Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157927 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Glires ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157927 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157927 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157927 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157927 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000157927 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00860000135742 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00860000135742 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f.a ##34 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00860000135742 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f.a ##34 Prairie vole MODERN SPECIES 352 Adgrf4 (ENSMOCG00000007247) #7 Opn5 (ENSMOCG00000015157) #8 Ptchd4 (ENSMOCG00000009170) #9 Mmut (ENSMOCG00000006660) #10 Cenpq (ENSMOCG00000020003) #11 Glyatl3 (ENSMOCG00000010563) #12 Rhag (ENSMOCG00000017965) #13 Crisp2 (ENSMOCG00000015071) #14 ENSMOCG00000007214 #15 ENSMOCG00000006213 #16 Mad2l1bp (ENSMOCG00000010147) #17 Gtpbp2 (ENSMOCG00000014945) #18 Polh (ENSMOCG00000014193) #19 Xpo5 (ENSMOCG00000016105) #20 Polr1c (ENSMOCG00000017549) #21 Yipf3 (ENSMOCG00000013556) #22 Lrrc73 (ENSMOCG00000013005) #23 Tjap1 (ENSMOCG00000019758) #24 Dlk2 (ENSMOCG00000010846) #25 ENSMOCG00000011089 #26 ENSMOCG00000003424 #27 ENSMOCG00000019472 #28 Zfp318 (ENSMOCG00000017163) #29 Crip3 (ENSMOCG00000016524) #30 Slc22a7 (ENSMOCG00000019817) #31 Ttbk1 (ENSMOCG00000017960) #32 Dnph1 (ENSMOCG00000016980) #33 Cul9 (ENSMOCG00000012664) #34 Srf (ENSMOCG00000018008) #35 Ptk7 (ENSMOCG00000006889) #36 Klc4 (ENSMOCG00000001647) #37 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 13 Slc35b2 (ENSPEMG00000010433) ENSPEMG00000020801 Slc29a1 (ENSPEMG00000012099) Mymx (ENSPEMG00000031136) Capn11 (ENSPEMG00000016267) Tmem63b (ENSPEMG00000020790) ENSPEMG00000007451 Vegfa (ENSPEMG00000023496) Mrps18a (ENSPEMG00000000405) Rsph9 (ENSPEMG00000011206) Mad2l1bp (ENSPEMG00000003113) #17 Gtpbp2 (ENSPEMG00000021976) #18 Polh (ENSPEMG00000014884) #19 Xpo5 (ENSPEMG00000020387) #20 Polr1c (ENSPEMG00000006970) #21 Yipf3 (ENSPEMG00000013680) #22 Lrrc73 (ENSPEMG00000010422) #23 Tjap1 (ENSPEMG00000000063) #24 Dlk2 (ENSPEMG00000014891) #25 Abcc10 (ENSPEMG00000008293) #26 ENSPEMG00000024236 #29 Crip3 (ENSPEMG00000015270) #30 Slc22a7 (ENSPEMG00000010267) #31 Ttbk1 (ENSPEMG00000023732) #32 Dnph1 (ENSPEMG00000017242) #33 Cul9 (ENSPEMG00000023429) #34 Srf (ENSPEMG00000024074) #35 Ptk7 (ENSPEMG00000008577) #36 Klc4 (ENSPEMG00000013017) #37 Mrpl2 (ENSPEMG00000009477) ENSPEMG00000029429 ##34 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000157927 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f.a ##34 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 184 Mdfi (ENSCGRG00001012532) Tfeb (ENSCGRG00001012215) Pgc (ENSCGRG00001020240) Frs3 (ENSCGRG00001017194) Prickle4 (ENSCGRG00001021444) Tomm6 (ENSCGRG00001023467) Usp49 (ENSCGRG00001017792) Med20 (ENSCGRG00001018311) ENSCGRG00001022668 Rsph9 (ENSCGRG00001023633) ENSCGRG00001000765 #17 Gtpbp2 (ENSCGRG00001006422) #18 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ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00860000135742 