Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254 #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000159777 ENSGT00940000172494 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c ENSGT00940000155464 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000158788 ENSGT00550000074846 ENSGT00390000006029 ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000018830.b ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000159777 ENSGT00940000172494 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000155776.b ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c ENSGT00940000155464 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 273 ENSGT00940000158788 ENSGT00550000074846 ENSGT00390000006029 ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000018830.a.a ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000168229 ENSGT00940000161260 ENSGT01050000244968.c.c ENSGT00940000156730.b ENSGT00940000156183 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000158788 ENSGT00550000074846 ENSGT00390000006029 ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000018830.b ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000155897 ENSGT00390000007246 ENSGT00390000009329 ENSGT00940000155498 ENSGT00940000155389 ENSGT00940000157105 ENSGT00390000004161 ENSGT00940000157140.b.a.b.b ENSGT00940000153288.b ENSGT00940000157156 ENSGT00390000004228 ENSGT00940000155831 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 254 ENSGT00940000155227.a ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846 ENSGT00390000006029 ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.b ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000167622 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00940000163466 ENSGT00950000183190.a.b.b Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 208 ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00390000006029 ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.b ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000167622 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00940000163466 ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.w.b Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.d #22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.d #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.d #22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157140.b.a.b.b.c ENSGT00390000004161.g ENSGT00940000157105.d.a ENSGT00940000155389.x ENSGT01050000244898.b.b.a ENSGT00940000157321.e.b ENSGT00940000156290.b.c ENSGT01070000253744.b.b.f.a ENSGT00940000154821.a.a.e.b ENSGT00940000156090.b.d ENSGT01000000214630.a ENSGT00900000141071.b.d.a ENSGT00390000016167.i ENSGT00940000156997.b.b ENSGT01030000234535.C.b ENSGT00390000005254.d #22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000157140.b.a.b.b.c ENSGT00390000004161.g ENSGT00940000157105.d.a ENSGT00940000155389.x ENSGT01050000244898.b.b.a ENSGT00940000157321.e.b ENSGT00940000156290.b.c ENSGT01070000253744.b.b.f.a ENSGT00940000154821.a.a.e.b ENSGT00940000156090.b.d ENSGT01000000214630.a ENSGT00900000141071.b.d.a ENSGT00390000016167.i ENSGT00940000156997.b.b ENSGT01030000234535.C.b ENSGT00390000005254.d #22 Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 26 foxd1 (ENSOTSG00005024694) TMEM174 (ENSOTSG00005024696) fcho2 (ENSOTSG00005024700) TNPO1 (ENSOTSG00005027517) MOB1B (ENSOTSG00005028267) dck (ENSOTSG00005028395) SLC4A4 (ENSOTSG00005028448) NPFFR2 (ENSOTSG00005039750) ENSOTSG00005039766 zgc:122979 (ENSOTSG00005039767) hwa (ENSOTSG00005039768) vcp (ENSOTSG00005039772) zgc:77838 (ENSOTSG00005039830) RNF165 (ENSOTSG00005039832) st8sia5 (ENSOTSG00005039835) rpl37 (ENSOTSG00005039836) #22 ENSOTSG00005039846 NSMF (ENSOTSG00005039849) zgc:113162 (ENSOTSG00005039850) ENSOTSG00005039852 ENSOTSG00005039853 ADORA2A (ENSOTSG00005039855) SPECC1L (ENSOTSG00005039858) BCR (ENSOTSG00005039880) ENSOTSG00005043229 pus1 (ENSOTSG00005045709) noc4l (ENSOTSG00005045713) vps29 (ENSOTSG00005045714) vps29 (ENSOTSG00005045716) gpn3 (ENSOTSG00005045719) arpc3 (ENSOTSG00005045720) Chinook salmon MODERN SPECIES 12 MOB1B (ENSOTSG00005036446) dck (ENSOTSG00005036445) SLC4A4 (ENSOTSG00005032168) NPFFR2 (ENSOTSG00005032160) ENSOTSG00005032159 ENSOTSG00005032157 zgc:122979 (ENSOTSG00005032156) hwa (ENSOTSG00005032155) vcp (ENSOTSG00005030302) atp5fa1 (ENSOTSG00005029651) haus1 (ENSOTSG00005029648) zgc:77838 (ENSOTSG00005029647) RNF165 (ENSOTSG00005029646) LOXHD1 (ENSOTSG00005029645) st8sia5 (ENSOTSG00005029642) rpl37 (ENSOTSG00005029640) #22 ENSOTSG00005029639 ENSOTSG00005013173 ENSOTSG00005012768 ENSOTSG00005012761 CNNM4 (ENSOTSG00005012760) ENSOTSG00005023664 ENSOTSG00005023661 ENSOTSG00005023657 ENSOTSG00005023654 SH2D4A (ENSOTSG00005023652) slc38a9 (ENSOTSG00005022506) ddx4 (ENSOTSG00005018312) ENSOTSG00005018273 il6st (ENSOTSG00005018268) ANKRD55 (ENSOTSG00005018164) Rainbow trout MODERN SPECIES 364 foxd1 (ENSOMYG00000037563) TMEM174 (ENSOMYG00000037558) ENSOMYG00000036506 FCHO2 (ENSOMYG00000069297) TNPO1 (ENSOMYG00000035081) MOB1B (ENSOMYG00000034906) DCK (ENSOMYG00000034882) SLC4A4 (ENSOMYG00000034651) NPFFR2 (ENSOMYG00000034453) ENSOMYG00000034446 ENSOMYG00000034435 ENSOMYG00000034424 C18orf25 (ENSOMYG00000034406) ENSOMYG00000034366 ST8SIA5 (ENSOMYG00000034302) ENSOMYG00000057258 #22 ENSOMYG00000056085 ENSOMYG00000054492 ENSOMYG00000067853 ENSOMYG00000076326 ENSOMYG00000031753 ENSOMYG00000049821 ENSOMYG00000071258 ENSOMYG00000067890 sdy (ENSOMYG00000068768) ENSOMYG00000017222 ENSOMYG00000038603 ENSOMYG00000054442 ENSOMYG00000074455 ENSOMYG00000026520 ENSOMYG00000026389 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.d #22 River trout MODERN SPECIES 3 fcho2 (ENSSTUG00000019513) TNPO1 (ENSSTUG00000019248) MOB1B (ENSSTUG00000019143) dck (ENSSTUG00000019125) ENSSTUG00000019120 SLC4A4 (ENSSTUG00000016091) NPFFR2 (ENSSTUG00000015842) zgc:122979 (ENSSTUG00000015838) ENSSTUG00000015826 hwa (ENSSTUG00000015819) vcp (ENSSTUG00000014383) atp5fa1 (ENSSTUG00000014277) zgc:77838 (ENSSTUG00000014266) RNF165 (ENSSTUG00000014249) st8sia5 (ENSSTUG00000014209) rpl37 (ENSSTUG00000014178) #22 ENSSTUG00000014169 ENSSTUG00000013884 CNNM4 (ENSSTUG00000013836) ENSSTUG00000013763 il1b (ENSSTUG00000013720) PURB (ENSSTUG00000013715) h2az2b (ENSSTUG00000013663) ved (ENSSTUG00000013629) ece2b (ENSSTUG00000010008) mrps24 (ENSSTUG00000009834) CAMK2B (ENSSTUG00000009551) OGDH (ENSSTUG00000009049) ZMIZ2 (ENSSTUG00000008944) ppiab (ENSSTUG00000008907) RNF122 (ENSSTUG00000008894) Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157321 ENSGT00940000156290.b ENSGT01070000253744.b.b.f ENSGT00940000154821.a.a ENSGT00940000154886.a.b ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00900000141071.b.d ENSGT00550000074846.mb.a ENSGT00390000006029 ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254.c.a.a ##22 ENSGT01080000257489 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000167011.a ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000161102 ENSGT01060000248847 ENSGT00900000140979.b ENSGT00940000167350 ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00390000011179 ENSGT00940000158444 ENSGT00940000158973.a.b ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a ENSGT00390000003652.d Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00940000157321.e.a ENSGT00940000156290.b.d ENSGT01070000253744.b.b.f.b ENSGT00940000154821.a.a.e.a ENSGT00940000154886.a.b ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b.c ENSGT01000000214630 ENSGT00900000141071.b.d.b ENSGT00550000074846.mb.a.a ENSGT00390000006029 ENSGT00390000016167.j ENSGT00940000156997.b.a ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C.a ENSGT00390000005254.c.a.a ##22 ENSGT01080000257489.f ENSGT00940000163461.a.a.a.b.c.b.b.b.b ENSGT00940000154290.b.f ENSGT00940000167011.a 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ENSGT00550000074846.mb.a.a ENSGT00390000006029 ENSGT00390000016167.j ENSGT00940000156997.b.a ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C.a ENSGT00390000005254.c.a.a ##22 ENSGT01080000257489.f ENSGT00940000163461.a.a.a.b.c.b.b.b.b ENSGT00940000154290.b.f ENSGT00940000167011.a ENSGT00940000156317.w.a.e ENSGT00940000161102.h ENSGT01060000248847.e ENSGT00950000183162.a.b.j.a ENSGT00900000140979.b.b ENSGT00940000167350.f ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00390000011179.g ENSGT00940000158444.i ENSGT00940000158973.a.b.c.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000157321.e.a ENSGT00940000156290.b.d ENSGT01070000253744.b.b.f.b ENSGT00940000154821.a.a.e.a ENSGT00940000154886.a.b ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b.c ENSGT01000000214630.b ENSGT00900000141071.b.d.b ENSGT00550000074846.mb.a.a ENSGT00390000006029 ENSGT00390000016167.j ENSGT00940000156997.b.a ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C.a ENSGT00390000005254.c.a.a ##22 ENSGT01080000257489.f 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ENSOMYG00000071242 polm (ENSOMYG00000025652) ENSOMYG00000025611 ENSOMYG00000025573 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157321.e.a ENSGT00940000156290.b.d ENSGT01070000253744.b.b.f.b ENSGT00940000154821.a.a.e.a ENSGT00940000154886.a.b ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b.c ENSGT01000000214630.b ENSGT00900000141071.b.d.b ENSGT00550000074846.mb.a.a ENSGT00390000006029 ENSGT00390000016167.j ENSGT00940000156997.b.a ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C.a ENSGT00390000005254.c.a.a ##22 ENSGT01080000257489.f ENSGT00940000163461.a.a.a.b.c.b.b.b.b ENSGT00940000154290.b.f ENSGT00940000167011.a ENSGT00940000156317.w.a.e ENSGT00940000161102.h ENSGT01060000248847.e ENSGT00950000183162.a.b.j.a ENSGT00900000140979.b.b ENSGT00940000167350.f ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00940000158444.i ENSGT00940000158973.a.b.c.b ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a.f Coho salmon MODERN SPECIES 15 SLC4A4 (ENSOKIG00005034421) NPFFR2 (ENSOKIG00005034757) ENSOKIG00005034769 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ENSSSAG00000036024 purb (ENSSSAG00000113117) h2az2b (ENSSSAG00000039042) ved (ENSSSAG00000103886) polm (ENSSSAG00000039392) gnsb (ENSSSAG00000039467) nudcd3 (ENSSSAG00000091881) mrps24 (ENSSSAG00000119544) ENSSSAG00000107947 OGDH (ENSSSAG00000043149) Northern pike MODERN SPECIES 13 dck (ENSELUG00000002787) SLC4A4 (ENSELUG00000002753) NPFFR2 (ENSELUG00000002622) ENSELUG00000000069 ENSELUG00000002592 ENSELUG00000002574 zgc:122979 (ENSELUG00000002557) hwa (ENSELUG00000001275) vcp (ENSELUG00000002541) atp5fa1 (ENSELUG00000002526) haus1 (ENSELUG00000002516) zgc:77838 (ENSELUG00000002487) RNF165 (ENSELUG00000002469) LOXHD1 (ENSELUG00000002422) st8sia5 (ENSELUG00000024561) rpl37 (ENSELUG00000024481) ##22 ENSELUG00000024465 ENSELUG00000024412 ENSELUG00000024396 CNNM4 (ENSELUG00000024299) ENSELUG00000024220 ENSELUG00000024202 PURB (ENSELUG00000024165) h2az2b (ENSELUG00000024156) ved (ENSELUG00000024130) polm (ENSELUG00000024125) gnsb (ENSELUG00000024113) mrps24 (ENSELUG00000023900) nudcd3 (ENSELUG00000024088) CAMK2B (ENSELUG00000023881) OGDH (ENSELUG00000023799) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.c.a.b ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 118 ENSGT00940000157140.b.a.b.b.c ENSGT00390000004161 ENSGT00940000157105.d.a ENSGT00940000155389.x ENSGT01050000244898.b.b.a ENSGT00940000157321.e.b ENSGT00940000156290.b.c ENSGT01070000253744.b.b.f.a ENSGT00940000154821.a.a.e.b ENSGT00940000156090.b.d ENSGT00550000074846.lb ENSGT00390000016167.i ENSGT00940000156997.b.b ENSGT00390000018830.b ENSGT01030000234535.C.b ENSGT00390000005254.c.a.b ##22 ENSGT01080000257489.e ENSGT00940000154290.b.e ENSGT00940000167011.b ENSGT00940000156317.w.a.f ENSGT00940000161102.g ENSGT00950000182943.o ENSGT00950000183162.a.b.j.b ENSGT00940000167350.e ENSGT00940000156921.h ENSGT00390000011179.h ENSGT00940000158444.j ENSGT00940000158973.a.b.c.a ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a.e ENSGT01030000234539.b.b.a.i.m.b ENSGT00940000165894.b.d Huchen MODERN SPECIES 2025 st8sia5 (ENSHHUG00000026786) 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ENSGT00390000004161.g ENSGT00940000157105.d.a ENSGT00940000155389.x ENSGT01050000244898.b.b.a ENSGT00940000157321.e.b ENSGT00940000156290.b.c ENSGT01070000253744.b.b.f.a ENSGT00940000154821.a.a.e.b ENSGT00940000156090.b.d ENSGT01000000214630.a ENSGT00900000141071.b.d.a ENSGT00550000074846.mb.a.b ENSGT00390000016167.i ENSGT00940000156997.b.b ENSGT01030000234535.C.b ENSGT00390000005254.c.a.b ##22 ENSGT01080000257489.e ENSGT00940000154290.b.e ENSGT00940000167011.b ENSGT00940000156317.w.a.f ENSGT00940000161102.g ENSGT00950000182943.o ENSGT00950000183162.a.b.j.b ENSGT00940000167350.e ENSGT00940000156921.h ENSGT00390000011179.h ENSGT00940000158973.a.b.c.a ENSGT00950000183125.b.a.a.a.a.a.e ENSGT01030000234539.b.b.a.i.m.b ENSGT00940000165894.b.c.a ENSGT00930000151016.bb Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 TMEM174 (ENSSSAG00000069497) fcho2 (ENSSSAG00000000898) TNPO1 (ENSSSAG00000068062) MOB1B (ENSSSAG00000100755) DCK (ENSSSAG00000068041) SLC4A4 (ENSSSAG00000067184) NPFFR2 (ENSSSAG00000034609) ENSSSAG00000067132 ENSSSAG00000067134 ENSSSAG00000104832 ENSSSAG00000063064 atp5fa1 (ENSSSAG00000061907) C18orf25 (ENSSSAG00000061825) RNF165 (ENSSSAG00000121000) ST8SIA5 (ENSSSAG00000098370) RL37 (ENSSSAG00000061468) ##22 ENSSSAG00000109975 CXL10 (ENSSSAG00000061390) ENSSSAG00000107205 ENSSSAG00000061191 ENSSSAG00000061150 ENSSSAG00000061123 cnnm3 (ENSSSAG00000061036) IL-1b3 (ENSSSAG00000060993) ENSSSAG00000039327 ENSSSAG00000118660 ENSSSAG00000112305 ENSSSAG00000005164 ENSSSAG00000047952 ENSSSAG00000009471 OGDH (ENSSSAG00000007455) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000158323.h ENSGT00390000009488 ENSGT00940000155477 ENSGT00940000164321.c ENSGT00730000111133.w ENSGT00940000158936 ENSGT00940000158107.a.b ENSGT00490000043388.a ENSGT00940000159152.d.j.b ENSGT01050000244968.c.d ENSGT00940000156730.a ENSGT00550000074846.mb.b ENSGT00940000156997.a ENSGT00390000018830.a.a ENSGT00940000165146 ENSGT00390000005254.c.b ##22 ENSGT01050000244902.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000007246 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(ENSHHUG00000042658) ENSHHUG00000042666 PLPP1 (ENSHHUG00000042687) atp5fa1 (ENSHHUG00000042702) RNF165 (ENSHHUG00000043190) rpl37 (ENSHHUG00000043201) ##22 ptger4a (ENSHHUG00000043205) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000015164.bb.b ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323.h.l ENSGT00390000009488.d ENSGT00940000155477.g ENSGT00940000164321.c.h ENSGT00730000111133.w.b ENSGT00940000158936.e ENSGT00940000158107.a.b ENSGT00490000043388.a.e ENSGT00940000159152.d.j.b ENSGT01050000244968.c.d ENSGT00940000156730.a.d ENSGT00550000074846.mb.b.b ENSGT00940000156997.a.f ENSGT00390000005254.c.b.a ##22 ENSGT01050000244902.a.a.a.a.a.b.f ENSGT00390000007246.i ENSGT00940000155498.f.b ENSGT00390000004511.c.b.c.a ENSGT00940000156114.d ENSGT00940000154078.b.b.d ENSGT00940000165543.h ENSGT00940000160343.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a.d ENSGT01080000257756.b ENSGT00940000157299.c.f ENSGT00940000179359.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000015164.bb.b ENSGT00390000006780 ENSGT00940000158323.h.l ENSGT00390000009488.d ENSGT00940000155477.g ENSGT00940000164321.c.h ENSGT00730000111133.w.b ENSGT00940000158936.e ENSGT00940000158107.a.b ENSGT00490000043388.a.e ENSGT00940000159152.d.j.b ENSGT01050000244968.c.d ENSGT00940000156730.a.d ENSGT00550000074846.mb.b.b ENSGT00940000156997.a.f ENSGT00390000005254.c.b.a ##22 ENSGT01050000244902.a.a.a.a.a.b.f ENSGT00390000007246.i ENSGT00940000155498.f.b ENSGT00390000004511.c.b.c.a ENSGT00940000156114.d ENSGT00940000154078.b.b.d ENSGT00940000165543.h ENSGT00940000160343.d ENSGT00950000182964.a.b.a.a.a.d ENSGT01080000257756.b ENSGT00390000002172.B.a.a.b ENSGT00940000157299.c.f ENSGT00940000156973.z ENSGT00510000048363 ENSGT00940000155899.f.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 12 pold2 (ENSSSAG00000074050) ENSSSAG00000086039 ENSSSAG00000074092 star (ENSSSAG00000074097) ENSSSAG00000074132 lsm1 (ENSSSAG00000074566) bag4 (ENSSSAG00000085578) ENSSSAG00000074573 ENSSSAG00000074579 ENSSSAG00000112259 ENSSSAG00000059101 ENSSSAG00000074591 ENSSSAG00000086212 ENSSSAG00000074629 ENSSSAG00000104912 RL37 (ENSSSAG00000074883) ##22 ptger4a (ENSSSAG00000116650) ENSSSAG00000074892 ENSSSAG00000074911 ENSSSAG00000074930 smyd1b (ENSSSAG00000074939) ENSSSAG00000074978 ENSSSAG00000085275 ENSSSAG00000074981 ga45g (ENSSSAG00000074990) ENSSSAG00000074995 ENSSSAG00000074997 ENSSSAG00000117984 ENSSSAG00000117711 efna5b (ENSSSAG00000081531) ENSSSAG00000075026 River trout MODERN SPECIES 39 YKT6 (ENSSTUG00000028077) pold2 (ENSSTUG00000028097) AEBP1 (ENSSTUG00000028168) ELMOD3 (ENSSTUG00000028216) star (ENSSTUG00000028236) ENSSTUG00000028275 lsm1 (ENSSTUG00000028860) bag4 (ENSSTUG00000028877) DUSP26 (ENSSTUG00000028885) ENSSTUG00000028900 RNF122 (ENSSTUG00000028953) ENSSTUG00000028961 ENSSTUG00000028990 atp5fa1 (ENSSTUG00000029001) RNF165 (ENSSTUG00000029167) rpl37 (ENSSTUG00000029177) ##22 ptger4a (ENSSTUG00000029208) mrps27 (ENSSTUG00000029213) ZNF366 (ENSSTUG00000029222) oxt (ENSSTUG00000029280) smyd1b 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ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.c.b.b ##22 Coho salmon MODERN SPECIES 22 myl7 (ENSOKIG00005016595) gck (ENSOKIG00005016659) YKT6 (ENSOKIG00005016913) NPC1L1 (ENSOKIG00005017077) ENSOKIG00005019898 ELMOD3 (ENSOKIG00005019932) ENSOKIG00005019969 ENSOKIG00005020514 lsm1 (ENSOKIG00005020519) bag4 (ENSOKIG00005020535) ENSOKIG00005020545 ENSOKIG00005020566 ATP5F1A (ENSOKIG00005020591) RNF165 (ENSOKIG00005020790) LOXHD1 (ENSOKIG00005020822) ENSOKIG00005021045 ##22 ptger4a (ENSOKIG00005021072) mrps27 (ENSOKIG00005021084) ZNF366 (ENSOKIG00005021188) ENSOKIG00005021210 FABP1 (ENSOKIG00005021232) FABP1 (ENSOKIG00005021281) LZTS3 (ENSOKIG00005021314) ubox5 (ENSOKIG00005021334) avp (ENSOKIG00005021373) ENSOKIG00005021384 SLC35D2 (ENSOKIG00005021402) znf367 (ENSOKIG00005021453) ENSOKIG00005021493 FBXL17 (ENSOKIG00005021683) EFNA5 (ENSOKIG00005021749) Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.c.b.b ##22 River trout MODERN SPECIES 19 gck (ENSSTUG00000028305) YKT6 (ENSSTUG00000028282) NPC1L1 (ENSSTUG00000023727) AEBP1 (ENSSTUG00000023548) AEBP1 (ENSSTUG00000023503) ELMOD3 (ENSSTUG00000023475) star (ENSSTUG00000023455) ENSSTUG00000023332 lsm1 (ENSSTUG00000023306) bag4 (ENSSTUG00000023297) RNF122 (ENSSTUG00000023291) ENSSTUG00000023280 atp5fa1 (ENSSTUG00000021824) RNF165 (ENSSTUG00000021753) LOXHD1 (ENSSTUG00000021308) rpl37 (ENSSTUG00000021262) ##22 ptger4a (ENSSTUG00000021259) mrps27 (ENSSTUG00000021230) ZNF366 (ENSSTUG00000021211) oxt (ENSSTUG00000021204) FABP1 (ENSSTUG00000021152) FABP1 (ENSSTUG00000021102) ENSSTUG00000021086 LZTS3 (ENSSTUG00000021076) ubox5 (ENSSTUG00000021062) avp (ENSSTUG00000021052) ENSSTUG00000021038 SLC35D2 (ENSSTUG00000021012) znf367 (ENSSTUG00000020998) ENSSTUG00000020820 FBXL17 (ENSSTUG00000020739) Huchen MODERN SPECIES 213 YKT6 (ENSHHUG00000005821) NPC1L1 (ENSHHUG00000005877) ENSHHUG00000006785 ELMOD3 (ENSHHUG00000006820) star (ENSHHUG00000006835) ENSHHUG00000006880 lsm1 (ENSHHUG00000006919) bag4 (ENSHHUG00000006925) ENSHHUG00000006940 RNF122 (ENSHHUG00000006953) ENSHHUG00000006964 atp5fa1 (ENSHHUG00000006983) RNF165 (ENSHHUG00000007320) ENSHHUG00000007328 ENSHHUG00000007379 rpl37 (ENSHHUG00000007381) ##22 ptger4a (ENSHHUG00000007429) mrps27 (ENSHHUG00000007435) ZNF366 (ENSHHUG00000007456) oxt (ENSHHUG00000007505) FABP1 (ENSHHUG00000007511) ENSHHUG00000007545 Northern pike MODERN SPECIES 12 ENSELUG00000029031 ercc6l2 (ENSELUG00000002272) hsd17b3 (ENSELUG00000002287) star (ENSELUG00000002291) ENSELUG00000002312 lsm1 (ENSELUG00000002322) bag4 (ENSELUG00000002331) DUSP26 (ENSELUG00000002325) ENSELUG00000002335 RNF122 (ENSELUG00000002338) ENSELUG00000002345 PLPP1 (ENSELUG00000002355) atp5fa1 (ENSELUG00000002365) RNF165 (ENSELUG00000002377) LOXHD1 (ENSELUG00000002386) RL37 (ENSELUG00000034681) ##22 ptger4a (ENSELUG00000002394) mrps27 (ENSELUG00000002400) ZNF366 (ENSELUG00000002403) oxt (ENSELUG00000002407) smyd1b (ENSELUG00000002415) LZTS3 (ENSELUG00000002420) ENSELUG00000002427 creb3l3l (ENSELUG00000002440) gadd45g (ENSELUG00000002447) EFNA5 (ENSELUG00000002457) FBXL17 (ENSELUG00000002467) ENSELUG00000029469 prxl2c (ENSELUG00000002485) cdc14b (ENSELUG00000002536) znf367 (ENSELUG00000002552) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x ENSGT00390000004067 ENSGT00390000006287 Cod MODERN SPECIES 10 paqr3b (ENSGMOG00000001789) ENSGMOG00000001759 ENSGMOG00000025634 ENSGMOG00000030243 ENSGMOG00000036386 ENSGMOG00000022716 ENSGMOG00000008869 ENSGMOG00000027072 ENSGMOG00000027513 ENSGMOG00000034454 ENSGMOG00000028287 C18orf25 (ENSGMOG00000028549) RNF165 (ENSGMOG00000017068) LOXHD1 (ENSGMOG00000017024) ST8SIA5 (ENSGMOG00000017008) rpl37 (ENSGMOG00000016997) #22 ENSGMOG00000016986 ENSGMOG00000027855 ENSGMOG00000015325 ENSGMOG00000035073 ENSGMOG00000016912 ENSGMOG00000016873 ENSGMOG00000022832 ENSGMOG00000016593 ENSGMOG00000029706 ENSGMOG00000016735 ENSGMOG00000025145 ENSGMOG00000034109 cdk5rap2 (ENSGMOG00000016387) ENSGMOG00000022660 ENSGMOG00000027526 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000176240 ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b 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Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000176240 ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00940000177433 ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x ENSGT00390000004067 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 265 coq4 (ENSHCOG00000003729) ENSHCOG00000003712 fbxw5 (ENSHCOG00000003688) prdm12b (ENSHCOG00000003663) fubp3 (ENSHCOG00000003639) ASS1 (ENSHCOG00000003559) surf4 (ENSHCOG00000003528) psmd5 (ENSHCOG00000003505) timm10b (ENSHCOG00000003495) st8sia5 (ENSHCOG00000003484) ENSHCOG00000003464 ENSHCOG00000003424 RNF165 (ENSHCOG00000003403) zgc:77838 (ENSHCOG00000003384) CAMSAP1 (ENSHCOG00000003358) rpl37 (ENSHCOG00000003192) #22 ptgs1 (ENSHCOG00000000092) pdcl (ENSHCOG00000003158) ENSHCOG00000003153 rpl28 (ENSHCOG00000003134) ENSHCOG00000003117 ENSHCOG00000003107 ENSHCOG00000003085 notch1a (ENSHCOG00000003070) atp5fa1 (ENSHCOG00000003031) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161347.a.a ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00940000177433 ENSGT00950000182975.a.a.b.l 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ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x ENSGT00390000004067 ENSGT00390000006287 Zig-zag eel MODERN SPECIES 3 ENSMAMG00000017014 gna14 (ENSMAMG00000017019) prune2 (ENSMAMG00000017035) ENSMAMG00000017069 ENSMAMG00000017089 ENSMAMG00000017146 thbs4b (ENSMAMG00000017169) ENSMAMG00000017218 ENSMAMG00000017288 hwa (ENSMAMG00000017297) atp5fa1 (ENSMAMG00000017312) C18orf25 (ENSMAMG00000017338) RNF165 (ENSMAMG00000017346) LOXHD1 (ENSMAMG00000017376) ST8SIA5 (ENSMAMG00000017453) rpl37 (ENSMAMG00000025959) #22 ENSMAMG00000017493 ENSMAMG00000017513 ENSMAMG00000017519 ENSMAMG00000017628 ENSMAMG00000017538 ENSMAMG00000017642 ENSMAMG00000017705 ENSMAMG00000017747 ENSMAMG00000017804 ENSMAMG00000017843 ENSMAMG00000027166 cdk5rap2 (ENSMAMG00000017869) NUP188 (ENSMAMG00000017976) dolk (ENSMAMG00000018058) phyhd1 (ENSMAMG00000018063) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161347.a.a ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x ENSGT00390000004067 ENSGT00390000006287 ENSGT00940000154043.A.j.b Siamese fighting fish MODERN SPECIES 3 ntrk2b (ENSBSLG00000002567) hnrpkl (ENSBSLG00000002500) gna14 (ENSBSLG00000002432) prune2 (ENSBSLG00000020016) 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(ENSATEG00000014053) RNF165 (ENSATEG00000014022) ENSATEG00000014014 ENSATEG00000013978 ST8SIA5 (ENSATEG00000028585) rpl37 (ENSATEG00000013933) #22 ENSATEG00000013897 ENSATEG00000013860 ENSATEG00000013839 ENSATEG00000013831 ENSATEG00000013761 ENSATEG00000013629 ENSATEG00000029256 ENSATEG00000013502 ENSATEG00000013483 ENSATEG00000013473 cdk5rap2 (ENSATEG00000013264) NUP188 (ENSATEG00000013129) dolk (ENSATEG00000013104) phyhd1 (ENSATEG00000013069) lrrc8aa (ENSATEG00000013062) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161347.a.a ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x ENSGT00390000004067 ENSGT00390000006287 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161347.a.a ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x ENSGT00390000004067 ENSGT00390000006287 Seriola ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00600000085659.b ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2796 gna14 (ENSSLDG00000005622) prune2 (ENSSLDG00000005588) ENSSLDG00000005501 ENSSLDG00000005480 zgc:73226 (ENSSLDG00000005473) thbs4b (ENSSLDG00000005407) ENSSLDG00000005269 ENSSLDG00000005223 zgc:122979 (ENSSLDG00000005215) hwa (ENSSLDG00000005194) ATP5F1A (ENSSLDG00000005152) zgc:77838 (ENSSLDG00000005097) RNF165 (ENSSLDG00000005052) LOXHD1 (ENSSLDG00000004940) st8sia5 (ENSSLDG00000004842) rpl37 (ENSSLDG00000004788) #22 ptgs1 (ENSSLDG00000004750) pdcl (ENSSLDG00000004736) Barramundi perch MODERN SPECIES 101 hnrpkl (ENSLCAG00010002964) ENSLCAG00010002954 ENSLCAG00010002949 prune2 (ENSLCAG00010002946) ENSLCAG00010002896 ENSLCAG00010002878 zgc:73226 (ENSLCAG00010002874) thbs4b (ENSLCAG00010002473) ENSLCAG00010002380 zgc:122979 (ENSLCAG00010002377) atp5fa1 (ENSLCAG00010002375) zgc:77838 (ENSLCAG00010002371) RNF165 (ENSLCAG00010002367) LOXHD1 (ENSLCAG00010002359) st8sia5 (ENSLCAG00010002346) rpl37 (ENSLCAG00010002333) #22 ptgs1 (ENSLCAG00010002329) pdcl (ENSLCAG00010002322) rpl28 (ENSLCAG00010002317) ENSLCAG00010002313 ENSLCAG00010002099 notch1a (ENSLCAG00010001977) camsap1a (ENSLCAG00010001967) KCNT1 (ENSLCAG00010001943) psmd5 (ENSLCAG00010001921) B3GALT9 (ENSLCAG00010001917) ENSLCAG00010001866 ENSLCAG00010001771 NUP188 (ENSLCAG00010001675) dolk (ENSLCAG00010001654) phyhd1 (ENSLCAG00010001651) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153434.c.b ENSGT00940000161347.a.a ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x ENSGT00390000004067 ENSGT00390000006287 ENSGT00940000154043.A.j.b Turbot MODERN SPECIES 7 hnrpkl (ENSSMAG00000007969) ENSSMAG00000008012 gna14 (ENSSMAG00000008031) prune2 (ENSSMAG00000008036) ENSSMAG00000008072 ENSSMAG00000008084 ENSSMAG00000008091 thbs4b (ENSSMAG00000008125) ENSSMAG00000008185 hwa (ENSSMAG00000008544) atp5fa1 (ENSSMAG00000008519) C18orf25 (ENSSMAG00000008557) RNF165 (ENSSMAG00000032415) LOXHD1 (ENSSMAG00000008589) ST8SIA5 (ENSSMAG00000008655) rpl37 (ENSSMAG00000008688) #22 ENSSMAG00000008708 ENSSMAG00000008737 ENSSMAG00000008756 ENSSMAG00000008778 ENSSMAG00000008794 ENSSMAG00000008857 ENSSMAG00000008955 ENSSMAG00000008991 ENSSMAG00000009172 ENSSMAG00000028675 ENSSMAG00000009277 NUP188 (ENSSMAG00000009352) dolk (ENSSMAG00000009434) phyhd1 (ENSSMAG00000009440) lrrc8aa (ENSSMAG00000009462) Tongue sole MODERN SPECIES 5 gna14 (ENSCSEG00000001032) prune2 (ENSCSEG00000001044) ENSCSEG00000001049 ENSCSEG00000001055 ENSCSEG00000001087 zgc:73226 (ENSCSEG00000001089) thbs4b (ENSCSEG00000001095) ENSCSEG00000001109 zgc:122979 (ENSCSEG00000001112) hwa (ENSCSEG00000001116) atp5fa1 (ENSCSEG00000001126) zgc:77838 (ENSCSEG00000001156) RNF165 (ENSCSEG00000001163) LOXHD1 (ENSCSEG00000001178) st8sia5 (ENSCSEG00000001273) rpl37 (ENSCSEG00000001286) #22 ptgs1 (ENSCSEG00000001302) pdcl (ENSCSEG00000001308) rpl28 (ENSCSEG00000001312) ENSCSEG00000001317 ENSCSEG00000001326 ENSCSEG00000001345 notch1a (ENSCSEG00000001351) camsap1a (ENSCSEG00000001372) KCNT1 (ENSCSEG00000001395) psmd5 (ENSCSEG00000001432) ENSCSEG00000001439 ENSCSEG00000001443 ENSCSEG00000001446 ENSCSEG00000001451 setd1ba (ENSCSEG00000001458) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161347.a.a ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00940000177433 ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x ENSGT00390000004067 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000153434.c.b ENSGT00940000161347.a.a ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x ENSGT00390000004067 ENSGT00390000006287 Tetraodon MODERN SPECIES 19 kcmf1 (ENSTNIG00000007552) ntrk2b (ENSTNIG00000007553) hnrpkl (ENSTNIG00000007554) gna14 (ENSTNIG00000007555) prune2 (ENSTNIG00000007556) ENSTNIG00000007557 ENSTNIG00000000733 zgc:73226 (ENSTNIG00000014273) thbs4b (ENSTNIG00000014272) zgc:122979 (ENSTNIG00000014271) atp5fa1 (ENSTNIG00000007010) zgc:77838 (ENSTNIG00000007009) RNF165 (ENSTNIG00000006462) LOXHD1 (ENSTNIG00000006461) st8sia5 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gna14 (ENSDLAG00005009757) ENSDLAG00005008973 ENSDLAG00005007696 ENSDLAG00005007831 ENSDLAG00005007671 atp5fa1 (ENSDLAG00005007330) C18orf25 (ENSDLAG00005027206) RNF165 (ENSDLAG00005007267) LOXHD1 (ENSDLAG00005006888) ST8SIA5 (ENSDLAG00005006845) rpl37 (ENSDLAG00005006838) #22 ENSDLAG00005006673 ENSDLAG00005006661 ENSDLAG00005006652 ENSDLAG00005030236 ENSDLAG00005004755 ENSDLAG00005001449 ENSDLAG00005001124 ENSDLAG00005000746 ENSDLAG00005000700 ENSDLAG00005000680 ENSDLAG00005000683 ENSDLAG00005030041 ENSDLAG00005000610 spout1 (ENSDLAG00005000535) ENSDLAG00005000515 Large yellow croaker MODERN SPECIES 4 kyat1 (ENSLCRG00005002729) spout1 (ENSLCRG00005002200) ST6GALNAC6 (ENSLCRG00005002196) st6galnac4 (ENSLCRG00005002193) miga2 (ENSLCRG00005002192) dolpp1 (ENSLCRG00005002189) NTNG2 (ENSLCRG00005002186) ENSLCRG00005002183 rapgef1b (ENSLCRG00005000470) uck1 (ENSLCRG00005000456) dnlz (ENSLCRG00005000450) zgc:77838 (ENSLCRG00005000446) RNF165 (ENSLCRG00005000440) LOXHD1 (ENSLCRG00005000408) 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ENSLBEG00000027743 KCNT1 (ENSLBEG00000027725) Ballan wrasse MODERN SPECIES 2645 rpl37 (ENSLBEG00000005693) #22 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161347.a.a ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00940000177433 ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000163466.g.a ENSGT00940000167622 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00950000183190.a.b.b Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161347.a.a ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 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ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT01100000264989 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000158788 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730.b ENSGT01050000244968.c.c Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161347.a.a ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT01100000264989 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000158788 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730.b ENSGT01050000244968.c.c Javanese ricefish MODERN SPECIES 3 ENSOJAG00000020754 gna14 (ENSOJAG00000020728) prune2 (ENSOJAG00000020711) ENSOJAG00000020258 ENSOJAG00000020231 zgc:73226 (ENSOJAG00000020227) thbs4b (ENSOJAG00000018504) ENSOJAG00000018401 zgc:122979 (ENSOJAG00000018394) hwa (ENSOJAG00000018370) atp5fa1 (ENSOJAG00000018308) zgc:77838 (ENSOJAG00000018287) RNF165 (ENSOJAG00000018268) LOXHD1 (ENSOJAG00000017805) st8sia5 (ENSOJAG00000017763) rpl37 (ENSOJAG00000017750) #22 PTGS1 (ENSOJAG00000017650) pdcl (ENSOJAG00000017635) rpl28 (ENSOJAG00000017615) rpl28 (ENSOJAG00000015806) ENSOJAG00000015796 SEC16A (ENSOJAG00000015472) notch1a (ENSOJAG00000011572) camsap1a (ENSOJAG00000011262) KCNT1 (ENSOJAG00000009198) psmd5 (ENSOJAG00000008893) B3GALT9 (ENSOJAG00000008859) ENSOJAG00000008824 mtrex (ENSOJAG00000006917) PLPP1 (ENSOJAG00000006897) CSGALNACT1 (ENSOJAG00000006876) Indian medaka MODERN SPECIES 30 gna14 (ENSOMEG00000010524) prune2 (ENSOMEG00000010475) ENSOMEG00000010420 ENSOMEG00000010389 ENSOMEG00000010335 zgc:73226 (ENSOMEG00000010315) thbs4b (ENSOMEG00000010286) ENSOMEG00000010200 zgc:122979 (ENSOMEG00000010133) hwa (ENSOMEG00000010118) atp5fa1 (ENSOMEG00000010085) zgc:77838 (ENSOMEG00000010042) RNF165 (ENSOMEG00000009998) LOXHD1 (ENSOMEG00000009953) st8sia5 (ENSOMEG00000009902) rpl37 (ENSOMEG00000009843) #22 PTGS1 (ENSOMEG00000009787) pdcl (ENSOMEG00000009734) rpl28 (ENSOMEG00000009716) ENSOMEG00000009696 ENSOMEG00000009643 notch1a (ENSOMEG00000009528) CAMSAP1 (ENSOMEG00000009410) KCNT1 (ENSOMEG00000009245) psmd5 (ENSOMEG00000009035) B3GALT9 (ENSOMEG00000009001) ENSOMEG00000008984 DHX29 (ENSOMEG00000008943) mtrex (ENSOMEG00000008825) PLPP1 (ENSOMEG00000008698) CSGALNACT1 (ENSOMEG00000008659) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000176240 ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f 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ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00940000167622.a ENSGT00940000163466.g.a ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161347.a.a ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000163466.g.a ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x ENSGT00390000004067 ENSGT00390000006287 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 9 ENSKMAG00000012188 gna14 (ENSKMAG00000012176) gna14 (ENSKMAG00000012157) prune2 (ENSKMAG00000012116) ENSKMAG00000012050 ENSKMAG00000012025 zgc:73226 (ENSKMAG00000011993) thbs4b (ENSKMAG00000011927) zgc:122979 (ENSKMAG00000011895) hwa (ENSKMAG00000011880) atp5fa1 (ENSKMAG00000011837) zgc:77838 (ENSKMAG00000011757) RNF165 (ENSKMAG00000011715) LOXHD1 (ENSKMAG00000011600) st8sia5 (ENSKMAG00000011551) rpl37 (ENSKMAG00000011480) #22 ptgs1 (ENSKMAG00000011446) pdcl (ENSKMAG00000011429) rpl28 (ENSKMAG00000011412) ENSKMAG00000011397 ENSKMAG00000011196 notch1a (ENSKMAG00000011050) camsap1a (ENSKMAG00000010972) KCNT1 (ENSKMAG00000010894) psmd5 (ENSKMAG00000010852) B3GALT9 (ENSKMAG00000010840) cdk5rap2 (ENSKMAG00000010733) NUP188 (ENSKMAG00000010645) dolk (ENSKMAG00000010614) phyhd1 (ENSKMAG00000010595) lrrc8aa (ENSKMAG00000010580) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1611 gna14 (ENSNFUG00015003936) PRUNE2 (ENSNFUG00015003938) ENSNFUG00015003987 Nfu_g_1_006391 (ENSNFUG00015004098) ENSNFUG00015004099 zgc:73226 (ENSNFUG00015004102) thbs4b (ENSNFUG00015004154) ENSNFUG00015004431 DNAJB5 (ENSNFUG00015004497) hwa (ENSNFUG00015004500) atp5fa1 (ENSNFUG00015003380) C21H18ORF25 (ENSNFUG00015003393) RNF165 (ENSNFUG00015003400) ENSNFUG00015003407 ST8SIA5 (ENSNFUG00015003451) RPL37 (ENSNFUG00015003531) #22 PTGS1 (ENSNFUG00015003556) PDCL (ENSNFUG00015003618) rpl28 (ENSNFUG00015003622) ENSNFUG00015003627 SEC16A (ENSNFUG00015003654) notch1a (ENSNFUG00015003776) CAMSAP1 (ENSNFUG00015004050) KCNT1 (ENSNFUG00015004125) psmd5 (ENSNFUG00015004192) ENSNFUG00015004211 ENSNFUG00015004235 ENSNFUG00015004241 B3GALT9 (ENSNFUG00015004245) ENSNFUG00015004252 CDK5RAP2 (ENSNFUG00015004279) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161347.a.b.g.a ENSGT00940000161347.a.b.h ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00940000167622.a ENSGT00940000163466.g.a ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161347.a.b.g.a ENSGT00940000161347.a.b.h ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00940000167622.a ENSGT00940000163466.g.a ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x Poecilia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161347.a.b.g.a ENSGT00940000161347.a.b.h ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x ENSGT00390000004067 ENSGT00390000006287 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 13 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ENSONIG00000007564 gna14 (ENSONIG00000007563) prune2 (ENSONIG00000007562) ENSONIG00000007540 ENSONIG00000042771 zgc:73226 (ENSONIG00000007539) thbs4b (ENSONIG00000007533) zgc:122979 (ENSONIG00000007532) hwa (ENSONIG00000036146) atp5fa1 (ENSONIG00000007531) zgc:77838 (ENSONIG00000042524) RNF165 (ENSONIG00000028971) LOXHD1 (ENSONIG00000007521) st8sia5 (ENSONIG00000007511) rpl37 (ENSONIG00000007508) #22 ptgs1 (ENSONIG00000007497) pdcl (ENSONIG00000028580) rpl28 (ENSONIG00000007486) ENSONIG00000043037 ENSONIG00000007476 notch1a (ENSONIG00000007454) camsap1a (ENSONIG00000007450) KCNT1 (ENSONIG00000007444) psmd5 (ENSONIG00000007437) B3GALT9 (ENSONIG00000007435) ENSONIG00000007416 ENSONIG00000028088 ENSONIG00000007403 NUP188 (ENSONIG00000007388) dolk (ENSONIG00000007387) Midas cichlid MODERN SPECIES 213 hnrpkl (ENSACIG00000014814) ENSACIG00000014795 gna14 (ENSACIG00000014767) prune2 (ENSACIG00000014725) ENSACIG00000014705 ENSACIG00000014647 zgc:73226 (ENSACIG00000014631) thbs4b 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ENSAPOG00000023397 NUP188 (ENSAPOG00000023370) dolk (ENSAPOG00000023235) phyhd1 (ENSAPOG00000023215) Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161347.a.a ENSGT00940000161347.a.b ENSGT00940000154422.d ENSGT00940000155770.b.b ENSGT00940000170274 ENSGT00390000013415.