Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000155582.q.a ENSGT00390000009628 ENSGT00940000159428.e.b ENSGT00390000018541 ENSGT00390000010157.b ENSGT00940000160377 ENSGT01100000263525.a.b.a.b ENSGT00390000005830 ENSGT00940000155904 ENSGT01090000259993.A.a.b ##21 ENSGT01090000259993.D.b.c.a ##21 ENSGT00940000163847.b ENSGT01090000259993.B.c.c.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.c ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849 #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01060000248704 ENSGT01090000259993.A.a.a #24 ENSGT01020000230358.h.d.a.a #23 ENSGT01090000259993.A.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a ##21 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536 ENSGT00940000161491 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000178126 ENSGT01100000263783 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.b ENSGT00390000009628 ENSGT00940000159428.e.b ENSGT00390000018541 ENSGT00390000010157.b ENSGT00940000160377.h ENSGT01100000263525.a.b.a.b ENSGT00390000005830 ENSGT00940000155904 ENSGT01090000259993.A.b.k.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.k.a.a.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01060000248704 ENSGT01100000263566.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849 #22 ENSGT01100000263566.a.a.b.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.a.a #23 ENSGT01090000259993.A.b.k.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.b ##23 ENSGT01030000234536 ENSGT00940000161491 ENSGT00940000178126 ENSGT01100000263783 ENSGT01100000263743 ENSGT01030000234901 ENSGT00940000159327.u.a ENSGT01100000263659 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018541 ENSGT00390000010157.b ENSGT00940000160377.h.a ENSGT01100000263525.a.b.a.b.c ENSGT00390000005830 ENSGT00940000155904.u.b ENSGT00940000155904.v ENSGT01090000259993.A.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.b.a.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.k.a ##21 ENSGT00940000163847.b.g.b.a.a ENSGT01090000259993.B.c.c.b.b.b.b.b.b.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.a.b ##23 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.a ##20 ENSGT01090000259993.A.b.k.b.a.b.a #21 ENSGT00940000163849.l.b.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.b.a.b.a #23 ENSGT00940000163847.b.g.a.a.a.a.b ENSGT01020000230358.h.c.a.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b ##22 ENSGT01050000244936 ENSGT01020000230358.h.d.a.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.c.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234536.m ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a ##23 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.b.b ##20 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.b.a.a #20 ENSGT01090000259993.A.b.k.b.a.b.a #21 ENSGT00940000163849.l.b.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.b.a.b.a #23 ENSGT01090000259993.A.a.a.a.b.a #24 ENSGT01100000263566.a.b.a.b ##20 ENSGT00940000163849.l.a.a.b ##22 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b.c ##21 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b.b ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.a ##22 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.a.a.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a ##23 ENSGT01030000234536.m ENSGT01100000263566.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b.d ##21 ENSGT01020000230358.h.c.a.b ##23 ENSGT00940000163847.b.g.b.a.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 316 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.b.a.a #20 ENSGT01090000259993.A.b.k.b.a.b.a #21 ENSGT00940000163849.l.b.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.b.a.b.a #23 ENSGT01090000259993.A.a.a.a.b.a #24 River trout MODERN SPECIES 25 ENSSTUG00000047924 ##21 ENSSTUG00000047927 ENSSTUG00000047930 ##23 ENSSTUG00000047932 ##21 ENSSTUG00000047935 ##20 ENSSTUG00000047940 ENSSTUG00000047946 ##23 ENSSTUG00000047948 ##21 ENSSTUG00000047957 ##21 ENSSTUG00000047959 ENSSTUG00000047960 ##23 ENSSTUG00000047964 ##23 ENSSTUG00000047966 ##20 ENSSTUG00000047973 ##20 ENSSTUG00000047979 #21 ENSSTUG00000047981 #22 ENSSTUG00000047988 #23 ENSSTUG00000047991 #24 ENSSTUG00000047994 ##23 ENSSTUG00000047998 ##23 ENSSTUG00000048001 ##20 ENSSTUG00000048002 ##20 yipf2 (ENSSTUG00000048008) carm1 (ENSSTUG00000048044) ENSSTUG00000048235 ##21 ENSSTUG00000048238 ##23 ENSSTUG00000048242 ##20 ENSSTUG00000048248 ENSSTUG00000048252 ##20 ENSSTUG00000048258 ENSSTUG00000048259 ##22 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000259993.A.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.b.a.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.k.a ##21 ENSGT00940000163847.b.g.b.a.a ENSGT01090000259993.B.c.c.b.b.b.b.b.b.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.a.b ##23 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.a ##20 ENSGT01090000259993.A.b.k.b.a.b.a #21 ENSGT00940000163849.l.b.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.b.a.b.a #23 ENSGT00940000163847.b.g.a.a.a.a.b ENSGT01020000230358.h.c.a.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b ##22 ENSGT01050000244936 ENSGT01020000230358.h.d.a.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.c.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234536.m ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a ##23 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.b.b ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.a ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.b.a ##20 ENSGT00940000163849.l.a.b.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.b.b.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.mb ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000005830 ENSGT00940000155904.u.b.a ENSGT01100000263566.a.b.b.a.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.mb ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.k.a.b ##21 ENSGT01090000259993.B.c.c.a.a.a.a ##21 ENSGT00940000163847.b.g.b.a.a ENSGT01020000230358.h.c.a.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b.d ##21 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT01030000234536.m ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.a.a.a.a ##21 ENSGT00940000163849.l.b.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b.b ##22 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b.c ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.b.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.a.a.a.b.a #24 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.b.a.b.a #23 ENSGT00940000163849.l.b.b #22 ENSGT01090000259993.A.b.k.b.a.b.a #21 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.b.a.a #20 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 142 ENSGT01020000230358.h.c.a.a.a.b.b ##23 ENSGT01100000263566.a.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.k.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.c.a.b.c.a ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b.d ##21 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.a.a.a.a ##21 ENSGT00940000163849.l.b.a.a ##22 ENSGT01020000230358.h.c.a.b.d ##23 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT00940000163847.b.g.b.a.a ENSGT01090000259993.B.c.c.b.b.b.b.b.b.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.a.b ##23 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.a ##20 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 709 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.a.a.a.a ##21 ENSGT00940000163849.l.b.a.a ##22 Chinook salmon MODERN SPECIES 38 ENSOTSG00005045946 clpp (ENSOTSG00005045944) aldh3b1 (ENSOTSG00005045943) ENSOTSG00005045941 ENSOTSG00005045940 ##20 ENSOTSG00005045938 ENSOTSG00005045937 ENSOTSG00005045936 ENSOTSG00005045935 ENSOTSG00005045934 ##23 ENSOTSG00005045933 ##21 ENSOTSG00005045932 ##21 ENSOTSG00005045931 ##23 ENSOTSG00005045930 ##21 ENSOTSG00005045929 ##21 ENSOTSG00005045927 ##22 ENSOTSG00005045926 ##21 ENSOTSG00005045925 ENSOTSG00005045924 ##23 ENSOTSG00005045923 ##20 ENSOTSG00005045921 ##20 ENSOTSG00005045920 ENSOTSG00005045919 #21 ENSOTSG00005045918 ##21 ENSOTSG00005045917 ##20 ENSOTSG00005045916 ENSOTSG00005045915 ##23 ENSOTSG00005045914 ##21 ENSOTSG00005045913 ENSOTSG00005045912 ENSOTSG00005045911 Coho salmon MODERN SPECIES 1 ENSOKIG00005042562 ENSOKIG00005042590 ##20 ENSOKIG00005042594 ENSOKIG00005042595 ENSOKIG00005042604 ENSOKIG00005042611 ##23 ENSOKIG00005042623 ENSOKIG00005042628 ##21 ENSOKIG00005042634 ENSOKIG00005042638 ENSOKIG00005042641 ##23 ENSOKIG00005042647 ##20 ENSOKIG00005042669 ##21 ENSOKIG00005042675 ##23 ENSOKIG00005042683 ##20 ENSOKIG00005042689 ##22 ENSOKIG00005042700 ##20 ENSOKIG00005042718 ##22 ENSOKIG00005042730 ##21 ENSOKIG00005042740 ##23 ENSOKIG00005042753 ##20 ENSOKIG00005042763 ENSOKIG00005042805 ENSOKIG00005043237 ##21 ENSOKIG00005043248 ENSOKIG00005043266 ##23 ENSOKIG00005043322 ##20 ENSOKIG00005043333 #21 ENSOKIG00005043341 ##21 ENSOKIG00005043349 ##22 ENSOKIG00005043369 ##21 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1714 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.a ##22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.k.a.a.a.b ##23 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 200 ENSGT01090000259993.A.b.k.b.b ##21 ENSGT01100000263566.a.b.b.a.b.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.k.b.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.b ##23 ENSGT00940000163847.b.g.b.b.a.b.b ENSGT00940000163849.l.b.a.b.a ##22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.k.a.a.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.a.a.a ##23 ENSGT01100000263566.a.a.b.b.a.b.b ##20 Salmo ANCESTRAL SPECIES 243 ENSGT01090000259993.A.b.k.b.b ##21 ENSGT01100000263566.a.b.b.a.b.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.k.b.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.b.a ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.k.a.a.a.a ##23 ENSGT01100000263566.a.b.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.a ##22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.k.a.a.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.a.a.a ##23 ENSGT01100000263566.a.a.b.b.a.b.b ##20 Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 22 ENSSSAG00000116386 ENSSSAG00000059727 ##21 ENSSSAG00000021712 ##22 ENSSSAG00000110816 ##23 ENSSSAG00000118260 ##20 ENSSSAG00000097348 ##22 ENSSSAG00000104021 ##21 ENSSSAG00000004118 ##21 ENSSSAG00000113318 ENSSSAG00000092937 ##21 ENSSSAG00000001711 ##20 ENSSSAG00000001717 ##21 ENSSSAG00000001726 ##23 ENSSSAG00000001727 ##23 ENSSSAG00000099337 ##20 ENSSSAG00000095529 ##22 ENSSSAG00000009076 ##23 ENSSSAG00000083867 ##23 ENSSSAG00000090150 ENSSSAG00000004153 ##20 ENSSSAG00000057854 ##20 ENSSSAG00000119692 ENSSSAG00000004133 ENSSSAG00000122104 ENSSSAG00000117389 ENSSSAG00000103889 ENSSSAG00000105240 ENSSSAG00000119424 ENSSSAG00000086014 ENSSSAG00000099024 ENSSSAG00000083716 Atlantic salmon MODERN SPECIES 25 timm29 (ENSSSAG00000010292) yipf2 (ENSSSAG00000099532) carm1 (ENSSSAG00000001207) aldh3b1 (ENSSSAG00000039535) clpp (ENSSSAG00000084560) ENSSSAG00000039502 ##23 ENSSSAG00000039473 ##23 ENSSSAG00000039462 ##21 ENSSSAG00000039445 ##23 ENSSSAG00000104553 ##23 ENSSSAG00000111626 ENSSSAG00000086407 ENSSSAG00000107858 ##20 ENSSSAG00000098225 ENSSSAG00000109549 ##21 ENSSSAG00000113735 ##22 ENSSSAG00000115189 ##23 ENSSSAG00000094941 ENSSSAG00000097071 ##22 ENSSSAG00000098737 ##20 ENSSSAG00000103820 ENSSSAG00000054474 ENSSSAG00000092216 ENSSSAG00000098811 ##23 ENSSSAG00000015385 ##21 ENSSSAG00000102924 ENSSSAG00000099009 ##21 ENSSSAG00000109500 ENSSSAG00000106400 ENSSSAG00000102788 ##21 ENSSSAG00000054478 ##21 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 11372 ENSHHUG00000015181 ##22 Huchen MODERN SPECIES 7325 ENSHHUG00000018709 ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000259993.A.b.k.a ##21 ENSGT00940000163847.b.g.b.a.a ENSGT01090000259993.B.c.c.b.b.b.b.b.b.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.a.b ##23 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.a ##20 ENSGT01090000259993.A.b.k.b.a.b.a #21 ENSGT00940000163849.l.b.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.b.a.b.a #23 ENSGT00940000163847.b.g.a.a.a.a.b ENSGT01020000230358.h.c.a.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b ##22 ENSGT01050000244936 ENSGT01020000230358.h.d.a.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.c.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234536.m ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a ##23 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.b.b ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.a ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.b.a ##20 ENSGT00940000163849.l.a.b.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.b.b.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.mb ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.a ENSGT01060000248704.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.k.a.a.b ##23 Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 457 ENSGT01090000259993.B.c.c.a.a.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000163847.b.g.a.a.a.a.b ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b.a ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 444 ENSGT01090000259993.B.c.c.a.a.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000163847.b.g.a.a.a.a.b ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b.a ##22 Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 628 ENSSSAG00000001720 ##21 ENSSSAG00000095029 ENSSSAG00000000633 ##22 ENSSSAG00000086632 #24 ENSSSAG00000037703 ##21 ENSSSAG00000085050 ##20 ENSSSAG00000097332 ##22 ENSSSAG00000088035 ##23 ENSSSAG00000013901 ##21 ENSSSAG00000098153 ENSSSAG00000099989 ENSSSAG00000114281 ##22 ENSSSAG00000104680 ##21 ENSSSAG00000106551 ##23 ENSSSAG00000116031 ENSSSAG00000122186 ##21 Atlantic salmon MODERN SPECIES 628 ENSSSAG00000122186 ##21 ENSSSAG00000116031 ENSSSAG00000106551 ##23 ENSSSAG00000104680 ##21 ENSSSAG00000114281 ##22 ENSSSAG00000099989 ENSSSAG00000098153 ENSSSAG00000013901 ##21 ENSSSAG00000088035 ##23 ENSSSAG00000097332 ##22 ENSSSAG00000085050 ##20 ENSSSAG00000037703 ##21 ENSSSAG00000086632 #24 ENSSSAG00000000633 ##22 ENSSSAG00000095029 ENSSSAG00000001720 ##21 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b.a ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b.a ##22 Coho salmon MODERN SPECIES 1 ENSOKIG00005043700 ENSOKIG00005043697 ENSOKIG00005043688 ENSOKIG00005043680 ENSOKIG00005043673 ENSOKIG00005043663 ENSOKIG00005043652 ENSOKIG00005043644 ENSOKIG00005043636 ENSOKIG00005043572 ENSOKIG00005043563 ##21 ENSOKIG00005043554 ##23 ENSOKIG00005043491 ##20 ENSOKIG00005043464 ##20 ENSOKIG00005043369 ##21 ENSOKIG00005043349 ##22 ENSOKIG00005043341 ##21 ENSOKIG00005043333 #21 ENSOKIG00005043322 ##20 ENSOKIG00005043266 ##23 ENSOKIG00005043248 ENSOKIG00005043237 ##21 ENSOKIG00005042805 ENSOKIG00005042763 ENSOKIG00005042753 ##20 ENSOKIG00005042740 ##23 ENSOKIG00005042730 ##21 ENSOKIG00005042718 ##22 ENSOKIG00005042700 ##20 ENSOKIG00005042689 ##22 ENSOKIG00005042683 ##20 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT01100000263566.a.b.b.a.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.mb ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.k.a.b ##21 ENSGT01090000259993.B.c.c.a.a.a.a ##21 ENSGT00940000163847.b.g.b.a.a ENSGT01020000230358.h.c.a.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b.d ##21 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT01030000234536.m ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.a.a.a.a ##21 ENSGT00940000163849.l.b.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b.b ##22 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b.c ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.b.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.a.a.a.b.a #24 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.b.a.b.a #23 ENSGT00940000163849.l.b.b #22 ENSGT01090000259993.A.b.k.b.a.b.a #21 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.b.a.a #20 Salmo ANCESTRAL SPECIES 349 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b.b ##22 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b.c ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.b.a.b ##20 Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 629 ENSSSAG00000110267 #21 ENSSSAG00000083271 ENSSSAG00000111224 ##21 ENSSSAG00000039316 ##22 ENSSSAG00000109053 #24 ENSSSAG00000095844 ##21 ENSSSAG00000001749 ##20 ENSSSAG00000001745 ENSSSAG00000119166 ##23 ENSSSAG00000115613 ##22 ENSSSAG00000118709 Atlantic salmon MODERN SPECIES 852 ENSSSAG00000096541 ENSSSAG00000121815 ##23 ENSSSAG00000085434 ##21 ENSSSAG00000090287 ##22 ENSSSAG00000082328 ENSSSAG00000092982 ##21 ENSSSAG00000109113 ##20 ENSSSAG00000085253 ENSSSAG00000087006 ENSSSAG00000105074 ##21 Atlantic salmon MODERN SPECIES 22 clpp (ENSSSAG00000001612) ENSSSAG00000092350 aldh3b1 (ENSSSAG00000001628) ENSSSAG00000001641 ##21 ENSSSAG00000001637 ##22 ENSSSAG00000097604 ##21 ENSSSAG00000090208 ##20 ENSSSAG00000091185 #20 ENSSSAG00000115151 ENSSSAG00000084032 #21 ENSSSAG00000110833 ENSSSAG00000110168 ##21 ENSSSAG00000103806 ENSSSAG00000092083 ##23 ENSSSAG00000105196 ##21 ENSSSAG00000092148 ##22 ENSSSAG00000103641 ##21 ENSSSAG00000102844 ##22 ENSSSAG00000119599 ##20 ENSSSAG00000102503 ##21 ENSSSAG00000093483 ##23 ENSSSAG00000093345 ENSSSAG00000099035 ##21 ENSSSAG00000118029 ENSSSAG00000090205 #21 ENSSSAG00000101183 #20 ENSSSAG00000107377 ENSSSAG00000098375 ##21 ENSSSAG00000088076 ENSSSAG00000118935 ##21 ENSSSAG00000001740 ##22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 619 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b.b ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.a ##20 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 757 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b.b ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.a ##20 Coho salmon DUPLICATION Coho salmon DUPLICATION Coho salmon MODERN SPECIES 1 ENSOKIG00005042594 ENSOKIG00005042595 ENSOKIG00005042604 ENSOKIG00005042611 ##23 ENSOKIG00005042623 ENSOKIG00005042628 ##21 ENSOKIG00005042634 ENSOKIG00005042638 ENSOKIG00005042641 ##23 ENSOKIG00005042647 ##20 ENSOKIG00005042669 ##21 ENSOKIG00005042675 ##23 ENSOKIG00005042683 ##20 ENSOKIG00005042689 ##22 ENSOKIG00005042700 ##20 ENSOKIG00005042718 ##22 ENSOKIG00005042730 ##21 ENSOKIG00005042740 ##23 ENSOKIG00005042753 ##20 ENSOKIG00005042763 ENSOKIG00005042805 ENSOKIG00005043237 ##21 ENSOKIG00005043248 ENSOKIG00005043266 ##23 ENSOKIG00005043322 ##20 ENSOKIG00005043333 #21 ENSOKIG00005043341 ##21 ENSOKIG00005043349 ##22 ENSOKIG00005043369 ##21 ENSOKIG00005043464 ##20 ENSOKIG00005043491 ##20 Coho salmon MODERN SPECIES 647 ENSOKIG00005042143 ##22 ENSOKIG00005042160 ##22 ENSOKIG00005042180 ##20 ENSOKIG00005042206 ##20 ENSOKIG00005042227 ##21 Coho salmon MODERN SPECIES 647 ENSOKIG00005042143 ##22 ENSOKIG00005042160 ##22 ENSOKIG00005042180 ##20 ENSOKIG00005042206 ##20 ENSOKIG00005042227 ##21 Huchen MODERN SPECIES 4927 ENSHHUG00000039406 ENSHHUG00000039409 ##23 ENSHHUG00000039411 ##21 ENSHHUG00000039414 ENSHHUG00000039416 ##22 ENSHHUG00000039421 ##23 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163847.b.g.a.a.a.a.b ENSGT01020000230358.h.c.a.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b ##22 ENSGT01050000244936 ENSGT01020000230358.h.d.a.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.c.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234536.m ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a ##23 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.b.b ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.a ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.b.a ##20 ENSGT00940000163849.l.a.b.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.b.b.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.mb ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.a ENSGT01060000248704.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.k.a.a.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.c.a.a.b.b ##21 ENSGT00940000163847.b.g.b.a.b.b ENSGT01090000259993.B.c.c.a.a.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.c.a.a.a.b.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.a.a.b ##23 ENSGT00940000163847.b.g.a.b ENSGT01090000259993.B.c.c.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.k.a.b.a ##23 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT01030000234559.a.a.b.b ENSGT00940000159323.a ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.b.a ENSGT01030000234862.c ENSGT00940000155582.q.a ENSGT00390000009628 ENSGT00940000159428.e.b ENSGT00390000018541 ENSGT00390000010157.b ENSGT00940000160377.h.a ENSGT01100000263525.a.b.a.b.c ENSGT00390000005830 ENSGT00940000155904.u.b.a ENSGT01100000263566.a.b.b.a.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.mb ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.k.a.b ##21 ENSGT01090000259993.B.c.c.a.a.a.a ##21 ENSGT00940000163847.b.g.b.a.a ENSGT01020000230358.h.c.a.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b.d ##21 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT01030000234536.m ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.a.a.a.a ##21 ENSGT00940000163849.l.b.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b.b ##22 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b.c ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.b ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 355 ENSGT01100000263566.a.b.b.a.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.mb ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.b ##20 Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 22 ENSSSAG00000057854 ##20 ENSSSAG00000004153 ##20 ENSSSAG00000090150 ENSSSAG00000083867 ##23 ENSSSAG00000009076 ##23 ENSSSAG00000095529 ##22 ENSSSAG00000099337 ##20 ENSSSAG00000001727 ##23 ENSSSAG00000001726 ##23 ENSSSAG00000001717 ##21 ENSSSAG00000001711 ##20 ENSSSAG00000092937 ##21 ENSSSAG00000113318 ENSSSAG00000004118 ##21 ENSSSAG00000104021 ##21 ENSSSAG00000097348 ##22 ENSSSAG00000118260 ##20 ENSSSAG00000110816 ##23 ENSSSAG00000021712 ##22 ENSSSAG00000059727 ##21 ENSSSAG00000116386 ENSSSAG00000100108 ##20 ENSSSAG00000113932 ##23 ENSSSAG00000039225 ##23 ENSSSAG00000108066 ENSSSAG00000111874 ##21 ENSSSAG00000102129 ##21 ENSSSAG00000116817 ENSSSAG00000001652 ##23 ENSSSAG00000088496 ##21 ENSSSAG00000037543 ##21 Atlantic salmon MODERN SPECIES 22 ENSSSAG00000088076 ENSSSAG00000118935 ##21 ENSSSAG00000001740 ##22 ENSSSAG00000037543 ##21 ENSSSAG00000088496 ##21 ENSSSAG00000001652 ##23 ENSSSAG00000116817 ENSSSAG00000102129 ##21 ENSSSAG00000111874 ##21 ENSSSAG00000108066 ENSSSAG00000039225 ##23 ENSSSAG00000113932 ##23 ENSSSAG00000100108 ##20 ENSSSAG00000116386 ENSSSAG00000059727 ##21 ENSSSAG00000021712 ##22 ENSSSAG00000110816 ##23 ENSSSAG00000118260 ##20 ENSSSAG00000097348 ##22 ENSSSAG00000104021 ##21 ENSSSAG00000004118 ##21 ENSSSAG00000113318 ENSSSAG00000092937 ##21 ENSSSAG00000001711 ##20 ENSSSAG00000001717 ##21 ENSSSAG00000001726 ##23 ENSSSAG00000001727 ##23 ENSSSAG00000099337 ##20 ENSSSAG00000095529 ##22 ENSSSAG00000009076 ##23 ENSSSAG00000083867 ##23 Atlantic salmon MODERN SPECIES 629 ENSSSAG00000110267 #21 ENSSSAG00000083271 ENSSSAG00000111224 ##21 ENSSSAG00000039316 ##22 ENSSSAG00000109053 #24 ENSSSAG00000095844 ##21 ENSSSAG00000001749 ##20 ENSSSAG00000001745 ENSSSAG00000119166 ##23 ENSSSAG00000115613 ##22 ENSSSAG00000118709 Atlantic salmon MODERN SPECIES 628 ENSSSAG00000001720 ##21 ENSSSAG00000095029 ENSSSAG00000000633 ##22 ENSSSAG00000086632 #24 ENSSSAG00000037703 ##21 ENSSSAG00000085050 ##20 ENSSSAG00000097332 ##22 ENSSSAG00000088035 ##23 ENSSSAG00000013901 ##21 ENSSSAG00000098153 ENSSSAG00000099989 ENSSSAG00000114281 ##22 ENSSSAG00000104680 ##21 ENSSSAG00000106551 ##23 ENSSSAG00000116031 ENSSSAG00000122186 ##21 River trout MODERN SPECIES 25 clpp (ENSSTUG00000047748) aldh3b1 (ENSSTUG00000047768) ENSSTUG00000047821 ENSSTUG00000047827 ##21 ENSSTUG00000047831 ##23 ENSSTUG00000047835 ENSSTUG00000047839 ENSSTUG00000047844 ##21 ENSSTUG00000047846 ##21 ENSSTUG00000047854 ##23 ENSSTUG00000047863 ##23 ENSSTUG00000047867 ##21 ENSSTUG00000047869 ENSSTUG00000047875 ##20 ENSSTUG00000047888 ##21 ENSSTUG00000047896 ##22 ENSSTUG00000047901 ##23 ENSSTUG00000047908 ##20 ENSSTUG00000047913 ##21 ENSSTUG00000047916 ##23 ENSSTUG00000047923 ENSSTUG00000047924 ##21 ENSSTUG00000047927 ENSSTUG00000047930 ##23 ENSSTUG00000047932 ##21 ENSSTUG00000047935 ##20 ENSSTUG00000047940 ENSSTUG00000047946 ##23 ENSSTUG00000047948 ##21 ENSSTUG00000047957 ##21 ENSSTUG00000047959 Huchen MODERN SPECIES 7922 ENSHHUG00000021839 ##22 ENSHHUG00000021842 ##20 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155904.u.b ENSGT00940000155904.v ENSGT01090000259993.A.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.b.a.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.k.a ##21 ENSGT00940000163847.b.g.b.a.a ENSGT01090000259993.B.c.c.b.b.b.b.b.b.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.a.b ##23 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.a ##20 ENSGT01090000259993.A.b.k.b.a.b.a #21 ENSGT00940000163849.l.b.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.b.a.b.a #23 ENSGT00940000163847.b.g.a.a.a.a.b ENSGT01020000230358.h.c.a.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b ##22 ENSGT01050000244936 ENSGT01020000230358.h.d.a.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.c.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234536.m ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a ##23 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.b.b ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.a ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.b.a ##20 ENSGT00940000163849.l.a.b.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.b.b.a ##20 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000163849.l.a.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.k.a.b ##21 ENSGT01090000259993.B.c.c.a.a.a.a ##21 ENSGT00940000163847.b.g.b.a.a ENSGT01020000230358.h.c.a.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b.d ##21 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT01030000234536.m ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.a.a.a.a ##21 ENSGT00940000163849.l.b.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b.b ##22 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b.c ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.b.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.a.a.a.b.a #24 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.b.a.b.a #23 ENSGT00940000163849.l.b.b #22 ENSGT01090000259993.A.b.k.b.a.b.a #21 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.b.a.a #20 Salmo ANCESTRAL SPECIES 349 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b.b ##22 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b.c ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.b.a.b ##20 Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 22 ENSSSAG00000118260 ##20 ENSSSAG00000110816 ##23 ENSSSAG00000021712 ##22 ENSSSAG00000059727 ##21 ENSSSAG00000116386 ENSSSAG00000100108 ##20 ENSSSAG00000113932 ##23 ENSSSAG00000039225 ##23 ENSSSAG00000108066 ENSSSAG00000111874 ##21 ENSSSAG00000102129 ##21 ENSSSAG00000116817 ENSSSAG00000001652 ##23 ENSSSAG00000088496 ##21 ENSSSAG00000037543 ##21 ENSSSAG00000001740 ##22 ENSSSAG00000118935 ##21 ENSSSAG00000088076 ENSSSAG00000098375 ##21 ENSSSAG00000107377 ENSSSAG00000101183 #20 ENSSSAG00000090205 #21 ENSSSAG00000118029 ENSSSAG00000099035 ##21 ENSSSAG00000093345 ENSSSAG00000093483 ##23 ENSSSAG00000102503 ##21 ENSSSAG00000119599 ##20 ENSSSAG00000102844 ##22 ENSSSAG00000103641 ##21 ENSSSAG00000092148 ##22 Atlantic salmon MODERN SPECIES 22 aldh3b1 (ENSSSAG00000001628) ENSSSAG00000001641 ##21 ENSSSAG00000001637 ##22 ENSSSAG00000097604 ##21 ENSSSAG00000090208 ##20 ENSSSAG00000091185 #20 ENSSSAG00000115151 ENSSSAG00000084032 #21 ENSSSAG00000110833 ENSSSAG00000110168 ##21 ENSSSAG00000103806 ENSSSAG00000092083 ##23 ENSSSAG00000105196 ##21 ENSSSAG00000092148 ##22 ENSSSAG00000103641 ##21 ENSSSAG00000102844 ##22 ENSSSAG00000119599 ##20 ENSSSAG00000102503 ##21 ENSSSAG00000093483 ##23 ENSSSAG00000093345 ENSSSAG00000099035 ##21 ENSSSAG00000118029 ENSSSAG00000090205 #21 ENSSSAG00000101183 #20 ENSSSAG00000107377 ENSSSAG00000098375 ##21 ENSSSAG00000088076 ENSSSAG00000118935 ##21 ENSSSAG00000001740 ##22 ENSSSAG00000037543 ##21 ENSSSAG00000088496 ##21 River trout MODERN SPECIES ENSSTUG00000010325 ##21 ENSSTUG00000010337 ##23 ENSSTUG00000010341 ##23 ENSSTUG00000010347 ##21 ENSSTUG00000010355 ##23 ENSSTUG00000010360 ##21 ENSSTUG00000010372 ENSSTUG00000010381 ##20 ENSSTUG00000010398 ##21 ENSSTUG00000010403 ##21 ENSSTUG00000010408 ENSSTUG00000010418 ##23 ENSSTUG00000010423 ENSSTUG00000010424 ENSSTUG00000010428 ##22 ENSSTUG00000010438 ##22 ENSSTUG00000010439 ##20 ENSSTUG00000010446 ENSSTUG00000010529 ##22 ENSSTUG00000010532 ENSSTUG00000010534 ENSSTUG00000010544 ENSSTUG00000010548 ENSSTUG00000010552 ENSSTUG00000010557 ENSSTUG00000010561 ENSSTUG00000010566 ENSSTUG00000010570 ENSSTUG00000010574 ENSSTUG00000010581 ENSSTUG00000010590 Huchen MODERN SPECIES 5427 ENSHHUG00000004262 ##23 ENSHHUG00000004255 ##20 ENSHHUG00000004229 ##20 ENSHHUG00000004221 ##22 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1224 ENSGT00940000163849.l.a.b.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.b.b.a.b.a ##20 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.a.a.a ##23 ENSGT01100000263566.a.a.b.b.a.b.b ##20 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 737 ENSGT00940000163849.l.a.b.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.b.b.a.b.a ##20 Salmo ANCESTRAL SPECIES 626 ENSGT00940000163849.l.a.b.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.b.b.a.b.a ##20 Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 25 aldh3b1 (ENSSSAG00000039535) clpp (ENSSSAG00000084560) ENSSSAG00000039502 ##23 ENSSSAG00000039473 ##23 ENSSSAG00000039462 ##21 ENSSSAG00000039445 ##23 ENSSSAG00000104553 ##23 ENSSSAG00000111626 ENSSSAG00000086407 ENSSSAG00000107858 ##20 ENSSSAG00000098225 ENSSSAG00000109549 ##21 ENSSSAG00000113735 ##22 ENSSSAG00000115189 ##23 ENSSSAG00000094941 ENSSSAG00000097071 ##22 ENSSSAG00000098737 ##20 ENSSSAG00000103820 ENSSSAG00000054474 ENSSSAG00000092216 ENSSSAG00000098811 ##23 ENSSSAG00000015385 ##21 ENSSSAG00000102924 ENSSSAG00000099009 ##21 ENSSSAG00000109500 ENSSSAG00000106400 ENSSSAG00000102788 ##21 ENSSSAG00000054478 ##21 ENSSSAG00000115981 ##21 ENSSSAG00000120131 ##21 ENSSSAG00000037275 ##22 Atlantic salmon MODERN SPECIES 327 ENSSSAG00000106744 ##21 ENSSSAG00000083061 ##21 ENSSSAG00000112422 ##20 ENSSSAG00000098025 ##21 ENSSSAG00000001657 ##23 ENSSSAG00000106172 ENSSSAG00000120221 ##20 ENSSSAG00000039013 ENSSSAG00000090476 ##21 ENSSSAG00000087371 ENSSSAG00000113696 ##22 ENSSSAG00000106481 ##21 ENSSSAG00000057858 Atlantic salmon MODERN SPECIES 25 ENSSSAG00000107979 ENSSSAG00000110388 ENSSSAG00000115653 ENSSSAG00000114615 ENSSSAG00000113381 ENSSSAG00000110944 ENSSSAG00000085804 ENSSSAG00000116051 ENSSSAG00000085846 ENSSSAG00000083940 ENSSSAG00000048830 ENSSSAG00000108875 ENSSSAG00000105128 ENSSSAG00000048900 ##22 ENSSSAG00000085402 ##23 ENSSSAG00000037275 ##22 ENSSSAG00000120131 ##21 ENSSSAG00000115981 ##21 ENSSSAG00000054478 ##21 ENSSSAG00000102788 ##21 ENSSSAG00000106400 ENSSSAG00000109500 ENSSSAG00000099009 ##21 ENSSSAG00000102924 ENSSSAG00000015385 ##21 ENSSSAG00000098811 ##23 ENSSSAG00000092216 ENSSSAG00000054474 ENSSSAG00000103820 ENSSSAG00000098737 ##20 ENSSSAG00000097071 ##22 River trout MODERN SPECIES ENSSTUG00000010604 ENSSTUG00000010598 ENSSTUG00000010591 ENSSTUG00000010590 ENSSTUG00000010581 ENSSTUG00000010574 ENSSTUG00000010570 ENSSTUG00000010566 ENSSTUG00000010561 ENSSTUG00000010557 ENSSTUG00000010552 ENSSTUG00000010548 ENSSTUG00000010544 ENSSTUG00000010534 ENSSTUG00000010532 ENSSTUG00000010529 ##22 ENSSTUG00000010446 ENSSTUG00000010439 ##20 ENSSTUG00000010438 ##22 ENSSTUG00000010428 ##22 ENSSTUG00000010424 ENSSTUG00000010423 ENSSTUG00000010418 ##23 ENSSTUG00000010408 ENSSTUG00000010403 ##21 ENSSTUG00000010398 ##21 ENSSTUG00000010381 ##20 ENSSTUG00000010372 ENSSTUG00000010360 ##21 ENSSTUG00000010355 ##23 ENSSTUG00000010347 ##21 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 1547 ENSHHUG00000036140 ENSHHUG00000036148 ENSHHUG00000036151 ##23 ENSHHUG00000036152 ##21 ENSHHUG00000036157 ##21 ENSHHUG00000036162 ##21 ENSHHUG00000036165 #21 ENSHHUG00000036170 ##21 ENSHHUG00000036173 ENSHHUG00000036180 ENSHHUG00000036181 ##22 kdelr2a (ENSHHUG00000036183) ENSHHUG00000036218 ENSHHUG00000036219 ENSHHUG00000036225 ENSHHUG00000036226 ENSHHUG00000036230 ENSHHUG00000036234 ENSHHUG00000036239 NACC1 (ENSHHUG00000036242) ier2a (ENSHHUG00000036246) ENSHHUG00000036249 ENSHHUG00000036300 Huchen MODERN SPECIES 2903 ENSHHUG00000039074 ENSHHUG00000039070 ENSHHUG00000039069 ENSHHUG00000039068 ENSHHUG00000039066 ENSHHUG00000038976 ##22 ENSHHUG00000038973 ENSHHUG00000038969 NACC1 (ENSHHUG00000038966) ier2a (ENSHHUG00000038960) ENSHHUG00000038940 ENSHHUG00000038930 ENSHHUG00000038936 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.b ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.l.b.a.b.b ##22 ENSGT01050000244936 ENSGT01020000230358.h.d.a.