Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159720.ab ENSGT00950000183025.a #7 ENSGT00940000161434 #8 ENSGT00940000159029 #9 ENSGT00940000161386 #10 ENSGT00940000161529 #11 ENSGT00940000161230 #12 ENSGT00940000161108 #13 ENSGT00940000158354 #14 ENSGT00940000162072 #15 ENSGT00940000159774 #16 ENSGT00940000155029.c.b #17 ENSGT00940000159503 #18 ENSGT00390000017856.b #20 ENSGT00940000160113 #21 ENSGT00940000154152.d.a.a #22 ENSGT00940000154152.d.b.dc.b ##22 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #23 ENSGT00390000004405.b #24 ENSGT00390000000713 #25 ENSGT00940000154534.a #26 ENSGT00390000011219 #27 ENSGT00940000159590 #28 ENSGT00940000161498 #29 ENSGT00390000013474.b.a #30 ENSGT00940000161315 #31 ENSGT00390000000603 #32 ENSGT00940000157439 #33 ENSGT00940000160397 #34 ENSGT00940000153704.B #35 ENSGT00550000074898 #36 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 33 ENSCGRG00001011435 #7 Ttll6 (ENSCGRG00001018398) #8 Hoxb13 (ENSCGRG00001015060) #9 Hoxb9 (ENSCGRG00001015314) #10 Hoxb8 (ENSCGRG00001020235) #11 Hoxb7 (ENSCGRG00001021590) #12 Hoxb6 (ENSCGRG00001015674) #13 Hoxb5 (ENSCGRG00001016167) #14 Hoxb4 (ENSCGRG00001022431) #15 Hoxb3 (ENSCGRG00001016667) #16 Hoxb2 (ENSCGRG00001017587) #17 Hoxb1 (ENSCGRG00001024619) #18 ENSCGRG00001023355 #19 ENSCGRG00001020759 #20 Snx11 (ENSCGRG00001022221) #21 Cbx1 (ENSCGRG00001014799) #22 Nfe2l1 (ENSCGRG00001015287) #23 Copz2 (ENSCGRG00001014767) #24 Cdk5rap3 (ENSCGRG00001006966) #25 Prr15l (ENSCGRG00001008926) #26 Pnpo (ENSCGRG00001018189) #27 Sp2 (ENSCGRG00001010976) #28 Sp6 (ENSCGRG00001002797) #29 Scrn2 (ENSCGRG00001022143) #30 Lrrc46 (ENSCGRG00001019758) #31 Mrpl10 (ENSCGRG00001024199) #32 Osbpl7 (ENSCGRG00001013737) #33 Tbx21 (ENSCGRG00001008276) #34 Tbkbp1 (ENSCGRG00001018526) #35 Kpnb1 (ENSCGRG00001016042) #36 Npepps (ENSCGRG00001005930) #37 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 21 Ube2z (ENSPEMG00000020953) Atp5g1 (ENSPEMG00000020590) ENSPEMG00000028729 #7 ENSPEMG00000025676 #7 Ttll6 (ENSPEMG00000021918) #8 Hoxb13 (ENSPEMG00000021511) #9 Hoxb9 (ENSPEMG00000027158) #10 Hoxb5 (ENSPEMG00000030101) #14 Hoxb4 (ENSPEMG00000029805) #15 Hoxb3 (ENSPEMG00000028692) #16 Hoxb2 (ENSPEMG00000029510) #17 Hoxb1 (ENSPEMG00000023977) #18 Skap1 (ENSPEMG00000000585) #20 ENSPEMG00000020286 Snx11 (ENSPEMG00000000381) #21 Cbx1 (ENSPEMG00000020976) #22 Nfe2l1 (ENSPEMG00000010512) #23 Copz2 (ENSPEMG00000011137) #24 Cdk5rap3 (ENSPEMG00000020712) #25 ENSPEMG00000030963 Prr15l (ENSPEMG00000024436) #26 Pnpo (ENSPEMG00000025094) #27 Sp2 (ENSPEMG00000017112) #28 Sp6 (ENSPEMG00000001231) #29 Scrn2 (ENSPEMG00000020381) #30 Lrrc46 (ENSPEMG00000020507) #31 Mrpl10 (ENSPEMG00000014613) #32 Osbpl7 (ENSPEMG00000001423) #33 Tbx21 (ENSPEMG00000010056) #34 Tbkbp1 (ENSPEMG00000027762) #35 Kpnb1 (ENSPEMG00000017783) #36 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Degu MODERN SPECIES 251 C3orf14 (ENSODEG00000000683) FEZF2 (ENSODEG00000000670) ENSODEG00000000611 ENSODEG00000018595 ENSODEG00000000529 #22 ENSODEG00000000523 SYNPR (ENSODEG00000000498) ENSODEG00000000473 ENSODEG00000000452 THOC7 (ENSODEG00000000426) ATXN7 (ENSODEG00000000403) PSMD6 (ENSODEG00000003221) PRICKLE2 (ENSODEG00000003159) ADAMTS9 (ENSODEG00000003028) ENSODEG00000018911 MAGI1 (ENSODEG00000002366) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 16 LATS1 (ENSSVLG00005013545) KATNA1 (ENSSVLG00005013780) ENSSVLG00005013892 PPIL4 (ENSSVLG00005013984) ZC3H12D (ENSSVLG00005014060) TAB2 (ENSSVLG00005014149) ENSSVLG00005014219 UST (ENSSVLG00005014236) SASH1 (ENSSVLG00005014292) ENSSVLG00005014345 SAMD5 (ENSSVLG00005014384) STXBP5 (ENSSVLG00005014456) ADGB (ENSSVLG00005014586) ENSSVLG00005014957 GRM1 (ENSSVLG00005015002) ENSSVLG00005015257 #22 SHPRH (ENSSVLG00005015321) FBXO30 (ENSSVLG00005016005) EPM2A (ENSSVLG00005016024) UTRN (ENSSVLG00005016150) ENSSVLG00005016411 STX11 (ENSSVLG00005016470) SF3B5 (ENSSVLG00005016490) PLAGL1 (ENSSVLG00005016506) ZC2HC1B (ENSSVLG00005016528) LTV1 (ENSSVLG00005016622) PHACTR2 (ENSSVLG00005016689) FUCA2 (ENSSVLG00005017059) PEX3 (ENSSVLG00005017100) ADAT2 (ENSSVLG00005017149) AIG1 (ENSSVLG00005017202) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Alpin marmot MODERN SPECIES 77 ZFAND2A (ENSMMMG00000009516) C7orf50 (ENSMMMG00000009537) GPER1 (ENSMMMG00000009541) ENSMMMG00000009549 GPR146 (ENSMMMG00000009564) CYP2W1 (ENSMMMG00000009569) COX19 (ENSMMMG00000009574) ADAP1 (ENSMMMG00000009595) GET4 (ENSMMMG00000009604) SUN1 (ENSMMMG00000009621) DNAAF5 (ENSMMMG00000010417) PRKAR1B (ENSMMMG00000010445) ENSMMMG00000010482 FAM20C (ENSMMMG00000010489) ENSMMMG00000010508 ENSMMMG00000010521 #22 ENSMMMG00000010529 ENSMMMG00000010542 ENSMMMG00000010556 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Squirrel DUPLICATION Squirrel MODERN SPECIES 750 ENSSTOG00000026730 #22 Squirrel MODERN SPECIES 354 MICALL2 (ENSSTOG00000001736) ZFAND2A (ENSSTOG00000003030) GPER1 (ENSSTOG00000034461) ENSSTOG00000031759 GPR146 (ENSSTOG00000030630) C7orf50 (ENSSTOG00000027588) CYP2W1 (ENSSTOG00000003002) COX19 (ENSSTOG00000032354) ADAP1 (ENSSTOG00000024349) GET4 (ENSSTOG00000003934) SUN1 (ENSSTOG00000003895) DNAAF5 (ENSSTOG00000003874) PRKAR1B (ENSSTOG00000003855) PDGFA (ENSSTOG00000003223) FAM20C (ENSSTOG00000019720) ENSSTOG00000034676 #22 ENSSTOG00000024440 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Rabbit MODERN SPECIES 5 RFC4 (ENSOCUG00000005014) ENSOCUG00000005011 ENSOCUG00000031344 KNG1 (ENSOCUG00000005003) HRG (ENSOCUG00000011687) FETUB (ENSOCUG00000001032) AHSG (ENSOCUG00000002057) DNAJB11 (ENSOCUG00000002053) TBCCD1 (ENSOCUG00000002050) CRYGS (ENSOCUG00000022375) DGKG (ENSOCUG00000005238) ETV5 (ENSOCUG00000005233) ENSOCUG00000034163 ENSOCUG00000001368 TRA2B (ENSOCUG00000008940) ENSOCUG00000026350 #22 IGF2BP2 (ENSOCUG00000005057) SENP2 (ENSOCUG00000005048) LIPH (ENSOCUG00000005043) TMEM41A (ENSOCUG00000026127) MAP3K13 (ENSOCUG00000005035) ENSOCUG00000023997 EHHADH (ENSOCUG00000012197) ENSOCUG00000014627 VPS8 (ENSOCUG00000002059) EPHB3 (ENSOCUG00000012637) ENSOCUG00000025191 ENSOCUG00000023062 CHRD (ENSOCUG00000007084) THPO (ENSOCUG00000007080) POLR2H (ENSOCUG00000007078) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Mouse lemur MODERN SPECIES 5 EEF1E1 (ENSMICG00000012636) BLOC1S5 (ENSMICG00000036195) ENSMICG00000005966 BMP6 (ENSMICG00000005957) SNRNP48 (ENSMICG00000012497) DSP (ENSMICG00000012470) RIOK1 (ENSMICG00000044301) CAGE1 (ENSMICG00000003644) SSR1 (ENSMICG00000047142) ENSMICG00000034173 ENSMICG00000013711 ENSMICG00000004474 GCM2 (ENSMICG00000032859) SYCP2L (ENSMICG00000004241) ELOVL2 (ENSMICG00000031480) ENSMICG00000029333 #22 SMIM13 (ENSMICG00000037605) NEDD9 (ENSMICG00000017359) TMEM170B (ENSMICG00000042371) HIVEP1 (ENSMICG00000032151) ENSMICG00000042252 EDN1 (ENSMICG00000035008) PHACTR1 (ENSMICG00000000165) TBC1D7 (ENSMICG00000000168) GFOD1 (ENSMICG00000000170) SIRT5 (ENSMICG00000000174) NOL7 (ENSMICG00000044935) RANBP9 (ENSMICG00000000179) ENSMICG00000000183 RNF182 (ENSMICG00000045818) CD83 (ENSMICG00000042608) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 564 TTLL6 (ENSCATG00000029768) #8 HOXB13 (ENSCATG00000041758) #9 PRAC1 (ENSCATG00000038550) HOXB9 (ENSCATG00000002169) #10 HOXB8 (ENSCATG00000025318) #11 HOXB7 (ENSCATG00000042829) #12 HOXB6 (ENSCATG00000043342) #13 HOXB5 (ENSCATG00000027616) #14 HOXB3 (ENSCATG00000031126) #16 HOXB4 (ENSCATG00000040704) #15 HOXB2 (ENSCATG00000035238) #17 HOXB1 (ENSCATG00000035575) #18 SKAP1 (ENSCATG00000044458) #20 ENSCATG00000019817 SNX11 (ENSCATG00000030351) #21 ENSCATG00000034735 #22 NFE2L1 (ENSCATG00000040775) #23 COPZ2 (ENSCATG00000042708) #24 CDK5RAP3 (ENSCATG00000006699) #25 PRR15L (ENSCATG00000020186) #26 PNPO (ENSCATG00000039934) #27 ENSCATG00000003341 #28 SP6 (ENSCATG00000020123) #29 SCRN2 (ENSCATG00000038846) #30 LRRC46 (ENSCATG00000031406) #31 MRPL10 (ENSCATG00000035686) #32 OSBPL7 (ENSCATG00000033623) #33 TBX21 (ENSCATG00000010529) #34 TBKBP1 (ENSCATG00000040564) #35 KPNB1 (ENSCATG00000037124) #36 NPEPPS (ENSCATG00000011160) #37 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158517 ENSGT00940000153336.e.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000001432 ENSGT00940000154453.b.a.b.b ENSGT01090000260082.d.a.a.a.a.c ENSGT00390000014785 ENSGT00940000159316 ENSGT00510000048363.h.b ENSGT00390000018389 ENSGT00950000182870.a.a.b.i.b ENSGT00940000162717 ENSGT00940000153902.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000154103.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ENSGT00940000154152.d.a.a #22 ENSGT00940000164739.b ENSGT00940000164739.a ENSGT00940000154746.h ENSGT00940000162502.c ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.b ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ENSGT00390000012916.h.a.a ENSGT00390000004891 ENSGT00940000162603 ENSGT00940000161062 ENSGT00950000183031.B.e.a ENSGT00940000162993 ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000153097.B.a.b.e.a Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000008859.b.d.k.a.b.b ENSGT00940000158517 ENSGT00940000153336.e.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000001432 ENSGT00940000154453.b.a.b.b ENSGT01090000260082.d.a.a.a.a.c ENSGT00390000014785 ENSGT00940000159316 ENSGT00510000048363.h.b ENSGT00390000018389 ENSGT00940000162717 ENSGT00940000153902.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000154103.b ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ENSGT00940000154152.d.a.a #22 ENSGT00940000164739.b ENSGT00940000164739.a ENSGT00940000154746.h ENSGT00940000162502.c 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#23 ENSPTIG00000007047 COPZ2 (ENSPTIG00000007508) #24 CDK5RAP3 (ENSPTIG00000009086) #25 PNPO (ENSPTIG00000012157) #27 SP2 (ENSPTIG00000014873) #28 SCRN2 (ENSPTIG00000016232) #30 LRRC46 (ENSPTIG00000018466) #31 MRPL10 (ENSPTIG00000018968) #32 ENSPTIG00000019388 #33 TBX21 (ENSPTIG00000001553) #34 ENSPTIG00000005274 #35 KPNB1 (ENSPTIG00000006870) #36 NPEPPS (ENSPTIG00000010447) #37 MRPL45 (ENSPTIG00000013013) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Ferret MODERN SPECIES 270 