Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 205 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 118 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 135 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT01050000247759 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 Amniota ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154906.C.d ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154906.C.d ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Theria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Rat DUPLICATION Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 14 Dlx6 (ENSRNOG00000063630) ENSRNOG00000068262 Dlx5 (ENSRNOG00000010905) Sdhaf3 (ENSRNOG00000011283) Asns (ENSRNOG00000007546) Polr1d-ps1 (ENSRNOG00000065557) C1galt1 (ENSRNOG00000007804) Col28a1 (ENSRNOG00000033618) Mios (ENSRNOG00000007924) Rpa3 (ENSRNOG00000008309) Glcci1 (ENSRNOG00000008524) Ica1 (ENSRNOG00000008628) Nxph1 (ENSRNOG00000008939) Rps4x-ps9 (ENSRNOG00000029574) LOC500028 (ENSRNOG00000008962) ENSRNOG00000065391 #22 LOC680964 (ENSRNOG00000047566) ENSRNOG00000066267 Ndufa4 (ENSRNOG00000005512) Phf14 (ENSRNOG00000005775) Thsd7a (ENSRNOG00000030151) ENSRNOG00000068666 ENSRNOG00000069963 Tmem106b (ENSRNOG00000006206) Vwde (ENSRNOG00000024709) AABR07059877.1 (ENSRNOG00000039626) Tas2r7l (ENSRNOG00000024685) ENSRNOG00000064825 LOC100911252 (ENSRNOG00000062896) Tmem168 (ENSRNOG00000057290) Bmt2 (ENSRNOG00000007224) Rat MODERN SPECIES 14 Clec4d (ENSRNOG00000067848) Clec6a-ps1 (ENSRNOG00000010057) Clec4b2 (ENSRNOG00000027655) Clec4a (ENSRNOG00000010045) Clec4a2 (ENSRNOG00000030012) Clec4a3 (ENSRNOG00000010018) Clec4a1 (ENSRNOG00000042139) ENSRNOG00000030870 Necap1 (ENSRNOG00000009236) RGD1563551 (ENSRNOG00000068644) C3ar1 (ENSRNOG00000009211) Foxj2 (ENSRNOG00000009000) Slc2a3 (ENSRNOG00000008376) Nanog (ENSRNOG00000008368) ENSRNOG00000064705 ENSRNOG00000065131 #22 Gdf3 (ENSRNOG00000015331) Dppa3 (ENSRNOG00000022950) Apobec1 (ENSRNOG00000015411) Aicda (ENSRNOG00000015478) Mfap5 (ENSRNOG00000015505) Rimklb (ENSRNOG00000064238) Phc1 (ENSRNOG00000015191) M6pr (ENSRNOG00000014992) Klrg1 (ENSRNOG00000014918) Cpamd8 (ENSRNOG00000065350) Mug2 (ENSRNOG00000065574) Mug1 (ENSRNOG00000067685) LOC297568 (ENSRNOG00000070375) A2m (ENSRNOG00000028896) Iqsec3 (ENSRNOG00000014083) Rat MODERN SPECIES 14 ENSRNOG00000065775 RGD1564712 (ENSRNOG00000043158) Npy (ENSRNOG00000046449) Pals2 (ENSRNOG00000021579) Gsdme (ENSRNOG00000009970) Osbpl3 (ENSRNOG00000010011) AC113910.1 (ENSRNOG00000033274) Cycs-ps9 (ENSRNOG00000010452) LOC500124 (ENSRNOG00000010594) Npvf (ENSRNOG00000010806) ENSRNOG00000062862 Cux1-ps1 (ENSRNOG00000065301) Nfe2l3 (ENSRNOG00000010886) Hnrnpa2b1 (ENSRNOG00000011175) Cbx3 (ENSRNOG00000011814) AABR07060577.1 (ENSRNOG00000015328) #22 Snx10 (ENSRNOG00000011944) ENSRNOG00000064847 Skap2 (ENSRNOG00000012228) Hoxa1 (ENSRNOG00000005628) Hoxa2 (ENSRNOG00000005968) Hoxa3 (ENSRNOG00000006281) Hoxa4 (ENSRNOG00000027365) LOC103692127 (ENSRNOG00000047951) LOC100911511 (ENSRNOG00000048917) Hoxa7 (ENSRNOG00000046361) Hoxa9 (ENSRNOG00000064322) LOC100911668 (ENSRNOG00000065199) Hoxa11 (ENSRNOG00000059870) Hoxa11-as (ENSRNOG00000050564) Hoxa13 (ENSRNOG00000057061) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Golden Hamster MODERN SPECIES 869 Clec1b (ENSMAUG00000017334) Clec9a (ENSMAUG00000017304) Clec1a (ENSMAUG00000009798) Clec7a (ENSMAUG00000009835) ENSMAUG00000012697 Tmem52b (ENSMAUG00000011688) Gabarapl1 (ENSMAUG00000009080) Klre1 (ENSMAUG00000008490) Klrd1 (ENSMAUG00000015760) Klrk1 (ENSMAUG00000002635) ENSMAUG00000006550 Klrc1 (ENSMAUG00000014060) ENSMAUG00000005190 ENSMAUG00000001962 ENSMAUG00000004046 ENSMAUG00000000486 #22 ENSMAUG00000014803 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 18 Mpp7 (ENSPEMG00000019604) ENSPEMG00000025891 ENSPEMG00000025783 ENSPEMG00000025246 ENSPEMG00000028982 Fzd8 (ENSPEMG00000019393) Gjd4 (ENSPEMG00000019387) Ccny (ENSPEMG00000011106) ENSPEMG00000029993 ENSPEMG00000014994 Itgb1 (ENSPEMG00000011120) Nrp1 (ENSPEMG00000017771) Pard3 (ENSPEMG00000007876) ENSPEMG00000024328 Rbm34 (ENSPEMG00000000265) Tomm20 (ENSPEMG00000011555) #22 Irf2bp2 (ENSPEMG00000030068) Tarbp1 (ENSPEMG00000006888) Coa6 (ENSPEMG00000011207) Slc35f3 (ENSPEMG00000010485) Kcnk1 (ENSPEMG00000026612) Map3k21 (ENSPEMG00000018415) Pcnx2 (ENSPEMG00000018455) ENSPEMG00000018134 Map10 (ENSPEMG00000027554) Sipa1l2 (ENSPEMG00000010643) Disc1 (ENSPEMG00000016648) Tsnax (ENSPEMG00000028815) Egln1 (ENSPEMG00000003824) Sprtn (ENSPEMG00000013722) Exoc8 (ENSPEMG00000007121) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 10 ENSHGLG00000001392 EXTL2 (ENSHGLG00000047823) SLC30A7 (ENSHGLG00000001503) DPH5 (ENSHGLG00000001639) ENSHGLG00000037805 S1PR1 (ENSHGLG00000035961) OLFM3 (ENSHGLG00000036982) ENSHGLG00000000829 ENSHGLG00000001660 ENSHGLG00000037669 ENSHGLG00000001708 ENSHGLG00000043012 ENSHGLG00000001774 ENSHGLG00000000096 ENSHGLG00000048203 ENSHGLG00000035781 #22 ENSHGLG00000014611 ENSHGLG00000040847 ENSHGLG00000041911 PRMT6 (ENSHGLG00000009142) ENSHGLG00000014793 ENSHGLG00000004961 VAV3 (ENSHGLG00000007646) ENSHGLG00000005383 SLC25A24 (ENSHGLG00000006802) EEIG2 (ENSHGLG00000010279) ENSHGLG00000013096 ENSHGLG00000032993 PRPF38B (ENSHGLG00000016583) FNDC7 (ENSHGLG00000017720) STXBP3 (ENSHGLG00000017668) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 7 ENSHGLG00000020198 ENSHGLG00000000456 ENSHGLG00000050232 ENSHGLG00000000376 ENSHGLG00000044002 ENSHGLG00000019736 ENSHGLG00000000433 ENSHGLG00000000477 ENSHGLG00000000505 ENSHGLG00000041760 RASGEF1A (ENSHGLG00000000157) ENSHGLG00000049285 ENSHGLG00000049491 ENSHGLG00000043153 ZNF239 (ENSHGLG00000050968) ENSHGLG00000000224 #22 ENSHGLG00000049509 ENSHGLG00000019761 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 16 ENSSVLG00005014490 MAS1 (ENSSVLG00005014545) ENSSVLG00005014568 MRPL18 (ENSSVLG00005014946) ENSSVLG00005015024 ENSSVLG00005015119 ACAT2 (ENSSVLG00005015487) ENSSVLG00005015534 ENSSVLG00005015666 ENSSVLG00005015820 FNDC1 (ENSSVLG00005015913) TAGAP (ENSSVLG00005016286) RSPH3 (ENSSVLG00005016457) EZR (ENSSVLG00005016672) SYTL3 (ENSSVLG00005016826) ENSSVLG00005017151 #22 DYNLT1 (ENSSVLG00005017209) TMEM181 (ENSSVLG00005017253) TULP4 (ENSSVLG00005017496) GTF2H5 (ENSSVLG00005017847) ENSSVLG00005017883 SERAC1 (ENSSVLG00005017957) SYNJ2 (ENSSVLG00005018380) SNX9 (ENSSVLG00005018666) ZDHHC14 (ENSSVLG00005018722) TMEM242 (ENSSVLG00005018773) ARID1B (ENSSVLG00005018938) ENSSVLG00005019380 ENSSVLG00005019405 NOX3 (ENSSVLG00005019493) TFB1M (ENSSVLG00005019605) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Squirrel MODERN SPECIES 118 FBXO4 (ENSSTOG00000021819) RIMOC1 (ENSSTOG00000008291) ENSSTOG00000008271 PLCXD3 (ENSSTOG00000008266) C6 (ENSSTOG00000008232) MROH2B (ENSSTOG00000008175) C7 (ENSSTOG00000019606) CARD6 (ENSSTOG00000027851) ENSSTOG00000033844 PRKAA1 (ENSSTOG00000008118) TTC33 (ENSSTOG00000025089) PTGER4 (ENSSTOG00000024710) ENSSTOG00000028948 DAB2 (ENSSTOG00000002461) C9 (ENSSTOG00000002454) ENSSTOG00000028890 #22 RICTOR (ENSSTOG00000005716) OSMR (ENSSTOG00000005685) LIFR (ENSSTOG00000012582) EGFLAM (ENSSTOG00000012561) ENSSTOG00000032013 GDNF (ENSSTOG00000028754) WDR70 (ENSSTOG00000005031) NUP155 (ENSSTOG00000015151) CPLANE1 (ENSSTOG00000015341) NIPBL (ENSSTOG00000014981) SLC1A3 (ENSSTOG00000015072) RANBP3L (ENSSTOG00000002767) NADK2 (ENSSTOG00000002754) SKP2 (ENSSTOG00000002739) LMBRD2 (ENSSTOG00000002718) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00390000011698.c.a.d #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00520000055570.B Pika MODERN SPECIES 1347 ARID4B (ENSOPRG00000013949) RBM34 (ENSOPRG00000013930) TOMM20 (ENSOPRG00000013908) #22 ENSOPRG00000013891 TARBP1 (ENSOPRG00000013822) COA6 (ENSOPRG00000013804) SLC35F3 (ENSOPRG00000013789) KCNK1 (ENSOPRG00000013778) Tree shrew MODERN SPECIES 3040 ENSTBEG00000004420 GGPS1 (ENSTBEG00000004293) ARID4B (ENSTBEG00000003961) ENSTBEG00000003827 #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Mouse lemur MODERN SPECIES 1 SPTLC1 (ENSMICG00000004405) ROR2 (ENSMICG00000013912) ENSMICG00000026732 AUH (ENSMICG00000045646) SYK (ENSMICG00000000066) DIRAS2 (ENSMICG00000041921) ENSMICG00000036910 ENSMICG00000029651 #22 GADD45G (ENSMICG00000030733) SEMA4D (ENSMICG00000001178) SECISBP2 (ENSMICG00000001176) CKS2 (ENSMICG00000043815) SHC3 (ENSMICG00000036874) NXNL2 (ENSMICG00000045442) SPIN1 (ENSMICG00000048058) ENSMICG00000029452 ENSMICG00000011445 PHF2 (ENSMICG00000011463) BARX1 (ENSMICG00000045287) PTPDC1 (ENSMICG00000006876) ZNF169 (ENSMICG00000003159) ENSMICG00000003697 CDK20 (ENSMICG00000002945) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 17 RYR2 (ENSCSAG00000009677) MTR (ENSCSAG00000009702) ACTN2 (ENSCSAG00000009716) HEATR1 (ENSCSAG00000009731) LGALS8 (ENSCSAG00000009741) EDARADD (ENSCSAG00000009746) ERO1B (ENSCSAG00000009755) GPR137B (ENSCSAG00000009761) NID1 (ENSCSAG00000009768) LYST (ENSCSAG00000009998) GNG4 (ENSCSAG00000010055) B3GALNT2 (ENSCSAG00000010061) TBCE (ENSCSAG00000010064) ARID4B (ENSCSAG00000010069) RBM34 (ENSCSAG00000010079) ENSCSAG00000010083 #22 IRF2BP2 (ENSCSAG00000010085) TARBP1 (ENSCSAG00000010100) COA6 (ENSCSAG00000010108) SLC35F3 (ENSCSAG00000010114) ENSCSAG00000019369 KCNK1 (ENSCSAG00000010120) ENSCSAG00000019368 MAP3K21 (ENSCSAG00000010168) ENSCSAG00000010186 ENSCSAG00000010192 NTPCR (ENSCSAG00000010197) MAP10 (ENSCSAG00000019367) SIPA1L2 (ENSCSAG00000010209) DISC1 (ENSCSAG00000010261) TSNAX (ENSCSAG00000010285) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000153253.b.a.g.h.b ENSGT00940000154303.C.g.b ENSGT00940000154173.A.a.c.a.b ENSGT00940000153594.d.j ENSGT01100000263482.A.b ENSGT01100000263482.E ENSGT00940000159212.a ENSGT00940000156014 ENSGT00940000154823 ENSGT00510000047059.l ENSGT00390000008135.lb.a ENSGT00940000153883.b ENSGT00940000154540.a.o ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a.n.a ENSGT00390000011698.c.a.d #22 ENSGT00940000161033.d ENSGT00940000154540.a.n.b ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00390000014189 ENSGT00950000183122.B ENSGT00390000001752.y.a.b ENSGT00940000162960.B ENSGT00940000164280 ENSGT01100000263507.D.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000163252.d ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a ENSGT00940000154251.A.a.a.b ENSGT00940000153236.b.b.a.b.a.a ENSGT00390000008072.e.b ENSGT00940000153236.b.b.a.b.b.a.a Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000161467 ENSGT00940000155974.j ENSGT00940000153253.b.a.g.h.b ENSGT00940000154303.C.g.b ENSGT00940000154173.A.a.c.a.b.a.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00390000008135.lb.b ENSGT00510000047059.l.j ENSGT00940000159212.a ENSGT00940000156014 ENSGT00940000154823 ENSGT00390000008135.lb.a.b ENSGT00940000153883.b ENSGT00940000154540.a.o ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a.n.a ENSGT00390000011698.c.a.d #22 ENSGT00940000161033.d ENSGT00940000154540.a.n.b ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00390000014189 ENSGT00950000183122.B ENSGT00390000001752.y.a.b ENSGT00940000162960.B ENSGT00940000164280 ENSGT01100000263507.D.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000163252.d ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a ENSGT00940000154251.A.a.a.b ENSGT00940000153236.b.b.a.b.a.a ENSGT00390000008072.e.b ENSGT00390000003682.ib.b.c.a.a.b Pan ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000008135.lb.a.b ENSGT00940000153883.b ENSGT00940000154540.a.o ENSGT00940000161327 ENSGT00940000154540.a.n.a ENSGT00390000011698.c.a.d #22 ENSGT00940000161033.d ENSGT00940000154540.a.n.b.a ENSGT00390000006030.d.a.b.g ENSGT00390000014189 ENSGT00950000183122.B ENSGT00940000154251.A.b.b.a.b.a.a ENSGT01100000263507.E.b.b.c.a ENSGT00910000146915 ENSGT01030000234556.a.b.a.z ENSGT00940000164280 ENSGT00940000160467.l ENSGT00940000163252.d ENSGT01090000260061.c.b.lg.b.a ENSGT00940000154251.A.a.a.b ENSGT00940000153236.b.b.a.b.a.a Bonobo MODERN SPECIES 20 ENSPPAG00000039313 FKBP6 (ENSPPAG00000041543) ENSPPAG00000040271 NSUN5 (ENSPPAG00000037296) POM121C (ENSPPAG00000035208) CALN1 (ENSPPAG00000033319) GALNT17 (ENSPPAG00000000822) AUTS2 (ENSPPAG00000037189) ENSPPAG00000040155 ENSPPAG00000007406 ENSPPAG00000043889 TMEM248 (ENSPPAG00000041425) RABGEF1 (ENSPPAG00000041294) KCTD7 (ENSPPAG00000034457) ENSPPAG00000034675 ENSPPAG00000029404 #22 ENSPPAG00000039731 ENSPPAG00000033663 TPST1 (ENSPPAG00000003699) CRCP (ENSPPAG00000030427) ASL (ENSPPAG00000039879) ENSPPAG00000028598 GUSB (ENSPPAG00000023698) ENSPPAG00000042346 ENSPPAG00000039958 ENSPPAG00000034318 ENSPPAG00000036990 ENSPPAG00000033998 ENSPPAG00000039306 ENSPPAG00000036473 ENSPPAG00000035687 Chimpanzee MODERN SPECIES 20 ENSPTRG00000046425 ENSPTRG00000045282 ENSPTRG00000051527 ENSPTRG00000049099 ENSPTRG00000046400 ENSPTRG00000052499 ENSPTRG00000047764 GALNT17 (ENSPTRG00000019262) AUTS2 (ENSPTRG00000019260) ENSPTRG00000044826 ENSPTRG00000042902 SBDS (ENSPTRG00000019254) TMEM248 (ENSPTRG00000019253) RABGEF1 (ENSPTRG00000019251) ENSPTRG00000047918 ENSPTRG00000046330 #22 ENSPTRG00000019250 ENSPTRG00000052637 TPST1 (ENSPTRG00000019247) CRCP (ENSPTRG00000046581) ASL (ENSPTRG00000019245) ENSPTRG00000043045 GUSB (ENSPTRG00000019244) ENSPTRG00000051007 ENSPTRG00000052536 ENSPTRG00000043078 ENSPTRG00000050358 ENSPTRG00000052238 ENSPTRG00000044344 ENSPTRG00000050257 ZNF92 (ENSPTRG00000019240) Gorilla MODERN SPECIES 20 ENSGGOG00000009070 BAZ1B (ENSGGOG00000016557) FZD9 (ENSGGOG00000016553) FKBP6 (ENSGGOG00000015753) TRIM50 (ENSGGOG00000015750) ENSGGOG00000037093 CALN1 (ENSGGOG00000038999) GALNT17 (ENSGGOG00000005815) AUTS2 (ENSGGOG00000011797) TYW1 (ENSGGOG00000001473) ENSGGOG00000001472 TMEM248 (ENSGGOG00000022776) RABGEF1 (ENSGGOG00000010317) KCTD7 (ENSGGOG00000014536) ENSGGOG00000037537 ENSGGOG00000037390 #22 ENSGGOG00000041759 ENSGGOG00000016242 ENSGGOG00000025422 ENSGGOG00000026241 TPST1 (ENSGGOG00000024216) CRCP (ENSGGOG00000039733) ASL (ENSGGOG00000007222) GUSB (ENSGGOG00000007902) ENSGGOG00000014185 ENSGGOG00000040753 ENSGGOG00000001751 ENSGGOG00000015983 ENSGGOG00000037087 ZNF138 (ENSGGOG00000008932) ZNF107 (ENSGGOG00000039417) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Tiger MODERN SPECIES 239 ACTN2 (ENSPTIG00000020701) HEATR1 (ENSPTIG00000017413) LGALS8 (ENSPTIG00000013624) EDARADD (ENSPTIG00000012291) ERO1B (ENSPTIG00000009660) GPR137B (ENSPTIG00000009159) NID1 (ENSPTIG00000005400) LYST (ENSPTIG00000019044) GNG4 (ENSPTIG00000017122) B3GALNT2 (ENSPTIG00000016537) TBCE (ENSPTIG00000016342) GGPS1 (ENSPTIG00000015630) ENSPTIG00000015273 ARID4B (ENSPTIG00000012520) RBM34 (ENSPTIG00000011612) TOMM20 (ENSPTIG00000011155) #22 TARBP1 (ENSPTIG00000009281) ENSPTIG00000008441 SLC35F3 (ENSPTIG00000008023) ENSPTIG00000002970 KCNK1 (ENSPTIG00000007674) ENSPTIG00000007282 ENSPTIG00000006850 ENSPTIG00000005528 ENSPTIG00000002957 NTPCR (ENSPTIG00000021503) SIPA1L2 (ENSPTIG00000020479) ENSPTIG00000015100 TSNAX (ENSPTIG00000014357) ENSPTIG00000014333 SPRTN (ENSPTIG00000013348) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.d #22 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00960000190028 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 Ursus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.d #22 ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 ENSGT00520000055570.B ENSGT00390000017022 American black bear MODERN SPECIES 386 ENSUAMG00000007077 ENSUAMG00000007080 #22 Giant Panda MODERN SPECIES 18 C2CD3 (ENSAMEG00000017216) UCP3 (ENSAMEG00000017226) UCP2 (ENSAMEG00000017239) DNAJB13 (ENSAMEG00000017254) PAAF1 (ENSAMEG00000017267) COA4 (ENSAMEG00000020288) MRPL48 (ENSAMEG00000017282) RAB6A (ENSAMEG00000017285) PLEKHB1 (ENSAMEG00000017291) FAM168A (ENSAMEG00000017296) RELT (ENSAMEG00000017300) ARHGEF17 (ENSAMEG00000017303) ENSAMEG00000030401 P2RY6 (ENSAMEG00000020289) P2RY2 (ENSAMEG00000020290) ENSAMEG00000031322 #22 ENSAMEG00000028744 FCHSD2 (ENSAMEG00000005338) ATG16L2 (ENSAMEG00000005345) STARD10 (ENSAMEG00000005382) ARAP1 (ENSAMEG00000005419) PDE2A (ENSAMEG00000005473) CLPB (ENSAMEG00000005592) PHOX2A (ENSAMEG00000030169) INPPL1 (ENSAMEG00000005610) ENSAMEG00000005691 FOLR1 (ENSAMEG00000030130) ENSAMEG00000010833 LAMTOR1 (ENSAMEG00000010854) LRTOMT (ENSAMEG00000010848) LRRC51 (ENSAMEG00000024659) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Ferret MODERN SPECIES 175 FGF1 (ENSMPUG00000007946) ARHGAP26 (ENSMPUG00000007885) NR3C1 (ENSMPUG00000007881) YIPF5 (ENSMPUG00000007876) KCTD16 (ENSMPUG00000020044) ENSMPUG00000007874 ENSMPUG00000007870 SH3RF2 (ENSMPUG00000007867) PLAC8L1 (ENSMPUG00000007862) LARS1 (ENSMPUG00000007844) RBM27 (ENSMPUG00000007832) POU4F3 (ENSMPUG00000007828) TCERG1 (ENSMPUG00000007817) GPR151 (ENSMPUG00000020043) PPP2R2B (ENSMPUG00000007809) ENSMPUG00000007807 #22 STK32A (ENSMPUG00000007797) DPYSL3 (ENSMPUG00000007786) JAKMIP2 (ENSMPUG00000007772) SPINK1 (ENSMPUG00000007762) C5orf46 (ENSMPUG00000007744) SPINK5 (ENSMPUG00000007719) ENSMPUG00000007717 ENSMPUG00000007707 GZMA (ENSMPUG00000007703) ENSMPUG00000007695 ENSMPUG00000007686 GPX8 (ENSMPUG00000007679) MCIDAS (ENSMPUG00000007663) CCNO (ENSMPUG00000007657) DHX29 (ENSMPUG00000007636) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Dingo MODERN SPECIES 7 ENSCAFG00020018011 ENSCAFG00020018013 ENSCAFG00020018025 ENSCAFG00020018029 ENSCAFG00020018037 ENSCAFG00020018042 ENSCAFG00020018044 ENSCAFG00020018046 ENSCAFG00020018055 PCDH20 (ENSCAFG00020018062) ENSCAFG00020018067 ENSCAFG00020018072 ENSCAFG00020018074 ENSCAFG00020018076 DIAPH3 (ENSCAFG00020018085) ENSCAFG00020018106 #22 ENSCAFG00020018107 PCDH17 (ENSCAFG00020018109) ENSCAFG00020018112 ENSCAFG00020018121 OLFM4 (ENSCAFG00020018137) PCDH8 (ENSCAFG00020018138) CNMD (ENSCAFG00020018141) SUGT1 (ENSCAFG00020018144) ELF1 (ENSCAFG00020018152) WBP4 (ENSCAFG00020018156) KBTBD6 (ENSCAFG00020018170) KBTBD7 (ENSCAFG00020018174) ENSCAFG00020018176 MTRF1 (ENSCAFG00020018178) ENSCAFG00020018183 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Pig MODERN SPECIES 5 HEATR1 (ENSSSCG00000010145) LGALS8 (ENSSSCG00000010146) EDARADD (ENSSSCG00000025986) ERO1B (ENSSSCG00000010148) GPR137B (ENSSSCG00000038853) NID1 (ENSSSCG00000026819) LYST (ENSSSCG00000010151) GNG4 (ENSSSCG00000033307) B3GALNT2 (ENSSSCG00000033692) ENSSSCG00000061082 TBCE (ENSSSCG00000034844) ENSSSCG00000057214 GGPS1 (ENSSSCG00000031680) ARID4B (ENSSSCG00000060488) RBM34 (ENSSSCG00000055425) TOMM20 (ENSSSCG00000010158) #22 IRF2BP2 (ENSSSCG00000038132) TARBP1 (ENSSSCG00000010160) ENSSSCG00000010161 SLC35F3 (ENSSSCG00000010162) KCNK1 (ENSSSCG00000010163) MAP3K21 (ENSSSCG00000010164) ENSSSCG00000010165 NTPCR (ENSSSCG00000010166) MAP10 (ENSSSCG00000010167) SIPA1L2 (ENSSSCG00000010169) DISC1 (ENSSSCG00000010170) TSNAX (ENSSSCG00000010171) ENSSSCG00000040694 EGLN1 (ENSSSCG00000010172) SPRTN (ENSSSCG00000040087) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Alpaca MODERN SPECIES 2068 TOMM20 (ENSVPAG00000003980) #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Blue whale MODERN SPECIES 7 HEATR1 (ENSBMSG00010018259) LGALS8 (ENSBMSG00010018343) EDARADD (ENSBMSG00010018437) ENSBMSG00010018541 ENSBMSG00010018552 ERO1B (ENSBMSG00010018563) GPR137B (ENSBMSG00010018583) NID1 (ENSBMSG00010018629) LYST (ENSBMSG00010018690) GNG4 (ENSBMSG00010018737) B3GALNT2 (ENSBMSG00010018760) ENSBMSG00010018838 ENSBMSG00010018914 ARID4B (ENSBMSG00010018959) ENSBMSG00010019006 ENSBMSG00010019032 #22 IRF2BP2 (ENSBMSG00010019063) TARBP1 (ENSBMSG00010019100) ENSBMSG00010019239 SLC35F3 (ENSBMSG00010019267) KCNK1 (ENSBMSG00010019306) MAP3K21 (ENSBMSG00010019318) PCNX2 (ENSBMSG00010019361) NTPCR (ENSBMSG00010019413) MAP10 (ENSBMSG00010019435) SIPA1L2 (ENSBMSG00010019471) ENSBMSG00010019578 ENSBMSG00010019610 ENSBMSG00010019646 ENSBMSG00010019659 EGLN1 (ENSBMSG00010013590) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161296 ENSGT00940000159388 ENSGT00940000159711 ENSGT00950000182998.D ENSGT00940000158855 ENSGT00940000158328 ENSGT00390000004641.a.a.a.b.b ENSGT00390000004641.a.a.a.b.a ENSGT00390000004641.a.a.b.a ENSGT00390000004641.a.a.b.b ENSGT00390000004641.a.a.a.a ENSGT00390000004641.a.b ENSGT01030000234595.B.c.a ENSGT00390000016901 ENSGT00940000155763 ENSGT00390000011698.c.a.d #22 ENSGT00390000005874 ENSGT00940000160561 ENSGT00390000007160.a.a ENSGT00940000155514 ENSGT00940000154089.a ENSGT00940000157392 ENSGT00390000014125 ENSGT00410000025882.a ENSGT00940000156238 ENSGT00390000002470 ENSGT00440000038072.c ENSGT00390000001414 ENSGT00940000153820.a ENSGT00940000155664 ENSGT00390000008040 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007084.c.b.ab ENSGT00940000155631 ENSGT00940000161296 ENSGT00940000159388 ENSGT00940000159711 ENSGT00950000182998.D ENSGT00940000158855 ENSGT00940000158328 ENSGT00390000004641.a.a.a.b.b ENSGT00390000004641.a.a.a.b.a ENSGT00390000004641.a.a.b.a ENSGT00390000004641.a.b ENSGT01030000234595.B.c.a ENSGT00390000016901 ENSGT00940000155763 ENSGT00390000011698.c.a.d #22 ENSGT00390000005874 ENSGT00940000160561 ENSGT00390000007160.a.a ENSGT00940000155514 ENSGT00940000154089.a ENSGT00940000157392 ENSGT00390000014125 ENSGT00410000025882.a ENSGT00940000156238 ENSGT00390000002470 ENSGT00440000038072.c ENSGT00390000001414 ENSGT00940000153820.a ENSGT00940000155664 ENSGT00390000008040 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157262 ENSGT00390000007084.c.b.ab ENSGT00940000155631 ENSGT00940000161296 ENSGT00940000159388 ENSGT00940000159711 ENSGT00950000182998.D ENSGT00940000158328 ENSGT00390000004641.a.a.a.b.b ENSGT00390000004641.a.a.a.b.a ENSGT00390000004641.a.a.b.a ENSGT00390000004641.a.b ENSGT01030000234595.B.c.a ENSGT00390000016901 ENSGT00940000155763 ENSGT00390000011698.c.a.d #22 ENSGT00390000005874 ENSGT00940000160561 ENSGT00390000007160.a.a ENSGT00940000155514 ENSGT00940000154089.a ENSGT00940000157392 ENSGT00390000014125 ENSGT00410000025882.a ENSGT00940000156238 ENSGT00390000002470 ENSGT00440000038072.c ENSGT00390000001414 ENSGT00940000153820.a ENSGT00940000155664 ENSGT00390000008040 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157262 ENSGT00390000007084.c.b.ab ENSGT00940000155631 ENSGT00940000161296 ENSGT00940000159388 ENSGT00940000159711 ENSGT00950000182998.D ENSGT00940000158328 ENSGT00390000004641.a.a.a.b.b ENSGT00390000004641.a.a.a.b.a ENSGT00390000004641.a.a.b.a ENSGT00390000004641.a.b ENSGT01030000234595.B.c.a ENSGT00390000016901 ENSGT00940000155763 ENSGT00390000011698.c.a.d #22 ENSGT00390000005874 ENSGT00940000160561 ENSGT00390000007160.a.a ENSGT00940000155514 ENSGT00940000154089.a ENSGT00940000157392 ENSGT00390000014125 ENSGT00410000025882.a ENSGT00940000156238 ENSGT00390000002470 ENSGT00440000038072.c ENSGT00390000001414 ENSGT00940000153820.a ENSGT00940000155664 ENSGT00390000008040 Beluga whale MODERN SPECIES 28 POC1A (ENSDLEG00000021877) DUSP7 (ENSDLEG00000021878) RPL29 (ENSDLEG00000021882) ACY1 (ENSDLEG00000021885) ENSDLEG00000021892 PCBP4 (ENSDLEG00000021894) GPR62 (ENSDLEG00000021898) RRP9 (ENSDLEG00000021900) ENSDLEG00000021902 IQCF5 (ENSDLEG00000021903) IQCF2 (ENSDLEG00000021904) ENSDLEG00000021907 GRM2 (ENSDLEG00000021908) TEX264 (ENSDLEG00000021910) RAD54L2 (ENSDLEG00000021912) ENSDLEG00000021913 #22 DCAF1 (ENSDLEG00000021914) RBM15B (ENSDLEG00000021915) MANF (ENSDLEG00000021916) DOCK3 (ENSDLEG00000021948) MAPKAPK3 (ENSDLEG00000021967) CISH (ENSDLEG00000021968) HEMK1 (ENSDLEG00000021969) CUNH3orf18 (ENSDLEG00000021970) CACNA2D2 (ENSDLEG00000021971) TMEM115 (ENSDLEG00000021972) CYB561D2 (ENSDLEG00000021973) NPRL2 (ENSDLEG00000021974) ZMYND10 (ENSDLEG00000021975) RASSF1 (ENSDLEG00000021976) TUSC2 (ENSDLEG00000011940) Narwhal MODERN SPECIES 310 ACY1 (ENSMMNG00015011040) ABHD14A (ENSMMNG00015010926) ABHD14B (ENSMMNG00015010906) PCBP4 (ENSMMNG00015010878) GPR62 (ENSMMNG00015010854) RRP9 (ENSMMNG00015010827) IQCF1 (ENSMMNG00015010797) IQCF5 (ENSMMNG00015010780) IQCF2 (ENSMMNG00015010764) IQCF6 (ENSMMNG00015010741) ENSMMNG00015010733 ENSMMNG00015010721 GRM2 (ENSMMNG00015010691) TEX264 (ENSMMNG00015010652) RAD54L2 (ENSMMNG00015010610) ENSMMNG00015010528 #22 DCAF1 (ENSMMNG00015010486) RBM15B (ENSMMNG00015010452) MANF (ENSMMNG00015010431) DOCK3 (ENSMMNG00015010361) MAPKAPK3 (ENSMMNG00015010310) CISH (ENSMMNG00015010293) HEMK1 (ENSMMNG00015014756) C3orf18 (ENSMMNG00015014712) CACNA2D2 (ENSMMNG00015014444) TMEM115 (ENSMMNG00015014284) CYB561D2 (ENSMMNG00015014275) NPRL2 (ENSMMNG00015014258) ZMYND10 (ENSMMNG00015014214) RASSF1 (ENSMMNG00015014235) TUSC2 (ENSMMNG00015014197) Vaquita MODERN SPECIES 2 ENSPSNG00000007010 ACY1 (ENSPSNG00000007116) ABHD14A (ENSPSNG00000007280) ENSPSNG00000007307 PCBP4 (ENSPSNG00000007369) GPR62 (ENSPSNG00000007429) RRP9 (ENSPSNG00000007448) ENSPSNG00000007492 IQCF1 (ENSPSNG00000007512) IQCF5 (ENSPSNG00000007539) IQCF2 (ENSPSNG00000007573) IQCF6 (ENSPSNG00000007610) GRM2 (ENSPSNG00000007653) TEX264 (ENSPSNG00000007739) RAD54L2 (ENSPSNG00000007811) ENSPSNG00000007937 #22 DCAF1 (ENSPSNG00000007982) MANF (ENSPSNG00000008062) DOCK3 (ENSPSNG00000008114) MAPKAPK3 (ENSPSNG00000008463) CISH (ENSPSNG00000008520) HEMK1 (ENSPSNG00000008558) C3orf18 (ENSPSNG00000008583) CACNA2D2 (ENSPSNG00000008802) TMEM115 (ENSPSNG00000009223) CYB561D2 (ENSPSNG00000009263) NPRL2 (ENSPSNG00000009339) ZMYND10 (ENSPSNG00000009378) RASSF1 (ENSPSNG00000009444) ENSPSNG00000009594 HYAL3 (ENSPSNG00000009719) Sperm whale DUPLICATION Sperm whale MODERN SPECIES 15 ENSPCTG00005002406 CFAP45 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RALGAPA2 (ENSCHYG00000021147) INSM1 (ENSCHYG00000021030) CFAP61 (ENSCHYG00000020914) CRNKL1 (ENSCHYG00000020782) NAA20 (ENSCHYG00000020635) RIN2 (ENSCHYG00000020319) ENSCHYG00000020275 SLC24A3 (ENSCHYG00000020129) SCP2D1 (ENSCHYG00000020102) Yarkand deer MODERN SPECIES 1028 ENSCHYG00000010503 #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Domestic yak DUPLICATION Domestic yak MODERN SPECIES 23 TAS2R16 (ENSBGRG00000025023) CADPS2 (ENSBGRG00000025072) FEZF1 (ENSBGRG00000025722) AASS (ENSBGRG00000025745) PTPRZ1 (ENSBGRG00000025791) FAM3C (ENSBGRG00000026163) WNT16 (ENSBGRG00000026173) CPED1 (ENSBGRG00000026179) ENSBGRG00000026183 ING3 (ENSBGRG00000026186) ENSBGRG00000026200 TSPAN12 (ENSBGRG00000026203) KCND2 (ENSBGRG00000026206) ENSBGRG00000026214 ENSBGRG00000026222 ENSBGRG00000026227 #22 ENSBGRG00000026231 ENSBGRG00000007313 ENSBGRG00000007452 ENSBGRG00000007474 ENSBGRG00000007497 ENSBGRG00000007552 ENSBGRG00000007614 ENSBGRG00000007638 ENSBGRG00000007662 ENSBGRG00000007684 ENSBGRG00000007724 ENSBGRG00000007791 AMPH (ENSBGRG00000007825) VPS41 (ENSBGRG00000008270) POU6F2 (ENSBGRG00000008844) Domestic yak MODERN SPECIES 18 ENSBGRG00000016279 ADCY9 (ENSBGRG00000016377) CREBBP (ENSBGRG00000016725) TRAP1 (ENSBGRG00000021774) DNASE1 (ENSBGRG00000022207) SLX4 (ENSBGRG00000022270) NLRC3 (ENSBGRG00000022542) CLUAP1 (ENSBGRG00000022708) C16orf90 (ENSBGRG00000023154) NAA60 (ENSBGRG00000023178) ENSBGRG00000023231 ZNF174 (ENSBGRG00000023242) OR2C1 (ENSBGRG00000023387) ENSBGRG00000023404 ENSBGRG00000023562 ENSBGRG00000023593 #22 ENSBGRG00000023621 ENSBGRG00000023657 ENSBGRG00000023711 ENSBGRG00000023736 ENSBGRG00000023753 ENSBGRG00000023806 ZNF213 (ENSBGRG00000023912) ZNF205 (ENSBGRG00000023966) ENSBGRG00000024068 ENSBGRG00000024096 ENSBGRG00000024139 ENSBGRG00000024149 MMP25 (ENSBGRG00000024172) BICDL2 (ENSBGRG00000024234) THOC6 (ENSBGRG00000024342) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.d #22 Hyrax MODERN SPECIES 5689 TOMM20 (ENSPCAG00000007924) #22 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 Common shrew MODERN SPECIES 4744 TOMM20 (ENSSARG00000014156) ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 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ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00960000190028 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000154442.z.a ENSGT00940000153498.A.s ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Dingo MODERN SPECIES 258 ACTN2 (ENSCAFG00020025472) HEATR1 (ENSCAFG00020026884) LGALS8 (ENSCAFG00020026961) EDARADD 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(ENSVVUG00000007881) ##22 ENSVVUG00000007867 TARBP1 (ENSVVUG00000007460) ENSVVUG00000007440 SLC35F3 (ENSVVUG00000007416) KCNK1 (ENSVVUG00000007351) MAP3K21 (ENSVVUG00000007319) PCNX2 (ENSVVUG00000007314) NTPCR (ENSVVUG00000007305) MAP10 (ENSVVUG00000007291) SIPA1L2 (ENSVVUG00000007190) ENSVVUG00000007151 DISC1 (ENSVVUG00000007101) TSNAX (ENSVVUG00000007083) ENSVVUG00000007066 SPRTN (ENSVVUG00000007060) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00960000190028 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.d #22 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00960000190028 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Giant Panda MODERN SPECIES 16 RYR2 (ENSAMEG00000002582) MTR (ENSAMEG00000001206) ACTN2 (ENSAMEG00000001117) HEATR1 (ENSAMEG00000001015) LGALS8 (ENSAMEG00000000976) EDARADD (ENSAMEG00000004777) ENSAMEG00000023782 NID1 (ENSAMEG00000003184) LYST (ENSAMEG00000003100) GNG4 (ENSAMEG00000024829) B3GALNT2 (ENSAMEG00000016166) TBCE (ENSAMEG00000016186) GGPS1 (ENSAMEG00000001137) ARID4B (ENSAMEG00000008801) ENSAMEG00000008831 TOMM20 (ENSAMEG00000029642) ##22 IRF2BP2 (ENSAMEG00000008840) TARBP1 (ENSAMEG00000003359) ENSAMEG00000028553 SLC35F3 (ENSAMEG00000003391) KCNK1 (ENSAMEG00000007248) MAP3K21 (ENSAMEG00000002788) PCNX2 (ENSAMEG00000002749) NTPCR (ENSAMEG00000002747) MAP10 (ENSAMEG00000019801) SIPA1L2 (ENSAMEG00000002663) DISC1 (ENSAMEG00000002649) ENSAMEG00000025464 ENSAMEG00000002637 ENSAMEG00000029151 ENSAMEG00000024244 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 123 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00960000190028 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 American mink MODERN SPECIES 308 ENSNVIG00000006838 GPR137B (ENSNVIG00000006852) NID1 (ENSNVIG00000006876) LYST (ENSNVIG00000006945) GNG4 (ENSNVIG00000007063) B3GALNT2 (ENSNVIG00000007076) TBCE (ENSNVIG00000007098) ENSNVIG00000007226 GGPS1 (ENSNVIG00000007231) ARID4B (ENSNVIG00000007256) RBM34 (ENSNVIG00000007398) TOM20 (ENSNVIG00000007428) ##22 IRF2BP2 (ENSNVIG00000007464) TARBP1 (ENSNVIG00000007492) ENSNVIG00000007537 SLC35F3 (ENSNVIG00000007554) Felidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00990000210647 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683.i ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Cat MODERN SPECIES 242 ACTN2 (ENSFCAG00000004445) HEATR1 (ENSFCAG00000053194) LGALS8 (ENSFCAG00000035073) EDARADD (ENSFCAG00000038673) ERO1B (ENSFCAG00000003384) GPR137B (ENSFCAG00000003382) NID1 (ENSFCAG00000011029) LYST (ENSFCAG00000006051) ENSFCAG00000034929 ENSFCAG00000046817 B3GALNT2 (ENSFCAG00000011870) TBCE (ENSFCAG00000011868) GGPS1 (ENSFCAG00000008442) ARID4B (ENSFCAG00000030096) RBM34 (ENSFCAG00000001852) TOMM20 (ENSFCAG00000028201) ##22 IRF2BP2 (ENSFCAG00000040408) TARBP1 (ENSFCAG00000014183) ENSFCAG00000033897 SLC35F3 (ENSFCAG00000001656) ENSFCAG00000027385 ENSFCAG00000006563 MAP3K21 (ENSFCAG00000009652) PCNX2 (ENSFCAG00000004254) NTPCR (ENSFCAG00000014211) MAP10 (ENSFCAG00000043757) SIPA1L2 (ENSFCAG00000007249) DISC1 (ENSFCAG00000002499) TSNAX (ENSFCAG00000028088) EGLN1 (ENSFCAG00000023997) SPRTN (ENSFCAG00000029939) Panthera ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00990000210647 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00500000045038.n.b.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683.i ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00990000210647 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00500000045038.n.b.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683.i ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 leopard MODERN SPECIES 76 MTR (ENSPPRG00000014567) ACTN2 (ENSPPRG00000014447) HEATR1 (ENSPPRG00000014254) LGALS8 (ENSPPRG00000014121) EDARADD (ENSPPRG00000014027) ERO1B (ENSPPRG00000014002) GPR137B (ENSPPRG00000013977) NID1 (ENSPPRG00000013954) LYST (ENSPPRG00000013880) GNG4 (ENSPPRG00000013823) B3GALNT2 (ENSPPRG00000013803) TBCE (ENSPPRG00000013794) GGPS1 (ENSPPRG00000013774) ARID4B (ENSPPRG00000013739) RBM34 (ENSPPRG00000013597) TOMM20 (ENSPPRG00000013589) ##22 IRF2BP2 (ENSPPRG00000013580) TARBP1 (ENSPPRG00000013561) ENSPPRG00000013529 SLC35F3 (ENSPPRG00000013494) ENSPPRG00000019973 KCNK1 (ENSPPRG00000013470) MAP3K21 (ENSPPRG00000013459) PCNX2 (ENSPPRG00000013432) NTPCR (ENSPPRG00000013384) SIPA1L2 (ENSPPRG00000013364) ENSPPRG00000013255 ENSPPRG00000013142 EGLN1 (ENSPPRG00000013135) ENSPPRG00000013122 EXOC8 (ENSPPRG00000019949) lion MODERN SPECIES 11 ACTN2 (ENSPLOG00000014697) HEATR1 (ENSPLOG00000015107) LGALS8 (ENSPLOG00000015207) EDARADD (ENSPLOG00000015279) ERO1B (ENSPLOG00000015401) GPR137B (ENSPLOG00000015508) NID1 (ENSPLOG00000015603) ENSPLOG00000015892 ENSPLOG00000015975 GNG4 (ENSPLOG00000016006) B3GALNT2 (ENSPLOG00000016028) TBCE (ENSPLOG00000016150) ENSPLOG00000016460 ARID4B (ENSPLOG00000016521) RBM34 (ENSPLOG00000016898) TOMM20 (ENSPLOG00000017129) ##22 TARBP1 (ENSPLOG00000017186) ENSPLOG00000017410 SLC35F3 (ENSPLOG00000017444) ENSPLOG00000017573 ENSPLOG00000017603 KCNK1 (ENSPLOG00000017615) MAP3K21 (ENSPLOG00000017645) PCNX2 (ENSPLOG00000017829) ENSPLOG00000018291 MAP10 (ENSPLOG00000018316) SIPA1L2 (ENSPLOG00000018356) ENSPLOG00000018628 TSNAX (ENSPLOG00000018693) EGLN1 (ENSPLOG00000018717) SPRTN (ENSPLOG00000018783) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Equus ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00940000153096.b.c.b.a.b.e ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Donkey MODERN SPECIES 11 ACTN2 (ENSEASG00005003395) HEATR1 (ENSEASG00005003385) LGALS8 (ENSEASG00005003376) EDARADD (ENSEASG00005035726) ERO1B (ENSEASG00005003339) GPR137B (ENSEASG00005003328) NID1 (ENSEASG00005003319) LYST (ENSEASG00005001718) ENSEASG00005004854 GNG4 (ENSEASG00005031442) B3GALNT2 (ENSEASG00005001274) TBCE (ENSEASG00005001261) GGPS1 (ENSEASG00005024771) ARID4B (ENSEASG00005000677) RBM34 (ENSEASG00005000624) TOMM20 (ENSEASG00005035533) ##22 ENSEASG00005025074 TARBP1 (ENSEASG00005000252) ENSEASG00005036792 SLC35F3 (ENSEASG00005038714) KCNK1 (ENSEASG00005012774) MAP3K21 (ENSEASG00005012775) PCNX2 (ENSEASG00005012793) NTPCR (ENSEASG00005012806) MAP10 (ENSEASG00005012809) SIPA1L2 (ENSEASG00005012815) DISC1 (ENSEASG00005012822) TSNAX (ENSEASG00005012828) EGLN1 (ENSEASG00005025099) SPRTN (ENSEASG00005030428) EXOC8 (ENSEASG00005012837) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Megabat MODERN SPECIES 2375 B3GALNT2 (ENSPVAG00000015166) TBCE (ENSPVAG00000015164) GGPS1 (ENSPVAG00000015162) ARID4B (ENSPVAG00000015159) RBM34 (ENSPVAG00000015158) TOMM20 (ENSPVAG00000015157) ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 19 MTR (ENSRFEG00010020870) ACTN2 (ENSRFEG00010021122) HEATR1 (ENSRFEG00010021201) LGALS8 (ENSRFEG00010021272) EDARADD (ENSRFEG00010021340) ERO1B (ENSRFEG00010021375) GPR137B (ENSRFEG00010021434) NID1 (ENSRFEG00010021463) LYST (ENSRFEG00010021539) ENSRFEG00010021627 GNG4 (ENSRFEG00010021636) B3GALNT2 (ENSRFEG00010021655) TBCE (ENSRFEG00010021701) GGPS1 (ENSRFEG00010021743) RBM34 (ENSRFEG00010022051) TOMM20 (ENSRFEG00010022058) ##22 IRF2BP2 (ENSRFEG00010022062) TARBP1 (ENSRFEG00010022066) COA6 (ENSRFEG00010022071) SLC35F3 (ENSRFEG00010022074) KCNK1 (ENSRFEG00010022078) MAP3K21 (ENSRFEG00010022081) PCNX2 (ENSRFEG00010022085) ENSRFEG00010022088 MAP10 (ENSRFEG00010022089) SIPA1L2 (ENSRFEG00010022092) ENSRFEG00010022098 ENSRFEG00010022102 TSNAX (ENSRFEG00010022105) EGLN1 (ENSRFEG00010022106) SPRTN (ENSRFEG00010022109) Microbat MODERN SPECIES 1509 ENSMLUG00000013613 ENSMLUG00000028428 ENSMLUG00000017601 TBCE (ENSMLUG00000017600) ENSMLUG00000016813 ARID4B (ENSMLUG00000016232) RBM34 (ENSMLUG00000016224) TOMM20 (ENSMLUG00000016218) ##22 IREB2 (ENSMLUG00000006783) ENSMLUG00000014369 TARBP1 (ENSMLUG00000002414) ENSMLUG00000003535 KCNK1 (ENSMLUG00000014944) ENSMLUG00000011167 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A.m ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A.m ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A.m ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 ENSGT00520000055570.B Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A.m ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 ENSGT00520000055570.B Vaquita MODERN SPECIES 7 ENSPSNG00000018643 MTR (ENSPSNG00000018069) ACTN2 (ENSPSNG00000017620) HEATR1 (ENSPSNG00000017452) LGALS8 (ENSPSNG00000017330) EDARADD (ENSPSNG00000017210) ERO1B (ENSPSNG00000017108) GPR137B (ENSPSNG00000017071) NID1 (ENSPSNG00000016998) ENSPSNG00000016937 B3GALNT2 (ENSPSNG00000016831) TBCE (ENSPSNG00000016546) ENSPSNG00000016428 ARID4B (ENSPSNG00000016188) ENSPSNG00000016090 TOMM20 (ENSPSNG00000016035) ##22 IRF2BP2 (ENSPSNG00000015933) TARBP1 (ENSPSNG00000015576) ENSPSNG00000015509 SLC35F3 (ENSPSNG00000015298) KCNK1 (ENSPSNG00000015220) MAP3K21 (ENSPSNG00000015079) PCNX2 (ENSPSNG00000014975) NTPCR (ENSPSNG00000014874) SIPA1L2 (ENSPSNG00000014318) ENSPSNG00000014077 ENSPSNG00000013969 TSNAX (ENSPSNG00000013890) EGLN1 (ENSPSNG00000013673) SPRTN (ENSPSNG00000013563) EXOC8 (ENSPSNG00000013521) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A.m ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 ENSGT00520000055570.B Narwhal MODERN SPECIES 311 MTR (ENSMMNG00015018116) ACTN2 (ENSMMNG00015018050) HEATR1 (ENSMMNG00015017660) LGALS8 (ENSMMNG00015017351) EDARADD (ENSMMNG00015017241) ERO1B (ENSMMNG00015017169) GPR137B (ENSMMNG00015017098) NID1 (ENSMMNG00015017041) LYST (ENSMMNG00015016793) GNG4 (ENSMMNG00015016725) B3GALNT2 (ENSMMNG00015016675) TBCE (ENSMMNG00015016561) ENSMMNG00015016507 ARID4B (ENSMMNG00015016391) ENSMMNG00015016320 TOMM20 (ENSMMNG00015016291) ##22 IRF2BP2 (ENSMMNG00015016256) TARBP1 (ENSMMNG00015016138) ENSMMNG00015016088 SLC35F3 (ENSMMNG00015015995) KCNK1 (ENSMMNG00015015956) MAP3K21 (ENSMMNG00015015882) ENSMMNG00015015821 ENSMMNG00015015805 PCNX2 (ENSMMNG00015015765) NTPCR (ENSMMNG00015015728) SIPA1L2 (ENSMMNG00015015679) ENSMMNG00015015637 ENSMMNG00015015616 TSNAX (ENSMMNG00015015576) EGLN1 (ENSMMNG00015015559) Pecora ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Yarkand deer MODERN SPECIES 17 MYO10 (ENSCHYG00000010240) RETREG1 (ENSCHYG00000012421) ZNF622 (ENSCHYG00000012501) MARCHF11 (ENSCHYG00000012594) FBXL7 (ENSCHYG00000012633) ENSCHYG00000012770 ANKH (ENSCHYG00000012797) OTULIN (ENSCHYG00000012858) ENSCHYG00000012895 OTULINL (ENSCHYG00000012915) ENSCHYG00000012999 ENSCHYG00000013264 ENSCHYG00000013334 DNAH5 (ENSCHYG00000013613) CTNND2 (ENSCHYG00000014547) ENSCHYG00000014724 ##22 ENSCHYG00000014792 DAP (ENSCHYG00000014843) ANKRD33B (ENSCHYG00000014906) MARCHF6 (ENSCHYG00000015092) CMBL (ENSCHYG00000016335) ENSCHYG00000016373 ATPSCKMT (ENSCHYG00000016616) ENSCHYG00000016710 TAS2R1 (ENSCHYG00000016763) SEMA5A (ENSCHYG00000016807) MTRR (ENSCHYG00000016969) FASTKD3 (ENSCHYG00000017127) CFAP90 (ENSCHYG00000017169) ENSCHYG00000017205 ADCY2 (ENSCHYG00000017238) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 1264 PTGR1 (ENSMMSG00000022840) ENSMMSG00000022853 GNG10 (ENSMMSG00000022861) SHOC1 (ENSMMSG00000022881) UGCG (ENSMMSG00000022919) SUSD1 (ENSMMSG00000022932) PTBP3 (ENSMMSG00000022952) HSDL2 (ENSMMSG00000022991) KIAA1958 (ENSMMSG00000023009) ENSMMSG00000023016 SNX30 (ENSMMSG00000023023) SLC46A2 (ENSMMSG00000023036) ENSMMSG00000023044 ENSMMSG00000023048 ZFP37 (ENSMMSG00000023059) ENSMMSG00000023065 ##22 ENSMMSG00000023070 FKBP15 (ENSMMSG00000012994) ENSMMSG00000013051 SLC31A1 (ENSMMSG00000013064) CDC26 (ENSMMSG00000013079) PRPF4 (ENSMMSG00000013096) RNF183 (ENSMMSG00000013152) WDR31 (ENSMMSG00000013163) BSPRY (ENSMMSG00000013218) HDHD3 (ENSMMSG00000013243) ALAD (ENSMMSG00000013255) POLE3 (ENSMMSG00000013280) C9orf43 (ENSMMSG00000013317) RGS3 (ENSMMSG00000013383) ZNF618 (ENSMMSG00000013627) Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 117 ENSMMSG00000008911 ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 45 ENSMMSG00000000423 ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011249 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(ENSBTAG00000013735) GGPS1 (ENSBTAG00000013068) ENSBTAG00000048382 ARID4B (ENSBTAG00000000222) RBM34 (ENSBTAG00000000221) TOMM20 (ENSBTAG00000000562) ##22 IRF2BP2 (ENSBTAG00000046841) TARBP1 (ENSBTAG00000004517) COA6 (ENSBTAG00000051467) SLC35F3 (ENSBTAG00000020361) KCNK1 (ENSBTAG00000004515) MAP3K21 (ENSBTAG00000021183) PCNX2 (ENSBTAG00000000535) NTPCR (ENSBTAG00000013935) MAP10 (ENSBTAG00000012566) ENSBTAG00000049681 SIPA1L2 (ENSBTAG00000000942) DISC1 (ENSBTAG00000050839) TSNAX (ENSBTAG00000047434) ENSBTAG00000048426 ENSBTAG00000012132 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00950000182994.B.a.b.e.a.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Goat MODERN SPECIES 20 MTR (ENSCHIG00000000324) ACTN2 (ENSCHIG00000010063) HEATR1 (ENSCHIG00000022619) LGALS8 (ENSCHIG00000022419) EDARADD (ENSCHIG00000011262) ERO1B (ENSCHIG00000019035) GPR137B (ENSCHIG00000011808) NID1 (ENSCHIG00000020764) LYST (ENSCHIG00000000114) GNG4 (ENSCHIG00000000426) B3GALNT2 (ENSCHIG00000010826) TBCE (ENSCHIG00000019154) GGPS1 (ENSCHIG00000015587) ARID4B (ENSCHIG00000020742) ENSCHIG00000020834 TOMM20 (ENSCHIG00000007684) ##22 IRF2BP2 (ENSCHIG00000011687) TARBP1 (ENSCHIG00000011437) ENSCHIG00000025782 SLC35F3 (ENSCHIG00000016638) KCNK1 (ENSCHIG00000026110) ENSCHIG00000015944 MAP3K21 (ENSCHIG00000015700) PCNX2 (ENSCHIG00000021717) NTPCR (ENSCHIG00000011997) MAP10 (ENSCHIG00000005553) SIPA1L2 (ENSCHIG00000023959) DISC1 (ENSCHIG00000019578) TSNAX (ENSCHIG00000012051) EGLN1 (ENSCHIG00000015968) SPRTN (ENSCHIG00000013744) Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 23 DLGAP5 (ENSOARG00020016493) FBXO34 (ENSOARG00020016670) ATG14 (ENSOARG00020016704) TBPL2 (ENSOARG00020016918) KTN1 (ENSOARG00020017183) PELI2 (ENSOARG00020019043) ENSOARG00020019111 OTX2 (ENSOARG00020019426) EXOC5 (ENSOARG00020019509) AP5M1 (ENSOARG00020020008) NAA30 (ENSOARG00020020150) CCDC198 (ENSOARG00020020200) ENSOARG00020020321 SLC35F4 (ENSOARG00020020338) ARMH4 (ENSOARG00020020459) ENSOARG00020020575 ##22 ACTR10 (ENSOARG00020020638) PSMA3 (ENSOARG00020020746) ARID4A (ENSOARG00020020842) TOMM20L (ENSOARG00020021304) ##22 TIMM9 (ENSOARG00020007740) DACT1 (ENSOARG00020008146) ENSOARG00020008208 ENSOARG00020008239 ENSOARG00020008270 ENSOARG00020008316 ENSOARG00020008342 DAAM1 (ENSOARG00020008441) L3HYPDH (ENSOARG00020008883) JKAMP (ENSOARG00020008977) CCDC175 (ENSOARG00020009081) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 17 ACTN2 (ENSOARG00020019247) HEATR1 (ENSOARG00020018840) LGALS8 (ENSOARG00020018619) EDARADD (ENSOARG00020018503) ERO1B (ENSOARG00020018369) GPR137B (ENSOARG00020018310) NID1 (ENSOARG00020017963) LYST (ENSOARG00020016708) GNG4 (ENSOARG00020016634) ENSOARG00020016607 B3GALNT2 (ENSOARG00020016542) TBCE (ENSOARG00020016274) GGPS1 (ENSOARG00020016218) ARID4B (ENSOARG00020015673) ENSOARG00020015590 TOMM20 (ENSOARG00020015523) ##22 IRF2BP2 (ENSOARG00020015445) ENSOARG00020015422 TARBP1 (ENSOARG00020014895) ENSOARG00020014831 SLC35F3 (ENSOARG00020014634) KCNK1 (ENSOARG00020014578) ENSOARG00020014471 MAP3K21 (ENSOARG00020014333) ENSOARG00020014283 NTPCR (ENSOARG00020014081) MAP10 (ENSOARG00020014059) SIPA1L2 (ENSOARG00020013094) TSNAX (ENSOARG00020012863) EGLN1 (ENSOARG00020012816) SPRTN (ENSOARG00020012710) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Primates ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00620000089401 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a.i ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a.i ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a.i ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a.i ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a.i ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT01080000257410.A.f ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00910000147013 ENSGT00730000111392 ENSGT00940000155888 ENSGT00950000183112.a ENSGT00860000135750 ENSGT00940000156291 ENSGT00950000182891.a.a.b.a.b.b.a.b ENSGT00940000157540.A ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00910000146810 ENSGT00940000160523 ENSGT00390000011698.c.a.c.a.i ##22 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000156682 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000159268 ENSGT00530000063847.a ENSGT01020000230401.b.a.m.a ENSGT00940000157771 ENSGT00910000148191 ENSGT00940000156205 ENSGT00910000146870 ENSGT00910000147385 ENSGT00940000160583 ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000158773 ENSGT01030000234515.a.b.a.b Sooty mangabey MODERN SPECIES 215 SV2B (ENSCATG00000040402) SLCO3A1 (ENSCATG00000037751) ENSCATG00000037617 ST8SIA2 (ENSCATG00000035756) FAM174B (ENSCATG00000037463) CHD2 (ENSCATG00000031069) RGMA (ENSCATG00000031113) ENSCATG00000044758 MCTP2 (ENSCATG00000040946) ENSCATG00000018962 NR2F2 (ENSCATG00000031188) ENSCATG00000038786 ENSCATG00000030455 ENSCATG00000039546 ARRDC4 (ENSCATG00000042268) ENSCATG00000037029 ##22 ENSCATG00000036401 IGF1R (ENSCATG00000027553) PGPEP1L (ENSCATG00000028080) SYNM (ENSCATG00000025065) TTC23 (ENSCATG00000030495) ENSCATG00000013868 LRRC28 (ENSCATG00000040008) ENSCATG00000022742 MEF2A (ENSCATG00000013642) ENSCATG00000041680 LYSMD4 (ENSCATG00000045215) ENSCATG00000039199 ADAMTS17 (ENSCATG00000022071) CERS3 (ENSCATG00000042107) LINS1 (ENSCATG00000038557) Drill MODERN SPECIES 1648 ENSMLEG00000040680 MCTP2 (ENSMLEG00000035947) ENSMLEG00000022024 NR2F2 (ENSMLEG00000039345) ENSMLEG00000027490 ENSMLEG00000037058 ENSMLEG00000033372 ARRDC4 (ENSMLEG00000026370) ENSMLEG00000018383 ##22 ENSMLEG00000043699 IGF1R (ENSMLEG00000036236) PGPEP1L (ENSMLEG00000039938) SYNM (ENSMLEG00000027302) TTC23 (ENSMLEG00000042651) ENSMLEG00000029728 LRRC28 (ENSMLEG00000028357) ENSMLEG00000043137 MEF2A (ENSMLEG00000040969) ENSMLEG00000026190 ENSMLEG00000022570 LYSMD4 (ENSMLEG00000037495) ENSMLEG00000034363 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a.i ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 135 ENSGT00510000048902.b ENSGT00390000011698.c.a.c.a.i ##22 Rhesus MODERN SPECIES 17 ENSMMUG00000011326 ENSMMUG00000042330 SV2B (ENSMMUG00000008399) SLCO3A1 (ENSMMUG00000001740) ST8SIA2 (ENSMMUG00000013814) FAM174B (ENSMMUG00000054786) ENSMMUG00000060896 CHD2 (ENSMMUG00000011782) RGMA (ENSMMUG00000017381) MCTP2 (ENSMMUG00000004787) ENSMMUG00000063701 NR2F2 (ENSMMUG00000005430) ARRDC4 (ENSMMUG00000062927) ENSMMUG00000049763 ENSMMUG00000043903 ENSMMUG00000002531 ##22 ENSMMUG00000063552 ENSMMUG00000058735 IGF1R (ENSMMUG00000012305) PGPEP1L (ENSMMUG00000012309) SYNM (ENSMMUG00000005220) TTC23 (ENSMMUG00000005224) LRRC28 (ENSMMUG00000005226) MEF2A (ENSMMUG00000018122) ENSMMUG00000056179 ENSMMUG00000054929 LYSMD4 (ENSMMUG00000018124) ENSMMUG00000045944 ENSMMUG00000052374 ADAMTS17 (ENSMMUG00000021160) CERS3 (ENSMMUG00000016498) Vervet Monkey MODERN SPECIES 21 BLM (ENSCSAG00000017040) CRTC3 (ENSCSAG00000017034) IQGAP1 (ENSCSAG00000017030) SV2B (ENSCSAG00000017020) SLCO3A1 (ENSCSAG00000017018) ENSCSAG00000017017 ST8SIA2 (ENSCSAG00000017015) FAM174B (ENSCSAG00000017009) CHD2 (ENSCSAG00000017007) RGMA (ENSCSAG00000017004) MCTP2 (ENSCSAG00000016995) NR2F2 (ENSCSAG00000016974) ENSCSAG00000000366 ARRDC4 (ENSCSAG00000016967) ENSCSAG00000016956 ENSCSAG00000000365 ##22 IGF1R (ENSCSAG00000016951) PGPEP1L (ENSCSAG00000016947) SYNM (ENSCSAG00000016942) TTC23 (ENSCSAG00000016940) LRRC28 (ENSCSAG00000016935) ENSCSAG00000000364 MEF2A (ENSCSAG00000016929) LYSMD4 (ENSCSAG00000016917) ENSCSAG00000016905 ADAMTS17 (ENSCSAG00000016882) CERS3 (ENSCSAG00000016875) LINS1 (ENSCSAG00000016869) ASB7 (ENSCSAG00000016864) ALDH1A3 (ENSCSAG00000016862) LRRK1 (ENSCSAG00000016858) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000155727 ENSGT00620000089401 ENSGT00950000182805.a.a.a.b.i.b.b.b ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176.q.b ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A Hominoidea DUPLICATION Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j.a.