Bovidae	DUPLICATION
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.a #22
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.a #22
Bos	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.a #22
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.a #22
Cow	MODERN SPECIES	12	ENSBTAG00000047333 #7	OR5I1FP (ENSBTAG00000000617) #8	SPZ1 (ENSBTAG00000024593) #9	PANK3 (ENSBTAG00000011895) #10	SLIT3 (ENSBTAG00000017746) #11	SPDL1 (ENSBTAG00000008180) #12	DOCK2 (ENSBTAG00000014612) #13	INSYN2B (ENSBTAG00000002134) #14	FOXI1 (ENSBTAG00000014620) #15	LCP2 (ENSBTAG00000009381) #16	KCNMB1 (ENSBTAG00000002985) #17	KCNIP1 (ENSBTAG00000002865) #18	GABRP (ENSBTAG00000002779) #19	RANBP17 (ENSBTAG00000024801) #20	TLX3 (ENSBTAG00000010003) #21	NPM1 (ENSBTAG00000015316) #22	FGF18 (ENSBTAG00000000128) #23	ENSBTAG00000054615 #24	ENSBTAG00000053610 #25	FBXW11 (ENSBTAG00000015376) #26	STK10 (ENSBTAG00000017457) #27	EFCAB9 (ENSBTAG00000008876) #28	UBTD2 (ENSBTAG00000034659) #29	SH3PXD2B (ENSBTAG00000009019) #30	NEURL1B (ENSBTAG00000001429) #31	DUSP1 (ENSBTAG00000013863) #32	ERGIC1 (ENSBTAG00000015955) #33	RPL26L1 (ENSBTAG00000015099) #34	ATP6V0E1 (ENSBTAG00000015100) #35	CREBRF (ENSBTAG00000002020) #36	BNIP1 (ENSBTAG00000002021) #37
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.a #22
Goat	MODERN SPECIES	12	SPZ1 (ENSCHIG00000003966) #9	ENSCHIG00000010867	PANK3 (ENSCHIG00000017246) #10	SLIT3 (ENSCHIG00000007677) #11	SPDL1 (ENSCHIG00000015214) #12	ENSCHIG00000022506 #13	INSYN2B (ENSCHIG00000008171) #14	FOXI1 (ENSCHIG00000015541) #15	LCP2 (ENSCHIG00000020683) #16	KCNMB1 (ENSCHIG00000016254) #17	ENSCHIG00000019721	KCNIP1 (ENSCHIG00000022505) #18	GABRP (ENSCHIG00000013304) #19	ENSCHIG00000007336 #20	TLX3 (ENSCHIG00000009023) #21	ENSCHIG00000013986 #22	FGF18 (ENSCHIG00000011455) #23	ENSCHIG00000020677	FBXW11 (ENSCHIG00000015807) #26	STK10 (ENSCHIG00000022275) #27	UBTD2 (ENSCHIG00000008177) #29	ENSCHIG00000019482	SH3PXD2B (ENSCHIG00000017285) #30	NEURL1B (ENSCHIG00000011973) #31	DUSP1 (ENSCHIG00000021879) #32	ERGIC1 (ENSCHIG00000000491) #33	RPL26L1 (ENSCHIG00000015371) ##34	ENSCHIG00000023731 #35	CREBRF (ENSCHIG00000011720) #36	BNIP1 (ENSCHIG00000007910) #37	NKX2-5 (ENSCHIG00000017420)
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000156079	ENSGT00940000157280	ENSGT00940000156658	ENSGT00940000154725	ENSGT00950000182872.f.a.b	ENSGT00940000158587	ENSGT00940000159104	ENSGT00940000159300	ENSGT00940000156215.f	ENSGT00390000011144	ENSGT00940000158506	ENSGT00940000159760	ENSGT00530000064699	ENSGT00940000159042	ENSGT00390000002143.a	ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.b ##22	ENSGT00940000158742	ENSGT00940000158547	ENSGT00390000015159.b	ENSGT00950000183140.a.a.m.a.a.b	ENSGT00940000155285.b.b	ENSGT00940000159198	ENSGT00950000182986.a.b.b	ENSGT00390000013961	ENSGT00390000011137	ENSGT00390000011759	ENSGT00940000162935	ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a	ENSGT00390000005809	ENSGT00940000156272	ENSGT00940000158932
