Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00940000156574.C ENSGT00390000009899.a.d ENSGT00940000167440 ENSGT00390000009663 ENSGT00940000165046 ENSGT00940000159464 ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a #23 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477 #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000167440 ENSGT00390000009663 ENSGT00940000165046.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000178524 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a #23 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477 #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000165046.a ENSGT00940000161379 ENSGT00990000204217 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 145 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000159916 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000157682.B.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ##23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.m #34 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156938.e ENSGT00940000163421.a.d.a.a ENSGT00940000159150.ab ENSGT00940000155010.a ENSGT01010000223078 ENSGT00390000004417.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.b ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01000000216979 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B.j Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.e.a #7 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.a ##23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #31 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00590000083094.a.b.k.b ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.e.a #7 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #31 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 ENSGT00390000016453.m #34 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00590000083094.a.b.k.b ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.e.a #7 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #31 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 ENSGT00390000016453.m #34 Coho salmon MODERN SPECIES 1 aass (ENSOKIG00005028706) #7 PTPRZ1 (ENSOKIG00005031860) #8 DLD (ENSOKIG00005032474) #9 ENSOKIG00005032722 #10 ENSOKIG00005032730 #11 ticam1 (ENSOKIG00005032764) #12 BET1L (ENSOKIG00005032895) #13 deaf1 (ENSOKIG00005032919) #14 drd4a (ENSOKIG00005032941) #15 ENSOKIG00005032958 #16 ENSOKIG00005032986 #17 ENSOKIG00005032992 #18 ENSOKIG00005033002 #19 SYT8 (ENSOKIG00005033015) #20 tnni2a.1 (ENSOKIG00005033031) #21 tnni2a.2 (ENSOKIG00005033122) #22 ENSOKIG00005033145 #23 ENSOKIG00005033174 #24 tnnt3b (ENSOKIG00005033212) #25 MYOD1 (ENSOKIG00005033239) #26 zgc:172145 (ENSOKIG00005033256) #27 CACNA2D4 (ENSOKIG00005033316) #28 LRTM2 (ENSOKIG00005034035) #29 ENSOKIG00005034065 #30 urahb (ENSOKIG00005034114) #31 GLG1 (ENSOKIG00005034363) #32 RFWD3 (ENSOKIG00005038361) #33 MLKL (ENSOKIG00005038521) #34 etfbkmt (ENSOKIG00005038535) #35 amn1 (ENSOKIG00005038546) #36 nfybb (ENSOKIG00005038602) #37 Chinook salmon MODERN SPECIES CADPS2 (ENSOTSG00005000454) fezf1 (ENSOTSG00005000577) aass (ENSOTSG00005000626) #7 PTPRZ1 (ENSOTSG00005007896) #8 dldh (ENSOTSG00005008481) #9 ENSOTSG00005009315 ENSOTSG00005009316 #11 ticam1 (ENSOTSG00005009318) #12 BET1L (ENSOTSG00005009320) #13 deaf1 (ENSOTSG00005009322) #14 drd4a (ENSOTSG00005009324) #15 ENSOTSG00005009327 #16 ENSOTSG00005009336 #18 ENSOTSG00005009337 #20 ENSOTSG00005009344 tnni2a.2 (ENSOTSG00005009347) #22 TNNI2 (ENSOTSG00005009348) ##23 ENSOTSG00005009349 #24 ENSOTSG00005009351 #25 MYOD1 (ENSOTSG00005009353) #26 zgc:172145 (ENSOTSG00005009354) #27 CACNA2D4 (ENSOTSG00005009358) #28 LRTM2 (ENSOTSG00005009493) #29 ENSOTSG00005009504 #30 urahb (ENSOTSG00005012417) #31 GLG1 (ENSOTSG00005012421) #32 RFWD3 (ENSOTSG00005014583) #33 MLKL (ENSOTSG00005014585) #34 etfbkmt (ENSOTSG00005014586) #35 amn1 (ENSOTSG00005014587) #36 ENSOTSG00005014589 Rainbow trout MODERN SPECIES 22 fezf1 (ENSOMYG00000042293) aass (ENSOMYG00000042455) #7 PTPRZ1 (ENSOMYG00000044183) #8 ENSOMYG00000044213 #9 ENSOMYG00000053913 ENSOMYG00000044242 #11 ENSOMYG00000051072 #12 bet1l (ENSOMYG00000071324) deaf1 (ENSOMYG00000044258) #14 drd4a (ENSOMYG00000044265) #15 ENSOMYG00000044274 #16 ENSOMYG00000044289 #18 ENSOMYG00000070342 SYT8 (ENSOMYG00000044334) #20 tnni2a.1 (ENSOMYG00000044342) #21 ENSOMYG00000051621 #22 ENSOMYG00000054158 ENSOMYG00000044366 #24 TNNT3 (ENSOMYG00000044367) #25 myod2 (ENSOMYG00000044372) #26 zgc:172145 (ENSOMYG00000068802) #27 ENSOMYG00000064959 ENSOMYG00000044396 #28 ENSOMYG00000054081 #29 ENSOMYG00000044518 #30 urahb (ENSOMYG00000045245) #31 ENSOMYG00000069462 ENSOMYG00000073315 GLG1 (ENSOMYG00000045338) #32 ENSOMYG00000045422 #33 MLKL (ENSOMYG00000045444) #34 Salmo ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b.k.a.a.b ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.f ##7 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 ENSGT00390000016453.m #34 ENSGT00940000163501 #35 ENSGT00730000111305 #36 ENSGT00940000154917.fb.b #37 River trout MODERN SPECIES 33 fezf1 (ENSSTUG00000023090) aass (ENSSTUG00000019952) ##7 ENSSTUG00000019843 PTPRZ1 (ENSSTUG00000017658) #8 dldh (ENSSTUG00000017505) #9 ENSSTUG00000017492 ##10 ENSSTUG00000017480 #11 ticam1 (ENSSTUG00000017476) #12 BET1L (ENSSTUG00000017470) #13 deaf1 (ENSSTUG00000017459) #14 drd4a (ENSSTUG00000017447) #15 ENSSTUG00000017421 #16 ENSSTUG00000017149 #18 SYT8 (ENSSTUG00000017135) #20 tnni2a.1 (ENSSTUG00000017118) #21 tnni2a.2 (ENSSTUG00000017106) #22 ENSSTUG00000017036 ##23 ENSSTUG00000017023 #24 tnnt3b (ENSSTUG00000016997) #25 MYOD1 (ENSSTUG00000016988) #26 zgc:172145 (ENSSTUG00000016985) #27 ENSSTUG00000016981 LRTM2 (ENSSTUG00000016977) #29 ENSSTUG00000015707 #28 ENSSTUG00000013806 #30 urahb (ENSSTUG00000013349) #31 ENSSTUG00000013296 GLG1 (ENSSTUG00000012698) #32 RFWD3 (ENSSTUG00000012610) #33 MLKL (ENSSTUG00000012572) #34 etfbkmt (ENSSTUG00000012566) #35 Huchen MODERN SPECIES 889 ENSHHUG00000028029 #16 ENSHHUG00000027755 #18 SYT8 (ENSHHUG00000027747) #20 ENSHHUG00000027744 tnni2a.1 (ENSHHUG00000027733) #21 tnni2a.2 (ENSHHUG00000027724) #22 TNNI2 (ENSHHUG00000027633) #23 TNNI2 (ENSHHUG00000027573) ##23 ENSHHUG00000027566 ENSHHUG00000027560 TNNT3 (ENSHHUG00000027549) #25 MYOD1 (ENSHHUG00000027540) #26 CACNA2D4 (ENSHHUG00000027532) #28 LRTM2 (ENSHHUG00000027521) #29 ENSHHUG00000027515 #28 ENSHHUG00000027513 #28 ENSHHUG00000027507 #30 urahb (ENSHHUG00000027499) #31 GLG1 (ENSHHUG00000027478) #32 RFWD3 (ENSHHUG00000027472) #33 ENSHHUG00000027468 #34 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 519 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.b ##34 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 544 ENSHHUG00000000310 tnni2a.1 (ENSHHUG00000000288) ##23 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000284) ##23 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000268) ##23 TNNI2 (ENSHHUG00000000259) ##23 TNNI2 (ENSHHUG00000000165) ##23 ENSHHUG00000000161 ##24 ENSHHUG00000000144 tnnt3b (ENSHHUG00000000132) ##25 MYOD1 (ENSHHUG00000000050) ##26 zgc:172145 (ENSHHUG00000000023) ##27 LRTM2 (ENSHHUG00000050722) ##29 CACNA2D4 (ENSHHUG00000050645) ##28 ENSHHUG00000050634 ##30 ENSHHUG00000050630 GLG1 (ENSHHUG00000050506) ##32 RFWD3 (ENSHHUG00000050492) ##33 Huchen MODERN SPECIES 544 ENSHHUG00000000310 tnni2a.1 (ENSHHUG00000000288) ##23 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000284) ##23 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000268) ##23 TNNI2 (ENSHHUG00000000259) ##23 TNNI2 (ENSHHUG00000000165) ##23 ENSHHUG00000000161 ##24 ENSHHUG00000000144 tnnt3b (ENSHHUG00000000132) ##25 MYOD1 (ENSHHUG00000000050) ##26 zgc:172145 (ENSHHUG00000000023) ##27 LRTM2 (ENSHHUG00000050722) ##29 CACNA2D4 (ENSHHUG00000050645) ##28 ENSHHUG00000050634 ##30 ENSHHUG00000050630 GLG1 (ENSHHUG00000050506) ##32 RFWD3 (ENSHHUG00000050492) ##33 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.b ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.a ##34 ENSGT00940000154917.fb.a ##37 Salmo ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.b ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b.a ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.a ##23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 River trout MODERN SPECIES 37 hyal6 (ENSSTUG00000010465) ENSSTUG00000010453 lmod2a (ENSSTUG00000010448) ASB15 (ENSSTUG00000010383) ENSSTUG00000010308 IQUB (ENSSTUG00000010187) CADPS2 (ENSSTUG00000010148) fezf1 (ENSSTUG00000010110) dldh (ENSSTUG00000009461) ##9 ENSSTUG00000009267 ##10 ENSSTUG00000009265 ##11 drd4a (ENSSTUG00000009260) ##15 ENSSTUG00000009255 SYT8 (ENSSTUG00000009213) ##20 tnni2a.1 (ENSSTUG00000009183) ##23 tnni2a.2 (ENSSTUG00000009174) ##23 ENSSTUG00000009167 ENSSTUG00000009062 ##23 ENSSTUG00000009047 ENSSTUG00000009021 ##24 TNNT3 (ENSSTUG00000008984) ##25 MYOD1 (ENSSTUG00000008976) ##26 zgc:172145 (ENSSTUG00000008972) ##27 ENSSTUG00000008947 ##29 CACNA2D4 (ENSSTUG00000007981) ##28 ENSSTUG00000007788 ##30 ENSSTUG00000007769 GLG1 (ENSSTUG00000007510) ##32 RFWD3 (ENSSTUG00000007387) ##33 MLKL (ENSSTUG00000007277) ##34 nfybb (ENSSTUG00000007199) ##37 Atlantic salmon MODERN SPECIES 1 hyal6 (ENSSSAG00000078041) wasl (ENSSSAG00000078048) lmod2 (ENSSSAG00000078108) IQUB (ENSSSAG00000078117) CADPS2 (ENSSSAG00000078300) ENSSSAG00000109161 fezf1 (ENSSSAG00000080179) ptprz1 (ENSSSAG00000080236) ##8 ENSSSAG00000080505 ##9 ENSSSAG00000112377 ENSSSAG00000080540 ##11 drd4a (ENSSSAG00000080543) ##15 ENSSSAG00000080545 SYT8 (ENSSSAG00000055269) ##20 tnni2a.1 (ENSSSAG00000080550) ##23 tnni2a.2 (ENSSSAG00000080555) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000115245) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000080558) ##23 ENSSSAG00000110670 ENSSSAG00000080568 ##24 ENSSSAG00000102688 TNNT3 (ENSSSAG00000080578) ##25 myod1c (ENSSSAG00000080596) ##26 ENSSSAG00000111233 zgc:172145 (ENSSSAG00000080600) ##27 ENSSSAG00000080628 ##28 ENSSSAG00000096889 ##29 ENSSSAG00000080771 ##30 ENSSSAG00000101363 GLG1 (ENSSSAG00000067039) ##32 ENSSSAG00000122167 ##33 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.a ##34 ENSGT00940000154917.fb.a ##37 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.a ##34 ENSGT00940000154917.fb.a ##37 Coho salmon MODERN SPECIES 14 ENSOKIG00005032154 lmod2a (ENSOKIG00005032140) ENSOKIG00005032117 IQUB (ENSOKIG00005032040) CADPS2 (ENSOKIG00005031265) fezf1 (ENSOKIG00005031170) ENSOKIG00005031137 PTPRZ1 (ENSOKIG00005028335) ##8 ENSOKIG00005028191 dldh (ENSOKIG00005027454) ##9 ENSOKIG00005027375 ##11 drd4a (ENSOKIG00005027194) ##15 ENSOKIG00005027164 SYT8 (ENSOKIG00005027132) ##20 tnni2a.1 (ENSOKIG00005027100) ##23 tnni2a.2 (ENSOKIG00005027046) ##23 TNNI2 (ENSOKIG00005027031) ##23 TNNI2 (ENSOKIG00005026949) ##23 ENSOKIG00005026905 ##24 ENSOKIG00005026885 TNNT3 (ENSOKIG00005026856) ##25 MYOD1 (ENSOKIG00005026839) ##26 zgc:172145 (ENSOKIG00005026835) ##27 ENSOKIG00005026827 LRTM2 (ENSOKIG00005026822) ##29 CACNA2D4 (ENSOKIG00005026408) ##28 ENSOKIG00005025848 ##30 ENSOKIG00005025795 GLG1 (ENSOKIG00005024239) ##32 RFWD3 (ENSOKIG00005024030) ##33 MLKL (ENSOKIG00005023992) ##34 Chinook salmon MODERN SPECIES 10 lmod2a (ENSOTSG00005043091) ASB15 (ENSOTSG00005043087) ENSOTSG00005043085 IQUB (ENSOTSG00005043082) ENSOTSG00005043079 ENSOTSG00005043078 CADPS2 (ENSOTSG00005042929) fezf1 (ENSOTSG00005042921) PTPRZ1 (ENSOTSG00005041692) ##8 dldh (ENSOTSG00005041612) ##9 ENSOTSG00005041604 ##11 drd4a (ENSOTSG00005041579) ##15 ENSOTSG00005041577 SYT8 (ENSOTSG00005041574) ##20 tnni2a.1 (ENSOTSG00005041572) ##23 tnni2a.2 (ENSOTSG00005041571) ##23 ENSOTSG00005041570 ##23 ENSOTSG00005041568 tnnt3b (ENSOTSG00005041567) ##25 MYOD1 (ENSOTSG00005041566) ##26 zgc:172145 (ENSOTSG00005041565) ##27 LRTM2 (ENSOTSG00005041564) ##29 CACNA2D4 (ENSOTSG00005041278) ##28 ENSOTSG00005041268 ##30 ENSOTSG00005041259 GLG1 (ENSOTSG00005040997) ##32 RFWD3 (ENSOTSG00005040989) ##33 MLKL (ENSOTSG00005040987) ##34 ENSOTSG00005040986 ##34 nfybb (ENSOTSG00005040983) ##37 ENSOTSG00005040982 Northern pike MODERN SPECIES 18 fezf1 (ENSELUG00000005702) aass (ENSELUG00000005758) #7 PTPRZ1 (ENSELUG00000005952) #8 dldh (ENSELUG00000006023) #9 ENSELUG00000006036 ##10 ENSELUG00000033613 #11 ticam1 (ENSELUG00000006060) #12 BET1L (ENSELUG00000032203) #13 deaf1 (ENSELUG00000006122) #14 drd4a (ENSELUG00000006156) #15 ENSELUG00000000195 ENSELUG00000006280 #18 ENSELUG00000006319 SYT8 (ENSELUG00000006343) #20 ENSELUG00000006355 tnni2a.2 (ENSELUG00000006408) #22 TNNI2 (ENSELUG00000006429) #23 TNNI2 (ENSELUG00000006514) ##23 ENSELUG00000006582 ENSELUG00000024853 ENSELUG00000006610 #24 tnnt3b (ENSELUG00000006673) #25 MYOD1 (ENSELUG00000006737) #26 zgc:172145 (ENSELUG00000028291) #27 LRTM2 (ENSELUG00000006756) #29 CACNA2D4 (ENSELUG00000006851) #28 ENSELUG00000006919 #30 urahb (ENSELUG00000034591) #31 ENSELUG00000006933 GLG1 (ENSELUG00000006991) #32 RFWD3 (ENSELUG00000007033) #33 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01020000231746 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Tetraodon MODERN SPECIES 4 ANKRD27 (ENSTNIG00000010417) TMED6 (ENSTNIG00000010418) MLKL (ENSTNIG00000010419) #34 RFWD3 (ENSTNIG00000010420) #33 ENSTNIG00000010421 #32 ENSTNIG00000018798 #32 ENSTNIG00000000428 ENSTNIG00000004682 #30 CACNA2D4 (ENSTNIG00000004494) #28 LRTM2 (ENSTNIG00000004493) #29 SLC7A10 (ENSTNIG00000004495) dldh (ENSTNIG00000004496) #9 ENSTNIG00000004497 #20 ENSTNIG00000002815 #20 tnni2a.1 (ENSTNIG00000002814) #21 tnni2a.2 (ENSTNIG00000002813) #22 ENSTNIG00000002812 #23 ENSTNIG00000001405 #23 TNNI2 (ENSTNIG00000002811) #23 ENSTNIG00000002810 #23 ENSTNIG00000000204 #24 tnnt3a (ENSTNIG00000002809) #25 myod1 (ENSTNIG00000002808) ##26 DUS2 (ENSTNIG00000005616) Fugu MODERN SPECIES 21 ENSTRUG00000030903 ENSTRUG00000026214 ##17 ENSTRUG00000028935 ENSTRUG00000031663 ENSTRUG00000032661 ccnd2a (ENSTRUG00000001816) ENSTRUG00000032400 ENSTRUG00000028185 DUS2 (ENSTRUG00000022441) SLC7A10 (ENSTRUG00000033356) ENSTRUG00000032988 dldh (ENSTRUG00000016659) #9 SYT8 (ENSTRUG00000016657) #20 ENSTRUG00000027114 tnni2a.1 (ENSTRUG00000022759) #21 tnni2a.2 (ENSTRUG00000016644) #22 ENSTRUG00000016632 #23 ENSTRUG00000033030 #23 ENSTRUG00000027588 #23 ENSTRUG00000027670 ENSTRUG00000030147 #24 tnnt3a (ENSTRUG00000016614) #25 myod1 (ENSTRUG00000016609) ##26 LRTM2 (ENSTRUG00000029534) #29 ENSTRUG00000016565 #30 urahb (ENSTRUG00000021342) #31 ENSTRUG00000030677 GLG1 (ENSTRUG00000016546) #32 RFWD3 (ENSTRUG00000016541) #33 TMED6 (ENSTRUG00000016539) ANKRD27 (ENSTRUG00000016516) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Ballan wrasse MODERN SPECIES 74 lmod2a (ENSLBEG00000003853) ASB15 (ENSLBEG00000003875) ASB15 (ENSLBEG00000003921) IQUB (ENSLBEG00000003961) slc13a1 (ENSLBEG00000004005) CADPS2 (ENSLBEG00000004036) fezf1 (ENSLBEG00000004119) aass (ENSLBEG00000004152) #7 ENSLBEG00000004277 #8 ENSLBEG00000004441 #8 ENSLBEG00000004466 dldh (ENSLBEG00000004489) #9 SYT8 (ENSLBEG00000004542) #20 ENSLBEG00000004567 tnni2a.1 (ENSLBEG00000004589) #21 tnni2a.2 (ENSLBEG00000004628) #22 TNNI2 (ENSLBEG00000004663) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004685) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004709) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004734) #23 ENSLBEG00000004756 ENSLBEG00000004792 #24 tnnt3a (ENSLBEG00000004820) #25 myod1 (ENSLBEG00000004859) ##26 zgc:172145 (ENSLBEG00000004893) #27 CACNA2D4 (ENSLBEG00000004912) #28 LRTM2 (ENSLBEG00000004951) #29 ENSLBEG00000004962 #28 ENSLBEG00000004986 #30 urahb (ENSLBEG00000005026) #31 ENSLBEG00000005041 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 European seabass MODERN SPECIES 19 ENSDLAG00005032060 ENSDLAG00005033208 SLC10A7 (ENSDLAG00005015389) ENSDLAG00005015413 ENSDLAG00005027879 ENSDLAG00005018653 ENSDLAG00005003124 ENSDLAG00005027593 ENSDLAG00005016966 ENSDLAG00005026858 ENSDLAG00005014942 ENSDLAG00005030743 ENSDLAG00005031818 #9 ENSDLAG00005018756 tnni2a.1 (ENSDLAG00005018746) #21 tnni2a.2 (ENSDLAG00005032524) #22 TNNI2 (ENSDLAG00005029433) #23 TNNI2 (ENSDLAG00005018667) #23 ENSDLAG00005018661 ENSDLAG00005018639 ENSDLAG00005032620 #24 tnnt3a (ENSDLAG00005018610) #25 myod1 (ENSDLAG00005018589) ##26 zgc:172145 (ENSDLAG00005018584) #27 ENSDLAG00005018579 #29 ENSDLAG00005017494 #30 ENSDLAG00005017692 #28 ENSDLAG00005034798 ENSDLAG00005017462 GLG1 (ENSDLAG00005015126) #32 ENSDLAG00005015034 #33 Large yellow croaker MODERN SPECIES 492 ENSLCRG00005001093 HYAL4 (ENSLCRG00005001083) hyal6 (ENSLCRG00005001078) wasla (ENSLCRG00005022134) lmod2a (ENSLCRG00005022129) ASB15 (ENSLCRG00005022127) ASB15 (ENSLCRG00005022123) IQUB (ENSLCRG00005022117) slc13a1 (ENSLCRG00005022115) CADPS2 (ENSLCRG00005020853) fezf1 (ENSLCRG00005020826) aass (ENSLCRG00005020281) #7 ENSLCRG00005020261 dldh (ENSLCRG00005020243) #9 SYT8 (ENSLCRG00005020234) #20 tnni2a.2 (ENSLCRG00005020228) #22 tnni2a.4 (ENSLCRG00005020224) #23 TNNI2 (ENSLCRG00005020221) #21 ENSLCRG00005020217 ENSLCRG00005020216 ENSLCRG00005020214 #24 tnnt3a (ENSLCRG00005020211) #25 myod1 (ENSLCRG00005020205) ##26 zgc:172145 (ENSLCRG00005020203) #27 LRTM2 (ENSLCRG00005020201) #29 CACNA2D4 (ENSLCRG00005020194) #28 ENSLCRG00005020191 #30 urahb (ENSLCRG00005020189) #31 ENSLCRG00005020187 GLG1 (ENSLCRG00005019420) #32 RFWD3 (ENSLCRG00005019395) #33 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157859.a.b ENSGT01030000234534.B.a.b.a.a ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000155465.j ENSGT00940000164138 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.a ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Lumpfish MODERN SPECIES 21 spg11 (ENSCLMG00005006174) znf277 (ENSCLMG00005006884) immp2l (ENSCLMG00005007053) ENSCLMG00005007055 LRRN3 (ENSCLMG00005007057) pdcd2l (ENSCLMG00005007059) ENSCLMG00005007061 ENSCLMG00005007072 SLC7A10 (ENSCLMG00005007309) ENSCLMG00005007357 ENSCLMG00005007358 dldh (ENSCLMG00005007366) #9 SYT8 (ENSCLMG00005007385) #20 ENSCLMG00005007387 tnni2a.1 (ENSCLMG00005007388) #21 tnni2a.2 (ENSCLMG00005007389) #22 TNNI2 (ENSCLMG00005007390) #23 ENSCLMG00005007391 ENSCLMG00005007392 ENSCLMG00005007394 #23 ENSCLMG00005007396 #23 TNNI2 (ENSCLMG00005007397) #23 ENSCLMG00005007399 #24 tnnt3a (ENSCLMG00005007403) #25 myod1 (ENSCLMG00005007406) ##26 CACNA2D4 (ENSCLMG00005007412) #28 ENSCLMG00005007700 LRTM2 (ENSCLMG00005007704) #29 ENSCLMG00005007712 #30 urahb (ENSCLMG00005007724) #31 ENSCLMG00005007726 Stickleback MODERN SPECIES 14 ENSGACG00000008030 ENSGACG00000008044 ENSGACG00000008049 ciao2a (ENSGACG00000008052) spg11 (ENSGACG00000008057) znf277 (ENSGACG00000008086) immp2l (ENSGACG00000008130) ENSGACG00000008150 ENSGACG00000008152 ENSGACG00000008153 DUS2 (ENSGACG00000008159) SLC7A10 (ENSGACG00000008186) dldh (ENSGACG00000008240) #9 SYT8 (ENSGACG00000008302) #20 tnni2a.1 (ENSGACG00000008315) #21 tnni2a.2 (ENSGACG00000008321) #22 TNNI2 (ENSGACG00000008333) #23 TNNI2 (ENSGACG00000008349) #23 LSP1 (ENSGACG00000008376) tnnt3a (ENSGACG00000008384) #25 myod1 (ENSGACG00000008444) ##26 ENSGACG00000008450 CACNA2D4 (ENSGACG00000008453) #28 ENSGACG00000008489 #29 ENSGACG00000008494 #30 urahb (ENSGACG00000008507) #31 ENSGACG00000008512 GLG1 (ENSGACG00000008520) #32 RFWD3 (ENSGACG00000008531) #33 MLKL (ENSGACG00000008536) #34 ENSGACG00000008543 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000157859.b ENSGT01030000234534.B.a.b.a.a ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00940000154617.B.d ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Pike perch MODERN SPECIES 51 SLC7A10 (ENSSLUG00000008382) ENSSLUG00000008410 ENSSLUG00000008415 ENSSLUG00000008422 ENSSLUG00000008432 ENSSLUG00000008441 ENSSLUG00000008445 ENSSLUG00000008451 ENSSLUG00000008461 ENSSLUG00000008472 ENSSLUG00000008480 dldh (ENSSLUG00000008565) #9 ENSSLUG00000009914 SYT8 (ENSSLUG00000009945) #20 ENSSLUG00000009952 tnni2a.2 (ENSSLUG00000009963) #22 tnni2a.4 (ENSSLUG00000009991) #23 ENSSLUG00000010045 ENSSLUG00000010049 ENSSLUG00000010057 #24 tnnt3a (ENSSLUG00000010068) #25 myod1 (ENSSLUG00000010105) ##26 zgc:172145 (ENSSLUG00000010117) #27 CACNA2D4 (ENSSLUG00000010134) #28 LRTM2 (ENSSLUG00000010170) #29 ENSSLUG00000010284 #30 urahb (ENSSLUG00000012700) #31 ENSSLUG00000012703 ENSSLUG00000012707 ENSSLUG00000012711 ENSSLUG00000012719 Channel bull blenny MODERN SPECIES 20 LRRN3 (ENSCGOG00000009712) immp2l (ENSCGOG00000009694) ENSCGOG00000009688 ENSCGOG00000009676 pdcd2l (ENSCGOG00000009673) ENSCGOG00000009670 ENSCGOG00000009667 DUS2 (ENSCGOG00000009109) ENSCGOG00000009096 ENSCGOG00000009092 dldh (ENSCGOG00000008107) #9 ENSCGOG00000008073 SLC7A10 (ENSCGOG00000007383) tnni2a.1 (ENSCGOG00000007358) #21 ENSCGOG00000007345 tnni2a.2 (ENSCGOG00000007341) #22 TNNI2 (ENSCGOG00000007334) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007324) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007317) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007312) #23 ENSCGOG00000007305 #24 ENSCGOG00000007292 zgc:172145 (ENSCGOG00000007280) #27 tnnt3a (ENSCGOG00000007130) #25 myod1 (ENSCGOG00000007087) ##26 zgc:172145 (ENSCGOG00000007083) #27 ENSCGOG00000007080 LRTM2 (ENSCGOG00000007053) #29 CACNA2D4 (ENSCGOG00000007039) #28 ENSCGOG00000006641 #30 urahb (ENSCGOG00000006621) #31 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.f ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000167703 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000156482.c ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a.h ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00390000009456 ENSGT00420000029847 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2635 ENSSLDG00000010199 TNNI2 (ENSSLDG00000010145) #21 tnni2a.2 (ENSSLDG00000010121) #22 ENSSLDG00000010097 ENSSLDG00000010087 ENSSLDG00000010065 Greater amberjack MODERN SPECIES 160 znf277 (ENSSDUG00000000239) LRRN3 (ENSSDUG00000000228) immp2l (ENSSDUG00000000205) amfra (ENSSDUG00000000125) pdcd2l (ENSSDUG00000000081) ENSSDUG00000017439 DUS2 (ENSSDUG00000017399) SLC7A10 (ENSSDUG00000017375) faap24 (ENSSDUG00000017353) ENSSDUG00000017304 dldh (ENSSDUG00000017239) #9 SYT8 (ENSSDUG00000017190) #20 ENSSDUG00000017175 ENSSDUG00000017137 tnni2a.1 (ENSSDUG00000017118) #21 tnni2a.2 (ENSSDUG00000017108) #22 ENSSDUG00000017101 TNNI2 (ENSSDUG00000017087) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017072) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017051) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017036) #23 ENSSDUG00000016991 ENSSDUG00000016965 ENSSDUG00000016941 tnnt3a (ENSSDUG00000016913) #25 myod1 (ENSSDUG00000016886) ##26 zgc:172145 (ENSSDUG00000016873) #27 ENSSDUG00000016853 #29 CACNA2D4 (ENSSDUG00000016797) #28 ENSSDUG00000016707 #30 urahb (ENSSDUG00000016691) #31 Barramundi perch MODERN SPECIES 31 ASB15 (ENSLCAG00010000274) ASB15 (ENSLCAG00010000226) IQUB (ENSLCAG00010000189) ENSLCAG00010013451 slc13a1 (ENSLCAG00010013405) CADPS2 (ENSLCAG00010013231) fezf1 (ENSLCAG00010013213) aass (ENSLCAG00010013014) #7 PTPRZ1 (ENSLCAG00010012605) #8 ENSLCAG00010012479 ENSLCAG00010012477 ENSLCAG00010012473 dldh (ENSLCAG00010012352) #9 SYT8 (ENSLCAG00010012305) #20 ENSLCAG00010012295 tnni2a.2 (ENSLCAG00010012290) #22 TNNI2 (ENSLCAG00010012275) #23 TNNI2 (ENSLCAG00010012249) #21 TNNI2 (ENSLCAG00010012232) #23 ENSLCAG00010012229 ENSLCAG00010012227 #24 ENSLCAG00010012223 tnnt3a (ENSLCAG00010012221) #25 myod1 (ENSLCAG00010012215) ##26 zgc:172145 (ENSLCAG00010012212) #27 CACNA2D4 (ENSLCAG00010012209) #28 LRTM2 (ENSLCAG00010012207) #29 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Tongue sole MODERN SPECIES 16 ppib (ENSCSEG00000001927) adpgk (ENSCSEG00000001935) ENSCSEG00000001946 exoc3l1 (ENSCSEG00000001976) ENSCSEG00000001985 KIF21A (ENSCSEG00000001988) ENSCSEG00000002001 ANO1 (ENSCSEG00000002014) ENSCSEG00000002069 ENSCSEG00000002072 smpd3 (ENSCSEG00000002076) ENSCSEG00000002089 septin15 (ENSCSEG00000002096) ENSCSEG00000002121 tnni2a.1 (ENSCSEG00000002133) #21 tnni2a.2 (ENSCSEG00000002138) #22 TNNI2 (ENSCSEG00000002145) #23 TNNI2 (ENSCSEG00000002164) #23 TNNI2 (ENSCSEG00000002169) #23 ENSCSEG00000002173 ENSCSEG00000002176 ENSCSEG00000002189 #24 ENSCSEG00000002191 tnnt3a (ENSCSEG00000002198) #25 myod1 (ENSCSEG00000002233) ##26 zgc:172145 (ENSCSEG00000002238) #27 CACNA2D4 (ENSCSEG00000002252) #28 LRTM2 (ENSCSEG00000002266) #29 PEAK1 (ENSCSEG00000002269) syt12 (ENSCSEG00000002273) cat (ENSCSEG00000002281) Turbot MODERN SPECIES 1 wasla (ENSSMAG00000002064) lmod2a (ENSSMAG00000002140) ASB15 (ENSSMAG00000002167) ASB15 (ENSSMAG00000002199) IQUB (ENSSMAG00000002231) slc13a1 (ENSSMAG00000002260) ENSSMAG00000002312 CADPS2 (ENSSMAG00000020348) fezf1 (ENSSMAG00000025856) aass (ENSSMAG00000020423) #7 PTPRZ1 (ENSSMAG00000020456) #8 ENSSMAG00000021503 ENSSMAG00000005976 #9 SYT8 (ENSSMAG00000006038) #20 tnni2a.1 (ENSSMAG00000032761) #21 tnni2a.2 (ENSSMAG00000006098) #22 TNNI2 (ENSSMAG00000006177) #23 TNNI2 (ENSSMAG00000006211) #23 ENSSMAG00000006237 ENSSMAG00000006257 #24 tnnt3a (ENSSMAG00000006288) #25 ENSSMAG00000023239 ENSSMAG00000028689 ENSSMAG00000032749 ENSSMAG00000022264 ENSSMAG00000030166 ENSSMAG00000036791 ENSSMAG00000023873 smpd3 (ENSSMAG00000002332) ENSSMAG00000002348 septin15 (ENSSMAG00000002389) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Zig-zag eel MODERN SPECIES 20 CADPS2 (ENSMAMG00000022799) fezf1 (ENSMAMG00000022795) aass (ENSMAMG00000022779) #7 ENSMAMG00000022774 PTPRZ1 (ENSMAMG00000027911) #8 ENSMAMG00000022767 ENSMAMG00000022758 ENSMAMG00000025915 ENSMAMG00000022762 ENSMAMG00000024786 ENSMAMG00000022760 ENSMAMG00000022756 #9 SYT8 (ENSMAMG00000026620) #20 ENSMAMG00000025933 tnni2a.1 (ENSMAMG00000022730) #21 tnni2a.2 (ENSMAMG00000022728) #22 TNNI2 (ENSMAMG00000028411) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000025267) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000022722) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000028574) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000024405) #23 ENSMAMG00000026203 ENSMAMG00000025176 tnnt3a (ENSMAMG00000022716) #25 myod1 (ENSMAMG00000025845) ##26 ENSMAMG00000022714 #29 ENSMAMG00000022713 #28 ENSMAMG00000022711 #30 urahb (ENSMAMG00000022710) #31 ENSMAMG00000025621 ENSMAMG00000022709 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Siamese fighting fish MODERN SPECIES 17 deaf1 (ENSBSLG00000026455) #14 drd4a (ENSBSLG00000026458) #15 ENSBSLG00000026461 GRAMD4 (ENSBSLG00000026476) ENSBSLG00000026499 CERK (ENSBSLG00000026507) TAFA5 (ENSBSLG00000026512) brd1b (ENSBSLG00000026513) ftsj1 (ENSBSLG00000026514) ENSBSLG00000003773 ENSBSLG00000003875 ENSBSLG00000003923 ENSBSLG00000004129 ENSBSLG00000004149 tnni2a.1 (ENSBSLG00000004158) #21 tnni2a.2 (ENSBSLG00000004174) #22 TNNI2 (ENSBSLG00000004185) #23 ENSBSLG00000004198 #23 TNNI2 (ENSBSLG00000004211) #23 ENSBSLG00000004751 #23 ENSBSLG00000004764 ENSBSLG00000004780 #24 ENSBSLG00000004819 tnnt3a (ENSBSLG00000004850) #25 myod1 (ENSBSLG00000004886) ##26 CACNA2D4 (ENSBSLG00000005093) #28 ENSBSLG00000005855 #29 ENSBSLG00000005902 #30 urahb (ENSBSLG00000005954) #31 ENSBSLG00000006449 GLG1 (ENSBSLG00000006927) #32 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00940000157021 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000174622 ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000017767.a.b Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000017767.a.b Poecilia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01020000231746 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000017767.a.b NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00950000183006.B.f.a ENSGT00940000158022 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Amazon molly MODERN SPECIES 474 ENSPFOG00000022265 gpd2 (ENSPFOG00000014961) ENSPFOG00000014905 st7 (ENSPFOG00000014750) wnt2 (ENSPFOG00000014710) asz1 (ENSPFOG00000014640) cftr (ENSPFOG00000014478) ENSPFOG00000014424 ENSPFOG00000014390 ENSPFOG00000014334 BET1L (ENSPFOG00000014322) #13 deaf1 (ENSPFOG00000014257) #14 ENSPFOG00000013986 dldh (ENSPFOG00000013896) #9 SYT8 (ENSPFOG00000013827) #20 tnni2a.2 (ENSPFOG00000013772) #22 TNNI2 (ENSPFOG00000023624) #23 TNNI2 (ENSPFOG00000013744) #23 TNNI2 (ENSPFOG00000013698) #23 ENSPFOG00000024450 #24 ENSPFOG00000013655 tnnt3a (ENSPFOG00000013555) #25 myod1 (ENSPFOG00000013532) ##26 LRTM2 (ENSPFOG00000013516) #29 CACNA2D4 (ENSPFOG00000013433) #28 ENSPFOG00000013283 #30 urahb (ENSPFOG00000013262) #31 ENSPFOG00000013224 GLG1 (ENSPFOG00000013019) #32 RFWD3 (ENSPFOG00000012973) #33 ENSPFOG00000012969 Sailfin molly MODERN SPECIES 1263 ENSPLAG00000001521 dldh (ENSPLAG00000001542) #9 SYT8 (ENSPLAG00000001548) #20 tnni2a.2 (ENSPLAG00000001553) #22 ENSPLAG00000001556 #23 ENSPLAG00000001562 #23 ENSPLAG00000001570 ENSPLAG00000001576 tnnt3a (ENSPLAG00000001599) #25 myod1 (ENSPLAG00000001610) ##26 Platyfish MODERN SPECIES 11 st7 (ENSXMAG00000004417) wnt2 (ENSXMAG00000004456) asz1 (ENSXMAG00000014458) cftr (ENSXMAG00000006463) CTTNBP2 (ENSXMAG00000011487) ENSXMAG00000017307 ENSXMAG00000011708 atp2b1b (ENSXMAG00000011746) BET1L (ENSXMAG00000023928) #13 deaf1 (ENSXMAG00000013352) #14 ENSXMAG00000013383 ENSXMAG00000029031 dldh (ENSXMAG00000013397) #9 SYT8 (ENSXMAG00000013405) #20 ENSXMAG00000029853 tnni2a.2 (ENSXMAG00000013409) #22 TNNI2 (ENSXMAG00000013411) #23 TNNI2 (ENSXMAG00000005048) #23 ENSXMAG00000001183 ENSXMAG00000026868 #24 tnnt3a (ENSXMAG00000007434) #25 myod1 (ENSXMAG00000026443) ##26 CACNA2D4 (ENSXMAG00000029376) #28 ENSXMAG00000025768 #29 ENSXMAG00000002743 #28 CPA1 (ENSXMAG00000008217) ENSXMAG00000000273 GPR37 (ENSXMAG00000000281) immp2l (ENSXMAG00000029951) ENSXMAG00000023358 ENSXMAG00000012291 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293.ib ENSGT00940000158293.hb ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000017767.a.b Mummichog MODERN SPECIES 2205 ENSFHEG00000009987 st7 (ENSFHEG00000009944) wnt2 (ENSFHEG00000009707) asz1 (ENSFHEG00000009691) cftr (ENSFHEG00000009671) ENSFHEG00000009567 ENSFHEG00000009557 ENSFHEG00000009543 ENSFHEG00000009504 BET1L (ENSFHEG00000009463) #13 deaf1 (ENSFHEG00000009441) #14 ENSFHEG00000009421 dldh (ENSFHEG00000009356) #9 SYT8 (ENSFHEG00000009291) #20 ENSFHEG00000009273 tnni2a.2 (ENSFHEG00000009249) #22 TNNI2 (ENSFHEG00000009222) #23 TNNI2 (ENSFHEG00000009184) #23 ENSFHEG00000009159 ENSFHEG00000009155 #24 ENSFHEG00000009147 ENSFHEG00000009127 tnnt3a (ENSFHEG00000009020) #25 myod1 (ENSFHEG00000008982) ##26 ENSFHEG00000008951 #28 LRTM2 (ENSFHEG00000008865) #29 ENSFHEG00000008763 #30 urahb (ENSFHEG00000008753) #31 ENSFHEG00000008745 GRAMD4 (ENSFHEG00000008727) CERK (ENSFHEG00000008626) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 545 tnni2a.2 (ENSCVAG00000019957) #22 TNNI2 (ENSCVAG00000019942) #23 TNNI2 (ENSCVAG00000019930) #23 TNNI2 (ENSCVAG00000019892) #23 ENSCVAG00000000969 ENSCVAG00000019873 #24 tnnt3a (ENSCVAG00000019864) #25 myod1 (ENSCVAG00000019855) ##26 CACNA2D4 (ENSCVAG00000019847) #28 LRTM2 (ENSCVAG00000019558) #29 ENSCVAG00000019550 #30 ENSCVAG00000019533 GLG1 (ENSCVAG00000019526) #32 RFWD3 (ENSCVAG00000019442) #33 GRAMD4 (ENSCVAG00000019434) ENSCVAG00000019324 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 282 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 315 tnni2a.2 (ENSKMAG00000007528) #22 ENSKMAG00000007513 #23 ENSKMAG00000007502 ENSKMAG00000007473 #23 ENSKMAG00000007450 ENSKMAG00000007443 #24 tnnt3a (ENSKMAG00000007415) #25 RFWD3 (ENSKMAG00000007381) #33 GLG1 (ENSKMAG00000007311) #32 ENSKMAG00000007281 urahb (ENSKMAG00000007268) #31 ENSKMAG00000007170 #30 ENSKMAG00000007121 #29 CACNA2D4 (ENSKMAG00000006777) #28 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000159477 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00940000161262.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT01030000234858 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000161262.b ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00390000018285 ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075044 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 20 slc12a3 (ENSORLG00000000412) ENSORLG00000000419 ENSORLG00000024966 ENSORLG00000024504 ENSORLG00000000450 #20 dldh (ENSORLG00000000461) #9 ENSORLG00000025976 grm8b (ENSORLG00000000478) pot1 (ENSORLG00000000493) GPR37 (ENSORLG00000027795) ENSORLG00000000501 HYAL4 (ENSORLG00000000515) hyal6 (ENSORLG00000000524) ENSORLG00000000533 tnni2a.1 (ENSORLG00000000545) #21 tnni2a.2 (ENSORLG00000024626) #22 TNNI2 (ENSORLG00000000559) #23 TNNI2 (ENSORLG00000000591) #23 ENSORLG00000024559 ENSORLG00000000599 ENSORLG00000025446 #24 tnnt3a (ENSORLG00000000678) #25 myod1 (ENSORLG00000000694) ##26 ENSORLG00000000721 #28 ENSORLG00000027522 #29 ENSORLG00000025119 RFWD3 (ENSORLG00000000737) #33 GLG1 (ENSORLG00000000767) #32 ENSORLG00000024437 ENSORLG00000000773 ENSORLG00000024074 Chinese medaka MODERN SPECIES 318 TNNI2 (ENSOSIG00000009747) #23 tnni2a.2 (ENSOSIG00000009737) #22 TNNI2 (ENSOSIG00000009722) #23 ENSOSIG00000009709 ENSOSIG00000009705 #24 tnnt3a (ENSOSIG00000009699) #25 myod1 (ENSOSIG00000009675) ##26 ENSOSIG00000009673 LRTM2 (ENSOSIG00000009671) #29 ENSOSIG00000009670 #28 RFWD3 (ENSOSIG00000009667) #33 GLG1 (ENSOSIG00000009567) #32 ENSOSIG00000009561 urahb (ENSOSIG00000009559) #31 ENSOSIG00000009549 #30 znf277 (ENSOSIG00000009505) ENSOSIG00000009503 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016075 ENSGT00940000156476.h ENSGT00940000159477 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00940000161262.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075019 Indian medaka MODERN SPECIES 15 ENSOMEG00000019701 tnni2a.1 (ENSOMEG00000019735) #21 tnni2a.2 (ENSOMEG00000019778) #22 TNNI2 (ENSOMEG00000019805) #23 TNNI2 (ENSOMEG00000019856) #23 ENSOMEG00000019864 #24 ENSOMEG00000019976 tnnt3a (ENSOMEG00000020063) #25 myod1 (ENSOMEG00000020091) ##26 CACNA2D4 (ENSOMEG00000000936) #28 ENSOMEG00000020139 #29 ENSOMEG00000020159 #28 RFWD3 (ENSOMEG00000020218) #33 GLG1 (ENSOMEG00000020401) #32 ENSOMEG00000020438 urahb (ENSOMEG00000020448) #31 ENSOMEG00000020489 #30 znf277 (ENSOMEG00000020520) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Clown anemonefish MODERN SPECIES 751 aass (ENSAOCG00000017468) #7 PTPRZ1 (ENSAOCG00000017569) #8 dldh (ENSAOCG00000002339) #9 ENSAOCG00000002665 #20 tnni2a.1 (ENSAOCG00000017857) #21 tnni2a.2 (ENSAOCG00000017871) #22 TNNI2 (ENSAOCG00000017888) #23 ENSAOCG00000002393 #23 TNNI2 (ENSAOCG00000017932) #23 TNNI2 (ENSAOCG00000017959) #23 Orange clownfish MODERN SPECIES 18 ENSAPEG00000017189 ENSAPEG00000017179 ASB15 (ENSAPEG00000017102) IQUB (ENSAPEG00000016998) slc13a1 (ENSAPEG00000016967) ENSAPEG00000016930 CADPS2 (ENSAPEG00000016782) fezf1 (ENSAPEG00000016744) aass (ENSAPEG00000016653) #7 ENSAPEG00000016522 #8 ENSAPEG00000016488 #8 dldh (ENSAPEG00000016431) #9 SYT8 (ENSAPEG00000016419) #20 ENSAPEG00000016387 tnni2a.1 (ENSAPEG00000016379) #21 tnni2a.2 (ENSAPEG00000016369) #22 TNNI2 (ENSAPEG00000016355) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016331) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016303) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016276) #23 ENSAPEG00000016264 ENSAPEG00000016255 #24 ENSAPEG00000016238 myod1 (ENSAPEG00000016219) ##26 tnnt3a (ENSAPEG00000016176) #25 ENSAPEG00000016163 #27 LRTM2 (ENSAPEG00000016139) #29 CACNA2D4 (ENSAPEG00000015687) #28 ENSAPEG00000015651 #30 urahb (ENSAPEG00000015634) #31 ENSAPEG00000015507 Spiny chromis MODERN SPECIES 1278 tnni2a.1 (ENSAPOG00000010015) #21 ENSAPOG00000010022 tnni2a.2 (ENSAPOG00000010244) #22 TNNI2 (ENSAPOG00000010262) #23 ENSAPOG00000010281 #23 TNNI2 (ENSAPOG00000010314) #23 TNNI2 (ENSAPOG00000010340) #23 tmem106bb (ENSAPOG00000010349) arl4ab (ENSAPOG00000010415) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 478 dldh (ENSSPAG00000007152) #9 SYT8 (ENSSPAG00000007134) #20 ENSSPAG00000007118 tnni2a.1 (ENSSPAG00000007097) #21 tnni2a.2 (ENSSPAG00000007090) #22 ENSSPAG00000007079 #23 ENSSPAG00000007073 #23 ENSSPAG00000007042 #23 TNNI2 (ENSSPAG00000007029) #23 ENSSPAG00000007019 ENSSPAG00000007014 #24 tnnt3a (ENSSPAG00000006984) #25 myod1 (ENSSPAG00000006959) ##26 ENSSPAG00000006936 ENSSPAG00000006900 #29 CACNA2D4 (ENSSPAG00000005360) #28 ENSSPAG00000005219 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000012498 ENSGT00940000158087 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000012498 ENSGT00940000158087 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000012498 ENSGT00940000158087 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Eastern happy MODERN SPECIES 19 kiaa0513 (ENSACLG00000000993) slc13a1 (ENSACLG00000001095) ENSACLG00000001131 ENSACLG00000001165 ENSACLG00000001172 ENSACLG00000001179 ces3 (ENSACLG00000001188) zfpm1 (ENSACLG00000001201) ENSACLG00000001259 dldh (ENSACLG00000001270) #9 SYT8 (ENSACLG00000001358) #20 ENSACLG00000001500 tnni2a.1 (ENSACLG00000001530) #21 ENSACLG00000001555 ENSACLG00000001563 tnni2a.2 (ENSACLG00000001585) #22 TNNI2 (ENSACLG00000001597) #23 ENSACLG00000001643 #23 TNNI2 (ENSACLG00000001689) #23 TNNI2 (ENSACLG00000001715) #23 ENSACLG00000001721 #24 tnnt3a (ENSACLG00000001727) #25 myod1 (ENSACLG00000001809) ##26 CACNA2D4 (ENSACLG00000002230) #28 LRTM2 (ENSACLG00000002286) #29 ENSACLG00000002295 #28 ENSACLG00000002306 #30 urahb (ENSACLG00000002381) #31 ENSACLG00000002396 ENSACLG00000002399 GLG1 (ENSACLG00000002404) #32 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1110 CMIP (ENSMZEG00005016284) GAN (ENSMZEG00005016250) ENSMZEG00005016243 foxl1 (ENSMZEG00005016238) kiaa0513 (ENSMZEG00005016224) slc13a1 (ENSMZEG00005016213) ENSMZEG00005016206 slc13a1 (ENSMZEG00005016201) ces3 (ENSMZEG00005016193) zfpm1 (ENSMZEG00005016182) ENSMZEG00005016163 dldh (ENSMZEG00005016147) #9 SYT8 (ENSMZEG00005016137) #20 ENSMZEG00005016129 tnni2a.1 (ENSMZEG00005016126) #21 tnni2a.2 (ENSMZEG00005016116) #22 TNNI2 (ENSMZEG00005016110) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016101) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016090) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016082) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016076) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016067) #23 ENSMZEG00005016060 ENSMZEG00005016057 ENSMZEG00005016053 ENSMZEG00005016049 #24 tnnt3a (ENSMZEG00005016043) #25 myod1 (ENSMZEG00005016037) ##26 LRTM2 (ENSMZEG00005016031) #29 CACNA2D4 (ENSMZEG00005016019) #28 ENSMZEG00005016011 #30 P. nyererei MODERN SPECIES 524 dldh (ENSPNYG00000019274) #9 SYT8 (ENSPNYG00000019335) #20 ENSPNYG00000019407 tnni2a.1 (ENSPNYG00000019446) #21 tnni2a.2 (ENSPNYG00000019708) #22 TNNI2 (ENSPNYG00000019723) #23 ENSPNYG00000019743 #23 TNNI2 (ENSPNYG00000019768) #23 TNNI2 (ENSPNYG00000019789) #23 ENSPNYG00000019796 tnnt3a (ENSPNYG00000019816) #25 myod1 (ENSPNYG00000019881) ##26 CACNA2D4 (ENSPNYG00000019913) #28 LRTM2 (ENSPNYG00000019981) #29 ENSPNYG00000020007 #30 urahb (ENSPNYG00000020098) #31 ENSPNYG00000020106 GLG1 (ENSPNYG00000020129) #32 RFWD3 (ENSPNYG00000020232) #33 anpeplb (ENSPNYG00000020252) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1105 dldh (ENSHBUG00000010870) #9 SYT8 (ENSHBUG00000010808) #20 tnni2a.1 (ENSHBUG00000010797) #21 tnni2a.2 (ENSHBUG00000010773) #22 TNNI2 (ENSHBUG00000010751) #23 ENSHBUG00000010740 #23 TNNI2 (ENSHBUG00000010717) #23 ENSHBUG00000010706 #23 ENSHBUG00000010695 ENSHBUG00000010683 #24 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 429 zfpm1 (ENSNBRG00000000569) ENSNBRG00000000542 dldh (ENSNBRG00000000346) #9 SYT8 (ENSNBRG00000000324) #20 ENSNBRG00000000308 tnni2a.2 (ENSNBRG00000000291) #22 ENSNBRG00000000285 #23 TNNI2 (ENSNBRG00000000275) #23 ENSNBRG00000000267 ENSNBRG00000000262 ENSNBRG00000022480 tnnt3a (ENSNBRG00000022442) #25 myod1 (ENSNBRG00000022428) ##26 ENSNBRG00000022414 ENSNBRG00000022400 #30 urahb (ENSNBRG00000022377) #31 ENSNBRG00000022322 GLG1 (ENSNBRG00000022286) #32 RFWD3 (ENSNBRG00000022266) #33 MLKL (ENSNBRG00000022248) #34 si:dkey-12e7.1 (ENSNBRG00000022234) Midas cichlid MODERN SPECIES 258 ENSACIG00000015530 frs2b (ENSACIG00000015503) nup160 (ENSACIG00000015433) slc13a1 (ENSACIG00000015361) ces3 (ENSACIG00000015245) ENSACIG00000015232 zfpm1 (ENSACIG00000015211) ENSACIG00000015203 ENSACIG00000015187 ENSACIG00000015131 ENSACIG00000015126 dldh (ENSACIG00000015096) #9 SYT8 (ENSACIG00000015081) #20 ENSACIG00000015057 tnni2a.1 (ENSACIG00000015042) #21 tnni2a.2 (ENSACIG00000014981) #22 TNNI2 (ENSACIG00000014860) #23 TNNI2 (ENSACIG00000014837) #23 TNNI2 (ENSACIG00000014818) #23 ENSACIG00000014805 #23 ENSACIG00000014797 ENSACIG00000014781 tnnt3a (ENSACIG00000014612) #25 myod1 (ENSACIG00000014400) ##26 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 496 ENSHCOG00000009421 DUS2 (ENSHCOG00000009462) SLC7A10 (ENSHCOG00000009496) urahb (ENSHCOG00000009505) #31 ENSHCOG00000009602 #30 ENSHCOG00000009616 #28 LRTM2 (ENSHCOG00000009629) #29 CACNA2D4 (ENSHCOG00000009660) #28 ENSHCOG00000009665 MYOD1 (ENSHCOG00000009682) ##26 ENSHCOG00000009758 #8 ENSHCOG00000009794 #8 dldh (ENSHCOG00000009848) #9 ENSHCOG00000009869 #20 tnni2a.1 (ENSHCOG00000009875) #21 tnni2a.2 (ENSHCOG00000009882) #22 ENSHCOG00000009905 #23 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 20 ENSMMDG00005013546 lmod2a (ENSMMDG00005013547) ASB15 (ENSMMDG00005004070) ASB15 (ENSMMDG00005004125) IQUB (ENSMMDG00005004156) slc13a1 (ENSMMDG00005004181) CADPS2 (ENSMMDG00005004524) fezf1 (ENSMMDG00005008356) aass (ENSMMDG00005008411) #7 PTPRZ1 (ENSMMDG00005010843) #8 dldh (ENSMMDG00005010882) #9 ENSMMDG00005010938 ENSMMDG00005010939 SYT8 (ENSMMDG00005010940) #20 tnni2a.1 (ENSMMDG00005010942) #21 tnni2a.2 (ENSMMDG00005010943) #22 ENSMMDG00005010944 #23 ENSMMDG00005010945 #23 ENSMMDG00005010946 #23 ENSMMDG00005010947 #23 TNNI2 (ENSMMDG00005010948) #23 ENSMMDG00005010949 #24 tnnt3a (ENSMMDG00005010950) #25 myod1 (ENSMMDG00005010952) ##26 zgc:172145 (ENSMMDG00005010974) #27 CACNA2D4 (ENSMMDG00005010984) #28 LRTM2 (ENSMMDG00005011155) #29 ENSMMDG00005011190 #30 urahb (ENSMMDG00005012437) #31 acot19 (ENSMMDG00005012454) ENSMMDG00005012464 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000016718 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 ENSGT00940000177178 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000159916 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00390000016718 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00390000016718 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.cc.