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000018729.a.f ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846.jb.b ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00390000010743.b.a ENSGT00940000159569 ENSGT00390000008732.b ENSGT00390000011509 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742.x ENSGT00390000004067 ENSGT00390000006287 Orange clownfish MODERN SPECIES 7 ENSAPEG00000019918 gna14 (ENSAPEG00000019943) prune2 (ENSAPEG00000019954) ENSAPEG00000019977 ENSAPEG00000020056 zgc:73226 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ENSGT00940000156090.b ENSGT00940000155227.a Atlantic herring MODERN SPECIES 3 med22 (ENSCHAG00000022804) zgc:103692 (ENSCHAG00000022825) usp20 (ENSCHAG00000022910) ptges (ENSCHAG00000023799) thbs4b (ENSCHAG00000023900) zgc:122979 (ENSCHAG00000025640) hwa (ENSCHAG00000025643) ENSCHAG00000025652 ENSCHAG00000025721 tor1 (ENSCHAG00000025847) nsa2 (ENSCHAG00000025862) spout1 (ENSCHAG00000025865) ENSCHAG00000025891 rpl28 (ENSCHAG00000025897) pdcl (ENSCHAG00000025906) rpl37 (ENSCHAG00000025911) #22 st8sia5 (ENSCHAG00000025920) ENSCHAG00000025936 LOXHD1 (ENSCHAG00000025959) zgc:77838 (ENSCHAG00000025971) ENSCHAG00000025974 spout1 (ENSCHAG00000025977) nsa2 (ENSCHAG00000025990) tor1 (ENSCHAG00000025993) ST6GALNAC6 (ENSCHAG00000025999) miga2 (ENSCHAG00000026011) dolpp1 (ENSCHAG00000026063) ENSCHAG00000026067 ENSCHAG00000026083 zbtb43 (ENSCHAG00000002356) RALGPS1 (ENSCHAG00000002473) Denticle herring MODERN SPECIES 13 SDK1 (ENSDCDG00000005539) ENSDCDG00000010843 ENSDCDG00000010850 ENSDCDG00000010859 ENSDCDG00000010863 ENSDCDG00000010870 ENSDCDG00000010876 ENSDCDG00000010881 f2rl1.1 (ENSDCDG00000010882) LOXHD1 (ENSDCDG00000010896) RNF165 (ENSDCDG00000010944) zgc:77838 (ENSDCDG00000010949) haus1 (ENSDCDG00000010956) atp5fa1 (ENSDCDG00000010991) st8sia5 (ENSDCDG00000011738) rpl37 (ENSDCDG00000011745) #22 pdcl (ENSDCDG00000011751) rpl28 (ENSDCDG00000011753) ENSDCDG00000011754 ENSDCDG00000011796 camsap1a (ENSDCDG00000012916) notch1a (ENSDCDG00000012926) tor1 (ENSDCDG00000012982) nsa2 (ENSDCDG00000012992) spout1 (ENSDCDG00000013004) ST6GALNAC6 (ENSDCDG00000013067) st6galnac4 (ENSDCDG00000013111) miga2 (ENSDCDG00000013121) dolpp1 (ENSDCDG00000013148) ENSDCDG00000013160 NTNG2 (ENSDCDG00000013171) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 124 ENSGT00940000156423.j ENSGT00940000154827 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a ENSGT00940000157778 ENSGT00390000007731 ENSGT00940000159569 ENSGT00940000159324 ENSGT00980000199895 ENSGT00390000008732.b ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00940000163466 ENSGT00940000167622 ENSGT00390000013040 ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000005254 #22 ENSGT00940000155227.a ENSGT00940000156090.b ENSGT01000000214630 ENSGT00550000074846 ENSGT00390000006029 ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00940000162230 ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742 ENSGT00390000004067 ENSGT00390000006287 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000159569 ENSGT00940000159324 ENSGT00980000199895 ENSGT00390000008732.b ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00390000013040 ENSGT00390000018830.a.b ENSGT01030000234535.C.c ENSGT00390000005254 #22 ENSGT01000000214630 ENSGT00940000156090.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00550000074846 ENSGT00390000006029 ENSGT00390000016167 ENSGT00940000156997.b ENSGT00940000162230 ENSGT00940000156880.d ENSGT00940000155199.e.b ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00390000005742 Zebrafish MODERN SPECIES 13 ENSDARG00000096310 ccng2 (ENSDARG00000017602) ccni (ENSDARG00000068214) SHROOM3 (ENSDARG00000102180) ENSDARG00000098408 ENSDARG00000103060 ENSDARG00000101786 ly6m6 (ENSDARG00000102159) ENSDARG00000099332 ENSDARG00000098616 ENSDARG00000099416 ENSDARG00000104775 psmd5 (ENSDARG00000059046) LOXHD1 (ENSDARG00000094738) st8sia5 (ENSDARG00000036584) rpl37 (ENSDARG00000034291) #22 hwa (ENSDARG00000094542) zgc:122979 (ENSDARG00000004187) thbs4b (ENSDARG00000020072) atp5fa1 (ENSDARG00000010149) haus1 (ENSDARG00000058968) C21H18orf25 (ENSDARG00000046071) RNF165 (ENSDARG00000077906) B3GALT9 (ENSDARG00000094253) ENSDARG00000090948 KCNT1 (ENSDARG00000079484) notch1a (ENSDARG00000103554) camsap1a (ENSDARG00000019208) ENSDARG00000086337 cdk5rap2 (ENSDARG00000024219) NUP188 (ENSDARG00000030022) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 535 ENSGT00390000008732.b.g ENSGT00940000163304.j.a.a.g.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000159569.l ENSGT00940000159324.a ENSGT00980000199895.b ENSGT00390000008732.b.h ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00390000013040.o ENSGT00390000018830.a.b.g ENSGT01030000234535.C.c.b ENSGT00940000165146 ENSGT01000000214630.c ENSGT00390000013040.p ENSGT00390000018830.a.b.h ENSGT01030000234535.C.c.a ENSGT00390000005254 #22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 227 ENSGT00940000162727.a.b.d ENSGT00390000013040.p ENSGT00390000018830.a.b.h ENSGT01030000234535.C.c.a ENSGT00390000005254 #22 ENSGT01030000234535.C.d ENSGT00940000165146 ENSGT01000000214630.c ENSGT00940000156090.b.f ENSGT00940000155227.a.f ENSGT00550000074846.fb.b ENSGT00390000006029.z ENSGT00390000016167.n.a ENSGT00940000156997.b.c ENSGT00940000162230.d ENSGT00940000156880.c.a.d ENSGT00940000157157.b.a.b.c ENSGT00950000182975.a.a.b.l.e ENSGT00950000183190.a.b.b.b ENSGT00390000005742.u.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 264 psmd5 (ENSSGRG00000019866) ENSSGRG00000019988 st8sia5 (ENSSGRG00000019989) rpl37 (ENSSGRG00000019990) #22 zgc:122979 (ENSSGRG00000019994) thbs4b 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ENSCCRG00000019257 notch1a (ENSCCRG00000019731) ENSCCRG00000020122 ENSCCRG00000019835 ENSCCRG00000019824 ENSCCRG00000020126 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00390000006287 ENSGT00390000004067 ENSGT00390000005742 ENSGT00950000183190.a.b.b ENSGT00950000182975.a.a.b.l ENSGT00940000157157.b.a.b ENSGT00940000156880.c.a ENSGT00940000162230 ENSGT00940000156997.b ENSGT00390000016167 ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846 ENSGT01000000214630 ENSGT00940000156090.b ENSGT00940000155227.a ENSGT00390000005254 #22 ENSGT01030000234535.C ENSGT00390000018830.a.b ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162727.a.b ENSGT00390000008732.b ENSGT00980000199895 ENSGT00940000159324.c ENSGT00940000159569 ENSGT00390000007731 ENSGT00940000157778 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a ENSGT00940000154827 ENSGT00940000156423.j ENSGT00390000010767 ENSGT01050000244840.A.b.b.b Channel catfish MODERN SPECIES 9 gnrh2 (ENSIPUG00000005968) gcnt4 (ENSIPUG00000005958) cdk5rap2 (ENSIPUG00000005846) ENSIPUG00000005821 camsap1a 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SPECIES 6 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009290 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 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WDR70 (ENSOCUG00000006883) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 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ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 48 ENSJJAG00000010041 ENSJJAG00000020605 Chd1 (ENSJJAG00000010572) ENSJJAG00000018381 ENSJJAG00000012290 Ccdc152 (ENSJJAG00000020346) Ghr (ENSJJAG00000018825) Fbxo4 (ENSJJAG00000021644) ENSJJAG00000021693 ENSJJAG00000004330 Plcxd3 (ENSJJAG00000023898) ENSJJAG00000020132 C6 (ENSJJAG00000008024) Mroh2b (ENSJJAG00000024133) Card6 (ENSJJAG00000023358) ENSJJAG00000014290 #22 Prkaa1 (ENSJJAG00000021671) ENSJJAG00000007891 Ptger4 (ENSJJAG00000023417) ENSJJAG00000011581 ENSJJAG00000018434 ENSJJAG00000000928 Fyb (ENSJJAG00000016416) Rictor (ENSJJAG00000014049) Osmr (ENSJJAG00000011588) Lifr (ENSJJAG00000018296) Egflam (ENSJJAG00000017564) Gdnf (ENSJJAG00000024134) Wdr70 (ENSJJAG00000000410) Nup155 (ENSJJAG00000020587) Cplane1 (ENSJJAG00000021533) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 68 ENSJJAG00000017499 Tbc1d1 (ENSJJAG00000022049) ENSJJAG00000013282 ENSJJAG00000021605 Fam114a1 (ENSJJAG00000022920) Klhl5 (ENSJJAG00000006854) Wdr19 (ENSJJAG00000018262) Rfc1 (ENSJJAG00000015683) ENSJJAG00000009804 ENSJJAG00000012957 ENSJJAG00000000380 ENSJJAG00000005695 ENSJJAG00000018695 ENSJJAG00000020106 Pds5a (ENSJJAG00000023708) ENSJJAG00000002005 #22 Rhoh (ENSJJAG00000005526) Rbm47 (ENSJJAG00000013823) Nsun7 (ENSJJAG00000001669) ENSJJAG00000012253 ENSJJAG00000019915 Uchl1 (ENSJJAG00000018713) ENSJJAG00000016303 Phox2b (ENSJJAG00000020459) Tmem33 (ENSJJAG00000014482) Slc30a9 (ENSJJAG00000017991) Bend4 (ENSJJAG00000020096) Shisa3 (ENSJJAG00000000616) Atp8a1 (ENSJJAG00000019331) Grxcr1 (ENSJJAG00000001041) Kctd8 (ENSJJAG00000016518) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00840000130401 ENSGT00730000112355 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00840000130401 ENSGT00730000112355 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Prairie vole MODERN SPECIES 6 Rhobtb3 (ENSMOCG00000013889) Glrx (ENSMOCG00000010760) Ell2 (ENSMOCG00000016428) Pcsk1 (ENSMOCG00000016958) Cast (ENSMOCG00000001071) Erap1 (ENSMOCG00000015368) Fbxo4 (ENSMOCG00000019324) Rimoc1 (ENSMOCG00000017689) Oxct1 (ENSMOCG00000020647) Plcxd3 (ENSMOCG00000003641) C6 (ENSMOCG00000015087) ENSMOCG00000008608 Mroh2b (ENSMOCG00000006405) C7 (ENSMOCG00000020383) Card6 (ENSMOCG00000000830) Rpl37 (ENSMOCG00000003835) #22 Prkaa1 (ENSMOCG00000004966) Ttc33 (ENSMOCG00000016527) Ptger4 (ENSMOCG00000017627) ENSMOCG00000000823 ENSMOCG00000022736 C9 (ENSMOCG00000018405) Fyb (ENSMOCG00000000549) Rictor (ENSMOCG00000018257) Osmr (ENSMOCG00000017794) Lifr (ENSMOCG00000021812) Egflam (ENSMOCG00000016024) Gdnf (ENSMOCG00000016819) Wdr70 (ENSMOCG00000000693) Nup155 (ENSMOCG00000014018) Cplane1 (ENSMOCG00000004713) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 6 Hmgcs1 (ENSPEMG00000020424) Nim1k (ENSPEMG00000024204) Zfp131 (ENSPEMG00000025948) ENSPEMG00000029508 ENSPEMG00000009877 Ghr (ENSPEMG00000006686) ENSPEMG00000025781 Fbxo4 (ENSPEMG00000020075) Rimoc1 (ENSPEMG00000010011) Oxct1 (ENSPEMG00000011121) Plcxd3 (ENSPEMG00000008571) C6 (ENSPEMG00000011145) Mroh2b (ENSPEMG00000011744) C7 (ENSPEMG00000009708) Card6 (ENSPEMG00000000513) Rpl37 (ENSPEMG00000015291) #22 ENSPEMG00000029179 Prkaa1 (ENSPEMG00000000574) Ttc33 (ENSPEMG00000026792) Ptger4 (ENSPEMG00000028671) ENSPEMG00000030159 Dab2 (ENSPEMG00000013156) C9 (ENSPEMG00000008329) Fyb (ENSPEMG00000001686) ENSPEMG00000014848 Rictor (ENSPEMG00000000667) Osmr (ENSPEMG00000008906) ENSPEMG00000030395 Lifr (ENSPEMG00000004406) Egflam (ENSPEMG00000017044) Gdnf (ENSPEMG00000027275) Murinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00840000130401 ENSGT00730000112355 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Rat MODERN SPECIES 1 Tlcd2 (ENSRNOG00000037275) Prpf8 (ENSRNOG00000003495) Rilp (ENSRNOG00000003784) Scarf1 (ENSRNOG00000059618) Slc43a2 (ENSRNOG00000003835) Pitpna (ENSRNOG00000003846) Inpp5k (ENSRNOG00000056954) Myo1c (ENSRNOG00000004072) Crk (ENSRNOG00000025792) Ywhae (ENSRNOG00000005290) Doc2b (ENSRNOG00000060054) Rph3al (ENSRNOG00000061429) C10h17orf97 (ENSRNOG00000025287) Rflnb (ENSRNOG00000006674) Vps53 (ENSRNOG00000006895) Rpl37l1 (ENSRNOG00000034180) #22 Tlcd3a (ENSRNOG00000007722) Gemin4 (ENSRNOG00000007788) Gemin4 (ENSRNOG00000055236) Mrm3 (ENSRNOG00000037238) Nxn (ENSRNOG00000008178) Timm22 (ENSRNOG00000007988) Abr (ENSRNOG00000056837) Gosr1 (ENSRNOG00000003971) Gosr1 (ENSRNOG00000070572) Gosr1 (ENSRNOG00000070896) Bhlha9 (ENSRNOG00000022232) Trarg1 (ENSRNOG00000022239) Cpd (ENSRNOG00000003873) Tmigd1 (ENSRNOG00000003865) Blmh (ENSRNOG00000003563) Mus ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00840000130401.d ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Shrew mouse MODERN SPECIES 2 Nim1k (MGP_PahariEiJ_G0016001) Zfp131 (MGP_PahariEiJ_G0016002) MGP_PahariEiJ_G0016003 MGP_PahariEiJ_G0016004 MGP_PahariEiJ_G0016005 Ccdc152 (MGP_PahariEiJ_G0016006) Ghr (MGP_PahariEiJ_G0016007) Fbxo4 (MGP_PahariEiJ_G0016008) Rimoc1 (MGP_PahariEiJ_G0016009) Oxct1 (MGP_PahariEiJ_G0016010) Plcxd3 (MGP_PahariEiJ_G0016011) MGP_PahariEiJ_G0016012 Mroh2b (MGP_PahariEiJ_G0016013) C7 (MGP_PahariEiJ_G0016014) Card6 (MGP_PahariEiJ_G0016015) Rpl37 (MGP_PahariEiJ_G0016016) #22 Prkaa1 (MGP_PahariEiJ_G0016017) Ttc33 (MGP_PahariEiJ_G0016018) Ptger4 (MGP_PahariEiJ_G0016019) Dab2 (MGP_PahariEiJ_G0016020) C9 (MGP_PahariEiJ_G0016021) Fyb (MGP_PahariEiJ_G0016022) Rictor (MGP_PahariEiJ_G0016023) Osmr (MGP_PahariEiJ_G0016024) Lifr (MGP_PahariEiJ_G0016025) Egflam (MGP_PahariEiJ_G0016026) Gdnf (MGP_PahariEiJ_G0016027) Wdr70 (MGP_PahariEiJ_G0016028) Nup155 (MGP_PahariEiJ_G0016029) Cplane1 (MGP_PahariEiJ_G0016030) Nipbl (MGP_PahariEiJ_G0016031) Mus_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Ryukyu mouse MODERN SPECIES 6 MGP_CAROLIEiJ_G0019624 Ccdc152 (MGP_CAROLIEiJ_G0019625) Ghr (MGP_CAROLIEiJ_G0019626) Fbxo4 (MGP_CAROLIEiJ_G0019627) Rimoc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019628) Oxct1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019629) Plcxd3 (MGP_CAROLIEiJ_G0019630) C6 (MGP_CAROLIEiJ_G0019631) Mroh2b (MGP_CAROLIEiJ_G0019632) C7 (MGP_CAROLIEiJ_G0019633) Card6 (MGP_CAROLIEiJ_G0019634) Rpl37 (MGP_CAROLIEiJ_G0019635) #22 Prkaa1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019636) MGP_CAROLIEiJ_G0019637 Ptger4 (MGP_CAROLIEiJ_G0019638) Dab2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019639) C9 (MGP_CAROLIEiJ_G0019640) Fyb (MGP_CAROLIEiJ_G0019641) Rictor (MGP_CAROLIEiJ_G0019642) Osmr (MGP_CAROLIEiJ_G0019643) Lifr (MGP_CAROLIEiJ_G0019644) Egflam (MGP_CAROLIEiJ_G0019645) Gdnf (MGP_CAROLIEiJ_G0019646) Wdr70 (MGP_CAROLIEiJ_G0019647) Nup155 (MGP_CAROLIEiJ_G0019648) Cplane1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019649) Nipbl (MGP_CAROLIEiJ_G0019650) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865.h ENSGT00940000158865.g ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 Mouse MODERN SPECIES 6 Selenop (ENSMUSG00000064373) Ccdc152 (ENSMUSG00000091119) Ghr (ENSMUSG00000055737) Fbxo4 (ENSMUSG00000022184) Rimoc1 (ENSMUSG00000041935) Oxct1 (ENSMUSG00000022186) Plcxd3 (ENSMUSG00000049148) C6 (ENSMUSG00000022181) Mroh2b (ENSMUSG00000022155) C7 (ENSMUSG00000079105) Card6 (ENSMUSG00000041849) Rpl37 (ENSMUSG00000041841) #22 Prkaa1 (ENSMUSG00000050697) Ttc33 (ENSMUSG00000022151) Ptger4 (ENSMUSG00000039942) Dab2 (ENSMUSG00000022150) C9 (ENSMUSG00000022149) Fyb (ENSMUSG00000022148) Rictor (ENSMUSG00000050310) Osmr (ENSMUSG00000022146) Lifr (ENSMUSG00000054263) Egflam (ENSMUSG00000042961) Gdnf (ENSMUSG00000022144) Wdr70 (ENSMUSG00000039828) Nup155 (ENSMUSG00000022142) Cplane1 (ENSMUSG00000039801) Nipbl (ENSMUSG00000022141) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865.h ENSGT00940000158865.g ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 Steppe mouse MODERN SPECIES 2724 C6 (ENSMSIG00000031834) Mroh2b (ENSMSIG00000031833) C7 (ENSMSIG00000031831) Card6 (ENSMSIG00000031830) Rpl37 (ENSMSIG00000031828) #22 ENSMSIG00000031827 ENSMSIG00000031826 Ttc33 (ENSMSIG00000031825) Ptger4 (ENSMSIG00000031824) ENSMSIG00000031823 Kangaroo rat DUPLICATION Kangaroo rat MODERN SPECIES 360 ENSDORG00000026513 Hmgcs1 (ENSDORG00000001725) Nim1k (ENSDORG00000001716) Zfp131 (ENSDORG00000028178) ENSDORG00000004794 Ccdc152 (ENSDORG00000004793) Ghr (ENSDORG00000008027) ENSDORG00000016321 Rimoc1 (ENSDORG00000016319) ENSDORG00000016318 Plcxd3 (ENSDORG00000006478) C6 (ENSDORG00000008629) Mroh2b (ENSDORG00000008307) C7 (ENSDORG00000008303) ENSDORG00000008302 ENSDORG00000008300 #22 Prkaa1 (ENSDORG00000014183) Ttc33 (ENSDORG00000014182) Ptger4 (ENSDORG00000005762) ENSDORG00000006875 Fyb (ENSDORG00000015775) Rictor (ENSDORG00000010369) Osmr (ENSDORG00000010368) Lifr (ENSDORG00000016168) Egflam (ENSDORG00000016165) Gdnf (ENSDORG00000027984) Wdr70 (ENSDORG00000008417) Nup155 (ENSDORG00000009542) Nipbl (ENSDORG00000002543) Slc1a3 (ENSDORG00000016590) ENSDORG00000029340 Kangaroo rat MODERN SPECIES 413 Zfx (ENSDORG00000026778) Eif2s3y (ENSDORG00000007498) Klhl15 (ENSDORG00000028113) Apoo (ENSDORG00000015741) Sat1 (ENSDORG00000028241) ENSDORG00000002910 Prdx4 (ENSDORG00000002908) Ptchd1 (ENSDORG00000004212) Phex (ENSDORG00000010976) ENSDORG00000025753 ENSDORG00000016069 Yy2 (ENSDORG00000011068) Mbtps2 (ENSDORG00000011065) Smpx (ENSDORG00000003075) Cnksr2 (ENSDORG00000010230) ENSDORG00000029700 #22 Rps6ka3 (ENSDORG00000011802) ENSDORG00000011536 Map7d2 (ENSDORG00000007990) Bclaf3 (ENSDORG00000007988) Sh3kbp1 (ENSDORG00000005919) Map3k15 (ENSDORG00000011849) Pdha1 (ENSDORG00000011848) Adgrg2 (ENSDORG00000003270) ENSDORG00000026958 ENSDORG00000011776 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567.de ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c ENSGT00940000155464 Guinea pig MODERN SPECIES 29 C5orf34 (ENSCPOG00000015360) TMEM267 (ENSCPOG00000001894) HMGCS1 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ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Marmotini ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b.g ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b.g ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 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ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009290 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009290 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160020 ENSGT00870000136506.ob.a.b ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009290 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00390000016655.a.a.b.f ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00620000089245 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00940000154314.k.a.b ENSGT00390000015433 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00870000136506.ob.a.b ENSGT00940000163415 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009290 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00390000016655.a.a.b.f ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00620000089245 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00910000147779 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00940000154314.k.a.b Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160020 ENSGT00870000136506.ob.a.b ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009290.h ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00390000016655.a.a.b.f ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00620000089245 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00910000147779 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00940000154314.k.a.b Vervet Monkey MODERN SPECIES 15 CXXC5 (ENSCSAG00000013001) ENSCSAG00000013007 STING1 (ENSCSAG00000013013) SMIM33 (ENSCSAG00000000496) ECSCR (ENSCSAG00000013023) DNAJC18 (ENSCSAG00000013027) SPATA24 (ENSCSAG00000013050) PROB1 (ENSCSAG00000000497) MZB1 (ENSCSAG00000013057) SLC23A1 (ENSCSAG00000013063) PAIP2 (ENSCSAG00000013068) MATR3 (ENSCSAG00000013075) SIL1 (ENSCSAG00000013083) LRRTM2 (ENSCSAG00000013088) CTNNA1 (ENSCSAG00000013096) ENSCSAG00000000498 #22 HSPA9 (ENSCSAG00000013103) EGR1 (ENSCSAG00000013111) REEP2 (ENSCSAG00000013117) KDM3B (ENSCSAG00000013123) FAM53C (ENSCSAG00000013139) CDC25C (ENSCSAG00000013168) GFRA3 (ENSCSAG00000013196) CDC23 (ENSCSAG00000013209) KIF20A (ENSCSAG00000013219) BRD8 (ENSCSAG00000013231) NME5 (ENSCSAG00000013244) WNT8A (ENSCSAG00000013279) FAM13B (ENSCSAG00000013293) PKD2L2 (ENSCSAG00000013310) MYOT (ENSCSAG00000013319) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009776.j.a.a ENSGT00910000147539 ENSGT00390000009290.g ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00390000016655.a.a.b.f ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00620000089245 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00910000147779 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00940000154314.k.a.b Macaca ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009776.j.a.a ENSGT00910000147539 ENSGT00390000009290.g ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00910000147779 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00940000154314.k.a.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 138 ZNF131 (ENSMNEG00000017333) ENSMNEG00000040118 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ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00620000089245 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00910000147779 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00940000154314.k.a.b Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009776.j.a.a ENSGT00910000147539 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00910000147460 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00390000016655.a.a.b.f ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00910000147779 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00940000154314.k.a.b ENSGT00390000015433 Drill MODERN SPECIES 244 ZNF131 (ENSMLEG00000044036) ENSMLEG00000034033 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snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1263 C6 (ENSRBIG00000034649) MROH2B (ENSRBIG00000038316) C7 (ENSRBIG00000040248) CARD6 (ENSRBIG00000039446) ENSRBIG00000038518 #22 PRKAA1 (ENSRBIG00000036645) PTGER4 (ENSRBIG00000028249) TTC33 (ENSRBIG00000039796) Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3287 ENSRBIG00000043568 #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3187 ENSRBIG00000042072 #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00870000136506.ob.a.b ENSGT00940000154668.ab.a ENSGT00390000009290 ENSGT00910000147539 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00390000016655.a.a.b.f ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00620000089245 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00940000154314.k.a.b ENSGT00390000015433 Gibbon MODERN SPECIES 21 ENSNLEG00000035285 ENSNLEG00000031086 SELENOP (ENSNLEG00000029119) CCDC152 (ENSNLEG00000016687) ENSNLEG00000033696 ENSNLEG00000031089 GHR (ENSNLEG00000016678) FBXO4 (ENSNLEG00000016662) RIMOC1 (ENSNLEG00000029700) OXCT1 (ENSNLEG00000016656) PLCXD3 (ENSNLEG00000030452) C6 (ENSNLEG00000016610) MROH2B (ENSNLEG00000016538) C7 (ENSNLEG00000016515) CARD6 (ENSNLEG00000016512) RPL37 (ENSNLEG00000034217) #22 PRKAA1 (ENSNLEG00000016472) PTGER4 (ENSNLEG00000016459) TTC33 (ENSNLEG00000016461) ENSNLEG00000016457 DAB2 (ENSNLEG00000016439) C9 (ENSNLEG00000016425) FYB1 (ENSNLEG00000032915) RICTOR (ENSNLEG00000016355) OSMR (ENSNLEG00000016342) LIFR (ENSNLEG00000028672) EGFLAM (ENSNLEG00000016287) ENSNLEG00000016286 ENSNLEG00000032684 WDR70 (ENSNLEG00000016270) ENSNLEG00000035003 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160020 ENSGT00870000136506.ob.a.b ENSGT00940000154668.ab.a ENSGT00390000009290 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00390000016655.a.a.b.f ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00620000089245 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 Orangutan MODERN SPECIES 18 NIM1K (ENSPPYG00000015438) ENSPPYG00000033307 ZNF131 (ENSPPYG00000015437) ENSPPYG00000015434 SELENOP (ENSPPYG00000025924) CCDC152 (ENSPPYG00000015432) GHR (ENSPPYG00000015431) FBXO4 (ENSPPYG00000015430) RIMOC1 (ENSPPYG00000030534) OXCT1 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ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00390000016655.a.a.b.f ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00620000089245 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 Gorilla MODERN SPECIES 8 NIM1K (ENSGGOG00000001138) ENSGGOG00000023143 ZNF131 (ENSGGOG00000002252) ANXA2R (ENSGGOG00000040072) ENSGGOG00000038169 CCDC152 (ENSGGOG00000012746) GHR (ENSGGOG00000012636) FBXO4 (ENSGGOG00000005501) RIMOC1 (ENSGGOG00000009157) OXCT1 (ENSGGOG00000025087) PLCXD3 (ENSGGOG00000042825) C6 (ENSGGOG00000008230) MROH2B (ENSGGOG00000002203) C7 (ENSGGOG00000002197) CARD6 (ENSGGOG00000003251) RPL37 (ENSGGOG00000003241) #22 PRKAA1 (ENSGGOG00000027961) PTGER4 (ENSGGOG00000007632) ENSGGOG00000040103 DAB2 (ENSGGOG00000005856) C9 (ENSGGOG00000015918) FYB1 (ENSGGOG00000001364) ENSGGOG00000025102 RICTOR (ENSGGOG00000014599) OSMR (ENSGGOG00000014580) LIFR (ENSGGOG00000015008) 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ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00390000016655.a.a.b.f ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00620000089245 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 Bonobo MODERN SPECIES 18 ZNF131 (ENSPPAG00000024198) ANXA2R (ENSPPAG00000026282) ENSPPAG00000000781 SELENOP (ENSPPAG00000003843) CCDC152 (ENSPPAG00000017518) GHR (ENSPPAG00000036371) FBXO4 (ENSPPAG00000036877) RIMOC1 (ENSPPAG00000027004) OXCT1 (ENSPPAG00000000926) PLCXD3 (ENSPPAG00000027307) C6 (ENSPPAG00000035900) ENSPPAG00000002482 ENSPPAG00000040649 C7 (ENSPPAG00000033591) CARD6 (ENSPPAG00000031567) RPL37 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Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462.o ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Mas night monkey MODERN SPECIES 576 C6 (ENSANAG00000029793) MROH2B (ENSANAG00000027518) C7 (ENSANAG00000023976) CARD6 (ENSANAG00000029436) RPL37 (ENSANAG00000031221) #22 PRKAA1 (ENSANAG00000032687) ENSANAG00000024466 PTGER4 (ENSANAG00000037694) ENSANAG00000022538 DAB2 (ENSANAG00000038111) C9 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ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00940000167563 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462.o ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 57 ZNF131 (ENSSBOG00000021812) CCDC152 (ENSSBOG00000025815) ENSSBOG00000029186 GHR (ENSSBOG00000026257) ENSSBOG00000024904 FBXO4 (ENSSBOG00000031090) RIMOC1 (ENSSBOG00000024152) ENSSBOG00000007830 ENSSBOG00000017199 PLCXD3 (ENSSBOG00000024536) ENSSBOG00000019421 C6 (ENSSBOG00000034860) 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Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 124 CEP135 (ENSCCAG00000035439) EXOC1 (ENSCCAG00000023309) EXOC1L (ENSCCAG00000029016) ENSCCAG00000019432 NMU (ENSCCAG00000033866) PDCL2 (ENSCCAG00000021001) CLOCK (ENSCCAG00000031941) TMEM165 (ENSCCAG00000031593) ENSCCAG00000012793 SRD5A3 (ENSCCAG00000037850) ENSCCAG00000012342 #22 KDR (ENSCCAG00000027345) KIT (ENSCCAG00000033583) ENSCCAG00000012432 #22 PDGFRA (ENSCCAG00000023887) ENSCCAG00000022442 GSX2 (ENSCCAG00000023920) CHIC2 (ENSCCAG00000030790) LNX1 (ENSCCAG00000034596) FIP1L1 (ENSCCAG00000021687) SCFD2 (ENSCCAG00000031373) ENSCCAG00000023197 ENSCCAG00000030526 ENSCCAG00000031404 RASL11B (ENSCCAG00000037560) ENSCCAG00000032234 Capuchin MODERN SPECIES 124 SGCB (ENSCCAG00000012614) SPATA18 (ENSCCAG00000020113) ENSCCAG00000030356 ENSCCAG00000032234 RASL11B (ENSCCAG00000037560) ENSCCAG00000031404 ENSCCAG00000030526 ENSCCAG00000023197 SCFD2 (ENSCCAG00000031373) FIP1L1 (ENSCCAG00000021687) LNX1 (ENSCCAG00000034596) CHIC2 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Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009290 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01090000262500 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009290 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01090000262500 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 Microbat MODERN SPECIES 1005 ENSMLUG00000026368 ENSMLUG00000023418 FBXO4 (ENSMLUG00000014799) RIMOC1 (ENSMLUG00000007915) ENSMLUG00000009431 PLCXD3 (ENSMLUG00000016916) C6 (ENSMLUG00000016910) MROH2B (ENSMLUG00000007613) C7 (ENSMLUG00000007586) ENSMLUG00000007572 RPL37 (ENSMLUG00000001565) #22 PRKAA1 (ENSMLUG00000014242) TTC33 (ENSMLUG00000012023) PTGER4 (ENSMLUG00000010038) ENSMLUG00000029265 ENSMLUG00000030031 ENSMLUG00000006820 ENSMLUG00000027508 DAB2 (ENSMLUG00000005444) C9 (ENSMLUG00000005440) FYB1 (ENSMLUG00000002937) RICTOR (ENSMLUG00000005754) OSMR (ENSMLUG00000005743) LIFR (ENSMLUG00000015027) EGFLAM (ENSMLUG00000012866) GDNF (ENSMLUG00000005002) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000167563 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01090000262500 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00980000202544 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00980000202544 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00940000169940 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Arabian camel MODERN SPECIES 22 NIM1K (ENSCDRG00005014864) ZNF131 (ENSCDRG00005014946) ENSCDRG00005015038 ENSCDRG00005015073 ENSCDRG00005015137 CCDC152 (ENSCDRG00005015162) GHR (ENSCDRG00005015314) FBXO4 (ENSCDRG00005015505) RIMOC1 (ENSCDRG00005015687) ENSCDRG00005015716 OXCT1 (ENSCDRG00005015763) PLCXD3 (ENSCDRG00005015917) C6 (ENSCDRG00005015939) MROH2B (ENSCDRG00005015996) C7 (ENSCDRG00005016414) RPL37 (ENSCDRG00005016487) #22 PRKAA1 (ENSCDRG00005016610) TTC33 (ENSCDRG00005016688) PTGER4 (ENSCDRG00005016717) DAB2 (ENSCDRG00005016789) C9 (ENSCDRG00005017085) FYB1 (ENSCDRG00005017167) RICTOR (ENSCDRG00005017323) OSMR (ENSCDRG00005017567) LIFR (ENSCDRG00005017655) EGFLAM (ENSCDRG00005017766) GDNF (ENSCDRG00005018248) WDR70 (ENSCDRG00005018283) NUP155 (ENSCDRG00005018373) CPLANE1 (ENSCDRG00005000143) NIPBL (ENSCDRG00005000397) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00980000202544 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 Pecora ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00980000202544 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00980000202544 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00980000202544 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000015797.d.r ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231.g ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 7 C5orf34 (ENSOARG00020005897) TMEM267 (ENSOARG00020005959) CCL28 (ENSOARG00020005973) HMGCS1 (ENSOARG00020005999) NIM1K (ENSOARG00020006035) ZNF131 (ENSOARG00020006056) ENSOARG00020006096 CCDC152 (ENSOARG00020006118) GHR (ENSOARG00020006196) FBXO4 (ENSOARG00020006423) ENSOARG00020006604 OXCT1 (ENSOARG00020006708) PLCXD3 (ENSOARG00020006984) C6 (ENSOARG00020007044) ENSOARG00020007543 RPL37 (ENSOARG00020007993) #22 PRKAA1 (ENSOARG00020008087) TTC33 (ENSOARG00020008406) PTGER4 (ENSOARG00020008466) ENSOARG00020008514 DAB2 (ENSOARG00020008646) C9 (ENSOARG00020008908) FYB1 (ENSOARG00020009055) RICTOR (ENSOARG00020009257) ENSOARG00020010918 LIFR (ENSOARG00020010940) EGFLAM (ENSOARG00020011103) GDNF (ENSOARG00020011807) WDR70 (ENSOARG00020011861) NUP155 (ENSOARG00020012252) NIPBL (ENSOARG00020013253) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00980000202544 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 American bison MODERN SPECIES 3245 CLCN5 (ENSBBBG00000012173) ENSBBBG00000012137 RP2 (ENSBBBG00000012116) ENSBBBG00000012108 USP27X (ENSBBBG00000012099) PAGE4 (ENSBBBG00000012093) FBXO4 (ENSBBBG00000012083) RIMOC1 (ENSBBBG00000012071) OXCT1 (ENSBBBG00000012068) PLCXD3 (ENSBBBG00000025503) C6 (ENSBBBG00000006743) MROH2B (ENSBBBG00000006720) C7 (ENSBBBG00000025233) CARD6 (ENSBBBG00000025191) RPL37 (ENSBBBG00000007752) #22 PRKAA1 (ENSBBBG00000006659) TTC33 (ENSBBBG00000006615) PTGER4 (ENSBBBG00000025021) ENSBBBG00000006604 DAB2 (ENSBBBG00000024953) C9 (ENSBBBG00000024759) FYB1 (ENSBBBG00000024722) RICTOR (ENSBBBG00000024605) OSMR (ENSBBBG00000024414) LIFR (ENSBBBG00000008997) EGFLAM (ENSBBBG00000024243) GDNF (ENSBBBG00000024032) WDR70 (ENSBBBG00000024014) NUP155 (ENSBBBG00000023976) CPLANE1 (ENSBBBG00000023780) Bos ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00980000202544 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150.s Bos_b ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00960000190072 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00390000015784.h ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150.s ENSGT00390000010427.c