Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00390000003348 ENSGT00940000162980 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00390000012715 ENSGT00390000003937 ENSGT00940000161880 ENSGT00940000155445 ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000164248 ENSGT00950000182846.a.b ENSGT00940000161969 ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00390000013740 ENSGT00550000074803 ENSGT00390000016224 Amniota ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00390000003348 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000164454 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000164248 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445 ENSGT00940000161880 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869 ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a Mammalia ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000159667 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000164454 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000164248 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445 ENSGT00940000161880 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869 ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a Theria ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000164196 ENSGT00940000159667 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00840000130063 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ##28 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000153097.B.a.b ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ##28 ENSGT00940000165111 ENSGT00940000166157 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000153097.B.a.b ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 ENSGT00940000154103.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000153902.b Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.b #28 ENSGT00940000162502 ENSGT00940000163246 ENSGT00940000162988 #29 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 Glires ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.b #28 ENSGT00940000162502 ENSGT00940000163246 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 ENSGT00940000154103.b Rodentia ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ##28 ENSGT00940000165111 ENSGT00940000166157 ENSGT00940000162988 #29 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 ENSGT00940000154103.b Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ##28 ENSGT00940000162988 #29 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 ENSGT00940000154103.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000153902.b Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 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ENSGT00940000162502 ENSGT00940000162988 #29 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000153902.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000153664.A.b.a ENSGT00390000018389 ENSGT00940000159316 Guinea pig MODERN SPECIES 170 ENSCPOG00000001051 #19 ENSCPOG00000022846 #20 PFKFB1 (ENSCPOG00000007261) #21 APEX2 (ENSCPOG00000007265) #22 ALAS2 (ENSCPOG00000007268) #23 RRAGB (ENSCPOG00000011266) #24 KLF8 (ENSCPOG00000010165) #25 UBQLN2 (ENSCPOG00000013496) #26 NBDY (ENSCPOG00000038469) #27 ENSCPOG00000037454 #28 ENSCPOG00000005007 #29 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00540000070023.c.a.a ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 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SPIN4 (ENSCLAG00000017570) ##28 ARHGEF9 (ENSCLAG00000004407) ASB12 (ENSCLAG00000006178) AMER1 (ENSCLAG00000017657) ENSCLAG00000007927 ZC4H2 (ENSCLAG00000002934) ZC3H12B (ENSCLAG00000003600) Degu MODERN SPECIES 398 ENSODEG00000000070 #20 ENSODEG00000003143 PFKFB1 (ENSODEG00000003122) #21 ENSODEG00000003095 #22 ENSODEG00000018880 ALAS2 (ENSODEG00000003044) #23 ENSODEG00000003024 ENSODEG00000003009 RRAGB (ENSODEG00000002951) #24 ENSODEG00000002914 #25 ENSODEG00000002898 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 31 ENSHGLG00000003448 ENSHGLG00000020403 ENSHGLG00000001475 ENSHGLG00000001525 ENSHGLG00000001827 ENSHGLG00000002712 ENSHGLG00000050769 ENSHGLG00000016776 ENSHGLG00000035449 FGD1 (ENSHGLG00000002606) GNL3L (ENSHGLG00000001778) ENSHGLG00000035750 ENSHGLG00000000204 #19 Tro (ENSHGLG00000000236) #20 Pfkfb1 (ENSHGLG00000000258) #21 APEX2 (ENSHGLG00000042453) #22 ENSHGLG00000000297 ALAS2 (ENSHGLG00000000286) #23 RRAGB (ENSHGLG00000000313) #24 ENSHGLG00000040831 ENSHGLG00000000922 #25 ENSHGLG00000037038 UBQLN2 (ENSHGLG00000020145) #26 ENSHGLG00000000962 NBDY (ENSHGLG00000049275) #27 ENSHGLG00000050802 #28 ENSHGLG00000000991 #28 ENSHGLG00000001021 ENSHGLG00000045579 SPIN4 (ENSHGLG00000034676) ##28 ARHGEF9 (ENSHGLG00000002050) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049526 ENSGT00840000130063.e ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063.f ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ##28 