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j.a.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j.a.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j.a.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182805.a.a.a.b.i.b.b.b ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j.a.a ##22 ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000000475.sb.u.e ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00390000014122.i.b.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 Bonobo MODERN SPECIES ENSPPAG00000034870 ENSPPAG00000030182 EDARADD (ENSPPAG00000038427) ERO1B (ENSPPAG00000043582) GPR137B (ENSPPAG00000031164) NID1 (ENSPPAG00000034176) ENSPPAG00000030475 LYST (ENSPPAG00000037311) GNG4 (ENSPPAG00000033594) B3GALNT2 (ENSPPAG00000035839) ENSPPAG00000020240 TBCE (ENSPPAG00000028683) GGPS1 (ENSPPAG00000030820) ARID4B (ENSPPAG00000031651) RBM34 (ENSPPAG00000030692) ENSPPAG00000030528 ##22 TARBP1 (ENSPPAG00000028097) COA6 (ENSPPAG00000039037) ENSPPAG00000038459 SLC35F3 (ENSPPAG00000039139) KCNK1 (ENSPPAG00000030456) ENSPPAG00000039094 ENSPPAG00000036146 ENSPPAG00000039639 PCNX2 (ENSPPAG00000017694) ENSPPAG00000030395 MAP10 (ENSPPAG00000022583) SIPA1L2 (ENSPPAG00000039392) DISC1 (ENSPPAG00000031414) TSNAX (ENSPPAG00000030431) ENSPPAG00000030076 Gibbon MODERN SPECIES 20 EDARADD (ENSNLEG00000003225) ERO1B (ENSNLEG00000003192) GPR137B (ENSNLEG00000003165) ENSNLEG00000036269 NID1 (ENSNLEG00000003070) LYST (ENSNLEG00000002982) ENSNLEG00000035816 ENSNLEG00000002971 B3GALNT2 (ENSNLEG00000002950) ENSNLEG00000032061 TBCE (ENSNLEG00000002823) GGPS1 (ENSNLEG00000002808) ARID4B (ENSNLEG00000002665) ENSNLEG00000032959 RBM34 (ENSNLEG00000002610) TOMM20 (ENSNLEG00000029038) ##22 ENSNLEG00000002590 TARBP1 (ENSNLEG00000002518) COA6 (ENSNLEG00000002501) ENSNLEG00000030108 SLC35F3 (ENSNLEG00000031022) ENSNLEG00000029888 MAP3K21 (ENSNLEG00000002463) PCNX2 (ENSNLEG00000002367) ENSNLEG00000028386 ENSNLEG00000002349 SIPA1L2 (ENSNLEG00000002184) ENSNLEG00000002177 TSNAX (ENSNLEG00000035882) ENSNLEG00000036156 EGLN1 (ENSNLEG00000002120) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000015252.h.a ENSGT00390000015252.g.b ENSGT00390000015252.g.a.a ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00510000047029.z.d.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843 ENSGT00950000183118.A.c.b ENSGT00410000029400.b ENSGT00410000029400.a ENSGT00940000165171 ENSGT00940000163063 ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j.a.b ##22 ENSGT00940000162554 ENSGT00940000154744.m.a ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000155268.f.b.a.a.a ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000015252.g.a.b ENSGT00390000015252.h.a ENSGT00390000015252.g.a.a ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00510000047029.z.d.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843 ENSGT00950000183118.A.c.b ENSGT00410000029400.b ENSGT00410000029400.a ENSGT00940000165171.b ENSGT00940000165171.a ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j.a.b ##22 ENSGT00940000162554 ENSGT00940000154744.m.a ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000155268.f.b.a.a.a ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 Pan ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183584 ENSGT00940000155085.b ENSGT00440000040163 ENSGT01050000244848.B.a.b ENSGT00390000015252.g.a.b ENSGT00390000015252.h.a ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00940000163191 ENSGT00510000047029.z.d.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843 ENSGT00950000183118.A.c.b ENSGT00940000160311 ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j.a.b ##22 ENSGT00940000162554 ENSGT00940000154744.m.a ENSGT00390000003601.a ENSGT00910000146883.A ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000155268.f.b.a.a.a ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 Bonobo MODERN SPECIES 369 OGT (ENSPPAG00000030832) ENSPPAG00000041492 CXCR3 (ENSPPAG00000042300) ENSPPAG00000029254 ENSPPAG00000030502 NHSL2 (ENSPPAG00000037776) ENSPPAG00000026409 PIN4 (ENSPPAG00000035593) ERCC6L (ENSPPAG00000031861) ENSPPAG00000039737 CITED1 (ENSPPAG00000037425) HDAC8 (ENSPPAG00000023056) PHKA1 (ENSPPAG00000042021) ENSPPAG00000042207 ENSPPAG00000012920 ENSPPAG00000035410 ##22 CDX4 (ENSPPAG00000036922) ENSPPAG00000038434 CHIC1 (ENSPPAG00000038543) ENSPPAG00000009768 ENSPPAG00000029442 ENSPPAG00000030864 SLC16A2 (ENSPPAG00000038613) RLIM (ENSPPAG00000027958) NEXMIF (ENSPPAG00000015470) ABCB7 (ENSPPAG00000031273) UPRT (ENSPPAG00000035587) ZDHHC15 (ENSPPAG00000017721) ENSPPAG00000036584 ENSPPAG00000042832 MAGEE2 (ENSPPAG00000000336) Chimpanzee MODERN SPECIES 972 ENSPTRG00000046702 ENSPTRG00000044432 ENSPTRG00000050221 NHSL2 (ENSPTRG00000028255) RTL5 (ENSPTRG00000039375) PIN4 (ENSPTRG00000049495) ERCC6L (ENSPTRG00000022023) RPS4X (ENSPTRG00000022025) CITED1 (ENSPTRG00000022026) HDAC8 (ENSPTRG00000051531) PHKA1 (ENSPTRG00000022029) ENSPTRG00000045935 ENSPTRG00000048543 ENSPTRG00000050068 ENSPTRG00000028252 ENSPTRG00000043791 ##22 CDX4 (ENSPTRG00000022032) ENSPTRG00000051207 CHIC1 (ENSPTRG00000028250) ENSPTRG00000049815 ENSPTRG00000049646 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Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155727 ENSGT00620000089401 ENSGT00950000182805.a.a.a.b.i.b.b.b ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT01100000264371 ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176.q.b ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A Hominidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00950000182805.a.a.a.b.i.b.b.b ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.b.a 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(ENSPPYG00000000114) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000155727 ENSGT00620000089401 ENSGT00950000182805.a.a.a.b.i.b.b.b ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176.q.b ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155727 ENSGT00620000089401 ENSGT00950000182805.a.a.a.b.i.b.b.b ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155727 ENSGT00620000089401 ENSGT00950000182805.a.a.a.b.i.b.b.b ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.b.a.a.a.b ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155727 ENSGT00620000089401 ENSGT00950000182805.a.a.a.b.i.b.b.b ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Olive baboon MODERN SPECIES LGALS8 (ENSPANG00000008422) EDARADD (ENSPANG00000009366) ENSPANG00000043056 ENSPANG00000049802 ERO1B (ENSPANG00000018966) GPR137B (ENSPANG00000006336) NID1 (ENSPANG00000010412) ENSPANG00000036019 LYST (ENSPANG00000016715) GNG4 (ENSPANG00000015791) B3GALNT2 (ENSPANG00000015279) TBCE (ENSPANG00000021031) GGPS1 (ENSPANG00000019749) ARID4B (ENSPANG00000013611) RBM34 (ENSPANG00000010411) TOMM20 (ENSPANG00000016861) ##22 IRF2BP2 (ENSPANG00000019525) TARBP1 (ENSPANG00000021933) COA6 (ENSPANG00000007339) SLC35F3 (ENSPANG00000014847) ENSPANG00000043317 KCNK1 (ENSPANG00000024047) MAP3K21 (ENSPANG00000013610) PCNX2 (ENSPANG00000016860) NTPCR (ENSPANG00000009145) MAP10 (ENSPANG00000030141) SIPA1L2 (ENSPANG00000024427) DISC1 (ENSPANG00000006042) TSNAX (ENSPANG00000008379) EGLN1 (ENSPANG00000017983) SPRTN (ENSPANG00000017798) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00620000089401 ENSGT00950000182805.a.a.a.b.i.b.b.b ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000154892.e.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Sooty mangabey MODERN SPECIES 449 LGALS8 (ENSCATG00000032807) ENSCATG00000038318 EDARADD (ENSCATG00000025338) ERO1B (ENSCATG00000041284) GPR137B (ENSCATG00000037762) ENSCATG00000026864 NID1 (ENSCATG00000016642) ENSCATG00000039185 LYST (ENSCATG00000038446) GNG4 (ENSCATG00000038013) B3GALNT2 (ENSCATG00000041972) TBCE (ENSCATG00000026739) GGPS1 (ENSCATG00000042363) ARID4B (ENSCATG00000042166) RBM34 (ENSCATG00000031771) TOMM20 (ENSCATG00000006064) ##22 IRF2BP2 (ENSCATG00000034706) TARBP1 (ENSCATG00000011754) COA6 (ENSCATG00000041539) SLC35F3 (ENSCATG00000036097) KCNK1 (ENSCATG00000039926) MAP3K21 (ENSCATG00000022233) PCNX2 (ENSCATG00000018119) NTPCR (ENSCATG00000040507) SIPA1L2 (ENSCATG00000043594) DISC1 (ENSCATG00000018901) TSNAX (ENSCATG00000037048) EGLN1 (ENSCATG00000042103) SPRTN (ENSCATG00000037067) EXOC8 (ENSCATG00000023140) GNPAT (ENSCATG00000038210) Drill MODERN SPECIES 1005 GNG4 (ENSMLEG00000039769) B3GALNT2 (ENSMLEG00000032063) TBCE (ENSMLEG00000030382) GGPS1 (ENSMLEG00000038865) ARID4B (ENSMLEG00000033583) ENSMLEG00000044363 TOMM20 (ENSMLEG00000036369) ##22 IRF2BP2 (ENSMLEG00000031137) TARBP1 (ENSMLEG00000044182) COA6 (ENSMLEG00000032737) SLC35F3 (ENSMLEG00000031963) KCNK1 (ENSMLEG00000040326) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00950000182805.a.a.a.b.i.b.b.b ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.b.a.a.a.b ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 530 HEATR1 (ENSMNEG00000035612) LGALS8 (ENSMNEG00000034839) ENSMNEG00000033371 EDARADD (ENSMNEG00000027890) ERO1B (ENSMNEG00000039548) GPR137B (ENSMNEG00000033925) NID1 (ENSMNEG00000028275) ENSMNEG00000039691 LYST (ENSMNEG00000033677) GNG4 (ENSMNEG00000044612) B3GALNT2 (ENSMNEG00000040976) TBCE (ENSMNEG00000033564) GGPS1 (ENSMNEG00000038980) ARID4B (ENSMNEG00000014840) RBM34 (ENSMNEG00000040149) TOMM20 (ENSMNEG00000033619) ##22 IRF2BP2 (ENSMNEG00000030590) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000174433.B.b ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a.j ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.b.a.a.a.b ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Rhesus MODERN SPECIES HEATR1 (ENSMMUG00000015135) LGALS8 (ENSMMUG00000015132) EDARADD (ENSMMUG00000021238) ERO1B (ENSMMUG00000044139) ENSMMUG00000056299 GPR137B (ENSMMUG00000014263) NID1 (ENSMMUG00000012716) LYST (ENSMMUG00000012729) GNG4 (ENSMMUG00000053807) B3GALNT2 (ENSMMUG00000008427) TBCE (ENSMMUG00000008426) ENSMMUG00000053318 GGPS1 (ENSMMUG00000007145) ARID4B (ENSMMUG00000007141) RBM34 (ENSMMUG00000039424) TOMM20 (ENSMMUG00000058824) ##22 IRF2BP2 (ENSMMUG00000049832) TARBP1 (ENSMMUG00000021703) COA6 (ENSMMUG00000021702) ENSMMUG00000052207 SLC35F3 (ENSMMUG00000006226) ENSMMUG00000052225 KCNK1 (ENSMMUG00000022429) MAP3K21 (ENSMMUG00000009226) PCNX2 (ENSMMUG00000012615) NTPCR (ENSMMUG00000063981) SIPA1L2 (ENSMMUG00000012068) DISC1 (ENSMMUG00000013119) TSNAX (ENSMMUG00000016204) EGLN1 (ENSMMUG00000053396) SPRTN (ENSMMUG00000005244) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00620000089401 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176.r ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Mas night monkey MODERN SPECIES 958 LGALS8 (ENSANAG00000027110) ENSANAG00000032286 EDARADD (ENSANAG00000036740) ERO1B (ENSANAG00000023707) ENSANAG00000028059 NID1 (ENSANAG00000023696) LYST (ENSANAG00000037136) GNG4 (ENSANAG00000012884) B3GALNT2 (ENSANAG00000036337) ENSANAG00000036876 TBCE (ENSANAG00000037588) GGPS1 (ENSANAG00000028242) ARID4B (ENSANAG00000038088) ENSANAG00000019826 RBM34 (ENSANAG00000029971) TOMM20 (ENSANAG00000033677) ##22 IRF2BP2 (ENSANAG00000024218) TARBP1 (ENSANAG00000022031) COA6 (ENSANAG00000033328) SLC35F3 (ENSANAG00000027066) KCNK1 (ENSANAG00000034990) MAP3K21 (ENSANAG00000030901) 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EDARADD (ENSCJAG00000047849) ERO1B (ENSCJAG00000017881) ENSCJAG00000017900 NID1 (ENSCJAG00000017921) LYST (ENSCJAG00000017931) ENSCJAG00000078073 GNG4 (ENSCJAG00000063269) B3GALNT2 (ENSCJAG00000018018) TBCE (ENSCJAG00000018023) ENSCJAG00000082062 GGPS1 (ENSCJAG00000018045) ARID4B (ENSCJAG00000018055) ENSCJAG00000075230 RBM34 (ENSCJAG00000018125) TOMM20 (ENSCJAG00000047923) ##22 ENSCJAG00000076408 IRF2BP2 (ENSCJAG00000018139) TARBP1 (ENSCJAG00000018155) ENSCJAG00000085373 COA6 (ENSCJAG00000018183) SLC35F3 (ENSCJAG00000018207) ENSCJAG00000071725 ENSCJAG00000074251 ENSCJAG00000082899 ENSCJAG00000086856 KCNK1 (ENSCJAG00000048323) MAP3K21 (ENSCJAG00000018228) PCNX2 (ENSCJAG00000018267) NTPCR (ENSCJAG00000018274) ENSCJAG00000083948 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00620000089401 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 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EGLN1 (ENSCCAG00000021728) SPRTN (ENSCCAG00000022861) EXOC8 (ENSCCAG00000003798) Bolivian squirrel monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 57 EMB (ENSSBOG00000031770) HCN1 (ENSSBOG00000032652) ENSSBOG00000033279 ENSSBOG00000030359 MRPS30 (ENSSBOG00000034220) ENSSBOG00000035921 FGF10 (ENSSBOG00000019373) NNT (ENSSBOG00000032175) PAIP1 (ENSSBOG00000024593) C5orf34 (ENSSBOG00000031040) TMEM267 (ENSSBOG00000032412) ENSSBOG00000011299 CCL28 (ENSSBOG00000029489) HMGCS1 (ENSSBOG00000020825) NIM1K (ENSSBOG00000024438) ENSSBOG00000006819 ##22 ZNF131 (ENSSBOG00000021812) CCDC152 (ENSSBOG00000025815) ENSSBOG00000029186 GHR (ENSSBOG00000026257) ENSSBOG00000024904 FBXO4 (ENSSBOG00000031090) RIMOC1 (ENSSBOG00000024152) ENSSBOG00000007830 ENSSBOG00000017199 PLCXD3 (ENSSBOG00000024536) ENSSBOG00000019421 C6 (ENSSBOG00000034860) MROH2B (ENSSBOG00000023538) C7 (ENSSBOG00000030097) CARD6 (ENSSBOG00000020523) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 176 ARID4B (ENSSBOG00000020196) 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(ENSOGAG00000032693) ##22 IRF2BP2 (ENSOGAG00000002391) TARBP1 (ENSOGAG00000002379) SLC35F3 (ENSOGAG00000002376) KCNK1 (ENSOGAG00000002272) MAP3K21 (ENSOGAG00000010128) PCNX2 (ENSOGAG00000004635) NTPCR (ENSOGAG00000004633) MAP10 (ENSOGAG00000024613) SIPA1L2 (ENSOGAG00000007607) DISC1 (ENSOGAG00000009237) ENSOGAG00000005575 EGLN1 (ENSOGAG00000033024) SPRTN (ENSOGAG00000008666) EXOC8 (ENSOGAG00000008664) CAPN9 (ENSOGAG00000003044) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176.q.a ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176.q.a ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 949 ARIH2 (ENSPSMG00000025990) P4HTM (ENSPSMG00000025991) WDR6 (ENSPSMG00000025992) DALRD3 (ENSPSMG00000025993) NDUFAF3 (ENSPSMG00000025995) QRICH1 (ENSPSMG00000025996) QARS1 (ENSPSMG00000025997) USP19 (ENSPSMG00000025998) LAMB2 (ENSPSMG00000025999) CCDC71 (ENSPSMG00000026000) KLHDC8B (ENSPSMG00000026001) C3orf84 (ENSPSMG00000026002) ENSPSMG00000026003 C3orf62 (ENSPSMG00000026004) USP4 (ENSPSMG00000026005) ENSPSMG00000026006 ##22 GPX1 (ENSPSMG00000026008) RHOA (ENSPSMG00000026009) TCTA (ENSPSMG00000026011) AMT (ENSPSMG00000026012) NICN1 (ENSPSMG00000026013) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 812 MTR (ENSPCOG00000027883) ACTN2 (ENSPCOG00000026369) HEATR1 (ENSPCOG00000018534) LGALS8 (ENSPCOG00000028427) EDARADD (ENSPCOG00000024505) ERO1B (ENSPCOG00000006144) GPR137B (ENSPCOG00000016957) NID1 (ENSPCOG00000009614) LYST (ENSPCOG00000019565) GNG4 (ENSPCOG00000004047) B3GALNT2 (ENSPCOG00000023952) TBCE (ENSPCOG00000021439) GGPS1 (ENSPCOG00000021243) ARID4B (ENSPCOG00000024328) RBM34 (ENSPCOG00000018448) TOMM20 (ENSPCOG00000021362) ##22 IRF2BP2 (ENSPCOG00000012988) TARBP1 (ENSPCOG00000005666) ENSPCOG00000020423 SLC35F3 (ENSPCOG00000023418) KCNK1 (ENSPCOG00000019655) MAP3K21 (ENSPCOG00000027124) PCNX2 (ENSPCOG00000018704) NTPCR (ENSPCOG00000026698) MAP10 (ENSPCOG00000025923) SIPA1L2 (ENSPCOG00000018831) ENSPCOG00000018491 ENSPCOG00000023345 TSNAX (ENSPCOG00000028517) EGLN1 (ENSPCOG00000025942) ENSPCOG00000009251 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Kangaroo rat MODERN SPECIES 343 Lyst (ENSDORG00000002783) Gng4 (ENSDORG00000008640) B3galnt2 (ENSDORG00000008655) Tbce (ENSDORG00000008650) Ggps1 (ENSDORG00000008648) Arid4b (ENSDORG00000006422) Rbm34 (ENSDORG00000006420) Tomm20 (ENSDORG00000006418) ##22 ENSDORG00000026942 Tarbp1 (ENSDORG00000007984) Coa6 (ENSDORG00000025191) Slc35f3 (ENSDORG00000007982) Kcnk1 (ENSDORG00000023268) Pcnx2 (ENSDORG00000014864) Ntpcr (ENSDORG00000014863) Sipa1l2 (ENSDORG00000001369) Tsnax (ENSDORG00000013537) ENSDORG00000006651 Exoc8 (ENSDORG00000026626) Gnpat (ENSDORG00000023736) 2810004N23Rik (ENSDORG00000001922) Arv1 (ENSDORG00000001380) ENSDORG00000005506 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 72 Zfp438 (ENSJJAG00000024201) ENSJJAG00000015366 Svil (ENSJJAG00000019438) Jcad (ENSJJAG00000008684) Mtpap (ENSJJAG00000023931) Map3k8 (ENSJJAG00000010969) Lyzl1 (ENSJJAG00000005043) Bambi (ENSJJAG00000023950) Lyst (ENSJJAG00000003513) Gng4 (ENSJJAG00000021565) B3galnt2 (ENSJJAG00000023217) Tbce (ENSJJAG00000016634) ENSJJAG00000010664 Arid4b (ENSJJAG00000021368) Rbm34 (ENSJJAG00000021295) Tomm20 (ENSJJAG00000013187) ##22 Irf2bp2 (ENSJJAG00000024254) Tarbp1 (ENSJJAG00000017840) Coa6 (ENSJJAG00000005913) Slc35f3 (ENSJJAG00000022971) Kcnk1 (ENSJJAG00000019265) ENSJJAG00000019015 Pcnx2 (ENSJJAG00000018916) Ntpcr (ENSJJAG00000021780) ENSJJAG00000012997 Sipa1l2 (ENSJJAG00000006772) ENSJJAG00000007822 ENSJJAG00000000228 ENSJJAG00000022492 Sprtn (ENSJJAG00000022876) Gnpat (ENSJJAG00000014883) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1887 Gm45261 (ENSNGAG00000022903) Cul3 (ENSNGAG00000022588) Fam124b (ENSNGAG00000021610) Serpine2 (ENSNGAG00000003149) Mrpl44 (ENSNGAG00000021751) Wdfy1 (ENSNGAG00000023734) Ap1s3 (ENSNGAG00000018689) Scg2 (ENSNGAG00000024294) Kcne4 (ENSNGAG00000021972) Acsl3 (ENSNGAG00000023634) Mogat1 (ENSNGAG00000023251) Farsb (ENSNGAG00000014602) Sgpp2 (ENSNGAG00000022640) Pax3 (ENSNGAG00000022200) Epha4 (ENSNGAG00000022753) ENSNGAG00000013386 ##22 Slc4a3 (ENSNGAG00000020496) Stk11ip (ENSNGAG00000023807) Inha (ENSNGAG00000022417) Obsl1 (ENSNGAG00000002817) Tmem198 (ENSNGAG00000022541) Chpf (ENSNGAG00000023137) Asic4 (ENSNGAG00000003829) Gmppa (ENSNGAG00000024013) ENSNGAG00000022363 Des (ENSNGAG00000011406) Dnpep (ENSNGAG00000011470) Resp18 (ENSNGAG00000020025) Ptprn (ENSNGAG00000005905) Dnajb2 (ENSNGAG00000022353) ENSNGAG00000012847 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1358 Nid1 (ENSNGAG00000023816) Lyst (ENSNGAG00000014639) Gng4 (ENSNGAG00000004691) B3galnt2 (ENSNGAG00000008261) Tbce (ENSNGAG00000020833) Ggps1 (ENSNGAG00000020240) Arid4b (ENSNGAG00000014629) Rbm34 (ENSNGAG00000010712) ENSNGAG00000003493 ##22 Irf2bp2 (ENSNGAG00000001609) Tarbp1 (ENSNGAG00000012556) ENSNGAG00000010757 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000009751 ENSGT00860000135880 ENSGT01090000259987.a.b ENSGT00940000157169 ENSGT00950000183214.a.b.a.a ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Murinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000009751.i.a ENSGT00390000009751.i.b ENSGT00860000135880 ENSGT01090000259987.a.b ENSGT00940000157169 ENSGT00950000183214.a.b.a.a ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Mus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000009751.i.a ENSGT00390000009751.i.b ENSGT01090000259987.a.b ENSGT00940000157169 ENSGT00950000183214.a.b.a.a ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000009751.i.a ENSGT00390000009751.i.b ENSGT01090000259987.a.b ENSGT00940000157169 ENSGT00950000183214.a.b.a.a ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.l ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000009751.i.a ENSGT00390000009751.i.b ENSGT01090000259987.a.b ENSGT00940000157169 ENSGT00950000183214.a.b.a.a ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.l ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Mouse MODERN SPECIES 17 2610044O15Rik8 (ENSMUSG00000071302) Ccdc7b (ENSMUSG00000056018) Ccdc7a (ENSMUSG00000025808) Itgb1 (ENSMUSG00000025809) Nrp1 (ENSMUSG00000025810) Pard3 (ENSMUSG00000025812) Rbm34 (ENSMUSG00000033931) Tomm20 (ENSMUSG00000093904) ##22 Irf2bp2 (ENSMUSG00000051495) Tarbp1 (ENSMUSG00000090290) Coa6 (ENSMUSG00000051671) Slc35f3 (ENSMUSG00000057060) Kcnk1 (ENSMUSG00000033998) Map3k21 (ENSMUSG00000031853) Pcnx2 (ENSMUSG00000060212) Ntpcr (ENSMUSG00000031851) Map10 (ENSMUSG00000050930) Sipa1l2 (ENSMUSG00000001995) Disc1 (ENSMUSG00000043051) Tsnax (ENSMUSG00000056820) Egln1 (ENSMUSG00000031987) Sprtn (ENSMUSG00000031986) Exoc8 (ENSMUSG00000074030) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000009751.i.b ENSGT01090000259987.a.b ENSGT00940000157169 ENSGT00950000183214.a.b.a.a ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.l ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Steppe mouse MODERN SPECIES 3154 ENSMSIG00000024547 ENSMSIG00000024537 Itgb1 (ENSMSIG00000024476) Nrp1 (ENSMSIG00000024428) ENSMSIG00000024385 Pard3 (ENSMSIG00000022671) ENSMSIG00000022652 Rbm34 (ENSMSIG00000022600) Tomm20 (ENSMSIG00000022578) ##22 ENSMSIG00000022577 Irf2bp2 (ENSMSIG00000022567) Tarbp1 (ENSMSIG00000022537) Coa6 (ENSMSIG00000022527) ENSMSIG00000022518 spretus MODERN SPECIES 17 MGP_SPRETEiJ_G0032855 MGP_SPRETEiJ_G0032854 MGP_SPRETEiJ_G0032853 Itgb1 (MGP_SPRETEiJ_G0032852) Nrp1 (MGP_SPRETEiJ_G0032851) Pard3 (MGP_SPRETEiJ_G0032850) Rbm34 (MGP_SPRETEiJ_G0032849) Tomm20 (MGP_SPRETEiJ_G0032848) ##22 Irf2bp2 (MGP_SPRETEiJ_G0032847) Tarbp1 (MGP_SPRETEiJ_G0032846) Coa6 (MGP_SPRETEiJ_G0032845) Slc35f3 (MGP_SPRETEiJ_G0032844) Kcnk1 (MGP_SPRETEiJ_G0032843) Map3k21 (MGP_SPRETEiJ_G0032842) Ntpcr (MGP_SPRETEiJ_G0032841) Pcnx2 (MGP_SPRETEiJ_G0032840) Map10 (MGP_SPRETEiJ_G0032839) MGP_SPRETEiJ_G0032838 Disc1 (MGP_SPRETEiJ_G0032837) Tsnax (MGP_SPRETEiJ_G0032836) Egln1 (MGP_SPRETEiJ_G0032835) Sprtn (MGP_SPRETEiJ_G0032834) Exoc8 (MGP_SPRETEiJ_G0032833) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 17 MGP_CAROLIEiJ_G0031736 Itgb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031735) Nrp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031734) Pard3 (MGP_CAROLIEiJ_G0031733) Rbm34 (MGP_CAROLIEiJ_G0031732) Tomm20 (MGP_CAROLIEiJ_G0031731) ##22 Irf2bp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031730) Tarbp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031729) Coa6 (MGP_CAROLIEiJ_G0031728) MGP_CAROLIEiJ_G0031727 Slc35f3 (MGP_CAROLIEiJ_G0031726) Kcnk1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031725) Map3k21 (MGP_CAROLIEiJ_G0031724) Pcnx2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031723) Ntpcr (MGP_CAROLIEiJ_G0031722) Map10 (MGP_CAROLIEiJ_G0031721) Sipa1l2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031720) Disc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031719) Tsnax (MGP_CAROLIEiJ_G0031718) Egln1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031717) MGP_CAROLIEiJ_G0031716 Rat MODERN SPECIES 10 LOC103690393 (ENSRNOG00000068632) Ccdc7b (ENSRNOG00000050191) Ccdc7a (ENSRNOG00000069478) ENSRNOG00000065872 Itgb1 (ENSRNOG00000010966) Nrp1 (ENSRNOG00000010744) Pard3 (ENSRNOG00000032437) LOC120098596 (ENSRNOG00000033345) Hmgb1l1 (ENSRNOG00000051482) AC125920.1 (ENSRNOG00000051278) Rbm34 (ENSRNOG00000020004) Tomm20 (ENSRNOG00000019980) ##22 Irf2bp2 (ENSRNOG00000070206) Tarbp1 (ENSRNOG00000053574) Coa6 (ENSRNOG00000062808) Slc35f3 (ENSRNOG00000049456) Kcnk1 (ENSRNOG00000019937) Map3k21 (ENSRNOG00000019931) Pcnx2 (ENSRNOG00000028580) Ntpcr (ENSRNOG00000019922) Map10 (ENSRNOG00000028652) Setsip (ENSRNOG00000062793) AABR07044111.1 (ENSRNOG00000038057) Sipa1l2 (ENSRNOG00000019791) Disc1 (ENSRNOG00000019779) Tsnax (ENSRNOG00000049784) Egln1 (ENSRNOG00000063609) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00520000059545 ENSGT00940000157325.x ENSGT00940000156227.f ENSGT00940000156625 ENSGT00940000156232.b ENSGT00440000037780.a ENSGT00940000161191.A ENSGT01090000260098.B ENSGT00940000154453.a.b.b ENSGT00390000009751 ENSGT00860000135880 ENSGT01090000259987.a.b ENSGT00940000157169 ENSGT00950000183214.a.b.a.a ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00520000059545 ENSGT00940000157325.x ENSGT00940000156227.f ENSGT00940000156625 ENSGT00940000156232.b ENSGT00440000037780.a ENSGT00940000161191.A ENSGT01090000260098.B ENSGT00940000154453.a.b.b ENSGT00390000009751 ENSGT00860000135880 ENSGT01090000259987.a.b ENSGT00940000157169 ENSGT00950000183214.a.b.a.a ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Prairie vole MODERN SPECIES 12 Rabgap1 (ENSMOCG00000015881) Zbtb26 (ENSMOCG00000005785) Zbtb6 (ENSMOCG00000003885) Rc3h2 (ENSMOCG00000009592) Pdcl (ENSMOCG00000005925) Fzd8 (ENSMOCG00000010067) Gjd4 (ENSMOCG00000004130) Ccny (ENSMOCG00000022281) ENSMOCG00000009744 ENSMOCG00000020281 ENSMOCG00000014584 Itgb1 (ENSMOCG00000019200) Nrp1 (ENSMOCG00000002681) Pard3 (ENSMOCG00000013254) Rbm34 (ENSMOCG00000013550) Tomm20 (ENSMOCG00000010595) ##22 Irf2bp2 (ENSMOCG00000009080) Tarbp1 (ENSMOCG00000004128) Coa6 (ENSMOCG00000014363) Slc35f3 (ENSMOCG00000014103) Kcnk1 (ENSMOCG00000010654) Map3k21 (ENSMOCG00000003917) Pcnx2 (ENSMOCG00000006218) Ntpcr (ENSMOCG00000022775) Sipa1l2 (ENSMOCG00000012417) Disc1 (ENSMOCG00000018986) Tsnax (ENSMOCG00000007651) ENSMOCG00000018917 Sprtn (ENSMOCG00000004695) Exoc8 (ENSMOCG00000003153) Gnpat (ENSMOCG00000014406) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 649 Rcan2 (ENSMAUG00000016625) Cyp39a1 (ENSMAUG00000014708) Slc25a27 (ENSMAUG00000013492) Tdrd6 (ENSMAUG00000001192) Pla2g7 (ENSMAUG00000019624) Ankrd66 (ENSMAUG00000018132) Mep1a (ENSMAUG00000011121) Adgrf5 (ENSMAUG00000000876) Adgrf1 (ENSMAUG00000000448) Tnfrsf21 (ENSMAUG00000019589) Cd2ap (ENSMAUG00000002697) Adgrf2 (ENSMAUG00000000367) Adgrf4 (ENSMAUG00000015896) Opn5 (ENSMAUG00000014253) Ptchd4 (ENSMAUG00000013409) ENSMAUG00000012583 ##22 Mmut (ENSMAUG00000010779) Cenpq (ENSMAUG00000013423) Glyatl3 (ENSMAUG00000013095) 9130008F23Rik (ENSMAUG00000012110) Rhag (ENSMAUG00000010616) Crisp2 (ENSMAUG00000008482) ENSMAUG00000010754 ENSMAUG00000017696 ENSMAUG00000009650 Pgk2 (ENSMAUG00000017658) Crisp4 (ENSMAUG00000007766) Defb41 (ENSMAUG00000005698) Tfap2d (ENSMAUG00000004727) Tfap2b (ENSMAUG00000017922) Pkhd1 (ENSMAUG00000017819) Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 76 Or2t6 (ENSCGRG00001010437) Psmd6 (ENSCGRG00001024223) Atxn7 (ENSCGRG00001022842) Thoc7 (ENSCGRG00001014815) Cdhr18 (ENSCGRG00001009383) Sntn (ENSCGRG00001000254) Synpr (ENSCGRG00001024206) Cadps (ENSCGRG00001018622) Fezf2 (ENSCGRG00001011113) 3830406C13Rik (ENSCGRG00001009640) ENSCGRG00001023304 Fhit (ENSCGRG00001000886) ENSCGRG00001008920 ENSCGRG00001011021 Cfap20dc (ENSCGRG00001017819) ENSCGRG00001016036 ##22 Fam3d (ENSCGRG00001000168) Fam107a (ENSCGRG00001022141) Acox2 (ENSCGRG00001013444) Kctd6 (ENSCGRG00001009848) ENSCGRG00001000571 Abcg3 (ENSCGRG00001004887) ENSCGRG00001023071 Thoc2l (ENSCGRG00001009811) Pkd2 (ENSCGRG00001016312) Spp1 (ENSCGRG00001012247) Dspp (ENSCGRG00001007381) Mepe (ENSCGRG00001019599) Ibsp (ENSCGRG00001016273) Dmp1 (ENSCGRG00001013845) Sparcl1 (ENSCGRG00001009590) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 188 ENSCGRG00001012031 Dzank1 (ENSCGRG00001019385) Polr3f (ENSCGRG00001002032) Rbbp9 (ENSCGRG00001022430) Sec23b (ENSCGRG00001020368) Smim26 (ENSCGRG00001010844) Dtd1 (ENSCGRG00001008221) Scp2d1 (ENSCGRG00001008412) Slc24a3 (ENSCGRG00001004364) Cfap61 (ENSCGRG00001022702) Insm1 (ENSCGRG00001011430) Ralgapa2 (ENSCGRG00001024249) Kiz (ENSCGRG00001020800) Xrn2 (ENSCGRG00001010676) Nkx2-4 (ENSCGRG00001002742) ENSCGRG00001016394 ##22 Nkx2-2 (ENSCGRG00001013924) Pax1 (ENSCGRG00001009223) Foxa2 (ENSCGRG00001000494) Sstr4 (ENSCGRG00001010896) Thbd (ENSCGRG00001010215) Cd93 (ENSCGRG00001016628) ENSCGRG00001007062 Gzf1 (ENSCGRG00001003944) Napb (ENSCGRG00001015884) Cstl1 (ENSCGRG00001006313) Cst11 (ENSCGRG00001004859) Cstdc1 (ENSCGRG00001024407) Cst12 (ENSCGRG00001024036) Cst8 (ENSCGRG00001020750) Cst13 (ENSCGRG00001024079) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 Degu MODERN SPECIES 74 CASKIN2 (ENSODEG00000011820) TMEM94 (ENSODEG00000010291) ENSODEG00000019702 ENSODEG00000010113 SLC25A19 (ENSODEG00000011447) MIF4GD (ENSODEG00000010307) ENSODEG00000011018 GGA3 (ENSODEG00000010399) ENSODEG00000019901 NUP85 (ENSODEG00000011190) ENSODEG00000010097 NT5C (ENSODEG00000010903) ARMC7 (ENSODEG00000010115) ENSODEG00000019675 ENSODEG00000011555 ENSODEG00000010750 ##22 ENSODEG00000010799 ENSODEG00000010532 MRPL58 (ENSODEG00000010192) CDR2L (ENSODEG00000010927) HID1 (ENSODEG00000009269) OTOP3 (ENSODEG00000009917) OTOP2 (ENSODEG00000009590) USH1G (ENSODEG00000009440) ENSODEG00000013900 FADS6 (ENSODEG00000014480) ENSODEG00000010042 GRIN2C (ENSODEG00000009618) TMEM104 (ENSODEG00000009326) NAT9 (ENSODEG00000008968) NHERF1 (ENSODEG00000009739) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 3 HEATR1 (ENSSVLG00005015652) LGALS8 (ENSSVLG00005015486) EDARADD (ENSSVLG00005015271) ERO1B (ENSSVLG00005015220) GPR137B (ENSSVLG00005015174) NID1 (ENSSVLG00005015084) LYST (ENSSVLG00005014429) GNG4 (ENSSVLG00005014355) ENSSVLG00005014340 B3GALNT2 (ENSSVLG00005014196) TBCE (ENSSVLG00005013938) ENSSVLG00005013782 ENSSVLG00005013692 ENSSVLG00005013591 RBM34 (ENSSVLG00005013229) ENSSVLG00005013106 ##22 IRF2BP2 (ENSSVLG00005013009) TARBP1 (ENSSVLG00005012318) ENSSVLG00005012181 SLC35F3 (ENSSVLG00005011983) KCNK1 (ENSSVLG00005011923) MAP3K21 (ENSSVLG00005011781) ENSSVLG00005011726 ENSSVLG00005011681 ENSSVLG00005011585 SIPA1L2 (ENSSVLG00005011103) ENSSVLG00005010987 TSNAX (ENSSVLG00005010917) EGLN1 (ENSSVLG00005010770) SPRTN (ENSSVLG00005010684) EXOC8 (ENSSVLG00005010655) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 119 ENSSVLG00005016811 ENSSVLG00005016747 ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00950000183128.B.z.b ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Alpin marmot MODERN SPECIES 91 HEATR1 (ENSMMMG00000018172) LGALS8 (ENSMMMG00000018132) EDARADD (ENSMMMG00000018120) ENSMMMG00000018111 ERO1B (ENSMMMG00000018104) ENSMMMG00000018089 ENSMMMG00000018084 NID1 (ENSMMMG00000016406) LYST (ENSMMMG00000016348) GNG4 (ENSMMMG00000016336) ENSMMMG00000016324 B3GALNT2 (ENSMMMG00000016298) TBCE (ENSMMMG00000016287) ARID4B (ENSMMMG00000016179) RBM34 (ENSMMMG00000016155) TOMM20 (ENSMMMG00000016144) ##22 TARBP1 (ENSMMMG00000015900) ENSMMMG00000015889 SLC35F3 (ENSMMMG00000015878) KCNK1 (ENSMMMG00000015874) MAP3K21 (ENSMMMG00000015822) PCNX2 (ENSMMMG00000015768) NTPCR (ENSMMMG00000015759) ENSMMMG00000015756 SIPA1L2 (ENSMMMG00000015639) DISC1 (ENSMMMG00000012596) ENSMMMG00000012575 ENSMMMG00000012567 SPRTN (ENSMMMG00000012556) EXOC8 (ENSMMMG00000012553) GNPAT (ENSMMMG00000012545) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00950000183128.B.z.b ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 ENSGT00520000055570.B Squirrel DUPLICATION Squirrel MODERN SPECIES 120 PTER (ENSSTOG00000021437) C1QL3 (ENSSTOG00000027778) RSU1 (ENSSTOG00000022646) CUBN (ENSSTOG00000029820) VIM (ENSSTOG00000022289) ST8SIA6 (ENSSTOG00000013711) ENSSTOG00000034590 HACD1 (ENSSTOG00000020424) ENSSTOG00000020280 ##22 STAM (ENSSTOG00000021902) TMEM236 (ENSSTOG00000000192) MRC1 (ENSSTOG00000005205) SLC39A12 (ENSSTOG00000014809) CACNB2 (ENSSTOG00000004300) NSUN6 (ENSSTOG00000004317) ARL5B (ENSSTOG00000027859) MALRD1 (ENSSTOG00000034625) PLXDC2 (ENSSTOG00000005048) NEBL (ENSSTOG00000020521) SKIDA1 (ENSSTOG00000005865) MLLT10 (ENSSTOG00000016486) DNAJC1 (ENSSTOG00000002303) COMMD3 (ENSSTOG00000001638) BMI1 (ENSSTOG00000001647) Squirrel MODERN SPECIES 84 HEATR1 (ENSSTOG00000007293) LGALS8 (ENSSTOG00000007266) EDARADD (ENSSTOG00000022830) ERO1B (ENSSTOG00000013810) GPR137B (ENSSTOG00000013802) NID1 (ENSSTOG00000015736) LYST (ENSSTOG00000015713) GNG4 (ENSSTOG00000015712) ENSSTOG00000030497 ENSSTOG00000020260 B3GALNT2 (ENSSTOG00000015705) TBCE (ENSSTOG00000015698) GGPS1 (ENSSTOG00000004263) ARID4B (ENSSTOG00000002810) RBM34 (ENSSTOG00000002792) TOMM20 (ENSSTOG00000027564) ##22 IRF2BP2 (ENSSTOG00000014666) TARBP1 (ENSSTOG00000032291) ENSSTOG00000023911 SLC35F3 (ENSSTOG00000014646) KCNK1 (ENSSTOG00000001207) MAP3K21 (ENSSTOG00000027529) PCNX2 (ENSSTOG00000016530) NTPCR (ENSSTOG00000028538) SIPA1L2 (ENSSTOG00000021559) ENSSTOG00000023596 TSNAX (ENSSTOG00000024989) ENSSTOG00000023570 SPRTN (ENSSTOG00000007850) EXOC8 (ENSSTOG00000020370) GNPAT (ENSSTOG00000005751) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00390000011698.c.a.d #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 20 ENSOCUG00000037555 ENSOCUG00000004941 ENSOCUG00000035363 ENSOCUG00000003123 ENSOCUG00000030022 ZNF660 (ENSOCUG00000028986) ZNF197 (ENSOCUG00000029675) ZNF35 (ENSOCUG00000004757) ACAD9 (ENSOCUG00000011635) CFAP92 (ENSOCUG00000011218) EFCC1 (ENSOCUG00000022659) GP9 (ENSOCUG00000026359) ENSOCUG00000020939 ISY1 (ENSOCUG00000003923) ENSOCUG00000008696 ENSOCUG00000009170 ##22 COPG1 (ENSOCUG00000005970) HMCES (ENSOCUG00000005983) ENSOCUG00000001645 RPN1 (ENSOCUG00000008171) ENSOCUG00000037243 DNAJB8 (ENSOCUG00000026352) EEFSEC (ENSOCUG00000016517) RUVBL1 (ENSOCUG00000016510) SEC61A1 (ENSOCUG00000016501) KBTBD12 (ENSOCUG00000016494) ENSOCUG00000036497 ABTB1 (ENSOCUG00000027274) PODXL2 (ENSOCUG00000014460) MCM2 (ENSOCUG00000015924) TPRA1 (ENSOCUG00000027115) Rabbit MODERN SPECIES 7 EXO1 (ENSOCUG00000016157) ENSOCUG00000029742 ENSOCUG00000034412 ENSOCUG00000039549 ENSOCUG00000031699 NID1 (ENSOCUG00000016007) LYST (ENSOCUG00000002867) ENSOCUG00000032324 ENSOCUG00000006831 B3GALNT2 (ENSOCUG00000017502) TBCE (ENSOCUG00000017490) ENSOCUG00000021833 GGPS1 (ENSOCUG00000013581) ARID4B (ENSOCUG00000006605) RBM34 (ENSOCUG00000009173) TOMM20 (ENSOCUG00000021470) ##22 ENSOCUG00000034600 ENSOCUG00000003968 TARBP1 (ENSOCUG00000017418) ENSOCUG00000017413 SLC35F3 (ENSOCUG00000016017) ENSOCUG00000022096 ENSOCUG00000006431 ENSOCUG00000004795 KCNK1 (ENSOCUG00000016003) ENSOCUG00000031343 MAP3K21 (ENSOCUG00000010372) PCNX2 (ENSOCUG00000014363) NTPCR (ENSOCUG00000014357) MAP10 (ENSOCUG00000025609) SIPA1L2 (ENSOCUG00000010297) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 Tenrec MODERN SPECIES 6710 TOMM20 (ENSETEG00000017693) ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 Sloth MODERN SPECIES 6125 TOMM20 (ENSCHOG00000002383) ##22 Armadillo MODERN SPECIES 629 INSM2 (ENSDNOG00000007824) RALGAPA1 (ENSDNOG00000007827) ENSDNOG00000040178 ##22 BRMS1L (ENSDNOG00000049614) ENSDNOG00000048938 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES 89 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a ENSGT00440000033232.d ENSGT00910000147490 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00390000009497 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063 ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 ENSGT00940000160762 ENSGT00500000044890.a.b ENSGT00390000010352 ENSGT00940000153733.A ENSGT00940000160906 ENSGT00390000005673 ENSGT00940000160942 ENSGT00940000157792 ENSGT01090000260123.a Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a.a ENSGT00440000033232.d ENSGT00910000147490 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00390000009497 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063.n ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 ENSGT00940000160762 ENSGT00500000044890.a.b ENSGT00390000010352 ENSGT00940000153733.A ENSGT00940000160906 ENSGT00390000005673 ENSGT00940000160942 ENSGT00940000157792 ENSGT01090000260123.a Hominidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a.a ENSGT00440000033232.d ENSGT00910000147490 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00390000009497 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063.n ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 ENSGT00940000160762 ENSGT00500000044890.a.b ENSGT00390000010352 ENSGT00940000153733.A ENSGT00940000160906 ENSGT00390000005673 ENSGT00940000160942 ENSGT00940000157792 ENSGT01030000234618.D Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a.a ENSGT00440000033232.d ENSGT00390000009554.o ENSGT00910000147490 ENSGT00390000009554.p ENSGT00940000162288 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00390000009497 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063.n ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 ENSGT00940000160762 ENSGT00500000044890.a.b ENSGT00390000010352 ENSGT00940000153733.A ENSGT00940000160906 ENSGT00390000005673 ENSGT00940000160942 ENSGT00940000157792 ENSGT01030000234618.D Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a.a ENSGT00440000033232.d ENSGT00390000009554.o ENSGT00910000147490 ENSGT00390000009554.p ENSGT00940000162288 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00390000009497 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063.n ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 ENSGT00940000160762 ENSGT00500000044890.a.b ENSGT00390000010352 ENSGT00940000153733.A ENSGT00940000160906 ENSGT00390000005673 ENSGT00940000160942 ENSGT00940000157792 ENSGT01030000234618.D Pan ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a.a ENSGT00440000033232.d ENSGT00390000009554.o ENSGT00910000147490 ENSGT00390000009554.p ENSGT00940000162288 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063.n ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 ENSGT00940000160762 ENSGT00500000044890.a.b ENSGT00390000010352 ENSGT00940000153733.A ENSGT00940000160906 ENSGT00390000005673 ENSGT00940000160942 ENSGT00940000157792 ENSGT01030000234618.D Bonobo MODERN SPECIES 2 DGAT2 (ENSPPAG00000015345) UVRAG (ENSPPAG00000027735) WNT11 (ENSPPAG00000010959) ENSPPAG00000030327 ENSPPAG00000038460 ENSPPAG00000028053 THAP12 (ENSPPAG00000005479) ENSPPAG00000027471 LRRC32 (ENSPPAG00000028327) TSKU (ENSPPAG00000025259) ACER3 (ENSPPAG00000015516) B3GNT6 (ENSPPAG00000004892) CAPN5 (ENSPPAG00000034162) MYO7A (ENSPPAG00000035116) GDPD4 (ENSPPAG00000033740) ENSPPAG00000033073 ##22 PAK1 (ENSPPAG00000042768) AQP11 (ENSPPAG00000030812) CLNS1A (ENSPPAG00000035940) RSF1 (ENSPPAG00000020888) ENSPPAG00000043844 ENSPPAG00000022805 ENSPPAG00000026625 ENSPPAG00000035381 KCTD14 (ENSPPAG00000042258) NDUFC2 (ENSPPAG00000039205) THRSP (ENSPPAG00000023087) ALG8 (ENSPPAG00000029627) KCTD21 (ENSPPAG00000000521) ENSPPAG00000002837 USP35 (ENSPPAG00000038381) Chimpanzee MODERN SPECIES 2 MOGAT2 (ENSPTRG00000004086) DGAT2 (ENSPTRG00000004087) UVRAG (ENSPTRG00000004088) WNT11 (ENSPTRG00000004090) THAP12 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LGALS8 (ENSRROG00000036202) ENSRROG00000020329 EDARADD (ENSRROG00000041710) ERO1B (ENSRROG00000035226) GPR137B (ENSRROG00000022835) ENSRROG00000020708 NID1 (ENSRROG00000020512) LYST (ENSRROG00000042293) GNG4 (ENSRROG00000039962) B3GALNT2 (ENSRROG00000036528) TBCE (ENSRROG00000010869) GGPS1 (ENSRROG00000032231) ARID4B (ENSRROG00000045203) RBM34 (ENSRROG00000039131) ENSRROG00000032599 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a ENSGT00440000033232.d ENSGT00910000147490 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00390000009497 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063 ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 ENSGT00940000160762 ENSGT00500000044890.a.b ENSGT00390000010352 ENSGT00940000153733.A ENSGT00390000005673 ENSGT00940000160906 ENSGT00940000160942 ENSGT00940000157792 ENSGT01030000234618.D Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a.d ENSGT00440000033232.d ENSGT00910000147490 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00390000009497 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063 ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 ENSGT00940000160762 ENSGT00500000044890.a.b ENSGT00390000010352 ENSGT00940000153733.A ENSGT00390000005673 ENSGT00940000160906 ENSGT00940000160942 ENSGT00940000157792 ENSGT01030000234618.D Macaca ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a.d ENSGT00440000033232.d ENSGT00910000147490 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00390000009497 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063 ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 ENSGT00940000160762 ENSGT00500000044890.a.b ENSGT00390000010352 ENSGT00940000153733.A ENSGT00940000160906 ENSGT00390000005673 ENSGT00940000160942 ENSGT00940000157792 ENSGT01030000234618.D Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 423 MOGAT2 (ENSMNEG00000017020) DGAT2 (ENSMNEG00000045455) UVRAG (ENSMNEG00000036116) WNT11 (ENSMNEG00000042384) ENSMNEG00000014529 GVQW3 (ENSMNEG00000035110) ENSMNEG00000025096 EMSY (ENSMNEG00000041511) LRRC32 (ENSMNEG00000041843) TSKU (ENSMNEG00000013194) ACER3 (ENSMNEG00000030819) B3GNT6 (ENSMNEG00000035934) CAPN5 (ENSMNEG00000037879) MYO7A (ENSMNEG00000030597) GDPD4 (ENSMNEG00000038159) ENSMNEG00000028157 ##22 PAK1 (ENSMNEG00000044840) AQP11 (ENSMNEG00000044078) CLNS1A (ENSMNEG00000036050) RSF1 (ENSMNEG00000043815) AAMDC (ENSMNEG00000029653) INTS4 (ENSMNEG00000044252) KCTD14 (ENSMNEG00000042231) NDUFC2 (ENSMNEG00000027120) ALG8 (ENSMNEG00000033047) KCTD21 (ENSMNEG00000009764) USP35 (ENSMNEG00000040956) GAB2 (ENSMNEG00000040872) NARS2 (ENSMNEG00000036144) ENSMNEG00000033890 TENM4 (ENSMNEG00000042610) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES EDARADD (ENSMFAG00000038481) ERO1B (ENSMFAG00000045389) GPR137B (ENSMFAG00000034812) ENSMFAG00000052304 NID1 (ENSMFAG00000026117) ENSMFAG00000059454 LYST (ENSMFAG00000044431) ENSMFAG00000065564 ENSMFAG00000039800 GNG4 (ENSMFAG00000062601) B3GALNT2 (ENSMFAG00000001068) TBCE (ENSMFAG00000003983) ENSMFAG00000054307 GGPS1 (ENSMFAG00000033173) ARID4B (ENSMFAG00000044016) ENSMFAG00000003478 ##22 ENSMFAG00000041239 ENSMFAG00000061039 COA6 (ENSMFAG00000034136) SLC35F3 (ENSMFAG00000045604) KCNK1 (ENSMFAG00000041435) ENSMFAG00000056382 MAP3K21 (ENSMFAG00000014791) PCNX2 (ENSMFAG00000034561) NTPCR (ENSMFAG00000037305) MAP10 (ENSMFAG00000035487) SIPA1L2 (ENSMFAG00000039676) ENSMFAG00000058767 DISC1 (ENSMFAG00000042435) EGLN1 (ENSMFAG00000039962) ENSMFAG00000053873 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a.d ENSGT00440000033232.d ENSGT00910000147490 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063 ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 ENSGT00940000160762 ENSGT00500000044890.a.b ENSGT00390000010352 ENSGT00940000153733.A ENSGT00390000005673 ENSGT00940000160906 ENSGT00940000160942 ENSGT00940000157792 ENSGT01030000234618.D Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01030000234582.e.b ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a.d ENSGT00440000033232.d ENSGT00910000147490 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063 ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 ENSGT00940000160762 ENSGT00390000010352 ENSGT00940000153733.A ENSGT00390000005673 ENSGT00940000160906 ENSGT00940000160942 ENSGT00940000157792 ENSGT01030000234618.D ENSGT00390000013354.d.a.b.a.a.a Sooty mangabey MODERN SPECIES 545 MOGAT2 (ENSCATG00000038955) DGAT2 (ENSCATG00000001407) UVRAG (ENSCATG00000039451) WNT11 (ENSCATG00000035881) THAP12 (ENSCATG00000024587) GVQW3 (ENSCATG00000035253) ENSCATG00000006180 EMSY (ENSCATG00000033145) LRRC32 (ENSCATG00000039757) TSKU (ENSCATG00000018628) ACER3 (ENSCATG00000024996) B3GNT6 (ENSCATG00000031669) CAPN5 (ENSCATG00000044156) MYO7A (ENSCATG00000037969) GDPD4 (ENSCATG00000038800) ENSCATG00000032730 ##22 PAK1 (ENSCATG00000032259) AQP11 (ENSCATG00000012294) CLNS1A (ENSCATG00000043634) RSF1 (ENSCATG00000041020) AAMDC (ENSCATG00000032345) INTS4 (ENSCATG00000039621) KCTD14 (ENSCATG00000007749) NDUFC2 (ENSCATG00000039655) ALG8 (ENSCATG00000044265) KCTD21 (ENSCATG00000007922) USP35 (ENSCATG00000034027) GAB2 (ENSCATG00000034189) NARS2 (ENSCATG00000031854) ENSCATG00000044075 TENM4 (ENSCATG00000045269) Drill MODERN SPECIES 1018 ACER3 (ENSMLEG00000027480) CAPN5 (ENSMLEG00000043868) MYO7A (ENSMLEG00000000314) GDPD4 (ENSMLEG00000044208) ENSMLEG00000039171 ##22 PAK1 (ENSMLEG00000033376) AQP11 (ENSMLEG00000028777) CLNS1A (ENSMLEG00000040581) RSF1 (ENSMLEG00000038363) AAMDC (ENSMLEG00000040894) INTS4 (ENSMLEG00000040512) KCTD14 (ENSMLEG00000030473) NDUFC2 (ENSMLEG00000039299) ALG8 (ENSMLEG00000025271) ENSMLEG00000026673 KCTD21 (ENSMLEG00000019386) USP35 (ENSMLEG00000038344) GAB2 (ENSMLEG00000038890) NARS2 (ENSMLEG00000029559) ENSMLEG00000037365 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 129 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176.q.a ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Mouse lemur MODERN SPECIES 8 ACTN2 (ENSMICG00000015908) HEATR1 (ENSMICG00000015859) LGALS8 (ENSMICG00000015835) EDARADD (ENSMICG00000047115) ERO1B (ENSMICG00000002613) GPR137B (ENSMICG00000002610) NID1 (ENSMICG00000002600) LYST (ENSMICG00000009412) GNG4 (ENSMICG00000028656) ENSMICG00000007386 TBCE (ENSMICG00000007372) GGPS1 (ENSMICG00000007369) ENSMICG00000047841 ARID4B (ENSMICG00000016358) ENSMICG00000016336 ENSMICG00000042731 ##22 IRF2BP2 (ENSMICG00000046369) TARBP1 (ENSMICG00000015280) ENSMICG00000034015 SLC35F3 (ENSMICG00000013397) KCNK1 (ENSMICG00000041556) MAP3K21 (ENSMICG00000015508) PCNX2 (ENSMICG00000015490) NTPCR (ENSMICG00000015482) MAP10 (ENSMICG00000027261) SIPA1L2 (ENSMICG00000015451) DISC1 (ENSMICG00000010360) TSNAX (ENSMICG00000043895) EGLN1 (ENSMICG00000010348) SPRTN (ENSMICG00000029926) GNPAT (ENSMICG00000029639) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 75 ENSPSMG00000023946 NID1 (ENSPSMG00000023922) ENSPSMG00000023859 LYST (ENSPSMG00000023795) GNG4 (ENSPSMG00000023646) B3GALNT2 (ENSPSMG00000023641) TBCE (ENSPSMG00000023591) GGPS1 (ENSPSMG00000023526) ARID4B (ENSPSMG00000023485) RBM34 (ENSPSMG00000023394) ENSPSMG00000023374 ##22 IRF2BP2 (ENSPSMG00000023357) ENSPSMG00000023343 SLC35F3 (ENSPSMG00000023336) KCNK1 (ENSPSMG00000023325) MAP3K21 (ENSPSMG00000023322) PCNX2 (ENSPSMG00000023316) NTPCR (ENSPSMG00000023300) MAP10 (ENSPSMG00000023290) SIPA1L2 (ENSPSMG00000023283) ENSPSMG00000023242 ENSPSMG00000023237 TSNAX (ENSPSMG00000023232) ENSPSMG00000023223 SPRTN (ENSPSMG00000023220) EXOC8 (ENSPSMG00000023216) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 863 GAB3 (ENSPCOG00000023755) ENSPCOG00000015802 DKC1 (ENSPCOG00000026874) MPP1 (ENSPCOG00000006163) SMIM9 (ENSPCOG00000024173) ENSPCOG00000025344 ENSPCOG00000001067 F8 (ENSPCOG00000022504) FUNDC2 (ENSPCOG00000015705) CMC4 (ENSPCOG00000024860) MTCP1 (ENSPCOG00000018892) ENSPCOG00000025743 ##22 BRCC3 (ENSPCOG00000010400) VBP1 (ENSPCOG00000019297) RAB39B (ENSPCOG00000013225) CLIC2 (ENSPCOG00000012095) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Rabbit MODERN SPECIES 6 NDST3 (ENSOCUG00000009952) ENSOCUG00000038669 TRAM1L1 (ENSOCUG00000003846) ENSOCUG00000003691 ENSOCUG00000002295 NDST4 (ENSOCUG00000007796) UGT8 (ENSOCUG00000015037) ENSOCUG00000030939 CAMK2D (ENSOCUG00000023650) ENSOCUG00000035520 ANK2 (ENSOCUG00000010618) ENSOCUG00000021222 LARP7 (ENSOCUG00000007073) ZGRF1 (ENSOCUG00000007057) NEUROG2 (ENSOCUG00000007063) ENSOCUG00000010848 ##22 ALPK1 (ENSOCUG00000024991) TIFA (ENSOCUG00000017578) AP1AR (ENSOCUG00000004413) FAM241A (ENSOCUG00000011383) PITX2 (ENSOCUG00000012685) ENPEP (ENSOCUG00000016264) ELOVL6 (ENSOCUG00000013069) EGF (ENSOCUG00000016388) LRIT3 (ENSOCUG00000003908) MCUB (ENSOCUG00000013751) RRH (ENSOCUG00000034648) GAR1 (ENSOCUG00000003901) CFI (ENSOCUG00000003892) CASP6 (ENSOCUG00000034509) ENSOCUG00000036219 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 12 MGP_PahariEiJ_G0023333 Itgb1 (MGP_PahariEiJ_G0023332) Nrp1 (MGP_PahariEiJ_G0023331) Pard3 (MGP_PahariEiJ_G0023330) Rbm34 (MGP_PahariEiJ_G0023329) MGP_PahariEiJ_G0023328 ##22 Irf2bp2 (MGP_PahariEiJ_G0023327) Tarbp1 (MGP_PahariEiJ_G0023326) Coa6 (MGP_PahariEiJ_G0023325) Slc35f3 (MGP_PahariEiJ_G0023324) Kcnk1 (MGP_PahariEiJ_G0023323) MGP_PahariEiJ_G0023322 Pcnx2 (MGP_PahariEiJ_G0023321) Ntpcr (MGP_PahariEiJ_G0023320) Map10 (MGP_PahariEiJ_G0023319) Sipa1l2 (MGP_PahariEiJ_G0023318) Disc1 (MGP_PahariEiJ_G0023317) Tsnax (MGP_PahariEiJ_G0023316) MGP_PahariEiJ_G0023315 Sprtn (MGP_PahariEiJ_G0023314) Exoc8 (MGP_PahariEiJ_G0023313) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157325.x ENSGT00940000156227.f ENSGT00940000156625 ENSGT00940000156232.b ENSGT00440000037780.a ENSGT00940000161191.A ENSGT01090000260098.B ENSGT00940000154453.a.b.b ENSGT00390000009751 ENSGT00860000135880 ENSGT01090000259987.a.b ENSGT00940000157169 ENSGT00950000183214.a.b.a.a ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000155003.e.a ENSGT00520000059545 ENSGT00940000157325.x ENSGT00940000156227.f ENSGT00940000156625 ENSGT00940000156232.b ENSGT00440000037780.a ENSGT00940000161191.A ENSGT01090000260098.B ENSGT00940000154453.a.b.b ENSGT00390000009751 ENSGT01090000259987.a.b