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.c.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234536.m ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a ##23 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.b.b ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.a ##21 ENSGT00940000163849.l.a.a.a ##22 ENSGT01100000263566.a.a.b.a ##20 ENSGT00940000163849.l.a.b.a.b ##22 ENSGT01100000263566.a.b.b.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.mb ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.a ENSGT01060000248704.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.k.a.a.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.c.a.a.b.b ##21 ENSGT00940000163847.b.g.b.a.b.b ENSGT01090000259993.B.c.c.a.a.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.c.a.a.a.b.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.a.a.f.a.a.b ##23 ENSGT00940000163847.b.g.a.b ENSGT01090000259993.B.c.c.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.k.a.b.a ##23 ENSGT00940000163847.b.g.b.b.a.a ENSGT01090000259993.A.b.k.b.a.b.b ##21 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 325 ENSGT01100000263566.a.a.b.a ##20 ENSGT00940000163849.l.a.b.a.b ##22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.k.a.b.b ##23 ENSGT01100000263566.a.a.b.b.a.a.a.b ##20 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT01030000234794.q ENSGT00940000163849.l.a.b.a.b ##22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.k.a.b.b ##23 ENSGT01100000263566.a.a.b.b.a.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.B.c.c.b.b.a.b.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.a.b.b.b ##23 ENSGT01030000234536.n ENSGT00940000161491 ENSGT00940000178126.f.a.c ENSGT01040000240716.A.c.a.b ENSGT00940000159327.u.a.f ENSGT01100000263659.h ENSGT00940000156518.B.f.b.a.a ENSGT00390000014585.f ENSGT00390000004681.a.b.g.a ENSGT00980000202616 Oncorhynchus_a DUPLICATION Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 139 ENSGT01030000234862.c.a.a ENSGT00940000155582.q.a.d ENSGT00390000009628.u ENSGT00940000159428.e.b.g ENSGT00390000018541.h ENSGT00390000010157.b.f ENSGT00940000160377.h.a ENSGT01100000263525.a.b.a.b.c.a ENSGT00390000005830.j.b ENSGT00940000155904.u.b.b ENSGT01020000230358.g.b.a.a ##23 ENSGT01090000260177.e ENSGT00970000196910 ENSGT01030000234901.k.b.a.a ENSGT01040000240716.A.d.b ENSGT00940000163849.l.a.b.a.b.a ##22 Coho salmon MODERN SPECIES 26 ENSOKIG00005037671 ##22 ENSOKIG00005037683 ##20 ENSOKIG00005037699 ##21 ENSOKIG00005037705 ##23 ENSOKIG00005037716 ##23 ENSOKIG00005037733 ##21 ENSOKIG00005037742 ##23 ENSOKIG00005037752 ##21 ENSOKIG00005037767 ENSOKIG00005037786 ##23 ENSOKIG00005037793 ##23 ENSOKIG00005037797 ENSOKIG00005037805 ENSOKIG00005037813 ENSOKIG00005037818 ENSOKIG00005037825 ##22 ENSOKIG00005037847 ENSOKIG00005037972 ##23 ENSOKIG00005037975 ##23 ENSOKIG00005037985 ##23 IGHV6-1 (ENSOKIG00005037996) ENSOKIG00005038002 ENSOKIG00005038007 ##21 ENSOKIG00005038011 ##23 ENSOKIG00005038019 ##23 ENSOKIG00005038024 ##20 ENSOKIG00005038029 ##21 ENSOKIG00005038034 ENSOKIG00005038040 ENSOKIG00005038062 ENSOKIG00005038081 Chinook salmon MODERN SPECIES 19 gspt1l (ENSOTSG00005005669) pdxdc1 (ENSOTSG00005010287) slc25a23b (ENSOTSG00005013980) timm29 (ENSOTSG00005014058) yipf2 (ENSOTSG00005014060) carm1 (ENSOTSG00005014064) ENSOTSG00005014065 clpp (ENSOTSG00005014067) aldh3b1 (ENSOTSG00005014070) ENSOTSG00005014115 ##21 ENSOTSG00005014116 ##23 ENSOTSG00005014118 ENSOTSG00005014119 ENSOTSG00005014120 ENSOTSG00005014121 ENSOTSG00005014122 ##22 ENSOTSG00005014123 ##20 ENSOTSG00005014124 ##21 ENSOTSG00005014126 ##23 ENSOTSG00005014127 ##23 ENSOTSG00005014129 ENSOTSG00005014130 ##21 ENSOTSG00005014131 ENSOTSG00005014132 ##23 ENSOTSG00005014133 ENSOTSG00005014134 ##23 ENSOTSG00005014135 ##21 ENSOTSG00005014136 ##20 ENSOTSG00005035819 ENSOTSG00005035848 ENSOTSG00005035872 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00940000163849.l.a.b.a.b.b ##22 ENSGT01100000263566.a.b.b.a.b.a ##20 ENSGT01090000259993.B.c.c.b.b.a.b.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.k.a.b.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.a.b.b.b.c ##23 ENSGT01030000234536.n ENSGT00940000161491.`b.b ENSGT01020000230358.h.d.a.b.b.b.d ##23 ENSGT01030000234536.m ENSGT01020000230358.h.d.b.b.l.a.a ##23 ENSGT01100000263566.a.b.b.b.b.b ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d.lb.a.a.a.b ##21 ENSGT01040000240716.A.d.a ENSGT00940000159327.u.a.e ENSGT01100000263659.g Coho salmon MODERN SPECIES 26 ENSOKIG00005030728 ENSOKIG00005030741 ENSOKIG00005030753 gspt1l (ENSOKIG00005030890) pdxdc1 (ENSOKIG00005033016) slc25a23b (ENSOKIG00005034471) timm29 (ENSOKIG00005034783) yipf2 (ENSOKIG00005034818) carm1 (ENSOKIG00005034948) ENSOKIG00005036922 clpp (ENSOKIG00005036933) aldh3b1 (ENSOKIG00005036990) ENSOKIG00005037162 ENSOKIG00005037324 ##21 ENSOKIG00005037651 ##23 ENSOKIG00005037671 ##22 ENSOKIG00005037683 ##20 ENSOKIG00005037699 ##21 ENSOKIG00005037705 ##23 ENSOKIG00005037716 ##23 ENSOKIG00005037733 ##21 ENSOKIG00005037742 ##23 ENSOKIG00005037752 ##21 ENSOKIG00005037767 ENSOKIG00005037786 ##23 ENSOKIG00005037793 ##23 ENSOKIG00005037797 ENSOKIG00005037805 ENSOKIG00005037813 ENSOKIG00005037818 ENSOKIG00005037825 ##22 Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 3 ENSOMYG00000056888 ENSOMYG00000054746 ENSOMYG00000076132 ENSOMYG00000073118 ##22 ENSOMYG00000070941 ##23 ENSOMYG00000073472 ##20 ENSOMYG00000071337 ENSOMYG00000074756 ##23 ENSOMYG00000048058 ENSOMYG00000052029 ENSOMYG00000074545 ENSOMYG00000014232 ##23 ENSOMYG00000014239 ##23 ENSOMYG00000062178 ##21 ENSOMYG00000050876 ENSOMYG00000059042 ##22 ENSOMYG00000055462 ##23 ENSOMYG00000057902 ##20 ENSOMYG00000076787 ##20 ENSOMYG00000064333 ##21 ENSOMYG00000064893 ##23 ENSOMYG00000065056 ENSOMYG00000075238 ENSOMYG00000014273 ##20 ENSOMYG00000060028 ##20 ENSOMYG00000014296 ##20 ENSOMYG00000072593 ##21 ENSOMYG00000050753 ##23 ENSOMYG00000063204 ENSOMYG00000058695 ENSOMYG00000076784 ##21 Rainbow trout MODERN SPECIES 3 clpp (ENSOMYG00000013742) aldh3b1 (ENSOMYG00000013794) ENSOMYG00000071305 ENSOMYG00000049163 ENSOMYG00000064461 ##23 ENSOMYG00000014091 ##20 ENSOMYG00000055629 ##23 ENSOMYG00000059183 ENSOMYG00000077573 ENSOMYG00000076457 ENSOMYG00000069670 ##21 ENSOMYG00000054059 ENSOMYG00000056888 ENSOMYG00000054746 ENSOMYG00000076132 ENSOMYG00000073118 ##22 ENSOMYG00000070941 ##23 ENSOMYG00000073472 ##20 ENSOMYG00000071337 ENSOMYG00000074756 ##23 ENSOMYG00000048058 ENSOMYG00000052029 ENSOMYG00000074545 ENSOMYG00000014232 ##23 ENSOMYG00000014239 ##23 ENSOMYG00000062178 ##21 ENSOMYG00000050876 ENSOMYG00000059042 ##22 ENSOMYG00000055462 ##23 ENSOMYG00000057902 ##20 ENSOMYG00000076787 ##20 Salmo ANCESTRAL SPECIES 622 ENSGT01100000263566.a.a.b.a ##20 ENSGT00940000163849.l.a.b.a.b ##22 River trout MODERN SPECIES 25 ENSSTUG00000047981 #22 ENSSTUG00000047988 #23 ENSSTUG00000047991 #24 ENSSTUG00000047994 ##23 ENSSTUG00000047998 ##23 ENSSTUG00000048001 ##20 ENSSTUG00000048002 ##20 yipf2 (ENSSTUG00000048008) carm1 (ENSSTUG00000048044) ENSSTUG00000048235 ##21 ENSSTUG00000048238 ##23 ENSSTUG00000048242 ##20 ENSSTUG00000048248 ENSSTUG00000048252 ##20 ENSSTUG00000048258 ENSSTUG00000048259 ##22 ENSSTUG00000048260 ##21 ENSSTUG00000048263 ENSSTUG00000048265 ##23 ENSSTUG00000048267 ENSSTUG00000048272 ENSSTUG00000048273 ENSSTUG00000048275 ENSSTUG00000016207 ENSSTUG00000016211 ENSSTUG00000016218 ENSSTUG00000016221 ENSSTUG00000016223 ENSSTUG00000016225 ENSSTUG00000016227 ENSSTUG00000016229 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 5407 ENSHHUG00000003302 ENSHHUG00000003327 ENSHHUG00000003334 ##22 ENSHHUG00000003342 ##21 Huchen MODERN SPECIES 5315 ENSHHUG00000028694 ##21 ENSHHUG00000028707 ##23 ENSHHUG00000028709 ENSHHUG00000028710 ##22 ENSHHUG00000028712 ##23 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1911 ENSGT01030000234794.p.b ENSGT00940000163849.l.a.b.b ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 796 ENSGT01030000234794.p.b ENSGT00940000163849.l.a.b.b ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 666 ENSGT01030000234794.p.b ENSGT00940000163849.l.a.b.b ##22 Atlantic salmon MODERN SPECIES 25 ENSSSAG00000113047 ENSSSAG00000082637 ENSSSAG00000107979 ENSSSAG00000110388 ENSSSAG00000115653 ENSSSAG00000114615 ENSSSAG00000113381 ENSSSAG00000110944 ENSSSAG00000085804 ENSSSAG00000116051 ENSSSAG00000085846 ENSSSAG00000083940 ENSSSAG00000048830 ENSSSAG00000108875 ENSSSAG00000105128 ENSSSAG00000048900 ##22 ENSSSAG00000085402 ##23 ENSSSAG00000037275 ##22 ENSSSAG00000120131 ##21 ENSSSAG00000115981 ##21 ENSSSAG00000054478 ##21 ENSSSAG00000102788 ##21 ENSSSAG00000106400 ENSSSAG00000109500 ENSSSAG00000099009 ##21 ENSSSAG00000102924 ENSSSAG00000015385 ##21 ENSSSAG00000098811 ##23 ENSSSAG00000092216 ENSSSAG00000054474 ENSSSAG00000103820 River trout MODERN SPECIES ENSSTUG00000010318 ENSSTUG00000010325 ##21 ENSSTUG00000010337 ##23 ENSSTUG00000010341 ##23 ENSSTUG00000010347 ##21 ENSSTUG00000010355 ##23 ENSSTUG00000010360 ##21 ENSSTUG00000010372 ENSSTUG00000010381 ##20 ENSSTUG00000010398 ##21 ENSSTUG00000010403 ##21 ENSSTUG00000010408 ENSSTUG00000010418 ##23 ENSSTUG00000010423 ENSSTUG00000010424 ENSSTUG00000010428 ##22 ENSSTUG00000010438 ##22 ENSSTUG00000010439 ##20 ENSSTUG00000010446 ENSSTUG00000010529 ##22 ENSSTUG00000010532 ENSSTUG00000010534 ENSSTUG00000010544 ENSSTUG00000010548 ENSSTUG00000010552 ENSSTUG00000010557 ENSSTUG00000010561 ENSSTUG00000010566 ENSSTUG00000010570 ENSSTUG00000010574 ENSSTUG00000010581 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.k ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.k ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.k ##22 Atlantic salmon MODERN SPECIES 22 ENSSSAG00000103706 ENSSSAG00000001493 ENSSSAG00000106619 ENSSSAG00000115740 ENSSSAG00000088029 ENSSSAG00000118330 ENSSSAG00000087065 yipf2 (ENSSSAG00000096358) timm29 (ENSSSAG00000001091) carm1 (ENSSSAG00000121914) ENSSSAG00000107495 clpp (ENSSSAG00000001612) ENSSSAG00000092350 aldh3b1 (ENSSSAG00000001628) ENSSSAG00000001641 ##21 ENSSSAG00000001637 ##22 ENSSSAG00000097604 ##21 ENSSSAG00000090208 ##20 ENSSSAG00000091185 #20 ENSSSAG00000115151 ENSSSAG00000084032 #21 ENSSSAG00000110833 ENSSSAG00000110168 ##21 ENSSSAG00000103806 ENSSSAG00000092083 ##23 ENSSSAG00000105196 ##21 ENSSSAG00000092148 ##22 ENSSSAG00000103641 ##21 ENSSSAG00000102844 ##22 ENSSSAG00000119599 ##20 ENSSSAG00000102503 ##21 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 241 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a ##21 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536 ENSGT01090000259993.A.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849 #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01060000248704 ENSGT00940000161491 ENSGT00940000163371.b ENSGT00970000196910 ENSGT01030000234901 Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a ##21 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b ENSGT01090000259993.A.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00940000163849.i.b #22 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01060000248704 ENSGT00940000161491 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000177284 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a ##23 ENSGT01100000263566.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536 ENSGT00940000163849.i.b #22 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01060000248704 ENSGT00940000161491 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000177284 Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT01030000234794 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.a #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 158 ENSGT01030000234794 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.a #22 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.a.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.a ##21 ENSGT01100000263566.b.b.b.b ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.a #22 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000161491 ENSGT01030000234901 ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000177484 ENSGT00940000163334.d.s.b Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 120 ENSGT01030000234794 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.a #22 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000025241 ENSMAMG00000027298 ##23 ENSMAMG00000028162 ##21 ENSMAMG00000027313 ENSMAMG00000023799 ENSMAMG00000023797 ENSMAMG00000028646 #22 ENSMAMG00000026602 ENSMAMG00000027900 ##21 ENSMAMG00000025388 ENSMAMG00000024452 ##21 ENSMAMG00000025148 ##23 ENSMAMG00000027798 ENSMAMG00000024999 ENSMAMG00000024783 ##21 ENSMAMG00000024487 #22 ENSMAMG00000023778 ENSMAMG00000023776 ##23 ENSMAMG00000027386 ##21 ENSMAMG00000027930 ENSMAMG00000026588 #22 ENSMAMG00000025240 ENSMAMG00000027087 #22 ENSMAMG00000023768 ENSMAMG00000023763 ENSMAMG00000023760 ENSMAMG00000023758 ENSMAMG00000023757 ENSMAMG00000023755 ENSMAMG00000023752 ENSMAMG00000023750 Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000026032 ##21 ENSMAMG00000024433 ##21 ENSMAMG00000025219 ENSMAMG00000027269 ##21 ENSMAMG00000028471 ##21 ENSMAMG00000000434 ENSMAMG00000027320 ENSMAMG00000024600 ##21 ENSMAMG00000024933 ENSMAMG00000026579 ##21 ENSMAMG00000025910 ##23 ENSMAMG00000024984 ENSMAMG00000028261 ENSMAMG00000026819 ##21 ENSMAMG00000028319 ##21 ENSMAMG00000028601 #22 ENSMAMG00000023887 ##21 ENSMAMG00000024945 ENSMAMG00000000746 #22 ENSMAMG00000027077 ENSMAMG00000026899 #22 ENSMAMG00000027508 ##21 ENSMAMG00000027036 ENSMAMG00000026010 #22 ENSMAMG00000023895 ##23 ENSMAMG00000027815 #22 ENSMAMG00000028177 ENSMAMG00000026986 ##21 ENSMAMG00000027133 #22 ENSMAMG00000023813 ENSMAMG00000024778 ##23 Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000000434 ENSMAMG00000027320 ENSMAMG00000024600 ##21 ENSMAMG00000024933 ENSMAMG00000026579 ##21 ENSMAMG00000025910 ##23 ENSMAMG00000024984 ENSMAMG00000028261 ENSMAMG00000026819 ##21 ENSMAMG00000028319 ##21 ENSMAMG00000028601 #22 ENSMAMG00000023887 ##21 ENSMAMG00000024945 ENSMAMG00000000746 #22 ENSMAMG00000027077 ENSMAMG00000026899 #22 ENSMAMG00000027508 ##21 ENSMAMG00000027036 ENSMAMG00000026010 #22 ENSMAMG00000023895 ##23 ENSMAMG00000027815 #22 ENSMAMG00000028177 ENSMAMG00000026986 ##21 ENSMAMG00000027133 #22 ENSMAMG00000023813 ENSMAMG00000024778 ##23 ENSMAMG00000025545 ENSMAMG00000023888 #22 ENSMAMG00000000406 ENSMAMG00000025580 ##21 ENSMAMG00000028529 ##23 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000024933 ENSMAMG00000026579 ##21 ENSMAMG00000025910 ##23 ENSMAMG00000024984 ENSMAMG00000028261 ENSMAMG00000026819 ##21 ENSMAMG00000028319 ##21 ENSMAMG00000028601 #22 ENSMAMG00000023887 ##21 ENSMAMG00000024945 ENSMAMG00000000746 #22 ENSMAMG00000027077 ENSMAMG00000026899 #22 ENSMAMG00000027508 ##21 ENSMAMG00000027036 ENSMAMG00000026010 #22 ENSMAMG00000023895 ##23 ENSMAMG00000027815 #22 ENSMAMG00000028177 ENSMAMG00000026986 ##21 ENSMAMG00000027133 #22 ENSMAMG00000023813 ENSMAMG00000024778 ##23 ENSMAMG00000025545 ENSMAMG00000023888 #22 ENSMAMG00000000406 ENSMAMG00000025580 ##21 ENSMAMG00000028529 ##23 ENSMAMG00000025108 ENSMAMG00000026321 ENSMAMG00000025918 ##21 Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000026711 ##23 ENSMAMG00000028283 ENSMAMG00000024549 ##21 ENSMAMG00000028650 #22 ENSMAMG00000026392 ENSMAMG00000023808 ENSMAMG00000023807 #22 ENSMAMG00000026749 ENSMAMG00000027228 ##23 ENSMAMG00000025241 ENSMAMG00000027298 ##23 ENSMAMG00000028162 ##21 ENSMAMG00000027313 ENSMAMG00000023799 ENSMAMG00000023797 ENSMAMG00000028646 #22 ENSMAMG00000026602 ENSMAMG00000027900 ##21 ENSMAMG00000025388 ENSMAMG00000024452 ##21 ENSMAMG00000025148 ##23 ENSMAMG00000027798 ENSMAMG00000024999 ENSMAMG00000024783 ##21 ENSMAMG00000024487 #22 ENSMAMG00000023778 ENSMAMG00000023776 ##23 ENSMAMG00000027386 ##21 ENSMAMG00000027930 ENSMAMG00000026588 #22 ENSMAMG00000025240 Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000000529 ##23 ENSMAMG00000028401 #22 ENSMAMG00000026254 ENSMAMG00000023820 ##23 ENSMAMG00000023818 #22 ENSMAMG00000024358 ENSMAMG00000025038 ##23 ENSMAMG00000024354 ##21 ENSMAMG00000000582 ENSMAMG00000026711 ##23 ENSMAMG00000028283 ENSMAMG00000024549 ##21 ENSMAMG00000028650 #22 ENSMAMG00000026392 ENSMAMG00000023808 ENSMAMG00000023807 #22 ENSMAMG00000026749 ENSMAMG00000027228 ##23 ENSMAMG00000025241 ENSMAMG00000027298 ##23 ENSMAMG00000028162 ##21 ENSMAMG00000027313 ENSMAMG00000023799 ENSMAMG00000023797 ENSMAMG00000028646 #22 ENSMAMG00000026602 ENSMAMG00000027900 ##21 ENSMAMG00000025388 ENSMAMG00000024452 ##21 ENSMAMG00000025148 ##23 ENSMAMG00000027798 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000023797 ENSMAMG00000028646 #22 ENSMAMG00000026602 ENSMAMG00000027900 ##21 ENSMAMG00000025388 ENSMAMG00000024452 ##21 ENSMAMG00000025148 ##23 ENSMAMG00000027798 ENSMAMG00000024999 ENSMAMG00000024783 ##21 ENSMAMG00000024487 #22 ENSMAMG00000023778 ENSMAMG00000023776 ##23 ENSMAMG00000027386 ##21 ENSMAMG00000027930 ENSMAMG00000026588 #22 ENSMAMG00000025240 ENSMAMG00000027087 #22 ENSMAMG00000023768 ENSMAMG00000023763 ENSMAMG00000023760 ENSMAMG00000023758 ENSMAMG00000023757 ENSMAMG00000023755 ENSMAMG00000023752 ENSMAMG00000023750 ENSMAMG00000023748 ENSMAMG00000028200 ENSMAMG00000004362 ENSMAMG00000024449 alkbh7 (ENSMAMG00000023732) Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000025822 ##21 ENSMAMG00000025036 ##21 ENSMAMG00000000836 ##21 ENSMAMG00000023804 ##21 ENSMAMG00000023837 ENSMAMG00000023889 ENSMAMG00000023835 ##23 ENSMAMG00000023832 ENSMAMG00000023829 ENSMAMG00000028322 ##23 ENSMAMG00000026629 ##21 ENSMAMG00000025173 ENSMAMG00000023824 ##23 ENSMAMG00000023823 ENSMAMG00000000529 ##23 ENSMAMG00000028401 #22 ENSMAMG00000026254 ENSMAMG00000023820 ##23 ENSMAMG00000023818 #22 ENSMAMG00000024358 ENSMAMG00000025038 ##23 ENSMAMG00000024354 ##21 ENSMAMG00000000582 ENSMAMG00000026711 ##23 ENSMAMG00000028283 ENSMAMG00000024549 ##21 ENSMAMG00000028650 #22 ENSMAMG00000026392 ENSMAMG00000023808 ENSMAMG00000023807 #22 ENSMAMG00000026749 Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000001089 #21 ENSMAMG00000026259 ENSMAMG00000025082 ENSMAMG00000000451 ENSMAMG00000028434 ENSMAMG00000001036 ##23 ENSMAMG00000000560 ##21 ENSMAMG00000028285 ENSMAMG00000000956 ##23 ENSMAMG00000028142 ##21 ENSMAMG00000026841 ENSMAMG00000024978 ENSMAMG00000026982 ##21 ENSMAMG00000028392 #22 ENSMAMG00000026436 ENSMAMG00000028692 #22 ENSMAMG00000028305 ##21 ENSMAMG00000024355 ENSMAMG00000000717 ##23 ENSMAMG00000024507 #22 ENSMAMG00000024965 ##21 ENSMAMG00000000650 ##21 ENSMAMG00000028585 ENSMAMG00000027080 ##21 ENSMAMG00000026032 ##21 ENSMAMG00000024433 ##21 ENSMAMG00000025219 ENSMAMG00000027269 ##21 ENSMAMG00000028471 ##21 ENSMAMG00000000434 ENSMAMG00000027320 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000025173 ENSMAMG00000023824 ##23 ENSMAMG00000023823 ENSMAMG00000000529 ##23 ENSMAMG00000028401 #22 ENSMAMG00000026254 ENSMAMG00000023820 ##23 ENSMAMG00000023818 #22 ENSMAMG00000024358 ENSMAMG00000025038 ##23 ENSMAMG00000024354 ##21 ENSMAMG00000000582 ENSMAMG00000026711 ##23 ENSMAMG00000028283 ENSMAMG00000024549 ##21 ENSMAMG00000028650 #22 ENSMAMG00000026392 ENSMAMG00000023808 ENSMAMG00000023807 #22 ENSMAMG00000026749 ENSMAMG00000027228 ##23 ENSMAMG00000025241 ENSMAMG00000027298 ##23 ENSMAMG00000028162 ##21 ENSMAMG00000027313 ENSMAMG00000023799 ENSMAMG00000023797 ENSMAMG00000028646 #22 ENSMAMG00000026602 ENSMAMG00000027900 ##21 ENSMAMG00000025388 Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000026819 ##21 ENSMAMG00000028319 ##21 ENSMAMG00000028601 #22 ENSMAMG00000023887 ##21 ENSMAMG00000024945 ENSMAMG00000000746 #22 ENSMAMG00000027077 ENSMAMG00000026899 #22 ENSMAMG00000027508 ##21 ENSMAMG00000027036 ENSMAMG00000026010 #22 ENSMAMG00000023895 ##23 ENSMAMG00000027815 #22 ENSMAMG00000028177 ENSMAMG00000026986 ##21 ENSMAMG00000027133 #22 ENSMAMG00000023813 ENSMAMG00000024778 ##23 ENSMAMG00000025545 ENSMAMG00000023888 #22 ENSMAMG00000000406 ENSMAMG00000025580 ##21 ENSMAMG00000028529 ##23 ENSMAMG00000025108 ENSMAMG00000026321 ENSMAMG00000025918 ##21 ENSMAMG00000025759 ENSMAMG00000025822 ##21 ENSMAMG00000025036 ##21 ENSMAMG00000000836 ##21 ENSMAMG00000023804 ##21 Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000026602 ENSMAMG00000027900 ##21 ENSMAMG00000025388 ENSMAMG00000024452 ##21 ENSMAMG00000025148 ##23 ENSMAMG00000027798 ENSMAMG00000024999 ENSMAMG00000024783 ##21 ENSMAMG00000024487 #22 ENSMAMG00000023778 ENSMAMG00000023776 ##23 ENSMAMG00000027386 ##21 ENSMAMG00000027930 ENSMAMG00000026588 #22 ENSMAMG00000025240 ENSMAMG00000027087 #22 ENSMAMG00000023768 ENSMAMG00000023763 ENSMAMG00000023760 ENSMAMG00000023758 ENSMAMG00000023757 ENSMAMG00000023755 ENSMAMG00000023752 ENSMAMG00000023750 ENSMAMG00000023748 ENSMAMG00000028200 ENSMAMG00000004362 ENSMAMG00000024449 alkbh7 (ENSMAMG00000023732) gtf2f1 (ENSMAMG00000023728) ENSMAMG00000023724 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.b #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.b #22 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.b #22 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.b #22 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000024945 ENSMAMG00000000746 #22 ENSMAMG00000027077 ENSMAMG00000026899 #22 ENSMAMG00000027508 ##21 ENSMAMG00000027036 ENSMAMG00000026010 #22 ENSMAMG00000023895 ##23 ENSMAMG00000027815 #22 ENSMAMG00000028177 ENSMAMG00000026986 ##21 ENSMAMG00000027133 #22 ENSMAMG00000023813 ENSMAMG00000024778 ##23 ENSMAMG00000025545 ENSMAMG00000023888 #22 ENSMAMG00000000406 ENSMAMG00000025580 ##21 ENSMAMG00000028529 ##23 ENSMAMG00000025108 ENSMAMG00000026321 ENSMAMG00000025918 ##21 ENSMAMG00000025759 ENSMAMG00000025822 ##21 ENSMAMG00000025036 ##21 ENSMAMG00000000836 ##21 ENSMAMG00000023804 ##21 ENSMAMG00000023837 ENSMAMG00000023889 ENSMAMG00000023835 ##23 ENSMAMG00000023832 Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000027269 ##21 ENSMAMG00000028471 ##21 ENSMAMG00000000434 ENSMAMG00000027320 ENSMAMG00000024600 ##21 ENSMAMG00000024933 ENSMAMG00000026579 ##21 ENSMAMG00000025910 ##23 ENSMAMG00000024984 ENSMAMG00000028261 ENSMAMG00000026819 ##21 ENSMAMG00000028319 ##21 ENSMAMG00000028601 #22 ENSMAMG00000023887 ##21 ENSMAMG00000024945 ENSMAMG00000000746 #22 ENSMAMG00000027077 ENSMAMG00000026899 #22 ENSMAMG00000027508 ##21 ENSMAMG00000027036 ENSMAMG00000026010 #22 ENSMAMG00000023895 ##23 ENSMAMG00000027815 #22 ENSMAMG00000028177 ENSMAMG00000026986 ##21 ENSMAMG00000027133 #22 ENSMAMG00000023813 ENSMAMG00000024778 ##23 ENSMAMG00000025545 ENSMAMG00000023888 #22 ENSMAMG00000000406 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.b #22 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.b #22 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.b #22 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.b #22 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.b #22 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.b #22 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.b #22 Sailfin molly MODERN SPECIES 1435 ENSPLAG00000011248 ##23 ENSPLAG00000011233 ENSPLAG00000011217 ENSPLAG00000011204 #21 ENSPLAG00000011199 #21 ENSPLAG00000011185 ##23 ENSPLAG00000011177 #21 ENSPLAG00000011170 ENSPLAG00000011154 ##23 ENSPLAG00000011104 ENSPLAG00000011092 #22 ENSPLAG00000011082 ##23 ENSPLAG00000011071 ENSPLAG00000011056 #22 ENSPLAG00000011052 ##23 ENSPLAG00000011045 #22 ENSPLAG00000011032 #22 ENSPLAG00000011013 ##21 ENSPLAG00000011009 ##21 ENSPLAG00000010992 ENSPLAG00000010988 #21 ENSPLAG00000010974 #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT01000000219961 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000161676 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j #21 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.b.a ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000163847.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.b ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01050000245780 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000177453 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000177484 ENSGT00940000163334.d.s.b Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160492 ENSGT00940000161676 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.a.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.a ##21 ENSGT01100000263566.b.b.b.b ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.a #22 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000161491 ENSGT01030000234901 ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01050000244936 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.a ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.a ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.b.r ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a ##20 ENSGT01090000259993.C.a ##21 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.d ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000159737.d ENSGT00940000157282 ENSGT00940000156054.c.a ENSGT00940000155025.B.j Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.d.f ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.b ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 ENSGT01090000259993.A.b.j #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000177227.b ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.d.e ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000159737.d ENSGT00940000157282 ENSGT00940000156054.c.a ENSGT00940000155025.B.j Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 21 ENSATEG00000025651 ENSATEG00000027143 ##21 ENSATEG00000027714 ##23 ENSATEG00000000370 ##23 ENSATEG00000029091 ##21 ENSATEG00000000333 ##21 ENSATEG00000026678 ENSATEG00000026383 ##21 ENSATEG00000000243 ##21 ENSATEG00000000194 ##21 ENSATEG00000000163 ##21 ENSATEG00000024908 #22 ENSATEG00000025655 ENSATEG00000030188 ENSATEG00000028082 ENSATEG00000024933 #22 ENSATEG00000030003 ##23 ENSATEG00000025343 ENSATEG00000000119 #22 ENSATEG00000024932 ENSATEG00000026819 ENSATEG00000028681 ENSATEG00000029868 ENSATEG00000024867 ENSATEG00000024915 ENSATEG00000024913 ENSATEG00000026351 ##23 ENSATEG00000024910 ENSATEG00000024909 #22 ENSATEG00000028306 ENSATEG00000024904 #22 Climbing perch MODERN SPECIES 21 ENSATEG00000000470 ENSATEG00000028305 ##21 ENSATEG00000000452 ##23 ENSATEG00000028854 ##21 ENSATEG00000025651 ENSATEG00000027143 ##21 ENSATEG00000027714 ##23 ENSATEG00000000370 ##23 ENSATEG00000029091 ##21 ENSATEG00000000333 ##21 ENSATEG00000026678 ENSATEG00000026383 ##21 ENSATEG00000000243 ##21 ENSATEG00000000194 ##21 ENSATEG00000000163 ##21 ENSATEG00000024908 #22 ENSATEG00000025655 ENSATEG00000030188 ENSATEG00000028082 ENSATEG00000024933 #22 ENSATEG00000030003 ##23 ENSATEG00000025343 ENSATEG00000000119 #22 ENSATEG00000024932 ENSATEG00000026819 ENSATEG00000028681 ENSATEG00000029868 ENSATEG00000024867 ENSATEG00000024915 ENSATEG00000024913 ENSATEG00000026351 ##23 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 21 ENSATEG00000000370 ##23 ENSATEG00000029091 ##21 ENSATEG00000000333 ##21 ENSATEG00000026678 ENSATEG00000026383 ##21 ENSATEG00000000243 ##21 ENSATEG00000000194 ##21 ENSATEG00000000163 ##21 ENSATEG00000024908 #22 ENSATEG00000025655 ENSATEG00000030188 ENSATEG00000028082 ENSATEG00000024933 #22 ENSATEG00000030003 ##23 ENSATEG00000025343 ENSATEG00000000119 #22 ENSATEG00000024932 ENSATEG00000026819 ENSATEG00000028681 ENSATEG00000029868 ENSATEG00000024867 ENSATEG00000024915 ENSATEG00000024913 ENSATEG00000026351 ##23 ENSATEG00000024910 ENSATEG00000024909 #22 ENSATEG00000028306 ENSATEG00000024904 #22 ENSATEG00000024890 ENSATEG00000024869 ENSATEG00000024883 Climbing perch MODERN SPECIES 21 ENSATEG00000030188 ENSATEG00000028082 ENSATEG00000024933 #22 ENSATEG00000030003 ##23 ENSATEG00000025343 ENSATEG00000000119 #22 ENSATEG00000024932 ENSATEG00000026819 ENSATEG00000028681 ENSATEG00000029868 ENSATEG00000024867 ENSATEG00000024915 ENSATEG00000024913 ENSATEG00000026351 ##23 ENSATEG00000024910 ENSATEG00000024909 #22 ENSATEG00000028306 ENSATEG00000024904 #22 ENSATEG00000024890 ENSATEG00000024869 ENSATEG00000024883 ENSATEG00000024882 ENSATEG00000024881 ENSATEG00000024878 ENSATEG00000024874 NACC1 (ENSATEG00000024864) ENSATEG00000024862 CACNA1A (ENSATEG00000024858) alkbh7 (ENSATEG00000024856) ENSATEG00000024853 gtf2f1 (ENSATEG00000024850) Climbing perch MODERN SPECIES 21 ENSATEG00000024933 #22 ENSATEG00000030003 ##23 ENSATEG00000025343 ENSATEG00000000119 #22 ENSATEG00000024932 ENSATEG00000026819 ENSATEG00000028681 ENSATEG00000029868 ENSATEG00000024867 ENSATEG00000024915 ENSATEG00000024913 ENSATEG00000026351 ##23 ENSATEG00000024910 ENSATEG00000024909 #22 ENSATEG00000028306 ENSATEG00000024904 #22 ENSATEG00000024890 ENSATEG00000024869 ENSATEG00000024883 ENSATEG00000024882 ENSATEG00000024881 ENSATEG00000024878 ENSATEG00000024874 NACC1 (ENSATEG00000024864) ENSATEG00000024862 CACNA1A (ENSATEG00000024858) alkbh7 (ENSATEG00000024856) ENSATEG00000024853 gtf2f1 (ENSATEG00000024850) ENSATEG00000024835 ENSATEG00000024811 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160492 ENSGT00940000161676 ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.b.a ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.b.b.a.b ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.a.a ENSGT01100000263485.a.b.b.b.b ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b.b ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.a.b ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.b.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.b ##23 ENSGT00940000177453 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000161491 ENSGT01030000234901 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 129 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.b.