ENSGT00940000163246 ENSGT00940000162502 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 194 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 360 IQSEC2 (ENSUPAG00010000324) SMC1A (ENSUPAG00010000638) RIBC1 (ENSUPAG00010000700) HSD17B10 (ENSUPAG00010000717) HUWE1 (ENSUPAG00010000765) PHF8 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MODERN SPECIES 37 Iqsec2 (ENSMUSG00000041115) Smc1a (ENSMUSG00000041133) Ribc1 (ENSMUSG00000025257) Hsd17b10 (ENSMUSG00000025260) Huwe1 (ENSMUSG00000025261) Phf8 (ENSMUSG00000041229) Fam120c (ENSMUSG00000025262) Wnk3 (ENSMUSG00000041245) Tsr2 (ENSMUSG00000025264) Fgd1 (ENSMUSG00000025265) Gnl3l (ENSMUSG00000025266) Maged2 (ENSMUSG00000025268) #19 Tro (ENSMUSG00000025272) #20 Pfkfb1 (ENSMUSG00000025271) #21 Alas2 (ENSMUSG00000025270) #23 Apex2 (ENSMUSG00000025269) #22 Tmem29 (ENSMUSG00000041353) Gm15091 (ENSMUSG00000095082) Gm15097 (ENSMUSG00000094378) Gm10439 (ENSMUSG00000072923) Gm15085 (ENSMUSG00000095621) Gm15093 (ENSMUSG00000094941) Ott (ENSMUSG00000094885) Luzp4 (ENSMUSG00000079387) Gm15127 (ENSMUSG00000096834) Gm15114 (ENSMUSG00000079395) Gm15107 (ENSMUSG00000072930) Gm15080 (ENSMUSG00000072931) Gm15128 (ENSMUSG00000095872) Lrch2 (ENSMUSG00000031290) Vmn1r239-ps (ENSMUSG00000067262) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847.h ENSGT00530000063168.a.a.b.g ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00510000049526 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000159971 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159055 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000163925 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00510000047493.e ENSGT00940000161570 ENSGT00940000156128.b ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000160983 ENSGT00730000110943.A.d spretus MODERN SPECIES 19 Iqsec2 (MGP_SPRETEiJ_G0034669) Smc1a (MGP_SPRETEiJ_G0034668) Ribc1 (MGP_SPRETEiJ_G0034667) Hsd17b10 (MGP_SPRETEiJ_G0034666) Huwe1 (MGP_SPRETEiJ_G0034665) Phf8 (MGP_SPRETEiJ_G0034664) Fam120c (MGP_SPRETEiJ_G0034663) Wnk3 (MGP_SPRETEiJ_G0034662) Tsr2 (MGP_SPRETEiJ_G0034661) Fgd1 (MGP_SPRETEiJ_G0034660) Gnl3l (MGP_SPRETEiJ_G0034659) Maged2 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(MGP_PahariEiJ_G0032027) #19 MGP_PahariEiJ_G0032026 #20 Pfkfb1 (MGP_PahariEiJ_G0032025) #21 Alas2 (MGP_PahariEiJ_G0032024) #23 Apex2 (MGP_PahariEiJ_G0032023) #22 Tmem29 (MGP_PahariEiJ_G0032022) Lrch2 (MGP_PahariEiJ_G0032021) Il13ra2 (MGP_PahariEiJ_G0032020) Htr2c (MGP_PahariEiJ_G0032019) Amot (MGP_PahariEiJ_G0032018) Lhfpl1 (MGP_PahariEiJ_G0032017) Rtl4 (MGP_PahariEiJ_G0032016) Trpc5 (MGP_PahariEiJ_G0032015) MGP_PahariEiJ_G0032014 MGP_PahariEiJ_G0032013 Dcx (MGP_PahariEiJ_G0032012) Capn6 (MGP_PahariEiJ_G0032011) Pak3 (MGP_PahariEiJ_G0032010) Chrdl1 (MGP_PahariEiJ_G0032009) Rtl9 (MGP_PahariEiJ_G0032008) Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 5 Hs3st1 (ENSRNOG00000068537) AABR07015759.1 (ENSRNOG00000033640) Rab28 (ENSRNOG00000017074) Nkx3-2 (ENSRNOG00000060782) Bod1l1 (ENSRNOG00000050437) RGD1561694 (ENSRNOG00000029107) Rps11-ps1 (ENSRNOG00000064268) Rab5al1 (ENSRNOG00000062595) Cpeb2 (ENSRNOG00000005043) Isca2-ps1 (ENSRNOG00000005077) C1qtnf7 (ENSRNOG00000005094) Cc2d2a (ENSRNOG00000059715) 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#22 Alas2 (ENSRNOG00000000167) #23 Fam104b (ENSRNOG00000049908) ENSRNOG00000070642 Rpgr-ps1 (ENSRNOG00000062329) LOC102546830 (ENSRNOG00000059783) Usp51 (ENSRNOG00000021434) Mageh1 (ENSRNOG00000003178) Foxr2 (ENSRNOG00000030619) RragB (ENSRNOG00000062421) #24 Rpl35-ps8 (ENSRNOG00000003158) Klf8 (ENSRNOG00000065004) #25 Ubqln2 (ENSRNOG00000003099) #26 LOC681355 (ENSRNOG00000069375) LOC102551133 (ENSRNOG00000063966) Spin2a (ENSRNOG00000031286) ##28 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1044 Tsr2 (ENSNGAG00000021351) Fgd1 (ENSNGAG00000000668) Gnl3l (ENSNGAG00000005965) Maged2 (ENSNGAG00000010942) #19 ENSNGAG00000011855 #20 Pfkfb1 (ENSNGAG00000012590) #21 Apex2 (ENSNGAG00000013576) #22 Alas2 (ENSNGAG00000014787) #23 ENSNGAG00000015072 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 182 Smc1a (ENSJJAG00000012909) Ribc1 (ENSJJAG00000013117) ENSJJAG00000014089 Huwe1 (ENSJJAG00000016223) Phf8 (ENSJJAG00000006057) Fam120c (ENSJJAG00000022074) Wnk3 (ENSJJAG00000003498) Tsr2 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ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.b #28 ENSGT00940000162502 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 ENSGT00940000154103.b ENSGT00530000063529.B Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00390000001055 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.b #28 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00390000001055 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.b #28 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 213 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00390000001055 