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Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063407.b	ENSGT00550000074792.a.b	ENSGT00940000156396	ENSGT00940000159322	ENSGT00510000047951	ENSGT00940000154903 #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00940000172454 #13	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.b #22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000162598.d #30	ENSGT00940000154590 #31	ENSGT00940000162598.c #32	ENSGT00940000158623 #33	ENSGT00390000015916 #34	ENSGT00390000009825 #35	ENSGT00940000156278 #36	ENSGT00390000002628 #37
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00550000074792.a.b	ENSGT00940000156396	ENSGT00940000159322	ENSGT00510000047951	ENSGT00940000154903.k #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00940000172454 #13	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT01060000252083 #17	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.b #22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000162598.d #30	ENSGT00940000154590 #31	ENSGT00940000162598.c #32	ENSGT00940000158623 #33	ENSGT00390000015916 #34	ENSGT00390000009825 #35	ENSGT00940000156278 #36	ENSGT00390000002628 #37
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3235				ENSMSIG00000022626 #10	Insyn2b (ENSMSIG00000022923) #11	Foxi1 (ENSMSIG00000022955) #12	4930469K13Rik (ENSMSIG00000022972) #13	ENSMSIG00000022989 #14	Kcnmb1 (ENSMSIG00000023135) #15	Kcnip1 (ENSMSIG00000023156) #16	ENSMSIG00000023232 #17	Gabrp (ENSMSIG00000023250) #18	Ranbp17 (ENSMSIG00000023281) #19	ENSMSIG00000023419 #20	Tlx3 (ENSMSIG00000023425) #21	Npm1 (ENSMSIG00000023445) #22	Fgf18 (ENSMSIG00000023572) #23	Smim23 (ENSMSIG00000023592) #24	Fbxw11 (ENSMSIG00000023614) #25	Stk10 (ENSMSIG00000023716) #26	Efcab9 (ENSMSIG00000023781) #27	Ubtd2 (ENSMSIG00000023792) #28	Sh3pxd2b (ENSMSIG00000023801) #29	Hbq1a (ENSMSIG00000023834) #30	ENSMSIG00000024204 #31	ENSMSIG00000024228 #32	Hba-x (ENSMSIG00000024240) #33	Nprl3 (ENSMSIG00000024256) #34	Mpg (ENSMSIG00000024316) #35	Rhbdf1 (ENSMSIG00000024323) #36	ENSMSIG00000024344 #37
spretus	MODERN SPECIES	2	Fbll1 (MGP_SPRETEiJ_G0017048)	Pank3 (MGP_SPRETEiJ_G0017047)	Slit3 (MGP_SPRETEiJ_G0017046)	Spdl1 (MGP_SPRETEiJ_G0017045)	Insyn2b (MGP_SPRETEiJ_G0017044) #11	Dock2 (MGP_SPRETEiJ_G0017043) #10	Foxi1 (MGP_SPRETEiJ_G0017042) #12	Lcp2 (MGP_SPRETEiJ_G0017041) #14	Kcnmb1 (MGP_SPRETEiJ_G0017040) #15	Kcnip1 (MGP_SPRETEiJ_G0017039) #16	MGP_SPRETEiJ_G0017038 #17	Gabrp (MGP_SPRETEiJ_G0017037) #18	MGP_SPRETEiJ_G0017036	MGP_SPRETEiJ_G0017035 #19	Tlx3 (MGP_SPRETEiJ_G0017034) #21	Npm1 (MGP_SPRETEiJ_G0017033) #22	Fgf18 (MGP_SPRETEiJ_G0017032) #23	Smim23 (MGP_SPRETEiJ_G0017031) #24	Fbxw11 (MGP_SPRETEiJ_G0017030) #25	Stk10 (MGP_SPRETEiJ_G0017029) #26	Efcab9 (MGP_SPRETEiJ_G0017028) #27	Ubtd2 (MGP_SPRETEiJ_G0017027) #28	Sh3pxd2b (MGP_SPRETEiJ_G0017026) #29	MGP_SPRETEiJ_G0017025 #33	Mpg (MGP_SPRETEiJ_G0017024) #35	Nprl3 (MGP_SPRETEiJ_G0017023) #34	Rhbdf1 (MGP_SPRETEiJ_G0017022) #36	MGP_SPRETEiJ_G0017021 #37	Il9r (MGP_SPRETEiJ_G0017020)	MGP_SPRETEiJ_G0017019	Nsg2 (MGP_SPRETEiJ_G0017018)
Mouse	MODERN SPECIES	2	Rars (ENSMUSG00000018848)	Fbll1 (ENSMUSG00000051062)	Pank3 (ENSMUSG00000018846)	Slit3 (ENSMUSG00000056427)	Spdl1 (ENSMUSG00000069910)	Insyn2b (ENSMUSG00000069911) #11	Dock2 (ENSMUSG00000020143) #10	Foxi1 (ENSMUSG00000047861) #12	Lcp2 (ENSMUSG00000002699) #14	4930469K13Rik (ENSMUSG00000085684) #13	Kcnmb1 (ENSMUSG00000020155) #15	Kcnip1 (ENSMUSG00000053519) #16	Gabrp (ENSMUSG00000020159) #18	Ranbp17 (ENSMUSG00000040594) #19	Tlx3 (ENSMUSG00000040610) #21	Npm1 (ENSMUSG00000057113) #22	Fgf18 (ENSMUSG00000057967) #23	Smim23 (ENSMUSG00000020270) #24	Fbxw11 (ENSMUSG00000020271) #25	Stk10 (ENSMUSG00000020272) #26	Efcab9 (ENSMUSG00000044056) #27	Ubtd2 (ENSMUSG00000044949) #28	Sh3pxd2b (ENSMUSG00000040711) #29	Hbq1a (ENSMUSG00000020295) #30	Hba-a2 (ENSMUSG00000069917) #31	Hbq1b (ENSMUSG00000073063) #32	Hba-a1 (ENSMUSG00000069919) #31	Hba-x (ENSMUSG00000055609) #33	Mpg (ENSMUSG00000020287) #35	Nprl3 (ENSMUSG00000020289) #34	Rhbdf1 (ENSMUSG00000020282) #36
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	2	Fbll1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016207)	Pank3 (MGP_CAROLIEiJ_G0016206)	Slit3 (MGP_CAROLIEiJ_G0016205)	Spdl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016204)	Insyn2b (MGP_CAROLIEiJ_G0016203) #11	Dock2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016202) #10	Foxi1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016201) #12	Lcp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016200) #14	Kcnmb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016199) #15	Kcnip1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016198) #16	MGP_CAROLIEiJ_G0016197	Gabrp (MGP_CAROLIEiJ_G0016196) #18	MGP_CAROLIEiJ_G0016195	Ranbp17 (MGP_CAROLIEiJ_G0016194) #19	Tlx3 (MGP_CAROLIEiJ_G0016193) #21	Npm1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016192) #22	Fgf18 (MGP_CAROLIEiJ_G0016191) #23	Smim23 (MGP_CAROLIEiJ_G0016190) #24	Fbxw11 (MGP_CAROLIEiJ_G0016189) #25	Stk10 (MGP_CAROLIEiJ_G0016188) #26	Efcab9 (MGP_CAROLIEiJ_G0016187) #27	Ubtd2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016186) #28	Sh3pxd2b (MGP_CAROLIEiJ_G0016185) #29	MGP_CAROLIEiJ_G0016184 #32	MGP_CAROLIEiJ_G0016183 #32	MGP_CAROLIEiJ_G0016182 #31	MGP_CAROLIEiJ_G0016181 #31	MGP_CAROLIEiJ_G0016180 #33	Mpg (MGP_CAROLIEiJ_G0016179) #35	Nprl3 (MGP_CAROLIEiJ_G0016178) #34	Rhbdf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016177) #36
Rat	DUPLICATION
Rat	MODERN SPECIES	1	Fbll1 (ENSRNOG00000015303)	Pank3 (ENSRNOG00000007419)	Slit3 (ENSRNOG00000007377)	Spdl1 (ENSRNOG00000007292)	Insyn2b (ENSRNOG00000032329) #11	Dock2 (ENSRNOG00000006932) #10	Foxi1 (ENSRNOG00000006293) #12	C10H5orf58 (ENSRNOG00000068310) #13	Lcp2 (ENSRNOG00000005620) #14	Kcnmb1 (ENSRNOG00000005465) #15	AABR07029262.1 (ENSRNOG00000029706)	Kcnip1 (ENSRNOG00000005365) #16	Gabrp (ENSRNOG00000032417) #18	Ranbp17 (ENSRNOG00000005042) #19	Tlx3 (ENSRNOG00000004976) #21	Npm1 (ENSRNOG00000004616) #22	Fgf18 (ENSRNOG00000048389) #23	Smim23 (ENSRNOG00000027196) #24	Fbxw11 (ENSRNOG00000004395) #25	ENSRNOG00000066039	Stk10 (ENSRNOG00000004217) #26	Efcab9 (ENSRNOG00000004142) #27	Ubtd2 (ENSRNOG00000004137) #28	Sh3pxd2b (ENSRNOG00000004063) #29	Neurl1b (ENSRNOG00000027606)	ENSRNOG00000069024	Ergic1 (ENSRNOG00000003508)	Atp6v0e1 (ENSRNOG00000003269)	Crebrf (ENSRNOG00000020769)	Bnip1 (ENSRNOG00000020753)	Nkx2-5 (ENSRNOG00000020747)
Rat	MODERN SPECIES	46	ENSRNOG00000067513	RGD1566184 (ENSRNOG00000057692)	Tesl (ENSRNOG00000033628)	ENSRNOG00000063057	Wdr44 (ENSRNOG00000029068)	Klhl13 (ENSRNOG00000014029)	Sec61g-ps4 (ENSRNOG00000061620)	AABR07041140.1 (ENSRNOG00000006459)	Ppp1r2-ps2 (ENSRNOG00000064591)	ENSRNOG00000068085	Slc6a14 (ENSRNOG00000005687)	Agtr2 (ENSRNOG00000050006)	AABR07041109.1 (ENSRNOG00000050465)	ENSRNOG00000067242	Pls3 (ENSRNOG00000027520)	AABR07041089.1 (ENSRNOG00000018923) #22	Luzp4 (ENSRNOG00000069107)	Lrch2 (ENSRNOG00000029582)	Il13ra2 (ENSRNOG00000032973)	Htr2c (ENSRNOG00000030877)	ENSRNOG00000065464	ENSRNOG00000065631	Amot (ENSRNOG00000007345)	Lhfpl1 (ENSRNOG00000027601)	Rtl4 (ENSRNOG00000031638)	Trpc5os (ENSRNOG00000064383)	Trpc5 (ENSRNOG00000027233)	LOC108349244 (ENSRNOG00000005753)	Alg13 (ENSRNOG00000065758)	LOC100361854 (ENSRNOG00000029512)	LOC100361756 (ENSRNOG00000051310)
Murinae	DUPLICATION
Murinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.a.a ##22
Mus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.a.a ##22
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.a.a ##22
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.a.a ##22
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.a.a ##22
Steppe mouse	DUPLICATION
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2891														ENSMSIG00000026585	Gja1 (ENSMSIG00000026588)	ENSMSIG00000026594 ##22
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2994												Lama4 (ENSMSIG00000001276)	Fam229b (ENSMSIG00000001215)	Tube1 (ENSMSIG00000001171)	Ccn6 (ENSMSIG00000001159)	ENSMSIG00000001142 ##22	ENSMSIG00000001131	Fyn (ENSMSIG00000001064)	Traf3ip2 (ENSMSIG00000001008)	ENSMSIG00000000979	Rev3l (ENSMSIG00000000767)	ENSMSIG00000000716	ENSMSIG00000000705	ENSMSIG00000000678	ENSMSIG00000000663	Mfsd4b5 (ENSMSIG00000000610)	Mfsd4b1 (ENSMSIG00000000578)	Slc16a10 (ENSMSIG00000000537)	ENSMSIG00000000467	ENSMSIG00000000433	ENSMSIG00000000270
Rat	DUPLICATION
Rat	MODERN SPECIES	17	OR6c8 (ENSRNOG00000043334)	Or6c38 (ENSRNOG00000043438)	Olfr769 (ENSRNOG00000064889)	Or6c201 (ENSRNOG00000043125)	Olr908 (ENSRNOG00000070683)	Or6c203 (ENSRNOG00000064174)	Or6c206 (ENSRNOG00000048201)	Or6c206 (ENSRNOG00000065551)	Or6c35 (ENSRNOG00000064899)	Or6c6i (ENSRNOG00000067036)	Or6c208 (ENSRNOG00000069328)	Or6c1h (ENSRNOG00000069127)	Or6c3d (ENSRNOG00000065705)	Olfr791 (ENSRNOG00000065284)	Or6c88 (ENSRNOG00000069689)	AABR07055492.1 (ENSRNOG00000056878) ##22	Or6c35f (ENSRNOG00000063008)	Or6c210b-ps1 (ENSRNOG00000065522)	ENSRNOG00000064169	Olr920 (ENSRNOG00000065582)	Or6c35d (ENSRNOG00000068317)	Or6c6f (ENSRNOG00000070603)	Or10u3b (ENSRNOG00000063567)	Or6c70 (ENSRNOG00000047264)	Or6c76b (ENSRNOG00000066966)	Olr936 (ENSRNOG00000069078)	Or6c214b (ENSRNOG00000049098)	Olr943 (ENSRNOG00000066391)	Olr947 (ENSRNOG00000002333)	Olr952 (ENSRNOG00000062619)	Or6c202 (ENSRNOG00000056595)
Rat	MODERN SPECIES	11	Utp15 (ENSRNOG00000016591)	Arhgef28 (ENSRNOG00000016544)	Enc1 (ENSRNOG00000016541)	Hexb (ENSRNOG00000025274)	Gfm2 (ENSRNOG00000025285)	Nsa2 (ENSRNOG00000016530)	Fam169a (ENSRNOG00000016505)	Gcnt4 (ENSRNOG00000064612)	Ankrd31 (ENSRNOG00000025321)	Hmgcr (ENSRNOG00000016122)	Cert1 (ENSRNOG00000015686)	ENSRNOG00000067644	Polk (ENSRNOG00000060626)	Ankdd1b (ENSRNOG00000025377)	Poc5 (ENSRNOG00000018193)	AABR07007744.2 (ENSRNOG00000060714) ##22	Sv2c (ENSRNOG00000018094)	F2rl2 (ENSRNOG00000018054)	Iqgap2 (ENSRNOG00000025406)	F2r (ENSRNOG00000048043)	AABR07007730.1 (ENSRNOG00000018045)	F2rl1 (ENSRNOG00000018003)	S100z (ENSRNOG00000017998)	Crhbp (ENSRNOG00000017890)	Aggf1 (ENSRNOG00000029304)	ENSRNOG00000063007	Zbed3 (ENSRNOG00000028941)	LOC100912266 (ENSRNOG00000059441)	ENSRNOG00000067662	Pde8b (ENSRNOG00000010280)	Wdr41 (ENSRNOG00000025462)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.a.b ##22
Mus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.b.a.b ##22
Shrew mouse	MODERN SPECIES	5	Fbll1 (MGP_PahariEiJ_G0017343)	Pank3 (MGP_PahariEiJ_G0017342)	Slit3 (MGP_PahariEiJ_G0017341)	Spdl1 (MGP_PahariEiJ_G0017340)	Insyn2b (MGP_PahariEiJ_G0017339) #11	Dock2 (MGP_PahariEiJ_G0017338) #10	Foxi1 (MGP_PahariEiJ_G0017337) #12	Lcp2 (MGP_PahariEiJ_G0017336) #14	Kcnmb1 (MGP_PahariEiJ_G0017335) #15	MGP_PahariEiJ_G0017334 #16	MGP_PahariEiJ_G0017333	Gabrp (MGP_PahariEiJ_G0017332) #18	MGP_PahariEiJ_G0017331	Ranbp17 (MGP_PahariEiJ_G0017330) #19	Tlx3 (MGP_PahariEiJ_G0017329) #21	MGP_PahariEiJ_G0017328 ##22	Fgf18 (MGP_PahariEiJ_G0017327) #23	Smim23 (MGP_PahariEiJ_G0017326) #24	Fbxw11 (MGP_PahariEiJ_G0017325) #25	Stk10 (MGP_PahariEiJ_G0017324) #26	Efcab9 (MGP_PahariEiJ_G0017323) #27	Ubtd2 (MGP_PahariEiJ_G0017322) #28	Sh3pxd2b (MGP_PahariEiJ_G0017321) #29	MGP_PahariEiJ_G0017320 #31	MGP_PahariEiJ_G0017319 #31	MGP_PahariEiJ_G0017318 #32	MGP_PahariEiJ_G0017317 #32	MGP_PahariEiJ_G0017316 #33	MGP_PahariEiJ_G0017315	Nprl3 (MGP_PahariEiJ_G0017314) #34	Rhbdf1 (MGP_PahariEiJ_G0017313) #36
Rat	MODERN SPECIES	17	Or10u3b (ENSRNOG00000063567)	Or6c70 (ENSRNOG00000047264)	Or6c76b (ENSRNOG00000066966)	Olr936 (ENSRNOG00000069078)	Or6c214b (ENSRNOG00000049098)	Olr943 (ENSRNOG00000066391)	Olr947 (ENSRNOG00000002333)	Olr952 (ENSRNOG00000062619)	Or6c202 (ENSRNOG00000056595)	Or6c69e (ENSRNOG00000070129)	Or6c213f (ENSRNOG00000067435)	Olr951 (ENSRNOG00000069974)	Or6c1 (ENSRNOG00000063839)	ENSRNOG00000064471	ENSRNOG00000065094	AABR07055527.1 (ENSRNOG00000039997) ##22	Or6c66b (ENSRNOG00000060866)	ENSRNOG00000065664	Or6c212 (ENSRNOG00000069548)	Olr990 (ENSRNOG00000064972)	ENSRNOG00000070115	Olr995 (ENSRNOG00000065975)	Or6c207 (ENSRNOG00000028911)	Or6c213c (ENSRNOG00000066066)	Or6c69b (ENSRNOG00000069876)	Or6c68 (ENSRNOG00000032428)	Or6c6b (ENSRNOG00000070116)	Or6c7 (ENSRNOG00000070885)	Or6c75 (ENSRNOG00000065865)	Or10p1 (ENSRNOG00000003347)	Or6c211 (ENSRNOG00000063210)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.a ##22
Mus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.a ##22
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.a ##22
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.a ##22
Mus_C	DUPLICATION
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000017288	ENSGT00940000154336.d	ENSGT00950000183144.A.j	ENSGT00940000153972.A	ENSGT00940000157994	ENSGT01100000263551.b.a.b	ENSGT00390000011810	ENSGT00390000017214	ENSGT00390000009061	ENSGT00940000153123.A.e	ENSGT00390000015987	ENSGT00940000153190.B.a	ENSGT00940000160117	ENSGT00940000162341	ENSGT00940000154981	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.a.a ##22	ENSGT00940000154174	ENSGT01030000234598.b.a.b.k.b	ENSGT00940000163858	ENSGT00950000183005.b.c.b	ENSGT00940000160844.a	ENSGT00950000183005.b.c.a	ENSGT00440000039287	ENSGT00940000163044	ENSGT00940000154131.f.a.a.a.a	ENSGT00940000154619.e.c.b	ENSGT00940000154131.e.a.b.a.a.a.b.c.b	ENSGT00940000163146.b	ENSGT00940000154131.f.a.a.a.b	ENSGT00940000154131.e.a.b.a.a.a.b.c.a.a	ENSGT00940000154619.f.a
