Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000016791 #7	ENSGT00390000018400 #8	ENSGT01040000240503.A.a.a #9	ENSGT00530000063675.a #10	ENSGT00940000156346 #11	ENSGT00510000048144 #12	ENSGT00690000102225 #13	ENSGT00390000008502 #14	ENSGT01030000234623.a.b.b #15	ENSGT00910000144347.x #16	ENSGT00940000161615 #17	ENSGT00940000155425 #18	ENSGT00910000144338 #19	ENSGT00950000182957.a.a.b #20	ENSGT00950000182772.B.a.b #21	ENSGT00390000009048.a.a #22	ENSGT00950000183254 #23	ENSGT00940000158701 #24	ENSGT00390000011891 #25	ENSGT00940000156677 #26	ENSGT00940000161523 #27	ENSGT00900000143426 #28	ENSGT00950000183113.b.a #29	ENSGT00940000162599 #30	ENSGT01050000244866.A.a.b.b #31	ENSGT01050000244866.A.a.b.a #32	ENSGT01050000244866.A.b #33	ENSGT00390000018016 #34	ENSGT00390000016216 #35	ENSGT00950000183075.a.a.a.b #36	ENSGT00940000160367 #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000016791 #7	ENSGT00390000018400 #8	ENSGT01040000240503.A.a.a #9	ENSGT00530000063675.a #10	ENSGT00940000156346 #11	ENSGT00510000048144 #12	ENSGT00690000102225 #13	ENSGT00390000008502 #14	ENSGT01030000234623.a.b.b #15	ENSGT00910000144347.x #16	ENSGT00940000161615 #17	ENSGT00940000155425 #18	ENSGT00910000144338 #19	ENSGT00950000182957.a.a.b #20	ENSGT00950000182772.B.a.b #21	ENSGT00390000009048.a.a #22	ENSGT00950000183254 #23	ENSGT00940000158701 #24	ENSGT00390000011891 #25	ENSGT00940000156677 #26	ENSGT00940000161523 #27	ENSGT00900000143426 #28	ENSGT00950000183113.b.a #29	ENSGT00940000162599 #30	ENSGT01050000244866.A.a.b.b #31	ENSGT01050000244866.A.a.b.a #32	ENSGT01050000244866.A.b #33	ENSGT00390000018016 #34	ENSGT00390000016216 #35	ENSGT00950000183075.a.a.a.b #36	ENSGT00940000160367 #37
Alpin marmot	MODERN SPECIES	7	SPG11 (ENSMMMG00000017966) #7	ENSMMMG00000017993 #8	CTDSPL2 (ENSMMMG00000018015) #9	GOLM2 (ENSMMMG00000018044) #10	FRMD5 (ENSMMMG00000018137) #11	ENSMMMG00000018185 #12	MFAP1 (ENSMMMG00000018199) #13	HYPK (ENSMMMG00000018203) #14	SERINC4 (ENSMMMG00000018211) #15	ENSMMMG00000018255 #16	ELL3 (ENSMMMG00000018287) #17	PDIA3 (ENSMMMG00000018324) #18	CATSPER2 (ENSMMMG00000018345) #19	STRC (ENSMMMG00000018372) #20	ENSMMMG00000018415 #21	PPIP5K1 (ENSMMMG00000018436) #22	ENSMMMG00000018606 #23	MAP1A (ENSMMMG00000018613) #24	TP53BP1 (ENSMMMG00000018697) #25	TUBGCP4 (ENSMMMG00000018766) #26	ZSCAN29 (ENSMMMG00000018814) #27	ENSMMMG00000018826 #28	ADAL (ENSMMMG00000018830) #29	LCMT2 (ENSMMMG00000018863) #30	TGM7 (ENSMMMG00000018868) #31	TGM5 (ENSMMMG00000018903) #32	EPB42 (ENSMMMG00000018914) #33	CCNDBP1 (ENSMMMG00000018926) #34	TMEM62 (ENSMMMG00000018944) #35	UBR1 (ENSMMMG00000018995) #36	TTBK2 (ENSMMMG00000019017) #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000016791 #7	ENSGT00390000018400 #8	ENSGT01040000240503.A.a.a #9	ENSGT00530000063675.a #10	ENSGT00940000156346 #11	ENSGT00510000048144 #12	ENSGT00690000102225 #13	ENSGT00390000008502 #14	ENSGT01030000234623.a.b.b #15	ENSGT00910000144347.x #16	ENSGT00940000161615 #17	ENSGT00940000155425 #18	ENSGT00910000144338 #19	ENSGT00950000182957.a.a.b #20	ENSGT00950000182772.B.a.b #21	ENSGT00390000009048.a.a #22	ENSGT00940000158701 #24	ENSGT00390000011891 #25	ENSGT00940000156677 #26	ENSGT00940000161523 #27	ENSGT00900000143426 #28	ENSGT00950000183113.b.a #29	ENSGT00940000162599 #30	ENSGT01050000244866.A.a.b.b #31	ENSGT01050000244866.A.a.b.a #32	ENSGT01050000244866.A.b #33	ENSGT00390000018016 #34	ENSGT00390000016216 #35	ENSGT00950000183075.a.a.a.b #36	ENSGT00940000160367 #37	ENSGT00390000000491