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 Turbot MODERN SPECIES 10 ENSSMAG00000010566 antkmt (ENSSMAG00000029225) ENSSMAG00000010641 ENSSMAG00000010650 ENSSMAG00000010659 ENSSMAG00000010670 ENSSMAG00000010685 ENSSMAG00000037533 ##21 ENSSMAG00000024005 ##21 ENSSMAG00000010727 ENSSMAG00000029804 ENSSMAG00000035564 ##21 ENSSMAG00000036124 ##23 ENSSMAG00000023159 ##23 ENSSMAG00000010758 ##21 ENSSMAG00000037722 #22 ENSSMAG00000010762 ENSSMAG00000010767 ENSSMAG00000010801 alkbh7 (ENSSMAG00000023657) ENSSMAG00000010926 ENSSMAG00000011044 ENSSMAG00000011074 ENSSMAG00000011092 gtpbp1 (ENSSMAG00000011143) ENSSMAG00000037586 ENSSMAG00000011232 ENSSMAG00000011257 ENSSMAG00000011283 ENSSMAG00000011333 spag9a (ENSSMAG00000011346) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00560000077365 ENSGT00940000155653.a ENSGT00940000159110.a ENSGT00940000163157.b ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT01000000219961 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000161676 ENSGT00940000160506.b ENSGT01050000244936 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01030000234901 ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.s.a ENSGT00940000177484 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000159737.d Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 733 ENSLCAG00010008179 ENSLCAG00010008211 ##21 ENSLCAG00010008213 ##21 ENSLCAG00010008217 ##21 ENSLCAG00010008221 ##21 ENSLCAG00010008228 ##23 ENSLCAG00010008235 ##21 ENSLCAG00010008238 ENSLCAG00010008240 ENSLCAG00010008247 ##21 ENSLCAG00010008252 ENSLCAG00010008255 ENSLCAG00010008256 ENSLCAG00010008260 ENSLCAG00010008264 #22 ENSLCAG00010008273 ENSLCAG00010008277 Barramundi perch MODERN SPECIES 41 ENSLCAG00010018839 ##23 ENSLCAG00010018838 ##21 ENSLCAG00010018837 ENSLCAG00010018834 ENSLCAG00010018832 ##21 ENSLCAG00010018831 ENSLCAG00010018830 ENSLCAG00010018829 ##21 ENSLCAG00010018827 ENSLCAG00010018826 ENSLCAG00010018825 ENSLCAG00010018823 #22 ENSLCAG00010018821 ENSLCAG00010018820 ENSLCAG00010018818 ENSLCAG00010018816 #22 ENSLCAG00010018814 ENSLCAG00010018812 ENSLCAG00010018810 ENSLCAG00010018809 ENSLCAG00010018808 ##21 ENSLCAG00010018807 ##21 ENSLCAG00010018806 ##23 ENSLCAG00010018804 ENSLCAG00010018803 ENSLCAG00010018802 ENSLCAG00010018799 ENSLCAG00010018798 ENSLCAG00010018797 ENSLCAG00010018796 ##23 ENSLCAG00010018794 Barramundi perch MODERN SPECIES 41 ENSLCAG00010018853 ENSLCAG00010018852 ENSLCAG00010018848 #21 ENSLCAG00010018841 ##21 ENSLCAG00010018839 ##23 ENSLCAG00010018838 ##21 ENSLCAG00010018837 ENSLCAG00010018834 ENSLCAG00010018832 ##21 ENSLCAG00010018831 ENSLCAG00010018830 ENSLCAG00010018829 ##21 ENSLCAG00010018827 ENSLCAG00010018826 ENSLCAG00010018825 ENSLCAG00010018823 #22 ENSLCAG00010018821 ENSLCAG00010018820 ENSLCAG00010018818 ENSLCAG00010018816 #22 ENSLCAG00010018814 ENSLCAG00010018812 ENSLCAG00010018810 ENSLCAG00010018809 ENSLCAG00010018808 ##21 ENSLCAG00010018807 ##21 ENSLCAG00010018806 ##23 ENSLCAG00010018804 ENSLCAG00010018803 ENSLCAG00010018802 ENSLCAG00010018799 Barramundi perch MODERN SPECIES 41 ENSLCAG00010018808 ##21 ENSLCAG00010018807 ##21 ENSLCAG00010018806 ##23 ENSLCAG00010018804 ENSLCAG00010018803 ENSLCAG00010018802 ENSLCAG00010018799 ENSLCAG00010018798 ENSLCAG00010018797 ENSLCAG00010018796 ##23 ENSLCAG00010018794 ENSLCAG00010018793 #22 ENSLCAG00010018792 ENSLCAG00010018790 ENSLCAG00010018784 ENSLCAG00010018782 #22 ENSLCAG00010018779 ##21 ENSLCAG00010018777 ##23 ENSLCAG00010018775 ##21 ENSLCAG00010018773 ENSLCAG00010018770 ##21 ENSLCAG00010018769 ENSLCAG00010018767 ENSLCAG00010018765 #22 ENSLCAG00010018763 ##21 ENSLCAG00010018760 ENSLCAG00010018758 ENSLCAG00010018756 ENSLCAG00010018755 ENSLCAG00010018752 ENSLCAG00010018749 Barramundi perch MODERN SPECIES 41 ENSLCAG00010018797 ENSLCAG00010018796 ##23 ENSLCAG00010018794 ENSLCAG00010018793 #22 ENSLCAG00010018792 ENSLCAG00010018790 ENSLCAG00010018784 ENSLCAG00010018782 #22 ENSLCAG00010018779 ##21 ENSLCAG00010018777 ##23 ENSLCAG00010018775 ##21 ENSLCAG00010018773 ENSLCAG00010018770 ##21 ENSLCAG00010018769 ENSLCAG00010018767 ENSLCAG00010018765 #22 ENSLCAG00010018763 ##21 ENSLCAG00010018760 ENSLCAG00010018758 ENSLCAG00010018756 ENSLCAG00010018755 ENSLCAG00010018752 ENSLCAG00010018749 ENSLCAG00010018746 ENSLCAG00010018744 ENSLCAG00010018740 ENSLCAG00010018666 NACC1 (ENSLCAG00010018652) ENSLCAG00010018650 CACNA1A (ENSLCAG00010016997) alkbh7 (ENSLCAG00010016827) Barramundi perch MODERN SPECIES 823 ENSLCAG00010017810 #21 ENSLCAG00010017812 ##21 ENSLCAG00010017817 ##21 ENSLCAG00010017821 ENSLCAG00010017824 ENSLCAG00010017827 ##23 ENSLCAG00010017828 ENSLCAG00010017833 ENSLCAG00010017835 ##21 ENSLCAG00010017837 ##21 ENSLCAG00010017840 ENSLCAG00010017841 ##23 ENSLCAG00010017842 ##21 ENSLCAG00010017845 ENSLCAG00010017847 ##21 ENSLCAG00010017850 #22 ENSLCAG00010017852 Seriola ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.i.a ##23 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a.i.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.a.b.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a.i.a ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01030000234901 ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000177484 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000159737.d Greater amberjack DUPLICATION Greater amberjack MODERN SPECIES 87 ENSSDUG00000004834 ENSSDUG00000004842 ##23 ENSSDUG00000004852 ENSSDUG00000004860 ENSSDUG00000004868 ENSSDUG00000004872 ##23 ENSSDUG00000004881 ENSSDUG00000004887 #22 ENSSDUG00000004896 ##23 ENSSDUG00000004907 ENSSDUG00000004928 ##21 ENSSDUG00000004938 ENSSDUG00000004941 ENSSDUG00000004944 ##23 ENSSDUG00000004955 ##21 ENSSDUG00000004959 #22 ENSSDUG00000004971 ##21 ENSSDUG00000004988 ENSSDUG00000005008 ENSSDUG00000005010 ENSSDUG00000005015 ENSSDUG00000005022 ENSSDUG00000005026 ENSSDUG00000005039 ENSSDUG00000005046 ENSSDUG00000005054 ENSSDUG00000005065 ENSSDUG00000005074 ENSSDUG00000005091 ENSSDUG00000005098 ENSSDUG00000005106 Greater amberjack MODERN SPECIES 87 ENSSDUG00000004772 #22 ENSSDUG00000004786 ENSSDUG00000004794 ENSSDUG00000004799 ##23 ENSSDUG00000004806 ENSSDUG00000004813 ENSSDUG00000004819 ##23 ENSSDUG00000004824 ENSSDUG00000004834 ENSSDUG00000004842 ##23 ENSSDUG00000004852 ENSSDUG00000004860 ENSSDUG00000004868 ENSSDUG00000004872 ##23 ENSSDUG00000004881 ENSSDUG00000004887 #22 ENSSDUG00000004896 ##23 ENSSDUG00000004907 ENSSDUG00000004928 ##21 ENSSDUG00000004938 ENSSDUG00000004941 ENSSDUG00000004944 ##23 ENSSDUG00000004955 ##21 ENSSDUG00000004959 #22 ENSSDUG00000004971 ##21 ENSSDUG00000004988 ENSSDUG00000005008 ENSSDUG00000005010 ENSSDUG00000005015 ENSSDUG00000005022 ENSSDUG00000005026 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3261 ENSSLDG00000007211 ENSSLDG00000007225 ENSSLDG00000007249 ENSSLDG00000007296 #22 ENSSLDG00000007321 ENSSLDG00000007358 ENSSLDG00000007373 ENSSLDG00000007388 ENSSLDG00000007405 ##23 ENSSLDG00000007408 ##23 ENSSLDG00000007415 ENSSLDG00000007422 ##21 ENSSLDG00000007442 ENSSLDG00000007449 ENSSLDG00000007473 ##23 ENSSLDG00000007490 #22 ENSSLDG00000007503 ##23 ENSSLDG00000007519 ENSSLDG00000007525 ##23 ENSSLDG00000007557 ##21 ENSSLDG00000007643 ENSSLDG00000007658 ##21 ENSSLDG00000007671 ENSSLDG00000007686 ##23 ENSSLDG00000007726 ENSSLDG00000007804 ENSSLDG00000007819 NACC1 (ENSSLDG00000007834) ENSSLDG00000007864 ENSSLDG00000007874 CACNA1A (ENSSLDG00000007904) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263485.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263485.b Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.a.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000163849.j.d #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.l.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263485.b ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.i ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01090000259993.B.c.b.a.b.q.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01100000263485.a.b.b.b.a.b ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.b Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.a.b.b.a ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT00940000163849.j.c #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.b.q.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.a.a.b ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.l.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.k ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.l.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.i Large yellow croaker MODERN SPECIES 483 ENSLCRG00005000719 ENSLCRG00005000721 ENSLCRG00005000731 ##23 ENSLCRG00005000735 #21 ENSLCRG00005000737 ENSLCRG00005000739 ##23 ENSLCRG00005000742 ENSLCRG00005000745 ENSLCRG00005000748 ENSLCRG00005000749 ENSLCRG00005000754 ##23 ENSLCRG00005000757 ENSLCRG00005000761 ##21 ENSLCRG00005000767 ##23 ENSLCRG00005000771 ENSLCRG00005000774 #22 ENSLCRG00005000777 ENSLCRG00005000783 #22 ENSLCRG00005000786 ENSLCRG00005000790 ENSLCRG00005000791 ENSLCRG00005000808 ENSLCRG00005000835 ENSLCRG00005000842 ENSLCRG00005000848 NACC1 (ENSLCRG00005000852) alkbh7 (ENSLCRG00005001146) GFUS (ENSLCRG00005001147) gtf2f1 (ENSLCRG00005001148) ENSLCRG00005001155 ENSLCRG00005001157 European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 4 ENSDLAG00005003916 ENSDLAG00005003989 ENSDLAG00005023993 ENSDLAG00005023985 ENSDLAG00005003193 ENSDLAG00005032812 ENSDLAG00005033077 ENSDLAG00005029142 ENSDLAG00005028290 ENSDLAG00005027898 ENSDLAG00005018336 ENSDLAG00005028298 ENSDLAG00005026811 ENSDLAG00005027472 ENSDLAG00005030592 ##23 ENSDLAG00005027510 #22 ENSDLAG00005033616 #21 ENSDLAG00005030697 ENSDLAG00005033348 ENSDLAG00005027195 ENSDLAG00005033006 ##21 ENSDLAG00005028993 ENSDLAG00005012822 #22 ENSDLAG00005029653 ENSDLAG00005027140 ##20 ENSDLAG00005017051 ##23 ENSDLAG00005028458 ENSDLAG00005031922 ##21 ENSDLAG00005032375 ENSDLAG00005029355 ##23 ENSDLAG00005032051 European seabass MODERN SPECIES 18 ENSDLAG00005031931 ENSDLAG00005019285 LAMC2 (ENSDLAG00005015577) ENSDLAG00005031313 ENSDLAG00005015593 SMG7 (ENSDLAG00005002976) ENSDLAG00005003721 ENSDLAG00005006795 ENSDLAG00005029324 ENSDLAG00005033122 ENSDLAG00005030459 ENSDLAG00005033953 ENSDLAG00005032788 ENSDLAG00005033791 ENSDLAG00005027135 ##23 ENSDLAG00005031651 #22 ENSDLAG00005018759 #22 ENSDLAG00005032486 ##21 ENSDLAG00005014629 ENSDLAG00005027174 ##23 ENSDLAG00005030508 ENSDLAG00005017907 ##23 ENSDLAG00005026787 ENSDLAG00005026410 ENSDLAG00005016100 ENSDLAG00005015705 ENSDLAG00005017486 ENSDLAG00005026988 ENSDLAG00005030913 ENSDLAG00005034116 ENSDLAG00005031771 European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 20 ENSDLAG00005017549 #22 ENSDLAG00005027143 ##21 ENSDLAG00005028371 ENSDLAG00005027698 ##21 ENSDLAG00005030038 ENSDLAG00005004957 ENSDLAG00005006329 #21 ENSDLAG00005004774 ENSDLAG00005027104 ENSDLAG00005031155 ##21 ENSDLAG00005015315 ENSDLAG00005034542 ENSDLAG00005032841 ##23 ENSDLAG00005032462 ENSDLAG00005015292 ENSDLAG00005030812 #22 ENSDLAG00005034017 ENSDLAG00005027227 ##21 ENSDLAG00005032254 ENSDLAG00005028853 ##23 ENSDLAG00005029626 ##21 ENSDLAG00005034661 ENSDLAG00005003586 ENSDLAG00005003636 ZNF207 (ENSDLAG00005003655) ENSDLAG00005003720 rhot1b (ENSDLAG00005003752) ADAP2 (ENSDLAG00005004108) tefm (ENSDLAG00005004141) ENSDLAG00005004151 suz12b (ENSDLAG00005004294) European seabass MODERN SPECIES 4 ENSDLAG00005012822 #22 ENSDLAG00005029653 ENSDLAG00005027140 ##20 ENSDLAG00005017051 ##23 ENSDLAG00005028458 ENSDLAG00005031922 ##21 ENSDLAG00005032375 ENSDLAG00005029355 ##23 ENSDLAG00005032051 ENSDLAG00005026374 ##23 ENSDLAG00005026588 #21 ENSDLAG00005034641 ENSDLAG00005029151 #21 ENSDLAG00005021706 ENSDLAG00005008189 #22 ENSDLAG00005027276 #22 ENSDLAG00005028813 ENSDLAG00005030291 ##23 ENSDLAG00005029958 ##21 ENSDLAG00005031287 ##20 ENSDLAG00005028080 ENSDLAG00005026783 ENSDLAG00005032907 ENSDLAG00005023977 ENSDLAG00005015293 ENSDLAG00005026939 pgrmc1 (ENSDLAG00005030065) ENSDLAG00005023967 ENSDLAG00005032692 ENSDLAG00005023891 ENSDLAG00005028375 European seabass MODERN SPECIES 4 ENSDLAG00005028993 ENSDLAG00005012822 #22 ENSDLAG00005029653 ENSDLAG00005027140 ##20 ENSDLAG00005017051 ##23 ENSDLAG00005028458 ENSDLAG00005031922 ##21 ENSDLAG00005032375 ENSDLAG00005029355 ##23 ENSDLAG00005032051 ENSDLAG00005026374 ##23 ENSDLAG00005026588 #21 ENSDLAG00005034641 ENSDLAG00005029151 #21 ENSDLAG00005021706 ENSDLAG00005008189 #22 ENSDLAG00005027276 #22 ENSDLAG00005028813 ENSDLAG00005030291 ##23 ENSDLAG00005029958 ##21 ENSDLAG00005031287 ##20 ENSDLAG00005028080 ENSDLAG00005026783 ENSDLAG00005032907 ENSDLAG00005023977 ENSDLAG00005015293 ENSDLAG00005026939 pgrmc1 (ENSDLAG00005030065) ENSDLAG00005023967 ENSDLAG00005032692 ENSDLAG00005023891 European seabass MODERN SPECIES 91 ENSDLAG00005027764 ##21 ENSDLAG00005027882 ENSDLAG00005030974 ENSDLAG00005029369 #22 ENSDLAG00005033742 ENSDLAG00005006320 #22 ENSDLAG00005005555 #21 ENSDLAG00005027015 ENSDLAG00005033188 ENSDLAG00005016193 #22 ENSDLAG00005033356 ENSDLAG00005020029 ENSDLAG00005004769 ##23 ENSDLAG00005027171 ENSDLAG00005029915 ENSDLAG00005026552 ENSDLAG00005030204 ENSDLAG00005015113 European seabass MODERN SPECIES 18 ENSDLAG00005019285 LAMC2 (ENSDLAG00005015577) ENSDLAG00005031313 ENSDLAG00005015593 SMG7 (ENSDLAG00005002976) ENSDLAG00005003721 ENSDLAG00005006795 ENSDLAG00005029324 ENSDLAG00005033122 ENSDLAG00005030459 ENSDLAG00005033953 ENSDLAG00005032788 ENSDLAG00005033791 ENSDLAG00005027135 ##23 ENSDLAG00005031651 #22 ENSDLAG00005018759 #22 ENSDLAG00005032486 ##21 ENSDLAG00005014629 ENSDLAG00005027174 ##23 ENSDLAG00005030508 ENSDLAG00005017907 ##23 ENSDLAG00005026787 ENSDLAG00005026410 ENSDLAG00005016100 ENSDLAG00005015705 ENSDLAG00005017486 ENSDLAG00005026988 ENSDLAG00005030913 ENSDLAG00005034116 ENSDLAG00005031771 ENSDLAG00005030756 European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 20 cfap52 (ENSDLAG00005001938) usp43a (ENSDLAG00005001977) ENSDLAG00005002024 gga3a (ENSDLAG00005002054) ENSDLAG00005003180 jpt1a (ENSDLAG00005003246) ENSDLAG00005003259 ENSDLAG00005003311 septin9b (ENSDLAG00005003337) ENSDLAG00005028559 ENSDLAG00005031612 ENSDLAG00005034541 ENSDLAG00005031837 ENSDLAG00005003317 ENSDLAG00005004094 ENSDLAG00005017549 #22 ENSDLAG00005027143 ##21 ENSDLAG00005028371 ENSDLAG00005027698 ##21 ENSDLAG00005030038 ENSDLAG00005004957 ENSDLAG00005006329 #21 ENSDLAG00005004774 ENSDLAG00005027104 ENSDLAG00005031155 ##21 ENSDLAG00005015315 ENSDLAG00005034542 ENSDLAG00005032841 ##23 ENSDLAG00005032462 ENSDLAG00005015292 ENSDLAG00005030812 #22 European seabass MODERN SPECIES 4 ENSDLAG00005029142 ENSDLAG00005028290 ENSDLAG00005027898 ENSDLAG00005018336 ENSDLAG00005028298 ENSDLAG00005026811 ENSDLAG00005027472 ENSDLAG00005030592 ##23 ENSDLAG00005027510 #22 ENSDLAG00005033616 #21 ENSDLAG00005030697 ENSDLAG00005033348 ENSDLAG00005027195 ENSDLAG00005033006 ##21 ENSDLAG00005028993 ENSDLAG00005012822 #22 ENSDLAG00005029653 ENSDLAG00005027140 ##20 ENSDLAG00005017051 ##23 ENSDLAG00005028458 ENSDLAG00005031922 ##21 ENSDLAG00005032375 ENSDLAG00005029355 ##23 ENSDLAG00005032051 ENSDLAG00005026374 ##23 ENSDLAG00005026588 #21 ENSDLAG00005034641 ENSDLAG00005029151 #21 ENSDLAG00005021706 ENSDLAG00005008189 #22 ENSDLAG00005027276 #22 European seabass MODERN SPECIES 91 ENSDLAG00005027764 ##21 ENSDLAG00005027882 ENSDLAG00005030974 ENSDLAG00005029369 #22 ENSDLAG00005033742 ENSDLAG00005006320 #22 ENSDLAG00005005555 #21 ENSDLAG00005027015 ENSDLAG00005033188 ENSDLAG00005016193 #22 ENSDLAG00005033356 ENSDLAG00005020029 ENSDLAG00005004769 ##23 ENSDLAG00005027171 ENSDLAG00005029915 ENSDLAG00005026552 ENSDLAG00005030204 ENSDLAG00005015113 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT01030000234901 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263485.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 143 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.o.a.a ##21 Pike perch DUPLICATION Pike perch DUPLICATION Pike perch DUPLICATION Pike perch MODERN SPECIES 38 slc17a7a (ENSSLUG00000005346) ENSSLUG00000009321 eps8l1a (ENSSLUG00000009333) nme4 (ENSSLUG00000009337) xpo6 (ENSSLUG00000009383) antkmt (ENSSLUG00000010248) hirip3 (ENSSLUG00000010260) kctd13 (ENSSLUG00000010312) SEZ6L2 (ENSSLUG00000010334) ASPHD2 (ENSSLUG00000010461) cabp5b (ENSSLUG00000010476) ENSSLUG00000010497 ##23 ENSSLUG00000010521 ENSSLUG00000010533 #22 ENSSLUG00000010537 ENSSLUG00000010541 #22 ENSSLUG00000010546 ENSSLUG00000010548 ENSSLUG00000010553 ENSSLUG00000010557 #21 ENSSLUG00000010564 ENSSLUG00000010571 ##23 ENSSLUG00000010578 #22 ENSSLUG00000010583 ##20 ENSSLUG00000010586 #21 ENSSLUG00000010589 ##21 ENSSLUG00000010599 #22 ENSSLUG00000010607 Pike perch MODERN SPECIES 174 ENSSLUG00000015540 ENSSLUG00000015536 ENSSLUG00000015533 ##23 ENSSLUG00000015528 ENSSLUG00000015525 ENSSLUG00000015522 ENSSLUG00000015516 ##21 ENSSLUG00000015513 ENSSLUG00000015510 ENSSLUG00000015507 ##23 ENSSLUG00000015502 ENSSLUG00000015498 #21 ENSSLUG00000015180 ENSSLUG00000015178 ##23 ENSSLUG00000015175 ENSSLUG00000015172 #22 ENSSLUG00000015168 ENSSLUG00000015163 #21 ENSSLUG00000015159 ENSSLUG00000015157 #21 ENSSLUG00000015155 ENSSLUG00000015149 ##21 ENSSLUG00000015144 #22 ENSSLUG00000015141 ##23 ENSSLUG00000015138 ENSSLUG00000015137 ENSSLUG00000015136 ##21 ENSSLUG00000015134 #21 ENSSLUG00000015129 ENSSLUG00000015126 ##21 ENSSLUG00000015123 Pike perch MODERN SPECIES 174 ENSSLUG00000015513 ENSSLUG00000015510 ENSSLUG00000015507 ##23 ENSSLUG00000015502 ENSSLUG00000015498 #21 ENSSLUG00000015180 ENSSLUG00000015178 ##23 ENSSLUG00000015175 ENSSLUG00000015172 #22 ENSSLUG00000015168 ENSSLUG00000015163 #21 ENSSLUG00000015159 ENSSLUG00000015157 #21 ENSSLUG00000015155 ENSSLUG00000015149 ##21 ENSSLUG00000015144 #22 ENSSLUG00000015141 ##23 ENSSLUG00000015138 ENSSLUG00000015137 ENSSLUG00000015136 ##21 ENSSLUG00000015134 #21 ENSSLUG00000015129 ENSSLUG00000015126 ##21 ENSSLUG00000015123 ENSSLUG00000015119 #22 ENSSLUG00000015116 ENSSLUG00000015113 ENSSLUG00000015112 ENSSLUG00000015108 ENSSLUG00000015104 ENSSLUG00000015102 Pike perch MODERN SPECIES 174 ENSSLUG00000015168 ENSSLUG00000015163 #21 ENSSLUG00000015159 ENSSLUG00000015157 #21 ENSSLUG00000015155 ENSSLUG00000015149 ##21 ENSSLUG00000015144 #22 ENSSLUG00000015141 ##23 ENSSLUG00000015138 ENSSLUG00000015137 ENSSLUG00000015136 ##21 ENSSLUG00000015134 #21 ENSSLUG00000015129 ENSSLUG00000015126 ##21 ENSSLUG00000015123 ENSSLUG00000015119 #22 ENSSLUG00000015116 ENSSLUG00000015113 ENSSLUG00000015112 ENSSLUG00000015108 ENSSLUG00000015104 ENSSLUG00000015102 ENSSLUG00000015097 ##21 ENSSLUG00000015048 ENSSLUG00000015030 ENSSLUG00000015027 CACNA1A (ENSSLUG00000014913) alkbh7 (ENSSLUG00000014891) GFUS (ENSSLUG00000014034) gtf2f1 (ENSSLUG00000013973) ENSSLUG00000013949 Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny MODERN SPECIES 22 ENSCGOG00000005955 eps8l1a (ENSCGOG00000005948) nme4 (ENSCGOG00000005826) xpo6 (ENSCGOG00000005055) antkmt (ENSCGOG00000005036) hirip3 (ENSCGOG00000004989) kctd13 (ENSCGOG00000004979) SEZ6L2 (ENSCGOG00000003949) ASPHD2 (ENSCGOG00000003907) cabp5b (ENSCGOG00000003900) ENSCGOG00000003895 ENSCGOG00000003890 ##21 ENSCGOG00000003885 ENSCGOG00000003882 ENSCGOG00000003880 ##23 ENSCGOG00000003873 #22 ENSCGOG00000003870 ##21 ENSCGOG00000003862 ENSCGOG00000003857 ##21 ENSCGOG00000015114 ##21 ENSCGOG00000015112 ##21 ENSCGOG00000015111 ENSCGOG00000015109 ENSCGOG00000015107 ##23 ENSCGOG00000015105 ENSCGOG00000015102 ##21 ENSCGOG00000015100 ENSCGOG00000015099 ENSCGOG00000015097 ##21 ENSCGOG00000015096 ENSCGOG00000015094 ##23 Channel bull blenny MODERN SPECIES 22 ENSCGOG00000015105 ENSCGOG00000015102 ##21 ENSCGOG00000015100 ENSCGOG00000015099 ENSCGOG00000015097 ##21 ENSCGOG00000015096 ENSCGOG00000015094 ##23 ENSCGOG00000015093 ##21 ENSCGOG00000015091 ENSCGOG00000015089 #22 ENSCGOG00000015087 ##21 ENSCGOG00000015086 ##21 ENSCGOG00000015083 ENSCGOG00000015082 ENSCGOG00000015081 ##23 ENSCGOG00000015080 #22 ENSCGOG00000015079 ENSCGOG00000015078 ENSCGOG00000015077 ##23 ENSCGOG00000015075 ##23 ENSCGOG00000015073 ##21 ENSCGOG00000015071 ENSCGOG00000015070 ##23 ENSCGOG00000015069 ENSCGOG00000015066 ENSCGOG00000015062 ENSCGOG00000015049 NACC1 (ENSCGOG00000015035) ENSCGOG00000015034 CACNA1A (ENSCGOG00000013215) alkbh7 (ENSCGOG00000013166) Channel bull blenny MODERN SPECIES 22 ENSCGOG00000003857 ##21 ENSCGOG00000015114 ##21 ENSCGOG00000015112 ##21 ENSCGOG00000015111 ENSCGOG00000015109 ENSCGOG00000015107 ##23 ENSCGOG00000015105 ENSCGOG00000015102 ##21 ENSCGOG00000015100 ENSCGOG00000015099 ENSCGOG00000015097 ##21 ENSCGOG00000015096 ENSCGOG00000015094 ##23 ENSCGOG00000015093 ##21 ENSCGOG00000015091 ENSCGOG00000015089 #22 ENSCGOG00000015087 ##21 ENSCGOG00000015086 ##21 ENSCGOG00000015083 ENSCGOG00000015082 ENSCGOG00000015081 ##23 ENSCGOG00000015080 #22 ENSCGOG00000015079 ENSCGOG00000015078 ENSCGOG00000015077 ##23 ENSCGOG00000015075 ##23 ENSCGOG00000015073 ##21 ENSCGOG00000015071 ENSCGOG00000015070 ##23 ENSCGOG00000015069 ENSCGOG00000015066 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT01030000234901 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263485.b Stickleback DUPLICATION Stickleback DUPLICATION Stickleback DUPLICATION Stickleback MODERN SPECIES 111 ENSGACG00000000569 ENSGACG00000000566 #22 Stickleback MODERN SPECIES 183 ENSGACG00000001698 #22 Stickleback MODERN SPECIES 477 ENSGACG00000001285 ENSGACG00000001283 #22 Stickleback MODERN SPECIES 10 nme4 (ENSGACG00000012855) ENSGACG00000012852 ENSGACG00000012850 antkmt (ENSGACG00000012848) hirip3 (ENSGACG00000012844) kctd13 (ENSGACG00000012838) SEZ6L2 (ENSGACG00000012825) ENSGACG00000012818 ENSGACG00000012814 ENSGACG00000012812 ENSGACG00000012809 ENSGACG00000012806 ENSGACG00000012804 ENSGACG00000012799 ENSGACG00000012797 ENSGACG00000012794 #22 ENSGACG00000012792 ENSGACG00000012790 ENSGACG00000012783 ENSGACG00000012781 ENSGACG00000012779 ENSGACG00000012776 ENSGACG00000012769 ENSGACG00000012767 ENSGACG00000012766 ENSGACG00000012763 NACC1 (ENSGACG00000012757) CACNA1A (ENSGACG00000012741) alkbh7 (ENSGACG00000012731) GFUS (ENSGACG00000012690) gtf2f1 (ENSGACG00000012677) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b.d.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.a.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000161491 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00440000038032 ENSGT00940000177484 ENSGT00940000163334.d ENSGT00940000159737.d ENSGT00940000157282 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263485.b Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263485.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.k.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.a ##21 Midas cichlid MODERN SPECIES 1680 ENSACIG00000006794 #22 ENSACIG00000006818 #22 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.l.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.a.b.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b ##23 Pseudocrenilabrinae_A DUPLICATION Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.a #22 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 310 ENSNBRG00000008480 ENSNBRG00000008469 #21 ENSNBRG00000008464 ENSNBRG00000008445 ENSNBRG00000008430 #21 ENSNBRG00000008409 ##21 ENSNBRG00000008392 ENSNBRG00000008373 ##20 ENSNBRG00000008358 ENSNBRG00000008348 ENSNBRG00000008335 ENSNBRG00000008318 ##21 ENSNBRG00000008310 #22 ENSNBRG00000008298 ##21 ENSNBRG00000008289 ##21 ENSNBRG00000008251 #22 ENSNBRG00000008243 ##21 ENSNBRG00000008208 #22 ENSNBRG00000008201 ENSNBRG00000008172 ##20 ENSNBRG00000008128 ENSNBRG00000008102 #22 ENSNBRG00000008084 ENSNBRG00000008069 ENSNBRG00000008037 ENSNBRG00000008021 ENSNBRG00000008012 ##21 ENSNBRG00000008005 ##23 ENSNBRG00000007900 ENSNBRG00000007872 #22 ENSNBRG00000007852 ##23 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.a #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.a #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.a #22 Eastern happy MODERN SPECIES 16 ENSACLG00000006044 ##21 ENSACLG00000006037 ENSACLG00000006018 #22 ENSACLG00000006013 ENSACLG00000006008 ENSACLG00000006003 ENSACLG00000005997 ##20 ENSACLG00000005985 ENSACLG00000005980 ENSACLG00000005965 ENSACLG00000005959 ENSACLG00000005949 #22 ENSACLG00000005943 ##23 ENSACLG00000005941 ##21 ENSACLG00000005933 ##21 ENSACLG00000005924 #22 ENSACLG00000005852 ##21 ENSACLG00000005846 ##23 ENSACLG00000005839 #22 ENSACLG00000005831 ##23 ENSACLG00000005820 ENSACLG00000005811 ENSACLG00000005806 ENSACLG00000005804 ENSACLG00000005798 ##21 ENSACLG00000005792 ##21 ENSACLG00000005790 ##23 ENSACLG00000005787 ##23 ENSACLG00000005782 ENSACLG00000005773 ENSACLG00000005771 #21 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000014062.f ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00980000198701 ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.a.a #21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.a ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.b ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01090000259993.B.d ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.b #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.l.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.k ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.a.b.b.a ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.a.a.b.a Haplochromini DUPLICATION Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.b.a.a #22 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1256 ENSHBUG00000006888 ##21 ENSHBUG00000001021 ##21 ENSHBUG00000006864 ENSHBUG00000006859 #22 ENSHBUG00000006852 #22 ENSHBUG00000006844 ##23 ENSHBUG00000006840 ##23 ENSHBUG00000006837 #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 420 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263485.b.c.b Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 448 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263485.b.c.b Zebra mbuna MODERN SPECIES 1107 ENSMZEG00005010078 ##21 ENSMZEG00005010070 ENSMZEG00005010057 #22 ENSMZEG00005010050 ENSMZEG00005010046 ENSMZEG00005010043 ENSMZEG00005010034 ##20 ENSMZEG00005010019 #22 ENSMZEG00005010011 ENSMZEG00005009999 #22 ENSMZEG00005009991 #22 ENSMZEG00005009982 ENSMZEG00005009975 ENSMZEG00005009966 ##21 ENSMZEG00005009962 ##23 ENSMZEG00005009957 #22 ENSMZEG00005009942 ENSMZEG00005009936 ##23 ENSMZEG00005009933 ##23 ENSMZEG00005009927 ##23 ENSMZEG00005009923 ENSMZEG00005009915 ENSMZEG00005009907 ENSMZEG00005009903 ENSMZEG00005009899 ##20 ENSMZEG00005009889 ##23 ENSMZEG00005009883 ##21 ENSMZEG00005009878 ##21 ENSMZEG00005009869 ##21 ENSMZEG00005009843 ENSMZEG00005009829 ##21 P. nyererei MODERN SPECIES 615 ENSPNYG00000023378 ##23 ENSPNYG00000023377 ENSPNYG00000023375 ENSPNYG00000023372 ENSPNYG00000023371 ENSPNYG00000023370 ENSPNYG00000023368 ENSPNYG00000023367 ##20 ENSPNYG00000023366 ENSPNYG00000023364 #22 ENSPNYG00000023363 #22 ENSPNYG00000023361 #22 ENSPNYG00000023359 ENSPNYG00000023358 ENSPNYG00000023357 ##21 ENSPNYG00000023355 #22 ENSPNYG00000023353 ##21 ENSPNYG00000023352 ##23 ENSPNYG00000023345 ##21 ENSPNYG00000023342 ##23 ENSPNYG00000023340 #22 ENSPNYG00000023339 ##23 ENSPNYG00000023337 ##23 ENSPNYG00000023335 ENSPNYG00000023332 ENSPNYG00000023331 ##23 ENSPNYG00000023330 ENSPNYG00000023326 ENSPNYG00000023325 ENSPNYG00000023322 ENSPNYG00000023321 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.b.a.b #22 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1396 ENSHBUG00000013333 ##20 ENSHBUG00000013350 ##23 ENSHBUG00000013389 ##21 ENSHBUG00000013407 ##21 ENSHBUG00000013413 ##21 ENSHBUG00000000396 #22 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a.g.b.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.b.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.a.a.b.b ENSGT01090000259993.B.d ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.a.b.a.b ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.f ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b.d.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.p ##23 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.l.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.k ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.a.b Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 139 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.b.a.a.a.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.a.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.a.a.b.b.b.a Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.k ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.a.a.b.a ENSGT00940000177284 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.e.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.a.b.a.b ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.f ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b.d.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.p ##23 ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a.a.a ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b.b.a.b.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b.a.a.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.b.n.a ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.b.a.a.a.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.a.b.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.a.b.b #21 Eastern happy MODERN SPECIES 16 ENSACLG00000006458 ENSACLG00000006453 ENSACLG00000006449 ENSACLG00000006442 ENSACLG00000006436 ENSACLG00000006433 ENSACLG00000006144 ##23 ENSACLG00000006135 ##20 ENSACLG00000006130 ENSACLG00000006115 ##21 ENSACLG00000006104 ENSACLG00000006096 ENSACLG00000006085 ENSACLG00000006077 ##21 ENSACLG00000006067 ##21 ENSACLG00000006058 #22 ENSACLG00000006049 ##21 ENSACLG00000006044 ##21 ENSACLG00000006037 ENSACLG00000006018 #22 ENSACLG00000006013 ENSACLG00000006008 ENSACLG00000006003 ENSACLG00000005997 ##20 ENSACLG00000005985 ENSACLG00000005980 ENSACLG00000005965 ENSACLG00000005959 ENSACLG00000005949 #22 ENSACLG00000005943 ##23 ENSACLG00000005941 ##21 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 694 ENSNBRG00000018137 ##21 ENSNBRG00000018120 ENSNBRG00000018112 ENSNBRG00000018107 ##21 ENSNBRG00000018058 ##21 ENSNBRG00000018051 ##23 ENSNBRG00000018042 ENSNBRG00000018028 ENSNBRG00000018014 ENSNBRG00000018007 ##20 ENSNBRG00000017985 #22 ENSNBRG00000017958 #22 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 296 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b.a.b.b.a ##23 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 182 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.e.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b.a.b.b.a ##23 Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 357 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.e.b.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.a #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 338 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.e.b.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.a #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 332 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.e.b.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.a #22 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 16 ENSACLG00000006436 ENSACLG00000006433 ENSACLG00000006144 ##23 ENSACLG00000006135 ##20 ENSACLG00000006130 ENSACLG00000006115 ##21 ENSACLG00000006104 ENSACLG00000006096 ENSACLG00000006085 ENSACLG00000006077 ##21 ENSACLG00000006067 ##21 ENSACLG00000006058 #22 ENSACLG00000006049 ##21 ENSACLG00000006044 ##21 ENSACLG00000006037 ENSACLG00000006018 #22 ENSACLG00000006013 ENSACLG00000006008 ENSACLG00000006003 ENSACLG00000005997 ##20 ENSACLG00000005985 ENSACLG00000005980 ENSACLG00000005965 ENSACLG00000005959 ENSACLG00000005949 #22 ENSACLG00000005943 ##23 ENSACLG00000005941 ##21 ENSACLG00000005933 ##21 ENSACLG00000005924 #22 ENSACLG00000005852 ##21 ENSACLG00000005846 ##23 Eastern happy MODERN SPECIES 16 ENSACLG00000006013 ENSACLG00000006008 ENSACLG00000006003 ENSACLG00000005997 ##20 ENSACLG00000005985 ENSACLG00000005980 ENSACLG00000005965 ENSACLG00000005959 ENSACLG00000005949 #22 ENSACLG00000005943 ##23 ENSACLG00000005941 ##21 ENSACLG00000005933 ##21 ENSACLG00000005924 #22 ENSACLG00000005852 ##21 ENSACLG00000005846 ##23 ENSACLG00000005839 #22 ENSACLG00000005831 ##23 ENSACLG00000005820 ENSACLG00000005811 ENSACLG00000005806 ENSACLG00000005804 ENSACLG00000005798 ##21 ENSACLG00000005792 ##21 ENSACLG00000005790 ##23 ENSACLG00000005787 ##23 ENSACLG00000005782 ENSACLG00000005773 ENSACLG00000005771 #21 ENSACLG00000005664 ENSACLG00000005656 ENSACLG00000005654 Haplochromini DUPLICATION Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 356 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.b.a.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b.a.b.b.a.b ##23 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1256 ENSHBUG00000006888 ##21 ENSHBUG00000001021 ##21 ENSHBUG00000006864 ENSHBUG00000006859 #22 ENSHBUG00000006852 #22 ENSHBUG00000006844 ##23 ENSHBUG00000006840 ##23 ENSHBUG00000006837 #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 337 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.b.a.