UBE2Z (ENSMPUG00000015342) ENSMPUG00000015341 CALCOCO2 (ENSMPUG00000015338) #7 TTLL6 (ENSMPUG00000015335) #8 HOXB13 (ENSMPUG00000015332) #9 HOXB9 (ENSMPUG00000015330) #10 HOXB8 (ENSMPUG00000015329) #11 HOXB7 (ENSMPUG00000015328) #12 HOXB6 (ENSMPUG00000015322) #13 HOXB5 (ENSMPUG00000015316) #14 HOXB4 (ENSMPUG00000015310) #15 HOXB2 (ENSMPUG00000015309) #17 HOXB1 (ENSMPUG00000015307) #18 SKAP1 (ENSMPUG00000015305) #20 SNX11 (ENSMPUG00000015303) #21 CBX1 (ENSMPUG00000015302) #22 NFE2L1 (ENSMPUG00000015301) #23 COPZ2 (ENSMPUG00000015292) #24 CDK5RAP3 (ENSMPUG00000015291) #25 PRR15L (ENSMPUG00000020087) #26 PNPO (ENSMPUG00000015290) #27 SP2 (ENSMPUG00000015289) #28 SP6 (ENSMPUG00000020086) #29 SCRN2 (ENSMPUG00000015288) #30 LRRC46 (ENSMPUG00000015287) #31 MRPL10 (ENSMPUG00000015278) #32 OSBPL7 (ENSMPUG00000015276) #33 ENSMPUG00000015275 ENSMPUG00000015273 TBX21 (ENSMPUG00000015272) #34 TBKBP1 (ENSMPUG00000015271) #35 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000154298.a.b ENSGT00940000159720 ENSGT00950000183025.a #7 ENSGT00940000161434 #8 ENSGT00940000159029 #9 ENSGT00940000161386 #10 ENSGT00940000161230 #12 ENSGT00940000161108 #13 ENSGT00940000158354 #14 ENSGT00940000162072 #15 ENSGT00940000159774 #16 ENSGT00940000155029.c.b #17 ENSGT00940000159503 #18 ENSGT00390000017856.b #20 ENSGT00940000160113 #21 ENSGT00940000154152.d.a.a #22 ENSGT00940000154152.d.b ##22 ENSGT00950000182892.a.b.a.a #23 ENSGT00950000185410 ENSGT00390000004405.b #24 ENSGT00390000000713 #25 ENSGT00940000154534.a #26 ENSGT00940000159590 #28 ENSGT00940000161498 #29 ENSGT00390000013474.b.a #30 ENSGT00940000161315 #31 ENSGT00390000000603 #32 ENSGT00940000157439 #33 ENSGT00940000160397 #34 ENSGT00940000153704.B #35 ENSGT00550000074898 #36 Arabian camel MODERN SPECIES 7 UBE2Z (ENSCDRG00005017075) ENSCDRG00005017142 CALCOCO2 (ENSCDRG00005017213) #7 TTLL6 (ENSCDRG00005017585) #8 HOXB13 (ENSCDRG00005017741) #9 HOXB9 (ENSCDRG00005017862) #10 HOXB7 (ENSCDRG00005018007) #12 HOXB6 (ENSCDRG00005018029) #13 HOXB5 (ENSCDRG00005018055) #14 HOXB4 (ENSCDRG00005018079) #15 HOXB3 (ENSCDRG00005018104) #16 HOXB2 (ENSCDRG00005018121) #17 HOXB1 (ENSCDRG00005018147) #18 SKAP1 (ENSCDRG00005018166) #20 SNX11 (ENSCDRG00005018232) #21 CBX1 (ENSCDRG00005018330) #22 NFE2L1 (ENSCDRG00005018357) #23 ENSCDRG00005018515 COPZ2 (ENSCDRG00005018538) #24 CDK5RAP3 (ENSCDRG00005018564) #25 PRR15L (ENSCDRG00005018636) #26 SP2 (ENSCDRG00005018756) #28 SP6 (ENSCDRG00005018791) #29 SCRN2 (ENSCDRG00005018805) #30 LRRC46 (ENSCDRG00005018865) #31 MRPL10 (ENSCDRG00005018906) #32 OSBPL7 (ENSCDRG00005018943) #33 TBX21 (ENSCDRG00005018980) #34 TBKBP1 (ENSCDRG00005018994) #35 KPNB1 (ENSCDRG00005019017) #36 NPEPPS (ENSCDRG00005019119) #37 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 3 C1orf112 (ENSOARG00020008897) METTL18 (ENSOARG00020008877) SELE (ENSOARG00020008826) SELL (ENSOARG00020008728) ENSOARG00020008710 SELP (ENSOARG00020008417) SLC19A2 (ENSOARG00020008147) CCDC181 (ENSOARG00020008091) BLZF1 (ENSOARG00020008036) ENSOARG00020008009 NME7 (ENSOARG00020007807) ATP1B1 (ENSOARG00020007736) DPT (ENSOARG00020007710) ENSOARG00020007688 XCL1 (ENSOARG00020007666) ENSOARG00020007655 #22 RGS7 (ENSOARG00020006899) FH (ENSOARG00020006418) KMO (ENSOARG00020006259) WDR64 (ENSOARG00020005994) EXO1 (ENSOARG00020005940) MAP1LC3C (ENSOARG00020005910) ENSOARG00020005851 PLD5 (ENSOARG00020005705) CEP170 (ENSOARG00020005464) AKT3 (ENSOARG00020005210) ZBTB18 (ENSOARG00020005168) C1orf100 (ENSOARG00020005127) ENSOARG00020005105 ENSOARG00020005072 DESI2 (ENSOARG00020005026) Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 26 ENSCHIG00000019835 ENSCHIG00000013757 CDC34 (ENSCHIG00000025931) TPGS1 (ENSCHIG00000021977) ENSCHIG00000011093 ODF3L2 (ENSCHIG00000008700) ENSCHIG00000016980 ENSCHIG00000009666 ENSCHIG00000021094 C2CD4C (ENSCHIG00000012931) THEG (ENSCHIG00000022326) MIER2 (ENSCHIG00000018261) PLPP2 (ENSCHIG00000026941) ENSCHIG00000006176 PGBD2 (ENSCHIG00000004584) ENSCHIG00000022233 #22 ZNF692 (ENSCHIG00000015907) ZNF672 (ENSCHIG00000007515) SH3BP5L (ENSCHIG00000009447) LYPD8 (ENSCHIG00000018982) ENSCHIG00000021690 ENSCHIG00000014028 ENSCHIG00000008999 ENSCHIG00000022428 ENSCHIG00000009490 ENSCHIG00000010616 ENSCHIG00000018731 ENSCHIG00000008431 OR2G6 (ENSCHIG00000002099) OR2T11 (ENSCHIG00000022429) ENSCHIG00000006401 Goat MODERN SPECIES 2 KYAT1 (ENSCHIG00000015959) LRRC8A (ENSCHIG00000003097) PHYHD1 (ENSCHIG00000025025) DOLK (ENSCHIG00000013790) NUP188 (ENSCHIG00000017195) SH3GLB2 (ENSCHIG00000023738) MIGA2 (ENSCHIG00000021488) DOLPP1 (ENSCHIG00000022790) CRAT (ENSCHIG00000016047) PTPA (ENSCHIG00000018428) IER5L (ENSCHIG00000007780) NTMT1 (ENSCHIG00000008995) ASB6 (ENSCHIG00000023406) PRRX2 (ENSCHIG00000024682) PTGES (ENSCHIG00000024614) ENSCHIG00000012306 #22 TOR1B (ENSCHIG00000015527) TOR1A (ENSCHIG00000020435) C9orf78 (ENSCHIG00000027025) ENSCHIG00000024518 USP20 (ENSCHIG00000017589) FNBP1 (ENSCHIG00000027203) GPR107 (ENSCHIG00000022854) NCS1 (ENSCHIG00000017219) HMCN2 (ENSCHIG00000017573) ASS1 (ENSCHIG00000017801) FUBP3 (ENSCHIG00000027228) PRDM12 (ENSCHIG00000025005) EXOSC2 (ENSCHIG00000021398) ABL1 (ENSCHIG00000021749) QRFP (ENSCHIG00000010002) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Cow MODERN SPECIES 11 LGSN (ENSBTAG00000010051) OCA2 (ENSBTAG00000009831) ENSBTAG00000040536 #22 HERC2 (ENSBTAG00000013916) NIPA1 (ENSBTAG00000002316) NIPA2 (ENSBTAG00000016895) CYFIP1 (ENSBTAG00000016894) TUBGCP5 (ENSBTAG00000014714) CCDC115 (ENSBTAG00000015841) IMP4 (ENSBTAG00000003225) PTPN18 (ENSBTAG00000011658) AMER3 (ENSBTAG00000038318) ARHGEF4 (ENSBTAG00000015834) FAM168B (ENSBTAG00000034978) PLEKHB2 (ENSBTAG00000000941) ENSBTAG00000050302 ENSBTAG00000049385 ENSBTAG00000049463 American bison DUPLICATION American bison MODERN SPECIES 3101 UBE2Z (ENSBBBG00000021371) ATP5MC1 (ENSBBBG00000021377) CALCOCO2 (ENSBBBG00000005726) #7 TTLL6 (ENSBBBG00000021540) #8 HOXB13 (ENSBBBG00000021546) #9 HOXB9 (ENSBBBG00000021558) #10 HOXB7 (ENSBBBG00000021565) #12 HOXB6 (ENSBBBG00000021567) #13 HOXB5 (ENSBBBG00000021577) #14 HOXB4 (ENSBBBG00000021585) #15 HOXB3 (ENSBBBG00000005740) #16 HOXB2 (ENSBBBG00000021598) #17 HOXB1 (ENSBBBG00000021601) #18 SKAP1 (ENSBBBG00000021634) #20 SNX11 (ENSBBBG00000021652) #21 ENSBBBG00000021675 #22 NFE2L1 (ENSBBBG00000021740) #23 COPZ2 (ENSBBBG00000021782) #24 CDK5RAP3 (ENSBBBG00000021808) #25 PRR15L (ENSBBBG00000021809) #26 PNPO (ENSBBBG00000021862) #27 SP2 (ENSBBBG00000021914) #28 SP6 (ENSBBBG00000021924) #29 SCRN2 (ENSBBBG00000021958) #30 LRRC46 (ENSBBBG00000021972) #31 MRPL10 (ENSBBBG00000021983) #32 OSBPL7 (ENSBBBG00000022056) #33 TBX21 (ENSBBBG00000005826) #34 ENSBBBG00000022076 #35 KPNB1 (ENSBBBG00000022131) #36 NPEPPS (ENSBBBG00000022236) #37 American bison MODERN SPECIES 3234 ENSBBBG00000008242 LGSN (ENSBBBG00000025133) ENSBBBG00000008248 #22 OCA2 (ENSBBBG00000025260) ENSBBBG00000025275 HERC2 (ENSBBBG00000025497) NIPA1 (ENSBBBG00000010801) NIPA2 (ENSBBBG00000010831) CYFIP1 (ENSBBBG00000001913) TUBGCP5 (ENSBBBG00000001933) ENSBBBG00000010913 IMP4 (ENSBBBG00000010931) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a #22 Monodontidae DUPLICATION Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155234.b ENSGT00940000155196.n.b ENSGT00940000158205 ENSGT00940000154194.lb ENSGT00940000161376 ENSGT00390000014293.a ENSGT00390000001063 ENSGT00530000063174.a.j ENSGT00950000182815.a.a.a.a.a ENSGT00940000155919 ENSGT00940000155292 ENSGT00940000156773.n ENSGT00940000160278 ENSGT00910000144252 ENSGT00940000160064.b ENSGT00940000154152.d.a.a.e #22 ENSGT00940000155192 ENSGT00530000064550.A ENSGT00940000153912.B ENSGT00940000160756.c.b ENSGT01030000234633.C.b ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00390000017443.m.a ENSGT00570000079168.b.b.b ENSGT00940000162273 ENSGT00950000183033.a.b.a ENSGT00730000111564 ENSGT00940000158189 ENSGT00390000015889.o.b.a.a ENSGT00940000162703 ENSGT00940000156633 Beluga whale MODERN SPECIES 13 ADH1C (ENSDLEG00000001132) ENSDLEG00000001104 METAP1 (ENSDLEG00000001082) ENSDLEG00000001061 TSPAN5 (ENSDLEG00000001033) RAP1GDS1 (ENSDLEG00000001000) STPG2 (ENSDLEG00000000965) ENSDLEG00000000945 ENSDLEG00000000932 UNC5C (ENSDLEG00000000896) BMPR1B (ENSDLEG00000000839) PDLIM5 (ENSDLEG00000000807) HPGDS (ENSDLEG00000000785) SMARCAD1 (ENSDLEG00000000742) ATOH1 (ENSDLEG00000000728) ENSDLEG00000000719 #22 GRID2 (ENSDLEG00000000678) ENSDLEG00000000650 CCSER1 (ENSDLEG00000000608) ENSDLEG00000000577 MMRN1 (ENSDLEG00000000553) SNCA (ENSDLEG00000000538) ENSDLEG00000000521 GPRIN3 (ENSDLEG00000000510) FAM13A (ENSDLEG00000000334) NAP1L5 (ENSDLEG00000000280) HERC3 (ENSDLEG00000000176) ENSDLEG00000004711 HERC5 (ENSDLEG00000004491) PPM1K (ENSDLEG00000004439) ABCG2 (ENSDLEG00000004291) Narwhal MODERN SPECIES 307 METAP1 (ENSMMNG00015011937) ENSMMNG00015011905 TSPAN5 (ENSMMNG00015011871) RAP1GDS1 (ENSMMNG00015011760) ENSMMNG00015011702 STPG2 (ENSMMNG00015011683) ENSMMNG00015011656 ENSMMNG00015011637 UNC5C (ENSMMNG00015011568) BMPR1B (ENSMMNG00015011501) PDLIM5 (ENSMMNG00015011438) ENSMMNG00015011412 HPGDS (ENSMMNG00015011400) SMARCAD1 (ENSMMNG00015011369) ATOH1 (ENSMMNG00015011356) ENSMMNG00015011351 #22 GRID2 (ENSMMNG00015011268) CCSER1 (ENSMMNG00015011215) ENSMMNG00015011167 MMRN1 (ENSMMNG00015011136) SNCA (ENSMMNG00015011091) ENSMMNG00015011065 GPRIN3 (ENSMMNG00015011061) TIGD2 (ENSMMNG00015011054) ENSMMNG00015011038 FAM13A (ENSMMNG00015010904) NAP1L5 (ENSMMNG00015010819) HERC3 (ENSMMNG00015010732) ENSMMNG00015010704 HERC5 (ENSMMNG00015010595) PPM1K (ENSMMNG00015010529) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.a.f #22 Beluga whale MODERN SPECIES 26 ATP5G1 (ENSDLEG00000004867) CALCOCO2 (ENSDLEG00000004861) #7 TTLL6 (ENSDLEG00000004850) #8 HOXB13 (ENSDLEG00000004844) #9 HOXB9 (ENSDLEG00000004838) #10 HOXB8 (ENSDLEG00000004837) #11 HOXB7 (ENSDLEG00000004834) #12 HOXB6 (ENSDLEG00000004829) #13 HOXB5 (ENSDLEG00000004826) #14 HOXB4 (ENSDLEG00000004820) #15 HOXB3 (ENSDLEG00000004817) #16 HOXB2 (ENSDLEG00000004813) #17 HOXB1 (ENSDLEG00000004807) #18 SKAP1 (ENSDLEG00000004779) #20 SNX11 (ENSDLEG00000004765) #21 CBX1 (ENSDLEG00000004754) #22 NFE2L1 (ENSDLEG00000004744) #23 ENSDLEG00000004734 COPZ2 (ENSDLEG00000004721) #24 CDK5RAP3 (ENSDLEG00000004709) #25 PRR15L (ENSDLEG00000004704) #26 PNPO (ENSDLEG00000004701) #27 SP2 (ENSDLEG00000004697) #28 SP6 (ENSDLEG00000004694) #29 SCRN2 (ENSDLEG00000004688) #30 ENSDLEG00000004684 MRPL10 (ENSDLEG00000004678) #32 OSBPL7 (ENSDLEG00000004366) #33 TBX21 (ENSDLEG00000004247) #34 TBKBP1 (ENSDLEG00000004240) #35 KPNB1 (ENSDLEG00000004223) #36 Vaquita MODERN SPECIES 15 KRTAP15-1 (ENSPSNG00000018174) ENSPSNG00000018158 ENSPSNG00000017997 ENSPSNG00000017975 ENSPSNG00000017921 CLDN8 (ENSPSNG00000017906) CLDN17 (ENSPSNG00000017893) GRIK1 (ENSPSNG00000016547) BACH1 (ENSPSNG00000016196) MAP3K7CL (ENSPSNG00000016152) CCT8 (ENSPSNG00000015918) USP16 (ENSPSNG00000015752) RWDD2B (ENSPSNG00000015651) LTN1 (ENSPSNG00000015262) N6AMT1 (ENSPSNG00000015154) ENSPSNG00000015081 #22 ADAMTS5 (ENSPSNG00000015026) ADAMTS1 (ENSPSNG00000014983) CYYR1 (ENSPSNG00000014901) APP (ENSPSNG00000014377) GABPA (ENSPSNG00000014275) ATP5PF (ENSPSNG00000014129) JAM2 (ENSPSNG00000014038) MRPL39 (ENSPSNG00000013924) ENSPSNG00000013821 ENSPSNG00000013776 ENSPSNG00000013753 NCAM2 (ENSPSNG00000013317) ENSPSNG00000013261 TMPRSS15 (ENSPSNG00000012969) CHODL (ENSPSNG00000012726) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Goat MODERN SPECIES 22 SPRR4 (ENSCHIG00000013052) ENSCHIG00000024891 ENSCHIG00000007657 ENSCHIG00000017937 KPRP (ENSCHIG00000023870) C1orf68 (ENSCHIG00000011620) LCE3B (ENSCHIG00000012019) CRNN (ENSCHIG00000025673) ENSCHIG00000020535 ENSCHIG00000026233 ENSCHIG00000018492 ENSCHIG00000005102 TCHHL1 (ENSCHIG00000010186) S100A11 (ENSCHIG00000009234) S100A10 (ENSCHIG00000017889) ENSCHIG00000024791 ##22 ENSCHIG00000023394 THEM4 (ENSCHIG00000015398) THEM5 (ENSCHIG00000021133) C2CD4D (ENSCHIG00000010717) RORC (ENSCHIG00000005408) LINGO4 (ENSCHIG00000010031) TDRKH (ENSCHIG00000025326) ENSCHIG00000018414 OAZ3 (ENSCHIG00000024499) MRPL9 (ENSCHIG00000011797) RIIAD1 (ENSCHIG00000025840) CELF3 (ENSCHIG00000025847) ENSCHIG00000012675 SNX27 (ENSCHIG00000021069) TUFT1 (ENSCHIG00000025397) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Vaquita MODERN SPECIES 6 ENSPSNG00000019191 GTF2I (ENSPSNG00000019075) NCF1 (ENSPSNG00000019008) ENSPSNG00000018942 RCC1L (ENSPSNG00000018853) CASTOR2 (ENSPSNG00000018797) ENSPSNG00000018777 ENSPSNG00000018766 ENSPSNG00000018750 ENSPSNG00000018713 AUTS2 (ENSPSNG00000017927) GALNT17 (ENSPSNG00000017697) CALN1 (ENSPSNG00000017600) ENSPSNG00000017350 SBDS (ENSPSNG00000017294) ENSPSNG00000017211 ##22 TMEM248 (ENSPSNG00000017186) RABGEF1 (ENSPSNG00000017123) ENSPSNG00000017096 KCTD7 (ENSPSNG00000017004) ENSPSNG00000016944 TPST1 (ENSPSNG00000016867) ASL (ENSPSNG00000016667) CRCP (ENSPSNG00000016442) GUSB (ENSPSNG00000016366) VKORC1L1 (ENSPSNG00000016290) NUPR2 (ENSPSNG00000016232) ENSPSNG00000016186 PHKG1 (ENSPSNG00000016006) ENSPSNG00000015508 PSPH (ENSPSNG00000015425) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155886 ENSGT00940000159562 ENSGT00530000063174.a.i ENSGT00940000156341 ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000159830 ENSGT00940000161181 ENSGT00940000157355 ENSGT00940000159407 ENSGT00940000164688 ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000164589 ENSGT00950000182963.b.a ENSGT00540000073670 ENSGT00940000158080 ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 ENSGT00940000154748.C ENSGT00940000155463 ENSGT00390000007662 ENSGT00530000064238 ENSGT00910000144179.b.a ENSGT00940000166998 ENSGT01100000263512.b.b.a ENSGT00970000193372.a.a ENSGT00950000183152.A ENSGT00940000156978 ENSGT00530000065045 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158077 ENSGT00940000161172 ENSGT00390000008044 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00530000063174.a.i ENSGT00910000148115 ENSGT00940000156341 ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000167769 ENSGT00940000159830 ENSGT00940000161181 ENSGT00940000157355 ENSGT00940000159407 ENSGT00940000164688 ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000164589 ENSGT00950000182963.b.a ENSGT00540000073670 ENSGT00940000158080 ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 ENSGT00940000154748.C ENSGT00910000147700 ENSGT00940000161236.a.b ENSGT00940000155463 ENSGT00390000007662 ENSGT00530000064238 ENSGT00910000144179.b.a ENSGT00940000166998 ENSGT01100000263512.b.b.a ENSGT00970000193372.a.a ENSGT00950000183152.A.q.a ENSGT00940000156978 ENSGT00530000065045 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158077 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183163.b ENSGT00940000155886 ENSGT00940000159562 ENSGT00530000063174.a.i ENSGT00940000156341 ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000167769 ENSGT00940000159830 ENSGT00940000161181 ENSGT00940000157355 ENSGT00940000159407 ENSGT00940000164688 ENSGT00940000164589 ENSGT00950000182963.b.a ENSGT00540000073670 ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 ENSGT00940000158080 ENSGT00940000154748.C