Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976 #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976 #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976 #22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976 #22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00390000016654 ENSGT01050000244814.b ENSGT00390000007165 ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00940000153496.b ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.d ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000164900 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 Amniota ANCESTRAL SPECIES 135 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000164900 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00390000001927.b #7 ENSGT00940000161908 #8 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 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#15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d #22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00830000128447 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 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ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d.w #22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00960000186612.A.q ENSGT00390000011694 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161908 #8 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d.w #22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 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ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 266 NUCB1 (ENSCLAG00000016793) #7 ENSCLAG00000017325 #8 PPP1R15A (ENSCLAG00000016020) #9 PLEKHA4 (ENSCLAG00000013782) #10 HSD17B14 (ENSCLAG00000014478) #11 BCAT2 (ENSCLAG00000015177) #12 FGF21 (ENSCLAG00000012823) #13 FUT1 (ENSCLAG00000009937) #14 RASIP1 (ENSCLAG00000005556) #15 MAMSTR (ENSCLAG00000005822) #16 ENSCLAG00000006338 #17 NTN5 (ENSCLAG00000006822) #18 CA11 (ENSCLAG00000007126) #19 DBP (ENSCLAG00000010719) #20 SPHK2 (ENSCLAG00000011383) #21 RPL18 (ENSCLAG00000013325) #22 FAM83E (ENSCLAG00000010586) #23 SPACA4 (ENSCLAG00000007867) #24 ENSCLAG00000007953 #25 LMTK3 (ENSCLAG00000008389) #26 GRIN2D (ENSCLAG00000010679) #27 CYTH2 (ENSCLAG00000005723) #28 KCNJ14 (ENSCLAG00000006690) #29 GRWD1 (ENSCLAG00000006905) #30 KDELR1 (ENSCLAG00000007088) #31 SYNGR4 (ENSCLAG00000007358) #32 TMEM143 (ENSCLAG00000004634) #33 EMP3 (ENSCLAG00000004840) #34 ODAD1 (ENSCLAG00000005046) #35 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 27 ENSODEG00000000045 #22 Degu MODERN SPECIES 95 ST18 (ENSODEG00000003288) PCMTD1 (ENSODEG00000003571) SNTG1 (ENSODEG00000003621) ENSODEG00000003654 CLXN (ENSODEG00000003725) ENSODEG00000003745 ENSODEG00000018960 ENSODEG00000019042 ENSODEG00000004479 MCM4 (ENSODEG00000004626) PRKDC (ENSODEG00000004916) CEBPD (ENSODEG00000002997) ENSODEG00000003011 ENSODEG00000003049 ENSODEG00000003100 ENSODEG00000018938 #22 PEX26 (ENSODEG00000003167) TUBA8 (ENSODEG00000003237) ENSODEG00000003289 RAD52 (ENSODEG00000002829) WNK1 (ENSODEG00000003149) NINJ2 (ENSODEG00000004549) B4GALNT3 (ENSODEG00000004594) ENSODEG00000004696 ENSODEG00000005724 CCDC77 (ENSODEG00000005738) KDM5A (ENSODEG00000005784) SLC6A13 (ENSODEG00000005821) SLC6A12 (ENSODEG00000005897) IQSEC3 (ENSODEG00000005994) ENSODEG00000018834 Guinea pig MODERN SPECIES 232 ENSCPOG00000021043 FLT4 (ENSCPOG00000008026) SCGB3A1 (ENSCPOG00000036615) 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ENSMMMG00000001535 ENSMMMG00000001503 ENSMMMG00000001489 ENSMMMG00000001478 ENSMMMG00000001460 ENSMMMG00000001451 EBNA1BP2 (ENSMMMG00000001428) CFAP57 (ENSMMMG00000001332) TMEM125 (ENSMMMG00000001319) Alpin marmot MODERN SPECIES 45 PPP1R15A (ENSMMMG00000011557) #9 PLEKHA4 (ENSMMMG00000011567) #10 HSD17B14 (ENSMMMG00000011592) #11 BCAT2 (ENSMMMG00000011632) #12 FGF21 (ENSMMMG00000011664) #13 FUT1 (ENSMMMG00000011666) #14 ENSMMMG00000011670 ENSMMMG00000011677 ENSMMMG00000011701 RASIP1 (ENSMMMG00000011712) #15 MAMSTR (ENSMMMG00000011759) #16 FUT2 (ENSMMMG00000011789) ##17 NTN5 (ENSMMMG00000011793) #18 CA11 (ENSMMMG00000011824) #19 SPHK2 (ENSMMMG00000011854) #21 ENSMMMG00000011897 #22 FAM83E (ENSMMMG00000011902) #23 SULT2B1 (ENSMMMG00000011911) #25 CYTH2 (ENSMMMG00000012062) #28 KCNJ14 (ENSMMMG00000012082) #29 GRWD1 (ENSMMMG00000012084) #30 ENSMMMG00000012100 #31 SYNGR4 (ENSMMMG00000012129) #32 TMEM143 (ENSMMMG00000012139) #33 EMP3 (ENSMMMG00000012164) #34 ENSMMMG00000012175 ENSMMMG00000012186 ENSMMMG00000012194 ENSMMMG00000012204 ENSMMMG00000012207 ENSMMMG00000012213 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 424 Bax (ENSDORG00000015554) Nucb1 (ENSDORG00000010952) #7 ENSDORG00000028603 Plekha4 (ENSDORG00000010947) #10 ENSDORG00000010946 #11 Bcat2 (ENSDORG00000010944) #12 Fgf21 (ENSDORG00000001234) #13 Rasip1 (ENSDORG00000001230) #15 Mamstr (ENSDORG00000001229) #16 Fut2 (ENSDORG00000005297) ##17 Sec1 (ENSDORG00000001228) #17 Ntn5 (ENSDORG00000010603) #18 Car11 (ENSDORG00000010602) #19 Dbp (ENSDORG00000010599) #20 Sphk2 (ENSDORG00000010598) #21 Rpl18 (ENSDORG00000010597) #22 Fam83e (ENSDORG00000010595) #23 Sult2b1 (ENSDORG00000010594) #25 ENSDORG00000012826 #26 Cyth2 (ENSDORG00000012825) #28 Kcnj14 (ENSDORG00000012823) #29 Grwd1 (ENSDORG00000012820) #30 Grin2d (ENSDORG00000012818) #27 Kdelr1 (ENSDORG00000026691) #31 Syngr4 (ENSDORG00000003793) #32 Tmem143 (ENSDORG00000003792) #33 Emp3 (ENSDORG00000003791) #34 ENSDORG00000023841 #35 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3251 D6Wsu163e (ENSMSIG00000024953) ENSMSIG00000024945 Fgf6 (ENSMSIG00000024934) Fgf23 (ENSMSIG00000024926) Tigar (ENSMSIG00000024906) Ccnd2 (ENSMSIG00000024886) ENSMSIG00000024876 ENSMSIG00000024875 ENSMSIG00000024833 Parp11 (ENSMSIG00000024808) Cracr2a (ENSMSIG00000024763) Prmt8 (ENSMSIG00000024750) Tspan11 (ENSMSIG00000024741) ENSMSIG00000024702 Tead4 (ENSMSIG00000024608) ENSMSIG00000024597 #22 Tulp3 (ENSMSIG00000024523) Foxm1 (ENSMSIG00000024510) Tex52 (ENSMSIG00000024499) ENSMSIG00000024482 Itfg2 (ENSMSIG00000024435) Fkbp4 (ENSMSIG00000024415) Rat MODERN SPECIES 5 Tmed4 (ENSRNOG00000005016) Ddx56 (ENSRNOG00000004670) Npc1l1 (ENSRNOG00000049955) Nudcd3 (ENSRNOG00000056148) Camk2b (ENSRNOG00000052080) Ykt6 (ENSRNOG00000014785) Gck (ENSRNOG00000061527) Myl7 (ENSRNOG00000014409) Pold2 (ENSRNOG00000014098) Aebp1 (ENSRNOG00000013720) Polm (ENSRNOG00000013647) Pgam2 (ENSRNOG00000013532) Dbnl (ENSRNOG00000012378) Urgcp (ENSRNOG00000012184) Mrps24 (ENSRNOG00000011979) ENSRNOG00000069799 #22 AC136588.2 (ENSRNOG00000030988) Ankrd36 (ENSRNOG00000056767) Ccdc117 (ENSRNOG00000010706) Xbp1 (ENSRNOG00000010298) Znrf3 (ENSRNOG00000067305) Kremen1 (ENSRNOG00000051487) Emid1 (ENSRNOG00000033575) Rhbdd3 (ENSRNOG00000027032) Ewsr1 (ENSRNOG00000009437) Rasl10a (ENSRNOG00000008951) Gas2l1 (ENSRNOG00000009040) Ap1b1 (ENSRNOG00000008786) Nefh (ENSRNOG00000008716) Thoc5 (ENSRNOG00000008456) Nipsnap1 (ENSRNOG00000008374) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Ptprn (ENSCGRG00001021829) Resp18 (ENSCGRG00001021418) Dnpep (ENSCGRG00001021220) Des (ENSCGRG00001021172) Speg (ENSCGRG00001021728) Gmppa (ENSCGRG00001021452) Asic4 (ENSCGRG00001022497) Chpf (ENSCGRG00001022407) Tmem198 (ENSCGRG00001020730) Obsl1 (ENSCGRG00001024617) Inha (ENSCGRG00001024171) Stk11ip (ENSCGRG00001022049) Slc4a3 (ENSCGRG00001022779) Epha4 (ENSCGRG00001021931) ENSCGRG00001024297 #22 ENSCGRG00001021628 #22 Pax3 (ENSCGRG00001021432) Sgpp2 (ENSCGRG00001000644) Farsb (ENSCGRG00001022928) Mogat1 (ENSCGRG00001024802) Acsl3 (ENSCGRG00001021642) ENSCGRG00001021806 Scg2 (ENSCGRG00001022025) Ap1s3 (ENSCGRG00001024122) Wdfy1 (ENSCGRG00001024667) Mrpl44 (ENSCGRG00001021967) Serpine2 (ENSCGRG00001021899) Fam124b (ENSCGRG00001002666) Cul3 (ENSCGRG00001021603) ENSCGRG00001022684 Gm45261 (ENSCGRG00001024178) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Dnajb2 (ENSCGRG00001020980) Ptprn (ENSCGRG00001021829) Resp18 (ENSCGRG00001021418) Dnpep (ENSCGRG00001021220) Des (ENSCGRG00001021172) Speg (ENSCGRG00001021728) Gmppa (ENSCGRG00001021452) Asic4 (ENSCGRG00001022497) Chpf (ENSCGRG00001022407) Tmem198 (ENSCGRG00001020730) Obsl1 (ENSCGRG00001024617) Inha (ENSCGRG00001024171) Stk11ip (ENSCGRG00001022049) Slc4a3 (ENSCGRG00001022779) Epha4 (ENSCGRG00001021931) ENSCGRG00001024297 #22 ENSCGRG00001021628 #22 Pax3 (ENSCGRG00001021432) Sgpp2 (ENSCGRG00001000644) Farsb (ENSCGRG00001022928) Mogat1 (ENSCGRG00001024802) Acsl3 (ENSCGRG00001021642) ENSCGRG00001021806 Scg2 (ENSCGRG00001022025) Ap1s3 (ENSCGRG00001024122) Wdfy1 (ENSCGRG00001024667) Mrpl44 (ENSCGRG00001021967) Serpine2 (ENSCGRG00001021899) Fam124b (ENSCGRG00001002666) Cul3 (ENSCGRG00001021603) ENSCGRG00001022684 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 111 Glis1 (ENSCGRG00001023732) Dmrtb1 (ENSCGRG00001022904) Lrp8 (ENSCGRG00001021933) Magoh (ENSCGRG00001020438) ENSCGRG00001015690 Cpt2 (ENSCGRG00001024083) Slc1a7 (ENSCGRG00001023415) Podn (ENSCGRG00001012649) Scp2 (ENSCGRG00001010125) Echdc2 (ENSCGRG00001001923) Zyg11a (ENSCGRG00001023446) Zyg11b (ENSCGRG00001016208) Coa7 (ENSCGRG00001023745) Shisal2a (ENSCGRG00001022860) Gpx7 (ENSCGRG00001021907) ENSCGRG00001020028 #22 ENSCGRG00001020315 ENSCGRG00001018502 Orc1 (ENSCGRG00001007386) Cc2d1b (ENSCGRG00001013141) Zfyve9 (ENSCGRG00001023802) ENSCGRG00001021792 ENSCGRG00001021460 Txndc12 (ENSCGRG00001019312) Rab3b (ENSCGRG00001013853) Nrd1 (ENSCGRG00001022296) Osbpl9 (ENSCGRG00001021068) Calr4 (ENSCGRG00001011514) Eps15 (ENSCGRG00001009890) Ttc39a (ENSCGRG00001020495) Rnf11 (ENSCGRG00001018595) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Prairie vole MODERN SPECIES 4 Armh4 (ENSMOCG00000015938) Slc35f4 (ENSMOCG00000007286) ccdc198 (ENSMOCG00000009305) Naa30 (ENSMOCG00000013852) ENSMOCG00000006129 Ap5m1 (ENSMOCG00000021173) Exoc5 (ENSMOCG00000019782) ENSMOCG00000007409 #22 ENSMOCG00000011281 ENSMOCG00000006238 Atg14 (ENSMOCG00000000144) Fbxo34 (ENSMOCG00000006547) Dlgap5 (ENSMOCG00000021523) Lgals3 (ENSMOCG00000022866) Mapk1ip1l (ENSMOCG00000000105) Socs4 (ENSMOCG00000000093) Wdhd1 (ENSMOCG00000013032) Gch1 (ENSMOCG00000022270) Samd4 (ENSMOCG00000014893) Cgrrf1 (ENSMOCG00000015089) Gmfb (ENSMOCG00000004831) Cnih1 (ENSMOCG00000014115) Cdkn3 (ENSMOCG00000014227) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Pika MODERN SPECIES 6122 ENSOPRG00000002607 #22 Tree shrew MODERN SPECIES 2357 ENSTBEG00000002402 #21 RPL18 (ENSTBEG00000001594) #22 SPACA4 (ENSTBEG00000001251) #24 FAM83E (ENSTBEG00000000955) #23 Primates ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a ##22 ENSGT00390000012976.d.w #22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00830000128447 ENSGT00390000011694 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 5560 SPRED1 (ENSTSYG00000001554) FAM98B (ENSTSYG00000001553) RASGRP1 (ENSTSYG00000001564) ENSTSYG00000012093 C4BPA (ENSTSYG00000014490) C4BPB (ENSTSYG00000014489) PFKFB2 (ENSTSYG00000001745) YOD1 (ENSTSYG00000001743) C1orf116 (ENSTSYG00000001720) ENSTSYG00000031712 #22 FCAMR (ENSTSYG00000036251) PIGR (ENSTSYG00000009175) FCMR (ENSTSYG00000014064) Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 1887 ENSTSYG00000029815 #15 MAMSTR (ENSTSYG00000026265) #16 NTN5 (ENSTSYG00000028617) #18 CA11 (ENSTSYG00000028824) #19 DBP (ENSTSYG00000033501) #20 SPHK2 (ENSTSYG00000013188) #21 RPL18 (ENSTSYG00000030586) #22 FAM83E (ENSTSYG00000025468) #23 SULT2B1 (ENSTSYG00000013746) #25 Tarsier MODERN SPECIES 4007 ENSTSYG00000029412 ENSTSYG00000013186 #22 Tarsier MODERN SPECIES 3868 SEC31A (ENSTSYG00000014285) THAP9 (ENSTSYG00000005287) LIN54 (ENSTSYG00000005291) ENSTSYG00000028917 #22 COPS4 (ENSTSYG00000011699) ENSTSYG00000029901 Tarsier MODERN SPECIES 7001 ENSTSYG00000026121 #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 664 TMOD3 (ENSANAG00000026713) TMOD2 (ENSANAG00000028736) LYSMD2 (ENSANAG00000032260) SCG3 (ENSANAG00000038079) DMXL2 (ENSANAG00000038122) GLDN (ENSANAG00000036122) CYP19A1 (ENSANAG00000022843) TNFAIP8L3 (ENSANAG00000032545) AP4E1 (ENSANAG00000033916) SPPL2A (ENSANAG00000020492) TRPM7 (ENSANAG00000035495) ENSANAG00000006598 USP8 (ENSANAG00000037924) ENSANAG00000001540 ENSANAG00000006271 ENSANAG00000022805 #22 GABPB1 (ENSANAG00000025207) HDC (ENSANAG00000023809) SLC27A2 (ENSANAG00000038506) ENSANAG00000020984 ATP8B4 (ENSANAG00000029755) DTWD1 (ENSANAG00000037736) ENSANAG00000037534 FGF7 (ENSANAG00000035772) FAM227B (ENSANAG00000033925) GALK2 (ENSANAG00000034466) COPS2 (ENSANAG00000033255) SECISBP2L (ENSANAG00000027892) EID1 (ENSANAG00000022853) ENSANAG00000029738 SHC4 (ENSANAG00000038494) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 79 CR2 (ENSSBOG00000021258) ENSSBOG00000018205 CR1L (ENSSBOG00000022625) CD46 (ENSSBOG00000019001) CD34 (ENSSBOG00000030347) ENSSBOG00000036095 PLXNA2 (ENSSBOG00000033258) CAMK1G (ENSSBOG00000027000) LAMB3 (ENSSBOG00000031511) HSD11B1 (ENSSBOG00000035190) ENSSBOG00000012130 TRAF3IP3 (ENSSBOG00000021891) IRF6 (ENSSBOG00000003627) UTP25 (ENSSBOG00000022281) SYT14 (ENSSBOG00000029111) ENSSBOG00000026801 #22 SERTAD4 (ENSSBOG00000035607) ENSSBOG00000026679 ENSSBOG00000020597 HHAT (ENSSBOG00000035340) ENSSBOG00000020043 KCNH1 (ENSSBOG00000032494) ENSSBOG00000035382 RCOR3 (ENSSBOG00000015131) TRAF5 (ENSSBOG00000027194) ENSSBOG00000020190 RD3 (ENSSBOG00000034844) SLC30A1 (ENSSBOG00000023733) NEK2 (ENSSBOG00000034232) LPGAT1 (ENSSBOG00000034328) INTS7 (ENSSBOG00000023687) Marmoset MODERN SPECIES 14 CEACAM7 (ENSCJAG00000020206) ERICH4 (ENSCJAG00000020204) DMAC2 (ENSCJAG00000020190) B3GNT8 (ENSCJAG00000039694) BCKDHA (ENSCJAG00000020155) EXOSC5 (ENSCJAG00000020152) TMEM91 (ENSCJAG00000022834) B9D2 (ENSCJAG00000045008) TGFB1 (ENSCJAG00000020149) CCDC97 (ENSCJAG00000046949) HNRNPUL1 (ENSCJAG00000020106) AXL (ENSCJAG00000020090) CYP2S1 (ENSCJAG00000020085) CYP2B6 (ENSCJAG00000020082) ENSCJAG00000075960 ENSCJAG00000020079 #22 CYP2A7 (ENSCJAG00000036060) ENSCJAG00000079630 CYP2F1 (ENSCJAG00000034902) EGLN2 (ENSCJAG00000014887) RAB4B (ENSCJAG00000047458) MIA (ENSCJAG00000014879) ENSCJAG00000014865 ACTMAP (ENSCJAG00000014857) ITPKC (ENSCJAG00000014755) COQ8B (ENSCJAG00000014833) NUMBL (ENSCJAG00000014829) LTBP4 (ENSCJAG00000037941) SHKBP1 (ENSCJAG00000014763) SPTBN4 (ENSCJAG00000086111) BLVRB (ENSCJAG00000014665) Catarrhini DUPLICATION Catarrhini DUPLICATION Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000012976.d.w.e.a.a #22 ENSGT00940000158708.b ENSGT00940000158487 ENSGT00940000159270 ENSGT00550000074827 ENSGT00390000009403 ENSGT00390000011314 ENSGT00940000157796 ENSGT00940000159422 ENSGT00940000153533.a ENSGT00940000155707 ENSGT00940000160380 ENSGT00910000146897 ENSGT00950000182989.A ENSGT00940000157327 ENSGT00940000160977 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000012976.d.w.e.a.a #22 ENSGT00940000158708.b ENSGT00940000158487 ENSGT00940000159270 ENSGT00550000074827 ENSGT00390000009403 ENSGT00390000011314 ENSGT00940000157796 ENSGT00940000159422 ENSGT00940000153533.a ENSGT00940000155707 ENSGT00940000160380 ENSGT00910000146897 ENSGT00950000182989.A.i ENSGT00940000157327 ENSGT00940000160977 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 531 ENSGT00390000012976.d.w.e.a.a #22 ENSGT00940000158708.b ENSGT00940000158487 ENSGT00940000159270 ENSGT00550000074827 ENSGT00390000009403 ENSGT00390000011314 ENSGT00940000157796 ENSGT00940000159422 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 803 ENSRBIG00000035755 #22 CHRNB4 (ENSRBIG00000027736) CHRNA3 (ENSRBIG00000043340) CHRNA5 (ENSRBIG00000030239) PSMA4 (ENSRBIG00000007152) ENSRBIG00000030477 HYKK (ENSRBIG00000041521) IREB2 (ENSRBIG00000033855) CRABP1 (ENSRBIG00000034703) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000012976.d.w.e.a.a #22 ENSGT00940000158708.b ENSGT00940000158487 ENSGT00940000159270 ENSGT00550000074827 ENSGT00390000009403 ENSGT00390000011314 ENSGT00940000157796 ENSGT00940000159422 ENSGT00940000153533.a ENSGT00940000155707 ENSGT00940000160380 ENSGT00910000146897 ENSGT00950000182989.A ENSGT00940000157327 ENSGT00940000160977 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.a.a #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.a.a #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.a.a #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.a.a #22 Chimpanzee MODERN SPECIES 20 HYAL4 (ENSPTRG00000019642) WASL (ENSPTRG00000019640) LMOD2 (ENSPTRG00000019639) ASB15 (ENSPTRG00000019638) NDUFA5 (ENSPTRG00000019637) IQUB (ENSPTRG00000019636) SLC13A1 (ENSPTRG00000019635) TAS2R16 (ENSPTRG00000019634) ENSPTRG00000044019 CADPS2 (ENSPTRG00000019632) FEZF1 (ENSPTRG00000019631) ENSPTRG00000044831 AASS (ENSPTRG00000023614) PTPRZ1 (ENSPTRG00000019629) ENSPTRG00000045463 ENSPTRG00000043912 #22 FAM3C (ENSPTRG00000022727) WNT16 (ENSPTRG00000019627) ENSPTRG00000044943 CPED1 (ENSPTRG00000019626) ING3 (ENSPTRG00000019625) TSPAN12 (ENSPTRG00000019624) KCND2 (ENSPTRG00000047469) ENSPTRG00000050664 ANKRD7 (ENSPTRG00000019622) LSM8 (ENSPTRG00000046596) CTTNBP2 (ENSPTRG00000019620) CFTR (ENSPTRG00000019619) ASZ1 (ENSPTRG00000019618) WNT2 (ENSPTRG00000019617) ST7 (ENSPTRG00000019616) Gibbon MODERN SPECIES 21 ARNT2 (ENSNLEG00000008951) CTXND1 (ENSNLEG00000030745) FAH (ENSNLEG00000008888) ENSNLEG00000035748 ENSNLEG00000029141 ENSNLEG00000034840 ENSNLEG00000030566 ENSNLEG00000033724 TMED3 (ENSNLEG00000008832) ANKRD34C (ENSNLEG00000028399) ENSNLEG00000009500 ENSNLEG00000032326 RASGRF1 (ENSNLEG00000008805) CTSH (ENSNLEG00000008753) ENSNLEG00000008678 ENSNLEG00000032339 #22 CHRNB4 (ENSNLEG00000008668) CHRNA3 (ENSNLEG00000008651) CHRNA5 (ENSNLEG00000008645) PSMA4 (ENSNLEG00000030373) ENSNLEG00000018490 HYKK (ENSNLEG00000008639) IREB2 (ENSNLEG00000008549) CRABP1 (ENSNLEG00000008542) SKIC8 (ENSNLEG00000029873) DNAJA4 (ENSNLEG00000008494) ACSBG1 (ENSNLEG00000008482) IDH3A (ENSNLEG00000008435) CIB2 (ENSNLEG00000031509) SH2D7 (ENSNLEG00000031178) TBC1D2B (ENSNLEG00000008394) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.a.b #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.a.b #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.a.b #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2460 ENSRBIG00000040829 #22 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.b.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.b.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.b.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.b.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.b.a #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000004738 ENSGT00390000016908 ENSGT00940000159646 ENSGT00390000011067.B ENSGT00940000161531 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000165693 ENSGT00940000164262 ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.d.w.e.b.a #22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000165352 ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.f ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.e ENSGT00940000161694 ENSGT00940000158705 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 12 MAF (ENSMFAG00000064321) ENSMFAG00000061675 ENSMFAG00000055442 ENSMFAG00000054515 WWOX (ENSMFAG00000037127) CLEC3A (ENSMFAG00000050540) VAT1L (ENSMFAG00000034237) NUDT7 (ENSMFAG00000000905) ADAMTS18 (ENSMFAG00000003786) SYCE1L (ENSMFAG00000031480) MON1B (ENSMFAG00000039703) ENSMFAG00000054937 ENSMFAG00000051727 ENSMFAG00000060570 CNTNAP4 (ENSMFAG00000001819) ENSMFAG00000055239 #22 CPHXL (ENSMFAG00000045285) DUXB (ENSMFAG00000037666) TERF2IP (ENSMFAG00000034117) KARS1 (ENSMFAG00000040024) ADAT1 (ENSMFAG00000026786) ENSMFAG00000061946 GABARAPL2 (ENSMFAG00000041724) TMEM231 (ENSMFAG00000041367) CHST6 (ENSMFAG00000064157) TMEM170A (ENSMFAG00000051686) ENSMFAG00000041029 ENSMFAG00000058743 CFDP1 (ENSMFAG00000031867) ENSMFAG00000022948 BCAR1 (ENSMFAG00000035344) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.d.w.e.b.a #22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000166442 ENSGT00940000167227 ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.f ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.e ENSGT00940000161694 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 255 UVRAG (ENSRBIG00000038543) WNT11 (ENSRBIG00000042828) THAP12 (ENSRBIG00000038933) GVQW3 (ENSRBIG00000043158) ENSRBIG00000012140 EMSY (ENSRBIG00000035210) LRRC32 (ENSRBIG00000043891) WWOX (ENSRBIG00000035298) CLEC3A (ENSRBIG00000042562) VAT1L (ENSRBIG00000010655) NUDT7 (ENSRBIG00000030419) ADAMTS18 (ENSRBIG00000042780) SYCE1L (ENSRBIG00000040130) MON1B (ENSRBIG00000040530) CNTNAP4 (ENSRBIG00000037916) ENSRBIG00000004803 #22 CPHXL (ENSRBIG00000009404) ENSRBIG00000032539 TERF2IP (ENSRBIG00000032872) KARS1 (ENSRBIG00000030118) ADAT1 (ENSRBIG00000035278) GABARAPL2 (ENSRBIG00000039577) TMEM231 (ENSRBIG00000033662) CHST6 (ENSRBIG00000013592) TMEM170A (ENSRBIG00000044660) CFDP1 (ENSRBIG00000027809) BCAR1 (ENSRBIG00000030766) ENSRBIG00000028741 ENSRBIG00000043238 ZFP1 (ENSRBIG00000039257) LDHD (ENSRBIG00000042158) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.b.a #22 Gibbon MODERN SPECIES 8 ZSCAN10 (ENSNLEG00000009597) ZNF205 (ENSNLEG00000009600) ENSNLEG00000031328 ZNF200 (ENSNLEG00000033803) MEFV (ENSNLEG00000009630) ENSNLEG00000009603 TIGD7 (ENSNLEG00000018448) ENSNLEG00000009645 ZSCAN32 (ENSNLEG00000009646) ZNF174 (ENSNLEG00000029360) ZNF597 (ENSNLEG00000009655) ENSNLEG00000031700 ENSNLEG00000027592 ENSNLEG00000031353 C16orf90 (ENSNLEG00000009661) ENSNLEG00000029706 #22 CLUAP1 (ENSNLEG00000009663) NLRC3 (ENSNLEG00000009681) SLX4 (ENSNLEG00000009686) DNASE1 (ENSNLEG00000036054) TRAP1 (ENSNLEG00000009708) CREBBP (ENSNLEG00000009748) ADCY9 (ENSNLEG00000009784) ENSNLEG00000034099 SRL (ENSNLEG00000029051) TFAP4 (ENSNLEG00000009797) GLIS2 (ENSNLEG00000009834) PAM16 (ENSNLEG00000009842) ENSNLEG00000035648 CORO7 (ENSNLEG00000009847) DNAJA3 (ENSNLEG00000009811) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b #22 Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d.re.b ENSGT00940000155761 ENSGT00940000161435.b ENSGT00940000162882 ENSGT00510000049019 ENSGT00940000163640 ENSGT00390000017136 ENSGT00940000156544.a ENSGT00390000006167 ENSGT00940000158269 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234586.B.a.a ##29 ENSGT01080000257365.a ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.a #22 ENSGT00940000157836 ENSGT00940000158172 ENSGT00910000147358 ENSGT00940000162673.m ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162012 ENSGT01030000234574.B.c.a.d ENSGT00950000182951.A.b ENSGT00940000155148.b.t ENSGT00940000156833 ENSGT00940000159093 ENSGT00940000155575 ENSGT00530000063996.a.e ENSGT01050000244891.A.k.i.a Macaca ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003718.d.re.a.a ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d.se ENSGT00940000155761 ENSGT00940000161435.b ENSGT00940000162882 ENSGT00510000049019 ENSGT00940000163640 ENSGT00390000017136 ENSGT00940000156544.a ENSGT00390000006167 ENSGT00940000158269 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT01030000234586.B.a.a ##29 ENSGT01080000257365.a ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.a #22 ENSGT00940000157836 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000162673.m ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162012 ENSGT00950000182951.A.b ENSGT00940000155148.b.t ENSGT00940000156833 ENSGT00940000159093 ENSGT00940000155575 ENSGT00530000063996.a.e ENSGT01050000244891.A.k.i.a ENSGT00390000002361.a ENSGT00940000154830 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161939 ENSGT00950000183060.a.b.a ENSGT00390000003718.d.se ENSGT00940000155761 ENSGT00940000161435.b ENSGT00940000162882 ENSGT00510000049019 ENSGT00940000163640 ENSGT00390000017136 ENSGT00940000156544.a ENSGT00390000006167 ENSGT00940000158269 ENSGT00940000174433.A.b ENSGT01030000234586.B.a.a ##29 ENSGT01080000257365.a ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.a #22 ENSGT00940000157836 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000162673.m ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162012 ENSGT00950000182951.A.b ENSGT00940000155148.b.t ENSGT01100000263493.a.a.a.b.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000156833 ENSGT00940000159093 ENSGT00940000155575 ENSGT00530000063996.a.e ENSGT01100000263539.b.a.a.