Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480 #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480 #22 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 239 ENSGT00940000154107 ENSGT00940000154995 ENSGT00940000156869 ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT01100000266357 ENSGT00910000144184 ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000009313 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000266357 ENSGT00910000144184 ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000009313 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00910000144184 ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000009313 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a Anura ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01100000266357 ENSGT00910000144184 ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 Frog MODERN SPECIES il6st (ENSXETG00000015503) #7 ankrd55 (ENSXETG00000015510) #8 map3k1 (ENSXETG00000015513) #9 setd9 (ENSXETG00000015517) #10 mier3 (ENSXETG00000015520) #11 gpbp1 (ENSXETG00000015527) #12 ENSXETG00000047127 #13 ENSXETG00000045262 #14 smyd5 (ENSXETG00000011764) #15 ENSXETG00000044015 #16 ENSXETG00000048571 #17 ENSXETG00000049463 #18 plk2 (ENSXETG00000018847) #19 ENSXETG00000036149 #20 ENSXETG00000044791 #21 dazl (ENSXETG00000025199) #22 rab3c (ENSXETG00000018853) #23 pde4d (ENSXETG00000018854) #24 ENSXETG00000045835 #25 depdc1b (ENSXETG00000006073) #26 ENSXETG00000026198 #27 elovl7 (ENSXETG00000016688) #28 hps5 (ENSXETG00000016685) #29 ndufaf2 (ENSXETG00000016684) #30 smim15 (ENSXETG00000043765) #31 zswim6 (ENSXETG00000016681) #32 hacd2 (ENSXETG00000014831) #33 dimt1 (ENSXETG00000014830) #34 LRRC70 (ENSXETG00000042543) #35 ipo11 (ENSXETG00000014823) #36 ENSXETG00000047301 #37 Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad MODERN SPECIES 8 ENSLLEG00000016364 ENSLLEG00000016259 KAT2B (ENSLLEG00000014888) ENSLLEG00000014797 PP2D1 (ENSLLEG00000014763) ENSLLEG00000014742 RAB5A (ENSLLEG00000014688) ENSLLEG00000014251 KCNH8 (ENSLLEG00000013837) ENSLLEG00000013792 ENSLLEG00000013631 ENSLLEG00000013583 ENSLLEG00000013533 TBC1D5 (ENSLLEG00000013413) PLCL2 (ENSLLEG00000013245) ENSLLEG00000013104 #22 RFTN1 (ENSLLEG00000013002) ENSLLEG00000012981 OXNAD1 (ENSLLEG00000012884) GALNT15 (ENSLLEG00000012781) ENSLLEG00000012662 ANKRD28 (ENSLLEG00000012335) ##8 BTD (ENSLLEG00000012283) ENSLLEG00000012262 HACL1 (ENSLLEG00000011774) COLQ (ENSLLEG00000011444) PLEKHA8 (ENSLLEG00000011242) FKBP14 (ENSLLEG00000011179) SCRN1 (ENSLLEG00000011017) WIPF3 (ENSLLEG00000010864) PRR15 (ENSLLEG00000010846) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 5 CDK18 (ENSLLEG00000000794) ENSLLEG00000000783 ENSLLEG00000000774 ENSLLEG00000000732 KLHDC8A (ENSLLEG00000000686) NUAK2 (ENSLLEG00000000659) TMCC2 (ENSLLEG00000000610) DSTYK (ENSLLEG00000000488) ENSLLEG00000000454 ENSLLEG00000000336 PFKFB2 (ENSLLEG00000000114) YOD1 (ENSLLEG00000000057) C1orf116 (ENSLLEG00000013164) ENSLLEG00000012498 ENSLLEG00000012384 ENSLLEG00000012353 #22 ENSLLEG00000012244 IL10 (ENSLLEG00000012047) MAPKAPK2 (ENSLLEG00000011762) DYRK3 (ENSLLEG00000011688) EIF2D (ENSLLEG00000011397) RASSF5 (ENSLLEG00000011355) ENSLLEG00000011335 ENSLLEG00000011313 ENSLLEG00000011285 ENSLLEG00000011258 IKBKE (ENSLLEG00000011050) ENSLLEG00000010377 ENSLLEG00000010309 AVPR1B (ENSLLEG00000010254) ENSLLEG00000009895 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 909 ENSLLEG00000018126 #22 ENSLLEG00000017730 ENSLLEG00000017520 Amniota ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00390000009313 ENSGT01030000234590.B.a.b ENSGT00390000000527 ENSGT00390000010184 ENSGT00950000182887.C.a.a.b ENSGT00730000111225 ENSGT00940000155191.b ENSGT00390000009664 ENSGT00390000014721 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a Mammalia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00390000017724.b ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00390000017724.b ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 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ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00390000017724.b ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000154989 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00390000017724.b ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b #22 Hedgehog MODERN SPECIES 226 ENSEEUG00000005973 #22 Common shrew MODERN SPECIES 12490 ENSSARG00000008473 #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00390000017724.b ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 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(ENSUAMG00000020294) DPH3 (ENSUAMG00000020293) GALNT15 (ENSUAMG00000020289) Giant Panda MODERN SPECIES 16 NKIRAS1 (ENSAMEG00000003508) UBE2E1 (ENSAMEG00000003515) UBE2E2 (ENSAMEG00000003528) ZNF385D (ENSAMEG00000009354) ENSAMEG00000025071 SGO1 (ENSAMEG00000000913) KAT2B (ENSAMEG00000000922) PP2D1 (ENSAMEG00000000952) RAB5A (ENSAMEG00000000954) EFHB (ENSAMEG00000000973) KCNH8 (ENSAMEG00000007435) SATB1 (ENSAMEG00000009099) ENSAMEG00000024183 TBC1D5 (ENSAMEG00000009080) PLCL2 (ENSAMEG00000009078) ENSAMEG00000009059 #22 ENSAMEG00000027343 RFTN1 (ENSAMEG00000009041) OXNAD1 (ENSAMEG00000009028) DPH3 (ENSAMEG00000030700) GALNT15 (ENSAMEG00000008995) ANKRD28 (ENSAMEG00000008924) ##8 BTD (ENSAMEG00000008918) HACL1 (ENSAMEG00000008878) COLQ (ENSAMEG00000008838) EAF1 (ENSAMEG00000008829) METTL6 (ENSAMEG00000008819) ENSAMEG00000008803 ENSAMEG00000008756 ENSAMEG00000026185 ENSAMEG00000004820 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 153 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995.w ENSGT00390000017863 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(ENSNVIG00000017486) COLQ (ENSNVIG00000017326) ENSNVIG00000017316 American mink MODERN SPECIES 26 ENSNVIG00000004556 KRTAP27-1 (ENSNVIG00000004552) KRTAP25-1 (ENSNVIG00000004548) KRTAP24-1 (ENSNVIG00000004545) CLD8 (ENSNVIG00000004535) CLDN17 (ENSNVIG00000004520) GRIK1 (ENSNVIG00000004199) BACH1 (ENSNVIG00000004162) B4DFW0 (ENSNVIG00000004133) CCT8 (ENSNVIG00000004044) USP16 (ENSNVIG00000003966) RWDD2B (ENSNVIG00000003943) LTN1 (ENSNVIG00000003815) N6AMT1 (ENSNVIG00000003781) ENSNVIG00000003753 ENSNVIG00000003724 #22 ADAMTS5 (ENSNVIG00000003697) ADAMTS1 (ENSNVIG00000003683) CYYR1 (ENSNVIG00000003664) APP (ENSNVIG00000003384) GABPA (ENSNVIG00000003339) ATP5PF (ENSNVIG00000003266) JAM2 (ENSNVIG00000003231) MRPL39 (ENSNVIG00000003180) ENSNVIG00000003171 ENSNVIG00000003162 ENSNVIG00000003122 Ferret MODERN SPECIES 345 KCNH8 (ENSMPUG00000001398) ENSMPUG00000001402 SATB1 (ENSMPUG00000001406) ENSMPUG00000001411 TBC1D5 (ENSMPUG00000001414) PLCL2 (ENSMPUG00000001422) ENSMPUG00000001426 #22 ENSMPUG00000001472 ENSMPUG00000001478 OXNAD1 (ENSMPUG00000001516) DPH3 (ENSMPUG00000001521) GALNT15 (ENSMPUG00000001528) ANKRD28 (ENSMPUG00000001532) ##8 BTD (ENSMPUG00000001545) HACL1 (ENSMPUG00000001551) COLQ (ENSMPUG00000001650) EAF1 (ENSMPUG00000001699) METTL6 (ENSMPUG00000001741) SH3BP5 (ENSMPUG00000001747) CAPN7 (ENSMPUG00000001751) ENSMPUG00000001757 ENSMPUG00000001768 Canidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415.h ENSGT00940000155985.eb ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679.e ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00910000144184.q.b.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415.h ENSGT00940000155985.eb ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679.e ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 Dog MODERN SPECIES 15 NKIRAS1 (ENSCAFG00845019798) ENSCAFG00845019901 UBE2E2 (ENSCAFG00845020072) ZNF385D (ENSCAFG00845020268) SGO1 (ENSCAFG00845020400) KAT2B (ENSCAFG00845020587) PP2D1 (ENSCAFG00845021158) RAB5A 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ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b.a.a ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT01000000220746 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 Panthera ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b.a.a ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 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(ENSPPRG00000007488) OXNAD1 (ENSPPRG00000007203) DPH3 (ENSPPRG00000004843) GALNT15 (ENSPPRG00000004449) ANKRD28 (ENSPPRG00000004331) ##8 ENSPPRG00000003237 BTD (ENSPPRG00000002804) HACL1 (ENSPPRG00000001693) COLQ (ENSPPRG00000023699) EAF1 (ENSPPRG00000014826) METTL6 (ENSPPRG00000014661) SH3BP5 (ENSPPRG00000014017) CAPN7 (ENSPPRG00000012968) ENSPPRG00000012527 COL6A5 (ENSPPRG00000009495) lion MODERN SPECIES 9 ENSPLOG00000007334 NKIRAS1 (ENSPLOG00000007358) UBE2E1 (ENSPLOG00000007394) UBE2E2 (ENSPLOG00000007465) ZNF385D (ENSPLOG00000007520) SGO1 (ENSPLOG00000007578) KAT2B (ENSPLOG00000007809) ENSPLOG00000008548 PP2D1 (ENSPLOG00000008568) RAB5A (ENSPLOG00000008606) EFHB (ENSPLOG00000008658) KCNH8 (ENSPLOG00000008800) SATB1 (ENSPLOG00000008905) TBC1D5 (ENSPLOG00000008965) PLCL2 (ENSPLOG00000009144) ENSPLOG00000009211 #22 RFTN1 (ENSPLOG00000009354) OXNAD1 (ENSPLOG00000009387) DPH3 (ENSPLOG00000009427) ENSPLOG00000009456 GALNT15 (ENSPLOG00000009476) ANKRD28 (ENSPLOG00000009621) ##8 BTD (ENSPLOG00000009945) HACL1 (ENSPLOG00000010310) COLQ (ENSPLOG00000011130) EAF1 (ENSPLOG00000011678) SH3BP5 (ENSPLOG00000011742) CAPN7 (ENSPLOG00000011881) ENSPLOG00000011940 ENSPLOG00000012148 COL6A6 (ENSPLOG00000012227) Cat MODERN SPECIES 240 UBE2E1 (ENSFCAG00000035590) UBE2E2 (ENSFCAG00000007748) ZNF385D (ENSFCAG00000027175) SGO1 (ENSFCAG00000035315) ENSFCAG00000033105 KAT2B (ENSFCAG00000004458) PP2D1 (ENSFCAG00000040097) RAB5A (ENSFCAG00000039795) EFHB (ENSFCAG00000004454) KCNH8 (ENSFCAG00000012306) ENSFCAG00000022406 SATB1 (ENSFCAG00000004295) ENSFCAG00000044938 TBC1D5 (ENSFCAG00000004653) PLCL2 (ENSFCAG00000022152) ENSFCAG00000023607 #22 RFTN1 (ENSFCAG00000022758) OXNAD1 (ENSFCAG00000006357) DPH3 (ENSFCAG00000035252) ENSFCAG00000053298 GALNT15 (ENSFCAG00000006350) ANKRD28 (ENSFCAG00000011307) ##8 BTD (ENSFCAG00000011306) HACL1 (ENSFCAG00000011305) COLQ (ENSFCAG00000011304) EAF1 (ENSFCAG00000011303) METTL6 (ENSFCAG00000022284) SH3BP5 (ENSFCAG00000013213) CAPN7 (ENSFCAG00000030939) COL6A5 (ENSFCAG00000044600) COL6A6 (ENSFCAG00000013504) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 Equus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT01030000238633 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00940000167515 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 Donkey MODERN SPECIES 13 ENSEASG00005027441 NKIRAS1 (ENSEASG00005026235) UBE2E1 (ENSEASG00005005967) UBE2E2 (ENSEASG00005028306) ENSEASG00005005954 SGO1 (ENSEASG00005005948) KAT2B (ENSEASG00005005848) PP2D1 (ENSEASG00005005822) RAB5A (ENSEASG00005005818) EFHB (ENSEASG00005005815) ENSEASG00005005811 KCNH8 (ENSEASG00005005804) SATB1 (ENSEASG00005005787) TBC1D5 (ENSEASG00005005775) PLCL2 (ENSEASG00005005767) ENSEASG00005005756 #22 RFTN1 (ENSEASG00005005754) OXNAD1 (ENSEASG00005005749) ENSEASG00005025473 ENSEASG00005023827 GALNT15 (ENSEASG00005005743) ENSEASG00005005740 ANKRD28 (ENSEASG00005005733) ##8 BTD (ENSEASG00005005732) HACL1 (ENSEASG00005005730) COLQ (ENSEASG00005005725) EAF1 (ENSEASG00005005720) METTL6 (ENSEASG00005005716) ENSEASG00005005713 ENSEASG00005005708 ENSEASG00005005705 Horse MODERN SPECIES 7 NKIRAS1 (ENSECAG00000010292) UBE2E1 (ENSECAG00000011371) UBE2E2 (ENSECAG00000029267) ZNF385D (ENSECAG00000012368) KAT2B (ENSECAG00000013925) SGO1 (ENSECAG00000012475) PP2D1 (ENSECAG00000018679) RAB5A (ENSECAG00000019062) EFHB (ENSECAG00000019496) ENSECAG00000031635 KCNH8 (ENSECAG00000023098) SATB1 (ENSECAG00000023585) TBC1D5 (ENSECAG00000008017) ENSECAG00000053253 PLCL2 (ENSECAG00000010068) ENSECAG00000010923 #22 RFTN1 (ENSECAG00000013897) OXNAD1 (ENSECAG00000014741) ENSECAG00000042046 GALNT15 (ENSECAG00000016679) ANKRD28 (ENSECAG00000019591) ##8 BTD (ENSECAG00000003387) ENSECAG00000056916 HACL1 (ENSECAG00000009309) COLQ (ENSECAG00000019755) EAF1 (ENSECAG00000024360) METTL6 (ENSECAG00000055054) SH3BP5 (ENSECAG00000024842) CAPN7 (ENSECAG00000004932) ENSECAG00000011581 COL6A5 (ENSECAG00000012733) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 Megabat MODERN SPECIES 527 ENSPVAG00000007836 #22 RFTN1 (ENSPVAG00000007833) OXNAD1 (ENSPVAG00000007831) ENSPVAG00000007830 GALNT15 (ENSPVAG00000007827) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 8 NKIRAS1 (ENSRFEG00010011183) ENSRFEG00010011222 UBE2E2 (ENSRFEG00010011378) ENSRFEG00010011446 ZNF385D (ENSRFEG00010011496) SGO1 (ENSRFEG00010011604) KAT2B (ENSRFEG00010012070) PP2D1 (ENSRFEG00010012143) RAB5A (ENSRFEG00010012219) EFHB (ENSRFEG00010012369) KCNH8 (ENSRFEG00010012438) SATB1 (ENSRFEG00010012658) ENSRFEG00010012725 TBC1D5 (ENSRFEG00010012791) PLCL2 (ENSRFEG00010012959) ENSRFEG00010013048 #22 RFTN1 (ENSRFEG00010013368) OXNAD1 (ENSRFEG00010013428) DPH3 (ENSRFEG00010013628) GALNT15 (ENSRFEG00010013714) ANKRD28 (ENSRFEG00010013787) ##8 BTD (ENSRFEG00010013954) HACL1 (ENSRFEG00010014213) COLQ (ENSRFEG00010014398) EAF1 (ENSRFEG00010014564) METTL6 (ENSRFEG00010014617) SH3BP5 (ENSRFEG00010014768) CAPN7 (ENSRFEG00010014864) ENSRFEG00010014927 COL6A5 (ENSRFEG00010015260) COL6A6 (ENSRFEG00010015736) Microbat MODERN SPECIES 945 SGO1 (ENSMLUG00000007432) KAT2B (ENSMLUG00000007403) PP2D1 (ENSMLUG00000011709) RAB5A (ENSMLUG00000011716) EFHB (ENSMLUG00000011722) KCNH8 (ENSMLUG00000001650) SATB1 (ENSMLUG00000001860) TBC1D5 (ENSMLUG00000013559) PLCL2 (ENSMLUG00000013543) ENSMLUG00000011337 #22 RFTN1 (ENSMLUG00000000975) OXNAD1 (ENSMLUG00000000969) DPH3 (ENSMLUG00000017660) GALNT15 (ENSMLUG00000017659) ENSMLUG00000022391 ANKRD28 (ENSMLUG00000002784) ##8 BTD (ENSMLUG00000002778) HACL1 (ENSMLUG00000002771) COLQ (ENSMLUG00000002756) EAF1 (ENSMLUG00000002747) METTL6 (ENSMLUG00000002743) SH3BP5 (ENSMLUG00000002737) CAPN7 (ENSMLUG00000002720) ENSMLUG00000005740 COL6A5 (ENSMLUG00000010691) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00910000144184.r ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 Suina ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.b.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 Pig MODERN SPECIES 4 KAT2B (ENSSSCG00000024621) PP2D1 (ENSSSCG00000027327) RAB5A (ENSSSCG00000037653) EFHB (ENSSSCG00000011205) KCNH8 (ENSSSCG00000011204) ENSSSCG00000056921 ENSSSCG00000059545 ENSSSCG00000053218 SATB1 (ENSSSCG00000011201) ENSSSCG00000058979 ENSSSCG00000061112 ENSSSCG00000061080 ENSSSCG00000049233 TBC1D5 (ENSSSCG00000011199) PLCL2 (ENSSSCG00000029811) ENSSSCG00000030671 #22 ENSSSCG00000050150 RFTN1 (ENSSSCG00000011198) OXNAD1 (ENSSSCG00000011197) DPH3 (ENSSSCG00000056217) GALNT15 (ENSSSCG00000011195) ANKRD28 (ENSSSCG00000011194) ##8 BTD (ENSSSCG00000011193) HACL1 (ENSSSCG00000011192) COLQ (ENSSSCG00000028911) EAF1 (ENSSSCG00000026622) METTL6 (ENSSSCG00000011190) SH3BP5 (ENSSSCG00000024938) CAPN7 (ENSSSCG00000030697) ENSSSCG00000054192 COL6A5 (ENSSSCG00000011186) Chacoan peccary MODERN SPECIES 950 RPL15 (ENSCWAG00000014981) NKIRAS1 (ENSCWAG00000014944) ENSCWAG00000014883 ENSCWAG00000014850 UBE2E2 (ENSCWAG00000014787) ZNF385D (ENSCWAG00000014736) SGO1 (ENSCWAG00000014455) KAT2B (ENSCWAG00000014268) PP2D1 (ENSCWAG00000014209) RAB5A (ENSCWAG00000014144) EFHB (ENSCWAG00000013945) KCNH8 (ENSCWAG00000013749) SATB1 (ENSCWAG00000013549) TBC1D5 (ENSCWAG00000013341) PLCL2 (ENSCWAG00000013243) ENSCWAG00000013021 #22 RFTN1 (ENSCWAG00000012968) OXNAD1 (ENSCWAG00000012470) DPH3 (ENSCWAG00000012398) GALNT15 (ENSCWAG00000012343) ANKRD28 (ENSCWAG00000011879) ##8 ENSCWAG00000020745 BTD (ENSCWAG00000020723) HACL1 (ENSCWAG00000020631) COLQ (ENSCWAG00000020535) EAF1 (ENSCWAG00000020521) METTL6 (ENSCWAG00000020511) SH3BP5 (ENSCWAG00000020499) CAPN7 (ENSCWAG00000020439) ENSCWAG00000020406 COL6A5 (ENSCWAG00000020322) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000164180 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00940000169811 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 Alpaca MODERN SPECIES 5240 ENSVPAG00000000468 #22 Arabian camel MODERN SPECIES NKIRAS1 (ENSCDRG00005003487) UBE2E1 (ENSCDRG00005003446) ENSCDRG00005003402 UBE2E2 (ENSCDRG00005003374) ZNF385D (ENSCDRG00005003324) ENSCDRG00005003293 KAT2B (ENSCDRG00005002364) PP2D1 (ENSCDRG00005002250) RAB5A (ENSCDRG00005002235) EFHB (ENSCDRG00005002193) KCNH8 (ENSCDRG00005002155) SATB1 (ENSCDRG00005002136) ENSCDRG00005002109 TBC1D5 (ENSCDRG00005002049) PLCL2 (ENSCDRG00005002032) ENSCDRG00005002024 #22 RFTN1 (ENSCDRG00005002002) OXNAD1 (ENSCDRG00005001933) DPH3 (ENSCDRG00005001905) GALNT15 (ENSCDRG00005001875) ANKRD28 (ENSCDRG00005001643) ##8 BTD (ENSCDRG00005001581) HACL1 (ENSCDRG00005001449) COLQ (ENSCDRG00005001323) EAF1 (ENSCDRG00005001289) SH3BP5 (ENSCDRG00005001218) CAPN7 (ENSCDRG00005001146) COL6A5 (ENSCDRG00005000604) COL6A6 (ENSCDRG00005000408) PIK3R4 (ENSCDRG00005000341) ATP2C1 (ENSCDRG00005000079) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00910000144184.q.b.a ENSGT00910000144184.r ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415.d ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000164180 Pecora ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154559.C ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000164180 Yarkand deer MODERN SPECIES 10 ATG3 (ENSCHYG00000021648) ENSCHYG00000021566 ZNF596 (ENSCHYG00000021476) ENSCHYG00000021440 SGO1 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ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 Bos ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158211.y.a.a.b ENSGT00940000154559.C ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.l ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00960000190334 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C.e.a ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT01050000248068 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158211.y.a.a.b ENSGT00940000154559.C ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.E.b ENSGT00390000008096.E.a ENSGT00940000157121 ENSGT00940000154846.b.x.c ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.l ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00960000190334 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C.f ##8 ENSGT00950000182908.C.e.a ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000162990 Wild yak MODERN SPECIES 804 ENSBMUG00000022078 ENSBMUG00000022040 PLCL2 (ENSBMUG00000022030) ENSBMUG00000021997 #22 RFTN1 (ENSBMUG00000021986) OXNAD1 (ENSBMUG00000021961) ENSBMUG00000021892 ENSBMUG00000021878 GALNT15 (ENSBMUG00000021868) Domestic yak MODERN SPECIES ZNF596 (ENSBGRG00000002023) ENSBGRG00000002004 SGO1 (ENSBGRG00000001982) KAT2B (ENSBGRG00000001845) RAB5A (ENSBGRG00000001791) EFHB (ENSBGRG00000001764) ENSBGRG00000001755 KCNH8 (ENSBGRG00000001743) ENSBGRG00000001733 ENSBGRG00000001727 ENSBGRG00000001708 TBC1D5 (ENSBGRG00000000433) ENSBGRG00000000231 ENSBGRG00000000227 PLCL2 (ENSBGRG00000000215) ENSBGRG00000000174 #22 ENSBGRG00000005989 RFTN1 (ENSBGRG00000005969) OXNAD1 (ENSBGRG00000005867) DPH3 (ENSBGRG00000005826) GALNT15 (ENSBGRG00000005716) ANKRD28 (ENSBGRG00000005474) ##8 ENSBGRG00000005423 HACL1 (ENSBGRG00000004645) COLQ (ENSBGRG00000004392) EAF1 (ENSBGRG00000004328) METTL6 (ENSBGRG00000004234) ENSBGRG00000004225 SH3BP5 (ENSBGRG00000004132) CAPN7 (ENSBGRG00000004003) COL6A5 (ENSBGRG00000003956) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158211.y.a.a.b ENSGT00940000154559.C ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.l ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT01100000263481.n.a.a.b.b.