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Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161569	ENSGT00940000153840.a.a	ENSGT00440000033919 #7	ENSGT00940000155223.b #9	ENSGT00940000163180 #10	ENSGT00940000160240 #12	ENSGT00390000007512 #13	ENSGT00390000002226 #14	ENSGT00940000156555 #15	ENSGT00940000157428 #17	ENSGT00980000198588 #18	ENSGT00940000154322.A #19	ENSGT00940000156843 #20	ENSGT00940000159856 #21	ENSGT00940000163071	ENSGT00390000006009.a.a.a #22	ENSGT00390000006555 #23	ENSGT00940000158604 #24	ENSGT00940000160741 #25	ENSGT00390000004832 #26	ENSGT00940000156193 #28	ENSGT00390000001360 #29	ENSGT00940000155420.b #30	ENSGT00390000014787 #31	ENSGT00390000009030 #32	ENSGT00390000006762 #33	ENSGT00940000155932 #34	ENSGT00940000155585 #35	ENSGT00390000000378.d.a #36	ENSGT00940000154503.b	ENSGT00940000154503.a
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161569	ENSGT00940000153840.a.a	ENSGT00440000033919 #7	ENSGT00940000155223.b #9	ENSGT00940000163180 #10	ENSGT00940000160240 #12	ENSGT00390000007512 #13	ENSGT00390000002226 #14	ENSGT00940000156555 #15	ENSGT00940000157428 #17	ENSGT00980000198588 #18	ENSGT00940000154322.A #19	ENSGT00940000156843 #20	ENSGT00940000159856 #21	ENSGT00940000163071	ENSGT00390000006009.a.a.a #22	ENSGT00390000006555 #23	ENSGT00940000158604 #24	ENSGT00940000160741 #25	ENSGT00390000004832 #26	ENSGT00940000156193 #28	ENSGT00390000001360 #29	ENSGT00940000155420.b #30	ENSGT00390000014787 #31	ENSGT00390000009030 #32	ENSGT00390000006762 #33	ENSGT00940000155932 #34	ENSGT00940000155585 #35	ENSGT00390000000378.d.a #36	ENSGT00940000154503.b	ENSGT00940000154503.a
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Alpin marmot	MODERN SPECIES	42	ENSMMMG00000021160	CA10 (ENSMMMG00000021089) #9	KIF2B (ENSMMMG00000021059) #10	TOM1L1 (ENSMMMG00000020950) #12	COX11 (ENSMMMG00000020936) #13	STXBP4 (ENSMMMG00000020922) #14	HLF (ENSMMMG00000020915) #15	ENSMMMG00000020913 #16	ENSMMMG00000020910	MMD (ENSMMMG00000020888) #17	SMIM36 (ENSMMMG00000020885) #18	TMEM100 (ENSMMMG00000020880) #19	PCTP (ENSMMMG00000020875) #20	ANKFN1 (ENSMMMG00000020855) #21	ENSMMMG00000020845	NOG (ENSMMMG00000020841) #22	C17orf67 (ENSMMMG00000020832) #23	DGKE (ENSMMMG00000020817) #24	TRIM25 (ENSMMMG00000020801) #25	COIL (ENSMMMG00000020795) #26	SCPEP1 (ENSMMMG00000020785) #28	ENSMMMG00000020780	ENSMMMG00000020772 #29	ENSMMMG00000020763 #29	MSI2 (ENSMMMG00000020747) #30	CCDC182 (ENSMMMG00000020744) #31	MRPS23 (ENSMMMG00000020740) #32	CUEDC1 (ENSMMMG00000020733) #33	VEZF1 (ENSMMMG00000020729) #34	SRSF1 (ENSMMMG00000020693) #35	DYNLL2 (ENSMMMG00000020685) #36
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Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000161569	ENSGT00940000153840.a.a	ENSGT00440000033919 #7	ENSGT00940000155223.b #9	ENSGT00940000163180 #10	ENSGT00940000160240 #12	ENSGT00390000007512 #13	ENSGT00390000002226 #14	ENSGT00940000156555 #15	ENSGT00940000157428 #17	ENSGT00980000198588 #18	ENSGT00940000154322.A #19	ENSGT00940000156843 #20	ENSGT00940000159856 #21	ENSGT00940000163071	ENSGT00390000006009.a.a.a #22	ENSGT00390000006555 #23	ENSGT00940000158604 #24	ENSGT00940000160741 #25	ENSGT00390000004832 #26	ENSGT00940000156193 #28	ENSGT00390000001360 #29	ENSGT00940000155420.b #30	ENSGT00390000014787 #31	ENSGT00390000009030 #32	ENSGT00390000006762 #33	ENSGT00940000155932 #34	ENSGT00940000155585 #35	ENSGT00390000000378.d.a #36	ENSGT00940000154503.b	ENSGT00940000154503.a