Cow MODERN SPECIES 12 NIM1K (ENSBTAG00000006233) ZNF131 (ENSBTAG00000015504) ENSBTAG00000054352 SELENOP (ENSBTAG00000054085) CCDC152 (ENSBTAG00000033221) GHR (ENSBTAG00000001335) FBXO4 (ENSBTAG00000016981) RIMOC1 (ENSBTAG00000004929) OXCT1 (ENSBTAG00000033186) ENSBTAG00000049771 PLCXD3 (ENSBTAG00000010822) C6 (ENSBTAG00000014177) MROH2B (ENSBTAG00000001997) C7 (ENSBTAG00000011766) CARD6 (ENSBTAG00000014374) RPL37 (ENSBTAG00000005142) #22 PRKAA1 (ENSBTAG00000000013) TTC33 (ENSBTAG00000000012) PTGER4 (ENSBTAG00000014972) DAB2 (ENSBTAG00000016152) C9 (ENSBTAG00000016149) FYB1 (ENSBTAG00000001492) RICTOR (ENSBTAG00000006697) OSMR (ENSBTAG00000033107) LIFR (ENSBTAG00000010423) EGFLAM (ENSBTAG00000019595) GDNF (ENSBTAG00000005176) WDR70 (ENSBTAG00000033095) NUP155 (ENSBTAG00000002458) CPLANE1 (ENSBTAG00000000586) NIPBL (ENSBTAG00000000579) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00980000202544 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150.s Domestic yak MODERN SPECIES 15 NIM1K (ENSBGRG00000015911) ZNF131 (ENSBGRG00000015728) ENSBGRG00000015629 ENSBGRG00000015444 CCDC152 (ENSBGRG00000025298) GHR (ENSBGRG00000025165) FBXO4 (ENSBGRG00000025120) RIMOC1 (ENSBGRG00000025094) OXCT1 (ENSBGRG00000025043) PLCXD3 (ENSBGRG00000025032) C6 (ENSBGRG00000024962) MROH2B (ENSBGRG00000024835) C7 (ENSBGRG00000024642) ENSBGRG00000024609 ENSBGRG00000024600 RPL37 (ENSBGRG00000024490) #22 PRKAA1 (ENSBGRG00000024391) TTC33 (ENSBGRG00000024337) PTGER4 (ENSBGRG00000024291) DAB2 (ENSBGRG00000024066) C9 (ENSBGRG00000023994) FYB1 (ENSBGRG00000023892) ENSBGRG00000023878 RICTOR (ENSBGRG00000023459) OSMR (ENSBGRG00000022920) ENSBGRG00000022886 LIFR (ENSBGRG00000022759) ENSBGRG00000022731 EGFLAM (ENSBGRG00000021685) GDNF (ENSBGRG00000021590) WDR70 (ENSBGRG00000021511) Wild yak MODERN SPECIES 263 GHR (ENSBMUG00000026271) FBXO4 (ENSBMUG00000026264) RIMOC1 (ENSBMUG00000026260) OXCT1 (ENSBMUG00000026258) PLCXD3 (ENSBMUG00000026253) C6 (ENSBMUG00000026250) MROH2B (ENSBMUG00000026248) C7 (ENSBMUG00000026244) CARD6 (ENSBMUG00000026242) RPL37 (ENSBMUG00000026237) #22 PRKAA1 (ENSBMUG00000026232) TTC33 (ENSBMUG00000026229) PTGER4 (ENSBMUG00000026228) DAB2 (ENSBMUG00000026225) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00960000189773 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000006707.r.g ENSGT00390000011383 ENSGT00940000154721.vb.a ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00940000165146 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00940000153239.B.n ENSGT00530000063460.A.b ENSGT01010000228899 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 Blue whale MODERN SPECIES 14 ENSBMSG00010002479 ENSBMSG00010002468 ENSBMSG00010002463 CCDC152 (ENSBMSG00010002439) GHR (ENSBMSG00010002362) ENSBMSG00010002320 FBXO4 (ENSBMSG00010002261) ENSBMSG00010002244 RIMOC1 (ENSBMSG00010002238) ENSBMSG00010002229 OXCT1 (ENSBMSG00010002211) PLCXD3 (ENSBMSG00010002197) C6 (ENSBMSG00010002171) MROH2B (ENSBMSG00010002084) C7 (ENSBMSG00010002048) RPL37 (ENSBMSG00010002005) #22 PRKAA1 (ENSBMSG00010001960) TTC33 (ENSBMSG00010001948) PTGER4 (ENSBMSG00010001942) DAB2 (ENSBMSG00010001905) C9 (ENSBMSG00010001883) ENSBMSG00010001877 ENSBMSG00010001871 ENSBMSG00010001865 RICTOR (ENSBMSG00010001806) OSMR (ENSBMSG00010001765) EGFLAM (ENSBMSG00010001547) GDNF (ENSBMSG00010001506) WDR70 (ENSBMSG00010001492) NUP155 (ENSBMSG00010001449) CPLANE1 (ENSBMSG00010001402) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000167563 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000006707.r.g ENSGT00390000011383 ENSGT00940000154721.vb.a ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00940000165146 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00940000153239.B.n ENSGT00530000063460.A.b ENSGT01010000228899 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000009290 ENSGT00940000167563 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000006707.r.g ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00940000165146 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00940000153239.B.n ENSGT00530000063460.A.b ENSGT01010000228899 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183183.b.a.r.b.a ENSGT00940000154668.rb.a ENSGT00390000009290 ENSGT00940000167563 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000006707.r.g ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00940000153239.B.n ENSGT00530000063460.A.b ENSGT01010000228899 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155725.c.b ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 Vaquita MODERN SPECIES 14 ENSPSNG00000012654 ENSPSNG00000012686 ENSPSNG00000012706 CCDC152 (ENSPSNG00000012763) GHR (ENSPSNG00000012982) FBXO4 (ENSPSNG00000013298) RIMOC1 (ENSPSNG00000013384) ENSPSNG00000013420 OXCT1 (ENSPSNG00000013489) PLCXD3 (ENSPSNG00000013744) ENSPSNG00000013802 C6 (ENSPSNG00000003100) ENSPSNG00000003137 ENSPSNG00000003175 C7 (ENSPSNG00000003232) RPL37 (ENSPSNG00000003299) #22 PRKAA1 (ENSPSNG00000003371) TTC33 (ENSPSNG00000003417) PTGER4 (ENSPSNG00000003430) ENSPSNG00000003449 DAB2 (ENSPSNG00000003484) C9 (ENSPSNG00000003566) FYB1 (ENSPSNG00000003635) ENSPSNG00000003737 RICTOR (ENSPSNG00000003768) OSMR (ENSPSNG00000003821) ENSPSNG00000003851 ENSPSNG00000003863 LIFR (ENSPSNG00000003881) EGFLAM (ENSPSNG00000003979) GDNF (ENSPSNG00000004104) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 Narwhal MODERN SPECIES 298 ENSMMNG00015004294 ENSMMNG00015004288 CCDC152 (ENSMMNG00015004263) GHR (ENSMMNG00015004218) FBXO4 (ENSMMNG00015004176) ENSMMNG00015004154 RIMOC1 (ENSMMNG00015004141) OXCT1 (ENSMMNG00015004110) ENSMMNG00015004093 PLCXD3 (ENSMMNG00015004082) ENSMMNG00015004073 C6 (ENSMMNG00015004038) MROH2B (ENSMMNG00015003995) C7 (ENSMMNG00015003958) ENSMMNG00015003941 RPL37 (ENSMMNG00015003911) #22 PRKAA1 (ENSMMNG00015003860) TTC33 (ENSMMNG00015003825) PTGER4 (ENSMMNG00015003808) DAB2 (ENSMMNG00015003683) C9 (ENSMMNG00015003592) ENSMMNG00015003575 FYB1 (ENSMMNG00015003499) ENSMMNG00015003438 RICTOR (ENSMMNG00015003392) OSMR (ENSMMNG00015003314) ENSMMNG00015003299 ENSMMNG00015003285 LIFR (ENSMMNG00015003256) EGFLAM (ENSMMNG00015003099) ENSMMNG00015003038 Suina ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009290 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00940000167563 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01090000262500 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00980000202544 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 Pig MODERN SPECIES 7 ENSSSCG00000057205 ENSSSCG00000051775 ENSSSCG00000050190 ENSSSCG00000048667 CCDC152 (ENSSSCG00000016867) GHR (ENSSSCG00000016866) FBXO4 (ENSSSCG00000016865) RIMOC1 (ENSSSCG00000040855) OXCT1 (ENSSSCG00000016863) ENSSSCG00000031448 PLCXD3 (ENSSSCG00000033993) ENSSSCG00000048052 C6 (ENSSSCG00000016861) MROH2B (ENSSSCG00000021645) C7 (ENSSSCG00000016859) RPL37 (ENSSSCG00000033326) #22 PRKAA1 (ENSSSCG00000024598) TTC33 (ENSSSCG00000034966) PTGER4 (ENSSSCG00000024439) ENSSSCG00000061479 ENSSSCG00000044033 DAB2 (ENSSSCG00000016857) C9 (ENSSSCG00000016856) FYB1 (ENSSSCG00000016855) RICTOR (ENSSSCG00000016853) OSMR (ENSSSCG00000016851) LIFR (ENSSSCG00000016850) EGFLAM (ENSSSCG00000016848) ENSSSCG00000045434 GDNF (ENSSSCG00000038727) WDR70 (ENSSSCG00000016846) Chacoan peccary MODERN SPECIES 7 FBXL7 (ENSCWAG00000004214) ANKH (ENSCWAG00000004145) OTULIN (ENSCWAG00000004072) ENSCWAG00000004045 ENSCWAG00000004029 CCDC152 (ENSCWAG00000003977) GHR (ENSCWAG00000003810) FBXO4 (ENSCWAG00000003760) RIMOC1 (ENSCWAG00000003741) OXCT1 (ENSCWAG00000003672) PLCXD3 (ENSCWAG00000003655) C6 (ENSCWAG00000003638) MROH2B (ENSCWAG00000003569) C7 (ENSCWAG00000003542) CARD6 (ENSCWAG00000003528) RPL37 (ENSCWAG00000003508) #22 PRKAA1 (ENSCWAG00000003485) TTC33 (ENSCWAG00000003468) ENSCWAG00000003465 PTGER4 (ENSCWAG00000003457) DAB2 (ENSCWAG00000003433) C9 (ENSCWAG00000003303) FYB1 (ENSCWAG00000003152) RICTOR (ENSCWAG00000002954) OSMR (ENSCWAG00000002899) LIFR (ENSCWAG00000002882) EGFLAM (ENSCWAG00000002665) ENSCWAG00000002634 WDR70 (ENSCWAG00000002608) NUP155 (ENSCWAG00000002550) CPLANE1 (ENSCWAG00000002502) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009290 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150.k.a ENSGT00390000010427.c Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 245 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 729 ENSDNOG00000045460 ZNF793 (ENSDNOG00000002626) ENSDNOG00000038073 ZNF383 (ENSDNOG00000044355) ZNF875 (ENSDNOG00000033077) ENSDNOG00000040925 ENSDNOG00000032914 ENSDNOG00000041572 #22 PHEX (ENSDNOG00000002993) SMS (ENSDNOG00000006712) MBTPS2 (ENSDNOG00000033022) SMPX (ENSDNOG00000016757) KLHL34 (ENSDNOG00000033922) CNKSR2 (ENSDNOG00000000614) ENSDNOG00000031647 RPS6KA3 (ENSDNOG00000003310) EIF1AX (ENSDNOG00000045675) MAP7D2 (ENSDNOG00000017855) BCLAF3 (ENSDNOG00000045492) SH3KBP1 (ENSDNOG00000016477) MAP3K15 (ENSDNOG00000007828) PDHA1 (ENSDNOG00000008462) ADGRG2 (ENSDNOG00000012455) Armadillo MODERN SPECIES 486 DENND6A (ENSDNOG00000048420) ENSDNOG00000009513 CCDC152 (ENSDNOG00000004246) GHR (ENSDNOG00000037370) ENSDNOG00000046709 FBXO4 (ENSDNOG00000033184) RIMOC1 (ENSDNOG00000034451) OXCT1 (ENSDNOG00000043891) PLCXD3 (ENSDNOG00000009886) ENSDNOG00000039934 C6 (ENSDNOG00000047186) MROH2B (ENSDNOG00000009137) C7 (ENSDNOG00000024383) ENSDNOG00000047850 #22 CARD6 (ENSDNOG00000000946) RPL37 (ENSDNOG00000040203) #22 PRKAA1 (ENSDNOG00000034370) TTC33 (ENSDNOG00000041184) PTGER4 (ENSDNOG00000044393) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Armadillo MODERN SPECIES 1027 IRAG1 (ENSDNOG00000008986) LYVE1 (ENSDNOG00000032795) RNF141 (ENSDNOG00000035538) AMPD3 (ENSDNOG00000009058) ENSDNOG00000046373 #22 ADM (ENSDNOG00000034436) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Rat MODERN SPECIES 18 Or7g17 (ENSRNOG00000051847) Or7g16 (ENSRNOG00000006439) Or1m1 (ENSRNOG00000006428) Mbd3l1 (ENSRNOG00000006363) RGD1304745 (ENSRNOG00000052334) LOC120094327 (ENSRNOG00000065634) Or7g25c (ENSRNOG00000034283) Or7g24 (ENSRNOG00000030856) Or7g23 (ENSRNOG00000068297) Or7g23b (ENSRNOG00000069781) Mbd3l2 (ENSRNOG00000026629) LOC100363016 (ENSRNOG00000070596) ENSRNOG00000070900 Naalad2 (ENSRNOG00000005955) Chordc1 (ENSRNOG00000026643) LOC120097744 (ENSRNOG00000064258) #22 LOC690235 (ENSRNOG00000024200) ENSRNOG00000031660 Nek2l1 (ENSRNOG00000012119) LOC689840 (ENSRNOG00000031522) Fat3 (ENSRNOG00000011585) Mtnr1b (ENSRNOG00000008972) Slc36a4 (ENSRNOG00000011455) Deup1 (ENSRNOG00000061247) Smco4 (ENSRNOG00000011162) Cep295 (ENSRNOG00000010999) Taf1d (ENSRNOG00000010921) C8h11orf54 (ENSRNOG00000010887) Med17 (ENSRNOG00000010496) Vstm5 (ENSRNOG00000010480) ENSRNOG00000062992 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Bushbaby MODERN SPECIES 139 C2orf73 (ENSOGAG00000015145) ENSOGAG00000024407 SPTBN1 (ENSOGAG00000007249) EML6 (ENSOGAG00000029470) ENSOGAG00000002719 CLHC1 (ENSOGAG00000004301) MTIF2 (ENSOGAG00000004306) CCDC88A (ENSOGAG00000004308) CFAP36 (ENSOGAG00000009833) PPP4R3B (ENSOGAG00000009837) PNPT1 (ENSOGAG00000009840) EFEMP1 (ENSOGAG00000000054) CCDC85A (ENSOGAG00000026544) ENSOGAG00000016063 FANCL (ENSOGAG00000016066) ENSOGAG00000028600 #22 ENSOGAG00000026311 BCL11A (ENSOGAG00000024696) PAPOLG (ENSOGAG00000003145) REL (ENSOGAG00000013722) PUS10 (ENSOGAG00000013726) PEX13 (ENSOGAG00000032082) SANBR (ENSOGAG00000013736) C2orf74 (ENSOGAG00000033349) ENSOGAG00000012906 USP34 (ENSOGAG00000012908) XPO1 (ENSOGAG00000000143) FAM161A (ENSOGAG00000024144) CCT4 (ENSOGAG00000003974) COMMD1 (ENSOGAG00000029292) ENSOGAG00000028774 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a.a #22 Pig-tailed macaque DUPLICATION Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 540 NALF2 (ENSMNEG00000037819) ENSMNEG00000037907 EDA (ENSMNEG00000039091) AWAT2 (ENSMNEG00000032170) ENSMNEG00000043565 DGAT2L6 (ENSMNEG00000034654) AWAT1 (ENSMNEG00000032436) P2RY4 (ENSMNEG00000002840) ARR3 (ENSMNEG00000030463) RAB41 (ENSMNEG00000045569) PDZD11 (ENSMNEG00000035922) ENSMNEG00000034152 KIF4A (ENSMNEG00000045076) GDPD2 (ENSMNEG00000032785) DLG3 (ENSMNEG00000030338) ENSMNEG00000018129 #22 TEX11 (ENSMNEG00000043445) SLC7A3 (ENSMNEG00000031301) SNX12 (ENSMNEG00000039010) FOXO4 (ENSMNEG00000043365) CXorf65 (ENSMNEG00000038907) IL2RG (ENSMNEG00000031163) MED12 (ENSMNEG00000041257) NLGN3 (ENSMNEG00000041386) GJB1 (ENSMNEG00000006305) ENSMNEG00000021179 ZMYM3 (ENSMNEG00000043291) NONO (ENSMNEG00000009698) ITGB1BP2 (ENSMNEG00000038061) ENSMNEG00000032137 ENSMNEG00000035750 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 174 IL17F (ENSMNEG00000038791) MCM3 (ENSMNEG00000035280) PAQR8 (ENSMNEG00000011526) ENSMNEG00000007313 EFHC1 (ENSMNEG00000041404) TRAM2 (ENSMNEG00000032001) TMEM14A (ENSMNEG00000035396) GSTA3 (ENSMNEG00000037930) ENSMNEG00000034303 GSTA4 (ENSMNEG00000018065) CILK1 (ENSMNEG00000032820) FBXO9 (ENSMNEG00000041281) GCM1 (ENSMNEG00000037532) ELOVL5 (ENSMNEG00000044116) GCLC (ENSMNEG00000035105) ENSMNEG00000035875 #22 KLHL31 (ENSMNEG00000033545) ENSMNEG00000038147 LRRC1 (ENSMNEG00000029924) MLIP (ENSMNEG00000040551) TINAG (ENSMNEG00000036616) FAM83B (ENSMNEG00000035498) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a.a #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a.a #22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 603 OPCML (ENSCATG00000044307) ENSCATG00000018132 #22 NTM (ENSCATG00000042122) SNX19 (ENSCATG00000015689) ENSCATG00000019805 ENSCATG00000014856 ADAMTS15 (ENSCATG00000032278) ENSCATG00000019923 ADAMTS8 (ENSCATG00000028329) ZBTB44 (ENSCATG00000007997) ST14 (ENSCATG00000044655) APLP2 (ENSCATG00000040012) ENSCATG00000020953 PRDM10 (ENSCATG00000040031) NFRKB (ENSCATG00000042203) TMEM45B (ENSCATG00000039293) BARX2 (ENSCATG00000043064) Drill MODERN SPECIES 1718 OPCML (ENSMLEG00000035861) ENSMLEG00000027755 NTM (ENSMLEG00000023296) ENSMLEG00000028364 ENSMLEG00000028115 #22 ENSMLEG00000028121 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a.b #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a.b #22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 535 ZNF260 (ENSCATG00000018994) ENSCATG00000043646 ZFP82 (ENSCATG00000013092) ZFP14 (ENSCATG00000033008) ENSCATG00000032351 ZNF146 (ENSCATG00000022531) ZNF565 (ENSCATG00000014031) COX7A1 (ENSCATG00000038429) CAPNS1 (ENSCATG00000040427) ENSCATG00000003751 POLR2I (ENSCATG00000017413) OVOL3 (ENSCATG00000043037) ENSCATG00000021335 #22 WDR62 (ENSCATG00000036165) THAP8 (ENSCATG00000011950) CLIP3 (ENSCATG00000036218) ALKBH6 (ENSCATG00000029769) SYNE4 (ENSCATG00000009810) SDHAF1 (ENSCATG00000022631) LRFN3 (ENSCATG00000032694) TYROBP (ENSCATG00000035896) HCST (ENSCATG00000034100) NFKBID (ENSCATG00000041900) APLP1 (ENSCATG00000023992) KIRREL2 (ENSCATG00000034518) NPHS1 (ENSCATG00000033289) PRODH2 (ENSCATG00000039359) ARHGAP33 (ENSCATG00000019525) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.a #22 Marmoset MODERN SPECIES 7 CHCHD7 (ENSCJAG00000043436) SDR16C5 (ENSCJAG00000016608) ENSCJAG00000054039 PENK (ENSCJAG00000016597) ENSCJAG00000073317 ENSCJAG00000082207 IMPAD1 (ENSCJAG00000016573) ENSCJAG00000061141 ENSCJAG00000073997 FAM110B (ENSCJAG00000008657) ENSCJAG00000073685 UBXN2B (ENSCJAG00000008666) CYP7A1 (ENSCJAG00000008684) SDCBP (ENSCJAG00000008697) NSMAF (ENSCJAG00000008834) ENSCJAG00000070948 #22 ENSCJAG00000082557 ENSCJAG00000052054 TOX (ENSCJAG00000008958) ENSCJAG00000051398 ENSCJAG00000072177 ENSCJAG00000044576 ENSCJAG00000078019 CA8 (ENSCJAG00000008976) RAB2A (ENSCJAG00000009000) CHD7 (ENSCJAG00000009025) CLVS1 (ENSCJAG00000040445) ASPH (ENSCJAG00000009122) ENSCJAG00000073133 NKAIN3 (ENSCJAG00000067094) GGH (ENSCJAG00000009191) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 329 Pate1 (ENSDORG00000009056) ENSDORG00000023962 Pate3 (ENSDORG00000028774) Hyls1 (ENSDORG00000026551) Pus3 (ENSDORG00000001819) Ddx25 (ENSDORG00000001822) Gm1113 (ENSDORG00000026304) Cdon (ENSDORG00000001825) Rpusd4 (ENSDORG00000016717) ENSDORG00000016718 Srpr (ENSDORG00000016719) ENSDORG00000016720 Dcps (ENSDORG00000000696) St3gal4 (ENSDORG00000003992) Kirrel3 (ENSDORG00000003993) ENSDORG00000027604 #22 Ets1 (ENSDORG00000007930) Fli1 (ENSDORG00000025430) Kcnj1 (ENSDORG00000030107) Kcnj5 (ENSDORG00000007974) ENSDORG00000008680 Barx2 (ENSDORG00000015772) Acad8 (ENSDORG00000012787) Thyn1 (ENSDORG00000012783) Vps26b (ENSDORG00000024561) Ncapd3 (ENSDORG00000012781) Jam3 (ENSDORG00000012780) Igsf9b (ENSDORG00000000088) Spata19 (ENSDORG00000012682) Opcml (ENSDORG00000000527) Ntm (ENSDORG00000007086) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1183 Zfp131 (ENSNGAG00000016975) ENSNGAG00000014392 ENSNGAG00000013987 Ccdc152 (ENSNGAG00000000268) Ghr (ENSNGAG00000020869) ENSNGAG00000019160 Fbxo4 (ENSNGAG00000000112) Rimoc1 (ENSNGAG00000000034) Oxct1 (ENSNGAG00000010264) Plcxd3 (ENSNGAG00000020465) C6 (ENSNGAG00000015691) Mroh2b (ENSNGAG00000018783) C7 (ENSNGAG00000014593) ENSNGAG00000014031 Card6 (ENSNGAG00000001444) ENSNGAG00000000693 #22 Prkaa1 (ENSNGAG00000008327) Ttc33 (ENSNGAG00000005682) Ptger4 (ENSNGAG00000002797) ENSNGAG00000017678 ENSNGAG00000018186 C9 (ENSNGAG00000013631) Fyb (ENSNGAG00000008827) Rictor (ENSNGAG00000000546) Osmr (ENSNGAG00000016413) ENSNGAG00000009080 Lifr (ENSNGAG00000006273) Egflam (ENSNGAG00000019890) Gdnf (ENSNGAG00000017460) Wdr70 (ENSNGAG00000013618) Nup155 (ENSNGAG00000001345) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 668 ENSNGAG00000021742 Lrrk2 (ENSNGAG00000022979) Slc2a13 (ENSNGAG00000016956) ENSNGAG00000011942 Abcd2 (ENSNGAG00000023010) Kif21a (ENSNGAG00000023544) Cpne8 (ENSNGAG00000024044) Alg10b (ENSNGAG00000004690) ENSNGAG00000001023 Syt10 (ENSNGAG00000014442) Pkp2 (ENSNGAG00000003543) Yars2 (ENSNGAG00000021477) Dnm1l (ENSNGAG00000012978) ENSNGAG00000010899 #22 Fgd4 (ENSNGAG00000023777) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Rat MODERN SPECIES 8 Prl8a7 (ENSRNOG00000016933) Prl2b1 (ENSRNOG00000017007) Prl8a2 (ENSRNOG00000017048) Prl6a1 (ENSRNOG00000017089) Prl3a1 (ENSRNOG00000017103) Prl3b1 (ENSRNOG00000017185) Prl3d2 (ENSRNOG00000032845) Prl (ENSRNOG00000017374) ENSRNOG00000065594 Nrsn1 (ENSRNOG00000017444) Dcdc2 (ENSRNOG00000017511) Mrs2 (ENSRNOG00000017545) Gpld1 (ENSRNOG00000017702) Aldh5a1 (ENSRNOG00000023538) RGD1307443 (ENSRNOG00000018141) Rpl37-ps1 (ENSRNOG00000063362) #22 Tdp2 (ENSRNOG00000018246) Acot13 (ENSRNOG00000018415) C17h6orf62-ps1 (ENSRNOG00000018456) Gmnn (ENSRNOG00000018782) Armh2 (ENSRNOG00000064812) Ripor2 (ENSRNOG00000018804) Cmahp (ENSRNOG00000003094) ENSRNOG00000067245 ENSRNOG00000064118 Carmil1 (ENSRNOG00000016576) Scgn (ENSRNOG00000016628) H2ac1 (ENSRNOG00000065352) H2bc1 (ENSRNOG00000069905) Slc17a4 (ENSRNOG00000022505) AABR07027750.1 (ENSRNOG00000042692) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 Foxr2 (ENSPEMG00000025527) ENSPEMG00000026118 Mageh1 (ENSPEMG00000003236) Usp51 (ENSPEMG00000022623) ENSPEMG00000027395 ENSPEMG00000024891 Mycs (ENSPEMG00000026712) ENSPEMG00000016072 ENSPEMG00000030562 ENSPEMG00000030440 ENSPEMG00000025360 ENSPEMG00000031215 ENSPEMG00000027174 Bmp15 (ENSPEMG00000026057) Shroom4 (ENSPEMG00000022302) ENSPEMG00000028579 #22 Dgkk (ENSPEMG00000022777) Ccnb3 (ENSPEMG00000022596) Akap4 (ENSPEMG00000023845) Clcn5 (ENSPEMG00000011139) Usp27x (ENSPEMG00000005635) Ppp1r3f (ENSPEMG00000015653) Foxp3 (ENSPEMG00000012847) Ccdc22 (ENSPEMG00000015959) Cacna1f (ENSPEMG00000009739) Syp (ENSPEMG00000007762) Prickle3 (ENSPEMG00000005910) ENSPEMG00000012167 Magix (ENSPEMG00000025490) Gpkow (ENSPEMG00000009966) Wdr45 (ENSPEMG00000015281) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 212 Dpp6 (ENSCGRG00001021197) Paxip1 (ENSCGRG00001019392) Htr5a (ENSCGRG00001010326) Insig1 (ENSCGRG00001012058) En2 (ENSCGRG00001019240) Cnpy1 (ENSCGRG00001022362) Rbm33 (ENSCGRG00001021677) Shh (ENSCGRG00001016950) Rnf32 (ENSCGRG00001006621) ENSCGRG00001013740 Lmbr1 (ENSCGRG00001017749) ENSCGRG00001002440 Nom1 (ENSCGRG00001020293) Mnx1 (ENSCGRG00001023539) Ube3c (ENSCGRG00001012001) ENSCGRG00001021591 #22 ENSCGRG00001022947 Il6 (ENSCGRG00001024135) Tomm7 (ENSCGRG00001024471) ENSCGRG00001000775 Hycc1 (ENSCGRG00001014837) ENSCGRG00001002267 Nupl2 (ENSCGRG00001019625) Gpnmb (ENSCGRG00001018141) Malsu1 (ENSCGRG00001007836) Igf2bp3 (ENSCGRG00001011804) Tra2a (ENSCGRG00001019980) Ccdc126 (ENSCGRG00001011659) Fam221a (ENSCGRG00001015242) Stk31 (ENSCGRG00001021953) Npy (ENSCGRG00001016547) Golden Hamster DUPLICATION Golden Hamster MODERN SPECIES 760 ENSMAUG00000007835 Or2a25 (ENSMAUG00000008829) Or6b1 (ENSMAUG00000016368) Or2f2 (ENSMAUG00000004972) Or2f1b (ENSMAUG00000016449) Or2f1 (ENSMAUG00000016432) Tcaf1 (ENSMAUG00000007112) Tcaf2 (ENSMAUG00000002366) Tcaf3 (ENSMAUG00000009105) Or10ac1 (ENSMAUG00000016547) Tas2r126 (ENSMAUG00000016535) ENSMAUG00000007053 Fam131b (ENSMAUG00000010019) Clcn1 (ENSMAUG00000000083) Casp2 (ENSMAUG00000012123) ENSMAUG00000016442 #22 Gstk1 (ENSMAUG00000009165) ENSMAUG00000017122 Kel (ENSMAUG00000011935) Llcfc1 (ENSMAUG00000016022) Trpv5 (ENSMAUG00000011813) Trpv6 (ENSMAUG00000011719) Ephb6 (ENSMAUG00000014846) ENSMAUG00000016149 ENSMAUG00000018483 ENSMAUG00000009768 ENSMAUG00000008681 ENSMAUG00000013781 ENSMAUG00000018446 ENSMAUG00000003004 Prss59 (ENSMAUG00000013886) Golden Hamster MODERN SPECIES 829 Mylk2 (ENSMAUG00000011764) Tpx2 (ENSMAUG00000009148) Bcl2l1 (ENSMAUG00000004031) Cox4i2 (ENSMAUG00000002542) Id1 (ENSMAUG00000001378) H13 (ENSMAUG00000008869) Rem1 (ENSMAUG00000005104) Defb25 (ENSMAUG00000002438) Defb36 (ENSMAUG00000006783) Defb45 (ENSMAUG00000006224) Defb19 (ENSMAUG00000003742) ENSMAUG00000000830 Defb28 (ENSMAUG00000002935) Defb20 (ENSMAUG00000001746) 6820408C15Rik (ENSMAUG00000000591) ENSMAUG00000015912 #22 Sox12 (ENSMAUG00000016069) Nrsn2 (ENSMAUG00000000544) Tbc1d20 (ENSMAUG00000000430) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 17 KIAA1549 (ENSHGLG00000009787) ENSHGLG00000005299 ZC3HAV1 (ENSHGLG00000006700) TTC26 (ENSHGLG00000009066) ENSHGLG00000047005 UBN2 (ENSHGLG00000005428) FMC1 (ENSHGLG00000050501) LUC7L2 (ENSHGLG00000004646) CLEC2L (ENSHGLG00000036583) HIPK2 (ENSHGLG00000006604) TBXAS1 (ENSHGLG00000014596) ENSHGLG00000040227 ENSHGLG00000034540 PARP12 (ENSHGLG00000018555) KDM7A (ENSHGLG00000012198) ENSHGLG00000021196 #22 ENSHGLG00000039773 ENSHGLG00000009494 RAB19 (ENSHGLG00000010948) ENSHGLG00000044578 ENSHGLG00000040747 ENSHGLG00000043500 DENND2A (ENSHGLG00000014310) ADCK2 (ENSHGLG00000037504) ENSHGLG00000017933 BRAF (ENSHGLG00000014168) ENSHGLG00000049810 ENSHGLG00000040990 TMEM178B (ENSHGLG00000043245) AGK (ENSHGLG00000046237) DENND11 (ENSHGLG00000010322) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 59 FGF4 (ENSODEG00000017332) FGF19 (ENSODEG00000017850) LTO1 (ENSODEG00000017276) CCND1 (ENSODEG00000017314) TPCN2 (ENSODEG00000017370) ENSODEG00000017365 ENSODEG00000017628 MRGPRF (ENSODEG00000017539) MRGPRD (ENSODEG00000017313) IGHMBP2 (ENSODEG00000017354) MRPL21 (ENSODEG00000017369) CPT1A (ENSODEG00000017481) TESMIN (ENSODEG00000017728) GAL (ENSODEG00000017519) PPP6R3 (ENSODEG00000017311) ENSODEG00000020451 #22 LRP5 (ENSODEG00000017493) C11orf24 (ENSODEG00000017396) ENSODEG00000017460 CHKA (ENSODEG00000017808) TCIRG1 (ENSODEG00000017607) ENSODEG00000017577 ALDH3B1 (ENSODEG00000017474) UNC93B1 (ENSODEG00000017652) ENSODEG00000017464 ALDH3B2 (ENSODEG00000017453) ACY3 (ENSODEG00000017439) TBX10 (ENSODEG00000017601) ENSODEG00000017697 ENSODEG00000017660 NDUFV1 (ENSODEG00000017535) Degu MODERN SPECIES 391 ENSODEG00000002038 ENSODEG00000000103 METTL17 (ENSODEG00000000134) SLC39A2 (ENSODEG00000000223) NDRG2 (ENSODEG00000000287) TPPP2 (ENSODEG00000000308) ARHGEF40 (ENSODEG00000000399) ZNF219 (ENSODEG00000000562) TMEM253 (ENSODEG00000000578) ENSODEG00000018586 #22 ENSODEG00000000603 ENSODEG00000018543 RPGRIP1 (ENSODEG00000000444) SUPT16H (ENSODEG00000000863) CHD8 (ENSODEG00000001047) ENSODEG00000001304 RAB2B (ENSODEG00000001343) TOX4 (ENSODEG00000001388) METTL3 (ENSODEG00000001417) ENSODEG00000018698 SALL2 (ENSODEG00000001454) ENSODEG00000001491 ENSODEG00000001541 ENSODEG00000000533 OR4E1 (ENSODEG00000000587) Degu MODERN SPECIES 44 ENSODEG00000018302 ZNF521 (ENSODEG00000018410) SS18 (ENSODEG00000018466) PSMA8 (ENSODEG00000018364) TAF4B (ENSODEG00000018462) ENSODEG00000020494 KCTD1 (ENSODEG00000018447) AQP4 (ENSODEG00000018294) CHST9 (ENSODEG00000018320) CDH2 (ENSODEG00000018382) ENSODEG00000020488 #22 DSC3 (ENSODEG00000018293) DSC2 (ENSODEG00000018413) DSC1 (ENSODEG00000018325) DSG1 (ENSODEG00000018310) DSG4 (ENSODEG00000018468) DSG3 (ENSODEG00000018316) ENSODEG00000018312 TTR (ENSODEG00000018347) B4GALT6 (ENSODEG00000018324) ENSODEG00000018411 ENSODEG00000018406 ENSODEG00000018452 MEP1B (ENSODEG00000018454) GAREM1 (ENSODEG00000018355) ENSODEG00000018292 Degu MODERN SPECIES 153 ENSODEG00000007318 ENSODEG00000007990 ENSODEG00000008372 ACAT2 (ENSODEG00000008431) ENSODEG00000008023 ENSODEG00000019351 SOD2 (ENSODEG00000007052) ENSODEG00000019438 METRNL (ENSODEG00000008002) B3GNTL1 (ENSODEG00000011917) TBCD (ENSODEG00000009094) ZNF750 (ENSODEG00000008866) ENSODEG00000019653 ENSODEG00000009328 FN3KRP (ENSODEG00000012467) ENSODEG00000020021 #22 RAB40B (ENSODEG00000007441) WDR45B (ENSODEG00000007809) FOXK2 (ENSODEG00000008321) NARF (ENSODEG00000007704) CYBC1 (ENSODEG00000008201) HEXD (ENSODEG00000009299) OGFOD3 (ENSODEG00000007453) ENSODEG00000007186 ENSODEG00000019459 ENSODEG00000007569 ENSODEG00000007855 ENSODEG00000008173 CCDC57 (ENSODEG00000008365) ENSODEG00000019447 ENSODEG00000019449 Guinea pig DUPLICATION Guinea pig MODERN SPECIES FHIT (ENSCPOG00000014924) ENSCPOG00000032909 PTPRG (ENSCPOG00000003197) C3orf14 (ENSCPOG00000006026) FEZF2 (ENSCPOG00000001697) ENSCPOG00000001699 SYNPR (ENSCPOG00000012817) SNTN (ENSCPOG00000012821) ENSCPOG00000021409 THOC7 (ENSCPOG00000007930) ATXN7 (ENSCPOG00000002924) PSMD6 (ENSCPOG00000006160) PRICKLE2 (ENSCPOG00000031153) ADAMTS9 (ENSCPOG00000004877) MAGI1 (ENSCPOG00000002169) ENSCPOG00000013562 #22 DYNC1LI1 (ENSCPOG00000011613) CMTM6 (ENSCPOG00000030201) CMTM7 (ENSCPOG00000013148) ENSCPOG00000008461 CMTM8 (ENSCPOG00000040696) GPD1L (ENSCPOG00000034805) OSBPL10 (ENSCPOG00000014318) STT3B (ENSCPOG00000014313) GADL1 (ENSCPOG00000003744) TGFBR2 (ENSCPOG00000014487) RBMS3 (ENSCPOG00000006457) AZI2 (ENSCPOG00000014333) CMC1 (ENSCPOG00000014332) EOMES (ENSCPOG00000004381) SLC4A7 (ENSCPOG00000004444) Guinea pig MODERN SPECIES 135 ENSCPOG00000031265 EXOC6 (ENSCPOG00000003806) ENSCPOG00000030450 CYP26C1 (ENSCPOG00000003810) CYP26A1 (ENSCPOG00000021751) MYOF (ENSCPOG00000009867) CEP55 (ENSCPOG00000007305) FFAR4 (ENSCPOG00000002132) RBP4 (ENSCPOG00000002134) PDE6C (ENSCPOG00000004287) FRA10AC1 (ENSCPOG00000004292) LGI1 (ENSCPOG00000008822) SLC35G1 (ENSCPOG00000012167) PLCE1 (ENSCPOG00000009723) NOC3L (ENSCPOG00000009746) ENSCPOG00000037761 #22 TBC1D12 (ENSCPOG00000007903) HELLS (ENSCPOG00000003043) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Gibbon MODERN SPECIES 18 LIPN (ENSNLEG00000012203) LIPM (ENSNLEG00000012208) ANKRD22 (ENSNLEG00000012212) STAMBPL1 (ENSNLEG00000012216) ACTA2 (ENSNLEG00000012233) FAS (ENSNLEG00000012260) CH25H (ENSNLEG00000018634) IFIT2 (ENSNLEG00000018635) IFIT1B (ENSNLEG00000018636) IFIT1 (ENSNLEG00000012308) LIPA (ENSNLEG00000031920) IFIT5 (ENSNLEG00000033953) SLC16A12 (ENSNLEG00000012310) ENSNLEG00000012314 KIF20B (ENSNLEG00000012326) ENSNLEG00000035960 #22 ENSNLEG00000012379 RPP30 (ENSNLEG00000012383) ANKRD1 (ENSNLEG00000012395) ENSNLEG00000034294 PCGF5 (ENSNLEG00000033917) HECTD2 (ENSNLEG00000012415) PPP1R3C (ENSNLEG00000012453) TNKS2 (ENSNLEG00000012457) BTAF1 (ENSNLEG00000012513) ENSNLEG00000035780 CPEB3 (ENSNLEG00000012600) MARCHF5 (ENSNLEG00000012617) IDE (ENSNLEG00000012631) KIF11 (ENSNLEG00000012674) ENSNLEG00000012707 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 510 ENSGT00390000016470.d ENSGT00940000153912.A ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b ENSGT00940000156033 ENSGT00940000159143 ENSGT00940000155509 ENSGT00390000015172 ENSGT01050000244940.a.b ENSGT00940000156754.a.b Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1951 ENSRROG00000044106 ENSRROG00000028965 #22 CCSER2 (ENSRROG00000043777) RGR (ENSRROG00000039695) LRIT1 (ENSRROG00000032033) LRIT2 (ENSRROG00000042726) CDHR1 (ENSRROG00000042213) GPR15LG (ENSRROG00000007847) ENSRROG00000019648 ENSRROG00000004632 NRG3 (ENSRROG00000035383) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 731 CXADR (ENSRBIG00000043668) BTG3 (ENSRBIG00000028455) ENSRBIG00000039921 CCSER2 (ENSRBIG00000031061) ENSRBIG00000036356 #22 RGR (ENSRBIG00000039406) LRIT1 (ENSRBIG00000005191) LRIT2 (ENSRBIG00000033724) CDHR1 (ENSRBIG00000037935) GPR15LG (ENSRBIG00000015067) GHITM (ENSRBIG00000034415) ENSRBIG00000038720 NRG3 (ENSRBIG00000044380) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 383 PSD2 (ENSMNEG00000043579) CXXC5 (ENSMNEG00000037432) UBE2D2 (ENSMNEG00000034060) STING1 (ENSMNEG00000039403) SMIM33 (ENSMNEG00000043798) ECSCR (ENSMNEG00000037834) DNAJC18 (ENSMNEG00000045280) SPATA24 (ENSMNEG00000041746) MZB1 (ENSMNEG00000040385) SLC23A1 (ENSMNEG00000041491) PAIP2 (ENSMNEG00000028526) MATR3 (ENSMNEG00000042856) SIL1 (ENSMNEG00000044481) CTNNA1 (ENSMNEG00000043129) LRRTM2 (ENSMNEG00000031495) ENSMNEG00000018118 #22 HSPA9 (ENSMNEG00000034224) ETF1 (ENSMNEG00000033524) EGR1 (ENSMNEG00000044551) REEP2 (ENSMNEG00000042650) KDM3B (ENSMNEG00000027089) FAM53C (ENSMNEG00000039587) CDC25C (ENSMNEG00000035967) GFRA3 (ENSMNEG00000042264) CDC23 (ENSMNEG00000028841) KIF20A (ENSMNEG00000045484) BRD8 (ENSMNEG00000042771) NME5 (ENSMNEG00000032008) WNT8A (ENSMNEG00000035024) FAM13B (ENSMNEG00000040006) PKD2L2 (ENSMNEG00000013404) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000063528.A.a ENSGT00910000147663 ENSGT00510000046470.a.b ENSGT00940000158206 ENSGT00940000164034.b ENSGT00940000164034.a ENSGT00940000163367 ENSGT00940000164319 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000162778 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000000903.a.f.a.b.a ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000161065 ENSGT00940000157889 ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00390000014122.i.b.