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C.e.a ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT01050000248068 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES ENSBIXG00005013496 ENSBIXG00005013542 ZNF596 (ENSBIXG00005013604) ENSBIXG00005013619 SGO1 (ENSBIXG00005013664) KAT2B (ENSBIXG00005013873) PP2D1 (ENSBIXG00005013941) RAB5A (ENSBIXG00005001761) EFHB (ENSBIXG00005001828) KCNH8 (ENSBIXG00005001852) SATB1 (ENSBIXG00005014252) TBC1D5 (ENSBIXG00005005933) ENSBIXG00005001921 PLCL2 (ENSBIXG00005014406) ENSBIXG00005014489 #22 RFTN1 (ENSBIXG00005001982) OXNAD1 (ENSBIXG00005002032) DPH3 (ENSBIXG00005002043) ENSBIXG00005014630 GALNT15 (ENSBIXG00005014657) ANKRD28 (ENSBIXG00005014993) ##8 BTD (ENSBIXG00005015145) HACL1 (ENSBIXG00005015316) COLQ (ENSBIXG00005006233) EAF1 (ENSBIXG00005002299) METTL6 (ENSBIXG00005015538) SH3BP5 (ENSBIXG00005015583) CAPN7 (ENSBIXG00005015610) ENSBIXG00005002441 COL6A5 (ENSBIXG00005015760) Cow MODERN SPECIES ENSBTAG00000040393 PRDM9 (ENSBTAG00000004538) ZNF596 (ENSBTAG00000049158) ENSBTAG00000047076 SGO1 (ENSBTAG00000000752) KAT2B (ENSBTAG00000000746) PP2D1 (ENSBTAG00000004061) RAB5A (ENSBTAG00000046385) EFHB (ENSBTAG00000013806) ENSBTAG00000047978 KCNH8 (ENSBTAG00000012798) SATB1 (ENSBTAG00000021158) TBC1D5 (ENSBTAG00000030581) ENSBTAG00000049193 PLCL2 (ENSBTAG00000009942) DAZL (ENSBTAG00000000502) #22 ENSBTAG00000051752 RFTN1 (ENSBTAG00000030593) OXNAD1 (ENSBTAG00000004891) ENSBTAG00000053091 DPH3 (ENSBTAG00000003916) ENSBTAG00000051065 GALNT15 (ENSBTAG00000008240) ANKRD28 (ENSBTAG00000024815) ##8 BTD (ENSBTAG00000019129) HACL1 (ENSBTAG00000003718) COLQ (ENSBTAG00000040193) COLQ (ENSBTAG00000051541) EAF1 (ENSBTAG00000019202) METTL6 (ENSBTAG00000023375) ENSBTAG00000030592 American bison MODERN SPECIES 3288 KAT2B (ENSBBBG00000001812) PP2D1 (ENSBBBG00000010399) RAB5A (ENSBBBG00000010394) EFHB (ENSBBBG00000010382) ENSBBBG00000010362 ENSBBBG00000010360 ENSBBBG00000010354 ENSBBBG00000010352 KCNH8 (ENSBBBG00000010348) ENSBBBG00000010337 ENSBBBG00000010335 ENSBBBG00000010332 SATB1 (ENSBBBG00000010327) TBC1D5 (ENSBBBG00000010308) PLCL2 (ENSBBBG00000010278) ENSBBBG00000007878 #22 ENSBBBG00000000039 ENSBBBG00000000041 OXNAD1 (ENSBBBG00000000045) DPH3 (ENSBBBG00000000067) ENSBBBG00000000073 GALNT15 (ENSBBBG00000000086) ANKRD28 (ENSBBBG00000010251) ##8 BTD (ENSBBBG00000010234) HACL1 (ENSBBBG00000010217) ENSBBBG00000010128 COLQ (ENSBBBG00000010123) EAF1 (ENSBBBG00000010116) METTL6 (ENSBBBG00000010111) SH3BP5 (ENSBBBG00000010106) CAPN7 (ENSBBBG00000010094) Caprinae DUPLICATION Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b.c #22 Goat MODERN SPECIES 7 ENSCHIG00000011366 AHCTF1 (ENSCHIG00000023392) ENSCHIG00000010278 CDC42BPA (ENSCHIG00000021878) COQ8A (ENSCHIG00000012633) PSEN2 (ENSCHIG00000025180) ITPKB (ENSCHIG00000016348) STUM (ENSCHIG00000026813) PARP1 (ENSCHIG00000018072) LIN9 (ENSCHIG00000003005) MIXL1 (ENSCHIG00000017640) ACBD3 (ENSCHIG00000010539) ENSCHIG00000021907 ENSCHIG00000013022 SDE2 (ENSCHIG00000022358) ENSCHIG00000016605 #22 ENSCHIG00000010623 PYCR2 (ENSCHIG00000022032) ENSCHIG00000017375 TMEM63A (ENSCHIG00000026549) EPHX1 (ENSCHIG00000017919) SRP9 (ENSCHIG00000006407) ENSCHIG00000004057 ENSCHIG00000000542 ENAH (ENSCHIG00000022407) LBR (ENSCHIG00000013607) DNAH14 (ENSCHIG00000021801) CNIH3 (ENSCHIG00000015311) ENSCHIG00000008380 WDR26 (ENSCHIG00000020527) CNIH4 (ENSCHIG00000014392) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158211.y.a.a.a ENSGT00940000154559.C ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b.d #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES ENSOARG00020000700 ZNF596 (ENSOARG00020000680) ENSOARG00020000663 SGO1 (ENSOARG00020000404) KAT2B (ENSOARG00020000211) RAB5A (ENSOARG00020000129) EFHB (ENSOARG00020000122) SATB1 (ENSOARG00020022035) TBC1D5 (ENSOARG00020021801) PLCL2 (ENSOARG00020021690) ENSOARG00020021565 #22 RFTN1 (ENSOARG00020021528) OXNAD1 (ENSOARG00020021467) ENSOARG00020021433 ANKRD28 (ENSOARG00020020797) ##8 ENSOARG00020020758 BTD (ENSOARG00020020641) HACL1 (ENSOARG00020020063) COLQ (ENSOARG00020019567) EAF1 (ENSOARG00020019515) METTL6 (ENSOARG00020019436) SH3BP5 (ENSOARG00020019355) CAPN7 (ENSOARG00020019235) COL6A5 (ENSOARG00020019139) COL6A6 (ENSOARG00020018833) PIK3R4 (ENSOARG00020018400) Goat MODERN SPECIES ENSCHIG00000026346 ZNF596 (ENSCHIG00000023889) SGO1 (ENSCHIG00000013739) KAT2B (ENSCHIG00000022776) PP2D1 (ENSCHIG00000017933) RAB5A (ENSCHIG00000025419) EFHB (ENSCHIG00000013082) KCNH8 (ENSCHIG00000018810) SATB1 (ENSCHIG00000023143) TBC1D5 (ENSCHIG00000022282) PLCL2 (ENSCHIG00000010205) DAZL (ENSCHIG00000017877) #22 RFTN1 (ENSCHIG00000013091) OXNAD1 (ENSCHIG00000027046) DPH3 (ENSCHIG00000016516) GALNT15 (ENSCHIG00000012848) ANKRD28 (ENSCHIG00000022112) ##8 BTD (ENSCHIG00000014947) HACL1 (ENSCHIG00000013034) COLQ (ENSCHIG00000012168) EAF1 (ENSCHIG00000024831) METTL6 (ENSCHIG00000021242) SH3BP5 (ENSCHIG00000007654) CAPN7 (ENSCHIG00000022356) COL6A5 (ENSCHIG00000010899) ENSCHIG00000027271 COL6A6 (ENSCHIG00000018630) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415.d ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00900000141074.l ENSGT00390000008096.A ENSGT00390000007149.l ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225.h ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00950000182988.a.a.q ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 Blue whale MODERN SPECIES 15 UBE2E2 (ENSBMSG00010001542) ENSBMSG00010001558 ZNF385D (ENSBMSG00010001563) SGO1 (ENSBMSG00010001587) KAT2B (ENSBMSG00010001643) ENSBMSG00010001678 PP2D1 (ENSBMSG00010001686) RAB5A (ENSBMSG00010001697) EFHB (ENSBMSG00010001716) KCNH8 (ENSBMSG00010001759) ENSBMSG00010001776 SATB1 (ENSBMSG00010001793) ENSBMSG00010001810 TBC1D5 (ENSBMSG00010001844) PLCL2 (ENSBMSG00010002116) ENSBMSG00010002140 #22 RFTN1 (ENSBMSG00010002183) OXNAD1 (ENSBMSG00010002208) ENSBMSG00010002225 GALNT15 (ENSBMSG00010002234) ANKRD28 (ENSBMSG00010002267) ##8 BTD (ENSBMSG00010002337) HACL1 (ENSBMSG00010002421) COLQ (ENSBMSG00010002575) EAF1 (ENSBMSG00010002751) METTL6 (ENSBMSG00010002767) SH3BP5 (ENSBMSG00010002776) ENSBMSG00010002789 CAPN7 (ENSBMSG00010002796) ENSBMSG00010002810 COL6A5 (ENSBMSG00010002820) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00990000211206 ENSGT00940000156869 ENSGT00940000160286.u.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000167974.d ENSGT00390000007149.l ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225.h ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00950000182988.a.a.q ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00990000211206 ENSGT00940000156869 ENSGT00940000160286.u.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000167974.d ENSGT00390000007149.l ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225.h ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00950000182988.a.a.q ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000012818.o.a.a.a.a.c.b ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00990000211206 ENSGT00940000156869 ENSGT00940000160286.u.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000167974.d ENSGT00390000007149.l ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225.h ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00950000182988.a.a.q ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000012818.o.a.a.a.a.c.b ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00990000211206 ENSGT00940000156869 ENSGT00940000160286.u.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00390000007149.l ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225.h ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00910000144184.r.a.b ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 Narwhal MODERN SPECIES 297 ZNF385D (ENSMMNG00015011111) SGO1 (ENSMMNG00015011082) KAT2B (ENSMMNG00015011041) PP2D1 (ENSMMNG00015011021) RAB5A (ENSMMNG00015011002) EFHB (ENSMMNG00015010970) ENSMMNG00015010961 ENSMMNG00015010952 KCNH8 (ENSMMNG00015010929) ENSMMNG00015010903 SATB1 (ENSMMNG00015010870) ENSMMNG00015010848 TBC1D5 (ENSMMNG00015010791) PLCL2 (ENSMMNG00015010765) ENSMMNG00015010745 ENSMMNG00015010705 #22 RFTN1 (ENSMMNG00015010679) OXNAD1 (ENSMMNG00015010649) ENSMMNG00015010634 GALNT15 (ENSMMNG00015010623) ANKRD28 (ENSMMNG00015010516) ##8 BTD (ENSMMNG00015010445) HACL1 (ENSMMNG00015010128) EAF1 (ENSMMNG00015009972) METTL6 (ENSMMNG00015009949) SH3BP5 (ENSMMNG00015009931) CAPN7 (ENSMMNG00015009911) ENSMMNG00015009902 ENSMMNG00015009901 COL6A5 (ENSMMNG00015009886) COL6A6 (ENSMMNG00015009859) Beluga whale MODERN SPECIES 18 PLCL2 (ENSDLEG00000007213) ENSDLEG00000007223 #22 RFTN1 (ENSDLEG00000007243) OXNAD1 (ENSDLEG00000007252) DPH3 (ENSDLEG00000007255) GALNT15 (ENSDLEG00000007259) ANKRD28 (ENSDLEG00000007274) ##8 BTD (ENSDLEG00000007312) HACL1 (ENSDLEG00000007320) COLQ (ENSDLEG00000007339) EAF1 (ENSDLEG00000007366) METTL6 (ENSDLEG00000007375) SH3BP5 (ENSDLEG00000007381) CAPN7 (ENSDLEG00000007395) ENSDLEG00000007406 ENSDLEG00000007410 ENSDLEG00000007417 Vaquita MODERN SPECIES 15 ZNF385D (ENSPSNG00000004270) SGO1 (ENSPSNG00000004303) KAT2B (ENSPSNG00000004333) ENSPSNG00000004378 PP2D1 (ENSPSNG00000004395) ENSPSNG00000004424 EFHB (ENSPSNG00000005780) ENSPSNG00000005865 KCNH8 (ENSPSNG00000005906) ENSPSNG00000005960 SATB1 (ENSPSNG00000005991) ENSPSNG00000006021 ENSPSNG00000006034 TBC1D5 (ENSPSNG00000006070) PLCL2 (ENSPSNG00000006137) ENSPSNG00000006191 #22 RFTN1 (ENSPSNG00000006302) OXNAD1 (ENSPSNG00000006384) GALNT15 (ENSPSNG00000006494) ANKRD28 (ENSPSNG00000006571) ##8 BTD (ENSPSNG00000006709) HACL1 (ENSPSNG00000006877) COLQ (ENSPSNG00000007053) EAF1 (ENSPSNG00000007176) METTL6 (ENSPSNG00000007214) SH3BP5 (ENSPSNG00000007274) CAPN7 (ENSPSNG00000007360) ENSPSNG00000007439 COL6A5 (ENSPSNG00000007479) COL6A6 (ENSPSNG00000007661) PIK3R4 (ENSPSNG00000007901) Dolphin MODERN SPECIES 3037 ENSTTRG00000012649 #22 Sperm whale MODERN SPECIES UBE2E2 (ENSPCTG00005002250) ZNF385D (ENSPCTG00005002168) SGO1 (ENSPCTG00005002136) KAT2B (ENSPCTG00005002112) PP2D1 (ENSPCTG00005002090) RAB5A (ENSPCTG00005002067) EFHB (ENSPCTG00005002045) ENSPCTG00005002029 KCNH8 (ENSPCTG00005002008) ENSPCTG00005001988 SATB1 (ENSPCTG00005001955) ENSPCTG00005001947 ENSPCTG00005001940 TBC1D5 (ENSPCTG00005001824) PLCL2 (ENSPCTG00005001792) ENSPCTG00005001768 #22 RFTN1 (ENSPCTG00005001747) OXNAD1 (ENSPCTG00005001722) DPH3 (ENSPCTG00005001706) GALNT15 (ENSPCTG00005001677) ANKRD28 (ENSPCTG00005001558) ##8 BTD (ENSPCTG00005001503) HACL1 (ENSPCTG00005001391) EAF1 (ENSPCTG00005001335) METTL6 (ENSPCTG00005001309) SH3BP5 (ENSPCTG00005001266) CAPN7 (ENSPCTG00005001222) ENSPCTG00005001200 ENSPCTG00005001195 COL6A5 (ENSPCTG00005001123) COL6A6 (ENSPCTG00005001039) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00910000144184.q.a.h ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000167515 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00900000143613 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a.h ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000167515 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b Tree shrew DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 10068 ENSTBEG00000014941 #22 Tree shrew MODERN SPECIES 1391 ENSTBEG00000012225 #22 ENSTBEG00000012002 OXNAD1 (ENSTBEG00000011749) ENSTBEG00000011675 GALNT15 (ENSTBEG00000011226) Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a.h ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000167515 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b #22 Pika MODERN SPECIES 5161 ENSOPRG00000001387 #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a.h ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000167515 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a.h ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 Kangaroo rat MODERN SPECIES 379 ENSDORG00000014556 ENSDORG00000027020 ENSDORG00000028975 ENSDORG00000027946 ENSDORG00000028910 ENSDORG00000023947 Pp2d1 (ENSDORG00000024799) ENSDORG00000024958 Efhb (ENSDORG00000009402) ENSDORG00000023871 Kcnh8 (ENSDORG00000010205) Satb1 (ENSDORG00000005578) Tbc1d5 (ENSDORG00000001677) Plcl2 (ENSDORG00000004496) ENSDORG00000024181 Dazl (ENSDORG00000011497) #22 ENSDORG00000027840 ENSDORG00000024452 Oxnad1 (ENSDORG00000011643) ENSDORG00000011642 Galnt15 (ENSDORG00000011640) Ankrd28 (ENSDORG00000002191) ##8 Btd (ENSDORG00000008251) Hacl1 (ENSDORG00000008247) Colq (ENSDORG00000014117) Eaf1 (ENSDORG00000027979) Mettl6 (ENSDORG00000014113) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a.h ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 82 ENSJJAG00000016630 ENSJJAG00000018004 ENSJJAG00000012104 ENSJJAG00000020894 Rab5a (ENSJJAG00000020190) Efhb (ENSJJAG00000023722) Kcnh8 (ENSJJAG00000011433) Satb1 (ENSJJAG00000011907) Tbc1d5 (ENSJJAG00000020820) Plcl2 (ENSJJAG00000016157) Dazl (ENSJJAG00000010767) #22 ENSJJAG00000010277 ENSJJAG00000018830 ENSJJAG00000017236 ENSJJAG00000013287 Galnt15 (ENSJJAG00000019499) Ankrd28 (ENSJJAG00000005228) ##8 Btd (ENSJJAG00000020488) Hacl1 (ENSJJAG00000018292) Colq (ENSJJAG00000012436) ENSJJAG00000014692 Eaf1 (ENSJJAG00000019409) Mettl6 (ENSJJAG00000018567) ENSJJAG00000014685 Sh3bp5 (ENSJJAG00000014182) Capn7 (ENSJJAG00000019584) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.a.h ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 ENSGT00950000182865.a Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1513 Kcnh8 (ENSNGAG00000013207) Satb1 (ENSNGAG00000020340) Tbc1d5 (ENSNGAG00000018813) Plcl2 (ENSNGAG00000023127) ENSNGAG00000020385 Dazl (ENSNGAG00000009472) #22 ENSNGAG00000014161 ENSNGAG00000015104 Oxnad1 (ENSNGAG00000019562) ENSNGAG00000015855 Galnt15 (ENSNGAG00000017514) Ankrd28 (ENSNGAG00000015942) ##8 Btd (ENSNGAG00000013985) Hacl1 (ENSNGAG00000014477) Colq (ENSNGAG00000019455) Eaf1 (ENSNGAG00000008079) Mettl6 (ENSNGAG00000015822) Sh3bp5 (ENSNGAG00000018171) Capn7 (ENSNGAG00000000411) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00940000157697 ENSGT00940000157801 ENSGT00390000016567 ENSGT00940000156417 ENSGT00950000182815.b ENSGT00390000012980.b ENSGT00940000156616 ENSGT00390000006988 ENSGT00390000015714 ENSGT00470000042300 ENSGT00470000042297 ENSGT00940000153835.a.b.d ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00940000153835.a.b.c.a.a Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00940000162681 ENSGT00940000157697 ENSGT00940000157801 ENSGT00390000016567 ENSGT00940000156417 ENSGT00950000182815.b ENSGT00390000012980.b ENSGT00940000156616 ENSGT00390000006988 ENSGT00390000015714 ENSGT00470000042300 ENSGT00470000042297 ENSGT00940000153835.a.b.d ENSGT00940000153835.a.a Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00940000162681 ENSGT00940000157697 ENSGT00940000157801 ENSGT00390000016567 ENSGT00940000156417 ENSGT00950000182815.b ENSGT00390000012980.b ENSGT00940000156616 ENSGT00390000006988 ENSGT00390000015714 ENSGT00470000042300 ENSGT00470000042297 ENSGT00940000153835.a.b.d ENSGT00940000153835.a.a Prairie vole MODERN SPECIES 219 Plcl2 (ENSMOCG00000017643) Dazl (ENSMOCG00000016627) #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 13 Cd2ap (ENSPEMG00000013997) Adgrf2 (ENSPEMG00000016659) Adgrf4 (ENSPEMG00000012424) Opn5 (ENSPEMG00000022219) Ptchd4 (ENSPEMG00000023455) Sgo1 (ENSPEMG00000013004) Pp2d1 (ENSPEMG00000019407) Rab5a (ENSPEMG00000029423) Efhb (ENSPEMG00000020099) ENSPEMG00000031002 Kcnh8 (ENSPEMG00000021076) ENSPEMG00000004477 Satb1 (ENSPEMG00000019744) Tbc1d5 (ENSPEMG00000019337) ENSPEMG00000019815 Dazl (ENSPEMG00000019679) #22 Rftn1 (ENSPEMG00000010897) ENSPEMG00000025845 Kif6 (ENSPEMG00000013628) Daam2 (ENSPEMG00000001066) Mocs1 (ENSPEMG00000023108) Lrfn2 (ENSPEMG00000019605) Unc5cl (ENSPEMG00000011269) Tspo2 (ENSPEMG00000010280) Apobec2 (ENSPEMG00000005724) Oard1 (ENSPEMG00000024978) Nfya (ENSPEMG00000012280) Treml1 (ENSPEMG00000012297) Trem2 (ENSPEMG00000013350) ENSPEMG00000001398 ENSPEMG00000016786 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00940000162681 ENSGT00940000157697 ENSGT00940000157801 ENSGT00390000016567 ENSGT00940000156417 ENSGT00950000182815.b ENSGT00390000012980.b ENSGT00940000156616 ENSGT00390000006988 ENSGT00390000015714 ENSGT00470000042300 ENSGT00470000042297 ENSGT00940000153835.a.b.d ENSGT00940000153835.a.a Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 184 ENSCGRG00001022014 ENSCGRG00001022886 ENSCGRG00001024265 ENSCGRG00001000093 Sgo1 (ENSCGRG00001021224) Kat2b (ENSCGRG00001006983) Pp2d1 (ENSCGRG00001019391) ENSCGRG00001020018 ENSCGRG00001004203 Efhb (ENSCGRG00001007930) ENSCGRG00001001002 Kcnh8 (ENSCGRG00001023448) Satb1 (ENSCGRG00001012162) Tbc1d5 (ENSCGRG00001012430) Plcl2 (ENSCGRG00001019852) Dazl (ENSCGRG00001021961) #22 Rftn1 (ENSCGRG00001005272) ENSCGRG00001015490 Kif6 (ENSCGRG00001021327) Daam2 (ENSCGRG00001016238) Mocs1 (ENSCGRG00001021044) Lrfn2 (ENSCGRG00001023899) ENSCGRG00001016038 Unc5cl (ENSCGRG00001020057) Tspo2 (ENSCGRG00001011008) Apobec2 (ENSCGRG00001014983) Oard1 (ENSCGRG00001019722) Nfya (ENSCGRG00001008539) Treml1 (ENSCGRG00001003109) Trem2 (ENSCGRG00001004763) ENSCGRG00001010441 Golden Hamster MODERN SPECIES 649 Sgo1 (ENSMAUG00000013572) Kat2b (ENSMAUG00000013162) Pp2d1 (ENSMAUG00000012292) Rab5a (ENSMAUG00000011242) Efhb (ENSMAUG00000009772) Kcnh8 (ENSMAUG00000004139) ENSMAUG00000000482 ENSMAUG00000000207 ENSMAUG00000019938 Tbc1d5 (ENSMAUG00000012827) Plcl2 (ENSMAUG00000008046) Dazl (ENSMAUG00000018931) #22 Rftn1 (ENSMAUG00000017586) Kif6 (ENSMAUG00000016153) Daam2 (ENSMAUG00000011180) Mocs1 (ENSMAUG00000009643) Lrfn2 (ENSMAUG00000008478) Unc5cl (ENSMAUG00000006999) Tspo2 (ENSMAUG00000000293) Apobec2 (ENSMAUG00000011016) Nfya (ENSMAUG00000019965) Treml1 (ENSMAUG00000019166) Trem2 (ENSMAUG00000018601) ENSMAUG00000009298 Treml2 (ENSMAUG00000007921) Treml4 (ENSMAUG00000003024) Trem1 (ENSMAUG00000001065) Murinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000018285.b ENSGT00950000183069.b.b.a.b.c.a.b.a.b ENSGT00940000158714 ENSGT00690000101915 ENSGT00940000160996 ENSGT00940000160912 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00940000157697 ENSGT00940000157801 ENSGT00390000016567 ENSGT00940000156417 ENSGT00950000182815.b ENSGT00390000012980.b ENSGT00940000156616 ENSGT00390000006988 ENSGT00390000015714 ENSGT00470000042300 ENSGT00470000042297 ENSGT00940000153835.a.b.d ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00940000153835.a.b.c.a.a Mus ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000018285.b ENSGT00950000183069.b.b.a.b.c.a.b.a.b ENSGT00940000158714 ENSGT00690000101915 ENSGT00940000160996 ENSGT00940000160912 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00940000157697 ENSGT00940000157801 ENSGT00390000016567 ENSGT00940000156417 ENSGT00950000182815.b ENSGT00390000012980.b ENSGT00940000156616 ENSGT00390000006988 ENSGT00390000015714 ENSGT00470000042300 ENSGT00470000042297 ENSGT00940000153835.a.b.d ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00940000153835.a.b.c.a.a Mus_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000162163 ENSGT00390000018285.b ENSGT00940000158714 ENSGT00690000101915 ENSGT00940000160996 ENSGT00940000160912 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00940000157697 ENSGT00940000157801 ENSGT00390000016567 ENSGT00940000156417 ENSGT00950000182815.b ENSGT00390000012980.b ENSGT00940000156616 ENSGT00390000006988 ENSGT00390000015714 ENSGT00470000042300 ENSGT00470000042297 ENSGT00940000153835.a.b.d.i ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00940000153835.a.b.c.a.a Mus_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000018285.b ENSGT00950000183069.b.b.a.b.c.a.b.a.b ENSGT00940000158714 ENSGT00690000101915 ENSGT00940000160996 ENSGT00940000160912 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995.q.a ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00940000157697 ENSGT00940000157801 ENSGT00390000016567 ENSGT00940000156417 ENSGT00950000182815.b ENSGT00390000012980.b ENSGT00940000156616 ENSGT00390000006988 ENSGT00390000015714 ENSGT00470000042300 ENSGT00470000042297 ENSGT00940000153835.a.b.d.i ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00940000153835.a.b.c.a.a Mouse MODERN SPECIES 8 Pot1b (ENSMUSG00000024174) Vmn2r118 (ENSMUSG00000091504) St6gal2 (ENSMUSG00000024172) Slc5a7 (ENSMUSG00000023945) Sult1c1 (ENSMUSG00000023943) Sult1c2 (ENSMUSG00000023122) Sgo1 (ENSMUSG00000023940) Kat2b (ENSMUSG00000000708) Pp2d1 (ENSMUSG00000044957) Rab5a (ENSMUSG00000017831) Efhb (ENSMUSG00000023931) Kcnh8 (ENSMUSG00000035580) Satb1 (ENSMUSG00000023927) Tbc1d5 (ENSMUSG00000023923) Plcl2 (ENSMUSG00000038910) Dazl (ENSMUSG00000010592) #22 Rftn1 (ENSMUSG00000039316) Kif6 (ENSMUSG00000023999) Daam2 (ENSMUSG00000040260) Mocs1 (ENSMUSG00000064120) Lrfn2 (ENSMUSG00000040490) Unc5cl (ENSMUSG00000043592) Tspo2 (ENSMUSG00000023995) Apobec2 (ENSMUSG00000040694) Oard1 (ENSMUSG00000040771) Nfya (ENSMUSG00000023994) Treml1 (ENSMUSG00000023993) Trem2 (ENSMUSG00000023992) B430306N03Rik (ENSMUSG00000043740) Treml2 (ENSMUSG00000071068) Treml4 (ENSMUSG00000051682) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000153805.q.b.a.a.a.a.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000162163 ENSGT00390000018285.b ENSGT00940000158714 ENSGT00690000101915 ENSGT00940000160996 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995.q.a ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00940000157697 ENSGT00940000157801 ENSGT00390000016567 ENSGT00940000156417 ENSGT00950000182815.b ENSGT00390000012980.b ENSGT00940000156616 ENSGT00390000006988 ENSGT00390000015714 ENSGT00470000042300 ENSGT00470000042297 ENSGT00940000153835.a.b.d.i ENSGT00940000153835.a.a ENSGT00940000153835.a.b.c.a.a spretus MODERN SPECIES 8 Adgre4 (MGP_SPRETEiJ_G0022662) Pot1b (MGP_SPRETEiJ_G0022661) Vmn2r118 (MGP_SPRETEiJ_G0022660) St6gal2 (MGP_SPRETEiJ_G0022659) MGP_SPRETEiJ_G0022658 Slc5a7 (MGP_SPRETEiJ_G0022657) Sult1c2 (MGP_SPRETEiJ_G0022656) Sgo1 (MGP_SPRETEiJ_G0022655) Kat2b (MGP_SPRETEiJ_G0022654) Rab5a (MGP_SPRETEiJ_G0022653) Efhb (MGP_SPRETEiJ_G0022652) Kcnh8 (MGP_SPRETEiJ_G0022651) Satb1 (MGP_SPRETEiJ_G0022650) Tbc1d5 (MGP_SPRETEiJ_G0022649) Plcl2 (MGP_SPRETEiJ_G0022648) Dazl (MGP_SPRETEiJ_G0022647) #22 Rftn1 (MGP_SPRETEiJ_G0022646) Kif6 (MGP_SPRETEiJ_G0022645) Daam2 (MGP_SPRETEiJ_G0022644) Mocs1 (MGP_SPRETEiJ_G0022643) Lrfn2 (MGP_SPRETEiJ_G0022642) Unc5cl (MGP_SPRETEiJ_G0022641) Tspo2 (MGP_SPRETEiJ_G0022640) Apobec2 (MGP_SPRETEiJ_G0022639) Oard1 (MGP_SPRETEiJ_G0022638) Nfya 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(MGP_PahariEiJ_G0020717) Apobec2 (MGP_PahariEiJ_G0020716) Oard1 (MGP_PahariEiJ_G0020715) Nfya (MGP_PahariEiJ_G0020714) Treml1 (MGP_PahariEiJ_G0020713) Trem2 (MGP_PahariEiJ_G0020712) MGP_PahariEiJ_G0020711 Treml2 (MGP_PahariEiJ_G0020710) Treml4 (MGP_PahariEiJ_G0020709) Rat MODERN SPECIES 19 Sult1c3 (ENSRNOG00000011269) Slc5a7 (ENSRNOG00000010597) ENSRNOG00000062352 ENSRNOG00000068934 St6gal2 (ENSRNOG00000046515) Vom2r76 (ENSRNOG00000045587) Vom2r77 (ENSRNOG00000049443) Pot1b (ENSRNOG00000047439) Adgre4 (ENSRNOG00000050325) LOC691414 (ENSRNOG00000063425) LOC103690742 (ENSRNOG00000067240) LOC108351885 (ENSRNOG00000068779) LOC360998 (ENSRNOG00000062590) AABR07069611.1 (ENSRNOG00000061279) LOC102557419 (ENSRNOG00000048686) Dazl (ENSRNOG00000023474) #22 Rftn1 (ENSRNOG00000011321) Kif6 (ENSRNOG00000011453) Daam2 (ENSRNOG00000053945) Mocs1 (ENSRNOG00000011784) Lrfn2 (ENSRNOG00000011803) Unc5cl (ENSRNOG00000046601) Tspo2 (ENSRNOG00000050521) Apobec2 (ENSRNOG00000012303) Oard1 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ENSGT00940000156297.y ENSGT00940000157205 ENSGT00940000154280.lb ENSGT00940000156550 Guinea pig MODERN SPECIES NKIRAS1 (ENSCPOG00000038523) UBE2E1 (ENSCPOG00000002251) UBE2E2 (ENSCPOG00000034482) ZNF385D (ENSCPOG00000033668) ENSCPOG00000020230 SGO1 (ENSCPOG00000008318) ENSCPOG00000032533 ENSCPOG00000008310 RAB5A (ENSCPOG00000005322) EFHB (ENSCPOG00000001936) KCNH8 (ENSCPOG00000033526) SATB1 (ENSCPOG00000007101) TBC1D5 (ENSCPOG00000011184) PLCL2 (ENSCPOG00000008396) ENSCPOG00000003836 ENSCPOG00000007628 #22 RFTN1 (ENSCPOG00000007616) OXNAD1 (ENSCPOG00000026881) DPH3 (ENSCPOG00000003477) GALNT15 (ENSCPOG00000003476) ANKRD28 (ENSCPOG00000015199) ##8 BTD (ENSCPOG00000024569) PLEKHO2 (ENSCPOG00000030376) PIF1 (ENSCPOG00000008211) RBPMS2 (ENSCPOG00000007695) OAZ2 (ENSCPOG00000001960) ZNF609 (ENSCPOG00000001956) TRIP4 (ENSCPOG00000006483) PCLAF (ENSCPOG00000033197) CSNK1G1 (ENSCPOG00000000256) PPIB (ENSCPOG00000034437) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000155168.a.b 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ENSGT00390000013823.a.c ENSGT00950000182846.a.a.a.b ENSGT00390000003224.A ENSGT00940000156286.pb ENSGT00940000157660.f ENSGT00390000005529.a ENSGT00940000156297.v ENSGT00940000157205 ENSGT00940000154280 ENSGT00940000156550 Squirrel MODERN SPECIES 73 ENSSTOG00000011153 NKIRAS1 (ENSSTOG00000010538) UBE2E1 (ENSSTOG00000025799) ENSSTOG00000034552 ENSSTOG00000028898 ZNF385D (ENSSTOG00000005742) ENSSTOG00000031366 SGO1 (ENSSTOG00000003766) KAT2B (ENSSTOG00000002904) PP2D1 (ENSSTOG00000012388) RAB5A (ENSSTOG00000026229) KCNH8 (ENSSTOG00000023006) SATB1 (ENSSTOG00000010856) TBC1D5 (ENSSTOG00000028034) PLCL2 (ENSSTOG00000000749) ENSSTOG00000022122 #22 RFTN1 (ENSSTOG00000000072) OXNAD1 (ENSSTOG00000000071) ENSSTOG00000033525 GALNT15 (ENSSTOG00000021175) ANKRD28 (ENSSTOG00000003112) ##8 DNASE1L3 (ENSSTOG00000010015) FLNB (ENSSTOG00000009959) SLMAP (ENSSTOG00000025675) DENND6A (ENSSTOG00000007895) ENSSTOG00000019470 PDE12 (ENSSTOG00000007861) ENSSTOG00000022072 ENSSTOG00000034503 ASB14 (ENSSTOG00000013391) APPL1 (ENSSTOG00000015203) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 60 TBC1D5 (ENSUPAG00010015063) PLCL2 (ENSUPAG00010015041) ENSUPAG00010014999 #22 RFTN1 (ENSUPAG00010014993) OXNAD1 (ENSUPAG00010014977) ENSUPAG00010014962 GALNT15 (ENSUPAG00010014931) ANKRD28 (ENSUPAG00010014697) ##8 ENSUPAG00010014681 DNASE1L3 (ENSUPAG00010014663) ENSUPAG00010014651 FLNB (ENSUPAG00010014602) SLMAP (ENSUPAG00010014147) DENND6A (ENSUPAG00010014063) ENSUPAG00010014058 PDE12 (ENSUPAG00010014057) DNAH12 (ENSUPAG00010013944) ASB14 (ENSUPAG00010013934) Alpin marmot MODERN SPECIES 38 ZNF385D (ENSMMMG00000008042) ENSMMMG00000008108 KAT2B (ENSMMMG00000008121) PP2D1 (ENSMMMG00000008687) RAB5A (ENSMMMG00000008690) EFHB (ENSMMMG00000008698) KCNH8 (ENSMMMG00000008724) SATB1 (ENSMMMG00000008761) TBC1D5 (ENSMMMG00000009048) ENSMMMG00000009082 PLCL2 (ENSMMMG00000009088) ENSMMMG00000009099 ENSMMMG00000009107 #22 ENSMMMG00000009137 ENSMMMG00000009151 OXNAD1 (ENSMMMG00000009156) ENSMMMG00000009167 ENSMMMG00000009182 GALNT15 (ENSMMMG00000009190) ENSMMMG00000009230 ANKRD28 (ENSMMMG00000009244) ##8 ENSMMMG00000009351 DNASE1L3 (ENSMMMG00000009356) FLNB (ENSMMMG00000009402) SLMAP (ENSMMMG00000009479) DENND6A (ENSMMMG00000009892) ARF4 (ENSMMMG00000009997) PDE12 (ENSMMMG00000010035) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 7 ZNF385D (ENSSVLG00005023781) ENSSVLG00005023824 ENSSVLG00005023862 ENSSVLG00005023889 ENSSVLG00005023908 ENSSVLG00005023944 PP2D1 (ENSSVLG00005023998) RAB5A (ENSSVLG00005024015) EFHB (ENSSVLG00005024067) ENSSVLG00005024162 ENSSVLG00005024173 KCNH8 (ENSSVLG00005024188) SATB1 (ENSSVLG00005024270) TBC1D5 (ENSSVLG00005008563) PLCL2 (ENSSVLG00005008741) ENSSVLG00005008794 #22 ENSSVLG00005008951 ENSSVLG00005008982 RFTN1 (ENSSVLG00005009013) ENSSVLG00005009053 ENSSVLG00005009153 ENSSVLG00005009200 GALNT15 (ENSSVLG00005009222) ENSSVLG00005009250 ENSSVLG00005009267 ENSSVLG00005009285 ANKRD28 (ENSSVLG00005009365) ##8 ENSSVLG00005009644 ENSSVLG00005009695 ENSSVLG00005009728 DNASE1L3 (ENSSVLG00005009776) Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00910000144184.q.a.h ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00390000008096.E.b ENSGT00390000008096.E.a ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00390000008096.E.b ENSGT00390000008096.E.a ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 Mouse lemur MODERN SPECIES UBE2E1 (ENSMICG00000048911) UBE2E2 (ENSMICG00000049547) ZNF385D (ENSMICG00000049193) SGO1 (ENSMICG00000049414) KAT2B (ENSMICG00000049426) PP2D1 (ENSMICG00000048941) RAB5A (ENSMICG00000049130) EFHB (ENSMICG00000049240) ENSMICG00000049539 KCNH8 (ENSMICG00000049082) ENSMICG00000049466 ENSMICG00000049113 ENSMICG00000049072 TBC1D5 (ENSMICG00000049088) PLCL2 (ENSMICG00000049502) ENSMICG00000049389 #22 ENSMICG00000049245 RFTN1 (ENSMICG00000049449) OXNAD1 (ENSMICG00000049273) ENSMICG00000048866 DPH3 (ENSMICG00000049463) GALNT15 (ENSMICG00000049267) ENSMICG00000048918 ANKRD28 (ENSMICG00000048989) ##8 BTD (ENSMICG00000049329) HACL1 (ENSMICG00000049455) ENSMICG00000048874 COLQ (ENSMICG00000049255) EAF1 (ENSMICG00000048930) ENSMICG00000048914 ENSMICG00000049001 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 134 TBC1D5 (ENSPSMG00000008857) PLCL2 (ENSPSMG00000008999) ENSPSMG00000009049 #22 RFTN1 (ENSPSMG00000009111) OXNAD1 (ENSPSMG00000009164) DPH3 (ENSPSMG00000009196) GALNT15 (ENSPSMG00000009213) ANKRD28 (ENSPSMG00000009271) ##8 BTD (ENSPSMG00000009312) HACL1 (ENSPSMG00000009541) COLQ (ENSPSMG00000009807) EAF1 (ENSPSMG00000009851) METTL6 (ENSPSMG00000009871) SH3BP5 (ENSPSMG00000009896) CAPN7 (ENSPSMG00000009974) ENSPSMG00000009992 Bushbaby MODERN SPECIES 117 ENSOGAG00000031261 ZNF385D (ENSOGAG00000015958) ENSOGAG00000029509 SGO1 (ENSOGAG00000016786) KAT2B (ENSOGAG00000016781) PP2D1 (ENSOGAG00000007917) RAB5A (ENSOGAG00000003948) EFHB (ENSOGAG00000003944) ENSOGAG00000027211 KCNH8 (ENSOGAG00000000804) SATB1 (ENSOGAG00000015441) ENSOGAG00000025343 ENSOGAG00000030351 TBC1D5 (ENSOGAG00000016352) PLCL2 (ENSOGAG00000030914) ENSOGAG00000006983 #22 RFTN1 (ENSOGAG00000014420) OXNAD1 (ENSOGAG00000014419) DPH3 (ENSOGAG00000034296) GALNT15 (ENSOGAG00000014413) ANKRD28 (ENSOGAG00000013981) ##8 BTD (ENSOGAG00000013977) HACL1 (ENSOGAG00000013969) COLQ (ENSOGAG00000013967) EAF1 (ENSOGAG00000013964) METTL6 (ENSOGAG00000013962) SH3BP5 (ENSOGAG00000013959) CAPN7 (ENSOGAG00000013951) ENSOGAG00000032781 COL6A5 (ENSOGAG00000028058) COL6A6 (ENSOGAG00000007814) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00910000144184.q.a.h ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00910000144184.q.a.h ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 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ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.a.a.a ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00390000007159 Gorilla MODERN SPECIES 16 NKIRAS1 (ENSGGOG00000013354) UBE2E1 (ENSGGOG00000008393) UBE2E2 (ENSGGOG00000040750) ZNF385D (ENSGGOG00000001637) SGO1 (ENSGGOG00000006380) KAT2B (ENSGGOG00000016696) PP2D1 (ENSGGOG00000012034) RAB5A (ENSGGOG00000015981) EFHB (ENSGGOG00000013587) KCNH8 (ENSGGOG00000028470) SATB1 (ENSGGOG00000001779) ENSGGOG00000028241 ENSGGOG00000024653 TBC1D5 (ENSGGOG00000016312) PLCL2 (ENSGGOG00000016029) DAZL (ENSGGOG00000023632) #22 ENSGGOG00000040632 RFTN1 (ENSGGOG00000008885) OXNAD1 (ENSGGOG00000006174) DPH3 (ENSGGOG00000043523) GALNT15 (ENSGGOG00000009285) ANKRD28 (ENSGGOG00000009548) ##8 BTD (ENSGGOG00000013932) HACL1 (ENSGGOG00000010802) COLQ (ENSGGOG00000004457) EAF1 (ENSGGOG00000004453) METTL6 (ENSGGOG00000024436) ENSGGOG00000023889 SH3BP5 (ENSGGOG00000001667) CAPN7 (ENSGGOG00000025671) RBSN (ENSGGOG00000012784) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156415 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ENSMMUG00000031489 ENSMMUG00000002827 ENSMMUG00000065285 COL6A5 (ENSMMUG00000020377) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000012078.b.d ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b.g #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00910000147226 ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000162990 Olive baboon MODERN SPECIES 11 ENSPANG00000044236 ENSPANG00000045561 SGO1 (ENSPANG00000005201) KAT2B (ENSPANG00000015053) PP2D1 (ENSPANG00000017678) RAB5A (ENSPANG00000001328) EFHB (ENSPANG00000002796) KCNH8 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ENSGT00530000063480.b.g #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00910000147226 ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000164180 Sooty mangabey MODERN SPECIES 538 UBE2E2 (ENSCATG00000040534) ENSCATG00000020620 ZNF385D (ENSCATG00000033080) SGO1 (ENSCATG00000031797) KAT2B (ENSCATG00000033089) PP2D1 (ENSCATG00000030080) ENSCATG00000033588 EFHB (ENSCATG00000034471) KCNH8 (ENSCATG00000031386) ENSCATG00000040272 SATB1 (ENSCATG00000040637) ENSCATG00000033401 ENSCATG00000033349 TBC1D5 (ENSCATG00000044866) PLCL2 (ENSCATG00000028725) DAZL (ENSCATG00000009078) #22 RFTN1 (ENSCATG00000040094) ENSCATG00000022854 ENSCATG00000033560 DPH3 (ENSCATG00000024833) ENSCATG00000031070 GALNT15 (ENSCATG00000037609) ANKRD28 (ENSCATG00000031374) ##8 BTD (ENSCATG00000035945) HACL1 (ENSCATG00000039224) COLQ (ENSCATG00000034663) EAF1 (ENSCATG00000025927) METTL6 (ENSCATG00000038487) SH3BP5 (ENSCATG00000033553) CAPN7 (ENSCATG00000040761) ENSCATG00000035859 Drill MODERN SPECIES 695 ENSMLEG00000042274 SATB1 (ENSMLEG00000036859) ENSMLEG00000014893 TBC1D5 (ENSMLEG00000042528) PLCL2 (ENSMLEG00000000560) DAZL (ENSMLEG00000038997) #22 RFTN1 (ENSMLEG00000034985) ENSMLEG00000042876 OXNAD1 (ENSMLEG00000035297) DPH3 (ENSMLEG00000031053) ENSMLEG00000021537 GALNT15 (ENSMLEG00000038498) ANKRD28 (ENSMLEG00000032794) ##8 BTD (ENSMLEG00000013550) HACL1 (ENSMLEG00000037023) COLQ (ENSMLEG00000040921) EAF1 (ENSMLEG00000027766) METTL6 (ENSMLEG00000036079) SH3BP5 (ENSMLEG00000032953) CAPN7 (ENSMLEG00000022967) ENSMLEG00000029398 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 272 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b.g #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00910000147226 ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 21 DAZL (ENSRBIG00000039636) #22 RFTN1 (ENSRBIG00000031445) OXNAD1 (ENSRBIG00000040950) DPH3 (ENSRBIG00000039145) GALNT15 (ENSRBIG00000041660) ANKRD28 (ENSRBIG00000036586) ##8 ENSRBIG00000040105 BTD (ENSRBIG00000044461) HACL1 (ENSRBIG00000000662) EAF1 (ENSRBIG00000039147) METTL6 (ENSRBIG00000044482) SH3BP5 (ENSRBIG00000004842) CAPN7 (ENSRBIG00000031389) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2009 SATB1 (ENSRROG00000040418) ENSRROG00000034404 ENSRROG00000039333 TBC1D5 (ENSRROG00000015637) PLCL2 (ENSRROG00000042773) DAZL (ENSRROG00000036493) #22 RFTN1 (ENSRROG00000031054) ENSRROG00000006436 OXNAD1 (ENSRROG00000034825) DPH3 (ENSRROG00000024382) GALNT15 (ENSRROG00000038018) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b.h #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b.h #22 Cercopithecinae DUPLICATION Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b.h.