Mammalia ANCESTRAL SPECIES 253 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.a #22 Theria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158555 #9 ENSGT00390000012331 #10 ENSGT00390000001731 #11 ENSGT00390000001654 #12 ENSGT00390000001618 ENSGT00390000000378.d.b #13 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00940000163530 ENSGT00940000154612 #17 ENSGT00940000156515 #19 ENSGT00940000154885.A #20 ENSGT00940000158891 #21 ENSGT00940000158897 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00390000017839.p ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 #24 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E #26 ENSGT00940000155307.b #28 ENSGT00940000162372 #29 ENSGT00390000015428 #30 ENSGT00940000160605 #31 ENSGT00730000111247 #32 ENSGT00910000144281 #33 ENSGT00940000155735 #34 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 #36 ENSGT00890000139406.b Eutheria ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT00940000166687 ENSGT00390000017839.o.a #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000012331 #10 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ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 #36 ENSGT00890000139406.b Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000012331 #10 ENSGT00390000001731 #11 ENSGT00390000001654 #12 ENSGT00390000000378.d.b.g ##13 ENSGT00390000001618.rb ENSGT00390000001618.qb ENSGT00390000000378.d.b.h #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n #17 ENSGT00940000156515 #19 ENSGT00940000154885.A #20 ENSGT00940000158891 #21 ENSGT00940000158897 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 #24 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E #26 ENSGT00910000146992 #27 ENSGT00940000155307.b #28 ENSGT00940000162372 #29 ENSGT00390000015428 #30 ENSGT00940000160605 #31 ENSGT00730000111247 #32 ENSGT00910000144281 #33 ENSGT00940000155735 #34 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 #36 ENSGT00890000139406.b Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158555 #9 ENSGT00390000012331 #10 ENSGT00390000001731 #11 ENSGT00390000001654 #12 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Hominidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000016504 #8 ENSGT00940000158555 #9 ENSGT00390000012331 #10 ENSGT00390000001731 #11 ENSGT00390000001654 #12 ENSGT00390000001618.rb ENSGT00390000000378.d.b.g ##13 ENSGT00940000156839.bb.a #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n #17 ENSGT00940000156515 #19 ENSGT00940000154885.A #20 ENSGT00940000158891 #21 ENSGT00940000158897 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 #24 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E #26 ENSGT00910000146992 #27 ENSGT00940000155307.b #28 ENSGT00940000162372 #29 ENSGT00390000015428 #30 ENSGT00390000018509.a.m ENSGT00940000160605 #31 ENSGT00730000111247 #32 ENSGT00910000148197 ENSGT00910000144281 #33 ENSGT00940000155735 #34 ENSGT00940000157251 Orangutan DUPLICATION Orangutan MODERN SPECIES 3 CABP1 (ENSPPYG00000005037) #9 POP5 (ENSPPYG00000005036) #10 RNF10 (ENSPPYG00000005035) #11 COQ5 (ENSPPYG00000005034) #12 ENSPPYG00000005032 ENSPPYG00000005033 #13 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(ENSOCUG00000013715) TMEM267 (ENSOCUG00000009355) ENSOCUG00000007934 ENSOCUG00000038605 ENSOCUG00000010243 HMGCS1 (ENSOCUG00000003569) NIM1K (ENSOCUG00000017808) ZNF131 (ENSOCUG00000017804) ENSOCUG00000031479 ENSOCUG00000033003 CCDC152 (ENSOCUG00000003391) GHR (ENSOCUG00000008496) ENSOCUG00000034980 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 67 POLR2H (ENSUPAG00010002737) THPO (ENSUPAG00010002733) CHRD (ENSUPAG00010002655) ENSUPAG00010002644 EPHB3 (ENSUPAG00010002608) MAGEF1 (ENSUPAG00010002606) VPS8 (ENSUPAG00010002273) C3orf70 (ENSUPAG00010002260) ENSUPAG00010002254 ENSUPAG00010002246 ENSUPAG00010002245 MAP3K13 (ENSUPAG00010002192) TMEM41A (ENSUPAG00010002185) LIPH (ENSUPAG00010002143) SENP2 (ENSUPAG00010002084) ENSUPAG00010002075 #22 IGF2BP2 (ENSUPAG00010001983) TRA2B (ENSUPAG00010001968) ENSUPAG00010001933 ETV5 (ENSUPAG00010001897) DGKG (ENSUPAG00010001778) CRYGS (ENSUPAG00010001767) TBCCD1 (ENSUPAG00010001735) DNAJB11 (ENSUPAG00010001712) AHSG (ENSUPAG00010001698) FETUB (ENSUPAG00010001683) HRG (ENSUPAG00010001673) KNG1 (ENSUPAG00010001555) ENSUPAG00010001548 ENSUPAG00010001535 EIF4A2 (ENSUPAG00010001415) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 15 CABP1 (ENSHGLG00000010180) #9 POP5 (ENSHGLG00000011786) #10 RNF10 (ENSHGLG00000010890) #11 ENSHGLG00000044841 COQ5 (ENSHGLG00000038449) #12 ENSHGLG00000034830 DYNLL1 (ENSHGLG00000013536) #13 SRSF9 (ENSHGLG00000038336) #14 GATC (ENSHGLG00000011394) #15 ENSHGLG00000012057 #16 COX6A1 (ENSHGLG00000038002) #17 MSI1 (ENSHGLG00000040070) #19 PLA2G1B (ENSHGLG00000014412) #20 SIRT4 (ENSHGLG00000014746) #21 PXN (ENSHGLG00000010923) RPLP0 (ENSHGLG00000011358) #22 GCN1 (ENSHGLG00000012548) #23 RAB35 (ENSHGLG00000012703) #24 BICDL1 (ENSHGLG00000014394) #25 CIT (ENSHGLG00000010569) #26 PRKAB1 (ENSHGLG00000007003) #28 TMEM233 (ENSHGLG00000038208) #29 CCDC60 (ENSHGLG00000010014) #30 HSPB8 (ENSHGLG00000011316) #31 SRRM4 (ENSHGLG00000007830) #32 ENSHGLG00000046690 SUDS3 (ENSHGLG00000011951) #33 ENSHGLG00000047298 #34 TAOK3 (ENSHGLG00000011803) #34 ENSHGLG00000010723 VSIG10 (ENSHGLG00000011958) #36 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Guinea pig MODERN SPECIES 17 RANBP17 (ENSCPOG00000005628) GABRP (ENSCPOG00000039299) KCNIP1 (ENSCPOG00000014295) KCNMB1 (ENSCPOG00000036105) LCP2 (ENSCPOG00000002851) FOXI1 (ENSCPOG00000019611) INSYN2B (ENSCPOG00000010850) DOCK2 (ENSCPOG00000010822) SPDL1 (ENSCPOG00000010816) SLIT3 (ENSCPOG00000011591) PANK3 (ENSCPOG00000003340) FBLL1 (ENSCPOG00000025737) RARS1 (ENSCPOG00000007379) WWC1 (ENSCPOG00000011701) TENM2 (ENSCPOG00000000985) ENSCPOG00000035724 #22 MAT2B (ENSCPOG00000002033) HMMR (ENSCPOG00000000878) NUDCD2 (ENSCPOG00000040077) CCNG1 (ENSCPOG00000040311) GABRG2 (ENSCPOG00000002188) GABRA1 (ENSCPOG00000006871) GABRA6 (ENSCPOG00000009693) GABRB2 (ENSCPOG00000015215) ATP10B (ENSCPOG00000015077) ENSCPOG00000011971 