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3318	ENSMSIG00000016588	Gpr83 (ENSMSIG00000016567)	Izumo1r (ENSMSIG00000016359)	Panx1 (ENSMSIG00000016343)	Hephl1 (ENSMSIG00000016306)	Vstm5 (ENSMSIG00000016281)	Med17 (ENSMSIG00000016253)	4931406C07Rik (ENSMSIG00000016204)	Taf1d (ENSMSIG00000016165)	Cep295 (ENSMSIG00000015917)	ENSMSIG00000015880	Deup1 (ENSMSIG00000015751)	Slc36a4 (ENSMSIG00000015623)	Mtnr1b (ENSMSIG00000015621)	Fat3 (ENSMSIG00000015207)	ENSMSIG00000015183 ##22	ENSMSIG00000015180	ENSMSIG00000015167	Chordc1 (ENSMSIG00000015139)	Ubtfl1 (ENSMSIG00000015135)	Mbd3l2 (ENSMSIG00000015109)	Naalad2 (ENSMSIG00000014984)	Zfp558 (ENSMSIG00000014968)	Mbd3l1 (ENSMSIG00000014959)	Muc16 (ENSMSIG00000014757)	Or1m1 (ENSMSIG00000014729)	Or7g16 (ENSMSIG00000014723)	Or7g17 (ENSMSIG00000014713)	Or7g18 (ENSMSIG00000014709)	Or7g12 (ENSMSIG00000014695)	Or7g20 (ENSMSIG00000014691)
spretus	MODERN SPECIES	18	Ankrd49 (MGP_SPRETEiJ_G0032907)	Mre11a (MGP_SPRETEiJ_G0032908)	MGP_SPRETEiJ_G0032909	Izumo1r (MGP_SPRETEiJ_G0032910)	Panx1 (MGP_SPRETEiJ_G0032911)	Hephl1 (MGP_SPRETEiJ_G0032912)	Vstm5 (MGP_SPRETEiJ_G0032913)	Med17 (MGP_SPRETEiJ_G0032914)	4931406C07Rik (MGP_SPRETEiJ_G0032915)	Cep295 (MGP_SPRETEiJ_G0032916)	Smco4 (MGP_SPRETEiJ_G0032917)	Deup1 (MGP_SPRETEiJ_G0032918)	Slc36a4 (MGP_SPRETEiJ_G0032919)	MGP_SPRETEiJ_G0032920	Fat3 (MGP_SPRETEiJ_G0032921)	MGP_SPRETEiJ_G0032922 ##22	Chordc1 (MGP_SPRETEiJ_G0032923)	Naalad2 (MGP_SPRETEiJ_G0032924)	Ubtfl1 (MGP_SPRETEiJ_G0032925)	Mbd3l2 (MGP_SPRETEiJ_G0032926)	Zfp558 (MGP_SPRETEiJ_G0032927)	Mbd3l1 (MGP_SPRETEiJ_G0032928)	MGP_SPRETEiJ_G0032929	Or1m1 (MGP_SPRETEiJ_G0032930)	Or7g16 (MGP_SPRETEiJ_G0032931)	Or7g17 (MGP_SPRETEiJ_G0032932)	Or7g18 (MGP_SPRETEiJ_G0032933)	Or7g20 (MGP_SPRETEiJ_G0032934)	Or7g19 (MGP_SPRETEiJ_G0032935)	Or7g21 (MGP_SPRETEiJ_G0032936)	Or7g25 (MGP_SPRETEiJ_G0032937)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.a.b ##22
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3273	Krtap8-1 (ENSMSIG00000011956)	ENSMSIG00000011965	Krtap20-2 (ENSMSIG00000011987)	Gm7735 (ENSMSIG00000012004)	Gm9789 (ENSMSIG00000012011)	Gm10061 (ENSMSIG00000012018)	ENSMSIG00000012022	ENSMSIG00000012028	1110025L11Rik (ENSMSIG00000012034)	ENSMSIG00000012036	ENSMSIG00000012042	ENSMSIG00000012045	Gm10229 (ENSMSIG00000012050)	Krtap22-2 (ENSMSIG00000012058)	Krtap19-9b (ENSMSIG00000012068)	ENSMSIG00000012075 ##22	Krtap19-5 (ENSMSIG00000012077)	Krtap19-4 (ENSMSIG00000012087)	Krtap19-3 (ENSMSIG00000012094)	ENSMSIG00000012101	ENSMSIG00000012114	Gm20741 (ENSMSIG00000012121)	Gm5965 (ENSMSIG00000012131)	2310057N15Rik (ENSMSIG00000012151)	Krtap13 (ENSMSIG00000012161)	Krtap13-1 (ENSMSIG00000012169)	2310061N02Rik (ENSMSIG00000012174)	ENSMSIG00000012180	Krtap27-1 (ENSMSIG00000012189)	Krtap26-1 (ENSMSIG00000012203)	2310079G19Rik (ENSMSIG00000012210)
Rat	MODERN SPECIES	16	Acp1 (ENSRNOG00000005260)	Alkal2 (ENSRNOG00000005154)	Tmem18 (ENSRNOG00000005144)	Sntg2 (ENSRNOG00000004928)	Tpo (ENSRNOG00000004646)	Pxdn (ENSRNOG00000060614)	Myt1l (ENSRNOG00000004269)	AABR07064622.1 (ENSRNOG00000047877)	Eipr1 (ENSRNOG00000009285)	Trappc12 (ENSRNOG00000009039)	Adi1 (ENSRNOG00000008950)	Rnaseh1 (ENSRNOG00000008584)	Rps7 (ENSRNOG00000008373)	Allc (ENSRNOG00000008299)	Akr1b1-ps1 (ENSRNOG00000042697)	ENSRNOG00000070424 ##22	Dcdc2c (ENSRNOG00000067604)	ENSRNOG00000069562	ENSRNOG00000068283	Sox11 (ENSRNOG00000030034)	Cmpk2 (ENSRNOG00000007690)	Rsad2 (ENSRNOG00000007539)	Rnf144a (ENSRNOG00000007370)	Id2 (ENSRNOG00000007237)	LOC120093241 (ENSRNOG00000062523)	Kidins220 (ENSRNOG00000023176)	Mboat2 (ENSRNOG00000061050)	Rrm2 (ENSRNOG00000054286)	Cys1 (ENSRNOG00000058891)	Klf11 (ENSRNOG00000054259)	Grhl1 (ENSRNOG00000054989)
Cricetidae	DUPLICATION
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.c #22
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.c #22
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	382	Or5ac20 (ENSCGRG00001010307)	ENSCGRG00001007156	ENSCGRG00001006091	ENSCGRG00001008228	ENSCGRG00001009031	ENSCGRG00001009832	ENSCGRG00001004066	Or5ac25 (ENSCGRG00001004546)	Gabrr3 (ENSCGRG00001012824)	ENSCGRG00001021101	ENSCGRG00001006924	Arl6 (ENSCGRG00001021791)	ENSCGRG00001010094	ENSCGRG00001018957	ENSCGRG00001023290	ENSCGRG00001011827 #22	Nsun3 (ENSCGRG00001013850)	Arl13b (ENSCGRG00001022552)	Stx19 (ENSCGRG00001001896)	ENSCGRG00001009587	Epha3 (ENSCGRG00001006199)	Csnka2ip (ENSCGRG00001014750)	4930453N24Rik (ENSCGRG00001015042)	Zfp654 (ENSCGRG00001020292)	Cggbp1 (ENSCGRG00001010279)	Htr1f (ENSCGRG00001010649)	ENSCGRG00001017747	ENSCGRG00001022071	Pou1f1 (ENSCGRG00001011471)	Chmp2b (ENSCGRG00001022834)	Vgll3 (ENSCGRG00001015980)
Cricetidae	DUPLICATION
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.d.a #22
Cricetinae	DUPLICATION
Cricetinae	DUPLICATION
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00410000025556.a.a.a.a	ENSGT00530000063407.b	ENSGT00550000074792.a.b	ENSGT00940000156396	ENSGT00940000159322	ENSGT00510000047951	ENSGT00940000154903 #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.d.a.a.a #22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000157079.a	ENSGT00940000159044	ENSGT00530000063113.C	ENSGT00940000156866	ENSGT00390000007125.b	ENSGT00390000014412	ENSGT00940000158996	ENSGT00390000005989.a
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	229	Fbll1 (ENSCGRG00001010028)	Pank3 (ENSCGRG00001024715)	Slit3 (ENSCGRG00001024427)	Spdl1 (ENSCGRG00001020544)	ENSCGRG00001016907 #10	Insyn2b (ENSCGRG00001011838) #11	ENSCGRG00001024778	Foxi1 (ENSCGRG00001018922) #12	Lcp2 (ENSCGRG00001017371) #14	Kcnmb1 (ENSCGRG00001013776) #15	Kcnip1 (ENSCGRG00001012407) #16	Gabrp (ENSCGRG00001018465) #18	ENSCGRG00001012148	Ranbp17 (ENSCGRG00001015450) #19	Tlx3 (ENSCGRG00001015510) #21	ENSCGRG00001001985 #22	Fgf18 (ENSCGRG00001017188) #23	Smim23 (ENSCGRG00001015541) #24	Fbxw11 (ENSCGRG00001016029) #25	Stk10 (ENSCGRG00001013751) #26	Efcab9 (ENSCGRG00001001253) #27	Ubtd2 (ENSCGRG00001022026) #28	Sh3pxd2b (ENSCGRG00001010764) #29	Neurl1b (ENSCGRG00001022855)	Dusp1 (ENSCGRG00001019246)	Ergic1 (ENSCGRG00001024104)	Atp6v0e (ENSCGRG00001022946)	Crebrf (ENSCGRG00001007231)	Bnip1 (ENSCGRG00001000805)	Nkx2-5 (ENSCGRG00001024735)	Stc2 (ENSCGRG00001023337)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	647	Wwc1 (ENSMAUG00000017390)	Rars (ENSMAUG00000008565)	Fbll1 (ENSMAUG00000015741)	Pank3 (ENSMAUG00000015169)	Slit3 (ENSMAUG00000020131)	Spdl1 (ENSMAUG00000016538)	Insyn2b (ENSMAUG00000014081) #11	Foxi1 (ENSMAUG00000015026) #12	Lcp2 (ENSMAUG00000017641) #14	Kcnmb1 (ENSMAUG00000013389) #15	Kcnip1 (ENSMAUG00000001514) #16	Gabrp (ENSMAUG00000012765) #18	ENSMAUG00000014767	Ranbp17 (ENSMAUG00000017990) #19	Tlx3 (ENSMAUG00000000195) #21	ENSMAUG00000009288 #22	Fgf18 (ENSMAUG00000000510) #23	Smim23 (ENSMAUG00000000246) #24	Fbxw11 (ENSMAUG00000003046) #25	Stk10 (ENSMAUG00000005509) #26
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.d.a.a.b #22
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	219	Pigk (ENSCGRG00001004016)	St6galnac5 (ENSCGRG00001000655)	St6galnac3 (ENSCGRG00001021202)	Asb17 (ENSCGRG00001019617)	Msh4 (ENSCGRG00001016582)	Rabggtb (ENSCGRG00001015396)	Acadm (ENSCGRG00001014947)	ENSCGRG00001011523	Lhx8 (ENSCGRG00001023560)	Tyw3 (ENSCGRG00001022820)	Cryz (ENSCGRG00001022359)	ENSCGRG00001021548	Tnni3k (ENSCGRG00001019929)	Fpgt (ENSCGRG00001018999)	ENSCGRG00001018112	ENSCGRG00001009246 #22	Negr1 (ENSCGRG00001006889)	ENSCGRG00001019737	Ptger3 (ENSCGRG00001018046)	Cth (ENSCGRG00001017639)	Ankrd13c (ENSCGRG00001014243)	Srsf11 (ENSCGRG00001012043)	Lrrc40 (ENSCGRG00001008246)	Lrrc7 (ENSCGRG00001014135)	ENSCGRG00001016303	Depdc1a (ENSCGRG00001021261)	Rpe65 (ENSCGRG00001003298)	Wls (ENSCGRG00001000949)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	839										Oprk1 (ENSMAUG00000001461)	ENSMAUG00000003064	Npbwr1 (ENSMAUG00000015729)	ENSMAUG00000002024	ENSMAUG00000000926	Alkal1 (ENSMAUG00000001110)	ENSMAUG00000001039 #22	St18 (ENSMAUG00000000573)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.d.a.b #22
Chinese hamster chok1gshd	DUPLICATION
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	352	ENSCGRG00001012986	ENSCGRG00001018287	Tiparp (ENSCGRG00001011123)	Ssr3 (ENSCGRG00001019723)	Kcnab1 (ENSCGRG00001005457)	ENSCGRG00001005615	ENSCGRG00001017013	Vmn2r1 (ENSCGRG00001023200)	Gmps (ENSCGRG00001018772)	Slc33a1 (ENSCGRG00001018761)	E130311K13Rik (ENSCGRG00001024290)	Plch1 (ENSCGRG00001000217)	ENSCGRG00001021700	ENSCGRG00001022762	Mme (ENSCGRG00001000828)	ENSCGRG00001008438 #22	ENSCGRG00001007190	Gpr149 (ENSCGRG00001013143)	Dhx36 (ENSCGRG00001013722)	Arhgef26 (ENSCGRG00001017827)	Rap2b (ENSCGRG00001008789)	P2ry1 (ENSCGRG00001004469)	Mbnl1 (ENSCGRG00001007139)	Sucnr1 (ENSCGRG00001017063)	Aadac (ENSCGRG00001018575)	Aadacl2 (ENSCGRG00001019320)	Aadacl2fm1 (ENSCGRG00001013390)	Aadacl2fm3 (ENSCGRG00001016631)	Igsf10 (ENSCGRG00001011835)	Med12l (ENSCGRG00001002841)	P2ry12 (ENSCGRG00001004633)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	1	ENSCGRG00001012265	Slc6a19 (ENSCGRG00001011943)	Slc6a18 (ENSCGRG00001012926)	Tert (ENSCGRG00001012546)	Clptm1l (ENSCGRG00001016619)	Slc6a3 (ENSCGRG00001006359)	Lpcat1 (ENSCGRG00001005110)	Mrpl36 (ENSCGRG00001008138)	ENSCGRG00001016119	Irx4 (ENSCGRG00001014881)	Irx2 (ENSCGRG00001014435)	ENSCGRG00001013677	Irx1 (ENSCGRG00001000951)	Adamts16 (ENSCGRG00001024673)	ENSCGRG00001024420	ENSCGRG00001013263 #22	MED10 (ENSCGRG00001014842)	Ube2ql1 (ENSCGRG00001007893)	Nsun2 (ENSCGRG00001003947)	Srd5a1 (ENSCGRG00001002045)	Tent4a (ENSCGRG00001014344)	Adcy2 (ENSCGRG00001012614)	Cfap90 (ENSCGRG00001012047)	Fastkd3 (ENSCGRG00001016248)	Mtrr (ENSCGRG00001015919)	ENSCGRG00001020262	ENSCGRG00001019143	ENSCGRG00001024688	ENSCGRG00001024555	ENSCGRG00001024303	ENSCGRG00001024630
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.d.a #22
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	7	Asf1a (ENSPEMG00000027084)	Fam184a (ENSPEMG00000022865)	Man1a (ENSPEMG00000023840)	ENSPEMG00000030386	Tbc1d32 (ENSPEMG00000020235)	Msl3l2 (ENSPEMG00000028387)	Gja1 (ENSPEMG00000027947)	Hsf2 (ENSPEMG00000019842)	Serinc1 (ENSPEMG00000019365)	Pkib (ENSPEMG00000024490)	Fabp7 (ENSPEMG00000019798)	Smpdl3a (ENSPEMG00000008641)	Clvs2 (ENSPEMG00000025108)	Trdn (ENSPEMG00000020000)	Nkain2 (ENSPEMG00000019922)	ENSPEMG00000008328 #22	Rnf217 (ENSPEMG00000006698)	Tpd52l1 (ENSPEMG00000019746)	Hddc2 (ENSPEMG00000019710)	Hey2 (ENSPEMG00000030365)	Ncoa7 (ENSPEMG00000012382)	Hint3 (ENSPEMG00000019687)	Trmt11 (ENSPEMG00000019414)	ENSPEMG00000007641	Cenpw (ENSPEMG00000030616)	Rspo3 (ENSPEMG00000016458)	ENSPEMG00000024818	Echdc1 (ENSPEMG00000022705)	9330159F19Rik (ENSPEMG00000023194)	Soga3 (ENSPEMG00000021640)	2310057J18Rik (ENSPEMG00000022500)
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063407.b	ENSGT00550000074792.a.b	ENSGT00940000156396	ENSGT00940000159322	ENSGT00510000047951	ENSGT00940000154903 #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00940000172454 #13	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.d.b #22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000157079.a	ENSGT00940000159044	ENSGT00530000063113.C	ENSGT00940000156866	ENSGT00390000007125.b	ENSGT00390000014412	ENSGT00940000158996	ENSGT00390000005989.a
Cricetidae_B	DUPLICATION
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063407.b	ENSGT00550000074792.a.b	ENSGT00940000156396	ENSGT00940000159322	ENSGT00510000047951	ENSGT00940000154903 #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00940000172454 #13	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.d.b.a #22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000157079.a	ENSGT00940000159044	ENSGT00530000063113.C	ENSGT00940000156866	ENSGT00390000007125.b	ENSGT00390000014412	ENSGT00940000158996	ENSGT00390000005989.a
Northern American deer mouse	DUPLICATION
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	21	Rpl3l (ENSPEMG00000010667)	Msrb1 (ENSPEMG00000018902)	Hs3st6 (ENSPEMG00000016998)	ENSPEMG00000025436	Spdl1 (ENSPEMG00000009912)	Dock2 (ENSPEMG00000015007) #10	Insyn2b (ENSPEMG00000015788) #11	Foxi1 (ENSPEMG00000015123) #12	4930469K13Rik (ENSPEMG00000029094) #13	Lcp2 (ENSPEMG00000011935) #14	Kcnmb1 (ENSPEMG00000025688) #15	Kcnip1 (ENSPEMG00000007681) #16	Gabrp (ENSPEMG00000008255) #18	Ranbp17 (ENSPEMG00000013086) #19	Tlx3 (ENSPEMG00000009002) #21	ENSPEMG00000010032 #22	Fgf18 (ENSPEMG00000027707) #23	ENSPEMG00000005862	Smim23 (ENSPEMG00000009648) #24	Fbxw11 (ENSPEMG00000014614) #25	Stk10 (ENSPEMG00000016749) #26	Efcab9 (ENSPEMG00000012516) #27	Ubtd2 (ENSPEMG00000028774) #28	Sh3pxd2b (ENSPEMG00000011209) #29	Neurl1b (ENSPEMG00000018647)	Dusp1 (ENSPEMG00000008974)	ENSPEMG00000029256	Ergic1 (ENSPEMG00000011371)	Atp6v0e (ENSPEMG00000016171)	Crebrf (ENSPEMG00000019136)	Bnip1 (ENSPEMG00000014579)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	21	Nsf (ENSPEMG00000018090)	Arf2 (ENSPEMG00000028221)	Crhr1 (ENSPEMG00000002077)	Sppl2c (ENSPEMG00000031371)	Mapt (ENSPEMG00000011911)	Kansl1 (ENSPEMG00000005436)	Cdc27 (ENSPEMG00000014883)	Myl4 (ENSPEMG00000012002)	Itgb3 (ENSPEMG00000007846)	Gm11639 (ENSPEMG00000027977)	Mettl2 (ENSPEMG00000011277)	Tlk2 (ENSPEMG00000009099)	Mrc2 (ENSPEMG00000008777)	Marchf10 (ENSPEMG00000016468)	Tanc2 (ENSPEMG00000013025)	ENSPEMG00000019831 #22	Cyb561 (ENSPEMG00000009659)	Ace (ENSPEMG00000018095)	Ace3 (ENSPEMG00000014555)	Kcnh6 (ENSPEMG00000015737)	Dcaf7 (ENSPEMG00000029147)	Taco1 (ENSPEMG00000014249)	Map3k3 (ENSPEMG00000013883)	Limd2 (ENSPEMG00000025945)	Strada (ENSPEMG00000012148)	ENSPEMG00000010379	Ddx42 (ENSPEMG00000006755)	Ftsj3 (ENSPEMG00000000248)	ENSPEMG00000018373	Smarcd2 (ENSPEMG00000008268)	Tcam1 (ENSPEMG00000007448)
