Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00940000175507 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 Theria DUPLICATION Theria DUPLICATION Theria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Primates ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 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ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000155263.v ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a.a ENSGT00940000155121 ENSGT00390000004881.z Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00910000147347 ENSGT00940000155059.f.b ENSGT00940000154502.g.b.a.a ENSGT00940000155762 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a.a ENSGT00940000155121 ENSGT00390000004881.z ENSGT00940000159123 ENSGT00910000147783 ENSGT00390000003289 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 792 IL1RAPL1 (ENSPANG00000007585) ENSPANG00000048760 ENSPANG00000040133 DCAF8L1 (ENSPANG00000024278) ENSPANG00000049317 MAGEB10 (ENSPANG00000048909) ENSPANG00000040441 DCAF8L2 (ENSPANG00000046861) ENSPANG00000034100 ENSPANG00000041552 MAGEB5 (ENSPANG00000035394) MAGEB18 (ENSPANG00000039076) ENSPANG00000019440 ENSPANG00000045518 POLA1 (ENSPANG00000010729) ENSPANG00000039655 #22 ARX (ENSPANG00000008103) PCYT1B (ENSPANG00000002970) PDK3 (ENSPANG00000017372) ENSPANG00000042252 ENSPANG00000049773 ENSPANG00000010730 ENSPANG00000020386 ZFX (ENSPANG00000000982) ENSPANG00000045157 ENSPANG00000004507 KLHL15 (ENSPANG00000010573) CXorf58 (ENSPANG00000017030) APOO (ENSPANG00000009164) ENSPANG00000010731 SAT1 (ENSPANG00000004013) Olive baboon MODERN SPECIES 18 CYP7A1 (ENSPANG00000017844) UBXN2B (ENSPANG00000014734) FAM110B (ENSPANG00000013667) ENSPANG00000041025 ENSPANG00000044863 ENSPANG00000042586 ENSPANG00000042702 ENSPANG00000050330 BPNT2 (ENSPANG00000008388) ENSPANG00000048475 ENSPANG00000050287 PENK (ENSPANG00000015057) SDR16C5 (ENSPANG00000005056) CHCHD7 (ENSPANG00000026089) PLAG1 (ENSPANG00000009705) ENSPANG00000018451 #22 LYN (ENSPANG00000024756) TGS1 (ENSPANG00000018910) TMEM68 (ENSPANG00000009706) XKR4 (ENSPANG00000034384) RP1 (ENSPANG00000005975) ENSPANG00000030917 SOX17 (ENSPANG00000044610) ENSPANG00000049863 ENSPANG00000015007 ENSPANG00000009673 TCEA1 (ENSPANG00000018453) RGS20 (ENSPANG00000017181) ATP6V1H (ENSPANG00000015126) ENSPANG00000032914 OPRK1 (ENSPANG00000009674) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 124 ENSGT00390000004690.a.b.h 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CEP135 (ENSMLEG00000042514) ENSMLEG00000016421 #22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 180 ENSCATG00000038972 PDGFRA (ENSCATG00000018830) KIT (ENSCATG00000004601) KDR (ENSCATG00000026660) ENSCATG00000035741 SRD5A3 (ENSCATG00000040052) TMEM165 (ENSCATG00000036895) ENSCATG00000017377 CLOCK (ENSCATG00000002646) PDCL2 (ENSCATG00000041890) ENSCATG00000040815 NMU (ENSCATG00000000632) EXOC1L (ENSCATG00000029322) EXOC1 (ENSCATG00000043473) CEP135 (ENSCATG00000012612) ENSCATG00000020059 #22 CRACD (ENSCATG00000034559) AASDH (ENSCATG00000009332) PPAT (ENSCATG00000000386) PAICS (ENSCATG00000036203) SRP72 (ENSCATG00000008072) ARL9 (ENSCATG00000031380) THEGL (ENSCATG00000041268) ENSCATG00000032783 Macaca ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155059.f.b ENSGT00940000154502.g.b.a.a ENSGT00940000155762 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00910000147608 ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 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ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT01040000240559.a.a.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a.a ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00910000147783 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 18 TOX (ENSMFAG00000017703) NSMAF (ENSMFAG00000003576) SDCBP (ENSMFAG00000037999) ENSMFAG00000049240 CYP7A1 (ENSMFAG00000041863) UBXN2B (ENSMFAG00000014095) FAM110B (ENSMFAG00000038229) BPNT2 (ENSMFAG00000034283) ENSMFAG00000061878 PENK (ENSMFAG00000031729) ENSMFAG00000059119 SDR16C5 (ENSMFAG00000002079) ENSMFAG00000040366 PLAG1 (ENSMFAG00000030888) MOS (ENSMFAG00000012716) RPS20 (ENSMFAG00000053482) #22 ENSMFAG00000049803 LYN (ENSMFAG00000043272) ENSMFAG00000059898 TGS1 (ENSMFAG00000029838) TMEM68 (ENSMFAG00000019904) XKR4 (ENSMFAG00000039071) RP1 (ENSMFAG00000038067) SOX17 (ENSMFAG00000056293) ENSMFAG00000062730 ENSMFAG00000064062 MRPL15 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C18orf32 (ENSNLEG00000011553) ENSNLEG00000029836 ENSNLEG00000034341 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00910000147347 ENSGT00940000155059.e ENSGT00940000154502.g.b.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00390000005254.i.a.b.n.a ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000155263.v ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a ENSGT00940000154185.l.a.b ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155059.e ENSGT00940000154502.g.b.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b.d ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a 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ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.f.c.b ENSGT00940000156694 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a ENSGT00940000154185.l.a.b.a ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 Human MODERN SPECIES 20 CHD7 (ENSG00000171316) RAB2A (ENSG00000104388) CA8 (ENSG00000178538) TOX (ENSG00000198846) NSMAF (ENSG00000035681) SDCBP (ENSG00000137575) CYP7A1 (ENSG00000167910) UBXN2B (ENSG00000215114) FAM110B (ENSG00000169122) BPNT2 (ENSG00000104331) PENK (ENSG00000181195) SDR16C5 (ENSG00000170786) CHCHD7 (ENSG00000170791) PLAG1 (ENSG00000181690) MOS (ENSG00000172680) RPS20 (ENSG00000008988) #22 LYN (ENSG00000254087) TGS1 (ENSG00000137574) TMEM68 (ENSG00000167904) XKR4 (ENSG00000206579) RP1 (ENSG00000104237) SOX17 (ENSG00000164736) MRPL15 (ENSG00000137547) LYPLA1 (ENSG00000120992) TCEA1 (ENSG00000187735) RGS20 (ENSG00000147509) ATP6V1H 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ENSCCAG00000000796 ENSCCAG00000036893 ENSCCAG00000023731 TCEA1 (ENSCCAG00000018619) RGS20 (ENSCCAG00000029095) Capuchin MODERN SPECIES 109 CFAP418 (ENSCCAG00000029098) PLEKHF2 (ENSCCAG00000019372) NDUFAF6 (ENSCCAG00000030934) TP53INP1 (ENSCCAG00000026030) CCNE2 (ENSCCAG00000020230) INTS8 (ENSCCAG00000037448) ENSCCAG00000028912 DPY19L4 (ENSCCAG00000032282) ENSCCAG00000028859 ESRP1 (ENSCCAG00000021066) ENSCCAG00000009664 #22 VIRMA (ENSCCAG00000036600) RAD54B (ENSCCAG00000011754) GEM (ENSCCAG00000005600) CDH17 (ENSCCAG00000028997) ENSCCAG00000033599 PDP1 (ENSCCAG00000036931) ENSCCAG00000021460 TMEM67 (ENSCCAG00000026829) CIBAR1 (ENSCCAG00000034321) TRIQK (ENSCCAG00000021343) RUNX1T1 (ENSCCAG00000025365) SLC26A7 (ENSCCAG00000017342) LRRC69 (ENSCCAG00000032597) OTUD6B (ENSCCAG00000027195) PIP4P2 (ENSCCAG00000026867) Bolivian squirrel monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 119 LTK (ENSSBOG00000020788) ITPKA (ENSSBOG00000020388) RTF1 (ENSSBOG00000034017) NDUFAF1 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monkey MODERN SPECIES 1366 SPART (ENSANAG00000031821) CCDC169 (ENSANAG00000027605) SOHLH2 (ENSANAG00000027740) ENSANAG00000034415 NBEA (ENSANAG00000035835) MAB21L1 (ENSANAG00000006106) ENSANAG00000013822 RFC3 (ENSANAG00000020441) ENSANAG00000025512 ENSANAG00000029740 STARD13 (ENSANAG00000018248) ENSANAG00000030076 KL (ENSANAG00000028905) PDS5B (ENSANAG00000020920) ENSANAG00000037444 ENSANAG00000011089 #22 ENSANAG00000019223 N4BP2L1 (ENSANAG00000029400) BRCA2 (ENSANAG00000025577) ZAR1L (ENSANAG00000037320) FRY (ENSANAG00000030749) ENSANAG00000031194 RXFP2 (ENSANAG00000034315) Mas night monkey MODERN SPECIES 561 ENSANAG00000031741 #22 PTEN (ENSANAG00000033430) KLLN (ENSANAG00000033415) ATAD1 (ENSANAG00000029977) PAPSS2 (ENSANAG00000035795) MINPP1 (ENSANAG00000035646) ENSANAG00000030500 ENSANAG00000030316 ENSANAG00000029474 SGMS1 (ENSANAG00000020922) ENSANAG00000030762 A1CF (ENSANAG00000019974) ENSANAG00000027508 PRKG1 (ENSANAG00000026052) DKK1 (ENSANAG00000020791) ENSANAG00000025343 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 27 ENSMICG00000042671 GRIA4 (ENSMICG00000003112) MSANTD4 (ENSMICG00000036595) KBTBD3 (ENSMICG00000030981) AASDHPPT (ENSMICG00000032630) ENSMICG00000036566 ENSMICG00000035020 GUCY1A2 (ENSMICG00000004925) CWF19L2 (ENSMICG00000010853) ALKBH8 (ENSMICG00000001044) ELMOD1 (ENSMICG00000001050) SLC35F2 (ENSMICG00000000245) ENSMICG00000038149 RAB39A (ENSMICG00000045554) CUL5 (ENSMICG00000000376) ENSMICG00000028194 #22 ACAT1 (ENSMICG00000000380) NPAT (ENSMICG00000000386) ATM (ENSMICG00000013655) ENSMICG00000001104 C11orf65 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ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Glires ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694.hb ENSGT00940000156694.gb ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Pika MODERN SPECIES 3138 RPS20 (ENSOPRG00000011042) #22 LYN (ENSOPRG00000011016) ENSOPRG00000010995 TMEM68 (ENSOPRG00000010979) Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 10 TUBD1 (ENSOCUG00000013772) VMP1 (ENSOCUG00000004210) PTRH2 (ENSOCUG00000023345) CLTC (ENSOCUG00000016413) DHX40 (ENSOCUG00000038496) ENSOCUG00000031327 ENSOCUG00000035846 YPEL2 (ENSOCUG00000020978) GDPD1 (ENSOCUG00000013113) SMG8 (ENSOCUG00000002350) PRR11 (ENSOCUG00000002337) ENSOCUG00000002334 TRIM37 (ENSOCUG00000002326) PPM1E (ENSOCUG00000026526) ENSOCUG00000002269 ENSOCUG00000025769 #22 TEX14 (ENSOCUG00000009775) ENSOCUG00000009757 MTMR4 (ENSOCUG00000009743) HSF5 (ENSOCUG00000009733) RNF43 (ENSOCUG00000009729) SUPT4H1 (ENSOCUG00000025823) TSPOAP1 (ENSOCUG00000009705) MPO (ENSOCUG00000006526) LPO (ENSOCUG00000009698) MKS1 (ENSOCUG00000010018) EPX (ENSOCUG00000010009) OR4D2 (ENSOCUG00000010006) OR4D1 (ENSOCUG00000011022) DYNLL2 (ENSOCUG00000016563) ENSOCUG00000017678 Rabbit MODERN SPECIES 6 RRH (ENSOCUG00000034648) MCUB (ENSOCUG00000013751) LRIT3 (ENSOCUG00000003908) EGF (ENSOCUG00000016388) ELOVL6 (ENSOCUG00000013069) ENPEP (ENSOCUG00000016264) PITX2 (ENSOCUG00000012685) FAM241A (ENSOCUG00000011383) AP1AR (ENSOCUG00000004413) TIFA (ENSOCUG00000017578) ALPK1 (ENSOCUG00000024991) ENSOCUG00000010848 NEUROG2 (ENSOCUG00000007063) ZGRF1 (ENSOCUG00000007057) LARP7 (ENSOCUG00000007073) ENSOCUG00000021222 #22 ANK2 (ENSOCUG00000010618) ENSOCUG00000035520 CAMK2D (ENSOCUG00000023650) ENSOCUG00000030939 UGT8 (ENSOCUG00000015037) NDST4 (ENSOCUG00000007796) ENSOCUG00000002295 ENSOCUG00000003691 TRAM1L1 (ENSOCUG00000003846) ENSOCUG00000038669 NDST3 (ENSOCUG00000009952) PRSS12 (ENSOCUG00000013625) ENSOCUG00000033772 PABPC4L (ENSOCUG00000028226) ENSOCUG00000038661 Rabbit MODERN SPECIES 14 CYP7A1 (ENSOCUG00000012283) UBXN2B (ENSOCUG00000023461) FAM110B (ENSOCUG00000028224) ENSOCUG00000035749 ENSOCUG00000034339 ENSOCUG00000034482 BPNT2 (ENSOCUG00000004428) ENSOCUG00000033892 ENSOCUG00000012122 ENSOCUG00000007052 ENSOCUG00000023853 SDR16C5 (ENSOCUG00000009657) ENSOCUG00000036164 PLAG1 (ENSOCUG00000006001) MOS (ENSOCUG00000014049) ENSOCUG00000003068 #22 LYN (ENSOCUG00000003056) TGS1 (ENSOCUG00000017522) TMEM68 (ENSOCUG00000017517) ENSOCUG00000027524 XKR4 (ENSOCUG00000017875) RP1 (ENSOCUG00000015022) ENSOCUG00000037040 ENSOCUG00000012651 ENSOCUG00000008012 MRPL15 (ENSOCUG00000001949) LYPLA1 (ENSOCUG00000006751) ENSOCUG00000001051 ATP6V1H (ENSOCUG00000016298) OPRK1 (ENSOCUG00000003120) NPBWR1 (ENSOCUG00000028231) Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES ENSOCUG00000030357 ENSOCUG00000038359 ENSOCUG00000030169 ENSOCUG00000037426 ENSOCUG00000031086 INSL6 (ENSOCUG00000013682) ENSOCUG00000037721 JAK2 (ENSOCUG00000016853) RCL1 (ENSOCUG00000008161) ENSOCUG00000013279 ENSOCUG00000011411 CDC37L1 (ENSOCUG00000003468) SPATA6L (ENSOCUG00000003455) PLPP6 (ENSOCUG00000003465) ENSOCUG00000022202 ENSOCUG00000026987 #22 ENSOCUG00000013264 ENSOCUG00000036407 GLIS3 (ENSOCUG00000023004) ENSOCUG00000027590 ENSOCUG00000023393 RFX3 (ENSOCUG00000014086) ENSOCUG00000039572 ENSOCUG00000004189 KCNV2 (ENSOCUG00000004385) VLDLR (ENSOCUG00000002231) ENSOCUG00000022775 SMARCA2 (ENSOCUG00000006320) ENSOCUG00000000241 ENSOCUG00000035677 ENSOCUG00000023438 Rabbit MODERN SPECIES 5 KCNMB3 (ENSOCUG00000010643) MFN1 (ENSOCUG00000000928) GNB4 (ENSOCUG00000000931) ACTL6A (ENSOCUG00000017883) MRPL47 (ENSOCUG00000017886) NDUFB5 (ENSOCUG00000017887) USP13 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ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00940000154383.s.a ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056.f ENSGT00390000011782 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00940000154383.s.a ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056.f ENSGT00390000011782 Steppe mouse MODERN SPECIES 3083 ENSMSIG00000023749 Cyp7a1 (ENSMSIG00000023757) Ubxn2b (ENSMSIG00000023768) ENSMSIG00000023784 Fam110b (ENSMSIG00000023787) ENSMSIG00000023798 ENSMSIG00000023802 Bpnt2 (ENSMSIG00000023807) ENSMSIG00000023818 Penk (ENSMSIG00000023830) Sdr16c6 (ENSMSIG00000023838) Sdr16c5 (ENSMSIG00000023861) Chchd7 (ENSMSIG00000023876) Plag1 (ENSMSIG00000023923) Mos (ENSMSIG00000023932) ENSMSIG00000023940 #22 spretus MODERN SPECIES 13 Rab2a (MGP_SPRETEiJ_G0026744) Car8 (MGP_SPRETEiJ_G0026743) Tox (MGP_SPRETEiJ_G0026742) Nsmaf (MGP_SPRETEiJ_G0026741) Sdcbp (MGP_SPRETEiJ_G0026740) Cyp7a1 (MGP_SPRETEiJ_G0026739) Ubxn2b (MGP_SPRETEiJ_G0026738) Fam110b (MGP_SPRETEiJ_G0026737) MGP_SPRETEiJ_G0026736 Penk (MGP_SPRETEiJ_G0026735) Sdr16c6 (MGP_SPRETEiJ_G0026734) Sdr16c5 (MGP_SPRETEiJ_G0026733) Chchd7 (MGP_SPRETEiJ_G0026732) Plag1 (MGP_SPRETEiJ_G0026731) Mos (MGP_SPRETEiJ_G0026730) Rps20 (MGP_SPRETEiJ_G0026729) #22 Lyn (MGP_SPRETEiJ_G0026728) Tgs1 (MGP_SPRETEiJ_G0026727) MGP_SPRETEiJ_G0026726 MGP_SPRETEiJ_G0026725 Rat MODERN SPECIES 19 RGD1559960 (ENSRNOG00000068175) ENSRNOG00000069656 Sult1c2a (ENSRNOG00000042111) LOC102551938 (ENSRNOG00000067413) LOC120093086 (ENSRNOG00000065530) LOC301165 (ENSRNOG00000046714) Sgo1 (ENSRNOG00000022499) Kat2b (ENSRNOG00000011871) Pp2d1 (ENSRNOG00000004719) Rab5a (ENSRNOG00000057056) LOC103690615 (ENSRNOG00000000124) Efhb (ENSRNOG00000012618) LOC689479 (ENSRNOG00000046576) Kcnh8 (ENSRNOG00000058626) Satb1 (ENSRNOG00000012942) Rps20-ps11 (ENSRNOG00000030345) #22 Tbc1d5 (ENSRNOG00000010637) Plcl2 (ENSRNOG00000013368) ENSRNOG00000064269 LOC120094619 (ENSRNOG00000063528) AABR07066416.2 (ENSRNOG00000046104) ENSRNOG00000070668 LOC120093071 (ENSRNOG00000049503) ENSRNOG00000070131 LOC120094615 (ENSRNOG00000068213) LOC120094611 (ENSRNOG00000066837) LOC108351878 (ENSRNOG00000062425) LOC100360856 (ENSRNOG00000047581) LOC120094612 (ENSRNOG00000064783) LOC120094606 (ENSRNOG00000067046) ENSRNOG00000066561 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00940000154383.s.a ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db.d #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 11 Car8 (ENSPEMG00000019908) Tox (ENSPEMG00000019966) Nsmaf (ENSPEMG00000019696) Sdcbp (ENSPEMG00000020043) Cyp7a1 (ENSPEMG00000019921) Ubxn2b (ENSPEMG00000028233) Fam110b (ENSPEMG00000028969) Bpnt2 (ENSPEMG00000000461) ENSPEMG00000015262 Penk (ENSPEMG00000016794) Sdr16c6 (ENSPEMG00000023129) Sdr16c5 (ENSPEMG00000021917) ENSPEMG00000023256 Plag1 (ENSPEMG00000027390) Mos (ENSPEMG00000008516) ENSPEMG00000029829 #22 Lyn (ENSPEMG00000021545) ENSPEMG00000029859 Tgs1 (ENSPEMG00000007957) Tmem68 (ENSPEMG00000021534) ENSPEMG00000030336 Xkr4 (ENSPEMG00000021985) Rp1 (ENSPEMG00000013397) ENSPEMG00000014386 ENSPEMG00000026817 Sox17 (ENSPEMG00000030488) Mrpl15 (ENSPEMG00000000583) ENSPEMG00000027695 ENSPEMG00000014138 Tcea1 (ENSPEMG00000023948) Rgs20 (ENSPEMG00000009893) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Eurasian red squirrel MODERN SPECIES CA8 (ENSSVLG00005012006) TOX (ENSSVLG00005011958) NSMAF (ENSSVLG00005011910) SDCBP (ENSSVLG00005011445) CYP7A1 (ENSSVLG00005011337) UBXN2B (ENSSVLG00005011261) FAM110B (ENSSVLG00005011236) BPNT2 (ENSSVLG00005011167) PENK (ENSSVLG00005011127) ENSSVLG00005010971 SDR16C5 (ENSSVLG00005010895) ENSSVLG00005010860 CHCHD7 (ENSSVLG00005010790) PLAG1 (ENSSVLG00005010731) MOS (ENSSVLG00005010710) RPS20 (ENSSVLG00005010588) #22 LYN (ENSSVLG00005010475) TGS1 (ENSSVLG00005010446) ENSSVLG00005010412 ENSSVLG00005010285 XKR4 (ENSSVLG00005010234) RP1 (ENSSVLG00005009858) SOX17 (ENSSVLG00005009789) MRPL15 (ENSSVLG00005009764) ENSSVLG00005009666 ENSSVLG00005009646 TCEA1 (ENSSVLG00005009501) RGS20 (ENSSVLG00005009394) ENSSVLG00005009360 ATP6V1H (ENSSVLG00005009299) ENSSVLG00005009270 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000157108 ENSGT00940000159307 ENSGT00940000155894 ENSGT00390000005870 ENSGT00940000157544 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 137 RPS20 (ENSUPAG00010002625) #22 LYN (ENSUPAG00010002635) TMEM68 (ENSUPAG00010002929) XKR4 (ENSUPAG00010002936) RP1 (ENSUPAG00010002942) ENSUPAG00010002961 SOX17 (ENSUPAG00010002964) MRPL15 (ENSUPAG00010002973) LYPLA1 (ENSUPAG00010002986) TCEA1 (ENSUPAG00010003008) ENSUPAG00010003023 RGS20 (ENSUPAG00010003027) ATP6V1H (ENSUPAG00010003037) OPRK1 (ENSUPAG00010003107) ENSUPAG00010003124 NPBWR1 (ENSUPAG00010003128) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 ENSGT00390000003248.a.b.b ##22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.cb ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.cb ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871.v Guinea pig MODERN SPECIES 64 FAM110B (ENSCPOG00000033617) BPNT2 (ENSCPOG00000023705) PENK (ENSCPOG00000031786) ENSCPOG00000020018 SDR16C5 (ENSCPOG00000000571) CHCHD7 (ENSCPOG00000030280) PLAG1 (ENSCPOG00000039131) MOS (ENSCPOG00000020476) ENSCPOG00000011697 #22 ENSCPOG00000030320 LYN (ENSCPOG00000011693) TGS1 (ENSCPOG00000009713) TMEM68 (ENSCPOG00000019826) XKR4 (ENSCPOG00000003676) ENSCPOG00000039324 SOX17 (ENSCPOG00000000892) MRPL15 (ENSCPOG00000035946) LYPLA1 (ENSCPOG00000022715) TCEA1 (ENSCPOG00000005886) ENSCPOG00000038533 ENSCPOG00000022816 ATP6V1H (ENSCPOG00000012174) ENSCPOG00000023180 OPRK1 (ENSCPOG00000006607) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 Degu MODERN SPECIES 126 ENSODEG00000019073 #22 ENSODEG00000004554 ENSODEG00000005181 HMMR (ENSODEG00000004387) ENSODEG00000004867 ENSODEG00000005448 TENM2 (ENSODEG00000005069) WWC1 (ENSODEG00000004850) RARS1 (ENSODEG00000005980) ENSODEG00000005759 FBLL1 (ENSODEG00000019199) PANK3 (ENSODEG00000005503) SLIT3 (ENSODEG00000005145) ENSODEG00000006240 INSYN2B (ENSODEG00000006097) DOCK2 (ENSODEG00000004282) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.b #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.b #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.b #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.b #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.b #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.b #22 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 13 ENSRNOG00000067722 Pdcl (ENSRNOG00000008484) Rc3h2 (ENSRNOG00000009196) Zbtb6 (ENSRNOG00000009340) Zbtb26 (ENSRNOG00000009346) Rabgap1 (ENSRNOG00000009402) Gpr21 (ENSRNOG00000042269) Strbp (ENSRNOG00000010150) RGD1561137 (ENSRNOG00000030143) Crb2 (ENSRNOG00000025498) Dennd1a (ENSRNOG00000010526) Lhx2 (ENSRNOG00000010551) Nek6 (ENSRNOG00000010897) Psmb7 (ENSRNOG00000011732) ENSRNOG00000066446 Rps20 (ENSRNOG00000029627) #22 Nr5a1 (ENSRNOG00000012682) Nr6a1 (ENSRNOG00000013232) Olfml2a (ENSRNOG00000014034) Wdr38 (ENSRNOG00000014102) Rpl35 (ENSRNOG00000014272) Arpc5l (ENSRNOG00000014317) Golga1 (ENSRNOG00000014493) Scai (ENSRNOG00000025278) Ppp6c (ENSRNOG00000015145) AABR07051831.1 (ENSRNOG00000015854) LOC100362366 (ENSRNOG00000028690) Lrp1b (ENSRNOG00000030243) Kynu (ENSRNOG00000029993) Arhgap15 (ENSRNOG00000031168) Gtdc1 (ENSRNOG00000031038) Rat MODERN SPECIES 15 Cyp7a1 (ENSRNOG00000009488) Ubxn2b (ENSRNOG00000071045) ENSRNOG00000063053 Fam110b (ENSRNOG00000009114) ENSRNOG00000069204 Bpnt2 (ENSRNOG00000046647) RGD1563405 (ENSRNOG00000069142) Penk (ENSRNOG00000008943) Sdr16c6 (ENSRNOG00000067216) Sdr16c6 (ENSRNOG00000040151) Sdr16c5 (ENSRNOG00000008871) Chchd7 (ENSRNOG00000031769) Plag1 (ENSRNOG00000008846) LOC100364265 (ENSRNOG00000012088) Mos (ENSRNOG00000008567) Rps20-ps10 (ENSRNOG00000008555) #22 Lyn (ENSRNOG00000008180) Tgs1 (ENSRNOG00000008156) Tmem68 (ENSRNOG00000008872) Xkr4 (ENSRNOG00000027276) Cyld-ps1 (ENSRNOG00000008861) Rp1 (ENSRNOG00000008807) ENSRNOG00000065942 Sumo4 (ENSRNOG00000069967) Sox17 (ENSRNOG00000027357) Mrpl15 (ENSRNOG00000008566) Lypla1 (ENSRNOG00000008320) Tcea1 (ENSRNOG00000022323) Rgs20 (ENSRNOG00000008100) Atp6v1h (ENSRNOG00000030862) Oprk1 (ENSRNOG00000007647) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.b #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.b #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 10 Tmx3 (ENSPEMG00000011968) ENSPEMG00000030219 Dok6 (ENSPEMG00000019316) Cd226 (ENSPEMG00000029583) Rttn (ENSPEMG00000019864) ENSPEMG00000027089 Socs6 (ENSPEMG00000009086) ENSPEMG00000009228 ENSPEMG00000004621 ENSPEMG00000028176 Cbln2 (ENSPEMG00000024653) Neto1 (ENSPEMG00000021247) ENSPEMG00000026675 ENSPEMG00000030444 #22 Fbxo15 (ENSPEMG00000003160) Timm21 (ENSPEMG00000024475) Cyb5a (ENSPEMG00000020270) Gm17266 (ENSPEMG00000031219) Dipk1c (ENSPEMG00000019790) Cndp2 (ENSPEMG00000020038) Cndp1 (ENSPEMG00000017304) Zfp407 (ENSPEMG00000019754) Zadh2 (ENSPEMG00000028418) Tshz1 (ENSPEMG00000022838) Zfp516 (ENSPEMG00000024000) ENSPEMG00000024427 Zfp236 (ENSPEMG00000026320) Mbp (ENSPEMG00000021451) Galr1 (ENSPEMG00000022914) Rodentia DUPLICATION Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.a #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.a #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.a #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.a #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.a #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.a #22 Rat MODERN SPECIES 15 Reck (ENSRNOG00000014863) Or13c7 (ENSRNOG00000068857) Or13c7c (ENSRNOG00000070597) Or13c7b (ENSRNOG00000063480) Or13c7e (ENSRNOG00000065792) Or13c7d (ENSRNOG00000062897) ENSRNOG00000070391 Hrct1 (ENSRNOG00000039336) Or13j1 (ENSRNOG00000066545) Or13e8 (ENSRNOG00000015652) Tmem8b (ENSRNOG00000015664) Fam221b (ENSRNOG00000025453) Hint2 (ENSRNOG00000015866) Spag8 (ENSRNOG00000032539) Npr2 (ENSRNOG00000015991) RGD1562259 (ENSRNOG00000070923) #22 Msmp (ENSRNOG00000043023) Rgp1 (ENSRNOG00000016309) Gba2 (ENSRNOG00000016364) Creb3 (ENSRNOG00000016452) Tln1 (ENSRNOG00000016630) Tpm2 (ENSRNOG00000016731) Car9 (ENSRNOG00000017073) Arhgef39 (ENSRNOG00000021433) Ccdc107 (ENSRNOG00000017253) Sit1 (ENSRNOG00000021546) RGD1560723 (ENSRNOG00000063741) Cd72 (ENSRNOG00000017485) Tesk1 (ENSRNOG00000053729) Fam166b (ENSRNOG00000065204) Rusc2 (ENSRNOG00000045843) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 ENSGT00390000003248.a.b.b ##22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.cb ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871.v ENSGT00940000159969.a Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.cb ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871.v ENSGT00940000159969.a Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.bb.a ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871.v ENSGT00940000159969.a ENSGT00940000159905 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 161 NSMAF (ENSCLAG00000013661) SDCBP (ENSCLAG00000013259) CYP7A1 (ENSCLAG00000012771) UBXN2B (ENSCLAG00000011369) ENSCLAG00000010131 PENK (ENSCLAG00000017733) ENSCLAG00000009495 SDR16C5 (ENSCLAG00000012258) CHCHD7 (ENSCLAG00000009729) PLAG1 (ENSCLAG00000013839) RPS20 (ENSCLAG00000015938) #22 LYN (ENSCLAG00000010085) TGS1 (ENSCLAG00000009468) TMEM68 (ENSCLAG00000009473) XKR4 (ENSCLAG00000010575) ENSCLAG00000011553 MRPL15 (ENSCLAG00000010064) ENSCLAG00000014943 TCEA1 (ENSCLAG00000013516) ENSCLAG00000016009 ATP6V1H (ENSCLAG00000009337) OPRK1 (ENSCLAG00000009850) ENSCLAG00000009340 RB1CC1 (ENSCLAG00000009807) ENSCLAG00000014346 ST18 (ENSCLAG00000011202) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 51 Chd7 (ENSJJAG00000022064) Rab2a (ENSJJAG00000000676) Car8 (ENSJJAG00000000356) Tox (ENSJJAG00000023957) Nsmaf (ENSJJAG00000018732) Sdcbp (ENSJJAG00000008505) Cyp7a1 (ENSJJAG00000009993) Ubxn2b (ENSJJAG00000017241) Fam110b (ENSJJAG00000011482) Bpnt2 (ENSJJAG00000016357) Penk (ENSJJAG00000012141) Sdr16c6 (ENSJJAG00000005653) Sdr16c5 (ENSJJAG00000012889) Chchd7 (ENSJJAG00000004951) Plag1 (ENSJJAG00000008706) ENSJJAG00000000512 #22 Lyn (ENSJJAG00000014669) Tgs1 (ENSJJAG00000016239) Tmem68 (ENSJJAG00000009727) ENSJJAG00000003859 Xkr4 (ENSJJAG00000013870) ENSJJAG00000015642 ENSJJAG00000012132 Sox17 (ENSJJAG00000021381) Mrpl15 (ENSJJAG00000016599) ENSJJAG00000019339 Tcea1 (ENSJJAG00000020282) Rgs20 (ENSJJAG00000004359) Atp6v1h (ENSJJAG00000018257) Oprk1 (ENSJJAG00000019887) ENSJJAG00000011904 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 Prairie vole MODERN SPECIES 356 Spata4 (ENSMOCG00000003714) Asb5 (ENSMOCG00000022930) Spcs3 (ENSMOCG00000022872) Vegfc (ENSMOCG00000021548) ENSMOCG00000007262 ENSMOCG00000018728 Aga (ENSMOCG00000014844) Tenm3 (ENSMOCG00000020342) Dctd (ENSMOCG00000015038) ENSMOCG00000005387 ENSMOCG00000003820 Cldn22 (ENSMOCG00000006954) ENSMOCG00000008252 Cdkn2aip (ENSMOCG00000016713) Ing2 (ENSMOCG00000005078) ENSMOCG00000004967 #22 Rwdd4a (ENSMOCG00000002163) Trappc11 (ENSMOCG00000015798) Stox2 (ENSMOCG00000006233) Enpp6 (ENSMOCG00000021517) Irf2 (ENSMOCG00000013068) Casp3 (ENSMOCG00000011756) Primpol (ENSMOCG00000006815) Cenpu (ENSMOCG00000004846) Acsl1 (ENSMOCG00000008489) Helt (ENSMOCG00000012330) ENSMOCG00000009524 Cfap97 (ENSMOCG00000005943) Snx25 (ENSMOCG00000012866) Lrp2bp (ENSMOCG00000014647) Ankrd37 (ENSMOCG00000011842) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.b.b #22 Rat MODERN SPECIES 18 Htr1b (ENSRNOG00000013042) Mei4 (ENSRNOG00000023794) Irak1bp1 (ENSRNOG00000008984) Phip (ENSRNOG00000008652) Hmgn3 (ENSRNOG00000031032) Lca5 (ENSRNOG00000009580) Sh3bgrl2 (ENSRNOG00000009613) Sh3bgrl2 (ENSRNOG00000068670) ENSRNOG00000066197 Elovl4 (ENSRNOG00000009773) Ttk (ENSRNOG00000029055) Bckdhb (ENSRNOG00000009928) RGD1560917 (ENSRNOG00000034128) Tent5a (ENSRNOG00000010240) Ibtk (ENSRNOG00000027728) LOC100359563 (ENSRNOG00000029843) #22 Tpbg (ENSRNOG00000010694) Ube3d (ENSRNOG00000010802) Dop1a (ENSRNOG00000022847) Pgm3 (ENSRNOG00000009515) Rwdd2a (ENSRNOG00000009599) Me1 (ENSRNOG00000009715) Prss35 (ENSRNOG00000025184) Snap91 (ENSRNOG00000023861) Ripply2 (ENSRNOG00000010004) Cyb5r4 (ENSRNOG00000010024) Mrap2 (ENSRNOG00000010545) Cep162 (ENSRNOG00000010608) Tbx18 (ENSRNOG00000010685) Gabarapl2 (ENSRNOG00000051416) Nt5e (ENSRNOG00000011071) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Kangaroo rat MODERN SPECIES 328 Nsmaf (ENSDORG00000006742) Sdcbp (ENSDORG00000006741) Cyp7a1 (ENSDORG00000004649) Ubxn2b (ENSDORG00000005860) ENSDORG00000026451 Fam110b (ENSDORG00000015721) ENSDORG00000025951 Bpnt2 (ENSDORG00000015489) Penk (ENSDORG00000011721) Sdr16c6 (ENSDORG00000026488) Sdr16c5 (ENSDORG00000004594) ENSDORG00000025931 Chchd7 (ENSDORG00000004592) Plag1 (ENSDORG00000011524) ENSDORG00000029409 Rps20 (ENSDORG00000005794) #22 Lyn (ENSDORG00000000747) Tgs1 (ENSDORG00000012484) ENSDORG00000012483 Xkr4 (ENSDORG00000005763) Rp1 (ENSDORG00000009139) Sox17 (ENSDORG00000027735) Mrpl15 (ENSDORG00000012200) Lypla1 (ENSDORG00000001479) Tcea1 (ENSDORG00000015058) ENSDORG00000006333 Atp6v1h (ENSDORG00000007689) Oprk1 (ENSDORG00000009506) Npbwr1 (ENSDORG00000013949) ENSDORG00000005679 ENSDORG00000029422 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 144 Hipk1 (ENSJJAG00000023146) Olfml3 (ENSJJAG00000021371) Syt6 (ENSJJAG00000020309) Trim33 (ENSJJAG00000012942) ENSJJAG00000007313 Dennd2c (ENSJJAG00000009709) Ampd1 (ENSJJAG00000021675) ENSJJAG00000020941 Csde1 (ENSJJAG00000019571) ENSJJAG00000019089 Nr1h5 (ENSJJAG00000018578) ENSJJAG00000018067 Tshb (ENSJJAG00000001329) Tspan2 (ENSJJAG00000000832) Ngf (ENSJJAG00000022901) ENSJJAG00000021722 #22 Vangl1 (ENSJJAG00000021462) Casq2 (ENSJJAG00000020862) Nhlh2 (ENSJJAG00000019983) Slc22a15 (ENSJJAG00000000255) Mab21l3 (ENSJJAG00000022482) Atp1a1 (ENSJJAG00000020791) Igsf3 (ENSJJAG00000017489) Cd2 (ENSJJAG00000019842) Ptgfrn (ENSJJAG00000019616) Ttf2 (ENSJJAG00000015225) Trim45 (ENSJJAG00000007227) Vtcn1 (ENSJJAG00000019207) ENSJJAG00000018170 Man1a2 (ENSJJAG00000017865) Tent5c (ENSJJAG00000013174) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00940000154383.s.a ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Murinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00940000154383.s.a ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 15 Tmem82 (ENSRNOG00000011970) Plekhm2 (ENSRNOG00000012163) Ddi2 (ENSRNOG00000012274) Agmat (ENSRNOG00000012315) Dnajc16 (ENSRNOG00000012503) Casp9 (ENSRNOG00000012944) Cela2a (ENSRNOG00000013628) Ctrc (ENSRNOG00000013745) Efhd2 (ENSRNOG00000013783) Fhad1 (ENSRNOG00000028064) Tmem51 (ENSRNOG00000014197) ENSRNOG00000070661 Kazn (ENSRNOG00000014322) 6330411D24Rik (ENSRNOG00000065736) Prdm2 (ENSRNOG00000033522) LOC100359951 (ENSRNOG00000071148) #22 ENSRNOG00000070725 Pdpn (ENSRNOG00000014961) Lrrc38 (ENSRNOG00000015264) Pramef27 (ENSRNOG00000027328) Pramef8 (ENSRNOG00000027278) Oog3 (ENSRNOG00000033000) Pramef5 (ENSRNOG00000067307) ENSRNOG00000065869 Oog1 (ENSRNOG00000027142) LOC120103107 (ENSRNOG00000047341) RGD1306186 (ENSRNOG00000037039) Pramef17 (ENSRNOG00000042820) Pramef25 (ENSRNOG00000027000) Pramef20 (ENSRNOG00000053942) Pramef12 (ENSRNOG00000037035) Rat MODERN SPECIES 10 Tat (ENSRNOG00000016348) Marveld3 (ENSRNOG00000016291) Phlpp2 (ENSRNOG00000016108) Ap1g1 (ENSRNOG00000069458) Atxn1l (ENSRNOG00000038766) Zfp821 (ENSRNOG00000000262) Ist1 (ENSRNOG00000015144) Pkd1l3 (ENSRNOG00000052310) Dhodh (ENSRNOG00000015063) Hp (ENSRNOG00000014964) ENSRNOG00000063716 Txnl4b (ENSRNOG00000021379) Dhx38 (ENSRNOG00000014619) Pmfbp1 (ENSRNOG00000014505) Zfhx3 (ENSRNOG00000014452) LOC679899 (ENSRNOG00000069342) #22 Psmd7 (ENSRNOG00000014097) Wwp2 (ENSRNOG00000012937) Nob1 (ENSRNOG00000021890) Nqo1 (ENSRNOG00000012772) Nfat5 (ENSRNOG00000011879) Cyb5b (ENSRNOG00000011142) Terf2 (ENSRNOG00000020435) Tmed6 (ENSRNOG00000020406) Nip7 (ENSRNOG00000020391) Cog8 (ENSRNOG00000020379) Pdf (ENSRNOG00000022303) Vps4a (ENSRNOG00000020351) Sntb2 (ENSRNOG00000020344) Utp4 (ENSRNOG00000020333) Chtf8 (ENSRNOG00000047246) Mus ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00940000154383.s.a ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT01100000265193 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Shrew mouse MODERN SPECIES 14 Rab2a (MGP_PahariEiJ_G0023919) Car8 (MGP_PahariEiJ_G0023918) Tox (MGP_PahariEiJ_G0023917) Nsmaf (MGP_PahariEiJ_G0023916) Sdcbp (MGP_PahariEiJ_G0023915) Cyp7a1 (MGP_PahariEiJ_G0023914) Ubxn2b (MGP_PahariEiJ_G0023913) Fam110b (MGP_PahariEiJ_G0023912) Bpnt2 (MGP_PahariEiJ_G0023911) Penk (MGP_PahariEiJ_G0023910) Sdr16c6 (MGP_PahariEiJ_G0023909) Sdr16c5 (MGP_PahariEiJ_G0023908) Chchd7 (MGP_PahariEiJ_G0023907) Plag1 (MGP_PahariEiJ_G0023906) Mos (MGP_PahariEiJ_G0023905) Rps20 (MGP_PahariEiJ_G0023904) #22 Lyn (MGP_PahariEiJ_G0023903) MGP_PahariEiJ_G0023902 MGP_PahariEiJ_G0023901 MGP_PahariEiJ_G0023900 Xkr4 (MGP_PahariEiJ_G0023899) Rp1 (MGP_PahariEiJ_G0023898) Sox17 (MGP_PahariEiJ_G0023897) Mrpl15 (MGP_PahariEiJ_G0023896) Lypla1 (MGP_PahariEiJ_G0023895) MGP_PahariEiJ_G0023894 Tcea1 (MGP_PahariEiJ_G0023893) Rgs20 (MGP_PahariEiJ_G0023892) Atp6v1h (MGP_PahariEiJ_G0023891) Oprk1 (MGP_PahariEiJ_G0023890) Npbwr1 (MGP_PahariEiJ_G0023889) Mus_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00940000154383.s.a ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056.f ENSGT00390000011782 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 13 Rab2a (MGP_CAROLIEiJ_G0025796) Car8 (MGP_CAROLIEiJ_G0025795) Tox (MGP_CAROLIEiJ_G0025794) Nsmaf (MGP_CAROLIEiJ_G0025793) Sdcbp (MGP_CAROLIEiJ_G0025792) Cyp7a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025791) Ubxn2b (MGP_CAROLIEiJ_G0025790) Fam110b (MGP_CAROLIEiJ_G0025789) Bpnt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0025788) Penk (MGP_CAROLIEiJ_G0025787) Sdr16c6 (MGP_CAROLIEiJ_G0025786) Sdr16c5 (MGP_CAROLIEiJ_G0025785) Chchd7 (MGP_CAROLIEiJ_G0025784) Plag1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025783) Mos (MGP_CAROLIEiJ_G0025782) Rps20 (MGP_CAROLIEiJ_G0025781) #22 MGP_CAROLIEiJ_G0025780 MGP_CAROLIEiJ_G0025779 Tmem68 (MGP_CAROLIEiJ_G0025778) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00940000154383.s.a ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056.f ENSGT00390000011782 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3284 ENSMSIG00000003831 Naaladl2 (ENSMSIG00000003840) ENSMSIG00000003888 ENSMSIG00000003917 #22 Tbl1xr1 (ENSMSIG00000003957) Mouse MODERN SPECIES 13 Car8 (ENSMUSG00000041261) Tox (ENSMUSG00000041272) Nsmaf (ENSMUSG00000028245) Sdcbp (ENSMUSG00000028249) Cyp7a1 (ENSMUSG00000028240) Ubxn2b (ENSMUSG00000028243) Fam110b (ENSMUSG00000049119) Bpnt2 (ENSMUSG00000066324) Penk (ENSMUSG00000045573) Sdr16c6 (ENSMUSG00000071019) Sdr16c5 (ENSMUSG00000028236) Gm11808 (ENSMUSG00000068240) Chchd7 (ENSMUSG00000042198) Plag1 (ENSMUSG00000003282) Mos (ENSMUSG00000078365) Rps20 (ENSMUSG00000028234) #22 Lyn (ENSMUSG00000042228) Tgs1 (ENSMUSG00000028233) Tmem68 (ENSMUSG00000028232) Vmn1r3 (ENSMUSG00000115466) Vmn1r2 (ENSMUSG00000115072) Cricetidae DUPLICATION Cricetidae DUPLICATION Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db.c.a #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db.c.a #22 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 2 Cyp11b2 (ENSMOCG00000001733) Cyp11b1 (ENSMOCG00000020170) ENSMOCG00000015409 ENSMOCG00000008187 Nell2 (ENSMOCG00000002600) Ano6 (ENSMOCG00000018323) ENSMOCG00000016077 ENSMOCG00000019972 Scaf11 (ENSMOCG00000000678) Slc38a1 (ENSMOCG00000006739) Slc38a2 (ENSMOCG00000003601) Slc38a4 (ENSMOCG00000015247) Amigo2 (ENSMOCG00000013021) Pced1b (ENSMOCG00000005496) Rpap3 (ENSMOCG00000021033) ENSMOCG00000005623 #22 Endou (ENSMOCG00000015012) Rapgef3 (ENSMOCG00000002335) Slc48a1 (ENSMOCG00000013448) Hdac7 (ENSMOCG00000019731) ENSMOCG00000013472 Tmem106c (ENSMOCG00000016714) Col2a1 (ENSMOCG00000014833) ENSMOCG00000002706 ENSMOCG00000015383 Pfkm (ENSMOCG00000021333) Asb8 (ENSMOCG00000017776) Ccdc184 (ENSMOCG00000003788) ENSMOCG00000001175 ENSMOCG00000001245 Zfp641 (ENSMOCG00000019174) Prairie vole MODERN SPECIES 9 Tyr (ENSMOCG00000014094) ENSMOCG00000019618 Grm5 (ENSMOCG00000007786) Ctsc (ENSMOCG00000014577) Rab38 (ENSMOCG00000017329) Tmem135 (ENSMOCG00000018801) Fzd4 (ENSMOCG00000003180) ENSMOCG00000004372 Hddc3 (ENSMOCG00000010323) ENSMOCG00000017504 ENSMOCG00000012208 Fes (ENSMOCG00000015972) Furin (ENSMOCG00000010449) Blm (ENSMOCG00000016367) Crtc3 (ENSMOCG00000013330) ENSMOCG00000018309 #22 Iqgap1 (ENSMOCG00000008969) Zscan2 (ENSMOCG00000014314) Wdr73 (ENSMOCG00000015177) Nmb (ENSMOCG00000017100) Sec11a (ENSMOCG00000005585) Zfp592 (ENSMOCG00000019221) Alpk3 (ENSMOCG00000021545) Slc28a1 (ENSMOCG00000008190) Pde8a (ENSMOCG00000005246) Rps17 (ENSMOCG00000018582) Cpeb1 (ENSMOCG00000006902) Ap3b2 (ENSMOCG00000007121) BC048679 (ENSMOCG00000000682) ENSMOCG00000009343 Fsd2 (ENSMOCG00000015179) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db.c.b #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db.c.b #22 Prairie vole MODERN SPECIES 355 ENSMOCG00000005603 Tmem67 (ENSMOCG00000011860) Pdp1 (ENSMOCG00000014340) Cdh17 (ENSMOCG00000010844) Gem (ENSMOCG00000006722) Fsbp (ENSMOCG00000008704) Rad54b (ENSMOCG00000020035) Virma (ENSMOCG00000015388) Esrp1 (ENSMOCG00000013567) Dpy19l4 (ENSMOCG00000007197) Ints8 (ENSMOCG00000017112) Ccne2 (ENSMOCG00000001638) Trp53inp1 (ENSMOCG00000021132) Ndufaf6 (ENSMOCG00000015272) Plekhf2 (ENSMOCG00000002768) ENSMOCG00000002359 #22 Cfap418 (ENSMOCG00000019280) ENSMOCG00000000256 Gdf6 (ENSMOCG00000021011) Asph (ENSMOCG00000013819) Clvs1 (ENSMOCG00000013201) ENSMOCG00000010657 Chd7 (ENSMOCG00000011408) Rab2a (ENSMOCG00000014140) Car8 (ENSMOCG00000018985) Tox (ENSMOCG00000013368) Nsmaf (ENSMOCG00000018628) ENSMOCG00000014994 Cyp7a1 (ENSMOCG00000004265) Ubxn2b (ENSMOCG00000009288) Fam110b (ENSMOCG00000010757) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db.c.b #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 54 ENSCGRG00001013970 ENSCGRG00001004842 Nxph1 (ENSCGRG00001017708) Ica1 (ENSCGRG00001013759) Glcci1 (ENSCGRG00001020867) Umad1 (ENSCGRG00001019337) Rpa3 (ENSCGRG00001004183) Mios (ENSCGRG00001022654) Col28a1 (ENSCGRG00001018669) ENSCGRG00001016873 ASNS (ENSCGRG00001015428) Tac1 (ENSCGRG00001020738) Sdhaf3 (ENSCGRG00001012553) Dlx5 (ENSCGRG00001001362) Dlx6 (ENSCGRG00001015244) ENSCGRG00001016396 #22 Sem1 (ENSCGRG00001000539) ENSCGRG00001023047 Slc25a13 (ENSCGRG00001024718) ENSCGRG00001003096 ENSCGRG00001022786 Pdk4 (ENSCGRG00001014183) Asb4 (ENSCGRG00001002568) Pon2 (ENSCGRG00001017926) Pon3 (ENSCGRG00001017513) Pon1 (ENSCGRG00001017580) ENSCGRG00001022001 ENSCGRG00001012942 ENSCGRG00001010002 Sgce (ENSCGRG00001021015) Casd1 (ENSCGRG00001001133) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00940000154383.s.a ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db.d #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db.d #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000164647 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 136 Car8 (ENSCGRG00001016884) ENSCGRG00001015202 Tox (ENSCGRG00001012296) Nsmaf (ENSCGRG00001000418) Sdcbp (ENSCGRG00001024052) Cyp7a1 (ENSCGRG00001023767) Ubxn2b (ENSCGRG00001022571) Fam110b (ENSCGRG00001016576) Bpnt2 (ENSCGRG00001020859) Penk (ENSCGRG00001017327) Sdr16c6 (ENSCGRG00001015002) Sdr16c5 (ENSCGRG00001012918) Chchd7 (ENSCGRG00001011586) Plag1 (ENSCGRG00001007120) Mos (ENSCGRG00001001977) ENSCGRG00001010356 #22 Lyn (ENSCGRG00001023003) Tgs1 (ENSCGRG00001019470) Tmem68 (ENSCGRG00001014894) ENSCGRG00001014282 ENSCGRG00001013815 ENSCGRG00001010786 Sox17 (ENSCGRG00001009950) ENSCGRG00001020498 ENSCGRG00001016962 ENSCGRG00001000991 Rgs20 (ENSCGRG00001023847) Atp6v1h (ENSCGRG00001018456) Oprk1 (ENSCGRG00001014321) ENSCGRG00001013124 Npbwr1 (ENSCGRG00001001773) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00940000154383.s.a ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db.d #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 12 Zfp821 (ENSMOCG00000021660) Ist1 (ENSMOCG00000001146) Pkd1l3 (ENSMOCG00000021954) ENSMOCG00000017444 ENSMOCG00000011833 Hp (ENSMOCG00000022096) Txnl4b (ENSMOCG00000013902) Dhx38 (ENSMOCG00000016798) Pmfbp1 (ENSMOCG00000008708) Zfhx3 (ENSMOCG00000017998) Psmd7 (ENSMOCG00000018363) Wwp2 (ENSMOCG00000019211) Nob1 (ENSMOCG00000010370) ENSMOCG00000009352 Cntnap4 (ENSMOCG00000005286) ENSMOCG00000010395 #22 Mon1b (ENSMOCG00000003753) Syce1l (ENSMOCG00000022883) Adamts18 (ENSMOCG00000015505) ENSMOCG00000010114 Nudt7 (ENSMOCG00000015530) Vat1l (ENSMOCG00000018479) Clec3a (ENSMOCG00000016149) Wwox (ENSMOCG00000013122) Maf (ENSMOCG00000017607) Dynlrb2 (ENSMOCG00000016123) Cdyl2 (ENSMOCG00000021578) ENSMOCG00000007353 Cenpn (ENSMOCG00000011952) Atmin (ENSMOCG00000020741) 1700030J22Rik (ENSMOCG00000021044) Prairie vole MODERN SPECIES 20 ENSMOCG00000000517 #22 Prairie vole MODERN SPECIES 355 Rab2a (ENSMOCG00000014140) Car8 (ENSMOCG00000018985) Tox (ENSMOCG00000013368) Nsmaf (ENSMOCG00000018628) ENSMOCG00000014994 Cyp7a1 (ENSMOCG00000004265) Ubxn2b (ENSMOCG00000009288) Fam110b (ENSMOCG00000010757) Bpnt2 (ENSMOCG00000015732) ENSMOCG00000003270 Penk (ENSMOCG00000005168) Sdr16c6 (ENSMOCG00000012126) Sdr16c5 (ENSMOCG00000002710) Chchd7 (ENSMOCG00000015783) Plag1 (ENSMOCG00000015674) ENSMOCG00000019980 #22 Lyn (ENSMOCG00000018677) Tgs1 (ENSMOCG00000019560) Tmem68 (ENSMOCG00000004085) ENSMOCG00000017472 Xkr4 (ENSMOCG00000014076) ENSMOCG00000003814 ENSMOCG00000019449 ENSMOCG00000021042 Mrpl15 (ENSMOCG00000015777) ENSMOCG00000018466 Lypla1 (ENSMOCG00000016895) Tcea1 (ENSMOCG00000018663) Rgs20 (ENSMOCG00000021946) Atp6v1h (ENSMOCG00000013542) Oprk1 (ENSMOCG00000021359) Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1100 ENSNGAG00000012102 ENSNGAG00000013595 #22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 826 ENSNGAG00000017707 Bpnt2 (ENSNGAG00000019142) Penk (ENSNGAG00000011902) Sdr16c6 (ENSNGAG00000012717) Sdr16c5 (ENSNGAG00000013369) Chchd7 (ENSNGAG00000013871) Plag1 (ENSNGAG00000014522) Mos (ENSNGAG00000015058) ENSNGAG00000015253 #22 Lyn (ENSNGAG00000016075) Tgs1 (ENSNGAG00000019532) ENSNGAG00000020846 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1279 ENSNGAG00000021481 Hmg20a (ENSNGAG00000021385) Lingo1 (ENSNGAG00000021247) Odf3l1 (ENSNGAG00000020969) ENSNGAG00000020737 #22 Cspg4 (ENSNGAG00000019508) Snx33 (ENSNGAG00000019047) Imp3 (ENSNGAG00000017248) Snupn (ENSNGAG00000018735) Ptpn9 (ENSNGAG00000018454) Sin3a (ENSNGAG00000015781) Man2c1 (ENSNGAG00000015162) Neil1 (ENSNGAG00000012812) Commd4 (ENSNGAG00000007593) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 43 TGM7 (ENSODEG00000016365) ADAL (ENSODEG00000016433) ZSCAN29 (ENSODEG00000016691) TUBGCP4 (ENSODEG00000016217) TP53BP1 (ENSODEG00000016364) MAP1A (ENSODEG00000016751) PPIP5K1 (ENSODEG00000016403) ENSODEG00000016390 PDIA3 (ENSODEG00000016212) ENSODEG00000016295 HYPK (ENSODEG00000016700) MFAP1 (ENSODEG00000016397) ENSODEG00000016060 FRMD5 (ENSODEG00000016269) ENSODEG00000020502 ENSODEG00000016724 #22 GOLM2 (ENSODEG00000016663) ENSODEG00000016525 CTDSPL2 (ENSODEG00000016569) ENSODEG00000016386 SPG11 (ENSODEG00000016165) ENSODEG00000016509 ENSODEG00000015913 CEMIP (ENSODEG00000016192) ENSODEG00000016748 TLNRD1 (ENSODEG00000020545) CFAP161 (ENSODEG00000015893) ENSODEG00000016584 ENSODEG00000016326 STARD5 (ENSODEG00000015843) TMC3 (ENSODEG00000015805) Degu MODERN SPECIES 43 ENSODEG00000020443 CHP1 (ENSODEG00000016900) RTF1 (ENSODEG00000016921) ITPKA (ENSODEG00000016760) ENSODEG00000017041 ENSODEG00000020489 ENSODEG00000020390 MGA (ENSODEG00000017016) ENSODEG00000016967 JMJD7 (ENSODEG00000016738) EHD4 (ENSODEG00000016665) PLA2G4F (ENSODEG00000016568) VPS39 (ENSODEG00000016980) TMEM87A (ENSODEG00000016556) GANC (ENSODEG00000016815) ENSODEG00000017288 #22 CAPN3 (ENSODEG00000017103) ENSODEG00000016557 ENSODEG00000020344 ENSODEG00000016643 ENSODEG00000016623 ENSODEG00000016919 ENSODEG00000016844 CDAN1 (ENSODEG00000016883) ENSODEG00000016839 UBR1 (ENSODEG00000016879) TMEM62 (ENSODEG00000016864) ENSODEG00000017025 TGM5 (ENSODEG00000016333) TGM7 (ENSODEG00000016365) ADAL (ENSODEG00000016433) Guinea pig MODERN SPECIES 25 RCC1 (ENSCPOG00000010069) PHACTR4 (ENSCPOG00000003219) MED18 (ENSCPOG00000038084) SESN2 (ENSCPOG00000000236) ATP5IF1 (ENSCPOG00000030836) DNAJC8 (ENSCPOG00000014652) PTAFR (ENSCPOG00000031748) EYA3 (ENSCPOG00000012512) ENSCPOG00000033302 SMPDL3B (ENSCPOG00000008773) RPA2 (ENSCPOG00000008766) THEMIS2 (ENSCPOG00000033796) PPP1R8 (ENSCPOG00000036078) STX12 (ENSCPOG00000013160) FAM76A (ENSCPOG00000006186) ENSCPOG00000031828 #22 FGR (ENSCPOG00000015092) AHDC1 (ENSCPOG00000022607) WASF2 (ENSCPOG00000012376) GPR3 (ENSCPOG00000027123) CD164L2 (ENSCPOG00000022092) MAP3K6 (ENSCPOG00000012359) SYTL1 (ENSCPOG00000012354) TMEM222 (ENSCPOG00000020198) WDTC1 (ENSCPOG00000012347) SLC9A1 (ENSCPOG00000035897) TENT5B (ENSCPOG00000032542) KDF1 (ENSCPOG00000022999) NUDC (ENSCPOG00000010413) NR0B2 (ENSCPOG00000010409) GPATCH3 (ENSCPOG00000010404) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000153886.a.b.f ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.cb.a.a #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157108 ENSGT00940000159307 ENSGT00940000155894 ENSGT00390000005870 ENSGT00940000157544 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Alpin marmot MODERN SPECIES 16 ARFGEF1 (ENSMMMG00000001982) CPA6 (ENSMMMG00000001953) PREX2 (ENSMMMG00000001880) C8orf34 (ENSMMMG00000001709) ENSMMMG00000001538 CYP7A1 (ENSMMMG00000001515) UBXN2B (ENSMMMG00000001510) FAM110B (ENSMMMG00000001495) ENSMMMG00000001477 PENK (ENSMMMG00000001467) ENSMMMG00000001408 SDR16C5 (ENSMMMG00000001394) CHCHD7 (ENSMMMG00000001389) PLAG1 (ENSMMMG00000001377) MOS (ENSMMMG00000001371) RPS20 (ENSMMMG00000001350) #22 LYN (ENSMMMG00000001265) TGS1 (ENSMMMG00000001130) TMEM68 (ENSMMMG00000001093) RP1 (ENSMMMG00000001046) ENSMMMG00000001041 SOX17 (ENSMMMG00000001029) ENSMMMG00000001024 MRPL15 (ENSMMMG00000001003) LYPLA1 (ENSMMMG00000000994) TCEA1 (ENSMMMG00000000970) ATP6V1H (ENSMMMG00000000819) OPRK1 (ENSMMMG00000000792) ENSMMMG00000000769 ENSMMMG00000000761 NPBWR1 (ENSMMMG00000000755) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00990000212811 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 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ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159905 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 5 ENSRFEG00010007288 TOX (ENSRFEG00010007308) NSMAF (ENSRFEG00010007360) SDCBP (ENSRFEG00010007422) CYP7A1 (ENSRFEG00010007643) UBXN2B (ENSRFEG00010007689) ENSRFEG00010007735 FAM110B (ENSRFEG00010007745) BPNT2 (ENSRFEG00010007765) PENK (ENSRFEG00010007792) ENSRFEG00010007826 SDR16C5 (ENSRFEG00010007843) CHCHD7 (ENSRFEG00010007883) PLAG1 (ENSRFEG00010008003) MOS (ENSRFEG00010008043) RPS20 (ENSRFEG00010008066) #22 LYN (ENSRFEG00010008285) TGS1 (ENSRFEG00010008465) TMEM68 (ENSRFEG00010008543) ENSRFEG00010008656 XKR4 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ENSMLUG00000023216 OPRK1 (ENSMLUG00000015401) TBC1D31 (ENSMLUG00000015809) DERL1 (ENSMLUG00000009085) Equus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00990000212811 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Donkey MODERN SPECIES 3 ENSEASG00005016264 TOX (ENSEASG00005016265) NSMAF (ENSEASG00005016270) SDCBP (ENSEASG00005016275) CYP7A1 (ENSEASG00005016330) UBXN2B (ENSEASG00005016334) FAM110B (ENSEASG00005024095) ENSEASG00005030180 BPNT2 (ENSEASG00005016346) PENK (ENSEASG00005030368) ENSEASG00005016354 SDR16C5 (ENSEASG00005016356) CHCHD7 (ENSEASG00005016359) PLAG1 (ENSEASG00005016361) MOS (ENSEASG00005036688) RPS20 (ENSEASG00005016365) #22 LYN (ENSEASG00005016369) TGS1 (ENSEASG00005016371) TMEM68 (ENSEASG00005016372) XKR4 (ENSEASG00005035480) RP1 (ENSEASG00005016381) SOX17 (ENSEASG00005028498) ENSEASG00005025388 ENSEASG00005035435 ENSEASG00005027512 ENSEASG00005035589 ENSEASG00005029551 LYPLA1 (ENSEASG00005020322) TCEA1 (ENSEASG00005020313) RGS20 (ENSEASG00005020310) ATP6V1H (ENSEASG00005020298) Horse MODERN SPECIES 30 TOX (ENSECAG00000022430) NSMAF (ENSECAG00000000565) SDCBP (ENSECAG00000015053) CYP7A1 (ENSECAG00000012946) UBXN2B (ENSECAG00000017075) FAM110B (ENSECAG00000004777) ENSECAG00000028112 BPNT2 (ENSECAG00000020044) ENSECAG00000056448 PENK (ENSECAG00000024110) ENSECAG00000006420 SDR16C5 (ENSECAG00000008479) CHCHD7 (ENSECAG00000010468) PLAG1 (ENSECAG00000010773) MOS (ENSECAG00000012087) 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ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Camelidae ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Arabian camel MODERN SPECIES 21 RAB2A (ENSCDRG00005020500) CA8 (ENSCDRG00005020483) TOX (ENSCDRG00005020469) NSMAF (ENSCDRG00005020419) SDCBP (ENSCDRG00005020366) CYP7A1 (ENSCDRG00005020352) UBXN2B (ENSCDRG00005020346) FAM110B (ENSCDRG00005020341) ENSCDRG00005020337 PENK (ENSCDRG00005020332) ENSCDRG00005020328 SDR16C5 (ENSCDRG00005020318) CHCHD7 (ENSCDRG00005020260) PLAG1 (ENSCDRG00005020252) MOS (ENSCDRG00005020244) RPS20 (ENSCDRG00005020230) #22 LYN (ENSCDRG00005020208) TGS1 (ENSCDRG00005020178) TMEM68 (ENSCDRG00005020157) ENSCDRG00005020056 SOX17 (ENSCDRG00005020040) MRPL15 (ENSCDRG00005020012) LYPLA1 (ENSCDRG00005019997) TCEA1 (ENSCDRG00005019946) ENSCDRG00005019928 ATP6V1H (ENSCDRG00005019870) OPRK1 (ENSCDRG00005019845) NPBWR1 (ENSCDRG00005019836) ALKAL1 (ENSCDRG00005019754) ST18 (ENSCDRG00005019658) PCMTD1 (ENSCDRG00005019634) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Pecora DUPLICATION Pecora DUPLICATION Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.a #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.a #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.a #22 Bovinae DUPLICATION Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.a.a #22 Bos ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.p.b.b.b ENSGT00940000157417 ENSGT00940000158243 ENSGT00940000161472 ENSGT00390000017666 ENSGT00940000161067 ENSGT00940000162712 ENSGT00940000161933.e ENSGT00940000161933.f ENSGT00520000055955 ENSGT00830000128402 ENSGT00940000157547 ENSGT00390000018436.a.a ENSGT00950000182808.a.a.b.a ENSGT00940000158275 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.a.a #22 ENSGT00940000157120 ENSGT00740000115643 ENSGT00950000183017.a ENSGT00390000010094.a ENSGT00390000003316.d.g.a.a ENSGT00940000158846 ENSGT00390000014318 ENSGT00950000182900.A.b ENSGT00940000155548 ENSGT00940000155076.a ENSGT00940000160169 ENSGT00920000149143 ENSGT00940000161505 ENSGT00940000158191 ENSGT00950000183192.a.a Bos_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155944 ENSGT00940000157417 ENSGT00940000158243 ENSGT00940000161472 ENSGT00390000017666 ENSGT00940000161067 ENSGT00940000162712 ENSGT00940000161933.e ENSGT00940000161933.f ENSGT00520000055955 ENSGT00830000128402 ENSGT00940000157547 ENSGT00390000018436.a.a ENSGT00950000182808.a.a.b.a ENSGT00940000158275 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.a.a #22 ENSGT00940000157120 ENSGT00740000115643 ENSGT00950000183017.a ENSGT00390000010094.a ENSGT00390000003316.d.g.a.a.b ENSGT00940000158846 ENSGT00390000014318 ENSGT00950000182900.A.b ENSGT00940000155548 ENSGT00940000155076.a ENSGT00940000160169 ENSGT00920000149143 ENSGT00940000161505 ENSGT00940000158191 ENSGT00950000183192.a.a Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 1 SIPA1L1 (ENSBIXG00005028352) PCNX1 (ENSBIXG00005002329) MAP3K9 (ENSBIXG00005005038) TTC9 (ENSBIXG00005028903) ENSBIXG00005028916 MED6 (ENSBIXG00005005085) ADAM21 (ENSBIXG00005028972) ENSBIXG00005028980 ENSBIXG00005002066 COX16 (ENSBIXG00005005118) SYNJ2BP (ENSBIXG00005029040) SLC8A3 (ENSBIXG00005029096) SMOC1 (ENSBIXG00005001873) SLC10A1 (ENSBIXG00005005187) SRSF5 (ENSBIXG00005001782) ENSBIXG00005001752 #22 SUSD6 (ENSBIXG00005001703) CCDC177 (ENSBIXG00005001674) PLEKHD1 (ENSBIXG00005001643) SLC39A9 (ENSBIXG00005029879) ENSBIXG00005029870 GALNT16 (ENSBIXG00005029858) EXD2 (ENSBIXG00005029803) DCAF5 (ENSBIXG00005029780) ACTN1 (ENSBIXG00005029682) ZFP36L1 (ENSBIXG00005029639) ENSBIXG00005029630 RAD51B (ENSBIXG00005029614) ZFYVE26 (ENSBIXG00005029551) RDH12 (ENSBIXG00005029526) RDH11 (ENSBIXG00005029495) Cow MODERN SPECIES 1 PCNX1 (ENSBTAG00000012565) MAP3K9 (ENSBTAG00000005700) TTC9 (ENSBTAG00000045604) ENSBTAG00000052827 ADAM20 (ENSBTAG00000038377) MED6 (ENSBTAG00000006786) ADAM21 (ENSBTAG00000003715) ENSBTAG00000037932 ENSBTAG00000054288 COX16 (ENSBTAG00000030595) SYNJ2BP (ENSBTAG00000007586) SLC8A3 (ENSBTAG00000027080) SMOC1 (ENSBTAG00000030599) SLC10A1 (ENSBTAG00000001881) SRSF5 (ENSBTAG00000011596) ENSBTAG00000050645 #22 SUSD6 (ENSBTAG00000003857) CCDC177 (ENSBTAG00000047101) PLEKHD1 (ENSBTAG00000008576) SLC39A9 (ENSBTAG00000017811) ERH (ENSBTAG00000017798) GALNT16 (ENSBTAG00000009998) EXD2 (ENSBTAG00000010052) DCAF5 (ENSBTAG00000048519) ACTN1 (ENSBTAG00000018255) ZFP36L1 (ENSBTAG00000025434) RAD51B (ENSBTAG00000018971) ZFYVE26 (ENSBTAG00000014334) RDH12 (ENSBTAG00000012838) RDH11 (ENSBTAG00000001950) VTI1B (ENSBTAG00000001948) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.p.b.b.b ENSGT00940000157417 ENSGT00940000158243 ENSGT00940000161472 ENSGT00390000017666 ENSGT00940000161067 ENSGT00940000162712 ENSGT00940000161933.e ENSGT00940000161933.f ENSGT00520000055955 ENSGT00830000128402 ENSGT00940000157547 ENSGT00390000018436.a.a ENSGT00950000182808.a.a.b.a ENSGT00940000158275 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.a.a #22 ENSGT00940000157120 ENSGT00740000115643 ENSGT00950000183017.a ENSGT00390000010094.a ENSGT00390000003316.d.g.a.a ENSGT00940000158846 ENSGT00390000014318 ENSGT00950000182900.A.b ENSGT00940000155548 ENSGT00940000155076.a ENSGT00940000160169 ENSGT00920000149143 ENSGT00940000161505 ENSGT00940000158191 ENSGT00950000183192.a.a Domestic yak MODERN SPECIES 2 SIPA1L1 (ENSBGRG00000010469) ENSBGRG00000010436 PCNX1 (ENSBGRG00000009684) MAP3K9 (ENSBGRG00000009390) TTC9 (ENSBGRG00000009323) MED6 (ENSBGRG00000008994) ADAM21 (ENSBGRG00000008955) ENSBGRG00000008921 ENSBGRG00000008867 COX16 (ENSBGRG00000008784) SYNJ2BP (ENSBGRG00000008751) SLC8A3 (ENSBGRG00000008321) SMOC1 (ENSBGRG00000007997) SLC10A1 (ENSBGRG00000007947) SRSF5 (ENSBGRG00000007863) ENSBGRG00000007840 #22 SUSD6 (ENSBGRG00000007738) CCDC177 (ENSBGRG00000007718) PLEKHD1 (ENSBGRG00000007631) SLC39A9 (ENSBGRG00000007464) ENSBGRG00000007387 GALNT16 (ENSBGRG00000007271) EXD2 (ENSBGRG00000007112) DCAF5 (ENSBGRG00000007044) ACTN1 (ENSBGRG00000006595) ZFP36L1 (ENSBGRG00000006544) RAD51B (ENSBGRG00000006291) ZFYVE26 (ENSBGRG00000006154) RDH12 (ENSBGRG00000006048) RDH11 (ENSBGRG00000005960) VTI1B (ENSBGRG00000005918) American bison MODERN SPECIES 3156 TTC9 (ENSBBBG00000024964) ENSBBBG00000024958 MED6 (ENSBBBG00000007826) ENSBBBG00000024889 ADAM20 (ENSBBBG00000024877) ADAM21 (ENSBBBG00000024843) ENSBBBG00000006817 ENSBBBG00000008045 COX16 (ENSBBBG00000006522) SYNJ2BP (ENSBBBG00000024709) SLC8A3 (ENSBBBG00000024696) SMOC1 (ENSBBBG00000006424) SLC10A1 (ENSBBBG00000009026) SRSF5 (ENSBBBG00000024564) SUSD6 (ENSBBBG00000008034) ENSBBBG00000024477 #22 PLEKHD1 (ENSBBBG00000024457) SLC39A9 (ENSBBBG00000009006) ENSBBBG00000024305 GALNT16 (ENSBBBG00000024287) EXD2 (ENSBBBG00000024244) DCAF5 (ENSBBBG00000024180) ACTN1 (ENSBBBG00000008979) RAD51B (ENSBBBG00000006221) ZFYVE26 (ENSBBBG00000008688) RDH12 (ENSBBBG00000006192) RDH11 (ENSBBBG00000023755) VTI1B (ENSBBBG00000006185) ARG2 (ENSBBBG00000023706) ENSBBBG00000023690 PIGH (ENSBBBG00000023681) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.a.b #22 American bison MODERN SPECIES 3059 ENSBBBG00000017478 OTOL1 (ENSBBBG00000017470) ENSBBBG00000017464 SPTSSB (ENSBBBG00000017462) ENSBBBG00000017451 #22 NMD3 (ENSBBBG00000017439) PPM1L (ENSBBBG00000017357) ARL14 (ENSBBBG00000004289) KPNA4 (ENSBBBG00000007462) TRIM59 (ENSBBBG00000004283) SMC4 (ENSBBBG00000017274) IFT80 (ENSBBBG00000017101) C3orf80 (ENSBBBG00000004213) IL12A (ENSBBBG00000017024) SCHIP1 (ENSBBBG00000017002) IQCJ (ENSBBBG00000006892) ENSBBBG00000016927 MFSD1 (ENSBBBG00000016915) RARRES1 (ENSBBBG00000007038) GFM1 (ENSBBBG00000016884) Siberian musk deer MODERN SPECIES 181 CA8 (ENSMMSG00000017738) ENSMMSG00000017777 TOX (ENSMMSG00000017819) NSMAF (ENSMMSG00000017867) ENSMMSG00000018010 CYP7A1 (ENSMMSG00000018193) UBXN2B (ENSMMSG00000018228) FAM110B (ENSMMSG00000018255) BPNT2 (ENSMMSG00000018264) PENK (ENSMMSG00000018295) ENSMMSG00000018326 SDR16C5 (ENSMMSG00000018350) CHCHD7 (ENSMMSG00000018418) PLAG1 (ENSMMSG00000018496) MOS (ENSMMSG00000018521) ENSMMSG00000018541 #22 LYN (ENSMMSG00000018689) TGS1 (ENSMMSG00000018818) TMEM68 (ENSMMSG00000018879) XKR4 (ENSMMSG00000018988) ENSMMSG00000019022 SOX17 (ENSMMSG00000019055) ENSMMSG00000019067 LYPLA1 (ENSMMSG00000019125) TCEA1 (ENSMMSG00000019249) RGS20 (ENSMMSG00000019413) ATP6V1H (ENSMMSG00000019499) OPRK1 (ENSMMSG00000019585) ENSMMSG00000019617 NPBWR1 (ENSMMSG00000019656) RB1CC1 (ENSMMSG00000019672) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.b #22 Yarkand deer MODERN SPECIES B3GNT6 (ENSCHYG00000005731) CAPN5 (ENSCHYG00000005742) MYO7A (ENSCHYG00000005782) ENSCHYG00000005884 ENSCHYG00000006051 ANO3 (ENSCHYG00000006109) MUC15 (ENSCHYG00000006418) SLC5A12 (ENSCHYG00000006464) ENSCHYG00000006539 FIBIN (ENSCHYG00000006554) BBOX1 (ENSCHYG00000006577) CCDC34 (ENSCHYG00000006637) LGR4 (ENSCHYG00000006707) LIN7C (ENSCHYG00000006875) BDNF (ENSCHYG00000006918) ENSCHYG00000006950 #22 KIF18A (ENSCHYG00000006968) METTL15 (ENSCHYG00000007039) ENSCHYG00000007105 ENSCHYG00000007126 KCNA4 (ENSCHYG00000007143) ENSCHYG00000007152 ENSCHYG00000007179 ENSCHYG00000007199 ARL14EP (ENSCHYG00000007219) MPPED2 (ENSCHYG00000007271) DCDC1 (ENSCHYG00000007355) DNAJC24 (ENSCHYG00000007483) IMMP1L (ENSCHYG00000007517) ELP4 (ENSCHYG00000007588) PAX6 (ENSCHYG00000007997) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.b #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.b #22 Goat MODERN SPECIES 5 CA8 (ENSCHIG00000019407) TOX (ENSCHIG00000024631) NSMAF (ENSCHIG00000015908) SDCBP (ENSCHIG00000017671) CYP7A1 (ENSCHIG00000012643) UBXN2B (ENSCHIG00000016275) FAM110B (ENSCHIG00000025189) BPNT2 (ENSCHIG00000012443) ENSCHIG00000013126 PENK (ENSCHIG00000023682) ENSCHIG00000024910 SDR16C5 (ENSCHIG00000020829) CHCHD7 (ENSCHIG00000013735) PLAG1 (ENSCHIG00000000623) MOS (ENSCHIG00000011697) RPS20 (ENSCHIG00000017184) #22 LYN (ENSCHIG00000022450) TGS1 (ENSCHIG00000013976) TMEM68 (ENSCHIG00000023378) XKR4 (ENSCHIG00000012863) RP1 (ENSCHIG00000024939) SOX17 (ENSCHIG00000020928) ENSCHIG00000000811 ENSCHIG00000009109 ENSCHIG00000022556 RGS20 (ENSCHIG00000006425) ATP6V1H (ENSCHIG00000016415) OPRK1 (ENSCHIG00000023230) NPBWR1 (ENSCHIG00000010898) RB1CC1 (ENSCHIG00000017614) ENSCHIG00000027047 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.b #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.b #22 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 5 ENSBIXG00005022654 UBXN2B (ENSBIXG00005022720) ENSBIXG00005022753 ENSBIXG00005022760 FAM110B (ENSBIXG00005003896) ENSBIXG00005022797 BPNT2 (ENSBIXG00005003904) ENSBIXG00005022851 PENK (ENSBIXG00005022883) ENSBIXG00005022898 SDR16C5 (ENSBIXG00005003919) ENSBIXG00005023000 ENSBIXG00005023097 PLAG1 (ENSBIXG00005023155) MOS (ENSBIXG00005007074) ENSBIXG00005003964 #22 LYN (ENSBIXG00005023239) TGS1 (ENSBIXG00005023257) TMEM68 (ENSBIXG00005023366) XKR4 (ENSBIXG00005023413) RP1 (ENSBIXG00005023448) SOX17 (ENSBIXG00005023546) ENSBIXG00005023590 ENSBIXG00005004065 TCEA1 (ENSBIXG00005023901) RGS20 (ENSBIXG00005004106) ENSBIXG00005023996 ENSBIXG00005004122 ENSBIXG00005024120 OPRK1 (ENSBIXG00005024194) NPBWR1 (ENSBIXG00005024209) Siberian musk deer MODERN SPECIES 279 NSUN3 (ENSMMSG00000004538) ARL13B (ENSMMSG00000004620) STX19 (ENSMMSG00000004737) PROS1 (ENSMMSG00000004821) EPHA3 (ENSMMSG00000005101) ENSMMSG00000005161 CSNKA2IP (ENSMMSG00000005187) C3orf38 (ENSMMSG00000005242) ZNF654 (ENSMMSG00000005277) CGGBP1 (ENSMMSG00000005329) POU1F1 (ENSMMSG00000005357) CHMP2B (ENSMMSG00000005505) VGLL3 (ENSMMSG00000005580) CADM2 (ENSMMSG00000005641) ENSMMSG00000005800 #22 ENSMMSG00000005849 ENSMMSG00000005872 Pecora ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502.o.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.u #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040.a ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Yarkand deer MODERN SPECIES 13 CA8 (ENSCHYG00000025104) TOX (ENSCHYG00000025044) NSMAF (ENSCHYG00000024822) SDCBP (ENSCHYG00000024674) CYP7A1 (ENSCHYG00000024626) UBXN2B (ENSCHYG00000024580) FAM110B (ENSCHYG00000024557) ENSCHYG00000024542 ENSCHYG00000024535 BPNT2 (ENSCHYG00000024500) PENK (ENSCHYG00000024468) ENSCHYG00000024371 CHCHD7 (ENSCHYG00000024223) PLAG1 (ENSCHYG00000024189) MOS (ENSCHYG00000024173) RPS20 (ENSCHYG00000024102) #22 LYN (ENSCHYG00000023984) TGS1 (ENSCHYG00000023932) TMEM68 (ENSCHYG00000023790) XKR4 (ENSCHYG00000023732) ENSCHYG00000023702 SOX17 (ENSCHYG00000023663) MRPL15 (ENSCHYG00000023624) LYPLA1 (ENSCHYG00000023356) ENSCHYG00000022967 RGS20 (ENSCHYG00000022852) ATP6V1H (ENSCHYG00000022766) OPRK1 (ENSCHYG00000022698) NPBWR1 (ENSCHYG00000022686) RB1CC1 (ENSCHYG00000022542) ALKAL1 (ENSCHYG00000022488) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502.o.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.u #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040.a ENSGT00940000154185.f ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Siberian musk deer MODERN SPECIES 49 ENSMMSG00000000065 ENSMMSG00000000077 ENSMMSG00000000087 PGBD2 (ENSMMSG00000000103) ZNF692 (ENSMMSG00000000125) ENSMMSG00000000154 SH3BP5L (ENSMMSG00000000169) ENSMMSG00000000198 ENSMMSG00000000214 ENSMMSG00000000224 ENSMMSG00000000240 ENSMMSG00000000251 OR2T11 (ENSMMSG00000000272) ENSMMSG00000000309 ENSMMSG00000000319 ENSMMSG00000000326 #22 OR2G6 (ENSMMSG00000000350) ENSMMSG00000000357 OR2T27 (ENSMMSG00000000365) OR2T1 (ENSMMSG00000000377) OR2T6 (ENSMMSG00000000386) ENSMMSG00000000394 ENSMMSG00000000400 ENSMMSG00000000425 ENSMMSG00000000438 ENSMMSG00000000448 ENSMMSG00000000461 ENSMMSG00000000475 ENSMMSG00000000487 ENSMMSG00000000497 ENSMMSG00000000509 ##12 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502.o.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.u #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040.a ENSGT00940000154185.f ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Caprinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502.o.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.u #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040.a ENSGT00940000154185.f ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 25 CHD7 (ENSOARG00020025706) RAB2A (ENSOARG00020025690) CA8 (ENSOARG00020025684) TOX (ENSOARG00020025664) SDCBP (ENSOARG00020025628) CYP7A1 (ENSOARG00020025602) UBXN2B (ENSOARG00020025589) FAM110B (ENSOARG00020025582) BPNT2 (ENSOARG00020025578) PENK (ENSOARG00020025573) ENSOARG00020025564 SDR16C5 (ENSOARG00020025547) CHCHD7 (ENSOARG00020025533) PLAG1 (ENSOARG00020025527) MOS (ENSOARG00020025525) RPS20 (ENSOARG00020025515) #22 LYN (ENSOARG00020025503) TMEM68 (ENSOARG00020025479) XKR4 (ENSOARG00020025470) RP1 (ENSOARG00020025463) SOX17 (ENSOARG00020025457) MRPL15 (ENSOARG00020025448) LYPLA1 (ENSOARG00020025402) TCEA1 (ENSOARG00020025361) RGS20 (ENSOARG00020025341) ATP6V1H (ENSOARG00020025312) OPRK1 (ENSOARG00020025297) NPBWR1 (ENSOARG00020025293) RB1CC1 (ENSOARG00020025223) ALKAL1 (ENSOARG00020025195) ENSOARG00020025180 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502.o.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.u #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040.a ENSGT00940000154185.f.a ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000010130.f ENSGT00390000003289.g.a ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 American bison MODERN SPECIES 3036 RAB2A (ENSBBBG00000017073) CA8 (ENSBBBG00000017090) TOX (ENSBBBG00000017129) NSMAF (ENSBBBG00000004247) ENSBBBG00000017283 CYP7A1 (ENSBBBG00000008342) UBXN2B (ENSBBBG00000017321) ENSBBBG00000007573 BPNT2 (ENSBBBG00000017338) PENK (ENSBBBG00000017347) ENSBBBG00000017363 SDR16C5 (ENSBBBG00000017391) CHCHD7 (ENSBBBG00000017425) PLAG1 (ENSBBBG00000017437) MOS (ENSBBBG00000004319) RPS20 (ENSBBBG00000017472) #22 LYN (ENSBBBG00000017506) TGS1 (ENSBBBG00000017523) TMEM68 (ENSBBBG00000017572) XKR4 (ENSBBBG00000004357) RP1 (ENSBBBG00000008007) ENSBBBG00000017605 ENSBBBG00000008932 TCEA1 (ENSBBBG00000004377) RGS20 (ENSBBBG00000017756) ENSBBBG00000006782 ENSBBBG00000004389 OPRK1 (ENSBBBG00000017852) NPBWR1 (ENSBBBG00000017860) RB1CC1 (ENSBBBG00000017917) ALKAL1 (ENSBBBG00000004408) Bos ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502.o.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00970000194954 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.u #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 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ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b Domestic yak MODERN SPECIES 24 ENSBGRG00000020011 ENSBGRG00000020063 CAND1 (ENSBGRG00000020115) DYRK2 (ENSBGRG00000020516) ENSBGRG00000020554 ENSBGRG00000020561 IFNG (ENSBGRG00000020571) IL26 (ENSBGRG00000020605) IL22 (ENSBGRG00000020656) MDM1 (ENSBGRG00000020724) RAP1B (ENSBGRG00000021221) NUP107 (ENSBGRG00000021761) ENSBGRG00000022075 MDM2 (ENSBGRG00000022145) CPM (ENSBGRG00000022902) ENSBGRG00000022992 #22 CPSF6 (ENSBGRG00000023026) ENSBGRG00000023194 ENSBGRG00000023254 ENSBGRG00000023317 ENSBGRG00000023368 ENSBGRG00000023386 ENSBGRG00000023408 ENSBGRG00000023471 ENSBGRG00000007422 YEATS4 (ENSBGRG00000007500) FRS2 (ENSBGRG00000007705) CCT2 (ENSBGRG00000007901) LRRC10 (ENSBGRG00000008156) ENSBGRG00000008385 RAB3IP (ENSBGRG00000008446) Wild yak MODERN SPECIES 210 TOX (ENSBMUG00000012126) NSMAF (ENSBMUG00000012057) ENSBMUG00000011917 CYP7A1 (ENSBMUG00000011852) UBXN2B (ENSBMUG00000011833) ENSBMUG00000011815 ENSBMUG00000011795 BPNT2 (ENSBMUG00000011773) PENK (ENSBMUG00000011752) ENSBMUG00000011743 SDR16C5 (ENSBMUG00000011734) ENSBMUG00000011708 ENSBMUG00000011692 PLAG1 (ENSBMUG00000011659) MOS (ENSBMUG00000011644) RPS20 (ENSBMUG00000011614) #22 LYN (ENSBMUG00000011591) TGS1 (ENSBMUG00000011561) TMEM68 (ENSBMUG00000011514) XKR4 (ENSBMUG00000011415) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00970000193421.C.b.d.a.b ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00390000009517.n ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.h ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Blue whale MODERN SPECIES 9 UGGT2 (ENSBMSG00010019576) DNAJC3 (ENSBMSG00010019510) DZIP1 (ENSBMSG00010019461) CLDN10 (ENSBMSG00010019414) ABCC4 (ENSBMSG00010019322) SOX21 (ENSBMSG00010019291) GPR180 (ENSBMSG00010019260) TGDS (ENSBMSG00010019226) DCT (ENSBMSG00010019181) GPC6 (ENSBMSG00010019116) GPC5 (ENSBMSG00010018992) SLITRK5 (ENSBMSG00010018926) SLITRK6 (ENSBMSG00010018912) ENSBMSG00010018896 SLITRK1 (ENSBMSG00010018887) ENSBMSG00010018878 #22 ENSBMSG00010018865 ENSBMSG00010018840 ENSBMSG00010018826 SPRY2 (ENSBMSG00010018812) ENSBMSG00010018790 NDFIP2 (ENSBMSG00010018773) RBM26 (ENSBMSG00010018424) OBI1 (ENSBMSG00010018362) POU4F1 (ENSBMSG00010018346) ENSBMSG00010018327 EDNRB (ENSBMSG00010018307) SLAIN1 (ENSBMSG00010018187) SCEL (ENSBMSG00010018108) ENSBMSG00010018068 ENSBMSG00010018045 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00970000193421.C.b.d.a.b ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00390000009517.n ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.h ENSGT00940000155121.n ENSGT00940000155121.m.b ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158863 ENSGT00970000193421.C.b.d.a.b ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.h ENSGT00940000155121.n ENSGT00940000155121.m.a ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Dolphin MODERN SPECIES 957 TMEM126B (ENSTTRG00000016854) SDR16C5 (ENSTTRG00000016853) CHCHD7 (ENSTTRG00000016852) PLAG1 (ENSTTRG00000016849) RPS20 (ENSTTRG00000016847) #22 LYN (ENSTTRG00000016842) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158863 ENSGT00970000193421.C.b.d.a.b ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502.q.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b 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(ENSSSCG00000040470) #22 LYN (ENSSSCG00000006250) TGS1 (ENSSSCG00000006251) TMEM68 (ENSSSCG00000006252) XKR4 (ENSSSCG00000031813) RP1 (ENSSSCG00000042752) SOX17 (ENSSSCG00000060730) MRPL15 (ENSSSCG00000030578) LYPLA1 (ENSSSCG00000006260) TCEA1 (ENSSSCG00000006261) RGS20 (ENSSSCG00000006262) ATP6V1H (ENSSSCG00000006263) OPRK1 (ENSSSCG00000006264) NPBWR1 (ENSSSCG00000059721) RB1CC1 (ENSSSCG00000028902) ALKAL1 (ENSSSCG00000033922) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 564 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 1927 ENSDNOG00000033422 #22 EGR2 (ENSDNOG00000048621) ADO (ENSDNOG00000048738) ZNF365 (ENSDNOG00000007049) RTKN2 (ENSDNOG00000038486) ARID5B (ENSDNOG00000043861) CABCOCO1 (ENSDNOG00000034594) Armadillo MODERN SPECIES 695 SDR16C5 (ENSDNOG00000036542) CHCHD7 (ENSDNOG00000014484) PLAG1 (ENSDNOG00000041438) MOS (ENSDNOG00000008331) ENSDNOG00000034693 #22 LYN (ENSDNOG00000014741) TGS1 (ENSDNOG00000008353) TMEM68 (ENSDNOG00000044009) ENSDNOG00000009644 ENSDNOG00000046187 Armadillo MODERN SPECIES 1154 ENSDNOG00000009228 VEPH1 (ENSDNOG00000015818) PTX3 (ENSDNOG00000036438) ENSDNOG00000031998 CCNL1 (ENSDNOG00000009325) ENSDNOG00000039650 ENSDNOG00000031446 ENSDNOG00000046381 TIPARP (ENSDNOG00000006676) ENSDNOG00000048811 ENSDNOG00000000752 KCNAB1 (ENSDNOG00000000745) ENSDNOG00000038913 ENSDNOG00000019348 GMPS (ENSDNOG00000017772) ENSDNOG00000040652 #22 SLC33A1 (ENSDNOG00000045008) C3orf33 (ENSDNOG00000031969) PLCH1 (ENSDNOG00000008919) ENSDNOG00000041013 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 173 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 12742 ENSETEG00000009392 #22 Tenrec MODERN SPECIES 190 ENSETEG00000003394 #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 175 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 Hyrax MODERN SPECIES 8847 RPS20 (ENSPCAG00000004300) #22 Elephant MODERN SPECIES 557 METRNL (ENSLAFG00000020822) CYP7A1 (ENSLAFG00000006242) UBXN2B (ENSLAFG00000020868) FAM110B (ENSLAFG00000015139) BPNT2 (ENSLAFG00000004652) PENK (ENSLAFG00000002757) SDR16C5 (ENSLAFG00000013161) CHCHD7 (ENSLAFG00000017177) PLAG1 (ENSLAFG00000013617) MOS (ENSLAFG00000006188) ENSLAFG00000026686 RPS20 (ENSLAFG00000002515) #22 LYN (ENSLAFG00000007811) TGS1 (ENSLAFG00000015386) TMEM68 (ENSLAFG00000014168) XKR4 (ENSLAFG00000008709) RP1 (ENSLAFG00000022734) SOX17 (ENSLAFG00000028829) MRPL15 (ENSLAFG00000008830) LYPLA1 (ENSLAFG00000028778) NPBWR1 (ENSLAFG00000001447) RB1CC1 (ENSLAFG00000015909) ST18 (ENSLAFG00000004212) PCMTD1 (ENSLAFG00000014089) ENSLAFG00000027761 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153886.a.b.d ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694.rb ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153886.a.b.d ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694.rb ENSGT00940000156694.qb ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000021182 CA8 (ENSSHAG00000007782) TOX (ENSSHAG00000007522) NSMAF (ENSSHAG00000012487) SDCBP (ENSSHAG00000012826) CYP7A1 (ENSSHAG00000013201) UBXN2B (ENSSHAG00000003004) FAM110B (ENSSHAG00000024247) BPNT2 (ENSSHAG00000030599) PENK (ENSSHAG00000022421) ENSSHAG00000024007 SDR16C5 (ENSSHAG00000009512) CHCHD7 (ENSSHAG00000010193) PLAG1 (ENSSHAG00000010371) MOS (ENSSHAG00000030233) RPS20 (ENSSHAG00000031978) #22 LYN (ENSSHAG00000011662) TGS1 (ENSSHAG00000012878) TMEM68 (ENSSHAG00000030996) XKR4 (ENSSHAG00000024606) ENSSHAG00000009787 ENSSHAG00000011351 ENSSHAG00000027123 MRPL15 (ENSSHAG00000013435) LYPLA1 (ENSSHAG00000027960) ENSSHAG00000025222 ENSSHAG00000023280 ENSSHAG00000026155 ATP6V1H (ENSSHAG00000014375) OPRK1 (ENSSHAG00000032283) NPBWR1 (ENSSHAG00000006572) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153886.a.b.d ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a ENSGT00940000177933 ENSGT00940000159905 Wallaby MODERN SPECIES 11075 RPS20 (ENSMEUG00000014171) #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.d ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502.a ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a ENSGT00940000177933 ENSGT00940000159905 koala MODERN SPECIES 110 ENSPCIG00000000024 CA8 (ENSPCIG00000000022) ENSPCIG00000000020 TOX (ENSPCIG00000032348) NSMAF (ENSPCIG00000000016) SDCBP (ENSPCIG00000000015) CYP7A1 (ENSPCIG00000005169) UBXN2B (ENSPCIG00000005156) FAM110B (ENSPCIG00000013271) BPNT2 (ENSPCIG00000013018) PENK (ENSPCIG00000016638) SDR16C5 (ENSPCIG00000011567) CHCHD7 (ENSPCIG00000011568) PLAG1 (ENSPCIG00000011571) MOS (ENSPCIG00000011573) RPS20 (ENSPCIG00000011576) #22 LYN (ENSPCIG00000016237) TGS1 (ENSPCIG00000016232) TMEM68 (ENSPCIG00000016228) ENSPCIG00000011774 ENSPCIG00000011781 ENSPCIG00000011782 ENSPCIG00000024928 MRPL15 (ENSPCIG00000011783) LYPLA1 (ENSPCIG00000011784) ENSPCIG00000011786 ENSPCIG00000011787 ATP6V1H (ENSPCIG00000011788) OPRK1 (ENSPCIG00000011789) NPBWR1 (ENSPCIG00000016798) ENSPCIG00000030880 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1064 ABCC9 (ENSVURG00010016276) KCNJ8 (ENSVURG00010016410) LDHB (ENSVURG00010016421) GYS2 (ENSVURG00010016441) ENSVURG00010016461 GOLT1B (ENSVURG00010016474) RECQL (ENSVURG00010016484) PYROXD1 (ENSVURG00010016502) ENSVURG00010016537 SLCO1A2 (ENSVURG00010016568) ENSVURG00010016769 SLCO1C1 (ENSVURG00010016901) PDE3A (ENSVURG00010016911) AEBP2 (ENSVURG00010016921) PLEKHA5 (ENSVURG00010016942) ENSVURG00010017008 #22 CAPZA3 (ENSVURG00010017010) PLCZ1 (ENSVURG00010017021) ENSVURG00010017090 ENSVURG00010017100 LMO3 (ENSVURG00010017118) MGST1 (ENSVURG00010017195) SLC15A5 (ENSVURG00010017212) DERA (ENSVURG00010017235) STRAP (ENSVURG00010017251) EPS8 (ENSVURG00010017309) PTPRO (ENSVURG00010017425) RERG (ENSVURG00010017487) ENSVURG00010017492 PDE6H (ENSVURG00010017494) ARHGDIB (ENSVURG00010017504) Common wonbat MODERN SPECIES 1048 ENSVURG00010020551 ENSVURG00010020540 ENSVURG00010020495 ENSVURG00010020487 ENSVURG00010020451 ENSVURG00010020433 ENSVURG00010020425 ENSVURG00010020408 ENSVURG00010020396 ENSVURG00010020387 ENSVURG00010020378 ENSVURG00010020372 ENSVURG00010020342 ENSVURG00010020326 ENSVURG00010020321 ENSVURG00010020309 #22 ENSVURG00010020295 ENSVURG00010020230 ENSVURG00010020218 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Common wonbat MODERN SPECIES 1049 ARL5A (ENSVURG00010019249) NEB (ENSVURG00010019306) RIF1 (ENSVURG00010019510) TNFAIP6 (ENSVURG00010019533) NMI (ENSVURG00010019539) ENSVURG00010019544 RND3 (ENSVURG00010019553) MMADHC (ENSVURG00010019562) SPART (ENSVURG00010019598) ENSVURG00010019614 ENSVURG00010019621 DCLK1 (ENSVURG00010019643) ENSVURG00010019677 NBEA (ENSVURG00010019712) MAB21L1 (ENSVURG00010019759) ENSVURG00010019764 ##22 RFC3 (ENSVURG00010019770) ENSVURG00010019790 STARD13 (ENSVURG00010019796) KL (ENSVURG00010019815) PDS5B (ENSVURG00010019844) ENSVURG00010019875 ENSVURG00010019878 N4BP2L1 (ENSVURG00010019887) ENSVURG00010019923 ZAR1L (ENSVURG00010020132) FRY (ENSVURG00010020156) RXFP2 (ENSVURG00010020177) B3GLCT (ENSVURG00010020199) HSPH1 (ENSVURG00010020215) ENSVURG00010020232 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 386 CIAO2A (ENSCCAG00000018177) SNX1 (ENSCCAG00000036677) SNX22 (ENSCCAG00000035856) PPIB (ENSCCAG00000037462) CSNK1G1 (ENSCCAG00000028280) PCLAF (ENSCCAG00000035573) TRIP4 (ENSCCAG00000026483) ZNF609 (ENSCCAG00000023662) OAZ2 (ENSCCAG00000031358) RBPMS2 (ENSCCAG00000036496) PIF1 (ENSCCAG00000033317) PLEKHO2 (ENSCCAG00000024801) ANKDD1A (ENSCCAG00000032885) SPG21 (ENSCCAG00000020796) ENSCCAG00000037021 ENSCCAG00000034785 ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 CCDC148 (ENSSVLG00005008598) UPP2 (ENSSVLG00005008546) ENSSVLG00005008520 ACVR1 (ENSSVLG00005008490) ACVR1C (ENSSVLG00005008270) CYTIP (ENSSVLG00005008173) ERMN (ENSSVLG00005008084) ENSSVLG00005008042 GPD2 (ENSSVLG00005007886) NR4A2 (ENSSVLG00005007787) KCNJ3 (ENSSVLG00005007729) ENSSVLG00005007594 RPRM (ENSSVLG00005007559) ENSSVLG00005007524 PRPF40A (ENSSVLG00005007429) ENSSVLG00005007428 ##22 FMNL2 (ENSSVLG00005007277) STAM2 (ENSSVLG00005007197) ENSSVLG00005007179 CACNB4 (ENSSVLG00005005336) ENSSVLG00005004741 ENSSVLG00005004729 NEB (ENSSVLG00005004118) RIF1 (ENSSVLG00005003716) TNFAIP6 (ENSSVLG00005003640) ENSSVLG00005003622 ENSSVLG00005003611 RBM43 (ENSSVLG00005003593) ENSSVLG00005003570 RND3 (ENSSVLG00005003560) ENSSVLG00005003548 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 26 ELMO3 (ENSHGLG00000014154) E2F4 (ENSHGLG00000014276) EXOC3L1 (ENSHGLG00000010315) MATCAP1 (ENSHGLG00000011035) ENSHGLG00000037771 HSF4 (ENSHGLG00000014438) FBXL8 (ENSHGLG00000019079) B3GNT9 (ENSHGLG00000035794) ENSHGLG00000009942 ENSHGLG00000016123 ENSHGLG00000046177 CBFB (ENSHGLG00000050469) CES4A (ENSHGLG00000033432) ENSHGLG00000012610 ENSHGLG00000016814 ENSHGLG00000042617 ##22 ENSHGLG00000042496 ENSHGLG00000014852 ENSHGLG00000014325 ENSHGLG00000018728 ENSHGLG00000038905 ENSHGLG00000011239 CDH13 (ENSHGLG00000016234) HSBP1 (ENSHGLG00000044111) OSGIN1 (ENSHGLG00000019076) SLC38A8 (ENSHGLG00000018305) MBTPS1 (ENSHGLG00000016427) HSDL1 (ENSHGLG00000014586) TAF1C (ENSHGLG00000019282) ADAD2 (ENSHGLG00000014351) KCNG4 (ENSHGLG00000014193) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 55 ENSCCAG00000032549 BOD1L2 (ENSCCAG00000003679) ST8SIA3 (ENSCCAG00000023718) ONECUT2 (ENSCCAG00000000967) FECH (ENSCCAG00000023604) NARS1 (ENSCCAG00000035268) ATP8B1 (ENSCCAG00000017761) ENSCCAG00000037194 NEDD4L (ENSCCAG00000026176) ALPK2 (ENSCCAG00000037732) MALT1 (ENSCCAG00000029709) ENSCCAG00000034657 ##22 ZNF532 (ENSCCAG00000037629) SEC11C (ENSCCAG00000021598) GRP (ENSCCAG00000037333) RAX (ENSCCAG00000026966) CPLX4 (ENSCCAG00000036168) ENSCCAG00000020582 LMAN1 (ENSCCAG00000022128) CCBE1 (ENSCCAG00000028326) ENSCCAG00000026400 ENSCCAG00000023744 PMAIP1 (ENSCCAG00000026882) ENSCCAG00000035349 MC4R (ENSCCAG00000010738) CDH20 (ENSCCAG00000024476) ENSCCAG00000019220 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.a.b ##22 Gibbon MODERN SPECIES 12 TMEM184A (ENSNLEG00000034813) PSMG3 (ENSNLEG00000034760) ENSNLEG00000008588 ENSNLEG00000029371 ENSNLEG00000008599 MRM2 (ENSNLEG00000034773) NUDT1 (ENSNLEG00000029411) SNX8 (ENSNLEG00000008623) EIF3B (ENSNLEG00000008647) CHST12 (ENSNLEG00000018713) ENSNLEG00000027995 LFNG (ENSNLEG00000008670) LYPD6 (ENSNLEG00000008684) LYPD6B (ENSNLEG00000031677) KIF5C (ENSNLEG00000008723) ENSNLEG00000035194 ##22 EPC2 (ENSNLEG00000009134) MBD5 (ENSNLEG00000009103) ORC4 (ENSNLEG00000009077) ACVR2A (ENSNLEG00000009051) ENSNLEG00000034154 ENSNLEG00000029139 ZEB2 (ENSNLEG00000009020) ENSNLEG00000033258 ENSNLEG00000031423 GTDC1 (ENSNLEG00000009003) ARHGAP15 (ENSNLEG00000008984) KYNU (ENSNLEG00000008970) LRP1B (ENSNLEG00000008924) ENSNLEG00000030102 ENSNLEG00000028194 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Rabbit MODERN SPECIES 5 HACL1 (ENSOCUG00000000765) BTD (ENSOCUG00000008562) ANKRD28 (ENSOCUG00000008568) GALNT15 (ENSOCUG00000025111) ENSOCUG00000039398 DPH3 (ENSOCUG00000015862) OXNAD1 (ENSOCUG00000015868) ENSOCUG00000026336 RFTN1 (ENSOCUG00000015875) PLCL2 (ENSOCUG00000008317) TBC1D5 (ENSOCUG00000016596) SATB1 (ENSOCUG00000007174) KCNH8 (ENSOCUG00000016348) ENSOCUG00000034295 ENSOCUG00000027919 ENSOCUG00000025838 ##22 ENSOCUG00000000698 ENSOCUG00000032896 EFHB (ENSOCUG00000013712) RAB5A (ENSOCUG00000012200) PP2D1 (ENSOCUG00000017225) ENSOCUG00000006039 SGO1 (ENSOCUG00000006050) ENSOCUG00000033619 ZNF385D (ENSOCUG00000029070) ENSOCUG00000031633 ENSOCUG00000039156 ENSOCUG00000006026 NKIRAS1 (ENSOCUG00000002483) ENSOCUG00000010961 NR1D2 (ENSOCUG00000009329) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00940000153571.a.eb ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.m ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 Mas night monkey MODERN SPECIES 249 TOX (ENSANAG00000037539) NSMAF (ENSANAG00000027618) SDCBP (ENSANAG00000029608) CYP7A1 (ENSANAG00000019928) UBXN2B (ENSANAG00000034539) ENSANAG00000038124 FAM110B (ENSANAG00000019375) BPNT2 (ENSANAG00000021522) ENSANAG00000002536 PENK (ENSANAG00000017945) SDR16C5 (ENSANAG00000035994) CHCHD7 (ENSANAG00000022037) PLAG1 (ENSANAG00000023401) ENSANAG00000027241 ENSANAG00000024083 ENSANAG00000038097 ##22 LYN (ENSANAG00000021085) TGS1 (ENSANAG00000035525) TMEM68 (ENSANAG00000025144) XKR4 (ENSANAG00000023443) RP1 (ENSANAG00000026159) ENSANAG00000035125 SOX17 (ENSANAG00000035193) ENSANAG00000018191 KCNB2 (ENSANAG00000030632) TERF1 (ENSANAG00000034933) SBSPON (ENSANAG00000036555) ENSANAG00000033829 ENSANAG00000036501 RDH10 (ENSANAG00000033999) STAU2 (ENSANAG00000023588) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00940000153571.a.eb ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000009040.l ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040.k.a ENSGT00940000154185.m ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 Marmoset MODERN SPECIES 7 CYP7A1 (ENSCJAG00000008684) UBXN2B (ENSCJAG00000008666) ENSCJAG00000073685 FAM110B (ENSCJAG00000008657) ENSCJAG00000073997 ENSCJAG00000061141 IMPAD1 (ENSCJAG00000016573) ENSCJAG00000082207 ENSCJAG00000073317 PENK (ENSCJAG00000016597) ENSCJAG00000054039 SDR16C5 (ENSCJAG00000016608) CHCHD7 (ENSCJAG00000043436) PLAG1 (ENSCJAG00000016621) MOS (ENSCJAG00000021905) ENSCJAG00000016631 ##22 LYN (ENSCJAG00000016635) TGS1 (ENSCJAG00000016657) TMEM68 (ENSCJAG00000038709) ENSCJAG00000053100 XKR4 (ENSCJAG00000016679) ENSCJAG00000077562 RP1 (ENSCJAG00000016695) SOX17 (ENSCJAG00000067378) ENSCJAG00000061327 LYPLA1 (ENSCJAG00000011562) ENSCJAG00000084672 ENSCJAG00000074471 ENSCJAG00000051249 ENSCJAG00000058055 ENSCJAG00000059708 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154502.h ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a ENSGT00520000055567.a.a.b.c.a ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00910000148739 ENSGT00940000160216 ENSGT00390000005254.i.a.b.n.a ENSGT00940000155238.k.b ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT00940000155263.v ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.f.c.b ENSGT00940000156694 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000159076.v.b ENSGT00940000154185.l.a.b.a ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 Bonobo MODERN SPECIES 21 ENSPPAG00000035380 NSMAF (ENSPPAG00000028955) ENSPPAG00000038846 CYP7A1 (ENSPPAG00000043585) ENSPPAG00000037576 ENSPPAG00000035036 ENSPPAG00000032162 BPNT2 (ENSPPAG00000042643) ENSPPAG00000040415 ENSPPAG00000002731 PENK (ENSPPAG00000043514) SDR16C5 (ENSPPAG00000032503) ENSPPAG00000033262 PLAG1 (ENSPPAG00000043737) MOS (ENSPPAG00000020866) ENSPPAG00000005938 ##22 LYN (ENSPPAG00000030503) TGS1 (ENSPPAG00000039058) TMEM68 (ENSPPAG00000036306) ENSPPAG00000040800 XKR4 (ENSPPAG00000036029) RP1 (ENSPPAG00000036902) ENSPPAG00000037225 SOX17 (ENSPPAG00000001324) MRPL15 (ENSPPAG00000034223) ENSPPAG00000031297 ENSPPAG00000038171 TCEA1 (ENSPPAG00000007248) RGS20 (ENSPPAG00000033679) ATP6V1H (ENSPPAG00000038229) OPRK1 (ENSPPAG00000028202) Chimpanzee MODERN SPECIES 21 SDCBP (ENSPTRG00000020277) CYP7A1 (ENSPTRG00000020275) ENSPTRG00000051087 UBXN2B (ENSPTRG00000033886) FAM110B (ENSPTRG00000044402) ENSPTRG00000047634 ENSPTRG00000051826 BPNT2 (ENSPTRG00000020271) ENSPTRG00000049159 ENSPTRG00000046053 PENK (ENSPTRG00000020270) SDR16C5 (ENSPTRG00000020268) CHCHD7 (ENSPTRG00000020267) PLAG1 (ENSPTRG00000051855) MOS (ENSPTRG00000020265) RPS20 (ENSPTRG00000020264) ##22 LYN (ENSPTRG00000020263) TGS1 (ENSPTRG00000020262) TMEM68 (ENSPTRG00000020261) ENSPTRG00000047768 XKR4 (ENSPTRG00000020257) RP1 (ENSPTRG00000020256) SOX17 (ENSPTRG00000020254) ENSPTRG00000044364 MRPL15 (ENSPTRG00000020253) ENSPTRG00000052864 LYPLA1 (ENSPTRG00000043681) TCEA1 (ENSPTRG00000020251) RGS20 (ENSPTRG00000020250) ATP6V1H (ENSPTRG00000020249) ENSPTRG00000051579 Gorilla MODERN SPECIES 21 TOX (ENSGGOG00000012139) NSMAF (ENSGGOG00000004827) SDCBP (ENSGGOG00000009019) CYP7A1 (ENSGGOG00000023783) ENSGGOG00000016080 ENSGGOG00000044170 ENSGGOG00000043065 ENSGGOG00000027156 ENSGGOG00000036414 BPNT2 (ENSGGOG00000025130) PENK (ENSGGOG00000016266) SDR16C5 (ENSGGOG00000004025) ENSGGOG00000002029 PLAG1 (ENSGGOG00000026661) MOS (ENSGGOG00000024676) ENSGGOG00000001837 ##22 LYN (ENSGGOG00000012490) TGS1 (ENSGGOG00000008624) TMEM68 (ENSGGOG00000005948) ENSGGOG00000025035 ENSGGOG00000039865 RP1 (ENSGGOG00000012280) ENSGGOG00000024314 ENSGGOG00000023175 ENSGGOG00000039556 MRPL15 (ENSGGOG00000010403) ENSGGOG00000028339 TCEA1 (ENSGGOG00000023652) RGS20 (ENSGGOG00000001386) ATP6V1H (ENSGGOG00000000515) ENSGGOG00000043511 Orangutan MODERN SPECIES 21 CHD7 (ENSPPYG00000018618) RAB2A (ENSPPYG00000018617) CA8 (ENSPPYG00000018615) TOX (ENSPPYG00000018614) NSMAF 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ENSNLEG00000001238 PLAG1 (ENSNLEG00000031521) MOS (ENSNLEG00000018389) ENSNLEG00000001214 ##22 ENSNLEG00000001213 LYN (ENSNLEG00000001140) TGS1 (ENSNLEG00000001101) TMEM68 (ENSNLEG00000001094) ENSNLEG00000001093 ENSNLEG00000001087 ENSNLEG00000032778 SOX17 (ENSNLEG00000001085) MRPL15 (ENSNLEG00000029566) LYPLA1 (ENSNLEG00000001027) TCEA1 (ENSNLEG00000000981) RGS20 (ENSNLEG00000000956) ATP6V1H (ENSNLEG00000000870) OPRK1 (ENSNLEG00000033253) NPBWR1 (ENSNLEG00000018388) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 463 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1028 BPNT2 (ENSRROG00000028627) PENK (ENSRROG00000026954) SDR16C5 (ENSRROG00000045792) CHCHD7 (ENSRROG00000031283) PLAG1 (ENSRROG00000031737) MOS (ENSRROG00000038417) ENSRROG00000034398 ##22 LYN (ENSRROG00000026498) TGS1 (ENSRROG00000035127) TMEM68 (ENSRROG00000024510) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2217 MOS (ENSRBIG00000035310) ENSRBIG00000041719 ##22 LYN (ENSRBIG00000041855) TGS1 (ENSRBIG00000041893) TMEM68 (ENSRBIG00000032051) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154502.g.b.a.a ENSGT00940000155762 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000155263.v ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a.a ENSGT00940000155121 ENSGT00390000004881.z ENSGT00940000159123 ENSGT00910000147783 Macaca ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155762 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00910000147608 ENSGT00840000130804 ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000155263.v ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a.a ENSGT00940000155121 ENSGT00390000004881.z ENSGT00940000159123 ENSGT00910000147783 ENSGT00390000003289 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 580 ENSMNEG00000033392 ENSMNEG00000006454 SDCBP (ENSMNEG00000039350) ENSMNEG00000005216 CYP7A1 (ENSMNEG00000040092) UBXN2B (ENSMNEG00000041477) ENSMNEG00000023891 ENSMNEG00000042237 BPNT2 (ENSMNEG00000030740) PENK (ENSMNEG00000035854) SDR16C5 (ENSMNEG00000032388) CHCHD7 (ENSMNEG00000032713) PLAG1 (ENSMNEG00000037064) MOS (ENSMNEG00000005956) ENSMNEG00000035640 ENSMNEG00000040485 ##22 LYN (ENSMNEG00000041788) TGS1 (ENSMNEG00000023719) TMEM68 (ENSMNEG00000027608) XKR4 (ENSMNEG00000034542) ENSMNEG00000040226 RP1 (ENSMNEG00000029732) ENSMNEG00000008914 SOX17 (ENSMNEG00000034488) MRPL15 (ENSMNEG00000037090) ENSMNEG00000041836 TCEA1 (ENSMNEG00000034707) ENSMNEG00000034313 RGS20 (ENSMNEG00000042031) ENSMNEG00000028306 ATP6V1H (ENSMNEG00000035291) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154502.h ENSGT00910000147347 ENSGT00940000155059.f.b ENSGT00940000154502.g.b.a.a ENSGT00940000155762 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a.a ENSGT00940000155121 ENSGT00390000004881.z ENSGT00940000159123 ENSGT00910000147783 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00910000147347 ENSGT00940000155059.f.b ENSGT00940000154502.g.b.a.a ENSGT00940000155762 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00910000147608 ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a.a ENSGT00940000155121 ENSGT00390000004881.z ENSGT00940000159123 ENSGT00910000147783 ENSGT00390000003289 Drill MODERN SPECIES 1239 ENSMLEG00000036810 PENK (ENSMLEG00000034631) SDR16C5 (ENSMLEG00000040788) CHCHD7 (ENSMLEG00000030836) PLAG1 (ENSMLEG00000014288) MOS (ENSMLEG00000015500) ENSMLEG00000025668 ENSMLEG00000032433 ##22 LYN (ENSMLEG00000005913) TGS1 (ENSMLEG00000034807) TMEM68 (ENSMLEG00000044358) Sooty mangabey MODERN SPECIES 184 ENSCATG00000034029 SDR16C5 (ENSCATG00000043443) CHCHD7 (ENSCATG00000032939) PLAG1 (ENSCATG00000032765) MOS (ENSCATG00000018631) ENSCATG00000042295 ENSCATG00000035702 ##22 LYN (ENSCATG00000030247) TGS1 (ENSCATG00000035375) TMEM68 (ENSCATG00000040134) XKR4 (ENSCATG00000035909) RP1 (ENSCATG00000036262) ENSCATG00000032680 ENSCATG00000033814 SOX17 (ENSCATG00000032966) MRPL15 (ENSCATG00000029666) LYPLA1 (ENSCATG00000007446) TCEA1 (ENSCATG00000039602) ENSCATG00000029701 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ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000164631 ENSGT00390000014654 ENSGT00940000163032 ENSGT00940000155633.D ENSGT01050000244824.A ENSGT00740000115534.a.b.f.a.b ENSGT00940000159968 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 