ENSGT00940000157169 ENSGT00950000183214.a.b.a.a ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 285 ENSCGRG00001014784 ENSCGRG00001014917 Itgb1 (ENSCGRG00001011947) Nrp1 (ENSCGRG00001011493) Pard3 (ENSCGRG00001012331) Rbm34 (ENSCGRG00001018721) ENSCGRG00001004758 ##22 Irf2bp2 (ENSCGRG00001002471) Coa6 (ENSCGRG00001000203) Tarbp1 (ENSCGRG00001016690) Slc35f3 (ENSCGRG00001010139) Kcnk1 (ENSCGRG00001008192) Map3k21 (ENSCGRG00001000308) Pcnx2 (ENSCGRG00001021346) Ntpcr (ENSCGRG00001004980) Map10 (ENSCGRG00001014469) Sipa1l2 (ENSCGRG00001023394) ENSCGRG00001020535 ENSCGRG00001020276 Disc1 (ENSCGRG00001022006) Tsnax (ENSCGRG00001011132) Egln1 (ENSCGRG00001009766) Golden Hamster DUPLICATION Golden Hamster MODERN SPECIES 661 Cdkl5 (ENSMAUG00000009424) Gja6 (ENSMAUG00000016764) Rs1 (ENSMAUG00000017955) Ppef1 (ENSMAUG00000016981) Phka2 (ENSMAUG00000001285) Adgrg2 (ENSMAUG00000001544) Pdha1 (ENSMAUG00000002413) Map3k15 (ENSMAUG00000006183) Sh3kbp1 (ENSMAUG00000017328) ENSMAUG00000009356 Map7d2 (ENSMAUG00000016214) ENSMAUG00000007856 ENSMAUG00000012396 Rps6ka3 (ENSMAUG00000015390) ENSMAUG00000017351 ENSMAUG00000008169 ##22 Cnksr2 (ENSMAUG00000021259) Smpx (ENSMAUG00000016078) Mbtps2 (ENSMAUG00000017121) Yy2 (ENSMAUG00000016161) Sms (ENSMAUG00000017854) Phex (ENSMAUG00000016421) ENSMAUG00000007163 ENSMAUG00000007368 Golden Hamster MODERN SPECIES 618 Rpap1 (ENSMAUG00000020079) Tyro3 (ENSMAUG00000001705) Mga (ENSMAUG00000020891) ENSMAUG00000018864 Pla2g4b (ENSMAUG00000021445) ENSMAUG00000020595 Ehd4 (ENSMAUG00000020399) Pla2g4e (ENSMAUG00000012112) Pla2g4d (ENSMAUG00000010988) Pla2g4f (ENSMAUG00000010523) Vps39 (ENSMAUG00000009974) Tmem87a (ENSMAUG00000007640) Ganc (ENSMAUG00000003060) ENSMAUG00000020144 ENSMAUG00000019821 ENSMAUG00000021243 ##22 Irf2bp2 (ENSMAUG00000021162) Tarbp1 (ENSMAUG00000020968) Coa6 (ENSMAUG00000019221) Slc35f3 (ENSMAUG00000019152) Kcnk1 (ENSMAUG00000018879) Map3k21 (ENSMAUG00000020182) Pcnx2 (ENSMAUG00000019465) Ntpcr (ENSMAUG00000018566) ENSMAUG00000020751 Sipa1l2 (ENSMAUG00000019999) Disc1 (ENSMAUG00000001315) Tsnax (ENSMAUG00000019962) ENSMAUG00000019756 Sprtn (ENSMAUG00000021498) Gnpat (ENSMAUG00000021271) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00390000011698.c.a.c.a ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 17 HEATR1 (ENSUPAG00010020924) LGALS8 (ENSUPAG00010020959) EDARADD (ENSUPAG00010021013) ERO1B (ENSUPAG00010021030) GPR137B (ENSUPAG00010021079) NID1 (ENSUPAG00010021109) LYST (ENSUPAG00010021128) ENSUPAG00010021171 GNG4 (ENSUPAG00010021177) ENSUPAG00010021184 B3GALNT2 (ENSUPAG00010021217) TBCE (ENSUPAG00010021272) GGPS1 (ENSUPAG00010021295) ARID4B (ENSUPAG00010021312) RBM34 (ENSUPAG00010021384) ENSUPAG00010021396 ##22 IRF2BP2 (ENSUPAG00010021413) TARBP1 (ENSUPAG00010021424) ENSUPAG00010021434 SLC35F3 (ENSUPAG00010021437) KCNK1 (ENSUPAG00010021440) MAP3K21 (ENSUPAG00010021445) PCNX2 (ENSUPAG00010021456) NTPCR (ENSUPAG00010021487) SIPA1L2 (ENSUPAG00010021526) DISC1 (ENSUPAG00010021561) TSNAX (ENSUPAG00010021601) ENSUPAG00010021608 EGLN1 (ENSUPAG00010021616) SPRTN (ENSUPAG00010021620) EXOC8 (ENSUPAG00010021624) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A.f ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 28 HEATR1 (ENSHGLG00000016543) LGALS8 (ENSHGLG00000016074) EDARADD (ENSHGLG00000043766) ERO1B (ENSHGLG00000018091) GPR137B (ENSHGLG00000015957) NID1 (ENSHGLG00000017135) LYST (ENSHGLG00000015493) GNG4 (ENSHGLG00000037464) ENSHGLG00000039942 ENSHGLG00000016198 ENSHGLG00000006905 ENSHGLG00000019008 GGPS1 (ENSHGLG00000020898) ARID4B (ENSHGLG00000012546) RBM34 (ENSHGLG00000016495) ENSHGLG00000016770 ##22 ENSHGLG00000037951 ENSHGLG00000009866 TARBP1 (ENSHGLG00000011592) ENSHGLG00000012375 SLC35F3 (ENSHGLG00000049707) ENSHGLG00000034501 KCNK1 (ENSHGLG00000015891) ENSHGLG00000011707 MAP3K21 (ENSHGLG00000018159) PCNX2 (ENSHGLG00000013796) NTPCR (ENSHGLG00000040929) ENSHGLG00000038496 MAP10 (ENSHGLG00000015887) SIPA1L2 (ENSHGLG00000016409) DISC1 (ENSHGLG00000015934) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A.f ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 ENSGT00520000055570.B Guinea pig MODERN SPECIES 16 MTR (ENSCPOG00000015171) ACTN2 (ENSCPOG00000013969) HEATR1 (ENSCPOG00000008331) LGALS8 (ENSCPOG00000009849) EDARADD (ENSCPOG00000026728) ERO1B (ENSCPOG00000006615) GPR137B (ENSCPOG00000012635) NID1 (ENSCPOG00000014654) LYST (ENSCPOG00000011468) GNG4 (ENSCPOG00000038993) B3GALNT2 (ENSCPOG00000014195) TBCE (ENSCPOG00000014190) GGPS1 (ENSCPOG00000030797) ARID4B (ENSCPOG00000034766) RBM34 (ENSCPOG00000015213) ENSCPOG00000015211 ##22 TARBP1 (ENSCPOG00000013995) ENSCPOG00000030904 SLC35F3 (ENSCPOG00000013991) KCNK1 (ENSCPOG00000001069) MAP3K21 (ENSCPOG00000003876) PCNX2 (ENSCPOG00000008593) NTPCR (ENSCPOG00000008589) SIPA1L2 (ENSCPOG00000000466) DISC1 (ENSCPOG00000013230) TSNAX (ENSCPOG00000036257) ENSCPOG00000024067 SPRTN (ENSCPOG00000015655) EXOC8 (ENSCPOG00000015656) GNPAT (ENSCPOG00000012228) C1orf131 (ENSCPOG00000033025) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A.f ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 ENSGT00520000055570.B Degu MODERN SPECIES 168 ENSODEG00000006801 LGALS8 (ENSODEG00000006705) EDARADD (ENSODEG00000008012) ERO1B (ENSODEG00000005305) GPR137B (ENSODEG00000005781) NID1 (ENSODEG00000007141) LYST (ENSODEG00000005832) GNG4 (ENSODEG00000005790) ENSODEG00000006722 TBCE (ENSODEG00000007759) ENSODEG00000007467 ENSODEG00000006253 ENSODEG00000006205 ARID4B (ENSODEG00000005373) RBM34 (ENSODEG00000006130) ENSODEG00000005252 ##22 IRF2BP2 (ENSODEG00000007656) ENSODEG00000007350 TARBP1 (ENSODEG00000005238) ENSODEG00000005008 SLC35F3 (ENSODEG00000005836) ENSODEG00000019357 KCNK1 (ENSODEG00000006201) MAP3K21 (ENSODEG00000006318) PCNX2 (ENSODEG00000004978) NTPCR (ENSODEG00000004704) SIPA1L2 (ENSODEG00000005861) ENSODEG00000005475 ENSODEG00000005830 SPRTN (ENSODEG00000005433) EXOC8 (ENSODEG00000019188) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 199 ACTN2 (ENSCLAG00000016616) HEATR1 (ENSCLAG00000016900) LGALS8 (ENSCLAG00000017295) EDARADD (ENSCLAG00000016588) ERO1B (ENSCLAG00000017322) GPR137B (ENSCLAG00000009487) NID1 (ENSCLAG00000009631) LYST (ENSCLAG00000009899) ENSCLAG00000010780 GNG4 (ENSCLAG00000003009) B3GALNT2 (ENSCLAG00000003046) TBCE (ENSCLAG00000003096) GGPS1 (ENSCLAG00000003159) ARID4B (ENSCLAG00000003255) RBM34 (ENSCLAG00000003464) ENSCLAG00000003558 ##22 IRF2BP2 (ENSCLAG00000003611) TARBP1 (ENSCLAG00000003655) ENSCLAG00000003766 SLC35F3 (ENSCLAG00000003795) KCNK1 (ENSCLAG00000003836) MAP3K21 (ENSCLAG00000003881) PCNX2 (ENSCLAG00000003984) NTPCR (ENSCLAG00000004088) SIPA1L2 (ENSCLAG00000004244) DISC1 (ENSCLAG00000004662) TSNAX (ENSCLAG00000004894) EGLN1 (ENSCLAG00000005012) SPRTN (ENSCLAG00000005040) EXOC8 (ENSCLAG00000017614) GNPAT (ENSCLAG00000005106) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 4464 ENSEEUG00000000221 ##22 SURF2 (ENSEEUG00000000212) SURF1 (ENSEEUG00000000207) RPL7A (ENSEEUG00000000203) Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000159915 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159037 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00940000163560 ENSGT00940000163425 ENSGT00940000162830.b ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000161033 ENSGT00940000161736 ENSGT01050000244887.B ENSGT00500000044945.a ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00950000182916.a.a ENSGT00950000185935 ENSGT00940000154660.a ENSGT00390000003403 ENSGT00500000044957 ENSGT00950000183104.B.a.a ENSGT00390000004282 ENSGT00390000005318.a ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00520000060565 ENSGT00950000183102.A.a Suina ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Chacoan peccary MODERN SPECIES 975 MTR (ENSCWAG00000019533) ACTN2 (ENSCWAG00000019345) HEATR1 (ENSCWAG00000019211) LGALS8 (ENSCWAG00000019096) EDARADD (ENSCWAG00000018986) ERO1B (ENSCWAG00000018960) GPR137B (ENSCWAG00000018939) NID1 (ENSCWAG00000018873) LYST (ENSCWAG00000018583) GNG4 (ENSCWAG00000018536) B3GALNT2 (ENSCWAG00000018504) TBCE (ENSCWAG00000018356) GGPS1 (ENSCWAG00000018324) ARID4B (ENSCWAG00000018281) RBM34 (ENSCWAG00000018240) ENSCWAG00000018217 ##22 IRF2BP2 (ENSCWAG00000018181) ENSCWAG00000018155 TARBP1 (ENSCWAG00000018105) ENSCWAG00000018078 SLC35F3 (ENSCWAG00000017969) KCNK1 (ENSCWAG00000017940) MAP3K21 (ENSCWAG00000017800) PCNX2 (ENSCWAG00000017422) NTPCR (ENSCWAG00000017373) MAP10 (ENSCWAG00000017340) SIPA1L2 (ENSCWAG00000017097) ENSCWAG00000017068 DISC1 (ENSCWAG00000015444) TSNAX (ENSCWAG00000015346) EGLN1 (ENSCWAG00000015320) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159037 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00940000163560 ENSGT00940000163425 ENSGT00940000162830.a.a.a ENSGT00940000162830.a.b ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000161033 ENSGT00940000161736 ENSGT01050000244887.B ENSGT00500000044945.a ENSGT00940000164119 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00950000182916.a.a ENSGT00950000185935 ENSGT00940000154660.a ENSGT00390000003403 ENSGT00500000044957 ENSGT00950000183104.B.a.a ENSGT00390000004282 ENSGT00390000005318.a ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00520000060565 ENSGT00950000183102.A.a Camelidae ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00390000011249 ENSGT00940000158149 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156359 ENSGT00940000156318 ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00390000007753.a ENSGT00390000001136 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000015845 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00420000029824 Arabian camel MODERN SPECIES 2 AGT (ENSCDRG00005014204) COG2 (ENSCDRG00005014234) PGBD5 (ENSCDRG00005014288) GALNT2 (ENSCDRG00005014350) URB2 (ENSCDRG00005014428) TAF5L (ENSCDRG00005014497) ABCB10 (ENSCDRG00005014571) NUP133 (ENSCDRG00005014682) ENSCDRG00005014779 ENSCDRG00005014984 RHOU (ENSCDRG00005015120) ENSCDRG00005015134 ENSCDRG00005006671 ENSCDRG00005006737 IRF2BP2 (ENSCDRG00005006772) ENSCDRG00005006836 ##22 RBM34 (ENSCDRG00005006895) ARID4B (ENSCDRG00005006968) GGPS1 (ENSCDRG00005007164) ENSCDRG00005007219 ENSCDRG00005007815 GNG4 (ENSCDRG00005007835) ENSCDRG00005007872 NID1 (ENSCDRG00005007906) GPR137B (ENSCDRG00005008022) ERO1B (ENSCDRG00005008068) EDARADD (ENSCDRG00005008346) LGALS8 (ENSCDRG00005008412) ENSCDRG00005008573 ENSCDRG00005008659 ACTN2 (ENSCDRG00005008706) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Blue whale DUPLICATION Blue whale MODERN SPECIES 2 ACY1 (ENSBMSG00010007659) ABHD14B (ENSBMSG00010007604) PCBP4 (ENSBMSG00010007576) GPR62 (ENSBMSG00010007553) PARP3 (ENSBMSG00010007529) RRP9 (ENSBMSG00010007510) IQCF1 (ENSBMSG00010007503) IQCF5 (ENSBMSG00010007494) ENSBMSG00010007490 IQCF3 (ENSBMSG00010007479) ENSBMSG00010007470 IQCF6 (ENSBMSG00010007464) GRM2 (ENSBMSG00010007448) TEX264 (ENSBMSG00010007420) RAD54L2 (ENSBMSG00010007389) ENSBMSG00010012666 ##22 DCAF1 (ENSBMSG00010012639) RBM15B (ENSBMSG00010012619) MANF (ENSBMSG00010012601) DOCK3 (ENSBMSG00010012543) MAPKAPK3 (ENSBMSG00010012481) CISH (ENSBMSG00010012459) HEMK1 (ENSBMSG00010012444) C3orf18 (ENSBMSG00010012426) CACNA2D2 (ENSBMSG00010012218) CYB561D2 (ENSBMSG00010012095) TMEM115 (ENSBMSG00010012075) ZMYND10 (ENSBMSG00010012049) RASSF1 (ENSBMSG00010012023) TUSC2 (ENSBMSG00010012006) HYAL1 (ENSBMSG00010011991) Blue whale MODERN SPECIES 2 CFAP100 (ENSBMSG00010009313) KLF15 (ENSBMSG00010009299) ALDH1L1 (ENSBMSG00010009202) ENSBMSG00010009159 ##22 SLC41A3 (ENSBMSG00010009132) ZXDC (ENSBMSG00010009104) UROC1 (ENSBMSG00010009072) CHST13 (ENSBMSG00010009052) ENSBMSG00010009042 TXNRD3 (ENSBMSG00010008948) CHCHD6 (ENSBMSG00010008862) PLXNA1 (ENSBMSG00010012942) TPRA1 (ENSBMSG00010012862) MCM2 (ENSBMSG00010012822) PODXL2 (ENSBMSG00010012808) ABTB1 (ENSBMSG00010012797) MGLL (ENSBMSG00010012751) KBTBD12 (ENSBMSG00010012727) SEC61A1 (ENSBMSG00010012693) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 12 MTR (ENSPCTG00005017157) ACTN2 (ENSPCTG00005016643) HEATR1 (ENSPCTG00005015550) LGALS8 (ENSPCTG00005014968) EDARADD (ENSPCTG00005014699) ERO1B (ENSPCTG00005014569) GPR137B (ENSPCTG00005014448) NID1 (ENSPCTG00005014345) LYST (ENSPCTG00005013962) GNG4 (ENSPCTG00005013875) B3GALNT2 (ENSPCTG00005013772) TBCE (ENSPCTG00005013402) GGPS1 (ENSPCTG00005013323) ARID4B (ENSPCTG00005013219) RBM34 (ENSPCTG00005013128) TOMM20 (ENSPCTG00005013086) ##22 TARBP1 (ENSPCTG00005012747) ENSPCTG00005012708 SLC35F3 (ENSPCTG00005012532) KCNK1 (ENSPCTG00005012485) MAP3K21 (ENSPCTG00005012285) ENSPCTG00005012202 NTPCR (ENSPCTG00005012147) MAP10 (ENSPCTG00005012130) SIPA1L2 (ENSPCTG00005011979) ENSPCTG00005011886 ENSPCTG00005011808 TSNAX (ENSPCTG00005011781) EGLN1 (ENSPCTG00005011619) SPRTN (ENSPCTG00005011531) EXOC8 (ENSPCTG00005011506) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Beluga whale MODERN SPECIES 46 ACTN2 (ENSDLEG00000018818) ENSDLEG00000019148 ENSDLEG00000019158 LGALS8 (ENSDLEG00000019169) ENSDLEG00000019181 ERO1B (ENSDLEG00000019217) GPR137B (ENSDLEG00000019442) NID1 (ENSDLEG00000019448) LYST (ENSDLEG00000019492) GNG4 (ENSDLEG00000019745) B3GALNT2 (ENSDLEG00000019750) TBCE (ENSDLEG00000019780) GGPS1 (ENSDLEG00000019839) ARID4B (ENSDLEG00000019846) ENSDLEG00000019859 ENSDLEG00000019884 ##22 IRF2BP2 (ENSDLEG00000019890) TARBP1 (ENSDLEG00000019914) ENSDLEG00000020056 SLC35F3 (ENSDLEG00000020064) KCNK1 (ENSDLEG00000007310) MAP3K21 (ENSDLEG00000007318) PCNX2 (ENSDLEG00000007346) NTPCR (ENSDLEG00000007439) SIPA1L2 (ENSDLEG00000007486) DISC1 (ENSDLEG00000007541) TSNAX (ENSDLEG00000007566) EGLN1 (ENSDLEG00000007575) SPRTN (ENSDLEG00000007584) EXOC8 (ENSDLEG00000007592) GNPAT (ENSDLEG00000007597) Dolphin MODERN SPECIES 1990 ARID4B (ENSTTRG00000002228) ENSTTRG00000002216 ENSTTRG00000002200 ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1227 ENSMMSG00000018975 LGALS8 (ENSMMSG00000013733) ENSMMSG00000013711 EDARADD (ENSMMSG00000013675) ENSMMSG00000013658 ERO1B (ENSMMSG00000013428) GPR137B (ENSMMSG00000013373) NID1 (ENSMMSG00000013215) LYST (ENSMMSG00000013087) GNG4 (ENSMMSG00000013032) B3GALNT2 (ENSMMSG00000012986) TBCE (ENSMMSG00000012851) ENSMMSG00000012823 ARID4B (ENSMMSG00000012753) ENSMMSG00000012711 ENSMMSG00000012670 ##22 IRF2BP2 (ENSMMSG00000012640) TARBP1 (ENSMMSG00000012045) ENSMMSG00000011970 SLC35F3 (ENSMMSG00000011897) ENSMMSG00000011880 MAP3K21 (ENSMMSG00000011828) PCNX2 (ENSMMSG00000011626) ENSMMSG00000011591 MAP10 (ENSMMSG00000011578) SIPA1L2 (ENSMMSG00000011444) ENSMMSG00000011379 ENSMMSG00000011340 ENSMMSG00000011301 ENSMMSG00000011278 EGLN1 (ENSMMSG00000011248) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Goat MODERN SPECIES 20 ANXA11 (ENSCHIG00000000134) ENSCHIG00000000166 ZCCHC24 (ENSCHIG00000000203) PPIF (ENSCHIG00000000241) ZMIZ1 (ENSCHIG00000000282) ENSCHIG00000000315 POLR3A (ENSCHIG00000000352) DLG5 (ENSCHIG00000000389) ENSCHIG00000016306 KCNMA1 (ENSCHIG00000025127) LRMDA (ENSCHIG00000011904) ENSCHIG00000016052 ZNF503 (ENSCHIG00000020542) COMTD1 (ENSCHIG00000005405) VDAC2 (ENSCHIG00000013328) ENSCHIG00000023236 ##22 SAMD8 (ENSCHIG00000012189) ENSCHIG00000017421 DUSP13 (ENSCHIG00000024051) DUSP29 (ENSCHIG00000012654) KAT6B (ENSCHIG00000000073) ADK (ENSCHIG00000000113) ENSCHIG00000000178 AP3M1 (ENSCHIG00000000213) VCL (ENSCHIG00000000321) ENSCHIG00000019095 PLAU (ENSCHIG00000000480) CAMK2G (ENSCHIG00000010155) NDST2 (ENSCHIG00000021909) ZSWIM8 (ENSCHIG00000000068) CHCHD1 (ENSCHIG00000000211) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01090000260086.F.a.a.a.a.h ENSGT01090000260086.F.a.a.a.a.g.a ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000160176 ENSGT00390000017909 ENSGT00390000006888 ENSGT00390000014056 ENSGT00940000153582.b.a.b ENSGT00940000163366 ENSGT00440000039001 ENSGT00890000139531 ENSGT00390000012040 ENSGT00940000154289.B.g ENSGT00510000047893 ENSGT00940000156958 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00390000009258 ENSGT00940000153342.b.i.a.a ENSGT00940000157680 ENSGT00390000011529 ENSGT00940000156048.b ENSGT00390000003512 ENSGT00940000157464 ENSGT00940000156644 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01090000260086.F.a.a.a.a.h ENSGT01090000260086.F.a.a.a.a.g.a ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000160176 ENSGT00390000017909 ENSGT00390000006888 ENSGT00390000014056 ENSGT00940000153582.b.a.b ENSGT00940000163366 ENSGT00440000039001 ENSGT00890000139531 ENSGT00390000012040 ENSGT00940000154289.B.g ENSGT00510000047893 ENSGT00940000156958 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00390000009258 ENSGT00940000153342.b.i.a.a ENSGT00940000157680 ENSGT00390000011529 ENSGT00940000156048.b ENSGT00390000003512 ENSGT00940000157464 ENSGT00940000156644 Domestic yak MODERN SPECIES 19 ENSBGRG00000018468 ZNF22 (ENSBGRG00000018502) RASSF4 (ENSBGRG00000018526) DEPP1 (ENSBGRG00000018716) TMEM72 (ENSBGRG00000018738) CXCL12 (ENSBGRG00000018824) ZNF32 (ENSBGRG00000019058) ZNF239 (ENSBGRG00000019074) TFAM (ENSBGRG00000019113) AGT (ENSBGRG00000019268) COG2 (ENSBGRG00000019477) ENSBGRG00000020288 ENSBGRG00000020323 PGBD5 (ENSBGRG00000020351) GALNT2 (ENSBGRG00000020406) ENSBGRG00000020520 ##22 URB2 (ENSBGRG00000020548) ENSBGRG00000020586 ABCB10 (ENSBGRG00000020619) NUP133 (ENSBGRG00000020666) ACTA1 (ENSBGRG00000020862) CCSAP (ENSBGRG00000020935) ENSBGRG00000020978 RHOU (ENSBGRG00000021068) ENSBGRG00000021134 Wild yak MODERN SPECIES 1467 ENSBMUG00000008571 ##22 URB2 (ENSBMUG00000008577) TAF5L (ENSBMUG00000008596) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 ENSGT00520000055570.B ENSGT00390000017022 ENSGT00940000154071.B ENSGT00940000153370.a.b ENSGT00390000002675 ENSGT00940000158461 ENSGT00390000018361 ENSGT00940000161899 ENSGT00940000154289.B.g ENSGT00510000047893 ENSGT00940000156958 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.b.a.b ENSGT00390000009258 ENSGT00940000153342.b.i.a.a ENSGT00940000157680 ENSGT00390000011529 ENSGT00940000156048.b ENSGT00390000003512 ENSGT00940000157464 ENSGT00940000156644 ENSGT01100000263572.a.a.b.a.a.i.a ENSGT01100000263496.D.a.u.a ENSGT01100000263496.D.b.a.e.t.b.a ENSGT01100000263496.D.a.u.b.c ENSGT01100000263496.D.b.b.b Cow MODERN SPECIES 20 ENSBTAG00000012132 EGLN1 (ENSBTAG00000053296) SPRTN (ENSBTAG00000006112) EXOC8 (ENSBTAG00000006111) GNPAT (ENSBTAG00000010773) C28H1orf131 (ENSBTAG00000010765) TRIM67 (ENSBTAG00000047877) FAM89A (ENSBTAG00000023073) ARV1 (ENSBTAG00000021822) TTC13 (ENSBTAG00000010367) C28H1orf198 (ENSBTAG00000023074) FMN2 (ENSBTAG00000025021) ENSBTAG00000048153 PGBD5 (ENSBTAG00000027205) GALNT2 (ENSBTAG00000004870) ENSBTAG00000011457 ##22 ENSBTAG00000053712 URB2 (ENSBTAG00000010180) ENSBTAG00000034225 ABCB10 (ENSBTAG00000017053) NUP133 (ENSBTAG00000004965) ACTA1 (ENSBTAG00000046332) ENSBTAG00000048654 CCSAP (ENSBTAG00000000079) RAB4A (ENSBTAG00000018857) RHOU (ENSBTAG00000018691) OR5AS1 (ENSBTAG00000011707) OR5L20 (ENSBTAG00000039837) OR5D18K (ENSBTAG00000033555) ENSBTAG00000038418 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 20 C1orf131 (ENSBIXG00005024897) TRIM67 (ENSBIXG00005024996) FAM89A (ENSBIXG00005025027) ARV1 (ENSBIXG00005025061) TTC13 (ENSBIXG00005025142) C1orf198 (ENSBIXG00005025245) ENSBIXG00005006522 ENSBIXG00005025280 ENSBIXG00005025286 FMN2 (ENSBIXG00005006011) ENSBIXG00005025487 PGBD5 (ENSBIXG00005025562) ENSBIXG00005025584 ENSBIXG00005025591 GALNT2 (ENSBIXG00005025642) ENSBIXG00005025667 ##22 ENSBIXG00005025674 URB2 (ENSBIXG00005025710) ENSBIXG00005004402 ABCB10 (ENSBIXG00005025809) NUP133 (ENSBIXG00005004411) ACTA1 (ENSBIXG00005025901) ENSBIXG00005025928 CCSAP (ENSBIXG00005007404) ENSBIXG00005026045 RHOU (ENSBIXG00005026085) ENSBIXG00005026103 ENSBIXG00005026116 ENSBIXG00005026134 OR5D14 (ENSBIXG00005026152) American bison DUPLICATION American bison MODERN SPECIES 3079 ENSBBBG00000022622 ENSBBBG00000022631 ##22 ENSBBBG00000022640 LSM8 (ENSBBBG00000022649) ENSBBBG00000022653 ENSBBBG00000022660 American bison MODERN SPECIES 16 ENSBBBG00000007779 ##22 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 4 CPSF2 (ENSCHYG00000017298) ENSCHYG00000017223 ATXN3 (ENSCHYG00000016824) TRIP11 (ENSCHYG00000016126) FBLN5 (ENSCHYG00000015684) ENSCHYG00000015643 ENSCHYG00000015585 TC2N (ENSCHYG00000015465) ENSCHYG00000015239 PPP4R3A (ENSCHYG00000014915) CCDC88C (ENSCHYG00000014063) GPR68 (ENSCHYG00000013997) ENSCHYG00000013980 ENSCHYG00000013835 FRMD5 (ENSCHYG00000013139) ENSCHYG00000013083 ##22 WDR76 (ENSCHYG00000012996) ENSCHYG00000012950 HYPK (ENSCHYG00000012914) SERINC4 (ENSCHYG00000012661) ENSCHYG00000012607 ENSCHYG00000012511 ELL3 (ENSCHYG00000012394) CATSPER2 (ENSCHYG00000012331) STRC (ENSCHYG00000012126) ENSCHYG00000012057 PDIA3 (ENSCHYG00000011974) PPIP5K1 (ENSCHYG00000011394) MAP1A (ENSCHYG00000011244) TP53BP1 (ENSCHYG00000010117) TUBGCP4 (ENSCHYG00000009762) Yarkand deer MODERN SPECIES 6 MTR (ENSCHYG00000013845) ACTN2 (ENSCHYG00000014774) HEATR1 (ENSCHYG00000015016) LGALS8 (ENSCHYG00000015624) EDARADD (ENSCHYG00000016052) ERO1B (ENSCHYG00000016281) GPR137B (ENSCHYG00000016532) NID1 (ENSCHYG00000016716) LYST (ENSCHYG00000017624) GNG4 (ENSCHYG00000017866) B3GALNT2 (ENSCHYG00000017928) TBCE (ENSCHYG00000018284) GGPS1 (ENSCHYG00000018859) ARID4B (ENSCHYG00000018925) ENSCHYG00000019082 ENSCHYG00000019328 ##22 TARBP1 (ENSCHYG00000019455) ENSCHYG00000019754 SLC35F3 (ENSCHYG00000019811) KCNK1 (ENSCHYG00000019984) MAP3K21 (ENSCHYG00000020014) PCNX2 (ENSCHYG00000020126) NTPCR (ENSCHYG00000020800) MAP10 (ENSCHYG00000020916) SIPA1L2 (ENSCHYG00000020978) DISC1 (ENSCHYG00000021661) ENSCHYG00000021874 TSNAX (ENSCHYG00000021893) ENSCHYG00000013420 SPRTN (ENSCHYG00000013445) EXOC8 (ENSCHYG00000013549) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Ferret MODERN SPECIES 417 NID1 (ENSMPUG00000003001) LYST (ENSMPUG00000002982) B3GALNT2 (ENSMPUG00000002933) TBCE (ENSMPUG00000002924) GGPS1 (ENSMPUG00000002920) ARID4B (ENSMPUG00000002906) RBM34 (ENSMPUG00000002849) ENSMPUG00000002823 ##22 IRF2BP2 (ENSMPUG00000002819) TARBP1 (ENSMPUG00000002802) SLC35F3 (ENSMPUG00000002798) KCNK1 (ENSMPUG00000002793) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 Horse MODERN SPECIES LGALS8 (ENSECAG00000015230) EDARADD (ENSECAG00000007926) ENSECAG00000056914 ERO1B (ENSECAG00000008935) GPR137B (ENSECAG00000019821) NID1 (ENSECAG00000016615) LYST (ENSECAG00000006981) ENSECAG00000057381 ENSECAG00000003192 B3GALNT2 (ENSECAG00000013338) TBCE (ENSECAG00000018794) GGPS1 (ENSECAG00000017806) ARID4B (ENSECAG00000017836) ENSECAG00000029944 RBM34 (ENSECAG00000013333) TOMM20 (ENSECAG00000019640) ##22 IRF2BP2 (ENSECAG00000023459) ENSECAG00000050783 TARBP1 (ENSECAG00000023673) SLC35F3 (ENSECAG00000007284) KCNK1 (ENSECAG00000009313) MAP3K21 (ENSECAG00000009443) PCNX2 (ENSECAG00000009930) NTPCR (ENSECAG00000023376) MAP10 (ENSECAG00000007746) SIPA1L2 (ENSECAG00000008162) DISC1 (ENSECAG00000001262) TSNAX (ENSECAG00000045739) EGLN1 (ENSECAG00000021704) SPRTN (ENSECAG00000023916) EXOC8 (ENSECAG00000003363) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 ENSGT00520000055570.B Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 ENSGT00520000055570.B Elephant MODERN SPECIES 126 MTR (ENSLAFG00000006529) ACTN2 (ENSLAFG00000014233) ENSLAFG00000002968 LGALS8 (ENSLAFG00000005065) EDARADD (ENSLAFG00000020561) ERO1B (ENSLAFG00000001418) GPR137B (ENSLAFG00000001415) NID1 (ENSLAFG00000005889) LYST (ENSLAFG00000015071) GNG4 (ENSLAFG00000027636) B3GALNT2 (ENSLAFG00000006723) TBCE (ENSLAFG00000006718) GGPS1 (ENSLAFG00000012036) ARID4B (ENSLAFG00000014295) RBM34 (ENSLAFG00000014289) ENSLAFG00000015499 ##22 IRF2BP2 (ENSLAFG00000032672) TARBP1 (ENSLAFG00000011394) ENSLAFG00000030912 SLC35F3 (ENSLAFG00000011492) KCNK1 (ENSLAFG00000003530) MAP3K21 (ENSLAFG00000001764) PCNX2 (ENSLAFG00000017938) NTPCR (ENSLAFG00000022724) MAP10 (ENSLAFG00000020699) SIPA1L2 (ENSLAFG00000002420) ENSLAFG00000026718 TSNAX (ENSLAFG00000006692) ENSLAFG00000026586 EGLN1 (ENSLAFG00000027305) SPRTN (ENSLAFG00000022053) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Opossum DUPLICATION Opossum MODERN SPECIES 1 LGALS8 (ENSMODG00000007976) ENSMODG00000007986 ERO1B (ENSMODG00000008014) GPR137B (ENSMODG00000008061) NID1 (ENSMODG00000008119) ENSMODG00000048273 LYST (ENSMODG00000008251) ENSMODG00000043325 GNG4 (ENSMODG00000029104) ENSMODG00000043602 TBCE (ENSMODG00000008312) ENSMODG00000024615 GGPS1 (ENSMODG00000047954) ARID4B (ENSMODG00000008417) RBM34 (ENSMODG00000008436) TOMM20 (ENSMODG00000008452) #22 IRF2BP2 (ENSMODG00000008478) TARBP1 (ENSMODG00000008504) ENSMODG00000008510 SLC35F3 (ENSMODG00000008526) KCNK1 (ENSMODG00000008541) ENSMODG00000046510 MAP3K21 (ENSMODG00000008553) PCNX2 (ENSMODG00000008590) ENSMODG00000038554 NTPCR (ENSMODG00000008600) ENSMODG00000008607 SIPA1L2 (ENSMODG00000008745) ENSMODG00000008793 TSNAX (ENSMODG00000047031) ENSMODG00000027858 Opossum MODERN SPECIES 2 ENSMODG00000046414 ENSMODG00000028668 TRIQK (ENSMODG00000024567) RUNX1T1 (ENSMODG00000007500) ENSMODG00000040659 ENSMODG00000029086 SLC26A7 (ENSMODG00000007528) ENSMODG00000024575 ENSMODG00000007537 ENSMODG00000007551 PIP4P2 (ENSMODG00000007561) C8orf88 (ENSMODG00000047666) NECAB1 (ENSMODG00000007570) TMEM64 (ENSMODG00000007607) ENSMODG00000047647 ENSMODG00000007612 #22 CALB1 (ENSMODG00000007628) DECR1 (ENSMODG00000007644) ENSMODG00000007677 OSGIN2 (ENSMODG00000007690) ENSMODG00000007706 RIPK2 (ENSMODG00000007716) MMP16 (ENSMODG00000007939) ENSMODG00000043497 ENSMODG00000029240 CNGB3 (ENSMODG00000008010) CPNE3 (ENSMODG00000008067) RMDN1 (ENSMODG00000008100) WWP1 (ENSMODG00000008132) ATP6V0D2 (ENSMODG00000008153) PSKH2 (ENSMODG00000008159) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Tasmanian devil MODERN SPECIES 3 RYR2 (ENSSHAG00000009656) MTR (ENSSHAG00000002966) ACTN2 (ENSSHAG00000005901) HEATR1 (ENSSHAG00000007902) LGALS8 (ENSSHAG00000008607) EDARADD (ENSSHAG00000029385) ERO1B (ENSSHAG00000010253) GPR137B (ENSSHAG00000010599) NID1 (ENSSHAG00000011798) LYST (ENSSHAG00000013171) B3GALNT2 (ENSSHAG00000014693) TBCE (ENSSHAG00000014780) GGPS1 (ENSSHAG00000022767) ARID4B (ENSSHAG00000015214) RBM34 (ENSSHAG00000015812) TOMM20 (ENSSHAG00000022894) #22 IRF2BP2 (ENSSHAG00000024262) TARBP1 (ENSSHAG00000000013) SLC35F3 (ENSSHAG00000024071) KCNK1 (ENSSHAG00000011575) MAP3K21 (ENSSHAG00000027157) PCNX2 (ENSSHAG00000002534) NTPCR (ENSSHAG00000007471) ENSSHAG00000032184 SIPA1L2 (ENSSHAG00000011171) ENSSHAG00000026219 ENSSHAG00000002544 TSNAX (ENSSHAG00000030330) EGLN1 (ENSSHAG00000028332) EXOC8 (ENSSHAG00000008461) SPRTN (ENSSHAG00000027841) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.g.