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b Channel catfish MODERN SPECIES 5 gdpgp1 (ENSIPUG00000003999) rhcg1 (ENSIPUG00000004004) polg (ENSIPUG00000004036) fanci (ENSIPUG00000004103) FBXO31 (ENSIPUG00000004197) ENSIPUG00000004211 rassf8 (ENSIPUG00000004240) kras (ENSIPUG00000004259) znf469 (ENSIPUG00000004306) ENSIPUG00000004314 banp (ENSIPUG00000004342) PDCD2L (ENSIPUG00000004421) SYT8 (ENSIPUG00000004448) #20 ENSIPUG00000004455 TNNI2 (ENSIPUG00000004462) #21 tnni2a.2 (ENSIPUG00000004477) #22 TNNI2 (ENSIPUG00000004491) #23 tnni2a.3 (ENSIPUG00000004514) #23 tnni2 (ENSIPUG00000004539) #23 ENSIPUG00000004583 ENSIPUG00000004645 #24 ENSIPUG00000004650 tnnt3a (ENSIPUG00000004658) #25 myod1 (ENSIPUG00000004693) ##26 zgc:172145 (ENSIPUG00000004699) #27 ush1c (ENSIPUG00000004724) abcc8 (ENSIPUG00000004801) kcnj11 (ENSIPUG00000005009) mob2a (ENSIPUG00000005022) dusp8a (ENSIPUG00000005041) ENSIPUG00000005070 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000016718 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.cc.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b Characoidei ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368.m ENSGT00940000155200.cc.b.a ENSGT00940000155200.cc.b.b ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626.`b.b ENSGT00940000156626.`b.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000160004.f Red-bellied piranha MODERN SPECIES 65 POLG (ENSPNAG00000004568) fanci (ENSPNAG00000006572) FBXO31 (ENSPNAG00000028889) ENSPNAG00000028806 ENSPNAG00000028758 ENSPNAG00000004407 ENSPNAG00000004742 RASSF8 (ENSPNAG00000028666) kras (ENSPNAG00000028629) ENSPNAG00000006076 banp (ENSPNAG00000028568) pdcd2l (ENSPNAG00000004367) SYT8 (ENSPNAG00000028474) #20 ENSPNAG00000028459 tnni2a.1 (ENSPNAG00000006788) #21 tnni2a.2 (ENSPNAG00000028418) #22 tnni2a.3 (ENSPNAG00000006873) #23 tnni2a.4 (ENSPNAG00000028390) #23 ENSPNAG00000006385 ENSPNAG00000028344 #24 tnnt3a (ENSPNAG00000005106) #25 myod1 (ENSPNAG00000006274) ##26 zgc:172145 (ENSPNAG00000005729) #27 ush1c (ENSPNAG00000004979) abcc8 (ENSPNAG00000006867) dusp8a (ENSPNAG00000027990) ENSPNAG00000027977 Electric eel MODERN SPECIES 236 ENSEEEG00000007384 banp (ENSEEEG00000007385) pdcd2l (ENSEEEG00000007386) SYT8 (ENSEEEG00000007387) #20 ENSEEEG00000007390 tnni2a.1 (ENSEEEG00000007391) #21 tnni2a.2 (ENSEEEG00000007393) #22 tnni2a.3 (ENSEEEG00000007394) #23 tnni2a.4 (ENSEEEG00000007412) #23 ENSEEEG00000007427 #24 tnnt3a (ENSEEEG00000007429) #25 myod1 (ENSEEEG00000007431) ##26 ush1c (ENSEEEG00000007432) abcc8 (ENSEEEG00000007434) kcnj11 (ENSEEEG00000007443) mob2a (ENSEEEG00000007448) dusp8a (ENSEEEG00000007456) ENSEEEG00000007463 OSBPL5 (ENSEEEG00000007471) phlda2 (ENSEEEG00000007614) nap1l4a (ENSEEEG00000007616) ENSEEEG00000007618 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT01090000259985.b.b.b.b ENSGT00700000104539.b.b ENSGT00390000011067.B ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.ec.b ENSGT00940000155200.ec.a ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116.i ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a.n ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 219 ENSGT00390000008107.c.b.a ENSGT00940000159515.c.a.d ENSGT01090000259985.b.b.b.b.j ENSGT00700000104539.b.b ENSGT00390000011067.B ENSGT00390000001368.p ENSGT00940000155200.ec.a ENSGT00940000158339.a ENSGT00390000011116.i.a ENSGT00530000065415.b ENSGT00940000155871.k.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.a #22 ENSGT00940000153901.a.b.b.b ENSGT00940000167812.d #24 ENSGT00940000158477.b ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a.b ##26 ENSGT00920000149457.a #27 ENSGT00950000183002.A.c ENSGT00940000156626.w.b ENSGT00990000203615.a.a.a.b.f ENSGT01050000244956.a.a.n.b ENSGT00940000160004.f.a ENSGT00940000156870.bb.b.a ENSGT00940000159535.h ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159.a ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a.a Goldfish MODERN SPECIES 45 hexa (ENSCARG00000070296) pkp3a (ENSCARG00000070305) sigirr (ENSCARG00000070314) ENSCARG00000070316 dynlrb2 (ENSCARG00000070319) FBXO31 (ENSCARG00000070320) ENSCARG00000070322 pdcd2l (ENSCARG00000070326) banp (ENSCARG00000047101) ENSCARG00000047113 ENSCARG00000047116 kras (ENSCARG00000047124) RASSF8 (ENSCARG00000047148) ENSCARG00000047172 tnni2a.1 (ENSCARG00000047183) #21 tnni2a.2 (ENSCARG00000047218) #22 ENSCARG00000047242 #24 tnni2a.3 (ENSCARG00000047250) #23 ENSCARG00000047262 myod1 (ENSCARG00000047275) ##26 zgc:172145 (ENSCARG00000047288) #27 ush1c (ENSCARG00000047304) abcc8 (ENSCARG00000047502) kcnj11 (ENSCARG00000048580) mob2a (ENSCARG00000048612) dusp8a (ENSCARG00000048679) ENSCARG00000048706 OSBPL5 (ENSCARG00000048773) phlda2 (ENSCARG00000049767) nap1l4a (ENSCARG00000049783) ENSCARG00000049918 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00940000159515.c.a.d ENSGT01090000259985.b.b.b.b.j ENSGT00700000104539.b.b.b ENSGT00390000011067.B ENSGT00390000001368.p ENSGT00940000155200.ec.a ENSGT00940000158339.a ENSGT00390000011116.j ENSGT00390000011116.i.a ENSGT00530000065415.b ENSGT00940000155871.k.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.a #22 ENSGT00940000167812.d #24 ENSGT00940000158477.b ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a.b ##26 ENSGT00920000149457.a #27 ENSGT00950000183002.A.c ENSGT00940000156626.w.b ENSGT00990000203615.a.a.a.b.f ENSGT01050000244956.a.a.n.b ENSGT00940000160004.f.a ENSGT00940000156870.bb.b.a ENSGT00940000159535.h ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159.a ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a.a ENSGT00940000164715.b.b Common carp reference MODERN SPECIES 33 nr2e3 (ENSCCRG00000077330) hexa (ENSCCRG00000074553) pkp3a (ENSCCRG00000042746) sigirr (ENSCCRG00000060543) dynlrb2 (ENSCCRG00000047355) ENSCCRG00000043287 ENSCCRG00000015852 pdcd2l (ENSCCRG00000043265) ENSCCRG00000068910 banp (ENSCCRG00000029986) ENSCCRG00000062479 kras (ENSCCRG00000049418) ENSCCRG00000024104 ENSCCRG00000049349 SYT8 (ENSCCRG00000007820) #20 tnni2a.2 (ENSCCRG00000007838) #22 tnni2a.3 (ENSCCRG00000067810) #23 ENSCCRG00000049337 ENSCCRG00000059451 #24 TNNT3 (ENSCCRG00000056652) ##25 myod1 (ENSCCRG00000078915) ##26 zgc:172145 (ENSCCRG00000074849) #27 ENSCCRG00000081027 ush1c (ENSCCRG00000014177) abcc8 (ENSCCRG00000004760) kcnj11 (ENSCCRG00000075210) mob2a (ENSCCRG00000008336) dusp8a (ENSCCRG00000056844) ENSCCRG00000022539 ENSCCRG00000075142 ENSCCRG00000070395 Golden-line barbel MODERN SPECIES 198 pkp3a (ENSSGRG00000039111) sigirr (ENSSGRG00000039109) ENSSGRG00000039108 dynlrb2 (ENSSGRG00000039107) FBXO31 (ENSSGRG00000039106) ENSSGRG00000039103 ENSSGRG00000039102 pdcd2l (ENSSGRG00000039101) ENSSGRG00000039100 ENSSGRG00000039099 kras (ENSSGRG00000039029) RASSF8 (ENSSGRG00000039023) ENSSGRG00000039021 #20 ENSSGRG00000039020 tnni2a.1 (ENSSGRG00000039014) #21 tnni2a.2 (ENSSGRG00000039009) #22 tnni2a.3 (ENSSGRG00000039007) #23 ENSSGRG00000039005 #23 ENSSGRG00000039001 ENSSGRG00000039000 #24 ENSSGRG00000038998 #24 myod1 (ENSSGRG00000038991) ##26 zgc:172145 (ENSSGRG00000038989) #27 ush1c (ENSSGRG00000038778) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 296 ENSGT00390000001368.o ENSGT00940000155200.ec.b ENSGT00940000158339.b ENSGT00390000011116.i.b ENSGT00530000065415.a ENSGT00940000155871.l ENSGT00940000155871.k.a ENSGT00950000182839.B.a.a.l.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b.a ENSGT00940000167812.c #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.a.a.a ##26 ENSGT00920000149457.b #27 ENSGT00950000183002.A.d ENSGT00940000156626.w.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b.e ENSGT01050000244956.a.a.n.a ENSGT00940000160004.f.b ENSGT00940000156870.cb ENSGT00940000159535.g ENSGT00940000169159.b ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01030000234614.C ENSGT00940000156926.c.b ENSGT00390000008107.c.b.b ENSGT00940000159515.c.a.c.a ENSGT01090000259985.b.b.b.b.i ENSGT00700000104539.b.b.a ENSGT00390000001368.o ENSGT00940000155200.ec.b.a ENSGT00940000158339.b ENSGT00390000011116.i.b ENSGT00530000065415.a ENSGT00940000155871.l ENSGT00950000182839.B.a.a.l.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b.b ENSGT00940000153901.a.b.b.a ENSGT00940000167812.c #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.a.a.a ##26 ENSGT00920000149457.b #27 ENSGT00950000183002.A.d ENSGT00940000156626.w.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b.e ENSGT01050000244956.a.a.n.a ENSGT00940000160004.f.b ENSGT00940000156870.cb ENSGT00940000159535.g ENSGT00940000169159.b Common carp reference MODERN SPECIES 37 nr2e3 (ENSCCRG00000071591) hexa (ENSCCRG00000042810) pkp3a (ENSCCRG00000042877) sigirr (ENSCCRG00000042867) ENSCCRG00000018100 ENSCCRG00000071670 ENSCCRG00000059814 pdcd2l (ENSCCRG00000015904) banp (ENSCCRG00000043253) ENSCCRG00000058767 ENSCCRG00000053006 kras (ENSCCRG00000024099) ENSCCRG00000069031 SYT8 (ENSCCRG00000059526) #20 tnni2a.1 (ENSCCRG00000039838) #21 tnni2a.2 (ENSCCRG00000064585) #22 tnni2a.3 (ENSCCRG00000007849) #23 ENSCCRG00000007923 ENSCCRG00000007936 #24 tnnt3a (ENSCCRG00000062720) #25 myod1 (ENSCCRG00000049312) ##26 zgc:172145 (ENSCCRG00000059740) #27 ush1c (ENSCCRG00000013479) abcc8 (ENSCCRG00000006460) ENSCCRG00000078356 kcnj11 (ENSCCRG00000078656) mob2a (ENSCCRG00000062835) dusp8a (ENSCCRG00000066543) ENSCCRG00000070357 ENSCCRG00000066001 ENSCCRG00000068830 Goldfish MODERN SPECIES 1850 tnni2a.2 (ENSCARG00000038769) #22 Zebrafish MODERN SPECIES 17 ENSDARG00000029431 api5 (ENSDARG00000033597) hsd17b12a (ENSDARG00000015709) alkbh3 (ENSDARG00000045606) C25H11orf96 (ENSDARG00000097208) pdia3 (ENSDARG00000102640) ENSDARG00000104818 ENSDARG00000101726 pdcd2l (ENSDARG00000002754) banp (ENSDARG00000017562) ENSDARG00000115365 kras (ENSDARG00000010844) RASSF8 (ENSDARG00000045596) ENSDARG00000110361 tnni2a.1 (ENSDARG00000045592) #21 tnni2a.2 (ENSDARG00000005841) #22 tnni2a.3 (ENSDARG00000013752) #23 tnni2a.4 (ENSDARG00000029069) #23 ENSDARG00000027310 ENSDARG00000097224 #24 tnnt3a (ENSDARG00000030270) #25 myod1 (ENSDARG00000030110) ##26 zgc:172145 (ENSDARG00000045586) #27 lamb1a (ENSDARG00000101209) lamb4 (ENSDARG00000039133) acot19 (ENSDARG00000040427) ubl7a (ENSDARG00000024229) scamp5a (ENSDARG00000018743) parp16 (ENSDARG00000018593) ENSDARG00000097169 EIF3J (ENSDARG00000097988) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A.f ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b.d ENSGT00940000159535.i ENSGT00440000039564.a.b.i ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a ENSGT00940000164715.b ENSGT00940000160745.d Denticle herring MODERN SPECIES 8 LRRC56 (ENSDCDG00000031142) RASSF7 (ENSDCDG00000031144) ENSDCDG00000031146 irf7 (ENSDCDG00000031151) ascl1b (ENSDCDG00000031153) CES3 (ENSDCDG00000031156) pdcd2l (ENSDCDG00000031158) banp (ENSDCDG00000031160) ENSDCDG00000031164 kras (ENSDCDG00000031166) RASSF8 (ENSDCDG00000031168) ENSDCDG00000031170 SYT8 (ENSDCDG00000031171) #20 ENSDCDG00000031173 tnni2a.1 (ENSDCDG00000031175) #21 tnni2a.2 (ENSDCDG00000031178) #22 ENSDCDG00000031179 #23 ENSDCDG00000031186 #23 TNNI2 (ENSDCDG00000005638) #23 tnni2a.4 (ENSDCDG00000005740) #23 ENSDCDG00000006819 ENSDCDG00000006877 #24 MYOD1 (ENSDCDG00000006890) ##26 zgc:172145 (ENSDCDG00000006912) #27 ush1c (ENSDCDG00000007075) abcc8 (ENSDCDG00000007647) kcnj11 (ENSDCDG00000007731) mob2a (ENSDCDG00000007735) dusp8a (ENSDCDG00000007781) ENSDCDG00000007814 OSBPL5 (ENSDCDG00000008088) Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ifit9 (ENSCHAG00000015560) ENSCHAG00000015577 ENSCHAG00000015724 ENSCHAG00000015739 ENSCHAG00000015753 ENSCHAG00000015784 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) #20 ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) #21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) #22 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) #23 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) #23 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 #24 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) #25 MYOD1 (ENSCHAG00000016826) #26 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00390000009663 ENSGT00940000165046.a ENSGT00940000161379 ENSGT00990000204217 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00390000014700.b.a.a.c ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.b #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812.a #24 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000159916.d ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 Asian bonytongue MODERN SPECIES 20 ENSSFOG00015000494 eif3m (ENSSFOG00015000568) prrg4 (ENSSFOG00015000619) ENSSFOG00015000627 syt9b (ENSSFOG00015000644) bbox1 (ENSSFOG00015000689) fibinb (ENSSFOG00015000695) cstpp1 (ENSSFOG00015000701) IFT140 (ENSSFOG00015000759) antkmt (ENSSFOG00015026035) ENSSFOG00015000887 ##16 ctsd (ENSSFOG00015000892) #18 ENSSFOG00015000957 SYT8 (ENSSFOG00015000963) #20 ENSSFOG00015000969 tnni2a.2 (ENSSFOG00015001029) #22 tnni2a.4 (ENSSFOG00015001189) #23 ENSSFOG00015001301 ENSSFOG00015001312 #24 TNNT3 (ENSSFOG00015001321) ##25 myod1 (ENSSFOG00015001375) ##26 zgc:172145 (ENSSFOG00015001401) #27 OTOG (ENSSFOG00015025460) ush1c (ENSSFOG00015001489) abcc8 (ENSSFOG00015001504) kcnj11 (ENSSFOG00015025143) MOB2 (ENSSFOG00015001705) dusp8a (ENSSFOG00015025183) PTPN5 (ENSSFOG00015001826) OSBPL5 (ENSSFOG00015002010) phlda2 (ENSSFOG00015002113) P. kingsleyae MODERN SPECIES 38 ENSPKIG00000003177 zgc:110339 (ENSPKIG00000003141) zgc:110339 (ENSPKIG00000003099) ENSPKIG00000003044 cox8b (ENSPKIG00000003015) psmd13 (ENSPKIG00000002977) sirt3 (ENSPKIG00000002937) ric8a (ENSPKIG00000002880) deaf1 (ENSPKIG00000002796) #14 DRD4 (ENSPKIG00000002751) #15 ENSPKIG00000002707 ctsd (ENSPKIG00000002678) #18 ENSPKIG00000002661 SYT8 (ENSPKIG00000002642) #20 TNNI2 (ENSPKIG00000002626) #23 tnni2a.2 (ENSPKIG00000002613) #22 TNNI2 (ENSPKIG00000002585) #23 TNNI2 (ENSPKIG00000002556) #23 ENSPKIG00000002535 ENSPKIG00000002526 #24 ENSPKIG00000002481 TNNT3 (ENSPKIG00000002402) ##25 MYOD1 (ENSPKIG00000002354) #26 zgc:172145 (ENSPKIG00000002339) #27 OTOG (ENSPKIG00000002227) ush1c (ENSPKIG00000002131) abcc8 (ENSPKIG00000002041) kcnj11 (ENSPKIG00000001997) MOB2 (ENSPKIG00000001948) dusp8a (ENSPKIG00000001877) PTPN5 (ENSPKIG00000001814) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000159464 ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000159916 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 145 ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000158927 ENSGT00390000016718 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 ENSGT00940000177178 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f Otophysi ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000159320 ENSGT00390000016718 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000159320 ENSGT00390000016718 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.cc.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 Channel catfish MODERN SPECIES 5 unc45a (ENSIPUG00000003978) gdpgp1 (ENSIPUG00000003999) rhcg1 (ENSIPUG00000004004) polg (ENSIPUG00000004036) fanci (ENSIPUG00000004103) FBXO31 (ENSIPUG00000004197) ENSIPUG00000004211 rassf8 (ENSIPUG00000004240) kras (ENSIPUG00000004259) znf469 (ENSIPUG00000004306) ENSIPUG00000004314 banp (ENSIPUG00000004342) PDCD2L (ENSIPUG00000004421) SYT8 (ENSIPUG00000004448) #20 ENSIPUG00000004455 TNNI2 (ENSIPUG00000004462) #21 tnni2a.2 (ENSIPUG00000004477) #22 TNNI2 (ENSIPUG00000004491) #23 tnni2a.3 (ENSIPUG00000004514) #23 tnni2 (ENSIPUG00000004539) #23 ENSIPUG00000004583 ENSIPUG00000004645 #24 ENSIPUG00000004650 tnnt3a (ENSIPUG00000004658) #25 myod1 (ENSIPUG00000004693) ##26 zgc:172145 (ENSIPUG00000004699) #27 ush1c (ENSIPUG00000004724) abcc8 (ENSIPUG00000004801) kcnj11 (ENSIPUG00000005009) mob2a (ENSIPUG00000005022) dusp8a (ENSIPUG00000005041) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000159320 ENSGT00390000016718 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.cc.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00390000016718 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368.m ENSGT00940000155200.cc.b.a ENSGT00940000155200.cc.b.b ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626.`b.b ENSGT00940000156626.`b.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000160004.f Red-bellied piranha MODERN SPECIES 65 rhcgb (ENSPNAG00000029436) POLG (ENSPNAG00000004568) fanci (ENSPNAG00000006572) FBXO31 (ENSPNAG00000028889) ENSPNAG00000028806 ENSPNAG00000028758 ENSPNAG00000004407 ENSPNAG00000004742 RASSF8 (ENSPNAG00000028666) kras (ENSPNAG00000028629) ENSPNAG00000006076 banp (ENSPNAG00000028568) pdcd2l (ENSPNAG00000004367) SYT8 (ENSPNAG00000028474) #20 ENSPNAG00000028459 tnni2a.1 (ENSPNAG00000006788) #21 tnni2a.2 (ENSPNAG00000028418) #22 tnni2a.3 (ENSPNAG00000006873) #23 tnni2a.4 (ENSPNAG00000028390) #23 ENSPNAG00000006385 ENSPNAG00000028344 #24 tnnt3a (ENSPNAG00000005106) #25 myod1 (ENSPNAG00000006274) ##26 zgc:172145 (ENSPNAG00000005729) #27 ush1c (ENSPNAG00000004979) abcc8 (ENSPNAG00000006867) dusp8a (ENSPNAG00000027990) ENSPNAG00000027977 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1246 ENSAMXG00000039263 banp (ENSAMXG00000017170) pdcd2l (ENSAMXG00000017155) ENSAMXG00000017150 #20 ENSAMXG00000037298 TNNI2 (ENSAMXG00000042297) #23 tnni2a.4 (ENSAMXG00000017111) #23 tnni2a.1 (ENSAMXG00000035063) #21 Electric eel MODERN SPECIES 236 ENSEEEG00000007384 banp (ENSEEEG00000007385) pdcd2l (ENSEEEG00000007386) SYT8 (ENSEEEG00000007387) #20 ENSEEEG00000007390 tnni2a.1 (ENSEEEG00000007391) #21 tnni2a.2 (ENSEEEG00000007393) #22 tnni2a.3 (ENSEEEG00000007394) #23 tnni2a.4 (ENSEEEG00000007412) #23 ENSEEEG00000007427 #24 tnnt3a (ENSEEEG00000007429) #25 myod1 (ENSEEEG00000007431) ##26 ush1c (ENSEEEG00000007432) abcc8 (ENSEEEG00000007434) kcnj11 (ENSEEEG00000007443) mob2a (ENSEEEG00000007448) dusp8a (ENSEEEG00000007456) ENSEEEG00000007463 OSBPL5 (ENSEEEG00000007471) phlda2 (ENSEEEG00000007614) nap1l4a (ENSEEEG00000007616) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000159515.c.a ENSGT01090000259985.b.b.b.b ENSGT00700000104539.b.b ENSGT00390000011067.B ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.ec.b ENSGT00940000155200.ec.a ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116.i ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a.n ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 296 ENSGT00390000001368.o ENSGT00940000155200.ec.b ENSGT00940000158339.b ENSGT00390000011116.i.b ENSGT00530000065415.a ENSGT00940000155871.l ENSGT00940000155871.k.a ENSGT00950000182839.B.a.a.l.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b.a ENSGT00940000167812.c #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.a.a.a ##26 ENSGT00920000149457.b #27 ENSGT00950000183002.A.d ENSGT00940000156626.w.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b.e ENSGT01050000244956.a.a.n.a ENSGT00940000160004.f.b ENSGT00940000156870.cb ENSGT00940000159535.g ENSGT00940000169159.b Goldfish MODERN SPECIES 17 ENSCARG00000006953 CYP11A1 (ENSCARG00000007032) nr2e3 (ENSCARG00000007717) hexa (ENSCARG00000007837) pkp3a (ENSCARG00000011246) ENSCARG00000011358 ENSCARG00000011380 FBXO31 (ENSCARG00000011416) ENSCARG00000011509 pdcd2l (ENSCARG00000011542) banp (ENSCARG00000011549) ENSCARG00000011595 kras (ENSCARG00000011599) RASSF8 (ENSCARG00000011612) SYT8 (ENSCARG00000011614) #20 tnni2a.1 (ENSCARG00000011629) #21 ENSCARG00000011653 ENSCARG00000011667 #24 tnnt3a (ENSCARG00000011669) #25 myod1 (ENSCARG00000011672) ##26 zgc:172145 (ENSCARG00000011680) #27 ush1c (ENSCARG00000011715) abcc8 (ENSCARG00000011954) kcnj11 (ENSCARG00000012748) mob2a (ENSCARG00000012767) dusp8a (ENSCARG00000012784) ENSCARG00000012795 ENSCARG00000012810 ENSCARG00000012825 OSBPL5 (ENSCARG00000012856) phlda2 (ENSCARG00000013035) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158575.a ENSGT01030000234614.C ENSGT00940000156926.c.b ENSGT00390000008107.c.b.b ENSGT00940000159515.c.a.c.a ENSGT01090000259985.b.b.b.b.i ENSGT00700000104539.b.b.a ENSGT00390000001368.o ENSGT00940000155200.ec.b.a ENSGT00940000158339.b ENSGT00390000011116.i.b ENSGT00530000065415.a ENSGT00940000155871.l ENSGT00950000182839.B.a.a.l.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b.b ENSGT00940000153901.a.b.b.a ENSGT00940000167812.c #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.a.a.a ##26 ENSGT00920000149457.b #27 ENSGT00950000183002.A.d ENSGT00940000156626.w.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b.e ENSGT01050000244956.a.a.n.a ENSGT00940000160004.f.b ENSGT00940000156870.cb ENSGT00940000159535.g Common carp reference MODERN SPECIES 37 stoml1 (ENSCCRG00000003865) nr2e3 (ENSCCRG00000071591) hexa (ENSCCRG00000042810) pkp3a (ENSCCRG00000042877) sigirr (ENSCCRG00000042867) ENSCCRG00000018100 ENSCCRG00000071670 ENSCCRG00000059814 pdcd2l (ENSCCRG00000015904) banp (ENSCCRG00000043253) ENSCCRG00000058767 ENSCCRG00000053006 kras (ENSCCRG00000024099) ENSCCRG00000069031 SYT8 (ENSCCRG00000059526) #20 tnni2a.1 (ENSCCRG00000039838) #21 tnni2a.2 (ENSCCRG00000064585) #22 tnni2a.3 (ENSCCRG00000007849) #23 ENSCCRG00000007923 ENSCCRG00000007936 #24 tnnt3a (ENSCCRG00000062720) #25 myod1 (ENSCCRG00000049312) ##26 zgc:172145 (ENSCCRG00000059740) #27 ush1c (ENSCCRG00000013479) abcc8 (ENSCCRG00000006460) ENSCCRG00000078356 kcnj11 (ENSCCRG00000078656) mob2a (ENSCCRG00000062835) dusp8a (ENSCCRG00000066543) ENSCCRG00000070357 ENSCCRG00000066001 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 219 ENSGT00940000156926.c.a ENSGT00390000008107.c.b.a ENSGT00940000159515.c.a.d ENSGT01090000259985.b.b.b.b.j ENSGT00700000104539.b.b ENSGT00390000011067.B ENSGT00390000001368.p ENSGT00940000155200.ec.a ENSGT00940000158339.a ENSGT00390000011116.i.a ENSGT00530000065415.b ENSGT00940000155871.k.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.a #22 ENSGT00940000153901.a.b.b.b ENSGT00940000167812.d #24 ENSGT00940000158477.b ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a.b ##26 ENSGT00920000149457.a #27 ENSGT00950000183002.A.c ENSGT00940000156626.w.b ENSGT00990000203615.a.a.a.b.f ENSGT01050000244956.a.a.n.b ENSGT00940000160004.f.a ENSGT00940000156870.bb.b.a ENSGT00940000159535.h ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00390000008107.c.b.a ENSGT00940000159515.c.a.d ENSGT01090000259985.b.b.b.b.j ENSGT00700000104539.b.b.b ENSGT00390000011067.B ENSGT00390000001368.p ENSGT00940000155200.ec.a ENSGT00940000158339.a ENSGT00390000011116.j ENSGT00390000011116.i.a ENSGT00530000065415.b ENSGT00940000155871.k.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.a #22 ENSGT00940000167812.d #24 ENSGT00940000158477.b ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a.b ##26 ENSGT00920000149457.a #27 ENSGT00950000183002.A.c ENSGT00940000156626.w.b ENSGT00990000203615.a.a.a.b.f ENSGT01050000244956.a.a.n.b ENSGT00940000160004.f.a ENSGT00940000156870.bb.b.a ENSGT00940000159535.h ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159.a ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 198 hexa (ENSSGRG00000039143) pkp3a (ENSSGRG00000039111) sigirr (ENSSGRG00000039109) ENSSGRG00000039108 dynlrb2 (ENSSGRG00000039107) FBXO31 (ENSSGRG00000039106) ENSSGRG00000039103 ENSSGRG00000039102 pdcd2l (ENSSGRG00000039101) ENSSGRG00000039100 ENSSGRG00000039099 kras (ENSSGRG00000039029) RASSF8 (ENSSGRG00000039023) ENSSGRG00000039021 #20 ENSSGRG00000039020 tnni2a.1 (ENSSGRG00000039014) #21 tnni2a.2 (ENSSGRG00000039009) #22 tnni2a.3 (ENSSGRG00000039007) #23 ENSSGRG00000039005 #23 ENSSGRG00000039001 ENSSGRG00000039000 #24 ENSSGRG00000038998 #24 myod1 (ENSSGRG00000038991) ##26 zgc:172145 (ENSSGRG00000038989) #27 ush1c (ENSSGRG00000038778) Goldfish MODERN SPECIES 45 nr2e3 (ENSCARG00000070290) hexa (ENSCARG00000070296) pkp3a (ENSCARG00000070305) sigirr (ENSCARG00000070314) ENSCARG00000070316 dynlrb2 (ENSCARG00000070319) FBXO31 (ENSCARG00000070320) ENSCARG00000070322 pdcd2l (ENSCARG00000070326) banp (ENSCARG00000047101) ENSCARG00000047113 ENSCARG00000047116 kras (ENSCARG00000047124) RASSF8 (ENSCARG00000047148) ENSCARG00000047172 tnni2a.1 (ENSCARG00000047183) #21 tnni2a.2 (ENSCARG00000047218) #22 ENSCARG00000047242 #24 tnni2a.3 (ENSCARG00000047250) #23 ENSCARG00000047262 myod1 (ENSCARG00000047275) ##26 zgc:172145 (ENSCARG00000047288) #27 ush1c (ENSCARG00000047304) abcc8 (ENSCARG00000047502) kcnj11 (ENSCARG00000048580) mob2a (ENSCARG00000048612) dusp8a (ENSCARG00000048679) ENSCARG00000048706 OSBPL5 (ENSCARG00000048773) phlda2 (ENSCARG00000049767) nap1l4a (ENSCARG00000049783) Zebrafish MODERN SPECIES 17 ENSDARG00000103517 ENSDARG00000029431 api5 (ENSDARG00000033597) hsd17b12a (ENSDARG00000015709) alkbh3 (ENSDARG00000045606) C25H11orf96 (ENSDARG00000097208) pdia3 (ENSDARG00000102640) ENSDARG00000104818 ENSDARG00000101726 pdcd2l (ENSDARG00000002754) banp (ENSDARG00000017562) ENSDARG00000115365 kras (ENSDARG00000010844) RASSF8 (ENSDARG00000045596) ENSDARG00000110361 tnni2a.1 (ENSDARG00000045592) #21 tnni2a.2 (ENSDARG00000005841) #22 tnni2a.3 (ENSDARG00000013752) #23 tnni2a.4 (ENSDARG00000029069) #23 ENSDARG00000027310 ENSDARG00000097224 #24 tnnt3a (ENSDARG00000030270) #25 myod1 (ENSDARG00000030110) ##26 zgc:172145 (ENSDARG00000045586) #27 lamb1a (ENSDARG00000101209) lamb4 (ENSDARG00000039133) acot19 (ENSDARG00000040427) ubl7a (ENSDARG00000024229) scamp5a (ENSDARG00000018743) parp16 (ENSDARG00000018593) ENSDARG00000097169 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A.f ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b.d ENSGT00940000159535.i ENSGT00440000039564.a.b.i ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a ENSGT00940000164715.b Denticle herring MODERN SPECIES 8 hrasa (ENSDCDG00000031140) LRRC56 (ENSDCDG00000031142) RASSF7 (ENSDCDG00000031144) ENSDCDG00000031146 irf7 (ENSDCDG00000031151) ascl1b (ENSDCDG00000031153) CES3 (ENSDCDG00000031156) pdcd2l (ENSDCDG00000031158) banp (ENSDCDG00000031160) ENSDCDG00000031164 kras (ENSDCDG00000031166) RASSF8 (ENSDCDG00000031168) ENSDCDG00000031170 SYT8 (ENSDCDG00000031171) #20 ENSDCDG00000031173 tnni2a.1 (ENSDCDG00000031175) #21 tnni2a.2 (ENSDCDG00000031178) #22 ENSDCDG00000031179 #23 ENSDCDG00000031186 #23 TNNI2 (ENSDCDG00000005638) #23 tnni2a.4 (ENSDCDG00000005740) #23 ENSDCDG00000006819 ENSDCDG00000006877 #24 MYOD1 (ENSDCDG00000006890) ##26 zgc:172145 (ENSDCDG00000006912) #27 ush1c (ENSDCDG00000007075) abcc8 (ENSDCDG00000007647) kcnj11 (ENSDCDG00000007731) mob2a (ENSDCDG00000007735) dusp8a (ENSDCDG00000007781) ENSDCDG00000007814 Atlantic herring MODERN SPECIES 19 impdh1a (ENSCHAG00000015360) ifit9 (ENSCHAG00000015560) ENSCHAG00000015577 ENSCHAG00000015724 ENSCHAG00000015739 ENSCHAG00000015753 ENSCHAG00000015784 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) #20 ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) #21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) #22 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) #23 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) #23 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 #24 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) #25 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000178634 ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000165218.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01020000231746 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 496 ENSHCOG00000009337 ENSHCOG00000009421 DUS2 (ENSHCOG00000009462) SLC7A10 (ENSHCOG00000009496) urahb (ENSHCOG00000009505) #31 ENSHCOG00000009602 #30 ENSHCOG00000009616 #28 LRTM2 (ENSHCOG00000009629) #29 CACNA2D4 (ENSHCOG00000009660) #28 ENSHCOG00000009665 MYOD1 (ENSHCOG00000009682) ##26 ENSHCOG00000009758 #8 ENSHCOG00000009794 #8 dldh (ENSHCOG00000009848) #9 ENSHCOG00000009869 #20 tnni2a.1 (ENSHCOG00000009875) #21 tnni2a.2 (ENSHCOG00000009882) #22 ENSHCOG00000009905 #23 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 Zig-zag eel MODERN SPECIES 20 slc13a1 (ENSMAMG00000022806) CADPS2 (ENSMAMG00000022799) fezf1 (ENSMAMG00000022795) aass (ENSMAMG00000022779) #7 ENSMAMG00000022774 PTPRZ1 (ENSMAMG00000027911) #8 ENSMAMG00000022767 ENSMAMG00000022758 ENSMAMG00000025915 ENSMAMG00000022762 ENSMAMG00000024786 ENSMAMG00000022760 ENSMAMG00000022756 #9 SYT8 (ENSMAMG00000026620) #20 ENSMAMG00000025933 tnni2a.1 (ENSMAMG00000022730) #21 tnni2a.2 (ENSMAMG00000022728) #22 TNNI2 (ENSMAMG00000028411) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000025267) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000022722) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000028574) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000024405) #23 ENSMAMG00000026203 ENSMAMG00000025176 tnnt3a (ENSMAMG00000022716) #25 myod1 (ENSMAMG00000025845) ##26 ENSMAMG00000022714 #29 ENSMAMG00000022713 #28 ENSMAMG00000022711 #30 urahb (ENSMAMG00000022710) #31 ENSMAMG00000025621 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Climbing perch MODERN SPECIES 19 slc13a1 (ENSATEG00000009372) CADPS2 (ENSATEG00000009437) fezf1 (ENSATEG00000009565) aass (ENSATEG00000009598) #7 PTPRZ1 (ENSATEG00000009734) #8 ENSATEG00000009981 ENSATEG00000009999 ENSATEG00000027494 ENSATEG00000010027 ENSATEG00000010089 ENSATEG00000026154 ENSATEG00000027850 ENSATEG00000027848 ENSATEG00000010140 #9 SYT8 (ENSATEG00000010173) #20 tnni2a.1 (ENSATEG00000010223) #21 TNNI2 (ENSATEG00000010240) #23 TNNI2 (ENSATEG00000010278) #23 TNNI2 (ENSATEG00000010717) #23 ENSATEG00000010747 ENSATEG00000010769 #24 tnnt3a (ENSATEG00000010782) #25 myod1 (ENSATEG00000010852) ##26 zgc:172145 (ENSATEG00000010861) #27 ENSATEG00000010873 #28 ENSATEG00000026163 #29 ENSATEG00000027583 #28 ENSATEG00000011010 #30 urahb (ENSATEG00000027908) #31 ENSATEG00000011076 GLG1 (ENSATEG00000011236) #32 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 17 BET1L (ENSBSLG00000026450) #13 deaf1 (ENSBSLG00000026455) #14 drd4a (ENSBSLG00000026458) #15 ENSBSLG00000026461 GRAMD4 (ENSBSLG00000026476) ENSBSLG00000026499 CERK (ENSBSLG00000026507) TAFA5 (ENSBSLG00000026512) brd1b (ENSBSLG00000026513) ftsj1 (ENSBSLG00000026514) ENSBSLG00000003773 ENSBSLG00000003875 ENSBSLG00000003923 ENSBSLG00000004129 ENSBSLG00000004149 tnni2a.1 (ENSBSLG00000004158) #21 tnni2a.2 (ENSBSLG00000004174) #22 TNNI2 (ENSBSLG00000004185) #23 ENSBSLG00000004198 #23 TNNI2 (ENSBSLG00000004211) #23 ENSBSLG00000004751 #23 ENSBSLG00000004764 ENSBSLG00000004780 #24 ENSBSLG00000004819 tnnt3a (ENSBSLG00000004850) #25 myod1 (ENSBSLG00000004886) ##26 CACNA2D4 (ENSBSLG00000005093) #28 ENSBSLG00000005855 #29 ENSBSLG00000005902 #30 urahb (ENSBSLG00000005954) #31 ENSBSLG00000006449 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.f ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Seriola ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000154617.B.d ENSGT00940000167703 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000156482.c ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a.h ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00390000009456 ENSGT00420000029847 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Greater amberjack MODERN SPECIES 160 ENSSDUG00000000249 znf277 (ENSSDUG00000000239) LRRN3 (ENSSDUG00000000228) immp2l (ENSSDUG00000000205) amfra (ENSSDUG00000000125) pdcd2l (ENSSDUG00000000081) ENSSDUG00000017439 DUS2 (ENSSDUG00000017399) SLC7A10 (ENSSDUG00000017375) faap24 (ENSSDUG00000017353) ENSSDUG00000017304 dldh (ENSSDUG00000017239) #9 SYT8 (ENSSDUG00000017190) #20 ENSSDUG00000017175 ENSSDUG00000017137 tnni2a.1 (ENSSDUG00000017118) #21 tnni2a.2 (ENSSDUG00000017108) #22 ENSSDUG00000017101 TNNI2 (ENSSDUG00000017087) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017072) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017051) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017036) #23 ENSSDUG00000016991 ENSSDUG00000016965 ENSSDUG00000016941 tnnt3a (ENSSDUG00000016913) #25 myod1 (ENSSDUG00000016886) ##26 zgc:172145 (ENSSDUG00000016873) #27 ENSSDUG00000016853 #29 CACNA2D4 (ENSSDUG00000016797) #28 ENSSDUG00000016707 #30 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2635 ENSSLDG00000010199 TNNI2 (ENSSLDG00000010145) #21 tnni2a.2 (ENSSLDG00000010121) #22 ENSSLDG00000010097 ENSSLDG00000010087 ENSSLDG00000010065 Barramundi perch MODERN SPECIES 31 IQUB (ENSLCAG00010000189) ENSLCAG00010013451 slc13a1 (ENSLCAG00010013405) CADPS2 (ENSLCAG00010013231) fezf1 (ENSLCAG00010013213) aass (ENSLCAG00010013014) #7 PTPRZ1 (ENSLCAG00010012605) #8 ENSLCAG00010012479 ENSLCAG00010012477 ENSLCAG00010012473 dldh (ENSLCAG00010012352) #9 SYT8 (ENSLCAG00010012305) #20 ENSLCAG00010012295 tnni2a.2 (ENSLCAG00010012290) #22 TNNI2 (ENSLCAG00010012275) #23 TNNI2 (ENSLCAG00010012249) #21 TNNI2 (ENSLCAG00010012232) #23 ENSLCAG00010012229 ENSLCAG00010012227 #24 ENSLCAG00010012223 tnnt3a (ENSLCAG00010012221) #25 myod1 (ENSLCAG00010012215) ##26 zgc:172145 (ENSLCAG00010012212) #27 CACNA2D4 (ENSLCAG00010012209) #28 LRTM2 (ENSLCAG00010012207) #29 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Turbot MODERN SPECIES 1 hyal6 (ENSSMAG00000002043) wasla (ENSSMAG00000002064) lmod2a (ENSSMAG00000002140) ASB15 (ENSSMAG00000002167) ASB15 (ENSSMAG00000002199) IQUB (ENSSMAG00000002231) slc13a1 (ENSSMAG00000002260) ENSSMAG00000002312 CADPS2 (ENSSMAG00000020348) fezf1 (ENSSMAG00000025856) aass (ENSSMAG00000020423) #7 PTPRZ1 (ENSSMAG00000020456) #8 ENSSMAG00000021503 ENSSMAG00000005976 #9 SYT8 (ENSSMAG00000006038) #20 tnni2a.1 (ENSSMAG00000032761) #21 tnni2a.2 (ENSSMAG00000006098) #22 TNNI2 (ENSSMAG00000006177) #23 TNNI2 (ENSSMAG00000006211) #23 ENSSMAG00000006237 ENSSMAG00000006257 #24 tnnt3a (ENSSMAG00000006288) #25 ENSSMAG00000023239 ENSSMAG00000028689 ENSSMAG00000032749 ENSSMAG00000022264 ENSSMAG00000030166 ENSSMAG00000036791 ENSSMAG00000023873 smpd3 (ENSSMAG00000002332) ENSSMAG00000002348 Tongue sole DUPLICATION Tongue sole MODERN SPECIES 193 ENSCSEG00000006876 #21 Tongue sole MODERN SPECIES 16 OAZ2 (ENSCSEG00000001923) ppib (ENSCSEG00000001927) adpgk (ENSCSEG00000001935) ENSCSEG00000001946 exoc3l1 (ENSCSEG00000001976) ENSCSEG00000001985 KIF21A (ENSCSEG00000001988) ENSCSEG00000002001 ANO1 (ENSCSEG00000002014) ENSCSEG00000002069 ENSCSEG00000002072 smpd3 (ENSCSEG00000002076) ENSCSEG00000002089 septin15 (ENSCSEG00000002096) ENSCSEG00000002121 tnni2a.1 (ENSCSEG00000002133) #21 tnni2a.2 (ENSCSEG00000002138) #22 TNNI2 (ENSCSEG00000002145) #23 TNNI2 (ENSCSEG00000002164) #23 TNNI2 (ENSCSEG00000002169) #23 ENSCSEG00000002173 ENSCSEG00000002176 ENSCSEG00000002189 #24 ENSCSEG00000002191 tnnt3a (ENSCSEG00000002198) #25 myod1 (ENSCSEG00000002233) ##26 zgc:172145 (ENSCSEG00000002238) #27 CACNA2D4 (ENSCSEG00000002252) #28 LRTM2 (ENSCSEG00000002266) #29 PEAK1 (ENSCSEG00000002269) syt12 (ENSCSEG00000002273) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Tetraodon MODERN SPECIES 4 ENSTNIG00000000465 ANKRD27 (ENSTNIG00000010417) TMED6 (ENSTNIG00000010418) MLKL (ENSTNIG00000010419) #34 RFWD3 (ENSTNIG00000010420) #33 ENSTNIG00000010421 #32 ENSTNIG00000018798 #32 ENSTNIG00000000428 ENSTNIG00000004682 #30 CACNA2D4 (ENSTNIG00000004494) #28 LRTM2 (ENSTNIG00000004493) #29 SLC7A10 (ENSTNIG00000004495) dldh (ENSTNIG00000004496) #9 ENSTNIG00000004497 #20 ENSTNIG00000002815 #20 tnni2a.1 (ENSTNIG00000002814) #21 tnni2a.2 (ENSTNIG00000002813) #22 ENSTNIG00000002812 #23 ENSTNIG00000001405 #23 TNNI2 (ENSTNIG00000002811) #23 ENSTNIG00000002810 #23 ENSTNIG00000000204 #24 tnnt3a (ENSTNIG00000002809) #25 myod1 (ENSTNIG00000002808) ##26 DUS2 (ENSTNIG00000005616) Fugu MODERN SPECIES 21 spon1b (ENSTRUG00000031973) ENSTRUG00000030903 ENSTRUG00000026214 ##17 ENSTRUG00000028935 ENSTRUG00000031663 ENSTRUG00000032661 ccnd2a (ENSTRUG00000001816) ENSTRUG00000032400 ENSTRUG00000028185 DUS2 (ENSTRUG00000022441) SLC7A10 (ENSTRUG00000033356) ENSTRUG00000032988 dldh (ENSTRUG00000016659) #9 SYT8 (ENSTRUG00000016657) #20 ENSTRUG00000027114 tnni2a.1 (ENSTRUG00000022759) #21 tnni2a.2 (ENSTRUG00000016644) #22 ENSTRUG00000016632 #23 ENSTRUG00000033030 #23 ENSTRUG00000027588 #23 ENSTRUG00000027670 ENSTRUG00000030147 #24 tnnt3a (ENSTRUG00000016614) #25 myod1 (ENSTRUG00000016609) ##26 LRTM2 (ENSTRUG00000029534) #29 ENSTRUG00000016565 #30 urahb (ENSTRUG00000021342) #31 ENSTRUG00000030677 GLG1 (ENSTRUG00000016546) #32 RFWD3 (ENSTRUG00000016541) #33 TMED6 (ENSTRUG00000016539) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Ballan wrasse MODERN SPECIES 74 wasla (ENSLBEG00000003825) lmod2a (ENSLBEG00000003853) ASB15 (ENSLBEG00000003875) ASB15 (ENSLBEG00000003921) IQUB (ENSLBEG00000003961) slc13a1 (ENSLBEG00000004005) CADPS2 (ENSLBEG00000004036) fezf1 (ENSLBEG00000004119) aass (ENSLBEG00000004152) #7 ENSLBEG00000004277 #8 ENSLBEG00000004441 #8 ENSLBEG00000004466 dldh (ENSLBEG00000004489) #9 SYT8 (ENSLBEG00000004542) #20 ENSLBEG00000004567 tnni2a.1 (ENSLBEG00000004589) #21 tnni2a.2 (ENSLBEG00000004628) #22 TNNI2 (ENSLBEG00000004663) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004685) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004709) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004734) #23 ENSLBEG00000004756 ENSLBEG00000004792 #24 tnnt3a (ENSLBEG00000004820) #25 myod1 (ENSLBEG00000004859) ##26 zgc:172145 (ENSLBEG00000004893) #27 CACNA2D4 (ENSLBEG00000004912) #28 LRTM2 (ENSLBEG00000004951) #29 ENSLBEG00000004962 #28 ENSLBEG00000004986 #30 urahb (ENSLBEG00000005026) #31 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 161 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 European seabass MODERN SPECIES 19 ENSDLAG00005012875 ENSDLAG00005032060 ENSDLAG00005033208 SLC10A7 (ENSDLAG00005015389) ENSDLAG00005015413 ENSDLAG00005027879 ENSDLAG00005018653 ENSDLAG00005003124 ENSDLAG00005027593 ENSDLAG00005016966 ENSDLAG00005026858 ENSDLAG00005014942 ENSDLAG00005030743 ENSDLAG00005031818 #9 ENSDLAG00005018756 tnni2a.1 (ENSDLAG00005018746) #21 tnni2a.2 (ENSDLAG00005032524) #22 TNNI2 (ENSDLAG00005029433) #23 TNNI2 (ENSDLAG00005018667) #23 ENSDLAG00005018661 ENSDLAG00005018639 ENSDLAG00005032620 #24 tnnt3a (ENSDLAG00005018610) #25 myod1 (ENSDLAG00005018589) ##26 zgc:172145 (ENSDLAG00005018584) #27 ENSDLAG00005018579 #29 ENSDLAG00005017494 #30 ENSDLAG00005017692 #28 ENSDLAG00005034798 ENSDLAG00005017462 GLG1 (ENSDLAG00005015126) #32 Large yellow croaker MODERN SPECIES 492 hyal6 (ENSLCRG00005001078) wasla (ENSLCRG00005022134) lmod2a (ENSLCRG00005022129) ASB15 (ENSLCRG00005022127) ASB15 (ENSLCRG00005022123) IQUB (ENSLCRG00005022117) slc13a1 (ENSLCRG00005022115) CADPS2 (ENSLCRG00005020853) fezf1 (ENSLCRG00005020826) aass (ENSLCRG00005020281) #7 ENSLCRG00005020261 dldh (ENSLCRG00005020243) #9 SYT8 (ENSLCRG00005020234) #20 tnni2a.2 (ENSLCRG00005020228) #22 tnni2a.4 (ENSLCRG00005020224) #23 TNNI2 (ENSLCRG00005020221) #21 ENSLCRG00005020217 ENSLCRG00005020216 ENSLCRG00005020214 #24 tnnt3a (ENSLCRG00005020211) #25 myod1 (ENSLCRG00005020205) ##26 zgc:172145 (ENSLCRG00005020203) #27 LRTM2 (ENSLCRG00005020201) #29 CACNA2D4 (ENSLCRG00005020194) #28 ENSLCRG00005020191 #30 urahb (ENSLCRG00005020189) #31 ENSLCRG00005020187 GLG1 (ENSLCRG00005019420) #32 RFWD3 (ENSLCRG00005019395) #33 MLKL (ENSLCRG00005019391) #34 ENSLCRG00005019390 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000164138 ENSGT00940000157859.a.b ENSGT01030000234534.B.a.b.a.a ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 Channel bull blenny MODERN SPECIES 20 ENSCGOG00000009995 znf277 (ENSCGOG00000009736) LRRN3 (ENSCGOG00000009712) immp2l (ENSCGOG00000009694) ENSCGOG00000009688 ENSCGOG00000009676 pdcd2l (ENSCGOG00000009673) ENSCGOG00000009670 ENSCGOG00000009667 DUS2 (ENSCGOG00000009109) ENSCGOG00000009096 ENSCGOG00000009092 dldh (ENSCGOG00000008107) #9 ENSCGOG00000008073 SLC7A10 (ENSCGOG00000007383) tnni2a.1 (ENSCGOG00000007358) #21 ENSCGOG00000007345 tnni2a.2 (ENSCGOG00000007341) #22 TNNI2 (ENSCGOG00000007334) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007324) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007317) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007312) #23 ENSCGOG00000007305 #24 ENSCGOG00000007292 zgc:172145 (ENSCGOG00000007280) #27 tnnt3a (ENSCGOG00000007130) #25 myod1 (ENSCGOG00000007087) ##26 zgc:172145 (ENSCGOG00000007083) #27 ENSCGOG00000007080 LRTM2 (ENSCGOG00000007053) #29 CACNA2D4 (ENSCGOG00000007039) #28 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000164099.a.b ENSGT00940000155465.j ENSGT00940000164138 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.a ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Lumpfish MODERN SPECIES 21 ENSCLMG00005006172 spg11 (ENSCLMG00005006174) znf277 (ENSCLMG00005006884) immp2l (ENSCLMG00005007053) ENSCLMG00005007055 LRRN3 (ENSCLMG00005007057) pdcd2l (ENSCLMG00005007059) ENSCLMG00005007061 ENSCLMG00005007072 SLC7A10 (ENSCLMG00005007309) ENSCLMG00005007357 ENSCLMG00005007358 dldh (ENSCLMG00005007366) #9 SYT8 (ENSCLMG00005007385) #20 ENSCLMG00005007387 tnni2a.1 (ENSCLMG00005007388) #21 tnni2a.2 (ENSCLMG00005007389) #22 TNNI2 (ENSCLMG00005007390) #23 ENSCLMG00005007391 ENSCLMG00005007392 ENSCLMG00005007394 #23 ENSCLMG00005007396 #23 TNNI2 (ENSCLMG00005007397) #23 ENSCLMG00005007399 #24 tnnt3a (ENSCLMG00005007403) #25 myod1 (ENSCLMG00005007406) ##26 CACNA2D4 (ENSCLMG00005007412) #28 ENSCLMG00005007700 LRTM2 (ENSCLMG00005007704) #29 ENSCLMG00005007712 #30 urahb (ENSCLMG00005007724) #31 Stickleback MODERN SPECIES 14 ENSGACG00000008022 ENSGACG00000008030 ENSGACG00000008044 ENSGACG00000008049 ciao2a (ENSGACG00000008052) spg11 (ENSGACG00000008057) znf277 (ENSGACG00000008086) immp2l (ENSGACG00000008130) ENSGACG00000008150 ENSGACG00000008152 ENSGACG00000008153 DUS2 (ENSGACG00000008159) SLC7A10 (ENSGACG00000008186) dldh (ENSGACG00000008240) #9 SYT8 (ENSGACG00000008302) #20 tnni2a.1 (ENSGACG00000008315) #21 tnni2a.2 (ENSGACG00000008321) #22 TNNI2 (ENSGACG00000008333) #23 TNNI2 (ENSGACG00000008349) #23 LSP1 (ENSGACG00000008376) tnnt3a (ENSGACG00000008384) #25 myod1 (ENSGACG00000008444) ##26 ENSGACG00000008450 CACNA2D4 (ENSGACG00000008453) #28 ENSGACG00000008489 #29 ENSGACG00000008494 #30 urahb (ENSGACG00000008507) #31 ENSGACG00000008512 GLG1 (ENSGACG00000008520) #32 RFWD3 (ENSGACG00000008531) #33 MLKL (ENSGACG00000008536) #34 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Clown anemonefish MODERN SPECIES 751 aass (ENSAOCG00000017468) #7 PTPRZ1 (ENSAOCG00000017569) #8 dldh (ENSAOCG00000002339) #9 ENSAOCG00000002665 #20 tnni2a.1 (ENSAOCG00000017857) #21 tnni2a.2 (ENSAOCG00000017871) #22 