Chordata DUPLICATION Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.a #21 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.a #21 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 620 ENSGT01030000234588.b.b.b.a #21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b #25 ENSGT00940000156735 ENSGT00940000160123 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000159363 ENSGT00390000010229 ENSGT00940000153414.A ENSGT00940000159401 ENSGT00390000006865 ENSGT00940000160161 ENSGT00940000164299 #16 ENSGT00940000158576 #17 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000156000 ENSGT01030000234588.b.b.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a #21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b #25 ENSGT00940000159750 ENSGT00940000154814.b ENSGT00940000156403.b ENSGT00940000155197 ENSGT00390000007878 ENSGT00940000158916 ENSGT00390000011980.a ENSGT00940000153908.a ENSGT00440000033863 ENSGT00940000159982 ENSGT00940000159950 ENSGT00940000155728 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 461 ENSGT01030000234588.b.b.b.a #21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b #25 ENSGT00940000159750 ENSGT00940000154814.b ENSGT00940000156403.b Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000155480.d ENSGT00940000157682.B ENSGT01090000260145 ENSGT00890000139436.B ENSGT00390000010382 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000013347.a ENSGT00940000167703 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000155659 ENSGT00940000164174 ENSGT00940000160513 ENSGT00550000075044 ENSGT01030000234588.b.b.b.a #21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b #25 ENSGT00940000155504 #26 ENSGT00940000156246 #27 ENSGT00940000164630 ENSGT01050000244882.b.d ENSGT00940000154738.a #30 ENSGT00940000155419 #31 ENSGT00940000155915 ENSGT00950000183062.a.a.b #32 ENSGT00940000156242 ENSGT00390000013995.b.b #33 ENSGT00390000016228.b ##34 ENSGT00940000157529 #36 Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 827 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000178181 ENSGT00940000153525.i.a ENSGT00390000008708 #12 ENSGT00940000154098.a.f ##13 ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a.h #11 ENSGT00390000014507.a.a.g ##11 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00390000008708.a #12 ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000160916 #15 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a.g ##31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c #33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT01010000222986 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 171 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915.e #10 ENSGT00390000014507.a.a.h #11 ENSGT00940000153525.i.b.f ENSGT00390000008708.a.b #12 ENSGT00940000154098.a.e.i #13 ENSGT00390000004933.k.b.d #14 ENSGT00940000160916 #15 ENSGT00940000164299.b.b.a #16 ENSGT00940000158576.a.b.a #17 ENSGT00390000000068.a.b.d #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.g #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT00950000182926.a.o #24 ENSGT00940000154709.a.b.b.c.c #25 ENSGT00940000155504.k.a.c #26 ENSGT00940000156246.c.a.c #27 ENSGT00940000154738.a.q.c #30 ENSGT00940000155419.c.a.h #31 ENSGT00940000155915.a.d ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.f #32 ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.a #33 ENSGT00390000016228.a.b.b #34 ENSGT00940000157529.i.a.f #36 ENSGT01010000222986.a ENSGT00390000014700.b.a.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915.e #10 ENSGT00390000014507.a.a.h #11 ENSGT00940000153525.i.b.f ENSGT00390000008708.a.b #12 ENSGT00940000154098.a.e.i #13 ENSGT00390000004933.k.b.d #14 ENSGT00940000160916 #15 ENSGT00940000164299.b.b.a #16 ENSGT00940000158576.a.b.a #17 ENSGT00390000000068.a.b.d #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.g #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT00950000182926.a.o #24 ENSGT00940000154709.a.b.b.c.c #25 ENSGT00940000155504.k.a.c #26 ENSGT00940000156246.c.a.c #27 ENSGT00940000154738.a.q.c #30 ENSGT00940000155419.c.a.h #31 ENSGT00940000155915.a.d ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.f #32 ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.a #33 ENSGT00390000016228.a.b.b #34 ENSGT00940000157529.i.a.f #36 ENSGT01010000222986.a ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000159763.o Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915.e #10 ENSGT00390000014507.a.a.h #11 ENSGT00390000008708.a.b #12 ENSGT00940000154098.a.e.i #13 ENSGT00390000004933.k.b.d #14 ENSGT00940000160916 #15 ENSGT00940000164299.b.b.a #16 ENSGT00940000158576.a.b.a #17 ENSGT00390000000068.a.b.d #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.g #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT00950000182926.a.o #24 ENSGT00940000154709.a.b.b.c.c #25 ENSGT00940000155504.k.a.c #26 ENSGT00940000156246.c.a.c #27 ENSGT00940000154738.a.q.c #30 ENSGT00940000155419.c.a.h #31 ENSGT00940000155915.a.d ENSGT01080000258033.b ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.f #32 ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.a #33 ENSGT00390000016228.a.b.b #34 ENSGT00940000157529.i.a.f #36 ENSGT01010000222986.a ENSGT00390000014700.b.a.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915.e #10 ENSGT00390000014507.a.a.h #11 ENSGT00390000008708.a.b #12 ENSGT00940000154098.a.e.i #13 ENSGT00390000004933.k.b.d #14 ENSGT00940000160916 #15 ENSGT00940000164299.b.b.a #16 ENSGT00940000158576.a.b.a #17 ENSGT00390000000068.a.b.d #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.g #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT00950000182926.a.o #24 ENSGT00940000154709.a.b.b.c.c #25 ENSGT00940000155504.k.a.c #26 ENSGT00940000156246.c.a.c #27 ENSGT00940000154738.a.q.c #30 ENSGT00940000155419.c.a.h #31 ENSGT00940000155915.a.d ENSGT01080000258033.b ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.f #32 ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.a #33 ENSGT00390000016228.a.b.b #34 ENSGT00940000157529.i.a.f #36 ENSGT01010000222986.a ENSGT00390000014700.b.a.a Chinook salmon MODERN SPECIES 10 ENSOTSG00005002735 #7 ENSOTSG00005002727 #8 chchd3b (ENSOTSG00005002714) #9 slc35b4 (ENSOTSG00005002559) #10 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##36 Rainbow trout MODERN SPECIES ENSOMYG00000071565 ##7 ENSOMYG00000050257 slc35b4 (ENSOMYG00000044709) ##10 golt1bb (ENSOMYG00000044707) ##11 ENSOMYG00000068445 ldhbb (ENSOMYG00000044694) slc25a3b (ENSOMYG00000044676) ##12 tmpob (ENSOMYG00000044670) ##13 pthlhb (ENSOMYG00000044666) ##14 ENSOMYG00000061278 ENSOMYG00000004825 ENSOMYG00000044665 ##16 ENSOMYG00000044662 ##17 ENSOMYG00000071286 ENSOMYG00000044648 ##18 ENSOMYG00000044636 ##21 bpgm (ENSOMYG00000044633) ##24 ENSOMYG00000044617 dnm1l (ENSOMYG00000043734) ##26 dnajb9a (ENSOMYG00000043552) ##27 ENSOMYG00000014596 ##35 ENSOMYG00000035634 ##31 ENSOMYG00000056734 ENSOMYG00000056490 CNTN1 (ENSOMYG00000029641) ENSOMYG00000070317 PDZRN4 (ENSOMYG00000073658) ##32 GXYLT1 (ENSOMYG00000028164) YAF2 (ENSOMYG00000028116) ##33 ENSOMYG00000028084 ENSOMYG00000028069 ##36 Salmo ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00950000183125.a.a.a ENSGT00940000155461.E.k ENSGT00710000106806.k ENSGT00950000182994.B.a.b.pb.a ENSGT00530000063735.b.g ##7 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##21 ENSHHUG00000000401 bpgm (ENSHHUG00000000382) ##24 ENSHHUG00000000361 tnnt2d (ENSHHUG00000000257) ##25 dnm1l (ENSHHUG00000000243) ##26 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000156246.c.b ##27 ENSGT00940000153272.a.b.d ENSGT00940000153272.a.b.c ENSGT00940000159404 ENSGT00940000157682.B.a ENSGT01090000260145 ENSGT00890000139436.B ENSGT00390000005941.c ENSGT00390000013347.a ENSGT00940000155659 ENSGT00940000160513.a ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT00940000153901.a.a.b ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##25 ENSGT00940000155504.k.b ##26 ENSGT00980000199777 ENSGT00550000076278 ENSGT00980000198695 ENSGT00940000156883 ENSGT00390000006619 ENSGT00940000175997 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a ENSGT01030000235325 ENSGT00390000013963 ENSGT00940000156443 ENSGT00950000182931.B.a.a.h Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 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(ENSSDUG00000022955) #36 ENSSDUG00000022967 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000170627 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000170627 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 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Spiny chromis MODERN SPECIES 141 ALDH1L2 (ENSAPOG00000000452) pthlhb (ENSAPOG00000016163) #14 ENSAPOG00000016181 #16 KCNA1 (ENSAPOG00000016187) #17 ENSAPOG00000016198 CNOT4 (ENSAPOG00000016272) #18 zgc:136858 (ENSAPOG00000016393) #19 ENSAPOG00000016427 ##21 ENSAPOG00000016449 #22 ENSAPOG00000016478 ##21 bpgm (ENSAPOG00000016493) #24 ENSAPOG00000016511 ENSAPOG00000016532 tnnt2d (ENSAPOG00000016573) #25 dnm1l (ENSAPOG00000016682) #26 dnajb9a (ENSAPOG00000016699) #27 ENSAPOG00000016711 #30 NRCAM (ENSAPOG00000016917) #31 CNTN1 (ENSAPOG00000016941) PDZRN4 (ENSAPOG00000016980) #32 GXYLT1 (ENSAPOG00000017039) YAF2 (ENSAPOG00000016986) ##33 ifitm5 (ENSAPOG00000017051) ENSAPOG00000017126 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1217 ldhbb (ENSSPAG00000012436) tmpob (ENSSPAG00000012406) #13 pthlhb (ENSSPAG00000012395) #14 ENSSPAG00000012390 #16 KCNA1 (ENSSPAG00000012387) #17 CNOT4 (ENSSPAG00000012329) #18 zgc:136858 (ENSSPAG00000012273) #19 ENSSPAG00000012226 #20 ENSSPAG00000012204 ##21 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ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000170627 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000170627 ENSGT00940000158636 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 6 ENSKMAG00000004225 #8 NET1 (ENSKMAG00000004260) 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ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000175224 ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000170627 Mummichog MODERN SPECIES 2447 ASB13 (ENSFHEG00000006982) NET1 (ENSFHEG00000006961) chchd3b (ENSFHEG00000006911) #9 slc35b4 (ENSFHEG00000006897) #10 golt1bb (ENSFHEG00000006866) #11 ldhbb (ENSFHEG00000006831) tmpob (ENSFHEG00000006728) #13 pthlhb (ENSFHEG00000006716) #14 ENSFHEG00000006696 #16 KCNA1 (ENSFHEG00000006686) #17 CNOT4 (ENSFHEG00000006608) #18 zgc:136858 (ENSFHEG00000006533) #19 ENSFHEG00000006438 #20 tnni4a (ENSFHEG00000006404) 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#21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000175224 ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.c #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000170627 ENSGT00940000158636 Javanese ricefish MODERN SPECIES 20 ENSOJAG00000000519 #7 ASB13 (ENSOJAG00000000509) NET1 (ENSOJAG00000000422) chchd3b (ENSOJAG00000000345) #9 slc35b4 (ENSOJAG00000000339) #10 ENSOJAG00000000331 golt1bb (ENSOJAG00000000317) #11 ENSOJAG00000000303 ldhbb (ENSOJAG00000000294) tmpob (ENSOJAG00000000281) #13 pthlhb (ENSOJAG00000000274) #14 ENSOJAG00000000271 #16 KCNA1 (ENSOJAG00000000266) #17 CNOT4 (ENSOJAG00000000245) #18 zgc:136858 (ENSOJAG00000000205) #19 ENSOJAG00000000125 #22 ENSOJAG00000022616 ##21 ENSOJAG00000022607 #20 bpgm 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#26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00390000011620.b.e.h ENSGT00940000159496.l ENSGT00940000159100.h ENSGT00950000183113.b.a ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.b ENSGT00940000157431.c.a ENSGT00390000016435 ENSGT00530000064192 ENSGT00530000063113.A Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT00720000108833.a ENSGT00940000154189.B.a ENSGT00940000158686.d.b ENSGT00640000091774.a.c.a.a ENSGT00640000091774.a.c.b.a ENSGT00950000183004.a.b.b.a ENSGT00510000047522.d.a ENSGT00940000159839.d.b.a ENSGT00390000010968.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b.e #17 ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e.b ENSGT00390000000068.a.b.b #18 ENSGT00390000007427.b #19 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.n.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a.a #23 ENSGT00950000182926.a.q #24 ENSGT00940000153901.a.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c.e #25 ENSGT00940000155504.j.b #26 ENSGT00940000156246.c.a.a #27 ENSGT00390000011620.b.e.h.b ENSGT00940000159496.l.a ENSGT00940000159100.h.a 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ENSGT00530000064192 ENSGT00530000063113.A.s.a ENSGT00940000155057.wb.e.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 30 atp2b1b (ENSSGRG00000050038) zgc:171459 (ENSSGRG00000050037) zgc:113426 (ENSSGRG00000050035) mxg (ENSSGRG00000049977) zgc:101783 (ENSSGRG00000049975) ENSSGRG00000049974 ENSSGRG00000049973 GRAMD4 (ENSSGRG00000049972) kcna6a (ENSSGRG00000049971) ##17 KCNA1 (ENSSGRG00000049969) #17 tmem178ba (ENSSGRG00000049967) CNOT4 (ENSSGRG00000049881) #18 zgc:136858 (ENSSGRG00000049879) #19 ENSSGRG00000049878 tnni4b.2 (ENSSGRG00000049876) #23 ENSSGRG00000049833 #22 ENSSGRG00000049830 #23 bpgm (ENSSGRG00000049828) #24 tnnt2d (ENSSGRG00000049789) #25 DNM1L (ENSSGRG00000049324) #26 dnajb9a (ENSSGRG00000049321) #27 ENSSGRG00000049320 CHST8 (ENSSGRG00000049319) kctd15a (ENSSGRG00000049318) CPLX3 (ENSSGRG00000049316) csk (ENSSGRG00000049064) kxd1 (ENSSGRG00000049053) edc3 (ENSSGRG00000049052) ergic2 (ENSSGRG00000048832) ENSSGRG00000048828 MAGI2 (ENSSGRG00000048416) Common carp reference MODERN SPECIES 33 si:ch211-59o9.10 (ENSCCRG00000015921) actr6 (ENSCCRG00000015866) atp2b1b (ENSCCRG00000015848) zgc:113426 (ENSCCRG00000015835) mxg (ENSCCRG00000045849) ENSCCRG00000053451 zgc:101783 (ENSCCRG00000014583) ENSCCRG00000071231 ENSCCRG00000000912 ENSCCRG00000006960 ENSCCRG00000076127 #16 ENSCCRG00000065772 #17 ENSCCRG00000038814 #18 zgc:136858 (ENSCCRG00000038816) #19 ENSCCRG00000038826 #21 ENSCCRG00000072998 #22 tnni4b.2 (ENSCCRG00000038842) #23 bpgm (ENSCCRG00000074369) #24 ENSCCRG00000079503 ENSCCRG00000059759 tnnt2d (ENSCCRG00000067690) #25 ENSCCRG00000038928 #26 dnajb9a (ENSCCRG00000063117) #27 ENSCCRG00000038902 kctd15a (ENSCCRG00000065628) ENSCCRG00000039975 ENSCCRG00000081808 adal (ENSCCRG00000047193) cplx3a (ENSCCRG00000063843) csk (ENSCCRG00000040243) edc3 (ENSCCRG00000072553) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 139 ENSGT00940000158686.d ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000159839.d.b ENSGT00390000010968.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a #23 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000175224 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504 #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000155025.A ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00530000063554.a ENSGT00940000160061 Denticle herring DUPLICATION Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 8 ENSDCDG00000031903 ENSDCDG00000032957 ENSDCDG00000032966 GRAMD4 (ENSDCDG00000033039) ENSDCDG00000033134 #16 KCNA1 (ENSDCDG00000033135) #17 tmem178ba (ENSDCDG00000033136) CNOT4 (ENSDCDG00000033138) #18 ENSDCDG00000033146 ENSDCDG00000033148 ENSDCDG00000033149 ENSDCDG00000033151 zgc:136858 (ENSDCDG00000033153) #19 ENSDCDG00000033158 #21 ENSDCDG00000033159 #22 ENSDCDG00000033161 #22 ENSDCDG00000033162 #22 tnni4b.2 (ENSDCDG00000033163) #23 bpgm (ENSDCDG00000033165) #24 CALD1 (ENSDCDG00000033169) tnnt2d (ENSDCDG00000033173) #25 dnm1l (ENSDCDG00000033194) #26 dnajb9a (ENSDCDG00000033272) #27 ENSDCDG00000012665 ENSDCDG00000012785 #30 ENSDCDG00000013496 #31 CNTN1 (ENSDCDG00000027377) ENSDCDG00000027473 PDZRN4 (ENSDCDG00000027474) #32 GXYLT1 (ENSDCDG00000027476) pus7 (ENSDCDG00000027483) Denticle herring MODERN SPECIES 8 zgc:171459 (ENSDCDG00000031814) ENSDCDG00000031903 ENSDCDG00000032957 ENSDCDG00000032966 GRAMD4 (ENSDCDG00000033039) ENSDCDG00000033134 #16 KCNA1 (ENSDCDG00000033135) #17 tmem178ba (ENSDCDG00000033136) CNOT4 (ENSDCDG00000033138) #18 ENSDCDG00000033146 ENSDCDG00000033148 ENSDCDG00000033149 ENSDCDG00000033151 zgc:136858 (ENSDCDG00000033153) #19 ENSDCDG00000033158 #21 ENSDCDG00000033159 #22 ENSDCDG00000033161 #22 ENSDCDG00000033162 #22 tnni4b.2 (ENSDCDG00000033163) #23 bpgm (ENSDCDG00000033165) #24 CALD1 (ENSDCDG00000033169) tnnt2d (ENSDCDG00000033173) #25 dnm1l (ENSDCDG00000033194) #26 dnajb9a (ENSDCDG00000033272) #27 ENSDCDG00000012665 ENSDCDG00000012785 #30 ENSDCDG00000013496 #31 CNTN1 (ENSDCDG00000027377) ENSDCDG00000027473 PDZRN4 (ENSDCDG00000027474) #32 GXYLT1 (ENSDCDG00000027476) Denticle herring MODERN SPECIES 8 ENSDCDG00000032957 ENSDCDG00000032966 GRAMD4 (ENSDCDG00000033039) ENSDCDG00000033134 #16 KCNA1 (ENSDCDG00000033135) #17 tmem178ba (ENSDCDG00000033136) CNOT4 (ENSDCDG00000033138) #18 ENSDCDG00000033146 ENSDCDG00000033148 ENSDCDG00000033149 ENSDCDG00000033151 zgc:136858 (ENSDCDG00000033153) #19 ENSDCDG00000033158 #21 ENSDCDG00000033159 #22 ENSDCDG00000033161 #22 ENSDCDG00000033162 #22 tnni4b.2 (ENSDCDG00000033163) #23 bpgm (ENSDCDG00000033165) #24 CALD1 (ENSDCDG00000033169) tnnt2d (ENSDCDG00000033173) #25 dnm1l (ENSDCDG00000033194) #26 dnajb9a (ENSDCDG00000033272) #27 ENSDCDG00000012665 ENSDCDG00000012785 #30 ENSDCDG00000013496 #31 CNTN1 (ENSDCDG00000027377) ENSDCDG00000027473 PDZRN4 (ENSDCDG00000027474) #32 GXYLT1 (ENSDCDG00000027476) pus7 (ENSDCDG00000027483) hdac10 (ENSDCDG00000027612) Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ruvbl2 (ENSCHAG00000012194) ENSCHAG00000012164 atp2b1b (ENSCHAG00000006419) gtse1 (ENSCHAG00000006220) ENSCHAG00000004490 GRAMD4 (ENSCHAG00000002310) ENSCHAG00000002221 #16 KCNA1 (ENSCHAG00000002201) #17 tmem178ba (ENSCHAG00000002185) CNOT4 (ENSCHAG00000002097) #18 ENSCHAG00000002073 ENSCHAG00000002049 zgc:136858 (ENSCHAG00000001892) #19 ENSCHAG00000001832 #21 tnni4b.2 (ENSCHAG00000001623) #23 ENSCHAG00000001241 #22 bpgm (ENSCHAG00000001141) #24 ENSCHAG00000001093 tnnt2d (ENSCHAG00000000865) #25 dnm1l (ENSCHAG00000027213) #26 dnajb9a (ENSCHAG00000027196) #27 ENSCHAG00000027195 ENSCHAG00000027160 #30 NRCAM (ENSCHAG00000024494) #31 CNTN1 (ENSCHAG00000022843) PDZRN4 (ENSCHAG00000022707) #32 ENSCHAG00000022702 GXYLT1 (ENSCHAG00000022694) pus7 (ENSCHAG00000021961) hdac10 (ENSCHAG00000021810) parvb (ENSCHAG00000021676) Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000155480.d ENSGT00940000157682.B.a ENSGT01090000260145 ENSGT00890000139436.B ENSGT00390000010382 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00940000155659 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000160513 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000153901.a.a.b ENSGT00940000154709.a.b.b #25 ENSGT00940000155504 #26 ENSGT00940000156246 #27 ENSGT00940000164630 ENSGT01050000244882.b.d ENSGT00940000154738.a.r ##30 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419 #31 ENSGT00940000155915.b ENSGT00950000183062.a.a.b.b.a ##32 ENSGT00390000013995.b.b.l ##33 ENSGT00940000155915.a Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 399 ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT00940000175224 ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000178181 ENSGT00940000153525.i.a ENSGT00390000008708 #12 ENSGT00940000154098.a.f ##13 ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000158636 ENSGT00940000158792 Acanthomorphata DUPLICATION Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000168203 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000158636 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000170627 ENSGT00940000158636 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 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ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000170627 ENSGT00940000158636 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a 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Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000165059.B.a #8 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000155533.d.r ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000170627 