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 koala MODERN SPECIES 83 MTR (ENSPCIG00000008386) ACTN2 (ENSPCIG00000008366) HEATR1 (ENSPCIG00000008351) ENSPCIG00000033460 EDARADD (ENSPCIG00000008342) ERO1B (ENSPCIG00000008338) GPR137B (ENSPCIG00000008334) NID1 (ENSPCIG00000003050) LYST (ENSPCIG00000003740) GNG4 (ENSPCIG00000018255) B3GALNT2 (ENSPCIG00000018216) TBCE (ENSPCIG00000018226) GGPS1 (ENSPCIG00000029802) ARID4B (ENSPCIG00000029756) RBM34 (ENSPCIG00000029736) ENSPCIG00000029734 #22 IRF2BP2 (ENSPCIG00000029728) TARBP1 (ENSPCIG00000029710) COA6 (ENSPCIG00000029705) SLC35F3 (ENSPCIG00000029704) KCNK1 (ENSPCIG00000029702) MAP3K21 (ENSPCIG00000029701) ENSPCIG00000029699 PCNX2 (ENSPCIG00000001724) ENSPCIG00000001951 ENSPCIG00000001971 SIPA1L2 (ENSPCIG00000029108) ENSPCIG00000029107 ENSPCIG00000011962 ENSPCIG00000032036 ENSPCIG00000018086 Common wonbat MODERN SPECIES 1035 ENSVURG00010005441 ENSVURG00010005388 ENSVURG00010005374 ENSVURG00010004350 ENSVURG00010004255 ENSVURG00010004209 ENSVURG00010004159 ENSVURG00010004143 ENSVURG00010004059 ENSVURG00010004029 ENSVURG00010003951 ENSVURG00010003943 ENSVURG00010003935 ENSVURG00010003736 ENSVURG00010003652 ENSVURG00010003639 #22 ENSVURG00010003578 ENSVURG00010003138 ENSVURG00010003038 ENSVURG00010003016 ENSVURG00010002944 ENSVURG00010002892 ENSVURG00010002240 ENSVURG00010002109 ENSVURG00010002018 ENSVURG00010001913 ENSVURG00010001903 ENSVURG00010001729 ENSVURG00010001459 ENSVURG00010001387 ENSVURG00010001360 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.g.b #22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 652 ENSVURG00010018046 #22 Common wonbat MODERN SPECIES 1037 ENSVURG00010004380 ENSVURG00010004485 #22 ENSVURG00010004500 ENSVURG00010004575 ENSVURG00010004590 ENSVURG00010004596 ENSVURG00010004603 ENSVURG00010004613 ENSVURG00010004619 KRT40 (ENSVURG00010004631) ENSVURG00010004646 KRT23 (ENSVURG00010004662) KRT20 (ENSVURG00010004673) KRT12 (ENSVURG00010004697) KRT10 (ENSVURG00010004767) ENSVURG00010004869 KRT24 (ENSVURG00010004908) Common wonbat MODERN SPECIES 653 ENSVURG00010018049 #22 koala MODERN SPECIES 119 ENSPCIG00000029744 RNF180 (ENSPCIG00000029743) HTR1A (ENSPCIG00000012371) ENSPCIG00000028931 IPO11 (ENSPCIG00000023292) DIMT1 (ENSPCIG00000023293) KIF2A (ENSPCIG00000023295) ENSPCIG00000013664 ZSWIM6 (ENSPCIG00000013654) SMIM15 (ENSPCIG00000013649) ENSPCIG00000013645 ENSPCIG00000013647 ERCC8 (ENSPCIG00000013639) ELOVL7 (ENSPCIG00000013633) ENSPCIG00000001733 ENSPCIG00000013636 #22 DEPDC1B (ENSPCIG00000013626) ENSPCIG00000011471 ENSPCIG00000031441 ENSPCIG00000011457 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.h #22 koala MODERN SPECIES 137 PRR16 (ENSPCIG00000034540) ENSPCIG00000018258 ENSPCIG00000028531 #22 SRFBP1 (ENSPCIG00000028532) LOX (ENSPCIG00000028533) ENSPCIG00000028536 SNCAIP (ENSPCIG00000019685) ENSPCIG00000031617 SNX2 (ENSPCIG00000026934) SNX24 (ENSPCIG00000027271) PPIC (ENSPCIG00000027269) PRDM6 (ENSPCIG00000015716) CEP120 (ENSPCIG00000021920) ENSPCIG00000021926 NXNL2 (ENSPCIG00000021927) ENSPCIG00000021928 S1PR3 (ENSPCIG00000000130) SHC3 (ENSPCIG00000000220) Common wonbat MODERN SPECIES 1035 ENSVURG00010006357 ENSVURG00010006012 ENSVURG00010005999 ENSVURG00010005985 ENSVURG00010004924 ENSVURG00010004845 ENSVURG00010004793 ENSVURG00010004057 ENSVURG00010003872 ENSVURG00010003841 ENSVURG00010003768 ENSVURG00010003749 ENSVURG00010003743 ENSVURG00010003528 ENSVURG00010003503 ENSVURG00010003478 #22 ENSVURG00010003421 ENSVURG00010002876 ENSVURG00010002819 ENSVURG00010002804 ENSVURG00010002732 ENSVURG00010002679 ENSVURG00010002671 ENSVURG00010002619 ENSVURG00010001863 ENSVURG00010001773 ENSVURG00010001630 ENSVURG00010001543 ENSVURG00010001534 ENSVURG00010001357 ENSVURG00010001230 Platypus MODERN SPECIES 10 RYR2 (ENSOANG00000010281) MTR (ENSOANG00000048280) ACTN2 (ENSOANG00000009397) HEATR1 (ENSOANG00000006937) ENSOANG00000039266 ERO1B (ENSOANG00000029286) GPR137B (ENSOANG00000041576) NID1 (ENSOANG00000001218) LYST (ENSOANG00000001216) GNG4 (ENSOANG00000001563) B3GALNT2 (ENSOANG00000001215) TBCE (ENSOANG00000001213) GGPS1 (ENSOANG00000001212) ARID4B (ENSOANG00000001208) RBM34 (ENSOANG00000001206) TOMM20 (ENSOANG00000001205) #22 ENSOANG00000041931 ENSOANG00000004525 ENSOANG00000044787 SLC35F3 (ENSOANG00000002914) KCNK1 (ENSOANG00000012916) PCNX2 (ENSOANG00000006841) NTPCR (ENSOANG00000037851) SIPA1L2 (ENSOANG00000004653) ENSOANG00000037328 TSNAX (ENSOANG00000013721) ENSOANG00000013722 ENSOANG00000048013 EXOC8 (ENSOANG00000048589) RHOU (ENSOANG00000045167) RAB4A (ENSOANG00000041440) Sauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00940000165200 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00940000165200 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 tuatara MODERN SPECIES 1361 ENSSPUG00000015826 ENSSPUG00000015821 ENSSPUG00000015815 LGALS8 (ENSSPUG00000015796) ENSSPUG00000015777 ERO1B (ENSSPUG00000015761) GPR137B (ENSSPUG00000015742) NID1 (ENSSPUG00000015655) LYST (ENSSPUG00000015580) GNG4 (ENSSPUG00000015543) B3GALNT2 (ENSSPUG00000015528) GGPS1 (ENSSPUG00000015510) ARID4B (ENSSPUG00000015466) ENSSPUG00000015446 RBM34 (ENSSPUG00000015430) TOMM20 (ENSSPUG00000015407) #22 IRF2BP2 (ENSSPUG00000015394) TARBP1 (ENSSPUG00000015364) ENSSPUG00000015352 SLC35F3 (ENSSPUG00000015333) Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00940000165200 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Laterata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00940000165200 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Common wall lizard DUPLICATION Common wall lizard MODERN SPECIES 11 HEATR1 (ENSPMRG00000004862) LGALS8 (ENSPMRG00000004822) ENSPMRG00000004818 ERO1B (ENSPMRG00000004797) GPR137B (ENSPMRG00000004791) NID1 (ENSPMRG00000004779) ENSPMRG00000004774 LYST (ENSPMRG00000002316) GNG4 (ENSPMRG00000001879) B3GALNT2 (ENSPMRG00000001866) TBCE (ENSPMRG00000001851) ENSPMRG00000001842 GGPS1 (ENSPMRG00000001836) ARID4B (ENSPMRG00000001233) RBM34 (ENSPMRG00000001044) ENSPMRG00000001023 #22 IRF2BP2 (ENSPMRG00000001011) COA6 (ENSPMRG00000000996) TARBP1 (ENSPMRG00000000940) SLC35F3 (ENSPMRG00000000883) KCNK1 (ENSPMRG00000000854) MAP3K21 (ENSPMRG00000000802) PCNX2 (ENSPMRG00000000649) NTPCR (ENSPMRG00000000599) MAP10 (ENSPMRG00000000584) SIPA1L2 (ENSPMRG00000000464) DISC1 (ENSPMRG00000000321) TSNAX (ENSPMRG00000000258) EGLN1 (ENSPMRG00000000207) SPRTN (ENSPMRG00000005464) EXOC8 (ENSPMRG00000005460) Common wall lizard MODERN SPECIES 276 ENSPMRG00000022244 #22 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 2 MTR (ENSSMRG00000021868) ACTN2 (ENSSMRG00000021869) HEATR1 (ENSSMRG00000021870) LGALS8 (ENSSMRG00000021871) ENSSMRG00000021872 ERO1B (ENSSMRG00000021873) GPR137B (ENSSMRG00000021874) NID1 (ENSSMRG00000021875) LYST (ENSSMRG00000021876) GNG4 (ENSSMRG00000021877) B3GALNT2 (ENSSMRG00000021878) TBCE (ENSSMRG00000021879) GGPS1 (ENSSMRG00000021880) ARID4B (ENSSMRG00000021881) RBM34 (ENSSMRG00000021985) TOMM20 (ENSSMRG00000021986) #22 IRF2BP2 (ENSSMRG00000021993) ENSSMRG00000021994 TARBP1 (ENSSMRG00000021996) COA6 (ENSSMRG00000021998) SLC35F3 (ENSSMRG00000021999) KCNK1 (ENSSMRG00000022001) MAP3K21 (ENSSMRG00000022002) PCNX2 (ENSSMRG00000022003) NTPCR (ENSSMRG00000022005) MAP10 (ENSSMRG00000022006) SIPA1L2 (ENSSMRG00000022009) DISC1 (ENSSMRG00000022010) TSNAX (ENSSMRG00000022013) ENSSMRG00000022014 EGLN1 (ENSSMRG00000022015) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00940000165200 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154906.C.d ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00940000165200 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000158149.i ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154906.C.d 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ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.e ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704.w ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 28 MTR (ENSNSUG00000016909) ACTN2 (ENSNSUG00000017933) ENSNSUG00000017934 ENSNSUG00000017935 LGALS8 (ENSNSUG00000017936) ENSNSUG00000017937 ERO1B (ENSNSUG00000017938) GPR137B (ENSNSUG00000017939) NID1 (ENSNSUG00000017941) LYST (ENSNSUG00000017942) GNG4 (ENSNSUG00000017943) B3GALNT2 (ENSNSUG00000000021) TBCE (ENSNSUG00000000220) ARID4B (ENSNSUG00000000258) ENSNSUG00000001036 TOMM20 (ENSNSUG00000001037) #22 IRF2BP2 (ENSNSUG00000001041) TARBP1 (ENSNSUG00000001044) COA6 (ENSNSUG00000001056) SLC35F3 (ENSNSUG00000001061) KCNK1 (ENSNSUG00000001063) MAP3K21 (ENSNSUG00000001064) PCNX2 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Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00940000165200 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00940000165200 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a 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SPECIES 188 PDE10A (ENSSCUG00000001053) TBXT (ENSSCUG00000001044) SFT2D1 (ENSSCUG00000001038) MPC1 (ENSSCUG00000001035) RPS6KA2 (ENSSCUG00000001026) RNASET2 (ENSSCUG00000001018) CEP43 (ENSSCUG00000001013) CCR6 (ENSSCUG00000001009) LYST (ENSSCUG00000000828) GNG4 (ENSSCUG00000000697) B3GALNT2 (ENSSCUG00000000694) TBCE (ENSSCUG00000000653) GGPS1 (ENSSCUG00000000626) ARID4B (ENSSCUG00000000590) RBM34 (ENSSCUG00000000551) TOMM20 (ENSSCUG00000000546) #22 TARBP1 (ENSSCUG00000000505) COA6 (ENSSCUG00000000479) SLC35F3 (ENSSCUG00000000476) KCNK1 (ENSSCUG00000000475) MAP3K21 (ENSSCUG00000000474) PCNX2 (ENSSCUG00000000462) NTPCR (ENSSCUG00000000457) SIPA1L2 (ENSSCUG00000000437) DISC1 (ENSSCUG00000000420) TSNAX (ENSSCUG00000000411) EGLN1 (ENSSCUG00000000408) SPRTN (ENSSCUG00000000401) EXOC8 (ENSSCUG00000000390) RHOU (ENSSCUG00000000383) RAB4A (ENSSCUG00000000374) Neognathae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00940000165200 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ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Zebra finch MODERN SPECIES 23 MTR (ENSTGUG00000010458) ACTN2 (ENSTGUG00000010436) HEATR1 (ENSTGUG00000010404) LGALS8 (ENSTGUG00000010394) ENSTGUG00000021438 ERO1B (ENSTGUG00000010384) GPR137B (ENSTGUG00000010376) NID1 (ENSTGUG00000010336) LYST (ENSTGUG00000010290) GNG4 (ENSTGUG00000010286) B3GALNT2 (ENSTGUG00000010280) TBCE (ENSTGUG00000010264) GGPS1 (ENSTGUG00000025259) ARID4B (ENSTGUG00000010246) RBM34 (ENSTGUG00000010234) TOMM20 (ENSTGUG00000026446) #22 IRF2BP2 (ENSTGUG00000010224) TARBP1 (ENSTGUG00000010214) COA6 (ENSTGUG00000026578) SLC35F3 (ENSTGUG00000010208) KCNK1 (ENSTGUG00000010202) MAP3K21 (ENSTGUG00000010194) PCNX2 (ENSTGUG00000010143) NTPCR (ENSTGUG00000010136) ENSTGUG00000010135 SIPA1L2 (ENSTGUG00000010103) DISC1 (ENSTGUG00000010096) EGLN1 (ENSTGUG00000010081) SPRTN (ENSTGUG00000010080) EXOC8 (ENSTGUG00000018403) RHOU (ENSTGUG00000025893) Common canary MODERN SPECIES 20 MTR (ENSSCAG00000004458) ACTN2 (ENSSCAG00000004367) HEATR1 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ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00940000165200 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Chicken MODERN SPECIES 22 MTR (ENSGALG00010009104) ACTN2 (ENSGALG00010009118) HEATR1 (ENSGALG00010009130) LGALS8 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ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 ENSGT00940000156644 Duck MODERN SPECIES 21 TSNAX (ENSAPLG00000013433) ENSAPLG00000013374 SPRTN (ENSAPLG00000013330) EXOC8 (ENSAPLG00000030708) RHOU (ENSAPLG00000028150) ERO1B (ENSAPLG00000008526) GPR137B (ENSAPLG00000008345) NID1 (ENSAPLG00000007233) ENSAPLG00000006342 GNG4 (ENSAPLG00000006331) B3GALNT2 (ENSAPLG00000006156) TBCE (ENSAPLG00000005834) GGPS1 (ENSAPLG00000005831) ARID4B (ENSAPLG00000004422) RBM34 (ENSAPLG00000004344) TOMM20 (ENSAPLG00000004030) #22 TARBP1 (ENSAPLG00000007666) COA6 (ENSAPLG00000022615) SLC35F3 (ENSAPLG00000008027) KCNK1 (ENSAPLG00000008119) UTP25 (ENSAPLG00000007948) SYT14 (ENSAPLG00000007935) SERTAD4 (ENSAPLG00000020952) ENSAPLG00000007807 ENSAPLG00000029050 KCNH1 (ENSAPLG00000007453) ENSAPLG00000007210 TRAF5 (ENSAPLG00000006555) RD3 (ENSAPLG00000020251) SLC30A1 (ENSAPLG00000000775) NEK2 (ENSAPLG00000010876) Pink-footed goose MODERN SPECIES 53 RYR2 (ENSABRG00000018175) MTR (ENSABRG00000017015) ACTN2 (ENSABRG00000014949) HEATR1 (ENSABRG00000013178) LGALS8 (ENSABRG00000013037) ENSABRG00000013019 ERO1B (ENSABRG00000012980) GPR137B (ENSABRG00000012967) NID1 (ENSABRG00000012425) LYST (ENSABRG00000006032) GNG4 (ENSABRG00000005763) B3GALNT2 (ENSABRG00000005698) TBCE (ENSABRG00000004101) GGPS1 (ENSABRG00000003887) ARID4B (ENSABRG00000003096) TOMM20 (ENSABRG00000003041) #22 IRF2BP2 (ENSABRG00000003025) TARBP1 (ENSABRG00000002605) COA6 (ENSABRG00000002551) SLC35F3 (ENSABRG00000002516) KCNK1 (ENSABRG00000002492) MAP3K21 (ENSABRG00000002442) PCNX2 (ENSABRG00000002223) NTPCR (ENSABRG00000002177) SIPA1L2 (ENSABRG00000002092) DISC1 (ENSABRG00000001859) TSNAX (ENSABRG00000001807) EGLN1 (ENSABRG00000001777) Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00940000165200 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Chinese turtle MODERN SPECIES 1009 ACTN2 (ENSPSIG00000011905) HEATR1 (ENSPSIG00000010048) LGALS8 (ENSPSIG00000009463) ENSPSIG00000008940 ERO1B (ENSPSIG00000007860) GPR137B (ENSPSIG00000007819) NID1 (ENSPSIG00000006311) LYST (ENSPSIG00000013825) GNG4 (ENSPSIG00000013489) B3GALNT2 (ENSPSIG00000012953) TBCE 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ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00940000165200 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 ENSGT00390000015936 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 17 MTR (ENSGEVG00005005768) ACTN2 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ENSGT00940000155727 ENSGT00940000165200 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a #22 ENSGT00940000160591.b ENSGT00390000003939 ENSGT00390000004094 ENSGT00390000008727.a.a ENSGT00990000214031 ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00940000159629 ENSGT00940000157374 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00390000003585 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 31 MTR (ENSTMTG00000010954) ACTN2 (ENSTMTG00000011097) HEATR1 (ENSTMTG00000011387) LGALS8 (ENSTMTG00000011456) ENSTMTG00000011483 ERO1B (ENSTMTG00000011500) GPR137B (ENSTMTG00000011516) NID1 (ENSTMTG00000011531) LYST (ENSTMTG00000012250) GNG4 (ENSTMTG00000019992) B3GALNT2 (ENSTMTG00000019998) TBCE (ENSTMTG00000020012) GGPS1 (ENSTMTG00000020032) ARID4B 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(ENSLLEG00000018947) ENSLLEG00000018570 ENSLLEG00000018527 #22 ENSLLEG00000018016 ENSLLEG00000017772 ENSLLEG00000017724 ENSLLEG00000017709 ENSLLEG00000017471 ENSLLEG00000017441 ENSLLEG00000017104 ENSLLEG00000017027 ENSLLEG00000016977 ENSLLEG00000016953 ENSLLEG00000016925 PARG (ENSLLEG00000016165) ENSLLEG00000016083 ENSLLEG00000016070 ENSLLEG00000016040 Coelacanth MODERN SPECIES 382 CEP43 (ENSLACG00000001390) TBP (ENSLACG00000005118) PDCD2 (ENSLACG00000005872) ENSLACG00000006227 GPATCH11 (ENSLACG00000008344) ENSLACG00000022552 MRPL4 (ENSLACG00000009255) ENSLACG00000009811 SLC30A6 (ENSLACG00000010855) ENSLACG00000022642 GGPS1 (ENSLACG00000012397) TBCE (ENSLACG00000012659) B3GALNT2 (ENSLACG00000013209) RBM34 (ENSLACG00000013628) NUP133 (ENSLACG00000013878) TOMM20 (ENSLACG00000014544) #22 TBXT (ENSLACG00000015449) TTC13 (ENSLACG00000015671) ARV1 (ENSLACG00000016152) C1orf131 (ENSLACG00000016190) GNPAT (ENSLACG00000016223) EXOC8 (ENSLACG00000016425) tfb2m (ENSLACG00000016461) PPIL4 (ENSLACG00000016551) ENSLACG00000016816 TAB2 (ENSLACG00000016935) Actinopterygii DUPLICATION Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 968 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 742 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00530000064271 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000163863 ENSGT00940000160736 ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b ENSGT00940000159330 ENSGT01100000263524.G.f.b ENSGT00940000156258.f.b ENSGT00390000008808.q ENSGT00940000157923 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000180095 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863 ENSGT00940000160736 ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330 ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000008808.r.b ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a.a ENSGT00390000007214 ENSGT00390000016400 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000180095 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00390000008808.r.a ENSGT00940000156258.f.b ENSGT01100000263524.G.f.b ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863 ENSGT00940000160736 ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330 ENSGT01100000263524.G.f.a Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000180095 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863 ENSGT00940000160736 ENSGT00440000039029 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SPECIES 5 ENSGT00940000180095 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863.f.b ENSGT00940000160736 ENSGT00940000163863.f.a ENSGT00940000180148 ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330 ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a.a ENSGT00390000007214 ENSGT00390000016400 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000180095 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863.f.b.b ENSGT00940000160736 ENSGT00940000180148 ENSGT00940000163863.f.a ENSGT00940000163863.f.b.a ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330.h ENSGT00940000159330.g.a ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000180095 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863.f.b.b ENSGT00940000160736 ENSGT00940000180148 ENSGT00940000163863.f.a ENSGT00940000163863.f.b.a ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330.h ENSGT00940000159330.g.a ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000180095 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863.f.a ENSGT00940000160736 ENSGT00940000180148 ENSGT00940000163863.f.b.b ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330.h ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a.a ENSGT00390000007214 ENSGT00390000016400 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000180095 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863.f.a ENSGT00940000180148 ENSGT00940000163863.f.b.b ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330.h ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a.a ENSGT00390000007214 ENSGT00390000016400 ENSGT00940000166212 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157952 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000179674 ENSGT00940000163863.f.a ENSGT00940000180148 ENSGT00940000163863.f.b.b ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330.h ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a.a ENSGT00390000007214 ENSGT00390000016400 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 6 KLHDC3 (ENSORLG00000012833) ENSORLG00000028577 ntpcr (ENSORLG00000012781) ENSORLG00000012773 SIPA1L2 (ENSORLG00000012766) disc1 (ENSORLG00000012717) tsnax (ENSORLG00000030285) EGLN1 (ENSORLG00000012686) gpr137ba (ENSORLG00000012678) NID1 (ENSORLG00000012649) LYST (ENSORLG00000012597) GNG4 (ENSORLG00000024211) b3galnt2 (ENSORLG00000012537) ggps1 (ENSORLG00000012519) ARID4B (ENSORLG00000012510) ENSORLG00000012459 #22 irf2bp2a (ENSORLG00000024085) ENSORLG00000024543 ENSORLG00000012432 ENSORLG00000018980 gpatch11 (ENSORLG00000028418) HEATR5B 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ENSBSLG00000007499 ENSBSLG00000007513 ENSBSLG00000007521 ENSBSLG00000007531 ENSBSLG00000007538 ENSBSLG00000007565 gpatch11 (ENSBSLG00000007570) HEATR5B (ENSBSLG00000007591) STRN (ENSBSLG00000007890) VIT (ENSBSLG00000008650) ENSBSLG00000008688 SPAST (ENSBSLG00000008729) memo1 (ENSBSLG00000008856) srd5a2b (ENSBSLG00000008888) Climbing perch MODERN SPECIES 6 ENSATEG00000026324 ENSATEG00000027334 ntpcr (ENSATEG00000014445) ENSATEG00000026112 SIPA1L2 (ENSATEG00000014495) disc1 (ENSATEG00000014612) tsnax (ENSATEG00000026726) EGLN1 (ENSATEG00000014683) gpr137ba (ENSATEG00000014691) NID1 (ENSATEG00000014711) LYST (ENSATEG00000014737) GNG4 (ENSATEG00000028112) b3galnt2 (ENSATEG00000014874) ggps1 (ENSATEG00000014890) ARID4B (ENSATEG00000014930) ENSATEG00000014976 #22 irf2bp2a (ENSATEG00000014999) ENSATEG00000015063 ENSATEG00000015535 GPATCH11 (ENSATEG00000015556) HEATR5B (ENSATEG00000015657) STRN (ENSATEG00000015765) VIT (ENSATEG00000015883) ENSATEG00000016185 SPAST (ENSATEG00000016207) memo1 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Seriola ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157952 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863.f.b.b ENSGT00940000163863.f.a ENSGT00940000163863.f.b.a ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330.h ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a.a ENSGT00390000007214 ENSGT00390000016400 ENSGT00940000166212 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2884 KLHDC3 (ENSSLDG00000024385) ENSSLDG00000024409 ntpcr (ENSSLDG00000024450) ENSSLDG00000024453 SIPA1L2 (ENSSLDG00000024477) disc1 (ENSSLDG00000024589) tsnax (ENSSLDG00000024597) EGLN1 (ENSSLDG00000024610) gpr137ba 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ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A.d ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863.f.b.b