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SPECIES 10 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.fb.b #12 ENSGT00390000001618.cb #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.m.a #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000166687 ENSGT00940000170510 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT00940000156240 #26 ENSGT00940000154089.b #27 ENSGT00940000161891.l ##28 ENSGT00940000161891.k #28 ENSGT00390000003209 #30 ENSGT00390000018566 #32 ENSGT00950000183174.A #33 ENSGT00530000063869.B #34 ENSGT00910000144226 #35 ENSGT00390000003682.gb.a #36 ENSGT00940000153876.B #37 ENSGT00940000157468.a.b Pecora ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158555.j ##8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618.cb #13 ENSGT00390000000378.d.b.fb.b.c #12 ENSGT00940000156839 #14 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ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.fb.b.c.g #12 ENSGT00390000001618.cb.a #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.m.a.d #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT00940000156240 #26 ENSGT00940000154089.b #27 ENSGT00940000161891.l.d ##28 ENSGT00940000161891.k #28 ENSGT00950000183010.a.b.a.a.a.a.b #29 ENSGT00390000003209 #30 ENSGT00390000018566.n #32 ENSGT01100000263480.a.a.a.a.b.b.b.b ENSGT00950000183174.A #33 ENSGT00530000063869.B #34 ENSGT00910000144226 #35 ENSGT00390000003682.gb.a.d.a.a #36 Domestic yak MODERN SPECIES 7 UNC119B (ENSBGRG00000026410) MLEC (ENSBGRG00000026401) #7 ENSBGRG00000026390 #8 POP5 (ENSBGRG00000026381) #9 RNF10 (ENSBGRG00000026361) #10 COQ5 (ENSBGRG00000026354) #11 ENSBGRG00000026352 #12 SRSF9 (ENSBGRG00000026347) #14 GATC (ENSBGRG00000026344) #15 TRIAP1 (ENSBGRG00000026341) #16 ENSBGRG00000026336 #17 MSI1 (ENSBGRG00000026314) #18 ENSBGRG00000026299 #19 SIRT4 (ENSBGRG00000026294) #20 PXN (ENSBGRG00000026252) #21 RPLP0 (ENSBGRG00000026224) #22 GCN1 (ENSBGRG00000026191) #23 RAB35 (ENSBGRG00000026176) BICDL1 (ENSBGRG00000026169) #25 ALDH2 (ENSBGRG00000026145) #26 MAPKAPK5 (ENSBGRG00000026124) #27 ENSBGRG00000026118 ##28 ENSBGRG00000026113 #28 ENSBGRG00000026110 #29 TMEM116 (ENSBGRG00000026093) #30 ERP29 (ENSBGRG00000026087) #32 ENSBGRG00000026083 NAA25 (ENSBGRG00000026066) #33 TRAFD1 (ENSBGRG00000026052) #34 HECTD4 (ENSBGRG00000020611) #35 ENSBGRG00000020003 #36 Wild yak MODERN SPECIES 410 ENSBMUG00000021423 #7 ENSBMUG00000021407 #8 POP5 (ENSBMUG00000021396) #9 RNF10 (ENSBMUG00000021341) #10 COQ5 (ENSBMUG00000021281) #11 ENSBMUG00000021217 #12 ENSBMUG00000021172 #13 ENSBMUG00000021163 #14 ENSBMUG00000021153 #15 TRIAP1 (ENSBMUG00000021136) #16 ENSBMUG00000021128 #17 MSI1 (ENSBMUG00000021109) #18 PLA2G1B (ENSBMUG00000021087) #19 SIRT4 (ENSBMUG00000021078) #20 ENSBMUG00000021049 #21 RPLP0 (ENSBMUG00000021009) #22 GCN1 (ENSBMUG00000020963) #23 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158555.i.a #8 ENSGT00950000185577 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.fb.b.c #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000163530 ENSGT00940000154612.m.a.d #17 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT00940000156240 #26 ENSGT00940000154089.b #27 ENSGT00940000161891.l.c.a.a ##28 ENSGT00940000161891.l.c.a.b.a.a ##28 ENSGT00940000161891.k #28 ENSGT00390000003209 #30 ENSGT00390000018566.n #32 ENSGT01100000263480.a.a.a.a.b.b.b.b ENSGT00950000183174.A #33 ENSGT00530000063869.B #34 ENSGT00910000144226 #35 ENSGT00390000003682.gb.a.d.a.a #36 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 8 ACADS (ENSBIXG00005004992) UNC119B (ENSBIXG00005028770) MLEC (ENSBIXG00005028736) #7 CABP1 (ENSBIXG00005028677) #8 POP5 (ENSBIXG00005028572) #9 RNF10 (ENSBIXG00005028528) #10 COQ5 (ENSBIXG00005004904) #11 ENSBIXG00005028470 #12 ENSBIXG00005028429 #14 ENSBIXG00005028388 ##17 ENSBIXG00005028363 MSI1 (ENSBIXG00005028333) #18 ENSBIXG00005028230 #19 SIRT4 (ENSBIXG00005028207) #20 PXN (ENSBIXG00005007786) #21 RPLP0 (ENSBIXG00005028020) #22 GCN1 (ENSBIXG00005027905) #23 RAB35 (ENSBIXG00005027772) BICDL1 (ENSBIXG00005027728) #25 ALDH2 (ENSBIXG00005027675) #26 MAPKAPK5 (ENSBIXG00005027614) #27 ENSBIXG00005027590 ##28 ENSBIXG00005027585 ENSBIXG00005027575 ##28 ENSBIXG00005006622 ##28 ENSBIXG00005027508 #28 TMEM116 (ENSBIXG00005027493) #30 ERP29 (ENSBIXG00005027415) #32 NAA25 (ENSBIXG00005027395) #33 ENSBIXG00005027372 TRAFD1 (ENSBIXG00005027354) #34 Cow MODERN SPECIES 8 MLEC (ENSBTAG00000020050) #7 CABP1 (ENSBTAG00000020049) #8 ENSBTAG00000055032 POP5 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VSIG10 (ENSECAG00000002661) WSB2 (ENSECAG00000007479) RFC5 (ENSECAG00000015326) KSR2 (ENSECAG00000004582) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 leopard MODERN SPECIES HTRA2 (ENSPPRG00000007923) LOXL3 (ENSPPRG00000007886) DOK1 (ENSPPRG00000007779) M1AP (ENSPPRG00000007750) SEMA4F (ENSPPRG00000007712) ENSPPRG00000007686 HK2 (ENSPPRG00000007681) ENSPPRG00000020433 POLE4 (ENSPPRG00000007674) TACR1 (ENSPPRG00000007672) EVA1A (ENSPPRG00000007663) MRPL19 (ENSPPRG00000007656) GCFC2 (ENSPPRG00000007643) ENSPPRG00000020405 LRRTM4 (ENSPPRG00000007603) ENSPPRG00000007590 #22 ENSPPRG00000007566 ENSPPRG00000007546 ENSPPRG00000007531 LRRTM1 (ENSPPRG00000020381) CTNNA2 (ENSPPRG00000007522) ENSPPRG00000007459 ENSPPRG00000007449 ENSPPRG00000020355 SUCLG1 (ENSPPRG00000007440) DNAH6 (ENSPPRG00000007406) TRABD2A 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ENSGT00950000183015.A ENSGT00940000154544.a ENSGT00390000010591 ENSGT00390000012248 ENSGT00940000157885 ENSGT00390000004284 ENSGT00940000156530.c ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a.a ##29 ENSGT00390000009597 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000156327 ENSGT00950000183164.E.c.b.b ENSGT00940000156841 ENSGT00910000147398 ENSGT00940000154556 ENSGT00390000017004.a.a.q.a ENSGT00940000154958 ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00940000154186.a ENSGT00940000155337 ENSGT00950000183050.b.b.a ENSGT00390000000583 ENSGT00940000153464.B ENSGT00530000063410.a Dingo MODERN SPECIES 307 GKN1 (ENSCAFG00020000316) GKN2 (ENSCAFG00020000261) BMP10 (ENSCAFG00020000180) ARHGAP25 (ENSCAFG00020000168) PROKR1 (ENSCAFG00020000143) APLF (ENSCAFG00020000129) FBXO48 (ENSCAFG00020000114) PLEK (ENSCAFG00020000109) CNRIP1 (ENSCAFG00020000090) PPP3R1 (ENSCAFG00020027004) PNO1 (ENSCAFG00020027002) DNAAF10 (ENSCAFG00020026999) C1D (ENSCAFG00020026997) ENSCAFG00020026995 ##29 ETAA1 (ENSCAFG00020026994) ENSCAFG00020026992 #22 MEIS1 (ENSCAFG00020026989) ENSCAFG00020026987 ENSCAFG00020026985 SPRED2 (ENSCAFG00020026983) ENSCAFG00020026981 ACTR2 (ENSCAFG00020026978) ENSCAFG00020026973 RAB1A (ENSCAFG00020026971) CEP68 (ENSCAFG00020026969) SLC1A4 (ENSCAFG00020026962) AFTPH (ENSCAFG00020026953) LGALSL (ENSCAFG00020026947) PELI1 (ENSCAFG00020026939) VPS54 (ENSCAFG00020026938) UGP2 (ENSCAFG00020026936) Dog MODERN SPECIES 1 GKN1 (ENSCAFG00845024000) GKN2 (ENSCAFG00845023893) BMP10 (ENSCAFG00845023837) ARHGAP25 (ENSCAFG00845023650) PROKR1 (ENSCAFG00845023574) APLF (ENSCAFG00845023524) FBXO48 (ENSCAFG00845023484) PLEK (ENSCAFG00845023363) CNRIP1 (ENSCAFG00845023282) PPP3R1 (ENSCAFG00845022977) PNO1 (ENSCAFG00845022894) WDR92 (ENSCAFG00845022818) WDR92 (ENSCAFG00845022766) ENSCAFG00845022735 ##29 ETAA1 (ENSCAFG00845022577) ENSCAFG00845022346 #22 MEIS1 (ENSCAFG00845022164) ENSCAFG00845022112 SPRED2 (ENSCAFG00845022023) ACTR2 (ENSCAFG00845021843) ENSCAFG00845021409 ENSCAFG00845021343 RAB1A (ENSCAFG00845021139) CEP68 (ENSCAFG00845021026) SLC1A4 (ENSCAFG00845020925) AFTPH (ENSCAFG00845020600) ENSCAFG00845020543 LGALSL (ENSCAFG00845020462) PELI1 (ENSCAFG00845020350) VPS54 (ENSCAFG00845019815) UGP2 (ENSCAFG00845019476) Red fox MODERN SPECIES 141 ANTXR1 (ENSVVUG00000027689) GKN1 (ENSVVUG00000027676) GKN2 (ENSVVUG00000027671) BMP10 (ENSVVUG00000027668) ARHGAP25 (ENSVVUG00000027661) PROKR1 (ENSVVUG00000027657) APLF (ENSVVUG00000027649) FBXO48 (ENSVVUG00000027647) PLEK (ENSVVUG00000027643) ENSVVUG00000027638 PPP3R1 (ENSVVUG00000027635) PNO1 (ENSVVUG00000027634) WDR92 (ENSVVUG00000027632) C1D (ENSVVUG00000027629) ETAA1 (ENSVVUG00000027624) ENSVVUG00000027618 #22 MEIS1 (ENSVVUG00000027610) ENSVVUG00000027601 SPRED2 (ENSVVUG00000027600) ACTR2 (ENSVVUG00000027598) ENSVVUG00000027596 ENSVVUG00000027593 ENSVVUG00000027592 RAB1A (ENSVVUG00000027588) CEP68 (ENSVVUG00000027585) SLC1A4 (ENSVVUG00000027576) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Giant Panda MODERN SPECIES 1814 ENSAMEG00000026855 #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 274 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00390000013422 ENSGT00940000156738 ENSGT00950000182922.a.a.a.b.b.a.b ENSGT00390000013049 ENSGT00940000155357 ENSGT00940000155962 American black bear MODERN SPECIES 5052 ISL2 (ENSUAMG00000024822) ENSUAMG00000024821 #22 ETFA (ENSUAMG00000024820) ENSUAMG00000024819 Polar bear MODERN SPECIES 479 SCAPER (ENSUMAG00000017597) ENSUMAG00000017716 ENSUMAG00000017738 #22 ETFA (ENSUMAG00000017747) TMEM266 (ENSUMAG00000017765) ENSUMAG00000017772 FBXO22 (ENSUMAG00000017786) UBE2Q2 (ENSUMAG00000017803) TUBGCP5 (ENSUMAG00000017849) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00950000186285 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT01100000263696 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Rabbit MODERN SPECIES 2 FST (ENSOCUG00000004687) ENSOCUG00000011406 ITGA2 (ENSOCUG00000011387) ENSOCUG00000035154 PELO (ENSOCUG00000023902) ITGA1 (ENSOCUG00000011357) ISL1 (ENSOCUG00000027605) ENSOCUG00000021598 PARP8 (ENSOCUG00000014454) EMB (ENSOCUG00000016659) HCN1 (ENSOCUG00000017084) MRPS30 (ENSOCUG00000004207) ENSOCUG00000036050 FGF10 (ENSOCUG00000008499) ENSOCUG00000029125 ENSOCUG00000022901 #22 NNT (ENSOCUG00000001269) ENSOCUG00000002739 C5orf34 (ENSOCUG00000013715) TMEM267 (ENSOCUG00000009355) ENSOCUG00000007934 ENSOCUG00000038605 ENSOCUG00000010243 HMGCS1 (ENSOCUG00000003569) NIM1K (ENSOCUG00000017808) ZNF131 (ENSOCUG00000017804) ENSOCUG00000031479 ENSOCUG00000033003 CCDC152 (ENSOCUG00000003391) GHR (ENSOCUG00000008496) ENSOCUG00000034980 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 67 POLR2H (ENSUPAG00010002737) THPO (ENSUPAG00010002733) CHRD (ENSUPAG00010002655) ENSUPAG00010002644 EPHB3 (ENSUPAG00010002608) MAGEF1 (ENSUPAG00010002606) VPS8 (ENSUPAG00010002273) C3orf70 (ENSUPAG00010002260) ENSUPAG00010002254 ENSUPAG00010002246 ENSUPAG00010002245 MAP3K13 (ENSUPAG00010002192) TMEM41A (ENSUPAG00010002185) LIPH (ENSUPAG00010002143) SENP2 (ENSUPAG00010002084) ENSUPAG00010002075 #22 IGF2BP2 (ENSUPAG00010001983) TRA2B (ENSUPAG00010001968) ENSUPAG00010001933 ETV5 (ENSUPAG00010001897) DGKG (ENSUPAG00010001778) CRYGS (ENSUPAG00010001767) TBCCD1 (ENSUPAG00010001735) DNAJB11 (ENSUPAG00010001712) AHSG (ENSUPAG00010001698) FETUB (ENSUPAG00010001683) HRG (ENSUPAG00010001673) KNG1 (ENSUPAG00010001555) ENSUPAG00010001548 ENSUPAG00010001535 EIF4A2 (ENSUPAG00010001415) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 15 CABP1 (ENSHGLG00000010180) #8 POP5 (ENSHGLG00000011786) #9 RNF10 (ENSHGLG00000010890) #10 ENSHGLG00000044841 COQ5 (ENSHGLG00000038449) #11 ENSHGLG00000034830 DYNLL1 (ENSHGLG00000013536) #12 SRSF9 (ENSHGLG00000038336) #14 GATC (ENSHGLG00000011394) #15 ENSHGLG00000012057 #16 COX6A1 (ENSHGLG00000038002) ##17 MSI1 (ENSHGLG00000040070) #18 PLA2G1B (ENSHGLG00000014412) #19 SIRT4 (ENSHGLG00000014746) #20 PXN (ENSHGLG00000010923) #21 RPLP0 (ENSHGLG00000011358) #22 GCN1 (ENSHGLG00000012548) #23 RAB35 (ENSHGLG00000012703) BICDL1 (ENSHGLG00000014394) #25 CIT (ENSHGLG00000010569) PRKAB1 (ENSHGLG00000007003) TMEM233 (ENSHGLG00000038208) CCDC60 (ENSHGLG00000010014) HSPB8 (ENSHGLG00000011316) SRRM4 (ENSHGLG00000007830) ENSHGLG00000046690 SUDS3 (ENSHGLG00000011951) ENSHGLG00000047298 TAOK3 (ENSHGLG00000011803) ENSHGLG00000010723 VSIG10 (ENSHGLG00000011958) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Guinea pig MODERN SPECIES 17 RANBP17 (ENSCPOG00000005628) GABRP (ENSCPOG00000039299) KCNIP1 (ENSCPOG00000014295) KCNMB1 (ENSCPOG00000036105) LCP2 (ENSCPOG00000002851) FOXI1 (ENSCPOG00000019611) INSYN2B (ENSCPOG00000010850) DOCK2 (ENSCPOG00000010822) SPDL1 (ENSCPOG00000010816) SLIT3 (ENSCPOG00000011591) PANK3 (ENSCPOG00000003340) FBLL1 (ENSCPOG00000025737) RARS1 (ENSCPOG00000007379) WWC1 (ENSCPOG00000011701) TENM2 (ENSCPOG00000000985) ENSCPOG00000035724 #22 MAT2B (ENSCPOG00000002033) HMMR (ENSCPOG00000000878) NUDCD2 (ENSCPOG00000040077) CCNG1 (ENSCPOG00000040311) GABRG2 (ENSCPOG00000002188) GABRA1 (ENSCPOG00000006871) GABRA6 (ENSCPOG00000009693) GABRB2 (ENSCPOG00000015215) ATP10B (ENSCPOG00000015077) ENSCPOG00000011971 SLU7 (ENSCPOG00000004484) FAM200C (ENSCPOG00000040506) C1QTNF2 (ENSCPOG00000002753) CCNJL (ENSCPOG00000034225) FABP6 (ENSCPOG00000025902) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 328 PMEL (ENSODEG00000004214) DGKA (ENSODEG00000004252) PYM1 (ENSODEG00000004289) MMP19 (ENSODEG00000004495) ENSODEG00000004534 DNAJC14 (ENSODEG00000004548) ENSODEG00000004596 ENSODEG00000004608 GDF11 (ENSODEG00000004691) ENSODEG00000004712 CD63 (ENSODEG00000004741) ENSODEG00000004837 ITGA7 (ENSODEG00000004568) METTL7B (ENSODEG00000004695) ENSODEG00000004768 ENSODEG00000004775 #22 ENSODEG00000004697 Degu MODERN SPECIES 103 NDUFB9 (ENSODEG00000005991) MTSS1 (ENSODEG00000005974) ENSODEG00000005940 SQLE (ENSODEG00000005923) WASHC5 (ENSODEG00000005903) NSMCE2 (ENSODEG00000005494) ENSODEG00000005467 ENSODEG00000005440 ENSODEG00000005425 ENSODEG00000005388 LRATD2 (ENSODEG00000019440) ENSODEG00000005362 ENSODEG00000005289 ASAP1 (ENSODEG00000003587) ADCY8 (ENSODEG00000003952) ENSODEG00000003871 #22 Degu MODERN SPECIES 23 ENSODEG00000000146 #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 18 Abce1 (ENSPEMG00000020086) ENSPEMG00000025681 Anapc10 (ENSPEMG00000020210) ENSPEMG00000027237 Hhip (ENSPEMG00000020265) Smarca5 (ENSPEMG00000008060) Gab1 (ENSPEMG00000011664) Usp38 (ENSPEMG00000017993) Inpp4b (ENSPEMG00000005790) Il15 (ENSPEMG00000029894) Zfp330 (ENSPEMG00000022167) Rnf150 (ENSPEMG00000008599) ENSPEMG00000030162 ENSPEMG00000026256 Tbc1d9 (ENSPEMG00000024048) ENSPEMG00000024217 #22 Ucp1 (ENSPEMG00000022488) Elmod2 (ENSPEMG00000028361) Mgat4d (ENSPEMG00000022918) Clgn (ENSPEMG00000023114) Scoc (ENSPEMG00000024835) Or10k2 (ENSPEMG00000027328) Prmt9 (ENSPEMG00000029675) Ndufb7 (ENSPEMG00000010565) Tecr (ENSPEMG00000008519) Dnajb1 (ENSPEMG00000007843) Gipc1 (ENSPEMG00000008496) Ptger1 (ENSPEMG00000027389) Pkn1 (ENSPEMG00000018704) ENSPEMG00000017767 Adgre5 (ENSPEMG00000012912) Northern American deer mouse MODERN SPECIES ENSPEMG00000014499 ENSPEMG00000017498 Gda (ENSPEMG00000009797) Zfand5 (ENSPEMG00000024511) Tmc1 (ENSPEMG00000021043) ENSPEMG00000031397 ENSPEMG00000030997 Aldh1a1 (ENSPEMG00000029294) Anxa1 (ENSPEMG00000014478) Rorb (ENSPEMG00000000824) Trpm6 (ENSPEMG00000011848) D030056L22Rik (ENSPEMG00000025661) Carnmt1 (ENSPEMG00000010072) Nmrk1 (ENSPEMG00000013725) Ostf1 (ENSPEMG00000020370) ENSPEMG00000003630 #22 Pcsk5 (ENSPEMG00000002720) Rfk (ENSPEMG00000031112) Gcnt1 (ENSPEMG00000024295) ENSPEMG00000025542 Prune2 (ENSPEMG00000009652) ENSPEMG00000001408 Vps13a (ENSPEMG00000022969) Gna14 (ENSPEMG00000022983) ENSPEMG00000026093 ENSPEMG00000029390 Cep78 (ENSPEMG00000013176) Psat1 (ENSPEMG00000022279) ENSPEMG00000025664 Tle4 (ENSPEMG00000006537) ENSPEMG00000029012 Primates ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00900000143589 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00910000146992 ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000016504 #7 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00910000146992 ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b Bushbaby MODERN SPECIES 153 ACADS 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ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b.e Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES 2 ENSMFAG00000039526 ENSMFAG00000031052 #8 POP5 (ENSMFAG00000045933) #9 RNF10 (ENSMFAG00000041159) #10 COQ5 (ENSMFAG00000038162) #11 DYNLL1 (ENSMFAG00000030961) #12 ENSMFAG00000036100 #13 SRSF9 (ENSMFAG00000039423) #14 GATC (ENSMFAG00000034197) #15 ENSMFAG00000064730 ##17 MSI1 (ENSMFAG00000001798) #18 PLA2G1B (ENSMFAG00000052529) #19 SIRT4 (ENSMFAG00000038370) #20 ENSMFAG00000055389 PXN (ENSMFAG00000031289) #21 RPLP0 (ENSMFAG00000044128) #22 GCN1 (ENSMFAG00000003588) #23 ENSMFAG00000065035 RAB35 (ENSMFAG00000038261) ENSMFAG00000051433 BICDL1 (ENSMFAG00000003401) #25 ENSMFAG00000002139 PRKAB1 (ENSMFAG00000002388) TMEM233 (ENSMFAG00000064866) CCDC60 (ENSMFAG00000003228) HSPB8 (ENSMFAG00000007246) SRRM4 (ENSMFAG00000041271) ENSMFAG00000054118 SUDS3 (ENSMFAG00000031069) PEBP1 (ENSMFAG00000032635) TAOK3 (ENSMFAG00000017617) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 3 CCDC148 (ENSMFAG00000038269) UPP2 (ENSMFAG00000003209) ENSMFAG00000058914 ACVR1 (ENSMFAG00000042305) ACVR1C (ENSMFAG00000042281) CYTIP (ENSMFAG00000043861) ERMN (ENSMFAG00000045944) GALNT5 (ENSMFAG00000036566) ENSMFAG00000059673 GPD2 (ENSMFAG00000031606) NR4A2 (ENSMFAG00000036654) ENSMFAG00000048164 ENSMFAG00000043008 ENSMFAG00000050325 GALNT13 (ENSMFAG00000043213) ENSMFAG00000065123 #22 RPRM (ENSMFAG00000023756) ARL6IP6 (ENSMFAG00000046021) PRPF40A (ENSMFAG00000038480) FMNL2 (ENSMFAG00000000995) STAM2 (ENSMFAG00000039480) CACNB4 (ENSMFAG00000044631) ENSMFAG00000056377 NEB (ENSMFAG00000000188) RIF1 (ENSMFAG00000032233) TNFAIP6 (ENSMFAG00000000925) NMI (ENSMFAG00000045501) RBM43 (ENSMFAG00000031648) RND3 (ENSMFAG00000045221) ENSMFAG00000037633 ENSMFAG00000060272 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Elephant MODERN SPECIES 332 PTP4A2 (ENSLAFG00000008462) ENSLAFG00000003350 COL16A1 (ENSLAFG00000003775) PEF1 (ENSLAFG00000010012) HCRTR1 (ENSLAFG00000010009) TINAGL1 (ENSLAFG00000010005) SERINC2 (ENSLAFG00000005871) FABP3 (ENSLAFG00000022206) ZCCHC17 (ENSLAFG00000015364) SNRNP40 (ENSLAFG00000013976) NKAIN1 (ENSLAFG00000017512) PUM1 (ENSLAFG00000003178) SDC3 (ENSLAFG00000013200) LAPTM5 (ENSLAFG00000029640) MATN1 (ENSLAFG00000012878) ENSLAFG00000032386 #22 PTPRU (ENSLAFG00000010090) MECR (ENSLAFG00000002576) SRSF4 (ENSLAFG00000002575) TMEM200B (ENSLAFG00000031258) EPB41 (ENSLAFG00000002571) OPRD1 (ENSLAFG00000017219) YTHDF2 (ENSLAFG00000030451) GMEB1 (ENSLAFG00000011849) TAF12 (ENSLAFG00000014103) TRNAU1AP (ENSLAFG00000007628) RCC1 (ENSLAFG00000007626) PHACTR4 (ENSLAFG00000007617) MED18 (ENSLAFG00000012511) SESN2 (ENSLAFG00000013698) ATP5IF1 (ENSLAFG00000005700) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Common wonbat MODERN SPECIES 34 SNRNP48 (ENSVURG00010003775) DSP (ENSVURG00010003799) RIOK1 (ENSVURG00010003926) ENSVURG00010003938 ENSVURG00010003957 RREB1 (ENSVURG00010004039) LY86 (ENSVURG00010004118) ENSVURG00010004125 F13A1 (ENSVURG00010004170) NRN1 (ENSVURG00010004289) FARS2 (ENSVURG00010004338) LYRM4 (ENSVURG00010004361) ENSVURG00010004367 RPP40 (ENSVURG00010004377) ENSVURG00010004414 ENSVURG00010004422 #22 ENSVURG00010004427 ENSVURG00010004444 ECI2 (ENSVURG00010004465) FAM217A (ENSVURG00010004476) PRPF4B (ENSVURG00010004483) ENSVURG00010004506 PXDC1 (ENSVURG00010004534) SLC22A23 (ENSVURG00010004586) PSMG4 (ENSVURG00010004617) TUBB2A (ENSVURG00010004658) BPHL (ENSVURG00010004675) RIPK1 (ENSVURG00010004694) ENSVURG00010004709 ENSVURG00010004723 IRF4 (ENSVURG00010004732) Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Laterata ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00980000199549 ENSGT00390000018806 ENSGT00940000157272 ENSGT00640000091701 ENSGT00390000018130.a.a.b ENSGT00390000000059 ENSGT00960000189379 ENSGT00390000006208.b ENSGT00940000157386 ENSGT00940000162372 ENSGT00940000155307.b ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000157442 #25 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000158897.l #21 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00390000017839.p ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251.g ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00940000153110.D ENSGT00550000075100 ENSGT00390000013005 ENSGT00730000111354 ENSGT00940000158958 ENSGT00940000157433 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 41 ZMAT5 (ENSSMRG00000018090) ENSSMRG00000018089 ASCC2 (ENSSMRG00000018088) MTMR3 (ENSSMRG00000018085) ENSSMRG00000018084 LIF (ENSSMRG00000018082) CASTOR1 (ENSSMRG00000018081) TBC1D10A (ENSSMRG00000018080) TMEM233 (ENSSMRG00000018079) PRKAB1 (ENSSMRG00000018077) CIT (ENSSMRG00000018069) FRRS1L (ENSSMRG00000018068) BICDL1 (ENSSMRG00000018067) #25 RAB35 (ENSSMRG00000018066) PXN (ENSSMRG00000018064) #21 RPLP0 (ENSSMRG00000018062) #22 ENSSMRG00000018060 ##22 GCN1 (ENSSMRG00000014544) #23 HSPB8 (ENSSMRG00000014543) SUDS3 (ENSSMRG00000014542) TAOK3 (ENSSMRG00000014541) DTX1 (ENSSMRG00000014540) CFAP73 (ENSSMRG00000014539) DDX54 (ENSSMRG00000014538) RITA1 (ENSSMRG00000014537) IQCD (ENSSMRG00000014536) TPCN1 (ENSSMRG00000014535) SLC8B1 (ENSSMRG00000014534) PLBD2 (ENSSMRG00000014533) SDS (ENSSMRG00000014532) SDSL (ENSSMRG00000014531) Amniota DUPLICATION Amniota DUPLICATION Amniota DUPLICATION Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 American mink MODERN SPECIES 69 UNC119B (ENSNVIG00000009190) MLEC (ENSNVIG00000009196) #7 ENSNVIG00000009215 #8 POP5 (ENSNVIG00000009240) #9 RNF10 (ENSNVIG00000009269) #10 COQ5 (ENSNVIG00000009357) #11 DYNLL1 (ENSNVIG00000009399) #12 ENSNVIG00000009423 #13 SRSF9 (ENSNVIG00000009434) #14 GATC (ENSNVIG00000009447) #15 TRIAP1 (ENSNVIG00000009500) #16 MSI1 (ENSNVIG00000009511) #18 PLA2G1B (ENSNVIG00000009520) #19 SIRT4 (ENSNVIG00000009562) #20 ENSNVIG00000009577 #21 ENSNVIG00000009596 ##22 ENSNVIG00000009703 #23 RAB35 (ENSNVIG00000012703) BICDL1 (ENSNVIG00000012716) #25 CIT (ENSNVIG00000012752) PRKAB1 (ENSNVIG00000013546) TMEM233 (ENSNVIG00000013572) CCDC60 (ENSNVIG00000013588) HSPB8 (ENSNVIG00000013622) SRRM4 (ENSNVIG00000013633) SUDS3 (ENSNVIG00000013657) TAOK3 (ENSNVIG00000013693) ENSNVIG00000013756 VSIG10 (ENSNVIG00000013772) WSB2 (ENSNVIG00000013785) RFC5 (ENSNVIG00000013801) Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1614 ENSAMEG00000025800 ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.a ##22 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 41 ENSSMRG00000018089 ASCC2 (ENSSMRG00000018088) MTMR3 (ENSSMRG00000018085) ENSSMRG00000018084 LIF (ENSSMRG00000018082) CASTOR1 (ENSSMRG00000018081) TBC1D10A (ENSSMRG00000018080) TMEM233 (ENSSMRG00000018079) PRKAB1 (ENSSMRG00000018077) CIT (ENSSMRG00000018069) FRRS1L (ENSSMRG00000018068) BICDL1 (ENSSMRG00000018067) #25 RAB35 (ENSSMRG00000018066) PXN (ENSSMRG00000018064) #21 RPLP0 (ENSSMRG00000018062) #22 ENSSMRG00000018060 ##22 GCN1 (ENSSMRG00000014544) #23 HSPB8 (ENSSMRG00000014543) SUDS3 (ENSSMRG00000014542) TAOK3 (ENSSMRG00000014541) DTX1 (ENSSMRG00000014540) CFAP73 (ENSSMRG00000014539) DDX54 (ENSSMRG00000014538) RITA1 (ENSSMRG00000014537) IQCD (ENSSMRG00000014536) TPCN1 (ENSSMRG00000014535) SLC8B1 (ENSSMRG00000014534) PLBD2 (ENSSMRG00000014533) SDS (ENSSMRG00000014532) SDSL (ENSSMRG00000014531) LHX5 (ENSSMRG00000014530) Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1275 ENSAMEG00000024373 ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.a.b ##22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 1692 ENSNSUG00000002849 ENSNSUG00000002847 ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Lizard DUPLICATION Lizard MODERN SPECIES 3 ENSACAG00000041059 ENSACAG00000010841 ENSACAG00000028852 ENSACAG00000035475 ENSACAG00000034052 RAD21 (ENSACAG00000010909) UTP23 (ENSACAG00000042204) EIF3H (ENSACAG00000011074) TRPS1 (ENSACAG00000011161) ENSACAG00000036398 ENSACAG00000043161 ENSACAG00000041401 ENSACAG00000034618 ENSACAG00000036363 CSMD3 (ENSACAG00000003719) ENSACAG00000035032 ##22 ENSACAG00000043055 ENSACAG00000037289 KCNV1 (ENSACAG00000002558) SYBU (ENSACAG00000002527) EBAG9 (ENSACAG00000002489) eny2 (ENSACAG00000038384) NUDCD1 (ENSACAG00000002434) TRHR (ENSACAG00000010418) TMEM74 (ENSACAG00000010417) EMC2 (ENSACAG00000010310) EIF3E (ENSACAG00000010203) RSPO2 (ENSACAG00000010188) ANGPT1 (ENSACAG00000010050) ENSACAG00000010012 ABRA (ENSACAG00000009983) Lizard MODERN SPECIES 2 RCSD1 (ENSACAG00000009481) CREG1 (ENSACAG00000009495) CD247 (ENSACAG00000039922) ENSACAG00000038619 POU2F1 (ENSACAG00000009565) STYXL2 (ENSACAG00000009644) GPA33 (ENSACAG00000009675) ENSACAG00000029327 ENSACAG00000037937 ENSACAG00000043967 ILDR2 (ENSACAG00000009692) ENSACAG00000009719 ENSACAG00000043524 PTGFRN (ENSACAG00000009724) ENSACAG00000009783 ENSACAG00000039248 ##22 ENSACAG00000008642 ENSACAG00000013748 ENSACAG00000025288 ENSACAG00000013754 ENSACAG00000013777 BCL9 (ENSACAG00000013842) ACP6 (ENSACAG00000013881) GJA5 (ENSACAG00000013936) ENSACAG00000038252 GJA8 (ENSACAG00000013946) ENSACAG00000013950 ENSACAG00000041024 ENSACAG00000014019 ENSACAG00000040139 ENSACAG00000013729 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT01100000263696 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612 #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00390000017839.p ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Common wonbat MODERN SPECIES 1128 ENSVURG00010007882 ENSVURG00010007873 ENSVURG00010007842 KRT7 (ENSVURG00010007830) KRT80 (ENSVURG00010007815) ENSVURG00010007804 ATG101 (ENSVURG00010007798) NR4A1 (ENSVURG00010007769) TAMALIN (ENSVURG00010007754) ACVR1B (ENSVURG00010007747) ACVRL1 (ENSVURG00010007737) ANKRD33 (ENSVURG00010007731) FIGNL2 (ENSVURG00010007719) ENSVURG00010007715 SCN8A (ENSVURG00010007644) ENSVURG00010007622 ##22 SLC4A8 (ENSVURG00010007558) CELA1 (ENSVURG00010007524) ENSVURG00010007496 ENSVURG00010007477 ENSVURG00010007459 POU6F1 (ENSVURG00010007440) TFCP2 (ENSVURG00010007416) CSRNP2 (ENSVURG00010007407) LETMD1 (ENSVURG00010007360) SLC11A2 (ENSVURG00010007263) METTL7A (ENSVURG00010007245) ENSVURG00010007237 ENSVURG00010007229 ENSVURG00010007214 ENSVURG00010007206 koala MODERN SPECIES 46 MAPRE2 (ENSPCIG00000006582) ENSPCIG00000006577 ENSPCIG00000006573 ENSPCIG00000030795 ENSPCIG00000006572 ENSPCIG00000020828 ENSPCIG00000031715 ENSPCIG00000031800 PRKDC (ENSPCIG00000020925) MCM4 (ENSPCIG00000023029) ENSPCIG00000023033 CLXN (ENSPCIG00000025158) SNAI2 (ENSPCIG00000025156) PPDPFL (ENSPCIG00000002032) ENSPCIG00000031904 ENSPCIG00000011267 ##22 SNTG1 (ENSPCIG00000000617) PXDNL (ENSPCIG00000023871) PCMTD1 (ENSPCIG00000006617) ST18 (ENSPCIG00000027453) Eutheria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT01100000263696 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612 #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 126 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES 124 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 109 Unc119b (ENSJJAG00000024182) ENSJJAG00000018770 #7 ENSJJAG00000021885 #8 Pop5 (ENSJJAG00000001080) #9 Rnf10 (ENSJJAG00000018379) #10 Coq5 (ENSJJAG00000021649) #11 ENSJJAG00000020596 #12 ENSJJAG00000009686 Srsf9 (ENSJJAG00000013374) #14 Gatc (ENSJJAG00000000369) #15 ENSJJAG00000017654 #16 Cox6a1 (ENSJJAG00000022385) ##17 ENSJJAG00000010463 #18 Sirt4 (ENSJJAG00000018872) #20 ENSJJAG00000024166 #21 ENSJJAG00000013250 ##22 Gcn1 (ENSJJAG00000018574) #23 Rab35 (ENSJJAG00000010646) Bicdl1 (ENSJJAG00000014990) #25 Cit (ENSJJAG00000021797) ENSJJAG00000003437 Tmem233 (ENSJJAG00000023958) Ccdc60 (ENSJJAG00000016522) Hspb8 (ENSJJAG00000024220) Srrm4 (ENSJJAG00000016448) ENSJJAG00000000401 ENSJJAG00000021003 ENSJJAG00000024022 Pebp1 (ENSJJAG00000018822) Wsb2 (ENSJJAG00000021913) Rfc5 (ENSJJAG00000018010) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 Rat MODERN SPECIES 11 Bcas2 (ENSRNOG00000018783) ENSRNOG00000067127 Trim33 (ENSRNOG00000018946) Rbis (ENSRNOG00000038902) Syt6 (ENSRNOG00000019163) Olfml3 (ENSRNOG00000019211) Hipk1 (ENSRNOG00000019333) Dclre1b (ENSRNOG00000019367) Ap4b1 (ENSRNOG00000019455) Bcl2l15 (ENSRNOG00000037149) Ptpn22 (ENSRNOG00000019614) Rsbn1 (ENSRNOG00000019671) Phtf1 (ENSRNOG00000019785) Magi3 (ENSRNOG00000019885) AABR07012763.1 (ENSRNOG00000057707) Rplp0l1 (ENSRNOG00000031358) ##22 Lrig2 (ENSRNOG00000019957) Slc16a1 (ENSRNOG00000019996) Tafa3 (ENSRNOG00000030253) Ppm1j (ENSRNOG00000012481) Rhoc (ENSRNOG00000012630) Mov10 (ENSRNOG00000012946) Capza1 (ENSRNOG00000013538) St7l (ENSRNOG00000014002) Wnt2b (ENSRNOG00000014385) Cttnbp2nl (ENSRNOG00000014479) ENSRNOG00000068611 ENSRNOG00000066674 Kcnd3 (ENSRNOG00000014686) Ddx20 (ENSRNOG00000015274) Inka2 (ENSRNOG00000015691) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b.l #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654.j #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b.l #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000163122 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072.j Marmotini DUPLICATION Marmotini ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654.j #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b.l #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a.a ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00530000063869.B #34 ENSGT00910000144226 #35 ENSGT00390000003682 #36 Marmotini_b DUPLICATION Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654.j #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b.l #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a.a.a ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00530000063869.B #34 ENSGT00910000144226 #35 ENSGT00390000003682 #36 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 290 POP5 (ENSUPAG00010016859) #9 RNF10 (ENSUPAG00010016864) #10 COQ5 (ENSUPAG00010016972) #11 ENSUPAG00010016987 #13 DYNLL1 (ENSUPAG00010016994) #12 SRSF9 (ENSUPAG00010016997) #14 GATC (ENSUPAG00010017011) #15 TRIAP1 (ENSUPAG00010017017) #16 COX6A1 (ENSUPAG00010017023) ##17 MSI1 (ENSUPAG00010017036) #18 ENSUPAG00010017050 PLA2G1B (ENSUPAG00010017052) #19 SIRT4 (ENSUPAG00010017061) #20 PXN (ENSUPAG00010017089) #21 ENSUPAG00010017112 ENSUPAG00010017116 ##22 GCN1 (ENSUPAG00010017122) #23 RAB35 (ENSUPAG00010017163) BICDL1 (ENSUPAG00010017174) #25 CIT (ENSUPAG00010017192) PRKAB1 (ENSUPAG00010017447) TMEM233 (ENSUPAG00010017457) CCDC60 (ENSUPAG00010017462) HSPB8 (ENSUPAG00010017480) SRRM4 (ENSUPAG00010017495) SUDS3 (ENSUPAG00010017512) TAOK3 (ENSUPAG00010017547) ENSUPAG00010017559 TRAFD1 (ENSUPAG00010017571) #34 HECTD4 (ENSUPAG00010017636) #35 Squirrel MODERN SPECIES 268 ENSSTOG00000022751 MLEC (ENSSTOG00000003095) #7 ENSSTOG00000027234 #8 POP5 (ENSSTOG00000012577) #9 RNF10 (ENSSTOG00000012565) #10 COQ5 (ENSSTOG00000012560) #11 DYNLL1 (ENSSTOG00000026447) #12 SRSF9 (ENSSTOG00000007344) #14 GATC (ENSSTOG00000025740) #15 TRIAP1 (ENSSTOG00000012553) #16 COX6A1 (ENSSTOG00000023604) ##17 MSI1 (ENSSTOG00000009799) #18 PLA2G1B (ENSSTOG00000004258) #19 SIRT4 (ENSSTOG00000009795) #20 ENSSTOG00000014093 #21 ENSSTOG00000011327 ##22 GCN1 (ENSSTOG00000014045) #23 RAB35 (ENSSTOG00000014038) BICDL1 (ENSSTOG00000014021) #25 CIT (ENSSTOG00000008634) PRKAB1 (ENSSTOG00000008615) ENSSTOG00000025916 SRRM4 (ENSSTOG00000026642) SUDS3 (ENSSTOG00000024189) TAOK3 (ENSSTOG00000024483) ENSSTOG00000004085 TRAFD1 (ENSSTOG00000005726) #34 HECTD4 (ENSSTOG00000026003) #35 RPL6 (ENSSTOG00000009409) #36 PTPN11 (ENSSTOG00000027384) #37 RPH3A (ENSSTOG00000016262) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a.a.b ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 52 FAM219B (ENSUPAG00010005524) MPI (ENSUPAG00010005516) SCAMP2 (ENSUPAG00010005507) ULK3 (ENSUPAG00010005489) CPLX3 (ENSUPAG00010005476) LMAN1L (ENSUPAG00010005459) CSK (ENSUPAG00010005432) CYP1A2 (ENSUPAG00010005422) CYP1A1 (ENSUPAG00010005403) EDC3 (ENSUPAG00010005374) CLK3 (ENSUPAG00010005361) ARID3B (ENSUPAG00010005354) ENSUPAG00010005349 UBL7 (ENSUPAG00010005340) SEMA7A (ENSUPAG00010005327) ENSUPAG00010005323 ##22 ENSUPAG00010005312 CYP11A1 (ENSUPAG00010005293) ENSUPAG00010005277 STRA6 (ENSUPAG00010005225) ISLR (ENSUPAG00010005217) ISLR2 (ENSUPAG00010005208) PML (ENSUPAG00010005190) STOML1 (ENSUPAG00010005176) LOXL1 (ENSUPAG00010005163) TBC1D21 (ENSUPAG00010005154) INSYN1 (ENSUPAG00010005150) CD276 (ENSUPAG00010005140) NPTN (ENSUPAG00010005109) REC114 (ENSUPAG00010005101) HCN4 (ENSUPAG00010005082) Squirrel MODERN SPECIES 178 FAM131A (ENSSTOG00000021429) CLCN2 (ENSSTOG00000008267) POLR2H (ENSSTOG00000008300) THPO (ENSSTOG00000008312) CHRD (ENSSTOG00000008321) EPHB3 (ENSSTOG00000009427) MAGEF1 (ENSSTOG00000014789) VPS8 (ENSSTOG00000022395) C3orf70 (ENSSTOG00000006003) ENSSTOG00000032120 EHHADH (ENSSTOG00000027701) MAP3K13 (ENSSTOG00000001986) TMEM41A (ENSSTOG00000001995) LIPH (ENSSTOG00000011247) SENP2 (ENSSTOG00000011258) ENSSTOG00000033088 ##22 IGF2BP2 (ENSSTOG00000022077) ENSSTOG00000033354 TRA2B (ENSSTOG00000006720) ETV5 (ENSSTOG00000006743) DGKG (ENSSTOG00000006763) ENSSTOG00000029627 CRYGS (ENSSTOG00000027888) TBCCD1 (ENSSTOG00000004471) ENSSTOG00000009449 AHSG (ENSSTOG00000009460) FETUB (ENSSTOG00000012584) HRG (ENSSTOG00000012587) KNG1 (ENSSTOG00000027812) ENSSTOG00000012601 ENSSTOG00000012616 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a.b ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 101 MLEC (ENSMMMG00000021005) #7 ENSMMMG00000021011 #8 POP5 (ENSMMMG00000021028) #9 RNF10 (ENSMMMG00000021037) #10 COQ5 (ENSMMMG00000021065) #11 DYNLL1 (ENSMMMG00000021076) #12 SRSF9 (ENSMMMG00000021084) #14 GATC (ENSMMMG00000021090) #15 ENSMMMG00000021094 #16 COX6A1 (ENSMMMG00000021098) ##17 MSI1 (ENSMMMG00000021106) #18 PLA2G1B (ENSMMMG00000021113) #19 SIRT4 (ENSMMMG00000021122) #20 ENSMMMG00000021140 #21 ENSMMMG00000021161 ENSMMMG00000021163 ##22 GCN1 (ENSMMMG00000021170) #23 RAB35 (ENSMMMG00000021212) BICDL1 (ENSMMMG00000021218) #25 CIT (ENSMMMG00000021230) PRKAB1 (ENSMMMG00000021359) TMEM233 (ENSMMMG00000021361) CCDC60 (ENSMMMG00000021368) HSPB8 (ENSMMMG00000021377) SRRM4 (ENSMMMG00000021383) SUDS3 (ENSMMMG00000021390) TAOK3 (ENSMMMG00000021406) ENSMMMG00000021428 TRAFD1 (ENSMMMG00000021430) #34 HECTD4 (ENSMMMG00000021437) #35 RPL6 (ENSMMMG00000021495) #36 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a.b ##22 Squirrel MODERN SPECIES 74 GPATCH3 (ENSSTOG00000015220) GPN2 (ENSSTOG00000015216) SFN (ENSSTOG00000015213) ZDHHC18 (ENSSTOG00000015208) PIGV (ENSSTOG00000021148) ENSSTOG00000031355 ENSSTOG00000022501 RPS6KA1 (ENSSTOG00000004355) HMGN2 (ENSSTOG00000030691) DHDDS (ENSSTOG00000004335) ENSSTOG00000004329 CRYBG2 (ENSSTOG00000025229) UBXN11 (ENSSTOG00000005110) SH3BGRL3 (ENSSTOG00000005087) CEP85 (ENSSTOG00000005057) ENSSTOG00000033310 ##22 CATSPER4 (ENSSTOG00000028150) CNKSR1 (ENSSTOG00000020206) ZNF593OS (ENSSTOG00000032687) ZNF593 (ENSSTOG00000022153) C1orf232 (ENSSTOG00000030099) FAM110D (ENSSTOG00000023295) PDIK1L (ENSSTOG00000004995) TRIM63 (ENSSTOG00000004982) SLC30A2 (ENSSTOG00000004955) EXTL1 (ENSSTOG00000022136) PAFAH2 (ENSSTOG00000002899) ENSSTOG00000021708 PAQR7 (ENSSTOG00000003791) AUNIP (ENSSTOG00000003781) MTFR1L (ENSSTOG00000023300) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 17 UNC119B (ENSSVLG00005007337) MLEC (ENSSVLG00005007381) #7 CABP1 (ENSSVLG00005007451) #8 POP5 (ENSSVLG00005007552) #9 RNF10 (ENSSVLG00005007641) #10 COQ5 (ENSSVLG00005007727) #11 DYNLL1 (ENSSVLG00005007794) #12 SRSF9 (ENSSVLG00005007838) #14 GATC (ENSSVLG00005007876) #15 ENSSVLG00005007900 #16 COX6A1 (ENSSVLG00005007927) ##17 MSI1 (ENSSVLG00005007951) #18 PLA2G1B (ENSSVLG00005008025) #19 SIRT4 (ENSSVLG00005008089) #20 PXN (ENSSVLG00005008164) #21 ENSSVLG00005008367 ##22 GCN1 (ENSSVLG00005008536) #23 ENSSVLG00005008862 BICDL1 (ENSSVLG00005008936) #25 ENSSVLG00005009004 CIT (ENSSVLG00005009150) ENSSVLG00005009745 TMEM233 (ENSSVLG00005009774) CCDC60 (ENSSVLG00005009813) HSPB8 (ENSSVLG00005009960) SRRM4 (ENSSVLG00005009999) SUDS3 (ENSSVLG00005010109) TAOK3 (ENSSVLG00005010141) PEBP1 (ENSSVLG00005010178) ENSSVLG00005010202 VSIG10 (ENSSVLG00005010212) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 6127 ENSTSYG00000037292 ##22 DHRS2 (ENSTSYG00000007299) JPH4 (ENSTSYG00000005028) AP1G2 (ENSTSYG00000006759) THTPA (ENSTSYG00000006757) ZFHX2 (ENSTSYG00000026013) NGDN (ENSTSYG00000009606) MYH7 (ENSTSYG00000004246) MYH6 (ENSTSYG00000010605) CMTM5 (ENSTSYG00000006244) IL25 (ENSTSYG00000006243) EFS (ENSTSYG00000010826) SLC22A17 (ENSTSYG00000032744) BCL2L2 (ENSTSYG00000033996) PPP1R3E (ENSTSYG00000004723) HOMEZ (ENSTSYG00000026061) Tarsier MODERN SPECIES 1188 CHP1 (ENSTSYG00000004064) OIP5 (ENSTSYG00000000873) ENSTSYG00000028174 ##22 NUSAP1 (ENSTSYG00000000875) NDUFAF1 (ENSTSYG00000007673) RTF1 (ENSTSYG00000004886) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.b ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 65 ENSJJAG00000015258 Prcp (ENSJJAG00000022121) Ddias (ENSJJAG00000009611) Rab30 (ENSJJAG00000020064) ENSJJAG00000012172 Ankrd42 (ENSJJAG00000023528) ENSJJAG00000023792 ENSJJAG00000011365 ENSJJAG00000014690 ENSJJAG00000010286 ##22 Dlg2 (ENSJJAG00000023731) Tmem126b (ENSJJAG00000012522) Tmem126a (ENSJJAG00000008852) Crebzf (ENSJJAG00000010759) ENSJJAG00000010545 ENSJJAG00000017139 Ccdc83 (ENSJJAG00000017603) ENSJJAG00000001614 Eed (ENSJJAG00000016121) Hikeshi (ENSJJAG00000012398) ENSJJAG00000022293 Ccdc81 (ENSJJAG00000011496) Me3 (ENSJJAG00000022815) Prss23 (ENSJJAG00000010057) Fzd4 (ENSJJAG00000008823) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00950000186285 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.b ##22 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000163122 Rabbit MODERN SPECIES 13 POP5 (ENSOCUG00000006537) #9 RNF10 (ENSOCUG00000014880) #10 ENSOCUG00000035991 COQ5 (ENSOCUG00000014871) #11 ENSOCUG00000017806 #12 ENSOCUG00000039563 #13 SRSF9 (ENSOCUG00000024603) #14 ENSOCUG00000009867 #15 TRIAP1 (ENSOCUG00000009871) #16 ENSOCUG00000009873 ##17 ENSOCUG00000037826 MSI1 (ENSOCUG00000027716) #18 PLA2G1B (ENSOCUG00000001105) #19 SIRT4 (ENSOCUG00000011320) #20 PXN (ENSOCUG00000005754) #21 ENSOCUG00000005749 ##22 GCN1 (ENSOCUG00000005717) #23 ENSOCUG00000014600 BICDL1 (ENSOCUG00000025898) #25 CIT (ENSOCUG00000016324) PRKAB1 (ENSOCUG00000016312) TMEM233 (ENSOCUG00000027773) CCDC60 (ENSOCUG00000009665) HSPB8 (ENSOCUG00000004511) SRRM4 (ENSOCUG00000004503) SUDS3 (ENSOCUG00000007051) ENSOCUG00000036274 ENSOCUG00000007043 PEBP1 (ENSOCUG00000008395) VSIG10 (ENSOCUG00000008387) WSB2 (ENSOCUG00000010382) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.b ##22 Tarsier MODERN SPECIES 6397 MSI1 (ENSTSYG00000033949) #18 PLA2G1B (ENSTSYG00000035990) #19 SIRT4 (ENSTSYG00000003258) #20 PXN (ENSTSYG00000004857) #21 RPLP0 (ENSTSYG00000009732) ##22 GCN1 (ENSTSYG00000012206) #23 RAB35 (ENSTSYG00000014110) BICDL1 (ENSTSYG00000010120) #25 CIT (ENSTSYG00000008981) PRKAB1 (ENSTSYG00000034630) TMEM233 (ENSTSYG00000030650) CCDC60 (ENSTSYG00000011158) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000186285 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT01100000263696 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Tree shrew MODERN SPECIES 1594 POP5 (ENSTBEG00000010131) #9 RNF10 (ENSTBEG00000009469) #10 COQ5 (ENSTBEG00000009255) #11 ENSTBEG00000009154 #12 ENSTBEG00000008820 #13 SRSF9 (ENSTBEG00000008499) #14 COX6A1 (ENSTBEG00000008018) ##17 MSI1 (ENSTBEG00000007182) #18 PLA2G1B (ENSTBEG00000006463) #19 SIRT4 (ENSTBEG00000006165) #20 ENSTBEG00000005498 ##22 ENSTBEG00000002947 #23 RAB35 (ENSTBEG00000002015) ENSTBEG00000001052 #25 Glires ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000186285 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT01100000263696 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00950000186285 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.b ##22 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000163122 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b Pika DUPLICATION Pika MODERN SPECIES 1304 MSI1 (ENSOPRG00000016879) #18 PLA2G1B (ENSOPRG00000016876) #19 SIRT4 (ENSOPRG00000016871) #20 ENSOPRG00000016861 ENSOPRG00000016857 ##22 GCN1 (ENSOPRG00000016810) #23 RAB35 (ENSOPRG00000016805) BICDL1 (ENSOPRG00000016794) #25 Pika MODERN SPECIES 2581 ENSOPRG00000009995 ENSOPRG00000019126 ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b.l #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.c.a ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 92 GPATCH3 (ENSUPAG00010021268) GPN2 (ENSUPAG00010021274) SFN (ENSUPAG00010021279) ZDHHC18 (ENSUPAG00010021282) PIGV (ENSUPAG00010021291) ARID1A (ENSUPAG00010021300) RPS6KA1 (ENSUPAG00010021318) ENSUPAG00010021391 DHDDS (ENSUPAG00010021412) ZNF683 (ENSUPAG00010021486) ENSUPAG00010021495 ENSUPAG00010021517 UBXN11 (ENSUPAG00010021521) SH3BGRL3 (ENSUPAG00010021534) CEP85 (ENSUPAG00010021539) ENSUPAG00010021552 ##22 ENSUPAG00010021555 CATSPER4 (ENSUPAG00010021560) CNKSR1 (ENSUPAG00010021586) ENSUPAG00010021706 C1orf232 (ENSUPAG00010021707) ZNF593 (ENSUPAG00010021709) FAM110D (ENSUPAG00010021710) PDIK1L (ENSUPAG00010021712) TRIM63 (ENSUPAG00010021713) SLC30A2 (ENSUPAG00010021717) EXTL1 (ENSUPAG00010021721) PAFAH2 (ENSUPAG00010021733) ENSUPAG00010021739 PAQR7 (ENSUPAG00010021741) AUNIP (ENSUPAG00010021743) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016504 #7 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT01100000263696 ENSGT00390000000378.d.b.l #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251.l ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 11 SDR39U1 (ENSHGLG00000001566) ENSHGLG00000042529 CMA1 (ENSHGLG00000001391) ENSHGLG00000003064 ENSHGLG00000003002 ENSHGLG00000002857 GZMH (ENSHGLG00000002789) GZMB (ENSHGLG00000002596) STXBP6 (ENSHGLG00000049108) ENSHGLG00000048483 NOVA1 (ENSHGLG00000046120) ENSHGLG00000002548 ENSHGLG00000000491 ENSHGLG00000043768 Ftl (ENSHGLG00000033017) ENSHGLG00000002139 ##22 ENSHGLG00000020158 ENSHGLG00000003134 ENSHGLG00000040265 G2E3 (ENSHGLG00000001901) SCFD1 (ENSHGLG00000002694) ENSHGLG00000002448 ENSHGLG00000000528 ENSHGLG00000033126 ENSHGLG00000040863 ENSHGLG00000048240 ENSHGLG00000032423 ENSHGLG00000048687 DMXL2 (ENSHGLG00000013835) ENSHGLG00000042917 SCG3 (ENSHGLG00000019449) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000014595.b ENSGT00390000016504 #7 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.l #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251.l ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Guinea pig MODERN SPECIES 4 MLEC (ENSCPOG00000014377) #7 ENSCPOG00000025419 #8 POP5 (ENSCPOG00000012337) #9 RNF10 (ENSCPOG00000012331) #10 COQ5 (ENSCPOG00000031239) #11 DYNLL1 (ENSCPOG00000036786) #12 SRSF9 (ENSCPOG00000033486) #14 GATC (ENSCPOG00000026436) #15 TRIAP1 (ENSCPOG00000033275) #16 COX6A1 (ENSCPOG00000036824) ##17 MSI1 (ENSCPOG00000012361) #18 PLA2G1B (ENSCPOG00000012358) #19 SIRT4 (ENSCPOG00000012355) #20 ENSCPOG00000026308 PXN (ENSCPOG00000000411) #21 ENSCPOG00000021812 ##22 GCN1 (ENSCPOG00000000406) #23 RAB35 (ENSCPOG00000000404) BICDL1 (ENSCPOG00000000402) #25 CIT (ENSCPOG00000026104) ENSCPOG00000015636 TMEM233 (ENSCPOG00000037552) CCDC60 (ENSCPOG00000015551) HSPB8 (ENSCPOG00000024598) SRRM4 (ENSCPOG00000003544) SUDS3 (ENSCPOG00000009189) TAOK3 (ENSCPOG00000027606) ENSCPOG00000038781 VSIG10 (ENSCPOG00000007016) WSB2 (ENSCPOG00000014155) RFC5 (ENSCPOG00000022189) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000014595.b ENSGT00390000016504 #7 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.l #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251.l ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Long-tailed chinchilla DUPLICATION Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 162 MLEC (ENSCLAG00000010269) #7 ENSCLAG00000008163 #8 POP5 (ENSCLAG00000007808) #9 RNF10 (ENSCLAG00000017372) #10 COQ5 (ENSCLAG00000011645) #11 ENSCLAG00000010874 DYNLL1 (ENSCLAG00000015769) #12 SRSF9 (ENSCLAG00000012289) #14 GATC (ENSCLAG00000011015) #15 TRIAP1 (ENSCLAG00000011307) #16 COX6A1 (ENSCLAG00000013008) ##17 MSI1 (ENSCLAG00000011329) #18 PLA2G1B (ENSCLAG00000014353) #19 SIRT4 (ENSCLAG00000010770) #20 PXN (ENSCLAG00000016279) #21 ENSCLAG00000014722 ##22 GCN1 (ENSCLAG00000010466) #23 RAB35 (ENSCLAG00000013339) BICDL1 (ENSCLAG00000012595) #25 CIT (ENSCLAG00000014860) PRKAB1 (ENSCLAG00000009053) TMEM233 (ENSCLAG00000013093) CCDC60 (ENSCLAG00000013673) HSPB8 (ENSCLAG00000011079) SRRM4 (ENSCLAG00000009764) SUDS3 (ENSCLAG00000012870) TAOK3 (ENSCLAG00000014513) ENSCLAG00000016201 VSIG10 (ENSCLAG00000010336) WSB2 (ENSCLAG00000011974) RFC5 (ENSCLAG00000009944) Long-tailed chinchilla DUPLICATION Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 201 PRSS58 (ENSCLAG00000002996) ENSCLAG00000003077 ENSCLAG00000003095 ENSCLAG00000003350 ENSCLAG00000007384 TAS2R38 (ENSCLAG00000008669) CLEC5A (ENSCLAG00000008820) PRSS37 (ENSCLAG00000008886) SSBP1 (ENSCLAG00000009247) WEE2 (ENSCLAG00000009356) ENSCLAG00000001751 DENND11 (ENSCLAG00000001043) AGK (ENSCLAG00000001071) ENSCLAG00000001114 MRPS33 (ENSCLAG00000001134) ENSCLAG00000001167 ##22 ENSCLAG00000001297 ENSCLAG00000001414 NDUFB2 (ENSCLAG00000001447) ADCK2 (ENSCLAG00000001471) DENND2A (ENSCLAG00000001519) ENSCLAG00000001763 MKRN1 (ENSCLAG00000001783) SLC37A3 (ENSCLAG00000001923) RAB19 (ENSCLAG00000001959) KDM7A (ENSCLAG00000001992) PARP12 (ENSCLAG00000002012) TBXAS1 (ENSCLAG00000002208) HIPK2 (ENSCLAG00000002901) CLEC2L (ENSCLAG00000002955) LUC7L2 (ENSCLAG00000002030) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 135 ARSJ (ENSCLAG00000007365) UGT8 (ENSCLAG00000006668) NDST4 (ENSCLAG00000010385) TRAM1L1 (ENSCLAG00000016886) NDST3 (ENSCLAG00000004346) PRSS12 (ENSCLAG00000003330) METTL14 (ENSCLAG00000013189) SEC24D (ENSCLAG00000009632) SYNPO2 (ENSCLAG00000004412) MYOZ2 (ENSCLAG00000003567) USP53 (ENSCLAG00000005403) C4orf3 (ENSCLAG00000005064) FABP2 (ENSCLAG00000004293) PDE5A (ENSCLAG00000004806) MAD2L1 (ENSCLAG00000003756) ENSCLAG00000003295 ##22 PRDM5 (ENSCLAG00000005392) NDNF (ENSCLAG00000004819) TNIP3 (ENSCLAG00000004304) QRFPR (ENSCLAG00000006789) ENSCLAG00000005382 ANXA5 (ENSCLAG00000004278) EXOSC9 (ENSCLAG00000004644) CCNA2 (ENSCLAG00000003880) BBS7 (ENSCLAG00000004340) TRPC3 (ENSCLAG00000003574) BLTP1 (ENSCLAG00000007818) ADAD1 (ENSCLAG00000004688) IL2 (ENSCLAG00000009317) IL21 (ENSCLAG00000009098) BBS12 (ENSCLAG00000017705) Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 61 SRBD1 (ENSODEG00000012095) PRKCE (ENSODEG00000011779) EPAS1 (ENSODEG00000011675) RHOQ (ENSODEG00000012565) ENSODEG00000013963 ENSODEG00000011714 SOCS5 (ENSODEG00000019978) ENSODEG00000011724 TTC7A (ENSODEG00000011584) STPG4 (ENSODEG00000012221) CALM2 (ENSODEG00000013273) EPCAM (ENSODEG00000015335) MSH2 (ENSODEG00000012853) KCNK12 (ENSODEG00000015067) ENSODEG00000020322 ENSODEG00000012086 ##22 MSH6 (ENSODEG00000012640) FBXO11 (ENSODEG00000013014) FOXN2 (ENSODEG00000012405) PPP1R21 (ENSODEG00000013346) STON1 (ENSODEG00000012778) GTF2A1L (ENSODEG00000012958) LHCGR (ENSODEG00000011660) ENSODEG00000012799 FSHR (ENSODEG00000014615) MRPL39 (ENSODEG00000013710) JAM2 (ENSODEG00000012747) ENSODEG00000012348 GABPA (ENSODEG00000014082) ENSODEG00000012653 APP (ENSODEG00000013466) Degu MODERN SPECIES 84 ENSODEG00000009554 ENSODEG00000009106 ENSODEG00000006477 PDE12 (ENSODEG00000006268) ENSODEG00000006837 DENND6A (ENSODEG00000005908) ENSODEG00000019341 ENSODEG00000006496 SLMAP (ENSODEG00000005798) FLNB (ENSODEG00000008526) ENSODEG00000006739 DNASE1L3 (ENSODEG00000006359) BTD (ENSODEG00000006036) ENSODEG00000019220 ENSODEG00000019255 ENSODEG00000008690 ##22 ENSODEG00000019376 ANKRD28 (ENSODEG00000007156) GALNT15 (ENSODEG00000005854) ENSODEG00000005288 OXNAD1 (ENSODEG00000005968) RFTN1 (ENSODEG00000005477) ENSODEG00000019190 ENSODEG00000006167 ENSODEG00000019240 #36 PLCL2 (ENSODEG00000005955) TBC1D5 (ENSODEG00000006516) SATB1 (ENSODEG00000006082) KCNH8 (ENSODEG00000005720) Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 120 UNC119B (ENSODEG00000006951) MLEC (ENSODEG00000006857) #7 ENSODEG00000006509 #8 ENSODEG00000006549 #9 RNF10 (ENSODEG00000007815) #10 COQ5 (ENSODEG00000006329) #11 ENSODEG00000006171 #12 SRSF9 (ENSODEG00000006061) #14 GATC (ENSODEG00000005919) #15 ENSODEG00000005787 #16 ENSODEG00000005584 ##17 MSI1 (ENSODEG00000006328) #18 PLA2G1B (ENSODEG00000006112) #19 SIRT4 (ENSODEG00000005972) #20 ENSODEG00000005742 #21 ENSODEG00000005457 ##22 GCN1 (ENSODEG00000005719) #23 RAB35 (ENSODEG00000007219) ENSODEG00000005856 #25 ENSODEG00000019184 CIT (ENSODEG00000006978) PRKAB1 (ENSODEG00000006326) TMEM233 (ENSODEG00000006179) CCDC60 (ENSODEG00000005468) HSPB8 (ENSODEG00000006631) SRRM4 (ENSODEG00000006291) SUDS3 (ENSODEG00000007364) ENSODEG00000019296 TAOK3 (ENSODEG00000007289) ENSODEG00000007114 VSIG10 (ENSODEG00000005668) Degu MODERN SPECIES 101 ENSODEG00000005714 PRNP (ENSODEG00000019133) ADRA1D (ENSODEG00000005086) SMOX (ENSODEG00000006624) RNF24 (ENSODEG00000005604) PANK2 (ENSODEG00000005402) MAVS (ENSODEG00000007437) AP5S1 (ENSODEG00000005338) CDC25B (ENSODEG00000005076) CENPB (ENSODEG00000006217) SPEF1 (ENSODEG00000005543) ADISSP (ENSODEG00000006785) HSPA12B (ENSODEG00000006345) SIGLEC1 (ENSODEG00000005702) GFRA4 (ENSODEG00000006159) ENSODEG00000005788 ##22 ATRN (ENSODEG00000004625) ENSODEG00000005518 DNAAF9 (ENSODEG00000005205) SLC4A11 (ENSODEG00000006000) ITPA (ENSODEG00000005202) DDRGK1 (ENSODEG00000005502) LZTS3 (ENSODEG00000006348) ENSODEG00000019287 FASTKD5 (ENSODEG00000005773) UBOX5 (ENSODEG00000006821) AVP (ENSODEG00000006589) ENSODEG00000004605 MRPS26 (ENSODEG00000004501) PTPRA (ENSODEG00000005651) VPS16 (ENSODEG00000004474) Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 165 ENSODEG00000003412 PRR16 (ENSODEG00000003401) ENSODEG00000003064 ENSODEG00000003051 FAM170A (ENSODEG00000003032) ENSODEG00000003016 HSD17B4 (ENSODEG00000002614) ENSODEG00000018825 ENSODEG00000002485 DMXL1 (ENSODEG00000002200) ENSODEG00000018764 DTWD2 (ENSODEG00000001974) ENSODEG00000018846 ENSODEG00000018768 ENSODEG00000002744 ##22 SEMA6A (ENSODEG00000002653) ENSODEG00000002602 ENSODEG00000002580 ENSODEG00000002563 ARL14EPL (ENSODEG00000002532) LVRN (ENSODEG00000002192) ENSODEG00000002163 ATG12 (ENSODEG00000002126) CDO1 (ENSODEG00000002104) TMED7 (ENSODEG00000002066) ENSODEG00000018754 FEM1C (ENSODEG00000002045) CCDC112 (ENSODEG00000002154) PGGT1B (ENSODEG00000002053) TRIM36 (ENSODEG00000002034) Degu MODERN SPECIES 87 MINPP1 (ENSODEG00000006300) ENSODEG00000019187 PAPSS2 (ENSODEG00000005976) ATAD1 (ENSODEG00000005551) ENSODEG00000005308 PTEN (ENSODEG00000006042) RNLS (ENSODEG00000005292) LIPJ (ENSODEG00000004545) ENSODEG00000005297 ##22 LIPF (ENSODEG00000005106) LIPK (ENSODEG00000004941) LIPN (ENSODEG00000005009) LIPM (ENSODEG00000004722) ANKRD22 (ENSODEG00000006197) ENSODEG00000005966 ACTA2 (ENSODEG00000005541) ENSODEG00000005184 LIPA (ENSODEG00000005659) ENSODEG00000006311 SLC16A12 (ENSODEG00000006954) PANK1 (ENSODEG00000006515) ENSODEG00000019069 ENSODEG00000004557 KIF20B (ENSODEG00000005304) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 445 Mlec (ENSNGAG00000005925) #7 ENSNGAG00000022386 #8 Pop5 (ENSNGAG00000002594) #9 Rnf10 (ENSNGAG00000023924) #10 Coq5 (ENSNGAG00000020139) #11 ENSNGAG00000023733 #12 ENSNGAG00000013457 Srsf9 (ENSNGAG00000012738) #14 Gatc (ENSNGAG00000004734) #15 Triap1 (ENSNGAG00000023480) #16 Cox6a1 (ENSNGAG00000005868) ##17 Msi1 (ENSNGAG00000014508) #18 Pla2g1b (ENSNGAG00000022899) #19 Sirt4 (ENSNGAG00000019284) #20 Pxn (ENSNGAG00000001212) #21 ENSNGAG00000024037 ##22 Gcn1 (ENSNGAG00000019286) #23 Rab35 (ENSNGAG00000007255) ENSNGAG00000022874 #25 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2181 Mycs (ENSMSIG00000023303) ENSMSIG00000023307 ENSMSIG00000023318 ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 15 Unc119b (MGP_PahariEiJ_G0024195) Mlec (MGP_PahariEiJ_G0024196) #7 Cabp1 (MGP_PahariEiJ_G0024197) #8 Pop5 (MGP_PahariEiJ_G0024198) #9 Rnf10 (MGP_PahariEiJ_G0024199) #10 MGP_PahariEiJ_G0024200 #11 Dynll1 (MGP_PahariEiJ_G0024201) #12 MGP_PahariEiJ_G0024202 #14 Gatc (MGP_PahariEiJ_G0024203) #15 Triap1 (MGP_PahariEiJ_G0024204) #16 Cox6a1 (MGP_PahariEiJ_G0024205) ##17 Msi1 (MGP_PahariEiJ_G0024206) #18 Pla2g1b (MGP_PahariEiJ_G0024207) #19 Sirt4 (MGP_PahariEiJ_G0024208) #20 MGP_PahariEiJ_G0024209 #21 MGP_PahariEiJ_G0024210 ##22 Gcn1 (MGP_PahariEiJ_G0024211) #23 Rab35 (MGP_PahariEiJ_G0024212) Bicdl1 (MGP_PahariEiJ_G0024213) #25 Cit (MGP_PahariEiJ_G0024214) Prkab1 (MGP_PahariEiJ_G0024215) Tmem233 (MGP_PahariEiJ_G0024216) Ccdc60 (MGP_PahariEiJ_G0024217) Hspb8 (MGP_PahariEiJ_G0024218) Srrm4 (MGP_PahariEiJ_G0024219) Suds3 (MGP_PahariEiJ_G0024220) Taok3 (MGP_PahariEiJ_G0024221) Pebp1 (MGP_PahariEiJ_G0024222) MGP_PahariEiJ_G0024223 Wsb2 (MGP_PahariEiJ_G0024224) Rfc5 (MGP_PahariEiJ_G0024225) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Tarsier DUPLICATION Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 6896 QKI (ENSTSYG00000036757) ENSTSYG00000028458 ##22 Tarsier MODERN SPECIES 5942 ENSTSYG00000029724 ##22 ENSTSYG00000007175 ENSTSYG00000035687 ENSTSYG00000027186 GSTM3 (ENSTSYG00000006736) EPS8L3 (ENSTSYG00000004905) ENSTSYG00000028831 AHCYL1 (ENSTSYG00000008997) STRIP1 (ENSTSYG00000010909) ALX3 (ENSTSYG00000034965) SLC6A17 (ENSTSYG00000004546) Tarsier MODERN SPECIES 4386 ENSTSYG00000008220 ENSTSYG00000035143 ##22 ENSTSYG00000036746 EPHA7 (ENSTSYG00000005245) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Marmoset MODERN SPECIES 1 ENSCJAG00000081814 ENSCJAG00000078340 ENSCJAG00000006806 ENSCJAG00000073389 ENSCJAG00000071935 PSMA6 (ENSCJAG00000041141) PRORP (ENSCJAG00000006750) PPP2R3C (ENSCJAG00000041694) ENSCJAG00000062861 FAM177A1 (ENSCJAG00000069586) SRP54 (ENSCJAG00000006581) BAZ1A (ENSCJAG00000006421) CFL2 (ENSCJAG00000041665) SNX6 (ENSCJAG00000044761) EAPP (ENSCJAG00000042239) ENSCJAG00000032302 ##22 SPTSSA (ENSCJAG00000086959) EGLN3 (ENSCJAG00000005424) NPAS3 (ENSCJAG00000047425) AKAP6 (ENSCJAG00000005474) ARHGAP5 (ENSCJAG00000005538) NUBPL (ENSCJAG00000005582) GPR33 (ENSCJAG00000035428) DTD2 (ENSCJAG00000073851) ENSCJAG00000075200 HEATR5A (ENSCJAG00000005593) ENSCJAG00000073672 HECTD1 (ENSCJAG00000005631) AP4S1 (ENSCJAG00000005786) ENSCJAG00000071091 STRN3 (ENSCJAG00000005822) Catarrhini DUPLICATION Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.j.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.j.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.j.a ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2296 ID4 (ENSRBIG00000029524) ENSRBIG00000000546 ##22 MBOAT1 (ENSRBIG00000033142) ENSRBIG00000019741 E2F3 (ENSRBIG00000043652) ENSRBIG00000037771 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.j.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.j.a ##22 Orangutan MODERN SPECIES 1 OPTN (ENSPPYG00000002095) CCDC3 (ENSPPYG00000002094) CAMK1D (ENSPPYG00000002093) CDC123 (ENSPPYG00000002092) NUDT5 (ENSPPYG00000002091) SEC61A2 (ENSPPYG00000002090) DHTKD1 (ENSPPYG00000002833) UPF2 (ENSPPYG00000002089) PROSER2 (ENSPPYG00000040683) ECHDC3 (ENSPPYG00000031131) ENSPPYG00000002086 USP6NL (ENSPPYG00000002085) CELF2 (ENSPPYG00000002083) ENSPPYG00000036463 ENSPPYG00000034572 ENSPPYG00000002080 ##22 GATA3 (ENSPPYG00000002079) TAF3 (ENSPPYG00000002077) ATP5F1C (ENSPPYG00000002076) KIN (ENSPPYG00000002075) ITIH2 (ENSPPYG00000002074) ITIH5 (ENSPPYG00000002073) SFMBT2 (ENSPPYG00000002072) PRKCQ (ENSPPYG00000002071) PFKFB3 (ENSPPYG00000002068) RBM17 (ENSPPYG00000002067) IL2RA (ENSPPYG00000002066) ENSPPYG00000002065 FBH1 (ENSPPYG00000002064) ANKRD16 (ENSPPYG00000002063) GDI2 (ENSPPYG00000002062) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.j.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.j.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.j.b ##22 Orangutan MODERN SPECIES 5 ACIN1 (ENSPPYG00000005657) CDH24 (ENSPPYG00000005656) PSMB5 (ENSPPYG00000041109) ENSPPYG00000005655 C14H14orf93 (ENSPPYG00000005653) AJUBA (ENSPPYG00000005652) HAUS4 (ENSPPYG00000005651) PRMT5 (ENSPPYG00000005650) RBM23 (ENSPPYG00000005649) REM2 (ENSPPYG00000005648) LRP10 (ENSPPYG00000005647) MMP14 (ENSPPYG00000005646) ENSPPYG00000005645 SLC7A7 (ENSPPYG00000005643) OXA1L (ENSPPYG00000005642) ENSPPYG00000019928 ##22 OR6J1 (ENSPPYG00000005640) ABHD4 (ENSPPYG00000005639) DAD1 (ENSPPYG00000005638) ENSPPYG00000031404 TRAC (ENSPPYG00000005637) ENSPPYG00000033635 ENSPPYG00000034775 ENSPPYG00000040530 TRAJ18 (ENSPPYG00000032749) ENSPPYG00000040270 ENSPPYG00000040330 ENSPPYG00000041342 ENSPPYG00000034396 ENSPPYG00000035246 ENSPPYG00000035728 Gibbon MODERN SPECIES 24 TMEM150C (ENSNLEG00000008720) ENSNLEG00000028521 #37 ENSNLEG00000008733 SEC31A (ENSNLEG00000008736) THAP9 (ENSNLEG00000008931) LIN54 (ENSNLEG00000008934) COPS4 (ENSNLEG00000008953) PLAC8 (ENSNLEG00000009010) COQ2 (ENSNLEG00000009024) HPSE (ENSNLEG00000009047) HELQ (ENSNLEG00000009088) MRPS18C (ENSNLEG00000009119) ABRAXAS1 (ENSNLEG00000009133) GPAT3 (ENSNLEG00000034519) NKX6-1 (ENSNLEG00000009157) ENSNLEG00000028024 ##22 CDS1 (ENSNLEG00000009160) WDFY3 (ENSNLEG00000009171) ARHGAP24 (ENSNLEG00000009269) MAPK10 (ENSNLEG00000009285) PTPN13 (ENSNLEG00000009323) SLC10A6 (ENSNLEG00000009412) ENSNLEG00000033518 C4orf36 (ENSNLEG00000030589) ENSNLEG00000027926 AFF1 (ENSNLEG00000009429) KLHL8 (ENSNLEG00000009463) HSD17B13 (ENSNLEG00000009489) HSD17B11 (ENSNLEG00000033296) NUDT9 (ENSNLEG00000032434) SPARCL1 (ENSNLEG00000009544) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.j.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.j.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.j.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.j.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.j.b ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 2 THAP2 (ENSMFAG00000056975) TMEM19 (ENSMFAG00000033955) RAB21 (ENSMFAG00000044317) TBC1D15 (ENSMFAG00000000077) TPH2 (ENSMFAG00000035804) TRHDE (ENSMFAG00000044278) ENSMFAG00000060154 ENSMFAG00000060704 ENSMFAG00000051484 ENSMFAG00000060772 KCNC2 (ENSMFAG00000032844) CAPS2 (ENSMFAG00000038272) GLIPR1L1 (ENSMFAG00000031259) GLIPR1 (ENSMFAG00000003978) KRR1 (ENSMFAG00000000042) ENSMFAG00000001123 ##22 ENSMFAG00000032969 ENSMFAG00000053039 PHLDA1 (ENSMFAG00000001119) NAP1L1 (ENSMFAG00000001457) BBS10 (ENSMFAG00000033883) OSBPL8 (ENSMFAG00000036321) ENSMFAG00000057937 ENSMFAG00000047389 ENSMFAG00000034161 ZDHHC17 (ENSMFAG00000042288) CSRP2 (ENSMFAG00000033853) E2F7 (ENSMFAG00000000355) ENSMFAG00000065572 ENSMFAG00000060207 ENSMFAG00000059233 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.k ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.k ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d.k ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1031 KCNC2 (ENSRROG00000028887) ENSRROG00000007078 CAPS2 (ENSRROG00000036265) GLIPR1L1 (ENSRROG00000039268) GLIPR1L2 (ENSRROG00000017927) ENSRROG00000016846 ENSRROG00000041620 GLIPR1 (ENSRROG00000043395) KRR1 (ENSRROG00000029658) ENSRROG00000037708 ##22 ENSRROG00000024996 PHLDA1 (ENSRROG00000007029) ENSRROG00000033201 NAP1L1 (ENSRROG00000026775) ENSRROG00000014250 BBS10 (ENSRROG00000028824) OSBPL8 (ENSRROG00000042405) ZDHHC17 (ENSRROG00000039872) CSRP2 (ENSRROG00000031526) E2F7 (ENSRROG00000031867) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 142 PARD6G (ENSOGAG00000032827) ADNP2 (ENSOGAG00000032513) RBFA (ENSOGAG00000012673) ENSOGAG00000026000 TXNL4A (ENSOGAG00000034753) SLC66A2 (ENSOGAG00000027223) KCNG2 (ENSOGAG00000033887) ENSOGAG00000032618 CTDP1 (ENSOGAG00000026225) ENSOGAG00000027882 ##22 NFATC1 (ENSOGAG00000008159) ATP9B (ENSOGAG00000008156) SALL3 (ENSOGAG00000031681) ENSOGAG00000012140 MBP (ENSOGAG00000026007) ZNF236 (ENSOGAG00000027487) ZNF516 (ENSOGAG00000033116) TSHZ1 (ENSOGAG00000007341) PTGR3 (ENSOGAG00000007345) ZNF407 (ENSOGAG00000032013) CNDP1 (ENSOGAG00000013478) CNDP2 (ENSOGAG00000013471) DIPK1C (ENSOGAG00000025227) C18orf63 (ENSOGAG00000000053) CYB5A (ENSOGAG00000000052) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 Mouse lemur MODERN SPECIES 7 COIL (ENSMICG00000000676) TRIM25 (ENSMICG00000000659) DGKE (ENSMICG00000000649) C17orf67 (ENSMICG00000047765) NOG (ENSMICG00000003932) ANKFN1 (ENSMICG00000003923) PCTP (ENSMICG00000002870) ENSMICG00000042462 MMD (ENSMICG00000034764) HLF (ENSMICG00000046916) ENSMICG00000033389 STXBP4 (ENSMICG00000005231) ENSMICG00000005225 TOM1L1 (ENSMICG00000005217) ENSMICG00000036993 ENSMICG00000030277 ##22 CA10 (ENSMICG00000043674) UTP18 (ENSMICG00000009331) MBTD1 (ENSMICG00000016291) ENSMICG00000046144 NME1 (ENSMICG00000007444) SPAG9 (ENSMICG00000013743) TOB1 (ENSMICG00000041835) WFIKKN2 (ENSMICG00000037081) ENSMICG00000009835 ANKRD40 (ENSMICG00000009832) ABCC3 (ENSMICG00000009822) CACNA1G (ENSMICG00000009782) SPATA20 (ENSMICG00000009762) EPN3 (ENSMICG00000009752) MYCBPAP (ENSMICG00000009732) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 267 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 Common shrew MODERN SPECIES 7248 ENSSARG00000006659 ##22 GCN1 (ENSSARG00000006491) #23 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.db.a #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b.eb #12 ENSGT01100000263696 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000166687 ENSGT00940000170510 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00950000186285 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.db.a #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000154612.m.a.h #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000170510 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Felidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00950000186285 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.db.a #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.m.a.h #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Cat MODERN SPECIES 243 MLEC (ENSFCAG00000002400) #7 CABP1 (ENSFCAG00000024731) #8 POP5 (ENSFCAG00000042614) #9 RNF10 (ENSFCAG00000033733) #10 COQ5 (ENSFCAG00000011014) #11 DYNLL1 (ENSFCAG00000036800) #12 ENSFCAG00000011013 #13 SRSF9 (ENSFCAG00000011011) #14 GATC (ENSFCAG00000038718) #15 TRIAP1 (ENSFCAG00000032445) #16 ENSFCAG00000042543 #17 MSI1 (ENSFCAG00000011007) #18 PLA2G1B (ENSFCAG00000038683) #19 SIRT4 (ENSFCAG00000025934) #20 PXN (ENSFCAG00000018405) #21 RPLP0 (ENSFCAG00000013354) ##22 GCN1 (ENSFCAG00000013353) #23 RAB35 (ENSFCAG00000032566) BICDL1 (ENSFCAG00000015453) #25 CIT (ENSFCAG00000000924) PRKAB1 (ENSFCAG00000000923) TMEM233 (ENSFCAG00000033143) CCDC60 (ENSFCAG00000010538) HSPB8 (ENSFCAG00000027056) SRRM4 (ENSFCAG00000010536) SUDS3 (ENSFCAG00000012316) TAOK3 (ENSFCAG00000027996) ENSFCAG00000039682 VSIG10 (ENSFCAG00000002276) WSB2 (ENSFCAG00000026080) RFC5 (ENSFCAG00000002274) Panthera ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00950000186285 ENSGT00390000001654 #11 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#19 SIRT4 (ENSPTIG00000008563) #20 PXN (ENSPTIG00000006433) #21 ENSPTIG00000001811 ##22 GCN1 (ENSPTIG00000018996) #23 RAB35 (ENSPTIG00000018147) BICDL1 (ENSPTIG00000017719) #25 CIT (ENSPTIG00000014138) ENSPTIG00000013641 TMEM233 (ENSPTIG00000013589) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00950000186285 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.db.a #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.m.a.h #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b 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ENSMPUG00000002861 VSIG10 (ENSMPUG00000002850) WSB2 (ENSMPUG00000002848) RFC5 (ENSMPUG00000002841) KSR2 (ENSMPUG00000002832) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.eb #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b.db.a #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000016504 #7 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b.db.a #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Megabat MODERN SPECIES 4011 ENSPVAG00000003110 ##22 GCN1 (ENSPVAG00000003107) #23 RAB35 (ENSPVAG00000003103) BICDL1 (ENSPVAG00000003098) #25 CIT (ENSPVAG00000003087) PRKAB1 (ENSPVAG00000003082) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000016504 #7 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b.db.a #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000163530 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 17 UNC119B (ENSRFEG00010015944) MLEC (ENSRFEG00010015876) #7 CABP1 (ENSRFEG00010015615) #8 POP5 (ENSRFEG00010015446) #9 RNF10 (ENSRFEG00010015360) #10 COQ5 (ENSRFEG00010015289) #11 ENSRFEG00010015213 #13 ENSRFEG00010015155 #12 SRSF9 (ENSRFEG00010015094) #14 ENSRFEG00010015041 ENSRFEG00010014936 ##17 MSI1 (ENSRFEG00010014857) #18 PLA2G1B (ENSRFEG00010014744) #19 SIRT4 (ENSRFEG00010014687) #20 PXN (ENSRFEG00010014299) #21 ENSRFEG00010014141 ##22 ENSRFEG00010013638 #23 RAB35 (ENSRFEG00010013543) BICDL1 (ENSRFEG00010016328) #25 CIT (ENSRFEG00010014846) PRKAB1 (ENSRFEG00010014678) TMEM233 (ENSRFEG00010014621) CCDC60 (ENSRFEG00010014357) HSPB8 (ENSRFEG00010014309) SRRM4 (ENSRFEG00010014279) ENSRFEG00010014262 SUDS3 (ENSRFEG00010014068) TAOK3 (ENSRFEG00010013925) PEBP1 (ENSRFEG00010013879) VSIG10 (ENSRFEG00010013815) WSB2 (ENSRFEG00010013572) Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1040 RTCB (ENSMLUG00000007803) ASCL4 (ENSMLUG00000023526) PRDM4 (ENSMLUG00000000767) PWP1 (ENSMLUG00000000756) ABTB3 (ENSMLUG00000000748) CRY1 (ENSMLUG00000016284) MTERF2 (ENSMLUG00000016281) TMEM263 (ENSMLUG00000029065) RIC8B (ENSMLUG00000016270) RFX4 (ENSMLUG00000016257) POLR3B (ENSMLUG00000016235) TCP11L2 (ENSMLUG00000016228) CKAP4 (ENSMLUG00000016221) NUAK1 (ENSMLUG00000006906) C12orf75 (ENSMLUG00000024665) ENSMLUG00000028275 ##22 APPL2 (ENSMLUG00000007408) WASHC4 (ENSMLUG00000007308) ALDH1L2 (ENSMLUG00000007263) ENSMLUG00000007251 Microbat