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b.a.b.b.a.b ##23 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 331 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.b.a.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b.a.b.b.a.b ##23 Eastern happy MODERN SPECIES 16 ENSACLG00000005133 ENSACLG00000005123 ##21 ENSACLG00000005121 ##23 ENSACLG00000005104 #22 ENSACLG00000005088 ENSACLG00000005068 #22 ENSACLG00000005062 ENSACLG00000005055 ENSACLG00000005046 ##20 ENSACLG00000005018 ENSACLG00000005009 ENSACLG00000004996 #22 ENSACLG00000004986 ##21 ENSACLG00000004978 #22 ENSACLG00000004975 ENSACLG00000004969 #22 ENSACLG00000004959 ##23 ENSACLG00000004949 ##23 ENSACLG00000004946 ##23 ENSACLG00000004942 ##23 ENSACLG00000004940 ENSACLG00000004934 ##20 ENSACLG00000004932 ENSACLG00000004927 ENSACLG00000004923 ENSACLG00000004913 ENSACLG00000004905 ENSACLG00000004892 ##23 ENSACLG00000004884 ##23 ENSACLG00000004860 ##21 ENSACLG00000004858 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.b.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b.l.a ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.b.a.a.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.b.a.c.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b.k.a.d ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.b.d ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.l.a.b ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.q #22 ENSGT01100000263485.b ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b.c ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.k.b ##21 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1640 ENSHBUG00000014056 #22 ENSHBUG00000014067 ##23 ENSHBUG00000014080 ##23 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.b.a.b #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.b.a.b #22 Eastern happy MODERN SPECIES 16 ENSACLG00000005259 ENSACLG00000005256 ##23 ENSACLG00000005251 ##21 ENSACLG00000005244 ENSACLG00000005234 ENSACLG00000005225 ENSACLG00000005221 ENSACLG00000005215 ENSACLG00000005170 #22 ENSACLG00000005155 ENSACLG00000005148 ##21 ENSACLG00000005141 ##21 ENSACLG00000005133 ENSACLG00000005123 ##21 ENSACLG00000005121 ##23 ENSACLG00000005104 #22 ENSACLG00000005088 ENSACLG00000005068 #22 ENSACLG00000005062 ENSACLG00000005055 ENSACLG00000005046 ##20 ENSACLG00000005018 ENSACLG00000005009 ENSACLG00000004996 #22 ENSACLG00000004986 ##21 ENSACLG00000004978 #22 ENSACLG00000004975 ENSACLG00000004969 #22 ENSACLG00000004959 ##23 ENSACLG00000004949 ##23 ENSACLG00000004946 ##23 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.b.b #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b.b.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b.a.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.b.n.a ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.f ##21 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b.b.a.b.a ##21 ENSGT01100000263485.b.c.a ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b.b.a.a.a.b.a.b ##21 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.a.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.k ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.a.a.b.a ENSGT00940000177284 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.e.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.a.b.a.b ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.f ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b.d.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.p ##23 ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a.a.a ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b.b.a.b.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b.a.a.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.b.n.a ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.b.a.a.a.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.a.b.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.b.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.a.b.b #21 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1107 ENSMZEG00005010273 ENSMZEG00005010268 ENSMZEG00005010251 ##23 ENSMZEG00005010247 ##20 ENSMZEG00005010237 ##23 ENSMZEG00005010227 ENSMZEG00005010223 ##23 ENSMZEG00005010214 ##21 ENSMZEG00005010204 ENSMZEG00005010197 ENSMZEG00005010192 ENSMZEG00005010184 ENSMZEG00005010173 ##21 ENSMZEG00005010168 ##23 ENSMZEG00005010161 ##21 ENSMZEG00005010149 #22 ENSMZEG00005010142 ENSMZEG00005010128 ENSMZEG00005010122 ENSMZEG00005010110 ENSMZEG00005010102 ##21 ENSMZEG00005010096 ENSMZEG00005010090 ##21 ENSMZEG00005010085 ENSMZEG00005010078 ##21 ENSMZEG00005010070 ENSMZEG00005010057 #22 ENSMZEG00005010050 ENSMZEG00005010046 ENSMZEG00005010043 ENSMZEG00005010034 ##20 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 310 ENSNBRG00000008464 ENSNBRG00000008445 ENSNBRG00000008430 #21 ENSNBRG00000008409 ##21 ENSNBRG00000008392 ENSNBRG00000008373 ##20 ENSNBRG00000008358 ENSNBRG00000008348 ENSNBRG00000008335 ENSNBRG00000008318 ##21 ENSNBRG00000008310 #22 ENSNBRG00000008298 ##21 ENSNBRG00000008289 ##21 ENSNBRG00000008251 #22 ENSNBRG00000008243 ##21 ENSNBRG00000008208 #22 ENSNBRG00000008201 ENSNBRG00000008172 ##20 ENSNBRG00000008128 ENSNBRG00000008102 #22 ENSNBRG00000008084 ENSNBRG00000008069 ENSNBRG00000008037 ENSNBRG00000008021 ENSNBRG00000008012 ##21 ENSNBRG00000008005 ##23 ENSNBRG00000007900 ENSNBRG00000007872 #22 ENSNBRG00000007852 ##23 ENSNBRG00000007836 ENSNBRG00000007826 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 16 ENSONIG00000043141 #22 ENSONIG00000038932 ##21 ENSONIG00000030668 ##21 ENSONIG00000032868 ##21 ENSONIG00000036039 ENSONIG00000032475 ##21 ENSONIG00000042463 ##23 ENSONIG00000034713 ##23 ENSONIG00000033960 ENSONIG00000040303 ENSONIG00000041608 ##23 ENSONIG00000036300 ##21 ENSONIG00000004535 ##21 ENSONIG00000028664 ##21 ENSONIG00000038438 ##21 ENSONIG00000032899 #22 ENSONIG00000040926 ##23 ENSONIG00000035242 ENSONIG00000034612 ##23 ENSONIG00000043105 ENSONIG00000033091 ENSONIG00000038638 ENSONIG00000042426 ENSONIG00000040943 ##20 ENSONIG00000039516 ##23 ENSONIG00000004526 ##23 ENSONIG00000040218 ENSONIG00000038896 ##20 ENSONIG00000004534 ENSONIG00000030355 ENSONIG00000034921 ##23 Nile tilapia MODERN SPECIES 16 ENSONIG00000035945 ##23 ENSONIG00000040847 #21 ENSONIG00000014934 #21 ENSONIG00000039810 #21 ENSONIG00000034972 #21 ENSONIG00000035404 ENSONIG00000030829 ENSONIG00000038835 ENSONIG00000031402 ENSONIG00000038238 ENSONIG00000039037 ENSONIG00000028759 #21 ENSONIG00000035157 ENSONIG00000021355 ##21 ENSONIG00000033763 ENSONIG00000021354 #22 ENSONIG00000031839 ##21 ENSONIG00000030782 ##21 ENSONIG00000033516 ##21 ENSONIG00000042037 ##21 ENSONIG00000038705 ##23 ENSONIG00000021353 ENSONIG00000032344 ENSONIG00000031122 ##20 ENSONIG00000043141 #22 ENSONIG00000038932 ##21 ENSONIG00000030668 ##21 ENSONIG00000032868 ##21 ENSONIG00000036039 ENSONIG00000032475 ##21 ENSONIG00000042463 ##23 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 355 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.f.b.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.b #22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 358 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.f.b.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.b #22 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.b #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.b #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 330 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.e.a.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.b #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1107 ENSMZEG00005010122 ENSMZEG00005010110 ENSMZEG00005010102 ##21 ENSMZEG00005010096 ENSMZEG00005010090 ##21 ENSMZEG00005010085 ENSMZEG00005010078 ##21 ENSMZEG00005010070 ENSMZEG00005010057 #22 ENSMZEG00005010050 ENSMZEG00005010046 ENSMZEG00005010043 ENSMZEG00005010034 ##20 ENSMZEG00005010019 #22 ENSMZEG00005010011 ENSMZEG00005009999 #22 ENSMZEG00005009991 #22 ENSMZEG00005009982 ENSMZEG00005009975 ENSMZEG00005009966 ##21 ENSMZEG00005009962 ##23 ENSMZEG00005009957 #22 ENSMZEG00005009942 ENSMZEG00005009936 ##23 ENSMZEG00005009933 ##23 ENSMZEG00005009927 ##23 ENSMZEG00005009923 ENSMZEG00005009915 ENSMZEG00005009907 ENSMZEG00005009903 ENSMZEG00005009899 ##20 Eastern happy MODERN SPECIES 16 ENSACLG00000005170 #22 ENSACLG00000005155 ENSACLG00000005148 ##21 ENSACLG00000005141 ##21 ENSACLG00000005133 ENSACLG00000005123 ##21 ENSACLG00000005121 ##23 ENSACLG00000005104 #22 ENSACLG00000005088 ENSACLG00000005068 #22 ENSACLG00000005062 ENSACLG00000005055 ENSACLG00000005046 ##20 ENSACLG00000005018 ENSACLG00000005009 ENSACLG00000004996 #22 ENSACLG00000004986 ##21 ENSACLG00000004978 #22 ENSACLG00000004975 ENSACLG00000004969 #22 ENSACLG00000004959 ##23 ENSACLG00000004949 ##23 ENSACLG00000004946 ##23 ENSACLG00000004942 ##23 ENSACLG00000004940 ENSACLG00000004934 ##20 ENSACLG00000004932 ENSACLG00000004927 ENSACLG00000004923 ENSACLG00000004913 ENSACLG00000004905 P. nyererei MODERN SPECIES 615 ENSPNYG00000023384 ##21 ENSPNYG00000023383 ##23 ENSPNYG00000023381 ##23 ENSPNYG00000023379 ##23 ENSPNYG00000023378 ##23 ENSPNYG00000023377 ENSPNYG00000023375 ENSPNYG00000023372 ENSPNYG00000023371 ENSPNYG00000023370 ENSPNYG00000023368 ENSPNYG00000023367 ##20 ENSPNYG00000023366 ENSPNYG00000023364 #22 ENSPNYG00000023363 #22 ENSPNYG00000023361 #22 ENSPNYG00000023359 ENSPNYG00000023358 ENSPNYG00000023357 ##21 ENSPNYG00000023355 #22 ENSPNYG00000023353 ##21 ENSPNYG00000023352 ##23 ENSPNYG00000023345 ##21 ENSPNYG00000023342 ##23 ENSPNYG00000023340 #22 ENSPNYG00000023339 ##23 ENSPNYG00000023337 ##23 ENSPNYG00000023335 ENSPNYG00000023332 ENSPNYG00000023331 ##23 ENSPNYG00000023330 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 310 ENSNBRG00000008392 ENSNBRG00000008373 ##20 ENSNBRG00000008358 ENSNBRG00000008348 ENSNBRG00000008335 ENSNBRG00000008318 ##21 ENSNBRG00000008310 #22 ENSNBRG00000008298 ##21 ENSNBRG00000008289 ##21 ENSNBRG00000008251 #22 ENSNBRG00000008243 ##21 ENSNBRG00000008208 #22 ENSNBRG00000008201 ENSNBRG00000008172 ##20 ENSNBRG00000008128 ENSNBRG00000008102 #22 ENSNBRG00000008084 ENSNBRG00000008069 ENSNBRG00000008037 ENSNBRG00000008021 ENSNBRG00000008012 ##21 ENSNBRG00000008005 ##23 ENSNBRG00000007900 ENSNBRG00000007872 #22 ENSNBRG00000007852 ##23 ENSNBRG00000007836 ENSNBRG00000007826 ENSNBRG00000007817 ENSNBRG00000007795 ##21 ENSNBRG00000007783 ENSNBRG00000007761 ##21 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 453 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.b.a.a.a.a ##23 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 448 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.b.a.b ##23 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 459 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.b.a.a.a.a.a ##23 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1256 ENSHBUG00000006888 ##21 ENSHBUG00000001021 ##21 ENSHBUG00000006864 ENSHBUG00000006859 #22 ENSHBUG00000006852 #22 ENSHBUG00000006844 ##23 ENSHBUG00000006840 ##23 ENSHBUG00000006837 #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 419 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.b.a.a.a.a.a ##23 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.f ##21 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b.b.a.b.a ##21 ENSGT01100000263485.b.c.a ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT00940000177227.b.a ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.a.b.c ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a.d ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.b.a #22 Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 1107 ENSMZEG00005010184 ENSMZEG00005010173 ##21 ENSMZEG00005010168 ##23 ENSMZEG00005010161 ##21 ENSMZEG00005010149 #22 ENSMZEG00005010142 ENSMZEG00005010128 ENSMZEG00005010122 ENSMZEG00005010110 ENSMZEG00005010102 ##21 ENSMZEG00005010096 ENSMZEG00005010090 ##21 ENSMZEG00005010085 ENSMZEG00005010078 ##21 ENSMZEG00005010070 ENSMZEG00005010057 #22 ENSMZEG00005010050 ENSMZEG00005010046 ENSMZEG00005010043 ENSMZEG00005010034 ##20 ENSMZEG00005010019 #22 ENSMZEG00005010011 ENSMZEG00005009999 #22 ENSMZEG00005009991 #22 ENSMZEG00005009982 ENSMZEG00005009975 ENSMZEG00005009966 ##21 ENSMZEG00005009962 ##23 ENSMZEG00005009957 #22 ENSMZEG00005009942 ENSMZEG00005009936 ##23 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1107 ENSMZEG00005009933 ##23 ENSMZEG00005009927 ##23 ENSMZEG00005009923 ENSMZEG00005009915 ENSMZEG00005009907 ENSMZEG00005009903 ENSMZEG00005009899 ##20 ENSMZEG00005009889 ##23 ENSMZEG00005009883 ##21 ENSMZEG00005009878 ##21 ENSMZEG00005009869 ##21 ENSMZEG00005009843 ENSMZEG00005009829 ##21 ENSMZEG00005009824 ##23 ENSMZEG00005009815 ENSMZEG00005009804 #22 ENSMZEG00005009800 ENSMZEG00005009792 ENSMZEG00005009781 #22 ENSMZEG00005009774 ENSMZEG00005009763 #22 ENSMZEG00005009755 #22 ENSMZEG00005009745 ENSMZEG00005009735 ##21 ENSMZEG00005009728 ##21 ENSMZEG00005009719 ##21 dhrs7b (ENSMZEG00005009693) CRAMP1 (ENSMZEG00005009624) jpt2 (ENSMZEG00005009602) mapk8ip3 (ENSMZEG00005009202) mrps34 (ENSMZEG00005009087) Eastern happy MODERN SPECIES 16 ENSACLG00000005251 ##21 ENSACLG00000005244 ENSACLG00000005234 ENSACLG00000005225 ENSACLG00000005221 ENSACLG00000005215 ENSACLG00000005170 #22 ENSACLG00000005155 ENSACLG00000005148 ##21 ENSACLG00000005141 ##21 ENSACLG00000005133 ENSACLG00000005123 ##21 ENSACLG00000005121 ##23 ENSACLG00000005104 #22 ENSACLG00000005088 ENSACLG00000005068 #22 ENSACLG00000005062 ENSACLG00000005055 ENSACLG00000005046 ##20 ENSACLG00000005018 ENSACLG00000005009 ENSACLG00000004996 #22 ENSACLG00000004986 ##21 ENSACLG00000004978 #22 ENSACLG00000004975 ENSACLG00000004969 #22 ENSACLG00000004959 ##23 ENSACLG00000004949 ##23 ENSACLG00000004946 ##23 ENSACLG00000004942 ##23 ENSACLG00000004940 P. nyererei MODERN SPECIES 615 ENSPNYG00000023370 ENSPNYG00000023368 ENSPNYG00000023367 ##20 ENSPNYG00000023366 ENSPNYG00000023364 #22 ENSPNYG00000023363 #22 ENSPNYG00000023361 #22 ENSPNYG00000023359 ENSPNYG00000023358 ENSPNYG00000023357 ##21 ENSPNYG00000023355 #22 ENSPNYG00000023353 ##21 ENSPNYG00000023352 ##23 ENSPNYG00000023345 ##21 ENSPNYG00000023342 ##23 ENSPNYG00000023340 #22 ENSPNYG00000023339 ##23 ENSPNYG00000023337 ##23 ENSPNYG00000023335 ENSPNYG00000023332 ENSPNYG00000023331 ##23 ENSPNYG00000023330 ENSPNYG00000023326 ENSPNYG00000023325 ENSPNYG00000023322 ENSPNYG00000023321 ENSPNYG00000023320 ENSPNYG00000023315 ##23 ENSPNYG00000023314 ENSPNYG00000023312 ##23 ENSPNYG00000023308 ##21 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 310 ENSNBRG00000008289 ##21 ENSNBRG00000008251 #22 ENSNBRG00000008243 ##21 ENSNBRG00000008208 #22 ENSNBRG00000008201 ENSNBRG00000008172 ##20 ENSNBRG00000008128 ENSNBRG00000008102 #22 ENSNBRG00000008084 ENSNBRG00000008069 ENSNBRG00000008037 ENSNBRG00000008021 ENSNBRG00000008012 ##21 ENSNBRG00000008005 ##23 ENSNBRG00000007900 ENSNBRG00000007872 #22 ENSNBRG00000007852 ##23 ENSNBRG00000007836 ENSNBRG00000007826 ENSNBRG00000007817 ENSNBRG00000007795 ##21 ENSNBRG00000007783 ENSNBRG00000007761 ##21 ENSNBRG00000007748 ENSNBRG00000007741 ENSNBRG00000007716 ##21 ENSNBRG00000007706 ENSNBRG00000007699 ENSNBRG00000007684 #22 ENSNBRG00000007677 ENSNBRG00000007662 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 203 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.f.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.a #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b.b.a.b.b.b ##21 Nile tilapia MODERN SPECIES 16 ENSONIG00000038238 ENSONIG00000039037 ENSONIG00000028759 #21 ENSONIG00000035157 ENSONIG00000021355 ##21 ENSONIG00000033763 ENSONIG00000021354 #22 ENSONIG00000031839 ##21 ENSONIG00000030782 ##21 ENSONIG00000033516 ##21 ENSONIG00000042037 ##21 ENSONIG00000038705 ##23 ENSONIG00000021353 ENSONIG00000032344 ENSONIG00000031122 ##20 ENSONIG00000043141 #22 ENSONIG00000038932 ##21 ENSONIG00000030668 ##21 ENSONIG00000032868 ##21 ENSONIG00000036039 ENSONIG00000032475 ##21 ENSONIG00000042463 ##23 ENSONIG00000034713 ##23 ENSONIG00000033960 ENSONIG00000040303 ENSONIG00000041608 ##23 ENSONIG00000036300 ##21 ENSONIG00000004535 ##21 ENSONIG00000028664 ##21 ENSONIG00000038438 ##21 ENSONIG00000032899 #22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 207 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.a #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b.b.a.b.b.b ##21 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b.b.a.a.a.a.a ##21 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.a #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.a #22 P. nyererei MODERN SPECIES 615 ENSPNYG00000023386 ENSPNYG00000023384 ##21 ENSPNYG00000023383 ##23 ENSPNYG00000023381 ##23 ENSPNYG00000023379 ##23 ENSPNYG00000023378 ##23 ENSPNYG00000023377 ENSPNYG00000023375 ENSPNYG00000023372 ENSPNYG00000023371 ENSPNYG00000023370 ENSPNYG00000023368 ENSPNYG00000023367 ##20 ENSPNYG00000023366 ENSPNYG00000023364 #22 ENSPNYG00000023363 #22 ENSPNYG00000023361 #22 ENSPNYG00000023359 ENSPNYG00000023358 ENSPNYG00000023357 ##21 ENSPNYG00000023355 #22 ENSPNYG00000023353 ##21 ENSPNYG00000023352 ##23 ENSPNYG00000023345 ##21 ENSPNYG00000023342 ##23 ENSPNYG00000023340 #22 ENSPNYG00000023339 ##23 ENSPNYG00000023337 ##23 ENSPNYG00000023335 ENSPNYG00000023332 ENSPNYG00000023331 ##23 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.a #22 Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 1107 ENSMZEG00005010110 ENSMZEG00005010102 ##21 ENSMZEG00005010096 ENSMZEG00005010090 ##21 ENSMZEG00005010085 ENSMZEG00005010078 ##21 ENSMZEG00005010070 ENSMZEG00005010057 #22 ENSMZEG00005010050 ENSMZEG00005010046 ENSMZEG00005010043 ENSMZEG00005010034 ##20 ENSMZEG00005010019 #22 ENSMZEG00005010011 ENSMZEG00005009999 #22 ENSMZEG00005009991 #22 ENSMZEG00005009982 ENSMZEG00005009975 ENSMZEG00005009966 ##21 ENSMZEG00005009962 ##23 ENSMZEG00005009957 #22 ENSMZEG00005009942 ENSMZEG00005009936 ##23 ENSMZEG00005009933 ##23 ENSMZEG00005009927 ##23 ENSMZEG00005009923 ENSMZEG00005009915 ENSMZEG00005009907 ENSMZEG00005009903 ENSMZEG00005009899 ##20 ENSMZEG00005009889 ##23 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1107 ENSMZEG00005009903 ENSMZEG00005009899 ##20 ENSMZEG00005009889 ##23 ENSMZEG00005009883 ##21 ENSMZEG00005009878 ##21 ENSMZEG00005009869 ##21 ENSMZEG00005009843 ENSMZEG00005009829 ##21 ENSMZEG00005009824 ##23 ENSMZEG00005009815 ENSMZEG00005009804 #22 ENSMZEG00005009800 ENSMZEG00005009792 ENSMZEG00005009781 #22 ENSMZEG00005009774 ENSMZEG00005009763 #22 ENSMZEG00005009755 #22 ENSMZEG00005009745 ENSMZEG00005009735 ##21 ENSMZEG00005009728 ##21 ENSMZEG00005009719 ##21 dhrs7b (ENSMZEG00005009693) CRAMP1 (ENSMZEG00005009624) jpt2 (ENSMZEG00005009602) mapk8ip3 (ENSMZEG00005009202) mrps34 (ENSMZEG00005009087) spsb3a (ENSMZEG00005009070) ATP6V0C (ENSMZEG00005009057) ypel3 (ENSMZEG00005009048) gdpd3a (ENSMZEG00005009007) mapk3 (ENSMZEG00005008971) Eastern happy MODERN SPECIES 16 ENSACLG00000005148 ##21 ENSACLG00000005141 ##21 ENSACLG00000005133 ENSACLG00000005123 ##21 ENSACLG00000005121 ##23 ENSACLG00000005104 #22 ENSACLG00000005088 ENSACLG00000005068 #22 ENSACLG00000005062 ENSACLG00000005055 ENSACLG00000005046 ##20 ENSACLG00000005018 ENSACLG00000005009 ENSACLG00000004996 #22 ENSACLG00000004986 ##21 ENSACLG00000004978 #22 ENSACLG00000004975 ENSACLG00000004969 #22 ENSACLG00000004959 ##23 ENSACLG00000004949 ##23 ENSACLG00000004946 ##23 ENSACLG00000004942 ##23 ENSACLG00000004940 ENSACLG00000004934 ##20 ENSACLG00000004932 ENSACLG00000004927 ENSACLG00000004923 ENSACLG00000004913 ENSACLG00000004905 ENSACLG00000004892 ##23 ENSACLG00000004884 ##23 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 310 ENSNBRG00000008510 ENSNBRG00000008503 ##23 ENSNBRG00000008490 ##21 ENSNBRG00000008480 ENSNBRG00000008469 #21 ENSNBRG00000008464 ENSNBRG00000008445 ENSNBRG00000008430 #21 ENSNBRG00000008409 ##21 ENSNBRG00000008392 ENSNBRG00000008373 ##20 ENSNBRG00000008358 ENSNBRG00000008348 ENSNBRG00000008335 ENSNBRG00000008318 ##21 ENSNBRG00000008310 #22 ENSNBRG00000008298 ##21 ENSNBRG00000008289 ##21 ENSNBRG00000008251 #22 ENSNBRG00000008243 ##21 ENSNBRG00000008208 #22 ENSNBRG00000008201 ENSNBRG00000008172 ##20 ENSNBRG00000008128 ENSNBRG00000008102 #22 ENSNBRG00000008084 ENSNBRG00000008069 ENSNBRG00000008037 ENSNBRG00000008021 ENSNBRG00000008012 ##21 ENSNBRG00000008005 ##23 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a.d ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.k.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b.a.b.b.b.b.a ##23 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a.d ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.k.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b.a.b.b.b.b.a ##23 Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 264 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a.d ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.b.a #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 267 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a.d ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.b.a #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.f ##21 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b.b.a.b.a ##21 ENSGT01100000263485.b.c.a ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT00940000177227.b.a ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.a.b.c ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a.d ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.b.a #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1107 ENSMZEG00005010142 ENSMZEG00005010128 ENSMZEG00005010122 ENSMZEG00005010110 ENSMZEG00005010102 ##21 ENSMZEG00005010096 ENSMZEG00005010090 ##21 ENSMZEG00005010085 ENSMZEG00005010078 ##21 ENSMZEG00005010070 ENSMZEG00005010057 #22 ENSMZEG00005010050 ENSMZEG00005010046 ENSMZEG00005010043 ENSMZEG00005010034 ##20 ENSMZEG00005010019 #22 ENSMZEG00005010011 ENSMZEG00005009999 #22 ENSMZEG00005009991 #22 ENSMZEG00005009982 ENSMZEG00005009975 ENSMZEG00005009966 ##21 ENSMZEG00005009962 ##23 ENSMZEG00005009957 #22 ENSMZEG00005009942 ENSMZEG00005009936 ##23 ENSMZEG00005009933 ##23 ENSMZEG00005009927 ##23 ENSMZEG00005009923 ENSMZEG00005009915 ENSMZEG00005009907 P. nyererei MODERN SPECIES 615 ENSPNYG00000023410 ##20 ENSPNYG00000023409 ENSPNYG00000023407 ##21 ENSPNYG00000023406 ENSPNYG00000023405 ENSPNYG00000023404 ##21 ENSPNYG00000023403 ENSPNYG00000023402 ##21 ENSPNYG00000023400 ##21 ENSPNYG00000023399 ##23 ENSPNYG00000023398 ##21 acat2 (ENSPNYG00000023397) ENSPNYG00000023395 ENSPNYG00000023393 ENSPNYG00000023392 ENSPNYG00000023390 #22 ENSPNYG00000023389 ##21 ENSPNYG00000023386 ENSPNYG00000023384 ##21 ENSPNYG00000023383 ##23 ENSPNYG00000023381 ##23 ENSPNYG00000023379 ##23 ENSPNYG00000023378 ##23 ENSPNYG00000023377 ENSPNYG00000023375 ENSPNYG00000023372 ENSPNYG00000023371 ENSPNYG00000023370 ENSPNYG00000023368 ENSPNYG00000023367 ##20 ENSPNYG00000023366 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 149 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.f.b.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.b.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.k.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.a ##21 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1791 ENSHBUG00000006952 #22 ENSHBUG00000006945 #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 153 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.f.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.b.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.k.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.a ##21 P. nyererei MODERN SPECIES 615 ENSPNYG00000023389 ##21 ENSPNYG00000023386 ENSPNYG00000023384 ##21 ENSPNYG00000023383 ##23 ENSPNYG00000023381 ##23 ENSPNYG00000023379 ##23 ENSPNYG00000023378 ##23 ENSPNYG00000023377 ENSPNYG00000023375 ENSPNYG00000023372 ENSPNYG00000023371 ENSPNYG00000023370 ENSPNYG00000023368 ENSPNYG00000023367 ##20 ENSPNYG00000023366 ENSPNYG00000023364 #22 ENSPNYG00000023363 #22 ENSPNYG00000023361 #22 ENSPNYG00000023359 ENSPNYG00000023358 ENSPNYG00000023357 ##21 ENSPNYG00000023355 #22 ENSPNYG00000023353 ##21 ENSPNYG00000023352 ##23 ENSPNYG00000023345 ##21 ENSPNYG00000023342 ##23 ENSPNYG00000023340 #22 ENSPNYG00000023339 ##23 ENSPNYG00000023337 ##23 ENSPNYG00000023335 ENSPNYG00000023332 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 173 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.f.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.b.b.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.k.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.a.a ##21 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 16 ENSACLG00000006077 ##21 ENSACLG00000006067 ##21 ENSACLG00000006058 #22 ENSACLG00000006049 ##21 ENSACLG00000006044 ##21 ENSACLG00000006037 ENSACLG00000006018 #22 ENSACLG00000006013 ENSACLG00000006008 ENSACLG00000006003 ENSACLG00000005997 ##20 ENSACLG00000005985 ENSACLG00000005980 ENSACLG00000005965 ENSACLG00000005959 ENSACLG00000005949 #22 ENSACLG00000005943 ##23 ENSACLG00000005941 ##21 ENSACLG00000005933 ##21 ENSACLG00000005924 #22 ENSACLG00000005852 ##21 ENSACLG00000005846 ##23 ENSACLG00000005839 #22 ENSACLG00000005831 ##23 ENSACLG00000005820 ENSACLG00000005811 ENSACLG00000005806 ENSACLG00000005804 ENSACLG00000005798 ##21 ENSACLG00000005792 ##21 ENSACLG00000005790 ##23 Eastern happy MODERN SPECIES 16 ENSACLG00000005334 ENSACLG00000005323 ##20 ENSACLG00000005314 ENSACLG00000005297 ##21 ENSACLG00000005293 ENSACLG00000005289 ENSACLG00000005273 ENSACLG00000005259 ENSACLG00000005256 ##23 ENSACLG00000005251 ##21 ENSACLG00000005244 ENSACLG00000005234 ENSACLG00000005225 ENSACLG00000005221 ENSACLG00000005215 ENSACLG00000005170 #22 ENSACLG00000005155 ENSACLG00000005148 ##21 ENSACLG00000005141 ##21 ENSACLG00000005133 ENSACLG00000005123 ##21 ENSACLG00000005121 ##23 ENSACLG00000005104 #22 ENSACLG00000005088 ENSACLG00000005068 #22 ENSACLG00000005062 ENSACLG00000005055 ENSACLG00000005046 ##20 ENSACLG00000005018 ENSACLG00000005009 ENSACLG00000004996 #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1107 ENSMZEG00005009915 ENSMZEG00005009907 ENSMZEG00005009903 ENSMZEG00005009899 ##20 ENSMZEG00005009889 ##23 ENSMZEG00005009883 ##21 ENSMZEG00005009878 ##21 ENSMZEG00005009869 ##21 ENSMZEG00005009843 ENSMZEG00005009829 ##21 ENSMZEG00005009824 ##23 ENSMZEG00005009815 ENSMZEG00005009804 #22 ENSMZEG00005009800 ENSMZEG00005009792 ENSMZEG00005009781 #22 ENSMZEG00005009774 ENSMZEG00005009763 #22 ENSMZEG00005009755 #22 ENSMZEG00005009745 ENSMZEG00005009735 ##21 ENSMZEG00005009728 ##21 ENSMZEG00005009719 ##21 dhrs7b (ENSMZEG00005009693) CRAMP1 (ENSMZEG00005009624) jpt2 (ENSMZEG00005009602) mapk8ip3 (ENSMZEG00005009202) mrps34 (ENSMZEG00005009087) spsb3a (ENSMZEG00005009070) ATP6V0C (ENSMZEG00005009057) ypel3 (ENSMZEG00005009048) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 694 ENSNBRG00000018137 ##21 ENSNBRG00000018120 ENSNBRG00000018112 ENSNBRG00000018107 ##21 ENSNBRG00000018058 ##21 ENSNBRG00000018051 ##23 ENSNBRG00000018042 ENSNBRG00000018028 ENSNBRG00000018014 ENSNBRG00000018007 ##20 ENSNBRG00000017985 #22 ENSNBRG00000017958 #22 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a ENSGT01100000263485.a.a.a.b.b.d.a ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a.g.b.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d.b.b.a.a.b.a ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.f ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b.d.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.c ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.q #22 ENSGT01100000263485.b ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000174865 ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.p ENSGT00940000177484 ENSGT00940000163334.d.o ENSGT00940000159737.d ENSGT00940000157282 ENSGT00940000156054.c.a ENSGT00940000155025.B.j.g Nile tilapia MODERN SPECIES 16 ENSONIG00000033637 ENSONIG00000036579 ENSONIG00000038048 ##21 ENSONIG00000036031 ENSONIG00000035343 ##21 ENSONIG00000034417 ENSONIG00000042073 ENSONIG00000041349 ##23 ENSONIG00000041652 ENSONIG00000028007 ENSONIG00000027690 ENSONIG00000033619 ENSONIG00000034909 ENSONIG00000039577 ENSONIG00000026635 ENSONIG00000033340 #22 ENSONIG00000028618 ENSONIG00000034216 ##21 ENSONIG00000032816 ENSONIG00000033481 ENSONIG00000036798 ENSONIG00000027274 ENSONIG00000040057 ENSONIG00000007350 ENSONIG00000029127 ENSONIG00000033472 ENSONIG00000033593 ENSONIG00000030428 ENSONIG00000040712 ENSONIG00000034392 ENSONIG00000031881 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.a.a.d.c.b ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.k.a.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.a.a.c.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b.k.a.d ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.b.d ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.l.a.b ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.q #22 ENSGT01100000263485.b ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.b.a.a.a.a.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.l.a.a ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.a.a.c.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.d.b ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.c ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000178353 ENSGT00940000161491 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000177453 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b ENSGT01100000263566.b.a ##20 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 310 ENSNBRG00000008005 ##23 ENSNBRG00000007900 ENSNBRG00000007872 #22 ENSNBRG00000007852 ##23 ENSNBRG00000007836 ENSNBRG00000007826 ENSNBRG00000007817 ENSNBRG00000007795 ##21 ENSNBRG00000007783 ENSNBRG00000007761 ##21 ENSNBRG00000007748 ENSNBRG00000007741 ENSNBRG00000007716 ##21 ENSNBRG00000007706 ENSNBRG00000007699 ENSNBRG00000007684 #22 ENSNBRG00000007677 ENSNBRG00000007662 ENSNBRG00000007655 ENSNBRG00000007642 ENSNBRG00000007634 ENSNBRG00000007609 ##21 ENSNBRG00000007592 ENSNBRG00000007586 ENSNBRG00000007579 ENSNBRG00000007568 ENSNBRG00000007554 ENSNBRG00000007552 ENSNBRG00000007481 ENSNBRG00000007463 ENSNBRG00000007444 ##23 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.p.a.a.a.b.b.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b.l.a ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.b.a.a.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.b.a.c.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b.k.a.d ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.b.d ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.l.a.b ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.q #22 ENSGT01100000263485.b ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b.c ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.k.b ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.a.a.d.d ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.a.a.c.a.b.a ENSGT01100000263485.a.a.a.b.b.d.a Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.f.b.a ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b.b.b.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b.a.b.b.b.b.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b.l.a ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.b.a.a.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.b.a.c.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b.k.a.d ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.b.d ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.l.a.b ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.q #22 ENSGT01100000263485.b.d ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b.c ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.k.b ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.a.a.d.d ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.a.a.c.a.b.a ENSGT01100000263485.a.a.a.b.b.d.