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b.h.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b.h.a #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b.h.a #22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 174 ENSMFAG00000061240 #22 ENSMFAG00000055594 ENSMFAG00000062404 ENSMFAG00000059046 ENSMFAG00000057622 ENSMFAG00000054407 #22 ENSMFAG00000054020 ENSMFAG00000048100 ENSMFAG00000056918 ENSMFAG00000059356 ENSMFAG00000048008 ENSMFAG00000065739 ENSMFAG00000052765 XKR3 (ENSMFAG00000048309) ENSMFAG00000065658 ENSMFAG00000049576 ENSMFAG00000051695 RPS4Y2 (ENSMFAG00000048442) EIF1AY (ENSMFAG00000052371) KDM5D (ENSMFAG00000063076) ENSMFAG00000055347 Rhesus MODERN SPECIES 328 ENSMMUG00000045289 #22 ENSMMUG00000057875 ENSMMUG00000049217 ENSMMUG00000038984 ENSMMUG00000041274 ENSMMUG00000041692 #22 ENSMMUG00000050111 CDY (ENSMMUG00000054832) ENSMMUG00000042062 ENSMMUG00000064248 ENSMMUG00000049379 XKR3 (ENSMMUG00000039089) ENSMMUG00000056138 ENSMMUG00000061536 ENSMMUG00000039261 RPS4Y2 (ENSMMUG00000038824) ENSMMUG00000059478 EIF1AY (ENSMMUG00000043715) ENSMMUG00000057579 KDM5D (ENSMMUG00000045017) CYorf15A (ENSMMUG00000049104) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b.h.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b.h.b #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b.h.b #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b.h.b #22 Rhesus MODERN SPECIES 328 RPS4Y2 (ENSMMUG00000038824) ENSMMUG00000039261 ENSMMUG00000061536 ENSMMUG00000056138 XKR3 (ENSMMUG00000039089) ENSMMUG00000049379 ENSMMUG00000064248 ENSMMUG00000042062 CDY (ENSMMUG00000054832) ENSMMUG00000050111 ENSMMUG00000041692 #22 ENSMMUG00000041274 ENSMMUG00000038984 ENSMMUG00000049217 ENSMMUG00000057875 ENSMMUG00000045289 #22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 174 ENSMFAG00000049576 ENSMFAG00000065658 XKR3 (ENSMFAG00000048309) ENSMFAG00000052765 ENSMFAG00000065739 ENSMFAG00000048008 ENSMFAG00000059356 ENSMFAG00000056918 ENSMFAG00000048100 ENSMFAG00000054020 ENSMFAG00000054407 #22 ENSMFAG00000057622 ENSMFAG00000059046 ENSMFAG00000062404 ENSMFAG00000055594 ENSMFAG00000061240 #22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 173 ENSCSAG00000017742 #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.b.h #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.s.a.a ENSGT00390000001805 ENSGT00400000022103.a ENSGT00940000157533 ENSGT00390000018605 ENSGT01050000244939.a.a.a ENSGT00530000063853.a.a.b ENSGT00940000158071 ENSGT00940000157289.a ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.b.b.b ENSGT00910000146968 ENSGT00940000169445 ENSGT00940000163747 ENSGT00390000014167 ENSGT00550000076325 ENSGT00530000063480.b.h #22 ENSGT00940000155106 ENSGT00940000155105 ENSGT00390000008360 ENSGT00940000154543.b ENSGT00940000155562 ENSGT00390000004735.B ENSGT00390000009209 ENSGT00940000157354 ENSGT00390000011804 ENSGT00940000154150 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ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1028 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 Armadillo MODERN SPECIES 2551 PLCL2 (ENSDNOG00000048022) ENSDNOG00000044775 ENSDNOG00000019085 #22 RFTN1 (ENSDNOG00000032015) ENSDNOG00000039709 OXNAD1 (ENSDNOG00000000768) DPH3 (ENSDNOG00000012030) Sloth MODERN SPECIES 138 ENSCHOG00000005264 #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00910000144184.q.b ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 Tenrec MODERN SPECIES 8906 ENSETEG00000004434 #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.b ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 Elephant MODERN SPECIES 348 RPL15 (ENSLAFG00000004155) NKIRAS1 (ENSLAFG00000004153) UBE2E1 (ENSLAFG00000004150) UBE2E2 (ENSLAFG00000010500) SGO1 (ENSLAFG00000032470) KAT2B (ENSLAFG00000006300) PP2D1 (ENSLAFG00000008322) RAB5A (ENSLAFG00000008321) EFHB (ENSLAFG00000008317) ENSLAFG00000028706 KCNH8 (ENSLAFG00000000251) SATB1 (ENSLAFG00000009015) ENSLAFG00000028726 ENSLAFG00000005895 PLCL2 (ENSLAFG00000015491) ENSLAFG00000009132 #22 ENSLAFG00000009129 OXNAD1 (ENSLAFG00000009127) ENSLAFG00000025650 GALNT15 (ENSLAFG00000018400) Hyrax MODERN SPECIES 9298 ENSPCAG00000016182 #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985.nb.a ENSGT00940000155985.ob ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 ENSGT00940000164180 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985.nb.a ENSGT00940000155985.ob ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.h ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a.b ENSGT00390000017724.a.a.a ENSGT00940000156679 ENSGT00390000018500.b ENSGT00940000155892 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985.nb.a ENSGT00940000155985.ob ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.h ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00390000017724.a.a.a 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ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.r ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00390000009313.j ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.r ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a Aves ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.r ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.r ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b 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ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 Golden eagle MODERN SPECIES 19 THRB (ENSACCG00020012126) NR1D2 (ENSACCG00020012176) RPL15 (ENSACCG00020012212) NKIRAS1 (ENSACCG00020012236) UBE2E2 (ENSACCG00020012314) ZNF385D (ENSACCG00020012382) ENSACCG00020012400 KAT2B (ENSACCG00020012524) PP2D1 (ENSACCG00020012744) RAB5A (ENSACCG00020012757) ENSACCG00020012772 KCNH8 (ENSACCG00020012790) ENSACCG00020012827 TBC1D5 (ENSACCG00020012882) PLCL2 (ENSACCG00020012951) ENSACCG00020012975 #22 RFTN1 (ENSACCG00020013002) OXNAD1 (ENSACCG00020013025) DPH3 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ENSGT00940000157121.b ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156809.b ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.r ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121.b ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 Common canary MODERN SPECIES 5 THRB (ENSSCAG00000015306) NR1D2 (ENSSCAG00000015303) RPL15 (ENSSCAG00000015297) NKIRAS1 (ENSSCAG00000015293) UBE2E1 (ENSSCAG00000015288) UBE2E2 (ENSSCAG00000015285) ZNF385D (ENSSCAG00000015281) SGO1 (ENSSCAG00000015278) KAT2B (ENSSCAG00000015226) RAB5A (ENSSCAG00000015213) ENSSCAG00000015212 KCNH8 (ENSSCAG00000015206) ENSSCAG00000015196 TBC1D5 (ENSSCAG00000015186) PLCL2 (ENSSCAG00000015180) ENSSCAG00000015174 #22 RFTN1 (ENSSCAG00000015166) OXNAD1 (ENSSCAG00000015162) DPH3 (ENSSCAG00000015155) GALNT15 (ENSSCAG00000015152) ANKRD28 (ENSSCAG00000015148) ##8 BTD (ENSSCAG00000015144) HACL1 (ENSSCAG00000015140) PLEKHA8 (ENSSCAG00000015137) FKBP14 (ENSSCAG00000015135) SCRN1 (ENSSCAG00000015131) WIPF3 (ENSSCAG00000015128) ENSSCAG00000015122 CHN2 (ENSSCAG00000015120) ENSSCAG00000015114 CREB5 (ENSSCAG00000015109) Zebra finch MODERN SPECIES 12 RARB (ENSTGUG00000003374) THRB (ENSTGUG00000018874) NR1D2 (ENSTGUG00000003335) RPL15 (ENSTGUG00000025989) NKIRAS1 (ENSTGUG00000026551) UBE2E1 (ENSTGUG00000003303) ENSTGUG00000003279 SGO1 (ENSTGUG00000003277) KAT2B (ENSTGUG00000003246) RAB5A (ENSTGUG00000003236) EFHB (ENSTGUG00000003223) KCNH8 (ENSTGUG00000003211) ENSTGUG00000003198 TBC1D5 (ENSTGUG00000003159) PLCL2 (ENSTGUG00000003154) ENSTGUG00000003145 #22 RFTN1 (ENSTGUG00000003139) OXNAD1 (ENSTGUG00000003132) GALNT15 (ENSTGUG00000003115) ANKRD28 (ENSTGUG00000003060) ##8 BTD (ENSTGUG00000023167) HACL1 (ENSTGUG00000003040) COLQ (ENSTGUG00000003015) PLEKHA8 (ENSTGUG00000002993) FKBP14 (ENSTGUG00000029292) SCRN1 (ENSTGUG00000002975) WIPF3 (ENSTGUG00000002969) ENSTGUG00000026485 CHN2 (ENSTGUG00000026687) TRIL (ENSTGUG00000025309) CREB5 (ENSTGUG00000002959) Medium ground finch MODERN SPECIES 36 SGO1 (ENSGFOG00000006618) KAT2B (ENSGFOG00000006661) RAB5A (ENSGFOG00000007671) ENSGFOG00000007686 KCNH8 (ENSGFOG00000007725) ENSGFOG00000007747 TBC1D5 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ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156809.b ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.r ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 Turkey MODERN SPECIES 26 ENSMGAG00000019537 CHN2 (ENSMGAG00000010748) ENSMGAG00000010774 ENSMGAG00000010766 FKBP14 (ENSMGAG00000010782) ENSMGAG00000010801 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ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288.i ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a Emydidae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000156809.b ENSGT00940000155168.a.b ENSGT00910000144184.q.b ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00390000009313.j ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288.i ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a painted turtle MODERN SPECIES 7 NKIRAS1 (ENSCPBG00000022583) UBE2E1 (ENSCPBG00000022581) UBE2E2 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ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT01080000259642 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00390000009313.h.b ENSGT00940000160808 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(ENSACAG00000007864) ENSACAG00000037902 ENSACAG00000039364 PLCL2 (ENSACAG00000007836) ENSACAG00000007822 #22 RFTN1 (ENSACAG00000007784) OXNAD1 (ENSACAG00000007757) DPH3 (ENSACAG00000007752) ENSACAG00000007746 GALNT15 (ENSACAG00000007710) ANKRD28 (ENSACAG00000002496) ##8 BTD (ENSACAG00000002449) HACL1 (ENSACAG00000002368) COLQ (ENSACAG00000002275) PLEKHA8 (ENSACAG00000000988) FKBP14 (ENSACAG00000000953) ENSACAG00000041098 SCRN1 (ENSACAG00000000877) WIPF3 (ENSACAG00000000853) ENSACAG00000003118 Laterata ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00910000144184.q.a ENSGT00940000159705 ENSGT00940000155611.s ENSGT00940000156415 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000007225 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C.p ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 Argentine black and white tegu DUPLICATION Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 5 ENSSMRG00000011454 UBE2E2 (ENSSMRG00000011494) ENSSMRG00000011496 ZNF385D (ENSSMRG00000011619) SGO1 (ENSSMRG00000011637) KAT2B (ENSSMRG00000011638) PP2D1 (ENSSMRG00000011639) RAB5A (ENSSMRG00000011640) EFHB (ENSSMRG00000011641) ENSSMRG00000011642 KCNH8 (ENSSMRG00000011744) ENSSMRG00000011745 ENSSMRG00000011767 TBC1D5 (ENSSMRG00000011861) PLCL2 (ENSSMRG00000000014) ENSSMRG00000000066 #22 RFTN1 (ENSSMRG00000000291) OXNAD1 (ENSSMRG00000000328) DPH3 (ENSSMRG00000000343) ENSSMRG00000000373 ANKRD28 (ENSSMRG00000000389) ##8 BTD (ENSSMRG00000002412) HACL1 (ENSSMRG00000002413) COLQ (ENSSMRG00000002517) PLEKHA8 (ENSSMRG00000002525) FKBP14 (ENSSMRG00000002542) SCRN1 (ENSSMRG00000002549) WIPF3 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ENSSPUG00000002495 COLQ (ENSSPUG00000002500) PLEKHA8 (ENSSPUG00000002533) ENSSPUG00000002554 SCRN1 (ENSSPUG00000002570) WIPF3 (ENSSPUG00000002603) PRR15 (ENSSPUG00000002614) CHN2 (ENSSPUG00000002626) Coelacanth MODERN SPECIES 1051 ENSLACG00000002895 #22 ENSLACG00000006795 OXNAD1 (ENSLACG00000008261) ENSLACG00000009282 GALNT15 (ENSLACG00000009544) ANKRD28 (ENSLACG00000012544) ##8 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159705 ENSGT00940000156415 ENSGT00940000165358 ENSGT00940000165550.a.b ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.b ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b ENSGT00390000004280 ENSGT00390000009313 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000182908.C ##8 ENSGT00390000013823.a ENSGT00940000156802 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 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kat2b (ENSPKIG00000009612) rab5ab (ENSPKIG00000009578) KCNH8 (ENSPKIG00000009502) ENSPKIG00000009394 ENSPKIG00000009338 tbc1d5 (ENSPKIG00000009255) PLCL2 (ENSPKIG00000009187) ENSPKIG00000009153 #22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 190 ENSGT00940000160242.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.a ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00390000004280 ENSGT00940000160808 ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000154957.B ENSGT00940000157167 ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000156475.f ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000155880.f ENSGT00940000155957.b ENSGT01030000234992 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 172 ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154337.b ENSGT00940000168259 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.a ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00390000004280 ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000154957.B ENSGT00940000157167 ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000156475.f ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000155880.f ENSGT00940000155957.b ENSGT01030000234992 ENSGT00950000182892.a.a.b.e ENSGT00940000157883.a.b.f ENSGT00390000003271 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 217 ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154337.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.a ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00390000004280 ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000154957.B ENSGT00940000157167 ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000155880.f ENSGT00940000155957.b ENSGT01030000234992 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000157315.kc ENSGT00940000159854 ENSGT00950000183025.b.a.ab Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 19 nkain1 (ENSDCDG00000027531) pum1 (ENSDCDG00000026845) SDC3 (ENSDCDG00000026799) matn1 (ENSDCDG00000026793) yrk 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(ENSDCDG00000020424) ENSDCDG00000020341 #22 oxnad1 (ENSDCDG00000020334) ENSDCDG00000020333 ccdc126 (ENSDCDG00000020327) ENSDCDG00000020324 ENSDCDG00000020266 ENSDCDG00000020249 ENSDCDG00000020247 nfe2l3 (ENSDCDG00000020246) cbx3a (ENSDCDG00000020241) snx10a (ENSDCDG00000020066) hoxa1a (ENSDCDG00000020061) ENSDCDG00000020059 hoxa1a (ENSDCDG00000020057) ENSDCDG00000020055 evx1 (ENSDCDG00000020054) Atlantic herring MODERN SPECIES 10 ENSCHAG00000014614 ENSCHAG00000014620 ENSCHAG00000014624 dync1li1 (ENSCHAG00000014672) CPNE4 (ENSCHAG00000014978) mrpl3 (ENSCHAG00000015559) ptpn23b (ENSCHAG00000015627) cspg5b (ENSCHAG00000015662) smarcc1b (ENSCHAG00000015712) ENSCHAG00000015832 kat2b (ENSCHAG00000015861) rab5aa (ENSCHAG00000016078) KCNH8 (ENSCHAG00000016128) tbc1d5 (ENSCHAG00000016337) ENSCHAG00000016939 dazl (ENSCHAG00000016954) #22 ENSCHAG00000016972 oxnad1 (ENSCHAG00000017000) ENSCHAG00000017009 ENSCHAG00000017052 polr1h (ENSCHAG00000017073) ddx39b (ENSCHAG00000017091) mgat1b (ENSCHAG00000017409) gtf2h4 (ENSCHAG00000017497) SH3BP5L (ENSCHAG00000017638) ENSCHAG00000017687 tnfa (ENSCHAG00000019362) atat1 (ENSCHAG00000019370) ENSCHAG00000019398 bag6l (ENSCHAG00000019410) tk1 (ENSCHAG00000019543) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C.b ENSGT00940000157121 ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00390000004280 ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000154957.B ENSGT00940000157167 ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000156475.f ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000155880.f ENSGT00940000155957.b ENSGT00390000003271 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154337.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000157121 ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00390000004280 ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000154957.B ENSGT00940000157167 ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000156475.f ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000155880.f ENSGT00940000155957.b ENSGT00390000003271 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154337.a.b ENSGT00940000154337.