Prairie vole	DUPLICATION
Prairie vole	DUPLICATION
Prairie vole	MODERN SPECIES	15	Wwc1 (ENSMOCG00000019399)	Rars (ENSMOCG00000005240)	Fbll1 (ENSMOCG00000022683)	Pank3 (ENSMOCG00000006926)	Slit3 (ENSMOCG00000011712)	Spdl1 (ENSMOCG00000014400)	Insyn2b (ENSMOCG00000022544) #11	Dock2 (ENSMOCG00000007487) #10	Foxi1 (ENSMOCG00000004587) #12	Lcp2 (ENSMOCG00000012783) #14	Kcnmb1 (ENSMOCG00000012254) #15	Kcnip1 (ENSMOCG00000019706) #16	Gabrp (ENSMOCG00000022600) #18	Ranbp17 (ENSMOCG00000007105) #19	Tlx3 (ENSMOCG00000013764) #21	ENSMOCG00000001485 #22	Fgf18 (ENSMOCG00000010978) #23	Smim23 (ENSMOCG00000008049) #24	Fbxw11 (ENSMOCG00000005139) #25	ENSMOCG00000022759 #26	Efcab9 (ENSMOCG00000022547) #27	ENSMOCG00000022075 #28	ENSMOCG00000022493 #29	Abcc1 (ENSMOCG00000001674)	Cep20 (ENSMOCG00000002426)	Myh11 (ENSMOCG00000001351)	Nde1 (ENSMOCG00000004322)	Marf1 (ENSMOCG00000001136)	ENSMOCG00000022220	Bmerb1 (ENSMOCG00000018990)	Mpv17l (ENSMOCG00000016475)
Prairie vole	MODERN SPECIES	1											ENSMOCG00000015130	ENSMOCG00000010768	ENSMOCG00000017651	Cfap107 (ENSMOCG00000021478)	Aadacl3 (ENSMOCG00000019587)	ENSMOCG00000001628 #22	Aadacl4fm1 (ENSMOCG00000018268)	ENSMOCG00000020825	Aadacl4 (ENSMOCG00000004268)	Aadacl4fm4 (ENSMOCG00000019793)	ENSMOCG00000017314	Dhrs3 (ENSMOCG00000015852)	Vps13d (ENSMOCG00000021798)	Tnfrsf1b (ENSMOCG00000011772)	Tnfrsf8 (ENSMOCG00000013428)	Miip (ENSMOCG00000012534)	Mfn2 (ENSMOCG00000018675)	Plod1 (ENSMOCG00000012299)	2510039O18Rik (ENSMOCG00000016570)	Nppb (ENSMOCG00000008405)	Nppa (ENSMOCG00000001019)
Prairie vole	MODERN SPECIES	353	Tnfrsf11b (ENSMOCG00000019162)	Samd12 (ENSMOCG00000000941)	Ext1 (ENSMOCG00000010164)	Med30 (ENSMOCG00000003186)	Slc30a8 (ENSMOCG00000004114)	Aard (ENSMOCG00000009240)	Rad21 (ENSMOCG00000012525)	ENSMOCG00000018221	Eif3h (ENSMOCG00000020728)	ENSMOCG00000007048	Trps1 (ENSMOCG00000004602)	Csmd3 (ENSMOCG00000005179)	Ncam2 (ENSMOCG00000019910)	ENSMOCG00000022813	Tmprss15 (ENSMOCG00000000730)	ENSMOCG00000005366 #22	Chodl (ENSMOCG00000009339)	D16Ertd472e (ENSMOCG00000013574)	Btg3 (ENSMOCG00000014652)	Cxadr (ENSMOCG00000018494)	ENSMOCG00000002949	ENSMOCG00000004992	Ccser1 (ENSMOCG00000003290)	ENSMOCG00000013401	Mmrn1 (ENSMOCG00000020376)	Snca (ENSMOCG00000022869)	Gprin3 (ENSMOCG00000001332)	ENSMOCG00000001905	Tigd2 (ENSMOCG00000011023)	Fam13a (ENSMOCG00000014628)	Herc3 (ENSMOCG00000021374)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.d.b.b #22
Prairie vole	DUPLICATION
Prairie vole	MODERN SPECIES	16	Cntf (ENSMOCG00000016049)	Zfp91 (ENSMOCG00000018468)	Lpxn (ENSMOCG00000019266)	Or5b21 (ENSMOCG00000002067)	ENSMOCG00000009033	ENSMOCG00000017684	Or9q1 (ENSMOCG00000009793)	Tle4 (ENSMOCG00000011846)	ENSMOCG00000017959	ENSMOCG00000021736	Cep78 (ENSMOCG00000020072)	ENSMOCG00000012700	Gna14 (ENSMOCG00000012393)	ENSMOCG00000013981	Vps13a (ENSMOCG00000019974)	ENSMOCG00000019450 #22	Foxb2 (ENSMOCG00000001949)	ENSMOCG00000009883	ENSMOCG00000019381	Gcnt1 (ENSMOCG00000013528)	Rfk (ENSMOCG00000019217)	ENSMOCG00000020199	Ostf1 (ENSMOCG00000021405)	Nmrk1 (ENSMOCG00000022247)	Carnmt1 (ENSMOCG00000005517)	D030056L22Rik (ENSMOCG00000012610)	Trpm6 (ENSMOCG00000012817)	Rorb (ENSMOCG00000020519)	Anxa1 (ENSMOCG00000014540)	Aldh1a1 (ENSMOCG00000018548)	ENSMOCG00000013424
Prairie vole	MODERN SPECIES	3	4921517D22Rik (ENSMOCG00000022999)	ENSMOCG00000019507	Naa35 (ENSMOCG00000013999)	Agtpbp1 (ENSMOCG00000014650)	Ntrk2 (ENSMOCG00000015461)	Slc28a3 (ENSMOCG00000005269)	Rmi1 (ENSMOCG00000016761)	ENSMOCG00000001446	2210016F16Rik (ENSMOCG00000017857)	Kif27 (ENSMOCG00000015570)	Gkap1 (ENSMOCG00000011062)	Ubqln1 (ENSMOCG00000001210)	Idnk (ENSMOCG00000010669)	ENSMOCG00000021968	Klhl3 (ENSMOCG00000009025)	ENSMOCG00000022384 #22	Spock1 (ENSMOCG00000020464)	Trpc7 (ENSMOCG00000007497)	Smim32 (ENSMOCG00000005510)	Smad5 (ENSMOCG00000014515)	Tgfbi (ENSMOCG00000016445)	Lect2 (ENSMOCG00000010525)	Fbxl21 (ENSMOCG00000017953)	Il9 (ENSMOCG00000015389)	Slc25a48 (ENSMOCG00000014485)	ENSMOCG00000013166	Cxcl14 (ENSMOCG00000012248)	Tifab (ENSMOCG00000006896)	Macroh2a1 (ENSMOCG00000002242)	Pitx1 (ENSMOCG00000012203)	Catsper3 (ENSMOCG00000005794)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	8	Arhgef10 (ENSPEMG00000023366)	Cln8 (ENSPEMG00000027459)	Dlgap2 (ENSPEMG00000024199)	Erich1 (ENSPEMG00000017352)	Tdrp (ENSPEMG00000024535)	Fbxo25 (ENSPEMG00000019484)	ENSPEMG00000030218	Champ1 (ENSPEMG00000019715)	Upf3a (ENSPEMG00000019968)	Cdc16 (ENSPEMG00000020029)	Cfap97d2 (ENSPEMG00000019811)	Rasa3 (ENSPEMG00000019978)	1700029H14Rik (ENSPEMG00000003001)	Gas6 (ENSPEMG00000018326)	Tmem255b (ENSPEMG00000011727)	ENSPEMG00000030658 #22	Grk1 (ENSPEMG00000019528)	Atp4b (ENSPEMG00000020168)	Tfdp1 (ENSPEMG00000020251)	Tmco3 (ENSPEMG00000009817)	Dcun1d2 (ENSPEMG00000011440)	ENSPEMG00000017800	Grtp1 (ENSPEMG00000019914)	Lamp1 (ENSPEMG00000020244)	Cul4a (ENSPEMG00000019569)	Pcid2 (ENSPEMG00000019575)	Proz (ENSPEMG00000020154)	F10 (ENSPEMG00000004452)	F7 (ENSPEMG00000019915)	Mcf2l (ENSPEMG00000019409)	Atp11a (ENSPEMG00000008831)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.d.d.b #22
Golden Hamster	MODERN SPECIES	701	Cfap20 (ENSMAUG00000002778)	Csnk2a2 (ENSMAUG00000008176)	Ccdc113 (ENSMAUG00000000235)	Prss54 (ENSMAUG00000000894)	Gins3 (ENSMAUG00000008574)	Ndrg4 (ENSMAUG00000016805)	Setd6 (ENSMAUG00000004853)	ENSMAUG00000009731	ENSMAUG00000014000	Slc38a7 (ENSMAUG00000016252)	Got2 (ENSMAUG00000018221)	ENSMAUG00000012456	Cdh8 (ENSMAUG00000000265)	ENSMAUG00000013353	ENSMAUG00000014350	ENSMAUG00000015943 #22	ENSMAUG00000017111	Cdh11 (ENSMAUG00000015471)	Cdh5 (ENSMAUG00000016489)	Bean1 (ENSMAUG00000018813)	Tk2 (ENSMAUG00000014656)	Cklf (ENSMAUG00000019904)	ENSMAUG00000010482	Cmtm3 (ENSMAUG00000010935)	Cmtm4 (ENSMAUG00000011070)	Dync1li2 (ENSMAUG00000011837)	Terb1 (ENSMAUG00000010324)	Nae1 (ENSMAUG00000013882)	Car7 (ENSMAUG00000012285)	Pdp2 (ENSMAUG00000013617)	Cdh16 (ENSMAUG00000000808)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	332	Gdf5 (ENSDORG00000015642)	Uqcc1 (ENSDORG00000001426)	Fam83c (ENSDORG00000001424)	Eif6 (ENSDORG00000001423)	Mmp24 (ENSDORG00000001419)	Procr (ENSDORG00000001184)	Edem2 (ENSDORG00000006204)	Trpc4ap (ENSDORG00000008578)	Myh7b (ENSDORG00000008575)	ENSDORG00000008574	Acss2 (ENSDORG00000008570)	Ggt7 (ENSDORG00000008568)	ENSDORG00000016245	Trp53inp2 (ENSDORG00000026160)	Pigu (ENSDORG00000001715)	ENSDORG00000029351 #22	Dynlrb1 (ENSDORG00000028607)	Itch (ENSDORG00000027257)	ENSDORG00000012590	a (ENSDORG00000013768)	Eif2s2 (ENSDORG00000001920)	Raly (ENSDORG00000013400)	Chmp4b (ENSDORG00000011539)	Zfp341 (ENSDORG00000000005)	Pxmp4 (ENSDORG00000030129)	E2f1 (ENSDORG00000013793)	Necab3 (ENSDORG00000013792)	Cbfa2t2 (ENSDORG00000001656)	Snta1 (ENSDORG00000029237)	Cdk5rap1 (ENSDORG00000004622)	Bpifb5 (ENSDORG00000028380)
Rodentia_B	DUPLICATION
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.a ##22
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	350	Top3a (ENSDORG00000005350)	Mief2 (ENSDORG00000027947)	Flii (ENSDORG00000005341)	Llgl1 (ENSDORG00000005339)	ENSDORG00000024764	Myo15a (ENSDORG00000016485)	Drg2 (ENSDORG00000016484)	Gid4 (ENSDORG00000016482)	Atpaf2 (ENSDORG00000016481)	Drc3 (ENSDORG00000016478)	Tom1l2 (ENSDORG00000016476)	Srebf1 (ENSDORG00000012333)	Rai1 (ENSDORG00000012338)	Pemt (ENSDORG00000015700)	Med9 (ENSDORG00000015698)	ENSDORG00000025877 ##22	Nt5m (ENSDORG00000005928)	Cops3 (ENSDORG00000011133)	Flcn (ENSDORG00000011129)	Pld6 (ENSDORG00000006462)	ENSDORG00000025758	ENSDORG00000024704	ENSDORG00000024708	Usp22 (ENSDORG00000008743)	Dhrs7b (ENSDORG00000010575)	Tmem11 (ENSDORG00000010578)	Natd1 (ENSDORG00000024761)	ENSDORG00000012413	Kcnj12 (ENSDORG00000004888)	ENSDORG00000026977	ENSDORG00000026128
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.a ##22
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.a ##22
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.a ##22
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.a ##22
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.a ##22
Golden Hamster	MODERN SPECIES	833					Gabre (ENSMAUG00000001350)	Cnga2 (ENSMAUG00000002288)	Fate1 (ENSMAUG00000002949)	Prrg3 (ENSMAUG00000001542)	ENSMAUG00000002037	Gpr50 (ENSMAUG00000002329)	Hmgb3 (ENSMAUG00000003762)	Cd99l2 (ENSMAUG00000005037)	Mtmr1 (ENSMAUG00000003637)	Mtm1 (ENSMAUG00000007647)	Mamld1 (ENSMAUG00000005591)	ENSMAUG00000007102 ##22	Eola1 (ENSMAUG00000007164)	Tmem185a (ENSMAUG00000007774)
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.c.b ##22
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	431	Ccng1 (ENSDORG00000014293)	Mat2b (ENSDORG00000011688)	Tenm2 (ENSDORG00000000072)	Wwc1 (ENSDORG00000026822)	Rars (ENSDORG00000010641)	Pank3 (ENSDORG00000016387)	Slit3 (ENSDORG00000024863)	Spdl1 (ENSDORG00000006325)	Insyn2b (ENSDORG00000026025) #11	Dock2 (ENSDORG00000006519) #10	ENSDORG00000016444 #14	Kcnmb1 (ENSDORG00000023698) #15	Kcnip1 (ENSDORG00000008211) #16	Gabrp (ENSDORG00000012082) #18	Ranbp17 (ENSDORG00000001411) #19	ENSDORG00000028337 ##22	Fgf18 (ENSDORG00000025835) #23	ENSDORG00000026619	Fbxw11 (ENSDORG00000009769) #25	Stk10 (ENSDORG00000009303) #26	Efcab9 (ENSDORG00000010658) #27	Ubtd2 (ENSDORG00000026096) #28	Sh3pxd2b (ENSDORG00000003937) #29
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00530000063407.b	ENSGT00550000074792.a.b	ENSGT00940000156396	ENSGT00940000159322	ENSGT00510000047951	ENSGT00940000154903 #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00560000078585	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.b #22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000157079.a	ENSGT00940000159044	ENSGT00530000063113.C	ENSGT00390000014165.c.b	ENSGT00940000156866	ENSGT00390000007125.b	ENSGT00390000014412	ENSGT00940000158996
Sciuridae	DUPLICATION
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.a #22
Eurasian red squirrel	DUPLICATION
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	15	RARS1 (ENSSVLG00005017270)	FBLL1 (ENSSVLG00005017249)	ENSSVLG00005017131	SLIT3 (ENSSVLG00005017034)	SPDL1 (ENSSVLG00005016956)	INSYN2B (ENSSVLG00005016909) #11	DOCK2 (ENSSVLG00005016455) #10	FOXI1 (ENSSVLG00005016401) #12	C5orf58 (ENSSVLG00005016377)	LCP2 (ENSSVLG00005015956) #14	KCNMB1 (ENSSVLG00005015902) #15	KCNIP1 (ENSSVLG00005015593) #16	GABRP (ENSSVLG00005015323) #18	RANBP17 (ENSSVLG00005015018) #19	TLX3 (ENSSVLG00005014955) #21	ENSSVLG00005014590 #22	FGF18 (ENSSVLG00005014519) #23	FBXW11 (ENSSVLG00005014207) #25	STK10 (ENSSVLG00005014068) #26	EFCAB9 (ENSSVLG00005013993) #27	UBTD2 (ENSSVLG00005013934) #28	SH3PXD2B (ENSSVLG00005013894) #29	NEURL1B (ENSSVLG00005013785)	DUSP1 (ENSSVLG00005013587)	ERGIC1 (ENSSVLG00005013430)	RPL26L1 (ENSSVLG00005013228)	ATP6V0E1 (ENSSVLG00005013162)	CREBRF (ENSSVLG00005013005)	BNIP1 (ENSSVLG00005012932)	NKX2-5 (ENSSVLG00005012867)	STC2 (ENSSVLG00005012797)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	14	MFHAS1 (ENSSVLG00005016271)	ERI1 (ENSSVLG00005016316)	PPP1R3B (ENSSVLG00005016330)	ENSSVLG00005016347	TNKS (ENSSVLG00005016386)	DUSP4 (ENSSVLG00005016443)	SARAF (ENSSVLG00005016504)	LEPROTL1 (ENSSVLG00005016547)	ENSSVLG00005016597	ENSSVLG00005016629	ENSSVLG00005016714	HGSNAT (ENSSVLG00005016741)	POMK (ENSSVLG00005016784)	ENSSVLG00005016814	HOOK3 (ENSSVLG00005016854)	ENSSVLG00005017098 #22	RNF170 (ENSSVLG00005017139)	THAP1 (ENSSVLG00005017229)	CHRNA6 (ENSSVLG00005017315)	CHRNB3 (ENSSVLG00005017450)	SMIM19 (ENSSVLG00005017542)	SLC20A2 (ENSSVLG00005017580)	ENSSVLG00005017652	DKK4 (ENSSVLG00005017944)	POLB (ENSSVLG00005018013)	IKBKB (ENSSVLG00005018109)	PLAT (ENSSVLG00005018429)	AP3M2 (ENSSVLG00005019071)	KAT6A (ENSSVLG00005019144)	ANK1 (ENSSVLG00005019744)	NKX6-3 (ENSSVLG00005020897)
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.a #22
Alpin marmot	MODERN SPECIES	1	SIX1 (ENSMMMG00000020535)	ENSMMMG00000020537	MNAT1 (ENSMMMG00000020544)	TRMT5 (ENSMMMG00000020550)	SLC38A6 (ENSMMMG00000020558)	TMEM30B (ENSMMMG00000020577)	PRKCH (ENSMMMG00000020586)	HIF1A (ENSMMMG00000020603)	SNAPC1 (ENSMMMG00000020631)	SYT16 (ENSMMMG00000020656)	ENSMMMG00000020664	KCNH5 (ENSMMMG00000020695)	RHOJ (ENSMMMG00000020711)	GPHB5 (ENSMMMG00000020716)	PPP2R5E (ENSMMMG00000020722)	ENSMMMG00000020739 #22	WDR89 (ENSMMMG00000020745)	SGPP1 (ENSMMMG00000020751)	ENSMMMG00000020757	ENSMMMG00000020769	ESR2 (ENSMMMG00000020849)	ENSMMMG00000020893	MTHFD1 (ENSMMMG00000020925)	AKAP5 (ENSMMMG00000020940)	ZBTB25 (ENSMMMG00000020941)	ZBTB1 (ENSMMMG00000020951)	HSPA2 (ENSMMMG00000020955)	PPP1R36 (ENSMMMG00000020959)	PLEKHG3 (ENSMMMG00000020967)	SPTB (ENSMMMG00000020993)	FNTB (ENSMMMG00000021058)
