Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000159667	ENSGT00940000155614	ENSGT00390000010825.a	ENSGT00940000155170	ENSGT00940000156319 #7	ENSGT00940000157847 #8	ENSGT00530000063168.a.a.b #9	ENSGT00940000160145.b #11	ENSGT00390000012692 #12	ENSGT00940000159438 #13	ENSGT00940000155877 #14	ENSGT00940000162980 #18	ENSGT00940000161795 #19	ENSGT00940000162763 #20	ENSGT00950000182835.c.c #21	ENSGT00530000063540.a #22	ENSGT00940000159912 #23	ENSGT00390000001055 #24	ENSGT00510000049526	ENSGT00840000130063.e ##31	ENSGT00940000163664 #30	ENSGT00840000130063.f #31	ENSGT00940000162993 #32	ENSGT00950000183031.B.e.a #33	ENSGT00940000161062 #35	ENSGT00940000162603 #36	ENSGT00940000163673	ENSGT00390000004891	ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000163246	ENSGT00940000162502
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	156	HUWE1 (ENSSVLG00005013657) #7	PHF8 (ENSSVLG00005013001) #8	FAM120C (ENSSVLG00005012884) #9	ENSSVLG00005012811 #10	WNK3 (ENSSVLG00005012128) #11	ENSSVLG00005012050 #12	FGD1 (ENSSVLG00005011952) #13	GNL3L (ENSSVLG00005011899) #14	ENSSVLG00005011877 #15	ENSSVLG00005011838 #16	ENSSVLG00005011811 #17	ITIH6 (ENSSVLG00005011628) #18	ENSSVLG00005011487 #19	ENSSVLG00005011142 #20	PFKFB1 (ENSSVLG00005010833) #21	APEX2 (ENSSVLG00005010743) #22	ALAS2 (ENSSVLG00005010575) #23	ENSSVLG00005010526 #24	ENSSVLG00005010499 #25	ENSSVLG00005010473 #26	ENSSVLG00005010447 #27	ENSSVLG00005010343 #28	ENSSVLG00005022919 #29	USP51 (ENSSVLG00005022912) #30	ENSSVLG00005022899 #31	FOXR2 (ENSSVLG00005022885) #32	RRAGB (ENSSVLG00005022820) #33	ENSSVLG00005022786 #34	KLF8 (ENSSVLG00005022667) #35	UBQLN2 (ENSSVLG00005022640) #36	ENSSVLG00005022614 #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	105	ENSGT00940000159667	ENSGT00940000155614	ENSGT00390000010825.a	ENSGT00940000155170	ENSGT00940000156319 #7	ENSGT00940000157847 #8	ENSGT00530000063168.a.a.b #9	ENSGT00940000160145.b #11	ENSGT00390000012692 #12	ENSGT00940000159438 #13	ENSGT00940000155877 #14	ENSGT00940000162980 #18	ENSGT00940000161795 #19	ENSGT00940000162763 #20	ENSGT00950000182835.c.c #21	ENSGT00530000063540.a #22	ENSGT00940000159912 #23
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	194	ENSGT00940000159667	ENSGT00940000155614	ENSGT00390000010825.a	ENSGT00940000155170	ENSGT00940000156319 #7	ENSGT00940000157847 #8	ENSGT00530000063168.a.a.b #9	ENSGT00940000160145.b #11	ENSGT00390000012692 #12	ENSGT00940000159438 #13	ENSGT00940000155877 #14	ENSGT00940000162980 #18	ENSGT00940000161795 #19	ENSGT00940000162763 #20	ENSGT00950000182835.c.c #21	ENSGT00530000063540.a #22	ENSGT00940000159912 #23
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	360	IQSEC2 (ENSUPAG00010000324)	SMC1A (ENSUPAG00010000638)	RIBC1 (ENSUPAG00010000700)	HSD17B10 (ENSUPAG00010000717)	HUWE1 (ENSUPAG00010000765) #7	PHF8 (ENSUPAG00010001412) #8	FAM120C (ENSUPAG00010001651) #9	WNK3 (ENSUPAG00010001662) #11	TSR2 (ENSUPAG00010001725) #12	FGD1 (ENSUPAG00010001738) #13	GNL3L (ENSUPAG00010001765) #14	ITIH6 (ENSUPAG00010001804) #18	MAGED2 (ENSUPAG00010001842) #19	TRO (ENSUPAG00010001905) #20	PFKFB1 (ENSUPAG00010001964) #21	APEX2 (ENSUPAG00010002030) #22	ALAS2 (ENSUPAG00010002077) #23	FAM104B (ENSUPAG00010002111) #24	ENSUPAG00010002151
Squirrel	MODERN SPECIES	351	IQSEC2 (ENSSTOG00000001231)	SMC1A (ENSSTOG00000005481)	RIBC1 (ENSSTOG00000005524)	HSD17B10 (ENSSTOG00000005535)	HUWE1 (ENSSTOG00000005546) #7	PHF8 (ENSSTOG00000000290) #8	FAM120C (ENSSTOG00000000293) #9	WNK3 (ENSSTOG00000000299) #11	TSR2 (ENSSTOG00000033612) #12	FGD1 (ENSSTOG00000027673) #13	GNL3L (ENSSTOG00000023157) #14	ITIH6 (ENSSTOG00000026991) #18	MAGED2 (ENSSTOG00000006621) #19	ENSSTOG00000020140 #20	PFKFB1 (ENSSTOG00000016108) #21	APEX2 (ENSSTOG00000025121) #22	ALAS2 (ENSSTOG00000008000) #23	ENSSTOG00000019959
Alpin marmot	MODERN SPECIES	121	IQSEC2 (ENSMMMG00000012831)	SMC1A (ENSMMMG00000012856)	RIBC1 (ENSMMMG00000012889)	HSD17B10 (ENSMMMG00000012895)	HUWE1 (ENSMMMG00000012907) #7	PHF8 (ENSMMMG00000013095) #8	FAM120C (ENSMMMG00000013313) #9	WNK3 (ENSMMMG00000013351) #11	TSR2 (ENSMMMG00000013450) #12	FGD1 (ENSMMMG00000013467) #13	GNL3L (ENSMMMG00000013506) #14	ITIH6 (ENSMMMG00000013549) #18	MAGED2 (ENSMMMG00000013585) #19	ENSMMMG00000013632 #20	PFKFB1 (ENSMMMG00000013675) #21	APEX2 (ENSMMMG00000013719) #22	ALAS2 (ENSMMMG00000013791) #23