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00860000135742 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00860000135742 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 spretus MODERN SPECIES 8 Hsp90ab1 (MGP_SPRETEiJ_G0022560) Slc29a1 (MGP_SPRETEiJ_G0022561) Mymx (MGP_SPRETEiJ_G0022562) Capn11 (MGP_SPRETEiJ_G0022563) Tmem63b (MGP_SPRETEiJ_G0022564) Mrpl14 (MGP_SPRETEiJ_G0022565) 1600014C23Rik (MGP_SPRETEiJ_G0022566) Vegfa (MGP_SPRETEiJ_G0022567) Mrps18a (MGP_SPRETEiJ_G0022568) Rsph9 (MGP_SPRETEiJ_G0022569) Mad2l1bp (MGP_SPRETEiJ_G0022570) #17 Gtpbp2 (MGP_SPRETEiJ_G0022571) #18 Polh (MGP_SPRETEiJ_G0022572) #19 Xpo5 (MGP_SPRETEiJ_G0022573) #20 Polr1c (MGP_SPRETEiJ_G0022574) #21 Yipf3 (MGP_SPRETEiJ_G0022575) #22 Lrrc73 (MGP_SPRETEiJ_G0022576) 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ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 25 MAD2L1BP (ENSUPAG00010018636) #17 GTPBP2 (ENSUPAG00010018626) #18 POLH (ENSUPAG00010018589) #19 XPO5 (ENSUPAG00010018556) #20 POLR1C (ENSUPAG00010018540) #21 YIPF3 (ENSUPAG00010018525) #22 LRRC73 (ENSUPAG00010018517) #23 TJAP1 (ENSUPAG00010018437) #24 DLK2 (ENSUPAG00010018412) #25 ABCC10 (ENSUPAG00010018361) #26 ZNF318 (ENSUPAG00010018340) #29 CRIP3 (ENSUPAG00010018305) #30 SLC22A7 (ENSUPAG00010018280) #31 TTBK1 (ENSUPAG00010018241) #32 DNPH1 (ENSUPAG00010018235) #33 ENSUPAG00010018229 #34 ENSUPAG00010018129 #34 SRF (ENSUPAG00010018113) #35 PTK7 (ENSUPAG00010018092) #36 KLC4 (ENSUPAG00010018084) #37 MRPL2 (ENSUPAG00010018077) Squirrel MODERN SPECIES 76 SLC35B2 (ENSSTOG00000026446) HSP90AB1 (ENSSTOG00000024614) SLC29A1 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TMEM63B (ENSMMMG00000024568) MRPL14 (ENSMMMG00000024567) ENSMMMG00000024566 VEGFA (ENSMMMG00000024565) MRPS18A (ENSMMMG00000024564) RSPH9 (ENSMMMG00000024563) ENSMMMG00000024562 #17 GTPBP2 (ENSMMMG00000024561) #18 POLH (ENSMMMG00000024560) #19 XPO5 (ENSMMMG00000024559) #20 POLR1C (ENSMMMG00000024558) #21 YIPF3 (ENSMMMG00000024557) #22 LRRC73 (ENSMMMG00000024556) #23 TJAP1 (ENSMMMG00000024555) #24 DLK2 (ENSMMMG00000024553) #25 ABCC10 (ENSMMMG00000024552) #26 ENSMMMG00000024551 ZNF318 (ENSMMMG00000024550) #29 CRIP3 (ENSMMMG00000024549) #30 SLC22A7 (ENSMMMG00000024548) #31 TTBK1 (ENSMMMG00000024547) #32 DNPH1 (ENSMMMG00000024546) #33 CUL9 (ENSMMMG00000024544) #34 SRF (ENSMMMG00000024543) #35 PTK7 (ENSMMMG00000024542) #36 KLC4 (ENSMMMG00000024541) #37 MRPL2 (ENSMMMG00000024538) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 16 HSP90AB1 (ENSSVLG00005004982) SLC29A1 (ENSSVLG00005004999) MYMX (ENSSVLG00005005017) CAPN11 (ENSSVLG00005005041) TMEM63B (ENSSVLG00005005124) MRPL14 (ENSSVLG00005005175) VEGFA (ENSSVLG00005005248) MRPS18A (ENSSVLG00005005389) RSPH9 (ENSSVLG00005005429) MAD2L1BP (ENSSVLG00005005455) #17 ENSSVLG00005005500 #18 POLH (ENSSVLG00005005606) #19 ENSSVLG00005005709 XPO5 (ENSSVLG00005005755) #20 POLR1C (ENSSVLG00005005820) #21 YIPF3 (ENSSVLG00005005873) #22 LRRC73 (ENSSVLG00005005929) #23 TJAP1 (ENSSVLG00005005960) #24 DLK2 (ENSSVLG00005006024) #25 ABCC10 (ENSSVLG00005006073) #26 ZNF318 (ENSSVLG00005006110) #29 CRIP3 (ENSSVLG00005006201) #30 SLC22A7 (ENSSVLG00005006303) #31 TTBK1 (ENSSVLG00005006427) #32 DNPH1 (ENSSVLG00005006570) #33 CUL9 (ENSSVLG00005006664) #34 SRF (ENSSVLG00005006722) #35 PTK7 (ENSSVLG00005006890) #36 KLC4 (ENSSVLG00005007306) #37 MRPL2 (ENSSVLG00005007449) CUL7 (ENSSVLG00005007507) ##34 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157927 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00490000044373 ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 4 SLC35B2 (ENSHGLG00000013337) HSP90AB1 (ENSHGLG00000013490) SLC29A1 (ENSHGLG00000013873) MYMX (ENSHGLG00000014348) ENSHGLG00000034302 TMEM63B (ENSHGLG00000014725) MRPL14 (ENSHGLG00000048124) VEGFA (ENSHGLG00000045954) MRPS18A (ENSHGLG00000014356) RSPH9 (ENSHGLG00000050155) MAD2L1BP (ENSHGLG00000014709) #17 GTPBP2 (ENSHGLG00000014886) #18 POLH (ENSHGLG00000019433) #19 XPO5 (ENSHGLG00000019191) #20 POLR1C (ENSHGLG00000039530) #21 YIPF3 (ENSHGLG00000019245) #22 LRRC73 (ENSHGLG00000019162) #23 TJAP1 (ENSHGLG00000050716) #24 DLK2 (ENSHGLG00000017186) #25 ABCC10 (ENSHGLG00000017199) #26 ZNF318 (ENSHGLG00000017209) #29 CRIP3 (ENSHGLG00000017216) #30 SLC22A7 (ENSHGLG00000019228) #31 TTBK1 (ENSHGLG00000019189) #32 DNPH1 (ENSHGLG00000045212) #33 CUL9 (ENSHGLG00000019373) #34 ENSHGLG00000019183 #35 ENSHGLG00000049441 #36 ENSHGLG00000032903 ENSHGLG00000017195 ZBTB22 (ENSHGLG00000017146) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159120 ENSGT00940000157927 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159120 ENSGT00940000157927 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b ENSGT00940000158672 ENSGT00940000157084 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000006493 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000003812 #17 ENSGT00940000155636 #18 ENSGT00940000157048 #19 ENSGT00940000153408.A #20 ENSGT00950000183100.B #21 ENSGT00940000153766.A #22 ENSGT00390000003256 #23 ENSGT00940000161543 #24 ENSGT00940000160761 #25 ENSGT00940000161082 #26 ENSGT00390000000614 #29 ENSGT00940000161321 #30 ENSGT00940000154922.b #31 ENSGT00940000160981 #32 ENSGT00390000001216 #33 ENSGT00940000153954.e #34 ENSGT00400000022158 #35 ENSGT00940000157908 #36 ENSGT00940000161323 #37 ENSGT00940000153244.A ENSGT00940000153954.f ##34 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 144 NFKBIE (ENSCLAG00000011710) SLC35B2 (ENSCLAG00000010878) HSP90AB1 (ENSCLAG00000015740) SLC29A1 (ENSCLAG00000010529) CAPN11 (ENSCLAG00000013084) TMEM63B (ENSCLAG00000014238) MRPL14 (ENSCLAG00000016855) ENSCLAG00000014201 MRPS18A (ENSCLAG00000012929) RSPH9 (ENSCLAG00000012706) MAD2L1BP (ENSCLAG00000011121) #17 GTPBP2 (ENSCLAG00000010271) #18 POLH (ENSCLAG00000010068) #19 XPO5 (ENSCLAG00000009723) #20 POLR1C (ENSCLAG00000009266) #21 YIPF3 (ENSCLAG00000015747) #22 LRRC73 (ENSCLAG00000015757) #23 TJAP1 (ENSCLAG00000009058) #24 DLK2 (ENSCLAG00000012976) #25 ABCC10 (ENSCLAG00000012360) #26 ZNF318 (ENSCLAG00000009156) #29 CRIP3 (ENSCLAG00000010491) #30 SLC22A7 (ENSCLAG00000009201) #31 TTBK1 (ENSCLAG00000012525) #32 DNPH1 (ENSCLAG00000011315) #33 CUL9 (ENSCLAG00000013036) #34 SRF (ENSCLAG00000010541) #35 PTK7 (ENSCLAG00000011720) #36 KLC4 (ENSCLAG00000012910) #37 MRPL2 (ENSCLAG00000011117) CUL7 (ENSCLAG00000009633) ##34 Degu MODERN SPECIES 46 NFKBIE 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