Sciuridae	DUPLICATION
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00530000063407.b	ENSGT00550000074792.a.b	ENSGT00940000156396	ENSGT00940000159322	ENSGT00510000047951	ENSGT00940000154903 #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00560000078585	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.b.a #22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000157079.a	ENSGT00940000159044	ENSGT00530000063113.C	ENSGT00390000014165.c.b	ENSGT00940000156866	ENSGT00390000007125.b	ENSGT00390000014412	ENSGT00940000158996
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00550000074792.a.b	ENSGT00940000156396	ENSGT00940000159322	ENSGT00510000047951	ENSGT00940000154903 #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00560000078585	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00390000010491.f.b	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.b.a #22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000157079.a	ENSGT00940000159044	ENSGT00530000063113.C	ENSGT00390000014165.c.b	ENSGT00940000156866	ENSGT00390000007125.b	ENSGT00390000014412	ENSGT00940000158996
Alpin marmot	MODERN SPECIES	31	RARS1 (ENSMMMG00000010943)	ENSMMMG00000010921	SLIT3 (ENSMMMG00000010861)	SPDL1 (ENSMMMG00000010830)	INSYN2B (ENSMMMG00000010818) #11	DOCK2 (ENSMMMG00000010732) #10	FOXI1 (ENSMMMG00000010708) #12	C5orf58 (ENSMMMG00000010701)	LCP2 (ENSMMMG00000010608) #14	KCNMB1 (ENSMMMG00000010599) #15	ENSMMMG00000010588	KCNIP1 (ENSMMMG00000010524) #16	GABRP (ENSMMMG00000010504) #18	RANBP17 (ENSMMMG00000010468) #19	TLX3 (ENSMMMG00000010459) #21	ENSMMMG00000010435 #22	ENSMMMG00000010418 #23	SMIM23 (ENSMMMG00000010399) #24	FBXW11 (ENSMMMG00000010309) #25	STK10 (ENSMMMG00000010286) #26	ENSMMMG00000010272 #27	UBTD2 (ENSMMMG00000010264) #28	SH3PXD2B (ENSMMMG00000010235) #29	NEURL1B (ENSMMMG00000010222)	ENSMMMG00000010217	ERGIC1 (ENSMMMG00000010202)	RPL26L1 (ENSMMMG00000010196)	CREBRF (ENSMMMG00000010165)	BNIP1 (ENSMMMG00000010131)	NKX2-5 (ENSMMMG00000010122)	STC2 (ENSMMMG00000010105)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	127					ENSGT00940000154903 #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00560000078585	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00390000010491.f.b	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.b.a #22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000157079.a	ENSGT00940000159044	ENSGT00530000063113.C	ENSGT00390000014165.c.b	ENSGT00940000156866	ENSGT00390000007125.b	ENSGT00390000014412	ENSGT00940000158996
Squirrel	DUPLICATION
Squirrel	DUPLICATION
Squirrel	MODERN SPECIES	105								ENSSTOG00000024801	TMPRSS15 (ENSSTOG00000011027)	CHODL (ENSSTOG00000011022)	C21orf91 (ENSSTOG00000027303)	ENSSTOG00000010285	CXADR (ENSSTOG00000026899)	USP25 (ENSSTOG00000034203)	NRIP1 (ENSSTOG00000020623)	ENSSTOG00000027949 #22	SAMSN1 (ENSSTOG00000025735)	HSPA13 (ENSSTOG00000011229)	RBM11 (ENSSTOG00000034273)	LIPI (ENSSTOG00000013743)	ROBO2 (ENSSTOG00000015604)	ROBO1 (ENSSTOG00000000470)	GBE1 (ENSSTOG00000002532)
Squirrel	MODERN SPECIES	183																ENSSTOG00000033121 #22	C14orf28 (ENSSTOG00000009376)	KLHL28 (ENSSTOG00000009381)	TOGARAM1 (ENSSTOG00000009385)	PRPF39 (ENSSTOG00000019828)	FKBP3 (ENSSTOG00000002249)	RPL10L (ENSSTOG00000020857)	MDGA2 (ENSSTOG00000008672)	ENSSTOG00000006936	LRR1 (ENSSTOG00000006973)	ENSSTOG00000033824	MGAT2 (ENSSTOG00000007012)	DNAAF2 (ENSSTOG00000023987)	POLE2 (ENSSTOG00000007024)	KLHDC1 (ENSSTOG00000007062)	KLHDC2 (ENSSTOG00000000958)
Squirrel	MODERN SPECIES	209							INSYN2B (ENSSTOG00000016521) #11	DOCK2 (ENSSTOG00000028655) #10	FOXI1 (ENSSTOG00000016524) #12	LCP2 (ENSSTOG00000016525) #14	KCNMB1 (ENSSTOG00000021835) #15	KCNIP1 (ENSSTOG00000004193) #16	ENSSTOG00000014692 #18	RANBP17 (ENSSTOG00000014700) #19	TLX3 (ENSSTOG00000026927) #21	ENSSTOG00000014732 #22	FGF18 (ENSSTOG00000023666) #23	SMIM23 (ENSSTOG00000024706) #24	FBXW11 (ENSSTOG00000023506) #25	STK10 (ENSSTOG00000026208) #26	EFCAB9 (ENSSTOG00000020218) #27	UBTD2 (ENSSTOG00000014298) #28	SH3PXD2B (ENSSTOG00000028124) #29	NEURL1B (ENSSTOG00000025420)	DUSP1 (ENSSTOG00000023698)	ERGIC1 (ENSSTOG00000025246)	RPL26L1 (ENSSTOG00000026876)	ATP6V0E1 (ENSSTOG00000025255)	CREBRF (ENSSTOG00000004368)	BNIP1 (ENSSTOG00000004393)	NKX2-5 (ENSSTOG00000004407)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	242					DOCK2 (ENSUPAG00010022135) #10	INSYN2B (ENSUPAG00010022143) #11	FOXI1 (ENSUPAG00010022146) #12	C5orf58 (ENSUPAG00010022147)	LCP2 (ENSUPAG00010022148) #14	KCNMB1 (ENSUPAG00010022156) #15	ENSUPAG00010022158	KCNIP1 (ENSUPAG00010022160) #16	GABRP (ENSUPAG00010022164) #18	RANBP17 (ENSUPAG00010022169) #19	TLX3 (ENSUPAG00010022175) #21	NPM1 (ENSUPAG00010022177) #22	FGF18 (ENSUPAG00010022179) #23	SMIM23 (ENSUPAG00010022182) #24	ENSUPAG00010022184 #25	STK10 (ENSUPAG00010022207) #26	EFCAB9 (ENSUPAG00010022210) #27	UBTD2 (ENSUPAG00010022213) #28	SH3PXD2B (ENSUPAG00010022216) #29	NEURL1B (ENSUPAG00010022219)	ERGIC1 (ENSUPAG00010022238)	RPL26L1 (ENSUPAG00010022239)	ATP6V0E1 (ENSUPAG00010022244)	CREBRF (ENSUPAG00010022247)	BNIP1 (ENSUPAG00010022250)	NKX2-5 (ENSUPAG00010022252)	STC2 (ENSUPAG00010022254)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	18	CDS1 (ENSSVLG00005019388)	NKX6-1 (ENSSVLG00005019440)	ENSSVLG00005019498	GPAT3 (ENSSVLG00005019557)	ABRAXAS1 (ENSSVLG00005019610)	ENSSVLG00005019766	HELQ (ENSSVLG00005019975)	ENSSVLG00005020214	HPSE (ENSSVLG00005020319)	COQ2 (ENSSVLG00005020613)	ENSSVLG00005020728	PLAC8 (ENSSVLG00005020747)	COPS4 (ENSSVLG00005020796)	LIN54 (ENSSVLG00005020883)	THAP9 (ENSSVLG00005021207)	ENSSVLG00005021269 #22	SEC31A (ENSSVLG00005021390)	SCD5 (ENSSVLG00005021839)	ENSSVLG00005021877	TMEM150C (ENSSVLG00005021907)	ENOPH1 (ENSSVLG00005022006)	HNRNPDL (ENSSVLG00005022171)	HNRNPD (ENSSVLG00005022330)	RASGEF1B (ENSSVLG00005022447)	PRKG2 (ENSSVLG00005022851)	BMP3 (ENSSVLG00005023094)	CFAP299 (ENSSVLG00005023128)	FGF5 (ENSSVLG00005023174)	ENSSVLG00005023206	ANTXR2 (ENSSVLG00005023242)	ENSSVLG00005023309
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.b.b #22
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.b.b #22
Alpin marmot	MODERN SPECIES	35	ZNF862 (ENSMMMG00000006562)	ZNF467 (ENSMMMG00000006797)	KRBA1 (ENSMMMG00000006852)	ZNF746 (ENSMMMG00000006886)	ZNF777 (ENSMMMG00000006944)	ENSMMMG00000006955	ENSMMMG00000006972	ZNF212 (ENSMMMG00000006983)	ZNF282 (ENSMMMG00000006992)	ZNF398 (ENSMMMG00000007052)	ZNF786 (ENSMMMG00000007070)	PDIA4 (ENSMMMG00000007099)	EZH2 (ENSMMMG00000007126)	CUL1 (ENSMMMG00000007363)	CNTNAP2 (ENSMMMG00000007396)	ENSMMMG00000007425 #22	ENSMMMG00000007430	TPK1 (ENSMMMG00000007491)	ARHGEF5 (ENSMMMG00000007524)	ENSMMMG00000007656	ENSMMMG00000007663	OR2A2 (ENSMMMG00000007675)	ENSMMMG00000007684	ENSMMMG00000007690	OR2A25 (ENSMMMG00000007701)	OR2A5 (ENSMMMG00000007707)	OR6B1 (ENSMMMG00000007724)	ENSMMMG00000007734	ENSMMMG00000007738	ENSMMMG00000007771	ENSMMMG00000007782
Primates	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b #22
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b #22
Bushbaby	DUPLICATION
Bushbaby	MODERN SPECIES	137	KCNF1 (ENSOGAG00000026918)	C2orf50 (ENSOGAG00000009762)	SLC66A3 (ENSOGAG00000009765)	ROCK2 (ENSOGAG00000009767)	ENSOGAG00000024515	E2F6 (ENSOGAG00000013601)	GREB1 (ENSOGAG00000013608)	NTSR2 (ENSOGAG00000013618)	LPIN1 (ENSOGAG00000013620)	TRIB2 (ENSOGAG00000002490)	LRATD1 (ENSOGAG00000032892)	NBAS (ENSOGAG00000008723)	DDX1 (ENSOGAG00000008730)	MYCN (ENSOGAG00000010927)	CYRIA (ENSOGAG00000009218)	ENSOGAG00000031508 #22	VSNL1 (ENSOGAG00000030574)	SMC6 (ENSOGAG00000004809)	GEN1 (ENSOGAG00000004816)	MSGN1 (ENSOGAG00000012569)	KCNS3 (ENSOGAG00000007336)	RDH14 (ENSOGAG00000027061)	NT5C1B (ENSOGAG00000001728)	OSR1 (ENSOGAG00000003047)	TTC32 (ENSOGAG00000002990)	WDR35 (ENSOGAG00000002991)	MATN3 (ENSOGAG00000002995)	ENSOGAG00000029374	LAPTM4A (ENSOGAG00000003002)	SDC1 (ENSOGAG00000010183)	PUM2 (ENSOGAG00000002187)
Bushbaby	MODERN SPECIES	122	NR2C1 (ENSOGAG00000011821)	FGD6 (ENSOGAG00000011825)	VEZT (ENSOGAG00000011835)	ENSOGAG00000008469	USP44 (ENSOGAG00000008473)	NTN4 (ENSOGAG00000014317)	ENSOGAG00000027793	ENSOGAG00000014320	CCDC38 (ENSOGAG00000014323)	AMDHD1 (ENSOGAG00000014327)	HAL (ENSOGAG00000014330)	LTA4H (ENSOGAG00000014336)	ELK3 (ENSOGAG00000031899)	CDK17 (ENSOGAG00000007484)	ENSOGAG00000012022	ENSOGAG00000024990 #22	ENSOGAG00000005823	NEDD1 (ENSOGAG00000005824)	ENSOGAG00000012220	SLC25A3 (ENSOGAG00000012222)	ENSOGAG00000028619	IKBIP (ENSOGAG00000012226)	APAF1 (ENSOGAG00000012229)	ENSOGAG00000025146	GARIN6 (ENSOGAG00000006412)	ANKS1B (ENSOGAG00000012239)	BLTP3B (ENSOGAG00000001738)	ACTR6 (ENSOGAG00000001741)	ENSOGAG00000026542	DEPDC4 (ENSOGAG00000026205)	SCYL2 (ENSOGAG00000007862)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b #22
Simiiformes	DUPLICATION
Simiiformes	DUPLICATION
Simiiformes	DUPLICATION
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a #22
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a #22
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a #22
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a #22
Cercopithecinae_a	DUPLICATION
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.a #22
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.a #22
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.a #22
Drill	MODERN SPECIES	584	ADHFE1 (ENSMLEG00000037829)	VXN (ENSMLEG00000029077)	MYBL1 (ENSMLEG00000032838)	VCPIP1 (ENSMLEG00000035358)	ENSMLEG00000037739	ENSMLEG00000042544	SGK3 (ENSMLEG00000041322)	MCMDC2 (ENSMLEG00000038410)	ENSMLEG00000000766	TCF24 (ENSMLEG00000039858)	PPP1R42 (ENSMLEG00000040981)	ENSMLEG00000041065	ENSMLEG00000035973	ENSMLEG00000015396	CSPP1 (ENSMLEG00000007846)	ENSMLEG00000035224 #22	ARFGEF1 (ENSMLEG00000043500)	CPA6 (ENSMLEG00000039764)	PREX2 (ENSMLEG00000004343)	C8orf34 (ENSMLEG00000033292)	SULF1 (ENSMLEG00000036884)	SLCO5A1 (ENSMLEG00000036819)	ENSMLEG00000030182	ENSMLEG00000041678	ENSMLEG00000023557	PRDM14 (ENSMLEG00000027772)	NCOA2 (ENSMLEG00000034329)	ENSMLEG00000031623	TRAM1 (ENSMLEG00000043709)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.a #22
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	580	TRIM55 (ENSMNEG00000041922)	CRH (ENSMNEG00000011754)	RRS1 (ENSMNEG00000011696)	ADHFE1 (ENSMNEG00000035326)	VXN (ENSMNEG00000036354)	MYBL1 (ENSMNEG00000039299)	VCPIP1 (ENSMNEG00000021855)	ENSMNEG00000028480	SGK3 (ENSMNEG00000044391)	ENSMNEG00000026502	MCMDC2 (ENSMNEG00000032561)	TCF24 (ENSMNEG00000031304)	PPP1R42 (ENSMNEG00000033894)	ENSMNEG00000038050	COPS5 (ENSMNEG00000032680)	ENSMNEG00000030459 #22	CSPP1 (ENSMNEG00000033156)	ARFGEF1 (ENSMNEG00000044978)	CPA6 (ENSMNEG00000036786)	PREX2 (ENSMNEG00000039793)	C8orf34 (ENSMNEG00000021015)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.b #22
Macaca	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.b #22
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	419	MCTS1 (ENSMNEG00000041580)	ENSMNEG00000007215	ENSMNEG00000004584	C1GALT1C1 (ENSMNEG00000009174)	ENSMNEG00000040465	ENSMNEG00000022497	ENSMNEG00000038048	ENSMNEG00000042959	ENSMNEG00000028910	GRIA3 (ENSMNEG00000032915)	ENSMNEG00000039323	THOC2 (ENSMNEG00000033627)	XIAP (ENSMNEG00000036769)	ENSMNEG00000031659	STAG2 (ENSMNEG00000033817)	ENSMNEG00000034784 #22	SH2D1A (ENSMNEG00000035692)	ENSMNEG00000039683	TENM1 (ENSMNEG00000030864)	TEX13C (ENSMNEG00000037340)	DCAF12L2 (ENSMNEG00000026496)	DCAF12L1 (ENSMNEG00000020052)	ENSMNEG00000005648	PRR32 (ENSMNEG00000028118)	ACTRT1 (ENSMNEG00000021005)	ENSMNEG00000039781	ENSMNEG00000029813	SMARCA1 (ENSMNEG00000041768)	OCRL (ENSMNEG00000039517)	APLN (ENSMNEG00000025745)	XPNPEP2 (ENSMNEG00000011460)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	48										ENSGT00940000156123.b	ENSGT00940000161972.d.b	ENSGT00710000106792	ENSGT00940000158743	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.m.a.b	ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.b #22	ENSGT00940000161768.A.o	ENSGT00940000155920	ENSGT01030000234566.e.b.b.b	ENSGT00940000161768.A.p	ENSGT00940000161322	ENSGT00940000165384	ENSGT00390000012726	ENSGT00940000162451	ENSGT00940000154612.n.fb.b	ENSGT00940000157297	ENSGT00940000157996	ENSGT00390000014020	ENSGT00940000157196	ENSGT00940000160111	ENSGT00940000159999
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	113										ENSGT00940000156123.b	ENSGT00940000161972.d.b	ENSGT00710000106792	ENSGT00940000158743	ENSGT00940000153288.a.b.a.b.m.a.b	ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a.b #22	ENSGT00940000155920	ENSGT01030000234566.e.b.b.b	ENSGT00940000161322	ENSGT00940000165384	ENSGT00390000012726	ENSGT00940000162451	ENSGT00940000154612.n.fb.b	ENSGT00390000013354.d.a.b.a.a.b	ENSGT00940000157297	ENSGT00940000157996	ENSGT00390000014020	ENSGT00940000157196	ENSGT00940000160111	ENSGT00940000159999	ENSGT00390000008142.i
