Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 126 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a #22 Glires ANCESTRAL SPECIES 124 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000001731 ENSGT00390000001654 ENSGT00390000001618 ENSGT00390000000378.d.b ENSGT00940000156839 ENSGT00390000018351 ENSGT00940000162087 ENSGT00940000154612.n ENSGT00940000156515 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A ENSGT00940000158891 ENSGT00940000158897 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a #22 ENSGT00940000153612.B ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a #22 Rat MODERN SPECIES 11 Bcas2 (ENSRNOG00000018783) #7 ENSRNOG00000067127 #8 Trim33 (ENSRNOG00000018946) #9 Rbis (ENSRNOG00000038902) #10 Syt6 (ENSRNOG00000019163) #11 Olfml3 (ENSRNOG00000019211) #12 Hipk1 (ENSRNOG00000019333) #13 Dclre1b (ENSRNOG00000019367) #14 Ap4b1 (ENSRNOG00000019455) #15 Bcl2l15 (ENSRNOG00000037149) #16 Ptpn22 (ENSRNOG00000019614) #17 Rsbn1 (ENSRNOG00000019671) #18 Phtf1 (ENSRNOG00000019785) #19 Magi3 (ENSRNOG00000019885) #20 AABR07012763.1 (ENSRNOG00000057707) #21 Rplp0l1 (ENSRNOG00000031358) #22 Lrig2 (ENSRNOG00000019957) #23 Slc16a1 (ENSRNOG00000019996) #24 Tafa3 (ENSRNOG00000030253) #25 Ppm1j (ENSRNOG00000012481) #26 Rhoc (ENSRNOG00000012630) #27 Mov10 (ENSRNOG00000012946) #28 Capza1 (ENSRNOG00000013538) #29 St7l (ENSRNOG00000014002) #30 Wnt2b (ENSRNOG00000014385) #31 Cttnbp2nl (ENSRNOG00000014479) #32 ENSRNOG00000068611 #33 ENSRNOG00000066674 #34 Kcnd3 (ENSRNOG00000014686) #35 Ddx20 (ENSRNOG00000015274) #36 Inka2 (ENSRNOG00000015691) #37 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 109 Unc119b (ENSJJAG00000024182) ENSJJAG00000018770 ENSJJAG00000021885 Pop5 (ENSJJAG00000001080) Rnf10 (ENSJJAG00000018379) Coq5 (ENSJJAG00000021649) ENSJJAG00000020596 ENSJJAG00000009686 Srsf9 (ENSJJAG00000013374) Gatc (ENSJJAG00000000369) ENSJJAG00000017654 Cox6a1 (ENSJJAG00000022385) ENSJJAG00000010463 Sirt4 (ENSJJAG00000018872) ENSJJAG00000024166 ENSJJAG00000013250 #22 Gcn1 (ENSJJAG00000018574) Rab35 (ENSJJAG00000010646) Bicdl1 (ENSJJAG00000014990) Cit (ENSJJAG00000021797) ENSJJAG00000003437 Tmem233 (ENSJJAG00000023958) Ccdc60 (ENSJJAG00000016522) Hspb8 (ENSJJAG00000024220) Srrm4 (ENSJJAG00000016448) ENSJJAG00000000401 ENSJJAG00000021003 ENSJJAG00000024022 Pebp1 (ENSJJAG00000018822) Wsb2 (ENSJJAG00000021913) Rfc5 (ENSJJAG00000018010) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000001731 ENSGT00390000001654 ENSGT00390000001618 ENSGT00390000000378.d.b.l ENSGT00940000156839 ENSGT00390000018351 ENSGT00940000162087 ENSGT00940000154612.n ENSGT00940000156515 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A ENSGT00940000158891 ENSGT00940000158897 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a #22 ENSGT00940000153612.B ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000012331 ENSGT00390000001731 ENSGT00390000001654.j ENSGT00390000001618 ENSGT00390000000378.d.b.l ENSGT00940000156839 ENSGT00390000018351 ENSGT00940000162087 ENSGT00940000154612.n ENSGT00940000156515 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A ENSGT00940000158891 ENSGT00940000158897 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a #22 ENSGT00940000153612.B ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000163122 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072.j Marmotini DUPLICATION Marmotini ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00390000012331 ENSGT00390000001731 ENSGT00390000001654.j ENSGT00390000001618 ENSGT00390000000378.d.b.l ENSGT00940000156839 ENSGT00390000018351 ENSGT00940000162087 ENSGT00940000154612.n ENSGT00940000156515 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A ENSGT00940000158891 ENSGT00940000158897 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a.a #22 ENSGT00940000153612.B ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00530000063869.B ENSGT00910000144226 ENSGT00390000003682 Marmotini_b DUPLICATION Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00390000012331 ENSGT00390000001731 ENSGT00390000001654.j ENSGT00390000001618 ENSGT00390000000378.d.b.l ENSGT00940000156839 ENSGT00390000018351 ENSGT00940000162087 ENSGT00940000154612.n ENSGT00940000156515 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A ENSGT00940000158891 ENSGT00940000158897 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a.a.a #22 ENSGT00940000153612.B ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00530000063869.B ENSGT00910000144226 ENSGT00390000003682 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 290 POP5 (ENSUPAG00010016859) RNF10 (ENSUPAG00010016864) COQ5 (ENSUPAG00010016972) ENSUPAG00010016987 DYNLL1 (ENSUPAG00010016994) SRSF9 (ENSUPAG00010016997) GATC (ENSUPAG00010017011) TRIAP1 (ENSUPAG00010017017) COX6A1 (ENSUPAG00010017023) MSI1 (ENSUPAG00010017036) ENSUPAG00010017050 PLA2G1B (ENSUPAG00010017052) SIRT4 (ENSUPAG00010017061) PXN (ENSUPAG00010017089) ENSUPAG00010017112 ENSUPAG00010017116 #22 GCN1 (ENSUPAG00010017122) RAB35 (ENSUPAG00010017163) BICDL1 (ENSUPAG00010017174) CIT (ENSUPAG00010017192) PRKAB1 (ENSUPAG00010017447) TMEM233 (ENSUPAG00010017457) CCDC60 (ENSUPAG00010017462) HSPB8 (ENSUPAG00010017480) SRRM4 (ENSUPAG00010017495) SUDS3 (ENSUPAG00010017512) TAOK3 (ENSUPAG00010017547) ENSUPAG00010017559 TRAFD1 (ENSUPAG00010017571) HECTD4 (ENSUPAG00010017636) Squirrel MODERN SPECIES 268 ENSSTOG00000022751 MLEC (ENSSTOG00000003095) ENSSTOG00000027234 POP5 (ENSSTOG00000012577) RNF10 (ENSSTOG00000012565) COQ5 (ENSSTOG00000012560) DYNLL1 (ENSSTOG00000026447) SRSF9 (ENSSTOG00000007344) GATC (ENSSTOG00000025740) TRIAP1 (ENSSTOG00000012553) COX6A1 (ENSSTOG00000023604) MSI1 (ENSSTOG00000009799) PLA2G1B (ENSSTOG00000004258) SIRT4 (ENSSTOG00000009795) ENSSTOG00000014093 ENSSTOG00000011327 #22 GCN1 (ENSSTOG00000014045) RAB35 (ENSSTOG00000014038) BICDL1 (ENSSTOG00000014021) CIT (ENSSTOG00000008634) PRKAB1 (ENSSTOG00000008615) ENSSTOG00000025916 SRRM4 (ENSSTOG00000026642) SUDS3 (ENSSTOG00000024189) TAOK3 (ENSSTOG00000024483) ENSSTOG00000004085 TRAFD1 (ENSSTOG00000005726) HECTD4 (ENSSTOG00000026003) RPL6 (ENSSTOG00000009409) PTPN11 (ENSSTOG00000027384) RPH3A (ENSSTOG00000016262) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a.a.b #22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 52 FAM219B (ENSUPAG00010005524) MPI (ENSUPAG00010005516) SCAMP2 (ENSUPAG00010005507) ULK3 (ENSUPAG00010005489) CPLX3 (ENSUPAG00010005476) LMAN1L (ENSUPAG00010005459) CSK (ENSUPAG00010005432) CYP1A2 (ENSUPAG00010005422) CYP1A1 (ENSUPAG00010005403) EDC3 (ENSUPAG00010005374) CLK3 (ENSUPAG00010005361) ARID3B (ENSUPAG00010005354) ENSUPAG00010005349 UBL7 (ENSUPAG00010005340) SEMA7A (ENSUPAG00010005327) ENSUPAG00010005323 #22 ENSUPAG00010005312 CYP11A1 (ENSUPAG00010005293) ENSUPAG00010005277 STRA6 (ENSUPAG00010005225) ISLR (ENSUPAG00010005217) ISLR2 (ENSUPAG00010005208) PML (ENSUPAG00010005190) STOML1 (ENSUPAG00010005176) LOXL1 (ENSUPAG00010005163) TBC1D21 (ENSUPAG00010005154) INSYN1 (ENSUPAG00010005150) CD276 (ENSUPAG00010005140) NPTN (ENSUPAG00010005109) REC114 (ENSUPAG00010005101) HCN4 (ENSUPAG00010005082) Squirrel MODERN SPECIES 178 FAM131A (ENSSTOG00000021429) CLCN2 (ENSSTOG00000008267) POLR2H (ENSSTOG00000008300) THPO (ENSSTOG00000008312) CHRD (ENSSTOG00000008321) EPHB3 (ENSSTOG00000009427) MAGEF1 (ENSSTOG00000014789) VPS8 (ENSSTOG00000022395) C3orf70 (ENSSTOG00000006003) ENSSTOG00000032120 EHHADH (ENSSTOG00000027701) MAP3K13 (ENSSTOG00000001986) TMEM41A (ENSSTOG00000001995) LIPH (ENSSTOG00000011247) SENP2 (ENSSTOG00000011258) ENSSTOG00000033088 #22 IGF2BP2 (ENSSTOG00000022077) ENSSTOG00000033354 TRA2B (ENSSTOG00000006720) ETV5 (ENSSTOG00000006743) DGKG (ENSSTOG00000006763) ENSSTOG00000029627 CRYGS (ENSSTOG00000027888) TBCCD1 (ENSSTOG00000004471) ENSSTOG00000009449 AHSG (ENSSTOG00000009460) FETUB (ENSSTOG00000012584) HRG (ENSSTOG00000012587) KNG1 (ENSSTOG00000027812) ENSSTOG00000012601 ENSSTOG00000012616 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a.b #22 Alpin marmot MODERN SPECIES 101 MLEC (ENSMMMG00000021005) ENSMMMG00000021011 POP5 (ENSMMMG00000021028) RNF10 (ENSMMMG00000021037) COQ5 (ENSMMMG00000021065) DYNLL1 (ENSMMMG00000021076) SRSF9 (ENSMMMG00000021084) GATC (ENSMMMG00000021090) ENSMMMG00000021094 COX6A1 (ENSMMMG00000021098) MSI1 (ENSMMMG00000021106) PLA2G1B (ENSMMMG00000021113) SIRT4 (ENSMMMG00000021122) ENSMMMG00000021140 ENSMMMG00000021161 ENSMMMG00000021163 #22 GCN1 (ENSMMMG00000021170) RAB35 (ENSMMMG00000021212) BICDL1 (ENSMMMG00000021218) CIT (ENSMMMG00000021230) PRKAB1 (ENSMMMG00000021359) TMEM233 (ENSMMMG00000021361) CCDC60 (ENSMMMG00000021368) HSPB8 (ENSMMMG00000021377) SRRM4 (ENSMMMG00000021383) SUDS3 (ENSMMMG00000021390) TAOK3 (ENSMMMG00000021406) ENSMMMG00000021428 TRAFD1 (ENSMMMG00000021430) HECTD4 (ENSMMMG00000021437) RPL6 (ENSMMMG00000021495) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a.b #22 Squirrel MODERN SPECIES 74 GPATCH3 (ENSSTOG00000015220) GPN2 (ENSSTOG00000015216) SFN (ENSSTOG00000015213) ZDHHC18 (ENSSTOG00000015208) PIGV (ENSSTOG00000021148) ENSSTOG00000031355 ENSSTOG00000022501 RPS6KA1 (ENSSTOG00000004355) HMGN2 (ENSSTOG00000030691) DHDDS (ENSSTOG00000004335) ENSSTOG00000004329 CRYBG2 (ENSSTOG00000025229) UBXN11 (ENSSTOG00000005110) SH3BGRL3 (ENSSTOG00000005087) CEP85 (ENSSTOG00000005057) ENSSTOG00000033310 #22 CATSPER4 (ENSSTOG00000028150) CNKSR1 (ENSSTOG00000020206) ZNF593OS (ENSSTOG00000032687) ZNF593 (ENSSTOG00000022153) C1orf232 (ENSSTOG00000030099) FAM110D (ENSSTOG00000023295) PDIK1L (ENSSTOG00000004995) TRIM63 (ENSSTOG00000004982) SLC30A2 (ENSSTOG00000004955) EXTL1 (ENSSTOG00000022136) PAFAH2 (ENSSTOG00000002899) ENSSTOG00000021708 PAQR7 (ENSSTOG00000003791) AUNIP (ENSSTOG00000003781) MTFR1L (ENSSTOG00000023300) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 17 UNC119B (ENSSVLG00005007337) MLEC (ENSSVLG00005007381) CABP1 (ENSSVLG00005007451) POP5 (ENSSVLG00005007552) RNF10 (ENSSVLG00005007641) COQ5 (ENSSVLG00005007727) DYNLL1 (ENSSVLG00005007794) SRSF9 (ENSSVLG00005007838) GATC (ENSSVLG00005007876) ENSSVLG00005007900 COX6A1 (ENSSVLG00005007927) MSI1 (ENSSVLG00005007951) PLA2G1B (ENSSVLG00005008025) SIRT4 (ENSSVLG00005008089) PXN (ENSSVLG00005008164) ENSSVLG00005008367 #22 GCN1 (ENSSVLG00005008536) ENSSVLG00005008862 BICDL1 (ENSSVLG00005008936) ENSSVLG00005009004 CIT (ENSSVLG00005009150) ENSSVLG00005009745 TMEM233 (ENSSVLG00005009774) CCDC60 (ENSSVLG00005009813) HSPB8 (ENSSVLG00005009960) SRRM4 (ENSSVLG00005009999) SUDS3 (ENSSVLG00005010109) TAOK3 (ENSSVLG00005010141) PEBP1 (ENSSVLG00005010178) ENSSVLG00005010202 VSIG10 (ENSSVLG00005010212) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a #22 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 6127 ENSTSYG00000037292 #22 DHRS2 (ENSTSYG00000007299) JPH4 (ENSTSYG00000005028) AP1G2 (ENSTSYG00000006759) THTPA (ENSTSYG00000006757) ZFHX2 (ENSTSYG00000026013) NGDN (ENSTSYG00000009606) MYH7 (ENSTSYG00000004246) MYH6 (ENSTSYG00000010605) CMTM5 (ENSTSYG00000006244) IL25 (ENSTSYG00000006243) EFS (ENSTSYG00000010826) SLC22A17 (ENSTSYG00000032744) BCL2L2 (ENSTSYG00000033996) PPP1R3E (ENSTSYG00000004723) HOMEZ (ENSTSYG00000026061) Tarsier MODERN SPECIES 1188 CHP1 (ENSTSYG00000004064) OIP5 (ENSTSYG00000000873) ENSTSYG00000028174 #22 NUSAP1 (ENSTSYG00000000875) NDUFAF1 (ENSTSYG00000007673) RTF1 (ENSTSYG00000004886)