ENSGT00940000158636 ENSGT00940000158792 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 20 chchd3b (ENSORLG00000003836) #9 slc35b4 (ENSORLG00000003802) #10 golt1bb 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ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00990000208084 ENSGT00940000168203 ENSGT00390000013995.b.b.l ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000063735.b #7 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT01100000263518.C ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000167414.e ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00990000208084 ENSGT00940000168203 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000170627 Fugu MODERN SPECIES 21 ENSTRUG00000024331 #7 ASB13 (ENSTRUG00000028781) NET1 (ENSTRUG00000016882) ENSTRUG00000016881 #9 slc35b4 (ENSTRUG00000016876) #10 golt1bb (ENSTRUG00000016875) #11 ldhbb (ENSTRUG00000016868) tmpob (ENSTRUG00000028971) #13 pthlhb (ENSTRUG00000016866) #14 ENSTRUG00000033461 ENSTRUG00000029325 #16 KCNA1 (ENSTRUG00000016864) #17 CNOT4 (ENSTRUG00000016861) #18 zgc:136858 (ENSTRUG00000016859) #19 ENSTRUG00000016855 ##21 ENSTRUG00000016854 ##21 bpgm (ENSTRUG00000016853) #24 ENSTRUG00000023529 tnnt2d (ENSTRUG00000016845) #25 dnm1l (ENSTRUG00000016834) #26 ENSTRUG00000022853 #30 ENSTRUG00000016812 CNTN1 (ENSTRUG00000016799) PDZRN4 (ENSTRUG00000016792) #32 GXYLT1 (ENSTRUG00000016788) YAF2 (ENSTRUG00000016786) ##33 ENSTRUG00000023687 #34 prickle1a (ENSTRUG00000016783) #36 ENSTRUG00000023125 ADAMTS20 (ENSTRUG00000016748) irak4 (ENSTRUG00000025150) Tetraodon MODERN SPECIES 4 CDK17 (ENSTNIG00000016012) CAMK1D (ENSTNIG00000016011) dhtkd1 (ENSTNIG00000016010) ENSTNIG00000016009 taf3 (ENSTNIG00000016008) ASB13 (ENSTNIG00000016007) NET1 (ENSTNIG00000016006) slc35b4 (ENSTNIG00000016005) #10 ldhbb (ENSTNIG00000016004) tmpob (ENSTNIG00000016003) #13 pthlhb (ENSTNIG00000016002) #14 KCNA1 (ENSTNIG00000016001) #17 CNOT4 (ENSTNIG00000016000) #18 zgc:136858 (ENSTNIG00000015999) #19 ENSTNIG00000000259 ##21 ENSTNIG00000015998 ##21 bpgm (ENSTNIG00000015997) #24 ENSTNIG00000015996 tnnt2d (ENSTNIG00000015995) #25 dnm1l (ENSTNIG00000015994) #26 ENSTNIG00000015993 #30 ENSTNIG00000015992 CNTN1 (ENSTNIG00000015991) PDZRN4 (ENSTNIG00000015990) #32 GXYLT1 (ENSTNIG00000015989) YAF2 (ENSTNIG00000015988) ##33 ENSTNIG00000015987 ENSTNIG00000015986 prickle1a (ENSTNIG00000015985) #36 ADAMTS20 (ENSTNIG00000015984) irak4 (ENSTNIG00000015983) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a.f #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00990000208084 ENSGT00940000168203 ENSGT00390000013995.b.b.l ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 Ballan wrasse MODERN SPECIES 15 slc35b4 (ENSLBEG00000010300) #10 golt1bb 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#26 dnajb9a (ENSGACG00000004142) #27 ENSGACG00000004140 #30 CNTN1 (ENSGACG00000004129) PDZRN4 (ENSGACG00000004122) #32 GXYLT1 (ENSGACG00000004112) YAF2 (ENSGACG00000004103) ##33 ENSGACG00000004099 ENSGACG00000004098 prickle1a (ENSGACG00000004088) #36 ADAMTS20 (ENSGACG00000004063) irak4 (ENSGACG00000004050) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a.f #31 ENSGT00940000155915.a 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(ENSCGOG00000020003) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a.f #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000170627 ENSGT00940000158636 Gilthead seabream MODERN SPECIES 22 NET1 (ENSSAUG00010010076) ENSSAUG00010010519 #9 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ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 446 tes (ENSHCOG00000016055) cav2 (ENSHCOG00000016026) cav1 (ENSHCOG00000000452) met (ENSHCOG00000016015) ENSHCOG00000000450 st7 (ENSHCOG00000015979) ENSHCOG00000015945 cftr (ENSHCOG00000015934) ENSHCOG00000015882 asz1 (ENSHCOG00000000444) wnt2 (ENSHCOG00000015861) CNOT4 (ENSHCOG00000015815) #18 zgc:136858 (ENSHCOG00000015773) #19 ENSHCOG00000015709 ENSHCOG00000015702 #21 ENSHCOG00000015660 ##21 ENSHCOG00000015652 ##21 bpgm (ENSHCOG00000015648) #24 ENSHCOG00000015641 tnnt2d (ENSHCOG00000015570) #25 ENSHCOG00000015552 ##26 dnajb9a (ENSHCOG00000015547) #27 PNPLA8 (ENSHCOG00000015537) #30 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 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#22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a 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(ENSTRUG00000016783) #36 ENSTRUG00000023125 ADAMTS20 (ENSTRUG00000016748) Tetraodon MODERN SPECIES 4 elk3 (ENSTNIG00000016013) CDK17 (ENSTNIG00000016012) CAMK1D (ENSTNIG00000016011) dhtkd1 (ENSTNIG00000016010) ENSTNIG00000016009 taf3 (ENSTNIG00000016008) ASB13 (ENSTNIG00000016007) NET1 (ENSTNIG00000016006) slc35b4 (ENSTNIG00000016005) #10 ldhbb (ENSTNIG00000016004) tmpob (ENSTNIG00000016003) #13 pthlhb (ENSTNIG00000016002) #14 KCNA1 (ENSTNIG00000016001) #17 CNOT4 (ENSTNIG00000016000) #18 zgc:136858 (ENSTNIG00000015999) #19 ENSTNIG00000000259 ##21 ENSTNIG00000015998 ##21 bpgm (ENSTNIG00000015997) #24 ENSTNIG00000015996 tnnt2d (ENSTNIG00000015995) #25 dnm1l (ENSTNIG00000015994) #26 ENSTNIG00000015993 #30 ENSTNIG00000015992 CNTN1 (ENSTNIG00000015991) PDZRN4 (ENSTNIG00000015990) #32 GXYLT1 (ENSTNIG00000015989) YAF2 (ENSTNIG00000015988) ##33 ENSTNIG00000015987 ENSTNIG00000015986 prickle1a (ENSTNIG00000015985) #36 ADAMTS20 (ENSTNIG00000015984) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 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##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a.f #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000170627 Pike perch MODERN SPECIES 6 ASB13 (ENSSLUG00000017185) NET1 (ENSSLUG00000017249) ENSSLUG00000018072 #9 slc35b4 (ENSSLUG00000018079) #10 golt1bb (ENSSLUG00000018091) #11 ENSSLUG00000018100 ldhbb (ENSSLUG00000018108) tmpob (ENSSLUG00000018115) #13 pthlhb (ENSSLUG00000018119) #14 KCNA1 (ENSSLUG00000018123) #17 CNOT4 (ENSSLUG00000018127) #18 zgc:136858 (ENSSLUG00000018154) #19 ENSSLUG00000018174 #20 tnni4a (ENSSLUG00000018184) #21 ENSSLUG00000018187 ENSSLUG00000018191 ##21 ENSSLUG00000018197 #22 ENSSLUG00000018200 ##21 bpgm (ENSSLUG00000018205) #24 tnnt2d 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ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a.f #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 Gilthead seabream MODERN SPECIES 22 ENSSAUG00010010062 #7 ASB13 (ENSSAUG00010010064) NET1 (ENSSAUG00010010076) ENSSAUG00010010519 #9 slc35b4 (ENSSAUG00010010522) #10 golt1bb (ENSSAUG00010010527) #11 ldhbb (ENSSAUG00010010530) tmpob (ENSSAUG00010010532) #13 PTHrP (ENSSAUG00010010533) #14 ENSSAUG00010010534 #16 KCNA1 (ENSSAUG00010010536) #17 CNOT4 (ENSSAUG00010010539) #18 zgc:136858 (ENSSAUG00010010549) #19 ENSSAUG00010010551 #20 tnni4a (ENSSAUG00010010554) #21 ENSSAUG00010010556 ##21 ENSSAUG00010010558 #22 ENSSAUG00010010600 ##21 bpgm (ENSSAUG00010010602) #24 ENSSAUG00010010603 sTnT2 (ENSSAUG00010010604) #25 dnm1l (ENSSAUG00010010614) #26 dnajb9a (ENSSAUG00010010717) #27 ENSSAUG00010010719 #30 ENSSAUG00010011084 CNTN1 (ENSSAUG00010023482) PDZRN4 (ENSSAUG00010024511) #32 GXYLT1 (ENSSAUG00010024512) YAF2 (ENSSAUG00010024514) ##33 YAF2 (ENSSAUG00010024515) ##33 ENSSAUG00010024516 #34 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a.f #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a 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Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 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##30 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419 #31 ENSGT00940000155915.b ENSGT00950000183062.a.a.b.b.a ##32 ENSGT00390000013995.b.b.l ##33 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00390000013347.a ENSGT00940000155659.i ENSGT00940000160513.c ENSGT00550000075044 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT00950000182926.a.t #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b #25 ENSGT00940000155504.g #26 ENSGT00940000156246 #27 ENSGT00940000154738.a.q.b #30 ENSGT00940000155419.b #31 ENSGT00940000155915.b ENSGT00950000183062.a.a.b.b.a.a ##32 ENSGT00940000156242.c.b ENSGT00390000013995.b.b.l ##33 ENSGT00730000111061 ENSGT00940000157529.h #36 ENSGT00940000158636.c ENSGT00530000063554.b P. kingsleyae MODERN SPECIES 277 mdfic (ENSPKIG00000011284) foxp2 (ENSPKIG00000011260) ENSPKIG00000011225 gpr85 (ENSPKIG00000011194) ifrd1 (ENSPKIG00000011125) DOCK4 (ENSPKIG00000011039) ENSPKIG00000011004 LRRN3 (ENSPKIG00000010996) immp2l (ENSPKIG00000010962) ENSPKIG00000010928 ENSPKIG00000010896 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(ENSSFOG00015005067) ##32 gxylt1b (ENSSFOG00015005096) yaf2 (ENSSFOG00015005138) ##33 zcrb1 (ENSSFOG00015005150) PRICKLE1 (ENSSFOG00015005176) #36 ADAMTS20 (ENSSFOG00015005220) pus7l (ENSSFOG00015005598) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 827 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000178181 ENSGT00940000153525.i.a ENSGT00390000008708 #12 ENSGT00940000154098.a.f ##13 ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 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ENSGT01010000222986.a ENSGT00390000014700.b.a.