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1532 TRO (ENSPSMG00000009582) #20 PFKFB1 (ENSPSMG00000009673) #21 ENSPSMG00000009686 APEX2 (ENSPSMG00000009696) #22 ALAS2 (ENSPSMG00000009728) #23 FAM104B (ENSPSMG00000009736) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 868 ENSPCOG00000024532 TSR2 (ENSPCOG00000002354) FGD1 (ENSPCOG00000017816) GNL3L (ENSPCOG00000016430) ENSPCOG00000019698 ITIH6 (ENSPCOG00000021013) MAGED2 (ENSPCOG00000012185) #19 TRO (ENSPCOG00000022855) #20 PFKFB1 (ENSPCOG00000019906) #21 APEX2 (ENSPCOG00000016083) #22 ALAS2 (ENSPCOG00000003133) #23 FAM104B (ENSPCOG00000013525) Mouse lemur MODERN SPECIES 169 WNK3 (ENSMICG00000011844) ENSMICG00000033159 ENSMICG00000027258 TSR2 (ENSMICG00000010116) FGD1 (ENSMICG00000010121) GNL3L (ENSMICG00000010144) ENSMICG00000042417 ENSMICG00000033971 ENSMICG00000030111 ENSMICG00000035154 ENSMICG00000044749 ENSMICG00000042881 MAGED2 (ENSMICG00000035446) #19 ENSMICG00000032024 #20 PFKFB1 (ENSMICG00000003427) #21 APEX2 (ENSMICG00000043181) #22 ALAS2 (ENSMICG00000003435) #23 FAM104B (ENSMICG00000043344) ENSMICG00000043531 MAGEH1 (ENSMICG00000017394) RRAGB (ENSMICG00000035059) #24 ENSMICG00000036762 ENSMICG00000026546 Bushbaby MODERN SPECIES 121 BNC2 (ENSOGAG00000001628) CCDC171 (ENSOGAG00000002180) PSIP1 (ENSOGAG00000002179) SNAPC3 (ENSOGAG00000002175) ENSOGAG00000028248 TTC39B (ENSOGAG00000011887) FREM1 (ENSOGAG00000011871) CER1 (ENSOGAG00000011870) ZDHHC21 (ENSOGAG00000011869) NFIB (ENSOGAG00000016282) MPDZ (ENSOGAG00000006106) LURAP1L (ENSOGAG00000030142) TYRP1 (ENSOGAG00000013041) PTPRD (ENSOGAG00000007930) KDM4C (ENSOGAG00000009288) APEX2 (ENSOGAG00000007797) #22 GLDC (ENSOGAG00000026078) UHRF2 (ENSOGAG00000010598) TPD52L3 (ENSOGAG00000011718) ENSOGAG00000004525 RANBP6 (ENSOGAG00000010992) ENSOGAG00000032415 ENSOGAG00000030737 MLANA (ENSOGAG00000010986) ERMP1 (ENSOGAG00000012020) RIC1 (ENSOGAG00000012009) PDCD1LG2 (ENSOGAG00000003284) CD274 (ENSOGAG00000003282) PLGRKT (ENSOGAG00000003280) ENSOGAG00000009500 JAK2 (ENSOGAG00000012246) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.b #28 ENSGT00940000162502 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 ENSGT00940000154103.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000153902.b Tarsier MODERN SPECIES 3276 TRO (ENSTSYG00000001951) #20 PFKFB1 (ENSTSYG00000005596) #21 APEX2 (ENSTSYG00000005612) #22 ALAS2 (ENSTSYG00000005631) #23 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877.i.a ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000153097.B.a.b ENSGT00940000153097.B.a.a ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.b #28 ENSGT00940000162502 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 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ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00390000012916.h.a.a Gorilla MODERN SPECIES 523 ENSGGOG00000036329 ENSGGOG00000036941 HUWE1 (ENSGGOG00000014342) ENSGGOG00000039310 ENSGGOG00000040785 PHF8 (ENSGGOG00000014703) FAM120C (ENSGGOG00000001504) WNK3 (ENSGGOG00000011572) TSR2 (ENSGGOG00000041368) FGD1 (ENSGGOG00000007985) GNL3L (ENSGGOG00000007550) ENSGGOG00000011042 MAGED2 (ENSGGOG00000002286) #19 TRO (ENSGGOG00000002043) #20 PFKFB1 (ENSGGOG00000002046) #21 APEX2 (ENSGGOG00000002056) #22 ALAS2 (ENSGGOG00000002057) #23 ENSGGOG00000011026 ENSGGOG00000003715 PAGE3 (ENSGGOG00000028520) MAGEH1 (ENSGGOG00000036928) ENSGGOG00000043838 ENSGGOG00000038688 FOXR2 (ENSGGOG00000008237) RRAGB (ENSGGOG00000011501) #24 ENSGGOG00000037846 KLF8 (ENSGGOG00000008188) #25 UBQLN2 (ENSGGOG00000016984) #26 NBDY (ENSGGOG00000043011) #27 ENSGGOG00000011533 ENSGGOG00000011187 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00390000005764.h ENSGT00940000156319 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ENSGT00390000018904.ib ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00390000012916.h.a.a ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00390000005764.h ENSGT00940000156319 ENSGT00390000014996.z ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692.f ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877.i.a ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000153097.B.a.b.f.a.a ENSGT00390000001055 ENSGT00940000153097.B.a.b.e ENSGT00940000153097.B.a.a ENSGT00940000153097.B.a.b.f.a.b ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00390000018904.ib ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00390000012916.h.a.a Macaca ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00390000005764.h ENSGT00940000156319 ENSGT00390000014996.z ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692.f ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877.i.a ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000153097.B.a.b.f.a.a ENSGT00390000001055 ENSGT00940000153097.B.a.b.e ENSGT00940000153097.B.a.a ENSGT00940000153097.B.a.b.f.a.b ENSGT00840000130063 ENSGT00390000018904.ib ENSGT00940000163664 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00390000012916.h.a.