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000158644 ENSGT00940000162318 ENSGT00940000155008.C ENSGT00940000155494.f.b ENSGT00390000016954 Sooty mangabey MODERN SPECIES 97 IL17F (ENSCATG00000041329) MCM3 (ENSCATG00000031333) PAQR8 (ENSCATG00000020608) ENSCATG00000021876 EFHC1 (ENSCATG00000038309) TRAM2 (ENSCATG00000029584) TMEM14A (ENSCATG00000043586) GSTA2 (ENSCATG00000033148) ENSCATG00000040439 GSTA4 (ENSCATG00000027052) CILK1 (ENSCATG00000041316) FBXO9 (ENSCATG00000019206) GCM1 (ENSCATG00000008922) ELOVL5 (ENSCATG00000041100) GCLC (ENSCATG00000033054) ENSCATG00000018676 #22 KLHL31 (ENSCATG00000044715) ENSCATG00000020528 LRRC1 (ENSCATG00000022505) MLIP (ENSCATG00000036438) TINAG (ENSCATG00000021018) FAM83B (ENSCATG00000039759) HCRTR2 (ENSCATG00000028771) GFRAL (ENSCATG00000044981) HMGCLL1 (ENSCATG00000030227) ENSCATG00000038476 BMP5 (ENSCATG00000038039) COL21A1 (ENSCATG00000034013) DST (ENSCATG00000032609) ENSCATG00000036494 BEND6 (ENSCATG00000036894) Drill DUPLICATION Drill MODERN SPECIES 817 ENSMLEG00000027940 EFHC1 (ENSMLEG00000029768) TRAM2 (ENSMLEG00000040892) TMEM14A (ENSMLEG00000043906) GSTA2 (ENSMLEG00000027727) GSTA1 (ENSMLEG00000043178) GSTA5 (ENSMLEG00000036948) GSTA3 (ENSMLEG00000037252) GSTA4 (ENSMLEG00000042277) CILK1 (ENSMLEG00000006267) FBXO9 (ENSMLEG00000043788) GCM1 (ENSMLEG00000035639) ENSMLEG00000004252 ELOVL5 (ENSMLEG00000041247) GCLC (ENSMLEG00000041190) ENSMLEG00000005454 #22 KLHL31 (ENSMLEG00000044008) ENSMLEG00000001868 LRRC1 (ENSMLEG00000039785) MLIP (ENSMLEG00000039543) TINAG (ENSMLEG00000039572) FAM83B (ENSMLEG00000033866) HCRTR2 (ENSMLEG00000032422) GFRAL (ENSMLEG00000039080) HMGCLL1 (ENSMLEG00000018567) Drill MODERN SPECIES 976 RTKN2 (ENSMLEG00000033404) ARID5B (ENSMLEG00000028359) CABCOCO1 (ENSMLEG00000034131) TMEM26 (ENSMLEG00000038227) RHOBTB1 (ENSMLEG00000024225) ENSMLEG00000043302 ANK3 (ENSMLEG00000042741) ENSMLEG00000024387 #22 ENSMLEG00000032715 CCDC6 (ENSMLEG00000031481) MRLN (ENSMLEG00000006336) SLC16A9 (ENSMLEG00000042267) ENSMLEG00000029714 FAM13C (ENSMLEG00000040069) PHYHIPL (ENSMLEG00000034186) ENSMLEG00000034531 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 742 ENSANAG00000019451 #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b.a.b #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 64 DTNBP1 (ENSSBOG00000027094) JARID2 (ENSSBOG00000021029) ENSSBOG00000028490 ENSSBOG00000035633 CD83 (ENSSBOG00000022214) RNF182 (ENSSBOG00000019678) ENSSBOG00000032159 RANBP9 (ENSSBOG00000029468) NOL7 (ENSSBOG00000020450) SIRT5 (ENSSBOG00000022870) GFOD1 (ENSSBOG00000026414) TBC1D7 (ENSSBOG00000025824) PHACTR1 (ENSSBOG00000019197) EDN1 (ENSSBOG00000021292) HIVEP1 (ENSSBOG00000017977) ENSSBOG00000015128 #22 ENSSBOG00000031592 TMEM170B (ENSSBOG00000033304) NEDD9 (ENSSBOG00000029685) ENSSBOG00000019731 SMIM13 (ENSSBOG00000026734) ELOVL2 (ENSSBOG00000033957) SYCP2L (ENSSBOG00000035587) GCM2 (ENSSBOG00000026197) MAK (ENSSBOG00000031537) TMEM14C (ENSSBOG00000030151) PAK1IP1 (ENSSBOG00000029190) C6orf52 (ENSSBOG00000008885) GCNT2 (ENSSBOG00000025973) ENSSBOG00000018780 ENSSBOG00000025486 Capuchin MODERN SPECIES 296 ENSCCAG00000028941 ZNF155 (ENSCCAG00000038005) ENSCCAG00000002072 ZNF221 (ENSCCAG00000019355) ZNF45 (ENSCCAG00000032415) ZNF283 (ENSCCAG00000029683) LYPD5 (ENSCCAG00000023362) KCNN4 (ENSCCAG00000025935) SMG9 (ENSCCAG00000024570) PLAUR (ENSCCAG00000037900) CADM4 (ENSCCAG00000024687) SRRM5 (ENSCCAG00000034733) ZNF428 (ENSCCAG00000037819) ZNF576 (ENSCCAG00000032242) IRGQ (ENSCCAG00000027901) ENSCCAG00000037878 #22 ENSCCAG00000033217 PINLYP (ENSCCAG00000027071) XRCC1 (ENSCCAG00000031891) ZNF575 (ENSCCAG00000037392) ETHE1 (ENSCCAG00000025485) PHLDB3 (ENSCCAG00000026521) LYPD3 (ENSCCAG00000030857) TEX101 (ENSCCAG00000030792) CD177 (ENSCCAG00000031023) Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 19 BSDC1 (ENSCJAG00000000980) TSSK3 (ENSCJAG00000000977) FAM229A (ENSCJAG00000059506) ENSCJAG00000043873 HDAC1 (ENSCJAG00000000970) LCK (ENSCJAG00000000957) FAM167B (ENSCJAG00000006830) EIF3I (ENSCJAG00000006810) TMEM234 (ENSCJAG00000006793) DCDC2B (ENSCJAG00000006772) IQCC (ENSCJAG00000006762) CCDC28B (ENSCJAG00000006747) TXLNA (ENSCJAG00000006728) KPNA6 (ENSCJAG00000006669) TMEM39B (ENSCJAG00000006630) ENSCJAG00000076153 #22 ENSCJAG00000006580 PTP4A2 (ENSCJAG00000044384) ENSCJAG00000006536 ADGRB2 (ENSCJAG00000006434) COL16A1 (ENSCJAG00000006371) ENSCJAG00000006355 HCRTR1 (ENSCJAG00000006342) TINAGL1 (ENSCJAG00000006317) ENSCJAG00000075483 SERINC2 (ENSCJAG00000006312) ENSCJAG00000067643 ENSCJAG00000065200 ENSCJAG00000006259 ENSCJAG00000006212 NKAIN1 (ENSCJAG00000038268) Marmoset MODERN SPECIES 19 BRDT (ENSCJAG00000017507) ENSCJAG00000010406 TGFBR3 (ENSCJAG00000001778) CDC7 (ENSCJAG00000045959) ENSCJAG00000038757 HFM1 (ENSCJAG00000001843) ENSCJAG00000075350 ZNF644 (ENSCJAG00000001855) BARHL2 (ENSCJAG00000001885) ENSCJAG00000072305 ENSCJAG00000074692 ENSCJAG00000081574 ENSCJAG00000081260 ZNF326 (ENSCJAG00000001897) LRRC8D (ENSCJAG00000001919) ENSCJAG00000022018 #22 ENSCJAG00000079745 ENSCJAG00000074034 LRRC8C (ENSCJAG00000043026) LRRC8B (ENSCJAG00000001922) GBP6 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ENSODEG00000012878 #22 ENSODEG00000012154 ENSODEG00000012715 TAB3 (ENSODEG00000012833) ENSODEG00000012363 ENSODEG00000011964 ENSODEG00000013819 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161683 ENSGT00940000157624 ENSGT00940000153635.B ENSGT00940000157441 ENSGT00390000003855.b ENSGT00900000141110 ENSGT00390000003581 ENSGT00940000154629.B ENSGT00940000154267.A ENSGT00390000006370.h.a ENSGT00390000007200 ENSGT00390000012493 ENSGT00940000161350 ENSGT00390000007594 ENSGT00940000155879 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 ENSGT00940000156269 ENSGT00940000160664 ENSGT00900000141196 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184 ARHGAP17 (ENSVVUG00000005309) SLC5A11 (ENSVVUG00000005336) ENSVVUG00000005360 TNRC6A (ENSVVUG00000005380) ENSVVUG00000005479 #22 RBBP6 (ENSVVUG00000005484) CACNG3 (ENSVVUG00000005520) PRKCB (ENSVVUG00000005527) CHP2 (ENSVVUG00000005588) ERN2 (ENSVVUG00000005617) PLK1 (ENSVVUG00000005935) DCTN5 (ENSVVUG00000005995) PALB2 (ENSVVUG00000006016) NDUFAB1 (ENSVVUG00000006032) ENSVVUG00000006042 EARS2 (ENSVVUG00000006049) GGA2 (ENSVVUG00000006084) COG7 (ENSVVUG00000006216) SCNN1B (ENSVVUG00000006228) SCNN1G (ENSVVUG00000006248) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Blue whale MODERN SPECIES ATXN7L2 (ENSBMSG00010007676) SYPL2 (ENSBMSG00010007639) PSMA5 (ENSBMSG00010007626) SORT1 (ENSBMSG00010007603) PSRC1 (ENSBMSG00010007573) CELSR2 (ENSBMSG00010007536) SARS1 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(ENSPCTG00005004114) ENSPCTG00005004126 WDR47 (ENSPCTG00005004149) CLCC1 (ENSPCTG00005004264) GPSM2 (ENSPCTG00005004322) ENSPCTG00005004358 #22 STXBP3 (ENSPCTG00005004389) FNDC7 (ENSPCTG00005004446) ENSPCTG00005004507 HENMT1 (ENSPCTG00005000242) ENSPCTG00005000256 FAM102B (ENSPCTG00005000272) ENSPCTG00005000298 SLC25A24 (ENSPCTG00005000331) ENSPCTG00005000353 VAV3 (ENSPCTG00005000432) ENSPCTG00005000616 NTNG1 (ENSPCTG00005000682) PRMT6 (ENSPCTG00005000735) ENSPCTG00005000754 ENSPCTG00005000762 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1235 HMGCS1 (ENSMMSG00000021238) NIM1K (ENSMMSG00000021209) ENSMMSG00000021167 ENSMMSG00000021132 ENSMMSG00000021107 CCDC152 (ENSMMSG00000021074) GHR (ENSMMSG00000020908) FBXO4 (ENSMMSG00000020820) OXCT1 (ENSMMSG00000020705) ENSMMSG00000020689 PLCXD3 (ENSMMSG00000020669) C6 (ENSMMSG00000020604) MROH2B (ENSMMSG00000020386) C7 (ENSMMSG00000020330) CARD6 (ENSMMSG00000020302) ENSMMSG00000020242 #22 PRKAA1 (ENSMMSG00000020136) TTC33 (ENSMMSG00000020105) PTGER4 (ENSMMSG00000020089) ENSMMSG00000020059 DAB2 (ENSMMSG00000019922) C9 (ENSMMSG00000019814) FYB1 (ENSMMSG00000019572) RICTOR (ENSMMSG00000019199) OSMR (ENSMMSG00000019092) LIFR (ENSMMSG00000019030) EGFLAM (ENSMMSG00000018823) ENSMMSG00000018725 ENSMMSG00000018703 GDNF (ENSMMSG00000018647) WDR70 (ENSMMSG00000018497) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154868.a.a ENSGT00940000156277 ENSGT00940000157191 ENSGT00940000156533.b ENSGT00950000182984.a ENSGT01050000244838.D ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00940000154915.mb.a.b ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724.i ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000003986 ENSGT00940000154868.a.a ENSGT00940000156277 ENSGT00940000157191 ENSGT00940000156533.b ENSGT00950000182984.a ENSGT01050000244838.D ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00940000154915.mb.a.a ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724.i ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a.a.b.b ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E Cow MODERN SPECIES 28 TPBG (ENSBTAG00000039477) IBTK (ENSBTAG00000026716) TENT5A (ENSBTAG00000000995) BCKDHB (ENSBTAG00000012096) TTK (ENSBTAG00000005456) ELOVL4 (ENSBTAG00000015498) SH3BGRL2 (ENSBTAG00000055014) LCA5 (ENSBTAG00000043950) ENSBTAG00000048976 ENSBTAG00000052031 PHIP (ENSBTAG00000024688) IRAK1BP1 (ENSBTAG00000020825) ENSBTAG00000034662 MEI4 (ENSBTAG00000054151) HTR1B (ENSBTAG00000037429) ENSBTAG00000016391 #22 IMPG1 (ENSBTAG00000021175) MYO6 (ENSBTAG00000016751) SENP6 (ENSBTAG00000005869) ENSBTAG00000032382 FILIP1 (ENSBTAG00000000053) TMEM30A (ENSBTAG00000005100) COX7A2 (ENSBTAG00000005096) COL12A1 (ENSBTAG00000020056) ENSBTAG00000053911 ENSBTAG00000054709 CD109 (ENSBTAG00000013222) SLC17A5 (ENSBTAG00000044053) EEF1A1 (ENSBTAG00000014534) MTO1 (ENSBTAG00000016839) CGAS (ENSBTAG00000000892) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000154868.a.a ENSGT00940000156277 ENSGT00940000157191 ENSGT00940000156533.b ENSGT00950000182984.a ENSGT01050000244838.D ENSGT00950000183087.A.a.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00940000154915.mb.a.b ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b #22 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724.i ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 Domestic yak MODERN SPECIES 1 IBTK (ENSBGRG00000003635) ENSBGRG00000003704 TENT5A (ENSBGRG00000003767) ENSBGRG00000003829 BCKDHB (ENSBGRG00000003847) TTK (ENSBGRG00000003901) ELOVL4 (ENSBGRG00000004114) ENSBGRG00000004196 SH3BGRL2 (ENSBGRG00000004217) ENSBGRG00000004232 ENSBGRG00000004306 PHIP (ENSBGRG00000004460) IRAK1BP1 (ENSBGRG00000004671) MEI4 (ENSBGRG00000004738) HTR1B (ENSBGRG00000004799) ENSBGRG00000004810 #22 IMPG1 (ENSBGRG00000004826) MYO6 (ENSBGRG00000004931) SENP6 (ENSBGRG00000005342) FILIP1 (ENSBGRG00000005876) TMEM30A (ENSBGRG00000005958) ENSBGRG00000006074 COL12A1 (ENSBGRG00000006189) ENSBGRG00000007839 CD109 (ENSBGRG00000007902) SLC17A5 (ENSBGRG00000008882) EEF1A1 (ENSBGRG00000009070) MTO1 (ENSBGRG00000009205) CGAS (ENSBGRG00000009337) ENSBGRG00000009400 ENSBGRG00000009579 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000015797.d.r ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231.g ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 Goat MODERN SPECIES 12 NIM1K (ENSCHIG00000017425) ENSCHIG00000020006 ENSCHIG00000023711 ENSCHIG00000006291 CCDC152 (ENSCHIG00000011450) GHR (ENSCHIG00000018928) FBXO4 (ENSCHIG00000021750) RIMOC1 (ENSCHIG00000000538) ENSCHIG00000012124 PLCXD3 (ENSCHIG00000016815) C6 (ENSCHIG00000021210) ENSCHIG00000002172 ENSCHIG00000012521 C7 (ENSCHIG00000016536) CARD6 (ENSCHIG00000020994) RPL37 (ENSCHIG00000014444) #22 PRKAA1 (ENSCHIG00000017495) TTC33 (ENSCHIG00000020642) PTGER4 (ENSCHIG00000023835) DAB2 (ENSCHIG00000009529) C9 (ENSCHIG00000014791) FYB1 (ENSCHIG00000018413) RICTOR (ENSCHIG00000022858) OSMR (ENSCHIG00000009367) LIFR (ENSCHIG00000014349) EGFLAM (ENSCHIG00000019067) GDNF (ENSCHIG00000023187) WDR70 (ENSCHIG00000012219) NUP155 (ENSCHIG00000016985) CPLANE1 (ENSCHIG00000022182) NIPBL (ENSCHIG00000011197) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 12 ENSBIXG00005000812 ENSBIXG00005010200 CCDC152 (ENSBIXG00005010167) GHR (ENSBIXG00005000790) ENSBIXG00005000772 FBXO4 (ENSBIXG00005010018) OXCT1 (ENSBIXG00005009957) ENSBIXG00005000669 PLCXD3 (ENSBIXG00005009870) C6 (ENSBIXG00005009838) MROH2B (ENSBIXG00005005801) C7 (ENSBIXG00005009426) ENSBIXG00005009368 CARD6 (ENSBIXG00005009362) ENSBIXG00005009352 RPL37 (ENSBIXG00005009336) #22 PRKAA1 (ENSBIXG00005009308) TTC33 (ENSBIXG00005009287) PTGER4 (ENSBIXG00005009279) DAB2 (ENSBIXG00005009202) C9 (ENSBIXG00005009100) FYB1 (ENSBIXG00005009080) RICTOR (ENSBIXG00005009018) ENSBIXG00005008919 OSMR (ENSBIXG00005008909) LIFR (ENSBIXG00005008844) EGFLAM (ENSBIXG00005008798) GDNF (ENSBIXG00005008679) WDR70 (ENSBIXG00005008644) NUP155 (ENSBIXG00005008569) CPLANE1 (ENSBIXG00005008503) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Sperm whale MODERN SPECIES 19 ZNF131 (ENSPCTG00005019729) ENSPCTG00005019667 CCDC152 (ENSPCTG00005019630) GHR (ENSPCTG00005019431) FBXO4 (ENSPCTG00005019359) C8H5orf51 (ENSPCTG00005019324) ENSPCTG00005019287 OXCT1 (ENSPCTG00005019136) PLCXD3 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(ENSUAMG00000025066) #22 PRKAA1 (ENSUAMG00000025069) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Equus ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009290 ENSGT00940000167563 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01090000262500 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 Donkey MODERN SPECIES 1 NIM1K (ENSEASG00005013507) ZNF131 (ENSEASG00005013512) ENSEASG00005013517 ENSEASG00005033022 CCDC152 (ENSEASG00005013536) GHR (ENSEASG00005013544) FBXO4 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ENSGT00390000005254.i.a.a.b.a #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b.a #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183206.b.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154251.A.b.a.b.a ENSGT00940000164793 ENSGT00940000164691 ENSGT00940000164696 ENSGT00940000154251.A.b.a.a ENSGT00390000018900.e ENSGT00390000004799 ENSGT00390000005861 ENSGT00950000183142.a.b.a.b ENSGT00940000156766 ENSGT00940000156992 ENSGT00940000160590 ENSGT00940000156546 ENSGT00390000016158.v ENSGT00390000005254.i.a.a.b.a #22 ENSGT00730000111005 ENSGT00940000162691 ENSGT00390000015553.a.a.b ENSGT00390000017364 ENSGT00940000155092.b ENSGT00940000157060.t ENSGT00730000111198 ENSGT00910000146860.b.a.a ENSGT00940000155103.a.b.o ENSGT00950000183059.b.a.b.m ENSGT00940000161436.b ENSGT00940000161852 ENSGT00950000183000.c.a.a.i.a.a.b.a.b ENSGT00390000008164.d ENSGT00510000047676 Chimpanzee MODERN SPECIES ENSPTRG00000002194 ZNF124 (ENSPTRG00000023216) ZNF669 (ENSPTRG00000048039) ZNF670 (ENSPTRG00000051921) ZNF695 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CATSPERE (ENSPPYG00000000056) ADSS2 (ENSPPYG00000000057) C1orf100 (ENSPPYG00000000058) ZBTB18 (ENSPPYG00000000059) AKT3 (ENSPPYG00000000060) SDCCAG8 (ENSPPYG00000000061) CEP170 (ENSPPYG00000000063) PLD5 (ENSPPYG00000000064) MAP1LC3C (ENSPPYG00000010665) ENSPPYG00000037133 BECN2 (ENSPPYG00000000066) EXO1 (ENSPPYG00000000067) WDR64 (ENSPPYG00000000068) OPN3 (ENSPPYG00000000069) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b.b #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160950 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000159233 ENSGT00390000001159 ENSGT00940000158315 ENSGT01100000265414 ENSGT00390000015972 ENSGT00940000160254 ENSGT00390000018118 ENSGT00940000160455 ENSGT00400000024545 ENSGT00940000161056 ENSGT00510000049503 ENSGT00530000063113.B ENSGT00940000160586 ENSGT00390000005254.i.a.a.b.b #22 ENSGT00940000161566.d ENSGT00940000160611 ENSGT00940000155740 ENSGT00390000005315 ENSGT00940000154468.ib ENSGT00390000007279.c.b.b.a.b ENSGT00940000156477 ENSGT00940000163024 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ENSPPAG00000034505 CNBD2 (ENSPPAG00000038317) EPB41L1 (ENSPPAG00000033941) ENSPPAG00000017860 AAR2 (ENSPPAG00000038429) DLGAP4 (ENSPPAG00000037781) ENSPPAG00000040234 MYL9 (ENSPPAG00000041059) Gorilla MODERN SPECIES 11 ACSS2 (ENSGGOG00000006934) GSS (ENSGGOG00000006950) EDEM2 (ENSGGOG00000013171) PROCR (ENSGGOG00000001019) MMP24 (ENSGGOG00000012090) MMP24OS (ENSGGOG00000039535) EIF6 (ENSGGOG00000012097) FAM83C (ENSGGOG00000012107) UQCC1 (ENSGGOG00000012109) GDF5 (ENSGGOG00000015513) ENSGGOG00000040812 CEP250 (ENSGGOG00000008213) C20orf173 (ENSGGOG00000006887) ERGIC3 (ENSGGOG00000027615) ENSGGOG00000007921 ENSGGOG00000038140 #22 SPAG4 (ENSGGOG00000007969) RBM12 (ENSGGOG00000028500) RBM39 (ENSGGOG00000003950) ENSGGOG00000024187 PHF20 (ENSGGOG00000001674) ENSGGOG00000001678 CNBD2 (ENSGGOG00000002640) ENSGGOG00000036198 EPB41L1 (ENSGGOG00000022733) AAR2 (ENSGGOG00000027575) DLGAP4 (ENSGGOG00000005453) ENSGGOG00000037355 MYL9 (ENSGGOG00000024477) TGIF2 (ENSGGOG00000011784) RAB5IF (ENSGGOG00000012877) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 7 ENSHGLG00000040007 ENSHGLG00000034345 ENSHGLG00000032978 FBXO4 (ENSHGLG00000003767) RIMOC1 (ENSHGLG00000050431) ENSHGLG00000044099 ENSHGLG00000049767 OXCT1 (ENSHGLG00000005620) ENSHGLG00000000417 PLCXD3 (ENSHGLG00000005203) C6 (ENSHGLG00000005314) MROH2B (ENSHGLG00000006059) ENSHGLG00000008189 C7 (ENSHGLG00000007774) ENSHGLG00000038929 ENSHGLG00000009486 #22 PRKAA1 (ENSHGLG00000010227) ENSHGLG00000038071 ENSHGLG00000010606 ENSHGLG00000041880 PTGER4 (ENSHGLG00000002903) ENSHGLG00000019934 DAB2 (ENSHGLG00000003257) C9 (ENSHGLG00000003707) ENSHGLG00000003910 ENSHGLG00000049355 RICTOR (ENSHGLG00000004986) ENSHGLG00000038546 OSMR (ENSHGLG00000002225) LIFR (ENSHGLG00000002688) EGFLAM (ENSHGLG00000003265) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 133 ENSCLAG00000010107 CCDC152 (ENSCLAG00000008976) GHR (ENSCLAG00000014878) FBXO4 (ENSCLAG00000011352) RIMOC1 (ENSCLAG00000009605) OXCT1 (ENSCLAG00000008732) PLCXD3 (ENSCLAG00000008935) MROH2B (ENSCLAG00000008282) RPL37 (ENSCLAG00000008803) #22 PRKAA1 (ENSCLAG00000009683) TTC33 (ENSCLAG00000009002) PTGER4 (ENSCLAG00000014156) ENSCLAG00000007996 ENSCLAG00000015330 FYB1 (ENSCLAG00000012441) RICTOR (ENSCLAG00000007847) OSMR (ENSCLAG00000008932) LIFR (ENSCLAG00000008192) EGFLAM (ENSCLAG00000011146) GDNF (ENSCLAG00000013976) WDR70 (ENSCLAG00000012915) NUP155 (ENSCLAG00000010580) CPLANE1 (ENSCLAG00000010572) NIPBL (ENSCLAG00000009826) Degu MODERN SPECIES 187 RELT (ENSODEG00000007100) ARHGEF17 (ENSODEG00000006220) P2RY6 (ENSODEG00000019427) P2RY2 (ENSODEG00000007272) ENSODEG00000019749 FCHSD2 (ENSODEG00000006875) ENSODEG00000008989 ATG16L2 (ENSODEG00000007030) STARD10 (ENSODEG00000006015) ENSODEG00000009509 PDE2A (ENSODEG00000009589) CLPB (ENSODEG00000009124) ENSODEG00000007512 PHOX2A (ENSODEG00000006697) INPPL1 (ENSODEG00000006960) ENSODEG00000019600 #22 FOLR1 (ENSODEG00000006777) ENSODEG00000007214 Tomt (ENSODEG00000008354) ENSODEG00000007062 Lrrc51 (ENSODEG00000008284) ENSODEG00000007877 IL18BP (ENSODEG00000010200) RNF121 (ENSODEG00000009786) ENSODEG00000008950 ART5 (ENSODEG00000007527) ENSODEG00000008188 ART1 (ENSODEG00000009116) CHRNA10 (ENSODEG00000007974) NUP98 (ENSODEG00000008778) ENSODEG00000008581 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 99 ENSJJAG00000015091 Or5h17 (ENSJJAG00000014061) ENSJJAG00000014297 ENSJJAG00000010500 Gabrr3 (ENSJJAG00000018558) Riox2 (ENSJJAG00000017682) ENSJJAG00000014703 Arl6 (ENSJJAG00000014206) ENSJJAG00000012956 ENSJJAG00000013966 Nsun3 (ENSJJAG00000011783) Stx19 (ENSJJAG00000013942) ENSJJAG00000010679 Pros1 (ENSJJAG00000000094) Epha3 (ENSJJAG00000023086) ENSJJAG00000022581 #22 ENSJJAG00000016108 ENSJJAG00000015343 Zfp654 (ENSJJAG00000014040) Htr1f (ENSJJAG00000013994) Pou1f1 (ENSJJAG00000011761) Chmp2b (ENSJJAG00000010165) Vgll3 (ENSJJAG00000008774) ENSJJAG00000001124 ENSJJAG00000011025 Cadm2 (ENSJJAG00000001556) ENSJJAG00000018522 ENSJJAG00000017273 Nuf2 (ENSJJAG00000015135) Rgs5 (ENSJJAG00000015242) Rgs4 (ENSJJAG00000014256) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 19 ENSRNOG00000066953 LOC301444 (ENSRNOG00000019107) Fam117b (ENSRNOG00000022066) Ica1l (ENSRNOG00000017258) Wdr12 (ENSRNOG00000017340) Carf (ENSRNOG00000017491) Nbeal1 (ENSRNOG00000021525) Cyp20a1 (ENSRNOG00000017631) Abi2 (ENSRNOG00000017707) Raph1 (ENSRNOG00000014722) Cd28 (ENSRNOG00000010283) Ctla4 (ENSRNOG00000054129) Icos (ENSRNOG00000046196) Pard3b (ENSRNOG00000024345) Nrp2 (ENSRNOG00000031232) Rpl37-ps5 (ENSRNOG00000033803) #22 Ino80d (ENSRNOG00000024272) Ndufs1 (ENSRNOG00000011849) Eef1b2 (ENSRNOG00000024186) Cmklr2 (ENSRNOG00000045532) Zdbf2 (ENSRNOG00000024114) Adam23 (ENSRNOG00000012424) Fam237a (ENSRNOG00000054699) Dytn (ENSRNOG00000042181) Mdh1b (ENSRNOG00000012891) ENSRNOG00000063009 Fastkd2 (ENSRNOG00000023923) ENSRNOG00000063607 Klf7 (ENSRNOG00000046242) LOC103690545 (ENSRNOG00000064370) Creb1 (ENSRNOG00000013412) Rat MODERN SPECIES 4 LOC678708 (ENSRNOG00000071166) Angel2 (ENSRNOG00000003795) Vash2 (ENSRNOG00000003832) Flvcr1 (ENSRNOG00000049633) SPATA45 (ENSRNOG00000048659) Tatdn3 (ENSRNOG00000046460) Nsl1 (ENSRNOG00000042286) Batf3 (ENSRNOG00000003716) Garin4 (ENSRNOG00000029371) Atf3 (ENSRNOG00000003745) Nenf (ENSRNOG00000003833) Pacc1 (ENSRNOG00000003915) Ppp2r5a (ENSRNOG00000000068) Dtl (ENSRNOG00000004195) Ints7 (ENSRNOG00000004263) RGD1560186 (ENSRNOG00000031098) #22 Lpgat1 (ENSRNOG00000004402) Nek2l1 (ENSRNOG00000004487) AABR07022168.1 (ENSRNOG00000059863) Slc30a1 (ENSRNOG00000004749) Rd3 (ENSRNOG00000050766) Traf5 (ENSRNOG00000047957) Rcor3 (ENSRNOG00000046445) Kcnh1 (ENSRNOG00000003841) Hhat (ENSRNOG00000003925) Sertad4 (ENSRNOG00000060773) Syt14 (ENSRNOG00000046139) Utp25 (ENSRNOG00000004789) Irf6 (ENSRNOG00000005082) LOC100125367 (ENSRNOG00000005558) Traf3ip3 (ENSRNOG00000005565) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 spretus MODERN SPECIES 6 MGP_SPRETEiJ_G0020521 Ccdc152 (MGP_SPRETEiJ_G0020522) Ghr (MGP_SPRETEiJ_G0020523) Fbxo4 (MGP_SPRETEiJ_G0020524) Rimoc1 (MGP_SPRETEiJ_G0020525) Oxct1 (MGP_SPRETEiJ_G0020526) Plcxd3 (MGP_SPRETEiJ_G0020527) C6 (MGP_SPRETEiJ_G0020528) Mroh2b (MGP_SPRETEiJ_G0020529) C7 (MGP_SPRETEiJ_G0020530) Card6 (MGP_SPRETEiJ_G0020531) Rpl37 (MGP_SPRETEiJ_G0020532) #22 MGP_SPRETEiJ_G0020533 Ttc33 (MGP_SPRETEiJ_G0020534) Ptger4 (MGP_SPRETEiJ_G0020535) Dab2 (MGP_SPRETEiJ_G0020536) C9 (MGP_SPRETEiJ_G0020537) Fyb (MGP_SPRETEiJ_G0020538) Rictor (MGP_SPRETEiJ_G0020539) Osmr (MGP_SPRETEiJ_G0020540) Lifr (MGP_SPRETEiJ_G0020541) Egflam (MGP_SPRETEiJ_G0020542) Gdnf (MGP_SPRETEiJ_G0020543) Wdr70 (MGP_SPRETEiJ_G0020544) Nup155 (MGP_SPRETEiJ_G0020545) Cplane1 (MGP_SPRETEiJ_G0020546) Nipbl (MGP_SPRETEiJ_G0020547) Steppe mouse MODERN SPECIES 95 Supt7l (ENSMSIG00000019995) Slc4a1ap (ENSMSIG00000020013) Mrpl33 (ENSMSIG00000020079) Rbks (ENSMSIG00000020092) ENSMSIG00000020110 Babam2 (ENSMSIG00000020121) ENSMSIG00000020960 Fosl2 (ENSMSIG00000020964) ENSMSIG00000020977 Plb1 (ENSMSIG00000020988) ENSMSIG00000021257 Ppp1cb (ENSMSIG00000021280) Yes1 (ENSMSIG00000021303) Pisd (ENSMSIG00000021330) Prr14l (ENSMSIG00000021404) ENSMSIG00000021437 #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00840000130401 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00940000165146 ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Golden Hamster MODERN SPECIES 842 ENSMAUG00000015154 Ccdc152 (ENSMAUG00000018506) Ghr (ENSMAUG00000000862) Fbxo4 (ENSMAUG00000011656) Rimoc1 (ENSMAUG00000013375) Plcxd3 (ENSMAUG00000016090) C6 (ENSMAUG00000007780) Mroh2b (ENSMAUG00000000313) C7 (ENSMAUG00000018078) ENSMAUG00000000193 #22 Prkaa1 (ENSMAUG00000001004) Ttc33 (ENSMAUG00000000173) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Prairie vole MODERN SPECIES 360 ENSMOCG00000016033 Thoc2 (ENSMOCG00000009946) Xiap (ENSMOCG00000022406) Stag2 (ENSMOCG00000004951) Tex13d (ENSMOCG00000017962) Sh2d1a (ENSMOCG00000004698) Tenm1 (ENSMOCG00000007304) ENSMOCG00000008269 Tex13c1 (ENSMOCG00000008436) ENSMOCG00000006467 Dcaf12l2 (ENSMOCG00000021979) Dcaf12l1 (ENSMOCG00000009747) ENSMOCG00000014325 Prr32 (ENSMOCG00000011393) Actrt1 (ENSMOCG00000013689) ENSMOCG00000010136 #22 ENSMOCG00000017233 Smarca1 (ENSMOCG00000009464) Ocrl (ENSMOCG00000010531) Apln (ENSMOCG00000001240) Xpnpep2 (ENSMOCG00000020269) Sash3 (ENSMOCG00000010968) Zdhhc9 (ENSMOCG00000009045) Utp14a (ENSMOCG00000002489) Bcorl1 (ENSMOCG00000007803) Elf4 (ENSMOCG00000000912) Aifm1 (ENSMOCG00000022628) Rab33a (ENSMOCG00000020142) Zfp280c (ENSMOCG00000002435) ENSMOCG00000020880 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 Armadillo MODERN SPECIES 3994 KCNN4 (ENSDNOG00000044059) ENSDNOG00000044820 ENSDNOG00000042221 #22 KCTD13 (ENSDNOG00000024321) ASPHD1 (ENSDNOG00000025039) SEZ6L2 (ENSDNOG00000006890) ENSDNOG00000025916 CDIPT (ENSDNOG00000043327) MVP (ENSDNOG00000040061) PAGR1 (ENSDNOG00000048009) PRRT2 (ENSDNOG00000045777) KIF22 (ENSDNOG00000025062) ZG16 (ENSDNOG00000025094) C16orf54 (ENSDNOG00000005217) QPRT (ENSDNOG00000007102) ENSDNOG00000046199 CD2BP2 (ENSDNOG00000005462) ENSDNOG00000041755 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009290 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150.k.a ENSGT00390000010427.c Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00390000009290 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.a.b #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150.k.a ENSGT00390000010427.c Elephant DUPLICATION Elephant MODERN SPECIES 526 ZNF131 (ENSLAFG00000004927) ENSLAFG00000000549 ENSLAFG00000028858 ENSLAFG00000020651 CCDC152 (ENSLAFG00000010324) GHR (ENSLAFG00000025524) FBXO4 (ENSLAFG00000000157) RIMOC1 (ENSLAFG00000000155) OXCT1 (ENSLAFG00000000153) PLCXD3 (ENSLAFG00000022636) C6 (ENSLAFG00000003388) ENSLAFG00000003380 ENSLAFG00000027888 ENSLAFG00000003378 CARD6 (ENSLAFG00000003376) RPL37 (ENSLAFG00000030052) #22 PRKAA1 (ENSLAFG00000017784) TTC33 (ENSLAFG00000003139) PTGER4 (ENSLAFG00000017781) DAB2 (ENSLAFG00000014524) C9 (ENSLAFG00000023078) FYB1 (ENSLAFG00000017371) RICTOR (ENSLAFG00000004289) OSMR (ENSLAFG00000004288) LIFR (ENSLAFG00000009058) EGFLAM (ENSLAFG00000009049) GDNF (ENSLAFG00000012711) WDR70 (ENSLAFG00000012469) NUP155 (ENSLAFG00000012454) ENSLAFG00000020573 ENSLAFG00000029995 Elephant MODERN SPECIES 428 INMT (ENSLAFG00000005251) CRHR2 (ENSLAFG00000002500) GARS1 (ENSLAFG00000002496) GGCT (ENSLAFG00000031681) NOD1 (ENSLAFG00000011290) ZNRF2 (ENSLAFG00000023370) PLEKHA8 (ENSLAFG00000007041) FKBP14 (ENSLAFG00000007038) SCRN1 (ENSLAFG00000017504) ENSLAFG00000030264 PRR15 (ENSLAFG00000002598) CHN2 (ENSLAFG00000002595) CPVL (ENSLAFG00000002811) TRIL (ENSLAFG00000029935) CREB5 (ENSLAFG00000029453) ENSLAFG00000027732 #22 JAZF1 (ENSLAFG00000006942) TAX1BP1 (ENSLAFG00000006940) HIBADH (ENSLAFG00000013650) EVX1 (ENSLAFG00000001942) HOXA13 (ENSLAFG00000000738) HOXA11 (ENSLAFG00000005482) HOXA10 (ENSLAFG00000030920) HOXA9 (ENSLAFG00000008970) HOXA7 (ENSLAFG00000002101) HOXA6 (ENSLAFG00000006281) HOXA5 (ENSLAFG00000026981) HOXA4 (ENSLAFG00000008965) HOXA3 (ENSLAFG00000023253) HOXA2 (ENSLAFG00000001565) HOXA1 (ENSLAFG00000001615) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.a #22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1011 TTC33 (ENSVURG00010001701) PRKAA1 (ENSVURG00010001645) ENSVURG00010001637 ENSVURG00010001625 #22 ENSVURG00010001615 C7 (ENSVURG00010001566) MROH2B (ENSVURG00010001388) C6 (ENSVURG00010001315) PLCXD3 (ENSVURG00010001256) ENSVURG00010001169 RIMOC1 (ENSVURG00010001150) FBXO4 (ENSVURG00010001116) GHR (ENSVURG00010001082) CCDC152 (ENSVURG00010000969) ENSVURG00010000951 ENSVURG00010000926 #22 ENSVURG00010000923 ZNF131 (ENSVURG00010000916) NIM1K (ENSVURG00010000879) HMGCS1 (ENSVURG00010000850) CCL28 (ENSVURG00010000830) TMEM267 (ENSVURG00010000813) C5orf34 (ENSVURG00010000798) PAIP1 (ENSVURG00010000774) NNT (ENSVURG00010000674) FGF10 (ENSVURG00010000643) MRPS30 (ENSVURG00010000603) ENSVURG00010000582 ENSVURG00010000562 PARP8 (ENSVURG00010000482) ISL1 (ENSVURG00010000400) Common wonbat MODERN SPECIES 1095 ENSVURG00010002181 ENSVURG00010002166 ENSVURG00010002140 OSBPL8 (ENSVURG00010002089) ZDHHC17 (ENSVURG00010002037) CSRP2 (ENSVURG00010002008) E2F7 (ENSVURG00010001992) ENSVURG00010001969 ENSVURG00010001942 ENSVURG00010001934 NAV3 (ENSVURG00010001745) ENSVURG00010001638 #22 ENSVURG00010001581 SYT1 (ENSVURG00010001565) PAWR (ENSVURG00010001479) PPP1R12A (ENSVURG00010001421) OTOGL (ENSVURG00010001281) PTPRQ (ENSVURG00010001162) MYF6 (ENSVURG00010001122) MYF5 (ENSVURG00010001088) LIN7A (ENSVURG00010001078) ACSS3 (ENSVURG00010000986) PPFIA2 (ENSVURG00010000931) CCDC59 (ENSVURG00010000865) METTL25 (ENSVURG00010000829) TMTC2 (ENSVURG00010000692) ENSVURG00010000644 Theria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.b #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Opossum MODERN SPECIES 5 ZPBP (ENSMODG00000009302) SPATA48 (ENSMODG00000028255) IKZF1 (ENSMODG00000009274) ENSMODG00000044243 FIGNL1 (ENSMODG00000024147) DDC (ENSMODG00000009255) ENSMODG00000037779 GRB10 (ENSMODG00000009212) ENSMODG00000009205 ENSMODG00000051593 ENSMODG00000009148 ENSMODG00000029195 ENSMODG00000009113 VSTM2A (ENSMODG00000009103) SEC61G (ENSMODG00000037009) ENSMODG00000009039 #22 EGFR (ENSMODG00000009033) LANCL2 (ENSMODG00000008968) VOPP1 (ENSMODG00000029263) ENSMODG00000008902 ACVR2B (ENSMODG00000008889) XYLB (ENSMODG00000008877) NINJ1 (ENSMODG00000008842) WNK2 (ENSMODG00000008832) FAM120A (ENSMODG00000008789) PHF2 (ENSMODG00000008768) BARX1 (ENSMODG00000008720) PTPDC1 (ENSMODG00000008716) ENSMODG00000036655 ENSMODG00000008696 WNT7A (ENSMODG00000008659) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.a #22 koala MODERN SPECIES 9 CPB1 (ENSPCIG00000005481) ENSPCIG00000023055 AGTR1 (ENSPCIG00000023054) ENSPCIG00000034512 ZIC1 (ENSPCIG00000023051) ENSPCIG00000023047 ENSPCIG00000023048 ENSPCIG00000032139 PLSCR5 (ENSPCIG00000018538) PLSCR1 (ENSPCIG00000018535) PLSCR4 (ENSPCIG00000018533) PLOD2 (ENSPCIG00000018522) ENSPCIG00000013897 ENSPCIG00000029198 ENSPCIG00000007920 ENSPCIG00000018428 #22 DIPK2A (ENSPCIG00000037438) Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.b.a #22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat DUPLICATION Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1043 ENSVURG00010020600 ENSVURG00010020647 ENSVURG00010020655 ENSVURG00010020659 ENSVURG00010020674 ENSVURG00010020682 ENSVURG00010020688 ENSVURG00010020692 ENSVURG00010020698 ENSVURG00010020707 ENSVURG00010020715 ENSVURG00010020721 ENSVURG00010020738 ENSVURG00010020803 ENSVURG00010020814 ENSVURG00010020821 #22 ENSVURG00010020824 ENSVURG00010020829 ENSVURG00010020834 ENSVURG00010020846 ENSVURG00010020857 ENSVURG00010020865 ENSVURG00010020890 ENSVURG00010020894 ENSVURG00010020898 ENSVURG00010020903 ENSVURG00010020931 ENSVURG00010020941 ENSVURG00010020981 ENSVURG00010020987 Common wonbat MODERN SPECIES 1043 ENSVURG00010018128 ENSVURG00010018156 ENSVURG00010018230 ENSVURG00010018235 ENSVURG00010018251 ENSVURG00010018266 ENSVURG00010018276 ENSVURG00010018286 ENSVURG00010018292 ENSVURG00010018310 ENSVURG00010018330 ENSVURG00010000106 ENSVURG00010000166 ENSVURG00010000353 ENSVURG00010000397 ENSVURG00010000441 #22 ENSVURG00010000451 ENSVURG00010000528 ENSVURG00010000842 ENSVURG00010005547 ENSVURG00010005566 ENSVURG00010005601 ENSVURG00010005661 ENSVURG00010005676 ENSVURG00010005710 ENSVURG00010005718 ENSVURG00010005796 ENSVURG00010005927 ENSVURG00010005939 MFAP4 (ENSVURG00010005955) MAPK7 (ENSVURG00010005968) Common wonbat MODERN SPECIES 1046 RSRC1 (ENSVURG00010016788) SHOX2 (ENSVURG00010016800) VEPH1 (ENSVURG00010016819) PTX3 (ENSVURG00010016844) CCNL1 (ENSVURG00010016857) ENSVURG00010016876 ENSVURG00010016886 TIPARP (ENSVURG00010016896) SSR3 (ENSVURG00010016903) KCNAB1 (ENSVURG00010016914) ENSVURG00010016928 GMPS (ENSVURG00010016941) SLC33A1 (ENSVURG00010016955) ENSVURG00010016972 PLCH1 (ENSVURG00010017004) ENSVURG00010017174 #22 MME (ENSVURG00010017187) GPR149 (ENSVURG00010017273) DHX36 (ENSVURG00010017291) ARHGEF26 (ENSVURG00010017313) RAP2B (ENSVURG00010017346) P2RY1 (ENSVURG00010017360) MBNL1 (ENSVURG00010017405) SUCNR1 (ENSVURG00010017482) AADAC (ENSVURG00010017488) ENSVURG00010017495 ENSVURG00010017506 ENSVURG00010017518 AHSG (ENSVURG00010017527) SENP5 (ENSVURG00010017534) ENSVURG00010017540 Common wonbat MODERN SPECIES 1067 MCMBP (ENSVURG00010017481) SEC23IP (ENSVURG00010017493) PLPP4 (ENSVURG00010017515) ENSVURG00010017529 WDR11 (ENSVURG00010017552) FGFR2 (ENSVURG00010017618) ATE1 (ENSVURG00010017712) ENSVURG00010017748 ENSVURG00010017780 BTBD16 (ENSVURG00010018157) ENSVURG00010018198 PLEKHA1 (ENSVURG00010018214) HTRA1 (ENSVURG00010018270) ENSVURG00010018555 ENSVURG00010018628 ENSVURG00010018656 #22 ENSVURG00010018659 CUZD1 (ENSVURG00010018665) C10orf88 (ENSVURG00010018674) ENSVURG00010018686 IKZF5 (ENSVURG00010018688) ACADSB (ENSVURG00010018698) ENSVURG00010018711 GPR26 (ENSVURG00010018721) CPXM2 (ENSVURG00010018730) CHST15 (ENSVURG00010018756) ENSVURG00010018775 ENSVURG00010018780 ENSVURG00010018781 ENSVURG00010018787 SLC16A12 (ENSVURG00010018792) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.b.b #22 Common wonbat MODERN SPECIES 258 TRIM16 (ENSVURG00010016344) ENSVURG00010016234 ENSVURG00010016215 ENSVURG00010016208 ENSVURG00010016204 PMP22 (ENSVURG00010016198) ZKSCAN5 (ENSVURG00010016078) ENSVURG00010016051 ENSVURG00010016045 ENSVURG00010016039 ZNF24 (ENSVURG00010016030) ENSVURG00010016024 OGFOD3 (ENSVURG00010016016) HEXD (ENSVURG00010016007) CYBC1 (ENSVURG00010015978) ENSVURG00010015966 #22 NARF (ENSVURG00010015958) ENSVURG00010015951 FOXK2 (ENSVURG00010015943) WDR45B (ENSVURG00010015932) ENSVURG00010015926 ZNF750 (ENSVURG00010015919) ENSVURG00010015911 TBCD (ENSVURG00010013399) B3GNTL1 (ENSVURG00010013256) METRNL (ENSVURG00010013246) ENSVURG00010013241 koala MODERN SPECIES 216 KPNA5 (ENSPCIG00000023067) ENSPCIG00000009100 RFX6 (ENSPCIG00000023071) ENSPCIG00000031623 DCBLD1 (ENSPCIG00000023078) GOPC (ENSPCIG00000023081) ENSPCIG00000023085 NUS1 (ENSPCIG00000022299) SLC35F1 (ENSPCIG00000033480) CEP85L (ENSPCIG00000021049) PLN (ENSPCIG00000021050) MCM9 (ENSPCIG00000021051) ASF1A (ENSPCIG00000021052) FAM184A (ENSPCIG00000021053) MAN1A1 (ENSPCIG00000021057) ENSPCIG00000034430 #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Arabian camel MODERN SPECIES 4 ENSCDRG00005013988 ENSCDRG00005014010 ENSCDRG00005014098 CDC42 (ENSCDRG00005014119) WNT4 (ENSCDRG00005014185) ZBTB40 (ENSCDRG00005014228) EPHA8 (ENSCDRG00005014357) C1QA (ENSCDRG00005014427) C1QC (ENSCDRG00005014455) C1QB (ENSCDRG00005014476) EPHB2 (ENSCDRG00005014531) LACTBL1 (ENSCDRG00005014651) TEX46 (ENSCDRG00005014727) KDM1A (ENSCDRG00005014888) LUZP1 (ENSCDRG00005017675) ENSCDRG00005017708 #22 HTR1D (ENSCDRG00005017723) HNRNPR (ENSCDRG00005017745) ZNF436 (ENSCDRG00005017814) TCEA3 (ENSCDRG00005017851) ASAP3 (ENSCDRG00005017913) E2F2 (ENSCDRG00005018277) ENSCDRG00005018301 RPL11 (ENSCDRG00005018317) ELOA (ENSCDRG00005018386) PITHD1 (ENSCDRG00005018453) LYPLA2 (ENSCDRG00005003312) GALE (ENSCDRG00005003344) HMGCL (ENSCDRG00005003396) FUCA1 (ENSCDRG00005003479) CNR2 (ENSCDRG00005003510) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00930000151059 ENSGT00790000123099.ac ENSGT00390000001319.nb.b ENSGT00940000157888 ENSGT00940000158331 ENSGT00940000159043 ENSGT00390000001667 ENSGT01030000234543.F ENSGT00450000040303.i.a ENSGT00390000013344.t ENSGT00450000040303.i.b ENSGT00390000013344.s ENSGT00940000162158 ENSGT00940000162582 ENSGT00390000015600.c.a.o ENSGT00390000005254.i.a.b #22 ENSGT00940000156229.k.a ENSGT00390000012078.b.r ENSGT00940000156411 ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000160867 ENSGT00390000014471 ENSGT00940000157979 ENSGT00940000157174 ENSGT00940000154658.b ENSGT00950000183018.b.k.b ENSGT00950000183018.b.k.a ENSGT01040000240406.A.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01040000240406.A.b.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000162868.e ENSGT00530000064170.f Blue whale MODERN SPECIES 17 PALM2AKAP2 (ENSBMSG00010004905) ENSBMSG00010004868 ENSBMSG00010004865 PTPN3 (ENSBMSG00010004820) EPB41L4B (ENSBMSG00010004773) FRRS1L (ENSBMSG00010004752) TMEM245 (ENSBMSG00010004728) ENSBMSG00010004705 ENSBMSG00010004692 ELP1 (ENSBMSG00010004684) ENSBMSG00010004678 ACTL7A (ENSBMSG00010004670) ACTL7B (ENSBMSG00010004666) ENSBMSG00010004658 ENSBMSG00010004650 ENSBMSG00010004642 #22 ENSBMSG00010004626 ENSBMSG00010004608 ZNF462 (ENSBMSG00010004577) ENSBMSG00010004562 ENSBMSG00010004552 TMEM38B (ENSBMSG00010004523) TAL2 (ENSBMSG00010004504) FKTN (ENSBMSG00010007756) FSD1L (ENSBMSG00010007682) SLC44A1 (ENSBMSG00010007629) ABCA1 (ENSBMSG00010007600) NIPSNAP3B (ENSBMSG00010007586) NIPSNAP3A (ENSBMSG00010007574) ENSBMSG00010007565 OR13C8 (ENSBMSG00010007546) Odontoceti DUPLICATION Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.c #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.c #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.b.c #22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183183.b.a.r.b.a ENSGT00940000154668.rb.a ENSGT00940000167563 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000006707.r.g ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.a.b.c #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00940000153239.B.n ENSGT00530000063460.A.b ENSGT01010000228899 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155725.c.b ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 Beluga whale MODERN SPECIES 71 GHR (ENSDLEG00000011057) ENSDLEG00000011077 FBXO4 (ENSDLEG00000011088) CUNH5orf51 (ENSDLEG00000011097) ENSDLEG00000011117 OXCT1 (ENSDLEG00000007932) ENSDLEG00000007959 PLCXD3 (ENSDLEG00000007969) ENSDLEG00000007976 C6 (ENSDLEG00000007985) ENSDLEG00000008015 ENSDLEG00000008047 C7 (ENSDLEG00000008142) ENSDLEG00000008182 ENSDLEG00000008197 ENSDLEG00000008233 #22 PRKAA1 (ENSDLEG00000008270) TTC33 (ENSDLEG00000008324) PTGER4 (ENSDLEG00000008354) DAB2 (ENSDLEG00000008396) C9 (ENSDLEG00000008449) ENSDLEG00000008481 ENSDLEG00000008494 ENSDLEG00000008508 RICTOR (ENSDLEG00000008761) OSMR (ENSDLEG00000011096) ENSDLEG00000011140 LIFR (ENSDLEG00000011161) EGFLAM (ENSDLEG00000011222) GDNF (ENSDLEG00000011285) WDR70 (ENSDLEG00000011311) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161837 ENSGT00790000123099.ac ENSGT00390000001319.nb.b ENSGT00940000157888 ENSGT00940000158331 ENSGT00940000159043 ENSGT00390000001667 ENSGT01030000234543.F ENSGT00450000040303.i.a.a.b ENSGT00390000013344.t ENSGT00450000040303.i.b ENSGT00390000013344.s ENSGT00940000162158 ENSGT00940000162582 ENSGT00390000015600.c.a.o ENSGT00390000005254.i.a.b.d #22 ENSGT00940000156229.k.a ENSGT00390000012078.b.r ENSGT00390000012078.b.q ENSGT00940000156411 ENSGT00390000018845.e ENSGT00940000160867 ENSGT00390000014471 ENSGT00940000157979 ENSGT00940000157174 ENSGT00940000154658.b ENSGT00950000183018.b.k.b ENSGT00950000183018.b.k.a ENSGT01040000240406.A.