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ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.a.a ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b #22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.b.b #22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 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DUPLICATION Murinae DUPLICATION Murinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00940000172454 #14 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.b #22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 1 Fbll1 (ENSRNOG00000015303) #7 Pank3 (ENSRNOG00000007419) #8 Slit3 (ENSRNOG00000007377) #9 Spdl1 (ENSRNOG00000007292) #10 Insyn2b 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ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000162598 ENSGT00940000154590 ENSGT00940000158623 ENSGT00390000015916 ENSGT00390000009825 ENSGT00940000156278 ENSGT00390000002628 ENSGT00510000049125 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00940000172454 #14 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.b #22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000162598.d ENSGT00940000154590 ENSGT00940000162598.c ENSGT00940000158623 ENSGT00390000015916 ENSGT00390000009825 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ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.a.a ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2891 ENSMSIG00000026585 Gja1 (ENSMSIG00000026588) ENSMSIG00000026594 ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2994 Lama4 (ENSMSIG00000001276) Fam229b (ENSMSIG00000001215) Tube1 (ENSMSIG00000001171) Ccn6 (ENSMSIG00000001159) ENSMSIG00000001142 ##22 ENSMSIG00000001131 Fyn (ENSMSIG00000001064) Traf3ip2 (ENSMSIG00000001008) ENSMSIG00000000979 Rev3l (ENSMSIG00000000767) ENSMSIG00000000716 ENSMSIG00000000705 ENSMSIG00000000678 ENSMSIG00000000663 Mfsd4b5 (ENSMSIG00000000610) Mfsd4b1 (ENSMSIG00000000578) Slc16a10 (ENSMSIG00000000537) ENSMSIG00000000467 ENSMSIG00000000433 ENSMSIG00000000270 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 17 OR6c8 (ENSRNOG00000043334) Or6c38 (ENSRNOG00000043438) Olfr769 (ENSRNOG00000064889) Or6c201 (ENSRNOG00000043125) Olr908 (ENSRNOG00000070683) Or6c203 (ENSRNOG00000064174) Or6c206 (ENSRNOG00000048201) Or6c206 (ENSRNOG00000065551) Or6c35 (ENSRNOG00000064899) Or6c6i (ENSRNOG00000067036) Or6c208 (ENSRNOG00000069328) Or6c1h (ENSRNOG00000069127) Or6c3d (ENSRNOG00000065705) Olfr791 (ENSRNOG00000065284) Or6c88 (ENSRNOG00000069689) AABR07055492.1 (ENSRNOG00000056878) ##22 Or6c35f (ENSRNOG00000063008) Or6c210b-ps1 (ENSRNOG00000065522) ENSRNOG00000064169 Olr920 (ENSRNOG00000065582) Or6c35d (ENSRNOG00000068317) Or6c6f (ENSRNOG00000070603) Or10u3b (ENSRNOG00000063567) Or6c70 (ENSRNOG00000047264) Or6c76b (ENSRNOG00000066966) Olr936 (ENSRNOG00000069078) Or6c214b (ENSRNOG00000049098) Olr943 (ENSRNOG00000066391) Olr947 (ENSRNOG00000002333) Olr952 (ENSRNOG00000062619) Or6c202 (ENSRNOG00000056595) Rat MODERN SPECIES 11 Utp15 (ENSRNOG00000016591) Arhgef28 (ENSRNOG00000016544) Enc1 (ENSRNOG00000016541) Hexb (ENSRNOG00000025274) Gfm2 (ENSRNOG00000025285) Nsa2 (ENSRNOG00000016530) Fam169a (ENSRNOG00000016505) Gcnt4 (ENSRNOG00000064612) Ankrd31 (ENSRNOG00000025321) Hmgcr (ENSRNOG00000016122) Cert1 (ENSRNOG00000015686) ENSRNOG00000067644 Polk (ENSRNOG00000060626) Ankdd1b (ENSRNOG00000025377) Poc5 (ENSRNOG00000018193) AABR07007744.2 (ENSRNOG00000060714) ##22 Sv2c (ENSRNOG00000018094) F2rl2 (ENSRNOG00000018054) Iqgap2 (ENSRNOG00000025406) F2r (ENSRNOG00000048043) AABR07007730.1 (ENSRNOG00000018045) F2rl1 (ENSRNOG00000018003) S100z (ENSRNOG00000017998) Crhbp (ENSRNOG00000017890) Aggf1 (ENSRNOG00000029304) ENSRNOG00000063007 Zbed3 (ENSRNOG00000028941) LOC100912266 (ENSRNOG00000059441) ENSRNOG00000067662 Pde8b (ENSRNOG00000010280) Wdr41 (ENSRNOG00000025462) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.a.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.a.b ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 5 Fbll1 (MGP_PahariEiJ_G0017343) #7 Pank3 (MGP_PahariEiJ_G0017342) #8 Slit3 (MGP_PahariEiJ_G0017341) #9 Spdl1 (MGP_PahariEiJ_G0017340) #10 Insyn2b (MGP_PahariEiJ_G0017339) #11 Dock2 (MGP_PahariEiJ_G0017338) #12 Foxi1 (MGP_PahariEiJ_G0017337) #13 Lcp2 (MGP_PahariEiJ_G0017336) #15 Kcnmb1 (MGP_PahariEiJ_G0017335) #16 MGP_PahariEiJ_G0017334 #18 MGP_PahariEiJ_G0017333 Gabrp (MGP_PahariEiJ_G0017332) #19 MGP_PahariEiJ_G0017331 Ranbp17 (MGP_PahariEiJ_G0017330) #20 Tlx3 (MGP_PahariEiJ_G0017329) #21 MGP_PahariEiJ_G0017328 ##22 Fgf18 (MGP_PahariEiJ_G0017327) #23 Smim23 (MGP_PahariEiJ_G0017326) #24 Fbxw11 (MGP_PahariEiJ_G0017325) #25 Stk10 (MGP_PahariEiJ_G0017324) #27 Efcab9 (MGP_PahariEiJ_G0017323) #28 Ubtd2 (MGP_PahariEiJ_G0017322) #29 Sh3pxd2b (MGP_PahariEiJ_G0017321) #30 MGP_PahariEiJ_G0017320 MGP_PahariEiJ_G0017319 MGP_PahariEiJ_G0017318 MGP_PahariEiJ_G0017317 MGP_PahariEiJ_G0017316 MGP_PahariEiJ_G0017315 Nprl3 (MGP_PahariEiJ_G0017314) Rhbdf1 (MGP_PahariEiJ_G0017313) Rat MODERN SPECIES 17 Or10u3b (ENSRNOG00000063567) Or6c70 (ENSRNOG00000047264) Or6c76b (ENSRNOG00000066966) Olr936 (ENSRNOG00000069078) Or6c214b (ENSRNOG00000049098) Olr943 (ENSRNOG00000066391) Olr947 (ENSRNOG00000002333) Olr952 (ENSRNOG00000062619) Or6c202 (ENSRNOG00000056595) Or6c69e (ENSRNOG00000070129) Or6c213f (ENSRNOG00000067435) Olr951 (ENSRNOG00000069974) Or6c1 (ENSRNOG00000063839) ENSRNOG00000064471 ENSRNOG00000065094 AABR07055527.1 (ENSRNOG00000039997) ##22 Or6c66b (ENSRNOG00000060866) ENSRNOG00000065664 Or6c212 (ENSRNOG00000069548) Olr990 (ENSRNOG00000064972) ENSRNOG00000070115 Olr995 (ENSRNOG00000065975) Or6c207 (ENSRNOG00000028911) Or6c213c (ENSRNOG00000066066) Or6c69b (ENSRNOG00000069876) Or6c68 (ENSRNOG00000032428) Or6c6b (ENSRNOG00000070116) Or6c7 (ENSRNOG00000070885) Or6c75 (ENSRNOG00000065865) Or10p1 (ENSRNOG00000003347) Or6c211 (ENSRNOG00000063210) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.a ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.a ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.a ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.a ##22 Mus_C DUPLICATION Mus_C ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000017288 ENSGT00940000154336.d ENSGT00950000183144.A.j ENSGT00940000153972.A ENSGT00940000157994 ENSGT01100000263551.b.a.b ENSGT00390000011810 ENSGT00390000017214 ENSGT00390000009061 ENSGT00940000153123.A.e ENSGT00390000015987 ENSGT00940000153190.B.a ENSGT00940000160117 ENSGT00940000162341 ENSGT00940000154981 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.a.a ##22 ENSGT00940000154174 ENSGT01030000234598.b.a.b.k.b ENSGT00940000163858 ENSGT00950000183005.b.c.b ENSGT00940000160844.a ENSGT00950000183005.b.c.a ENSGT00440000039287 ENSGT00940000163044 ENSGT00940000154131.f.a.a.a.a ENSGT00940000154619.e.c.b ENSGT00940000154131.e.a.b.a.a.a.b.c.b ENSGT00940000163146.b ENSGT00940000154131.f.a.a.a.b ENSGT00940000154131.e.a.b.a.a.a.b.c.a.a ENSGT00940000154619.f.a Steppe mouse MODERN SPECIES 3318 ENSMSIG00000016588 Gpr83 (ENSMSIG00000016567) Izumo1r (ENSMSIG00000016359) Panx1 (ENSMSIG00000016343) Hephl1 (ENSMSIG00000016306) Vstm5 (ENSMSIG00000016281) Med17 (ENSMSIG00000016253) 4931406C07Rik (ENSMSIG00000016204) Taf1d (ENSMSIG00000016165) Cep295 (ENSMSIG00000015917) ENSMSIG00000015880 Deup1 (ENSMSIG00000015751) Slc36a4 (ENSMSIG00000015623) Mtnr1b (ENSMSIG00000015621) Fat3 (ENSMSIG00000015207) ENSMSIG00000015183 ##22 ENSMSIG00000015180 ENSMSIG00000015167 Chordc1 (ENSMSIG00000015139) Ubtfl1 (ENSMSIG00000015135) Mbd3l2 (ENSMSIG00000015109) Naalad2 (ENSMSIG00000014984) Zfp558 (ENSMSIG00000014968) Mbd3l1 (ENSMSIG00000014959) Muc16 (ENSMSIG00000014757) Or1m1 (ENSMSIG00000014729) Or7g16 (ENSMSIG00000014723) Or7g17 (ENSMSIG00000014713) Or7g18 (ENSMSIG00000014709) Or7g12 (ENSMSIG00000014695) Or7g20 (ENSMSIG00000014691) spretus MODERN SPECIES 18 Ankrd49 (MGP_SPRETEiJ_G0032907) Mre11a (MGP_SPRETEiJ_G0032908) MGP_SPRETEiJ_G0032909 Izumo1r (MGP_SPRETEiJ_G0032910) Panx1 (MGP_SPRETEiJ_G0032911) Hephl1 (MGP_SPRETEiJ_G0032912) Vstm5 (MGP_SPRETEiJ_G0032913) Med17 (MGP_SPRETEiJ_G0032914) 4931406C07Rik (MGP_SPRETEiJ_G0032915) Cep295 (MGP_SPRETEiJ_G0032916) Smco4 (MGP_SPRETEiJ_G0032917) Deup1 (MGP_SPRETEiJ_G0032918) Slc36a4 (MGP_SPRETEiJ_G0032919) MGP_SPRETEiJ_G0032920 Fat3 (MGP_SPRETEiJ_G0032921) MGP_SPRETEiJ_G0032922 ##22 Chordc1 (MGP_SPRETEiJ_G0032923) Naalad2 (MGP_SPRETEiJ_G0032924) Ubtfl1 (MGP_SPRETEiJ_G0032925) Mbd3l2 (MGP_SPRETEiJ_G0032926) Zfp558 (MGP_SPRETEiJ_G0032927) Mbd3l1 (MGP_SPRETEiJ_G0032928) MGP_SPRETEiJ_G0032929 Or1m1 (MGP_SPRETEiJ_G0032930) Or7g16 (MGP_SPRETEiJ_G0032931) Or7g17 (MGP_SPRETEiJ_G0032932) Or7g18 (MGP_SPRETEiJ_G0032933) Or7g20 (MGP_SPRETEiJ_G0032934) Or7g19 (MGP_SPRETEiJ_G0032935) Or7g21 (MGP_SPRETEiJ_G0032936) Or7g25 (MGP_SPRETEiJ_G0032937) Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.a.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3273 Krtap8-1 (ENSMSIG00000011956) ENSMSIG00000011965 Krtap20-2 (ENSMSIG00000011987) Gm7735 (ENSMSIG00000012004) Gm9789 (ENSMSIG00000012011) Gm10061 (ENSMSIG00000012018) ENSMSIG00000012022 ENSMSIG00000012028 1110025L11Rik (ENSMSIG00000012034) ENSMSIG00000012036 ENSMSIG00000012042 ENSMSIG00000012045 Gm10229 (ENSMSIG00000012050) Krtap22-2 (ENSMSIG00000012058) Krtap19-9b (ENSMSIG00000012068) ENSMSIG00000012075 ##22 Krtap19-5 (ENSMSIG00000012077) Krtap19-4 (ENSMSIG00000012087) Krtap19-3 (ENSMSIG00000012094) ENSMSIG00000012101 ENSMSIG00000012114 Gm20741 (ENSMSIG00000012121) Gm5965 (ENSMSIG00000012131) 2310057N15Rik (ENSMSIG00000012151) Krtap13 (ENSMSIG00000012161) Krtap13-1 (ENSMSIG00000012169) 2310061N02Rik (ENSMSIG00000012174) ENSMSIG00000012180 Krtap27-1 (ENSMSIG00000012189) Krtap26-1 (ENSMSIG00000012203) 2310079G19Rik (ENSMSIG00000012210) Rat MODERN SPECIES 16 Acp1 (ENSRNOG00000005260) Alkal2 (ENSRNOG00000005154) Tmem18 (ENSRNOG00000005144) Sntg2 (ENSRNOG00000004928) Tpo (ENSRNOG00000004646) Pxdn (ENSRNOG00000060614) Myt1l (ENSRNOG00000004269) AABR07064622.1 (ENSRNOG00000047877) Eipr1 (ENSRNOG00000009285) Trappc12 (ENSRNOG00000009039) Adi1 (ENSRNOG00000008950) Rnaseh1 (ENSRNOG00000008584) Rps7 (ENSRNOG00000008373) Allc (ENSRNOG00000008299) Akr1b1-ps1 (ENSRNOG00000042697) ENSRNOG00000070424 ##22 Dcdc2c (ENSRNOG00000067604) ENSRNOG00000069562 ENSRNOG00000068283 Sox11 (ENSRNOG00000030034) Cmpk2 (ENSRNOG00000007690) Rsad2 (ENSRNOG00000007539) Rnf144a (ENSRNOG00000007370) Id2 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ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 21 Rpl3l (ENSPEMG00000010667) Msrb1 (ENSPEMG00000018902) Hs3st6 (ENSPEMG00000016998) ENSPEMG00000025436 Spdl1 (ENSPEMG00000009912) #10 Dock2 (ENSPEMG00000015007) #12 Insyn2b (ENSPEMG00000015788) #11 Foxi1 (ENSPEMG00000015123) #13 4930469K13Rik (ENSPEMG00000029094) #14 Lcp2 (ENSPEMG00000011935) #15 Kcnmb1 (ENSPEMG00000025688) #16 Kcnip1 (ENSPEMG00000007681) #18 Gabrp (ENSPEMG00000008255) #19 Ranbp17 (ENSPEMG00000013086) #20 Tlx3 (ENSPEMG00000009002) #21 ENSPEMG00000010032 #22 Fgf18 (ENSPEMG00000027707) #23 ENSPEMG00000005862 Smim23 (ENSPEMG00000009648) #24 Fbxw11 (ENSPEMG00000014614) #25 Stk10 (ENSPEMG00000016749) #27 Efcab9 (ENSPEMG00000012516) #28 Ubtd2 (ENSPEMG00000028774) #29 Sh3pxd2b (ENSPEMG00000011209) #30 Neurl1b (ENSPEMG00000018647) #31 Dusp1 (ENSPEMG00000008974) #32 ENSPEMG00000029256 Ergic1 (ENSPEMG00000011371) #33 Atp6v0e (ENSPEMG00000016171) #34 Crebrf (ENSPEMG00000019136) #35 Bnip1 (ENSPEMG00000014579) #36 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 21 Nsf (ENSPEMG00000018090) Arf2 (ENSPEMG00000028221) Crhr1 (ENSPEMG00000002077) Sppl2c (ENSPEMG00000031371) Mapt (ENSPEMG00000011911) Kansl1 (ENSPEMG00000005436) Cdc27 (ENSPEMG00000014883) Myl4 (ENSPEMG00000012002) Itgb3 (ENSPEMG00000007846) Gm11639 (ENSPEMG00000027977) Mettl2 (ENSPEMG00000011277) Tlk2 (ENSPEMG00000009099) Mrc2 (ENSPEMG00000008777) Marchf10 (ENSPEMG00000016468) Tanc2 (ENSPEMG00000013025) ENSPEMG00000019831 #22 Cyb561 (ENSPEMG00000009659) Ace (ENSPEMG00000018095) Ace3 (ENSPEMG00000014555) Kcnh6 (ENSPEMG00000015737) Dcaf7 (ENSPEMG00000029147) Taco1 (ENSPEMG00000014249) Map3k3 (ENSPEMG00000013883) Limd2 (ENSPEMG00000025945) Strada (ENSPEMG00000012148) ENSPEMG00000010379 Ddx42 (ENSPEMG00000006755) Ftsj3 (ENSPEMG00000000248) ENSPEMG00000018373 Smarcd2 (ENSPEMG00000008268) Tcam1 (ENSPEMG00000007448) Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 15 Wwc1 (ENSMOCG00000019399) Rars (ENSMOCG00000005240) Fbll1 (ENSMOCG00000022683) #7 Pank3 (ENSMOCG00000006926) #8 Slit3 (ENSMOCG00000011712) #9 Spdl1 (ENSMOCG00000014400) #10 Insyn2b (ENSMOCG00000022544) #11 Dock2 (ENSMOCG00000007487) #12 Foxi1 (ENSMOCG00000004587) #13 Lcp2 (ENSMOCG00000012783) #15 Kcnmb1 (ENSMOCG00000012254) #16 Kcnip1 (ENSMOCG00000019706) #18 Gabrp (ENSMOCG00000022600) #19 Ranbp17 (ENSMOCG00000007105) #20 Tlx3 (ENSMOCG00000013764) #21 ENSMOCG00000001485 #22 Fgf18 (ENSMOCG00000010978) #23 Smim23 (ENSMOCG00000008049) #24 Fbxw11 (ENSMOCG00000005139) #25 ENSMOCG00000022759 #27 Efcab9 (ENSMOCG00000022547) #28 ENSMOCG00000022075 #29 ENSMOCG00000022493 #30 Abcc1 (ENSMOCG00000001674) Cep20 (ENSMOCG00000002426) Myh11 (ENSMOCG00000001351) Nde1 (ENSMOCG00000004322) Marf1 (ENSMOCG00000001136) ENSMOCG00000022220 Bmerb1 (ENSMOCG00000018990) Mpv17l (ENSMOCG00000016475) Prairie vole MODERN SPECIES 1 ENSMOCG00000015130 ENSMOCG00000010768 ENSMOCG00000017651 Cfap107 (ENSMOCG00000021478) Aadacl3 (ENSMOCG00000019587) ENSMOCG00000001628 #22 Aadacl4fm1 (ENSMOCG00000018268) ENSMOCG00000020825 Aadacl4 (ENSMOCG00000004268) Aadacl4fm4 (ENSMOCG00000019793) ENSMOCG00000017314 Dhrs3 (ENSMOCG00000015852) Vps13d (ENSMOCG00000021798) Tnfrsf1b (ENSMOCG00000011772) Tnfrsf8 (ENSMOCG00000013428) Miip (ENSMOCG00000012534) Mfn2 (ENSMOCG00000018675) Plod1 (ENSMOCG00000012299) 2510039O18Rik (ENSMOCG00000016570) Nppb (ENSMOCG00000008405) Nppa (ENSMOCG00000001019) Prairie vole MODERN SPECIES 353 Tnfrsf11b (ENSMOCG00000019162) Samd12 (ENSMOCG00000000941) Ext1 (ENSMOCG00000010164) Med30 (ENSMOCG00000003186) Slc30a8 (ENSMOCG00000004114) Aard (ENSMOCG00000009240) Rad21 (ENSMOCG00000012525) ENSMOCG00000018221 Eif3h (ENSMOCG00000020728) ENSMOCG00000007048 Trps1 (ENSMOCG00000004602) Csmd3 (ENSMOCG00000005179) Ncam2 (ENSMOCG00000019910) ENSMOCG00000022813 Tmprss15 (ENSMOCG00000000730) ENSMOCG00000005366 #22 Chodl (ENSMOCG00000009339) D16Ertd472e (ENSMOCG00000013574) Btg3 (ENSMOCG00000014652) Cxadr (ENSMOCG00000018494) ENSMOCG00000002949 ENSMOCG00000004992 Ccser1 (ENSMOCG00000003290) ENSMOCG00000013401 Mmrn1 (ENSMOCG00000020376) Snca (ENSMOCG00000022869) Gprin3 (ENSMOCG00000001332) ENSMOCG00000001905 Tigd2 (ENSMOCG00000011023) Fam13a (ENSMOCG00000014628) Herc3 (ENSMOCG00000021374) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.d.b.b #22 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 16 Cntf (ENSMOCG00000016049) Zfp91 (ENSMOCG00000018468) Lpxn (ENSMOCG00000019266) Or5b21 (ENSMOCG00000002067) ENSMOCG00000009033 ENSMOCG00000017684 Or9q1 (ENSMOCG00000009793) Tle4 (ENSMOCG00000011846) ENSMOCG00000017959 ENSMOCG00000021736 Cep78 (ENSMOCG00000020072) ENSMOCG00000012700 Gna14 (ENSMOCG00000012393) ENSMOCG00000013981 Vps13a (ENSMOCG00000019974) ENSMOCG00000019450 #22 Foxb2 (ENSMOCG00000001949) ENSMOCG00000009883 ENSMOCG00000019381 Gcnt1 (ENSMOCG00000013528) Rfk (ENSMOCG00000019217) ENSMOCG00000020199 Ostf1 (ENSMOCG00000021405) Nmrk1 (ENSMOCG00000022247) Carnmt1 (ENSMOCG00000005517) D030056L22Rik (ENSMOCG00000012610) Trpm6 (ENSMOCG00000012817) Rorb (ENSMOCG00000020519) Anxa1 (ENSMOCG00000014540) Aldh1a1 (ENSMOCG00000018548) ENSMOCG00000013424 Prairie vole MODERN SPECIES 3 4921517D22Rik (ENSMOCG00000022999) ENSMOCG00000019507 Naa35 (ENSMOCG00000013999) Agtpbp1 (ENSMOCG00000014650) Ntrk2 (ENSMOCG00000015461) Slc28a3 (ENSMOCG00000005269) Rmi1 (ENSMOCG00000016761) ENSMOCG00000001446 2210016F16Rik (ENSMOCG00000017857) Kif27 (ENSMOCG00000015570) Gkap1 (ENSMOCG00000011062) Ubqln1 (ENSMOCG00000001210) Idnk (ENSMOCG00000010669) ENSMOCG00000021968 Klhl3 (ENSMOCG00000009025) ENSMOCG00000022384 #22 Spock1 (ENSMOCG00000020464) Trpc7 (ENSMOCG00000007497) Smim32 (ENSMOCG00000005510) Smad5 (ENSMOCG00000014515) Tgfbi (ENSMOCG00000016445) Lect2 (ENSMOCG00000010525) Fbxl21 (ENSMOCG00000017953) Il9 (ENSMOCG00000015389) Slc25a48 (ENSMOCG00000014485) ENSMOCG00000013166 Cxcl14 (ENSMOCG00000012248) Tifab (ENSMOCG00000006896) Macroh2a1 (ENSMOCG00000002242) Pitx1 (ENSMOCG00000012203) Catsper3 (ENSMOCG00000005794) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 8 Arhgef10 (ENSPEMG00000023366) Cln8 (ENSPEMG00000027459) Dlgap2 (ENSPEMG00000024199) Erich1 (ENSPEMG00000017352) Tdrp (ENSPEMG00000024535) Fbxo25 (ENSPEMG00000019484) ENSPEMG00000030218 Champ1 (ENSPEMG00000019715) Upf3a (ENSPEMG00000019968) Cdc16 (ENSPEMG00000020029) Cfap97d2 (ENSPEMG00000019811) Rasa3 (ENSPEMG00000019978) 1700029H14Rik (ENSPEMG00000003001) Gas6 (ENSPEMG00000018326) Tmem255b (ENSPEMG00000011727) ENSPEMG00000030658 #22 Grk1 (ENSPEMG00000019528) Atp4b (ENSPEMG00000020168) Tfdp1 (ENSPEMG00000020251) Tmco3 (ENSPEMG00000009817) Dcun1d2 (ENSPEMG00000011440) ENSPEMG00000017800 Grtp1 (ENSPEMG00000019914) Lamp1 (ENSPEMG00000020244) Cul4a (ENSPEMG00000019569) Pcid2 (ENSPEMG00000019575) Proz (ENSPEMG00000020154) F10 (ENSPEMG00000004452) F7 (ENSPEMG00000019915) Mcf2l (ENSPEMG00000019409) Atp11a (ENSPEMG00000008831) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.d.b #22 Golden Hamster MODERN SPECIES 701 Cfap20 (ENSMAUG00000002778) Csnk2a2 (ENSMAUG00000008176) Ccdc113 (ENSMAUG00000000235) Prss54 (ENSMAUG00000000894) Gins3 (ENSMAUG00000008574) Ndrg4 (ENSMAUG00000016805) Setd6 (ENSMAUG00000004853) ENSMAUG00000009731 ENSMAUG00000014000 Slc38a7 (ENSMAUG00000016252) Got2 (ENSMAUG00000018221) ENSMAUG00000012456 Cdh8 (ENSMAUG00000000265) ENSMAUG00000013353 ENSMAUG00000014350 ENSMAUG00000015943 #22 ENSMAUG00000017111 Cdh11 (ENSMAUG00000015471) Cdh5 (ENSMAUG00000016489) Bean1 (ENSMAUG00000018813) Tk2 (ENSMAUG00000014656) Cklf (ENSMAUG00000019904) ENSMAUG00000010482 Cmtm3 (ENSMAUG00000010935) Cmtm4 (ENSMAUG00000011070) Dync1li2 (ENSMAUG00000011837) Terb1 (ENSMAUG00000010324) Nae1 (ENSMAUG00000013882) Car7 (ENSMAUG00000012285) Pdp2 (ENSMAUG00000013617) Cdh16 (ENSMAUG00000000808) Kangaroo rat MODERN SPECIES 332 Gdf5 (ENSDORG00000015642) Uqcc1 (ENSDORG00000001426) Fam83c (ENSDORG00000001424) Eif6 (ENSDORG00000001423) Mmp24 (ENSDORG00000001419) Procr (ENSDORG00000001184) Edem2 (ENSDORG00000006204) Trpc4ap (ENSDORG00000008578) Myh7b (ENSDORG00000008575) ENSDORG00000008574 Acss2 (ENSDORG00000008570) Ggt7 (ENSDORG00000008568) ENSDORG00000016245 Trp53inp2 (ENSDORG00000026160) Pigu (ENSDORG00000001715) ENSDORG00000029351 #22 Dynlrb1 (ENSDORG00000028607) Itch (ENSDORG00000027257) ENSDORG00000012590 a (ENSDORG00000013768) Eif2s2 (ENSDORG00000001920) Raly (ENSDORG00000013400) Chmp4b (ENSDORG00000011539) Zfp341 (ENSDORG00000000005) Pxmp4 (ENSDORG00000030129) E2f1 (ENSDORG00000013793) Necab3 (ENSDORG00000013792) Cbfa2t2 (ENSDORG00000001656) Snta1 (ENSDORG00000029237) Cdk5rap1 (ENSDORG00000004622) Bpifb5 (ENSDORG00000028380) Rodentia_B DUPLICATION Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.a ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 350 Top3a (ENSDORG00000005350) Mief2 (ENSDORG00000027947) Flii (ENSDORG00000005341) Llgl1 (ENSDORG00000005339) ENSDORG00000024764 Myo15a (ENSDORG00000016485) Drg2 (ENSDORG00000016484) Gid4 (ENSDORG00000016482) Atpaf2 (ENSDORG00000016481) Drc3 (ENSDORG00000016478) Tom1l2 (ENSDORG00000016476) Srebf1 (ENSDORG00000012333) Rai1 (ENSDORG00000012338) Pemt (ENSDORG00000015700) Med9 (ENSDORG00000015698) ENSDORG00000025877 ##22 Nt5m (ENSDORG00000005928) Cops3 (ENSDORG00000011133) Flcn (ENSDORG00000011129) Pld6 (ENSDORG00000006462) ENSDORG00000025758 ENSDORG00000024704 ENSDORG00000024708 Usp22 (ENSDORG00000008743) Dhrs7b (ENSDORG00000010575) Tmem11 (ENSDORG00000010578) Natd1 (ENSDORG00000024761) ENSDORG00000012413 Kcnj12 (ENSDORG00000004888) ENSDORG00000026977 ENSDORG00000026128 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.a ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.a ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 833 Gabre (ENSMAUG00000001350) Cnga2 (ENSMAUG00000002288) Fate1 (ENSMAUG00000002949) Prrg3 (ENSMAUG00000001542) ENSMAUG00000002037 Gpr50 (ENSMAUG00000002329) Hmgb3 (ENSMAUG00000003762) Cd99l2 (ENSMAUG00000005037) Mtmr1 (ENSMAUG00000003637) Mtm1 (ENSMAUG00000007647) Mamld1 (ENSMAUG00000005591) ENSMAUG00000007102 ##22 Eola1 (ENSMAUG00000007164) Tmem185a (ENSMAUG00000007774) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.b ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 431 Ccng1 (ENSDORG00000014293) Mat2b (ENSDORG00000011688) Tenm2 (ENSDORG00000000072) Wwc1 (ENSDORG00000026822) Rars (ENSDORG00000010641) Pank3 (ENSDORG00000016387) #8 Slit3 (ENSDORG00000024863) #9 Spdl1 (ENSDORG00000006325) #10 Insyn2b (ENSDORG00000026025) #11 Dock2 (ENSDORG00000006519) #12 ENSDORG00000016444 #15 Kcnmb1 (ENSDORG00000023698) #16 Kcnip1 (ENSDORG00000008211) #18 Gabrp (ENSDORG00000012082) #19 Ranbp17 (ENSDORG00000001411) #20 ENSDORG00000028337 ##22 Fgf18 (ENSDORG00000025835) #23 ENSDORG00000026619 Fbxw11 (ENSDORG00000009769) #25 Stk10 (ENSDORG00000009303) #27 Efcab9 (ENSDORG00000010658) #28 Ubtd2 (ENSDORG00000026096) #29 Sh3pxd2b (ENSDORG00000003937) #30 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.b.b #22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Sciuridae DUPLICATION Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.a #22 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 15 RARS1 (ENSSVLG00005017270) FBLL1 (ENSSVLG00005017249) #7 ENSSVLG00005017131 #8 SLIT3 (ENSSVLG00005017034) #9 SPDL1 (ENSSVLG00005016956) #10 INSYN2B (ENSSVLG00005016909) #11 DOCK2 (ENSSVLG00005016455) #12 FOXI1 (ENSSVLG00005016401) #13 C5orf58 (ENSSVLG00005016377) LCP2 (ENSSVLG00005015956) #15 KCNMB1 (ENSSVLG00005015902) #16 KCNIP1 (ENSSVLG00005015593) #18 GABRP (ENSSVLG00005015323) #19 RANBP17 (ENSSVLG00005015018) #20 TLX3 (ENSSVLG00005014955) #21 ENSSVLG00005014590 #22 FGF18 (ENSSVLG00005014519) #23 FBXW11 (ENSSVLG00005014207) #25 STK10 (ENSSVLG00005014068) #27 EFCAB9 (ENSSVLG00005013993) #28 UBTD2 (ENSSVLG00005013934) #29 SH3PXD2B (ENSSVLG00005013894) #30 NEURL1B (ENSSVLG00005013785) #31 DUSP1 (ENSSVLG00005013587) #32 ERGIC1 (ENSSVLG00005013430) #33 RPL26L1 (ENSSVLG00005013228) ATP6V0E1 (ENSSVLG00005013162) #34 CREBRF (ENSSVLG00005013005) #35 BNIP1 (ENSSVLG00005012932) #36 NKX2-5 (ENSSVLG00005012867) #37 STC2 (ENSSVLG00005012797) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 MFHAS1 (ENSSVLG00005016271) ERI1 (ENSSVLG00005016316) PPP1R3B (ENSSVLG00005016330) ENSSVLG00005016347 TNKS (ENSSVLG00005016386) DUSP4 (ENSSVLG00005016443) SARAF (ENSSVLG00005016504) LEPROTL1 (ENSSVLG00005016547) ENSSVLG00005016597 ENSSVLG00005016629 ENSSVLG00005016714 HGSNAT (ENSSVLG00005016741) POMK (ENSSVLG00005016784) ENSSVLG00005016814 HOOK3 (ENSSVLG00005016854) ENSSVLG00005017098 #22 RNF170 (ENSSVLG00005017139) THAP1 (ENSSVLG00005017229) CHRNA6 (ENSSVLG00005017315) CHRNB3 (ENSSVLG00005017450) SMIM19 (ENSSVLG00005017542) SLC20A2 (ENSSVLG00005017580) ENSSVLG00005017652 DKK4 (ENSSVLG00005017944) POLB (ENSSVLG00005018013) IKBKB (ENSSVLG00005018109) PLAT (ENSSVLG00005018429) AP3M2 (ENSSVLG00005019071) KAT6A (ENSSVLG00005019144) ANK1 (ENSSVLG00005019744) NKX6-3 (ENSSVLG00005020897) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.a #22 Alpin marmot MODERN SPECIES 1 SIX1 (ENSMMMG00000020535) ENSMMMG00000020537 MNAT1 (ENSMMMG00000020544) TRMT5 (ENSMMMG00000020550) SLC38A6 (ENSMMMG00000020558) TMEM30B (ENSMMMG00000020577) PRKCH (ENSMMMG00000020586) HIF1A (ENSMMMG00000020603) SNAPC1 (ENSMMMG00000020631) SYT16 (ENSMMMG00000020656) ENSMMMG00000020664 KCNH5 (ENSMMMG00000020695) RHOJ (ENSMMMG00000020711) GPHB5 (ENSMMMG00000020716) PPP2R5E (ENSMMMG00000020722) ENSMMMG00000020739 #22 WDR89 (ENSMMMG00000020745) SGPP1 (ENSMMMG00000020751) ENSMMMG00000020757 ENSMMMG00000020769 ESR2 (ENSMMMG00000020849) ENSMMMG00000020893 MTHFD1 (ENSMMMG00000020925) AKAP5 (ENSMMMG00000020940) ZBTB25 (ENSMMMG00000020941) ZBTB1 (ENSMMMG00000020951) HSPA2 (ENSMMMG00000020955) PPP1R36 (ENSMMMG00000020959) PLEKHG3 (ENSMMMG00000020967) SPTB (ENSMMMG00000020993) FNTB (ENSMMMG00000021058) Sciuridae DUPLICATION Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.b.a #22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00390000010491.f.b ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.b.a #22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Alpin marmot MODERN SPECIES 31 RARS1 (ENSMMMG00000010943) ENSMMMG00000010921 #8 SLIT3 (ENSMMMG00000010861) #9 SPDL1 (ENSMMMG00000010830) #10 INSYN2B (ENSMMMG00000010818) #11 DOCK2 (ENSMMMG00000010732) #12 FOXI1 (ENSMMMG00000010708) #13 C5orf58 (ENSMMMG00000010701) LCP2 (ENSMMMG00000010608) #15 KCNMB1 (ENSMMMG00000010599) #16 ENSMMMG00000010588 KCNIP1 (ENSMMMG00000010524) #18 GABRP (ENSMMMG00000010504) #19 RANBP17 (ENSMMMG00000010468) #20 TLX3 (ENSMMMG00000010459) #21 ENSMMMG00000010435 #22 ENSMMMG00000010418 #23 SMIM23 (ENSMMMG00000010399) #24 FBXW11 (ENSMMMG00000010309) #25 STK10 (ENSMMMG00000010286) #27 ENSMMMG00000010272 #28 UBTD2 (ENSMMMG00000010264) #29 SH3PXD2B (ENSMMMG00000010235) #30 NEURL1B (ENSMMMG00000010222) #31 ENSMMMG00000010217 #32 ERGIC1 (ENSMMMG00000010202) #33 RPL26L1 (ENSMMMG00000010196) CREBRF (ENSMMMG00000010165) #35 BNIP1 (ENSMMMG00000010131) #36 NKX2-5 (ENSMMMG00000010122) #37 STC2 (ENSMMMG00000010105) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00390000010491.f.b ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.b.a #22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Squirrel DUPLICATION Squirrel DUPLICATION Squirrel MODERN SPECIES 105 ENSSTOG00000024801 TMPRSS15 (ENSSTOG00000011027) CHODL (ENSSTOG00000011022) C21orf91 (ENSSTOG00000027303) ENSSTOG00000010285 CXADR (ENSSTOG00000026899) USP25 (ENSSTOG00000034203) NRIP1 (ENSSTOG00000020623) ENSSTOG00000027949 #22 SAMSN1 (ENSSTOG00000025735) HSPA13 (ENSSTOG00000011229) RBM11 (ENSSTOG00000034273) LIPI (ENSSTOG00000013743) ROBO2 (ENSSTOG00000015604) ROBO1 (ENSSTOG00000000470) GBE1 (ENSSTOG00000002532) Squirrel MODERN SPECIES 183 ENSSTOG00000033121 #22 C14orf28 (ENSSTOG00000009376) KLHL28 (ENSSTOG00000009381) TOGARAM1 (ENSSTOG00000009385) PRPF39 (ENSSTOG00000019828) FKBP3 (ENSSTOG00000002249) RPL10L (ENSSTOG00000020857) MDGA2 (ENSSTOG00000008672) ENSSTOG00000006936 LRR1 (ENSSTOG00000006973) ENSSTOG00000033824 MGAT2 (ENSSTOG00000007012) DNAAF2 (ENSSTOG00000023987) POLE2 (ENSSTOG00000007024) KLHDC1 (ENSSTOG00000007062) KLHDC2 (ENSSTOG00000000958) Squirrel MODERN SPECIES 209 INSYN2B (ENSSTOG00000016521) #11 DOCK2 (ENSSTOG00000028655) #12 FOXI1 (ENSSTOG00000016524) #13 LCP2 (ENSSTOG00000016525) #15 KCNMB1 (ENSSTOG00000021835) #16 KCNIP1 (ENSSTOG00000004193) #18 ENSSTOG00000014692 #19 RANBP17 (ENSSTOG00000014700) #20 TLX3 (ENSSTOG00000026927) #21 ENSSTOG00000014732 #22 FGF18 (ENSSTOG00000023666) #23 SMIM23 (ENSSTOG00000024706) #24 FBXW11 (ENSSTOG00000023506) #25 STK10 (ENSSTOG00000026208) #27 EFCAB9 (ENSSTOG00000020218) #28 UBTD2 (ENSSTOG00000014298) #29 SH3PXD2B (ENSSTOG00000028124) #30 NEURL1B (ENSSTOG00000025420) #31 DUSP1 (ENSSTOG00000023698) #32 ERGIC1 (ENSSTOG00000025246) #33 RPL26L1 (ENSSTOG00000026876) ATP6V0E1 (ENSSTOG00000025255) #34 CREBRF (ENSSTOG00000004368) #35 BNIP1 (ENSSTOG00000004393) #36 NKX2-5 (ENSSTOG00000004407) #37 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 242 DOCK2 (ENSUPAG00010022135) #12 INSYN2B (ENSUPAG00010022143) #11 FOXI1 (ENSUPAG00010022146) #13 C5orf58 (ENSUPAG00010022147) LCP2 (ENSUPAG00010022148) #15 KCNMB1 (ENSUPAG00010022156) #16 ENSUPAG00010022158 KCNIP1 (ENSUPAG00010022160) #18 GABRP (ENSUPAG00010022164) #19 RANBP17 (ENSUPAG00010022169) #20 TLX3 (ENSUPAG00010022175) #21 NPM1 (ENSUPAG00010022177) #22 FGF18 (ENSUPAG00010022179) #23 SMIM23 (ENSUPAG00010022182) #24 ENSUPAG00010022184 #25 STK10 (ENSUPAG00010022207) #27 EFCAB9 (ENSUPAG00010022210) #28 UBTD2 (ENSUPAG00010022213) #29 SH3PXD2B (ENSUPAG00010022216) #30 NEURL1B (ENSUPAG00010022219) #31 ERGIC1 (ENSUPAG00010022238) #33 RPL26L1 (ENSUPAG00010022239) ATP6V0E1 (ENSUPAG00010022244) #34 CREBRF (ENSUPAG00010022247) #35 BNIP1 (ENSUPAG00010022250) #36 NKX2-5 (ENSUPAG00010022252) #37 STC2 (ENSUPAG00010022254) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 18 CDS1 (ENSSVLG00005019388) NKX6-1 (ENSSVLG00005019440) ENSSVLG00005019498 GPAT3 (ENSSVLG00005019557) ABRAXAS1 (ENSSVLG00005019610) ENSSVLG00005019766 HELQ (ENSSVLG00005019975) ENSSVLG00005020214 HPSE (ENSSVLG00005020319) COQ2 (ENSSVLG00005020613) ENSSVLG00005020728 PLAC8 (ENSSVLG00005020747) COPS4 (ENSSVLG00005020796) LIN54 (ENSSVLG00005020883) THAP9 (ENSSVLG00005021207) ENSSVLG00005021269 #22 SEC31A (ENSSVLG00005021390) SCD5 (ENSSVLG00005021839) ENSSVLG00005021877 TMEM150C (ENSSVLG00005021907) ENOPH1 (ENSSVLG00005022006) HNRNPDL (ENSSVLG00005022171) HNRNPD (ENSSVLG00005022330) RASGEF1B (ENSSVLG00005022447) PRKG2 (ENSSVLG00005022851) BMP3 (ENSSVLG00005023094) CFAP299 (ENSSVLG00005023128) FGF5 (ENSSVLG00005023174) ENSSVLG00005023206 ANTXR2 (ENSSVLG00005023242) ENSSVLG00005023309 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.b.b #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.b.b #22 Alpin marmot MODERN SPECIES 35 ZNF862 (ENSMMMG00000006562) ZNF467 (ENSMMMG00000006797) KRBA1 (ENSMMMG00000006852) ZNF746 (ENSMMMG00000006886) ZNF777 (ENSMMMG00000006944) ENSMMMG00000006955 ENSMMMG00000006972 ZNF212 (ENSMMMG00000006983) ZNF282 (ENSMMMG00000006992) ZNF398 (ENSMMMG00000007052) ZNF786 (ENSMMMG00000007070) PDIA4 (ENSMMMG00000007099) EZH2 (ENSMMMG00000007126) CUL1 (ENSMMMG00000007363) CNTNAP2 (ENSMMMG00000007396) ENSMMMG00000007425 #22 ENSMMMG00000007430 TPK1 (ENSMMMG00000007491) ARHGEF5 (ENSMMMG00000007524) ENSMMMG00000007656 ENSMMMG00000007663 OR2A2 (ENSMMMG00000007675) ENSMMMG00000007684 ENSMMMG00000007690 OR2A25 (ENSMMMG00000007701) OR2A5 (ENSMMMG00000007707) OR6B1 (ENSMMMG00000007724) ENSMMMG00000007734 ENSMMMG00000007738 ENSMMMG00000007771 ENSMMMG00000007782 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b #22 Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 137 KCNF1 (ENSOGAG00000026918) C2orf50 (ENSOGAG00000009762) SLC66A3 (ENSOGAG00000009765) ROCK2 (ENSOGAG00000009767) ENSOGAG00000024515 E2F6 (ENSOGAG00000013601) GREB1 (ENSOGAG00000013608) NTSR2 (ENSOGAG00000013618) LPIN1 (ENSOGAG00000013620) TRIB2 (ENSOGAG00000002490) LRATD1 (ENSOGAG00000032892) NBAS (ENSOGAG00000008723) DDX1 (ENSOGAG00000008730) MYCN (ENSOGAG00000010927) CYRIA (ENSOGAG00000009218) ENSOGAG00000031508 #22 VSNL1 (ENSOGAG00000030574) SMC6 (ENSOGAG00000004809) GEN1 (ENSOGAG00000004816) MSGN1 (ENSOGAG00000012569) KCNS3 (ENSOGAG00000007336) RDH14 (ENSOGAG00000027061) NT5C1B (ENSOGAG00000001728) OSR1 (ENSOGAG00000003047) TTC32 (ENSOGAG00000002990) WDR35 (ENSOGAG00000002991) MATN3 (ENSOGAG00000002995) ENSOGAG00000029374 LAPTM4A (ENSOGAG00000003002) SDC1 (ENSOGAG00000010183) PUM2 (ENSOGAG00000002187) Bushbaby MODERN SPECIES 122 NR2C1 (ENSOGAG00000011821) FGD6 (ENSOGAG00000011825) VEZT (ENSOGAG00000011835) ENSOGAG00000008469 USP44 (ENSOGAG00000008473) NTN4 (ENSOGAG00000014317) ENSOGAG00000027793 ENSOGAG00000014320 CCDC38 (ENSOGAG00000014323) AMDHD1 (ENSOGAG00000014327) HAL (ENSOGAG00000014330) LTA4H (ENSOGAG00000014336) ELK3 (ENSOGAG00000031899) CDK17 (ENSOGAG00000007484) ENSOGAG00000012022 ENSOGAG00000024990 #22 ENSOGAG00000005823 NEDD1 (ENSOGAG00000005824) ENSOGAG00000012220 SLC25A3 (ENSOGAG00000012222) ENSOGAG00000028619 IKBIP (ENSOGAG00000012226) APAF1 (ENSOGAG00000012229) ENSOGAG00000025146 GARIN6 (ENSOGAG00000006412) ANKS1B (ENSOGAG00000012239) BLTP3B (ENSOGAG00000001738) ACTR6 (ENSOGAG00000001741) ENSOGAG00000026542 DEPDC4 (ENSOGAG00000026205) SCYL2 (ENSOGAG00000007862) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b #22 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a #22 Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.a #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.a #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.a #22 Drill MODERN SPECIES 584 ADHFE1 (ENSMLEG00000037829) VXN (ENSMLEG00000029077) MYBL1 (ENSMLEG00000032838) VCPIP1 (ENSMLEG00000035358) ENSMLEG00000037739 ENSMLEG00000042544 SGK3 (ENSMLEG00000041322) MCMDC2 (ENSMLEG00000038410) ENSMLEG00000000766 TCF24 (ENSMLEG00000039858) PPP1R42 (ENSMLEG00000040981) ENSMLEG00000041065 ENSMLEG00000035973 ENSMLEG00000015396 CSPP1 (ENSMLEG00000007846) ENSMLEG00000035224 #22 ARFGEF1 (ENSMLEG00000043500) CPA6 (ENSMLEG00000039764) PREX2 (ENSMLEG00000004343) C8orf34 (ENSMLEG00000033292) SULF1 (ENSMLEG00000036884) SLCO5A1 (ENSMLEG00000036819) ENSMLEG00000030182 ENSMLEG00000041678 ENSMLEG00000023557 PRDM14 (ENSMLEG00000027772) NCOA2 (ENSMLEG00000034329) ENSMLEG00000031623 TRAM1 (ENSMLEG00000043709) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.a #22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 580 TRIM55 (ENSMNEG00000041922) CRH (ENSMNEG00000011754) RRS1 (ENSMNEG00000011696) ADHFE1 (ENSMNEG00000035326) VXN (ENSMNEG00000036354) MYBL1 (ENSMNEG00000039299) VCPIP1 (ENSMNEG00000021855) ENSMNEG00000028480 SGK3 (ENSMNEG00000044391) ENSMNEG00000026502 MCMDC2 (ENSMNEG00000032561) TCF24 (ENSMNEG00000031304) PPP1R42 (ENSMNEG00000033894) ENSMNEG00000038050 COPS5 (ENSMNEG00000032680) ENSMNEG00000030459 #22 CSPP1 (ENSMNEG00000033156) ARFGEF1 (ENSMNEG00000044978) CPA6 (ENSMNEG00000036786) PREX2 (ENSMNEG00000039793) C8orf34 (ENSMNEG00000021015) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.b #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.b #22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 419 MCTS1 (ENSMNEG00000041580) ENSMNEG00000007215 ENSMNEG00000004584 C1GALT1C1 (ENSMNEG00000009174) ENSMNEG00000040465 ENSMNEG00000022497 ENSMNEG00000038048 ENSMNEG00000042959 ENSMNEG00000028910 GRIA3 (ENSMNEG00000032915) ENSMNEG00000039323 THOC2 (ENSMNEG00000033627) XIAP (ENSMNEG00000036769) ENSMNEG00000031659 STAG2 (ENSMNEG00000033817) ENSMNEG00000034784 #22 SH2D1A (ENSMNEG00000035692) ENSMNEG00000039683 TENM1 (ENSMNEG00000030864) TEX13C (ENSMNEG00000037340) DCAF12L2 (ENSMNEG00000026496) DCAF12L1 (ENSMNEG00000020052) ENSMNEG00000005648 PRR32 (ENSMNEG00000028118) ACTRT1 (ENSMNEG00000021005) ENSMNEG00000039781 ENSMNEG00000029813 SMARCA1 (ENSMNEG00000041768) OCRL (ENSMNEG00000039517) APLN (ENSMNEG00000025745) XPNPEP2 (ENSMNEG00000011460) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000156123.b ENSGT00940000161972.d.b ENSGT00710000106792 ENSGT00940000158743 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.m.a.b ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.b #22 ENSGT00940000161768.A.o ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000161768.A.p ENSGT00940000161322 ENSGT00940000165384 ENSGT00390000012726 ENSGT00940000162451 ENSGT00940000154612.n.fb.b ENSGT00940000157297 ENSGT00940000157996 ENSGT00390000014020 ENSGT00940000157196 ENSGT00940000160111 ENSGT00940000159999 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 113 ENSGT00940000156123.b ENSGT00940000161972.d.b ENSGT00710000106792 ENSGT00940000158743 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.m.a.b ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.b #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000161322 ENSGT00940000165384 ENSGT00390000012726 ENSGT00940000162451 ENSGT00940000154612.n.fb.b ENSGT00390000013354.d.a.b.a.a.b ENSGT00940000157297 ENSGT00940000157996 ENSGT00390000014020 ENSGT00940000157196 ENSGT00940000160111 ENSGT00940000159999 ENSGT00390000008142.i Drill MODERN SPECIES 1386 GRIA3 (ENSMLEG00000000292) ENSMLEG00000038682 THOC2 (ENSMLEG00000034817) XIAP (ENSMLEG00000041038) ENSMLEG00000037792 STAG2 (ENSMLEG00000035654) ENSMLEG00000043971 #22 SH2D1A (ENSMLEG00000038431) TENM1 (ENSMLEG00000044221) Sooty mangabey MODERN SPECIES 655 GRIA3 (ENSCATG00000036841) ENSCATG00000038781 THOC2 (ENSCATG00000003183) XIAP (ENSCATG00000029823) ENSCATG00000044937 STAG2 (ENSCATG00000027639) ENSCATG00000014743 #22 SH2D1A (ENSCATG00000013291) TENM1 (ENSCATG00000010260) DCAF12L2 (ENSCATG00000018014) DCAF12L1 (ENSCATG00000022780) PRR32 (ENSCATG00000037226) ACTRT1 (ENSCATG00000018422) ENSCATG00000033747 ENSCATG00000031968 SMARCA1 (ENSCATG00000015921) OCRL (ENSCATG00000037629) ENSCATG00000035939 XPNPEP2 (ENSCATG00000015884) SASH3 (ENSCATG00000033233) ZDHHC9 (ENSCATG00000031943) UTP14A (ENSCATG00000036177) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 553 ENSANAG00000028603 ACTR8 (ENSANAG00000028469) IL17RB (ENSANAG00000034959) CHDH (ENSANAG00000029420) CACNA1D (ENSANAG00000025578) DCP1A (ENSANAG00000025834) ENSANAG00000037688 PRKCD (ENSANAG00000022094) RFT1 (ENSANAG00000031288) SFMBT1 (ENSANAG00000036375) STIMATE (ENSANAG00000038396) MUSTN1 (ENSANAG00000037491) ITIH4 (ENSANAG00000021480) ITIH3 (ENSANAG00000025494) ITIH1 (ENSANAG00000036541) ENSANAG00000030360 #22 NEK4 (ENSANAG00000021460) SPCS1 (ENSANAG00000031409) GLT8D1 (ENSANAG00000026279) GNL3 (ENSANAG00000033209) ENSANAG00000032255 PBRM1 (ENSANAG00000034205) UQCC5 (ENSANAG00000007283) NT5DC2 (ENSANAG00000005150) STAB1 (ENSANAG00000031871) NISCH (ENSANAG00000022782) TNNC1 (ENSANAG00000022710) SEMA3G (ENSANAG00000026752) ENSANAG00000026339 PHF7 (ENSANAG00000021364) ENSANAG00000025082 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22 Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.a #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.a #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.a #22 Bolivian squirrel monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 45 MSH4 (ENSSBOG00000020272) RABGGTB (ENSSBOG00000030418) ACADM (ENSSBOG00000032362) SLC44A5 (ENSSBOG00000025792) LHX8 (ENSSBOG00000031302) TYW3 (ENSSBOG00000022917) CRYZ (ENSSBOG00000027623) ERICH3 (ENSSBOG00000030083) TNNI3K (ENSSBOG00000027342) LRRC53 (ENSSBOG00000031388) FPGT (ENSSBOG00000031862) LRRIQ3 (ENSSBOG00000023453) ENSSBOG00000022738 NEGR1 (ENSSBOG00000033521) ENSSBOG00000022428 ENSSBOG00000036028 #22 ENSSBOG00000013268 PTGER3 (ENSSBOG00000032109) CTH (ENSSBOG00000004834) ENSSBOG00000033163 ANKRD13C (ENSSBOG00000035265) SRSF11 (ENSSBOG00000033461) LRRC40 (ENSSBOG00000033042) LRRC7 (ENSSBOG00000023202) ENSSBOG00000024654 DEPDC1 (ENSSBOG00000032526) RPE65 (ENSSBOG00000020711) ENSSBOG00000017047 WLS (ENSSBOG00000029071) GNG12 (ENSSBOG00000023413) GADD45A (ENSSBOG00000026960) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 190 WDR72 (ENSSBOG00000020082) ONECUT1 (ENSSBOG00000033790) ATOSA (ENSSBOG00000028184) ARPP19 (ENSSBOG00000030365) ENSSBOG00000026330 ENSSBOG00000029727 MYO5A (ENSSBOG00000033216) MYO5C (ENSSBOG00000020491) GNB5 (ENSSBOG00000031028) ENSSBOG00000026375 MAPK6 (ENSSBOG00000023650) LEO1 (ENSSBOG00000030660) ENSSBOG00000025734 #22 TMOD3 (ENSSBOG00000020246) EVL (ENSSBOG00000021298) DEGS2 (ENSSBOG00000000041) ENSSBOG00000030828 SLC25A29 (ENSSBOG00000027271) SLC25A47 (ENSSBOG00000026024) WARS1 (ENSSBOG00000024797) WDR25 (ENSSBOG00000022958) BEGAIN (ENSSBOG00000028969) DLK1 (ENSSBOG00000024967) ENSSBOG00000032215 ENSSBOG00000019405 PPP2R5C (ENSSBOG00000026611) ENSSBOG00000028383 DYNC1H1 (ENSSBOG00000025585) Capuchin MODERN SPECIES 234 ANGPTL8 (ENSCCAG00000035333) DOCK6 (ENSCCAG00000036513) TSPAN16 (ENSCCAG00000033000) RAB3D (ENSCCAG00000025383) TMEM205 (ENSCCAG00000036980) CCDC159 (ENSCCAG00000031662) PLPPR2 (ENSCCAG00000032464) SWSAP1 (ENSCCAG00000027417) EPOR (ENSCCAG00000036869) RGL3 (ENSCCAG00000028640) ODAD3 (ENSCCAG00000028303) PRKCSH (ENSCCAG00000022230) ELAVL3 (ENSCCAG00000034350) ZNF653 (ENSCCAG00000027104) ECSIT (ENSCCAG00000030491) ENSCCAG00000016051 #22 CNN1 (ENSCCAG00000028138) ELOF1 (ENSCCAG00000033676) ENSCCAG00000018398 ACP5 (ENSCCAG00000031739) ENSCCAG00000037049 ENSCCAG00000015998 ZNF823 (ENSCCAG00000037280) ZNF441 (ENSCCAG00000024894) ENSCCAG00000034489 ZNF433 (ENSCCAG00000031149) ZNF878 (ENSCCAG00000033113) ENSCCAG00000029056 ENSCCAG00000024419 ZNF20 (ENSCCAG00000000011) ZNF625 (ENSCCAG00000030631) Mas night monkey MODERN SPECIES 1222 SPATA1 (ENSANAG00000028513) GNG5 (ENSANAG00000037163) RPF1 (ENSANAG00000035706) ENSANAG00000035698 DNASE2B (ENSANAG00000034051) ENSANAG00000025747 ENSANAG00000033696 SAMD13 (ENSANAG00000035857) ENSANAG00000020653 PRKACB (ENSANAG00000024480) TTLL7 (ENSANAG00000024884) ADGRL2 (ENSANAG00000036995) ENSANAG00000026509 ENSANAG00000032415 ENSANAG00000014411 ENSANAG00000026461 #22 ADGRL4 (ENSANAG00000033541) IFI44 (ENSANAG00000037840) IFI44L (ENSANAG00000025193) PTGFR (ENSANAG00000032906) GIPC2 (ENSANAG00000002242) DNAJB4 (ENSANAG00000038333) ENSANAG00000036937 ENSANAG00000037601 ENSANAG00000004931 NEXN (ENSANAG00000037207) ENSANAG00000032240 MIGA1 (ENSANAG00000033584) USP33 (ENSANAG00000024189) ZZZ3 (ENSANAG00000029618) ENSANAG00000028230 Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.b.a #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.b.a #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.b.a #22 Capuchin MODERN SPECIES 6 IYD (ENSCCAG00000036983) PLEKHG1 (ENSCCAG00000027481) MTHFD1L (ENSCCAG00000033752) AKAP12 (ENSCCAG00000030534) ZBTB2 (ENSCCAG00000029241) RMND1 (ENSCCAG00000036014) ARMT1 (ENSCCAG00000027013) CCDC170 (ENSCCAG00000035936) ENSCCAG00000036007 #22 ENSCCAG00000023199 ESR1 (ENSCCAG00000030983) SYNE1 (ENSCCAG00000034147) MYCT1 (ENSCCAG00000031493) VIP (ENSCCAG00000034128) FBXO5 (ENSCCAG00000035526) MTRF1L (ENSCCAG00000035144) RGS17 (ENSCCAG00000030080) OPRM1 (ENSCCAG00000025874) IPCEF1 (ENSCCAG00000036029) CNKSR3 (ENSCCAG00000022570) SCAF8 (ENSCCAG00000024952) TIAM2 (ENSCCAG00000023099) CLDN20 (ENSCCAG00000002679) TFB1M (ENSCCAG00000015250) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 91 ENSSBOG00000032831 #22 TBC1D32 (ENSSBOG00000027468) ENSSBOG00000022760 HSF2 (ENSSBOG00000026121) SERINC1 (ENSSBOG00000030876) ENSSBOG00000027151 PKIB (ENSSBOG00000027107) ENSSBOG00000019176 SMPDL3A (ENSSBOG00000027815) ENSSBOG00000034173 CLVS2 (ENSSBOG00000024013) TRDN (ENSSBOG00000000089) NKAIN2 (ENSSBOG00000029069) RNF217 (ENSSBOG00000026271) TPD52L1 (ENSSBOG00000033817) HDDC2 (ENSSBOG00000031623) Mas night monkey MODERN SPECIES 382 ENSANAG00000038101 GTF2E1 (ENSANAG00000025430) RABL3 (ENSANAG00000027278) ENSANAG00000037659 #22 HGD (ENSANAG00000030887) NDUFB4 (ENSANAG00000034913) FSTL1 (ENSANAG00000020551) LRRC58 (ENSANAG00000031980) GPR156 (ENSANAG00000022869) GSK3B (ENSANAG00000026215) ENSANAG00000032801 NR1I2 (ENSANAG00000036076) CFAP91 (ENSANAG00000030006) COX17 (ENSANAG00000020473) POPDC2 (ENSANAG00000029325) PLA1A (ENSANAG00000028215) ENSANAG00000010341 ADPRH (ENSANAG00000031217) CD80 (ENSANAG00000034828) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.b.b #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.b.