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915.e #10 ENSGT00390000014507.a.a.h #11 ENSGT00940000153525.i.b.f ENSGT00390000008708.a.b #12 ENSGT00940000154098.a.e.i #13 ENSGT00390000004933.k.b.d #14 ENSGT00940000160916 #15 ENSGT00940000164299.b.b.a #16 ENSGT00940000158576.a.b.a #17 ENSGT00390000000068.a.b.d #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.g #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT00950000182926.a.o #24 ENSGT00940000154709.a.b.b.c.c #25 ENSGT00940000155504.k.a.c #26 ENSGT00940000156246.c.a.c #27 ENSGT00940000154738.a.q.c #30 ENSGT00940000155419.c.a.h #31 ENSGT00940000155915.a.d ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.f #32 ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.a #33 ENSGT00390000016228.a.b.b #34 ENSGT00940000157529.i.a.f #36 ENSGT01010000222986.a ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000159763.o ENSGT00940000157816.a.a.a Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915.e #10 ENSGT00390000014507.a.a.h #11 ENSGT00390000008708.a.b #12 ENSGT00940000154098.a.e.i #13 ENSGT00390000004933.k.b.d #14 ENSGT00940000160916 #15 ENSGT00940000164299.b.b.a #16 ENSGT00940000158576.a.b.a #17 ENSGT00390000000068.a.b.d #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.g #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT00950000182926.a.o #24 ENSGT00940000154709.a.b.b.c.c #25 ENSGT00940000155504.k.a.c #26 ENSGT00940000156246.c.a.c #27 ENSGT00940000154738.a.q.c #30 ENSGT00940000155419.c.a.h #31 ENSGT00940000155915.a.d ENSGT01080000258033.b ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.f #32 ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.a #33 ENSGT00390000016228.a.b.b #34 ENSGT00940000157529.i.a.f #36 ENSGT01010000222986.a ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000159763.o Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915.e #10 ENSGT00390000014507.a.a.h #11 ENSGT00390000008708.a.b #12 ENSGT00940000154098.a.e.i #13 ENSGT00390000004933.k.b.d #14 ENSGT00940000160916 #15 ENSGT00940000164299.b.b.a #16 ENSGT00940000158576.a.b.a #17 ENSGT00390000000068.a.b.d #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.g #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT00950000182926.a.o #24 ENSGT00940000154709.a.b.b.c.c #25 ENSGT00940000155504.k.a.c #26 ENSGT00940000156246.c.a.c #27 ENSGT00940000154738.a.q.c #30 ENSGT00940000155419.c.a.h #31 ENSGT00940000155915.a.d ENSGT01080000258033.b ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.f #32 ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.a #33 ENSGT00390000016228.a.b.b #34 ENSGT00940000157529.i.a.f #36 ENSGT01010000222986.a ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000157816.a.a.a Chinook salmon MODERN SPECIES 10 ENSOTSG00005002727 #8 chchd3b (ENSOTSG00005002714) #9 slc35b4 (ENSOTSG00005002559) 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(ENSCCRG00000065628) ENSCCRG00000039975 ENSCCRG00000081808 adal (ENSCCRG00000047193) cplx3a (ENSCCRG00000063843) csk (ENSCCRG00000040243) edc3 (ENSCCRG00000072553) ENSCCRG00000081903 Golden-line barbel MODERN SPECIES 30 zgc:171459 (ENSSGRG00000050037) zgc:113426 (ENSSGRG00000050035) mxg (ENSSGRG00000049977) zgc:101783 (ENSSGRG00000049975) ENSSGRG00000049974 ENSSGRG00000049973 GRAMD4 (ENSSGRG00000049972) kcna6a (ENSSGRG00000049971) ##17 KCNA1 (ENSSGRG00000049969) #17 tmem178ba (ENSSGRG00000049967) CNOT4 (ENSSGRG00000049881) #18 zgc:136858 (ENSSGRG00000049879) #19 ENSSGRG00000049878 tnni4b.2 (ENSSGRG00000049876) #23 ENSSGRG00000049833 #22 ENSSGRG00000049830 #23 bpgm (ENSSGRG00000049828) #24 tnnt2d (ENSSGRG00000049789) #25 DNM1L (ENSSGRG00000049324) #26 dnajb9a (ENSSGRG00000049321) #27 ENSSGRG00000049320 CHST8 (ENSSGRG00000049319) kctd15a (ENSSGRG00000049318) CPLX3 (ENSSGRG00000049316) csk (ENSSGRG00000049064) kxd1 (ENSSGRG00000049053) edc3 (ENSSGRG00000049052) ergic2 (ENSSGRG00000048832) ENSSGRG00000048828 MAGI2 (ENSSGRG00000048416) gnaia (ENSSGRG00000048356) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 197 ENSGT00640000091774.a.c.b.b ENSGT00940000164201.c.b.b.b ENSGT00940000164201.c.b.a.e.a ENSGT00940000164201.c.b.a.e.b.a ENSGT00950000183004.a.b.b.b ENSGT00510000047522.d.b ENSGT00940000159839.d.b.b ENSGT00390000010968.a.b ENSGT00940000158576.b ##17 ENSGT00940000158576.a.b.f #17 ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e.a ENSGT00390000000068.a.b.a #18 ENSGT00390000007427.a #19 ENSGT00940000165644.e ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.n.a #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a.b #23 ENSGT00950000182926.a.r #24 ENSGT00940000153901.a.a.a.b ENSGT00940000154709.a.b.b.c.f #25 ENSGT00940000155504.j.a #26 ENSGT00940000156246.c.a.b #27 ENSGT00390000011620.b.e.h.a ENSGT00940000159496.l.b ENSGT00940000159100.h.b ENSGT00950000183113.b.a ENSGT00940000157431.c.a.a ENSGT00390000016435.e Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000164201.c.b.a.e.a.a ENSGT00940000164201.c.b.a.e.b.a 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SPECIES 139 ENSGT00940000158686.d ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000159839.d.b ENSGT00390000010968.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.b #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a #23 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000175224 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504 #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000155025.A ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00530000063554.a ENSGT00940000160061 ENSGT00950000183194.a.a Denticle herring MODERN SPECIES 8 ENSDCDG00000032966 GRAMD4 (ENSDCDG00000033039) ENSDCDG00000033134 #16 KCNA1 (ENSDCDG00000033135) #17 tmem178ba (ENSDCDG00000033136) CNOT4 (ENSDCDG00000033138) #18 ENSDCDG00000033146 ENSDCDG00000033148 ENSDCDG00000033149 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ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000175224 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504 #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000155025.A ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00530000063554.a Atlantic herring MODERN SPECIES 19 faxdc2 (ENSCHAG00000012360) ruvbl2 (ENSCHAG00000012194) ENSCHAG00000012164 atp2b1b (ENSCHAG00000006419) gtse1 (ENSCHAG00000006220) ENSCHAG00000004490 GRAMD4 (ENSCHAG00000002310) ENSCHAG00000002221 #16 KCNA1 (ENSCHAG00000002201) #17 tmem178ba (ENSCHAG00000002185) CNOT4 (ENSCHAG00000002097) #18 ENSCHAG00000002073 ENSCHAG00000002049 zgc:136858 (ENSCHAG00000001892) #19 ENSCHAG00000001832 #21 tnni4b.2 (ENSCHAG00000001623) #23 ENSCHAG00000001241 #22 bpgm (ENSCHAG00000001141) #24 ENSCHAG00000001093 tnnt2d (ENSCHAG00000000865) #25 dnm1l (ENSCHAG00000027213) #26 dnajb9a (ENSCHAG00000027196) #27 ENSCHAG00000027195 ENSCHAG00000027160 #30 NRCAM (ENSCHAG00000024494) #31 CNTN1 (ENSCHAG00000022843) PDZRN4 (ENSCHAG00000022707) #32 ENSCHAG00000022702 GXYLT1 (ENSCHAG00000022694) pus7 (ENSCHAG00000021961) hdac10 (ENSCHAG00000021810) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT01060000248530.C ENSGT00390000013963 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000155480.d ENSGT00940000157682.B.a ENSGT01090000260145 ENSGT00890000139436.B ENSGT00390000010382 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010852 ENSGT00390000013347.a ENSGT00940000155659 ENSGT00550000075044 ENSGT00940000160513 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000153901.a.a.b ENSGT00940000154709.a.b.b #25 ENSGT00940000155504 #26 ENSGT00940000156246 #27 ENSGT00940000164630 ENSGT01050000244882.b.d ENSGT00940000154738.a.r ##30 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419 #31 ENSGT00940000155915.b ENSGT00950000183062.a.a.b.b.a ##32 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a ENSGT01030000235325 ENSGT01060000248530.C.d ENSGT00950000182981.b.f.a.c.b ENSGT00390000013963 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000155480.d ENSGT00940000157682.B.a ENSGT01090000260145 ENSGT00890000139436.B ENSGT00390000005941.c ENSGT00390000013347.a ENSGT00940000155659 ENSGT00940000160513.a ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT00940000153901.a.a.b ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##25 ENSGT00940000155504 #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000158636 ENSGT00940000158792 ENSGT00530000063868.b Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000178181 ENSGT00940000153525.i.a ENSGT00390000008708 #12 ENSGT00940000154098.a.f ##13 ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a #23 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00390000011239.j ENSGT00940000155529.B ENSGT00390000004094 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b ENSGT00940000166253 ENSGT00390000018424 ENSGT00390000002796 ENSGT00940000157659 ENSGT00940000158094 ENSGT00940000155659 ENSGT00940000160513.a ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT00940000153901.a.a.b ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##25 ENSGT00940000155504.k.b ##26 ENSGT00940000156246.c.b ##27 ENSGT00940000165554 ENSGT00940000159918.a.a ENSGT00940000177041 ENSGT00940000162902 ENSGT00940000156443 ENSGT00390000013963 ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a.c ENSGT00400000022095.a ENSGT00640000091917 ENSGT00980000198695 ENSGT00550000076278 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 468 ENSGT00940000156858.b ENSGT00390000002417 ENSGT00940000158160.j.a ENSGT00390000011239.j.a ENSGT00940000155529.B.c ENSGT00390000004094.i ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b.d ENSGT00940000166253.e ENSGT00390000018424 ENSGT00390000002796.ib.a ENSGT00940000157659.d ENSGT00940000158094.eb ENSGT00940000155659.e.b ENSGT00940000155659.e.a.b ENSGT00940000160513.a.c ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.a.a ##21 ENSGT00940000153901.a.a.b.c.a ENSGT00940000154709.a.b.b.d.h.a.b ##25 ENSGT00940000155504.k.b.a ##26 ENSGT00940000156246.c.b.c ##27 ENSGT00940000165554.b ENSGT00940000159918.a.a.c Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153456.b.a.bb.a.a ENSGT00940000156858.b ENSGT00940000158160.j.a ENSGT00390000011239.j.a ENSGT00940000155529.B.c ENSGT00390000004094.i ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b.d ENSGT00940000166253.e ENSGT00390000018424 ENSGT00390000002796.ib.a ENSGT00940000157659.d ENSGT00940000158094.eb ENSGT00940000155659.e.a.b ENSGT00940000155659.e.b ENSGT00940000160513.a.c ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.a.a ##21 ENSGT00940000153901.a.a.b.c.a ENSGT00940000154709.a.b.b.d.h.a.b ##25 ENSGT00940000155504.k.b.a ##26 ENSGT00940000156246.c.b.c ##27 ENSGT00940000165554.b ENSGT00940000159918.a.a.c ENSGT00940000162902.l.b ENSGT00940000156443.r ENSGT00390000013963.j ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a.c.b ENSGT00400000022095.a.e ENSGT00640000091917 ENSGT00980000198695 ENSGT00550000076278 