MODERN SPECIES 1118 ACADS (ENSMLUG00000010067) UNC119B (ENSMLUG00000005519) MLEC (ENSMLUG00000005515) #7 ENSMLUG00000015996 #8 POP5 (ENSMLUG00000014657) #9 RNF10 (ENSMLUG00000014644) #10 COQ5 (ENSMLUG00000014636) #11 ENSMLUG00000010358 #12 SRSF9 (ENSMLUG00000010346) #14 GATC (ENSMLUG00000010341) #15 ENSMLUG00000010334 COX6A1 (ENSMLUG00000010330) ##17 MSI1 (ENSMLUG00000010313) #18 PLA2G1B (ENSMLUG00000009487) #19 ENSMLUG00000015484 #21 ENSMLUG00000001970 ##22 GCN1 (ENSMLUG00000015444) #23 RAB35 (ENSMLUG00000015439) BICDL1 (ENSMLUG00000015429) #25 CIT (ENSMLUG00000015398) ENSMLUG00000027709 PRKAB1 (ENSMLUG00000015390) TMEM233 (ENSMLUG00000028162) CCDC60 (ENSMLUG00000010585) HSPB8 (ENSMLUG00000016849) SRRM4 (ENSMLUG00000017666) SUDS3 (ENSMLUG00000002657) TAOK3 (ENSMLUG00000002264) ENSMLUG00000002259 VSIG10 (ENSMLUG00000016362) WSB2 (ENSMLUG00000002114) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000016504 #7 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000163530 ENSGT00940000154612.m.a #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT00940000156240 #26 ENSGT00940000154089.b #27 ENSGT00940000161891.k #28 ENSGT00390000003209 #30 ENSGT00390000018566 #32 ENSGT00950000183174.A #33 ENSGT00530000063869.B #34 ENSGT00910000144226 #35 ENSGT00390000003682 #36 ENSGT00940000153876.B #37 ENSGT00940000157468.a.b ENSGT00510000046406.f.b.a.b Pig MODERN SPECIES 5 CABP1 (ENSSSCG00000056057) #8 POP5 (ENSSSCG00000009912) #9 ENSSSCG00000009911 RNF10 (ENSSSCG00000009910) #10 COQ5 (ENSSSCG00000009903) #11 DYNLL1 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##12 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.m.a #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Arabian camel MODERN SPECIES 25 ACADS (ENSCDRG00005019139) UNC119B (ENSCDRG00005019110) ENSCDRG00005018935 #8 POP5 (ENSCDRG00005018863) #9 RNF10 (ENSCDRG00005018670) #10 COQ5 (ENSCDRG00005018628) #11 ENSCDRG00005018600 #13 SRSF9 (ENSCDRG00005018565) #14 GATC (ENSCDRG00005018512) ##12 TRIAP1 (ENSCDRG00005018489) #16 ENSCDRG00005018462 #17 MSI1 (ENSCDRG00005018349) #18 PLA2G1B (ENSCDRG00005018265) #19 SIRT4 (ENSCDRG00005018239) #20 PXN (ENSCDRG00005017984) #21 ENSCDRG00005017865 ##22 GCN1 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ENSGT00390000016504 #7 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612 #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Elephant MODERN SPECIES 527 ACADS (ENSLAFG00000000481) UNC119B (ENSLAFG00000014554) MLEC (ENSLAFG00000014549) #7 ENSLAFG00000031900 #8 POP5 (ENSLAFG00000014545) #9 RNF10 (ENSLAFG00000006648) #10 COQ5 (ENSLAFG00000006646) #11 SRSF9 (ENSLAFG00000006381) #14 GATC (ENSLAFG00000006384) #15 TRIAP1 (ENSLAFG00000006387) #16 COX6A1 (ENSLAFG00000006388) #17 MSI1 (ENSLAFG00000009412) #18 PLA2G1B (ENSLAFG00000032602) #19 SIRT4 (ENSLAFG00000002250) #20 ENSLAFG00000031476 #21 ENSLAFG00000012290 ##22 GCN1 (ENSLAFG00000012272) #23 RAB35 (ENSLAFG00000012120) BICDL1 (ENSLAFG00000015362) #25 CIT (ENSLAFG00000023302) PRKAB1 (ENSLAFG00000005553) ENSLAFG00000026040 CCDC60 (ENSLAFG00000005420) HSPB8 (ENSLAFG00000003734) SRRM4 (ENSLAFG00000003731) ENSLAFG00000029899 SUDS3 (ENSLAFG00000001274) TAOK3 (ENSLAFG00000015482) ENSLAFG00000015477 VSIG10 (ENSLAFG00000011273) WSB2 (ENSLAFG00000011263) Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612 #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 Sloth MODERN SPECIES 56 ENSCHOG00000002749 ENSCHOG00000002745 ##22 GCN1 (ENSCHOG00000002732) #23 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 3073 ENSDNOG00000034131 ENSDNOG00000043755 ENSDNOG00000039964 ##22 SYNJ2BP (ENSDNOG00000035278) COX16 (ENSDNOG00000038961) Armadillo MODERN SPECIES 2129 ENSDNOG00000006959 ENSDNOG00000035549 ENSDNOG00000033512 ENSDNOG00000038484 ##22 NEGR1 (ENSDNOG00000004975) IMPG1 (ENSDNOG00000010255) MYO6 (ENSDNOG00000014711) ENSDNOG00000002293 FILIP1 (ENSDNOG00000001733) TMEM30A (ENSDNOG00000036068) ENSDNOG00000032705 COL12A1 (ENSDNOG00000010395) Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b ##22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES 205 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.b.b ##22 Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a ##22 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a ##22 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000162391 ENSGT00390000012569.a.fb.a.a ENSGT00940000162733 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000162391 ENSGT00390000012569.a.fb.a.a ENSGT00940000162733 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161442 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000162043 ENSGT00390000017800 ENSGT00730000111119 ENSGT00940000159896 ENSGT00940000161610 ENSGT00940000161107 ENSGT00560000078697 ENSGT00510000047831 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PGLYRP4 (ENSCATG00000015274) S100A9 (ENSCATG00000041594) S100A12 (ENSCATG00000045129) ENSCATG00000040711 S100A8 (ENSCATG00000042130) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161842.b.d.c ENSGT00940000161842.b.d.d.a.b ENSGT00730000111554 ENSGT00950000183301.h.a.a ENSGT00950000183301.h.b.a ENSGT00950000183301.h.b.b ENSGT00950000183278 ENSGT00950000183312 ENSGT00440000039991 ENSGT00940000164168 ENSGT00940000163019.b ENSGT00940000164092 ENSGT00940000163622.a.a.b.c.a ENSGT00730000112350 ENSGT00700000104637 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000162657 ENSGT00940000162349 ENSGT00940000161606 ENSGT00940000162189 ENSGT00940000153446.a.a.q.a.b ENSGT00910000144329 ENSGT00940000163488.b.c.b ENSGT00940000165664.b ENSGT00940000165664.a ENSGT00940000163488.b.c.a ENSGT00940000161896 ENSGT00940000161986 ENSGT00940000161276.C ENSGT00940000161959 ENSGT00940000163114 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 262 ENSMNEG00000023573 ENSMNEG00000033860 ENSMNEG00000035302 C1orf68 (ENSMNEG00000033043) ENSMNEG00000025567 LCE1A (ENSMNEG00000028072) SMCP (ENSMNEG00000004702) SPRR4 (ENSMNEG00000028143) SPRR1A (ENSMNEG00000010908) SPRR2D (ENSMNEG00000007440) ENSMNEG00000027185 ENSMNEG00000027297 ENSMNEG00000004937 SPRR2G (ENSMNEG00000019148) PRR9 (ENSMNEG00000014390) ENSMNEG00000030552 ##22 PGLYRP3 (ENSMNEG00000042260) PGLYRP4 (ENSMNEG00000043479) S100A9 (ENSMNEG00000033915) S100A12 (ENSMNEG00000045337) ENSMNEG00000039924 S100A8 (ENSMNEG00000042438) S100A7A (ENSMNEG00000029655) ENSMNEG00000027268 S100A6 (ENSMNEG00000030585) S100A5 (ENSMNEG00000032743) S100A4 (ENSMNEG00000029879) S100A3 (ENSMNEG00000025039) S100A2 (ENSMNEG00000040172) S100A16 (ENSMNEG00000038632) S100A14 (ENSMNEG00000039071) Vervet Monkey MODERN SPECIES 12 KPRP (ENSCSAG00000018409) ENSCSAG00000001840 ENSCSAG00000018408 LCE6A (ENSCSAG00000000038) SMCP (ENSCSAG00000000039) ENSCSAG00000000040 SPRR4 (ENSCSAG00000000041) SPRR1A (ENSCSAG00000000042) SPRR3 (ENSCSAG00000000043) SPRR1B (ENSCSAG00000000044) ENSCSAG00000000045 ENSCSAG00000000046 SPRR2G (ENSCSAG00000000049) LELP1 (ENSCSAG00000000051) PRR9 (ENSCSAG00000000053) ENSCSAG00000001841 ##22 ENSCSAG00000000054 PGLYRP3 (ENSCSAG00000001842) PGLYRP4 (ENSCSAG00000001843) S100A9 (ENSCSAG00000001844) S100A12 (ENSCSAG00000001846) S100A8 (ENSCSAG00000001847) ENSCSAG00000001848 S100A7A (ENSCSAG00000001849) S100A6 (ENSCSAG00000001851) S100A5 (ENSCSAG00000001852) S100A4 (ENSCSAG00000001853) S100A3 (ENSCSAG00000001854) S100A2 (ENSCSAG00000001855) S100A16 (ENSCSAG00000001856) S100A14 (ENSCSAG00000001857) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 626 ENSGT00940000163622.a.a.b.d ENSGT01060000249097 ENSGT00940000163622.a.a.b.c.a ENSGT00730000112350 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000162657 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2254 ENSRROG00000035312 ##22 PGLYRP4 (ENSRROG00000029317) S100A9 (ENSRROG00000028176) S100A12 (ENSRROG00000042962) S100A8 (ENSRROG00000039821) S100A7A (ENSRROG00000043953) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1361 SPRR2B (ENSRBIG00000026467) SPRR2A (ENSRBIG00000016461) SPRR2G (ENSRBIG00000017579) ENSRBIG00000040236 ##22 ENSRBIG00000036816 PGLYRP3 (ENSRBIG00000039930) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000163622.b ENSGT00730000112350 ENSGT00730000111592 ENSGT00700000104637 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000163622.b ENSGT00730000112350 ENSGT00730000111592 ENSGT00700000104637 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000163622.a.b ENSGT01100000264356 ENSGT00730000112350 ENSGT00730000111592 ENSGT00700000104637 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.b ##22 Gorilla MODERN SPECIES LCE1A (ENSGGOG00000011546) LCE6A (ENSGGOG00000024534) ENSGGOG00000001753 SPRR4 (ENSGGOG00000012423) SPRR1A (ENSGGOG00000043048) SPRR3 (ENSGGOG00000006640) ENSGGOG00000039316 SPRR2A (ENSGGOG00000037594) ENSGGOG00000036313 SPRR2E (ENSGGOG00000042210) SPRR2F (ENSGGOG00000043834) ENSGGOG00000026986 SPRR2G (ENSGGOG00000039397) LELP1 (ENSGGOG00000004549) PRR9 (ENSGGOG00000004548) ENSGGOG00000028143 ##22 PGLYRP3 (ENSGGOG00000000853) PGLYRP4 (ENSGGOG00000000856) S100A9 (ENSGGOG00000000857) S100A12 (ENSGGOG00000006742) ENSGGOG00000042529 ENSGGOG00000037627 ENSGGOG00000042236 S100A7 (ENSGGOG00000024101) S100A7A (ENSGGOG00000040685) S100A6 (ENSGGOG00000007245) S100A5 (ENSGGOG00000007241) S100A4 (ENSGGOG00000007240) S100A3 (ENSGGOG00000026672) S100A2 (ENSGGOG00000024473) S100A16 (ENSGGOG00000026763) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000155234.b.m.b.a ENSGT00940000155234.b.m.a.a ENSGT00910000146913 ENSGT00940000162645 ENSGT00940000155196.q.a ENSGT00940000158205 ENSGT00940000154194 ENSGT00940000161376 ENSGT00390000014293.a ENSGT00390000001063 ENSGT00950000182815.a.a.a.a.a ENSGT00940000155919 ENSGT00940000155292 ENSGT00940000160278 ENSGT00910000144252 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000160064.b ENSGT00940000155192 ENSGT00940000153912.B ENSGT01030000234633.C.b ENSGT00950000183175.B.b ENSGT00940000162273 ENSGT00950000183033.a.b.a ENSGT00940000158189 ENSGT00390000015889 ENSGT00940000162703 ENSGT00940000162279 ENSGT00940000156633 ENSGT00940000160729 ENSGT00940000159025 ENSGT00390000002509 Capuchin MODERN SPECIES 144 STPG2 (ENSCCAG00000033222) UNC5C (ENSCCAG00000021342) BMPR1B (ENSCCAG00000026229) PDLIM5 (ENSCCAG00000021552) HPGDS (ENSCCAG00000028311) SMARCAD1 (ENSCCAG00000022264) ENSCCAG00000025960 ##22 ENSCCAG00000020949 ATOH1 (ENSCCAG00000005361) GRID2 (ENSCCAG00000024729) Mas night monkey MODERN SPECIES 674 UNC5C (ENSANAG00000024029) BMPR1B (ENSANAG00000023818) PDLIM5 (ENSANAG00000023131) ENSANAG00000038080 ENSANAG00000021653 HPGDS (ENSANAG00000025366) SMARCAD1 (ENSANAG00000020488) ENSANAG00000028224 ##22 ATOH1 (ENSANAG00000011331) GRID2 (ENSANAG00000020247) CCSER1 (ENSANAG00000029488) ENSANAG00000029300 MMRN1 (ENSANAG00000034311) SNCA (ENSANAG00000021535) ENSANAG00000011931 FAM13A (ENSANAG00000031344) HERC3 (ENSANAG00000022838) NAP1L5 (ENSANAG00000007129) PYURF (ENSANAG00000029857) PIGY (ENSANAG00000009282) HERC5 (ENSANAG00000024422) HERC6 (ENSANAG00000028341) PPM1K (ENSANAG00000022825) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000017536 ENSGT00910000147781 ENSGT00950000183012.A.b ENSGT00940000155036.k.a ENSGT00940000161089 ENSGT00950000183151.a.a.a ENSGT00390000015415 ENSGT00950000183197.b.a ENSGT00390000018587 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00730000110905.a ENSGT00390000001149 ENSGT00390000003127 ENSGT00940000155040.a ENSGT00940000157180 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161192 ENSGT00500000045299 ENSGT00530000063626.a ENSGT00390000010089.f ENSGT00940000155807.a ENSGT00520000061410 ENSGT00950000182990.a.a.b.b ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00950000183316 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ENSGT00730000111073 ENSGT00530000063866.d Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000017536 ENSGT00910000147781 ENSGT00950000183012.A.b ENSGT00940000155036.k.a.a.a ENSGT00940000161089 ENSGT00950000183151.a.a.a ENSGT00390000015415 ENSGT00950000183197.b.a ENSGT00390000018587 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00730000110905.a ENSGT00390000001149 ENSGT00390000003127 ENSGT00940000155040.a ENSGT00940000157180 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161192 ENSGT00500000045299 ENSGT00530000063626.a ENSGT00390000010089.f ENSGT00940000155807.a.a ENSGT00520000061410 ENSGT01100000264610 ENSGT00910000148081 ENSGT00950000182990.a.a.b.b ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00950000183316 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a Hominidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00910000147781 ENSGT00950000183012.A.b ENSGT00940000155036.k.a.b ENSGT00940000155036.k.a.a.a.b 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ENSGT00940000155040.a ENSGT00940000157180 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161192 ENSGT00500000045299 ENSGT00530000063626.a ENSGT00390000010089.f ENSGT00940000155807.a.a ENSGT01100000264610 ENSGT00910000148081 ENSGT00950000182990.a.a.b.b ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00950000183316 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.b ENSGT00730000111073 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000017536 ENSGT00910000147781 ENSGT00950000183012.A.b ENSGT00940000155036.k.a.b ENSGT00940000161089 ENSGT00950000183151.a.a.a ENSGT00390000015415 ENSGT00950000183197.b.a ENSGT00390000018587 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00730000110905.a ENSGT00390000001149 ENSGT00390000003127 ENSGT00940000155040.a ENSGT00940000157180 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161192 ENSGT00500000045299 ENSGT00530000063626.a ENSGT00390000010089.f ENSGT00940000155807.a.a ENSGT01100000264610 ENSGT00910000148081 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SPECIES 2 ENSPTRG00000050302 ENSPTRG00000003731 ENSPTRG00000039058 VWCE (ENSPTRG00000003736) DDB1 (ENSPTRG00000003737) TKFC (ENSPTRG00000003738) CYB561A3 (ENSPTRG00000003739) TMEM138 (ENSPTRG00000003740) TMEM216 (ENSPTRG00000003741) CPSF7 (ENSPTRG00000003742) SDHAF2 (ENSPTRG00000003743) PPP1R32 (ENSPTRG00000003744) ENSPTRG00000044765 LRRC10B (ENSPTRG00000051448) SYT7 (ENSPTRG00000003745) ENSPTRG00000043757 ##22 DAGLA (ENSPTRG00000003747) MYRF (ENSPTRG00000003749) ENSPTRG00000048157 TMEM258 (ENSPTRG00000003750) FEN1 (ENSPTRG00000003751) ENSPTRG00000052250 ENSPTRG00000047132 FADS1 (ENSPTRG00000041542) FADS2 (ENSPTRG00000003753) ENSPTRG00000052244 FADS3 (ENSPTRG00000003754) RAB3IL1 (ENSPTRG00000003755) BEST1 (ENSPTRG00000003756) ENSPTRG00000050975 INCENP (ENSPTRG00000003760) Bonobo MODERN SPECIES 2 ENSPPAG00000005140 CD5 (ENSPPAG00000040152) VPS37C (ENSPPAG00000032955) ENSPPAG00000042417 VWCE (ENSPPAG00000034720) DDB1 (ENSPPAG00000035343) TKFC (ENSPPAG00000027814) CYB561A3 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ENSGT00940000157180 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161192 ENSGT00500000045299 ENSGT00530000063626.a ENSGT00390000010089.f ENSGT00940000155807.a ENSGT00520000061410 ENSGT00950000182990.a.a.b.b ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00950000183316 ENSGT00910000147498 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ENSGT00730000111073 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183012.A.b ENSGT00940000155036.k.a.c.a ENSGT00940000155036.k.a.d ENSGT00940000155036.k.a.c.b.b ENSGT00940000161089 ENSGT00950000183151.a.a.a ENSGT00390000015415 ENSGT00950000183197.b.a ENSGT00390000018587 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00730000110905.a ENSGT00390000001149 ENSGT00390000003127 ENSGT00940000155040.a ENSGT00940000157180 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161192 ENSGT00500000045299 ENSGT00530000063626.a ENSGT00390000010089.f ENSGT00940000155807.a ENSGT00520000061410 ENSGT00950000182990.a.a.b.b 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ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155036.k.a.c.a ENSGT00940000155036.k.a.c.b.a ENSGT00940000155036.k.a.c.b.b ENSGT00940000161089 ENSGT00950000183151.a.a.a ENSGT00390000015415 ENSGT00950000183197.b.a ENSGT00390000018587 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00730000110905.a ENSGT00390000001149 ENSGT00390000003127 ENSGT00940000155040.a ENSGT00910000147348 ENSGT00940000157180 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161192 ENSGT00530000063626.a ENSGT00390000010089.f ENSGT00940000155807.a ENSGT00520000061410 ENSGT00950000182990.a.a.b.b ENSGT00950000183316 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00980000199420 ENSGT00910000147498 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ENSGT00390000011666.x.a.e.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 433 VWCE (ENSMNEG00000035182) DDB1 (ENSMNEG00000031559) TKFC (ENSMNEG00000030238) CYB561A3 (ENSMNEG00000006486) TMEM138 (ENSMNEG00000042127) TMEM216 (ENSMNEG00000038513) CPSF7 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ENSGT00390000010089.f ENSGT00940000155807.a ENSGT00950000182990.a.a.b.b ENSGT00950000183316 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b.a ENSGT00730000111073 ENSGT00530000063866.d ENSGT00390000013802.v.b.d Crab-eating macaque MODERN SPECIES 5 SLC15A3 (ENSMFAG00000038208) TMEM109 (ENSMFAG00000000546) CD6 (ENSMFAG00000033693) ENSMFAG00000056355 ENSMFAG00000053582 ENSMFAG00000037169 DDB1 (ENSMFAG00000042035) TKFC (ENSMFAG00000032712) CYB561A3 (ENSMFAG00000045492) TMEM138 (ENSMFAG00000046357) TMEM216 (ENSMFAG00000043498) ENSMFAG00000001401 SDHAF2 (ENSMFAG00000037382) PPP1R32 (ENSMFAG00000043367) SYT7 (ENSMFAG00000043470) ENSMFAG00000002147 ##22 DAGLA (ENSMFAG00000065195) MYRF (ENSMFAG00000039452) TMEM258 (ENSMFAG00000035478) FEN1 (ENSMFAG00000009480) FADS1 (ENSMFAG00000037025) ENSMFAG00000041715 FADS2 (ENSMFAG00000042844) ENSMFAG00000062962 FADS3 (ENSMFAG00000040762) RAB3IL1 (ENSMFAG00000045583) BEST1 (ENSMFAG00000033154) ENSMFAG00000007415 ENSMFAG00000047451 INCENP (ENSMFAG00000031558) SCGB1D1 (ENSMFAG00000032054) Rhesus MODERN SPECIES 5 VPS37C (ENSMMUG00000015019) PGA4 (ENSMMUG00000037611) ENSMMUG00000059343 ENSMMUG00000042208 VWCE (ENSMMUG00000002688) DDB1 (ENSMMUG00000002691) TKFC (ENSMMUG00000002692) CYB561A3 (ENSMMUG00000022372) TMEM138 (ENSMMUG00000022373) TMEM216 (ENSMMUG00000002365) CPSF7 (ENSMMUG00000015280) SDHAF2 (ENSMMUG00000015281) PPP1R32 (ENSMMUG00000014913) LRRC10B (ENSMMUG00000031111) SYT7 (ENSMMUG00000005122) ENSMMUG00000020911 ##22 DAGLA (ENSMMUG00000049301) MYRF (ENSMMUG00000006655) TMEM258 (ENSMMUG00000006656) FEN1 (ENSMMUG00000006657) FADS1 (ENSMMUG00000013798) FADS2 (ENSMMUG00000000327) FADS3 (ENSMMUG00000000328) RAB3IL1 (ENSMMUG00000015148) BEST1 (ENSMMUG00000015147) FTH1 (ENSMMUG00000015146) ENSMMUG00000062874 INCENP (ENSMMUG00000004420) SCGB1D1 (ENSMMUG00000062870) SCGB2A1 (ENSMMUG00000054866) SCGB1D2 (ENSMMUG00000004424) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000017536 ENSGT00950000183012.A.b ENSGT00940000155036.k.a.d ENSGT00940000161089 ENSGT00950000183151.a.a.a ENSGT00390000015415 ENSGT00950000183197.b.a ENSGT00390000018587 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00730000110905.a ENSGT00390000001149 ENSGT00390000003127 ENSGT00940000155040.a ENSGT00910000147348 ENSGT00940000157180 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161192 ENSGT00500000045299 ENSGT00530000063626.a ENSGT00390000010089.f ENSGT00940000155807.a ENSGT00520000061410 ENSGT00950000182990.a.a.b.b ENSGT01090000263457 ENSGT00950000183316 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00980000199420 ENSGT00910000147498 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161089 ENSGT00950000183151.a.a.a ENSGT00390000015415 ENSGT00950000183197.b.a ENSGT00390000018587 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00730000110905.a ENSGT00390000001149 ENSGT00390000003127 ENSGT00940000155040.a ENSGT00910000147348 ENSGT00940000157180 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000161192 ENSGT00500000045299 ENSGT00530000063626.a ENSGT00390000010089.f ENSGT00940000155807.a ENSGT00520000061410 ENSGT00910000148833 ENSGT00950000182990.a.a.b.b ENSGT01090000263457 ENSGT00950000183316 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00980000199420 ENSGT00910000147498 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 Drill MODERN SPECIES 1111 VWCE (ENSMLEG00000044054) DDB1 (ENSMLEG00000044136) TKFC (ENSMLEG00000002152) CYB561A3 (ENSMLEG00000040386) TMEM138 (ENSMLEG00000034709) TMEM216 (ENSMLEG00000020360) CPSF7 (ENSMLEG00000031269) SDHAF2 (ENSMLEG00000040587) PPP1R32 (ENSMLEG00000031820) ENSMLEG00000030704 SYT7 (ENSMLEG00000032904) ENSMLEG00000031105 ##22 DAGLA (ENSMLEG00000038160) MYRF (ENSMLEG00000044406) TMEM258 (ENSMLEG00000040546) FEN1 (ENSMLEG00000012762) ENSMLEG00000030899 ENSMLEG00000027767 FADS1 (ENSMLEG00000043726) ENSMLEG00000041423 ENSMLEG00000024484 FADS2 (ENSMLEG00000039664) ENSMLEG00000044256 ENSMLEG00000021942 FADS3 (ENSMLEG00000043283) RAB3IL1 (ENSMLEG00000043733) BEST1 (ENSMLEG00000034408) Sooty mangabey MODERN SPECIES 518 VWCE (ENSCATG00000021513) DDB1 (ENSCATG00000044495) TKFC (ENSCATG00000044633) CYB561A3 (ENSCATG00000041666) TMEM138 (ENSCATG00000038658) TMEM216 (ENSCATG00000032394) CPSF7 (ENSCATG00000042801) SDHAF2 (ENSCATG00000042999) PPP1R32 (ENSCATG00000039418) LRRC10B (ENSCATG00000004145) ENSCATG00000042271 SYT7 (ENSCATG00000043350) ENSCATG00000038917 ##22 DAGLA (ENSCATG00000032611) ENSCATG00000015757 MYRF (ENSCATG00000042261) TMEM258 (ENSCATG00000044378) FEN1 (ENSCATG00000006690) ENSCATG00000003311 FADS1 (ENSCATG00000037775) ENSCATG00000041629 ENSCATG00000044239 FADS2 (ENSCATG00000043575) ENSCATG00000002961 FADS3 (ENSCATG00000042722) RAB3IL1 (ENSCATG00000038420) BEST1 (ENSCATG00000037568) FTH1 (ENSCATG00000043595) Olive baboon MODERN SPECIES 3 CD6 (ENSPANG00000003105) CD5 (ENSPANG00000017382) VPS37C (ENSPANG00000038012) ENSPANG00000012130 VWCE (ENSPANG00000000243) DDB1 (ENSPANG00000000242) TKFC (ENSPANG00000002763) CYB561A3 (ENSPANG00000015259) TMEM138 (ENSPANG00000005451) TMEM216 (ENSPANG00000013645) ENSPANG00000006037 SDHAF2 (ENSPANG00000023744) PPP1R32 (ENSPANG00000011447) LRRC10B (ENSPANG00000023823) SYT7 (ENSPANG00000022956) ENSPANG00000035141 ##22 DAGLA (ENSPANG00000013480) MYRF (ENSPANG00000013413) TMEM258 (ENSPANG00000005281) FEN1 (ENSPANG00000011882) FADS1 (ENSPANG00000013646) FADS2 (ENSPANG00000015652) ENSPANG00000035579 FADS3 (ENSPANG00000016422) RAB3IL1 (ENSPANG00000023599) BEST1 (ENSPANG00000016663) FTH1 (ENSPANG00000016662) ENSPANG00000032665 INCENP (ENSPANG00000016661) SCGB1D1 (ENSPANG00000016660) SCGB2A1 (ENSPANG00000046637) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 362 ENSANAG00000027386 PGAP1 (ENSANAG00000035641) C2orf66 (ENSANAG00000027973) GTF3C3 (ENSANAG00000000179) ENSANAG00000024825 ENSANAG00000035797 ENSANAG00000021324 ENSANAG00000035947 HECW2 (ENSANAG00000033510) STK17B (ENSANAG00000038231) ENSANAG00000025582 ENSANAG00000021882 ENSANAG00000026977 ENSANAG00000034842 SLC39A10 (ENSANAG00000029908) ENSANAG00000035111 ##22 ENSANAG00000019821 ENSANAG00000020112 ENSANAG00000037533 ENSANAG00000019178 ENSANAG00000036714 ENSANAG00000019787 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a ##22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 1 GUCA1C (ENSSVLG00005006046) TRAT1 (ENSSVLG00005005964) RETNLB (ENSSVLG00005005932) DZIP3 (ENSSVLG00005005793) CIP2A (ENSSVLG00005005509) IFT57 (ENSSVLG00005005448) CD47 (ENSSVLG00005005377) BBX (ENSSVLG00005005300) CCDC54 (ENSSVLG00005005280) ENSSVLG00005005260 ENSSVLG00005005236 CBLB (ENSSVLG00005005143) ALCAM (ENSSVLG00005004976) ENSSVLG00005004923 ZPLD1 (ENSSVLG00005004840) ENSSVLG00005004798 ##22 ENSSVLG00005019698 NFKBIZ (ENSSVLG00005019514) NXPE3 (ENSSVLG00005019296) CEP97 (ENSSVLG00005019091) RPL24 (ENSSVLG00005019027) ZBTB11 (ENSSVLG00005018859) ENSSVLG00005018695 TRMT10C (ENSSVLG00005018651) ENSSVLG00005018637 SENP7 (ENSSVLG00005018105) IMPG2 (ENSSVLG00005017818) ENSSVLG00005017776 TFG (ENSSVLG00005017515) ADGRG7 (ENSSVLG00005017175) ENSSVLG00005017103 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 2559 ENSDNOG00000049212 IDO2 (ENSDNOG00000031246) TCIM (ENSDNOG00000012336) ENSDNOG00000047042 ##22 ZMAT4 (ENSDNOG00000001045) SFRP1 (ENSDNOG00000049393) GINS4 (ENSDNOG00000011987) GPAT4 (ENSDNOG00000043535) NKX6-3 (ENSDNOG00000025828) ENSDNOG00000031978 ANK1 (ENSDNOG00000012081) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Goat MODERN SPECIES 24 ENSCHIG00000012251 ENSCHIG00000013688 ENSCHIG00000013321 OR6C74 (ENSCHIG00000006373) ENSCHIG00000023020 ENSCHIG00000007872 ENSCHIG00000016606 ENSCHIG00000008116 ENSCHIG00000008039 ENSCHIG00000007816 ENSCHIG00000005984 ENSCHIG00000001653 OR6C75 (ENSCHIG00000005914) OR6C76 (ENSCHIG00000003607) ENSCHIG00000004292 ENSCHIG00000016635 ##22 ENSCHIG00000005744 ENSCHIG00000011029 ENSCHIG00000006788 ENSCHIG00000004713 ENSCHIG00000008170 ENSCHIG00000009797 ENSCHIG00000013315 ENSCHIG00000005335 ENSCHIG00000004976 ENSCHIG00000016098 ENSCHIG00000010904 OR6C4 (ENSCHIG00000013348) ENSCHIG00000014481 OR2AP1 (ENSCHIG00000013176) ENSCHIG00000006012 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Mouse lemur MODERN SPECIES 27 ENSMICG00000016169 STT3A (ENSMICG00000003036) ENSMICG00000003023 FEZ1 (ENSMICG00000003008) PATE3 (ENSMICG00000041728) PATE2 (ENSMICG00000002420) PATE1 (ENSMICG00000001520) ENSMICG00000009663 ENSMICG00000028529 PKNOX2 (ENSMICG00000002993) SLC37A2 (ENSMICG00000002974) CCDC15 (ENSMICG00000032597) HEPACAM (ENSMICG00000032042) ROBO4 (ENSMICG00000001710) ROBO3 (ENSMICG00000001703) ENSMICG00000034417 ##22 MSANTD2 (ENSMICG00000032131) ESAM (ENSMICG00000044251) VSIG2 (ENSMICG00000001695) NRGN (ENSMICG00000038339) SPA17 (ENSMICG00000046417) SIAE (ENSMICG00000001679) ENSMICG00000001677 PANX3 (ENSMICG00000046650) ENSMICG00000043632 ENSMICG00000046486 ENSMICG00000010380 ENSMICG00000042736 ENSMICG00000009900 OR8D2 (ENSMICG00000001098) ENSMICG00000042956 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Tarsier MODERN SPECIES 6956 NPY (ENSTSYG00000010053) ENSTSYG00000025989 ##22 PALS2 (ENSTSYG00000005353) DFNA5 (ENSTSYG00000005409) OSBPL3 (ENSTSYG00000009017) ENSTSYG00000028606 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157407 ENSGT00390000016736.b ENSGT00390000006681 ENSGT00390000016465 ENSGT00950000182767.a.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000161139 ENSGT00940000157671 ENSGT00910000147222 ENSGT00950000183093.C ENSGT00940000162410 ENSGT00940000159665 ENSGT00390000004585 ENSGT00940000157560.e ENSGT00950000182810.A.a.a.mb.b.a ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 ENSGT00390000005794 ENSGT00550000074910 ENSGT00940000157359 ENSGT00550000074815 ENSGT00940000159967 ENSGT00940000159171 ENSGT00940000157390 ENSGT00390000001960 ENSGT00390000011270 ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000153433.B.a.b ENSGT00940000158456 ENSGT00940000153881.a ENSGT00940000156560 ENSGT00730000111187.b Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157407 ENSGT00390000016736.b ENSGT00390000006681 ENSGT00390000016465 ENSGT00950000182767.a.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000161139 ENSGT00940000157671 ENSGT00910000147222 ENSGT00950000183093.C ENSGT00940000162410 ENSGT00940000159665 ENSGT00390000004585 ENSGT00940000157560.e ENSGT00950000182810.A.a.a.mb.b.a ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 ENSGT00390000005794 ENSGT00550000074910 ENSGT00940000157359 ENSGT00550000074815 ENSGT00940000159967 ENSGT00940000159171 ENSGT00940000157390 ENSGT00390000001960 ENSGT00390000011270 ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000153433.B.a.b ENSGT00940000158456 ENSGT00940000153881.a ENSGT00940000156560 ENSGT00730000111187.b Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160410 ENSGT00940000162464 ENSGT00940000157407 ENSGT00390000016736.b ENSGT00390000006681 ENSGT00390000016465 ENSGT00950000182767.a.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000161139 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00940000162410 ENSGT00940000159665 ENSGT00390000004585 ENSGT00940000157560.e ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 ENSGT00390000005794 ENSGT00550000074910 ENSGT00940000157359 ENSGT00550000074815 ENSGT00940000159967 ENSGT00940000159171 ENSGT00940000157390 ENSGT00390000001960 ENSGT00390000011270 ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000153433.B.a.b ENSGT00940000158456 ENSGT00940000153881.a ENSGT00940000156560 ENSGT00730000111187.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160410 ENSGT00940000162464 ENSGT00940000157407 ENSGT00390000016736.b ENSGT00390000006681 ENSGT00390000016465 ENSGT00950000182767.a.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000161139 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00940000162410 ENSGT00940000159665 ENSGT00390000004585 ENSGT00940000157560.e ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 ENSGT00390000005794 ENSGT00550000074910 ENSGT00940000157359 ENSGT00550000074815 ENSGT00940000159967 ENSGT00940000159171 ENSGT00940000157390 ENSGT00390000001960 ENSGT00390000011270 ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000153433.B.a.b ENSGT00940000158456 ENSGT00940000153881.a ENSGT00940000156560 ENSGT00730000111187.b Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160410 ENSGT00940000162464 ENSGT00940000157407 ENSGT00390000016736.b ENSGT00390000006681 ENSGT00390000016465 ENSGT00950000182767.a.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000161139 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00940000162410 ENSGT00940000159665 ENSGT00390000004585 ENSGT00940000157560.e ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 ENSGT00390000005794 ENSGT00550000074910 ENSGT00940000157359 ENSGT00550000074815 ENSGT00940000159967 ENSGT00920000149095.a.h ENSGT01010000222851.c ENSGT00940000159171 ENSGT00940000157390 ENSGT00390000001960 ENSGT00390000011270 ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000153433.B.a.b ENSGT00940000158456 ENSGT00940000153881.a Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160410 ENSGT00940000162464 ENSGT00940000157407 ENSGT00390000016736.b ENSGT00390000006681 ENSGT00390000016465 ENSGT00950000182767.a.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000161139 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00940000162410 ENSGT00940000159665 ENSGT00390000004585 ENSGT00940000157560.e ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000154900.f ENSGT00390000005794 ENSGT00550000074910 ENSGT00940000157359 ENSGT00550000074815 ENSGT00940000159967 ENSGT00940000159171 ENSGT00940000157390 ENSGT00390000001960 ENSGT00390000011270 ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000153433.B.a.b ENSGT00940000158456 ENSGT00940000153881.a ENSGT00910000147483 Bonobo MODERN SPECIES FAM177B (ENSPPAG00000043057) BROX (ENSPPAG00000039244) ENSPPAG00000034152 ENSPPAG00000034603 MIA3 (ENSPPAG00000034682) TAF1A (ENSPPAG00000038647) HHIPL2 (ENSPPAG00000042275) ENSPPAG00000041428 DUSP10 (ENSPPAG00000035438) ENSPPAG00000039905 HLX (ENSPPAG00000031929) MTARC1 (ENSPPAG00000040763) MTARC2 (ENSPPAG00000001103) C1orf115 (ENSPPAG00000042551) MARK1 (ENSPPAG00000034966) ENSPPAG00000032071 ##22 ENSPPAG00000027472 RAB3GAP2 (ENSPPAG00000041652) IARS2 (ENSPPAG00000029870) BPNT1 (ENSPPAG00000030575) EPRS1 (ENSPPAG00000036757) SLC30A10 (ENSPPAG00000041238) LYPLAL1 (ENSPPAG00000038656) TGFB2 (ENSPPAG00000030603) RRP15 (ENSPPAG00000042109) ENSPPAG00000018811 SPATA17 (ENSPPAG00000031018) GPATCH2 (ENSPPAG00000038887) ESRRG (ENSPPAG00000035120) USH2A (ENSPPAG00000030873) KCTD3 (ENSPPAG00000041980) Chimpanzee MODERN SPECIES DISP1 (ENSPTRG00000002013) FAM177B (ENSPTRG00000023862) BROX (ENSPTRG00000002012) AIDA (ENSPTRG00000002010) ENSPTRG00000052614 MIA3 (ENSPTRG00000052232) TAF1A (ENSPTRG00000002007) HHIPL2 (ENSPTRG00000002006) ENSPTRG00000045546 DUSP10 (ENSPTRG00000002005) HLX (ENSPTRG00000002004) MTARC1 (ENSPTRG00000002003) MTARC2 (ENSPTRG00000002002) C1H1orf115 (ENSPTRG00000047775) MARK1 (ENSPTRG00000002000) ENSPTRG00000048086 ##22 ENSPTRG00000046120 ENSPTRG00000047107 ENSPTRG00000049590 ENSPTRG00000052357 RAB3GAP2 (ENSPTRG00000001999) IARS2 (ENSPTRG00000001997) BPNT1 (ENSPTRG00000001996) EPRS1 (ENSPTRG00000001995) SLC30A10 (ENSPTRG00000001994) LYPLAL1 (ENSPTRG00000001993) TGFB2 (ENSPTRG00000001992) RRP15 (ENSPTRG00000039779) SPATA17 (ENSPTRG00000001988) GPATCH2 (ENSPTRG00000001986) ESRRG (ENSPTRG00000023622) Gorilla MODERN SPECIES FAM177B (ENSGGOG00000017105) BROX (ENSGGOG00000000636) AIDA (ENSGGOG00000015289) ENSGGOG00000037338 MIA3 (ENSGGOG00000015271) TAF1A (ENSGGOG00000001183) HHIPL2 (ENSGGOG00000001182) ENSGGOG00000038551 DUSP10 (ENSGGOG00000001563) HLX (ENSGGOG00000002735) ENSGGOG00000022792 MTARC1 (ENSGGOG00000039255) MTARC2 (ENSGGOG00000008183) C1orf115 (ENSGGOG00000003776) MARK1 (ENSGGOG00000000960) ENSGGOG00000041289 ##22 RAB3GAP2 (ENSGGOG00000013163) IARS2 (ENSGGOG00000007340) BPNT1 (ENSGGOG00000022921) EPRS1 (ENSGGOG00000012404) SLC30A10 (ENSGGOG00000009511) ENSGGOG00000008911 LYPLAL1 (ENSGGOG00000001773) TGFB2 (ENSGGOG00000004593) RRP15 (ENSGGOG00000016603) KCTD3 (ENSGGOG00000001811) SPATA17 (ENSGGOG00000009448) GPATCH2 (ENSGGOG00000009440) ESRRG (ENSGGOG00000010263) USH2A (ENSGGOG00000009561) ENSGGOG00000040219 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000016736.b ENSGT00390000006681 ENSGT00390000016465 ENSGT00390000008783.m.b ENSGT00950000182767.a.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000161139 ENSGT00940000157671 ENSGT00910000147222 ENSGT00950000183093.C ENSGT00940000162410 ENSGT00940000159665 ENSGT00390000004585 ENSGT00940000157560.e ENSGT00950000182810.A.a.a.mb.b.a ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 ENSGT00390000005794 ENSGT00550000074910 ENSGT00940000157359 ENSGT00550000074815 ENSGT00940000159967 ENSGT00940000159171 ENSGT00940000157390 ENSGT00390000001960.e.a ENSGT00390000011270 ENSGT00410000025698.a ENSGT00940000153433.B.a.b ENSGT00940000158456 ENSGT00940000153881.a ENSGT00940000156560 ENSGT00730000111187.b Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.a.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 113 COQ10B (ENSCCAG00000036492) ENSCCAG00000014439 SF3B1 (ENSCCAG00000020506) ANKRD44 (ENSCCAG00000021887) PGAP1 (ENSCCAG00000007274) C2orf66 (ENSCCAG00000022882) GTF3C3 (ENSCCAG00000035358) CCDC150 (ENSCCAG00000027251) HECW2 (ENSCCAG00000034988) STK17B (ENSCCAG00000027737) DNAH7 (ENSCCAG00000024358) ENSCCAG00000008409 ENSCCAG00000024489 ##22 SLC39A10 (ENSCCAG00000026823) ENSCCAG00000017770 LUZP2 (ENSCCAG00000037659) MUC15 (ENSCCAG00000022698) ANO3 (ENSCCAG00000021124) SLC5A12 (ENSCCAG00000031218) BBOX1 (ENSCCAG00000036585) CCDC34 (ENSCCAG00000029468) LGR4 (ENSCCAG00000022571) LIN7C (ENSCCAG00000020782) BDNF (ENSCCAG00000037853) ENSCCAG00000035192 Mas night monkey MODERN SPECIES 958 DISP1 (ENSANAG00000026382) FAM177B (ENSANAG00000037064) BROX (ENSANAG00000020200) AIDA (ENSANAG00000020176) MIA3 (ENSANAG00000032600) ENSANAG00000034113 TAF1A (ENSANAG00000020382) HHIPL2 (ENSANAG00000019716) DUSP10 (ENSANAG00000028459) ENSANAG00000036000 HLX (ENSANAG00000036855) MTARC1 (ENSANAG00000035591) MTARC2 (ENSANAG00000037842) C1orf115 (ENSANAG00000033392) MARK1 (ENSANAG00000037020) ENSANAG00000021939 ##22 RAB3GAP2 (ENSANAG00000037148) IARS2 (ENSANAG00000013146) BPNT1 (ENSANAG00000022540) EPRS1 (ENSANAG00000022208) SLC30A10 (ENSANAG00000021852) LYPLAL1 (ENSANAG00000025763) ENSANAG00000024112 TGFB2 (ENSANAG00000032505) ENSANAG00000019880 SPATA17 (ENSANAG00000017809) GPATCH2 (ENSANAG00000032851) ESRRG (ENSANAG00000021556) USH2A (ENSANAG00000024118) KCTD3 (ENSANAG00000028292) KCNK2 (ENSANAG00000027145) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00950000186285 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT01100000263696 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 Glires ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00950000186285 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT01100000263696 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 69 Fndc7 (ENSJJAG00000017545) Prpf38b (ENSJJAG00000015013) Henmt1 (ENSJJAG00000017857) Eeig2 (ENSJJAG00000010928) Slc25a54 (ENSJJAG00000014843) ENSJJAG00000016898 Ntng1 (ENSJJAG00000017290) ENSJJAG00000024217 ENSJJAG00000019466 ENSJJAG00000021129 ENSJJAG00000023262 Rnpc3 (ENSJJAG00000010203) Col11a1 (ENSJJAG00000018420) Olfm3 (ENSJJAG00000010747) S1pr1 (ENSJJAG00000010551) ENSJJAG00000019910 ##22 Dph5 (ENSJJAG00000008927) Slc30a7 (ENSJJAG00000002926) Extl2 (ENSJJAG00000014735) Vcam1 (ENSJJAG00000015695) Gpr88 (ENSJJAG00000012613) Cdc14a (ENSJJAG00000022290) Rtca (ENSJJAG00000016178) Zfp697 (ENSJJAG00000017598) Phgdh (ENSJJAG00000014448) ENSJJAG00000017734 Reg4 (ENSJJAG00000000579) Notch2 (ENSJJAG00000013302) ENSJJAG00000010827 ENSJJAG00000019713 Prkab2 (ENSJJAG00000023668) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618.sb #13 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00960000191875 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618.sb #13 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A.u #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00960000191875 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Cricetidae_B DUPLICATION Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618.sb #13 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A.u #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00960000191875 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 7 Unc119b (ENSMOCG00000017585) Mlec (ENSMOCG00000001542) #7 ENSMOCG00000004672 #8 Pop5 (ENSMOCG00000013322) #9 Rnf10 (ENSMOCG00000018331) #10 Coq5 (ENSMOCG00000022159) #11 ENSMOCG00000018482 #12 Srsf9 (ENSMOCG00000021163) #14 Gatc (ENSMOCG00000005051) #15 Triap1 (ENSMOCG00000005593) #16 ENSMOCG00000006758 ##17 Msi1 (ENSMOCG00000002286) #18 Pla2g1b (ENSMOCG00000010330) #19 Sirt4 (ENSMOCG00000016396) #20 Pxn (ENSMOCG00000014430) #21 ENSMOCG00000012309 ##22 Gcn1 (ENSMOCG00000000746) #23 Rab35 (ENSMOCG00000019999) Bicdl1 (ENSMOCG00000019402) #25 Cit (ENSMOCG00000012761) Prkab1 (ENSMOCG00000006183) Tmem233 (ENSMOCG00000002502) Ccdc60 (ENSMOCG00000011345) ENSMOCG00000007613 Hspb8 (ENSMOCG00000009705) Srrm4 (ENSMOCG00000006737) Suds3 (ENSMOCG00000001519) Taok3 (ENSMOCG00000015684) ENSMOCG00000001486 Vsig10 (ENSMOCG00000014068) Wsb2 (ENSMOCG00000021973) Prairie vole MODERN SPECIES 15 ENSMOCG00000015646 Gpr142 (ENSMOCG00000015525) Btbd17 (ENSMOCG00000022850) Kif19a (ENSMOCG00000022165) Dnai2 (ENSMOCG00000019588) Ttyh2 (ENSMOCG00000004219) ENSMOCG00000001940 Sdk2 (ENSMOCG00000022457) Cdc42ep4 (ENSMOCG00000018039) ENSMOCG00000015313 ENSMOCG00000013577 Fam104a (ENSMOCG00000018026) Cog1 (ENSMOCG00000014351) Sstr2 (ENSMOCG00000016578) ENSMOCG00000016669 ENSMOCG00000007307 ##22 Sox9 (ENSMOCG00000006903) Kcnj2 (ENSMOCG00000021823) Kcnj16 (ENSMOCG00000013843) ENSMOCG00000002504 Map2k6 (ENSMOCG00000017028) Abca5 (ENSMOCG00000012456) Abca6 (ENSMOCG00000013898) Abca9 (ENSMOCG00000015163) 1700012B07Rik (ENSMOCG00000015491) Fam20a (ENSMOCG00000006439) Prkar1a (ENSMOCG00000014659) Wipi1 (ENSMOCG00000019305) Arsg (ENSMOCG00000017412) Slc16a6 (ENSMOCG00000017493) Amz2 (ENSMOCG00000011962) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 15 Gatc (ENSPEMG00000000665) #15 Triap1 (ENSPEMG00000027703) #16 ENSPEMG00000017519 ##17 Msi1 (ENSPEMG00000010491) #18 ENSPEMG00000031420 #19 ENSPEMG00000031062 ENSPEMG00000027796 #19 ENSPEMG00000024349 #19 ENSPEMG00000027736 #19 ENSPEMG00000030171 #19 ENSPEMG00000025319 Sirt4 (ENSPEMG00000008498) #20 ENSPEMG00000025717 Pxn (ENSPEMG00000006601) #21 ENSPEMG00000030775 ENSPEMG00000008446 ##22 Gcn1 (ENSPEMG00000003097) #23 Rab35 (ENSPEMG00000008640) Bicdl1 (ENSPEMG00000019025) #25 Cit (ENSPEMG00000010653) Prkab1 (ENSPEMG00000008164) Tmem233 (ENSPEMG00000028294) Ccdc60 (ENSPEMG00000018944) Hspb8 (ENSPEMG00000030787) Srrm4 (ENSPEMG00000001823) Suds3 (ENSPEMG00000008610) Taok3 (ENSPEMG00000011978) Pebp1 (ENSPEMG00000005130) ENSPEMG00000026518 Wsb2 (ENSPEMG00000018736) Rfc5 (ENSPEMG00000008196) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a.b ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 354 ENSMOCG00000017040 Ankrd12 (ENSMOCG00000021346) Twsg1 (ENSMOCG00000000463) Ralbp1 (ENSMOCG00000019366) ENSMOCG00000020493 ENSMOCG00000000416 ENSMOCG00000005090 ENSMOCG00000020258 Rab31 (ENSMOCG00000022784) Vapa (ENSMOCG00000001029) Tmem232 (ENSMOCG00000003862) Man2a1 (ENSMOCG00000018786) Pja2 (ENSMOCG00000022161) Fer (ENSMOCG00000010661) ENSMOCG00000022954 ENSMOCG00000023037 ##22 ENSMOCG00000011127 Efna5 (ENSMOCG00000018750) ENSMOCG00000005450 ENSMOCG00000007368 Nudt12 (ENSMOCG00000005692) ENSMOCG00000015936 Macir (ENSMOCG00000018727) Ppip5k2 (ENSMOCG00000020966) Gin1 (ENSMOCG00000021884) Pam (ENSMOCG00000012283) ENSMOCG00000006301 ENSMOCG00000018358 Slco4c1 (ENSMOCG00000004368) ENSMOCG00000006288 ENSMOCG00000009291 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 5 ENSPEMG00000028429 Meox2 (ENSPEMG00000016173) Agmo (ENSPEMG00000000373) Dgkb (ENSPEMG00000014272) Etv1 (ENSPEMG00000019917) ENSPEMG00000022349 Arl4a (ENSPEMG00000029611) Scin (ENSPEMG00000000931) Lsmem1 (ENSPEMG00000026633) Ifrd1 (ENSPEMG00000000131) ENSPEMG00000025333 Zfp277 (ENSPEMG00000016665) Dock4 (ENSPEMG00000011461) Lrrn3 (ENSPEMG00000013198) Immp2l (ENSPEMG00000017740) ENSPEMG00000000820 ##22 ENSPEMG00000030494 Dnajb9 (ENSPEMG00000025224) Pnpla8 (ENSPEMG00000013308) Nrcam (ENSPEMG00000000666) ENSPEMG00000008750 Stxbp6 (ENSPEMG00000006826) Nova1 (ENSPEMG00000006503) Foxg1 (ENSPEMG00000014163) ENSPEMG00000011512 ENSPEMG00000029110 Prkd1 (ENSPEMG00000011695) G2e3 (ENSPEMG00000014724) Scfd1 (ENSPEMG00000013333) Coch (ENSPEMG00000014561) Strn3 (ENSPEMG00000018694) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 755 Traf3ip3 (ENSMAUG00000000850) Irf6 (ENSMAUG00000019003) Utp25 (ENSMAUG00000017463) Syt14 (ENSMAUG00000001868) ENSMAUG00000000396 Sertad4 (ENSMAUG00000000932) Hhat (ENSMAUG00000008212) Kcnh1 (ENSMAUG00000019709) Rcor3 (ENSMAUG00000000503) Traf5 (ENSMAUG00000001323) Rd3 (ENSMAUG00000019032) Slc30a1 (ENSMAUG00000021127) ENSMAUG00000001247 Nek2 (ENSMAUG00000007374) Lpgat1 (ENSMAUG00000000283) ENSMAUG00000000601 ##22 Ints7 (ENSMAUG00000002724) ENSMAUG00000021059 Ppp2r5a (ENSMAUG00000000319) Pacc1 (ENSMAUG00000009322) Nenf (ENSMAUG00000010743) Atf3 (ENSMAUG00000011123) Garin4 (ENSMAUG00000013757) Batf3 (ENSMAUG00000014205) Nsl1 (ENSMAUG00000016792) Tatdn3 (ENSMAUG00000018308) Spata45 (ENSMAUG00000016023) Flvcr1 (ENSMAUG00000016771) Vash2 (ENSMAUG00000009215) Angel2 (ENSMAUG00000010091) Rps6kc1 (ENSMAUG00000012269) Murinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618.sb #13 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00960000191875 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Mus ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.o #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00960000191875 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Mus_A DUPLICATION Mus_A DUPLICATION Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a.c.a ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a.c.a ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a.c.a ##22 spretus MODERN SPECIES 14 Unc119b (MGP_SPRETEiJ_G0028613) Mlec (MGP_SPRETEiJ_G0028614) #7 Cabp1 (MGP_SPRETEiJ_G0028615) #8 Pop5 (MGP_SPRETEiJ_G0028616) #9 Rnf10 (MGP_SPRETEiJ_G0028617) #10 Coq5 (MGP_SPRETEiJ_G0028618) #11 Dynll1 (MGP_SPRETEiJ_G0028619) #12 Srsf9 (MGP_SPRETEiJ_G0028620) #14 Gatc (MGP_SPRETEiJ_G0028621) #15 Triap1 (MGP_SPRETEiJ_G0028622) #16 Cox6a1 (MGP_SPRETEiJ_G0028623) ##17 Msi1 (MGP_SPRETEiJ_G0028624) #18 Pla2g1b (MGP_SPRETEiJ_G0028625) #19 Sirt4 (MGP_SPRETEiJ_G0028626) #20 MGP_SPRETEiJ_G0028627 #21 MGP_SPRETEiJ_G0028628 ##22 Gcn1 (MGP_SPRETEiJ_G0028629) #23 Rab35 (MGP_SPRETEiJ_G0028630) Bicdl1 (MGP_SPRETEiJ_G0028631) #25 Cit (MGP_SPRETEiJ_G0028632) Prkab1 (MGP_SPRETEiJ_G0028633) Tmem233 (MGP_SPRETEiJ_G0028634) Ccdc60 (MGP_SPRETEiJ_G0028635) Hspb8 (MGP_SPRETEiJ_G0028636) Srrm4 (MGP_SPRETEiJ_G0028637) Suds3 (MGP_SPRETEiJ_G0028638) Taok3 (MGP_SPRETEiJ_G0028639) Pebp1 (MGP_SPRETEiJ_G0028640) Vsig10 (MGP_SPRETEiJ_G0028641) Wsb2 (MGP_SPRETEiJ_G0028642) Rfc5 (MGP_SPRETEiJ_G0028643) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 12 MGP_CAROLIEiJ_G0025283 Lce1k (MGP_CAROLIEiJ_G0025284) Kprp (MGP_CAROLIEiJ_G0025285) Lce1l (MGP_CAROLIEiJ_G0025286) 2310050C09Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0025287) MGP_CAROLIEiJ_G0025288 MGP_CAROLIEiJ_G0025289 MGP_CAROLIEiJ_G0025290 MGP_CAROLIEiJ_G0025291 MGP_CAROLIEiJ_G0025292 Crct1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025293) Lce1m (MGP_CAROLIEiJ_G0025294) Crnn (MGP_CAROLIEiJ_G0025295) MGP_CAROLIEiJ_G0025296 Flg (MGP_CAROLIEiJ_G0025297) MGP_CAROLIEiJ_G0025298 ##22 MGP_CAROLIEiJ_G0025299 MGP_CAROLIEiJ_G0025300 MGP_CAROLIEiJ_G0025301 Tchhl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025302) S100a11 (MGP_CAROLIEiJ_G0025303) S100a10 (MGP_CAROLIEiJ_G0025304) MGP_CAROLIEiJ_G0025305 MGP_CAROLIEiJ_G0025306 C2cd4d (MGP_CAROLIEiJ_G0025307) Rorc (MGP_CAROLIEiJ_G0025308) Lingo4 (MGP_CAROLIEiJ_G0025309) Tdrkh (MGP_CAROLIEiJ_G0025310) MGP_CAROLIEiJ_G0025311 Mrpl9 (MGP_CAROLIEiJ_G0025312) Riiad1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025313) Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a.c.b ##22 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 14 Unc119b (MGP_CAROLIEiJ_G0027615) Mlec (MGP_CAROLIEiJ_G0027616) #7 Cabp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027617) #8 Pop5 (MGP_CAROLIEiJ_G0027618) #9 Rnf10 (MGP_CAROLIEiJ_G0027619) #10 Coq5 (MGP_CAROLIEiJ_G0027620) #11 Dynll1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027621) #12 Srsf9 (MGP_CAROLIEiJ_G0027622) #14 Gatc (MGP_CAROLIEiJ_G0027623) #15 Triap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027624) #16 Cox6a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027625) ##17 Msi1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027626) #18 Pla2g1b (MGP_CAROLIEiJ_G0027627) #19 Sirt4 (MGP_CAROLIEiJ_G0027628) #20 MGP_CAROLIEiJ_G0027629 #21 MGP_CAROLIEiJ_G0027630 ##22 Gcn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027631) #23 Rab35 (MGP_CAROLIEiJ_G0027632) Cit (MGP_CAROLIEiJ_G0027633) Prkab1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027634) Tmem233 (MGP_CAROLIEiJ_G0027635) Ccdc60 (MGP_CAROLIEiJ_G0027636) Hspb8 (MGP_CAROLIEiJ_G0027637) Srrm4 (MGP_CAROLIEiJ_G0027638) Suds3 (MGP_CAROLIEiJ_G0027639) Taok3 (MGP_CAROLIEiJ_G0027640) Pebp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027641) Vsig10 (MGP_CAROLIEiJ_G0027642) Wsb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027643) Rfc5 (MGP_CAROLIEiJ_G0027644) Ksr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027645) Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a.c.