TNNI2 (ENSAOCG00000017888) #23 ENSAOCG00000002393 #23 TNNI2 (ENSAOCG00000017932) #23 TNNI2 (ENSAOCG00000017959) #23 Orange clownfish MODERN SPECIES 18 wasla (ENSAPEG00000017207) ENSAPEG00000017189 ENSAPEG00000017179 ASB15 (ENSAPEG00000017102) IQUB (ENSAPEG00000016998) slc13a1 (ENSAPEG00000016967) ENSAPEG00000016930 CADPS2 (ENSAPEG00000016782) fezf1 (ENSAPEG00000016744) aass (ENSAPEG00000016653) #7 ENSAPEG00000016522 #8 ENSAPEG00000016488 #8 dldh (ENSAPEG00000016431) #9 SYT8 (ENSAPEG00000016419) #20 ENSAPEG00000016387 tnni2a.1 (ENSAPEG00000016379) #21 tnni2a.2 (ENSAPEG00000016369) #22 TNNI2 (ENSAPEG00000016355) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016331) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016303) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016276) #23 ENSAPEG00000016264 ENSAPEG00000016255 #24 ENSAPEG00000016238 myod1 (ENSAPEG00000016219) ##26 tnnt3a (ENSAPEG00000016176) #25 ENSAPEG00000016163 #27 LRTM2 (ENSAPEG00000016139) #29 CACNA2D4 (ENSAPEG00000015687) #28 ENSAPEG00000015651 #30 urahb (ENSAPEG00000015634) #31 Spiny chromis MODERN SPECIES 1278 tnni2a.1 (ENSAPOG00000010015) #21 ENSAPOG00000010022 tnni2a.2 (ENSAPOG00000010244) #22 TNNI2 (ENSAPOG00000010262) #23 ENSAPOG00000010281 #23 TNNI2 (ENSAPOG00000010314) #23 TNNI2 (ENSAPOG00000010340) #23 tmem106bb (ENSAPOG00000010349) arl4ab (ENSAPOG00000010415) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 478 dldh (ENSSPAG00000007152) #9 SYT8 (ENSSPAG00000007134) #20 ENSSPAG00000007118 tnni2a.1 (ENSSPAG00000007097) #21 tnni2a.2 (ENSSPAG00000007090) #22 ENSSPAG00000007079 #23 ENSSPAG00000007073 #23 ENSSPAG00000007042 #23 TNNI2 (ENSSPAG00000007029) #23 ENSSPAG00000007019 ENSSPAG00000007014 #24 tnnt3a (ENSSPAG00000006984) #25 myod1 (ENSSPAG00000006959) ##26 ENSSPAG00000006936 ENSSPAG00000006900 #29 CACNA2D4 (ENSSPAG00000005360) #28 ENSSPAG00000005219 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000157543 ENSGT00390000012498 ENSGT00940000158087 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157543 ENSGT00390000012498 ENSGT00940000158087 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000157543 ENSGT00390000012498 ENSGT00940000158087 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000158087 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1105 dldh (ENSHBUG00000010870) #9 SYT8 (ENSHBUG00000010808) #20 tnni2a.1 (ENSHBUG00000010797) #21 tnni2a.2 (ENSHBUG00000010773) #22 TNNI2 (ENSHBUG00000010751) #23 ENSHBUG00000010740 #23 TNNI2 (ENSHBUG00000010717) #23 ENSHBUG00000010706 #23 ENSHBUG00000010695 ENSHBUG00000010683 #24 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000158087 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000158087 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1110 plcg2 (ENSMZEG00005000123) CMIP (ENSMZEG00005016284) GAN (ENSMZEG00005016250) ENSMZEG00005016243 foxl1 (ENSMZEG00005016238) kiaa0513 (ENSMZEG00005016224) slc13a1 (ENSMZEG00005016213) ENSMZEG00005016206 slc13a1 (ENSMZEG00005016201) ces3 (ENSMZEG00005016193) zfpm1 (ENSMZEG00005016182) ENSMZEG00005016163 dldh (ENSMZEG00005016147) #9 SYT8 (ENSMZEG00005016137) #20 ENSMZEG00005016129 tnni2a.1 (ENSMZEG00005016126) #21 tnni2a.2 (ENSMZEG00005016116) #22 TNNI2 (ENSMZEG00005016110) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016101) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016090) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016082) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016076) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016067) #23 ENSMZEG00005016060 ENSMZEG00005016057 ENSMZEG00005016053 ENSMZEG00005016049 #24 tnnt3a (ENSMZEG00005016043) #25 myod1 (ENSMZEG00005016037) ##26 LRTM2 (ENSMZEG00005016031) #29 CACNA2D4 (ENSMZEG00005016019) #28 Eastern happy MODERN SPECIES 19 GAN (ENSACLG00000000819) ENSACLG00000000869 foxl1 (ENSACLG00000000884) kiaa0513 (ENSACLG00000000993) slc13a1 (ENSACLG00000001095) ENSACLG00000001131 ENSACLG00000001165 ENSACLG00000001172 ENSACLG00000001179 ces3 (ENSACLG00000001188) zfpm1 (ENSACLG00000001201) ENSACLG00000001259 dldh (ENSACLG00000001270) #9 SYT8 (ENSACLG00000001358) #20 ENSACLG00000001500 tnni2a.1 (ENSACLG00000001530) #21 ENSACLG00000001555 ENSACLG00000001563 tnni2a.2 (ENSACLG00000001585) #22 TNNI2 (ENSACLG00000001597) #23 ENSACLG00000001643 #23 TNNI2 (ENSACLG00000001689) #23 TNNI2 (ENSACLG00000001715) #23 ENSACLG00000001721 #24 tnnt3a (ENSACLG00000001727) #25 myod1 (ENSACLG00000001809) ##26 CACNA2D4 (ENSACLG00000002230) #28 LRTM2 (ENSACLG00000002286) #29 ENSACLG00000002295 #28 ENSACLG00000002306 #30 urahb (ENSACLG00000002381) #31 P. nyererei MODERN SPECIES 524 dldh (ENSPNYG00000019274) #9 SYT8 (ENSPNYG00000019335) #20 ENSPNYG00000019407 tnni2a.1 (ENSPNYG00000019446) #21 tnni2a.2 (ENSPNYG00000019708) #22 TNNI2 (ENSPNYG00000019723) #23 ENSPNYG00000019743 #23 TNNI2 (ENSPNYG00000019768) #23 TNNI2 (ENSPNYG00000019789) #23 ENSPNYG00000019796 tnnt3a (ENSPNYG00000019816) #25 myod1 (ENSPNYG00000019881) ##26 CACNA2D4 (ENSPNYG00000019913) #28 LRTM2 (ENSPNYG00000019981) #29 ENSPNYG00000020007 #30 urahb (ENSPNYG00000020098) #31 ENSPNYG00000020106 GLG1 (ENSPNYG00000020129) #32 RFWD3 (ENSPNYG00000020232) #33 Nile tilapia MODERN SPECIES 19 CMIP (ENSONIG00000010739) GAN (ENSONIG00000010745) foxl1 (ENSONIG00000030034) kiaa0513 (ENSONIG00000010750) slc13a1 (ENSONIG00000010754) ENSONIG00000041520 ENSONIG00000034024 ENSONIG00000010760 zfpm1 (ENSONIG00000035110) ENSONIG00000010767 ENSONIG00000030669 ENSONIG00000028992 dldh (ENSONIG00000010769) #9 SYT8 (ENSONIG00000041185) #20 ENSONIG00000029220 tnni2a.1 (ENSONIG00000010776) #21 tnni2a.4 (ENSONIG00000010787) #23 ENSONIG00000010790 ENSONIG00000033565 #24 ENSONIG00000028193 tnnt3a (ENSONIG00000010794) #25 myod1 (ENSONIG00000010796) ##26 ENSONIG00000031210 CACNA2D4 (ENSONIG00000010799) #28 LRTM2 (ENSONIG00000010803) #29 ENSONIG00000010804 #30 ENSONIG00000037724 urahb (ENSONIG00000039662) #31 ENSONIG00000038642 ENSONIG00000042116 GLG1 (ENSONIG00000010813) #32 Midas cichlid MODERN SPECIES 258 ENSACIG00000015641 ENSACIG00000015530 frs2b (ENSACIG00000015503) nup160 (ENSACIG00000015433) slc13a1 (ENSACIG00000015361) ces3 (ENSACIG00000015245) ENSACIG00000015232 zfpm1 (ENSACIG00000015211) ENSACIG00000015203 ENSACIG00000015187 ENSACIG00000015131 ENSACIG00000015126 dldh (ENSACIG00000015096) #9 SYT8 (ENSACIG00000015081) #20 ENSACIG00000015057 tnni2a.1 (ENSACIG00000015042) #21 tnni2a.2 (ENSACIG00000014981) #22 TNNI2 (ENSACIG00000014860) #23 TNNI2 (ENSACIG00000014837) #23 TNNI2 (ENSACIG00000014818) #23 ENSACIG00000014805 #23 ENSACIG00000014797 ENSACIG00000014781 tnnt3a (ENSACIG00000014612) #25 myod1 (ENSACIG00000014400) ##26 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 340 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 700 ENSKMAG00000003293 #20 ENSKMAG00000003282 ENSKMAG00000003254 #21 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1623 ENSNFUG00015004909 dldh (ENSNFUG00015004817) #9 ENSNFUG00015004770 ENSNFUG00015017402 PTPRZ1 (ENSNFUG00015017375) #8 ENSNFUG00015017364 AASS (ENSNFUG00015016246) #7 fezf1 (ENSNFUG00015016152) ENSNFUG00015016148 ENSNFUG00015016146 CADPS2 (ENSNFUG00015013246) slc13a1 (ENSNFUG00015012971) IQUB (ENSNFUG00015012926) ASB15 (ENSNFUG00015012906) ENSNFUG00015012893 tnni2a.1 (ENSNFUG00015012880) #21 TNNI2 (ENSNFUG00015012847) #23 BX004812.1 (ENSNFUG00015012831) ENSNFUG00015012822 #24 TNNT3A (ENSNFUG00015012775) #25 ENSNFUG00015012762 ANO1 (ENSNFUG00015011844) ENSNFUG00015011772 ENSNFUG00015011757 ENSNFUG00015011747 ENSNFUG00015011739 ripor1 (ENSNFUG00015011725) ctcf (ENSNFUG00015011705) ENSNFUG00015011697 carmil2 (ENSNFUG00015011647) RIC8A (ENSNFUG00015011583) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000159477 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00940000161262.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00390000010852 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012715.e ENSGT00390000016075 ENSGT00940000156476.h ENSGT00940000159477 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00940000161262.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00390000010852 Indian medaka MODERN SPECIES 15 ENSOMEG00000019701 tnni2a.1 (ENSOMEG00000019735) #21 tnni2a.2 (ENSOMEG00000019778) #22 TNNI2 (ENSOMEG00000019805) #23 TNNI2 (ENSOMEG00000019856) #23 ENSOMEG00000019864 #24 ENSOMEG00000019976 tnnt3a (ENSOMEG00000020063) #25 myod1 (ENSOMEG00000020091) ##26 CACNA2D4 (ENSOMEG00000000936) #28 ENSOMEG00000020139 #29 ENSOMEG00000020159 #28 RFWD3 (ENSOMEG00000020218) #33 GLG1 (ENSOMEG00000020401) #32 ENSOMEG00000020438 urahb (ENSOMEG00000020448) #31 ENSOMEG00000020489 #30 Javanese ricefish MODERN SPECIES 20 ENSOJAG00000006245 mpi (ENSOJAG00000006219) scamp2 (ENSOJAG00000006200) fezf1 (ENSOJAG00000006167) slc13a1 (ENSOJAG00000005938) IQUB (ENSOJAG00000005813) hyal6 (ENSOJAG00000005777) HYAL4 (ENSOJAG00000005762) ENSOJAG00000005647 GPR37 (ENSOJAG00000005638) pot1 (ENSOJAG00000005624) grm8b (ENSOJAG00000004853) CHST1 (ENSOJAG00000004747) dldh (ENSOJAG00000003976) #9 SYT8 (ENSOJAG00000003818) #20 tnni2a.1 (ENSOJAG00000003772) #21 TNNI2 (ENSOJAG00000003725) #23 TNNI2 (ENSOJAG00000003627) #23 ENSOJAG00000003599 ENSOJAG00000003563 #24 ENSOJAG00000003546 tnnt3a (ENSOJAG00000003454) #25 myod1 (ENSOJAG00000003402) ##26 ENSOJAG00000003382 #29 RFWD3 (ENSOJAG00000003173) #33 GLG1 (ENSOJAG00000002985) #32 ENSOJAG00000002895 urahb (ENSOJAG00000002909) #31 ENSOJAG00000002852 #30 znf277 (ENSOJAG00000002400) DUS2 (ENSOJAG00000002235) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT01030000234858 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000161262.b ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00390000018285 ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00390000010852 Chinese medaka MODERN SPECIES 142 CHST1 (ENSOSIG00000010778) ENSOSIG00000010779 #20 ENSOSIG00000010781 tnni2a.1 (ENSOSIG00000010784) #21 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 20 herpud1 (ENSORLG00000000388) slc12a3 (ENSORLG00000000412) ENSORLG00000000419 ENSORLG00000024966 ENSORLG00000024504 ENSORLG00000000450 #20 dldh (ENSORLG00000000461) #9 ENSORLG00000025976 grm8b (ENSORLG00000000478) pot1 (ENSORLG00000000493) GPR37 (ENSORLG00000027795) ENSORLG00000000501 HYAL4 (ENSORLG00000000515) hyal6 (ENSORLG00000000524) ENSORLG00000000533 tnni2a.1 (ENSORLG00000000545) #21 tnni2a.2 (ENSORLG00000024626) #22 TNNI2 (ENSORLG00000000559) #23 TNNI2 (ENSORLG00000000591) #23 ENSORLG00000024559 ENSORLG00000000599 ENSORLG00000025446 #24 tnnt3a (ENSORLG00000000678) #25 myod1 (ENSORLG00000000694) ##26 ENSORLG00000000721 #28 ENSORLG00000027522 #29 ENSORLG00000025119 RFWD3 (ENSORLG00000000737) #33 GLG1 (ENSORLG00000000767) #32 ENSORLG00000024437 ENSORLG00000000773 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 20 wasla (ENSMMDG00005013544) ENSMMDG00005013546 lmod2a (ENSMMDG00005013547) ASB15 (ENSMMDG00005004070) ASB15 (ENSMMDG00005004125) IQUB (ENSMMDG00005004156) slc13a1 (ENSMMDG00005004181) CADPS2 (ENSMMDG00005004524) fezf1 (ENSMMDG00005008356) aass (ENSMMDG00005008411) #7 PTPRZ1 (ENSMMDG00005010843) #8 dldh (ENSMMDG00005010882) #9 ENSMMDG00005010938 ENSMMDG00005010939 SYT8 (ENSMMDG00005010940) #20 tnni2a.1 (ENSMMDG00005010942) #21 tnni2a.2 (ENSMMDG00005010943) #22 ENSMMDG00005010944 #23 ENSMMDG00005010945 #23 ENSMMDG00005010946 #23 ENSMMDG00005010947 #23 TNNI2 (ENSMMDG00005010948) #23 ENSMMDG00005010949 #24 tnnt3a (ENSMMDG00005010950) #25 myod1 (ENSMMDG00005010952) ##26 zgc:172145 (ENSMMDG00005010974) #27 CACNA2D4 (ENSMMDG00005010984) #28 LRTM2 (ENSMMDG00005011155) #29 ENSMMDG00005011190 #30 urahb (ENSMMDG00005012437) #31 acot19 (ENSMMDG00005012454) Cod MODERN SPECIES 22 spam1 (ENSGMOG00000010327) HYAL4 (ENSGMOG00000010316) hyal6 (ENSGMOG00000025679) wasla (ENSGMOG00000037020) ENSGMOG00000010258 IQUB (ENSGMOG00000019307) slc13a1 (ENSGMOG00000009178) CADPS2 (ENSGMOG00000035623) fezf1 (ENSGMOG00000023584) aass (ENSGMOG00000010875) #7 ENSGMOG00000036942 PTPRZ1 (ENSGMOG00000010806) #8 ENSGMOG00000016861 #9 SYT8 (ENSGMOG00000016874) #20 ENSGMOG00000031300 tnni2a.1 (ENSGMOG00000026765) #21 ENSGMOG00000036471 #23 ENSGMOG00000034763 ENSGMOG00000027097 tnnt3a (ENSGMOG00000016942) #25 ENSGMOG00000030879 ##26 ENSGMOG00000003800 #28 ENSGMOG00000024112 #29 ENSGMOG00000003907 #30 ENSGMOG00000003566 si:ch211-59o9.10 (ENSGMOG00000037257) ENSGMOG00000027867 actr6 (ENSGMOG00000003691) ENSGMOG00000031025 ENSGMOG00000034008 ENSGMOG00000031788 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000157682.B.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ##23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1724 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00590000083094.a.b.k.b ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.e.a #7 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.a ##23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #31 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 Salmo ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.b ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b.k.a.a.b ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.f ##7 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 ENSGT00390000016453.m #34 ENSGT00940000163501 #35 ENSGT00730000111305 #36 Atlantic salmon MODERN SPECIES 15 ENSSSAG00000090692 ENSSSAG00000060765 fezf1 (ENSSSAG00000059944) aass (ENSSSAG00000056714) ##7 PTPRZ1 (ENSSSAG00000056177) #8 ENSSSAG00000055366 #9 ENSSSAG00000084730 ##10 ENSSSAG00000055331 #11 ENSSSAG00000055330 #12 deaf1 (ENSSSAG00000055310) #14 drd4a (ENSSSAG00000055298) #15 ENSSSAG00000122200 ENSSSAG00000055278 #16 ENSSSAG00000055272 #18 SYT8 (ENSSSAG00000119353) #20 tnni2a.1 (ENSSSAG00000055259) #21 ENSSSAG00000103611 TNNI2 (ENSSSAG00000055203) ##23 ENSSSAG00000055171 ENSSSAG00000055179 ENSSSAG00000100003 #24 TNNT3 (ENSSSAG00000055126) #25 myod2 (ENSSSAG00000055102) #26 ENSSSAG00000007878 zgc:172145 (ENSSSAG00000055098) #27 ENSSSAG00000092025 #29 ENSSSAG00000054630 #28 ENSSSAG00000052259 #30 ENSSSAG00000115733 GLG1 (ENSSSAG00000004048) #32 ENSSSAG00000088259 #33 River trout MODERN SPECIES 33 CADPS2 (ENSSTUG00000023122) fezf1 (ENSSTUG00000023090) aass (ENSSTUG00000019952) ##7 ENSSTUG00000019843 PTPRZ1 (ENSSTUG00000017658) #8 dldh (ENSSTUG00000017505) #9 ENSSTUG00000017492 ##10 ENSSTUG00000017480 #11 ticam1 (ENSSTUG00000017476) #12 BET1L (ENSSTUG00000017470) #13 deaf1 (ENSSTUG00000017459) #14 drd4a (ENSSTUG00000017447) #15 ENSSTUG00000017421 #16 ENSSTUG00000017149 #18 SYT8 (ENSSTUG00000017135) #20 tnni2a.1 (ENSSTUG00000017118) #21 tnni2a.2 (ENSSTUG00000017106) #22 ENSSTUG00000017036 ##23 ENSSTUG00000017023 #24 tnnt3b (ENSSTUG00000016997) #25 MYOD1 (ENSSTUG00000016988) #26 zgc:172145 (ENSSTUG00000016985) #27 ENSSTUG00000016981 LRTM2 (ENSSTUG00000016977) #29 ENSSTUG00000015707 #28 ENSSTUG00000013806 #30 urahb (ENSSTUG00000013349) #31 ENSSTUG00000013296 GLG1 (ENSSTUG00000012698) #32 RFWD3 (ENSSTUG00000012610) #33 MLKL (ENSSTUG00000012572) #34 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000013249.e.a #7 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #31 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 ENSGT00390000016453.m #34 ENSGT00940000163501 #35 ENSGT00730000111305 #36 Rainbow trout MODERN SPECIES 22 ENSOMYG00000042228 fezf1 (ENSOMYG00000042293) aass (ENSOMYG00000042455) #7 PTPRZ1 (ENSOMYG00000044183) #8 ENSOMYG00000044213 #9 ENSOMYG00000053913 ENSOMYG00000044242 #11 ENSOMYG00000051072 #12 bet1l (ENSOMYG00000071324) deaf1 (ENSOMYG00000044258) #14 drd4a (ENSOMYG00000044265) #15 ENSOMYG00000044274 #16 ENSOMYG00000044289 #18 ENSOMYG00000070342 SYT8 (ENSOMYG00000044334) #20 tnni2a.1 (ENSOMYG00000044342) #21 ENSOMYG00000051621 #22 ENSOMYG00000054158 ENSOMYG00000044366 #24 TNNT3 (ENSOMYG00000044367) #25 myod2 (ENSOMYG00000044372) #26 zgc:172145 (ENSOMYG00000068802) #27 ENSOMYG00000064959 ENSOMYG00000044396 #28 ENSOMYG00000054081 #29 ENSOMYG00000044518 #30 urahb (ENSOMYG00000045245) #31 ENSOMYG00000069462 ENSOMYG00000073315 GLG1 (ENSOMYG00000045338) #32 ENSOMYG00000045422 #33 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000013249.e.a #7 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #31 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 ENSGT00390000016453.m #34 ENSGT00940000163501 #35 ENSGT00730000111305 #36 Coho salmon MODERN SPECIES 1 fezf1 (ENSOKIG00005028474) aass (ENSOKIG00005028706) #7 PTPRZ1 (ENSOKIG00005031860) #8 DLD (ENSOKIG00005032474) #9 ENSOKIG00005032722 #10 ENSOKIG00005032730 #11 ticam1 (ENSOKIG00005032764) #12 BET1L (ENSOKIG00005032895) #13 deaf1 (ENSOKIG00005032919) #14 drd4a (ENSOKIG00005032941) #15 ENSOKIG00005032958 #16 ENSOKIG00005032986 #17 ENSOKIG00005032992 #18 ENSOKIG00005033002 #19 SYT8 (ENSOKIG00005033015) #20 tnni2a.1 (ENSOKIG00005033031) #21 tnni2a.2 (ENSOKIG00005033122) #22 ENSOKIG00005033145 #23 ENSOKIG00005033174 #24 tnnt3b (ENSOKIG00005033212) #25 MYOD1 (ENSOKIG00005033239) #26 zgc:172145 (ENSOKIG00005033256) #27 CACNA2D4 (ENSOKIG00005033316) #28 LRTM2 (ENSOKIG00005034035) #29 ENSOKIG00005034065 #30 urahb (ENSOKIG00005034114) #31 GLG1 (ENSOKIG00005034363) #32 RFWD3 (ENSOKIG00005038361) #33 MLKL (ENSOKIG00005038521) #34 etfbkmt (ENSOKIG00005038535) #35 amn1 (ENSOKIG00005038546) #36 Huchen MODERN SPECIES 889 ENSHHUG00000028029 #16 ENSHHUG00000027755 #18 SYT8 (ENSHHUG00000027747) #20 ENSHHUG00000027744 tnni2a.1 (ENSHHUG00000027733) #21 tnni2a.2 (ENSHHUG00000027724) #22 TNNI2 (ENSHHUG00000027633) #23 TNNI2 (ENSHHUG00000027573) ##23 ENSHHUG00000027566 ENSHHUG00000027560 TNNT3 (ENSHHUG00000027549) #25 MYOD1 (ENSHHUG00000027540) #26 CACNA2D4 (ENSHHUG00000027532) #28 LRTM2 (ENSHHUG00000027521) #29 ENSHHUG00000027515 #28 ENSHHUG00000027513 #28 ENSHHUG00000027507 #30 urahb (ENSHHUG00000027499) #31 GLG1 (ENSHHUG00000027478) #32 RFWD3 (ENSHHUG00000027472) #33 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 519 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.b ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.a ##34 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01020000230364.a.a.b.b.f ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.a ##34 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01020000230364.a.a.b.b.f ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.a ##34 Coho salmon MODERN SPECIES 14 WASL (ENSOKIG00005032174) ENSOKIG00005032154 lmod2a (ENSOKIG00005032140) ENSOKIG00005032117 IQUB (ENSOKIG00005032040) CADPS2 (ENSOKIG00005031265) fezf1 (ENSOKIG00005031170) ENSOKIG00005031137 PTPRZ1 (ENSOKIG00005028335) ##8 ENSOKIG00005028191 dldh (ENSOKIG00005027454) ##9 ENSOKIG00005027375 ##11 drd4a (ENSOKIG00005027194) ##15 ENSOKIG00005027164 SYT8 (ENSOKIG00005027132) ##20 tnni2a.1 (ENSOKIG00005027100) ##23 tnni2a.2 (ENSOKIG00005027046) ##23 TNNI2 (ENSOKIG00005027031) ##23 TNNI2 (ENSOKIG00005026949) ##23 ENSOKIG00005026905 ##24 ENSOKIG00005026885 TNNT3 (ENSOKIG00005026856) ##25 MYOD1 (ENSOKIG00005026839) ##26 zgc:172145 (ENSOKIG00005026835) ##27 ENSOKIG00005026827 LRTM2 (ENSOKIG00005026822) ##29 CACNA2D4 (ENSOKIG00005026408) ##28 ENSOKIG00005025848 ##30 ENSOKIG00005025795 GLG1 (ENSOKIG00005024239) ##32 RFWD3 (ENSOKIG00005024030) ##33 Chinook salmon MODERN SPECIES 10 WASL (ENSOTSG00005043093) lmod2a (ENSOTSG00005043091) ASB15 (ENSOTSG00005043087) ENSOTSG00005043085 IQUB (ENSOTSG00005043082) ENSOTSG00005043079 ENSOTSG00005043078 CADPS2 (ENSOTSG00005042929) fezf1 (ENSOTSG00005042921) PTPRZ1 (ENSOTSG00005041692) ##8 dldh (ENSOTSG00005041612) ##9 ENSOTSG00005041604 ##11 drd4a (ENSOTSG00005041579) ##15 ENSOTSG00005041577 SYT8 (ENSOTSG00005041574) ##20 tnni2a.1 (ENSOTSG00005041572) ##23 tnni2a.2 (ENSOTSG00005041571) ##23 ENSOTSG00005041570 ##23 ENSOTSG00005041568 tnnt3b (ENSOTSG00005041567) ##25 MYOD1 (ENSOTSG00005041566) ##26 zgc:172145 (ENSOTSG00005041565) ##27 LRTM2 (ENSOTSG00005041564) ##29 CACNA2D4 (ENSOTSG00005041278) ##28 ENSOTSG00005041268 ##30 ENSOTSG00005041259 GLG1 (ENSOTSG00005040997) ##32 RFWD3 (ENSOTSG00005040989) ##33 MLKL (ENSOTSG00005040987) ##34 ENSOTSG00005040986 ##34 nfybb (ENSOTSG00005040983) ##37 Rainbow trout MODERN SPECIES 11 ENSOMYG00000042922 lmod2a (ENSOMYG00000042938) ENSOMYG00000042939 IQUB (ENSOMYG00000042943) CADPS2 (ENSOMYG00000043456) fezf1 (ENSOMYG00000046419) PTPRZ1 (ENSOMYG00000046529) ##8 ENSOMYG00000062994 ENSOMYG00000072513 ENSOMYG00000046768 ##9 ENSOMYG00000046847 ENSOMYG00000059689 ##11 drd4a (ENSOMYG00000046859) ##15 ENSOMYG00000046870 SYT8 (ENSOMYG00000014086) ##20 ENSOMYG00000014110 ##23 TNNT3 (ENSOMYG00000014129) ##25 ENSOMYG00000014295 ##24 ENSOMYG00000014328 ##26 zgc:172145 (ENSOMYG00000014339) ##27 ENSOMYG00000063995 ENSOMYG00000069921 ENSOMYG00000014514 ##28 ENSOMYG00000017932 ##29 ENSOMYG00000017972 ##30 ENSOMYG00000018085 GLG1 (ENSOMYG00000018184) ##32 ENSOMYG00000072615 ##33 ENSOMYG00000049946 MLKL (ENSOMYG00000019863) ##34 ENSOMYG00000019902 ##37 Salmo ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.b ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b.a ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.a ##23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 Atlantic salmon MODERN SPECIES 1 HYAL4 (ENSSSAG00000078037) hyal6 (ENSSSAG00000078041) wasl (ENSSSAG00000078048) lmod2 (ENSSSAG00000078108) IQUB (ENSSSAG00000078117) CADPS2 (ENSSSAG00000078300) ENSSSAG00000109161 fezf1 (ENSSSAG00000080179) ptprz1 (ENSSSAG00000080236) ##8 ENSSSAG00000080505 ##9 ENSSSAG00000112377 ENSSSAG00000080540 ##11 drd4a (ENSSSAG00000080543) ##15 ENSSSAG00000080545 SYT8 (ENSSSAG00000055269) ##20 tnni2a.1 (ENSSSAG00000080550) ##23 tnni2a.2 (ENSSSAG00000080555) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000115245) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000080558) ##23 ENSSSAG00000110670 ENSSSAG00000080568 ##24 ENSSSAG00000102688 TNNT3 (ENSSSAG00000080578) ##25 myod1c (ENSSSAG00000080596) ##26 ENSSSAG00000111233 zgc:172145 (ENSSSAG00000080600) ##27 ENSSSAG00000080628 ##28 ENSSSAG00000096889 ##29 ENSSSAG00000080771 ##30 ENSSSAG00000101363 GLG1 (ENSSSAG00000067039) ##32 River trout MODERN SPECIES 37 HYAL4 (ENSSTUG00000010474) hyal6 (ENSSTUG00000010465) ENSSTUG00000010453 lmod2a (ENSSTUG00000010448) ASB15 (ENSSTUG00000010383) ENSSTUG00000010308 IQUB (ENSSTUG00000010187) CADPS2 (ENSSTUG00000010148) fezf1 (ENSSTUG00000010110) dldh (ENSSTUG00000009461) ##9 ENSSTUG00000009267 ##10 ENSSTUG00000009265 ##11 drd4a (ENSSTUG00000009260) ##15 ENSSTUG00000009255 SYT8 (ENSSTUG00000009213) ##20 tnni2a.1 (ENSSTUG00000009183) ##23 tnni2a.2 (ENSSTUG00000009174) ##23 ENSSTUG00000009167 ENSSTUG00000009062 ##23 ENSSTUG00000009047 ENSSTUG00000009021 ##24 TNNT3 (ENSSTUG00000008984) ##25 MYOD1 (ENSSTUG00000008976) ##26 zgc:172145 (ENSSTUG00000008972) ##27 ENSSTUG00000008947 ##29 CACNA2D4 (ENSSTUG00000007981) ##28 ENSSTUG00000007788 ##30 ENSSTUG00000007769 GLG1 (ENSSTUG00000007510) ##32 RFWD3 (ENSSTUG00000007387) ##33 MLKL (ENSSTUG00000007277) ##34 Huchen MODERN SPECIES 544 ENSHHUG00000000310 tnni2a.1 (ENSHHUG00000000288) ##23 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000284) ##23 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000268) ##23 TNNI2 (ENSHHUG00000000259) ##23 TNNI2 (ENSHHUG00000000165) ##23 ENSHHUG00000000161 ##24 ENSHHUG00000000144 tnnt3b (ENSHHUG00000000132) ##25 MYOD1 (ENSHHUG00000000050) ##26 zgc:172145 (ENSHHUG00000000023) ##27 LRTM2 (ENSHHUG00000050722) ##29 CACNA2D4 (ENSHHUG00000050645) ##28 ENSHHUG00000050634 ##30 ENSHHUG00000050630 GLG1 (ENSHHUG00000050506) ##32 RFWD3 (ENSHHUG00000050492) ##33 Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000161379 ENSGT00990000204217 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000165046.a ENSGT00940000161379 ENSGT00990000204217 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00390000014700.b.a.a.c ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.b #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812.a #24 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000159916.d ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b.a Asian bonytongue MODERN SPECIES 20 eif3m (ENSSFOG00015000568) prrg4 (ENSSFOG00015000619) ENSSFOG00015000627 syt9b (ENSSFOG00015000644) bbox1 (ENSSFOG00015000689) fibinb (ENSSFOG00015000695) cstpp1 (ENSSFOG00015000701) IFT140 (ENSSFOG00015000759) antkmt (ENSSFOG00015026035) ENSSFOG00015000887 ##16 ctsd (ENSSFOG00015000892) #18 ENSSFOG00015000957 SYT8 (ENSSFOG00015000963) #20 ENSSFOG00015000969 tnni2a.2 (ENSSFOG00015001029) #22 tnni2a.4 (ENSSFOG00015001189) #23 ENSSFOG00015001301 ENSSFOG00015001312 #24 TNNT3 (ENSSFOG00015001321) ##25 myod1 (ENSSFOG00015001375) ##26 zgc:172145 (ENSSFOG00015001401) #27 OTOG (ENSSFOG00015025460) ush1c (ENSSFOG00015001489) abcc8 (ENSSFOG00015001504) kcnj11 (ENSSFOG00015025143) MOB2 (ENSSFOG00015001705) dusp8a (ENSSFOG00015025183) PTPN5 (ENSSFOG00015001826) OSBPL5 (ENSSFOG00015002010) phlda2 (ENSSFOG00015002113) nap1l4b (ENSSFOG00015002142) P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 38 zgc:110339 (ENSPKIG00000003099) ENSPKIG00000003044 cox8b (ENSPKIG00000003015) psmd13 (ENSPKIG00000002977) sirt3 (ENSPKIG00000002937) ric8a (ENSPKIG00000002880) deaf1 (ENSPKIG00000002796) #14 DRD4 (ENSPKIG00000002751) #15 ENSPKIG00000002707 ctsd (ENSPKIG00000002678) #18 ENSPKIG00000002661 SYT8 (ENSPKIG00000002642) #20 TNNI2 (ENSPKIG00000002626) #23 tnni2a.2 (ENSPKIG00000002613) #22 TNNI2 (ENSPKIG00000002585) #23 TNNI2 (ENSPKIG00000002556) #23 ENSPKIG00000002535 ENSPKIG00000002526 #24 ENSPKIG00000002481 TNNT3 (ENSPKIG00000002402) ##25 MYOD1 (ENSPKIG00000002354) #26 zgc:172145 (ENSPKIG00000002339) #27 OTOG (ENSPKIG00000002227) ush1c (ENSPKIG00000002131) abcc8 (ENSPKIG00000002041) kcnj11 (ENSPKIG00000001997) MOB2 (ENSPKIG00000001948) dusp8a (ENSPKIG00000001877) PTPN5 (ENSPKIG00000001814) ENSPKIG00000001750 OSBPL5 (ENSPKIG00000001623) P. kingsleyae MODERN SPECIES 38 zgc:110339 (ENSPKIG00000003141) zgc:110339 (ENSPKIG00000003099) ENSPKIG00000003044 cox8b (ENSPKIG00000003015) psmd13 (ENSPKIG00000002977) sirt3 (ENSPKIG00000002937) ric8a (ENSPKIG00000002880) deaf1 (ENSPKIG00000002796) #14 DRD4 (ENSPKIG00000002751) #15 ENSPKIG00000002707 ctsd (ENSPKIG00000002678) #18 ENSPKIG00000002661 SYT8 (ENSPKIG00000002642) #20 TNNI2 (ENSPKIG00000002626) #23 tnni2a.2 (ENSPKIG00000002613) #22 TNNI2 (ENSPKIG00000002585) #23 TNNI2 (ENSPKIG00000002556) #23 ENSPKIG00000002535 ENSPKIG00000002526 #24 ENSPKIG00000002481 TNNT3 (ENSPKIG00000002402) ##25 MYOD1 (ENSPKIG00000002354) #26 zgc:172145 (ENSPKIG00000002339) #27 OTOG (ENSPKIG00000002227) ush1c (ENSPKIG00000002131) abcc8 (ENSPKIG00000002041) kcnj11 (ENSPKIG00000001997) MOB2 (ENSPKIG00000001948) dusp8a (ENSPKIG00000001877) PTPN5 (ENSPKIG00000001814) ENSPKIG00000001750 P. kingsleyae MODERN SPECIES 38 ENSPKIG00000003206 ENSPKIG00000003177 zgc:110339 (ENSPKIG00000003141) zgc:110339 (ENSPKIG00000003099) ENSPKIG00000003044 cox8b (ENSPKIG00000003015) psmd13 (ENSPKIG00000002977) sirt3 (ENSPKIG00000002937) ric8a (ENSPKIG00000002880) deaf1 (ENSPKIG00000002796) #14 DRD4 (ENSPKIG00000002751) #15 ENSPKIG00000002707 ctsd (ENSPKIG00000002678) #18 ENSPKIG00000002661 SYT8 (ENSPKIG00000002642) #20 TNNI2 (ENSPKIG00000002626) #23 tnni2a.2 (ENSPKIG00000002613) #22 TNNI2 (ENSPKIG00000002585) #23 TNNI2 (ENSPKIG00000002556) #23 ENSPKIG00000002535 ENSPKIG00000002526 #24 ENSPKIG00000002481 TNNT3 (ENSPKIG00000002402) ##25 MYOD1 (ENSPKIG00000002354) #26 zgc:172145 (ENSPKIG00000002339) #27 OTOG (ENSPKIG00000002227) ush1c (ENSPKIG00000002131) abcc8 (ENSPKIG00000002041) kcnj11 (ENSPKIG00000001997) MOB2 (ENSPKIG00000001948) dusp8a (ENSPKIG00000001877) P. kingsleyae MODERN SPECIES 1438 TNNI2 (ENSPKIG00000018467) #23 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 145 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000156870 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Acanthomorphata DUPLICATION Acanthomorphata DUPLICATION Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01020000231746 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Carangaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.f ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Seriola ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000156482.c ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a.h ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00390000009456 ENSGT00420000029847 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Greater amberjack MODERN SPECIES 160 immp2l (ENSSDUG00000000205) amfra (ENSSDUG00000000125) pdcd2l (ENSSDUG00000000081) ENSSDUG00000017439 DUS2 (ENSSDUG00000017399) SLC7A10 (ENSSDUG00000017375) faap24 (ENSSDUG00000017353) ENSSDUG00000017304 dldh (ENSSDUG00000017239) #9 SYT8 (ENSSDUG00000017190) #20 ENSSDUG00000017175 ENSSDUG00000017137 tnni2a.1 (ENSSDUG00000017118) #21 tnni2a.2 (ENSSDUG00000017108) #22 ENSSDUG00000017101 TNNI2 (ENSSDUG00000017087) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017072) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017051) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017036) #23 ENSSDUG00000016991 ENSSDUG00000016965 ENSSDUG00000016941 tnnt3a (ENSSDUG00000016913) #25 myod1 (ENSSDUG00000016886) ##26 zgc:172145 (ENSSDUG00000016873) #27 ENSSDUG00000016853 #29 CACNA2D4 (ENSSDUG00000016797) #28 ENSSDUG00000016707 #30 urahb (ENSSDUG00000016691) #31 ENSSDUG00000016686 GLG1 (ENSSDUG00000016609) #32 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 Turbot MODERN SPECIES 1 lmod2a (ENSSMAG00000002140) ASB15 (ENSSMAG00000002167) ASB15 (ENSSMAG00000002199) IQUB (ENSSMAG00000002231) slc13a1 (ENSSMAG00000002260) ENSSMAG00000002312 CADPS2 (ENSSMAG00000020348) fezf1 (ENSSMAG00000025856) aass (ENSSMAG00000020423) #7 PTPRZ1 (ENSSMAG00000020456) #8 ENSSMAG00000021503 ENSSMAG00000005976 #9 SYT8 (ENSSMAG00000006038) #20 tnni2a.1 (ENSSMAG00000032761) #21 tnni2a.2 (ENSSMAG00000006098) #22 TNNI2 (ENSSMAG00000006177) #23 TNNI2 (ENSSMAG00000006211) #23 ENSSMAG00000006237 ENSSMAG00000006257 #24 tnnt3a (ENSSMAG00000006288) #25 ENSSMAG00000023239 ENSSMAG00000028689 ENSSMAG00000032749 ENSSMAG00000022264 ENSSMAG00000030166 ENSSMAG00000036791 ENSSMAG00000023873 smpd3 (ENSSMAG00000002332) ENSSMAG00000002348 septin15 (ENSSMAG00000002389) ENSSMAG00000002399 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 20 aass (ENSMAMG00000022779) #7 ENSMAMG00000022774 PTPRZ1 (ENSMAMG00000027911) #8 ENSMAMG00000022767 ENSMAMG00000022758 ENSMAMG00000025915 ENSMAMG00000022762 ENSMAMG00000024786 ENSMAMG00000022760 ENSMAMG00000022756 #9 SYT8 (ENSMAMG00000026620) #20 ENSMAMG00000025933 tnni2a.1 (ENSMAMG00000022730) #21 tnni2a.2 (ENSMAMG00000022728) #22 TNNI2 (ENSMAMG00000028411) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000025267) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000022722) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000028574) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000024405) #23 ENSMAMG00000026203 ENSMAMG00000025176 tnnt3a (ENSMAMG00000022716) #25 myod1 (ENSMAMG00000025845) ##26 ENSMAMG00000022714 #29 ENSMAMG00000022713 #28 ENSMAMG00000022711 #30 urahb (ENSMAMG00000022710) #31 ENSMAMG00000025621 ENSMAMG00000022709 GLG1 (ENSMAMG00000022699) #32 ENSMAMG00000022695 #33 Zig-zag eel MODERN SPECIES 20 fezf1 (ENSMAMG00000022795) aass (ENSMAMG00000022779) #7 ENSMAMG00000022774 PTPRZ1 (ENSMAMG00000027911) #8 ENSMAMG00000022767 ENSMAMG00000022758 ENSMAMG00000025915 ENSMAMG00000022762 ENSMAMG00000024786 ENSMAMG00000022760 ENSMAMG00000022756 #9 SYT8 (ENSMAMG00000026620) #20 ENSMAMG00000025933 tnni2a.1 (ENSMAMG00000022730) #21 tnni2a.2 (ENSMAMG00000022728) #22 TNNI2 (ENSMAMG00000028411) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000025267) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000022722) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000028574) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000024405) #23 ENSMAMG00000026203 ENSMAMG00000025176 tnnt3a (ENSMAMG00000022716) #25 myod1 (ENSMAMG00000025845) ##26 ENSMAMG00000022714 #29 ENSMAMG00000022713 #28 ENSMAMG00000022711 #30 urahb (ENSMAMG00000022710) #31 ENSMAMG00000025621 ENSMAMG00000022709 GLG1 (ENSMAMG00000022699) #32 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 17 drd4a (ENSBSLG00000026458) #15 ENSBSLG00000026461 GRAMD4 (ENSBSLG00000026476) ENSBSLG00000026499 CERK (ENSBSLG00000026507) TAFA5 (ENSBSLG00000026512) brd1b (ENSBSLG00000026513) ftsj1 (ENSBSLG00000026514) ENSBSLG00000003773 ENSBSLG00000003875 ENSBSLG00000003923 ENSBSLG00000004129 ENSBSLG00000004149 tnni2a.1 (ENSBSLG00000004158) #21 tnni2a.2 (ENSBSLG00000004174) #22 TNNI2 (ENSBSLG00000004185) #23 ENSBSLG00000004198 #23 TNNI2 (ENSBSLG00000004211) #23 ENSBSLG00000004751 #23 ENSBSLG00000004764 ENSBSLG00000004780 #24 ENSBSLG00000004819 tnnt3a (ENSBSLG00000004850) #25 myod1 (ENSBSLG00000004886) ##26 CACNA2D4 (ENSBSLG00000005093) #28 ENSBSLG00000005855 #29 ENSBSLG00000005902 #30 urahb (ENSBSLG00000005954) #31 ENSBSLG00000006449 GLG1 (ENSBSLG00000006927) #32 RFWD3 (ENSBSLG00000007791) #33 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.d Tetraodon MODERN SPECIES 4 TMED6 (ENSTNIG00000010418) MLKL (ENSTNIG00000010419) #34 RFWD3 (ENSTNIG00000010420) #33 ENSTNIG00000010421 #32 ENSTNIG00000018798 #32 ENSTNIG00000000428 ENSTNIG00000004682 #30 CACNA2D4 (ENSTNIG00000004494) #28 LRTM2 (ENSTNIG00000004493) #29 SLC7A10 (ENSTNIG00000004495) dldh (ENSTNIG00000004496) #9 ENSTNIG00000004497 #20 ENSTNIG00000002815 #20 tnni2a.1 (ENSTNIG00000002814) #21 tnni2a.2 (ENSTNIG00000002813) #22 ENSTNIG00000002812 #23 ENSTNIG00000001405 #23 TNNI2 (ENSTNIG00000002811) #23 ENSTNIG00000002810 #23 ENSTNIG00000000204 #24 tnnt3a (ENSTNIG00000002809) #25 myod1 (ENSTNIG00000002808) ##26 DUS2 (ENSTNIG00000005616) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.a ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.a ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00940000154617.B.d ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Channel bull blenny MODERN SPECIES 20 immp2l (ENSCGOG00000009694) ENSCGOG00000009688 ENSCGOG00000009676 pdcd2l (ENSCGOG00000009673) ENSCGOG00000009670 ENSCGOG00000009667 DUS2 (ENSCGOG00000009109) ENSCGOG00000009096 ENSCGOG00000009092 dldh (ENSCGOG00000008107) #9 ENSCGOG00000008073 SLC7A10 (ENSCGOG00000007383) tnni2a.1 (ENSCGOG00000007358) #21 ENSCGOG00000007345 tnni2a.2 (ENSCGOG00000007341) #22 TNNI2 (ENSCGOG00000007334) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007324) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007317) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007312) #23 ENSCGOG00000007305 #24 ENSCGOG00000007292 zgc:172145 (ENSCGOG00000007280) #27 tnnt3a (ENSCGOG00000007130) #25 myod1 (ENSCGOG00000007087) ##26 zgc:172145 (ENSCGOG00000007083) #27 ENSCGOG00000007080 LRTM2 (ENSCGOG00000007053) #29 CACNA2D4 (ENSCGOG00000007039) #28 ENSCGOG00000006641 #30 urahb (ENSCGOG00000006621) #31 ENSCGOG00000006612 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000164138 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.a ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Lumpfish MODERN SPECIES 21 znf277 (ENSCLMG00005006884) immp2l (ENSCLMG00005007053) ENSCLMG00005007055 LRRN3 (ENSCLMG00005007057) pdcd2l (ENSCLMG00005007059) ENSCLMG00005007061 ENSCLMG00005007072 SLC7A10 (ENSCLMG00005007309) ENSCLMG00005007357 ENSCLMG00005007358 dldh (ENSCLMG00005007366) #9 SYT8 (ENSCLMG00005007385) #20 ENSCLMG00005007387 tnni2a.1 (ENSCLMG00005007388) #21 tnni2a.2 (ENSCLMG00005007389) #22 TNNI2 (ENSCLMG00005007390) #23 ENSCLMG00005007391 ENSCLMG00005007392 ENSCLMG00005007394 #23 ENSCLMG00005007396 #23 TNNI2 (ENSCLMG00005007397) #23 ENSCLMG00005007399 #24 tnnt3a (ENSCLMG00005007403) #25 myod1 (ENSCLMG00005007406) ##26 CACNA2D4 (ENSCLMG00005007412) #28 ENSCLMG00005007700 LRTM2 (ENSCLMG00005007704) #29 ENSCLMG00005007712 #30 urahb (ENSCLMG00005007724) #31 ENSCLMG00005007726 GLG1 (ENSCLMG00005007781) #32 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 European seabass MODERN SPECIES 19 ENSDLAG00005033208 SLC10A7 (ENSDLAG00005015389) ENSDLAG00005015413 ENSDLAG00005027879 ENSDLAG00005018653 ENSDLAG00005003124 ENSDLAG00005027593 ENSDLAG00005016966 ENSDLAG00005026858 ENSDLAG00005014942 ENSDLAG00005030743 ENSDLAG00005031818 #9 ENSDLAG00005018756 tnni2a.1 (ENSDLAG00005018746) #21 tnni2a.2 (ENSDLAG00005032524) #22 TNNI2 (ENSDLAG00005029433) #23 TNNI2 (ENSDLAG00005018667) #23 ENSDLAG00005018661 ENSDLAG00005018639 ENSDLAG00005032620 #24 tnnt3a (ENSDLAG00005018610) #25 myod1 (ENSDLAG00005018589) ##26 zgc:172145 (ENSDLAG00005018584) #27 ENSDLAG00005018579 #29 ENSDLAG00005017494 #30 ENSDLAG00005017692 #28 ENSDLAG00005034798 ENSDLAG00005017462 GLG1 (ENSDLAG00005015126) #32 ENSDLAG00005015034 #33 MLKL (ENSDLAG00005015000) #34 Gilthead seabream MODERN SPECIES 22 ENSSAUG00010005878 ENSSAUG00010005877 ENSSAUG00010005876 ENSSAUG00010005875 ENSSAUG00010005873 ENSSAUG00010005872 ENSSAUG00010005871 ENSSAUG00010005869 ENSSAUG00010005868 dldh (ENSSAUG00010004955) #9 ENSSAUG00010004939 #20 ENSSAUG00010004937 ENSSAUG00010004936 ENSSAUG00010004935 #24 ENSSAUG00010004932 tnni2a.3 (ENSSAUG00010004903) #23 myod1 (ENSSAUG00010004893) ##26 zgc:172145 (ENSSAUG00010004889) #27 LRTM2 (ENSSAUG00010004887) #29 CACNA2D4 (ENSSAUG00010004611) #28 ENSSAUG00010004583 #30 urahb (ENSSAUG00010004577) #31 ENSSAUG00010004574 ENSSAUG00010004572 ENSSAUG00010004567 ENSSAUG00010004565 ENSSAUG00010004562 ENSSAUG00010004558 GLG1 (ENSSAUG00010004416) #32 RFWD3 (ENSSAUG00010004383) #33 MLKL (ENSSAUG00010004319) #34 Ballan wrasse MODERN SPECIES 74 ASB15 (ENSLBEG00000003875) ASB15 (ENSLBEG00000003921) IQUB (ENSLBEG00000003961) slc13a1 (ENSLBEG00000004005) CADPS2 (ENSLBEG00000004036) fezf1 (ENSLBEG00000004119) aass (ENSLBEG00000004152) #7 ENSLBEG00000004277 #8 ENSLBEG00000004441 #8 ENSLBEG00000004466 dldh (ENSLBEG00000004489) #9 SYT8 (ENSLBEG00000004542) #20 ENSLBEG00000004567 tnni2a.1 (ENSLBEG00000004589) #21 tnni2a.2 (ENSLBEG00000004628) #22 TNNI2 (ENSLBEG00000004663) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004685) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004709) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004734) #23 ENSLBEG00000004756 ENSLBEG00000004792 #24 tnnt3a (ENSLBEG00000004820) #25 myod1 (ENSLBEG00000004859) ##26 zgc:172145 (ENSLBEG00000004893) #27 CACNA2D4 (ENSLBEG00000004912) #28 LRTM2 (ENSLBEG00000004951) #29 ENSLBEG00000004962 #28 ENSLBEG00000004986 #30 urahb (ENSLBEG00000005026) #31 ENSLBEG00000005041 GLG1 (ENSLBEG00000005124) #32 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000158087 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000158087 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000158087 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 ENSGT00390000013269 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1105 dldh (ENSHBUG00000010870) #9 SYT8 (ENSHBUG00000010808) #20 tnni2a.1 (ENSHBUG00000010797) #21 tnni2a.2 (ENSHBUG00000010773) #22 TNNI2 (ENSHBUG00000010751) #23 ENSHBUG00000010740 #23 TNNI2 (ENSHBUG00000010717) #23 ENSHBUG00000010706 #23 ENSHBUG00000010695 ENSHBUG00000010683 #24 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1110 GAN (ENSMZEG00005016250) ENSMZEG00005016243 foxl1 (ENSMZEG00005016238) kiaa0513 (ENSMZEG00005016224) slc13a1 (ENSMZEG00005016213) ENSMZEG00005016206 slc13a1 (ENSMZEG00005016201) ces3 (ENSMZEG00005016193) zfpm1 (ENSMZEG00005016182) ENSMZEG00005016163 dldh (ENSMZEG00005016147) #9 SYT8 (ENSMZEG00005016137) #20 ENSMZEG00005016129 tnni2a.1 (ENSMZEG00005016126) #21 tnni2a.2 (ENSMZEG00005016116) #22 TNNI2 (ENSMZEG00005016110) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016101) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016090) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016082) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016076) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016067) #23 ENSMZEG00005016060 ENSMZEG00005016057 ENSMZEG00005016053 ENSMZEG00005016049 #24 tnnt3a (ENSMZEG00005016043) #25 myod1 (ENSMZEG00005016037) ##26 LRTM2 (ENSMZEG00005016031) #29 CACNA2D4 (ENSMZEG00005016019) #28 ENSMZEG00005016011 #30 urahb (ENSMZEG00005016003) #31 Eastern happy MODERN SPECIES 19 slc13a1 (ENSACLG00000001095) ENSACLG00000001131 ENSACLG00000001165 ENSACLG00000001172 ENSACLG00000001179 ces3 (ENSACLG00000001188) zfpm1 (ENSACLG00000001201) ENSACLG00000001259 dldh (ENSACLG00000001270) #9 SYT8 (ENSACLG00000001358) #20 ENSACLG00000001500 tnni2a.1 (ENSACLG00000001530) #21 ENSACLG00000001555 ENSACLG00000001563 tnni2a.2 (ENSACLG00000001585) #22 TNNI2 (ENSACLG00000001597) #23 ENSACLG00000001643 #23 TNNI2 (ENSACLG00000001689) #23 TNNI2 (ENSACLG00000001715) #23 ENSACLG00000001721 #24 tnnt3a (ENSACLG00000001727) #25 myod1 (ENSACLG00000001809) ##26 CACNA2D4 (ENSACLG00000002230) #28 LRTM2 (ENSACLG00000002286) #29 ENSACLG00000002295 #28 ENSACLG00000002306 #30 urahb (ENSACLG00000002381) #31 ENSACLG00000002396 ENSACLG00000002399 GLG1 (ENSACLG00000002404) #32 RFWD3 (ENSACLG00000002612) #33 P. nyererei MODERN SPECIES 524 dldh (ENSPNYG00000019274) #9 SYT8 (ENSPNYG00000019335) #20 ENSPNYG00000019407 tnni2a.1 (ENSPNYG00000019446) #21 tnni2a.2 (ENSPNYG00000019708) #22 TNNI2 (ENSPNYG00000019723) #23 ENSPNYG00000019743 #23 TNNI2 (ENSPNYG00000019768) #23 TNNI2 (ENSPNYG00000019789) #23 ENSPNYG00000019796 tnnt3a (ENSPNYG00000019816) #25 myod1 (ENSPNYG00000019881) ##26 CACNA2D4 (ENSPNYG00000019913) #28 LRTM2 (ENSPNYG00000019981) #29 ENSPNYG00000020007 #30 urahb (ENSPNYG00000020098) #31 ENSPNYG00000020106 GLG1 (ENSPNYG00000020129) #32 RFWD3 (ENSPNYG00000020232) #33 anpeplb (ENSPNYG00000020252) arpin (ENSPNYG00000020274) Midas cichlid MODERN SPECIES 258 frs2b (ENSACIG00000015503) nup160 (ENSACIG00000015433) slc13a1 (ENSACIG00000015361) ces3 (ENSACIG00000015245) ENSACIG00000015232 zfpm1 (ENSACIG00000015211) ENSACIG00000015203 ENSACIG00000015187 ENSACIG00000015131 ENSACIG00000015126 dldh (ENSACIG00000015096) #9 SYT8 (ENSACIG00000015081) #20 ENSACIG00000015057 tnni2a.1 (ENSACIG00000015042) #21 tnni2a.2 (ENSACIG00000014981) #22 TNNI2 (ENSACIG00000014860) #23 TNNI2 (ENSACIG00000014837) #23 TNNI2 (ENSACIG00000014818) #23 ENSACIG00000014805 #23 ENSACIG00000014797 ENSACIG00000014781 tnnt3a (ENSACIG00000014612) #25 myod1 (ENSACIG00000014400) ##26 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 478 dldh (ENSSPAG00000007152) #9 SYT8 (ENSSPAG00000007134) #20 ENSSPAG00000007118 tnni2a.1 (ENSSPAG00000007097) #21 tnni2a.2 (ENSSPAG00000007090) #22 ENSSPAG00000007079 #23 ENSSPAG00000007073 #23 ENSSPAG00000007042 #23 TNNI2 (ENSSPAG00000007029) #23 ENSSPAG00000007019 ENSSPAG00000007014 #24 tnnt3a (ENSSPAG00000006984) #25 myod1 (ENSSPAG00000006959) ##26 ENSSPAG00000006936 ENSSPAG00000006900 #29 CACNA2D4 (ENSSPAG00000005360) #28 ENSSPAG00000005219 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Clown anemonefish MODERN SPECIES 751 aass (ENSAOCG00000017468) #7 PTPRZ1 (ENSAOCG00000017569) #8 dldh (ENSAOCG00000002339) #9 ENSAOCG00000002665 #20 tnni2a.1 (ENSAOCG00000017857) #21 tnni2a.2 (ENSAOCG00000017871) #22 TNNI2 (ENSAOCG00000017888) #23 ENSAOCG00000002393 #23 TNNI2 (ENSAOCG00000017932) #23 TNNI2 (ENSAOCG00000017959) #23 Orange clownfish MODERN SPECIES 18 ENSAPEG00000017179 ASB15 (ENSAPEG00000017102) IQUB (ENSAPEG00000016998) slc13a1 (ENSAPEG00000016967) ENSAPEG00000016930 CADPS2 (ENSAPEG00000016782) fezf1 (ENSAPEG00000016744) aass (ENSAPEG00000016653) #7 ENSAPEG00000016522 #8 ENSAPEG00000016488 #8 dldh (ENSAPEG00000016431) #9 SYT8 (ENSAPEG00000016419) #20 ENSAPEG00000016387 tnni2a.1 (ENSAPEG00000016379) #21 tnni2a.2 (ENSAPEG00000016369) #22 TNNI2 (ENSAPEG00000016355) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016331) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016303) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016276) #23 ENSAPEG00000016264 ENSAPEG00000016255 #24 ENSAPEG00000016238 myod1 (ENSAPEG00000016219) ##26 tnnt3a (ENSAPEG00000016176) #25 ENSAPEG00000016163 #27 LRTM2 (ENSAPEG00000016139) #29 CACNA2D4 (ENSAPEG00000015687) #28 ENSAPEG00000015651 #30 urahb (ENSAPEG00000015634) #31 ENSAPEG00000015507 GLG1 (ENSAPEG00000015395) #32 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 496 DUS2 (ENSHCOG00000009462) SLC7A10 (ENSHCOG00000009496) urahb (ENSHCOG00000009505) #31 ENSHCOG00000009602 #30 ENSHCOG00000009616 #28 LRTM2 (ENSHCOG00000009629) #29 CACNA2D4 (ENSHCOG00000009660) #28 ENSHCOG00000009665 MYOD1 (ENSHCOG00000009682) ##26 ENSHCOG00000009758 #8 ENSHCOG00000009794 #8 dldh (ENSHCOG00000009848) #9 ENSHCOG00000009869 #20 tnni2a.1 (ENSHCOG00000009875) #21 tnni2a.2 (ENSHCOG00000009882) #22 ENSHCOG00000009905 #23 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 20 lmod2a (ENSMMDG00005013547) ASB15 (ENSMMDG00005004070) ASB15 (ENSMMDG00005004125) IQUB (ENSMMDG00005004156) slc13a1 (ENSMMDG00005004181) CADPS2 (ENSMMDG00005004524) fezf1 (ENSMMDG00005008356) aass (ENSMMDG00005008411) #7 PTPRZ1 (ENSMMDG00005010843) #8 dldh (ENSMMDG00005010882) #9 ENSMMDG00005010938 ENSMMDG00005010939 SYT8 (ENSMMDG00005010940) #20 tnni2a.1 (ENSMMDG00005010942) #21 tnni2a.2 (ENSMMDG00005010943) #22 ENSMMDG00005010944 #23 ENSMMDG00005010945 #23 ENSMMDG00005010946 #23 ENSMMDG00005010947 #23 TNNI2 (ENSMMDG00005010948) #23 ENSMMDG00005010949 #24 tnnt3a (ENSMMDG00005010950) #25 myod1 (ENSMMDG00005010952) ##26 zgc:172145 (ENSMMDG00005010974) #27 CACNA2D4 (ENSMMDG00005010984) #28 LRTM2 (ENSMMDG00005011155) #29 ENSMMDG00005011190 #30 urahb (ENSMMDG00005012437) #31 acot19 (ENSMMDG00005012454) ENSMMDG00005012464 ENSMMDG00005012488 Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 311 TNNI2 (ENSHCOG00000009397) #23 ENSHCOG00000009415 ENSHCOG00000009424 #24 tnnt3a (ENSHCOG00000009452) #25 aass (ENSHCOG00000009548) #7 fezf1 (ENSHCOG00000009567) ENSHCOG00000009589 ENSHCOG00000009607 CADPS2 (ENSHCOG00000009666) slc13a1 (ENSHCOG00000000299) ENSHCOG00000009738 ENSHCOG00000009744 ENSHCOG00000009768 hyal6 (ENSHCOG00000009783) HYAL4 (ENSHCOG00000009889) ENSHCOG00000000311 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Clown anemonefish MODERN SPECIES 751 aass (ENSAOCG00000017468) #7 PTPRZ1 (ENSAOCG00000017569) #8 dldh (ENSAOCG00000002339) #9 ENSAOCG00000002665 #20 tnni2a.1 (ENSAOCG00000017857) #21 tnni2a.2 (ENSAOCG00000017871) #22 TNNI2 (ENSAOCG00000017888) #23 ENSAOCG00000002393 #23 TNNI2 (ENSAOCG00000017932) #23 TNNI2 (ENSAOCG00000017959) #23 Orange clownfish MODERN SPECIES 18 IQUB (ENSAPEG00000016998) slc13a1 (ENSAPEG00000016967) ENSAPEG00000016930 CADPS2 (ENSAPEG00000016782) fezf1 (ENSAPEG00000016744) aass (ENSAPEG00000016653) #7 ENSAPEG00000016522 #8 ENSAPEG00000016488 #8 dldh (ENSAPEG00000016431) #9 SYT8 (ENSAPEG00000016419) #20 ENSAPEG00000016387 tnni2a.1 (ENSAPEG00000016379) #21 tnni2a.2 (ENSAPEG00000016369) #22 TNNI2 (ENSAPEG00000016355) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016331) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016303) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016276) #23 ENSAPEG00000016264 ENSAPEG00000016255 #24 ENSAPEG00000016238 myod1 (ENSAPEG00000016219) ##26 tnnt3a (ENSAPEG00000016176) #25 ENSAPEG00000016163 #27 LRTM2 (ENSAPEG00000016139) #29 CACNA2D4 (ENSAPEG00000015687) #28 ENSAPEG00000015651 #30 urahb (ENSAPEG00000015634) #31 ENSAPEG00000015507 GLG1 (ENSAPEG00000015395) #32 RFWD3 (ENSAPEG00000015379) #33 MLKL (ENSAPEG00000015334) #34 Spiny chromis MODERN SPECIES 1278 tnni2a.1 (ENSAPOG00000010015) #21 ENSAPOG00000010022 tnni2a.2 (ENSAPOG00000010244) #22 TNNI2 (ENSAPOG00000010262) #23 ENSAPOG00000010281 #23 TNNI2 (ENSAPOG00000010314) #23 TNNI2 (ENSAPOG00000010340) #23 tmem106bb (ENSAPOG00000010349) arl4ab (ENSAPOG00000010415) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 478 dldh (ENSSPAG00000007152) #9 SYT8 (ENSSPAG00000007134) #20 ENSSPAG00000007118 tnni2a.1 (ENSSPAG00000007097) #21 tnni2a.2 (ENSSPAG00000007090) #22 ENSSPAG00000007079 #23 ENSSPAG00000007073 #23 ENSSPAG00000007042 #23 TNNI2 (ENSSPAG00000007029) #23 ENSSPAG00000007019 ENSSPAG00000007014 #24 tnnt3a (ENSSPAG00000006984) #25 myod1 (ENSSPAG00000006959) ##26 ENSSPAG00000006936 ENSSPAG00000006900 #29 CACNA2D4 (ENSSPAG00000005360) #28 ENSSPAG00000005219 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.d ENSGT00940000157021 ENSGT00420000029847 Tetraodon MODERN SPECIES 4 RFWD3 (ENSTNIG00000010420) #33 ENSTNIG00000010421 #32 ENSTNIG00000018798 #32 ENSTNIG00000000428 ENSTNIG00000004682 #30 CACNA2D4 (ENSTNIG00000004494) #28 LRTM2 (ENSTNIG00000004493) #29 SLC7A10 (ENSTNIG00000004495) dldh (ENSTNIG00000004496) #9 ENSTNIG00000004497 #20 ENSTNIG00000002815 #20 tnni2a.1 (ENSTNIG00000002814) #21 tnni2a.2 (ENSTNIG00000002813) #22 ENSTNIG00000002812 #23 ENSTNIG00000001405 #23 TNNI2 (ENSTNIG00000002811) #23 ENSTNIG00000002810 #23 ENSTNIG00000000204 #24 tnnt3a (ENSTNIG00000002809) #25 myod1 (ENSTNIG00000002808) ##26 DUS2 (ENSTNIG00000005616) Fugu MODERN SPECIES 21 ENSTRUG00000028935 ENSTRUG00000031663 ENSTRUG00000032661 ccnd2a (ENSTRUG00000001816) ENSTRUG00000032400 ENSTRUG00000028185 DUS2 (ENSTRUG00000022441) SLC7A10 (ENSTRUG00000033356) ENSTRUG00000032988 dldh (ENSTRUG00000016659) #9 SYT8 (ENSTRUG00000016657) #20 ENSTRUG00000027114 tnni2a.1 (ENSTRUG00000022759) #21 tnni2a.2 (ENSTRUG00000016644) #22 ENSTRUG00000016632 #23 ENSTRUG00000033030 #23 ENSTRUG00000027588 #23 ENSTRUG00000027670 ENSTRUG00000030147 #24 tnnt3a (ENSTRUG00000016614) #25 myod1 (ENSTRUG00000016609) ##26 LRTM2 (ENSTRUG00000029534) #29 ENSTRUG00000016565 #30 urahb (ENSTRUG00000021342) #31 ENSTRUG00000030677 GLG1 (ENSTRUG00000016546) #32 RFWD3 (ENSTRUG00000016541) #33 TMED6 (ENSTRUG00000016539) ANKRD27 (ENSTRUG00000016516) ENSTRUG00000021888 ENSTRUG00000029018 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Ballan wrasse MODERN SPECIES 74 IQUB (ENSLBEG00000003961) slc13a1 (ENSLBEG00000004005) CADPS2 (ENSLBEG00000004036) fezf1 (ENSLBEG00000004119) aass (ENSLBEG00000004152) #7 ENSLBEG00000004277 #8 ENSLBEG00000004441 #8 ENSLBEG00000004466 dldh (ENSLBEG00000004489) #9 SYT8 (ENSLBEG00000004542) #20 ENSLBEG00000004567 tnni2a.1 (ENSLBEG00000004589) #21 tnni2a.2 (ENSLBEG00000004628) #22 TNNI2 (ENSLBEG00000004663) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004685) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004709) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004734) #23 ENSLBEG00000004756 ENSLBEG00000004792 #24 tnnt3a (ENSLBEG00000004820) #25 myod1 (ENSLBEG00000004859) ##26 zgc:172145 (ENSLBEG00000004893) #27 CACNA2D4 (ENSLBEG00000004912) #28 LRTM2 (ENSLBEG00000004951) #29 ENSLBEG00000004962 #28 ENSLBEG00000004986 #30 urahb (ENSLBEG00000005026) #31 ENSLBEG00000005041 GLG1 (ENSLBEG00000005124) #32 RFWD3 (ENSLBEG00000005275) #33 MLKL (ENSLBEG00000005305) #34 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Perciformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000016791 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.a ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c ENSGT00390000010961.d Lumpfish MODERN SPECIES 21 pdcd2l (ENSCLMG00005007059) ENSCLMG00005007061 ENSCLMG00005007072 SLC7A10 (ENSCLMG00005007309) ENSCLMG00005007357 ENSCLMG00005007358 dldh (ENSCLMG00005007366) #9 SYT8 (ENSCLMG00005007385) #20 ENSCLMG00005007387 tnni2a.1 (ENSCLMG00005007388) #21 tnni2a.2 (ENSCLMG00005007389) #22 TNNI2 (ENSCLMG00005007390) #23 ENSCLMG00005007391 ENSCLMG00005007392 ENSCLMG00005007394 #23 ENSCLMG00005007396 #23 TNNI2 (ENSCLMG00005007397) #23 ENSCLMG00005007399 #24 tnnt3a (ENSCLMG00005007403) #25 myod1 (ENSCLMG00005007406) ##26 CACNA2D4 (ENSCLMG00005007412) #28 ENSCLMG00005007700 LRTM2 (ENSCLMG00005007704) #29 ENSCLMG00005007712 #30 urahb (ENSCLMG00005007724) #31 ENSCLMG00005007726 GLG1 (ENSCLMG00005007781) #32 RFWD3 (ENSCLMG00005007893) #33 MLKL (ENSCLMG00005007894) #34 TMED6 (ENSCLMG00005007896) ENSCLMG00005007897 Stickleback MODERN SPECIES 14 ENSGACG00000008044 ENSGACG00000008049 ciao2a (ENSGACG00000008052) spg11 (ENSGACG00000008057) znf277 (ENSGACG00000008086) immp2l (ENSGACG00000008130) ENSGACG00000008150 ENSGACG00000008152 ENSGACG00000008153 DUS2 (ENSGACG00000008159) SLC7A10 (ENSGACG00000008186) dldh (ENSGACG00000008240) #9 SYT8 (ENSGACG00000008302) #20 tnni2a.1 (ENSGACG00000008315) #21 tnni2a.2 (ENSGACG00000008321) #22 TNNI2 (ENSGACG00000008333) #23 TNNI2 (ENSGACG00000008349) #23 LSP1 (ENSGACG00000008376) tnnt3a (ENSGACG00000008384) #25 myod1 (ENSGACG00000008444) ##26 ENSGACG00000008450 CACNA2D4 (ENSGACG00000008453) #28 ENSGACG00000008489 #29 ENSGACG00000008494 #30 urahb (ENSGACG00000008507) #31 ENSGACG00000008512 GLG1 (ENSGACG00000008520) #32 RFWD3 (ENSGACG00000008531) #33 MLKL (ENSGACG00000008536) #34 ENSGACG00000008543 ZDHHC7 (ENSGACG00000008550) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000016791 ENSGT00940000154617.B.d ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Channel bull blenny MODERN SPECIES 20 ENSCGOG00000009676 pdcd2l (ENSCGOG00000009673) ENSCGOG00000009670 ENSCGOG00000009667 DUS2 (ENSCGOG00000009109) ENSCGOG00000009096 ENSCGOG00000009092 dldh (ENSCGOG00000008107) #9 ENSCGOG00000008073 SLC7A10 (ENSCGOG00000007383) tnni2a.1 (ENSCGOG00000007358) #21 ENSCGOG00000007345 tnni2a.2 (ENSCGOG00000007341) #22 TNNI2 (ENSCGOG00000007334) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007324) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007317) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007312) #23 ENSCGOG00000007305 #24 ENSCGOG00000007292 zgc:172145 (ENSCGOG00000007280) #27 tnnt3a (ENSCGOG00000007130) #25 myod1 (ENSCGOG00000007087) ##26 zgc:172145 (ENSCGOG00000007083) #27 ENSCGOG00000007080 LRTM2 (ENSCGOG00000007053) #29 CACNA2D4 (ENSCGOG00000007039) #28 ENSCGOG00000006641 #30 urahb (ENSCGOG00000006621) #31 ENSCGOG00000006612 ENSCGOG00000006597 GLG1 (ENSCGOG00000005997) #32 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Large yellow croaker MODERN SPECIES 492 HYAL4 (ENSLCRG00005001083) hyal6 (ENSLCRG00005001078) wasla (ENSLCRG00005022134) lmod2a (ENSLCRG00005022129) ASB15 (ENSLCRG00005022127) ASB15 (ENSLCRG00005022123) IQUB (ENSLCRG00005022117) slc13a1 (ENSLCRG00005022115) CADPS2 (ENSLCRG00005020853) fezf1 (ENSLCRG00005020826) aass (ENSLCRG00005020281) #7 ENSLCRG00005020261 dldh (ENSLCRG00005020243) #9 SYT8 (ENSLCRG00005020234) #20 tnni2a.2 (ENSLCRG00005020228) #22 tnni2a.4 (ENSLCRG00005020224) #23 TNNI2 (ENSLCRG00005020221) #21 ENSLCRG00005020217 ENSLCRG00005020216 ENSLCRG00005020214 #24 tnnt3a (ENSLCRG00005020211) #25 myod1 (ENSLCRG00005020205) ##26 zgc:172145 (ENSLCRG00005020203) #27 LRTM2 (ENSLCRG00005020201) #29 CACNA2D4 (ENSLCRG00005020194) #28 ENSLCRG00005020191 #30 urahb (ENSLCRG00005020189) #31 ENSLCRG00005020187 GLG1 (ENSLCRG00005019420) #32 RFWD3 (ENSLCRG00005019395) #33 MLKL (ENSLCRG00005019391) #34 European seabass MODERN SPECIES 19 SLC10A7 (ENSDLAG00005015389) ENSDLAG00005015413 ENSDLAG00005027879 ENSDLAG00005018653 ENSDLAG00005003124 ENSDLAG00005027593 ENSDLAG00005016966 ENSDLAG00005026858 ENSDLAG00005014942 ENSDLAG00005030743 ENSDLAG00005031818 #9 ENSDLAG00005018756 tnni2a.1 (ENSDLAG00005018746) #21 tnni2a.2 (ENSDLAG00005032524) #22 TNNI2 (ENSDLAG00005029433) #23 TNNI2 (ENSDLAG00005018667) #23 ENSDLAG00005018661 ENSDLAG00005018639 ENSDLAG00005032620 #24 tnnt3a (ENSDLAG00005018610) #25 myod1 (ENSDLAG00005018589) ##26 zgc:172145 (ENSDLAG00005018584) #27 ENSDLAG00005018579 #29 ENSDLAG00005017494 #30 ENSDLAG00005017692 #28 ENSDLAG00005034798 ENSDLAG00005017462 GLG1 (ENSDLAG00005015126) #32 ENSDLAG00005015034 #33 MLKL (ENSDLAG00005015000) #34 ENSDLAG00005012594 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Climbing perch MODERN SPECIES 19 aass (ENSATEG00000009598) #7 PTPRZ1 (ENSATEG00000009734) #8 ENSATEG00000009981 ENSATEG00000009999 ENSATEG00000027494 ENSATEG00000010027 ENSATEG00000010089 ENSATEG00000026154 ENSATEG00000027850 ENSATEG00000027848 ENSATEG00000010140 #9 SYT8 (ENSATEG00000010173) #20 tnni2a.1 (ENSATEG00000010223) #21 TNNI2 (ENSATEG00000010240) #23 TNNI2 (ENSATEG00000010278) #23 TNNI2 (ENSATEG00000010717) #23 ENSATEG00000010747 ENSATEG00000010769 #24 tnnt3a (ENSATEG00000010782) #25 myod1 (ENSATEG00000010852) ##26 zgc:172145 (ENSATEG00000010861) #27 ENSATEG00000010873 #28 ENSATEG00000026163 #29 ENSATEG00000027583 #28 ENSATEG00000011010 #30 urahb (ENSATEG00000027908) #31 ENSATEG00000011076 GLG1 (ENSATEG00000011236) #32 ENSATEG00000011399 #33 MLKL (ENSATEG00000011422) #34 ENSATEG00000027365 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 17 GRAMD4 (ENSBSLG00000026476) ENSBSLG00000026499 CERK (ENSBSLG00000026507) TAFA5 (ENSBSLG00000026512) brd1b (ENSBSLG00000026513) ftsj1 (ENSBSLG00000026514) ENSBSLG00000003773 ENSBSLG00000003875 ENSBSLG00000003923 ENSBSLG00000004129 ENSBSLG00000004149 tnni2a.1 (ENSBSLG00000004158) #21 tnni2a.2 (ENSBSLG00000004174) #22 TNNI2 (ENSBSLG00000004185) #23 ENSBSLG00000004198 #23 TNNI2 (ENSBSLG00000004211) #23 ENSBSLG00000004751 #23 ENSBSLG00000004764 ENSBSLG00000004780 #24 ENSBSLG00000004819 tnnt3a (ENSBSLG00000004850) #25 myod1 (ENSBSLG00000004886) ##26 CACNA2D4 (ENSBSLG00000005093) #28 ENSBSLG00000005855 #29 ENSBSLG00000005902 #30 urahb (ENSBSLG00000005954) #31 ENSBSLG00000006449 GLG1 (ENSBSLG00000006927) #32 RFWD3 (ENSBSLG00000007791) #33 MLKL (ENSBSLG00000007872) #34 ENSBSLG00000007888 Zig-zag eel MODERN SPECIES 20 PTPRZ1 (ENSMAMG00000027911) #8 ENSMAMG00000022767 ENSMAMG00000022758 ENSMAMG00000025915 ENSMAMG00000022762 ENSMAMG00000024786 ENSMAMG00000022760 ENSMAMG00000022756 #9 SYT8 (ENSMAMG00000026620) #20 ENSMAMG00000025933 tnni2a.1 (ENSMAMG00000022730) #21 tnni2a.2 (ENSMAMG00000022728) #22 TNNI2 (ENSMAMG00000028411) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000025267) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000022722) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000028574) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000024405) #23 ENSMAMG00000026203 ENSMAMG00000025176 tnnt3a (ENSMAMG00000022716) #25 myod1 (ENSMAMG00000025845) ##26 ENSMAMG00000022714 #29 ENSMAMG00000022713 #28 ENSMAMG00000022711 #30 urahb (ENSMAMG00000022710) #31 ENSMAMG00000025621 ENSMAMG00000022709 GLG1 (ENSMAMG00000022699) #32 ENSMAMG00000022695 #33 MLKL (ENSMAMG00000022692) #34 ENSMAMG00000022690 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Tongue sole MODERN SPECIES 16 ENSCSEG00000001946 exoc3l1 (ENSCSEG00000001976) ENSCSEG00000001985 KIF21A (ENSCSEG00000001988) ENSCSEG00000002001 ANO1 (ENSCSEG00000002014) ENSCSEG00000002069 ENSCSEG00000002072 smpd3 (ENSCSEG00000002076) ENSCSEG00000002089 septin15 (ENSCSEG00000002096) ENSCSEG00000002121 tnni2a.1 (ENSCSEG00000002133) #21 tnni2a.2 (ENSCSEG00000002138) #22 TNNI2 (ENSCSEG00000002145) #23 TNNI2 (ENSCSEG00000002164) #23 TNNI2 (ENSCSEG00000002169) #23 ENSCSEG00000002173 ENSCSEG00000002176 ENSCSEG00000002189 #24 ENSCSEG00000002191 tnnt3a (ENSCSEG00000002198) #25 myod1 (ENSCSEG00000002233) ##26 zgc:172145 (ENSCSEG00000002238) #27 CACNA2D4 (ENSCSEG00000002252) #28 LRTM2 (ENSCSEG00000002266) #29 PEAK1 (ENSCSEG00000002269) syt12 (ENSCSEG00000002273) cat (ENSCSEG00000002281) ifitm5 (ENSCSEG00000002289) ENSCSEG00000002294 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.f ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Seriola ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000156482.c ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a.h ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00390000009456 ENSGT00420000029847 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Greater amberjack MODERN SPECIES 160 pdcd2l (ENSSDUG00000000081) ENSSDUG00000017439 DUS2 (ENSSDUG00000017399) SLC7A10 (ENSSDUG00000017375) faap24 (ENSSDUG00000017353) ENSSDUG00000017304 dldh (ENSSDUG00000017239) #9 SYT8 (ENSSDUG00000017190) #20 ENSSDUG00000017175 ENSSDUG00000017137 tnni2a.1 (ENSSDUG00000017118) #21 tnni2a.2 (ENSSDUG00000017108) #22 ENSSDUG00000017101 TNNI2 (ENSSDUG00000017087) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017072) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017051) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017036) #23 ENSSDUG00000016991 ENSSDUG00000016965 ENSSDUG00000016941 tnnt3a (ENSSDUG00000016913) #25 myod1 (ENSSDUG00000016886) ##26 zgc:172145 (ENSSDUG00000016873) #27 ENSSDUG00000016853 #29 CACNA2D4 (ENSSDUG00000016797) #28 ENSSDUG00000016707 #30 urahb (ENSSDUG00000016691) #31 ENSSDUG00000016686 GLG1 (ENSSDUG00000016609) #32 RFWD3 (ENSSDUG00000016584) #33 MLKL (ENSSDUG00000016569) #34 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3178 TNNI2 (ENSSLDG00000022266) #23 TNNI2 (ENSSLDG00000022273) #23 TNNI2 (ENSSLDG00000022278) #23 TNNI2 (ENSSLDG00000022288) #23 ENSSLDG00000022300 ENSSLDG00000022311 #24 tnnt3a (ENSSLDG00000022320) #25 myod1 (ENSSLDG00000022337) ##26 zgc:172145 (ENSSLDG00000022358) #27 ENSSLDG00000022362 CACNA2D4 (ENSSLDG00000022368) #28 LRTM2 (ENSSLDG00000022406) #29 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 20 ASB15 (ENSMMDG00005004125) IQUB (ENSMMDG00005004156) slc13a1 (ENSMMDG00005004181) CADPS2 (ENSMMDG00005004524) fezf1 (ENSMMDG00005008356) aass (ENSMMDG00005008411) #7 PTPRZ1 (ENSMMDG00005010843) #8 dldh (ENSMMDG00005010882) #9 ENSMMDG00005010938 ENSMMDG00005010939 SYT8 (ENSMMDG00005010940) #20 tnni2a.1 (ENSMMDG00005010942) #21 tnni2a.2 (ENSMMDG00005010943) #22 ENSMMDG00005010944 #23 ENSMMDG00005010945 #23 ENSMMDG00005010946 #23 ENSMMDG00005010947 #23 TNNI2 (ENSMMDG00005010948) #23 ENSMMDG00005010949 #24 tnnt3a (ENSMMDG00005010950) #25 myod1 (ENSMMDG00005010952) ##26 zgc:172145 (ENSMMDG00005010974) #27 CACNA2D4 (ENSMMDG00005010984) #28 LRTM2 (ENSMMDG00005011155) #29 ENSMMDG00005011190 #30 urahb (ENSMMDG00005012437) #31 acot19 (ENSMMDG00005012454) ENSMMDG00005012464 ENSMMDG00005012488 ENSMMDG00005012495 ENSMMDG00005012577 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 20 IQUB (ENSMMDG00005004156) slc13a1 (ENSMMDG00005004181) CADPS2 (ENSMMDG00005004524) fezf1 (ENSMMDG00005008356) aass (ENSMMDG00005008411) #7 PTPRZ1 (ENSMMDG00005010843) #8 dldh (ENSMMDG00005010882) #9 ENSMMDG00005010938 ENSMMDG00005010939 SYT8 (ENSMMDG00005010940) #20 tnni2a.1 (ENSMMDG00005010942) #21 tnni2a.2 (ENSMMDG00005010943) #22 ENSMMDG00005010944 #23 ENSMMDG00005010945 #23 ENSMMDG00005010946 #23 ENSMMDG00005010947 #23 TNNI2 (ENSMMDG00005010948) #23 ENSMMDG00005010949 #24 tnnt3a (ENSMMDG00005010950) #25 myod1 (ENSMMDG00005010952) ##26 zgc:172145 (ENSMMDG00005010974) #27 CACNA2D4 (ENSMMDG00005010984) #28 LRTM2 (ENSMMDG00005011155) #29 ENSMMDG00005011190 #30 urahb (ENSMMDG00005012437) #31 acot19 (ENSMMDG00005012454) ENSMMDG00005012464 ENSMMDG00005012488 ENSMMDG00005012495 ENSMMDG00005012577 ENSMMDG00005012579 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 20 ASB15 (ENSMMDG00005004070) ASB15 (ENSMMDG00005004125) IQUB (ENSMMDG00005004156) slc13a1 (ENSMMDG00005004181) CADPS2 (ENSMMDG00005004524) fezf1 (ENSMMDG00005008356) aass (ENSMMDG00005008411) #7 PTPRZ1 (ENSMMDG00005010843) #8 dldh (ENSMMDG00005010882) #9 ENSMMDG00005010938 ENSMMDG00005010939 SYT8 (ENSMMDG00005010940) #20 tnni2a.1 (ENSMMDG00005010942) #21 tnni2a.2 (ENSMMDG00005010943) #22 ENSMMDG00005010944 #23 ENSMMDG00005010945 #23 ENSMMDG00005010946 #23 ENSMMDG00005010947 #23 TNNI2 (ENSMMDG00005010948) #23 ENSMMDG00005010949 #24 tnnt3a (ENSMMDG00005010950) #25 myod1 (ENSMMDG00005010952) ##26 zgc:172145 (ENSMMDG00005010974) #27 CACNA2D4 (ENSMMDG00005010984) #28 LRTM2 (ENSMMDG00005011155) #29 ENSMMDG00005011190 #30 urahb (ENSMMDG00005012437) #31 acot19 (ENSMMDG00005012454) ENSMMDG00005012464 ENSMMDG00005012488 ENSMMDG00005012495 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Clown anemonefish MODERN SPECIES 751 aass (ENSAOCG00000017468) #7 PTPRZ1 (ENSAOCG00000017569) #8 dldh (ENSAOCG00000002339) #9 ENSAOCG00000002665 #20 tnni2a.1 (ENSAOCG00000017857) #21 tnni2a.2 (ENSAOCG00000017871) #22 TNNI2 (ENSAOCG00000017888) #23 ENSAOCG00000002393 #23 TNNI2 (ENSAOCG00000017932) #23 TNNI2 (ENSAOCG00000017959) #23 Orange clownfish MODERN SPECIES 18 ASB15 (ENSAPEG00000017102) IQUB (ENSAPEG00000016998) slc13a1 (ENSAPEG00000016967) ENSAPEG00000016930 CADPS2 (ENSAPEG00000016782) fezf1 (ENSAPEG00000016744) aass (ENSAPEG00000016653) #7 ENSAPEG00000016522 #8 ENSAPEG00000016488 #8 dldh (ENSAPEG00000016431) #9 SYT8 (ENSAPEG00000016419) #20 ENSAPEG00000016387 tnni2a.1 (ENSAPEG00000016379) #21 tnni2a.2 (ENSAPEG00000016369) #22 TNNI2 (ENSAPEG00000016355) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016331) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016303) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016276) #23 ENSAPEG00000016264 ENSAPEG00000016255 #24 ENSAPEG00000016238 myod1 (ENSAPEG00000016219) ##26 tnnt3a (ENSAPEG00000016176) #25 ENSAPEG00000016163 #27 LRTM2 (ENSAPEG00000016139) #29 CACNA2D4 (ENSAPEG00000015687) #28 ENSAPEG00000015651 #30 urahb (ENSAPEG00000015634) #31 ENSAPEG00000015507 GLG1 (ENSAPEG00000015395) #32 RFWD3 (ENSAPEG00000015379) #33 Spiny chromis MODERN SPECIES 1278 tnni2a.1 (ENSAPOG00000010015) #21 ENSAPOG00000010022 tnni2a.2 (ENSAPOG00000010244) #22 TNNI2 (ENSAPOG00000010262) #23 ENSAPOG00000010281 #23 TNNI2 (ENSAPOG00000010314) #23 TNNI2 (ENSAPOG00000010340) #23 tmem106bb (ENSAPOG00000010349) arl4ab (ENSAPOG00000010415) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 478 dldh (ENSSPAG00000007152) #9 SYT8 (ENSSPAG00000007134) #20 ENSSPAG00000007118 tnni2a.1 (ENSSPAG00000007097) #21 tnni2a.2 (ENSSPAG00000007090) #22 ENSSPAG00000007079 #23 ENSSPAG00000007073 #23 ENSSPAG00000007042 #23 TNNI2 (ENSSPAG00000007029) #23 ENSSPAG00000007019 ENSSPAG00000007014 #24 tnnt3a (ENSSPAG00000006984) #25 myod1 (ENSSPAG00000006959) ##26 ENSSPAG00000006936 ENSSPAG00000006900 #29 CACNA2D4 (ENSSPAG00000005360) #28 ENSSPAG00000005219 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.d ENSGT00940000157021 Fugu MODERN SPECIES 21 ENSTRUG00000026214 ##17 ENSTRUG00000028935 ENSTRUG00000031663 ENSTRUG00000032661 ccnd2a (ENSTRUG00000001816) ENSTRUG00000032400 ENSTRUG00000028185 DUS2 (ENSTRUG00000022441) SLC7A10 (ENSTRUG00000033356) ENSTRUG00000032988 dldh (ENSTRUG00000016659) #9 SYT8 (ENSTRUG00000016657) #20 ENSTRUG00000027114 tnni2a.1 (ENSTRUG00000022759) #21 tnni2a.2 (ENSTRUG00000016644) #22 ENSTRUG00000016632 #23 ENSTRUG00000033030 #23 ENSTRUG00000027588 #23 ENSTRUG00000027670 ENSTRUG00000030147 #24 tnnt3a (ENSTRUG00000016614) #25 myod1 (ENSTRUG00000016609) ##26 LRTM2 (ENSTRUG00000029534) #29 ENSTRUG00000016565 #30 urahb (ENSTRUG00000021342) #31 ENSTRUG00000030677 GLG1 (ENSTRUG00000016546) #32 RFWD3 (ENSTRUG00000016541) #33 TMED6 (ENSTRUG00000016539) ANKRD27 (ENSTRUG00000016516) ENSTRUG00000021888 Tetraodon MODERN SPECIES 4 MLKL (ENSTNIG00000010419) #34 RFWD3 (ENSTNIG00000010420) #33 ENSTNIG00000010421 #32 ENSTNIG00000018798 #32 ENSTNIG00000000428 ENSTNIG00000004682 #30 CACNA2D4 (ENSTNIG00000004494) #28 LRTM2 (ENSTNIG00000004493) #29 SLC7A10 (ENSTNIG00000004495) dldh (ENSTNIG00000004496) #9 ENSTNIG00000004497 #20 ENSTNIG00000002815 #20 tnni2a.1 (ENSTNIG00000002814) #21 tnni2a.2 (ENSTNIG00000002813) #22 ENSTNIG00000002812 #23 ENSTNIG00000001405 #23 TNNI2 (ENSTNIG00000002811) #23 ENSTNIG00000002810 #23 ENSTNIG00000000204 #24 tnnt3a (ENSTNIG00000002809) #25 myod1 (ENSTNIG00000002808) ##26 DUS2 (ENSTNIG00000005616) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Ballan wrasse MODERN SPECIES 74 ASB15 (ENSLBEG00000003921) IQUB (ENSLBEG00000003961) slc13a1 (ENSLBEG00000004005) CADPS2 (ENSLBEG00000004036) fezf1 (ENSLBEG00000004119) aass (ENSLBEG00000004152) #7 ENSLBEG00000004277 #8 ENSLBEG00000004441 #8 ENSLBEG00000004466 dldh (ENSLBEG00000004489) #9 SYT8 (ENSLBEG00000004542) #20 ENSLBEG00000004567 tnni2a.1 (ENSLBEG00000004589) #21 tnni2a.2 (ENSLBEG00000004628) #22 TNNI2 (ENSLBEG00000004663) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004685) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004709) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004734) #23 ENSLBEG00000004756 ENSLBEG00000004792 #24 tnnt3a (ENSLBEG00000004820) #25 myod1 (ENSLBEG00000004859) ##26 zgc:172145 (ENSLBEG00000004893) #27 CACNA2D4 (ENSLBEG00000004912) #28 LRTM2 (ENSLBEG00000004951) #29 ENSLBEG00000004962 #28 ENSLBEG00000004986 #30 urahb (ENSLBEG00000005026) #31 ENSLBEG00000005041 GLG1 (ENSLBEG00000005124) #32 RFWD3 (ENSLBEG00000005275) #33 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 Lumpfish MODERN SPECIES 21 LRRN3 (ENSCLMG00005007057) pdcd2l (ENSCLMG00005007059) ENSCLMG00005007061 ENSCLMG00005007072 SLC7A10 (ENSCLMG00005007309) ENSCLMG00005007357 ENSCLMG00005007358 dldh (ENSCLMG00005007366) #9 SYT8 (ENSCLMG00005007385) #20 ENSCLMG00005007387 tnni2a.1 (ENSCLMG00005007388) #21 tnni2a.2 (ENSCLMG00005007389) #22 TNNI2 (ENSCLMG00005007390) #23 ENSCLMG00005007391 ENSCLMG00005007392 ENSCLMG00005007394 #23 ENSCLMG00005007396 #23 TNNI2 (ENSCLMG00005007397) #23 ENSCLMG00005007399 #24 tnnt3a (ENSCLMG00005007403) #25 myod1 (ENSCLMG00005007406) ##26 CACNA2D4 (ENSCLMG00005007412) #28 ENSCLMG00005007700 LRTM2 (ENSCLMG00005007704) #29 ENSCLMG00005007712 #30 urahb (ENSCLMG00005007724) #31 ENSCLMG00005007726 GLG1 (ENSCLMG00005007781) #32 RFWD3 (ENSCLMG00005007893) #33 MLKL (ENSCLMG00005007894) #34 TMED6 (ENSCLMG00005007896) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00940000154617.B.d ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Pike perch MODERN SPECIES 51 ENSSLUG00000008410 ENSSLUG00000008415 ENSSLUG00000008422 ENSSLUG00000008432 ENSSLUG00000008441 ENSSLUG00000008445 ENSSLUG00000008451 ENSSLUG00000008461 ENSSLUG00000008472 ENSSLUG00000008480 dldh (ENSSLUG00000008565) #9 ENSSLUG00000009914 SYT8 (ENSSLUG00000009945) #20 ENSSLUG00000009952 tnni2a.2 (ENSSLUG00000009963) #22 tnni2a.4 (ENSSLUG00000009991) #23 ENSSLUG00000010045 ENSSLUG00000010049 ENSSLUG00000010057 #24 tnnt3a (ENSSLUG00000010068) #25 myod1 (ENSSLUG00000010105) ##26 zgc:172145 (ENSSLUG00000010117) #27 CACNA2D4 (ENSSLUG00000010134) #28 LRTM2 (ENSSLUG00000010170) #29 ENSSLUG00000010284 #30 urahb (ENSSLUG00000012700) #31 ENSSLUG00000012703 ENSSLUG00000012707 ENSSLUG00000012711 ENSSLUG00000012719 ENSSLUG00000012721 Channel bull blenny MODERN SPECIES 20 ENSCGOG00000009688 ENSCGOG00000009676 pdcd2l (ENSCGOG00000009673) ENSCGOG00000009670 ENSCGOG00000009667 DUS2 (ENSCGOG00000009109) ENSCGOG00000009096 ENSCGOG00000009092 dldh (ENSCGOG00000008107) #9 ENSCGOG00000008073 SLC7A10 (ENSCGOG00000007383) tnni2a.1 (ENSCGOG00000007358) #21 ENSCGOG00000007345 tnni2a.2 (ENSCGOG00000007341) #22 TNNI2 (ENSCGOG00000007334) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007324) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007317) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007312) #23 ENSCGOG00000007305 #24 ENSCGOG00000007292 zgc:172145 (ENSCGOG00000007280) #27 tnnt3a (ENSCGOG00000007130) #25 myod1 (ENSCGOG00000007087) ##26 zgc:172145 (ENSCGOG00000007083) #27 ENSCGOG00000007080 LRTM2 (ENSCGOG00000007053) #29 CACNA2D4 (ENSCGOG00000007039) #28 ENSCGOG00000006641 #30 urahb (ENSCGOG00000006621) #31 ENSCGOG00000006612 ENSCGOG00000006597 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.f ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Barramundi perch MODERN SPECIES 31 ASB15 (ENSLCAG00010000226) IQUB (ENSLCAG00010000189) ENSLCAG00010013451 slc13a1 (ENSLCAG00010013405) CADPS2 (ENSLCAG00010013231) fezf1 (ENSLCAG00010013213) aass (ENSLCAG00010013014) #7 PTPRZ1 (ENSLCAG00010012605) #8 ENSLCAG00010012479 ENSLCAG00010012477 ENSLCAG00010012473 dldh (ENSLCAG00010012352) #9 SYT8 (ENSLCAG00010012305) #20 ENSLCAG00010012295 tnni2a.2 (ENSLCAG00010012290) #22 TNNI2 (ENSLCAG00010012275) #23 TNNI2 (ENSLCAG00010012249) #21 TNNI2 (ENSLCAG00010012232) #23 ENSLCAG00010012229 ENSLCAG00010012227 #24 ENSLCAG00010012223 tnnt3a (ENSLCAG00010012221) #25 myod1 (ENSLCAG00010012215) ##26 zgc:172145 (ENSLCAG00010012212) #27 CACNA2D4 (ENSLCAG00010012209) #28 LRTM2 (ENSLCAG00010012207) #29 Seriola ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000156482.c ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a.h ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00390000009456 ENSGT00420000029847 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Greater amberjack MODERN SPECIES 160 amfra (ENSSDUG00000000125) pdcd2l (ENSSDUG00000000081) ENSSDUG00000017439 DUS2 (ENSSDUG00000017399) SLC7A10 (ENSSDUG00000017375) faap24 (ENSSDUG00000017353) ENSSDUG00000017304 dldh (ENSSDUG00000017239) #9 SYT8 (ENSSDUG00000017190) #20 ENSSDUG00000017175 ENSSDUG00000017137 tnni2a.1 (ENSSDUG00000017118) #21 tnni2a.2 (ENSSDUG00000017108) #22 ENSSDUG00000017101 TNNI2 (ENSSDUG00000017087) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017072) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017051) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017036) #23 ENSSDUG00000016991 ENSSDUG00000016965 ENSSDUG00000016941 tnnt3a (ENSSDUG00000016913) #25 myod1 (ENSSDUG00000016886) ##26 zgc:172145 (ENSSDUG00000016873) #27 ENSSDUG00000016853 #29 CACNA2D4 (ENSSDUG00000016797) #28 ENSSDUG00000016707 #30 urahb (ENSSDUG00000016691) #31 ENSSDUG00000016686 GLG1 (ENSSDUG00000016609) #32 RFWD3 (ENSSDUG00000016584) #33 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3178 TNNI2 (ENSSLDG00000022266) #23 TNNI2 (ENSSLDG00000022273) #23 TNNI2 (ENSSLDG00000022278) #23 TNNI2 (ENSSLDG00000022288) #23 ENSSLDG00000022300 ENSSLDG00000022311 #24 tnnt3a (ENSSLDG00000022320) #25 myod1 (ENSSLDG00000022337) ##26 zgc:172145 (ENSSLDG00000022358) #27 ENSSLDG00000022362 CACNA2D4 (ENSSLDG00000022368) #28 LRTM2 (ENSSLDG00000022406) #29 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Tongue sole MODERN SPECIES 16 adpgk (ENSCSEG00000001935) ENSCSEG00000001946 exoc3l1 (ENSCSEG00000001976) ENSCSEG00000001985 KIF21A (ENSCSEG00000001988) ENSCSEG00000002001 ANO1 (ENSCSEG00000002014) ENSCSEG00000002069 ENSCSEG00000002072 smpd3 (ENSCSEG00000002076) ENSCSEG00000002089 septin15 (ENSCSEG00000002096) ENSCSEG00000002121 tnni2a.1 (ENSCSEG00000002133) #21 tnni2a.2 (ENSCSEG00000002138) #22 TNNI2 (ENSCSEG00000002145) #23 TNNI2 (ENSCSEG00000002164) #23 TNNI2 (ENSCSEG00000002169) #23 ENSCSEG00000002173 ENSCSEG00000002176 ENSCSEG00000002189 #24 ENSCSEG00000002191 tnnt3a (ENSCSEG00000002198) #25 myod1 (ENSCSEG00000002233) ##26 zgc:172145 (ENSCSEG00000002238) #27 CACNA2D4 (ENSCSEG00000002252) #28 LRTM2 (ENSCSEG00000002266) #29 PEAK1 (ENSCSEG00000002269) syt12 (ENSCSEG00000002273) cat (ENSCSEG00000002281) ifitm5 (ENSCSEG00000002289) Turbot MODERN SPECIES 1 ASB15 (ENSSMAG00000002167) ASB15 (ENSSMAG00000002199) IQUB (ENSSMAG00000002231) slc13a1 (ENSSMAG00000002260) ENSSMAG00000002312 CADPS2 (ENSSMAG00000020348) fezf1 (ENSSMAG00000025856) aass (ENSSMAG00000020423) #7 PTPRZ1 (ENSSMAG00000020456) #8 ENSSMAG00000021503 ENSSMAG00000005976 #9 SYT8 (ENSSMAG00000006038) #20 tnni2a.1 (ENSSMAG00000032761) #21 tnni2a.2 (ENSSMAG00000006098) #22 TNNI2 (ENSSMAG00000006177) #23 TNNI2 (ENSSMAG00000006211) #23 ENSSMAG00000006237 ENSSMAG00000006257 #24 tnnt3a (ENSSMAG00000006288) #25 ENSSMAG00000023239 ENSSMAG00000028689 ENSSMAG00000032749 ENSSMAG00000022264 ENSSMAG00000030166 ENSSMAG00000036791 ENSSMAG00000023873 smpd3 (ENSSMAG00000002332) ENSSMAG00000002348 septin15 (ENSSMAG00000002389) ENSSMAG00000002399 ENSSMAG00000002414 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c ENSGT00390000010961.d Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Climbing perch MODERN SPECIES 19 fezf1 (ENSATEG00000009565) aass (ENSATEG00000009598) #7 PTPRZ1 (ENSATEG00000009734) #8 ENSATEG00000009981 ENSATEG00000009999 ENSATEG00000027494 ENSATEG00000010027 ENSATEG00000010089 ENSATEG00000026154 ENSATEG00000027850 ENSATEG00000027848 ENSATEG00000010140 #9 SYT8 (ENSATEG00000010173) #20 tnni2a.1 (ENSATEG00000010223) #21 TNNI2 (ENSATEG00000010240) #23 TNNI2 (ENSATEG00000010278) #23 TNNI2 (ENSATEG00000010717) #23 ENSATEG00000010747 ENSATEG00000010769 #24 tnnt3a (ENSATEG00000010782) #25 myod1 (ENSATEG00000010852) ##26 zgc:172145 (ENSATEG00000010861) #27 ENSATEG00000010873 #28 ENSATEG00000026163 #29 ENSATEG00000027583 #28 ENSATEG00000011010 #30 urahb (ENSATEG00000027908) #31 ENSATEG00000011076 GLG1 (ENSATEG00000011236) #32 ENSATEG00000011399 #33 MLKL (ENSATEG00000011422) #34 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 17 ENSBSLG00000026461 GRAMD4 (ENSBSLG00000026476) ENSBSLG00000026499 CERK (ENSBSLG00000026507) TAFA5 (ENSBSLG00000026512) brd1b (ENSBSLG00000026513) ftsj1 (ENSBSLG00000026514) ENSBSLG00000003773 ENSBSLG00000003875 ENSBSLG00000003923 ENSBSLG00000004129 ENSBSLG00000004149 tnni2a.1 (ENSBSLG00000004158) #21 tnni2a.2 (ENSBSLG00000004174) #22 TNNI2 (ENSBSLG00000004185) #23 ENSBSLG00000004198 #23 TNNI2 (ENSBSLG00000004211) #23 ENSBSLG00000004751 #23 ENSBSLG00000004764 ENSBSLG00000004780 #24 ENSBSLG00000004819 tnnt3a (ENSBSLG00000004850) #25 myod1 (ENSBSLG00000004886) ##26 CACNA2D4 (ENSBSLG00000005093) #28 ENSBSLG00000005855 #29 ENSBSLG00000005902 #30 urahb (ENSBSLG00000005954) #31 ENSBSLG00000006449 GLG1 (ENSBSLG00000006927) #32 RFWD3 (ENSBSLG00000007791) #33 MLKL (ENSBSLG00000007872) #34 Zig-zag eel MODERN SPECIES 20 ENSMAMG00000022774 PTPRZ1 (ENSMAMG00000027911) #8 ENSMAMG00000022767 ENSMAMG00000022758 ENSMAMG00000025915 ENSMAMG00000022762 ENSMAMG00000024786 ENSMAMG00000022760 ENSMAMG00000022756 #9 SYT8 (ENSMAMG00000026620) #20 ENSMAMG00000025933 tnni2a.1 (ENSMAMG00000022730) #21 tnni2a.2 (ENSMAMG00000022728) #22 TNNI2 (ENSMAMG00000028411) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000025267) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000022722) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000028574) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000024405) #23 ENSMAMG00000026203 ENSMAMG00000025176 tnnt3a (ENSMAMG00000022716) #25 myod1 (ENSMAMG00000025845) ##26 ENSMAMG00000022714 #29 ENSMAMG00000022713 #28 ENSMAMG00000022711 #30 urahb (ENSMAMG00000022710) #31 ENSMAMG00000025621 ENSMAMG00000022709 GLG1 (ENSMAMG00000022699) #32 ENSMAMG00000022695 #33 MLKL (ENSMAMG00000022692) #34 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 327 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000180774 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000174622 ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293.ib ENSGT00940000158293.hb ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00390000010968.a ENSGT00940000178524 Mummichog MODERN SPECIES 2205 wnt2 (ENSFHEG00000009707) asz1 (ENSFHEG00000009691) cftr (ENSFHEG00000009671) ENSFHEG00000009567 ENSFHEG00000009557 ENSFHEG00000009543 ENSFHEG00000009504 BET1L (ENSFHEG00000009463) #13 deaf1 (ENSFHEG00000009441) #14 ENSFHEG00000009421 dldh (ENSFHEG00000009356) #9 SYT8 (ENSFHEG00000009291) #20 ENSFHEG00000009273 tnni2a.2 (ENSFHEG00000009249) #22 TNNI2 (ENSFHEG00000009222) #23 TNNI2 (ENSFHEG00000009184) #23 ENSFHEG00000009159 ENSFHEG00000009155 #24 ENSFHEG00000009147 ENSFHEG00000009127 tnnt3a (ENSFHEG00000009020) #25 myod1 (ENSFHEG00000008982) ##26 ENSFHEG00000008951 #28 LRTM2 (ENSFHEG00000008865) #29 ENSFHEG00000008763 #30 urahb (ENSFHEG00000008753) #31 ENSFHEG00000008745 GRAMD4 (ENSFHEG00000008727) CERK (ENSFHEG00000008626) ENSFHEG00000008607 TAFA5 (ENSFHEG00000008597) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 545 tnni2a.2 (ENSCVAG00000019957) #22 TNNI2 (ENSCVAG00000019942) #23 TNNI2 (ENSCVAG00000019930) #23 TNNI2 (ENSCVAG00000019892) #23 ENSCVAG00000000969 ENSCVAG00000019873 #24 tnnt3a (ENSCVAG00000019864) #25 myod1 (ENSCVAG00000019855) ##26 CACNA2D4 (ENSCVAG00000019847) #28 LRTM2 (ENSCVAG00000019558) #29 ENSCVAG00000019550 #30 ENSCVAG00000019533 GLG1 (ENSCVAG00000019526) #32 RFWD3 (ENSCVAG00000019442) #33 GRAMD4 (ENSCVAG00000019434) ENSCVAG00000019324 CERK (ENSCVAG00000019307) TAFA5 (ENSCVAG00000019290) Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01020000231746 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00390000010968.a Amazon molly MODERN SPECIES 474 ENSPFOG00000014905 st7 (ENSPFOG00000014750) wnt2 (ENSPFOG00000014710) asz1 (ENSPFOG00000014640) cftr (ENSPFOG00000014478) ENSPFOG00000014424 ENSPFOG00000014390 ENSPFOG00000014334 BET1L (ENSPFOG00000014322) #13 deaf1 (ENSPFOG00000014257) #14 ENSPFOG00000013986 dldh (ENSPFOG00000013896) #9 SYT8 (ENSPFOG00000013827) #20 tnni2a.2 (ENSPFOG00000013772) #22 TNNI2 (ENSPFOG00000023624) #23 TNNI2 (ENSPFOG00000013744) #23 TNNI2 (ENSPFOG00000013698) #23 ENSPFOG00000024450 #24 ENSPFOG00000013655 tnnt3a (ENSPFOG00000013555) #25 myod1 (ENSPFOG00000013532) ##26 LRTM2 (ENSPFOG00000013516) #29 CACNA2D4 (ENSPFOG00000013433) #28 ENSPFOG00000013283 #30 urahb (ENSPFOG00000013262) #31 ENSPFOG00000013224 GLG1 (ENSPFOG00000013019) #32 RFWD3 (ENSPFOG00000012973) #33 ENSPFOG00000012969 GRAMD4 (ENSPFOG00000012715) ENSPFOG00000012663 #16 Sailfin molly MODERN SPECIES 1263 ENSPLAG00000001521 dldh (ENSPLAG00000001542) #9 SYT8 (ENSPLAG00000001548) #20 tnni2a.2 (ENSPLAG00000001553) #22 ENSPLAG00000001556 #23 ENSPLAG00000001562 #23 ENSPLAG00000001570 ENSPLAG00000001576 tnnt3a (ENSPLAG00000001599) #25 myod1 (ENSPLAG00000001610) ##26 Guppy MODERN SPECIES 458 wnt2 (ENSPREG00000002673) asz1 (ENSPREG00000002662) cftr (ENSPREG00000002638) CTTNBP2 (ENSPREG00000002579) ENSPREG00000002507 ENSPREG00000002490 ENSPREG00000002453 ENSPREG00000002425 deaf1 (ENSPREG00000002403) #14 ENSPREG00000002322 dldh (ENSPREG00000002267) #9 SYT8 (ENSPREG00000002242) #20 ENSPREG00000002225 ENSPREG00000002208 ENSPREG00000002186 #23 ENSPREG00000002158 #23 TNNI2 (ENSPREG00000002134) #23 ENSPREG00000002125 #24 ENSPREG00000002107 tnnt3a (ENSPREG00000002040) #25 myod1 (ENSPREG00000001997) ##26 ENSPREG00000001945 #28 ENSPREG00000001932 #29 ENSPREG00000001915 #28 ENSPREG00000001880 #30 ENSPREG00000001846 ENSPREG00000001828 GLG1 (ENSPREG00000001759) #32 RFWD3 (ENSPREG00000001734) #33 GRAMD4 (ENSPREG00000001575) ENSPREG00000001519 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 282 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1623 dldh (ENSNFUG00015004817) #9 ENSNFUG00015004770 ENSNFUG00015017402 PTPRZ1 (ENSNFUG00015017375) #8 ENSNFUG00015017364 AASS (ENSNFUG00015016246) #7 fezf1 (ENSNFUG00015016152) ENSNFUG00015016148 ENSNFUG00015016146 CADPS2 (ENSNFUG00015013246) slc13a1 (ENSNFUG00015012971) IQUB (ENSNFUG00015012926) ASB15 (ENSNFUG00015012906) ENSNFUG00015012893 tnni2a.1 (ENSNFUG00015012880) #21 TNNI2 (ENSNFUG00015012847) #23 BX004812.1 (ENSNFUG00015012831) ENSNFUG00015012822 #24 TNNT3A (ENSNFUG00015012775) #25 ENSNFUG00015012762 ANO1 (ENSNFUG00015011844) ENSNFUG00015011772 ENSNFUG00015011757 ENSNFUG00015011747 ENSNFUG00015011739 ripor1 (ENSNFUG00015011725) ctcf (ENSNFUG00015011705) ENSNFUG00015011697 carmil2 (ENSNFUG00015011647) RIC8A (ENSNFUG00015011583) ppp6r3 (ENSNFUG00015011328) Mangrove rivulus MODERN SPECIES 315 tnni2a.2 (ENSKMAG00000007528) #22 ENSKMAG00000007513 #23 ENSKMAG00000007502 ENSKMAG00000007473 #23 ENSKMAG00000007450 ENSKMAG00000007443 #24 tnnt3a (ENSKMAG00000007415) #25 RFWD3 (ENSKMAG00000007381) #33 GLG1 (ENSKMAG00000007311) #32 ENSKMAG00000007281 urahb (ENSKMAG00000007268) #31 ENSKMAG00000007170 #30 ENSKMAG00000007121 #29 CACNA2D4 (ENSKMAG00000006777) #28 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00940000161262.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT01030000234858 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000161262.b ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00390000018285 ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 Chinese medaka MODERN SPECIES 318 TNNI2 (ENSOSIG00000009747) #23 tnni2a.2 (ENSOSIG00000009737) #22 TNNI2 (ENSOSIG00000009722) #23 ENSOSIG00000009709 ENSOSIG00000009705 #24 tnnt3a (ENSOSIG00000009699) #25 myod1 (ENSOSIG00000009675) ##26 ENSOSIG00000009673 LRTM2 (ENSOSIG00000009671) #29 ENSOSIG00000009670 #28 RFWD3 (ENSOSIG00000009667) #33 GLG1 (ENSOSIG00000009567) #32 ENSOSIG00000009561 urahb (ENSOSIG00000009559) #31 ENSOSIG00000009549 #30 znf277 (ENSOSIG00000009505) ENSOSIG00000009503 DUS2 (ENSOSIG00000009224) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 20 ENSORLG00000000419 ENSORLG00000024966 ENSORLG00000024504 ENSORLG00000000450 #20 dldh (ENSORLG00000000461) #9 ENSORLG00000025976 grm8b (ENSORLG00000000478) pot1 (ENSORLG00000000493) GPR37 (ENSORLG00000027795) ENSORLG00000000501 HYAL4 (ENSORLG00000000515) hyal6 (ENSORLG00000000524) ENSORLG00000000533 tnni2a.1 (ENSORLG00000000545) #21 tnni2a.2 (ENSORLG00000024626) #22 TNNI2 (ENSORLG00000000559) #23 TNNI2 (ENSORLG00000000591) #23 ENSORLG00000024559 ENSORLG00000000599 ENSORLG00000025446 #24 tnnt3a (ENSORLG00000000678) #25 myod1 (ENSORLG00000000694) ##26 ENSORLG00000000721 #28 ENSORLG00000027522 #29 ENSORLG00000025119 RFWD3 (ENSORLG00000000737) #33 GLG1 (ENSORLG00000000767) #32 ENSORLG00000024437 ENSORLG00000000773 ENSORLG00000024074 urahb (ENSORLG00000029953) #31 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159477 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00940000161262.