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000157121 ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00390000004280 ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000154957.B ENSGT00940000157167 ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000156475.f ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000155880.f ENSGT00940000155957.b ENSGT00390000003271 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k Characoidei ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000157121 ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00390000004280 ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000154957.B ENSGT00940000157167 ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000156475.f ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000155880.f ENSGT00940000155957.b ENSGT00390000003271 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k Red-bellied piranha MODERN SPECIES 926 tbc1d5 (ENSPNAG00000012701) dazl (ENSPNAG00000012690) #22 RFTN1 (ENSPNAG00000012657) oxnad1 (ENSPNAG00000012606) Mexicana tetra MODERN SPECIES 49 tbc1d5 (ENSAMXG00000007142) dazl (ENSAMXG00000035291) #22 RFTN1 (ENSAMXG00000007317) oxnad1 (ENSAMXG00000007345) GPNMB (ENSAMXG00000007393) igf2bp3 (ENSAMXG00000007453) ENSAMXG00000036147 tra2a (ENSAMXG00000005553) ccdc126 (ENSAMXG00000039633) fam221a (ENSAMXG00000005524) ENSAMXG00000042268 hoxa1a (ENSAMXG00000005258) ENSAMXG00000043544 HOXA4 (ENSAMXG00000036478) hoxa3a (ENSAMXG00000029041) hoxa5a (ENSAMXG00000037678) ENSAMXG00000005199 Electric eel MODERN SPECIES 808 dazl (ENSEEEG00000008546) #22 ENSEEEG00000008544 oxnad1 (ENSEEEG00000008542) GPNMB (ENSEEEG00000008540) igf2bp3 (ENSEEEG00000008395) tra2a (ENSEEEG00000008388) ccdc126 (ENSEEEG00000008387) fam221a (ENSEEEG00000008384) npy (ENSEEEG00000008383) ENSEEEG00000008264 ENSEEEG00000008246 Channel catfish MODERN SPECIES 3 ubap2l (ENSIPUG00000007128) ENSIPUG00000007044 PBXIP1 (ENSIPUG00000006990) s100a11 (ENSIPUG00000006945) ENSIPUG00000006924 s100s (ENSIPUG00000006911) pygo2 (ENSIPUG00000006900) cgnb (ENSIPUG00000006734) nudc (ENSIPUG00000006691) tbxta (ENSIPUG00000006660) ARID1A (ENSIPUG00000006578) kat2b (ENSIPUG00000006521) ENSIPUG00000006495 ENSIPUG00000006482 tbc1d5 (ENSIPUG00000006394) dazl (ENSIPUG00000006376) #22 ENSIPUG00000006330 ENSIPUG00000006286 osbpl3a (ENSIPUG00000006191) npy (ENSIPUG00000006156) ccdc126 (ENSIPUG00000006135) igf2bp3 (ENSIPUG00000006070) oxnad1 (ENSIPUG00000005994) ENSIPUG00000005966 chd4 (ENSIPUG00000005694) Cdc42 (ENSIPUG00000005587) ENO2 (ENSIPUG00000005498) daxx (ENSIPUG00000005459) rxrba (ENSIPUG00000005324) col11a2 (ENSIPUG00000005088) sdha (ENSIPUG00000005032) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000157071 ENSGT00940000159356.a.b.b ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.i 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(ENSSTUG00000019686) ENSSTUG00000019651 GSDME (ENSSTUG00000019636) osbpl3a (ENSSTUG00000019417) ENSSTUG00000019376 TRIL (ENSSTUG00000019352) CREB5 (ENSSTUG00000019318) Atlantic salmon MODERN SPECIES 19 ENSSSAG00000046830 ENSSSAG00000068152 ubql4 (ENSSSAG00000046723) ENSSSAG00000046697 ENSSSAG00000046690 ENSSSAG00000046678 kat2b (ENSSSAG00000046492) RAB5A (ENSSSAG00000110045) ENSSSAG00000045793 satb1a (ENSSSAG00000114957) ENSSSAG00000088469 tbc1d5 (ENSSSAG00000040193) ENSSSAG00000040073 ENSSSAG00000096809 ENSSSAG00000088140 dazl (ENSSSAG00000116219) #22 ENSSSAG00000039761 ENSSSAG00000118045 oxnad1 (ENSSSAG00000039654) ENSSSAG00000039484 GALNT15 (ENSSSAG00000039629) igf2bp3 (ENSSSAG00000016115) tra2a (ENSSSAG00000015847) ENSSSAG00000108185 ccdc126 (ENSSSAG00000015834) ENSSSAG00000108649 ENSSSAG00000121146 fam221a (ENSSSAG00000114309) npy (ENSSSAG00000084788) ENSSSAG00000118492 ENSSSAG00000114219 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.a.f.b 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ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000160808 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.a ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x.f ENSGT00390000004280 ENSGT00760000119737 ENSGT00940000160267 ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00390000003271 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000157315 ENSGT00940000155029.c.a.f ENSGT00940000159522 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159894 Javanese ricefish MODERN SPECIES 2 sdhaf3 (ENSOJAG00000008283) ENSOJAG00000008255 si:ch211-165i18.2 (ENSOJAG00000008245) ENSOJAG00000007010 npy (ENSOJAG00000006875) ccdc126 (ENSOJAG00000006866) tra2a (ENSOJAG00000006860) igf2bp3 (ENSOJAG00000006832) GPNMB (ENSOJAG00000006814) ENSOJAG00000006792 KCNH8 (ENSOJAG00000006704) ENSOJAG00000006657 ENSOJAG00000006651 tbc1d5 (ENSOJAG00000005575) ENSOJAG00000004895 dazl (ENSOJAG00000004441) #22 ENSOJAG00000004362 ENSOJAG00000004347 oxnad1 (ENSOJAG00000004338) 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Siamese fighting fish MODERN SPECIES 2 dlx6a (ENSBSLG00000003257) dlx5a (ENSBSLG00000003256) ago2 (ENSBSLG00000002868) ENSBSLG00000002388 npy (ENSBSLG00000016166) ccdc126 (ENSBSLG00000016161) tra2a (ENSBSLG00000016152) igf2bp3 (ENSBSLG00000014618) GPNMB (ENSBSLG00000014590) ENSBSLG00000014584 ENSBSLG00000014563 satb1a (ENSBSLG00000014540) tbc1d5 (ENSBSLG00000012727) ENSBSLG00000012668 DNAH3 (ENSBSLG00000012261) dazl (ENSBSLG00000012205) #22 ENSBSLG00000012189 oxnad1 (ENSBSLG00000012170) ENSBSLG00000012157 ENSBSLG00000012133 FKBP14 (ENSBSLG00000012125) ENSBSLG00000012090 ENSBSLG00000012060 nfe2l3 (ENSBSLG00000012036) cbx3a (ENSBSLG00000011919) snx10a (ENSBSLG00000011898) hoxa1a (ENSBSLG00000011877) ENSBSLG00000011861 hoxa3a (ENSBSLG00000011839) HOXA4 (ENSBSLG00000011815) hoxa5a (ENSBSLG00000011797) Climbing perch MODERN SPECIES 2 dlx5a (ENSATEG00000026247) ago2 (ENSATEG00000000529) ENSATEG00000000607 npy (ENSATEG00000000620) fam221a (ENSATEG00000000634) ccdc126 (ENSATEG00000000665) 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#22 ENSMAMG00000024330 ENSMAMG00000028333 oxnad1 (ENSMAMG00000026716) ENSMAMG00000008108 ENSMAMG00000008087 ENSMAMG00000027344 ENSMAMG00000008039 ENSMAMG00000008025 nfe2l3 (ENSMAMG00000008016) CBX3 (ENSMAMG00000008011) snx10a (ENSMAMG00000007992) HOXA1 (ENSMAMG00000007973) ENSMAMG00000007958 hoxa3a (ENSMAMG00000007941) HOXA4 (ENSMAMG00000007955) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159188 ENSGT00940000155239 ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475.f ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000157167 ENSGT00940000154957.B ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000160808 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000154959 ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00390000004280 ENSGT00760000119737 ENSGT00940000160267 ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000157248.c.b ENSGT01030000234992 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000157315 ENSGT00940000155029.c.a.f ENSGT00940000159522 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159894 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159188 ENSGT00940000155239 ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475.f ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000157167 ENSGT00940000154957.B ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000160808 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000154959 ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00390000004280 ENSGT00760000119737 ENSGT00940000160267 ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00390000003271 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000157315 ENSGT00940000155029.c.a.f ENSGT00940000159522 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159894 Seriola ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159188 ENSGT00940000155239 ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475.f ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000157167 ENSGT00940000154957.B ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000160808 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000154959 ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00390000004280 ENSGT00760000119737 ENSGT00940000160267 ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00390000003271 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000157315 ENSGT00940000155029.c.a.f ENSGT00940000159522 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159894 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3204 ENSSLDG00000005024 DNAH3 (ENSSLDG00000005261) dazl (ENSSLDG00000005485) #22 ENSSLDG00000005518 oxnad1 (ENSSLDG00000005533) ENSSLDG00000005548 ENSSLDG00000005567 FKBP14 (ENSSLDG00000005590) COLQ (ENSSLDG00000005618) ENSSLDG00000005643 ENSSLDG00000005659 nfe2l3 (ENSSLDG00000005672) cbx3a (ENSSLDG00000005680) snx10a (ENSSLDG00000005732) hoxa1a (ENSSLDG00000005844) ENSSLDG00000005939 hoxa3a (ENSSLDG00000006013) HOXA4 (ENSSLDG00000006027) Greater amberjack MODERN SPECIES 48 fam221a (ENSSDUG00000005642) ccdc126 (ENSSDUG00000005634) tra2a (ENSSDUG00000005610) igf2bp3 (ENSSDUG00000005535) GPNMB (ENSSDUG00000005497) ENSSDUG00000005485 ENSSDUG00000005464 satb1a (ENSSDUG00000005436) tbc1d5 (ENSSDUG00000005303) ENSSDUG00000005269 ENSSDUG00000005261 ENSSDUG00000005250 ENSSDUG00000005235 ENSSDUG00000005221 ENSSDUG00000005200 dazl (ENSSDUG00000005172) #22 ENSSDUG00000005158 oxnad1 (ENSSDUG00000005142) ENSSDUG00000005132 ENSSDUG00000005117 FKBP14 (ENSSDUG00000005096) ENSSDUG00000005062 ENSSDUG00000005049 ENSSDUG00000005032 nfe2l3 (ENSSDUG00000005020) cbx3a (ENSSDUG00000005004) snx10a (ENSSDUG00000004833) hoxa1a (ENSSDUG00000004791) ENSSDUG00000004775 hoxa3a (ENSSDUG00000004765) HOXA4 (ENSSDUG00000004757) Barramundi perch MODERN SPECIES 3 ENSLCAG00010017125 npy (ENSLCAG00010017108) fam221a (ENSLCAG00010017098) ENSLCAG00010017096 ccdc126 (ENSLCAG00010017095) tra2a (ENSLCAG00010017089) igf2bp3 (ENSLCAG00010017069) GPNMB (ENSLCAG00010017059) 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(ENSCSEG00000014321) hoxa5a (ENSCSEG00000014317) Turbot MODERN SPECIES 14 dlx5a (ENSSMAG00000014079) ago2 (ENSSMAG00000014089) ENSSMAG00000014160 npy (ENSSMAG00000014204) fam221a (ENSSMAG00000014220) ccdc126 (ENSSMAG00000014236) tra2a (ENSSMAG00000014242) igf2bp3 (ENSSMAG00000014262) GPNMB (ENSSMAG00000014341) ENSSMAG00000014358 ENSSMAG00000014391 satb1a (ENSSMAG00000014406) tbc1d5 (ENSSMAG00000014510) ENSSMAG00000014560 ENSSMAG00000036740 dazl (ENSSMAG00000014694) #22 ENSSMAG00000014721 oxnad1 (ENSSMAG00000014752) ENSSMAG00000014767 ENSSMAG00000014778 ENSSMAG00000014788 ENSSMAG00000014800 ENSSMAG00000014822 ENSSMAG00000014833 nfe2l3 (ENSSMAG00000014852) CBX3 (ENSSMAG00000014860) snx10a (ENSSMAG00000014876) ENSSMAG00000015127 HOXA1 (ENSSMAG00000015134) ENSSMAG00000015164 HOXA3 (ENSSMAG00000015176) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000159188 ENSGT00940000155239 ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475.f ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000157167 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ENSGT00940000160267 ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00390000003271 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000157315 ENSGT00940000155029.c.a.f ENSGT00940000159522 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159894 Fugu MODERN SPECIES 3 zbtb8b (ENSTRUG00000014848) FUCA1 (ENSTRUG00000025553) dlgap3 (ENSTRUG00000014901) gja4 (ENSTRUG00000019570) smim12 (ENSTRUG00000015020) pef1 (ENSTRUG00000015023) gjb9b (ENSTRUG00000015038) ENSTRUG00000015057 angpt2b (ENSTRUG00000015237) col9a2 (ENSTRUG00000015261) ENSTRUG00000019764 ADGRB2 (ENSTRUG00000028305) ptp4a2b (ENSTRUG00000015716) col8a2 (ENSTRUG00000024438) trappc3 (ENSTRUG00000015734) dazl (ENSTRUG00000015745) #22 oxnad1 (ENSTRUG00000015784) ENSTRUG00000020614 ENSTRUG00000015805 FKBP14 (ENSTRUG00000021578) ENSTRUG00000015831 ENSTRUG00000024909 rfrp (ENSTRUG00000015852) nfe2l3 (ENSTRUG00000015857) cbx3a (ENSTRUG00000015895) snx10a (ENSTRUG00000015910) hoxa1a (ENSTRUG00000015937) ENSTRUG00000015941 HOXA4 (ENSTRUG00000023173) hoxa3a (ENSTRUG00000022811) hoxa5a (ENSTRUG00000018252) Tetraodon MODERN SPECIES 15 ENSTNIG00000009225 dlgap3 (ENSTNIG00000009224) gja4 (ENSTNIG00000009223) pef1 (ENSTNIG00000009222) gjb9b (ENSTNIG00000009221) ENSTNIG00000009220 angpt2b (ENSTNIG00000009219) col9a2 (ENSTNIG00000009218) ENSTNIG00000009217 ENSTNIG00000000175 ENSTNIG00000009216 ENSTNIG00000001705 ptp4a2b (ENSTNIG00000001611) col8a2 (ENSTNIG00000009215) trappc3 (ENSTNIG00000009214) dazl (ENSTNIG00000001115) #22 ENSTNIG00000009213 oxnad1 (ENSTNIG00000009212) FKBP14 (ENSTNIG00000009211) ENSTNIG00000009210 nfe2l3 (ENSTNIG00000009209) cbx3a (ENSTNIG00000001200) snx10a (ENSTNIG00000009208) hoxa1a (ENSTNIG00000000977) ENSTNIG00000001753 hoxa3a (ENSTNIG00000001754) HOXA4 (ENSTNIG00000001755) hoxa5a (ENSTNIG00000001756) ENSTNIG00000001582 hoxa10b (ENSTNIG00000001766) hoxa11a (ENSTNIG00000001767) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159188 ENSGT00940000155239 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(ENSLBEG00000005629) ENSLBEG00000005694 DNAH3 (ENSLBEG00000005767) dazl (ENSLBEG00000006023) #22 ENSLBEG00000006086 oxnad1 (ENSLBEG00000006128) ENSLBEG00000006164 ENSLBEG00000006184 FKBP14 (ENSLBEG00000006207) ENSLBEG00000006241 ENSLBEG00000006274 ENSLBEG00000006286 nfe2l3 (ENSLBEG00000006302) cbx3a (ENSLBEG00000006320) snx10a (ENSLBEG00000006336) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159188 ENSGT00940000155239 ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475.f ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000157167 ENSGT00940000154957.B ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000160808 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000154959 ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00390000004280 ENSGT00760000119737 ENSGT00940000160267 ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00390000003271 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000157315 ENSGT00940000155029.c.a.f ENSGT00940000159522 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159894 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000159188 ENSGT00940000155239 ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475.f ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000157167 ENSGT00940000154957.B ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000160808 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000154959 ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00390000004280 ENSGT00760000119737 ENSGT00940000160267 ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000157248.c.b ENSGT01030000234992 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000157315 ENSGT00940000155029.c.a.f ENSGT00940000159522 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159894 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159188 ENSGT00940000155239 ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475.f ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000157167 ENSGT00940000154957.B ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000160808 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000154959 ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00390000004280 ENSGT00760000119737 ENSGT00940000160267 ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000157248.c.b ENSGT01030000234992 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000157315 ENSGT00940000155029.c.a.f ENSGT00940000159522 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159894 Pike perch MODERN SPECIES 41 dlx5a (ENSSLUG00000007147) ago2 (ENSSLUG00000002830) ENSSLUG00000002011 npy (ENSSLUG00000001901) fam221a (ENSSLUG00000001895) ccdc126 (ENSSLUG00000001888) tra2a (ENSSLUG00000001878) igf2bp3 (ENSSLUG00000001733) GPNMB (ENSSLUG00000001528) ENSSLUG00000001516 KCNH8 (ENSSLUG00000001500) satb1a (ENSSLUG00000014957) tbc1d5 (ENSSLUG00000014419) ENSSLUG00000014304 DNAH3 (ENSSLUG00000011601) dazl (ENSSLUG00000011304) #22 ENSSLUG00000011298 oxnad1 (ENSSLUG00000011292) 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ENSGT00940000157315 ENSGT00940000155029.c.a.f ENSGT00940000159522 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159894 Gilthead seabream MODERN SPECIES 17 ago2 (ENSSAUG00010013491) ENSSAUG00010019199 npy (ENSSAUG00010020936) fam221a (ENSSAUG00010020937) ccdc126 (ENSSAUG00010020938) tra2a (ENSSAUG00010020940) igf2bp3 (ENSSAUG00010020965) GPNMB (ENSSAUG00010022256) GALNT15 (ENSSAUG00010022257) ENSSAUG00010022259 ENSSAUG00010022260 satb1a (ENSSAUG00010022261) tbc1d5 (ENSSAUG00010022263) ENSSAUG00010022956 DNAH3 (ENSSAUG00010023021) dazl (ENSSAUG00010023098) #22 ENSSAUG00010023101 oxnad1 (ENSSAUG00010023102) ENSSAUG00010023103 ENSSAUG00010023104 FKBP14 (ENSSAUG00010023105) ENSSAUG00010023106 ENSSAUG00010023107 ENSSAUG00010023108 nfe2l3 (ENSSAUG00010023109) cbx3a (ENSSAUG00010023110) snx10a (ENSSAUG00010023111) hoxa1a (ENSSAUG00010023113) ENSSAUG00010023114 hoxa3a (ENSSAUG00010023115) HOXA4 (ENSSAUG00010023116) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159188 ENSGT00940000155239 ENSGT00940000155348.A ENSGT00940000156475.f ENSGT00770000120611.B ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00940000157167 ENSGT00940000154957.B ENSGT00950000183188.B ENSGT00940000160808 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C.b ENSGT00940000157121 ENSGT00940000155660.a ENSGT00940000154959 ENSGT00530000063480.b #22 ENSGT00530000063609.b.x ENSGT00390000004280 ENSGT00760000119737 ENSGT00940000160267 ENSGT00940000157858.j ENSGT00940000157248.c.b ENSGT00390000003271 ENSGT00950000182892.a.b.b ENSGT00940000153305 ENSGT00940000156007.k ENSGT00940000157315 