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 205 RIBC1 (ENSMNEG00000000866) HSD17B10 (ENSMNEG00000033240) ENSMNEG00000030731 HUWE1 (ENSMNEG00000028305) ENSMNEG00000043124 PHF8 (ENSMNEG00000031521) FAM120C (ENSMNEG00000043194) WNK3 (ENSMNEG00000000787) TSR2 (ENSMNEG00000041996) FGD1 (ENSMNEG00000044881) GNL3L (ENSMNEG00000034813) ITIH6 (ENSMNEG00000042036) MAGED2 (ENSMNEG00000044797) #19 TRO (ENSMNEG00000037926) #20 PFKFB1 (ENSMNEG00000039571) #21 APEX2 (ENSMNEG00000036783) #22 ALAS2 (ENSMNEG00000035005) #23 ENSMNEG00000029837 FAM104B (ENSMNEG00000039753) PAGE3 (ENSMNEG00000036137) ENSMNEG00000045510 MAGEH1 (ENSMNEG00000016687) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692.f ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877.i.a ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000153097.B.a.b.f.a.a ENSGT00390000001055 ENSGT00940000153097.B.a.b.e ENSGT00940000153097.B.a.a ENSGT00940000153097.B.a.b.f.a.b ENSGT00840000130063 ENSGT00390000018904.ib ENSGT00940000163664 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000012916.h.a.a ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 175 IQSEC2 (ENSMFAG00000037994) SMC1A (ENSMFAG00000003859) RIBC1 (ENSMFAG00000002670) HSD17B10 (ENSMFAG00000033364) ENSMFAG00000048422 HUWE1 (ENSMFAG00000036347) PHF8 (ENSMFAG00000036532) FAM120C (ENSMFAG00000036765) WNK3 (ENSMFAG00000031003) ENSMFAG00000001364 FGD1 (ENSMFAG00000035269) ITIH6 (ENSMFAG00000044176) MAGED2 (ENSMFAG00000038463) #19 TRO (ENSMFAG00000000246) #20 PFKFB1 (ENSMFAG00000031227) #21 APEX2 (ENSMFAG00000002486) #22 ALAS2 (ENSMFAG00000003452) #23 PAGE5 (ENSMFAG00000053596) ENSMFAG00000058880 FAM104B (ENSMFAG00000052840) PAGE3 (ENSMFAG00000032335) ENSMFAG00000038401 MAGEH1 (ENSMFAG00000051520) USP51 (ENSMFAG00000033473) FOXR2 (ENSMFAG00000047174) RRAGB (ENSMFAG00000041833) #24 ENSMFAG00000049302 KLF8 (ENSMFAG00000046239) #25 ENSMFAG00000041060 #26 ENSMFAG00000022204 SPIN3 (ENSMFAG00000036843) ##28 Rhesus MODERN SPECIES 327 SMC1A (ENSMMUG00000009293) RIBC1 (ENSMMUG00000009295) HSD17B10 (ENSMMUG00000009296) HUWE1 (ENSMMUG00000006362) PHF8 (ENSMMUG00000008751) FAM120C (ENSMMUG00000008760) WNK3 (ENSMMUG00000005433) TSR2 (ENSMMUG00000012612) FGD1 (ENSMMUG00000012613) GNL3L (ENSMMUG00000008231) ITIH6 (ENSMMUG00000007339) MAGED2 (ENSMMUG00000007345) #19 ALAS2 (ENSMMUG00000008429) #23 TRO (ENSMMUG00000008422) #20 PFKFB1 (ENSMMUG00000008425) #21 APEX2 (ENSMMUG00000008428) #22 ENSMMUG00000045847 ENSMMUG00000053924 FAM104B (ENSMMUG00000059922) PAGE3 (ENSMMUG00000010324) ENSMMUG00000060530 MAGEH1 (ENSMMUG00000046259) USP51 (ENSMMUG00000052760) ENSMMUG00000042926 FOXR2 (ENSMMUG00000061763) RRAGB (ENSMMUG00000017635) #24 ENSMMUG00000053644 ENSMMUG00000062445 ENSMMUG00000062132 ENSMMUG00000063731 KLF8 (ENSMMUG00000014678) #25 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00390000014996.z 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ENSGT00840000130063 Sooty mangabey MODERN SPECIES 284 HUWE1 (ENSCATG00000033964) ENSCATG00000036636 PHF8 (ENSCATG00000040353) FAM120C (ENSCATG00000044222) WNK3 (ENSCATG00000034697) ENSCATG00000036868 FGD1 (ENSCATG00000036367) GNL3L (ENSCATG00000031729) ITIH6 (ENSCATG00000044595) MAGED2 (ENSCATG00000036626) #19 TRO (ENSCATG00000039483) #20 PFKFB1 (ENSCATG00000027526) #21 APEX2 (ENSCATG00000044854) #22 ALAS2 (ENSCATG00000006585) #23 ENSCATG00000043958 FAM104B (ENSCATG00000029688) PAGE5 (ENSCATG00000030330) PAGE3 (ENSCATG00000030931) ENSCATG00000038059 ENSCATG00000038893 MAGEH1 (ENSCATG00000016838) Drill MODERN SPECIES 1073 HUWE1 (ENSMLEG00000040083) ENSMLEG00000034750 PHF8 (ENSMLEG00000039406) FAM120C (ENSMLEG00000032896) WNK3 (ENSMLEG00000029595) TSR2 (ENSMLEG00000032632) FGD1 (ENSMLEG00000030030) GNL3L (ENSMLEG00000029679) ITIH6 (ENSMLEG00000028158) MAGED2 (ENSMLEG00000002525) #19 TRO (ENSMLEG00000032029) #20 PFKFB1 (ENSMLEG00000040347) #21 APEX2 (ENSMLEG00000028208) #22 ALAS2 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MODERN SPECIES 3140 PFKFB1 (ENSRROG00000038104) #21 APEX2 (ENSRROG00000032674) #22 ALAS2 (ENSRROG00000034189) #23 Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000155373.f ENSGT00390000011365.b.