Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b #7	ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #8	ENSGT00490000044373	ENSGT00940000158672 #9	ENSGT00940000165752 #10	ENSGT00940000157084 #11	ENSGT00390000001121 #12	ENSGT00940000157284 #13	ENSGT00390000006493 #14	ENSGT00390000018686 #16	ENSGT00390000003812 #17	ENSGT00940000155636 #18	ENSGT00940000157048 #19	ENSGT00940000153408.A.d #20	ENSGT00950000183100.B #21	ENSGT00940000153766.A #22	ENSGT00390000003256 #24	ENSGT00940000161543 #23	ENSGT00940000160761 #25	ENSGT00940000161082 #26	ENSGT00390000000614 #27	ENSGT00940000161321 #28	ENSGT00940000154922.b #29	ENSGT00940000160981 #30	ENSGT00390000001216 #31	ENSGT00940000153954.e #32	ENSGT00400000022158 #33	ENSGT00940000157908 #34	ENSGT00940000161323 #35	ENSGT00940000153244.A #36	ENSGT00940000153954.f #37
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b #7	ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #8	ENSGT00490000044373	ENSGT00940000158672 #9	ENSGT00940000165752 #10	ENSGT00940000157084 #11	ENSGT00390000001121 #12	ENSGT00940000157284 #13	ENSGT00390000006493 #14	ENSGT00390000018686 #16	ENSGT00390000003812 #17	ENSGT00940000155636 #18	ENSGT00940000157048 #19	ENSGT00940000153408.A.d #20	ENSGT00950000183100.B #21	ENSGT00940000153766.A #22	ENSGT00390000003256 #24	ENSGT00940000161543 #23	ENSGT00940000160761 #25	ENSGT00940000161082 #26	ENSGT00390000000614 #27	ENSGT00940000161321 #28	ENSGT00940000154922.b #29	ENSGT00940000160981 #30	ENSGT00390000001216 #31	ENSGT00940000153954.e #32	ENSGT00400000022158 #33	ENSGT00940000157908 #34	ENSGT00940000161323 #35	ENSGT00940000153244.A #36	ENSGT00940000153954.f #37
Goat	MODERN SPECIES	15	ENSCHIG00000017807 #7	SLC29A1 (ENSCHIG00000022410) #8	CAPN11 (ENSCHIG00000010362) #9	ENSCHIG00000017964 #10	TMEM63B (ENSCHIG00000010295) #11	MRPL14 (ENSCHIG00000016433) #12	VEGFA (ENSCHIG00000009242) #13	MRPS18A (ENSCHIG00000013039) #14	ENSCHIG00000006683 #15	RSPH9 (ENSCHIG00000014085) #16	MAD2L1BP (ENSCHIG00000008563) #17	GTPBP2 (ENSCHIG00000011328) #18	POLH (ENSCHIG00000010328) #19	XPO5 (ENSCHIG00000011271) #20	POLR1C (ENSCHIG00000004352) #21	YIPF3 (ENSCHIG00000012623) #22	TJAP1 (ENSCHIG00000021772) #23	LRRC73 (ENSCHIG00000022549) #24	DLK2 (ENSCHIG00000005158) #25	ABCC10 (ENSCHIG00000016995) #26	ZNF318 (ENSCHIG00000003026) #27	CRIP3 (ENSCHIG00000016523) #28	SLC22A7 (ENSCHIG00000017192) #29	TTBK1 (ENSCHIG00000011661) #30	DNPH1 (ENSCHIG00000014711) #31	CUL9 (ENSCHIG00000014269) #32	SRF (ENSCHIG00000012065) #33	PTK7 (ENSCHIG00000019771) #34	KLC4 (ENSCHIG00000010669) #35	MRPL2 (ENSCHIG00000017416) #36	CUL7 (ENSCHIG00000015144) #37