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.b.b #22 Capuchin MODERN SPECIES 9 CATSPER2 (ENSCCAG00000026150) PDIA3 (ENSCCAG00000030244) ELL3 (ENSCCAG00000012316) ENSCCAG00000035655 SERINC4 (ENSCCAG00000026023) HYPK (ENSCCAG00000024826) MFAP1 (ENSCCAG00000036634) WDR76 (ENSCCAG00000032447) FRMD5 (ENSCCAG00000033220) ENSCCAG00000024066 GOLM2 (ENSCCAG00000023648) CTDSPL2 (ENSCCAG00000021587) EIF3J (ENSCCAG00000028410) SPG11 (ENSCCAG00000035886) PATL2 (ENSCCAG00000025261) ENSCCAG00000028063 #22 B2M (ENSCCAG00000028100) TRIM69 (ENSCCAG00000022680) TERB2 (ENSCCAG00000030778) SORD (ENSCCAG00000036842) DUOX2 (ENSCCAG00000034804) DUOXA2 (ENSCCAG00000024977) DUOXA1 (ENSCCAG00000026858) DUOX1 (ENSCCAG00000032449) SHF (ENSCCAG00000037493) ENSCCAG00000031747 SLC28A2 (ENSCCAG00000027848) GATM (ENSCCAG00000031962) SPATA5L1 (ENSCCAG00000029452) C15orf48 (ENSCCAG00000022789) SLC30A4 (ENSCCAG00000001193) Mas night monkey MODERN SPECIES 1007 TEAD3 (ENSANAG00000028458) TULP1 (ENSANAG00000030313) FKBP5 (ENSANAG00000030235) ARMC12 (ENSANAG00000038298) ENSANAG00000022845 CLPSL1 (ENSANAG00000032715) CLPS (ENSANAG00000033395) LHFPL5 (ENSANAG00000035803) SRPK1 (ENSANAG00000021431) SLC26A8 (ENSANAG00000020781) MAPK14 (ENSANAG00000038041) ENSANAG00000032413 MAPK13 (ENSANAG00000022181) ENSANAG00000032262 BRPF3 (ENSANAG00000028984) ENSANAG00000033497 #22 PNPLA1 (ENSANAG00000034134) BNIP5 (ENSANAG00000030362) ETV7 (ENSANAG00000034107) PXT1 (ENSANAG00000024752) KCTD20 (ENSANAG00000026537) ENSANAG00000024804 ENSANAG00000033233 CDKN1A (ENSANAG00000037294) RAB44 (ENSANAG00000027844) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878.`b.a.a.a ENSGT01030000234626.B.w.a ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a ENSGT00390000013931.a.b.b.ab ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 ENSGT00390000004172 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000156693 ENSGT00940000153609.b ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000159826 ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k ENSGT00390000005306.v ENSGT00390000000663 ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00530000063695.b ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000159634 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159117 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878.`b.a.a.a ENSGT01030000234626.B.w.a ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 ENSGT00390000004172 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000156693 ENSGT00940000153609.b ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000159826 ENSGT00390000000663 ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00530000063695.b ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000159634 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159117 ENSGT00940000159373 ENSGT00740000115564 Olive baboon MODERN SPECIES 16 IGF2R (ENSPANG00000018547) MAS1 (ENSPANG00000024549) PNLDC1 (ENSPANG00000022009) MRPL18 (ENSPANG00000023667) ENSPANG00000011086 ACAT2 (ENSPANG00000006086) WTAP (ENSPANG00000018386) SOD2 (ENSPANG00000006178) ENSPANG00000043348 ENSPANG00000046898 FNDC1 (ENSPANG00000024066) ENSPANG00000043396 TAGAP (ENSPANG00000006087) RSPH3 (ENSPANG00000015890) ENSPANG00000044542 ENSPANG00000004075 #22 OSTM1 (ENSPANG00000024443) NR2E1 (ENSPANG00000016092) ENSPANG00000017995 SNX3 (ENSPANG00000045017) AFG1L (ENSPANG00000007612) ENSPANG00000015284 SESN1 (ENSPANG00000012995) ARMC2 (ENSPANG00000006019) ZBTB24 (ENSPANG00000006918) SMPD2 (ENSPANG00000024480) MICAL1 (ENSPANG00000014435) CD164 (ENSPANG00000030351) ENSPANG00000039980 CEP57L1 (ENSPANG00000008201) ENSPANG00000008202 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878.`b.a.a.a ENSGT01030000234626.B.w.a ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 ENSGT00390000004172 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000156693 ENSGT00940000153609.b ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000159826 ENSGT00390000000663 ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00530000063695.b ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000159634 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159117 ENSGT00940000159373 ENSGT00740000115564 Sooty mangabey MODERN SPECIES 590 SLC22A2 (ENSCATG00000035775) SLC22A1 (ENSCATG00000037974) IGF2R (ENSCATG00000040245) ENSCATG00000031955 MAS1 (ENSCATG00000018354) PNLDC1 (ENSCATG00000033196) MRPL18 (ENSCATG00000039405) ENSCATG00000040449 ENSCATG00000029973 ENSCATG00000032080 ENSCATG00000018577 SOD2 (ENSCATG00000041741) FNDC1 (ENSCATG00000041959) TAGAP (ENSCATG00000031180) RSPH3 (ENSCATG00000037174) ENSCATG00000038882 #22 OSTM1 (ENSCATG00000039725) NR2E1 (ENSCATG00000040877) SNX3 (ENSCATG00000029122) AFG1L (ENSCATG00000009873) ENSCATG00000039123 ENSCATG00000039457 ARMC2 (ENSCATG00000039753) SESN1 (ENSCATG00000025577) CEP57L1 (ENSCATG00000029658) ENSCATG00000036188 CD164 (ENSCATG00000038139) PPIL6 (ENSCATG00000042720) SMPD2 (ENSCATG00000015266) MICAL1 (ENSCATG00000032923) ZBTB24 (ENSCATG00000039996) Drill MODERN SPECIES 546 ENSMLEG00000029985 SLC22A3 (ENSMLEG00000038788) SLC22A2 (ENSMLEG00000016886) SLC22A1 (ENSMLEG00000042980) IGF2R (ENSMLEG00000030426) MAS1 (ENSMLEG00000021239) PNLDC1 (ENSMLEG00000044059) MRPL18 (ENSMLEG00000009952) ENSMLEG00000010006 ACAT2 (ENSMLEG00000030278) ENSMLEG00000036194 SOD2 (ENSMLEG00000031266) FNDC1 (ENSMLEG00000036645) TAGAP (ENSMLEG00000019766) RSPH3 (ENSMLEG00000040694) ENSMLEG00000034288 #22 OSTM1 (ENSMLEG00000042119) NR2E1 (ENSMLEG00000042106) SNX3 (ENSMLEG00000009064) AFG1L (ENSMLEG00000042976) ENSMLEG00000035215 ARMC2 (ENSMLEG00000028725) SESN1 (ENSMLEG00000023202) CEP57L1 (ENSMLEG00000042256) ENSMLEG00000038718 ENSMLEG00000019287 CD164 (ENSMLEG00000043297) PPIL6 (ENSMLEG00000043068) SMPD2 (ENSMLEG00000039457) MICAL1 (ENSMLEG00000031079) ZBTB24 (ENSMLEG00000036578) Macaca ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394.i.a ENSGT00550000074878.`b.a.a.a ENSGT01030000234626.B.w.a ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a ENSGT00940000163505.a.b.a.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00910000148724 ENSGT00940000157993 ENSGT00390000004172 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22 ENSGT00390000012341 ENSGT00940000156693 ENSGT00940000153609.b ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000159826 ENSGT00390000005306.v ENSGT00390000000663 ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00530000063695.b ENSGT00940000163170 ENSGT00530000063929.a.a ENSGT00940000159634 ENSGT00390000009166 ENSGT00940000159117 ENSGT00940000159373 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 186 SLC22A2 (ENSMNEG00000034324) SLC22A1 (ENSMNEG00000019486) IGF2R (ENSMNEG00000033736) ENSMNEG00000029146 PNLDC1 (ENSMNEG00000034271) ENSMNEG00000045344 ENSMNEG00000041282 ENSMNEG00000032924 ENSMNEG00000034307 ENSMNEG00000027147 SOD2 (ENSMNEG00000031749) FNDC1 (ENSMNEG00000043137) ENSMNEG00000021558 TAGAP (ENSMNEG00000029744) RSPH3 (ENSMNEG00000038143) ENSMNEG00000041823 #22 OSTM1 (ENSMNEG00000036298) NR2E1 (ENSMNEG00000034662) SNX3 (ENSMNEG00000027766) AFG1L (ENSMNEG00000044043) ENSMNEG00000040158 ENSMNEG00000041536 ARMC2 (ENSMNEG00000037523) SESN1 (ENSMNEG00000032849) CEP57L1 (ENSMNEG00000004205) ENSMNEG00000017770 CD164 (ENSMNEG00000036168) PPIL6 (ENSMNEG00000039500) SMPD2 (ENSMNEG00000042401) MICAL1 (ENSMNEG00000039173) ZBTB24 (ENSMNEG00000037210) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.b #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.b #22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00900000143489 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866.s #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.b #22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866.s #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Cebidae_a DUPLICATION Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.b.a #22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866.s #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Capuchin DUPLICATION Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 89 IGFBP2 (ENSCCAG00000032963) ENSCCAG00000020405 ENSCCAG00000021500 SMARCAL1 (ENSCCAG00000022646) ASNA1 (ENSCCAG00000020440) MARCHF4 (ENSCCAG00000031877) XRCC5 (ENSCCAG00000027147) ENSCCAG00000020388 TMEM169 (ENSCCAG00000030518) PECR (ENSCCAG00000028783) ENSCCAG00000031458 MREG (ENSCCAG00000034986) FN1 (ENSCCAG00000021281) ENSCCAG00000022620 ABCA12 (ENSCCAG00000029993) ENSCCAG00000020726 #22 BARD1 (ENSCCAG00000021151) VWC2L (ENSCCAG00000021422) SPAG16 (ENSCCAG00000027929) IKZF2 (ENSCCAG00000029869) ENSCCAG00000016584 ERBB4 (ENSCCAG00000036465) Capuchin MODERN SPECIES PATE4 (ENSCCAG00000035746) ENSCCAG00000019073 PUS3 (ENSCCAG00000035999) DDX25 (ENSCCAG00000027629) VSIG10L2 (ENSCCAG00000006965) CDON (ENSCCAG00000001077) RPUSD4 (ENSCCAG00000027838) FAM118B (ENSCCAG00000020310) SRPRA (ENSCCAG00000025602) FOXRED1 (ENSCCAG00000025248) TIRAP (ENSCCAG00000035574) ENSCCAG00000028368 DCPS (ENSCCAG00000030779) ST3GAL4 (ENSCCAG00000034084) KIRREL3 (ENSCCAG00000026745) ENSCCAG00000030721 #22 ETS1 (ENSCCAG00000025251) FLI1 (ENSCCAG00000014342) KCNJ1 (ENSCCAG00000027825) C11orf45 (ENSCCAG00000035237) KCNJ5 (ENSCCAG00000021826) ENSCCAG00000000172 ARHGAP32 (ENSCCAG00000036347) ENSCCAG00000037290 BARX2 (ENSCCAG00000027214) TMEM45B (ENSCCAG00000024426) NFRKB (ENSCCAG00000022547) PRDM10 (ENSCCAG00000024567) APLP2 (ENSCCAG00000019969) ST14 (ENSCCAG00000028292) ZBTB44 (ENSCCAG00000037104) Capuchin MODERN SPECIES 200 SPDL1 (ENSCCAG00000035090) #10 INSYN2B (ENSCCAG00000033382) #11 ENSCCAG00000021528 DOCK2 (ENSCCAG00000037383) #12 FOXI1 (ENSCCAG00000029998) #13 ENSCCAG00000019246 LCP2 (ENSCCAG00000014560) #15 KCNMB1 (ENSCCAG00000029582) #16 KCNIP1 (ENSCCAG00000025512) #18 GABRP (ENSCCAG00000027392) #19 RANBP17 (ENSCCAG00000021816) #20 TLX3 (ENSCCAG00000022971) #21 ENSCCAG00000034814 #22 FGF18 (ENSCCAG00000025826) #23 SMIM23 (ENSCCAG00000027927) #24 ENSCCAG00000035992 ##22 ENSCCAG00000034903 #25 STK10 (ENSCCAG00000021548) #27 EFCAB9 (ENSCCAG00000030106) #28 UBTD2 (ENSCCAG00000030325) #29 SH3PXD2B (ENSCCAG00000018545) #30 NEURL1B (ENSCCAG00000024696) #31 ENSCCAG00000023304 DUSP1 (ENSCCAG00000028115) #32 ERGIC1 (ENSCCAG00000027066) #33 RPL26L1 (ENSCCAG00000022572) ENSCCAG00000030182 #34 ENSCCAG00000036235 #35 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 123 RARS1 (ENSSBOG00000020783) FBLL1 (ENSSBOG00000019476) #7 ENSSBOG00000023908 #8 SLIT3 (ENSSBOG00000020831) #9 SPDL1 (ENSSBOG00000033764) #10 INSYN2B (ENSSBOG00000024498) #11 DOCK2 (ENSSBOG00000026287) #12 FOXI1 (ENSSBOG00000033617) #13 C5orf58 (ENSSBOG00000020509) LCP2 (ENSSBOG00000035016) #15 KCNMB1 (ENSSBOG00000026355) #16 KCNIP1 (ENSSBOG00000001622) #18 GABRP (ENSSBOG00000028102) #19 RANBP17 (ENSSBOG00000032147) #20 TLX3 (ENSSBOG00000034367) #21 ENSSBOG00000033634 #22 FGF18 (ENSSBOG00000024519) #23 SMIM23 (ENSSBOG00000018130) #24 FBXW11 (ENSSBOG00000023046) #25 STK10 (ENSSBOG00000033405) #27 EFCAB9 (ENSSBOG00000019620) #28 UBTD2 (ENSSBOG00000013274) #29 SH3PXD2B (ENSSBOG00000014112) #30 NEURL1B (ENSSBOG00000029939) #31 DUSP1 (ENSSBOG00000027324) #32 ERGIC1 (ENSSBOG00000032967) #33 RPL26L1 (ENSSBOG00000027992) ATP6V0E1 (ENSSBOG00000031772) #34 CREBRF (ENSSBOG00000031151) #35 ENSSBOG00000026680 BNIP1 (ENSSBOG00000029104) #36 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.b.b #22 Capuchin MODERN SPECIES 323 SLC15A4 (ENSCCAG00000026060) GLT1D1 (ENSCCAG00000020488) ENSCCAG00000031772 #22 TMEM132D (ENSCCAG00000034319) PIWIL1 (ENSCCAG00000036270) RIMBP2 (ENSCCAG00000024259) STX2 (ENSCCAG00000021191) RAN (ENSCCAG00000026184) ADGRD1 (ENSCCAG00000015195) Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 11 ENSCJAG00000071432 ENSCJAG00000022619 DOCK2 (ENSCJAG00000011464) #12 INSYN2B (ENSCJAG00000011632) #11 FOXI1 (ENSCJAG00000073946) #13 C5orf58 (ENSCJAG00000037697) LCP2 (ENSCJAG00000011656) #15 KCNIP1 (ENSCJAG00000019441) #18 KCNMB1 (ENSCJAG00000040466) #16 ENSCJAG00000081529 GABRP (ENSCJAG00000019417) #19 RANBP17 (ENSCJAG00000019368) #20 ENSCJAG00000083773 ENSCJAG00000038990 TLX3 (ENSCJAG00000038714) #21 ENSCJAG00000019334 #22 FGF18 (ENSCJAG00000019329) #23 SMIM23 (ENSCJAG00000019324) #24 FBXW11 (ENSCJAG00000019297) #25 ENSCJAG00000073693 STK10 (ENSCJAG00000019275) #27 ENSCJAG00000069688 ENSCJAG00000069421 EFCAB9 (ENSCJAG00000019273) #28 ENSCJAG00000047953 UBTD2 (ENSCJAG00000046779) #29 SH3PXD2B (ENSCJAG00000019258) #30 NEURL1B (ENSCJAG00000019254) #31 DUSP1 (ENSCJAG00000067622) #32 ERGIC1 (ENSCJAG00000019238) #33 CREBRF (ENSCJAG00000019193) #35 Marmoset MODERN SPECIES 17 ENSCJAG00000043117 ADIG (ENSCJAG00000041176) ARHGAP40 (ENSCJAG00000011443) SLC32A1 (ENSCJAG00000066263) ACTR5 (ENSCJAG00000011470) PPP1R16B (ENSCJAG00000011490) DHX35 (ENSCJAG00000011495) TOP1 (ENSCJAG00000018101) PLCG1 (ENSCJAG00000018013) ZHX3 (ENSCJAG00000018012) LPIN3 (ENSCJAG00000017986) EMILIN3 (ENSCJAG00000081544) CHD6 (ENSCJAG00000017920) PTPRT (ENSCJAG00000017913) SRSF6 (ENSCJAG00000067472) ENSCJAG00000046459 #22 L3MBTL1 (ENSCJAG00000003964) SGK2 (ENSCJAG00000017869) IFT52 (ENSCJAG00000017838) ENSCJAG00000076696 MYBL2 (ENSCJAG00000017819) TOX2 (ENSCJAG00000017806) OSER1 (ENSCJAG00000017794) JPH2 (ENSCJAG00000017802) ENSCJAG00000072121 GDAP1L1 (ENSCJAG00000017789) FITM2 (ENSCJAG00000017787) ENSCJAG00000055291 HNF4A (ENSCJAG00000017746) TTPAL (ENSCJAG00000017736) SERINC3 (ENSCJAG00000017722) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22 Bonobo MODERN SPECIES 18 PCSK1 (ENSPPAG00000037499) ELL2 (ENSPPAG00000018384) GLRX (ENSPPAG00000043613) RHOBTB3 (ENSPPAG00000031638) SPATA9 (ENSPPAG00000035429) ENSPPAG00000032941 ARSK (ENSPPAG00000037483) SKIC3 (ENSPPAG00000032676) ENSPPAG00000044070 MCTP1 (ENSPPAG00000044096) SLF1 (ENSPPAG00000044094) ENSPPAG00000043061 KIAA0825 (ENSPPAG00000029168) FAM172A (ENSPPAG00000030542) POU5F2 (ENSPPAG00000014596) ENSPPAG00000042574 #22 NR2F1 (ENSPPAG00000029692) ARRDC3 (ENSPPAG00000034772) ENSPPAG00000024964 ADGRV1 (ENSPPAG00000034954) ENSPPAG00000035937 LYSMD3 (ENSPPAG00000036100) POLR3G (ENSPPAG00000038891) MBLAC2 (ENSPPAG00000030673) CETN3 (ENSPPAG00000042285) MEF2C (ENSPPAG00000039315) TMEM161B (ENSPPAG00000034458) CCNH (ENSPPAG00000034768) RASA1 (ENSPPAG00000031210) ENSPPAG00000033965 ENSPPAG00000028873 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Lemuriformes DUPLICATION Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Mouse lemur MODERN SPECIES 31 ZFTRAF1 (ENSMICG00000015866) KIFC2 (ENSMICG00000037324) FOXH1 (ENSMICG00000037745) PPP1R16A (ENSMICG00000043502) GPT (ENSMICG00000015902) MFSD3 (ENSMICG00000046404) LRRC14 (ENSMICG00000015949) RECQL4 (ENSMICG00000015923) LRRC24 (ENSMICG00000015954) C8orf82 (ENSMICG00000037461) ARHGAP39 (ENSMICG00000015961) ENSMICG00000041818 ENSMICG00000035596 ZNF251 (ENSMICG00000011171) ZNF7 (ENSMICG00000000042) ENSMICG00000030363 ##22 ZNF517 (ENSMICG00000001574) RPL8 (ENSMICG00000001569) ENSMICG00000047840 ZNF250 (ENSMICG00000042144) ZNF16 (ENSMICG00000045289) ENSMICG00000037351 ENSMICG00000036664 TUBGCP5 (ENSMICG00000012969) CYFIP1 (ENSMICG00000016431) NIPA2 (ENSMICG00000041893) NIPA1 (ENSMICG00000038451) ENSMICG00000035106 ENSMICG00000043818 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 146 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 428 ENSPCOG00000016594 SLIT3 (ENSPCOG00000019184) #9 SPDL1 (ENSPCOG00000025644) #10 ENSPCOG00000020825 #12 INSYN2B (ENSPCOG00000007889) #11 ENSPCOG00000020988 #12 FOXI1 (ENSPCOG00000022931) #13 ENSPCOG00000012130 LCP2 (ENSPCOG00000022747) #15 KCNIP1 (ENSPCOG00000015105) #18 KCNMB1 (ENSPCOG00000021448) #16 GABRP (ENSPCOG00000017643) #19 ENSPCOG00000007993 #20 ENSPCOG00000015791 TLX3 (ENSPCOG00000015947) #21 ENSPCOG00000024038 ##22 FGF18 (ENSPCOG00000028662) #23 SMIM23 (ENSPCOG00000018006) #24 FBXW11 (ENSPCOG00000017113) #25 STK10 (ENSPCOG00000019111) #27 EFCAB9 (ENSPCOG00000015386) #28 UBTD2 (ENSPCOG00000014867) #29 ENSPCOG00000023430 SH3PXD2B (ENSPCOG00000021760) #30 NEURL1B (ENSPCOG00000025987) #31 DUSP1 (ENSPCOG00000025861) #32 ERGIC1 (ENSPCOG00000014528) #33 RPL26L1 (ENSPCOG00000016409) ATP6V0E1 (ENSPCOG00000022516) #34 CREBRF (ENSPCOG00000024235) #35 BNIP1 (ENSPCOG00000018899) #36 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 329 MAP9 (ENSPCOG00000013203) NPY2R (ENSPCOG00000008812) RBM46 (ENSPCOG00000024347) LRAT (ENSPCOG00000019913) FGG (ENSPCOG00000018435) FGA (ENSPCOG00000023999) FGB (ENSPCOG00000015023) PLRG1 (ENSPCOG00000015384) SFRP2 (ENSPCOG00000021378) RNF175 (ENSPCOG00000026626) TMEM131L (ENSPCOG00000013860) ENSPCOG00000026703 TRIM2 (ENSPCOG00000002394) FHDC1 (ENSPCOG00000021332) ARFIP1 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ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000154353.A.m ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000018130.a.a.a.h ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00940000167584 ENSGT00870000136506.ob.b ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000163729 ENSGT00940000155080 ENSGT00940000154406.b.h ENSGT00960000187030 ENSGT00390000013639 ENSGT00940000153311.a.b.a.fb.a.a ENSGT00940000157134 ENSGT00390000009790 ENSGT00940000155064 ENSGT00390000017590 ENSGT00390000011354 ENSGT00940000162903.f ENSGT00390000016954 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154353.B ENSGT00390000002661.b.kb.a ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000018130.a.a.a.h ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B 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ENSGT00940000155080 ENSGT00940000154406.b.h ENSGT00390000013639 ENSGT00940000157134 ENSGT00390000009790 ENSGT00940000155064 ENSGT00390000017590 ENSGT00390000011354 ENSGT00940000162903.f ENSGT00390000016954 ENSGT00940000155008.C Chimpanzee MODERN SPECIES 19 KHDC1L (ENSPTRG00000052071) ENSPTRG00000018341 ENSPTRG00000048515 KCNQ5 (ENSPTRG00000018339) ENSPTRG00000046439 RIMS1 (ENSPTRG00000051415) OGFRL1 (ENSPTRG00000018335) ENSPTRG00000039066 B3GAT2 (ENSPTRG00000018334) SMAP1 (ENSPTRG00000018333) ENSPTRG00000050587 SDHAF4 (ENSPTRG00000018331) FAM135A (ENSPTRG00000018330) COL9A1 (ENSPTRG00000018329) COL19A1 (ENSPTRG00000018327) ENSPTRG00000044889 ##22 LMBRD1 (ENSPTRG00000018326) ADGRB3 (ENSPTRG00000018325) ENSPTRG00000051292 ENSPTRG00000018324 EYS (ENSPTRG00000051263) PHF3 (ENSPTRG00000018315) ENSPTRG00000046993 PTP4A1 (ENSPTRG00000043932) LGSN (ENSPTRG00000018312) KHDRBS2 (ENSPTRG00000018311) ENSPTRG00000050769 ENSPTRG00000052541 ENSPTRG00000051660 ENSPTRG00000044256 RAB23 (ENSPTRG00000043341) Bonobo MODERN SPECIES 19 KHDC1L (ENSPPAG00000025424) ENSPPAG00000041906 ENSPPAG00000038149 KCNQ5 (ENSPPAG00000040956) ENSPPAG00000034250 RIMS1 (ENSPPAG00000040646) OGFRL1 (ENSPPAG00000043342) ENSPPAG00000041570 ENSPPAG00000032375 SMAP1 (ENSPPAG00000036070) ENSPPAG00000032234 SDHAF4 (ENSPPAG00000032082) FAM135A (ENSPPAG00000034229) COL9A1 (ENSPPAG00000036128) COL19A1 (ENSPPAG00000040447) ENSPPAG00000028836 ##22 LMBRD1 (ENSPPAG00000032391) ADGRB3 (ENSPPAG00000037212) PHF3 (ENSPPAG00000027689) PTP4A1 (ENSPPAG00000043163) LGSN (ENSPPAG00000032360) ENSPPAG00000042416 KHDRBS2 (ENSPPAG00000032651) ENSPPAG00000000267 RAB23 (ENSPPAG00000010023) BAG2 (ENSPPAG00000039605) ZNF451 (ENSPPAG00000042859) KIAA1586 (ENSPPAG00000038232) BEND6 (ENSPPAG00000038759) DST (ENSPPAG00000023253) ENSPPAG00000034011 Gorilla MODERN SPECIES 19 KHDC1L (ENSGGOG00000025471) ENSGGOG00000043309 ENSGGOG00000038734 ENSGGOG00000038380 KCNQ5 (ENSGGOG00000011406) ENSGGOG00000040624 RIMS1 (ENSGGOG00000003628) OGFRL1 (ENSGGOG00000010724) B3GAT2 (ENSGGOG00000021933) SMAP1 (ENSGGOG00000011243) ENSGGOG00000040766 SDHAF4 (ENSGGOG00000037113) FAM135A (ENSGGOG00000004791) COL9A1 (ENSGGOG00000010221) ENSGGOG00000005906 ENSGGOG00000021992 ##22 LMBRD1 (ENSGGOG00000014341) ADGRB3 (ENSGGOG00000015587) ENSGGOG00000038010 ENSGGOG00000026362 ENSGGOG00000042367 ENSGGOG00000027663 EYS (ENSGGOG00000034946) PHF3 (ENSGGOG00000007906) ENSGGOG00000024946 PTP4A1 (ENSGGOG00000043919) LGSN (ENSGGOG00000003942) KHDRBS2 (ENSGGOG00000025068) ENSGGOG00000039155 PRIM2 (ENSGGOG00000007076) ENSGGOG00000002933 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 83 CUEDC2 (ENSODEG00000007262) FBXL15 (ENSODEG00000007513) PSD (ENSODEG00000006424) NFKB2 (ENSODEG00000007396) ENSODEG00000006690 GBF1 (ENSODEG00000007076) PITX3 (ENSODEG00000007162) ELOVL3 (ENSODEG00000006606) NOLC1 (ENSODEG00000006304) ENSODEG00000006985 ENSODEG00000009568 LDB1 (ENSODEG00000009090) HPS6 (ENSODEG00000007638) ENSODEG00000019424 ARMH3 (ENSODEG00000007299) ENSODEG00000010569 ##22 KCNIP2 (ENSODEG00000007199) ENSODEG00000019634 OGA (ENSODEG00000008001) NPM3 (ENSODEG00000006704) FGF8 (ENSODEG00000006423) FBXW4 (ENSODEG00000007897) DPCD (ENSODEG00000005983) POLL (ENSODEG00000007469) BTRC (ENSODEG00000008464) LBX1 (ENSODEG00000006684) ENSODEG00000006094 KAZALD1 (ENSODEG00000005804) SFXN3 (ENSODEG00000007542) PDZD7 (ENSODEG00000006718) LZTS2 (ENSODEG00000006752) Degu MODERN SPECIES 80 ENSODEG00000009187 TMCO3 (ENSODEG00000009661) DCUN1D2 (ENSODEG00000008899) ENSODEG00000007633 ENSODEG00000008619 GRTP1 (ENSODEG00000007871) LAMP1 (ENSODEG00000009126) CUL4A (ENSODEG00000007751) PCID2 (ENSODEG00000007738) PROZ (ENSODEG00000009284) F10 (ENSODEG00000008696) MCF2L (ENSODEG00000009412) ATP11A (ENSODEG00000008675) ENSODEG00000008533 TUBGCP3 (ENSODEG00000008609) ENSODEG00000019619 ##22 ENSODEG00000009444 ARHGEF7 (ENSODEG00000009477) ENSODEG00000008348 ING1 (ENSODEG00000008422) CARS2 (ENSODEG00000008933) NAXD (ENSODEG00000008623) ENSODEG00000019961 RAB20 (ENSODEG00000010199) COL4A2 (ENSODEG00000012107) COL4A1 (ENSODEG00000011076) IRS2 (ENSODEG00000009721) MYO16 (ENSODEG00000008856) TNFSF13B (ENSODEG00000010925) ABHD13 (ENSODEG00000019588) LIG4 (ENSODEG00000019683) Degu MODERN SPECIES 141 RAPGEF3 (ENSODEG00000003613) ENDOU (ENSODEG00000003517) RPAP3 (ENSODEG00000003489) PCED1B (ENSODEG00000003479) ENSODEG00000018996 AMIGO2 (ENSODEG00000018958) ENSODEG00000003462 ENSODEG00000003450 SLC38A2 (ENSODEG00000003379) SLC38A1 (ENSODEG00000003269) SCAF11 (ENSODEG00000003223) ENSODEG00000019076 ENSODEG00000004013 ARID2 (ENSODEG00000003976) ENSODEG00000003928 ENSODEG00000018973 ##22 ENSODEG00000018965 ENSODEG00000003909 ANO6 (ENSODEG00000003814) NELL2 (ENSODEG00000003669) TMEM117 (ENSODEG00000003583) ENSODEG00000003529 ENSODEG00000018930 PUS7L (ENSODEG00000003484) ADAMTS20 (ENSODEG00000003382) PRICKLE1 (ENSODEG00000003320) PPHLN1 (ENSODEG00000003297) ENSODEG00000003268 ENSODEG00000003254 YAF2 (ENSODEG00000004846) GXYLT1 (ENSODEG00000004822) Degu MODERN SPECIES 113 RHOT1 (ENSODEG00000012674) RHBDL3 (ENSODEG00000012800) C17orf75 (ENSODEG00000012638) ZNF207 (ENSODEG00000012683) ENSODEG00000013615 ENSODEG00000014487 CDK5R1 (ENSODEG00000020159) MYO1D (ENSODEG00000012420) TMEM98 (ENSODEG00000012273) ENSODEG00000012654 ASIC2 (ENSODEG00000012964) CCL11 (ENSODEG00000013280) ENSODEG00000013352 TMEM132E (ENSODEG00000013225) CCT6B (ENSODEG00000013365) ENSODEG00000020133 ##22 ZNF830 (ENSODEG00000012121) LIG3 (ENSODEG00000014335) RFFL (ENSODEG00000013992) RAD51D (ENSODEG00000014400) NLE1 (ENSODEG00000015154) UNC45B (ENSODEG00000013654) ENSODEG00000020075 Degu MODERN SPECIES 42 CDR2 (ENSODEG00000011922) POLR3E (ENSODEG00000011375) EEF2K (ENSODEG00000011952) SDR42E2 (ENSODEG00000011677) VWA3A (ENSODEG00000011821) MOSMO (ENSODEG00000012172) PDZD9 (ENSODEG00000012039) ENSODEG00000011711 ENSODEG00000011826 CRYM (ENSODEG00000011398) ANKS4B (ENSODEG00000011058) ZP2 (ENSODEG00000011036) LDAF1 (ENSODEG00000011669) ENSODEG00000012131 DNAH3 (ENSODEG00000010918) ENSODEG00000020044 ##22 ENSODEG00000012660 DCUN1D3 (ENSODEG00000013932) ENSODEG00000010720 ACSM3 (ENSODEG00000013265) THUMPD1 (ENSODEG00000012360) ACSM4 (ENSODEG00000011575) Degu MODERN SPECIES 262 TEX10 (ENSODEG00000002157) ENSODEG00000002138 INVS (ENSODEG00000003552) ENSODEG00000003531 ERP44 (ENSODEG00000003516) STX17 (ENSODEG00000003407) NR4A3 (ENSODEG00000003374) SEC61B (ENSODEG00000003360) ENSODEG00000003346 TGFBR1 (ENSODEG00000003331) ENSODEG00000003112 GALNT12 (ENSODEG00000003074) ENSODEG00000003063 ANKS6 (ENSODEG00000002878) GABBR2 (ENSODEG00000002271) ENSODEG00000002235 ##22 TBC1D2 (ENSODEG00000002208) CORO2A (ENSODEG00000002085) TRIM14 (ENSODEG00000002021) ENSODEG00000001976 ENSODEG00000001939 TRMO (ENSODEG00000001916) ENSODEG00000018738 XPA (ENSODEG00000001712) NCBP1 (ENSODEG00000003232) TSTD2 (ENSODEG00000003152) TMOD1 (ENSODEG00000003115) TDRD7 (ENSODEG00000002889) ENSODEG00000002716 ENSODEG00000002561 KLHL9 (ENSODEG00000002552) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 218 CLP1 (ENSCLAG00000004094) ZDHHC5 (ENSCLAG00000012355) MED19 (ENSCLAG00000009229) TMX2 (ENSCLAG00000009505) BTBD18 (ENSCLAG00000005879) CTNND1 (ENSCLAG00000006994) OR6Q1 (ENSCLAG00000017704) OR9I1 (ENSCLAG00000007789) OR9Q1 (ENSCLAG00000017558) OR9Q2 (ENSCLAG00000017540) ENSCLAG00000003862 ENSCLAG00000004264 ENSCLAG00000017598 ENSCLAG00000004783 ENSCLAG00000004811 ENSCLAG00000003117 ##22 ENSCLAG00000017573 LPXN (ENSCLAG00000003524) ZFP91 (ENSCLAG00000002619) CNTF (ENSCLAG00000002770) ENSCLAG00000003021 ENSCLAG00000003144 ENSCLAG00000017625 GLYAT (ENSCLAG00000003221) ENSCLAG00000003420 FAM111A (ENSCLAG00000003531) DTX4 (ENSCLAG00000003959) MPEG1 (ENSCLAG00000017607) ENSCLAG00000004222 ENSCLAG00000017620 ENSCLAG00000017592 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1546 Insyn2b (ENSNGAG00000014504) #11 Foxi1 (ENSNGAG00000019108) #13 Lcp2 (ENSNGAG00000008561) #15 Kcnmb1 (ENSNGAG00000005867) #16 Kcnip1 (ENSNGAG00000010312) #18 Gabrp (ENSNGAG00000017036) #19 Ranbp17 (ENSNGAG00000014221) #20 Tlx3 (ENSNGAG00000011712) #21 ENSNGAG00000016679 ##22 Fgf18 (ENSNGAG00000001054) #23 Smim23 (ENSNGAG00000001372) #24 Fbxw11 (ENSNGAG00000006880) #25 Stk10 (ENSNGAG00000019942) #27 Efcab9 (ENSNGAG00000019506) #28 Ubtd2 (ENSNGAG00000000104) #29 Sh3pxd2b (ENSNGAG00000000827) #30 Neurl1b (ENSNGAG00000018472) #31 Dusp1 (ENSNGAG00000019520) #32 Ergic1 (ENSNGAG00000020608) #33 ENSNGAG00000002828 ENSNGAG00000003294 #34 ENSNGAG00000009349 #35 Bnip1 (ENSNGAG00000019475) #36 Nkx2-5 (ENSNGAG00000016164) #37 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Mouse lemur MODERN SPECIES VWA5B2 (ENSMICG00000049272) ALG3 (ENSMICG00000048992) EEF1AKMT4 (ENSMICG00000049030) CAMK2N2 (ENSMICG00000049125) PSMD2 (ENSMICG00000049512) EIF4G1 (ENSMICG00000049010) FAM131A (ENSMICG00000049438) CLCN2 (ENSMICG00000049507) ENSMICG00000048991 THPO (ENSMICG00000049369) CHRD (ENSMICG00000049478) ENSMICG00000049109 EPHB3 (ENSMICG00000049312) ENSMICG00000049325 VPS8 (ENSMICG00000048987) ENSMICG00000049412 ##22 C3orf70 (ENSMICG00000049150) EHHADH (ENSMICG00000049546) MAP3K13 (ENSMICG00000049178) ENSMICG00000049489 TMEM41A (ENSMICG00000049227) LIPH (ENSMICG00000049296) SENP2 (ENSMICG00000049584) ENSMICG00000049453 ENSMICG00000049295 ENSMICG00000049192 TRA2B (ENSMICG00000048969) ENSMICG00000048951 ENSMICG00000049439 ETV5 (ENSMICG00000049011) DGKG (ENSMICG00000049209) Bushbaby MODERN SPECIES 141 GMPR (ENSOGAG00000006073) ATXN1 (ENSOGAG00000028623) ENSOGAG00000025254 STMND1 (ENSOGAG00000033742) RBM24 (ENSOGAG00000027311) CAP2 (ENSOGAG00000027194) FAM8A1 (ENSOGAG00000026076) NUP153 (ENSOGAG00000014899) KIF13A (ENSOGAG00000014904) NHLRC1 (ENSOGAG00000007737) TPMT (ENSOGAG00000007738) KDM1B (ENSOGAG00000007744) DEK (ENSOGAG00000007750) RNF144B (ENSOGAG00000007755) ENSOGAG00000026614 ENSOGAG00000031663 ##22 ID4 (ENSOGAG00000033346) MBOAT1 (ENSOGAG00000010766) E2F3 (ENSOGAG00000004347) CDKAL1 (ENSOGAG00000015955) ENSOGAG00000014939 SOX4 (ENSOGAG00000033507) ENSOGAG00000026636 PRL (ENSOGAG00000008372) HDGFL1 (ENSOGAG00000008374) NRSN1 (ENSOGAG00000025470) DCDC2 (ENSOGAG00000015852) MRS2 (ENSOGAG00000015862) GPLD1 (ENSOGAG00000015865) ALDH5A1 (ENSOGAG00000010743) KIAA0319 (ENSOGAG00000010747) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156813 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000162149 ENSGT00940000159320 ENSGT00390000011608 ENSGT01030000234638.b.b.c.a ENSGT00940000158881 ENSGT00940000157220 ENSGT00940000156800 ENSGT00390000010652.C ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00940000163116 ENSGT00940000156876.k.b ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00910000147013 ENSGT00730000111392 ENSGT00940000157160.e ENSGT00940000155888 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000156291 ENSGT00940000157540.A ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00910000146810 ENSGT00940000160523 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000156682 ENSGT00390000015368.a.b Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000156876.k.b ENSGT00940000163116 ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00390000010652.C ENSGT00940000156800 ENSGT00940000157220 ENSGT00940000158881 ENSGT01030000234638.b.b.c.a ENSGT00390000011608 ENSGT00940000159320 ENSGT00940000162149 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000156813 ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00910000147013 ENSGT00730000111392 ENSGT00940000157160.e ENSGT00940000155888 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000156291 ENSGT00860000135750 ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00940000161069.f ENSGT00940000157540.A ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00910000146810 ENSGT00940000160523 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000156876.k.b ENSGT00940000163116 ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00390000010652.C ENSGT00940000156800 ENSGT00940000157220 ENSGT00940000158881 ENSGT01030000234638.b.b.c.a ENSGT00390000011608 ENSGT00940000159320 ENSGT00940000162149 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000156813 ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00910000147013 ENSGT00730000111392 ENSGT00940000155888 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000156291 ENSGT00860000135750 ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00940000157540.A ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00390000010718 ENSGT00940000160523 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000156682 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000156876.k.b ENSGT00940000163116 ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00390000010652.C ENSGT00940000156800 ENSGT00940000157220 ENSGT00940000158881 ENSGT01030000234638.b.b.c.a ENSGT00390000011608 ENSGT00940000159320 ENSGT00940000162149 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000156813 ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00910000147013 ENSGT00730000111392 ENSGT00940000155888 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000156291 ENSGT00860000135750 ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00940000157540.A ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00390000010718 ENSGT00940000160523 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000156682 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000156876.k.b ENSGT00940000163116 ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00390000010652.C ENSGT00940000156800 ENSGT00940000157220 ENSGT00940000158881 ENSGT01030000234638.b.b.c.a ENSGT00390000011608 ENSGT00940000159320 ENSGT00940000162149 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000156813 ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00910000147013 ENSGT00730000111392 ENSGT00940000155888 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000156291 ENSGT00860000135750 ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00940000157540.A ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00390000010718 ENSGT00940000160523 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000156682 Pan ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000156876.k.b ENSGT00940000163116 ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00390000010652.C ENSGT00940000156800 ENSGT00940000157220 ENSGT00940000158881 ENSGT01030000234638.b.b.c.a ENSGT00390000011608 ENSGT00940000159320 ENSGT00940000162149 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000156813 ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00910000147013 ENSGT00730000111392 ENSGT00940000157160.e ENSGT00940000155888 ENSGT00950000183112.a ENSGT00940000156291 ENSGT00860000135750 ENSGT00390000017267.i.b ENSGT00940000157540.A ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b ENSGT00530000063727.A.j ENSGT00390000010718 ENSGT00940000160523 ENSGT00510000048902.b Bonobo MODERN SPECIES 6 ZNF774 (ENSPPAG00000028939) IQGAP1 (ENSPPAG00000039618) CRTC3 (ENSPPAG00000035032) BLM (ENSPPAG00000032173) FURIN (ENSPPAG00000034430) FES (ENSPPAG00000035301) MAN2A2 (ENSPPAG00000030909) ENSPPAG00000029551 UNC45A (ENSPPAG00000038005) ENSPPAG00000039645 RCCD1 (ENSPPAG00000041396) PRC1 (ENSPPAG00000033888) VPS33B (ENSPPAG00000001343) SV2B (ENSPPAG00000028665) SLCO3A1 (ENSPPAG00000042705) ENSPPAG00000040610 ##22 ST8SIA2 (ENSPPAG00000042880) ENSPPAG00000038835 FAM174B (ENSPPAG00000034687) ENSPPAG00000015337 ENSPPAG00000036927 CHD2 (ENSPPAG00000030381) RGMA (ENSPPAG00000028287) MCTP2 (ENSPPAG00000000288) ENSPPAG00000023150 ENSPPAG00000029337 ENSPPAG00000031306 ENSPPAG00000039383 ENSPPAG00000036593 ARRDC4 (ENSPPAG00000040079) ENSPPAG00000029563 Chimpanzee MODERN SPECIES 6 ENSPTRG00000040709 ZNF774 (ENSPTRG00000023856) IQGAP1 (ENSPTRG00000007455) CRTC3 (ENSPTRG00000007457) BLM (ENSPTRG00000007460) FURIN (ENSPTRG00000007461) FES (ENSPTRG00000007462) MAN2A2 (ENSPTRG00000007463) UNC45A (ENSPTRG00000007465) HDDC3 (ENSPTRG00000007464) RCCD1 (ENSPTRG00000007466) PRC1 (ENSPTRG00000007467) VPS33B (ENSPTRG00000007468) SV2B (ENSPTRG00000007469) SLCO3A1 (ENSPTRG00000007471) ENSPTRG00000052368 ##22 ST8SIA2 (ENSPTRG00000049717) ENSPTRG00000047348 FAM174B (ENSPTRG00000007475) ENSPTRG00000042874 ENSPTRG00000044489 CHD2 (ENSPTRG00000007478) RGMA (ENSPTRG00000007480) MCTP2 (ENSPTRG00000007482) ENSPTRG00000043984 ENSPTRG00000052493 NR2F2 (ENSPTRG00000044693) ENSPTRG00000044433 ENSPTRG00000045669 SPATA8 (ENSPTRG00000007486) ARRDC4 (ENSPTRG00000007487) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000162149 ENSGT00940000159320 ENSGT00390000011608 ENSGT01030000234638.b.b.c.a ENSGT00940000158881 ENSGT00940000157220 ENSGT00940000156800 ENSGT00940000155158.j ENSGT00390000010652.C ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00940000163116 ENSGT00940000156876.k.b ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00910000147013 ENSGT00730000111392 ENSGT00940000157160.e ENSGT00940000155888 ENSGT00950000183112.a ENSGT00860000135750 ENSGT00940000156291 ENSGT00940000157540.A ENSGT00940000160523 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000156682 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000159268 ENSGT00530000063847.a Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 775 MAP6 (ENSRBIG00000032932) SERPINH1 (ENSRBIG00000028537) GDPD5 (ENSRBIG00000037527) KLHL35 (ENSRBIG00000036873) RPS3 (ENSRBIG00000044916) ARRB1 (ENSRBIG00000041523) SLCO2B1 (ENSRBIG00000035476) ENSRBIG00000037921 OR2AT4 (ENSRBIG00000036161) ENSRBIG00000043933 ##22 NEU3 (ENSRBIG00000040960) ENSRBIG00000011964 XRRA1 (ENSRBIG00000036115) RNF169 (ENSRBIG00000035895) CHRDL2 (ENSRBIG00000028182) ENSRBIG00000044531 ENSRBIG00000011853 ENSRBIG00000001091 LIPT2 (ENSRBIG00000031912) PGM2L1 (ENSRBIG00000043298) ENSRBIG00000002437 P4HA3 (ENSRBIG00000034204) PPME1 (ENSRBIG00000032741) C2CD3 (ENSRBIG00000036054) UCP3 (ENSRBIG00000032946) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000009453 ENSGT00940000162149 ENSGT00940000159320 ENSGT00390000011608 ENSGT01030000234638.b.b.c.a ENSGT00940000158881 ENSGT00940000157220 ENSGT00940000156800 ENSGT00940000155158.j ENSGT00390000010652.C ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00940000163116 ENSGT00940000156876.k.b ENSGT00950000182940.b.a.a ENSGT01080000257410.A.f ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 ENSGT01030000234535.F.a ENSGT00910000147013 ENSGT00730000111392 ENSGT00940000157160.e ENSGT00940000155888 ENSGT00950000183112.a ENSGT00860000135750 ENSGT00940000156291 ENSGT00940000157540.A ENSGT00940000160523 ENSGT00510000048902.b ENSGT00940000156682 ENSGT00390000015368.a.b ENSGT00940000159268 ENSGT00530000063847.a Vervet Monkey MODERN SPECIES 21 TTLL13 (ENSCSAG00000017100) NGRN (ENSCSAG00000017097) VPS33B (ENSCSAG00000017088) PRC1 (ENSCSAG00000017083) RCCD1 (ENSCSAG00000017077) UNC45A (ENSCSAG00000017071) HDDC3 (ENSCSAG00000017067) MAN2A2 (ENSCSAG00000017063) FES (ENSCSAG00000017051) FURIN (ENSCSAG00000017046) BLM (ENSCSAG00000017040) CRTC3 (ENSCSAG00000017034) IQGAP1 (ENSCSAG00000017030) SV2B (ENSCSAG00000017020) SLCO3A1 (ENSCSAG00000017018) ENSCSAG00000017017 ##22 ST8SIA2 (ENSCSAG00000017015) FAM174B (ENSCSAG00000017009) CHD2 (ENSCSAG00000017007) RGMA (ENSCSAG00000017004) MCTP2 (ENSCSAG00000016995) NR2F2 (ENSCSAG00000016974) ENSCSAG00000000366 ARRDC4 (ENSCSAG00000016967) ENSCSAG00000016956 ENSCSAG00000000365 IGF1R (ENSCSAG00000016951) PGPEP1L (ENSCSAG00000016947) SYNM (ENSCSAG00000016942) TTC23 (ENSCSAG00000016940) LRRC28 (ENSCSAG00000016935) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Rabbit MODERN SPECIES 2 ENSOCUG00000026510 ENSOCUG00000036492 WDR36 (ENSOCUG00000003129) ENSOCUG00000034609 ENSOCUG00000024909 ENSOCUG00000000089 SLC25A46 (ENSOCUG00000012366) TMEM232 (ENSOCUG00000009594) MAN2A1 (ENSOCUG00000003404) PJA2 (ENSOCUG00000011136) ENSOCUG00000035509 ENSOCUG00000032654 ENSOCUG00000010918 ENSOCUG00000012609 EFNA5 (ENSOCUG00000016107) ENSOCUG00000035176 ##22 ENSOCUG00000037124 ENSOCUG00000025766 ENSOCUG00000024359 NUDT12 (ENSOCUG00000017632) ENSOCUG00000022102 MACIR (ENSOCUG00000022010) PPIP5K2 (ENSOCUG00000001610) GIN1 (ENSOCUG00000025993) PAM (ENSOCUG00000001598) SLCO6A1 (ENSOCUG00000003393) SLCO4C1 (ENSOCUG00000016948) ENSOCUG00000027390 ENSOCUG00000035604 ST8SIA4 (ENSOCUG00000007922) FAM174A (ENSOCUG00000007657) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1875 Tmx3 (ENSNGAG00000001873) ENSNGAG00000011454 ##22 Dok6 (ENSNGAG00000014451) Cd226 (ENSNGAG00000016544) Rttn (ENSNGAG00000017865) Socs6 (ENSNGAG00000013534) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b #22 Microbat MODERN SPECIES 1017 ENSMLUG00000023145 ENSMLUG00000029414 LRRC1 (ENSMLUG00000008118) MLIP (ENSMLUG00000008145) TINAG (ENSMLUG00000016940) FAM83B (ENSMLUG00000006727) ENSMLUG00000024260 HCRTR2 (ENSMLUG00000012103) GFRAL (ENSMLUG00000012114) HMGCLL1 (ENSMLUG00000002703) BMP5 (ENSMLUG00000004021) COL21A1 (ENSMLUG00000004388) ENSMLUG00000027092 DST (ENSMLUG00000005610) ENSMLUG00000030379 #22 BEND6 (ENSMLUG00000001178) ENSMLUG00000023844 ZNF451 (ENSMLUG00000004044) ENSMLUG00000004055 RAB23 (ENSMLUG00000004058) ENSMLUG00000027806 ENSMLUG00000028909 ENSMLUG00000030356 ENSMLUG00000005434 KHDRBS2 (ENSMLUG00000005484) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.b #22 Armadillo MODERN SPECIES 3295 ENSDNOG00000046867 ENSDNOG00000041087 RBM12B (ENSDNOG00000041608) CIBAR1 (ENSDNOG00000013822) TRIQK (ENSDNOG00000019786) RUNX1T1 (ENSDNOG00000030709) ENSDNOG00000047390 SLC26A7 (ENSDNOG00000015538) LRRC69 (ENSDNOG00000024272) ENSDNOG00000032119 PIP4P2 (ENSDNOG00000019478) C8orf88 (ENSDNOG00000042167) NECAB1 (ENSDNOG00000016197) ENSDNOG00000018952 TMEM64 (ENSDNOG00000004256) ENSDNOG00000039191 #22 CALB1 (ENSDNOG00000044661) DECR1 (ENSDNOG00000043391) NBN (ENSDNOG00000010843) OSGIN2 (ENSDNOG00000039511) RIPK2 (ENSDNOG00000038605) MMP16 (ENSDNOG00000015771) CPNE3 (ENSDNOG00000014867) RMDN1 (ENSDNOG00000046346) WWP1 (ENSDNOG00000019937) ATP6V0D2 (ENSDNOG00000008447) PSKH2 (ENSDNOG00000011495) ENSDNOG00000049521 CA2 (ENSDNOG00000043973) CA3 (ENSDNOG00000044877) ENSDNOG00000043023 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a ##22 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 405 ENSOGAG00000033210 AMER1 (ENSOGAG00000012535) ASB12 (ENSOGAG00000017240) ENSOGAG00000024242 ENSOGAG00000025437 ##22 ZC4H2 (ENSOGAG00000013705) ENSOGAG00000034884 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00530000063410.b ENSGT00940000162403 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000158781 ENSGT00440000037606.b ENSGT00390000015060.n ENSGT00940000160642 ENSGT00950000183014.f.a.g.a ENSGT00940000153514.b ENSGT00940000157974 ENSGT00910000148124 ENSGT00940000155270 ENSGT00950000183214.a.b.a.b ENSGT00390000000801 ENSGT00530000063873.B ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00530000063873.A ENSGT00940000156552 ENSGT00940000156089 ENSGT00500000044939 ENSGT00940000155041 ENSGT00390000013916 ENSGT00930000150950.b.m.b ENSGT00390000005530.a.a ENSGT00950000183046.a.a ENSGT00940000156449 ENSGT00390000008128.c.a.a ENSGT00940000153534.A ENSGT00940000154319.u.b.a.b ENSGT00390000000685.o.a ENSGT00950000183314 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000063410.b ENSGT00940000162403 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000158781 ENSGT00440000037606.b ENSGT00390000015060.n ENSGT00940000160642 ENSGT00950000183014.f.a.g.a.a ENSGT00940000153514.b ENSGT00940000157974 ENSGT00910000148124 ENSGT00940000155270 ENSGT00950000183214.a.b.a.b ENSGT00390000000801 ENSGT00530000063873.B ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00530000063873.A ENSGT00940000156552 ENSGT00940000156089 ENSGT00500000044939 ENSGT00940000155041 ENSGT00390000013916 ENSGT00930000150950.b.m.b ENSGT00390000005530.a.a ENSGT00950000183046.a.a ENSGT00940000156449 ENSGT00390000008128.c.a.a ENSGT00940000153534.A ENSGT00940000154319.u.b.a.b ENSGT00390000000685.o.a ENSGT00950000183314 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT01030000234607.A.b ENSGT00530000063410.b.c ENSGT00940000162403 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000158781 ENSGT00440000037606.b ENSGT00390000015060.n ENSGT00940000160642 ENSGT00950000183014.f.a.g.a.a ENSGT00940000153514.b ENSGT00940000157974 ENSGT00940000155270 ENSGT00950000183214.a.b.a.b ENSGT00390000000801 ENSGT00530000063873.B ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00530000063873.A ENSGT00940000156552 ENSGT00940000156089 ENSGT00500000044939 ENSGT00940000155041 ENSGT00390000013916 ENSGT00930000150950.b.m.b ENSGT00390000005530.a.a ENSGT00950000183046.a.a ENSGT00940000156449 ENSGT00390000008128.c.a.a ENSGT00940000153534.A ENSGT00940000154319.u.b.a.b ENSGT00860000133854 ENSGT00390000000685.o.a Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 765 ICOS (ENSRBIG00000030423) CTLA4 (ENSRBIG00000039535) ENSRBIG00000031889 ##22 CD28 (ENSRBIG00000030086) RAPH1 (ENSRBIG00000043732) ABI2 (ENSRBIG00000029760) CYP20A1 (ENSRBIG00000021309) NBEAL1 (ENSRBIG00000037739) CARF (ENSRBIG00000040577) ENSRBIG00000026475 ICA1L (ENSRBIG00000004725) FAM117B (ENSRBIG00000041167) BMPR2 (ENSRBIG00000029562) ENSRBIG00000041839 NOP58 (ENSRBIG00000043924) ENSRBIG00000000040 KIAA2012 (ENSRBIG00000040519) ENSRBIG00000039264 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2758 ADAM23 (ENSRROG00000036437) ZDBF2 (ENSRROG00000032109) ENSRROG00000038360 CMKLR2 (ENSRROG00000015659) ENSRROG00000041925 NDUFS1 (ENSRROG00000033953) INO80D (ENSRROG00000003571) NRP2 (ENSRROG00000040911) PARD3B (ENSRROG00000013717) ICOS (ENSRROG00000038288) CTLA4 (ENSRROG00000028565) ENSRROG00000034095 ##22 CD28 (ENSRROG00000043826) ENSRROG00000034411 ENSRROG00000006311 RAPH1 (ENSRROG00000010278) ABI2 (ENSRROG00000040959) CYP20A1 (ENSRROG00000040044) NBEAL1 (ENSRROG00000015491) CARF (ENSRROG00000045180) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234607.A.b ENSGT00530000063410.b ENSGT00940000162403 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000158781 ENSGT00440000037606.b ENSGT00940000160642 ENSGT00950000183014.f.a.g.a.a ENSGT00940000153514.b ENSGT00940000157974 ENSGT00910000148124 ENSGT00940000155270 ENSGT00950000183214.a.b.a.b ENSGT00390000000801 ENSGT00530000063873.B ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00530000063873.A ENSGT00940000156552 ENSGT00940000156089 ENSGT00500000044939 ENSGT00940000155041 ENSGT00390000013916 ENSGT00930000150950.b.m.b ENSGT00390000005530.a.a ENSGT00950000183046.a.a ENSGT00940000156449 ENSGT00940000153534.A ENSGT00940000154319.u.b.a.b ENSGT00390000000685.o.a ENSGT00950000183314 ENSGT00860000133854 Vervet Monkey MODERN SPECIES 1 CPO (ENSCSAG00000010143) FASTKD2 (ENSCSAG00000010158) MDH1B (ENSCSAG00000010163) DYTN (ENSCSAG00000010181) ADAM23 (ENSCSAG00000010198) ENSCSAG00000010220 ZDBF2 (ENSCSAG00000010233) CMKLR2 (ENSCSAG00000018769) ENSCSAG00000010238 NDUFS1 (ENSCSAG00000010247) INO80D (ENSCSAG00000010251) NRP2 (ENSCSAG00000010258) PARD3B (ENSCSAG00000010270) ICOS (ENSCSAG00000010281) CTLA4 (ENSCSAG00000010288) ENSCSAG00000010293 ##22 CD28 (ENSCSAG00000010308) RAPH1 (ENSCSAG00000010318) ABI2 (ENSCSAG00000010327) CYP20A1 (ENSCSAG00000010341) NBEAL1 (ENSCSAG00000010364) CARF (ENSCSAG00000010380) ENSCSAG00000010442 ICA1L (ENSCSAG00000010466) FAM117B (ENSCSAG00000010474) BMPR2 (ENSCSAG00000010485) NOP58 (ENSCSAG00000010496) ENSCSAG00000010504 ENSCSAG00000010514 ENSCSAG00000010526 FZD7 (ENSCSAG00000018768) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00530000063410.b ENSGT00940000162403 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000158781 ENSGT00950000182810.A.a.a.lb.d ENSGT00440000037606.b ENSGT00940000160642 ENSGT00950000183014.f.a.g.a.a ENSGT00940000153514.b ENSGT00940000157974 ENSGT00910000148124 ENSGT00940000155270 ENSGT00950000183214.a.b.a.b ENSGT00390000000801 ENSGT00530000063873.B ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00530000063873.A ENSGT00940000156552 ENSGT00940000156089 ENSGT00500000044939 ENSGT00940000155041 ENSGT00390000013916 ENSGT00930000150950.b.m.b ENSGT00390000005530.a.a ENSGT00950000183046.a.a ENSGT00940000156449 ENSGT00940000153534.A ENSGT00940000154319.u.b.a.b ENSGT00390000000685.o.a ENSGT00950000183314 ENSGT00860000133854 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00390000014165.c.a.b.b.b.q.k ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00390000014165.c.a.b.b.b.q.k ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 Drill MODERN SPECIES 153 BOLL (ENSMLEG00000023905) MARS2 (ENSMLEG00000023045) GLUD2 (ENSMLEG00000033872) RFTN2 (ENSMLEG00000033396) HIGD2B (ENSMLEG00000033233) MOB4 (ENSMLEG00000035032) ENSMLEG00000034274 HSPD1 (ENSMLEG00000033771) COQ10B (ENSMLEG00000028484) ENSMLEG00000027345 SF3B1 (ENSMLEG00000026141) ENSMLEG00000038707 ##22 ENSMLEG00000035765 Sooty mangabey MODERN SPECIES 570 C2orf69 (ENSCATG00000031233) FTCDNL1 (ENSCATG00000018934) ENSCATG00000044312 SATB2 (ENSCATG00000017161) PLCL1 (ENSCATG00000014153) BOLL (ENSCATG00000004430) MARS2 (ENSCATG00000001827) GLUD2 (ENSCATG00000044639) RFTN2 (ENSCATG00000031580) MOB4 (ENSCATG00000002964) ENSCATG00000022859 HSPD1 (ENSCATG00000044175) COQ10B (ENSCATG00000031857) ENSCATG00000031238 SF3B1 (ENSCATG00000035735) ENSCATG00000040754 ##22 ENSCATG00000039142 ANKRD44 (ENSCATG00000034086) PGAP1 (ENSCATG00000041899) C2orf66 (ENSCATG00000040552) GTF3C3 (ENSCATG00000041160) CCDC150 (ENSCATG00000039440) HECW2 (ENSCATG00000042498) STK17B (ENSCATG00000041109) ENSCATG00000041947 ENSCATG00000005122 DNAH7 (ENSCATG00000044354) SLC39A10 (ENSCATG00000003457) ENSCATG00000038644 TMEFF2 (ENSCATG00000044161) ENSCATG00000041477 Olive baboon MODERN SPECIES 1 ENSPANG00000044612 ENSPANG00000031615 SATB2 (ENSPANG00000011212) ENSPANG00000050725 PLCL1 (ENSPANG00000000848) BOLL (ENSPANG00000009570) ENSPANG00000042310 MARS2 (ENSPANG00000016544) RFTN2 (ENSPANG00000009899) MOB4 (ENSPANG00000016215) ENSPANG00000046137 ENSPANG00000029555 COQ10B (ENSPANG00000006879) ENSPANG00000037062 SF3B1 (ENSPANG00000013417) ENSPANG00000016748 ##22 ENSPANG00000037191 ENSPANG00000048684 ENSPANG00000041875 ANKRD44 (ENSPANG00000000736) PGAP1 (ENSPANG00000004620) C2orf66 (ENSPANG00000021308) GTF3C3 (ENSPANG00000004621) CCDC150 (ENSPANG00000012442) HECW2 (ENSPANG00000004283) STK17B (ENSPANG00000021873) ENSPANG00000051235 ENSPANG00000038928 DNAH7 (ENSPANG00000012148) SLC39A10 (ENSPANG00000024555) ENSPANG00000047944 Macaca DUPLICATION Macaca ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000014423 ENSGT00390000015360.i.a ENSGT00940000157752.a ENSGT00940000160812 ENSGT00940000161957 ENSGT00940000155217 ENSGT01050000244893.c.a.a ENSGT00940000157561 ENSGT00940000158180 ENSGT00940000157690 ENSGT00940000156201 ENSGT00910000146945 ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 ENSGT00940000161884 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000161466 ENSGT00910000147036 ENSGT00940000158074 ENSGT00390000009084 ENSGT00510000049182 ENSGT00510000048783 ENSGT00390000008664 ENSGT00390000004566 ENSGT00910000146988 ENSGT01050000244814.a.a.a.a ENSGT00390000002810.a ENSGT00940000154852.a ENSGT00390000014223 ENSGT00390000005976.b ENSGT00390000007119 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000015360.i.a ENSGT00940000157752.a ENSGT00940000160812 ENSGT00940000161957 ENSGT01100000263493.a.a.a.b.a.a.b.a.b.a.a.a.a.b.a.b.d.a.b.a ENSGT00940000155217 ENSGT01050000244893.c.a.a ENSGT00940000157561 ENSGT00940000158180 ENSGT00940000157690 ENSGT00940000156201 ENSGT00910000146945 ENSGT00940000156372 ENSGT00940000159304 ENSGT00940000161884 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000161466 ENSGT00390000001471 ENSGT00940000158074 ENSGT00390000009084 ENSGT00510000049182 ENSGT00510000048783 ENSGT00390000008664 ENSGT00390000004566 ENSGT01050000244814.a.a.a.a ENSGT00390000002810.a ENSGT00390000014223 ENSGT00390000005976.b ENSGT00390000007119 ENSGT00390000014991.b ENSGT00530000063743.a Rhesus MODERN SPECIES 12 CHP2 (ENSMMUG00000063053) ENSMMUG00000058502 ENSMMUG00000053370 PRKCB (ENSMMUG00000014271) ENSMMUG00000054064 CACNG3 (ENSMMUG00000013560) ENSMMUG00000057850 RBBP6 (ENSMMUG00000015908) TNRC6A (ENSMMUG00000020428) SLC5A11 (ENSMMUG00000001407) ARHGAP17 (ENSMMUG00000029176) LCMT1 (ENSMMUG00000005942) ENSMMUG00000061898 AQP8 (ENSMMUG00000010472) ZKSCAN2 (ENSMMUG00000010470) ENSMMUG00000005139 ##22 HS3ST4 (ENSMMUG00000057856) ENSMMUG00000052257 C20H16orf82 (ENSMMUG00000056930) KDM8 (ENSMMUG00000015829) NSMCE1 (ENSMMUG00000015832) ENSMMUG00000054538 IL4R (ENSMMUG00000004666) IL21R (ENSMMUG00000008252) GTF3C1 (ENSMMUG00000008254) KATNIP (ENSMMUG00000015570) GSG1L (ENSMMUG00000015572) XPO6 (ENSMMUG00000018623) ENSMMUG00000051475 ENSMMUG00000051703 SBK1 (ENSMMUG00000000515) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 114 PALB2 (ENSMNEG00000045413) DCTN5 (ENSMNEG00000039632) PLK1 (ENSMNEG00000043893) ERN2 (ENSMNEG00000034382) CHP2 (ENSMNEG00000029883) PRKCB (ENSMNEG00000025935) CACNG3 (ENSMNEG00000039460) RBBP6 (ENSMNEG00000033630) TNRC6A (ENSMNEG00000034854) SLC5A11 (ENSMNEG00000028880) ARHGAP17 (ENSMNEG00000042785) ENSMNEG00000034318 LCMT1 (ENSMNEG00000036894) AQP8 (ENSMNEG00000018309) ZKSCAN2 (ENSMNEG00000006827) ENSMNEG00000019062 ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00530000063410.b ENSGT00940000162403 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000158781 ENSGT00950000182810.A.a.a.lb.d ENSGT00440000037606.b ENSGT00940000160642 ENSGT00950000183014.f.a.g.a.a ENSGT00940000153514.b ENSGT00940000157974 ENSGT00910000148124 ENSGT00940000155270 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ENSGT00390000013749 ENSGT00940000162839.b ENSGT00940000155329.b.a.a ENSGT00940000155329.a ENSGT00950000183347 ENSGT00770000121728 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000161969 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000160268 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000154256.l.a ENSGT00390000014876 ENSGT00940000153763.b ENSGT00940000158460 ENSGT00940000155875 ENSGT00940000157620 ENSGT00940000153441.a.a ENSGT00940000164328 ENSGT00940000157188 ENSGT00940000160623 ENSGT00940000157828 ENSGT00940000157225 ENSGT00390000004860.ab ENSGT00940000154677.h ENSGT00940000157158.d ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000158012 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.o.b ENSGT00940000156434 ENSGT01000000214434.B.b.e.a.p ENSGT00390000013749 ENSGT00940000163894 ENSGT00940000162839.b ENSGT00940000155329.b.a.a ENSGT00620000089275 ENSGT00950000183347 ENSGT00770000121728 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000161969 ENSGT00940000161766 Sooty mangabey MODERN SPECIES 272 ENSCATG00000029833 HPF1 (ENSCATG00000040382) CLCN3 (ENSCATG00000035110) NEK1 (ENSCATG00000041685) SH3RF1 (ENSCATG00000044552) CBR4 (ENSCATG00000044537) ENSCATG00000038325 PALLD (ENSCATG00000034876) DDX60L (ENSCATG00000044236) DDX60 (ENSCATG00000038859) ANXA10 (ENSCATG00000041057) SPOCK3 (ENSCATG00000045135) TLL1 (ENSCATG00000045361) ENSCATG00000038353 CPE (ENSCATG00000034797) ENSCATG00000040801 ##22 MSMO1 (ENSCATG00000029596) KLHL2 (ENSCATG00000042711) ENSCATG00000040073 TMEM192 (ENSCATG00000031779) ENSCATG00000035632 TRIM75 (ENSCATG00000021106) ENSCATG00000035799 ENSCATG00000036915 APELA (ENSCATG00000037336) SMIM31 (ENSCATG00000013550) MARCHF1 (ENSCATG00000033869) TMA16 (ENSCATG00000010392) TKTL2 (ENSCATG00000022800) NPY5R (ENSCATG00000022555) NPY1R (ENSCATG00000034959) Olive baboon MODERN SPECIES 13 ENSPANG00000007780 HPF1 (ENSPANG00000006046) CLCN3 (ENSPANG00000011413) NEK1 (ENSPANG00000018130) SH3RF1 (ENSPANG00000006245) CBR4 (ENSPANG00000017537) PALLD (ENSPANG00000018592) DDX60L (ENSPANG00000017684) ENSPANG00000019535 ANXA10 (ENSPANG00000009896) SPOCK3 (ENSPANG00000006370) ENSPANG00000050156 TLL1 (ENSPANG00000019718) ENSPANG00000044888 CPE (ENSPANG00000008752) ENSPANG00000025445 ##22 MSMO1 (ENSPANG00000044750) KLHL2 (ENSPANG00000007135) GK3 (ENSPANG00000049013) TMEM192 (ENSPANG00000015573) ENSPANG00000046375 ENSPANG00000038075 ENSPANG00000036093 ENSPANG00000014469 ENSPANG00000040369 APELA (ENSPANG00000034001) SMIM31 (ENSPANG00000029574) ENSPANG00000037313 MARCHF1 (ENSPANG00000010028) TMA16 (ENSPANG00000018456) TKTL2 (ENSPANG00000015009) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 287 ENSGT00940000157225 ENSGT00390000004860.ab ENSGT00940000157158.d ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000013749 ENSGT00940000162839.b ENSGT00620000089275 ENSGT00940000155329.b.a.a ENSGT00950000183347 ENSGT00770000121728 ENSGT00910000148912 ENSGT00940000159346 ENSGT00390000004179 ENSGT00940000161969 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000160268 ENSGT00390000004697 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1170 ENSRROG00000033368 CPE (ENSRROG00000044324) ENSRROG00000028538 ##22 MSMO1 (ENSRROG00000042423) KLHL2 (ENSRROG00000031904) ENSRROG00000009326 TMEM192 (ENSRROG00000025812) TRIM75 (ENSRROG00000038459) ENSRROG00000045692 ENSRROG00000036449 APELA (ENSRROG00000028795) SMIM31 (ENSRROG00000042199) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2254 TLL1 (ENSRBIG00000032934) ENSRBIG00000011855 ENSRBIG00000039572 ##22 ENSRBIG00000042572 CPE (ENSRBIG00000032074) MSMO1 (ENSRBIG00000039648) KLHL2 (ENSRBIG00000038533) ENSRBIG00000004342 Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.c ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.c ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 143 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.c ##22 ENSGT00390000012818.o.a.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.c ##22 ENSGT00390000012818.o.a.b Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159314 ENSGT00940000155194 ENSGT00390000013174 ENSGT00940000156585 ENSGT01090000260040.b.b.b.a ENSGT00950000183172.B ENSGT00390000004191 ENSGT00390000015719.c ENSGT00940000155361 ENSGT00390000016565 ENSGT00390000001376.bb.a.a ENSGT00390000017418 ENSGT00940000160747 ENSGT00940000156338 ENSGT00390000000903.a.f.a ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.c ##22 ENSGT00390000012818.o.a.b ENSGT00950000182900.B ENSGT00390000007371 ENSGT00940000160932 ENSGT00940000159398 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00950000182962.b.a.h ENSGT00390000018883 ENSGT00940000157554 ENSGT00390000003710.d.c.a ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 ENSGT01000000214440.A.a.b.a Bonobo MODERN SPECIES ENSPPAG00000028434 RPS6KA1 (ENSPPAG00000041102) ARID1A (ENSPPAG00000035294) PIGV (ENSPPAG00000033338) ZDHHC18 (ENSPPAG00000031507) SFN (ENSPPAG00000013397) GPN2 (ENSPPAG00000039790) GPATCH3 (ENSPPAG00000032902) NR0B2 (ENSPPAG00000039413) NUDC 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(ENSGGOG00000041212) WASF2 (ENSGGOG00000004436) AHDC1 (ENSGGOG00000014466) FGR (ENSGGOG00000000775) IFI6 (ENSGGOG00000000776) FAM76A (ENSGGOG00000006690) STX12 (ENSGGOG00000001668) PPP1R8 (ENSGGOG00000012062) Gibbon MODERN SPECIES 16 LIN28A (ENSNLEG00000028132) DHDDS (ENSNLEG00000009298) HMGN2 (ENSNLEG00000030914) ENSNLEG00000032309 RPS6KA1 (ENSNLEG00000009314) ENSNLEG00000009343 PIGV (ENSNLEG00000009372) ENSNLEG00000033920 SFN (ENSNLEG00000018582) GPN2 (ENSNLEG00000009383) GPATCH3 (ENSNLEG00000009387) NR0B2 (ENSNLEG00000009403) NUDC (ENSNLEG00000009404) TENT5B (ENSNLEG00000009432) SLC9A1 (ENSNLEG00000009434) ENSNLEG00000035618 ##22 WDTC1 (ENSNLEG00000009495) TMEM222 (ENSNLEG00000009516) SYTL1 (ENSNLEG00000009521) MAP3K6 (ENSNLEG00000009550) FCN3 (ENSNLEG00000009613) CD164L2 (ENSNLEG00000009625) GPR3 (ENSNLEG00000028413) ENSNLEG00000009635 AHDC1 (ENSNLEG00000034636) ENSNLEG00000009650 IFI6 (ENSNLEG00000009659) FAM76A (ENSNLEG00000027579) ENSNLEG00000029142 STX12 (ENSNLEG00000030651) PPP1R8 (ENSNLEG00000009676) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00530000063410.b ENSGT00940000162403 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000158781 ENSGT00440000037606.b ENSGT00390000015060.n ENSGT00940000160642 ENSGT00950000183014.f.a.g.b.a.b ENSGT00940000153514.b ENSGT00940000157974 ENSGT00910000148124 ENSGT00940000155270 ENSGT00950000183214.a.b.a.b ENSGT00390000000801 ENSGT00530000063873.B ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT00530000063873.A ENSGT00940000156552 ENSGT00940000156089 ENSGT00500000044939 ENSGT00940000155041 ENSGT00390000013916 ENSGT00930000150950.b.m.b ENSGT00390000005530.a.a ENSGT00950000183046.a.a ENSGT00940000156449 ENSGT00390000008128.c.a.a ENSGT00940000153534.A ENSGT00940000154319.u.b.a.b ENSGT00390000000685.o.a ENSGT00940000154319.u.a.d Hominidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000063410.b ENSGT00940000162403 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000158781 ENSGT00440000037606.b ENSGT00390000015060.n ENSGT00940000160642 ENSGT00950000183014.f.a.g.b.a.b ENSGT00940000153514.b ENSGT00940000157974 ENSGT00910000148124 ENSGT00940000155270 ENSGT00950000183214.a.b.a.b ENSGT00390000000801 ENSGT00530000063873.B ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT00530000063873.A ENSGT00940000156552 ENSGT00940000156089 ENSGT00500000044939 ENSGT00940000155041 ENSGT00390000013916 ENSGT00930000150950.b.m.b ENSGT00390000005530.a.a ENSGT00950000183046.a.a ENSGT00940000156449 ENSGT00390000008128.c.a.a ENSGT00940000153534.A ENSGT00940000154319.u.b.a.b ENSGT00860000133854 ENSGT00940000158239.b Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00530000063410.b ENSGT00940000162403 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000158781 ENSGT00440000037606.b ENSGT00390000015060.n ENSGT00940000160642 ENSGT00950000183014.f.a.g.b.a.b.a.a ENSGT00940000153514.b ENSGT00940000157974 ENSGT00910000148124 ENSGT00940000155270 ENSGT00950000183214.a.b.a.b ENSGT00390000000801 ENSGT00530000063873.B ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT00530000063873.A ENSGT00940000156552 ENSGT00940000156089 ENSGT00500000044939 ENSGT00940000155041 ENSGT00390000013916 ENSGT00930000150950.b.m.b ENSGT00390000005530.a.a ENSGT00390000015889.j ENSGT00610000087446 ENSGT00950000183046.a.a ENSGT00940000156449 ENSGT00390000008128.c.a.a ENSGT00940000153534.A ENSGT00940000154319.u.b.a.a Gorilla MODERN SPECIES 15 FASTKD2 (ENSGGOG00000002062) MDH1B (ENSGGOG00000002059) DYTN (ENSGGOG00000027242) FAM237A (ENSGGOG00000037017) ADAM23 (ENSGGOG00000012509) ENSGGOG00000024971 ZDBF2 (ENSGGOG00000023142) ENSGGOG00000042195 EEF1B2 (ENSGGOG00000007002) NDUFS1 (ENSGGOG00000001513) INO80D (ENSGGOG00000015570) NRP2 (ENSGGOG00000009537) PARD3B (ENSGGOG00000034911) ICOS (ENSGGOG00000014097) CTLA4 (ENSGGOG00000007961) ENSGGOG00000039900 ##22 CD28 (ENSGGOG00000041735) ENSGGOG00000023735 RAPH1 (ENSGGOG00000016399) ABI2 (ENSGGOG00000016384) CYP20A1 (ENSGGOG00000007044) NBEAL1 (ENSGGOG00000015453) ENSGGOG00000036442 WDR12 (ENSGGOG00000026073) ICA1L (ENSGGOG00000017038) ENSGGOG00000016194 ENSGGOG00000014813 BMPR2 (ENSGGOG00000010989) ENSGGOG00000042085 ENSGGOG00000014545 ENSGGOG00000026439 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000063410.b ENSGT00940000162403 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000158781 ENSGT00440000037606.b ENSGT00390000015060.n ENSGT00940000160642 ENSGT00950000183014.f.a.g.b.a.b.a.a ENSGT00940000153514.b ENSGT00940000157974 ENSGT00910000148124 ENSGT00940000155270 ENSGT00950000183214.a.b.a.b ENSGT00390000000801 ENSGT00530000063873.B ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT00530000063873.A ENSGT00940000156552 ENSGT00940000156089 ENSGT00500000044939 ENSGT00940000155041 ENSGT00390000013916 ENSGT00930000150950.b.m.b ENSGT00390000005530.a.a ENSGT00390000015889.j ENSGT00610000087446 ENSGT00950000183046.a.a ENSGT00940000156449 ENSGT00390000008128.c.a.a ENSGT00940000153534.A ENSGT00940000154319.u.b.a.b Pan ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00530000063410.b ENSGT00940000162403 ENSGT00390000015769.B ENSGT00940000158781 ENSGT00440000037606.b ENSGT00390000015060.n ENSGT00940000160642 ENSGT00950000183014.f.a.g.b.a.b.a.a ENSGT00940000153514.b ENSGT00940000157974 ENSGT00910000148124 ENSGT00940000155270 ENSGT00950000183214.a.b.a.b ENSGT00390000000801 ENSGT00530000063873.B ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.d ##22 ENSGT00530000063873.A ENSGT00940000156552 ENSGT00940000156089 ENSGT00500000044939 ENSGT00940000155041 ENSGT00390000013916 ENSGT00930000150950.b.m.b ENSGT00390000005530.a.a ENSGT00390000015889.j ENSGT00610000087446 ENSGT00950000183046.a.a ENSGT00940000156449 ENSGT00390000008128.c.a.a ENSGT00940000153534.A ENSGT00940000154319.u.b.a.a Chimpanzee MODERN SPECIES 15 FASTKD2 (ENSPTRG00000012848) MDH1B (ENSPTRG00000012847) DYTN (ENSPTRG00000042355) FAM237A (ENSPTRG00000045763) ADAM23 (ENSPTRG00000012846) ZDBF2 (ENSPTRG00000029052) ENSPTRG00000052002 CMKLR2 (ENSPTRG00000012844) EEF1B2 (ENSPTRG00000049619) NDUFS1 (ENSPTRG00000012842) INO80D (ENSPTRG00000012841) NRP2 (ENSPTRG00000012839) PARD3B (ENSPTRG00000012838) ICOS (ENSPTRG00000012837) CTLA4 (ENSPTRG00000044793) ENSPTRG00000051964 ##22 CD28 (ENSPTRG00000012833) ENSPTRG00000043246 RAPH1 (ENSPTRG00000012831) ABI2 (ENSPTRG00000012830) ENSPTRG00000012829 NBEAL1 (ENSPTRG00000012828) CARF (ENSPTRG00000012824) WDR12 (ENSPTRG00000012823) ICA1L (ENSPTRG00000012822) ENSPTRG00000044806 ENSPTRG00000040928 FAM117B (ENSPTRG00000012821) BMPR2 (ENSPTRG00000029076) ENSPTRG00000047517 NOP58 (ENSPTRG00000012818) Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00520000055955.f.a ENSGT00830000128402 ENSGT00940000161067 ENSGT00390000017666 ENSGT00940000161472 ENSGT00940000158243 ENSGT00940000157417 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.b.k.b 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ENSGT00940000156005 ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000013207 ENSGT01010000222336.a.a.a.ob.a.a ENSGT01010000222336.a.a.a.ob.a.b ENSGT01010000222336.a.a.a.ob.b ENSGT00390000016904 ENSGT01030000234522.C.b.e.b.a.a.a ENSGT00940000157459 ENSGT00940000156793 ENSGT00940000158098 ENSGT00940000159998 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00830000128402 ENSGT00940000162712.d ENSGT00940000161933.`b.a.a ENSGT00940000161933.`b.a.b.a ENSGT00940000161067 ENSGT00390000017666 ENSGT00940000161472 ENSGT00940000158243 ENSGT00940000157417 ENSGT00940000155944 ENSGT00940000157159 ENSGT00940000159153 ENSGT00860000135749 ENSGT00390000009546.a ENSGT00390000016097 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT00730000111019 ENSGT00940000158751 ENSGT00940000156891 ENSGT00940000156005 ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000013207 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222336.a.a.a.ob.b ENSGT00390000016904 ENSGT01030000234522.C.b.e.b.a.a.a ENSGT00940000157459 ENSGT00940000156793 ENSGT00940000158098 ENSGT00940000159998 ENSGT00390000015152 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 17 ENSMFAG00000025676 ENSMFAG00000039914 ENSMFAG00000023207 ADAM20 (ENSMFAG00000056245) MED6 (ENSMFAG00000032743) TTC9 (ENSMFAG00000052601) MAP3K9 (ENSMFAG00000002562) PCNX1 (ENSMFAG00000033279) SIPA1L1 (ENSMFAG00000038037) RGS6 (ENSMFAG00000033074) DPF3 (ENSMFAG00000033308) ENSMFAG00000057362 DCAF4 (ENSMFAG00000037267) ENSMFAG00000064227 ZFYVE1 (ENSMFAG00000037270) ENSMFAG00000047560 ##22 ENSMFAG00000063025 RBM25 (ENSMFAG00000040040) PSEN1 (ENSMFAG00000000113) PAPLN (ENSMFAG00000021512) NUMB (ENSMFAG00000046300) HEATR4 (ENSMFAG00000043816) ENSMFAG00000048994 ENSMFAG00000049913 ##22 ENSMFAG00000031617 DNAL1 (ENSMFAG00000035392) PNMA1 (ENSMFAG00000007972) ENSMFAG00000063574 MIDEAS (ENSMFAG00000034140) PTGR2 (ENSMFAG00000045904) ZNF410 (ENSMFAG00000000428) Rhesus MODERN SPECIES 17 ENSMMUG00000053103 ENSMMUG00000059282 ENSMMUG00000052580 ADAM20 (ENSMMUG00000000202) MED6 (ENSMMUG00000005781) TTC9 (ENSMMUG00000056365) ENSMMUG00000051671 MAP3K9 (ENSMMUG00000005786) PCNX1 (ENSMMUG00000019470) SIPA1L1 (ENSMMUG00000020067) RGS6 (ENSMMUG00000001820) DPF3 (ENSMMUG00000016351) ENSMMUG00000063538 DCAF4 (ENSMMUG00000003625) ZFYVE1 (ENSMMUG00000005140) ENSMMUG00000056507 ##22 RBM25 (ENSMMUG00000002332) PSEN1 (ENSMMUG00000010173) PAPLN (ENSMMUG00000020195) NUMB (ENSMMUG00000020196) RIOX1 (ENSMMUG00000000315) ENSMMUG00000053481 ENSMMUG00000049894 ##22 ENSMMUG00000006855 DNAL1 (ENSMMUG00000004910) PNMA1 (ENSMMUG00000004911) MIDEAS (ENSMMUG00000004913) PTGR2 (ENSMMUG00000018146) ZNF410 (ENSMMUG00000011144) FAM161B (ENSMMUG00000029273) COQ6 (ENSMMUG00000011148) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00520000055955.f.a ENSGT00830000128402 ENSGT00940000161933.`b.a.a ENSGT00940000161933.`b.b ENSGT00390000017666 ENSGT00940000161472 ENSGT00940000158243 ENSGT00940000157417 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.b.k.b ENSGT00940000155944 ENSGT00950000183779 ENSGT00940000157159 ENSGT00940000159153 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##22 ENSGT00940000155153.B ENSGT00910000147008 ENSGT00940000161747 ENSGT00390000006211 ENSGT00940000162497 ENSGT00940000155829 ENSGT00940000162620 ENSGT00940000162476 ENSGT00510000050353 ENSGT00390000006479 ENSGT00390000016226 ENSGT00940000162588 ENSGT00940000156207.b ENSGT01030000234781 ENSGT00940000162462 Vervet Monkey MODERN SPECIES 13 ENSCSAG00000007113 ENSCSAG00000019521 ARHGEF5 (ENSCSAG00000007100) NOBOX (ENSCSAG00000007090) TPK1 (ENSCSAG00000007078) ENSCSAG00000007065 ENSCSAG00000019522 CUL1 (ENSCSAG00000007057) EZH2 (ENSCSAG00000007037) PDIA4 (ENSCSAG00000007026) ZNF786 (ENSCSAG00000007023) ZNF425 (ENSCSAG00000007020) ZNF398 (ENSCSAG00000007015) ZNF282 (ENSCSAG00000007010) ZNF783 (ENSCSAG00000007001) ENSCSAG00000006996 ##22 ZNF777 (ENSCSAG00000006994) ZNF746 (ENSCSAG00000006985) KRBA1 (ENSCSAG00000006959) ZNF467 (ENSCSAG00000006913) ENSCSAG00000006907 ENSCSAG00000006904 ZNF862 (ENSCSAG00000006899) ATP6V0E2 (ENSCSAG00000006895) LRRC61 (ENSCSAG00000019523) RARRES2 (ENSCSAG00000006891) REPIN1 (ENSCSAG00000006882) ENSCSAG00000019524 GIMAP8 (ENSCSAG00000006880) GIMAP4 (ENSCSAG00000006878) GIMAP6 (ENSCSAG00000006876) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a ENSGT00650000093445 ENSGT00390000016016.A ENSGT00940000154516.b.ib.a ENSGT00530000065058 ENSGT00940000154774 ENSGT00390000008496.db.b ENSGT00940000155013 ENSGT00940000157738 ENSGT00940000162604 ENSGT00940000163692 ENSGT00940000161603 ENSGT00940000161885 ENSGT00940000162364 ENSGT00940000162942 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000155153.B ENSGT00910000147008 ENSGT00940000161747 ENSGT00390000006211 ENSGT00940000162497 ENSGT00940000155829 ENSGT00940000162620 ENSGT00940000162476 ENSGT00510000050353 ENSGT00390000006479 ENSGT00390000016226 ENSGT00940000162588 ENSGT00940000156207.b ENSGT01030000234781 ENSGT00940000162462 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a ENSGT00650000093445 ENSGT00390000016016.A ENSGT00940000154516.b.ib.a ENSGT00530000065058 ENSGT00940000154774 ENSGT00390000008496.db.b ENSGT00940000155013 ENSGT00940000157738 ENSGT00940000162604 ENSGT00940000163692 ENSGT00940000161603 ENSGT00940000161885 ENSGT00940000162364 ENSGT00940000162942 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000155153.B ENSGT00910000147008 ENSGT00940000161747 ENSGT00390000006211 ENSGT00940000162497 ENSGT00940000155829 ENSGT00940000162620 ENSGT00940000162476 ENSGT00510000050353 ENSGT00390000006479 ENSGT00390000016226 ENSGT00940000162588 ENSGT00940000156207.b ENSGT01030000234781 ENSGT00940000162462 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a ENSGT00650000093445 ENSGT00390000016016.A ENSGT00940000154516.b.ib.a ENSGT00530000065058 ENSGT00940000154774 ENSGT00390000008496.db.b ENSGT00940000155013 ENSGT00940000157738 ENSGT00940000162604 ENSGT00940000163692 ENSGT00940000161603 ENSGT00940000161885 ENSGT00940000162364 ENSGT00940000162942 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000155153.B ENSGT00910000147008 ENSGT00940000161747 ENSGT00390000006211 ENSGT00940000162497 ENSGT00940000155829 ENSGT00940000162620 ENSGT00940000162476 ENSGT00510000050353 ENSGT00390000006479 ENSGT00390000016226 ENSGT00940000162588 ENSGT00940000156207.b ENSGT01030000234781 ENSGT00940000162462 Drill MODERN SPECIES 1012 IFNAR2 (ENSMLEG00000033683) IL10RB (ENSMLEG00000040401) ENSMLEG00000040477 ENSMLEG00000043674 C7orf33 (ENSMLEG00000039098) ENSMLEG00000042394 CUL1 (ENSMLEG00000044437) EZH2 (ENSMLEG00000041853) PDIA4 (ENSMLEG00000043525) ZNF786 (ENSMLEG00000027484) ZNF425 (ENSMLEG00000000829) ZNF398 (ENSMLEG00000010475) ZNF282 (ENSMLEG00000043161) ZNF212 (ENSMLEG00000042732) ZNF783 (ENSMLEG00000018683) ENSMLEG00000041646 ##22 ZNF777 (ENSMLEG00000043487) ENSMLEG00000032180 ZNF746 (ENSMLEG00000036958) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 331 ENSGT00940000154516.b.ib.b ENSGT00530000065058 ENSGT00390000008502.h ENSGT00940000154774 ENSGT00940000155013 ENSGT00940000157738 ENSGT00940000162604 ENSGT00940000163692 ENSGT00940000161603 ENSGT00940000161885 ENSGT00940000162364 ENSGT00940000162942 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000155153.B ENSGT00910000147008 ENSGT00940000161747 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 797 RGS6 (ENSRROG00000040751) DPF3 (ENSRROG00000039384) ENSRROG00000045287 ENSRROG00000044529 DCAF4 (ENSRROG00000035960) ZFYVE1 (ENSRROG00000037742) ENSRROG00000028901 ##22 RBM25 (ENSRROG00000035556) PSEN1 (ENSRROG00000023023) PAPLN (ENSRROG00000032324) NUMB (ENSRROG00000039499) ENSRROG00000035725 HEATR4 (ENSRROG00000040469) RIOX1 (ENSRROG00000010218) ENSRROG00000039724 ##22 ENSRROG00000036776 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2321 C7orf33 (ENSRBIG00000029766) ENSRBIG00000036365 CUL1 (ENSRBIG00000029940) EZH2 (ENSRBIG00000034606) ENSRBIG00000031094 PDIA4 (ENSRBIG00000040572) ZNF786 (ENSRBIG00000033283) ZNF425 (ENSRBIG00000042005) ZNF398 (ENSRBIG00000025520) ZNF282 (ENSRBIG00000037602) ZNF212 (ENSRBIG00000041274) ZNF783 (ENSRBIG00000027067) ENSRBIG00000023618 ##22 ZNF777 (ENSRBIG00000033059) ENSRBIG00000032511 ZNF746 (ENSRBIG00000009398) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.b.