ENSGT00940000163863.f.a ENSGT00940000163863.f.b.a ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330.h ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a.a ENSGT00390000007214 ENSGT00390000016400 ENSGT00940000166212 Pike perch MODERN SPECIES 10 disc1 (ENSSLUG00000001815) tsnax (ENSSLUG00000001824) EGLN1 (ENSSLUG00000001837) gpr137ba (ENSSLUG00000001848) NID1 (ENSSLUG00000002077) LYST (ENSSLUG00000004235) GNG4 (ENSSLUG00000004821) b3galnt2 (ENSSLUG00000004831) ggps1 (ENSSLUG00000004879) ENSSLUG00000004896 ENSSLUG00000004906 #22 irf2bp2a (ENSSLUG00000004922) ENSSLUG00000004930 ENSSLUG00000004966 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ENSCGOG00000016625 SPAST (ENSCGOG00000016641) ENSCGOG00000017159 memo1 (ENSCGOG00000017167) srd5a2b (ENSCGOG00000017256) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000064165.b ENSGT00940000157952 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A.d ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863.f.a ENSGT00940000163863.f.b.a ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330.h ENSGT00940000159330.g.a ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a.a ENSGT00390000007214 ENSGT00940000166212 ENSGT00940000156461 Lumpfish MODERN SPECIES 6 KLHDC3 (ENSCLMG00005002452) ENSCLMG00005002450 ntpcr (ENSCLMG00005002449) SIPA1L2 (ENSCLMG00005002442) 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ENSSAUG00010004815 SPAST (ENSSAUG00010003337) memo1 (ENSSAUG00010003308) srd5a2b (ENSSAUG00010003302) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000180095 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A.d ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863.f.b.b ENSGT00940000163863.f.b.a ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330.h ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a.a ENSGT00390000007214 ENSGT00390000016400 ENSGT00940000166212 ENSGT00940000156461 European seabass MODERN SPECIES 1 ENSDLAG00005031591 ENSDLAG00005024316 ENSDLAG00005024341 ntpcr (ENSDLAG00005024368) SIPA1L2 (ENSDLAG00005024392) 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ENSGT00940000160736 ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b ENSGT00940000159330 ENSGT01100000263524.G ENSGT00940000156258 ENSGT00390000008808 ENSGT00940000157923 ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a ENSGT00390000007214 Reedfish MODERN SPECIES 6 sipa1l2 (ENSECRG00000016262) DISC1 (ENSECRG00000016303) ENSECRG00000016330 tsnax (ENSECRG00000016347) egln1b (ENSECRG00000016369) ero1b (ENSECRG00000016434) gpr137ba (ENSECRG00000016556) NID1 (ENSECRG00000016589) LYST (ENSECRG00000016700) GNG4 (ENSECRG00000016869) b3galnt2 (ENSECRG00000016891) tbce (ENSECRG00000016920) ggps1 (ENSECRG00000016961) ARID4B (ENSECRG00000017017) RBM34 (ENSECRG00000017099) tomm20b (ENSECRG00000017143) #22 irf2bp2b (ENSECRG00000017168) ENSECRG00000017187 gpatch11 (ENSECRG00000017220) HEATR5B (ENSECRG00000017276) strn (ENSECRG00000017351) VIT (ENSECRG00000017493) opn6a (ENSECRG00000017700) spast (ENSECRG00000017739) dpy30 (ENSECRG00000017803) psen2 (ENSECRG00000017831) memo1 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soul4 (ENSLOCG00000015879) ptk7a (ENSLOCG00000015880) srfb (ENSLOCG00000015887) b3galnt2 (ENSLOCG00000015892) tbce (ENSLOCG00000015896) ggps1 (ENSLOCG00000015898) ARID4B (ENSLOCG00000015899) rbm34 (ENSLOCG00000015902) tomm20b (ENSLOCG00000015904) #22 irf2bp2b (ENSLOCG00000015906) map1lc3c (ENSLOCG00000015907) ENSLOCG00000015909 gpatch11 (ENSLOCG00000015919) HEATR5B (ENSLOCG00000015922) strn (ENSLOCG00000015925) VIT (ENSLOCG00000015932) opn6a (ENSLOCG00000015937) spast (ENSLOCG00000015939) dpy30 (ENSLOCG00000015945) psen2 (ENSLOCG00000015948) memo1 (ENSLOCG00000015951) srd5a2b (ENSLOCG00000015953) mkks (ENSLOCG00000015954) SLX4IP (ENSLOCG00000015956) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00530000064271 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000163863 ENSGT00940000160736 ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b ENSGT00940000159330 ENSGT01100000263524.G.f.b ENSGT00940000156258.f.b ENSGT00390000008808.q ENSGT00940000157923 ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000008808.r.b Osteoglossiformes DUPLICATION Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 128 ENSGT00390000003866.a.a.d ENSGT00530000064271 ENSGT00940000157388.c.b ENSGT00940000155704.cb ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a.s.a ENSGT00940000156318.b.a.b ENSGT00940000156359 ENSGT00940000156562.r ENSGT00390000011698.c.a.b.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000166218.b ENSGT00940000163863 ENSGT00940000160736 ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.d ENSGT00940000159330 ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000008808.r.b ENSGT00940000157923 ENSGT00390000006408.xb ENSGT00950000182886.b.a.c ENSGT00390000007214 P. kingsleyae MODERN SPECIES 53 ENSPKIG00000023189 ENSPKIG00000023220 ntpcr (ENSPKIG00000023312) ENSPKIG00000023342 sipa1l2 (ENSPKIG00000023428) ENSPKIG00000023521 tsnax (ENSPKIG00000023546) EGLN1 (ENSPKIG00000023572) gpr137ba (ENSPKIG00000023590) ENSPKIG00000023601 ENSPKIG00000023614 LYST (ENSPKIG00000023735) B3GALNT2 (ENSPKIG00000023912) ENSPKIG00000023926 ARID4B (ENSPKIG00000023938) tomm20b (ENSPKIG00000023966) #22 irf2bp2a (ENSPKIG00000023982) ENSPKIG00000023997 pkz (ENSPKIG00000024012) eif2ak2 (ENSPKIG00000024036) gpatch11 (ENSPKIG00000024060) HEATR5B (ENSPKIG00000024098) strn (ENSPKIG00000024149) VIT (ENSPKIG00000024171) SPAST (ENSPKIG00000024207) DPY30 (ENSPKIG00000024233) psen2 (ENSPKIG00000024241) memo1 (ENSPKIG00000024273) srd5a2b (ENSPKIG00000024297) mkks (ENSPKIG00000024314) slx4ip (ENSPKIG00000024328) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 447 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562.q ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011249 ENSGT00390000011698.c.a.b.b #22 ENSGT00940000160591.a.a Asian bonytongue MODERN SPECIES 7 rrp36 (ENSSFOG00015023058) sipa1l2 (ENSSFOG00015023071) EGLN1 (ENSSFOG00015008300) ENSSFOG00015032952 ero1b (ENSSFOG00015023107) GPR137B (ENSSFOG00015008492) NID1 (ENSSFOG00015023125) LYST (ENSSFOG00015023174) ENSSFOG00015032886 GNG4 (ENSSFOG00015023221) b3galnt2 (ENSSFOG00015023226) tbce (ENSSFOG00015023234) ggps1 (ENSSFOG00015032076) ARID4B (ENSSFOG00015000132) rbm34 (ENSSFOG00015000148) tomm20b (ENSSFOG00015000175) #22 irf2bp2b (ENSSFOG00015025490) map1lc3c (ENSSFOG00015032836) strn (ENSSFOG00015009248) VIT (ENSSFOG00015000365) ENSSFOG00015024576 opn6a (ENSSFOG00015000403) SPAST (ENSSFOG00015000444) dpy30 (ENSSFOG00015000542) memo1 (ENSSFOG00015000579) SRD5A2 (ENSSFOG00015000636) ENSSFOG00015000670 BTBD3 (ENSSFOG00015025030) ism1 (ENSSFOG00015026493) ism1 (ENSSFOG00015029892) flrt3 (ENSSFOG00015000847) P. kingsleyae MODERN SPECIES 306 sipa1l2 (ENSPKIG00000008478) EGLN1 (ENSPKIG00000008734) ero1b (ENSPKIG00000008791) GPR137B (ENSPKIG00000008855) NID1 (ENSPKIG00000008884) LYST (ENSPKIG00000008940) GNG4 (ENSPKIG00000009012) b3galnt2 (ENSPKIG00000009056) tbce (ENSPKIG00000009157) ggps1 (ENSPKIG00000009234) ARID4B (ENSPKIG00000009248) rbm34 (ENSPKIG00000009284) TOMM20 (ENSPKIG00000009309) #22 irf2bp2b (ENSPKIG00000009344) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.a #22 ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863 ENSGT00940000160736 ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330 ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000008808.r.b ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a.a ENSGT00390000007214 ENSGT00390000016400 ENSGT00940000166212 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 457 ENSGT01100000263524.G.f.b ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 193 ENSGT00940000153986.b.a.v ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149 ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863 ENSGT00940000160736 ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00950000183059.b.a.b.q ENSGT00390000012785 ENSGT00940000173161 ENSGT00940000166212 ENSGT00940000156461 ENSGT00940000158513 ENSGT00940000159062 ENSGT00950000183045.B ENSGT00940000162838.h Atlantic herring MODERN SPECIES 4 ENSCHAG00000007582 ENSCHAG00000007589 cisd1 (ENSCHAG00000007599) ctbp2a (ENSCHAG00000007630) ENSCHAG00000007876 ENSCHAG00000007902 fkbp6 (ENSCHAG00000007909) ENSCHAG00000007915 GPR137B (ENSCHAG00000007929) NID1 (ENSCHAG00000008235) LYST (ENSCHAG00000009851) GNG4 (ENSCHAG00000010455) b3galnt2 (ENSCHAG00000010483) ggps1 (ENSCHAG00000010643) ARID4B (ENSCHAG00000010662) tomm20a (ENSCHAG00000010753) #22 irf2bp2a (ENSCHAG00000010851) pkz (ENSCHAG00000010896) eif2ak2 (ENSCHAG00000011002) gpatch11 (ENSCHAG00000011023) HEATR5B (ENSCHAG00000011196) STRN (ENSCHAG00000014228) PLD5 (ENSCHAG00000015023) cfap36 (ENSCHAG00000015041) ENSCHAG00000015067 slx4ip (ENSCHAG00000015082) jag1b (ENSCHAG00000015232) BTBD3 (ENSCHAG00000017580) sptlc3 (ENSCHAG00000017627) ism1 (ENSCHAG00000018813) tasp1 (ENSCHAG00000018870) Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 18 g6pc3 (ENSDCDG00000033201) TANC2 (ENSDCDG00000033212) WNK4 (ENSDCDG00000033269) coa3a (ENSDCDG00000033271) 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(ENSDCDG00000001138) map1lc3c (ENSDCDG00000001118) irf2bp2b (ENSDCDG00000001115) tomm20b (ENSDCDG00000001105) #22 rbm34 (ENSDCDG00000001100) tbce (ENSDCDG00000001078) NID1 (ENSDCDG00000000544) ENSDCDG00000000354 ero1b (ENSDCDG00000000301) zgc:113162 (ENSDCDG00000000201) NSMF (ENSDCDG00000024563) ENSDCDG00000024546 ENSDCDG00000019137 clic3 (ENSDCDG00000018951) FUT7 (ENSDCDG00000018946) pou5f3 (ENSDCDG00000018945) npdc1a (ENSDCDG00000018942) ENSDCDG00000017957 slc31a2 (ENSDCDG00000017917) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 391 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182935.B.a.c ENSGT00390000011309 ENSGT00390000011093 ENSGT00390000012872.b ENSGT00390000007726.a.b ENSGT00950000183137.a.l ENSGT00390000005639.a.b.d.b ENSGT00390000015228 ENSGT00390000018807 ENSGT00390000016988.a.a.a.a.b ENSGT00940000155037 ENSGT01100000263524.G.f.b ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000156291.e ENSGT00940000156205.g ENSGT00940000157771 ENSGT00940000156682.e.a ENSGT00940000154876.a.a.a.a ENSGT00940000154876.a.a.a.b ENSGT00530000063712.a.a.o.a ENSGT00530000063712.a.a.o.b.a.a ENSGT00950000182940.b.a.a.g.b ENSGT00940000154146.b.a Channel catfish MODERN SPECIES 1 afmid (ENSIPUG00000021582) cant1 (ENSIPUG00000021609) ENSIPUG00000021621 si:dkey-93h22.8 (ENSIPUG00000021651) ldb1b (ENSIPUG00000021664) orc2 (ENSIPUG00000021681) c10h21orf2 (ENSIPUG00000021692) pfkl (ENSIPUG00000021701) rpl37a (ENSIPUG00000021767) eif4a3 (ENSIPUG00000021785) opn6a (ENSIPUG00000021834) STRN (ENSIPUG00000021850) map1lc3c (ENSIPUG00000021896) irf2bp2 (ENSIPUG00000021926) ENSIPUG00000021929 tomm20b (ENSIPUG00000021935) #22 rbm34 (ENSIPUG00000021952) tbce (ENSIPUG00000021983) nid1 (ENSIPUG00000022017) gpr137b (ENSIPUG00000022038) ero1b (ENSIPUG00000022054) ENSIPUG00000022099 ENSIPUG00000022109 ENSIPUG00000022132 lrrc28 (ENSIPUG00000022158) Igf1r (ENSIPUG00000022197) ENSIPUG00000022242 ANPEP (ENSIPUG00000022254) mespaa (ENSIPUG00000022281) mespba (ENSIPUG00000022294) Sv2b (ENSIPUG00000022299) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182935.B.a.c ENSGT00390000011309 ENSGT00390000011093 ENSGT00390000012872.b ENSGT00390000007726.a.b ENSGT00950000183137.a.l ENSGT00390000005639.a.b.d.b ENSGT00390000015228 ENSGT00390000018807 ENSGT00390000016988.a.a.a.a.b ENSGT00940000155037 ENSGT01100000263524.G.f.b ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000156291.e ENSGT00940000156205.g ENSGT00940000157771 ENSGT00940000156682.e.a ENSGT00940000154876.a.a.a.a ENSGT00940000154876.a.a.a.b ENSGT00530000063712.a.a.o.a ENSGT00530000063712.a.a.o.b.a.a ENSGT00950000182940.b.a.a.g.b ENSGT00940000154146.b.a Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 909 ENSEEEG00000000199 tomm20a (ENSEEEG00000000147) #22 irf2bp2a (ENSEEEG00000021773) Electric eel MODERN SPECIES 505 zgc:171772 (ENSEEEG00000001471) eif4a3 (ENSEEEG00000001465) strn (ENSEEEG00000001397) map1lc3c (ENSEEEG00000001395) irf2bp2b (ENSEEEG00000001394) tomm20b (ENSEEEG00000001392) #22 rbm34 (ENSEEEG00000001390) tbce (ENSEEEG00000001386) NID1 (ENSEEEG00000001285) GPR137B (ENSEEEG00000001266) ero1b (ENSEEEG00000000596) MCTP2 (ENSEEEG00000000324) ENSEEEG00000000295 ENSEEEG00000000285 LRRC28 (ENSEEEG00000000261) igf1rb (ENSEEEG00000000219) ANPEP (ENSEEEG00000000125) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182935.B.a.c ENSGT00390000011309 ENSGT00390000011093 ENSGT00390000012872.b ENSGT00390000007726.a.b ENSGT00950000183137.a.l ENSGT00390000005639.a.b.d.b ENSGT00390000015228 ENSGT00390000018807 ENSGT00390000016988.a.a.a.a.b ENSGT00940000155037 ENSGT01100000263524.G.f.b ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000156291.e ENSGT00940000156291.f ENSGT00940000156205.h ENSGT00940000157771 ENSGT00940000156682.e.a ENSGT00940000154876.a.a.a.a ENSGT00940000154876.a.a.a.b ENSGT00530000063712.a.a.o.a ENSGT00530000063712.a.a.o.b.a.a ENSGT00950000182940.b.a.a.g.b Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 491 ENSPNAG00000000536 ENSPNAG00000007891 MYPN (ENSPNAG00000007887) ggps1 (ENSPNAG00000007868) ARID4B (ENSPNAG00000000523) tomm20a (ENSPNAG00000007853) #22 irf2bp2a (ENSPNAG00000007846) eif2ak2 (ENSPNAG00000000508) gpatch11 (ENSPNAG00000000500) cox5b2 (ENSPNAG00000000497) dnajc12 (ENSPNAG00000000493) SIRT1 (ENSPNAG00000007824) CACUL1 (ENSPNAG00000007817) ENSPNAG00000000483 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 82 ddx59 (ENSPNAG00000002963) kif14 (ENSPNAG00000013834) ENSPNAG00000002953 nr5a2 (ENSPNAG00000013785) PTPRC (ENSPNAG00000013739) nek7 (ENSPNAG00000002888) lhx9 (ENSPNAG00000013648) si:dkey-121a9.3 (ENSPNAG00000013602) DENND1B (ENSPNAG00000013596) crb1 (ENSPNAG00000013567) aspm (ENSPNAG00000013547) cfhl4 (ENSPNAG00000002752) strn (ENSPNAG00000013407) map1lc3c (ENSPNAG00000002701) irf2bp2b (ENSPNAG00000013291) tomm20b (ENSPNAG00000002652) #22 rbm34 (ENSPNAG00000002639) tbce (ENSPNAG00000013216) NID1 (ENSPNAG00000002616) ero1b (ENSPNAG00000013189) GPR137B (ENSPNAG00000013091) ENSPNAG00000013040 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 17 GTPBP2 (ENSAMXG00000038826) OTOR (ENSAMXG00000035535) pcsk2 (ENSAMXG00000038222) BFSP1 (ENSAMXG00000040313) ENSAMXG00000003741 ENSAMXG00000003731 dnajc12 (ENSAMXG00000043714) cox5b2 (ENSAMXG00000003723) gpatch11 (ENSAMXG00000043007) eif2ak2 (ENSAMXG00000003716) 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HNRNPLL (ENSCARG00000009600) ATL2 (ENSCARG00000010128) LOXL4 (ENSCARG00000011112) ENSCARG00000011134 FILIP1L (ENSCARG00000011137) ENSCARG00000011143 ENSCARG00000011147 ENSCARG00000011157 ldb1b (ENSCARG00000011166) ENSCARG00000011219 LOXL4 (ENSCARG00000011234) ATL2 (ENSCARG00000011283) ENSCARG00000011393 Goldfish MODERN SPECIES 1495 tomm20b (ENSCARG00000042392) #22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 348 ENSGT00950000183137.a.l ENSGT00390000005639.a.b.d.b.b ENSGT01000000219139 ENSGT00390000005639.a.b.d.b.a.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292.v.b ENSGT01100000263476.E.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00390000016988.a.a.a.a.b ENSGT00940000155037 ENSGT01100000263524.G.f.b ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000166218.d ENSGT00940000166218.c.a ENSGT00940000160591.a.a.b ENSGT00390000011698.c.a.b.n #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a.ab ENSGT00940000156318.b.b.m ENSGT00940000156318.b.b.n ENSGT00940000153986.b.a.u.b Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 13 tk1 (ENSCCRG00000036374) ENSCCRG00000038287 ldb1b (ENSCCRG00000075309) ENSCCRG00000067968 ENSCCRG00000045296 ENSCCRG00000031895 pfklb (ENSCCRG00000031972) ENSCCRG00000047598 ENSCCRG00000010733 zgc:171772 (ENSCCRG00000010731) eif4a3 (ENSCCRG00000021863) opn6a (ENSCCRG00000075563) strn (ENSCCRG00000044182) map1lc3c (ENSCCRG00000066841) irf2bp2b (ENSCCRG00000072833) tomm20b (ENSCCRG00000061925) #22 rbm34 (ENSCCRG00000011466) tbce (ENSCCRG00000003697) ENSCCRG00000018986 ENSCCRG00000082110 ENSCCRG00000016221 ENSCCRG00000012752 gnb4b (ENSCCRG00000075304) ENSCCRG00000062031 clcn4 (ENSCCRG00000069987) ENSCCRG00000006082 CLASP1 (ENSCCRG00000065112) ENSCCRG00000075985 INHBB (ENSCCRG00000076349) ENSCCRG00000070857 ENSCCRG00000068256 Common carp reference MODERN SPECIES 42 TMC6 (ENSCCRG00000051089) TMC8 (ENSCCRG00000072909) ENSCCRG00000073842 syngr2b (ENSCCRG00000036364) tk1 (ENSCCRG00000047295) cant1b (ENSCCRG00000015933) ENSCCRG00000007932 si:dkey-93h22.8 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ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a ENSGT00390000006176 ENSGT00940000153568.A ENSGT00940000155704 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A ENSGT00940000158149.z.a.b ENSGT00940000158149.z.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b.o.a #22 ENSGT00940000160591.a.b ENSGT00940000163863 ENSGT00940000160736 ENSGT00940000180148 ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000159330 ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000008808.r.b ENSGT00390000006408 ENSGT00950000182886.b.a.a ENSGT00390000007214 ENSGT00390000016400 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 266 ENSGT00940000157952 ENSGT00940000180095 ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a.d ENSGT00940000157388.b.a.c ENSGT00940000155704.cc ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a 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ENSGT00940000163863 ENSGT00940000180148 ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b.e ENSGT00940000159330 ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000008808.r.b ENSGT00390000006408.ac ENSGT00950000182886.b.a.a ENSGT00390000007214 ENSGT00390000016400 ENSGT00940000166212.a.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000163461.a.a.a.b.c.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00530000064165.b ENSGT00940000157952.e.b ENSGT00940000180095 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A.e.a ENSGT00940000156562 ENSGT00940000153498.A.z.a ENSGT00940000158149.z.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b.o.a #22 ENSGT00940000160591.a.b.i ENSGT00940000163863 ENSGT00940000180148 ENSGT00440000039029 ENSGT00390000006205.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.b.e.a ENSGT00940000159330 ENSGT01100000263524.G.f.a ENSGT00940000156258.f.a ENSGT00390000008808.r.b ENSGT00390000006408.ac 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cfl1l (ENSSTUG00000031537) River trout MODERN SPECIES 1 mrpl2 (ENSSTUG00000034359) ENSSTUG00000034357 ENSSTUG00000034351 ENSSTUG00000034348 KLHDC3 (ENSSTUG00000034316) ENSSTUG00000034298 disc1 (ENSSTUG00000034270) tsnax (ENSSTUG00000034255) EGLN1 (ENSSTUG00000034168) ENSSTUG00000034162 ENSSTUG00000034157 ENSSTUG00000034138 #22 tomm20a (ENSSTUG00000034127) #22 ENSSTUG00000034121 #22 irf2bp2a (ENSSTUG00000034116) ENSSTUG00000033344 ENSSTUG00000033322 memo1 (ENSSTUG00000033308) ENSSTUG00000033296 BTBD3 (ENSSTUG00000033282) sptlc3 (ENSSTUG00000033268) ENSSTUG00000033262 ENSSTUG00000033256 ENSSTUG00000033248 ENSSTUG00000033217 ENSSTUG00000031955 MYH6 (ENSSTUG00000031561) Salmo ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00530000064165.b ENSGT00940000175152 ENSGT00940000157952.e.b ENSGT00530000069620 ENSGT00390000018683 ENSGT00390000008459 ENSGT00940000157388.b.a.d ENSGT00940000153986.b.a.u.a ENSGT00940000156318.b.a ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A.e.a ENSGT00940000156562 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ENSGT00530000063405.a.y ENSGT00530000063405.a.z.c ENSGT00940000154063.C.a.a.b.i.a ENSGT00940000156318.b.b.g ENSGT00940000163301.c.a.a.a.g.a ENSGT00940000153986.b.a.u.b.b.b ENSGT00390000007753.a.m.a ENSGT00940000156461.o.a ENSGT00390000004881.ac.b ENSGT00390000014687.c ENSGT00940000162838.g.a.c.a ENSGT00390000007046.a.e.a ENSGT00940000170452 ENSGT00390000012248.i ENSGT00390000004284.f.f Coho salmon MODERN SPECIES 12 TMEM63B (ENSOKIG00005012507) ENSOKIG00005013822 srd5a2a (ENSOKIG00005013836) ENSOKIG00005013851 psen2 (ENSOKIG00005013858) dpy30 (ENSOKIG00005013888) ENSOKIG00005013900 spast (ENSOKIG00005013940) ENSOKIG00005015219 CAT (ENSOKIG00005015254) opn6a (ENSOKIG00005015360) ENSOKIG00005015365 STRN (ENSOKIG00005015455) map1lc3c (ENSOKIG00005016789) IRF2BP2 (ENSOKIG00005016797) ENSOKIG00005016815 #22 ENSOKIG00005016880 rbm34 (ENSOKIG00005016889) ENSOKIG00005017025 NID1 (ENSOKIG00005018875) ENSOKIG00005019441 ENSOKIG00005019643 ero1b (ENSOKIG00005019669) ENSOKIG00005019773 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ENSGT00940000166657.b ENSGT00390000010591.l ENSGT00390000012248.i River trout MODERN SPECIES 31 ENSSTUG00000049349 ENSSTUG00000049342 srd5a2a (ENSSTUG00000049340) psen2 (ENSSTUG00000049336) dpy30 (ENSSTUG00000049321) spast (ENSSTUG00000049253) ENSSTUG00000049235 ENSSTUG00000049232 ENSSTUG00000049229 cat (ENSSTUG00000048451) opn6a (ENSSTUG00000048369) ENSSTUG00000048358 strn (ENSSTUG00000047925) map1lc3c (ENSSTUG00000047868) IRF2BP2 (ENSSTUG00000047858) ENSSTUG00000047833 #22 rbm34 (ENSSTUG00000047825) tbce (ENSSTUG00000047815) ENSSTUG00000046057 NID1 (ENSSTUG00000045544) ENSSTUG00000045461 ENSSTUG00000045441 ENSSTUG00000045428 ero1b (ENSSTUG00000045370) ENSSTUG00000045356 esf1 (ENSSTUG00000045309) ndufaf5 (ENSSTUG00000045298) KIF16B (ENSSTUG00000045176) snrpb2 (ENSSTUG00000045143) ENSSTUG00000045138 ENSSTUG00000045128 Huchen MODERN SPECIES 240 ENSHHUG00000041536 #22 rbm34 (ENSHHUG00000041566) ENSHHUG00000041585 ENSHHUG00000041596 ENSHHUG00000041619 NID1 (ENSHHUG00000042793) 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Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000160148 ENSGT01100000263871 ENSGT00950000182886.b.a.b ENSGT00940000157923 ENSGT00390000008808.r.a ENSGT00970000197675 ENSGT00940000156258.f.b ENSGT01100000263524.G.f.b ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b.o.b #22 ENSGT00530000063405.a.z ENSGT00390000011698.c.a.b.p #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a.y ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00390000004881 ENSGT00390000014687 ENSGT00940000162838.g.a ENSGT00390000007046.a ENSGT00940000170452 ENSGT00990000212397 ENSGT00390000010591 ENSGT00390000012248 ENSGT00390000004284.f ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000009597.d Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.b.p #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT01100000263474.a.b.a.b.a.c.a.a.b ENSGT00950000183154.a.a ENSGT00940000157084.e.a.`b.a ENSGT01100000263871.b.b ENSGT00950000182886.b.a.b.l ENSGT00940000157923.e ENSGT00390000008808.r.a.d ENSGT00970000197675 ENSGT00940000156258.f.b.b ENSGT00950000182857.a.b.m ENSGT00390000018100.y.b.a ENSGT01100000263524.G.f.b.g ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a.j ENSGT00940000166218.i ENSGT00940000160591.a.a.d ENSGT00390000011698.c.a.b.p #22 ENSGT00940000154063.C.a.a.b.i.a ENSGT00940000156318.b.b.g ENSGT00940000163301.c.a.a.a.g.a ENSGT00940000153986.b.a.u.b.b.b ENSGT00390000007753.a.m.a ENSGT00940000156461.o.a ENSGT00390000004881.ac.b ENSGT00390000014687.c ENSGT00940000162838.g.a.c.a ENSGT00390000007046.a.e.a ENSGT00940000170452 ENSGT00940000166657.b ENSGT00390000010591.l ENSGT00390000012248.i ENSGT00390000004284.f.f Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011698.c.a.b.p #22 Atlantic salmon MODERN SPECIES 11 ENSSSAG00000043147 jag1a (ENSSSAG00000043209) s5a2 (ENSSSAG00000044549) psen2 (ENSSSAG00000044602) dpy30 (ENSSSAG00000044712) spast (ENSSSAG00000044816) ENSSSAG00000046528 ENSSSAG00000085838 ENSSSAG00000046626 opn6a (ENSSSAG00000046862) ENSSSAG00000046866 ENSSSAG00000046942 ENSSSAG00000096147 mlp3c (ENSSSAG00000049637) i2b2a (ENSSSAG00000049651) ENSSSAG00000049666 #22 rbm34 (ENSSSAG00000049698) ENSSSAG00000049716 ENSSSAG00000049802 ENSSSAG00000099849 NID1 (ENSSSAG00000051642) ENSSSAG00000051769 ENSSSAG00000111690 ero1b (ENSSSAG00000051854) btbd3 (ENSSSAG00000069147) ENSSSAG00000103440 ENSSSAG00000052501 ENSSSAG00000052530 ENSSSAG00000052734 RU2B (ENSSSAG00000053481) ENSSSAG00000114042 Huchen MODERN SPECIES 9260 ENSHHUG00000037544 #22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793.a.a ENSGT00550000074953 ENSGT00940000165311.b ENSGT00940000162755 ENSGT00500000045018 ENSGT00940000154987.i.b.a.b ENSGT00940000155129.B Cod MODERN SPECIES 16 ENSGMOG00000005330 ENSGMOG00000028750 ENSGMOG00000025710 ndufaf5 (ENSGMOG00000028014) ENSGMOG00000033633 ENSGMOG00000023431 ENSGMOG00000015595 esf1 (ENSGMOG00000015619) btbd3a (ENSGMOG00000024273) ENSGMOG00000034085 ENSGMOG00000018360 ENSGMOG00000023670 strn (ENSGMOG00000010979) map1lc3c (ENSGMOG00000011624) ENSGMOG00000011645 tomm20b (ENSGMOG00000011662) #22 rbm34 (ENSGMOG00000011683) tbce (ENSGMOG00000011693) ENSGMOG00000015682 ENSGMOG00000011702 ENSGMOG00000014468 ENSGMOG00000005563 psen2 (ENSGMOG00000011816) ENSGMOG00000011824 spast (ENSGMOG00000011826) ENSGMOG00000011837 ENSGMOG00000024413 ENSGMOG00000025638 RBBP9 (ENSGMOG00000000207) polr3f (ENSGMOG00000000206) dzank1 (ENSGMOG00000029126) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000009597.d ENSGT00940000156530.c.ab ENSGT00940000156530.c.