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877.i.a.a ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000153097.B.a.b.d ENSGT00390000001055 ENSGT00940000153097.B.a.b.c ENSGT00940000153097.B.a.a ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.b #28 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 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(ENSANAG00000023583) ENSANAG00000015501 ENSANAG00000023117 ITIH6 (ENSANAG00000034254) MAGED2 (ENSANAG00000030510) #19 TRO (ENSANAG00000031246) #20 PFKFB1 (ENSANAG00000024490) #21 ENSANAG00000021907 #22 ALAS2 (ENSANAG00000022690) #23 ENSANAG00000036702 FAM104B (ENSANAG00000026192) ENSANAG00000022117 PAGE3 (ENSANAG00000027674) Mas night monkey MODERN SPECIES 253 ENSANAG00000022481 PRTFDC1 (ENSANAG00000021054) ARHGAP21 (ENSANAG00000030080) KIAA1217 (ENSANAG00000000079) ENSANAG00000036097 ENSANAG00000031524 OTUD1 (ENSANAG00000018820) C10orf67 (ENSANAG00000021920) PTF1A (ENSANAG00000019785) MSRB2 (ENSANAG00000034030) ARMC3 (ENSANAG00000023936) PIP4K2A (ENSANAG00000030847) SPAG6 (ENSANAG00000031306) ENSANAG00000026096 COMMD3 (ENSANAG00000019594) ENSANAG00000020845 #22 DNAJC1 (ENSANAG00000028982) ENSANAG00000025170 ENSANAG00000026944 MLLT10 (ENSANAG00000031669) SKIDA1 (ENSANAG00000025637) ENSANAG00000027348 NEBL (ENSANAG00000024561) ENSANAG00000036176 PLXDC2 (ENSANAG00000023957) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063540.a.b #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063540.a.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063540.a.b #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 81 MYO3A (ENSSBOG00000036221) GPR158 (ENSSBOG00000029162) ENKUR (ENSSBOG00000019774) PRTFDC1 (ENSSBOG00000028411) ARHGAP21 (ENSSBOG00000029568) KIAA1217 (ENSSBOG00000028147) ENSSBOG00000018568 C10orf67 (ENSSBOG00000022972) PTF1A (ENSSBOG00000025704) MSRB2 (ENSSBOG00000025907) ARMC3 (ENSSBOG00000025211) PIP4K2A (ENSSBOG00000032835) SPAG6 (ENSSBOG00000033856) ENSSBOG00000031424 COMMD3 (ENSSBOG00000018266) ENSSBOG00000003489 #22 ENSSBOG00000020699 DNAJC1 (ENSSBOG00000021860) MLLT10 (ENSSBOG00000025506) SKIDA1 (ENSSBOG00000024001) ENSSBOG00000019161 ENSSBOG00000018093 ENSSBOG00000026757 ENSSBOG00000024773 NEBL (ENSSBOG00000027679) PLXDC2 (ENSSBOG00000022808) MALRD1 (ENSSBOG00000022337) ARL5B (ENSSBOG00000029492) NSUN6 (ENSSBOG00000036167) CACNB2 (ENSSBOG00000021365) SLC39A12 (ENSSBOG00000026815) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000153097.B.a.b ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ##28 ENSGT00940000165111 ENSGT00940000166157 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 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ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a ##28 ENSGT00940000162502 ENSGT00940000163246 Suina ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000153097.B.a.b ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a ##28 ENSGT00940000163246 ENSGT00940000162988 #29 ENSGT00940000166157 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 Pig MODERN SPECIES 300 SMC1A (ENSSSCG00000012325) RIBC1 (ENSSSCG00000012326) HSD17B10 (ENSSSCG00000012327) HUWE1 (ENSSSCG00000012328) ENSSSCG00000047701 PHF8 (ENSSSCG00000012329) FAM120C (ENSSSCG00000035822) WNK3 (ENSSSCG00000012332) TSR2 (ENSSSCG00000012334) FGD1 (ENSSSCG00000012335) GNL3L (ENSSSCG00000012336) ENSSSCG00000038019 TRO (ENSSSCG00000039027) #20 PFKFB1 (ENSSSCG00000024814) #21 ENSSSCG00000041777 APEX2 (ENSSSCG00000012348) #22 ALAS2 (ENSSSCG00000012347) #23 PAGE2B (ENSSSCG00000012346) USP51 (ENSSSCG00000012349) MAGEH1 (ENSSSCG00000012350) FOXR2 (ENSSSCG00000020805) ENSSSCG00000059274 RRAGB (ENSSSCG00000037228) #24 KLF8 (ENSSSCG00000012352) #25 UBQLN2 (ENSSSCG00000035264) #26 ENSSSCG00000041254 ENSSSCG00000043490 NBDY (ENSSSCG00000053779) #27 ENSSSCG00000042147 ENSSSCG00000012354 SPIN3 (ENSSSCG00000055308) ##28 Chacoan peccary MODERN 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ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a ##28 ENSGT00940000162988 #29 ENSGT00940000163246 ENSGT00940000158517 ENSGT00390000001432 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.a Cetacea ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159316 ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.a ENSGT00390000001432 ENSGT00940000158517 ENSGT00940000154172.ab.a.b.b ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000162993 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000159438 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000160145.b ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000157847 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000155170 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155614 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000161236.a.a Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.a ENSGT00390000001432 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ENSGT01090000260082.d.a.a.a.a ENSGT00390000014785 ENSGT00940000159316 Bos ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000153299.c.b.a.b ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692.i ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000153299.c.b.a.b ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692.i ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT01090000260200 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a.e ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a.f ##28 ENSGT00940000165111.b ENSGT00940000158517 ENSGT00390000001432 Wild yak MODERN SPECIES 655 