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	12	HSP90AB1 (ENSOARG00020024426) #7	SLC29A1 (ENSOARG00020024417) #8	MYMX (ENSOARG00020024406)	CAPN11 (ENSOARG00020024352) #9	TMEM63B (ENSOARG00020024328) #11	MRPL14 (ENSOARG00020024309) #12	VEGFA (ENSOARG00020022857) #13	ENSOARG00020022732 ##15	MRPS18A (ENSOARG00020022680) #14	RSPH9 (ENSOARG00020022645) #16	MAD2L1BP (ENSOARG00020022622) #17	GTPBP2 (ENSOARG00020022529) #18	POLH (ENSOARG00020022497) #19	XPO5 (ENSOARG00020022433) #20	POLR1C (ENSOARG00020022290) #21	YIPF3 (ENSOARG00020022197) #22	LRRC73 (ENSOARG00020022144) #24	TJAP1 (ENSOARG00020021973) #23	DLK2 (ENSOARG00020021941) #25	ABCC10 (ENSOARG00020021781) #26	ZNF318 (ENSOARG00020021662) #27	CRIP3 (ENSOARG00020021515) #28	SLC22A7 (ENSOARG00020021341) #29	TTBK1 (ENSOARG00020020989) #30	DNPH1 (ENSOARG00020020949) #31	CUL9 (ENSOARG00020019931) #32	SRF (ENSOARG00020019777) #33	KLC4 (ENSOARG00020019543) #35	MRPL2 (ENSOARG00020019391) #36	CUL7 (ENSOARG00020019219) #37	RRP36 (ENSOARG00020019171)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b #7	ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #8	ENSGT00490000044373	ENSGT00940000158672 #9	ENSGT00940000165752 #10	ENSGT00940000157084 #11	ENSGT00390000001121 #12	ENSGT00940000157284 #13	ENSGT00390000006493 #14	ENSGT00390000018686 #16	ENSGT00390000003812 #17	ENSGT00940000155636 #18	ENSGT00940000157048 #19	ENSGT00940000153408.A.d #20	ENSGT00950000183100.B #21	ENSGT00940000153766.A #22	ENSGT00390000003256 #24	ENSGT00940000161543 #23	ENSGT00940000160761 #25	ENSGT00940000161082 #26	ENSGT00390000000614 #27	ENSGT00940000161321 #28	ENSGT00940000154922.b #29	ENSGT00940000160981 #30	ENSGT00390000001216.d.b #31	ENSGT00940000153954.e #32	ENSGT00400000022158 #33	ENSGT00940000157908 #34	ENSGT00940000161323 #35	ENSGT00940000153244.A #36	ENSGT00940000153954.f #37
American bison	MODERN SPECIES	3345	ENSBBBG00000009167 #7	SLC29A1 (ENSBBBG00000019250) #8	MYMX (ENSBBBG00000019201)	CAPN11 (ENSBBBG00000004944) #9	ENSBBBG00000019176 #10	TMEM63B (ENSBBBG00000019165) #11	MRPL14 (ENSBBBG00000019131) #12	VEGFA (ENSBBBG00000004895) #13	MRPS18A (ENSBBBG00000019022) #14	RSPH9 (ENSBBBG00000004846) #16	MAD2L1BP (ENSBBBG00000004843) #17	GTPBP2 (ENSBBBG00000004840) #18	POLH (ENSBBBG00000004824) #19	XPO5 (ENSBBBG00000018959) #20	POLR1C (ENSBBBG00000018932) #21	YIPF3 (ENSBBBG00000004770) #22	LRRC73 (ENSBBBG00000018869) #24	ENSBBBG00000018854	DLK2 (ENSBBBG00000018845) #25	ABCC10 (ENSBBBG00000018811) #26	ZNF318 (ENSBBBG00000004718) #27	CRIP3 (ENSBBBG00000004705) #28	SLC22A7 (ENSBBBG00000018739) #29	TTBK1 (ENSBBBG00000018712) #30	ENSBBBG00000018693 #31	CUL9 (ENSBBBG00000018662) #32	SRF (ENSBBBG00000018544) #33	PTK7 (ENSBBBG00000004566) #34	KLC4 (ENSBBBG00000018482) #35	MRPL2 (ENSBBBG00000018394) #36	ENSBBBG00000018349 #37
Bos	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b #7	ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #8	ENSGT00490000044373	ENSGT00940000158672 #9	ENSGT00940000165752 #10	ENSGT00940000157084 #11	ENSGT00390000001121 #12	ENSGT00940000157284 #13	ENSGT00390000006493 #14	ENSGT00390000018686 #16	ENSGT00390000003812 #17	ENSGT00940000155636 #18	ENSGT00940000157048 #19	ENSGT00940000153408.A.d #20	ENSGT00950000183100.B #21	ENSGT00940000153766.A #22	ENSGT00390000003256 #24	ENSGT00940000161543 #23	ENSGT00940000160761 #25	ENSGT00940000161082 #26	ENSGT00390000000614 #27	ENSGT00940000161321 #28	ENSGT00940000154922.b #29	ENSGT00940000160981 #30	ENSGT00390000001216.d.b #31	ENSGT00940000153954.e #32	ENSGT00400000022158 #33	ENSGT00940000157908 #34	ENSGT00940000161323 #35	ENSGT00940000153244.A #36	ENSGT00940000153954.f #37