SLU7 (ENSCPOG00000004484) FAM200C (ENSCPOG00000040506) C1QTNF2 (ENSCPOG00000002753) CCNJL (ENSCPOG00000034225) FABP6 (ENSCPOG00000025902) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 328 PMEL (ENSODEG00000004214) DGKA (ENSODEG00000004252) PYM1 (ENSODEG00000004289) MMP19 (ENSODEG00000004495) ENSODEG00000004534 DNAJC14 (ENSODEG00000004548) ENSODEG00000004596 ENSODEG00000004608 GDF11 (ENSODEG00000004691) ENSODEG00000004712 CD63 (ENSODEG00000004741) ENSODEG00000004837 ITGA7 (ENSODEG00000004568) METTL7B (ENSODEG00000004695) ENSODEG00000004768 ENSODEG00000004775 #22 ENSODEG00000004697 Degu MODERN SPECIES 103 NDUFB9 (ENSODEG00000005991) MTSS1 (ENSODEG00000005974) ENSODEG00000005940 SQLE (ENSODEG00000005923) WASHC5 (ENSODEG00000005903) NSMCE2 (ENSODEG00000005494) ENSODEG00000005467 ENSODEG00000005440 ENSODEG00000005425 ENSODEG00000005388 LRATD2 (ENSODEG00000019440) ENSODEG00000005362 ENSODEG00000005289 ASAP1 (ENSODEG00000003587) ADCY8 (ENSODEG00000003952) ENSODEG00000003871 #22 Degu MODERN SPECIES 23 ENSODEG00000000146 #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 18 Abce1 (ENSPEMG00000020086) ENSPEMG00000025681 Anapc10 (ENSPEMG00000020210) ENSPEMG00000027237 Hhip (ENSPEMG00000020265) Smarca5 (ENSPEMG00000008060) Gab1 (ENSPEMG00000011664) Usp38 (ENSPEMG00000017993) Inpp4b (ENSPEMG00000005790) Il15 (ENSPEMG00000029894) Zfp330 (ENSPEMG00000022167) Rnf150 (ENSPEMG00000008599) ENSPEMG00000030162 ENSPEMG00000026256 Tbc1d9 (ENSPEMG00000024048) ENSPEMG00000024217 #22 Ucp1 (ENSPEMG00000022488) Elmod2 (ENSPEMG00000028361) Mgat4d (ENSPEMG00000022918) Clgn (ENSPEMG00000023114) Scoc (ENSPEMG00000024835) Or10k2 (ENSPEMG00000027328) Prmt9 (ENSPEMG00000029675) Ndufb7 (ENSPEMG00000010565) Tecr (ENSPEMG00000008519) Dnajb1 (ENSPEMG00000007843) Gipc1 (ENSPEMG00000008496) Ptger1 (ENSPEMG00000027389) Pkn1 (ENSPEMG00000018704) ENSPEMG00000017767 Adgre5 (ENSPEMG00000012912) Northern American deer mouse MODERN SPECIES ENSPEMG00000014499 ENSPEMG00000017498 Gda (ENSPEMG00000009797) Zfand5 (ENSPEMG00000024511) Tmc1 (ENSPEMG00000021043) ENSPEMG00000031397 ENSPEMG00000030997 Aldh1a1 (ENSPEMG00000029294) Anxa1 (ENSPEMG00000014478) Rorb (ENSPEMG00000000824) Trpm6 (ENSPEMG00000011848) D030056L22Rik (ENSPEMG00000025661) Carnmt1 (ENSPEMG00000010072) Nmrk1 (ENSPEMG00000013725) Ostf1 (ENSPEMG00000020370) ENSPEMG00000003630 #22 Pcsk5 (ENSPEMG00000002720) Rfk (ENSPEMG00000031112) Gcnt1 (ENSPEMG00000024295) ENSPEMG00000025542 Prune2 (ENSPEMG00000009652) ENSPEMG00000001408 Vps13a (ENSPEMG00000022969) Gna14 (ENSPEMG00000022983) ENSPEMG00000026093 ENSPEMG00000029390 Cep78 (ENSPEMG00000013176) Psat1 (ENSPEMG00000022279) ENSPEMG00000025664 Tle4 (ENSPEMG00000006537) ENSPEMG00000029012 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000012331 #10 ENSGT00390000001731 #11 ENSGT00950000186285 ENSGT00390000001654 #12 ENSGT00390000001618 ENSGT00390000000378.d.b #13 ENSGT01100000263696 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.m.a ##17 ENSGT00940000156515 #19 ENSGT00940000154885.A #20 ENSGT00940000158891 #21 ENSGT00940000158897 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 #24 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E #26 ENSGT00940000155307.b #28 ENSGT00940000162372 #29 ENSGT00390000015428 #30 ENSGT00940000160605 #31 ENSGT00730000111247 #32 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ENSGT00390000003682.gb.a.d.a.a Domestic yak MODERN SPECIES 7 UNC119B (ENSBGRG00000026410) #7 MLEC (ENSBGRG00000026401) #8 ENSBGRG00000026390 #9 POP5 (ENSBGRG00000026381) #10 RNF10 (ENSBGRG00000026361) #11 COQ5 (ENSBGRG00000026354) #12 ENSBGRG00000026352 #13 SRSF9 (ENSBGRG00000026347) #14 GATC (ENSBGRG00000026344) #15 TRIAP1 (ENSBGRG00000026341) #16 ENSBGRG00000026336 ##17 MSI1 (ENSBGRG00000026314) #19 ENSBGRG00000026299 #20 SIRT4 (ENSBGRG00000026294) #21 PXN (ENSBGRG00000026252) RPLP0 (ENSBGRG00000026224) #22 GCN1 (ENSBGRG00000026191) #23 RAB35 (ENSBGRG00000026176) #24 BICDL1 (ENSBGRG00000026169) #25 ALDH2 (ENSBGRG00000026145) MAPKAPK5 (ENSBGRG00000026124) ENSBGRG00000026118 ENSBGRG00000026113 ENSBGRG00000026110 TMEM116 (ENSBGRG00000026093) ERP29 (ENSBGRG00000026087) ENSBGRG00000026083 NAA25 (ENSBGRG00000026066) TRAFD1 (ENSBGRG00000026052) HECTD4 (ENSBGRG00000020611) ENSBGRG00000020003 Wild yak MODERN SPECIES 410 ENSBMUG00000021423 #8 ENSBMUG00000021407 #9 POP5 (ENSBMUG00000021396) #10 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(ENSBMSG00010009059) #24 BICDL1 (ENSBMSG00010008994) #25 ALDH2 (ENSBMSG00010008956) MAPKAPK5 (ENSBMSG00010008906) ENSBMSG00010008881 ENSBMSG00010008872 ENSBMSG00010008860 TMEM116 (ENSBMSG00010008775) ERP29 (ENSBMSG00010008749) NAA25 (ENSBMSG00010008727) TRAFD1 (ENSBMSG00010008710) HECTD4 (ENSBMSG00010008670) ENSBMSG00010019058 PTPN11 (ENSBMSG00010019008) Blue whale MODERN SPECIES 14 ENC1 (ENSBMSG00010004655) ARHGEF28 (ENSBMSG00010004561) UTP15 (ENSBMSG00010004487) ANKRA2 (ENSBMSG00010004475) ENSBMSG00010004469 FOXD1 (ENSBMSG00010004462) TMEM174 (ENSBMSG00010004452) ENSBMSG00010004443 TMEM171 (ENSBMSG00010004430) FCHO2 (ENSBMSG00010004388) ENSBMSG00010004357 ZNF366 (ENSBMSG00010004343) PTCD2 (ENSBMSG00010004295) MRPS27 (ENSBMSG00010004277) MAP1B (ENSBMSG00010004274) ENSBMSG00010004267 #22 CARTPT (ENSBMSG00010004259) MCCC2 (ENSBMSG00010004252) ENSBMSG00010004248 ENSBMSG00010008398 ENSBMSG00010008386 ENSBMSG00010008339 NAIP (ENSBMSG00010008228) ENSBMSG00010008204 OCLN (ENSBMSG00010008177) MARVELD2 (ENSBMSG00010008162) RAD17 (ENSBMSG00010008093) TAF9 (ENSBMSG00010008016) AK6 (ENSBMSG00010008004) CCDC125 (ENSBMSG00010007976) CDK7 (ENSBMSG00010007947) Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Alpaca MODERN SPECIES 3089 RPLP0 (ENSVPAG00000012156) #22 Arabian camel MODERN SPECIES 35 FNBP1L (ENSCDRG00005002139) BCAR3 (ENSCDRG00005002103) DNTTIP2 (ENSCDRG00005002089) GCLM (ENSCDRG00005002067) ABCA4 (ENSCDRG00005001970) ENSCDRG00005001919 ENSCDRG00005001902 ABCD3 (ENSCDRG00005001791) F3 (ENSCDRG00005001755) SLC44A3 (ENSCDRG00005001509) CNN3 (ENSCDRG00005001443) ALG14 (ENSCDRG00005001410) TLCD4 (ENSCDRG00005001384) RWDD3 (ENSCDRG00005001363) ENSCDRG00005001342 ENSCDRG00005001326 #22 PTBP2 (ENSCDRG00005001247) DPYD (ENSCDRG00005001178) SNX7 (ENSCDRG00005001104) ENSCDRG00005001081 PLPPR5 (ENSCDRG00005001050) PLPPR4 (ENSCDRG00005001016) PALMD (ENSCDRG00005000990) FRRS1 (ENSCDRG00005000965) AGL (ENSCDRG00005000899) ENSCDRG00005000764 MFSD14A (ENSCDRG00005000703) SASS6 (ENSCDRG00005000624) TRMT13 (ENSCDRG00005000563) LRRC39 (ENSCDRG00005000535) DBT (ENSCDRG00005000504) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000158555 #9 ENSGT00390000012331 #10 ENSGT00390000001731 #11 ENSGT00390000001654 #12 ENSGT00390000000378.d.b.eb #13 ENSGT00390000001618 ENSGT00390000000378.d.b.db.a #13 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000162087 #16 ENSGT00940000154612.n #17 ENSGT00940000156515 #19 ENSGT00940000154885.A #20 ENSGT00940000158891 #21 ENSGT00940000158897 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00390000017839.o.b.a.b ##22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 #24 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E #26 ENSGT00940000155307.b #28 ENSGT00940000162372 #29 ENSGT00390000015428 #30 ENSGT00940000160605 #31 ENSGT00730000111247 #32 ENSGT00910000144281 #33 ENSGT00940000155735 #34 ENSGT00940000157251 ENSGT00940000159876 #36 ENSGT00890000139406.b Equus ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00390000016504 #8 ENSGT00940000158555 #9 ENSGT00390000012331 #10 ENSGT00390000001731 #11 ENSGT00390000001654 #12 ENSGT00390000000378.d.b.eb #13 ENSGT00390000001618 ENSGT00940000156839 #14 ENSGT00390000018351 #15 ENSGT00940000163530 ENSGT00940000154612.n #17 ENSGT00940000156515 #19 ENSGT00940000154885.A #20 ENSGT00940000158891 #21 ENSGT00940000158897 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000153612.B #23 ENSGT00940000158557 #24 ENSGT00940000157442 #25 ENSGT01030000234517.E #26 ENSGT00940000155307.b #28 ENSGT00940000162372 #29 ENSGT00390000015428 #30 ENSGT00940000160605 #31 ENSGT00730000111247 #32 ENSGT00910000144281 #33 ENSGT00940000155735 #34 ENSGT00940000163122 #35 ENSGT00940000159876 #36 ENSGT00890000139406.b ENSGT00550000075072 Donkey MODERN SPECIES 28 MLEC (ENSEASG00005030416) #8 ENSEASG00005004668 #9 POP5 (ENSEASG00005004714) #10 RNF10 (ENSEASG00005004717) #11 COQ5 (ENSEASG00005004720) #12 ENSEASG00005037824 #13 ENSEASG00005004721 SRSF9 (ENSEASG00005004727) #14 GATC (ENSEASG00005004729) #15 ENSEASG00005035552 ENSEASG00005038589 #17 MSI1 (ENSEASG00005004736) #19 ENSEASG00005033886 #20 SIRT4 (ENSEASG00005004744) #21 PXN (ENSEASG00005004771) RPLP0 (ENSEASG00005005174) #22 GCN1 (ENSEASG00005005480) #23 RAB35 (ENSEASG00005031195) #24 BICDL1 (ENSEASG00005007623) #25 CIT (ENSEASG00005007703) #26 PRKAB1 (ENSEASG00005008740) #28 ENSEASG00005034264 #29 CCDC60 (ENSEASG00005008751) #30 HSPB8 (ENSEASG00005034083) #31 SRRM4 (ENSEASG00005008759) #32 SUDS3 (ENSEASG00005008761) #33 TAOK3 (ENSEASG00005008815) #34 PEBP1 (ENSEASG00005035057) #35 VSIG10 (ENSEASG00005009276) #36 WSB2 (ENSEASG00005009280) RFC5 (ENSEASG00005009285) Horse