ENSGT00940000153272.a.b.d.g Salmo ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT01030000234637.a.b.p 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ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000063735.b #7 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 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(ENSHCOG00000015934) ENSHCOG00000015882 asz1 (ENSHCOG00000000444) wnt2 (ENSHCOG00000015861) CNOT4 (ENSHCOG00000015815) #18 zgc:136858 (ENSHCOG00000015773) #19 ENSHCOG00000015709 ENSHCOG00000015702 #21 ENSHCOG00000015660 ##21 ENSHCOG00000015652 ##21 bpgm (ENSHCOG00000015648) #24 ENSHCOG00000015641 tnnt2d (ENSHCOG00000015570) #25 ENSHCOG00000015552 ##26 dnajb9a (ENSHCOG00000015547) #27 PNPLA8 (ENSHCOG00000015537) #30 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 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(ENSMAMG00000023185) #27 ENSMAMG00000023184 #30 NRCAM (ENSMAMG00000023183) #31 CNTN1 (ENSMAMG00000023182) PDZRN4 (ENSMAMG00000023181) #32 YAF2 (ENSMAMG00000023180) PPHLN1 (ENSMAMG00000023178) #34 PRICKLE1 (ENSMAMG00000023177) #36 ENSMAMG00000023176 ADAMTS20 (ENSMAMG00000023175) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000063735.b #7 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 17 ENSBSLG00000020231 #7 ASB13 (ENSBSLG00000020278) NET1 (ENSBSLG00000020297) ENSBSLG00000020430 #9 slc35b4 (ENSBSLG00000020433) #10 golt1bb (ENSBSLG00000020450) #11 ENSBSLG00000020456 ldhbb (ENSBSLG00000020458) tmpob (ENSBSLG00000020475) #13 pthlhb (ENSBSLG00000020476) #14 ENSBSLG00000020479 #16 KCNA1 (ENSBSLG00000020481) #17 CNOT4 (ENSBSLG00000020482) #18 zgc:136858 (ENSBSLG00000020493) #19 ENSBSLG00000020505 #20 tnni4a (ENSBSLG00000020512) #21 ENSBSLG00000020517 ##21 ENSBSLG00000020526 ##21 bpgm (ENSBSLG00000020529) #24 CALD1 (ENSBSLG00000020532) tnnt2d (ENSBSLG00000020535) #25 dnm1l (ENSBSLG00000020578) #26 dnajb9a (ENSBSLG00000020854) #27 PNPLA8 (ENSBSLG00000020857) #30 NRCAM (ENSBSLG00000020914) #31 CNTN1 (ENSBSLG00000024323) PDZRN4 (ENSBSLG00000024471) #32 GXYLT1 (ENSBSLG00000024478) YAF2 (ENSBSLG00000024491) ##33 PPHLN1 (ENSBSLG00000024499) #34 prickle1a (ENSBSLG00000024530) #36 Climbing perch MODERN SPECIES 19 ENSATEG00000017254 #7 ENSATEG00000017329 ENSATEG00000017353 chchd3b (ENSATEG00000017382) #9 slc35b4 (ENSATEG00000017404) #10 golt1bb (ENSATEG00000017434) #11 ENSATEG00000028717 ldhbb (ENSATEG00000017453) tmpob (ENSATEG00000017483) #13 pthlhb (ENSATEG00000017497) #14 ENSATEG00000017517 #16 ENSATEG00000017560 #17 ENSATEG00000017580 #18 zgc:136858 (ENSATEG00000017671) #19 ENSATEG00000028067 #20 ENSATEG00000017735 #21 ENSATEG00000017758 ##21 ENSATEG00000017792 ##21 bpgm (ENSATEG00000017809) #24 ENSATEG00000017824 tnnt2d (ENSATEG00000017875) #25 dnm1l (ENSATEG00000018248) #26 dnajb9a (ENSATEG00000025169) #27 ENSATEG00000018329 #30 ENSATEG00000018349 CNTN1 (ENSATEG00000018430) PDZRN4 (ENSATEG00000018448) #32 GXYLT1 (ENSATEG00000018487) YAF2 (ENSATEG00000028697) ##33 PPHLN1 (ENSATEG00000027966) #34 PRICKLE1 (ENSATEG00000018535) #36 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160326.d 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#11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00950000182857.a.a.b.b ENSGT00390000007126 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000162649.f.b.d ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 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SPECIES 5 ENSGT00530000063735.b #7 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000159286.a.a ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a.a ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000156246.c.a #27 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063735.b #7 ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g 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(ENSOSIG00000023063) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160326.d ENSGT00940000155849.g ENSGT00390000000903.a.j #9 ENSGT00390000002915 #10 ENSGT00390000014507.a.a #11 ENSGT00940000177912 ENSGT00940000153525.i.b ENSGT00940000154098.a.e #13 ENSGT00390000004933.k.b #14 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000164299.b.b #16 ENSGT00940000158576.a.b #17 ENSGT00390000000068.a.b #18 ENSGT00390000007427 #19 ENSGT00940000159018.d #20 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #22 ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000175224 ENSGT00940000154709.a.b.b.c #25 ENSGT00940000155504.k.a #26 ENSGT00940000154738.a.q #30 ENSGT00940000155419.c.a #31 ENSGT00940000155915.a ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.c #32 ENSGT00940000156242.c.a ENSGT00390000013995.b.b.k.b ##33 ENSGT00390000016228.a.b #34 ENSGT00940000157529.i.a #36 ENSGT00940000170627 Indian medaka MODERN SPECIES 15 taf3 (ENSOMEG00000011560) ENSOMEG00000011532 #7 ASB13 (ENSOMEG00000011447) 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(ENSMMDG00005022017) slc25a3b (ENSMMDG00005022022) #12 tmpob (ENSMMDG00005022032) #13 pthlhb (ENSMMDG00005022033) #14 ENSMMDG00005022038 #16 KCNA1 (ENSMMDG00005022042) #17 CNOT4 (ENSMMDG00005022049) #18 zgc:136858 (ENSMMDG00005022097) #19 ENSMMDG00005022105 #20 tnni4a (ENSMMDG00005022107) #21 ENSMMDG00005000116 ##21 ENSMMDG00005000125 #22 ENSMMDG00005000128 ##21 bpgm (ENSMMDG00005000142) #24 tnnt2d (ENSMMDG00005000172) #25 dnm1l (ENSMMDG00005000248) #26 dnajb9a (ENSMMDG00005000306) #27 ENSMMDG00005000313 #30 NRCAM (ENSMMDG00005000496) #31 CNTN1 (ENSMMDG00005001022) PDZRN4 (ENSMMDG00005001054) #32 GXYLT1 (ENSMMDG00005001060) YAF2 (ENSMMDG00005001063) ##33 PPHLN1 (ENSMMDG00005001065) #34 prickle1a (ENSMMDG00005001069) #36 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 286 ENSGT00980000198695 ENSGT00640000091917 ENSGT00400000022095.a ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a ENSGT00390000013963 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000155480.d ENSGT00940000157682.B.a ENSGT01090000260145 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arl1 (ENSIPUG00000013834) UTP20 (ENSIPUG00000013717) SLC5A8 (ENSIPUG00000013614) lyrm5a (ENSIPUG00000013599) tmem209 (ENSIPUG00000013541) ahcyl2 (ENSIPUG00000013498) strip2 (ENSIPUG00000013388) ENSIPUG00000013372 cd9b (ENSIPUG00000013348) ENSIPUG00000013339 ano2b (ENSIPUG00000013298) ENSIPUG00000013287 ntf3 (ENSIPUG00000013282) tbc1d30 (ENSIPUG00000013150) Channel catfish MODERN SPECIES 27 lrrn3 (ENSIPUG00000006757) immp2l (ENSIPUG00000006732) ENSIPUG00000006715 atp2b1b (ENSIPUG00000006615) zgc:171459 (ENSIPUG00000006601) zgc:113426 (ENSIPUG00000006587) ENSIPUG00000006567 ENSIPUG00000006537 GRAMD4 (ENSIPUG00000006473) ENSIPUG00000006451 #16 KCNA1 (ENSIPUG00000006446) ##17 tmem178ba (ENSIPUG00000006428) cnot4 (ENSIPUG00000006393) #18 zgc:136858 (ENSIPUG00000006339) #19 ENSIPUG00000006327 ENSIPUG00000006305 #21 tnni4b.2 (ENSIPUG00000006254) #23 ENSIPUG00000006229 #22 ENSIPUG00000006197 #23 bpgm (ENSIPUG00000006178) #24 ENSIPUG00000006161 tnnt2d (ENSIPUG00000006128) #25 dnm1l 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ENSPNAG00000005186 #20 ENSPNAG00000020311 #21 tnni4b.2 (ENSPNAG00000020281) #23 ENSPNAG00000020275 #22 ENSPNAG00000020254 #23 bpgm (ENSPNAG00000020232) #24 ENSPNAG00000020214 tnnt2d (ENSPNAG00000020179) #25 dnm1l (ENSPNAG00000020017) #26 dnajb9a (ENSPNAG00000019951) #27 ENSPNAG00000019924 kctd15a (ENSPNAG00000019793) CHST8 (ENSPNAG00000019778) adal (ENSPNAG00000019774) cplx3a (ENSPNAG00000003608) csk (ENSPNAG00000019720) edc3 (ENSPNAG00000019657) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00390000001775.B ENSGT01030000234852 ENSGT00940000155834.i.a ENSGT00940000157129.f.a ENSGT00940000156375 ENSGT00940000159404 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000155480.d ENSGT00940000157682.B.a ENSGT01090000260145 ENSGT00890000139436.B ENSGT00390000005941.c ENSGT00390000013347.a ENSGT00940000155659.g ENSGT00940000160513.a ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT00940000153901.a.a.b ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##25 ENSGT00940000155118 ENSGT00390000016813 ENSGT00940000155166.A ENSGT00390000001810.b 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carp reference MODERN SPECIES 37 ENSCCRG00000060954 ENSCCRG00000061754 ENSCCRG00000058370 ENSCCRG00000000127 ENSCCRG00000073340 ENSCCRG00000015905 ENSCCRG00000059214 ENSCCRG00000014579 ENSCCRG00000060223 ENSCCRG00000038683 kcna6a (ENSCCRG00000080457) ##17 ENSCCRG00000067113 #17 tmem178ba (ENSCCRG00000050586) ENSCCRG00000038798 #18 zgc:136858 (ENSCCRG00000038805) #19 ENSCCRG00000038912 #21 bpgm (ENSCCRG00000058627) #24 ENSCCRG00000038889 #26 ENSCCRG00000081197 tnnt2d (ENSCCRG00000063735) #25 dnajb9a (ENSCCRG00000076246) #27 ENSCCRG00000017402 kctd15a (ENSCCRG00000051449) ENSCCRG00000072019 adal (ENSCCRG00000040220) csk (ENSCCRG00000046713) edc3 (ENSCCRG00000040375) ergic2 (ENSCCRG00000015617) ENSCCRG00000076015 gnaia (ENSCCRG00000046884) ENSCCRG00000046877 Goldfish MODERN SPECIES 17 ENSCARG00000012786 ENSCARG00000012807 ENSCARG00000012829 ENSCARG00000012834 ENSCARG00000012847 ENSCARG00000012852 ENSCARG00000012871 zgc:101783 (ENSCARG00000012876) ENSCARG00000012881 ENSCARG00000012918 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Atlantic herring MODERN SPECIES 7 atp23 (ENSCHAG00000004901) tdrd9 (ENSCHAG00000002181) ENSCHAG00000002119 ttll12 (ENSCHAG00000001935) tfec (ENSCHAG00000001890) mdfic (ENSCHAG00000001867) foxp2 (ENSCHAG00000001700) ENSCHAG00000001675 gpr85 (ENSCHAG00000001657) tmem168a (ENSCHAG00000001632) ENSCHAG00000001589 ENSCHAG00000001572 ifrd1 (ENSCHAG00000000859) dock4b (ENSCHAG00000025982) LRRN3 (ENSCHAG00000025932) tnni4a (ENSCHAG00000025931) #21 ENSCHAG00000025913 tnnt2e (ENSCHAG00000025894) ##25 recql (ENSCHAG00000025656) golt1ba (ENSCHAG00000025646) ##11 spx (ENSCHAG00000025633) gys2 (ENSCHAG00000025612) ENSCHAG00000025606 LDHB (ENSCHAG00000025589) slc25a3a (ENSCHAG00000025575) #12 tmpoa (ENSCHAG00000025573) ##13 strap (ENSCHAG00000025561) ETNK1 (ENSCHAG00000025552) ENSCHAG00000025547 sox5 (ENSCHAG00000024830) bcat1 (ENSCHAG00000024785) Atlantic herring MODERN SPECIES 19 zgc:101783 (ENSCHAG00000012388) faxdc2 (ENSCHAG00000012360) ruvbl2 (ENSCHAG00000012194) ENSCHAG00000012164 atp2b1b 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ENSDCDG00000033158 #21 ENSDCDG00000033159 #22 ENSDCDG00000033161 #22 ENSDCDG00000033162 #22 tnni4b.2 (ENSDCDG00000033163) #23 bpgm (ENSDCDG00000033165) #24 CALD1 (ENSDCDG00000033169) tnnt2d (ENSDCDG00000033173) #25 dnm1l (ENSDCDG00000033194) #26 dnajb9a (ENSDCDG00000033272) #27 ENSDCDG00000012665 ENSDCDG00000012785 #30 ENSDCDG00000013496 #31 CNTN1 (ENSDCDG00000027377) ENSDCDG00000027473 PDZRN4 (ENSDCDG00000027474) #32 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 262 ENSGT00940000157682.B.a.b ENSGT00890000139436.B ENSGT00390000010382 ENSGT00390000005941 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000155659.j ENSGT00940000160513.d ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #21 ENSGT00950000182926.a.s #24 ENSGT00940000153901.a.a.b ENSGT00940000155504.h #26 ENSGT00940000164630 ENSGT00940000158600 ENSGT00940000158917.b ENSGT00940000155486.b ENSGT00950000183205.b.a.b.a.b ENSGT00390000016138 ENSGT00940000157255.c.b ENSGT00940000165903 ENSGT00810000125439.B.c.a.b ENSGT00940000158636.d ENSGT00940000157033.h ENSGT00730000110905.b.cb Asian bonytongue MODERN SPECIES 11 zc3hc1 (ENSSFOG00015003667) ube2h (ENSSFOG00015030643) nrf1 (ENSSFOG00015003725) ahcyl2b (ENSSFOG00015003733) ENSSFOG00015025216 tmem209 (ENSSFOG00015003806) tfec (ENSSFOG00015003909) mdfic (ENSSFOG00015003924) foxp2 (ENSSFOG00015028287) ENSSFOG00015004031 gpr85 (ENSSFOG00015028854) ifrd1 (ENSSFOG00015004065) DOCK4 (ENSSFOG00015004127) immp2l (ENSSFOG00015004251) LRRN3 (ENSSFOG00015004288) tnni4a (ENSSFOG00015029160) #21 tnni4b.2 (ENSSFOG00015004323) #23 BPGM (ENSSFOG00015025855) #24 ENSSFOG00015004354 tnnt2e (ENSSFOG00015004428) #25 dnm1l (ENSSFOG00015004634) #26 dnajb9a (ENSSFOG00015026036) #27 PNPLA8 (ENSSFOG00015004728) #30 NRCAM (ENSSFOG00015004774) #31 cntn1b (ENSSFOG00015004987) pdzrn4 (ENSSFOG00015005067) ##32 gxylt1b (ENSSFOG00015005096) yaf2 (ENSSFOG00015005138) ##33 zcrb1 (ENSSFOG00015005150) PRICKLE1 (ENSSFOG00015005176) #36 ADAMTS20 (ENSSFOG00015005220) P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 277 mdfic (ENSPKIG00000011284) foxp2 (ENSPKIG00000011260) ENSPKIG00000011225 gpr85 (ENSPKIG00000011194) ifrd1 (ENSPKIG00000011125) DOCK4 (ENSPKIG00000011039) ENSPKIG00000011004 LRRN3 (ENSPKIG00000010996) immp2l (ENSPKIG00000010962) ENSPKIG00000010928 ENSPKIG00000010896 #21 tnni4b.2 (ENSPKIG00000010867) #23 BPGM (ENSPKIG00000010857) #24 CALD1 (ENSPKIG00000010762) tnnt2e (ENSPKIG00000010693) #25 dnm1l (ENSPKIG00000010643) #26 dnajb9a (ENSPKIG00000010622) #27 ENSPKIG00000010599 #30 NRCAM (ENSPKIG00000010362) #31 cntn1b (ENSPKIG00000010270) P. kingsleyae MODERN SPECIES 98 ENSPKIG00000000812 ASCL4 (ENSPKIG00000000847) prdm4 (ENSPKIG00000000875) cpa4 (ENSPKIG00000000906) tfec (ENSPKIG00000000953) foxp2 (ENSPKIG00000000998) ENSPKIG00000001022 ENSPKIG00000001050 ENSPKIG00000001062 gpr85 (ENSPKIG00000001070) bmt2 (ENSPKIG00000001087) tmem168a (ENSPKIG00000001106) znf277 (ENSPKIG00000001137) DOCK4 (ENSPKIG00000001298) LRRN3 (ENSPKIG00000001382) ENSPKIG00000001406 #21 bpgm (ENSPKIG00000001444) #24 ENSPKIG00000001488 dnm1l (ENSPKIG00000001634) #26 ENSPKIG00000001801 ANO4 (ENSPKIG00000001879) slc38a4 (ENSPKIG00000002099) slc38a2 (ENSPKIG00000002207) SCAF11 (ENSPKIG00000002269) arid2 (ENSPKIG00000002325) ENSPKIG00000002368 ENSPKIG00000002415 NELL2 (ENSPKIG00000002558) ENSPKIG00000002630 ENSPKIG00000002721 nots (ENSPKIG00000003042) Spotted gar MODERN SPECIES 237 tnni4b.2 (ENSLOCG00000000803) #21 bpgm (ENSLOCG00000000860) #24 CALD1 (ENSLOCG00000000883) tnnt2d (ENSLOCG00000000913) #25 dnm1l (ENSLOCG00000000949) #26 dnajb9a (ENSLOCG00000001014) #27 ENSLOCG00000001060 ENSLOCG00000001076 PNPLA8 (ENSLOCG00000001102) #30 nrcama (ENSLOCG00000001143) #31 cntn1b (ENSLOCG00000001255) ENSLOCG00000001323 pdzrn4 (ENSLOCG00000001340) #32 gxylt1b (ENSLOCG00000001360) yaf2 (ENSLOCG00000001370) #33 zcrb1 (ENSLOCG00000001409) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157821 ENSGT00390000010229 ENSGT00940000153414.A ENSGT00940000159401 ENSGT00390000006865 ENSGT00940000160161 ENSGT00940000164299 #16 ENSGT00940000158576 #17 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155083.a ENSGT00940000156000 ENSGT01030000234588.b.b.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.a #21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a ENSGT00940000159750 ENSGT00940000154814.b ENSGT00940000156403.b ENSGT00940000155197 ENSGT00390000007878 ENSGT00940000158916 ENSGT00390000011980.a ENSGT00940000153908.a ENSGT00940000159982 ENSGT00940000159950 ENSGT00940000155728 ENSGT00510000048519 ENSGT01080000257336.b.e.b.a.b.b Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000160821 ENSGT00940000157821 ENSGT00390000010229 ENSGT00940000153414.A ENSGT00940000159401 ENSGT00390000006865 ENSGT00940000160161 ENSGT00940000164299 #16 ENSGT00940000158576 #17 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155083.a ENSGT00940000156000 ENSGT01030000234588.b.b.b.a #21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a ENSGT00940000159750 ENSGT00940000154814.b ENSGT00940000156403.b ENSGT00940000155197 ENSGT00390000007878 ENSGT00940000158916 ENSGT00390000011980.a ENSGT00940000153908.a ENSGT00940000159982 ENSGT00940000159950 ENSGT00940000155728 ENSGT00510000048519 ENSGT01030000234874 Anura ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000013337 ENSGT00530000064023 ENSGT00390000006865 ENSGT00940000164299 #16 ENSGT00940000158576 #17 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155083.a ENSGT00940000156000 ENSGT01030000234588.b.b.b.a #21 ENSGT00950000182926.a #24 ENSGT00940000153901.a.a ENSGT00940000163509.b ENSGT00940000158509 ENSGT00390000002110 ENSGT00620000088064 ENSGT00390000000080.a.b ENSGT00940000157328.C ENSGT00940000159577 ENSGT00940000161111 ENSGT00390000006633.a ENSGT00940000156690 ENSGT00390000011576.b ENSGT00390000010054.a ENSGT00440000033329.a.a.a Frog MODERN SPECIES 3 sap30l (ENSXETG00000034608) galnt10 (ENSXETG00000008481) ENSXETG00000043354 rmnd1 (ENSXETG00000026520) armt1 (ENSXETG00000035782) ndufa9 (ENSXETG00000008484) kcna6 (ENSXETG00000008488) #16 kcna1 (ENSXETG00000048960) #17 kcna5 (ENSXETG00000008493) ENSXETG00000042315 ENSXETG00000041412 ntf3 (ENSXETG00000008495) ano2 (ENSXETG00000008496) vwf (ENSXETG00000023591) cd9 (ENSXETG00000023609) tnni1.2 (ENSXETG00000023613) #21 bpgm (ENSXETG00000023616) #24 ENSXETG00000041577 cald1 (ENSXETG00000023618) havcr1 (ENSXETG00000026528) sgcd (ENSXETG00000039919) ENSXETG00000037566 ENSXETG00000044379 mrpl22 (ENSXETG00000019403) gemin5 (ENSXETG00000019404) ccdc69 (ENSXETG00000019409) gm2a (ENSXETG00000040972) ENSXETG00000049352 ENSXETG00000040181 ENSXETG00000042567 slc36a1 (ENSXETG00000019424) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 6 ENSLLEG00000009507 ENSLLEG00000009481 ENSLLEG00000009470 KCNA1 (ENSLLEG00000009448) #17 ENSLLEG00000009430 NTF3 (ENSLLEG00000009399) ENSLLEG00000009336 ENSLLEG00000009245 ENSLLEG00000009234 ENSLLEG00000009172 ENSLLEG00000009133 VWF (ENSLLEG00000007361) ENSLLEG00000007170 ENSLLEG00000007138 CWF19L1 (ENSLLEG00000006695) ENSLLEG00000006606 #21 BPGM (ENSLLEG00000006580) #24 ENSLLEG00000006563 CALD1 (ENSLLEG00000005885) ENSLLEG00000005787 ENSLLEG00000005775 SGCD (ENSLLEG00000005708) ENSLLEG00000005686 ENSLLEG00000005673 MRPL22 (ENSLLEG00000005595) GEMIN5 (ENSLLEG00000005303) CNOT8 (ENSLLEG00000005260) ENSLLEG00000005235 LARP1 (ENSLLEG00000005153) ENSLLEG00000005129 HAND1 (ENSLLEG00000005115) Elephant shark MODERN SPECIES 1604 ENSCMIG00000012702 ENSCMIG00000012701 zgc:154077 (ENSCMIG00000012699) ENSCMIG00000012697 ENSCMIG00000012692 ndufa9 (ENSCMIG00000012667) ENSCMIG00000012655 #16 KCNA1 (ENSCMIG00000012654) #17 KCNA5 (ENSCMIG00000012652) ntf3 (ENSCMIG00000012649) ano2b (ENSCMIG00000012617) VWF (ENSCMIG00000012486) cd9 (ENSCMIG00000012373) cwf19l1 (ENSCMIG00000012296) ENSCMIG00000012262 ##21 tnni4a (ENSCMIG00000012259) #21 bpgm (ENSCMIG00000012257) #24 CALD1 (ENSCMIG00000012255) ENSCMIG00000012249 #25 si:cabz01085950.1 (ENSCMIG00000012246) ENSCMIG00000012244 PTPRO (ENSCMIG00000012157) eps8a (ENSCMIG00000012069) strap (ENSCMIG00000012009) dera (ENSCMIG00000011884) SLC15A5 (ENSCMIG00000011848) mgst1.1 (ENSCMIG00000011845) lmo3 (ENSCMIG00000011829) arhgef39 (ENSCMIG00000011819) ENSCMIG00000011806 rergla (ENSCMIG00000011798) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.a #21 Lamprey MODERN SPECIES 6080 ENSPMAG00000005378 #21 Chordata DUPLICATION Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 615 ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00390000017767.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00940000158477 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00940000156574.C ENSGT00390000009899.a.d ENSGT00940000167440 ENSGT00390000009663 ENSGT00940000165046 ENSGT00940000159464 ENSGT00390000014700.b.a.a 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ENSGT00390000011067.B ENSGT00390000001368.p ENSGT00940000155200.ec.a ENSGT00940000158339.a ENSGT00390000011116.j ENSGT00390000011116.i.a ENSGT00530000065415.b ENSGT00940000155871.k.