ENSGT00940000155463 ENSGT00390000007662 ENSGT00530000064238 ENSGT00910000144179.b.a ENSGT00940000166998 ENSGT01100000263512.b.b.a ENSGT00970000193372.a.a.pb.a ENSGT00950000183152.A.q.a ENSGT00940000156978.m ENSGT00940000156978.n ENSGT00910000147321.a ENSGT00530000065045 ENSGT00910000147321.b Chimpanzee MODERN SPECIES 972 BCLAF3 (ENSPTRG00000021725) SH3KBP1 (ENSPTRG00000048773) MAP3K15 (ENSPTRG00000022605) PDHA1 (ENSPTRG00000021717) ADGRG2 (ENSPTRG00000021716) PHKA2 (ENSPTRG00000021715) ENSPTRG00000046843 PPEF1 (ENSPTRG00000021714) RS1 (ENSPTRG00000021713) CDKL5 (ENSPTRG00000021711) SCML2 (ENSPTRG00000021710) BEND2 (ENSPTRG00000021708) SCML1 (ENSPTRG00000021706) NHS (ENSPTRG00000021705) ENSPTRG00000047191 ENSPTRG00000052150 ##22 REPS2 (ENSPTRG00000021703) RBBP7 (ENSPTRG00000021702) TXLNG (ENSPTRG00000021701) SYAP1 (ENSPTRG00000021700) S100G (ENSPTRG00000021699) CTPS2 (ENSPTRG00000021698) MAGEB17 (ENSPTRG00000021697) GRPR (ENSPTRG00000021696) AP1S2 (ENSPTRG00000049388) ZRSR2 (ENSPTRG00000021693) CA5B (ENSPTRG00000043027) ENSPTRG00000052872 ENSPTRG00000043619 ENSPTRG00000048102 CLTRN (ENSPTRG00000047109) Bonobo MODERN SPECIES 369 BCLAF3 (ENSPPAG00000040123) SH3KBP1 (ENSPPAG00000037769) MAP3K15 (ENSPPAG00000039708) PDHA1 (ENSPPAG00000032993) ADGRG2 (ENSPPAG00000044060) PHKA2 (ENSPPAG00000036527) ENSPPAG00000027509 PPEF1 (ENSPPAG00000027881) RS1 (ENSPPAG00000040996) CDKL5 (ENSPPAG00000027668) SCML2 (ENSPPAG00000039952) BEND2 (ENSPPAG00000032642) SCML1 (ENSPPAG00000031177) NHS (ENSPPAG00000031794) ENSPPAG00000004504 ENSPPAG00000031475 ##22 REPS2 (ENSPPAG00000037795) RBBP7 (ENSPPAG00000036647) TXLNG (ENSPPAG00000034208) SYAP1 (ENSPPAG00000042206) S100G (ENSPPAG00000035686) CTPS2 (ENSPPAG00000031030) GRPR (ENSPPAG00000035890) AP1S2 (ENSPPAG00000042543) ZRSR2 (ENSPPAG00000022429) CA5B (ENSPPAG00000030955) ENSPPAG00000036333 ENSPPAG00000028785 ENSPPAG00000039307 ENSPPAG00000035025 CLTRN (ENSPPAG00000029681) Gibbon MODERN SPECIES 449 BCLAF3 (ENSNLEG00000009878) SH3KBP1 (ENSNLEG00000009860) MAP3K15 (ENSNLEG00000009849) PDHA1 (ENSNLEG00000009805) ADGRG2 (ENSNLEG00000009745) PHKA2 (ENSNLEG00000009732) ENSNLEG00000029919 PPEF1 (ENSNLEG00000009696) RS1 (ENSNLEG00000009691) CDKL5 (ENSNLEG00000009674) ENSNLEG00000027405 SCML2 (ENSNLEG00000009648) BEND2 (ENSNLEG00000009644) SCML1 (ENSNLEG00000009621) NHS (ENSNLEG00000009610) ENSNLEG00000029607 ##22 REPS2 (ENSNLEG00000009591) RBBP7 (ENSNLEG00000009557) ENSNLEG00000032743 TXLNG (ENSNLEG00000009549) SYAP1 (ENSNLEG00000009545) S100G (ENSNLEG00000009542) CTPS2 (ENSNLEG00000009514) GRPR (ENSNLEG00000009513) AP1S2 (ENSNLEG00000009511) ZRSR2 (ENSNLEG00000009496) CA5B (ENSNLEG00000009483) ENSNLEG00000034587 CLTRN (ENSNLEG00000009482) ACE2 (ENSNLEG00000009423) BMX (ENSNLEG00000009395) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000159562 ENSGT00530000063174.a.i ENSGT00910000148115 ENSGT00940000156341 ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000167769 ENSGT00940000159830 ENSGT00940000161181 ENSGT00940000157355 ENSGT00940000159407 ENSGT00940000164688 ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000164589 ENSGT00950000182963.b.a ENSGT00940000158080 ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 ENSGT00940000154748.C ENSGT00910000147700 ENSGT00940000155463 ENSGT00390000007662 ENSGT00530000064238 ENSGT00910000144179.b.a ENSGT00940000166998 ENSGT01100000263512.b.b.a ENSGT00970000193372.a.a ENSGT00950000183152.A.q.a ENSGT00940000156978 ENSGT00530000065045 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158077 ENSGT00940000161172 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159562 ENSGT00530000063174.a.i ENSGT00940000156341 ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000167769 ENSGT00940000159830 ENSGT00940000161181 ENSGT00940000157355 ENSGT00940000159407 ENSGT00940000164688 ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000164589 ENSGT00950000182963.b.a ENSGT00940000154185.l.a.a.b ENSGT00940000158080 ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 ENSGT00940000154748.C ENSGT00940000155463 ENSGT00390000007662 ENSGT00530000064238 ENSGT00910000144179.b.a ENSGT00940000166998 ENSGT01100000263512.b.b.a ENSGT00970000193372.a.a ENSGT00950000183152.A.q.a ENSGT00940000156978 ENSGT00530000065045 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158077 ENSGT00940000161172 ENSGT00390000008044 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000063174.a.i.e ENSGT00940000156341 ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000167769 ENSGT00940000159830 ENSGT00940000161181 ENSGT00940000157355 ENSGT00940000159407 ENSGT00940000164688 ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000164589 ENSGT00950000182963.b.a ENSGT01100000263509.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.b.b.a.a.