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00940000158339 Javanese ricefish MODERN SPECIES 20 scamp2 (ENSOJAG00000006200) fezf1 (ENSOJAG00000006167) slc13a1 (ENSOJAG00000005938) IQUB (ENSOJAG00000005813) hyal6 (ENSOJAG00000005777) HYAL4 (ENSOJAG00000005762) ENSOJAG00000005647 GPR37 (ENSOJAG00000005638) pot1 (ENSOJAG00000005624) grm8b (ENSOJAG00000004853) CHST1 (ENSOJAG00000004747) dldh (ENSOJAG00000003976) #9 SYT8 (ENSOJAG00000003818) #20 tnni2a.1 (ENSOJAG00000003772) #21 TNNI2 (ENSOJAG00000003725) #23 TNNI2 (ENSOJAG00000003627) #23 ENSOJAG00000003599 ENSOJAG00000003563 #24 ENSOJAG00000003546 tnnt3a (ENSOJAG00000003454) #25 myod1 (ENSOJAG00000003402) ##26 ENSOJAG00000003382 #29 RFWD3 (ENSOJAG00000003173) #33 GLG1 (ENSOJAG00000002985) #32 ENSOJAG00000002895 urahb (ENSOJAG00000002909) #31 ENSOJAG00000002852 #30 znf277 (ENSOJAG00000002400) DUS2 (ENSOJAG00000002235) ENSOJAG00000002187 ENSOJAG00000002177 Indian medaka MODERN SPECIES 15 ENSOMEG00000019701 tnni2a.1 (ENSOMEG00000019735) #21 tnni2a.2 (ENSOMEG00000019778) #22 TNNI2 (ENSOMEG00000019805) #23 TNNI2 (ENSOMEG00000019856) #23 ENSOMEG00000019864 #24 ENSOMEG00000019976 tnnt3a (ENSOMEG00000020063) #25 myod1 (ENSOMEG00000020091) ##26 CACNA2D4 (ENSOMEG00000000936) #28 ENSOMEG00000020139 #29 ENSOMEG00000020159 #28 RFWD3 (ENSOMEG00000020218) #33 GLG1 (ENSOMEG00000020401) #32 ENSOMEG00000020438 urahb (ENSOMEG00000020448) #31 ENSOMEG00000020489 #30 znf277 (ENSOMEG00000020520) DUS2 (ENSOMEG00000020631) ENSOMEG00000020663 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.d ENSGT00940000156519.p ENSGT00940000157021 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 258 nup160 (ENSACIG00000015433) slc13a1 (ENSACIG00000015361) ces3 (ENSACIG00000015245) ENSACIG00000015232 zfpm1 (ENSACIG00000015211) ENSACIG00000015203 ENSACIG00000015187 ENSACIG00000015131 ENSACIG00000015126 dldh (ENSACIG00000015096) #9 SYT8 (ENSACIG00000015081) #20 ENSACIG00000015057 tnni2a.1 (ENSACIG00000015042) #21 tnni2a.2 (ENSACIG00000014981) #22 TNNI2 (ENSACIG00000014860) #23 TNNI2 (ENSACIG00000014837) #23 TNNI2 (ENSACIG00000014818) #23 ENSACIG00000014805 #23 ENSACIG00000014797 ENSACIG00000014781 tnnt3a (ENSACIG00000014612) #25 myod1 (ENSACIG00000014400) ##26 Midas cichlid MODERN SPECIES 258 slc13a1 (ENSACIG00000015361) ces3 (ENSACIG00000015245) ENSACIG00000015232 zfpm1 (ENSACIG00000015211) ENSACIG00000015203 ENSACIG00000015187 ENSACIG00000015131 ENSACIG00000015126 dldh (ENSACIG00000015096) #9 SYT8 (ENSACIG00000015081) #20 ENSACIG00000015057 tnni2a.1 (ENSACIG00000015042) #21 tnni2a.2 (ENSACIG00000014981) #22 TNNI2 (ENSACIG00000014860) #23 TNNI2 (ENSACIG00000014837) #23 TNNI2 (ENSACIG00000014818) #23 ENSACIG00000014805 #23 ENSACIG00000014797 ENSACIG00000014781 tnnt3a (ENSACIG00000014612) #25 myod1 (ENSACIG00000014400) ##26 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 ENSGT00390000013269 Nile tilapia MODERN SPECIES 19 GAN (ENSONIG00000010745) foxl1 (ENSONIG00000030034) kiaa0513 (ENSONIG00000010750) slc13a1 (ENSONIG00000010754) ENSONIG00000041520 ENSONIG00000034024 ENSONIG00000010760 zfpm1 (ENSONIG00000035110) ENSONIG00000010767 ENSONIG00000030669 ENSONIG00000028992 dldh (ENSONIG00000010769) #9 SYT8 (ENSONIG00000041185) #20 ENSONIG00000029220 tnni2a.1 (ENSONIG00000010776) #21 tnni2a.4 (ENSONIG00000010787) #23 ENSONIG00000010790 ENSONIG00000033565 #24 ENSONIG00000028193 tnnt3a (ENSONIG00000010794) #25 myod1 (ENSONIG00000010796) ##26 ENSONIG00000031210 CACNA2D4 (ENSONIG00000010799) #28 LRTM2 (ENSONIG00000010803) #29 ENSONIG00000010804 #30 ENSONIG00000037724 urahb (ENSONIG00000039662) #31 ENSONIG00000038642 ENSONIG00000042116 GLG1 (ENSONIG00000010813) #32 RFWD3 (ENSONIG00000010818) #33 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 ENSGT00390000013269 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 ENSGT00390000013269 ENSGT00940000164605 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 ENSGT00390000013269 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 ENSGT00390000013269 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 19 ENSACLG00000001131 ENSACLG00000001165 ENSACLG00000001172 ENSACLG00000001179 ces3 (ENSACLG00000001188) zfpm1 (ENSACLG00000001201) ENSACLG00000001259 dldh (ENSACLG00000001270) #9 SYT8 (ENSACLG00000001358) #20 ENSACLG00000001500 tnni2a.1 (ENSACLG00000001530) #21 ENSACLG00000001555 ENSACLG00000001563 tnni2a.2 (ENSACLG00000001585) #22 TNNI2 (ENSACLG00000001597) #23 ENSACLG00000001643 #23 TNNI2 (ENSACLG00000001689) #23 TNNI2 (ENSACLG00000001715) #23 ENSACLG00000001721 #24 tnnt3a (ENSACLG00000001727) #25 myod1 (ENSACLG00000001809) ##26 CACNA2D4 (ENSACLG00000002230) #28 LRTM2 (ENSACLG00000002286) #29 ENSACLG00000002295 #28 ENSACLG00000002306 #30 urahb (ENSACLG00000002381) #31 ENSACLG00000002396 ENSACLG00000002399 GLG1 (ENSACLG00000002404) #32 RFWD3 (ENSACLG00000002612) #33 MLKL (ENSACLG00000002629) #34 Eastern happy MODERN SPECIES 19 ENSACLG00000001165 ENSACLG00000001172 ENSACLG00000001179 ces3 (ENSACLG00000001188) zfpm1 (ENSACLG00000001201) ENSACLG00000001259 dldh (ENSACLG00000001270) #9 SYT8 (ENSACLG00000001358) #20 ENSACLG00000001500 tnni2a.1 (ENSACLG00000001530) #21 ENSACLG00000001555 ENSACLG00000001563 tnni2a.2 (ENSACLG00000001585) #22 TNNI2 (ENSACLG00000001597) #23 ENSACLG00000001643 #23 TNNI2 (ENSACLG00000001689) #23 TNNI2 (ENSACLG00000001715) #23 ENSACLG00000001721 #24 tnnt3a (ENSACLG00000001727) #25 myod1 (ENSACLG00000001809) ##26 CACNA2D4 (ENSACLG00000002230) #28 LRTM2 (ENSACLG00000002286) #29 ENSACLG00000002295 #28 ENSACLG00000002306 #30 urahb (ENSACLG00000002381) #31 ENSACLG00000002396 ENSACLG00000002399 GLG1 (ENSACLG00000002404) #32 RFWD3 (ENSACLG00000002612) #33 MLKL (ENSACLG00000002629) #34 anpeplb (ENSACLG00000002651) Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 1110 kiaa0513 (ENSMZEG00005016224) slc13a1 (ENSMZEG00005016213) ENSMZEG00005016206 slc13a1 (ENSMZEG00005016201) ces3 (ENSMZEG00005016193) zfpm1 (ENSMZEG00005016182) ENSMZEG00005016163 dldh (ENSMZEG00005016147) #9 SYT8 (ENSMZEG00005016137) #20 ENSMZEG00005016129 tnni2a.1 (ENSMZEG00005016126) #21 tnni2a.2 (ENSMZEG00005016116) #22 TNNI2 (ENSMZEG00005016110) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016101) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016090) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016082) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016076) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016067) #23 ENSMZEG00005016060 ENSMZEG00005016057 ENSMZEG00005016053 ENSMZEG00005016049 #24 tnnt3a (ENSMZEG00005016043) #25 myod1 (ENSMZEG00005016037) ##26 LRTM2 (ENSMZEG00005016031) #29 CACNA2D4 (ENSMZEG00005016019) #28 ENSMZEG00005016011 #30 urahb (ENSMZEG00005016003) #31 ENSMZEG00005015977 GLG1 (ENSMZEG00005015951) #32 RFWD3 (ENSMZEG00005015944) #33 Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 1110 slc13a1 (ENSMZEG00005016213) ENSMZEG00005016206 slc13a1 (ENSMZEG00005016201) ces3 (ENSMZEG00005016193) zfpm1 (ENSMZEG00005016182) ENSMZEG00005016163 dldh (ENSMZEG00005016147) #9 SYT8 (ENSMZEG00005016137) #20 ENSMZEG00005016129 tnni2a.1 (ENSMZEG00005016126) #21 tnni2a.2 (ENSMZEG00005016116) #22 TNNI2 (ENSMZEG00005016110) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016101) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016090) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016082) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016076) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016067) #23 ENSMZEG00005016060 ENSMZEG00005016057 ENSMZEG00005016053 ENSMZEG00005016049 #24 tnnt3a (ENSMZEG00005016043) #25 myod1 (ENSMZEG00005016037) ##26 LRTM2 (ENSMZEG00005016031) #29 CACNA2D4 (ENSMZEG00005016019) #28 ENSMZEG00005016011 #30 urahb (ENSMZEG00005016003) #31 ENSMZEG00005015977 GLG1 (ENSMZEG00005015951) #32 RFWD3 (ENSMZEG00005015944) #33 MLKL (ENSMZEG00005015932) #34 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1110 ENSMZEG00005016243 foxl1 (ENSMZEG00005016238) kiaa0513 (ENSMZEG00005016224) slc13a1 (ENSMZEG00005016213) ENSMZEG00005016206 slc13a1 (ENSMZEG00005016201) ces3 (ENSMZEG00005016193) zfpm1 (ENSMZEG00005016182) ENSMZEG00005016163 dldh (ENSMZEG00005016147) #9 SYT8 (ENSMZEG00005016137) #20 ENSMZEG00005016129 tnni2a.1 (ENSMZEG00005016126) #21 tnni2a.2 (ENSMZEG00005016116) #22 TNNI2 (ENSMZEG00005016110) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016101) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016090) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016082) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016076) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016067) #23 ENSMZEG00005016060 ENSMZEG00005016057 ENSMZEG00005016053 ENSMZEG00005016049 #24 tnnt3a (ENSMZEG00005016043) #25 myod1 (ENSMZEG00005016037) ##26 LRTM2 (ENSMZEG00005016031) #29 CACNA2D4 (ENSMZEG00005016019) #28 ENSMZEG00005016011 #30 urahb (ENSMZEG00005016003) #31 ENSMZEG00005015977 P. nyererei DUPLICATION P. nyererei MODERN SPECIES 524 dldh (ENSPNYG00000019274) #9 SYT8 (ENSPNYG00000019335) #20 ENSPNYG00000019407 tnni2a.1 (ENSPNYG00000019446) #21 tnni2a.2 (ENSPNYG00000019708) #22 TNNI2 (ENSPNYG00000019723) #23 ENSPNYG00000019743 #23 TNNI2 (ENSPNYG00000019768) #23 TNNI2 (ENSPNYG00000019789) #23 ENSPNYG00000019796 tnnt3a (ENSPNYG00000019816) #25 myod1 (ENSPNYG00000019881) ##26 CACNA2D4 (ENSPNYG00000019913) #28 LRTM2 (ENSPNYG00000019981) #29 ENSPNYG00000020007 #30 urahb (ENSPNYG00000020098) #31 ENSPNYG00000020106 GLG1 (ENSPNYG00000020129) #32 RFWD3 (ENSPNYG00000020232) #33 anpeplb (ENSPNYG00000020252) arpin (ENSPNYG00000020274) ENSPNYG00000020285 P. nyererei MODERN SPECIES 524 dldh (ENSPNYG00000019274) #9 SYT8 (ENSPNYG00000019335) #20 ENSPNYG00000019407 tnni2a.1 (ENSPNYG00000019446) #21 tnni2a.2 (ENSPNYG00000019708) #22 TNNI2 (ENSPNYG00000019723) #23 ENSPNYG00000019743 #23 TNNI2 (ENSPNYG00000019768) #23 TNNI2 (ENSPNYG00000019789) #23 ENSPNYG00000019796 tnnt3a (ENSPNYG00000019816) #25 myod1 (ENSPNYG00000019881) ##26 CACNA2D4 (ENSPNYG00000019913) #28 LRTM2 (ENSPNYG00000019981) #29 ENSPNYG00000020007 #30 urahb (ENSPNYG00000020098) #31 ENSPNYG00000020106 GLG1 (ENSPNYG00000020129) #32 RFWD3 (ENSPNYG00000020232) #33 anpeplb (ENSPNYG00000020252) arpin (ENSPNYG00000020274) ENSPNYG00000020285 ldhd (ENSPNYG00000020302) Burton s mouthbrooder DUPLICATION Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1105 dldh (ENSHBUG00000010870) #9 SYT8 (ENSHBUG00000010808) #20 tnni2a.1 (ENSHBUG00000010797) #21 tnni2a.2 (ENSHBUG00000010773) #22 TNNI2 (ENSHBUG00000010751) #23 ENSHBUG00000010740 #23 TNNI2 (ENSHBUG00000010717) #23 ENSHBUG00000010706 #23 ENSHBUG00000010695 ENSHBUG00000010683 #24 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1105 dldh (ENSHBUG00000010870) #9 SYT8 (ENSHBUG00000010808) #20 tnni2a.1 (ENSHBUG00000010797) #21 tnni2a.2 (ENSHBUG00000010773) #22 TNNI2 (ENSHBUG00000010751) #23 ENSHBUG00000010740 #23 TNNI2 (ENSHBUG00000010717) #23 ENSHBUG00000010706 #23 ENSHBUG00000010695 ENSHBUG00000010683 #24 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01020000231746 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 20 slc13a1 (ENSMMDG00005004181) CADPS2 (ENSMMDG00005004524) fezf1 (ENSMMDG00005008356) aass (ENSMMDG00005008411) #7 PTPRZ1 (ENSMMDG00005010843) #8 dldh (ENSMMDG00005010882) #9 ENSMMDG00005010938 ENSMMDG00005010939 SYT8 (ENSMMDG00005010940) #20 tnni2a.1 (ENSMMDG00005010942) #21 tnni2a.2 (ENSMMDG00005010943) #22 ENSMMDG00005010944 #23 ENSMMDG00005010945 #23 ENSMMDG00005010946 #23 ENSMMDG00005010947 #23 TNNI2 (ENSMMDG00005010948) #23 ENSMMDG00005010949 #24 tnnt3a (ENSMMDG00005010950) #25 myod1 (ENSMMDG00005010952) ##26 zgc:172145 (ENSMMDG00005010974) #27 CACNA2D4 (ENSMMDG00005010984) #28 LRTM2 (ENSMMDG00005011155) #29 ENSMMDG00005011190 #30 urahb (ENSMMDG00005012437) #31 acot19 (ENSMMDG00005012454) ENSMMDG00005012464 ENSMMDG00005012488 ENSMMDG00005012495 ENSMMDG00005012577 ENSMMDG00005012579 ENSMMDG00005012580 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.d Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.d Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.d Clown anemonefish MODERN SPECIES 751 aass (ENSAOCG00000017468) #7 PTPRZ1 (ENSAOCG00000017569) #8 dldh (ENSAOCG00000002339) #9 ENSAOCG00000002665 #20 tnni2a.1 (ENSAOCG00000017857) #21 tnni2a.2 (ENSAOCG00000017871) #22 TNNI2 (ENSAOCG00000017888) #23 ENSAOCG00000002393 #23 TNNI2 (ENSAOCG00000017932) #23 TNNI2 (ENSAOCG00000017959) #23 Orange clownfish MODERN SPECIES 18 slc13a1 (ENSAPEG00000016967) ENSAPEG00000016930 CADPS2 (ENSAPEG00000016782) fezf1 (ENSAPEG00000016744) aass (ENSAPEG00000016653) #7 ENSAPEG00000016522 #8 ENSAPEG00000016488 #8 dldh (ENSAPEG00000016431) #9 SYT8 (ENSAPEG00000016419) #20 ENSAPEG00000016387 tnni2a.1 (ENSAPEG00000016379) #21 tnni2a.2 (ENSAPEG00000016369) #22 TNNI2 (ENSAPEG00000016355) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016331) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016303) #23 TNNI2 (ENSAPEG00000016276) #23 ENSAPEG00000016264 ENSAPEG00000016255 #24 ENSAPEG00000016238 myod1 (ENSAPEG00000016219) ##26 tnnt3a (ENSAPEG00000016176) #25 ENSAPEG00000016163 #27 LRTM2 (ENSAPEG00000016139) #29 CACNA2D4 (ENSAPEG00000015687) #28 ENSAPEG00000015651 #30 urahb (ENSAPEG00000015634) #31 ENSAPEG00000015507 GLG1 (ENSAPEG00000015395) #32 RFWD3 (ENSAPEG00000015379) #33 MLKL (ENSAPEG00000015334) #34 TMED6 (ENSAPEG00000015317) Spiny chromis MODERN SPECIES 1278 tnni2a.1 (ENSAPOG00000010015) #21 ENSAPOG00000010022 tnni2a.2 (ENSAPOG00000010244) #22 TNNI2 (ENSAPOG00000010262) #23 ENSAPOG00000010281 #23 TNNI2 (ENSAPOG00000010314) #23 TNNI2 (ENSAPOG00000010340) #23 tmem106bb (ENSAPOG00000010349) arl4ab (ENSAPOG00000010415) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 478 dldh (ENSSPAG00000007152) #9 SYT8 (ENSSPAG00000007134) #20 ENSSPAG00000007118 tnni2a.1 (ENSSPAG00000007097) #21 tnni2a.2 (ENSSPAG00000007090) #22 ENSSPAG00000007079 #23 ENSSPAG00000007073 #23 ENSSPAG00000007042 #23 TNNI2 (ENSSPAG00000007029) #23 ENSSPAG00000007019 ENSSPAG00000007014 #24 tnnt3a (ENSSPAG00000006984) #25 myod1 (ENSSPAG00000006959) ##26 ENSSPAG00000006936 ENSSPAG00000006900 #29 CACNA2D4 (ENSSPAG00000005360) #28 ENSSPAG00000005219 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 ENSGT00390000010961.d Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 ENSGT00390000013269 ENSGT00940000164605 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 ENSGT00390000013269 ENSGT00940000164605 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 ENSGT00390000013269 ENSGT00940000164605 ENSGT00530000064251 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1105 dldh (ENSHBUG00000010870) #9 SYT8 (ENSHBUG00000010808) #20 tnni2a.1 (ENSHBUG00000010797) #21 tnni2a.2 (ENSHBUG00000010773) #22 TNNI2 (ENSHBUG00000010751) #23 ENSHBUG00000010740 #23 TNNI2 (ENSHBUG00000010717) #23 ENSHBUG00000010706 #23 ENSHBUG00000010695 ENSHBUG00000010683 #24 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 ENSGT00390000013269 ENSGT00940000164605 P. nyererei MODERN SPECIES 524 dldh (ENSPNYG00000019274) #9 SYT8 (ENSPNYG00000019335) #20 ENSPNYG00000019407 tnni2a.1 (ENSPNYG00000019446) #21 tnni2a.2 (ENSPNYG00000019708) #22 TNNI2 (ENSPNYG00000019723) #23 ENSPNYG00000019743 #23 TNNI2 (ENSPNYG00000019768) #23 TNNI2 (ENSPNYG00000019789) #23 ENSPNYG00000019796 tnnt3a (ENSPNYG00000019816) #25 myod1 (ENSPNYG00000019881) ##26 CACNA2D4 (ENSPNYG00000019913) #28 LRTM2 (ENSPNYG00000019981) #29 ENSPNYG00000020007 #30 urahb (ENSPNYG00000020098) #31 ENSPNYG00000020106 GLG1 (ENSPNYG00000020129) #32 RFWD3 (ENSPNYG00000020232) #33 anpeplb (ENSPNYG00000020252) arpin (ENSPNYG00000020274) ENSPNYG00000020285 ldhd (ENSPNYG00000020302) znrf1 (ENSPNYG00000020314) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.c #34 ENSGT00390000013269 ENSGT00940000164605 Eastern happy MODERN SPECIES 19 ENSACLG00000001172 ENSACLG00000001179 ces3 (ENSACLG00000001188) zfpm1 (ENSACLG00000001201) ENSACLG00000001259 dldh (ENSACLG00000001270) #9 SYT8 (ENSACLG00000001358) #20 ENSACLG00000001500 tnni2a.1 (ENSACLG00000001530) #21 ENSACLG00000001555 ENSACLG00000001563 tnni2a.2 (ENSACLG00000001585) #22 TNNI2 (ENSACLG00000001597) #23 ENSACLG00000001643 #23 TNNI2 (ENSACLG00000001689) #23 TNNI2 (ENSACLG00000001715) #23 ENSACLG00000001721 #24 tnnt3a (ENSACLG00000001727) #25 myod1 (ENSACLG00000001809) ##26 CACNA2D4 (ENSACLG00000002230) #28 LRTM2 (ENSACLG00000002286) #29 ENSACLG00000002295 #28 ENSACLG00000002306 #30 urahb (ENSACLG00000002381) #31 ENSACLG00000002396 ENSACLG00000002399 GLG1 (ENSACLG00000002404) #32 RFWD3 (ENSACLG00000002612) #33 MLKL (ENSACLG00000002629) #34 anpeplb (ENSACLG00000002651) arpin (ENSACLG00000002677) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1110 ENSMZEG00005016206 slc13a1 (ENSMZEG00005016201) ces3 (ENSMZEG00005016193) zfpm1 (ENSMZEG00005016182) ENSMZEG00005016163 dldh (ENSMZEG00005016147) #9 SYT8 (ENSMZEG00005016137) #20 ENSMZEG00005016129 tnni2a.1 (ENSMZEG00005016126) #21 tnni2a.2 (ENSMZEG00005016116) #22 TNNI2 (ENSMZEG00005016110) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016101) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016090) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016082) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016076) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016067) #23 ENSMZEG00005016060 ENSMZEG00005016057 ENSMZEG00005016053 ENSMZEG00005016049 #24 tnnt3a (ENSMZEG00005016043) #25 myod1 (ENSMZEG00005016037) ##26 LRTM2 (ENSMZEG00005016031) #29 CACNA2D4 (ENSMZEG00005016019) #28 ENSMZEG00005016011 #30 urahb (ENSMZEG00005016003) #31 ENSMZEG00005015977 GLG1 (ENSMZEG00005015951) #32 RFWD3 (ENSMZEG00005015944) #33 MLKL (ENSMZEG00005015932) #34 si:dkey-12e7.1 (ENSMZEG00005015924) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 429 zfpm1 (ENSNBRG00000000569) ENSNBRG00000000542 dldh (ENSNBRG00000000346) #9 SYT8 (ENSNBRG00000000324) #20 ENSNBRG00000000308 tnni2a.2 (ENSNBRG00000000291) #22 ENSNBRG00000000285 #23 TNNI2 (ENSNBRG00000000275) #23 ENSNBRG00000000267 ENSNBRG00000000262 ENSNBRG00000022480 tnnt3a (ENSNBRG00000022442) #25 myod1 (ENSNBRG00000022428) ##26 ENSNBRG00000022414 ENSNBRG00000022400 #30 urahb (ENSNBRG00000022377) #31 ENSNBRG00000022322 GLG1 (ENSNBRG00000022286) #32 RFWD3 (ENSNBRG00000022266) #33 MLKL (ENSNBRG00000022248) #34 si:dkey-12e7.1 (ENSNBRG00000022234) anpeplb (ENSNBRG00000022087) ENSNBRG00000022049 Midas cichlid MODERN SPECIES 258 ces3 (ENSACIG00000015245) ENSACIG00000015232 zfpm1 (ENSACIG00000015211) ENSACIG00000015203 ENSACIG00000015187 ENSACIG00000015131 ENSACIG00000015126 dldh (ENSACIG00000015096) #9 SYT8 (ENSACIG00000015081) #20 ENSACIG00000015057 tnni2a.1 (ENSACIG00000015042) #21 tnni2a.2 (ENSACIG00000014981) #22 TNNI2 (ENSACIG00000014860) #23 TNNI2 (ENSACIG00000014837) #23 TNNI2 (ENSACIG00000014818) #23 ENSACIG00000014805 #23 ENSACIG00000014797 ENSACIG00000014781 tnnt3a (ENSACIG00000014612) #25 myod1 (ENSACIG00000014400) ##26 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00940000157021 ENSGT00420000029847 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000159477 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00940000161262.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075044 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156476.h ENSGT00940000159477 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00940000161262.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156131.a.a Indian medaka MODERN SPECIES 15 ENSOMEG00000019701 tnni2a.1 (ENSOMEG00000019735) #21 tnni2a.2 (ENSOMEG00000019778) #22 TNNI2 (ENSOMEG00000019805) #23 TNNI2 (ENSOMEG00000019856) #23 ENSOMEG00000019864 #24 ENSOMEG00000019976 tnnt3a (ENSOMEG00000020063) #25 myod1 (ENSOMEG00000020091) ##26 CACNA2D4 (ENSOMEG00000000936) #28 ENSOMEG00000020139 #29 ENSOMEG00000020159 #28 RFWD3 (ENSOMEG00000020218) #33 GLG1 (ENSOMEG00000020401) #32 ENSOMEG00000020438 urahb (ENSOMEG00000020448) #31 ENSOMEG00000020489 #30 znf277 (ENSOMEG00000020520) DUS2 (ENSOMEG00000020631) Javanese ricefish MODERN SPECIES 20 mpi (ENSOJAG00000006219) scamp2 (ENSOJAG00000006200) fezf1 (ENSOJAG00000006167) slc13a1 (ENSOJAG00000005938) IQUB (ENSOJAG00000005813) hyal6 (ENSOJAG00000005777) HYAL4 (ENSOJAG00000005762) ENSOJAG00000005647 GPR37 (ENSOJAG00000005638) pot1 (ENSOJAG00000005624) grm8b (ENSOJAG00000004853) CHST1 (ENSOJAG00000004747) dldh (ENSOJAG00000003976) #9 SYT8 (ENSOJAG00000003818) #20 tnni2a.1 (ENSOJAG00000003772) #21 TNNI2 (ENSOJAG00000003725) #23 TNNI2 (ENSOJAG00000003627) #23 ENSOJAG00000003599 ENSOJAG00000003563 #24 ENSOJAG00000003546 tnnt3a (ENSOJAG00000003454) #25 myod1 (ENSOJAG00000003402) ##26 ENSOJAG00000003382 #29 RFWD3 (ENSOJAG00000003173) #33 GLG1 (ENSOJAG00000002985) #32 ENSOJAG00000002895 urahb (ENSOJAG00000002909) #31 ENSOJAG00000002852 #30 znf277 (ENSOJAG00000002400) DUS2 (ENSOJAG00000002235) ENSOJAG00000002187 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT01030000234858 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000161262.b ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00390000018285 ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a Chinese medaka MODERN SPECIES 318 TNNI2 (ENSOSIG00000009747) #23 tnni2a.2 (ENSOSIG00000009737) #22 TNNI2 (ENSOSIG00000009722) #23 ENSOSIG00000009709 ENSOSIG00000009705 #24 tnnt3a (ENSOSIG00000009699) #25 myod1 (ENSOSIG00000009675) ##26 ENSOSIG00000009673 LRTM2 (ENSOSIG00000009671) #29 ENSOSIG00000009670 #28 RFWD3 (ENSOSIG00000009667) #33 GLG1 (ENSOSIG00000009567) #32 ENSOSIG00000009561 urahb (ENSOSIG00000009559) #31 ENSOSIG00000009549 #30 znf277 (ENSOSIG00000009505) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 20 ENSORLG00000024966 ENSORLG00000024504 ENSORLG00000000450 #20 dldh (ENSORLG00000000461) #9 ENSORLG00000025976 grm8b (ENSORLG00000000478) pot1 (ENSORLG00000000493) GPR37 (ENSORLG00000027795) ENSORLG00000000501 HYAL4 (ENSORLG00000000515) hyal6 (ENSORLG00000000524) ENSORLG00000000533 tnni2a.1 (ENSORLG00000000545) #21 tnni2a.2 (ENSORLG00000024626) #22 TNNI2 (ENSORLG00000000559) #23 TNNI2 (ENSORLG00000000591) #23 ENSORLG00000024559 ENSORLG00000000599 ENSORLG00000025446 #24 tnnt3a (ENSORLG00000000678) #25 myod1 (ENSORLG00000000694) ##26 ENSORLG00000000721 #28 ENSORLG00000027522 #29 ENSORLG00000025119 RFWD3 (ENSORLG00000000737) #33 GLG1 (ENSORLG00000000767) #32 ENSORLG00000024437 ENSORLG00000000773 ENSORLG00000024074 urahb (ENSORLG00000029953) #31 ENSORLG00000000787 #30 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.d Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 282 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 315 tnni2a.2 (ENSKMAG00000007528) #22 ENSKMAG00000007513 #23 ENSKMAG00000007502 ENSKMAG00000007473 #23 ENSKMAG00000007450 ENSKMAG00000007443 #24 tnnt3a (ENSKMAG00000007415) #25 RFWD3 (ENSKMAG00000007381) #33 GLG1 (ENSKMAG00000007311) #32 ENSKMAG00000007281 urahb (ENSKMAG00000007268) #31 ENSKMAG00000007170 #30 ENSKMAG00000007121 #29 CACNA2D4 (ENSKMAG00000006777) #28 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000174622 ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00390000010968.a NAME_4 DUPLICATION NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293.ib ENSGT00940000158293.hb ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00390000010968.a ENSGT00940000178524 ENSGT00940000156976.gb Sheepshead minnow MODERN SPECIES 545 tnni2a.2 (ENSCVAG00000019957) #22 TNNI2 (ENSCVAG00000019942) #23 TNNI2 (ENSCVAG00000019930) #23 TNNI2 (ENSCVAG00000019892) #23 ENSCVAG00000000969 ENSCVAG00000019873 #24 tnnt3a (ENSCVAG00000019864) #25 myod1 (ENSCVAG00000019855) ##26 CACNA2D4 (ENSCVAG00000019847) #28 LRTM2 (ENSCVAG00000019558) #29 ENSCVAG00000019550 #30 ENSCVAG00000019533 GLG1 (ENSCVAG00000019526) #32 RFWD3 (ENSCVAG00000019442) #33 GRAMD4 (ENSCVAG00000019434) ENSCVAG00000019324 CERK (ENSCVAG00000019307) TAFA5 (ENSCVAG00000019290) ENSCVAG00000019275 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293.ib ENSGT00940000158293.hb ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00390000010968.a Sheepshead minnow MODERN SPECIES 545 tnni2a.2 (ENSCVAG00000019957) #22 TNNI2 (ENSCVAG00000019942) #23 TNNI2 (ENSCVAG00000019930) #23 TNNI2 (ENSCVAG00000019892) #23 ENSCVAG00000000969 ENSCVAG00000019873 #24 tnnt3a (ENSCVAG00000019864) #25 myod1 (ENSCVAG00000019855) ##26 CACNA2D4 (ENSCVAG00000019847) #28 LRTM2 (ENSCVAG00000019558) #29 ENSCVAG00000019550 #30 ENSCVAG00000019533 GLG1 (ENSCVAG00000019526) #32 RFWD3 (ENSCVAG00000019442) #33 GRAMD4 (ENSCVAG00000019434) ENSCVAG00000019324 CERK (ENSCVAG00000019307) Mummichog MODERN SPECIES 2205 st7 (ENSFHEG00000009944) wnt2 (ENSFHEG00000009707) asz1 (ENSFHEG00000009691) cftr (ENSFHEG00000009671) ENSFHEG00000009567 ENSFHEG00000009557 ENSFHEG00000009543 ENSFHEG00000009504 BET1L (ENSFHEG00000009463) #13 deaf1 (ENSFHEG00000009441) #14 ENSFHEG00000009421 dldh (ENSFHEG00000009356) #9 SYT8 (ENSFHEG00000009291) #20 ENSFHEG00000009273 tnni2a.2 (ENSFHEG00000009249) #22 TNNI2 (ENSFHEG00000009222) #23 TNNI2 (ENSFHEG00000009184) #23 ENSFHEG00000009159 ENSFHEG00000009155 #24 ENSFHEG00000009147 ENSFHEG00000009127 tnnt3a (ENSFHEG00000009020) #25 myod1 (ENSFHEG00000008982) ##26 ENSFHEG00000008951 #28 LRTM2 (ENSFHEG00000008865) #29 ENSFHEG00000008763 #30 urahb (ENSFHEG00000008753) #31 ENSFHEG00000008745 GRAMD4 (ENSFHEG00000008727) CERK (ENSFHEG00000008626) ENSFHEG00000008607 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00390000010968.a Poecilia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01020000231746 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00390000010968.a NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00940000158022 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000000873.a.b ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000017767.a.b Sailfin molly MODERN SPECIES 1263 ENSPLAG00000001521 dldh (ENSPLAG00000001542) #9 SYT8 (ENSPLAG00000001548) #20 tnni2a.2 (ENSPLAG00000001553) #22 ENSPLAG00000001556 #23 ENSPLAG00000001562 #23 ENSPLAG00000001570 ENSPLAG00000001576 tnnt3a (ENSPLAG00000001599) #25 myod1 (ENSPLAG00000001610) ##26 Amazon molly DUPLICATION Amazon molly MODERN SPECIES 474 gpd2 (ENSPFOG00000014961) ENSPFOG00000014905 st7 (ENSPFOG00000014750) wnt2 (ENSPFOG00000014710) asz1 (ENSPFOG00000014640) cftr (ENSPFOG00000014478) ENSPFOG00000014424 ENSPFOG00000014390 ENSPFOG00000014334 BET1L (ENSPFOG00000014322) #13 deaf1 (ENSPFOG00000014257) #14 ENSPFOG00000013986 dldh (ENSPFOG00000013896) #9 SYT8 (ENSPFOG00000013827) #20 tnni2a.2 (ENSPFOG00000013772) #22 TNNI2 (ENSPFOG00000023624) #23 TNNI2 (ENSPFOG00000013744) #23 TNNI2 (ENSPFOG00000013698) #23 ENSPFOG00000024450 #24 ENSPFOG00000013655 tnnt3a (ENSPFOG00000013555) #25 myod1 (ENSPFOG00000013532) ##26 LRTM2 (ENSPFOG00000013516) #29 CACNA2D4 (ENSPFOG00000013433) #28 ENSPFOG00000013283 #30 urahb (ENSPFOG00000013262) #31 ENSPFOG00000013224 GLG1 (ENSPFOG00000013019) #32 RFWD3 (ENSPFOG00000012973) #33 ENSPFOG00000012969 GRAMD4 (ENSPFOG00000012715) Amazon molly MODERN SPECIES 474 st7 (ENSPFOG00000014750) wnt2 (ENSPFOG00000014710) asz1 (ENSPFOG00000014640) cftr (ENSPFOG00000014478) ENSPFOG00000014424 ENSPFOG00000014390 ENSPFOG00000014334 BET1L (ENSPFOG00000014322) #13 deaf1 (ENSPFOG00000014257) #14 ENSPFOG00000013986 dldh (ENSPFOG00000013896) #9 SYT8 (ENSPFOG00000013827) #20 tnni2a.2 (ENSPFOG00000013772) #22 TNNI2 (ENSPFOG00000023624) #23 TNNI2 (ENSPFOG00000013744) #23 TNNI2 (ENSPFOG00000013698) #23 ENSPFOG00000024450 #24 ENSPFOG00000013655 tnnt3a (ENSPFOG00000013555) #25 myod1 (ENSPFOG00000013532) ##26 LRTM2 (ENSPFOG00000013516) #29 CACNA2D4 (ENSPFOG00000013433) #28 ENSPFOG00000013283 #30 urahb (ENSPFOG00000013262) #31 ENSPFOG00000013224 GLG1 (ENSPFOG00000013019) #32 RFWD3 (ENSPFOG00000012973) #33 ENSPFOG00000012969 GRAMD4 (ENSPFOG00000012715) ENSPFOG00000012663 #16 CERK (ENSPFOG00000012654) Guppy DUPLICATION Guppy MODERN SPECIES 458 st7 (ENSPREG00000002700) wnt2 (ENSPREG00000002673) asz1 (ENSPREG00000002662) cftr (ENSPREG00000002638) CTTNBP2 (ENSPREG00000002579) ENSPREG00000002507 ENSPREG00000002490 ENSPREG00000002453 ENSPREG00000002425 deaf1 (ENSPREG00000002403) #14 ENSPREG00000002322 dldh (ENSPREG00000002267) #9 SYT8 (ENSPREG00000002242) #20 ENSPREG00000002225 ENSPREG00000002208 ENSPREG00000002186 #23 ENSPREG00000002158 #23 TNNI2 (ENSPREG00000002134) #23 ENSPREG00000002125 #24 ENSPREG00000002107 tnnt3a (ENSPREG00000002040) #25 myod1 (ENSPREG00000001997) ##26 ENSPREG00000001945 #28 ENSPREG00000001932 #29 ENSPREG00000001915 #28 ENSPREG00000001880 #30 ENSPREG00000001846 ENSPREG00000001828 GLG1 (ENSPREG00000001759) #32 RFWD3 (ENSPREG00000001734) #33 GRAMD4 (ENSPREG00000001575) Guppy MODERN SPECIES 458 asz1 (ENSPREG00000002662) cftr (ENSPREG00000002638) CTTNBP2 (ENSPREG00000002579) ENSPREG00000002507 ENSPREG00000002490 ENSPREG00000002453 ENSPREG00000002425 deaf1 (ENSPREG00000002403) #14 ENSPREG00000002322 dldh (ENSPREG00000002267) #9 SYT8 (ENSPREG00000002242) #20 ENSPREG00000002225 ENSPREG00000002208 ENSPREG00000002186 #23 ENSPREG00000002158 #23 TNNI2 (ENSPREG00000002134) #23 ENSPREG00000002125 #24 ENSPREG00000002107 tnnt3a (ENSPREG00000002040) #25 myod1 (ENSPREG00000001997) ##26 ENSPREG00000001945 #28 ENSPREG00000001932 #29 ENSPREG00000001915 #28 ENSPREG00000001880 #30 ENSPREG00000001846 ENSPREG00000001828 GLG1 (ENSPREG00000001759) #32 RFWD3 (ENSPREG00000001734) #33 GRAMD4 (ENSPREG00000001575) ENSPREG00000001519 CERK (ENSPREG00000001487) Platyfish DUPLICATION Platyfish MODERN SPECIES 11 wnt2 (ENSXMAG00000004456) asz1 (ENSXMAG00000014458) cftr (ENSXMAG00000006463) CTTNBP2 (ENSXMAG00000011487) ENSXMAG00000017307 ENSXMAG00000011708 atp2b1b (ENSXMAG00000011746) BET1L (ENSXMAG00000023928) #13 deaf1 (ENSXMAG00000013352) #14 ENSXMAG00000013383 ENSXMAG00000029031 dldh (ENSXMAG00000013397) #9 SYT8 (ENSXMAG00000013405) #20 ENSXMAG00000029853 tnni2a.2 (ENSXMAG00000013409) #22 TNNI2 (ENSXMAG00000013411) #23 TNNI2 (ENSXMAG00000005048) #23 ENSXMAG00000001183 ENSXMAG00000026868 #24 tnnt3a (ENSXMAG00000007434) #25 myod1 (ENSXMAG00000026443) ##26 CACNA2D4 (ENSXMAG00000029376) #28 ENSXMAG00000025768 #29 ENSXMAG00000002743 #28 CPA1 (ENSXMAG00000008217) ENSXMAG00000000273 GPR37 (ENSXMAG00000000281) immp2l (ENSXMAG00000029951) ENSXMAG00000023358 ENSXMAG00000012291 pdcd2l (ENSXMAG00000012292) Platyfish MODERN SPECIES 11 asz1 (ENSXMAG00000014458) cftr (ENSXMAG00000006463) CTTNBP2 (ENSXMAG00000011487) ENSXMAG00000017307 ENSXMAG00000011708 atp2b1b (ENSXMAG00000011746) BET1L (ENSXMAG00000023928) #13 deaf1 (ENSXMAG00000013352) #14 ENSXMAG00000013383 ENSXMAG00000029031 dldh (ENSXMAG00000013397) #9 SYT8 (ENSXMAG00000013405) #20 ENSXMAG00000029853 tnni2a.2 (ENSXMAG00000013409) #22 TNNI2 (ENSXMAG00000013411) #23 TNNI2 (ENSXMAG00000005048) #23 ENSXMAG00000001183 ENSXMAG00000026868 #24 tnnt3a (ENSXMAG00000007434) #25 myod1 (ENSXMAG00000026443) ##26 CACNA2D4 (ENSXMAG00000029376) #28 ENSXMAG00000025768 #29 ENSXMAG00000002743 #28 CPA1 (ENSXMAG00000008217) ENSXMAG00000000273 GPR37 (ENSXMAG00000000281) immp2l (ENSXMAG00000029951) ENSXMAG00000023358 ENSXMAG00000012291 pdcd2l (ENSXMAG00000012292) DUS2 (ENSXMAG00000012268) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Carangaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Tongue sole MODERN SPECIES 16 exoc3l1 (ENSCSEG00000001976) ENSCSEG00000001985 KIF21A (ENSCSEG00000001988) ENSCSEG00000002001 ANO1 (ENSCSEG00000002014) ENSCSEG00000002069 ENSCSEG00000002072 smpd3 (ENSCSEG00000002076) ENSCSEG00000002089 septin15 (ENSCSEG00000002096) ENSCSEG00000002121 tnni2a.1 (ENSCSEG00000002133) #21 tnni2a.2 (ENSCSEG00000002138) #22 TNNI2 (ENSCSEG00000002145) #23 TNNI2 (ENSCSEG00000002164) #23 TNNI2 (ENSCSEG00000002169) #23 ENSCSEG00000002173 ENSCSEG00000002176 ENSCSEG00000002189 #24 ENSCSEG00000002191 tnnt3a (ENSCSEG00000002198) #25 myod1 (ENSCSEG00000002233) ##26 zgc:172145 (ENSCSEG00000002238) #27 CACNA2D4 (ENSCSEG00000002252) #28 LRTM2 (ENSCSEG00000002266) #29 PEAK1 (ENSCSEG00000002269) syt12 (ENSCSEG00000002273) cat (ENSCSEG00000002281) ifitm5 (ENSCSEG00000002289) ENSCSEG00000002294 ENSCSEG00000002298 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.f ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Barramundi perch MODERN SPECIES 31 ENSLCAG00010013451 slc13a1 (ENSLCAG00010013405) CADPS2 (ENSLCAG00010013231) fezf1 (ENSLCAG00010013213) aass (ENSLCAG00010013014) #7 PTPRZ1 (ENSLCAG00010012605) #8 ENSLCAG00010012479 ENSLCAG00010012477 ENSLCAG00010012473 dldh (ENSLCAG00010012352) #9 SYT8 (ENSLCAG00010012305) #20 ENSLCAG00010012295 tnni2a.2 (ENSLCAG00010012290) #22 TNNI2 (ENSLCAG00010012275) #23 TNNI2 (ENSLCAG00010012249) #21 TNNI2 (ENSLCAG00010012232) #23 ENSLCAG00010012229 ENSLCAG00010012227 #24 ENSLCAG00010012223 tnnt3a (ENSLCAG00010012221) #25 myod1 (ENSLCAG00010012215) ##26 zgc:172145 (ENSLCAG00010012212) #27 CACNA2D4 (ENSLCAG00010012209) #28 LRTM2 (ENSLCAG00010012207) #29 Seriola ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000156482.c ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a.h ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00390000009456 ENSGT00420000029847 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c ENSGT00390000010961.d Greater amberjack MODERN SPECIES 160 ENSSDUG00000017439 DUS2 (ENSSDUG00000017399) SLC7A10 (ENSSDUG00000017375) faap24 (ENSSDUG00000017353) ENSSDUG00000017304 dldh (ENSSDUG00000017239) #9 SYT8 (ENSSDUG00000017190) #20 ENSSDUG00000017175 ENSSDUG00000017137 tnni2a.1 (ENSSDUG00000017118) #21 tnni2a.2 (ENSSDUG00000017108) #22 ENSSDUG00000017101 TNNI2 (ENSSDUG00000017087) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017072) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017051) #23 TNNI2 (ENSSDUG00000017036) #23 ENSSDUG00000016991 ENSSDUG00000016965 ENSSDUG00000016941 tnnt3a (ENSSDUG00000016913) #25 myod1 (ENSSDUG00000016886) ##26 zgc:172145 (ENSSDUG00000016873) #27 ENSSDUG00000016853 #29 CACNA2D4 (ENSSDUG00000016797) #28 ENSSDUG00000016707 #30 urahb (ENSSDUG00000016691) #31 ENSSDUG00000016686 GLG1 (ENSSDUG00000016609) #32 RFWD3 (ENSSDUG00000016584) #33 MLKL (ENSSDUG00000016569) #34 TMED6 (ENSSDUG00000016560) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3178 TNNI2 (ENSSLDG00000022266) #23 TNNI2 (ENSSLDG00000022273) #23 TNNI2 (ENSSLDG00000022278) #23 TNNI2 (ENSSLDG00000022288) #23 ENSSLDG00000022300 ENSSLDG00000022311 #24 tnnt3a (ENSSLDG00000022320) #25 myod1 (ENSSLDG00000022337) ##26 zgc:172145 (ENSSLDG00000022358) #27 ENSSLDG00000022362 CACNA2D4 (ENSSLDG00000022368) #28 LRTM2 (ENSSLDG00000022406) #29 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 Zig-zag eel MODERN SPECIES 20 ENSMAMG00000022767 ENSMAMG00000022758 ENSMAMG00000025915 ENSMAMG00000022762 ENSMAMG00000024786 ENSMAMG00000022760 ENSMAMG00000022756 #9 SYT8 (ENSMAMG00000026620) #20 ENSMAMG00000025933 tnni2a.1 (ENSMAMG00000022730) #21 tnni2a.2 (ENSMAMG00000022728) #22 TNNI2 (ENSMAMG00000028411) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000025267) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000022722) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000028574) #23 TNNI2 (ENSMAMG00000024405) #23 ENSMAMG00000026203 ENSMAMG00000025176 tnnt3a (ENSMAMG00000022716) #25 myod1 (ENSMAMG00000025845) ##26 ENSMAMG00000022714 #29 ENSMAMG00000022713 #28 ENSMAMG00000022711 #30 urahb (ENSMAMG00000022710) #31 ENSMAMG00000025621 ENSMAMG00000022709 GLG1 (ENSMAMG00000022699) #32 ENSMAMG00000022695 #33 MLKL (ENSMAMG00000022692) #34 ENSMAMG00000022690 ENSMAMG00000022688 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Siamese fighting fish MODERN SPECIES 17 ENSBSLG00000026499 CERK (ENSBSLG00000026507) TAFA5 (ENSBSLG00000026512) brd1b (ENSBSLG00000026513) ftsj1 (ENSBSLG00000026514) ENSBSLG00000003773 ENSBSLG00000003875 ENSBSLG00000003923 ENSBSLG00000004129 ENSBSLG00000004149 tnni2a.1 (ENSBSLG00000004158) #21 tnni2a.2 (ENSBSLG00000004174) #22 TNNI2 (ENSBSLG00000004185) #23 ENSBSLG00000004198 #23 TNNI2 (ENSBSLG00000004211) #23 ENSBSLG00000004751 #23 ENSBSLG00000004764 ENSBSLG00000004780 #24 ENSBSLG00000004819 tnnt3a (ENSBSLG00000004850) #25 myod1 (ENSBSLG00000004886) ##26 CACNA2D4 (ENSBSLG00000005093) #28 ENSBSLG00000005855 #29 ENSBSLG00000005902 #30 urahb (ENSBSLG00000005954) #31 ENSBSLG00000006449 GLG1 (ENSBSLG00000006927) #32 RFWD3 (ENSBSLG00000007791) #33 MLKL (ENSBSLG00000007872) #34 ENSBSLG00000007888 ENSBSLG00000007917 #34 Climbing perch MODERN SPECIES 19 CADPS2 (ENSATEG00000009437) fezf1 (ENSATEG00000009565) aass (ENSATEG00000009598) #7 PTPRZ1 (ENSATEG00000009734) #8 ENSATEG00000009981 ENSATEG00000009999 ENSATEG00000027494 ENSATEG00000010027 ENSATEG00000010089 ENSATEG00000026154 ENSATEG00000027850 ENSATEG00000027848 ENSATEG00000010140 #9 SYT8 (ENSATEG00000010173) #20 tnni2a.1 (ENSATEG00000010223) #21 TNNI2 (ENSATEG00000010240) #23 TNNI2 (ENSATEG00000010278) #23 TNNI2 (ENSATEG00000010717) #23 ENSATEG00000010747 ENSATEG00000010769 #24 tnnt3a (ENSATEG00000010782) #25 myod1 (ENSATEG00000010852) ##26 zgc:172145 (ENSATEG00000010861) #27 ENSATEG00000010873 #28 ENSATEG00000026163 #29 ENSATEG00000027583 #28 ENSATEG00000011010 #30 urahb (ENSATEG00000027908) #31 ENSATEG00000011076 GLG1 (ENSATEG00000011236) #32 ENSATEG00000011399 #33 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c ENSGT00390000010961.d Perciformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c ENSGT00390000010961.d Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00390000010852 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c ENSGT00390000010961.d ENSGT00940000156519.p Lumpfish MODERN SPECIES 21 ENSCLMG00005007061 ENSCLMG00005007072 SLC7A10 (ENSCLMG00005007309) ENSCLMG00005007357 ENSCLMG00005007358 dldh (ENSCLMG00005007366) #9 SYT8 (ENSCLMG00005007385) #20 ENSCLMG00005007387 tnni2a.1 (ENSCLMG00005007388) #21 tnni2a.2 (ENSCLMG00005007389) #22 TNNI2 (ENSCLMG00005007390) #23 ENSCLMG00005007391 ENSCLMG00005007392 ENSCLMG00005007394 #23 ENSCLMG00005007396 #23 TNNI2 (ENSCLMG00005007397) #23 ENSCLMG00005007399 #24 tnnt3a (ENSCLMG00005007403) #25 myod1 (ENSCLMG00005007406) ##26 CACNA2D4 (ENSCLMG00005007412) #28 ENSCLMG00005007700 LRTM2 (ENSCLMG00005007704) #29 ENSCLMG00005007712 #30 urahb (ENSCLMG00005007724) #31 ENSCLMG00005007726 GLG1 (ENSCLMG00005007781) #32 RFWD3 (ENSCLMG00005007893) #33 MLKL (ENSCLMG00005007894) #34 TMED6 (ENSCLMG00005007896) ENSCLMG00005007897 ENSCLMG00005007898 Stickleback MODERN SPECIES 14 ENSGACG00000008049 ciao2a (ENSGACG00000008052) spg11 (ENSGACG00000008057) znf277 (ENSGACG00000008086) immp2l (ENSGACG00000008130) ENSGACG00000008150 ENSGACG00000008152 ENSGACG00000008153 DUS2 (ENSGACG00000008159) SLC7A10 (ENSGACG00000008186) dldh (ENSGACG00000008240) #9 SYT8 (ENSGACG00000008302) #20 tnni2a.1 (ENSGACG00000008315) #21 tnni2a.2 (ENSGACG00000008321) #22 TNNI2 (ENSGACG00000008333) #23 TNNI2 (ENSGACG00000008349) #23 LSP1 (ENSGACG00000008376) tnnt3a (ENSGACG00000008384) #25 myod1 (ENSGACG00000008444) ##26 ENSGACG00000008450 CACNA2D4 (ENSGACG00000008453) #28 ENSGACG00000008489 #29 ENSGACG00000008494 #30 urahb (ENSGACG00000008507) #31 ENSGACG00000008512 GLG1 (ENSGACG00000008520) #32 RFWD3 (ENSGACG00000008531) #33 MLKL (ENSGACG00000008536) #34 ENSGACG00000008543 ZDHHC7 (ENSGACG00000008550) ENSGACG00000008572 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000154617.B.d ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.c ENSGT00390000010961.d Channel bull blenny MODERN SPECIES 20 pdcd2l (ENSCGOG00000009673) ENSCGOG00000009670 ENSCGOG00000009667 DUS2 (ENSCGOG00000009109) ENSCGOG00000009096 ENSCGOG00000009092 dldh (ENSCGOG00000008107) #9 ENSCGOG00000008073 SLC7A10 (ENSCGOG00000007383) tnni2a.1 (ENSCGOG00000007358) #21 ENSCGOG00000007345 tnni2a.2 (ENSCGOG00000007341) #22 TNNI2 (ENSCGOG00000007334) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007324) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007317) #23 TNNI2 (ENSCGOG00000007312) #23 ENSCGOG00000007305 #24 ENSCGOG00000007292 zgc:172145 (ENSCGOG00000007280) #27 tnnt3a (ENSCGOG00000007130) #25 myod1 (ENSCGOG00000007087) ##26 zgc:172145 (ENSCGOG00000007083) #27 ENSCGOG00000007080 LRTM2 (ENSCGOG00000007053) #29 CACNA2D4 (ENSCGOG00000007039) #28 ENSCGOG00000006641 #30 urahb (ENSCGOG00000006621) #31 ENSCGOG00000006612 ENSCGOG00000006597 GLG1 (ENSCGOG00000005997) #32 RFWD3 (ENSCGOG00000005985) #33 Ballan wrasse MODERN SPECIES 74 slc13a1 (ENSLBEG00000004005) CADPS2 (ENSLBEG00000004036) fezf1 (ENSLBEG00000004119) aass (ENSLBEG00000004152) #7 ENSLBEG00000004277 #8 ENSLBEG00000004441 #8 ENSLBEG00000004466 dldh (ENSLBEG00000004489) #9 SYT8 (ENSLBEG00000004542) #20 ENSLBEG00000004567 tnni2a.1 (ENSLBEG00000004589) #21 tnni2a.2 (ENSLBEG00000004628) #22 TNNI2 (ENSLBEG00000004663) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004685) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004709) #23 TNNI2 (ENSLBEG00000004734) #23 ENSLBEG00000004756 ENSLBEG00000004792 #24 tnnt3a (ENSLBEG00000004820) #25 myod1 (ENSLBEG00000004859) ##26 zgc:172145 (ENSLBEG00000004893) #27 CACNA2D4 (ENSLBEG00000004912) #28 LRTM2 (ENSLBEG00000004951) #29 ENSLBEG00000004962 #28 ENSLBEG00000004986 #30 urahb (ENSLBEG00000005026) #31 ENSLBEG00000005041 GLG1 (ENSLBEG00000005124) #32 RFWD3 (ENSLBEG00000005275) #33 MLKL (ENSLBEG00000005305) #34 TMED6 (ENSLBEG00000005338) Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453 #34 ENSGT00390000010961.d ENSGT00940000157021 ENSGT00420000029847 ENSGT00390000009456 Tetraodon MODERN SPECIES 4 ENSTNIG00000010421 #32 ENSTNIG00000018798 #32 ENSTNIG00000000428 ENSTNIG00000004682 #30 CACNA2D4 (ENSTNIG00000004494) #28 LRTM2 (ENSTNIG00000004493) #29 SLC7A10 (ENSTNIG00000004495) dldh (ENSTNIG00000004496) #9 ENSTNIG00000004497 #20 ENSTNIG00000002815 #20 tnni2a.1 (ENSTNIG00000002814) #21 tnni2a.2 (ENSTNIG00000002813) #22 ENSTNIG00000002812 #23 ENSTNIG00000001405 #23 TNNI2 (ENSTNIG00000002811) #23 ENSTNIG00000002810 #23 ENSTNIG00000000204 #24 tnnt3a (ENSTNIG00000002809) #25 myod1 (ENSTNIG00000002808) ##26 DUS2 (ENSTNIG00000005616) Fugu MODERN SPECIES 21 ENSTRUG00000031663 ENSTRUG00000032661 ccnd2a (ENSTRUG00000001816) ENSTRUG00000032400 ENSTRUG00000028185 DUS2 (ENSTRUG00000022441) SLC7A10 (ENSTRUG00000033356) ENSTRUG00000032988 dldh (ENSTRUG00000016659) #9 SYT8 (ENSTRUG00000016657) #20 ENSTRUG00000027114 tnni2a.1 (ENSTRUG00000022759) #21 tnni2a.2 (ENSTRUG00000016644) #22 ENSTRUG00000016632 #23 ENSTRUG00000033030 #23 ENSTRUG00000027588 #23 ENSTRUG00000027670 ENSTRUG00000030147 #24 tnnt3a (ENSTRUG00000016614) #25 myod1 (ENSTRUG00000016609) ##26 LRTM2 (ENSTRUG00000029534) #29 ENSTRUG00000016565 #30 urahb (ENSTRUG00000021342) #31 ENSTRUG00000030677 GLG1 (ENSTRUG00000016546) #32 RFWD3 (ENSTRUG00000016541) #33 TMED6 (ENSTRUG00000016539) ANKRD27 (ENSTRUG00000016516) ENSTRUG00000021888 ENSTRUG00000029018 ENSTRUG00000030993 Cod MODERN SPECIES 22 HYAL4 (ENSGMOG00000010316) hyal6 (ENSGMOG00000025679) wasla (ENSGMOG00000037020) ENSGMOG00000010258 IQUB (ENSGMOG00000019307) slc13a1 (ENSGMOG00000009178) CADPS2 (ENSGMOG00000035623) fezf1 (ENSGMOG00000023584) aass (ENSGMOG00000010875) #7 ENSGMOG00000036942 PTPRZ1 (ENSGMOG00000010806) #8 ENSGMOG00000016861 #9 SYT8 (ENSGMOG00000016874) #20 ENSGMOG00000031300 tnni2a.1 (ENSGMOG00000026765) #21 ENSGMOG00000036471 #23 ENSGMOG00000034763 ENSGMOG00000027097 tnnt3a (ENSGMOG00000016942) #25 ENSGMOG00000030879 ##26 ENSGMOG00000003800 #28 ENSGMOG00000024112 #29 ENSGMOG00000003907 #30 ENSGMOG00000003566 si:ch211-59o9.10 (ENSGMOG00000037257) ENSGMOG00000027867 actr6 (ENSGMOG00000003691) ENSGMOG00000031025 ENSGMOG00000034008 ENSGMOG00000031788 ENSGMOG00000035361 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b #23 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3178 TNNI2 (ENSSLDG00000022266) #23 TNNI2 (ENSSLDG00000022273) #23 TNNI2 (ENSSLDG00000022278) #23 TNNI2 (ENSSLDG00000022288) #23 ENSSLDG00000022300 ENSSLDG00000022311 #24 tnnt3a (ENSSLDG00000022320) #25 myod1 (ENSSLDG00000022337) ##26 zgc:172145 (ENSSLDG00000022358) #27 ENSSLDG00000022362 CACNA2D4 (ENSSLDG00000022368) #28 LRTM2 (ENSSLDG00000022406) #29 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Indian medaka MODERN SPECIES 114 ENSOMEG00000009258 #23 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 #7 ENSGT00940000155529.A #8 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b #23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.b.e.