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000156079	ENSGT00940000157280	ENSGT00940000156658	ENSGT00940000154725	ENSGT00950000182872.f.a.b	ENSGT00940000158587	ENSGT00940000159104	ENSGT00940000159300	ENSGT00940000156215.f	ENSGT00390000011144	ENSGT00940000158506	ENSGT00940000159760	ENSGT00530000064699	ENSGT00940000159042	ENSGT00390000002143.a	ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.b ##22	ENSGT00940000158742	ENSGT00940000158547	ENSGT00390000015159.b	ENSGT00950000183140.a.a.m.a.a.b	ENSGT00940000154509.z	ENSGT00940000155285.b.b	ENSGT00940000166198	ENSGT00940000160886	ENSGT00940000159198	ENSGT00950000182986.a.b.b	ENSGT00390000013961	ENSGT00390000011137	ENSGT00390000011759	ENSGT00940000162935	ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a
Bos	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000156079	ENSGT00940000157280	ENSGT00940000156658	ENSGT00940000154725	ENSGT00950000182872.f.a.b	ENSGT00940000158587	ENSGT00940000159104	ENSGT00940000159300	ENSGT00940000156215.f	ENSGT00390000011144	ENSGT00940000158506	ENSGT00940000159760	ENSGT00530000064699	ENSGT00940000159042	ENSGT00390000002143.a	ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.b ##22	ENSGT00940000158742	ENSGT00940000158547	ENSGT00390000015159.b	ENSGT00950000183140.a.a.m.a.a.b	ENSGT00940000154509.z	ENSGT00940000155285.b.b	ENSGT00940000166198	ENSGT00940000160886.d	ENSGT00940000159198	ENSGT00950000182986.a.b.b	ENSGT00390000013961	ENSGT00390000011137	ENSGT00390000011759	ENSGT00940000162935	ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156079	ENSGT00940000157280	ENSGT00940000156658	ENSGT00940000154725	ENSGT00950000182872.f.a.b	ENSGT00940000158587	ENSGT00940000159300	ENSGT00940000159104	ENSGT00940000156215.f	ENSGT00390000011144	ENSGT00940000158506	ENSGT00940000159760	ENSGT00530000064699	ENSGT00940000159042.a	ENSGT00390000002143.a	ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.b ##22	ENSGT00940000158742	ENSGT00940000158547	ENSGT00390000015159.b	ENSGT00390000018141.i.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183140.a.a.m.a.a.b	ENSGT00940000154509.z	ENSGT00940000155285.b.b	ENSGT00940000166198	ENSGT00940000160886.d	ENSGT00940000159198	ENSGT00950000182986.a.b.b	ENSGT00390000013961	ENSGT00390000011137	ENSGT00390000011759	ENSGT00940000162935
Cow	MODERN SPECIES	5	FAM135B (ENSBTAG00000018218)	KHDRBS3 (ENSBTAG00000002181)	ZFAT (ENSBTAG00000017731)	ST3GAL1 (ENSBTAG00000001156)	NDRG1 (ENSBTAG00000000711)	CCN4 (ENSBTAG00000000707)	TG (ENSBTAG00000007823)	SLA (ENSBTAG00000007828)	PHF20L1 (ENSBTAG00000006869)	TMEM71 (ENSBTAG00000017138)	DNAAF11 (ENSBTAG00000010548)	KCNQ3 (ENSBTAG00000020667)	HHLA1 (ENSBTAG00000034196)	OC90 (ENSBTAG00000007736)	EFR3A (ENSBTAG00000047834)	ENSBTAG00000003838 ##22	ADCY8 (ENSBTAG00000014600)	ASAP1 (ENSBTAG00000003185)	CYRIB (ENSBTAG00000020801)	ENSBTAG00000052291	GSDMC (ENSBTAG00000017478)	ENSBTAG00000050216	MYC (ENSBTAG00000008409)	ENSBTAG00000052622	ENSBTAG00000050469	LRATD2 (ENSBTAG00000026172)	TRIB1 (ENSBTAG00000023179)	NSMCE2 (ENSBTAG00000009394)	