Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156938.e	ENSGT00940000163421.a.d.a.a	ENSGT00940000159150.ab	ENSGT00940000155010.a	ENSGT01010000223078	ENSGT00390000004417.b	ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.b	ENSGT00940000160309.e.b	ENSGT00940000158707.a.a	ENSGT00390000001802	ENSGT00940000159464	ENSGT00940000160974.b.d #18	ENSGT00940000162463 #19	ENSGT00940000155733.a.a #20	ENSGT00940000160892.f #21	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##22	ENSGT00940000153901.a.b.a ##26	ENSGT01000000216979	ENSGT00940000158477.a.a ##28	ENSGT00950000182959.b.a.a ##29	ENSGT00940000157490	ENSGT00390000002049.c.b	ENSGT00940000160967.f	ENSGT00940000153246.a.a.a.d	ENSGT00940000156926.d	ENSGT00940000155744.t.a	ENSGT00530000062962.b.a.e	ENSGT01030000234532.B.e.b.e	ENSGT00940000155836.B.j
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000159477.d #8	ENSGT00390000013249.e.a #9	ENSGT00940000155529.A.f #10	ENSGT00550000074844.jb.b #11	ENSGT00940000157682.B.b.b #12	ENSGT00940000163706 #13	ENSGT00940000160208 #14	ENSGT00940000159701 #15	ENSGT00940000160974.b.c.g.b #16	ENSGT00940000164955.b #17	ENSGT00940000160974.b.d #18	ENSGT00940000162463 #19	ENSGT00940000155733.a.a #20	ENSGT00940000160892.f #21	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #24	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b #25	ENSGT00940000153901.a.b.b.d ##26	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.a ##22	ENSGT00940000177178	ENSGT00940000153901.a.b.b.c #26	ENSGT00940000167812.f #27	ENSGT00940000158477.a.b.d #28	ENSGT00950000182959.b.a.b.d #29	ENSGT00920000149457.d #30	ENSGT00940000155997.lb.b.v #31	ENSGT00940000157572.a.b.d #32	ENSGT00940000160625.r.a.a #33	ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #34	ENSGT00390000011262.e.a.b.a #35	ENSGT00390000008931.h #36
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	51	ENSGT00590000083094.a.b.k.b #7	ENSGT00940000159477.d #8	ENSGT00390000013249.e.a #9	ENSGT00940000155529.A.f #10	ENSGT00550000074844.jb.b #11	ENSGT00940000157682.B.b.b #12	ENSGT00940000163706 #13	ENSGT00940000160208 #14	ENSGT00940000159701 #15	ENSGT00940000160974.b.c.g.b #16	ENSGT00940000164955.b #17	ENSGT00940000160974.b.d #18	ENSGT00940000162463 #19	ENSGT00940000155733.a.a #20	ENSGT00940000160892.f #21	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #24	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b #25	ENSGT00940000153901.a.b.b.c #26	ENSGT00940000167812.f #27	ENSGT00940000158477.a.b.d #28	ENSGT00950000182959.b.a.b.d #29	ENSGT00920000149457.d #30	ENSGT00940000155997.lb.b.v #31	ENSGT00940000157572.a.b.d #32	ENSGT00940000160625.r.a.a #33	ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #34	ENSGT00390000011262.e.a.b.a #35	ENSGT00390000008931.h #36	ENSGT00390000016453.m #37