Drill	MODERN SPECIES	1386										GRIA3 (ENSMLEG00000000292)	ENSMLEG00000038682	THOC2 (ENSMLEG00000034817)	XIAP (ENSMLEG00000041038)	ENSMLEG00000037792	STAG2 (ENSMLEG00000035654)	ENSMLEG00000043971 #22	SH2D1A (ENSMLEG00000038431)	TENM1 (ENSMLEG00000044221)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	655										GRIA3 (ENSCATG00000036841)	ENSCATG00000038781	THOC2 (ENSCATG00000003183)	XIAP (ENSCATG00000029823)	ENSCATG00000044937	STAG2 (ENSCATG00000027639)	ENSCATG00000014743 #22	SH2D1A (ENSCATG00000013291)	TENM1 (ENSCATG00000010260)	DCAF12L2 (ENSCATG00000018014)	DCAF12L1 (ENSCATG00000022780)	PRR32 (ENSCATG00000037226)	ACTRT1 (ENSCATG00000018422)	ENSCATG00000033747	ENSCATG00000031968	SMARCA1 (ENSCATG00000015921)	OCRL (ENSCATG00000037629)	ENSCATG00000035939	XPNPEP2 (ENSCATG00000015884)	SASH3 (ENSCATG00000033233)	ZDHHC9 (ENSCATG00000031943)	UTP14A (ENSCATG00000036177)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.a #22
Mas night monkey	MODERN SPECIES	553	ENSANAG00000028603	ACTR8 (ENSANAG00000028469)	IL17RB (ENSANAG00000034959)	CHDH (ENSANAG00000029420)	CACNA1D (ENSANAG00000025578)	DCP1A (ENSANAG00000025834)	ENSANAG00000037688	PRKCD (ENSANAG00000022094)	RFT1 (ENSANAG00000031288)	SFMBT1 (ENSANAG00000036375)	STIMATE (ENSANAG00000038396)	MUSTN1 (ENSANAG00000037491)	ITIH4 (ENSANAG00000021480)	ITIH3 (ENSANAG00000025494)	ITIH1 (ENSANAG00000036541)	ENSANAG00000030360 #22	NEK4 (ENSANAG00000021460)	SPCS1 (ENSANAG00000031409)	GLT8D1 (ENSANAG00000026279)	GNL3 (ENSANAG00000033209)	ENSANAG00000032255	PBRM1 (ENSANAG00000034205)	UQCC5 (ENSANAG00000007283)	NT5DC2 (ENSANAG00000005150)	STAB1 (ENSANAG00000031871)	NISCH (ENSANAG00000022782)	TNNC1 (ENSANAG00000022710)	SEMA3G (ENSANAG00000026752)	ENSANAG00000026339	PHF7 (ENSANAG00000021364)	ENSANAG00000025082
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22
Platyrrhini	DUPLICATION
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.a #22
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.a #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.a #22
Bolivian squirrel monkey	DUPLICATION
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	45	MSH4 (ENSSBOG00000020272)	RABGGTB (ENSSBOG00000030418)	ACADM (ENSSBOG00000032362)	SLC44A5 (ENSSBOG00000025792)	LHX8 (ENSSBOG00000031302)	TYW3 (ENSSBOG00000022917)	CRYZ (ENSSBOG00000027623)	ERICH3 (ENSSBOG00000030083)	TNNI3K (ENSSBOG00000027342)	LRRC53 (ENSSBOG00000031388)	FPGT (ENSSBOG00000031862)	LRRIQ3 (ENSSBOG00000023453)	ENSSBOG00000022738	NEGR1 (ENSSBOG00000033521)	ENSSBOG00000022428	ENSSBOG00000036028 #22	ENSSBOG00000013268	PTGER3 (ENSSBOG00000032109)	CTH (ENSSBOG00000004834)	ENSSBOG00000033163	ANKRD13C (ENSSBOG00000035265)	SRSF11 (ENSSBOG00000033461)	LRRC40 (ENSSBOG00000033042)	LRRC7 (ENSSBOG00000023202)	ENSSBOG00000024654	DEPDC1 (ENSSBOG00000032526)	RPE65 (ENSSBOG00000020711)	ENSSBOG00000017047	WLS (ENSSBOG00000029071)	GNG12 (ENSSBOG00000023413)	GADD45A (ENSSBOG00000026960)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	190				WDR72 (ENSSBOG00000020082)	ONECUT1 (ENSSBOG00000033790)	ATOSA (ENSSBOG00000028184)	ARPP19 (ENSSBOG00000030365)	ENSSBOG00000026330	ENSSBOG00000029727	MYO5A (ENSSBOG00000033216)	MYO5C (ENSSBOG00000020491)	GNB5 (ENSSBOG00000031028)	ENSSBOG00000026375	MAPK6 (ENSSBOG00000023650)	LEO1 (ENSSBOG00000030660)	ENSSBOG00000025734 #22	TMOD3 (ENSSBOG00000020246)	EVL (ENSSBOG00000021298)	DEGS2 (ENSSBOG00000000041)	ENSSBOG00000030828	SLC25A29 (ENSSBOG00000027271)	SLC25A47 (ENSSBOG00000026024)	WARS1 (ENSSBOG00000024797)	WDR25 (ENSSBOG00000022958)	BEGAIN (ENSSBOG00000028969)	DLK1 (ENSSBOG00000024967)	ENSSBOG00000032215	ENSSBOG00000019405	PPP2R5C (ENSSBOG00000026611)	ENSSBOG00000028383	DYNC1H1 (ENSSBOG00000025585)
Capuchin	MODERN SPECIES	234	ANGPTL8 (ENSCCAG00000035333)	DOCK6 (ENSCCAG00000036513)	TSPAN16 (ENSCCAG00000033000)	RAB3D (ENSCCAG00000025383)	TMEM205 (ENSCCAG00000036980)	CCDC159 (ENSCCAG00000031662)	PLPPR2 (ENSCCAG00000032464)	SWSAP1 (ENSCCAG00000027417)	EPOR (ENSCCAG00000036869)	RGL3 (ENSCCAG00000028640)	ODAD3 (ENSCCAG00000028303)	PRKCSH (ENSCCAG00000022230)	ELAVL3 (ENSCCAG00000034350)	ZNF653 (ENSCCAG00000027104)	ECSIT (ENSCCAG00000030491)	ENSCCAG00000016051 #22	CNN1 (ENSCCAG00000028138)	ELOF1 (ENSCCAG00000033676)	ENSCCAG00000018398	ACP5 (ENSCCAG00000031739)	ENSCCAG00000037049	ENSCCAG00000015998	ZNF823 (ENSCCAG00000037280)	ZNF441 (ENSCCAG00000024894)	ENSCCAG00000034489	ZNF433 (ENSCCAG00000031149)	ZNF878 (ENSCCAG00000033113)	ENSCCAG00000029056	ENSCCAG00000024419	ZNF20 (ENSCCAG00000000011)	ZNF625 (ENSCCAG00000030631)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1222	SPATA1 (ENSANAG00000028513)	GNG5 (ENSANAG00000037163)	RPF1 (ENSANAG00000035706)	ENSANAG00000035698	DNASE2B (ENSANAG00000034051)	ENSANAG00000025747	ENSANAG00000033696	SAMD13 (ENSANAG00000035857)	ENSANAG00000020653	PRKACB (ENSANAG00000024480)	TTLL7 (ENSANAG00000024884)	ADGRL2 (ENSANAG00000036995)	ENSANAG00000026509	ENSANAG00000032415	ENSANAG00000014411	ENSANAG00000026461 #22	ADGRL4 (ENSANAG00000033541)	IFI44 (ENSANAG00000037840)	IFI44L (ENSANAG00000025193)	PTGFR (ENSANAG00000032906)	GIPC2 (ENSANAG00000002242)	DNAJB4 (ENSANAG00000038333)	ENSANAG00000036937	ENSANAG00000037601	ENSANAG00000004931	NEXN (ENSANAG00000037207)	ENSANAG00000032240	MIGA1 (ENSANAG00000033584)	USP33 (ENSANAG00000024189)	ZZZ3 (ENSANAG00000029618)	ENSANAG00000028230
Platyrrhini	DUPLICATION
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.b.a #22
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.b.a #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.b.a #22
Capuchin	MODERN SPECIES	6								IYD (ENSCCAG00000036983)	PLEKHG1 (ENSCCAG00000027481)	MTHFD1L (ENSCCAG00000033752)	AKAP12 (ENSCCAG00000030534)	ZBTB2 (ENSCCAG00000029241)	RMND1 (ENSCCAG00000036014)	ARMT1 (ENSCCAG00000027013)	CCDC170 (ENSCCAG00000035936)	ENSCCAG00000036007 #22	ENSCCAG00000023199	ESR1 (ENSCCAG00000030983)	SYNE1 (ENSCCAG00000034147)	MYCT1 (ENSCCAG00000031493)	VIP (ENSCCAG00000034128)	FBXO5 (ENSCCAG00000035526)	MTRF1L (ENSCCAG00000035144)	RGS17 (ENSCCAG00000030080)	OPRM1 (ENSCCAG00000025874)	IPCEF1 (ENSCCAG00000036029)	CNKSR3 (ENSCCAG00000022570)	SCAF8 (ENSCCAG00000024952)	TIAM2 (ENSCCAG00000023099)	CLDN20 (ENSCCAG00000002679)	TFB1M (ENSCCAG00000015250)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	91																ENSSBOG00000032831 #22	TBC1D32 (ENSSBOG00000027468)	ENSSBOG00000022760	HSF2 (ENSSBOG00000026121)	SERINC1 (ENSSBOG00000030876)	ENSSBOG00000027151	PKIB (ENSSBOG00000027107)	ENSSBOG00000019176	SMPDL3A (ENSSBOG00000027815)	ENSSBOG00000034173	CLVS2 (ENSSBOG00000024013)	TRDN (ENSSBOG00000000089)	NKAIN2 (ENSSBOG00000029069)	RNF217 (ENSSBOG00000026271)	TPD52L1 (ENSSBOG00000033817)	HDDC2 (ENSSBOG00000031623)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	382													ENSANAG00000038101	GTF2E1 (ENSANAG00000025430)	RABL3 (ENSANAG00000027278)	ENSANAG00000037659 #22	HGD (ENSANAG00000030887)	NDUFB4 (ENSANAG00000034913)	FSTL1 (ENSANAG00000020551)	LRRC58 (ENSANAG00000031980)	GPR156 (ENSANAG00000022869)	GSK3B (ENSANAG00000026215)	ENSANAG00000032801	NR1I2 (ENSANAG00000036076)	CFAP91 (ENSANAG00000030006)	COX17 (ENSANAG00000020473)	POPDC2 (ENSANAG00000029325)	PLA1A (ENSANAG00000028215)	ENSANAG00000010341	ADPRH (ENSANAG00000031217)	CD80 (ENSANAG00000034828)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.b.b #22
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.b.b #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b.b.b #22
Capuchin	MODERN SPECIES	9	CATSPER2 (ENSCCAG00000026150)	PDIA3 (ENSCCAG00000030244)	ELL3 (ENSCCAG00000012316)	ENSCCAG00000035655	SERINC4 (ENSCCAG00000026023)	HYPK (ENSCCAG00000024826)	MFAP1 (ENSCCAG00000036634)	WDR76 (ENSCCAG00000032447)	FRMD5 (ENSCCAG00000033220)	ENSCCAG00000024066	GOLM2 (ENSCCAG00000023648)	CTDSPL2 (ENSCCAG00000021587)	EIF3J (ENSCCAG00000028410)	SPG11 (ENSCCAG00000035886)	PATL2 (ENSCCAG00000025261)	ENSCCAG00000028063 #22	B2M (ENSCCAG00000028100)	TRIM69 (ENSCCAG00000022680)	TERB2 (ENSCCAG00000030778)	SORD (ENSCCAG00000036842)	DUOX2 (ENSCCAG00000034804)	DUOXA2 (ENSCCAG00000024977)	DUOXA1 (ENSCCAG00000026858)	DUOX1 (ENSCCAG00000032449)	SHF (ENSCCAG00000037493)	ENSCCAG00000031747	SLC28A2 (ENSCCAG00000027848)	GATM (ENSCCAG00000031962)	SPATA5L1 (ENSCCAG00000029452)	C15orf48 (ENSCCAG00000022789)	SLC30A4 (ENSCCAG00000001193)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1007	TEAD3 (ENSANAG00000028458)	TULP1 (ENSANAG00000030313)	FKBP5 (ENSANAG00000030235)	ARMC12 (ENSANAG00000038298)	ENSANAG00000022845	CLPSL1 (ENSANAG00000032715)	CLPS (ENSANAG00000033395)	LHFPL5 (ENSANAG00000035803)	SRPK1 (ENSANAG00000021431)	SLC26A8 (ENSANAG00000020781)	MAPK14 (ENSANAG00000038041)	ENSANAG00000032413	MAPK13 (ENSANAG00000022181)	ENSANAG00000032262	BRPF3 (ENSANAG00000028984)	ENSANAG00000033497 #22	PNPLA1 (ENSANAG00000034134)	BNIP5 (ENSANAG00000030362)	ETV7 (ENSANAG00000034107)	PXT1 (ENSANAG00000024752)	KCTD20 (ENSANAG00000026537)	ENSANAG00000024804	ENSANAG00000033233	CDKN1A (ENSANAG00000037294)	RAB44 (ENSANAG00000027844)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000155089	ENSGT00940000162065	ENSGT00390000013943	ENSGT00940000154629.B.db.b.a	ENSGT01030000234639.A.a	ENSGT00940000153167.A.a	ENSGT00390000006394	ENSGT00550000074878.`b.a.a.a	ENSGT01030000234626.B.w.a	ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a	ENSGT00390000013931.a.b.b.ab	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000157993	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.a	ENSGT00940000159826	ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k	ENSGT00390000005306.v	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00940000163170	ENSGT00530000063929.a.a	ENSGT00940000159634	ENSGT00390000009166	ENSGT00940000159117
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000160810	ENSGT00940000155089	ENSGT00940000162065	ENSGT00390000013943	ENSGT00940000154629.B.db.b.a	ENSGT01030000234639.A.a	ENSGT00940000153167.A.a	ENSGT00390000006394	ENSGT00550000074878.`b.a.a.a	ENSGT01030000234626.B.w.a	ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000157993	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.a	ENSGT00940000159826	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00940000163170	ENSGT00530000063929.a.a	ENSGT00940000159634	ENSGT00390000009166	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000159373	ENSGT00740000115564
Olive baboon	MODERN SPECIES	16	IGF2R (ENSPANG00000018547)	MAS1 (ENSPANG00000024549)	PNLDC1 (ENSPANG00000022009)	MRPL18 (ENSPANG00000023667)	ENSPANG00000011086	ACAT2 (ENSPANG00000006086)	WTAP (ENSPANG00000018386)	SOD2 (ENSPANG00000006178)	ENSPANG00000043348	ENSPANG00000046898	FNDC1 (ENSPANG00000024066)	ENSPANG00000043396	TAGAP (ENSPANG00000006087)	RSPH3 (ENSPANG00000015890)	ENSPANG00000044542	ENSPANG00000004075 #22	OSTM1 (ENSPANG00000024443)	NR2E1 (ENSPANG00000016092)	ENSPANG00000017995	SNX3 (ENSPANG00000045017)	AFG1L (ENSPANG00000007612)	ENSPANG00000015284	SESN1 (ENSPANG00000012995)	ARMC2 (ENSPANG00000006019)	ZBTB24 (ENSPANG00000006918)	SMPD2 (ENSPANG00000024480)	MICAL1 (ENSPANG00000014435)	CD164 (ENSPANG00000030351)	ENSPANG00000039980	CEP57L1 (ENSPANG00000008201)	ENSPANG00000008202
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00940000160810	ENSGT00940000155089	ENSGT00940000162065	ENSGT00390000013943	ENSGT00940000154629.B.db.b.a	ENSGT01030000234639.A.a	ENSGT00940000153167.A.a	ENSGT00390000006394	ENSGT00550000074878.`b.a.a.a	ENSGT01030000234626.B.w.a	ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000157993	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.a	ENSGT00940000159826	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00940000163170	ENSGT00530000063929.a.a	ENSGT00940000159634	ENSGT00390000009166	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000159373	ENSGT00740000115564
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	590	SLC22A2 (ENSCATG00000035775)	SLC22A1 (ENSCATG00000037974)	IGF2R (ENSCATG00000040245)	ENSCATG00000031955	MAS1 (ENSCATG00000018354)	PNLDC1 (ENSCATG00000033196)	MRPL18 (ENSCATG00000039405)	ENSCATG00000040449	ENSCATG00000029973	ENSCATG00000032080	ENSCATG00000018577	SOD2 (ENSCATG00000041741)	FNDC1 (ENSCATG00000041959)	TAGAP (ENSCATG00000031180)	RSPH3 (ENSCATG00000037174)	ENSCATG00000038882 #22	OSTM1 (ENSCATG00000039725)	NR2E1 (ENSCATG00000040877)	SNX3 (ENSCATG00000029122)	AFG1L (ENSCATG00000009873)	ENSCATG00000039123	ENSCATG00000039457	ARMC2 (ENSCATG00000039753)	SESN1 (ENSCATG00000025577)	CEP57L1 (ENSCATG00000029658)	ENSCATG00000036188	CD164 (ENSCATG00000038139)	PPIL6 (ENSCATG00000042720)	SMPD2 (ENSCATG00000015266)	MICAL1 (ENSCATG00000032923)	ZBTB24 (ENSCATG00000039996)
