) #28	CYP2D8 (ENSCCAG00000034203) #29	TCF20 (ENSCCAG00000027829) #30	NFAM1 (ENSCCAG00000026337) #31	SERHL2 (ENSCCAG00000023420) #33	RRP7A (ENSCCAG00000021486) #34	ENSCCAG00000027969 #35
Capuchin	MODERN SPECIES	19															ADAMTS7 (ENSCCAG00000036763)	ENSCCAG00000028535 #22	NGRN (ENSCCAG00000030018)	TTLL13 (ENSCCAG00000021482)	CIB1 (ENSCCAG00000014836)	SEMA4B (ENSCCAG00000024539)	IDH2 (ENSCCAG00000024978)	ZNF710 (ENSCCAG00000029250)	ARPIN (ENSCCAG00000022649)	ANPEP (ENSCCAG00000030317)	MESP2 (ENSCCAG00000011316)	MESP1 (ENSCCAG00000025283)	WDR93 (ENSCCAG00000032328)	PEX11A (ENSCCAG00000036277)	PLIN1 (ENSCCAG00000035870)	KIF7 (ENSCCAG00000033647)	ENSCCAG00000025798
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1154	PMM1 (ENSANAG00000027683) #10	DESI1 (ENSANAG00000033964) #11	XRCC6 (ENSANAG00000018684) #12	SNU13 (ENSANAG00000023772) #13	MEI1 (ENSANAG00000030252) #14	CCDC134 (ENSANAG00000030858) #15	ENSANAG00000031745	SREBF2 (ENSANAG00000027763) #16	SHISA8 (ENSANAG00000030774) #17	TNFRSF13C (ENSANAG00000022162) #18	ENSANAG00000031331	CENPM (ENSANAG00000032170) #19	ENSANAG00000020496 #20	ENSANAG00000031290 ##20	ENSANAG00000019445 #21	WBP2NL (ENSANAG00000029029) #22	NAGA (ENSANAG00000027293) #23