APEX2 (ENSBMUG00000026249) #22 ALAS2 (ENSBMUG00000026246) #23 Domestic yak MODERN SPECIES 69 HUWE1 (ENSBGRG00000026013) ENSBGRG00000026042 PHF8 (ENSBGRG00000026049) ENSBGRG00000026075 ENSBGRG00000026084 WNK3 (ENSBGRG00000026090) ENSBGRG00000026097 FGD1 (ENSBGRG00000026106) ENSBGRG00000026149 GNL3L (ENSBGRG00000026157) ENSBGRG00000026166 MAGED2 (ENSBGRG00000026168) #19 ENSBGRG00000026172 #20 PFKFB1 (ENSBGRG00000007193) #21 ENSBGRG00000007503 APEX2 (ENSBGRG00000007525) #22 ALAS2 (ENSBGRG00000007653) #23 ENSBGRG00000007858 ENSBGRG00000007909 MAGEH1 (ENSBGRG00000007940) FOXR2 (ENSBGRG00000007965) RRAGB (ENSBGRG00000008042) #24 ENSBGRG00000008268 KLF8 (ENSBGRG00000008297) #25 UBQLN2 (ENSBGRG00000008416) #26 NBDY (ENSBGRG00000008427) #27 ENSBGRG00000008442 ENSBGRG00000008462 ENSBGRG00000008488 ##28 ENSBGRG00000008507 ##28 ENSBGRG00000008521 ##28 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000153299.c.b.a.b ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692.i ENSGT00940000159438 ENSGT00940000156786.l ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a.e ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a.f ##28 ENSGT00940000165111.b ENSGT00940000158517 ENSGT00390000001432 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.a Cow MODERN SPECIES 177 RIBC1 (ENSBTAG00000017769) HSD17B10 (ENSBTAG00000017779) HUWE1 (ENSBTAG00000006122) ENSBTAG00000005098 PHF8 (ENSBTAG00000013289) FAM120C (ENSBTAG00000003855) WNK3 (ENSBTAG00000023182) TSR2 (ENSBTAG00000015858) FGD1 (ENSBTAG00000015860) RAB21 (ENSBTAG00000019370) GNL3L (ENSBTAG00000031564) ENSBTAG00000049441 MAGED2 (ENSBTAG00000039888) #19 TRO (ENSBTAG00000051604) #20 PFKFB1 (ENSBTAG00000000172) #21 APEX2 (ENSBTAG00000013177) #22 ALAS2 (ENSBTAG00000013178) #23 MAGEH1 (ENSBTAG00000039090) FOXR2 (ENSBTAG00000046659) RRAGB (ENSBTAG00000012980) #24 KLF8 (ENSBTAG00000005852) #25 UBQLN2 (ENSBTAG00000021843) #26 NBDY (ENSBTAG00000054746) #27 ENSBTAG00000049019 ENSBTAG00000053877 ##28 SPIN2 (ENSBTAG00000013260) ##28 SPIN2B (ENSBTAG00000046769) ##28 SPIN2B (ENSBTAG00000038387) ##28 ENSBTAG00000045616 HEPH (ENSBTAG00000047416) VSIG4 (ENSBTAG00000015769) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 315 ENSBIXG00005013304 PHF8 (ENSBIXG00005013537) FAM120C (ENSBIXG00005013694) ENSBIXG00005013719 WNK3 (ENSBIXG00005013750) ENSBIXG00005001713 FGD1 (ENSBIXG00005013811) ENSBIXG00005013829 GNL3L (ENSBIXG00005001728) ENSBIXG00005007315 MAGED2 (ENSBIXG00005014025) #19 ENSBIXG00005014063 ENSBIXG00005001826 ENSBIXG00005014077 PFKFB1 (ENSBIXG00005014145) #21 APEX2 (ENSBIXG00005014199) #22 ALAS2 (ENSBIXG00005014264) #23 MAGEH1 (ENSBIXG00005001884) FOXR2 (ENSBIXG00005014322) RRAGB (ENSBIXG00005014371) #24 KLF8 (ENSBIXG00005014469) #25 UBQLN2 (ENSBIXG00005014517) #26 NBDY (ENSBIXG00005014528) #27 ENSBIXG00005014533 ##28 ENSBIXG00005002025 ##28 ENSBIXG00005014560 ##28 ENSBIXG00005014564 ##28 ENSBIXG00005002029 ENSBIXG00005014584 HEPH (ENSBIXG00005014859) ENSBIXG00005014906 American bison MODERN SPECIES 2535 APEX2 (ENSBBBG00000016207) #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000153299.c.b.a.b ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692.i ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00940000167970.a.b Goat MODERN SPECIES 29 ENSCHIG00000026014 ENSCHIG00000017570 ENSCHIG00000022374 NDP (ENSCHIG00000013603) ENSCHIG00000025084 EFHC2 (ENSCHIG00000005059) FUNDC1 (ENSCHIG00000019943) ENSCHIG00000011225 DIPK2B (ENSCHIG00000014928) KDM6A (ENSCHIG00000026240) ENSCHIG00000015092 ENSCHIG00000011583 ENSCHIG00000021372 ENSCHIG00000015519 #20 PFKFB1 (ENSCHIG00000023388) #21 APEX2 (ENSCHIG00000019916) #22 ALAS2 (ENSCHIG00000011854) #23 RRAGB (ENSCHIG00000018786) #24 KLF8 (ENSCHIG00000011453) #25 ENSCHIG00000009409 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ENSOARG00020023450 ##28 ENSOARG00020023439 ##28 HEPH (ENSOARG00020023252) VSIG4 (ENSOARG00020023216) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000159667 ENSGT00990000210767 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163664 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a ##28 ENSGT00940000162502 ENSGT00940000163246 ENSGT00940000162988 #29 Arabian camel MODERN SPECIES 204 RIBC1 (ENSCDRG00005020442) HSD17B10 (ENSCDRG00005020487) HUWE1 (ENSCDRG00005020527) ENSCDRG00005020654 PHF8 (ENSCDRG00005020670) FAM120C 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ENSGT01090000260962 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 ENSGT00940000154103.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000153902.b ENSGT00940000162717 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a ##28 ENSGT00940000162988 #29 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 ENSGT00940000154103.b ENSGT00530000063529.B Caniformia ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.a ##28 ENSGT00940000162988 #29 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ##28 ENSGT00940000154103.