MODERN SPECIES 29 UNC119B (ENSECAG00000022266) #7 MLEC (ENSECAG00000022275) #8 CABP1 (ENSECAG00000001290) #9 POP5 (ENSECAG00000010012) #10 RNF10 (ENSECAG00000012725) #11 COQ5 (ENSECAG00000006182) #12 ENSECAG00000046364 #13 ENSECAG00000056251 SRSF9 (ENSECAG00000009116) #14 GATC (ENSECAG00000011118) #15 MSI1 (ENSECAG00000017526) #19 COX6A1 (ENSECAG00000012512) #17 PLA2G1B (ENSECAG00000009152) #20 SIRT4 (ENSECAG00000013537) #21 PXN (ENSECAG00000014975) RPLP0 (ENSECAG00000015816) #22 GCN1 (ENSECAG00000016996) #23 RAB35 (ENSECAG00000002380) #24 BICDL1 (ENSECAG00000004286) #25 CIT (ENSECAG00000010078) #26 PRKAB1 (ENSECAG00000011947) #28 ENSECAG00000046698 #29 CCDC60 (ENSECAG00000018470) #30 SRRM4 (ENSECAG00000021729) #32 SUDS3 (ENSECAG00000023366) #33 TAOK3 (ENSECAG00000006859) #34 PEBP1 (ENSECAG00000024564) #35 VSIG10 (ENSECAG00000002661) #36 WSB2 (ENSECAG00000007479) RFC5 (ENSECAG00000015326) KSR2 (ENSECAG00000004582) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 leopard MODERN SPECIES HTRA2 (ENSPPRG00000007923) LOXL3 (ENSPPRG00000007886) DOK1 (ENSPPRG00000007779) M1AP (ENSPPRG00000007750) SEMA4F (ENSPPRG00000007712) ENSPPRG00000007686 HK2 (ENSPPRG00000007681) ENSPPRG00000020433 POLE4 (ENSPPRG00000007674) TACR1 (ENSPPRG00000007672) EVA1A (ENSPPRG00000007663) MRPL19 (ENSPPRG00000007656) GCFC2 (ENSPPRG00000007643) ENSPPRG00000020405 LRRTM4 (ENSPPRG00000007603) ENSPPRG00000007590 #22 ENSPPRG00000007566 ENSPPRG00000007546 ENSPPRG00000007531 LRRTM1 (ENSPPRG00000020381) CTNNA2 (ENSPPRG00000007522) ENSPPRG00000007459 ENSPPRG00000007449 ENSPPRG00000020355 SUCLG1 (ENSPPRG00000007440) DNAH6 (ENSPPRG00000007406) TRABD2A (ENSPPRG00000007266) KCMF1 (ENSPPRG00000007234) TCF7L1 (ENSPPRG00000007227) ENSPPRG00000007210 RETSAT (ENSPPRG00000007198) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156522 ENSGT00930000150969.A.c.b.a ENSGT00930000150969.A.c.a ENSGT00940000156279 ENSGT00950000183015.A ENSGT00940000154544.a ENSGT00390000010591 ENSGT00390000012248 ENSGT00940000157885 ENSGT00390000004284 ENSGT00940000156530.c ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000156327 ENSGT00950000183164.E.c.b.b ENSGT00940000156841 ENSGT00910000147398 ENSGT00940000154556 ENSGT00940000154958 ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00940000154186.a ENSGT00940000155337 ENSGT00950000183050.b.b.a ENSGT00390000000583 ENSGT00940000153464.B ENSGT00530000063410.a ENSGT00390000016551 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00930000150969.A.c.b.a ENSGT00930000150969.A.c.a ENSGT00940000156279 ENSGT00950000183015.A ENSGT00940000154544.a ENSGT00390000010591 ENSGT00390000012248 ENSGT00940000157885 ENSGT00390000004284 ENSGT00940000156530.c ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a.a ENSGT00390000009597 ENSGT00390000017839.o.a #22 ENSGT00940000156327 ENSGT00950000183164.E.c.b.b ENSGT00940000156841 ENSGT00910000147398 ENSGT00940000154556 ENSGT00390000017004.a.a.q.a ENSGT00940000154958 ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00940000154186.a ENSGT00940000155337 