`b.a ENSGT00390000004284.f ENSGT00390000012248 ENSGT00390000010591 ENSGT00940000170452 ENSGT00390000007046.a ENSGT00940000162838.g.a ENSGT00390000014687 ENSGT00390000004881 ENSGT00940000167000 ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00940000153566.b ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160148 ENSGT01100000263621 ENSGT00940000176873 ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793.a.a Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 6 ENSMMDG00005024153 ntpcr (ENSMMDG00005024152) ENSMMDG00005024150 SIPA1L2 (ENSMMDG00005024147) ENSMMDG00005024146 tsnax (ENSMMDG00005024144) EGLN1 (ENSMMDG00005024141) gpr137ba (ENSMMDG00005024139) NID1 (ENSMMDG00005024071) LYST (ENSMMDG00005020666) GNG4 (ENSMMDG00005020395) b3galnt2 (ENSMMDG00005020272) ggps1 (ENSMMDG00005020256) ENSMMDG00005020252 ENSMMDG00005020249 tomm20b (ENSMMDG00005020244) #22 irf2bp2a (ENSMMDG00005020235) ENSMMDG00005020231 ENSMMDG00005020227 eif2ak2 (ENSMMDG00005020153) gpatch11 (ENSMMDG00005020140) HEATR5B (ENSMMDG00005018430) STRN (ENSMMDG00005017892) VIT (ENSMMDG00005017862) ENSMMDG00005017857 SPAST (ENSMMDG00005017342) memo1 (ENSMMDG00005017324) srd5a2b (ENSMMDG00005017315) mkks (ENSMMDG00005017308) slx4ip (ENSMMDG00005017306) jag1b (ENSMMDG00005014679) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES ACTR2 (ENSMMDG00005008542) SPRED2 (ENSMMDG00005008521) ENSMMDG00005008505 ENSMMDG00005008491 ppp3r1b (ENSMMDG00005008478) cnrip1a (ENSMMDG00005008472) ENSMMDG00005008468 snrpb2 (ENSMMDG00005008460) ENSMMDG00005008402 ndufaf5 (ENSMMDG00005008365) esf1 (ENSMMDG00005008361) ENSMMDG00005008307 strn (ENSMMDG00005007845) map1lc3c (ENSMMDG00005007826) irf2bp2b (ENSMMDG00005007824) ENSMMDG00005007822 #22 ENSMMDG00005007820 rbm34 (ENSMMDG00005007819) tbce (ENSMMDG00005007817) NID1 (ENSMMDG00005007354) ENSMMDG00005007337 ero1b (ENSMMDG00005006448) gtpbp2b (ENSMMDG00005006402) tp53bp2b (ENSMMDG00005006382) ncapd3 (ENSMMDG00005006117) ENSMMDG00005006093 ENSMMDG00005006090 ENSMMDG00005006087 ENSMMDG00005006085 ENSMMDG00005006082 ENSMMDG00005006079 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000156530.c.ab ENSGT01030000235154 ENSGT00940000156530.c.`b.a ENSGT00390000004284.f ENSGT00390000012248 ENSGT00390000010591 ENSGT00940000170452 ENSGT00390000007046.a ENSGT00940000162838.g.a ENSGT00390000014687 ENSGT00390000004881 ENSGT00940000167000 ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160148 ENSGT01100000263621 ENSGT00940000176873 ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793.a.a ENSGT00550000074953 ENSGT00940000165311.b Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 389 tpcn3 (ENSHCOG00000010437) pgap4 (ENSHCOG00000000321) rbm34 (ENSHCOG00000010393) tbce (ENSHCOG00000010369) ero1b 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(ENSPNYG00000004989) #22 rbm34 (ENSPNYG00000004970) tbce (ENSPNYG00000005013) NID1 (ENSPNYG00000005036) GPR137B (ENSPNYG00000005097) ero1b (ENSPNYG00000005134) ddt (ENSPNYG00000005145) chchd10 (ENSPNYG00000005156) ENSPNYG00000005202 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000158356 ENSGT00940000160772 ENSGT00940000174164 ENSGT00940000168028 ENSGT00940000165127.a ENSGT00390000008711.h ENSGT00940000178757 ENSGT00940000157807.g.b ENSGT00390000003751.a ENSGT00940000156001.c ENSGT00940000153576.c.a.a.b ENSGT00940000165861 ENSGT00390000005096 ENSGT01020000230351.B.j.a ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b.a.a ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000163205.d.b ENSGT00940000166931 ENSGT00940000161345 ENSGT00940000158942.a ENSGT00950000183012.A.b ENSGT00510000052942 ENSGT00510000052596.b ENSGT01030000234627.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000155484.b ENSGT00390000009223 Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 622 ENSMZEG00005010119 ENSMZEG00005010111 tomm20b (ENSMZEG00005010104) #22 rbm34 (ENSMZEG00005010091) Zebra mbuna MODERN SPECIES 269 ENSMZEG00005021594 tomm20b (ENSMZEG00005021590) #22 rbm34 (ENSMZEG00005021586) tbce (ENSMZEG00005021582) NID1 (ENSMZEG00005021580) GPR137B (ENSMZEG00005021574) ero1b (ENSMZEG00005021555) Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 141 ENSACLG00000026323 #22 rbm34 (ENSACLG00000026337) tbce (ENSACLG00000026359) NID1 (ENSACLG00000026381) Eastern happy MODERN SPECIES 18 ENSACLG00000017600 ENSACLG00000017613 ENSACLG00000017678 ENSACLG00000017800 ENSACLG00000017809 ENSACLG00000017914 ENSACLG00000017924 tmx2b (ENSACLG00000017930) zdhhc5a (ENSACLG00000017981) slc43a1b (ENSACLG00000018013) ENSACLG00000018125 pold4 (ENSACLG00000018341) p2rx3b (ENSACLG00000018368) ENSACLG00000018432 irf2bp2b (ENSACLG00000018448) tomm20b (ENSACLG00000018460) #22 rbm34 (ENSACLG00000018471) tbce (ENSACLG00000018483) NID1 (ENSACLG00000018528) GPR137B (ENSACLG00000018600) ero1b (ENSACLG00000018651) gstt1b (ENSACLG00000018766) ddt (ENSACLG00000019041) gstt1b (ENSACLG00000019064) chchd10 (ENSACLG00000019377) ENSACLG00000019396 ENSACLG00000019413 ENSACLG00000019424 ENSACLG00000019452 vps37c (ENSACLG00000019481) ENSACLG00000019497 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 254 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2618 tomm20b (ENSSPAG00000010163) #22 rbm34 (ENSSPAG00000010174) tbce (ENSSPAG00000010192) Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 284 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a.q Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 309 ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a.q ENSGT00940000156318.b.b.d ENSGT01010000223313 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2946 tomm20b (ENSAOCG00000006120) #22 rbm34 (ENSAOCG00000006146) ENSAOCG00000006154 Orange clownfish MODERN SPECIES 17 btbd3a (ENSAPEG00000022414) acaa1 (ENSAPEG00000022396) esf1 (ENSAPEG00000022385) ndufaf5 (ENSAPEG00000022351) gas8 (ENSAPEG00000022335) KIF16B (ENSAPEG00000022252) snrpb2 (ENSAPEG00000022231) prokr1a (ENSAPEG00000022223) APLF (ENSAPEG00000022214) ENSAPEG00000022203 fbxo48 (ENSAPEG00000022199) cnrip1a (ENSAPEG00000022193) ENSAPEG00000022167 IRF2BP2 (ENSAPEG00000022150) ENSAPEG00000022141 tomm20b (ENSAPEG00000022117) #22 rbm34 (ENSAPEG00000022105) tbce (ENSAPEG00000022075) ENSAPEG00000022052 ENSAPEG00000022037 NID1 (ENSAPEG00000021990) ENSAPEG00000021969 ENSAPEG00000021952 JAG1 (ENSAPEG00000021693) ENSAPEG00000021655 ENSAPEG00000021650 zdhhc5a (ENSAPEG00000021635) tmx2b (ENSAPEG00000021613) ENSAPEG00000021590 kdm2aa (ENSAPEG00000021461) stx3a (ENSAPEG00000021427) Spiny chromis MODERN SPECIES 2149 tomm20b (ENSAPOG00000016690) #22 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000156167.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000168028 ENSGT00940000165127.a ENSGT00390000013973.A.a.c.b.a ENSGT00390000008711.h ENSGT01100000263483.E.b.b ENSGT00940000157807.g.b ENSGT00390000003751.a ENSGT00940000156001.c ENSGT00940000153576.c.a.a.b ENSGT00940000165861 ENSGT00390000005096 ENSGT01020000230351.B.j.a ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160148 ENSGT01100000264278 ENSGT00940000176873 ENSGT00940000154922.a ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.f ENSGT00940000155710.b ENSGT00940000157560.d.a Oryzias ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160148 ENSGT01100000264278 ENSGT00940000176873 ENSGT00940000154922.a ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.f ENSGT00940000155710.b ENSGT00940000157560.d.a ENSGT00950000182772.A.b ENSGT00940000163836.a ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793.a.a ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00390000002789 ENSGT00940000177040 ENSGT00530000067736 ENSGT00770000121010 ENSGT00940000166495 ENSGT00390000007529 ENSGT00550000074956 ENSGT00940000157824.i.a ENSGT00940000153408.B.s.b ENSGT00940000158659 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160148 ENSGT01100000264278 ENSGT00940000176873 ENSGT00940000154922.a ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.f ENSGT00940000155710.b ENSGT00940000157560.d.a ENSGT00950000182772.A.b ENSGT00940000163836.a ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793.a.a ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00390000002789 ENSGT00940000177040 ENSGT00530000067736 ENSGT00770000121010 ENSGT00940000166495 ENSGT00390000007529 ENSGT00550000074956 ENSGT00940000157824.i.a ENSGT00940000153408.B.s.b ENSGT00940000158659 Chinese medaka MODERN SPECIES 744 tp53bp2b (ENSOSIG00000020538) RRP36 (ENSOSIG00000020536) JAG1 (ENSOSIG00000020506) ENSOSIG00000020481 ENSOSIG00000020480 slc22a7a (ENSOSIG00000020477) ATL2 (ENSOSIG00000020415) HNRNPLL (ENSOSIG00000020394) ENSOSIG00000020386 ENSOSIG00000017859 ENSOSIG00000017656 ENSOSIG00000017650 rcor3 (ENSOSIG00000017647) kcnh1b (ENSOSIG00000017571) IRF2BP2 (ENSOSIG00000017566) tomm20b (ENSOSIG00000017562) #22 rbm34 (ENSOSIG00000017558) tbce (ENSOSIG00000017552) NID1 (ENSOSIG00000017538) GPR137B (ENSOSIG00000017526) ero1b (ENSOSIG00000017048) ENSOSIG00000017026 ENSOSIG00000016545 cct4 (ENSOSIG00000016484) ENSOSIG00000016472 XPO1 (ENSOSIG00000015991) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES ENSORLG00000025624 slc22a7a (ENSORLG00000000981) HNRNPLL (ENSORLG00000001005) ENSORLG00000001049 ENSORLG00000001076 ENSORLG00000001087 ENSORLG00000001109 rcor3 (ENSORLG00000001117) ENSORLG00000001160 ENSORLG00000022684 ENSORLG00000024338 hist1h2a11 (ENSORLG00000024975) ENSORLG00000030596 ENSORLG00000029583 ENSORLG00000001201 tomm20b (ENSORLG00000029910) #22 rbm34 (ENSORLG00000001221) tbce (ENSORLG00000001253) NID1 (ENSORLG00000001273) ENSORLG00000001277 ENSORLG00000026620 ENSORLG00000001294 ero1b (ENSORLG00000001316) ENSORLG00000024877 H4C7 (ENSORLG00000026225) ENSORLG00000023073 ENSORLG00000027975 ENSORLG00000028520 ltv1 (ENSORLG00000001375) ENSORLG00000029695 ifngr1 (ENSORLG00000001387) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160148 ENSGT01100000264278 ENSGT00940000176873 ENSGT00940000154922.a ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.f ENSGT00940000155710.b ENSGT00940000157560.d.a ENSGT00950000182772.A.b ENSGT00940000163836.a ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793.a.a ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00390000002789 ENSGT00940000177040 ENSGT00530000067736.a ENSGT00770000121010 ENSGT00940000166495 ENSGT00390000007529 ENSGT00550000074956 ENSGT00940000157824.i.a ENSGT00940000153408.B.s.b ENSGT00940000158659 Indian medaka MODERN SPECIES 21 slc22a7a (ENSOMEG00000008469) HNRNPLL (ENSOMEG00000008453) ATL2 (ENSOMEG00000008420) ENSOMEG00000008324 ENSOMEG00000008260 ENSOMEG00000008226 rcor3 (ENSOMEG00000000661) kcnh1b (ENSOMEG00000008109) ENSOMEG00000008067 ENSOMEG00000008062 H2BC7 (ENSOMEG00000008050) ENSOMEG00000008040 ENSOMEG00000008032 ENSOMEG00000008013 IRF2BP2 (ENSOMEG00000007959) tomm20b (ENSOMEG00000007937) #22 rbm34 (ENSOMEG00000007902) tbce (ENSOMEG00000007846) NID1 (ENSOMEG00000007786) ENSOMEG00000007765 ero1b (ENSOMEG00000007744) ENSOMEG00000007674 ENSOMEG00000007670 ltv1 (ENSOMEG00000001034) ENSOMEG00000007562 ENSOMEG00000007543 ENSOMEG00000007515 ENSOMEG00000007489 pus10 (ENSOMEG00000007432) cct4 (ENSOMEG00000007401) FAM161A (ENSOMEG00000007369) Javanese ricefish MODERN SPECIES ENSOJAG00000015267 rcor3 (ENSOJAG00000015116) ENSOJAG00000015082 ENSOJAG00000015060 ENSOJAG00000015045 ENSOJAG00000015018 kcnh1b (ENSOJAG00000014926) ENSOJAG00000014893 ENSOJAG00000014861 ENSOJAG00000014850 ENSOJAG00000014835 ENSOJAG00000014813 ENSOJAG00000014797 ENSOJAG00000014768 IRF2BP2 (ENSOJAG00000014745) tomm20b (ENSOJAG00000014723) #22 rbm34 (ENSOJAG00000014677) tbce (ENSOJAG00000014100) GPR137B (ENSOJAG00000013781) ero1b (ENSOJAG00000013693) ENSOJAG00000013661 ENSOJAG00000013643 ENSOJAG00000013622 ENSOJAG00000013606 ENSOJAG00000013584 ENSOJAG00000013560 ltv1 (ENSOJAG00000013552) ENSOJAG00000013544 ENSOJAG00000013513 ENSOJAG00000013460 ENSOJAG00000013381 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000156167.b ENSGT00390000004697 ENSGT00940000168028 ENSGT00940000165127.a ENSGT00390000013973.A.a.c.b.a ENSGT00390000008711.h ENSGT01100000263483.E.b.b ENSGT00940000157807.g.b ENSGT00390000003751.a ENSGT00940000156001.c ENSGT00940000153576.c.a.a.b ENSGT00940000165861 ENSGT00390000005096 ENSGT01020000230351.B.j.a ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00530000064271 ENSGT01100000264278 ENSGT00940000176873 ENSGT00940000154922.a ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.f ENSGT00940000155710.b ENSGT00950000182772.A.b ENSGT00940000163836.a ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793.a.a Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00940000168028 ENSGT00940000165127.a ENSGT00390000008711.h ENSGT00390000003751.a ENSGT00940000156001.c ENSGT00940000153576.c.a.a.b ENSGT00940000165861 ENSGT00390000005096 ENSGT01020000230351.B.j.a ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00390000007753.a Mangrove rivulus MODERN SPECIES 276 ENSKMAG00000007616 ENSKMAG00000007692 ENSKMAG00000007709 ENSKMAG00000007724 p2rx3b (ENSKMAG00000007737) irf2bp2b (ENSKMAG00000007757) tomm20b (ENSKMAG00000007770) #22 rbm34 (ENSKMAG00000007790) tbce (ENSKMAG00000007819) ero1b (ENSKMAG00000007845) ENSKMAG00000007885 ENSKMAG00000007902 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1617 ENTPD7 (ENSNFUG00015011274) CREBRF (ENSNFUG00015011320) atpv0e2 (ENSNFUG00015011330) HYLS1 (ENSNFUG00015011348) ccdc3b (ENSNFUG00015011363) ZGMRPL4 (ENSNFUG00015011372) ENSNFUG00015011456 mrpl21 (ENSNFUG00015011963) C11H6ORF120 (ENSNFUG00015011970) npepps (ENSNFUG00015012030) MRPL45 (ENSNFUG00015012866) ENSNFUG00015012876 socs7 (ENSNFUG00015012904) ENSNFUG00015012916 sp2 (ENSNFUG00015012924) tomm20b (ENSNFUG00015012928) #22 RBM34 (ENSNFUG00015012947) tbce (ENSNFUG00015012964) glrba (ENSNFUG00015013001) ENSNFUG00015013009 ENSNFUG00015013085 CCSAP (ENSNFUG00015013594) NUP133 (ENSNFUG00015013662) ATL2 (ENSNFUG00015014470) ENSNFUG00015014935 HNRPLL (ENSNFUG00015014956) slc22a7a (ENSNFUG00015015342) ENSNFUG00015015427 ENSNFUG00015015432 rrp36 (ENSNFUG00015015436) tp53bp2b (ENSNFUG00015015450) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156530.c.`b.a ENSGT00390000004284.f ENSGT00390000012248 ENSGT00390000010591 ENSGT00940000170452 ENSGT00390000007046.a ENSGT00940000162838.g.a ENSGT00390000009477.t ENSGT00390000014687 ENSGT00390000004881 ENSGT01030000234626.C ENSGT00940000167000 ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160148 ENSGT01100000263621 ENSGT00940000176873 ENSGT00940000154922.a ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.f ENSGT00940000155710.b ENSGT00940000157560.d.a Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156530.c.`b.a ENSGT00390000004284.f ENSGT00390000012248 ENSGT00390000010591 ENSGT00940000170452 ENSGT00390000007046.a ENSGT00940000162838.g.a ENSGT00390000009477.t ENSGT00390000014687 ENSGT00390000004881 ENSGT01030000234626.C ENSGT00940000167000 ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160148 ENSGT01100000263621 ENSGT00940000176873 ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793.a.a ENSGT00550000074953 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 244 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a Fugu MODERN SPECIES 8 mtif2 (ENSTRUG00000012596) ENSTRUG00000029100 SPTBN1 (ENSTRUG00000012113) ENSTRUG00000012074 kat14 (ENSTRUG00000012026) TMEM63B (ENSTRUG00000022708) ENSTRUG00000033243 dpy30 (ENSTRUG00000011982) psen2 (ENSTRUG00000024631) eif4a3 (ENSTRUG00000011543) SRF (ENSTRUG00000011448) soul4 (ENSTRUG00000020755) tmem178a (ENSTRUG00000011391) ENSTRUG00000030212 irf2bp2b (ENSTRUG00000022397) tomm20a (ENSTRUG00000011255) #22 rbm34 (ENSTRUG00000011172) tbce (ENSTRUG00000011146) ENSTRUG00000033272 ENSTRUG00000027181 ENSTRUG00000032835 ero1b (ENSTRUG00000011019) ENSTRUG00000010886 ENSTRUG00000030871 ENSTRUG00000028140 gtpbp2b (ENSTRUG00000010665) tp53bp2b (ENSTRUG00000010361) rrp36 (ENSTRUG00000021893) ENSTRUG00000023709 map1lc3c (ENSTRUG00000010294) strn (ENSTRUG00000009886) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156530.c.`b.a ENSGT00390000004284.f ENSGT00390000012248 ENSGT00390000010591 ENSGT00940000170452 ENSGT00390000007046.a ENSGT00940000162838.g.a ENSGT00390000009477.t ENSGT00390000014687 ENSGT00390000004881 ENSGT01030000234626.C ENSGT00940000167000 ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160148 ENSGT01100000263621 ENSGT00940000176873 ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793.a.a ENSGT00550000074953 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 1796 tomm20b (ENSLBEG00000022558) #22 rbm34 (ENSLBEG00000022530) Ballan wrasse MODERN SPECIES 795 irf2bp2b (ENSLBEG00000028300) tomm20b (ENSLBEG00000028301) #22 rbm34 (ENSLBEG00000028305) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.i.a.a ENSGT00390000004284.f ENSGT00390000012248 ENSGT00390000010591 ENSGT00940000170452 ENSGT00390000007046.a ENSGT00940000162838.g.a ENSGT00390000009477.t ENSGT00390000014687 ENSGT00390000004881 ENSGT01030000234626.C ENSGT00940000167000 ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.i.a.b ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160148 ENSGT01100000263621 ENSGT00940000176873 ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793.a.a Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.j ENSGT00390000004284.f ENSGT00390000012248 ENSGT00390000010591 ENSGT00940000170452 ENSGT00390000007046.a ENSGT00940000162838.g.a ENSGT00390000009477.t ENSGT00390000014687 ENSGT00390000004881 ENSGT01030000234626.C ENSGT00940000167000 ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.i.a.b ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00940000176873 ENSGT01100000263621 ENSGT00940000160148 ENSGT00530000064271 ENSGT00940000154922.a ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.f ENSGT00940000155710.b Gilthead seabream MODERN SPECIES KIF16B (ENSSAUG00010012862) gas8 (ENSSAUG00010012853) ndufaf5 (ENSSAUG00010012237) esf1 (ENSSAUG00010012175) acaa1 (ENSSAUG00010012141) ENSSAUG00010012133 ENSSAUG00010012126 btbd3a (ENSSAUG00010012119) ENSSAUG00010012116 ENSSAUG00010012113 ENSSAUG00010012110 strn (ENSSAUG00010010507) ENSSAUG00010010500 map1lc3c (ENSSAUG00010010493) irf2bp2b (ENSSAUG00010010489) tomm20b (ENSSAUG00010010484) #22 rbm34 (ENSSAUG00010010478) tbce (ENSSAUG00010010467) NID1 (ENSSAUG00010010447) ENSSAUG00010010445 ENSSAUG00010010444 ENSSAUG00010010443 ENSSAUG00010010437 ENSSAUG00010010434 ero1b (ENSSAUG00010010429) ENSSAUG00010010426 ENSSAUG00010010424 gtpbp2b (ENSSAUG00010010422) tp53bp2b (ENSSAUG00010008937) ENSSAUG00010008910 ENSSAUG00010008907 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000004284.f ENSGT00390000012248 ENSGT00390000010591 ENSGT00940000170452 ENSGT00390000007046.a ENSGT00940000162838.g.a ENSGT00390000009477.t ENSGT00390000014687 ENSGT00390000004881 ENSGT01030000234626.C ENSGT00940000167000 ENSGT00940000162888.A.a.a.b.r.a ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.i.a.b ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160148 ENSGT01100000263621 ENSGT00940000176873 ENSGT00940000154922.a ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.f ENSGT00940000155710.b Large yellow croaker MODERN SPECIES 481 fbxo48 (ENSLCRG00005017784) ENSLCRG00005017783 prokr1a (ENSLCRG00005017781) snrpb2 (ENSLCRG00005017778) KIF16B (ENSLCRG00005017763) gas8 (ENSLCRG00005017751) ndufaf5 (ENSLCRG00005017664) ENSLCRG00005017662 acaa1 (ENSLCRG00005017657) btbd3a (ENSLCRG00005017654) ENSLCRG00005015752 ENSLCRG00005015745 strn (ENSLCRG00005015246) map1lc3c (ENSLCRG00005015235) irf2bp2b (ENSLCRG00005015234) tomm20b (ENSLCRG00005015232) #22 rbm34 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ENSDLAG00005031823 ENSDLAG00005034239 ENSDLAG00005028668 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00390000004284.f ENSGT00390000012248 ENSGT00390000010591 ENSGT00940000170452 ENSGT00390000007046.a ENSGT00940000162838.g.a ENSGT00390000009477.t ENSGT00390000014687 ENSGT00390000004881 ENSGT01030000234626.C ENSGT00940000167000 ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.i.a.b ENSGT00940000155636.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160148 ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.f ENSGT00940000155710.b ENSGT00940000157560.d.a ENSGT00950000182772.A.b ENSGT00940000163836.a Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156530.c.`b.a ENSGT00390000004284.f ENSGT00390000012248 ENSGT00390000010591 ENSGT00940000170452 ENSGT00390000007046.a 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ENSSLUG00000007124 Channel bull blenny MODERN SPECIES fbxo48 (ENSCGOG00000000040) ENSCGOG00000000041 prokr1a (ENSCGOG00000000042) prokr1a (ENSCGOG00000000043) ENSCGOG00000000044 ENSCGOG00000000045 snrpb2 (ENSCGOG00000000046) KIF16B (ENSCGOG00000000047) gas8 (ENSCGOG00000000048) ndufaf5 (ENSCGOG00000000050) esf1 (ENSCGOG00000000051) acaa1 (ENSCGOG00000000052) btbd3a (ENSCGOG00000000053) strn (ENSCGOG00000000054) irf2bp2b (ENSCGOG00000000055) tomm20b (ENSCGOG00000000056) #22 ENSCGOG00000000057 ENSCGOG00000000058 ENSCGOG00000000059 ENSCGOG00000000060 rbm34 (ENSCGOG00000000061) tbce (ENSCGOG00000000062) NID1 (ENSCGOG00000000063) GPR137B (ENSCGOG00000000251) ero1b (ENSCGOG00000000281) ENSCGOG00000000329 ENSCGOG00000000346 ENSCGOG00000000413 gtpbp2b (ENSCGOG00000000439) tp53bp2b (ENSCGOG00000000577) rrp36 (ENSCGOG00000000590) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157824.i.a ENSGT00940000153408.B.s.b ENSGT00940000158659 ENSGT00390000012029 ENSGT00940000155345.r ENSGT01100000263891 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ENSGT00390000014687 ENSGT00390000004881 ENSGT01030000234626.C ENSGT00940000167000 ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000166218 ENSGT00940000160591.a.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00390000011698.c.a.b #22 ENSGT00390000011249 ENSGT00530000063405.a ENSGT00940000156318.b.b ENSGT00940000153986.b.a.u.b ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000155636.b.a ENSGT00940000153463.b.b ENSGT00530000064271 ENSGT00940000160148 ENSGT01100000263621 ENSGT00940000176873 ENSGT00940000154922.a.f ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.f ENSGT00940000155710.b ENSGT00940000157560.d.a Barramundi perch MODERN SPECIES 432 ENSLCAG00010012111 snrpb2 (ENSLCAG00010012100) KIF16B (ENSLCAG00010011982) gas8 (ENSLCAG00010011928) ndufaf5 (ENSLCAG00010011921) ENSLCAG00010011914 ENSLCAG00010011908 acaa1 (ENSLCAG00010011755) btbd3a (ENSLCAG00010011741) esf1 (ENSLCAG00010011734) strn (ENSLCAG00010011653) map1lc3c (ENSLCAG00010011602) irf2bp2b (ENSLCAG00010011595) ENSLCAG00010011579 ENSLCAG00010011572 tomm20b 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