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000154185.l.a.a.b ENSGT00940000158080 ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 ENSGT00940000154748.C.cb ENSGT00940000155463 ENSGT00390000007662 ENSGT00530000064238 ENSGT00910000144179.b.a ENSGT00940000166998 ENSGT01100000263512.b.b.a ENSGT00970000193372.a.a ENSGT00950000183152.A.q.a ENSGT00940000156978 ENSGT00530000065045 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158077 ENSGT00940000161172 ENSGT00390000008044 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00950000183163.b ENSGT00940000155886 ENSGT00940000159562.f ENSGT00530000063174.a.i.e ENSGT00940000156341 ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000167769 ENSGT00940000159830 ENSGT00940000161181 ENSGT00940000157355 ENSGT00940000159407 ENSGT00940000154164.d ENSGT00940000164589 ENSGT00950000182963.b.a ENSGT00940000158080 ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 ENSGT00940000154748.C.cb ENSGT00940000155463 ENSGT00390000007662 ENSGT00910000144179.b.a ENSGT00530000064238 ENSGT00940000166998 ENSGT01100000263512.b.b.a ENSGT00970000193372.a.a ENSGT00950000183152.A.q.a ENSGT00940000156978 ENSGT00530000065045 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158077 ENSGT00940000161172 ENSGT00390000008044 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00950000182941.b.b ENSGT00950000183163.b ENSGT00940000155886 ENSGT00940000159562.f ENSGT00530000063174.a.i.e ENSGT00940000156341 ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000167769 ENSGT00940000159830 ENSGT00940000161181 ENSGT00940000157355 ENSGT00940000159407 ENSGT00940000164589 ENSGT00950000182963.b.a ENSGT00940000158080 ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 ENSGT00940000154748.C.cb ENSGT00940000155463 ENSGT00390000007662 ENSGT00910000144179.b.a ENSGT00530000064238 ENSGT01100000263512.b.b.a ENSGT00970000193372.a.a ENSGT00950000183152.A.q.a ENSGT00940000156978 ENSGT00530000065045 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158077 ENSGT00940000161172 ENSGT00390000008044 ENSGT00940000159726 Drill MODERN SPECIES 1179 SCML1 (ENSMLEG00000036563) NHS (ENSMLEG00000028637) REPS2 (ENSMLEG00000030048) ENSMLEG00000028521 ##22 RBBP7 (ENSMLEG00000032262) TXLNG (ENSMLEG00000041875) SYAP1 (ENSMLEG00000033274) CTPS2 (ENSMLEG00000037437) S100G (ENSMLEG00000033043) GRPR (ENSMLEG00000034488) AP1S2 (ENSMLEG00000009838) ZRSR2 (ENSMLEG00000028125) CA5B (ENSMLEG00000044443) ENSMLEG00000007060 CLTRN (ENSMLEG00000027121) ACE2 (ENSMLEG00000040068) BMX (ENSMLEG00000040489) PIR (ENSMLEG00000039142) VEGFD (ENSMLEG00000043567) Sooty mangabey MODERN SPECIES 448 BCLAF3 (ENSCATG00000039065) SH3KBP1 (ENSCATG00000034119) MAP3K15 (ENSCATG00000024304) PDHA1 (ENSCATG00000044567) ADGRG2 (ENSCATG00000035439) PHKA2 (ENSCATG00000044694) ENSCATG00000037972 PPEF1 (ENSCATG00000043035) RS1 (ENSCATG00000029796) CDKL5 (ENSCATG00000041616) SCML2 (ENSCATG00000038994) BEND2 (ENSCATG00000036336) SCML1 (ENSCATG00000006222) NHS (ENSCATG00000033217) REPS2 (ENSCATG00000041359) ENSCATG00000037187 ##22 RBBP7 (ENSCATG00000042741) TXLNG (ENSCATG00000032410) SYAP1 (ENSCATG00000044882) CTPS2 (ENSCATG00000030123) S100G (ENSCATG00000035072) ENSCATG00000015601 GRPR (ENSCATG00000035466) AP1S2 (ENSCATG00000039294) ZRSR2 (ENSCATG00000034085) CA5B (ENSCATG00000032924) CLTRN (ENSCATG00000032908) ACE2 (ENSCATG00000013606) BMX (ENSCATG00000044540) PIR (ENSCATG00000017482) VEGFD (ENSCATG00000034073) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 216 ENSRBIG00000028218 ##22 ENSRBIG00000017236 REPS2 (ENSRBIG00000028939) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2718 ENSRROG00000023316 ##22 Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b.a ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 481 PRAC2 (ENSANAG00000025557) HOXB13 (ENSANAG00000023991) #9 ENSANAG00000030331 HOXB9 (ENSANAG00000035156) #10 HOXB8 (ENSANAG00000028346) #11 HOXB7 (ENSANAG00000025513) #12 HOXB6 (ENSANAG00000023964) #13 HOXB5 (ENSANAG00000024299) #14 HOXB4 (ENSANAG00000024005) #15 HOXB3 (ENSANAG00000032072) #16 HOXB2 (ENSANAG00000023626) #17 HOXB1 (ENSANAG00000032306) #18 ENSANAG00000023400 SKAP1 (ENSANAG00000026853) #20 SNX11 (ENSANAG00000022588) #21 ENSANAG00000036853 ##22 NFE2L1 (ENSANAG00000027606) #23 COPZ2 (ENSANAG00000023309) #24 CDK5RAP3 (ENSANAG00000021880) #25 PNPO (ENSANAG00000026080) #27 SP2 (ENSANAG00000032738) #28 SP6 (ENSANAG00000019338) #29 SCRN2 (ENSANAG00000021482) #30 LRRC46 (ENSANAG00000028496) #31 MRPL10 (ENSANAG00000022792) #32 OSBPL7 (ENSANAG00000021406) #33 TBX21 (ENSANAG00000037999) #34 TBKBP1 (ENSANAG00000020710) #35 ENSANAG00000024932 #36 ENSANAG00000019395 NPEPPS (ENSANAG00000028371) #37 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00950000182941.b.b ENSGT00950000183163.b ENSGT00940000155886.g ENSGT00940000159562 ENSGT00530000063174.a.i.a ENSGT00940000156341 ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000159830 ENSGT00940000161181 ENSGT00940000157355 ENSGT00940000159407 ENSGT00940000164688 ENSGT00940000164589 ENSGT00950000182963.b.a ENSGT00940000158080 ENSGT00940000154152.d.a.b.b ##22 ENSGT00940000154748.C ENSGT00940000155463 ENSGT00390000007662 ENSGT00530000064238 ENSGT00910000144179.b.a ENSGT00940000166998 ENSGT01100000263512.b.b.a ENSGT00970000193372.a.a.nb ENSGT00950000183152.A