ENSGT00950000183050.b.b.a ENSGT00390000000583 ENSGT00940000153464.B ENSGT00530000063410.a Dingo MODERN SPECIES 307 GKN1 (ENSCAFG00020000316) GKN2 (ENSCAFG00020000261) BMP10 (ENSCAFG00020000180) ARHGAP25 (ENSCAFG00020000168) PROKR1 (ENSCAFG00020000143) APLF (ENSCAFG00020000129) FBXO48 (ENSCAFG00020000114) PLEK (ENSCAFG00020000109) CNRIP1 (ENSCAFG00020000090) PPP3R1 (ENSCAFG00020027004) PNO1 (ENSCAFG00020027002) DNAAF10 (ENSCAFG00020026999) C1D (ENSCAFG00020026997) ENSCAFG00020026995 ETAA1 (ENSCAFG00020026994) ENSCAFG00020026992 #22 MEIS1 (ENSCAFG00020026989) ENSCAFG00020026987 ENSCAFG00020026985 SPRED2 (ENSCAFG00020026983) ENSCAFG00020026981 ACTR2 (ENSCAFG00020026978) ENSCAFG00020026973 RAB1A (ENSCAFG00020026971) CEP68 (ENSCAFG00020026969) SLC1A4 (ENSCAFG00020026962) AFTPH (ENSCAFG00020026953) LGALSL (ENSCAFG00020026947) PELI1 (ENSCAFG00020026939) VPS54 (ENSCAFG00020026938) UGP2 (ENSCAFG00020026936) Dog MODERN SPECIES 1 GKN1 (ENSCAFG00845024000) GKN2 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(ENSUMAG00000017597) ENSUMAG00000017716 ENSUMAG00000017738 #22 ETFA (ENSUMAG00000017747) TMEM266 (ENSUMAG00000017765) ENSUMAG00000017772 FBXO22 (ENSUMAG00000017786) UBE2Q2 (ENSUMAG00000017803) TUBGCP5 (ENSUMAG00000017849) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Elephant MODERN SPECIES 332 PTP4A2 (ENSLAFG00000008462) ENSLAFG00000003350 COL16A1 (ENSLAFG00000003775) PEF1 (ENSLAFG00000010012) HCRTR1 (ENSLAFG00000010009) TINAGL1 (ENSLAFG00000010005) SERINC2 (ENSLAFG00000005871) FABP3 (ENSLAFG00000022206) ZCCHC17 (ENSLAFG00000015364) SNRNP40 (ENSLAFG00000013976) NKAIN1 (ENSLAFG00000017512) PUM1 (ENSLAFG00000003178) SDC3 (ENSLAFG00000013200) LAPTM5 (ENSLAFG00000029640) MATN1 (ENSLAFG00000012878) ENSLAFG00000032386 #22 PTPRU (ENSLAFG00000010090) MECR (ENSLAFG00000002576) SRSF4 (ENSLAFG00000002575) TMEM200B (ENSLAFG00000031258) EPB41 (ENSLAFG00000002571) OPRD1 (ENSLAFG00000017219) YTHDF2 (ENSLAFG00000030451) GMEB1 (ENSLAFG00000011849) TAF12 (ENSLAFG00000014103) TRNAU1AP (ENSLAFG00000007628) RCC1 (ENSLAFG00000007626) PHACTR4 (ENSLAFG00000007617) MED18 (ENSLAFG00000012511) SESN2 (ENSLAFG00000013698) ATP5IF1 (ENSLAFG00000005700) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017839.o.a #22 Common wonbat MODERN SPECIES 34 SNRNP48 (ENSVURG00010003775) DSP (ENSVURG00010003799) RIOK1 (ENSVURG00010003926) ENSVURG00010003938 ENSVURG00010003957 RREB1 (ENSVURG00010004039) LY86 (ENSVURG00010004118) ENSVURG00010004125 F13A1 (ENSVURG00010004170) NRN1 (ENSVURG00010004289) FARS2 (ENSVURG00010004338) LYRM4 (ENSVURG00010004361) ENSVURG00010004367 RPP40 (ENSVURG00010004377) ENSVURG00010004414 ENSVURG00010004422 #22 ENSVURG00010004427 ENSVURG00010004444 ECI2 (ENSVURG00010004465) FAM217A (ENSVURG00010004476) PRPF4B (ENSVURG00010004483) ENSVURG00010004506 PXDC1 (ENSVURG00010004534) SLC22A23 (ENSVURG00010004586) PSMG4 (ENSVURG00010004617) TUBB2A (ENSVURG00010004658) BPHL (ENSVURG00010004675) RIPK1 (ENSVURG00010004694) ENSVURG00010004709 ENSVURG00010004723 IRF4 (ENSVURG00010004732)