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.a.b ENSGT01050000244891.A.k.i.a Crab-eating macaque MODERN SPECIES 7 ENSMFAG00000034510 SDK2 (ENSMFAG00000043895) CDC42EP4 (ENSMFAG00000056650) ENSMFAG00000037840 C17orf80 (ENSMFAG00000046042) FAM104A (ENSMFAG00000042824) COG1 (ENSMFAG00000018901) ENSMFAG00000054662 SSTR2 (ENSMFAG00000030140) SLC39A11 (ENSMFAG00000031162) SOX9 (ENSMFAG00000039651) ENSMFAG00000065112 ENSMFAG00000057143 KCNJ2 (ENSMFAG00000010019) ##29 KCNJ16 (ENSMFAG00000037585) ENSMFAG00000003168 #22 MAP2K6 (ENSMFAG00000040095) ABCA5 (ENSMFAG00000041992) ABCA10 (ENSMFAG00000003350) ABCA6 (ENSMFAG00000003737) ABCA9 (ENSMFAG00000042813) ABCA8 (ENSMFAG00000046401) FAM20A (ENSMFAG00000033263) ENSMFAG00000031285 ENSMFAG00000048206 WIPI1 (ENSMFAG00000039344) SLC16A6 (ENSMFAG00000039686) ARSG (ENSMFAG00000018643) ENSMFAG00000059326 AMZ2 (ENSMFAG00000038772) ENSMFAG00000048443 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 432 DNAI2 (ENSMNEG00000031905) TTYH2 (ENSMNEG00000033098) RPL38 (ENSMNEG00000044832) ENSMNEG00000030327 SDK2 (ENSMNEG00000042378) CPSF4L (ENSMNEG00000045419) C17orf80 (ENSMNEG00000019592) FAM104A (ENSMNEG00000002163) COG1 (ENSMNEG00000032253) SSTR2 (ENSMNEG00000037800) SLC39A11 (ENSMNEG00000035521) SOX9 (ENSMNEG00000042495) ENSMNEG00000033499 KCNJ2 (ENSMNEG00000009146) ##29 KCNJ16 (ENSMNEG00000021955) ENSMNEG00000028037 #22 MAP2K6 (ENSMNEG00000036682) ABCA5 (ENSMNEG00000013415) ABCA10 (ENSMNEG00000034672) ABCA6 (ENSMNEG00000002396) ABCA9 (ENSMNEG00000004754) ABCA8 (ENSMNEG00000041857) FAM20A (ENSMNEG00000044810) ENSMNEG00000043975 WIPI1 (ENSMNEG00000042194) SLC16A6 (ENSMNEG00000007934) ARSG (ENSMNEG00000042581) AMZ2 (ENSMNEG00000030824) ENSMNEG00000010189 KPNA2 (ENSMNEG00000041275) BPTF (ENSMNEG00000033041) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d.re.b ENSGT00940000155761 ENSGT00940000161435.b ENSGT00940000162882 ENSGT00510000049019 ENSGT00940000163640 ENSGT00390000017136 ENSGT00940000156544.a ENSGT00390000006167 ENSGT00940000158269 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234586.B.a.a ##29 ENSGT01080000257365.a ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.a #22 ENSGT00940000157836 ENSGT00940000158172 ENSGT00910000147358 ENSGT00940000162673.m ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162012 ENSGT01030000234574.B.c.a.d ENSGT00950000182951.A.b ENSGT00940000155148.b.t ENSGT00940000156833 ENSGT00940000159093 ENSGT00940000155575 ENSGT00530000063996.a.e ENSGT01050000244891.A.k.i.a Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000003718.d.se ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d.re.b ENSGT00940000155761 ENSGT00940000162882 ENSGT00510000049019 ENSGT00940000163640 ENSGT00390000017136 ENSGT00940000156544.a ENSGT00390000006167 ENSGT00940000158269 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234586.B.a.a ##29 ENSGT01080000257365.a ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.a #22 ENSGT00940000157836 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000162673.m ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162012 ENSGT01030000234574.B.c.a.d ENSGT00950000182951.A.b ENSGT00940000155148.b.t ENSGT00940000156833 ENSGT00940000159093 ENSGT00940000155575 ENSGT00530000063996.a.e ENSGT01050000244891.A.k.i.a ENSGT01050000244891.A.k.j.b.b Drill MODERN SPECIES 65 ENSMLEG00000037985 ENSMLEG00000043208 SDK2 (ENSMLEG00000004609) CPSF4L (ENSMLEG00000038527) C17orf80 (ENSMLEG00000043102) FAM104A (ENSMLEG00000037920) COG1 (ENSMLEG00000012489) SSTR2 (ENSMLEG00000009848) ENSMLEG00000027808 SLC39A11 (ENSMLEG00000039135) SOX9 (ENSMLEG00000043120) ENSMLEG00000040840 ENSMLEG00000008720 KCNJ2 (ENSMLEG00000027783) ##29 KCNJ16 (ENSMLEG00000040988) ENSMLEG00000035280 #22 MAP2K6 (ENSMLEG00000031299) ABCA5 (ENSMLEG00000033484) ENSMLEG00000040631 ABCA6 (ENSMLEG00000031170) ABCA9 (ENSMLEG00000039507) ABCA8 (ENSMLEG00000033757) ENSMLEG00000042934 FAM20A (ENSMLEG00000029432) ENSMLEG00000000918 WIPI1 (ENSMLEG00000041934) ARSG (ENSMLEG00000038238) SLC16A6 (ENSMLEG00000004113) AMZ2 (ENSMLEG00000037157) ENSMLEG00000038928 BPTF (ENSMLEG00000031103) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.b #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.b #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.b #22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 17 GEMIN2 (ENSMFAG00000014362) TRAPPC6B (ENSMFAG00000001450) PNN (ENSMFAG00000003712) MIA2 (ENSMFAG00000043624) ENSMFAG00000052620 ENSMFAG00000052623 ENSMFAG00000007781 ENSMFAG00000065701 ENSMFAG00000047395 ENSMFAG00000061647 ENSMFAG00000052517 LRFN5 (ENSMFAG00000039677) ENSMFAG00000058010 ENSMFAG00000047539 ENSMFAG00000023443 ENSMFAG00000030865 #22 FSCB (ENSMFAG00000040613) ENSMFAG00000053324 ENSMFAG00000057564 ENSMFAG00000054302 C14orf28 (ENSMFAG00000032623) KLHL28 (ENSMFAG00000033166) TOGARAM1 (ENSMFAG00000041007) ENSMFAG00000000044 FANCM (ENSMFAG00000000383) MIS18BP1 (ENSMFAG00000043146) ENSMFAG00000055972 ENSMFAG00000055183 ENSMFAG00000064548 RPL10L (ENSMFAG00000053210) MDGA2 (ENSMFAG00000032319) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b #22 Gibbon MODERN SPECIES 21 SCG5 (ENSNLEG00000010645) ENSNLEG00000010680 FMN1 (ENSNLEG00000010682) RYR3 (ENSNLEG00000010690) AVEN (ENSNLEG00000010751) CHRM5 (ENSNLEG00000019193) KATNBL1 (ENSNLEG00000010772) ENSNLEG00000030518 EMC4 (ENSNLEG00000010823) SLC12A6 (ENSNLEG00000010859) NOP10 (ENSNLEG00000011119) ENSNLEG00000011122 LPCAT4 (ENSNLEG00000011127) GJD2 (ENSNLEG00000011145) ACTC1 (ENSNLEG00000011150) ENSNLEG00000035857 #22 ENSNLEG00000031378 AQR (ENSNLEG00000011180) ENSNLEG00000032348 ZNF770 (ENSNLEG00000011204) ENSNLEG00000033760 ENSNLEG00000030671 ENSNLEG00000033103 ENSNLEG00000036071 ENSNLEG00000011208 ENSNLEG00000032512 DPH6 (ENSNLEG00000030603) ENSNLEG00000031933 ENSNLEG00000019333 ENSNLEG00000035983 CDIN1 (ENSNLEG00000032501) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.f #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.f #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.f #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.f #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.f #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.f #22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 12 ZNF205 (ENSMFAG00000031163) ENSMFAG00000032481 OR1F1 (ENSMFAG00000052944) ENSMFAG00000055296 ZNF200 (ENSMFAG00000043461) MEFV (ENSMFAG00000041452) ENSMFAG00000064290 ENSMFAG00000031121 TIGD7 (ENSMFAG00000013017) ZNF75A (ENSMFAG00000042242) ZSCAN32 (ENSMFAG00000001468) ZNF174 (ENSMFAG00000025850) ENSMFAG00000058507 ZNF597 (ENSMFAG00000052188) ENSMFAG00000038482 ENSMFAG00000060256 #22 C16orf90 (ENSMFAG00000042292) CLUAP1 (ENSMFAG00000037147) NLRC3 (ENSMFAG00000044885) SLX4 (ENSMFAG00000043878) DNASE1 (ENSMFAG00000030938) TRAP1 (ENSMFAG00000041269) ADCY9 (ENSMFAG00000054277) ENSMFAG00000058808 ENSMFAG00000053629 ENSMFAG00000037383 ENSMFAG00000065645 TFAP4 (ENSMFAG00000033942) GLIS2 (ENSMFAG00000041657) CORO7 (ENSMFAG00000031015) DNAJA3 (ENSMFAG00000042573) Rhesus DUPLICATION Rhesus MODERN SPECIES 12 ZNF213 (ENSMMUG00000020970) CASP16 (ENSMMUG00000051323) OR1F1 (ENSMMUG00000052485) ENSMMUG00000059278 ZNF200 (ENSMMUG00000017972) MEFV (ENSMMUG00000017969) ENSMMUG00000052473 ZNF263 (ENSMMUG00000017973) TIGD7 (ENSMMUG00000040952) ZNF75A (ENSMMUG00000017975) ZSCAN32 (ENSMMUG00000007564) ZNF174 (ENSMMUG00000007568) ENSMMUG00000065316 ZNF597 (ENSMMUG00000054288) NAA60 (ENSMMUG00000018711) ENSMMUG00000049639 #22 C20H16orf90 (ENSMMUG00000045936) CLUAP1 (ENSMMUG00000007569) NLRC3 (ENSMMUG00000007571) SLX4 (ENSMMUG00000007574) DNASE1 (ENSMMUG00000021866) TRAP1 (ENSMMUG00000021868) CREBBP (ENSMMUG00000002286) ENSMMUG00000061528 ADCY9 (ENSMMUG00000039943) ENSMMUG00000054212 ENSMMUG00000051196 SRL (ENSMMUG00000040803) TFAP4 (ENSMMUG00000044729) GLIS2 (ENSMMUG00000015758) CORO7 (ENSMMUG00000006499) Rhesus MODERN SPECIES 17 TTC6 (ENSMMUG00000011316) SSTR1 (ENSMMUG00000039337) CLEC14A (ENSMMUG00000051249) ENSMMUG00000051750 SEC23A (ENSMMUG00000003184) ENSMMUG00000062599 GEMIN2 (ENSMMUG00000021028) TRAPPC6B (ENSMMUG00000021027) PNN (ENSMMUG00000049567) MIA2 (ENSMMUG00000021121) FBXO33 (ENSMMUG00000006984) ENSMMUG00000061753 ENSMMUG00000063162 ENSMMUG00000060176 LRFN5 (ENSMMUG00000011997) ENSMMUG00000065104 #22 FSCB (ENSMMUG00000011876) ENSMMUG00000063179 ENSMMUG00000049994 ENSMMUG00000052465 C7H14orf28 (ENSMMUG00000017677) KLHL28 (ENSMMUG00000017678) TOGARAM1 (ENSMMUG00000010860) PRPF39 (ENSMMUG00000010862) FKBP3 (ENSMMUG00000016512) FANCM (ENSMMUG00000016513) MIS18BP1 (ENSMMUG00000016515) ENSMMUG00000053931 ENSMMUG00000053288 RPL10L (ENSMMUG00000058343) MDGA2 (ENSMMUG00000015110) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.f #22 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 792 MAGEA8 (ENSPANG00000026481) ENSPANG00000049817 ENSPANG00000004032 TMEM185A (ENSPANG00000013627) ENSPANG00000042095 ENSPANG00000037367 AFF2 (ENSPANG00000002926) ENSPANG00000032630 ENSPANG00000016635 ENSPANG00000018447 ENSPANG00000048224 ENSPANG00000045404 SLITRK2 (ENSPANG00000011464) ENSPANG00000029618 ENSPANG00000017877 ENSPANG00000051175 #22 SPANXN3 (ENSPANG00000000098) SLITRK4 (ENSPANG00000005820) ENSPANG00000046479 SPANXN4 (ENSPANG00000013571) MAGEC2 (ENSPANG00000051336) ENSPANG00000017786 ENSPANG00000016851 ENSPANG00000040826 ENSPANG00000034008 SOX3 (ENSPANG00000014880) CXorf66 (ENSPANG00000021191) ATP11C (ENSPANG00000002237) F9 (ENSPANG00000002645) ENSPANG00000013572 ENSPANG00000014777 Olive baboon MODERN SPECIES 11 BBX (ENSPANG00000018335) CCDC54 (ENSPANG00000047290) ENSPANG00000030283 ENSPANG00000048087 CBLB (ENSPANG00000007141) ALCAM (ENSPANG00000009915) ZPLD1 (ENSPANG00000018975) ENSPANG00000047468 NFKBIZ (ENSPANG00000006771) NXPE3 (ENSPANG00000025575) CEP97 (ENSPANG00000000403) RPL24 (ENSPANG00000021719) ZBTB11 (ENSPANG00000021636) PCNP (ENSPANG00000034032) TRMT10C (ENSPANG00000011784) ENSPANG00000012400 #22 ENSPANG00000044303 ENSPANG00000032659 SENP7 (ENSPANG00000005243) IMPG2 (ENSPANG00000017183) ENSPANG00000038042 ABI3BP (ENSPANG00000009916) TFG (ENSPANG00000005129) ADGRG7 (ENSPANG00000006084) TMEM45A (ENSPANG00000014747) LNP1 (ENSPANG00000033088) ENSPANG00000025904 ENSPANG00000021638 TBC1D23 (ENSPANG00000012557) ENSPANG00000018918 FILIP1L (ENSPANG00000026226) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000153901.a.a ENSGT00940000160916 ENSGT00390000014089 ENSGT00390000013192 ENSGT00390000001566 ENSGT00390000017181 ENSGT00390000000068 ENSGT00390000004003 ENSGT00550000076278 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b ENSGT00940000154479.b ENSGT00470000042642 ENSGT00430000031071 ENSGT01020000230346.C.c.a.a.a.a ENSGT00940000158940 ENSGT00390000012976.d.w.f #22 ENSGT00390000007640.a ENSGT00910000147899 ENSGT00940000158094 ENSGT00940000157659 ENSGT00940000155961 ENSGT00940000154156.d.n.b.a.a.a ENSGT00940000159863 ENSGT00940000158632 ENSGT00950000182881.a.a.a ENSGT00390000014153 ENSGT00910000147035 ENSGT00530000063472.b.b.a.a ENSGT00710000106871 ENSGT00940000162001 ENSGT00390000000159 Gibbon MODERN SPECIES 3 AGBL3 (ENSNLEG00000013163) ENSNLEG00000031154 CYREN (ENSNLEG00000013225) WDR91 (ENSNLEG00000013246) ENSNLEG00000013340 CNOT4 (ENSNLEG00000013352) ENSNLEG00000018611 NUP205 (ENSNLEG00000013422) STMP1 (ENSNLEG00000036220) SLC13A4 (ENSNLEG00000013581) FAM180A (ENSNLEG00000013609) ENSNLEG00000018612 MTPN (ENSNLEG00000013619) ENSNLEG00000035281 CHRM2 (ENSNLEG00000030880) ENSNLEG00000029510 #22 PTN (ENSNLEG00000013636) DGKI (ENSNLEG00000013659) ENSNLEG00000034798 CREB3L2 (ENSNLEG00000026880) AKR1D1 (ENSNLEG00000013710) ENSNLEG00000030936 TRIM24 (ENSNLEG00000013750) SVOPL (ENSNLEG00000013825) ATP6V0A4 (ENSNLEG00000013849) TMEM213 (ENSNLEG00000028210) ENSNLEG00000029990 KIAA1549 (ENSNLEG00000013955) ZC3HAV1L (ENSNLEG00000031167) ZC3HAV1 (ENSNLEG00000014005) TTC26 (ENSNLEG00000014013) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153901.a.a ENSGT00940000160916 ENSGT00390000014089 ENSGT00390000013192 ENSGT00390000001566 ENSGT00390000017181 ENSGT00390000000068 ENSGT00390000004003 ENSGT00550000076278 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b ENSGT00940000154479.b ENSGT00470000042642 ENSGT00430000031071 ENSGT01020000230346.C.c.a.a.a.a ENSGT00940000158940 ENSGT00390000012976.d.w.f #22 ENSGT00390000007640.a ENSGT00910000147899 ENSGT00940000158094 ENSGT00940000157659 ENSGT00940000155961 ENSGT00940000154156.d.n.b.a.a.a ENSGT00940000159863 ENSGT00940000158632 ENSGT00950000182881.a.a.a ENSGT00390000014153 ENSGT00910000147035 ENSGT00530000063472.b.b.a.a ENSGT00710000106871 ENSGT00940000162001 ENSGT00390000000159 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.w.f #22 Gorilla MODERN SPECIES 2 CD44 (ENSGGOG00000000851) ENSGGOG00000043068 SLC1A2 (ENSGGOG00000041651) PAMR1 (ENSGGOG00000014257) FJX1 (ENSGGOG00000026577) TRIM44 (ENSGGOG00000004970) ENSGGOG00000037454 ENSGGOG00000024203 LDLRAD3 (ENSGGOG00000016627) COMMD9 (ENSGGOG00000012472) PRR5L (ENSGGOG00000008909) TRAF6 (ENSGGOG00000005854) RAG1 (ENSGGOG00000041736) RAG2 (ENSGGOG00000027505) IFTAP (ENSGGOG00000004773) ENSGGOG00000024548 #22 LRRC4C (ENSGGOG00000006776) API5 (ENSGGOG00000002358) TTC17 (ENSGGOG00000008811) ENSGGOG00000022574 HSD17B12 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ENSMICG00000008449 ENSMICG00000011981 TMEM69 (ENSMICG00000029891) ENSMICG00000012308 IPP (ENSMICG00000007162) MAST2 (ENSMICG00000001029) Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d.x.a.a ##22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a 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#15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d.x.a.a.a ##22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 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ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d.x.a.a.a ##22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00940000157145 ENSGT00390000000089 Murinae 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(ENSJJAG00000010348) #31 Syngr4 (ENSJJAG00000010621) #32 Tmem143 (ENSJJAG00000012044) #33 Emp3 (ENSJJAG00000012186) #34 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000001927.b #7 ENSGT00940000161908 #8 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d.x.a.a.a ##22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 Guinea pig MODERN SPECIES 70 BAX (ENSCPOG00000037703) DHDH (ENSCPOG00000011194) NUCB1 (ENSCPOG00000009433) #7 PLEKHA4 (ENSCPOG00000008161) #10 HSD17B14 (ENSCPOG00000008153) #11 BCAT2 (ENSCPOG00000012794) #12 FGF21 (ENSCPOG00000000270) #13 FUT1 (ENSCPOG00000030715) #14 RASIP1 (ENSCPOG00000001881) #15 MAMSTR (ENSCPOG00000031881) #16 ENSCPOG00000007337 #17 NTN5 (ENSCPOG00000001878) #18 CA11 (ENSCPOG00000012738) #19 DBP (ENSCPOG00000019616) #20 SPHK2 (ENSCPOG00000035448) #21 ENSCPOG00000026334 ##22 FAM83E (ENSCPOG00000032844) #23 SULT2B1 (ENSCPOG00000022158) #25 LMTK3 (ENSCPOG00000013659) #26 CYTH2 (ENSCPOG00000022636) #28 KCNJ14 (ENSCPOG00000026778) #29 GRIN2D (ENSCPOG00000036935) #27 KDELR1 (ENSCPOG00000000425) #31 SYNGR4 (ENSCPOG00000020860) #32 TMEM143 (ENSCPOG00000020531) #33 EMP3 (ENSCPOG00000001785) #34 ENSCPOG00000024178 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.a ##22 Degu MODERN SPECIES 61 ENSODEG00000011737 ENSODEG00000020039 ENSODEG00000019947 LRPPRC (ENSODEG00000011211) ABCG8 (ENSODEG00000012555) ABCG5 (ENSODEG00000010535) DYNC2LI1 (ENSODEG00000011054) PLEKHH2 (ENSODEG00000012982) ENSODEG00000010547 ENSODEG00000012111 HAAO (ENSODEG00000010886) ENSODEG00000019803 ENSODEG00000011091 ENSODEG00000012097 KCNG3 (ENSODEG00000014536) ENSODEG00000011166 ##22 COX7A2L (ENSODEG00000011433) EML4 (ENSODEG00000011507) PKDCC (ENSODEG00000014354) ENSODEG00000010490 ENSODEG00000019723 ENSODEG00000010136 ENSODEG00000019775 ENSODEG00000009978 SLC8A1 (ENSODEG00000010025) ENSODEG00000019855 ENSODEG00000010561 TMEM178A (ENSODEG00000010204) MAP4K3 (ENSODEG00000011426) CDKL4 (ENSODEG00000010265) SOS1 (ENSODEG00000012567) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 214 Slc6a6 (ENSJJAG00000017759) Lsm3 (ENSJJAG00000017351) Xpc (ENSJJAG00000017201) Tmem43 (ENSJJAG00000016739) ENSJJAG00000016008 ENSJJAG00000015764 Vmn1r54 (ENSJJAG00000015738) Wnt7a (ENSJJAG00000015421) Fbln2 (ENSJJAG00000014814) Hdac11 (ENSJJAG00000013601) Nup210 (ENSJJAG00000017557) Iqsec1 (ENSJJAG00000015042) Slc41a3 (ENSJJAG00000013462) Aldh1l1 (ENSJJAG00000012446) Klf15 (ENSJJAG00000012086) ENSJJAG00000011690 ##22 Cfap100 (ENSJJAG00000011434) Zxdc (ENSJJAG00000011015) Uroc1 (ENSJJAG00000010526) Chst13 (ENSJJAG00000010270) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2668 Zfp804b (ENSMSIG00000027177) ENSMSIG00000027170 ##22 ENSMSIG00000027166 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 Bcap31 (ENSPEMG00000018100) ENSPEMG00000001387 Pnck (ENSPEMG00000018929) Dusp9 (ENSPEMG00000009249) Atp2b3 (ENSPEMG00000001607) Bgn (ENSPEMG00000017164) Haus7 (ENSPEMG00000011467) Trex2 (ENSPEMG00000004918) Zfp92 (ENSPEMG00000029357) ENSPEMG00000002119 Zfp275 (ENSPEMG00000028598) ENSPEMG00000014112 ENSPEMG00000029415 Pnma5 (ENSPEMG00000029060) Zfp185 (ENSPEMG00000001172) ENSPEMG00000016866 ##22 Nsdhl (ENSPEMG00000028251) Cetn2 (ENSPEMG00000009693) Gabrq (ENSPEMG00000024127) Gabra3 (ENSPEMG00000018328) Magea10 (ENSPEMG00000012129) ENSPEMG00000005494 Cnga2 (ENSPEMG00000015478) Prrg3 (ENSPEMG00000023422) Vma21 (ENSPEMG00000031324) Gpr50 (ENSPEMG00000017264) Cd99l2 (ENSPEMG00000013252) Mtmr1 (ENSPEMG00000015094) Mtm1 (ENSPEMG00000002415) Mamld1 (ENSPEMG00000013693) ENSPEMG00000028824 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 256 ZFPM1 (ENSODEG00000004547) ZC3H18 (ENSODEG00000004401) IL17C (ENSODEG00000004311) CYBA (ENSODEG00000004204) MVD (ENSODEG00000004168) SNAI3 (ENSODEG00000004154) RNF166 (ENSODEG00000004145) CTU2 (ENSODEG00000004093) PIEZO1 (ENSODEG00000005089) CDT1 (ENSODEG00000004905) ENSODEG00000004857 GALNS (ENSODEG00000004721) ENSODEG00000004673 PABPN1L (ENSODEG00000004649) CBFA2T3 (ENSODEG00000004615) ENSODEG00000004407 ##22 ACSF3 (ENSODEG00000004369) CDH15 (ENSODEG00000004669) ANKRD11 (ENSODEG00000004490) ENSODEG00000019057 SPG7 (ENSODEG00000004303) ENSODEG00000004235 CPNE7 (ENSODEG00000004085) ENSODEG00000004875 DPEP1 (ENSODEG00000004853) CHMP1A (ENSODEG00000004817) ENSODEG00000004794 CDK10 (ENSODEG00000004698) SPATA2L (ENSODEG00000004672) VPS9D1 (ENSODEG00000004436) ZNF276 (ENSODEG00000004375) Degu MODERN SPECIES 51 C10orf82 (ENSODEG00000017640) HSPA12A (ENSODEG00000017751) ENO4 (ENSODEG00000017769) ENSODEG00000017934 ENSODEG00000017664 ENSODEG00000017629 VAX1 (ENSODEG00000017835) ENSODEG00000017686 SLC18A2 (ENSODEG00000017927) ENSODEG00000017676 ENSODEG00000017723 PDZD8 (ENSODEG00000017906) EMX2 (ENSODEG00000017809) RAB11FIP2 (ENSODEG00000017734) ENSODEG00000017745 ENSODEG00000017684 ##22 ENSODEG00000018333 ENSODEG00000017661 PRLHR (ENSODEG00000020548) CACUL1 (ENSODEG00000017578) NANOS1 (ENSODEG00000017556) EIF3A (ENSODEG00000017775) ENSODEG00000017551 ENSODEG00000017739 GRK5 (ENSODEG00000017760) RGS10 (ENSODEG00000017673) TIAL1 (ENSODEG00000017741) ENSODEG00000020474 BAG3 (ENSODEG00000017665) INPP5F (ENSODEG00000017771) MCMBP (ENSODEG00000017666) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.a.b ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 34 MYG1 (ENSMMMG00000002670) PFDN5 (ENSMMMG00000002736) AAAS (ENSMMMG00000002752) SP7 (ENSMMMG00000002774) SP1 (ENSMMMG00000002792) AMHR2 (ENSMMMG00000002803) PRR13 (ENSMMMG00000002834) ENSMMMG00000002876 MAP3K12 (ENSMMMG00000003252) ENSMMMG00000003318 TARBP2 (ENSMMMG00000003329) NPFF (ENSMMMG00000003352) ATF7 (ENSMMMG00000003376) ATP5MC2 (ENSMMMG00000003392) CALCOCO1 (ENSMMMG00000003404) ENSMMMG00000003492 ##22 HOXC12 (ENSMMMG00000003500) HOXC11 (ENSMMMG00000003528) HOXC10 (ENSMMMG00000003541) HOXC8 (ENSMMMG00000003555) HOXC6 (ENSMMMG00000003562) HOXC5 (ENSMMMG00000003567) HOXC4 (ENSMMMG00000003571) SMUG1 (ENSMMMG00000003585) CBX5 (ENSMMMG00000003604) ENSMMMG00000003625 NFE2 (ENSMMMG00000003708) COPZ1 (ENSMMMG00000003722) ENSMMMG00000003736 ZNF385A (ENSMMMG00000003744) ITGA5 (ENSMMMG00000003779) Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 19 Dph5 (ENSPEMG00000025433) S1pr1 (ENSPEMG00000028825) Olfm3 (ENSPEMG00000020151) Col11a1 (ENSPEMG00000017917) Rnpc3 (ENSPEMG00000020112) Amy1 (ENSPEMG00000029201) ENSPEMG00000012886 ENSPEMG00000027658 ENSPEMG00000030588 ENSPEMG00000026869 Prmt6 (ENSPEMG00000014774) Ntng1 (ENSPEMG00000016239) Vav3 (ENSPEMG00000000426) Slc25a24 (ENSPEMG00000003900) Slc25a54 (ENSPEMG00000007258) ENSPEMG00000007978 ##22 Eeig2 (ENSPEMG00000008531) Henmt1 (ENSPEMG00000010177) Prpf38b (ENSPEMG00000025269) Fndc7 (ENSPEMG00000013002) Stxbp3 (ENSPEMG00000015429) Aknad1 (ENSPEMG00000016192) Gpsm2 (ENSPEMG00000016798) Clcc1 (ENSPEMG00000017752) Wdr47 (ENSPEMG00000000140) Taf13 (ENSPEMG00000029393) ENSPEMG00000026520 Cfap276 (ENSPEMG00000018503) Elapor1 (ENSPEMG00000000166) Sars (ENSPEMG00000013142) Celsr2 (ENSPEMG00000014503) Prairie vole MODERN SPECIES 27 ENSMOCG00000006032 ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a ##22 Golden Hamster DUPLICATION Golden Hamster MODERN SPECIES 621 Stx11 (ENSMAUG00000002127) Sf3b5 (ENSMAUG00000008283) ENSMAUG00000002849 Zc2hc1b (ENSMAUG00000019428) Ltv1 (ENSMAUG00000021486) Phactr2 (ENSMAUG00000022240) Fuca2 (ENSMAUG00000021938) Pex3 (ENSMAUG00000010762) Adat2 (ENSMAUG00000013019) Aig1 (ENSMAUG00000008262) Hivep2 (ENSMAUG00000009905) Adgrg6 (ENSMAUG00000014685) Vta1 (ENSMAUG00000020904) Gje1 (ENSMAUG00000002260) Nmbr (ENSMAUG00000021278) ENSMAUG00000004450 ##22 ENSMAUG00000012425 ENSMAUG00000021746 Cited2 (ENSMAUG00000003775) Txlnb (ENSMAUG00000019209) ENSMAUG00000008713 Abracl (ENSMAUG00000002521) Reps1 (ENSMAUG00000021612) Ect2l (ENSMAUG00000010748) Ccdc28a (ENSMAUG00000012356) Nhsl1 (ENSMAUG00000017101) Hebp2 (ENSMAUG00000022054) Arfgef3 (ENSMAUG00000015376) Perp (ENSMAUG00000020965) Tnfaip3 (ENSMAUG00000019454) Olig3 (ENSMAUG00000007734) Golden Hamster MODERN SPECIES 632 Emid1 (ENSMAUG00000021658) Rhbdd3 (ENSMAUG00000005424) ENSMAUG00000008205 Gas2l1 (ENSMAUG00000003133) Rasl10a (ENSMAUG00000021590) Ap1b1 (ENSMAUG00000013837) Nipsnap1 (ENSMAUG00000008275) ENSMAUG00000007776 ##22 Nf2 (ENSMAUG00000007897) Cabp7 (ENSMAUG00000009001) Zmat5 (ENSMAUG00000021576) Ascc2 (ENSMAUG00000001729) ENSMAUG00000001830 Hormad2 (ENSMAUG00000020954) Lif (ENSMAUG00000008708) Osm (ENSMAUG00000021755) Castor1 (ENSMAUG00000020915) Tbc1d10a (ENSMAUG00000020719) Sf3a1 (ENSMAUG00000020317) Ccdc157 (ENSMAUG00000019490) Rnf215 (ENSMAUG00000016671) Sec14l2 (ENSMAUG00000017568) Mtfp1 (ENSMAUG00000019895) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 101 Pak1 (ENSCGRG00001022975) Aqp11 (ENSCGRG00001017793) Clns1a (ENSCGRG00001015805) Rsf1 (ENSCGRG00001008301) Aamdc (ENSCGRG00001016432) ENSCGRG00001012029 Ints4 (ENSCGRG00001017981) ENSCGRG00001018658 Thrsp (ENSCGRG00001006063) Ndufc2 (ENSCGRG00001017125) Alg8 (ENSCGRG00001012346) Kctd21 (ENSCGRG00001007277) Usp35 (ENSCGRG00001015950) Gab2 (ENSCGRG00001012091) Nars2 (ENSCGRG00001014939) ENSCGRG00001010169 ##22 Tenm4 (ENSCGRG00001023459) ENSCGRG00001000971 ENSCGRG00001008864 ENSCGRG00001011137 Fam181b (ENSCGRG00001022273) ENSCGRG00001019744 Prcp (ENSCGRG00001007111) Ddias (ENSCGRG00001005369) Rab30 (ENSCGRG00001021787) Pcf11 (ENSCGRG00001014596) Ankrd42 (ENSCGRG00001009333) Ccdc90b (ENSCGRG00001017562) ENSCGRG00001006228 ENSCGRG00001004849 ENSCGRG00001020141 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a ##22 Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a.c ##22 Tarsier MODERN SPECIES 4153 ENSTSYG00000027592 ##22 SLC15A5 (ENSTSYG00000006634) ENSTSYG00000034307 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a.d ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a.d ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a.d ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a.d ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a.d ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000156663.A ENSGT00940000153683.a ENSGT00940000162595 ENSGT00940000161955 ENSGT00940000159965.f.b ENSGT00940000163295 ENSGT00940000162456 ENSGT01100000263548.b.b ENSGT00940000159113.a ENSGT00940000162024 ENSGT00940000162263 ENSGT00910000147848 ENSGT00390000008314 ENSGT00910000147625 ENSGT00390000014875 ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a.d ##22 ENSGT00390000008957 ENSGT00940000159861 ENSGT00390000014091 ENSGT00950000182846.b.q ENSGT01020000230401.b.b ENSGT00940000155364 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000157834 ENSGT00910000147132 ENSGT00390000015189 ENSGT00940000158383 ENSGT00390000012037 ENSGT00940000156606 ENSGT00940000159318 ENSGT00940000155280 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161865 ENSGT00940000156663.A ENSGT00940000153683.a ENSGT00940000162595 ENSGT00940000161955 ENSGT00940000159965.f.b ENSGT00940000163295 ENSGT00940000162456 ENSGT01100000263548.b.b ENSGT00940000159113.a ENSGT00940000162024 ENSGT00940000162263 ENSGT00390000008314 ENSGT00910000147625 ENSGT00390000014875 ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a.d ##22 ENSGT00390000008957 ENSGT00940000159861 ENSGT00390000014091 ENSGT00950000182846.b.q ENSGT01020000230401.b.b ENSGT00940000155364 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000157834 ENSGT00910000147132 ENSGT00390000015189 ENSGT00940000158383 ENSGT00390000012037 ENSGT00940000156606 ENSGT00940000159318 ENSGT00940000155280 Pan ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000161865 ENSGT00940000156663.A ENSGT00940000153683.a ENSGT00940000162595 ENSGT00940000161955 ENSGT00940000159965.f.b ENSGT00940000163295 ENSGT00940000162456 ENSGT01090000261235.a ENSGT00940000159113.a ENSGT00940000162024 ENSGT00940000162263 ENSGT00390000008314 ENSGT00910000147625 ENSGT00390000014875 ENSGT00390000012976.d.x.a.b.a.d ##22 ENSGT00390000008957 ENSGT00940000159861 ENSGT00390000014091 ENSGT00950000182846.b.q ENSGT01020000230401.b.b ENSGT00940000155364 ENSGT00940000155577 ENSGT00940000157834 ENSGT00910000147132 ENSGT00390000015189 ENSGT00940000158383 ENSGT00940000156606 ENSGT00940000159318 ENSGT00940000155280 ENSGT00940000160872 Bonobo MODERN SPECIES 7 ZSCAN10 (ENSPPAG00000039788) ZNF205 (ENSPPAG00000029679) ZNF213 (ENSPPAG00000040592) ZNF200 (ENSPPAG00000029115) MEFV (ENSPPAG00000028835) ENSPPAG00000032719 TIGD7 (ENSPPAG00000001013) ENSPPAG00000029289 ENSPPAG00000033101 ZSCAN32 (ENSPPAG00000020829) ENSPPAG00000033179 ZNF174 (ENSPPAG00000032009) ZNF597 (ENSPPAG00000033411) NAA60 (ENSPPAG00000039652) C16orf90 (ENSPPAG00000032262) ENSPPAG00000035121 ##22 CLUAP1 (ENSPPAG00000028103) NLRC3 (ENSPPAG00000034416) SLX4 (ENSPPAG00000043515) DNASE1 (ENSPPAG00000035371) TRAP1 (ENSPPAG00000026134) CREBBP (ENSPPAG00000038134) ADCY9 (ENSPPAG00000015957) ENSPPAG00000024919 ENSPPAG00000029489 TFAP4 (ENSPPAG00000033388) CORO7 (ENSPPAG00000036983) GLIS2 (ENSPPAG00000027590) VASN (ENSPPAG00000003672) DNAJA3 (ENSPPAG00000005143) ENSPPAG00000028682 Chimpanzee MODERN SPECIES 7 ZNF205 (ENSPTRG00000007686) ZNF213 (ENSPTRG00000007687) ZNF200 (ENSPTRG00000007689) MEFV (ENSPTRG00000007690) ZNF263 (ENSPTRG00000007692) TIGD7 (ENSPTRG00000007693) ZNF75A (ENSPTRG00000007694) MTRNR2L4 (ENSPTRG00000041438) ZSCAN32 (ENSPTRG00000007696) ENSPTRG00000043340 ZNF174 (ENSPTRG00000007698) ZNF597 (ENSPTRG00000007699) NAA60 (ENSPTRG00000007700) NAT15 (ENSPTRG00000043232) C16H16orf90 (ENSPTRG00000034133) ENSPTRG00000051052 ##22 CLUAP1 (ENSPTRG00000007702) NLRC3 (ENSPTRG00000007703) SLX4 (ENSPTRG00000007706) DNASE1 (ENSPTRG00000007707) TRAP1 (ENSPTRG00000007708) CREBBP (ENSPTRG00000007710) ADCY9 (ENSPTRG00000007711) SRL (ENSPTRG00000007712) ENSPTRG00000047063 TFAP4 (ENSPTRG00000007713) CORO7 (ENSPTRG00000007716) GLIS2 (ENSPTRG00000007714) VASN (ENSPTRG00000031304) DNAJA3 (ENSPTRG00000007718) NMRAL1 (ENSPTRG00000007719) Gorilla MODERN SPECIES 7 MEFV (ENSGGOG00000015800) ENSGGOG00000010468 TIGD7 (ENSGGOG00000010475) ENSGGOG00000023562 OR2C1 (ENSGGOG00000008320) ENSGGOG00000039068 ZSCAN32 (ENSGGOG00000016427) ENSGGOG00000043446 ENSGGOG00000037597 ZNF174 (ENSGGOG00000016442) ZNF597 (ENSGGOG00000043594) ENSGGOG00000037117 ENSGGOG00000041058 ENSGGOG00000038910 C16orf90 (ENSGGOG00000016572) ENSGGOG00000038713 ##22 CLUAP1 (ENSGGOG00000016576) NLRC3 (ENSGGOG00000016587) SLX4 (ENSGGOG00000016599) DNASE1 (ENSGGOG00000007945) TRAP1 (ENSGGOG00000007955) CREBBP (ENSGGOG00000006025) ADCY9 (ENSGGOG00000000671) ENSGGOG00000011312 ENSGGOG00000037359 TFAP4 (ENSGGOG00000000451) PAM16 (ENSGGOG00000004713) GLIS2 (ENSGGOG00000004717) CORO7 (ENSGGOG00000004648) VASN (ENSGGOG00000025796) DNAJA3 (ENSGGOG00000009927) Tarsier MODERN SPECIES 4315 ENSTSYG00000033931 ##22 ZBTB40 (ENSTSYG00000000979) EPHA8 (ENSTSYG00000026360) C1QA (ENSTSYG00000037380) C1QC (ENSTSYG00000032136) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Rat MODERN SPECIES 17 Pced1b (ENSRNOG00000022807) Amigo2 (ENSRNOG00000007032) Slc38a4 (ENSRNOG00000006653) Slc38a2 (ENSRNOG00000006305) Slc38a1 (ENSRNOG00000005291) RGD1564963 (ENSRNOG00000069806) Scaf11 (ENSRNOG00000005263) Arid2 (ENSRNOG00000004831) ENSRNOG00000067243 Ano6 (ENSRNOG00000006995) Dbx2 (ENSRNOG00000006885) Nell2 (ENSRNOG00000006235) Tmem117 (ENSRNOG00000006068) ENSRNOG00000064416 Twf1 (ENSRNOG00000022507) ENSRNOG00000071195 ##22 Irak4 (ENSRNOG00000005965) Pus7l (ENSRNOG00000022570) Adamts20 (ENSRNOG00000033397) Prickle1 (ENSRNOG00000022772) Pphln1 (ENSRNOG00000022778) Zcrb1 (ENSRNOG00000004996) Yaf2 (ENSRNOG00000004773) Gxylt1 (ENSRNOG00000005234) Pdzrn4 (ENSRNOG00000022844) Cntn1 (ENSRNOG00000004438) AABR07058745.1 (ENSRNOG00000050884) AC096792.1 (ENSRNOG00000054624) Smgc (ENSRNOG00000037025) AC108595.1 (ENSRNOG00000032420) Lrrk2 (ENSRNOG00000004048) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3302 Crk (ENSMSIG00000024436) Ywhae (ENSMSIG00000024444) Doc2b (ENSMSIG00000024467) Rph3al (ENSMSIG00000024486) 1700016K19Rik (ENSMSIG00000024518) ENSMSIG00000024526 Vps53 (ENSMSIG00000024533) Tlcd3a (ENSMSIG00000024761) Gemin4 (ENSMSIG00000024775) ENSMSIG00000024822 Dbil5 (ENSMSIG00000024828) Mrm3 (ENSMSIG00000024835) Nxn (ENSMSIG00000024846) Timm22 (ENSMSIG00000024863) Abr (ENSMSIG00000024887) ENSMSIG00000025320 ##22 Bhlha9 (ENSMSIG00000025324) Trarg1 (ENSMSIG00000025329) Gosr1 (ENSMSIG00000025334) Cpd (ENSMSIG00000025347) Tmigd1 (ENSMSIG00000025382) Blmh (ENSMSIG00000025419) Slc6a4 (ENSMSIG00000025438) Nsrp1 (ENSMSIG00000025473) Efcab5 (ENSMSIG00000025530) ENSMSIG00000025570 Ssh2 (ENSMSIG00000025588) ENSMSIG00000025656 Coro6 (ENSMSIG00000025660) ENSMSIG00000025858 Git1 (ENSMSIG00000025882) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Cricetinae DUPLICATION Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b.a ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 44 Ugt2b1 (ENSCGRG00001018386) ENSCGRG00001008437 ##22 ENSCGRG00001003360 ENSCGRG00001017054 Ythdc1 (ENSCGRG00001000816) Tmprss11e (ENSCGRG00001021954) Tmprss11b (ENSCGRG00001013017) Tmprss11f (ENSCGRG00001015940) Tmprss11g (ENSCGRG00001004910) Tmprss11a (ENSCGRG00001024889) Tmprss11d (ENSCGRG00001024644) Tmprss11c (ENSCGRG00001005492) Gnrhr (ENSCGRG00001000278) ENSCGRG00001016191 Uba6 (ENSCGRG00001007962) Stap1 (ENSCGRG00001021063) Cenpc1 (ENSCGRG00001015797) Golden Hamster MODERN SPECIES 667 Dcaf1 (ENSMAUG00000020890) Rad54l2 (ENSMAUG00000011651) Grm2 (ENSMAUG00000008556) Iqcf6 (ENSMAUG00000020900) Iqcf4 (ENSMAUG00000020377) Iqcf5 (ENSMAUG00000021864) Iqcf1 (ENSMAUG00000010313) Rrp9 (ENSMAUG00000021744) Parp3 (ENSMAUG00000010154) Gpr62 (ENSMAUG00000010973) Pcbp4 (ENSMAUG00000021064) Abhd14b (ENSMAUG00000020892) Abhd14a (ENSMAUG00000021839) Acy1 (ENSMAUG00000009332) ENSMAUG00000017959 ENSMAUG00000019982 ##22 Dusp7 (ENSMAUG00000020685) Poc1a (ENSMAUG00000017403) Alas1 (ENSMAUG00000019423) Tlr9 (ENSMAUG00000017446) Twf2 (ENSMAUG00000004692) Ppm1m (ENSMAUG00000019115) Wdr82 (ENSMAUG00000019638) Glyctk (ENSMAUG00000021788) Col6a4 (ENSMAUG00000018662) Col6a5 (ENSMAUG00000018573) Col6a6 (ENSMAUG00000011745) Pik3r4 (ENSMAUG00000021984) Atp2c1 (ENSMAUG00000013153) Aste1 (ENSMAUG00000021373) ENSMAUG00000021626 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b.b ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 618 Agps (ENSMAUG00000017317) Nfe2l2 (ENSMAUG00000017700) ENSMAUG00000017462 Mtx2 (ENSMAUG00000017870) Hoxd1 (ENSMAUG00000018401) Hoxd3 (ENSMAUG00000018318) Hoxd4 (ENSMAUG00000018545) Hoxd8 (ENSMAUG00000018092) Hoxd9 (ENSMAUG00000018538) Hoxd10 (ENSMAUG00000016731) ENSMAUG00000020249 Hoxd12 (ENSMAUG00000018416) Hoxd13 (ENSMAUG00000017185) Evx2 (ENSMAUG00000020383) Lnpk (ENSMAUG00000018821) ENSMAUG00000020495 ##22 Atp5g3 (ENSMAUG00000017685) Atf2 (ENSMAUG00000018366) Chn1 (ENSMAUG00000018455) Chrna1 (ENSMAUG00000017924) ENSMAUG00000019796 Gpr155 (ENSMAUG00000019481) Scrn3 (ENSMAUG00000020703) ENSMAUG00000019383 Sp9 (ENSMAUG00000020520) Ola1 (ENSMAUG00000019168) ENSMAUG00000001485 ENSMAUG00000020351 Cdca7 (ENSMAUG00000020932) Map3k20 (ENSMAUG00000021309) Rapgef4 (ENSMAUG00000021185) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.a.b.b ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 3 Cd47 (ENSPEMG00000017957) Ift57 (ENSPEMG00000018735) ENSPEMG00000028363 Myh15 (ENSPEMG00000009117) Cip2a (ENSPEMG00000017928) Dzip3 (ENSPEMG00000019145) ENSPEMG00000025860 ENSPEMG00000026489 ENSPEMG00000029157 ENSPEMG00000015272 ENSPEMG00000008553 ENSPEMG00000029878 ENSPEMG00000026123 Retnlb (ENSPEMG00000011003) Trat1 (ENSPEMG00000014746) ENSPEMG00000030457 ##22 Morc1 (ENSPEMG00000018148) Gm5485 (ENSPEMG00000012775) Dppa2 (ENSPEMG00000011758) Dppa4 (ENSPEMG00000010661) ENSPEMG00000027241 ENSPEMG00000025124 ENSPEMG00000026546 ENSPEMG00000031353 ENSPEMG00000027538 ENSPEMG00000008865 ENSPEMG00000026718 Cd96 (ENSPEMG00000029899) Plcxd2 (ENSPEMG00000000526) Phldb2 (ENSPEMG00000018799) Abhd10 (ENSPEMG00000018151) Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.b.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.b.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.b.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.b.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.b.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.b.a ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 31 IL13RA1 (ENSHGLG00000001323) ZCCHC12 (ENSHGLG00000036218) LONRF3 (ENSHGLG00000002169) ENSHGLG00000011436 ENSHGLG00000021066 PGRMC1 (ENSHGLG00000011689) ENSHGLG00000011847 ENSHGLG00000043718 SLC25A43 (ENSHGLG00000044553) SLC25A5 (ENSHGLG00000000244) UBE2A (ENSHGLG00000013610) STEEP1 (ENSHGLG00000017843) NKRF (ENSHGLG00000013935) SEPT6 (ENSHGLG00000045974) ENSHGLG00000021365 ENSHGLG00000040456 ##22 ENSHGLG00000048082 ENSHGLG00000019569 UPF3B (ENSHGLG00000019582) ENSHGLG00000040509 ENSHGLG00000033450 ENSHGLG00000039528 ENSHGLG00000032810 ENSHGLG00000040898 ENSHGLG00000039888 ENSHGLG00000049926 ENSHGLG00000032932 ZBTB33 (ENSHGLG00000000484) TMEM255A (ENSHGLG00000000612) ENSHGLG00000036791 ATP1B4 (ENSHGLG00000048642) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.b.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.b.a ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 300 SPG7 (ENSOGAG00000015790) RPL13 (ENSOGAG00000026444) CPNE7 (ENSOGAG00000001075) DPEP1 (ENSOGAG00000004881) ENSOGAG00000004883 SPATA33 (ENSOGAG00000004885) CDK10 (ENSOGAG00000004886) SPATA2L (ENSOGAG00000028038) VPS9D1 (ENSOGAG00000004889) ZNF276 (ENSOGAG00000004891) FANCA (ENSOGAG00000004893) SPIRE2 (ENSOGAG00000004901) TCF25 (ENSOGAG00000004904) TUBB3 (ENSOGAG00000032833) DEF8 (ENSOGAG00000004911) ENSOGAG00000024894 ##22 DBNDD1 (ENSOGAG00000028679) GAS8 (ENSOGAG00000005434) ENSOGAG00000030671 ENSOGAG00000027365 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.b.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.b.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.x.b.b ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 212 PATE1 (ENSOGAG00000013405) PATE2 (ENSOGAG00000013407) ENSOGAG00000029669 PUS3 (ENSOGAG00000008913) HYLS1 (ENSOGAG00000008916) DDX25 (ENSOGAG00000013409) CDON (ENSOGAG00000008918) ENSOGAG00000028968 ##22 RPUSD4 (ENSOGAG00000008922) FAM118B (ENSOGAG00000008923) SRPRA (ENSOGAG00000008926) FOXRED1 (ENSOGAG00000008933) TIRAP (ENSOGAG00000008935) DCPS (ENSOGAG00000008937) ST3GAL4 (ENSOGAG00000010459) KIRREL3 (ENSOGAG00000010463) ETS1 (ENSOGAG00000015467) FLI1 (ENSOGAG00000013083) KCNJ1 (ENSOGAG00000031352) KCNJ5 (ENSOGAG00000013078) ARHGAP32 (ENSOGAG00000002135) BARX2 (ENSOGAG00000009784) ENSOGAG00000026612 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d #22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00830000128447 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d #22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00830000128447 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d #22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00830000128447 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d #22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00960000186612.A ENSGT01100000263521.a.b.a.b Equus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d #22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 ENSGT00940000162921 ENSGT00960000186612.A.l.a Horse MODERN SPECIES 1 TULP2 (ENSECAG00000010999) #8 PLEKHA4 (ENSECAG00000024841) #10 BCAT2 (ENSECAG00000011310) #12 FGF21 (ENSECAG00000010695) #13 FUT1 (ENSECAG00000006058) #14 IZUMO1 (ENSECAG00000009165) RASIP1 (ENSECAG00000021108) #15 MAMSTR (ENSECAG00000020390) #16 ENSECAG00000039846 ##17 ENSECAG00000028964 ##17 ENSECAG00000005681 #17 NTN5 (ENSECAG00000019279) #18 CA11 (ENSECAG00000018341) #19 DBP (ENSECAG00000014275) #20 SPHK2 (ENSECAG00000007474) #21 RPL18 (ENSECAG00000021927) #22 FAM83E (ENSECAG00000020402) #23 SULT2B1 (ENSECAG00000015059) #25 LMTK3 (ENSECAG00000013701) #26 CYTH2 (ENSECAG00000009878) #28 GRWD1 (ENSECAG00000019607) #30 KDELR1 (ENSECAG00000012699) #31 GRIN2D (ENSECAG00000037147) #27 SYNGR4 (ENSECAG00000012381) #32 TMEM143 (ENSECAG00000010122) #33 EMP3 (ENSECAG00000050101) #34 ODAD1 (ENSECAG00000009302) ZNF114 (ENSECAG00000009283) ENSECAG00000034914 ENSECAG00000043494 ZSWIM9 (ENSECAG00000033101) Donkey MODERN SPECIES 18 PPP1R15A (ENSEASG00005025885) #9 PLEKHA4 (ENSEASG00005004778) #10 HSD17B14 (ENSEASG00005004757) #11 BCAT2 (ENSEASG00005004733) #12 FGF21 (ENSEASG00005004718) #13 FUT1 (ENSEASG00005034214) #14 IZUMO1 (ENSEASG00005035661) RASIP1 (ENSEASG00005004696) #15 MAMSTR (ENSEASG00005004688) #16 FUT2 (ENSEASG00005036881) ##17 ENSEASG00005004684 #17 NTN5 (ENSEASG00005004680) #18 CA11 (ENSEASG00005004677) #19 DBP (ENSEASG00005004667) #20 SPHK2 (ENSEASG00005034300) #21 ENSEASG00005004636 #22 SPACA4 (ENSEASG00005004615) #24 FAM83E (ENSEASG00005004610) #23 SULT2B1 (ENSEASG00005004606) #25 ENSEASG00005037733 #26 CYTH2 (ENSEASG00005004547) #28 KCNJ14 (ENSEASG00005027713) #29 GRWD1 (ENSEASG00005004540) #30 GRIN2D (ENSEASG00005004530) #27 KDELR1 (ENSEASG00005004521) #31 SYNGR4 (ENSEASG00005004517) #32 TMEM143 (ENSEASG00005004515) #33 EMP3 (ENSEASG00005024504) #34 ENSEASG00005004495 #35 ENSEASG00005004490 ENSEASG00005004484 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00990000212874 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d #22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 ENSGT00390000011694 ENSGT00940000157783 Megabat MODERN SPECIES 1011 DHDH (ENSPVAG00000009566) NUCB1 (ENSPVAG00000009563) #7 TULP2 (ENSPVAG00000009561) #8 PPP1R15A (ENSPVAG00000009560) #9 PLEKHA4 (ENSPVAG00000009557) #10 ENSPVAG00000009551 BCAT2 (ENSPVAG00000009544) #12 ENSPVAG00000009543 #13 IZUMO1 (ENSPVAG00000009540) RASIP1 (ENSPVAG00000009537) #15 MAMSTR (ENSPVAG00000009535) #16 NTN5 (ENSPVAG00000009531) #18 ENSPVAG00000009529 #19 DBP (ENSPVAG00000009528) #20 SPHK2 (ENSPVAG00000009526) #21 RPL18 (ENSPVAG00000009524) #22 FAM83E (ENSPVAG00000009522) #23 ENSPVAG00000009520 #26 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00990000212874 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d #22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 ENSGT00390000011694 ENSGT00940000167541 Microbat MODERN SPECIES 1872 ENSMLUG00000026601 #13 FUT1 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#9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136.b #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d #22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00950000183364 ENSGT00940000162921 ENSGT00830000128447 ENSGT00390000011694 Polar bear DUPLICATION Polar bear MODERN SPECIES 115 NUCB1 (ENSUMAG00000001370) #7 TULP2 (ENSUMAG00000001243) #8 PPP1R15A (ENSUMAG00000001228) #9 PLEKHA4 (ENSUMAG00000000980) #10 HSD17B14 (ENSUMAG00000000972) #11 BCAT2 (ENSUMAG00000000838) 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ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d.t #22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00940000162678.c.a ENSGT00830000128447.d Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 271 PYCR2 (ENSCAFG00020003264) TMEM63A (ENSCAFG00020003274) EPHX1 (ENSCAFG00020003279) SRP9 (ENSCAFG00020003285) ENAH (ENSCAFG00020003296) LBR (ENSCAFG00020003321) ENSCAFG00020003326 ENSCAFG00020003333 ENSCAFG00020003357 ENSCAFG00020003361 ENSCAFG00020003365 CNIH3 (ENSCAFG00020003397) WDR26 (ENSCAFG00020003429) CNIH4 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#25 LMTK3 (ENSCAFG00020026391) #26 CYTH2 (ENSCAFG00020026412) #28 KCNJ14 (ENSCAFG00020026435) #29 GRWD1 (ENSCAFG00020026436) #30 GRIN2D (ENSCAFG00020026438) #27 KDELR1 (ENSCAFG00020026440) #31 SYNGR4 (ENSCAFG00020026441) #32 TMEM143 (ENSCAFG00020026442) #33 EMP3 (ENSCAFG00020026443) #34 ODAD1 (ENSCAFG00020026444) #35 ENSCAFG00020026445 ENSCAFG00020026447 Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 35 ENSCAFG00845009009 PYCR2 (ENSCAFG00845009034) ENSCAFG00845009114 TMEM63A (ENSCAFG00845009155) EPHX1 (ENSCAFG00845009397) SRP9 (ENSCAFG00845009505) ENAH (ENSCAFG00845009892) LBR (ENSCAFG00845010980) DNAH14 (ENSCAFG00845011498) ENSCAFG00845012247 ENSCAFG00845012260 CNIH3 (ENSCAFG00845012278) WDR26 (ENSCAFG00845012382) CNIH4 (ENSCAFG00845012452) NVL (ENSCAFG00845012656) ENSCAFG00845012857 #22 DEGS1 (ENSCAFG00845012915) FBXO28 (ENSCAFG00845012940) ENSCAFG00845012978 TP53BP2 (ENSCAFG00845013060) CAPN2 (ENSCAFG00845013136) ENSCAFG00845013276 ENSCAFG00845013378 CD5L (ENSCAFG00845013426) FCRL1 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(ENSCAFG00845001628) #34 CCDC114 (ENSCAFG00845001666) #35 ENSCAFG00845001715 CARD8 (ENSCAFG00845001775) Artiodactyla DUPLICATION Artiodactyla DUPLICATION Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.u.a #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.u.a #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.u.a #22 Arabian camel MODERN SPECIES 22 ANKH (ENSCDRG00005002678) FBXL7 (ENSCDRG00005002650) MARCHF11 (ENSCDRG00005002629) ENSCDRG00005002615 ENSCDRG00005002600 RETREG1 (ENSCDRG00005002579) MYO10 (ENSCDRG00005002542) ENSCDRG00005002517 ENSCDRG00005002502 CDH18 (ENSCDRG00005002478) ENSCDRG00005002470 CDH12 (ENSCDRG00005002445) CDH10 (ENSCDRG00005002409) CDH9 (ENSCDRG00005002390) ENSCDRG00005002378 ENSCDRG00005002367 #22 CDH6 (ENSCDRG00005002349) DROSHA (ENSCDRG00005002311) C5orf22 (ENSCDRG00005002291) PDZD2 (ENSCDRG00005002253) GOLPH3 (ENSCDRG00005002236) MTMR12 (ENSCDRG00005002210) ZFR (ENSCDRG00005002165) SUB1 (ENSCDRG00005002152) NPR3 (ENSCDRG00005002141) ENSCDRG00005002135 TARS1 (ENSCDRG00005002113) ADAMTS12 (ENSCDRG00005002046) ENSCDRG00005002019 SLC45A2 (ENSCDRG00005001980) AMACR (ENSCDRG00005001960) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.u.a #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.u.a #22 Blue whale MODERN SPECIES SLC9A1 (ENSBMSG00010007105) TENT5B (ENSBMSG00010007093) TRNP1 (ENSBMSG00010007081) ENSBMSG00010007072 KDF1 (ENSBMSG00010007059) NUDC (ENSBMSG00010007048) NR0B2 (ENSBMSG00010007031) GPATCH3 (ENSBMSG00010007019) GPN2 (ENSBMSG00010006997) SFN (ENSBMSG00010006986) ZDHHC18 (ENSBMSG00010006969) ENSBMSG00010006951 PIGV (ENSBMSG00010006940) ARID1A (ENSBMSG00010006900) RPS6KA1 (ENSBMSG00010006719) ENSBMSG00010006627 #22 ENSBMSG00010006614 DHDDS (ENSBMSG00010006583) ENSBMSG00010006545 ZNF683 (ENSBMSG00010006527) CRYBG2 (ENSBMSG00010006433) ENSBMSG00010006397 UBXN11 (ENSBMSG00010006285) SH3BGRL3 (ENSBMSG00010006248) CEP85 (ENSBMSG00010006227) CATSPER4 (ENSBMSG00010006207) CNKSR1 (ENSBMSG00010006179) ZNF593OS (ENSBMSG00010006167) ZNF593 (ENSBMSG00010006155) C1orf232 (ENSBMSG00010006145) FAM110D (ENSBMSG00010006138) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.u.b #22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.d.u.b #22 Pig MODERN SPECIES 14 TULP2 (ENSSSCG00000003149) #8 PPP1R15A (ENSSSCG00000003155) #9 PLEKHA4 (ENSSSCG00000003137) #10 BCAT2 (ENSSSCG00000003139) #12 FGF21 (ENSSSCG00000003140) #13 FUT1 (ENSSSCG00000038580) #14 IZUMO1 (ENSSSCG00000003142) RASIP1 (ENSSSCG00000029151) #15 MAMSTR (ENSSSCG00000003143) #16 FUT2 (ENSSSCG00000003145) ##17 NTN5 (ENSSSCG00000003146) #18 CA11 (ENSSSCG00000003147) #19 ENSSSCG00000040556 #17 DBP (ENSSSCG00000003148) #20 SPHK2 (ENSSSCG00000030425) #21 ENSSSCG00000025928 #22 SPACA4 (ENSSSCG00000025441) #24 FAM83E (ENSSSCG00000025975) #23 SULT2B1 (ENSSSCG00000023280) #25 LMTK3 (ENSSSCG00000030561) #26 CYTH2 (ENSSSCG00000003136) #28 KCNJ14 (ENSSSCG00000003135) #29 GRWD1 (ENSSSCG00000003134) #30 GRIN2D (ENSSSCG00000003133) #27 KDELR1 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SPECIES 799 PPP1R15A (ENSCWAG00000004142) #9 PLEKHA4 (ENSCWAG00000004107) #10 HSD17B14 (ENSCWAG00000004042) #11 BCAT2 (ENSCWAG00000003938) #12 FGF21 (ENSCWAG00000003895) #13 FUT1 (ENSCWAG00000003881) #14 IZUMO1 (ENSCWAG00000003812) RASIP1 (ENSCWAG00000016586) #15 MAMSTR (ENSCWAG00000016467) #16 ENSCWAG00000016446 ##17 ENSCWAG00000016423 #17 NTN5 (ENSCWAG00000016374) #18 CA11 (ENSCWAG00000016300) #19 DBP (ENSCWAG00000016241) #20 SPHK2 (ENSCWAG00000016163) #21 RPL18 (ENSCWAG00000016034) #22 SPACA4 (ENSCWAG00000016008) #24 FAM83E (ENSCWAG00000015962) #23 SULT2B1 (ENSCWAG00000015867) #25 LMTK3 (ENSCWAG00000015668) #26 CYTH2 (ENSCWAG00000015567) #28 KCNJ14 (ENSCWAG00000015542) #29 GRWD1 (ENSCWAG00000015508) #30 GRIN2D (ENSCWAG00000015395) #27 KDELR1 (ENSCWAG00000015347) #31 SYNGR4 (ENSCWAG00000015298) #32 TMEM143 (ENSCWAG00000015029) #33 EMP3 (ENSCWAG00000014962) #34 ENSCWAG00000014738 ENSCWAG00000014692 ZSWIM9 (ENSCWAG00000014642) Pig MODERN SPECIES ENSSSCG00000043963 ENSSSCG00000040797 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#16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d.v #22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 ENSGT01100000263495.A.a.a ENSGT00960000186612.A.o.a Camelidae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 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#29 GRWD1 (ENSCDRG00005001910) #30 GRIN2D (ENSCDRG00005001886) #27 KDELR1 (ENSCDRG00005001862) #31 SYNGR4 (ENSCDRG00005001841) #32 TMEM143 (ENSCDRG00005001812) #33 EMP3 (ENSCDRG00005001790) #34 ODAD1 (ENSCDRG00005001762) #35 ENSCDRG00005001749 ENSCDRG00005001743 ENSCDRG00005001735 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.d.v #22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 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(ENSOARG00020015518) #34 ENSOARG00020014718 ENSOARG00020014647 ENSOARG00020014629 ENSOARG00020014616 Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 9 PPP1R15A (ENSCHIG00000021684) #9 PLEKHA4 (ENSCHIG00000024507) #10 HSD17B14 (ENSCHIG00000023978) #11 BCAT2 (ENSCHIG00000008019) #12 FGF21 (ENSCHIG00000025254) #13 FUT1 (ENSCHIG00000019772) #14 IZUMO1 (ENSCHIG00000021873) RASIP1 (ENSCHIG00000016547) #15 MAMSTR (ENSCHIG00000017698) #16 FUT2 (ENSCHIG00000014375) ##17 ENSCHIG00000023768 #17 NTN5 (ENSCHIG00000023495) #18 CA11 (ENSCHIG00000023460) #19 DBP (ENSCHIG00000022150) #20 SPHK2 (ENSCHIG00000024197) #21 ENSCHIG00000017451 #22 SPACA4 (ENSCHIG00000009568) #24 FAM83E (ENSCHIG00000015933) #23 SULT2B1 (ENSCHIG00000023093) #25 LMTK3 (ENSCHIG00000016447) #26 CYTH2 (ENSCHIG00000010907) #28 KCNJ14 (ENSCHIG00000025744) #29 GRWD1 (ENSCHIG00000018080) #30 GRIN2D (ENSCHIG00000027247) #27 KDELR1 (ENSCHIG00000021544) #31 SYNGR4 (ENSCHIG00000026260) #32 TMEM143 (ENSCHIG00000016978) #33 EMP3 (ENSCHIG00000026219) #34 ENSCHIG00000007852 ENSCHIG00000025224 ENSCHIG00000024324 Goat MODERN SPECIES 4 ENSCHIG00000016875 ENSCHIG00000024952 ENSCHIG00000006706 ENSCHIG00000024303 ENSCHIG00000018837 ENSCHIG00000025340 ENSCHIG00000010822 ENSCHIG00000024446 ENSCHIG00000022735 ENSCHIG00000025619 WFDC2 (ENSCHIG00000023883) EPPIN (ENSCHIG00000024806) WFDC10A (ENSCHIG00000024267) WFDC11 (ENSCHIG00000015007) ENSCHIG00000015666 ENSCHIG00000027151 #22 ENSCHIG00000019494 DNTTIP1 (ENSCHIG00000023238) UBE2C (ENSCHIG00000016162) TNNC2 (ENSCHIG00000010571) SNX21 (ENSCHIG00000026212) ACOT8 (ENSCHIG00000017449) ZSWIM3 (ENSCHIG00000018636) ZSWIM1 (ENSCHIG00000003236) SPATA25 (ENSCHIG00000025305) NEURL2 (ENSCHIG00000023384) CTSA (ENSCHIG00000024206) PLTP (ENSCHIG00000021164) PCIF1 (ENSCHIG00000010762) ZNF335 (ENSCHIG00000022148) MMP9 (ENSCHIG00000016983) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 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(ENSBGRG00000020732) #22 FAM83E (ENSBGRG00000021009) #23 SPACA4 (ENSBGRG00000021057) #24 SULT2B1 (ENSBGRG00000021082) #25 LMTK3 (ENSBGRG00000021230) #26 CYTH2 (ENSBGRG00000021287) #28 KCNJ14 (ENSBGRG00000021570) #29 GRWD1 (ENSBGRG00000021592) #30 GRIN2D (ENSBGRG00000021624) #27 KDELR1 (ENSBGRG00000021688) #31 SYNGR4 (ENSBGRG00000021768) #32 TMEM143 (ENSBGRG00000021815) #33 EMP3 (ENSBGRG00000021880) #34 ENSBGRG00000021948 ENSBGRG00000021999 ENSBGRG00000022007 Wild yak MODERN SPECIES 720 PPP1R15A (ENSBMUG00000015896) #9 PLEKHA4 (ENSBMUG00000015946) #10 HSD17B14 (ENSBMUG00000015987) #11 BCAT2 (ENSBMUG00000016040) #12 FGF21 (ENSBMUG00000016082) #13 FUT1 (ENSBMUG00000016096) #14 IZUMO1 (ENSBMUG00000016133) RASIP1 (ENSBMUG00000016153) #15 MAMSTR (ENSBMUG00000016195) #16 FUT2 (ENSBMUG00000016210) ##17 ENSBMUG00000016219 #17 CA11 (ENSBMUG00000016248) #19 ENSBMUG00000016256 ENSBMUG00000016282 #20 SPHK2 (ENSBMUG00000016308) #21 RPL18 (ENSBMUG00000016360) #22 FAM83E (ENSBMUG00000016380) #23 SPACA4 (ENSBMUG00000016388) #24 SULT2B1 (ENSBMUG00000016418) #25 LMTK3 (ENSBMUG00000016497) #26 CYTH2 (ENSBMUG00000016644) #28 KCNJ14 (ENSBMUG00000016716) #29 GRWD1 (ENSBMUG00000016721) #30 GRIN2D (ENSBMUG00000016762) #27 KDELR1 (ENSBMUG00000016785) #31 SYNGR4 (ENSBMUG00000016799) #32 TMEM143 (ENSBMUG00000016866) #33 EMP3 (ENSBMUG00000016899) #34 ENSBMUG00000016919 ENSBMUG00000016934 ENSBMUG00000016947 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 893 ENSGT00390000012976.d #22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 Hedgehog MODERN SPECIES 4634 RPL18 (ENSEEUG00000015872) #22 FAM83E (ENSEEUG00000015833) #23 Common shrew MODERN SPECIES 3379 ENSSARG00000010366 #22 SPACA4 (ENSSARG00000010364) #24 ENSSARG00000010353 #23 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 881 ENSGT00390000010218.f.a.b.a.b ENSGT00910000146981 ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3162 ENSRROG00000013033 DNAJC10 (ENSRROG00000030365) FRZB (ENSRROG00000045430) NCKAP1 (ENSRROG00000044734) DUSP19 (ENSRROG00000039223) NUP35 (ENSRROG00000026525) ENSRROG00000032651 ENSRROG00000037791 ENSRROG00000029549 ENSRROG00000033144 ##22 ENSRROG00000028811 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 544 ENSRBIG00000037601 ENSRBIG00000040865 ENSRBIG00000024922 ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Gibbon MODERN SPECIES 11 ARL14EPL (ENSNLEG00000035776) COMMD10 (ENSNLEG00000026562) ENSNLEG00000033349 SEMA6A (ENSNLEG00000011779) ENSNLEG00000035368 ENSNLEG00000031042 ENSNLEG00000030536 DTWD2 (ENSNLEG00000011825) DMXL1 (ENSNLEG00000011838) TNFAIP8 (ENSNLEG00000011925) HSD17B4 (ENSNLEG00000011926) FAM170A (ENSNLEG00000011943) ENSNLEG00000034199 PRR16 (ENSNLEG00000011947) ENSNLEG00000031918 ENSNLEG00000027706 ##22 FTMT (ENSNLEG00000018895) ENSNLEG00000032909 SRFBP1 (ENSNLEG00000011949) LOX (ENSNLEG00000011966) ENSNLEG00000011997 SNCAIP (ENSNLEG00000011998) ENSNLEG00000029668 ENSNLEG00000031106 SNX24 (ENSNLEG00000012059) PPIC (ENSNLEG00000012061) PRDM6 (ENSNLEG00000012064) CEP120 (ENSNLEG00000012069) CSNK1G3 (ENSNLEG00000012089) ZNF608 (ENSNLEG00000012117) ENSNLEG00000028602 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000153745.b ENSGT00940000154108.b.a.a ENSGT00940000160003 ENSGT00390000017004.a.a ENSGT00950000183088.a.b.b ENSGT00390000005218 ENSGT00390000004446 ENSGT00930000150973.B ENSGT00940000158244 ENSGT00940000154950.w ENSGT00530000069080 ENSGT00940000162188 ENSGT00390000009613.b ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 ENSGT00940000157370 ENSGT00940000157714 ENSGT00940000159984 ENSGT00940000159660 ENSGT00390000008294.f ENSGT00390000001376.db ENSGT00940000157910 ENSGT00940000159823 ENSGT00950000182924.B.a.a ENSGT00940000158059 ENSGT00940000155140 ENSGT00930000151042 ENSGT00730000111223 ENSGT01100000263524.I ENSGT00940000156627 Horse MODERN SPECIES 11 TACR3 (ENSECAG00000012284) CXXC4 (ENSECAG00000030032) TET2 (ENSECAG00000004773) PPA2 (ENSECAG00000011236) INTS12 (ENSECAG00000010911) ARHGEF38 (ENSECAG00000011171) GSTCD (ENSECAG00000009590) NPNT (ENSECAG00000008518) TBCK (ENSECAG00000006577) AIMP1 (ENSECAG00000006138) DKK2 (ENSECAG00000032911) PAPSS1 (ENSECAG00000021678) ENSECAG00000032757 ##22 SGMS2 (ENSECAG00000021665) CYP2U1 (ENSECAG00000048143) CYP2U1 (ENSECAG00000021232) ENSECAG00000057434 LEF1 (ENSECAG00000019975) RPL34 (ENSECAG00000019719) OSTC (ENSECAG00000019709) ETNPPL (ENSECAG00000018724) COL25A1 (ENSECAG00000017518) SEC24B (ENSECAG00000016518) MCUB (ENSECAG00000016301) CASP6 (ENSECAG00000015479) CFI (ENSECAG00000013869) GAR1 (ENSECAG00000013624) RRH (ENSECAG00000013464) Donkey MODERN SPECIES 22 ENSEASG00005037471 ENSEASG00005004456 CXXC4 (ENSEASG00005024013) TET2 (ENSEASG00005004466) PPA2 (ENSEASG00005004477) ENSEASG00005033358 ARHGEF38 (ENSEASG00005004487) INTS12 (ENSEASG00005004498) GSTCD (ENSEASG00005004503) NPNT (ENSEASG00005004514) TBCK (ENSEASG00005004526) ENSEASG00005004535 ENSEASG00005004539 DKK2 (ENSEASG00005028714) PAPSS1 (ENSEASG00005004544) ENSEASG00005033971 ##22 SGMS2 (ENSEASG00005004553) CYP2U1 (ENSEASG00005004558) HADH (ENSEASG00005004564) LEF1 (ENSEASG00005004575) ENSEASG00005004585 OSTC (ENSEASG00005034695) ETNPPL (ENSEASG00005004593) COL25A1 (ENSEASG00005036242) SEC24B (ENSEASG00005004609) MCUB (ENSEASG00005004625) CASP6 (ENSEASG00005004631) CFI (ENSEASG00005004646) GAR1 (ENSEASG00005004658) RRH (ENSEASG00005004665) LRIT3 (ENSEASG00005004671) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.a ##22 Red fox MODERN SPECIES 24 ENSVVUG00000014498 ##22 ENSVVUG00000014494 ENSVVUG00000014491 ENSVVUG00000014486 ENSVVUG00000014484 ENSVVUG00000014473 GRPR (ENSVVUG00000014470) S100G (ENSVVUG00000014451) CTPS2 (ENSVVUG00000014440) SYAP1 (ENSVVUG00000014436) TXLNG (ENSVVUG00000014420) RBBP7 (ENSVVUG00000014406) ENSVVUG00000014403 ENSVVUG00000014401 REPS2 (ENSVVUG00000014319) NHS (ENSVVUG00000014292) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Rat MODERN SPECIES 46 Btk (ENSRNOG00000052407) Rpl36a (ENSRNOG00000011494) Gla (ENSRNOG00000011513) Hnrnph2 (ENSRNOG00000011661) ENSRNOG00000037711 ENSRNOG00000066297 Armcx4 (ENSRNOG00000043128) LOC108348137 (ENSRNOG00000046862) AC130862.2 (ENSRNOG00000056968) Armcx6 (ENSRNOG00000037707) Armcx3 (ENSRNOG00000025730) Armcx2 (ENSRNOG00000025705) RGD1564480 (ENSRNOG00000059641) Nxf2 (ENSRNOG00000011729) Zmat1 (ENSRNOG00000024135) ENSRNOG00000063223 ##22 Tceal6 (ENSRNOG00000049020) RGD1566159 (ENSRNOG00000037684) Pramel3 (ENSRNOG00000023469) Pramel (ENSRNOG00000068726) Nxf7 (ENSRNOG00000023256) Prame (ENSRNOG00000011113) Tcp11x2 (ENSRNOG00000011034) Tmsb15a (ENSRNOG00000053780) Nxf5 (ENSRNOG00000043306) Armcx5 (ENSRNOG00000003187) Gprasp1 (ENSRNOG00000049985) Gprasp2 (ENSRNOG00000037658) Gprasp3 (ENSRNOG00000003191) Arxes2 (ENSRNOG00000046858) Tpgs2-ps2 (ENSRNOG00000003194) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 27 ENSCSAG00000018606 ANGPT1 (ENSCSAG00000011748) RSPO2 (ENSCSAG00000011712) EIF3E (ENSCSAG00000011703) EMC2 (ENSCSAG00000011696) TMEM74 (ENSCSAG00000018608) TRHR (ENSCSAG00000011682) NUDCD1 (ENSCSAG00000011655) ENY2 (ENSCSAG00000011647) PKHD1L1 (ENSCSAG00000011552) EBAG9 (ENSCSAG00000011304) SYBU (ENSCSAG00000011296) ENSCSAG00000011264 KCNV1 (ENSCSAG00000011260) CSMD3 (ENSCSAG00000011193) ENSCSAG00000010978 ##22 TRPS1 (ENSCSAG00000010958) UTP23 (ENSCSAG00000010933) RAD21 (ENSCSAG00000010927) AARD (ENSCSAG00000010917) SLC30A8 (ENSCSAG00000010907) ENSCSAG00000010884 MED30 (ENSCSAG00000010875) EXT1 (ENSCSAG00000010872) SAMD12 (ENSCSAG00000010860) ENSCSAG00000018611 TNFRSF11B (ENSCSAG00000010858) COLEC10 (ENSCSAG00000010854) MAL2 (ENSCSAG00000010849) CCN3 (ENSCSAG00000010843) ENPP2 (ENSCSAG00000010835) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00730000111779.d ENSGT00940000160666 ENSGT00940000162400 ENSGT00940000162938 ENSGT00940000158835 ENSGT00390000009359.a ENSGT01100000263564.b ENSGT00940000161053 ENSGT00940000160313 ENSGT00670000098076 ENSGT00400000025247 ENSGT00800000124303 ENSGT00940000162534 ENSGT00940000161190 ENSGT00940000158731 ENSGT00390000012976.c.a.b ##22 ENSGT00390000017736.a ENSGT00390000014577.a ENSGT00940000163018 ENSGT00940000156612 ENSGT00390000002109 ENSGT00940000156296 ENSGT00940000164557 ENSGT00940000154904.b ENSGT00940000163775 ENSGT00940000158779 ENSGT00940000154685.b ENSGT00940000155319 ENSGT00940000154685.a ENSGT00940000163004 ENSGT00940000163123 Horse MODERN SPECIES 27 CLEC4E (ENSECAG00000008274) CLEC4D (ENSECAG00000009973) CLEC6A (ENSECAG00000010716) ENSECAG00000055481 NECAP1 (ENSECAG00000012978) C3AR1 (ENSECAG00000003106) FOXJ2 (ENSECAG00000020237) ENSECAG00000024719 ENSECAG00000012614 ENSECAG00000031106 ENSECAG00000003269 DPPA3 (ENSECAG00000028670) GDF3 (ENSECAG00000017031) APOBEC1 (ENSECAG00000017163) AICDA (ENSECAG00000018578) ENSECAG00000040400 ##22 ENSECAG00000033567 RIMKLB (ENSECAG00000026969) A2ML1 (ENSECAG00000024232) PHC1 (ENSECAG00000015666) M6PR (ENSECAG00000021995) KLRG1 (ENSECAG00000024523) ENSECAG00000024571 A2M (ENSECAG00000012558) ENSECAG00000012299 ENSECAG00000015784 KLRB1 (ENSECAG00000034172) CLEC2D (ENSECAG00000021563) ENSECAG00000035478 ENSECAG00000022636 ENSECAG00000022644 Donkey MODERN SPECIES 14 ENSEASG00005015993 ENSEASG00005029235 CLEC4D (ENSEASG00005015987) CLEC6A (ENSEASG00005025981) ENSEASG00005024712 NECAP1 (ENSEASG00005015980) C3AR1 (ENSEASG00005026436) FOXJ2 (ENSEASG00005015977) ENSEASG00005015964 ENSEASG00005015961 ENSEASG00005015959 ENSEASG00005038232 GDF3 (ENSEASG00005015956) ENSEASG00005015951 ENSEASG00005015947 ENSEASG00005015945 ##22 ENSEASG00005015943 RIMKLB (ENSEASG00005015941) A2ML1 (ENSEASG00005029047) PHC1 (ENSEASG00005015938) M6PR (ENSEASG00005025448) KLRG1 (ENSEASG00005033856) ENSEASG00005015884 A2M (ENSEASG00005015229) ENSEASG00005014949 ENSEASG00005035261 KLRB1 (ENSEASG00005014838) ENSEASG00005014830 CLEC2D (ENSEASG00005014827) ENSEASG00005014825 ENSEASG00005014822 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000017224 ENSGT00390000013091 ENSGT00390000004738 ENSGT00390000016908 ENSGT00940000159646 ENSGT00390000011067.B ENSGT00940000161531 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000165352 ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a ENSGT00940000161694 ENSGT00940000158705 ENSGT00940000159278 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000013091.o ENSGT00390000004738 ENSGT00390000016908 ENSGT00940000159646 ENSGT00390000011067.B ENSGT00940000161531 ENSGT00860000136182 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000165352 ENSGT00520000058758.h ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.b ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a ENSGT00940000161694 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000013091.o ENSGT00390000004738 ENSGT00390000016908 ENSGT00940000159646 ENSGT00390000011067.B ENSGT00940000161531 ENSGT00860000136182 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000165352 ENSGT00520000058758.h ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.b ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.c ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.d Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000013091.o ENSGT00390000004738 ENSGT00390000016908 ENSGT00940000159646 ENSGT00390000011067.B ENSGT00940000161531 ENSGT00860000136182 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000165352 ENSGT00520000058758.h ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.b ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.c ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.d Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000017224 ENSGT00390000013091.o ENSGT00390000004738 ENSGT00390000016908 ENSGT00940000159646 ENSGT00390000011067.B ENSGT00940000161531 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000165352 ENSGT00520000058758.h ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.b ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.c ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.d Pan ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000013091.o ENSGT00390000004738 ENSGT00390000016908 ENSGT00940000159646 ENSGT00390000011067.B ENSGT00940000161531 ENSGT00860000136182 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000165352 ENSGT00520000058758.h ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.b ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.c ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.d Chimpanzee MODERN SPECIES 7 CENPN (ENSPTRG00000008383) CMC2 (ENSPTRG00000008382) CDYL2 (ENSPTRG00000008380) DYNLRB2 (ENSPTRG00000008379) MAF (ENSPTRG00000045874) ENSPTRG00000047655 ENSPTRG00000049801 WWOX (ENSPTRG00000008376) CLEC3A (ENSPTRG00000008375) VAT1L (ENSPTRG00000008374) NUDT7 (ENSPTRG00000008373) ADAMTS18 (ENSPTRG00000008372) SYCE1L (ENSPTRG00000031140) MON1B (ENSPTRG00000008370) CNTNAP4 (ENSPTRG00000008367) ENSPTRG00000047564 ##22 CPHXL (ENSPTRG00000052208) DUXB (ENSPTRG00000033728) CPHXL2 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(ENSGGOG00000006121) Gibbon MODERN SPECIES 11 C16orf46 (ENSNLEG00000035295) ATMIN (ENSNLEG00000029083) CENPN (ENSNLEG00000010442) ENSNLEG00000010438 CDYL2 (ENSNLEG00000010424) ENSNLEG00000010422 MAF (ENSNLEG00000010420) ENSNLEG00000030521 WWOX (ENSNLEG00000013308) CLEC3A (ENSNLEG00000030222) VAT1L (ENSNLEG00000013285) NUDT7 (ENSNLEG00000013280) ADAMTS18 (ENSNLEG00000013176) MON1B (ENSNLEG00000013161) CNTNAP4 (ENSNLEG00000013100) ENSNLEG00000033037 ##22 CPHXL (ENSNLEG00000032281) DUXB (ENSNLEG00000013098) CPHXL2 (ENSNLEG00000034972) ENSNLEG00000013093 KARS1 (ENSNLEG00000013072) ADAT1 (ENSNLEG00000013060) GABARAPL2 (ENSNLEG00000035229) TMEM231 (ENSNLEG00000013045) ENSNLEG00000028577 CHST6 (ENSNLEG00000013042) TMEM170A (ENSNLEG00000013039) CFDP1 (ENSNLEG00000013027) BCAR1 (ENSNLEG00000013003) ZFP1 (ENSNLEG00000013001) ENSNLEG00000012995 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000013091 ENSGT00390000004738 ENSGT00390000016908 ENSGT00940000159646 ENSGT00390000011067.B ENSGT00940000161531 ENSGT00860000136182 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.c.b.a.a.a ##22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000165352 ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.f ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.e ENSGT00940000161694 ENSGT00940000158705 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.a.a ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1810 ENSRROG00000028355 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000013091 ENSGT00390000004738 ENSGT00390000016908 ENSGT00940000159646 ENSGT00390000011067.B ENSGT00940000161531 ENSGT00860000136182 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.c.b.a.a.a ##22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000165352 ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.f ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.e ENSGT00940000161694 ENSGT00940000158705 Vervet Monkey MODERN SPECIES 1 ZNF385B (ENSCSAG00000012932) CWC22 (ENSCSAG00000012925) UBE2E3 (ENSCSAG00000012910) ITGA4 (ENSCSAG00000012902) CERKL (ENSCSAG00000012861) NEUROD1 (ENSCSAG00000018652) ITPRID2 (ENSCSAG00000012799) PPP1R1C (ENSCSAG00000012786) PDE1A (ENSCSAG00000012759) DNAJC10 (ENSCSAG00000012686) ENSCSAG00000012675 FRZB (ENSCSAG00000012659) NCKAP1 (ENSCSAG00000012646) DUSP19 (ENSCSAG00000012629) NUP35 (ENSCSAG00000012620) ENSCSAG00000018653 ##22 ZNF804A (ENSCSAG00000012608) FSIP2 (ENSCSAG00000012586) ZC3H15 (ENSCSAG00000012554) ENSCSAG00000018654 ITGAV (ENSCSAG00000012541) FAM171B (ENSCSAG00000012524) ZSWIM2 (ENSCSAG00000012509) CALCRL (ENSCSAG00000012480) TFPI (ENSCSAG00000012471) GULP1 (ENSCSAG00000012462) ENSCSAG00000018656 COL3A1 (ENSCSAG00000012451) COL5A2 (ENSCSAG00000012430) ENSCSAG00000012407 ENSCSAG00000018658 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000013091 ENSGT00390000004738 ENSGT00390000016908 ENSGT00940000159646 ENSGT00390000011067.B ENSGT00940000161531 ENSGT00860000136182 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.c.b.a.a.a ##22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000165352 ENSGT00940000167227 ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.f ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.e ENSGT00940000161694 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000013091 ENSGT00390000004738 ENSGT00390000016908 ENSGT00940000159646 ENSGT00390000011067.B ENSGT00940000161531 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000162517.k.a ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.c.b.a.a.a ##22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000165352 ENSGT00940000167227 ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.f ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.e ENSGT00940000161694 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000013091 ENSGT00390000004738 ENSGT00390000016908 ENSGT00940000159646 ENSGT00390000011067.B ENSGT00940000161531 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000162517.k.a ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.c.b.a.a.a ##22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000165352 ENSGT00940000167227 ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.f ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.e ENSGT00940000161694 Drill MODERN SPECIES 1030 C16orf46 (ENSMLEG00000029776) ATMIN (ENSMLEG00000035981) CENPN (ENSMLEG00000043653) CMC2 (ENSMLEG00000043490) CDYL2 (ENSMLEG00000043686) DYNLRB2 (ENSMLEG00000036024) WWOX (ENSMLEG00000026450) CLEC3A (ENSMLEG00000035474) VAT1L (ENSMLEG00000040020) NUDT7 (ENSMLEG00000044207) ADAMTS18 (ENSMLEG00000040294) SYCE1L (ENSMLEG00000043298) MON1B (ENSMLEG00000033579) ENSMLEG00000002295 CNTNAP4 (ENSMLEG00000029378) ENSMLEG00000037780 ##22 CPHXL (ENSMLEG00000028811) DUXB (ENSMLEG00000043826) ENSMLEG00000031492 TERF2IP (ENSMLEG00000027600) KARS1 (ENSMLEG00000034947) ADAT1 (ENSMLEG00000041477) GABARAPL2 (ENSMLEG00000024305) ENSMLEG00000031379 Sooty mangabey MODERN SPECIES 96 ATMIN (ENSCATG00000041468) CENPN (ENSCATG00000033167) CMC2 (ENSCATG00000036100) CDYL2 (ENSCATG00000043765) DYNLRB2 (ENSCATG00000036839) MAF (ENSCATG00000041922) WWOX (ENSCATG00000038357) ENSCATG00000031630 CLEC3A (ENSCATG00000037811) VAT1L (ENSCATG00000037460) NUDT7 (ENSCATG00000031071) ADAMTS18 (ENSCATG00000030919) SYCE1L (ENSCATG00000040347) MON1B (ENSCATG00000017854) CNTNAP4 (ENSCATG00000034579) ENSCATG00000038738 ##22 CPHXL (ENSCATG00000032012) DUXB (ENSCATG00000032747) ENSCATG00000036716 TERF2IP (ENSCATG00000038084) KARS1 (ENSCATG00000038129) ADAT1 (ENSCATG00000032587) GABARAPL2 (ENSCATG00000029316) TMEM231 (ENSCATG00000032613) CHST6 (ENSCATG00000000065) TMEM170A (ENSCATG00000034720) CFDP1 (ENSCATG00000014807) ENSCATG00000029207 BCAR1 (ENSCATG00000038291) ENSCATG00000029684 ENSCATG00000029905 Macaca ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000013091 ENSGT00390000004738 ENSGT00390000016908 ENSGT00940000159646 ENSGT00390000011067.B ENSGT00940000161531 ENSGT00860000136182 ENSGT00940000157389 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631 ENSGT00940000157553 ENSGT00390000017352.d ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000157674 ENSGT00390000012976.c.b.a.a.a ##22 ENSGT00520000058758.g ENSGT00940000165352 ENSGT00940000167227 ENSGT00390000005351 ENSGT01030000234618.A ENSGT00940000157942 ENSGT00940000155010 ENSGT00390000015366 ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.f ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.e ENSGT00940000161694 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 178 CENPN (ENSMNEG00000037652) CMC2 (ENSMNEG00000032151) CDYL2 (ENSMNEG00000010839) DYNLRB2 (ENSMNEG00000041692) MAF (ENSMNEG00000037088) WWOX (ENSMNEG00000011321) ENSMNEG00000035509 ENSMNEG00000037686 CLEC3A (ENSMNEG00000035656) VAT1L (ENSMNEG00000021232) NUDT7 (ENSMNEG00000038660) ADAMTS18 (ENSMNEG00000031484) SYCE1L (ENSMNEG00000033349) MON1B (ENSMNEG00000037776) CNTNAP4 (ENSMNEG00000029247) ENSMNEG00000028504 ##22 CPHXL (ENSMNEG00000036650) DUXB (ENSMNEG00000034566) ENSMNEG00000037927 TERF2IP (ENSMNEG00000039437) ENSMNEG00000028741 ENSMNEG00000042879 ADAT1 (ENSMNEG00000032840) GABARAPL2 (ENSMNEG00000019325) TMEM231 (ENSMNEG00000034545) CHST6 (ENSMNEG00000000950) TMEM170A (ENSMNEG00000023287) CFDP1 (ENSMNEG00000043347) BCAR1 (ENSMNEG00000035896) ENSMNEG00000041082 ENSMNEG00000032297 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00910000147280 ENSGT00940000158592 ENSGT00390000008948 ENSGT00940000153876.B.j.b ENSGT00940000156631.B ENSGT00940000156881 ENSGT00940000156527 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000153695.B ENSGT00950000182866.D.d.a.d ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A.m.a.r ENSGT00900000141090 ENSGT00390000010218.e.b ENSGT00530000063169.b.b ENSGT00390000012976.c.b.a.a.b ##22 ENSGT00870000136521.g.b.a ENSGT00530000063907.d ENSGT00940000157308 ENSGT00530000063503.a.a ENSGT00530000063558.A ENSGT00510000047809 ENSGT00390000008920.c.a.q.b ENSGT00940000159169 ENSGT00940000155530 ENSGT00390000007797 ENSGT00940000157095 ENSGT00550000074838.f ENSGT00390000000191 ENSGT00390000004660.C.b ENSGT00390000006574 Macaca ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007697 ENSGT00910000147280 ENSGT00940000158592 ENSGT00950000183198.c.b.a ENSGT00940000156631.B ENSGT00940000156881 ENSGT00940000156527 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000153695.B ENSGT00950000182866.D.d.a.d ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A.m.a.r ENSGT00900000141090 ENSGT00390000010218.e.b ENSGT00530000063169.b.b ENSGT00390000012976.c.b.a.a.b ##22 ENSGT00870000136521.g.b.a ENSGT00530000063907.d ENSGT00940000157308 ENSGT00530000063503.a.a ENSGT00530000063558.A ENSGT00510000047809 ENSGT00390000008920.c.a.q.b ENSGT00940000159169 ENSGT00940000155530 ENSGT00390000007797 ENSGT00940000157095 ENSGT00550000074838.f ENSGT00390000000191 ENSGT00390000004660.C.b ENSGT00390000006574 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 545 CD47 (ENSMNEG00000040225) ENSMNEG00000027109 BBX (ENSMNEG00000029292) ENSMNEG00000044050 CBLB (ENSMNEG00000035250) ALCAM (ENSMNEG00000039658) ENSMNEG00000023503 ZPLD1 (ENSMNEG00000041037) ENSMNEG00000029296 NFKBIZ (ENSMNEG00000035736) NXPE3 (ENSMNEG00000032855) CEP97 (ENSMNEG00000031114) RPL24 (ENSMNEG00000033010) ZBTB11 (ENSMNEG00000040650) ENSMNEG00000028646 ENSMNEG00000032826 ##22 ENSMNEG00000038744 ENSMNEG00000043641 SENP7 (ENSMNEG00000034444) IMPG2 (ENSMNEG00000019829) ABI3BP (ENSMNEG00000039863) TFG (ENSMNEG00000028246) ENSMNEG00000026927 ADGRG7 (ENSMNEG00000035882) TMEM45A (ENSMNEG00000032719) LNP1 (ENSMNEG00000036651) TOMM70 (ENSMNEG00000019074) NIT2 (ENSMNEG00000037498) TBC1D23 (ENSMNEG00000026957) ENSMNEG00000020357 FILIP1L (ENSMNEG00000043266) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000147280 ENSGT00940000158592 ENSGT00390000008948 ENSGT00940000153876.B.j.b ENSGT00940000156631.B ENSGT00940000156881 ENSGT00940000156527 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000153695.B ENSGT00950000182866.D.d.a.d ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A.m.a.q.b.c ENSGT00900000141090 ENSGT00390000010218.e.b ENSGT00530000063169.b.b ENSGT00390000012976.c.b.a.a.b ##22 ENSGT00870000136521.g.b.a ENSGT00530000063907.d ENSGT00940000157308 ENSGT00530000063503.a.a ENSGT00530000063558.A ENSGT00510000047809 ENSGT00390000008920.c.a.q.b ENSGT00940000159169 ENSGT00940000155530 ENSGT00390000007797 ENSGT00940000157095 ENSGT00550000074838.f ENSGT00390000000191 ENSGT00390000004660.C.b ENSGT00390000006574 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00940000156527 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000153695.B ENSGT00950000182866.D.d.a.d ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A.m.a.q.b.c ENSGT00900000141090 ENSGT00390000010218.e.b ENSGT00390000012976.c.b.a.a.b ##22 ENSGT00870000136521.g.b.a ENSGT00530000063907.d ENSGT00940000157308 ENSGT00530000063503.a.a ENSGT00530000063558.A ENSGT00510000047809 ENSGT00390000008920.c.a.q.b ENSGT00940000159169 ENSGT00940000155530 ENSGT00390000007797 ENSGT00940000157095 ENSGT00550000074838.f ENSGT00390000000191 ENSGT00390000004660.C.b ENSGT00390000006574 Sooty mangabey MODERN SPECIES 258 ZPLD1 (ENSCATG00000041557) ENSCATG00000018735 NFKBIZ (ENSCATG00000010523) NXPE3 (ENSCATG00000035123) CEP97 (ENSCATG00000035351) ENSCATG00000040562 ZBTB11 (ENSCATG00000037658) ENSCATG00000042673 ENSCATG00000037151 ##22 ENSCATG00000037420 ENSCATG00000039128 SENP7 (ENSCATG00000032014) IMPG2 (ENSCATG00000006718) ABI3BP (ENSCATG00000002681) TFG (ENSCATG00000018889) ENSCATG00000024708 ADGRG7 (ENSCATG00000031346) TMEM45A (ENSCATG00000029802) LNP1 (ENSCATG00000039201) TOMM70 (ENSCATG00000032909) ENSCATG00000030037 TBC1D23 (ENSCATG00000036057) ENSCATG00000031034 FILIP1L (ENSCATG00000024597) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 451 ENSGT00940000153695.B ENSGT00950000182866.D.d.a.d ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A.m.a.r ENSGT00900000141090 ENSGT00390000010218.e.b ENSGT00390000012976.c.b.a.a.b ##22 ENSGT00870000136521.g.b.a ENSGT00530000063907.d ENSGT00940000157308 ENSGT00530000063503.a.a Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 294 ZPLD1 (ENSRBIG00000012597) ENSRBIG00000043224 NFKBIZ (ENSRBIG00000029869) NXPE3 (ENSRBIG00000033297) CEP97 (ENSRBIG00000033344) ENSRBIG00000033278 ZBTB11 (ENSRBIG00000023111) ENSRBIG00000043858 ENSRBIG00000033445 ##22 ENSRBIG00000028972 SENP7 (ENSRBIG00000042341) IMPG2 (ENSRBIG00000037261) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.b ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3021 ENSRROG00000013114 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.b ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 519 DNAI2 (ENSCATG00000034158) TTYH2 (ENSCATG00000038553) RPL38 (ENSCATG00000044644) SDK2 (ENSCATG00000038911) CPSF4L (ENSCATG00000044555) C17orf80 (ENSCATG00000041538) FAM104A (ENSCATG00000017508) COG1 (ENSCATG00000035112) SSTR2 (ENSCATG00000018657) SLC39A11 (ENSCATG00000037201) SOX9 (ENSCATG00000039427) ENSCATG00000038337 ENSCATG00000044321 KCNJ2 (ENSCATG00000021487) ##29 KCNJ16 (ENSCATG00000027784) ENSCATG00000042046 ##22 MAP2K6 (ENSCATG00000044176) ABCA5 (ENSCATG00000045332) ENSCATG00000028819 ABCA6 (ENSCATG00000037276) ABCA9 (ENSCATG00000030382) ABCA8 (ENSCATG00000034010) FAM20A (ENSCATG00000044722) ENSCATG00000030683 WIPI1 (ENSCATG00000032812) ARSG (ENSCATG00000040037) SLC16A6 (ENSCATG00000032794) AMZ2 (ENSCATG00000034421) Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.a.c.a ##22 ENSGT00390000012976.c.b.a.c.b ##22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 1285 DHDH (ENSANAG00000026754) NUCB1 (ENSANAG00000027682) #7 TULP2 (ENSANAG00000023196) #8 PPP1R15A (ENSANAG00000024830) #9 PLEKHA4 (ENSANAG00000026960) #10 HSD17B14 (ENSANAG00000027396) #11 BCAT2 (ENSANAG00000020416) #12 FGF21 (ENSANAG00000022622) #13 IZUMO1 (ENSANAG00000027491) RASIP1 (ENSANAG00000030043) #15 MAMSTR (ENSANAG00000025139) #16 NTN5 (ENSANAG00000027097) #18 CA11 (ENSANAG00000025178) #19 DBP (ENSANAG00000027789) #20 SPHK2 (ENSANAG00000033050) #21 ENSANAG00000036491 ##22 FAM83E (ENSANAG00000021014) #23 SULT2B1 (ENSANAG00000024910) #25 Mas night monkey MODERN SPECIES 1206 ENSANAG00000020179 NUDT11 (ENSANAG00000027486) EZHIP (ENSANAG00000027291) BMP15 (ENSANAG00000028806) SHROOM4 (ENSANAG00000020629) DGKK (ENSANAG00000024570) ENSANAG00000035064 AKAP4 (ENSANAG00000033875) CLCN5 (ENSANAG00000000063) USP27X (ENSANAG00000019357) PAGE4 (ENSANAG00000029457) PAGE1 (ENSANAG00000024656) ENSANAG00000037052 ##22 ENSANAG00000031014 ENSANAG00000030824 ENSANAG00000029419 PPP1R3F (ENSANAG00000027387) FOXP3 (ENSANAG00000036359) CCDC22 (ENSANAG00000028058) CACNA1F (ENSANAG00000020527) SYP (ENSANAG00000034953) PRICKLE3 (ENSANAG00000024859) PLP2 (ENSANAG00000029245) MAGIX (ENSANAG00000038043) ENSANAG00000030473 WDR45 (ENSANAG00000036620) CCDC120 (ENSANAG00000021812) TFE3 (ENSANAG00000037525) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.c.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161908 #8 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00830000128447 ENSGT00940000157783 Capuchin MODERN SPECIES 266 NUCB1 (ENSCCAG00000023404) #7 TULP2 (ENSCCAG00000022051) #8 PPP1R15A (ENSCCAG00000026657) #9 PLEKHA4 (ENSCCAG00000024874) #10 HSD17B14 (ENSCCAG00000030294) #11 BCAT2 (ENSCCAG00000032989) #12 ENSCCAG00000028875 FGF21 (ENSCCAG00000024308) #13 IZUMO1 (ENSCCAG00000031630) RASIP1 (ENSCCAG00000030355) #15 MAMSTR (ENSCCAG00000029438) #16 NTN5 (ENSCCAG00000032785) #18 CA11 (ENSCCAG00000034561) #19 DBP (ENSCCAG00000027309) #20 SPHK2 (ENSCCAG00000035453) #21 ENSCCAG00000020757 ##22 FAM83E (ENSCCAG00000021138) #23 SULT2B1 (ENSCCAG00000030640) #25 LMTK3 (ENSCCAG00000037797) #26 CYTH2 (ENSCCAG00000025963) #28 KCNJ14 (ENSCCAG00000031489) #29 GRWD1 (ENSCCAG00000033422) #30 GRIN2D (ENSCCAG00000023954) #27 KDELR1 (ENSCCAG00000037236) #31 SYNGR4 (ENSCCAG00000032104) #32 TMEM143 (ENSCCAG00000027338) #33 EMP3 (ENSCCAG00000020848) #34 ODAD1 (ENSCCAG00000025664) #35 CARD8 (ENSCCAG00000030014) ENSCCAG00000033677 ENSCCAG00000030878 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.a.c.a ##22 ENSGT00390000012976.c.b.a.c.b ##22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00830000128447 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.a.c.b ##22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00830000128447 Cebidae_a DUPLICATION Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.c.b.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 269 ENSCCAG00000035740 ##22 ENSCCAG00000027832 RASEF (ENSCCAG00000031624) ENSCCAG00000028546 ENSCCAG00000027734 TLE1 (ENSCCAG00000030133) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 65 LDB2 (ENSSBOG00000029579) QDPR (ENSSBOG00000032183) CLRN2 (ENSSBOG00000019889) ENSSBOG00000001223 MED28 (ENSSBOG00000023401) FAM184B (ENSSBOG00000030079) DCAF16 (ENSSBOG00000013262) ENSSBOG00000009348 NCAPG (ENSSBOG00000022967) LCORL (ENSSBOG00000026920) ENSSBOG00000030307 SLIT2 (ENSSBOG00000017816) PACRGL (ENSSBOG00000024032) KCNIP4 (ENSSBOG00000034826) ENSSBOG00000023241 ENSSBOG00000032262 ##22 ADGRA3 (ENSSBOG00000006417) GBA3 (ENSSBOG00000032739) PPARGC1A (ENSSBOG00000006423) DHX15 (ENSSBOG00000022126) ENSSBOG00000030054 SOD3 (ENSSBOG00000003134) CCDC149 (ENSSBOG00000034478) LGI2 (ENSSBOG00000033943) SEPSECS (ENSSBOG00000023218) PI4K2B (ENSSBOG00000030108) ZCCHC4 (ENSSBOG00000020855) ANAPC4 (ENSSBOG00000025712) SLC34A2 (ENSSBOG00000023680) SEL1L3 (ENSSBOG00000031484) ENSSBOG00000022950 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.c.b.