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01040000240406.A.b.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00550000074857 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.d #22 Odontoceti_b DUPLICATION Odontoceti_b DUPLICATION Odontoceti_b DUPLICATION Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000006492 ENSGT00940000159565 ENSGT00940000159625 ENSGT00940000158195 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.b ENSGT00950000182887.C.b.b ENSGT01030000234621.C.a.a.a ENSGT00390000002414.hb ENSGT00940000163556 ENSGT01030000234582.f.a.a.a.b ENSGT00730000111220 ENSGT00390000002873.z.b.b ENSGT00940000161362 ENSGT00390000005254.i.a.b.d.a.a.a #22 ENSGT00940000154585.b ENSGT01010000230188 ENSGT00940000160128 ENSGT00950000183061.a.a.a.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00940000160157 ENSGT00940000155516 ENSGT00940000153259.a.a.a Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000153609.a ENSGT00940000154651 ENSGT00390000006492 ENSGT00940000159565 ENSGT00940000159625 ENSGT00940000158195 ENSGT00940000153222.a.b.b.b.b ENSGT00950000182887.C.b.b ENSGT01030000234621.C.a.a.a ENSGT00390000002414.hb ENSGT00940000163556 ENSGT01030000234582.f.a.a.a.b ENSGT00730000111220 ENSGT00390000002873.z.b.b ENSGT00940000161362 ENSGT00390000005254.i.a.b.d.a.a.a #22 ENSGT00940000154585.b ENSGT01010000230188 ENSGT00940000160128 ENSGT00950000183061.a.a.a.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00940000160157 ENSGT00940000155516 ENSGT00940000153259.a.a.a Beluga whale MODERN SPECIES 76 SLC7A3 (ENSDLEG00000008236) TEX11 (ENSDLEG00000008003) ENSDLEG00000015578 GDPD2 (ENSDLEG00000015195) ENSDLEG00000015180 KIF4A (ENSDLEG00000015138) PDZD11 (ENSDLEG00000015114) ARR3 (ENSDLEG00000015084) P2RY4 (ENSDLEG00000015071) ENSDLEG00000015058 OTUD6A (ENSDLEG00000015033) AWAT2 (ENSDLEG00000014968) EDA (ENSDLEG00000014935) ENSDLEG00000014923 FAM155B (ENSDLEG00000014915) ENSDLEG00000014895 #22 PJA1 (ENSDLEG00000014891) ENSDLEG00000014880 ENSDLEG00000014876 ENSDLEG00000014858 STARD8 (ENSDLEG00000014834) YIPF6 (ENSDLEG00000014821) OPHN1 (ENSDLEG00000014700) ENSDLEG00000014683 AR (ENSDLEG00000014573) ENSDLEG00000014536 Narwhal MODERN SPECIES 309 SLC7A3 (ENSMMNG00015009926) TEX11 (ENSMMNG00015009880) ENSMMNG00015009851 DLG3 (ENSMMNG00015009786) GDPD2 (ENSMMNG00015009740) KIF4A (ENSMMNG00015009682) PDZD11 (ENSMMNG00015009657) ARR3 (ENSMMNG00015009631) P2RY4 (ENSMMNG00015009613) ENSMMNG00015009602 OTUD6A (ENSMMNG00015009597) AWAT2 (ENSMMNG00015009580) EDA (ENSMMNG00015009555) ENSMMNG00015009543 NALF2 (ENSMMNG00015009538) ENSMMNG00015009530 #22 PJA1 (ENSMMNG00015009520) EFNB1 (ENSMMNG00015009506) STARD8 (ENSMMNG00015009480) YIPF6 (ENSMMNG00015009448) OPHN1 (ENSMMNG00015009417) AR (ENSMMNG00015009371) EDA2R (ENSMMNG00015009344) ENSMMNG00015009336 ENSMMNG00015009330 ENSMMNG00015009327 ENSMMNG00015009322 ENSMMNG00015009316 ABITRAM (ENSMMNG00015009309) ENSMMNG00015009307 ENSMMNG00015009302 Vaquita MODERN SPECIES 34 SLC7A3 (ENSPSNG00000017602) TEX11 (ENSPSNG00000017527) ENSPSNG00000017458 DLG3 (ENSPSNG00000016885) GDPD2 (ENSPSNG00000016544) KIF4A (ENSPSNG00000016454) PDZD11 (ENSPSNG00000016382) ARR3 (ENSPSNG00000015831) P2RY4 (ENSPSNG00000015732) ENSPSNG00000015550 OTUD6A (ENSPSNG00000015527) AWAT2 (ENSPSNG00000015304) EDA (ENSPSNG00000014912) ENSPSNG00000014880 NALF2 (ENSPSNG00000014821) ENSPSNG00000014751 #22 PJA1 (ENSPSNG00000014701) ENSPSNG00000014632 EFNB1 (ENSPSNG00000014578) STARD8 (ENSPSNG00000014521) YIPF6 (ENSPSNG00000014380) OPHN1 (ENSPSNG00000014060) AR (ENSPSNG00000013551) EDA2R (ENSPSNG00000020846) HEPH (ENSPSNG00000020688) ENSPSNG00000020637 VSIG4 (ENSPSNG00000020471) MSN (ENSPSNG00000020415) LAS1L (ENSPSNG00000020353) ZC3H12B (ENSPSNG00000020301) ENSPSNG00000020288 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.d.a.a.b #22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156000 ENSGT00950000182937.A.a ENSGT00390000014666.b ENSGT00940000163402 ENSGT00950000182965.b.`b.a ENSGT00940000158235 ENSGT00950000183178.b.a.kb ENSGT00950000183088.a.b.a ENSGT00940000161741 ENSGT00390000008454 ENSGT00390000002223 ENSGT01100000263540.B.c ENSGT00940000157049 ENSGT00950000182922.a.b.e.b ENSGT00940000157556 ENSGT00390000005254.i.a.b.d.a.a.b #22 ENSGT00950000183082.b.b.b ENSGT00940000157525 ENSGT00390000004874.a.a ENSGT00390000015298 ENSGT00390000011684 ENSGT00940000157042 ENSGT00530000063711.b ENSGT00390000013726 ENSGT00390000000134.a ENSGT00940000160608 ENSGT00390000013298 ENSGT00510000049375 ENSGT00510000049872 ENSGT00390000010434.b ENSGT00730000111173 Beluga whale MODERN SPECIES 65 CWF19L1 (ENSDLEG00000016684) CHUK (ENSDLEG00000016724) ERLIN1 (ENSDLEG00000016752) ENSDLEG00000016762 ENSDLEG00000016781 CPN1 (ENSDLEG00000016805) DNMBP (ENSDLEG00000016839) ENSDLEG00000016877 ABCC2 (ENSDLEG00000017009) CUTC (ENSDLEG00000018572) COX15 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ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00390000014349 ENSGT00400000022269 ENSGT00940000153594.c ENSGT00950000183012.A.a ENSGT00940000155431.a ENSGT00940000153974.B ENSGT00390000009670 ENSGT00940000153849.a ENSGT00500000044984 ENSGT00390000012759 ENSGT00940000155149 ENSGT00940000155449 ENSGT00940000160030 ENSGT00940000160182 ENSGT00390000005254.i.a.b.d.a.b #22 ENSGT00940000157648 ENSGT00940000157897 ENSGT00940000155143.lb ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000013143 ENSGT00570000079101.b ENSGT00950000182881.a.b.a.a.k ENSGT00950000182881.a.b.a.a.l ENSGT00940000154642 ENSGT00430000031027.a ENSGT01100000263534.b.k.a.b.a ENSGT00390000016836.a ENSGT00940000159022 ENSGT00940000153372.B Beluga whale MODERN SPECIES 60 DENR (ENSDLEG00000009916) ENSDLEG00000009938 HIP1R (ENSDLEG00000009964) VPS37B (ENSDLEG00000010052) ABCB9 (ENSDLEG00000010074) OGFOD2 (ENSDLEG00000010174) ARL6IP4 (ENSDLEG00000010186) PITPNM2 (ENSDLEG00000010486) MPHOSPH9 (ENSDLEG00000013123) 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IRAK1BP1 (ENSBIXG00005001929) ENSBIXG00005014458 ENSBIXG00005001941 ENSBIXG00005014467 MEI4 (ENSBIXG00005014504) HTR1B (ENSBIXG00005005419) ENSBIXG00005014540 #22 ENSBIXG00005014555 IMPG1 (ENSBIXG00005014572) ENSBIXG00005006341 MYO6 (ENSBIXG00005014655) ENSBIXG00005014745 ENSBIXG00005002089 FILIP1 (ENSBIXG00005014816) ENSBIXG00005007540 TMEM30A (ENSBIXG00005014933) COL12A1 (ENSBIXG00005015265) ENSBIXG00005015368 CD109 (ENSBIXG00005002279) SLC17A5 (ENSBIXG00005015518) EEF1A1 (ENSBIXG00005015547) MTO1 (ENSBIXG00005015597) Yarkand deer MODERN SPECIES 32 ENSCHYG00000013740 ENSCHYG00000013715 ENSCHYG00000013700 ENSCHYG00000013659 ENSCHYG00000013627 TIMD4 (ENSCHYG00000013576) ENSCHYG00000013529 SGCD (ENSCHYG00000013376) ENSCHYG00000013190 MRPL22 (ENSCHYG00000013068) GEMIN5 (ENSCHYG00000012924) CNOT8 (ENSCHYG00000012798) ENSCHYG00000012741 ENSCHYG00000012708 LARP1 (ENSCHYG00000012618) ENSCHYG00000012584 #22 HAND1 (ENSCHYG00000012541) ENSCHYG00000012437 GALNT10 (ENSCHYG00000012158) MFAP3 (ENSCHYG00000012108) FAM114A2 (ENSCHYG00000011772) GRIA1 (ENSCHYG00000011374) NMUR2 (ENSCHYG00000011292) GLRA1 (ENSCHYG00000011170) G3BP1 (ENSCHYG00000011097) ENSCHYG00000011020 ENSCHYG00000010996 SPARC (ENSCHYG00000010867) FAT2 (ENSCHYG00000010698) SLC36A1 (ENSCHYG00000010573) SLC36A2 (ENSCHYG00000010468) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.e.a.a.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.e.a.a.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.e.a.a.b #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.e.a.a.b #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 22 ADGRA3 (ENSOARG00020012646) ENSOARG00020014326 GBA3 (ENSOARG00020014356) PPARGC1A (ENSOARG00020014504) DHX15 (ENSOARG00020015199) SOD3 (ENSOARG00020015395) CCDC149 (ENSOARG00020015431) LGI2 (ENSOARG00020015826) SEPSECS (ENSOARG00020015918) PI4K2B (ENSOARG00020015990) ZCCHC4 (ENSOARG00020016087) ANAPC4 (ENSOARG00020016174) ENSOARG00020017059 SLC34A2 (ENSOARG00020017154) SEL1L3 (ENSOARG00020017417) ENSOARG00020019074 #22 ENSOARG00020019119 RBPJ (ENSOARG00020019203) CCKAR (ENSOARG00020019878) TBC1D19 (ENSOARG00020019954) STIM2 (ENSOARG00020020357) ENSOARG00020020464 ENSOARG00020020499 PCDH7 (ENSOARG00020020567) ENSOARG00020020648 ARAP2 (ENSOARG00020020778) DTHD1 (ENSOARG00020021575) NWD2 (ENSOARG00020021937) C6H4orf19 (ENSOARG00020021966) RELL1 (ENSOARG00020021988) PGM2 (ENSOARG00020022008) Yarkand deer MODERN SPECIES 7 HNRNPK (ENSCHYG00000012829) RMI1 (ENSCHYG00000012958) SLC28A3 (ENSCHYG00000012981) ENSCHYG00000013297 ENSCHYG00000013335 ENSCHYG00000013387 NTRK2 (ENSCHYG00000013465) AGTPBP1 (ENSCHYG00000014224) NAA35 (ENSCHYG00000015776) GOLM1 (ENSCHYG00000015988) ENSCHYG00000016108 ENSCHYG00000016237 TUT7 (ENSCHYG00000016346) ENSCHYG00000016910 GAS1 (ENSCHYG00000016949) ENSCHYG00000016995 #22 DAPK1 (ENSCHYG00000017064) CTSL (ENSCHYG00000017720) FBP2 (ENSCHYG00000017797) FBP1 (ENSCHYG00000017872) AOPEP (ENSCHYG00000017977) FANCC (ENSCHYG00000005194) PTCH1 (ENSCHYG00000005314) ERCC6L2 (ENSCHYG00000005683) ENSCHYG00000005815 HSD17B3 (ENSCHYG00000005840) SLC35D2 (ENSCHYG00000005943) ZNF367 (ENSCHYG00000006054) HABP4 (ENSCHYG00000006099) ENSCHYG00000006254 PRXL2C (ENSCHYG00000006833) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.e.a.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.e.a.b #22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1271 ENSMMSG00000017213 USP53 (ENSMMSG00000017172) MYOZ2 (ENSMMSG00000017140) SYNPO2 (ENSMMSG00000017112) SEC24D (ENSMMSG00000024289) METTL14 (ENSMMSG00000024284) PRSS12 (ENSMMSG00000024282) NDST3 (ENSMMSG00000024279) TRAM1L1 (ENSMMSG00000024274) ENSMMSG00000024273 ENSMMSG00000024271 NDST4 (ENSMMSG00000024268) UGT8 (ENSMMSG00000024267) ARSJ (ENSMMSG00000024266) CAMK2D (ENSMMSG00000024263) ENSMMSG00000024258 #22 ANK2 (ENSMMSG00000024111) LARP7 (ENSMMSG00000024065) ZGRF1 (ENSMMSG00000024057) ENSMMSG00000024053 NEUROG2 (ENSMMSG00000024051) ALPK1 (ENSMMSG00000024041) ENSMMSG00000024037 ENSMMSG00000024030 FAM241A (ENSMMSG00000024017) ENSMMSG00000024009 PITX2 (ENSMMSG00000023999) ENPEP (ENSMMSG00000023990) ELOVL6 (ENSMMSG00000023985) ENSMMSG00000023982 LRIT3 (ENSMMSG00000023978) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.e.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.e.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063554.b ENSGT00940000158792 ENSGT00530000063868.b ENSGT00390000013052 ENSGT00810000125439.B ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00390000009776.g.b ENSGT00940000158969 ENSGT00390000016138 ENSGT00950000183205.b.a.b.a.b ENSGT00940000160716 ENSGT00940000155486 ENSGT00940000158917 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00390000002231.d.a ENSGT00390000005254.i.a.b.e.b #22 ENSGT00940000156749 ENSGT00530000063825.B ENSGT00940000159931 ENSGT00390000002307 ENSGT00940000159065 ENSGT00940000155473 ENSGT00940000161281 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b.f ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT01100000263574.a.m ENSGT00940000156867.b ENSGT01100000263574.a.n Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.e.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.e.b #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.e.b #22 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 24 ENSBIXG00005023667 ENSBIXG00005023651 DBX2 (ENSBIXG00005023629) ANO6 (ENSBIXG00005023586) ENSBIXG00005023433 ARID2 (ENSBIXG00005023392) SCAF11 (ENSBIXG00005003981) SLC38A1 (ENSBIXG00005006278) ENSBIXG00005023142 SLC38A2 (ENSBIXG00005023118) ENSBIXG00005023082 SLC38A4 (ENSBIXG00005023039) ENSBIXG00005022876 AMIGO2 (ENSBIXG00005006671) PCED1B (ENSBIXG00005022843) ENSBIXG00005022807 #22 ENSBIXG00005022795 RPAP3 (ENSBIXG00005022769) ENDOU (ENSBIXG00005022710) RAPGEF3 (ENSBIXG00005022592) ENSBIXG00005022526 SLC48A1 (ENSBIXG00005022519) HDAC7 (ENSBIXG00005022454) VDR (ENSBIXG00005022293) TMEM106C (ENSBIXG00005022255) COL2A1 (ENSBIXG00005022157) SENP1 (ENSBIXG00005022082) PFKM (ENSBIXG00005021906) ASB8 (ENSBIXG00005005446) CCDC184 (ENSBIXG00005021363) ENSBIXG00005021327 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063554.b ENSGT00940000158792 ENSGT00530000063868.b ENSGT00390000013052 ENSGT00810000125439.B ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00390000009776.g.b ENSGT00940000158969 ENSGT00390000016138 ENSGT00950000183205.b.a.b.a.b ENSGT00940000160716 ENSGT00940000155486 ENSGT00940000158917 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00390000002231.d.a ENSGT00390000005254.i.a.b.e.b #22 ENSGT00940000156749 ENSGT00530000063825.B ENSGT00940000159931 ENSGT00390000002307 ENSGT00940000159065 ENSGT00940000155473 ENSGT00940000161281 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b.f ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT01100000263574.a.m ENSGT00940000156867.b ENSGT00940000162121 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 19 PUS7L (ENSOARG00020005488) IRAK4 (ENSOARG00020005397) TWF1 (ENSOARG00020005323) TMEM117 (ENSOARG00020005245) NELL2 (ENSOARG00020005041) DBX2 (ENSOARG00020004994) ENSOARG00020004973 ANO6 (ENSOARG00020003993) ARID2 (ENSOARG00020003803) 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(ENSBBBG00000012909) HMGN3 (ENSBBBG00000002546) PHIP (ENSBBBG00000012882) IRAK1BP1 (ENSBBBG00000006752) ENSBBBG00000006744 MEI4 (ENSBBBG00000025407) HTR1B (ENSBBBG00000006724) ENSBBBG00000025384 #22 IMPG1 (ENSBBBG00000025343) MYO6 (ENSBBBG00000025149) SENP6 (ENSBBBG00000024359) FILIP1 (ENSBBBG00000008820) TMEM30A (ENSBBBG00000006288) ENSBBBG00000024128 COL12A1 (ENSBBBG00000008642) ENSBBBG00000006123 ENSBBBG00000006122 ENSBBBG00000023393 ENSBBBG00000023388 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.f #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 22 ANTXR2 (ENSOARG00020008268) ENSOARG00020008183 BMP3 (ENSOARG00020008128) GK2 (ENSOARG00020008089) NAA11 (ENSOARG00020008072) PAQR3 (ENSOARG00020008001) BMP2K (ENSOARG00020007544) ANXA3 (ENSOARG00020007381) FRAS1 (ENSOARG00020006780) ENSOARG00020006669 CNOT6L (ENSOARG00020006410) ENSOARG00020006387 CCNG2 (ENSOARG00020006282) CCNI (ENSOARG00020006256) SEPTIN11 (ENSOARG00020006144) ENSOARG00020006114 #22 CCDC158 (ENSOARG00020004930) STBD1 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(ENSCHIG00000011588) CREBBP (ENSCHIG00000017639) TRAP1 (ENSCHIG00000020250) DNASE1 (ENSCHIG00000018726) ENSCHIG00000010168 SLX4 (ENSCHIG00000017094) NLRC3 (ENSCHIG00000022312) CLUAP1 (ENSCHIG00000022309) Goat MODERN SPECIES 25 GK2 (ENSCHIG00000010705) NAA11 (ENSCHIG00000009560) PAQR3 (ENSCHIG00000013139) BMP2K (ENSCHIG00000017622) ANXA3 (ENSCHIG00000011590) ENSCHIG00000022327 FRAS1 (ENSCHIG00000024787) ENSCHIG00000011183 CNOT6L (ENSCHIG00000006297) ENSCHIG00000016915 ENSCHIG00000021974 CCNG2 (ENSCHIG00000002533) CCNI (ENSCHIG00000015282) SEPTIN11 (ENSCHIG00000021075) SOWAHB (ENSCHIG00000010690) ENSCHIG00000014894 #22 SHROOM3 (ENSCHIG00000021130) CCDC158 (ENSCHIG00000025634) STBD1 (ENSCHIG00000012021) ENSCHIG00000018331 FAM47E (ENSCHIG00000025302) ENSCHIG00000013809 NUP54 (ENSCHIG00000027258) CXCL11 (ENSCHIG00000017407) CXCL10 (ENSCHIG00000015403) CXCL9 (ENSCHIG00000021546) ART3 (ENSCHIG00000021462) SDAD1 (ENSCHIG00000006867) NAAA (ENSCHIG00000016109) PPEF2 (ENSCHIG00000024221) USO1 (ENSCHIG00000013930) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161308 ENSGT00940000159938 ENSGT00940000161457 ENSGT00940000161025 ENSGT00390000001859 ENSGT00940000154298.a.a.m.b ENSGT00940000156582 ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000156851 ENSGT00910000144296 ENSGT00910000147479.a.b ENSGT00390000004153 ENSGT00390000013474.a ENSGT00730000111135 ENSGT00940000162304 ENSGT00390000005254.i.a.b #22 ENSGT00390000000673.b ENSGT00940000155099 ENSGT00940000155436 ENSGT00940000161352 ENSGT00940000156075.a.a ENSGT01030000234646.B.a.a.b ENSGT00940000155353 ENSGT00940000160127 ENSGT00940000160029 ENSGT00940000157735 ENSGT00390000007069 ENSGT00940000155963 ENSGT00940000155442 ENSGT00950000183197.b.b ENSGT00390000012728 Ursus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161308 ENSGT00940000159938 ENSGT00940000161457 ENSGT00940000161025 ENSGT00390000001859 ENSGT00940000154298.a.a.m.b ENSGT00940000156582 ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000156851 ENSGT00910000144296 ENSGT00910000147479.a.b ENSGT00390000004153 ENSGT00390000013474.a ENSGT00730000111135 ENSGT00940000162304 ENSGT00390000005254.i.a.b #22 ENSGT00390000000673.b ENSGT00940000155099 ENSGT00940000155436 ENSGT00940000161352 ENSGT00940000156075.a.a ENSGT01030000234646.B.a.a.b ENSGT00940000155353 ENSGT00940000160127 ENSGT00940000160029 ENSGT00940000157735 ENSGT00390000007069 ENSGT00940000155963 ENSGT00940000155442 ENSGT00950000183197.b.b ENSGT00950000186354 American black bear MODERN SPECIES 2456 CIR1 (ENSUAMG00000025622) SP9 (ENSUAMG00000025621) ENSUAMG00000025620 ENSUAMG00000025619 #22 Polar bear MODERN SPECIES 142 MTX2 (ENSUMAG00000015662) HOXD4 (ENSUMAG00000015658) ENSUMAG00000015653 HOXD10 (ENSUMAG00000015650) ENSUMAG00000015649 LNPK (ENSUMAG00000015613) ATP5MC3 (ENSUMAG00000015579) ATF2 (ENSUMAG00000015564) CHN1 (ENSUMAG00000015511) CHRNA1 (ENSUMAG00000015480) ENSUMAG00000015473 ENSUMAG00000015461 GPR155 (ENSUMAG00000015425) SCRN3 (ENSUMAG00000015422) CIR1 (ENSUMAG00000015415) ENSUMAG00000015413 #22 OLA1 (ENSUMAG00000015410) SP3 (ENSUMAG00000015395) ENSUMAG00000015375 CDCA7 (ENSUMAG00000015367) ENSUMAG00000015337 RAPGEF4 (ENSUMAG00000015328) PDK1 (ENSUMAG00000015250) ITGA6 (ENSUMAG00000014604) DLX1 (ENSUMAG00000014510) METAP1D (ENSUMAG00000014498) HAT1 (ENSUMAG00000014469) SLC25A12 (ENSUMAG00000014456) DYNC1I2 (ENSUMAG00000014430) CYBRD1 (ENSUMAG00000014399) ENSUMAG00000014396 Giant Panda MODERN SPECIES 11 ENSAMEG00000025193 HOXD12 (ENSAMEG00000023609) HOXD13 (ENSAMEG00000001865) EVX2 (ENSAMEG00000001868) LNPK (ENSAMEG00000001869) ATP5MC3 (ENSAMEG00000012367) ATF2 (ENSAMEG00000012333) CHN1 (ENSAMEG00000012304) CHRNA1 (ENSAMEG00000012277) WIPF1 (ENSAMEG00000012269) ENSAMEG00000027164 GPR155 (ENSAMEG00000012251) SCRN3 (ENSAMEG00000012230) CIR1 (ENSAMEG00000012211) SP9 (ENSAMEG00000028382) ENSAMEG00000025792 #22 OLA1 (ENSAMEG00000012204) ENSAMEG00000024507 SP3 (ENSAMEG00000000258) ENSAMEG00000028241 ENSAMEG00000000267 ENSAMEG00000000282 RAPGEF4 (ENSAMEG00000000315) ENSAMEG00000001727 ITGA6 (ENSAMEG00000012952) ENSAMEG00000026488 DLX2 (ENSAMEG00000024570) DLX1 (ENSAMEG00000030721) METAP1D (ENSAMEG00000013042) HAT1 (ENSAMEG00000008488) SLC25A12 (ENSAMEG00000008505) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 American mink DUPLICATION American mink MODERN SPECIES 40 RFTN2 (ENSNVIG00000010521) PHOCN (ENSNVIG00000010530) ENSNVIG00000010568 ENSNVIG00000010575 COQ10B (ENSNVIG00000010606) SF3B1 (ENSNVIG00000010631) ANKRD44 (ENSNVIG00000010686) PGAP1 (ENSNVIG00000010723) C2orf66 (ENSNVIG00000010821) GTF3C3 (ENSNVIG00000010824) CCDC150 (ENSNVIG00000010849) HECW2 (ENSNVIG00000010922) ST17B (ENSNVIG00000011032) DNAH7 (ENSNVIG00000011056) SLC39A10 (ENSNVIG00000011150) ENSNVIG00000011199 #22 TMEFF2 (ENSNVIG00000011205) CAVIN2 (ENSNVIG00000011218) NABP1 (ENSNVIG00000011229) MYO1B (ENSNVIG00000011263) American mink MODERN SPECIES ENSNVIG00000006787 SYT16 (ENSNVIG00000006766) SNAPC1 (ENSNVIG00000006757) HIF1A (ENSNVIG00000006663) KPCL (ENSNVIG00000006557) TMEM30B (ENSNVIG00000006547) SLC38A6 (ENSNVIG00000006495) TRMT5 (ENSNVIG00000006473) MAT1 (ENSNVIG00000006449) SIX4 (ENSNVIG00000006443) SIX1 (ENSNVIG00000006437) SIX6 (ENSNVIG00000006422) C14orf39 (ENSNVIG00000006397) PPM1A (ENSNVIG00000006366) DHRS7 (ENSNVIG00000006325) ENSNVIG00000006318 #22 PCNX4 (ENSNVIG00000006277) LRRC9 (ENSNVIG00000006214) RTN1 (ENSNVIG00000006123) CCDC175 (ENSNVIG00000006070) JKAMP (ENSNVIG00000006023) L3HYPDH (ENSNVIG00000006003) GPR135 (ENSNVIG00000006000) DAAM1 (ENSNVIG00000005958) ENSNVIG00000005940 DACT1 (ENSNVIG00000005916) KIAA0586 (ENSNVIG00000005684) TIMM9 (ENSNVIG00000005646) TOMM20L (ENSNVIG00000005638) ARID4A (ENSNVIG00000005417) PSMA3 (ENSNVIG00000005285) Canidae DUPLICATION Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.i #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.i #22 Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 373 RNF222 (ENSCAFG00020006991) NDEL1 (ENSCAFG00020006983) MYH10 (ENSCAFG00020006977) CCDC42 (ENSCAFG00020006967) MFSD6L (ENSCAFG00020006964) PIK3R6 (ENSCAFG00020006951) PIK3R5 (ENSCAFG00020006765) NTN1 (ENSCAFG00020006735) ENSCAFG00020006714 CFAP52 (ENSCAFG00020006700) USP43 (ENSCAFG00020006641) DHRS7C (ENSCAFG00020006637) GLP2R (ENSCAFG00020006619) RCVRN (ENSCAFG00020006608) GAS7 (ENSCAFG00020006602) ENSCAFG00020006590 #22 MYH13 (ENSCAFG00020006005) ENSCAFG00020005978 MYH8 (ENSCAFG00020004818) ENSCAFG00020003702 MYH1 (ENSCAFG00020003220) ENSCAFG00020001841 ENSCAFG00020001535 SCO1 (ENSCAFG00020001530) ADPRM (ENSCAFG00020001525) TMEM220 (ENSCAFG00020001519) PIRT (ENSCAFG00020001513) DNAH9 (ENSCAFG00020001198) ZNF18 (ENSCAFG00020001141) MAP2K4 (ENSCAFG00020001091) ENSCAFG00020001071 Dingo MODERN SPECIES 398 MPP4 (ENSCAFG00020003035) ALS2 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(ENSCAFG00845030741) FZD7 (ENSCAFG00845030754) ENSCAFG00845015007 KIAA2012 (ENSCAFG00845015039) SUMO1 (ENSCAFG00845015246) NOP58 (ENSCAFG00845015320) BMPR2 (ENSCAFG00845015459) FAM117B (ENSCAFG00845015582) ICA1L (ENSCAFG00845015647) WDR12 (ENSCAFG00845015685) CARF (ENSCAFG00845015868) ENSCAFG00845016161 NBEAL1 (ENSCAFG00845016248) CYP20A1 (ENSCAFG00845016438) ENSCAFG00845016541 #22 ABI2 (ENSCAFG00845016661) ENSCAFG00845016782 ENSCAFG00845016818 RAPH1 (ENSCAFG00845017225) ENSCAFG00845017896 CD28 (ENSCAFG00845018097) CTLA4 (ENSCAFG00845018252) ICOS (ENSCAFG00845018403) PARD3B (ENSCAFG00845018916) NRP2 (ENSCAFG00845019968) INO80D (ENSCAFG00845020375) NDUFS1 (ENSCAFG00845020511) EEF1B2 (ENSCAFG00845020822) GPR1 (ENSCAFG00845020895) ZDBF2 (ENSCAFG00845020911) Dog MODERN SPECIES 33 NATD1 (ENSCAFG00845026261) TMEM11 (ENSCAFG00845026180) ENSCAFG00845025849 ENSCAFG00845025581 TNFRSF13B (ENSCAFG00845025488) MPRIP (ENSCAFG00845024946) PLD6 (ENSCAFG00845024817) FLCN (ENSCAFG00845024691) COPS3 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ENSVVUG00000008710 #22 ENSVVUG00000008707 ENSVVUG00000008702 ENSVVUG00000008688 ZFC3H1 (ENSVVUG00000008655) THAP2 (ENSVVUG00000008651) TMEM19 (ENSVVUG00000008629) TBC1D15 (ENSVVUG00000008586) ENSVVUG00000008565 ENSVVUG00000008561 TPH2 (ENSVVUG00000008519) TRHDE (ENSVVUG00000008252) ENSVVUG00000008215 ENSVVUG00000008213 ATXN7L3B (ENSVVUG00000008201) ENSVVUG00000008182 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.j.b #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155415 ENSGT00390000006670 ENSGT01100000263545.a.b.c.a ENSGT00940000155911.s ENSGT00940000162902 ENSGT00940000156443 ENSGT00390000017324 ENSGT00940000156419 ENSGT00940000155455 ENSGT00530000063817.b ENSGT00390000013899.a.a ENSGT00390000014700.a ENSGT01050000244879.b.a.b.a ENSGT00950000183132.A ENSGT00940000157835 ENSGT00390000005254.i.a.b.j.b #22 ENSGT00390000015968 ENSGT00940000157255 ENSGT00390000000153.l.a.eb ENSGT00610000087444 ENSGT00940000167128 ENSGT00950000185154 ENSGT00940000158319 ENSGT00390000002524 ENSGT00940000158018 ENSGT00390000000376 ENSGT00950000183042.a.b ENSGT00940000159167 ENSGT00940000160180 ENSGT00940000165197 ENSGT00950000183003.a.a.b Dog MODERN SPECIES 1 TIMP3 (ENSCAFG00845010998) FBXO7 (ENSCAFG00845011055) BPIFC (ENSCAFG00845011126) ENSCAFG00845011277 ENSCAFG00845011320 PRDM4 (ENSCAFG00845011355) PWP1 (ENSCAFG00845011494) BTBD11 (ENSCAFG00845011667) CRY1 (ENSCAFG00845012163) MTERF2 (ENSCAFG00845012213) TMEM263 (ENSCAFG00845012231) RIC8B (ENSCAFG00845012335) RFX4 (ENSCAFG00845012620) POLR3B (ENSCAFG00845013006) TCP11L2 (ENSCAFG00845013102) ENSCAFG00845013150 #22 CKAP4 (ENSCAFG00845013172) NUAK1 (ENSCAFG00845005700) ENSCAFG00845005724 ENSCAFG00845005795 ENSCAFG00845005863 APPL2 (ENSCAFG00845005921) WASHC4 (ENSCAFG00845006021) ALDH1L2 (ENSCAFG00845006151) NOPCHAP1 (ENSCAFG00845006255) SLC41A2 (ENSCAFG00845006325) CHST11 (ENSCAFG00845006468) TXNRD1 (ENSCAFG00845006566) ENSCAFG00845006675 SEPTIN10 (ENSCAFG00845006721) SH3RF3 (ENSCAFG00845006868) Dingo MODERN SPECIES 307 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MYO5A (ENSPLOG00000003030) leopard MODERN SPECIES 7 LIPC (ENSPPRG00000010248) ALDH1A2 (ENSPPRG00000009754) AQP9 (ENSPPRG00000008797) ENSPPRG00000008593 ENSPPRG00000008155 MYZAP (ENSPPRG00000008038) CGNL1 (ENSPPRG00000007520) ENSPPRG00000007010 TCF12 (ENSPPRG00000006795) ENSPPRG00000004158 ZNF280D (ENSPPRG00000003905) MNS1 (ENSPPRG00000003500) TEX9 (ENSPPRG00000003149) RFX7 (ENSPPRG00000002232) NEDD4 (ENSPPRG00000001102) ENSPPRG00000023548 #22 PRTG (ENSPPRG00000023644) PYGO1 (ENSPPRG00000023789) DNAAF4 (ENSPPRG00000023889) PIERCE2 (ENSPPRG00000023926) CCPG1 (ENSPPRG00000023996) PIGB (ENSPPRG00000021881) PIGBOS1 (ENSPPRG00000021706) RAB27A (ENSPPRG00000016973) RSL24D1 (ENSPPRG00000016099) UNC13C (ENSPPRG00000015908) ENSPPRG00000014802 ENSPPRG00000014379 ENSPPRG00000014219 WDR72 (ENSPPRG00000014044) ENSPPRG00000012958 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.k.b #22 leopard MODERN SPECIES 15 FSTL1 (ENSPPRG00000000812) ENSPPRG00000017598 HGD (ENSPPRG00000017055) RABL3 (ENSPPRG00000016325) GTF2E1 (ENSPPRG00000015486) STXBP5L (ENSPPRG00000014151) POLQ (ENSPPRG00000007014) FBXO40 (ENSPPRG00000005750) HCLS1 (ENSPPRG00000005291) GOLGB1 (ENSPPRG00000003483) IQCB1 (ENSPPRG00000002414) EAF2 (ENSPPRG00000001483) SLC15A2 (ENSPPRG00000000860) ILDR1 (ENSPPRG00000019114) CD86 (ENSPPRG00000016126) ENSPPRG00000015375 #22 CASR (ENSPPRG00000014081) CSTA (ENSPPRG00000012891) MIX23 (ENSPPRG00000012735) FAM162A (ENSPPRG00000011296) WDR5B (ENSPPRG00000018618) KPNA1 (ENSPPRG00000010308) PARP9 (ENSPPRG00000009678) DTX3L (ENSPPRG00000006373) PARP15 (ENSPPRG00000005753) PARP14 (ENSPPRG00000002799) HSPBAP1 (ENSPPRG00000002258) SLC49A4 (ENSPPRG00000002012) SEMA5B (ENSPPRG00000001265) PDIA5 (ENSPPRG00000016643) SEC22A (ENSPPRG00000014133) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.l #22 leopard MODERN SPECIES 20 SEMA3A (ENSPPRG00000004246) ENSPPRG00000017150 #22 SEMA3E (ENSPPRG00000007025) ENSPPRG00000007553 ENSPPRG00000007922 CACNA2D1 (ENSPPRG00000011796) HGF (ENSPPRG00000018072) ENSPPRG00000019518 SEMA3C (ENSPPRG00000024414) CD36 (ENSPPRG00000000567) GNAT3 (ENSPPRG00000000974) GNAI1 (ENSPPRG00000001682) MAGI2 (ENSPPRG00000005759) PHTF2 (ENSPPRG00000012229) TMEM60 (ENSPPRG00000017983) RSBN1L (ENSPPRG00000013312) ENSPPRG00000013705 lion MODERN SPECIES 487 ENSPLOG00000017280 ENSPLOG00000017353 #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Equus ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000185696 ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000153298.n.q.g.a ENSGT00580000082664.a.a ENSGT00940000160335 ENSGT00940000155282 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155466 ENSGT00940000167666 ENSGT00390000005285 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016484 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000005254.i.a.b #22 ENSGT00390000018393 ENSGT00940000155367 ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00530000063609.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063480.a ENSGT00940000158407 ENSGT00390000008096.B ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000005550 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000004145 ENSGT00390000001138.b Horse MODERN SPECIES 9 TMEFF2 (ENSECAG00000020863) ENSECAG00000049056 ENSECAG00000003944 ENSECAG00000053879 ENSECAG00000059223 SLC39A10 (ENSECAG00000006518) DNAH7 (ENSECAG00000009699) STK17B (ENSECAG00000000520) HECW2 (ENSECAG00000000544) ENSECAG00000047100 CCDC150 (ENSECAG00000010941) GTF3C3 (ENSECAG00000014763) C2orf66 (ENSECAG00000058124) PGAP1 (ENSECAG00000019980) ANKRD44 (ENSECAG00000008835) ENSECAG00000034847 #22 SF3B1 (ENSECAG00000021657) COQ10B (ENSECAG00000006436) HSPD1 (ENSECAG00000008968) ENSECAG00000049872 ENSECAG00000055696 MOB4 (ENSECAG00000015560) RFTN2 (ENSECAG00000021296) MARS2 (ENSECAG00000004931) PLCL1 (ENSECAG00000007274) BOLL (ENSECAG00000040654) ENSECAG00000058569 SATB2 (ENSECAG00000010043) ENSECAG00000013663 C18H2orf69 (ENSECAG00000014107) TYW5 (ENSECAG00000014128) Donkey MODERN SPECIES 24 NABP1 (ENSEASG00005020861) ENSEASG00005023585 CAVIN2 (ENSEASG00005027165) ENSEASG00005020854 ENSEASG00005029879 ENSEASG00005025902 SLC39A10 (ENSEASG00005020825) DNAH7 (ENSEASG00005020795) STK17B (ENSEASG00005020775) HECW2 (ENSEASG00005020398) CCDC150 (ENSEASG00005020257) GTF3C3 (ENSEASG00005020250) C2orf66 (ENSEASG00005029887) PGAP1 (ENSEASG00005020202) ANKRD44 (ENSEASG00005020169) ENSEASG00005020167 #22 SF3B1 (ENSEASG00005020159) COQ10B (ENSEASG00005032559) ENSEASG00005020152 HSPE1 (ENSEASG00005034821) MOB4 (ENSEASG00005020142) RFTN2 (ENSEASG00005020136) MARS2 (ENSEASG00005020133) BOLL (ENSEASG00005020122) ENSEASG00005020114 PLCL1 (ENSEASG00005020113) ENSEASG00005029514 ENSEASG00005020080 C2orf69 (ENSEASG00005031146) TYW5 (ENSEASG00005026976) MAIP1 (ENSEASG00005020067) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 8 CCR3 (ENSRFEG00010016949) CCR2 (ENSRFEG00010016924) CCR5 (ENSRFEG00010016913) CCRL2 (ENSRFEG00010016890) LTF (ENSRFEG00010016815) ENSRFEG00010016720 LRRC2 (ENSRFEG00010016672) ENSRFEG00010016488 FAM240A (ENSRFEG00010016371) ALS2CL (ENSRFEG00010016314) TMIE (ENSRFEG00010016254) PRSS50 (ENSRFEG00010016152) ENSRFEG00010016015 ENSRFEG00010015985 ENSRFEG00010015837 ENSRFEG00010015785 #22 PTH1R (ENSRFEG00010015528) MYL3 (ENSRFEG00010015295) NBEAL2 (ENSRFEG00010011711) ENSRFEG00010011613 SETD2 (ENSRFEG00010011221) KIF9 (ENSRFEG00010011015) KLHL18 (ENSRFEG00010010955) ENSRFEG00010010917 PTPN23 (ENSRFEG00010010849) SCAP (ENSRFEG00010010753) ELP6 (ENSRFEG00010010670) CSPG5 (ENSRFEG00010010552) SMARCC1 (ENSRFEG00010010455) DHX30 (ENSRFEG00010010331) ENSRFEG00010010277 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 64 SEC31A (ENSPSMG00000019006) THAP9 (ENSPSMG00000018581) LIN54 (ENSPSMG00000018520) COPS4 (ENSPSMG00000018382) PLAC8 (ENSPSMG00000018310) ENSPSMG00000018300 COQ2 (ENSPSMG00000018286) HPSE (ENSPSMG00000018251) HELQ (ENSPSMG00000018202) MRPS18C (ENSPSMG00000018158) ABRAXAS1 (ENSPSMG00000018130) GPAT3 (ENSPSMG00000018113) NKX6-1 (ENSPSMG00000018100) CDS1 (ENSPSMG00000018082) WDFY3 (ENSPSMG00000018028) ENSPSMG00000017913 #22 ARHGAP24 (ENSPSMG00000017866) ENSPSMG00000017824 MAPK10 (ENSPSMG00000017774) PTPN13 (ENSPSMG00000017328) SLC10A6 (ENSPSMG00000016898) C4orf36 (ENSPSMG00000016893) AFF1 (ENSPSMG00000016833) KLHL8 (ENSPSMG00000016695) HSD17B13 (ENSPSMG00000016633) HSD17B11 (ENSPSMG00000016611) NUDT9 (ENSPSMG00000016567) SPARCL1 (ENSPSMG00000016553) DSPP (ENSPSMG00000016539) DMP1 (ENSPSMG00000016501) IBSP (ENSPSMG00000016491) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Tarsier MODERN SPECIES 1679 CYP2A13 (ENSTSYG00000027333) ENSTSYG00000035918 CYP2S1 (ENSTSYG00000002442) AXL (ENSTSYG00000029162) ENSTSYG00000025588 #22 HNRNPUL1 (ENSTSYG00000004534) CCDC97 (ENSTSYG00000032888) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.m #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.m #22 Homo/Pan/Gorilla group DUPLICATION Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000010337.A ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a ENSGT00910000148209 ENSGT00940000163379 ENSGT00940000164046 ENSGT00910000147852 ENSGT00940000162851 ENSGT00940000162449 ENSGT00940000163298 ENSGT00940000162748.f ENSGT00940000163119 ENSGT00940000164553 ENSGT00940000155131.i.a ENSGT00940000164749 ENSGT00390000005254.i.a.b.m.a #22 ENSGT00940000164568 ENSGT00950000183066.a.a.a ENSGT00940000165090 ENSGT00940000163746.a.a ENSGT00940000163746.a.b ENSGT00940000163013.b.a ENSGT00940000163013.b.b ENSGT00940000165725 ENSGT00940000154397.b.c.b.a.a.b ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b.d ENSGT00940000154397.b.c.a.b.a.a ENSGT00940000154397.a ENSGT00940000163013.a ENSGT00940000154397.b.c.b.a.b.c ENSGT00940000164431 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000009010 ENSGT00390000010337.A ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a ENSGT00910000148209 ENSGT00940000163379 ENSGT00940000164046 ENSGT00940000162851 ENSGT00940000162449 ENSGT00940000163298 ENSGT00940000162748.f ENSGT00940000163119 ENSGT00940000164553 ENSGT00940000155131.i.a ENSGT00940000164749 ENSGT00390000005254.i.a.b.m.a #22 ENSGT00940000164568 ENSGT00950000183066.a.a.a ENSGT00940000165090 ENSGT00940000163746.a.a ENSGT00940000163746.a.b ENSGT00940000163013.b.a ENSGT00940000163013.b.b ENSGT00940000165725 ENSGT00940000154397.b.c.b.a.a.b ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b.d ENSGT00940000154397.b.c.a.b.a.a ENSGT00940000154397.a ENSGT00940000154397.b.c.b.a.b.c ENSGT00940000164431 ENSGT00940000165246 Pan ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000009010 ENSGT00390000010337.A ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.b ENSGT01020000230438.B.b.b.b.c.a ENSGT00910000148209 ENSGT00940000163379 ENSGT00940000164046 ENSGT00940000162851 ENSGT00940000162449 ENSGT00940000163298 ENSGT00940000162748.f ENSGT00940000163119 ENSGT00940000164553 ENSGT00940000155131.i.a ENSGT00940000164749 ENSGT00390000005254.i.a.b.m.a #22 ENSGT00940000164568 ENSGT00950000183066.a.a.a ENSGT00940000165090 ENSGT00940000163746.a.a ENSGT00940000163746.a.b ENSGT00940000163013.b.a ENSGT00940000163013.b.b ENSGT00940000165725 ENSGT00940000154397.b.c.b.a.a.b ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b.d ENSGT00940000154397.b.c.a.b.a.a ENSGT00940000154397.a ENSGT00940000154397.b.c.b.a.b.c ENSGT00940000154397.b.c.b.a.a.a ENSGT00940000164431 Bonobo MODERN SPECIES 10 SPACA6 (ENSPPAG00000042668) HAS1 (ENSPPAG00000037352) FPR1 (ENSPPAG00000020189) FPR3 (ENSPPAG00000005403) ENSPPAG00000030462 ZNF577 (ENSPPAG00000034514) ZNF649 (ENSPPAG00000027177) ZNF613 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TBX10 (ENSPPAG00000030171) NUDT8 (ENSPPAG00000043158) NDUFV1 (ENSPPAG00000043544) GSTP1 (ENSPPAG00000043169) ENSPPAG00000043180 CDK2AP2 (ENSPPAG00000043090) PITPNM1 (ENSPPAG00000044125) AIP (ENSPPAG00000026775) TMEM134 (ENSPPAG00000038698) CABP4 (ENSPPAG00000031081) GPR152 (ENSPPAG00000008770) CORO1B (ENSPPAG00000030008) PTPRCAP (ENSPPAG00000044074) Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000155263.v ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00390000011782 ENSGT00390000018056 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 ENSGT00950000183149.A ENSGT00390000005254.i.a.b.n.a #22 ENSGT00940000160216 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00940000154502.g.b.a ENSGT00940000155059.e ENSGT00910000147347 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000155263.v ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00390000011782 ENSGT00390000018056 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 ENSGT00950000183149.A ENSGT00390000005254.i.a.b.n.a #22 ENSGT00940000160216 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00940000154502.g.b.a ENSGT00940000155059.e ENSGT00910000147347 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000158863 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000159947 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.n.a #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.n.a #22 Pan ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156694 ENSGT00390000015600.c.a.f.c.b ENSGT00940000154242.b ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000155263.v ENSGT00390000011782 ENSGT00390000018056 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000155238.k.b ENSGT00390000005254.i.a.b.n.a #22 ENSGT00940000160216 ENSGT00910000148739 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00520000055567.a.a.b.c.a ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00940000154502.h ENSGT00940000155059.e ENSGT00910000147347 ENSGT00940000159497 ENSGT00950000183913 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000153649.A Chimpanzee MODERN SPECIES 21 ENSPTRG00000044364 SOX17 (ENSPTRG00000020254) RP1 (ENSPTRG00000020256) XKR4 (ENSPTRG00000020257) ENSPTRG00000047768 TMEM68 (ENSPTRG00000020261) TGS1 (ENSPTRG00000020262) LYN (ENSPTRG00000020263) RPS20 (ENSPTRG00000020264) MOS (ENSPTRG00000020265) PLAG1 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(ENSPPYG00000018622) NKAIN3 (ENSPPYG00000018623) GGH (ENSPPYG00000018624) Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 6 MRPL15 (ENSNLEG00000029566) SOX17 (ENSNLEG00000001085) ENSNLEG00000032778 ENSNLEG00000001087 ENSNLEG00000001093 TMEM68 (ENSNLEG00000001094) TGS1 (ENSNLEG00000001101) LYN (ENSNLEG00000001140) ENSNLEG00000001213 ENSNLEG00000001214 MOS (ENSNLEG00000018389) PLAG1 (ENSNLEG00000031521) ENSNLEG00000001238 SDR16C5 (ENSNLEG00000001266) PENK (ENSNLEG00000001307) ENSNLEG00000029194 #22 BPNT2 (ENSNLEG00000001322) UBXN2B (ENSNLEG00000033129) ENSNLEG00000034722 CYP7A1 (ENSNLEG00000001373) SDCBP (ENSNLEG00000001408) NSMAF (ENSNLEG00000001542) ENSNLEG00000032927 ENSNLEG00000035613 TOX (ENSNLEG00000001791) CA8 (ENSNLEG00000001830) ENSNLEG00000029912 RAB2A (ENSNLEG00000036148) CHD7 (ENSNLEG00000002027) ENSNLEG00000033557 ENSNLEG00000035467 Gibbon MODERN SPECIES 8 VSTM4 (ENSNLEG00000015788) FAM170B (ENSNLEG00000015797) ENSNLEG00000028739 C10orf71 (ENSNLEG00000015798) DRGX (ENSNLEG00000035839) ERCC6 (ENSNLEG00000015807) CHAT (ENSNLEG00000015852) ENSNLEG00000015910 ENSNLEG00000031155 OGDHL (ENSNLEG00000026732) PARG (ENSNLEG00000015917) TIMM23 (ENSNLEG00000015985) NCOA4 (ENSNLEG00000035317) MSMB (ENSNLEG00000016023) ENSNLEG00000016026 ENSNLEG00000032674 #22 ENSNLEG00000033451 ENSNLEG00000015776 ENSNLEG00000015778 ANKRD30BL (ENSNLEG00000015783) ENSNLEG00000015790 BMS1 (ENSNLEG00000015791) RET (ENSNLEG00000015820) CSGALNACT2 (ENSNLEG00000015866) RASGEF1A (ENSNLEG00000015884) FXYD4 (ENSNLEG00000035436) HNRNPF (ENSNLEG00000019098) ENSNLEG00000029427 ZNF239 (ENSNLEG00000015896) ENSNLEG00000034314 ZNF485 (ENSNLEG00000015899) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.n.