622 FAM110B (ENSPSMG00000004340) BPNT2 (ENSPSMG00000004326) PENK (ENSPSMG00000004299) ENSPSMG00000004283 SDR16C5 (ENSPSMG00000004268) CHCHD7 (ENSPSMG00000004228) PLAG1 (ENSPSMG00000004215) ENSPSMG00000004197 MOS (ENSPSMG00000004189) ENSPSMG00000004179 ##22 LYN (ENSPSMG00000004140) TGS1 (ENSPSMG00000004097) TMEM68 (ENSPSMG00000004069) Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 853 CHD7 (ENSPCOG00000013850) RAB2A (ENSPCOG00000020717) CA8 (ENSPCOG00000028332) ENSPCOG00000020627 TOX (ENSPCOG00000016690) NSMAF (ENSPCOG00000020110) ENSPCOG00000026207 CYP7A1 (ENSPCOG00000025220) UBXN2B (ENSPCOG00000025222) FAM110B (ENSPCOG00000026950) BPNT2 (ENSPCOG00000028648) PENK (ENSPCOG00000022168) ENSPCOG00000000959 SDR16C5 (ENSPCOG00000024871) CHCHD7 (ENSPCOG00000018176) ENSPCOG00000019798 ##22 LYN (ENSPCOG00000024655) TGS1 (ENSPCOG00000013537) TMEM68 (ENSPCOG00000006274) XKR4 (ENSPCOG00000013290) ENSPCOG00000014780 SOX17 (ENSPCOG00000015523) MRPL15 (ENSPCOG00000027252) LYPLA1 (ENSPCOG00000021102) ENSPCOG00000025760 ENSPCOG00000024613 ENSPCOG00000024411 PRKDC (ENSPCOG00000014140) MCM4 (ENSPCOG00000014586) ENSPCOG00000025231 CLXN (ENSPCOG00000013982) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 237 ENSPCOG00000024227 ENSPCOG00000017327 FOLH1 (ENSPCOG00000018014) NOX4 (ENSPCOG00000017092) TYR (ENSPCOG00000016235) GRM5 (ENSPCOG00000028721) ENSPCOG00000024115 CTSC (ENSPCOG00000001859) RAB38 (ENSPCOG00000020800) TMEM135 (ENSPCOG00000015029) FZD4 (ENSPCOG00000018933) ME3 (ENSPCOG00000027098) CCDC81 (ENSPCOG00000024443) HIKESHI (ENSPCOG00000028239) EED (ENSPCOG00000022510) ENSPCOG00000024002 ##22 PICALM (ENSPCOG00000026679) CCDC83 (ENSPCOG00000008593) SYTL2 (ENSPCOG00000009450) ENSPCOG00000015922 TMEM126A (ENSPCOG00000020359) TMEM126B (ENSPCOG00000020968) DLG2 (ENSPCOG00000019969) CCDC90B (ENSPCOG00000021879) ANKRD42 (ENSPCOG00000026124) PCF11 (ENSPCOG00000000051) RAB30 (ENSPCOG00000017316) ENSPCOG00000027868 PRCP (ENSPCOG00000027887) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Vaquita MODERN SPECIES 8 ENSPSNG00000013920 ENSPSNG00000013856 TOX (ENSPSNG00000013722) NSMAF (ENSPSNG00000013633) ENSPSNG00000013252 CYP7A1 (ENSPSNG00000013094) UBXN2B (ENSPSNG00000013041) FAM110B (ENSPSNG00000012940) ENSPSNG00000012901 BPNT2 (ENSPSNG00000012862) PENK (ENSPSNG00000012737) SDR16C5 (ENSPSNG00000012633) CHCHD7 (ENSPSNG00000012370) PLAG1 (ENSPSNG00000012314) MOS (ENSPSNG00000012282) ENSPSNG00000012196 ##22 LYN (ENSPSNG00000012016) TGS1 (ENSPSNG00000011959) TMEM68 (ENSPSNG00000011792) XKR4 (ENSPSNG00000011695) ENSPSNG00000011669 ENSPSNG00000011608 RP1 (ENSPSNG00000011554) SOX17 (ENSPSNG00000011510) MRPL15 (ENSPSNG00000011469) ENSPSNG00000011338 ENSPSNG00000011078 RGS20 (ENSPSNG00000010954) ATP6V1H (ENSPSNG00000010849) OPRK1 (ENSPSNG00000010750) NPBWR1 (ENSPSNG00000020139) Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Pig MODERN SPECIES 8 ENSSSCG00000055878 ENSSSCG00000003935 ENSSSCG00000033117 CLDN23 (ENSSSCG00000006966) ENSSSCG00000025403 ENSSSCG00000052785 ENSSSCG00000047269 LONRF1 (ENSSSCG00000006968) TRMT9B (ENSSSCG00000006969) DLC1 (ENSSSCG00000006970) C8orf48 (ENSSSCG00000006972) ENSSSCG00000043551 ENSSSCG00000060690 ENSSSCG00000006973 ##22 SGCZ (ENSSSCG00000038257) ENSSSCG00000047953 TUSC3 (ENSSSCG00000021988) ENSSSCG00000041353 MSR1 (ENSSSCG00000006979) FGF20 (ENSSSCG00000006980) MICU3 (ENSSSCG00000006981) ZDHHC2 (ENSSSCG00000006982) CNOT7 (ENSSSCG00000006983) VPS37A (ENSSSCG00000006984) MTMR7 (ENSSSCG00000036785) SLC7A2 (ENSSSCG00000006987) PDGFRL (ENSSSCG00000006988) MTUS1 (ENSSSCG00000040013) FGL1 (ENSSSCG00000035335) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Microbat MODERN SPECIES 940 UBE2F (ENSMLUG00000001286) RAMP1 (ENSMLUG00000002016) RBM44 (ENSMLUG00000002010) LRRFIP1 (ENSMLUG00000002001) RAB17 (ENSMLUG00000000446) ENSMLUG00000000444 MLPH (ENSMLUG00000000438) COL6A3 (ENSMLUG00000006761) COPS8 (ENSMLUG00000006750) ACKR3 (ENSMLUG00000011535) IQCA1 (ENSMLUG00000011512) ASB18 (ENSMLUG00000011493) GBX2 (ENSMLUG00000011484) AGAP1 (ENSMLUG00000005147) SH3BP4 (ENSMLUG00000011869) ENSMLUG00000025370 ##22 SPP2 (ENSMLUG00000017424) TRPM8 (ENSMLUG00000017423) HJURP (ENSMLUG00000017421) MROH2A (ENSMLUG00000017412) ENSMLUG00000017411 UGT1A6 (ENSMLUG00000017410) ENSMLUG00000024668 USP40 (ENSMLUG00000017407) DGKD (ENSMLUG00000017404) SAG (ENSMLUG00000017400) ATG16L1 (ENSMLUG00000017395) INPP5D (ENSMLUG00000017391) NEU2 (ENSMLUG00000028068) NGEF (ENSMLUG00000017390) SNORC (ENSMLUG00000017388) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Ferret MODERN SPECIES 310 ZNF503 (ENSMPUG00000003264) ENSMPUG00000018792 ##22 VDAC2 (ENSMPUG00000003268) COMTD1 (ENSMPUG00000003277) SAMD8 (ENSMPUG00000003283) ENSMPUG00000003289 ENSMPUG00000003324 DUSP29 (ENSMPUG00000003311) KAT6B (ENSMPUG00000003327) ADK (ENSMPUG00000003340) AP3M1 (ENSMPUG00000003345) VCL (ENSMPUG00000003355) PLAU (ENSMPUG00000003367) CAMK2G (ENSMPUG00000003376) NDST2 (ENSMPUG00000003447) ZSWIM8 (ENSMPUG00000003454) CHCHD1 (ENSMPUG00000003469) American mink MODERN SPECIES 446 ENSNVIG00000019907 ##22 CT83 (ENSNVIG00000019900) SLC6A14 (ENSNVIG00000019874) AGTR2 (ENSNVIG00000019858) ENSNVIG00000019853 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000161941 ENSGT00730000111328 ENSGT00940000156876 ENSGT00940000160107.h ENSGT00940000154558 ENSGT00940000154752.A.f.a.b ENSGT00940000154752.A.f.a.a ENSGT00940000154752.A.f.b.a.a.b ENSGT00940000154752.B ENSGT00940000154752.A.f.b.b ENSGT00940000154752.A.e ENSGT00730000111779 ENSGT00940000164346.a ENSGT00390000008117.k ENSGT00390000003156.a.b.q.b ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 ENSGT00390000003156.a.b.r ENSGT00940000157871 ENSGT00940000159340 ENSGT01100000263477.A.b.a.b.b ENSGT01100000263477.A.b.a.b.a.a ENSGT01100000263477.A.b.a.b.a.b ENSGT01100000263477.A.b.a.a.a.a ENSGT01100000263477.A.b.a.a.b.a.b ENSGT01100000263477.A.b.a.a.b.a.a.a.a.b.k ENSGT01100000263477.A.b.a.a.b.a.a.a.a.b.l ENSGT01030000235044 ENSGT00390000014547.d.b ENSGT01100000263477.A.b.a.a.a.b ENSGT00940000159508 ENSGT00940000154318.A Ursus ANCESTRAL SPECIES 151 ENSGT00940000161941 ENSGT00730000111328 ENSGT00940000156876 ENSGT00940000160107.h ENSGT00940000154558 ENSGT00940000154752.A.f.a.b ENSGT00940000154752.A.f.a.a ENSGT00940000154752.A.f.b.a.a.b ENSGT00940000154752.B ENSGT00940000154752.A.f.b.b ENSGT00940000154752.A.e ENSGT00730000111779 ENSGT00940000164346.a ENSGT00390000008117.k ENSGT00390000003156.a.b.q.a.d ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 ENSGT00390000003156.a.b.r ENSGT00940000157871 ENSGT00940000159340 American black bear MODERN SPECIES 9304 ENSUAMG00000002243 ##22 Polar bear MODERN SPECIES 206 GABARAPL1 (ENSUMAG00000016270) KLRD1 (ENSUMAG00000016266) KLRK1 (ENSUMAG00000016260) ENSUMAG00000016248 ENSUMAG00000016240 ENSUMAG00000016236 ENSUMAG00000016233 ENSUMAG00000016231 ENSUMAG00000016183 ENSUMAG00000016165 ENSUMAG00000016161 ENSUMAG00000016154 ENSUMAG00000016146 ENSUMAG00000016142 ENSUMAG00000016134 ENSUMAG00000016130 ##22 STYK1 (ENSUMAG00000016124) YBX3 (ENSUMAG00000016118) Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 7 OLR1 (ENSAMEG00000031192) TMEM52B (ENSAMEG00000030893) GABARAPL1 (ENSAMEG00000026339) KLRD1 (ENSAMEG00000004634) ENSAMEG00000011988 ENSAMEG00000011985 ENSAMEG00000029046 ENSAMEG00000011978 ENSAMEG00000027474 ENSAMEG00000030922 ENSAMEG00000031084 ENSAMEG00000024050 ENSAMEG00000011948 MAGOHB (ENSAMEG00000009447) ENSAMEG00000025740 ENSAMEG00000027334 ##22 ENSAMEG00000009437 YBX3 (ENSAMEG00000009393) TAS2R10 (ENSAMEG00000019374) ENSAMEG00000019368 ENSAMEG00000001982 ENSAMEG00000029720 ENSAMEG00000028724 SMIM10L1 (ENSAMEG00000019357) ENSAMEG00000001979 TAS2R42 (ENSAMEG00000019344) ETV6 (ENSAMEG00000001957) BCL2L14 (ENSAMEG00000001947) LRP6 (ENSAMEG00000001930) MANSC1 (ENSAMEG00000026697) BORCS5 (ENSAMEG00000010795) Giant Panda MODERN SPECIES 13 ENSAMEG00000003347 ENSAMEG00000024028 ENSAMEG00000003316 ENSAMEG00000003288 OCLN (ENSAMEG00000003282) MARVELD2 (ENSAMEG00000003264) RAD17 (ENSAMEG00000003234) AK6 (ENSAMEG00000003223) CCDC125 (ENSAMEG00000003209) CDK7 (ENSAMEG00000003163) MRPS36 (ENSAMEG00000003161) CENPH (ENSAMEG00000003155) CCNB1 (ENSAMEG00000003117) SLC30A5 (ENSAMEG00000003073) PIK3R1 (ENSAMEG00000003039) ENSAMEG00000023533 ##22 CD180 (ENSAMEG00000003031) MAST4 (ENSAMEG00000002975) SREK1 (ENSAMEG00000011327) ERBIN (ENSAMEG00000011253) NLN (ENSAMEG00000011242) SGTB (ENSAMEG00000011207) TRAPPC13 (ENSAMEG00000011174) TRIM23 (ENSAMEG00000011157) PPWD1 (ENSAMEG00000011137) CENPK (ENSAMEG00000011135) ADAMTS6 (ENSAMEG00000011127) CWC27 (ENSAMEG00000011115) SREK1IP1 (ENSAMEG00000025044) RGS7BP (ENSAMEG00000013534) RNF180 (ENSAMEG00000013528) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Tenrec MODERN SPECIES 10389 ENSETEG00000011136 ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.a ##22 Armadillo MODERN SPECIES 3508 GAR1 (ENSDNOG00000037632) CFI (ENSDNOG00000012346) ENSDNOG00000016573 CASP6 (ENSDNOG00000016571) MCUB (ENSDNOG00000016570) SEC24B (ENSDNOG00000012980) ENSDNOG00000048517 COL25A1 (ENSDNOG00000016800) ETNPPL (ENSDNOG00000014825) OSTC (ENSDNOG00000011172) ENSDNOG00000011179 LEF1 (ENSDNOG00000019529) HADH (ENSDNOG00000000868) CYP2U1 (ENSDNOG00000000863) SGMS2 (ENSDNOG00000048393) ENSDNOG00000044160 ##22 PAPSS1 (ENSDNOG00000003032) DKK2 (ENSDNOG00000039230) ENSDNOG00000035061 GIMD1 (ENSDNOG00000037621) AIMP1 (ENSDNOG00000039310) TBCK (ENSDNOG00000010062) ENSDNOG00000033067 NPNT (ENSDNOG00000047147) GSTCD (ENSDNOG00000010872) INTS12 (ENSDNOG00000041045) ARHGEF38 (ENSDNOG00000031825) ENSDNOG00000031837 ENSDNOG00000012327 ENSDNOG00000041521 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1048 ENSVURG00010006781 ENSVURG00010006683 ENSVURG00010006655 ENSVURG00010006633 ENSVURG00010006624 ENSVURG00010006609 ENSVURG00010006594 ENSVURG00010006577 ENSVURG00010006567 ENSVURG00010006555 ENSVURG00010006550 ENSVURG00010006542 ENSVURG00010006519 ENSVURG00010006508 ENSVURG00010006506 ENSVURG00010006501 ##22 ENSVURG00010006465 ENSVURG00010006301 ENSVURG00010006275 ENSVURG00010006098 ENSVURG00010006034 ENSVURG00010005956 ENSVURG00010005920 ENSVURG00010005916 ENSVURG00010005902 ENSVURG00010005886 ENSVURG00010005848 ENSVURG00010005809 ENSVURG00010005778 ENSVURG00010005677 ENSVURG00010005668 Common wonbat MODERN SPECIES 1058 CAPRIN1 (ENSVURG00010012674) LMO2 (ENSVURG00010012705) FBXO3 (ENSVURG00010012709) ENSVURG00010012719 KIAA1549L (ENSVURG00010012738) HIPK3 (ENSVURG00010012975) ENSVURG00010013024 TCP11L1 (ENSVURG00010013070) DEPDC7 (ENSVURG00010013084) QSER1 (ENSVURG00010013101) PRRG4 (ENSVURG00010013112) ENSVURG00010013117 EIF3M (ENSVURG00010013122) WT1 (ENSVURG00010013148) RCN1 (ENSVURG00010013320) ENSVURG00010013326 ##22 PAX6 (ENSVURG00010013364) ELP4 (ENSVURG00010014242) IMMP1L (ENSVURG00010014340) DNAJC24 (ENSVURG00010014357) ENSVURG00010014371 MPPED2 (ENSVURG00010014383) ARL14EP (ENSVURG00010014405) FSHB (ENSVURG00010014414) KCNA4 (ENSVURG00010014424) Opossum MODERN SPECIES 2 CA8 (ENSMODG00000008571) TOX (ENSMODG00000008712) NSMAF (ENSMODG00000008797) SDCBP (ENSMODG00000008819) CYP7A1 (ENSMODG00000008855) UBXN2B (ENSMODG00000008866) FAM110B (ENSMODG00000008907) BPNT2 (ENSMODG00000008961) ENSMODG00000038941 PENK (ENSMODG00000049693) ENSMODG00000009075 SDR16C5 (ENSMODG00000009095) ENSMODG00000024930 PLAG1 (ENSMODG00000043175) MOS (ENSMODG00000024929) RPS20 (ENSMODG00000045434) ##22 LYN (ENSMODG00000009142) TGS1 (ENSMODG00000009174) TMEM68 (ENSMODG00000009183) XKR4 (ENSMODG00000025611) ENSMODG00000044310 ENSMODG00000009188 ENSMODG00000027805 ENSMODG00000024927 MRPL15 (ENSMODG00000009360) LYPLA1 (ENSMODG00000009367) ENSMODG00000009389 RGS20 (ENSMODG00000009398) ENSMODG00000024926 ATP6V1H (ENSMODG00000009431) ENSMODG00000040801 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Pig MODERN SPECIES 6 ACTR3 (ENSSSCG00000015710) DPP10 (ENSSSCG00000015711) ENSSSCG00000040343 ENSSSCG00000051241 DDX18 (ENSSSCG00000015712) ENSSSCG00000015713 CCDC93 (ENSSSCG00000015714) INSIG2 (ENSSSCG00000036229) EN1 (ENSSSCG00000015715) MARCO (ENSSSCG00000015716) C1QL2 (ENSSSCG00000015717) ENSSSCG00000031239 STEAP3 (ENSSSCG00000029304) C2orf76 (ENSSSCG00000015718) DBI (ENSSSCG00000032213) ENSSSCG00000055602 ##22 PROC (ENSSSCG00000023693) MAP3K2 (ENSSSCG00000030354) ERCC3 (ENSSSCG00000015721) ENSSSCG00000043454 BIN1 (ENSSSCG00000015720) ENSSSCG00000050390 GYPC (ENSSSCG00000040701) ENSSSCG00000026916 CNTNAP5 (ENSSSCG00000015726) TSN (ENSSSCG00000015729) NIFK (ENSSSCG00000015730) CLASP1 (ENSSSCG00000039157) ENSSSCG00000047828 TFCP2L1 (ENSSSCG00000054656) GLI2 (ENSSSCG00000015733) Chacoan peccary MODERN SPECIES 921 MAP3K11 (ENSCWAG00000011375) KCNK7 (ENSCWAG00000011467) EHBP1L1 (ENSCWAG00000011539) FAM89B (ENSCWAG00000011651) ZNRD2 (ENSCWAG00000011716) LTBP3 (ENSCWAG00000011790) SCYL1 (ENSCWAG00000012347) FRMD8 (ENSCWAG00000012465) SLC25A45 (ENSCWAG00000012825) TIGD3 (ENSCWAG00000013059) DPF2 (ENSCWAG00000013089) CDC42EP2 (ENSCWAG00000013248) POLA2 (ENSCWAG00000013270) ENSCWAG00000013457 CAPN1 (ENSCWAG00000013563) ENSCWAG00000013693 ##22 ENSCWAG00000013712 SYVN1 (ENSCWAG00000013781) MRPL49 (ENSCWAG00000013869) FAU (ENSCWAG00000013937) ZNHIT2 (ENSCWAG00000014020) TM7SF2 (ENSCWAG00000014042) VPS51 (ENSCWAG00000014106) TMEM262 (ENSCWAG00000014146) ZFPL1 (ENSCWAG00000014169) CDCA5 (ENSCWAG00000014203) ENSCWAG00000014285 SAC3D1 (ENSCWAG00000014323) SNX15 (ENSCWAG00000014357) ARL2 (ENSCWAG00000014404) BATF2 (ENSCWAG00000014448) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Cetacea DUPLICATION Cetacea DUPLICATION Cetacea ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000003855.a ENSGT00940000159080 ENSGT00940000163749 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000163055 ENSGT00940000158817 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000159118 ENSGT00950000185154 ENSGT00530000063425.a.b ENSGT00550000075024 ENSGT00940000161424 ENSGT00550000074867 ENSGT00390000018245.c ENSGT00390000003248.a.a.b.c.a ##22 ENSGT00950000182980.a.b.b.b ENSGT00390000008095 ENSGT00940000158638 ENSGT00940000154141.B ENSGT00940000159000 ENSGT00950000183100.C.j ENSGT00390000016617 ENSGT00940000155970.q ENSGT00390000002730.c.b ENSGT00390000002879 ENSGT00940000155930 ENSGT01060000249326 ENSGT00940000154711 ENSGT00510000047850 ENSGT00940000153311.a.b.a.i.a Blue whale MODERN SPECIES 4 ASB3 (ENSBMSG00010020218) ERLEC1 (ENSBMSG00010020317) CHAC2 (ENSBMSG00010020397) NRXN1 (ENSBMSG00010020610) FSHR (ENSBMSG00010021830) LHCGR (ENSBMSG00010021848) GTF2A1L (ENSBMSG00010021873) STON1 (ENSBMSG00010021880) PPP1R21 (ENSBMSG00010021894) FOXN2 (ENSBMSG00010021911) FBXO11 (ENSBMSG00010021915) MSH6 (ENSBMSG00010021923) KCNK12 (ENSBMSG00010011727) MSH2 (ENSBMSG00010011772) EPCAM (ENSBMSG00010011820) ENSBMSG00010011835 ##22 CALM2 (ENSBMSG00010011851) STPG4 (ENSBMSG00010011867) TTC7A (ENSBMSG00010011891) MCFD2 (ENSBMSG00010011931) SOCS5 (ENSBMSG00010011946) CRIPT (ENSBMSG00010011952) PIGF (ENSBMSG00010011960) ENSBMSG00010011969 ATP6V1E2 (ENSBMSG00010011978) TMEM247 (ENSBMSG00010011983) ENSBMSG00010011993 ENSBMSG00010012008 PRKCE (ENSBMSG00010012019) SRBD1 (ENSBMSG00010012055) ENSBMSG00010012072 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000003855.a ENSGT00940000159080 ENSGT00940000163749 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000163055 ENSGT00940000158817 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000159118 ENSGT00950000185154 ENSGT00530000063425.a.b ENSGT00550000075024 ENSGT00940000161424 ENSGT00550000074867 ENSGT00390000018245.c ENSGT00390000003248.a.a.b.c.a ##22 ENSGT00950000182980.a.b.b.b ENSGT00390000008095 ENSGT00940000158638 ENSGT00940000154141.B ENSGT00940000159000 ENSGT00950000183100.C.j ENSGT00390000016617 ENSGT00940000155970.q ENSGT00390000002730.c.b ENSGT00390000002879 ENSGT00940000155930 ENSGT01060000249326.a ENSGT00940000154711 ENSGT00510000047850 ENSGT00940000153311.a.b.a.i.a Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000003855.a ENSGT00940000159080 ENSGT00940000163749 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000163055 ENSGT00940000158817 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000159118 ENSGT00950000185154 ENSGT00530000063425.a.b ENSGT00550000075024 ENSGT00940000161424 ENSGT00550000074867 ENSGT00390000018245.c ENSGT00390000003248.a.a.b.c.a ##22 ENSGT00950000182980.a.b.b.b ENSGT00390000008095 ENSGT00940000158638 ENSGT00940000154141.B ENSGT00940000159000 ENSGT00950000183100.C.j ENSGT00390000016617 ENSGT00940000155970.q ENSGT00390000002730.c.b ENSGT00390000002879 ENSGT00940000155930 ENSGT01060000249326.a ENSGT00940000154711 ENSGT00510000047850 ENSGT00940000153311.a.b.a.i.a Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000003855.a ENSGT00940000159080 ENSGT00940000163749 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000163055 ENSGT00940000158817 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000159118 ENSGT00950000185154 ENSGT00530000063425.a.b ENSGT00550000075024 ENSGT00940000161424 ENSGT00550000074867 ENSGT00390000018245.c ENSGT00390000003248.a.a.b.c.a ##22 ENSGT00950000182980.a.b.b.b ENSGT00390000008095 ENSGT00940000158638 ENSGT00940000154141.B ENSGT00940000159000 ENSGT00950000183100.C.j ENSGT00390000016617 ENSGT00940000155970.q ENSGT00390000002730.c.b ENSGT00390000002879 ENSGT00940000155930 ENSGT01060000249326.a ENSGT00940000154711 ENSGT00510000047850 ENSGT00940000153311.a.b.a.i.a Vaquita MODERN SPECIES 4 ENSPSNG00000013504 ENSPSNG00000013411 ENSPSNG00000013363 NRXN1 (ENSPSNG00000011177) FSHR (ENSPSNG00000010658) LHCGR (ENSPSNG00000010226) GTF2A1L (ENSPSNG00000009974) STON1 (ENSPSNG00000010101) PPP1R21 (ENSPSNG00000009787) FOXN2 (ENSPSNG00000009685) FBXO11 (ENSPSNG00000009596) MSH6 (ENSPSNG00000009454) KCNK12 (ENSPSNG00000009311) MSH2 (ENSPSNG00000009243) EPCAM (ENSPSNG00000009186) ENSPSNG00000009132 ##22 CALM2 (ENSPSNG00000009077) STPG4 (ENSPSNG00000008945) TTC7A (ENSPSNG00000008809) MCFD2 (ENSPSNG00000008747) SOCS5 (ENSPSNG00000008716) ENSPSNG00000008692 CRIPT (ENSPSNG00000008658) PIGF (ENSPSNG00000008639) ENSPSNG00000008605 ATP6V1E2 (ENSPSNG00000008582) TMEM247 (ENSPSNG00000008541) EPAS1 (ENSPSNG00000008475) PRKCE (ENSPSNG00000008404) SRBD1 (ENSPSNG00000007161) SIX2 (ENSPSNG00000006741) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000003855.a ENSGT00940000159080 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000158952 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000163055 ENSGT00940000158817 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000159118 ENSGT00950000185154 ENSGT00530000063425.a.b ENSGT00550000075024 ENSGT00940000161424 ENSGT00550000074867 ENSGT00390000018245.c ENSGT00390000003248.a.a.b.c.a ##22 ENSGT00950000182980.a.b.b.b ENSGT00390000008095 ENSGT00940000158638 ENSGT00940000154141.B ENSGT00940000159000 ENSGT00950000183100.C.j ENSGT00390000016617 ENSGT00940000155970.q ENSGT00390000002879 ENSGT00940000155930 ENSGT01060000249326.a ENSGT00940000154711 ENSGT00510000047850 ENSGT00940000153311.a.b.a.i.a ENSGT00940000158292.a Narwhal MODERN SPECIES 305 CHAC2 (ENSMMNG00015010577) NRXN1 (ENSMMNG00015010769) ENSMMNG00015011190 ENSMMNG00015011204 FSHR (ENSMMNG00015011225) LHCGR (ENSMMNG00015011283) GTF2A1L (ENSMMNG00015011353) STON1 (ENSMMNG00015011373) PPP1R21 (ENSMMNG00015011420) FOXN2 (ENSMMNG00015011506) FBXO11 (ENSMMNG00015011536) MSH6 (ENSMMNG00015011587) KCNK12 (ENSMMNG00015011625) MSH2 (ENSMMNG00015011643) EPCAM (ENSMMNG00015011682) ENSMMNG00015011701 ##22 CALM2 (ENSMMNG00015011714) STPG4 (ENSMMNG00015011734) TTC7A (ENSMMNG00015011753) MCFD2 (ENSMMNG00015011799) SOCS5 (ENSMMNG00015011854) CRIPT (ENSMMNG00015011859) PIGF (ENSMMNG00015011874) ENSMMNG00015011892 TMEM247 (ENSMMNG00015011931) EPAS1 (ENSMMNG00015011953) ENSMMNG00015011999 PRKCE (ENSMMNG00015012023) SRBD1 (ENSMMNG00015012057) ENSMMNG00015012089 SIX2 (ENSMMNG00015012101) Sperm whale MODERN SPECIES 3 CHAC2 (ENSPCTG00005017650) ASB3 (ENSPCTG00005017506) ENSPCTG00005017492 NRXN1 (ENSPCTG00005014692) FSHR (ENSPCTG00005014365) LHCGR (ENSPCTG00005013644) GTF2A1L (ENSPCTG00005013351) STON1 (ENSPCTG00005013286) PPP1R21 (ENSPCTG00005013035) FOXN2 (ENSPCTG00005012938) FBXO11 (ENSPCTG00005012807) MSH6 (ENSPCTG00005012642) KCNK12 (ENSPCTG00005012592) MSH2 (ENSPCTG00005012352) EPCAM (ENSPCTG00005012231) ENSPCTG00005012212 ##22 CALM3 (ENSPCTG00005012107) STPG4 (ENSPCTG00005012076) TTC7A (ENSPCTG00005012058) MCFD2 (ENSPCTG00005011960) SOCS5 (ENSPCTG00005011939) ENSPCTG00005011927 CRIPT (ENSPCTG00005011891) PIGF (ENSPCTG00005011831) RHOQ (ENSPCTG00005011755) ATP6V1E2 (ENSPCTG00005011740) TMEM247 (ENSPCTG00005011702) EPAS1 (ENSPCTG00005011633) ENSPCTG00005011606 ENSPCTG00005011576 ENSPCTG00005011534 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b.c.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b.c.b ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 2 FCF1 (ENSPCTG00005022674) YLPM1 (ENSPCTG00005022679) ENSPCTG00005022683 DLST (ENSPCTG00005022685) ENSPCTG00005022692 PGF (ENSPCTG00005022697) EIF2B2 (ENSPCTG00005022702) ACYP1 (ENSPCTG00005022706) ZC2HC1C (ENSPCTG00005022709) TMED10 (ENSPCTG00005022711) ENSPCTG00005022712 BATF (ENSPCTG00005022713) FLVCR2 (ENSPCTG00005022714) ERG28 (ENSPCTG00005022716) TTLL5 (ENSPCTG00005022718) ENSPCTG00005022725 ##22 GPATCH2L (ENSPCTG00005022727) IFT43 (ENSPCTG00005022728) ENSPCTG00005022729 VASH1 (ENSPCTG00005022730) ANGEL1 (ENSPCTG00005022732) LRRC74A (ENSPCTG00005022735) IRF2BPL (ENSPCTG00005022737) CIPC (ENSPCTG00005022738) ZDHHC22 (ENSPCTG00005022739) TMEM63C (ENSPCTG00005022741) NGB (ENSPCTG00005022742) POMT2 (ENSPCTG00005022743) GSTZ1 (ENSPCTG00005022747) TMED8 (ENSPCTG00005022751) SAMD15 (ENSPCTG00005022753) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00420000029792 ENSGT00390000010783 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00940000158008 ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000155144.j ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000162862 ENSGT00390000018110 ENSGT00950000182878.b.b.k.b ENSGT00940000157222 ENSGT00530000063576.B ENSGT00390000005801 ENSGT00390000012916.z ENSGT00940000162274 ENSGT00390000003248.a.a.b.d ##22 ENSGT00390000006173 ENSGT00940000156408 ENSGT00510000048688 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00420000029792.j ENSGT00390000010783 ENSGT00390000012138.a.b.t.bb.b ENSGT00940000158008 ENSGT00940000153446.a.a ENSGT00940000155144.j ENSGT00940000154181.a ENSGT00940000162862 ENSGT00390000018110 ENSGT00950000182878.b.b.k.b ENSGT00940000157222 ENSGT00530000063576.B ENSGT00390000005801 ENSGT00390000012916.z ENSGT00940000162274 ENSGT00390000003248.a.a.b.d ##22 ENSGT00390000006173 ENSGT00940000156408 ENSGT00510000048688 ENSGT00530000063829.A ENSGT00940000156934 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000159511 ENSGT00390000002833 ENSGT00390000008778 ENSGT00940000156966 ENSGT00940000157830 ENSGT00940000157655 ENSGT00940000156368.b ENSGT00390000010606 Sperm whale MODERN SPECIES 6 RIDA (ENSPCTG00005005680) ERICH5 (ENSPCTG00005005712) RPL30 (ENSPCTG00005005738) MATN2 (ENSPCTG00005005898) LAPTM4B (ENSPCTG00005006269) ENSPCTG00005006300 MTDH (ENSPCTG00005006348) TSPYL5 (ENSPCTG00005006480) CPQ (ENSPCTG00005006492) ENSPCTG00005006521 SDC2 (ENSPCTG00005006539) PTDSS1 (ENSPCTG00005006587) MTERF3 (ENSPCTG00005006724) ENSPCTG00005006779 GDF6 (ENSPCTG00005006818) ENSPCTG00005006830 ##22 C15H8orf37 (ENSPCTG00005006841) PLEKHF2 (ENSPCTG00005006872) NDUFAF6 (ENSPCTG00005006899) TP53INP1 (ENSPCTG00005006971) ENSPCTG00005007014 CCNE2 (ENSPCTG00005007033) INTS8 (ENSPCTG00005007091) DPY19L4 (ENSPCTG00005007336) ESRP1 (ENSPCTG00005007404) VIRMA (ENSPCTG00005007475) ENSPCTG00005007598 RAD54B (ENSPCTG00005007630) GEM (ENSPCTG00005007759) CDH17 (ENSPCTG00005007812) ENSPCTG00005007923 Blue whale DUPLICATION Blue whale MODERN SPECIES 8 POP1 (ENSBMSG00010014249) ENSBMSG00010014294 ERICH5 (ENSBMSG00010014315) ENSBMSG00010014363 MATN2 (ENSBMSG00010014488) LAPTM4B (ENSBMSG00010014706) ENSBMSG00010014726 MTDH (ENSBMSG00010014792) TSPYL5 (ENSBMSG00010014931) CPQ (ENSBMSG00010014948) SDC2 (ENSBMSG00010014977) PTDSS1 (ENSBMSG00010015027) MTERF3 (ENSBMSG00010015060) ENSBMSG00010015122 GDF6 (ENSBMSG00010015166) ENSBMSG00010015195 ##22 CFAP418 (ENSBMSG00010015212) ENSBMSG00010015232 PLEKHF2 (ENSBMSG00010015243) NDUFAF6 (ENSBMSG00010015267) TP53INP1 (ENSBMSG00010015369) CCNE2 (ENSBMSG00010015418) INTS8 (ENSBMSG00010015475) DPY19L4 (ENSBMSG00010015651) ESRP1 (ENSBMSG00010015708) VIRMA (ENSBMSG00010015867) RAD54B (ENSBMSG00010015975) GEM (ENSBMSG00010016010) CDH17 (ENSBMSG00010016044) PDP1 (ENSBMSG00010016171) TMEM67 (ENSBMSG00010016211) Blue whale MODERN SPECIES 8 TOX (ENSBMSG00010014010) ENSBMSG00010014092 NSMAF (ENSBMSG00010014175) SDCBP (ENSBMSG00010014364) CYP7A1 (ENSBMSG00010014601) UBXN2B (ENSBMSG00010014672) FAM110B (ENSBMSG00010014783) ENSBMSG00010014803 BPNT2 (ENSBMSG00010014836) ENSBMSG00010014887 PENK (ENSBMSG00010014925) SDR16C5 (ENSBMSG00010014961) CHCHD7 (ENSBMSG00010015042) PLAG1 (ENSBMSG00010015113) MOS (ENSBMSG00010015136) ENSBMSG00010015164 ##22 LYN (ENSBMSG00010015246) TGS1 (ENSBMSG00010015383) TMEM68 (ENSBMSG00010015509) XKR4 (ENSBMSG00010015591) ENSBMSG00010015625 RP1 (ENSBMSG00010015672) SOX17 (ENSBMSG00010015701) MRPL15 (ENSBMSG00010015731) LYPLA1 (ENSBMSG00010015788) TCEA1 (ENSBMSG00010015953) RGS20 (ENSBMSG00010016086) ATP6V1H (ENSBMSG00010016209) OPRK1 (ENSBMSG00010016297) ENSBMSG00010016334 NPBWR1 (ENSBMSG00010016365) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Yarkand deer MODERN SPECIES 28 ITGB4 (ENSCHYG00000000692) SAP30BP (ENSCHYG00000000899) RECQL5 (ENSCHYG00000000984) SMIM5 (ENSCHYG00000001117) ENSCHYG00000001173 LLGL2 (ENSCHYG00000001311) TSEN54 (ENSCHYG00000001411) CASKIN2 (ENSCHYG00000001493) TMEM94 (ENSCHYG00000001778) GRB2 (ENSCHYG00000002255) SLC25A19 (ENSCHYG00000002296) MIF4GD (ENSCHYG00000002361) MRPS7 (ENSCHYG00000002429) GGA3 (ENSCHYG00000002497) NUP85 (ENSCHYG00000002671) ENSCHYG00000002708 ##22 ENSCHYG00000002733 ENSCHYG00000002774 ENSCHYG00000002843 ENSCHYG00000002868 SLC16A5 (ENSCHYG00000002899) ENSCHYG00000002928 ENSCHYG00000002952 ENSCHYG00000002965 MRPL58 (ENSCHYG00000002970) CDR2L (ENSCHYG00000002992) HID1 (ENSCHYG00000003028) OTOP3 (ENSCHYG00000003091) OTOP2 (ENSCHYG00000003102) USH1G (ENSCHYG00000003115) FADS6 (ENSCHYG00000003135) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158763 ENSGT00550000074961 ENSGT00390000009566 ENSGT00940000153772.B ENSGT00940000158501 ENSGT00390000016384.f.d ENSGT00940000162358 ENSGT00940000157194 ENSGT00940000157936 ENSGT00940000153391.c.b.a ENSGT00940000161534 ENSGT00940000157419 ENSGT00940000159990 ENSGT00940000158540 ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 ENSGT00940000156261 ENSGT00950000183101.a.b.b ENSGT00940000154687.B ENSGT00950000182922.a.b.e.a ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 ENSGT00940000157920.a ENSGT00940000161459 ENSGT00940000157685 ENSGT00940000159569 ENSGT00940000153683.b ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b ENSGT00940000163456.m ENSGT00940000163938 ENSGT00940000165831 Bos ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158763 ENSGT00550000074961 ENSGT00390000009566 ENSGT00940000153772.B ENSGT00940000158501 ENSGT00390000016384.f.d ENSGT00940000162358 ENSGT00940000157194 ENSGT00940000157936 ENSGT00940000153391.c.b.a ENSGT00940000161534 ENSGT00940000157419 ENSGT00940000159990 ENSGT00940000158540 ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 ENSGT00940000156261 ENSGT00950000183101.a.b.b ENSGT00940000154687.B ENSGT00950000182922.a.b.e.a ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 ENSGT00940000157920.a ENSGT00940000161459 ENSGT00940000157685 ENSGT00940000159569 ENSGT00940000153683.b ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b ENSGT00940000163456.m ENSGT00940000163938 ENSGT00940000165831 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158763 ENSGT00550000074961 ENSGT00390000009566 ENSGT00940000153772.B ENSGT00940000158501 ENSGT00390000016384.f.d ENSGT00940000162358 ENSGT00940000157194 ENSGT00940000157936 ENSGT00940000153391.c.b.a ENSGT00940000161534 ENSGT00940000157419 ENSGT00940000159990 ENSGT00940000158540 ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 ENSGT00940000156261 ENSGT00950000183101.a.b.b ENSGT00940000154687.B ENSGT00950000182922.a.b.e.a ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 ENSGT00940000157920.a ENSGT00940000161459 ENSGT00940000157685 ENSGT00940000159569 ENSGT00940000153683.b ENSGT01100000263572.a.a.b.a.b ENSGT00940000163456.m ENSGT00940000163938 ENSGT00940000165831 Cow MODERN SPECIES 2 RABEPK (ENSBTAG00000015098) PPP6C (ENSBTAG00000008033) SCAI (ENSBTAG00000015553) GOLGA1 (ENSBTAG00000015286) ARPC5L (ENSBTAG00000015278) RPL35 (ENSBTAG00000003205) WDR38 (ENSBTAG00000039223) OLFML2A (ENSBTAG00000004848) NR6A1 (ENSBTAG00000040585) NR5A1 (ENSBTAG00000009017) ADGRD2 (ENSBTAG00000017576) PSMB7 (ENSBTAG00000003067) NEK6 (ENSBTAG00000019470) LHX2 (ENSBTAG00000010990) ENSBTAG00000023860 ENSBTAG00000048688 ##22 DENND1A (ENSBTAG00000003610) CRB2 (ENSBTAG00000014391) STRBP (ENSBTAG00000021921) ENSBTAG00000048537 GPR21 (ENSBTAG00000040296) RABGAP1 (ENSBTAG00000039172) ZBTB26 (ENSBTAG00000038610) ZBTB6 (ENSBTAG00000039815) RC3H2 (ENSBTAG00000023867) PDCL (ENSBTAG00000030675) OR1K1 (ENSBTAG00000030676) OR5C1 (ENSBTAG00000038249) OR1AH6 (ENSBTAG00000030677) OR1AF1 (ENSBTAG00000004667) OR1AF3 (ENSBTAG00000038665) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 2 PPP6C (ENSBIXG00005002881) SCAI (ENSBIXG00005017823) GOLGA1 (ENSBIXG00005017888) ARPC5L (ENSBIXG00005017925) ENSBIXG00005017947 WDR38 (ENSBIXG00005017964) OLFML2A (ENSBIXG00005017994) ENSBIXG00005017999 NR6A1 (ENSBIXG00005018129) NR5A1 (ENSBIXG00005007287) ADGRD2 (ENSBIXG00005018218) ENSBIXG00005018237 NEK6 (ENSBIXG00005018334) LHX2 (ENSBIXG00005018376) ENSBIXG00005018399 ENSBIXG00005018414 ##22 DENND1A (ENSBIXG00005018546) CRB2 (ENSBIXG00005007721) STRBP (ENSBIXG00005003042) ENSBIXG00005018783 GPR21 (ENSBIXG00005018797) RABGAP1 (ENSBIXG00005005857) ZBTB26 (ENSBIXG00005018935) ZBTB6 (ENSBIXG00005003085) RC3H2 (ENSBIXG00005019119) PDCL (ENSBIXG00005019164) OR1K1 (ENSBIXG00005019174) OR5C1 (ENSBIXG00005019185) ENSBIXG00005019201 ENSBIXG00005003131 ENSBIXG00005019218 American bison MODERN SPECIES 3112 RABEPK (ENSBBBG00000014930) PPP6C (ENSBBBG00000003624) SCAI (ENSBBBG00000014945) GOLGA1 (ENSBBBG00000014965) ARPC5L (ENSBBBG00000003705) RPL35 (ENSBBBG00000014980) WDR38 (ENSBBBG00000003711) OLFML2A (ENSBBBG00000000806) NR6A1 (ENSBBBG00000015024) NR5A1 (ENSBBBG00000015038) ADGRD2 (ENSBBBG00000015057) PSMB7 (ENSBBBG00000015071) NEK6 (ENSBBBG00000015078) LHX2 (ENSBBBG00000003743) ENSBBBG00000015098 ENSBBBG00000015103 ##22 DENND1A (ENSBBBG00000003787) CRB2 (ENSBBBG00000015282) STRBP (ENSBBBG00000001399) ENSBBBG00000001391 GPR21 (ENSBBBG00000001383) RABGAP1 (ENSBBBG00000001355) ZBTB6 (ENSBBBG00000001347) RC3H2 (ENSBBBG00000001251) PDCL (ENSBBBG00000003806) OR1K1 (ENSBBBG00000003504) OR5C1 (ENSBBBG00000003497) ENSBBBG00000003491 ENSBBBG00000015334 ENSBBBG00000007989 ENSBBBG00000015348 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1241 MIP (ENSMMSG00000015573) SPRYD4 (ENSMMSG00000015594) GLS2 (ENSMMSG00000015620) RBMS2 (ENSMMSG00000015740) ENSMMSG00000015852 ENSMMSG00000015953 ENSMMSG00000016159 PRIM1 (ENSMMSG00000016240) ENSMMSG00000016273 HSD17B6 (ENSMMSG00000016311) ENSMMSG00000016333 ENSMMSG00000016383 SDR9C7 (ENSMMSG00000016406) ENSMMSG00000016459 ENSMMSG00000016516 ENSMMSG00000016550 ##22 ENSMMSG00000016565 GPR182 (ENSMMSG00000016587) ZBTB39 (ENSMMSG00000016599) TAC3 (ENSMMSG00000016614) MYO1A (ENSMMSG00000016701) NEMP1 (ENSMMSG00000016873) NAB2 (ENSMMSG00000016947) STAT6 (ENSMMSG00000016988) LRP1 (ENSMMSG00000013521) NXPH4 (ENSMMSG00000013785) ENSMMSG00000013800 NDUFA4L2 (ENSMMSG00000013824) STAC3 (ENSMMSG00000013843) R3HDM2 (ENSMMSG00000013912) INHBC (ENSMMSG00000014131) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 American black bear MODERN SPECIES 4794 PLAG1 (ENSUAMG00000026302) MOS (ENSUAMG00000026303) ENSUAMG00000026304 ##22 ENSUAMG00000026311 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01090000260040.a.a.b.dc.b ENSGT00940000154978 ENSGT00390000011932 ENSGT00940000160339 ENSGT00390000008611 ENSGT01100000263512.a.a.b ENSGT00940000155201 ENSGT00940000158472 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 ENSGT00940000159333 ENSGT00390000010038 ENSGT00950000182869.e.b.b.o.b ENSGT00940000154895.a.a ENSGT00940000154778 ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 ENSGT01050000244827.C.c.a.a ENSGT00940000162325.B.l ENSGT00390000018433.s.a.a.e.b ENSGT00940000155694 ENSGT00940000160791.A ENSGT00950000182936.a.a.b ENSGT00390000016644 ENSGT00950000183198.c.b.b.g.a.a ENSGT00940000154986 ENSGT00390000008828.k.a ENSGT00390000016183 ENSGT00940000160195.b.b ENSGT00950000183040.A.b ENSGT00940000155128.a.b ENSGT00940000155905.a.d Dog MODERN SPECIES 6 ZNF827 (ENSCAFG00845012357) ENSCAFG00845012641 ENSCAFG00845012694 SLC10A7 (ENSCAFG00845012862) POU4F2 (ENSCAFG00845013080) TTC29 (ENSCAFG00845013144) EDNRA (ENSCAFG00845013340) TMEM184C (ENSCAFG00845013383) PRMT9 (ENSCAFG00845013422) ARHGAP10 (ENSCAFG00845013505) NR3C2 (ENSCAFG00845013694) IQCM (ENSCAFG00845013775) ENSCAFG00845013810 DCLK2 (ENSCAFG00845013901) LRBA (ENSCAFG00845014163) ENSCAFG00845014213 ##22 MAB21L2 (ENSCAFG00845005729) ENSCAFG00845005741 RPS3A (ENSCAFG00845005765) SH3D19 (ENSCAFG00845005957) PRSS48 (ENSCAFG00845006205) ENSCAFG00845006404 FAM160A1 (ENSCAFG00845006461) ATP5J2 (ENSCAFG00845006554) GATB (ENSCAFG00845006707) ENSCAFG00845006957 FBXW7 (ENSCAFG00845007020) ENSCAFG00845007288 TMEM154 (ENSCAFG00845007673) TIGD4 (ENSCAFG00845007856) ARFIP1 (ENSCAFG00845007940) Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 30 TOX (ENSCAFG00020015841) NSMAF (ENSCAFG00020015657) ENSCAFG00020015560 ENSCAFG00020015555 CYP7A1 (ENSCAFG00020015551) UBXN2B (ENSCAFG00020015548) FAM110B (ENSCAFG00020015547) ENSCAFG00020015542 BPNT2 (ENSCAFG00020015539) PENK (ENSCAFG00020015536) ENSCAFG00020015532 SDR16C5 (ENSCAFG00020015530) CHCHD7 (ENSCAFG00020015527) PLAG1 (ENSCAFG00020015525) MOS (ENSCAFG00020015523) ENSCAFG00020015520 ##22 ENSCAFG00020015514 LYN (ENSCAFG00020015508) TGS1 (ENSCAFG00020015485) TMEM68 (ENSCAFG00020015483) ENSCAFG00020015480 ENSCAFG00020015479 ENSCAFG00020015466 SOX17 (ENSCAFG00020015465) ENSCAFG00020015460 ENSCAFG00020015458 LYPLA1 (ENSCAFG00020015455) TCEA1 (ENSCAFG00020015451) RGS20 (ENSCAFG00020015450) ATP6V1H (ENSCAFG00020015448) ENSCAFG00020015447 Dingo MODERN SPECIES 277 ZNF827 (ENSCAFG00020025846) ENSCAFG00020025899 LSM6 (ENSCAFG00020025902) SLC10A7 (ENSCAFG00020025908) POU4F2 (ENSCAFG00020025916) TTC29 (ENSCAFG00020025920) EDNRA (ENSCAFG00020025935) TMEM184C (ENSCAFG00020025936) PRMT9 (ENSCAFG00020025939) ENSCAFG00020025962 ARHGAP10 (ENSCAFG00020025975) NR3C2 (ENSCAFG00020025992) ENSCAFG00020026009 DCLK2 (ENSCAFG00020026012) LRBA (ENSCAFG00020026144) ENSCAFG00020026662 ##22 MAB21L2 (ENSCAFG00020026663) ENSCAFG00020026664 ENSCAFG00020026665 