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b.l.b ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.k.a.a.a ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.a.a.c.a.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.d.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.d.b.a ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.c Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 139 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.k.a.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.a.a.c.b.b ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.b.d ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.l.a.b ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.q #22 ENSGT01100000263485.b.d Zebra mbuna MODERN SPECIES 330 ENSMZEG00005025903 ENSMZEG00005025904 ##21 ENSMZEG00005025905 ENSMZEG00005025907 ENSMZEG00005025908 ##21 ENSMZEG00005025910 #22 ENSMZEG00005025911 ENSMZEG00005025912 ENSMZEG00005025914 ##21 ENSMZEG00005025915 ENSMZEG00005025916 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01090000259993.A.b.j #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01050000244936 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01100000263566.b.b.a.a ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b ENSGT01030000234794 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.a ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.d ##23 ENSGT00940000177453 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d Oryzias DUPLICATION Oryzias ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.r #22 Oryzias_b DUPLICATION Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.r.a #22 Indian medaka DUPLICATION Indian medaka MODERN SPECIES 41 ENSOMEG00000015391 #22 Indian medaka MODERN SPECIES 92 ENSOMEG00000011065 #22 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.a ##20 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.r.b #22 Javanese ricefish MODERN SPECIES 22 arhgdia (ENSOJAG00000003425) cdr2l (ENSOJAG00000003438) ENSOJAG00000003470 xylt2 (ENSOJAG00000003484) ENSOJAG00000003830 NHERF1 (ENSOJAG00000003891) atp2a1 (ENSOJAG00000004349) rabep2 (ENSOJAG00000006741) ENSOJAG00000006759 nudt9 (ENSOJAG00000006795) mapk3 (ENSOJAG00000006809) gdpd3a (ENSOJAG00000006893) ypel3 (ENSOJAG00000006916) ATP6V0C (ENSOJAG00000006942) ENSOJAG00000007003 ENSOJAG00000007043 #22 ENSOJAG00000007088 ENSOJAG00000007105 ENSOJAG00000007155 ##23 ENSOJAG00000007207 ENSOJAG00000007225 #22 ENSOJAG00000007251 ##20 ENSOJAG00000007279 ENSOJAG00000007317 ##20 ENSOJAG00000007334 ##20 ENSOJAG00000007353 ##20 ENSOJAG00000007398 ##23 ENSOJAG00000007422 ##23 ENSOJAG00000007451 ##20 ENSOJAG00000007463 #22 ENSOJAG00000007488 ##21 Indian medaka MODERN SPECIES 608 ENSOMEG00000012127 ##20 ENSOMEG00000012114 #22 Oryzias DUPLICATION Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000008964 ENSGT01030000234629.E.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.t.a.a.b.a.a.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.t.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b.a.b.a.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.C.a ##21 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.b.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.t.a.a.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.a #22 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b.a.b.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.b.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.a ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.d ##23 ENSGT00940000163371.b.ab ENSGT00550000074873.ob.a.a ENSGT00940000161514 ENSGT00940000160759 ENSGT00940000160691 ENSGT00390000017405 ENSGT00500000045140.a.a ENSGT00530000063743.a ENSGT00940000164922.g.a Oryzias_a DUPLICATION Oryzias_a DUPLICATION Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 146 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.b.b.a ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.b.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.t.a.a.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.b ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.a.a.a #22 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.b.a ##20 Chinese medaka MODERN SPECIES 1594 ENSOSIG00000005556 #22 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 22 ENSORLG00000025233 ENSORLG00000027946 ##21 ENSORLG00000022356 ##23 ENSORLG00000028465 ##20 ENSORLG00000030301 ##23 ENSORLG00000030110 ##21 ENSORLG00000030191 ##20 ENSORLG00000011796 ENSORLG00000028354 ENSORLG00000011780 ##23 ENSORLG00000030504 ##20 ENSORLG00000029474 #22 ENSORLG00000023717 ##23 ENSORLG00000024345 ##20 ENSORLG00000011891 ENSORLG00000022501 #22 ENSORLG00000022799 ##20 ENSORLG00000024108 ENSORLG00000022287 ##21 ENSORLG00000029160 ENSORLG00000022540 ENSORLG00000024251 ENSORLG00000026360 #22 ENSORLG00000024396 #21 ATP6V0C (ENSORLG00000011910) ypel3 (ENSORLG00000011915) gdpd3a (ENSORLG00000011954) mapk3 (ENSORLG00000011993) nudt9 (ENSORLG00000012004) ENSORLG00000012015 rabep2 (ENSORLG00000012024) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 158 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.b.b ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.a.a.b #22 ENSGT01100000263566.b.a ##20 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 22 tufm (ENSORLG00000011497) ENSORLG00000011503 ENSORLG00000023644 natd1 (ENSORLG00000022403) tmem11 (ENSORLG00000011519) dhrs7b (ENSORLG00000011564) CRAMP1 (ENSORLG00000011587) jpt2 (ENSORLG00000011625) mapk8ip3 (ENSORLG00000011718) nme3 (ENSORLG00000011728) mrps34 (ENSORLG00000011731) spsb3a (ENSORLG00000011746) ENSORLG00000030329 ##20 ENSORLG00000024303 ##20 ENSORLG00000028651 ##21 ENSORLG00000029391 #22 ENSORLG00000023671 ##20 ENSORLG00000011755 ##23 ENSORLG00000022719 ##20 ENSORLG00000026700 ##23 ENSORLG00000022902 ##20 ENSORLG00000028397 ##20 ENSORLG00000022945 ##23 ENSORLG00000023162 ##20 ENSORLG00000029771 ##23 ENSORLG00000028300 ##20 ENSORLG00000025464 ##23 ENSORLG00000030146 ##21 ENSORLG00000027388 ##23 ENSORLG00000024471 ##23 ENSORLG00000026626 ##20 Oryzias_a DUPLICATION Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 242 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.b #21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.a.b.a #22 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 22 cdr2l (ENSORLG00000025610) ENSORLG00000012294 ENSORLG00000012256 xylt2 (ENSORLG00000012244) ENSORLG00000012199 ENSORLG00000028216 atp2a1 (ENSORLG00000012163) rabep2 (ENSORLG00000012024) ENSORLG00000012015 nudt9 (ENSORLG00000012004) mapk3 (ENSORLG00000011993) gdpd3a (ENSORLG00000011954) ypel3 (ENSORLG00000011915) ATP6V0C (ENSORLG00000011910) ENSORLG00000024396 #21 ENSORLG00000026360 #22 ENSORLG00000024251 ENSORLG00000022540 ENSORLG00000029160 ENSORLG00000022287 ##21 ENSORLG00000024108 ENSORLG00000022799 ##20 ENSORLG00000022501 #22 ENSORLG00000011891 ENSORLG00000024345 ##20 ENSORLG00000023717 ##23 ENSORLG00000029474 #22 ENSORLG00000030504 ##20 ENSORLG00000011780 ##23 ENSORLG00000028354 ENSORLG00000011796 Chinese medaka MODERN SPECIES 1424 ENSOSIG00000004937 #22 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 145 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.a.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.b.a ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b.a.b.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.a.a.a.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b.a.a.a.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.a.a ##20 Chinese medaka MODERN SPECIES 3211 ENSOSIG00000009710 ##20 ENSOSIG00000009708 #22 ENSOSIG00000009707 ##20 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b.a.a.c.a ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.b.b.d.a ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.t.b.b ##23 Indian medaka MODERN SPECIES 430 ENSOMEG00000017994 ##20 ENSOMEG00000018004 ENSOMEG00000018011 ##20 ENSOMEG00000018018 ENSOMEG00000018033 ##20 ENSOMEG00000018041 ##23 ENSOMEG00000018045 ##21 ENSOMEG00000018054 ##20 ENSOMEG00000018071 ##23 ENSOMEG00000018081 ##23 ENSOMEG00000018090 ENSOMEG00000018104 ##23 ENSOMEG00000018112 ##23 ENSOMEG00000018144 ##21 ENSOMEG00000018156 ##23 ENSOMEG00000018167 #22 ENSOMEG00000018183 ##23 ENSOMEG00000018193 ##20 ENSOMEG00000018201 ##23 ENSOMEG00000018213 ##20 ENSOMEG00000018219 ##20 ENSOMEG00000018234 ##23 ENSOMEG00000018240 ENSOMEG00000018252 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003337 ENSGT00390000007652 ENSGT00940000153496.a.a ENSGT00940000161283 ENSGT00390000008964 ENSGT01030000234629.E.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.t.a.a.b.a.a.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.t.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b.a.b.a.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.C.a ##21 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.b.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.t.a.a.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.a #22 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b.a.b.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.b.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.a ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.d ##23 ENSGT00940000163371.b.ab ENSGT00550000074873.ob.a.a ENSGT00940000161514 ENSGT00940000160759 ENSGT00940000160691 Oryzias_a DUPLICATION Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 146 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.b.b.a ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.b.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.t.a.a.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.b ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.a.a.a #22 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.b.a ##20 Chinese medaka DUPLICATION Chinese medaka MODERN SPECIES 3154 ENSOSIG00000001835 ##20 ENSOSIG00000001847 #22 Chinese medaka MODERN SPECIES 3216 ENSOSIG00000009718 #22 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 22 ENSORLG00000030140 ##21 ENSORLG00000029942 ENSORLG00000025931 ##20 ENSORLG00000023952 ##20 ENSORLG00000025233 ENSORLG00000027946 ##21 ENSORLG00000022356 ##23 ENSORLG00000028465 ##20 ENSORLG00000030301 ##23 ENSORLG00000030110 ##21 ENSORLG00000030191 ##20 ENSORLG00000011796 ENSORLG00000028354 ENSORLG00000011780 ##23 ENSORLG00000030504 ##20 ENSORLG00000029474 #22 ENSORLG00000023717 ##23 ENSORLG00000024345 ##20 ENSORLG00000011891 ENSORLG00000022501 #22 ENSORLG00000022799 ##20 ENSORLG00000024108 ENSORLG00000022287 ##21 ENSORLG00000029160 ENSORLG00000022540 ENSORLG00000024251 ENSORLG00000026360 #22 ENSORLG00000024396 #21 ATP6V0C (ENSORLG00000011910) ypel3 (ENSORLG00000011915) gdpd3a (ENSORLG00000011954) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.b.b #22 Chinese medaka MODERN SPECIES 2052 ENSOSIG00000012594 #22 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 128 ENSGT01090000259993.C.a ##21 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.s.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.b.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.t.b.a ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b.a.b.a.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a.b.b ##20 Indian medaka DUPLICATION Indian medaka DUPLICATION Indian medaka MODERN SPECIES 566 ENSOMEG00000000504 ##21 ENSOMEG00000019185 ##23 ENSOMEG00000019168 ##20 ENSOMEG00000019158 #22 ENSOMEG00000019145 ##23 ENSOMEG00000019125 ##23 ENSOMEG00000019111 ##21 ENSOMEG00000019094 ##23 ENSOMEG00000019085 ##23 ENSOMEG00000019076 #22 Indian medaka MODERN SPECIES 566 ENSOMEG00000000504 ##21 ENSOMEG00000019185 ##23 ENSOMEG00000019168 ##20 ENSOMEG00000019158 #22 ENSOMEG00000019145 ##23 ENSOMEG00000019125 ##23 ENSOMEG00000019111 ##21 ENSOMEG00000019094 ##23 ENSOMEG00000019085 ##23 ENSOMEG00000019076 #22 Indian medaka MODERN SPECIES 512 ENSOMEG00000006946 ##21 ENSOMEG00000006943 #22 Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish MODERN SPECIES 22 ENSOJAG00000006716 natd1 (ENSOJAG00000006702) tmem11 (ENSOJAG00000006685) dhrs7b (ENSOJAG00000006625) CRAMP1 (ENSOJAG00000006411) jpt2 (ENSOJAG00000006396) mapk8ip3 (ENSOJAG00000006152) nme3 (ENSOJAG00000006123) mrps34 (ENSOJAG00000006105) spsb3a (ENSOJAG00000006086) ENSOJAG00000006044 ##21 ENSOJAG00000006018 ##23 ENSOJAG00000006005 ##23 ENSOJAG00000005980 ##20 ENSOJAG00000005959 ##23 ENSOJAG00000005929 #22 ENSOJAG00000005917 ##23 ENSOJAG00000005896 ##20 ENSOJAG00000005880 ##23 ENSOJAG00000005868 ##23 ENSOJAG00000005847 ##20 ENSOJAG00000005838 ##23 ENSOJAG00000005803 ##20 ENSOJAG00000005800 ENSOJAG00000005792 ##23 ENSOJAG00000005760 ##20 ENSOJAG00000005752 ##23 ENSOJAG00000005743 ##20 ENSOJAG00000005740 ##20 ENSOJAG00000005728 ##23 ENSOJAG00000005709 ##20 Javanese ricefish MODERN SPECIES 22 ENSOJAG00000007585 ##21 ENSOJAG00000007562 ##20 ENSOJAG00000007550 ##23 ENSOJAG00000007526 ##20 ENSOJAG00000007496 ##21 ENSOJAG00000007488 ##21 ENSOJAG00000007463 #22 ENSOJAG00000007451 ##20 ENSOJAG00000007422 ##23 ENSOJAG00000007398 ##23 ENSOJAG00000007353 ##20 ENSOJAG00000007334 ##20 ENSOJAG00000007317 ##20 ENSOJAG00000007279 ENSOJAG00000007251 ##20 ENSOJAG00000007225 #22 ENSOJAG00000007207 ENSOJAG00000007155 ##23 ENSOJAG00000007105 ENSOJAG00000007088 ENSOJAG00000007043 #22 ENSOJAG00000007003 ATP6V0C (ENSOJAG00000006942) ypel3 (ENSOJAG00000006916) gdpd3a (ENSOJAG00000006893) mapk3 (ENSOJAG00000006809) nudt9 (ENSOJAG00000006795) ENSOJAG00000006759 rabep2 (ENSOJAG00000006741) atp2a1 (ENSOJAG00000004349) NHERF1 (ENSOJAG00000003891) Javanese ricefish MODERN SPECIES 22 ENSOJAG00000005752 ##23 ENSOJAG00000005743 ##20 ENSOJAG00000005740 ##20 ENSOJAG00000005728 ##23 ENSOJAG00000005709 ##20 ENSOJAG00000005694 ENSOJAG00000007641 ENSOJAG00000007613 ##21 ENSOJAG00000007594 ##20 ENSOJAG00000007585 ##21 ENSOJAG00000007562 ##20 ENSOJAG00000007550 ##23 ENSOJAG00000007526 ##20 ENSOJAG00000007496 ##21 ENSOJAG00000007488 ##21 ENSOJAG00000007463 #22 ENSOJAG00000007451 ##20 ENSOJAG00000007422 ##23 ENSOJAG00000007398 ##23 ENSOJAG00000007353 ##20 ENSOJAG00000007334 ##20 ENSOJAG00000007317 ##20 ENSOJAG00000007279 ENSOJAG00000007251 ##20 ENSOJAG00000007225 #22 ENSOJAG00000007207 ENSOJAG00000007155 ##23 ENSOJAG00000007105 ENSOJAG00000007088 ENSOJAG00000007043 #22 ENSOJAG00000007003 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000163849.i.b.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b ENSGT01090000259993.A.b.j.i.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT01030000234794 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT00940000163847.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.a.e.a ENSGT01090000259993.A.b.j.i.b #21 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.a.e.b ##21 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.b ##20 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a #21 ENSGT01100000263566.b.b.c.b ##20 ENSGT01030000234536 ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 187 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01030000234794 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d ENSGT00940000159737.d ENSGT00940000157282 ENSGT00940000156054.c.a Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus MODERN SPECIES 61 ENSKMAG00000001905 ##21 ENSKMAG00000001894 ##23 ENSKMAG00000001879 ENSKMAG00000001869 ENSKMAG00000001860 ##23 ENSKMAG00000001841 ENSKMAG00000001814 #21 ENSKMAG00000001802 ENSKMAG00000001781 ##21 ENSKMAG00000001770 ##21 ENSKMAG00000001764 ENSKMAG00000001752 ##21 ENSKMAG00000001724 ENSKMAG00000001712 #22 ENSKMAG00000001688 ENSKMAG00000001672 #22 ENSKMAG00000001652 NACC1 (ENSKMAG00000001572) ENSKMAG00000001561 CACNA1A (ENSKMAG00000001188) alkbh7 (ENSKMAG00000001132) gtf2f1 (ENSKMAG00000001116) ENSKMAG00000001012 ENSKMAG00000000982 ELFN2 (ENSKMAG00000000941) sgsm3 (ENSKMAG00000000824) gtpbp1 (ENSKMAG00000000729) ENSKMAG00000000720 ENSKMAG00000000712 ENSKMAG00000000694 ENSKMAG00000000613 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 1270 ENSKMAG00000009619 ENSKMAG00000009632 ENSKMAG00000009642 #22 ENSKMAG00000009654 ENSKMAG00000009663 #22 ENSKMAG00000009676 ENSKMAG00000009684 ##21 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 61 ENSKMAG00000001923 ENSKMAG00000001911 ENSKMAG00000001905 ##21 ENSKMAG00000001894 ##23 ENSKMAG00000001879 ENSKMAG00000001869 ENSKMAG00000001860 ##23 ENSKMAG00000001841 ENSKMAG00000001814 #21 ENSKMAG00000001802 ENSKMAG00000001781 ##21 ENSKMAG00000001770 ##21 ENSKMAG00000001764 ENSKMAG00000001752 ##21 ENSKMAG00000001724 ENSKMAG00000001712 #22 ENSKMAG00000001688 ENSKMAG00000001672 #22 ENSKMAG00000001652 NACC1 (ENSKMAG00000001572) ENSKMAG00000001561 CACNA1A (ENSKMAG00000001188) alkbh7 (ENSKMAG00000001132) gtf2f1 (ENSKMAG00000001116) ENSKMAG00000001012 ENSKMAG00000000982 ELFN2 (ENSKMAG00000000941) sgsm3 (ENSKMAG00000000824) gtpbp1 (ENSKMAG00000000729) ENSKMAG00000000720 ENSKMAG00000000712 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01030000234794 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.g.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.s ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.j.i.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.r ##23 ENSGT00940000163849.j #22 ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.a ##23 ENSGT01030000234536 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.a.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a ##23 ENSGT01090000259993.C.a.b.b ##21 ENSGT01100000263566.b.a ##20 NAME_4 DUPLICATION NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.g.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.s ##23 ENSGT01050000244936 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.b.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.j.i.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.v #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.a.e.a.b ENSGT00940000161491.p ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00440000038032 ENSGT00940000159737.d ENSGT00940000157282 ENSGT00940000156054.c.a ENSGT00940000179768 ENSGT00940000155025.B.j ENSGT00950000183213.a.b ENSGT00390000007792 ENSGT00940000158031.d Mummichog MODERN SPECIES 1683 ENSFHEG00000010249 ENSFHEG00000010256 ##20 ENSFHEG00000010269 ENSFHEG00000010290 #22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 704 ENSCVAG00000007937 ##23 ENSCVAG00000007943 #21 ENSCVAG00000007966 ##23 ENSCVAG00000000218 #22 ENSCVAG00000008028 ENSCVAG00000008036 #21 ENSCVAG00000008042 ##21 ENSCVAG00000008045 ENSCVAG00000008055 ##20 ENSCVAG00000008056 ##21 ENSCVAG00000008065 ENSCVAG00000008080 ENSCVAG00000008344 NACC1 (ENSCVAG00000008398) ENSCVAG00000008403 CACNA1A (ENSCVAG00000013063) PEX5L (ENSCVAG00000013181) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 449 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.b.d ##20 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.w #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.b ##23 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1234 ENSCVAG00000019731 ENSCVAG00000019665 SLC24A1 (ENSCVAG00000019525) ENSCVAG00000019518 ints14 (ENSCVAG00000019509) hacd3 (ENSCVAG00000019445) ppcdc (ENSCVAG00000019390) ENSCVAG00000019361 arih1 (ENSCVAG00000019348) hexa (ENSCVAG00000019285) nr2e3 (ENSCVAG00000019105) stoml1 (ENSCVAG00000019065) cyp11a1.1 (ENSCVAG00000018994) ENSCVAG00000017876 #22 ENSCVAG00000017859 ##23 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1466 ENSCVAG00000009713 ENSCVAG00000009717 ##21 ENSCVAG00000009732 ##21 ENSCVAG00000009736 ##21 ENSCVAG00000009741 ##21 ENSCVAG00000009746 ##20 ENSCVAG00000009751 ##21 ENSCVAG00000009754 ##20 ENSCVAG00000009759 ##20 ENSCVAG00000009762 ENSCVAG00000009776 #22 ENSCVAG00000009799 #22 ENSCVAG00000009809 #21 ENSCVAG00000009822 #21 ENSCVAG00000009837 ENSCVAG00000009846 #22 ENSCVAG00000009857 #22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 106 ENSCVAG00000020874 #22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1466 ENSCVAG00000009704 ENSCVAG00000009713 ENSCVAG00000009717 ##21 ENSCVAG00000009732 ##21 ENSCVAG00000009736 ##21 ENSCVAG00000009741 ##21 ENSCVAG00000009746 ##20 ENSCVAG00000009751 ##21 ENSCVAG00000009754 ##20 ENSCVAG00000009759 ##20 ENSCVAG00000009762 ENSCVAG00000009776 #22 ENSCVAG00000009799 #22 ENSCVAG00000009809 #21 ENSCVAG00000009822 #21 ENSCVAG00000009837 ENSCVAG00000009846 #22 ENSCVAG00000009857 #22 Mummichog MODERN SPECIES 1493 ENSFHEG00000015177 #22 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b ENSGT01090000259993.D.b.d.y ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01100000263566.b.b.a.a ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.f ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.b ##23 Poecilia DUPLICATION Poecilia ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b ENSGT01090000259993.D.b.d.y ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.f ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.f ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.a.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j.g.b.a #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.a ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.b.a ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.b.a.b ##20 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536.r ENSGT01090000259993.A.b.j.j.g.b.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234536.q ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.r ##23 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 282 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.e ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.f ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.f ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.a.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j.g.b.a #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234536.q ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.r ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a.a.a ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.a.a ##23 Amazon molly MODERN SPECIES 392 ENSPFOG00000009571 ENSPFOG00000024798 ##20 ENSPFOG00000009578 ENSPFOG00000009595 ##20 ENSPFOG00000009536 ##20 ENSPFOG00000009744 ##21 ENSPFOG00000022897 ##20 ENSPFOG00000009608 ##20 ENSPFOG00000023215 ##20 ENSPFOG00000023957 ##21 ENSPFOG00000022441 ##20 ENSPFOG00000023962 ENSPFOG00000009527 ENSPFOG00000009616 ##23 ENSPFOG00000009601 #21 ENSPFOG00000009629 #22 ENSPFOG00000009645 ##23 ENSPFOG00000022462 ENSPFOG00000022578 ##23 ENSPFOG00000009649 #21 ENSPFOG00000009656 ##23 ENSPFOG00000009658 ##23 ENSPFOG00000009662 #21 ENSPFOG00000009670 ##23 ENSPFOG00000022229 ##23 ENSPFOG00000009676 ENSPFOG00000009682 #21 ENSPFOG00000009692 ##23 ENSPFOG00000009700 #22 ENSPFOG00000009706 ##23 ENSPFOG00000023918 ##23 Sailfin molly MODERN SPECIES 3385 ENSPLAG00000019358 ENSPLAG00000019353 ENSPLAG00000019335 ENSPLAG00000019333 ENSPLAG00000019323 ENSPLAG00000019309 ##21 ENSPLAG00000019301 ENSPLAG00000000435 #22 Guppy MODERN SPECIES 460 SSTR2 (ENSPREG00000002051) ENSPREG00000002001 ENSPREG00000001984 ENSPREG00000001975 SOX8 (ENSPREG00000001953) RAB26 (ENSPREG00000001912) ENSPREG00000001872 rnps1 (ENSPREG00000001843) ENSPREG00000001839 ENSPREG00000001820 ##21 ENSPREG00000001811 ENSPREG00000001800 ENSPREG00000001788 ##21 ENSPREG00000001786 ENSPREG00000001780 #22 ENSPREG00000001760 #22 ENSPREG00000001748 ENSPREG00000001727 #21 ENSPREG00000001711 ##23 ENSPREG00000001698 ENSPREG00000001685 ##23 ENSPREG00000001678 #22 ENSPREG00000001654 ##23 ENSPREG00000001636 ##23 ENSPREG00000001629 ##23 ENSPREG00000001621 ENSPREG00000001590 #22 ENSPREG00000001573 ENSPREG00000001557 ##21 ENSPREG00000001541 ENSPREG00000001531 #21 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 176 ENSGT00940000163533 ENSGT01090000259993.A.b.j.j.h #21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.a.b #22 Guppy MODERN SPECIES 460 sox9 (ENSPREG00000002057) SSTR2 (ENSPREG00000002051) ENSPREG00000002001 ENSPREG00000001984 ENSPREG00000001975 SOX8 (ENSPREG00000001953) RAB26 (ENSPREG00000001912) ENSPREG00000001872 rnps1 (ENSPREG00000001843) ENSPREG00000001839 ENSPREG00000001820 ##21 ENSPREG00000001811 ENSPREG00000001800 ENSPREG00000001788 ##21 ENSPREG00000001786 ENSPREG00000001780 #22 ENSPREG00000001760 #22 ENSPREG00000001748 ENSPREG00000001727 #21 ENSPREG00000001711 ##23 ENSPREG00000001698 ENSPREG00000001685 ##23 ENSPREG00000001678 #22 ENSPREG00000001654 ##23 ENSPREG00000001636 ##23 ENSPREG00000001629 ##23 ENSPREG00000001621 ENSPREG00000001590 #22 ENSPREG00000001573 ENSPREG00000001557 ##21 ENSPREG00000001541 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 623 ENSGT00940000163533 ENSGT01090000259993.A.b.j.j.h #21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.a.b #22 Amazon molly MODERN SPECIES 205 ENSPFOG00000024506 #22 Sailfin molly MODERN SPECIES 1435 ENSPLAG00000011177 #21 ENSPLAG00000011170 ENSPLAG00000011154 ##23 ENSPLAG00000011104 ENSPLAG00000011092 #22 ENSPLAG00000011082 ##23 ENSPLAG00000011071 ENSPLAG00000011056 #22 ENSPLAG00000011052 ##23 ENSPLAG00000011045 #22 ENSPLAG00000011032 #22 ENSPLAG00000011013 ##21 ENSPLAG00000011009 ##21 ENSPLAG00000010992 ENSPLAG00000010988 #21 ENSPLAG00000010974 #22 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.b.a.a ENSGT01100000263566.b.b.c.a.b.a.a.b ##20 ENSGT00940000163847.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.c #21 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536.r ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b.a.b.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.a ##23 ENSGT01030000234536.q ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.r ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a.a.a ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.b.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.j.i.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b.h.a ENSGT01100000263485.b ENSGT01090000259993.D.b.d.x ##21 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b.a.a ##23 ENSGT00940000161491.o.a ENSGT00940000163371.b Poecilia ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.a.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j.g.b.a #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.a ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.b.a ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.b.a.b ##20 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536.r ENSGT01090000259993.A.b.j.j.g.b.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234536.q ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.r ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a.a.a ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.a.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.i.a #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.f ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b.h.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01090000259993.D.b.d.x ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000161491.o.a ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 282 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.e ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.f ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.f ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.a.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j.g.b.a #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234536.q ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.r ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a.a.a ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.a.a ##23 Sailfin molly MODERN SPECIES 1435 ENSPLAG00000011248 ##23 ENSPLAG00000011233 ENSPLAG00000011217 ENSPLAG00000011204 #21 ENSPLAG00000011199 #21 ENSPLAG00000011185 ##23 ENSPLAG00000011177 #21 ENSPLAG00000011170 ENSPLAG00000011154 ##23 ENSPLAG00000011104 ENSPLAG00000011092 #22 ENSPLAG00000011082 ##23 ENSPLAG00000011071 ENSPLAG00000011056 #22 ENSPLAG00000011052 ##23 ENSPLAG00000011045 #22 ENSPLAG00000011032 #22 ENSPLAG00000011013 ##21 ENSPLAG00000011009 ##21 ENSPLAG00000010992 ENSPLAG00000010988 #21 ENSPLAG00000010974 #22 Amazon molly MODERN SPECIES 392 ENSPFOG00000022578 ##23 ENSPFOG00000009649 #21 ENSPFOG00000009656 ##23 ENSPFOG00000009658 ##23 ENSPFOG00000009662 #21 ENSPFOG00000009670 ##23 ENSPFOG00000022229 ##23 ENSPFOG00000009676 ENSPFOG00000009682 #21 ENSPFOG00000009692 ##23 ENSPFOG00000009700 #22 ENSPFOG00000009706 ##23 ENSPFOG00000023918 ##23 ENSPFOG00000009719 ##23 ENSPFOG00000021976 ##23 ENSPFOG00000009730 #22 ENSPFOG00000009612 ##23 ENSPFOG00000009735 ##23 ENSPFOG00000009737 #22 ENSPFOG00000009711 #22 ENSPFOG00000022986 ENSPFOG00000024674 ENSPFOG00000022066 #21 ENSPFOG00000009747 ##21 ENSPFOG00000009751 #21 ENSPFOG00000009754 #21 ENSPFOG00000009765 ENSPFOG00000024452 ##23 ENSPFOG00000022129 ENSPFOG00000022600 ##21 ENSPFOG00000020769 Platyfish MODERN SPECIES 7 ENSXMAG00000022615 ENSXMAG00000021571 #21 ENSXMAG00000024899 ENSXMAG00000024790 ##23 ENSXMAG00000023468 #21 ENSXMAG00000021885 ##23 ENSXMAG00000029596 #22 ENSXMAG00000028302 ##23 ENSXMAG00000027675 ENSXMAG00000028495 ##23 ENSXMAG00000024118 ##23 ENSXMAG00000022914 ENSXMAG00000022779 ENSXMAG00000024780 ##23 ENSXMAG00000029974 #22 ENSXMAG00000023060 #22 ENSXMAG00000027121 ##23 ENSXMAG00000030034 ENSXMAG00000025074 #22 ENSXMAG00000019791 #22 ENSXMAG00000023473 ##21 ENSXMAG00000025675 #21 ENSXMAG00000024542 #21 ENSXMAG00000027049 ENSXMAG00000021588 #21 ENSXMAG00000024766 ##21 ENSXMAG00000024548 #21 ENSXMAG00000028218 ##20 ENSXMAG00000020862 #21 ENSXMAG00000027236 ENSXMAG00000025942 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 157 ENSGT01030000234794 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.y #22 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 223 ENSGT01030000234794 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.y #22 Guppy MODERN SPECIES 460 ENSPREG00000001800 ENSPREG00000001788 ##21 ENSPREG00000001786 ENSPREG00000001780 #22 ENSPREG00000001760 #22 ENSPREG00000001748 ENSPREG00000001727 #21 ENSPREG00000001711 ##23 ENSPREG00000001698 ENSPREG00000001685 ##23 ENSPREG00000001678 #22 ENSPREG00000001654 ##23 ENSPREG00000001636 ##23 ENSPREG00000001629 ##23 ENSPREG00000001621 ENSPREG00000001590 #22 ENSPREG00000001573 ENSPREG00000001557 ##21 ENSPREG00000001541 ENSPREG00000001531 #21 ENSPREG00000001524 ##20 ENSPREG00000001517 ##21 ENSPREG00000001499 ENSPREG00000001473 #21 ENSPREG00000001447 ENSPREG00000001424 #21 ENSPREG00000001382 ##23 ENSPREG00000001371 ENSPREG00000001358 ENSPREG00000001345 ENSPREG00000001328 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.f ##21 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536 ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.a.b Percomorphaceae_C DUPLICATION Percomorphaceae_C DUPLICATION Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155653.a ENSGT00940000159110.a ENSGT00940000163157.b ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT01000000219961 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000161676 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.b ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01050000245780 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263485.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263485.b Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263566.b.b.b.b ##20 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263566.b.b.b.