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 169 TULP2 (ENSSBOG00000021269) #8 PPP1R15A (ENSSBOG00000034219) #9 PLEKHA4 (ENSSBOG00000031859) #10 HSD17B14 (ENSSBOG00000034675) #11 BCAT2 (ENSSBOG00000035423) #12 FGF21 (ENSSBOG00000032332) #13 FUT1 (ENSSBOG00000030866) #14 IZUMO1 (ENSSBOG00000023018) ENSSBOG00000022695 #15 MAMSTR (ENSSBOG00000028762) #16 ENSSBOG00000027486 #17 NTN5 (ENSSBOG00000024767) #18 CA11 (ENSSBOG00000029986) #19 DBP (ENSSBOG00000023229) #20 SPHK2 (ENSSBOG00000031672) #21 ENSSBOG00000023499 ##22 FAM83E (ENSSBOG00000016816) #23 SULT2B1 (ENSSBOG00000023674) #25 LMTK3 (ENSSBOG00000029705) #26 ENSSBOG00000032627 CYTH2 (ENSSBOG00000023438) #28 GRWD1 (ENSSBOG00000023078) #30 GRIN2D (ENSSBOG00000025199) #27 KDELR1 (ENSSBOG00000032254) #31 SYNGR4 (ENSSBOG00000022795) #32 TMEM143 (ENSSBOG00000019834) #33 EMP3 (ENSSBOG00000014858) #34 ODAD1 (ENSSBOG00000034193) #35 CARD8 (ENSSBOG00000025126) ENSSBOG00000021513 ENSSBOG00000035984 Marmoset MODERN SPECIES 14 NUCB1 (ENSCJAG00000000266) #7 PPP1R15A (ENSCJAG00000070294) #9 PLEKHA4 (ENSCJAG00000000281) #10 HSD17B14 (ENSCJAG00000000291) #11 BCAT2 (ENSCJAG00000000293) #12 FGF21 (ENSCJAG00000000299) #13 FUT1 (ENSCJAG00000048235) #14 IZUMO1 (ENSCJAG00000000311) RASIP1 (ENSCJAG00000000320) #15 MAMSTR (ENSCJAG00000000326) #16 FUT2 (ENSCJAG00000023164) ##17 NTN5 (ENSCJAG00000000341) #18 CA11 (ENSCJAG00000000345) #19 DBP (ENSCJAG00000000360) #20 SPHK2 (ENSCJAG00000000366) #21 ENSCJAG00000000377 ##22 SPACA4 (ENSCJAG00000057696) #24 FAM83E (ENSCJAG00000000384) #23 SULT2B1 (ENSCJAG00000000388) #25 LMTK3 (ENSCJAG00000000398) #26 CYTH2 (ENSCJAG00000000408) #28 KCNJ14 (ENSCJAG00000040655) #29 GRWD1 (ENSCJAG00000000440) #30 GRIN2D (ENSCJAG00000000450) #27 KDELR1 (ENSCJAG00000000475) #31 SYNGR4 (ENSCJAG00000000478) #32 TMEM143 (ENSCJAG00000000479) #33 EMP3 (ENSCJAG00000000482) #34 ODAD1 (ENSCJAG00000000486) #35 CARD8 (ENSCJAG00000000489) LIG1 (ENSCJAG00000000504) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.d ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.d ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a.d ##22 Capuchin MODERN SPECIES 440 ABCF1 (ENSCCAG00000026192) PPP1R10 (ENSCCAG00000030052) MRPS18B (ENSCCAG00000037423) ENSCCAG00000017044 ATAT1 (ENSCCAG00000027296) DHX16 (ENSCCAG00000025435) ENSCCAG00000034759 PPP1R18 (ENSCCAG00000026370) NRM (ENSCCAG00000029982) ENSCCAG00000022402 MDC1 (ENSCCAG00000023691) ENSCCAG00000024382 ENSCCAG00000034270 IER3 (ENSCCAG00000021244) ENSCCAG00000006732 ENSCCAG00000036454 ##22 DDR1 (ENSCCAG00000027343) GTF2H4 (ENSCCAG00000021702) VARS2 (ENSCCAG00000037907) SFTA2 (ENSCCAG00000029652) ENSCCAG00000028097 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 571 NUP133 (ENSOCUG00000007234) ACTA1 (ENSOCUG00000007566) ENSOCUG00000023673 ##22 CCSAP (ENSOCUG00000006822) RAB4A (ENSOCUG00000006816) ENSOCUG00000038255 ENSOCUG00000031001 ENSOCUG00000036619 ENSOCUG00000038025 ENSOCUG00000031222 ENSOCUG00000036823 ENSOCUG00000034019 ENSOCUG00000039124 ENSOCUG00000037776 Rabbit MODERN SPECIES 1401 ZNF182 (ENSOCUG00000017226) ZNF81 (ENSOCUG00000029071) ENSOCUG00000023087 ENSOCUG00000034922 ENSOCUG00000032683 ENSOCUG00000037506 ENSOCUG00000036214 UXT (ENSOCUG00000010525) ELK1 (ENSOCUG00000010521) CFP (ENSOCUG00000015944) TIMP1 (ENSOCUG00000010718) SYN1 (ENSOCUG00000024150) ARAF (ENSOCUG00000016449) ZNF41 (ENSOCUG00000029242) ZNF157 (ENSOCUG00000029541) ENSOCUG00000028092 ##22 USP11 (ENSOCUG00000008403) CDK16 (ENSOCUG00000008394) UBA1 (ENSOCUG00000008376) RBM10 (ENSOCUG00000006454) NDUFB11 (ENSOCUG00000008371) RGN (ENSOCUG00000023725) JADE3 (ENSOCUG00000004676) RP2 (ENSOCUG00000005647) SLC9A7 (ENSOCUG00000004230) CHST7 (ENSOCUG00000004224) ENSOCUG00000022444 ENSOCUG00000023405 ENSOCUG00000017464 DIPK2B (ENSOCUG00000014763) KDM6A (ENSOCUG00000014741) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000019406 ENSGT00510000047812 ENSGT00940000157545 ENSGT00390000009277 ENSGT00940000160700 ENSGT00390000011613 ENSGT00390000016025.b.h ENSGT00940000159452 ENSGT00940000161792 ENSGT00390000008240.m ENSGT00390000008240.n ENSGT00940000160291 ENSGT00550000074781 ENSGT00390000012336 ENSGT00940000160707.b ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 ENSGT00690000102227 ENSGT00520000055649.b ENSGT00390000016791 ENSGT00390000018400 ENSGT01040000240503.A.a.a ENSGT00530000063675.a ENSGT00940000156346 ENSGT00510000048144 ENSGT00690000102225 ENSGT00390000008502 ENSGT01030000234623.a.b.b ENSGT00910000144347.x ENSGT00940000161615 ENSGT00940000155425 ENSGT00910000144338 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000019406 ENSGT00510000047812 ENSGT00940000157545 ENSGT00390000009277 ENSGT00940000160700 ENSGT00390000011613 ENSGT00390000016025.b.h ENSGT00940000159452 ENSGT00940000161792 ENSGT00390000008240.m ENSGT00390000008240.n ENSGT00940000160291 ENSGT00550000074781 ENSGT00390000012336 ENSGT00940000160707.b ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 ENSGT00690000102227 ENSGT00520000055649.b ENSGT00390000016791 ENSGT00390000018400 ENSGT01040000240503.A.a.a ENSGT00530000063675.a ENSGT00940000156346 ENSGT00510000048144 ENSGT00690000102225 ENSGT00390000008502 ENSGT01030000234623.a.b.b ENSGT00910000144347.x ENSGT00940000161615 ENSGT00940000155425 ENSGT00910000144338 Squirrel MODERN SPECIES 71 ENSSTOG00000025343 SQOR (ENSSTOG00000005093) BLOC1S6 (ENSSTOG00000001615) SLC30A4 (ENSSTOG00000001606) C15orf48 (ENSSTOG00000021929) SPATA5L1 (ENSSTOG00000028609) GATM (ENSSTOG00000012180) SLC28A2 (ENSSTOG00000012167) SHF (ENSSTOG00000026488) DUOX1 (ENSSTOG00000008816) DUOXA1 (ENSSTOG00000008792) DUOXA2 (ENSSTOG00000008782) DUOX2 (ENSSTOG00000008727) SORD (ENSSTOG00000008709) TERB2 (ENSSTOG00000013661) ENSSTOG00000033780 ##22 TRIM69 (ENSSTOG00000002274) B2M (ENSSTOG00000032330) PATL2 (ENSSTOG00000033848) ENSSTOG00000002225 EIF3J (ENSSTOG00000025483) CTDSPL2 (ENSSTOG00000002215) GOLM2 (ENSSTOG00000009014) FRMD5 (ENSSTOG00000007019) WDR76 (ENSSTOG00000006985) HYPK (ENSSTOG00000006916) MFAP1 (ENSSTOG00000006967) SERINC4 (ENSSTOG00000006939) ENSSTOG00000021211 ELL3 (ENSSTOG00000012181) PDIA3 (ENSSTOG00000006893) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 4 SQOR (ENSUPAG00010009674) BLOC1S6 (ENSUPAG00010009684) SLC30A4 (ENSUPAG00010009697) C15orf48 (ENSUPAG00010009717) SPATA5L1 (ENSUPAG00010009731) GATM (ENSUPAG00010009746) SLC28A2 (ENSUPAG00010009757) SHF (ENSUPAG00010009782) DUOX1 (ENSUPAG00010009803) DUOXA1 (ENSUPAG00010009830) DUOXA2 (ENSUPAG00010009876) DUOX2 (ENSUPAG00010009883) SORD (ENSUPAG00010009931) TERB2 (ENSUPAG00010009958) TRIM69 (ENSUPAG00010009970) ENSUPAG00010009982 ##22 B2M (ENSUPAG00010009989) PATL2 (ENSUPAG00010009997) SPG11 (ENSUPAG00010010037) EIF3J (ENSUPAG00010010111) CTDSPL2 (ENSUPAG00010010125) GOLM2 (ENSUPAG00010010162) FRMD5 (ENSUPAG00010010188) WDR76 (ENSUPAG00010010229) MFAP1 (ENSUPAG00010010275) HYPK (ENSUPAG00010010283) SERINC4 (ENSUPAG00010010300) ENSUPAG00010010342 ELL3 (ENSUPAG00010010367) PDIA3 (ENSUPAG00010010414) ENSUPAG00010010432 Alpin marmot MODERN SPECIES 7 SQOR (ENSMMMG00000017646) BLOC1S6 (ENSMMMG00000017665) SLC30A4 (ENSMMMG00000017672) C15orf48 (ENSMMMG00000017695) SPATA5L1 (ENSMMMG00000017707) GATM (ENSMMMG00000017727) SLC28A2 (ENSMMMG00000017753) SHF (ENSMMMG00000017757) DUOX1 (ENSMMMG00000017791) DUOXA1 (ENSMMMG00000017815) DUOXA2 (ENSMMMG00000017845) DUOX2 (ENSMMMG00000017855) SORD (ENSMMMG00000017888) TERB2 (ENSMMMG00000017900) TRIM69 (ENSMMMG00000017914) ENSMMMG00000017923 ##22 B2M (ENSMMMG00000017935) PATL2 (ENSMMMG00000017944) SPG11 (ENSMMMG00000017966) ENSMMMG00000017993 CTDSPL2 (ENSMMMG00000018015) GOLM2 (ENSMMMG00000018044) FRMD5 (ENSMMMG00000018137) ENSMMMG00000018185 MFAP1 (ENSMMMG00000018199) HYPK (ENSMMMG00000018203) SERINC4 (ENSMMMG00000018211) ENSMMMG00000018255 ELL3 (ENSMMMG00000018287) PDIA3 (ENSMMMG00000018324) CATSPER2 (ENSMMMG00000018345) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.a ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 12 CCDC40 (ENSHGLG00000007128) GAA (ENSHGLG00000008110) EIF4A3 (ENSHGLG00000004635) CARD14 (ENSHGLG00000004835) SGSH (ENSHGLG00000050807) ENSHGLG00000008648 ENSHGLG00000034263 ENSHGLG00000044372 ENSHGLG00000045428 ENSHGLG00000046238 ENSHGLG00000009957 ENDOV (ENSHGLG00000004976) ENSHGLG00000034473 NPTX1 (ENSHGLG00000048442) RPTOR (ENSHGLG00000006474) ENSHGLG00000008858 ##22 CHMP6 (ENSHGLG00000009561) BAIAP2 (ENSHGLG00000004417) AATK (ENSHGLG00000004598) ##26 CEP131 (ENSHGLG00000005455) TEPSIN (ENSHGLG00000008179) NDUFAF8 (ENSHGLG00000009200) SLC38A10 (ENSHGLG00000004919) BAHCC1 (ENSHGLG00000006440) ACTG1 (ENSHGLG00000009170) FSCN2 (ENSHGLG00000012271) FAAP100 (ENSHGLG00000012377) ENSHGLG00000015156 TSPAN10 (ENSHGLG00000013685) PDE6G (ENSHGLG00000008357) OXLD1 (ENSHGLG00000040014) Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.a ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.a ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1321 ENSAMEG00000025084 ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.a ##22 Red fox MODERN SPECIES 11 ENSVVUG00000023203 ENSVVUG00000023210 EDIL3 (ENSVVUG00000023242) HAPLN1 (ENSVVUG00000023246) VCAN (ENSVVUG00000023253) XRCC4 (ENSVVUG00000023262) ENSVVUG00000023272 ENSVVUG00000023284 RPS23 (ENSVVUG00000023287) ENSVVUG00000023289 ATG10 (ENSVVUG00000023291) SSBP2 (ENSVVUG00000023314) ACOT12 (ENSVVUG00000023325) ZCCHC9 (ENSVVUG00000023331) SEPT11 (ENSVVUG00000023346) ENSVVUG00000023386 ##22 SHROOM3 (ENSVVUG00000023389) CCDC158 (ENSVVUG00000023403) STBD1 (ENSVVUG00000023432) ENSVVUG00000023434 SCARB2 (ENSVVUG00000023440) NUP54 (ENSVVUG00000023444) ENSVVUG00000023448 ART3 (ENSVVUG00000023461) CXCL10 (ENSVVUG00000023469) ENSVVUG00000023471 CXCL9 (ENSVVUG00000023474) ENSVVUG00000023531 NAAA (ENSVVUG00000024151) PPEF2 (ENSVVUG00000024157) USO1 (ENSVVUG00000024163) Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a ##22 ENSGT00390000012976.d.w #22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00830000128447 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a ##22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00830000128447 ENSGT00390000011694 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a ##22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00830000128447 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158878 ENSGT00390000004226 ENSGT00390000002886.b.b ENSGT00940000162359 ENSGT00390000013647 ENSGT01010000223978 ENSGT00890000139472.a.b ENSGT00940000162721 ENSGT00940000164981 ENSGT00940000164535.b.a ENSGT00940000164535.b.b ENSGT00940000164535.a ENSGT00940000165112 ENSGT00940000163956.c.b ENSGT00940000160971 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000163956.c.a ENSGT00940000164738.d ENSGT00940000161248 ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.i.a ENSGT00850000133588 ENSGT00950000183189.a.b.b ENSGT00390000007953 ENSGT00910000148734 ENSGT00950000182974.a.a.a.a ENSGT00970000197053 ENSGT00940000156803 ENSGT00390000012182.ab ENSGT00940000161825.c ENSGT00940000165348 ENSGT00940000165994 Macaca_a DUPLICATION Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.a.a ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 175 ENSMFAG00000048803 ENSMFAG00000045725 ENSMFAG00000057019 LDOC1 (ENSMFAG00000036681) ENSMFAG00000054331 ENSMFAG00000062242 MAGEC2 (ENSMFAG00000055842) ENSMFAG00000060567 ENSMFAG00000058294 SPANXN4 (ENSMFAG00000003443) ENSMFAG00000058596 SPANXN3 (ENSMFAG00000035745) SLITRK4 (ENSMFAG00000029666) SPANXN2 (ENSMFAG00000043556) ENSMFAG00000030134 ENSMFAG00000027138 ##22 ENSMFAG00000054570 ENSMFAG00000031635 ENSMFAG00000053441 ENSMFAG00000061545 SLITRK2 (ENSMFAG00000030304) ENSMFAG00000032729 FMR1 (ENSMFAG00000000241) FMR1NB (ENSMFAG00000036881) ENSMFAG00000003429 AFF2 (ENSMFAG00000044807) ENSMFAG00000053111 IDS (ENSMFAG00000037097) ENSMFAG00000053185 ENSMFAG00000054856 ENSMFAG00000062619 Rhesus MODERN SPECIES 7 CDC42EP4 (ENSMMUG00000018148) CPSF4L (ENSMMUG00000001271) C16H17orf80 (ENSMMUG00000001269) FAM104A (ENSMMUG00000001268) ENSMMUG00000060397 COG1 (ENSMMUG00000001266) ENSMMUG00000063103 SSTR2 (ENSMMUG00000051322) SLC39A11 (ENSMMUG00000014195) SOX9 (ENSMMUG00000063817) ENSMMUG00000058041 ENSMMUG00000065160 ENSMMUG00000057057 KCNJ2 (ENSMMUG00000056768) ##29 KCNJ16 (ENSMMUG00000014053) ENSMMUG00000003076 ##22 MAP2K6 (ENSMMUG00000001051) ABCA5 (ENSMMUG00000018608) ABCA6 (ENSMMUG00000018592) ABCA9 (ENSMMUG00000044129) ENSMMUG00000053614 ABCA8 (ENSMMUG00000018587) FAM20A (ENSMMUG00000002195) PRKAR1A (ENSMMUG00000002194) ENSMMUG00000058707 WIPI1 (ENSMMUG00000007309) SLC16A6 (ENSMMUG00000011094) ARSG (ENSMMUG00000051869) ENSMMUG00000056322 AMZ2 (ENSMMUG00000048903) ENSMMUG00000053260 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000159516 ENSGT00940000156974 ENSGT00940000158878 ENSGT00390000004226 ENSGT00940000162359 ENSGT01100000263539.b.b.b.b.b.a.b.a.a.b.b.b 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ENSGT00940000158117 ENSGT00940000159194 ENSGT00390000000984.t.a.b ENSGT00390000002661.b.lb ENSGT00390000011922 ENSGT00530000063880.b ENSGT01100000263484.B.b.b ENSGT00390000007776 ENSGT00390000011748.q ENSGT00940000157594 ENSGT00390000004040 ENSGT00520000055634.a ENSGT00940000159740 ENSGT00940000155549.b ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.a.e ##22 ENSGT00940000157893 ENSGT00730000111042 ENSGT00940000153117.A ENSGT00940000154655.a.d ENSGT00390000007815 ENSGT00940000160706 ENSGT00390000010887.a ENSGT00940000155321 ENSGT00390000008161.a.b ENSGT00940000155167.b.b ENSGT00940000159374 ENSGT00940000159514 ENSGT00940000159963 ENSGT00940000155778.A ENSGT00390000000420 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.a.e ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.a.e ##22 Bonobo MODERN SPECIES 21 ABRA (ENSPPAG00000030770) ANGPT1 (ENSPPAG00000036353) RSPO2 (ENSPPAG00000029316) ENSPPAG00000034564 ENSPPAG00000021691 EMC2 (ENSPPAG00000041266) TRHR (ENSPPAG00000039177) 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(ENSPPYG00000018832) AARD (ENSPPYG00000018833) SLC30A8 (ENSPPYG00000018834) MED30 (ENSPPYG00000018835) EXT1 (ENSPPYG00000018836) SAMD12 (ENSPPYG00000018837) TNFRSF11B (ENSPPYG00000018838) COLEC10 (ENSPPYG00000018839) MAL2 (ENSPPYG00000030093) CCN3 (ENSPPYG00000018841) ENPP2 (ENSPPYG00000018842) TAF2 (ENSPPYG00000018843) Gibbon MODERN SPECIES 6 ENSNLEG00000004052 ABRA (ENSNLEG00000004053) ANGPT1 (ENSNLEG00000035980) RSPO2 (ENSNLEG00000004105) ENSNLEG00000032454 EIF3E (ENSNLEG00000004120) EMC2 (ENSNLEG00000004190) TRHR (ENSNLEG00000004227) NUDCD1 (ENSNLEG00000004231) ENSNLEG00000004284 PKHD1L1 (ENSNLEG00000029337) EBAG9 (ENSNLEG00000030785) SYBU (ENSNLEG00000004459) KCNV1 (ENSNLEG00000004533) CSMD3 (ENSNLEG00000004538) ENSNLEG00000027500 ##22 TRPS1 (ENSNLEG00000004770) EIF3H (ENSNLEG00000033146) UTP23 (ENSNLEG00000032995) RAD21 (ENSNLEG00000004817) AARD (ENSNLEG00000031855) SLC30A8 (ENSNLEG00000027604) MED30 (ENSNLEG00000004863) EXT1 (ENSNLEG00000004870) SAMD12 (ENSNLEG00000004875) TNFRSF11B (ENSNLEG00000004882) COLEC10 (ENSNLEG00000004892) ENSNLEG00000004905 CCN3 (ENSNLEG00000004910) ENSNLEG00000028485 ENPP2 (ENSNLEG00000004918) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.a.f ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.a.f ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.a.f ##22 Gorilla MODERN SPECIES 10 TULP2 (ENSGGOG00000006328) #8 PPP1R15A (ENSGGOG00000006324) #9 PLEKHA4 (ENSGGOG00000006315) #10 ENSGGOG00000006306 #11 BCAT2 (ENSGGOG00000003564) #12 FGF21 (ENSGGOG00000001246) #13 FUT1 (ENSGGOG00000001245) #14 IZUMO1 (ENSGGOG00000001242) RASIP1 (ENSGGOG00000001240) #15 MAMSTR (ENSGGOG00000001237) #16 FUT2 (ENSGGOG00000001236) ##17 NTN5 (ENSGGOG00000013014) #18 CA11 (ENSGGOG00000001446) #19 DBP (ENSGGOG00000001444) #20 SPHK2 (ENSGGOG00000001443) #21 ENSGGOG00000024878 ##22 SPACA4 (ENSGGOG00000036566) #24 FAM83E (ENSGGOG00000008727) #23 SULT2B1 (ENSGGOG00000012369) #25 LMTK3 (ENSGGOG00000010710) #26 ENSGGOG00000042390 CYTH2 (ENSGGOG00000013458) #28 KCNJ14 (ENSGGOG00000013455) #29 GRWD1 (ENSGGOG00000013449) #30 GRIN2D (ENSGGOG00000013433) #27 ENSGGOG00000022018 #31 SYNGR4 (ENSGGOG00000023884) #32 TMEM143 (ENSGGOG00000001880) #33 EMP3 (ENSGGOG00000015107) #34 ODAD1 (ENSGGOG00000001249) #35 ENSGGOG00000006459 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 ENSGT00830000128447 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT01100000263507.D.a.b.a.a.a.b Gibbon DUPLICATION Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES DHDH (ENSNLEG00000004702) ENSNLEG00000004692 #7 ENSNLEG00000031971 #8 PPP1R15A (ENSNLEG00000027708) #9 PLEKHA4 (ENSNLEG00000004678) #10 ENSNLEG00000004661 #12 FGF21 (ENSNLEG00000004653) #13 FUT1 (ENSNLEG00000018767) #14 IZUMO1 (ENSNLEG00000004623) RASIP1 (ENSNLEG00000004607) #15 ENSNLEG00000004605 #16 NTN5 (ENSNLEG00000004598) #18 CA11 (ENSNLEG00000004568) #19 DBP (ENSNLEG00000004551) #20 SPHK2 (ENSNLEG00000004543) #21 ENSNLEG00000004537 ##22 SPACA4 (ENSNLEG00000032131) #24 ENSNLEG00000027349 #23 SULT2B1 (ENSNLEG00000004526) #25 ENSNLEG00000033767 #26 ENSNLEG00000004524 CYTH2 (ENSNLEG00000004424) #28 ENSNLEG00000028295 #29 GRWD1 (ENSNLEG00000035384) #30 ENSNLEG00000029729 #27 ENSNLEG00000004402 #32 TMEM143 (ENSNLEG00000004369) #33 EMP3 (ENSNLEG00000004357) #34 ODAD1 (ENSNLEG00000004346) #35 ENSNLEG00000004344 ENSNLEG00000034930 Gibbon MODERN SPECIES 10 PSAT1 (ENSNLEG00000002989) CEP78 (ENSNLEG00000002920) GNAQ (ENSNLEG00000002860) GNA14 (ENSNLEG00000002821) ENSNLEG00000033637 VPS13A (ENSNLEG00000002199) ENSNLEG00000030344 PRUNE2 (ENSNLEG00000002079) GCNT1 (ENSNLEG00000034138) RFK (ENSNLEG00000035200) PCSK5 (ENSNLEG00000001931) OSTF1 (ENSNLEG00000001854) NMRK1 (ENSNLEG00000001798) CARNMT1 (ENSNLEG00000034652) ENSNLEG00000001769 ENSNLEG00000028548 ##22 TRPM6 (ENSNLEG00000001498) RORB (ENSNLEG00000001398) ANXA1 (ENSNLEG00000001203) ENSNLEG00000033507 ALDH1A1 (ENSNLEG00000001128) TMC1 (ENSNLEG00000001086) ZFAND5 (ENSNLEG00000032345) GDA (ENSNLEG00000001030) ENSNLEG00000030794 ENSNLEG00000001023 ABHD17B (ENSNLEG00000001017) CEMIP2 (ENSNLEG00000000905) TRPM3 (ENSNLEG00000000832) KLF9 (ENSNLEG00000030809) ENSNLEG00000000775 Gibbon MODERN SPECIES 1 ENSNLEG00000035193 ABCC5 (ENSNLEG00000006079) PARL (ENSNLEG00000006072) ENSNLEG00000034670 YEATS2 (ENSNLEG00000006070) KLHL24 (ENSNLEG00000006066) ENSNLEG00000006063 B3GNT5 (ENSNLEG00000018942) MCF2L2 (ENSNLEG00000006037) LAMP3 (ENSNLEG00000006034) MCCC1 (ENSNLEG00000005989) DCUN1D1 (ENSNLEG00000005983) ATP11B (ENSNLEG00000005959) ENSNLEG00000032897 ENSNLEG00000030225 ENSNLEG00000032218 ##22 SOX2 (ENSNLEG00000018940) DNAJC19 (ENSNLEG00000033702) FXR1 (ENSNLEG00000005928) ENSNLEG00000033880 CCDC39 (ENSNLEG00000005916) TTC14 (ENSNLEG00000005900) ENSNLEG00000030368 PEX5L (ENSNLEG00000005874) USP13 (ENSNLEG00000005851) NDUFB5 (ENSNLEG00000034646) MRPL47 (ENSNLEG00000005831) ACTL6A (ENSNLEG00000035913) ENSNLEG00000035220 GNB4 (ENSNLEG00000005751) MFN1 (ENSNLEG00000005745) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT01100000263507.D.a.b.a.a.a.b Orangutan MODERN SPECIES 10 NUCB1 (ENSPPYG00000010220) #7 TULP2 (ENSPPYG00000010219) #8 ENSPPYG00000010218 #9 PLEKHA4 (ENSPPYG00000010217) #10 HSD17B14 (ENSPPYG00000010216) #11 BCAT2 (ENSPPYG00000010215) #12 FGF21 (ENSPPYG00000010214) #13 FUT1 (ENSPPYG00000010213) #14 IZUMO1 (ENSPPYG00000039596) RASIP1 (ENSPPYG00000010211) #15 MAMSTR (ENSPPYG00000010591) #16 NTN5 (ENSPPYG00000010209) #18 ENSPPYG00000010210 #17 CA11 (ENSPPYG00000010208) #19 SPHK2 (ENSPPYG00000010207) #21 RPL18 (ENSPPYG00000010206) ##22 SPACA4 (ENSPPYG00000010205) #24 FAM83E (ENSPPYG00000010204) #23 SULT2B1 (ENSPPYG00000010203) #25 LMTK3 (ENSPPYG00000010202) #26 ENSPPYG00000010201 ENSPPYG00000010200 #28 KCNJ14 (ENSPPYG00000029820) #29 GRWD1 (ENSPPYG00000010199) #30 ENSPPYG00000034873 GRIN2D (ENSPPYG00000010198) #27 ENSPPYG00000010197 #31 SYNGR4 (ENSPPYG00000010196) #32 TMEM143 (ENSPPYG00000010195) #33 EMP3 (ENSPPYG00000010194) #34 ODAD1 (ENSPPYG00000010193) #35 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161908 #8 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT01100000263507.D.a.b.a.a.a.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161908 #8 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT01100000263507.D.a.b.a.a.a.b Human MODERN SPECIES 10 TULP2 (ENSG00000104804) #8 PPP1R15A (ENSG00000087074) #9 PLEKHA4 (ENSG00000105559) #10 HSD17B14 (ENSG00000087076) #11 BCAT2 (ENSG00000105552) #12 FGF21 (ENSG00000105550) #13 FUT1 (ENSG00000174951) #14 IZUMO1 (ENSG00000182264) RASIP1 (ENSG00000105538) #15 MAMSTR (ENSG00000176909) #16 FUT2 (ENSG00000176920) ##17 NTN5 (ENSG00000142233) #18 CA11 (ENSG00000063180) #19 DBP (ENSG00000105516) #20 SPHK2 (ENSG00000063176) #21 RPL18 (ENSG00000063177) ##22 SPACA4 (ENSG00000177202) #24 FAM83E (ENSG00000105523) #23 SULT2B1 (ENSG00000088002) #25 LMTK3 (ENSG00000142235) #26 CYTH2 (ENSG00000105443) #28 ENSG00000268465 KCNJ14 (ENSG00000182324) #29 GRWD1 (ENSG00000105447) #30 GRIN2D (ENSG00000105464) #27 KDELR1 (ENSG00000105438) #31 SYNGR4 (ENSG00000105467) #32 TMEM143 (ENSG00000161558) #33 EMP3 (ENSG00000142227) #34 ODAD1 (ENSG00000105479) #35 ZNF114 (ENSG00000178150) Pan ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161908 #8 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT01100000263507.D.a.b.a.a.a.b Chimpanzee MODERN SPECIES 10 TULP2 (ENSPTRG00000011262) #8 PPP1R15A (ENSPTRG00000011261) #9 PLEKHA4 (ENSPTRG00000011260) #10 HSD17B14 (ENSPTRG00000011259) #11 BCAT2 (ENSPTRG00000011258) #12 FGF21 (ENSPTRG00000011257) #13 FUT1 (ENSPTRG00000045221) #14 IZUMO1 (ENSPTRG00000011255) RASIP1 (ENSPTRG00000011254) #15 MAMSTR (ENSPTRG00000011253) #16 FUT2 (ENSPTRG00000011251) ##17 NTN5 (ENSPTRG00000011250) #18 CA11 (ENSPTRG00000011248) #19 DBP (ENSPTRG00000011247) #20 SPHK2 (ENSPTRG00000011246) #21 RPL18 (ENSPTRG00000011245) ##22 SPACA4 (ENSPTRG00000050556) #24 FAM83E (ENSPTRG00000011243) #23 SULT2B1 (ENSPTRG00000011241) #25 LMTK3 (ENSPTRG00000011240) #26 ENSPTRG00000045875 CYTH2 (ENSPTRG00000011238) #28 KCNJ14 (ENSPTRG00000011237) #29 GRWD1 (ENSPTRG00000011236) #30 ENSPTRG00000048202 #27 KDELR1 (ENSPTRG00000011234) #31 SYNGR4 (ENSPTRG00000011233) #32 TMEM143 (ENSPTRG00000011232) #33 EMP3 (ENSPTRG00000011230) #34 ODAD1 (ENSPTRG00000011229) #35 ZNF114 (ENSPTRG00000011228) Bonobo MODERN SPECIES 10 ENSPPAG00000031059 GYS1 (ENSPPAG00000039489) RUVBL2 (ENSPPAG00000038265) LHB (ENSPPAG00000034358) ENSPPAG00000037032 ENSPPAG00000033461 #13 FUT1 (ENSPPAG00000000286) #14 IZUMO1 (ENSPPAG00000028632) ENSPPAG00000027129 #15 ENSPPAG00000034570 #16 FUT2 (ENSPPAG00000013699) ##17 NTN5 (ENSPPAG00000017316) #18 CA11 (ENSPPAG00000028734) #19 ENSPPAG00000036181 #20 SPHK2 (ENSPPAG00000034225) #21 RPL18 (ENSPPAG00000015665) ##22 ENSPPAG00000042307 #23 SPACA4 (ENSPPAG00000021089) #24 SULT2B1 (ENSPPAG00000038079) #25 ENSPPAG00000036426 #26 ENSPPAG00000033414 CYTH2 (ENSPPAG00000041205) #28 KCNJ14 (ENSPPAG00000028906) #29 ENSPPAG00000027550 #30 ENSPPAG00000034600 #27 ENSPPAG00000019380 #31 SYNGR4 (ENSPPAG00000043363) #32 TMEM143 (ENSPPAG00000036496) #33 EMP3 (ENSPPAG00000040648) #34 ODAD1 (ENSPPAG00000036707) #35 ENSPPAG00000029290 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 ENSGT00830000128447.g Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 ENSGT00830000128447.g Vervet Monkey DUPLICATION Vervet Monkey MODERN SPECIES 18 DMXL2 (ENSCSAG00000011292) SCG3 (ENSCSAG00000011309) LYSMD2 (ENSCSAG00000011314) TMOD2 (ENSCSAG00000011323) TMOD3 (ENSCSAG00000011333) LEO1 (ENSCSAG00000011342) MAPK6 (ENSCSAG00000011360) BCL2L10 (ENSCSAG00000011373) GNB5 (ENSCSAG00000011383) MYO5C (ENSCSAG00000011460) ENSCSAG00000011503 MYO5A (ENSCSAG00000011520) ARPP19 (ENSCSAG00000011529) ATOSA (ENSCSAG00000011540) ONECUT1 (ENSCSAG00000011546) ENSCSAG00000019744 ##22 WDR72 (ENSCSAG00000011567) UNC13C (ENSCSAG00000011584) RSL24D1 (ENSCSAG00000011613) RAB27A (ENSCSAG00000011625) PIGB (ENSCSAG00000011658) CCPG1 (ENSCSAG00000011670) PIERCE2 (ENSCSAG00000011676) DNAAF4 (ENSCSAG00000011680) PYGO1 (ENSCSAG00000011684) PRTG (ENSCSAG00000011752) NEDD4 (ENSCSAG00000011809) RFX7 (ENSCSAG00000011819) ENSCSAG00000019743 TEX9 (ENSCSAG00000011830) MNS1 (ENSCSAG00000011864) Vervet Monkey MODERN SPECIES 7 DNAI2 (ENSCSAG00000004510) TTYH2 (ENSCSAG00000004506) SDK2 (ENSCSAG00000004490) CDC42EP4 (ENSCSAG00000000539) CPSF4L (ENSCSAG00000004429) C17orf80 (ENSCSAG00000004421) FAM104A (ENSCSAG00000004417) COG1 (ENSCSAG00000004413) SLC39A11 (ENSCSAG00000004409) SSTR2 (ENSCSAG00000000538) SOX9 (ENSCSAG00000004389) ENSCSAG00000000537 ENSCSAG00000000536 KCNJ2 (ENSCSAG00000000535) ##29 KCNJ16 (ENSCSAG00000000534) ENSCSAG00000004386 ##22 MAP2K6 (ENSCSAG00000004379) ABCA5 (ENSCSAG00000004374) ABCA10 (ENSCSAG00000004363) ABCA6 (ENSCSAG00000004356) ABCA9 (ENSCSAG00000004348) ABCA8 (ENSCSAG00000004307) FAM20A (ENSCSAG00000004246) PRKAR1A (ENSCSAG00000004240) WIPI1 (ENSCSAG00000004236) ARSG (ENSCSAG00000004231) SLC16A6 (ENSCSAG00000004226) AMZ2 (ENSCSAG00000004222) ENSCSAG00000000533 KPNA2 (ENSCSAG00000004208) ENSCSAG00000004196 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 ENSGT00830000128447.g Macaca ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 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ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00830000128447.g ENSGT00830000128447.h ENSGT00390000011694 Rhesus MODERN SPECIES 10 PPP1R15A (ENSMMUG00000009223) #9 PLEKHA4 (ENSMMUG00000009222) #10 HSD17B14 (ENSMMUG00000028736) #11 BCAT2 (ENSMMUG00000010079) #12 FGF21 (ENSMMUG00000028737) #13 FUT1 (ENSMMUG00000004020) #14 IZUMO1 (ENSMMUG00000004019) RASIP1 (ENSMMUG00000018415) #15 MAMSTR (ENSMMUG00000055036) #16 FUT2 (ENSMMUG00000019738) ##17 ENSMMUG00000064048 #17 NTN5 (ENSMMUG00000064152) #18 CA11 (ENSMMUG00000022161) #19 DBP (ENSMMUG00000022160) #20 SPHK2 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(ENSMFAG00000039479) ##22 SPACA4 (ENSMFAG00000063798) #24 ENSMFAG00000053965 SULT2B1 (ENSMFAG00000042452) #25 CYTH2 (ENSMFAG00000043432) #28 KCNJ14 (ENSMFAG00000045491) #29 GRWD1 (ENSMFAG00000030565) #30 GRIN2D (ENSMFAG00000031618) #27 KDELR1 (ENSMFAG00000000858) #31 SYNGR4 (ENSMFAG00000034386) #32 EMP3 (ENSMFAG00000032947) #34 ENSMFAG00000000160 #33 ENSMFAG00000044862 ENSMFAG00000030997 ENSMFAG00000001671 ENSMFAG00000061337 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00910000148675 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 ENSGT00830000128447.g Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161908 #8 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00910000148675 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT01100000263507.D.a.b.a.a.a.b ENSGT00830000128447.g Sooty mangabey MODERN SPECIES 228 TULP2 (ENSCATG00000032198) #8 PPP1R15A (ENSCATG00000030162) #9 PLEKHA4 (ENSCATG00000042217) #10 HSD17B14 (ENSCATG00000030145) #11 BCAT2 (ENSCATG00000033645) #12 FGF21 (ENSCATG00000040054) #13 FUT1 (ENSCATG00000016442) #14 IZUMO1 (ENSCATG00000037416) RASIP1 (ENSCATG00000006863) #15 MAMSTR (ENSCATG00000031813) #16 ENSCATG00000032879 NTN5 (ENSCATG00000038492) #18 CA11 (ENSCATG00000042675) #19 DBP (ENSCATG00000035077) #20 SPHK2 (ENSCATG00000040452) #21 RPL18 (ENSCATG00000029125) ##22 FAM83E (ENSCATG00000044898) #23 SULT2B1 (ENSCATG00000042336) #25 LMTK3 (ENSCATG00000003568) #26 ENSCATG00000038602 CYTH2 (ENSCATG00000027174) #28 KCNJ14 (ENSCATG00000040844) #29 GRWD1 (ENSCATG00000032225) #30 GRIN2D (ENSCATG00000039328) #27 KDELR1 (ENSCATG00000005365) #31 SYNGR4 (ENSCATG00000042213) #32 TMEM143 (ENSCATG00000035976) #33 EMP3 (ENSCATG00000035697) #34 ODAD1 (ENSCATG00000035191) #35 ENSCATG00000042223 ENSCATG00000017978 Olive baboon MODERN SPECIES 12 CA11 (ENSPANG00000014596) #19 DBP (ENSPANG00000015471) #20 SPHK2 (ENSPANG00000016639) #21 RPL18 (ENSPANG00000000131) ##22 FAM83E (ENSPANG00000002014) #23 SPACA4 (ENSPANG00000049719) #24 SULT2B1 (ENSPANG00000000367) #25 ENSPANG00000048766 #26 CYTH2 (ENSPANG00000009361) #28 KCNJ14 (ENSPANG00000020383) #29 GRWD1 (ENSPANG00000012217) #30 GRIN2D (ENSPANG00000019447) #27 KDELR1 (ENSPANG00000016640) #31 SYNGR4 (ENSPANG00000010569) #32 ENSPANG00000046161 #33 EMP3 (ENSPANG00000009362) #34 ENSPANG00000013186 ENSPANG00000030542 ENSPANG00000046789 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00940000159940.a.a ENSGT00910000146981 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.b.