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.b.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.b.a ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 99 PDCL2 (ENSSBOG00000027890) NMU (ENSSBOG00000028898) ENSSBOG00000017845 EXOC1L (ENSSBOG00000023113) EXOC1 (ENSSBOG00000034813) CEP135 (ENSSBOG00000023582) CRACD (ENSSBOG00000034674) AASDH (ENSSBOG00000029836) ENSSBOG00000017998 PAICS (ENSSBOG00000024834) ENSSBOG00000032586 ENSSBOG00000031860 ARL9 (ENSSBOG00000032014) THEGL (ENSSBOG00000023585) HOPX (ENSSBOG00000017553) ENSSBOG00000023352 ##22 ENSSBOG00000032589 ENSSBOG00000026443 REST (ENSSBOG00000032119) NOA1 (ENSSBOG00000022956) POLR2B (ENSSBOG00000023163) ENSSBOG00000021494 IGFBP7 (ENSSBOG00000023614) ENSSBOG00000022027 ENSSBOG00000034992 ADGRL3 (ENSSBOG00000001001) ENSSBOG00000021089 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.b.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.b.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.b.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 229 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.b.k.b ENSGT00940000155944 ENSGT00940000157159 ENSGT00940000159153 ENSGT00860000135749 ENSGT00910000147388 ENSGT00390000009546.a ENSGT00390000016097 ENSGT00730000111019 ENSGT00940000158751 ENSGT00940000156891 ENSGT00940000156005 ENSGT00940000153385.b.a.b.oc ENSGT00390000013207 ENSGT00390000000083.a ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.b.b ##22 ENSGT01010000222336.a.a.a.ob.a.a.o Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 713 ENSRBIG00000033864 SIPA1L1 (ENSRBIG00000013622) RGS6 (ENSRBIG00000038422) DPF3 (ENSRBIG00000021314) ENSRBIG00000038609 ENSRBIG00000040543 DCAF4 (ENSRBIG00000041818) ZFYVE1 (ENSRBIG00000036107) RBM25 (ENSRBIG00000039904) PSEN1 (ENSRBIG00000019293) PAPLN (ENSRBIG00000033248) NUMB (ENSRBIG00000043156) ENSRBIG00000015372 HEATR4 (ENSRBIG00000041847) RIOX1 (ENSRBIG00000017859) ENSRBIG00000031681 ##22 ENSRBIG00000023969 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 797 RGS6 (ENSRROG00000040751) DPF3 (ENSRROG00000039384) ENSRROG00000045287 ENSRROG00000044529 DCAF4 (ENSRROG00000035960) ZFYVE1 (ENSRROG00000037742) ENSRROG00000028901 ##22 RBM25 (ENSRROG00000035556) PSEN1 (ENSRROG00000023023) PAPLN (ENSRROG00000032324) NUMB (ENSRROG00000039499) ENSRROG00000035725 HEATR4 (ENSRROG00000040469) RIOX1 (ENSRROG00000010218) ENSRROG00000039724 ##22 ENSRROG00000036776 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158243 ENSGT00940000157417 ENSGT00940000155944 ENSGT00940000157159 ENSGT00940000159153 ENSGT00860000135749 ENSGT00390000009546.a ENSGT00390000016097 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT00730000111019 ENSGT00940000158751 ENSGT00940000156891 ENSGT00940000156005 ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000013207 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.b ##22 ENSGT01010000222336.a.a.a.ob.b ENSGT00390000016904 ENSGT01030000234522.C.b.e.b.a.a.a ENSGT00940000157459 ENSGT00940000156793 ENSGT00940000158098 ENSGT00940000159998 ENSGT00390000015152 ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00390000017443.s.a.a ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b Rhesus MODERN SPECIES 17 MAP3K9 (ENSMMUG00000005786) PCNX1 (ENSMMUG00000019470) SIPA1L1 (ENSMMUG00000020067) RGS6 (ENSMMUG00000001820) DPF3 (ENSMMUG00000016351) ENSMMUG00000063538 DCAF4 (ENSMMUG00000003625) ZFYVE1 (ENSMMUG00000005140) ENSMMUG00000056507 ##22 RBM25 (ENSMMUG00000002332) PSEN1 (ENSMMUG00000010173) PAPLN (ENSMMUG00000020195) NUMB (ENSMMUG00000020196) RIOX1 (ENSMMUG00000000315) ENSMMUG00000053481 ENSMMUG00000049894 ##22 ENSMMUG00000006855 DNAL1 (ENSMMUG00000004910) PNMA1 (ENSMMUG00000004911) MIDEAS (ENSMMUG00000004913) PTGR2 (ENSMMUG00000018146) ZNF410 (ENSMMUG00000011144) FAM161B (ENSMMUG00000029273) COQ6 (ENSMMUG00000011148) BBOF1 (ENSMMUG00000012683) ALDH6A1 (ENSMMUG00000012684) LIN52 (ENSMMUG00000052506) VSX2 (ENSMMUG00000029272) ABCD4 (ENSMMUG00000004041) VRTN (ENSMMUG00000012383) SYNDIG1L (ENSMMUG00000038996) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 17 SIPA1L1 (ENSMFAG00000038037) RGS6 (ENSMFAG00000033074) DPF3 (ENSMFAG00000033308) ENSMFAG00000057362 DCAF4 (ENSMFAG00000037267) ENSMFAG00000064227 ZFYVE1 (ENSMFAG00000037270) ENSMFAG00000047560 ##22 ENSMFAG00000063025 RBM25 (ENSMFAG00000040040) PSEN1 (ENSMFAG00000000113) PAPLN (ENSMFAG00000021512) NUMB (ENSMFAG00000046300) HEATR4 (ENSMFAG00000043816) ENSMFAG00000048994 ENSMFAG00000049913 ##22 ENSMFAG00000031617 DNAL1 (ENSMFAG00000035392) PNMA1 (ENSMFAG00000007972) ENSMFAG00000063574 MIDEAS (ENSMFAG00000034140) PTGR2 (ENSMFAG00000045904) ZNF410 (ENSMFAG00000000428) FAM161B (ENSMFAG00000038086) COQ6 (ENSMFAG00000046089) ENTPD5 (ENSMFAG00000001083) BBOF1 (ENSMFAG00000037820) ALDH6A1 (ENSMFAG00000039673) LIN52 (ENSMFAG00000062510) ENSMFAG00000058590 VSX2 (ENSMFAG00000050163) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Red fox MODERN SPECIES 277 ENSVVUG00000015892 ENSVVUG00000015889 ENSVVUG00000015888 ENSVVUG00000015868 CHIC1 (ENSVVUG00000015860) ENSVVUG00000015823 ENSVVUG00000015801 ##22 ENSVVUG00000015792 ENSVVUG00000015788 ZCCHC13 (ENSVVUG00000015754) ENSVVUG00000015751 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Odontoceti DUPLICATION Odontoceti DUPLICATION Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000005923 ENSGT00940000160909 ENSGT00940000164671.a.b ENSGT00680000100018.a.a.a ENSGT00390000015818.f ENSGT00940000158361 ENSGT00950000183184.a.a ENSGT00390000006826 ENSGT00940000159898 ENSGT00940000160767 ENSGT00940000156186 ENSGT00940000157376.tb.b ENSGT00940000161229 ENSGT00940000155675 ENSGT00390000006303 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.c.a ##22 ENSGT00390000015143 ENSGT00390000012446.o.a ENSGT00680000100065 ENSGT00940000153744.A ENSGT00950000183178.b.a.jb ENSGT00940000157085 ENSGT00940000160657 ENSGT00390000011537 ENSGT00890000139491 ENSGT00940000156785 ENSGT00530000063599.B ENSGT00390000002174.b ENSGT00390000006330.a.a ENSGT00390000010463.a.b ENSGT01050000244905.E Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000005923 ENSGT00940000160909 ENSGT00940000164671.a.b ENSGT00680000100018.a.a.a ENSGT00390000015818.f ENSGT00940000158361 ENSGT00950000183184.a.a ENSGT00390000006826 ENSGT00940000159898 ENSGT00940000160767 ENSGT00940000156186 ENSGT00940000157376.tb.b ENSGT00940000161229 ENSGT00940000155675 ENSGT00390000006303 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.c.a ##22 ENSGT00390000015143 ENSGT00390000012446.o.a.a ENSGT00680000100065 ENSGT00940000153744.A ENSGT00950000183178.b.a.jb ENSGT00940000157085 ENSGT00940000160657 ENSGT00390000011537 ENSGT00890000139491 ENSGT00940000156785.a ENSGT00530000063599.B ENSGT00390000002174.b ENSGT00390000006330.a.a ENSGT00390000010463.a.b ENSGT01050000244905.E Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000164671.a.b ENSGT00680000100018.a.a.a ENSGT00970000193510.a ENSGT00390000015818.f ENSGT00940000158361 ENSGT00950000183184.a.a ENSGT00390000006826 ENSGT00940000159898 ENSGT00940000160767 ENSGT00390000009113.a.a.k.a.b.b ENSGT00940000156186 ENSGT00940000157376.tb.b ENSGT00940000161229 ENSGT00940000155675 ENSGT00390000006303 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.c.a ##22 ENSGT00390000015143 ENSGT00390000005954.v ENSGT01030000234770 ENSGT00390000012446.o.a.a ENSGT00680000100065 ENSGT00940000153744.A ENSGT00950000183178.b.a.jb.a ENSGT00940000157085 ENSGT00940000160657 ENSGT00390000011537 ENSGT00890000139491 ENSGT00940000156785.a ENSGT00530000063599.B ENSGT00390000002174.b ENSGT00390000006330.a.a Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00680000100018.a.a.a ENSGT00970000193510.a ENSGT00390000015818.f ENSGT00940000158361 ENSGT00950000183184.a.a ENSGT00390000006826 ENSGT00940000159898 ENSGT00940000160767 ENSGT00390000009113.a.a.k.a.b.b ENSGT00910000148656 ENSGT00940000156186 ENSGT00940000157376.tb.b ENSGT00940000161229 ENSGT00940000155675 ENSGT00390000006303 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.c.a ##22 ENSGT00390000015143 ENSGT00950000182802.A.ab.a.a.a.a.b.a.b.a ENSGT00390000005954.v ENSGT01030000234770 ENSGT00390000012446.o.a.a ENSGT00680000100065 ENSGT00940000153744.A ENSGT00950000183178.b.a.jb.a ENSGT00940000157085 ENSGT00940000160657 ENSGT00390000011537 ENSGT00890000139491 ENSGT00940000156785.a ENSGT00530000063599.B ENSGT00390000002174.b Narwhal MODERN SPECIES 302 ENSMMNG00015007366 ENSMMNG00015007359 ZC3H15 (ENSMMNG00015007338) ITGAV (ENSMMNG00015007224) FAM171B (ENSMMNG00015007149) ZSWIM2 (ENSMMNG00015007121) CALCRL (ENSMMNG00015007087) TFPI (ENSMMNG00015007064) ENSMMNG00015007048 ENSMMNG00015007038 GULP1 (ENSMMNG00015007017) ENSMMNG00015006999 COL3A1 (ENSMMNG00015006908) COL5A2 (ENSMMNG00015006631) WDR75 (ENSMMNG00015006509) ENSMMNG00015006481 ##22 SLC40A1 (ENSMMNG00015006461) ENSMMNG00015006448 ENSMMNG00015006438 ASDURF (ENSMMNG00015006418) ASNSD1 (ENSMMNG00015006404) ANKAR (ENSMMNG00015006364) OSGEPL1 (ENSMMNG00015006333) ENSMMNG00015006312 PMS1 (ENSMMNG00015006254) MSTN (ENSMMNG00015006200) C2orf88 (ENSMMNG00015006188) HIBCH (ENSMMNG00015006139) ENSMMNG00015006099 MFSD6 (ENSMMNG00015006083) NEMP2 (ENSMMNG00015006064) Beluga whale MODERN SPECIES 84 ENSDLEG00000011938 ZC3H15 (ENSDLEG00000011955) ITGAV (ENSDLEG00000011966) FAM171B (ENSDLEG00000012009) ZSWIM2 (ENSDLEG00000012065) CALCRL (ENSDLEG00000012084) TFPI (ENSDLEG00000012125) ENSDLEG00000012157 ENSDLEG00000012163 GULP1 (ENSDLEG00000012180) ENSDLEG00000012251 ENSDLEG00000012272 COL3A1 (ENSDLEG00000012280) COL5A2 (ENSDLEG00000012350) WDR75 (ENSDLEG00000013039) ENSDLEG00000013074 ##22 SLC40A1 (ENSDLEG00000013082) ENSDLEG00000013108 ENSDLEG00000013118 ASDURF (ENSDLEG00000013124) ASNSD1 (ENSDLEG00000008114) ANKAR (ENSDLEG00000008204) OSGEPL1 (ENSDLEG00000008651) ORMDL1 (ENSDLEG00000008680) PMS1 (ENSDLEG00000008701) MSTN (ENSDLEG00000008742) CUNH2orf88 (ENSDLEG00000008759) HIBCH (ENSDLEG00000008781) INPP1 (ENSDLEG00000008853) MFSD6 (ENSDLEG00000008915) NEMP2 (ENSDLEG00000008991) Vaquita MODERN SPECIES 18 FSIP2 (ENSPSNG00000004740) ENSPSNG00000004689 ENSPSNG00000004659 ZC3H15 (ENSPSNG00000004633) ITGAV (ENSPSNG00000004427) ZSWIM2 (ENSPSNG00000004240) CALCRL (ENSPSNG00000004200) TFPI (ENSPSNG00000004167) ENSPSNG00000004128 ENSPSNG00000004106 GULP1 (ENSPSNG00000004089) ENSPSNG00000004049 COL3A1 (ENSPSNG00000004016) COL5A2 (ENSPSNG00000003919) WDR75 (ENSPSNG00000003840) ENSPSNG00000003805 ##22 SLC40A1 (ENSPSNG00000003778) ENSPSNG00000003760 ENSPSNG00000003748 ASNSD1 (ENSPSNG00000003732) ASDURF (ENSPSNG00000003690) ANKAR (ENSPSNG00000003641) OSGEPL1 (ENSPSNG00000003595) ENSPSNG00000003553 PMS1 (ENSPSNG00000003477) MSTN (ENSPSNG00000003402) C2orf88 (ENSPSNG00000003366) HIBCH (ENSPSNG00000003321) ENSPSNG00000003265 MFSD6 (ENSPSNG00000003226) NEMP2 (ENSPSNG00000003200) Sperm whale MODERN SPECIES 11 ZNF804A (ENSPCTG00005013423) ENSPCTG00005013497 ENSPCTG00005013515 ZC3H15 (ENSPCTG00005013588) ITGAV (ENSPCTG00005013761) FAM171B (ENSPCTG00005014706) ZSWIM2 (ENSPCTG00005014863) CALCRL (ENSPCTG00005014989) TFPI (ENSPCTG00005015062) GULP1 (ENSPCTG00005015202) ENSPCTG00005015367 ENSPCTG00005015414 COL3A1 (ENSPCTG00005015521) COL5A2 (ENSPCTG00005016567) WDR75 (ENSPCTG00005017607) ENSPCTG00005017797 ##22 SLC40A1 (ENSPCTG00005017848) ENSPCTG00005017870 ENSPCTG00005017880 ASDURF (ENSPCTG00005017899) ASNSD1 (ENSPCTG00005017998) ANKAR (ENSPCTG00005018060) OSGEPL1 (ENSPCTG00005018294) ORMDL1 (ENSPCTG00005018369) PMS1 (ENSPCTG00005018433) MSTN (ENSPCTG00005018647) C2H2orf88 (ENSPCTG00005018687) HIBCH (ENSPCTG00005018699) INPP1 (ENSPCTG00005018792) MFSD6 (ENSPCTG00005018816) NEMP2 (ENSPCTG00005018872) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.c.b ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 19 TRAPPC13 (ENSPCTG00005012479) ENSPCTG00005012421 TRIM23 (ENSPCTG00005012189) PPWD1 (ENSPCTG00005012126) CENPK (ENSPCTG00005012024) ADAMTS6 (ENSPCTG00005011980) CWC27 (ENSPCTG00005011894) SREK1IP1 (ENSPCTG00005011865) SHISAL2B (ENSPCTG00005011811) ENSPCTG00005011774 RGS7BP (ENSPCTG00005011710) RNF180 (ENSPCTG00005011581) ENSPCTG00005011564 HTR1A (ENSPCTG00005011540) ENSPCTG00005011501 ENSPCTG00005011444 ##22 ENSPCTG00005011421 ENSPCTG00005011384 IPO11 (ENSPCTG00005011053) DIMT1 (ENSPCTG00005010923) KIF2A (ENSPCTG00005010833) ZSWIM6 (ENSPCTG00005010676) SMIM15 (ENSPCTG00005010661) ENSPCTG00005010642 NDUFAF2 (ENSPCTG00005010591) ERCC8 (ENSPCTG00005010440) ELOVL7 (ENSPCTG00005010318) ENSPCTG00005010219 DEPDC1B (ENSPCTG00005010156) ENSPCTG00005010102 ENSPCTG00005010095 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.d ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 20 SEC61B (ENSPCTG00005010498) ALG2 (ENSPCTG00005010557) TGFBR1 (ENSPCTG00005010608) COL15A1 (ENSPCTG00005010849) ENSPCTG00005011349 GALNT12 (ENSPCTG00005011405) ANKS6 (ENSPCTG00005011527) GABBR2 (ENSPCTG00005011749) ENSPCTG00005011983 CORO2A (ENSPCTG00005012032) ENSPCTG00005012512 NANS (ENSPCTG00005012522) ENSPCTG00005012572 HEMGN (ENSPCTG00005012629) TRMO (ENSPCTG00005012657) ENSPCTG00005012706 ##22 FOXE1 (ENSPCTG00005012727) ENSPCTG00005012741 XPA (ENSPCTG00005012752) NCBP1 (ENSPCTG00005012790) TSTD2 (ENSPCTG00005013126) TMOD1 (ENSPCTG00005013192) TDRD7 (ENSPCTG00005013350) CCDC180 (ENSPCTG00005013505) ENSPCTG00005014176 IGFBPL1 (ENSPCTG00005014852) ALDH1B1 (ENSPCTG00005014922) SHB (ENSPCTG00005014948) DCAF10 (ENSPCTG00005015030) ENSPCTG00005015156 EXOSC3 (ENSPCTG00005015181) Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Arabian camel MODERN SPECIES 9 ENSCDRG00005010702 ENSCDRG00005010440 ENSCDRG00005010343 RBFOX1 (ENSCDRG00005010237) TMEM114 (ENSCDRG00005010137) METTL22 (ENSCDRG00005009957) ABAT (ENSCDRG00005009720) TMEM186 (ENSCDRG00005009666) ENSCDRG00005009645 PMM2 (ENSCDRG00005009547) CARHSP1 (ENSCDRG00005009500) LITAFD (ENSCDRG00005009464) USP7 (ENSCDRG00005008873) HAPSTR1 (ENSCDRG00005008800) ENSCDRG00005019366 ENSCDRG00005019350 ##22 GRIN2A (ENSCDRG00005019296) ATF7IP2 (ENSCDRG00005019202) EMP2 (ENSCDRG00005019179) TEKT5 (ENSCDRG00005019148) NUBP1 (ENSCDRG00005019094) TVP23A (ENSCDRG00005019069) CIITA (ENSCDRG00005018981) DEXI (ENSCDRG00005018966) CLEC16A (ENSCDRG00005018921) SOCS1 (ENSCDRG00005018901) TNP2 (ENSCDRG00005018883) ENSCDRG00005018867 PRM1 (ENSCDRG00005018857) RMI2 (ENSCDRG00005018849) ENSCDRG00005018649 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a ##22 Pig MODERN SPECIES 5 MINPP1 (ENSSSCG00000010435) SGMS1 (ENSSSCG00000010433) ENSSSCG00000010432 A1CF (ENSSSCG00000010431) ENSSSCG00000041250 CSTF2T (ENSSSCG00000010430) PRKG1 (ENSSSCG00000010429) DKK1 (ENSSSCG00000010428) MBL2 (ENSSSCG00000010427) ENSSSCG00000053385 ENSSSCG00000010426 ENSSSCG00000043054 ZWINT (ENSSSCG00000027984) ENSSSCG00000048242 ENSSSCG00000044100 ENSSSCG00000056924 ##22 ENSSSCG00000044916 IPMK (ENSSSCG00000040863) ENSSSCG00000035762 UBE2D1 (ENSSSCG00000033323) TFAM (ENSSSCG00000040185) ENSSSCG00000056090 ZNF239 (ENSSSCG00000029576) ZNF32 (ENSSSCG00000010416) ENSSSCG00000039475 ENSSSCG00000047764 ENSSSCG00000056553 ENSSSCG00000057641 CXCL12 (ENSSSCG00000034973) TMEM72 (ENSSSCG00000025787) DEPP1 (ENSSSCG00000022256) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1168 ENSPSMG00000003926 ENSPSMG00000003933 ##22 Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.a ##22 Drill MODERN SPECIES 1126 ENSMLEG00000014910 ENSMLEG00000033959 ENSMLEG00000036869 ##22 TAMM41 (ENSMLEG00000029636) VGLL4 (ENSMLEG00000040172) ATG7 (ENSMLEG00000027353) ENSMLEG00000038712 HRH1 (ENSMLEG00000027693) ENSMLEG00000022044 ENSMLEG00000003255 SLC6A1 (ENSMLEG00000040884) SLC6A11 (ENSMLEG00000026707) ATP2B2 (ENSMLEG00000008003) ENSMLEG00000002470 SEC13 (ENSMLEG00000032755) GHRL (ENSMLEG00000038855) TATDN2 (ENSMLEG00000018747) ENSMLEG00000040143 Sooty mangabey MODERN SPECIES 650 NUP210 (ENSCATG00000035260) IQSEC1 (ENSCATG00000037864) RPL32 (ENSCATG00000038198) CAND2 (ENSCATG00000038720) TMEM40 (ENSCATG00000027847) ENSCATG00000031525 ENSCATG00000001547 ENSCATG00000035852 MKRN2 (ENSCATG00000041591) MKRN2OS (ENSCATG00000040481) TSEN2 (ENSCATG00000031911) PPARG (ENSCATG00000022947) ENSCATG00000017268 TIMP4 (ENSCATG00000034145) SYN2 (ENSCATG00000031791) ENSCATG00000042881 ##22 ENSCATG00000031162 TAMM41 (ENSCATG00000033399) VGLL4 (ENSCATG00000041543) ATG7 (ENSCATG00000034745) HRH1 (ENSCATG00000000316) ENSCATG00000031939 SLC6A1 (ENSCATG00000019250) SLC6A11 (ENSCATG00000032556) ATP2B2 (ENSCATG00000033513) SEC13 (ENSCATG00000032325) GHRL (ENSCATG00000029881) ENSCATG00000038884 TATDN2 (ENSCATG00000035359) IRAK2 (ENSCATG00000034879) VHL (ENSCATG00000036952) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.a ##22 Orangutan MODERN SPECIES HMGN2 (ENSPPYG00000001682) RPS6KA1 (ENSPPYG00000001681) ARID1A (ENSPPYG00000001680) PIGV (ENSPPYG00000001679) ZDHHC18 (ENSPPYG00000001678) SFN (ENSPPYG00000001677) GPN2 (ENSPPYG00000001676) GPATCH3 (ENSPPYG00000001675) NR0B2 (ENSPPYG00000001674) NUDC (ENSPPYG00000001673) KDF1 (ENSPPYG00000001672) TRNP1 (ENSPPYG00000036663) TENT5B (ENSPPYG00000038825) ENSPPYG00000033121 SLC9A1 (ENSPPYG00000001669) ENSPPYG00000017919 ##22 WDTC1 (ENSPPYG00000001668) TMEM222 (ENSPPYG00000001667) SYTL1 (ENSPPYG00000001666) MAP3K6 (ENSPPYG00000001665) FCN3 (ENSPPYG00000001664) CD164L2 (ENSPPYG00000001663) GPR3 (ENSPPYG00000001662) WASF2 (ENSPPYG00000001661) FGR (ENSPPYG00000001659) IFI6 (ENSPPYG00000001658) FAM76A (ENSPPYG00000001656) STX12 (ENSPPYG00000001655) ENSPPYG00000001653 PPP1R8 (ENSPPYG00000001654) THEMIS2 (ENSPPYG00000001652) Tarsier MODERN SPECIES 5556 ENSTSYG00000030323 ENSTSYG00000036865 ##22 RRAGC (ENSTSYG00000005680) ENSTSYG00000005690 RHBDL2 (ENSTSYG00000005696) ENSTSYG00000003345 NDUFS5 (ENSTSYG00000007896) ENSTSYG00000034050 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ##22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 27 RAB2A (ENSCSAG00000014359) CA8 (ENSCSAG00000014368) TOX (ENSCSAG00000014375) ENSCSAG00000014470 ENSCSAG00000014518 CYP7A1 (ENSCSAG00000014532) UBXN2B (ENSCSAG00000014542) FAM110B (ENSCSAG00000018549) ENSCSAG00000018548 BPNT2 (ENSCSAG00000014546) PENK (ENSCSAG00000014552) SDR16C5 (ENSCSAG00000014558) CHCHD7 (ENSCSAG00000014569) PLAG1 (ENSCSAG00000014574) MOS (ENSCSAG00000018547) ENSCSAG00000014589 ##22 RPS20 (ENSCSAG00000014597) LYN (ENSCSAG00000014603) TGS1 (ENSCSAG00000014611) TMEM68 (ENSCSAG00000014625) ENSCSAG00000014632 ENSCSAG00000014645 RP1 (ENSCSAG00000014654) SOX17 (ENSCSAG00000014667) ENSCSAG00000018544 MRPL15 (ENSCSAG00000014671) TCEA1 (ENSCSAG00000014680) RGS20 (ENSCSAG00000014690) ATP6V1H (ENSCSAG00000014698) OPRK1 (ENSCSAG00000014703) NPBWR1 (ENSCSAG00000018542) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155059.f.b ENSGT00940000154502.g.b.a.a ENSGT00940000155762 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000155263.v ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a.a ENSGT00940000155121 ENSGT00390000004881.z ENSGT00940000159123 Macaca ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154502.g.b.a.a ENSGT00940000155762 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00910000147608 ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000155263.v ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a.a ENSGT00940000155121 ENSGT00390000004881.z ENSGT00940000159123 ENSGT00910000147783 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 580 TOX (ENSMNEG00000030315) ENSMNEG00000033392 ENSMNEG00000006454 SDCBP (ENSMNEG00000039350) ENSMNEG00000005216 CYP7A1 (ENSMNEG00000040092) UBXN2B (ENSMNEG00000041477) ENSMNEG00000023891 ENSMNEG00000042237 BPNT2 (ENSMNEG00000030740) PENK (ENSMNEG00000035854) SDR16C5 (ENSMNEG00000032388) CHCHD7 (ENSMNEG00000032713) PLAG1 (ENSMNEG00000037064) MOS (ENSMNEG00000005956) ENSMNEG00000035640 ##22 ENSMNEG00000040485 LYN (ENSMNEG00000041788) TGS1 (ENSMNEG00000023719) TMEM68 (ENSMNEG00000027608) XKR4 (ENSMNEG00000034542) ENSMNEG00000040226 RP1 (ENSMNEG00000029732) ENSMNEG00000008914 SOX17 (ENSMNEG00000034488) MRPL15 (ENSMNEG00000037090) ENSMNEG00000041836 TCEA1 (ENSMNEG00000034707) ENSMNEG00000034313 RGS20 (ENSMNEG00000042031) ENSMNEG00000028306 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155059.f.a.b ENSGT00940000154502.h ENSGT00910000147347 ENSGT00940000155059.f.b ENSGT00940000154502.g.b.a.a ENSGT00940000155762 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a.a ENSGT00940000155121 ENSGT00390000004881.z ENSGT00940000159123 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000159497 ENSGT00910000147347 ENSGT00940000155059.f.b ENSGT00940000154502.g.b.a.a ENSGT00940000155762 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00910000147608 ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a.a ENSGT00940000155121 ENSGT00390000004881.z ENSGT00940000159123 ENSGT00910000147783 Drill MODERN SPECIES 1239 ENSMLEG00000036810 PENK (ENSMLEG00000034631) SDR16C5 (ENSMLEG00000040788) CHCHD7 (ENSMLEG00000030836) PLAG1 (ENSMLEG00000014288) MOS (ENSMLEG00000015500) ENSMLEG00000025668 ##22 ENSMLEG00000032433 LYN (ENSMLEG00000005913) TGS1 (ENSMLEG00000034807) TMEM68 (ENSMLEG00000044358) Sooty mangabey MODERN SPECIES 184 ENSCATG00000034029 SDR16C5 (ENSCATG00000043443) CHCHD7 (ENSCATG00000032939) PLAG1 (ENSCATG00000032765) MOS (ENSCATG00000018631) ENSCATG00000042295 ##22 ENSCATG00000035702 LYN (ENSCATG00000030247) TGS1 (ENSCATG00000035375) TMEM68 (ENSCATG00000040134) XKR4 (ENSCATG00000035909) RP1 (ENSCATG00000036262) ENSCATG00000032680 ENSCATG00000033814 SOX17 (ENSCATG00000032966) MRPL15 (ENSCATG00000029666) LYPLA1 (ENSCATG00000007446) TCEA1 (ENSCATG00000039602) ENSCATG00000029701 RGS20 (ENSCATG00000035536) ATP6V1H (ENSCATG00000036357) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b ##22 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group DUPLICATION Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154828.k.a ENSGT00900000141068.m.a.a ENSGT00850000132411 ENSGT00390000014160 ENSGT00390000018225.B ENSGT01050000244841.B.b ENSGT00940000158982 ENSGT00390000016407 ENSGT00390000004985.a ENSGT00940000156031 ENSGT00940000158953 ENSGT00390000006564 ENSGT00610000086112 ENSGT00940000164293 ENSGT00530000063907.c ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000157876 ENSGT00940000155411.c ENSGT00910000146984 ENSGT00390000007473.h ENSGT00940000154880 ENSGT00940000158711 ENSGT00940000164875 ENSGT00390000017819 ENSGT00940000157995 ENSGT00940000157492.b ENSGT00390000000672.a.b.e.a ENSGT00390000008634 ENSGT00940000155846 ENSGT00390000018086.n.a.a ENSGT00390000018509.a.n.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154828.k.a ENSGT00900000141068.m.a.a ENSGT00850000132411 ENSGT00390000014160 ENSGT00390000018225.B ENSGT01050000244841.B.b ENSGT00940000158982 ENSGT00390000016407 ENSGT00390000004985.a ENSGT00940000156031 ENSGT00940000158953 ENSGT00390000006564 ENSGT00610000086112 ENSGT00940000164293 ENSGT00530000063907.c ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000157876 ENSGT00940000155411.c ENSGT00910000146984 ENSGT00940000154880 ENSGT00940000158711 ENSGT00940000164875 ENSGT00390000017819 ENSGT00940000157995 ENSGT00940000157492.b ENSGT00390000000672.a.b.e.a ENSGT00390000008634 ENSGT00940000155846 ENSGT00390000018086.n.a.a ENSGT00390000018509.a.n.b ENSGT00390000018086.n.b Pan ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000154828.k.a ENSGT00900000141068.m.a.a ENSGT00850000132411 ENSGT00390000014160 ENSGT00390000018225.B ENSGT01050000244841.B.b ENSGT00940000158982 ENSGT00390000016407 ENSGT00390000004985.a ENSGT00940000156031 ENSGT00940000158953 ENSGT00390000006564 ENSGT00610000086112 ENSGT00530000063907.c ENSGT00940000164293 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000157876 ENSGT00940000155411.c ENSGT00910000146984 ENSGT00940000154880 ENSGT00940000154276.hb.a.e.b.b ENSGT00940000158711 ENSGT00940000164875 ENSGT00390000017819 ENSGT00940000157995 ENSGT00940000157492.b ENSGT00390000000672.a.b.e.a ENSGT00390000008634 ENSGT00940000155846 ENSGT00390000018086.n.a.a ENSGT00390000018509.a.n.b Chimpanzee MODERN SPECIES 18 PCSK1 (ENSPTRG00000017091) ELL2 (ENSPTRG00000017090) GLRX (ENSPTRG00000044246) RHOBTB3 (ENSPTRG00000017087) SPATA9 (ENSPTRG00000017086) RFESD (ENSPTRG00000017085) GPR150 (ENSPTRG00000028773) ARSK (ENSPTRG00000017084) SKIC3 (ENSPTRG00000017083) FAM81B (ENSPTRG00000017082) MCTP1 (ENSPTRG00000017081) SLF1 (ENSPTRG00000017079) ENSPTRG00000051147 KIAA0825 (ENSPTRG00000023210) FAM172A (ENSPTRG00000017074) ENSPTRG00000046378 ##22 NR2F1 (ENSPTRG00000017073) ARRDC3 (ENSPTRG00000017072) ENSPTRG00000052572 ADGRV1 (ENSPTRG00000017070) ENSPTRG00000052859 LYSMD3 (ENSPTRG00000017069) POLR3G (ENSPTRG00000017068) MBLAC2 (ENSPTRG00000017067) CETN3 (ENSPTRG00000017066) MEF2C (ENSPTRG00000024214) TMEM161B (ENSPTRG00000017064) CCNH (ENSPTRG00000017063) RASA1 (ENSPTRG00000017062) COX7C (ENSPTRG00000048661) ENSPTRG00000001027 Gorilla MODERN SPECIES 18 PCSK1 (ENSGGOG00000006986) ENSGGOG00000040980 ELL2 (ENSGGOG00000000216) GLRX (ENSGGOG00000009175) RHOBTB3 (ENSGGOG00000004327) ENSGGOG00000015939 RFESD (ENSGGOG00000036207) GPR150 (ENSGGOG00000002380) ARSK (ENSGGOG00000005782) SKIC3 (ENSGGOG00000025709) FAM81B (ENSGGOG00000013826) MCTP1 (ENSGGOG00000015178) ENSGGOG00000042071 SLF1 (ENSGGOG00000014178) KIAA0825 (ENSGGOG00000003363) ENSGGOG00000027925 ##22 FAM172A (ENSGGOG00000010296) ENSGGOG00000011470 ENSGGOG00000024153 ENSGGOG00000043080 ARRDC3 (ENSGGOG00000004294) ENSGGOG00000025546 ENSGGOG00000043133 ADGRV1 (ENSGGOG00000010968) LYSMD3 (ENSGGOG00000043192) POLR3G (ENSGGOG00000000266) MBLAC2 (ENSGGOG00000002845) CETN3 (ENSGGOG00000009598) MEF2C (ENSGGOG00000002856) TMEM161B (ENSGGOG00000005684) CCNH (ENSGGOG00000005172) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Chimpanzee MODERN SPECIES 7 CDH11 (ENSPTRG00000008189) ENSPTRG00000048094 CDH8 (ENSPTRG00000008186) ENSPTRG00000023227 ENSPTRG00000049649 ENSPTRG00000045841 ENSPTRG00000044393 GOT2 (ENSPTRG00000008185) ENSPTRG00000047982 SLC38A7 (ENSPTRG00000008184) CNOT1 (ENSPTRG00000008183) SETD6 (ENSPTRG00000008182) NDRG4 (ENSPTRG00000008181) GINS3 (ENSPTRG00000008179) PRSS54 (ENSPTRG00000008178) ENSPTRG00000034281 ##22 CCDC113 (ENSPTRG00000008176) CSNK2A2 (ENSPTRG00000008175) CFAP20 (ENSPTRG00000008174) ENSPTRG00000044572 MMP15 (ENSPTRG00000008173) USB1 (ENSPTRG00000008172) ZNF319 (ENSPTRG00000031195) ENSPTRG00000008170 CNGB1 (ENSPTRG00000008169) ENSPTRG00000008168 KIFC3 (ENSPTRG00000008167) KATNB1 (ENSPTRG00000008166) DRC7 (ENSPTRG00000008165) ADGRG3 (ENSPTRG00000008164) ADGRG1 (ENSPTRG00000031199) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.a ##22 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 990 SLC4A10 (ENSRROG00000035249) DPP4 (ENSRROG00000044466) GCG (ENSRROG00000040389) ENSRROG00000041536 ##22 FAP (ENSRROG00000037166) IFIH1 (ENSRROG00000030959) GCA (ENSRROG00000032090) ENSRROG00000021640 KCNH7 (ENSRROG00000042455) ENSRROG00000013338 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1008 ZNF736 (ENSRROG00000035774) ZNF679 (ENSRROG00000032274) ENSRROG00000029111 ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.b ##22 Gibbon MODERN SPECIES 8 MYOZ1 (ENSNLEG00000016715) USP54 (ENSNLEG00000016705) ENSNLEG00000029785 MSS51 (ENSNLEG00000016690) ENSNLEG00000034377 ANXA7 (ENSNLEG00000016635) CFAP70 (ENSNLEG00000016601) ENSNLEG00000016597 ENSNLEG00000016596 DNAJC9 (ENSNLEG00000016595) FAM149B1 (ENSNLEG00000016575) ECD (ENSNLEG00000016547) NUDT13 (ENSNLEG00000016526) P4HA1 (ENSNLEG00000035416) PLA2G12B (ENSNLEG00000016502) ENSNLEG00000016500 ##22 OIT3 (ENSNLEG00000016468) MCU (ENSNLEG00000016456) ENSNLEG00000030767 MICU1 (ENSNLEG00000016433) DNAJB12 (ENSNLEG00000016428) DDIT4 (ENSNLEG00000016416) ANAPC16 (ENSNLEG00000016411) ASCC1 (ENSNLEG00000016392) SPOCK2 (ENSNLEG00000016379) CHST3 (ENSNLEG00000016376) PSAP (ENSNLEG00000016317) VSIR (ENSNLEG00000032028) CDH23 (ENSNLEG00000016188) SLC29A3 (ENSNLEG00000016293) UNC5B (ENSNLEG00000016277) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.a.b ##22 Gorilla MODERN SPECIES 1 MYOZ1 (ENSGGOG00000024324) USP54 (ENSGGOG00000011382) PPP3CB (ENSGGOG00000007556) MSS51 (ENSGGOG00000022616) ANXA7 (ENSGGOG00000004451) CFAP70 (ENSGGOG00000015060) ENSGGOG00000015052 MRPS16 (ENSGGOG00000015055) DNAJC9 (ENSGGOG00000015046) FAM149B1 (ENSGGOG00000015033) ENSGGOG00000039184 ECD (ENSGGOG00000016428) P4HA1 (ENSGGOG00000015551) PLA2G12B (ENSGGOG00000012772) OIT3 (ENSGGOG00000012768) ENSGGOG00000026297 ##22 ENSGGOG00000023366 MICU1 (ENSGGOG00000004841) ENSGGOG00000024986 DNAJB12 (ENSGGOG00000000683) DDIT4 (ENSGGOG00000002759) ENSGGOG00000007567 ASCC1 (ENSGGOG00000007559) SPOCK2 (ENSGGOG00000023784) ENSGGOG00000036638 CHST3 (ENSGGOG00000043006) PSAP (ENSGGOG00000008433) CDH23 (ENSGGOG00000008379) VSIR (ENSGGOG00000008426) C10orf105 (ENSGGOG00000037482) SLC29A3 (ENSGGOG00000000803) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.b ##22 Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 6 BPNT2 (ENSNLEG00000001322) UBXN2B (ENSNLEG00000033129) ENSNLEG00000034722 CYP7A1 (ENSNLEG00000001373) SDCBP (ENSNLEG00000001408) NSMAF (ENSNLEG00000001542) ENSNLEG00000032927 ENSNLEG00000035613 TOX (ENSNLEG00000001791) CA8 (ENSNLEG00000001830) ENSNLEG00000029912 RAB2A (ENSNLEG00000036148) CHD7 (ENSNLEG00000002027) ENSNLEG00000033557 ENSNLEG00000035467 ENSNLEG00000033932 ##22 ENSNLEG00000002143 CLVS1 (ENSNLEG00000002146) ASPH (ENSNLEG00000002208) ERICH5 (ENSNLEG00000002460) RIDA (ENSNLEG00000027254) POP1 (ENSNLEG00000002541) NIPAL2 (ENSNLEG00000002626) ENSNLEG00000030963 STK3 (ENSNLEG00000002668) ENSNLEG00000027654 ENSNLEG00000002725 ENSNLEG00000002742 ENSNLEG00000029708 COX6C (ENSNLEG00000002864) RGS22 (ENSNLEG00000002877) Gibbon MODERN SPECIES 7 BMPER (ENSNLEG00000015455) NPSR1 (ENSNLEG00000015478) DPY19L1 (ENSNLEG00000015491) DPY19L2 (ENSNLEG00000015504) TBX20 (ENSNLEG00000001606) ENSNLEG00000033578 ENSNLEG00000029677 ENSNLEG00000026926 HERPUD2 (ENSNLEG00000001647) SEPTIN7 (ENSNLEG00000001673) ENSNLEG00000001924 EEPD1 (ENSNLEG00000001926) MATCAP2 (ENSNLEG00000001964) ANLN (ENSNLEG00000001988) ENSNLEG00000002212 ENSNLEG00000033081 ##22 ELMO1 (ENSNLEG00000002372) ENSNLEG00000033801 NME8 (ENSNLEG00000002555) SFRP4 (ENSNLEG00000034263) EPDR1 (ENSNLEG00000029788) STARD3NL (ENSNLEG00000034855) ENSNLEG00000030988 ENSNLEG00000029674 ENSNLEG00000030425 ENSNLEG00000028134 ENSNLEG00000027199 AMPH (ENSNLEG00000002797) VPS41 (ENSNLEG00000002939) POU6F2 (ENSNLEG00000003036) ENSNLEG00000029534 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.b ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2166 ENSRROG00000035590 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00500000044938 ENSGT00920000149095.b ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.b.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000155352 ENSGT00640000091574 ENSGT00950000182839.A.c ENSGT00940000158251 ENSGT00940000162858 ENSGT00940000163725 ENSGT00940000157277 ENSGT00940000156144 ENSGT00530000063745.b ENSGT00390000006546 ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b ENSGT00940000157479 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000153222.a.a ENSGT00950000182959.a.a ENSGT00950000182959.a.b.b.a ENSGT00940000159215 ENSGT00940000160698 ENSGT00940000156120.a ENSGT00940000161627.a.a.a.a.b.a.a.b.a.a.a.a.a.a.a.b.a.a.b.a.b.c.b ENSGT00390000000406 ENSGT00940000155394 ENSGT00950000183030.m.a.a.b.b.a.b.a ENSGT00940000158014 ENSGT00940000161627.a.a.a.a.b.a.a.a.b.c.a.a.a.b ENSGT01050000245239.a.a ENSGT00940000157713 ENSGT00940000154980 Rhesus MODERN SPECIES 2 ENSMMUG00000037648 ENSMMUG00000052077 LRRIQ1 (ENSMMUG00000016535) TSPAN19 (ENSMMUG00000042255) SLC6A15 (ENSMMUG00000013650) ENSMMUG00000058294 ENSMMUG00000043159 TMTC2 (ENSMMUG00000011305) ENSMMUG00000059068 METTL25 (ENSMMUG00000002514) CCDC59 (ENSMMUG00000063005) ENSMMUG00000050266 PPFIA2 (ENSMMUG00000013804) ENSMMUG00000046323 ACSS3 (ENSMMUG00000013800) ENSMMUG00000017463 ##22 LIN7A (ENSMMUG00000011671) MYF5 (ENSMMUG00000011669) MYF6 (ENSMMUG00000011667) PTPRQ (ENSMMUG00000037711) OTOGL (ENSMMUG00000000121) PPP1R12A (ENSMMUG00000019214) ENSMMUG00000053591 PAWR (ENSMMUG00000015179) SYT1 (ENSMMUG00000005530) ENSMMUG00000060137 ENSMMUG00000051304 ENSMMUG00000058640 NAV3 (ENSMMUG00000021329) ENSMMUG00000060140 ENSMMUG00000055171 Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES 18 ENSMFAG00000000112 ENSMFAG00000039679 ENSMFAG00000048811 SLC30A8 (ENSMFAG00000047830) AARD (ENSMFAG00000036725) RAD21 (ENSMFAG00000032636) UTP23 (ENSMFAG00000003374) EIF3H (ENSMFAG00000004699) ENSMFAG00000063107 ENSMFAG00000047786 TRPS1 (ENSMFAG00000036446) ENSMFAG00000059169 ENSMFAG00000049159 ENSMFAG00000010713 CSMD3 (ENSMFAG00000032839) ENSMFAG00000044195 ##22 ENSMFAG00000061084 KCNV1 (ENSMFAG00000037130) SYBU (ENSMFAG00000037775) EBAG9 (ENSMFAG00000000766) PKHD1L1 (ENSMFAG00000035938) ENY2 (ENSMFAG00000044548) NUDCD1 (ENSMFAG00000043118) TRHR (ENSMFAG00000031071) TMEM74 (ENSMFAG00000030150) ENSMFAG00000059409 ENSMFAG00000057800 EMC2 (ENSMFAG00000045969) EIF3E (ENSMFAG00000035456) RSPO2 (ENSMFAG00000031789) ENSMFAG00000044812 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 2 SLC6A15 (ENSMFAG00000003556) ENSMFAG00000031125 ENSMFAG00000047900 ENSMFAG00000047713 ENSMFAG00000060580 ENSMFAG00000051138 ENSMFAG00000053756 TMTC2 (ENSMFAG00000038030) ENSMFAG00000052001 ENSMFAG00000051090 METTL25 (ENSMFAG00000036420) CCDC59 (ENSMFAG00000034303) ENSMFAG00000049838 PPFIA2 (ENSMFAG00000031204) ACSS3 (ENSMFAG00000040344) ENSMFAG00000031214 ##22 LIN7A (ENSMFAG00000040160) MYF5 (ENSMFAG00000042044) MYF6 (ENSMFAG00000033881) ENSMFAG00000058049 ENSMFAG00000052094 PTPRQ (ENSMFAG00000044210) OTOGL (ENSMFAG00000031786) PPP1R12A (ENSMFAG00000034239) ENSMFAG00000049694 ENSMFAG00000063729 PAWR (ENSMFAG00000062333) ENSMFAG00000050054 SYT1 (ENSMFAG00000003495) ENSMFAG00000000157 ENSMFAG00000034379 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.b ##22 Olive baboon MODERN SPECIES SLC30A10 (ENSPANG00000019211) ENSPANG00000042545 LYPLAL1 (ENSPANG00000014635) TGFB2 (ENSPANG00000017620) RRP15 (ENSPANG00000016573) ENSPANG00000045253 SPATA17 (ENSPANG00000012134) GPATCH2 (ENSPANG00000020943) ENSPANG00000040866 ESRRG (ENSPANG00000014193) USH2A (ENSPANG00000010480) ENSPANG00000020677 KCTD3 (ENSPANG00000016718) ENSPANG00000039006 KCNK2 (ENSPANG00000010636) ENSPANG00000007591 ##22 CENPF (ENSPANG00000002386) PTPN14 (ENSPANG00000003305) SMYD2 (ENSPANG00000013753) PROX1 (ENSPANG00000017714) RPS6KC1 (ENSPANG00000017815) ANGEL2 (ENSPANG00000024020) VASH2 (ENSPANG00000008486) ENSPANG00000040581 FLVCR1 (ENSPANG00000015223) SPATA45 (ENSPANG00000003460) TATDN3 (ENSPANG00000026097) NSL1 (ENSPANG00000021442) ENSPANG00000037410 ENSPANG00000044876 BATF3 (ENSPANG00000046484) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b.b ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 474 MN1 (ENSCATG00000011740) ENSCATG00000013017 ENSCATG00000020760 CRYBA4 (ENSCATG00000015206) CRYBB1 (ENSCATG00000044761) TPST2 (ENSCATG00000041997) TFIP11 (ENSCATG00000040954) SRRD (ENSCATG00000032586) HPS4 (ENSCATG00000044526) ASPHD2 (ENSCATG00000027082) SEZ6L (ENSCATG00000034410) MYO18B (ENSCATG00000043606) ENSCATG00000030608 GRK3 (ENSCATG00000036335) PIWIL3 (ENSCATG00000044030) ENSCATG00000041646 ##22 SGSM1 (ENSCATG00000002153) LHFPL7 (ENSCATG00000044808) KIAA1671 (ENSCATG00000043893) CRYBB3 (ENSCATG00000041743) CRYBB2 (ENSCATG00000040020) ENSCATG00000030029 ENSCATG00000014595 DRICH1 (ENSCATG00000037304) ENSCATG00000035022 ENSCATG00000013082 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 966 PDE6A (ENSANAG00000035251) PPARGC1B (ENSANAG00000021830) ARHGEF37 (ENSANAG00000025504) CSNK1A1 (ENSANAG00000021098) IL17B (ENSANAG00000020790) PCYOX1L (ENSANAG00000020560) GRPEL2 (ENSANAG00000030295) AFAP1L1 (ENSANAG00000024427) ABLIM3 (ENSANAG00000036878) ENSANAG00000026413 SH3TC2 (ENSANAG00000019462) ADRB2 (ENSANAG00000025525) HTR4 (ENSANAG00000016946) FBXO38 (ENSANAG00000025070) SPINK9 (ENSANAG00000017436) ENSANAG00000037965 ##22 SPINK7 (ENSANAG00000024041) SPINK13 (ENSANAG00000024157) MARCOL (ENSANAG00000026951) SPINK6 (ENSANAG00000037160) SPINK14 (ENSANAG00000029562) SPINK5 (ENSANAG00000034759) C5orf46 (ENSANAG00000037273) SCGB3A2 (ENSANAG00000023468) SPINK1 (ENSANAG00000023762) JAKMIP2 (ENSANAG00000023224) DPYSL3 (ENSANAG00000021603) STK32A (ENSANAG00000026412) PPP2R2B (ENSANAG00000034965) TCERG1 (ENSANAG00000028973) POU4F3 (ENSANAG00000037628) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 79 CR1L (ENSSBOG00000022625) CD46 (ENSSBOG00000019001) CD34 (ENSSBOG00000030347) ENSSBOG00000036095 PLXNA2 (ENSSBOG00000033258) CAMK1G (ENSSBOG00000027000) LAMB3 (ENSSBOG00000031511) HSD11B1 (ENSSBOG00000035190) ENSSBOG00000012130 TRAF3IP3 (ENSSBOG00000021891) IRF6 (ENSSBOG00000003627) UTP25 (ENSSBOG00000022281) SYT14 (ENSSBOG00000029111) ENSSBOG00000026801 SERTAD4 (ENSSBOG00000035607) ENSSBOG00000026679 ##22 ENSSBOG00000020597 HHAT (ENSSBOG00000035340) ENSSBOG00000020043 KCNH1 (ENSSBOG00000032494) ENSSBOG00000035382 RCOR3 (ENSSBOG00000015131) TRAF5 (ENSSBOG00000027194) ENSSBOG00000020190 RD3 (ENSSBOG00000034844) SLC30A1 (ENSSBOG00000023733) NEK2 (ENSSBOG00000034232) LPGAT1 (ENSSBOG00000034328) INTS7 (ENSSBOG00000023687) DTL (ENSSBOG00000020769) PPP2R5A (ENSSBOG00000031243) Capuchin MODERN SPECIES 19 ENSCCAG00000028933 ##22 TJP1 (ENSCCAG00000036081) TARS3 (ENSCCAG00000030068) TM2D3 (ENSCCAG00000033979) PCSK6 (ENSCCAG00000029734) ENSCCAG00000023765 SELENOS (ENSCCAG00000025586) CHSY1 (ENSCCAG00000030422) LRRK1 (ENSCCAG00000030657) ALDH1A3 (ENSCCAG00000028268) ASB7 (ENSCCAG00000029646) LINS1 (ENSCCAG00000029271) CERS3 (ENSCCAG00000020766) ADAMTS17 (ENSCCAG00000037999) LYSMD4 (ENSCCAG00000022661) ENSCCAG00000027834 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 486 Abhd14b (ENSNGAG00000003301) Pcbp4 (ENSNGAG00000013148) Gpr62 (ENSNGAG00000009612) Parp3 (ENSNGAG00000020533) Rrp9 (ENSNGAG00000013829) ENSNGAG00000012471 Iqcf5 (ENSNGAG00000009687) Iqcf4 (ENSNGAG00000019517) Iqcf6 (ENSNGAG00000014367) Grm2 (ENSNGAG00000015786) Tex264 (ENSNGAG00000002134) Rad54l2 (ENSNGAG00000015629) Dcaf1 (ENSNGAG00000001189) Rbm15b (ENSNGAG00000022552) Manf (ENSNGAG00000022322) ENSNGAG00000016711 ##22 Dock3 (ENSNGAG00000015516) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 660 Or52p2 (ENSMAUG00000009179) Or52k2 (ENSMAUG00000009485) Or52m1 (ENSMAUG00000009101) Trim68 (ENSMAUG00000018554) Or51e1 (ENSMAUG00000009042) Or51e2 (ENSMAUG00000009277) Or51f23b (ENSMAUG00000014505) ENSMAUG00000013317 Or51a8 (ENSMAUG00000007141) Or51s1 (ENSMAUG00000009534) Or51h5 (ENSMAUG00000009385) ENSMAUG00000006993 Or51g2 (ENSMAUG00000009242) Or51p1 (ENSMAUG00000009617) ENSMAUG00000009285 ENSMAUG00000005696 ##22 ENSMAUG00000009408 ENSMAUG00000009596 Or52ad1 (ENSMAUG00000012138) Or51l14 (ENSMAUG00000009512) Or52d13 (ENSMAUG00000009427) Or51ah3 (ENSMAUG00000009326) ENSMAUG00000020614 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 119 Crym (ENSJJAG00000019186) Anks4b (ENSJJAG00000014568) Zp2 (ENSJJAG00000017256) ENSJJAG00000015777 ##22 Tmem159 (ENSJJAG00000012610) Dnah3 (ENSJJAG00000012577) Lyrm1 (ENSJJAG00000003698) ENSJJAG00000000306 Rexo5 (ENSJJAG00000023821) ENSJJAG00000022292 Acsm3 (ENSJJAG00000017815) ENSJJAG00000017307 Acsm4 (ENSJJAG00000015189) Acsm1 (ENSJJAG00000013667) Acsm5 (ENSJJAG00000018424) Pdilt (ENSJJAG00000017573) Umod (ENSJJAG00000015950) ENSJJAG00000015644 Gpr139 (ENSJJAG00000014655) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 7 ENSHGLG00000033306 ENSHGLG00000020572 ENSHGLG00000007397 ENSHGLG00000019942 ENSHGLG00000040270 ENSHGLG00000036098 ENSHGLG00000003675 ENSHGLG00000003890 ENSHGLG00000011908 ENSHGLG00000000095 ENSHGLG00000040982 ENSHGLG00000041373 MYO10 (ENSHGLG00000006481) RETREG1 (ENSHGLG00000033002) ZNF622 (ENSHGLG00000040123) ENSHGLG00000042572 ##22 ENSHGLG00000047002 ENSHGLG00000005413 FBXL7 (ENSHGLG00000039624) ENSHGLG00000049744 ANKH (ENSHGLG00000009005) OTULIN (ENSHGLG00000008326) ENSHGLG00000040674 OTULINL (ENSHGLG00000007364) ENSHGLG00000004346 ENSHGLG00000004104 ENSHGLG00000034661 ENSHGLG00000017230 ENSHGLG00000034637 ENSHGLG00000032946 ENSHGLG00000007547 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Alpin marmot DUPLICATION Alpin marmot DUPLICATION Alpin marmot MODERN SPECIES PCSK1 (ENSMMMG00000005758) CAST (ENSMMMG00000005793) ERAP1 (ENSMMMG00000005931) ERAP2 (ENSMMMG00000006028) LNPEP (ENSMMMG00000007455) LIX1 (ENSMMMG00000007525) RIOK2 (ENSMMMG00000007539) ENSMMMG00000007554 ENSMMMG00000007586 ENSMMMG00000007613 CHD1 (ENSMMMG00000007643) ENSMMMG00000007722 ST8SIA4 (ENSMMMG00000007750) SLCO4C1 (ENSMMMG00000007769) ENSMMMG00000007789 ENSMMMG00000007805 ##22 PAM (ENSMMMG00000007816) GIN1 (ENSMMMG00000007965) PPIP5K2 (ENSMMMG00000008005) MACIR (ENSMMMG00000008109) ENSMMMG00000008182 NUDT12 (ENSMMMG00000008194) ENSMMMG00000008229 EFNA5 (ENSMMMG00000008246) ENSMMMG00000008309 FER (ENSMMMG00000008367) PJA2 (ENSMMMG00000008527) ENSMMMG00000008614 MAN2A1 (ENSMMMG00000008653) TMEM232 (ENSMMMG00000008697) SLC25A46 (ENSMMMG00000008723) Alpin marmot MODERN SPECIES 44 ENSMMMG00000004346 IFT80 (ENSMMMG00000004265) SMC4 (ENSMMMG00000004167) TRIM59 (ENSMMMG00000004153) KPNA4 (ENSMMMG00000004101) ARL14 (ENSMMMG00000004089) PPM1L (ENSMMMG00000004080) B3GALNT1 (ENSMMMG00000004076) ENSMMMG00000004072 CDH12 (ENSMMMG00000004013) CDH10 (ENSMMMG00000003979) CDH9 (ENSMMMG00000003936) ENSMMMG00000003838 ##22 ENSMMMG00000003830 CDH6 (ENSMMMG00000003788) DROSHA (ENSMMMG00000003703) C5orf22 (ENSMMMG00000003684) ENSMMMG00000003675 ENSMMMG00000003660 GOLPH3 (ENSMMMG00000003651) MTMR12 (ENSMMMG00000003611) ZFR (ENSMMMG00000003574) SUB1 (ENSMMMG00000003560) NPR3 (ENSMMMG00000003513) TARS1 (ENSMMMG00000003465) ADAMTS12 (ENSMMMG00000003395) ENSMMMG00000003385 ENSMMMG00000003382 Alpin marmot MODERN SPECIES 51 AGR3 (ENSMMMG00000015096) AGR2 (ENSMMMG00000015076) TSPAN13 (ENSMMMG00000015067) BZW2 (ENSMMMG00000015053) ANKMY2 (ENSMMMG00000015031) ENSMMMG00000015026 ENSMMMG00000015021 SOSTDC1 (ENSMMMG00000015016) ENSMMMG00000015015 CRPPA (ENSMMMG00000014965) MEOX2 (ENSMMMG00000014951) AGMO (ENSMMMG00000014935) DGKB (ENSMMMG00000014873) ENSMMMG00000014863 ETV1 (ENSMMMG00000014020) ENSMMMG00000013997 ##22 ARL4A (ENSMMMG00000013991) SCIN (ENSMMMG00000013945) LSMEM1 (ENSMMMG00000013941) IFRD1 (ENSMMMG00000013925) ZNF277 (ENSMMMG00000013906) DOCK4 (ENSMMMG00000013747) LRRN3 (ENSMMMG00000013726) IMMP2L (ENSMMMG00000013704) DNAJB9 (ENSMMMG00000013686) THAP5 (ENSMMMG00000013685) PNPLA8 (ENSMMMG00000013634) NRCAM (ENSMMMG00000013544) ENSMMMG00000013532 ELAPOR2 (ENSMMMG00000013464) GRM3 (ENSMMMG00000013459) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Squirrel MODERN SPECIES 111 ENSSTOG00000028945 KLHL1 (ENSSTOG00000000273) DACH1 (ENSSTOG00000027522) ENSSTOG00000030928 ENSSTOG00000034713 BORA (ENSSTOG00000011919) DIS3 (ENSSTOG00000000311) ENSSTOG00000029788 ##22 ENSSTOG00000032909 PIBF1 (ENSSTOG00000000315) KLF5 (ENSSTOG00000024009) KLF12 (ENSSTOG00000022810) TBC1D4 (ENSSTOG00000005610) COMMD6 (ENSSTOG00000023782) UCHL3 (ENSSTOG00000013054) ENSSTOG00000013061 KCTD12 (ENSSTOG00000029073) ACOD1 (ENSSTOG00000023728) CLN5 (ENSSTOG00000028565) FBXL3 (ENSSTOG00000002591) MYCBP2 (ENSSTOG00000010696) SCEL (ENSSTOG00000008526) SLAIN1 (ENSSTOG00000011095) Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 PFDN5 (ENSSVLG00005023667) ESPL1 (ENSSVLG00005023501) MFSD5 (ENSSVLG00005023473) ENSSVLG00005023458 RARG (ENSSVLG00005023407) ITGB7 (ENSSVLG00005023259) ZNF740 (ENSSVLG00005023231) CSAD (ENSSVLG00005023137) SOAT2 (ENSSVLG00005023026) ENSSVLG00005023005 ENSSVLG00005022985 SPRYD3 (ENSSVLG00005022945) TNS2 (ENSSVLG00005022041) ENSSVLG00005021941 ENSSVLG00005021660 ENSSVLG00005021603 ##22 KRT18 (ENSSVLG00005021499) ENSSVLG00005021348 KRT78 (ENSSVLG00005021137) KRT79 (ENSSVLG00005021030) KRT4 (ENSSVLG00005020931) KRT3 (ENSSVLG00005020835) KRT77 (ENSSVLG00005020691) KRT1 (ENSSVLG00005020586) KRT2 (ENSSVLG00005020442) KRT73 (ENSSVLG00005020348) KRT72 (ENSSVLG00005020141) KRT74 (ENSSVLG00005019935) KRT71 (ENSSVLG00005019831) KRT5 (ENSSVLG00005019726) ENSSVLG00005019632 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 10 CHST13 (ENSSVLG00005018700) ENSSVLG00005018790 C3orf22 (ENSSVLG00005018804) ENSSVLG00005018846 ENSSVLG00005018882 ENSSVLG00005018911 ENSSVLG00005018957 ENSSVLG00005019062 ENSSVLG00005019156 ENSSVLG00005019218 ENSSVLG00005019247 ENSSVLG00005019319 ENSSVLG00005019357 ENSSVLG00005019418 ENSSVLG00005019453 ENSSVLG00005019512 ##22 ENSSVLG00005019581 ENSSVLG00005019649 ENSSVLG00005019723 ENSSVLG00005019757 ENSSVLG00005019823 ENSSVLG00005019882 ENSSVLG00005019920 ENSSVLG00005019961 ENSSVLG00005020003 CHCHD4 (ENSSVLG00005020063) TMEM43 (ENSSVLG00005020105) XPC (ENSSVLG00005020171) LSM3 (ENSSVLG00005020441) SLC6A6 (ENSSVLG00005020466) GRIP2 (ENSSVLG00005020528) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 NLE1 (ENSSVLG00005012107) FNDC8 (ENSSVLG00005012462) RAD51D (ENSSVLG00005012550) RFFL (ENSSVLG00005012713) LIG3 (ENSSVLG00005012872) ZNF830 (ENSSVLG00005012926) CCT6B (ENSSVLG00005012972) TMEM132E (ENSSVLG00005013218) CCL1 (ENSSVLG00005013323) CCL7 (ENSSVLG00005013388) CCL11 (ENSSVLG00005013421) ENSSVLG00005005526 ENSSVLG00005005549 ENSSVLG00005005588 ENSSVLG00005005625 ENSSVLG00005005651 ##22 ENSSVLG00005005663 ENSSVLG00005005684 MAP2K3 (ENSSVLG00005005697) NATD1 (ENSSVLG00005005732) TMEM11 (ENSSVLG00005005759) DHRS7B (ENSSVLG00005005782) USP22 (ENSSVLG00005005846) TNFRSF13B (ENSSVLG00005005879) ENSSVLG00005005949 PLD6 (ENSSVLG00005005993) ENSSVLG00005006020 COPS3 (ENSSVLG00005006098) ENSSVLG00005006151 NT5M (ENSSVLG00005006183) MED9 (ENSSVLG00005006210) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 346 ARL5A (ENSMMSG00000016042) NEB (ENSMMSG00000016236) RIF1 (ENSMMSG00000017985) TNFAIP6 (ENSMMSG00000018393) NMI (ENSMMSG00000018423) RBM43 (ENSMMSG00000018455) ENSMMSG00000018486 RND3 (ENSMMSG00000018506) MMADHC (ENSMMSG00000018547) LYPD6 (ENSMMSG00000018611) LYPD6B (ENSMMSG00000018636) KIF5C (ENSMMSG00000018662) EPC2 (ENSMMSG00000018790) ENSMMSG00000018886 MBD5 (ENSMMSG00000019026) ENSMMSG00000019093 ##22 ORC4 (ENSMMSG00000019167) ACVR2A (ENSMMSG00000019227) ENSMMSG00000019266 ENSMMSG00000019276 ENSMMSG00000019314 ZEB2 (ENSMMSG00000019357) ENSMMSG00000019525 GTDC1 (ENSMMSG00000019550) ARHGAP15 (ENSMMSG00000019673) KYNU (ENSMMSG00000019754) ENSMMSG00000019836 LRP1B (ENSMMSG00000019882) ENSMMSG00000020194 ENSMMSG00000020212 ENSMMSG00000020234 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Blue whale MODERN SPECIES 15 CAMK2N2 (ENSBMSG00010007339) ECE2 (ENSBMSG00010007367) PSMD2 (ENSBMSG00010007497) EIF4G1 (ENSBMSG00010007584) FAM131A (ENSBMSG00010007712) CLCN2 (ENSBMSG00010007788) POLR2H (ENSBMSG00010008055) THPO (ENSBMSG00010008075) CHRD (ENSBMSG00010008137) EPHB3 (ENSBMSG00010008212) VPS8 (ENSBMSG00010008275) C3orf70 (ENSBMSG00010008341) EHHADH (ENSBMSG00010008354) ENSBMSG00010008372 MAP3K13 (ENSBMSG00010008402) ENSBMSG00010008447 ##22 ENSBMSG00010008466 LIPH (ENSBMSG00010008483) SENP2 (ENSBMSG00010008506) IGF2BP2 (ENSBMSG00010008535) ENSBMSG00010008576 ETV5 (ENSBMSG00010008599) DGKG (ENSBMSG00010008655) ENSBMSG00010008736 TBCCD1 (ENSBMSG00010008761) DNAJB11 (ENSBMSG00010008785) AHSG (ENSBMSG00010008864) FETUB (ENSBMSG00010008904) ENSBMSG00010008942 KNG1 (ENSBMSG00010008972) ENSBMSG00010009019 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Beluga whale MODERN SPECIES 33 WWC1 (ENSDLEG00000012345) RARS (ENSDLEG00000012297) FBLL1 (ENSDLEG00000012282) #7 PANK3 (ENSDLEG00000012248) #8 SLIT3 (ENSDLEG00000012172) #9 SPDL1 (ENSDLEG00000012152) #10 FAM196B (ENSDLEG00000012141) #11 DOCK2 (ENSDLEG00000012052) #12 FOXI1 (ENSDLEG00000012032) #13 LCP2 (ENSDLEG00000011962) #15 KCNMB1 (ENSDLEG00000011951) #16 KCNIP1 (ENSDLEG00000011937) #18 GABRP (ENSDLEG00000011916) #19 RANBP17 (ENSDLEG00000011734) #20 TLX3 (ENSDLEG00000011715) #21 ENSDLEG00000011597 ##22 FGF18 (ENSDLEG00000011572) #23 FBXW11 (ENSDLEG00000011487) #25 STK10 (ENSDLEG00000011442) #27 EFCAB9 (ENSDLEG00000011435) #28 UBTD2 (ENSDLEG00000011425) #29 SH3PXD2B (ENSDLEG00000011382) #30 NEURL1B (ENSDLEG00000011362) #31 DUSP1 (ENSDLEG00000011353) #32 ENSDLEG00000011343 ERGIC1 (ENSDLEG00000011315) #33 RPL26L1 (ENSDLEG00000011305) ATP6V0E1 (ENSDLEG00000011297) #34 CREBRF (ENSDLEG00000011269) #35 BNIP1 (ENSDLEG00000011252) #36 NKX2-5 (ENSDLEG00000011239) #37 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Donkey MODERN SPECIES 29 RARS1 (ENSEASG00005012782) FBLL1 (ENSEASG00005012784) #7 PANK3 (ENSEASG00005012785) #8 SLIT3 (ENSEASG00005012871) #9 SPDL1 (ENSEASG00005013116) #10 INSYN2B (ENSEASG00005013429) #11 DOCK2 (ENSEASG00005013144) #12 FOXI1 (ENSEASG00005036642) #13 C5orf58 (ENSEASG00005025476) LCP2 (ENSEASG00005013437) #15 KCNMB1 (ENSEASG00005013450) #16 KCNIP1 (ENSEASG00005013452) #18 GABRP (ENSEASG00005013457) #19 RANBP17 (ENSEASG00005010605) #20 TLX3 (ENSEASG00005011900) #21 ENSEASG00005011903 ##22 FGF18 (ENSEASG00005033570) #23 ENSEASG00005011908 SMIM23 (ENSEASG00005024362) #24 FBXW11 (ENSEASG00005011915) #25 STK10 (ENSEASG00005011922) #27 EFCAB9 (ENSEASG00005011925) #28 UBTD2 (ENSEASG00005028770) #29 SH3PXD2B (ENSEASG00005011927) #30 NEURL1B (ENSEASG00005028285) #31 DUSP1 (ENSEASG00005011932) #32 ERGIC1 (ENSEASG00005011934) #33 RPL26L1 (ENSEASG00005011935) ATP6V0E1 (ENSEASG00005011936) #34 CREBRF (ENSEASG00005011938) #35 BNIP1 (ENSEASG00005027404) #36 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Microbat MODERN SPECIES 1564 ENSMLUG00000003262 ENSMLUG00000026516 ENSMLUG00000011554 ENSMLUG00000023317 ENSMLUG00000002431 SLC16A11 (ENSMLUG00000010921) SLC16A13 (ENSMLUG00000010905) ENSMLUG00000001364 ENSMLUG00000014781 ENSMLUG00000025018 ##22 ENSMLUG00000028131 ENSMLUG00000026739 ENSMLUG00000009592 ENSMLUG00000027561 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES DRP2 (ENSRFEG00010001435) CENPI (ENSRFEG00010001521) TMEM35A (ENSRFEG00010001537) ENSRFEG00010001544 ARL13A (ENSRFEG00010001559) XKRX (ENSRFEG00010001578) NOX1 (ENSRFEG00010001646) CSTF2 (ENSRFEG00010001749) SYTL4 (ENSRFEG00010001817) SRPX2 (ENSRFEG00010001854) TSPAN6 (ENSRFEG00010004465) TNMD (ENSRFEG00010004486) PCDH19 (ENSRFEG00010004514) ENSRFEG00010004537 ENSRFEG00010004553 ENSRFEG00010004557 ##22 ENSRFEG00010004567 ENSRFEG00010004581 DIAPH2 (ENSRFEG00010004623) ENSRFEG00010004680 ENSRFEG00010004688 ENSRFEG00010004697 ENSRFEG00010004703 ENSRFEG00010004710 ENSRFEG00010004722 ENSRFEG00010004728 ENSRFEG00010004739 NAP1L3 (ENSRFEG00010004744) ENSRFEG00010004747 ENSRFEG00010004780 PABPC5 (ENSRFEG00010004787) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 9 ENSRFEG00010010737 ACP5 (ENSRFEG00010010655) ENSRFEG00010010613 ENSRFEG00010010596 ENSRFEG00010010515 ENSRFEG00010010491 ENSRFEG00010010433 ENSRFEG00010010385 ZNF669 (ENSRFEG00010010329) ENSRFEG00010010295 ENSRFEG00010009966 ENSRFEG00010009937 ENSRFEG00010009718 OR2Z1 (ENSRFEG00010009691) ENSRFEG00010009651 ENSRFEG00010009565 ##22 SPOCK3 (ENSRFEG00010009354) ENSRFEG00010009334 ANXA10 (ENSRFEG00010009234) DDX60 (ENSRFEG00010007842) PALLD (ENSRFEG00010006988) CBR4 (ENSRFEG00010006884) SH3RF1 (ENSRFEG00010006828) NEK1 (ENSRFEG00010006499) CLCN3 (ENSRFEG00010006286) HPF1 (ENSRFEG00010006209) MFAP3L (ENSRFEG00010006163) AADAT (ENSRFEG00010006065) GALNTL6 (ENSRFEG00010005964) GALNT7 (ENSRFEG00010005905) ENSRFEG00010005858 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 21 HEBP2 (ENSRFEG00010004794) NHSL1 (ENSRFEG00010004837) ENSRFEG00010004877 ENSRFEG00010004883 ENSRFEG00010004891 ECT2L (ENSRFEG00010004905) ENSRFEG00010010302 ABRACL (ENSRFEG00010010361) HECA (ENSRFEG00010010416) TXLNB (ENSRFEG00010010511) CITED2 (ENSRFEG00010010559) NMBR (ENSRFEG00010010601) GJE1 (ENSRFEG00010010668) VTA1 (ENSRFEG00010010808) ADGRG6 (ENSRFEG00010011095) ENSRFEG00010011218 ##22 HIVEP2 (ENSRFEG00010011238) AIG1 (ENSRFEG00010011301) ADAT2 (ENSRFEG00010011481) PEX3 (ENSRFEG00010011505) ENSRFEG00010011585 FUCA2 (ENSRFEG00010011637) PHACTR2 (ENSRFEG00010011749) LTV1 (ENSRFEG00010011981) ZC2HC1B (ENSRFEG00010012034) PLAGL1 (ENSRFEG00010012152) SF3B5 (ENSRFEG00010012221) STX11 (ENSRFEG00010012239) UTRN (ENSRFEG00010012298) EPM2A (ENSRFEG00010012771) ENSRFEG00010012883 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 leopard MODERN SPECIES 47 ENSPPRG00000018692 ENSPPRG00000018969 KCNT2 (ENSPPRG00000018540) ENSPPRG00000017753 ##22 ENSPPRG00000017595 ENSPPRG00000018952 CDC73 (ENSPPRG00000017525) B3GALT2 (ENSPPRG00000018936) GLRX2 (ENSPPRG00000017310) RO60 (ENSPPRG00000017233) UCHL5 (ENSPPRG00000016476) RGS2 (ENSPPRG00000015858) RGS13 (ENSPPRG00000015829) RGS1 (ENSPPRG00000015667) RGS21 (ENSPPRG00000015463) RGS18 (ENSPPRG00000015245) BRINP3 (ENSPPRG00000015190) ENSPPRG00000018908 ENSPPRG00000015159 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 American black bear MODERN SPECIES 5440 ENSUAMG00000023574 ##22 FGF18 (ENSUAMG00000023588) #23 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 American mink MODERN SPECIES 480 ENSNVIG00000004531 ##22 Ferret MODERN SPECIES 162 WWC1 (ENSMPUG00000013058) RARS1 (ENSMPUG00000013050) FBLL1 (ENSMPUG00000013045) #7 PANK3 (ENSMPUG00000013038) #8 SLIT3 (ENSMPUG00000013020) #9 SPDL1 (ENSMPUG00000013010) #10 INSYN2B (ENSMPUG00000013005) #11 DOCK2 (ENSMPUG00000012987) #12 FOXI1 (ENSMPUG00000012982) #13 LCP2 (ENSMPUG00000012897) #15 KCNMB1 (ENSMPUG00000012894) #16 KCNIP1 (ENSMPUG00000012891) #18 GABRP (ENSMPUG00000012885) #19 RANBP17 (ENSMPUG00000012874) #20 TLX3 (ENSMPUG00000012862) #21 ENSMPUG00000012858 ##22 FGF18 (ENSMPUG00000012855) #23 SMIM23 (ENSMPUG00000012844) #24 ENSMPUG00000012839 FBXW11 (ENSMPUG00000012769) #25 ENSMPUG00000012767 STK10 (ENSMPUG00000012761) #27 EFCAB9 (ENSMPUG00000012759) #28 UBTD2 (ENSMPUG00000012758) #29 SH3PXD2B (ENSMPUG00000012754) #30 NEURL1B (ENSMPUG00000012751) #31 DUSP1 (ENSMPUG00000012746) #32 ERGIC1 (ENSMPUG00000012743) #33 RPL26L1 (ENSMPUG00000012729) CREBRF (ENSMPUG00000012726) #35 BNIP1 (ENSMPUG00000012710) #36 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b ##22 Canis_lupus DUPLICATION Canis_lupus DUPLICATION Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.j.a ##22 Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 223 CDC42EP3 (ENSCAFG00020022827) QPCT (ENSCAFG00020022828) PRKD3 (ENSCAFG00020022829) NDUFAF7 (ENSCAFG00020022830) CEBPZ (ENSCAFG00020022832) ENSCAFG00020022834 SULT6B1 (ENSCAFG00020022838) EIF2AK2 (ENSCAFG00020022842) GPATCH11 (ENSCAFG00020022847) HEATR5B (ENSCAFG00020022854) STRN (ENSCAFG00020022876) VIT (ENSCAFG00020022889) FEZ2 (ENSCAFG00020022913) CRIM1 (ENSCAFG00020022922) ENSCAFG00020022982 ENSCAFG00020022999 ##22 ENSCAFG00020023002 FAM98A (ENSCAFG00020023008) RASGRP3 (ENSCAFG00020023024) LTBP1 (ENSCAFG00020023118) TTC27 (ENSCAFG00020023206) BIRC6 (ENSCAFG00020023216) ENSCAFG00020023343 YIPF4 (ENSCAFG00020023346) SLC30A6 (ENSCAFG00020023357) SPAST (ENSCAFG00020023436) DPY30 (ENSCAFG00020023631) MEMO1 (ENSCAFG00020023633) SRD5A2 (ENSCAFG00020023636) XDH (ENSCAFG00020023641) EHD3 (ENSCAFG00020023684) Dingo MODERN SPECIES 41 RAB3C (ENSCAFG00020023917) ENSCAFG00020023916 PDE4D (ENSCAFG00020023895) ENSCAFG00020023880 ENSCAFG00020023875 ENSCAFG00020023873 ENSCAFG00020023868 ENSCAFG00020023865 ENSCAFG00020023858 DEPDC1B (ENSCAFG00020023842) ELOVL7 (ENSCAFG00020023835) ERCC8 (ENSCAFG00020023820) NDUFAF2 (ENSCAFG00020023818) ENSCAFG00020023816 ZSWIM6 (ENSCAFG00020023815) ENSCAFG00020023812 ##22 KIF2A (ENSCAFG00020022848) ENSCAFG00020022808 ENSCAFG00020022776 ENSCAFG00020022750 ENSCAFG00020022746 ENSCAFG00020022740 ENSCAFG00020022736 RNF180 (ENSCAFG00020022731) RGS7BP (ENSCAFG00020022730) SHISAL2B (ENSCAFG00020022729) ENSCAFG00020022726 CWC27 (ENSCAFG00020022711) ADAMTS6 (ENSCAFG00020022699) CENPK (ENSCAFG00020022691) PPWD1 (ENSCAFG00020022688) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000159433 ENSGT00390000013811.b.d ENSGT00950000183199.b ENSGT00950000186221 ENSGT00390000014501 ENSGT00940000161612 ENSGT00940000153665.a ENSGT00950000182886.b.b ENSGT00940000157811 ENSGT00940000156424 ENSGT00390000015121 ENSGT01030000234607.A.a.a.a ENSGT00940000155822 ENSGT00940000158036 ENSGT01100000263477.E ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.j.b ##22 ENSGT00390000014771.a ENSGT00550000074988 ENSGT00390000000183 ENSGT00940000155171.a.b ENSGT00390000012731.a.a ENSGT00500000044852.a ENSGT00940000154574.c ENSGT00940000154952.a.b ENSGT00940000155533.d ENSGT00940000154766.a.a ENSGT00940000166969.b ENSGT00390000009802.a ENSGT00390000009802.b Dog MODERN SPECIES 27 ADAMTS16 (ENSCAFG00845024365) ENSCAFG00845024318 ICE1 (ENSCAFG00845024182) ENSCAFG00845024145 MED10 (ENSCAFG00845024101) UBE2QL1 (ENSCAFG00845024067) NSUN2 (ENSCAFG00845023886) SRD5A1 (ENSCAFG00845023819) TENT4A (ENSCAFG00845023557) ADCY2 (ENSCAFG00845023075) CFAP90 (ENSCAFG00845022890) FASTKD3 (ENSCAFG00845022802) MTRR (ENSCAFG00845022722) SEMA5A (ENSCAFG00845022219) TAS2R1 (ENSCAFG00845022145) ENSCAFG00845022120 ##22 ATPSCKMT (ENSCAFG00845021964) CCT5 (ENSCAFG00845021786) CMBL (ENSCAFG00845021687) ENSCAFG00845021651 MARCHF6 (ENSCAFG00845021339) ROPN1L (ENSCAFG00845021182) ANKRD33B (ENSCAFG00845021111) DAP (ENSCAFG00845021036) CTNND2 (ENSCAFG00845020488) ENSCAFG00845020338 DNAH5 (ENSCAFG00845017070) ENSCAFG00845015335 TRIO (ENSCAFG00845014950) TRIO (ENSCAFG00845014922) OTULINL (ENSCAFG00845014899) Dingo MODERN SPECIES 159 ENSCAFG00020022878 ENSCAFG00020022877 ENSCAFG00020022874 MED10 (ENSCAFG00020022869) UBE2QL1 (ENSCAFG00020022868) NSUN2 (ENSCAFG00020022862) SRD5A1 (ENSCAFG00020022843) TENT4A (ENSCAFG00020022835) ENSCAFG00020022831 ADCY2 (ENSCAFG00020022544) CFAP90 (ENSCAFG00020022543) FASTKD3 (ENSCAFG00020022541) MTRR (ENSCAFG00020022525) SEMA5A (ENSCAFG00020022499) TAS2R1 (ENSCAFG00020022493) ENSCAFG00020022491 ##22 ATPSCKMT (ENSCAFG00020022486) CCT5 (ENSCAFG00020022484) CMBL (ENSCAFG00020022483) ENSCAFG00020022482 ENSCAFG00020022481 MARCHF6 (ENSCAFG00020022480) ROPN1L (ENSCAFG00020022479) ANKRD33B (ENSCAFG00020022477) DAP (ENSCAFG00020022476) CTNND2 (ENSCAFG00020022473) ENSCAFG00020022472 ENSCAFG00020022471 ENSCAFG00020022470 DNAH5 (ENSCAFG00020022467) ENSCAFG00020022465 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.k ##22 Dog MODERN SPECIES 4 ENSCAFG00845023420 ENSCAFG00845023447 LAPTM4B (ENSCAFG00845023537) ENSCAFG00845023761 RPL30 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#20 ENSCAFG00020008705 TLX3 (ENSCAFG00020008709) #21 ENSCAFG00020008713 ##22 FGF18 (ENSCAFG00020008729) #23 FBXW11 (ENSCAFG00020008756) #25 STK10 (ENSCAFG00020009145) #27 UBTD2 (ENSCAFG00020011220) #29 SH3PXD2B (ENSCAFG00020011225) #30 NEURL1B (ENSCAFG00020011251) #31 DUSP1 (ENSCAFG00020011252) #32 ERGIC1 (ENSCAFG00020011256) #33 ENSCAFG00020011259 #34 CREBRF (ENSCAFG00020011261) #35 BNIP1 (ENSCAFG00020011264) #36 NKX2-5 (ENSCAFG00020011268) #37 STC2 (ENSCAFG00020011270) ENSCAFG00020011274 ENSCAFG00020011279 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 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ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.a.a.h.g ENSGT00940000163300 ENSGT00900000143489 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00900000143489 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396.l.a #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00900000143765 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898.c #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00910000148172 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00900000143489 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396.l.a #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00900000143765 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898.c #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00910000148172 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00900000143489 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 Gibbon MODERN SPECIES 11 SPDL1 (ENSNLEG00000004947) #10 INSYN2B (ENSNLEG00000005107) #11 DOCK2 (ENSNLEG00000004980) #12 FOXI1 (ENSNLEG00000005109) #13 ENSNLEG00000032677 ENSNLEG00000005110 LCP2 (ENSNLEG00000005113) #15 ENSNLEG00000005166 #16 ENSNLEG00000018628 ENSNLEG00000030707 KCNIP1 (ENSNLEG00000000256) #18 GABRP 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RANBP17 (ENSMFAG00000034347) #20 TLX3 (ENSMFAG00000048247) #21 ENSMFAG00000062884 NPM1 (ENSMFAG00000043579) ##22 FGF18 (ENSMFAG00000064381) #23 ENSMFAG00000039380 SMIM23 (ENSMFAG00000039057) #24 FBXW11 (ENSMFAG00000039918) #25 ENSMFAG00000047803 ENSMFAG00000057552 STK10 (ENSMFAG00000033923) #27 ENSMFAG00000051726 EFCAB9 (ENSMFAG00000043157) #28 UBTD2 (ENSMFAG00000052150) #29 SH3PXD2B (ENSMFAG00000040954) #30 DUSP1 (ENSMFAG00000044045) #32 ERGIC1 (ENSMFAG00000037788) #33 ATP6V0E1 (ENSMFAG00000045429) #34 CREBRF (ENSMFAG00000036600) #35 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 16 IL21R (ENSOARG00020025605) GTF3C1 (ENSOARG00020025654) GSG1L (ENSOARG00020025869) XPO6 (ENSOARG00020025881) SBK1 (ENSOARG00020025897) LAT (ENSOARG00020025902) SPNS1 (ENSOARG00020025911) ENSOARG00020025930 ENSOARG00020025935 CD19 (ENSOARG00020025940) RABEP2 (ENSOARG00020025948) ATP2A1 (ENSOARG00020025958) SH2B1 (ENSOARG00020025973) TUFM (ENSOARG00020025991) ATXN2L (ENSOARG00020026002) ENSOARG00020026028 ##22 EIF3C (ENSOARG00020026031) CLN3 (ENSOARG00020026043) ENSOARG00020026072 IL27 (ENSOARG00020026079) NUPR1 (ENSOARG00020026084) SGF29 (ENSOARG00020014549) ENSOARG00020014591 ENSOARG00020014644 ENSOARG00020014726 CORO1A (ENSOARG00020014834) MAPK3 (ENSOARG00020015005) GDPD3 (ENSOARG00020015512) YPEL3 (ENSOARG00020015578) TBX6 (ENSOARG00020015766) PPP4C (ENSOARG00020015863) Suina ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00900000143489 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866.db.a.a #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Chacoan peccary MODERN SPECIES 97 ENSCWAG00000001901 FBLL1 (ENSCWAG00000001899) #7 PANK3 (ENSCWAG00000001882) #8 SLIT3 (ENSCWAG00000001758) #9 SPDL1 (ENSCWAG00000001722) #10 INSYN2B (ENSCWAG00000001704) #11 DOCK2 (ENSCWAG00000001602) #12 FOXI1 (ENSCWAG00000001576) #13 C5orf58 (ENSCWAG00000001565) LCP2 (ENSCWAG00000001455) #15 KCNMB1 (ENSCWAG00000001422) #16 KCNIP1 (ENSCWAG00000001291) #18 GABRP (ENSCWAG00000001221) #19 RANBP17 (ENSCWAG00000001156) #20 TLX3 (ENSCWAG00000001128) #21 NPM1 (ENSCWAG00000001072) ##22 FGF18 (ENSCWAG00000001037) #23 FBXW11 (ENSCWAG00000000944) #25 STK10 (ENSCWAG00000000878) #27 EFCAB9 (ENSCWAG00000000850) #28 UBTD2 (ENSCWAG00000000837) #29 SH3PXD2B (ENSCWAG00000000790) #30 NEURL1B (ENSCWAG00000000720) #31 DUSP1 (ENSCWAG00000000695) #32 ERGIC1 (ENSCWAG00000000647) #33 ENSCWAG00000000627 RPL26L1 (ENSCWAG00000000616) ENSCWAG00000000600 #34 CREBRF (ENSCWAG00000000582) #35 BNIP1 (ENSCWAG00000000552) #36 NKX2-5 (ENSCWAG00000000540) #37 Pig MODERN SPECIES 7 RARS1 (ENSSSCG00000017015) FBLL1 (ENSSSCG00000017013) #7 PANK3 (ENSSSCG00000017014) #8 SLIT3 (ENSSSCG00000017012) #9 SPDL1 (ENSSSCG00000025965) #10 INSYN2B (ENSSSCG00000017010) #11 DOCK2 (ENSSSCG00000017008) #12 FOXI1 (ENSSSCG00000017009) #13 C5orf58 (ENSSSCG00000051265) LCP2 (ENSSSCG00000017006) #15 KCNMB1 (ENSSSCG00000017005) #16 KCNIP1 (ENSSSCG00000017003) #18 GABRP (ENSSSCG00000021902) #19 RANBP17 (ENSSSCG00000017000) #20 TLX3 (ENSSSCG00000016999) #21 ENSSSCG00000016998 ##22 FGF18 (ENSSSCG00000016997) #23 ENSSSCG00000023757 FBXW11 (ENSSSCG00000023307) #25 STK10 (ENSSSCG00000022478) #27 EFCAB9 (ENSSSCG00000016995) #28 UBTD2 (ENSSSCG00000023948) #29 SH3PXD2B (ENSSSCG00000027378) #30 NEURL1B (ENSSSCG00000016992) #31 DUSP1 (ENSSSCG00000016991) #32 ENSSSCG00000056851 ERGIC1 (ENSSSCG00000016988) #33 ENSSSCG00000035845 RPL26L1 (ENSSSCG00000016989) ENSSSCG00000016990 #34 CREBRF (ENSSSCG00000016986) #35 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1270 ENSMLUG00000022764 #12 INSYN2B (ENSMLUG00000010342) #11 ENSMLUG00000010249 #12 FOXI1 (ENSMLUG00000027832) #13 ENSMLUG00000022753 LCP2 (ENSMLUG00000011482) #15 KCNMB1 (ENSMLUG00000005669) #16 KCNIP1 (ENSMLUG00000007694) #18 RANBP17 (ENSMLUG00000005680) #20 TLX3 (ENSMLUG00000016783) #21 ENSMLUG00000005693 ##22 FGF18 (ENSMLUG00000005698) #23 Microbat MODERN SPECIES 1274 KANK1 (ENSMLUG00000001345) DOCK8 (ENSMLUG00000016819) ENSMLUG00000014379 ENSMLUG00000014374 PGM5 (ENSMLUG00000012848) TMEM252 (ENSMLUG00000012853) PABIR1 (ENSMLUG00000029695) PIP5K1B (ENSMLUG00000017346) ENSMLUG00000022332 ##22 ENSMLUG00000026887 FXN (ENSMLUG00000016443) Microbat MODERN SPECIES 1410 ENSMLUG00000023462 ##22 ENSMLUG00000003818 Microbat MODERN SPECIES 938 TKTL2 (ENSMLUG00000017315) TMA16 (ENSMLUG00000009697) ENSMLUG00000009712 ENSMLUG00000029949 ENSMLUG00000028427 ENSMLUG00000002174 ENSMLUG00000024057 ENSMLUG00000027802 TMEM192 (ENSMLUG00000014023) KLHL2 (ENSMLUG00000014026) MSMO1 (ENSMLUG00000014033) CPE (ENSMLUG00000014038) TLL1 (ENSMLUG00000011094) ENSMLUG00000012832 NPY2R (ENSMLUG00000010894) ENSMLUG00000022847 ##22 RBM46 (ENSMLUG00000003221) LRAT (ENSMLUG00000027595) ENSMLUG00000024636 FGG (ENSMLUG00000005542) ENSMLUG00000005537 FGB (ENSMLUG00000007690) ENSMLUG00000008318 ENSMLUG00000024184 DCHS2 (ENSMLUG00000008273) SFRP2 (ENSMLUG00000012827) ENSMLUG00000030163 RNF175 (ENSMLUG00000012819) TLR2 (ENSMLUG00000012813) TMEM131L (ENSMLUG00000010411) MND1 (ENSMLUG00000002215) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1880 ENSAMEG00000028680 ##22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.a ##22 Orangutan MODERN SPECIES 21 PLAG1 (ENSPPYG00000018602) ENSPPYG00000018604 SDR16C5 (ENSPPYG00000018605) PENK (ENSPPYG00000018606) ENSPPYG00000030167 BPNT2 (ENSPPYG00000018607) UBXN2B (ENSPPYG00000018610) CYP7A1 (ENSPPYG00000018611) SDCBP (ENSPPYG00000018612) NSMAF (ENSPPYG00000018613) TOX (ENSPPYG00000018614) CA8 (ENSPPYG00000018615) RAB2A (ENSPPYG00000018617) CHD7 (ENSPPYG00000018618) ENSPPYG00000036142 ENSPPYG00000039758 ##22 CLVS1 (ENSPPYG00000018621) ASPH (ENSPPYG00000018622) NKAIN3 (ENSPPYG00000018623) GGH (ENSPPYG00000018624) TTPA (ENSPPYG00000040852) YTHDF3 (ENSPPYG00000018626) ENSPPYG00000018628 CYP7B1 (ENSPPYG00000018629) ENSPPYG00000030990 ARMC1 (ENSPPYG00000018630) MTFR1 (ENSPPYG00000018631) PDE7A (ENSPPYG00000018632) DNAJC5B (ENSPPYG00000018634) TRIM55 (ENSPPYG00000018635) CRH (ENSPPYG00000018636) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.a ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1711 USP54 (ENSRROG00000037681) ENSRROG00000041573 PPP3CB (ENSRROG00000032212) MSS51 (ENSRROG00000042078) ANXA7 (ENSRROG00000037933) CFAP70 (ENSRROG00000043305) MRPS16 (ENSRROG00000040939) ENSRROG00000031732 DNAJC9 (ENSRROG00000038222) ENSRROG00000038925 FAM149B1 (ENSRROG00000044382) ECD (ENSRROG00000044967) NUDT13 (ENSRROG00000029969) P4HA1 (ENSRROG00000044078) PLA2G12B (ENSRROG00000037167) ENSRROG00000030596 ##22 OIT3 (ENSRROG00000031981) MCU (ENSRROG00000044644) ENSRROG00000037322 ENSRROG00000024038 MICU1 (ENSRROG00000043635) DNAJB12 (ENSRROG00000030694) DDIT4 (ENSRROG00000025799) ANAPC16 (ENSRROG00000038072) ASCC1 (ENSRROG00000005189) SPOCK2 (ENSRROG00000033157) ENSRROG00000035598 CHST3 (ENSRROG00000029327) PSAP (ENSRROG00000033645) ENSRROG00000044593 VSIR (ENSRROG00000040606) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.a ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00410000025556.a.a.a.a ENSGT00530000063407.b ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.a ##22 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.d ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 16 CA7 (ENSOCUG00000027920) NAE1 (ENSOCUG00000000573) TERB1 (ENSOCUG00000000569) DYNC1LI2 (ENSOCUG00000006143) CMTM3 (ENSOCUG00000027757) ENSOCUG00000026523 CKLF (ENSOCUG00000038857) ENSOCUG00000014873 ENSOCUG00000021527 ENSOCUG00000039132 CDH5 (ENSOCUG00000010192) CDH11 (ENSOCUG00000017019) ENSOCUG00000013269 ENSOCUG00000022105 ENSOCUG00000038879 NPM1 (ENSOCUG00000021499) ##22 CDH8 (ENSOCUG00000013774) ENSOCUG00000034960 ENSOCUG00000030517 GOT2 (ENSOCUG00000003871) SLC38A7 (ENSOCUG00000003868) CNOT1 (ENSOCUG00000006911) SETD6 (ENSOCUG00000006903) NDRG4 (ENSOCUG00000022245) GINS3 (ENSOCUG00000006054) PRSS54 (ENSOCUG00000027370) CCDC113 (ENSOCUG00000008832) CSNK2A2 (ENSOCUG00000005074) CFAP20 (ENSOCUG00000014026) MMP15 (ENSOCUG00000014015) ZNF319 (ENSOCUG00000011058) Rabbit MODERN SPECIES 245 ENSOCUG00000026724 ##22 ENSOCUG00000029620 Rabbit MODERN SPECIES 14 WWC1 (ENSOCUG00000003581) RARS1 (ENSOCUG00000015698) PANK3 (ENSOCUG00000011991) #8 SLIT3 (ENSOCUG00000017302) #9 SPDL1 (ENSOCUG00000005503) #10 ENSOCUG00000031547 #12 INSYN2B (ENSOCUG00000000834) #11 FOXI1 (ENSOCUG00000000836) #13 C5orf58 (ENSOCUG00000030888) LCP2 (ENSOCUG00000000534) #15 KCNIP1 (ENSOCUG00000000540) #18 KCNMB1 (ENSOCUG00000000539) #16 GABRP (ENSOCUG00000008191) #19 RANBP17 (ENSOCUG00000011100) #20 TLX3 (ENSOCUG00000000918) #21 ENSOCUG00000011117 ##22 FGF18 (ENSOCUG00000011124) #23 FBXW11 (ENSOCUG00000007739) #25 STK10 (ENSOCUG00000005098) #27 EFCAB9 (ENSOCUG00000024250) #28 UBTD2 (ENSOCUG00000005108) #29 ENSOCUG00000034187 SH3PXD2B (ENSOCUG00000006784) #30 NEURL1B (ENSOCUG00000027790) #31 DUSP1 (ENSOCUG00000007999) #32 ERGIC1 (ENSOCUG00000029231) #33 RPL26L1 (ENSOCUG00000006172) ATP6V0E1 (ENSOCUG00000006174) #34 CREBRF (ENSOCUG00000000038) #35 BNIP1 (ENSOCUG00000000040) #36 NKX2-5 (ENSOCUG00000000041) #37 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2781 ENSRROG00000032845 MOSPD2 (ENSRROG00000032705) FANCB (ENSRROG00000035196) ENSRROG00000045758 ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 576 DXO (ENSPCOG00000016641) STK19 (ENSPCOG00000016856) ENSPCOG00000023318 CYP21A2 (ENSPCOG00000026091) TNXB (ENSPCOG00000021738) ATF6B (ENSPCOG00000020781) PRRT1 (ENSPCOG00000016826) PPT2 (ENSPCOG00000021664) EGFL8 (ENSPCOG00000026233) AGPAT1 (ENSPCOG00000023882) ENSPCOG00000027774 AGER (ENSPCOG00000001492) PBX2 (ENSPCOG00000021000) GPSM3 (ENSPCOG00000016738) NOTCH4 (ENSPCOG00000027165) ENSPCOG00000023601 ##22 ENSPCOG00000024034 ENSPCOG00000027524 HLA-DRA (ENSPCOG00000025637) ENSPCOG00000022579 Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 152 ENSOGAG00000025182 ENSOGAG00000006943 LSM8 (ENSOGAG00000013377) CTTNBP2 (ENSOGAG00000001760) CFTR (ENSOGAG00000001756) ASZ1 (ENSOGAG00000003040) WNT2 (ENSOGAG00000013574) ST7 (ENSOGAG00000013563) CAPZA2 (ENSOGAG00000012540) MET (ENSOGAG00000003961) CAV1 (ENSOGAG00000014265) CAV2 (ENSOGAG00000025779) TES (ENSOGAG00000010070) TFEC (ENSOGAG00000010066) MDFIC (ENSOGAG00000002835) ENSOGAG00000027543 ##22 FOXP2 (ENSOGAG00000002833) PPP1R3A (ENSOGAG00000005234) SMIM30 (ENSOGAG00000029997) GPR85 (ENSOGAG00000003489) BMT2 (ENSOGAG00000004827) TMEM168 (ENSOGAG00000004826) LSMEM1 (ENSOGAG00000004197) IFRD1 (ENSOGAG00000004194) ZNF277 (ENSOGAG00000005326) DOCK4 (ENSOGAG00000015147) Bushbaby MODERN SPECIES 251 GZF1 (ENSOGAG00000028389) NXT1 (ENSOGAG00000000717) CD93 (ENSOGAG00000017109) THBD (ENSOGAG00000026061) SSTR4 (ENSOGAG00000017105) ENSOGAG00000025509 FOXA2 (ENSOGAG00000033297) PAX1 (ENSOGAG00000033162) NKX2-2 (ENSOGAG00000029474) ENSOGAG00000025951 NKX2-4 (ENSOGAG00000024342) XRN2 (ENSOGAG00000001068) KIZ (ENSOGAG00000010591) RALGAPA2 (ENSOGAG00000011557) INSM1 (ENSOGAG00000034802) ENSOGAG00000031837 ##22 CFAP61 (ENSOGAG00000011546) CRNKL1 (ENSOGAG00000011544) NAA20 (ENSOGAG00000011542) RIN2 (ENSOGAG00000011531) SLC24A3 (ENSOGAG00000026410) SCP2D1 (ENSOGAG00000004222) DTD1 (ENSOGAG00000007972) ENSOGAG00000031912 SEC23B (ENSOGAG00000004546) RBBP9 (ENSOGAG00000002919) POLR3F (ENSOGAG00000002916) DZANK1 (ENSOGAG00000002912) ENSOGAG00000002908 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Degu MODERN SPECIES 342 ZDHHC15 (ENSODEG00000002027) ENSODEG00000001977 ENSODEG00000001941 ENSODEG00000001923 ##22 ABCB7 (ENSODEG00000004036) ENSODEG00000003977 NEXMIF (ENSODEG00000003957) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 729 Fam110b (ENSNGAG00000013227) ENSNGAG00000020094 ##22 Ubxn2b (ENSNGAG00000014598) Cyp7a1 (ENSNGAG00000011429) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.b ##22 Rabbit MODERN SPECIES 439 ADRB3 (ENSOCUG00000007804) EIF4EBP1 (ENSOCUG00000017792) ENSOCUG00000029521 STAR (ENSOCUG00000002507) BAG4 (ENSOCUG00000015405) DDHD2 (ENSOCUG00000009979) NSD3 (ENSOCUG00000016542) LETM2 (ENSOCUG00000004141) FGFR1 (ENSOCUG00000004150) TACC1 (ENSOCUG00000004500) PLEKHA2 (ENSOCUG00000000080) HTRA4 (ENSOCUG00000000083) TM2D2 (ENSOCUG00000000085) ENSOCUG00000013397 ADAM9 (ENSOCUG00000013380) ENSOCUG00000026704 ##22 ENSOCUG00000013399 ENSOCUG00000017406 ENSOCUG00000024496 ENSOCUG00000026361 ENSOCUG00000024455 ENSOCUG00000038658 ENSOCUG00000005475 ENSOCUG00000024508 ENSOCUG00000023766 ENSOCUG00000037745 ADAM18 (ENSOCUG00000027734) IDO1 (ENSOCUG00000003344) IDO2 (ENSOCUG00000003349) TCIM (ENSOCUG00000027445) ZMAT4 (ENSOCUG00000000977) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.d ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.d ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.d ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.d ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.d ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.d ##22 Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 127 ENSJJAG00000015719 Cyp4f18 (ENSJJAG00000019533) Tpm4 (ENSJJAG00000019418) Rab8a (ENSJJAG00000021959) ENSJJAG00000018938 ##22 Fam32a (ENSJJAG00000022461) Ap1m1 (ENSJJAG00000003963) Klf2 (ENSJJAG00000019814) Eps15l1 (ENSJJAG00000001243) ENSJJAG00000008721 ENSJJAG00000012853 Calr3 (ENSJJAG00000019732) Cherp (ENSJJAG00000017982) Slc35e1 (ENSJJAG00000014718) Med26 (ENSJJAG00000020010) Smim7 (ENSJJAG00000000221) Tmem38a (ENSJJAG00000013265) Nwd1 (ENSJJAG00000017294) F2rl3 (ENSJJAG00000008663) Haus8 (ENSJJAG00000016878) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 77 Tacr1 (ENSJJAG00000009094) Eva1a (ENSJJAG00000000520) Mrpl19 (ENSJJAG00000011449) Gcfc2 (ENSJJAG00000020797) ENSJJAG00000021250 ENSJJAG00000016811 Lrrtm4 (ENSJJAG00000014862) ENSJJAG00000004619 ENSJJAG00000024137 ENSJJAG00000004867 ENSJJAG00000023603 ENSJJAG00000020877 Lrrtm1 (ENSJJAG00000021646) Ctnna2 (ENSJJAG00000020758) ENSJJAG00000014736 ENSJJAG00000024130 ##22 ENSJJAG00000014417 ENSJJAG00000001553 Suclg1 (ENSJJAG00000023782) ENSJJAG00000020479 Dnah6 (ENSJJAG00000013999) ENSJJAG00000009987 ENSJJAG00000006387 Kcmf1 (ENSJJAG00000020771) ENSJJAG00000010136 Tcf7l1 (ENSJJAG00000023485) ENSJJAG00000022764 Retsat (ENSJJAG00000018206) Elmod3 (ENSJJAG00000015903) Capg (ENSJJAG00000011988) Sh2d6 (ENSJJAG00000011036) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 151 ENSJJAG00000008716 Tinag (ENSJJAG00000009957) Fam83b (ENSJJAG00000010325) Hcrtr2 (ENSJJAG00000010947) Gfral (ENSJJAG00000017368) ENSJJAG00000017592 Bmp5 (ENSJJAG00000018304) ENSJJAG00000018917 Dst (ENSJJAG00000001952) Bend6 (ENSJJAG00000015751) Zfp451 (ENSJJAG00000017308) Bag2 (ENSJJAG00000019549) Rab23 (ENSJJAG00000020094) Prim2 (ENSJJAG00000015897) Khdrbs2 (ENSJJAG00000017812) ENSJJAG00000012395 ##22 ENSJJAG00000014590 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 43 Dennd2b (ENSJJAG00000011335) Akip1 (ENSJJAG00000010655) BC051019 (ENSJJAG00000016215) Tmem9b (ENSJJAG00000015398) Nrip3 (ENSJJAG00000016827) Scube2 (ENSJJAG00000016896) ENSJJAG00000011892 Dennd5a (ENSJJAG00000022509) ENSJJAG00000021740 Ipo7 (ENSJJAG00000018743) Zfp143 (ENSJJAG00000009710) Wee1 (ENSJJAG00000015007) Swap70 (ENSJJAG00000020532) ENSJJAG00000008080 