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a.c.b ##22 spretus MODERN SPECIES 7 Usp25 (MGP_SPRETEiJ_G0021784) MGP_SPRETEiJ_G0021785 Cxadr (MGP_SPRETEiJ_G0021786) MGP_SPRETEiJ_G0021787 Btg3 (MGP_SPRETEiJ_G0021788) D16Ertd472e (MGP_SPRETEiJ_G0021789) Chodl (MGP_SPRETEiJ_G0021790) Tmprss15 (MGP_SPRETEiJ_G0021791) Ncam2 (MGP_SPRETEiJ_G0021792) Mrpl39 (MGP_SPRETEiJ_G0021793) Jam2 (MGP_SPRETEiJ_G0021794) Atp5j (MGP_SPRETEiJ_G0021795) Gabpa (MGP_SPRETEiJ_G0021796) App (MGP_SPRETEiJ_G0021797) Cyyr1 (MGP_SPRETEiJ_G0021798) MGP_SPRETEiJ_G0021799 ##22 Adamts1 (MGP_SPRETEiJ_G0021800) Adamts5 (MGP_SPRETEiJ_G0021801) N6amt1 (MGP_SPRETEiJ_G0021802) Ltn1 (MGP_SPRETEiJ_G0021803) Rwdd2b (MGP_SPRETEiJ_G0021804) Usp16 (MGP_SPRETEiJ_G0021805) Cct8 (MGP_SPRETEiJ_G0021806) Map3k7cl (MGP_SPRETEiJ_G0021807) Bach1 (MGP_SPRETEiJ_G0021808) Grik1 (MGP_SPRETEiJ_G0021809) Cldn17 (MGP_SPRETEiJ_G0021810) Cldn8 (MGP_SPRETEiJ_G0021811) Krtap24-1 (MGP_SPRETEiJ_G0021812) 2310079G19Rik (MGP_SPRETEiJ_G0021813) Krtap26-1 (MGP_SPRETEiJ_G0021814) Mus_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.o #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00960000191875 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a.d ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.o #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00960000191875 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a.d ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.o #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00960000193046 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00960000191875 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.a.d ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 3377 Mlec (ENSMSIG00000010508) #7 Cabp1 (ENSMSIG00000010533) #8 Pop5 (ENSMSIG00000010678) #9 Rnf10 (ENSMSIG00000010698) #10 Coq5 (ENSMSIG00000010765) #11 Srsf9 (ENSMSIG00000010795) #14 Gatc (ENSMSIG00000010809) #15 Triap1 (ENSMSIG00000010821) #16 Cox6a1 (ENSMSIG00000010830) ##17 ENSMSIG00000010846 #18 ENSMSIG00000010942 ENSMSIG00000010948 #19 ENSMSIG00000011053 #20 ENSMSIG00000011114 ENSMSIG00000011129 #21 ENSMSIG00000011210 ##22 Gcn1 (ENSMSIG00000011226) #23 ENSMSIG00000011351 Rab35 (ENSMSIG00000011361) Bicdl1 (ENSMSIG00000011390) #25 Cit (ENSMSIG00000011444) Prkab1 (ENSMSIG00000012099) Tmem233 (ENSMSIG00000012120) Ccdc60 (ENSMSIG00000012141) Hspb8 (ENSMSIG00000012263) Srrm4 (ENSMSIG00000012281) ENSMSIG00000012334 Suds3 (ENSMSIG00000012350) Taok3 (ENSMSIG00000012407) Steppe mouse MODERN SPECIES 919 ENSMSIG00000007739 ##22 Mouse MODERN SPECIES 14 Unc119b (ENSMUSG00000046562) Mlec (ENSMUSG00000048578) #7 Cabp1 (ENSMUSG00000029544) #8 Pop5 (ENSMUSG00000060152) #9 Rnf10 (ENSMUSG00000041740) #10 Coq5 (ENSMUSG00000041733) #11 Dynll1 (ENSMUSG00000009013) #12 Srsf9 (ENSMUSG00000029538) #14 Gatc (ENSMUSG00000029536) #15 Triap1 (ENSMUSG00000029535) #16 Cox6a1 (ENSMUSG00000041697) ##17 Msi1 (ENSMUSG00000054256) #18 Pla2g1b (ENSMUSG00000029522) #19 Sirt4 (ENSMUSG00000029524) #20 Pxn (ENSMUSG00000029528) #21 Rplp0 (ENSMUSG00000067274) ##22 Gcn1 (ENSMUSG00000041638) #23 Rab35 (ENSMUSG00000029518) Bicdl1 (ENSMUSG00000041609) #25 Cit (ENSMUSG00000029516) Prkab1 (ENSMUSG00000029513) Tmem233 (ENSMUSG00000079278) Ccdc60 (ENSMUSG00000043913) Hspb8 (ENSMUSG00000041548) Srrm4 (ENSMUSG00000063919) Suds3 (ENSMUSG00000066900) Taok3 (ENSMUSG00000061288) Pebp1 (ENSMUSG00000032959) Vsig10 (ENSMUSG00000066894) Wsb2 (ENSMUSG00000029364) Rfc5 (ENSMUSG00000029363) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.b ##22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 352 Lrrc71 (ENSCGRG00001010641) Arhgef11 (ENSCGRG00001018844) ENSCGRG00001022805 Etv3 (ENSCGRG00001023444) Fcrl5 (ENSCGRG00001024696) Fcrl1 (ENSCGRG00001002734) Cd5l (ENSCGRG00001024433) ENSCGRG00001010645 Fcrls (ENSCGRG00001023718) Kirrel (ENSCGRG00001019106) ENSCGRG00001024546 ENSCGRG00001001996 Dclk2 (ENSCGRG00001024523) Lrba (ENSCGRG00001011663) Mab21l2 (ENSCGRG00001011307) ENSCGRG00001019518 ##22 Rps3a1 (ENSCGRG00001017462) Sh3d19 (ENSCGRG00001000110) Prss48 (ENSCGRG00001016837) ENSCGRG00001000269 Fhip1a (ENSCGRG00001016327) GATB (ENSCGRG00001024051) Fbxw7 (ENSCGRG00001024605) Tmem154 (ENSCGRG00001020221) Tigd4 (ENSCGRG00001012439) Arfip1 (ENSCGRG00001022813) Fhdc1 (ENSCGRG00001002573) Trim2 (ENSCGRG00001007113) ENSCGRG00001024742 Tmem131l (ENSCGRG00001007404) Tlr2 (ENSCGRG00001013303) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 92 B4galt6 (ENSCGRG00001023652) Ttr (ENSCGRG00001021304) Dsg3 (ENSCGRG00001017357) Dsg4 (ENSCGRG00001015415) ENSCGRG00001018683 Dsc1 (ENSCGRG00001018340) Dsc2 (ENSCGRG00001024514) Dsc3 (ENSCGRG00001018804) ENSCGRG00001000131 ENSCGRG00001020686 ENSCGRG00001019027 Cdh2 (ENSCGRG00001015862) Chst9 (ENSCGRG00001013825) Aqp4 (ENSCGRG00001023202) Kctd1 (ENSCGRG00001007208) ENSCGRG00001021440 ##22 Taf4b (ENSCGRG00001003694) Psma8 (ENSCGRG00001022616) Ss18 (ENSCGRG00001023153) Zfp521 (ENSCGRG00001024510) Hrh4 (ENSCGRG00001020367) Impact (ENSCGRG00001014462) ENSCGRG00001008388 Osbpl1a (ENSCGRG00001000881) Cabyr (ENSCGRG00001010088) Ttc39c (ENSCGRG00001022129) Lama3 (ENSCGRG00001008813) Ankrd29 (ENSCGRG00001014314) Npc1 (ENSCGRG00001018684) Rmc1 (ENSCGRG00001014209) Riok3 (ENSCGRG00001013249) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 33 Ptrh2 (ENSCGRG00001011782) Vmp1 (ENSCGRG00001006496) Tubd1 (ENSCGRG00001022519) Rps6kb1 (ENSCGRG00001010187) Rnft1 (ENSCGRG00001022766) Med13 (ENSCGRG00001012260) Ints2 (ENSCGRG00001004999) Brip1 (ENSCGRG00001014758) Tbx4 (ENSCGRG00001003392) Tbx2 (ENSCGRG00001002926) Bcas3 (ENSCGRG00001020361) Ppm1d (ENSCGRG00001000325) Appbp2 (ENSCGRG00001017780) Chct1 (ENSCGRG00001006750) ENSCGRG00001023587 ENSCGRG00001013461 ##22 Usp32 (ENSCGRG00001020062) Car4 (ENSCGRG00001008651) ENSCGRG00001019811 Myo19 (ENSCGRG00001016014) Pigw (ENSCGRG00001001433) Ggnbp2 (ENSCGRG00001004400) Dhrs11 (ENSCGRG00001017376) Mrm1 (ENSCGRG00001001937) Lhx1 (ENSCGRG00001018330) Aatf (ENSCGRG00001005527) Gm11437 (ENSCGRG00001012632) Acaca (ENSCGRG00001022253) Tada2a (ENSCGRG00001018460) Dusp14 (ENSCGRG00001010127) Synrg (ENSCGRG00001021744) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.b ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 21 Mfsd11 (ENSPEMG00000014004) Mgat5b (ENSPEMG00000005373) Sec14l1 (ENSPEMG00000011090) Septin9 (ENSPEMG00000016176) Tnrc6c (ENSPEMG00000009785) ENSPEMG00000027443 Tmc6 (ENSPEMG00000012089) Tmc8 (ENSPEMG00000012329) 6030468B19Rik (ENSPEMG00000005757) Syngr2 (ENSPEMG00000010557) Tk1 (ENSPEMG00000014295) Afmid (ENSPEMG00000013489) Birc5 (ENSPEMG00000007142) Tmem235 (ENSPEMG00000007972) Tha1 (ENSPEMG00000010615) ENSPEMG00000006732 ##22 Socs3 (ENSPEMG00000031054) Pgs1 (ENSPEMG00000018438) Dnah17 (ENSPEMG00000012181) Cyth1 (ENSPEMG00000010161) Usp36 (ENSPEMG00000016433) Timp2 (ENSPEMG00000026701) Lgals3bp (ENSPEMG00000016195) Cant1 (ENSPEMG00000018679) C1qtnf1 (ENSPEMG00000026107) Engase (ENSPEMG00000014032) Rbfox3 (ENSPEMG00000010500) Enpp7 (ENSPEMG00000016180) Cbx2 (ENSPEMG00000030547) Cbx8 (ENSPEMG00000018804) Cbx4 (ENSPEMG00000016584) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.a.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2639 Tsen34 (ENSMSIG00000007160) ENSMSIG00000007134 Tmc4 (ENSMSIG00000007100) Leng1 (ENSMSIG00000007082) Cnot3 (ENSMSIG00000007036) Prpf31 (ENSMSIG00000006948) Tfpt (ENSMSIG00000006893) ENSMSIG00000006868 Oscar (ENSMSIG00000006817) Tarm1 (ENSMSIG00000006740) Cacng6 (ENSMSIG00000006698) Cacng8 (ENSMSIG00000006679) Cacng7 (ENSMSIG00000006664) Prkcg (ENSMSIG00000000769) Myadm (ENSMSIG00000000569) ENSMSIG00000000562 ##22 Nlrp12 (ENSMSIG00000000526) AU018091 (ENSMSIG00000000409) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.b ##22 Rat MODERN SPECIES 3 Mlec (ENSRNOG00000064601) #7 Cabp1 (ENSRNOG00000001173) #8 Pop5 (ENSRNOG00000001199) #9 Rnf10 (ENSRNOG00000001172) #10 Coq5 (ENSRNOG00000001171) #11 ENSRNOG00000068496 #13 Dynll1 (ENSRNOG00000011222) #12 Srsf9 (ENSRNOG00000001163) #14 Gatc (ENSRNOG00000045621) #15 Triap1 (ENSRNOG00000001160) #16 Cox6a1 (ENSRNOG00000001170) ##17 Msi1 (ENSRNOG00000001156) #18 Pla2g1b (ENSRNOG00000001153) #19 Sirt4 (ENSRNOG00000001151) #20 Pxn (ENSRNOG00000001149) #21 Rplp0 (ENSRNOG00000001148) ##22 Gcn1 (ENSRNOG00000021871) #23 Rab35 (ENSRNOG00000022014) Bicdl1 (ENSRNOG00000056955) #25 Cit (ENSRNOG00000001143) Prkab1 (ENSRNOG00000001142) Tmem233 (ENSRNOG00000053974) Ccdc60 (ENSRNOG00000032684) Hspb8 (ENSRNOG00000022392) Srrm4 (ENSRNOG00000001141) Suds3 (ENSRNOG00000001139) Taok3 (ENSRNOG00000001138) Pebp1 (ENSRNOG00000001136) Vsig10 (ENSRNOG00000022698) Wsb2 (ENSRNOG00000001135) Rfc5 (ENSRNOG00000001134) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000014595.b ENSGT00390000016504 #7 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b.t #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n ##17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A.u #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 130 COQ5 (ENSCGRG00001009849) #11 ENSCGRG00001022287 #12 Srsf9 (ENSCGRG00001021965) #14 ENSCGRG00001019220 #15 Triap1 (ENSCGRG00001021863) #16 Cox6a1 (ENSCGRG00001021684) ##17 Msi1 (ENSCGRG00001018883) #18 ENSCGRG00001012740 #19 ENSCGRG00001010219 #19 ENSCGRG00001005863 #19 ENSCGRG00001016265 #19 ENSCGRG00001008684 ENSCGRG00001024937 SIRT4 (ENSCGRG00001024733) #20 Pxn (ENSCGRG00001010481) #21 ENSCGRG00001023247 ##22 Gcn1 (ENSCGRG00001005500) #23 Rab35 (ENSCGRG00001023636) Bicdl1 (ENSCGRG00001000846) #25 Cit (ENSCGRG00001014957) Prkab1 (ENSCGRG00001011789) Tmem233 (ENSCGRG00001008180) Ccdc60 (ENSCGRG00001021437) Hspb8 (ENSCGRG00001015702) Srrm4 (ENSCGRG00001000544) Suds3 (ENSCGRG00001018235) Taok3 (ENSCGRG00001023031) ENSCGRG00001019504 Vsig10 (ENSCGRG00001018184) Wsb2 (ENSCGRG00001003338) Rfc5 (ENSCGRG00001000176) Kangaroo rat DUPLICATION Kangaroo rat DUPLICATION Kangaroo rat MODERN SPECIES 456 Frmd3 (ENSDORG00000000390) Idnk (ENSDORG00000008263) Ubqln1 (ENSDORG00000015266) Gkap1 (ENSDORG00000026066) Kif27 (ENSDORG00000011169) 2210016F16Rik (ENSDORG00000016023) ENSDORG00000016024 Rmi1 (ENSDORG00000028852) Slc28a3 (ENSDORG00000008007) ENSDORG00000024890 Ntrk2 (ENSDORG00000007365) ENSDORG00000024497 Agtpbp1 (ENSDORG00000011166) Naa35 (ENSDORG00000001956) ENSDORG00000001970 ENSDORG00000008588 ##22 ENSDORG00000029969 Kangaroo rat MODERN SPECIES 333 Plk1 (ENSDORG00000001245) Dctn5 (ENSDORG00000012604) ENSDORG00000012600 Ndufab1 (ENSDORG00000001412) Ubfd1 (ENSDORG00000001403) Ears2 (ENSDORG00000001402) Gga2 (ENSDORG00000011649) Cog7 (ENSDORG00000007290) Scnn1b (ENSDORG00000025617) Scnn1g (ENSDORG00000011648) Usp31 (ENSDORG00000004669) Hs3st2 (ENSDORG00000012824) Otoa (ENSDORG00000024446) Igsf6 (ENSDORG00000009216) Mettl9 (ENSDORG00000009215) ENSDORG00000025673 ##22 Cdr2 (ENSDORG00000029069) Polr3e (ENSDORG00000014078) Eef2k (ENSDORG00000014075) Gm5737 (ENSDORG00000005925) ENSDORG00000028502 Mosmo (ENSDORG00000010954) Pdzd9 (ENSDORG00000001916) Uqcrc2 (ENSDORG00000028329) Crym (ENSDORG00000003402) Anks4b (ENSDORG00000008693) Tmem159 (ENSDORG00000006852) ENSDORG00000029973 Dnah3 (ENSDORG00000006840) Lyrm1 (ENSDORG00000025180) Dcun1d3 (ENSDORG00000029001) Kangaroo rat MODERN SPECIES 342 Unc119b (ENSDORG00000023526) Mlec (ENSDORG00000026837) #7 ENSDORG00000028706 Pop5 (ENSDORG00000029401) #9 Rnf10 (ENSDORG00000006157) #10 ENSDORG00000029773 Coq5 (ENSDORG00000006156) #11 ENSDORG00000030011 #12 Srsf9 (ENSDORG00000013162) #14 Triap1 (ENSDORG00000013157) #16 Cox6a1 (ENSDORG00000028878) ##17 Msi1 (ENSDORG00000005610) #18 Pla2g1b (ENSDORG00000005190) #19 Sirt4 (ENSDORG00000027939) #20 ENSDORG00000023577 #21 ENSDORG00000029016 ##22 Gcn1 (ENSDORG00000000975) #23 Rab35 (ENSDORG00000000972) Bicdl1 (ENSDORG00000000969) #25 Cit (ENSDORG00000014600) Prkab1 (ENSDORG00000028447) Hspb8 (ENSDORG00000013686) Srrm4 (ENSDORG00000015243) Suds3 (ENSDORG00000003983) Taok3 (ENSDORG00000001342) Pbp2 (ENSDORG00000027183) Wsb2 (ENSDORG00000011782) Rfc5 (ENSDORG00000011777) Ksr2 (ENSDORG00000001105) Nos1 (ENSDORG00000009177) Fbxo21 (ENSDORG00000009176) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 156 ACVR1 (ENSCLAG00000004342) UPP2 (ENSCLAG00000003919) CCDC148 (ENSCLAG00000003622) PKP4 (ENSCLAG00000005831) DAPL1 (ENSCLAG00000004812) TANC1 (ENSCLAG00000004542) ENSCLAG00000007913 BAZ2B (ENSCLAG00000006190) ENSCLAG00000009790 MARCHF7 (ENSCLAG00000009318) CD302 (ENSCLAG00000012904) LY75 (ENSCLAG00000004023) PLA2R1 (ENSCLAG00000003681) ITGB6 (ENSCLAG00000003399) RBMS1 (ENSCLAG00000003031) ENSCLAG00000002833 ##22 TANK (ENSCLAG00000002677) ENSCLAG00000010278 TBR1 (ENSCLAG00000010093) SLC4A10 (ENSCLAG00000002940) DPP4 (ENSCLAG00000002709) GCG (ENSCLAG00000002597) FAP (ENSCLAG00000011098) IFIH1 (ENSCLAG00000008509) GCA (ENSCLAG00000007904) KCNH7 (ENSCLAG00000005890) FIGN (ENSCLAG00000005735) GRB14 (ENSCLAG00000004467) COBLL1 (ENSCLAG00000002534) SLC38A11 (ENSCLAG00000002390) SCN3A (ENSCLAG00000005437) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 15 KIF2C (ENSMMMG00000019460) ARMH1 (ENSMMMG00000000087) TMEM53 (ENSMMMG00000000115) RNF220 (ENSMMMG00000000157) ERI3 (ENSMMMG00000000242) DMAP1 (ENSMMMG00000000264) ENSMMMG00000000285 SLC6A9 (ENSMMMG00000000316) CCDC24 (ENSMMMG00000000389) B4GALT2 (ENSMMMG00000000415) ATP6V0B (ENSMMMG00000000438) DPH2 (ENSMMMG00000000471) IPO13 (ENSMMMG00000000493) ARTN (ENSMMMG00000000545) ST3GAL3 (ENSMMMG00000000564) ENSMMMG00000000640 ##22 KDM4A (ENSMMMG00000000651) ENSMMMG00000000772 PTPRF (ENSMMMG00000000795) HYI (ENSMMMG00000000876) SZT2 (ENSMMMG00000000919) MED8 (ENSMMMG00000001069) ELOVL1 (ENSMMMG00000001113) CDC20 (ENSMMMG00000001150) MPL (ENSMMMG00000001171) TIE1 (ENSMMMG00000001231) C1orf210 (ENSMMMG00000001310) TMEM125 (ENSMMMG00000001319) CFAP57 (ENSMMMG00000001332) EBNA1BP2 (ENSMMMG00000001428) ENSMMMG00000001451 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.e.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.e.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.e.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.e.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.e.a ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 84 ENSRBIG00000040622 ##22 MED14 (ENSRBIG00000038799) CXorf38 (ENSRBIG00000011595) ATP6AP2 (ENSRBIG00000033262) ENSRBIG00000041722 Tarsier MODERN SPECIES 5965 FADS2 (ENSTSYG00000027730) FADS3 (ENSTSYG00000028544) RAB3IL1 (ENSTSYG00000026945) BEST1 (ENSTSYG00000005300) ENSTSYG00000005342 ENSTSYG00000035265 ##22 INCENP (ENSTSYG00000035004) ENSTSYG00000035917 ENSTSYG00000034665 ENSTSYG00000027155 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.e.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.e.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.e.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.e.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.e.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 91 ENPP1 (ENSSBOG00000020891) ENSSBOG00000021040 ENPP3 (ENSSBOG00000034636) MED23 (ENSSBOG00000021347) ARG1 (ENSSBOG00000028695) ENSSBOG00000032757 AKAP7 (ENSSBOG00000024938) EPB41L2 (ENSSBOG00000019108) SMLR1 (ENSSBOG00000022845) TMEM200A (ENSSBOG00000019814) SAMD3 (ENSSBOG00000018556) L3MBTL3 (ENSSBOG00000024884) TMEM244 (ENSSBOG00000033327) ARHGAP18 (ENSSBOG00000027485) LAMA2 (ENSSBOG00000030144) ENSSBOG00000032913 ##22 PTPRK (ENSSBOG00000031629) THEMIS (ENSSBOG00000033862) C6orf58 (ENSSBOG00000033907) SOGA3 (ENSSBOG00000019637) KIAA0408 (ENSSBOG00000030407) ENSSBOG00000006821 ECHDC1 (ENSSBOG00000022121) ENSSBOG00000029715 ENSSBOG00000020969 RSPO3 (ENSSBOG00000024997) ENSSBOG00000023887 CENPW (ENSSBOG00000027071) TRMT11 (ENSSBOG00000026579) ENSSBOG00000034181 ENSSBOG00000022486 Tarsier MODERN SPECIES 6412 ABTB3 (ENSTSYG00000014668) ENSTSYG00000032231 ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ##22 Orangutan MODERN SPECIES 10 ENSPPYG00000029596 LILRA5 (ENSPPYG00000010378) LILRA4 (ENSPPYG00000010379) LAIR1 (ENSPPYG00000010380) ENSPPYG00000010381 LENG8 (ENSPPYG00000010382) LENG9 (ENSPPYG00000032758) CDC42EP5 (ENSPPYG00000010384) ENSPPYG00000010391 ENSPPYG00000010521 ENSPPYG00000038639 ENSPPYG00000010390 FCAR (ENSPPYG00000010393) NCR1 (ENSPPYG00000029449) NLRP7 (ENSPPYG00000010394) ENSPPYG00000010395 ##22 NLRP2 (ENSPPYG00000010396) ENSPPYG00000010385 ENSPPYG00000040255 LILRA2 (ENSPPYG00000029712) ENSPPYG00000010387 ENSPPYG00000010388 LILRB4 (ENSPPYG00000034755) ENSPPYG00000010564 ENSPPYG00000010389 ENSPPYG00000010392 RDH13 (ENSPPYG00000010398) EPS8L1 (ENSPPYG00000010399) PPP1R12C (ENSPPYG00000010400) ENSPPYG00000010401 TNNI3 (ENSPPYG00000010403) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000001116 ENSGT00940000161088 ENSGT00390000017998 ENSGT00940000156786 ENSGT00940000156429 ENSGT00950000182885.A.b ENSGT00940000155878 ENSGT00940000162576 ENSGT00910000147024 ENSGT00940000157371 ENSGT00940000159670 ENSGT00940000162547 ENSGT00940000162357 ENSGT00940000160727 ENSGT00390000018775 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ##22 ENSGT00440000039564.b ENSGT00940000153362.a ENSGT00390000002417 ENSGT00960000192410 ENSGT00940000156622 ENSGT00530000063074.b.b ENSGT00940000154980 ENSGT00940000157713 ENSGT00940000158014 ENSGT01100000263748 ENSGT00940000155142.i.a.a ENSGT00940000155394 ENSGT00390000000406 ENSGT00940000156120.a ENSGT00940000160698 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000001116 ENSGT00940000161088 ENSGT00390000017998 ENSGT00940000156786 ENSGT00940000156429 ENSGT00950000182885.A.b ENSGT00940000155878 ENSGT00940000162576 ENSGT00910000147024 ENSGT00940000157371 ENSGT00940000159670 ENSGT00940000162547 ENSGT00940000162357 ENSGT00940000160727 ENSGT00390000018775 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ##22 ENSGT00440000039564.b ENSGT00940000153362.a ENSGT00390000002417 ENSGT00960000192410 ENSGT00940000156622 ENSGT00530000063074.b.b ENSGT00940000154980 ENSGT00940000157713 ENSGT00940000158014 ENSGT01100000263748 ENSGT00940000155142.i.a.a ENSGT00940000155394 ENSGT00390000000406 ENSGT00940000156120.a ENSGT00940000160698 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161088 ENSGT00390000017998 ENSGT00940000156786 ENSGT00940000156429 ENSGT00950000182885.A.b ENSGT00940000155878 ENSGT00410000025695.a.n.b ENSGT00940000162576 ENSGT00910000147024 ENSGT00940000157371 ENSGT00940000159670 ENSGT00940000162547 ENSGT00940000162357 ENSGT00940000160727 ENSGT00390000018775 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ##22 ENSGT00440000039564.b ENSGT00940000153362.a ENSGT00390000002417 ENSGT00960000192410 ENSGT00940000156622 ENSGT01050000244986.b.b.d.a.a.b ENSGT00390000009168.hb ENSGT00530000063074.b.b ENSGT00940000154980 ENSGT00940000157713 ENSGT00940000158014 ENSGT01100000263748 ENSGT00940000155142.i.a.a ENSGT00940000155394 ENSGT00390000000406 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00530000063666.a.m.a.a.b ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281.i ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000155266.lb ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153525.g.a ENSGT00940000163182 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 268 ENSGT00940000153525.g.a ENSGT00940000163182 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 389 PBDC1 (ENSCATG00000034130) ENSCATG00000032399 MAGEE1 (ENSCATG00000031411) ENSCATG00000011638 ##22 Drill MODERN SPECIES 1717 ENSMLEG00000041342 MAGEE1 (ENSMLEG00000034318) ENSMLEG00000027377 ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165171 ENSGT00940000160311 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281.i ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000155266.lb ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ##22 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.a.a.b ENSGT00940000161697.f ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00950000183070.a.a.i.a.