Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157927 #7 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #8 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #9 ENSGT00490000044373 #10 ENSGT00940000158672 #11 ENSGT00940000157084 #12 ENSGT00390000001121 #13 ENSGT00940000157284 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00390000018686 #16 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #27 ENSGT00940000161321 #28 ENSGT00940000154922.b #29 ENSGT00940000160981 #30 ENSGT00390000001216 #31 ENSGT00940000153954.e #32 ENSGT00400000022158 #33 ENSGT00940000157908 #34 ENSGT00940000161323 #35 ENSGT00940000153244.A #36 ENSGT00940000153954.f #37 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #8 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #9 ENSGT00490000044373 #10 ENSGT00940000158672 #11 ENSGT00940000157084 #12 ENSGT00390000001121 #13 ENSGT00960000190714 ENSGT00940000157284 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00390000018686 #16 ENSGT00390000003812.h #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #27 ENSGT00940000161321 #28 ENSGT00940000154922.b #29 ENSGT00940000160981 #30 ENSGT00390000001216 #31 ENSGT00940000153954.e #32 ENSGT00400000022158 #33 ENSGT00940000157908 #34 ENSGT00940000161323 #35 ENSGT00940000153244.A #36 ENSGT00940000153954.f #37 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #8 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #9 ENSGT00490000044373 #10 ENSGT00940000158672 #11 ENSGT00940000157084 #12 ENSGT00390000001121 #13 ENSGT00960000190714 ENSGT00940000157284 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00390000018686 #16 ENSGT00390000003812.h #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #27 ENSGT00940000161321 #28 ENSGT00940000154922.b #29 ENSGT00940000160981 #30 ENSGT00390000001216 #31 ENSGT00940000153954.e #32 ENSGT00400000022158 #33 ENSGT00940000157908 #34 ENSGT00940000161323 #35 ENSGT00940000153244.A #36 ENSGT00940000153954.f #37 Squirrel MODERN SPECIES 76 SLC35B2 (ENSSTOG00000026446) #7 HSP90AB1 (ENSSTOG00000024614) #8 SLC29A1 (ENSSTOG00000003337) #9 MYMX (ENSSTOG00000030271) #10 CAPN11 (ENSSTOG00000003304) #11 TMEM63B (ENSSTOG00000007096) #12 MRPL14 (ENSSTOG00000004549) #13 VEGFA (ENSSTOG00000008877) #14 MRPS18A (ENSSTOG00000004490) #15 RSPH9 (ENSSTOG00000028063) #16 MAD2L1BP (ENSSTOG00000028891) #17 GTPBP2 (ENSSTOG00000021274) #18 POLH (ENSSTOG00000010681) #19 XPO5 (ENSSTOG00000020172) #20 POLR1C (ENSSTOG00000010631) #21 YIPF3 (ENSSTOG00000010624) #22 LRRC73 (ENSSTOG00000010618) #23 TJAP1 (ENSSTOG00000010606) #24 DLK2 (ENSSTOG00000010600) #25 ABCC10 (ENSSTOG00000010566) #26 ENSSTOG00000012280 #27 CRIP3 (ENSSTOG00000024025) #28 SLC22A7 (ENSSTOG00000024272) #29 TTBK1 (ENSSTOG00000014248) #30 DNPH1 (ENSSTOG00000026925) #31 CUL9 (ENSSTOG00000014226) #32 SRF (ENSSTOG00000014222) #33 PTK7 (ENSSTOG00000014198) #34 KLC4 (ENSSTOG00000014183) #35 MRPL2 (ENSSTOG00000023948) #36 CUL7 (ENSSTOG00000009522) #37 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 25 MAD2L1BP (ENSUPAG00010018636) ##17 GTPBP2 (ENSUPAG00010018626) #18 POLH (ENSUPAG00010018589) #19 XPO5 (ENSUPAG00010018556) #20 POLR1C (ENSUPAG00010018540) #21 YIPF3 (ENSUPAG00010018525) #22 LRRC73 (ENSUPAG00010018517) #23 TJAP1 (ENSUPAG00010018437) #24 DLK2 (ENSUPAG00010018412) #25 ABCC10 (ENSUPAG00010018361) #26 ZNF318 (ENSUPAG00010018340) #27 CRIP3 (ENSUPAG00010018305) #28 SLC22A7 (ENSUPAG00010018280) #29 TTBK1 (ENSUPAG00010018241) #30 DNPH1 (ENSUPAG00010018235) #31 ENSUPAG00010018229 #32 ENSUPAG00010018129 #32 SRF (ENSUPAG00010018113) #33 PTK7 (ENSUPAG00010018092) #34 KLC4 (ENSUPAG00010018084) #35 MRPL2 (ENSUPAG00010018077) #36 Alpin marmot MODERN SPECIES 20 HSP90AB1 (ENSMMMG00000024577) #8 SLC29A1 (ENSMMMG00000024571) #9 MYMX (ENSMMMG00000024570) #10 CAPN11 (ENSMMMG00000024569) #11 TMEM63B (ENSMMMG00000024568) #12 MRPL14 (ENSMMMG00000024567) #13 ENSMMMG00000024566 VEGFA (ENSMMMG00000024565) #14 MRPS18A (ENSMMMG00000024564) #15 RSPH9 (ENSMMMG00000024563) #16 ENSMMMG00000024562 ##17 GTPBP2 (ENSMMMG00000024561) #18 POLH (ENSMMMG00000024560) #19 XPO5 (ENSMMMG00000024559) #20 POLR1C (ENSMMMG00000024558) #21 YIPF3 (ENSMMMG00000024557) #22 LRRC73 (ENSMMMG00000024556) #23 TJAP1 (ENSMMMG00000024555) #24 DLK2 (ENSMMMG00000024553) #25 ABCC10 (ENSMMMG00000024552) #26 ENSMMMG00000024551 ZNF318 (ENSMMMG00000024550) #27 CRIP3 (ENSMMMG00000024549) #28 SLC22A7 (ENSMMMG00000024548) #29 TTBK1 (ENSMMMG00000024547) #30 DNPH1 (ENSMMMG00000024546) #31 CUL9 (ENSMMMG00000024544) #32 SRF (ENSMMMG00000024543) #33 PTK7 (ENSMMMG00000024542) #34 KLC4 (ENSMMMG00000024541) #35 MRPL2 (ENSMMMG00000024538) #36 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 16 HSP90AB1 (ENSSVLG00005004982) #8 SLC29A1 (ENSSVLG00005004999) #9 MYMX (ENSSVLG00005005017) #10 CAPN11 (ENSSVLG00005005041) #11 TMEM63B (ENSSVLG00005005124) #12 MRPL14 (ENSSVLG00005005175) #13 VEGFA (ENSSVLG00005005248) #14 MRPS18A (ENSSVLG00005005389) #15 RSPH9 (ENSSVLG00005005429) #16 MAD2L1BP (ENSSVLG00005005455) #17 ENSSVLG00005005500 #18 POLH (ENSSVLG00005005606) #19 ENSSVLG00005005709 XPO5 (ENSSVLG00005005755) #20 POLR1C (ENSSVLG00005005820) #21 YIPF3 (ENSSVLG00005005873) #22 LRRC73 (ENSSVLG00005005929) #23 TJAP1 (ENSSVLG00005005960) #24 DLK2 (ENSSVLG00005006024) #25 ABCC10 (ENSSVLG00005006073) #26 ZNF318 (ENSSVLG00005006110) #27 CRIP3 (ENSSVLG00005006201) #28 SLC22A7 (ENSSVLG00005006303) #29 TTBK1 (ENSSVLG00005006427) #30 DNPH1 (ENSSVLG00005006570) #31 CUL9 (ENSSVLG00005006664) #32 SRF (ENSSVLG00005006722) #33 PTK7 (ENSSVLG00005006890) #34 KLC4 (ENSSVLG00005007306) #35 MRPL2 (ENSSVLG00005007449) #36 CUL7 (ENSSVLG00005007507) #37