ENSJJAG00000013130 ENSJJAG00000015333 ##22 ENSJJAG00000020513 Adm (ENSJJAG00000024387) Ampd3 (ENSJJAG00000010237) ENSJJAG00000000841 ENSJJAG00000014778 Lyve1 (ENSJJAG00000018545) Irag1 (ENSJJAG00000013023) Ctr9 (ENSJJAG00000003972) ENSJJAG00000006637 ENSJJAG00000021142 ENSJJAG00000011119 ENSJJAG00000011627 Galnt18 (ENSJJAG00000021987) Usp47 (ENSJJAG00000022599) Dkk3 (ENSJJAG00000013289) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 116 Foxi1 (ENSJJAG00000022048) #13 Lcp2 (ENSJJAG00000007933) #15 Kcnmb1 (ENSJJAG00000019472) #16 Kcnip1 (ENSJJAG00000022582) #18 Gabrp (ENSJJAG00000024063) #19 Ranbp17 (ENSJJAG00000004292) #20 Tlx3 (ENSJJAG00000010676) #21 ENSJJAG00000014455 ##22 Fgf18 (ENSJJAG00000016780) #23 Smim23 (ENSJJAG00000017456) #24 ENSJJAG00000021804 #25 Stk10 (ENSJJAG00000023041) #27 Efcab9 (ENSJJAG00000009458) #28 Ubtd2 (ENSJJAG00000010668) #29 Sh3pxd2b (ENSJJAG00000013982) #30 Neurl1b (ENSJJAG00000016269) #31 Msx2 (ENSJJAG00000016806) Nsg2 (ENSJJAG00000020822) Cpeb4 (ENSJJAG00000021518) Bod1 (ENSJJAG00000007832) Stc2 (ENSJJAG00000012335) Nkx2-5 (ENSJJAG00000015156) #37 ENSJJAG00000016444 #36 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 75 Pde1a (ENSJJAG00000010493) Dnajc10 (ENSJJAG00000017845) Frzb (ENSJJAG00000013147) Nckap1 (ENSJJAG00000015103) Dusp19 (ENSJJAG00000012971) ENSJJAG00000016432 Capza1b (ENSJJAG00000008304) ENSJJAG00000014835 Zfp804a (ENSJJAG00000000470) ENSJJAG00000021088 Itgav (ENSJJAG00000011169) Fam171b (ENSJJAG00000008385) Zswim2 (ENSJJAG00000006978) Calcrl (ENSJJAG00000020254) ENSJJAG00000024078 ENSJJAG00000021702 ##22 ENSJJAG00000000884 Gulp1 (ENSJJAG00000019167) ENSJJAG00000000793 Col3a1 (ENSJJAG00000021342) Col5a2 (ENSJJAG00000006385) Wdr75 (ENSJJAG00000021588) Slc40a1 (ENSJJAG00000001247) ENSJJAG00000023048 Ankar (ENSJJAG00000020631) Osgepl1 (ENSJJAG00000016698) ENSJJAG00000014553 ENSJJAG00000020803 ENSJJAG00000017137 Mstn (ENSJJAG00000016346) Hibch (ENSJJAG00000017214) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.d ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.d ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 24 ANKRD42 (ENSHGLG00000007952) ENSHGLG00000002410 PCF11 (ENSHGLG00000002473) ENSHGLG00000002759 DDIAS (ENSHGLG00000050869) ENSHGLG00000046609 PRCP (ENSHGLG00000036425) ENSHGLG00000045251 ENSHGLG00000032876 ENSHGLG00000048309 ENSHGLG00000046901 ENSHGLG00000018145 ENSHGLG00000045517 ENSHGLG00000044687 ENSHGLG00000004145 ENSHGLG00000004806 ##22 NARS2 (ENSHGLG00000003746) ENSHGLG00000003188 GAB2 (ENSHGLG00000002641) USP35 (ENSHGLG00000019526) KCTD21 (ENSHGLG00000032398) ALG8 (ENSHGLG00000019304) NDUFC2 (ENSHGLG00000042879) THRSP (ENSHGLG00000013110) ENSHGLG00000018875 ENSHGLG00000041450 ENSHGLG00000019142 ENSHGLG00000005234 AAMDC (ENSHGLG00000003585) RSF1 (ENSHGLG00000002695) ENSHGLG00000002326 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00530000063407.b ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.c.a ##22 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.b.d ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a Pika MODERN SPECIES 3849 NPM1 (ENSOPRG00000007381) ##22 FGF18 (ENSOPRG00000007393) #23 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00940000172454 #14 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 1062 LIMA1 (ENSDNOG00000031237) FAM186A (ENSDNOG00000031578) LARP4 (ENSDNOG00000038525) DIP2B (ENSDNOG00000004136) ATF1 (ENSDNOG00000006951) TMPRSS12 (ENSDNOG00000009890) ENSDNOG00000042206 ##22 ENSDNOG00000031675 ENSDNOG00000036666 HIGD1C (ENSDNOG00000033730) SLC11A2 (ENSDNOG00000000724) LETMD1 (ENSDNOG00000047600) CSRNP2 (ENSDNOG00000023591) TFCP2 (ENSDNOG00000017309) POU6F1 (ENSDNOG00000009291) DAZAP2 (ENSDNOG00000040311) BIN2 (ENSDNOG00000037336) CELA1 (ENSDNOG00000019534) GALNT6 (ENSDNOG00000031434) SLC4A8 (ENSDNOG00000016961) Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 444 THBS2 (ENSDNOG00000000603) ENSDNOG00000046334 ##22 Armadillo MODERN SPECIES 3692 ENSDNOG00000045096 ENSDNOG00000033175 ##22 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2663 ENSDNOG00000030667 ENSDNOG00000036168 ##22 ENSDNOG00000009202 Armadillo MODERN SPECIES 1386 ENSDNOG00000042329 ##22 ENSDNOG00000045014 HNF4G (ENSDNOG00000035639) ZNRF2 (ENSDNOG00000007138) MTURN (ENSDNOG00000009770) PLEKHA8 (ENSDNOG00000047754) FKBP14 (ENSDNOG00000040923) SCRN1 (ENSDNOG00000035864) WIPF3 (ENSDNOG00000010077) CHN2 (ENSDNOG00000000404) Armadillo MODERN SPECIES 3260 ENSDNOG00000045917 ##22 ENSDNOG00000038021 PLPP3 (ENSDNOG00000042541) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00900000143489 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Rabbit MODERN SPECIES 11 PCYOX1 (ENSOCUG00000011208) SNRPG (ENSOCUG00000011214) ENSOCUG00000017416 ENSOCUG00000000889 TGFA (ENSOCUG00000029636) ADD2 (ENSOCUG00000014450) FIGLA (ENSOCUG00000017295) CD207 (ENSOCUG00000017299) ATP6V1B1 (ENSOCUG00000024303) ANKRD53 (ENSOCUG00000008891) TEX261 (ENSOCUG00000008898) NAGK (ENSOCUG00000008901) PAIP2B (ENSOCUG00000022370) ENSOCUG00000020930 ZNF638 (ENSOCUG00000010045) ENSOCUG00000032009 ##22 DYSF (ENSOCUG00000010062) CYP26B1 (ENSOCUG00000007620) ENSOCUG00000031957 EXOC6B (ENSOCUG00000015311) ENSOCUG00000002515 SPR (ENSOCUG00000000835) EMX1 (ENSOCUG00000008208) ENSOCUG00000027648 RAB11FIP5 (ENSOCUG00000000837) NOTO (ENSOCUG00000005360) SMYD5 (ENSOCUG00000002421) PRADC1 (ENSOCUG00000002428) CCT7 (ENSOCUG00000002429) EGR4 (ENSOCUG00000002443) ENSOCUG00000021825 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00410000025556.a.a.a.a ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00410000025556.a.a.a.a ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Long-tailed chinchilla DUPLICATION Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 115 WWC1 (ENSCLAG00000013004) ENSCLAG00000013061 FBLL1 (ENSCLAG00000018056) #7 PANK3 (ENSCLAG00000014838) #8 SLIT3 (ENSCLAG00000015496) #9 SPDL1 (ENSCLAG00000014912) #10 DOCK2 (ENSCLAG00000014012) #12 INSYN2B (ENSCLAG00000013576) #11 FOXI1 (ENSCLAG00000014060) #13 LCP2 (ENSCLAG00000015940) #15 KCNMB1 (ENSCLAG00000014418) #16 KCNIP1 (ENSCLAG00000013854) #18 GABRP (ENSCLAG00000012510) #19 RANBP17 (ENSCLAG00000013185) #20 TLX3 (ENSCLAG00000013094) #21 ENSCLAG00000014392 ##22 FGF18 (ENSCLAG00000013051) #23 SMIM23 (ENSCLAG00000012177) #24 FBXW11 (ENSCLAG00000013691) #25 STK10 (ENSCLAG00000015147) #27 EFCAB9 (ENSCLAG00000013040) #28 UBTD2 (ENSCLAG00000015134) #29 SH3PXD2B (ENSCLAG00000015389) #30 NEURL1B (ENSCLAG00000014210) #31 DUSP1 (ENSCLAG00000013473) #32 ERGIC1 (ENSCLAG00000014304) #33 RPL26L1 (ENSCLAG00000014524) ATP6V0E1 (ENSCLAG00000014664) #34 CREBRF (ENSCLAG00000014588) #35 BNIP1 (ENSCLAG00000015919) #36 NKX2-5 (ENSCLAG00000013992) #37 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 117 AGR2 (ENSCLAG00000005464) AHR (ENSCLAG00000005612) SNX13 (ENSCLAG00000005253) HDAC9 (ENSCLAG00000007911) FERD3L (ENSCLAG00000017792) POLR1F (ENSCLAG00000012696) TMEM196 (ENSCLAG00000013947) MACC1 (ENSCLAG00000005944) ITGB8 (ENSCLAG00000006980) ABCB5 (ENSCLAG00000012805) SP8 (ENSCLAG00000013238) SP4 (ENSCLAG00000013285) DNAH11 (ENSCLAG00000007590) CDCA7L (ENSCLAG00000007779) RAPGEF5 (ENSCLAG00000009347) ENSCLAG00000009385 ##22 TOMM7 (ENSCLAG00000009880) HYCC1 (ENSCLAG00000008734) KLHL7 (ENSCLAG00000007077) NUP42 (ENSCLAG00000007547) GPNMB (ENSCLAG00000004706) MALSU1 (ENSCLAG00000008469) IGF2BP3 (ENSCLAG00000009835) TRA2A (ENSCLAG00000007917) CCDC126 (ENSCLAG00000006880) FAM221A (ENSCLAG00000007737) STK31 (ENSCLAG00000006727) NPY (ENSCLAG00000004780) PALS2 (ENSCLAG00000006677) GSDME 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ENSHGLG00000017100 ENSHGLG00000018219 #34 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 118 WWC1 (ENSOGAG00000006362) RARS1 (ENSOGAG00000006369) PANK3 (ENSOGAG00000006376) #8 SLIT3 (ENSOGAG00000006377) #9 SPDL1 (ENSOGAG00000002804) #10 INSYN2B (ENSOGAG00000002809) #11 DOCK2 (ENSOGAG00000002807) #12 FOXI1 (ENSOGAG00000032689) #13 LCP2 (ENSOGAG00000002810) #15 KCNMB1 (ENSOGAG00000016972) #16 KCNIP1 (ENSOGAG00000013599) #18 GABRP (ENSOGAG00000013604) #19 ENSOGAG00000028828 RANBP17 (ENSOGAG00000013609) #20 TLX3 (ENSOGAG00000029862) #21 ENSOGAG00000013616 ##22 FGF18 (ENSOGAG00000013617) #23 ENSOGAG00000028434 SMIM23 (ENSOGAG00000025446) #24 FBXW11 (ENSOGAG00000011988) #25 STK10 (ENSOGAG00000011991) #27 EFCAB9 (ENSOGAG00000033621) #28 UBTD2 (ENSOGAG00000011997) #29 SH3PXD2B (ENSOGAG00000012721) #30 NEURL1B (ENSOGAG00000026783) #31 DUSP1 (ENSOGAG00000017064) #32 ERGIC1 (ENSOGAG00000017066) #33 ENSOGAG00000032228 ATP6V0E1 (ENSOGAG00000017071) #34 ENSOGAG00000030210 #35 BNIP1 (ENSOGAG00000007537) #36 Bushbaby MODERN SPECIES 130 ITPR1 (ENSOGAG00000003704) BHLHE40 (ENSOGAG00000029762) ARL8B (ENSOGAG00000026863) EDEM1 (ENSOGAG00000003714) ENSOGAG00000025402 ENSOGAG00000034686 ENSOGAG00000025792 GRM7 (ENSOGAG00000004355) ENSOGAG00000027930 LMCD1 (ENSOGAG00000009965) SSUH2 (ENSOGAG00000009967) ENSOGAG00000032668 ENSOGAG00000027853 CAV3 (ENSOGAG00000027025) OXTR (ENSOGAG00000001407) ENSOGAG00000029283 ##22 RAD18 (ENSOGAG00000001410) SRGAP3 (ENSOGAG00000001412) THUMPD3 (ENSOGAG00000017111) SETD5 (ENSOGAG00000006870) LHFPL4 (ENSOGAG00000032622) MTMR14 (ENSOGAG00000015616) CPNE9 (ENSOGAG00000015624) BRPF1 (ENSOGAG00000005158) OGG1 (ENSOGAG00000034171) CAMK1 (ENSOGAG00000029040) TADA3 (ENSOGAG00000034225) ARPC4 (ENSOGAG00000026074) TTLL3 (ENSOGAG00000034727) RPUSD3 (ENSOGAG00000012592) CIDEC (ENSOGAG00000006291) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 200 SPDL1 (ENSCCAG00000035090) #10 INSYN2B (ENSCCAG00000033382) #11 ENSCCAG00000021528 DOCK2 (ENSCCAG00000037383) #12 FOXI1 (ENSCCAG00000029998) #13 ENSCCAG00000019246 LCP2 (ENSCCAG00000014560) #15 KCNMB1 (ENSCCAG00000029582) #16 KCNIP1 (ENSCCAG00000025512) #18 GABRP (ENSCCAG00000027392) #19 RANBP17 (ENSCCAG00000021816) #20 TLX3 (ENSCCAG00000022971) #21 ENSCCAG00000034814 #22 FGF18 (ENSCCAG00000025826) #23 SMIM23 (ENSCCAG00000027927) #24 ENSCCAG00000035992 ##22 ENSCCAG00000034903 #25 STK10 (ENSCCAG00000021548) #27 EFCAB9 (ENSCCAG00000030106) #28 UBTD2 (ENSCCAG00000030325) #29 SH3PXD2B (ENSCCAG00000018545) #30 NEURL1B (ENSCCAG00000024696) #31 ENSCCAG00000023304 DUSP1 (ENSCCAG00000028115) #32 ERGIC1 (ENSCCAG00000027066) #33 RPL26L1 (ENSCCAG00000022572) ENSCCAG00000030182 #34 ENSCCAG00000036235 #35 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 106 N4BP2L2 (ENSSBOG00000027888) PDS5B (ENSSBOG00000024183) ENSSBOG00000007092 ##22 KL (ENSSBOG00000021191) STARD13 (ENSSBOG00000033967) RFC3 (ENSSBOG00000002113) MAB21L1 (ENSSBOG00000015537) NBEA (ENSSBOG00000036122) DCLK1 (ENSSBOG00000035278) SOHLH2 (ENSSBOG00000034504) CCDC169 (ENSSBOG00000030756) SPART (ENSSBOG00000022178) CCNA1 (ENSSBOG00000024788) ENSSBOG00000031402 SERTM1 (ENSSBOG00000018464) ENSSBOG00000031771 RFXAP (ENSSBOG00000027209) SMAD9 (ENSSBOG00000030748) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 17 COX16 (ENSPANG00000034762) ENSPANG00000035478 SYNJ2BP (ENSPANG00000010342) ADAM20 (ENSPANG00000048884) ENSPANG00000039971 MED6 (ENSPANG00000036307) TTC9 (ENSPANG00000017558) MAP3K9 (ENSPANG00000024112) PCNX1 (ENSPANG00000018659) ENSPANG00000049489 SIPA1L1 (ENSPANG00000010341) ENSPANG00000043598 RGS6 (ENSPANG00000006945) DPF3 (ENSPANG00000018213) DCAF4 (ENSPANG00000016403) ENSPANG00000000607 ##22 ZFYVE1 (ENSPANG00000009729) RBM25 (ENSPANG00000018212) PSEN1 (ENSPANG00000006859) PAPLN (ENSPANG00000009728) NUMB (ENSPANG00000026174) ENSPANG00000026271 ENSPANG00000031897 DNAL1 (ENSPANG00000015764) PNMA1 (ENSPANG00000003663) ENSPANG00000015765 ENSPANG00000029412 PTGR2 (ENSPANG00000015767) ZNF410 (ENSPANG00000013439) FAM161B (ENSPANG00000018775) COQ6 (ENSPANG00000022438) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162400 ENSGT00940000160666 ENSGT00940000158731 ENSGT00940000154677.g.b ENSGT00390000017736.a ENSGT00390000014577.a.i ENSGT00940000163018 ENSGT00940000156612 ENSGT00390000002109 ENSGT00940000156296 ENSGT00940000154904.b ENSGT00940000163609 ENSGT00940000154685.b ENSGT00940000163004 ENSGT00940000155319 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000163123 ENSGT00940000161987 ENSGT00940000163227 ENSGT00940000163321 ENSGT00940000163993 ENSGT00940000163789 ENSGT00940000162719 ENSGT00940000162140 ENSGT00940000162751 ENSGT00940000161796 ENSGT00940000161945 ENSGT00940000154735.db.b ENSGT00940000161161.b ENSGT00940000161941 ENSGT00730000111328 Chimpanzee MODERN SPECIES 3 A2ML1 (ENSPTRG00000004645) PHC1 (ENSPTRG00000004647) M6PR (ENSPTRG00000004648) KLRG1 (ENSPTRG00000004649) A2M (ENSPTRG00000004650) PZP (ENSPTRG00000004652) ENSPTRG00000046748 ENSPTRG00000044384 ENSPTRG00000045267 ENSPTRG00000047644 DDX11 (ENSPTRG00000004804) ENSPTRG00000044752 ENSPTRG00000052015 KLRB1 (ENSPTRG00000004656) CLEC2D (ENSPTRG00000043256) ENSPTRG00000042970 ##22 CLECL1 (ENSPTRG00000004658) CD69 (ENSPTRG00000004659) KLRF1 (ENSPTRG00000004660) CLEC2B (ENSPTRG00000004661) KLRF2 (ENSPTRG00000042023) CLEC2A (ENSPTRG00000004662) CLEC12A (ENSPTRG00000039976) CLEC1B (ENSPTRG00000004664) CLEC12B (ENSPTRG00000004663) CLEC9A (ENSPTRG00000022678) CLEC1A (ENSPTRG00000004666) ENSPTRG00000048246 CLEC7A (ENSPTRG00000004667) OLR1 (ENSPTRG00000004668) TMEM52B (ENSPTRG00000004669) Bonobo MODERN SPECIES 3 AICDA (ENSPPAG00000038169) ENSPPAG00000034360 MFAP5 (ENSPPAG00000039297) RIMKLB (ENSPPAG00000029802) A2ML1 (ENSPPAG00000036011) PHC1 (ENSPPAG00000030042) M6PR (ENSPPAG00000036879) KLRG1 (ENSPPAG00000040135) A2M (ENSPPAG00000027498) PZP (ENSPPAG00000035493) ENSPPAG00000025405 ENSPPAG00000042963 KLRB1 (ENSPPAG00000031614) ENSPPAG00000042683 ENSPPAG00000043051 ENSPPAG00000039851 ##22 ENSPPAG00000023274 CD69 (ENSPPAG00000039246) KLRF1 (ENSPPAG00000040358) CLEC2B (ENSPPAG00000042048) KLRF2 (ENSPPAG00000039440) CLEC2A (ENSPPAG00000043122) CLEC12A (ENSPPAG00000000670) CLEC1B (ENSPPAG00000032879) CLEC12B (ENSPPAG00000030399) CLEC9A (ENSPPAG00000035185) CLEC1A (ENSPPAG00000042203) ENSPPAG00000041555 CLEC7A (ENSPPAG00000029575) OLR1 (ENSPPAG00000026910) TMEM52B (ENSPPAG00000031349) Gorilla MODERN SPECIES 3 ENSGGOG00000024007 ENSGGOG00000022717 RIMKLB (ENSGGOG00000000332) A2ML1 (ENSGGOG00000004629) PHC1 (ENSGGOG00000010735) M6PR (ENSGGOG00000010747) ENSGGOG00000041505 KLRG1 (ENSGGOG00000008059) A2M (ENSGGOG00000013727) PZP (ENSGGOG00000005938) ENSGGOG00000028434 ENSGGOG00000040959 KLRB1 (ENSGGOG00000005970) ENSGGOG00000039235 CLEC2D (ENSGGOG00000013106) ENSGGOG00000036702 ##22 ENSGGOG00000000257 CD69 (ENSGGOG00000002549) KLRF1 (ENSGGOG00000026169) CLEC2B (ENSGGOG00000014313) KLRF2 (ENSGGOG00000038281) ENSGGOG00000022633 CLEC12A (ENSGGOG00000043881) CLEC1B (ENSGGOG00000005700) CLEC12B (ENSGGOG00000008840) CLEC9A (ENSGGOG00000000198) CLEC1A (ENSGGOG00000008545) ENSGGOG00000028444 CLEC7A (ENSGGOG00000004490) ENSGGOG00000013210 TMEM52B (ENSGGOG00000028581) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00900000143489 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00900000143489 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00900000143489 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866.db.a #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866.db.a #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866.eb #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a Arabian camel MODERN SPECIES 14 RARS1 (ENSCDRG00005007078) FBLL1 (ENSCDRG00005007060) #7 PANK3 (ENSCDRG00005007025) #8 SLIT3 (ENSCDRG00005006931) #9 SPDL1 (ENSCDRG00005006854) #10 INSYN2B (ENSCDRG00005006819) #11 DOCK2 (ENSCDRG00005006556) #12 FOXI1 (ENSCDRG00005006523) #13 C5orf58 (ENSCDRG00005006496) LCP2 (ENSCDRG00005006345) #15 KCNMB1 (ENSCDRG00005006283) #16 KCNIP1 (ENSCDRG00005006051) #18 GABRP (ENSCDRG00005005990) #19 RANBP17 (ENSCDRG00005005894) #20 TLX3 (ENSCDRG00005005878) #21 ENSCDRG00005005702 ##22 FGF18 (ENSCDRG00005005676) #23 FBXW11 (ENSCDRG00005005462) #25 STK10 (ENSCDRG00005005406) #27 EFCAB9 (ENSCDRG00005005368) #28 UBTD2 (ENSCDRG00005005351) #29 SH3PXD2B (ENSCDRG00005005308) #30 NEURL1B (ENSCDRG00005005289) #31 DUSP1 (ENSCDRG00005005269) #32 ENSCDRG00005005259 #32 ERGIC1 (ENSCDRG00005005118) #33 RPL26L1 (ENSCDRG00005005086) ENSCDRG00005005054 #34 ENSCDRG00005005036 CREBRF (ENSCDRG00005005000) #35 BNIP1 (ENSCDRG00005004968) #36 Alpaca MODERN SPECIES 2317 ENSVPAG00000002441 #18 GABRP (ENSVPAG00000002443) #19 RANBP17 (ENSVPAG00000002444) #20 ENSVPAG00000002450 ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866.db.a #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Cetacea DUPLICATION Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.j ##22 Blue whale MODERN SPECIES 12 TOM1L2 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whale MODERN SPECIES 17 PARPBP (ENSPCTG00005016310) PMCH (ENSPCTG00005016493) IGF1 (ENSPCTG00005016550) PAH (ENSPCTG00005016692) ASCL1 (ENSPCTG00005016858) ENSPCTG00005016886 STAB2 (ENSPCTG00005017013) NT5DC3 (ENSPCTG00005017736) HSP90B1 (ENSPCTG00005018513) C6H12orf73 (ENSPCTG00005018570) ENSPCTG00005018623 TDG (ENSPCTG00005018640) GLT8D2 (ENSPCTG00005018709) HCFC2 (ENSPCTG00005018737) NFYB (ENSPCTG00005018775) ENSPCTG00005018803 ##22 TXNRD1 (ENSPCTG00005018838) ENSPCTG00005019044 CHST11 (ENSPCTG00005019084) ENSPCTG00005019155 SLC41A2 (ENSPCTG00005019190) C6H12orf45 (ENSPCTG00005019243) ALDH1L2 (ENSPCTG00005019294) WASHC4 (ENSPCTG00005019327) APPL2 (ENSPCTG00005019471) C6H12orf75 (ENSPCTG00005019785) ENSPCTG00005019877 NUAK1 (ENSPCTG00005019927) CKAP4 (ENSPCTG00005019993) TCP11L2 (ENSPCTG00005020009) POLR3B (ENSPCTG00005020061) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.k.a.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 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(ENSPSNG00000007915) #21 ENSPSNG00000007851 ##22 FGF18 (ENSPSNG00000007820) #23 SMIM23 (ENSPSNG00000007767) #24 FBXW11 (ENSPSNG00000007701) #25 ENSPSNG00000007596 STK10 (ENSPSNG00000007570) #27 EFCAB9 (ENSPSNG00000007521) #28 UBTD2 (ENSPSNG00000007475) #29 SH3PXD2B (ENSPSNG00000007402) #30 NEURL1B (ENSPSNG00000007317) #31 DUSP1 (ENSPSNG00000007271) #32 ERGIC1 (ENSPSNG00000007216) #33 RPL26L1 (ENSPSNG00000007180) ENSPSNG00000007148 #34 CREBRF (ENSPSNG00000007099) #35 BNIP1 (ENSPSNG00000007042) #36 Dolphin MODERN SPECIES 2762 RANBP17 (ENSTTRG00000008362) #20 TLX3 (ENSTTRG00000008369) #21 ENSTTRG00000008370 ##22 FGF18 (ENSTTRG00000008375) #23 Blue whale DUPLICATION Blue whale MODERN SPECIES 3 IRAK1BP1 (ENSBMSG00010014893) PHIP (ENSBMSG00010014858) HMGN3 (ENSBMSG00010014805) LCA5 (ENSBMSG00010014743) ENSBMSG00010014719 ELOVL4 (ENSBMSG00010014673) TTK (ENSBMSG00010014603) BCKDHB (ENSBMSG00010014540) ENSBMSG00010014511 ENSBMSG00010014491 TENT5A (ENSBMSG00010014385) ENSBMSG00010014356 ENSBMSG00010014338 IBTK (ENSBMSG00010014267) TPBG (ENSBMSG00010014234) ENSBMSG00010014221 ##22 UBE3D (ENSBMSG00010014192) DOP1A (ENSBMSG00010013981) PGM3 (ENSBMSG00010011334) RWDD2A (ENSBMSG00010011300) ME1 (ENSBMSG00010011286) ENSBMSG00010011265 PRSS35 (ENSBMSG00010011257) SNAP91 (ENSBMSG00010011047) RIPPLY2 (ENSBMSG00010010972) CYB5R4 (ENSBMSG00010010955) MRAP2 (ENSBMSG00010010923) CEP162 (ENSBMSG00010010866) TBX18 (ENSBMSG00010010836) ENSBMSG00010010824 NT5E (ENSBMSG00010010752) Blue whale MODERN SPECIES 14 C1QTNF2 (ENSBMSG00010010310) CCNJL (ENSBMSG00010010325) FABP6 (ENSBMSG00010010332) PWWP2A (ENSBMSG00010010346) TTC1 (ENSBMSG00010010355) ADRA1B (ENSBMSG00010010374) ENSBMSG00010010381 IL12B (ENSBMSG00010010391) ENSBMSG00010010400 RNF145 (ENSBMSG00010010449) KCNMB1 (ENSBMSG00010010631) #16 ENSBMSG00010010657 #18 GABRP (ENSBMSG00010010718) #19 RANBP17 (ENSBMSG00010010778) #20 TLX3 (ENSBMSG00010010805) #21 ENSBMSG00010010827 ##22 FGF18 (ENSBMSG00010010843) #23 SMIM23 (ENSBMSG00010010861) #24 FBXW11 (ENSBMSG00010010896) #25 ENSBMSG00010010999 STK10 (ENSBMSG00010011007) #27 ENSBMSG00010011019 EFCAB9 (ENSBMSG00010011022) #28 UBTD2 (ENSBMSG00010011030) #29 ENSBMSG00010011045 SH3PXD2B (ENSBMSG00010011059) #30 NEURL1B (ENSBMSG00010011096) #31 DUSP1 (ENSBMSG00010011183) #32 ERGIC1 (ENSBMSG00010011201) #33 RPL26L1 (ENSBMSG00010011223) ENSBMSG00010011236 #34 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.k.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.k.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.k.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.k.b ##22 Vaquita MODERN SPECIES 34 GPR119 (ENSPSNG00000021286) SLC25A14 (ENSPSNG00000021178) ZNF280C (ENSPSNG00000021118) RAB33A (ENSPSNG00000021088) AIFM1 (ENSPSNG00000020896) ELF4 (ENSPSNG00000020769) BCORL1 (ENSPSNG00000020696) ENSPSNG00000020526 ENSPSNG00000020494 ZDHHC9 (ENSPSNG00000020463) SASH3 (ENSPSNG00000020412) XPNPEP2 (ENSPSNG00000020259) ENSPSNG00000020221 OCRL (ENSPSNG00000020175) SMARCA1 (ENSPSNG00000020057) ENSPSNG00000019998 ##22 ENSPSNG00000019967 PRR32 (ENSPSNG00000019940) DCAF12L1 (ENSPSNG00000019924) DCAF12L2 (ENSPSNG00000019910) ENSPSNG00000019888 TENM1 (ENSPSNG00000019528) SH2D1A (ENSPSNG00000019428) STAG2 (ENSPSNG00000019195) XIAP (ENSPSNG00000019138) THOC2 (ENSPSNG00000018864) GRIA3 (ENSPSNG00000018786) ENSPSNG00000018741 ENSPSNG00000018728 ENSPSNG00000018684 C1GALT1C1 (ENSPSNG00000018655) Blue whale MODERN SPECIES 40 ENSBMSG00010016289 FAM199X (ENSBMSG00010016256) ENSBMSG00010020585 SLC25A53 (ENSBMSG00010020578) ENSBMSG00010020566 GPRASP2 (ENSBMSG00010020553) GPRASP1 (ENSBMSG00010020542) BEX5 (ENSBMSG00010020535) ENSBMSG00010020523 ENSBMSG00010020515 NXF3 (ENSBMSG00010020486) BEX4 (ENSBMSG00010020472) ENSBMSG00010020463 ENSBMSG00010020443 TCEAL7 (ENSBMSG00010020437) ENSBMSG00010020430 ##22 TCEAL9 (ENSBMSG00010020422) ENSBMSG00010020404 ENSBMSG00010020360 ARMCX2 (ENSBMSG00010020339) ARMCX3 (ENSBMSG00010020327) ARMCX6 (ENSBMSG00010020308) ARMCX1 (ENSBMSG00010020297) ENSBMSG00010020286 HNRNPH2 (ENSBMSG00010020275) GLA (ENSBMSG00010020265) RPL36A (ENSBMSG00010020241) BTK (ENSBMSG00010019923) ENSBMSG00010019879 TAF7L (ENSBMSG00010019762) DRP2 (ENSBMSG00010019675) Pecora ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866.db.a #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a Percora_a DUPLICATION Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l ##22 Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 367 L2HGDH (ENSMMSG00000014759) DMAC2L (ENSMMSG00000014785) CDKL1 (ENSMMSG00000014797) MAP4K5 (ENSMMSG00000014820) ATL1 (ENSMMSG00000014871) SAV1 (ENSMMSG00000014902) NIN (ENSMMSG00000014951) PYGL (ENSMMSG00000015265) ABHD12B (ENSMMSG00000015404) TRIM9 (ENSMMSG00000015468) TMX1 (ENSMMSG00000015541) FRMD6 (ENSMMSG00000015570) GNG2 (ENSMMSG00000015632) ENSMMSG00000015674 NID2 (ENSMMSG00000015694) ENSMMSG00000015752 ##22 ENSMMSG00000015763 PTGDR (ENSMMSG00000015794) ENSMMSG00000015839 ENSMMSG00000015854 PLEKHO2 (ENSMMSG00000015873) PIF1 (ENSMMSG00000015904) ENSMMSG00000015991 OAZ2 (ENSMMSG00000016048) ZNF609 (ENSMMSG00000016094) TRIP4 (ENSMMSG00000016140) ENSMMSG00000016175 CSNK1G1 (ENSMMSG00000016321) PPIB (ENSMMSG00000016470) SNX22 (ENSMMSG00000016511) SNX1 (ENSMMSG00000016577) Siberian musk deer MODERN SPECIES 349 SLC39A10 (ENSMMSG00000010018) DNAH7 (ENSMMSG00000010078) ENSMMSG00000010454 ##22 STK17B (ENSMMSG00000010475) HECW2 (ENSMMSG00000010520) ENSMMSG00000010563 ENSMMSG00000010586 ENSMMSG00000010610 GTF3C3 (ENSMMSG00000010673) C2orf66 (ENSMMSG00000010760) PGAP1 (ENSMMSG00000010803) ANKRD44 (ENSMMSG00000010957) SF3B1 (ENSMMSG00000011033) COQ10B (ENSMMSG00000011136) HSPD1 (ENSMMSG00000011233) ENSMMSG00000011286 MOB4 (ENSMMSG00000011395) RFTN2 (ENSMMSG00000011573) Bovidae DUPLICATION Bovidae DUPLICATION Bovidae DUPLICATION Bovidae DUPLICATION Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.a ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.a ##22 Goat MODERN SPECIES 12 SPZ1 (ENSCHIG00000003966) ENSCHIG00000010867 PANK3 (ENSCHIG00000017246) #8 SLIT3 (ENSCHIG00000007677) #9 SPDL1 (ENSCHIG00000015214) #10 ENSCHIG00000022506 #12 INSYN2B (ENSCHIG00000008171) #11 FOXI1 (ENSCHIG00000015541) #13 LCP2 (ENSCHIG00000020683) #15 KCNMB1 (ENSCHIG00000016254) #16 ENSCHIG00000019721 KCNIP1 (ENSCHIG00000022505) #18 GABRP (ENSCHIG00000013304) #19 ENSCHIG00000007336 #20 TLX3 (ENSCHIG00000009023) #21 ENSCHIG00000013986 ##22 FGF18 (ENSCHIG00000011455) #23 ENSCHIG00000020677 FBXW11 (ENSCHIG00000015807) #25 STK10 (ENSCHIG00000022275) #27 UBTD2 (ENSCHIG00000008177) #29 ENSCHIG00000019482 SH3PXD2B (ENSCHIG00000017285) #30 NEURL1B (ENSCHIG00000011973) #31 DUSP1 (ENSCHIG00000021879) #32 ERGIC1 (ENSCHIG00000000491) #33 RPL26L1 (ENSCHIG00000015371) ENSCHIG00000023731 #34 CREBRF (ENSCHIG00000011720) #35 BNIP1 (ENSCHIG00000007910) #36 NKX2-5 (ENSCHIG00000017420) #37 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.a ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.a ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.a ##22 Cow MODERN SPECIES 12 ENSBTAG00000047333 OR5I1FP (ENSBTAG00000000617) SPZ1 (ENSBTAG00000024593) PANK3 (ENSBTAG00000011895) #8 SLIT3 (ENSBTAG00000017746) #9 SPDL1 (ENSBTAG00000008180) #10 DOCK2 (ENSBTAG00000014612) #12 INSYN2B (ENSBTAG00000002134) #11 FOXI1 (ENSBTAG00000014620) #13 LCP2 (ENSBTAG00000009381) #15 KCNMB1 (ENSBTAG00000002985) #16 KCNIP1 (ENSBTAG00000002865) #18 GABRP (ENSBTAG00000002779) #19 RANBP17 (ENSBTAG00000024801) #20 TLX3 (ENSBTAG00000010003) #21 NPM1 (ENSBTAG00000015316) ##22 FGF18 (ENSBTAG00000000128) #23 ENSBTAG00000054615 ENSBTAG00000053610 FBXW11 (ENSBTAG00000015376) #25 STK10 (ENSBTAG00000017457) #27 EFCAB9 (ENSBTAG00000008876) #28 UBTD2 (ENSBTAG00000034659) #29 SH3PXD2B (ENSBTAG00000009019) #30 NEURL1B (ENSBTAG00000001429) #31 DUSP1 (ENSBTAG00000013863) #32 ERGIC1 (ENSBTAG00000015955) #33 RPL26L1 (ENSBTAG00000015099) ATP6V0E1 (ENSBTAG00000015100) #34 CREBRF (ENSBTAG00000002020) #35 BNIP1 (ENSBTAG00000002021) #36 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156079 ENSGT00940000157280 ENSGT00940000156658 ENSGT00940000154725 ENSGT00950000182872.f.a.b ENSGT00940000158587 ENSGT00940000159104 ENSGT00940000159300 ENSGT00940000156215.f ENSGT00390000011144 ENSGT00940000158506 ENSGT00940000159760 ENSGT00530000064699 ENSGT00940000159042 ENSGT00390000002143.a ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000158742 ENSGT00940000158547 ENSGT00390000015159.b ENSGT00950000183140.a.a.m.a.a.b ENSGT00940000155285.b.b ENSGT00940000159198 ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000013961 ENSGT00390000011137 ENSGT00390000011759 ENSGT00940000162935 ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156079 ENSGT00940000157280 ENSGT00940000156658 ENSGT00940000154725 ENSGT00950000182872.f.a.b ENSGT00940000158587 ENSGT00940000159104 ENSGT00940000159300 ENSGT00940000156215.f ENSGT00390000011144 ENSGT00940000158506 ENSGT00940000159760 ENSGT00530000064699 ENSGT00940000159042 ENSGT00390000002143.a ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000158742 ENSGT00940000158547 ENSGT00390000015159.b ENSGT00950000183140.a.a.m.a.a.b ENSGT00940000154509.z ENSGT00940000155285.b.b ENSGT00940000166198 ENSGT00940000160886 ENSGT00940000159198 ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000013961 ENSGT00390000011137 ENSGT00390000011759 ENSGT00940000162935 ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a Bos ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156079 ENSGT00940000157280 ENSGT00940000156658 ENSGT00940000154725 ENSGT00950000182872.f.a.b ENSGT00940000158587 ENSGT00940000159104 ENSGT00940000159300 ENSGT00940000156215.f ENSGT00390000011144 ENSGT00940000158506 ENSGT00940000159760 ENSGT00530000064699 ENSGT00940000159042 ENSGT00390000002143.a ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000158742 ENSGT00940000158547 ENSGT00390000015159.b ENSGT00950000183140.a.a.m.a.a.b ENSGT00940000154509.z ENSGT00940000155285.b.b ENSGT00940000166198 ENSGT00940000160886.d ENSGT00940000159198 ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000013961 ENSGT00390000011137 ENSGT00390000011759 ENSGT00940000162935 ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a Bos_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000156079 ENSGT00940000157280 ENSGT00940000156658 ENSGT00940000154725 ENSGT00950000182872.f.a.b ENSGT00940000158587 ENSGT00940000159300 ENSGT00940000159104 ENSGT00940000156215.f ENSGT00390000011144 ENSGT00940000158506 ENSGT00940000159760 ENSGT00530000064699 ENSGT00940000159042.a ENSGT00390000002143.a ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000158742 ENSGT00940000158547 ENSGT00390000015159.b ENSGT00390000018141.i.a.a.a.b.b ENSGT00950000183140.a.a.m.a.a.b ENSGT00940000154509.z ENSGT00940000155285.b.b ENSGT00940000166198 ENSGT00940000160886.d ENSGT00940000159198 ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000013961 ENSGT00390000011137 ENSGT00390000011759 ENSGT00940000162935 Cow MODERN SPECIES 5 FAM135B (ENSBTAG00000018218) KHDRBS3 (ENSBTAG00000002181) ZFAT (ENSBTAG00000017731) ST3GAL1 (ENSBTAG00000001156) NDRG1 (ENSBTAG00000000711) CCN4 (ENSBTAG00000000707) TG (ENSBTAG00000007823) SLA (ENSBTAG00000007828) PHF20L1 (ENSBTAG00000006869) TMEM71 (ENSBTAG00000017138) DNAAF11 (ENSBTAG00000010548) KCNQ3 (ENSBTAG00000020667) HHLA1 (ENSBTAG00000034196) OC90 (ENSBTAG00000007736) EFR3A (ENSBTAG00000047834) ENSBTAG00000003838 ##22 ADCY8 (ENSBTAG00000014600) ASAP1 (ENSBTAG00000003185) CYRIB (ENSBTAG00000020801) ENSBTAG00000052291 GSDMC (ENSBTAG00000017478) ENSBTAG00000050216 MYC (ENSBTAG00000008409) ENSBTAG00000052622 ENSBTAG00000050469 LRATD2 (ENSBTAG00000026172) TRIB1 (ENSBTAG00000023179) NSMCE2 (ENSBTAG00000009394) WASHC5 (ENSBTAG00000010275) SQLE (ENSBTAG00000005498) ZNF572 (ENSBTAG00000009072) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 5 FAM135B (ENSBIXG00005031125) KHDRBS3 (ENSBIXG00005031144) ZFAT (ENSBIXG00005031165) NDRG1 (ENSBIXG00005031191) CCN4 (ENSBIXG00005031198) TG (ENSBIXG00005031209) ENSBIXG00005031228 SLA (ENSBIXG00005031229) PHF20L1 (ENSBIXG00005031232) TMEM71 (ENSBIXG00005031248) DNAAF11 (ENSBIXG00005031261) KCNQ3 (ENSBIXG00005031272) HHLA1 (ENSBIXG00005031286) ENSBIXG00005031289 EFR3A (ENSBIXG00005031297) ENSBIXG00005031307 ##22 ADCY8 (ENSBIXG00005031309) ASAP1 (ENSBIXG00005005233) ENSBIXG00005029009 CYRIB (ENSBIXG00005002096) ENSBIXG00005005063 GSDMC (ENSBIXG00005028921) ENSBIXG00005005029 MYC (ENSBIXG00005028785) ENSBIXG00005004952 ENSBIXG00005004951 ENSBIXG00005002377 ENSBIXG00005028619 ENSBIXG00005006639 LRATD2 (ENSBIXG00005028575) TRIB1 (ENSBIXG00005028498) Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.b ##22 Wild yak MODERN SPECIES 1148 ENSBMUG00000005495 ##22 ADCY8 (ENSBMUG00000005531) ASAP1 (ENSBMUG00000006493) CYRIB (ENSBMUG00000007935) GSDMC (ENSBMUG00000007958) ENSBMUG00000007963 MYC (ENSBMUG00000008022) American bison MODERN SPECIES 3118 EFR3A (ENSBBBG00000023024) ENSBBBG00000022875 ##22 ADCY8 (ENSBBBG00000022858) ASAP1 (ENSBBBG00000022792) CYRIB (ENSBBBG00000022674) ENSBBBG00000022581 ENSBBBG00000022571 MYC (ENSBBBG00000022548) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156079 ENSGT00940000157280 ENSGT00940000156658 ENSGT00940000154725 ENSGT00950000182872.f.a.b ENSGT00940000158587 ENSGT00940000159104 ENSGT00940000159300 ENSGT00940000156215.f ENSGT00390000011144 ENSGT00940000158506 ENSGT00940000159760 ENSGT00530000064699 ENSGT00940000159042 ENSGT00390000002143.a ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000158742 ENSGT00940000158547 ENSGT00390000015159.b ENSGT00950000183140.a.a.m.a.a.b ENSGT00940000155285.b.b ENSGT00940000159198 ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000013961 ENSGT00390000011137 ENSGT00390000011759 ENSGT00940000162935 ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 Goat MODERN SPECIES 5 ENSCHIG00000019586 KHDRBS3 (ENSCHIG00000016533) ZFAT (ENSCHIG00000013122) ST3GAL1 (ENSCHIG00000021799) NDRG1 (ENSCHIG00000015852) CCN4 (ENSCHIG00000012315) SLA (ENSCHIG00000017077) TG (ENSCHIG00000026405) PHF20L1 (ENSCHIG00000009054) TMEM71 (ENSCHIG00000013935) DNAAF11 (ENSCHIG00000008846) KCNQ3 (ENSCHIG00000022278) HHLA1 (ENSCHIG00000009769) OC90 (ENSCHIG00000014260) EFR3A (ENSCHIG00000022409) ENSCHIG00000008417 ##22 ADCY8 (ENSCHIG00000026047) ASAP1 (ENSCHIG00000020558) ENSCHIG00000005794 ENSCHIG00000018918 MYC (ENSCHIG00000013686) LRATD2 (ENSCHIG00000009416) TRIB1 (ENSCHIG00000021266) NSMCE2 (ENSCHIG00000027170) WASHC5 (ENSCHIG00000012199) SQLE (ENSCHIG00000025130) ZNF572 (ENSCHIG00000013612) MTSS1 (ENSCHIG00000023315) NDUFB9 (ENSCHIG00000020741) TATDN1 (ENSCHIG00000024616) RNF139 (ENSCHIG00000021860) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.b ##22 Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 23 FERMT2 (ENSOARG00020012866) SORD (ENSOARG00020012388) DUOX2 (ENSOARG00020011873) DUOXA2 (ENSOARG00020011766) DUOXA1 (ENSOARG00020011656) DUOX1 (ENSOARG00020010050) SHF (ENSOARG00020009604) SLC28A2 (ENSOARG00020009490) GATM (ENSOARG00020009432) SPATA5L1 (ENSOARG00020009315) C15orf48 (ENSOARG00020009251) SLC30A4 (ENSOARG00020009191) BLOC1S6 (ENSOARG00020009083) ENSOARG00020009067 SQOR (ENSOARG00020009009) ENSOARG00020008972 ##22 ENSOARG00020008939 ENSOARG00020008904 ENSOARG00020008854 ENSOARG00020008828 ENSOARG00020008814 SEMA6D (ENSOARG00020008460) SLC24A5 (ENSOARG00020008222) MYEF2 (ENSOARG00020007659) CTXN2 (ENSOARG00020007622) SLC12A1 (ENSOARG00020007145) ENSOARG00020006888 FBN1 (ENSOARG00020006413) ENSOARG00020006361 CEP152 (ENSOARG00020006167) ENSOARG00020006136 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 24 ZBTB2 (ENSOARG00020021872) RMND1 (ENSOARG00020021897) ARMT1 (ENSOARG00020021948) CCDC170 (ENSOARG00020021972) ESR1 (ENSOARG00020022045) SYNE1 (ENSOARG00020022335) MYCT1 (ENSOARG00020024842) VIP (ENSOARG00020024851) FBXO5 (ENSOARG00020024869) MTRF1L (ENSOARG00020024904) RGS17 (ENSOARG00020024922) ENSOARG00020024931 OPRM1 (ENSOARG00020024943) IPCEF1 (ENSOARG00020024992) CNKSR3 (ENSOARG00020025010) ENSOARG00020025048 ##22 ENSOARG00020025060 ENSOARG00020025094 SCAF8 (ENSOARG00020025109) ENSOARG00020025142 TIAM2 (ENSOARG00020025148) TFB1M (ENSOARG00020025200) CLDN20 (ENSOARG00020025258) NOX3 (ENSOARG00020003085) ENSOARG00020003115 ARID1B (ENSOARG00020003186) TMEM242 (ENSOARG00020003775) ZDHHC14 (ENSOARG00020003801) SNX9 (ENSOARG00020003963) RPS25 (ENSOARG00020004228) SYNJ2 (ENSOARG00020004254) Bovidae DUPLICATION Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.b.a ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155602.j ENSGT00510000046985.h.b.a.a.a ENSGT00390000000118 ENSGT00950000183188.B ENSGT00390000015035 ENSGT00940000154957.B ENSGT00940000157167 ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00960000191042 ENSGT00530000063909.b ENSGT00940000160249.e ENSGT00940000159175 ENSGT00940000160249.f ENSGT00940000159418 ENSGT01060000248556.C ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.b.a ##22 ENSGT00390000010221 ENSGT00940000156016 ENSGT00940000154983.c.b ENSGT01030000234595.B.c.b ENSGT00940000156681 ENSGT00940000158203 ENSGT00940000158437 ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000155209 ENSGT00940000156019 ENSGT00940000153362.a.cb.a.a.b ENSGT01100000263506.a.f.a.a.a.a.b ENSGT00940000159379 ENSGT00940000153372.A.f.s.b ENSGT00940000153372.A.f.t Bos ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000011295.b ENSGT00940000155602.j ENSGT00510000046985.h.b.a.a.a ENSGT00390000000118 ENSGT00950000183188.B ENSGT00390000015035 ENSGT00940000154957.B ENSGT00940000157167 ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00960000191042 ENSGT00530000063909.b ENSGT00940000160249.e ENSGT00940000159175 ENSGT00940000159418 ENSGT01060000248556.C ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.b.a ##22 ENSGT00390000010221 ENSGT00940000156016 ENSGT00940000154983.c.b ENSGT01030000234595.B.c.b ENSGT00940000156681 ENSGT00940000158203 ENSGT00940000158437 ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000155209 ENSGT00940000156019 ENSGT00940000153362.a.cb.a.a.b ENSGT01100000263506.a.f.a.a.a.a.b ENSGT00940000159379 ENSGT00940000153372.A.f.s.b ENSGT00940000153372.A.f.t Bos_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183188.B ENSGT00390000015035 ENSGT00940000154957.B ENSGT00940000157167 ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00960000191042 ENSGT00530000063909.b ENSGT00940000160249.e ENSGT00940000175433 ENSGT00940000155287.p ENSGT00940000159175 ENSGT00950000186219 ENSGT00940000155287.o ENSGT00940000159418 ENSGT01060000248556.C ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.b.a ##22 ENSGT00390000010221 ENSGT00940000156016 ENSGT00940000154586.j.h ENSGT00940000154983.c.b ENSGT01030000234595.B.c.b ENSGT00940000156681 ENSGT00940000158203 ENSGT00940000158437 ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000155209 ENSGT00940000156019 ENSGT00940000159379 ENSGT00940000153372.A.f.s.b ENSGT00940000153372.A.f.t ENSGT00940000153372.A.f.s.a Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 23 NUP42 (ENSBIXG00005020467) GPNMB (ENSBIXG00005020528) MALSU1 (ENSBIXG00005003472) IGF2BP3 (ENSBIXG00005020602) TRA2A (ENSBIXG00005020646) CCDC126 (ENSBIXG00005020716) DBF4 (ENSBIXG00005020728) ENSBIXG00005020760 ENSBIXG00005020805 ENSBIXG00005021204 RUNDC3B (ENSBIXG00005021322) ENSBIXG00005021366 ENSBIXG00005021456 ABCB4 (ENSBIXG00005007678) CROT (ENSBIXG00005021594) ENSBIXG00005021635 ##22 TMEM243 (ENSBIXG00005021654) DMTF1 (ENSBIXG00005021807) ENSBIXG00005021826 ENSBIXG00005021856 ELAPOR2 (ENSBIXG00005022210) ENSBIXG00005006832 GRM3 (ENSBIXG00005022303) SEMA3D (ENSBIXG00005003818) SEMA3A (ENSBIXG00005022440) SEMA3E (ENSBIXG00005022548) PCLO (ENSBIXG00005022768) ENSBIXG00005022835 ENSBIXG00005022862 CACNA2D1 (ENSBIXG00005023176) HGF (ENSBIXG00005007384) Cow MODERN SPECIES 23 MALSU1 (ENSBTAG00000019403) IGF2BP3 (ENSBTAG00000019406) TRA2A (ENSBTAG00000012622) CCDC126 (ENSBTAG00000013010) ENSBTAG00000052932 DBF4 (ENSBTAG00000014711) SLC25A40 (ENSBTAG00000054987) ENSBTAG00000052947 ENSBTAG00000015666 RUNDC3B (ENSBTAG00000021313) ENSBTAG00000033449 ENSBTAG00000052401 ENSBTAG00000005997 ABCB4 (ENSBTAG00000005653) CROT (ENSBTAG00000021535) ENSBTAG00000035379 ##22 TMEM243 (ENSBTAG00000038283) DMTF1 (ENSBTAG00000020878) ENSBTAG00000019276 ELAPOR2 (ENSBTAG00000004023) GRM3 (ENSBTAG00000018989) SEMA3D (ENSBTAG00000024394) SEMA3A (ENSBTAG00000018133) SEMA3E (ENSBTAG00000014920) PCLO (ENSBTAG00000017350) CACNA2D1 (ENSBTAG00000020569) HGF (ENSBTAG00000017664) SEMA3C (ENSBTAG00000006138) ENSBTAG00000047646 ENSBTAG00000014220 CD36 (ENSBTAG00000017866) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183087.A.