ENSGT00940000155029.c.a.f ENSGT00940000159522 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159894 European seabass MODERN SPECIES 22 dlx5a (ENSDLAG00005034499) ago2 (ENSDLAG00005009789) ENSDLAG00005008554 npy (ENSDLAG00005008510) fam221a (ENSDLAG00005008493) ccdc126 (ENSDLAG00005033349) tra2a (ENSDLAG00005008478) igf2bp3 (ENSDLAG00005007961) GPNMB (ENSDLAG00005007926) ENSDLAG00005007909 ENSDLAG00005007626 satb1a (ENSDLAG00005031860) tbc1d5 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(ENSLOCG00000006139) Reedfish MODERN SPECIES 4 nkiras1 (ENSECRG00000018221) UBE2E1 (ENSECRG00000018245) ENSECRG00000018320 UBE2E2 (ENSECRG00000018668) ZNF385D (ENSECRG00000018686) ENSECRG00000018715 kat2b (ENSECRG00000018781) ddx21 (ENSECRG00000019058) PP2D1 (ENSECRG00000020433) rab5ab (ENSECRG00000020444) ENSECRG00000020467 KCNH8 (ENSECRG00000020514) satb1a (ENSECRG00000020534) tbc1d5 (ENSECRG00000020562) PLCL2 (ENSECRG00000020617) dazl (ENSECRG00000020678) #22 RFTN1 (ENSECRG00000020704) oxnad1 (ENSECRG00000020731) ENSECRG00000020745 GALNT15 (ENSECRG00000020760) ENSECRG00000020785 ANKRD28 (ENSECRG00000020828) ##8 btd (ENSECRG00000020919) hacl1 (ENSECRG00000020942) COLQ (ENSECRG00000020973) plekha8 (ENSECRG00000021010) fkbp14 (ENSECRG00000021041) SCRN1 (ENSECRG00000021054) WIPF3 (ENSECRG00000021065) ENSECRG00000021076 ENSECRG00000021118 Elephant shark MODERN SPECIES 1541 ENSCMIG00000018927 abitram (ENSCMIG00000018929) ctnnal1 (ENSCMIG00000018930) ENSCMIG00000018938 KAT2B 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ENSGT00940000166096 ENSGT00510000047481 ENSGT00390000003033 ENSGT00940000165242 ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000165788 ENSGT00940000156387 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 365 ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000157249 ENSGT00940000154453.a.b.a ENSGT00940000162639 ENSGT00940000159743 ENSGT00390000012547.b 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chromis MODERN SPECIES 2045 ENSAPOG00000007050 ##22 ENSAPOG00000007007 crygmxl1 (ENSAPOG00000006990) ENSAPOG00000006974 ENSAPOG00000006945 crygs3 (ENSAPOG00000006933) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00530000063970.f.eb.a.a.a.b.a ENSGT01060000248713 ENSGT00530000063970.f.eb.a.a.a.b.b.a.b.a ENSGT00640000091610 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000154443.e ENSGT00940000161679.b ENSGT00940000158367 ENSGT00940000171952.A ENSGT00390000002403 ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00940000165242.d ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00940000163494.a.b.a ENSGT00940000163148.a.b.a ENSGT00940000164501.a.a.a.a.a ENSGT00940000163149.a.a ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000163494.a.a.c.b.b ENSGT00940000163494.a.a.c.a.d ENSGT00940000165279.d ENSGT00950000182837.b.b.c.b ENSGT00940000156712.a ENSGT00940000155502 ENSGT00390000007055 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00940000159848 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00640000091610 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000154443.e ENSGT00940000161679.b ENSGT00940000158367 ENSGT00940000171952.A.c ENSGT00940000171952.A.d.b ENSGT00940000171952.A.d.a ENSGT00390000002403 ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00940000165242.d ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00940000163494.a.b.a ENSGT00940000163148.a.b.a ENSGT00940000164501.a.a.a.a.a ENSGT00940000163149.a.a ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000163494.a.a.c.b.b ENSGT00940000163494.a.a.c.a.d ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b Nile tilapia MODERN SPECIES 14 ENSONIG00000015306 ENSONIG00000028752 GPR180 (ENSONIG00000015303) ENSONIG00000015300 ENSONIG00000015293 SLC5A3 (ENSONIG00000035996) ENSONIG00000036064 ENSONIG00000015288 ENSONIG00000030818 ENSONIG00000033357 ENSONIG00000015285 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Siamese fighting fish MODERN SPECIES 50 SATB2 (ENSBSLG00000019430) ENSBSLG00000019403 ##22 ENSBSLG00000019209 ENSBSLG00000019086 ENSBSLG00000019035 ENSBSLG00000019018 ENSBSLG00000018986 ENSBSLG00000018966 ENSBSLG00000018955 ENSBSLG00000018941 ENSBSLG00000018925 ENSBSLG00000018794 ENSBSLG00000018503 ENSBSLG00000018495 Climbing perch MODERN SPECIES 11 ENSATEG00000019898 ENSATEG00000019815 ENSATEG00000019752 ENSATEG00000019703 ENSATEG00000019695 ENSATEG00000019666 ENSATEG00000019657 ENSATEG00000019608 ENSATEG00000028895 ENSATEG00000019582 ENSATEG00000028016 ENSATEG00000019553 ENSATEG00000019503 ENSATEG00000018899 ENSATEG00000018770 ENSATEG00000025932 ##22 ENSATEG00000026479 ENSATEG00000018700 ENSATEG00000027480 ENSATEG00000018674 ENSATEG00000018622 ENSATEG00000018608 ENSATEG00000018574 ENSATEG00000018561 ENSATEG00000026606 ENSATEG00000028515 ENSATEG00000018551 ENSATEG00000018546 ENSATEG00000018539 ENSATEG00000018513 ENSATEG00000018497 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155502 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ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT01050000244956.b.x ENSGT00940000164501.a.a.a ENSGT00940000163494.a.b.a ENSGT00940000163148.a.b.a ENSGT00940000163148.a.a ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000163494.a.a.c.a.b ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a Atlantic herring MODERN SPECIES 13 ENSCHAG00000023073 sugt1 (ENSCHAG00000023067) CNMD (ENSCHAG00000023062) PCDH8 (ENSCHAG00000023059) ENSCHAG00000023057 ENSCHAG00000023055 ENSCHAG00000023041 ENSCHAG00000023032 ENSCHAG00000023020 ENSCHAG00000023016 ENSCHAG00000023010 FGF14 (ENSCHAG00000022993) mettl21a (ENSCHAG00000022988) crygs1 (ENSCHAG00000022974) SATB2 (ENSCHAG00000022933) BOLL (ENSCHAG00000022917) ##22 MOB4 (ENSCHAG00000022903) hspd1 (ENSCHAG00000022870) ENSCHAG00000022857 crygm7 (ENSCHAG00000022845) ENSCHAG00000022833 ENSCHAG00000022819 ENSCHAG00000022727 ENSCHAG00000022676 sowahcb (ENSCHAG00000022662) septin10 (ENSCHAG00000021327) cep70 (ENSCHAG00000021175) ADARB1 (ENSCHAG00000021085) slx9 (ENSCHAG00000021057) ENSCHAG00000021035 ENSCHAG00000021028 Denticle herring MODERN SPECIES 15 ENSDCDG00000001872 ENSDCDG00000001871 ENSDCDG00000001868 lim2.5 (ENSDCDG00000001865) ENSDCDG00000001862 zgc:172122 (ENSDCDG00000001857) tpt1 (ENSDCDG00000001847) gtf2f2a (ENSDCDG00000001832) gpalpp1 (ENSDCDG00000001831) tra2b (ENSDCDG00000001824) igf2bp2b (ENSDCDG00000001651) tmem41ab (ENSDCDG00000001591) si:dkey-22o12.2 (ENSDCDG00000001584) vps8 (ENSDCDG00000001381) SATB2 (ENSDCDG00000001343) ENSDCDG00000001341 ##22 MOB4 (ENSDCDG00000001336) HSPD1 (ENSDCDG00000001331) ENSDCDG00000001326 ENSDCDG00000001325 crygmxl1 (ENSDCDG00000001315) ENSDCDG00000001311 ENSDCDG00000001296 ENSDCDG00000001276 ENSDCDG00000001270 SOWAHC (ENSDCDG00000001263) septin10 (ENSDCDG00000000991) cep70 (ENSDCDG00000000891) ORC2 (ENSDCDG00000000865) ENSDCDG00000000854 pfklb (ENSDCDG00000000691) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 612 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT01050000244956.b.w.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000002204 ENSGT00950000182905.a.b 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ENSGT00940000164501 ENSGT00940000163322.a.b.a.a ENSGT00940000163148 ENSGT00940000163322.a.a ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a ENSGT00940000156768 P. kingsleyae MODERN SPECIES 8 ENSPKIG00000000220 armc8 (ENSPKIG00000000262) dbr1 (ENSPKIG00000000310) rab5b (ENSPKIG00000000335) lcmt2 (ENSPKIG00000000360) crygs1 (ENSPKIG00000000390) tbccd1 (ENSPKIG00000000413) dnajb11 (ENSPKIG00000000436) satb2 (ENSPKIG00000000474) PLCL1 (ENSPKIG00000000508) BOLL (ENSPKIG00000000551) ##22 rftn2 (ENSPKIG00000000614) mob4 (ENSPKIG00000000644) hspe1 (ENSPKIG00000000682) hspd1 (ENSPKIG00000000702) coq10b (ENSPKIG00000000731) SF3B1 (ENSPKIG00000000784) ANKRD44 (ENSPKIG00000000886) ##8 pikfyve (ENSPKIG00000000993) si:dkey-69o16.5 (ENSPKIG00000001041) nhej1 (ENSPKIG00000001066) ENSPKIG00000001095 ENSPKIG00000001119 ENSPKIG00000001155 bin1b (ENSPKIG00000001205) ercc3 (ENSPKIG00000001319) Asian bonytongue MODERN SPECIES CREB1 (ENSSFOG00015011346) mettl21a (ENSSFOG00015023473) ccnyl1 (ENSSFOG00015023466) 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ENSGT00940000165788 ENSGT00940000156387 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160994 ENSGT00530000064199 ENSGT00390000010316 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000165788 ENSGT00940000156387 Amniota ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 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ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 315 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 Armadillo MODERN SPECIES 2552 PLCL1 (ENSDNOG00000030916) ENSDNOG00000000115 ENSDNOG00000035028 BOLL (ENSDNOG00000017076) ##22 MARS2 (ENSDNOG00000041522) RFTN2 (ENSDNOG00000001933) ENSDNOG00000041539 ENSDNOG00000008252 ENSDNOG00000013226 COQ10B (ENSDNOG00000031357) SF3B1 (ENSDNOG00000011754) ENSDNOG00000037521 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ENSETEG00000013582 ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163579 ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Elephant MODERN SPECIES 301 ENSLAFG00000009894 CLK1 (ENSLAFG00000009891) BZW1 (ENSLAFG00000009883) ENSLAFG00000026161 ENSLAFG00000028503 AOX1 (ENSLAFG00000007070) SGO2 (ENSLAFG00000028451) KCTD18 (ENSLAFG00000003281) SPATS2L (ENSLAFG00000001437) MAIP1 (ENSLAFG00000011639) TYW5 (ENSLAFG00000018708) C2orf69 (ENSLAFG00000018707) ENSLAFG00000030925 SATB2 (ENSLAFG00000002924) PLCL1 (ENSLAFG00000016349) BOLL (ENSLAFG00000010956) ##22 MARS2 (ENSLAFG00000030667) RFTN2 (ENSLAFG00000000141) MOB4 (ENSLAFG00000008054) ENSLAFG00000000057 HSPD1 (ENSLAFG00000000053) COQ10B (ENSLAFG00000000052) SF3B1 (ENSLAFG00000001956) ANKRD44 (ENSLAFG00000002537) ##8 PGAP1 (ENSLAFG00000022372) GTF3C3 (ENSLAFG00000001792) CCDC150 (ENSLAFG00000008819) HECW2 (ENSLAFG00000011976) STK17B (ENSLAFG00000011972) DNAH7 (ENSLAFG00000011951) SLC39A10 (ENSLAFG00000011949) Hyrax MODERN SPECIES 3876 BOLL (ENSPCAG00000010640) ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b 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ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT01010000225408 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Carnivora ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT01010000225408 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 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ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.o ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 lion MODERN SPECIES 8 NIF3L1 (ENSPLOG00000016032) PPIL3 (ENSPLOG00000016086) CLK1 (ENSPLOG00000016118) BZW1 (ENSPLOG00000016320) ENSPLOG00000016579 SGO2 (ENSPLOG00000016840) KCTD18 (ENSPLOG00000016872) SPATS2L (ENSPLOG00000016944) MAIP1 (ENSPLOG00000010863) TYW5 (ENSPLOG00000010891) C2orf69 (ENSPLOG00000010947) FTCDNL1 (ENSPLOG00000010989) SATB2 (ENSPLOG00000011078) PLCL1 (ENSPLOG00000011340) ENSPLOG00000011407 BOLL (ENSPLOG00000011460) ##22 MARS2 (ENSPLOG00000011689) RFTN2 (ENSPLOG00000011715) MOB4 (ENSPLOG00000011894) ENSPLOG00000012097 HSPD1 (ENSPLOG00000012200) ENSPLOG00000012317 ENSPLOG00000012415 SF3B1 (ENSPLOG00000012481) ANKRD44 (ENSPLOG00000012744) ##8 PGAP1 (ENSPLOG00000012908) GTF3C3 (ENSPLOG00000013217) CCDC150 (ENSPLOG00000013330) HECW2 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ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b.c ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000182922.a.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT01070000254992 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 Dog MODERN SPECIES 30 PPIL3 (ENSCAFG00845029569) CLK1 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ENSUAMG00000016040 BOLL (ENSUAMG00000016037) ##22 Polar bear MODERN SPECIES 142 BZW1 (ENSUMAG00000021441) ENSUMAG00000021399 ENSUMAG00000021134 AOX1 (ENSUMAG00000021073) SGO2 (ENSUMAG00000021068) KCTD18 (ENSUMAG00000021066) SPATS2L (ENSUMAG00000021060) MAIP1 (ENSUMAG00000021043) TYW5 (ENSUMAG00000021039) C2orf69 (ENSUMAG00000021037) FTCDNL1 (ENSUMAG00000021033) SATB2 (ENSUMAG00000021003) PLCL1 (ENSUMAG00000020984) ENSUMAG00000020978 ENSUMAG00000020976 BOLL (ENSUMAG00000020969) ##22 MARS2 (ENSUMAG00000020961) RFTN2 (ENSUMAG00000020958) MOB4 (ENSUMAG00000020955) HSPE1 (ENSUMAG00000020954) HSPD1 (ENSUMAG00000020952) COQ10B (ENSUMAG00000020949) SF3B1 (ENSUMAG00000020945) ANKRD44 (ENSUMAG00000020937) ##8 PGAP1 (ENSUMAG00000020815) GTF3C3 (ENSUMAG00000020787) CCDC150 (ENSUMAG00000020726) HECW2 (ENSUMAG00000020667) STK17B (ENSUMAG00000020656) DNAH7 (ENSUMAG00000020608) SLC39A10 (ENSUMAG00000020598) Giant Panda MODERN SPECIES 11 CLK1 (ENSAMEG00000005887) BZW1 (ENSAMEG00000005859) AOX2 (ENSAMEG00000005633) AOX4 (ENSAMEG00000005561) AOX1 (ENSAMEG00000005445) SGO2 (ENSAMEG00000005435) KCTD18 (ENSAMEG00000005423) SPATS2L (ENSAMEG00000005405) MAIP1 (ENSAMEG00000005390) TYW5 (ENSAMEG00000005386) C2orf69 (ENSAMEG00000005381) ENSAMEG00000023460 SATB2 (ENSAMEG00000005350) ENSAMEG00000019732 PLCL1 (ENSAMEG00000013707) BOLL (ENSAMEG00000013712) ##22 MARS2 (ENSAMEG00000019748) RFTN2 (ENSAMEG00000013737) MOB4 (ENSAMEG00000013751) ENSAMEG00000013769 HSPD1 (ENSAMEG00000013770) COQ10B (ENSAMEG00000013802) SF3B1 (ENSAMEG00000013809) ANKRD44 (ENSAMEG00000013836) ##8 PGAP1 (ENSAMEG00000013887) C2orf66 (ENSAMEG00000013924) GTF3C3 (ENSAMEG00000013925) CCDC150 (ENSAMEG00000013946) HECW2 (ENSAMEG00000004852) STK17B (ENSAMEG00000004835) DNAH7 (ENSAMEG00000004749) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Equus ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b.a ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00390000005254.i.a.b ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 Donkey MODERN SPECIES 24 ENSEASG00005021400 ENSEASG00005028089 ENSEASG00005029204 ENSEASG00005024840 ENSEASG00005027058 SGO2 (ENSEASG00005024538) KCTD18 (ENSEASG00005020042) SPATS2L (ENSEASG00005020050) MAIP1 (ENSEASG00005020067) TYW5 (ENSEASG00005026976) C2orf69 (ENSEASG00005031146) ENSEASG00005020080 ENSEASG00005029514 PLCL1 (ENSEASG00005020113) ENSEASG00005020114 BOLL (ENSEASG00005020122) ##22 MARS2 (ENSEASG00005020133) RFTN2 (ENSEASG00005020136) MOB4 (ENSEASG00005020142) HSPE1 (ENSEASG00005034821) ENSEASG00005020152 COQ10B (ENSEASG00005032559) SF3B1 (ENSEASG00005020159) ENSEASG00005020167 ANKRD44 (ENSEASG00005020169) ##8 PGAP1 (ENSEASG00005020202) C2orf66 (ENSEASG00005029887) GTF3C3 (ENSEASG00005020250) CCDC150 (ENSEASG00005020257) HECW2 (ENSEASG00005020398) STK17B (ENSEASG00005020775) Horse MODERN SPECIES 9 ENSECAG00000015199 AOX4 (ENSECAG00000024701) ENSECAG00000032497 ENSECAG00000058396 ENSECAG00000007830 ENSECAG00000018147 SGO2 (ENSECAG00000006038) KCTD18 (ENSECAG00000001039) SPATS2L (ENSECAG00000018564) MAIP1 (ENSECAG00000050073) TYW5 (ENSECAG00000014128) C18H2orf69 (ENSECAG00000014107) ENSECAG00000013663 SATB2 (ENSECAG00000010043) ENSECAG00000058569 BOLL (ENSECAG00000040654) ##22 PLCL1 (ENSECAG00000007274) MARS2 (ENSECAG00000004931) RFTN2 (ENSECAG00000021296) MOB4 (ENSECAG00000015560) ENSECAG00000055696 ENSECAG00000049872 HSPD1 (ENSECAG00000008968) COQ10B (ENSECAG00000006436) SF3B1 (ENSECAG00000021657) ENSECAG00000034847 ANKRD44 (ENSECAG00000008835) ##8 PGAP1 (ENSECAG00000019980) C2orf66 (ENSECAG00000058124) GTF3C3 (ENSECAG00000014763) CCDC150 (ENSECAG00000010941) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.r ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D.f ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Megabat MODERN SPECIES 1772 PLCL1 (ENSPVAG00000015271) BOLL (ENSPVAG00000015269) ##22 MARS2 (ENSPVAG00000015267) RFTN2 (ENSPVAG00000015266) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.d ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.r ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D.f ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 26 PPIL3 (ENSRFEG00010017851) CLK1 (ENSRFEG00010017933) BZW1 (ENSRFEG00010018183) ENSRFEG00010018448 ENSRFEG00010019480 AOX1 (ENSRFEG00010021989) SGO2 (ENSRFEG00010022000) KCTD18 (ENSRFEG00010022002) SPATS2L (ENSRFEG00010022016) MAIP1 (ENSRFEG00010022032) TYW5 (ENSRFEG00010022036) C2orf69 (ENSRFEG00010022039) FTCDNL1 (ENSRFEG00010022040) SATB2 (ENSRFEG00010022046) PLCL1 (ENSRFEG00010022056) BOLL (ENSRFEG00010022065) ##22 MARS2 (ENSRFEG00010022069) RFTN2 (ENSRFEG00010022072) ENSRFEG00010022073 MOB4 (ENSRFEG00010022077) ENSRFEG00010022080 HSPD1 (ENSRFEG00010022083) ENSRFEG00010022086 SF3B1 (ENSRFEG00010022087) ANKRD44 (ENSRFEG00010022091) ##8 PGAP1 (ENSRFEG00010022103) GTF3C3 (ENSRFEG00010022114) CCDC150 (ENSRFEG00010022122) HECW2 (ENSRFEG00010022130) STK17B (ENSRFEG00010022132) ENSRFEG00010022133 Microbat MODERN SPECIES 940 PPIL3 (ENSMLUG00000013189) CLK1 (ENSMLUG00000000344) BZW1 (ENSMLUG00000001653) ENSMLUG00000022412 ENSMLUG00000027760 AOX1 (ENSMLUG00000016684) SGO2 (ENSMLUG00000004245) KCTD18 (ENSMLUG00000006605) SPATS2L (ENSMLUG00000006594) MAIP1 (ENSMLUG00000015960) TYW5 (ENSMLUG00000015955) C2orf69 (ENSMLUG00000026751) ENSMLUG00000011411 SATB2 (ENSMLUG00000001554) PLCL1 (ENSMLUG00000002677) BOLL (ENSMLUG00000004999) ##22 RFTN2 (ENSMLUG00000004991) MOB4 (ENSMLUG00000004971) ENSMLUG00000000883 HSPE1 (ENSMLUG00000000878) ENSMLUG00000000871 COQ10B (ENSMLUG00000000865) SF3B1 (ENSMLUG00000000840) 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ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Pig MODERN SPECIES 6 BZW1 (ENSSSCG00000016094) ENSSSCG00000016093 ENSSSCG00000040051 AOX1 (ENSSSCG00000029606) SGO2 (ENSSSCG00000016092) ENSSSCG00000016091 SPATS2L (ENSSSCG00000016090) MAIP1 (ENSSSCG00000036676) TYW5 (ENSSSCG00000016087) C2orf69 (ENSSSCG00000016086) ENSSSCG00000016085 SATB2 (ENSSSCG00000021657) 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(ENSCDRG00005012028) ENSCDRG00005012185 SF3B1 (ENSCDRG00005012215) ANKRD44 (ENSCDRG00005012443) ##8 PGAP1 (ENSCDRG00005012687) C2orf66 (ENSCDRG00005012843) GTF3C3 (ENSCDRG00005012878) CCDC150 (ENSCDRG00005012991) ENSCDRG00005013160 HECW2 (ENSCDRG00005013187) Alpaca MODERN SPECIES 3682 BOLL (ENSVPAG00000005816) ##22 RFTN2 (ENSVPAG00000005811) MOB4 (ENSVPAG00000005808) ENSVPAG00000005805 HSPD1 (ENSVPAG00000005803) COQ10B (ENSVPAG00000005801) SF3B1 (ENSVPAG00000005798) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT01010000225408 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b 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ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Bos ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.g ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.t ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.g ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b.a ENSGT00940000155367.t ENSGT00390000018393 ENSGT00940000162534.b ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 11 BZW1 (ENSBIXG00005031551) ENSBIXG00005031550 ENSBIXG00005030534 AOX1 (ENSBIXG00005008599) SGO2 (ENSBIXG00005008643) KCTD18 (ENSBIXG00005005902) ENSBIXG00005008660 SPATS2L (ENSBIXG00005008726) MAIP1 (ENSBIXG00005008787) TYW5 (ENSBIXG00005008805) C2orf69 (ENSBIXG00005008818) FTCDNL1 (ENSBIXG00005008837) SATB2 (ENSBIXG00005008954) PLCL1 (ENSBIXG00005009092) ENSBIXG00005009140 BOLL (ENSBIXG00005009209) ##22 MARS2 (ENSBIXG00005009234) RFTN2 (ENSBIXG00005009241) MOB4 (ENSBIXG00005009278) ENSBIXG00005009301 ENSBIXG00005009345 COQ10B (ENSBIXG00005009394) SF3B1 (ENSBIXG00005000503) ENSBIXG00005009496 ANKRD44 (ENSBIXG00005009540) ##8 PGAP1 (ENSBIXG00005009684) C2orf66 (ENSBIXG00005009722) GTF3C3 (ENSBIXG00005005945) CCDC150 (ENSBIXG00005006499) HECW2 (ENSBIXG00005000763) STK17B (ENSBIXG00005010089) Cow MODERN SPECIES 11 BZW1 (ENSBTAG00000006049) AOX2 (ENSBTAG00000026812) AOX4 (ENSBTAG00000038878) ENSBTAG00000047849 AOX1 (ENSBTAG00000009725) SGO2 (ENSBTAG00000031579) KCTD18 (ENSBTAG00000002272) SPATS2L (ENSBTAG00000016092) ENSBTAG00000024003 MAIP1 (ENSBTAG00000019231) TYW5 (ENSBTAG00000019232) C2H2orf69 (ENSBTAG00000009952) ENSBTAG00000031595 SATB2 (ENSBTAG00000016334) PLCL1 (ENSBTAG00000007635) BOLL (ENSBTAG00000031614) ##22 MARS2 (ENSBTAG00000002056) RFTN2 (ENSBTAG00000007652) MOB4 (ENSBTAG00000019116) HSPE1 (ENSBTAG00000012589) HSPD1 (ENSBTAG00000012586) COQ10B (ENSBTAG00000004659) SF3B1 (ENSBTAG00000008915) ENSBTAG00000012171 ANKRD44 (ENSBTAG00000031696) ##8 PGAP1 (ENSBTAG00000020416) GTF3C3 (ENSBTAG00000007779) CCDC150 (ENSBTAG00000017695) HECW2 (ENSBTAG00000020696) STK17B (ENSBTAG00000013196) DNAH7 (ENSBTAG00000016784) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.g ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.t ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Domestic yak MODERN SPECIES 11 BZW1 (ENSBGRG00000023222) ENSBGRG00000023761 ENSBGRG00000026310 ENSBGRG00000026671 AOX1 (ENSBGRG00000026674) SGO2 (ENSBGRG00000026677) KCTD18 (ENSBGRG00000026680) SPATS2L (ENSBGRG00000026684) MAIP1 (ENSBGRG00000026693) TYW5 (ENSBGRG00000026697) C2orf69 (ENSBGRG00000026703) FTCDNL1 (ENSBGRG00000026708) SATB2 (ENSBGRG00000026716) ENSBGRG00000000192 PLCL1 (ENSBGRG00000000210) BOLL (ENSBGRG00000000262) ##22 MARS2 (ENSBGRG00000000375) RFTN2 (ENSBGRG00000000406) ENSBGRG00000000487 HSPE1 (ENSBGRG00000000521) HSPD1 (ENSBGRG00000000539) COQ10B (ENSBGRG00000000566) SF3B1 (ENSBGRG00000000604) ANKRD44 (ENSBGRG00000000733) ##8 PGAP1 (ENSBGRG00000000882) C2orf66 (ENSBGRG00000001016) GTF3C3 (ENSBGRG00000001029) ENSBGRG00000001058 CCDC150 (ENSBGRG00000001090) HECW2 (ENSBGRG00000001305) ENSBGRG00000001327 Wild yak MODERN SPECIES 666 ENSBMUG00000010105 BOLL (ENSBMUG00000010078) ##22 MARS2 (ENSBMUG00000010049) ENSBMUG00000010038 ENSBMUG00000010029 ENSBMUG00000010020 HSPE1 (ENSBMUG00000010011) HSPD1 (ENSBMUG00000009989) COQ10B (ENSBMUG00000009973) SF3B1 (ENSBMUG00000009914) ANKRD44 (ENSBMUG00000009842) ##8 PGAP1 (ENSBMUG00000009744) C2orf66 (ENSBMUG00000009657) GTF3C3 (ENSBMUG00000009649) American bison MODERN SPECIES 3330 ENSBBBG00000013042 ENSBBBG00000013095 ENSBBBG00000002631 AOX1 (ENSBBBG00000013130) ENSBBBG00000013142 ENSBBBG00000013146 KCTD18 (ENSBBBG00000013155) ENSBBBG00000013159 SPATS2L (ENSBBBG00000013236) MAIP1 (ENSBBBG00000001643) TYW5 (ENSBBBG00000013257) C2orf69 (ENSBBBG00000002681) FTCDNL1 (ENSBBBG00000008285) SATB2 (ENSBBBG00000013343) PLCL1 (ENSBBBG00000002738) BOLL (ENSBBBG00000013412) ##22 MARS2 (ENSBBBG00000013415) RFTN2 (ENSBBBG00000002765) MOB4 (ENSBBBG00000013501) ENSBBBG00000013516 HSPD1 (ENSBBBG00000013534) ENSBBBG00000007252 ENSBBBG00000013596 ENSBBBG00000013601 ANKRD44 (ENSBBBG00000013667) ##8 PGAP1 (ENSBBBG00000013723) C2orf66 (ENSBBBG00000013730) GTF3C3 (ENSBBBG00000002934) ENSBBBG00000013757 ENSBBBG00000013767 HECW2 (ENSBBBG00000013842) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT01010000225408 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493.h ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.e ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.s ENSGT00940000155367.t ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 11 AOX1 (ENSOARG00020014833) ENSOARG00020014683 ENSOARG00020014668 SPATS2L (ENSOARG00020014270) MAIP1 (ENSOARG00020014186) TYW5 (ENSOARG00020014145) C2orf69 (ENSOARG00020014115) FTCDNL1 (ENSOARG00020013918) SATB2 (ENSOARG00020013534) ENSOARG00020013422 ENSOARG00020013393 ENSOARG00020013380 ENSOARG00020013353 ENSOARG00020013326 ENSOARG00020013287 BOLL (ENSOARG00020012643) ##22 MARS2 (ENSOARG00020012596) RFTN2 (ENSOARG00020012524) ENSOARG00020012334 HSP10 (ENSOARG00020012227) ENSOARG00020012172 COQ10B (ENSOARG00020011999) SF3B1 (ENSOARG00020011806) ANKRD44 (ENSOARG00020010197) ##8 PGAP1 (ENSOARG00020009268) C2orf66 (ENSOARG00020009210) GTF3C3 (ENSOARG00020009036) ENSOARG00020008885 HECW2 (ENSOARG00020008825) STK17B (ENSOARG00020008783) ENSOARG00020008748 Goat MODERN SPECIES 11 ENSCHIG00000020570 ENSCHIG00000013677 ENSCHIG00000019390 AOX1 (ENSCHIG00000013439) SGO2 (ENSCHIG00000013638) KCTD18 (ENSCHIG00000022753) SPATS2L (ENSCHIG00000026377) MAIP1 (ENSCHIG00000007507) ENSCHIG00000017324 ENSCHIG00000011016 FTCDNL1 (ENSCHIG00000022126) SATB2 (ENSCHIG00000022376) PLCL1 (ENSCHIG00000013331) ENSCHIG00000011685 ENSCHIG00000021317 BOLL (ENSCHIG00000024995) ##22 MARS2 (ENSCHIG00000016548) RFTN2 (ENSCHIG00000012903) ENSCHIG00000026973 HSPE1 (ENSCHIG00000009467) HSPD1 (ENSCHIG00000004382) ENSCHIG00000020913 SF3B1 (ENSCHIG00000015226) ANKRD44 (ENSCHIG00000017665) ##8 ENSCHIG00000012550 PGAP1 (ENSCHIG00000018177) GTF3C3 (ENSCHIG00000016485) CCDC150 (ENSCHIG00000010518) HECW2 (ENSCHIG00000012868) STK17B (ENSCHIG00000013934) DNAH7 (ENSCHIG00000010331) Siberian musk deer MODERN SPECIES 350 PLCL1 (ENSMMSG00000011625) ENSMMSG00000011612 ##22 Yarkand deer MODERN SPECIES 31 ENSCHYG00000009851 ENSCHYG00000010410 ENSCHYG00000010452 AOX1 (ENSCHYG00000010517) SGO2 (ENSCHYG00000011236) KCTD18 (ENSCHYG00000011325) SPATS2L (ENSCHYG00000011390) ENSCHYG00000011736 MAIP1 (ENSCHYG00000011759) TYW5 (ENSCHYG00000011850) C2orf69 (ENSCHYG00000011903) ENSCHYG00000011965 SATB2 (ENSCHYG00000012100) ENSCHYG00000012371 PLCL1 (ENSCHYG00000012427) BOLL (ENSCHYG00000012765) ##22 MARS2 (ENSCHYG00000013177) RFTN2 (ENSCHYG00000013201) MOB4 (ENSCHYG00000013303) ENSCHYG00000013442 ENSCHYG00000013593 ENSCHYG00000013673 SF3B1 (ENSCHYG00000013853) ANKRD44 (ENSCHYG00000014222) ##8 PGAP1 (ENSCHYG00000015550) C2orf66 (ENSCHYG00000015983) GTF3C3 (ENSCHYG00000016098) CCDC150 (ENSCHYG00000016506) HECW2 (ENSCHYG00000017663) ENSCHYG00000017914 STK17B (ENSCHYG00000017949) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b.i.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00390000012561.b.i.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Blue whale MODERN SPECIES 18 PPIL3 (ENSBMSG00010003923) CLK1 (ENSBMSG00010003860) ENSBMSG00010003785 ENSBMSG00010003674 AOX1 (ENSBMSG00010003482) ENSBMSG00010003395 ENSBMSG00010003382 KCTD18 (ENSBMSG00010003365) SPATS2L (ENSBMSG00010003251) MAIP1 (ENSBMSG00010003193) TYW5 (ENSBMSG00010003179) C2orf69 (ENSBMSG00010003167) FTCDNL1 (ENSBMSG00010003148) SATB2 (ENSBMSG00010003076) PLCL1 (ENSBMSG00010002964) BOLL (ENSBMSG00010002886) ##22 MARS2 (ENSBMSG00010002857) RFTN2 (ENSBMSG00010002848) MOB4 (ENSBMSG00010002811) ENSBMSG00010002778 HSPD1 (ENSBMSG00010002754) COQ10B (ENSBMSG00010002718) SF3B1 (ENSBMSG00010002624) ENSBMSG00010002564 ANKRD44 (ENSBMSG00010002506) ##8 PGAP1 (ENSBMSG00010002370) C2orf66 (ENSBMSG00010002279) GTF3C3 (ENSBMSG00010002241) CCDC150 (ENSBMSG00010002134) HECW2 (ENSBMSG00010002072) STK17B (ENSBMSG00010002050) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b.i.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Sperm whale MODERN SPECIES 11 ORC2 (ENSPCTG00005001802) NIF3L1 (ENSPCTG00005001774) PPIL3 (ENSPCTG00005001749) CLK1 (ENSPCTG00005001575) BZW1 (ENSPCTG00005001498) AOX1 (ENSPCTG00005001418) SGO2 (ENSPCTG00005001385) KCTD18 (ENSPCTG00005001363) SPATS2L (ENSPCTG00005001213) MAIP1 (ENSPCTG00005001167) TYW5 (ENSPCTG00005001148) C2H2orf69 (ENSPCTG00005001135) ENSPCTG00005001114 SATB2 (ENSPCTG00005001020) PLCL1 (ENSPCTG00005000965) BOLL (ENSPCTG00005000834) ##22 MARS2 (ENSPCTG00005000802) RFTN2 (ENSPCTG00005000782) MOB4 (ENSPCTG00005000750) HSPE1 (ENSPCTG00005000700) HSPD1 (ENSPCTG00005000653) COQ10B (ENSPCTG00005000606) SF3B1 (ENSPCTG00005000567) ANKRD44 (ENSPCTG00005000458) ##8 PGAP1 (ENSPCTG00005000363) C2orf66 (ENSPCTG00005000282) GTF3C3 (ENSPCTG00005000262) ENSPCTG00005000238 ENSPCTG00005000224 HECW2 (ENSPCTG00005020633) STK17B (ENSPCTG00005020604) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b.i.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Dolphin MODERN SPECIES 808 BOLL (ENSTTRG00000003422) ##22 MARS2 (ENSTTRG00000003421) RFTN2 (ENSTTRG00000003420) HSPE1 (ENSTTRG00000003419) ENSTTRG00000003418 HSPD1 (ENSTTRG00000003417) COQ10B (ENSTTRG00000003416) SF3B1 (ENSTTRG00000003414) ANKRD44 (ENSTTRG00000003413) ##8 PGAP1 (ENSTTRG00000003412) ENSTTRG00000003411 GTF3C3 (ENSTTRG00000003409) CCDC150 (ENSTTRG00000003407) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b.i.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000154631.c.b ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Vaquita MODERN SPECIES 18 PPIL3 (ENSPSNG00000018105) CLK1 (ENSPSNG00000018159) ENSPSNG00000018409 AOX1 (ENSPSNG00000018708) SGO2 (ENSPSNG00000018985) KCTD18 (ENSPSNG00000019019) SPATS2L (ENSPSNG00000019081) MAIP1 (ENSPSNG00000019254) TYW5 (ENSPSNG00000019307) C2orf69 (ENSPSNG00000019348) ENSPSNG00000019397 SATB2 (ENSPSNG00000019498) ENSPSNG00000019635 PLCL1 (ENSPSNG00000019688) ENSPSNG00000019773 BOLL (ENSPSNG00000019819) ##22 MARS2 (ENSPSNG00000020001) RFTN2 (ENSPSNG00000020023) MOB4 (ENSPSNG00000020101) HSPD1 (ENSPSNG00000020243) ENSPSNG00000020315 COQ10B (ENSPSNG00000020376) SF3B1 (ENSPSNG00000020453) ANKRD44 (ENSPSNG00000020570) ##8 PGAP1 (ENSPSNG00000020691) C2orf66 (ENSPSNG00000020837) GTF3C3 (ENSPSNG00000002123) ENSPSNG00000002154 ENSPSNG00000002190 HECW2 (ENSPSNG00000002242) STK17B (ENSPSNG00000002351) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b.i.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000154631.c.b ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Beluga whale MODERN SPECIES 84 CLK1 (ENSDLEG00000017601) ENSDLEG00000017537 AOX1 (ENSDLEG00000017388) SGO2 (ENSDLEG00000017351) KCTD18 (ENSDLEG00000017330) SPATS2L (ENSDLEG00000017277) MAIP1 (ENSDLEG00000017256) TYW5 (ENSDLEG00000017244) CUNH2orf69 (ENSDLEG00000017234) ENSDLEG00000017202 SATB2 (ENSDLEG00000017180) ENSDLEG00000017147 PLCL1 (ENSDLEG00000017124) ENSDLEG00000017113 ENSDLEG00000017109 BOLL (ENSDLEG00000017047) ##22 MARS2 (ENSDLEG00000017031) RFTN2 (ENSDLEG00000017004) HSPE1 (ENSDLEG00000016991) ENSDLEG00000016973 HSPD1 (ENSDLEG00000016961) COQ10B (ENSDLEG00000016950) SF3B1 (ENSDLEG00000016863) ANKRD44 (ENSDLEG00000016735) ##8 PGAP1 (ENSDLEG00000016703) GTF3C3 (ENSDLEG00000016677) CCDC150 (ENSDLEG00000016660) ENSDLEG00000016646 HECW2 (ENSDLEG00000016572) STK17B (ENSDLEG00000016549) DNAH7 (ENSDLEG00000010467) Narwhal DUPLICATION Narwhal MODERN SPECIES 139 ENSMMNG00015001425 ##22 Narwhal MODERN SPECIES 248 ENSMMNG00015000777 ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063480.a ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 4754 BOLL (ENSEEUG00000003441) ##22 Common shrew MODERN SPECIES 4272 BOLL (ENSSARG00000000182) ##22 ENSSARG00000000174 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.b.b ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 Primates ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 Bushbaby MODERN SPECIES 385 PLCL1 (ENSOGAG00000011498) BOLL (ENSOGAG00000007207) ##22 MARS2 (ENSOGAG00000007205) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.b ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 Mouse lemur MODERN SPECIES 30 CLK1 (ENSMICG00000003361) BZW1 (ENSMICG00000003355) ENSMICG00000033651 ENSMICG00000027664 AOX1 (ENSMICG00000005718) SGO2 (ENSMICG00000033463) ENSMICG00000003963 SPATS2L (ENSMICG00000003956) MAIP1 (ENSMICG00000044985) TYW5 (ENSMICG00000046098) C2orf69 (ENSMICG00000035511) ENSMICG00000026608 ENSMICG00000037134 SATB2 (ENSMICG00000009378) PLCL1 (ENSMICG00000011854) BOLL (ENSMICG00000011845) ##22 RFTN2 (ENSMICG00000028117) ENSMICG00000037985 HSPD1 (ENSMICG00000028600) HSPE1 (ENSMICG00000046768) COQ10B (ENSMICG00000013910) SF3B1 (ENSMICG00000013879) ANKRD44 (ENSMICG00000013853) ##8 PGAP1 (ENSMICG00000013824) C2orf66 (ENSMICG00000043136) GTF3C3 (ENSMICG00000013800) CCDC150 (ENSMICG00000013761) HECW2 (ENSMICG00000013727) STK17B (ENSMICG00000013716) DNAH7 (ENSMICG00000012420) SLC39A10 (ENSMICG00000012402) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 232 ENSPCOG00000015991 PLCL1 (ENSPCOG00000000157) BOLL (ENSPCOG00000002476) ##22 RFTN2 (ENSPCOG00000025477) ENSPCOG00000022966 ENSPCOG00000011151 ENSPCOG00000028555 HSPD1 (ENSPCOG00000013989) COQ10B (ENSPCOG00000009128) SF3B1 (ENSPCOG00000024074) ANKRD44 (ENSPCOG00000028108) ##8 PGAP1 (ENSPCOG00000022807) ENSPCOG00000021792 CCDC150 (ENSPCOG00000019512) HECW2 (ENSPCOG00000028576) STK17B (ENSPCOG00000015317) DNAH7 (ENSPCOG00000015047) SLC39A10 (ENSPCOG00000028345) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 225 TMEM14C (ENSPSMG00000025455) C6orf52 (ENSPSMG00000025442) ENSPSMG00000025433 GCNT2 (ENSPSMG00000025432) HNRNPA1L3 (ENSPSMG00000025423) AOX1 (ENSPSMG00000025393) SGO2 (ENSPSMG00000025322) KCTD18 (ENSPSMG00000025316) SPATS2L (ENSPSMG00000025292) MAIP1 (ENSPSMG00000025245) TYW5 (ENSPSMG00000025236) C2orf69 (ENSPSMG00000025231) FTCDNL1 (ENSPSMG00000025226) SATB2 (ENSPSMG00000025213) PLCL1 (ENSPSMG00000025179) BOLL (ENSPSMG00000025166) ##22 MARS2 (ENSPSMG00000025148) RFTN2 (ENSPSMG00000025142) ENSPSMG00000025134 ENSPSMG00000025114 ENSPSMG00000025102 COQ10B (ENSPSMG00000025082) SF3B1 (ENSPSMG00000025061) ANKRD44 (ENSPSMG00000025023) ##8 PGAP1 (ENSPSMG00000024985) GTF3C3 (ENSPSMG00000024937) CCDC150 (ENSPSMG00000024921) HECW2 (ENSPSMG00000024894) STK17B (ENSPSMG00000024880) ENSPSMG00000024870 DNAH7 (ENSPSMG00000024863) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Tarsier MODERN SPECIES 6618 ENSTSYG00000031829 BOLL (ENSTSYG00000014204) ##22 RFTN2 (ENSTSYG00000010929) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234.c ENSGT00390000001138.b 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ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Marmoset MODERN SPECIES 18 KCTD18 (ENSCJAG00000031173) ENSCJAG00000085721 SPATS2L (ENSCJAG00000004173) ENSCJAG00000083755 MAIP1 (ENSCJAG00000037075) TYW5 (ENSCJAG00000004155) C2orf69 (ENSCJAG00000004149) ENSCJAG00000044172 ENSCJAG00000078875 ENSCJAG00000082819 SATB2 (ENSCJAG00000004111) ENSCJAG00000055486 ENSCJAG00000085382 PLCL1 (ENSCJAG00000004100) ENSCJAG00000070051 BOLL (ENSCJAG00000004092) ##22 MARS2 (ENSCJAG00000022885) ENSCJAG00000077720 RFTN2 (ENSCJAG00000058836) MOB4 (ENSCJAG00000045626) ENSCJAG00000084245 ENSCJAG00000041512 HSPD1 (ENSCJAG00000003990) COQ10B (ENSCJAG00000039085) SF3B1 (ENSCJAG00000003902) ANKRD44 (ENSCJAG00000003803) ##8 GTF3C3 (ENSCJAG00000003694) ENSCJAG00000003683 ENSCJAG00000016079 ENSCJAG00000072827 ENSCJAG00000048553 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234.c ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367 ENSGT00950000183198.c.a.a.b ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 56 ENSSBOG00000028593 CLK1 (ENSSBOG00000031614) BZW1 (ENSSBOG00000020710) ENSSBOG00000034034 AOX1 (ENSSBOG00000032424) SGO2 (ENSSBOG00000035222) KCTD18 (ENSSBOG00000031520) SPATS2L 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ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00950000183743 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb 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Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 285 LINGO2 (ENSRBIG00000015493) C9orf72 (ENSRBIG00000044562) MOB3B (ENSRBIG00000037786) EQTN (ENSRBIG00000029364) TEK (ENSRBIG00000038089) LRRC19 (ENSRBIG00000004225) ENSRBIG00000040901 IFT74 (ENSRBIG00000020357) PLAA (ENSRBIG00000032657) CAAP1 (ENSRBIG00000031931) BOLL (ENSRBIG00000042131) ##22 MARS2 (ENSRBIG00000018803) ENSRBIG00000026367 RFTN2 (ENSRBIG00000026987) ENSRBIG00000041973 ENSRBIG00000035189 ENSRBIG00000031908 