Drill	MODERN SPECIES	546	ENSMLEG00000029985	SLC22A3 (ENSMLEG00000038788)	SLC22A2 (ENSMLEG00000016886)	SLC22A1 (ENSMLEG00000042980)	IGF2R (ENSMLEG00000030426)	MAS1 (ENSMLEG00000021239)	PNLDC1 (ENSMLEG00000044059)	MRPL18 (ENSMLEG00000009952)	ENSMLEG00000010006	ACAT2 (ENSMLEG00000030278)	ENSMLEG00000036194	SOD2 (ENSMLEG00000031266)	FNDC1 (ENSMLEG00000036645)	TAGAP (ENSMLEG00000019766)	RSPH3 (ENSMLEG00000040694)	ENSMLEG00000034288 #22	OSTM1 (ENSMLEG00000042119)	NR2E1 (ENSMLEG00000042106)	SNX3 (ENSMLEG00000009064)	AFG1L (ENSMLEG00000042976)	ENSMLEG00000035215	ARMC2 (ENSMLEG00000028725)	SESN1 (ENSMLEG00000023202)	CEP57L1 (ENSMLEG00000042256)	ENSMLEG00000038718	ENSMLEG00000019287	CD164 (ENSMLEG00000043297)	PPIL6 (ENSMLEG00000043068)	SMPD2 (ENSMLEG00000039457)	MICAL1 (ENSMLEG00000031079)	ZBTB24 (ENSMLEG00000036578)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000155089	ENSGT00940000162065	ENSGT00390000013943	ENSGT00940000154629.B.db.b.a	ENSGT00940000153167.A.a	ENSGT00390000006394.i.a	ENSGT00550000074878.`b.a.a.a	ENSGT01030000234626.B.w.a	ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a	ENSGT00940000163505.a.b.a.b	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00910000148724	ENSGT00940000157993	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.a.b #22	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.a	ENSGT00940000159826	ENSGT00390000005306.v	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00940000163170	ENSGT00530000063929.a.a	ENSGT00940000159634	ENSGT00390000009166	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000159373
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	186	SLC22A2 (ENSMNEG00000034324)	SLC22A1 (ENSMNEG00000019486)	IGF2R (ENSMNEG00000033736)	ENSMNEG00000029146	PNLDC1 (ENSMNEG00000034271)	ENSMNEG00000045344	ENSMNEG00000041282	ENSMNEG00000032924	ENSMNEG00000034307	ENSMNEG00000027147	SOD2 (ENSMNEG00000031749)	FNDC1 (ENSMNEG00000043137)	ENSMNEG00000021558	TAGAP (ENSMNEG00000029744)	RSPH3 (ENSMNEG00000038143)	ENSMNEG00000041823 #22	OSTM1 (ENSMNEG00000036298)	NR2E1 (ENSMNEG00000034662)	SNX3 (ENSMNEG00000027766)	AFG1L (ENSMNEG00000044043)	ENSMNEG00000040158	ENSMNEG00000041536	ARMC2 (ENSMNEG00000037523)	SESN1 (ENSMNEG00000032849)	CEP57L1 (ENSMNEG00000004205)	ENSMNEG00000017770	CD164 (ENSMNEG00000036168)	PPIL6 (ENSMNEG00000039500)	SMPD2 (ENSMNEG00000042401)	MICAL1 (ENSMNEG00000039173)	ZBTB24 (ENSMNEG00000037210)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.b #22
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00530000063407.b	ENSGT00550000074792.a.b	ENSGT00940000156396	ENSGT00940000159322	ENSGT00510000047951	ENSGT00940000154903 #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00560000078585	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.b #22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000157079.a	ENSGT00940000159044	ENSGT00530000063113.C	ENSGT00900000143489	ENSGT00390000014165.c.b	ENSGT00940000156866.s	ENSGT00390000007125.b	ENSGT00390000014412
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00530000063407.b	ENSGT00550000074792.a.b	ENSGT00940000156396	ENSGT00940000159322	ENSGT00510000047951	ENSGT00940000154903 #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00560000078585	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.b #22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000157079.a	ENSGT00940000159044	ENSGT00530000063113.C	ENSGT00390000014165.c.b	ENSGT00940000156866.s	ENSGT00390000007125.b	ENSGT00390000014412	ENSGT00940000158996
Cebidae_a	DUPLICATION
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00530000063407.b	ENSGT00550000074792.a.b	ENSGT00940000156396	ENSGT00940000159322	ENSGT00510000047951	ENSGT00940000154903 #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00560000078585	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.b.a #22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000157079.a	ENSGT00940000159044	ENSGT00530000063113.C	ENSGT00390000014165.c.b	ENSGT00940000156866.s	ENSGT00390000007125.b	ENSGT00390000014412	ENSGT00940000158996
Capuchin	DUPLICATION
Capuchin	DUPLICATION
Capuchin	MODERN SPECIES	89	IGFBP2 (ENSCCAG00000032963)	ENSCCAG00000020405	ENSCCAG00000021500	SMARCAL1 (ENSCCAG00000022646)	ASNA1 (ENSCCAG00000020440)	MARCHF4 (ENSCCAG00000031877)	XRCC5 (ENSCCAG00000027147)	ENSCCAG00000020388	TMEM169 (ENSCCAG00000030518)	PECR (ENSCCAG00000028783)	ENSCCAG00000031458	MREG (ENSCCAG00000034986)	FN1 (ENSCCAG00000021281)	ENSCCAG00000022620	ABCA12 (ENSCCAG00000029993)	ENSCCAG00000020726 #22	BARD1 (ENSCCAG00000021151)	VWC2L (ENSCCAG00000021422)	SPAG16 (ENSCCAG00000027929)	IKZF2 (ENSCCAG00000029869)	ENSCCAG00000016584	ERBB4 (ENSCCAG00000036465)
Capuchin	MODERN SPECIES		PATE4 (ENSCCAG00000035746)	ENSCCAG00000019073	PUS3 (ENSCCAG00000035999)	DDX25 (ENSCCAG00000027629)	VSIG10L2 (ENSCCAG00000006965)	CDON (ENSCCAG00000001077)	RPUSD4 (ENSCCAG00000027838)	FAM118B (ENSCCAG00000020310)	SRPRA (ENSCCAG00000025602)	FOXRED1 (ENSCCAG00000025248)	TIRAP (ENSCCAG00000035574)	ENSCCAG00000028368	DCPS (ENSCCAG00000030779)	ST3GAL4 (ENSCCAG00000034084)	KIRREL3 (ENSCCAG00000026745)	ENSCCAG00000030721 #22	ETS1 (ENSCCAG00000025251)	FLI1 (ENSCCAG00000014342)	KCNJ1 (ENSCCAG00000027825)	C11orf45 (ENSCCAG00000035237)	KCNJ5 (ENSCCAG00000021826)	ENSCCAG00000000172	ARHGAP32 (ENSCCAG00000036347)	ENSCCAG00000037290	BARX2 (ENSCCAG00000027214)	TMEM45B (ENSCCAG00000024426)	NFRKB (ENSCCAG00000022547)	PRDM10 (ENSCCAG00000024567)	APLP2 (ENSCCAG00000019969)	ST14 (ENSCCAG00000028292)	ZBTB44 (ENSCCAG00000037104)
Capuchin	MODERN SPECIES	200				SPDL1 (ENSCCAG00000035090)	INSYN2B (ENSCCAG00000033382) #11	ENSCCAG00000021528	DOCK2 (ENSCCAG00000037383) #10	FOXI1 (ENSCCAG00000029998) #12	ENSCCAG00000019246	LCP2 (ENSCCAG00000014560) #14	KCNMB1 (ENSCCAG00000029582) #15	KCNIP1 (ENSCCAG00000025512) #16	GABRP (ENSCCAG00000027392) #18	RANBP17 (ENSCCAG00000021816) #19	TLX3 (ENSCCAG00000022971) #21	ENSCCAG00000034814 #22	FGF18 (ENSCCAG00000025826) #23	SMIM23 (ENSCCAG00000027927) #24	ENSCCAG00000035992 ##22	ENSCCAG00000034903 #25	STK10 (ENSCCAG00000021548) #26	EFCAB9 (ENSCCAG00000030106) #27	UBTD2 (ENSCCAG00000030325) #28	SH3PXD2B (ENSCCAG00000018545) #29	NEURL1B (ENSCCAG00000024696)	ENSCCAG00000023304	DUSP1 (ENSCCAG00000028115)	ERGIC1 (ENSCCAG00000027066)	RPL26L1 (ENSCCAG00000022572)	ENSCCAG00000030182	ENSCCAG00000036235
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	123	RARS1 (ENSSBOG00000020783)	FBLL1 (ENSSBOG00000019476)	ENSSBOG00000023908	SLIT3 (ENSSBOG00000020831)	SPDL1 (ENSSBOG00000033764)	INSYN2B (ENSSBOG00000024498) #11	DOCK2 (ENSSBOG00000026287) #10	FOXI1 (ENSSBOG00000033617) #12	C5orf58 (ENSSBOG00000020509)	LCP2 (ENSSBOG00000035016) #14	KCNMB1 (ENSSBOG00000026355) #15	KCNIP1 (ENSSBOG00000001622) #16	GABRP (ENSSBOG00000028102) #18	RANBP17 (ENSSBOG00000032147) #19	TLX3 (ENSSBOG00000034367) #21	ENSSBOG00000033634 #22	FGF18 (ENSSBOG00000024519) #23	SMIM23 (ENSSBOG00000018130) #24	FBXW11 (ENSSBOG00000023046) #25	STK10 (ENSSBOG00000033405) #26	EFCAB9 (ENSSBOG00000019620) #27	UBTD2 (ENSSBOG00000013274) #28	SH3PXD2B (ENSSBOG00000014112) #29	NEURL1B (ENSSBOG00000029939)	DUSP1 (ENSSBOG00000027324)	ERGIC1 (ENSSBOG00000032967)	RPL26L1 (ENSSBOG00000027992)	ATP6V0E1 (ENSSBOG00000031772)	CREBRF (ENSSBOG00000031151)	ENSSBOG00000026680	BNIP1 (ENSSBOG00000029104)
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.g.b.b #22
Capuchin	MODERN SPECIES	323														SLC15A4 (ENSCCAG00000026060)	GLT1D1 (ENSCCAG00000020488)	ENSCCAG00000031772 #22	TMEM132D (ENSCCAG00000034319)	PIWIL1 (ENSCCAG00000036270)	RIMBP2 (ENSCCAG00000024259)	STX2 (ENSCCAG00000021191)	RAN (ENSCCAG00000026184)	ADGRD1 (ENSCCAG00000015195)
Marmoset	DUPLICATION
Marmoset	MODERN SPECIES	11	ENSCJAG00000071432	ENSCJAG00000022619	DOCK2 (ENSCJAG00000011464) #10	INSYN2B (ENSCJAG00000011632) #11	FOXI1 (ENSCJAG00000073946) #12	C5orf58 (ENSCJAG00000037697)	LCP2 (ENSCJAG00000011656) #14	KCNIP1 (ENSCJAG00000019441) #16	KCNMB1 (ENSCJAG00000040466) #15	ENSCJAG00000081529	GABRP (ENSCJAG00000019417) #18	RANBP17 (ENSCJAG00000019368) #19	ENSCJAG00000083773	ENSCJAG00000038990	TLX3 (ENSCJAG00000038714) #21	ENSCJAG00000019334 #22	FGF18 (ENSCJAG00000019329) #23	SMIM23 (ENSCJAG00000019324) #24	FBXW11 (ENSCJAG00000019297) #25	ENSCJAG00000073693	STK10 (ENSCJAG00000019275) #26	ENSCJAG00000069688	ENSCJAG00000069421	EFCAB9 (ENSCJAG00000019273) #27	ENSCJAG00000047953	UBTD2 (ENSCJAG00000046779) #28	SH3PXD2B (ENSCJAG00000019258) #29	NEURL1B (ENSCJAG00000019254)	DUSP1 (ENSCJAG00000067622)	ERGIC1 (ENSCJAG00000019238)	CREBRF (ENSCJAG00000019193)
Marmoset	MODERN SPECIES	17	ENSCJAG00000043117	ADIG (ENSCJAG00000041176)	ARHGAP40 (ENSCJAG00000011443)	SLC32A1 (ENSCJAG00000066263)	ACTR5 (ENSCJAG00000011470)	PPP1R16B (ENSCJAG00000011490)	DHX35 (ENSCJAG00000011495)	TOP1 (ENSCJAG00000018101)	PLCG1 (ENSCJAG00000018013)	ZHX3 (ENSCJAG00000018012)	LPIN3 (ENSCJAG00000017986)	EMILIN3 (ENSCJAG00000081544)	CHD6 (ENSCJAG00000017920)	PTPRT (ENSCJAG00000017913)	SRSF6 (ENSCJAG00000067472)	ENSCJAG00000046459 #22	L3MBTL1 (ENSCJAG00000003964)	SGK2 (ENSCJAG00000017869)	IFT52 (ENSCJAG00000017838)	ENSCJAG00000076696	MYBL2 (ENSCJAG00000017819)	TOX2 (ENSCJAG00000017806)	OSER1 (ENSCJAG00000017794)	JPH2 (ENSCJAG00000017802)	ENSCJAG00000072121	GDAP1L1 (ENSCJAG00000017789)	FITM2 (ENSCJAG00000017787)	ENSCJAG00000055291	HNF4A (ENSCJAG00000017746)	TTPAL (ENSCJAG00000017736)	SERINC3 (ENSCJAG00000017722)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22
Pan	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.b.h #22
Bonobo	MODERN SPECIES	18	PCSK1 (ENSPPAG00000037499)	ELL2 (ENSPPAG00000018384)	GLRX (ENSPPAG00000043613)	RHOBTB3 (ENSPPAG00000031638)	SPATA9 (ENSPPAG00000035429)	ENSPPAG00000032941	ARSK (ENSPPAG00000037483)	SKIC3 (ENSPPAG00000032676)	ENSPPAG00000044070	MCTP1 (ENSPPAG00000044096)	SLF1 (ENSPPAG00000044094)	ENSPPAG00000043061	KIAA0825 (ENSPPAG00000029168)	FAM172A (ENSPPAG00000030542)	POU5F2 (ENSPPAG00000014596)	ENSPPAG00000042574 #22	NR2F1 (ENSPPAG00000029692)	ARRDC3 (ENSPPAG00000034772)	ENSPPAG00000024964	ADGRV1 (ENSPPAG00000034954)	ENSPPAG00000035937	LYSMD3 (ENSPPAG00000036100)	POLR3G (ENSPPAG00000038891)	MBLAC2 (ENSPPAG00000030673)	CETN3 (ENSPPAG00000042285)	MEF2C (ENSPPAG00000039315)	TMEM161B (ENSPPAG00000034458)	CCNH (ENSPPAG00000034768)	RASA1 (ENSPPAG00000031210)	ENSPPAG00000033965	ENSPPAG00000028873
Euarchontoglires	DUPLICATION
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Primates	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Lemuriformes	DUPLICATION
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00530000063407.b	ENSGT00550000074792.a.b	ENSGT00940000156396	ENSGT00940000159322	ENSGT00510000047951	ENSGT00940000154903 #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00560000078585	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a.a ##22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000157079.a	ENSGT00940000159044	ENSGT00530000063113.C	ENSGT00390000014165.c.b	ENSGT00940000156866	ENSGT00390000007125.b	ENSGT00390000014412	ENSGT00940000158996
Mouse lemur	MODERN SPECIES	31	ZFTRAF1 (ENSMICG00000015866)	KIFC2 (ENSMICG00000037324)	FOXH1 (ENSMICG00000037745)	PPP1R16A (ENSMICG00000043502)	GPT (ENSMICG00000015902)	MFSD3 (ENSMICG00000046404)	LRRC14 (ENSMICG00000015949)	RECQL4 (ENSMICG00000015923)	LRRC24 (ENSMICG00000015954)	C8orf82 (ENSMICG00000037461)	ARHGAP39 (ENSMICG00000015961)	ENSMICG00000041818	ENSMICG00000035596	ZNF251 (ENSMICG00000011171)	ZNF7 (ENSMICG00000000042)	ENSMICG00000030363 ##22	ZNF517 (ENSMICG00000001574)	RPL8 (ENSMICG00000001569)	ENSMICG00000047840	ZNF250 (ENSMICG00000042144)	ZNF16 (ENSMICG00000045289)	ENSMICG00000037351	ENSMICG00000036664	TUBGCP5 (ENSMICG00000012969)	CYFIP1 (ENSMICG00000016431)	NIPA2 (ENSMICG00000041893)	NIPA1 (ENSMICG00000038451)	ENSMICG00000035106	ENSMICG00000043818
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	146				ENSGT00940000159322	ENSGT00510000047951	ENSGT00940000154903 #10	ENSGT00530000063787.A #11	ENSGT00940000161316 #12	ENSGT00560000078585	ENSGT00940000156835 #14	ENSGT00950000183039.B.b.b #15	ENSGT00940000158048 #16	ENSGT00940000160813 #18	ENSGT00940000153139.B.b #19	ENSGT00940000160629 #21	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a.a ##22	ENSGT00940000159553 #23	ENSGT00390000017300 #24	ENSGT00940000155898 #25	ENSGT00940000156818 #26	ENSGT00390000007501 #27	ENSGT00940000156641 #28	ENSGT00940000158396 #29	ENSGT00940000157079.a	ENSGT00940000159044	ENSGT00530000063113.C	ENSGT00390000014165.c.b	ENSGT00940000156866	ENSGT00390000007125.b	ENSGT00390000014412	ENSGT00940000158996
Coquerels sifaka	DUPLICATION
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	428	ENSPCOG00000016594	SLIT3 (ENSPCOG00000019184)	SPDL1 (ENSPCOG00000025644)	ENSPCOG00000020825 #10	INSYN2B (ENSPCOG00000007889) #11	ENSPCOG00000020988 #10	FOXI1 (ENSPCOG00000022931) #12	ENSPCOG00000012130	LCP2 (ENSPCOG00000022747) #14	KCNIP1 (ENSPCOG00000015105) #16	KCNMB1 (ENSPCOG00000021448) #15	GABRP (ENSPCOG00000017643) #18	ENSPCOG00000007993 #19	ENSPCOG00000015791	TLX3 (ENSPCOG00000015947) #21	ENSPCOG00000024038 ##22	FGF18 (ENSPCOG00000028662) #23	SMIM23 (ENSPCOG00000018006) #24	FBXW11 (ENSPCOG00000017113) #25	STK10 (ENSPCOG00000019111) #26	EFCAB9 (ENSPCOG00000015386) #27	UBTD2 (ENSPCOG00000014867) #28	ENSPCOG00000023430	SH3PXD2B (ENSPCOG00000021760) #29	NEURL1B (ENSPCOG00000025987)	DUSP1 (ENSPCOG00000025861)	ERGIC1 (ENSPCOG00000014528)	RPL26L1 (ENSPCOG00000016409)	ATP6V0E1 (ENSPCOG00000022516)	CREBRF (ENSPCOG00000024235)	BNIP1 (ENSPCOG00000018899)