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.n.b #22 Orangutan MODERN SPECIES 17 RFC1 (ENSPPYG00000014673) KLB (ENSPPYG00000014674) ENSPPYG00000014675 LIAS (ENSPPYG00000014676) UGDH (ENSPPYG00000014677) SMIM14 (ENSPPYG00000014678) UBE2K (ENSPPYG00000030577) ENSPPYG00000040313 PDS5A (ENSPPYG00000014682) ENSPPYG00000014684 N4BP2 (ENSPPYG00000014686) RHOH (ENSPPYG00000014687) ENSPPYG00000030777 CHRNA9 (ENSPPYG00000015291) RBM47 (ENSPPYG00000040899) ENSPPYG00000036617 #22 NSUN7 (ENSPPYG00000014689) APBB2 (ENSPPYG00000014690) ENSPPYG00000035163 ENSPPYG00000014691 LIMCH1 (ENSPPYG00000014692) PHOX2B (ENSPPYG00000014693) TMEM33 (ENSPPYG00000014694) DCAF4L1 (ENSPPYG00000014695) SLC30A9 (ENSPPYG00000014696) BEND4 (ENSPPYG00000014697) SHISA3 (ENSPPYG00000014698) ATP8A1 (ENSPPYG00000014699) GRXCR1 (ENSPPYG00000014700) KCTD8 (ENSPPYG00000014701) YIPF7 (ENSPPYG00000038685) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.o.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.o.a #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.o.a #22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 15 RRH (ENSMFAG00000006731) GAR1 (ENSMFAG00000024592) CFI (ENSMFAG00000032258) CASP6 (ENSMFAG00000034038) MCUB (ENSMFAG00000031082) SEC24B (ENSMFAG00000038799) ENSMFAG00000031126 ENSMFAG00000060894 COL25A1 (ENSMFAG00000031895) ENSMFAG00000062873 ETNPPL (ENSMFAG00000031575) ENSMFAG00000034553 ENSMFAG00000034368 ENSMFAG00000062885 LEF1 (ENSMFAG00000037201) ENSMFAG00000002923 #22 HADH (ENSMFAG00000033488) CYP2U1 (ENSMFAG00000003841) SGMS2 (ENSMFAG00000041579) PAPSS1 (ENSMFAG00000032785) ENSMFAG00000003949 ENSMFAG00000054818 DKK2 (ENSMFAG00000032422) GIMD1 (ENSMFAG00000007005) AIMP1 (ENSMFAG00000044822) TBCK (ENSMFAG00000034054) NPNT (ENSMFAG00000045955) GSTCD (ENSMFAG00000000581) INTS12 (ENSMFAG00000042815) ARHGEF38 (ENSMFAG00000041172) PPA2 (ENSMFAG00000040113) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.o.a #22 Olive baboon MODERN SPECIES 18 CPNE3 (ENSPANG00000011828) RMDN1 (ENSPANG00000011829) WWP1 (ENSPANG00000019676) SLC7A13 (ENSPANG00000009669) ATP6V0D2 (ENSPANG00000022220) PSKH2 (ENSPANG00000008746) ENSPANG00000034225 CA2 (ENSPANG00000017180) CA3 (ENSPANG00000040364) CA1 (ENSPANG00000019035) CA13 (ENSPANG00000047659) RBIS (ENSPANG00000021683) E2F5 (ENSPANG00000014637) LRRCC1 (ENSPANG00000005748) RALYL (ENSPANG00000029305) ENSPANG00000029827 #22 SNX16 (ENSPANG00000021915) CHMP4C (ENSPANG00000021865) ZFAND1 (ENSPANG00000000979) SLC10A5 (ENSPANG00000019392) IMPA1 (ENSPANG00000015217) ENSPANG00000015930 ENSPANG00000038117 FABP9 (ENSPANG00000033863) PMP2 (ENSPANG00000014642) ENSPANG00000021943 PAG1 (ENSPANG00000010440) ENSPANG00000038368 ZNF704 (ENSPANG00000026084) ZBTB10 (ENSPANG00000034587) ENSPANG00000040884 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.o.b #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.o.b #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.o.b #22 Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES 10 ZNF567 (ENSMFAG00000000930) ZNF382 (ENSMFAG00000043559) ZNF529 (ENSMFAG00000039375) ZNF260 (ENSMFAG00000056037) ZNF461 (ENSMFAG00000001612) ENSMFAG00000050600 ZFP82 (ENSMFAG00000022094) ZFP14 (ENSMFAG00000037861) ZNF146 (ENSMFAG00000063538) ZNF565 (ENSMFAG00000050344) COX7A1 (ENSMFAG00000037973) ENSMFAG00000007624 TBCB (ENSMFAG00000041556) POLR2I (ENSMFAG00000039443) OVOL3 (ENSMFAG00000038638) ENSMFAG00000001318 #22 WDR62 (ENSMFAG00000045599) THAP8 (ENSMFAG00000030838) ENSMFAG00000058452 ENSMFAG00000044096 ALKBH6 (ENSMFAG00000042361) SYNE4 (ENSMFAG00000040369) SDHAF1 (ENSMFAG00000015193) ENSMFAG00000058987 ENSMFAG00000055104 ENSMFAG00000039856 HCST (ENSMFAG00000037963) APLP1 (ENSMFAG00000038687) NFKBID (ENSMFAG00000036666) KIRREL2 (ENSMFAG00000032870) NPHS1 (ENSMFAG00000042644) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 1 MROH8 (ENSMFAG00000041031) RBL1 (ENSMFAG00000030714) ENSMFAG00000056553 SAMHD1 (ENSMFAG00000036597) TLDC2 (ENSMFAG00000038882) SOGA1 (ENSMFAG00000032873) MYL9 (ENSMFAG00000000687) ENSMFAG00000052977 DLGAP4 (ENSMFAG00000032148) AAR2 (ENSMFAG00000030564) EPB41L1 (ENSMFAG00000039873) ENSMFAG00000050258 CNBD2 (ENSMFAG00000044530) SCAND1 (ENSMFAG00000058122) PHF20 (ENSMFAG00000044861) ENSMFAG00000001821 #22 ENSMFAG00000042593 ROMO1 (ENSMFAG00000045983) NFS1 (ENSMFAG00000045105) SPAG4 (ENSMFAG00000033014) RBM12 (ENSMFAG00000032583) ERGIC3 (ENSMFAG00000037850) C20orf173 (ENSMFAG00000040638) ENSMFAG00000051683 GDF5 (ENSMFAG00000037058) FAM83C (ENSMFAG00000038878) EIF6 (ENSMFAG00000031657) UQCC1 (ENSMFAG00000034648) MMP24 (ENSMFAG00000043972) PROCR (ENSMFAG00000003141) EDEM2 (ENSMFAG00000002746) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.o.b #22 Olive baboon MODERN SPECIES 16 TRAM2 (ENSPANG00000005247) TMEM14A (ENSPANG00000045952) GSTA3 (ENSPANG00000017005) GSTA1 (ENSPANG00000046442) GSTA4 (ENSPANG00000007356) CILK1 (ENSPANG00000016921) FBXO9 (ENSPANG00000015587) GCM1 (ENSPANG00000037213) ENSPANG00000038301 ENSPANG00000042447 ENSPANG00000039030 ELOVL5 (ENSPANG00000013429) ENSPANG00000041153 ENSPANG00000037335 GCLC (ENSPANG00000016920) ENSPANG00000030362 #22 ENSPANG00000039927 KLHL31 (ENSPANG00000005758) ENSPANG00000051191 LRRC1 (ENSPANG00000005018) MLIP (ENSPANG00000011495) ENSPANG00000040964 TINAG (ENSPANG00000017090) ENSPANG00000040600 HCRTR2 (ENSPANG00000017773) GFRAL (ENSPANG00000008942) HMGCLL1 (ENSPANG00000000755) BMP5 (ENSPANG00000033450) COL21A1 (ENSPANG00000015183) DST (ENSPANG00000016027) BEND6 (ENSPANG00000011220) Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.p.a.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157814 ENSGT00940000158418 ENSGT00940000153232.a.a ENSGT00390000006729 ENSGT00940000158766 ENSGT00390000015483 ENSGT00940000161953 ENSGT00720000108851 ENSGT00940000158754 ENSGT00940000159040 ENSGT00950000183067.a.b.b ENSGT00950000182850.a.a ENSGT00950000182936.a.b.a ENSGT00940000158962 ENSGT00940000155790 ENSGT00390000005254.i.a.b.p.a.a #22 ENSGT00940000155560 ENSGT00390000005203 ENSGT00940000163197 ENSGT00940000160632.d ENSGT00940000162375 ENSGT00940000155139 ENSGT00390000017460 ENSGT00940000154551 ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000157425.B Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.p.a.a #22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 19 ENSMFAG00000061496 HABP2 (ENSMFAG00000037647) NRAP (ENSMFAG00000001231) CASP7 (ENSMFAG00000045136) DCLRE1A (ENSMFAG00000040983) PLEKHS1 (ENSMFAG00000001676) NHLRC2 (ENSMFAG00000038268) CCDC186 (ENSMFAG00000031702) TDRD1 (ENSMFAG00000043487) VWA2 (ENSMFAG00000022092) ABLIM1 (ENSMFAG00000046222) FHIP2A (ENSMFAG00000045717) TRUB1 (ENSMFAG00000062394) ATRNL1 (ENSMFAG00000003582) ENSMFAG00000048224 ENSMFAG00000036454 #22 GFRA1 (ENSMFAG00000001953) CCDC172 (ENSMFAG00000039541) PNLIPRP3 (ENSMFAG00000030751) PNLIP (ENSMFAG00000002362) PNLIPRP1 (ENSMFAG00000039844) PNLIPRP2 (ENSMFAG00000000722) C10orf82 (ENSMFAG00000031805) HSPA12A (ENSMFAG00000034502) ENO4 (ENSMFAG00000038492) SHTN1 (ENSMFAG00000042541) ENSMFAG00000048457 VAX1 (ENSMFAG00000044674) KCNK18 (ENSMFAG00000045802) SLC18A2 (ENSMFAG00000031383) PDZD8 (ENSMFAG00000037170) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 90 NRAP (ENSMNEG00000035727) CASP7 (ENSMNEG00000036337) PLEKHS1 (ENSMNEG00000041368) DCLRE1A (ENSMNEG00000025715) NHLRC2 (ENSMNEG00000039100) ADRB1 (ENSMNEG00000012630) CCDC186 (ENSMNEG00000028671) TDRD1 (ENSMNEG00000031108) AFAP1L2 (ENSMNEG00000044504) ENSMNEG00000002846 ENSMNEG00000036938 ABLIM1 (ENSMNEG00000030952) FHIP2A (ENSMNEG00000041076) TRUB1 (ENSMNEG00000044646) ATRNL1 (ENSMNEG00000039610) ENSMNEG00000038395 #22 GFRA1 (ENSMNEG00000042286) CCDC172 (ENSMNEG00000032123) PNLIPRP3 (ENSMNEG00000002816) PNLIP (ENSMNEG00000038735) PNLIPRP1 (ENSMNEG00000044722) PNLIPRP2 (ENSMNEG00000042883) C10orf82 (ENSMNEG00000031041) HSPA12A (ENSMNEG00000035966) ENO4 (ENSMNEG00000038465) SHTN1 (ENSMNEG00000023707) VAX1 (ENSMNEG00000042756) KCNK18 (ENSMNEG00000037673) SLC18A2 (ENSMNEG00000008691) PDZD8 (ENSMNEG00000045026) EMX2 (ENSMNEG00000027592) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.p.a.a #22 Olive baboon MODERN SPECIES 2 NRAP (ENSPANG00000020790) CASP7 (ENSPANG00000020745) PLEKHS1 (ENSPANG00000020746) DCLRE1A (ENSPANG00000020747) NHLRC2 (ENSPANG00000020749) ADRB1 (ENSPANG00000017618) CCDC186 (ENSPANG00000020751) TDRD1 (ENSPANG00000020752) VWA2 (ENSPANG00000020743) AFAP1L2 (ENSPANG00000020708) ABLIM1 (ENSPANG00000020709) FHIP2A (ENSPANG00000020711) TRUB1 (ENSPANG00000020712) ENSPANG00000045420 ATRNL1 (ENSPANG00000020713) ENSPANG00000044591 #22 ENSPANG00000051370 GFRA1 (ENSPANG00000020715) CCDC172 (ENSPANG00000020716) PNLIPRP3 (ENSPANG00000020717) PNLIP (ENSPANG00000020718) PNLIPRP1 (ENSPANG00000020719) PNLIPRP2 (ENSPANG00000020721) C10orf82 (ENSPANG00000020741) HSPA12A (ENSPANG00000020739) ENO4 (ENSPANG00000020737) SHTN1 (ENSPANG00000020735) ENSPANG00000047135 VAX1 (ENSPANG00000020704) KCNK18 (ENSPANG00000020705) SLC18A2 (ENSPANG00000020706) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.p.a.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.p.a.b #22 Olive baboon MODERN SPECIES 3 B3GAT1 (ENSPANG00000039627) GLB1L3 (ENSPANG00000013777) ACAD8 (ENSPANG00000002732) THYN1 (ENSPANG00000014430) VPS26B (ENSPANG00000010630) NCAPD3 (ENSPANG00000011703) JAM3 (ENSPANG00000006329) IGSF9B (ENSPANG00000001817) SPATA19 (ENSPANG00000012104) OPCML (ENSPANG00000011046) NTM (ENSPANG00000004917) ENSPANG00000050437 #22 ENSPANG00000044106 SNX19 (ENSPANG00000013779) ENSPANG00000042127 ADAMTS15 (ENSPANG00000004682) ADAMTS8 (ENSPANG00000004946) ZBTB44 (ENSPANG00000017978) ST14 (ENSPANG00000001818) APLP2 (ENSPANG00000013780) ENSPANG00000046393 ENSPANG00000040253 PRDM10 (ENSPANG00000017470) NFRKB (ENSPANG00000005706) TMEM45B (ENSPANG00000013781) BARX2 (ENSPANG00000019449) ARHGAP32 (ENSPANG00000003086) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.p.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.p.b #22 Olive baboon MODERN SPECIES 792 ENSPANG00000051062 ENSPANG00000013476 EDA (ENSPANG00000031419) ENSPANG00000045845 ENSPANG00000012946 DGAT2L6 (ENSPANG00000001814) AWAT1 (ENSPANG00000005317) P2RY4 (ENSPANG00000023783) ARR3 (ENSPANG00000008091) RAB41 (ENSPANG00000007317) PDZD11 (ENSPANG00000003830) ENSPANG00000034433 KIF4A (ENSPANG00000009949) GDPD2 (ENSPANG00000001063) DLG3 (ENSPANG00000010097) ENSPANG00000044424 #22 ENSPANG00000049739 TEX11 (ENSPANG00000009217) SLC7A3 (ENSPANG00000019289) SNX12 (ENSPANG00000024513) ENSPANG00000045699 FOXO4 (ENSPANG00000026427) IL2RG (ENSPANG00000010096) MED12 (ENSPANG00000002788) NLGN3 (ENSPANG00000015903) GJB1 (ENSPANG00000007805) ITGB1BP2 (ENSPANG00000011696) NONO (ENSPANG00000013979) ZMYM3 (ENSPANG00000008073) ENSPANG00000023326 TAF1 (ENSPANG00000023870) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.p.b #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.p.b #22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 175 EDA (ENSMFAG00000042139) ENSMFAG00000037756 AWAT2 (ENSMFAG00000003948) ENSMFAG00000037720 DGAT2L6 (ENSMFAG00000034189) AWAT1 (ENSMFAG00000030435) ARR3 (ENSMFAG00000001019) RAB41 (ENSMFAG00000000762) PDZD11 (ENSMFAG00000038177) KIF4A (ENSMFAG00000037167) ENSMFAG00000038868 GDPD2 (ENSMFAG00000037742) DLG3 (ENSMFAG00000036638) TEX11 (ENSMFAG00000037625) ENSMFAG00000049127 ENSMFAG00000000899 #22 SLC7A3 (ENSMFAG00000002533) SNX12 (ENSMFAG00000033920) FOXO4 (ENSMFAG00000043151) IL2RG (ENSMFAG00000043570) MED12 (ENSMFAG00000032161) ENSMFAG00000062198 NLGN3 (ENSMFAG00000002421) ENSMFAG00000057282 ENSMFAG00000060662 GJB1 (ENSMFAG00000063942) ENSMFAG00000064000 ZMYM3 (ENSMFAG00000043632) NONO (ENSMFAG00000041557) ITGB1BP2 (ENSMFAG00000037969) ENSMFAG00000058252 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000163308 ENSGT00940000156284.B ENSGT00940000162857 ENSGT00950000183169.A.b.b ENSGT00530000064407.b.b.d.i.b ENSGT00940000161781.a.b ENSGT00940000161781.a.a ENSGT00940000156284.A ENSGT00940000163548 ENSGT00940000162987 ENSGT00940000154650.d ENSGT00940000160177 ENSGT00940000163141 ENSGT00940000163517 ENSGT00940000164340 ENSGT00390000005254.i.a.b #22 ENSGT00940000162363 ENSGT00390000016119.r ENSGT00950000183070.a.b.h.t.b ENSGT00940000163859 ENSGT00940000163768 ENSGT00530000063583.a.a.b.c ENSGT00390000008624.e.a.b.b ENSGT00940000159183 ENSGT00940000160692 ENSGT00950000182985.a.b ENSGT00940000160348 ENSGT00940000163639 ENSGT00390000009423.b ENSGT00940000160509 ENSGT00390000014139 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 326 ZNF875 (ENSRBIG00000028681) ZNF527 (ENSRBIG00000038154) ZNF569 (ENSRBIG00000033892) ZNF570 (ENSRBIG00000043265) ZNF793 (ENSRBIG00000042539) ZNF571 (ENSRBIG00000032470) ZNF540 (ENSRBIG00000029084) ENSRBIG00000029339 #22 ZFP30 (ENSRBIG00000039413) ENSRBIG00000042139 ENSRBIG00000024362 ZNF607 (ENSRBIG00000043164) ZNF573 (ENSRBIG00000044929) WDR87 (ENSRBIG00000043294) ENSRBIG00000031396 CXCR5 (ENSRBIG00000039142) BCL9L (ENSRBIG00000036020) UPK2 (ENSRBIG00000033540) FOXR1 (ENSRBIG00000028617) CENATAC (ENSRBIG00000032357) RPS25 (ENSRBIG00000030058) TRAPPC4 (ENSRBIG00000028460) SLC37A4 (ENSRBIG00000003785) Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1031 KCNC2 (ENSRROG00000028887) ENSRROG00000007078 CAPS2 (ENSRROG00000036265) GLIPR1L1 (ENSRROG00000039268) GLIPR1L2 (ENSRROG00000017927) ENSRROG00000016846 ENSRROG00000041620 GLIPR1 (ENSRROG00000043395) KRR1 (ENSRROG00000029658) ENSRROG00000037708 ENSRROG00000024996 PHLDA1 (ENSRROG00000007029) ENSRROG00000033201 NAP1L1 (ENSRROG00000026775) ENSRROG00000014250 #22 BBS10 (ENSRROG00000028824) OSBPL8 (ENSRROG00000042405) ZDHHC17 (ENSRROG00000039872) CSRP2 (ENSRROG00000031526) E2F7 (ENSRROG00000031867) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2536 ZNF829 (ENSRROG00000030120) ZNF568 (ENSRROG00000034950) ENSRROG00000039373 ENSRROG00000010774 ZNF585A (ENSRROG00000042154) ZNF585B (ENSRROG00000041541) ZNF383 (ENSRROG00000045585) ZNF875 (ENSRROG00000044808) ZNF527 (ENSRROG00000045552) ZNF569 (ENSRROG00000033596) ZNF570 (ENSRROG00000043128) ZNF793 (ENSRROG00000035042) ZNF571 (ENSRROG00000004328) ZNF540 (ENSRROG00000002447) ZFP30 (ENSRROG00000039306) ENSRROG00000034457 #22 ENSRROG00000031507 ZNF607 (ENSRROG00000040754) ZNF573 (ENSRROG00000043105) WDR87 (ENSRROG00000035495) SIPA1L3 (ENSRROG00000041601) ENSRROG00000035604 ENSRROG00000037709 DPF1 (ENSRROG00000042921) PPP1R14A (ENSRROG00000000043) SPINT2 (ENSRROG00000037295) C19orf33 (ENSRROG00000038967) YIF1B (ENSRROG00000038450) KCNK6 (ENSRROG00000042639) CATSPERG (ENSRROG00000034937) PSMD8 (ENSRROG00000015820) Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.s.a.a #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.s.a.a #22 Cebidae_a DUPLICATION Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.s.a.a.a #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 95 SPNS3 (ENSSBOG00000029998) ENSSBOG00000025559 ANKFY1 (ENSSBOG00000034382) CYB5D2 (ENSSBOG00000016637) ZZEF1 (ENSSBOG00000019866) ATP2A3 (ENSSBOG00000025936) P2RX1 (ENSSBOG00000025078) CAMKK1 (ENSSBOG00000035609) NCBP3 (ENSSBOG00000023178) ITGAE (ENSSBOG00000029571) HASPIN (ENSSBOG00000028630) P2RX5 (ENSSBOG00000030664) EMC6 (ENSSBOG00000019385) TAX1BP3 (ENSSBOG00000022310) CTNS (ENSSBOG00000023097) ENSSBOG00000023479 #22 SHPK (ENSSBOG00000028634) TRPV1 (ENSSBOG00000033403) TRPV3 (ENSSBOG00000035972) ASPA (ENSSBOG00000033075) SPATA22 (ENSSBOG00000032068) OR1D2 (ENSSBOG00000011764) OR1D5 (ENSSBOG00000023874) RAP1GAP2 (ENSSBOG00000027571) CLUH (ENSSBOG00000021545) ENSSBOG00000022312 ENSSBOG00000025489 ENSSBOG00000023013 MNT (ENSSBOG00000031011) SGSM2 (ENSSBOG00000034563) ENSSBOG00000030592 Capuchin MODERN SPECIES 260 ENSCCAG00000027727 BRAF (ENSCCAG00000031128) NDUFB2 (ENSCCAG00000029688) ENSCCAG00000008528 DENND2A (ENSCCAG00000027573) MKRN1 (ENSCCAG00000037582) RAB19 (ENSCCAG00000029268) SLC37A3 (ENSCCAG00000026819) ENSCCAG00000028375 KDM7A (ENSCCAG00000036194) PARP12 (ENSCCAG00000032426) TBXAS1 (ENSCCAG00000032748) HIPK2 (ENSCCAG00000034723) CLEC2L (ENSCCAG00000032456) KLRG2 (ENSCCAG00000027319) ENSCCAG00000024159 #22 FMC1-LUC7L2 (ENSCCAG00000023339) UBN2 (ENSCCAG00000034946) ENSCCAG00000018712 ENSCCAG00000032814 ZC3HAV1 (ENSCCAG00000028272) ZC3HAV1L (ENSCCAG00000029946) KIAA1549 (ENSCCAG00000026364) TMEM213 (ENSCCAG00000027190) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.s.a.a.b #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 141 LAD1 (ENSSBOG00000026021) TNNT2 (ENSSBOG00000027536) ENSSBOG00000028457 PKP1 (ENSSBOG00000036168) IGFN1 (ENSSBOG00000013748) TMEM9 (ENSSBOG00000018806) CACNA1S (ENSSBOG00000012566) KIF21B (ENSSBOG00000030857) INAVA (ENSSBOG00000000914) GPR25 (ENSSBOG00000027419) ENSSBOG00000024998 CAMSAP2 (ENSSBOG00000034399) DDX59 (ENSSBOG00000035527) KIF14 (ENSSBOG00000030090) ZNF281 (ENSSBOG00000001320) ENSSBOG00000023904 #22 ENSSBOG00000023922 ENSSBOG00000022123 ENSSBOG00000032361 NR5A2 (ENSSBOG00000025451) ENSSBOG00000008418 ENSSBOG00000022413 ENSSBOG00000019469 ENSSBOG00000020415 ENSSBOG00000033286 PTPRC (ENSSBOG00000028913) ATP6V1G3 (ENSSBOG00000028633) NEK7 (ENSSBOG00000032078) ENSSBOG00000033040 Marmoset MODERN SPECIES 17 KCNQ2 (ENSCJAG00000010184) EEF1A2 (ENSCJAG00000010227) ENSCJAG00000076938 PTK6 (ENSCJAG00000010243) SRMS (ENSCJAG00000010253) FNDC11 (ENSCJAG00000010272) ENSCJAG00000081424 GMEB2 (ENSCJAG00000075313) STMN3 (ENSCJAG00000010324) RTEL1 (ENSCJAG00000010336) ARFRP1 (ENSCJAG00000010382) ZGPAT (ENSCJAG00000010398) LIME1 (ENSCJAG00000038018) SLC2A4RG (ENSCJAG00000036855) ZBTB46 (ENSCJAG00000010439) ENSCJAG00000020377 #22 ABHD16B (ENSCJAG00000010499) ENSCJAG00000010441 DNAJC5 (ENSCJAG00000010501) UCKL1 (ENSCJAG00000010518) ZNF512B (ENSCJAG00000010553) SAMD10 (ENSCJAG00000010587) PRPF6 (ENSCJAG00000010616) ENSCJAG00000072924 C20orf204 (ENSCJAG00000042619) SOX18 (ENSCJAG00000022379) TCEA2 (ENSCJAG00000010658) NPBWR2 (ENSCJAG00000022380) RGS19 (ENSCJAG00000010687) LKAAEAR1 (ENSCJAG00000010705) OPRL1 (ENSCJAG00000043076) Mas night monkey MODERN SPECIES 914 MCU (ENSANAG00000034094) ENSANAG00000026504 MICU1 (ENSANAG00000023282) DNAJB12 (ENSANAG00000013275) DDIT4 (ENSANAG00000036767) ANAPC16 (ENSANAG00000020558) ASCC1 (ENSANAG00000027828) ENSANAG00000001612 ENSANAG00000028229 SPOCK2 (ENSANAG00000036693) CHST3 (ENSANAG00000021274) PSAP (ENSANAG00000025217) ENSANAG00000033011 VSIR (ENSANAG00000028142) ENSANAG00000027248 ENSANAG00000025046 #22 SLC29A3 (ENSANAG00000028508) UNC5B (ENSANAG00000024842) PCBD1 (ENSANAG00000036039) SGPL1 (ENSANAG00000025187) TBATA (ENSANAG00000029809) ADAMTS14 (ENSANAG00000035447) PRF1 (ENSANAG00000026005) PALD1 (ENSANAG00000034270) NODAL (ENSANAG00000023960) ENSANAG00000024340 ENSANAG00000022049 ENSANAG00000035837 LRRC20 (ENSANAG00000027549) ENSANAG00000021565 NPFFR1 (ENSANAG00000026811) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.s.a.b #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.s.a.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.s.a.b #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 93 ENSSBOG00000028726 ENSSBOG00000019282 ENSSBOG00000030411 BMP7 (ENSSBOG00000029401) SPO11 (ENSSBOG00000032033) RAE1 (ENSSBOG00000027737) RBM38 (ENSSBOG00000031053) CTCFL (ENSSBOG00000029240) PCK1 (ENSSBOG00000020912) ZBP1 (ENSSBOG00000032730) PMEPA1 (ENSSBOG00000018423) C20orf85 (ENSSBOG00000032942) ANKRD60 (ENSSBOG00000026461) ENSSBOG00000030417 ENSSBOG00000033720 ENSSBOG00000030326 #22 ENSSBOG00000031322 ENSSBOG00000032634 VAPB (ENSSBOG00000023022) APCDD1L (ENSSBOG00000030551) STX16 (ENSSBOG00000035326) NPEPL1 (ENSSBOG00000002808) ENSSBOG00000013127 ENSSBOG00000032092 NELFCD (ENSSBOG00000024245) CTSZ (ENSSBOG00000029319) TUBB1 (ENSSBOG00000031264) ATP5F1E (ENSSBOG00000032643) PRELID3B (ENSSBOG00000019233) ZNF831 (ENSSBOG00000031251) EDN3 (ENSSBOG00000024971) Capuchin MODERN SPECIES 70 CCDC32 (ENSCCAG00000035329) BAHD1 (ENSCCAG00000017539) IVD (ENSCCAG00000029561) KNSTRN (ENSCCAG00000019758) DISP2 (ENSCCAG00000030261) PHGR1 (ENSCCAG00000024258) CCDC9B (ENSCCAG00000022949) ENSCCAG00000019910 PLCB2 (ENSCCAG00000029295) ANKRD63 (ENSCCAG00000019183) PAK6 (ENSCCAG00000022613) ENSCCAG00000001521 BUB1B (ENSCCAG00000026679) BMF (ENSCCAG00000032823) SRP14 (ENSCCAG00000025744) ENSCCAG00000025401 #22 EIF2AK4 (ENSCCAG00000021302) GPR176 (ENSCCAG00000000507) ENSCCAG00000034251 FSIP1 (ENSCCAG00000026842) THBS1 (ENSCCAG00000034695) RASGRP1 (ENSCCAG00000019865) FAM98B (ENSCCAG00000037688) SPRED1 (ENSCCAG00000031080) TMCO5A (ENSCCAG00000029918) Mas night monkey MODERN SPECIES 657 PRKDC (ENSANAG00000028345) MCM4 (ENSANAG00000026411) ENSANAG00000024543 ENSANAG00000027457 CLXN (ENSANAG00000032509) SNAI2 (ENSANAG00000021163) PPDPFL (ENSANAG00000022280) SNTG1 (ENSANAG00000024114) PXDNL (ENSANAG00000025434) ENSANAG00000024030 PCMTD1 (ENSANAG00000003477) ST18 (ENSANAG00000030299) ENSANAG00000031552 ALKAL1 (ENSANAG00000030352) RB1CC1 (ENSANAG00000029285) ENSANAG00000022735 #22 NPBWR1 (ENSANAG00000004911) OPRK1 (ENSANAG00000033012) ENSANAG00000035847 ATP6V1H (ENSANAG00000012840) RGS20 (ENSANAG00000034281) ENSANAG00000002590 ENSANAG00000035611 MRPL15 (ENSANAG00000031982) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.s.b #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 385 PLAUR (ENSANAG00000035806) CADM4 (ENSANAG00000005388) ZNF576 (ENSANAG00000027939) IRGQ (ENSANAG00000035041) ENSANAG00000029993 #22 ENSANAG00000023503 PINLYP (ENSANAG00000026466) XRCC1 (ENSANAG00000027295) ZNF575 (ENSANAG00000033009) ETHE1 (ENSANAG00000033114) PHLDB3 (ENSANAG00000031610) LYPD3 (ENSANAG00000026620) TEX101 (ENSANAG00000021146) CD177 (ENSANAG00000028243) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.t #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.t #22 Marmoset MODERN SPECIES 11 SELENOP (ENSCJAG00000076517) CCDC152 (ENSCJAG00000001260) GHR (ENSCJAG00000038769) ENSCJAG00000079558 ENSCJAG00000081636 FBXO4 (ENSCJAG00000001220) RIMOC1 (ENSCJAG00000056589) OXCT1 (ENSCJAG00000007199) PLCXD3 (ENSCJAG00000007232) ENSCJAG00000079370 C6 (ENSCJAG00000007234) ENSCJAG00000069764 MROH2B (ENSCJAG00000007279) C7 (ENSCJAG00000007321) CARD6 (ENSCJAG00000007376) ENSCJAG00000087109 #22 PRKAA1 (ENSCJAG00000007341) TTC33 (ENSCJAG00000047411) PTGER4 (ENSCJAG00000007410) DAB2 (ENSCJAG00000007426) C9 (ENSCJAG00000007477) FYB1 (ENSCJAG00000007485) RICTOR (ENSCJAG00000007501) OSMR (ENSCJAG00000007577) ENSCJAG00000078983 ENSCJAG00000074673 LIFR (ENSCJAG00000007608) EGFLAM (ENSCJAG00000007668) GDNF (ENSCJAG00000007761) WDR70 (ENSCJAG00000007784) ENSCJAG00000070684 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b.t #22 Capuchin MODERN SPECIES 204 ENSCCAG00000019454 ZMYM5 (ENSCCAG00000031521) ENSCCAG00000001171 ZMYM2 (ENSCCAG00000029184) GJB2 (ENSCCAG00000032636) GJB6 (ENSCCAG00000031996) CRYL1 (ENSCCAG00000027310) IFT88 (ENSCCAG00000032883) IL17D (ENSCCAG00000037480) EEF1AKMT1 (ENSCCAG00000026801) XPO4 (ENSCCAG00000020123) ENSCCAG00000030799 LATS2 (ENSCCAG00000020164) ENSCCAG00000029715 SKA3 (ENSCCAG00000033697) ENSCCAG00000029524 #22 ZDHHC20 (ENSCCAG00000036345) MICU2 (ENSCCAG00000021957) FGF9 (ENSCCAG00000021640) ENSCCAG00000003879 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Rabbit MODERN SPECIES 20 PTPRM (ENSOCUG00000016125) ENSOCUG00000032560 LRRC30 (ENSOCUG00000001704) LAMA1 (ENSOCUG00000009424) ARHGAP28 (ENSOCUG00000003323) L3MBTL4 (ENSOCUG00000013013) ENSOCUG00000037625 TMEM200C (ENSOCUG00000024350) ENSOCUG00000032244 EPB41L3 (ENSOCUG00000021196) ZBTB14 (ENSOCUG00000004131) ENSOCUG00000023402 AKAIN1 (ENSOCUG00000035231) DLGAP1 (ENSOCUG00000013763) ENSOCUG00000029174 ENSOCUG00000037037 #22 TGIF1 (ENSOCUG00000013752) ENSOCUG00000021304 MYOM1 (ENSOCUG00000008571) LPIN2 (ENSOCUG00000009433) EMILIN2 (ENSOCUG00000002553) SMCHD1 (ENSOCUG00000000020) NDC80 (ENSOCUG00000015410) METTL4 (ENSOCUG00000022390) ENSOCUG00000024410 ADCYAP1 (ENSOCUG00000009463) YES1 (ENSOCUG00000005874) ENOSF1 (ENSOCUG00000008678) ENSOCUG00000008667 CLUL1 (ENSOCUG00000008658) CETN1 (ENSOCUG00000009188) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 3364 ENSMSIG00000024355 Rnf6 (ENSMSIG00000024340) Cdk8 (ENSMSIG00000024179) Wasf3 (ENSMSIG00000024134) Gpr12 (ENSMSIG00000024129) ENSMSIG00000024119 #22 Usp12 (ENSMSIG00000024096) ENSMSIG00000024049 Rasl11a (ENSMSIG00000024039) Gtf3a (ENSMSIG00000024026) Mtif3 (ENSMSIG00000024005) Lnx2 (ENSMSIG00000023999) ENSMSIG00000023978 Gsx1 (ENSMSIG00000023969) Pdx1 (ENSMSIG00000023956) Cdx2 (ENSMSIG00000023947) ENSMSIG00000023941 ENSMSIG00000023930 Flt3 (ENSMSIG00000023851) Pan3 (ENSMSIG00000023687) Flt1 (ENSMSIG00000023642) Steppe mouse MODERN SPECIES 2949 Galnt14 (ENSMSIG00000017578) Ehd3 (ENSMSIG00000017648) ENSMSIG00000017664 Xdh (ENSMSIG00000017693) Srd5a2 (ENSMSIG00000022711) ENSMSIG00000022729 ENSMSIG00000022739 Dpy30 (ENSMSIG00000022833) ENSMSIG00000022859 Slc30a6 (ENSMSIG00000023266) Nlrc4 (ENSMSIG00000023326) Yipf4 (ENSMSIG00000023337) Birc6 (ENSMSIG00000023387) ENSMSIG00000024707 ENSMSIG00000024781 #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3404 ENSMSIG00000030796 Fbln5 (ENSMSIG00000030807) Trip11 (ENSMSIG00000030814) Atxn3 (ENSMSIG00000030823) ENSMSIG00000030830 Cpsf2 (ENSMSIG00000030833) ENSMSIG00000030837 #22 Slc24a4 (ENSMSIG00000030840) Rin3 (ENSMSIG00000030844) Lgmn (ENSMSIG00000030851) Golga5 (ENSMSIG00000030853) Chga (ENSMSIG00000030856) Itpk1 (ENSMSIG00000030859) Moap1 (ENSMSIG00000030861) Tmem251 (ENSMSIG00000030862) Gon7 (ENSMSIG00000030863) Ubr7 (ENSMSIG00000030867) Btbd7 (ENSMSIG00000030868) Cox8c (ENSMSIG00000030869) Unc79 (ENSMSIG00000030870) ENSMSIG00000030901 Fam181a (ENSMSIG00000030904) Steppe mouse MODERN SPECIES 2239 ENSMSIG00000006714 ENSMSIG00000006718 ENSMSIG00000006734 Lima1 (ENSMSIG00000006756) ENSMSIG00000006828 #22 Cers5 (ENSMSIG00000006848) Cox14 (ENSMSIG00000006927) Gpd1 (ENSMSIG00000006935) Smarcd1 (ENSMSIG00000006988) Asic1 (ENSMSIG00000007108) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 13 Sult1c1 (ENSPEMG00000018208) Sult1c2 (ENSPEMG00000022816) Gcc2 (ENSPEMG00000022738) ENSPEMG00000030257 Lims1 (ENSPEMG00000000614) Ranbp2 (ENSPEMG00000021565) Ccdc138 (ENSPEMG00000015820) Edar (ENSPEMG00000001781) Sh3rf3 (ENSPEMG00000021347) Septin10 (ENSPEMG00000007611) Sowahc (ENSPEMG00000000439) P4ha1 (ENSPEMG00000006561) Pla2g12b (ENSPEMG00000026795) Oit3 (ENSPEMG00000011782) Mcu (ENSPEMG00000024070) ENSPEMG00000025760 #22 Micu1 (ENSPEMG00000014057) Dnajb12 (ENSPEMG00000005161) Ddit4 (ENSPEMG00000025339) Anapc16 (ENSPEMG00000011038) Ascc1 (ENSPEMG00000002244) Spock2 (ENSPEMG00000008616) Chst3 (ENSPEMG00000017475) Psap (ENSPEMG00000009902) Vsir (ENSPEMG00000010452) Gm17455 (ENSPEMG00000008830) Cdh23 (ENSPEMG00000001083) Slc29a3 (ENSPEMG00000013214) Unc5b (ENSPEMG00000000250) Pcbd1 (ENSPEMG00000027007) Sgpl1 (ENSPEMG00000012173) Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 21 ENSPEMG00000025420 ENSPEMG00000030292 ENSPEMG00000025766 Or3a4 (ENSPEMG00000002598) Or1r1 (ENSPEMG00000028563) Or1e1f (ENSPEMG00000029075) ENSPEMG00000025324 ENSPEMG00000026192 ENSPEMG00000025636 ENSPEMG00000024787 ENSPEMG00000027149 ENSPEMG00000024637 ENSPEMG00000029609 ENSPEMG00000024574 ENSPEMG00000025868 ENSPEMG00000015302 #22 ENSPEMG00000030026 ENSPEMG00000030415 ENSPEMG00000024352 Or1e1c (ENSPEMG00000030754) ENSPEMG00000027363 ENSPEMG00000028287 Spata22 (ENSPEMG00000007961) Aspa (ENSPEMG00000007320) Trpv3 (ENSPEMG00000018941) Trpv1 (ENSPEMG00000017952) Shpk (ENSPEMG00000015933) Ctns (ENSPEMG00000018672) Tax1bp3 (ENSPEMG00000000701) Emc6 (ENSPEMG00000007528) P2rx5 (ENSPEMG00000018884) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 5 Npas3 (ENSPEMG00000012109) Akap6 (ENSPEMG00000012708) Arhgap5 (ENSPEMG00000000871) Nubpl (ENSPEMG00000008972) Gpr33 (ENSPEMG00000015422) Dtd2 (ENSPEMG00000020439) Heatr5a (ENSPEMG00000014455) Hectd1 (ENSPEMG00000011192) Ap4s1 (ENSPEMG00000028602) Strn3 (ENSPEMG00000018694) Coch (ENSPEMG00000014561) Scfd1 (ENSPEMG00000013333) G2e3 (ENSPEMG00000014724) Prkd1 (ENSPEMG00000011695) ENSPEMG00000029110 ENSPEMG00000011512 #22 Foxg1 (ENSPEMG00000014163) Nova1 (ENSPEMG00000006503) Stxbp6 (ENSPEMG00000006826) ENSPEMG00000008750 Nrcam (ENSPEMG00000000666) Pnpla8 (ENSPEMG00000013308) Dnajb9 (ENSPEMG00000025224) ENSPEMG00000030494 ENSPEMG00000000820 Immp2l (ENSPEMG00000017740) Lrrn3 (ENSPEMG00000013198) Dock4 (ENSPEMG00000011461) Zfp277 (ENSPEMG00000016665) ENSPEMG00000025333 Ifrd1 (ENSPEMG00000000131) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 175 ENSCGRG00001021296 Tmem29 (ENSCGRG00001006192) ENSCGRG00001013308 ENSCGRG00001021001 ENSCGRG00001009910 Usp51 (ENSCGRG00001009830) Mageh1 (ENSCGRG00001009846) Foxr2 (ENSCGRG00001009252) Rragb (ENSCGRG00001013394) Klf8 (ENSCGRG00001019035) Ubqln2 (ENSCGRG00001016085) Kctd12b (ENSCGRG00001004538) Nbdy (ENSCGRG00001003251) ENSCGRG00001005909 Spin2c (ENSCGRG00001004592) ENSCGRG00001018471 #22 ENSCGRG00001000978 ENSCGRG00001023144 Mycs (ENSCGRG00001000792) ENSCGRG00001003982 ENSCGRG00001000208 ENSCGRG00001010729 ENSCGRG00001007007 ENSCGRG00001022547 ENSCGRG00001007687 ENSCGRG00001008851 ENSCGRG00001009060 ENSCGRG00001001286 Bmp15 (ENSCGRG00001012329) Shroom4 (ENSCGRG00001016683) Dgkk (ENSCGRG00001005491) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 111 Ror1 (ENSCGRG00001015667) Pgm1 (ENSCGRG00001024185) Efcab7 (ENSCGRG00001013291) Itgb3bp (ENSCGRG00001023317) Alg6 (ENSCGRG00001024513) Foxd3 (ENSCGRG00001009393) ENSCGRG00001002098 Atg4c (ENSCGRG00001000630) ENSCGRG00001002780 Dock7 (ENSCGRG00001017762) Angptl3 (ENSCGRG00001024053) Usp1 (ENSCGRG00001018963) Kank4 (ENSCGRG00001023583) L1td1 (ENSCGRG00001024238) Patj (ENSCGRG00001024524) ENSCGRG00001014726 #22 Tm2d1 (ENSCGRG00001017276) Nfia (ENSCGRG00001000754) Gm12695 (ENSCGRG00001014021) ENSCGRG00001015523 Cyp2j6 (ENSCGRG00001017724) ENSCGRG00001020085 ENSCGRG00001005478 Hook1 (ENSCGRG00001001100) ENSCGRG00001008656 Fggy (ENSCGRG00001024005) Jun (ENSCGRG00001011810) Mysm1 (ENSCGRG00001015762) Eqtn (ENSCGRG00001001186) Tek (ENSCGRG00001018441) Ift74 (ENSCGRG00001020714) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 92 Pcdhb21 (ENSCGRG00001010379) Pcdhb22 (ENSCGRG00001009602) Slc25a2 (ENSCGRG00001006059) Taf7 (ENSCGRG00001008337) Pcdhgc5 (ENSCGRG00001014048) Pcdhgb1 (ENSCGRG00001000864) Pcdhgb2 (ENSCGRG00001008251) Pcdhga8 (ENSCGRG00001013599) Pcdhgb7 (ENSCGRG00001009927) Diaph1 (ENSCGRG00001022620) Hdac3 (ENSCGRG00001010047) Rell2 (ENSCGRG00001020596) Fchsd1 (ENSCGRG00001023716) Arap3 (ENSCGRG00001020709) Pcdh1 (ENSCGRG00001019962) ENSCGRG00001023147 #22 Dele1 (ENSCGRG00001001000) Pcdh12 (ENSCGRG00001016477) Rnf14 (ENSCGRG00001021566) Gnpda1 (ENSCGRG00001022546) Ndfip1 (ENSCGRG00001005355) Spry4 (ENSCGRG00001006586) Fgf1 (ENSCGRG00001017683) Arhgap26 (ENSCGRG00001014813) ENSCGRG00001023620 