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a #31 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 Spiny chromis MODERN SPECIES 1278 tnni2a.1 (ENSAPOG00000010015) #21 ENSAPOG00000010022 tnni2a.2 (ENSAPOG00000010244) #22 TNNI2 (ENSAPOG00000010262) #23 ENSAPOG00000010281 #23 TNNI2 (ENSAPOG00000010314) #23 TNNI2 (ENSAPOG00000010340) #23 tmem106bb (ENSAPOG00000010349) arl4ab (ENSAPOG00000010415) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Lyretail cichlid DUPLICATION Lyretail cichlid MODERN SPECIES 1035 TNNI2 (ENSNBRG00000011263) #23 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 429 zfpm1 (ENSNBRG00000000569) ENSNBRG00000000542 dldh (ENSNBRG00000000346) #9 SYT8 (ENSNBRG00000000324) #20 ENSNBRG00000000308 tnni2a.2 (ENSNBRG00000000291) #22 ENSNBRG00000000285 #23 TNNI2 (ENSNBRG00000000275) #23 ENSNBRG00000000267 ENSNBRG00000000262 ENSNBRG00000022480 tnnt3a (ENSNBRG00000022442) #25 myod1 (ENSNBRG00000022428) ##26 ENSNBRG00000022414 ENSNBRG00000022400 #30 urahb (ENSNBRG00000022377) #31 ENSNBRG00000022322 GLG1 (ENSNBRG00000022286) #32 RFWD3 (ENSNBRG00000022266) #33 MLKL (ENSNBRG00000022248) #34 si:dkey-12e7.1 (ENSNBRG00000022234) anpeplb (ENSNBRG00000022087) Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d #23 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1110 foxl1 (ENSMZEG00005016238) kiaa0513 (ENSMZEG00005016224) slc13a1 (ENSMZEG00005016213) ENSMZEG00005016206 slc13a1 (ENSMZEG00005016201) ces3 (ENSMZEG00005016193) zfpm1 (ENSMZEG00005016182) ENSMZEG00005016163 dldh (ENSMZEG00005016147) #9 SYT8 (ENSMZEG00005016137) #20 ENSMZEG00005016129 tnni2a.1 (ENSMZEG00005016126) #21 tnni2a.2 (ENSMZEG00005016116) #22 TNNI2 (ENSMZEG00005016110) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016101) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016090) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016082) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016076) #23 TNNI2 (ENSMZEG00005016067) #23 ENSMZEG00005016060 ENSMZEG00005016057 ENSMZEG00005016053 ENSMZEG00005016049 #24 tnnt3a (ENSMZEG00005016043) #25 myod1 (ENSMZEG00005016037) ##26 LRTM2 (ENSMZEG00005016031) #29 CACNA2D4 (ENSMZEG00005016019) #28 ENSMZEG00005016011 #30 urahb (ENSMZEG00005016003) #31 ENSMZEG00005015977 GLG1 (ENSMZEG00005015951) #32 Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000157682.B.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ##23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.m #34 ENSGT00940000163501 #35 ENSGT00730000111305 #36 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 519 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.b ##34 Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.a ##23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #31 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 ENSGT00390000016453.m #34 ENSGT00940000163501 #35 ENSGT00730000111305 #36 Salmo ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.b ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b.a ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.a ##23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.a ##34 ENSGT00940000154917.fb.a ##37 ENSGT00390000001285.j.c ENSGT00940000164030.i.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 15 fezf1 (ENSSSAG00000059944) aass (ENSSSAG00000056714) ##7 PTPRZ1 (ENSSSAG00000056177) #8 ENSSSAG00000055366 #9 ENSSSAG00000084730 ##10 ENSSSAG00000055331 #11 ENSSSAG00000055330 #12 deaf1 (ENSSSAG00000055310) #14 drd4a (ENSSSAG00000055298) #15 ENSSSAG00000122200 ENSSSAG00000055278 #16 ENSSSAG00000055272 #18 SYT8 (ENSSSAG00000119353) #20 tnni2a.1 (ENSSSAG00000055259) #21 ENSSSAG00000103611 TNNI2 (ENSSSAG00000055203) ##23 ENSSSAG00000055171 ENSSSAG00000055179 ENSSSAG00000100003 #24 TNNT3 (ENSSSAG00000055126) #25 myod2 (ENSSSAG00000055102) #26 ENSSSAG00000007878 zgc:172145 (ENSSSAG00000055098) #27 ENSSSAG00000092025 #29 ENSSSAG00000054630 #28 ENSSSAG00000052259 #30 ENSSSAG00000115733 GLG1 (ENSSSAG00000004048) #32 ENSSSAG00000088259 #33 MLKL (ENSSSAG00000067010) #34 etfbkmt (ENSSSAG00000103483) #35 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000013249.e.a #7 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.a ##23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #31 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 ENSGT00390000016453.m #34 Salmo DUPLICATION Salmo ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.b ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b.a ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.a ##23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.a ##34 ENSGT00940000154917.fb.a ##37 Atlantic salmon MODERN SPECIES 1 lmod2 (ENSSSAG00000078108) IQUB (ENSSSAG00000078117) CADPS2 (ENSSSAG00000078300) ENSSSAG00000109161 fezf1 (ENSSSAG00000080179) ptprz1 (ENSSSAG00000080236) ##8 ENSSSAG00000080505 ##9 ENSSSAG00000112377 ENSSSAG00000080540 ##11 drd4a (ENSSSAG00000080543) ##15 ENSSSAG00000080545 SYT8 (ENSSSAG00000055269) ##20 tnni2a.1 (ENSSSAG00000080550) ##23 tnni2a.2 (ENSSSAG00000080555) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000115245) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000080558) ##23 ENSSSAG00000110670 ENSSSAG00000080568 ##24 ENSSSAG00000102688 TNNT3 (ENSSSAG00000080578) ##25 myod1c (ENSSSAG00000080596) ##26 ENSSSAG00000111233 zgc:172145 (ENSSSAG00000080600) ##27 ENSSSAG00000080628 ##28 ENSSSAG00000096889 ##29 ENSSSAG00000080771 ##30 ENSSSAG00000101363 GLG1 (ENSSSAG00000067039) ##32 ENSSSAG00000122167 ##33 MLKL (ENSSSAG00000087130) ##34 mlkl (ENSSSAG00000005722) ##34 River trout MODERN SPECIES 37 lmod2a (ENSSTUG00000010448) ASB15 (ENSSTUG00000010383) ENSSTUG00000010308 IQUB (ENSSTUG00000010187) CADPS2 (ENSSTUG00000010148) fezf1 (ENSSTUG00000010110) dldh (ENSSTUG00000009461) ##9 ENSSTUG00000009267 ##10 ENSSTUG00000009265 ##11 drd4a (ENSSTUG00000009260) ##15 ENSSTUG00000009255 SYT8 (ENSSTUG00000009213) ##20 tnni2a.1 (ENSSTUG00000009183) ##23 tnni2a.2 (ENSSTUG00000009174) ##23 ENSSTUG00000009167 ENSSTUG00000009062 ##23 ENSSTUG00000009047 ENSSTUG00000009021 ##24 TNNT3 (ENSSTUG00000008984) ##25 MYOD1 (ENSSTUG00000008976) ##26 zgc:172145 (ENSSTUG00000008972) ##27 ENSSTUG00000008947 ##29 CACNA2D4 (ENSSTUG00000007981) ##28 ENSSTUG00000007788 ##30 ENSSTUG00000007769 GLG1 (ENSSTUG00000007510) ##32 RFWD3 (ENSSTUG00000007387) ##33 MLKL (ENSSTUG00000007277) ##34 nfybb (ENSSTUG00000007199) ##37 cnot2 (ENSSTUG00000006366) ENSSTUG00000006322 Salmo ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00590000083094.a.b.k.a.a.b ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.f ##7 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 ENSGT00390000016453.m #34 ENSGT00940000163501 #35 ENSGT00730000111305 #36 ENSGT00940000154917.fb.b #37 ENSGT00950000183042.a.b.b River trout MODERN SPECIES 33 aass (ENSSTUG00000019952) ##7 ENSSTUG00000019843 PTPRZ1 (ENSSTUG00000017658) #8 dldh (ENSSTUG00000017505) #9 ENSSTUG00000017492 ##10 ENSSTUG00000017480 #11 ticam1 (ENSSTUG00000017476) #12 BET1L (ENSSTUG00000017470) #13 deaf1 (ENSSTUG00000017459) #14 drd4a (ENSSTUG00000017447) #15 ENSSTUG00000017421 #16 ENSSTUG00000017149 #18 SYT8 (ENSSTUG00000017135) #20 tnni2a.1 (ENSSTUG00000017118) #21 tnni2a.2 (ENSSTUG00000017106) #22 ENSSTUG00000017036 ##23 ENSSTUG00000017023 #24 tnnt3b (ENSSTUG00000016997) #25 MYOD1 (ENSSTUG00000016988) #26 zgc:172145 (ENSSTUG00000016985) #27 ENSSTUG00000016981 LRTM2 (ENSSTUG00000016977) #29 ENSSTUG00000015707 #28 ENSSTUG00000013806 #30 urahb (ENSSTUG00000013349) #31 ENSSTUG00000013296 GLG1 (ENSSTUG00000012698) #32 RFWD3 (ENSSTUG00000012610) #33 MLKL (ENSSTUG00000012572) #34 etfbkmt (ENSSTUG00000012566) #35 amn1 (ENSSTUG00000012549) #36 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #31 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 ENSGT00390000016453.m #34 ENSGT00940000163501 #35 ENSGT00730000111305 #36 ENSGT00940000154917.fb.b #37 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #31 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 ENSGT00390000016453.m #34 ENSGT00940000163501 #35 ENSGT00730000111305 #36 ENSGT00940000154917.fb.b #37 Chinook salmon MODERN SPECIES fezf1 (ENSOTSG00005000577) aass (ENSOTSG00005000626) #7 PTPRZ1 (ENSOTSG00005007896) #8 dldh (ENSOTSG00005008481) #9 ENSOTSG00005009315 ENSOTSG00005009316 #11 ticam1 (ENSOTSG00005009318) #12 BET1L (ENSOTSG00005009320) #13 deaf1 (ENSOTSG00005009322) #14 drd4a (ENSOTSG00005009324) #15 ENSOTSG00005009327 #16 ENSOTSG00005009336 #18 ENSOTSG00005009337 #20 ENSOTSG00005009344 tnni2a.2 (ENSOTSG00005009347) #22 TNNI2 (ENSOTSG00005009348) ##23 ENSOTSG00005009349 #24 ENSOTSG00005009351 #25 MYOD1 (ENSOTSG00005009353) #26 zgc:172145 (ENSOTSG00005009354) #27 CACNA2D4 (ENSOTSG00005009358) #28 LRTM2 (ENSOTSG00005009493) #29 ENSOTSG00005009504 #30 urahb (ENSOTSG00005012417) #31 GLG1 (ENSOTSG00005012421) #32 RFWD3 (ENSOTSG00005014583) #33 MLKL (ENSOTSG00005014585) #34 etfbkmt (ENSOTSG00005014586) #35 amn1 (ENSOTSG00005014587) #36 ENSOTSG00005014589 nfybb (ENSOTSG00005014590) #37 Coho salmon MODERN SPECIES 14 ENSOKIG00005032117 IQUB (ENSOKIG00005032040) CADPS2 (ENSOKIG00005031265) fezf1 (ENSOKIG00005031170) ENSOKIG00005031137 PTPRZ1 (ENSOKIG00005028335) ##8 ENSOKIG00005028191 dldh (ENSOKIG00005027454) ##9 ENSOKIG00005027375 ##11 drd4a (ENSOKIG00005027194) ##15 ENSOKIG00005027164 SYT8 (ENSOKIG00005027132) ##20 tnni2a.1 (ENSOKIG00005027100) ##23 tnni2a.2 (ENSOKIG00005027046) ##23 TNNI2 (ENSOKIG00005027031) ##23 TNNI2 (ENSOKIG00005026949) ##23 ENSOKIG00005026905 ##24 ENSOKIG00005026885 TNNT3 (ENSOKIG00005026856) ##25 MYOD1 (ENSOKIG00005026839) ##26 zgc:172145 (ENSOKIG00005026835) ##27 ENSOKIG00005026827 LRTM2 (ENSOKIG00005026822) ##29 CACNA2D4 (ENSOKIG00005026408) ##28 ENSOKIG00005025848 ##30 ENSOKIG00005025795 GLG1 (ENSOKIG00005024239) ##32 RFWD3 (ENSOKIG00005024030) ##33 MLKL (ENSOKIG00005023992) ##34 NFYB (ENSOKIG00005023881) ##37 CNOT2 (ENSOKIG00005023295) Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 889 ENSHHUG00000028029 #16 ENSHHUG00000027755 #18 SYT8 (ENSHHUG00000027747) #20 ENSHHUG00000027744 tnni2a.1 (ENSHHUG00000027733) #21 tnni2a.2 (ENSHHUG00000027724) #22 TNNI2 (ENSHHUG00000027633) #23 TNNI2 (ENSHHUG00000027573) ##23 ENSHHUG00000027566 ENSHHUG00000027560 TNNT3 (ENSHHUG00000027549) #25 MYOD1 (ENSHHUG00000027540) #26 CACNA2D4 (ENSHHUG00000027532) #28 LRTM2 (ENSHHUG00000027521) #29 ENSHHUG00000027515 #28 ENSHHUG00000027513 #28 ENSHHUG00000027507 #30 urahb (ENSHHUG00000027499) #31 GLG1 (ENSHHUG00000027478) #32 RFWD3 (ENSHHUG00000027472) #33 ENSHHUG00000027468 #34 etfbkmt (ENSHHUG00000027465) #35 amn1 (ENSHHUG00000027459) #36 Huchen MODERN SPECIES 544 ENSHHUG00000000310 tnni2a.1 (ENSHHUG00000000288) ##23 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000284) ##23 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000268) ##23 TNNI2 (ENSHHUG00000000259) ##23 TNNI2 (ENSHHUG00000000165) ##23 ENSHHUG00000000161 ##24 ENSHHUG00000000144 tnnt3b (ENSHHUG00000000132) ##25 MYOD1 (ENSHHUG00000000050) ##26 zgc:172145 (ENSHHUG00000000023) ##27 LRTM2 (ENSHHUG00000050722) ##29 CACNA2D4 (ENSHHUG00000050645) ##28 ENSHHUG00000050634 ##30 ENSHHUG00000050630 GLG1 (ENSHHUG00000050506) ##32 RFWD3 (ENSHHUG00000050492) ##33 Northern pike MODERN SPECIES 18 PTPRZ1 (ENSELUG00000005952) #8 dldh (ENSELUG00000006023) #9 ENSELUG00000006036 ##10 ENSELUG00000033613 #11 ticam1 (ENSELUG00000006060) #12 BET1L (ENSELUG00000032203) #13 deaf1 (ENSELUG00000006122) #14 drd4a (ENSELUG00000006156) #15 ENSELUG00000000195 ENSELUG00000006280 #18 ENSELUG00000006319 SYT8 (ENSELUG00000006343) #20 ENSELUG00000006355 tnni2a.2 (ENSELUG00000006408) #22 TNNI2 (ENSELUG00000006429) #23 TNNI2 (ENSELUG00000006514) ##23 ENSELUG00000006582 ENSELUG00000024853 ENSELUG00000006610 #24 tnnt3b (ENSELUG00000006673) #25 MYOD1 (ENSELUG00000006737) #26 zgc:172145 (ENSELUG00000028291) #27 LRTM2 (ENSELUG00000006756) #29 CACNA2D4 (ENSELUG00000006851) #28 ENSELUG00000006919 #30 urahb (ENSELUG00000034591) #31 ENSELUG00000006933 GLG1 (ENSELUG00000006991) #32 RFWD3 (ENSELUG00000007033) #33 MLKL (ENSELUG00000007058) #34 etfbkmt (ENSELUG00000007086) #35 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00550000074844 #9 ENSGT00940000157682.B.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c #15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ##23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000155997.lb.b #28 ENSGT00940000157572.a.b #29 ENSGT00940000160625.r.a #30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a #32 ENSGT00390000008931 #33 ENSGT00390000016453.m #34 ENSGT00940000163501 #35 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 519 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.b ##34 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.b ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.a ##34 ENSGT00940000154917.fb.a ##37 ENSGT00390000001285.j.c Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.a ##34 ENSGT00940000154917.fb.a ##37 ENSGT00390000001285.j.c Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.a ##34 ENSGT00940000154917.fb.a ##37 ENSGT00390000001285.j.c Chinook salmon MODERN SPECIES 10 ASB15 (ENSOTSG00005043087) ENSOTSG00005043085 IQUB (ENSOTSG00005043082) ENSOTSG00005043079 ENSOTSG00005043078 CADPS2 (ENSOTSG00005042929) fezf1 (ENSOTSG00005042921) PTPRZ1 (ENSOTSG00005041692) ##8 dldh (ENSOTSG00005041612) ##9 ENSOTSG00005041604 ##11 drd4a (ENSOTSG00005041579) ##15 ENSOTSG00005041577 SYT8 (ENSOTSG00005041574) ##20 tnni2a.1 (ENSOTSG00005041572) ##23 tnni2a.2 (ENSOTSG00005041571) ##23 ENSOTSG00005041570 ##23 ENSOTSG00005041568 tnnt3b (ENSOTSG00005041567) ##25 MYOD1 (ENSOTSG00005041566) ##26 zgc:172145 (ENSOTSG00005041565) ##27 LRTM2 (ENSOTSG00005041564) ##29 CACNA2D4 (ENSOTSG00005041278) ##28 ENSOTSG00005041268 ##30 ENSOTSG00005041259 GLG1 (ENSOTSG00005040997) ##32 RFWD3 (ENSOTSG00005040989) ##33 MLKL (ENSOTSG00005040987) ##34 ENSOTSG00005040986 ##34 nfybb (ENSOTSG00005040983) ##37 ENSOTSG00005040982 cnot2 (ENSOTSG00005040964) Coho salmon MODERN SPECIES 14 lmod2a (ENSOKIG00005032140) ENSOKIG00005032117 IQUB (ENSOKIG00005032040) CADPS2 (ENSOKIG00005031265) fezf1 (ENSOKIG00005031170) ENSOKIG00005031137 PTPRZ1 (ENSOKIG00005028335) ##8 ENSOKIG00005028191 dldh (ENSOKIG00005027454) ##9 ENSOKIG00005027375 ##11 drd4a (ENSOKIG00005027194) ##15 ENSOKIG00005027164 SYT8 (ENSOKIG00005027132) ##20 tnni2a.1 (ENSOKIG00005027100) ##23 tnni2a.2 (ENSOKIG00005027046) ##23 TNNI2 (ENSOKIG00005027031) ##23 TNNI2 (ENSOKIG00005026949) ##23 ENSOKIG00005026905 ##24 ENSOKIG00005026885 TNNT3 (ENSOKIG00005026856) ##25 MYOD1 (ENSOKIG00005026839) ##26 zgc:172145 (ENSOKIG00005026835) ##27 ENSOKIG00005026827 LRTM2 (ENSOKIG00005026822) ##29 CACNA2D4 (ENSOKIG00005026408) ##28 ENSOKIG00005025848 ##30 ENSOKIG00005025795 GLG1 (ENSOKIG00005024239) ##32 RFWD3 (ENSOKIG00005024030) ##33 MLKL (ENSOKIG00005023992) ##34 NFYB (ENSOKIG00005023881) ##37 Salmo ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ##8 ENSGT00550000074844.jb.a ##9 ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.b ENSGT00940000157682.B.b.a ##11 ENSGT00940000160974.b.c.g.a ##15 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ##20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b.a ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.a ##23 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812.e ##24 ENSGT00940000158477.a.b.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.b.c ##26 ENSGT00920000149457.c ##27 ENSGT00940000157572.a.b.c ##29 ENSGT00940000155997.lb.b.u ##28 ENSGT00940000160625.r.a.b ##30 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ##32 ENSGT00390000008931.g ##33 ENSGT00390000016453.n.a ##34 Atlantic salmon MODERN SPECIES 1 wasl (ENSSSAG00000078048) lmod2 (ENSSSAG00000078108) IQUB (ENSSSAG00000078117) CADPS2 (ENSSSAG00000078300) ENSSSAG00000109161 fezf1 (ENSSSAG00000080179) ptprz1 (ENSSSAG00000080236) ##8 ENSSSAG00000080505 ##9 ENSSSAG00000112377 ENSSSAG00000080540 ##11 drd4a (ENSSSAG00000080543) ##15 ENSSSAG00000080545 SYT8 (ENSSSAG00000055269) ##20 tnni2a.1 (ENSSSAG00000080550) ##23 tnni2a.2 (ENSSSAG00000080555) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000115245) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000080558) ##23 ENSSSAG00000110670 ENSSSAG00000080568 ##24 ENSSSAG00000102688 TNNT3 (ENSSSAG00000080578) ##25 myod1c (ENSSSAG00000080596) ##26 ENSSSAG00000111233 zgc:172145 (ENSSSAG00000080600) ##27 ENSSSAG00000080628 ##28 ENSSSAG00000096889 ##29 ENSSSAG00000080771 ##30 ENSSSAG00000101363 GLG1 (ENSSSAG00000067039) ##32 ENSSSAG00000122167 ##33 MLKL (ENSSSAG00000087130) ##34 Huchen MODERN SPECIES 544 ENSHHUG00000000310 tnni2a.1 (ENSHHUG00000000288) ##23 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000284) ##23 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000268) ##23 TNNI2 (ENSHHUG00000000259) ##23 TNNI2 (ENSHHUG00000000165) ##23 ENSHHUG00000000161 ##24 ENSHHUG00000000144 tnnt3b (ENSHHUG00000000132) ##25 MYOD1 (ENSHHUG00000000050) ##26 zgc:172145 (ENSHHUG00000000023) ##27 LRTM2 (ENSHHUG00000050722) ##29 CACNA2D4 (ENSHHUG00000050645) ##28 ENSHHUG00000050634 ##30 ENSHHUG00000050630 GLG1 (ENSHHUG00000050506) ##32 RFWD3 (ENSHHUG00000050492) ##33 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163421.a.d.a.a ENSGT00940000159150.ab ENSGT00940000155010.a ENSGT01010000223078 ENSGT00390000004417.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.b ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01000000216979 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B.j ENSGT00940000154914.vb Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.e.a #7 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #31 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 ENSGT00390000016453.m #34 ENSGT00940000163501 #35 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.e.a #7 ENSGT00940000155529.A.f #8 ENSGT00550000074844.jb.b #9 ENSGT00940000157682.B.b.b #11 ENSGT00940000163706 #12 ENSGT00940000160208 #13 ENSGT00940000159701 #14 ENSGT00940000160974.b.c.g.b #15 ENSGT00940000164955.b #16 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f #24 ENSGT00940000158477.a.b.d #25 ENSGT00950000182959.b.a.b.d #26 ENSGT00920000149457.d #27 ENSGT00940000155997.lb.b.v #28 ENSGT00940000157572.a.b.d #29 ENSGT00940000160625.r.a.a #30 ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #31 ENSGT00390000011262.e.a.b.a #32 ENSGT00390000008931.h #33 ENSGT00390000016453.m #34 ENSGT00940000163501 #35 Coho salmon MODERN SPECIES 1 PTPRZ1 (ENSOKIG00005031860) #8 DLD (ENSOKIG00005032474) #9 ENSOKIG00005032722 #10 ENSOKIG00005032730 #11 ticam1 (ENSOKIG00005032764) #12 BET1L (ENSOKIG00005032895) #13 deaf1 (ENSOKIG00005032919) #14 drd4a (ENSOKIG00005032941) #15 ENSOKIG00005032958 #16 ENSOKIG00005032986 #17 ENSOKIG00005032992 #18 ENSOKIG00005033002 #19 SYT8 (ENSOKIG00005033015) #20 tnni2a.1 (ENSOKIG00005033031) #21 tnni2a.2 (ENSOKIG00005033122) #22 ENSOKIG00005033145 #23 ENSOKIG00005033174 #24 tnnt3b (ENSOKIG00005033212) #25 MYOD1 (ENSOKIG00005033239) #26 zgc:172145 (ENSOKIG00005033256) #27 CACNA2D4 (ENSOKIG00005033316) #28 LRTM2 (ENSOKIG00005034035) #29 ENSOKIG00005034065 #30 urahb (ENSOKIG00005034114) #31 GLG1 (ENSOKIG00005034363) #32 RFWD3 (ENSOKIG00005038361) #33 MLKL (ENSOKIG00005038521) #34 etfbkmt (ENSOKIG00005038535) #35 amn1 (ENSOKIG00005038546) #36 nfybb (ENSOKIG00005038602) #37 ENSOKIG00005038688 Huchen MODERN SPECIES 889 ENSHHUG00000028029 #16 ENSHHUG00000027755 #18 SYT8 (ENSHHUG00000027747) #20 ENSHHUG00000027744 tnni2a.1 (ENSHHUG00000027733) #21 tnni2a.2 (ENSHHUG00000027724) #22 TNNI2 (ENSHHUG00000027633) #23 TNNI2 (ENSHHUG00000027573) ##23 ENSHHUG00000027566 ENSHHUG00000027560 TNNT3 (ENSHHUG00000027549) #25 MYOD1 (ENSHHUG00000027540) #26 CACNA2D4 (ENSHHUG00000027532) #28 LRTM2 (ENSHHUG00000027521) #29 ENSHHUG00000027515 #28 ENSHHUG00000027513 #28 ENSHHUG00000027507 #30 urahb (ENSHHUG00000027499) #31 GLG1 (ENSHHUG00000027478) #32 RFWD3 (ENSHHUG00000027472) #33 ENSHHUG00000027468 #34 etfbkmt (ENSHHUG00000027465) #35 Northern pike MODERN SPECIES 18 aass (ENSELUG00000005758) #7 PTPRZ1 (ENSELUG00000005952) #8 dldh (ENSELUG00000006023) #9 ENSELUG00000006036 ##10 ENSELUG00000033613 #11 ticam1 (ENSELUG00000006060) #12 BET1L (ENSELUG00000032203) #13 deaf1 (ENSELUG00000006122) #14 drd4a (ENSELUG00000006156) #15 ENSELUG00000000195 ENSELUG00000006280 #18 ENSELUG00000006319 SYT8 (ENSELUG00000006343) #20 ENSELUG00000006355 tnni2a.2 (ENSELUG00000006408) #22 TNNI2 (ENSELUG00000006429) #23 TNNI2 (ENSELUG00000006514) ##23 ENSELUG00000006582 ENSELUG00000024853 ENSELUG00000006610 #24 tnnt3b (ENSELUG00000006673) #25 MYOD1 (ENSELUG00000006737) #26 zgc:172145 (ENSELUG00000028291) #27 LRTM2 (ENSELUG00000006756) #29 CACNA2D4 (ENSELUG00000006851) #28 ENSELUG00000006919 #30 urahb (ENSELUG00000034591) #31 ENSELUG00000006933 GLG1 (ENSELUG00000006991) #32 RFWD3 (ENSELUG00000007033) #33 MLKL (ENSELUG00000007058) #34 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.f ##23 Northern pike MODERN SPECIES 1 ENSELUG00000031353 ENSELUG00000028070 ENSELUG00000032595 ENSELUG00000018487 psmd13 (ENSELUG00000018515) sirt3 (ENSELUG00000018526) drd4b (ENSELUG00000018550) ##15 ENSELUG00000018575 ##16 ctsd (ENSELUG00000018601) #18 ENSELUG00000028989 ENSELUG00000027344 ENSELUG00000033770 ENSELUG00000028980 ENSELUG00000028322 tnni2b.1 (ENSELUG00000018719) ##23 ENSELUG00000018743 ##23 ENSELUG00000018803 ENSELUG00000026443 TNNT3 (ENSELUG00000018827) ##25 MYOD1 (ENSELUG00000018844) ##26 OTOG (ENSELUG00000018933) aph1b (ENSELUG00000018962) ENSELUG00000018968 ENSELUG00000019041 NR2E3 (ENSELUG00000019079) arih1l (ENSELUG00000019125) HACD3 (ENSELUG00000019142) SLC24A1 (ENSELUG00000019158) dennd4a (ENSELUG00000000821) RAB11B (ENSELUG00000019240) ENSELUG00000019353 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.f ##23 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.f ##23 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.f ##23 Rainbow trout MODERN SPECIES 27 ENSOMYG00000064485 ENSOMYG00000073327 ENSOMYG00000063737 csnk2a2a (ENSOMYG00000073972) ENSOMYG00000030874 ENSOMYG00000077711 ENSOMYG00000062215 ENSOMYG00000030436 ENSOMYG00000030266 ENSOMYG00000072011 ##15 ENSOMYG00000050352 CTSD (ENSOMYG00000029741) #18 ENSOMYG00000029435 ENSOMYG00000030025 ENSOMYG00000030016 ENSOMYG00000029399 ##23 ENSOMYG00000057374 ENSOMYG00000029082 ENSOMYG00000055514 TNNT3 (ENSOMYG00000049303) ##25 myod1 (ENSOMYG00000029242) ##26 ENSOMYG00000069614 ENSOMYG00000063706 ENSOMYG00000060149 ENSOMYG00000005082 ENSOMYG00000005006 ENSOMYG00000050119 ENSOMYG00000004974 ENSOMYG00000023825 HACD3 (ENSOMYG00000059785) SLC24A1 (ENSOMYG00000004858) Otomorpha DUPLICATION Otomorpha DUPLICATION Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 ENSGT00940000177178 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000159916 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A.f ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b.d ENSGT00940000159535.i ENSGT00440000039564.a.b.i ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a ENSGT00940000164715.b ENSGT00940000160745.d ENSGT00390000007739 ENSGT00950000183151.a.a.b.b Denticle herring MODERN SPECIES 8 ascl1b (ENSDCDG00000031153) CES3 (ENSDCDG00000031156) pdcd2l (ENSDCDG00000031158) banp (ENSDCDG00000031160) ENSDCDG00000031164 kras (ENSDCDG00000031166) RASSF8 (ENSDCDG00000031168) ENSDCDG00000031170 SYT8 (ENSDCDG00000031171) #20 ENSDCDG00000031173 tnni2a.1 (ENSDCDG00000031175) #21 tnni2a.2 (ENSDCDG00000031178) #22 ENSDCDG00000031179 #23 ENSDCDG00000031186 #23 TNNI2 (ENSDCDG00000005638) #23 tnni2a.4 (ENSDCDG00000005740) #23 ENSDCDG00000006819 ENSDCDG00000006877 #24 MYOD1 (ENSDCDG00000006890) ##26 zgc:172145 (ENSDCDG00000006912) #27 ush1c (ENSDCDG00000007075) abcc8 (ENSDCDG00000007647) kcnj11 (ENSDCDG00000007731) mob2a (ENSDCDG00000007735) dusp8a (ENSDCDG00000007781) ENSDCDG00000007814 OSBPL5 (ENSDCDG00000008088) phlda2 (ENSDCDG00000013795) ENSDCDG00000013798 ENSDCDG00000013856 ENSDCDG00000014858 Atlantic herring MODERN SPECIES 19 RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) #20 ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) #21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) #22 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) #23 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) #23 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 #24 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) #25 MYOD1 (ENSCHAG00000016826) #26 zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) #27 ush1c (ENSCHAG00000016858) abcc8 (ENSCHAG00000017040) kcnj11 (ENSCHAG00000020282) mob2a (ENSCHAG00000020294) dusp8a (ENSCHAG00000020357) ENSCHAG00000020362 ENSCHAG00000020373 ENSCHAG00000020389 ENSCHAG00000020425 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.cc.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.cc.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368.m ENSGT00940000155200.cc.b.a ENSGT00940000155200.cc.b.b ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626.`b.b ENSGT00940000156626.`b.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000160004.f Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 23 FBXO31 (ENSAMXG00000036671) ENSAMXG00000035097 ENSAMXG00000030702 ENSAMXG00000029035 ENSAMXG00000042542 ENSAMXG00000038653 ENSAMXG00000042943 ENSAMXG00000037266 ENSAMXG00000017283 ENSAMXG00000037992 ENSAMXG00000017252 RASSF8 (ENSAMXG00000017235) kras (ENSAMXG00000017217) ENSAMXG00000041046 tnni2a.3 (ENSAMXG00000017131) #23 tnni2a.4 (ENSAMXG00000039743) #23 ENSAMXG00000042220 ENSAMXG00000034923 #24 tnnt3a (ENSAMXG00000017067) #25 myod1 (ENSAMXG00000017040) ##26 zgc:172145 (ENSAMXG00000037676) #27 ush1c (ENSAMXG00000017009) abcc8 (ENSAMXG00000016995) kcnj11 (ENSAMXG00000016977) mob2a (ENSAMXG00000000963) dusp8a (ENSAMXG00000016953) ENSAMXG00000032145 igf2b (ENSAMXG00000031616) th (ENSAMXG00000016719) ENSAMXG00000016679 ENSAMXG00000016647 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1246 ENSAMXG00000039263 banp (ENSAMXG00000017170) pdcd2l (ENSAMXG00000017155) ENSAMXG00000017150 #20 ENSAMXG00000037298 TNNI2 (ENSAMXG00000042297) #23 tnni2a.4 (ENSAMXG00000017111) #23 tnni2a.1 (ENSAMXG00000035063) #21 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 65 FBXO31 (ENSPNAG00000028889) ENSPNAG00000028806 ENSPNAG00000028758 ENSPNAG00000004407 ENSPNAG00000004742 RASSF8 (ENSPNAG00000028666) kras (ENSPNAG00000028629) ENSPNAG00000006076 banp (ENSPNAG00000028568) pdcd2l (ENSPNAG00000004367) SYT8 (ENSPNAG00000028474) #20 ENSPNAG00000028459 tnni2a.1 (ENSPNAG00000006788) #21 tnni2a.2 (ENSPNAG00000028418) #22 tnni2a.3 (ENSPNAG00000006873) #23 tnni2a.4 (ENSPNAG00000028390) #23 ENSPNAG00000006385 ENSPNAG00000028344 #24 tnnt3a (ENSPNAG00000005106) #25 myod1 (ENSPNAG00000006274) ##26 zgc:172145 (ENSPNAG00000005729) #27 ush1c (ENSPNAG00000004979) abcc8 (ENSPNAG00000006867) dusp8a (ENSPNAG00000027990) ENSPNAG00000027977 Electric eel MODERN SPECIES 236 ENSEEEG00000007384 banp (ENSEEEG00000007385) pdcd2l (ENSEEEG00000007386) SYT8 (ENSEEEG00000007387) #20 ENSEEEG00000007390 tnni2a.1 (ENSEEEG00000007391) #21 tnni2a.2 (ENSEEEG00000007393) #22 tnni2a.3 (ENSEEEG00000007394) #23 tnni2a.4 (ENSEEEG00000007412) #23 ENSEEEG00000007427 #24 tnnt3a (ENSEEEG00000007429) #25 myod1 (ENSEEEG00000007431) ##26 ush1c (ENSEEEG00000007432) abcc8 (ENSEEEG00000007434) kcnj11 (ENSEEEG00000007443) mob2a (ENSEEEG00000007448) dusp8a (ENSEEEG00000007456) ENSEEEG00000007463 OSBPL5 (ENSEEEG00000007471) phlda2 (ENSEEEG00000007614) nap1l4a (ENSEEEG00000007616) ENSEEEG00000007618 Channel catfish MODERN SPECIES 5 fanci (ENSIPUG00000004103) FBXO31 (ENSIPUG00000004197) ENSIPUG00000004211 rassf8 (ENSIPUG00000004240) kras (ENSIPUG00000004259) znf469 (ENSIPUG00000004306) ENSIPUG00000004314 banp (ENSIPUG00000004342) PDCD2L (ENSIPUG00000004421) SYT8 (ENSIPUG00000004448) #20 ENSIPUG00000004455 TNNI2 (ENSIPUG00000004462) #21 tnni2a.2 (ENSIPUG00000004477) #22 TNNI2 (ENSIPUG00000004491) #23 tnni2a.3 (ENSIPUG00000004514) #23 tnni2 (ENSIPUG00000004539) #23 ENSIPUG00000004583 ENSIPUG00000004645 #24 ENSIPUG00000004650 tnnt3a (ENSIPUG00000004658) #25 myod1 (ENSIPUG00000004693) ##26 zgc:172145 (ENSIPUG00000004699) #27 ush1c (ENSIPUG00000004724) abcc8 (ENSIPUG00000004801) kcnj11 (ENSIPUG00000005009) mob2a (ENSIPUG00000005022) dusp8a (ENSIPUG00000005041) ENSIPUG00000005070 ENSIPUG00000005122 OSBPL5 (ENSIPUG00000005152) phlda2 (ENSIPUG00000005186) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00390000011067.B ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.ec.b ENSGT00940000155200.ec.a ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116.i ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a.n ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a ENSGT00940000164715.b Zebrafish MODERN SPECIES 17 hsd17b12a (ENSDARG00000015709) alkbh3 (ENSDARG00000045606) C25H11orf96 (ENSDARG00000097208) pdia3 (ENSDARG00000102640) ENSDARG00000104818 ENSDARG00000101726 pdcd2l (ENSDARG00000002754) banp (ENSDARG00000017562) ENSDARG00000115365 kras (ENSDARG00000010844) RASSF8 (ENSDARG00000045596) ENSDARG00000110361 tnni2a.1 (ENSDARG00000045592) #21 tnni2a.2 (ENSDARG00000005841) #22 tnni2a.3 (ENSDARG00000013752) #23 tnni2a.4 (ENSDARG00000029069) #23 ENSDARG00000027310 ENSDARG00000097224 #24 tnnt3a (ENSDARG00000030270) #25 myod1 (ENSDARG00000030110) ##26 zgc:172145 (ENSDARG00000045586) #27 lamb1a (ENSDARG00000101209) lamb4 (ENSDARG00000039133) acot19 (ENSDARG00000040427) ubl7a (ENSDARG00000024229) scamp5a (ENSDARG00000018743) parp16 (ENSDARG00000018593) ENSDARG00000097169 EIF3J (ENSDARG00000097988) eif3ja (ENSDARG00000012603) ENSDARG00000063314 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 1908 ENSGT01020000231746 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 1482 ENSGT01020000231746 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 Golden-line barbel MODERN SPECIES 366 cfap45 (ENSSGRG00000039288) tbrg1 (ENSSGRG00000039290) snrpa (ENSSGRG00000039361) zgc:153119 (ENSSGRG00000039362) itpkcb (ENSSGRG00000039365) kras (ENSSGRG00000039378) RASSF8 (ENSSGRG00000039425) ENSSGRG00000039426 ENSSGRG00000039427 #20 ENSSGRG00000039428 tnni2a.4 (ENSSGRG00000039431) #23 ENSSGRG00000039467 ENSSGRG00000039475 #24 tnnt3a (ENSSGRG00000039479) #25 myod1 (ENSSGRG00000039484) ##26 zgc:172145 (ENSSGRG00000039515) #27 ush1c (ENSSGRG00000039517) abcc8 (ENSSGRG00000039570) kcnj11 (ENSSGRG00000039775) mob2a (ENSSGRG00000039776) dusp8a (ENSSGRG00000039777) ENSSGRG00000039787 OSBPL5 (ENSSGRG00000039818) phlda2 (ENSSGRG00000041036) nap1l4a (ENSSGRG00000041037) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 ENSGT00940000177178 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000159916 ENSGT00940000156870 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.cc.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.cc.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368.m ENSGT00940000155200.cc.b.a ENSGT00940000155200.cc.b.b ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626.`b.b ENSGT00940000156626.`b.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000160004.f Mexicana tetra MODERN SPECIES 23 ENSAMXG00000029137 FBXO31 (ENSAMXG00000036671) ENSAMXG00000035097 ENSAMXG00000030702 ENSAMXG00000029035 ENSAMXG00000042542 ENSAMXG00000038653 ENSAMXG00000042943 ENSAMXG00000037266 ENSAMXG00000017283 ENSAMXG00000037992 ENSAMXG00000017252 RASSF8 (ENSAMXG00000017235) kras (ENSAMXG00000017217) ENSAMXG00000041046 tnni2a.3 (ENSAMXG00000017131) #23 tnni2a.4 (ENSAMXG00000039743) #23 ENSAMXG00000042220 ENSAMXG00000034923 #24 tnnt3a (ENSAMXG00000017067) #25 myod1 (ENSAMXG00000017040) ##26 zgc:172145 (ENSAMXG00000037676) #27 ush1c (ENSAMXG00000017009) abcc8 (ENSAMXG00000016995) kcnj11 (ENSAMXG00000016977) mob2a (ENSAMXG00000000963) dusp8a (ENSAMXG00000016953) ENSAMXG00000032145 igf2b (ENSAMXG00000031616) th (ENSAMXG00000016719) ENSAMXG00000016679 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 65 fanci (ENSPNAG00000006572) FBXO31 (ENSPNAG00000028889) ENSPNAG00000028806 ENSPNAG00000028758 ENSPNAG00000004407 ENSPNAG00000004742 RASSF8 (ENSPNAG00000028666) kras (ENSPNAG00000028629) ENSPNAG00000006076 banp (ENSPNAG00000028568) pdcd2l (ENSPNAG00000004367) SYT8 (ENSPNAG00000028474) #20 ENSPNAG00000028459 tnni2a.1 (ENSPNAG00000006788) #21 tnni2a.2 (ENSPNAG00000028418) #22 tnni2a.3 (ENSPNAG00000006873) #23 tnni2a.4 (ENSPNAG00000028390) #23 ENSPNAG00000006385 ENSPNAG00000028344 #24 tnnt3a (ENSPNAG00000005106) #25 myod1 (ENSPNAG00000006274) ##26 zgc:172145 (ENSPNAG00000005729) #27 ush1c (ENSPNAG00000004979) abcc8 (ENSPNAG00000006867) dusp8a (ENSPNAG00000027990) ENSPNAG00000027977 Electric eel MODERN SPECIES 236 ENSEEEG00000007384 banp (ENSEEEG00000007385) pdcd2l (ENSEEEG00000007386) SYT8 (ENSEEEG00000007387) #20 ENSEEEG00000007390 tnni2a.1 (ENSEEEG00000007391) #21 tnni2a.2 (ENSEEEG00000007393) #22 tnni2a.3 (ENSEEEG00000007394) #23 tnni2a.4 (ENSEEEG00000007412) #23 ENSEEEG00000007427 #24 tnnt3a (ENSEEEG00000007429) #25 myod1 (ENSEEEG00000007431) ##26 ush1c (ENSEEEG00000007432) abcc8 (ENSEEEG00000007434) kcnj11 (ENSEEEG00000007443) mob2a (ENSEEEG00000007448) dusp8a (ENSEEEG00000007456) ENSEEEG00000007463 OSBPL5 (ENSEEEG00000007471) phlda2 (ENSEEEG00000007614) nap1l4a (ENSEEEG00000007616) ENSEEEG00000007618 Channel catfish MODERN SPECIES 5 polg (ENSIPUG00000004036) fanci (ENSIPUG00000004103) FBXO31 (ENSIPUG00000004197) ENSIPUG00000004211 rassf8 (ENSIPUG00000004240) kras (ENSIPUG00000004259) znf469 (ENSIPUG00000004306) ENSIPUG00000004314 banp (ENSIPUG00000004342) PDCD2L (ENSIPUG00000004421) SYT8 (ENSIPUG00000004448) #20 ENSIPUG00000004455 TNNI2 (ENSIPUG00000004462) #21 tnni2a.2 (ENSIPUG00000004477) #22 TNNI2 (ENSIPUG00000004491) #23 tnni2a.3 (ENSIPUG00000004514) #23 tnni2 (ENSIPUG00000004539) #23 ENSIPUG00000004583 ENSIPUG00000004645 #24 ENSIPUG00000004650 tnnt3a (ENSIPUG00000004658) #25 myod1 (ENSIPUG00000004693) ##26 zgc:172145 (ENSIPUG00000004699) #27 ush1c (ENSIPUG00000004724) abcc8 (ENSIPUG00000004801) kcnj11 (ENSIPUG00000005009) mob2a (ENSIPUG00000005022) dusp8a (ENSIPUG00000005041) ENSIPUG00000005070 ENSIPUG00000005122 OSBPL5 (ENSIPUG00000005152) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00700000104539.b.b ENSGT00390000011067.B ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.ec.b ENSGT00940000155200.ec.a ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116.i ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a.n ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 296 ENSGT00390000001368.o ENSGT00940000155200.ec.b ENSGT00940000158339.b ENSGT00390000011116.i.b ENSGT00530000065415.a ENSGT00940000155871.l ENSGT00940000155871.k.a ENSGT00950000182839.B.a.a.l.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b.a ENSGT00940000167812.c #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.a.a.a ##26 ENSGT00920000149457.b #27 ENSGT00950000183002.A.d ENSGT00940000156626.w.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b.e ENSGT01050000244956.a.a.n.a ENSGT00940000160004.f.b ENSGT00940000156870.cb ENSGT00940000159535.g ENSGT00940000169159.b ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a.b ENSGT00940000164715.b.a Goldfish MODERN SPECIES 45 sigirr (ENSCARG00000070314) ENSCARG00000070316 dynlrb2 (ENSCARG00000070319) FBXO31 (ENSCARG00000070320) ENSCARG00000070322 pdcd2l (ENSCARG00000070326) banp (ENSCARG00000047101) ENSCARG00000047113 ENSCARG00000047116 kras (ENSCARG00000047124) RASSF8 (ENSCARG00000047148) ENSCARG00000047172 tnni2a.1 (ENSCARG00000047183) #21 tnni2a.2 (ENSCARG00000047218) #22 ENSCARG00000047242 #24 tnni2a.3 (ENSCARG00000047250) #23 ENSCARG00000047262 myod1 (ENSCARG00000047275) ##26 zgc:172145 (ENSCARG00000047288) #27 ush1c (ENSCARG00000047304) abcc8 (ENSCARG00000047502) kcnj11 (ENSCARG00000048580) mob2a (ENSCARG00000048612) dusp8a (ENSCARG00000048679) ENSCARG00000048706 OSBPL5 (ENSCARG00000048773) phlda2 (ENSCARG00000049767) nap1l4a (ENSCARG00000049783) ENSCARG00000049918 ENSCARG00000050525 mrpl23 (ENSCARG00000050540) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156926.c.b ENSGT00390000008107.c.b.b ENSGT00940000159515.c.a.c.a ENSGT01090000259985.b.b.b.b.i ENSGT00700000104539.b.b.a ENSGT00390000001368.o ENSGT00940000155200.ec.b.a ENSGT00940000158339.b ENSGT00390000011116.i.b ENSGT00530000065415.a ENSGT00940000155871.l ENSGT00950000182839.B.a.a.l.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT00940000153901.a.b.b.b ENSGT00940000153901.a.b.b.a ENSGT00940000167812.c #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.a.a.a ##26 ENSGT00920000149457.b #27 ENSGT00950000183002.A.d ENSGT00940000156626.w.