COQ10B (ENSRBIG00000034451) ENSRBIG00000033148 ##15 SF3B1 (ENSRBIG00000026096) ENSRBIG00000031237 ANKRD44 (ENSRBIG00000044303) ##8 PGAP1 (ENSRBIG00000028600) C2orf66 (ENSRBIG00000038713) GTF3C3 (ENSRBIG00000010299) CCDC150 (ENSRBIG00000031913) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2289 PLCL1 (ENSRROG00000033434) BOLL (ENSRROG00000016942) ##22 MARS2 (ENSRROG00000012594) GLUD2 (ENSRROG00000032728) RFTN2 (ENSRROG00000039985) ENSRROG00000045160 HSPE1 (ENSRROG00000043083) ENSRROG00000031493 COQ10B (ENSRROG00000041035) 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ENSGT00390000005285 Vervet Monkey MODERN SPECIES 1 NIF3L1 (ENSCSAG00000010842) PPIL3 (ENSCSAG00000010852) CLK1 (ENSCSAG00000010924) BZW1 (ENSCSAG00000010957) ENSCSAG00000011187 AOX1 (ENSCSAG00000011276) SGO2 (ENSCSAG00000011303) KCTD18 (ENSCSAG00000011318) SPATS2L (ENSCSAG00000011326) MAIP1 (ENSCSAG00000011334) TYW5 (ENSCSAG00000011351) C2orf69 (ENSCSAG00000011358) FTCDNL1 (ENSCSAG00000011372) SATB2 (ENSCSAG00000011380) PLCL1 (ENSCSAG00000011391) BOLL (ENSCSAG00000011399) ##22 MARS2 (ENSCSAG00000018765) RFTN2 (ENSCSAG00000011411) MOB4 (ENSCSAG00000011421) ENSCSAG00000011427 HSPD1 (ENSCSAG00000011463) COQ10B (ENSCSAG00000011483) SF3B1 (ENSCSAG00000011505) ENSCSAG00000011517 ANKRD44 (ENSCSAG00000011536) ##8 PGAP1 (ENSCSAG00000011561) C2orf66 (ENSCSAG00000011573) GTF3C3 (ENSCSAG00000011582) CCDC150 (ENSCSAG00000011637) HECW2 (ENSCSAG00000011673) STK17B (ENSCSAG00000011683) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b 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ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ##15 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 Olive baboon MODERN SPECIES 1 CLK1 (ENSPANG00000015580) BZW1 (ENSPANG00000016459) AOX2 (ENSPANG00000016460) AOX4 (ENSPANG00000024540) AOX1 (ENSPANG00000015933) SGO2 (ENSPANG00000021922) KCTD18 (ENSPANG00000021439) SPATS2L (ENSPANG00000008482) TYW5 (ENSPANG00000009235) C2orf69 (ENSPANG00000040521) ENSPANG00000044612 ENSPANG00000031615 SATB2 (ENSPANG00000011212) ENSPANG00000050725 PLCL1 (ENSPANG00000000848) BOLL (ENSPANG00000009570) ##22 ENSPANG00000042310 MARS2 (ENSPANG00000016544) 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ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 Drill MODERN SPECIES 153 BOLL (ENSMLEG00000023905) ##22 MARS2 (ENSMLEG00000023045) GLUD2 (ENSMLEG00000033872) RFTN2 (ENSMLEG00000033396) HIGD2B (ENSMLEG00000033233) MOB4 (ENSMLEG00000035032) ENSMLEG00000034274 HSPD1 (ENSMLEG00000033771) COQ10B (ENSMLEG00000028484) ENSMLEG00000027345 ##15 SF3B1 (ENSMLEG00000026141) ENSMLEG00000038707 ENSMLEG00000035765 Sooty mangabey MODERN SPECIES 570 CLK1 (ENSCATG00000030802) BZW1 (ENSCATG00000032512) ENSCATG00000019918 ENSCATG00000042053 AOX1 (ENSCATG00000033826) SGO2 (ENSCATG00000027226) KCTD18 (ENSCATG00000044706) SPATS2L (ENSCATG00000008807) MAIP1 (ENSCATG00000036858) TYW5 (ENSCATG00000033078) C2orf69 (ENSCATG00000031233) FTCDNL1 (ENSCATG00000018934) ENSCATG00000044312 SATB2 (ENSCATG00000017161) PLCL1 (ENSCATG00000014153) BOLL (ENSCATG00000004430) ##22 MARS2 (ENSCATG00000001827) GLUD2 (ENSCATG00000044639) RFTN2 (ENSCATG00000031580) MOB4 (ENSCATG00000002964) ENSCATG00000022859 HSPD1 (ENSCATG00000044175) COQ10B (ENSCATG00000031857) ENSCATG00000031238 ##15 SF3B1 (ENSCATG00000035735) ENSCATG00000040754 ENSCATG00000039142 ANKRD44 (ENSCATG00000034086) ##8 PGAP1 (ENSCATG00000041899) C2orf66 (ENSCATG00000040552) GTF3C3 (ENSCATG00000041160) Macaca ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 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ENSNLEG00000006833 HECW2 (ENSNLEG00000006821) STK17B (ENSNLEG00000006813) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb.a.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.b.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b 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ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Bonobo MODERN SPECIES 15 PPIL3 (ENSPPAG00000039183) CLK1 (ENSPPAG00000036957) BZW1 (ENSPPAG00000027971) ENSPPAG00000030893 AOX1 (ENSPPAG00000000241) SGO2 (ENSPPAG00000000061) KCTD18 (ENSPPAG00000038865) SPATS2L (ENSPPAG00000036160) MAIP1 (ENSPPAG00000026692) TYW5 (ENSPPAG00000027150) C2orf69 (ENSPPAG00000035529) FTCDNL1 (ENSPPAG00000020283) ENSPPAG00000039843 SATB2 (ENSPPAG00000044026) PLCL1 (ENSPPAG00000042453) BOLL (ENSPPAG00000033757) ##22 MARS2 (ENSPPAG00000007220) RFTN2 (ENSPPAG00000026815) MOB4 (ENSPPAG00000044023) ENSPPAG00000023895 HSPD1 (ENSPPAG00000038858) COQ10B (ENSPPAG00000010452) SF3B1 (ENSPPAG00000035007) ENSPPAG00000043776 ENSPPAG00000042224 ANKRD44 (ENSPPAG00000033556) ##8 PGAP1 (ENSPPAG00000039254) C2orf66 (ENSPPAG00000029492) GTF3C3 (ENSPPAG00000002745) CCDC150 (ENSPPAG00000038945) HECW2 (ENSPPAG00000033901) Chimpanzee MODERN SPECIES 15 PPIL3 (ENSPTRG00000012793) CLK1 (ENSPTRG00000012792) BZW1 (ENSPTRG00000012791) ENSPTRG00000044647 AOX1 (ENSPTRG00000012790) SGO2 (ENSPTRG00000022953) KCTD18 (ENSPTRG00000012787) SPATS2L (ENSPTRG00000012785) MAIP1 (ENSPTRG00000012784) TYW5 (ENSPTRG00000012783) C2orf69 (ENSPTRG00000012782) FTCDNL1 (ENSPTRG00000047502) ENSPTRG00000050460 SATB2 (ENSPTRG00000012779) PLCL1 (ENSPTRG00000012778) BOLL (ENSPTRG00000012777) ##22 MARS2 (ENSPTRG00000047853) RFTN2 (ENSPTRG00000012776) MOB4 (ENSPTRG00000012775) HSPE1 (ENSPTRG00000012774) HSPD1 (ENSPTRG00000044665) COQ10B (ENSPTRG00000012772) SF3B1 (ENSPTRG00000012771) ENSPTRG00000049270 ANKRD44 (ENSPTRG00000012770) ##8 PGAP1 (ENSPTRG00000012769) C2BH2orf66 (ENSPTRG00000012768) GTF3C3 (ENSPTRG00000012767) CCDC150 (ENSPTRG00000012765) HECW2 (ENSPTRG00000012764) STK17B (ENSPTRG00000012763) Human MODERN SPECIES 11 ORC2 (ENSG00000115942) NIF3L1 (ENSG00000196290) PPIL3 (ENSG00000240344) CLK1 (ENSG00000013441) BZW1 (ENSG00000082153) AOX1 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ENSGGOG00000044011 SATB2 (ENSGGOG00000014123) PLCL1 (ENSGGOG00000001959) BOLL (ENSGGOG00000013594) ##22 MARS2 (ENSGGOG00000034895) RFTN2 (ENSGGOG00000009318) MOB4 (ENSGGOG00000036779) HSPE1 (ENSGGOG00000027944) HSPD1 (ENSGGOG00000008267) COQ10B (ENSGGOG00000039158) SF3B1 (ENSGGOG00000009264) ENSGGOG00000038007 ANKRD44 (ENSGGOG00000014558) ##8 PGAP1 (ENSGGOG00000001785) C2orf66 (ENSGGOG00000038009) GTF3C3 (ENSGGOG00000011787) CCDC150 (ENSGGOG00000010004) HECW2 (ENSGGOG00000013295) STK17B (ENSGGOG00000016830) Orangutan MODERN SPECIES 15 ORC2 (ENSPPYG00000013064) NIF3L1 (ENSPPYG00000013063) ENSPPYG00000013062 CLK1 (ENSPPYG00000013061) BZW1 (ENSPPYG00000035986) AOX1 (ENSPPYG00000013058) SGO2 (ENSPPYG00000013057) KCTD18 (ENSPPYG00000030650) SPATS2L (ENSPPYG00000013055) MAIP1 (ENSPPYG00000035692) TYW5 (ENSPPYG00000033416) C2orf69 (ENSPPYG00000013054) FTCDNL1 (ENSPPYG00000033061) SATB2 (ENSPPYG00000013052) PLCL1 (ENSPPYG00000039108) BOLL (ENSPPYG00000037688) ##22 MARS2 (ENSPPYG00000013049) ENSPPYG00000041557 RFTN2 (ENSPPYG00000013048) MOB4 (ENSPPYG00000013047) HSPE1 (ENSPPYG00000025876) HSPD1 (ENSPPYG00000013046) COQ10B (ENSPPYG00000039065) SF3B1 (ENSPPYG00000013044) ANKRD44 (ENSPPYG00000013043) ##8 PGAP1 (ENSPPYG00000013042) C2orf66 (ENSPPYG00000037735) GTF3C3 (ENSPPYG00000013040) CCDC150 (ENSPPYG00000013039) HECW2 (ENSPPYG00000013038) STK17B (ENSPPYG00000013037) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Tree shrew MODERN SPECIES 2577 BOLL (ENSTBEG00000017343) ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Rabbit MODERN SPECIES 18 ENSOCUG00000010647 ENSOCUG00000026480 ENSOCUG00000024593 ENSOCUG00000035654 AOX1 (ENSOCUG00000013971) ENSOCUG00000000547 ENSOCUG00000037416 KCTD18 (ENSOCUG00000011556) SPATS2L (ENSOCUG00000011549) ENSOCUG00000017946 ENSOCUG00000035705 ENSOCUG00000016464 C2orf69 (ENSOCUG00000016473) SATB2 (ENSOCUG00000009700) PLCL1 (ENSOCUG00000013978) BOLL (ENSOCUG00000013979) ##22 MARS2 (ENSOCUG00000017798) RFTN2 (ENSOCUG00000003993) ENSOCUG00000005712 HSPE1 (ENSOCUG00000010360) HSPD1 (ENSOCUG00000012736) COQ10B (ENSOCUG00000012735) ENSOCUG00000000205 ENSOCUG00000029492 ENSOCUG00000012722 ANKRD44 (ENSOCUG00000009183) ##8 PGAP1 (ENSOCUG00000002192) C2orf66 (ENSOCUG00000028999) GTF3C3 (ENSOCUG00000000463) CCDC150 (ENSOCUG00000013579) ENSOCUG00000023862 Pika MODERN SPECIES 2250 BOLL (ENSOPRG00000013693) ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00390000006350.m.a.c.b.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Marmotini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b.v ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000012178.g.a.a ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a.v ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Alpin marmot MODERN SPECIES 8 ENSMMMG00000011976 ENSMMMG00000011959 ENSMMMG00000011912 AOX1 (ENSMMMG00000011886) ENSMMMG00000011877 KCTD18 (ENSMMMG00000011839) SPATS2L (ENSMMMG00000011689) MAIP1 (ENSMMMG00000011679) TYW5 (ENSMMMG00000011668) C2orf69 (ENSMMMG00000011660) FTCDNL1 (ENSMMMG00000011655) ENSMMMG00000011650 SATB2 (ENSMMMG00000011551) ENSMMMG00000011481 PLCL1 (ENSMMMG00000011429) BOLL (ENSMMMG00000011354) ##22 MARS2 (ENSMMMG00000011347) RFTN2 (ENSMMMG00000011220) ENSMMMG00000011174 ENSMMMG00000011161 ENSMMMG00000011138 ENSMMMG00000011101 SF3B1 (ENSMMMG00000011081) ANKRD44 (ENSMMMG00000010980) ##8 PGAP1 (ENSMMMG00000010912) GTF3C3 (ENSMMMG00000010874) ENSMMMG00000010858 ENSMMMG00000010842 HECW2 (ENSMMMG00000010763) STK17B (ENSMMMG00000010745) ENSMMMG00000010716 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000012178.g.a.a ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a.v ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Squirrel MODERN SPECIES 106 SATB2 (ENSSTOG00000024964) PLCL1 (ENSSTOG00000026164) BOLL (ENSSTOG00000003536) ##22 MARS2 (ENSSTOG00000015451) RFTN2 (ENSSTOG00000015446) MOB4 (ENSSTOG00000021024) ENSSTOG00000031333 ENSSTOG00000028470 COQ10B (ENSSTOG00000011048) SF3B1 (ENSSTOG00000011034) ANKRD44 (ENSSTOG00000012130) ##8 PGAP1 (ENSSTOG00000010633) GTF3C3 (ENSSTOG00000011894) ENSSTOG00000014552 HECW2 (ENSSTOG00000015188) STK17B (ENSSTOG00000020599) DNAH7 (ENSSTOG00000024509) ENSSTOG00000026225 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 210 ENSUPAG00010015923 AOX1 (ENSUPAG00010015861) SGO2 (ENSUPAG00010015843) KCTD18 (ENSUPAG00010015819) SPATS2L (ENSUPAG00010015777) MAIP1 (ENSUPAG00010015760) TYW5 (ENSUPAG00010015739) C2orf69 (ENSUPAG00010015730) FTCDNL1 (ENSUPAG00010015721) ENSUPAG00010015718 SATB2 (ENSUPAG00010015643) PLCL1 (ENSUPAG00010015612) BOLL (ENSUPAG00010015589) ##22 MARS2 (ENSUPAG00010015585) RFTN2 (ENSUPAG00010015580) ENSUPAG00010015569 ENSUPAG00010015563 COQ10B (ENSUPAG00010015540) SF3B1 (ENSUPAG00010015518) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 BZW1 (ENSSVLG00005003945) ENSSVLG00005003845 ENSSVLG00005003767 AOX1 (ENSSVLG00005003683) SGO2 (ENSSVLG00005003633) ENSSVLG00005003604 SPATS2L (ENSSVLG00005003512) MAIP1 (ENSSVLG00005003433) TYW5 (ENSSVLG00005003405) C2orf69 (ENSSVLG00005003387) FTCDNL1 (ENSSVLG00005003343) ENSSVLG00005003317 SATB2 (ENSSVLG00005003278) PLCL1 (ENSSVLG00005003227) ENSSVLG00005003207 BOLL (ENSSVLG00005003123) ##22 MARS2 (ENSSVLG00005003085) RFTN2 (ENSSVLG00005003057) MOB4 (ENSSVLG00005002989) HSPE1 (ENSSVLG00005002940) ENSSVLG00005002895 ENSSVLG00005002862 SF3B1 (ENSSVLG00005002801) ANKRD44 (ENSSVLG00005002705) ##8 PGAP1 (ENSSVLG00005002564) C2orf66 (ENSSVLG00005002524) ENSSVLG00005002519 GTF3C3 (ENSSVLG00005002487) CCDC150 (ENSSVLG00005002390) HECW2 (ENSSVLG00005002250) STK17B (ENSSVLG00005002206) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.b.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.b.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.b.b.a.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000156056.A Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 110 NIF3L1 (ENSCLAG00000013524) PPIL3 (ENSCLAG00000014050) CLK1 (ENSCLAG00000011455) BZW1 (ENSCLAG00000012079) ENSCLAG00000011199 ENSCLAG00000014402 AOX1 (ENSCLAG00000011481) ENSCLAG00000012456 ENSCLAG00000014377 SPATS2L (ENSCLAG00000013167) MAIP1 (ENSCLAG00000011913) TYW5 (ENSCLAG00000012009) C2orf69 (ENSCLAG00000012813) SATB2 (ENSCLAG00000016994) PLCL1 (ENSCLAG00000016098) BOLL (ENSCLAG00000017375) ##22 MARS2 (ENSCLAG00000010386) RFTN2 (ENSCLAG00000009821) MOB4 (ENSCLAG00000010086) ENSCLAG00000010686 HSPD1 (ENSCLAG00000011541) COQ10B (ENSCLAG00000017377) SF3B1 (ENSCLAG00000014767) ANKRD44 (ENSCLAG00000015396) ##8 PGAP1 (ENSCLAG00000011838) GTF3C3 (ENSCLAG00000009827) CCDC150 (ENSCLAG00000012365) HECW2 (ENSCLAG00000011628) STK17B (ENSCLAG00000012520) DNAH7 (ENSCLAG00000014436) ENSCLAG00000010357 Degu MODERN SPECIES 66 NIF3L1 (ENSODEG00000008894) PPIL3 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ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00390000005727.a.b.b.w.a ENSGT00390000005727.a.b.b.w.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Aox2 (ENSCGRG00001017735) Aox4 (ENSCGRG00001016089) Aox3 (ENSCGRG00001016559) Aox1 (ENSCGRG00001018485) ENSCGRG00001016045 Kctd18 (ENSCGRG00001016666) Spats2l (ENSCGRG00001019123) Maip1 (ENSCGRG00001018639) Tyw5 (ENSCGRG00001015297) 1700066M21Rik (ENSCGRG00001016585) Satb2 (ENSCGRG00001019669) Hsfy2 (ENSCGRG00001009926) ENSCGRG00001010393 Plcl1 (ENSCGRG00001015676) ENSCGRG00001009537 Boll (ENSCGRG00001020168) ##22 Mars2 (ENSCGRG00001010364) Rftn2 (ENSCGRG00001017788) Mob4 (ENSCGRG00001024203) ENSCGRG00001015345 HSPD1 (ENSCGRG00001021126) Coq10b (ENSCGRG00001015271) Sf3b1 (ENSCGRG00001016990) Ankrd44 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ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.a ENSGT00940000154107.b ENSGT00390000004840 ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 Laterata ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 Common wall lizard MODERN SPECIES CLK1 (ENSPMRG00000002909) BZW1 (ENSPMRG00000002917) ENSPMRG00000003375 ENSPMRG00000005111 ENSPMRG00000005124 KCTD18 (ENSPMRG00000005144) SPATS2L (ENSPMRG00000005149) ENSPMRG00000005158 MAIP1 (ENSPMRG00000005161) TYW5 (ENSPMRG00000005165) C2orf69 (ENSPMRG00000005171) FTCDNL1 (ENSPMRG00000005176) SATB2 (ENSPMRG00000005180) ENSPMRG00000005184 PLCL1 (ENSPMRG00000005188) BOLL (ENSPMRG00000005191) ##22 RFTN2 (ENSPMRG00000005194) MOB4 (ENSPMRG00000005201) ENSPMRG00000005210 ENSPMRG00000005220 COQ10B (ENSPMRG00000005252) SF3B1 (ENSPMRG00000005261) ANKRD44 (ENSPMRG00000005384) ##8 PGAP1 (ENSPMRG00000006002) GTF3C3 (ENSPMRG00000006178) ENSPMRG00000006458 MPP4 (ENSPMRG00000006532) ALS2 (ENSPMRG00000006747) CDK15 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HECW2 (ENSSPUG00000019200) STK17B (ENSSPUG00000019195) ENSSPUG00000019192 ENSSPUG00000019190 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.a ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##22 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##8 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.a 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ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000161744 ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 Chicken MODERN SPECIES 36 ORC2 (ENSGALG00010024830) NIF3L1 (ENSGALG00010024811) PPIL3 (ENSGALG00010024807) CLK1 (ENSGALG00010024803) BZW1 (ENSGALG00010024792) AOX2 (ENSGALG00010024771) AOX1 (ENSGALG00010024731) ENSGALG00010024213 KCTD18 (ENSGALG00010024207) SPATS2L (ENSGALG00010024075) MAIP1 (ENSGALG00010024020) TYW5 (ENSGALG00010023968) C2orf69 (ENSGALG00010023884) SATB2 (ENSGALG00010023831) PLCL1 (ENSGALG00010015218) BOLL (ENSGALG00010015152) ##22 RFTN2 (ENSGALG00010015133) MOB4 (ENSGALG00010015100) HSPE1 (ENSGALG00010015092) HSPD1 (ENSGALG00010015069) COQ10B (ENSGALG00010015043) SF3B1 (ENSGALG00010010748) ANKRD44 (ENSGALG00010010988) ##8 PGAP1 (ENSGALG00010010973) C7H2ORF66 (ENSGALG00010010961) GTF3C3 (ENSGALG00010010955) HECW2 (ENSGALG00010010928) STK17B (ENSGALG00010010908) ENSGALG00010010895 DNAH7 (ENSGALG00010010884) SLC39A10 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MOB4 (ENSPSIG00000017978) HSPE1 (ENSPSIG00000017974) HSPD1 (ENSPSIG00000017889) COQ10B (ENSPSIG00000017692) SF3B1 (ENSPSIG00000017222) ANKRD44 (ENSPSIG00000015936) ##8 C2orf66 (ENSPSIG00000015930) GTF3C3 (ENSPSIG00000015691) CCDC150 (ENSPSIG00000015196) HECW2 (ENSPSIG00000013756) STK17B (ENSPSIG00000013683) ENSPSIG00000013666 DNAH7 (ENSPSIG00000012760) SLC39A10 (ENSPSIG00000012655) Coelacanth MODERN SPECIES 267 ENSLACG00000018397 ENSLACG00000018337 KCTD18 (ENSLACG00000018201) SPATS2L (ENSLACG00000018167) MAIP1 (ENSLACG00000018077) TYW5 (ENSLACG00000018061) C2orf69 (ENSLACG00000018043) ftcdnl1 (ENSLACG00000018033) SATB2 (ENSLACG00000017798) PLCL1 (ENSLACG00000016887) BOLL (ENSLACG00000015867) ##22 ENSLACG00000015721 RFTN2 (ENSLACG00000015529) MOB4 (ENSLACG00000015430) HSPE1 (ENSLACG00000015377) HSPD1 (ENSLACG00000015296) COQ10B (ENSLACG00000015175) MGAT2 (ENSLACG00000015114) SF3B1 (ENSLACG00000014832) ENSLACG00000013926 ##8 ENSLACG00000013757 ##8 PGAP1 (ENSLACG00000013127) GTF3C3 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intestinalis MODERN SPECIES 4 ENSCING00000004068 ENSCING00000024339 ENSCING00000004962 ENSCING00000018575 ENSCING00000019962 ENSCING00000005039 ENSCING00000005030 ENSCING00000022714 ENSCING00000016632 ENSCING00000016403 ENSCING00000000592 ENSCING00000016394 ENSCING00000005043 ENSCING00000016409 ENSCING00000024811 ENSCING00000010230 #22 ENSCING00000023630 ENSCING00000000448 ENSCING00000000210 ENSCING00000010797 ENSCING00000022628 ENSCING00000002438 ENSCING00000015123 ENSCING00000022324 bf-3 (ENSCING00000002423) ENSCING00000014759 ENSCING00000023909 ENSCING00000025159 ENSCING00000014754 ENSCING00000022890 ENSCING00000023658