Nr3c1 (ENSCGRG00001023458) ENSCGRG00001000351 Yipf5 (ENSCGRG00001011656) Kctd16 (ENSCGRG00001017823) Prelid2 (ENSCGRG00001018946) Grxcr2 (ENSCGRG00001003107) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 112 Znrf1 (ENSCGRG00001022179) Wdr59 (ENSCGRG00001016673) Fa2h (ENSCGRG00001000708) Mlkl (ENSCGRG00001014734) Rfwd3 (ENSCGRG00001023818) Glg1 (ENSCGRG00001018933) Pdpr (ENSCGRG00001021291) Clec18a (ENSCGRG00001018618) Exosc6 (ENSCGRG00001000899) AARS (ENSCGRG00001014390) Ddx19b (ENSCGRG00001015299) St3gal2 (ENSCGRG00001019838) Fcsk (ENSCGRG00001025027) Cog4 (ENSCGRG00001007403) Sf3b3 (ENSCGRG00001015908) ENSCGRG00001000994 #22 Il34 (ENSCGRG00001005627) Mtss2 (ENSCGRG00001008250) Vac14 (ENSCGRG00001003764) Hydin (ENSCGRG00001020638) Cmtr2 (ENSCGRG00001008188) Calb2 (ENSCGRG00001021465) Tle7 (ENSCGRG00001018163) Zfp612 (ENSCGRG00001000845) Chst4 (ENSCGRG00001013422) Tat (ENSCGRG00001010175) Marveld3 (ENSCGRG00001018229) Phlpp2 (ENSCGRG00001014088) Ap1g1 (ENSCGRG00001022757) Atxn1l (ENSCGRG00001005951) Zfp821 (ENSCGRG00001023974) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.a.b #22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 88 ADGRB3 (ENSUPAG00010012154) LMBRD1 (ENSUPAG00010012245) COL19A1 (ENSUPAG00010012279) COL9A1 (ENSUPAG00010012340) FAM135A (ENSUPAG00010012439) SDHAF4 (ENSUPAG00010012579) ENSUPAG00010012584 SMAP1 (ENSUPAG00010012588) B3GAT2 (ENSUPAG00010012603) OGFRL1 (ENSUPAG00010012613) ENSUPAG00010012628 #22 ENSUPAG00010012630 ENSUPAG00010012639 KCNQ5 (ENSUPAG00010012650) ENSUPAG00010012879 DPPA5 (ENSUPAG00010012891) ENSUPAG00010012908 ENSUPAG00010012926 ENSUPAG00010012946 CGAS (ENSUPAG00010012982) MTO1 (ENSUPAG00010013013) ENSUPAG00010013033 SLC17A5 (ENSUPAG00010013040) CD109 (ENSUPAG00010013092) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 2 CYP2R1 (ENSSVLG00005009273) PDE3B (ENSSVLG00005009340) ENSSVLG00005009603 ENSSVLG00005009633 ENSSVLG00005009657 PSMA1 (ENSSVLG00005009698) ENSSVLG00005009821 ENSSVLG00005009856 SPON1 (ENSSVLG00005009915) FAR1 (ENSSVLG00005010034) PTH (ENSSVLG00005010094) ENSSVLG00005010129 BMAL1 (ENSSVLG00005010226) RASSF10 (ENSSVLG00005010782) TEAD1 (ENSSVLG00005010836) ENSSVLG00005010968 #22 ENSSVLG00005011006 ENSSVLG00005011151 MICAL2 (ENSSVLG00005011268) DKK3 (ENSSVLG00005011338) USP47 (ENSSVLG00005011470) GALNT18 (ENSSVLG00005012194) ENSSVLG00005012265 ENSSVLG00005012285 ZBED5 (ENSSVLG00005012301) ENSSVLG00005012340 CTR9 (ENSSVLG00005012431) ENSSVLG00005012508 IRAG1 (ENSSVLG00005012560) LYVE1 (ENSSVLG00005013146) ENSSVLG00005013181 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Aves ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Zebra finch MODERN SPECIES 104 C5orf34 (ENSTGUG00000002291) TMEM267 (ENSTGUG00000022905) NIM1K (ENSTGUG00000022249) HMGCS1 (ENSTGUG00000002279) ZNF131 (ENSTGUG00000002273) SELENOP (ENSTGUG00000021379) CCDC152 (ENSTGUG00000019272) GHR (ENSTGUG00000002265) FBXO4 (ENSTGUG00000002262) RIMOC1 (ENSTGUG00000002256) ENSTGUG00000002229 ENSTGUG00000026505 PLCXD3 (ENSTGUG00000002227) C6 (ENSTGUG00000002207) C7 (ENSTGUG00000002197) ENSTGUG00000002186 #22 PRKAA1 (ENSTGUG00000002173) TTC33 (ENSTGUG00000026129) PTGER4 (ENSTGUG00000002168) DAB2 (ENSTGUG00000002156) C9 (ENSTGUG00000002149) FYB1 (ENSTGUG00000002137) RICTOR (ENSTGUG00000002126) OSMR (ENSTGUG00000002125) LIFR (ENSTGUG00000002116) ENSTGUG00000019842 ENSTGUG00000025487 EGFLAM (ENSTGUG00000002114) GDNF (ENSTGUG00000019278) WDR70 (ENSTGUG00000002097) CPLANE1 (ENSTGUG00000002059) Medium ground finch MODERN SPECIES 625 ENSGFOG00000003846 #22 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Emydidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 323 FBN3 (ENSTMTG00000019349) ENSTMTG00000020619 ENSTMTG00000020643 ENSTMTG00000020795 ENSTMTG00000020800 ENSTMTG00000020807 ENSTMTG00000020824 ENSTMTG00000020835 ENSTMTG00000020844 ENSTMTG00000020871 ENSTMTG00000020881 LMNB2 (ENSTMTG00000020896) RPL36 (ENSTMTG00000020915) LONP1 (ENSTMTG00000020921) SLC1A6 (ENSTMTG00000020930) ENSTMTG00000020942 #22 RANBP3 (ENSTMTG00000020948) ENSTMTG00000020957 ENSTMTG00000020964 NDUFA11 (ENSTMTG00000020967) ENSTMTG00000020974 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Goode s thornscrub tortoise DUPLICATION Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 138 ENSGEVG00005012407 ENSGEVG00005012365 ENSGEVG00005012237 LIN7B (ENSGEVG00005012203) SNRNP70 (ENSGEVG00005012171) ENSGEVG00005012072 ENSGEVG00005012027 BAX (ENSGEVG00005012003) ENSGEVG00005011952 ENSGEVG00005011899 ENSGEVG00005011852 ENSGEVG00005011832 ENSGEVG00005011801 ENSGEVG00005011031 ENSGEVG00005010851 ENSGEVG00005010804 #22 ENSGEVG00005010788 ENSGEVG00005010773 ENSGEVG00005010725 PIH1D1 (ENSGEVG00005016578) SLC17A7 (ENSGEVG00005016456) DHDH (ENSGEVG00005016429) RPL13A (ENSGEVG00005016372) ENSGEVG00005016341 ENSGEVG00005016325 HSD17B14 (ENSGEVG00005016294) BCAT2 (ENSGEVG00005016261) ENSGEVG00005016210 ENSGEVG00005016187 ENSGEVG00005016140 ENSGEVG00005016088 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 20 XRCC4 (ENSGEVG00005010349) ENSGEVG00005010286 ENSGEVG00005010195 HAPLN1 (ENSGEVG00005010002) EDIL3 (ENSGEVG00005009290) COX7C (ENSGEVG00005009127) RASA1 (ENSGEVG00005007316) CCNH (ENSGEVG00005006937) TMEM161B (ENSGEVG00005006912) MEF2C (ENSGEVG00005006877) CETN3 (ENSGEVG00005006845) MBLAC2 (ENSGEVG00005006820) ENSGEVG00005006802 LYSMD3 (ENSGEVG00005006783) ADGRV1 (ENSGEVG00005006505) ENSGEVG00005006434 #22 ARRDC3 (ENSGEVG00005006404) NR2F1 (ENSGEVG00005006372) FAM172A (ENSGEVG00005006265) ENSGEVG00005006220 ENSGEVG00005006196 SLF1 (ENSGEVG00005006161) MCTP1 (ENSGEVG00005005848) FAM81B (ENSGEVG00005005706) SKIC3 (ENSGEVG00005005615) ARSK (ENSGEVG00005005584) GPR150 (ENSGEVG00005005561) RFESD (ENSGEVG00005005533) ENSGEVG00005005447 RHOBTB3 (ENSGEVG00005005390) GLRX (ENSGEVG00005005370) Abingdon island giant tortoise DUPLICATION Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 565 CXXC5 (ENSCABG00000012637) ENSCABG00000012634 #22 UBE2D2 (ENSCABG00000012630) STING1 (ENSCABG00000012626) ENSCABG00000012624 DNAJC18 (ENSCABG00000012567) Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2220 ERBB4 (ENSCABG00000008098) ENSCABG00000008131 PLCXD3 (ENSCABG00000008135) C6 (ENSCABG00000008137) C7 (ENSCABG00000008141) ENSCABG00000008146 #22 PRKAA1 (ENSCABG00000008149) ENSCABG00000008151 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Eastern brown snake MODERN SPECIES 8 RBM39 (ENSPTXG00000000540) ENSPTXG00000000577 ROMO1 (ENSPTXG00000000582) NFS1 (ENSPTXG00000000610) RBM12 (ENSPTXG00000001596) CPNE1 (ENSPTXG00000001600) ENSPTXG00000001632 ENSPTXG00000001678 ENSPTXG00000001679 ERGIC3 (ENSPTXG00000001680) ENSPTXG00000001682 ENSPTXG00000001685 GDF5 (ENSPTXG00000001697) UQCC1 (ENSPTXG00000001698) FAM83C (ENSPTXG00000001700) ENSPTXG00000001701 #22 EIF6 (ENSPTXG00000001702) MMP24 (ENSPTXG00000001703) LZTR1 (ENSPTXG00000001705) IPO9 (ENSPTXG00000001707) KDM5B (ENSPTXG00000001709) ENSPTXG00000001711 RABIF (ENSPTXG00000001713) KLHL12 (ENSPTXG00000001717) SHISA4 (ENSPTXG00000001720) LMOD1 (ENSPTXG00000001723) TIMM17A (ENSPTXG00000001725) ENSPTXG00000001727 TMEM183A (ENSPTXG00000001729) PPFIA4 (ENSPTXG00000001734) MYOG (ENSPTXG00000001738) Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Common wall lizard MODERN SPECIES DKK3 (ENSPMRG00000001772) MICAL2 (ENSPMRG00000001691) ENSPMRG00000001659 PARVA (ENSPMRG00000001638) TEAD1 (ENSPMRG00000001610) RASSF10 (ENSPMRG00000001601) BMAL1 (ENSPMRG00000001586) BTBD10 (ENSPMRG00000001570) PTH (ENSPMRG00000001559) FAR1 (ENSPMRG00000001540) OVCH2 (ENSPMRG00000001511) CYB5R2 (ENSPMRG00000001499) PPFIBP2 (ENSPMRG00000001265) OLFML1 (ENSPMRG00000001219) ENSPMRG00000001214 ENSPMRG00000001208 #22 SYT9 (ENSPMRG00000001186) ENSPMRG00000001170 SPON1 (ENSPMRG00000001084) ENSPMRG00000001052 C11orf91 (ENSPMRG00000001042) KIAA1549L (ENSPMRG00000000918) HIPK3 (ENSPMRG00000000806) CSTF3 (ENSPMRG00000000761) TCP11L1 (ENSPMRG00000000733) DEPDC7 (ENSPMRG00000000712) QSER1 (ENSPMRG00000000670) PRRG4 (ENSPMRG00000000641) ENSPMRG00000000627 CCDC73 (ENSPMRG00000000605) EIF3M (ENSPMRG00000000575) Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Sperm whale MODERN SPECIES 19 ENSPCTG00005019822 ZNF131 (ENSPCTG00005019729) ENSPCTG00005019667 CCDC152 (ENSPCTG00005019630) GHR (ENSPCTG00005019431) FBXO4 (ENSPCTG00005019359) C8H5orf51 (ENSPCTG00005019324) ENSPCTG00005019287 OXCT1 (ENSPCTG00005019136) PLCXD3 (ENSPCTG00005019106) ENSPCTG00005019087 #22 C7 (ENSPCTG00005018916) ENSPCTG00005018695 ENSPCTG00005018427 C6 (ENSPCTG00005018209) ENSPCTG00005018189 #22 ENSPCTG00005018160 #22 PRKAA1 (ENSPCTG00005018088) TTC33 (ENSPCTG00005018058) PTGER4 (ENSPCTG00005018041) DAB2 (ENSPCTG00005017944) C9 (ENSPCTG00005017803) ENSPCTG00005017759 ENSPCTG00005017725 RICTOR (ENSPCTG00005017549) OSMR (ENSPCTG00005017459) ENSPCTG00005017392 LIFR (ENSPCTG00005017295) EGFLAM (ENSPCTG00005016321) GDNF (ENSPCTG00005016211) WDR70 (ENSPCTG00005016122) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 17 CCL28 (ENSCHYG00000013940) HMGCS1 (ENSCHYG00000014011) NIM1K (ENSCHYG00000014092) ENSCHYG00000014151 ENSCHYG00000014330 ENSCHYG00000014378 GHR (ENSCHYG00000014476) FBXO4 (ENSCHYG00000015127) RIMOC1 (ENSCHYG00000015406) OXCT1 (ENSCHYG00000015484) PLCXD3 (ENSCHYG00000015980) C6 (ENSCHYG00000016069) MROH2B (ENSCHYG00000016365) C7 (ENSCHYG00000017007) CARD6 (ENSCHYG00000017300) ENSCHYG00000017362 #22 PRKAA1 (ENSCHYG00000017622) TTC33 (ENSCHYG00000017689) PTGER4 (ENSCHYG00000017728) ENSCHYG00000017787 DAB2 (ENSCHYG00000017878) C9 (ENSCHYG00000018644) FYB1 (ENSCHYG00000018867) RICTOR (ENSCHYG00000019087) OSMR (ENSCHYG00000019839) LIFR (ENSCHYG00000020189) EGFLAM (ENSCHYG00000020383) ENSCHYG00000021006 GDNF (ENSCHYG00000021089) WDR70 (ENSCHYG00000021169) NUP155 (ENSCHYG00000021563) Yarkand deer MODERN SPECIES 28 CHCT1 (ENSCHYG00000001527) ENSCHYG00000001515 APPBP2 (ENSCHYG00000001468) PPM1D (ENSCHYG00000001443) ENSCHYG00000001424 BCAS3 (ENSCHYG00000001231) TBX4 (ENSCHYG00000001113) BRIP1 (ENSCHYG00000001042) INTS2 (ENSCHYG00000000949) MED13 (ENSCHYG00000000865) RNFT1 (ENSCHYG00000000823) RPS6KB1 (ENSCHYG00000000572) TUBD1 (ENSCHYG00000000462) VMP1 (ENSCHYG00000000409) PTRH2 (ENSCHYG00000000401) ENSCHYG00000000393 #22 CLTC (ENSCHYG00000000331) ENSCHYG00000000301 DHX40 (ENSCHYG00000000218) ENSCHYG00000000189 ENSCHYG00000000162 ENSCHYG00000000124 SMG8 (ENSCHYG00000000079) SKA2 (ENSCHYG00000021682) ENSCHYG00000021645 TRIM37 (ENSCHYG00000020755) ENSCHYG00000020667 PPM1E (ENSCHYG00000020517) RAD51C (ENSCHYG00000020230) ENSCHYG00000020119 TEX14 (ENSCHYG00000019472) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Wild yak MODERN SPECIES 2048 ENSBMUG00000019023 ENSBMUG00000019035 #22 ENSBMUG00000019048 Siberian musk deer MODERN SPECIES 99 TMEM205 (ENSMMSG00000001291) ENSMMSG00000001273 ENSMMSG00000001255 ANGPTL8 (ENSMMSG00000001235) DOCK6 (ENSMMSG00000001206) KANK2 (ENSMMSG00000001149) SPC24 (ENSMMSG00000001132) LDLR (ENSMMSG00000000994) ENSMMSG00000000924 SMARCA4 (ENSMMSG00000000864) TIMM29 (ENSMMSG00000000837) YIPF2 (ENSMMSG00000000797) CARM1 (ENSMMSG00000000737) C19orf38 (ENSMMSG00000000715) TMED1 (ENSMMSG00000000705) ENSMMSG00000000690 #22 DNM2 (ENSMMSG00000000584) QTRT1 (ENSMMSG00000000539) ILF3 (ENSMMSG00000000473) SLC44A2 (ENSMMSG00000000342) Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Pig MODERN SPECIES 14 ENSSSCG00000044786 SSX2IP (ENSSSCG00000003757) LPAR3 (ENSSSCG00000003756) MCOLN2 (ENSSSCG00000003755) ENSSSCG00000003754 ENSSSCG00000003753 ENSSSCG00000060282 PARD6G (ENSSSCG00000023376) ADNP2 (ENSSSCG00000038632) ENSSSCG00000038475 TXNL4A (ENSSSCG00000005777) HSBP1L1 (ENSSSCG00000005778) SLC66A2 (ENSSSCG00000023171) KCNG2 (ENSSSCG00000005780) SYT4 (ENSSSCG00000037079) ENSSSCG00000037233 #22 PIK3C3 (ENSSSCG00000003749) CELF4 (ENSSSCG00000003748) ENSSSCG00000045019 ENSSSCG00000047288 KIAA1328 (ENSSSCG00000003747) TPGS2 (ENSSSCG00000026953) ENSSSCG00000003746 FHOD3 (ENSSSCG00000027935) MOCOS (ENSSSCG00000003744) ELP2 (ENSSSCG00000020898) SLC39A6 (ENSSSCG00000027455) RPRD1A (ENSSSCG00000027700) C18orf21 (ENSSSCG00000030002) GALNT1 (ENSSSCG00000003743) INO80C (ENSSSCG00000038859) Chacoan peccary MODERN SPECIES 58 TAAR6 (ENSCWAG00000000255) TAAR8 (ENSCWAG00000000262) TAAR9 (ENSCWAG00000000279) STX7 (ENSCWAG00000000293) MOXD1 (ENSCWAG00000000330) CCN2 (ENSCWAG00000000365) ENPP1 (ENSCWAG00000000399) ENPP3 (ENSCWAG00000000478) MED23 (ENSCWAG00000000713) ARG1 (ENSCWAG00000001377) AKAP7 (ENSCWAG00000001429) EPB41L2 (ENSCWAG00000001601) TMEM200A (ENSCWAG00000001969) ENSCWAG00000001978 L3MBTL3 (ENSCWAG00000002009) ENSCWAG00000002030 #22 TMEM244 (ENSCWAG00000002041) ARHGAP18 (ENSCWAG00000002060) ENSCWAG00000002087 LAMA2 (ENSCWAG00000002117) ENSCWAG00000002202 PTPRK (ENSCWAG00000002390) THEMIS (ENSCWAG00000003806) C6orf58 (ENSCWAG00000003873) SOGA3 (ENSCWAG00000003941) KIAA0408 (ENSCWAG00000003993) ECHDC1 (ENSCWAG00000004022) ENSCWAG00000004109 RSPO3 (ENSCWAG00000004132) CENPW (ENSCWAG00000004176) TRMT11 (ENSCWAG00000004219) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 25 ZNF131 (ENSRFEG00010019576) ENSRFEG00010019548 ENSRFEG00010019525 ENSRFEG00010019519 ENSRFEG00010019486 CCDC152 (ENSRFEG00010019379) GHR (ENSRFEG00010019166) FBXO4 (ENSRFEG00010018965) ENSRFEG00010018901 OXCT1 (ENSRFEG00010018672) PLCXD3 (ENSRFEG00010018621) C6 (ENSRFEG00010018563) MROH2B (ENSRFEG00010017942) C7 (ENSRFEG00010017868) CARD6 (ENSRFEG00010017825) ENSRFEG00010017746 #22 PRKAA1 (ENSRFEG00010017640) TTC33 (ENSRFEG00010017587) ENSRFEG00010017563 PTGER4 (ENSRFEG00010017531) DAB2 (ENSRFEG00010017317) C9 (ENSRFEG00010017279) FYB1 (ENSRFEG00010017159) RICTOR (ENSRFEG00010017013) OSMR (ENSRFEG00010016947) LIFR (ENSRFEG00010016911) EGFLAM (ENSRFEG00010016511) GDNF (ENSRFEG00010016423) WDR70 (ENSRFEG00010016145) NUP155 (ENSRFEG00010016030) CPLANE1 (ENSRFEG00010015958) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183025.b.a.k ENSGT00510000049326.b.b.h ENSGT00940000167563 ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.b ENSGT00940000158747 ENSGT00390000005569.x.a.a.a.a.b.d.b ENSGT01100000264727 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.b #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Polar bear MODERN SPECIES 179 ENSUMAG00000007181 ENSUMAG00000007184 ENSUMAG00000007193 ENSUMAG00000007197 CCDC152 (ENSUMAG00000007202) GHR (ENSUMAG00000007219) FBXO4 (ENSUMAG00000007263) RIMOC1 (ENSUMAG00000007277) OXCT1 (ENSUMAG00000007281) PLCXD3 (ENSUMAG00000007317) ENSUMAG00000007319 C6 (ENSUMAG00000007323) MROH2B (ENSUMAG00000007341) C7 (ENSUMAG00000007413) CARD6 (ENSUMAG00000007533) ENSUMAG00000007537 #22 PRKAA1 (ENSUMAG00000007543) TTC33 (ENSUMAG00000007549) PTGER4 (ENSUMAG00000007573) DAB2 (ENSUMAG00000007591) C9 (ENSUMAG00000007604) FYB1 (ENSUMAG00000007612) RICTOR (ENSUMAG00000007680) OSMR (ENSUMAG00000008099) LIFR (ENSUMAG00000008233) EGFLAM (ENSUMAG00000008246) GDNF (ENSUMAG00000008259) WDR70 (ENSUMAG00000008288) ENSUMAG00000008296 NUP155 (ENSUMAG00000008416) CPLANE1 (ENSUMAG00000009281) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 American mink DUPLICATION American mink MODERN SPECIES 151 KCNA4 (ENSNVIG00000005408) FSHB (ENSNVIG00000005394) ARL14EP (ENSNVIG00000005391) MPPD2 (ENSNVIG00000005372) DCDC1 (ENSNVIG00000005262) ENSNVIG00000005251 DNAJC24 (ENSNVIG00000005225) ENSNVIG00000005197 ELP4 (ENSNVIG00000005118) PAX6 (ENSNVIG00000004848) ENSNVIG00000004822 #22 ENSNVIG00000004817 RCN1 (ENSNVIG00000004807) ENSNVIG00000004794 WT1 (ENSNVIG00000004664) EIF3M (ENSNVIG00000004595) CCDC73 (ENSNVIG00000004533) PRRG4 (ENSNVIG00000004513) QSER1 (ENSNVIG00000004484) DEPDC7 (ENSNVIG00000004469) TCP11L1 (ENSNVIG00000004458) CSTF3 (ENSNVIG00000004364) HIPK3 (ENSNVIG00000004290) ENSNVIG00000004263 American mink MODERN SPECIES 446 ENSNVIG00000019907 CT83 (ENSNVIG00000019900) SLC6A14 (ENSNVIG00000019874) AGTR2 (ENSNVIG00000019858) ENSNVIG00000019853 #22 Canidae DUPLICATION Canidae DUPLICATION Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b.i.a #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b.i.a #22 Dingo MODERN SPECIES 373 TMEM11 (ENSCAFG00020020810) DHRS7B (ENSCAFG00020020817) USP22 (ENSCAFG00020020826) ENSCAFG00020020839 ENSCAFG00020020848 PLD6 (ENSCAFG00020020882) FLCN (ENSCAFG00020020885) COPS3 (ENSCAFG00020020887) NT5M (ENSCAFG00020020897) MED9 (ENSCAFG00020020902) RASD1 (ENSCAFG00020020907) PEMT (ENSCAFG00020020910) RAI1 (ENSCAFG00020020913) SREBF1 (ENSCAFG00020020926) TOM1L2 (ENSCAFG00020020938) ENSCAFG00020020946 #22 DRC3 (ENSCAFG00020020952) ATPAF2 (ENSCAFG00020020965) GID4 (ENSCAFG00020020971) DRG2 (ENSCAFG00020020973) MYO15A (ENSCAFG00020020988) ALKBH5 (ENSCAFG00020021061) LLGL1 (ENSCAFG00020021065) FLII (ENSCAFG00020021067) MIEF2 (ENSCAFG00020021070) TOP3A (ENSCAFG00020021071) SMCR8 (ENSCAFG00020021075) SHMT1 (ENSCAFG00020021076) PRPSAP2 (ENSCAFG00020021081) SLC5A10 (ENSCAFG00020021084) FAM83G (ENSCAFG00020021092) Red fox MODERN SPECIES 52 USP22 (ENSVVUG00000030245) TNFRSF13B (ENSVVUG00000030244) MPRIP (ENSVVUG00000030228) PLD6 (ENSVVUG00000030224) FLCN (ENSVVUG00000030221) COPS3 (ENSVVUG00000030158) ENSVVUG00000030142 NT5M (ENSVVUG00000030141) MED9 (ENSVVUG00000030140) RASD1 (ENSVVUG00000030139) ENSVVUG00000030138 ENSVVUG00000030136 RAI1 (ENSVVUG00000030135) SREBF1 (ENSVVUG00000030131) ENSVVUG00000030129 ENSVVUG00000030128 #22 TOM1L2 (ENSVVUG00000030127) DRC3 (ENSVVUG00000030126) ATPAF2 (ENSVVUG00000030125) GID4 (ENSVVUG00000030124) DRG2 (ENSVVUG00000030121) ENSVVUG00000030113 ENSVVUG00000030108 ALKBH5 (ENSVVUG00000030107) LLGL1 (ENSVVUG00000030104) FLII (ENSVVUG00000030101) MIEF2 (ENSVVUG00000030099) TOP3A (ENSVVUG00000030095) SMCR8 (ENSVVUG00000030092) SHMT1 (ENSVVUG00000030087) PRPSAP2 (ENSVVUG00000030081) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b.i.b #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b.i.b #22 Dingo MODERN SPECIES 319 PGAM2 (ENSCAFG00020016505) POLM (ENSCAFG00020016508) AEBP1 (ENSCAFG00020016512) POLD2 (ENSCAFG00020016514) MYL7 (ENSCAFG00020016519) GCK (ENSCAFG00020016524) YKT6 (ENSCAFG00020016566) CAMK2B (ENSCAFG00020016629) NUDCD3 (ENSCAFG00020019639) NPC1L1 (ENSCAFG00020019646) DDX56 (ENSCAFG00020019695) TMED4 (ENSCAFG00020019707) OGDH (ENSCAFG00020019711) ZMIZ2 (ENSCAFG00020019721) ENSCAFG00020019732 ENSCAFG00020019735 #22 ENSCAFG00020019741 PURB (ENSCAFG00020019767) MYO1G (ENSCAFG00020019769) CCM2 (ENSCAFG00020019780) ENSCAFG00020019791 TBRG4 (ENSCAFG00020019803) ENSCAFG00020019811 RAMP3 (ENSCAFG00020019820) Canidae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000167717 ENSGT00390000010397.a ENSGT00730000110943.A.d ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00510000047493 ENSGT00940000159922.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00550000075035.o.b ENSGT00390000005254.i.b.j #22 ENSGT00950000185126 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000157540.A.k.b ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000165469 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a ENSGT00940000159688 ENSGT00390000018873 ENSGT00390000000571.a ENSGT00940000154359.f ENSGT00940000157557 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000160896 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000010397.a ENSGT00730000110943.A.d ENSGT00940000160983 ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000156128.b ENSGT00940000161570 ENSGT00390000008947.i ENSGT00940000159922.b ENSGT00510000047493 ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00390000018248 ENSGT00940000163925 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT00940000159055 ENSGT00550000075035.o.b ENSGT00390000005254.i.b.j #22 ENSGT00950000185126 ENSGT01050000244937.a.b.a ENSGT00940000157540.A.k.b ENSGT00940000159971 ENSGT00940000160039 ENSGT00940000165469 ENSGT00950000183097.a.a.a ENSGT01050000244888.b.a.c.a ENSGT00940000159688 ENSGT00390000018873 ENSGT00390000000571.a ENSGT00940000156221.b ENSGT00940000154359.f ENSGT00390000006621.p.b ENSGT00940000157557 Dog MODERN SPECIES 144 ENSCAFG00845022264 CAPN6 (ENSCAFG00845022341) DCX (ENSCAFG00845022487) ENSCAFG00845022656 ENSCAFG00845022707 SERTM2 (ENSCAFG00845022740) ENSCAFG00845022756 ENSCAFG00845022820 ENSCAFG00845023179 TRPC5 (ENSCAFG00845023272) TRPC5OS (ENSCAFG00845023335) RTL4 (ENSCAFG00845023450) LHFPL1 (ENSCAFG00845023511) AMOT (ENSCAFG00845023646) ENSCAFG00845023745 ENSCAFG00845015589 #22 ENSCAFG00845015615 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(ENSMICG00000015349) TSPAN13 (ENSMICG00000015312) BZW2 (ENSMICG00000015293) ANKMY2 (ENSMICG00000009932) ENSMICG00000036491 SOSTDC1 (ENSMICG00000015715) CRPPA (ENSMICG00000047544) MEOX2 (ENSMICG00000033516) AGMO (ENSMICG00000033056) DGKB (ENSMICG00000006113) ETV1 (ENSMICG00000006101) ARL4A (ENSMICG00000044178) ENSMICG00000029946 #22 SCIN (ENSMICG00000029127) ENSMICG00000039717 VWDE (ENSMICG00000011837) TMEM106B (ENSMICG00000011835) THSD7A (ENSMICG00000014021) PHF14 (ENSMICG00000014004) ENSMICG00000013999 ENSMICG00000047415 NXPH1 (ENSMICG00000017518) ICA1 (ENSMICG00000017517) GLCCI1 (ENSMICG00000017516) UMAD1 (ENSMICG00000035355) RPA3 (ENSMICG00000000741) MIOS (ENSMICG00000017738) COL28A1 (ENSMICG00000032566) Mouse lemur MODERN SPECIES 13 RNF215 (ENSMICG00000010079) CCDC157 (ENSMICG00000010055) SF3A1 (ENSMICG00000010038) TBC1D10A (ENSMICG00000010031) CASTOR1 (ENSMICG00000046602) OSM (ENSMICG00000036578) LIF (ENSMICG00000032126) ENSMICG00000000729 HORMAD2 (ENSMICG00000017007) ENSMICG00000016695 MTMR3 (ENSMICG00000016994) ASCC2 (ENSMICG00000017414) UQCR10 (ENSMICG00000043752) ZMAT5 (ENSMICG00000027135) CABP7 (ENSMICG00000035699) ENSMICG00000045468 #22 NF2 (ENSMICG00000017402) NIPSNAP1 (ENSMICG00000042066) THOC5 (ENSMICG00000017393) ENSMICG00000017389 AP1B1 (ENSMICG00000004275) RASL10A (ENSMICG00000032503) GAS2L1 (ENSMICG00000038428) ENSMICG00000004264 RHBDD3 (ENSMICG00000004259) EMID1 (ENSMICG00000004254) ENSMICG00000035443 KREMEN1 (ENSMICG00000004247) C22orf31 (ENSMICG00000045788) ZNRF3 (ENSMICG00000004243) ENSMICG00000046197 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 847 ENSPCOG00000022043 CRYGA (ENSPCOG00000028701) C2orf80 (ENSPCOG00000013784) IDH1 (ENSPCOG00000021282) PIKFYVE (ENSPCOG00000021844) ENSPCOG00000014595 PTH2R (ENSPCOG00000016298) MAP2 (ENSPCOG00000020566) UNC80 (ENSPCOG00000028748) ENSPCOG00000017484 KANSL1L (ENSPCOG00000012542) ACADL (ENSPCOG00000021470) ENSPCOG00000026981 MYL1 (ENSPCOG00000018716) LANCL1 (ENSPCOG00000008331) ENSPCOG00000028314 #22 CPS1 (ENSPCOG00000021968) ENSPCOG00000027398 Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 671 WDR44 (ENSPSMG00000004335) ENSPSMG00000004257 #22 DOCK11 (ENSPSMG00000004232) IL13RA1 (ENSPSMG00000004161) ENSPSMG00000004111 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 130 SLC6A11 (ENSPSMG00000025382) SLC6A1 (ENSPSMG00000025445) HRH1 (ENSPSMG00000000102) ATG7 (ENSPSMG00000000247) VGLL4 (ENSPSMG00000000320) TAMM41 (ENSPSMG00000000346) SYN2 (ENSPSMG00000000398) TIMP4 (ENSPSMG00000000419) PPARG (ENSPSMG00000000463) TSEN2 (ENSPSMG00000000537) MKRN2OS (ENSPSMG00000000584) MKRN2 (ENSPSMG00000000636) RAF1 (ENSPSMG00000000725) TMEM40 (ENSPSMG00000000837) ENSPSMG00000000888 #22 CAND2 (ENSPSMG00000000926) ENSPSMG00000000953 EFCAB12 (ENSPSMG00000000969) MBD4 (ENSPSMG00000001016) IFT122 (ENSPSMG00000001543) RHO (ENSPSMG00000002457) H1-8 (ENSPSMG00000002466) ENSPSMG00000002470 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 2996 MROH2B (ENSTSYG00000010393) C7 (ENSTSYG00000005704) CARD6 (ENSTSYG00000029167) RPL37 (ENSTSYG00000006208) #22 PRKAA1 (ENSTSYG00000000917) TTC33 (ENSTSYG00000030893) PTGER4 (ENSTSYG00000027760) Tarsier MODERN SPECIES 4869 ENSTSYG00000037430 ZACN (ENSTSYG00000026562) EXOC7 (ENSTSYG00000007607) ENSTSYG00000027887 #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000160932 ENSGT00390000007371 ENSGT00950000182900.B ENSGT00940000156338 ENSGT00940000155479 ENSGT00940000160747 ENSGT00390000017418 ENSGT00390000001376.bb.a.a ENSGT00390000016565 ENSGT00940000155361.d ENSGT00390000015719.c ENSGT00390000004191 ENSGT00950000183172.B ENSGT01090000260040.b.b.b.a ENSGT00940000156585 ENSGT00390000005254.i.b #22 ENSGT00390000002615.o.b ENSGT00940000160512 ENSGT00390000015089.c ENSGT00390000013722 ENSGT00390000005727.a.b.a.a.d Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 685 POU4F2 (ENSRBIG00000030928) SLC10A7 (ENSRBIG00000032124) REELD1 (ENSRBIG00000031487) LSM6 (ENSRBIG00000027878) ZNF827 (ENSRBIG00000039596) C4orf51 (ENSRBIG00000035478) MMAA (ENSRBIG00000030561) SMAD1 (ENSRBIG00000032479) ENSRBIG00000033228 #22 ENSRBIG00000039194 OTUD4 (ENSRBIG00000035124) ABCE1 (ENSRBIG00000008340) ANAPC10 (ENSRBIG00000028929) ENSRBIG00000038383 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1846 SYTL1 (ENSRBIG00000029326) TMEM222 (ENSRBIG00000043541) WDTC1 (ENSRBIG00000040615) SLC9A1 (ENSRBIG00000022222) ENSRBIG00000014897 TENT5B (ENSRBIG00000033865) TRNP1 (ENSRBIG00000032398) ENSRBIG00000014734 KDF1 (ENSRBIG00000027752) NUDC (ENSRBIG00000018562) NR0B2 (ENSRBIG00000037548) GPATCH3 (ENSRBIG00000005853) GPN2 (ENSRBIG00000036062) SFN (ENSRBIG00000014515) ZDHHC18 (ENSRBIG00000042271) ENSRBIG00000029686 #22 PIGV (ENSRBIG00000012346) ARID1A (ENSRBIG00000036777) ENSRBIG00000031875 RPS6KA1 (ENSRBIG00000028386) ENSRBIG00000031876 DHDDS (ENSRBIG00000035249) LIN28A (ENSRBIG00000032004) ZNF683 (ENSRBIG00000034984) Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 593 POU4F2 (ENSRROG00000040033) SLC10A7 (ENSRROG00000044034) REELD1 (ENSRROG00000045752) LSM6 (ENSRROG00000024868) ZNF827 (ENSRROG00000018716) C4orf51 (ENSRROG00000035262) MMAA (ENSRROG00000028820) SMAD1 (ENSRROG00000042440) ENSRROG00000045571 #22 ENSRROG00000044373 OTUD4 (ENSRROG00000035696) ABCE1 (ENSRROG00000033945) ENSRROG00000029310 ANAPC10 (ENSRROG00000022239) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2213 MAP3K6 (ENSRROG00000031761) SYTL1 (ENSRROG00000037744) TMEM222 (ENSRROG00000032428) WDTC1 (ENSRROG00000039571) SLC9A1 (ENSRROG00000035382) ENSRROG00000030078 TENT5B (ENSRROG00000045423) ENSRROG00000045205 KDF1 (ENSRROG00000042590) NUDC (ENSRROG00000037321) NR0B2 (ENSRROG00000042749) GPATCH3 (ENSRROG00000038382) GPN2 (ENSRROG00000021722) SFN (ENSRROG00000003412) ZDHHC18 (ENSRROG00000041022) ENSRROG00000032291 #22 PIGV (ENSRROG00000045107) ARID1A (ENSRROG00000036508) ENSRROG00000043752 RPS6KA1 (ENSRROG00000039476) ENSRROG00000044797 ENSRROG00000037867 DHDDS (ENSRROG00000042135) LIN28A (ENSRROG00000013874) ZNF683 (ENSRROG00000002892) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000009290.h ENSGT00940000169940 ENSGT00390000009290.g.a ENSGT00390000009290.g.b ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.a.a.a.a.a ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.i.b #22 ENSGT00940000158865 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00910000147779 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT01000000216185.c ENSGT00940000164709.a.b.b.a.a.b.b.b.b.a.b.b.c.a.b.a Rhesus MODERN SPECIES 16 ENSMMUG00000064695 ENSMMUG00000050328 ENSMMUG00000063115 ENSMMUG00000030144 CCDC152 (ENSMMUG00000030145) ENSMMUG00000053009 GHR (ENSMMUG00000001336) RIMOC1 (ENSMMUG00000042412) OXCT1 (ENSMMUG00000011027) ENSMMUG00000061337 C6 (ENSMMUG00000021034) MROH2B (ENSMMUG00000004774) ENSMMUG00000061318 C7 (ENSMMUG00000014171) CARD6 (ENSMMUG00000023808) ENSMMUG00000062350 #22 PRKAA1 (ENSMMUG00000023806) PTGER4 (ENSMMUG00000016167) ENSMMUG00000060622 DAB2 (ENSMMUG00000019879) C9 (ENSMMUG00000019878) ENSMMUG00000063072 FYB1 (ENSMMUG00000021218) RICTOR (ENSMMUG00000001611) OSMR (ENSMMUG00000001609) ENSMMUG00000051389 LIFR (ENSMMUG00000007386) EGFLAM (ENSMMUG00000017163) GDNF (ENSMMUG00000018963) ENSMMUG00000052974 ENSMMUG00000052836 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Drill MODERN SPECIES 909 ZNF382 (ENSMLEG00000040106) ZNF529 (ENSMLEG00000042784) ZNF260 (ENSMLEG00000008321) ZNF566 (ENSMLEG00000040163) ENSMLEG00000038805 ZFP82 (ENSMLEG00000030757) ZFP14 (ENSMLEG00000031566) ZNF565 (ENSMLEG00000042219) ZNF146 (ENSMLEG00000001230) ENSMLEG00000033681 CAPNS1 (ENSMLEG00000018194) TBCB (ENSMLEG00000034300) POLR2I (ENSMLEG00000039720) OVOL3 (ENSMLEG00000038854) WDR62 (ENSMLEG00000037433) ENSMLEG00000039761 #22 THAP8 (ENSMLEG00000030286) CLIP3 (ENSMLEG00000043271) ENSMLEG00000028409 SYNE4 (ENSMLEG00000029473) ENSMLEG00000037867 LRFN3 (ENSMLEG00000038574) TYROBP (ENSMLEG00000030554) HCST (ENSMLEG00000021117) NFKBID (ENSMLEG00000029568) APLP1 (ENSMLEG00000040191) KIRREL2 (ENSMLEG00000039259) NPHS1 (ENSMLEG00000034437) PRODH2 (ENSMLEG00000037063) ARHGAP33 (ENSMLEG00000032252) PROSER3 (ENSMLEG00000033383) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 947 RAB11FIP2 (ENSANAG00000020732) ENSANAG00000035863 FAM204A (ENSANAG00000023847) PRLHR (ENSANAG00000009074) CACUL1 (ENSANAG00000034813) EIF3A (ENSANAG00000022156) DENND10 (ENSANAG00000031098) SFXN4 (ENSANAG00000033027) ENSANAG00000023590 GRK5 (ENSANAG00000037217) ENSANAG00000036161 RGS10 (ENSANAG00000037765) ENSANAG00000035819 TIAL1 (ENSANAG00000034445) ENSANAG00000037780 ENSANAG00000035957 #22 BAG3 (ENSANAG00000030494) ENSANAG00000025972 INPP5F (ENSANAG00000022163) MCMBP (ENSANAG00000030926) SEC23IP (ENSANAG00000033397) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Marmoset MODERN SPECIES 3 SPADH (ENSCJAG00000067245) ENSCJAG00000001157 ENSCJAG00000082859 HTRA1 (ENSCJAG00000001226) ENSCJAG00000001251 BTBD16 (ENSCJAG00000001276) TACC2 (ENSCJAG00000001289) ATE1 (ENSCJAG00000001411) FGFR2 (ENSCJAG00000001438) ENSCJAG00000074755 ENSCJAG00000081690 WDR11 (ENSCJAG00000006430) ENSCJAG00000071848 PLPP4 (ENSCJAG00000006402) ENSCJAG00000013460 ENSCJAG00000087246 #22 BAG3 (ENSCJAG00000020374) ENSCJAG00000020378 INPP5F (ENSCJAG00000020379) MCMBP (ENSCJAG00000020390) SEC23IP (ENSCJAG00000019189) ENSCJAG00000086412 ENSCJAG00000069509 ENSCJAG00000059975 TIAL1 (ENSCJAG00000019682) ENSCJAG00000061556 RGS10 (ENSCJAG00000019675) GRK5 (ENSCJAG00000019648) PRDX3 (ENSCJAG00000019636) SFXN4 (ENSCJAG00000034798) DENND10 (ENSCJAG00000019618) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 134 PLEKHF1 (ENSSBOG00000020039) ENSSBOG00000025647 CCNE1 (ENSSBOG00000028300) URI1 (ENSSBOG00000026899) ZNF536 (ENSSBOG00000030032) TSHZ3 (ENSSBOG00000026781) ZNF507 (ENSSBOG00000029395) DPY19L3 (ENSSBOG00000016884) ENSSBOG00000031965 ANKRD27 (ENSSBOG00000003371) TDRD12 (ENSSBOG00000034916) SLC7A9 (ENSSBOG00000026844) CEP89 (ENSSBOG00000020185) ENSSBOG00000032597 RHPN2 (ENSSBOG00000019588) ENSSBOG00000015947 #22 GPATCH1 (ENSSBOG00000034650) WDR88 (ENSSBOG00000025893) LRP3 (ENSSBOG00000035415) SLC7A10 (ENSSBOG00000027542) CEBPG (ENSSBOG00000019291) PEPD (ENSSBOG00000007422) CHST8 (ENSSBOG00000004821) ENSSBOG00000032093 LSM14A (ENSSBOG00000020141) GARRE1 (ENSSBOG00000025947) GPI (ENSSBOG00000026671) PDCD2L (ENSSBOG00000031958) ENSSBOG00000035469 WTIP (ENSSBOG00000026686) ZNF181 (ENSSBOG00000032015) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Rat MODERN SPECIES 11 ENSRNOG00000070040 ENSRNOG00000066265 ENSRNOG00000062856 ENSRNOG00000068842 Selenop (ENSRNOG00000053086) Ccdc152 (ENSRNOG00000039473) Ghr (ENSRNOG00000015654) Fbxo4 (ENSRNOG00000015622) Rimoc1 (ENSRNOG00000052775) Oxct1 (ENSRNOG00000043094) ENSRNOG00000065139 Plcxd3 (ENSRNOG00000014550) C6 (ENSRNOG00000024115) Mroh2b (ENSRNOG00000042327) Card6 (ENSRNOG00000001271) Rpl37 (ENSRNOG00000064545) #22 Prkaa1 (ENSRNOG00000012799) Ttc33 (ENSRNOG00000013217) Ptger4 (ENSRNOG00000013240) Rps15al4 (ENSRNOG00000052207) ENSRNOG00000063101 Dab2 (ENSRNOG00000028930) C9 (ENSRNOG00000013736) Fyb1 (ENSRNOG00000013886) Rictor (ENSRNOG00000011341) Osmr (ENSRNOG00000033192) Lifr (ENSRNOG00000011696) Egflam (ENSRNOG00000012058) Gdnf (ENSRNOG00000012819) Wdr70 (ENSRNOG00000013336) Nup155 (ENSRNOG00000013411) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Prairie vole MODERN SPECIES 85 Pcdh9 (ENSMOCG00000020371) ENSMOCG00000013247 ENSMOCG00000007324 ENSMOCG00000014243 ENSMOCG00000006904 Klhl1 (ENSMOCG00000011384) ENSMOCG00000015959 Mzt1 (ENSMOCG00000019241) Pibf1 (ENSMOCG00000015679) Klf5 (ENSMOCG00000006558) Klf12 (ENSMOCG00000013459) Tbc1d4 (ENSMOCG00000016967) ENSMOCG00000020785 Uchl3 (ENSMOCG00000006170) ENSMOCG00000021202 #22 Lmo7 (ENSMOCG00000015575) Kctd12 (ENSMOCG00000003893) Acod1 (ENSMOCG00000019100) Cln5 (ENSMOCG00000003256) Fbxl3 (ENSMOCG00000010792) Mycbp2 (ENSMOCG00000005187) Scel (ENSMOCG00000007480) Slain1 (ENSMOCG00000008980) ENSMOCG00000003045 Ednrb (ENSMOCG00000001567) Pou4f1 (ENSMOCG00000010670) Obi1 (ENSMOCG00000011940) Rbm26 (ENSMOCG00000019648) Ndfip2 (ENSMOCG00000011647) Spry2 (ENSMOCG00000020005) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 123 PLA2G4D (ENSCLAG00000010697) ENSCLAG00000017787 PLA2G4E (ENSCLAG00000010268) EHD4 (ENSCLAG00000010810) ENSCLAG00000009608 PLA2G4B (ENSCLAG00000008783) JMJD7 (ENSCLAG00000009508) MAPKBP1 (ENSCLAG00000009745) MGA (ENSCLAG00000014067) TYRO3 (ENSCLAG00000009717) RPAP1 (ENSCLAG00000008809) ENSCLAG00000010352 ITPKA (ENSCLAG00000007731) RTF1 (ENSCLAG00000007087) NDUFAF1 (ENSCLAG00000006731) ENSCLAG00000007768 #22 NUSAP1 (ENSCLAG00000012091) OIP5 (ENSCLAG00000012686) CHP1 (ENSCLAG00000009852) ENSCLAG00000009178 ENSCLAG00000017688 INO80 (ENSCLAG00000008397) CHAC1 (ENSCLAG00000008078) DLL4 (ENSCLAG00000011143) VPS18 (ENSCLAG00000009537) ENSCLAG00000009209 RHOV (ENSCLAG00000008701) SPINT1 (ENSCLAG00000011721) ENSCLAG00000011444 ZFYVE19 (ENSCLAG00000013853) C15orf62 (ENSCLAG00000017332) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 CACNA1G (ENSSVLG00005002928) ABCC3 (ENSSVLG00005007311) ANKRD40 (ENSSVLG00005007335) LUC7L3 (ENSSVLG00005007353) ANKRD40CL (ENSSVLG00005007394) WFIKKN2 (ENSSVLG00005007430) TOB1 (ENSSVLG00005007463) SPAG9 (ENSSVLG00005007544) NME1 (ENSSVLG00005007782) NME2 (ENSSVLG00005007836) MBTD1 (ENSSVLG00005007896) UTP18 (ENSSVLG00005007967) ENSSVLG00005007983 CA10 (ENSSVLG00005008014) KIF2B (ENSSVLG00005008107) ENSSVLG00005008126 #22 TOM1L1 (ENSSVLG00005008148) COX11 (ENSSVLG00005008220) STXBP4 (ENSSVLG00005008281) HLF (ENSSVLG00005008325) ENSSVLG00005008375 MMD (ENSSVLG00005008382) SMIM36 (ENSSVLG00005008407) TMEM100 (ENSSVLG00005008462) PCTP (ENSSVLG00005008497) ANKFN1 (ENSSVLG00005008633) NOG (ENSSVLG00005008960) C17orf67 (ENSSVLG00005008977) DGKE (ENSSVLG00005009005) TRIM25 (ENSSVLG00005009042) ENSSVLG00005009077 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.i.b #22 Squirrel MODERN SPECIES 118 ENSSTOG00000032946 CCDC152 (ENSSTOG00000007216) GHR (ENSSTOG00000007190) FBXO4 (ENSSTOG00000021819) RIMOC1 (ENSSTOG00000008291) ENSSTOG00000008271 PLCXD3 (ENSSTOG00000008266) C6 (ENSSTOG00000008232) MROH2B (ENSSTOG00000008175) C7 (ENSSTOG00000019606) CARD6 (ENSSTOG00000027851) ENSSTOG00000033844 #22 PRKAA1 (ENSSTOG00000008118) TTC33 (ENSSTOG00000025089) PTGER4 (ENSSTOG00000024710) ENSSTOG00000028948 DAB2 (ENSSTOG00000002461) C9 (ENSSTOG00000002454) ENSSTOG00000028890 RICTOR (ENSSTOG00000005716) OSMR (ENSSTOG00000005685) LIFR (ENSSTOG00000012582) EGFLAM (ENSSTOG00000012561) ENSSTOG00000032013 GDNF (ENSSTOG00000028754) WDR70 (ENSSTOG00000005031) NUP155 (ENSSTOG00000015151) Amniota ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00500000044987 ENSGT00390000003050 ENSGT00530000063923 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000156804 ENSGT00390000005254.j #22 ENSGT00390000005254.i.