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b #7	ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #8	ENSGT00490000044373	ENSGT00940000158672 #9	ENSGT00940000165752 #10	ENSGT00940000157084 #11	ENSGT00390000001121 #12	ENSGT00940000157284 #13	ENSGT00390000006493 #14	ENSGT00390000018686 #16	ENSGT00390000003812 #17	ENSGT00940000155636 #18	ENSGT00940000157048 #19	ENSGT00940000153408.A.d #20	ENSGT00950000183100.B #21	ENSGT00940000153766.A #22	ENSGT00390000003256 #24	ENSGT00940000161543 #23	ENSGT00940000160761 #25	ENSGT00940000161082 #26	ENSGT00390000000614 #27	ENSGT00940000161321 #28	ENSGT00940000154922.b #29	ENSGT00940000160981 #30	ENSGT00390000001216.d.b #31	ENSGT00940000153954.e #32	ENSGT00400000022158 #33	ENSGT00940000157908 #34	ENSGT00940000161323 #35	ENSGT00940000153244.A #36	ENSGT00940000153954.f #37
Wild yak	MODERN SPECIES	1156	ENSBMUG00000011676 #7	SLC29A1 (ENSBMUG00000011739) #8	MYMX (ENSBMUG00000011878)	CAPN11 (ENSBMUG00000011894) #9	ENSBMUG00000011908 #10	TMEM63B (ENSBMUG00000011927) #11	MRPL14 (ENSBMUG00000011949) #12	ENSBMUG00000011996 #13	MRPS18A (ENSBMUG00000012027) #14	RSPH9 (ENSBMUG00000012049) #16	MAD2L1BP (ENSBMUG00000012054) #17	GTPBP2 (ENSBMUG00000012068) #18	POLH (ENSBMUG00000012084) #19	XPO5 (ENSBMUG00000012108) #20	POLR1C (ENSBMUG00000012129) #21	YIPF3 (ENSBMUG00000012145) #22	LRRC73 (ENSBMUG00000012153) #24	TJAP1 (ENSBMUG00000012199) #23	DLK2 (ENSBMUG00000012238) #25	ABCC10 (ENSBMUG00000012259) #26	ZNF318 (ENSBMUG00000012273) #27	CRIP3 (ENSBMUG00000012319) #28	SLC22A7 (ENSBMUG00000012334) #29	TTBK1 (ENSBMUG00000012411) #30	DNPH1 (ENSBMUG00000012524) #31	CUL9 (ENSBMUG00000012576) #32	SRF (ENSBMUG00000012595) #33	PTK7 (ENSBMUG00000012742) #34	KLC4 (ENSBMUG00000012876) #35	MRPL2 (ENSBMUG00000012933) #36	CUL7 (ENSBMUG00000012982) #37
Domestic yak	MODERN SPECIES	16	SLC35B2 (ENSBGRG00000007502)	SLC29A1 (ENSBGRG00000007719) #8	MYMX (ENSBGRG00000008830)	ENSBGRG00000008841	TMEM63B (ENSBGRG00000008917) #11	ENSBGRG00000009756 #10	ENSBGRG00000009813 #12	VEGFA (ENSBGRG00000010227) #13	ENSBGRG00000010432 #14	RSPH9 (ENSBGRG00000010763) #16	MAD2L1BP (ENSBGRG00000010868) #17	GTPBP2 (ENSBGRG00000011005) #18	POLH (ENSBGRG00000011380) #19	XPO5 (ENSBGRG00000011470) #20	POLR1C (ENSBGRG00000011968) #21	YIPF3 (ENSBGRG00000012257) #22	LRRC73 (ENSBGRG00000012584) #24	TJAP1 (ENSBGRG00000012682) #23	DLK2 (ENSBGRG00000012938) #25	ABCC10 (ENSBGRG00000012998) #26	ZNF318 (ENSBGRG00000013542) #27	CRIP3 (ENSBGRG00000013743) #28	SLC22A7 (ENSBGRG00000014004) #29	ENSBGRG00000014322 #30	ENSBGRG00000014485 #31	SRF (ENSBGRG00000018179) #33	PTK7 (ENSBGRG00000018313) #34	KLC4 (ENSBGRG00000019525) #35	MRPL2 (ENSBGRG00000019931) #36	CUL7 (ENSBGRG00000020196) #37	RRP36 (ENSBGRG00000020475)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b #7	ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #8	ENSGT00490000044373	ENSGT00940000158672 #9	ENSGT00940000165752 #10	ENSGT00940000157084 #11	ENSGT00390000001121 #12	ENSGT00940000157284 #13	ENSGT00390000006493 #14	ENSGT00390000018686 #16	ENSGT00390000003812 #17	ENSGT00940000155636 #18	ENSGT00940000157048 #19	ENSGT00940000153408.A.d #20	ENSGT00950000183100.B #21	ENSGT00940000153766.A #22	ENSGT00390000003256 #24	ENSGT00940000161543 #23	ENSGT00940000160761 #25	ENSGT00940000161082 #26	ENSGT00390000000614 #27	ENSGT00940000161321 #28	ENSGT00940000154922.b #29	ENSGT00940000160981 #30	ENSGT00390000001216.d.b #31	ENSGT00940000153954.e #32	ENSGT00400000022158 #33	ENSGT00940000157908 #34	ENSGT00940000161323 #35	ENSGT00940000153244.A #36	ENSGT00940000153954.f #37
Cow	MODERN SPECIES	15	SLC29A1 (ENSBTAG00000015131) #8	MYMX (ENSBTAG00000049369)	ENSBTAG00000053551 #9	ENSBTAG00000050117 #10	CAPN11 (ENSBTAG00000021066) #9	TMEM63B (ENSBTAG00000032680) #11	ENSBTAG00000050249	VEGFA (ENSBTAG00000005339) #13	MRPS18A (ENSBTAG00000025571) #14	RSPH9 (ENSBTAG00000009549) #16	MAD2L1BP (ENSBTAG00000009548) #17	GTPBP2 (ENSBTAG00000006016) #18	POLH (ENSBTAG00000006015) #19	XPO5 (ENSBTAG00000018970) #20	POLR1C (ENSBTAG00000018969) #21	YIPF3 (ENSBTAG00000018967) #22	LRRC73 (ENSBTAG00000025554) #24	TJAP1 (ENSBTAG00000011189) #23	DLK2 (ENSBTAG00000005850) #25	ABCC10 (ENSBTAG00000005842) #26	ZNF318 (ENSBTAG00000010217) #27	CRIP3 (ENSBTAG00000006357) #28	SLC22A7 (ENSBTAG00000006350) #29	TTBK1 (ENSBTAG00000046107) #30	DNPH1 (ENSBTAG00000019913) #31	CUL9 (ENSBTAG00000019908) #32	SRF (ENSBTAG00000012777) #33	PTK7 (ENSBTAG00000012761) #34	KLC4 (ENSBTAG00000012755) #35	MRPL2 (ENSBTAG00000012752) #36	CUL7 (ENSBTAG00000012749) #37
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	15	SLC35B2 (ENSBIXG00005028950)	ENSBIXG00005005101 #7	SLC29A1 (ENSBIXG00005029077) #8	MYMX (ENSBIXG00005029092)	ENSBIXG00005001907 #10	TMEM63B (ENSBIXG00005029176) #11	ENSBIXG00005029198 #12	VEGFA (ENSBIXG00005029350) #13	MRPS18A (ENSBIXG00005029321) #14	RSPH9 (ENSBIXG00005029313) #16	MAD2L1BP (ENSBIXG00005029309) #17	GTPBP2 (ENSBIXG00005029285) #18	POLH (ENSBIXG00005029268) #19	XPO5 (ENSBIXG00005000022) #20	POLR1C (ENSBIXG00005007888) #21	YIPF3 (ENSBIXG00005007907) #22	LRRC73 (ENSBIXG00005007915) #24	TJAP1 (ENSBIXG00005007955) #23	DLK2 (ENSBIXG00005007975) #25	ABCC10 (ENSBIXG00005007997) #26	ZNF318 (ENSBIXG00005008030) #27	CRIP3 (ENSBIXG00005008099) #28	SLC22A7 (ENSBIXG00005000127) #29	ENSBIXG00005008144 #31	ENSBIXG00005008153 #31	CUL9 (ENSBIXG00005008227) #32	SRF (ENSBIXG00005008263) #33	ENSBIXG00005008279	PTK7 (ENSBIXG00005008336) #34	KLC4 (ENSBIXG00005008424) #35	MRPL2 (ENSBIXG00005008468) #36