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Guinea pig	MODERN SPECIES	15	NFKBIE (ENSCPOG00000020455) #7	SLC35B2 (ENSCPOG00000032240) #8	HSP90AB1 (ENSCPOG00000003887) #9	SLC29A1 (ENSCPOG00000005137) #10	CAPN11 (ENSCPOG00000020426) #11	TMEM63B (ENSCPOG00000026287) #12	MRPL14 (ENSCPOG00000031064) #13	ENSCPOG00000013559 #14	MRPS18A (ENSCPOG00000022949) #15	RSPH9 (ENSCPOG00000020076) #16	MAD2L1BP (ENSCPOG00000036430) #17	GTPBP2 (ENSCPOG00000026957) #18	POLH (ENSCPOG00000013907) #19	XPO5 (ENSCPOG00000009917) #20	POLR1C (ENSCPOG00000038098) #21	YIPF3 (ENSCPOG00000009908) #22	LRRC73 (ENSCPOG00000024689) #23	TJAP1 (ENSCPOG00000009903) #24	DLK2 (ENSCPOG00000037284) #25	ABCC10 (ENSCPOG00000009891) #26	ZNF318 (ENSCPOG00000009884) #27	CRIP3 (ENSCPOG00000025292) #28	SLC22A7 (ENSCPOG00000012952) #29	TTBK1 (ENSCPOG00000039436) #30	DNPH1 (ENSCPOG00000025216) #31	CUL9 (ENSCPOG00000003615) #32	SRF (ENSCPOG00000022327) #33	PTK7 (ENSCPOG00000003045) #34	KLC4 (ENSCPOG00000000230) #35	MRPL2 (ENSCPOG00000024326) #36	CUL7 (ENSCPOG00000008848) #37
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159120 #7	ENSGT00940000157927 #8	ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #9	ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #10	ENSGT00940000158672 #11	ENSGT00940000157084 #12	ENSGT00390000001121 #13	ENSGT00940000157284 #14	ENSGT00390000006493 #15	ENSGT00390000018686 #16	ENSGT00390000003812 #17	ENSGT00940000155636 #18	ENSGT00940000157048 #19	ENSGT00940000153408.A #20	ENSGT00950000183100.B #21	ENSGT00940000153766.A #22	ENSGT00390000003256 #23	ENSGT00940000161543 #24	ENSGT00940000160761 #25	ENSGT00940000161082 #26	ENSGT00390000000614 #27	ENSGT00940000161321 #28	ENSGT00940000154922.b #29	ENSGT00940000160981 #30	ENSGT00390000001216 #31	ENSGT00940000153954.e #32	ENSGT00400000022158 #33	ENSGT00940000157908 #34	ENSGT00940000161323 #35	ENSGT00940000153244.A #36	ENSGT00940000153954.f #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	144	NFKBIE (ENSCLAG00000011710) #7	SLC35B2 (ENSCLAG00000010878) #8	HSP90AB1 (ENSCLAG00000015740) #9	SLC29A1 (ENSCLAG00000010529) #10	CAPN11 (ENSCLAG00000013084) #11	TMEM63B (ENSCLAG00000014238) #12	MRPL14 (ENSCLAG00000016855) #13	ENSCLAG00000014201 #14	MRPS18A (ENSCLAG00000012929) #15	RSPH9 (ENSCLAG00000012706) #16	MAD2L1BP (ENSCLAG00000011121) #17	GTPBP2 (ENSCLAG00000010271) #18	POLH (ENSCLAG00000010068) #19	XPO5 (ENSCLAG00000009723) #20	POLR1C (ENSCLAG00000009266) #21	YIPF3 (ENSCLAG00000015747) #22	LRRC73 (ENSCLAG00000015757) #23	TJAP1 (ENSCLAG00000009058) #24	DLK2 (ENSCLAG00000012976) #25	ABCC10 (ENSCLAG00000012360) #26	ZNF318 (ENSCLAG00000009156) #27	CRIP3 (ENSCLAG00000010491) #28	SLC22A7 (ENSCLAG00000009201) #29	TTBK1 (ENSCLAG00000012525) #30	DNPH1 (ENSCLAG00000011315) #31	CUL9 (ENSCLAG00000013036) #32	SRF (ENSCLAG00000010541) #33	PTK7 (ENSCLAG00000011720) #34	KLC4 (ENSCLAG00000012910) #35	MRPL2 (ENSCLAG00000011117) #36	CUL7 (ENSCLAG00000009633) #37
Degu	MODERN SPECIES	46	NFKBIE (ENSODEG00000015243) #7	SLC35B2 (ENSODEG00000015458) #8	ENSODEG00000015488 ##9	ENSODEG00000015863	CAPN11 (ENSODEG00000015728) #11	TMEM63B (ENSODEG00000015474) #12	MRPL14 (ENSODEG00000015718) #13	ENSODEG00000016904 #14	MRPS18A (ENSODEG00000015388) #15	RSPH9 (ENSODEG00000015426) #16	MAD2L1BP (ENSODEG00000015761) #17	GTPBP2 (ENSODEG00000015979) #18	POLH (ENSODEG00000015994) #19	XPO5 (ENSODEG00000017078) #20	ENSODEG00000015831 #21	YIPF3 (ENSODEG00000016177) #22	LRRC73 (ENSODEG00000015609) #23	TJAP1 (ENSODEG00000016503) #24	DLK2 (ENSODEG00000015810) #25	ABCC10 (ENSODEG00000016331) #26	ZNF318 (ENSODEG00000015646) #27	ENSODEG00000020345	CRIP3 (ENSODEG00000015500) #28	SLC22A7 (ENSODEG00000016284) #29	ENSODEG00000015919 #30	DNPH1 (ENSODEG00000015708) #31	CUL9 (ENSODEG00000016007) #32	SRF (ENSODEG00000016147) #33	PTK7 (ENSODEG00000015717) #34	KLC4 (ENSODEG00000016341) #35	MRPL2 (ENSODEG00000015619) #36