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT00950000182907.a.b.b.a.q.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT00940000155351.bb.d ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 175 ZCCHC13 (ENSMFAG00000039978) ENSMFAG00000030404 SLC16A2 (ENSMFAG00000034044) RLIM (ENSMFAG00000063132) NEXMIF (ENSMFAG00000001576) ABCB7 (ENSMFAG00000041203) UPRT (ENSMFAG00000049237) ENSMFAG00000062687 ZDHHC15 (ENSMFAG00000041334) ENSMFAG00000056999 MAGEE2 (ENSMFAG00000022309) ENSMFAG00000053334 PBDC1 (ENSMFAG00000039912) ENSMFAG00000052737 ENSMFAG00000054114 ENSMFAG00000033199 ##22 ENSMFAG00000064327 FGF16 (ENSMFAG00000044477) ATRX (ENSMFAG00000031719) ENSMFAG00000053041 MAGT1 (ENSMFAG00000031612) COX7B (ENSMFAG00000002971) ATP7A (ENSMFAG00000037371) ENSMFAG00000031271 TAF9B (ENSMFAG00000045420) CYSLTR1 (ENSMFAG00000053095) ENSMFAG00000031310 LPAR4 (ENSMFAG00000025015) P2RY10 (ENSMFAG00000065797) ENSMFAG00000058091 GPR174 (ENSMFAG00000048513) Pig-tailed macaque DUPLICATION Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 85 PBDC1 (ENSMNEG00000018878) MAGEE1 (ENSMNEG00000039780) ENSMNEG00000028125 ##22 FGF16 (ENSMNEG00000036453) ATRX (ENSMNEG00000033171) MAGT1 (ENSMNEG00000039288) ENSMNEG00000033259 ATP7A (ENSMNEG00000018557) ENSMNEG00000034194 TAF9B (ENSMNEG00000040165) CYSLTR1 (ENSMNEG00000013446) ENSMNEG00000030251 ENSMNEG00000034394 LPAR4 (ENSMNEG00000026886) ENSMNEG00000039449 P2RY10 (ENSMNEG00000001678) ENSMNEG00000004426 GPR174 (ENSMNEG00000015097) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 517 THAP2 (ENSMNEG00000038799) TMEM19 (ENSMNEG00000032989) RAB21 (ENSMNEG00000037678) TBC1D15 (ENSMNEG00000044834) TPH2 (ENSMNEG00000036855) TRHDE (ENSMNEG00000038410) ENSMNEG00000035574 ATXN7L3B (ENSMNEG00000006304) ENSMNEG00000002104 KCNC2 (ENSMNEG00000035997) CAPS2 (ENSMNEG00000011146) GLIPR1L1 (ENSMNEG00000028603) GLIPR1L2 (ENSMNEG00000044396) GLIPR1 (ENSMNEG00000044536) ENSMNEG00000034922 ENSMNEG00000045114 ##22 ENSMNEG00000040738 PHLDA1 (ENSMNEG00000033607) NAP1L1 (ENSMNEG00000035793) BBS10 (ENSMNEG00000040224) ENSMNEG00000030308 OSBPL8 (ENSMNEG00000028835) ENSMNEG00000032096 ENSMNEG00000035026 ZDHHC17 (ENSMNEG00000028456) CSRP2 (ENSMNEG00000030922) E2F7 (ENSMNEG00000025875) NAV3 (ENSMNEG00000043424) ENSMNEG00000000985 ENSMNEG00000009689 ENSMNEG00000026858 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000017536 ENSGT00910000147781 ENSGT00950000183012.A.b ENSGT00940000155036.k.b.a ENSGT00940000161089 ENSGT00950000183151.a.a.a ENSGT00390000015415 ENSGT00950000183197.b.a ENSGT00390000018587 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00730000110905.a ENSGT00390000001149 ENSGT00390000003127 ENSGT00910000147348 ENSGT00940000157180 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ##22 ENSGT00940000161192 ENSGT00500000045299 ENSGT00530000063626.a ENSGT00390000010089.f ENSGT00940000155807.a ENSGT00950000182990.a.a.b.b ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00950000183316 ENSGT00910000147498 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ENSGT00730000111073 Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 416 GLIPR1L1 (ENSRBIG00000031640) GLIPR1L2 (ENSRBIG00000040782) GLIPR1 (ENSRBIG00000034588) KRR1 (ENSRBIG00000033716) ENSRBIG00000029304 ##22 ENSRBIG00000034429 PHLDA1 (ENSRBIG00000034999) ENSRBIG00000039726 ENSRBIG00000044471 BBS10 (ENSRBIG00000044840) OSBPL8 (ENSRBIG00000042807) ZDHHC17 (ENSRBIG00000036627) CSRP2 (ENSRBIG00000001565) E2F7 (ENSRBIG00000044218) NAV3 (ENSRBIG00000032816) ENSRBIG00000035549 ENSRBIG00000044553 ENSRBIG00000044674 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 600 ENSRBIG00000007008 ENSRBIG00000024349 VWCE (ENSRBIG00000035048) DDB1 (ENSRBIG00000033611) TKFC (ENSRBIG00000031373) CYB561A3 (ENSRBIG00000031687) TMEM138 (ENSRBIG00000030263) TMEM216 (ENSRBIG00000036394) CPSF7 (ENSRBIG00000031429) SDHAF2 (ENSRBIG00000044308) PPP1R32 (ENSRBIG00000038344) ENSRBIG00000036470 SYT7 (ENSRBIG00000022112) ENSRBIG00000031119 ##22 DAGLA (ENSRBIG00000036039) ENSRBIG00000035052 MYRF (ENSRBIG00000036200) TMEM258 (ENSRBIG00000041933) FEN1 (ENSRBIG00000014908) FADS1 (ENSRBIG00000037740) ENSRBIG00000031562 FADS2 (ENSRBIG00000043060) ENSRBIG00000023735 FADS3 (ENSRBIG00000035575) RAB3IL1 (ENSRBIG00000013414) BEST1 (ENSRBIG00000027850) FTH1 (ENSRBIG00000044604) INCENP (ENSRBIG00000040656) ENSRBIG00000038214 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 775 ENSRROG00000029990 ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2511 CD5 (ENSRROG00000038716) ENSRROG00000034129 VPS37C (ENSRROG00000043472) ENSRROG00000036152 VWCE (ENSRROG00000031637) DDB1 (ENSRROG00000041407) TKFC (ENSRROG00000030683) CYB561A3 (ENSRROG00000040114) TMEM138 (ENSRROG00000010574) TMEM216 (ENSRROG00000035894) CPSF7 (ENSRROG00000045009) SDHAF2 (ENSRROG00000037877) PPP1R32 (ENSRROG00000030339) ENSRROG00000041353 SYT7 (ENSRROG00000039141) ENSRROG00000043436 ##22 DAGLA (ENSRROG00000000749) ENSRROG00000041185 MYRF (ENSRROG00000042444) ENSRROG00000043536 FEN1 (ENSRROG00000018718) FADS1 (ENSRROG00000034617) ENSRROG00000035548 FADS2 (ENSRROG00000040657) ENSRROG00000020489 FADS3 (ENSRROG00000037612) RAB3IL1 (ENSRROG00000013229) BEST1 (ENSRROG00000034577) ENSRROG00000030005 INCENP (ENSRROG00000030466) ENSRROG00000023884 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 3188 ENSEEUG00000007553 ##22 GCN1 (ENSEEUG00000007013) #23 RAB35 (ENSEEUG00000006929) ENSEEUG00000006704 #25 Common shrew MODERN SPECIES 13576 ENSSARG00000006428 ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 1 TBC1D30 (ENSRFEG00010001766) GNS (ENSRFEG00010001681) RASSF3 (ENSRFEG00010001592) ENSRFEG00010001546 TBK1 (ENSRFEG00010001510) XPOT (ENSRFEG00010001458) C12orf56 (ENSRFEG00010001370) KICS2 (ENSRFEG00010001305) SRGAP1 (ENSRFEG00010001271) RXYLT1 (ENSRFEG00010001209) AVPR1A (ENSRFEG00010001185) PPM1H (ENSRFEG00010001118) MON2 (ENSRFEG00010000888) ENSRFEG00010000769 TAFA2 (ENSRFEG00010000707) ENSRFEG00010000681 ##22 SLC16A7 (ENSRFEG00010000654) LRIG3 (ENSRFEG00010000572) ATP23 (ENSRFEG00010000518) CTDSP2 (ENSRFEG00010000437) AVIL (ENSRFEG00010017502) TSFM (ENSRFEG00010017349) EEF1AKMT3 (ENSRFEG00010017275) METTL1 (ENSRFEG00010017174) CYP27B1 (ENSRFEG00010017027) MARCHF9 (ENSRFEG00010016968) CDK4 (ENSRFEG00010016927) TSPAN31 (ENSRFEG00010016812) AGAP2 (ENSRFEG00010016731) OS9 (ENSRFEG00010016224) B4GALNT1 (ENSRFEG00010016048) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Red fox MODERN SPECIES 64 DDX43 (ENSVVUG00000013908) CGAS (ENSVVUG00000013922) MTO1 (ENSVVUG00000013926) ENSVVUG00000013930 SLC17A5 (ENSVVUG00000013934) CD109 (ENSVVUG00000013948) ENSVVUG00000013998 COL12A1 (ENSVVUG00000014007) ENSVVUG00000014077 TMEM30A (ENSVVUG00000014078) FILIP1 (ENSVVUG00000014093) SENP6 (ENSVVUG00000014116) MYO6 (ENSVVUG00000014229) IMPG1 (ENSVVUG00000015999) ENSVVUG00000016016 ENSVVUG00000016021 ##22 HTR1B (ENSVVUG00000016034) MEI4 (ENSVVUG00000016043) ENSVVUG00000016055 IRAK1BP1 (ENSVVUG00000016082) PHIP (ENSVVUG00000016183) HMGN3 (ENSVVUG00000019173) LCA5 (ENSVVUG00000019184) ENSVVUG00000019190 ELOVL4 (ENSVVUG00000019199) TTK (ENSVVUG00000019206) BCKDHB (ENSVVUG00000019223) TENT5A (ENSVVUG00000019239) IBTK (ENSVVUG00000019246) ENSVVUG00000019256 TPBG (ENSVVUG00000019258) Felidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 ENSGT00940000158788 ENSGT00390000007354 ENSGT01080000257333.E.o.a.b ENSGT00390000018729.a.a ENSGT00390000018729.a.b ENSGT00940000158784 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 ENSGT00940000159026 ENSGT00940000161402 ENSGT00940000156943 ENSGT00940000158673 ENSGT00390000011152 ENSGT00940000164615 ENSGT00390000018344.l.b ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000157051 ENSGT00390000000916 ENSGT00940000156387 ENSGT00950000183094.b.b ENSGT00390000013383.e ENSGT00940000154732 ENSGT00390000014303 Panthera ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 ENSGT00940000158788 ENSGT00390000007354 ENSGT01080000257333.E.o.a.b ENSGT00390000018729.a.a ENSGT00390000018729.a.b ENSGT00940000158784 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 ENSGT00940000159026 ENSGT00940000161402 ENSGT00940000156943 ENSGT00940000158673 ENSGT00390000011152 ENSGT00940000164615 ENSGT00390000018344.l.b ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000157051 ENSGT00390000000916 ENSGT00940000156387 ENSGT00950000183094.b.b ENSGT00390000013383.e ENSGT00940000154732 ENSGT00390000014303 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 ENSGT00940000158788 ENSGT00390000007354 ENSGT01080000257333.E.o.a.b ENSGT00390000018729.a.a ENSGT00390000018729.a.b ENSGT00940000158784 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 ENSGT00940000159026 ENSGT00940000161402 ENSGT00940000156943 ENSGT00940000158673 ENSGT00390000011152 ENSGT00940000164615 ENSGT00390000018344.l.b ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000157051 ENSGT00390000000916 ENSGT00940000156387 ENSGT00950000183094.b.b ENSGT00390000013383.e ENSGT00940000154732 ENSGT00390000014303 lion MODERN SPECIES 12 DOK6 (ENSPLOG00000010297) CD226 (ENSPLOG00000010252) RTTN (ENSPLOG00000010132) SOCS6 (ENSPLOG00000010099) CBLN2 (ENSPLOG00000010061) NETO1 (ENSPLOG00000009969) FBXO15 (ENSPLOG00000009901) TIMM21 (ENSPLOG00000009879) ENSPLOG00000009842 C18orf63 (ENSPLOG00000009775) DIPK1C (ENSPLOG00000009732) CNDP1 (ENSPLOG00000009562) ZNF407 (ENSPLOG00000009501) PTGR3 (ENSPLOG00000009474) TSHZ1 (ENSPLOG00000009446) ENSPLOG00000009414 ##22 SYT4 (ENSPLOG00000009364) RIT2 (ENSPLOG00000009229) PIK3C3 (ENSPLOG00000008939) ENSPLOG00000008840 CELF4 (ENSPLOG00000008424) KIAA1328 (ENSPLOG00000008318) ENSPLOG00000008249 FHOD3 (ENSPLOG00000007767) MOCOS (ENSPLOG00000007580) ELP2 (ENSPLOG00000007229) SLC39A6 (ENSPLOG00000007028) RPRD1A (ENSPLOG00000006984) C18orf21 (ENSPLOG00000006945) GALNT1 (ENSPLOG00000006888) INO80C (ENSPLOG00000006836) leopard MODERN SPECIES 43 HDHD2 (ENSPPRG00000022964) KATNAL2 (ENSPPRG00000023079) PIAS2 (ENSPPRG00000023399) ST8SIA5 (ENSPPRG00000018954) LOXHD1 (ENSPPRG00000016773) RNF165 (ENSPPRG00000006559) C18orf25 (ENSPPRG00000005801) HAUS1 (ENSPPRG00000004691) ATP5F1A (ENSPPRG00000004018) PSTPIP2 (ENSPPRG00000002553) EPG5 (ENSPPRG00000000539) SIGLEC15 (ENSPPRG00000000322) SLC14A1 (ENSPPRG00000022676) ENSPPRG00000024428 SETBP1 (ENSPPRG00000024951) ENSPPRG00000022104 ##22 SYT4 (ENSPPRG00000021203) ENSPPRG00000019604 Cat MODERN SPECIES 243 HDHD2 (ENSFCAG00000002788) KATNAL2 (ENSFCAG00000018778) PIAS2 (ENSFCAG00000002787) ST8SIA5 (ENSFCAG00000002786) LOXHD1 (ENSFCAG00000002785) RNF165 (ENSFCAG00000002784) CD3H18orf25 (ENSFCAG00000030676) HAUS1 (ENSFCAG00000003729) ATP5F1A (ENSFCAG00000025952) PSTPIP2 (ENSFCAG00000029753) EPG5 (ENSFCAG00000010674) SIGLEC15 (ENSFCAG00000031358) SLC14A1 (ENSFCAG00000025903) ENSFCAG00000010670 SETBP1 (ENSFCAG00000007346) ENSFCAG00000045259 ##22 SYT4 (ENSFCAG00000033996) RIT2 (ENSFCAG00000010100) PIK3C3 (ENSFCAG00000022869) CELF4 (ENSFCAG00000045234) KIAA1328 (ENSFCAG00000035756) ENSFCAG00000036542 FHOD3 (ENSFCAG00000008802) MOCOS (ENSFCAG00000008801) ELP2 (ENSFCAG00000025491) SLC39A6 (ENSFCAG00000031649) RPRD1A (ENSFCAG00000026059) CD3H18orf21 (ENSFCAG00000000626) GALNT1 (ENSFCAG00000027087) INO80C (ENSFCAG00000003291) ZNF396 (ENSFCAG00000003290) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Yarkand deer MODERN SPECIES 28 UNC119B (ENSCHYG00000002573) MLEC (ENSCHYG00000002591) #7 ENSCHYG00000002614 #8 ENSCHYG00000002647 POP5 (ENSCHYG00000002661) #9 RNF10 (ENSCHYG00000002709) #10 COQ5 (ENSCHYG00000002831) #11 ENSCHYG00000002861 #12 SRSF9 (ENSCHYG00000002881) #14 ENSCHYG00000002908 ##17 ENSCHYG00000002940 MSI1 (ENSCHYG00000002954) #18 PLA2G1B (ENSCHYG00000002985) #19 SIRT4 (ENSCHYG00000003002) #20 PXN (ENSCHYG00000003049) #21 ENSCHYG00000003150 ##22 GCN1 (ENSCHYG00000003222) #23 RAB35 (ENSCHYG00000003441) BICDL1 (ENSCHYG00000003470) #25 ALDH2 (ENSCHYG00000003523) #26 MAPKAPK5 (ENSCHYG00000003619) #27 ENSCHYG00000003680 #28 TMEM116 (ENSCHYG00000003710) #30 ERP29 (ENSCHYG00000003761) #32 NAA25 (ENSCHYG00000003793) #33 TRAFD1 (ENSCHYG00000003861) #34 HECTD4 (ENSCHYG00000003932) #35 ENSCHYG00000003976 ENSCHYG00000003988 ##36 PTPN11 (ENSCHYG00000004010) #37 RPH3A (ENSCHYG00000000100) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Goat MODERN SPECIES 27 PDCD1LG2 (ENSCHIG00000024438) RIC1 (ENSCHIG00000021856) ERMP1 (ENSCHIG00000026817) MLANA (ENSCHIG00000014493) KIAA2026 (ENSCHIG00000024183) RANBP6 (ENSCHIG00000006704) IL33 (ENSCHIG00000020304) ENSCHIG00000026418 UHRF2 (ENSCHIG00000015113) GLDC (ENSCHIG00000022064) ENSCHIG00000003295 ENSCHIG00000003454 KDM4C (ENSCHIG00000026551) DMAC1 (ENSCHIG00000012785) PTPRD (ENSCHIG00000017325) ENSCHIG00000023085 ##22 ENSCHIG00000007639 ENSCHIG00000016449 TYRP1 (ENSCHIG00000026269) LURAP1L (ENSCHIG00000015129) MPDZ (ENSCHIG00000022331) ENSCHIG00000024971 NFIB (ENSCHIG00000012253) ZDHHC21 (ENSCHIG00000021429) CER1 (ENSCHIG00000016733) FREM1 (ENSCHIG00000026018) TTC39B (ENSCHIG00000010421) SNAPC3 (ENSCHIG00000020068) ENSCHIG00000016679 ENSCHIG00000008194 CCDC171 (ENSCHIG00000013723) Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 9 P2RY10 (ENSMMSG00000000233) LPAR4 (ENSMMSG00000000242) ENSMMSG00000000270 CYSLTR1 (ENSMMSG00000000289) ENSMMSG00000000301 TAF9B (ENSMMSG00000000384) ENSMMSG00000000413 ENSMMSG00000000439 ATP7A (ENSMMSG00000000479) ENSMMSG00000000541 MAGT1 (ENSMMSG00000000570) ATRX (ENSMMSG00000000633) FGF16 (ENSMMSG00000000801) ENSMMSG00000000830 PBDC1 (ENSMMSG00000000843) ENSMMSG00000000865 ##22 MAGEE2 (ENSMMSG00000000878) ZDHHC15 (ENSMMSG00000000902) UPRT (ENSMMSG00000000982) ABCB7 (ENSMMSG00000001025) ENSMMSG00000001187 NEXMIF (ENSMMSG00000001198) RLIM (ENSMMSG00000001223) SLC16A2 (ENSMMSG00000001236) ZCCHC13 (ENSMMSG00000001254) ENSMMSG00000001290 CHIC1 (ENSMMSG00000001301) CDX4 (ENSMMSG00000001319) ENSMMSG00000001340 ENSMMSG00000001364 ENSMMSG00000001383 Siberian musk deer MODERN SPECIES 279 ENSMMSG00000005872 ENSMMSG00000005849 ##22 ENSMMSG00000005800 CADM2 (ENSMMSG00000005641) VGLL3 (ENSMMSG00000005580) CHMP2B (ENSMMSG00000005505) POU1F1 (ENSMMSG00000005357) CGGBP1 (ENSMMSG00000005329) ZNF654 (ENSMMSG00000005277) C3orf38 (ENSMMSG00000005242) CSNKA2IP (ENSMMSG00000005187) ENSMMSG00000005161 EPHA3 (ENSMMSG00000005101) PROS1 (ENSMMSG00000004821) STX19 (ENSMMSG00000004737) ARL13B (ENSMMSG00000004620) NSUN3 (ENSMMSG00000004538) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 299 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000014595.b ENSGT00390000016504 #7 ENSGT00940000158555 #8 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612 #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 ENSGT00940000170510 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 Armadillo MODERN SPECIES 2156 MLEC (ENSDNOG00000011615) #7 ENSDNOG00000042834 #8 ENSDNOG00000012668 #9 RNF10 (ENSDNOG00000012640) #10 COQ5 (ENSDNOG00000012631) #11 DYNLL1 (ENSDNOG00000031391) #12 SRSF9 (ENSDNOG00000012598) #14 GATC (ENSDNOG00000012593) #15 TRIAP1 (ENSDNOG00000012588) #16 COX6A1 (ENSDNOG00000042128) #17 ENSDNOG00000040794 MSI1 (ENSDNOG00000005713) #18 PLA2G1B (ENSDNOG00000046317) #19 SIRT4 (ENSDNOG00000038654) #20 PXN (ENSDNOG00000045456) #21 ENSDNOG00000044347 ##22 GCN1 (ENSDNOG00000011771) #23 RAB35 (ENSDNOG00000012013) BICDL1 (ENSDNOG00000044681) #25 ENSDNOG00000031711 ENSDNOG00000046924 ENSDNOG00000042710 CIT (ENSDNOG00000013647) PRKAB1 (ENSDNOG00000007035) TMEM233 (ENSDNOG00000047332) CCDC60 (ENSDNOG00000039130) SRRM4 (ENSDNOG00000000260) SUDS3 (ENSDNOG00000005814) TAOK3 (ENSDNOG00000005572) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 370 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 354 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.b.b.b ##22 Hyrax MODERN SPECIES 2513 ENSPCAG00000016470 ENSPCAG00000016429 ##22 GCN1 (ENSPCAG00000016143) #23 RAB35 (ENSPCAG00000016108) BICDL1 (ENSPCAG00000016056) #25 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b ##22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b ##22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b ##22 Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157389 ENSGT01060000251508 ENSGT00950000183186.B.a ENSGT00940000159184 ENSGT00940000159631.k ENSGT00940000157553 ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.b.b.a.a.a.b.b.a.b ENSGT00940000153104.e.a.a.b.a.a ENSGT00940000153124.cb ENSGT00940000164509 ENSGT00940000162330.w ENSGT00940000163451.d ENSGT00940000163451.c ENSGT00940000163217.a ENSGT00950000182890.D.c.b.a.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000017839.o.b.b.c ##22 ENSGT00940000153691.a.b ENSGT00940000153691.a.a ENSGT00940000160587 ENSGT00940000165226 ENSGT00530000063956.b.b ENSGT00940000158005 ENSGT00940000162264 ENSGT00940000160432 ENSGT00940000159573 ENSGT00390000008295.a ENSGT00390000005075 ENSGT00550000074901 ENSGT00940000159757 ENSGT00940000160687 ENSGT00940000161650 koala MODERN SPECIES 143 ENSPCIG00000005179 ##22 CDH8 (ENSPCIG00000005185) ENSPCIG00000020633 ENSPCIG00000027087 CDH11 (ENSPCIG00000000070) Common wonbat MODERN SPECIES 1088 ENSVURG00010009756 ENSVURG00010009763 ENSVURG00010009788 ENSVURG00010009851 ENSVURG00010009919 ENSVURG00010010057 ENSVURG00010010071 ENSVURG00010010091 ENSVURG00010010084 ENSVURG00010010098 ENSVURG00010010104 ENSVURG00010010107 ENSVURG00010010114 ENSVURG00010010125 ENSVURG00010010132 ENSVURG00010010144 ##22 CDH8 (ENSVURG00010010157) ENSVURG00010010183 ENSVURG00010010188 ENSVURG00010010201 ENSVURG00010010215 ENSVURG00010010237 ENSVURG00010010259 ENSVURG00010010266 ENSVURG00010010272 ENSVURG00010010279 ENSVURG00010010293 ENSVURG00010010297 ENSVURG00010010310 ENSVURG00010010375 ENSVURG00010010390 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.b.b.d ##22 koala MODERN SPECIES 63 ENSPCIG00000010434 SPTBN1 (ENSPCIG00000018457) ENSPCIG00000026925 ENSPCIG00000026924 ENSPCIG00000026923 PSME4 (ENSPCIG00000008643) GPR75 (ENSPCIG00000008642) ERLEC1 (ENSPCIG00000007406) CHAC2 (ENSPCIG00000007404) ASB3 (ENSPCIG00000007187) ENSPCIG00000024152 ENSPCIG00000016001 ENSPCIG00000008827 ENSPCIG00000035154 ENSPCIG00000012044 ENSPCIG00000022612 ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT01100000263696 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612 #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.p ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT01100000263696 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612 #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897 #21 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00390000017839.p ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 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RFC5 (ENSVURG00010006004) Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.c.b.a ##22 koala DUPLICATION koala MODERN SPECIES 32 ENSPCIG00000021511 UAP1 (ENSPCIG00000021509) UHMK1 (ENSPCIG00000021507) ENSPCIG00000021505 ENSPCIG00000021501 SPATA46 (ENSPCIG00000021503) ENSPCIG00000033694 ATF6 (ENSPCIG00000016241) DUSP12 (ENSPCIG00000016253) FCRLB (ENSPCIG00000016255) ENSPCIG00000016259 ENSPCIG00000012170 ENSPCIG00000012174 ADGRL4 (ENSPCIG00000026590) ENSPCIG00000029745 ENSPCIG00000016330 ##22 ENSPCIG00000017625 ADGRL2 (ENSPCIG00000029600) ENSPCIG00000031116 TTLL7 (ENSPCIG00000006716) PRKACB (ENSPCIG00000013356) SAMD13 (ENSPCIG00000032677) ENSPCIG00000006699 ENSPCIG00000033404 DNASE2B (ENSPCIG00000006696) RPF1 (ENSPCIG00000006692) ENSPCIG00000006687 SPATA1 (ENSPCIG00000006684) CTBS (ENSPCIG00000006682) SSX2IP (ENSPCIG00000006678) LPAR3 (ENSPCIG00000006675) koala MODERN SPECIES 31 ENSPCIG00000036113 ENSPCIG00000011387 HSD17B11 (ENSPCIG00000011390) KLHL8 (ENSPCIG00000011392) ENSPCIG00000032362 ENSPCIG00000011395 ENSPCIG00000011404 SLC10A6 (ENSPCIG00000011405) ENSPCIG00000012380 MAPK10 (ENSPCIG00000030585) ARHGAP24 (ENSPCIG00000023709) HELQ (ENSPCIG00000019746) ENSPCIG00000019737 ENSPCIG00000019736 GPAT3 (ENSPCIG00000031909) ENSPCIG00000037118 ##22 NKX6-1 (ENSPCIG00000019277) CDS1 (ENSPCIG00000024379) WDFY3 (ENSPCIG00000024383) PRKG2 (ENSPCIG00000020110) BMP3 (ENSPCIG00000007894) CFAP299 (ENSPCIG00000007903) ENSPCIG00000007911 PRDM8 (ENSPCIG00000037036) ANTXR2 (ENSPCIG00000007919) PAQR3 (ENSPCIG00000025826) BMP2K (ENSPCIG00000025824) ANXA3 (ENSPCIG00000012713) ENSPCIG00000012720 ENSPCIG00000028020 CNOT6L (ENSPCIG00000027504) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.c.b.b ##22 koala MODERN SPECIES 40 ZNF385B (ENSPCIG00000011178) SESTD1 (ENSPCIG00000011185) CCDC141 (ENSPCIG00000011195) ENSPCIG00000011236 ENSPCIG00000011290 ENSPCIG00000011294 ENSPCIG00000035928 