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00590000083094.a.b.k.b #7	ENSGT00940000159477.d #8	ENSGT00390000013249.e.a #9	ENSGT00940000155529.A.f #10	ENSGT00550000074844.jb.b #11	ENSGT00940000157682.B.b.b #12	ENSGT00940000163706 #13	ENSGT00940000160208 #14	ENSGT00940000159701 #15	ENSGT00940000160974.b.c.g.b #16	ENSGT00940000164955.b #17	ENSGT00940000160974.b.d #18	ENSGT00940000162463 #19	ENSGT00940000155733.a.a #20	ENSGT00940000160892.f #21	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b #23	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #24	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b #25	ENSGT00940000153901.a.b.b.c #26	ENSGT00940000167812.f #27	ENSGT00940000158477.a.b.d #28	ENSGT00950000182959.b.a.b.d #29	ENSGT00920000149457.d #30	ENSGT00940000155997.lb.b.v #31	ENSGT00940000157572.a.b.d #32	ENSGT00940000160625.r.a.a #33	ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p #34	ENSGT00390000011262.e.a.b.a #35	ENSGT00390000008931.h #36	ENSGT00390000016453.m #37
Coho salmon	MODERN SPECIES	1	aass (ENSOKIG00005028706) #9	PTPRZ1 (ENSOKIG00005031860) #10	DLD (ENSOKIG00005032474) #11	ENSOKIG00005032722	ENSOKIG00005032730 #12	ticam1 (ENSOKIG00005032764) #13	BET1L (ENSOKIG00005032895) #14	deaf1 (ENSOKIG00005032919) #15	drd4a (ENSOKIG00005032941) #16	ENSOKIG00005032958 #17	ENSOKIG00005032986	ENSOKIG00005032992 #20	ENSOKIG00005033002	SYT8 (ENSOKIG00005033015) #21	tnni2a.1 (ENSOKIG00005033031) #24	tnni2a.2 (ENSOKIG00005033122) #22	ENSOKIG00005033145 #23	ENSOKIG00005033174 #27	tnnt3b (ENSOKIG00005033212) #28	MYOD1 (ENSOKIG00005033239) #29	zgc:172145 (ENSOKIG00005033256) #30	CACNA2D4 (ENSOKIG00005033316) #31	LRTM2 (ENSOKIG00005034035) #32	ENSOKIG00005034065 #33	urahb (ENSOKIG00005034114) #34	GLG1 (ENSOKIG00005034363) #35	RFWD3 (ENSOKIG00005038361) #36	MLKL (ENSOKIG00005038521) #37	etfbkmt (ENSOKIG00005038535)	amn1 (ENSOKIG00005038546)	nfybb (ENSOKIG00005038602)
Chinook salmon	MODERN SPECIES		CADPS2 (ENSOTSG00005000454) #7	fezf1 (ENSOTSG00005000577) #8	aass (ENSOTSG00005000626) #9	PTPRZ1 (ENSOTSG00005007896) #10	dldh (ENSOTSG00005008481) #11	ENSOTSG00005009315	ENSOTSG00005009316 #12	ticam1 (ENSOTSG00005009318) #13	BET1L (ENSOTSG00005009320) #14	deaf1 (ENSOTSG00005009322) #15	drd4a (ENSOTSG00005009324) #16	ENSOTSG00005009327 #17	ENSOTSG00005009336 #20	ENSOTSG00005009337 #21	ENSOTSG00005009344 #26	tnni2a.2 (ENSOTSG00005009347) #22	TNNI2 (ENSOTSG00005009348) #25	ENSOTSG00005009349 #27	ENSOTSG00005009351 #28	MYOD1 (ENSOTSG00005009353) #29	zgc:172145 (ENSOTSG00005009354) #30	CACNA2D4 (ENSOTSG00005009358) #31	LRTM2 (ENSOTSG00005009493) #32	ENSOTSG00005009504 #33	urahb (ENSOTSG00005012417) #34	GLG1 (ENSOTSG00005012421) #35	RFWD3 (ENSOTSG00005014583) #36	MLKL (ENSOTSG00005014585) #37	etfbkmt (ENSOTSG00005014586)	amn1 (ENSOTSG00005014587)	ENSOTSG00005014589