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.j #21 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 143 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.o.a.a ##21 Pike perch DUPLICATION Pike perch DUPLICATION Pike perch DUPLICATION Pike perch MODERN SPECIES 38 ENSSLUG00000010497 ##23 ENSSLUG00000010521 ENSSLUG00000010533 #22 ENSSLUG00000010537 ENSSLUG00000010541 #22 ENSSLUG00000010546 ENSSLUG00000010548 ENSSLUG00000010553 ENSSLUG00000010557 #21 ENSSLUG00000010564 ENSSLUG00000010571 ##23 ENSSLUG00000010578 #22 ENSSLUG00000010583 ##20 ENSSLUG00000010586 #21 ENSSLUG00000010589 ##21 ENSSLUG00000010599 #22 ENSSLUG00000010607 Pike perch MODERN SPECIES 174 ENSSLUG00000015713 #22 ENSSLUG00000015711 ENSSLUG00000015708 ENSSLUG00000015704 ENSSLUG00000015697 ENSSLUG00000015692 ENSSLUG00000015688 ##23 ENSSLUG00000015682 ENSSLUG00000015674 ENSSLUG00000015670 ##23 ENSSLUG00000015663 ##21 ENSSLUG00000015662 ##21 ENSSLUG00000015659 ##21 ENSSLUG00000015658 ENSSLUG00000015654 ENSSLUG00000015653 ##21 Pike perch MODERN SPECIES 38 kctd13 (ENSSLUG00000010312) SEZ6L2 (ENSSLUG00000010334) ASPHD2 (ENSSLUG00000010461) cabp5b (ENSSLUG00000010476) ENSSLUG00000010497 ##23 ENSSLUG00000010521 ENSSLUG00000010533 #22 ENSSLUG00000010537 ENSSLUG00000010541 #22 ENSSLUG00000010546 ENSSLUG00000010548 ENSSLUG00000010553 ENSSLUG00000010557 #21 ENSSLUG00000010564 ENSSLUG00000010571 ##23 ENSSLUG00000010578 #22 ENSSLUG00000010583 ##20 ENSSLUG00000010586 #21 ENSSLUG00000010589 ##21 ENSSLUG00000010599 #22 ENSSLUG00000010607 Pike perch MODERN SPECIES 540 ENSSLUG00000006633 #22 ENSSLUG00000006629 ENSSLUG00000006624 ENSSLUG00000006619 ENSSLUG00000006615 ##23 ENSSLUG00000006611 ##21 ENSSLUG00000006066 ENSSLUG00000006034 ##21 ENSSLUG00000006028 ENSSLUG00000006027 ENSSLUG00000006021 ##21 ENSSLUG00000006016 ##21 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 904 ENSLCAG00010016854 ENSLCAG00010016852 ##23 ENSLCAG00010016848 ENSLCAG00010016844 ENSLCAG00010016842 ENSLCAG00010016840 ENSLCAG00010016839 ENSLCAG00010016838 #22 ENSLCAG00010016837 ##21 ENSLCAG00010016833 ##23 ENSLCAG00010016831 ENSLCAG00010016829 ##23 Barramundi perch MODERN SPECIES 41 ENSLCAG00010018814 ENSLCAG00010018812 ENSLCAG00010018810 ENSLCAG00010018809 ENSLCAG00010018808 ##21 ENSLCAG00010018807 ##21 ENSLCAG00010018806 ##23 ENSLCAG00010018804 ENSLCAG00010018803 ENSLCAG00010018802 ENSLCAG00010018799 ENSLCAG00010018798 ENSLCAG00010018797 ENSLCAG00010018796 ##23 ENSLCAG00010018794 ENSLCAG00010018793 #22 ENSLCAG00010018792 ENSLCAG00010018790 ENSLCAG00010018784 ENSLCAG00010018782 #22 ENSLCAG00010018779 ##21 ENSLCAG00010018777 ##23 ENSLCAG00010018775 ##21 ENSLCAG00010018773 ENSLCAG00010018770 ##21 ENSLCAG00010018769 ENSLCAG00010018767 ENSLCAG00010018765 #22 ENSLCAG00010018763 ##21 ENSLCAG00010018760 ENSLCAG00010018758 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.b #22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.b #22 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.b #22 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.b #22 Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.b #22 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.b #22 Pike perch MODERN SPECIES 38 pold1 (ENSSLUG00000004188) zgc:55558 (ENSSLUG00000004975) slc17a7a (ENSSLUG00000005346) ENSSLUG00000009321 eps8l1a (ENSSLUG00000009333) nme4 (ENSSLUG00000009337) xpo6 (ENSSLUG00000009383) antkmt (ENSSLUG00000010248) hirip3 (ENSSLUG00000010260) kctd13 (ENSSLUG00000010312) SEZ6L2 (ENSSLUG00000010334) ASPHD2 (ENSSLUG00000010461) cabp5b (ENSSLUG00000010476) ENSSLUG00000010497 ##23 ENSSLUG00000010521 ENSSLUG00000010533 #22 ENSSLUG00000010537 ENSSLUG00000010541 #22 ENSSLUG00000010546 ENSSLUG00000010548 ENSSLUG00000010553 ENSSLUG00000010557 #21 ENSSLUG00000010564 ENSSLUG00000010571 ##23 ENSSLUG00000010578 #22 ENSSLUG00000010583 ##20 ENSSLUG00000010586 #21 ENSSLUG00000010589 ##21 ENSSLUG00000010599 #22 ENSSLUG00000010607 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b ##20 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.a ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.a ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 ENSGT01090000259993.A.b.j #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3261 ENSSLDG00000007056 ##23 ENSSLDG00000007070 ENSSLDG00000007077 ##21 ENSSLDG00000007083 ENSSLDG00000007092 ENSSLDG00000007101 ##21 ENSSLDG00000007122 ENSSLDG00000007135 ##23 ENSSLDG00000007149 ENSSLDG00000007172 ##23 ENSSLDG00000007185 ENSSLDG00000007200 ENSSLDG00000007211 ENSSLDG00000007225 ENSSLDG00000007249 ENSSLDG00000007296 #22 ENSSLDG00000007321 ENSSLDG00000007358 ENSSLDG00000007373 ENSSLDG00000007388 ENSSLDG00000007405 ##23 ENSSLDG00000007408 ##23 ENSSLDG00000007415 ENSSLDG00000007422 ##21 ENSSLDG00000007442 ENSSLDG00000007449 ENSSLDG00000007473 ##23 ENSSLDG00000007490 #22 ENSSLDG00000007503 ##23 ENSSLDG00000007519 ENSSLDG00000007525 ##23 Greater amberjack MODERN SPECIES 87 ENSSDUG00000004705 ENSSDUG00000004711 ENSSDUG00000004722 ENSSDUG00000004740 ##23 ENSSDUG00000004749 ENSSDUG00000004753 ##23 ENSSDUG00000004756 ##21 ENSSDUG00000004764 ENSSDUG00000004772 #22 ENSSDUG00000004786 ENSSDUG00000004794 ENSSDUG00000004799 ##23 ENSSDUG00000004806 ENSSDUG00000004813 ENSSDUG00000004819 ##23 ENSSDUG00000004824 ENSSDUG00000004834 ENSSDUG00000004842 ##23 ENSSDUG00000004852 ENSSDUG00000004860 ENSSDUG00000004868 ENSSDUG00000004872 ##23 ENSSDUG00000004881 ENSSDUG00000004887 #22 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.a.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.b ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.b ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.A.b.j #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.a ##21 ENSGT01100000263566.b.b.b.b ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 ENSGT00940000163533 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.a ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.a ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.b.r ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a ##20 ENSGT01090000259993.C.a ##21 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.d ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000161676 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.d.f ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.b ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 ENSGT01090000259993.A.b.j #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000177227.b ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.d.e ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 21 ENSATEG00000026824 ENSATEG00000026664 ENSATEG00000000930 ENSATEG00000028802 #22 ENSATEG00000000965 ENSATEG00000000961 ##21 ENSATEG00000000945 #21 ENSATEG00000029610 ENSATEG00000001616 ENSATEG00000000906 ENSATEG00000000888 ENSATEG00000000792 ENSATEG00000026710 ENSATEG00000029899 #21 ENSATEG00000028908 ##21 ENSATEG00000000836 #22 ENSATEG00000000714 ENSATEG00000000700 ##23 ENSATEG00000000155 #22 ENSATEG00000000696 ENSATEG00000000686 ##23 ENSATEG00000000663 ##20 ENSATEG00000000655 ##21 ENSATEG00000027922 ##20 ENSATEG00000000647 ##23 ENSATEG00000000621 ENSATEG00000029788 ENSATEG00000000601 ##20 ENSATEG00000000591 ENSATEG00000000581 ##20 ENSATEG00000001023 Climbing perch MODERN SPECIES 21 ENSATEG00000028802 #22 ENSATEG00000000965 ENSATEG00000000961 ##21 ENSATEG00000000945 #21 ENSATEG00000029610 ENSATEG00000001616 ENSATEG00000000906 ENSATEG00000000888 ENSATEG00000000792 ENSATEG00000026710 ENSATEG00000029899 #21 ENSATEG00000028908 ##21 ENSATEG00000000836 #22 ENSATEG00000000714 ENSATEG00000000700 ##23 ENSATEG00000000155 #22 ENSATEG00000000696 ENSATEG00000000686 ##23 ENSATEG00000000663 ##20 ENSATEG00000000655 ##21 ENSATEG00000027922 ##20 ENSATEG00000000647 ##23 ENSATEG00000000621 ENSATEG00000029788 ENSATEG00000000601 ##20 ENSATEG00000000591 ENSATEG00000000581 ##20 ENSATEG00000001023 ENSATEG00000000541 ##20 ENSATEG00000026078 #21 ENSATEG00000000470 Climbing perch MODERN SPECIES 21 ENSATEG00000001041 #21 ENSATEG00000026263 ENSATEG00000001387 ENSATEG00000001190 ##20 ENSATEG00000026139 ENSATEG00000001119 ENSATEG00000001087 ENSATEG00000001049 ENSATEG00000027272 ##21 ENSATEG00000026632 #21 ENSATEG00000001035 #22 ENSATEG00000028265 ENSATEG00000026824 ENSATEG00000026664 ENSATEG00000000930 ENSATEG00000028802 #22 ENSATEG00000000965 ENSATEG00000000961 ##21 ENSATEG00000000945 #21 ENSATEG00000029610 ENSATEG00000001616 ENSATEG00000000906 ENSATEG00000000888 ENSATEG00000000792 ENSATEG00000026710 ENSATEG00000029899 #21 ENSATEG00000028908 ##21 ENSATEG00000000836 #22 ENSATEG00000000714 ENSATEG00000000700 ##23 ENSATEG00000000155 #22 Climbing perch MODERN SPECIES 21 ENSATEG00000000668 ##23 ENSATEG00000001588 ENSATEG00000027565 ENSATEG00000027830 ENSATEG00000001423 ##21 ENSATEG00000001041 #21 ENSATEG00000026263 ENSATEG00000001387 ENSATEG00000001190 ##20 ENSATEG00000026139 ENSATEG00000001119 ENSATEG00000001087 ENSATEG00000001049 ENSATEG00000027272 ##21 ENSATEG00000026632 #21 ENSATEG00000001035 #22 ENSATEG00000028265 ENSATEG00000026824 ENSATEG00000026664 ENSATEG00000000930 ENSATEG00000028802 #22 ENSATEG00000000965 ENSATEG00000000961 ##21 ENSATEG00000000945 #21 ENSATEG00000029610 ENSATEG00000001616 ENSATEG00000000906 ENSATEG00000000888 ENSATEG00000000792 ENSATEG00000026710 ENSATEG00000029899 #21 Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish MODERN SPECIES 36 ENSBSLG00000005079 ENSBSLG00000005058 ##21 ENSBSLG00000005046 #22 ENSBSLG00000005026 #21 ENSBSLG00000005014 ENSBSLG00000007084 ENSBSLG00000007072 ##23 ENSBSLG00000007066 ENSBSLG00000007056 ENSBSLG00000007043 ##21 ENSBSLG00000007023 #21 ENSBSLG00000007012 ##21 ENSBSLG00000007001 #22 ENSBSLG00000006990 #21 ENSBSLG00000006976 ENSBSLG00000006970 #22 ENSBSLG00000006964 ENSBSLG00000006952 #21 ENSBSLG00000006934 ##23 ENSBSLG00000006926 ENSBSLG00000006908 ENSBSLG00000006883 ENSBSLG00000006878 ##23 ENSBSLG00000006869 ENSBSLG00000006859 ##23 ENSBSLG00000006840 ENSBSLG00000006816 ENSBSLG00000006789 ##23 ENSBSLG00000006783 ENSBSLG00000006765 ENSBSLG00000006715 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 36 ENSBSLG00000005436 #22 ENSBSLG00000005420 #21 ENSBSLG00000005405 ENSBSLG00000005385 ##21 ENSBSLG00000005360 ENSBSLG00000005330 ENSBSLG00000005293 ##21 ENSBSLG00000005270 ##23 ENSBSLG00000005222 ENSBSLG00000005193 #21 ENSBSLG00000005160 ##23 ENSBSLG00000005131 ##20 ENSBSLG00000005096 ENSBSLG00000005079 ENSBSLG00000005058 ##21 ENSBSLG00000005046 #22 ENSBSLG00000005026 #21 ENSBSLG00000005014 ENSBSLG00000007084 ENSBSLG00000007072 ##23 ENSBSLG00000007066 ENSBSLG00000007056 ENSBSLG00000007043 ##21 ENSBSLG00000007023 #21 ENSBSLG00000007012 ##21 ENSBSLG00000007001 #22 ENSBSLG00000006990 #21 ENSBSLG00000006976 ENSBSLG00000006970 #22 ENSBSLG00000006964 ENSBSLG00000006952 #21 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 19 ASPHD2 (ENSBSLG00000018390) ENSBSLG00000018395 ENSBSLG00000018403 ##21 ENSBSLG00000018431 #21 ENSBSLG00000018435 ENSBSLG00000018436 #21 ENSBSLG00000018439 ##23 ENSBSLG00000018449 ENSBSLG00000018462 ##21 ENSBSLG00000018469 ##20 ENSBSLG00000018475 ENSBSLG00000018483 ENSBSLG00000018494 ENSBSLG00000018501 ##23 ENSBSLG00000018506 ##21 ENSBSLG00000018513 #22 ENSBSLG00000018516 ENSBSLG00000018528 #21 ENSBSLG00000018529 ##23 ENSBSLG00000018533 ENSBSLG00000018535 ENSBSLG00000018538 ##23 ENSBSLG00000018542 ##21 ENSBSLG00000018545 ##21 ENSBSLG00000018548 ##23 ENSBSLG00000018550 ENSBSLG00000018552 ##23 ENSBSLG00000018556 odad3 (ENSBSLG00000018566) ENSBSLG00000018581 #22 ENSBSLG00000018587 #22 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 36 ENSBSLG00000005799 ##20 ENSBSLG00000005792 ENSBSLG00000005786 ENSBSLG00000005781 ENSBSLG00000005779 #21 ENSBSLG00000005769 ENSBSLG00000005640 ##21 ENSBSLG00000005616 ENSBSLG00000005601 #21 ENSBSLG00000005575 #22 ENSBSLG00000005537 #21 ENSBSLG00000005512 ENSBSLG00000005489 ENSBSLG00000005472 #21 ENSBSLG00000005456 ##21 ENSBSLG00000005436 #22 ENSBSLG00000005420 #21 ENSBSLG00000005405 ENSBSLG00000005385 ##21 ENSBSLG00000005360 ENSBSLG00000005330 ENSBSLG00000005293 ##21 ENSBSLG00000005270 ##23 ENSBSLG00000005222 ENSBSLG00000005193 #21 ENSBSLG00000005160 ##23 ENSBSLG00000005131 ##20 ENSBSLG00000005096 ENSBSLG00000005079 ENSBSLG00000005058 ##21 ENSBSLG00000005046 #22 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 36 ENSBSLG00000005160 ##23 ENSBSLG00000005131 ##20 ENSBSLG00000005096 ENSBSLG00000005079 ENSBSLG00000005058 ##21 ENSBSLG00000005046 #22 ENSBSLG00000005026 #21 ENSBSLG00000005014 ENSBSLG00000007084 ENSBSLG00000007072 ##23 ENSBSLG00000007066 ENSBSLG00000007056 ENSBSLG00000007043 ##21 ENSBSLG00000007023 #21 ENSBSLG00000007012 ##21 ENSBSLG00000007001 #22 ENSBSLG00000006990 #21 ENSBSLG00000006976 ENSBSLG00000006970 #22 ENSBSLG00000006964 ENSBSLG00000006952 #21 ENSBSLG00000006934 ##23 ENSBSLG00000006926 ENSBSLG00000006908 ENSBSLG00000006883 ENSBSLG00000006878 ##23 ENSBSLG00000006869 ENSBSLG00000006859 ##23 ENSBSLG00000006840 ENSBSLG00000006816 ENSBSLG00000006789 ##23 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 36 ENSBSLG00000005833 ENSBSLG00000005824 ##21 ENSBSLG00000005817 ##21 ENSBSLG00000005813 ##21 ENSBSLG00000005809 ##21 ENSBSLG00000005803 ##21 ENSBSLG00000005799 ##20 ENSBSLG00000005792 ENSBSLG00000005786 ENSBSLG00000005781 ENSBSLG00000005779 #21 ENSBSLG00000005769 ENSBSLG00000005640 ##21 ENSBSLG00000005616 ENSBSLG00000005601 #21 ENSBSLG00000005575 #22 ENSBSLG00000005537 #21 ENSBSLG00000005512 ENSBSLG00000005489 ENSBSLG00000005472 #21 ENSBSLG00000005456 ##21 ENSBSLG00000005436 #22 ENSBSLG00000005420 #21 ENSBSLG00000005405 ENSBSLG00000005385 ##21 ENSBSLG00000005360 ENSBSLG00000005330 ENSBSLG00000005293 ##21 ENSBSLG00000005270 ##23 ENSBSLG00000005222 ENSBSLG00000005193 #21 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000001104 ENSMAMG00000001097 ENSMAMG00000001089 #21 ENSMAMG00000026259 ENSMAMG00000025082 ENSMAMG00000000451 ENSMAMG00000028434 ENSMAMG00000001036 ##23 ENSMAMG00000000560 ##21 ENSMAMG00000028285 ENSMAMG00000000956 ##23 ENSMAMG00000028142 ##21 ENSMAMG00000026841 ENSMAMG00000024978 ENSMAMG00000026982 ##21 ENSMAMG00000028392 #22 ENSMAMG00000026436 ENSMAMG00000028692 #22 ENSMAMG00000028305 ##21 ENSMAMG00000024355 ENSMAMG00000000717 ##23 ENSMAMG00000024507 #22 ENSMAMG00000024965 ##21 ENSMAMG00000000650 ##21 ENSMAMG00000028585 ENSMAMG00000027080 ##21 ENSMAMG00000026032 ##21 ENSMAMG00000024433 ##21 ENSMAMG00000025219 ENSMAMG00000027269 ##21 ENSMAMG00000028471 ##21 Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000028434 ENSMAMG00000001036 ##23 ENSMAMG00000000560 ##21 ENSMAMG00000028285 ENSMAMG00000000956 ##23 ENSMAMG00000028142 ##21 ENSMAMG00000026841 ENSMAMG00000024978 ENSMAMG00000026982 ##21 ENSMAMG00000028392 #22 ENSMAMG00000026436 ENSMAMG00000028692 #22 ENSMAMG00000028305 ##21 ENSMAMG00000024355 ENSMAMG00000000717 ##23 ENSMAMG00000024507 #22 ENSMAMG00000024965 ##21 ENSMAMG00000000650 ##21 ENSMAMG00000028585 ENSMAMG00000027080 ##21 ENSMAMG00000026032 ##21 ENSMAMG00000024433 ##21 ENSMAMG00000025219 ENSMAMG00000027269 ##21 ENSMAMG00000028471 ##21 ENSMAMG00000000434 ENSMAMG00000027320 ENSMAMG00000024600 ##21 ENSMAMG00000024933 ENSMAMG00000026579 ##21 ENSMAMG00000025910 ##23 Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000025910 ##23 ENSMAMG00000024984 ENSMAMG00000028261 ENSMAMG00000026819 ##21 ENSMAMG00000028319 ##21 ENSMAMG00000028601 #22 ENSMAMG00000023887 ##21 ENSMAMG00000024945 ENSMAMG00000000746 #22 ENSMAMG00000027077 ENSMAMG00000026899 #22 ENSMAMG00000027508 ##21 ENSMAMG00000027036 ENSMAMG00000026010 #22 ENSMAMG00000023895 ##23 ENSMAMG00000027815 #22 ENSMAMG00000028177 ENSMAMG00000026986 ##21 ENSMAMG00000027133 #22 ENSMAMG00000023813 ENSMAMG00000024778 ##23 ENSMAMG00000025545 ENSMAMG00000023888 #22 ENSMAMG00000000406 ENSMAMG00000025580 ##21 ENSMAMG00000028529 ##23 ENSMAMG00000025108 ENSMAMG00000026321 ENSMAMG00000025918 ##21 ENSMAMG00000025759 ENSMAMG00000025822 ##21 Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000023804 ##21 ENSMAMG00000023837 ENSMAMG00000023889 ENSMAMG00000023835 ##23 ENSMAMG00000023832 ENSMAMG00000023829 ENSMAMG00000028322 ##23 ENSMAMG00000026629 ##21 ENSMAMG00000025173 ENSMAMG00000023824 ##23 ENSMAMG00000023823 ENSMAMG00000000529 ##23 ENSMAMG00000028401 #22 ENSMAMG00000026254 ENSMAMG00000023820 ##23 ENSMAMG00000023818 #22 ENSMAMG00000024358 ENSMAMG00000025038 ##23 ENSMAMG00000024354 ##21 ENSMAMG00000000582 ENSMAMG00000026711 ##23 ENSMAMG00000028283 ENSMAMG00000024549 ##21 ENSMAMG00000028650 #22 ENSMAMG00000026392 ENSMAMG00000023808 ENSMAMG00000023807 #22 ENSMAMG00000026749 ENSMAMG00000027228 ##23 ENSMAMG00000025241 ENSMAMG00000027298 ##23 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b ##20 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b ##20 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 113 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b ##20 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010007737 ENSSAUG00010007739 ##23 ENSSAUG00010007742 ENSSAUG00010007745 ##23 ENSSAUG00010007747 #21 ENSSAUG00010007750 ENSSAUG00010007754 ENSSAUG00010007756 ##23 ENSSAUG00010007758 #22 ENSSAUG00010007759 ENSSAUG00010007760 #22 ENSSAUG00010007762 ##21 ENSSAUG00010007764 ENSSAUG00010007765 ##21 ENSSAUG00010007768 ENSSAUG00010007772 #22 ENSSAUG00010007774 ENSSAUG00010007776 ##21 ENSSAUG00010007777 ENSSAUG00010007780 ##21 ENSSAUG00010007783 #21 ENSSAUG00010007785 #22 ENSSAUG00010007786 ENSSAUG00010007788 ENSSAUG00010007792 ##23 ENSSAUG00010007795 ENSSAUG00010007796 ##21 ENSSAUG00010007797 #22 ENSSAUG00010007799 ##21 ENSSAUG00010007800 ENSSAUG00010007801 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 142 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 91 ENSDLAG00005027764 ##21 ENSDLAG00005027882 ENSDLAG00005030974 ENSDLAG00005029369 #22 ENSDLAG00005033742 ENSDLAG00005006320 #22 ENSDLAG00005005555 #21 ENSDLAG00005027015 ENSDLAG00005033188 ENSDLAG00005016193 #22 ENSDLAG00005033356 ENSDLAG00005020029 ENSDLAG00005004769 ##23 ENSDLAG00005027171 ENSDLAG00005029915 ENSDLAG00005026552 ENSDLAG00005030204 ENSDLAG00005015113 European seabass MODERN SPECIES 13 ENSDLAG00005003596 ENSDLAG00005033609 ENSDLAG00005026872 ENSDLAG00005006439 ENSDLAG00005033500 ENSDLAG00005031704 ENSDLAG00005003557 ENSDLAG00005028963 ENSDLAG00005013040 ENSDLAG00005011971 ENSDLAG00005006360 ENSDLAG00005034241 ENSDLAG00005030778 ENSDLAG00005026911 ENSDLAG00005016933 ENSDLAG00005034780 #22 ENSDLAG00005027456 ##20 ENSDLAG00005027540 ##21 ENSDLAG00005028486 ENSDLAG00005031678 ENSDLAG00005034525 ENSDLAG00005029883 #21 ENSDLAG00005030612 ENSDLAG00005002994 ENSDLAG00005003929 ENSDLAG00005002353 ENSDLAG00005034020 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.f ##21 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536 ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.b ##20 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT01000000219961 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT00940000163847.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b ##23 ENSGT01030000234536 ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.a ENSGT01090000259993.A.b.j #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a.a.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01050000244936 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01100000263566.b.b.a.a ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT00940000163847.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.a.e.a ENSGT01090000259993.A.b.j.i.b #21 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.a.e.b ##21 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.b ##20 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a #21 ENSGT01100000263566.b.b.c.b ##20 ENSGT01030000234536 ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000161491 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00440000038032 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01030000234794 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.g.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.s ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.j.i.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.r ##23 ENSGT00940000163849.j #22 ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.a ##23 ENSGT01030000234536 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.a.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a ##23 ENSGT01090000259993.C.a.b.b ##21 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.b.c.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.b.c.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.b.a.b.a.a ENSGT01100000263566.b.b.c.a.b.a.a.b ##20 ENSGT00940000163847.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.c #21 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536.r ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b.a.b.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.a ##23 ENSGT01030000234536.q ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.r ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a.a.a ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.b.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.j.i.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b.h.a ENSGT01100000263485.b ENSGT01090000259993.D.b.d.x ##21 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01090000259993.D.b.d.y ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.f ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.f ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.a.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j.g.b.a #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.a ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.b.a ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.b.a.b ##20 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536.r ENSGT01090000259993.A.b.j.j.g.b.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234536.q ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.r ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a.a.a ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.a.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.i.a #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.f ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b.h.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01090000259993.D.b.d.x ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000161491.o.a NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 282 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.e ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.f ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b.f ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.a.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j.g.b.a #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234536.q ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b.x.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.r ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a.a.a ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.a.a ##23 Amazon molly DUPLICATION Amazon molly MODERN SPECIES 1491 ENSPFOG00000007902 ##23 ENSPFOG00000007885 #22 Amazon molly MODERN SPECIES 392 ENSPFOG00000009616 ##23 ENSPFOG00000009601 #21 ENSPFOG00000009629 #22 ENSPFOG00000009645 ##23 ENSPFOG00000022462 ENSPFOG00000022578 ##23 ENSPFOG00000009649 #21 ENSPFOG00000009656 ##23 ENSPFOG00000009658 ##23 ENSPFOG00000009662 #21 ENSPFOG00000009670 ##23 ENSPFOG00000022229 ##23 ENSPFOG00000009676 ENSPFOG00000009682 #21 ENSPFOG00000009692 ##23 ENSPFOG00000009700 #22 ENSPFOG00000009706 ##23 ENSPFOG00000023918 ##23 ENSPFOG00000009719 ##23 ENSPFOG00000021976 ##23 ENSPFOG00000009730 #22 ENSPFOG00000009612 ##23 ENSPFOG00000009735 ##23 ENSPFOG00000009737 #22 ENSPFOG00000009711 #22 ENSPFOG00000022986 ENSPFOG00000024674 ENSPFOG00000022066 #21 ENSPFOG00000009747 ##21 ENSPFOG00000009751 #21 ENSPFOG00000009754 #21 Sailfin molly MODERN SPECIES 1435 ENSPLAG00000011248 ##23 ENSPLAG00000011233 ENSPLAG00000011217 ENSPLAG00000011204 #21 ENSPLAG00000011199 #21 ENSPLAG00000011185 ##23 ENSPLAG00000011177 #21 ENSPLAG00000011170 ENSPLAG00000011154 ##23 ENSPLAG00000011104 ENSPLAG00000011092 #22 ENSPLAG00000011082 ##23 ENSPLAG00000011071 ENSPLAG00000011056 #22 ENSPLAG00000011052 ##23 ENSPLAG00000011045 #22 ENSPLAG00000011032 #22 ENSPLAG00000011013 ##21 ENSPLAG00000011009 ##21 ENSPLAG00000010992 ENSPLAG00000010988 #21 ENSPLAG00000010974 #22 Guppy MODERN SPECIES 460 ENSPREG00000001872 rnps1 (ENSPREG00000001843) ENSPREG00000001839 ENSPREG00000001820 ##21 ENSPREG00000001811 ENSPREG00000001800 ENSPREG00000001788 ##21 ENSPREG00000001786 ENSPREG00000001780 #22 ENSPREG00000001760 #22 ENSPREG00000001748 ENSPREG00000001727 #21 ENSPREG00000001711 ##23 ENSPREG00000001698 ENSPREG00000001685 ##23 ENSPREG00000001678 #22 ENSPREG00000001654 ##23 ENSPREG00000001636 ##23 ENSPREG00000001629 ##23 ENSPREG00000001621 ENSPREG00000001590 #22 ENSPREG00000001573 ENSPREG00000001557 ##21 ENSPREG00000001541 ENSPREG00000001531 #21 ENSPREG00000001524 ##20 ENSPREG00000001517 ##21 ENSPREG00000001499 ENSPREG00000001473 #21 ENSPREG00000001447 ENSPREG00000001424 #21 Platyfish MODERN SPECIES 7 ENSXMAG00000027148 ##20 ENSXMAG00000026485 ENSXMAG00000025546 ##20 ENSXMAG00000026026 ##20 ENSXMAG00000029805 ##20 ENSXMAG00000026991 ENSXMAG00000029553 ##20 ENSXMAG00000023175 ##21 ENSXMAG00000027449 ENSXMAG00000022615 ENSXMAG00000021571 #21 ENSXMAG00000024899 ENSXMAG00000024790 ##23 ENSXMAG00000023468 #21 ENSXMAG00000021885 ##23 ENSXMAG00000029596 #22 ENSXMAG00000028302 ##23 ENSXMAG00000027675 ENSXMAG00000028495 ##23 ENSXMAG00000024118 ##23 ENSXMAG00000022914 ENSXMAG00000022779 ENSXMAG00000024780 ##23 ENSXMAG00000029974 #22 ENSXMAG00000023060 #22 ENSXMAG00000027121 ##23 ENSXMAG00000030034 ENSXMAG00000025074 #22 ENSXMAG00000019791 #22 ENSXMAG00000023473 ##21 ENSXMAG00000025675 #21 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1466 ENSCVAG00000009717 ##21 ENSCVAG00000009732 ##21 ENSCVAG00000009736 ##21 ENSCVAG00000009741 ##21 ENSCVAG00000009746 ##20 ENSCVAG00000009751 ##21 ENSCVAG00000009754 ##20 ENSCVAG00000009759 ##20 ENSCVAG00000009762 ENSCVAG00000009776 #22 ENSCVAG00000009799 #22 ENSCVAG00000009809 #21 ENSCVAG00000009822 #21 ENSCVAG00000009837 ENSCVAG00000009846 #22 ENSCVAG00000009857 #22 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 Midas cichlid MODERN SPECIES 1680 ENSACIG00000006794 #22 ENSACIG00000006818 #22 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1791 ENSHBUG00000006952 #22 ENSHBUG00000006945 #22 Pomacentridae DUPLICATION Pomacentridae DUPLICATION Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00560000077365 ENSGT00940000155653.a ENSGT00940000159110.a ENSGT00940000163157.b ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000161676 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.e.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.c Bicolor damselfish DUPLICATION Bicolor damselfish MODERN SPECIES 279 slc17a7a (ENSSPAG00000009662) ENSSPAG00000009612 eps8l1a (ENSSPAG00000009589) nme4 (ENSSPAG00000009575) xpo6 (ENSSPAG00000009469) antkmt (ENSSPAG00000009411) kctd13 (ENSSPAG00000009375) SEZ6L2 (ENSSPAG00000009300) ENSSPAG00000009284 cabp5b (ENSSPAG00000009272) ENSSPAG00000009258 ENSSPAG00000009240 ##21 ENSSPAG00000009210 ENSSPAG00000009199 ENSSPAG00000009187 ##21 ENSSPAG00000009183 #22 ENSSPAG00000009170 ENSSPAG00000009150 ##23 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 427 metrnla (ENSSPAG00000011125) znf750 (ENSSPAG00000011111) TBCD (ENSSPAG00000011028) fn3krp (ENSSPAG00000011008) arl16 (ENSSPAG00000011000) ENSSPAG00000010975 rasd2a (ENSSPAG00000010931) rsad1 (ENSSPAG00000010913) ENSSPAG00000010906 btr02 (ENSSPAG00000010873) ENSSPAG00000010844 ENSSPAG00000010834 ##21 ENSSPAG00000010824 #22 hgs (ENSSPAG00000010735) zgc:103625 (ENSSPAG00000010700) mrpl12 (ENSSPAG00000010692) ENSSPAG00000010667 SLC25A10 (ENSSPAG00000010618) snx8a (ENSSPAG00000010575) nudt1 (ENSSPAG00000010558) MRM2 (ENSSPAG00000010550) ELFN1 (ENSSPAG00000010543) psmg3 (ENSSPAG00000010528) tmem184a (ENSSPAG00000010495) mafk (ENSSPAG00000010487) INTS1 (ENSSPAG00000010380) ENSSPAG00000010358 micall2a (ENSSPAG00000010328) Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 364 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.e.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.c Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 392 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.e.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.c Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish MODERN SPECIES 5 ENSAPEG00000017252 ENSAPEG00000017343 ENSAPEG00000017353 ENSAPEG00000017369 #22 ENSAPEG00000017392 #22 ENSAPEG00000017455 ENSAPEG00000017461 ENSAPEG00000017477 #22 ENSAPEG00000017488 ENSAPEG00000017492 ##23 ENSAPEG00000017498 ENSAPEG00000017503 ENSAPEG00000017517 #22 ENSAPEG00000017534 ##23 ENSAPEG00000017541 ENSAPEG00000017548 #22 ENSAPEG00000017563 ENSAPEG00000017572 #22 ENSAPEG00000017581 ##23 ENSAPEG00000017585 ENSAPEG00000017593 #22 ENSAPEG00000017608 #22 ENSAPEG00000017623 ENSAPEG00000017634 ##23 ENSAPEG00000017638 ENSAPEG00000017645 ##23 ENSAPEG00000017657 ENSAPEG00000017670 ENSAPEG00000017693 ENSAPEG00000017707 ENSAPEG00000000331 Orange clownfish MODERN SPECIES 5 ENSAPEG00000017126 ENSAPEG00000017135 ##21 ENSAPEG00000017142 ENSAPEG00000017148 ENSAPEG00000017153 #21 ENSAPEG00000017171 #21 ENSAPEG00000017184 ##21 ENSAPEG00000017233 #22 ENSAPEG00000017252 ENSAPEG00000017343 ENSAPEG00000017353 ENSAPEG00000017369 #22 ENSAPEG00000017392 #22 ENSAPEG00000017455 ENSAPEG00000017461 ENSAPEG00000017477 #22 ENSAPEG00000017488 ENSAPEG00000017492 ##23 ENSAPEG00000017498 ENSAPEG00000017503 ENSAPEG00000017517 #22 ENSAPEG00000017534 ##23 ENSAPEG00000017541 ENSAPEG00000017548 #22 ENSAPEG00000017563 ENSAPEG00000017572 #22 ENSAPEG00000017581 ##23 ENSAPEG00000017585 ENSAPEG00000017593 #22 ENSAPEG00000017608 #22 ENSAPEG00000017623 Orange clownfish MODERN SPECIES 5 ENSAPEG00000017455 ENSAPEG00000017461 ENSAPEG00000017477 #22 ENSAPEG00000017488 ENSAPEG00000017492 ##23 ENSAPEG00000017498 ENSAPEG00000017503 ENSAPEG00000017517 #22 ENSAPEG00000017534 ##23 ENSAPEG00000017541 ENSAPEG00000017548 #22 ENSAPEG00000017563 ENSAPEG00000017572 #22 ENSAPEG00000017581 ##23 ENSAPEG00000017585 ENSAPEG00000017593 #22 ENSAPEG00000017608 #22 ENSAPEG00000017623 ENSAPEG00000017634 ##23 ENSAPEG00000017638 ENSAPEG00000017645 ##23 ENSAPEG00000017657 ENSAPEG00000017670 ENSAPEG00000017693 ENSAPEG00000017707 ENSAPEG00000000331 ENSAPEG00000000357 ENSAPEG00000000382 #22 ENSAPEG00000000392 ENSAPEG00000000421 ENSAPEG00000000427 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2854 ENSAOCG00000015036 #22 ENSAOCG00000015044 ##23 ENSAOCG00000015052 ENSAOCG00000015071 ENSAOCG00000015087 ENSAOCG00000015105 ENSAOCG00000015121 #22 ENSAOCG00000015130 ENSAOCG00000015145 #22 ENSAOCG00000015160 ENSAOCG00000002080 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.e.b #22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.e.b #22 Amphiprion DUPLICATION Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 325 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.e.b.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.d.a.a.b.b.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b.e.a.b ##23 Orange clownfish MODERN SPECIES 16 ENSAPEG00000012601 igfbp5a (ENSAPEG00000012586) igfbp2a (ENSAPEG00000012551) stk11ip (ENSAPEG00000012477) ENSAPEG00000012453 ENSAPEG00000012419 ENSAPEG00000012395 ENSAPEG00000012373 ENSAPEG00000012358 ENSAPEG00000012341 ENSAPEG00000012329 ENSAPEG00000012317 ENSAPEG00000012272 ENSAPEG00000012251 ENSAPEG00000012154 ENSAPEG00000012047 #22 ENSAPEG00000012035 ENSAPEG00000012022 ENSAPEG00000011995 ENSAPEG00000011984 ENSAPEG00000011975 ##23 ENSAPEG00000011962 ENSAPEG00000011943 ENSAPEG00000011935 ##21 ENSAPEG00000011921 ENSAPEG00000011881 ENSAPEG00000011826 #22 ENSAPEG00000011809 ##23 ENSAPEG00000011744 ENSAPEG00000011735 ENSAPEG00000011697 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2854 ENSAOCG00000015036 #22 ENSAOCG00000015044 ##23 ENSAOCG00000015052 ENSAOCG00000015071 ENSAOCG00000015087 ENSAOCG00000015105 ENSAOCG00000015121 #22 ENSAOCG00000015130 ENSAOCG00000015145 #22 ENSAOCG00000015160 ENSAOCG00000002080 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 420 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.e.b.