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00940000159940.a.a ENSGT00910000146981 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.b.a ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 1 CERKL (ENSPANG00000004250) NEUROD1 (ENSPANG00000007303) ENSPANG00000010159 ITPRID2 (ENSPANG00000018187) PPP1R1C (ENSPANG00000026406) PDE1A (ENSPANG00000011992) ENSPANG00000009747 ENSPANG00000049718 DNAJC10 (ENSPANG00000012554) FRZB (ENSPANG00000050327) NCKAP1 (ENSPANG00000003739) DUSP19 (ENSPANG00000000355) NUP35 (ENSPANG00000013686) ENSPANG00000043715 ENSPANG00000037246 ENSPANG00000000634 ##22 ZNF804A (ENSPANG00000025573) ENSPANG00000050780 ENSPANG00000045538 ENSPANG00000044408 FSIP2 (ENSPANG00000000578) ENSPANG00000044520 ENSPANG00000044060 ZC3H15 (ENSPANG00000007787) ITGAV (ENSPANG00000002085) FAM171B (ENSPANG00000019195) ZSWIM2 (ENSPANG00000018598) CALCRL (ENSPANG00000010253) TFPI (ENSPANG00000014538) ENSPANG00000047568 GULP1 (ENSPANG00000013330) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 276 ENSGT00940000159940.a.a ENSGT00910000146981 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.b.a ##22 Drill MODERN SPECIES 1613 ENSMLEG00000030846 ENSMLEG00000029284 ENSMLEG00000031890 ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158443 ENSGT00940000157578 ENSGT00940000160478 ENSGT00940000158532 ENSGT00940000160192 ENSGT00940000157043 ENSGT00940000155558 ENSGT00940000160494 ENSGT00390000016619.a ENSGT00940000153339.a.a.b.b.b ENSGT00940000156472 ENSGT00390000005923 ENSGT00940000153295.a.n ENSGT00940000159940.a.a ENSGT00910000146981 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000160909 ENSGT00680000100018.a.a.a ENSGT00390000015818.f ENSGT00940000158361 ENSGT00950000183184.a.a ENSGT00390000006826 ENSGT00940000159898 ENSGT00940000160767 ENSGT00390000001347.vb.a.b.a.b ENSGT00390000016167.h ENSGT00940000156186 ENSGT00390000004165 ENSGT00940000161229 ENSGT00940000155675 ENSGT00390000017606.a.a.i.a.b.a.a.c.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 409 ENSMNEG00000040619 ENSMNEG00000019163 ENSMNEG00000041548 ##22 ZNF804A (ENSMNEG00000028428) FSIP2 (ENSMNEG00000044635) ZC3H15 (ENSMNEG00000031479) ITGAV (ENSMNEG00000012667) FAM171B (ENSMNEG00000032925) ZSWIM2 (ENSMNEG00000031433) CALCRL (ENSMNEG00000037865) TFPI (ENSMNEG00000035955) ENSMNEG00000025231 ENSMNEG00000037542 GULP1 (ENSMNEG00000031414) ENSMNEG00000029860 COL3A1 (ENSMNEG00000031153) COL5A2 (ENSMNEG00000032534) ENSMNEG00000036096 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.b.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.b.b ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 551 TULP2 (ENSMNEG00000018510) #8 PPP1R15A (ENSMNEG00000035756) #9 PLEKHA4 (ENSMNEG00000038423) #10 HSD17B14 (ENSMNEG00000038826) #11 BCAT2 (ENSMNEG00000004800) #12 FGF21 (ENSMNEG00000035287) #13 FUT1 (ENSMNEG00000026315) #14 IZUMO1 (ENSMNEG00000033280) RASIP1 (ENSMNEG00000044155) #15 ENSMNEG00000041409 MAMSTR (ENSMNEG00000041978) #16 NTN5 (ENSMNEG00000037465) #18 CA11 (ENSMNEG00000044987) #19 DBP (ENSMNEG00000040063) #20 SPHK2 (ENSMNEG00000040086) #21 ENSMNEG00000040858 ##22 FAM83E (ENSMNEG00000033849) #23 SULT2B1 (ENSMNEG00000030949) #25 LMTK3 (ENSMNEG00000034398) #26 ENSMNEG00000044936 CYTH2 (ENSMNEG00000042947) #28 KCNJ14 (ENSMNEG00000007842) #29 GRWD1 (ENSMNEG00000008638) #30 GRIN2D (ENSMNEG00000044003) #27 KDELR1 (ENSMNEG00000030715) #31 SYNGR4 (ENSMNEG00000030613) #32 TMEM143 (ENSMNEG00000032022) #33 EMP3 (ENSMNEG00000027183) #34 ODAD1 (ENSMNEG00000032779) #35 ENSMNEG00000043852 ENSMNEG00000042171 Vervet Monkey MODERN SPECIES 15 HSD17B4 (ENSCSAG00000014659) FAM170A (ENSCSAG00000014643) PRR16 (ENSCSAG00000000511) FTMT (ENSCSAG00000000510) SRFBP1 (ENSCSAG00000014636) LOX (ENSCSAG00000014633) ZNF474 (ENSCSAG00000000509) SNCAIP (ENSCSAG00000014626) SNX2 (ENSCSAG00000014620) SNX24 (ENSCSAG00000014613) ENSCSAG00000000508 PPIC (ENSCSAG00000014607) PRDM6 (ENSCSAG00000014599) CEP120 (ENSCSAG00000014571) CSNK1G3 (ENSCSAG00000014555) ENSCSAG00000000507 ##22 ZNF608 (ENSCSAG00000014544) GRAMD2B (ENSCSAG00000014535) ALDH7A1 (ENSCSAG00000014524) PHAX (ENSCSAG00000014510) TEX43 (ENSCSAG00000014492) LMNB1 (ENSCSAG00000014483) MARCHF3 (ENSCSAG00000014474) C5orf63 (ENSCSAG00000014468) MEGF10 (ENSCSAG00000014452) PRRC1 (ENSCSAG00000014434) CTXN3 (ENSCSAG00000000506) SLC12A2 (ENSCSAG00000014424) FBN2 (ENSCSAG00000014330) SLC27A6 (ENSCSAG00000014106) ISOC1 (ENSCSAG00000014095) Rhinopithecus DUPLICATION Rhinopithecus DUPLICATION Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 138 ENSGT00390000001927.b #7 ENSGT00940000161908 #8 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.b.c.a ##22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00620000089345 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00940000162638.A.f Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1410 DHDH (ENSRROG00000042884) NUCB1 (ENSRROG00000028748) #7 TULP2 (ENSRROG00000041898) #8 PPP1R15A (ENSRROG00000043677) #9 PLEKHA4 (ENSRROG00000036445) #10 HSD17B14 (ENSRROG00000031705) #11 BCAT2 (ENSRROG00000039463) #12 FGF21 (ENSRROG00000039078) #13 IZUMO1 (ENSRROG00000010904) RASIP1 (ENSRROG00000031224) #15 MAMSTR (ENSRROG00000033087) #16 NTN5 (ENSRROG00000045373) #18 CA11 (ENSRROG00000043960) #19 DBP (ENSRROG00000032004) #20 SPHK2 (ENSRROG00000035803) #21 ENSRROG00000040178 ##22 FAM83E (ENSRROG00000028721) #23 SULT2B1 (ENSRROG00000041387) #25 LMTK3 (ENSRROG00000031356) #26 CYTH2 (ENSRROG00000045403) #28 ENSRROG00000042646 KCNJ14 (ENSRROG00000037916) #29 GRWD1 (ENSRROG00000041194) #30 GRIN2D (ENSRROG00000039470) #27 KDELR1 (ENSRROG00000027435) #31 SYNGR4 (ENSRROG00000010088) #32 TMEM143 (ENSRROG00000034694) #33 EMP3 (ENSRROG00000039752) #34 ODAD1 (ENSRROG00000038894) #35 ENSRROG00000042913 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2560 ENSRBIG00000036899 NUCB1 (ENSRBIG00000030956) #7 TULP2 (ENSRBIG00000044891) #8 PPP1R15A (ENSRBIG00000041795) #9 PLEKHA4 (ENSRBIG00000030873) #10 HSD17B14 (ENSRBIG00000039376) #11 BCAT2 (ENSRBIG00000042092) #12 FUT1 (ENSRBIG00000038287) #14 IZUMO1 (ENSRBIG00000036773) ENSRBIG00000027797 #15 MAMSTR (ENSRBIG00000043644) #16 NTN5 (ENSRBIG00000036896) #18 CA11 (ENSRBIG00000029122) #19 DBP (ENSRBIG00000043502) #20 SPHK2 (ENSRBIG00000036481) #21 ENSRBIG00000030464 ##22 FAM83E (ENSRBIG00000035409) #23 SULT2B1 (ENSRBIG00000039281) #25 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 123 ENSGT00940000155739 ENSGT00390000018295 ENSGT00390000006425 ENSGT00940000158255 ENSGT00630000089917.c ENSGT00940000158605.fb ENSGT00940000159459 ENSGT00940000160576 ENSGT00950000182944.D ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.b.c.b ##22 ENSGT00610000087497 ENSGT00940000162096 ENSGT00390000016597.q.a ENSGT00940000157775 ENSGT00390000011517.a.b ENSGT00500000045192 ENSGT00900000143760 ENSGT00550000074977 ENSGT00940000154708.eb.a.a ENSGT00940000160769 ENSGT00390000017793 ENSGT00390000000752 ENSGT00390000015960.a.a.b ENSGT00390000007175 ENSGT00940000160908 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2001 STK19 (ENSRBIG00000031144) DXO (ENSRBIG00000044693) SKIC2 (ENSRBIG00000035485) ENSRBIG00000028593 CFB (ENSRBIG00000027009) EHMT2 (ENSRBIG00000039842) SLC44A4 (ENSRBIG00000030820) NEU1 (ENSRBIG00000034622) ENSRBIG00000042220 ##22 ENSRBIG00000031960 HSPA1L (ENSRBIG00000009659) LSM2 (ENSRBIG00000010172) VARS1 (ENSRBIG00000041669) VWA7 (ENSRBIG00000039101) SAPCD1 (ENSRBIG00000044186) ENSRBIG00000004381 MSH5 (ENSRBIG00000027560) CLIC1 (ENSRBIG00000042159) DDAH2 (ENSRBIG00000023949) MPIG6B (ENSRBIG00000041565) LY6G6C (ENSRBIG00000039417) LY6G6F (ENSRBIG00000028754) ENSRBIG00000005265 ABHD16A (ENSRBIG00000016129) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2414 ENSRROG00000033067 ENSRROG00000042148 STK19 (ENSRROG00000040538) DXO (ENSRROG00000035555) SKIC2 (ENSRROG00000036429) NELFE (ENSRROG00000041993) CFB (ENSRROG00000031058) EHMT2 (ENSRROG00000028913) SLC44A4 (ENSRROG00000030634) NEU1 (ENSRROG00000023915) ENSRROG00000028785 ##22 ENSRROG00000045141 ENSRROG00000001634 LSM2 (ENSRROG00000030345) VARS1 (ENSRROG00000045490) VWA7 (ENSRROG00000042330) SAPCD1 (ENSRROG00000033563) MSH5 (ENSRROG00000033293) CLIC1 (ENSRROG00000024225) DDAH2 (ENSRROG00000033495) MPIG6B (ENSRROG00000043021) LY6G6C (ENSRROG00000031504) LY6G6F (ENSRROG00000034734) ENSRROG00000009336 ENSRROG00000040885 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a.b.d ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1145 FBXO11 (ENSRROG00000044862) MSH6 (ENSRROG00000034827) ENSRROG00000034141 KCNK12 (ENSRROG00000044464) MSH2 (ENSRROG00000002126) EPCAM (ENSRROG00000005977) ENSRROG00000012737 ENSRROG00000033589 STPG4 (ENSRROG00000032949) ENSRROG00000043038 ##22 TTC7A (ENSRROG00000029928) MCFD2 (ENSRROG00000032954) SOCS5 (ENSRROG00000011752) CRIPT (ENSRROG00000039659) PIGF (ENSRROG00000043302) RHOQ (ENSRROG00000042208) ATP6V1E2 (ENSRROG00000014680) TMEM247 (ENSRROG00000028710) EPAS1 (ENSRROG00000040968) PRKCE (ENSRROG00000029195) SRBD1 (ENSRROG00000041599) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.a ##22 Degu MODERN SPECIES 309 ENSODEG00000017053 BAX (ENSODEG00000017282) NUCB1 (ENSODEG00000017408) #7 PLEKHA4 (ENSODEG00000017698) #10 HSD17B14 (ENSODEG00000017445) #11 BCAT2 (ENSODEG00000018162) #12 FGF21 (ENSODEG00000017425) #13 FUT1 (ENSODEG00000020523) #14 RASIP1 (ENSODEG00000017668) #15 MAMSTR (ENSODEG00000017655) #16 ENSODEG00000020557 #17 NTN5 (ENSODEG00000017585) #18 CA11 (ENSODEG00000017152) #19 DBP (ENSODEG00000017321) #20 SPHK2 (ENSODEG00000017472) #21 RPL18 (ENSODEG00000017416) ##22 FAM83E (ENSODEG00000017511) #23 SPACA4 (ENSODEG00000017325) #24 ENSODEG00000017685 #25 GRIN2D (ENSODEG00000017679) #27 ENSODEG00000017598 CYTH2 (ENSODEG00000017638) #28 KCNJ14 (ENSODEG00000017429) #29 GRWD1 (ENSODEG00000017532) #30 KDELR1 (ENSODEG00000017624) #31 SYNGR4 (ENSODEG00000017451) #32 TMEM143 (ENSODEG00000017757) #33 EMP3 (ENSODEG00000017763) #34 ENSODEG00000017412 #35 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Arabian camel MODERN SPECIES 3 NUP107 (ENSCDRG00005014693) SLC35E3 (ENSCDRG00005014826) MDM2 (ENSCDRG00005014898) CPM (ENSCDRG00005015280) ENSCDRG00005015562 CPSF6 (ENSCDRG00005015610) SYN3 (ENSCDRG00005015679) TIMP3 (ENSCDRG00005015818) FBXO7 (ENSCDRG00005015847) BPIFC (ENSCDRG00005015980) RTCB (ENSCDRG00005016207) ASCL4 (ENSCDRG00005016253) PRDM4 (ENSCDRG00005016292) PWP1 (ENSCDRG00005016339) ABTB3 (ENSCDRG00005016449) ENSCDRG00005017653 ##22 CRY1 (ENSCDRG00005017689) MTERF2 (ENSCDRG00005017725) TMEM263 (ENSCDRG00005017734) RIC8B (ENSCDRG00005017763) POLR3B (ENSCDRG00005017959) TCP11L2 (ENSCDRG00005018354) CKAP4 (ENSCDRG00005018403) NUAK1 (ENSCDRG00005018419) ENSCDRG00005018505 APPL2 (ENSCDRG00005018608) ENSCDRG00005018657 ALDH1L2 (ENSCDRG00005018717) NOPCHAP1 (ENSCDRG00005018766) SLC41A2 (ENSCDRG00005018798) CHST11 (ENSCDRG00005018831) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 4 ENSBIXG00005016363 ENSBIXG00005016369 ENSBIXG00005016383 ENSBIXG00005016407 ENSBIXG00005016429 ENSBIXG00005002622 WFDC2 (ENSBIXG00005016465) ENSBIXG00005016494 EPPIN (ENSBIXG00005016501) WFDC8 (ENSBIXG00005016511) WFDC10A (ENSBIXG00005016539) WFDC11 (ENSBIXG00005007043) WFDC10B (ENSBIXG00005016547) WFDC13 (ENSBIXG00005002668) SPINT4 (ENSBIXG00005016569) ENSBIXG00005016597 ##22 ENSBIXG00005016604 DNTTIP1 (ENSBIXG00005016639) UBE2C (ENSBIXG00005016676) TNNC2 (ENSBIXG00005016692) SNX21 (ENSBIXG00005016755) ACOT8 (ENSBIXG00005016801) ZSWIM3 (ENSBIXG00005016824) ZSWIM1 (ENSBIXG00005016841) SPATA25 (ENSBIXG00005016850) NEURL2 (ENSBIXG00005005845) CTSA (ENSBIXG00005017223) PLTP (ENSBIXG00005017350) PCIF1 (ENSBIXG00005017412) ZNF335 (ENSBIXG00005002838) MMP9 (ENSBIXG00005017489) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 14 ENSPCTG00005003503 AKIRIN1 (ENSPCTG00005003521) NDUFS5 (ENSPCTG00005003540) MEAF6 (ENSPCTG00005003560) SNIP1 (ENSPCTG00005003594) DNALI1 (ENSPCTG00005003612) GNL2 (ENSPCTG00005003644) SF3A3 (ENSPCTG00005003674) INPP5B (ENSPCTG00005003696) MTF1 (ENSPCTG00005003715) C3H1orf122 (ENSPCTG00005003734) YRDC (ENSPCTG00005003745) MANEAL (ENSPCTG00005003753) ENSPCTG00005003762 ENSPCTG00005003767 ENSPCTG00005003777 ##22 GRIK3 (ENSPCTG00005003798) OSCP1 (ENSPCTG00005003848) LSM10 (ENSPCTG00005003868) STK40 (ENSPCTG00005003877) EVA1B (ENSPCTG00005003886) ENSPCTG00005003892 COL8A2 (ENSPCTG00005003905) ADPRHL2 (ENSPCTG00005003914) ENSPCTG00005003935 AGO3 (ENSPCTG00005003950) AGO1 (ENSPCTG00005003991) AGO4 (ENSPCTG00005004016) CLSPN (ENSPCTG00005004034) PSMB2 (ENSPCTG00005004049) TFAP2E (ENSPCTG00005004064) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 30 PRPF18 (ENSRFEG00010018969) FRMD4A (ENSRFEG00010019050) FAM107B (ENSRFEG00010019206) CDNF (ENSRFEG00010019298) HSPA14 (ENSRFEG00010019357) SUV39H2 (ENSRFEG00010019418) DCLRE1C (ENSRFEG00010019540) MEIG1 (ENSRFEG00010019650) OLAH (ENSRFEG00010019677) ACBD7 (ENSRFEG00010019720) RPP38 (ENSRFEG00010019749) NMT2 (ENSRFEG00010019775) FAM171A1 (ENSRFEG00010019859) ITGA8 (ENSRFEG00010019917) MINDY3 (ENSRFEG00010020170) ENSRFEG00010020221 ##22 PTER (ENSRFEG00010020253) C1QL3 (ENSRFEG00010020295) RSU1 (ENSRFEG00010020311) CUBN (ENSRFEG00010020510) TRDMT1 (ENSRFEG00010021313) ENSRFEG00010021330 VIM (ENSRFEG00010021345) ST8SIA6 (ENSRFEG00010021356) HACD1 (ENSRFEG00010021363) STAM (ENSRFEG00010021374) TMEM236 (ENSRFEG00010021386) MRC1 (ENSRFEG00010021400) SLC39A12 (ENSRFEG00010005999) CACNB2 (ENSRFEG00010006472) NSUN6 (ENSRFEG00010007349) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 9 ENSMFAG00000037469 GAREM1 (ENSMFAG00000039588) MEP1B (ENSMFAG00000045964) RNF138 (ENSMFAG00000040383) TRAPPC8 (ENSMFAG00000039323) TTR (ENSMFAG00000039111) SLC25A52 (ENSMFAG00000020470) B4GALT6 (ENSMFAG00000033017) DSG2 (ENSMFAG00000014923) DSG3 (ENSMFAG00000031707) DSG4 (ENSMFAG00000031939) DSG1 (ENSMFAG00000033359) ENSMFAG00000059757 DSC1 (ENSMFAG00000035735) DSC2 (ENSMFAG00000045076) ENSMFAG00000033666 ##22 CDH2 (ENSMFAG00000004661) CHST9 (ENSMFAG00000037917) ENSMFAG00000056073 AQP4 (ENSMFAG00000041146) ENSMFAG00000052328 ENSMFAG00000050383 ENSMFAG00000036987 TAF4B (ENSMFAG00000031932) ENSMFAG00000050615 PSMA8 (ENSMFAG00000011562) SS18 (ENSMFAG00000035986) ZNF521 (ENSMFAG00000044636) ENSMFAG00000048831 HRH4 (ENSMFAG00000050624) ENSMFAG00000060888 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 584 ACE (ENSMNEG00000031000) CYB561 (ENSMNEG00000036313) TANC2 (ENSMNEG00000027293) MARCHF10 (ENSMNEG00000043862) MRC2 (ENSMNEG00000032144) TLK2 (ENSMNEG00000039025) ENSMNEG00000028100 ENSMNEG00000013742 EFCAB3 (ENSMNEG00000042933) EFCAB13 (ENSMNEG00000000900) ENSMNEG00000038116 ITGB3 (ENSMNEG00000028721) MYL4 (ENSMNEG00000040405) CDC27 (ENSMNEG00000044765) ENSMNEG00000011455 ENSMNEG00000035047 ##22 ENSMNEG00000039857 RAP1GAP (ENSMNEG00000041779) ALPL (ENSMNEG00000044451) ENSMNEG00000033001 ECE1 (ENSMNEG00000030778) EIF4G3 (ENSMNEG00000035435) HP1BP3 (ENSMNEG00000041121) SH2D5 (ENSMNEG00000029070) KIF17 (ENSMNEG00000028641) DDOST (ENSMNEG00000040019) PINK1 (ENSMNEG00000032582) CDA (ENSMNEG00000034710) ENSMNEG00000031902 ENSMNEG00000043302 MUL1 (ENSMNEG00000043077) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Drill MODERN SPECIES 1473 ENSMLEG00000033992 ##22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 9 MEP1B (ENSCSAG00000017877) RNF138 (ENSCSAG00000017873) RNF125 (ENSCSAG00000017870) TRAPPC8 (ENSCSAG00000017866) SLC25A52 (ENSCSAG00000018571) B4GALT6 (ENSCSAG00000017864) TTR (ENSCSAG00000017862) DSG2 (ENSCSAG00000017859) DSG3 (ENSCSAG00000017854) DSG4 (ENSCSAG00000017847) DSG1 (ENSCSAG00000017839) DSC1 (ENSCSAG00000017834) DSC2 (ENSCSAG00000017822) DSC3 (ENSCSAG00000017820) ENSCSAG00000018572 ENSCSAG00000018573 ##22 ENSCSAG00000018574 CDH2 (ENSCSAG00000017819) CHST9 (ENSCSAG00000017818) AQP4 (ENSCSAG00000017817) KCTD1 (ENSCSAG00000017816) TAF4B (ENSCSAG00000017814) PSMA8 (ENSCSAG00000017812) SS18 (ENSCSAG00000017808) ZNF521 (ENSCSAG00000017805) HRH4 (ENSCSAG00000017801) IMPACT (ENSCSAG00000017798) OSBPL1A (ENSCSAG00000017790) CABYR (ENSCSAG00000017786) TTC39C (ENSCSAG00000017784) LAMA3 (ENSCSAG00000017763) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 166 ENSRBIG00000000545 ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2074 ENSRROG00000033638 ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.c.b.b.b.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 14 ACTN3 (ENSHGLG00000010459) CTSF (ENSHGLG00000010139) CCDC87 (ENSHGLG00000020895) CCS (ENSHGLG00000016462) RBM14 (ENSHGLG00000012589) RBM4 (ENSHGLG00000009991) ENSHGLG00000016412 SPTBN2 (ENSHGLG00000014309) ENSHGLG00000017380 PC (ENSHGLG00000012030) LRFN4 (ENSHGLG00000043687) C11orf86 (ENSHGLG00000010988) SYT12 (ENSHGLG00000010017) RHOD (ENSHGLG00000033630) KDM2A (ENSHGLG00000019342) ENSHGLG00000050293 ##22 GRK2 (ENSHGLG00000016215) ANKRD13D (ENSHGLG00000019254) SSH3 (ENSHGLG00000011687) POLD4 (ENSHGLG00000010576) CLCF1 (ENSHGLG00000009725) RAD9A (ENSHGLG00000013829) PPP1CA (ENSHGLG00000013028) TBC1D10C (ENSHGLG00000011863) CARNS1 (ENSHGLG00000015759) RPS6KB2 (ENSHGLG00000011537) PTPRCAP (ENSHGLG00000038375) CORO1B (ENSHGLG00000014004) GPR152 (ENSHGLG00000020880) CABP4 (ENSHGLG00000012191) TMEM134 (ENSHGLG00000046661) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00950000183364 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 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ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 Tenrec MODERN SPECIES 4345 ENSETEG00000013159 #21 RPL18 (ENSETEG00000013157) #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00390000001450.h.a.a.a ##17 ENSGT00390000001450.h.a.a.b #17 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00510000049347 #24 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a #33 Elephant MODERN SPECIES 375 ENSLAFG00000031051 #8 PPP1R15A (ENSLAFG00000028832) #9 PLEKHA4 (ENSLAFG00000018252) #10 HSD17B14 (ENSLAFG00000000849) #11 FGF21 (ENSLAFG00000023380) #13 FUT1 (ENSLAFG00000012789) #14 IZUMO1 (ENSLAFG00000022408) RASIP1 (ENSLAFG00000022375) #15 MAMSTR (ENSLAFG00000017394) #16 FUT2 (ENSLAFG00000002910) ##17 ENSLAFG00000028837 #17 NTN5 (ENSLAFG00000001946) #18 CA11 (ENSLAFG00000031329) #19 DBP (ENSLAFG00000013079) #20 SPHK2 (ENSLAFG00000014968) #21 RPL18 (ENSLAFG00000031267) #22 FAM83E (ENSLAFG00000029646) #23 SPACA4 (ENSLAFG00000008713) #24 SULT2B1 (ENSLAFG00000016602) #25 ENSLAFG00000032228 #26 CYTH2 (ENSLAFG00000009549) #28 KCNJ14 (ENSLAFG00000007497) #29 GRWD1 (ENSLAFG00000000713) #30 GRIN2D (ENSLAFG00000000710) #27 KDELR1 (ENSLAFG00000000708) #31 SYNGR4 (ENSLAFG00000000707) #32 TMEM143 (ENSLAFG00000022197) #33 ODAD1 (ENSLAFG00000020831) #35 ENSLAFG00000014388 ENSLAFG00000021388 VRK3 (ENSLAFG00000001146) Hyrax MODERN SPECIES 615 ENSPCAG00000011426 #20 SPHK2 (ENSPCAG00000011359) #21 RPL18 (ENSPCAG00000011313) #22 SPACA4 (ENSPCAG00000011291) #24 FAM83E (ENSPCAG00000011234) #23 Marsupialia DUPLICATION Marsupialia DUPLICATION Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00730000111841 ENSGT00940000159110 ENSGT00940000154404.a #9 ENSGT00940000161121 #10 ENSGT00940000161346 #11 ENSGT00390000009532.A.d.b #12 ENSGT00940000161866 #13 ENSGT00390000001450.h.b #14 ENSGT00390000015014 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000154181.b #16 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.g.a #22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a.e #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00950000182933.C ENSGT00940000161219 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#20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976.g.a #22 ENSGT00940000161572 #23 ENSGT00940000159269.h #25 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00940000154315.a.e #33 ENSGT00950000182696.B.b #34 ENSGT00940000153116.A #35 ENSGT00950000182933.C.e ENSGT00940000161219 ENSGT01050000244961.b Common wonbat MODERN SPECIES 924 ENSVURG00010010595 SLC17A7 (ENSVURG00010010611) ENSVURG00010010630 #9 PLEKHA4 (ENSVURG00010010644) #10 HSD17B14 (ENSVURG00010010679) #11 BCAT2 (ENSVURG00010010710) #12 ENSVURG00010010789 FGF21 (ENSVURG00010010797) #13 FUT1 (ENSVURG00010010804) #14 ENSVURG00010010810 RASIP1 (ENSVURG00010010833) #15 NTN5 (ENSVURG00010010885) #18 CA11 (ENSVURG00010010910) #19 ENSVURG00010010925 SPHK2 (ENSVURG00010010932) #21 ENSVURG00010010941 #22 FAM83E (ENSVURG00010011013) #23 SULT2B1 (ENSVURG00010011024) #25 LMTK3 (ENSVURG00010011042) #26 CYTH2 (ENSVURG00010011128) #28 KCNJ14 (ENSVURG00010011144) #29 GRWD1 (ENSVURG00010011151) #30 GRIN2D (ENSVURG00010011175) #27 KDELR1 (ENSVURG00010011352) #31 SYNGR4 (ENSVURG00010011363) #32 TMEM143 (ENSVURG00010011378) #33 ENSVURG00010011401 #34 ENSVURG00010011407 #35 ENSVURG00010011422 PRKCG (ENSVURG00010011430) CACNG7 (ENSVURG00010011445) koala MODERN SPECIES 100 ENSPCIG00000001354 ENSPCIG00000001337 SLC17A7 (ENSPCIG00000001300) PLEKHA4 (ENSPCIG00000001244) #10 ENSPCIG00000001217 BCAT2 (ENSPCIG00000001205) #12 FGF21 (ENSPCIG00000001200) #13 ENSPCIG00000001187 RASIP1 (ENSPCIG00000001167) #15 ENSPCIG00000001155 #16 NTN5 (ENSPCIG00000001142) #18 CA11 (ENSPCIG00000001116) #19 ENSPCIG00000001099 #20 ENSPCIG00000035751 #21 ENSPCIG00000001088 #21 ENSPCIG00000001051 #22 FAM83E (ENSPCIG00000001024) #23 SULT2B1 (ENSPCIG00000001008) #25 LMTK3 (ENSPCIG00000000991) #26 CYTH2 (ENSPCIG00000000973) #28 KCNJ14 (ENSPCIG00000034100) #29 GRWD1 (ENSPCIG00000000910) #30 GRIN2D (ENSPCIG00000000902) #27 KDELR1 (ENSPCIG00000012934) #31 SYNGR4 (ENSPCIG00000012933) #32 ENSPCIG00000012931 #33 EMP3 (ENSPCIG00000012930) #34 ENSPCIG00000012929 #35 ENSPCIG00000012926 PRKCG (ENSPCIG00000012925) CACNG7 (ENSPCIG00000030900) Opossum MODERN SPECIES 513 CA11 (ENSMODG00000022682) #19 ENSMODG00000040832 #22 FAM83E (ENSMODG00000041843) #23 ENSMODG00000044977 #25 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.g.b #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.g.b #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.g.b #22 Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.g.b.a #22 koala DUPLICATION koala MODERN SPECIES 19 ENSPCIG00000016283 SLC6A2 (ENSPCIG00000003091) ENSPCIG00000033526 LPCAT2 (ENSPCIG00000003075) MMP2 (ENSPCIG00000003051) IRX6 (ENSPCIG00000022974) IRX5 (ENSPCIG00000013874) FTO (ENSPCIG00000024376) RPGRIP1L (ENSPCIG00000024349) ENSPCIG00000024347 AKTIP (ENSPCIG00000024346) RBL2 (ENSPCIG00000024344) CHD9 (ENSPCIG00000017215) TOX3 (ENSPCIG00000027529) SALL1 (ENSPCIG00000017840) ENSPCIG00000032216 #22 CYLD (ENSPCIG00000017853) NOD2 (ENSPCIG00000017861) SNX20 (ENSPCIG00000017863) NKD1 (ENSPCIG00000017864) BRD7 (ENSPCIG00000017871) ADCY7 (ENSPCIG00000016804) TENT4B (ENSPCIG00000018132) HEATR3 (ENSPCIG00000012841) CNEP1R1 (ENSPCIG00000003801) ENSPCIG00000002963 ZNF423 (ENSPCIG00000021085) ENSPCIG00000021089 ENSPCIG00000033644 CBLN1 (ENSPCIG00000031036) N4BP1 (ENSPCIG00000021093) koala MODERN SPECIES 118 TAGLN3 (ENSPCIG00000017833) TMPRSS7 (ENSPCIG00000017837) ENSPCIG00000017843 ENSPCIG00000017852 ENSPCIG00000017865 CD200 (ENSPCIG00000017867) ENSPCIG00000017868 ATG3 (ENSPCIG00000019591) SLC35A5 (ENSPCIG00000019594) CCDC80 (ENSPCIG00000019596) ENSPCIG00000019597 ENSPCIG00000019599 ENSPCIG00000019600 GTPBP8 (ENSPCIG00000019601) NEPRO (ENSPCIG00000019602) ENSPCIG00000019603 #22 BOC (ENSPCIG00000019604) CFAP44 (ENSPCIG00000019607) SPICE1 (ENSPCIG00000019613) SIDT1 (ENSPCIG00000019628) USF3 (ENSPCIG00000019823) NAA50 (ENSPCIG00000019828) ATP6V1A (ENSPCIG00000019831) GRAMD1C (ENSPCIG00000019836) ZDHHC23 (ENSPCIG00000019840) ENSPCIG00000019842 QTRT2 (ENSPCIG00000019843) DRD3 (ENSPCIG00000019846) ENSPCIG00000019861 ZBTB20 (ENSPCIG00000034518) GAP43 (ENSPCIG00000034647) Common wonbat MODERN SPECIES 909 ENSVURG00010014402 ENSVURG00010014389 GOLGA4 (ENSVURG00010014275) ENSVURG00010014240 #22 ITGA9 (ENSVURG00010014218) Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.g.b.b.a.a #22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1011 ENSVURG00010020962 NDUFAF2 (ENSVURG00010020959) SMIM15 (ENSVURG00010020953) ZSWIM6 (ENSVURG00010020943) KIF2A (ENSVURG00010020919) DIMT1 (ENSVURG00010020908) IPO11 (ENSVURG00010020888) HTR1A (ENSVURG00010020874) ENSVURG00010020871 RNF180 (ENSVURG00010020869) ENSVURG00010020860 RGS7BP (ENSVURG00010020856) SHISAL2B (ENSVURG00010020853) SREK1IP1 (ENSVURG00010020850) CWC27 (ENSVURG00010020847) ENSVURG00010020841 #22 ADAMTS6 (ENSVURG00010020836) CENPK (ENSVURG00010020831) PPWD1 (ENSVURG00010020828) TRIM23 (ENSVURG00010020826) TRAPPC13 (ENSVURG00010020820) SGTB (ENSVURG00010020813) NLN (ENSVURG00010020799) ERBIN (ENSVURG00010019723) ENSVURG00010019585 ENSVURG00010019565 MAST4 (ENSVURG00010019545) CD180 (ENSVURG00010019536) PIK3R1 (ENSVURG00010019506) ENSVURG00010019482 CCNB1 (ENSVURG00010019473) Common wonbat MODERN SPECIES 34 ENSVURG00010000981 ENSVURG00010000990 ALDH5A1 (ENSVURG00010001015) GPLD1 (ENSVURG00010001036) MRS2 (ENSVURG00010001202) DCDC2 (ENSVURG00010001376) NRSN1 (ENSVURG00010001397) PRL (ENSVURG00010001429) SOX4 (ENSVURG00010001465) CDKAL1 (ENSVURG00010001661) ENSVURG00010001713 E2F3 (ENSVURG00010001724) MBOAT1 (ENSVURG00010001763) ID4 (ENSVURG00010001841) RNF144B (ENSVURG00010001966) ENSVURG00010001981 #22 DEK (ENSVURG00010001997) ENSVURG00010002060 ENSVURG00010002073 TPMT (ENSVURG00010002092) NHLRC1 (ENSVURG00010002104) KIF13A (ENSVURG00010002158) NUP153 (ENSVURG00010002325) ENSVURG00010002466 CAP2 (ENSVURG00010002496) RBM24 (ENSVURG00010002571) STMND1 (ENSVURG00010002576) ATXN1 (ENSVURG00010002666) GMPR (ENSVURG00010002686) MYLIP (ENSVURG00010002708) DTNBP1 (ENSVURG00010002784) koala MODERN SPECIES 119 ENSPCIG00000013645 SMIM15 (ENSPCIG00000013649) ZSWIM6 (ENSPCIG00000013654) ENSPCIG00000013664 KIF2A (ENSPCIG00000023295) DIMT1 (ENSPCIG00000023293) IPO11 (ENSPCIG00000023292) ENSPCIG00000028931 HTR1A (ENSPCIG00000012371) RNF180 (ENSPCIG00000029743) ENSPCIG00000029744 ENSPCIG00000029746 SHISAL2B (ENSPCIG00000029747) SREK1IP1 (ENSPCIG00000035064) CWC27 (ENSPCIG00000029749) ENSPCIG00000033494 #22 ADAMTS6 (ENSPCIG00000029757) CENPK (ENSPCIG00000030679) PPWD1 (ENSPCIG00000029760) TRIM23 (ENSPCIG00000029762) TRAPPC13 (ENSPCIG00000029763) SGTB (ENSPCIG00000034123) NLN (ENSPCIG00000013293) ERBIN (ENSPCIG00000017735) SREK1 (ENSPCIG00000017750) ENSPCIG00000017757 MAST4 (ENSPCIG00000017760) CD180 (ENSPCIG00000017764) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.g.b.b.a.b #22 Common wonbat MODERN SPECIES 1007 CLDN3 (ENSVURG00010004044) CLDN4 (ENSVURG00010004047) ENSVURG00010004049 ENSVURG00010004082 LIMK1 (ENSVURG00010004129) EIF4H (ENSVURG00010004157) ENSVURG00010004177 RFC2 (ENSVURG00010004205) CLIP2 (ENSVURG00010004228) GTF2IRD1 (ENSVURG00010004286) GTF2I (ENSVURG00010004452) NCF1 (ENSVURG00010004576) RCC1L (ENSVURG00010004599) CASTOR2 (ENSVURG00010004680) PHKG1 (ENSVURG00010004704) ENSVURG00010004740 #22 AUTS2 (ENSVURG00010004785) GALNT17 (ENSVURG00010004853) CALN1 (ENSVURG00010004945) ENSVURG00010005017 SBDS (ENSVURG00010005041) ENSVURG00010005067 NIPSNAP2 (ENSVURG00010005157) PSPH (ENSVURG00010005186) ENSVURG00010005202 ENSVURG00010005245 NUPR2 (ENSVURG00010005251) VKORC1L1 (ENSVURG00010005257) GUSB (ENSVURG00010005267) ASL (ENSVURG00010005329) CRCP (ENSVURG00010005674) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.g.b.b.b #22 koala MODERN SPECIES 78 ENSPCIG00000033025 ENSPCIG00000017312 ENSPCIG00000017313 #22 ENSPCIG00000030798 ADGRL3 (ENSPCIG00000017414) ENSPCIG00000012461 TECRL (ENSPCIG00000006772) ENSPCIG00000024024 ENSPCIG00000024026 EPHA5 (ENSPCIG00000024027) ENSPCIG00000012623 STAP1 (ENSPCIG00000012621) UBA6 (ENSPCIG00000002425) GNRHR (ENSPCIG00000001816) ENSPCIG00000001778 TMPRSS11D (ENSPCIG00000001625) TMPRSS11A (ENSPCIG00000001569) TMPRSS11F (ENSPCIG00000019073) Wallaby MODERN SPECIES 560 CA11 (ENSMEUG00000000665) #19 DBP (ENSMEUG00000000663) #20 SPHK2 (ENSMEUG00000000644) #21 RPL18 (ENSMEUG00000000640) #22 FAM83E (ENSMEUG00000000624) #23 ENSMEUG00000000611 #25 Opossum MODERN SPECIES 5 SNX30 (ENSMODG00000004826) INIP (ENSMODG00000004831) KIAA1958 (ENSMODG00000004849) ENSMODG00000037172 HSDL2 (ENSMODG00000005316) PTBP3 (ENSMODG00000005502) SUSD1 (ENSMODG00000005525) UGCG (ENSMODG00000005539) SHOC1 (ENSMODG00000005617) GNG10 (ENSMODG00000005623) DNAJC25 (ENSMODG00000005635) ECPAS (ENSMODG00000005682) ABCC6 (ENSMODG00000005815) ENSMODG00000050357 ENSMODG00000044938 ENSMODG00000025119 #22 XYLT1 (ENSMODG00000005904) RPS15A (ENSMODG00000005920) ARL6IP1 (ENSMODG00000005944) SMG1 (ENSMODG00000006102) ENSMODG00000040296 ENSMODG00000051307 SYT17 (ENSMODG00000006147) ITPRIPL2 (ENSMODG00000025107) COQ7 (ENSMODG00000006166) TMC7 (ENSMODG00000006207) TMC5 (ENSMODG00000006227) GDE1 (ENSMODG00000006250) CCP110 (ENSMODG00000006278) VPS35L (ENSMODG00000006477) ENSMODG00000045967 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.h #22 Marsupialia_b DUPLICATION Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.h.a #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.h.a #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.h.a #22 koala DUPLICATION koala MODERN SPECIES 258 AIMP1 (ENSPCIG00000000116) TBCK (ENSPCIG00000000191) ENSPCIG00000033056 NPNT (ENSPCIG00000000294) GSTCD (ENSPCIG00000000415) INTS12 (ENSPCIG00000000458) ARHGEF38 (ENSPCIG00000030643) ENSPCIG00000000541 PPA2 (ENSPCIG00000000509) TET2 (ENSPCIG00000000570) ENSPCIG00000000618 ENSPCIG00000029758 #22 CXXC4 (ENSPCIG00000031593) koala MODERN SPECIES 77 DHTKD1 (ENSPCIG00000006647) SEC61A2 (ENSPCIG00000006644) NUDT5 (ENSPCIG00000006637) CDC123 (ENSPCIG00000006629) CAMK1D (ENSPCIG00000006626) CCDC3 (ENSPCIG00000035033) OPTN (ENSPCIG00000006619) MCM10 (ENSPCIG00000006612) UCMA (ENSPCIG00000006610) PHYH (ENSPCIG00000006607) SEPHS1 (ENSPCIG00000006605) BEND7 (ENSPCIG00000006593) PRPF18 (ENSPCIG00000012963) FRMD4A (ENSPCIG00000006587) ENSPCIG00000023215 ENSPCIG00000023216 #22 CDNF (ENSPCIG00000024399) HSPA14 (ENSPCIG00000024396) MSANTD7 (ENSPCIG00000024397) SUV39H2 (ENSPCIG00000024395) DCLRE1C (ENSPCIG00000024394) ENSPCIG00000024390 TMEM243 (ENSPCIG00000024389) DMTF1 (ENSPCIG00000024387) ELAPOR2 (ENSPCIG00000014821) GRM3 (ENSPCIG00000014828) SEMA3D (ENSPCIG00000013757) SEMA3A (ENSPCIG00000013761) SEMA3E (ENSPCIG00000024900) Common wonbat MODERN SPECIES 56 ENSVURG00010013009 TFG (ENSVURG00010012983) ADGRG7 (ENSVURG00010012960) TMEM45A (ENSVURG00010012942) ENSVURG00010012941 TOMM70 (ENSVURG00010012184) NIT2 (ENSVURG00010012148) TBC1D23 (ENSVURG00010012116) ENSVURG00010012099 CMSS1 (ENSVURG00010012075) FILIP1L (ENSVURG00010012064) COL8A1 (ENSVURG00010012056) DCBLD2 (ENSVURG00010012042) ST3GAL6 (ENSVURG00010012019) ENSVURG00010011973 ENSVURG00010011964 #22 MAP3K15 (ENSVURG00010011944) BCLAF3 (ENSVURG00010011888) ENSVURG00010011864 EIF1AX (ENSVURG00010011856) RPS6KA3 (ENSVURG00010011816) CNKSR2 (ENSVURG00010011791) ENSVURG00010011764 SMPX (ENSVURG00010011755) MBTPS2 (ENSVURG00010011746) SMS (ENSVURG00010011730) PHEX (ENSVURG00010011707) PTCHD1 (ENSVURG00010011688) ENSVURG00010011668 ACOT9 (ENSVURG00010011656) Marsupialia_b DUPLICATION Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.h.b.a #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.h.b.a #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.h.b.a #22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 574 TRIM35 (ENSVURG00010001232) STMN4 (ENSVURG00010001184) NCOA1 (ENSVURG00010001108) PTRHD1 (ENSVURG00010001076) CENPO (ENSVURG00010001066) ADCY3 (ENSVURG00010000999) DNAJC27 (ENSVURG00010000971) EFR3B (ENSVURG00010000919) ENSVURG00010000874 ENSVURG00010000869 #22 DNMT3A (ENSVURG00010000794) ENSVURG00010000721 ENSVURG00010000697 ASXL2 (ENSVURG00010000667) ENSVURG00010000654 KIF3C (ENSVURG00010000616) RAB10 (ENSVURG00010000601) GAREM2 (ENSVURG00010000581) HADHA (ENSVURG00010000555) HADHB (ENSVURG00010000535) ENSVURG00010000497 SELENOI (ENSVURG00010000464) DRC1 (ENSVURG00010000415) OTOF (ENSVURG00010000174) FAM166C (ENSVURG00010000107) Common wonbat MODERN SPECIES 302 ENSVURG00010001353 ENSVURG00010001330 ENSVURG00010001313 #22 ENSVURG00010001303 ENSVURG00010001291 ENSVURG00010001272 ENSVURG00010001257 Tasmanian devil MODERN SPECIES 2 ENSSHAG00000023176 ENSSHAG00000030026 #9 ENSSHAG00000021313 #10 ENSSHAG00000027240 #11 ENSSHAG00000027434 ENSSHAG00000005048 #12 FGF21 (ENSSHAG00000021607) #13 FUT1 (ENSSHAG00000022577) #14 ENSSHAG00000021087 ENSSHAG00000027285 #15 ENSSHAG00000025099 #16 NTN5 (ENSSHAG00000032194) #18 CA11 (ENSSHAG00000024442) #19 ENSSHAG00000025535 SPHK2 (ENSSHAG00000024807) #21 ENSSHAG00000031863 #22 FAM83E (ENSSHAG00000028462) #23 SULT2B1 (ENSSHAG00000006644) #25 CYTH2 (ENSSHAG00000007239) #28 GRWD1 (ENSSHAG00000007359) #30 ENSSHAG00000007651 #32 ENSSHAG00000022625 #33 ENSSHAG00000026619 #34 ENSSHAG00000021166 ENSSHAG00000004991 ENSSHAG00000026966 ENSSHAG00000031826 ENSSHAG00000008710 ENSSHAG00000023537 #33 ENSSHAG00000028531 ENSSHAG00000008401 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.h.b.b #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.h.b.b #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.h.b.b #22 Common wonbat MODERN SPECIES 964 GXYLT1 (ENSVURG00010007090) YAF2 (ENSVURG00010007113) ENSVURG00010007120 #22 PPHLN1 (ENSVURG00010007132) Platypus MODERN SPECIES 1 PIH1D1 (ENSOANG00000050468) ALDH16A1 (ENSOANG00000006835) ENSOANG00000000827 RPS11 (ENSOANG00000000829) ENSOANG00000046443 #7 ENSOANG00000048222 #8 ENSOANG00000031146 #9 ENSOANG00000049617 #35 PLEKHA4 (ENSOANG00000046259) #10 ENSOANG00000012856 #12 RASIP1 (ENSOANG00000049908) #15 NTN5 (ENSOANG00000001706) #18 CA11 (ENSOANG00000047341) #19 ENSOANG00000002210 #20 SPHK2 (ENSOANG00000039278) #21 RPL18 (ENSOANG00000021547) #22 SPACA4 (ENSOANG00000012774) #24 FAM83E (ENSOANG00000036377) #23 SULT2B1 (ENSOANG00000020298) #25 RPL13A (ENSOANG00000000828) KCNJ14 (ENSOANG00000043084) #29 CYTH2 (ENSOANG00000040148) #28 ENSOANG00000004811 LMTK3 (ENSOANG00000037126) #26 GRWD1 (ENSOANG00000047177) #30 GRIN2D (ENSOANG00000038773) #27 KDELR1 (ENSOANG00000036154) #31 ENSOANG00000039909 #32 TMEM143 (ENSOANG00000014820) #33 EMP3 (ENSOANG00000038257) #34 ENSOANG00000045196 Sauria ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.d ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000164900 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00950000182935.A #32 ENSGT00390000004010.a.a #31 ENSGT00940000159109 #27 ENSGT00550000075124 #30 ENSGT00390000003912 ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00510000048131 ENSGT00390000014743 ENSGT00550000075069 ENSGT00940000169414 ENSGT00940000164148.b ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT01050000244814.b ENSGT00390000008732.b ENSGT00940000159441 ENSGT00950000185550 ENSGT00940000157149 ENSGT00940000162254 ENSGT00390000006753.A ENSGT00940000164148.b ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 Chinese turtle MODERN SPECIES 2227 CYTH2 (ENSPSIG00000014005) #28 ENSPSIG00000015174 RPL28 (ENSPSIG00000015206) RCVRN (ENSPSIG00000015210) UBE2S (ENSPSIG00000015344) ISOC2 (ENSPSIG00000015426) ENSPSIG00000015660 ENSPSIG00000001743 ENSPSIG00000015784 #15 NTN5 (ENSPSIG00000016005) #18 ENSPSIG00000001746 RPL18 (ENSPSIG00000006821) #22 ENSPSIG00000007322 ##25 U2AF2 (ENSPSIG00000008014) ENSPSIG00000010693 ENSPSIG00000010769 ENSPSIG00000010860 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00390000008732.b ENSGT00940000159441 ENSGT00950000185550 ENSGT00940000157149 ENSGT00940000162254 ENSGT00390000006753.A ENSGT00940000153496.b ENSGT00390000007165 ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00940000162319 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 ENSGT01100000263519.A.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000163198 ENSGT00530000064557 ENSGT00940000163608.a ENSGT00390000013183 ENSGT00940000155556.d ENSGT00940000164866 ENSGT00940000160411 ENSGT00940000170710 ENSGT00940000158808.e ENSGT01100000263562.b.b.a.a.a.b.b Emydidae ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000161770 ENSGT00940000153561.b.a.b.j ENSGT00950000183186.A ENSGT00940000163186 ENSGT00390000004520 ENSGT00940000162319 ENSGT00940000164148.b ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT01100000263519.A.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000163198 ENSGT00530000064557 ENSGT00940000160374.ib ENSGT00940000163608.a ENSGT00390000013183 ENSGT00940000155556.d ENSGT00940000164866 ENSGT00940000160411 ENSGT00940000170710 ENSGT00940000158808.e ENSGT00940000157017.a.b.b.d ENSGT00970000193820 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 182 ENSTMTG00000019553 ENSTMTG00000019538 ENSTMTG00000019514 NTN5 (ENSTMTG00000019486) #18 ENSTMTG00000019464 SPHK2 (ENSTMTG00000019450) #21 RPL18 (ENSTMTG00000019435) #22 ENSTMTG00000019430 ZNF524 (ENSTMTG00000019421) ZNF865 (ENSTMTG00000019412) ENSTMTG00000019407 ENSTMTG00000019400 ZNF581 (ENSTMTG00000019380) U2AF2 (ENSTMTG00000019357) ENSTMTG00000019350 ENSTMTG00000019331 ENSTMTG00000019314 ENSTMTG00000019310 ENSTMTG00000019284 ENSTMTG00000019266 ENSTMTG00000019255 ENSTMTG00000019244 painted turtle MODERN SPECIES 1054 ENSCPBG00000004705 UBE2S (ENSCPBG00000004699) SHISA7 (ENSCPBG00000004695) ISOC2 (ENSCPBG00000004690) ENSCPBG00000004674 IL11 (ENSCPBG00000004669) ENSCPBG00000004661 TMEM238 (ENSCPBG00000004655) ENSCPBG00000004648 ENSCPBG00000004631 RASIP1 (ENSCPBG00000004614) #15 ENSCPBG00000004597 NTN5 (ENSCPBG00000004582) #18 DBP (ENSCPBG00000004568) #20 SPHK2 (ENSCPBG00000004560) #21 RPL18 (ENSCPBG00000004554) #22 ENSCPBG00000004550 ENSCPBG00000004547 ZNF865 (ENSCPBG00000004542) ENSCPBG00000004536 ENSCPBG00000004530 ZNF581 (ENSCPBG00000004520) CCDC106 (ENSCPBG00000004513) ENSCPBG00000004504 U2AF2 (ENSCPBG00000004485) ENSCPBG00000004468 EPN1 (ENSCPBG00000004449) ENSCPBG00000004430 ENSCPBG00000004425 ENSCPBG00000004413 ENSCPBG00000004373 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00390000008732.b ENSGT00940000159441 ENSGT00950000185550 ENSGT00940000157149 ENSGT00940000162254 ENSGT00390000006753.A ENSGT00940000153496.b ENSGT00390000007165 ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00940000162319 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 ENSGT01100000263519.A.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000163198 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 138 RPL28 (ENSGEVG00005005745) RCVRN (ENSGEVG00005005730) ENSGEVG00005005704 UBE2S (ENSGEVG00005005687) SHISA7 (ENSGEVG00005005650) ISOC2 (ENSGEVG00005005617) ENSGEVG00005005444 TMEM238 (ENSGEVG00005005395) ENSGEVG00005005378 ENSGEVG00005005338 RASIP1 (ENSGEVG00005005282) #15 ENSGEVG00005005226 NTN5 (ENSGEVG00005005104) #18 DBP (ENSGEVG00005005037) #20 SPHK2 (ENSGEVG00005005002) #21 RPL18 (ENSGEVG00005004955) #22 ENSGEVG00005018853 ##25 ZNF579 (ENSGEVG00005018843) ENSGEVG00005018835 ENSGEVG00005018818 ENSGEVG00005018808 ENSGEVG00005018761 ENSGEVG00005018748 ZNF581 (ENSGEVG00005018743) CCDC106 (ENSGEVG00005018724) U2AF2 (ENSGEVG00005018704) ENSGEVG00005018694 EPN1 (ENSGEVG00005018653) ENSGEVG00005018610 ENSGEVG00005018594 ENSGEVG00005018531 Abingdon island giant tortoise DUPLICATION Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2087 ENSCABG00000007499 #22 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 1720 ENSCABG00000010899 RCVRN (ENSCABG00000010897) ENSCABG00000010895 UBE2S (ENSCABG00000010893) SHISA7 (ENSCABG00000010892) ISOC2 (ENSCABG00000010891) ENSCABG00000010890 TMEM238 (ENSCABG00000010888) ENSCABG00000010886 ENSCABG00000010884 RASIP1 (ENSCABG00000010878) #15 NTN5 (ENSCABG00000010862) #18 ENSCABG00000010853 DBP (ENSCABG00000010850) #20 SPHK2 (ENSCABG00000010849) #21 ENSCABG00000010848 #22 ENSCABG00000010847 ##25 ENSCABG00000010846 ZNF524 (ENSCABG00000010845) ZNF581 (ENSCABG00000010844) CCDC106 (ENSCABG00000010843) U2AF2 (ENSCABG00000010842) ENSCABG00000010841 ENSCABG00000010840 ENSCABG00000010839 EPN1 (ENSCABG00000010837) ENSCABG00000010836 ENSCABG00000010835 ENSCABG00000010834 ENSCABG00000010832 ENSCABG00000010830 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 Aves ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 Kakapo MODERN SPECIES 16 ENSSHBG00005006387 ENSSHBG00005006371 ENSSHBG00005006356 LENG8 (ENSSHBG00005006330) U2AF2 (ENSSHBG00005006298) CCDC106 (ENSSHBG00005006269) ZNF581 (ENSSHBG00005006254) ENSSHBG00005006124 DBP (ENSSHBG00005006082) #20 SPHK2 (ENSSHBG00005006070) #21 RPL18 (ENSSHBG00005006056) #22 SULT2B1 (ENSSHBG00005005987) ##25 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ENSTGUG00000029399 #12 DHDH (ENSTGUG00000022809) RPL13A (ENSTGUG00000017025) SLC17A7 (ENSTGUG00000023432) PIH1D1 (ENSTGUG00000019254) ENSTGUG00000019271 ENSTGUG00000019509 ENSTGUG00000020449 BAX (ENSTGUG00000015645) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976 #22 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976 #22 Japanese quail MODERN SPECIES 323 ENSCJPG00005001446 ENSCJPG00005001439 #22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00940000159441 ENSGT00950000185550 ENSGT00390000008732.b ENSGT01050000244814.b ENSGT00390000007165 ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00940000153496.b ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00940000164900 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 tuatara MODERN SPECIES 844 ENSSPUG00000013877 #18 ENSSPUG00000013889 CA11 (ENSSPUG00000013895) #19 FAM83E (ENSSPUG00000013904) #23 DBP (ENSSPUG00000013910) #20 RPL18 (ENSSPUG00000013942) #22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000012820 ENSGT00390000013374 ENSGT00940000163198 ENSGT00530000064557 ENSGT00940000154308.A.b ENSGT00940000163608.a ENSGT00390000013183 ENSGT00940000155556.d ENSGT00940000160411 ENSGT00940000170710 ENSGT00940000165838 ENSGT00940000158808 ENSGT00390000006753.A ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000164900 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.d ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000156204.wb ENSGT00940000153496.b ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000007165 ENSGT01050000244814.b ENSGT00390000008732.b ENSGT00950000185550 ENSGT00940000159441 ENSGT00940000157149 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000163608.b ENSGT00530000064557 ENSGT00940000154308.A.b ENSGT00940000154715.b.k.b.a.b.b.b.b.b.a.d ENSGT01100000263556.a.a.o ENSGT00940000163608.a ENSGT00390000013183 ENSGT00940000155556.d ENSGT00940000160411 ENSGT00940000170710 ENSGT00940000165838 ENSGT00940000158808 ENSGT00390000006753.A ENSGT00940000162136 #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000164900 ENSGT00940000161874 #18 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.d ENSGT00940000160072 #15 ENSGT00940000156204.wb ENSGT00940000153496.b ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000007165 ENSGT01050000244814.b ENSGT00390000008732.b ENSGT00950000185550 ENSGT00940000159441 ENSGT00940000157149 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157017.a.b.b.d ENSGT00970000193820 ENSGT00940000157046.E ENSGT00940000164866.gb ENSGT00940000163608.b ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000163608.a ENSGT00390000013183 ENSGT00940000155556.d ENSGT00940000160411.c ENSGT00940000170710 ENSGT00940000158808.d ENSGT00390000006753.A.j ENSGT00940000162136.e.b #20 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000159269.g.b.a ##25 ENSGT00940000162098 #19 ENSGT00940000164900 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ENSECRG00000015356 ENSECRG00000014957 si:ch211-120k19.1 (ENSECRG00000014836) rpl18 (ENSECRG00000014717) #22 ENSECRG00000014658 #21 ENSECRG00000014637 #21 CADM3 (ENSECRG00000014605) sdhc (ENSECRG00000014575) mpz (ENSECRG00000014498) mpz (ENSECRG00000014403) ENSECRG00000014359 serpina10a (ENSECRG00000014338) atxn3 (ENSECRG00000014279) UNC79 (ENSECRG00000014088) tmem251 (ENSECRG00000014030) ubr7 (ENSECRG00000013985) btbd7 (ENSECRG00000013948) ENSECRG00000013930 ERH (ENSECRG00000013887) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 241 ENSGT00550000074829 ENSGT01030000234564.a.b ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT00510000048131 ENSGT00390000014743 ENSGT00550000075069 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000004322 ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT01060000248591.b ENSGT00940000160074 #28 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197 #21 Spotted gar MODERN SPECIES 273 cnot3b (ENSLOCG00000000005) prpf31 (ENSLOCG00000000007) ENSLOCG00000017622 ENSLOCG00000000009 zgc:158689 (ENSLOCG00000000011) ENSLOCG00000000013 ENSLOCG00000000014 ENSLOCG00000000015 si:ch211-120k19.1 (ENSLOCG00000000016) rpl18 (ENSLOCG00000000017) #22 ENSLOCG00000000018 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000164374.A ENSGT00940000154947.k ENSGT01060000248708 ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 ENSGT00940000162969 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000164374.A ENSGT00940000154947.k ENSGT01060000248708 ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c.k ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.a.j ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.i.g ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00940000166607 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 Asian bonytongue MODERN SPECIES 9 setdb1b (ENSSFOG00015022183) trim108 (ENSSFOG00015022196) ENSSFOG00015031896 clk2a (ENSSFOG00015022213) ENSSFOG00015022224 cyp11c1 (ENSSFOG00015022229) pklr (ENSSFOG00015022235) ENSSFOG00015022252 zbtb7b (ENSSFOG00015030270) NDUFV1 (ENSSFOG00015022273) khdc4 (ENSSFOG00015022282) ENSSFOG00015022296 ENSSFOG00015022316 #29 ENSSFOG00015022350 si:ch211-120k19.1 (ENSSFOG00015022434) rpl18 (ENSSFOG00015022442) #22 SPHK2 (ENSSFOG00015000102) #21 CYTH2 (ENSSFOG00015000108) #28 ENSSFOG00015000182 zgc:158689 (ENSSFOG00015000213) ndufa3 (ENSSFOG00015000227) tfpt (ENSSFOG00015025994) CNOT3 (ENSSFOG00015000248) prpf31 (ENSSFOG00015000288) ENSSFOG00015026034 #26 leng1 (ENSSFOG00015000370) ENSSFOG00015000399 mboat7 (ENSSFOG00015025153) ENSSFOG00015026833 rps9 (ENSSFOG00015000650) rbfox1l (ENSSFOG00015000675) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000164374.A ENSGT00940000154947.l ENSGT01060000248708 ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197 #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000164374.A ENSGT00940000154947.l ENSGT01060000248708 ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156893 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000164374.A.l ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00940000160219 ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000161506 ENSGT01060000248708 ENSGT00940000154947.l ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000161197.i.a #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 Northern pike MODERN SPECIES 19 prpf3 (ENSELUG00000013624) ENSELUG00000013661 ca14 (ENSELUG00000013739) setdb1b (ENSELUG00000013948) NDUFV1 (ENSELUG00000014045) zbtb7b (ENSELUG00000014058) ENSELUG00000001418 pklr (ENSELUG00000014172) cyp11c1 (ENSELUG00000014194) khdc4 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(ENSSSAG00000008594) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1209 ENSGT00940000165838.h ENSGT00390000012976.p #22 ENSGT00940000161197.i.a #21 ENSGT00940000160074.f #28 Huchen MODERN SPECIES 12274 ENSHHUG00000014902 #22 Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.p.a #22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.p.a #22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.p.a #22 Chinook salmon MODERN SPECIES 11 ENSOTSG00005000291 gga1 (ENSOTSG00005000275) ddx17 (ENSOTSG00005000254) ENSOTSG00005000218 get3 (ENSOTSG00005000214) smc3 (ENSOTSG00005000198) mxi1 (ENSOTSG00005000183) ENSOTSG00005000179 ENSOTSG00005000178 pgam1b (ENSOTSG00005000174) exosc1 (ENSOTSG00005000168) ENSOTSG00005000164 gprc5bb (ENSOTSG00005000162) ENSOTSG00005000158 ENSOTSG00005000153 ENSOTSG00005000149 #22 ENSOTSG00005000102 ENSOTSG00005000073 ENSOTSG00005000072 Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 606 ENSGT00940000165838.h ENSGT00390000012976.p.b.a #22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 208 ENSGT00940000169692 ENSGT00940000159286.a.b.d.f ENSGT01030000234586.B.a.b.h.a #29 ENSGT00940000158808.mb ENSGT00940000165838.g ENSGT00390000012976.p.b.b #22 ENSGT00940000165838.h ENSGT00390000012976.p.b.a #22 ENSGT00940000161197.i.a #21 ENSGT00940000160074.e.b.a #28 ENSGT01060000248591.b.b.d ENSGT00940000153560.b.a.b.m ENSGT00970000197851.b.a ENSGT00390000004322.m.a River trout MODERN SPECIES 30 CIART (ENSSTUG00000036159) ca14 (ENSSTUG00000036164) ENSSTUG00000036180 setdb1b (ENSSTUG00000036191) ENSSTUG00000036315 NDUFV1 (ENSSTUG00000036337) zbtb7b (ENSSTUG00000036463) ENSSTUG00000036481 ENSSTUG00000036502 pklr (ENSSTUG00000036585) clk2b (ENSSTUG00000037388) khdc4 (ENSSTUG00000037441) ENSSTUG00000037463 ENSSTUG00000037479 #29 si:ch211-120k19.1 (ENSSTUG00000037484) rpl18 (ENSSTUG00000037494) #22 ENSSTUG00000037608 #21 CYTH2 (ENSSTUG00000037647) #28 ENSSTUG00000038398 zgc:158689 (ENSSTUG00000038407) ENSSTUG00000038434 ndufa3 (ENSSTUG00000038458) tfpt (ENSSTUG00000038484) cnot3a (ENSSTUG00000038511) prpf31 (ENSSTUG00000014259) ENSSTUG00000015043 #26 leng1 (ENSSTUG00000015075) ENSSTUG00000015089 mboat7 (ENSSTUG00000015104) rps9 (ENSSTUG00000015141) rbfox1l (ENSSTUG00000015185) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.p.b.a #22 