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.a ##21 ENSGT00940000167812.d ENSGT00940000158477.b ENSGT00950000182959.b.a.a.b ENSGT00920000149457.a ENSGT00950000183002.A.c ENSGT00940000156626.w.b ENSGT00990000203615.a.a.a.b.f ENSGT01050000244956.a.a.n.b ENSGT00940000160004.f.a ENSGT00940000156870.bb.b.a ENSGT00940000159535.h ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159.a ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 198 hexa (ENSSGRG00000039143) pkp3a (ENSSGRG00000039111) sigirr (ENSSGRG00000039109) ENSSGRG00000039108 dynlrb2 (ENSSGRG00000039107) FBXO31 (ENSSGRG00000039106) ENSSGRG00000039103 ENSSGRG00000039102 pdcd2l (ENSSGRG00000039101) ENSSGRG00000039100 ENSSGRG00000039099 kras 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SPECIES 160 ENSSDUG00000000249 znf277 (ENSSDUG00000000239) LRRN3 (ENSSDUG00000000228) immp2l (ENSSDUG00000000205) amfra (ENSSDUG00000000125) pdcd2l (ENSSDUG00000000081) ENSSDUG00000017439 DUS2 (ENSSDUG00000017399) SLC7A10 (ENSSDUG00000017375) faap24 (ENSSDUG00000017353) ENSSDUG00000017304 dldh (ENSSDUG00000017239) SYT8 (ENSSDUG00000017190) ENSSDUG00000017175 ENSSDUG00000017137 tnni2a.1 (ENSSDUG00000017118) ##21 tnni2a.2 (ENSSDUG00000017108) ##21 ENSSDUG00000017101 TNNI2 (ENSSDUG00000017087) ##21 TNNI2 (ENSSDUG00000017072) ##21 TNNI2 (ENSSDUG00000017051) ##21 TNNI2 (ENSSDUG00000017036) ##21 ENSSDUG00000016991 ENSSDUG00000016965 ENSSDUG00000016941 tnnt3a (ENSSDUG00000016913) myod1 (ENSSDUG00000016886) zgc:172145 (ENSSDUG00000016873) ENSSDUG00000016853 CACNA2D4 (ENSSDUG00000016797) ENSSDUG00000016707 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2635 ENSSLDG00000010199 TNNI2 (ENSSLDG00000010145) ##21 tnni2a.2 (ENSSLDG00000010121) ##21 ENSSLDG00000010097 ENSSLDG00000010087 ENSSLDG00000010065 Barramundi perch MODERN SPECIES 31 IQUB (ENSLCAG00010000189) ENSLCAG00010013451 slc13a1 (ENSLCAG00010013405) CADPS2 (ENSLCAG00010013231) fezf1 (ENSLCAG00010013213) aass (ENSLCAG00010013014) PTPRZ1 (ENSLCAG00010012605) ENSLCAG00010012479 ENSLCAG00010012477 ENSLCAG00010012473 dldh (ENSLCAG00010012352) SYT8 (ENSLCAG00010012305) ENSLCAG00010012295 tnni2a.2 (ENSLCAG00010012290) ##21 TNNI2 (ENSLCAG00010012275) ##21 TNNI2 (ENSLCAG00010012249) ##21 TNNI2 (ENSLCAG00010012232) ##21 ENSLCAG00010012229 ENSLCAG00010012227 ENSLCAG00010012223 tnnt3a (ENSLCAG00010012221) myod1 (ENSLCAG00010012215) zgc:172145 (ENSLCAG00010012212) CACNA2D4 (ENSLCAG00010012209) LRTM2 (ENSLCAG00010012207) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b Turbot MODERN SPECIES 1 hyal6 (ENSSMAG00000002043) wasla (ENSSMAG00000002064) lmod2a (ENSSMAG00000002140) ASB15 (ENSSMAG00000002167) ASB15 (ENSSMAG00000002199) IQUB (ENSSMAG00000002231) slc13a1 (ENSSMAG00000002260) ENSSMAG00000002312 CADPS2 (ENSSMAG00000020348) fezf1 (ENSSMAG00000025856) aass (ENSSMAG00000020423) PTPRZ1 (ENSSMAG00000020456) ENSSMAG00000021503 ENSSMAG00000005976 SYT8 (ENSSMAG00000006038) tnni2a.1 (ENSSMAG00000032761) ##21 tnni2a.2 (ENSSMAG00000006098) ##21 TNNI2 (ENSSMAG00000006177) ##21 TNNI2 (ENSSMAG00000006211) ##21 ENSSMAG00000006237 ENSSMAG00000006257 tnnt3a (ENSSMAG00000006288) ENSSMAG00000023239 ENSSMAG00000028689 ENSSMAG00000032749 ENSSMAG00000022264 ENSSMAG00000030166 ENSSMAG00000036791 ENSSMAG00000023873 smpd3 (ENSSMAG00000002332) ENSSMAG00000002348 Tongue sole DUPLICATION Tongue sole MODERN SPECIES 193 ENSCSEG00000006876 ##21 Tongue sole MODERN SPECIES 16 OAZ2 (ENSCSEG00000001923) ppib (ENSCSEG00000001927) adpgk (ENSCSEG00000001935) ENSCSEG00000001946 exoc3l1 (ENSCSEG00000001976) ENSCSEG00000001985 KIF21A (ENSCSEG00000001988) ENSCSEG00000002001 ANO1 (ENSCSEG00000002014) ENSCSEG00000002069 ENSCSEG00000002072 smpd3 (ENSCSEG00000002076) ENSCSEG00000002089 septin15 (ENSCSEG00000002096) ENSCSEG00000002121 tnni2a.1 (ENSCSEG00000002133) ##21 tnni2a.2 (ENSCSEG00000002138) ##21 TNNI2 (ENSCSEG00000002145) ##21 TNNI2 (ENSCSEG00000002164) ##21 TNNI2 (ENSCSEG00000002169) ##21 ENSCSEG00000002173 ENSCSEG00000002176 ENSCSEG00000002189 ENSCSEG00000002191 tnnt3a (ENSCSEG00000002198) myod1 (ENSCSEG00000002233) zgc:172145 (ENSCSEG00000002238) CACNA2D4 (ENSCSEG00000002252) LRTM2 (ENSCSEG00000002266) PEAK1 (ENSCSEG00000002269) syt12 (ENSCSEG00000002273) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 Tetraodon MODERN SPECIES 4 ENSTNIG00000000465 ANKRD27 (ENSTNIG00000010417) TMED6 (ENSTNIG00000010418) MLKL (ENSTNIG00000010419) RFWD3 (ENSTNIG00000010420) ENSTNIG00000010421 ENSTNIG00000018798 ENSTNIG00000000428 ENSTNIG00000004682 CACNA2D4 (ENSTNIG00000004494) LRTM2 (ENSTNIG00000004493) SLC7A10 (ENSTNIG00000004495) dldh (ENSTNIG00000004496) ENSTNIG00000004497 ENSTNIG00000002815 tnni2a.1 (ENSTNIG00000002814) ##21 tnni2a.2 (ENSTNIG00000002813) ##21 ENSTNIG00000002812 ##21 ENSTNIG00000001405 ##21 TNNI2 (ENSTNIG00000002811) ##21 ENSTNIG00000002810 ##21 ENSTNIG00000000204 tnnt3a (ENSTNIG00000002809) myod1 (ENSTNIG00000002808) DUS2 (ENSTNIG00000005616) Fugu MODERN SPECIES 21 spon1b (ENSTRUG00000031973) ENSTRUG00000030903 ENSTRUG00000026214 ENSTRUG00000028935 ENSTRUG00000031663 ENSTRUG00000032661 ccnd2a (ENSTRUG00000001816) ENSTRUG00000032400 ENSTRUG00000028185 DUS2 (ENSTRUG00000022441) SLC7A10 (ENSTRUG00000033356) ENSTRUG00000032988 dldh (ENSTRUG00000016659) SYT8 (ENSTRUG00000016657) ENSTRUG00000027114 tnni2a.1 (ENSTRUG00000022759) ##21 tnni2a.2 (ENSTRUG00000016644) ##21 ENSTRUG00000016632 ##21 ENSTRUG00000033030 ##21 ENSTRUG00000027588 ##21 ENSTRUG00000027670 ENSTRUG00000030147 tnnt3a (ENSTRUG00000016614) myod1 (ENSTRUG00000016609) LRTM2 (ENSTRUG00000029534) ENSTRUG00000016565 urahb (ENSTRUG00000021342) ENSTRUG00000030677 GLG1 (ENSTRUG00000016546) RFWD3 (ENSTRUG00000016541) TMED6 (ENSTRUG00000016539) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a Ballan wrasse MODERN SPECIES 74 wasla (ENSLBEG00000003825) lmod2a (ENSLBEG00000003853) ASB15 (ENSLBEG00000003875) ASB15 (ENSLBEG00000003921) IQUB (ENSLBEG00000003961) slc13a1 (ENSLBEG00000004005) CADPS2 (ENSLBEG00000004036) fezf1 (ENSLBEG00000004119) aass (ENSLBEG00000004152) ENSLBEG00000004277 ENSLBEG00000004441 ENSLBEG00000004466 dldh (ENSLBEG00000004489) SYT8 (ENSLBEG00000004542) ENSLBEG00000004567 tnni2a.1 (ENSLBEG00000004589) ##21 tnni2a.2 (ENSLBEG00000004628) ##21 TNNI2 (ENSLBEG00000004663) ##21 TNNI2 (ENSLBEG00000004685) ##21 TNNI2 (ENSLBEG00000004709) ##21 TNNI2 (ENSLBEG00000004734) ##21 ENSLBEG00000004756 ENSLBEG00000004792 tnnt3a (ENSLBEG00000004820) myod1 (ENSLBEG00000004859) zgc:172145 (ENSLBEG00000004893) CACNA2D4 (ENSLBEG00000004912) LRTM2 (ENSLBEG00000004951) ENSLBEG00000004962 ENSLBEG00000004986 urahb (ENSLBEG00000005026) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 161 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 European seabass MODERN SPECIES 19 ENSDLAG00005012875 ENSDLAG00005032060 ENSDLAG00005033208 SLC10A7 (ENSDLAG00005015389) ENSDLAG00005015413 ENSDLAG00005027879 ENSDLAG00005018653 ENSDLAG00005003124 ENSDLAG00005027593 ENSDLAG00005016966 ENSDLAG00005026858 ENSDLAG00005014942 ENSDLAG00005030743 ENSDLAG00005031818 ENSDLAG00005018756 tnni2a.1 (ENSDLAG00005018746) ##21 tnni2a.2 (ENSDLAG00005032524) ##21 TNNI2 (ENSDLAG00005029433) ##21 TNNI2 (ENSDLAG00005018667) ##21 ENSDLAG00005018661 ENSDLAG00005018639 ENSDLAG00005032620 tnnt3a (ENSDLAG00005018610) myod1 (ENSDLAG00005018589) zgc:172145 (ENSDLAG00005018584) ENSDLAG00005018579 ENSDLAG00005017494 ENSDLAG00005017692 ENSDLAG00005034798 ENSDLAG00005017462 GLG1 (ENSDLAG00005015126) Large yellow croaker MODERN SPECIES 492 hyal6 (ENSLCRG00005001078) wasla (ENSLCRG00005022134) lmod2a (ENSLCRG00005022129) ASB15 (ENSLCRG00005022127) ASB15 (ENSLCRG00005022123) IQUB (ENSLCRG00005022117) slc13a1 (ENSLCRG00005022115) CADPS2 (ENSLCRG00005020853) fezf1 (ENSLCRG00005020826) aass (ENSLCRG00005020281) ENSLCRG00005020261 dldh (ENSLCRG00005020243) SYT8 (ENSLCRG00005020234) tnni2a.2 (ENSLCRG00005020228) ##21 tnni2a.4 (ENSLCRG00005020224) ##21 TNNI2 (ENSLCRG00005020221) ##21 ENSLCRG00005020217 ENSLCRG00005020216 ENSLCRG00005020214 tnnt3a (ENSLCRG00005020211) myod1 (ENSLCRG00005020205) zgc:172145 (ENSLCRG00005020203) LRTM2 (ENSLCRG00005020201) CACNA2D4 (ENSLCRG00005020194) ENSLCRG00005020191 urahb (ENSLCRG00005020189) ENSLCRG00005020187 GLG1 (ENSLCRG00005019420) RFWD3 (ENSLCRG00005019395) MLKL (ENSLCRG00005019391) ENSLCRG00005019390 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000164138 ENSGT00940000157859.a.b ENSGT01030000234534.B.a.b.a.a ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 Channel bull blenny MODERN SPECIES 20 ENSCGOG00000009995 znf277 (ENSCGOG00000009736) LRRN3 (ENSCGOG00000009712) immp2l (ENSCGOG00000009694) ENSCGOG00000009688 ENSCGOG00000009676 pdcd2l (ENSCGOG00000009673) ENSCGOG00000009670 ENSCGOG00000009667 DUS2 (ENSCGOG00000009109) ENSCGOG00000009096 ENSCGOG00000009092 dldh (ENSCGOG00000008107) ENSCGOG00000008073 SLC7A10 (ENSCGOG00000007383) tnni2a.1 (ENSCGOG00000007358) ##21 ENSCGOG00000007345 tnni2a.2 (ENSCGOG00000007341) ##21 TNNI2 (ENSCGOG00000007334) ##21 TNNI2 (ENSCGOG00000007324) ##21 TNNI2 (ENSCGOG00000007317) ##21 TNNI2 (ENSCGOG00000007312) ##21 ENSCGOG00000007305 ENSCGOG00000007292 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ENSACIG00000014805 ##21 ENSACIG00000014797 ENSACIG00000014781 tnnt3a (ENSACIG00000014612) myod1 (ENSACIG00000014400) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 340 ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 700 ENSKMAG00000003293 ENSKMAG00000003282 ENSKMAG00000003254 ##21 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1623 ENSNFUG00015004909 dldh (ENSNFUG00015004817) ENSNFUG00015004770 ENSNFUG00015017402 PTPRZ1 (ENSNFUG00015017375) ENSNFUG00015017364 AASS (ENSNFUG00015016246) fezf1 (ENSNFUG00015016152) ENSNFUG00015016148 ENSNFUG00015016146 CADPS2 (ENSNFUG00015013246) slc13a1 (ENSNFUG00015012971) IQUB (ENSNFUG00015012926) ASB15 (ENSNFUG00015012906) ENSNFUG00015012893 tnni2a.1 (ENSNFUG00015012880) ##21 TNNI2 (ENSNFUG00015012847) ##21 BX004812.1 (ENSNFUG00015012831) ENSNFUG00015012822 TNNT3A (ENSNFUG00015012775) ENSNFUG00015012762 ANO1 (ENSNFUG00015011844) ENSNFUG00015011772 ENSNFUG00015011757 ENSNFUG00015011747 ENSNFUG00015011739 ripor1 (ENSNFUG00015011725) ctcf (ENSNFUG00015011705) ENSNFUG00015011697 carmil2 (ENSNFUG00015011647) RIC8A (ENSNFUG00015011583) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000159477 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00940000161262.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00390000008931 ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00390000010852 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012715.e ENSGT00390000016075 ENSGT00940000156476.h ENSGT00940000159477 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00940000161262.