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.d.a.a.b.b.a.b Orange clownfish MODERN SPECIES 5 drg2 (ENSAPEG00000001397) gfer (ENSAPEG00000001380) syngr3a (ENSAPEG00000001376) znf598 (ENSAPEG00000001367) slc25a17 (ENSAPEG00000001328) rpusd1 (ENSAPEG00000001316) ENSAPEG00000001293 arhgdig (ENSAPEG00000001267) ENSAPEG00000001251 ENSAPEG00000001237 ENSAPEG00000001216 ENSAPEG00000001200 ENSAPEG00000001164 ENSAPEG00000001157 ENSAPEG00000001148 ENSAPEG00000001140 #22 ENSAPEG00000001121 ENSAPEG00000001111 ENSAPEG00000001107 ENSAPEG00000001087 ENSAPEG00000001076 ##23 ENSAPEG00000001015 ENSAPEG00000001008 ##21 ENSAPEG00000001004 #22 ENSAPEG00000000990 ##23 ENSAPEG00000000967 ENSAPEG00000000955 ##21 ENSAPEG00000000951 ##23 ENSAPEG00000000934 ENSAPEG00000000897 ##21 ENSAPEG00000000891 ##23 Spiny chromis MODERN SPECIES 3393 ENSAPOG00000000455 #22 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 224 ENSSPAG00000002588 #22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.f #22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.f #22 Spiny chromis MODERN SPECIES 4562 ENSAPOG00000020093 #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01100000263566.b.b.b.a ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000163847.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01060000248704 ENSGT00940000161491 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000177484 ENSGT00940000163334.d ENSGT00940000159737.d ENSGT00940000157282 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.b #22 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163847.b ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.d ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.b #21 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.h #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.l ##23 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.a.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.b ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.a ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b.d.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000161491 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00440000038032 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 244 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.d.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b.f ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 Bicolor damselfish DUPLICATION Bicolor damselfish MODERN SPECIES 223 ENSSPAG00000002567 #22 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 771 ENSSPAG00000013223 LLGL1 (ENSSPAG00000013131) flii (ENSSPAG00000013019) desi1a (ENSSPAG00000012997) ENSSPAG00000012976 ENSSPAG00000012935 ENSSPAG00000012918 #22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 267 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.d.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b.f ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 Amphiprion DUPLICATION Amphiprion ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.b.c #22 Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 2854 ENSAOCG00000015036 #22 ENSAOCG00000015044 ##23 ENSAOCG00000015052 ENSAOCG00000015071 ENSAOCG00000015087 ENSAOCG00000015105 ENSAOCG00000015121 #22 ENSAOCG00000015130 ENSAOCG00000015145 #22 ENSAOCG00000015160 ENSAOCG00000002080 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1813 ENSAOCG00000018234 #22 ENSAOCG00000001305 cabp5b (ENSAOCG00000018327) ENSAOCG00000018350 ENSAOCG00000018363 SEZ6L2 (ENSAOCG00000018390) kctd13 (ENSAOCG00000018424) hirip3 (ENSAOCG00000018436) antkmt (ENSAOCG00000018443) xpo6 (ENSAOCG00000001326) nme4 (ENSAOCG00000018585) eps8l1a (ENSAOCG00000018647) ENSAOCG00000018706 slc17a7a (ENSAOCG00000018768) Orange clownfish MODERN SPECIES 5 ENSAPEG00000000629 ENSAPEG00000000660 ENSAPEG00000000684 ENSAPEG00000000713 ENSAPEG00000000851 ENSAPEG00000000854 ENSAPEG00000000871 ##21 ENSAPEG00000000886 ##23 ENSAPEG00000000891 ##23 ENSAPEG00000000897 ##21 ENSAPEG00000000934 ENSAPEG00000000951 ##23 ENSAPEG00000000955 ##21 ENSAPEG00000000967 ENSAPEG00000000990 ##23 ENSAPEG00000001004 #22 ENSAPEG00000001008 ##21 ENSAPEG00000001015 ENSAPEG00000001076 ##23 ENSAPEG00000001087 ENSAPEG00000001107 ENSAPEG00000001111 ENSAPEG00000001121 ENSAPEG00000001140 #22 ENSAPEG00000001148 ENSAPEG00000001157 ENSAPEG00000001164 ENSAPEG00000001200 ENSAPEG00000001216 ENSAPEG00000001237 ENSAPEG00000001251 Amphiprion DUPLICATION Amphiprion ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.b.d.a #22 Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 1741 ENSAOCG00000017414 ##23 ENSAOCG00000017423 ENSAOCG00000017458 #22 ENSAOCG00000001222 ENSAOCG00000017490 ENSAOCG00000017499 ENSAOCG00000017521 #21 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2707 ENSAOCG00000012982 ENSAOCG00000013001 ENSAOCG00000013016 #22 Orange clownfish MODERN SPECIES 5 ENSAPEG00000017095 ENSAPEG00000017106 ##23 ENSAPEG00000017116 ENSAPEG00000017126 ENSAPEG00000017135 ##21 ENSAPEG00000017142 ENSAPEG00000017148 ENSAPEG00000017153 #21 ENSAPEG00000017171 #21 ENSAPEG00000017184 ##21 ENSAPEG00000017233 #22 ENSAPEG00000017252 ENSAPEG00000017343 ENSAPEG00000017353 ENSAPEG00000017369 #22 ENSAPEG00000017392 #22 ENSAPEG00000017455 ENSAPEG00000017461 ENSAPEG00000017477 #22 ENSAPEG00000017488 ENSAPEG00000017492 ##23 ENSAPEG00000017498 ENSAPEG00000017503 ENSAPEG00000017517 #22 ENSAPEG00000017534 ##23 ENSAPEG00000017541 ENSAPEG00000017548 #22 ENSAPEG00000017563 ENSAPEG00000017572 #22 ENSAPEG00000017581 ##23 ENSAPEG00000017585 Amphiprion DUPLICATION Amphiprion ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.b.d.b.a #22 Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish MODERN SPECIES 5 ENSAPEG00000017461 ENSAPEG00000017477 #22 ENSAPEG00000017488 ENSAPEG00000017492 ##23 ENSAPEG00000017498 ENSAPEG00000017503 ENSAPEG00000017517 #22 ENSAPEG00000017534 ##23 ENSAPEG00000017541 ENSAPEG00000017548 #22 ENSAPEG00000017563 ENSAPEG00000017572 #22 ENSAPEG00000017581 ##23 ENSAPEG00000017585 ENSAPEG00000017593 #22 ENSAPEG00000017608 #22 ENSAPEG00000017623 ENSAPEG00000017634 ##23 ENSAPEG00000017638 ENSAPEG00000017645 ##23 ENSAPEG00000017657 ENSAPEG00000017670 ENSAPEG00000017693 ENSAPEG00000017707 ENSAPEG00000000331 ENSAPEG00000000357 ENSAPEG00000000382 #22 ENSAPEG00000000392 ENSAPEG00000000421 ENSAPEG00000000427 ENSAPEG00000000464 Orange clownfish MODERN SPECIES 5 ENSAPEG00000017353 ENSAPEG00000017369 #22 ENSAPEG00000017392 #22 ENSAPEG00000017455 ENSAPEG00000017461 ENSAPEG00000017477 #22 ENSAPEG00000017488 ENSAPEG00000017492 ##23 ENSAPEG00000017498 ENSAPEG00000017503 ENSAPEG00000017517 #22 ENSAPEG00000017534 ##23 ENSAPEG00000017541 ENSAPEG00000017548 #22 ENSAPEG00000017563 ENSAPEG00000017572 #22 ENSAPEG00000017581 ##23 ENSAPEG00000017585 ENSAPEG00000017593 #22 ENSAPEG00000017608 #22 ENSAPEG00000017623 ENSAPEG00000017634 ##23 ENSAPEG00000017638 ENSAPEG00000017645 ##23 ENSAPEG00000017657 ENSAPEG00000017670 ENSAPEG00000017693 ENSAPEG00000017707 ENSAPEG00000000331 ENSAPEG00000000357 ENSAPEG00000000382 #22 Orange clownfish MODERN SPECIES 5 ENSAPEG00000017062 ##23 ENSAPEG00000017066 ENSAPEG00000017074 ##23 ENSAPEG00000017078 ENSAPEG00000017087 ##21 ENSAPEG00000017095 ENSAPEG00000017106 ##23 ENSAPEG00000017116 ENSAPEG00000017126 ENSAPEG00000017135 ##21 ENSAPEG00000017142 ENSAPEG00000017148 ENSAPEG00000017153 #21 ENSAPEG00000017171 #21 ENSAPEG00000017184 ##21 ENSAPEG00000017233 #22 ENSAPEG00000017252 ENSAPEG00000017343 ENSAPEG00000017353 ENSAPEG00000017369 #22 ENSAPEG00000017392 #22 ENSAPEG00000017455 ENSAPEG00000017461 ENSAPEG00000017477 #22 ENSAPEG00000017488 ENSAPEG00000017492 ##23 ENSAPEG00000017498 ENSAPEG00000017503 ENSAPEG00000017517 #22 ENSAPEG00000017534 ##23 ENSAPEG00000017541 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 324 ENSGT00940000163849.i.a.b.d.b.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b.e.a.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a.d.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.d.a.a.b.b.b.a.b.a Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish MODERN SPECIES 16 ENSAPEG00000012317 ENSAPEG00000012272 ENSAPEG00000012251 ENSAPEG00000012154 ENSAPEG00000012047 #22 ENSAPEG00000012035 ENSAPEG00000012022 ENSAPEG00000011995 ENSAPEG00000011984 ENSAPEG00000011975 ##23 ENSAPEG00000011962 ENSAPEG00000011943 ENSAPEG00000011935 ##21 ENSAPEG00000011921 ENSAPEG00000011881 ENSAPEG00000011826 #22 ENSAPEG00000011809 ##23 ENSAPEG00000011744 ENSAPEG00000011735 ENSAPEG00000011697 ENSAPEG00000011665 ENSAPEG00000011583 ENSAPEG00000011548 ENSAPEG00000011544 ENSAPEG00000011531 ENSAPEG00000011510 ENSAPEG00000011486 ENSAPEG00000011476 ENSAPEG00000011463 ENSAPEG00000011412 ENSAPEG00000011359 Orange clownfish MODERN SPECIES 5 ENSAPEG00000017087 ##21 ENSAPEG00000017095 ENSAPEG00000017106 ##23 ENSAPEG00000017116 ENSAPEG00000017126 ENSAPEG00000017135 ##21 ENSAPEG00000017142 ENSAPEG00000017148 ENSAPEG00000017153 #21 ENSAPEG00000017171 #21 ENSAPEG00000017184 ##21 ENSAPEG00000017233 #22 ENSAPEG00000017252 ENSAPEG00000017343 ENSAPEG00000017353 ENSAPEG00000017369 #22 ENSAPEG00000017392 #22 ENSAPEG00000017455 ENSAPEG00000017461 ENSAPEG00000017477 #22 ENSAPEG00000017488 ENSAPEG00000017492 ##23 ENSAPEG00000017498 ENSAPEG00000017503 ENSAPEG00000017517 #22 ENSAPEG00000017534 ##23 ENSAPEG00000017541 ENSAPEG00000017548 #22 ENSAPEG00000017563 ENSAPEG00000017572 #22 ENSAPEG00000017581 ##23 Orange clownfish MODERN SPECIES 5 ENSAPEG00000017572 #22 ENSAPEG00000017581 ##23 ENSAPEG00000017585 ENSAPEG00000017593 #22 ENSAPEG00000017608 #22 ENSAPEG00000017623 ENSAPEG00000017634 ##23 ENSAPEG00000017638 ENSAPEG00000017645 ##23 ENSAPEG00000017657 ENSAPEG00000017670 ENSAPEG00000017693 ENSAPEG00000017707 ENSAPEG00000000331 ENSAPEG00000000357 ENSAPEG00000000382 #22 ENSAPEG00000000392 ENSAPEG00000000421 ENSAPEG00000000427 ENSAPEG00000000464 ENSAPEG00000000473 ENSAPEG00000000476 ENSAPEG00000000524 ENSAPEG00000000603 ENSAPEG00000000611 ENSAPEG00000000623 ENSAPEG00000000626 ENSAPEG00000000629 ENSAPEG00000000660 ENSAPEG00000000684 ENSAPEG00000000713 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2812 ENSAOCG00000019513 ENSAOCG00000019539 #22 ENSAOCG00000019549 #21 ENSAOCG00000019552 ENSAOCG00000019558 ENSAOCG00000001422 ENSAOCG00000019572 ENSAOCG00000019582 ENSAOCG00000019609 ##23 ENSAOCG00000019638 ENSAOCG00000019662 ENSAOCG00000019736 ENSAOCG00000019772 ENSAOCG00000019778 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.b ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01050000245780 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000177453 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000177484 ENSGT00940000163334.d.s.b ENSGT00940000163334.d.s.a ENSGT00940000159737.d Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.a.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.a ##21 ENSGT01100000263566.b.b.b.b ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.a.a #22 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000161491 ENSGT01030000234901 ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000177484 ENSGT00940000163334.d.s.b ENSGT00940000159737.d Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.a ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.a ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.b.r ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.b.a ##20 ENSGT01090000259993.C.a ##21 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.d ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000159737.d ENSGT00940000157282 ENSGT00940000156054.c.a ENSGT00940000155025.B.j ENSGT00940000158594 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160506.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.d.f ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.b ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000163849.i.a.a.b.b #22 ENSGT01090000259993.A.b.j #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000177227.b ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.d.e ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000159737.d ENSGT00940000157282 ENSGT00940000156054.c.a ENSGT00940000155025.B.j ENSGT00940000158594 Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish MODERN SPECIES 36 ENSBSLG00000006840 ENSBSLG00000006816 ENSBSLG00000006789 ##23 ENSBSLG00000006783 ENSBSLG00000006765 ENSBSLG00000006715 ENSBSLG00000006706 ##23 ENSBSLG00000006678 ENSBSLG00000006656 ##23 ENSBSLG00000006646 ##23 ENSBSLG00000006621 ##21 ENSBSLG00000006590 ##21 ENSBSLG00000006542 ENSBSLG00000006521 #22 odad3 (ENSBSLG00000006444) ENSBSLG00000006418 #22 ENSBSLG00000006371 #22 ENSBSLG00000006322 ENSBSLG00000006290 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 19 ENSBSLG00000018506 ##21 ENSBSLG00000018513 #22 ENSBSLG00000018516 ENSBSLG00000018528 #21 ENSBSLG00000018529 ##23 ENSBSLG00000018533 ENSBSLG00000018535 ENSBSLG00000018538 ##23 ENSBSLG00000018542 ##21 ENSBSLG00000018545 ##21 ENSBSLG00000018548 ##23 ENSBSLG00000018550 ENSBSLG00000018552 ##23 ENSBSLG00000018556 odad3 (ENSBSLG00000018566) ENSBSLG00000018581 #22 ENSBSLG00000018587 #22 ENSBSLG00000018595 ENSBSLG00000018639 NACC1 (ENSBSLG00000018647) ENSBSLG00000018654 ENSBSLG00000018662 ENSBSLG00000018672 ENSBSLG00000018676 ENSBSLG00000018677 ENSBSLG00000018680 spag9a (ENSBSLG00000018699) tob1a (ENSBSLG00000019616) ENSBSLG00000019625 ANKRD40 (ENSBSLG00000019626) ENSBSLG00000019627 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 36 ENSBSLG00000006816 ENSBSLG00000006789 ##23 ENSBSLG00000006783 ENSBSLG00000006765 ENSBSLG00000006715 ENSBSLG00000006706 ##23 ENSBSLG00000006678 ENSBSLG00000006656 ##23 ENSBSLG00000006646 ##23 ENSBSLG00000006621 ##21 ENSBSLG00000006590 ##21 ENSBSLG00000006542 ENSBSLG00000006521 #22 odad3 (ENSBSLG00000006444) ENSBSLG00000006418 #22 ENSBSLG00000006371 #22 ENSBSLG00000006322 ENSBSLG00000006290 Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish MODERN SPECIES 19 ENSBSLG00000018513 #22 ENSBSLG00000018516 ENSBSLG00000018528 #21 ENSBSLG00000018529 ##23 ENSBSLG00000018533 ENSBSLG00000018535 ENSBSLG00000018538 ##23 ENSBSLG00000018542 ##21 ENSBSLG00000018545 ##21 ENSBSLG00000018548 ##23 ENSBSLG00000018550 ENSBSLG00000018552 ##23 ENSBSLG00000018556 odad3 (ENSBSLG00000018566) ENSBSLG00000018581 #22 ENSBSLG00000018587 #22 ENSBSLG00000018595 ENSBSLG00000018639 NACC1 (ENSBSLG00000018647) ENSBSLG00000018654 ENSBSLG00000018662 ENSBSLG00000018672 ENSBSLG00000018676 ENSBSLG00000018677 ENSBSLG00000018680 spag9a (ENSBSLG00000018699) tob1a (ENSBSLG00000019616) ENSBSLG00000019625 ANKRD40 (ENSBSLG00000019626) ENSBSLG00000019627 ENSBSLG00000019656 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 36 ENSBSLG00000006869 ENSBSLG00000006859 ##23 ENSBSLG00000006840 ENSBSLG00000006816 ENSBSLG00000006789 ##23 ENSBSLG00000006783 ENSBSLG00000006765 ENSBSLG00000006715 ENSBSLG00000006706 ##23 ENSBSLG00000006678 ENSBSLG00000006656 ##23 ENSBSLG00000006646 ##23 ENSBSLG00000006621 ##21 ENSBSLG00000006590 ##21 ENSBSLG00000006542 ENSBSLG00000006521 #22 odad3 (ENSBSLG00000006444) ENSBSLG00000006418 #22 ENSBSLG00000006371 #22 ENSBSLG00000006322 ENSBSLG00000006290 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.c.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.a ##23 ENSGT01100000263931 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000163847.b ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01060000248704 ENSGT00940000177453 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000177484 ENSGT00940000163334.d.s.a ENSGT00940000159737.d ENSGT00940000157282 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000163847.b ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT00940000177453 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000177484 ENSGT00940000163334.d.s.a ENSGT00940000159737.d Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 3620 ENSLBEG00000007712 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 3031 ENSLBEG00000004911 ##20 ENSLBEG00000004896 ENSLBEG00000004874 #22 ENSLBEG00000004864 #22 ENSLBEG00000004836 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1743 ENSLBEG00000018385 #22 ENSLBEG00000018396 ##21 ENSLBEG00000018406 #22 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 1272 ENSLBEG00000020847 ENSLBEG00000020872 ENSLBEG00000020883 ENSLBEG00000020894 ENSLBEG00000020902 ##23 ENSLBEG00000020925 #22 ENSLBEG00000020944 ENSLBEG00000020966 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2308 ENSLBEG00000021390 ENSLBEG00000021376 ENSLBEG00000021363 ##23 ENSLBEG00000021349 #22 ENSLBEG00000021329 ENSLBEG00000021304 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2127 ENSLBEG00000008559 #22 ENSLBEG00000008579 ENSLBEG00000008608 ENSLBEG00000008660 Ballan wrasse MODERN SPECIES 3557 ENSLBEG00000014551 ENSLBEG00000014560 ##21 ENSLBEG00000014567 ##23 ENSLBEG00000014584 #22 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 3085 ENSLBEG00000007871 ENSLBEG00000007849 #22 ENSLBEG00000007822 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4188 ENSLBEG00000011968 #22 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 1534 ENSLBEG00000015900 ##23 ENSLBEG00000015909 ENSLBEG00000015921 ENSLBEG00000015932 ##21 ENSLBEG00000015952 ENSLBEG00000015970 ##21 ENSLBEG00000015975 ##23 ENSLBEG00000015980 ENSLBEG00000015986 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1964 ENSLBEG00000010765 ENSLBEG00000010777 ##23 ENSLBEG00000010794 ENSLBEG00000010810 #22 ENSLBEG00000010822 ENSLBEG00000010838 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2604 ENSLBEG00000016898 ENSLBEG00000016929 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4860 ENSLBEG00000010676 ##20 ENSLBEG00000010651 ENSLBEG00000010633 #22 ENSLBEG00000010557 #22 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 3031 ENSLBEG00000004911 ##20 ENSLBEG00000004896 ENSLBEG00000004874 #22 ENSLBEG00000004864 #22 ENSLBEG00000004836 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4326 ENSLBEG00000016438 #22 ENSLBEG00000016366 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4954 ENSLBEG00000011370 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4169 ENSLBEG00000011242 #22 ENSLBEG00000011255 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 4647 ENSLBEG00000002201 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1506 ENSLBEG00000013852 ENSLBEG00000013872 ##23 ENSLBEG00000013891 ENSLBEG00000013902 ENSLBEG00000013920 #22 ENSLBEG00000013946 ##21 ENSLBEG00000013955 Ballan wrasse MODERN SPECIES 3085 ENSLBEG00000007871 ENSLBEG00000007849 #22 ENSLBEG00000007822 #22 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 4860 ENSLBEG00000010676 ##20 ENSLBEG00000010651 ENSLBEG00000010633 #22 ENSLBEG00000010557 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1680 ENSLBEG00000013273 ENSLBEG00000013288 ENSLBEG00000013300 ##21 ENSLBEG00000013319 ENSLBEG00000013331 #22 ENSLBEG00000013350 #22 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 3846 ENSLBEG00000018205 #22 ENSLBEG00000018231 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1743 ENSLBEG00000018385 #22 ENSLBEG00000018396 ##21 ENSLBEG00000018406 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2153 ENSLBEG00000009869 ##23 ENSLBEG00000009886 ENSLBEG00000009903 ENSLBEG00000009926 #22 ENSLBEG00000009943 ##23 ENSLBEG00000009960 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2717 ENSLBEG00000010599 ENSLBEG00000010617 ENSLBEG00000010641 #22 ENSLBEG00000010665 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2864 ENSLBEG00000019755 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2112 ENSLBEG00000007426 ENSLBEG00000007437 ##23 ENSLBEG00000007444 ENSLBEG00000007458 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4311 ENSLBEG00000014767 ENSLBEG00000014688 #22 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 4330 ENSLBEG00000017228 ENSLBEG00000017175 #22 ENSLBEG00000017122 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1762 ENSLBEG00000019717 ENSLBEG00000019703 ENSLBEG00000019694 ENSLBEG00000019676 ENSLBEG00000019670 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4259 ENSLBEG00000014533 #22 ENSLBEG00000014522 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1140 ENSLBEG00000025609 ENSLBEG00000025634 cabp5b (ENSLBEG00000025650) ENSLBEG00000025662 ENSLBEG00000025671 #21 ENSLBEG00000025683 ##23 ENSLBEG00000025694 ENSLBEG00000025702 ENSLBEG00000025713 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2130 ENSLBEG00000008753 ##21 ENSLBEG00000008759 ENSLBEG00000008768 ENSLBEG00000008791 ENSLBEG00000008807 ENSLBEG00000008826 ##21 ENSLBEG00000008838 ##23 ENSLBEG00000008852 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2121 ENSLBEG00000008296 ENSLBEG00000008334 ##21 ENSLBEG00000008346 ENSLBEG00000008356 ##21 ENSLBEG00000008372 #22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a ##21 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b ENSGT01090000259993.A.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b ##23 ENSGT01100000263566.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00940000163849.i.b #22 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01060000248704 ENSGT00940000161491 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000177284 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a ##23 ENSGT01100000263566.b ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536 ENSGT00940000163849.i.b #22 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01060000248704 ENSGT00940000161491 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000177284 Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 225 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 158 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 161 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.l.b Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.l.b Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 141 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.l.b Large yellow croaker MODERN SPECIES 483 ENSLCRG00005000731 ##23 ENSLCRG00005000735 #21 ENSLCRG00005000737 ENSLCRG00005000739 ##23 ENSLCRG00005000742 ENSLCRG00005000745 ENSLCRG00005000748 ENSLCRG00005000749 ENSLCRG00005000754 ##23 ENSLCRG00005000757 ENSLCRG00005000761 ##21 ENSLCRG00005000767 ##23 ENSLCRG00005000771 ENSLCRG00005000774 #22 ENSLCRG00005000777 ENSLCRG00005000783 #22 ENSLCRG00005000786 ENSLCRG00005000790 ENSLCRG00005000791 ENSLCRG00005000808 ENSLCRG00005000835 ENSLCRG00005000842 ENSLCRG00005000848 NACC1 (ENSLCRG00005000852) alkbh7 (ENSLCRG00005001146) GFUS (ENSLCRG00005001147) gtf2f1 (ENSLCRG00005001148) ENSLCRG00005001155 ENSLCRG00005001157 ENSLCRG00005001159 ELFN2 (ENSLCRG00005001160) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.b.a #22 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.b.a #22 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.b.a #22 Climbing perch MODERN SPECIES 9 ENSATEG00000007681 ENSATEG00000007738 ENSATEG00000026428 ENSATEG00000007636 ENSATEG00000007821 ENSATEG00000007845 ENSATEG00000026842 ENSATEG00000029242 ENSATEG00000007935 ENSATEG00000007978 ENSATEG00000028146 ENSATEG00000025716 ENSATEG00000008033 ENSATEG00000008078 ENSATEG00000026221 ENSATEG00000008137 #22 ENSATEG00000008189 ENSATEG00000008211 ENSATEG00000008264 ENSATEG00000008272 ENSATEG00000029572 ENSATEG00000022788 ENSATEG00000008348 ENSATEG00000027144 ENSATEG00000026965 ENSATEG00000008411 ENSATEG00000008653 ENSATEG00000030001 ENSATEG00000008880 ENSATEG00000028841 ENSATEG00000009871 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT00940000163849.i.b.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.k.b ##23 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 232 ENSGT00940000163849.i.b.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.k.b ##23 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000004452 ENSGT00390000018612.a.a ENSGT00560000077365 ENSGT00940000155653.a ENSGT00940000159110.a ENSGT00940000163157.b ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.b ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.a.b.b.a ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b ENSGT01090000259993.A.b.j.i.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT01030000234794 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000004452 ENSGT00390000018612.a.a ENSGT00560000077365 ENSGT00940000155653.a ENSGT00940000159110.a ENSGT00940000163157.b ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.b ##23 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000004452 ENSGT00390000018612.a.a ENSGT00560000077365 ENSGT00940000155653.a ENSGT00940000159110.a ENSGT00940000163157.b ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b.a.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.b.c.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.b.c.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.b.a.b.a.a ENSGT01100000263566.b.b.c.a.b.a.a.b ##20 ENSGT00940000163847.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.a.c #21 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01030000234536.r ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b.a.b.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.a ##23 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000004452 ENSGT00390000018612.a.a ENSGT00560000077365 ENSGT00940000155653.a ENSGT00940000159110.a ENSGT00940000163157.b ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j.g.a #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b.a.b.a ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.c ##23 Guppy MODERN SPECIES 460 SPHK1 (ENSPREG00000016154) ENSPREG00000016191 grapa (ENSPREG00000016211) EPN2 (ENSPREG00000016226) b9d1 (ENSPREG00000016266) ENSPREG00000016301 ENSPREG00000016342 eps8l1a (ENSPREG00000016362) nme4 (ENSPREG00000016410) xpo6 (ENSPREG00000016421) antkmt (ENSPREG00000016486) hirip3 (ENSPREG00000016543) kctd13 (ENSPREG00000016649) SEZ6L2 (ENSPREG00000016679) ASPHD2 (ENSPREG00000016698) ENSPREG00000016723 #22 cabp5b (ENSPREG00000016767) ENSPREG00000016780 ##23 ENSPREG00000016787 ##23 ENSPREG00000016798 ##23 ENSPREG00000016802 ##23 ENSPREG00000016814 #21 ENSPREG00000000554 #21 ENSPREG00000000562 ##21 ENSPREG00000000576 ##21 ENSPREG00000000632 ##23 ENSPREG00000000646 ##23 ENSPREG00000000654 ##23 ENSPREG00000000671 ENSPREG00000000698 ENSPREG00000000711 ##23 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00390000004452 ENSGT00390000018612.a.a ENSGT00560000077365 ENSGT00940000155653.a ENSGT00940000159110.a ENSGT00940000163157.b ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.b.c.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.a.b.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.b.c.b.a.b.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.a.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.b.c.a.a.b.a Sailfin molly MODERN SPECIES 465 gys1 (ENSPLAG00000014246) pold1 (ENSPLAG00000014202) zgc:55558 (ENSPLAG00000014136) slc17a7a (ENSPLAG00000014123) ENSPLAG00000014091 eps8l1a (ENSPLAG00000014077) nme4 (ENSPLAG00000014069) xpo6 (ENSPLAG00000014054) antkmt (ENSPLAG00000013983) hirip3 (ENSPLAG00000013979) kctd13 (ENSPLAG00000013971) SEZ6L2 (ENSPLAG00000013957) ENSPLAG00000013901 ENSPLAG00000013884 cabp5b (ENSPLAG00000013869) ENSPLAG00000013792 #22 ENSPLAG00000013714 ##23 ENSPLAG00000013708 ##23 ENSPLAG00000013700 ENSPLAG00000013687 #21 ENSPLAG00000013676 #21 ENSPLAG00000013657 ENSPLAG00000013648 ##23 ENSPLAG00000013633 ENSPLAG00000013623 ##21 ENSPLAG00000013611 ENSPLAG00000013602 ENSPLAG00000013595 ENSPLAG00000013589 ENSPLAG00000013580 ##23 ENSPLAG00000013573 Platyfish MODERN SPECIES 7 aspdh (ENSXMAG00000011818) gys1 (ENSXMAG00000011787) pold1 (ENSXMAG00000011702) zgc:55558 (ENSXMAG00000011691) slc17a7a (ENSXMAG00000011681) ENSXMAG00000011663 eps8l1a (ENSXMAG00000011657) nme4 (ENSXMAG00000011650) xpo6 (ENSXMAG00000011630) antkmt (ENSXMAG00000011622) hirip3 (ENSXMAG00000011617) kctd13 (ENSXMAG00000011606) SEZ6L2 (ENSXMAG00000011571) ENSXMAG00000011567 cabp5b (ENSXMAG00000011565) ENSXMAG00000011557 #22 ENSXMAG00000026421 ##23 ENSXMAG00000027203 ##23 ENSXMAG00000021411 ENSXMAG00000025489 ##23 ENSXMAG00000025581 ##23 ENSXMAG00000025947 ##23 ENSXMAG00000024289 ENSXMAG00000028491 #21 ENSXMAG00000026214 #21 ENSXMAG00000024750 #21 ENSXMAG00000022844 ##23 ENSXMAG00000026392 ENSXMAG00000024202 ENSXMAG00000027707 ENSXMAG00000024014 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00390000004452 ENSGT00390000018612.a.a ENSGT00560000077365 ENSGT00940000155653.a ENSGT00940000159110.a ENSGT00940000163157.b ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 Mummichog MODERN SPECIES 2491 aspdh (ENSFHEG00000020744) gys1 (ENSFHEG00000020804) pold1 (ENSFHEG00000020825) zgc:55558 (ENSFHEG00000020836) slc17a7a (ENSFHEG00000020886) ENSFHEG00000021008 eps8l1a (ENSFHEG00000021056) nme4 (ENSFHEG00000021063) xpo6 (ENSFHEG00000021190) antkmt (ENSFHEG00000000523) hirip3 (ENSFHEG00000021223) kctd13 (ENSFHEG00000021259) SEZ6L2 (ENSFHEG00000000762) ENSFHEG00000021279 cabp5b (ENSFHEG00000021325) ENSFHEG00000021435 #22 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00390000004452 ENSGT00390000018612.a.a ENSGT00560000077365 ENSGT00940000155653.a ENSGT00940000159110.a ENSGT00940000163157.b ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT00940000163849.i.b.a #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a.k.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b.g.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01100000263566.b.a ##20 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 108 gys1 (ENSKMAG00000009934) pold1 (ENSKMAG00000010007) zgc:55558 (ENSKMAG00000010093) slc17a7a (ENSKMAG00000010199) ENSKMAG00000010264 eps8l1a (ENSKMAG00000010313) nme4 (ENSKMAG00000010346) xpo6 (ENSKMAG00000010403) ENSKMAG00000010499 antkmt (ENSKMAG00000010520) hirip3 (ENSKMAG00000010532) kctd13 (ENSKMAG00000010552) SEZ6L2 (ENSKMAG00000010594) ENSKMAG00000010637 ENSKMAG00000010664 ENSKMAG00000010687 #22 ENSKMAG00000010713 ##23 ENSKMAG00000010724 ENSKMAG00000010742 ##23 ENSKMAG00000010759 ENSKMAG00000010767 ##23 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.b.a #22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.b.a #22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.b.a #22 Spiny chromis MODERN SPECIES 3614 ENSAPOG00000024219 #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a ##20 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263566.b.b.b.a ##20 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000163847.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01060000248704 ENSGT00940000161491 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000177484 ENSGT00940000163334.d Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161676 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT00940000163849.i.a.a.b.a.a #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.b ENSGT01100000263485.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01050000245780 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000177453 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00900000141021.b.b.e ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT00940000163849.j #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.c.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.a ##23 ENSGT01100000263931 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000163847.b ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT01060000248704 ENSGT00940000177453 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000163847.b ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT00940000163849.i.a.b #22 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT00940000177453 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000177484 ENSGT00940000163334.d.s.a ENSGT00940000159737.d ENSGT00940000157282 ENSGT00940000156054.c.a Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159110.a ENSGT00940000163157.b ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.k ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.a.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000163849.j.d #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.l.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.a.b.b.a ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT00940000163849.j.c #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.b.q.