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000153902.b Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00940000162993 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603 #26 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00940000153664.A.b.a ENSGT00390000018389 ENSGT00940000159316 ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.a ENSGT00390000001432 ENSGT00940000158517 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b 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ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00840000130063 ENSGT00940000163664 ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT00940000161062 #25 ENSGT00940000162603.d #26 ENSGT00940000163673 ENSGT00390000004891 #27 ENSGT00950000182925.D.a.a.b.b ##28 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.a.a.b ##28 ENSGT00940000154336.c.a ENSGT00940000158517 ENSGT00390000001432 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.a ENSGT00390000014785 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1106 IQSEC2 (ENSMLUG00000005010) SMC1A (ENSMLUG00000000158) RIBC1 (ENSMLUG00000000174) ENSMLUG00000000175 HUWE1 (ENSMLUG00000000179) PHF8 (ENSMLUG00000000508) FAM120C (ENSMLUG00000005433) WNK3 (ENSMLUG00000008181) TSR2 (ENSMLUG00000010613) FGD1 (ENSMLUG00000010619) GNL3L (ENSMLUG00000008331) ITIH6 (ENSMLUG00000013415) MAGED2 (ENSMLUG00000012630) #19 TRO (ENSMLUG00000016279) #20 PFKFB1 (ENSMLUG00000016291) #21 ENSMLUG00000016298 #22 ALAS2 (ENSMLUG00000016305) #23 ENSMLUG00000006806 USP51 (ENSMLUG00000015717) RRAGB (ENSMLUG00000015720) #24 KLF8 (ENSMLUG00000016695) #25 UBQLN2 (ENSMLUG00000007552) #26 ENSMLUG00000004357 SPIN3 (ENSMLUG00000015431) ##28 ENSMLUG00000006656 ##28 ENSMLUG00000002732 ##28 FAAH2 (ENSMLUG00000017725) ENSMLUG00000025240 ENSMLUG00000011370 #29 VAMP7 (ENSMLUG00000012765) SPRY3 (ENSMLUG00000022306) Microbat MODERN SPECIES 1010 PTPRZ1 (ENSMLUG00000013471) AASS (ENSMLUG00000015957) ENSMLUG00000004562 #22 FEZF1 (ENSMLUG00000005067) CADPS2 (ENSMLUG00000005076) RNF133 (ENSMLUG00000005094) RNF148 (ENSMLUG00000030104) ENSMLUG00000026399 ENSMLUG00000024279 TAS2R16 (ENSMLUG00000014220) SLC13A1 (ENSMLUG00000001020) IQUB (ENSMLUG00000001027) ASB15 (ENSMLUG00000014924) LMOD2 (ENSMLUG00000014932) WASL (ENSMLUG00000014937) ENSMLUG00000024052 HYAL4 (ENSMLUG00000022537) SPAM1 (ENSMLUG00000012742) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES HUWE1 (ENSRFEG00010002183) PHF8 (ENSRFEG00010001984) ENSRFEG00010001924 FAM120C (ENSRFEG00010001877) ENSRFEG00010001859 ENSRFEG00010001852 WNK3 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ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000162763 #20 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 165 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162980 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00940000162496 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000161795 #19 ENSGT00940000162980 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 Elephant MODERN SPECIES 584 TSPYL2 (ENSLAFG00000018730) KDM5C (ENSLAFG00000000303) IQSEC2 (ENSLAFG00000006181) SMC1A (ENSLAFG00000002363) RIBC1 (ENSLAFG00000030955) HSD17B10 (ENSLAFG00000002368) HUWE1 (ENSLAFG00000014785) PHF8 (ENSLAFG00000016189) WNK3 (ENSLAFG00000018354) TSR2 (ENSLAFG00000018093) FGD1 (ENSLAFG00000018095) GNL3L (ENSLAFG00000016701) MAGED2 (ENSLAFG00000021533) #19 ENSLAFG00000021415 PFKFB1 (ENSLAFG00000018310) #21 APEX2 (ENSLAFG00000018312) #22 ALAS2 (ENSLAFG00000028949) #23 MAGEH1 (ENSLAFG00000028261) FOXR2 (ENSLAFG00000028716) RRAGB (ENSLAFG00000016144) #24 UBQLN2 (ENSLAFG00000030258) #26 ENSLAFG00000009657 SPIN3 (ENSLAFG00000028333) ##28 ENSLAFG00000026755 ##28 ENSLAFG00000025577 #28 ENSLAFG00000027414 ENSLAFG00000017963 #29 Tenrec MODERN SPECIES 5026 ENSETEG00000000980 #21 APEX2 (ENSETEG00000000984) #22 ALAS2 (ENSETEG00000000987) #23 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1749 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 Armadillo MODERN SPECIES 3834 APEX2 (ENSDNOG00000038901) #22 ALAS2 (ENSDNOG00000015312) #23 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00530000063624.B ENSGT00950000183118.A.c.b.c ENSGT00950000183118.A.c.b.d ENSGT00940000160940 ENSGT00940000159479 ENSGT00940000164406 ENSGT00940000160459 ENSGT00940000153313.C.a ENSGT01070000253816.a.a.a ENSGT00940000153763.a ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT01030000234752 ENSGT00940000164454.h ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00390000004263.b.m ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00950000182890.D.c.a.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000154411.