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000011295.b ENSGT00940000155602.j ENSGT00510000046985.h.b.a.a.a ENSGT00390000000118 ENSGT00950000183188.B ENSGT00390000015035 ENSGT00940000154957.B ENSGT00940000157167 ENSGT00940000153470.a.a.a.b ENSGT00960000191042 ENSGT00530000063909.b ENSGT00940000160249.f ENSGT00940000159418 ENSGT01060000248556.C ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.b.a ##22 ENSGT00390000010221 ENSGT00940000156016 ENSGT00940000154983.c.b ENSGT01030000234595.B.c.b ENSGT00940000156681 ENSGT00940000158203 ENSGT00940000158437 ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000155209 ENSGT00940000156019 ENSGT00940000153362.a.cb.a.a.b ENSGT01100000263506.a.f.a.a.a.a.b ENSGT00940000159379 ENSGT00940000153372.A.f.s.b ENSGT00940000153372.A.f.t Wild yak MODERN SPECIES 1231 CROT (ENSBMUG00000010674) ENSBMUG00000010705 ##22 TMEM243 (ENSBMUG00000010722) DMTF1 (ENSBMUG00000010793) ELAPOR2 (ENSBMUG00000010901) GRM3 (ENSBMUG00000010947) American bison MODERN SPECIES 3314 ABCB1 (ENSBBBG00000002353) ENSBBBG00000001891 ENSBBBG00000002373 CROT (ENSBBBG00000012479) ENSBBBG00000012502 ##22 TMEM243 (ENSBBBG00000012514) DMTF1 (ENSBBBG00000012608) ELAPOR2 (ENSBBBG00000007401) GRM3 (ENSBBBG00000001816) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.b.a ##22 Goat MODERN SPECIES 22 ENSCHIG00000001509 ZFP69 (ENSCHIG00000008554) EXO5 (ENSCHIG00000007542) ZNF684 (ENSCHIG00000014482) ENSCHIG00000018474 RIMS3 (ENSCHIG00000008574) NFYC (ENSCHIG00000021122) KCNQ4 (ENSCHIG00000014613) CITED4 (ENSCHIG00000013877) CTPS1 (ENSCHIG00000026631) SLFNL1 (ENSCHIG00000015962) SCMH1 (ENSCHIG00000024918) FOXO6 (ENSCHIG00000018218) EDN2 (ENSCHIG00000024063) HIVEP3 (ENSCHIG00000011517) ENSCHIG00000012856 ##22 GUCA2B (ENSCHIG00000019738) GUCA2A (ENSCHIG00000005275) FOXJ3 (ENSCHIG00000021942) RIMKLA (ENSCHIG00000015404) ZMYND12 (ENSCHIG00000007728) PPCS (ENSCHIG00000022863) CCDC30 (ENSCHIG00000018207) ENSCHIG00000007905 ENSCHIG00000014169 CLDN19 (ENSCHIG00000017870) P3H1 (ENSCHIG00000008788) C1orf50 (ENSCHIG00000015103) ENSCHIG00000017910 SVBP (ENSCHIG00000008164) ENSCHIG00000013284 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.b.b ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b ENSGT00390000013727.c ENSGT00390000003768 ENSGT00510000049215 ENSGT00940000161800 ENSGT00950000183083.b ENSGT00940000158724 ENSGT00940000157630 ENSGT00390000015127 ENSGT00390000002560 ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.b.b ##22 ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b ENSGT00390000013502.b ENSGT00390000015231 ENSGT00390000005496.k ENSGT00940000158056 ENSGT00510000047399 ENSGT00940000155005 ENSGT00940000158561 ENSGT01050000245159 ENSGT00950000183161.b ENSGT00940000160256.b ENSGT00940000160945 ENSGT00940000161099 ENSGT00940000162771 ENSGT00940000161339 Bos ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b ENSGT00390000013727.c ENSGT00390000003768 ENSGT00510000049215 ENSGT00940000161800 ENSGT00950000183083.b ENSGT00940000158724 ENSGT00940000157630 ENSGT00390000015127 ENSGT00390000002560 ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.b.b ##22 ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b ENSGT00390000013502.b ENSGT00390000015231 ENSGT00390000005496.k ENSGT00940000158056 ENSGT00510000047399 ENSGT00940000155005 ENSGT00940000158561 ENSGT01050000245159 ENSGT00950000183161.b ENSGT00940000160256.b ENSGT00940000160945 ENSGT00940000161099 ENSGT00940000162771 ENSGT00940000161339 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b ENSGT00390000013727.c ENSGT00390000003768 ENSGT00510000049215 ENSGT00940000161800 ENSGT00950000183083.b ENSGT00940000158724 ENSGT00940000157630 ENSGT00390000015127 ENSGT00390000002560 ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.b.b ##22 ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b ENSGT00390000013502.b ENSGT00390000015231 ENSGT00390000005496.k ENSGT00940000158056 ENSGT00510000047399 ENSGT00940000155005 ENSGT00940000158561 ENSGT01050000245159 ENSGT00950000183161.b ENSGT00940000160256.b ENSGT00940000160945 ENSGT00940000161099 ENSGT00940000162771 ENSGT00940000161339 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 7 NPPA (ENSBIXG00005021133) ENSBIXG00005021152 KIAA2013 (ENSBIXG00005021208) PLOD1 (ENSBIXG00005021238) MFN2 (ENSBIXG00005021331) MIIP (ENSBIXG00005021362) TNFRSF8 (ENSBIXG00005003612) ENSBIXG00005021444 VPS13D (ENSBIXG00005021515) DHRS3 (ENSBIXG00005021601) AADACL4 (ENSBIXG00005021643) ENSBIXG00005021667 TNFSF4 (ENSBIXG00005021715) ENSBIXG00005021734 TNFSF18 (ENSBIXG00005021755) ENSBIXG00005021775 ##22 FASLG (ENSBIXG00005021795) SUCO (ENSBIXG00005021901) ENSBIXG00005003700 C1orf105 (ENSBIXG00005003707) ENSBIXG00005007845 ENSBIXG00005003723 ENSBIXG00005003731 DNM3 (ENSBIXG00005003773) METTL13 (ENSBIXG00005022250) VAMP4 (ENSBIXG00005022319) MYOC (ENSBIXG00005003815) ENSBIXG00005022368 PRRC2C (ENSBIXG00005022520) FMO4 (ENSBIXG00005022627) FMO1 (ENSBIXG00005003889) Cow MODERN SPECIES 7 NPPB (ENSBTAG00000021739) KIAA2013 (ENSBTAG00000019388) PLOD1 (ENSBTAG00000002052) MFN2 (ENSBTAG00000005314) MIIP (ENSBTAG00000019556) TNFRSF8 (ENSBTAG00000039937) TNFRSF1B (ENSBTAG00000024928) VPS13D (ENSBTAG00000016080) DHRS3 (ENSBTAG00000024493) AADACL4 (ENSBTAG00000055061) ENSBTAG00000020550 TNFSF4 (ENSBTAG00000002894) ENSBTAG00000053302 ENSBTAG00000052047 TNFSF18 (ENSBTAG00000047412) ENSBTAG00000016347 ##22 FASLG (ENSBTAG00000032808) SUCO (ENSBTAG00000010169) PIGC (ENSBTAG00000024542) C16H1orf105 (ENSBTAG00000051882) ENSBTAG00000048915 DNM3 (ENSBTAG00000014319) METTL13 (ENSBTAG00000017721) VAMP4 (ENSBTAG00000020591) MYOC (ENSBTAG00000020342) PRRC2C (ENSBTAG00000001821) FMO4 (ENSBTAG00000016685) FMO1 (ENSBTAG00000021408) FMO2 (ENSBTAG00000002974) ENSBTAG00000047256 FMO3 (ENSBTAG00000020597) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b ENSGT00390000013727.c ENSGT00390000003768 ENSGT00510000049215 ENSGT00940000161800 ENSGT00950000183083.b ENSGT00940000158724 ENSGT00940000157630 ENSGT00390000015127 ENSGT00390000002560 ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.b.b ##22 ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b ENSGT00390000013502.b ENSGT00390000015231 ENSGT00390000005496.k ENSGT00940000158056 ENSGT00510000047399 ENSGT00940000155005 ENSGT00940000158561 ENSGT01050000245159 ENSGT00950000183161.b ENSGT00940000160256.b ENSGT00940000160945 ENSGT00940000161099 ENSGT00940000162771 ENSGT00940000161339 Domestic yak MODERN SPECIES 5 CLCN6 (ENSBGRG00000008810) NPPA (ENSBGRG00000008736) ENSBGRG00000008719 KIAA2013 (ENSBGRG00000008665) PLOD1 (ENSBGRG00000008467) MFN2 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(ENSBBBG00000022669) TNFSF4 (ENSBBBG00000022690) ENSBBBG00000022704 TNFSF18 (ENSBBBG00000005979) ENSBBBG00000022731 ##22 FASLG (ENSBBBG00000022740) SUCO (ENSBBBG00000007337) ENSBBBG00000022833 C1orf105 (ENSBBBG00000006015) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.d ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.d ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 5 ENSOARG00020012548 ENSOARG00020012621 ZNF793 (ENSOARG00020012689) ENSOARG00020012902 ZNF383 (ENSOARG00020013124) ENSOARG00020013186 ZNF527 (ENSOARG00020013225) ZNF569 (ENSOARG00020013295) ZNF570 (ENSOARG00020013432) ENSOARG00020013494 ENSOARG00020013516 ENSOARG00020013537 ENSOARG00020013579 ZFP30 (ENSOARG00020013643) ENSOARG00020013728 ENSOARG00020013765 ##22 ENSOARG00020013806 ENSOARG00020013828 SIPA1L3 (ENSOARG00020014274) ENSOARG00020014345 DPF1 (ENSOARG00020014415) PPP1R14A (ENSOARG00020014667) ENSOARG00020014802 YIF1B (ENSOARG00020014827) KCNK6 (ENSOARG00020015049) CATSPERG (ENSOARG00020015126) PSMD8 (ENSOARG00020016783) SPRED3 (ENSOARG00020017011) FAM98C (ENSOARG00020017181) RASGRP4 (ENSOARG00020017469) RYR1 (ENSOARG00020021448) Goat MODERN SPECIES 9 ZNF566 (ENSCHIG00000001451) ZFP82 (ENSCHIG00000018313) ENSCHIG00000021469 ENSCHIG00000023659 ZNF793 (ENSCHIG00000026130) ENSCHIG00000021599 ZNF383 (ENSCHIG00000026946) ENSCHIG00000016562 ZNF527 (ENSCHIG00000013920) ZNF569 (ENSCHIG00000015245) ZNF570 (ENSCHIG00000016831) ENSCHIG00000024889 ENSCHIG00000018395 ZFP30 (ENSCHIG00000014053) ENSCHIG00000026239 ENSCHIG00000012256 ##22 ENSCHIG00000010861 WDR87 (ENSCHIG00000023559) SIPA1L3 (ENSCHIG00000013381) DPF1 (ENSCHIG00000010729) PPP1R14A (ENSCHIG00000013911) SPINT2 (ENSCHIG00000019574) YIF1B (ENSCHIG00000013902) KCNK6 (ENSCHIG00000021596) CATSPERG (ENSCHIG00000011318) PSMD8 (ENSCHIG00000026335) GGN (ENSCHIG00000017540) SPRED3 (ENSCHIG00000027252) FAM98C (ENSCHIG00000019659) RASGRP4 (ENSCHIG00000027087) RYR1 (ENSCHIG00000014164) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.d ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.d ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.d ##22 Domestic yak MODERN SPECIES 2 SECISBP2L (ENSBGRG00000014018) SHC4 (ENSBGRG00000014591) ENSBGRG00000014971 ENSBGRG00000014994 CEP152 (ENSBGRG00000015031) FBN1 (ENSBGRG00000015364) ENSBGRG00000016185 SLC12A1 (ENSBGRG00000016691) CTXN2 (ENSBGRG00000017870) MYEF2 (ENSBGRG00000017891) SLC24A5 (ENSBGRG00000018186) SEMA6D (ENSBGRG00000018349) SQOR (ENSBGRG00000018720) BLOC1S6 (ENSBGRG00000018884) SLC30A4 (ENSBGRG00000018987) ENSBGRG00000019041 ##22 C15orf48 (ENSBGRG00000019087) SPATA5L1 (ENSBGRG00000019163) ENSBGRG00000019317 GATM (ENSBGRG00000019341) SLC28A2 (ENSBGRG00000019499) SHF (ENSBGRG00000019626) DUOX1 (ENSBGRG00000020085) DUOXA1 (ENSBGRG00000020344) DUOXA2 (ENSBGRG00000020365) DUOX2 (ENSBGRG00000020426) SORD (ENSBGRG00000020659) ENSBGRG00000021022 FERMT2 (ENSBGRG00000021063) DDHD1 (ENSBGRG00000021474) ENSBGRG00000022535 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b.m ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866.db.a #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a Bovidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000182767.a.b.b ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b.m ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866.db.a #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a Bovinae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000182767.a.b.b ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b.m ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT01000000218258 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 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#35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00950000182767.a.b.b ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903.a #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b.m ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT01000000218258 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.d ENSGT00940000156866.db.a #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 12 SPZ1 (ENSBIXG00005020375) PANK3 (ENSBIXG00005006597) #8 SLIT3 (ENSBIXG00005020326) #9 SPDL1 (ENSBIXG00005006400) #10 DOCK2 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ENSGT00940000158996 #37 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 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(ENSVVUG00000017871) ENSVVUG00000017873 ENSVVUG00000017884 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00940000156866.fb #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a ENSGT00940000154979 Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 32 FBLL1 (ENSCAFG00845003123) #7 PANK3 (ENSCAFG00845003068) #8 SLIT3 (ENSCAFG00845002910) #9 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(ENSFCAG00000030268) ##22 FGF18 (ENSFCAG00000007079) #23 SMIM23 (ENSFCAG00000044613) #24 FBXW11 (ENSFCAG00000027834) #25 STK10 (ENSFCAG00000000434) #27 EFCAB9 (ENSFCAG00000016235) #28 UBTD2 (ENSFCAG00000044346) #29 SH3PXD2B (ENSFCAG00000038295) #30 NEURL1B (ENSFCAG00000031157) #31 DUSP1 (ENSFCAG00000037697) #32 ERGIC1 (ENSFCAG00000011258) #33 RPL26L1 (ENSFCAG00000026949) ATP6V0E1 (ENSFCAG00000031789) #34 CREBRF (ENSFCAG00000000534) #35 BNIP1 (ENSFCAG00000000536) #36 NKX2-5 (ENSFCAG00000000539) #37 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a Equus DUPLICATION Equus ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00530000063370.b ENSGT00390000002626 ENSGT00950000182923.C ENSGT00940000162471 ENSGT00940000162077 ENSGT00390000004019 ENSGT00940000160650 ENSGT00940000159671 ENSGT00390000013684 ENSGT00730000111077 ENSGT00940000157386 ENSGT00390000006208.b ENSGT00390000004850 ENSGT00390000000059 ENSGT00390000018130.a.a.b ENSGT00940000153052.c.b.a.b.v ##22 ENSGT00940000157272 ENSGT00390000018806 ENSGT00390000014052 ENSGT00390000009869 ENSGT00940000159368 ENSGT01020000230354.B.b.a.b ENSGT00950000183018.a.c ENSGT00390000013777 ENSGT00940000161893 ENSGT00940000155991 ENSGT00940000162366 ENSGT00940000154849.b ENSGT00940000154191.i.b ENSGT00390000013711 ENSGT00940000161542 Horse MODERN SPECIES 29 PES1 (ENSECAG00000002578) GAL3ST1 (ENSECAG00000018909) SEC14L4 (ENSECAG00000049903) SEC14L3 (ENSECAG00000039616) MTFP1 (ENSECAG00000018122) SEC14L2 (ENSECAG00000019540) RNF215 (ENSECAG00000020939) CCDC157 (ENSECAG00000021659) SF3A1 (ENSECAG00000023962) TBC1D10A (ENSECAG00000018611) CASTOR1 (ENSECAG00000024204) OSM (ENSECAG00000042076) LIF (ENSECAG00000030554) HORMAD2 (ENSECAG00000015457) MTMR3 (ENSECAG00000019738) ENSECAG00000018581 ##22 ASCC2 (ENSECAG00000023271) ZMAT5 (ENSECAG00000017576) CABP7 (ENSECAG00000020228) NF2 (ENSECAG00000022976) NIPSNAP1 (ENSECAG00000021731) THOC5 (ENSECAG00000011444) NEFH (ENSECAG00000018444) AP1B1 (ENSECAG00000019246) GAS2L1 (ENSECAG00000017735) EWSR1 (ENSECAG00000022120) RHBDD3 (ENSECAG00000022744) EMID1 (ENSECAG00000023554) KREMEN1 (ENSECAG00000008652) C8H22orf31 (ENSECAG00000011607) ZNRF3 (ENSECAG00000011694) Donkey MODERN SPECIES 28 PES1 (ENSEASG00005010295) GAL3ST1 (ENSEASG00005010289) ENSEASG00005010286 SEC14L4 (ENSEASG00005010279) SEC14L3 (ENSEASG00005010272) MTFP1 (ENSEASG00005010270) SEC14L2 (ENSEASG00005010263) RNF215 (ENSEASG00005010261) CCDC157 (ENSEASG00005010257) SF3A1 (ENSEASG00005010254) TBC1D10A (ENSEASG00005010251) CASTOR1 (ENSEASG00005010249) OSM (ENSEASG00005030079) LIF (ENSEASG00005027424) HORMAD2 (ENSEASG00005010236) ENSEASG00005030615 ##22 MTMR3 (ENSEASG00005010216) ASCC2 (ENSEASG00005010196) UQCR10 (ENSEASG00005033921) ZMAT5 (ENSEASG00005010189) CABP7 (ENSEASG00005010187) NF2 (ENSEASG00005010184) NIPSNAP1 (ENSEASG00005010096) THOC5 (ENSEASG00005010083) NEFH (ENSEASG00005010080) AP1B1 (ENSEASG00005010070) RASL10A (ENSEASG00005027499) GAS2L1 (ENSEASG00005010066) EWSR1 (ENSEASG00005010055) RHBDD3 (ENSEASG00005010050) EMID1 (ENSEASG00005010047) Equus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b.w ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00950000183120.e.b.a.a.b.b.a.b ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 Horse MODERN SPECIES 5 RARS1 (ENSECAG00000024383) PANK3 (ENSECAG00000020948) #8 SLIT3 (ENSECAG00000000495) #9 SPDL1 (ENSECAG00000018544) #10 INSYN2B (ENSECAG00000018408) #11 DOCK2 (ENSECAG00000009761) #12 FOXI1 (ENSECAG00000006873) #13 ENSECAG00000042392 LCP2 (ENSECAG00000021603) #15 KCNMB1 (ENSECAG00000021360) #16 KCNIP1 (ENSECAG00000019400) #18 ENSECAG00000050403 GABRP 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ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00560000078585 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.b.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 16 FBLL1 (ENSRFEG00010020446) #7 PANK3 (ENSRFEG00010020457) #8 SLIT3 (ENSRFEG00010020487) #9 SPDL1 (ENSRFEG00010020541) #10 DOCK2 (ENSRFEG00010020581) #12 INSYN2B (ENSRFEG00010020694) #11 FOXI1 (ENSRFEG00010020710) #13 C5orf58 (ENSRFEG00010020729) LCP2 (ENSRFEG00010020758) #15 KCNIP1 (ENSRFEG00010020846) #18 KCNMB1 (ENSRFEG00010020917) #16 GABRP (ENSRFEG00010005792) #19 ENSRFEG00010005874 RANBP17 (ENSRFEG00010005910) #20 TLX3 (ENSRFEG00010005948) #21 ENSRFEG00010006113 ##22 FGF18 (ENSRFEG00010006277) #23 FBXW11 (ENSRFEG00010006429) #25 STK10 (ENSRFEG00010006622) #27 EFCAB9 (ENSRFEG00010006675) #28 UBTD2 (ENSRFEG00010006696) #29 SH3PXD2B (ENSRFEG00010006731) #30 NEURL1B (ENSRFEG00010006802) #31 DUSP1 (ENSRFEG00010006882) #32 ERGIC1 (ENSRFEG00010006938) #33 RPL26L1 (ENSRFEG00010007037) ENSRFEG00010007076 #34 CREBRF (ENSRFEG00010007123) #35 BNIP1 (ENSRFEG00010007189) #36 NKX2-5 (ENSRFEG00010007273) #37 STC2 (ENSRFEG00010007301) Megabat MODERN SPECIES 2641 KCNMB1 (ENSPVAG00000002204) #16 KCNIP1 (ENSPVAG00000002206) #18 GABRP (ENSPVAG00000002208) #19 RANBP17 (ENSPVAG00000002209) #20 TLX3 (ENSPVAG00000002210) #21 ENSPVAG00000002211 ##22 FGF18 (ENSPVAG00000002212) #23 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Microbat MODERN SPECIES 940 NEMP2 (ENSMLUG00000010935) NAB1 (ENSMLUG00000017687) ENSMLUG00000010045 STAT1 (ENSMLUG00000010083) ENSMLUG00000000057 MYO1B (ENSMLUG00000000058) NABP1 (ENSMLUG00000012075) CAVIN2 (ENSMLUG00000015774) TMEFF2 (ENSMLUG00000007530) ENSMLUG00000028828 ##22 SLC39A10 (ENSMLUG00000007527) DNAH7 (ENSMLUG00000007538) STK17B (ENSMLUG00000007648) HECW2 (ENSMLUG00000007654) CCDC150 (ENSMLUG00000001986) GTF3C3 (ENSMLUG00000024692) PGAP1 (ENSMLUG00000010784) ANKRD44 (ENSMLUG00000010842) ENSMLUG00000005254 SF3B1 (ENSMLUG00000000840) COQ10B (ENSMLUG00000000865) ENSMLUG00000000871 HSPE1 (ENSMLUG00000000878) ENSMLUG00000000883 MOB4 (ENSMLUG00000004971) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Ferret MODERN SPECIES 170 ENSMPUG00000005839 OSBPL1A (ENSMPUG00000005858) IMPACT (ENSMPUG00000006271) HRH4 (ENSMPUG00000006279) ENSMPUG00000006318 ZNF521 (ENSMPUG00000006327) ENSMPUG00000006336 ENSMPUG00000006340 SS18 (ENSMPUG00000006348) PSMA8 (ENSMPUG00000006359) TAF4B (ENSMPUG00000006462) ENSMPUG00000006530 AQP4 (ENSMPUG00000006589) CHST9 (ENSMPUG00000006597) CDH2 (ENSMPUG00000006602) ENSMPUG00000006618 ##22 DSC3 (ENSMPUG00000006644) DSC2 (ENSMPUG00000006720) DSC1 (ENSMPUG00000006835) DSG1 (ENSMPUG00000006844) DSG4 (ENSMPUG00000006860) DSG3 (ENSMPUG00000006917) DSG2 (ENSMPUG00000006935) TTR (ENSMPUG00000006945) B4GALT6 (ENSMPUG00000006952) TRAPPC8 (ENSMPUG00000006957) RNF125 (ENSMPUG00000006975) RNF138 (ENSMPUG00000006982) MEP1B (ENSMPUG00000006993) GAREM1 (ENSMPUG00000007080) KLHL14 (ENSMPUG00000007086) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 11 TADA3 (ENSHGLG00000016125) ARPC4 (ENSHGLG00000007365) TTLL3 (ENSHGLG00000012292) RPUSD3 (ENSHGLG00000011722) CIDEC (ENSHGLG00000013573) IL17RE (ENSHGLG00000013446) IL17RC (ENSHGLG00000010789) CRELD1 (ENSHGLG00000019547) ENSHGLG00000018322 EMC3 (ENSHGLG00000018335) FANCD2 (ENSHGLG00000016165) FANCD2OS (ENSHGLG00000021223) ENSHGLG00000035278 ENSHGLG00000007041 SEC13 (ENSHGLG00000016676) ENSHGLG00000033106 ##22 GHRL (ENSHGLG00000016347) TATDN2 (ENSHGLG00000014225) ENSHGLG00000014561 ENSHGLG00000039395 ENSHGLG00000019782 ENSHGLG00000048266 ENSHGLG00000050768 TTC6 (ENSHGLG00000000647) ENSHGLG00000019925 SSTR1 (ENSHGLG00000046762) ENSHGLG00000033056 ENSHGLG00000003651 ENSHGLG00000003857 ENSHGLG00000047469 ENSHGLG00000045717 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Tarsier MODERN SPECIES 5938 ENSTSYG00000001998 PTPRB (ENSTSYG00000002140) KCNMB4 (ENSTSYG00000030945) ##16 CNOT2 (ENSTSYG00000012927) MYRFL (ENSTSYG00000005162) RAB3IP (ENSTSYG00000006842) BEST3 (ENSTSYG00000006780) ENSTSYG00000033989 ##22 CCT2 (ENSTSYG00000011458) FRS2 (ENSTSYG00000035362) YEATS4 (ENSTSYG00000012469) LYZ (ENSTSYG00000012468) CPSF6 (ENSTSYG00000008591) CPM (ENSTSYG00000002934) ENSTSYG00000036692 ENSTSYG00000035774 ENSTSYG00000003135 PIM3 (ENSTSYG00000032442) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 299 ENSSBOG00000030843 ENSSBOG00000022295 ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 478 CD164 (ENSANAG00000012591) PPIL6 (ENSANAG00000023713) SMPD2 (ENSANAG00000028732) MICAL1 (ENSANAG00000034803) ZBTB24 (ENSANAG00000023992) AK9 (ENSANAG00000028754) FIG4 (ENSANAG00000026338) GPR6 (ENSANAG00000024209) WASF1 (ENSANAG00000014957) CDC40 (ENSANAG00000018830) METTL24 (ENSANAG00000029394) DDO (ENSANAG00000033581) SLC22A16 (ENSANAG00000037609) ENSANAG00000034647 CDK19 (ENSANAG00000032334) ENSANAG00000022354 ##22 ENSANAG00000031910 AMD1 (ENSANAG00000027502) ENSANAG00000026549 ENSANAG00000035971 SLC16A10 (ENSANAG00000028401) MFSD4B (ENSANAG00000026781) REV3L (ENSANAG00000027204) TRAF3IP2 (ENSANAG00000025661) FYN (ENSANAG00000038326) CCN6 (ENSANAG00000024472) TUBE1 (ENSANAG00000028697) FAM229B (ENSANAG00000036970) LAMA4 (ENSANAG00000022474) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00520000061410 ENSGT00950000182990.a.a.b.b ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00950000183316 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ENSGT00730000111073 ENSGT00530000063866.d ENSGT00390000013802.v.b.d ENSGT00530000063866.c.a ENSGT00390000013802.v.a ENSGT00390000013802.v.b.c ENSGT00530000063866.c.b ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000155073.b ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00390000007552.f.x ENSGT00940000159914 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159589 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159139 ENSGT00390000008374 ENSGT00390000002615 ENSGT00510000049875 ENSGT00400000022873 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000061410 ENSGT00950000182990.a.a.b.b ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00950000183316 ENSGT00910000147498 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ENSGT00730000111073 ENSGT00530000063866.d ENSGT00390000013802.v.b.d ENSGT00530000063866.c.a ENSGT00390000013802.v.b.c ENSGT00530000063866.c.b ENSGT00940000153052.c.a.a.a ##22 ENSGT00390000013802.v.a ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000155073.b ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00390000007552.f.x ENSGT00940000159914 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159589 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159139 ENSGT00390000008374 ENSGT00390000002615.o.a ENSGT00510000049875 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00950000183316 ENSGT00910000147498 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ENSGT00730000111073 ENSGT00950000183014.f.b.a.a.t.g.a.b ENSGT00530000063866.d ENSGT00390000013802.v.b.d ENSGT00530000063866.c.a ENSGT00390000013802.v.b.c ENSGT00530000063866.c.b ENSGT00940000153052.c.a.a.a ##22 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT01090000263362 ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00390000007552.f.x.y.a ENSGT00390000007552.f.x.y.b ENSGT00940000159914 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159589 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159139 ENSGT00390000008374 ENSGT00390000002615.o.a ENSGT00510000049875 ENSGT00390000001930 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 600 ENSRBIG00000031562 FADS2 (ENSRBIG00000043060) ENSRBIG00000023735 FADS3 (ENSRBIG00000035575) RAB3IL1 (ENSRBIG00000013414) BEST1 (ENSRBIG00000027850) FTH1 (ENSRBIG00000044604) INCENP (ENSRBIG00000040656) ENSRBIG00000038214 SCGB1D1 (ENSRBIG00000034273) SCGB2A1 (ENSRBIG00000041379) SCGB1D2 (ENSRBIG00000032475) ENSRBIG00000039690 SCGB1D4 (ENSRBIG00000044615) ENSRBIG00000026802 ENSRBIG00000027474 ##22 ASRGL1 (ENSRBIG00000008615) ENSRBIG00000037491 ENSRBIG00000032801 ENSRBIG00000042208 TUT1 (ENSRBIG00000021240) MTA2 (ENSRBIG00000038336) EML3 (ENSRBIG00000029464) ROM1 (ENSRBIG00000033282) B3GAT3 (ENSRBIG00000012660) GANAB (ENSRBIG00000040636) INTS5 (ENSRBIG00000045006) ENSRBIG00000030851 CSKMT (ENSRBIG00000037785) UQCC3 (ENSRBIG00000038515) UBXN1 (ENSRBIG00000028404) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182990.a.a.b.b ENSGT01090000263457 ENSGT00950000183316 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ENSGT00730000111073 ENSGT00530000063866.d ENSGT00390000013802.v.b.d ENSGT00530000063866.c.a ENSGT00390000013802.v.b.c ENSGT00530000063866.c.b ENSGT00940000153052.c.a.a.a ##22 ENSGT00390000013802.v.a ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000155073.b ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00390000007552.f.x ENSGT00940000159914 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159589 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159139 ENSGT00390000008374 ENSGT00390000002615.o.a ENSGT00510000049875 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00980000199420 ENSGT00910000147498 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ENSGT00390000011666.x.a.e.a ENSGT00730000111073 ENSGT00530000063866.d ENSGT00390000013802.v.b.d 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ENSMNEG00000031419 CSKMT (ENSMNEG00000032750) UQCC3 (ENSMNEG00000009079) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00980000199420 ENSGT00910000147498 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ENSGT00390000011666.x.a.e.a ENSGT00730000111073 ENSGT00530000063866.d ENSGT00390000013802.v.b.d ENSGT00530000063866.c.a ENSGT00390000013802.v.a ENSGT00390000013802.v.b.c ENSGT00530000063866.c.b ENSGT00940000153052.c.a.a.a ##22 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000155073.b ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00390000007552.f.x ENSGT00940000159914 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159589 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159139 ENSGT00390000008374 ENSGT00390000002615.o.a ENSGT00510000049875 ENSGT00390000001930 ENSGT00940000156457 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183316 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00980000199420 ENSGT00910000147498 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 ENSGT00940000158650 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ENSGT00390000011666.x.a.e.a ENSGT00730000111073 ENSGT00530000063866.d ENSGT00390000013802.v.b.d ENSGT00530000063866.c.a ENSGT00390000013802.v.b.c ENSGT00530000063866.c.b ENSGT00940000153052.c.a.a.a ##22 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000155073.b ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00390000007552.f.x ENSGT00940000159914 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159589 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159139 ENSGT00390000008374 ENSGT00390000002615.o.a ENSGT00510000049875 ENSGT00390000001930 ENSGT00940000156457 Drill MODERN SPECIES 1111 ENSMLEG00000041423 ENSMLEG00000024484 FADS2 (ENSMLEG00000039664) ENSMLEG00000044256 ENSMLEG00000021942 FADS3 (ENSMLEG00000043283) RAB3IL1 (ENSMLEG00000043733) BEST1 (ENSMLEG00000034408) ENSMLEG00000042552 INCENP (ENSMLEG00000043817) SCGB1D1 (ENSMLEG00000042430) SCGB2A1 (ENSMLEG00000035453) SCGB1D2 (ENSMLEG00000035930) 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(ENSCATG00000038495) TUT1 (ENSCATG00000036770) MTA2 (ENSCATG00000037060) EML3 (ENSCATG00000043181) ROM1 (ENSCATG00000043968) B3GAT3 (ENSCATG00000043834) GANAB (ENSCATG00000037474) INTS5 (ENSCATG00000032127) CSKMT (ENSCATG00000035188) LBHD1 (ENSCATG00000037717) UQCC3 (ENSCATG00000015726) UBXN1 (ENSCATG00000036706) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a.b ##22 Drill MODERN SPECIES 1423 ENSMLEG00000033178 ##22 DMD (ENSMLEG00000026992) FAM47A (ENSMLEG00000028739) Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01100000264610 ENSGT00910000148081 ENSGT00950000182990.a.a.b.b ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a ENSGT00950000183316 ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b ENSGT00940000159102 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ENSGT00530000065045 ENSGT00910000147321.b ENSGT00940000160862 ENSGT00940000158077 ENSGT00940000161172 ENSGT00390000008044 ENSGT00940000159726 ENSGT00390000014405.e.a ENSGT00940000160592 ENSGT00940000157160.f ENSGT00390000016713 ENSGT00390000009885 ENSGT00940000158730.d ENSGT00940000153052.c.a.a.d ##22 ENSGT00940000158730.c ENSGT00390000013608 ENSGT00390000006915.c.c.b ENSGT00390000001798.c ENSGT00510000047168 ENSGT00940000158619 ENSGT00940000162067 ENSGT00930000150973.A ENSGT00940000156150.b.a.b ENSGT00390000001830.i.b ENSGT00390000000062.x.b.h ENSGT00860000135407.B ENSGT00940000154433.a.a ENSGT00940000160879 ENSGT00940000159771 Bonobo MODERN SPECIES 369 CA5B (ENSPPAG00000030955) ENSPPAG00000036333 ENSPPAG00000028785 ENSPPAG00000039307 ENSPPAG00000035025 CLTRN (ENSPPAG00000029681) ACE2 (ENSPPAG00000037947) BMX (ENSPPAG00000040357) PIR (ENSPPAG00000029891) VEGFD (ENSPPAG00000041677) PIGA (ENSPPAG00000041746) ASB11 (ENSPPAG00000028756) ASB9 (ENSPPAG00000043594) MOSPD2 (ENSPPAG00000029223) FANCB (ENSPPAG00000032670) ENSPPAG00000036646 ##22 GLRA2 (ENSPPAG00000033787) GEMIN8 (ENSPPAG00000005337) GPM6B (ENSPPAG00000038300) OFD1 (ENSPPAG00000043401) ENSPPAG00000038257 RAB9A (ENSPPAG00000024656) TCEANC (ENSPPAG00000022991) EGFL6 (ENSPPAG00000029730) ENSPPAG00000020465 ATXN3L (ENSPPAG00000006150) FAM9C (ENSPPAG00000028467) ENSPPAG00000007318 TMSB4X (ENSPPAG00000030133) TLR8 (ENSPPAG00000039752) TLR7 (ENSPPAG00000028017) Orangutan MODERN SPECIES 242 GRPR (ENSPPYG00000020152) AP1S2 (ENSPPYG00000020151) ZRSR2 (ENSPPYG00000020150) CA5B (ENSPPYG00000020149) ENSPPYG00000031174 CLTRN (ENSPPYG00000020147) ACE2 (ENSPPYG00000020146) BMX (ENSPPYG00000020145) PIR (ENSPPYG00000020144) VEGFD (ENSPPYG00000020143) PIGA (ENSPPYG00000020142) ASB11 (ENSPPYG00000020141) ASB9 (ENSPPYG00000020140) MOSPD2 (ENSPPYG00000020139) ENSPPYG00000020138 ENSPPYG00000018154 ##22 GLRA2 (ENSPPYG00000020137) ENSPPYG00000040686 GEMIN8 (ENSPPYG00000020136) GPM6B (ENSPPYG00000040776) OFD1 (ENSPPYG00000020134) ENSPPYG00000035830 RAB9A (ENSPPYG00000037977) TCEANC (ENSPPYG00000020132) EGFL6 (ENSPPYG00000020130) ATXN3L (ENSPPYG00000020129) ENSPPYG00000020128 TMSB4X (ENSPPYG00000020127) TLR8 (ENSPPYG00000020126) TLR7 (ENSPPYG00000035228) PRPS2 (ENSPPYG00000020125) Gibbon MODERN SPECIES 449 GRPR (ENSNLEG00000009513) AP1S2 (ENSNLEG00000009511) ZRSR2 (ENSNLEG00000009496) CA5B (ENSNLEG00000009483) ENSNLEG00000034587 CLTRN (ENSNLEG00000009482) ACE2 (ENSNLEG00000009423) BMX (ENSNLEG00000009395) PIR (ENSNLEG00000009370) VEGFD (ENSNLEG00000009360) ASB11 (ENSNLEG00000009345) PIGA (ENSNLEG00000009352) ASB9 (ENSNLEG00000009339) MOSPD2 (ENSNLEG00000009316) FANCB (ENSNLEG00000009295) ENSNLEG00000009293 ##22 GLRA2 (ENSNLEG00000009251) GEMIN8 (ENSNLEG00000034467) GPM6B (ENSNLEG00000009226) OFD1 (ENSNLEG00000009180) TRAPPC2 (ENSNLEG00000009176) RAB9A (ENSNLEG00000036073) TCEANC (ENSNLEG00000009169) EGFL6 (ENSNLEG00000009138) ENSNLEG00000027235 ENSNLEG00000009132 TMSB4X (ENSNLEG00000027420) TLR8 (ENSNLEG00000009126) TLR7 (ENSNLEG00000009123) ENSNLEG00000029266 PRPS2 (ENSNLEG00000031852) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.a ##22 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 4053 ENSDNOG00000018081 ANGPTL2 (ENSDNOG00000035485) ENSDNOG00000034360 ##22 ENSDNOG00000002490 GARNL3 (ENSDNOG00000008350) SLC2A8 (ENSDNOG00000008404) ZNF79 (ENSDNOG00000047558) ENSDNOG00000008412 LRSAM1 (ENSDNOG00000008428) NIBAN2 (ENSDNOG00000024691) STXBP1 (ENSDNOG00000012899) ENSDNOG00000033324 ##22 Armadillo MODERN SPECIES 2712 RNMT (ENSDNOG00000007547) FAM210A (ENSDNOG00000038989) ENSDNOG00000044868 LDLRAD4 (ENSDNOG00000048483) ENSDNOG00000041195 CEP192 (ENSDNOG00000013248) SEH1L (ENSDNOG00000001336) PTPN2 (ENSDNOG00000016588) PSMG2 (ENSDNOG00000005646) CEP76 (ENSDNOG00000005631) SPIRE1 (ENSDNOG00000000046) PRELID3A (ENSDNOG00000000045) ENSDNOG00000045740 AFG3L2 (ENSDNOG00000006459) TUBB6 (ENSDNOG00000001779) ENSDNOG00000046742 ##22 CIDEA (ENSDNOG00000041086) IMPA2 (ENSDNOG00000017480) MPPE1 (ENSDNOG00000042950) ENSDNOG00000044019 GNAL (ENSDNOG00000005581) ENSDNOG00000038243 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 3640 ENSDNOG00000040609 ##22 Armadillo MODERN SPECIES 551 ENSDNOG00000034640 ##22 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2631 ENSDNOG00000041943 ##22 ENSDNOG00000040986 Armadillo MODERN SPECIES 1673 ENSDNOG00000019697 ##22 ENSDNOG00000032157 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 137 SPDYA (ENSOGAG00000025796) WDR43 (ENSOGAG00000009879) ENSOGAG00000012108 PCARE (ENSOGAG00000029937) CLIP4 (ENSOGAG00000009897) ALK (ENSOGAG00000014350) YPEL5 (ENSOGAG00000030277) LBH (ENSOGAG00000014356) LCLAT1 (ENSOGAG00000026616) CAPN13 (ENSOGAG00000001574) GALNT14 (ENSOGAG00000003175) CAPN14 (ENSOGAG00000028994) EHD3 (ENSOGAG00000000397) XDH (ENSOGAG00000000400) SRD5A2 (ENSOGAG00000000403) ENSOGAG00000030243 ##22 ENSOGAG00000034627 MEMO1 (ENSOGAG00000010975) DPY30 (ENSOGAG00000034197) SPAST (ENSOGAG00000010207) SLC30A6 (ENSOGAG00000010211) NLRC4 (ENSOGAG00000010216) YIPF4 (ENSOGAG00000005958) BIRC6 (ENSOGAG00000005960) ENSOGAG00000028850 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 1256 ENSANAG00000033296 KIAA1614 (ENSANAG00000035945) STX6 (ENSANAG00000038302) MR1 (ENSANAG00000026295) IER5 (ENSANAG00000025354) CACNA1E (ENSANAG00000030753) GLUL (ENSANAG00000033083) TEDDM1 (ENSANAG00000028310) RGSL1 (ENSANAG00000036803) RNASEL (ENSANAG00000036044) RGS16 (ENSANAG00000033947) RGS8 (ENSANAG00000029079) NPL (ENSANAG00000024560) DHX9 (ENSANAG00000030279) SHCBP1L (ENSANAG00000030446) ENSANAG00000019097 ##22 LAMC1 (ENSANAG00000035362) LAMC2 (ENSANAG00000032212) NMNAT2 (ENSANAG00000036914) SMG7 (ENSANAG00000028114) ENSANAG00000007550 NCF2 (ENSANAG00000025682) ARPC5 (ENSANAG00000038092) RGL1 (ENSANAG00000028888) COLGALT2 (ENSANAG00000036754) ENSANAG00000022895 ENSANAG00000020185 C1orf21 (ENSANAG00000032558) ENSANAG00000021067 EDEM3 (ENSANAG00000026177) NIBAN1 (ENSANAG00000035356) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 76 CXCL14 (ENSCCAG00000026689) ENSCCAG00000025399 NEUROG1 (ENSCCAG00000024492) DCANP1 (ENSCCAG00000034427) MACROH2A1 (ENSCCAG00000007999) PITX1 (ENSCCAG00000026659) CATSPER3 (ENSCCAG00000023730) PCBD2 (ENSCCAG00000029800) TXNDC15 (ENSCCAG00000030665) ENSCCAG00000033520 C5orf24 (ENSCCAG00000025876) DDX46 (ENSCCAG00000026721) CAMLG (ENSCCAG00000034675) SEC24A (ENSCCAG00000032334) SAR1B (ENSCCAG00000037282) ENSCCAG00000026527 ##22 JADE2 (ENSCCAG00000027715) CDKN2AIPNL (ENSCCAG00000021921) UBE2B (ENSCCAG00000026429) CDKL3 (ENSCCAG00000024762) ENSCCAG00000025572 ENSCCAG00000031876 TCF7 (ENSCCAG00000026300) VDAC1 (ENSCCAG00000028384) C5orf15 (ENSCCAG00000024033) FSTL4 (ENSCCAG00000027531) HSPA4 (ENSCCAG00000036316) ENSCCAG00000031545 ENSCCAG00000015918 ZCCHC10 (ENSCCAG00000024643) ENSCCAG00000005532 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 47 CPN1 (ENSSBOG00000024485) ENSSBOG00000022350 ERLIN1 (ENSSBOG00000033053) CHUK (ENSSBOG00000024074) CWF19L1 (ENSSBOG00000027396) BLOC1S2 (ENSSBOG00000020521) ENSSBOG00000026797 PKD2L1 (ENSSBOG00000033363) SCD (ENSSBOG00000032833) WNT8B (ENSSBOG00000022114) SEC31B (ENSSBOG00000023347) NDUFB8 (ENSSBOG00000032796) HIF1AN (ENSSBOG00000023430) ENSSBOG00000018963 PAX2 (ENSSBOG00000030216) ENSSBOG00000036188 ##22 SLF2 (ENSSBOG00000034063) SEMA4G (ENSSBOG00000026805) MRPL43 (ENSSBOG00000022294) TWNK (ENSSBOG00000020346) LZTS2 (ENSSBOG00000032084) PDZD7 (ENSSBOG00000035647) SFXN3 (ENSSBOG00000032559) KAZALD1 (ENSSBOG00000032715) ENSSBOG00000030742 LBX1 (ENSSBOG00000026504) BTRC (ENSSBOG00000034480) POLL (ENSSBOG00000035823) DPCD (ENSSBOG00000024659) FBXW4 (ENSSBOG00000036214) ENSSBOG00000026520 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00520000055567.a.a.b.c.a ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a ENSGT00520000055567.a.a.b.d ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00940000154502.g.b.a ENSGT00940000155059.e ENSGT00910000147347 ENSGT00940000159497 ENSGT00950000183913 ENSGT00940000158863 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00900000143563.d ENSGT00390000016650.g.b ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000157752.b ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100.c ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00910000148230 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Gorilla MODERN SPECIES 21 ENSGGOG00000043065 ENSGGOG00000044170 ENSGGOG00000016080 CYP7A1 (ENSGGOG00000023783) SDCBP (ENSGGOG00000009019) NSMAF (ENSGGOG00000004827) TOX (ENSGGOG00000012139) ENSGGOG00000043542 CA8 (ENSGGOG00000026186) ENSGGOG00000039477 RAB2A (ENSGGOG00000043049) ENSGGOG00000043906 CHD7 (ENSGGOG00000012224) ENSGGOG00000041942 ENSGGOG00000023384 ENSGGOG00000028098 ##22 CLVS1 (ENSGGOG00000007625) ASPH (ENSGGOG00000008863) ENSGGOG00000024136 NKAIN3 (ENSGGOG00000034874) GGH (ENSGGOG00000007739) ENSGGOG00000004878 YTHDF3 (ENSGGOG00000027681) ENSGGOG00000039212 ENSGGOG00000039770 ENSGGOG00000037514 CYP7B1 (ENSGGOG00000009662) ARMC1 (ENSGGOG00000022803) MTFR1 (ENSGGOG00000007473) PDE7A (ENSGGOG00000007354) ENSGGOG00000043501 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00520000055567.a.a.b.c.a ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a ENSGT00520000055567.a.a.b.d ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00940000154502.h ENSGT00940000155059.f.b ENSGT00940000154502.g.b.a ENSGT00940000155059.e ENSGT00910000147347 ENSGT00940000159497 ENSGT00950000183913 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00390000016650.g.b ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000157752.b ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100.c ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a Pan ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00910000148739 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00520000055567.a.a.b.c.a ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00940000154502.h ENSGT00940000155059.e ENSGT00910000147347 