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b.e ENSGT01050000244956.a.a.n.a ENSGT00940000160004.f.b ENSGT00940000156870.cb ENSGT00940000159535.g ENSGT00940000169159.b ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a.b Golden-line barbel MODERN SPECIES 198 sigirr (ENSSGRG00000039109) ENSSGRG00000039108 dynlrb2 (ENSSGRG00000039107) FBXO31 (ENSSGRG00000039106) ENSSGRG00000039103 ENSSGRG00000039102 pdcd2l (ENSSGRG00000039101) ENSSGRG00000039100 ENSSGRG00000039099 kras (ENSSGRG00000039029) RASSF8 (ENSSGRG00000039023) ENSSGRG00000039021 #20 ENSSGRG00000039020 tnni2a.1 (ENSSGRG00000039014) #21 tnni2a.2 (ENSSGRG00000039009) #22 tnni2a.3 (ENSSGRG00000039007) #23 ENSSGRG00000039005 #23 ENSSGRG00000039001 ENSSGRG00000039000 #24 ENSSGRG00000038998 #24 myod1 (ENSSGRG00000038991) ##26 zgc:172145 (ENSSGRG00000038989) #27 ush1c (ENSSGRG00000038778) Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 33 hexa (ENSCCRG00000074553) pkp3a (ENSCCRG00000042746) sigirr (ENSCCRG00000060543) dynlrb2 (ENSCCRG00000047355) ENSCCRG00000043287 ENSCCRG00000015852 pdcd2l (ENSCCRG00000043265) ENSCCRG00000068910 banp (ENSCCRG00000029986) ENSCCRG00000062479 kras (ENSCCRG00000049418) ENSCCRG00000024104 ENSCCRG00000049349 SYT8 (ENSCCRG00000007820) #20 tnni2a.2 (ENSCCRG00000007838) #22 tnni2a.3 (ENSCCRG00000067810) #23 ENSCCRG00000049337 ENSCCRG00000059451 #24 TNNT3 (ENSCCRG00000056652) ##25 myod1 (ENSCCRG00000078915) ##26 zgc:172145 (ENSCCRG00000074849) #27 ENSCCRG00000081027 ush1c (ENSCCRG00000014177) abcc8 (ENSCCRG00000004760) kcnj11 (ENSCCRG00000075210) mob2a (ENSCCRG00000008336) dusp8a (ENSCCRG00000056844) ENSCCRG00000022539 ENSCCRG00000075142 ENSCCRG00000070395 ENSCCRG00000006126 Common carp reference MODERN SPECIES 37 hexa (ENSCCRG00000042810) pkp3a (ENSCCRG00000042877) sigirr (ENSCCRG00000042867) ENSCCRG00000018100 ENSCCRG00000071670 ENSCCRG00000059814 pdcd2l (ENSCCRG00000015904) banp (ENSCCRG00000043253) ENSCCRG00000058767 ENSCCRG00000053006 kras (ENSCCRG00000024099) ENSCCRG00000069031 SYT8 (ENSCCRG00000059526) #20 tnni2a.1 (ENSCCRG00000039838) #21 tnni2a.2 (ENSCCRG00000064585) #22 tnni2a.3 (ENSCCRG00000007849) #23 ENSCCRG00000007923 ENSCCRG00000007936 #24 tnnt3a (ENSCCRG00000062720) #25 myod1 (ENSCCRG00000049312) ##26 zgc:172145 (ENSCCRG00000059740) #27 ush1c (ENSCCRG00000013479) abcc8 (ENSCCRG00000006460) ENSCCRG00000078356 kcnj11 (ENSCCRG00000078656) mob2a (ENSCCRG00000062835) dusp8a (ENSCCRG00000066543) ENSCCRG00000070357 ENSCCRG00000066001 ENSCCRG00000068830 ENSCCRG00000031128 Zebrafish MODERN SPECIES 17 api5 (ENSDARG00000033597) hsd17b12a (ENSDARG00000015709) alkbh3 (ENSDARG00000045606) C25H11orf96 (ENSDARG00000097208) pdia3 (ENSDARG00000102640) ENSDARG00000104818 ENSDARG00000101726 pdcd2l (ENSDARG00000002754) banp (ENSDARG00000017562) ENSDARG00000115365 kras (ENSDARG00000010844) RASSF8 (ENSDARG00000045596) ENSDARG00000110361 tnni2a.1 (ENSDARG00000045592) #21 tnni2a.2 (ENSDARG00000005841) #22 tnni2a.3 (ENSDARG00000013752) #23 tnni2a.4 (ENSDARG00000029069) #23 ENSDARG00000027310 ENSDARG00000097224 #24 tnnt3a (ENSDARG00000030270) #25 myod1 (ENSDARG00000030110) ##26 zgc:172145 (ENSDARG00000045586) #27 lamb1a (ENSDARG00000101209) lamb4 (ENSDARG00000039133) acot19 (ENSDARG00000040427) ubl7a (ENSDARG00000024229) scamp5a (ENSDARG00000018743) parp16 (ENSDARG00000018593) ENSDARG00000097169 EIF3J (ENSDARG00000097988) eif3ja (ENSDARG00000012603) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 ENSGT00940000177178 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000159916 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 656 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 ENSGT00940000177178 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 471 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 ENSGT00940000177178 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 1560 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 ENSGT00940000177178 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 1182 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 ENSGT00940000177178 Golden-line barbel MODERN SPECIES 198 ENSSGRG00000039108 dynlrb2 (ENSSGRG00000039107) FBXO31 (ENSSGRG00000039106) ENSSGRG00000039103 ENSSGRG00000039102 pdcd2l (ENSSGRG00000039101) ENSSGRG00000039100 ENSSGRG00000039099 kras (ENSSGRG00000039029) RASSF8 (ENSSGRG00000039023) ENSSGRG00000039021 #20 ENSSGRG00000039020 tnni2a.1 (ENSSGRG00000039014) #21 tnni2a.2 (ENSSGRG00000039009) #22 tnni2a.3 (ENSSGRG00000039007) #23 ENSSGRG00000039005 #23 ENSSGRG00000039001 ENSSGRG00000039000 #24 ENSSGRG00000038998 #24 myod1 (ENSSGRG00000038991) ##26 zgc:172145 (ENSSGRG00000038989) #27 ush1c (ENSSGRG00000038778) Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 Channel catfish MODERN SPECIES 5 rhcg1 (ENSIPUG00000004004) polg (ENSIPUG00000004036) fanci (ENSIPUG00000004103) FBXO31 (ENSIPUG00000004197) ENSIPUG00000004211 rassf8 (ENSIPUG00000004240) kras (ENSIPUG00000004259) znf469 (ENSIPUG00000004306) ENSIPUG00000004314 banp (ENSIPUG00000004342) PDCD2L (ENSIPUG00000004421) SYT8 (ENSIPUG00000004448) #20 ENSIPUG00000004455 TNNI2 (ENSIPUG00000004462) #21 tnni2a.2 (ENSIPUG00000004477) #22 TNNI2 (ENSIPUG00000004491) #23 tnni2a.3 (ENSIPUG00000004514) #23 tnni2 (ENSIPUG00000004539) #23 ENSIPUG00000004583 ENSIPUG00000004645 #24 ENSIPUG00000004650 tnnt3a (ENSIPUG00000004658) #25 myod1 (ENSIPUG00000004693) ##26 zgc:172145 (ENSIPUG00000004699) #27 ush1c (ENSIPUG00000004724) abcc8 (ENSIPUG00000004801) kcnj11 (ENSIPUG00000005009) mob2a (ENSIPUG00000005022) dusp8a (ENSIPUG00000005041) ENSIPUG00000005070 ENSIPUG00000005122 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1246 ENSAMXG00000039263 banp (ENSAMXG00000017170) pdcd2l (ENSAMXG00000017155) ENSAMXG00000017150 #20 ENSAMXG00000037298 TNNI2 (ENSAMXG00000042297) #23 tnni2a.4 (ENSAMXG00000017111) #23 tnni2a.1 (ENSAMXG00000035063) #21 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b.a #25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00950000183002.A.f ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b.d ENSGT00940000159535.i ENSGT00440000039564.a.b.i ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a ENSGT00940000164715.b ENSGT00940000160745.d ENSGT00390000007739 Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000015753 ENSCHAG00000015784 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) #20 ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) #21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) #22 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) #23 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) #23 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 #24 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) #25 MYOD1 (ENSCHAG00000016826) #26 zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) #27 ush1c (ENSCHAG00000016858) abcc8 (ENSCHAG00000017040) kcnj11 (ENSCHAG00000020282) Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000015739 ENSCHAG00000015753 ENSCHAG00000015784 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) #20 ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) #21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) #22 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) #23 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) #23 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 #24 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) #25 MYOD1 (ENSCHAG00000016826) #26 zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) #27 ush1c (ENSCHAG00000016858) abcc8 (ENSCHAG00000017040) Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000015577 ENSCHAG00000015724 ENSCHAG00000015739 ENSCHAG00000015753 ENSCHAG00000015784 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) #20 ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) #21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) #22 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) #23 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) #23 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 #24 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) #25 MYOD1 (ENSCHAG00000016826) #26 zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) #27 Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000015784 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) #20 ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) #21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) #22 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) #23 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) #23 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 #24 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) #25 MYOD1 (ENSCHAG00000016826) #26 zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) #27 ush1c (ENSCHAG00000016858) abcc8 (ENSCHAG00000017040) kcnj11 (ENSCHAG00000020282) mob2a (ENSCHAG00000020294) Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000015724 ENSCHAG00000015739 ENSCHAG00000015753 ENSCHAG00000015784 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) #20 ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) #21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) #22 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) #23 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) #23 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 #24 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) #25 MYOD1 (ENSCHAG00000016826) #26 zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) #27 ush1c (ENSCHAG00000016858) Atlantic herring MODERN SPECIES 19 banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) #20 ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) #21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) #22 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) #23 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) #23 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 #24 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) #25 MYOD1 (ENSCHAG00000016826) #26 zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) #27 ush1c (ENSCHAG00000016858) abcc8 (ENSCHAG00000017040) kcnj11 (ENSCHAG00000020282) mob2a (ENSCHAG00000020294) dusp8a (ENSCHAG00000020357) ENSCHAG00000020362 Atlantic herring MODERN SPECIES 19 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) #20 ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) #21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) #22 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) #23 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) #23 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 #24 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) #25 MYOD1 (ENSCHAG00000016826) #26 zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) #27 ush1c (ENSCHAG00000016858) abcc8 (ENSCHAG00000017040) kcnj11 (ENSCHAG00000020282) mob2a (ENSCHAG00000020294) dusp8a (ENSCHAG00000020357) Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) #20 ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) #21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) #22 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) #23 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) #23 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 #24 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) #25 MYOD1 (ENSCHAG00000016826) #26 zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) #27 ush1c (ENSCHAG00000016858) abcc8 (ENSCHAG00000017040) kcnj11 (ENSCHAG00000020282) mob2a (ENSCHAG00000020294) dusp8a (ENSCHAG00000020357) ENSCHAG00000020362 ENSCHAG00000020373 Atlantic herring MODERN SPECIES 19 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) #20 ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) #21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) #22 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) #23 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) #23 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 #24 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) #25 MYOD1 (ENSCHAG00000016826) #26 zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) #27 ush1c (ENSCHAG00000016858) abcc8 (ENSCHAG00000017040) kcnj11 (ENSCHAG00000020282) mob2a (ENSCHAG00000020294) dusp8a (ENSCHAG00000020357) ENSCHAG00000020362 ENSCHAG00000020373 ENSCHAG00000020389 Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) #20 ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) #21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) #22 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) #23 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) #23 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) #23 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 #24 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) #25 MYOD1 (ENSCHAG00000016826) #26 zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) #27 ush1c (ENSCHAG00000016858) abcc8 (ENSCHAG00000017040) kcnj11 (ENSCHAG00000020282) mob2a (ENSCHAG00000020294) dusp8a (ENSCHAG00000020357) ENSCHAG00000020362 ENSCHAG00000020373 ENSCHAG00000020389 ENSCHAG00000020425 ENSCHAG00000021043 Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 8 RASSF7 (ENSDCDG00000031144) ENSDCDG00000031146 irf7 (ENSDCDG00000031151) ascl1b (ENSDCDG00000031153) CES3 (ENSDCDG00000031156) pdcd2l (ENSDCDG00000031158) banp (ENSDCDG00000031160) ENSDCDG00000031164 kras (ENSDCDG00000031166) RASSF8 (ENSDCDG00000031168) ENSDCDG00000031170 SYT8 (ENSDCDG00000031171) #20 ENSDCDG00000031173 tnni2a.1 (ENSDCDG00000031175) #21 tnni2a.2 (ENSDCDG00000031178) #22 ENSDCDG00000031179 #23 ENSDCDG00000031186 #23 TNNI2 (ENSDCDG00000005638) #23 tnni2a.4 (ENSDCDG00000005740) #23 ENSDCDG00000006819 ENSDCDG00000006877 #24 MYOD1 (ENSDCDG00000006890) ##26 zgc:172145 (ENSDCDG00000006912) #27 ush1c (ENSDCDG00000007075) abcc8 (ENSDCDG00000007647) kcnj11 (ENSDCDG00000007731) mob2a (ENSDCDG00000007735) dusp8a (ENSDCDG00000007781) ENSDCDG00000007814 OSBPL5 (ENSDCDG00000008088) phlda2 (ENSDCDG00000013795) Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 8 ENSDCDG00000031146 irf7 (ENSDCDG00000031151) ascl1b (ENSDCDG00000031153) CES3 (ENSDCDG00000031156) pdcd2l (ENSDCDG00000031158) banp (ENSDCDG00000031160) ENSDCDG00000031164 kras (ENSDCDG00000031166) RASSF8 (ENSDCDG00000031168) ENSDCDG00000031170 SYT8 (ENSDCDG00000031171) #20 ENSDCDG00000031173 tnni2a.1 (ENSDCDG00000031175) #21 tnni2a.2 (ENSDCDG00000031178) #22 ENSDCDG00000031179 #23 ENSDCDG00000031186 #23 TNNI2 (ENSDCDG00000005638) #23 tnni2a.4 (ENSDCDG00000005740) #23 ENSDCDG00000006819 ENSDCDG00000006877 #24 MYOD1 (ENSDCDG00000006890) ##26 zgc:172145 (ENSDCDG00000006912) #27 ush1c (ENSDCDG00000007075) abcc8 (ENSDCDG00000007647) kcnj11 (ENSDCDG00000007731) mob2a (ENSDCDG00000007735) dusp8a (ENSDCDG00000007781) ENSDCDG00000007814 OSBPL5 (ENSDCDG00000008088) phlda2 (ENSDCDG00000013795) ENSDCDG00000013798 Denticle herring MODERN SPECIES 8 irf7 (ENSDCDG00000031151) ascl1b (ENSDCDG00000031153) CES3 (ENSDCDG00000031156) pdcd2l (ENSDCDG00000031158) banp (ENSDCDG00000031160) ENSDCDG00000031164 kras (ENSDCDG00000031166) RASSF8 (ENSDCDG00000031168) ENSDCDG00000031170 SYT8 (ENSDCDG00000031171) #20 ENSDCDG00000031173 tnni2a.1 (ENSDCDG00000031175) #21 tnni2a.2 (ENSDCDG00000031178) #22 ENSDCDG00000031179 #23 ENSDCDG00000031186 #23 TNNI2 (ENSDCDG00000005638) #23 tnni2a.4 (ENSDCDG00000005740) #23 ENSDCDG00000006819 ENSDCDG00000006877 #24 MYOD1 (ENSDCDG00000006890) ##26 zgc:172145 (ENSDCDG00000006912) #27 ush1c (ENSDCDG00000007075) abcc8 (ENSDCDG00000007647) kcnj11 (ENSDCDG00000007731) mob2a (ENSDCDG00000007735) dusp8a (ENSDCDG00000007781) ENSDCDG00000007814 OSBPL5 (ENSDCDG00000008088) phlda2 (ENSDCDG00000013795) ENSDCDG00000013798 ENSDCDG00000013856 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000164955.a ##16 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 #20 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a #23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a #21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 #24 ENSGT00940000158477.a.b #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00920000149457 #27 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000160333 ENSGT00940000153362.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 564 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.b ##26 ENSGT00940000157490 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 261 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 303 ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 161 ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 136 ENSHCOG00000007050 prc1b (ENSHCOG00000007079) ptpmt1 (ENSHCOG00000000812) ndufs3 (ENSHCOG00000007117) slc22a18 (ENSHCOG00000007148) HACD3 (ENSHCOG00000000227) SLC24A1 (ENSHCOG00000007190) ENSHCOG00000007227 socs4 (ENSHCOG00000007249) wdhd1 (ENSHCOG00000007286) ENSHCOG00000007299 gch1 (ENSHCOG00000007311) SAMD4A (ENSHCOG00000007338) pacsin3 (ENSHCOG00000007361) GLG1 (ENSHCOG00000007399) ##32 tnni2b.1 (ENSHCOG00000007414) ##23 aph1b (ENSHCOG00000007434) OTOG (ENSHCOG00000007493) myod1 (ENSHCOG00000007505) ##26 TNNT3 (ENSHCOG00000007514) ##25 ENSHCOG00000007520 foxr1 (ENSHCOG00000007530) atp6v0d1 (ENSHCOG00000000254) ENSHCOG00000007547 ENSHCOG00000000257 ENSHCOG00000007798 ENSHCOG00000007856 ENSHCOG00000007893 c1qtnf4 (ENSHCOG00000007905) ENSHCOG00000007911 ist1 (ENSHCOG00000007934) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000161832.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.f.a ENSGT00940000163716.c.b.d.b.a ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.f.a ENSGT00940000163716.c.b.d.b.a ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 94 ENSKMAG00000020454 ENSKMAG00000020462 NR2E3 (ENSKMAG00000020481) slc22a18 (ENSKMAG00000020503) HACD3 (ENSKMAG00000020519) SAMD4A (ENSKMAG00000020543) gch1 (ENSKMAG00000020574) wdhd1 (ENSKMAG00000020604) socs4 (ENSKMAG00000020674) ENSKMAG00000020680 dennd4a (ENSKMAG00000020759) SLC24A1 (ENSKMAG00000020920) ero1a (ENSKMAG00000020950) pacsin3 (ENSKMAG00000021024) glg1b (ENSKMAG00000021075) ##32 tnni2b.1 (ENSKMAG00000021151) ##23 aph1b (ENSKMAG00000021168) OTOG (ENSKMAG00000021189) myod1 (ENSKMAG00000021238) ##26 TNNT3 (ENSKMAG00000021246) ##25 ENSKMAG00000000140 ENSKMAG00000000158 ENSKMAG00000000224 foxr1 (ENSKMAG00000000233) atp6v0d1 (ENSKMAG00000000274) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1616 WDHD1 (ENSNFUG00015004515) socs4 (ENSNFUG00015004506) ENSNFUG00015004502 dennd4a (ENSNFUG00015004412) SLC24A1 (ENSNFUG00015004331) PTPLAD1 (ENSNFUG00015004247) SLC22A18 (ENSNFUG00015004215) NR2E3 (ENSNFUG00015004197) STRA6 (ENSNFUG00015004168) ENSNFUG00015004153 MPPED2 (ENSNFUG00015004145) ZDHHC13 (ENSNFUG00015004092) CSRP3 (ENSNFUG00015004067) E2F8 (ENSNFUG00015004061) ENSNFUG00015004056 tnni2b.1 (ENSNFUG00015004041) ##23 ENSNFUG00015004036 aph1b (ENSNFUG00015004030) myod1 (ENSNFUG00015003991) ##26 TNNT3 (ENSNFUG00015003986) ##25 ENSNFUG00015003982 ENSNFUG00015003978 ENSNFUG00015003951 ENSNFUG00015003937 ENSNFUG00015003935 ENSNFUG00015003933 rnaset2 (ENSNFUG00015003928) MYOM2 (ENSNFUG00015003834) ENSNFUG00015003786 CSMD1 (ENSNFUG00015004499) ENSNFUG00015004374 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b.d.b.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.f.a ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000163716.c.b.d.b.b ENSGT00940000163716.c.b.d.a ENSGT00940000163716.c.b.c.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.f.b ENSGT00940000163716.c.b.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b.e ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030.l ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT00940000155836.B ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT00940000160333 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000160967.f ENSGT00390000007681.b.a.a Platyfish MODERN SPECIES 18 ENSXMAG00000028886 ENSXMAG00000017982 ENSXMAG00000019966 atp6v0d1 (ENSXMAG00000018770) foxr1 (ENSXMAG00000029193) ENSXMAG00000025525 ENSXMAG00000023777 ENSXMAG00000028813 ENSXMAG00000026706 ENSXMAG00000029307 ENSXMAG00000028640 TNNT3 (ENSXMAG00000027991) ##25 myod1 (ENSXMAG00000009780) ##26 OTOG (ENSXMAG00000009782) aph1b (ENSXMAG00000009804) tnni2b.1 (ENSXMAG00000009816) ##23 socs4 (ENSXMAG00000020189) wdhd1 (ENSXMAG00000009823) gch1 (ENSXMAG00000009846) SAMD4A (ENSXMAG00000009864) ENSXMAG00000023464 ero1a (ENSXMAG00000029457) pacsin3 (ENSXMAG00000022122) glg1b (ENSXMAG00000010415) ##32 dennd4a (ENSXMAG00000010376) SLC24A1 (ENSXMAG00000010371) HACD3 (ENSXMAG00000010327) slc22a18 (ENSXMAG00000010324) ENSXMAG00000029990 ENSXMAG00000027678 NR2E3 (ENSXMAG00000010311) Poecilia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161832.a ENSGT00940000163716.c.b.d.b.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.f.a ENSGT00940000163716.c.b.d.b.b ENSGT00940000163716.c.b.d.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.e ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030.l ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT00940000155836.B ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT00940000160333 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000160967.f ENSGT00390000007681.b.a.a NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00940000163716.c.b.d.b.b ENSGT00940000163716.c.b.d.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.e ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00940000163460.a.a.a.a.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030.l ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT00940000155836.B ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT00940000160333 ENSGT01090000260059.a.b.b.a.a.a.a.a.a.b.a.g.a.a.b.a.b.b.a.a.b.b.b.a.a.c ENSGT01090000260059.a.b.b.a.a.a.a.a.a.b.a.g.a.a.b.a.b.b.a.a.b.b.b.a.a.d.a ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000153246.a.a.a.d Sailfin molly MODERN SPECIES 1888 OTOG (ENSPLAG00000021180) aph1b (ENSPLAG00000021201) tnni2b.1 (ENSPLAG00000021212) ##23 socs4 (ENSPLAG00000021223) ENSPLAG00000021266 Amazon molly MODERN SPECIES 350 ENSPFOG00000023067 ENSPFOG00000024331 ENSPFOG00000010378 ENSPFOG00000010292 atp6v0d1 (ENSPFOG00000010180) foxr1 (ENSPFOG00000010151) ENSPFOG00000010075 ENSPFOG00000010010 ENSPFOG00000009981 ENSPFOG00000009947 ENSPFOG00000022109 TNNT3 (ENSPFOG00000009845) ##25 myod1 (ENSPFOG00000009843) ##26 OTOG (ENSPFOG00000009345) aph1b (ENSPFOG00000009273) tnni2b.1 (ENSPFOG00000009219) ##23 socs4 (ENSPFOG00000009206) ENSPFOG00000022454 wdhd1 (ENSPFOG00000008914) gch1 (ENSPFOG00000008835) SAMD4A (ENSPFOG00000008620) ero1a (ENSPFOG00000008385) pacsin3 (ENSPFOG00000008277) glg1b (ENSPFOG00000007965) ##32 dennd4a (ENSPFOG00000006791) ENSPFOG00000006545 HACD3 (ENSPFOG00000006432) slc22a18 (ENSPFOG00000006271) ENSPFOG00000006238 ENSPFOG00000006219 NR2E3 (ENSPFOG00000006106) Guppy MODERN SPECIES 455 ENSPREG00000018298 ENSPREG00000018312 ENSPREG00000018325 ENSPREG00000018336 ENSPREG00000018343 atp6v0d1 (ENSPREG00000018365) foxr1 (ENSPREG00000018384) ENSPREG00000018404 ENSPREG00000018416 ENSPREG00000018424 ENSPREG00000018428 TNNT3 (ENSPREG00000018442) ##25 myod1 (ENSPREG00000018453) ##26 ENSPREG00000018462 aph1b (ENSPREG00000018474) tnni2b.1 (ENSPREG00000018498) ##23 socs4 (ENSPREG00000018515) wdhd1 (ENSPREG00000018533) gch1 (ENSPREG00000018570) SAMD4A (ENSPREG00000018648) ENSPREG00000018696 ENSPREG00000018709 ero1a (ENSPREG00000018741) pacsin3 (ENSPREG00000018797) glg1b (ENSPREG00000018842) ##32 dennd4a (ENSPREG00000018994) SLC24A1 (ENSPREG00000019149) HACD3 (ENSPREG00000019209) slc22a18 (ENSPREG00000019227) ENSPREG00000019254 ENSPREG00000019267 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030.n ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a Sheepshead minnow MODERN SPECIES 198 ENSCVAG00000005070 ENSCVAG00000005078 ENSCVAG00000005151 NR2E3 (ENSCVAG00000005210) slc22a18 (ENSCVAG00000005226) HACD3 (ENSCVAG00000005529) SLC24A1 (ENSCVAG00000005559) dennd4a (ENSCVAG00000005774) socs4 (ENSCVAG00000005809) wdhd1 (ENSCVAG00000006106) gch1 (ENSCVAG00000006132) SAMD4A (ENSCVAG00000006183) ero1a (ENSCVAG00000006196) pacsin3 (ENSCVAG00000006247) glg1b (ENSCVAG00000006375) ##32 tnni2b.1 (ENSCVAG00000006390) ##23 aph1b (ENSCVAG00000006407) OTOG (ENSCVAG00000000628) myod1 (ENSCVAG00000006504) ##26 TNNT3 (ENSCVAG00000006519) ##25 ENSCVAG00000006531 ENSCVAG00000006553 ENSCVAG00000006565 ENSCVAG00000006585 foxr1 (ENSCVAG00000006599) atp6v0d1 (ENSCVAG00000006618) ENSCVAG00000006642 ENSCVAG00000006645 ENSCVAG00000006653 ENSCVAG00000006659 ENSCVAG00000006667 Mummichog MODERN SPECIES 354 dennd4a (ENSFHEG00000009121) socs4 (ENSFHEG00000009130) ENSFHEG00000009177 ENSFHEG00000009185 gch1 (ENSFHEG00000009194) SAMD4A (ENSFHEG00000009300) ero1a (ENSFHEG00000009396) pacsin3 (ENSFHEG00000009453) glg1b (ENSFHEG00000009842) ##32 tnni2b.1 (ENSFHEG00000009882) ##23 aph1b (ENSFHEG00000009933) OTOG (ENSFHEG00000010073) myod1 (ENSFHEG00000010084) ##26 ENSFHEG00000000227 ##25 ENSFHEG00000010124 ENSFHEG00000010134 ENSFHEG00000010171 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000161832.a Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007681.b.a.a.o ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00390000018319.a.a.a.a ENSGT00940000171332 ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00390000010652.C ENSGT00940000160456 ENSGT01030000234623.a.b.b ENSGT00390000008502 ENSGT00690000102225 ENSGT00390000011608 ENSGT00940000156813 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00390000014065 ENSGT00390000017480 ENSGT00940000161832.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000158376 ENSGT00390000018319.a.a.a.a ENSGT00940000171332 ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a ENSGT00390000010652.C ENSGT00940000160456 ENSGT01030000234623.a.b.b ENSGT00390000008502 ENSGT00690000102225 ENSGT00390000011608 ENSGT00940000156813 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00390000014065 ENSGT00390000017480 ENSGT00940000161832.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00960000186692 ENSGT00980000199380.a.b ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000007753.b ENSGT00940000157933 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00390000002030 Orange clownfish MODERN SPECIES iqgap1 (ENSAPEG00000000190) ENSAPEG00000000189 ENSAPEG00000000188 ENSAPEG00000000186 SERINC4 (ENSAPEG00000000185) hypk (ENSAPEG00000000184) mfap1 (ENSAPEG00000000183) hddc3 (ENSAPEG00000000182) vps33b (ENSAPEG00000000181) prc1b (ENSAPEG00000000180) ptpmt1 (ENSAPEG00000000179) ndufs3 (ENSAPEG00000000178) c1qtnf4 (ENSAPEG00000000177) ENSAPEG00000000176 ENSAPEG00000000175 tnni2b.1 (ENSAPEG00000000174) ##23 aph1b (ENSAPEG00000000173) OTOG (ENSAPEG00000000171) myod1 (ENSAPEG00000000170) ##26 TNNT3 (ENSAPEG00000000169) ##25 ENSAPEG00000000168 ENSAPEG00000000167 ENSAPEG00000000166 foxr1 (ENSAPEG00000000165) atp6v0d1 (ENSAPEG00000000164) glg1b (ENSAPEG00000000163) ##32 ENSAPEG00000000162 ##32 pacsin3 (ENSAPEG00000000161) ero1a (ENSAPEG00000000160) SAMD4A (ENSAPEG00000000159) gch1 (ENSAPEG00000000158) Clown anemonefish MODERN SPECIES 2000 ENSAOCG00000016088 ##10 ENSAOCG00000016140 tnni2b.1 (ENSAOCG00000016168) ##23 aph1b (ENSAOCG00000016196) OTOG (ENSAOCG00000016353) myod1 (ENSAOCG00000016381) ##26 TNNT3 (ENSAOCG00000016439) ##25 ENSAOCG00000001128 Spiny chromis MODERN SPECIES 203 ENSAPOG00000008561 SERINC4 (ENSAPOG00000008572) hypk (ENSAPOG00000008593) mfap1 (ENSAPOG00000008633) hddc3 (ENSAPOG00000008637) vps33b (ENSAPOG00000008758) prc1b (ENSAPOG00000000921) ptpmt1 (ENSAPOG00000009054) ndufs3 (ENSAPOG00000009074) c1qtnf4 (ENSAPOG00000009100) ENSAPOG00000009120 ENSAPOG00000009168 tnni2b.1 (ENSAPOG00000009198) ##23 aph1b (ENSAPOG00000009227) OTOG (ENSAPOG00000009407) myod1 (ENSAPOG00000000266) ##26 TNNT3 (ENSAPOG00000009460) ##25 ENSAPOG00000009481 ENSAPOG00000009501 ENSAPOG00000009515 ENSAPOG00000009535 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1388 SAMD4A (ENSSPAG00000007623) ero1a (ENSSPAG00000007676) pacsin3 (ENSSPAG00000007712) glg1b (ENSSPAG00000007737) ##32 TNNI2 (ENSSPAG00000007805) ##23 aph1b (ENSSPAG00000007820) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000161832.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a.o.b ENSGT00940000163716.c.b.b ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00960000186692 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000161832.a ENSGT00940000163716.c.b.a ENSGT00940000163716.c.b.b ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030.o ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00960000186692 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000177294 ENSGT00940000153901.a.b.a Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000161832.a ENSGT00940000163716.c.b.a ENSGT00940000163716.c.b.b ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030.o ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT00490000044642.a.a.a.a.a.b.a.a.b.h Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000161832.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a.o.b ENSGT01020000230593.B.a.a.b.a ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202.c ENSGT00390000002030.o ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT00490000044642.a.a.a.a.a.b.a.a.b.h Eastern happy MODERN SPECIES atp6v0d1 (ENSACLG00000008763) foxr1 (ENSACLG00000008771) ENSACLG00000008774 ENSACLG00000008777 HACD3 (ENSACLG00000008783) SLC24A1 (ENSACLG00000008823) ENSACLG00000008842 dennd4a (ENSACLG00000008854) socs4 (ENSACLG00000009024) wdhd1 (ENSACLG00000009036) gch1 (ENSACLG00000009069) SAMD4A (ENSACLG00000009089) ero1a (ENSACLG00000009207) pacsin3 (ENSACLG00000009240) glg1b (ENSACLG00000009342) ##32 tnni2b.1 (ENSACLG00000009427) ##23 aph1b (ENSACLG00000009435) OTOG (ENSACLG00000009449) myod1 (ENSACLG00000009487) ##26 TNNT3 (ENSACLG00000009498) ##25 ENSACLG00000009574 ENSACLG00000009580 ENSACLG00000009585 ENSACLG00000010176 celf1 (ENSACLG00000010181) mtfmt (ENSACLG00000010234) uqcrfs1 (ENSACLG00000010241) rasl12 (ENSACLG00000010244) ENSACLG00000010254 UBAP1L (ENSACLG00000010255) KBTBD13 (ENSACLG00000010261) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1091 c1qtnf4 (ENSMZEG00005015697) ENSMZEG00005015677 ENSMZEG00005015666 atp6v0d1 (ENSMZEG00005015650) foxr1 (ENSMZEG00005015635) HACD3 (ENSMZEG00005015600) SLC24A1 (ENSMZEG00005015586) dennd4a (ENSMZEG00005015311) socs4 (ENSMZEG00005015254) wdhd1 (ENSMZEG00005015228) gch1 (ENSMZEG00005015209) SAMD4A (ENSMZEG00005015188) ero1a (ENSMZEG00005015175) pacsin3 (ENSMZEG00005015162) glg1b (ENSMZEG00005015115) ##32 TNNI2 (ENSMZEG00005015093) ##23 aph1b (ENSMZEG00005015081) OTOG (ENSMZEG00005015041) myod1 (ENSMZEG00005015006) ##26 TNNT3 (ENSMZEG00005014820) ##25 ENSMZEG00005014810 ENSMZEG00005014803 ENSMZEG00005014794 ENSMZEG00005014786 ENSMZEG00005014779 ENSMZEG00005014767 slc22a18 (ENSMZEG00005014753) NR2E3 (ENSMZEG00005014737) ENSMZEG00005014718 ENSMZEG00005014709 mpped2a (ENSMZEG00005014683) P. nyererei MODERN SPECIES 604 SLC24A1 (ENSPNYG00000018952) dennd4a (ENSPNYG00000018998) socs4 (ENSPNYG00000019064) wdhd1 (ENSPNYG00000019115) gch1 (ENSPNYG00000019405) SAMD4A (ENSPNYG00000019428) ero1a (ENSPNYG00000019483) pacsin3 (ENSPNYG00000019526) glg1b (ENSPNYG00000019577) ##32 TNNI2 (ENSPNYG00000019672) ##23 aph1b (ENSPNYG00000019699) OTOG (ENSPNYG00000019728) myod1 (ENSPNYG00000019848) ##26 TNNT3 (ENSPNYG00000019870) ##25 ENSPNYG00000020016 ENSPNYG00000020046 ENSPNYG00000020055 ENSPNYG00000020071 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 684 HACD3 (ENSHBUG00000016439) SLC24A1 (ENSHBUG00000016373) dennd4a (ENSHBUG00000016303) socs4 (ENSHBUG00000015873) ENSHBUG00000015846 SAMD4A (ENSHBUG00000015778) gch1 (ENSHBUG00000015632) ero1a (ENSHBUG00000015614) pacsin3 (ENSHBUG00000015595) glg1b (ENSHBUG00000015542) ##32 ENSHBUG00000015470 ##23 aph1b (ENSHBUG00000015397) OTOG (ENSHBUG00000015356) myod1 (ENSHBUG00000015165) ##26 TNNT3 (ENSHBUG00000015184) ##25 ENSHBUG00000015145 ENSHBUG00000015130 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 412 ndufs3 (ENSNBRG00000010499) c1qtnf4 (ENSNBRG00000010484) ENSNBRG00000010454 atp6v0d1 (ENSNBRG00000010437) ENSNBRG00000010426 HACD3 (ENSNBRG00000010400) SLC24A1 (ENSNBRG00000010383) ENSNBRG00000010370 socs4 (ENSNBRG00000010334) wdhd1 (ENSNBRG00000010071) gch1 (ENSNBRG00000010039) SAMD4A (ENSNBRG00000009997) ero1a (ENSNBRG00000009955) pacsin3 (ENSNBRG00000009877) glg1b (ENSNBRG00000009842) ##32 ENSNBRG00000009822 ##23 aph1b (ENSNBRG00000009791) OTOG (ENSNBRG00000009698) myod1 (ENSNBRG00000009675) ##26 TNNT3 (ENSNBRG00000009613) ##25 ENSNBRG00000009599 ENSNBRG00000009589 Midas cichlid MODERN SPECIES 964 HACD3 (ENSACIG00000021659) SLC24A1 (ENSACIG00000021640) dennd4a (ENSACIG00000021585) socs4 (ENSACIG00000021569) wdhd1 (ENSACIG00000021530) gch1 (ENSACIG00000021478) SAMD4A (ENSACIG00000021444) ero1a (ENSACIG00000021417) pacsin3 (ENSACIG00000021397) glg1b (ENSACIG00000021354) ##32 TNNI2 (ENSACIG00000021349) ##23 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161051.a.a.b.a.c ENSGT00940000161832.a Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000163723.A.f.b ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000155568.l ENSGT00390000017790 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000155405 ENSGT00940000165890 ENSGT00940000157369.b ENSGT00390000005764 ENSGT00530000063106.B ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00940000154914 ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000155907.b.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000163723.A.f.b ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000155568.l ENSGT00390000017790 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000155405 ENSGT00940000165890 ENSGT00940000157369.b ENSGT00390000005764 ENSGT00530000063106.B ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00940000154914 ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000155907.b.b Climbing perch MODERN SPECIES 16 mpped2a (ENSATEG00000021765) ENSATEG00000021774 ENSATEG00000021798 ENSATEG00000021837 ENSATEG00000021851 HACD3 (ENSATEG00000021866) SLC24A1 (ENSATEG00000021887) DENND4A (ENSATEG00000021908) socs4 (ENSATEG00000021970) wdhd1 (ENSATEG00000021986) gch1 (ENSATEG00000022027) SAMD4A (ENSATEG00000022040) ero1a (ENSATEG00000022081) ENSATEG00000022101 ENSATEG00000022132 ##32 ENSATEG00000022204 ##23 ENSATEG00000022233 ENSATEG00000022248 ENSATEG00000022262 ENSATEG00000022291 ENSATEG00000022355 crybgx (ENSATEG00000022426) lctla (ENSATEG00000022437) tipin (ENSATEG00000022453) dis3l (ENSATEG00000022464) ENSATEG00000022505 RAB11A (ENSATEG00000023730) ENSATEG00000022546 ENSATEG00000022559 ENSATEG00000022577 ENSATEG00000022648 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 14 NAV2 (ENSBSLG00000005804) e2f8 (ENSBSLG00000005446) csrp3 (ENSBSLG00000005399) zdhhc13 (ENSBSLG00000005203) mpped2a (ENSBSLG00000004960) ENSBSLG00000004906 ENSBSLG00000004802 ENSBSLG00000004363 dennd4a (ENSBSLG00000004135) socs4 (ENSBSLG00000004085) gch1 (ENSBSLG00000004073) SAMD4A (ENSBSLG00000004019) wdhd1 (ENSBSLG00000003779) pacsin3 (ENSBSLG00000003052) glg1b (ENSBSLG00000002553) ##32 tnni2b.1 (ENSBSLG00000020423) ##23 ENSBSLG00000020374 ENSBSLG00000020364 arfgap2 (ENSBSLG00000020339) pex16 (ENSBSLG00000020299) cars1 (ENSBSLG00000019894) paqr5a (ENSBSLG00000019801) glceb (ENSBSLG00000019776) anp32a (ENSBSLG00000019742) CORO2B (ENSBSLG00000019705) itga11a (ENSBSLG00000019157) ENSBSLG00000019124 ADAMTS7 (ENSBSLG00000019017) calml4a (ENSBSLG00000018987) cln6a (ENSBSLG00000018967) chrna7a (ENSBSLG00000018854) Zig-zag eel MODERN SPECIES 17 mpped2a (ENSMAMG00000016266) ENSMAMG00000026458 ENSMAMG00000016336 ENSMAMG00000016434 ENSMAMG00000016453 HACD3 (ENSMAMG00000016477) SLC24A1 (ENSMAMG00000016511) DENND4A (ENSMAMG00000016577) socs4 (ENSMAMG00000016740) wdhd1 (ENSMAMG00000016742) gch1 (ENSMAMG00000016761) SAMD4A (ENSMAMG00000016799) ero1a (ENSMAMG00000016859) ENSMAMG00000016868 ENSMAMG00000016896 ##32 TNNI2 (ENSMAMG00000027039) ##23 ENSMAMG00000016992 ENSMAMG00000017001 ENSMAMG00000017043 ENSMAMG00000017073 ENSMAMG00000017121 crybgx (ENSMAMG00000017150) lctla (ENSMAMG00000017174) tipin (ENSMAMG00000017203) dis3l (ENSMAMG00000017229) ENSMAMG00000017293 RAB11A (ENSMAMG00000027414) ENSMAMG00000017337 ENSMAMG00000025603 ENSMAMG00000017358 ENSMAMG00000026774 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2714 sema6dl (ENSSLDG00000021909) ENSSLDG00000021886 slc24a5 (ENSSLDG00000021873) myef2 (ENSSLDG00000021862) ENSSLDG00000021852 CTXN2 (ENSSLDG00000021847) SLC12A1 (ENSSLDG00000021800) dennd4a (ENSSLDG00000021745) socs4 (ENSSLDG00000021736) wdhd1 (ENSSLDG00000021689) gch1 (ENSSLDG00000021679) SAMD4A (ENSSLDG00000021630) ero1a (ENSSLDG00000021600) pacsin3 (ENSSLDG00000021581) glg1b (ENSSLDG00000021532) ##32 TNNI2 (ENSSLDG00000021512) ##23 aph1b (ENSSLDG00000021492) OTOG (ENSSLDG00000021395) myod1 (ENSSLDG00000021376) ##26 TNNT3 (ENSSLDG00000021245) ##25 Greater amberjack MODERN SPECIES 3 ENSSDUG00000016457 ENSSDUG00000016485 NR2E3 (ENSSDUG00000016573) slc22a18 (ENSSDUG00000016604) HACD3 (ENSSDUG00000016623) SLC24A1 (ENSSDUG00000016668) dennd4a (ENSSDUG00000016708) socs4 (ENSSDUG00000016907) wdhd1 (ENSSDUG00000016996) gch1 (ENSSDUG00000017494) SAMD4A (ENSSDUG00000017510) ENSSDUG00000017549 ero1a (ENSSDUG00000017566) pacsin3 (ENSSDUG00000017630) glg1b (ENSSDUG00000017681) ##32 ENSSDUG00000017775 ##23 aph1b (ENSSDUG00000017793) OTOG (ENSSDUG00000017868) myod1 (ENSSDUG00000018276) ##26 TNNT3 (ENSSDUG00000018283) ##25 ENSSDUG00000018305 ENSSDUG00000018321 #24 ENSSDUG00000018331 foxr1 (ENSSDUG00000018344) atp6v0d1 (ENSSDUG00000018360) ENSSDUG00000018375 ENSSDUG00000018386 ENSSDUG00000018406 ENSSDUG00000018427 ENSSDUG00000018441 c1qtnf4 (ENSSDUG00000018457) Barramundi perch MODERN SPECIES 96 mpped2a (ENSLCAG00010017716) ENSLCAG00010017710 ENSLCAG00010017694 NR2E3 (ENSLCAG00010017688) slc22a18 (ENSLCAG00010017678) HACD3 (ENSLCAG00010017676) SLC24A1 (ENSLCAG00010017673) dennd4a (ENSLCAG00010017670) socs4 (ENSLCAG00010017668) wdhd1 (ENSLCAG00010017654) gch1 (ENSLCAG00010017650) SAMD4A (ENSLCAG00010017642) ero1a (ENSLCAG00010017638) pacsin3 (ENSLCAG00010017636) glg1b (ENSLCAG00010017596) ##32 tnni2b.1 (ENSLCAG00010017526) ##23 aph1b (ENSLCAG00010017523) OTOG (ENSLCAG00010017486) myod1 (ENSLCAG00010017465) ##26 TNNT3 (ENSLCAG00010017455) ##25 ENSLCAG00010017452 ENSLCAG00010017447 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 Turbot MODERN SPECIES 17 zdhhc13 (ENSSMAG00000008013) mpped2a (ENSSMAG00000033645) ENSSMAG00000007996 ENSSMAG00000007972 ENSSMAG00000007954 ENSSMAG00000007929 HACD3 (ENSSMAG00000007882) SLC24A1 (ENSSMAG00000007857) DENND4A (ENSSMAG00000007433) wdhd1 (ENSSMAG00000007346) ENSSMAG00000034634 SAMD4A (ENSSMAG00000007254) ero1a (ENSSMAG00000007207) ENSSMAG00000007168 ENSSMAG00000006788 ##32 ENSSMAG00000006609 ##23 ENSSMAG00000006568 ENSSMAG00000027873 ENSSMAG00000006529 ##26 ENSSMAG00000006392 ##25 ENSSMAG00000006376 ENSSMAG00000006344 ENSSMAG00000006320 ENSSMAG00000027949 ENSSMAG00000006274 ENSSMAG00000006222 c1qtnf4 (ENSSMAG00000030864) ENSSMAG00000006194 ptpmt1 (ENSSMAG00000006187) prc1b (ENSSMAG00000006152) vps33b (ENSSMAG00000006116) Tongue sole MODERN SPECIES 25 adcy7 (ENSCSEG00000011379) tent4b (ENSCSEG00000011367) nip7 (ENSCSEG00000011356) ENSCSEG00000011338 ENSCSEG00000011313 ENSCSEG00000011305 BRSK2 (ENSCSEG00000011247) ENSCSEG00000011220 CORO2B (ENSCSEG00000011186) anp32a (ENSCSEG00000011176) glceb (ENSCSEG00000011164) paqr5a (ENSCSEG00000011095) ero1a (ENSCSEG00000011060) pacsin3 (ENSCSEG00000011036) glg1b (ENSCSEG00000010964) ##32 tnni2b.1 (ENSCSEG00000010949) ##23 aph1b (ENSCSEG00000010946) OTOG (ENSCSEG00000010918) myod1 (ENSCSEG00000010907) ##26 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161051.a.a.b.a.c ENSGT00940000161832.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161051.a.a.b.a.c ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 Tetraodon MODERN SPECIES 20 zdhhc13 (ENSTNIG00000002121) mpped2a (ENSTNIG00000005247) ENSTNIG00000005152 ENSTNIG00000005151 NR2E3 (ENSTNIG00000005150) HACD3 (ENSTNIG00000001644) SLC24A1 (ENSTNIG00000018806) dennd4a (ENSTNIG00000018805) socs4 (ENSTNIG00000002432) wdhd1 (ENSTNIG00000018803) gch1 (ENSTNIG00000018802) SAMD4A (ENSTNIG00000018801) ero1a (ENSTNIG00000018800) pacsin3 (ENSTNIG00000018799) glg1b (ENSTNIG00000018797) ##32 tnni2b.1 (ENSTNIG00000018796) ##23 aph1b (ENSTNIG00000018795) OTOG (ENSTNIG00000018794) myod1 (ENSTNIG00000018793) ##26 TNNT3 (ENSTNIG00000018792) ##25 ENSTNIG00000018791 foxr1 (ENSTNIG00000018790) atp6v0d1 (ENSTNIG00000018789) ENSTNIG00000018788 ENSTNIG00000018787 ENSTNIG00000018786 c1qtnf4 (ENSTNIG00000018785) ndufs3 (ENSTNIG00000018784) prc1b (ENSTNIG00000018783) ENSTNIG00000018782 hddc3 (ENSTNIG00000018781) Fugu MODERN SPECIES 4 mpped2a (ENSTRUG00000015686) ENSTRUG00000020949 ENSTRUG00000015637 NR2E3 (ENSTRUG00000015582) slc22a18 (ENSTRUG00000015561) HACD3 (ENSTRUG00000015510) SLC24A1 (ENSTRUG00000015482) dennd4a (ENSTRUG00000015436) socs4 (ENSTRUG00000015433) wdhd1 (ENSTRUG00000015390) gch1 (ENSTRUG00000015367) SAMD4A (ENSTRUG00000015288) ero1a (ENSTRUG00000015220) pacsin3 (ENSTRUG00000015184) glg1b (ENSTRUG00000015083) ##32 tnni2b.1 (ENSTRUG00000015041) ##23 aph1b (ENSTRUG00000014985) myod1 (ENSTRUG00000014891) ##26 TNNT3 (ENSTRUG00000014861) ##25 ENSTRUG00000021513 ENSTRUG00000031897 foxr1 (ENSTRUG00000014847) ENSTRUG00000014811 ENSTRUG00000014775 fgc6ast1 (ENSTRUG00000014710) c1qtnf4 (ENSTRUG00000030667) ndufs3 (ENSTRUG00000014669) ptpmt1 (ENSTRUG00000021942) prc1b (ENSTRUG00000014588) vps33b (ENSTRUG00000014506) hddc3 (ENSTRUG00000021476) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 Ballan wrasse MODERN SPECIES 142 ENSLBEG00000024342 ENSLBEG00000024389 NR2E3 (ENSLBEG00000024468) slc22a18 (ENSLBEG00000024489) HACD3 (ENSLBEG00000024570) SLC24A1 (ENSLBEG00000024638) dennd4a (ENSLBEG00000024700) socs4 (ENSLBEG00000024771) wdhd1 (ENSLBEG00000024847) gch1 (ENSLBEG00000024950) SAMD4A (ENSLBEG00000025062) ero1a (ENSLBEG00000025153) pacsin3 (ENSLBEG00000025230) glg1b (ENSLBEG00000025302) ##32 tnni2b.1 (ENSLBEG00000025369) ##23 aph1b (ENSLBEG00000025401) ENSLBEG00000025428 ENSLBEG00000025444 ENSLBEG00000025461 myod1 (ENSLBEG00000025479) ##26 TNNT3 (ENSLBEG00000025517) ##25 ENSLBEG00000025581 ENSLBEG00000025615 foxr1 (ENSLBEG00000025631) atp6v0d1 (ENSLBEG00000025653) ENSLBEG00000025684 ENSLBEG00000025703 ENSLBEG00000025718 c1qtnf4 (ENSLBEG00000025735) ndufs3 (ENSLBEG00000025754) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 Lumpfish MODERN SPECIES 18 TSPAN18 (ENSCLMG00005003451) ENSCLMG00005003428 ENSCLMG00005003412 ENSCLMG00005003411 ENSCLMG00005003410 ##10 ENSCLMG00005003408 ENSCLMG00005003406 ENSCLMG00005003404 socs4 (ENSCLMG00005003403) wdhd1 (ENSCLMG00005003392) gch1 (ENSCLMG00005003387) SAMD4A (ENSCLMG00005003385) ero1a (ENSCLMG00005003328) pacsin3 (ENSCLMG00005003323) glg1b (ENSCLMG00005003173) ##32 tnni2b.1 (ENSCLMG00005003095) ##23 aph1b (ENSCLMG00005003089) OTOG (ENSCLMG00005003067) MYOD1 (ENSCLMG00005003056) ##26 TNNT3 (ENSCLMG00005003049) ##25 ENSCLMG00005003043 ENSCLMG00005003037 ENSCLMG00005003032 foxr1 (ENSCLMG00005003021) atp6v0d1 (ENSCLMG00005002959) ENSCLMG00005002921 ENSCLMG00005002881 c1qtnf4 (ENSCLMG00005002868) ENSCLMG00005002846 ENSCLMG00005002820 ENSCLMG00005012057 Stickleback MODERN SPECIES 1 ccnb2 (ENSGACG00000017292) crybgx (ENSGACG00000017294) ENSGACG00000017296 ENSGACG00000017297 ENSGACG00000017302 dapk2a (ENSGACG00000017307) ENSGACG00000017310 ENSGACG00000017313 dis3l (ENSGACG00000017315) socs4 (ENSGACG00000017319) wdhd1 (ENSGACG00000017321) gch1 (ENSGACG00000017325) ENSGACG00000017331 pacsin3 (ENSGACG00000017333) GLG1 (ENSGACG00000017337) ##32 tnni2b.1 (ENSGACG00000017338) ##23 aph1b (ENSGACG00000017339) OTOG (ENSGACG00000017343) myod1 (ENSGACG00000017350) ##26 TNNT3 (ENSGACG00000017352) ##25 ENSGACG00000017354 foxr1 (ENSGACG00000017356) atp6v0d1 (ENSGACG00000017358) ENSGACG00000017378 c1qtnf4 (ENSGACG00000017381) ndufs3 (ENSGACG00000017384) ptpmt1 (ENSGACG00000017391) prc1b (ENSGACG00000017394) vps33b (ENSGACG00000017403) hddc3 (ENSGACG00000017413) mfap1 (ENSGACG00000017419) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b Pike perch MODERN SPECIES 42 mpped2a (ENSSLUG00000014219) ENSSLUG00000014232 ENSSLUG00000014234 NR2E3 (ENSSLUG00000014245) slc22a18 (ENSSLUG00000014266) HACD3 (ENSSLUG00000014295) SLC24A1 (ENSSLUG00000014312) dennd4a (ENSSLUG00000014340) socs4 (ENSSLUG00000014357) wdhd1 (ENSSLUG00000014371) gch1 (ENSSLUG00000014411) SAMD4A (ENSSLUG00000014423) ero1a (ENSSLUG00000014452) pacsin3 (ENSSLUG00000014868) glg1b (ENSSLUG00000014927) ##32 tnni2b.1 (ENSSLUG00000015288) ##23 aph1b (ENSSLUG00000015292) OTOG (ENSSLUG00000015304) myod1 (ENSSLUG00000015360) ##26 TNNT3 (ENSSLUG00000015377) ##25 ENSSLUG00000015385 foxr1 (ENSSLUG00000015392) atp6v0d1 (ENSSLUG00000015419) ENSSLUG00000015470 ENSSLUG00000015477 ENSSLUG00000015482 c1qtnf4 (ENSSLUG00000015485) ndufs3 (ENSSLUG00000015488) ptpmt1 (ENSSLUG00000015495) prc1b (ENSSLUG00000015534) vps33b (ENSSLUG00000015798) Channel bull blenny MODERN SPECIES 17 mpped2a (ENSCGOG00000001116) ENSCGOG00000001115 ENSCGOG00000001114 NR2E3 (ENSCGOG00000001111) slc22a18 (ENSCGOG00000001108) HACD3 (ENSCGOG00000001094) SLC24A1 (ENSCGOG00000001085) dennd4a (ENSCGOG00000000880) socs4 (ENSCGOG00000000851) wdhd1 (ENSCGOG00000000697) gch1 (ENSCGOG00000000646) SAMD4A (ENSCGOG00000000470) ero1a (ENSCGOG00000000411) pacsin3 (ENSCGOG00000000368) glg1b (ENSCGOG00000000287) ##32 tnni2b.1 (ENSCGOG00000000244) ##23 aph1b (ENSCGOG00000000232) OTOG (ENSCGOG00000000174) myod1 (ENSCGOG00000000126) ##26 TNNT3 (ENSCGOG00000000102) ##25 ENSCGOG00000000089 ENSCGOG00000000084 ENSCGOG00000000074 ENSCGOG00000019539 foxr1 (ENSCGOG00000019537) atp6v0d1 (ENSCGOG00000019523) ENSCGOG00000019501 c1qtnf4 (ENSCGOG00000019498) ndufs3 (ENSCGOG00000019478) ptpmt1 (ENSCGOG00000019475) prc1b (ENSCGOG00000019399) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a.c ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 Gilthead seabream MODERN SPECIES 18 ENSSAUG00010011775 ENSSAUG00010011783 NR2E3 (ENSSAUG00010011796) slc22a18 (ENSSAUG00010011801) HACD3 (ENSSAUG00010011805) SLC24A1 (ENSSAUG00010011812) dennd4a (ENSSAUG00010011836) GFUS (ENSSAUG00010012034) socs4 (ENSSAUG00010012526) wdhd1 (ENSSAUG00010012535) gch1 (ENSSAUG00010012542) SAMD4A (ENSSAUG00010012545) ero1a (ENSSAUG00010012573) pacsin3 (ENSSAUG00010012825) glg1b (ENSSAUG00010012845) ##32 TNNI2 (ENSSAUG00010012899) ##23 aph1b (ENSSAUG00010012901) myod1 (ENSSAUG00010012905) ##26 TNNT3 (ENSSAUG00010012907) ##25 ENSSAUG00010012908 ENSSAUG00010012909 ENSSAUG00010012913 ENSSAUG00010012915 ppef1 (ENSSAUG00010012918) ENSSAUG00010012923 ENSSAUG00010012925 cdkl5 (ENSSAUG00010012926) SCML2 (ENSSAUG00010012942) NHS (ENSSAUG00010012957) ace2 (ENSSAUG00010013032) ENSSAUG00010017573 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ##32 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ##26 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Large yellow croaker MODERN SPECIES 480 csrp3 (ENSLCRG00005002604) mpped2a (ENSLCRG00005002608) ENSLCRG00005002609 ENSLCRG00005002613 NR2E3 (ENSLCRG00005002635) slc22a18 (ENSLCRG00005002671) HACD3 (ENSLCRG00005002710) SLC24A1 (ENSLCRG00005002811) dennd4a (ENSLCRG00005002845) socs4 (ENSLCRG00005002924) gch1 (ENSLCRG00005002929) SAMD4A (ENSLCRG00005002932) ero1a (ENSLCRG00005002944) pacsin3 (ENSLCRG00005002960) glg1b (ENSLCRG00005002969) ##32 tnni2b.1 (ENSLCRG00005003007) ##23 aph1b (ENSLCRG00005003009) aph1b (ENSLCRG00005003014) OTOG (ENSLCRG00005003017) nqo1 (ENSLCRG00005003029) ENSLCRG00005003039 ENSLCRG00005003042 ENSLCRG00005003045 ENSLCRG00005003048 rpl12 (ENSLCRG00005003051) pole3 (ENSLCRG00005003071) kmt5b (ENSLCRG00005003072) ccnb2 (ENSLCRG00005003075) cd82a (ENSLCRG00005003078) tspan18a (ENSLCRG00005003082) ENSLCRG00005003084 European seabass MODERN SPECIES 18 ENSDLAG00005026438 ENSDLAG00005031744 ENSDLAG00005017548 ENSDLAG00005017617 ENSDLAG00005030198 HACD3 (ENSDLAG00005032938) SLC24A1 (ENSDLAG00005029857) DENND4A (ENSDLAG00005017811) socs4 (ENSDLAG00005031594) wdhd1 (ENSDLAG00005018377) gch1 (ENSDLAG00005031132) SAMD4A (ENSDLAG00005018542) ero1a (ENSDLAG00005018493) ENSDLAG00005018657 ENSDLAG00005018712 ##32 ENSDLAG00005019543 ##23 ENSDLAG00005026766 ENSDLAG00005019564 ENSDLAG00005034786 ##26 ENSDLAG00005019645 ##25 ENSDLAG00005019721 ENSDLAG00005032447 ENSDLAG00005028426 ENSDLAG00005019755 ENSDLAG00005019779 ENSDLAG00005032776 ENSDLAG00005026741 ENSDLAG00005005513 ENSDLAG00005019814 ENSDLAG00005019820 ENSDLAG00005020430 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 17 ENSMMDG00005018766 ENSMMDG00005018767 ENSMMDG00005018769 EMILIN1 (ENSMMDG00005018772) ENSMMDG00005018777 ENSMMDG00005018779 gpn1 (ENSMMDG00005018793) stmn4l (ENSMMDG00005019155) il17a/f1 (ENSMMDG00005019158) ENSMMDG00005019163 PAQR8 (ENSMMDG00005019190) znf395a (ENSMMDG00005019384) ENSMMDG00005019389 ENSMMDG00005019392 GLG1 (ENSMMDG00005019418) ##32 ENSMMDG00005019456 ##23 ENSMMDG00005019558 TNNT3 (ENSMMDG00005019567) ##25 OTOG (ENSMMDG00005019687) aph1b (ENSMMDG00005002738) ENSMMDG00005002761 ENSMMDG00005002781 Cod MODERN SPECIES 5 ENSGMOG00000036674 dhx38 (ENSGMOG00000002840) zfhx3b (ENSGMOG00000002909) ENSGMOG00000002967 ENSGMOG00000003144 ENSGMOG00000003176 ENSGMOG00000003209 ENSGMOG00000006331 ENSGMOG00000006346 ENSGMOG00000025333 ENSGMOG00000006378 ENSGMOG00000025002 ENSGMOG00000006402 ENSGMOG00000018911 ENSGMOG00000018961 ##32 tnni2b.1 (ENSGMOG00000018981) ##23 ENSGMOG00000028561 TNNT3 (ENSGMOG00000011393) ##25 ENSGMOG00000035611 ##26 ENSGMOG00000011350 ENSGMOG00000011343 ENSGMOG00000013397 spon1a (ENSGMOG00000013410) ENSGMOG00000012262 hipk3b (ENSGMOG00000012267) cstf3 (ENSGMOG00000012275) QSER1 (ENSGMOG00000024870) prrg4 (ENSGMOG00000012288) eif3m (ENSGMOG00000012291) wt1b (ENSGMOG00000012296) pax6b (ENSGMOG00000012304) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00390000002381.b.c ENSGT00940000156938.e ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000159150 ENSGT00940000155010.a ENSGT00390000004417.