`b.i.e.b.b ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00390000006939.c ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00530000063624.B ENSGT00950000183118.A.c.b.c ENSGT00950000183118.A.c.b.d ENSGT00940000160940 ENSGT00940000159479 ENSGT00940000164406 ENSGT00940000160459 ENSGT00940000153313.C.a ENSGT01070000253816.a.a.a ENSGT00940000153763.a ENSGT00950000183031.B.e.a #24 ENSGT01030000234752 ENSGT00940000164454.h ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00390000004263.b.m ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00950000182890.D.c.a.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000154411.`b.i.e.b.b ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00950000183232 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00390000006939.c ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000159971 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 111 ENSGT00390000004263.b.m ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT01100000263534.b.k.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000154411.`b.i.e.b.b ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00390000004263.b.m ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT01100000263534.b.k.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000154411.`b.i.e.b.b ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 Common wonbat MODERN SPECIES 205 ENSVURG00010020506 APEX2 (ENSVURG00010020515) #22 ALAS2 (ENSVURG00010020519) #23 ENSVURG00010020524 ENSVURG00010020528 ENSVURG00010020532 ENSVURG00010020535 PAK3 (ENSVURG00010020598) CAPN6 (ENSVURG00010021039) DCX (ENSVURG00010021053) koala MODERN SPECIES 409 ENSPCIG00000020801 ENSPCIG00000033647 APEX2 (ENSPCIG00000007633) #22 ALAS2 (ENSPCIG00000008618) #23 ENSPCIG00000034224 ENSPCIG00000013044 ENSPCIG00000033336 PAK3 (ENSPCIG00000001945) CAPN6 (ENSPCIG00000001980) DCX (ENSPCIG00000001994) Tasmanian devil MODERN SPECIES 21 ENSSHAG00000007615 ENSSHAG00000026444 ENSSHAG00000025967 ENSSHAG00000027083 ENSSHAG00000010957 ENSSHAG00000011278 ENSSHAG00000023480 ENSSHAG00000022980 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(ENSMODG00000005255) CAPN6 (ENSMODG00000005238) ENSMODG00000037776 ENSMODG00000005175 ENSMODG00000005159 ENSMODG00000005054 LHFPL1 (ENSMODG00000005109) AMOT (ENSMODG00000005098) ENSMODG00000025173 ENSMODG00000005047 HTR2C (ENSMODG00000005042) Platypus MODERN SPECIES 17 IQSEC2 (ENSOANG00000005666) SMC1A (ENSOANG00000009211) ENSOANG00000041612 HSD17B10 (ENSOANG00000009214) ENSOANG00000031628 HUWE1 (ENSOANG00000000714) PHF8 (ENSOANG00000000712) FAM120C (ENSOANG00000000710) WNK3 (ENSOANG00000000708) TSR2 (ENSOANG00000000707) FGD1 (ENSOANG00000000703) GNL3L (ENSOANG00000000700) ENSOANG00000000695 ENSOANG00000020339 PFKFB1 (ENSOANG00000000691) #21 APEX2 (ENSOANG00000040218) #22 ALAS2 (ENSOANG00000000687) #23 TREX2 (ENSOANG00000000686) ENSOANG00000029619 BGN (ENSOANG00000000684) ATP2B3 (ENSOANG00000000679) CCNQ (ENSOANG00000000678) DUSP9 (ENSOANG00000005316) PNCK (ENSOANG00000036709) ENSOANG00000010213 BCAP31 (ENSOANG00000010212) ABCD1 (ENSOANG00000041560) PLXNB3 (ENSOANG00000005185) SRPK3 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ENSGT00940000159563 ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159128 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00720000108868 Laterata ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00410000025802 ENSGT00730000111022.m ENSGT00950000182808.b.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00940000164196 ENSGT00940000165056 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000155877 ENSGT00940000159438 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000160145.b ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000157847 ENSGT00940000162980 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00940000164755.C ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159128 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00720000108868 Common wall lizard MODERN SPECIES 8 ENSPMRG00000023889 ENSPMRG00000023888 SLC10A3 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Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2751 ENSCABG00000014527 PHF8 (ENSCABG00000014528) ENSCABG00000014540 ENSCABG00000014710 APEX2 (ENSCABG00000014713) #22 ENSCABG00000014719 #23 PRICKLE3 (ENSCABG00000014742) PLP2 (ENSCABG00000014746) GPKOW (ENSCABG00000014748) HSD17B10 (ENSCABG00000014750) RIBC1 (ENSCABG00000014752) SMC1A (ENSCABG00000014810) IQSEC2 (ENSCABG00000016172) ENSCABG00000016173 SYP (ENSCABG00000016175) TFE3 (ENSCABG00000016176) CCDC120 (ENSCABG00000016178) PRAF2 (ENSCABG00000016179) FTSJ1 (ENSCABG00000016180) PORCN (ENSCABG00000016181) Anura ANCESTRAL SPECIES 226 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 ENSGT00390000003348 ENSGT00940000162980 ENSGT00940000163627 ENSGT00940000164454 ENSGT00950000182835.c.c #21 ENSGT00530000063540.a #22 ENSGT00940000159912 #23 ENSGT00390000012715 ENSGT00390000003937 Frog MODERN SPECIES 8 fam102a (ENSXETG00000023071) ENSXETG00000035221 ENSXETG00000042722 fgd1 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