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	329	MAP9 (ENSPCOG00000013203)	NPY2R (ENSPCOG00000008812)	RBM46 (ENSPCOG00000024347)	LRAT (ENSPCOG00000019913)	FGG (ENSPCOG00000018435)	FGA (ENSPCOG00000023999)	FGB (ENSPCOG00000015023)	PLRG1 (ENSPCOG00000015384)	SFRP2 (ENSPCOG00000021378)	RNF175 (ENSPCOG00000026626)	TMEM131L (ENSPCOG00000013860)	ENSPCOG00000026703	TRIM2 (ENSPCOG00000002394)	FHDC1 (ENSPCOG00000021332)	ARFIP1 (ENSPCOG00000019366)	ENSPCOG00000016188 ##22	TMEM154 (ENSPCOG00000003473)	FBXW7 (ENSPCOG00000021861)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	635					SPDL1 (ENSPSMG00000016289)	DOCK2 (ENSPSMG00000016586) #10	INSYN2B (ENSPSMG00000016662) #11	FOXI1 (ENSPSMG00000016670) #12	C5orf58 (ENSPSMG00000016675)	LCP2 (ENSPSMG00000016768) #14	KCNIP1 (ENSPSMG00000016848) #16	KCNMB1 (ENSPSMG00000016861) #15	GABRP (ENSPSMG00000016887) #18	RANBP17 (ENSPSMG00000016972) #19	TLX3 (ENSPSMG00000016978) #21	ENSPSMG00000016994 ##22	FGF18 (ENSPSMG00000017028) #23	SMIM23 (ENSPSMG00000017034) #24	FBXW11 (ENSPSMG00000017174) #25	STK10 (ENSPSMG00000017263) #26	EFCAB9 (ENSPSMG00000017273) #27	UBTD2 (ENSPSMG00000017274) #28	ENSPSMG00000017278
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a.b ##22
Mouse lemur	MODERN SPECIES	15	WWC1 (ENSMICG00000004761)	ENSMICG00000004771	PANK3 (ENSMICG00000028235)	SLIT3 (ENSMICG00000009033)	SPDL1 (ENSMICG00000035310)	ENSMICG00000036573 #10	INSYN2B (ENSMICG00000046547) #11	C5orf58 (ENSMICG00000040175)	LCP2 (ENSMICG00000012579) #14	KCNIP1 (ENSMICG00000012622) #16	KCNMB1 (ENSMICG00000043676) #15	GABRP (ENSMICG00000012635) #18	RANBP17 (ENSMICG00000027710) #19	ENSMICG00000033249	TLX3 (ENSMICG00000045444) #21	ENSMICG00000002717 ##22	FGF18 (ENSMICG00000012403) #23	FOXI1 (ENSMICG00000041455) #12	ENSMICG00000045663 #10	ENSMICG00000029505	ENSMICG00000004512 #25	STK10 (ENSMICG00000004517) #26	ENSMICG00000038026	EFCAB9 (ENSMICG00000041945) #27	UBTD2 (ENSMICG00000037280) #28	SH3PXD2B (ENSMICG00000011279) #29	JAKMIP1 (ENSMICG00000002468)	C4orf50 (ENSMICG00000046962)	CRMP1 (ENSMICG00000005762)	ENSMICG00000032986	EVC (ENSMICG00000010561)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154353.A.n.a	ENSGT00940000154353.A.n.b	ENSGT00940000154353.A.m	ENSGT00940000155933.b.a	ENSGT00390000018130.a.a.a.h	ENSGT00940000155134	ENSGT00390000018730.B	ENSGT00940000159583	ENSGT00940000155884	ENSGT00940000167584	ENSGT00870000136506.ob.b	ENSGT00390000009155	ENSGT00940000157565	ENSGT00940000157935	ENSGT00940000158276	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22	ENSGT00390000002581	ENSGT00940000155081.D	ENSGT00940000163729	ENSGT00940000155080	ENSGT00940000154406.b.h	ENSGT00960000187030	ENSGT00390000013639	ENSGT00940000153311.a.b.a.fb.a.a	ENSGT00940000157134	ENSGT00390000009790	ENSGT00940000155064	ENSGT00390000017590	ENSGT00390000011354	ENSGT00940000162903.f	ENSGT00390000016954
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154353.B	ENSGT00390000002661.b.kb.a	ENSGT00940000154353.A.n.a	ENSGT00940000154353.A.n.b	ENSGT00940000155933.b.a	ENSGT00390000018130.a.a.a.h	ENSGT00940000155134	ENSGT00390000018730.B	ENSGT00940000159583	ENSGT00940000155884	ENSGT00870000136506.ob.b	ENSGT00390000009155	ENSGT00940000157565	ENSGT00940000157935	ENSGT00940000158276	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22	ENSGT00390000002581	ENSGT00940000155081.D	ENSGT00940000163729	ENSGT00940000155080	ENSGT00940000154406.b.h	ENSGT00960000187030	ENSGT00390000013639	ENSGT00940000153311.a.b.a.fb.a.a	ENSGT00940000157134	ENSGT00390000009790	ENSGT00940000155064	ENSGT00390000017590	ENSGT00390000011354	ENSGT00940000162903.f	ENSGT00390000016954
Pan	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154353.A.n.a	ENSGT00940000154353.A.n.b	ENSGT00940000154353.A.m	ENSGT00940000155933.b.a	ENSGT00390000018130.a.a.a.h	ENSGT00940000155134	ENSGT00390000018730.B	ENSGT00940000154185.l.a.b.b	ENSGT00940000159583	ENSGT00940000155884	ENSGT00870000136506.ob.b	ENSGT00390000009155	ENSGT00940000157565	ENSGT00940000157935	ENSGT00940000158276	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22	ENSGT00390000002581	ENSGT00940000155081.D	ENSGT00940000155196.q.a.b	ENSGT00940000163729	ENSGT00940000155080	ENSGT00940000154406.b.h	ENSGT00390000013639	ENSGT00940000157134	ENSGT00390000009790	ENSGT00940000155064	ENSGT00390000017590	ENSGT00390000011354	ENSGT00940000162903.f	ENSGT00390000016954	ENSGT00940000155008.C
Chimpanzee	MODERN SPECIES	19	KHDC1L (ENSPTRG00000052071)	ENSPTRG00000018341	ENSPTRG00000048515	KCNQ5 (ENSPTRG00000018339)	ENSPTRG00000046439	RIMS1 (ENSPTRG00000051415)	OGFRL1 (ENSPTRG00000018335)	ENSPTRG00000039066	B3GAT2 (ENSPTRG00000018334)	SMAP1 (ENSPTRG00000018333)	ENSPTRG00000050587	SDHAF4 (ENSPTRG00000018331)	FAM135A (ENSPTRG00000018330)	COL9A1 (ENSPTRG00000018329)	COL19A1 (ENSPTRG00000018327)	ENSPTRG00000044889 ##22	LMBRD1 (ENSPTRG00000018326)	ADGRB3 (ENSPTRG00000018325)	ENSPTRG00000051292	ENSPTRG00000018324	EYS (ENSPTRG00000051263)	PHF3 (ENSPTRG00000018315)	ENSPTRG00000046993	PTP4A1 (ENSPTRG00000043932)	LGSN (ENSPTRG00000018312)	KHDRBS2 (ENSPTRG00000018311)	ENSPTRG00000050769	ENSPTRG00000052541	ENSPTRG00000051660	ENSPTRG00000044256	RAB23 (ENSPTRG00000043341)
Bonobo	MODERN SPECIES	19	KHDC1L (ENSPPAG00000025424)	ENSPPAG00000041906	ENSPPAG00000038149	KCNQ5 (ENSPPAG00000040956)	ENSPPAG00000034250	RIMS1 (ENSPPAG00000040646)	OGFRL1 (ENSPPAG00000043342)	ENSPPAG00000041570	ENSPPAG00000032375	SMAP1 (ENSPPAG00000036070)	ENSPPAG00000032234	SDHAF4 (ENSPPAG00000032082)	FAM135A (ENSPPAG00000034229)	COL9A1 (ENSPPAG00000036128)	COL19A1 (ENSPPAG00000040447)	ENSPPAG00000028836 ##22	LMBRD1 (ENSPPAG00000032391)	ADGRB3 (ENSPPAG00000037212)	PHF3 (ENSPPAG00000027689)	PTP4A1 (ENSPPAG00000043163)	LGSN (ENSPPAG00000032360)	ENSPPAG00000042416	KHDRBS2 (ENSPPAG00000032651)	ENSPPAG00000000267	RAB23 (ENSPPAG00000010023)	BAG2 (ENSPPAG00000039605)	ZNF451 (ENSPPAG00000042859)	KIAA1586 (ENSPPAG00000038232)	BEND6 (ENSPPAG00000038759)	DST (ENSPPAG00000023253)	ENSPPAG00000034011
Gorilla	MODERN SPECIES	19	KHDC1L (ENSGGOG00000025471)	ENSGGOG00000043309	ENSGGOG00000038734	ENSGGOG00000038380	KCNQ5 (ENSGGOG00000011406)	ENSGGOG00000040624	RIMS1 (ENSGGOG00000003628)	OGFRL1 (ENSGGOG00000010724)	B3GAT2 (ENSGGOG00000021933)	SMAP1 (ENSGGOG00000011243)	ENSGGOG00000040766	SDHAF4 (ENSGGOG00000037113)	FAM135A (ENSGGOG00000004791)	COL9A1 (ENSGGOG00000010221)	ENSGGOG00000005906	ENSGGOG00000021992 ##22	LMBRD1 (ENSGGOG00000014341)	ADGRB3 (ENSGGOG00000015587)	ENSGGOG00000038010	ENSGGOG00000026362	ENSGGOG00000042367	ENSGGOG00000027663	EYS (ENSGGOG00000034946)	PHF3 (ENSGGOG00000007906)	ENSGGOG00000024946	PTP4A1 (ENSGGOG00000043919)	LGSN (ENSGGOG00000003942)	KHDRBS2 (ENSGGOG00000025068)	ENSGGOG00000039155	PRIM2 (ENSGGOG00000007076)	ENSGGOG00000002933
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Glires	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Degu	DUPLICATION
Degu	DUPLICATION
Degu	DUPLICATION
Degu	DUPLICATION
Degu	DUPLICATION
Degu	MODERN SPECIES	83	CUEDC2 (ENSODEG00000007262)	FBXL15 (ENSODEG00000007513)	PSD (ENSODEG00000006424)	NFKB2 (ENSODEG00000007396)	ENSODEG00000006690	GBF1 (ENSODEG00000007076)	PITX3 (ENSODEG00000007162)	ELOVL3 (ENSODEG00000006606)	NOLC1 (ENSODEG00000006304)	ENSODEG00000006985	ENSODEG00000009568	LDB1 (ENSODEG00000009090)	HPS6 (ENSODEG00000007638)	ENSODEG00000019424	ARMH3 (ENSODEG00000007299)	ENSODEG00000010569 ##22	KCNIP2 (ENSODEG00000007199)	ENSODEG00000019634	OGA (ENSODEG00000008001)	NPM3 (ENSODEG00000006704)	FGF8 (ENSODEG00000006423)	FBXW4 (ENSODEG00000007897)	DPCD (ENSODEG00000005983)	POLL (ENSODEG00000007469)	BTRC (ENSODEG00000008464)	LBX1 (ENSODEG00000006684)	ENSODEG00000006094	KAZALD1 (ENSODEG00000005804)	SFXN3 (ENSODEG00000007542)	PDZD7 (ENSODEG00000006718)	LZTS2 (ENSODEG00000006752)
Degu	MODERN SPECIES	80	ENSODEG00000009187	TMCO3 (ENSODEG00000009661)	DCUN1D2 (ENSODEG00000008899)	ENSODEG00000007633	ENSODEG00000008619	GRTP1 (ENSODEG00000007871)	LAMP1 (ENSODEG00000009126)	CUL4A (ENSODEG00000007751)	PCID2 (ENSODEG00000007738)	PROZ (ENSODEG00000009284)	F10 (ENSODEG00000008696)	MCF2L (ENSODEG00000009412)	ATP11A (ENSODEG00000008675)	ENSODEG00000008533	TUBGCP3 (ENSODEG00000008609)	ENSODEG00000019619 ##22	ENSODEG00000009444	ARHGEF7 (ENSODEG00000009477)	ENSODEG00000008348	ING1 (ENSODEG00000008422)	CARS2 (ENSODEG00000008933)	NAXD (ENSODEG00000008623)	ENSODEG00000019961	RAB20 (ENSODEG00000010199)	COL4A2 (ENSODEG00000012107)	COL4A1 (ENSODEG00000011076)	IRS2 (ENSODEG00000009721)	MYO16 (ENSODEG00000008856)	TNFSF13B (ENSODEG00000010925)	ABHD13 (ENSODEG00000019588)	LIG4 (ENSODEG00000019683)
Degu	MODERN SPECIES	141	RAPGEF3 (ENSODEG00000003613)	ENDOU (ENSODEG00000003517)	RPAP3 (ENSODEG00000003489)	PCED1B (ENSODEG00000003479)	ENSODEG00000018996	AMIGO2 (ENSODEG00000018958)	ENSODEG00000003462	ENSODEG00000003450	SLC38A2 (ENSODEG00000003379)	SLC38A1 (ENSODEG00000003269)	SCAF11 (ENSODEG00000003223)	ENSODEG00000019076	ENSODEG00000004013	ARID2 (ENSODEG00000003976)	ENSODEG00000003928	ENSODEG00000018973 ##22	ENSODEG00000018965	ENSODEG00000003909	ANO6 (ENSODEG00000003814)	NELL2 (ENSODEG00000003669)	TMEM117 (ENSODEG00000003583)	ENSODEG00000003529	ENSODEG00000018930	PUS7L (ENSODEG00000003484)	ADAMTS20 (ENSODEG00000003382)	PRICKLE1 (ENSODEG00000003320)	PPHLN1 (ENSODEG00000003297)	ENSODEG00000003268	ENSODEG00000003254	YAF2 (ENSODEG00000004846)	GXYLT1 (ENSODEG00000004822)
Degu	MODERN SPECIES	113	RHOT1 (ENSODEG00000012674)	RHBDL3 (ENSODEG00000012800)	C17orf75 (ENSODEG00000012638)	ZNF207 (ENSODEG00000012683)	ENSODEG00000013615	ENSODEG00000014487	CDK5R1 (ENSODEG00000020159)	MYO1D (ENSODEG00000012420)	TMEM98 (ENSODEG00000012273)	ENSODEG00000012654	ASIC2 (ENSODEG00000012964)	CCL11 (ENSODEG00000013280)	ENSODEG00000013352	TMEM132E (ENSODEG00000013225)	CCT6B (ENSODEG00000013365)	ENSODEG00000020133 ##22	ZNF830 (ENSODEG00000012121)	LIG3 (ENSODEG00000014335)	RFFL (ENSODEG00000013992)	RAD51D (ENSODEG00000014400)	NLE1 (ENSODEG00000015154)	UNC45B (ENSODEG00000013654)	ENSODEG00000020075
Degu	MODERN SPECIES	42	CDR2 (ENSODEG00000011922)	POLR3E (ENSODEG00000011375)	EEF2K (ENSODEG00000011952)	SDR42E2 (ENSODEG00000011677)	VWA3A (ENSODEG00000011821)	MOSMO (ENSODEG00000012172)	PDZD9 (ENSODEG00000012039)	ENSODEG00000011711	ENSODEG00000011826	CRYM (ENSODEG00000011398)	ANKS4B (ENSODEG00000011058)	ZP2 (ENSODEG00000011036)	LDAF1 (ENSODEG00000011669)	ENSODEG00000012131	DNAH3 (ENSODEG00000010918)	ENSODEG00000020044 ##22	ENSODEG00000012660	DCUN1D3 (ENSODEG00000013932)	ENSODEG00000010720	ACSM3 (ENSODEG00000013265)	THUMPD1 (ENSODEG00000012360)	ACSM4 (ENSODEG00000011575)
Degu	MODERN SPECIES	262	TEX10 (ENSODEG00000002157)	ENSODEG00000002138	INVS (ENSODEG00000003552)	ENSODEG00000003531	ERP44 (ENSODEG00000003516)	STX17 (ENSODEG00000003407)	NR4A3 (ENSODEG00000003374)	SEC61B (ENSODEG00000003360)	ENSODEG00000003346	TGFBR1 (ENSODEG00000003331)	ENSODEG00000003112	GALNT12 (ENSODEG00000003074)	ENSODEG00000003063	ANKS6 (ENSODEG00000002878)	GABBR2 (ENSODEG00000002271)	ENSODEG00000002235 ##22	TBC1D2 (ENSODEG00000002208)	CORO2A (ENSODEG00000002085)	TRIM14 (ENSODEG00000002021)	ENSODEG00000001976	ENSODEG00000001939 ##20	TRMO (ENSODEG00000001916)	ENSODEG00000018738	XPA (ENSODEG00000001712)	NCBP1 (ENSODEG00000003232)	TSTD2 (ENSODEG00000003152)	TMOD1 (ENSODEG00000003115)	TDRD7 (ENSODEG00000002889)	ENSODEG00000002716	ENSODEG00000002561	KLHL9 (ENSODEG00000002552)
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	218	CLP1 (ENSCLAG00000004094)	ZDHHC5 (ENSCLAG00000012355)	MED19 (ENSCLAG00000009229)	TMX2 (ENSCLAG00000009505)	BTBD18 (ENSCLAG00000005879)	CTNND1 (ENSCLAG00000006994)	OR6Q1 (ENSCLAG00000017704)	OR9I1 (ENSCLAG00000007789)	OR9Q1 (ENSCLAG00000017558)	OR9Q2 (ENSCLAG00000017540)	ENSCLAG00000003862	ENSCLAG00000004264	ENSCLAG00000017598	ENSCLAG00000004783	ENSCLAG00000004811	ENSCLAG00000003117 ##22	ENSCLAG00000017573	LPXN (ENSCLAG00000003524)	ZFP91 (ENSCLAG00000002619)	CNTF (ENSCLAG00000002770)	ENSCLAG00000003021	ENSCLAG00000003144	ENSCLAG00000017625	GLYAT (ENSCLAG00000003221)	ENSCLAG00000003420	FAM111A (ENSCLAG00000003531)	DTX4 (ENSCLAG00000003959)	MPEG1 (ENSCLAG00000017607)	ENSCLAG00000004222	ENSCLAG00000017620	ENSCLAG00000017592
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.a ##22
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1546								Insyn2b (ENSNGAG00000014504) #11	Foxi1 (ENSNGAG00000019108) #12	Lcp2 (ENSNGAG00000008561) #14	Kcnmb1 (ENSNGAG00000005867) #15	Kcnip1 (ENSNGAG00000010312) #16	Gabrp (ENSNGAG00000017036) #18	Ranbp17 (ENSNGAG00000014221) #19	Tlx3 (ENSNGAG00000011712) #21	ENSNGAG00000016679 ##22	Fgf18 (ENSNGAG00000001054) #23	Smim23 (ENSNGAG00000001372) #24	Fbxw11 (ENSNGAG00000006880) #25	Stk10 (ENSNGAG00000019942) #26	Efcab9 (ENSNGAG00000019506) #27	Ubtd2 (ENSNGAG00000000104) #28	Sh3pxd2b (ENSNGAG00000000827) #29	Neurl1b (ENSNGAG00000018472)	Dusp1 (ENSNGAG00000019520)	Ergic1 (ENSNGAG00000020608)	ENSNGAG00000002828	ENSNGAG00000003294	ENSNGAG00000009349	Bnip1 (ENSNGAG00000019475)	Nkx2-5 (ENSNGAG00000016164)