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.a.a.b ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.l.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.k ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B ENSGT00390000014585 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000159737.d ENSGT00940000157282 ENSGT00940000156054.c.a ENSGT00940000155025.B.j Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010017527 ##21 ENSSAUG00010017528 ENSSAUG00010017529 ##21 ENSSAUG00010017531 ##21 ENSSAUG00010017532 ##21 ENSSAUG00010017533 ##21 ENSSAUG00010017534 ##21 ENSSAUG00010017535 ##21 ENSSAUG00010017536 #22 ENSSAUG00010017537 ##21 ENSSAUG00010017538 ##23 ENSSAUG00010017539 ENSSAUG00010017540 ##23 ENSSAUG00010017541 ##21 ENSSAUG00010007693 ENSSAUG00010007695 #22 ENSSAUG00010007697 #21 ENSSAUG00010007699 ENSSAUG00010007700 ##21 ENSSAUG00010007701 ENSSAUG00010007702 ##21 ENSSAUG00010007703 ENSSAUG00010007706 ENSSAUG00010007707 ENSSAUG00010007709 ENSSAUG00010007710 ENSSAUG00010007711 ENSSAUG00010007713 ENSSAUG00010007714 ENSSAUG00010007717 ##20 ENSSAUG00010007720 Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010007754 ENSSAUG00010007756 ##23 ENSSAUG00010007758 #22 ENSSAUG00010007759 ENSSAUG00010007760 #22 ENSSAUG00010007762 ##21 ENSSAUG00010007764 ENSSAUG00010007765 ##21 ENSSAUG00010007768 ENSSAUG00010007772 #22 ENSSAUG00010007774 ENSSAUG00010007776 ##21 ENSSAUG00010007777 ENSSAUG00010007780 ##21 ENSSAUG00010007783 #21 ENSSAUG00010007785 #22 ENSSAUG00010007786 ENSSAUG00010007788 ENSSAUG00010007792 ##23 ENSSAUG00010007795 ENSSAUG00010007796 ##21 ENSSAUG00010007797 #22 ENSSAUG00010007799 ##21 ENSSAUG00010007800 ENSSAUG00010007801 ENSSAUG00010007802 ENSSAUG00010007803 ENSSAUG00010007804 ENSSAUG00010007805 ENSSAUG00010007806 NACC1 (ENSSAUG00010007807) Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010007725 ENSSAUG00010007728 ENSSAUG00010007729 #22 ENSSAUG00010007733 ENSSAUG00010007736 ##21 ENSSAUG00010007737 ENSSAUG00010007739 ##23 ENSSAUG00010007742 ENSSAUG00010007745 ##23 ENSSAUG00010007747 #21 ENSSAUG00010007750 ENSSAUG00010007754 ENSSAUG00010007756 ##23 ENSSAUG00010007758 #22 ENSSAUG00010007759 ENSSAUG00010007760 #22 ENSSAUG00010007762 ##21 ENSSAUG00010007764 ENSSAUG00010007765 ##21 ENSSAUG00010007768 ENSSAUG00010007772 #22 ENSSAUG00010007774 ENSSAUG00010007776 ##21 ENSSAUG00010007777 ENSSAUG00010007780 ##21 ENSSAUG00010007783 #21 ENSSAUG00010007785 #22 ENSSAUG00010007786 ENSSAUG00010007788 ENSSAUG00010007792 ##23 ENSSAUG00010007795 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010017365 ENSSAUG00010017366 ENSSAUG00010017368 ENSSAUG00010017369 ENSSAUG00010017370 ENSSAUG00010017374 ##23 ENSSAUG00010017375 ENSSAUG00010017376 ENSSAUG00010017378 ##23 ENSSAUG00010017380 ENSSAUG00010017381 ##21 ENSSAUG00010017399 ENSSAUG00010017401 ENSSAUG00010017402 ENSSAUG00010017404 ENSSAUG00010017405 #22 ENSSAUG00010017407 ENSSAUG00010017408 ENSSAUG00010017410 ENSSAUG00010017411 #22 ENSSAUG00010017413 ##23 ENSSAUG00010017414 #22 ENSSAUG00010017415 ##20 ENSSAUG00010017416 ##21 ENSSAUG00010017417 ##23 ENSSAUG00010017418 ##21 ENSSAUG00010017419 ENSSAUG00010017421 ENSSAUG00010017422 ##21 ENSSAUG00010017423 #21 ENSSAUG00010017425 ##23 Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010017327 ENSSAUG00010017328 #21 ENSSAUG00010017329 ENSSAUG00010017330 ENSSAUG00010017331 ##21 ENSSAUG00010017332 ##21 ENSSAUG00010017333 ENSSAUG00010017334 ENSSAUG00010017335 ENSSAUG00010017336 ENSSAUG00010017337 ##23 ENSSAUG00010017338 ENSSAUG00010017339 #22 ENSSAUG00010017340 ENSSAUG00010017341 ##23 ENSSAUG00010017342 #22 ENSSAUG00010017343 ENSSAUG00010017344 ##21 ENSSAUG00010017346 ENSSAUG00010017347 #21 ENSSAUG00010017348 ENSSAUG00010017349 ##21 ENSSAUG00010017350 ENSSAUG00010017351 ##23 ENSSAUG00010017352 ENSSAUG00010017353 ##21 ENSSAUG00010017354 ##21 ENSSAUG00010017355 #22 ENSSAUG00010017356 ENSSAUG00010017358 ##23 ENSSAUG00010017359 ##21 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010017516 ##21 ENSSAUG00010017518 ##20 ENSSAUG00010017519 ENSSAUG00010017520 #21 ENSSAUG00010017521 ENSSAUG00010017523 ##23 ENSSAUG00010017526 ENSSAUG00010017527 ##21 ENSSAUG00010017528 ENSSAUG00010017529 ##21 ENSSAUG00010017531 ##21 ENSSAUG00010017532 ##21 ENSSAUG00010017533 ##21 ENSSAUG00010017534 ##21 ENSSAUG00010017535 ##21 ENSSAUG00010017536 #22 ENSSAUG00010017537 ##21 ENSSAUG00010017538 ##23 ENSSAUG00010017539 ENSSAUG00010017540 ##23 ENSSAUG00010017541 ##21 ENSSAUG00010007693 ENSSAUG00010007695 #22 ENSSAUG00010007697 #21 ENSSAUG00010007699 ENSSAUG00010007700 ##21 ENSSAUG00010007701 ENSSAUG00010007702 ##21 ENSSAUG00010007703 ENSSAUG00010007706 ENSSAUG00010007707 Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010017339 #22 ENSSAUG00010017340 ENSSAUG00010017341 ##23 ENSSAUG00010017342 #22 ENSSAUG00010017343 ENSSAUG00010017344 ##21 ENSSAUG00010017346 ENSSAUG00010017347 #21 ENSSAUG00010017348 ENSSAUG00010017349 ##21 ENSSAUG00010017350 ENSSAUG00010017351 ##23 ENSSAUG00010017352 ENSSAUG00010017353 ##21 ENSSAUG00010017354 ##21 ENSSAUG00010017355 #22 ENSSAUG00010017356 ENSSAUG00010017358 ##23 ENSSAUG00010017359 ##21 ENSSAUG00010017360 ENSSAUG00010017361 ##21 ENSSAUG00010017362 ENSSAUG00010017363 ENSSAUG00010017365 ENSSAUG00010017366 ENSSAUG00010017368 ENSSAUG00010017369 ENSSAUG00010017370 ENSSAUG00010017374 ##23 ENSSAUG00010017375 ENSSAUG00010017376 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010007702 ##21 ENSSAUG00010007703 ENSSAUG00010007706 ENSSAUG00010007707 ENSSAUG00010007709 ENSSAUG00010007710 ENSSAUG00010007711 ENSSAUG00010007713 ENSSAUG00010007714 ENSSAUG00010007717 ##20 ENSSAUG00010007720 ENSSAUG00010007721 ENSSAUG00010007724 ENSSAUG00010007725 ENSSAUG00010007728 ENSSAUG00010007729 #22 ENSSAUG00010007733 ENSSAUG00010007736 ##21 ENSSAUG00010007737 ENSSAUG00010007739 ##23 ENSSAUG00010007742 ENSSAUG00010007745 ##23 ENSSAUG00010007747 #21 ENSSAUG00010007750 ENSSAUG00010007754 ENSSAUG00010007756 ##23 ENSSAUG00010007758 #22 ENSSAUG00010007759 ENSSAUG00010007760 #22 ENSSAUG00010007762 ##21 ENSSAUG00010007764 Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010007764 ENSSAUG00010007765 ##21 ENSSAUG00010007768 ENSSAUG00010007772 #22 ENSSAUG00010007774 ENSSAUG00010007776 ##21 ENSSAUG00010007777 ENSSAUG00010007780 ##21 ENSSAUG00010007783 #21 ENSSAUG00010007785 #22 ENSSAUG00010007786 ENSSAUG00010007788 ENSSAUG00010007792 ##23 ENSSAUG00010007795 ENSSAUG00010007796 ##21 ENSSAUG00010007797 #22 ENSSAUG00010007799 ##21 ENSSAUG00010007800 ENSSAUG00010007801 ENSSAUG00010007802 ENSSAUG00010007803 ENSSAUG00010007804 ENSSAUG00010007805 ENSSAUG00010007806 NACC1 (ENSSAUG00010007807) ENSSAUG00010007808 CACNA1A (ENSSAUG00010007818) alkbh7 (ENSSAUG00010007997) GFUS (ENSSAUG00010008001) gtf2f1 (ENSSAUG00010008012) GFUS (ENSSAUG00010008024) Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010017375 ENSSAUG00010017376 ENSSAUG00010017378 ##23 ENSSAUG00010017380 ENSSAUG00010017381 ##21 ENSSAUG00010017399 ENSSAUG00010017401 ENSSAUG00010017402 ENSSAUG00010017404 ENSSAUG00010017405 #22 ENSSAUG00010017407 ENSSAUG00010017408 ENSSAUG00010017410 ENSSAUG00010017411 #22 ENSSAUG00010017413 ##23 ENSSAUG00010017414 #22 ENSSAUG00010017415 ##20 ENSSAUG00010017416 ##21 ENSSAUG00010017417 ##23 ENSSAUG00010017418 ##21 ENSSAUG00010017419 ENSSAUG00010017421 ENSSAUG00010017422 ##21 ENSSAUG00010017423 #21 ENSSAUG00010017425 ##23 ENSSAUG00010017427 ENSSAUG00010017429 ENSSAUG00010017430 ENSSAUG00010017432 ENSSAUG00010017433 ENSSAUG00010017436 ##21 Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010017324 ENSSAUG00010017325 ##23 ENSSAUG00010017326 ENSSAUG00010017327 ENSSAUG00010017328 #21 ENSSAUG00010017329 ENSSAUG00010017330 ENSSAUG00010017331 ##21 ENSSAUG00010017332 ##21 ENSSAUG00010017333 ENSSAUG00010017334 ENSSAUG00010017335 ENSSAUG00010017336 ENSSAUG00010017337 ##23 ENSSAUG00010017338 ENSSAUG00010017339 #22 ENSSAUG00010017340 ENSSAUG00010017341 ##23 ENSSAUG00010017342 #22 ENSSAUG00010017343 ENSSAUG00010017344 ##21 ENSSAUG00010017346 ENSSAUG00010017347 #21 ENSSAUG00010017348 ENSSAUG00010017349 ##21 ENSSAUG00010017350 ENSSAUG00010017351 ##23 ENSSAUG00010017352 ENSSAUG00010017353 ##21 ENSSAUG00010017354 ##21 ENSSAUG00010017355 #22 Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010017468 ENSSAUG00010017469 ##23 ENSSAUG00010017472 ENSSAUG00010017474 ENSSAUG00010017475 ENSSAUG00010017477 ##23 ENSSAUG00010017482 ##23 ENSSAUG00010017484 ENSSAUG00010017489 ENSSAUG00010017492 ENSSAUG00010017494 ENSSAUG00010017496 ##21 ENSSAUG00010017497 ENSSAUG00010017499 ##21 ENSSAUG00010017502 ENSSAUG00010017503 #22 ENSSAUG00010017504 ##21 ENSSAUG00010017505 ENSSAUG00010017506 ENSSAUG00010017507 ENSSAUG00010017508 ENSSAUG00010017510 ENSSAUG00010017511 ENSSAUG00010017513 ENSSAUG00010017514 ENSSAUG00010017516 ##21 ENSSAUG00010017518 ##20 ENSSAUG00010017519 ENSSAUG00010017520 #21 ENSSAUG00010017521 ENSSAUG00010017523 ##23 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00390000004452 ENSGT00390000018612.a.a ENSGT00560000077365 ENSGT00940000155653.a ENSGT00940000159110.a ENSGT00940000163157.b ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000160506.b ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT00940000163371.b ENSGT00940000159327.u.a ENSGT00940000166693 ENSGT00940000156518.B.i ENSGT00390000014585 ENSGT00440000038032 ENSGT00390000004681.a.b ENSGT00940000163334.d.t ENSGT00940000159737.d ENSGT00940000157282 ENSGT00940000156054.c.a ENSGT00940000155025.B.j ENSGT00950000183213.a.b Fugu DUPLICATION Fugu DUPLICATION Fugu DUPLICATION Fugu DUPLICATION Fugu MODERN SPECIES 17 zgc:55558 (ENSTRUG00000006628) slc17a7a (ENSTRUG00000006463) ENSTRUG00000005532 eps8l1a (ENSTRUG00000005442) nme4 (ENSTRUG00000005236) xpo6 (ENSTRUG00000004696) antkmt (ENSTRUG00000004662) kctd13 (ENSTRUG00000004194) SEZ6L2 (ENSTRUG00000003228) cabp5b (ENSTRUG00000003005) ENSTRUG00000026531 ##20 ENSTRUG00000032055 ENSTRUG00000025998 ##23 ENSTRUG00000000530 ##23 ENSTRUG00000033012 ##20 ENSTRUG00000033194 #22 ENSTRUG00000030231 ##23 ENSTRUG00000032796 ##23 ENSTRUG00000032247 ##20 ENSTRUG00000023516 ##23 ENSTRUG00000029517 ##20 ENSTRUG00000027255 ##20 ENSTRUG00000030593 ##23 ENSTRUG00000028731 ##20 ENSTRUG00000028672 ##20 ENSTRUG00000032100 ##23 ENSTRUG00000028229 ##20 ENSTRUG00000029323 ##20 ENSTRUG00000003578 ##23 ENSTRUG00000024644 ##20 ENSTRUG00000031295 ##20 Fugu MODERN SPECIES 17 ENSTRUG00000003613 ##20 ENSTRUG00000032933 ##20 ENSTRUG00000033197 ##20 ENSTRUG00000030791 ##23 ENSTRUG00000032939 ##20 ENSTRUG00000026864 #22 ENSTRUG00000025248 ##23 ENSTRUG00000032375 ##20 ENSTRUG00000027717 ##23 ENSTRUG00000025518 ##20 ENSTRUG00000032725 ##20 ENSTRUG00000031881 ##20 ENSTRUG00000032940 ##20 ENSTRUG00000030374 ##20 ENSTRUG00000030415 ##20 ENSTRUG00000029781 #22 ENSTRUG00000027984 #22 ENSTRUG00000031570 ##20 ENSTRUG00000029586 ##23 ENSTRUG00000029335 ##20 ENSTRUG00000033260 ##20 ENSTRUG00000031180 ##20 ENSTRUG00000027213 ##20 ENSTRUG00000029416 ##20 ENSTRUG00000027843 ##20 ENSTRUG00000029871 ##20 ENSTRUG00000030120 ##20 ENSTRUG00000032439 ##20 ENSTRUG00000033375 ##20 ENSTRUG00000000089 ##23 ENSTRUG00000023840 ##20 Fugu MODERN SPECIES 17 ENSTRUG00000027984 #22 ENSTRUG00000031570 ##20 ENSTRUG00000029586 ##23 ENSTRUG00000029335 ##20 ENSTRUG00000033260 ##20 ENSTRUG00000031180 ##20 ENSTRUG00000027213 ##20 ENSTRUG00000029416 ##20 ENSTRUG00000027843 ##20 ENSTRUG00000029871 ##20 ENSTRUG00000030120 ##20 ENSTRUG00000032439 ##20 ENSTRUG00000033375 ##20 ENSTRUG00000000089 ##23 ENSTRUG00000023840 ##20 ENSTRUG00000002923 #22 ENSTRUG00000032529 ##20 ENSTRUG00000022833 ##23 ENSTRUG00000029916 ##20 ENSTRUG00000029486 ENSTRUG00000031579 ##20 ENSTRUG00000003480 ##20 ENSTRUG00000020328 ENSTRUG00000025090 ENSTRUG00000023823 ENSTRUG00000002527 NACC1 (ENSTRUG00000002054) ENSTRUG00000002420 CACNA1A (ENSTRUG00000002449) alkbh7 (ENSTRUG00000006386) gtf2f1 (ENSTRUG00000006429) Fugu MODERN SPECIES 17 ENSTRUG00000032933 ##20 ENSTRUG00000033197 ##20 ENSTRUG00000030791 ##23 ENSTRUG00000032939 ##20 ENSTRUG00000026864 #22 ENSTRUG00000025248 ##23 ENSTRUG00000032375 ##20 ENSTRUG00000027717 ##23 ENSTRUG00000025518 ##20 ENSTRUG00000032725 ##20 ENSTRUG00000031881 ##20 ENSTRUG00000032940 ##20 ENSTRUG00000030374 ##20 ENSTRUG00000030415 ##20 ENSTRUG00000029781 #22 ENSTRUG00000027984 #22 ENSTRUG00000031570 ##20 ENSTRUG00000029586 ##23 ENSTRUG00000029335 ##20 ENSTRUG00000033260 ##20 ENSTRUG00000031180 ##20 ENSTRUG00000027213 ##20 ENSTRUG00000029416 ##20 ENSTRUG00000027843 ##20 ENSTRUG00000029871 ##20 ENSTRUG00000030120 ##20 ENSTRUG00000032439 ##20 ENSTRUG00000033375 ##20 ENSTRUG00000000089 ##23 ENSTRUG00000023840 ##20 ENSTRUG00000002923 #22 Fugu MODERN SPECIES 17 ENSTRUG00000003578 ##23 ENSTRUG00000024644 ##20 ENSTRUG00000031295 ##20 ENSTRUG00000033133 ##23 ENSTRUG00000029321 ##20 ENSTRUG00000030019 ##20 ENSTRUG00000029942 ##20 ENSTRUG00000032910 ##20 ENSTRUG00000029020 ##23 ENSTRUG00000029608 ##20 ENSTRUG00000003613 ##20 ENSTRUG00000032933 ##20 ENSTRUG00000033197 ##20 ENSTRUG00000030791 ##23 ENSTRUG00000032939 ##20 ENSTRUG00000026864 #22 ENSTRUG00000025248 ##23 ENSTRUG00000032375 ##20 ENSTRUG00000027717 ##23 ENSTRUG00000025518 ##20 ENSTRUG00000032725 ##20 ENSTRUG00000031881 ##20 ENSTRUG00000032940 ##20 ENSTRUG00000030374 ##20 ENSTRUG00000030415 ##20 ENSTRUG00000029781 #22 ENSTRUG00000027984 #22 ENSTRUG00000031570 ##20 ENSTRUG00000029586 ##23 ENSTRUG00000029335 ##20 ENSTRUG00000033260 ##20 Tetraodon MODERN SPECIES 26 eps8l1a (ENSTNIG00000018947) nme4 (ENSTNIG00000018948) xpo6 (ENSTNIG00000018949) hirip3 (ENSTNIG00000000128) SEZ6L2 (ENSTNIG00000004090) ENSTNIG00000001382 ##20 ENSTNIG00000004091 ##23 ENSTNIG00000001398 ##20 ENSTNIG00000000813 ##23 ENSTNIG00000004485 ##20 ENSTNIG00000000757 ##23 ENSTNIG00000001357 ##20 ENSTNIG00000000799 ##20 ENSTNIG00000000116 ##23 ENSTNIG00000000009 ##23 ENSTNIG00000001034 #22 ENSTNIG00000001036 ##20 DNAH10 (ENSTNIG00000007222) ENSTNIG00000007223 ENSTNIG00000000689 ipo8 (ENSTNIG00000007224) ENSTNIG00000007225 msrb3 (ENSTNIG00000007226) ENSTNIG00000007227 dera (ENSTNIG00000007228) lmo3 (ENSTNIG00000007229) arhgef39 (ENSTNIG00000001519) TMEM121B (ENSTNIG00000007230) mkrn1 (ENSTNIG00000007231) tmem178bb (ENSTNIG00000007232) braf (ENSTNIG00000007233) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000163849.i.b.b #22 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 231 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000163849.i.b.b #22 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 234 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000163849.i.b.b #22 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.b.b #22 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.b.b #22 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.b.b #22 NAME_6 DUPLICATION NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.b.b.e #22 Sailfin molly MODERN SPECIES 1435 ENSPLAG00000011233 ENSPLAG00000011217 ENSPLAG00000011204 #21 ENSPLAG00000011199 #21 ENSPLAG00000011185 ##23 ENSPLAG00000011177 #21 ENSPLAG00000011170 ENSPLAG00000011154 ##23 ENSPLAG00000011104 ENSPLAG00000011092 #22 ENSPLAG00000011082 ##23 ENSPLAG00000011071 ENSPLAG00000011056 #22 ENSPLAG00000011052 ##23 ENSPLAG00000011045 #22 ENSPLAG00000011032 #22 ENSPLAG00000011013 ##21 ENSPLAG00000011009 ##21 ENSPLAG00000010992 ENSPLAG00000010988 #21 ENSPLAG00000010974 #22 Amazon molly MODERN SPECIES 392 ENSPFOG00000009662 #21 ENSPFOG00000009670 ##23 ENSPFOG00000022229 ##23 ENSPFOG00000009676 ENSPFOG00000009682 #21 ENSPFOG00000009692 ##23 ENSPFOG00000009700 #22 ENSPFOG00000009706 ##23 ENSPFOG00000023918 ##23 ENSPFOG00000009719 ##23 ENSPFOG00000021976 ##23 ENSPFOG00000009730 #22 ENSPFOG00000009612 ##23 ENSPFOG00000009735 ##23 ENSPFOG00000009737 #22 ENSPFOG00000009711 #22 ENSPFOG00000022986 ENSPFOG00000024674 ENSPFOG00000022066 #21 ENSPFOG00000009747 ##21 ENSPFOG00000009751 #21 ENSPFOG00000009754 #21 ENSPFOG00000009765 ENSPFOG00000024452 ##23 ENSPFOG00000022129 ENSPFOG00000022600 ##21 ENSPFOG00000020769 ENSPFOG00000009772 ##21 ENSPFOG00000009856 ##23 ENSPFOG00000024548 ENSPFOG00000009820 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.b.b.f #22 Amazon molly MODERN SPECIES 392 ENSPFOG00000009658 ##23 ENSPFOG00000009662 #21 ENSPFOG00000009670 ##23 ENSPFOG00000022229 ##23 ENSPFOG00000009676 ENSPFOG00000009682 #21 ENSPFOG00000009692 ##23 ENSPFOG00000009700 #22 ENSPFOG00000009706 ##23 ENSPFOG00000023918 ##23 ENSPFOG00000009719 ##23 ENSPFOG00000021976 ##23 ENSPFOG00000009730 #22 ENSPFOG00000009612 ##23 ENSPFOG00000009735 ##23 ENSPFOG00000009737 #22 ENSPFOG00000009711 #22 ENSPFOG00000022986 ENSPFOG00000024674 ENSPFOG00000022066 #21 ENSPFOG00000009747 ##21 ENSPFOG00000009751 #21 ENSPFOG00000009754 #21 ENSPFOG00000009765 ENSPFOG00000024452 ##23 ENSPFOG00000022129 ENSPFOG00000022600 ##21 ENSPFOG00000020769 ENSPFOG00000009772 ##21 ENSPFOG00000009856 ##23 ENSPFOG00000024548 Platyfish DUPLICATION Platyfish DUPLICATION Platyfish MODERN SPECIES 7 ENSXMAG00000027449 ENSXMAG00000022615 ENSXMAG00000021571 #21 ENSXMAG00000024899 ENSXMAG00000024790 ##23 ENSXMAG00000023468 #21 ENSXMAG00000021885 ##23 ENSXMAG00000029596 #22 ENSXMAG00000028302 ##23 ENSXMAG00000027675 ENSXMAG00000028495 ##23 ENSXMAG00000024118 ##23 ENSXMAG00000022914 ENSXMAG00000022779 ENSXMAG00000024780 ##23 ENSXMAG00000029974 #22 ENSXMAG00000023060 #22 ENSXMAG00000027121 ##23 ENSXMAG00000030034 ENSXMAG00000025074 #22 ENSXMAG00000019791 #22 ENSXMAG00000023473 ##21 ENSXMAG00000025675 #21 ENSXMAG00000024542 #21 ENSXMAG00000027049 ENSXMAG00000021588 #21 ENSXMAG00000024766 ##21 ENSXMAG00000024548 #21 ENSXMAG00000028218 ##20 ENSXMAG00000020862 #21 ENSXMAG00000027236 Platyfish MODERN SPECIES 7 ENSXMAG00000024790 ##23 ENSXMAG00000023468 #21 ENSXMAG00000021885 ##23 ENSXMAG00000029596 #22 ENSXMAG00000028302 ##23 ENSXMAG00000027675 ENSXMAG00000028495 ##23 ENSXMAG00000024118 ##23 ENSXMAG00000022914 ENSXMAG00000022779 ENSXMAG00000024780 ##23 ENSXMAG00000029974 #22 ENSXMAG00000023060 #22 ENSXMAG00000027121 ##23 ENSXMAG00000030034 ENSXMAG00000025074 #22 ENSXMAG00000019791 #22 ENSXMAG00000023473 ##21 ENSXMAG00000025675 #21 ENSXMAG00000024542 #21 ENSXMAG00000027049 ENSXMAG00000021588 #21 ENSXMAG00000024766 ##21 ENSXMAG00000024548 #21 ENSXMAG00000028218 ##20 ENSXMAG00000020862 #21 ENSXMAG00000027236 ENSXMAG00000025942 ENSXMAG00000025628 ##21 ENSXMAG00000019974 ##21 ENSXMAG00000028304 Platyfish MODERN SPECIES 7 ENSXMAG00000023468 #21 ENSXMAG00000021885 ##23 ENSXMAG00000029596 #22 ENSXMAG00000028302 ##23 ENSXMAG00000027675 ENSXMAG00000028495 ##23 ENSXMAG00000024118 ##23 ENSXMAG00000022914 ENSXMAG00000022779 ENSXMAG00000024780 ##23 ENSXMAG00000029974 #22 ENSXMAG00000023060 #22 ENSXMAG00000027121 ##23 ENSXMAG00000030034 ENSXMAG00000025074 #22 ENSXMAG00000019791 #22 ENSXMAG00000023473 ##21 ENSXMAG00000025675 #21 ENSXMAG00000024542 #21 ENSXMAG00000027049 ENSXMAG00000021588 #21 ENSXMAG00000024766 ##21 ENSXMAG00000024548 #21 ENSXMAG00000028218 ##20 ENSXMAG00000020862 #21 ENSXMAG00000027236 ENSXMAG00000025942 ENSXMAG00000025628 ##21 ENSXMAG00000019974 ##21 ENSXMAG00000028304 ENSXMAG00000021542 ##23 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.i.b.b #22 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 2304 ENSCVAG00000009626 #22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1466 ENSCVAG00000009704 ENSCVAG00000009713 ENSCVAG00000009717 ##21 ENSCVAG00000009732 ##21 ENSCVAG00000009736 ##21 ENSCVAG00000009741 ##21 ENSCVAG00000009746 ##20 ENSCVAG00000009751 ##21 ENSCVAG00000009754 ##20 ENSCVAG00000009759 ##20 ENSCVAG00000009762 ENSCVAG00000009776 #22 ENSCVAG00000009799 #22 ENSCVAG00000009809 #21 ENSCVAG00000009822 #21 ENSCVAG00000009837 ENSCVAG00000009846 #22 ENSCVAG00000009857 #22 Mummichog MODERN SPECIES 809 ENSFHEG00000008811 #22 ENSFHEG00000008816 ENSFHEG00000008825 ##23 ENSFHEG00000008829 ##21 ENSFHEG00000008847 ##21 ENSFHEG00000008859 ##23 ENSFHEG00000008863 ENSFHEG00000008878 ##20 ENSFHEG00000008902 #21 ENSFHEG00000008912 ##20 ENSFHEG00000008919 #21 ENSFHEG00000008932 ENSFHEG00000008938 ENSFHEG00000008960 ##21 ENSFHEG00000008972 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 360 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.b.d.a ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000163849.i.b.b #22 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 1270 ENSKMAG00000009619 ENSKMAG00000009632 ENSKMAG00000009642 #22 ENSKMAG00000009654 ENSKMAG00000009663 #22 ENSKMAG00000009676 ENSKMAG00000009684 ##21 Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 22 ENSMMDG00005002325 ENSMMDG00005002428 ##21 ENSMMDG00005002431 ENSMMDG00005002435 ENSMMDG00005002438 ##21 ENSMMDG00005002442 ENSMMDG00005002448 ENSMMDG00005002450 ENSMMDG00005002454 ENSMMDG00005002461 ENSMMDG00005002465 ENSMMDG00005002468 ENSMMDG00005002471 ENSMMDG00005002475 ENSMMDG00005002477 ENSMMDG00005002479 #22 ENSMMDG00005002482 ##21 ENSMMDG00005004167 ENSMMDG00005004172 ENSMMDG00005004179 ENSMMDG00005004186 ENSMMDG00005004191 ENSMMDG00005004194 ##23 ENSMMDG00005004204 ENSMMDG00005004210 ##23 ENSMMDG00005004216 ENSMMDG00005004222 ENSMMDG00005004231 ENSMMDG00005004240 ENSMMDG00005004250 ENSMMDG00005004256 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 22 ENSMMDG00005004222 ENSMMDG00005004231 ENSMMDG00005004240 ENSMMDG00005004250 ENSMMDG00005004256 ENSMMDG00005004260 ENSMMDG00005004266 ENSMMDG00005004275 ENSMMDG00005004280 #22 ENSMMDG00005004286 ##21 ENSMMDG00005004291 ENSMMDG00005004295 ENSMMDG00005004300 ##21 ENSMMDG00005004301 ENSMMDG00005004311 ENSMMDG00005004313 #22 ENSMMDG00005004316 ENSMMDG00005004326 ENSMMDG00005004331 ENSMMDG00005004335 ENSMMDG00005004341 ENSMMDG00005004346 ENSMMDG00005004353 ##23 ENSMMDG00005004361 ENSMMDG00005004371 ##21 ENSMMDG00005004375 ENSMMDG00005004380 ENSMMDG00005004390 ENSMMDG00005004404 ENSMMDG00005004411 ENSMMDG00005004418 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 22 ENSMMDG00005009339 ENSMMDG00005009340 ##21 ENSMMDG00005009342 ENSMMDG00005009344 ##21 ENSMMDG00005009346 ##23 ENSMMDG00005009347 ##23 ENSMMDG00005009349 ENSMMDG00005009350 ENSMMDG00005009351 ENSMMDG00005009353 ENSMMDG00005009356 ENSMMDG00005009359 ##23 ENSMMDG00005009363 ENSMMDG00005009365 ##23 ENSMMDG00005009369 ENSMMDG00005009370 #22 ENSMMDG00005009373 ENSMMDG00005009384 ENSMMDG00005009385 ENSMMDG00005009390 ENSMMDG00005009393 ENSMMDG00005009394 NACC1 (ENSMMDG00005009395) ENSMMDG00005009399 CACNA1A (ENSMMDG00005009476) alkbh7 (ENSMMDG00005012025) ENSMMDG00005012040 gtf2f1 (ENSMMDG00005012477) ENSMMDG00005012481 ELFN2 (ENSMMDG00005012483) sgsm3 (ENSMMDG00005012498) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 22 ENSMMDG00005004686 ENSMMDG00005004691 ENSMMDG00005004694 ENSMMDG00005004700 #21 ENSMMDG00005004703 ENSMMDG00005004707 ##21 ENSMMDG00005004714 ENSMMDG00005004719 ##23 ENSMMDG00005004722 ENSMMDG00005004726 ENSMMDG00005004727 ENSMMDG00005004730 ENSMMDG00005004731 #21 ENSMMDG00005004736 ENSMMDG00005004751 ENSMMDG00005004788 #22 ENSMMDG00005004790 ENSMMDG00005004793 ENSMMDG00005004797 ENSMMDG00005004813 PPP1R9B (ENSMMDG00005004835) ENSMMDG00005004884 ENSMMDG00005004893 ENSMMDG00005004899 ENSMMDG00005004901 ENSMMDG00005004944 pdk2b (ENSMMDG00005000434) ENSMMDG00005000479 ENSMMDG00005000503 ENSMMDG00005000532 ENSMMDG00005000535 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 22 ENSMMDG00005004179 ENSMMDG00005004186 ENSMMDG00005004191 ENSMMDG00005004194 ##23 ENSMMDG00005004204 ENSMMDG00005004210 ##23 ENSMMDG00005004216 ENSMMDG00005004222 ENSMMDG00005004231 ENSMMDG00005004240 ENSMMDG00005004250 ENSMMDG00005004256 ENSMMDG00005004260 ENSMMDG00005004266 ENSMMDG00005004275 ENSMMDG00005004280 #22 ENSMMDG00005004286 ##21 ENSMMDG00005004291 ENSMMDG00005004295 ENSMMDG00005004300 ##21 ENSMMDG00005004301 ENSMMDG00005004311 ENSMMDG00005004313 #22 ENSMMDG00005004316 ENSMMDG00005004326 ENSMMDG00005004331 ENSMMDG00005004335 ENSMMDG00005004341 ENSMMDG00005004346 ENSMMDG00005004353 ##23 ENSMMDG00005004361 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00560000077365 ENSGT00940000155653.a ENSGT00940000159110.a ENSGT00940000163157.b ENSGT00940000158125.b ENSGT00940000160286 ENSGT00390000002810 ENSGT00390000014771.b.a ENSGT00390000014062 ENSGT00950000183143.c.b ENSGT00940000160492 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT00940000163849.j #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.b.c.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.a.a ##23 ENSGT01100000263931 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.a ##23 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000163847.b ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 Eupecaria_A DUPLICATION Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j.c #22 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 4477 ENSLBEG00000028885 ##23 ENSLBEG00000028884 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1890 ENSLBEG00000003889 ENSLBEG00000003859 ENSLBEG00000003851 ##21 ENSLBEG00000003836 ENSLBEG00000003819 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1680 ENSLBEG00000013273 ENSLBEG00000013288 ENSLBEG00000013300 ##21 ENSLBEG00000013319 ENSLBEG00000013331 #22 ENSLBEG00000013350 #22 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.b.a.a.a ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT00940000163849.j.c #22 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.a.b.b.b ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.a.b.b.a ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b ##23 ENSGT00940000163849.j.c #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.b.q.a ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.a ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.a.a.b ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.l.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.k ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01050000244936 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000159327.u.a Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010007721 ENSSAUG00010007724 ENSSAUG00010007725 ENSSAUG00010007728 ENSSAUG00010007729 #22 ENSSAUG00010007733 ENSSAUG00010007736 ##21 ENSSAUG00010007737 ENSSAUG00010007739 ##23 ENSSAUG00010007742 ENSSAUG00010007745 ##23 ENSSAUG00010007747 #21 ENSSAUG00010007750 ENSSAUG00010007754 ENSSAUG00010007756 ##23 ENSSAUG00010007758 #22 ENSSAUG00010007759 ENSSAUG00010007760 #22 ENSSAUG00010007762 ##21 ENSSAUG00010007764 ENSSAUG00010007765 ##21 ENSSAUG00010007768 ENSSAUG00010007772 #22 ENSSAUG00010007774 ENSSAUG00010007776 ##21 ENSSAUG00010007777 ENSSAUG00010007780 ##21 ENSSAUG00010007783 #21 ENSSAUG00010007785 #22 ENSSAUG00010007786 ENSSAUG00010007788 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 160 ENSGT00940000163849.j.d #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b ##23 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159252.b.b ENSGT00940000160506.b ENSGT01050000244936 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.a ##21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.j.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.k ENSGT00940000163849.i.b.b #22 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.D.b.d ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.a.a.b.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.a.a.a ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.b.b.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000163849.j.d #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b ##23 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.a.b.b.a ENSGT01100000263485.a.b.a.b.a.l.a ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01100000263485.b ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.b.b.a.a.i ENSGT01090000259993.A.b.i.b #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b ##23 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b ##21 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.b #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.b ENSGT01090000259993.B.c.b.a.b.q.a ##21 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 165 ENSGT00940000163849.j.d #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.h.a.b ##23 Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 ENSSAUG00010017370 ENSSAUG00010017374 ##23 ENSSAUG00010017375 ENSSAUG00010017376 ENSSAUG00010017378 ##23 ENSSAUG00010017380 ENSSAUG00010017381 ##21 ENSSAUG00010017399 ENSSAUG00010017401 ENSSAUG00010017402 ENSSAUG00010017404 ENSSAUG00010017405 #22 ENSSAUG00010017407 ENSSAUG00010017408 ENSSAUG00010017410 ENSSAUG00010017411 #22 ENSSAUG00010017413 ##23 ENSSAUG00010017414 #22 ENSSAUG00010017415 ##20 ENSSAUG00010017416 ##21 ENSSAUG00010017417 ##23 ENSSAUG00010017418 ##21 ENSSAUG00010017419 ENSSAUG00010017421 ENSSAUG00010017422 ##21 ENSSAUG00010017423 #21 ENSSAUG00010017425 ##23 ENSSAUG00010017427 ENSSAUG00010017429 ENSSAUG00010017430 ENSSAUG00010017432 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2447 ENSLBEG00000009057 #22 ENSLBEG00000009102 ENSLBEG00000009117 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01030000234794 ENSGT01090000259993.B.c.b.a.a.a.b.a.b.g.b ##21 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.s ##23 ENSGT01100000263566.b.b.c.a.a.a.b ##20 ENSGT01090000259993.A.b.j.i.a #21 ENSGT01100000263485.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000163849.i.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.r ##23 ENSGT00940000163849.j #22 ENSGT00940000163849.i.a.a.b #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.a ##23 ENSGT01030000234536 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.b ##23 ENSGT01100000263485.a.b.a.b.b.c.b.a ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.b.a.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.j.j #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.b.a.b ##23 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.a.e.b.a.a.b ##23 ENSGT01090000259993.A.b.i.a.a #21 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a ##23 ENSGT01090000259993.C.a.b.b ##21 ENSGT01100000263566.b.a ##20 ENSGT01090000259993.B.c.b.b.e.b.b ##21 ENSGT01100000263485.a.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 671 ENSGT01020000230358.h.d.b.a.c.b.r ##23 ENSGT00940000163849.j #22 Mummichog MODERN SPECIES 1362 ENSFHEG00000022947 ##23 ENSFHEG00000022938 ##23 ENSFHEG00000022933 #22 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 419 ENSGT00940000163849.j #22 ENSGT01020000230358.h.d.b.b.g.b.b.b.e.a.a.a.a ##23 Orange clownfish MODERN SPECIES 5 ENSAPEG00000017171 #21 ENSAPEG00000017184 ##21 ENSAPEG00000017233 #22 ENSAPEG00000017252 ENSAPEG00000017343 ENSAPEG00000017353 ENSAPEG00000017369 #22 ENSAPEG00000017392 #22 ENSAPEG00000017455 ENSAPEG00000017461 ENSAPEG00000017477 #22 ENSAPEG00000017488 ENSAPEG00000017492 ##23 ENSAPEG00000017498 ENSAPEG00000017503 ENSAPEG00000017517 #22 ENSAPEG00000017534 ##23 ENSAPEG00000017541 ENSAPEG00000017548 #22 ENSAPEG00000017563 ENSAPEG00000017572 #22 ENSAPEG00000017581 ##23 ENSAPEG00000017585 ENSAPEG00000017593 #22 ENSAPEG00000017608 #22 ENSAPEG00000017623 ENSAPEG00000017634 ##23 ENSAPEG00000017638 ENSAPEG00000017645 ##23 ENSAPEG00000017657 ENSAPEG00000017670 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163849.j #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1107 ENSMZEG00005009899 ##20 ENSMZEG00005009889 ##23 ENSMZEG00005009883 ##21 ENSMZEG00005009878 ##21 ENSMZEG00005009869 ##21 ENSMZEG00005009843 ENSMZEG00005009829 ##21 ENSMZEG00005009824 ##23 ENSMZEG00005009815 ENSMZEG00005009804 #22 ENSMZEG00005009800 ENSMZEG00005009792 ENSMZEG00005009781 #22 ENSMZEG00005009774 ENSMZEG00005009763 #22 ENSMZEG00005009755 #22 ENSMZEG00005009745 ENSMZEG00005009735 ##21 ENSMZEG00005009728 ##21 ENSMZEG00005009719 ##21 dhrs7b (ENSMZEG00005009693) CRAMP1 (ENSMZEG00005009624) jpt2 (ENSMZEG00005009602) mapk8ip3 (ENSMZEG00005009202) mrps34 (ENSMZEG00005009087) spsb3a (ENSMZEG00005009070) ATP6V0C (ENSMZEG00005009057) ypel3 (ENSMZEG00005009048) gdpd3a (ENSMZEG00005009007) mapk3 (ENSMZEG00005008971) nudt9 (ENSMZEG00005008961)