Guinea pig	MODERN SPECIES	53	NME1 (ENSCPOG00000033542)	NME2 (ENSCPOG00000008413)	MBTD1 (ENSCPOG00000002995)	UTP18 (ENSCPOG00000001477) #7	CA10 (ENSCPOG00000015491) #9	KIF2B (ENSCPOG00000026487) #10	TOM1L1 (ENSCPOG00000023145) #12	COX11 (ENSCPOG00000008482) #13	STXBP4 (ENSCPOG00000011602) #14	HLF (ENSCPOG00000032087) #15	MMD (ENSCPOG00000039747) #17	SMIM36 (ENSCPOG00000032031) #18	TMEM100 (ENSCPOG00000040096) #19	PCTP (ENSCPOG00000013507) #20	ANKFN1 (ENSCPOG00000004925) #21	NOG (ENSCPOG00000004932) #22	C17orf67 (ENSCPOG00000022723) #23	DGKE (ENSCPOG00000011459) #24	ENSCPOG00000009078	TRIM25 (ENSCPOG00000013452) #25	COIL (ENSCPOG00000001284) #26	SCPEP1 (ENSCPOG00000002870) #28	AKAP1 (ENSCPOG00000013327) #29	MSI2 (ENSCPOG00000034042) #30	CCDC182 (ENSCPOG00000008757) #31	MRPS23 (ENSCPOG00000008761) #32	CUEDC1 (ENSCPOG00000022982) #33	VEZF1 (ENSCPOG00000002637) #34	SRSF1 (ENSCPOG00000032681) #35	DYNLL2 (ENSCPOG00000039544) #36	OR4D1 (ENSCPOG00000030997)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162213	ENSGT00940000161569	ENSGT00940000153840.a.a	ENSGT00440000033919 #7	ENSGT00940000155223.b #9	ENSGT00940000160240 #12	ENSGT00390000007512 #13	ENSGT00390000002226 #14	ENSGT00940000156555 #15	ENSGT00940000157428 #17	ENSGT00980000198588 #18	ENSGT00940000154322.A #19	ENSGT00940000156843 #20	ENSGT00940000159856 #21	ENSGT00940000163071	ENSGT00390000006009.a.a.a #22	ENSGT00390000006555 #23	ENSGT00940000158604 #24	ENSGT00940000160741 #25	ENSGT00390000004832 #26	ENSGT00940000156193 #28	ENSGT00390000001360 #29	ENSGT00940000155420.b #30	ENSGT00390000009030 #32	ENSGT00390000006762 #33	ENSGT00940000155932 #34	ENSGT00940000155585 #35	ENSGT00390000000378.d.a #36	ENSGT00940000154503.b	ENSGT00940000154503.a	ENSGT00940000156009.A
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	158	SPAG9 (ENSCLAG00000015982)	NME2 (ENSCLAG00000013895)	MBTD1 (ENSCLAG00000011590)	UTP18 (ENSCLAG00000012603) #7	CA10 (ENSCLAG00000014796) #9	TOM1L1 (ENSCLAG00000012206) #12	COX11 (ENSCLAG00000013909) #13	STXBP4 (ENSCLAG00000011711) #14	HLF (ENSCLAG00000013244) #15	MMD (ENSCLAG00000016458) #17	SMIM36 (ENSCLAG00000018044) #18	TMEM100 (ENSCLAG00000014942) #19	PCTP (ENSCLAG00000012326) #20	ANKFN1 (ENSCLAG00000015690) #21	ENSCLAG00000013710	NOG (ENSCLAG00000017798) #22	C17orf67 (ENSCLAG00000015852) #23	DGKE (ENSCLAG00000012917) #24	TRIM25 (ENSCLAG00000017035) #25	ENSCLAG00000014496 #26	SCPEP1 (ENSCLAG00000015159) #28	AKAP1 (ENSCLAG00000015261) #29	MSI2 (ENSCLAG00000014325) #30	MRPS23 (ENSCLAG00000013109) #32	CUEDC1 (ENSCLAG00000012560) #33	VEZF1 (ENSCLAG00000011306) #34	SRSF1 (ENSCLAG00000014707) #35	DYNLL2 (ENSCLAG00000014096) #36	ENSCLAG00000017831	ENSCLAG00000015179	OR4D2 (ENSCLAG00000017866)
Degu	MODERN SPECIES	263								ENSODEG00000011833 #13	STXBP4 (ENSODEG00000011379) #14	HLF (ENSODEG00000011608) #15	MMD (ENSODEG00000013055) #17	TMEM100 (ENSODEG00000019916) #19	PCTP (ENSODEG00000014619) #20	ANKFN1 (ENSODEG00000012115) #21	ENSODEG00000012707	NOG (ENSODEG00000020232) #22	C17orf67 (ENSODEG00000013079) #23	DGKE (ENSODEG00000012600) #24	TRIM25 (ENSODEG00000011829) #25	ENSODEG00000012139	COIL (ENSODEG00000012389) #26	SCPEP1 (ENSODEG00000010769) #28	ENSODEG00000011240 #29	TMEM238 (ENSODEG00000011450)	MSI2 (ENSODEG00000011974) #30	ENSODEG00000011449	MRPS23 (ENSODEG00000011027) #32	CUEDC1 (ENSODEG00000011861) #33	VEZF1 (ENSODEG00000011127) #34	SRSF1 (ENSODEG00000011481) #35	DYNLL2 (ENSODEG00000013208) #36