Squirrel	MODERN SPECIES	71	ENSSTOG00000002225 #7	EIF3J (ENSSTOG00000025483) #8	CTDSPL2 (ENSSTOG00000002215) #9	GOLM2 (ENSSTOG00000009014) #10	FRMD5 (ENSSTOG00000007019) #11	WDR76 (ENSSTOG00000006985) #12	HYPK (ENSSTOG00000006916) #14	MFAP1 (ENSSTOG00000006967) #13	SERINC4 (ENSSTOG00000006939) #15	ENSSTOG00000021211 #16	ELL3 (ENSSTOG00000012181) #17	PDIA3 (ENSSTOG00000006893) #18	CATSPER2 (ENSSTOG00000025459) #19	STRC (ENSSTOG00000006829) #20	ENSSTOG00000006810 #21	PPIP5K1 (ENSSTOG00000007074) #22	MAP1A (ENSSTOG00000026949) #24	TP53BP1 (ENSSTOG00000006966) #25	TUBGCP4 (ENSSTOG00000006918) #26	ZSCAN29 (ENSSTOG00000006892) #27	ADAL (ENSSTOG00000006870) #29	LCMT2 (ENSSTOG00000027246) #30	TGM7 (ENSSTOG00000001064) #31	TGM5 (ENSSTOG00000001050) #32	EPB42 (ENSSTOG00000001041) #33	CCNDBP1 (ENSSTOG00000001030) #34	TMEM62 (ENSSTOG00000012992) #35	UBR1 (ENSSTOG00000008907) #36	TTBK2 (ENSSTOG00000027361) #37	CDAN1 (ENSSTOG00000006305)	ENSSTOG00000034368
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	4	EIF3J (ENSUPAG00010010111) #8	CTDSPL2 (ENSUPAG00010010125) #9	GOLM2 (ENSUPAG00010010162) #10	FRMD5 (ENSUPAG00010010188) #11	WDR76 (ENSUPAG00010010229) #12	MFAP1 (ENSUPAG00010010275) #13	HYPK (ENSUPAG00010010283) #14	SERINC4 (ENSUPAG00010010300) #15	ENSUPAG00010010342 ##16	ELL3 (ENSUPAG00010010367) #17	PDIA3 (ENSUPAG00010010414) #18	ENSUPAG00010010432	CATSPER2 (ENSUPAG00010010437) #19	STRC (ENSUPAG00010010463) #20	ENSUPAG00010010501 #21	PPIP5K1 (ENSUPAG00010010520) #22	MAP1A (ENSUPAG00010011785) #24	ENSUPAG00010011798	TP53BP1 (ENSUPAG00010011808) #25	TUBGCP4 (ENSUPAG00010011916) #26	ZSCAN29 (ENSUPAG00010011982) #27	ENSUPAG00010012006 #28	ADAL (ENSUPAG00010012022) #29	LCMT2 (ENSUPAG00010012148) #30	TGM7 (ENSUPAG00010012150) #31	TGM5 (ENSUPAG00010012161) #32	EPB42 (ENSUPAG00010012173) #33	CCNDBP1 (ENSUPAG00010012188) #34	TMEM62 (ENSUPAG00010012249) #35	UBR1 (ENSUPAG00010012265) #36	TTBK2 (ENSUPAG00010012404) #37
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	CTDSPL2 (ENSSVLG00005005170) #9	GOLM2 (ENSSVLG00005005117) #10	ENSSVLG00005005085	FRMD5 (ENSSVLG00005004959) #11	WDR76 (ENSSVLG00005004907) #12	MFAP1 (ENSSVLG00005004879) #13	HYPK (ENSSVLG00005004857) #14	SERINC4 (ENSSVLG00005004821) #15	ENSSVLG00005004775 #16	ELL3 (ENSSVLG00005004750) #17	PDIA3 (ENSSVLG00005004732) #18	CATSPER2 (ENSSVLG00005004713) #19	STRC (ENSSVLG00005004652) #20	ENSSVLG00005004607 #21	ENSSVLG00005004584 #23	PPIP5K1 (ENSSVLG00005004405) #22	MAP1A (ENSSVLG00005004338) #24	TP53BP1 (ENSSVLG00005004287) #25	TUBGCP4 (ENSSVLG00005004238) #26	ZSCAN29 (ENSSVLG00005004207) #27	ADAL (ENSSVLG00005004166) #29	ENSSVLG00005004147	TGM7 (ENSSVLG00005004123) #31	TGM5 (ENSSVLG00005004088) #32	EPB42 (ENSSVLG00005003990) #33	CCNDBP1 (ENSSVLG00005003934) #34	TMEM62 (ENSSVLG00005003864) #35	UBR1 (ENSSVLG00005003806) #36	ENSSVLG00005003756	ENSSVLG00005003741	ENSSVLG00005003728