WASHC5 (ENSBTAG00000010275)	SQLE (ENSBTAG00000005498)	ZNF572 (ENSBTAG00000009072)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	5	FAM135B (ENSBIXG00005031125)	KHDRBS3 (ENSBIXG00005031144)	ZFAT (ENSBIXG00005031165)	NDRG1 (ENSBIXG00005031191)	CCN4 (ENSBIXG00005031198)	TG (ENSBIXG00005031209)	ENSBIXG00005031228	SLA (ENSBIXG00005031229)	PHF20L1 (ENSBIXG00005031232)	TMEM71 (ENSBIXG00005031248)	DNAAF11 (ENSBIXG00005031261)	KCNQ3 (ENSBIXG00005031272)	HHLA1 (ENSBIXG00005031286)	ENSBIXG00005031289	EFR3A (ENSBIXG00005031297)	ENSBIXG00005031307 ##22	ADCY8 (ENSBIXG00005031309)	ASAP1 (ENSBIXG00005005233)	ENSBIXG00005029009	CYRIB (ENSBIXG00005002096)	ENSBIXG00005005063	GSDMC (ENSBIXG00005028921)	ENSBIXG00005005029	MYC (ENSBIXG00005028785)	ENSBIXG00005004952	ENSBIXG00005004951	ENSBIXG00005002377	ENSBIXG00005028619	ENSBIXG00005006639	LRATD2 (ENSBIXG00005028575)	TRIB1 (ENSBIXG00005028498)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.b ##22
Wild yak	MODERN SPECIES	1148																ENSBMUG00000005495 ##22	ADCY8 (ENSBMUG00000005531)	ASAP1 (ENSBMUG00000006493)	CYRIB (ENSBMUG00000007935)	GSDMC (ENSBMUG00000007958)	ENSBMUG00000007963	MYC (ENSBMUG00000008022)
American bison	MODERN SPECIES	3118															EFR3A (ENSBBBG00000023024)	ENSBBBG00000022875 ##22	ADCY8 (ENSBBBG00000022858)	ASAP1 (ENSBBBG00000022792)	CYRIB (ENSBBBG00000022674)	ENSBBBG00000022581	ENSBBBG00000022571	MYC (ENSBBBG00000022548)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000156079	ENSGT00940000157280	ENSGT00940000156658	ENSGT00940000154725	ENSGT00950000182872.f.a.b	ENSGT00940000158587	ENSGT00940000159104	ENSGT00940000159300	ENSGT00940000156215.f	ENSGT00390000011144	ENSGT00940000158506	ENSGT00940000159760	ENSGT00530000064699	ENSGT00940000159042	ENSGT00390000002143.a	ENSGT00940000153052.c.b.a.b.l.c.a.a.b ##22	ENSGT00940000158742	ENSGT00940000158547	ENSGT00390000015159.b	ENSGT00950000183140.a.a.m.a.a.b	ENSGT00940000155285.b.b	ENSGT00940000159198	ENSGT00950000182986.a.b.b	ENSGT00390000013961	ENSGT00390000011137	ENSGT00390000011759	ENSGT00940000162935	ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a	ENSGT00390000005809	ENSGT00940000156272	ENSGT00940000158932
Goat	MODERN SPECIES	5	ENSCHIG00000019586	KHDRBS3 (ENSCHIG00000016533)	ZFAT (ENSCHIG00000013122)	ST3GAL1 (ENSCHIG00000021799)	NDRG1 (ENSCHIG00000015852)	CCN4 (ENSCHIG00000012315)	SLA (ENSCHIG00000017077)	TG (ENSCHIG00000026405)	PHF20L1 (ENSCHIG00000009054)	TMEM71 (ENSCHIG00000013935)	DNAAF11 (ENSCHIG00000008846)	KCNQ3 (ENSCHIG00000022278)	HHLA1 (ENSCHIG00000009769)	OC90 (ENSCHIG00000014260)	EFR3A (ENSCHIG00000022409)	ENSCHIG00000008417 ##22	ADCY8 (ENSCHIG00000026047)	ASAP1 (ENSCHIG00000020558)	ENSCHIG00000005794	ENSCHIG00000018918	MYC (ENSCHIG00000013686)	LRATD2 (ENSCHIG00000009416)	TRIB1 (ENSCHIG00000021266)	NSMCE2 (ENSCHIG00000027170)	WASHC5 (ENSCHIG00000012199)	SQLE (ENSCHIG00000025130)	ZNF572 (ENSCHIG00000013612)	MTSS1 (ENSCHIG00000023315)	NDUFB9 (ENSCHIG00000020741)	TATDN1 (ENSCHIG00000024616)	RNF139 (ENSCHIG00000021860)