SH3D19 (ENSCAFG00020026668) PRSS48 (ENSCAFG00020026672) ENSCAFG00020026675 FHIP1A (ENSCAFG00020026678) GATB (ENSCAFG00020026686) ENSCAFG00020026719 FBXW7 (ENSCAFG00020026731) ENSCAFG00020026769 ENSCAFG00020026770 TIGD4 (ENSCAFG00020001422) ARFIP1 (ENSCAFG00020001430) FHDC1 (ENSCAFG00020001445) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Rabbit MODERN SPECIES 436 ENSOCUG00000014090 ENSOCUG00000015177 ITPR1 (ENSOCUG00000012148) SUMF1 (ENSOCUG00000012348) ENSOCUG00000026652 ENSOCUG00000036153 ENSOCUG00000036915 LRRN1 (ENSOCUG00000023697) CRBN (ENSOCUG00000025795) TRNT1 (ENSOCUG00000008580) ENSOCUG00000015601 CNTN4 (ENSOCUG00000011025) CNTN6 (ENSOCUG00000012763) ENSOCUG00000037666 CHL1 (ENSOCUG00000004486) ENSOCUG00000023199 ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Degu MODERN SPECIES 186 ARMC3 (ENSODEG00000002341) MSRB2 (ENSODEG00000002295) PTF1A (ENSODEG00000002261) OTUD1 (ENSODEG00000002122) ENSODEG00000003530 KIAA1217 (ENSODEG00000003130) ARHGAP21 (ENSODEG00000003667) PRTFDC1 (ENSODEG00000003390) ENSODEG00000003316 ENSODEG00000003305 ##22 ENSODEG00000003243 ENKUR (ENSODEG00000003177) ENSODEG00000004103 GPR158 (ENSODEG00000004004) MYO3A (ENSODEG00000003447) GAD2 (ENSODEG00000002488) ENSODEG00000002425 ENSODEG00000002394 ENSODEG00000018879 ENSODEG00000002334 APBB1IP (ENSODEG00000002301) PDSS1 (ENSODEG00000003307) ABI1 (ENSODEG00000002843) MASTL (ENSODEG00000002698) YME1L1 (ENSODEG00000002663) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 21 ENSPEMG00000027432 Omg (ENSPEMG00000012789) Evi2b (ENSPEMG00000011425) Evi2a (ENSPEMG00000009997) Rab11fip4 (ENSPEMG00000017840) Utp6 (ENSPEMG00000014081) Suz12 (ENSPEMG00000019235) Crlf3 (ENSPEMG00000018811) Atad5 (ENSPEMG00000012850) Tefm (ENSPEMG00000016212) Adap2 (ENSPEMG00000002187) ENSPEMG00000018511 Rhot1 (ENSPEMG00000015998) Rhbdl3 (ENSPEMG00000017609) 5730455P16Rik (ENSPEMG00000007661) ENSPEMG00000031231 ##22 Zfp207 (ENSPEMG00000009110) Psmd11 (ENSPEMG00000015029) Cdk5r1 (ENSPEMG00000004672) Myo1d (ENSPEMG00000021437) Tmem98 (ENSPEMG00000015639) Spaca3 (ENSPEMG00000008847) Asic2 (ENSPEMG00000022612) ENSPEMG00000021078 Ccl2 (ENSPEMG00000024087) Ccl7 (ENSPEMG00000022329) Ccl11 (ENSPEMG00000031393) Ccl12 (ENSPEMG00000018710) Ccl8 (ENSPEMG00000024303) ENSPEMG00000022558 Tmem132e (ENSPEMG00000016046) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 66 Sh3gl2 (ENSJJAG00000017618) ENSJJAG00000011696 ENSJJAG00000008188 ENSJJAG00000022818 Bnc2 (ENSJJAG00000004324) ENSJJAG00000019056 Ccdc171 (ENSJJAG00000020916) ENSJJAG00000015360 Snapc3 (ENSJJAG00000018408) Ttc39b (ENSJJAG00000004238) ENSJJAG00000010564 ENSJJAG00000015519 Cer1 (ENSJJAG00000023511) Zdhhc21 (ENSJJAG00000002851) Nfib (ENSJJAG00000013052) ENSJJAG00000010432 ##22 Mpdz (ENSJJAG00000012097) Lurap1l (ENSJJAG00000014520) Tyrp1 (ENSJJAG00000015009) ENSJJAG00000010326 ENSJJAG00000023453 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 873 HELB (ENSPSMG00000001638) GRIP1 (ENSPSMG00000001787) ENSPSMG00000001925 ENSPSMG00000001937 DYRK2 (ENSPSMG00000001942) IFNG (ENSPSMG00000001959) IL26 (ENSPSMG00000001967) IL22 (ENSPSMG00000001981) MDM1 (ENSPSMG00000002086) RAP1B (ENSPSMG00000002325) NUP107 (ENSPSMG00000002791) SLC35E3 (ENSPSMG00000003036) ENSPSMG00000003043 MDM2 (ENSPSMG00000003389) CPM (ENSPSMG00000003940) ENSPSMG00000003948 ##22 CPSF6 (ENSPSMG00000004017) LYZ (ENSPSMG00000004084) YEATS4 (ENSPSMG00000004127) FRS2 (ENSPSMG00000004143) ENSPSMG00000004153 CCT2 (ENSPSMG00000004315) LRRC10 (ENSPSMG00000004380) BEST3 (ENSPSMG00000004408) RAB3IP (ENSPSMG00000004512) MYRFL (ENSPSMG00000004559) CNOT2 (ENSPSMG00000004665) KCNMB4 (ENSPSMG00000004719) PTPRB (ENSPSMG00000005064) PTPRR (ENSPSMG00000005364) TSPAN8 (ENSPSMG00000005479) Bushbaby MODERN SPECIES 153 VSIG10 (ENSOGAG00000008203) WSB2 (ENSOGAG00000008202) RFC5 (ENSOGAG00000008195) KSR2 (ENSOGAG00000005825) NOS1 (ENSOGAG00000012381) FBXO21 (ENSOGAG00000012377) TESC (ENSOGAG00000012373) FBXW8 (ENSOGAG00000012368) HRK (ENSOGAG00000033664) RNFT2 (ENSOGAG00000012361) SPRING1 (ENSOGAG00000011926) MED13L (ENSOGAG00000014346) TBX3 (ENSOGAG00000016212) TBX5 (ENSOGAG00000016204) RBM19 (ENSOGAG00000000602) ENSOGAG00000009881 ##22 LHX5 (ENSOGAG00000003519) SDSL (ENSOGAG00000015452) SDS (ENSOGAG00000015447) PLBD2 (ENSOGAG00000029910) SLC8B1 (ENSOGAG00000026353) TPCN1 (ENSOGAG00000015440) ENSOGAG00000033479 IQCD (ENSOGAG00000032287) RITA1 (ENSOGAG00000004214) DDX54 (ENSOGAG00000004210) CFAP73 (ENSOGAG00000033970) RASAL1 (ENSOGAG00000004208) DTX1 (ENSOGAG00000030292) OAS2 (ENSOGAG00000004204) OAS3 (ENSOGAG00000004202) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00940000160216 ENSGT00940000153571.a.eb ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000161696.c.a.a ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000009040.l ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040.k.a ENSGT00940000154185.m ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 Bolivian squirrel monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 50 MTMR2 (ENSSBOG00000012973) MAML2 (ENSSBOG00000031458) CCDC82 (ENSSBOG00000027897) ENSSBOG00000018311 CNTN5 (ENSSBOG00000023228) ARHGAP42 (ENSSBOG00000035822) PGR (ENSSBOG00000013714) ENSSBOG00000023277 ENSSBOG00000023108 ENSSBOG00000021319 TRPC6 (ENSSBOG00000019836) ENSSBOG00000032893 ANGPTL5 (ENSSBOG00000031015) CEP126 (ENSSBOG00000028647) CFAP300 (ENSSBOG00000033758) ENSSBOG00000036077 ##22 YAP1 (ENSSBOG00000027497) BIRC3 (ENSSBOG00000031187) BIRC2 (ENSSBOG00000034069) ENSSBOG00000029913 MMP7 (ENSSBOG00000026550) MMP20 (ENSSBOG00000023588) MMP27 (ENSSBOG00000003176) MMP8 (ENSSBOG00000031477) MMP10 (ENSSBOG00000029788) MMP1 (ENSSBOG00000034105) MMP3 (ENSSBOG00000033146) MMP12 (ENSSBOG00000028385) MMP13 (ENSSBOG00000035950) ENSSBOG00000033947 DYNC2H1 (ENSSBOG00000032663) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 116 CA8 (ENSSBOG00000023844) TOX (ENSSBOG00000033601) NSMAF (ENSSBOG00000025474) SDCBP (ENSSBOG00000023954) CYP7A1 (ENSSBOG00000021502) UBXN2B (ENSSBOG00000026177) ENSSBOG00000020724 BPNT2 (ENSSBOG00000021056) ENSSBOG00000023239 PENK (ENSSBOG00000027180) ENSSBOG00000030581 SDR16C5 (ENSSBOG00000017860) CHCHD7 (ENSSBOG00000001463) PLAG1 (ENSSBOG00000033202) ENSSBOG00000024676 ENSSBOG00000030662 ##22 LYN (ENSSBOG00000027675) TGS1 (ENSSBOG00000024469) TMEM68 (ENSSBOG00000021559) XKR4 (ENSSBOG00000019227) ENSSBOG00000027313 RP1 (ENSSBOG00000025024) MRPL15 (ENSSBOG00000023543) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 59 PAK2 (ENSSBOG00000033793) PIGX (ENSSBOG00000015817) CEP19 (ENSSBOG00000034597) NRROS (ENSSBOG00000031451) FBXO45 (ENSSBOG00000026526) WDR53 (ENSSBOG00000022633) RNF168 (ENSSBOG00000032076) CYP8B1 (ENSSBOG00000024342) ZNF662 (ENSSBOG00000029295) KRBOX1 (ENSSBOG00000035914) GASK1A (ENSSBOG00000015051) POMGNT2 (ENSSBOG00000018244) SNRK (ENSSBOG00000034910) ANO10 (ENSSBOG00000034955) ABHD5 (ENSSBOG00000032259) ENSSBOG00000012560 ##22 TOPAZ1 (ENSSBOG00000024621) TCAIM (ENSSBOG00000023548) ZNF445 (ENSSBOG00000032288) ZNF852 (ENSSBOG00000027551) ZKSCAN7 (ENSSBOG00000034737) ZNF197 (ENSSBOG00000030818) ZNF35 (ENSSBOG00000022775) ENSSBOG00000022588 ZNF502 (ENSSBOG00000013541) ENSSBOG00000031143 KIF15 (ENSSBOG00000035204) ENSSBOG00000018522 ENSSBOG00000019072 TMEM42 (ENSSBOG00000022245) TGM4 (ENSSBOG00000030333) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 10 PIEZO2 (ENSPANG00000012600) ENSPANG00000040623 GNAL (ENSPANG00000005629) CHMP1B (ENSPANG00000048968) MPPE1 (ENSPANG00000011901) ENSPANG00000050942 ENSPANG00000050868 IMPA2 (ENSPANG00000021939) NAPG (ENSPANG00000016946) APCDD1 (ENSPANG00000013298) VAPA (ENSPANG00000007689) TXNDC2 (ENSPANG00000021713) RAB31 (ENSPANG00000041614) PPP4R1 (ENSPANG00000015969) RALBP1 (ENSPANG00000008472) ENSPANG00000031821 ##22 TWSG1 (ENSPANG00000007236) ANKRD12 (ENSPANG00000008897) ENSPANG00000008383 ENSPANG00000009266 ENSPANG00000049362 MTCL1 (ENSPANG00000011897) RAB12 (ENSPANG00000009320) PTPRM (ENSPANG00000005610) LRRC30 (ENSPANG00000003355) ENSPANG00000019970 ENSPANG00000044570 L3MBTL4 (ENSPANG00000008894) TMEM200C (ENSPANG00000007851) EPB41L3 (ENSPANG00000006867) ZBTB14 (ENSPANG00000003128) Olive baboon MODERN SPECIES 13 CHIC2 (ENSPANG00000019862) GSX2 (ENSPANG00000021441) PDGFRA (ENSPANG00000021718) KIT (ENSPANG00000025525) KDR (ENSPANG00000009816) SRD5A3 (ENSPANG00000023285) TMEM165 (ENSPANG00000008925) CLOCK (ENSPANG00000006882) PDCL2 (ENSPANG00000007651) NMU (ENSPANG00000024021) ENSPANG00000040931 ENSPANG00000039918 EXOC1L (ENSPANG00000049134) EXOC1 (ENSPANG00000009817) CEP135 (ENSPANG00000007654) ENSPANG00000033113 ##22 CRACD (ENSPANG00000006883) AASDH (ENSPANG00000018913) PPAT (ENSPANG00000012149) PAICS (ENSPANG00000017692) SRP72 (ENSPANG00000005495) ARL9 (ENSPANG00000022288) THEGL (ENSPANG00000013419) ENSPANG00000050248 ENSPANG00000044703 HOPX (ENSPANG00000007783) ENSPANG00000038978 ENSPANG00000040417 ENSPANG00000048201 ENSPANG00000046814 REST (ENSPANG00000017819) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Rhesus MODERN SPECIES 6 CTSL (ENSMMUG00000017609) ENSMMUG00000013517 CDK20 (ENSMMUG00000010438) SPIN1 (ENSMMUG00000016295) NXNL2 (ENSMMUG00000008414) ENSMMUG00000049479 S1PR3 (ENSMMUG00000043913) SHC3 (ENSMMUG00000039355) CKS2 (ENSMMUG00000064761) SECISBP2 (ENSMMUG00000012532) SEMA4D (ENSMMUG00000008629) GADD45G (ENSMMUG00000048737) DIRAS2 (ENSMMUG00000007223) SYK (ENSMMUG00000001748) AUH (ENSMMUG00000015798) ENSMMUG00000047234 ##22 NFIL3 (ENSMMUG00000023257) ENSMMUG00000061473 ROR2 (ENSMMUG00000020009) ENSMMUG00000060533 SPTLC1 (ENSMMUG00000003006) ENSMMUG00000049490 ENSMMUG00000051880 ENSMMUG00000009642 ENSMMUG00000047417 IARS1 (ENSMMUG00000004628) NOL8 (ENSMMUG00000004629) CENPP (ENSMMUG00000004630) OGN (ENSMMUG00000004634) OMD (ENSMMUG00000061517) ASPN (ENSMMUG00000004638) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Orangutan DUPLICATION Orangutan MODERN SPECIES 3 EMP1 (ENSPPYG00000034556) ENSPPYG00000004315 FAM234B (ENSPPYG00000004314) HEBP1 (ENSPPYG00000004312) GPRC5D (ENSPPYG00000004311) GPRC5A (ENSPPYG00000037079) DDX47 (ENSPPYG00000004309) APOLD1 (ENSPPYG00000032200) CDKN1B (ENSPPYG00000004307) GPR19 (ENSPPYG00000004306) ENSPPYG00000040514 CREBL2 (ENSPPYG00000004305) DUSP16 (ENSPPYG00000004304) BORCS5 (ENSPPYG00000004303) MANSC1 (ENSPPYG00000037304) ENSPPYG00000031339 ##22 BCL2L14 (ENSPPYG00000004300) LRP6 (ENSPPYG00000029873) ETV6 (ENSPPYG00000039930) ENSPPYG00000004298 ENSPPYG00000037370 PRB4 (ENSPPYG00000036368) TAS2R42 (ENSPPYG00000004297) ENSPPYG00000031978 SMIM10L1 (ENSPPYG00000041450) TAS2R30 (ENSPPYG00000039044) ENSPPYG00000041200 TAS2R31 (ENSPPYG00000034819) TAS2R19 (ENSPPYG00000038226) TAS2R20 (ENSPPYG00000035028) TAS2R50 (ENSPPYG00000004291) Orangutan MODERN SPECIES 14 ENSPPYG00000012185 PAX8 (ENSPPYG00000030017) PSD4 (ENSPPYG00000012182) IL1RN (ENSPPYG00000032542) IL1F10 (ENSPPYG00000012180) IL36RN (ENSPPYG00000012179) IL36B (ENSPPYG00000012178) IL36A (ENSPPYG00000012177) IL36G (ENSPPYG00000012176) IL37 (ENSPPYG00000012175) IL1B (ENSPPYG00000012174) IL1A (ENSPPYG00000012173) CKAP2L (ENSPPYG00000012172) NT5DC4 (ENSPPYG00000012171) SLC20A1 (ENSPPYG00000012170) ENSPPYG00000030820 ##22 ENSPPYG00000012169 POLR1B (ENSPPYG00000012168) TTL (ENSPPYG00000030912) ENSPPYG00000032141 ZC3H6 (ENSPPYG00000012166) ZC3H8 (ENSPPYG00000012165) FBLN7 (ENSPPYG00000012164) TMEM87B (ENSPPYG00000012163) MERTK (ENSPPYG00000012162) ANAPC1 (ENSPPYG00000012161) ENSPPYG00000034622 ACOXL (ENSPPYG00000012154) BUB1 (ENSPPYG00000012153) MTLN (ENSPPYG00000012152) NPHP1 (ENSPPYG00000012151) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.b ##22 Bonobo MODERN SPECIES 14 ENSPPAG00000039050 CCT7 (ENSPPAG00000031783) PRADC1 (ENSPPAG00000038026) SMYD5 (ENSPPAG00000036998) NOTO (ENSPPAG00000035881) RAB11FIP5 (ENSPPAG00000029522) ENSPPAG00000028544 ENSPPAG00000023177 ENSPPAG00000041216 ENSPPAG00000038563 ENSPPAG00000036394 ENSPPAG00000001045 SPR (ENSPPAG00000040168) EXOC6B (ENSPPAG00000020760) CYP26B1 (ENSPPAG00000031389) ENSPPAG00000018681 ##22 DYSF (ENSPPAG00000035819) ZNF638 (ENSPPAG00000039298) PAIP2B (ENSPPAG00000037708) MPHOSPH10 (ENSPPAG00000031855) MCEE (ENSPPAG00000023678) NAGK (ENSPPAG00000038041) TEX261 (ENSPPAG00000037469) ANKRD53 (ENSPPAG00000026192) ATP6V1B1 (ENSPPAG00000026048) VAX2 (ENSPPAG00000025820) ENSPPAG00000025744 CD207 (ENSPPAG00000025628) ENSPPAG00000025468 CLEC4F (ENSPPAG00000028639) FIGLA (ENSPPAG00000033021) Platypus MODERN SPECIES 18 CHD7 (ENSOANG00000005042) RAB2A (ENSOANG00000041731) CA8 (ENSOANG00000005040) TOX (ENSOANG00000005038) NSMAF (ENSOANG00000005036) SDCBP (ENSOANG00000005034) CYP7A1 (ENSOANG00000005032) UBXN2B (ENSOANG00000005031) FAM110B (ENSOANG00000030653) BPNT2 (ENSOANG00000005030) PENK (ENSOANG00000006273) ENSOANG00000002450 CHCHD7 (ENSOANG00000005504) PLAG1 (ENSOANG00000005503) MOS (ENSOANG00000038966) RPS20 (ENSOANG00000005502) #22 LYN (ENSOANG00000005501) TGS1 (ENSOANG00000021853) TMEM68 (ENSOANG00000005499) XKR4 (ENSOANG00000048684) ENSOANG00000007287 ENSOANG00000037085 ENSOANG00000039063 MRPL15 (ENSOANG00000007286) LYPLA1 (ENSOANG00000007285) TCEA1 (ENSOANG00000007284) ENSOANG00000007283 ATP6V1H (ENSOANG00000007281) OPRK1 (ENSOANG00000037553) RB1CC1 (ENSOANG00000007278) ENSOANG00000021848 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Laterata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153649.A ENSGT00940000153886.a.b ENSGT00940000158863 ENSGT00940000159497 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00940000153141.B.a ENSGT00520000055567.a.a.b ENSGT00950000183056.B.b ENSGT00950000183149.A ENSGT00940000163618 ENSGT00940000156731 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a #22 ENSGT00390000003248.b ##22 ENSGT00940000164689 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000018056 ENSGT00390000011782.k.a.a.b ENSGT00390000011782.k.a.a.a.b.b ENSGT00390000011782.k.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000011782.k.b.b ENSGT00390000011782.k.b.a ENSGT00390000011782.l ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 Common wall lizard MODERN SPECIES 298 ENSPMRG00000022406 ENSPMRG00000022403 #22 Coelacanth MODERN SPECIES 385 CHCHD7 (ENSLACG00000000034) PLAG1 (ENSLACG00000002568) RPS20 (ENSLACG00000004213) #22 zgc:56231 (ENSLACG00000004707) LYN (ENSLACG00000005733) ENSLACG00000007214 TGS1 (ENSLACG00000008074) TMEM68 (ENSLACG00000009171) ENSLACG00000010658 ENSLACG00000012760 ENSLACG00000014370 ENSLACG00000014602 ENSLACG00000014671 SOX17 (ENSLACG00000015284) MRPL15 (ENSLACG00000016201) LYPLA1 (ENSLACG00000016249) TCEA1 (ENSLACG00000016348) RGS20 (ENSLACG00000016566) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000155142 ENSGT00940000157852.a.a ENSGT00940000164239.b.b ENSGT00390000015564 ENSGT00940000167726 ENSGT00530000063835.b ENSGT00510000048348 ENSGT00940000155059 ENSGT00940000154502 ENSGT00950000183056.B.b.h ENSGT00950000183149.A.e ENSGT00940000156731.q.a ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246.c ENSGT00940000160233 ENSGT00390000003248.a.a #22 ENSGT00390000003248.b ##22 ENSGT00940000164689 ENSGT00940000155406.g ENSGT00940000164792.a ENSGT00990000212128 ENSGT00940000161144 ENSGT00940000158727.b.a.a.a ENSGT00940000155918.c.a ENSGT00940000166789.h ENSGT00390000013183.c ENSGT00940000155939 ENSGT00940000157951 ENSGT00940000157881 ENSGT00940000156105.k.a ENSGT01080000257410.B.a.a.a.j Atlantic salmon MODERN SPECIES 21 ENSSSAG00000071869 ENSSSAG00000107372 ENSSSAG00000109415 ENSSSAG00000072081 ENSSSAG00000093351 ENSSSAG00000072090 ENSSSAG00000072100 nsmaf (ENSSSAG00000072140) SDCB1 (ENSSSAG00000073132) fam110b (ENSSSAG00000112643) penkb (ENSSSAG00000073140) sdr16c5 (ENSSSAG00000073141) chchd7 (ENSSSAG00000073145) plag1 (ENSSSAG00000108548) mos (ENSSSAG00000073153) RPS20 (ENSSSAG00000073156) #22 zgc:56231 (ENSSSAG00000073167) ARHGAP21 (ENSSSAG00000056186) ENSSSAG00000101393 THNSL1 (ENSSSAG00000106979) ENSSSAG00000066162 GPR158 (ENSSSAG00000066175) anxa13 (ENSSSAG00000066254) anxa13 (ENSSSAG00000091933) ENSSSAG00000110642 myo3a (ENSSSAG00000067094) gad2 (ENSSSAG00000069389) ENSSSAG00000118774 nle1 (ENSSSAG00000071944) APBB1IP (ENSSSAG00000072025) SLCO5A1 (ENSSSAG00000072039) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a #22 Fugu MODERN SPECIES 1 ENSTRUG00000005037 cd226 (ENSTRUG00000032198) dok6 (ENSTRUG00000004799) ENSTRUG00000029236 crispld1 (ENSTRUG00000029719) pi15 (ENSTRUG00000031696) gdap1 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ENSGT00390000003248.a.a #22 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000008527 ENSGT00940000154968.g ENSGT00940000154968.h.a ENSGT00950000182992.a.b.b ENSGT00940000154635.a ENSGT00520000062345 ENSGT00390000005651.m ENSGT00940000154835.C.lb.a.p ENSGT00940000164379.e.b.b ENSGT00940000154835.C.lb.a.o ENSGT00390000004912 ENSGT00940000154835.C.lb.b ENSGT00390000017728 ENSGT00940000154486.a.b.a.b ENSGT00940000157664 ENSGT00390000003248.a.a #22 ENSGT00940000164689 ENSGT00940000153725.a.b.b ENSGT00940000158957 ENSGT00940000153694.B ENSGT00530000063843.b ENSGT00530000063834.e.a ENSGT00950000183110.b.b.k.a ENSGT00940000155624.a.a ENSGT00950000182886.a.a.a.c ENSGT00940000156998.j.a ENSGT00940000154535.D.vb.a ENSGT00530000063786.a ENSGT00940000160961 ENSGT00940000153601.a.b.c ENSGT00940000155252.fb.a Javanese ricefish MODERN SPECIES 12 idi1 (ENSOJAG00000011069) cpne3 (ENSOJAG00000010882) cpne3 (ENSOJAG00000006769) rmdn1 (ENSOJAG00000006157) WWP1 (ENSOJAG00000003634) ENSOJAG00000021778 snx16 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