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Primates	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Mouse lemur	MODERN SPECIES		VWA5B2 (ENSMICG00000049272)	ALG3 (ENSMICG00000048992)	EEF1AKMT4 (ENSMICG00000049030)	CAMK2N2 (ENSMICG00000049125)	PSMD2 (ENSMICG00000049512)	EIF4G1 (ENSMICG00000049010)	FAM131A (ENSMICG00000049438)	CLCN2 (ENSMICG00000049507)	ENSMICG00000048991	THPO (ENSMICG00000049369)	CHRD (ENSMICG00000049478)	ENSMICG00000049109	EPHB3 (ENSMICG00000049312)	ENSMICG00000049325	VPS8 (ENSMICG00000048987)	ENSMICG00000049412 ##22	C3orf70 (ENSMICG00000049150)	EHHADH (ENSMICG00000049546)	MAP3K13 (ENSMICG00000049178)	ENSMICG00000049489	TMEM41A (ENSMICG00000049227)	LIPH (ENSMICG00000049296)	SENP2 (ENSMICG00000049584)	ENSMICG00000049453	ENSMICG00000049295	ENSMICG00000049192	TRA2B (ENSMICG00000048969)	ENSMICG00000048951	ENSMICG00000049439	ETV5 (ENSMICG00000049011)	DGKG (ENSMICG00000049209)
Bushbaby	MODERN SPECIES	141	GMPR (ENSOGAG00000006073)	ATXN1 (ENSOGAG00000028623)	ENSOGAG00000025254	STMND1 (ENSOGAG00000033742)	RBM24 (ENSOGAG00000027311)	CAP2 (ENSOGAG00000027194)	FAM8A1 (ENSOGAG00000026076)	NUP153 (ENSOGAG00000014899)	KIF13A (ENSOGAG00000014904)	NHLRC1 (ENSOGAG00000007737)	TPMT (ENSOGAG00000007738)	KDM1B (ENSOGAG00000007744)	DEK (ENSOGAG00000007750)	RNF144B (ENSOGAG00000007755)	ENSOGAG00000026614	ENSOGAG00000031663 ##22	ID4 (ENSOGAG00000033346)	MBOAT1 (ENSOGAG00000010766)	E2F3 (ENSOGAG00000004347)	CDKAL1 (ENSOGAG00000015955)	ENSOGAG00000014939	SOX4 (ENSOGAG00000033507)	ENSOGAG00000026636	PRL (ENSOGAG00000008372)	HDGFL1 (ENSOGAG00000008374)	NRSN1 (ENSOGAG00000025470)	DCDC2 (ENSOGAG00000015852)	MRS2 (ENSOGAG00000015862)	GPLD1 (ENSOGAG00000015865)	ALDH5A1 (ENSOGAG00000010743)	KIAA0319 (ENSOGAG00000010747)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000162149	ENSGT00940000159320	ENSGT00390000011608	ENSGT01030000234638.b.b.c.a	ENSGT00940000158881	ENSGT00940000157220	ENSGT00940000156800	ENSGT00390000010652.C	ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a	ENSGT00940000163116	ENSGT00940000156876.k.b	ENSGT00950000182940.b.a.a	ENSGT01080000257410.A.f	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22	ENSGT01030000234535.F.a	ENSGT00910000147013	ENSGT00730000111392	ENSGT00940000157160.e	ENSGT00940000155888	ENSGT00950000183112.a	ENSGT00940000156291	ENSGT00940000157540.A	ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b	ENSGT00530000063727.A.j	ENSGT00910000146810	ENSGT00940000160523	ENSGT00510000048902.b	ENSGT00940000156682	ENSGT00390000015368.a.b
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000156876.k.b	ENSGT00940000163116	ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a	ENSGT00390000010652.C	ENSGT00940000156800	ENSGT00940000157220	ENSGT00940000158881	ENSGT01030000234638.b.b.c.a	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000159320	ENSGT00940000162149	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00950000182940.b.a.a	ENSGT01080000257410.A.f	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22	ENSGT01030000234535.F.a	ENSGT00910000147013	ENSGT00730000111392	ENSGT00940000157160.e	ENSGT00940000155888	ENSGT00950000183112.a	ENSGT00940000156291	ENSGT00860000135750	ENSGT00390000017267.i.b	ENSGT00940000161069.f	ENSGT00940000157540.A	ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b	ENSGT00530000063727.A.j	ENSGT00910000146810	ENSGT00940000160523
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000156876.k.b	ENSGT00940000163116	ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a	ENSGT00390000010652.C	ENSGT00940000156800	ENSGT00940000157220	ENSGT00940000158881	ENSGT01030000234638.b.b.c.a	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000159320	ENSGT00940000162149	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00950000182940.b.a.a	ENSGT01080000257410.A.f	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22	ENSGT01030000234535.F.a	ENSGT00910000147013	ENSGT00730000111392	ENSGT00940000155888	ENSGT00950000183112.a	ENSGT00940000156291	ENSGT00860000135750	ENSGT00390000017267.i.b	ENSGT00940000157540.A	ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b	ENSGT00530000063727.A.j	ENSGT00390000010718	ENSGT00940000160523	ENSGT00510000048902.b	ENSGT00940000156682
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000156876.k.b	ENSGT00940000163116	ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a	ENSGT00390000010652.C	ENSGT00940000156800	ENSGT00940000157220	ENSGT00940000158881	ENSGT01030000234638.b.b.c.a	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000159320	ENSGT00940000162149	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00950000182940.b.a.a	ENSGT01080000257410.A.f	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22	ENSGT01030000234535.F.a	ENSGT00910000147013	ENSGT00730000111392	ENSGT00940000155888	ENSGT00950000183112.a	ENSGT00940000156291	ENSGT00860000135750	ENSGT00390000017267.i.b	ENSGT00940000157540.A	ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b	ENSGT00530000063727.A.j	ENSGT00390000010718	ENSGT00940000160523	ENSGT00510000048902.b	ENSGT00940000156682
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000156876.k.b	ENSGT00940000163116	ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a	ENSGT00390000010652.C	ENSGT00940000156800	ENSGT00940000157220	ENSGT00940000158881	ENSGT01030000234638.b.b.c.a	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000159320	ENSGT00940000162149	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00950000182940.b.a.a	ENSGT01080000257410.A.f	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22	ENSGT01030000234535.F.a	ENSGT00910000147013	ENSGT00730000111392	ENSGT00940000155888	ENSGT00950000183112.a	ENSGT00940000156291	ENSGT00860000135750	ENSGT00390000017267.i.b	ENSGT00940000157540.A	ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b	ENSGT00530000063727.A.j	ENSGT00390000010718	ENSGT00940000160523	ENSGT00510000048902.b	ENSGT00940000156682
Pan	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000156876.k.b	ENSGT00940000163116	ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a	ENSGT00390000010652.C	ENSGT00940000156800	ENSGT00940000157220	ENSGT00940000158881	ENSGT01030000234638.b.b.c.a	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000159320	ENSGT00940000162149	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00950000182940.b.a.a	ENSGT01080000257410.A.f	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22	ENSGT01030000234535.F.a	ENSGT00910000147013	ENSGT00730000111392	ENSGT00940000157160.e	ENSGT00940000155888	ENSGT00950000183112.a	ENSGT00940000156291	ENSGT00860000135750	ENSGT00390000017267.i.b	ENSGT00940000157540.A	ENSGT00950000182926.b.d.c.b.b.c.a.b	ENSGT00530000063727.A.j	ENSGT00390000010718	ENSGT00940000160523	ENSGT00510000048902.b
Bonobo	MODERN SPECIES	6	ZNF774 (ENSPPAG00000028939)	IQGAP1 (ENSPPAG00000039618)	CRTC3 (ENSPPAG00000035032)	BLM (ENSPPAG00000032173)	FURIN (ENSPPAG00000034430)	FES (ENSPPAG00000035301)	MAN2A2 (ENSPPAG00000030909)	ENSPPAG00000029551	UNC45A (ENSPPAG00000038005)	ENSPPAG00000039645	RCCD1 (ENSPPAG00000041396)	PRC1 (ENSPPAG00000033888)	VPS33B (ENSPPAG00000001343)	SV2B (ENSPPAG00000028665)	SLCO3A1 (ENSPPAG00000042705)	ENSPPAG00000040610 ##22	ST8SIA2 (ENSPPAG00000042880)	ENSPPAG00000038835	FAM174B (ENSPPAG00000034687)	ENSPPAG00000015337	ENSPPAG00000036927	CHD2 (ENSPPAG00000030381)	RGMA (ENSPPAG00000028287)	MCTP2 (ENSPPAG00000000288)	ENSPPAG00000023150	ENSPPAG00000029337	ENSPPAG00000031306	ENSPPAG00000039383	ENSPPAG00000036593	ARRDC4 (ENSPPAG00000040079)	ENSPPAG00000029563
Chimpanzee	MODERN SPECIES	6	ENSPTRG00000040709	ZNF774 (ENSPTRG00000023856)	IQGAP1 (ENSPTRG00000007455)	CRTC3 (ENSPTRG00000007457)	BLM (ENSPTRG00000007460)	FURIN (ENSPTRG00000007461)	FES (ENSPTRG00000007462)	MAN2A2 (ENSPTRG00000007463)	UNC45A (ENSPTRG00000007465)	HDDC3 (ENSPTRG00000007464)	RCCD1 (ENSPTRG00000007466)	PRC1 (ENSPTRG00000007467)	VPS33B (ENSPTRG00000007468)	SV2B (ENSPTRG00000007469)	SLCO3A1 (ENSPTRG00000007471)	ENSPTRG00000052368 ##22	ST8SIA2 (ENSPTRG00000049717)	ENSPTRG00000047348	FAM174B (ENSPTRG00000007475)	ENSPTRG00000042874	ENSPTRG00000044489	CHD2 (ENSPTRG00000007478)	RGMA (ENSPTRG00000007480)	MCTP2 (ENSPTRG00000007482)	ENSPTRG00000043984	ENSPTRG00000052493	NR2F2 (ENSPTRG00000044693)	ENSPTRG00000044433	ENSPTRG00000045669	SPATA8 (ENSPTRG00000007486)	ARRDC4 (ENSPTRG00000007487)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000162149	ENSGT00940000159320	ENSGT00390000011608	ENSGT01030000234638.b.b.c.a	ENSGT00940000158881	ENSGT00940000157220	ENSGT00940000156800	ENSGT00940000155158.j	ENSGT00390000010652.C	ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a	ENSGT00940000163116	ENSGT00940000156876.k.b	ENSGT00950000182940.b.a.a	ENSGT01080000257410.A.f	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22	ENSGT01030000234535.F.a	ENSGT00910000147013	ENSGT00730000111392	ENSGT00940000157160.e	ENSGT00940000155888	ENSGT00950000183112.a	ENSGT00860000135750	ENSGT00940000156291	ENSGT00940000157540.A	ENSGT00940000160523	ENSGT00510000048902.b	ENSGT00940000156682	ENSGT00390000015368.a.b	ENSGT00940000159268	ENSGT00530000063847.a
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	775							MAP6 (ENSRBIG00000032932)	SERPINH1 (ENSRBIG00000028537)	GDPD5 (ENSRBIG00000037527)	KLHL35 (ENSRBIG00000036873)	RPS3 (ENSRBIG00000044916)	ARRB1 (ENSRBIG00000041523)	SLCO2B1 (ENSRBIG00000035476)	ENSRBIG00000037921	OR2AT4 (ENSRBIG00000036161)	ENSRBIG00000043933 ##22	NEU3 (ENSRBIG00000040960)	ENSRBIG00000011964	XRRA1 (ENSRBIG00000036115)	RNF169 (ENSRBIG00000035895)	CHRDL2 (ENSRBIG00000028182)	ENSRBIG00000044531	ENSRBIG00000011853	ENSRBIG00000001091	LIPT2 (ENSRBIG00000031912)	PGM2L1 (ENSRBIG00000043298)	ENSRBIG00000002437	P4HA3 (ENSRBIG00000034204)	PPME1 (ENSRBIG00000032741)	C2CD3 (ENSRBIG00000036054)	UCP3 (ENSRBIG00000032946)
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000162149	ENSGT00940000159320	ENSGT00390000011608	ENSGT01030000234638.b.b.c.a	ENSGT00940000158881	ENSGT00940000157220	ENSGT00940000156800	ENSGT00940000155158.j	ENSGT00390000010652.C	ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a	ENSGT00940000163116	ENSGT00940000156876.k.b	ENSGT00950000182940.b.a.a	ENSGT01080000257410.A.f	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22	ENSGT01030000234535.F.a	ENSGT00910000147013	ENSGT00730000111392	ENSGT00940000157160.e	ENSGT00940000155888	ENSGT00950000183112.a	ENSGT00860000135750	ENSGT00940000156291	ENSGT00940000157540.A	ENSGT00940000160523	ENSGT00510000048902.b	ENSGT00940000156682	ENSGT00390000015368.a.b	ENSGT00940000159268	ENSGT00530000063847.a
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	21	TTLL13 (ENSCSAG00000017100)	NGRN (ENSCSAG00000017097)	VPS33B (ENSCSAG00000017088)	PRC1 (ENSCSAG00000017083)	RCCD1 (ENSCSAG00000017077)	UNC45A (ENSCSAG00000017071)	HDDC3 (ENSCSAG00000017067)	MAN2A2 (ENSCSAG00000017063)	FES (ENSCSAG00000017051)	FURIN (ENSCSAG00000017046)	BLM (ENSCSAG00000017040)	CRTC3 (ENSCSAG00000017034)	IQGAP1 (ENSCSAG00000017030)	SV2B (ENSCSAG00000017020)	SLCO3A1 (ENSCSAG00000017018)	ENSCSAG00000017017 ##22	ST8SIA2 (ENSCSAG00000017015)	FAM174B (ENSCSAG00000017009)	CHD2 (ENSCSAG00000017007)	RGMA (ENSCSAG00000017004)	MCTP2 (ENSCSAG00000016995)	NR2F2 (ENSCSAG00000016974)	ENSCSAG00000000366	ARRDC4 (ENSCSAG00000016967)	ENSCSAG00000016956	ENSCSAG00000000365	IGF1R (ENSCSAG00000016951)	PGPEP1L (ENSCSAG00000016947)	SYNM (ENSCSAG00000016942)	TTC23 (ENSCSAG00000016940)	LRRC28 (ENSCSAG00000016935)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Glires	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Rabbit	MODERN SPECIES	2	ENSOCUG00000026510	ENSOCUG00000036492	WDR36 (ENSOCUG00000003129)	ENSOCUG00000034609	ENSOCUG00000024909	ENSOCUG00000000089	SLC25A46 (ENSOCUG00000012366)	TMEM232 (ENSOCUG00000009594)	MAN2A1 (ENSOCUG00000003404)	PJA2 (ENSOCUG00000011136)	ENSOCUG00000035509	ENSOCUG00000032654	ENSOCUG00000010918	ENSOCUG00000012609	EFNA5 (ENSOCUG00000016107)	ENSOCUG00000035176 ##22	ENSOCUG00000037124	ENSOCUG00000025766	ENSOCUG00000024359	NUDT12 (ENSOCUG00000017632)	ENSOCUG00000022102	MACIR (ENSOCUG00000022010)	PPIP5K2 (ENSOCUG00000001610)	GIN1 (ENSOCUG00000025993)	PAM (ENSOCUG00000001598)	SLCO6A1 (ENSOCUG00000003393)	SLCO4C1 (ENSOCUG00000016948)	ENSOCUG00000027390	ENSOCUG00000035604	ST8SIA4 (ENSOCUG00000007922)	FAM174A (ENSOCUG00000007657)
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b.a.b ##22
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1875															Tmx3 (ENSNGAG00000001873)	ENSNGAG00000011454 ##22	Dok6 (ENSNGAG00000014451)	Cd226 (ENSNGAG00000016544)	Rttn (ENSNGAG00000017865)	Socs6 (ENSNGAG00000013534)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b #22
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b #22
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b #22
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b #22
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.b #22
Microbat	MODERN SPECIES	1017		ENSMLUG00000023145	ENSMLUG00000029414	LRRC1 (ENSMLUG00000008118)	MLIP (ENSMLUG00000008145)	TINAG (ENSMLUG00000016940)	FAM83B (ENSMLUG00000006727)	ENSMLUG00000024260	HCRTR2 (ENSMLUG00000012103)	GFRAL (ENSMLUG00000012114)	HMGCLL1 (ENSMLUG00000002703)	BMP5 (ENSMLUG00000004021)	COL21A1 (ENSMLUG00000004388)	ENSMLUG00000027092	DST (ENSMLUG00000005610)	ENSMLUG00000030379 #22	BEND6 (ENSMLUG00000001178)	ENSMLUG00000023844	ZNF451 (ENSMLUG00000004044)	ENSMLUG00000004055	RAB23 (ENSMLUG00000004058)	ENSMLUG00000027806	ENSMLUG00000028909	ENSMLUG00000030356	ENSMLUG00000005434	KHDRBS2 (ENSMLUG00000005484)