ENSPCIG00000011306 ENSPCIG00000025366 ENSPCIG00000025368 FKBP7 (ENSPCIG00000025369) PJVK (ENSPCIG00000025370) PRKRA (ENSPCIG00000025371) OSBPL6 (ENSPCIG00000025378) ENSPCIG00000025391 ##22 RBM45 (ENSPCIG00000025402) PDE11A (ENSPCIG00000025405) ENSPCIG00000025413 AGPS (ENSPCIG00000025418) ENSPCIG00000025432 NFE2L2 (ENSPCIG00000025438) ENSPCIG00000025443 ENSPCIG00000035345 ENSPCIG00000034180 MTX2 (ENSPCIG00000006277) HOXD1 (ENSPCIG00000026501) HOXD4 (ENSPCIG00000026503) HOXD3 (ENSPCIG00000026502) HOXD8 (ENSPCIG00000029145) HOXD9 (ENSPCIG00000033878) Common wonbat MODERN SPECIES 1106 LRRC9 (ENSVURG00010018060) RTN1 (ENSVURG00010018044) JKAMP (ENSVURG00010018038) ENSVURG00010018035 DAAM1 (ENSVURG00010018028) ENSVURG00010018023 ENSVURG00010018020 DACT1 (ENSVURG00010018006) KIAA0586 (ENSVURG00010017992) TIMM9 (ENSVURG00010017986) TOMM20L (ENSVURG00010017980) ARID4A (ENSVURG00010017963) PSMA3 (ENSVURG00010017951) ACTR10 (ENSVURG00010017945) ENSVURG00010017929 ENSVURG00010017925 ##22 ENSVURG00010017920 ##29 SLC35F4 (ENSVURG00010017916) CCDC198 (ENSVURG00010017910) NAA30 (ENSVURG00010017904) AP5M1 (ENSVURG00010017891) EXOC5 (ENSVURG00010017877) ENSVURG00010017871 TMEM260 (ENSVURG00010017838) PELI2 (ENSVURG00010017822) ENSVURG00010017651 ENSVURG00010017627 TBPL2 (ENSVURG00010017614) ATG14 (ENSVURG00010017599) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.d ##22 Common wonbat MODERN SPECIES 1132 TFEC (ENSVURG00010019984) TES (ENSVURG00010020012) CAV2 (ENSVURG00010020019) CAV1 (ENSVURG00010020024) MET (ENSVURG00010020038) ENSVURG00010020055 ##22 ENSVURG00010020061 ENSVURG00010020064 CAPZA2 (ENSVURG00010020077) ENSVURG00010020091 ST7 (ENSVURG00010020104) WNT2 (ENSVURG00010020146) ASZ1 (ENSVURG00010020160) CFTR (ENSVURG00010020201) CTTNBP2 (ENSVURG00010020262) ENSVURG00010020288 LSM8 (ENSVURG00010020298) ENSVURG00010020323 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Yarkand deer MODERN SPECIES 1210 ENSCHYG00000019876 ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 1820 ENSAMEG00000030444 ##22 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 805 ENSAMEG00000026730 ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1836 ENSAMEG00000028166 ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Tarsier MODERN SPECIES 4802 ENSTSYG00000027435 ENSTSYG00000034719 ##22 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.a ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 90 UNC119B (ENSSBOG00000035931) MLEC (ENSSBOG00000020984) #7 ENSSBOG00000036181 #8 ENSSBOG00000018438 POP5 (ENSSBOG00000032691) #9 RNF10 (ENSSBOG00000018787) #10 COQ5 (ENSSBOG00000024153) #11 SRSF9 (ENSSBOG00000017305) #14 GATC (ENSSBOG00000033750) #15 TRIAP1 (ENSSBOG00000023076) #16 COX6A1 (ENSSBOG00000027488) ##17 MSI1 (ENSSBOG00000030259) #18 ENSSBOG00000033472 #19 SIRT4 (ENSSBOG00000008123) #20 PXN (ENSSBOG00000029417) #21 ENSSBOG00000032238 ##22 GCN1 (ENSSBOG00000035257) #23 RAB35 (ENSSBOG00000015715) BICDL1 (ENSSBOG00000020926) #25 CIT (ENSSBOG00000033965) ENSSBOG00000024739 PRKAB1 (ENSSBOG00000030942) TMEM233 (ENSSBOG00000023158) CCDC60 (ENSSBOG00000027014) HSPB8 (ENSSBOG00000022568) SRRM4 (ENSSBOG00000035310) ENSSBOG00000036079 SUDS3 (ENSSBOG00000034907) TAOK3 (ENSSBOG00000032744) PEBP1 (ENSSBOG00000025736) VSIG10 (ENSSBOG00000036249) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.a ##22 Gorilla MODERN SPECIES 6 C15orf62 (ENSGGOG00000037548) DNAJC17 (ENSGGOG00000000051) GCHFR (ENSGGOG00000000050) RMDN3 (ENSGGOG00000002156) RAD51 (ENSGGOG00000014269) KNL1 (ENSGGOG00000021998) RPUSD2 (ENSGGOG00000006684) ENSGGOG00000021934 CHST14 (ENSGGOG00000037922) BAHD1 (ENSGGOG00000039720) IVD (ENSGGOG00000000181) KNSTRN (ENSGGOG00000000765) DISP2 (ENSGGOG00000000764) PHGR1 (ENSGGOG00000027216) CCDC9B (ENSGGOG00000000762) ENSGGOG00000039599 ##22 PLCB2 (ENSGGOG00000000759) ENSGGOG00000021955 PAK6 (ENSGGOG00000044172) BUB1B (ENSGGOG00000002288) BMF (ENSGGOG00000037507) SRP14 (ENSGGOG00000009921) EIF2AK4 (ENSGGOG00000000245) GPR176 (ENSGGOG00000007164) FSIP1 (ENSGGOG00000008225) THBS1 (ENSGGOG00000012987) RASGRP1 (ENSGGOG00000002051) ENSGGOG00000026320 SPRED1 (ENSGGOG00000041562) TMCO5A (ENSGGOG00000011525) MEIS2 (ENSGGOG00000006792) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.a ##22 Drill MODERN SPECIES 821 GLIPR1L1 (ENSMLEG00000020393) GLIPR1L2 (ENSMLEG00000040765) GLIPR1 (ENSMLEG00000037327) KRR1 (ENSMLEG00000037074) ENSMLEG00000042283 ##22 ENSMLEG00000039434 ENSMLEG00000027928 PHLDA1 (ENSMLEG00000037110) NAP1L1 (ENSMLEG00000044434) BBS10 (ENSMLEG00000042359) OSBPL8 (ENSMLEG00000035972) ENSMLEG00000040060 ENSMLEG00000042240 ZDHHC17 (ENSMLEG00000009010) CSRP2 (ENSMLEG00000041421) E2F7 (ENSMLEG00000040254) NAV3 (ENSMLEG00000033553) ENSMLEG00000027815 ENSMLEG00000034369 ENSMLEG00000020902 Sooty mangabey MODERN SPECIES 612 DNAJC2 (ENSCATG00000027304) PSMC2 (ENSCATG00000039605) SLC26A5 (ENSCATG00000044918) ENSCATG00000036984 RELN (ENSCATG00000045163) ORC5 (ENSCATG00000032116) LHFPL3 (ENSCATG00000041560) KMT2E (ENSCATG00000033465) ENSCATG00000012082 ENSCATG00000015447 SRPK2 (ENSCATG00000039894) PUS7 (ENSCATG00000044868) RINT1 (ENSCATG00000038012) EFCAB10 (ENSCATG00000039563) ATXN7L1 (ENSCATG00000010612) ENSCATG00000042106 ##22 CDHR3 (ENSCATG00000043633) SYPL1 (ENSCATG00000023698) ENSCATG00000037371 NAMPT (ENSCATG00000038617) CCDC71L (ENSCATG00000014282) PIK3CG (ENSCATG00000040160) PRKAR2B (ENSCATG00000044313) HBP1 (ENSCATG00000021910) GPR22 (ENSCATG00000000810) COG5 (ENSCATG00000034785) DUS4L (ENSCATG00000031611) BCAP29 (ENSCATG00000038162) ENSCATG00000029448 SLC26A4 (ENSCATG00000045147) CBLL1 (ENSCATG00000038218) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 19 ZFC3H1 (ENSPANG00000009558) RAB21 (ENSPANG00000024916) ENSPANG00000034096 TMEM19 (ENSPANG00000008711) TBC1D15 (ENSPANG00000009049) TPH2 (ENSPANG00000011239) TRHDE (ENSPANG00000007912) ENSPANG00000044875 ATXN7L3B (ENSPANG00000006847) KCNC2 (ENSPANG00000025710) CAPS2 (ENSPANG00000017443) GLIPR1L1 (ENSPANG00000032562) GLIPR1L2 (ENSPANG00000036151) GLIPR1 (ENSPANG00000005562) KRR1 (ENSPANG00000019085) ENSPANG00000031665 ##22 ENSPANG00000047595 ENSPANG00000048738 PHLDA1 (ENSPANG00000013115) NAP1L1 (ENSPANG00000009165) BBS10 (ENSPANG00000026355) OSBPL8 (ENSPANG00000009379) ENSPANG00000028903 ZDHHC17 (ENSPANG00000004050) CSRP2 (ENSPANG00000023047) E2F7 (ENSPANG00000004929) NAV3 (ENSPANG00000007911) ENSPANG00000043139 ENSPANG00000015985 ENSPANG00000040020 SYT1 (ENSPANG00000009048) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES SUSD4 (ENSMFAG00000043811) TLR5 (ENSMFAG00000029363) DISP1 (ENSMFAG00000033892) FAM177B (ENSMFAG00000032058) BROX (ENSMFAG00000000410) ENSMFAG00000002217 MIA3 (ENSMFAG00000002094) TAF1A (ENSMFAG00000039364) HHIPL2 (ENSMFAG00000036732) ENSMFAG00000058339 DUSP10 (ENSMFAG00000035766) HLX (ENSMFAG00000002500) MTARC2 (ENSMFAG00000032804) C1orf115 (ENSMFAG00000065552) MARK1 (ENSMFAG00000039269) ENSMFAG00000001949 ##22 ENSMFAG00000032535 RAB3GAP2 (ENSMFAG00000035771) IARS2 (ENSMFAG00000000345) BPNT1 (ENSMFAG00000003970) EPRS1 (ENSMFAG00000041902) SLC30A10 (ENSMFAG00000051013) ENSMFAG00000030239 LYPLAL1 (ENSMFAG00000003062) TGFB2 (ENSMFAG00000054210) RRP15 (ENSMFAG00000046095) SPATA17 (ENSMFAG00000030832) GPATCH2 (ENSMFAG00000000617) ENSMFAG00000055622 ESRRG (ENSMFAG00000004706) ENSMFAG00000016818 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Gorilla MODERN SPECIES 2 CD5 (ENSGGOG00000006638) VPS37C (ENSGGOG00000016788) ENSGGOG00000000140 ENSGGOG00000040956 ENSGGOG00000039945 VWCE (ENSGGOG00000004043) DDB1 (ENSGGOG00000004052) TKFC (ENSGGOG00000004065) CYB561A3 (ENSGGOG00000004073) TMEM138 (ENSGGOG00000004077) TMEM216 (ENSGGOG00000025195) ENSGGOG00000042753 SDHAF2 (ENSGGOG00000025140) PPP1R32 (ENSGGOG00000016977) SYT7 (ENSGGOG00000016983) ENSGGOG00000042672 ##22 DAGLA (ENSGGOG00000001163) MYRF (ENSGGOG00000012529) ENSGGOG00000022221 TMEM258 (ENSGGOG00000012557) FEN1 (ENSGGOG00000012562) ENSGGOG00000041619 ENSGGOG00000040582 FADS1 (ENSGGOG00000012565) ENSGGOG00000012374 ENSGGOG00000043363 ENSGGOG00000037580 FADS3 (ENSGGOG00000012388) ENSGGOG00000012399 BEST1 (ENSGGOG00000011404) ENSGGOG00000027722 Orangutan MODERN SPECIES 2 CD5 (ENSPPYG00000003197) VPS37C (ENSPPYG00000003196) ENSPPYG00000003195 VWCE (ENSPPYG00000003194) DDB1 (ENSPPYG00000003193) TKFC (ENSPPYG00000003192) CYB561A3 (ENSPPYG00000003191) ENSPPYG00000003190 TMEM216 (ENSPPYG00000037321) CPSF7 (ENSPPYG00000003188) SDHAF2 (ENSPPYG00000003187) ENSPPYG00000040375 PPP1R32 (ENSPPYG00000003186) LRRC10B (ENSPPYG00000003185) SYT7 (ENSPPYG00000003184) ENSPPYG00000034762 ##22 DAGLA (ENSPPYG00000003183) ENSPPYG00000003182 MYRF (ENSPPYG00000003180) TMEM258 (ENSPPYG00000025909) ENSPPYG00000039974 ENSPPYG00000038295 FEN1 (ENSPPYG00000003179) FADS1 (ENSPPYG00000003178) ENSPPYG00000033771 FADS2 (ENSPPYG00000003177) FADS3 (ENSPPYG00000003176) ENSPPYG00000003175 BEST1 (ENSPPYG00000003174) FTH1 (ENSPPYG00000003173) INCENP (ENSPPYG00000003171) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 1051 ENSANAG00000017175 ENSANAG00000026341 ENSANAG00000026542 ENSANAG00000020014 ENSANAG00000021854 ENSANAG00000021996 ENSANAG00000035423 ##22 ENSANAG00000024049 ENSANAG00000021180 ENSANAG00000024139 ENSANAG00000028031 ENSANAG00000023781 ENSANAG00000029494 ENSANAG00000022542 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.g.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 51 ATP6AP2 (ENSSBOG00000032565) ENSSBOG00000034566 MED14 (ENSSBOG00000035627) ENSSBOG00000027711 USP9X (ENSSBOG00000031035) ENSSBOG00000026638 ENSSBOG00000026314 ENSSBOG00000034438 ENSSBOG00000024292 ENSSBOG00000019095 NYX (ENSSBOG00000003432) GPR34 (ENSSBOG00000018759) CASK (ENSSBOG00000024108) ENSSBOG00000004894 ENSSBOG00000016740 ENSSBOG00000027708 ##22 ATOH1 (ENSSBOG00000019286) ENSSBOG00000025440 GRID2 (ENSSBOG00000035561) ENSSBOG00000025569 CCSER1 (ENSSBOG00000019787) MMRN1 (ENSSBOG00000028948) SNCA (ENSSBOG00000020497) TIGD2 (ENSSBOG00000018539) FAM13A (ENSSBOG00000022461) HERC3 (ENSSBOG00000023004) ENSSBOG00000028700 PYURF (ENSSBOG00000022328) HERC5 (ENSSBOG00000036207) HERC6 (ENSSBOG00000031841) PPM1K (ENSSBOG00000023972) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Capuchin MODERN SPECIES 22 TMEM70 (ENSCCAG00000036058) ENSCCAG00000020850 LY96 (ENSCCAG00000032245) JPH1 (ENSCCAG00000023758) GDAP1 (ENSCCAG00000028609) PI15 (ENSCCAG00000023132) CRISPLD1 (ENSCCAG00000034821) ENSCCAG00000037810 HNF4G (ENSCCAG00000026351) ENSCCAG00000028207 ZFHX4 (ENSCCAG00000026493) ENSCCAG00000000493 PKIA (ENSCCAG00000018464) ZC2HC1A (ENSCCAG00000022919) IL7 (ENSCCAG00000032867) ENSCCAG00000029483 ##22 EIF3K (ENSCCAG00000029206) STMN2 (ENSCCAG00000031143) HEY1 (ENSCCAG00000028786) MRPS28 (ENSCCAG00000022534) TPD52 (ENSCCAG00000028562) ZBTB10 (ENSCCAG00000035024) ENSCCAG00000021608 ZNF704 (ENSCCAG00000028960) PAG1 (ENSCCAG00000032193) ENSCCAG00000033845 FABP5 (ENSCCAG00000034226) PMP2 (ENSCCAG00000027113) FABP9 (ENSCCAG00000034511) FABP4 (ENSCCAG00000037151) FABP12 (ENSCCAG00000029659) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Bonobo MODERN SPECIES 14 HEATR5B (ENSPPAG00000041268) GPATCH11 (ENSPPAG00000043328) EIF2AK2 (ENSPPAG00000034727) ENSPPAG00000031791 SULT6B1 (ENSPPAG00000035149) CEBPZOS (ENSPPAG00000038691) CEBPZ (ENSPPAG00000043370) NDUFAF7 (ENSPPAG00000027677) PRKD3 (ENSPPAG00000030286) QPCT (ENSPPAG00000032157) CDC42EP3 (ENSPPAG00000002481) ENSPPAG00000034793 ENSPPAG00000035960 CYP1B1 (ENSPPAG00000043762) ATL2 (ENSPPAG00000035345) ENSPPAG00000041393 ##22 HNRNPLL (ENSPPAG00000039102) GALM (ENSPPAG00000039247) SRSF7 (ENSPPAG00000017907) ENSPPAG00000031868 GEMIN6 (ENSPPAG00000036509) DHX57 (ENSPPAG00000029117) ENSPPAG00000033212 ARHGEF33 (ENSPPAG00000040788) SOS1 (ENSPPAG00000027483) CDKL4 (ENSPPAG00000036308) MAP4K3 (ENSPPAG00000030086) ENSPPAG00000033382 THUMPD2 (ENSPPAG00000033850) ENSPPAG00000034044 ENSPPAG00000037941 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2901 ENSRROG00000032365 ##22 MBOAT1 (ENSRROG00000032906) ENSRROG00000037285 E2F3 (ENSRROG00000015071) ENSRROG00000043659 CDKAL1 (ENSRROG00000042610) PRL (ENSRROG00000032787) HDGFL1 (ENSRROG00000025475) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p.h ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 193 ENSMNEG00000034833 ##22 RPRM (ENSMNEG00000020933) ARL6IP6 (ENSMNEG00000041131) PRPF40A (ENSMNEG00000042025) FMNL2 (ENSMNEG00000042052) ENSMNEG00000031306 STAM2 (ENSMNEG00000026377) CACNB4 (ENSMNEG00000032652) ARL5A (ENSMNEG00000035230) NEB (ENSMNEG00000037586) RIF1 (ENSMNEG00000031616) TNFAIP6 (ENSMNEG00000005810) NMI (ENSMNEG00000036210) ENSMNEG00000043989 RBM43 (ENSMNEG00000030900) RND3 (ENSMNEG00000034976) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 50 ENSJJAG00000000311 Kif11 (ENSJJAG00000016860) Ide (ENSJJAG00000019815) ENSJJAG00000023593 Cpeb3 (ENSJJAG00000009135) Btaf1 (ENSJJAG00000016636) ENSJJAG00000010510 Tnks2 (ENSJJAG00000024121) Ppp1r3c (ENSJJAG00000023747) Hectd2 (ENSJJAG00000002659) Pcgf5 (ENSJJAG00000019027) ENSJJAG00000012541 #12 Ankrd1 (ENSJJAG00000005637) Rpp30 (ENSJJAG00000020041) Htr7 (ENSJJAG00000017934) ENSJJAG00000013447 ##22 ENSJJAG00000022465 Kif20b (ENSJJAG00000013969) ENSJJAG00000018494 Pank1 (ENSJJAG00000023788) Slc16a12 (ENSJJAG00000013860) ENSJJAG00000024328 Ifit2 (ENSJJAG00000019071) ENSJJAG00000010974 Lipa (ENSJJAG00000014976) Ch25h (ENSJJAG00000013038) ENSJJAG00000012674 Acta2 (ENSJJAG00000012960) ENSJJAG00000010334 Ankrd22 (ENSJJAG00000022505) Lipm (ENSJJAG00000016479) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 1276 Flg (ENSMSIG00000008392) ENSMSIG00000008404 ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2870 ENSMSIG00000003421 ##22 ENSMSIG00000003305 Btbd3 (ENSMSIG00000003269) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 189 Zfp558 (ENSCGRG00001013016) Mbd3l1 (ENSCGRG00001016373) ENSCGRG00001013955 Or1m1 (ENSCGRG00001000820) ENSCGRG00001014793 ENSCGRG00001016434 ENSCGRG00001000833 ENSCGRG00001000686 ENSCGRG00001003956 ENSCGRG00001008021 Or7g16 (ENSCGRG00001015939) ENSCGRG00001015806 ENSCGRG00001015721 ENSCGRG00001016106 ENSCGRG00001015856 ENSCGRG00001010476 ##22 ENSCGRG00001016165 Or7g30 (ENSCGRG00001016088) ENSCGRG00001015892 ENSCGRG00001015963 Or7g32 (ENSCGRG00001015946) Or7g33 (ENSCGRG00001016203) ENSCGRG00001015984 Or7g35 (ENSCGRG00001016143) Zfp317 (ENSCGRG00001012515) ENSCGRG00001015905 ENSCGRG00001016175 ENSCGRG00001015971 Or7d10 (ENSCGRG00001000669) Or7e173 (ENSCGRG00001014382) ENSCGRG00001016400 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES Rhcg (ENSPEMG00000017207) Polg (ENSPEMG00000015138) Fanci (ENSPEMG00000023214) Rlbp1 (ENSPEMG00000010592) Abhd2 (ENSPEMG00000016881) Mfge8 (ENSPEMG00000018759) Hapln3 (ENSPEMG00000016074) Acan (ENSPEMG00000018677) ENSPEMG00000020302 Aen (ENSPEMG00000020445) Mrps11 (ENSPEMG00000012996) Mrpl46 (ENSPEMG00000018885) Ntrk3 (ENSPEMG00000010258) ENSPEMG00000025464 ENSPEMG00000028078 ENSPEMG00000024886 ##22 Agbl1 (ENSPEMG00000012489) Klhl25 (ENSPEMG00000020845) Akap13 (ENSPEMG00000008191) Sv2b (ENSPEMG00000003875) Slco3a1 (ENSPEMG00000019635) St8sia2 (ENSPEMG00000030066) Fam174b (ENSPEMG00000019302) ENSPEMG00000027808 Chd2 (ENSPEMG00000019507) Rgma (ENSPEMG00000019300) Mctp2 (ENSPEMG00000013075) ENSPEMG00000025656 ENSPEMG00000012279 ENSPEMG00000000829 Arrdc4 (ENSPEMG00000015729) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 19 Alg14 (ENSPEMG00000029811) Tlcd4 (ENSPEMG00000016901) Rwdd3 (ENSPEMG00000015928) ENSPEMG00000029523 Ptbp2 (ENSPEMG00000014705) Dpyd (ENSPEMG00000012380) Snx7 (ENSPEMG00000009166) ENSPEMG00000025309 Plppr5 (ENSPEMG00000008752) Plppr4 (ENSPEMG00000028220) 4930455H04Rik (ENSPEMG00000015603) Palmd (ENSPEMG00000014442) Frrs1 (ENSPEMG00000013390) ENSPEMG00000024419 Agl (ENSPEMG00000012024) ENSPEMG00000025435 ##22 Slc35a3 (ENSPEMG00000009061) Mfsd14a (ENSPEMG00000007486) Sass6 (ENSPEMG00000001964) Trmt13 (ENSPEMG00000000275) Lrrc39 (ENSPEMG00000019068) Dbt (ENSPEMG00000018837) Rtca (ENSPEMG00000018582) Cdc14a (ENSPEMG00000016136) Gpr88 (ENSPEMG00000025413) Vcam1 (ENSPEMG00000011892) Extl2 (ENSPEMG00000011176) Slc30a7 (ENSPEMG00000029404) Dph5 (ENSPEMG00000025433) S1pr1 (ENSPEMG00000028825) Olfm3 (ENSPEMG00000020151) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 27 ENSHGLG00000047345 ENSHGLG00000050062 ENSHGLG00000048158 ##22 ENSHGLG00000008066 ENSHGLG00000009411 ENSHGLG00000038882 ENSHGLG00000049879 ENSHGLG00000009383 PDSS1 (ENSHGLG00000004870) APBB1IP (ENSHGLG00000006286) GAD2 (ENSHGLG00000007030) MYO3A (ENSHGLG00000008329) ENSHGLG00000048157 ENSHGLG00000004801 ENSHGLG00000040816 ENSHGLG00000034504 ENSHGLG00000044474 ENSHGLG00000047037 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.p ##22 Degu MODERN SPECIES 53 ETV6 (ENSODEG00000009759) BCL2L14 (ENSODEG00000008991) LRP6 (ENSODEG00000008930) MANSC1 (ENSODEG00000009259) ENSODEG00000008969 DUSP16 (ENSODEG00000009500) ENSODEG00000019647 CREBL2 (ENSODEG00000009860) GPR19 (ENSODEG00000013191) CDKN1B (ENSODEG00000012537) APOLD1 (ENSODEG00000010534) DDX47 (ENSODEG00000012890) GPRC5A (ENSODEG00000011233) GPRC5D (ENSODEG00000010762) HEBP1 (ENSODEG00000012201) ENSODEG00000013637 ##22 FAM234B (ENSODEG00000011474) ENSODEG00000019684 GSG1 (ENSODEG00000008985) EMP1 (ENSODEG00000011317) GRIN2B (ENSODEG00000010384) ENSODEG00000014213 PLBD1 (ENSODEG00000009318) GUCY2C (ENSODEG00000010539) ENSODEG00000019853 ENSODEG00000019973 ENSODEG00000010251 SMCO3 (ENSODEG00000019767) MGP (ENSODEG00000010694) ERP27 (ENSODEG00000009658) ARHGDIB (ENSODEG00000010000) Sauria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT01100000263696 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612 #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00390000004807 ENSGT00940000160097.d ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897.l #21 ENSGT00390000017839.p ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 172 ENSGT00940000158897.l #21 ENSGT00390000017839.p ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 tuatara MODERN SPECIES 1436 BICDL1 (ENSSPUG00000016269) #25 ENSSPUG00000016258 GCN1 (ENSSPUG00000016210) #23 PXN (ENSSPUG00000016181) #21 RPLP0 (ENSSPUG00000016154) ##22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000014052 ENSGT00390000018806 ENSGT00940000157272 ENSGT00640000091701 ENSGT00390000018130.a.a.b ENSGT00390000000059 ENSGT00960000189379 ENSGT00390000006208.b ENSGT00940000157386 ENSGT00940000162372 ENSGT00940000155307.b ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000157442 #25 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000158897.l #21 ENSGT00390000017839.p ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000163122 ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00940000153110.D ENSGT00550000075100 ENSGT00390000013005 ENSGT00730000111354 ENSGT00940000158958 ENSGT00940000157433 Laterata ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000018806 ENSGT00940000157272 ENSGT00640000091701 ENSGT00390000018130.a.a.b ENSGT00390000000059 ENSGT00960000189379 ENSGT00390000006208.b ENSGT00940000157386 ENSGT00940000162372 ENSGT00940000155307.b ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000157442 #25 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000158897.l #21 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00390000017839.p ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251.g ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715 ENSGT00940000153110.D ENSGT00550000075100 ENSGT00390000013005 ENSGT00730000111354 ENSGT00940000158958 ENSGT00940000157433 ENSGT00530000063509.B Common wall lizard DUPLICATION Common wall lizard MODERN SPECIES 7 MTMR3 (ENSPMRG00000023554) ENSPMRG00000023518 ENSPMRG00000023511 ENSPMRG00000023505 LIF (ENSPMRG00000023502) ENSPMRG00000023500 CASTOR1 (ENSPMRG00000023496) TBC1D10A (ENSPMRG00000023480) TMEM233 (ENSPMRG00000023469) PRKAB1 (ENSPMRG00000023465) CIT (ENSPMRG00000023376) BICDL1 (ENSPMRG00000023309) #25 RAB35 (ENSPMRG00000023305) ENSPMRG00000023301 PXN (ENSPMRG00000023294) #21 ENSPMRG00000023283 ##22 GCN1 (ENSPMRG00000022901) #23 CCDC60 (ENSPMRG00000022803) HSPB8 (ENSPMRG00000022797) SUDS3 (ENSPMRG00000022787) ENSPMRG00000022779 TAOK3 (ENSPMRG00000022757) ENSPMRG00000022753 DTX1 (ENSPMRG00000022740) RASAL1 (ENSPMRG00000022672) CFAP73 (ENSPMRG00000022636) DDX54 (ENSPMRG00000022614) RITA1 (ENSPMRG00000022611) IQCD (ENSPMRG00000022607) TPCN1 (ENSPMRG00000022600) SLC8B1 (ENSPMRG00000022593) Common wall lizard MODERN SPECIES 10 ENSPMRG00000000830 ENSPMRG00000000788 ENSPMRG00000000775 ENSPMRG00000000758 ENSPMRG00000000745 ENSPMRG00000000730 ENSPMRG00000000723 ENSPMRG00000000720 ENSPMRG00000000708 ENSPMRG00000000698 ENSPMRG00000000690 ENSPMRG00000000679 ENSPMRG00000000668 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DUPLICATION Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2434 ENSTMTG00000015608 ##22 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 1471 ENSTMTG00000019085 ##22 Three-toed box turtle DUPLICATION Three-toed box turtle MODERN SPECIES 1443 ENSTMTG00000018316 ##22 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2433 ENSTMTG00000015595 ##22 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000012331 #9 ENSGT00390000001731 #10 ENSGT00390000001654 #11 ENSGT00390000001618 #13 ENSGT00390000000378.d.b #12 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612 #17 ENSGT00940000156515 #18 ENSGT00940000154885.A #19 ENSGT00390000004807 ENSGT00940000160097.d ENSGT00940000158891 #20 ENSGT00940000158897.l #21 ENSGT00390000017839.p ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E ENSGT00940000155307.b ENSGT00940000162372 ENSGT00390000015428 ENSGT00940000160605 ENSGT00730000111247 ENSGT00910000144281 ENSGT00940000155735 ENSGT00940000157251 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