Rainbow trout MODERN SPECIES 21 ENSOMYG00000000802 ENSOMYG00000000883 ENSOMYG00000074213 ENSOMYG00000054999 ENSOMYG00000058718 ENSOMYG00000000936 ENSOMYG00000000401 cyp11b (ENSOMYG00000056586) ENSOMYG00000049867 ENSOMYG00000000423 ENSOMYG00000060247 #29 ENSOMYG00000064105 ENSOMYG00000058550 si:ch211-120k19.1 (ENSOMYG00000076055) ENSOMYG00000069398 rpl18 (ENSOMYG00000001001) #22 ENSOMYG00000001026 #21 ENSOMYG00000001116 #28 ENSOMYG00000001158 zgc:158689 (ENSOMYG00000001184) ENSOMYG00000064141 ndufa3 (ENSOMYG00000001216) ENSOMYG00000001247 cnot3a (ENSOMYG00000001571) prpf31 (ENSOMYG00000001859) ENSOMYG00000002005 #26 leng1 (ENSOMYG00000002050) ENSOMYG00000002092 mboat7 (ENSOMYG00000002170) ENSOMYG00000002194 ENSOMYG00000002249 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012976.p.b.b #22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 208 ENSGT00940000169692 ENSGT00940000159286.a.b.d.f ENSGT01030000234586.B.a.b.h.a #29 ENSGT00940000158808.mb ENSGT00940000165838.g ENSGT00390000012976.p.b.b #22 ENSGT00940000165838.h ENSGT00390000012976.p.b.a #22 ENSGT00940000161197.i.a #21 ENSGT00940000160074.e.b.a #28 ENSGT01060000248591.b.b.d ENSGT00940000153560.b.a.b.m ENSGT00970000197851.b.a ENSGT00390000004322.m.a River trout MODERN SPECIES 22 ENSSTUG00000000868 setdb1b (ENSSTUG00000000385) ENSSTUG00000000199 NDUFV1 (ENSSTUG00000001249) zbtb7b (ENSSTUG00000001230) ENSSTUG00000001223 ENSSTUG00000001219 pklr (ENSSTUG00000000928) ENSSTUG00000000890 cyp11c1 (ENSSTUG00000000883) ENSSTUG00000000876 ENSSTUG00000000870 ENSSTUG00000000859 #29 ENSSTUG00000000850 si:ch211-120k19.1 (ENSSTUG00000000844) rpl18 (ENSSTUG00000000834) #22 ENSSTUG00000000827 #21 CYTH2 (ENSSTUG00000000775) #28 ENSSTUG00000000760 zgc:158689 (ENSSTUG00000000749) ENSSTUG00000000747 ndufa3 (ENSSTUG00000000742) tfpt (ENSSTUG00000000732) cnot3a (ENSSTUG00000000675) prpf31 (ENSSTUG00000000624) leng1 (ENSSTUG00000000602) mboat7 (ENSSTUG00000000596) rps9 (ENSSTUG00000000588) ENSSTUG00000000584 rbfox1l (ENSSTUG00000000570) leng8 (ENSSTUG00000000540) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000154947.l ENSGT01060000248708 ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b 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ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 7 arnt (ENSMMDG00005006813) setdb1b (ENSMMDG00005006874) ENSMMDG00005007077 clk2b (ENSMMDG00005007081) ENSMMDG00005007087 cyp11c1 (ENSMMDG00005007096) pklr (ENSMMDG00005007168) ENSMMDG00005007176 zbtb7b (ENSMMDG00005007179) NDUFV1 (ENSMMDG00005007186) khdc4 (ENSMMDG00005007296) ENSMMDG00005007300 ENSMMDG00005007301 #29 ENSMMDG00005007305 si:ch211-120k19.1 (ENSMMDG00005007320) rpl18 (ENSMMDG00005007327) #22 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(ENSHCOG00000020748) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000174801 ENSGT00940000154947.l ENSGT01060000248708 ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00970000193820 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000174801 ENSGT00940000154947.l ENSGT01060000248708 ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a 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ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00390000011379 ENSGT00940000154947.l ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 Turbot MODERN SPECIES ENSSMAG00000015501 ENSSMAG00000015418 ENSSMAG00000015398 clk2b (ENSSMAG00000015365) ENSSMAG00000014255 pklr (ENSSMAG00000014175) ENSSMAG00000014167 ENSSMAG00000014148 ENSSMAG00000014119 ENSSMAG00000014077 ENSSMAG00000014066 ENSSMAG00000014045 #29 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ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00970000193820 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 7 setdb1b (ENSBSLG00000022420) ENSBSLG00000022373 clk2b (ENSBSLG00000022331) ENSBSLG00000022183 cyp11c1 (ENSBSLG00000021763) pklr (ENSBSLG00000021417) ENSBSLG00000021380 ZBTB7B (ENSBSLG00000021370) ENSBSLG00000021238 khdc4 (ENSBSLG00000021116) ENSBSLG00000020978 KCNJ14 (ENSBSLG00000020936) #29 ENSBSLG00000019939 ENSBSLG00000019863 si:ch211-120k19.1 (ENSBSLG00000019854) rpl18 (ENSBSLG00000019796) #22 ENSBSLG00000019768 #21 CYTH2 (ENSBSLG00000019134) #28 ENSBSLG00000019090 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ENSATEG00000022661 ENSATEG00000022649 ENSATEG00000022639 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000154947.l ENSGT01060000248708 ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00970000193820 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000157471.a ENSGT00390000011379 ENSGT00940000154947.l ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00940000169692 ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00970000193820 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 Fugu MODERN SPECIES 19 CELF3 (ENSTRUG00000014225) CERS2 (ENSTRUG00000014385) arnt (ENSTRUG00000014504) setdb1b (ENSTRUG00000014641) ENSTRUG00000026274 cyp11c1 (ENSTRUG00000014845) pklr (ENSTRUG00000014910) zbtb7b (ENSTRUG00000031262) NDUFV1 (ENSTRUG00000032214) ENSTRUG00000015115 ENSTRUG00000029166 ENSTRUG00000029074 #29 ENSTRUG00000015194 ENSTRUG00000030991 si:ch211-120k19.1 (ENSTRUG00000015593) rpl18 (ENSTRUG00000015604) #22 SPHK2 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SPECIES 97 CERS2 (ENSLBEG00000026082) arnt (ENSLBEG00000026037) setdb1b (ENSLBEG00000025862) ENSLBEG00000025807 clk2b (ENSLBEG00000025773) cyp11c1 (ENSLBEG00000025730) pklr (ENSLBEG00000025690) ENSLBEG00000025667 zbtb7b (ENSLBEG00000025578) NDUFV1 (ENSLBEG00000025548) khdc4 (ENSLBEG00000025524) ENSLBEG00000025510 ENSLBEG00000025488 #29 ENSLBEG00000025408 si:ch211-120k19.1 (ENSLBEG00000025378) rpl18 (ENSLBEG00000025339) #22 ENSLBEG00000025310 #21 ENSLBEG00000025298 #21 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000154947.l ENSGT01060000248708 ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000174801 ENSGT00940000154947.l ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000174801 ENSGT00940000154947.l ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 ENSGT00940000162969 European seabass MODERN SPECIES 6 ENSDLAG00005007549 ENSDLAG00005007305 ENSDLAG00005006849 ENSDLAG00005033042 clk2b (ENSDLAG00005006824) ENSDLAG00005006550 pklr (ENSDLAG00005005628) ENSDLAG00005029138 ENSDLAG00005026831 ENSDLAG00005004491 ENSDLAG00005004359 ENSDLAG00005029454 #29 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ENSSAUG00010021179 #26 leng1 (ENSSAUG00010021182) ENSSAUG00010021186 mboat7 (ENSSAUG00010021189) rps9 (ENSSAUG00010021194) rbfox1l (ENSSAUG00010021203) leng8 (ENSSAUG00010021210) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000154947.l ENSGT01060000248708 ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000177689 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000154947.l ENSGT01060000248708 ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 ENSGT00940000162969 Lumpfish MODERN SPECIES 7 CELF3 (ENSCLMG00005008804) CERS2 (ENSCLMG00005008805) arnt (ENSCLMG00005008812) setdb1b (ENSCLMG00005010098) clk2b (ENSCLMG00005010167) cyp11c1 (ENSCLMG00005010177) pklr (ENSCLMG00005010199) ENSCLMG00005010269 zbtb7b (ENSCLMG00005010275) NDUFV1 (ENSCLMG00005010282) khdc4 (ENSCLMG00005010289) 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(ENSGACG00000011515) #28 ENSGACG00000011513 zgc:158689 (ENSGACG00000011507) ENSGACG00000011504 cnot3a (ENSGACG00000011489) prpf31 (ENSGACG00000011464) leng1 (ENSGACG00000011462) TMC4 (ENSGACG00000011451) mboat7 (ENSGACG00000011436) rps9 (ENSGACG00000010761) rbfox1l (ENSGACG00000010757) leng8 (ENSGACG00000010754) cdc42ep5 (ENSGACG00000010751) grwd1 (ENSGACG00000010744) #30 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154716.gc.a ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000154947.l ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 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#21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000174801 ENSGT00940000154947.l ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000174801 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clownfish MODERN SPECIES 21 ENSAPEG00000007188 ENSAPEG00000007149 zbtb7b (ENSAPEG00000007135) NDUFV1 (ENSAPEG00000007094) khdc4 (ENSAPEG00000007073) ENSAPEG00000007065 ENSAPEG00000007057 ENSAPEG00000007032 #29 ENSAPEG00000006987 ENSAPEG00000006947 ENSAPEG00000006923 ENSAPEG00000006915 si:ch211-120k19.1 (ENSAPEG00000006884) ENSAPEG00000006865 ENSAPEG00000006861 rpl18 (ENSAPEG00000006834) #22 ENSAPEG00000006824 #21 ENSAPEG00000006818 #21 CYTH2 (ENSAPEG00000006766) #28 ENSAPEG00000006753 zgc:158689 (ENSAPEG00000006734) ndufa3 (ENSAPEG00000006697) tfpt (ENSAPEG00000006670) cnot3a (ENSAPEG00000006624) ENSAPEG00000006589 c1r (ENSAPEG00000006532) ENSAPEG00000006512 ENSAPEG00000006501 rbp5 (ENSAPEG00000006480) ptpn6 (ENSAPEG00000006402) ENSAPEG00000005957 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1440 si:ch211-120k19.1 (ENSAOCG00000008433) ENSAOCG00000008441 rpl18 (ENSAOCG00000008479) #22 SPHK2 (ENSAOCG00000008494) #21 CYTH2 (ENSAOCG00000008526) #28 ENSAOCG00000008540 zgc:158689 (ENSAOCG00000008602) 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khdc4 (ENSACIG00000007120) ENSACIG00000007108 ENSACIG00000007098 #29 ENSACIG00000006989 si:ch211-120k19.1 (ENSACIG00000006948) rpl18 (ENSACIG00000006925) #22 ENSACIG00000006911 #21 CYTH2 (ENSACIG00000006879) #28 ENSACIG00000006857 ENSACIG00000006836 ndufa3 (ENSACIG00000006815) tfpt (ENSACIG00000006784) cnot3a (ENSACIG00000006635) prpf31 (ENSACIG00000006591) leng1 (ENSACIG00000006569) TMC4 (ENSACIG00000006541) mboat7 (ENSACIG00000006480) ENSACIG00000006468 rbfox1l (ENSACIG00000006441) leng8 (ENSACIG00000006396) cdc42ep5 (ENSACIG00000006369) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000174801 ENSGT00940000154947.l ENSGT00940000165886.b ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838.d ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 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tmc4 (ENSONIG00000012746) ENSONIG00000039502 ENSONIG00000041788 ENSONIG00000033989 ENSONIG00000012743 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000154947.l ENSGT00940000165886.b ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838.d ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000177689 ENSGT00510000048131 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 421 CERS2 (ENSNBRG00000003338) arnt (ENSNBRG00000003317) setdb1b (ENSNBRG00000003147) clk2b 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mboat7 (ENSPREG00000007863) rps9 (ENSPREG00000007924) rbfox1l (ENSPREG00000007940) Platyfish MODERN SPECIES 17 CERS2 (ENSXMAG00000016508) arnt (ENSXMAG00000016545) setdb1b (ENSXMAG00000016600) ENSXMAG00000022818 clk2b (ENSXMAG00000016620) cyp11c1 (ENSXMAG00000016675) pklr (ENSXMAG00000016700) ENSXMAG00000021968 zbtb7b (ENSXMAG00000012652) NDUFV1 (ENSXMAG00000012641) khdc4 (ENSXMAG00000012623) ENSXMAG00000012619 ENSXMAG00000012601 #29 ENSXMAG00000012405 si:ch211-120k19.1 (ENSXMAG00000012399) rpl18 (ENSXMAG00000012396) #22 ENSXMAG00000022906 #21 CYTH2 (ENSXMAG00000012332) #28 ENSXMAG00000012319 zgc:158689 (ENSXMAG00000012300) ndufa3 (ENSXMAG00000012298) tfpt (ENSXMAG00000022608) cnot3a (ENSXMAG00000012273) prpf31 (ENSXMAG00000012272) ENSXMAG00000021691 #26 leng1 (ENSXMAG00000012267) ENSXMAG00000012215 mboat7 (ENSXMAG00000026346) rps9 (ENSXMAG00000012175) rbfox1l (ENSXMAG00000023471) leng8 (ENSXMAG00000012125) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000154947.l 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ENSFHEG00000022701 ENSFHEG00000022717 si:ch211-120k19.1 (ENSFHEG00000022726) rpl18 (ENSFHEG00000022747) #22 ENSFHEG00000022750 #21 ENSFHEG00000022756 #21 CYTH2 (ENSFHEG00000022821) #28 ENSFHEG00000022841 ENSFHEG00000022850 ndufa3 (ENSFHEG00000022863) tfpt (ENSFHEG00000022894) cnot3a (ENSFHEG00000023166) prpf31 (ENSFHEG00000003642) leng1 (ENSFHEG00000003647) TMC4 (ENSFHEG00000003677) mboat7 (ENSFHEG00000003721) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 341 arnt (ENSCVAG00000008992) setdb1b (ENSCVAG00000008877) clk2b (ENSCVAG00000000248) ENSCVAG00000008807 cyp11c1 (ENSCVAG00000008800) pklr (ENSCVAG00000008759) ENSCVAG00000008694 zbtb7b (ENSCVAG00000008597) NDUFV1 (ENSCVAG00000008586) ENSCVAG00000000955 ENSCVAG00000008536 ENSCVAG00000008533 #29 ENSCVAG00000008516 ENSCVAG00000008396 si:ch211-120k19.1 (ENSCVAG00000008380) rpl18 (ENSCVAG00000008338) #22 ENSCVAG00000008291 #21 CYTH2 (ENSCVAG00000008284) #28 ENSCVAG00000008238 zgc:158689 (ENSCVAG00000008226) ndufa3 (ENSCVAG00000008219) ENSCVAG00000000722 cnot3a (ENSCVAG00000008168) prpf31 (ENSCVAG00000000226) ENSCVAG00000008073 #26 leng1 (ENSCVAG00000008061) ENSCVAG00000000220 mboat7 (ENSCVAG00000008010) rps9 (ENSCVAG00000007999) rbfox1l (ENSCVAG00000007986) leng8 (ENSCVAG00000007965) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154716.gc.a ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000154947.l ENSGT01060000248708 ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000161197.j #21 ENSGT00940000160074 #28 ENSGT01060000248591.b.b ENSGT00940000153560.b.a.b ENSGT00390000004322 ENSGT00940000167238 ENSGT00390000014743.j ENSGT00550000075069 ENSGT00940000154244.B #26 ENSGT00940000177689 ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT01030000234564.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT00940000166165 ENSGT00390000008006 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1614 TMEM238 (ENSNFUG00015009076) CCDC106 (ENSNFUG00015009089) u2af2a (ENSNFUG00015009124) SETDB1B (ENSNFUG00015009197) ENSNFUG00015009478 cyp11c1 (ENSNFUG00015009520) pklr (ENSNFUG00015010007) ENSNFUG00015010707 zbtb7b (ENSNFUG00015010734) KIAA0907 (ENSNFUG00015010744) ENSNFUG00015010786 ENSNFUG00015010800 #29 ENSNFUG00015010883 ENSNFUG00015010974 si:ch211-120k19.1 (ENSNFUG00015010979) rpl18 (ENSNFUG00015010994) #22 ENSNFUG00015011008 #21 CYTH2 (ENSNFUG00015011254) #28 SI (ENSNFUG00015013986) ENSNFUG00015013990 zgc:158689 (ENSNFUG00015013994) ndufa3 (ENSNFUG00015013995) TFPT (ENSNFUG00015014001) CNOT3A (ENSNFUG00015014020) prpf31 (ENSNFUG00015014123) ENSNFUG00015014194 #26 LENG1 (ENSNFUG00015014209) ENSNFUG00015014229 MBOAT7 (ENSNFUG00015014371) rps9 (ENSNFUG00015014391) rbfox1l (ENSNFUG00015014448) Mangrove rivulus MODERN SPECIES 33 cyp11c1 (ENSKMAG00000004206) pklr (ENSKMAG00000004309) ENSKMAG00000004376 zbtb7b (ENSKMAG00000004422) khdc4 (ENSKMAG00000004433) ENSKMAG00000004454 KCNJ14 (ENSKMAG00000004475) #29 ENSKMAG00000004503 si:ch211-120k19.1 (ENSKMAG00000004635) rpl18 (ENSKMAG00000004646) #22 ENSKMAG00000004658 #21 CYTH2 (ENSKMAG00000004679) #28 ENSKMAG00000004728 zgc:158689 (ENSKMAG00000004752) ndufa3 (ENSKMAG00000004798) tfpt (ENSKMAG00000004817) cnot3a (ENSKMAG00000004863) prpf31 (ENSKMAG00000004967) ENSKMAG00000005011 #26 ENSKMAG00000005030 ENSKMAG00000005043 mboat7 (ENSKMAG00000005072) rps9 (ENSKMAG00000005101) rbfox1l (ENSKMAG00000005146) leng8 (ENSKMAG00000005210) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157585 ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000164374.A.c.b ENSGT00940000154947.l ENSGT01060000248708.a ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157471.a ENSGT00940000164374.A.c.b.b ENSGT00940000164374.A.c.b.a ENSGT00940000154947.l ENSGT01060000248708.a ENSGT00940000161506 ENSGT00390000008859.b.c ENSGT00940000154743.A.a.a ENSGT00940000160219 ENSGT00390000010641.i.a ENSGT00510000047412.a ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00940000157473.b.a ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b ENSGT00940000166118 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b ENSGT00390000005023.a ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.a ENSGT00940000153615.b Atlantic herring MODERN SPECIES 2 trim108 (ENSCHAG00000006119) trim108 (ENSCHAG00000006001) clk2b (ENSCHAG00000005172) cyp11c1 (ENSCHAG00000004600) ENSCHAG00000004556 pklr (ENSCHAG00000002526) ENSCHAG00000002345 zbtb7b (ENSCHAG00000022741) NDUFV1 (ENSCHAG00000022430) khdc4 (ENSCHAG00000022406) ENSCHAG00000022396 ENSCHAG00000022390 #29 ENSCHAG00000022372 si:ch211-120k19.1 (ENSCHAG00000022350) odr4 (ENSCHAG00000022338) rpl18 (ENSCHAG00000022298) #22 ENSCHAG00000022290 ENSCHAG00000022271 ENSCHAG00000022242 ENSCHAG00000022219 ENSCHAG00000022197 ENSCHAG00000022184 ENSCHAG00000022173 ENSCHAG00000022168 ENSCHAG00000022141 ENSCHAG00000022136 c1r (ENSCHAG00000022107) ENSCHAG00000021901 rbp5 (ENSCHAG00000021827) ptpn6 (ENSCHAG00000021612) ENSCHAG00000013844 Denticle herring MODERN SPECIES 15 setdb1b (ENSDCDG00000003641) trim108 (ENSDCDG00000003637) trim108 (ENSDCDG00000003630) clk2b (ENSDCDG00000002843) ENSDCDG00000002806 cyp11c1 (ENSDCDG00000002499) pklr (ENSDCDG00000002333) ENSDCDG00000002327 zbtb7b (ENSDCDG00000002324) ENSDCDG00000002322 khdc4 (ENSDCDG00000002319) ENSDCDG00000002315 ENSDCDG00000002311 #29 ENSDCDG00000002226 si:ch211-120k19.1 (ENSDCDG00000002219) rpl18 (ENSDCDG00000002215) #22 ENSDCDG00000002211 ENSDCDG00000002208 ENSDCDG00000002204 c1s.2 (ENSDCDG00000002200) ENSDCDG00000002196 ENSDCDG00000002194 ENSDCDG00000002161 c1r (ENSDCDG00000002111) c1s.2 (ENSDCDG00000002101) ENSDCDG00000002093 rbp5 (ENSDCDG00000002078) ENSDCDG00000002073 ptpn6 (ENSDCDG00000001550) CHD4 (ENSDCDG00000001313) wnt4b (ENSDCDG00000001254) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 177 ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT01050000245031 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000159540.d ENSGT00510000046803.b.a.a ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00940000153298.i.a ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000161554 ENSGT00390000000510 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00940000156657 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183103.d.a.a ENSGT00390000018130.a.a.a ENSGT00940000155413.d ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.b.b ENSGT00390000017503.i ENSGT00940000158734 ENSGT00390000010811 ENSGT00940000160002 ENSGT00390000003488.b.b ENSGT00940000163785.a.a.b ENSGT00940000158641.a.b ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT01050000245031 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000159540.d ENSGT00510000046803.b.a.a ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00940000153298.i.a ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000161554 ENSGT00390000000510 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00940000156657 Channel catfish MODERN SPECIES hormad1 (ENSIPUG00000006984) ensab (ENSIPUG00000007019) mcl1b (ENSIPUG00000007039) tmod4 (ENSIPUG00000007093) drc1 (ENSIPUG00000007240) drc1 (ENSIPUG00000007293) scnm1 (ENSIPUG00000007327) lysmd1 (ENSIPUG00000007401) tnfaip8l2b (ENSIPUG00000007411) ENSIPUG00000007446 sema6c (ENSIPUG00000007475) ENSIPUG00000007570 kcnj14 (ENSIPUG00000007594) #29 ENSIPUG00000007640 si:ch211-120k19.1 (ENSIPUG00000007726) rpl18 (ENSIPUG00000007810) #22 ENSIPUG00000007752 ENSIPUG00000007881 tnfrsf1a (ENSIPUG00000007897) Iffo1 (ENSIPUG00000007925) gapdh (ENSIPUG00000007949) wu:fj39g12 (ENSIPUG00000008182) nop2 (ENSIPUG00000008198) gtf3c6 (ENSIPUG00000008252) emg1 (ENSIPUG00000008261) ENSIPUG00000008285 zyx (ENSIPUG00000008337) FAM131B (ENSIPUG00000008365) ENSIPUG00000008379 CLCN1 (ENSIPUG00000008413) casp2 (ENSIPUG00000008552) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183103.d.a.a ENSGT00390000018130.a.a.a ENSGT00940000155413.d ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.b.b ENSGT00390000017503.i ENSGT00940000158734 ENSGT00390000010811 ENSGT00940000160002 ENSGT00390000003488.b.b ENSGT00940000163785.a.a.b ENSGT00940000158641.a.b ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT01050000245031 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000159540.d ENSGT00510000046803.b.a.a ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00940000153298.i.a ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000161554 ENSGT00390000000510 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00940000156657 Electric eel MODERN SPECIES 100 ctss2.1 (ENSEEEG00000000099) onecutl (ENSEEEG00000000053) hormad1 (ENSEEEG00000021444) ensab (ENSEEEG00000021443) mcl1b (ENSEEEG00000021442) VPS72 (ENSEEEG00000021441) tmod4 (ENSEEEG00000021435) scnm1 (ENSEEEG00000021430) lysmd1 (ENSEEEG00000021428) tnfaip8l2b (ENSEEEG00000021426) sema6e (ENSEEEG00000021337) ENSEEEG00000021326 ENSEEEG00000021229 #29 ENSEEEG00000021216 si:ch211-120k19.1 (ENSEEEG00000021213) rpl18 (ENSEEEG00000021210) #22 ENSEEEG00000021209 ENSEEEG00000021207 tnfrsf1a (ENSEEEG00000021206) IFFO1 (ENSEEEG00000021205) gapdh (ENSEEEG00000019740) nppcl (ENSEEEG00000019703) nop2 (ENSEEEG00000019698) gtf3c6 (ENSEEEG00000019696) emg1 (ENSEEEG00000019695) ENSEEEG00000019691 ENSEEEG00000019689 FAM131B (ENSEEEG00000019687) ENSEEEG00000019685 casp2 (ENSEEEG00000019681) m6pr (ENSEEEG00000019680) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183103.d.a.a ENSGT00390000018130.a.a.a ENSGT00940000155413.d ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.b.b ENSGT00390000017503.i ENSGT00940000158734 ENSGT00390000010811 ENSGT00940000160002 ENSGT00390000003488.b.b ENSGT00940000163785.a.a.b ENSGT00940000158641.a.b ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT01050000245031 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000159540.d ENSGT00510000046803.b.a.a ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00940000153298.i.a ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000161554 ENSGT00390000000510 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00940000156657 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1 mcl1b (ENSAMXG00000044037) VPS72 (ENSAMXG00000018817) tmod4 (ENSAMXG00000018826) scnm1 (ENSAMXG00000018828) lysmd1 (ENSAMXG00000018833) tnfaip8l2b (ENSAMXG00000042047) ENSAMXG00000030258 sema6e (ENSAMXG00000018856) ENSAMXG00000025099 ENSAMXG00000029653 #29 ENSAMXG00000018895 si:ch211-120k19.1 (ENSAMXG00000030967) ENSAMXG00000018926 ENSAMXG00000032096 tnfrsf1a (ENSAMXG00000018943) rpl18 (ENSAMXG00000018919) #22 IFFO1 (ENSAMXG00000018953) opn9 (ENSAMXG00000018966) gapdh (ENSAMXG00000039361) nppcl (ENSAMXG00000018980) nop2 (ENSAMXG00000018985) gtf3c6 (ENSAMXG00000038574) emg1 (ENSAMXG00000018994) ENSAMXG00000018998 zyx (ENSAMXG00000019006) FAM131B (ENSAMXG00000019016) CLCN1 (ENSAMXG00000019025) casp2 (ENSAMXG00000019043) m6pr (ENSAMXG00000037010) ENSAMXG00000041889 ccdc106a (ENSAMXG00000019054) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 67 sema6e (ENSPNAG00000018992) ENSPNAG00000019002 KCNJ14 (ENSPNAG00000019030) #29 ENSPNAG00000019561 si:ch211-120k19.1 (ENSPNAG00000019638) rpl18 (ENSPNAG00000019682) #22 ENSPNAG00000019699 ENSPNAG00000019746 tnfrsf1a (ENSPNAG00000005582) IFFO1 (ENSPNAG00000019791) opn9 (ENSPNAG00000019811) gapdh (ENSPNAG00000019846) nppcl (ENSPNAG00000006757) nop2 (ENSPNAG00000019880) gtf3c6 (ENSPNAG00000019896) ENSPNAG00000019928 emg1 (ENSPNAG00000019953) ENSPNAG00000005020 zyx (ENSPNAG00000003623) FAM131B (ENSPNAG00000020111) CLCN1 (ENSPNAG00000003638) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT01030000234586.B.a.b #29 ENSGT00940000158808 ENSGT00940000165838 ENSGT00390000012976 #22 ENSGT01050000245031 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000159540.d.e ENSGT00510000046803.b.a.a ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00940000153298.i.a ENSGT00390000015492.A.e ENSGT00940000161554 ENSGT00390000000510 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00940000156657 Zebrafish MODERN SPECIES 7 upp1 (ENSDARG00000040869) gra (ENSDARG00000078754) rbm12bb (ENSDARG00000079717) ENSDARG00000062244 ENSDARG00000057143 NBEAL2 (ENSDARG00000098641) ccdc12 (ENSDARG00000023003) ENSDARG00000053431 ENSDARG00000037550 ENSDARG00000001760 c4b (ENSDARG00000038424) ENSDARG00000040816 ENSDARG00000075914 #29 ENSDARG00000073732 si:ch211-120k19.1 (ENSDARG00000075517) rpl18 (ENSDARG00000029533) #22 ENSDARG00000086056 tnfrsf1a (ENSDARG00000018569) ENSDARG00000105423 ENSDARG00000094366 IFFO1 (ENSDARG00000062108) opn9 (ENSDARG00000104231) gapdh (ENSDARG00000043457) nppcl (ENSDARG00000043460) nop2 (ENSDARG00000043304) gtf3c6 (ENSDARG00000043301) emg1 (ENSDARG00000056914) ENSDARG00000076950 zyx (ENSDARG00000075733) FAM131B (ENSDARG00000070575) CLCN1 (ENSDARG00000012269) Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 184 ENSGT00940000155029.c.a.e.a.b ENSGT00390000017856.a.k ENSGT00940000156007.l.g ENSGT00940000166701.a ENSGT00940000165630.d ENSGT00940000155957.a.b ENSGT00940000155880.e.d ENSGT00940000158500.h ENSGT00940000156475.e ENSGT00390000007287 ENSGT00390000005708 ENSGT00940000159286.a.b.d.a.a ENSGT01030000234586.B.a.b.d #29 ENSGT00940000158808.db ENSGT00940000165838.b ENSGT00390000012976.bb #22 ENSGT00390000012976.cb.b #22 ENSGT01050000245031.a ENSGT00940000161250.a 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(ENSCARG00000019787) m6pr (ENSCARG00000019780) ENSCARG00000019775 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158311.b.b ENSGT00940000163268.d.a.a ENSGT00940000164628.s ENSGT00940000155029.c.a.e.a.b ENSGT00390000017856.a.l ENSGT00940000156007.l.h ENSGT00940000166701.b ENSGT00940000165630.c ENSGT00940000155957.a.a ENSGT00940000155880.e.c ENSGT00940000158500.g ENSGT00940000159286.a.b.d.a.b ENSGT01030000234586.B.a.b.c #29 ENSGT00940000158808.eb ENSGT00940000165838.a ENSGT00390000012976.cb.a #22 ENSGT01050000245031.b ENSGT00940000161250.b ENSGT00940000159540.d.e.b ENSGT00510000046803.b.a.a.a ENSGT01100000263524.B.a.a.g ENSGT00940000153298.i.a.l ENSGT00940000161554.b ENSGT00390000000510 ENSGT00390000000305.a ENSGT00940000156745.b.b ENSGT00390000000305.b ENSGT00940000156745.b.a ENSGT00940000168198.a ENSGT00950000183106.a.b.b.g ENSGT00940000157383.g.b.b Common carp reference MODERN SPECIES 47 hoxa2b (ENSCCRG00000080560) skap2 (ENSCCRG00000042752) snx10b (ENSCCRG00000042739) cbx3b 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