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00940000178634 ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01000000216979 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914.vb ENSGT00940000155333.A.a Northern pike MODERN SPECIES 1 IP6K1 (ENSELUG00000018463) ENSELUG00000031353 ENSELUG00000028070 ENSELUG00000032595 ENSELUG00000018487 psmd13 (ENSELUG00000018515) sirt3 (ENSELUG00000018526) drd4b (ENSELUG00000018550) ##15 ENSELUG00000018575 ##16 ctsd (ENSELUG00000018601) #18 ENSELUG00000028989 ENSELUG00000027344 ENSELUG00000033770 ENSELUG00000028980 ENSELUG00000028322 tnni2b.1 (ENSELUG00000018719) ##23 ENSELUG00000018743 ##23 ENSELUG00000018803 ENSELUG00000026443 TNNT3 (ENSELUG00000018827) ##25 MYOD1 (ENSELUG00000018844) ##26 OTOG (ENSELUG00000018933) aph1b (ENSELUG00000018962) ENSELUG00000018968 ENSELUG00000019041 NR2E3 (ENSELUG00000019079) arih1l (ENSELUG00000019125) HACD3 (ENSELUG00000019142) SLC24A1 (ENSELUG00000019158) dennd4a (ENSELUG00000000821) RAB11B (ENSELUG00000019240) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159150.ab ENSGT00940000155010.a ENSGT01010000223078 ENSGT00390000004417.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.b ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160974.b.d ##15 ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a #18 ENSGT00940000160892.f #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01000000216979 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B.j ENSGT00940000154914.vb ENSGT00940000155333.A.a Huchen MODERN SPECIES 5021 ENSHHUG00000049094 ENSHHUG00000049095 tnni2b.2 (ENSHHUG00000049097) ##23 Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.a ##23 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.a ##23 Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 ENSSSAG00000009794 ENSSSAG00000009832 ENSSSAG00000092045 ##15 ENSSSAG00000010218 CTSD (ENSSSAG00000010227) #18 ENSSSAG00000040098 ENSSSAG00000095829 ENSSSAG00000013813 ENSSSAG00000110591 ENSSSAG00000114143 ENSSSAG00000120009 ENSSSAG00000111535 ENSSSAG00000096849 ENSSSAG00000102508 tnni2b.2 (ENSSSAG00000115361) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000009799) ##23 ENSSSAG00000108614 ENSSSAG00000084840 myod1 (ENSSSAG00000040107) ##26 TNNT3 (ENSSSAG00000010002) ##25 ENSSSAG00000096205 ENSSSAG00000113698 ENSSSAG00000104282 ENSSSAG00000094543 ENSSSAG00000101082 ENSSSAG00000072984 ENSSSAG00000099816 HACD3 (ENSSSAG00000009594) SLC24A1 (ENSSSAG00000009849) DENND4A (ENSSSAG00000100635) RAB11A (ENSSSAG00000099276) River trout MODERN SPECIES 21 ENSSTUG00000034226 ENSSTUG00000034239 MATCAP1 (ENSSTUG00000034251) csnk2a2a (ENSSTUG00000034328) SLC7A5 (ENSSTUG00000034374) ENSSTUG00000035009 psmd13 (ENSSTUG00000035024) sirt3 (ENSSTUG00000035121) ENSSTUG00000035126 drd4b (ENSSTUG00000003691) ##15 ENSSTUG00000003710 ctsd (ENSSTUG00000003756) #18 ENSSTUG00000004269 ENSSTUG00000004274 TNNI2 (ENSSTUG00000004289) ##23 tnni2b.1 (ENSSTUG00000004312) ##23 ENSSTUG00000004360 ENSSTUG00000004371 TNNT3 (ENSSTUG00000004390) ##25 myod1 (ENSSTUG00000004466) ##26 aph1b (ENSSTUG00000004478) ENSSTUG00000004484 ENSSTUG00000004489 NR2E3 (ENSSTUG00000004529) ARIH1 (ENSSTUG00000004569) HACD3 (ENSSTUG00000004705) SLC24A1 (ENSSTUG00000004931) dennd4a (ENSSTUG00000004971) rab11a (ENSSTUG00000005754) ENSSTUG00000005780 dis3l (ENSSTUG00000005812) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000158999.k ENSGT01060000252812 ENSGT00940000181447 ENSGT00940000158999.l ENSGT00940000164815.b ENSGT00940000155024.a.b.c.b.a.b ENSGT01010000223078 ENSGT00390000004417.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.b ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B.j ENSGT00940000154914.vb ENSGT00940000155333.A.a.i.a ENSGT00530000063106.B Salmo ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000160974.b.d.j ##15 ENSGT00940000162463.a ENSGT00940000163911.b.c.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000158477.a.a.d ##25 ENSGT01000000216979.a ENSGT00940000158477.a.a.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b.l ENSGT00940000160967.f.b ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d.b ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e.a ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B.j.b ENSGT00940000154914.vb.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 18 ENSSSAG00000084012 CCL13 (ENSSSAG00000099932) ENSSSAG00000107416 ENSSSAG00000086363 ENSSSAG00000107601 ENSSSAG00000105539 ENSSSAG00000105548 ENSSSAG00000058230 ENSSSAG00000094753 ##15 ENSSSAG00000102956 ENSSSAG00000027269 #18 ENSSSAG00000009981 ENSSSAG00000101599 tnni2b.2 (ENSSSAG00000010154) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000010176) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000084513) ##23 ENSSSAG00000095150 ENSSSAG00000103815 ENSSSAG00000108582 TNNT3 (ENSSSAG00000009998) ##25 ENSSSAG00000010004 ##26 ENSSSAG00000056579 ENSSSAG00000104869 ENSSSAG00000010246 ENSSSAG00000119131 ENSSSAG00000009811 ENSSSAG00000009961 ENSSSAG00000095519 HACD3 (ENSSSAG00000095799) SLC24A1 (ENSSSAG00000010183) DENND4A (ENSSSAG00000082487) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 385 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##23 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 299 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##23 ENSGT01000000216979 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 Coho salmon MODERN SPECIES 32 ENSOKIG00005019931 ENSOKIG00005019921 MATCAP1 (ENSOKIG00005019906) ENSOKIG00005019859 ENSOKIG00005019845 ENSOKIG00005019823 psmd13 (ENSOKIG00005019710) SIRT3 (ENSOKIG00005019692) drd4b (ENSOKIG00005019681) ##15 ENSOKIG00005019667 CTSD (ENSOKIG00005018062) ##18 ENSOKIG00005017964 ENSOKIG00005017958 TNNI2 (ENSOKIG00005017950) ##23 tnni2b.1 (ENSOKIG00005017934) ##23 tnni2b.1 (ENSOKIG00005017921) ##23 ENSOKIG00005017897 TNNT3 (ENSOKIG00005017863) ##25 MYOD1 (ENSOKIG00005017854) ##26 ENSOKIG00005017845 OTOG (ENSOKIG00005017697) aph1b (ENSOKIG00005017675) ENSOKIG00005017668 ENSOKIG00005017602 NR2E3 (ENSOKIG00005043003) arih1l (ENSOKIG00005042766) HACD3 (ENSOKIG00005042645) SLC24A1 (ENSOKIG00005042621) ENSOKIG00005042607 DENND4A (ENSOKIG00005041726) ENSOKIG00005041656 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00390000014572 ENSGT00940000158999.k ENSGT01060000252812 ENSGT00940000181447 ENSGT00940000158999.l ENSGT00940000164815.b ENSGT00940000155024.a.b.c.b.a.b ENSGT01010000223078 ENSGT00390000004417.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.b ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B.j ENSGT00940000154914.vb ENSGT00940000155333.A.a.i.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000160974.b.d.j ##15 ENSGT00940000162463.a ENSGT00940000163911.b.c.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000158477.a.a.d ##25 ENSGT01000000216979.a ENSGT00940000158477.a.a.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b.l ENSGT00940000160967.f.b ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d.b ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e.a ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B.j.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 18 ENSSSAG00000118511 ENSSSAG00000084012 CCL13 (ENSSSAG00000099932) ENSSSAG00000107416 ENSSSAG00000086363 ENSSSAG00000107601 ENSSSAG00000105539 ENSSSAG00000105548 ENSSSAG00000058230 ENSSSAG00000094753 ##15 ENSSSAG00000102956 ENSSSAG00000027269 #18 ENSSSAG00000009981 ENSSSAG00000101599 tnni2b.2 (ENSSSAG00000010154) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000010176) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000084513) ##23 ENSSSAG00000095150 ENSSSAG00000103815 ENSSSAG00000108582 TNNT3 (ENSSSAG00000009998) ##25 ENSSSAG00000010004 ##26 ENSSSAG00000056579 ENSSSAG00000104869 ENSSSAG00000010246 ENSSSAG00000119131 ENSSSAG00000009811 ENSSSAG00000009961 ENSSSAG00000095519 HACD3 (ENSSSAG00000095799) SLC24A1 (ENSSSAG00000010183) River trout MODERN SPECIES 3 MATCAP1 (ENSSTUG00000001264) csnk2a2a (ENSSTUG00000001279) ZNF319 (ENSSTUG00000001305) SLC7A5 (ENSSTUG00000001349) ENSSTUG00000001580 psmd13 (ENSSTUG00000001588) sirt3 (ENSSTUG00000001668) drd4b (ENSSTUG00000001673) ##15 ENSSTUG00000001681 ENSSTUG00000001686 ctsd (ENSSTUG00000001706) #18 ENSSTUG00000001858 ENSSTUG00000001870 ENSSTUG00000001875 TNNI2 (ENSSTUG00000001889) ##23 tnni2b.1 (ENSSTUG00000001896) ##23 ENSSTUG00000001903 ENSSTUG00000001917 ##25 myod1 (ENSSTUG00000001933) ##26 OTOG (ENSSTUG00000001950) aph1b (ENSSTUG00000002066) ENSSTUG00000002075 ENSSTUG00000002080 NR2E3 (ENSSTUG00000002100) arih1l (ENSSTUG00000002114) HACD3 (ENSSTUG00000002183) SLC24A1 (ENSSTUG00000002229) dennd4a (ENSSTUG00000002300) rab11a (ENSSTUG00000004309) ENSSTUG00000004325 leo1 (ENSSTUG00000004341) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 385 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##23 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 299 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##23 ENSGT01000000216979 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 Coho salmon DUPLICATION Coho salmon MODERN SPECIES 32 ENSOKIG00005019939 ENSOKIG00005019931 ENSOKIG00005019921 MATCAP1 (ENSOKIG00005019906) ENSOKIG00005019859 ENSOKIG00005019845 ENSOKIG00005019823 psmd13 (ENSOKIG00005019710) SIRT3 (ENSOKIG00005019692) drd4b (ENSOKIG00005019681) ##15 ENSOKIG00005019667 CTSD (ENSOKIG00005018062) ##18 ENSOKIG00005017964 ENSOKIG00005017958 TNNI2 (ENSOKIG00005017950) ##23 tnni2b.1 (ENSOKIG00005017934) ##23 tnni2b.1 (ENSOKIG00005017921) ##23 ENSOKIG00005017897 TNNT3 (ENSOKIG00005017863) ##25 MYOD1 (ENSOKIG00005017854) ##26 ENSOKIG00005017845 OTOG (ENSOKIG00005017697) aph1b (ENSOKIG00005017675) ENSOKIG00005017668 ENSOKIG00005017602 NR2E3 (ENSOKIG00005043003) arih1l (ENSOKIG00005042766) HACD3 (ENSOKIG00005042645) SLC24A1 (ENSOKIG00005042621) ENSOKIG00005042607 DENND4A (ENSOKIG00005041726) Coho salmon MODERN SPECIES 1214 ENSOKIG00005030643 ENSOKIG00005030608 ENSOKIG00005030599 MATCAP1 (ENSOKIG00005030586) csnk2a2a (ENSOKIG00005030555) ZNF319 (ENSOKIG00005030534) ENSOKIG00005030527 PSMD13 (ENSOKIG00005030286) sirt3 (ENSOKIG00005030244) DRD4 (ENSOKIG00005030231) ##15 ENSOKIG00005030193 ctsd (ENSOKIG00005028120) ##18 ENSOKIG00005028028 ENSOKIG00005028020 ENSOKIG00005028012 ##23 TNNI2 (ENSOKIG00005027999) ##23 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000160522.c.b ENSGT00390000014572 ENSGT00940000158999.k ENSGT01060000252812 ENSGT00940000181447 ENSGT00940000158999.l ENSGT00940000164815.b ENSGT00940000155024.a.b.c.b.a.b ENSGT01010000223078 ENSGT00390000004417.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.b ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B.j ENSGT00940000154914.vb Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 385 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##23 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 299 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##23 ENSGT01000000216979 ENSGT00940000158477.a.a ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 Coho salmon DUPLICATION Coho salmon MODERN SPECIES 32 ENSOKIG00005019949 ENSOKIG00005019939 ENSOKIG00005019931 ENSOKIG00005019921 MATCAP1 (ENSOKIG00005019906) ENSOKIG00005019859 ENSOKIG00005019845 ENSOKIG00005019823 psmd13 (ENSOKIG00005019710) SIRT3 (ENSOKIG00005019692) drd4b (ENSOKIG00005019681) ##15 ENSOKIG00005019667 CTSD (ENSOKIG00005018062) ##18 ENSOKIG00005017964 ENSOKIG00005017958 TNNI2 (ENSOKIG00005017950) ##23 tnni2b.1 (ENSOKIG00005017934) ##23 tnni2b.1 (ENSOKIG00005017921) ##23 ENSOKIG00005017897 TNNT3 (ENSOKIG00005017863) ##25 MYOD1 (ENSOKIG00005017854) ##26 ENSOKIG00005017845 OTOG (ENSOKIG00005017697) aph1b (ENSOKIG00005017675) ENSOKIG00005017668 ENSOKIG00005017602 NR2E3 (ENSOKIG00005043003) arih1l (ENSOKIG00005042766) HACD3 (ENSOKIG00005042645) SLC24A1 (ENSOKIG00005042621) ENSOKIG00005042607 Coho salmon MODERN SPECIES 1214 GABARAPL2 (ENSOKIG00005030715) ENSOKIG00005030643 ENSOKIG00005030608 ENSOKIG00005030599 MATCAP1 (ENSOKIG00005030586) csnk2a2a (ENSOKIG00005030555) ZNF319 (ENSOKIG00005030534) ENSOKIG00005030527 PSMD13 (ENSOKIG00005030286) sirt3 (ENSOKIG00005030244) DRD4 (ENSOKIG00005030231) ##15 ENSOKIG00005030193 ctsd (ENSOKIG00005028120) ##18 ENSOKIG00005028028 ENSOKIG00005028020 ENSOKIG00005028012 ##23 TNNI2 (ENSOKIG00005027999) ##23 Chinook salmon MODERN SPECIES 1563 TNNI2 (ENSOTSG00005032801) ##23 Salmo ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000160974.b.d.j ##15 ENSGT00940000162463.a ENSGT00940000163911.b.c.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##23 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000158477.a.a.d ##25 ENSGT01000000216979.a ENSGT00940000158477.a.a.c ##25 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b.l ENSGT00940000160967.f.b ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d.b ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e.a ENSGT01030000234532.B.e.b.e River trout DUPLICATION River trout MODERN SPECIES 21 GABARAPL2 (ENSSTUG00000034205) ENSSTUG00000034226 ENSSTUG00000034239 MATCAP1 (ENSSTUG00000034251) csnk2a2a (ENSSTUG00000034328) SLC7A5 (ENSSTUG00000034374) ENSSTUG00000035009 psmd13 (ENSSTUG00000035024) sirt3 (ENSSTUG00000035121) ENSSTUG00000035126 drd4b (ENSSTUG00000003691) ##15 ENSSTUG00000003710 ctsd (ENSSTUG00000003756) #18 ENSSTUG00000004269 ENSSTUG00000004274 TNNI2 (ENSSTUG00000004289) ##23 tnni2b.1 (ENSSTUG00000004312) ##23 ENSSTUG00000004360 ENSSTUG00000004371 TNNT3 (ENSSTUG00000004390) ##25 myod1 (ENSSTUG00000004466) ##26 aph1b (ENSSTUG00000004478) ENSSTUG00000004484 ENSSTUG00000004489 NR2E3 (ENSSTUG00000004529) ARIH1 (ENSSTUG00000004569) HACD3 (ENSSTUG00000004705) SLC24A1 (ENSSTUG00000004931) dennd4a (ENSSTUG00000004971) rab11a (ENSSTUG00000005754) ENSSTUG00000005780 River trout MODERN SPECIES 3 ENSSTUG00000001246 MATCAP1 (ENSSTUG00000001264) csnk2a2a (ENSSTUG00000001279) ZNF319 (ENSSTUG00000001305) SLC7A5 (ENSSTUG00000001349) ENSSTUG00000001580 psmd13 (ENSSTUG00000001588) sirt3 (ENSSTUG00000001668) drd4b (ENSSTUG00000001673) ##15 ENSSTUG00000001681 ENSSTUG00000001686 ctsd (ENSSTUG00000001706) #18 ENSSTUG00000001858 ENSSTUG00000001870 ENSSTUG00000001875 TNNI2 (ENSSTUG00000001889) ##23 tnni2b.1 (ENSSTUG00000001896) ##23 ENSSTUG00000001903 ENSSTUG00000001917 ##25 myod1 (ENSSTUG00000001933) ##26 OTOG (ENSSTUG00000001950) aph1b (ENSSTUG00000002066) ENSSTUG00000002075 ENSSTUG00000002080 NR2E3 (ENSSTUG00000002100) arih1l (ENSSTUG00000002114) HACD3 (ENSSTUG00000002183) SLC24A1 (ENSSTUG00000002229) dennd4a (ENSSTUG00000002300) rab11a (ENSSTUG00000004309) ENSSTUG00000004325 Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 18 ENSSSAG00000113380 ENSSSAG00000118511 ENSSSAG00000084012 CCL13 (ENSSSAG00000099932) ENSSSAG00000107416 ENSSSAG00000086363 ENSSSAG00000107601 ENSSSAG00000105539 ENSSSAG00000105548 ENSSSAG00000058230 ENSSSAG00000094753 ##15 ENSSSAG00000102956 ENSSSAG00000027269 #18 ENSSSAG00000009981 ENSSSAG00000101599 tnni2b.2 (ENSSSAG00000010154) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000010176) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000084513) ##23 ENSSSAG00000095150 ENSSSAG00000103815 ENSSSAG00000108582 TNNT3 (ENSSSAG00000009998) ##25 ENSSSAG00000010004 ##26 ENSSSAG00000056579 ENSSSAG00000104869 ENSSSAG00000010246 ENSSSAG00000119131 ENSSSAG00000009811 ENSSSAG00000009961 ENSSSAG00000095519 HACD3 (ENSSSAG00000095799) Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 ENSSSAG00000115358 ENSSSAG00000009794 ENSSSAG00000009832 ENSSSAG00000092045 ##15 ENSSSAG00000010218 CTSD (ENSSSAG00000010227) #18 ENSSSAG00000040098 ENSSSAG00000095829 ENSSSAG00000013813 ENSSSAG00000110591 ENSSSAG00000114143 ENSSSAG00000120009 ENSSSAG00000111535 ENSSSAG00000096849 ENSSSAG00000102508 tnni2b.2 (ENSSSAG00000115361) ##23 TNNI2 (ENSSSAG00000009799) ##23 ENSSSAG00000108614 ENSSSAG00000084840 myod1 (ENSSSAG00000040107) ##26 TNNT3 (ENSSSAG00000010002) ##25 ENSSSAG00000096205 ENSSSAG00000113698 ENSSSAG00000104282 ENSSSAG00000094543 ENSSSAG00000101082 ENSSSAG00000072984 ENSSSAG00000099816 HACD3 (ENSSSAG00000009594) SLC24A1 (ENSSSAG00000009849) DENND4A (ENSSSAG00000100635) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 542 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000158477.a.b.b #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00940000157490 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 541 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.b.b #25 ENSGT00950000182959.b.a.b #26 ENSGT00950000182959.b.a.a ##26 ENSGT00940000157490 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000001032 #31 pdcd5 (ENSCHAG00000001089) mvda (ENSCHAG00000001207) cyba (ENSCHAG00000001263) tcf25 (ENSCHAG00000001359) mc1r (ENSCHAG00000002013) ENSCHAG00000002030 def8 (ENSCHAG00000002070) ENSCHAG00000002366 ##30 ENSCHAG00000004200 DBNDD1 (ENSCHAG00000004207) ENSCHAG00000004218 ENSCHAG00000004224 ENSCHAG00000004256 ENSCHAG00000004279 tnni2b.1 (ENSCHAG00000004290) ##23 ENSCHAG00000004434 ENSCHAG00000004444 tnnt3b (ENSCHAG00000004458) #25 MYOD1 (ENSCHAG00000004523) #26 OTOG (ENSCHAG00000004569) ABCC8 (ENSCHAG00000005413) KCNJ11 (ENSCHAG00000013212) mob2b (ENSCHAG00000013224) DUSP8 (ENSCHAG00000013334) PTPN5 (ENSCHAG00000013347) ENSCHAG00000013402 OSBPL5 (ENSCHAG00000013553) slc22a18 (ENSCHAG00000015000) PHLDA2 (ENSCHAG00000015121) PHLDA2 (ENSCHAG00000015146) Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 7 ccnd1 (ENSDCDG00000022299) ENSDCDG00000022301 lto1 (ENSDCDG00000022303) fgf19 (ENSDCDG00000022305) fgf4 (ENSDCDG00000022308) fgf3 (ENSDCDG00000022315) zgc:153993 (ENSDCDG00000022398) ano1a (ENSDCDG00000022511) FADD (ENSDCDG00000026252) pacsin3 (ENSDCDG00000026254) ACSF3 (ENSDCDG00000026303) CBFA2T3 (ENSDCDG00000026480) PABPN1L (ENSDCDG00000026482) trappc2l (ENSDCDG00000026484) galns (ENSDCDG00000026497) tnni2b.2 (ENSDCDG00000026548) ##23 tnni2b.1 (ENSDCDG00000026551) ##23 ENSDCDG00000026552 ENSDCDG00000026554 ENSDCDG00000026556 tnnt3b (ENSDCDG00000026571) #25 myod1 (ENSDCDG00000026580) ##26 OTOG (ENSDCDG00000026583) ABCC8 (ENSDCDG00000026610) ENSDCDG00000026869 chrna5 (ENSDCDG00000026872) ENSDCDG00000026877 ENSDCDG00000026881 CHRNA3 (ENSDCDG00000026890) CHRNB4 (ENSDCDG00000026897) ube2q1 (ENSDCDG00000026915) Denticle herring MODERN SPECIES 7 ENSDCDG00000022301 lto1 (ENSDCDG00000022303) fgf19 (ENSDCDG00000022305) fgf4 (ENSDCDG00000022308) fgf3 (ENSDCDG00000022315) zgc:153993 (ENSDCDG00000022398) ano1a (ENSDCDG00000022511) FADD (ENSDCDG00000026252) pacsin3 (ENSDCDG00000026254) ACSF3 (ENSDCDG00000026303) CBFA2T3 (ENSDCDG00000026480) PABPN1L (ENSDCDG00000026482) trappc2l (ENSDCDG00000026484) galns (ENSDCDG00000026497) tnni2b.2 (ENSDCDG00000026548) ##23 tnni2b.1 (ENSDCDG00000026551) ##23 ENSDCDG00000026552 ENSDCDG00000026554 ENSDCDG00000026556 tnnt3b (ENSDCDG00000026571) #25 myod1 (ENSDCDG00000026580) ##26 OTOG (ENSDCDG00000026583) ABCC8 (ENSDCDG00000026610) ENSDCDG00000026869 chrna5 (ENSDCDG00000026872) ENSDCDG00000026877 ENSDCDG00000026881 CHRNA3 (ENSDCDG00000026890) CHRNB4 (ENSDCDG00000026897) ube2q1 (ENSDCDG00000026915) ENSDCDG00000026948 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000164059 ENSGT00940000160630 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000016223 ENSGT00940000158446 ENSGT00940000155889.c ENSGT00940000157433 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.b.b #25 ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333 ENSGT00940000159916 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000164059 ENSGT00940000160630 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000016223 ENSGT00940000158446 ENSGT00940000155889.c ENSGT00940000157433 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.b.b #25 ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000162611.a.a.a ENSGT00530000063604.A ENSGT00950000182852.A.a.b.c ENSGT01090000260076.b.b.a ENSGT00390000015719.d.c ENSGT00940000162114 ENSGT00940000155850 ENSGT00940000155009.b Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000164059 ENSGT00940000160630 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000016223 ENSGT00940000158446 ENSGT00940000155889.c ENSGT00940000157433 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.b.b #25 ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000162611.a.a.a ENSGT00940000162611.b ENSGT00570000079239 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00390000002970 ENSGT00940000155080 ENSGT00940000169924 ENSGT00940000160615.b.b.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000160630 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000016223 ENSGT00940000158446 ENSGT00940000155889.c ENSGT01100000263547.a.a.b.a.a.a.b.b ENSGT00940000157433 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.b.b #25 ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000162611.a.a.a ENSGT00940000162611.b ENSGT00570000079239 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00390000002970 ENSGT00940000155080 ENSGT00940000169924 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 158 atg13 (ENSPNAG00000004830) harbi1 (ENSPNAG00000026033) zgc:110699 (ENSPNAG00000026018) phf21aa (ENSPNAG00000025960) creb3l1 (ENSPNAG00000025939) DGKZ (ENSPNAG00000005259) mdka (ENSPNAG00000006852) CHRM4 (ENSPNAG00000025805) ambra1a (ENSPNAG00000005343) acp2 (ENSPNAG00000025680) SNX1 (ENSPNAG00000025625) ENSPNAG00000025606 ENSPNAG00000025564 ENSPNAG00000025543 SLC8B1 (ENSPNAG00000006256) tnni2b.1 (ENSPNAG00000025492) ##23 ENSPNAG00000003920 tnnt3b (ENSPNAG00000005374) #25 OTOG (ENSPNAG00000005639) slc22a18 (ENSPNAG00000003886) ptprja (ENSPNAG00000025180) PTPN5 (ENSPNAG00000025075) ENSPNAG00000005752 hoga1 (ENSPNAG00000025051) FILIP1L (ENSPNAG00000025004) fbxo3 (ENSPNAG00000024996) cd59 (ENSPNAG00000024967) Mexicana tetra MODERN SPECIES 33 atg13 (ENSAMXG00000021375) harbi1 (ENSAMXG00000021383) zgc:110699 (ENSAMXG00000030692) phf21aa (ENSAMXG00000021466) creb3l1 (ENSAMXG00000035815) ENSAMXG00000043904 ENSAMXG00000035733 DGKZ (ENSAMXG00000021549) ENSAMXG00000032609 mdka (ENSAMXG00000037017) CHRM4 (ENSAMXG00000021569) acp2 (ENSAMXG00000021570) SNX1 (ENSAMXG00000037031) ENSAMXG00000021573 SLC8B1 (ENSAMXG00000031619) tnni2b.1 (ENSAMXG00000021577) ##23 ENSAMXG00000021578 ENSAMXG00000042231 ENSAMXG00000040476 tnnt3b (ENSAMXG00000021580) #25 OTOG (ENSAMXG00000021582) slc22a18 (ENSAMXG00000021590) ptprja (ENSAMXG00000021591) PTPN5 (ENSAMXG00000021598) ENSAMXG00000021599 ENSAMXG00000038272 hoga1 (ENSAMXG00000021600) FILIP1L (ENSAMXG00000021602) il1rapl1b (ENSAMXG00000008715) nr0b1 (ENSAMXG00000008711) ENSAMXG00000008687 Electric eel MODERN SPECIES 154 MAL (ENSEEEG00000006836) ENSEEEG00000006832 slc8a1a (ENSEEEG00000006788) tmem178a (ENSEEEG00000006782) ENSEEEG00000006781 ENSEEEG00000006775 pecr (ENSEEEG00000006768) ENSEEEG00000006765 tmem169a (ENSEEEG00000006764) cflara (ENSEEEG00000006760) ENSEEEG00000006756 ENSEEEG00000006755 acp2 (ENSEEEG00000006752) SNX1 (ENSEEEG00000006183) SLC8B1 (ENSEEEG00000006165) tnni2b.1 (ENSEEEG00000006164) ##23 ENSEEEG00000006163 ENSEEEG00000006162 tnnt3b (ENSEEEG00000006155) #25 OTOG (ENSEEEG00000006154) slc22a18 (ENSEEEG00000006153) PTPN5 (ENSEEEG00000006152) ENSEEEG00000006151 ENSEEEG00000006150 hoga1 (ENSEEEG00000006148) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000164059.d ENSGT00940000160630 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000016223 ENSGT00940000158446 ENSGT00940000155889.c ENSGT00940000157433 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.b.b #25 ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159916 ENSGT00390000018549 ENSGT00940000157250 ENSGT01100000263482.F ENSGT00940000154521.A ENSGT00940000157318 ENSGT00390000005589.a.a ENSGT01030000234563.b.a.a ENSGT00940000164582.a Zebrafish DUPLICATION Zebrafish MODERN SPECIES 22 znf408 (ENSDARG00000036043) f2 (ENSDARG00000036041) arhgap1 (ENSDARG00000024324) ENSDARG00000104129 atg13 (ENSDARG00000036040) harbi1 (ENSDARG00000036038) zgc:110699 (ENSDARG00000017474) phf21aa (ENSDARG00000006878) creb3l1 (ENSDARG00000015793) DGKZ (ENSDARG00000014439) mdka (ENSDARG00000036036) CHRM4 (ENSDARG00000069254) ambra1a (ENSDARG00000008322) acp2 (ENSDARG00000007244) ENSDARG00000105584 tnni2b.2 (ENSDARG00000029995) ##23 tnni2b.1 (ENSDARG00000035958) ##23 ENSDARG00000099385 tnnt3b (ENSDARG00000068457) #25 OTOG (ENSDARG00000068460) slc22a18 (ENSDARG00000052271) ptprja (ENSDARG00000033042) PTPN5 (ENSDARG00000074866) kiaa0232 (ENSDARG00000052244) TBC1D14 (ENSDARG00000003520) ccl36.1 (ENSDARG00000105263) ENSDARG00000098818 ccdc96 (ENSDARG00000035963) tada2b (ENSDARG00000003769) grpel1 (ENSDARG00000010021) SORCS2 (ENSDARG00000077465) Zebrafish MODERN SPECIES 22 f2 (ENSDARG00000036041) arhgap1 (ENSDARG00000024324) ENSDARG00000104129 atg13 (ENSDARG00000036040) harbi1 (ENSDARG00000036038) zgc:110699 (ENSDARG00000017474) phf21aa (ENSDARG00000006878) creb3l1 (ENSDARG00000015793) DGKZ (ENSDARG00000014439) mdka (ENSDARG00000036036) CHRM4 (ENSDARG00000069254) ambra1a (ENSDARG00000008322) acp2 (ENSDARG00000007244) ENSDARG00000105584 tnni2b.2 (ENSDARG00000029995) ##23 tnni2b.1 (ENSDARG00000035958) ##23 ENSDARG00000099385 tnnt3b (ENSDARG00000068457) #25 OTOG (ENSDARG00000068460) slc22a18 (ENSDARG00000052271) ptprja (ENSDARG00000033042) PTPN5 (ENSDARG00000074866) kiaa0232 (ENSDARG00000052244) TBC1D14 (ENSDARG00000003520) ccl36.1 (ENSDARG00000105263) ENSDARG00000098818 ccdc96 (ENSDARG00000035963) tada2b (ENSDARG00000003769) grpel1 (ENSDARG00000010021) SORCS2 (ENSDARG00000077465) shrprbck1r (ENSDARG00000059871) Cyprininae DUPLICATION Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00930000151062.g ENSGT00940000164059.d ENSGT00940000160630.g.a ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055.h ENSGT00940000166946.b ENSGT00940000156124.c.a.c ENSGT00940000159848.c ENSGT00940000156152.e.a.a.a ENSGT00390000007640.b.a.a ENSGT00940000160394.a.c ENSGT00390000016223.o.b ENSGT00940000158446.w ENSGT00940000155889.c.c ENSGT00940000157433.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.g.a ##23 ENSGT01030000234990.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.h.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a.e ENSGT00940000158477.a.b.b.b.a.b #25 ENSGT01030000234990.a ENSGT00940000158477.a.b.b.a #25 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.h.a ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a.f ENSGT00940000158477.a.b.b.b.a.a #25 ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333.b ENSGT00940000156870.bb.a.b ENSGT00940000159916.f ENSGT00390000018549.i ENSGT00940000157250.a Goldfish MODERN SPECIES 25 ENSCARG00000008645 ENSCARG00000008650 ENSCARG00000008659 trmt44 (ENSCARG00000008686) rpl34 (ENSCARG00000008836) ggh (ENSCARG00000008845) ENSCARG00000008871 ENSCARG00000008880 plag1 (ENSCARG00000008890) RPS20 (ENSCARG00000008893) ENSCARG00000008903 lypla1 (ENSCARG00000008922) ENSCARG00000009042 ENSCARG00000009045 SLC8B1 (ENSCARG00000009053) tnni2b.2 (ENSCARG00000009099) ##23 tnni2b.1 (ENSCARG00000009119) ##23 ENSCARG00000009136 ENSCARG00000009162 tnnt3b (ENSCARG00000009176) #25 slc22a18 (ENSCARG00000009279) ptprja (ENSCARG00000009289) PTPN5 (ENSCARG00000009327) ENSCARG00000009506 ENSCARG00000009515 kiaa0232 (ENSCARG00000009529) TBC1D14 (ENSCARG00000009619) ccl36.1 (ENSCARG00000010416) acp2 (ENSCARG00000005888) tada2b (ENSCARG00000006424) grpel1 (ENSCARG00000006436) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153571.b.g ENSGT00940000160226.f ENSGT00930000151062.g ENSGT00940000164059.d.a ENSGT00390000007055.h ENSGT00940000166946.b ENSGT00940000156124.c.a.c ENSGT00940000159848.c ENSGT00940000156152.e.a.a.a ENSGT00390000007640.b.a.a ENSGT00940000160394.a.c ENSGT00390000016223.o.b ENSGT00940000158446.w ENSGT00940000155889.c.c ENSGT00940000157433.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.g.a ##23 ENSGT01030000234990.b.b ENSGT00940000153901.a.b.a.e ENSGT00940000158477.a.b.b.b.a.b #25 ENSGT01030000234990.a ENSGT00940000158477.a.b.b.a #25 ENSGT00940000153901.a.b.a.f ENSGT00940000158477.a.b.b.b.a.a #25 ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333.b ENSGT00940000156870.bb.a.b ENSGT00940000159916.e.b ENSGT00390000018549.i ENSGT00940000157250.a ENSGT01100000263482.F.h ENSGT00940000154521.A Common carp reference MODERN SPECIES 6 fbxo3 (ENSCCRG00000018601) ENSCCRG00000010445 znf408 (ENSCCRG00000065505) f2 (ENSCCRG00000010428) ENSCCRG00000067668 atg13 (ENSCCRG00000010356) harbi1 (ENSCCRG00000076161) phf21aa (ENSCCRG00000016773) creb3l1 (ENSCCRG00000016767) DGKZ (ENSCCRG00000021059) mdka (ENSCCRG00000028278) ambra1a (ENSCCRG00000056784) acp2 (ENSCCRG00000018091) ENSCCRG00000014050 ENSCCRG00000002459 tnni2b.2 (ENSCCRG00000036681) ##23 ENSCCRG00000056847 ENSCCRG00000002518 tnnt3b (ENSCCRG00000053333) #25 ENSCCRG00000073086 slc22a18 (ENSCCRG00000022637) ptprja (ENSCCRG00000022622) ENSCCRG00000027619 kiaa0232 (ENSCCRG00000080085) TBC1D14 (ENSCCRG00000045074) tada2b (ENSCCRG00000076351) grpel1 (ENSCCRG00000007651) SORCS2 (ENSCCRG00000034005) shrprbck1r (ENSCCRG00000004071) maf1b (ENSCCRG00000051252) ENSCCRG00000053637 Golden-line barbel MODERN SPECIES 507 cd59 (ENSSGRG00000041437) fbxo3 (ENSSGRG00000041443) syt13 (ENSSGRG00000041563) znf408 (ENSSGRG00000041565) f2 (ENSSGRG00000041567) ENSSGRG00000041598 atg13 (ENSSGRG00000041610) zgc:110699 (ENSSGRG00000041883) DGKZ (ENSSGRG00000041904) mdka (ENSSGRG00000042043) CHRM4 (ENSSGRG00000042046) ambra1a (ENSSGRG00000042051) acp2 (ENSSGRG00000042055) SNX1 (ENSSGRG00000042081) SLC8B1 (ENSSGRG00000042914) tnni2b.2 (ENSSGRG00000042915) ##23 ENSSGRG00000042918 ENSSGRG00000042922 tnnt3b (ENSSGRG00000042926) #25 slc22a18 (ENSSGRG00000042928) ptprja (ENSSGRG00000042930) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000160226.e ENSGT00930000151062.h ENSGT00940000160630.g.b ENSGT00390000007055.g ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00940000166946.a ENSGT00940000156124.c.a.d ENSGT00940000159848.d ENSGT00940000156152.e.a.a.b ENSGT00390000007640.b.a.b ENSGT00940000160394.a.d ENSGT00390000016223.o.a ENSGT00940000158446.x ENSGT00940000155889.c.d ENSGT00940000157433.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.g.b ##23 ENSGT01030000234990.b.a.a Goldfish MODERN SPECIES 47 syt13 (ENSCARG00000053828) znf408 (ENSCARG00000053851) arhgap1 (ENSCARG00000053898) ENSCARG00000054858 atg13 (ENSCARG00000054881) zgc:110699 (ENSCARG00000055097) phf21aa (ENSCARG00000055122) creb3l1 (ENSCARG00000055149) DGKZ (ENSCARG00000055485) mdka (ENSCARG00000061706) CHRM4 (ENSCARG00000061743) ambra1a (ENSCARG00000061763) acp2 (ENSCARG00000061934) SNX1 (ENSCARG00000062323) SLC8B1 (ENSCARG00000063159) tnni2b.2 (ENSCARG00000063408) ##23 tnni2b.1 (ENSCARG00000063440) ##23 ENSCARG00000063477 ENSCARG00000063533 tnnt3b (ENSCARG00000063547) #25 slc22a18 (ENSCARG00000063760) ptprja (ENSCARG00000063875) PTPN5 (ENSCARG00000064009) kiaa0232 (ENSCARG00000064289) TBC1D14 (ENSCARG00000064324) ccl36.1 (ENSCARG00000064858) ccdc96 (ENSCARG00000064867) tada2b (ENSCARG00000064869) grpel1 (ENSCARG00000064878) SORCS2 (ENSCARG00000064928) shrprbck1r (ENSCARG00000065342) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000164059.d.b ENSGT00940000160630.g.a ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055.g ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00940000166946.a ENSGT00940000156124.c.a.d ENSGT00940000159848.d ENSGT00940000156152.e.a.a.b ENSGT00390000007640.b.a.b ENSGT00940000160394.a.d ENSGT00390000016223.o.a ENSGT00940000158446.x ENSGT00940000155889.c.d ENSGT00940000157433.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.g.b ##23 ENSGT01030000234990.b.a.a Common carp reference MODERN SPECIES f2 (ENSCCRG00000027707) arhgap1 (ENSCCRG00000010425) ENSCCRG00000062502 atg13 (ENSCCRG00000004933) harbi1 (ENSCCRG00000055144) zgc:110699 (ENSCCRG00000007128) phf21aa (ENSCCRG00000010347) creb3l1 (ENSCCRG00000016787) DGKZ (ENSCCRG00000045328) mdka (ENSCCRG00000041763) CHRM4 (ENSCCRG00000075300) ambra1a (ENSCCRG00000036765) acp2 (ENSCCRG00000036726) ENSCCRG00000036705 ENSCCRG00000036692 tnni2b.2 (ENSCCRG00000002481) ##23 ENSCCRG00000002656 ENSCCRG00000002639 tnnt3b (ENSCCRG00000002528) #25 ENSCCRG00000002720 slc22a18 (ENSCCRG00000003228) ptprja (ENSCCRG00000019231) ENSCCRG00000058248 kiaa0232 (ENSCCRG00000072478) TBC1D14 (ENSCCRG00000020597) ccdc96 (ENSCCRG00000069566) tada2b (ENSCCRG00000066504) grpel1 (ENSCCRG00000045066) SORCS2 (ENSCCRG00000004001) shrprbck1r (ENSCCRG00000034094) maf1b (ENSCCRG00000052020) Golden-line barbel MODERN SPECIES 708 ENSSGRG00000051278 f2 (ENSSGRG00000051279) arhgap1 (ENSSGRG00000051285) ENSSGRG00000051287 atg13 (ENSSGRG00000051289) zgc:110699 (ENSSGRG00000051460) phf21aa (ENSSGRG00000051461) creb3l1 (ENSSGRG00000051462) DGKZ (ENSSGRG00000051476) ENSSGRG00000051546 mdka (ENSSGRG00000051547) CHRM4 (ENSSGRG00000051548) ambra1a (ENSSGRG00000051551) acp2 (ENSSGRG00000051575) SNX1 (ENSSGRG00000051593) tnni2b.2 (ENSSGRG00000052159) ##23 ENSSGRG00000052160 ENSSGRG00000052162 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00940000159848.c ENSGT00940000156152.e.a.a.a ENSGT00390000007640.b.a.a ENSGT00940000160394.a.c ENSGT00390000016223.o.b ENSGT00940000158446.w ENSGT00940000155889.c.c ENSGT00940000157433.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.g.a ##23 ENSGT01030000234990.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.h.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a.e ENSGT00940000158477.a.b.b.b.a.b #25 ENSGT01030000234990.a ENSGT00940000158477.a.b.b.a #25 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.h.a ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a.f ENSGT00940000158477.a.b.b.b.a.a #25 ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333.b ENSGT00940000156870.bb.a.b ENSGT00940000159916.f ENSGT00390000018549.i ENSGT00940000157250.a ENSGT01100000263482.F.h ENSGT00940000154521.A ENSGT00940000157318.d ENSGT00390000005589.a.a.u ENSGT01030000234563.b.a.a.o.b ENSGT00940000164582.a.b ENSGT00390000006896.`b.a Goldfish MODERN SPECIES 47 znf408 (ENSCARG00000053851) arhgap1 (ENSCARG00000053898) ENSCARG00000054858 atg13 (ENSCARG00000054881) zgc:110699 (ENSCARG00000055097) phf21aa (ENSCARG00000055122) creb3l1 (ENSCARG00000055149) DGKZ (ENSCARG00000055485) mdka (ENSCARG00000061706) CHRM4 (ENSCARG00000061743) ambra1a (ENSCARG00000061763) acp2 (ENSCARG00000061934) SNX1 (ENSCARG00000062323) SLC8B1 (ENSCARG00000063159) tnni2b.2 (ENSCARG00000063408) ##23 tnni2b.1 (ENSCARG00000063440) ##23 ENSCARG00000063477 ENSCARG00000063533 tnnt3b (ENSCARG00000063547) #25 slc22a18 (ENSCARG00000063760) ptprja (ENSCARG00000063875) PTPN5 (ENSCARG00000064009) kiaa0232 (ENSCARG00000064289) TBC1D14 (ENSCARG00000064324) ccl36.1 (ENSCARG00000064858) ccdc96 (ENSCARG00000064867) tada2b (ENSCARG00000064869) grpel1 (ENSCARG00000064878) SORCS2 (ENSCARG00000064928) shrprbck1r (ENSCARG00000065342) maf1b (ENSCARG00000000237) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.h.a ##23 Golden-line barbel MODERN SPECIES 4216 tnni2b.1 (ENSSGRG00000006764) ##23 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00940000160630.g.a ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055.h ENSGT00940000166946.b ENSGT00940000156124.c.a.c ENSGT00940000159848.c ENSGT00940000156152.e.a.a.a ENSGT00390000007640.b.a.a ENSGT00940000160394.a.c ENSGT00390000016223.o.b ENSGT00940000158446.w ENSGT00940000155889.c.c ENSGT00940000157433.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.g.a ##23 ENSGT01030000234990.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.h.b ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a.e ENSGT00940000158477.a.b.b.b.a.b #25 ENSGT01030000234990.a ENSGT00940000158477.a.b.b.a #25 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.h.a ##23 ENSGT00940000153901.a.b.a.f ENSGT00940000158477.a.b.b.b.a.a #25 ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333.b ENSGT00940000156870.bb.a.b ENSGT00940000159916.f ENSGT00390000018549.i ENSGT00940000157250.a ENSGT01100000263482.F.h ENSGT00940000154521.A Goldfish MODERN SPECIES 25 ENSCARG00000008650 ENSCARG00000008659 trmt44 (ENSCARG00000008686) rpl34 (ENSCARG00000008836) ggh (ENSCARG00000008845) ENSCARG00000008871 ENSCARG00000008880 plag1 (ENSCARG00000008890) RPS20 (ENSCARG00000008893) ENSCARG00000008903 lypla1 (ENSCARG00000008922) ENSCARG00000009042 ENSCARG00000009045 SLC8B1 (ENSCARG00000009053) tnni2b.2 (ENSCARG00000009099) ##23 tnni2b.1 (ENSCARG00000009119) ##23 ENSCARG00000009136 ENSCARG00000009162 tnnt3b (ENSCARG00000009176) #25 slc22a18 (ENSCARG00000009279) ptprja (ENSCARG00000009289) PTPN5 (ENSCARG00000009327) ENSCARG00000009506 ENSCARG00000009515 kiaa0232 (ENSCARG00000009529) TBC1D14 (ENSCARG00000009619) ccl36.1 (ENSCARG00000010416) acp2 (ENSCARG00000005888) tada2b (ENSCARG00000006424) grpel1 (ENSCARG00000006436) ENSCARG00000006454 Spotted gar MODERN SPECIES 666 lrp5 (ENSLOCG00000002586) ppp6r3 (ENSLOCG00000002546) ENSLOCG00000002512 gal (ENSLOCG00000002486) zgc:110339 (ENSLOCG00000002463) psmd13 (ENSLOCG00000002439) sirt3 (ENSLOCG00000002426) ric8a (ENSLOCG00000002406) BET1L (ENSLOCG00000002376) #13 deaf1 (ENSLOCG00000002360) #14 drd4a (ENSLOCG00000002345) #15 ENSLOCG00000002337 ctsd (ENSLOCG00000002297) #18 ENSLOCG00000002283 SYT8 (ENSLOCG00000002263) #20 tnni2a.4 (ENSLOCG00000002237) #23 ENSLOCG00000017320 #24 ENSLOCG00000002207 tnnt3a (ENSLOCG00000002181) #25 MYOD1 (ENSLOCG00000002164) #26 zgc:172145 (ENSLOCG00000002153) #27 ENSLOCG00000002142 ##26 OTOG (ENSLOCG00000002110) ush1c (ENSLOCG00000002073) abcc8 (ENSLOCG00000002032) kcnj11 (ENSLOCG00000002016) ABTB2 (ENSLOCG00000001988) B4GALNT4 (ENSLOCG00000001959) IGSF22 (ENSLOCG00000001945) tmem86a (ENSLOCG00000001930) spty2d1 (ENSLOCG00000001901) Reedfish MODERN SPECIES 10 ppp6r3 (ENSECRG00000001119) gal (ENSECRG00000001093) ENSECRG00000001068 ENSECRG00000001044 ENSECRG00000001031 ENSECRG00000001018 psmd13 (ENSECRG00000000984) sirt3 (ENSECRG00000000947) ric8a (ENSECRG00000000914) BET1L (ENSECRG00000000891) #13 deaf1 (ENSECRG00000000848) #14 drd4a (ENSECRG00000000794) #15 ctsd (ENSECRG00000000723) #18 SYT8 (ENSECRG00000000689) #20 ENSECRG00000000682 tnni2a.4 (ENSECRG00000000665) #23 ENSECRG00000000643 ENSECRG00000000626 #24 tnnt3a (ENSECRG00000000597) #25 MYOD1 (ENSECRG00000000567) #26 ush1c (ENSECRG00000000542) abcc8 (ENSECRG00000003935) kcnj11 (ENSECRG00000003846) ENSECRG00000003840 ENSECRG00000003836 ENSECRG00000003833 si:dkey-10o6.2 (ENSECRG00000003829) nucb2b (ENSECRG00000003824) PIK3C2A (ENSECRG00000003812) rps13 (ENSECRG00000003804) PLEKHA7 (ENSECRG00000003752)