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 Sauria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000003050 ENSGT00530000063923 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814.k.a ENSGT00940000156814.k.b ENSGT00940000156804 ENSGT00390000005254.j #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000003050 ENSGT00530000063923 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b 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(ENSCJPG00005007972) OTP (ENSCJPG00005007969) WDR41 (ENSCJPG00005007966) PDE8B (ENSCJPG00005007937) AGGF1 (ENSCJPG00005007934) CRHBP (ENSCJPG00005007931) S100Z (ENSCJPG00005007930) F2RL1 (ENSCJPG00005007928) ENSCJPG00005007926 RPL37 (ENSCJPG00005007923) #22 PRKAA1 (ENSCJPG00005007921) TTC33 (ENSCJPG00005007920) PTGER4 (ENSCJPG00005007909) ENSCJPG00005007873 ENSCJPG00005007870 FYB1 (ENSCJPG00005007860) RICTOR (ENSCJPG00005007227) ENSCJPG00005007226 LIFR (ENSCJPG00005007224) EGFLAM (ENSCJPG00005007208) GDNF (ENSCJPG00005007181) WDR70 (ENSCJPG00005007178) NUP155 (ENSCJPG00005006933) CPLANE1 (ENSCJPG00005006920) NIPBL (ENSCJPG00005006734) Anatidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00500000044987 ENSGT00390000003050 ENSGT01030000235496 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814.k.a ENSGT00940000156804 ENSGT00390000005254.j #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Pink-footed goose MODERN SPECIES 131 ENSABRG00000006389 SELENOP (ENSABRG00000006374) CCDC152 (ENSABRG00000006364) GHR (ENSABRG00000006346) FBXO4 (ENSABRG00000006332) RIMOC1 (ENSABRG00000006314) ENSABRG00000006297 PLCXD3 (ENSABRG00000006284) C6 (ENSABRG00000006262) C7 (ENSABRG00000006244) ENSABRG00000006242 RPL37 (ENSABRG00000006230) #22 PRKAA1 (ENSABRG00000006221) ENSABRG00000006216 PTGER4 (ENSABRG00000006211) DAB2 (ENSABRG00000006154) C9 (ENSABRG00000006141) FYB1 (ENSABRG00000006127) ENSABRG00000006094 OSMR (ENSABRG00000006075) LIFR (ENSABRG00000006039) EGFLAM (ENSABRG00000006013) GDNF (ENSABRG00000005974) WDR70 (ENSABRG00000005828) NUP155 (ENSABRG00000002985) CPLANE1 (ENSABRG00000002600) NIPBL (ENSABRG00000000103) Duck MODERN SPECIES 4281 TMEM267 (ENSAPLG00000023166) ENSAPLG00000027336 HMGCS1 (ENSAPLG00000000587) NIM1K (ENSAPLG00000015565) ZNF131 (ENSAPLG00000026432) SELENOP (ENSAPLG00000028990) CCDC152 (ENSAPLG00000012069) ENSAPLG00000020489 GHR (ENSAPLG00000011650) FBXO4 (ENSAPLG00000023011) RIMOC1 (ENSAPLG00000011429) ENSAPLG00000010383 PLCXD3 (ENSAPLG00000010248) C6 (ENSAPLG00000009882) C7 (ENSAPLG00000009032) RPL37 (ENSAPLG00000024574) #22 PRKAA1 (ENSAPLG00000012738) TTC33 (ENSAPLG00000012734) PTGER4 (ENSAPLG00000017436) ENSAPLG00000028266 ENSAPLG00000021510 TMEM8B (ENSAPLG00000020746) TAF1C (ENSAPLG00000030984) TESK1 (ENSAPLG00000009265) NPR2 (ENSAPLG00000025468) MSMP (ENSAPLG00000018747) RGP1 (ENSAPLG00000006838) GBA2 (ENSAPLG00000021293) TLN1 (ENSAPLG00000004508) TPM2 (ENSAPLG00000004483) ENSAPLG00000030533 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00500000044987 ENSGT00390000003050 ENSGT00530000063923 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ENSGT00940000158865.a ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c.e.a Kakapo MODERN SPECIES 19 NNT (ENSSHBG00005004453) PAIP1 (ENSSHBG00005004461) C5orf34 (ENSSHBG00005004483) TMEM267 (ENSSHBG00005004504) ENSSHBG00005004509 HMGCS1 (ENSSHBG00005004513) NIM1K (ENSSHBG00005004524) ENSSHBG00005004542 SELENOP (ENSSHBG00005004547) GHR (ENSSHBG00005004562) FBXO4 (ENSSHBG00005004572) ENSSHBG00005004582 PLCXD3 (ENSSHBG00005004588) C6 (ENSSHBG00005004594) C7 (ENSSHBG00005004638) RPL37 (ENSSHBG00005004778) #22 ENSSHBG00005004786 TTC33 (ENSSHBG00005004791) PTGER4 (ENSSHBG00005004794) DAB2 (ENSSHBG00005004798) C9 (ENSSHBG00005004807) FYB1 (ENSSHBG00005004815) RICTOR (ENSSHBG00005004989) ENSSHBG00005009009 LIFR (ENSSHBG00005009016) EGFLAM 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(ENSACCG00020015233) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000003050 ENSGT01030000235496 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668.ec.a ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b ENSGT00980000198930 ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814.k.a ENSGT00940000156804 ENSGT00390000005254.j #22 ENSGT00940000158865.a ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c.e.a Great tit MODERN SPECIES 642 TMEM267 (ENSPMJG00000015865) ENSPMJG00000015864 HMGCS1 (ENSPMJG00000015863) NIM1K (ENSPMJG00000015862) ZNF131 (ENSPMJG00000015861) SELENOP (ENSPMJG00000015860) CCDC152 (ENSPMJG00000015859) GHR (ENSPMJG00000015858) FBXO4 (ENSPMJG00000015854) RIMOC1 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ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b ENSGT00980000198930 ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814.k.a ENSGT00940000156804 ENSGT00390000005254.j #22 ENSGT00940000158865.a ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00950000186371 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 Common canary DUPLICATION Common canary MODERN SPECIES 35 ITGA2 (ENSSCAG00000009046) ITGA1 (ENSSCAG00000009032) ENSSCAG00000009021 PARP8 (ENSSCAG00000008693) EMB (ENSSCAG00000008601) HCN1 (ENSSCAG00000008579) GHR (ENSSCAG00000008569) ENSSCAG00000008558 FBXO4 (ENSSCAG00000008556) RIMOC1 (ENSSCAG00000008550) ENSSCAG00000008527 ENSSCAG00000008525 PLCXD3 (ENSSCAG00000008518) C6 (ENSSCAG00000008466) C7 (ENSSCAG00000008418) ENSSCAG00000008409 #22 ENSSCAG00000008395 TTC33 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ENSGFOG00000008987 SLC1A3 (ENSGFOG00000008971) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003050 ENSGT01030000235496 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814.k.a ENSGT00940000156814.k.b ENSGT00940000156804 ENSGT00390000005254.j #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Episquamata ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003050 ENSGT01030000235496 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 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(ENSPTXG00000007804) EGFLAM (ENSPTXG00000007796) GDNF (ENSPTXG00000007789) WDR70 (ENSPTXG00000007785) Mainland tiger snake MODERN SPECIES 15 C5orf34 (ENSNSUG00000017084) TMEM267 (ENSNSUG00000017081) ENSNSUG00000017076 HMGCS1 (ENSNSUG00000017074) NIM1K (ENSNSUG00000017073) ENSNSUG00000017072 SELENOP (ENSNSUG00000017070) GHR (ENSNSUG00000017068) FBXO4 (ENSNSUG00000017066) RIMOC1 (ENSNSUG00000017065) ENSNSUG00000017062 PLCXD3 (ENSNSUG00000017058) ENSNSUG00000016788 ENSNSUG00000016787 C7 (ENSNSUG00000016786) RPL37 (ENSNSUG00000016784) #22 PRKAA1 (ENSNSUG00000016695) ENSNSUG00000016692 ENSNSUG00000016691 PTGER4 (ENSNSUG00000016689) ENSNSUG00000016688 ENSNSUG00000016687 C9 (ENSNSUG00000016686) FYB1 (ENSNSUG00000016685) RICTOR (ENSNSUG00000016683) LIFR (ENSNSUG00000016680) EGFLAM (ENSNSUG00000016679) GDNF (ENSNSUG00000016677) WDR70 (ENSNSUG00000016469) NUP155 (ENSNSUG00000015920) NIPBL (ENSNSUG00000015145) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 2700 RPL37 (ENSLLTG00000002527) #22 Lizard MODERN SPECIES 1 ENSACAG00000039103 HMGCS1 (ENSACAG00000010737) NIM1K (ENSACAG00000010721) ZNF131 (ENSACAG00000010702) SELENOP (ENSACAG00000026650) GHR (ENSACAG00000045331) ENSACAG00000043221 ENSACAG00000037677 FBXO4 (ENSACAG00000010612) RIMOC1 (ENSACAG00000010599) ENSACAG00000010461 PLCXD3 (ENSACAG00000010454) ENSACAG00000010314 ENSACAG00000022087 C7 (ENSACAG00000010303) RPL37 (ENSACAG00000035464) #22 PRKAA1 (ENSACAG00000010236) PTGER4 (ENSACAG00000010213) DAB2 (ENSACAG00000010173) ENSACAG00000010148 ENSACAG00000037160 FYB1 (ENSACAG00000026231) IPO11 (ENSACAG00000008472) DIMT1 (ENSACAG00000008504) KIF2A (ENSACAG00000008507) ZSWIM6 (ENSACAG00000008772) ENSACAG00000008871 NDUFAF2 (ENSACAG00000008879) ERCC8 (ENSACAG00000044507) ELOVL7 (ENSACAG00000008996) DEPDC1B (ENSACAG00000009000) Laterata ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000003050 ENSGT01030000235496 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 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ENSGT00390000005254.i.a #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 Platypus MODERN SPECIES 14 ENSOANG00000005822 SLC1A3 (ENSOANG00000028968) NIPBL (ENSOANG00000009233) CPLANE1 (ENSOANG00000009236) NUP155 (ENSOANG00000011539) WDR70 (ENSOANG00000044568) GDNF (ENSOANG00000005353) EGFLAM (ENSOANG00000051348) LIFR (ENSOANG00000011785) ENSOANG00000010210 RICTOR (ENSOANG00000010208) ENSOANG00000047702 DAB2 (ENSOANG00000010205) PTGER4 (ENSOANG00000000341) TTC33 (ENSOANG00000047394) RPL37 (ENSOANG00000004863) #22 PRKAA1 (ENSOANG00000004087) C7 (ENSOANG00000030433) MROH2B (ENSOANG00000002183) C6 (ENSOANG00000042077) PLCXD3 (ENSOANG00000002823) ENSOANG00000047971 RIMOC1 (ENSOANG00000040123) FBXO4 (ENSOANG00000032980) GHR (ENSOANG00000015024) CCDC152 (ENSOANG00000029600) ENSOANG00000040638 ATOH7 (ENSOANG00000047393) PBLD (ENSOANG00000039180) HNRNPH3 (ENSOANG00000002260) RUFY2 (ENSOANG00000031677) Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 486 PTGER4 (ENSDNOG00000044393) TTC33 (ENSDNOG00000041184) PRKAA1 (ENSDNOG00000034370) RPL37 (ENSDNOG00000040203) #22 CARD6 (ENSDNOG00000000946) ENSDNOG00000047850 #22 C7 (ENSDNOG00000024383) MROH2B (ENSDNOG00000009137) C6 (ENSDNOG00000047186) ENSDNOG00000039934 PLCXD3 (ENSDNOG00000009886) OXCT1 (ENSDNOG00000043891) RIMOC1 (ENSDNOG00000034451) FBXO4 (ENSDNOG00000033184) ENSDNOG00000046709 GHR (ENSDNOG00000037370) CCDC152 (ENSDNOG00000004246) ENSDNOG00000009513 DENND6A (ENSDNOG00000048420) ARF4 (ENSDNOG00000046406) PDE12 (ENSDNOG00000048413) Armadillo MODERN SPECIES 603 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(ENSNVIG00000009844) SWT1 (ENSNVIG00000009874) ENSNVIG00000009928 TRMT1L (ENSNVIG00000009933) RNF2 (ENSNVIG00000009964) ENSNVIG00000009991 #22 NIBAN1 (ENSNVIG00000010027) EDEM3 (ENSNVIG00000010306) CA021 (ENSNVIG00000010379) ENSNVIG00000010405 COLGALT2 (ENSNVIG00000010417) Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Panthera_a DUPLICATION Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00730000111088 ENSGT00390000009628 ENSGT00390000016730 ENSGT00390000001488 ENSGT00940000162720.a.a ENSGT00940000157803 ENSGT00390000005386 ENSGT00940000153167.A.b ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b ENSGT00390000004394 ENSGT00940000161478 ENSGT00390000008676 ENSGT00730000110975 ENSGT00390000002627 ENSGT00940000154485.B ENSGT00390000005254.j.e #22 ENSGT00940000155582 ENSGT00440000038603 leopard MODERN SPECIES 53 BMERB1 (ENSPPRG00000005590) MPV17L (ENSPPRG00000005973) PDXDC1 (ENSPPRG00000010715) NTAN1 (ENSPPRG00000011619) RRN3 (ENSPPRG00000013172) PLA2G10 (ENSPPRG00000013281) BFAR (ENSPPRG00000014174) PARN (ENSPPRG00000018583) MRTFB (ENSPPRG00000024730) ERCC4 (ENSPPRG00000023787) SHISA9 (ENSPPRG00000023574) CPPED1 (ENSPPRG00000023153) SNX29 (ENSPPRG00000000569) ENSPPRG00000000824 TNFRSF17 (ENSPPRG00000000992) ENSPPRG00000002859 #22 GSPT1 (ENSPPRG00000005042) RSL1D1 (ENSPPRG00000005220) ZC3H7A (ENSPPRG00000008257) TXNDC11 (ENSPPRG00000009213) SNN (ENSPPRG00000015862) LITAF (ENSPPRG00000009636) RMI2 (ENSPPRG00000013710) PRM3 (ENSPPRG00000016033) TNP2 (ENSPPRG00000014132) SOCS1 (ENSPPRG00000016042) CLEC16A (ENSPPRG00000022837) DEXI (ENSPPRG00000016256) ENSPPRG00000000664 TVP23A (ENSPPRG00000000890) NUBP1 (ENSPPRG00000001372) lion MODERN SPECIES 16 MPV17L (ENSPLOG00000011620) PDXDC1 (ENSPLOG00000011495) NTAN1 (ENSPLOG00000017760) RRN3 (ENSPLOG00000017031) ENSPLOG00000016879 PLA2G10 (ENSPLOG00000016831) BFAR (ENSPLOG00000016742) PARN (ENSPLOG00000016502) MRTFB (ENSPLOG00000016313) ERCC4 (ENSPLOG00000016255) SHISA9 (ENSPLOG00000016187) CPPED1 (ENSPLOG00000016074) SNX29 (ENSPLOG00000016009) ENSPLOG00000015973 TNFRSF17 (ENSPLOG00000015953) ENSPLOG00000015924 #22 GSPT1 (ENSPLOG00000015716) RSL1D1 (ENSPLOG00000015610) ZC3H7A (ENSPLOG00000015529) ENSPLOG00000015423 TXNDC11 (ENSPLOG00000015360) SNN (ENSPLOG00000015327) LITAF (ENSPLOG00000015282) RMI2 (ENSPLOG00000014600) PRM1 (ENSPLOG00000014558) PRM3 (ENSPLOG00000014538) TNP2 (ENSPLOG00000014505) SOCS1 (ENSPLOG00000014490) CLEC16A (ENSPLOG00000014242) DEXI (ENSPLOG00000014194) CIITA (ENSPLOG00000014048) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j.f #22 lion MODERN SPECIES 9 ENSPLOG00000014040 HGD (ENSPLOG00000013856) ENSPLOG00000013824 RABL3 (ENSPLOG00000013672) GTF2E1 (ENSPLOG00000013622) STXBP5L (ENSPLOG00000012229) POLQ (ENSPLOG00000011699) FBXO40 (ENSPLOG00000011625) HCLS1 (ENSPLOG00000011526) GOLGB1 (ENSPLOG00000011283) IQCB1 (ENSPLOG00000011182) EAF2 (ENSPLOG00000011045) SLC15A2 (ENSPLOG00000010963) ILDR1 (ENSPLOG00000010775) CD86 (ENSPLOG00000010604) ENSPLOG00000010552 #22 CASR (ENSPLOG00000010370) CSTA (ENSPLOG00000010302) MIX23 (ENSPLOG00000010210) FAM162A (ENSPLOG00000010147) WDR5B (ENSPLOG00000010123) KPNA1 (ENSPLOG00000010094) PARP9 (ENSPLOG00000009942) DTX3L (ENSPLOG00000009845) PARP15 (ENSPLOG00000009734) PARP14 (ENSPLOG00000009603) HSPBAP1 (ENSPLOG00000009504) SLC49A4 (ENSPLOG00000009454) SEMA5B (ENSPLOG00000008973) PDIA5 (ENSPLOG00000008785) SEC22A (ENSPLOG00000008711) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000063554.b ENSGT00940000158792 ENSGT00530000063868.b ENSGT00390000013052 ENSGT00810000125439.B ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00390000009776.g.b ENSGT00940000158969 ENSGT00390000016138 ENSGT00950000183205.b.a.b.a.b ENSGT00940000160716 ENSGT00940000155486 ENSGT00940000158917 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00390000002231.d.a ENSGT00390000005254.j #22 ENSGT00940000156749 ENSGT00530000063825.B ENSGT00940000159931 ENSGT00390000002307 ENSGT00940000159065 ENSGT00940000155473 ENSGT00940000161281 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b.f ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT01100000263574.a.m ENSGT01100000263574.a.n ENSGT00730000111596 Bos ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00530000063868.b ENSGT00390000013052 ENSGT00810000125439.B ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00390000009776.g.b ENSGT00940000158969 ENSGT00390000016138 ENSGT00950000183205.b.a.b.a.b ENSGT00940000160716 ENSGT01100000263481.n.a.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000155486 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000158917 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00390000002231.d.a ENSGT00390000005254.j #22 ENSGT00940000156749 ENSGT00530000063825.B ENSGT00940000159931 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000002307 ENSGT00940000159065 ENSGT00940000155473 ENSGT00940000161281 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b.f ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT01100000263574.a.m ENSGT01100000263574.a.n Bos_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000013052 ENSGT00940000157981.b.cb.a.b ENSGT00810000125439.B ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00390000009776.g.b ENSGT00940000158969 ENSGT00390000016138 ENSGT00950000183205.b.a.b.a.b ENSGT00940000160716 ENSGT01100000263481.n.a.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000155486 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000158917 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00390000002231.d.a ENSGT00390000005254.j #22 ENSGT00940000156749 ENSGT00530000063825.B ENSGT00940000159931 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000002307 ENSGT00940000159065 ENSGT00940000155473 ENSGT00940000161281 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b.f ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT01100000263574.a.m ENSGT01100000263574.a.n Cow MODERN SPECIES 24 TMEM117 (ENSBTAG00000032148) ENSBTAG00000032150 NELL2 (ENSBTAG00000032183) DBX2 (ENSBTAG00000006635) ENSBTAG00000026249 ANO6 (ENSBTAG00000002902) ARID2 (ENSBTAG00000011087) SCAF11 (ENSBTAG00000001810) SLC38A1 (ENSBTAG00000000859) SLC38A2 (ENSBTAG00000011105) SLC38A4 (ENSBTAG00000014197) ENSBTAG00000052030 ENSBTAG00000050492 AMIGO2 (ENSBTAG00000002025) PCED1B (ENSBTAG00000011838) ENSBTAG00000038027 #22 RPAP3 (ENSBTAG00000018690) ENDOU (ENSBTAG00000012275) RAPGEF3 (ENSBTAG00000006828) SLC48A1 (ENSBTAG00000032331) HDAC7 (ENSBTAG00000026819) VDR (ENSBTAG00000016414) TMEM106C (ENSBTAG00000000454) COL2A1 (ENSBTAG00000013155) SENP1 (ENSBTAG00000012423) PFKM (ENSBTAG00000000286) ASB8 (ENSBTAG00000000289) CCDC184 (ENSBTAG00000002390) ENSBTAG00000032428 ENSBTAG00000032429 H1-7 (ENSBTAG00000048712) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158792 ENSGT00530000063868.b ENSGT00390000013052 ENSGT00810000125439.B ENSGT00950000183093.A.a ENSGT00940000158969 ENSGT00390000016138 ENSGT00950000183205.b.a.b.a.b ENSGT00940000160716 ENSGT01100000263481.n.a.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000155486 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000158917 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00390000002231.d.a ENSGT00390000005254.j #22 ENSGT00940000156749 ENSGT00530000063825.B ENSGT00940000159931 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000002307 ENSGT00940000159065 ENSGT00940000155473 ENSGT00940000161281 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b.f ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT01100000263574.a.n ENSGT01100000263574.a.m Wild yak MODERN SPECIES 1505 SLC38A1 (ENSBMUG00000004329) SLC38A2 (ENSBMUG00000004267) SLC38A4 (ENSBMUG00000004218) AMIGO2 (ENSBMUG00000004200) PCED1B (ENSBMUG00000004167) ENSBMUG00000004161 #22 Domestic yak MODERN SPECIES 24 TMEM117 (ENSBGRG00000019563) NELL2 (ENSBGRG00000019703) ENSBGRG00000021330 DBX2 (ENSBGRG00000021373) ANO6 (ENSBGRG00000021443) ARID2 (ENSBGRG00000022144) SCAF11 (ENSBGRG00000022234) SLC38A1 (ENSBGRG00000022468) ENSBGRG00000022577 SLC38A2 (ENSBGRG00000022600) ENSBGRG00000022751 SLC38A4 (ENSBGRG00000022761) ENSBGRG00000022830 AMIGO2 (ENSBGRG00000022846) PCED1B (ENSBGRG00000022854) ENSBGRG00000022882 #22 RPAP3 (ENSBGRG00000022895) ENDOU (ENSBGRG00000023048) RAPGEF3 (ENSBGRG00000023304) ENSBGRG00000023626 SLC48A1 (ENSBGRG00000023644) HDAC7 (ENSBGRG00000023703) VDR (ENSBGRG00000024120) TMEM106C (ENSBGRG00000024215) COL2A1 (ENSBGRG00000024422) SENP1 (ENSBGRG00000024903) PFKM (ENSBGRG00000025004) ASB8 (ENSBGRG00000025109) CCDC184 (ENSBGRG00000025146) OR10AD1 (ENSBGRG00000025187) ENSBGRG00000000281 American bison MODERN SPECIES 3008 ARID2 (ENSBBBG00000007979) SCAF11 (ENSBBBG00000002951) SLC38A1 (ENSBBBG00000013825) SLC38A2 (ENSBBBG00000013855) SLC38A4 (ENSBBBG00000002999) AMIGO2 (ENSBBBG00000013887) PCED1B (ENSBBBG00000013892) ENSBBBG00000013896 #22 RPAP3 (ENSBBBG00000003039) ENDOU (ENSBBBG00000003048) RAPGEF3 (ENSBBBG00000003149) SLC48A1 (ENSBBBG00000014099) HDAC7 (ENSBBBG00000014193) VDR (ENSBBBG00000014238) TMEM106C (ENSBBBG00000014271) COL2A1 (ENSBBBG00000003288) SENP1 (ENSBBBG00000014417) PFKM (ENSBBBG00000003512) ASB8 (ENSBBBG00000014631) CCDC184 (ENSBBBG00000014636) OR10AD1 (ENSBBBG00000014653) ZNF641 (ENSBBBG00000003561) ENSBBBG00000006991 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Goat MODERN SPECIES 24 ENSCHIG00000009244 ENSCHIG00000009773 ENSCHIG00000016938 ENSCHIG00000012693 ASB8 (ENSCHIG00000009981) PFKM (ENSCHIG00000025820) SENP1 (ENSCHIG00000021315) COL2A1 (ENSCHIG00000009616) TMEM106C (ENSCHIG00000025500) VDR (ENSCHIG00000023586) HDAC7 (ENSCHIG00000012597) SLC48A1 (ENSCHIG00000012327) RAPGEF3 (ENSCHIG00000010621) ENSCHIG00000018045 RPAP3 (ENSCHIG00000011915) ENSCHIG00000013454 #22 PCED1B (ENSCHIG00000003911) AMIGO2 (ENSCHIG00000013658) SLC38A4 (ENSCHIG00000016540) SLC38A2 (ENSCHIG00000010302) SLC38A1 (ENSCHIG00000001165) ENSCHIG00000011733 SCAF11 (ENSCHIG00000016618) ARID2 (ENSCHIG00000010883) ANO6 (ENSCHIG00000000850) ENSCHIG00000023172 DBX2 (ENSCHIG00000022598) NELL2 (ENSCHIG00000010725) TMEM117 (ENSCHIG00000007627) TWF1 (ENSCHIG00000023302) IRAK4 (ENSCHIG00000017984) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Narwhal MODERN SPECIES 312 SVEP1 (ENSMMNG00015018740) ENSMMNG00015018628 ENSMMNG00015018572 C9orf152 (ENSMMNG00015018536) ENSMMNG00015018334 ENSMMNG00015018173 ENSMMNG00015018159 PTPN3 (ENSMMNG00015017954) EPB41L4B (ENSMMNG00015017649) FRRS1L (ENSMMNG00015017590) TMEM245 (ENSMMNG00015017484) CTNNAL1 (ENSMMNG00015017390) ENSMMNG00015017369 ENSMMNG00015017350 ENSMMNG00015017328 ENSMMNG00015017315 #22 KLF4 (ENSMMNG00015017268) ENSMMNG00015017216 ENSMMNG00015017196 ZNF462 (ENSMMNG00015017137) ENSMMNG00015017099 TMEM38B (ENSMMNG00015016987) TAL2 (ENSMMNG00015016959) FKTN (ENSMMNG00015016876) FSD1L (ENSMMNG00015016595) ENSMMNG00015016537 SLC44A1 (ENSMMNG00015016458) ABCA1 (ENSMMNG00015016187) NIPSNAP3A (ENSMMNG00015016152) ENSMMNG00015016093 OR13F1 (ENSMMNG00015015934) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Capuchin MODERN SPECIES 4 ENSCCAG00000031104 ENSCCAG00000020402 SCOC (ENSCCAG00000037302) CLGN (ENSCCAG00000019261) MGAT4D (ENSCCAG00000030185) ELMOD2 (ENSCCAG00000028648) UCP1 (ENSCCAG00000037986) TBC1D9 (ENSCCAG00000032177) RNF150 (ENSCCAG00000020786) ZNF330 (ENSCCAG00000028900) IL15 (ENSCCAG00000034837) INPP4B (ENSCCAG00000036276) ENSCCAG00000017228 ENSCCAG00000031159 USP38 (ENSCCAG00000036444) ENSCCAG00000017579 #22 GAB1 (ENSCCAG00000027991) SMARCA5 (ENSCCAG00000027215) FREM3 (ENSCCAG00000027764) ENSCCAG00000035001 HHIP (ENSCCAG00000026649) ANAPC10 (ENSCCAG00000022970) ENSCCAG00000021838 ABCE1 (ENSCCAG00000022952) OTUD4 (ENSCCAG00000019901) ENSCCAG00000035581 SMAD1 (ENSCCAG00000031698) MMAA (ENSCCAG00000016061) C4orf51 (ENSCCAG00000028054) ZNF827 (ENSCCAG00000029509) LSM6 (ENSCCAG00000036437) Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 19 TMIGD3 (ENSCJAG00000013385) ENSCJAG00000084304 RAP1A (ENSCJAG00000013392) KCND3 (ENSCJAG00000013456) DDX20 (ENSCJAG00000013428) ENSCJAG00000083135 CTTNBP2NL (ENSCJAG00000058885) WNT2B (ENSCJAG00000013473) ST7L (ENSCJAG00000013490) CAPZA1 (ENSCJAG00000013548) MOV10 (ENSCJAG00000013592) RHOC (ENSCJAG00000042030) PPM1J (ENSCJAG00000013680) ENSCJAG00000069199 SLC16A1 (ENSCJAG00000039688) ENSCJAG00000071583 #22 ENSCJAG00000072462 LRIG2 (ENSCJAG00000013709) ENSCJAG00000045357 MAGI3 (ENSCJAG00000011928) PHTF1 (ENSCJAG00000012018) RSBN1 (ENSCJAG00000012063) PTPN22 (ENSCJAG00000012107) ENSCJAG00000012160 ENSCJAG00000022770 AP4B1 (ENSCJAG00000012178) DCLRE1B (ENSCJAG00000079501) HIPK1 (ENSCJAG00000012221) OLFML3 (ENSCJAG00000075679) ENSCJAG00000041494 ENSCJAG00000074095 Marmoset MODERN SPECIES 2 WNT11 (ENSCJAG00000015296) UVRAG (ENSCJAG00000015319) DGAT2 (ENSCJAG00000015337) MOGAT2 (ENSCJAG00000015357) MAP6 (ENSCJAG00000015365) SERPINH1 (ENSCJAG00000015377) GDPD5 (ENSCJAG00000015399) KLHL35 (ENSCJAG00000015421) RPS3 (ENSCJAG00000015424) ENSCJAG00000072627 ARRB1 (ENSCJAG00000015459) TPBGL (ENSCJAG00000022087) SLCO2B1 (ENSCJAG00000015525) OR2AT4 (ENSCJAG00000015558) ENSCJAG00000022088 ENSCJAG00000067324 #22 NEU3 (ENSCJAG00000015573) SPCS2 (ENSCJAG00000015576) XRRA1 (ENSCJAG00000015587) ENSCJAG00000083650 RNF169 (ENSCJAG00000015610) CHRDL2 (ENSCJAG00000015616) POLD3 (ENSCJAG00000015657) ENSCJAG00000053703 LIPT2 (ENSCJAG00000038278) KCNE3 (ENSCJAG00000042738) PGM2L1 (ENSCJAG00000015692) ENSCJAG00000073784 P4HA3 (ENSCJAG00000015710) PPME1 (ENSCJAG00000015734) C2CD3 (ENSCJAG00000015764) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Drill MODERN SPECIES 1373 ENSMLEG00000026982 #22 GFRA1 (ENSMLEG00000030825) CCDC172 (ENSMLEG00000029061) PNLIPRP3 (ENSMLEG00000044275) PNLIP (ENSMLEG00000039360) PNLIPRP1 (ENSMLEG00000031655) PNLIPRP2 (ENSMLEG00000043570) C10orf82 (ENSMLEG00000019566) HSPA12A (ENSMLEG00000039129) ENO4 (ENSMLEG00000030373) SHTN1 (ENSMLEG00000034796) ENSMLEG00000030765 KCNK18 (ENSMLEG00000043402) SLC18A2 (ENSMLEG00000033472) PDZD8 (ENSMLEG00000033950) EMX2 (ENSMLEG00000039220) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 582 ENSRROG00000018024 MUC6 (ENSRROG00000034477) AP2A2 (ENSRROG00000043320) ENSRROG00000002911 #22 CHID1 (ENSRROG00000042999) TSPAN4 (ENSRROG00000043872) ENSRROG00000045437 CD151 (ENSRROG00000044035) CRACR2B (ENSRROG00000043391) PNPLA2 (ENSRROG00000032539) ENSRROG00000002182 PIDD1 (ENSRROG00000045626) SLC25A22 (ENSRROG00000045321) GATD1 (ENSRROG00000034516) TALDO1 (ENSRROG00000041539) EPS8L2 (ENSRROG00000032799) TMEM80 (ENSRROG00000039844) DEAF1 (ENSRROG00000045008) DRD4 (ENSRROG00000037225) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Gorilla MODERN SPECIES 2 MRGPRD (ENSGGOG00000027003) IGHMBP2 (ENSGGOG00000012131) MRPL21 (ENSGGOG00000012124) ENSGGOG00000001670 TESMIN (ENSGGOG00000001666) GAL (ENSGGOG00000000252) PPP6R3 (ENSGGOG00000006609) LRP5 (ENSGGOG00000000038) C11orf24 (ENSGGOG00000027226) KMT5B (ENSGGOG00000004122) TCIRG1 (ENSGGOG00000005005) NDUFS8 (ENSGGOG00000005001) ALDH3B1 (ENSGGOG00000004995) ENSGGOG00000025959 ENSGGOG00000003630 ENSGGOG00000038633 #22 ALDH3B2 (ENSGGOG00000015729) ACY3 (ENSGGOG00000011979) TBX10 (ENSGGOG00000011961) NUDT8 (ENSGGOG00000011953) ENSGGOG00000023590 NDUFV1 (ENSGGOG00000011943) GSTP1 (ENSGGOG00000013849) ENSGGOG00000010165 CDK2AP2 (ENSGGOG00000010159) PITPNM1 (ENSGGOG00000010148) AIP (ENSGGOG00000010142) TMEM134 (ENSGGOG00000042077) CABP4 (ENSGGOG00000010025) GPR152 (ENSGGOG00000010019) CORO1B (ENSGGOG00000010013) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Pan ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000005535 ENSGT01060000248595.b.a.b.a ENSGT00940000161379 ENSGT00390000009663 ENSGT00390000009899.a.d ENSGT00940000156574.C ENSGT00940000153377.B ENSGT00940000156431 ENSGT00910000148520 ENSGT00950000182939.a.b.b ENSGT00950000182881.a.b.a.b ENSGT00390000003049 ENSGT00940000162915 ENSGT00530000063359.B ENSGT00390000005254.j #22 ENSGT00940000155904.e.b ENSGT00390000001189.b ENSGT00940000154816.a.a ENSGT00940000163889 ENSGT00940000162875 ENSGT00390000010641 ENSGT00940000162460 ENSGT00940000159796 ENSGT00940000160334.i ENSGT00940000161522 ENSGT00390000001289.a ENSGT00390000011766 ENSGT00940000161468 ENSGT01030000234639.B ENSGT00940000159031 Chimpanzee MODERN SPECIES 2 IGHMBP2 (ENSPTRG00000003989) MRPL21 (ENSPTRG00000003988) CPT1A (ENSPTRG00000003987) TESMIN (ENSPTRG00000003986) GAL (ENSPTRG00000003985) PPP6R3 (ENSPTRG00000003984) LRP5 (ENSPTRG00000003983) C11H11orf24 (ENSPTRG00000003982) KMT5B (ENSPTRG00000003981) ENSPTRG00000051044 CHKA (ENSPTRG00000003980) TCIRG1 (ENSPTRG00000003979) NDUFS8 (ENSPTRG00000003978) ALDH3B1 (ENSPTRG00000051435) UNC93B1 (ENSPTRG00000003975) ENSPTRG00000044434 #22 ALDH3B2 (ENSPTRG00000003974) ACY3 (ENSPTRG00000003973) TBX10 (ENSPTRG00000003972) NUDT8 (ENSPTRG00000003971) DOC2G (ENSPTRG00000052755) NDUFV1 (ENSPTRG00000003969) GSTP1 (ENSPTRG00000003968) CABP2 (ENSPTRG00000003967) CDK2AP2 (ENSPTRG00000003966) PITPNM1 (ENSPTRG00000003965) AIP (ENSPTRG00000003964) TMEM134 (ENSPTRG00000003963) CABP4 (ENSPTRG00000050164) GPR152 (ENSPTRG00000003960) CORO1B (ENSPTRG00000003959) Gibbon MODERN SPECIES KCTD10 (ENSNLEG00000001668) UBE3B (ENSNLEG00000001706) ENSNLEG00000002073 MVK (ENSNLEG00000002176) TRPV4 (ENSNLEG00000002222) GLTP (ENSNLEG00000002238) ENSNLEG00000002257 GIT2 (ENSNLEG00000002339) ANKRD13A (ENSNLEG00000002504) ENSNLEG00000002602 ENSNLEG00000002603 IFT81 (ENSNLEG00000002605) ATP2A2 (ENSNLEG00000002636) ENSNLEG00000029890 ANAPC7 (ENSNLEG00000002721) ENSNLEG00000030264 #22 ENSNLEG00000008303 ENSNLEG00000002802 GPN3 (ENSNLEG00000029104) ENSNLEG00000034391 FAM216A (ENSNLEG00000002906) VPS29 (ENSNLEG00000036309) RAD9B (ENSNLEG00000002983) ENSNLEG00000033118 TCTN1 (ENSNLEG00000003041) HVCN1 (ENSNLEG00000003181) PPP1CC (ENSNLEG00000003186) CCDC63 (ENSNLEG00000000444) MYL2 (ENSNLEG00000000446) ENSNLEG00000000469 CUX2 (ENSNLEG00000000470) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j #22 Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j.i.a #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j.i.a #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j.i.a #22 Prairie vole MODERN SPECIES 12 Zdhhc12 (ENSMOCG00000004344) Pkn3 (ENSMOCG00000021624) ENSMOCG00000011320 Dync2i2 (ENSMOCG00000000668) Sptan1 (ENSMOCG00000012343) Gle1 (ENSMOCG00000014845) Odf2 (ENSMOCG00000014613) Cercam (ENSMOCG00000019610) Urm1 (ENSMOCG00000007365) Slc27a4 (ENSMOCG00000009385) Coq4 (ENSMOCG00000016657) Trub2 (ENSMOCG00000014291) ENSMOCG00000013759 Gm13420 (ENSMOCG00000016999) Rapgef1 (ENSMOCG00000003434) ENSMOCG00000001471 #22 Med27 (ENSMOCG00000001125) Ntng2 (ENSMOCG00000007465) Setx (ENSMOCG00000000848) Ttf1 (ENSMOCG00000022131) Cfap77 (ENSMOCG00000010524) Barhl1 (ENSMOCG00000013749) Ddx31 (ENSMOCG00000020938) Gtf3c4 (ENSMOCG00000011365) Ak8 (ENSMOCG00000015262) Spaca9 (ENSMOCG00000014407) Tsc1 (ENSMOCG00000003627) Gfi1b (ENSMOCG00000010408) Gtf3c5 (ENSMOCG00000019295) Cel (ENSMOCG00000016370) Ralgds (ENSMOCG00000018763) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j.i.b #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j.i.b #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j.i.b #22 Prairie vole MODERN SPECIES 114 Hoxb1 (ENSMOCG00000002452) Hoxb2 (ENSMOCG00000014846) Hoxb3 (ENSMOCG00000020739) Hoxb4 (ENSMOCG00000022964) Hoxb5 (ENSMOCG00000014523) Hoxb6 (ENSMOCG00000020355) Hoxb7 (ENSMOCG00000020820) Hoxb8 (ENSMOCG00000018435) Hoxb9 (ENSMOCG00000020312) Hoxb13 (ENSMOCG00000021389) Ttll6 (ENSMOCG00000021089) ENSMOCG00000013163 Ube2z (ENSMOCG00000018241) Snf8 (ENSMOCG00000016684) ENSMOCG00000021226 ENSMOCG00000004266 #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j.i.b #22 Golden Hamster MODERN SPECIES 900 ENSMAUG00000015752 #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j.i.b #22 Rat MODERN SPECIES 8 Prl8a9 (ENSRNOG00000024843) Prl7b1 (ENSRNOG00000016742) Prl7a1l-ps1 (ENSRNOG00000069612) Prl7a4 (ENSRNOG00000029126) Prl7a3 (ENSRNOG00000016616) Prl7d1 (ENSRNOG00000016510) Prl7c1 (ENSRNOG00000047649) Prl2a1 (ENSRNOG00000016463) Prl2c1 (ENSRNOG00000039058) Prl4a1 (ENSRNOG00000016436) Prl5a1 (ENSRNOG00000016307) Prl5a2 (ENSRNOG00000039075) Sox4 (ENSRNOG00000065643) ENSRNOG00000065771 Cdkal1 (ENSRNOG00000018381) RGD1561310 (ENSRNOG00000062739) #22 ENSRNOG00000062512 E2f3 (ENSRNOG00000029273) Mboat1 (ENSRNOG00000027125) Agtr1a (ENSRNOG00000018346) ENSRNOG00000070855 Uqcrfs1 (ENSRNOG00000018281) Dusp22 (ENSRNOG00000056376) Irf4 (ENSRNOG00000061070) Exoc2 (ENSRNOG00000060266) Foxq1 (ENSRNOG00000062314) Foxf2 (ENSRNOG00000063796) Foxc1 (ENSRNOG00000070919) Gmds (ENSRNOG00000017605) Mylk4 (ENSRNOG00000070083) ENSRNOG00000063699 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j.j #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j.j #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005254.j.j #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 11 Mpdz (ENSPEMG00000002221) Lurap1l (ENSPEMG00000028913) ENSPEMG00000026523 Tyrp1 (ENSPEMG00000020081) Ptprd (ENSPEMG00000017837) Dmac1 (ENSPEMG00000004174) ENSPEMG00000014283 Kdm4c (ENSPEMG00000009673) Frmd3 (ENSPEMG00000018030) 2310002L09Rik (ENSPEMG00000011897) Rasef (ENSPEMG00000002797) ENSPEMG00000026811 Tle1 (ENSPEMG00000009903) Megf9 (ENSPEMG00000027304) ENSPEMG00000003929 ENSPEMG00000024652 #22 Brinp1 (ENSPEMG00000009863) Tlr4 (ENSPEMG00000001134) ENSPEMG00000012154 Trim32 (ENSPEMG00000017435) Astn2 (ENSPEMG00000013068) Pappa (ENSPEMG00000002320) ENSPEMG00000030479 Tnc (ENSPEMG00000012234) Tnfsf8 (ENSPEMG00000025214) Tex48 (ENSPEMG00000017861) Tmem268 (ENSPEMG00000023755) ENSPEMG00000029329 Whrn (ENSPEMG00000014874) Akna (ENSPEMG00000009954) ENSPEMG00000007537 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.j #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00530000063460.A.b ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Opossum MODERN SPECIES 2 ENSMODG00000041513 ENSMODG00000038186 ENSMODG00000024848 ENSMODG00000048256 CCDC152 (ENSMODG00000024847) GHR (ENSMODG00000020284) FBXO4 (ENSMODG00000020286) C5orf51 (ENSMODG00000039581) ENSMODG00000020289 ENSMODG00000050297 PLCXD3 (ENSMODG00000020290) C6 (ENSMODG00000020291) MROH2B (ENSMODG00000020294) C7 (ENSMODG00000020299) ENSMODG00000020300 ENSMODG00000020301 #22 PRKAA1 (ENSMODG00000020303) TTC33 (ENSMODG00000049452) PTGER4 (ENSMODG00000020306) ENSMODG00000020307 ENSMODG00000050821 DAB2 (ENSMODG00000020308) C9 (ENSMODG00000020310) ENSMODG00000020311 FYB1 (ENSMODG00000020313) RICTOR (ENSMODG00000020315) ENSMODG00000020318 ENSMODG00000050317 LIFR (ENSMODG00000020327) EGFLAM (ENSMODG00000020329) GDNF (ENSMODG00000020332) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 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C9 (ENSSHAG00000008614) FYB1 (ENSSHAG00000009968) RICTOR (ENSSHAG00000011344) ENSSHAG00000011872 LIFR (ENSSHAG00000014197) EGFLAM (ENSSHAG00000014505) GDNF (ENSSHAG00000017134) ENSSHAG00000029137 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 ENSGT00940000154668 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000010075 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000014416 ENSGT00390000011383 ENSGT00390000009130.b ENSGT00940000158747 ENSGT00940000156814 ENSGT00940000161231 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000162106 ENSGT00390000005254.j #22 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000017462 ENSGT01050000244902.a.a.a.a ENSGT00940000155567 ENSGT00940000159777 ENSGT00940000172494 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000160851 ENSGT00940000155776 ENSGT00940000158504 ENSGT00950000182993.A.b ENSGT00390000015433 ENSGT00390000016532 ENSGT00800000124150 ENSGT00390000010427.c Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000160020 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