ENSGT00940000159497 ENSGT00950000183913 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00390000016650.g.b ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 ENSGT00940000159947 ENSGT00940000156304 ENSGT00940000157752.b ENSGT00940000161484 ENSGT00940000154795.c ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000153141.B.b ENSGT00390000014100.c ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Chimpanzee MODERN SPECIES 21 ENSPTRG00000047634 FAM110B (ENSPTRG00000044402) UBXN2B (ENSPTRG00000033886) ENSPTRG00000051087 CYP7A1 (ENSPTRG00000020275) SDCBP (ENSPTRG00000020277) NSMAF (ENSPTRG00000020279) ENSPTRG00000044166 TOX (ENSPTRG00000020281) ENSPTRG00000045756 CA8 (ENSPTRG00000020283) RAB2A (ENSPTRG00000020284) CHD7 (ENSPTRG00000020286) ENSPTRG00000048385 CLVS1 (ENSPTRG00000020288) ENSPTRG00000052386 ##22 ASPH (ENSPTRG00000020289) ENSPTRG00000042694 NKAIN3 (ENSPTRG00000020292) ENSPTRG00000046745 ENSPTRG00000043036 GGH (ENSPTRG00000020293) TTPA (ENSPTRG00000020294) YTHDF3 (ENSPTRG00000049135) ENSPTRG00000048438 ENSPTRG00000050724 ENSPTRG00000022575 CYP7B1 (ENSPTRG00000020297) ARMC1 (ENSPTRG00000020298) MTFR1 (ENSPTRG00000020299) PDE7A (ENSPTRG00000030991) Bonobo DUPLICATION Bonobo MODERN SPECIES 21 ENSPPAG00000032162 ENSPPAG00000035036 ENSPPAG00000037576 CYP7A1 (ENSPPAG00000043585) ENSPPAG00000038846 NSMAF (ENSPPAG00000028955) ENSPPAG00000035380 ENSPPAG00000032155 TOX (ENSPPAG00000036301) ENSPPAG00000036688 CA8 (ENSPPAG00000037018) RAB2A (ENSPPAG00000030918) CHD7 (ENSPPAG00000033330) ENSPPAG00000036715 CLVS1 (ENSPPAG00000033393) ENSPPAG00000028711 ##22 ASPH (ENSPPAG00000036467) ENSPPAG00000029474 NKAIN3 (ENSPPAG00000034556) ENSPPAG00000035311 ENSPPAG00000032702 GGH (ENSPPAG00000036800) TTPA (ENSPPAG00000039436) ENSPPAG00000001547 YTHDF3 (ENSPPAG00000043483) ENSPPAG00000041014 ENSPPAG00000032241 ENSPPAG00000032908 CYP7B1 (ENSPPAG00000038686) ARMC1 (ENSPPAG00000041437) MTFR1 (ENSPPAG00000030706) Bonobo MODERN SPECIES 15 MAIP1 (ENSPPAG00000026692) TYW5 (ENSPPAG00000027150) C2orf69 (ENSPPAG00000035529) FTCDNL1 (ENSPPAG00000020283) ENSPPAG00000039843 SATB2 (ENSPPAG00000044026) PLCL1 (ENSPPAG00000042453) BOLL (ENSPPAG00000033757) MARS2 (ENSPPAG00000007220) RFTN2 (ENSPPAG00000026815) MOB4 (ENSPPAG00000044023) ENSPPAG00000023895 HSPD1 (ENSPPAG00000038858) COQ10B (ENSPPAG00000010452) SF3B1 (ENSPPAG00000035007) ENSPPAG00000043776 ##22 ENSPPAG00000042224 ANKRD44 (ENSPPAG00000033556) PGAP1 (ENSPPAG00000039254) C2orf66 (ENSPPAG00000029492) GTF3C3 (ENSPPAG00000002745) CCDC150 (ENSPPAG00000038945) HECW2 (ENSPPAG00000033901) STK17B (ENSPPAG00000023641) ENSPPAG00000040576 DNAH7 (ENSPPAG00000039511) SLC39A10 (ENSPPAG00000042493) ENSPPAG00000043506 TMEFF2 (ENSPPAG00000008977) ENSPPAG00000043388 CAVIN2 (ENSPPAG00000041899) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1750 ENSNGAG00000010941 ENSNGAG00000000048 ##22 Fer (ENSNGAG00000006953) Pja2 (ENSNGAG00000019138) Man2a1 (ENSNGAG00000018533) Tmem232 (ENSNGAG00000016844) Slc25a46 (ENSNGAG00000013105) ENSNGAG00000017477 Wdr36 (ENSNGAG00000015392) Camk4 (ENSNGAG00000014481) Stard4 (ENSNGAG00000001318) Nrep (ENSNGAG00000018934) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 2 Acmsd (ENSPEMG00000022800) Tmem163 (ENSPEMG00000026492) Mgat5 (ENSPEMG00000011505) Nckap5 (ENSPEMG00000011621) Lypd1 (ENSPEMG00000024961) Gpr39 (ENSPEMG00000018261) Slc35f5 (ENSPEMG00000016352) Actr3 (ENSPEMG00000013664) Dpp10 (ENSPEMG00000000215) ENSPEMG00000026874 ENSPEMG00000031118 Ddx18 (ENSPEMG00000010438) Htr5b (ENSPEMG00000008772) Ccdc93 (ENSPEMG00000013504) Insig2 (ENSPEMG00000011061) ENSPEMG00000009245 ##22 Marco (ENSPEMG00000000377) C1ql2 (ENSPEMG00000027803) Steap3 (ENSPEMG00000023815) ENSPEMG00000023706 Dbi (ENSPEMG00000023060) Tmem37 (ENSPEMG00000022811) Sctr (ENSPEMG00000012122) Cfap221 (ENSPEMG00000013124) Tmem177 (ENSPEMG00000010461) Ptpn4 (ENSPEMG00000016685) Epb41l5 (ENSPEMG00000023844) Tmem185b (ENSPEMG00000006946) Ralb (ENSPEMG00000030915) Inhbb (ENSPEMG00000029287) Gli2 (ENSPEMG00000005696) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 11 KRTAP15-1 (ENSHGLG00000036136) ENSHGLG00000032553 ENSHGLG00000050239 ENSHGLG00000044373 ENSHGLG00000046543 ENSHGLG00000033708 KRTAP26-1 (ENSHGLG00000048050) KRTAP24-1 (ENSHGLG00000037357) CLDN8 (ENSHGLG00000050332) CLDN17 (ENSHGLG00000020247) ENSHGLG00000011007 GRIK1 (ENSHGLG00000008751) BACH1 (ENSHGLG00000009238) ENSHGLG00000044029 ENSHGLG00000015419 ENSHGLG00000005844 ##22 CCT8 (ENSHGLG00000010065) USP16 (ENSHGLG00000007405) ENSHGLG00000039973 LTN1 (ENSHGLG00000005092) ENSHGLG00000036479 ENSHGLG00000017436 ENSHGLG00000037563 ENSHGLG00000015489 ENSHGLG00000048019 ADAMTS1 (ENSHGLG00000012725) CYYR1 (ENSHGLG00000044595) APP (ENSHGLG00000010888) GABPA (ENSHGLG00000040618) ATP5PF (ENSHGLG00000035504) JAM2 (ENSHGLG00000009331) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Degu MODERN SPECIES 137 PNKD (ENSODEG00000009734) SLC11A1 (ENSODEG00000006626) CTDSP1 (ENSODEG00000006942) VIL1 (ENSODEG00000009742) ENSODEG00000009384 ENSODEG00000006228 ##22 USP37 (ENSODEG00000006571) ENSODEG00000007185 PLCD4 (ENSODEG00000009216) ENSODEG00000006310 ENSODEG00000008977 ENSODEG00000008204 ENSODEG00000006989 ENSODEG00000010583 ENSODEG00000010088 TTLL4 (ENSODEG00000008937) CYP27A1 (ENSODEG00000006917) PRKAG3 (ENSODEG00000007789) WNT6 (ENSODEG00000006363) WNT10A (ENSODEG00000005957) CDK5R2 (ENSODEG00000019819) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 142 SLC44A3 (ENSCLAG00000007928) CNN3 (ENSCLAG00000008495) ALG14 (ENSCLAG00000005571) TLCD4 (ENSCLAG00000006336) RWDD3 (ENSCLAG00000009102) PTBP2 (ENSCLAG00000016295) DPYD (ENSCLAG00000009825) ENSCLAG00000004609 ##22 SNX7 (ENSCLAG00000005256) PLPPR5 (ENSCLAG00000005411) PLPPR4 (ENSCLAG00000005614) PALMD (ENSCLAG00000004333) FRRS1 (ENSCLAG00000005704) AGL (ENSCLAG00000006779) SLC35A3 (ENSCLAG00000007132) MFSD14A (ENSCLAG00000005104) SASS6 (ENSCLAG00000006884) TRMT13 (ENSCLAG00000008220) LRRC39 (ENSCLAG00000010756) DBT (ENSCLAG00000013220) RTCA (ENSCLAG00000006125) CDC14A (ENSCLAG00000006592) VCAM1 (ENSCLAG00000007563) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 880 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.c.a.b ##22 ENSGT00940000159553 #23 Armadillo MODERN SPECIES 1263 KCNIP1 (ENSDNOG00000031557) #18 GABRP (ENSDNOG00000017092) #19 RANBP17 (ENSDNOG00000011107) #20 TLX3 (ENSDNOG00000011151) #21 ENSDNOG00000003012 ##22 FGF18 (ENSDNOG00000048612) #23 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00410000025556.a.a.a.a ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.d ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000006721 ENSGT01030000234566.e.b.a.b ENSGT00410000025556.a.a.a.a ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.d ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00410000025556.a.a.a.a ENSGT00530000063407.b ENSGT00550000074792.a.b #7 ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.d ##22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.b ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 ENSGT00390000005989.a Hyrax MODERN SPECIES 6079 NPM1 (ENSPCAG00000006555) ##22 Elephant DUPLICATION Elephant MODERN SPECIES 325 ADCY10 (ENSLAFG00000005846) MPC2 (ENSLAFG00000022641) DCAF6 (ENSLAFG00000005850) GPR161 (ENSLAFG00000007242) TIPRL (ENSLAFG00000007730) SFT2D2 (ENSLAFG00000020840) TBX19 (ENSLAFG00000011227) ENSLAFG00000017780 DPT (ENSLAFG00000011745) ATP1B1 (ENSLAFG00000013066) NME7 (ENSLAFG00000013069) BLZF1 (ENSLAFG00000021576) CCDC181 (ENSLAFG00000000540) ENSLAFG00000030894 ##22 SLC19A2 (ENSLAFG00000003370) F5 (ENSLAFG00000001975) SELP (ENSLAFG00000014536) SELL (ENSLAFG00000007162) SELE (ENSLAFG00000007166) METTL18 (ENSLAFG00000014426) C1orf112 (ENSLAFG00000014427) SCYL3 (ENSLAFG00000018090) KIFAP3 (ENSLAFG00000018434) NTMT2 (ENSLAFG00000001800) GORAB (ENSLAFG00000029502) PRRX1 (ENSLAFG00000007385) MROH9 (ENSLAFG00000006740) ENSLAFG00000009092 FMO2 (ENSLAFG00000016530) Elephant DUPLICATION Elephant MODERN SPECIES 2 RARS1 (ENSLAFG00000003877) FBLL1 (ENSLAFG00000032132) #7 PANK3 (ENSLAFG00000016337) #8 ENSLAFG00000009754 #9 ENSLAFG00000027741 #9 SPDL1 (ENSLAFG00000028816) #10 DOCK2 (ENSLAFG00000006687) #12 INSYN2B (ENSLAFG00000004326) #11 FOXI1 (ENSLAFG00000026591) #13 LCP2 (ENSLAFG00000012264) #15 KCNMB1 (ENSLAFG00000000860) #16 KCNIP1 (ENSLAFG00000016800) #18 GABRP (ENSLAFG00000016812) #19 RANBP17 (ENSLAFG00000006675) #20 TLX3 (ENSLAFG00000022612) #21 ENSLAFG00000007677 ##22 FGF18 (ENSLAFG00000021964) #23 SMIM23 (ENSLAFG00000007608) #24 FBXW11 (ENSLAFG00000006465) #25 ENSLAFG00000023319 #27 EFCAB9 (ENSLAFG00000020630) #28 UBTD2 (ENSLAFG00000011441) #29 SH3PXD2B (ENSLAFG00000016210) #30 ENSLAFG00000029644 NEURL1B (ENSLAFG00000020677) #31 DUSP1 (ENSLAFG00000007743) #32 ERGIC1 (ENSLAFG00000006791) #33 RPL26L1 (ENSLAFG00000006797) CREBRF (ENSLAFG00000013690) #35 ENSLAFG00000027511 #36 NKX2-5 (ENSLAFG00000029311) #37 Elephant MODERN SPECIES 164 TAPT1 (ENSLAFG00000003952) ENSLAFG00000028231 LDB2 (ENSLAFG00000000552) QDPR (ENSLAFG00000004518) CLRN2 (ENSLAFG00000016844) LAP3 (ENSLAFG00000016929) MED28 (ENSLAFG00000016936) FAM184B (ENSLAFG00000015420) NCAPG (ENSLAFG00000009686) ENSLAFG00000009691 SLIT2 (ENSLAFG00000017738) PACRGL (ENSLAFG00000005786) KCNIP4 (ENSLAFG00000005792) ADGRA3 (ENSLAFG00000003897) GBA3 (ENSLAFG00000029577) ENSLAFG00000030988 ##22 PPARGC1A (ENSLAFG00000012981) DHX15 (ENSLAFG00000005466) SOD3 (ENSLAFG00000022899) CCDC149 (ENSLAFG00000007108) LGI2 (ENSLAFG00000002475) SEPSECS (ENSLAFG00000010804) PI4K2B (ENSLAFG00000012228) ZCCHC4 (ENSLAFG00000012234) ANAPC4 (ENSLAFG00000012242) ENSLAFG00000026426 ENSLAFG00000013325 SEL1L3 (ENSLAFG00000012362) ENSLAFG00000007091 RBPJ (ENSLAFG00000000410) CCKAR (ENSLAFG00000000294) Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 4053 ENSDNOG00000033324 ##22 STXBP1 (ENSDNOG00000012899) NIBAN2 (ENSDNOG00000024691) LRSAM1 (ENSDNOG00000008428) ENSDNOG00000008412 ZNF79 (ENSDNOG00000047558) SLC2A8 (ENSDNOG00000008404) GARNL3 (ENSDNOG00000008350) ENSDNOG00000002490 ENSDNOG00000034360 ##22 ANGPTL2 (ENSDNOG00000035485) ENSDNOG00000018081 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 379 ENSDNOG00000039989 TEK (ENSDNOG00000008017) IFT74 (ENSDNOG00000038538) PLAA (ENSDNOG00000033337) CAAP1 (ENSDNOG00000016488) ENSDNOG00000046080 ##22 Armadillo MODERN SPECIES 520 KIF2A (ENSDNOG00000009367) DIMT1 (ENSDNOG00000009391) ENSDNOG00000035465 ENSDNOG00000044248 ENSDNOG00000038216 ENSDNOG00000032880 ENSDNOG00000039437 ##22 RNF180 (ENSDNOG00000003461) Armadillo MODERN SPECIES 1628 ENSDNOG00000049249 ##22 ENSDNOG00000040661 ENSDNOG00000040640 ENSDNOG00000040216 ABCC2 (ENSDNOG00000000321) ENSDNOG00000010301 DNMBP (ENSDNOG00000011766) CPN1 (ENSDNOG00000000491) ERLIN1 (ENSDNOG00000031616) CHUK (ENSDNOG00000014663) CWF19L1 (ENSDNOG00000036842) BLOC1S2 (ENSDNOG00000048901) PKD2L1 (ENSDNOG00000016768) SCD (ENSDNOG00000032519) WNT8B (ENSDNOG00000004552) SEC31B (ENSDNOG00000025686) Armadillo MODERN SPECIES 1903 ISOC1 (ENSDNOG00000042143) CNN2 (ENSDNOG00000046243) ADAMTS19 (ENSDNOG00000003880) MINAR2 (ENSDNOG00000019368) ENSDNOG00000002894 ENSDNOG00000038864 ##22 HINT1 (ENSDNOG00000030844) LYRM7 (ENSDNOG00000048402) CDC42SE2 (ENSDNOG00000016409) RAPGEF6 (ENSDNOG00000014913) FNIP1 (ENSDNOG00000045059) ENSDNOG00000045125 ACSL6 (ENSDNOG00000016953) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Domestic yak MODERN SPECIES 23 TOMM7 (ENSBGRG00000000858) ENSBGRG00000000852 ENSBGRG00000000842 ENSBGRG00000000814 HYCC1 (ENSBGRG00000000758) ENSBGRG00000000725 NUP42 (ENSBGRG00000000689) GPNMB (ENSBGRG00000000543) IGF2BP3 (ENSBGRG00000000352) TRA2A (ENSBGRG00000000299) CCDC126 (ENSBGRG00000000265) DBF4 (ENSBGRG00000025235) ENSBGRG00000025216 ABCB4 (ENSBGRG00000024009) CROT (ENSBGRG00000023583) ENSBGRG00000023524 ##22 TMEM243 (ENSBGRG00000023481) DMTF1 (ENSBGRG00000023340) ENSBGRG00000023265 ELAPOR2 (ENSBGRG00000022852) GRM3 (ENSBGRG00000022796) ENSBGRG00000022739 ENSBGRG00000022712 SEMA3D (ENSBGRG00000022561) ENSBGRG00000022512 SEMA3A (ENSBGRG00000022242) SEMA3E (ENSBGRG00000021923) PCLO (ENSBGRG00000021472) CACNA2D1 (ENSBGRG00000020514) HGF (ENSBGRG00000020419) ENSBGRG00000020372 Siberian musk deer MODERN SPECIES 98 OLFML3 (ENSMMSG00000011221) HIPK1 (ENSMMSG00000011030) ENSMMSG00000010993 DCLRE1B (ENSMMSG00000010980) AP4B1 (ENSMMSG00000010901) BCL2L15 (ENSMMSG00000010879) ENSMMSG00000010867 PTPN22 (ENSMMSG00000010432) RSBN1 (ENSMMSG00000010323) ENSMMSG00000010306 PHTF1 (ENSMMSG00000010111) MAGI3 (ENSMMSG00000010012) LRIG2 (ENSMMSG00000009918) ENSMMSG00000009834 ENSMMSG00000009820 ENSMMSG00000009792 ##22 ENSMMSG00000009760 TAFA3 (ENSMMSG00000009742) PPM1J (ENSMMSG00000009611) RHOC (ENSMMSG00000009557) MOV10 (ENSMMSG00000009432) CAPZA1 (ENSMMSG00000009368) ST7L (ENSMMSG00000009251) WNT2B (ENSMMSG00000009189) ENSMMSG00000009168 CTTNBP2NL (ENSMMSG00000009143) ENSMMSG00000009132 KCND3 (ENSMMSG00000009020) DDX20 (ENSMMSG00000008956) INKA2 (ENSMMSG00000008934) RAP1A (ENSMMSG00000008888) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Horse MODERN SPECIES 8 SLC25A30 (ENSECAG00000017334) TPT1 (ENSECAG00000018348) GTF2F2 (ENSECAG00000021923) KCTD4 (ENSECAG00000005117) GPALPP1 (ENSECAG00000009110) NUFIP1 (ENSECAG00000013295) TSC22D1 (ENSECAG00000005195) ENSECAG00000060045 ENSECAG00000040040 SMIM2 (ENSECAG00000040685) LACC1 (ENSECAG00000018885) CCDC122 (ENSECAG00000020440) ENOX1 (ENSECAG00000023538) DNAJC15 (ENSECAG00000007757) EPSTI1 (ENSECAG00000009543) ENSECAG00000033495 ##22 ENSECAG00000050320 FAM216B (ENSECAG00000015189) TNFSF11 (ENSECAG00000016559) AKAP11 (ENSECAG00000021005) DGKH (ENSECAG00000000237) VWA8 (ENSECAG00000006748) ENSECAG00000045148 ENSECAG00000050128 RGCC (ENSECAG00000013151) NAA16 (ENSECAG00000015497) MTRF1 (ENSECAG00000014389) KBTBD7 (ENSECAG00000001308) ENSECAG00000045437 KBTBD6 (ENSECAG00000001410) WBP4 (ENSECAG00000021033) Donkey DUPLICATION Donkey MODERN SPECIES 24 R3HDM1 (ENSEASG00005007392) ZRANB3 (ENSEASG00005007414) ENSEASG00005007411 RAB3GAP1 (ENSEASG00005007419) MAP3K19 (ENSEASG00005007431) CCNT2 (ENSEASG00005007433) ACMSD (ENSEASG00005007438) TMEM163 (ENSEASG00005007445) MGAT5 (ENSEASG00005007448) NCKAP5 (ENSEASG00005007468) ENSEASG00005007486 ENSEASG00005026537 ENSEASG00005007490 ENSEASG00005007495 DPP10 (ENSEASG00005002144) ENSEASG00005025997 ##22 ENSEASG00005002149 DDX18 (ENSEASG00005035983) ENSEASG00005029911 ENSEASG00005034600 CCDC93 (ENSEASG00005031718) INSIG2 (ENSEASG00005003537) EN1 (ENSEASG00005023738) MARCO (ENSEASG00005003544) C1QL2 (ENSEASG00005003554) STEAP3 (ENSEASG00005003559) C2orf76 (ENSEASG00005003565) ENSEASG00005026046 ENSEASG00005038352 TMEM37 (ENSEASG00005003582) SCTR (ENSEASG00005003586) Donkey MODERN SPECIES 2 COG3 (ENSEASG00005017090) ENSEASG00005017085 TPT1 (ENSEASG00005017078) KCTD4 (ENSEASG00005028559) GTF2F2 (ENSEASG00005017062) ENSEASG00005017051 NUFIP1 (ENSEASG00005017043) TSC22D1 (ENSEASG00005017037) ENSEASG00005031806 SERP2 (ENSEASG00005017029) SMIM2 (ENSEASG00005030223) LACC1 (ENSEASG00005017025) ENSEASG00005017023 ENOX1 (ENSEASG00005017017) DNAJC15 (ENSEASG00005027017) ENSEASG00005033429 ##22 EPSTI1 (ENSEASG00005017003) FAM216B (ENSEASG00005016998) TNFSF11 (ENSEASG00005025411) AKAP11 (ENSEASG00005016987) DGKH (ENSEASG00005016872) VWA8 (ENSEASG00005016214) RGCC (ENSEASG00005035316) ENSEASG00005035563 ENSEASG00005015756 MTRF1 (ENSEASG00005015715) KBTBD7 (ENSEASG00005015712) KBTBD6 (ENSEASG00005036527) ENSEASG00005015706 ENSEASG00005015703 ENSEASG00005015702 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d ##22 Microbat MODERN SPECIES 939 FHL1 (ENSMLUG00000014336) ENSMLUG00000014341 BRS3 (ENSMLUG00000010461) ENSMLUG00000009234 ENSMLUG00000009256 CD40LG (ENSMLUG00000007777) ARHGEF6 (ENSMLUG00000007783) ENSMLUG00000007996 ENSMLUG00000013209 ENSMLUG00000029450 GPR101 (ENSMLUG00000010221) ENSMLUG00000025989 ZIC3 (ENSMLUG00000011691) ENSMLUG00000005622 FGF13 (ENSMLUG00000005625) ENSMLUG00000027963 ##22 F9 (ENSMLUG00000011202) MCF2 (ENSMLUG00000011218) ATP11C (ENSMLUG00000008018) ENSMLUG00000013633 ENSMLUG00000027548 ENSMLUG00000027972 ENSMLUG00000029680 ENSMLUG00000000942 SOX3 (ENSMLUG00000000946) ENSMLUG00000030224 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 3 PALM2AKAP2 (ENSRFEG00010018553) ENSRFEG00010018409 PTPN3 (ENSRFEG00010018189) EPB41L4B (ENSRFEG00010018038) FRRS1L (ENSRFEG00010017957) TMEM245 (ENSRFEG00010017866) CTNNAL1 (ENSRFEG00010017765) ABITRAM (ENSRFEG00010017721) ELP1 (ENSRFEG00010017609) ACTL7A (ENSRFEG00010017577) ACTL7B (ENSRFEG00010017556) KLF4 (ENSRFEG00010017439) ENSRFEG00010017423 RAD23B (ENSRFEG00010017264) ZNF462 (ENSRFEG00010017189) ENSRFEG00010017124 ##22 TMEM38B (ENSRFEG00010017023) TAL2 (ENSRFEG00010017010) FKTN (ENSRFEG00010016923) FSD1L (ENSRFEG00010016824) ENSRFEG00010016774 SLC44A1 (ENSRFEG00010016269) ABCA1 (ENSRFEG00010016169) ENSRFEG00010016120 ENSRFEG00010016089 ENSRFEG00010016078 ENSRFEG00010016000 ENSRFEG00010015952 ENSRFEG00010015939 OR13C3 (ENSRFEG00010015918) SMC2 (ENSRFEG00010015863) Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 17 LANCL1 (ENSHGLG00000036257) CPS1 (ENSHGLG00000017911) ENSHGLG00000039921 ERBB4 (ENSHGLG00000015379) ENSHGLG00000036818 ENSHGLG00000049981 ENSHGLG00000042334 IKZF2 (ENSHGLG00000015317) ENSHGLG00000032302 ENSHGLG00000007634 ENSHGLG00000045998 VWC2L (ENSHGLG00000006216) BARD1 (ENSHGLG00000048952) ENSHGLG00000049209 ABCA12 (ENSHGLG00000004765) ENSHGLG00000004335 ##22 ENSHGLG00000004264 ATIC (ENSHGLG00000004192) FN1 (ENSHGLG00000004089) MREG (ENSHGLG00000040698) ENSHGLG00000045074 ENSHGLG00000041086 ENSHGLG00000032001 ENSHGLG00000038070 TMEM169 (ENSHGLG00000043207) ENSHGLG00000016206 XRCC5 (ENSHGLG00000015924) MARCHF4 (ENSHGLG00000016985) ENSHGLG00000045115 SMARCAL1 (ENSHGLG00000019107) ENSHGLG00000042129 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 121 Cep20 (ENSCGRG00001020973) Myh11 (ENSCGRG00001016129) Nde1 (ENSCGRG00001014010) Marf1 (ENSCGRG00001012680) Bmerb1 (ENSCGRG00001025033) Mpv17l (ENSCGRG00001015250) Pdxdc1 (ENSCGRG00001024495) Ntan1 (ENSCGRG00001017395) Rrn3 (ENSCGRG00001001530) Shcbp1 (ENSCGRG00001009318) Slc10a2 (ENSCGRG00001016184) ENSCGRG00001002626 ENSCGRG00001014075 Arglu1 (ENSCGRG00001015195) Nalf1 (ENSCGRG00001023371) ENSCGRG00001016397 ##22 Lig4 (ENSCGRG00001012072) Abhd13 (ENSCGRG00001011631) Tnfsf13b (ENSCGRG00001020485) Myo16 (ENSCGRG00001022966) Irs2 (ENSCGRG00001024746) Col4a1 (ENSCGRG00001004110) Col4a2 (ENSCGRG00001020959) Rab20 (ENSCGRG00001010575) Naxd (ENSCGRG00001015290) Cars2 (ENSCGRG00001007145) ENSCGRG00001021613 ENSCGRG00001015868 ENSCGRG00001016819 ENSCGRG00001020300 Arhgef7 (ENSCGRG00001000930) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 231 CD164 (ENSCCAG00000018828) PPIL6 (ENSCCAG00000024554) MICAL1 (ENSCCAG00000019494) SMPD2 (ENSCCAG00000036357) ZBTB24 (ENSCCAG00000021340) AK9 (ENSCCAG00000028355) FIG4 (ENSCCAG00000025196) GPR6 (ENSCCAG00000026698) WASF1 (ENSCCAG00000023365) CDC40 (ENSCCAG00000010517) METTL24 (ENSCCAG00000004299) DDO (ENSCCAG00000000005) SLC22A16 (ENSCCAG00000027034) CDK19 (ENSCCAG00000029336) ENSCCAG00000028433 ENSCCAG00000028221 ##22 ENSCCAG00000017866 ENSCCAG00000018328 GTF3C6 (ENSCCAG00000029714) RPF2 (ENSCCAG00000030864) ENSCCAG00000037609 SLC16A10 (ENSCCAG00000020583) ENSCCAG00000005460 MFSD4B (ENSCCAG00000027584) ENSCCAG00000024842 ENSCCAG00000027786 FAM217A (ENSCCAG00000014228) PRPF4B (ENSCCAG00000001770) PXDC1 (ENSCCAG00000029262) SLC22A23 (ENSCCAG00000019171) PSMG4 (ENSCCAG00000025375) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.b ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 33 Ccdc182 (ENSCGRG00001011932) Msi2 (ENSCGRG00001013330) ENSCGRG00001010274 Akap1 (ENSCGRG00001005318) Scpep1 (ENSCGRG00001000212) Coil (ENSCGRG00001012212) Trim25 (ENSCGRG00001014623) Dgke (ENSCGRG00001000768) Gm525 (ENSCGRG00001017334) Nog (ENSCGRG00001001979) ENSCGRG00001020352 Ankfn1 (ENSCGRG00001009369) Pctp (ENSCGRG00001015293) Tmem100 (ENSCGRG00001011394) ENSCGRG00001011423 ENSCGRG00001000174 ##22 Mmd (ENSCGRG00001021487) Hlf (ENSCGRG00001013188) Stxbp4 (ENSCGRG00001023598) Cox11 (ENSCGRG00001011330) Tom1l1 (ENSCGRG00001012617) Kif2b (ENSCGRG00001011166) Car10 (ENSCGRG00001017785) Utp18 (ENSCGRG00001008786) Mbtd1 (ENSCGRG00001008409) Nme2 (ENSCGRG00001012585) Nme1 (ENSCGRG00001022109) ENSCGRG00001010907 Spag9 (ENSCGRG00001020494) Tob1 (ENSCGRG00001009633) Wfikkn2 (ENSCGRG00001022356) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.g.b ##22 Rat MODERN SPECIES Exoc6 (ENSRNOG00000036601) Hhex (ENSRNOG00000016595) Kif11 (ENSRNOG00000056069) Ide (ENSRNOG00000016833) Marchf5 (ENSRNOG00000017396) Cpeb3 (ENSRNOG00000020689) Btaf1 (ENSRNOG00000017938) Fgfbp3 (ENSRNOG00000022796) Tnks2 (ENSRNOG00000052664) Ppp1r3c (ENSRNOG00000018494) Hectd2 (ENSRNOG00000056753) Pcgf5 (ENSRNOG00000018532) Ankrd1 (ENSRNOG00000018598) Rpp30 (ENSRNOG00000018718) Htr7 (ENSRNOG00000018827) ENSRNOG00000065783 ##22 ENSRNOG00000067512 Kif20b (ENSRNOG00000018929) Pank1 (ENSRNOG00000018944) Slc16a12 (ENSRNOG00000021916) Ifit1 (ENSRNOG00000019050) Ifit1bl (ENSRNOG00000036603) Ifit3 (ENSRNOG00000022839) Ifit2 (ENSRNOG00000036604) Lipa (ENSRNOG00000019077) Ch25h (ENSRNOG00000019141) Fas (ENSRNOG00000019142) Acta2 (ENSRNOG00000058039) Stambpl1 (ENSRNOG00000050224) Ankrd22 (ENSRNOG00000019190) Lipm (ENSRNOG00000019301) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 116 MIPOL1 (ENSCLAG00000012585) FOXA1 (ENSCLAG00000018012) TTC6 (ENSCLAG00000010689) SSTR1 (ENSCLAG00000013879) SEC23A (ENSCLAG00000010520) GEMIN2 (ENSCLAG00000008967) TRAPPC6B (ENSCLAG00000009363) ENSCLAG00000017822 ENSCLAG00000010040 ENSCLAG00000012827 ENSCLAG00000010812 FBXO33 (ENSCLAG00000011238) LRFN5 (ENSCLAG00000012406) KIF4B (ENSCLAG00000017749) ENSCLAG00000014365 ENSCLAG00000012694 ##22 C14orf28 (ENSCLAG00000012418) KLHL28 (ENSCLAG00000017031) TOGARAM1 (ENSCLAG00000013060) PRPF39 (ENSCLAG00000012205) FKBP3 (ENSCLAG00000016970) MIS18BP1 (ENSCLAG00000011476) RPL10L (ENSCLAG00000018026) MDGA2 (ENSCLAG00000015619) ENSCLAG00000010995 ENSCLAG00000008358 ENSCLAG00000013834 MGAT2 (ENSCLAG00000017895) DNAAF2 (ENSCLAG00000013335) POLE2 (ENSCLAG00000013349) KLHDC1 (ENSCLAG00000011115) Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 160 ENSODEG00000013294 ENSODEG00000015259 ENSODEG00000013335 ENSODEG00000013815 ENSODEG00000013885 ENSODEG00000013667 ENSODEG00000013504 ENSODEG00000015343 ENSODEG00000014935 ENSODEG00000020041 BTN2A2 (ENSODEG00000013492) BTN1A1 (ENSODEG00000013656) ABT1 (ENSODEG00000014676) ENSODEG00000012485 ENSODEG00000012723 ENSODEG00000013745 ##22 OR14J1 (ENSODEG00000020074) Degu MODERN SPECIES 42 PRIM2 (ENSODEG00000015933) KHDRBS2 (ENSODEG00000015927) ENSODEG00000016695 ENSODEG00000015713 ENSODEG00000016016 LGSN (ENSODEG00000016651) ENSODEG00000016255 ENSODEG00000020332 ENSODEG00000015899 ENSODEG00000015590 ENSODEG00000016630 ENSODEG00000015661 ENSODEG00000016000 ENSODEG00000015697 ENSODEG00000016046 ENSODEG00000015414 ##22 ENSODEG00000015537 ENSODEG00000016200 ZNF366 (ENSODEG00000015681) PTCD2 (ENSODEG00000016417) ENSODEG00000016220 MRPS27 (ENSODEG00000016210) ENSODEG00000015665 ENSODEG00000016114 ENSODEG00000015884 CARTPT (ENSODEG00000015860) MCCC2 (ENSODEG00000016026) ENSODEG00000016322 ENSODEG00000015976 ENSODEG00000016203 ENSODEG00000016357 Degu MODERN SPECIES 449 ENSODEG00000000160 ##22 FGF18 (ENSODEG00000000131) #23 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 28 ITIH2 (ENSHGLG00000018567) KIN (ENSHGLG00000005095) Atp5f1c (ENSHGLG00000045723) ENSHGLG00000041554 TAF3 (ENSHGLG00000008290) ENSHGLG00000050450 ENSHGLG00000038697 ENSHGLG00000035414 ENSHGLG00000020814 ENSHGLG00000050579 ENSHGLG00000045477 ENSHGLG00000017139 ENSHGLG00000039822 ENSHGLG00000014055 ENSHGLG00000042375 ENSHGLG00000001374 ##22 ENSHGLG00000042740 ECHDC3 (ENSHGLG00000038864) PROSER2 (ENSHGLG00000046574) ENSHGLG00000015176 ENSHGLG00000018501 PFKP (ENSHGLG00000009173) ENSHGLG00000040372 ENSHGLG00000018945 ADARB2 (ENSHGLG00000014550) ENSHGLG00000039263 WDR37 (ENSHGLG00000005345) IDI1 (ENSHGLG00000012398) ENSHGLG00000013071 ENSHGLG00000012936 DIP2C (ENSHGLG00000015497) Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 12 ENSHGLG00000002095 ENSHGLG00000002130 ENSHGLG00000047592 ENSHGLG00000034857 ENSHGLG00000046199 ENSHGLG00000039565 NOL11 (ENSHGLG00000003039) PITPNC1 (ENSHGLG00000003137) PSMD12 (ENSHGLG00000000655) HELZ (ENSHGLG00000000732) CACNG1 (ENSHGLG00000000787) CACNG4 (ENSHGLG00000037673) ENSHGLG00000044211 ENSHGLG00000041215 CACNG5 (ENSHGLG00000046862) ENSHGLG00000000889 ##22 PRKCA (ENSHGLG00000000872) APOH (ENSHGLG00000047681) CEP112 (ENSHGLG00000001177) AXIN2 (ENSHGLG00000001681) ENSHGLG00000033297 ENSHGLG00000001800 ENSHGLG00000041040 ENSHGLG00000045760 ENSHGLG00000001986 ENSHGLG00000043431 ENSHGLG00000040394 ENSHGLG00000002134 WIPI1 (ENSHGLG00000002208) PRKAR1A (ENSHGLG00000045787) FAM20A (ENSHGLG00000040292) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 23 HSPA4 (ENSHGLG00000017017) ENSHGLG00000050674 ENSHGLG00000001303 AFF4 (ENSHGLG00000006661) LEAP2 (ENSHGLG00000039112) UQCRQ (ENSHGLG00000040975) GDF9 (ENSHGLG00000006174) SHROOM1 (ENSHGLG00000008210) SOWAHA (ENSHGLG00000049840) SEPTIN8 (ENSHGLG00000007976) CCNI2 (ENSHGLG00000050667) KIF3A (ENSHGLG00000017608) ENSHGLG00000015884 IL13 (ENSHGLG00000047436) ENSHGLG00000007532 ENSHGLG00000010827 ##22 RAD50 (ENSHGLG00000013263) IL5 (ENSHGLG00000040092) ENSHGLG00000010931 SLC22A5 (ENSHGLG00000017486) SLC22A4 (ENSHGLG00000047238) PDLIM4 (ENSHGLG00000015806) P4HA2 (ENSHGLG00000013514) ENSHGLG00000034432 CSF2 (ENSHGLG00000017379) ACSL6 (ENSHGLG00000016429) MEIKIN (ENSHGLG00000010823) FNIP1 (ENSHGLG00000005873) ENSHGLG00000045572 ENSHGLG00000008395 RAPGEF6 (ENSHGLG00000009326) Naked mole-rat female MODERN SPECIES BEND3 (ENSHGLG00000002571) PDSS2 (ENSHGLG00000002304) SOBP (ENSHGLG00000006724) SCML4 (ENSHGLG00000013722) ENSHGLG00000048253 SEC63 (ENSHGLG00000012594) ENSHGLG00000041350 OSTM1 (ENSHGLG00000012295) NR2E1 (ENSHGLG00000003792) ENSHGLG00000003277 ENSHGLG00000035411 AFG1L (ENSHGLG00000003193) ENSHGLG00000002946 ENSHGLG00000048021 ENSHGLG00000033612 ENSHGLG00000002635 ##22 ENSHGLG00000013638 SESN1 (ENSHGLG00000000578) CEP57L1 (ENSHGLG00000002787) ENSHGLG00000042886 CD164 (ENSHGLG00000037227) PPIL6 (ENSHGLG00000043482) SMPD2 (ENSHGLG00000000226) MICAL1 (ENSHGLG00000000326) ENSHGLG00000000497 ZBTB24 (ENSHGLG00000019919) ENSHGLG00000032215 ENSHGLG00000000618 ENSHGLG00000049653 ENSHGLG00000050307 WASF1 (ENSHGLG00000001120) Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 11 ENSHGLG00000048687 ENSHGLG00000032423 ENSHGLG00000048240 ENSHGLG00000040863 ENSHGLG00000033126 ENSHGLG00000000528 ENSHGLG00000002448 SCFD1 (ENSHGLG00000002694) G2E3 (ENSHGLG00000001901) ENSHGLG00000040265 ENSHGLG00000003134 ENSHGLG00000020158 ENSHGLG00000002139 Ftl (ENSHGLG00000033017) ENSHGLG00000043768 ENSHGLG00000000491 ##22 ENSHGLG00000002548 NOVA1 (ENSHGLG00000046120) ENSHGLG00000048483 STXBP6 (ENSHGLG00000049108) GZMB (ENSHGLG00000002596) GZMH (ENSHGLG00000002789) ENSHGLG00000002857 ENSHGLG00000003002 ENSHGLG00000003064 CMA1 (ENSHGLG00000001391) ENSHGLG00000042529 SDR39U1 (ENSHGLG00000001566) KHNYN (ENSHGLG00000001740) CBLN3 (ENSHGLG00000041391) NYNRIN (ENSHGLG00000002148) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 28 SLC35B3 (ENSHGLG00000017775) ENSHGLG00000017811 EEF1E1 (ENSHGLG00000051014) BLOC1S5 (ENSHGLG00000050190) TXNDC5 (ENSHGLG00000019336) BMP6 (ENSHGLG00000015229) SNRNP48 (ENSHGLG00000015241) ENSHGLG00000045182 DSP (ENSHGLG00000008359) RIOK1 (ENSHGLG00000008699) CAGE1 (ENSHGLG00000009035) SSR1 (ENSHGLG00000009378) RREB1 (ENSHGLG00000015266) LY86 (ENSHGLG00000004184) ENSHGLG00000004262 ENSHGLG00000034596 ##22 ENSHGLG00000035488 ENSHGLG00000035907 ENSHGLG00000049115 ENSHGLG00000036093 ENSHGLG00000020343 ENSHGLG00000004389 ENSHGLG00000038262 PPP1R3G (ENSHGLG00000041006) ENSHGLG00000040678 RPP40 (ENSHGLG00000004871) ENSHGLG00000005262 ENSHGLG00000038867 ECI2 (ENSHGLG00000005614) PRPF4B (ENSHGLG00000005945) FAM50B (ENSHGLG00000006289) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 14 Ccdc105 (ENSPEMG00000008931) Casp14 (ENSPEMG00000003806) Or1i2 (ENSPEMG00000002732) Syde1 (ENSPEMG00000017967) Ilvbl (ENSPEMG00000016636) Or10b1 (ENSPEMG00000031391) Notch3 (ENSPEMG00000003368) ENSPEMG00000026978 Ephx3 (ENSPEMG00000001114) Brd4 (ENSPEMG00000015342) Akap8 (ENSPEMG00000016622) Akap8l (ENSPEMG00000008156) ENSPEMG00000014668 Rasal3 (ENSPEMG00000008310) Pglyrp2 (ENSPEMG00000007236) ENSPEMG00000020195 ##22 ENSPEMG00000004681 ENSPEMG00000024877 ENSPEMG00000025671 Cd320 (ENSPEMG00000016121) Ndufa7 (ENSPEMG00000016851) Rps28 (ENSPEMG00000015848) Kank3 (ENSPEMG00000010286) Angptl4 (ENSPEMG00000005356) Rab11b (ENSPEMG00000014536) Marchf2 (ENSPEMG00000018162) Hnrnpm (ENSPEMG00000009260) Pram1 (ENSPEMG00000011281) Zfp414 (ENSPEMG00000013240) Myo1f (ENSPEMG00000009368) Adamts10 (ENSPEMG00000014710) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 111 ENSCGRG00001003261 Txndc8 (ENSCGRG00001010737) ENSCGRG00001009840 Svep1 (ENSCGRG00001018972) Musk (ENSCGRG00001014907) Lpar1 (ENSCGRG00001010608) Or2k2 (ENSCGRG00001005176) Ecpas (ENSCGRG00001020995) Zkscan16 (ENSCGRG00001006142) Ptgr1 (ENSCGRG00001003272) ENSCGRG00001023594 Dnajc25 (ENSCGRG00001023169) Gng10 (ENSCGRG00001022338) Shoc1 (ENSCGRG00001020244) Ugcg (ENSCGRG00001024347) ENSCGRG00001022274 ##22 Susd1 (ENSCGRG00001016139) ENSCGRG00001023211 Hsdl2 (ENSCGRG00001018834) E130308A19Rik (ENSCGRG00001004916) Inip (ENSCGRG00001023615) Snx30 (ENSCGRG00001021142) Slc46a2 (ENSCGRG00001020019) ENSCGRG00001017813 Zfp37 (ENSCGRG00001017264) Slc31a2 (ENSCGRG00001016699) Fkbp15 (ENSCGRG00001010965) Slc31a1 (ENSCGRG00001024794) Cdc26 (ENSCGRG00001019052) Prpf4 (ENSCGRG00001016992) Rnf183 (ENSCGRG00001004898) Golden Hamster MODERN SPECIES 624 ENSMAUG00000014493 ENSMAUG00000014837 Ank1 (ENSMAUG00000000761) Nkx6-3 (ENSMAUG00000015260) Gpat4 (ENSMAUG00000019450) Gins4 (ENSMAUG00000004678) ENSMAUG00000001580 Golga7 (ENSMAUG00000015212) Sfrp1 (ENSMAUG00000020015) ENSMAUG00000004169 ENSMAUG00000017272 Tcim (ENSMAUG00000006142) Ido2 (ENSMAUG00000019264) Ido1 (ENSMAUG00000011058) Adam18 (ENSMAUG00000008085) ENSMAUG00000021018 ##22 Adam5 (ENSMAUG00000015457) Adam32 (ENSMAUG00000017370) Adam9 (ENSMAUG00000008043) Tm2d2 (ENSMAUG00000015269) Htra4 (ENSMAUG00000016673) Plekha2 (ENSMAUG00000013697) ENSMAUG00000016926 ENSMAUG00000000685 Fgfr1 (ENSMAUG00000018100) Letm2 (ENSMAUG00000004185) ENSMAUG00000021527 ENSMAUG00000022052 ENSMAUG00000011792 Ddhd2 (ENSMAUG00000020605) Bag4 (ENSMAUG00000008296) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Capuchin MODERN SPECIES 193 ENSCCAG00000035389 RPS6KA5 (ENSCCAG00000028076) DGLUCY (ENSCCAG00000036209) GPR68 (ENSCCAG00000031651) CCDC88C (ENSCCAG00000024095) PPP4R3A (ENSCCAG00000036267) CATSPERB (ENSCCAG00000026902) TC2N (ENSCCAG00000022518) FBLN5 (ENSCCAG00000023686) TRIP11 (ENSCCAG00000031692) ENSCCAG00000022879 ATXN3 (ENSCCAG00000027092) CPSF2 (ENSCCAG00000028088) SLC24A4 (ENSCCAG00000025277) RIN3 (ENSCCAG00000029756) ENSCCAG00000025336 ##22 ENSCCAG00000034501 GOLGA5 (ENSCCAG00000021972) CHGA (ENSCCAG00000034766) ITPK1 (ENSCCAG00000024227) TMEM251 (ENSCCAG00000031525) GON7 (ENSCCAG00000033161) ENSCCAG00000020649 BTBD7 (ENSCCAG00000036421) ENSCCAG00000035474 UNC79 (ENSCCAG00000025023) PRIMA1 (ENSCCAG00000021501) FAM181A (ENSCCAG00000017722) ASB2 (ENSCCAG00000032304) CCDC197 (ENSCCAG00000020750) OTUB2 (ENSCCAG00000030868) Mas night monkey MODERN SPECIES 610 SPDL1 (ENSANAG00000034230) #10 ENSANAG00000034728 ENSANAG00000038189 DOCK2 (ENSANAG00000034883) #12 INSYN2B (ENSANAG00000033878) #11 FOXI1 (ENSANAG00000025647) #13 C5orf58 (ENSANAG00000024091) LCP2 (ENSANAG00000031590) #15 KCNIP1 (ENSANAG00000014990) #18 KCNMB1 (ENSANAG00000034763) #16 GABRP (ENSANAG00000029839) #19 RANBP17 (ENSANAG00000028172) #20 ENSANAG00000031950 ENSANAG00000021888 TLX3 (ENSANAG00000029429) #21 ENSANAG00000034949 ##22 FGF18 (ENSANAG00000028876) #23 SMIM23 (ENSANAG00000018501) #24 ENSANAG00000024342 FBXW11 (ENSANAG00000036790) #25 STK10 (ENSANAG00000027679) #27 EFCAB9 (ENSANAG00000032826) #28 UBTD2 (ENSANAG00000033217) #29 SH3PXD2B (ENSANAG00000014072) #30 NEURL1B (ENSANAG00000038171) #31 DUSP1 (ENSANAG00000027062) #32 ERGIC1 (ENSANAG00000037298) #33 ENSANAG00000033316 RPL26L1 (ENSANAG00000034277) ENSANAG00000025907 #34 CREBRF (ENSANAG00000029119) #35 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 535 ENSMNEG00000043074 SLC30A8 (ENSMNEG00000029260) AARD (ENSMNEG00000036989) RAD21 (ENSMNEG00000045044) UTP23 (ENSMNEG00000028668) EIF3H (ENSMNEG00000033640) ENSMNEG00000040833 TRPS1 (ENSMNEG00000042015) CSMD3 (ENSMNEG00000035941) ENSMNEG00000032152 ##22 KCNV1 (ENSMNEG00000028762) SYBU (ENSMNEG00000040825) EBAG9 (ENSMNEG00000031030) PKHD1L1 (ENSMNEG00000038873) ENY2 (ENSMNEG00000035666) NUDCD1 (ENSMNEG00000032729) TRHR (ENSMNEG00000045348) ENSMNEG00000042220 TMEM74 (ENSMNEG00000005079) EMC2 (ENSMNEG00000040360) EIF3E (ENSMNEG00000045529) RSPO2 (ENSMNEG00000039405) ENSMNEG00000030765 ANGPT1 (ENSMNEG00000041312) ABRA (ENSMNEG00000032508) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.d.h ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 9 DCTN5 (ENSPANG00000018525) PLK1 (ENSPANG00000018526) ERN2 (ENSPANG00000023632) CHP2 (ENSPANG00000043637) PRKCB (ENSPANG00000019233) CACNG3 (ENSPANG00000023573) ENSPANG00000021395 RBBP6 (ENSPANG00000019625) TNRC6A (ENSPANG00000018523) SLC5A11 (ENSPANG00000017009) ARHGAP17 (ENSPANG00000009108) ENSPANG00000032374 LCMT1 (ENSPANG00000019591) AQP8 (ENSPANG00000024081) ZKSCAN2 (ENSPANG00000007624) ENSPANG00000009192 ##22 HS3ST4 (ENSPANG00000001142) C16orf82 (ENSPANG00000032310) KDM8 (ENSPANG00000009107) NSMCE1 (ENSPANG00000019590) IL4R (ENSPANG00000025457) IL21R (ENSPANG00000011264) GTF3C1 (ENSPANG00000007018) KATNIP (ENSPANG00000018771) GSG1L (ENSPANG00000049872) XPO6 (ENSPANG00000017103) SBK1 (ENSPANG00000034348) LAT (ENSPANG00000017105) SPNS1 (ENSPANG00000011263) CD19 (ENSPANG00000008272) RABEP2 (ENSPANG00000016479) Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 6396 ENSTSYG00000029274 ##22 ZBED5 (ENSTSYG00000037537) ENSTSYG00000000600 CTR9 (ENSTSYG00000006144) MRVI1 (ENSTSYG00000007871) LYVE1 (ENSTSYG00000001649) ENSTSYG00000027421 RNF141 (ENSTSYG00000013969) AMPD3 (ENSTSYG00000013967) Tarsier DUPLICATION Tarsier DUPLICATION Tarsier DUPLICATION Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 1279 ENSTSYG00000031261 ##22 ZNF135 (ENSTSYG00000028222) ZSCAN18 (ENSTSYG00000026905) Tarsier MODERN SPECIES 2035 DTL (ENSTSYG00000007387) INTS7 (ENSTSYG00000007373) ENSTSYG00000031172 ##22 LPGAT1 (ENSTSYG00000032887) NEK2 (ENSTSYG00000007080) Tarsier MODERN SPECIES 2666 ENSTSYG00000014739 ##22 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 4747 ENSTSYG00000028279 ##22 ENSTSYG00000033817 Tarsier MODERN SPECIES 3595 ENSTSYG00000036574 ##22 SH3BP4 (ENSTSYG00000030352) Tarsier MODERN SPECIES 1352 ENSTSYG00000031195 ENSTSYG00000028503 ##22 GPR143 (ENSTSYG00000006058) TBL1X (ENSTSYG00000010075) Marsupialia DUPLICATION Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.a #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.a #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.a #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153052.a #22 koala MODERN SPECIES 74 ENSPCIG00000031056 SCGB3A2 (ENSPCIG00000002957) ENSPCIG00000031311 ENSPCIG00000030894 ENSPCIG00000031137 ENSPCIG00000016444 ENSPCIG00000002980 HRH2 (ENSPCIG00000002988) ENSPCIG00000002995 ENSPCIG00000013017 #22 THOC3 (ENSPCIG00000034828) ENSPCIG00000035112 ENSPCIG00000032706 ARL10 (ENSPCIG00000009781) NOP16 (ENSPCIG00000009782) ENSPCIG00000033684 CLTB (ENSPCIG00000009784) FAF2 (ENSPCIG00000019507) RNF44 (ENSPCIG00000019036) CDHR2 (ENSPCIG00000018439) ENSPCIG00000018440 SNCB (ENSPCIG00000031086) EIF4E1B (ENSPCIG00000018442) TSPAN17 (ENSPCIG00000018443) UNC5A (ENSPCIG00000018444) Common wonbat MODERN SPECIES 243 STK26 (ENSVURG00010003573) FRMD7 (ENSVURG00010003533) RAP2C (ENSVURG00010003494) ENSVURG00010003483 ENSVURG00010003471 ENSVURG00010003459 GPC4 (ENSVURG00010003449) GPC3 (ENSVURG00010003432) ENSVURG00010003417 ENSVURG00010003378 ENSVURG00010003373 ENSVURG00010003357 ENSVURG00010003309 #22 ENSVURG00010003283 PABIR2 (ENSVURG00010003250) ENSVURG00010003216 ENSVURG00010003197 ENSVURG00010003145 ENSVURG00010003133 SLC9A6 (ENSVURG00010003079) FHL1 (ENSVURG00010002994) ENSVURG00010002978 Marsupialia DUPLICATION Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063407.b ENSGT00950000183061.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00940000172454 #14 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.b.a #22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000014165.c.a.a ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 ENSGT00940000158996 #37 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000063407.b ENSGT00950000183061.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156396 #8 ENSGT00940000159322 #9 ENSGT00510000047951 #10 ENSGT00530000063787.A #11 ENSGT00940000154903 #12 ENSGT00940000161316 #13 ENSGT00940000172454 #14 ENSGT00940000156835 #15 ENSGT00950000183039.B.b.b #16 ENSGT00940000158048 #18 ENSGT00940000160813 #19 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.b.a #22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 ENSGT00940000155898 #25 ENSGT00940000156818 #27 ENSGT00390000007501 #28 ENSGT00940000156641 #29 ENSGT00940000158396 #30 ENSGT00940000157079.a #31 ENSGT00940000159044 #32 ENSGT00530000063113.C #33 ENSGT00390000002856 ENSGT00390000014165.c.a.a ENSGT00940000156866 #34 ENSGT00390000007125.b #35 ENSGT00390000014412 #36 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000153139.B.b #20 ENSGT00940000160629 #21 ENSGT00940000153052.b.a #22 ENSGT00940000159553 #23 ENSGT00390000017300 #24 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