ENSGT00940000156978.k ENSGT00530000065045 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158077 ENSGT00940000161172 ENSGT00390000008044 Mas night monkey MODERN SPECIES 814 ENSANAG00000034832 ENSANAG00000030233 MAP3K15 (ENSANAG00000034023) PDHA1 (ENSANAG00000030855) ADGRG2 (ENSANAG00000034597) PHKA2 (ENSANAG00000038435) PPEF1 (ENSANAG00000023404) RS1 (ENSANAG00000029033) CDKL5 (ENSANAG00000034696) SCML2 (ENSANAG00000020966) ENSANAG00000037962 ENSANAG00000019386 SCML1 (ENSANAG00000021893) NHS (ENSANAG00000033727) REPS2 (ENSANAG00000031037) ENSANAG00000022723 ##22 ENSANAG00000020664 ENSANAG00000020204 RBBP7 (ENSANAG00000037598) TXLNG (ENSANAG00000021604) SYAP1 (ENSANAG00000036135) CTPS2 (ENSANAG00000037349) S100G (ENSANAG00000021290) ENSANAG00000020103 GRPR (ENSANAG00000021906) AP1S2 (ENSANAG00000026032) ZRSR2 (ENSANAG00000019297) ENSANAG00000035485 ENSANAG00000035146 CLTRN (ENSANAG00000035573) ACE2 (ENSANAG00000029368) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182941.b.b ENSGT00950000183163.b ENSGT00940000155886.g ENSGT00940000159562 ENSGT00530000063174.a.i.a ENSGT00940000156341 ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000159830 ENSGT00940000161181 ENSGT00940000157355 ENSGT00940000159407 ENSGT00940000164688 ENSGT00940000164589 ENSGT00950000182963.b.a ENSGT00940000158080 ENSGT00940000154152.d.a.b.b ##22 ENSGT00940000154748.C ENSGT00940000155463 ENSGT00390000007662 ENSGT00530000064238 ENSGT00910000144179.b.a ENSGT00940000166998 ENSGT01100000263512.b.b.a ENSGT00970000193372.a.a.nb ENSGT00950000183152.A ENSGT00940000156978.k ENSGT00530000065045 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158077 ENSGT00940000161172 ENSGT00390000008044 Marmoset MODERN SPECIES 20 AGAP3 (ENSCJAG00000020349) GBX1 (ENSCJAG00000076844) ASB10 (ENSCJAG00000020364) IQCA1L (ENSCJAG00000020368) H2BK1 (ENSCJAG00000066678) ABCF2 (ENSCJAG00000020371) CHPF2 (ENSCJAG00000020380) SMARCD3 (ENSCJAG00000020387) NUB1 (ENSCJAG00000020400) WDR86 (ENSCJAG00000020408) ENSCJAG00000083257 RHEB (ENSCJAG00000042669) PRKAG2 (ENSCJAG00000020422) GALNTL5 (ENSCJAG00000019740) GALNT11 (ENSCJAG00000019732) ENSCJAG00000044829 ##22 KMT2C (ENSCJAG00000019672) XRCC2 (ENSCJAG00000032080) ENSCJAG00000085430 ENSCJAG00000071228 ACTR3B (ENSCJAG00000019650) ENSCJAG00000082850 DPP6 (ENSCJAG00000000167) PAXIP1 (ENSCJAG00000000161) HTR5A (ENSCJAG00000083175) ENSCJAG00000073273 INSIG1 (ENSCJAG00000018517) EN2 (ENSCJAG00000080094) ENSCJAG00000045734 ENSCJAG00000053198 RBM33 (ENSCJAG00000020427) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00950000183163.b ENSGT00940000155886.g ENSGT00940000159562 ENSGT00530000063174.a.i.a ENSGT00940000156341 ENSGT00950000183118.A.c.a ENSGT00940000159830 ENSGT00940000161181 ENSGT00940000157355 ENSGT00940000159407 ENSGT00940000164688 ENSGT00940000154174.s.a.b ENSGT00940000164589 ENSGT00950000182963.b.a ENSGT00940000158080 ENSGT00940000154152.d.a.b.b ##22 ENSGT00940000154748.C.eb.a ENSGT00940000155463 ENSGT00390000007662 ENSGT00530000064238 ENSGT00910000144179.b.a ENSGT01100000263512.b.b.a ENSGT00970000193372.a.a.nb ENSGT00950000183152.A ENSGT00940000156978.k ENSGT00530000065045 ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158077 ENSGT00940000161172 ENSGT00390000008044 ENSGT00940000159726 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 51 ENSSBOG00000036210 ENSSBOG00000026951 MAP3K15 (ENSSBOG00000023444) PDHA1 (ENSSBOG00000021023) ADGRG2 (ENSSBOG00000036029) PHKA2 (ENSSBOG00000028848) PPEF1 (ENSSBOG00000025564) RS1 (ENSSBOG00000022074) CDKL5 (ENSSBOG00000034927) SCML2 (ENSSBOG00000023475) BEND2 (ENSSBOG00000034571) ENSSBOG00000032775 SCML1 (ENSSBOG00000025279) NHS (ENSSBOG00000032082) REPS2 (ENSSBOG00000018047) ENSSBOG00000030543 ##22 RBBP7 (ENSSBOG00000033728) ENSSBOG00000036156 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Rabbit MODERN SPECIES 1401 ENSOCUG00000006592 ENSOCUG00000003815 ENSOCUG00000021737 ENSOCUG00000024600 ENSOCUG00000033283 PDK3 (ENSOCUG00000007418) PCYT1B (ENSOCUG00000007424) ENSOCUG00000021995 POLA1 (ENSOCUG00000015209) ARX (ENSOCUG00000022180) ENSOCUG00000006236 ENSOCUG00000036870 ENSOCUG00000025944 ENSOCUG00000027612 ENSOCUG00000029666 ENSOCUG00000023111 ##22 ENSOCUG00000026167 ENSOCUG00000035781 PPP4R3C (ENSOCUG00000006805) ENSOCUG00000023630 ENSOCUG00000027776 MAGEB10 (ENSOCUG00000004193) ENSOCUG00000029452 ENSOCUG00000016444 ENSOCUG00000012965 IL1RAPL1 (ENSOCUG00000016512) ENSOCUG00000025464 ENSOCUG00000034438 ENSOCUG00000005944 MAGEB3 (ENSOCUG00000034396) ENSOCUG00000022750 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154152.d.a.b ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 135 ENSJJAG00000016944 ENSJJAG00000016315 ENSJJAG00000000889 ENSJJAG00000000451 Pabpc5 (ENSJJAG00000011960) ENSJJAG00000000309 Pcdh11x (ENSJJAG00000018102) ENSJJAG00000011816 Nap1l3 (ENSJJAG00000016020) ENSJJAG00000015860 ENSJJAG00000015282 ENSJJAG00000013712 ENSJJAG00000013070 ENSJJAG00000011791 ENSJJAG00000011556 ##22 ENSJJAG00000011300 ENSJJAG00000011033 Diaph2 (ENSJJAG00000008368)