Rainbow trout	MODERN SPECIES	22	fezf1 (ENSOMYG00000042293) #8	aass (ENSOMYG00000042455) #9	PTPRZ1 (ENSOMYG00000044183) #10	ENSOMYG00000044213 #11	ENSOMYG00000053913	ENSOMYG00000044242 #12	ENSOMYG00000051072 #13	bet1l (ENSOMYG00000071324)	deaf1 (ENSOMYG00000044258) #15	drd4a (ENSOMYG00000044265) #16	ENSOMYG00000044274 #17	ENSOMYG00000044289 #20	ENSOMYG00000070342	SYT8 (ENSOMYG00000044334) #21	tnni2a.1 (ENSOMYG00000044342) #24	ENSOMYG00000051621 #22	ENSOMYG00000054158	ENSOMYG00000044366 #27	TNNT3 (ENSOMYG00000044367) #28	myod2 (ENSOMYG00000044372) #29	zgc:172145 (ENSOMYG00000068802) #30	ENSOMYG00000064959	ENSOMYG00000044396 #31	ENSOMYG00000054081 #32	ENSOMYG00000044518 #33	urahb (ENSOMYG00000045245) #34	ENSOMYG00000069462	ENSOMYG00000073315	GLG1 (ENSOMYG00000045338) #35	ENSOMYG00000045422 #36	MLKL (ENSOMYG00000045444) #37
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a	ENSGT00590000083094.a.b.k.a.a.b ##7	ENSGT00940000159477.d #8	ENSGT00390000013249.f ##9	ENSGT00940000155529.A.f #10	ENSGT00550000074844.jb.b #11	ENSGT00940000157682.B.b.b #12	ENSGT00940000163706 #13	ENSGT00940000160208 #14	ENSGT00940000159701 #15	ENSGT00940000160974.b.c.g.b #16	ENSGT00940000164955.b #17	ENSGT00940000155733.a.a #20	ENSGT00940000160892.f #21	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e #24	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c #22	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b.b #25	ENSGT00940000153901.a.b.b.c #26	ENSGT00940000167812.f #27	ENSGT00940000158477.a.b.d #28	ENSGT00950000182959.b.a.b.d #29	ENSGT00920000149457.d #30	ENSGT00940000155997.lb.b.v #31	ENSGT00940000157572.a.b.d #32	ENSGT00940000160625.r.a.a #33	ENSGT00390000011262.e.a.b.a #35	ENSGT00390000008931.h #36	ENSGT00390000016453.m #37	ENSGT00940000163501	ENSGT00730000111305	ENSGT00940000154917.fb.b
River trout	MODERN SPECIES	33	fezf1 (ENSSTUG00000023090) #8	aass (ENSSTUG00000019952) ##9	ENSSTUG00000019843	PTPRZ1 (ENSSTUG00000017658) #10	dldh (ENSSTUG00000017505) #11	ENSSTUG00000017492	ENSSTUG00000017480 #12	ticam1 (ENSSTUG00000017476) #13	BET1L (ENSSTUG00000017470) #14	deaf1 (ENSSTUG00000017459) #15	drd4a (ENSSTUG00000017447) #16	ENSSTUG00000017421 #17	ENSSTUG00000017149 #20	SYT8 (ENSSTUG00000017135) #21	tnni2a.1 (ENSSTUG00000017118) #24	tnni2a.2 (ENSSTUG00000017106) #22	ENSSTUG00000017036 #25	ENSSTUG00000017023 #27	tnnt3b (ENSSTUG00000016997) #28	MYOD1 (ENSSTUG00000016988) #29	zgc:172145 (ENSSTUG00000016985) #30	ENSSTUG00000016981	LRTM2 (ENSSTUG00000016977) #32	ENSSTUG00000015707 #31	ENSSTUG00000013806 #33	urahb (ENSSTUG00000013349) #34	ENSSTUG00000013296	GLG1 (ENSSTUG00000012698) #35	RFWD3 (ENSSTUG00000012610) #36	MLKL (ENSSTUG00000012572) #37	etfbkmt (ENSSTUG00000012566)
Huchen	MODERN SPECIES	889											ENSHHUG00000028029 #17	ENSHHUG00000027755 #20	SYT8 (ENSHHUG00000027747) #21	ENSHHUG00000027744	tnni2a.1 (ENSHHUG00000027733) #24	tnni2a.2 (ENSHHUG00000027724) #22	TNNI2 (ENSHHUG00000027633) #23	TNNI2 (ENSHHUG00000027573) #25	ENSHHUG00000027566	ENSHHUG00000027560 #26	TNNT3 (ENSHHUG00000027549) #28	MYOD1 (ENSHHUG00000027540) #29	CACNA2D4 (ENSHHUG00000027532) #31	LRTM2 (ENSHHUG00000027521) #32	ENSHHUG00000027515 #31	ENSHHUG00000027513 #31	ENSHHUG00000027507 #33	urahb (ENSHHUG00000027499) #34	GLG1 (ENSHHUG00000027478) #35	RFWD3 (ENSHHUG00000027472) #36	ENSHHUG00000027468 #37