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00390000008931 ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00390000010852 Indian medaka MODERN SPECIES 15 ENSOMEG00000019701 tnni2a.1 (ENSOMEG00000019735) ##21 tnni2a.2 (ENSOMEG00000019778) ##21 TNNI2 (ENSOMEG00000019805) ##21 TNNI2 (ENSOMEG00000019856) ##21 ENSOMEG00000019864 ENSOMEG00000019976 tnnt3a (ENSOMEG00000020063) myod1 (ENSOMEG00000020091) CACNA2D4 (ENSOMEG00000000936) ENSOMEG00000020139 ENSOMEG00000020159 RFWD3 (ENSOMEG00000020218) GLG1 (ENSOMEG00000020401) ENSOMEG00000020438 urahb (ENSOMEG00000020448) ENSOMEG00000020489 Javanese ricefish MODERN SPECIES 20 ENSOJAG00000006245 mpi (ENSOJAG00000006219) scamp2 (ENSOJAG00000006200) fezf1 (ENSOJAG00000006167) slc13a1 (ENSOJAG00000005938) IQUB (ENSOJAG00000005813) hyal6 (ENSOJAG00000005777) HYAL4 (ENSOJAG00000005762) ENSOJAG00000005647 GPR37 (ENSOJAG00000005638) pot1 (ENSOJAG00000005624) grm8b (ENSOJAG00000004853) CHST1 (ENSOJAG00000004747) dldh (ENSOJAG00000003976) SYT8 (ENSOJAG00000003818) tnni2a.1 (ENSOJAG00000003772) ##21 TNNI2 (ENSOJAG00000003725) ##21 TNNI2 (ENSOJAG00000003627) ##21 ENSOJAG00000003599 ENSOJAG00000003563 ENSOJAG00000003546 tnnt3a (ENSOJAG00000003454) myod1 (ENSOJAG00000003402) ENSOJAG00000003382 RFWD3 (ENSOJAG00000003173) GLG1 (ENSOJAG00000002985) ENSOJAG00000002895 urahb (ENSOJAG00000002909) ENSOJAG00000002852 znf277 (ENSOJAG00000002400) DUS2 (ENSOJAG00000002235) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT01030000234858 ENSGT00940000160892 ENSGT00550000074844 ENSGT00940000161262.b ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b.cb.a ENSGT00390000018285 ENSGT01100000263518.B.b.b.a ENSGT01020000230364.a.a.b.a.y.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00390000008931 ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00390000010852 Chinese medaka MODERN SPECIES 142 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ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01020000230364.a.a.b.b.f ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ENSGT00550000074844.jb.a ENSGT00940000157682.B.b.a ENSGT00940000160974.b.c.g.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##21 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000167812.e ENSGT00940000158477.a.b.c ENSGT00950000182959.b.a.b.c ENSGT00920000149457.c ENSGT00940000155997.lb.b.u ENSGT00940000157572.a.b.c ENSGT00940000160625.r.a.b ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ENSGT00390000008931.g ENSGT00390000016453.n.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01020000230364.a.a.b.b.f ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ENSGT00550000074844.jb.a ENSGT00940000157682.B.b.a ENSGT00940000160974.b.c.g.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##21 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000167812.e ENSGT00940000158477.a.b.c ENSGT00950000182959.b.a.b.c ENSGT00920000149457.c ENSGT00940000157572.a.b.c ENSGT00940000155997.lb.b.u ENSGT00940000160625.r.a.b ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ENSGT00390000008931.g ENSGT00390000016453.n.a Coho salmon MODERN SPECIES 14 WASL (ENSOKIG00005032174) ENSOKIG00005032154 ##35 lmod2a (ENSOKIG00005032140) ENSOKIG00005032117 IQUB (ENSOKIG00005032040) CADPS2 (ENSOKIG00005031265) fezf1 (ENSOKIG00005031170) ENSOKIG00005031137 PTPRZ1 (ENSOKIG00005028335) ENSOKIG00005028191 dldh 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ENSOMYG00000072615 ENSOMYG00000049946 MLKL (ENSOMYG00000019863) ENSOMYG00000019902 Salmo ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ENSGT00550000074844.jb.a ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.b ENSGT00940000157682.B.b.a ENSGT00940000160974.b.c.g.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.a ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812.e ENSGT00940000158477.a.b.c ENSGT00950000182959.b.a.b.c ENSGT00920000149457.c ENSGT00940000157572.a.b.c ENSGT00940000155997.lb.b.u ENSGT00940000160625.r.a.b ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 1 HYAL4 (ENSSSAG00000078037) hyal6 (ENSSSAG00000078041) wasl (ENSSSAG00000078048) lmod2 (ENSSSAG00000078108) IQUB (ENSSSAG00000078117) CADPS2 (ENSSSAG00000078300) ENSSSAG00000109161 fezf1 (ENSSSAG00000080179) ptprz1 (ENSSSAG00000080236) ENSSSAG00000080505 ENSSSAG00000112377 ENSSSAG00000080540 drd4a (ENSSSAG00000080543) ENSSSAG00000080545 SYT8 (ENSSSAG00000055269) tnni2a.1 (ENSSSAG00000080550) ##21 tnni2a.2 (ENSSSAG00000080555) ##21 TNNI2 (ENSSSAG00000115245) ##21 TNNI2 (ENSSSAG00000080558) ##21 ENSSSAG00000110670 ENSSSAG00000080568 ENSSSAG00000102688 TNNT3 (ENSSSAG00000080578) myod1c (ENSSSAG00000080596) ENSSSAG00000111233 zgc:172145 (ENSSSAG00000080600) ENSSSAG00000080628 ENSSSAG00000096889 ENSSSAG00000080771 ENSSSAG00000101363 GLG1 (ENSSSAG00000067039) River trout MODERN SPECIES 37 HYAL4 (ENSSTUG00000010474) hyal6 (ENSSTUG00000010465) ENSSTUG00000010453 lmod2a (ENSSTUG00000010448) ASB15 (ENSSTUG00000010383) ENSSTUG00000010308 IQUB (ENSSTUG00000010187) CADPS2 (ENSSTUG00000010148) fezf1 (ENSSTUG00000010110) dldh (ENSSTUG00000009461) ENSSTUG00000009267 ENSSTUG00000009265 drd4a (ENSSTUG00000009260) ENSSTUG00000009255 SYT8 (ENSSTUG00000009213) tnni2a.1 (ENSSTUG00000009183) ##21 tnni2a.2 (ENSSTUG00000009174) ##21 ENSSTUG00000009167 ENSSTUG00000009062 ##21 ENSSTUG00000009047 ENSSTUG00000009021 TNNT3 (ENSSTUG00000008984) MYOD1 (ENSSTUG00000008976) zgc:172145 (ENSSTUG00000008972) ENSSTUG00000008947 CACNA2D4 (ENSSTUG00000007981) ENSSTUG00000007788 ENSSTUG00000007769 GLG1 (ENSSTUG00000007510) RFWD3 (ENSSTUG00000007387) MLKL (ENSSTUG00000007277) Huchen MODERN SPECIES 544 ENSHHUG00000000310 tnni2a.1 (ENSHHUG00000000288) ##21 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000284) ##21 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000268) ##21 TNNI2 (ENSHHUG00000000259) ##21 TNNI2 (ENSHHUG00000000165) ##21 ENSHHUG00000000161 ENSHHUG00000000144 tnnt3b (ENSHHUG00000000132) MYOD1 (ENSHHUG00000000050) zgc:172145 (ENSHHUG00000000023) LRTM2 (ENSHHUG00000050722) CACNA2D4 (ENSHHUG00000050645) ENSHHUG00000050634 ENSHHUG00000050630 GLG1 (ENSHHUG00000050506) RFWD3 (ENSHHUG00000050492) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000165046.a ENSGT00940000161379 ENSGT00990000204217 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00390000014700.b.a.a ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b ENSGT00940000162463 ENSGT00940000164955.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 145 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c ENSGT00940000164955.b ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000164955.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.a.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000159916 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000016718 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000159916 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00390000016718 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b 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EIF3J (ENSDARG00000097988) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A.f ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b.d ENSGT00940000159535.i ENSGT00440000039564.a.b.i ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a ENSGT00940000164715.b ENSGT00940000160745.d Denticle herring MODERN SPECIES 8 LRRC56 (ENSDCDG00000031142) RASSF7 (ENSDCDG00000031144) ENSDCDG00000031146 irf7 (ENSDCDG00000031151) ascl1b (ENSDCDG00000031153) CES3 (ENSDCDG00000031156) pdcd2l (ENSDCDG00000031158) banp (ENSDCDG00000031160) ENSDCDG00000031164 kras (ENSDCDG00000031166) RASSF8 (ENSDCDG00000031168) ENSDCDG00000031170 SYT8 (ENSDCDG00000031171) ENSDCDG00000031173 tnni2a.1 (ENSDCDG00000031175) ##21 tnni2a.2 (ENSDCDG00000031178) ##21 ENSDCDG00000031179 ##21 ENSDCDG00000031186 ##21 TNNI2 (ENSDCDG00000005638) ##21 tnni2a.4 (ENSDCDG00000005740) ##21 ENSDCDG00000006819 ENSDCDG00000006877 MYOD1 (ENSDCDG00000006890) zgc:172145 (ENSDCDG00000006912) ush1c (ENSDCDG00000007075) abcc8 (ENSDCDG00000007647) kcnj11 (ENSDCDG00000007731) mob2a (ENSDCDG00000007735) dusp8a (ENSDCDG00000007781) ENSDCDG00000007814 OSBPL5 (ENSDCDG00000008088) Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ifit9 (ENSCHAG00000015560) ENSCHAG00000015577 ENSCHAG00000015724 ENSCHAG00000015739 ENSCHAG00000015753 ENSCHAG00000015784 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) ##21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) ##21 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) ##21 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) MYOD1 (ENSCHAG00000016826) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000164955.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000157682.B.b ENSGT00940000163706 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000164955.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.a.b ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453.m Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156938.e ENSGT00940000163421.a.d.a.a ENSGT00940000159150.ab ENSGT00940000155010.a ENSGT01010000223078 ENSGT00390000004417.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.b ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892.f ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01000000216979 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.a.a ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B.j Huchen MODERN SPECIES 889 ENSHHUG00000028029 ENSHHUG00000027755 SYT8 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ENSGT00940000157572.a.b.d ENSGT00940000160625.r.a.a ENSGT00390000011262.e.a.b.a ENSGT00390000008931.h ENSGT00390000016453.m ENSGT00940000163501 ENSGT00730000111305 ENSGT00940000154917.fb.b River trout MODERN SPECIES 33 fezf1 (ENSSTUG00000023090) aass (ENSSTUG00000019952) ENSSTUG00000019843 PTPRZ1 (ENSSTUG00000017658) dldh (ENSSTUG00000017505) ENSSTUG00000017492 ENSSTUG00000017480 ticam1 (ENSSTUG00000017476) BET1L (ENSSTUG00000017470) deaf1 (ENSSTUG00000017459) drd4a (ENSSTUG00000017447) ENSSTUG00000017421 ENSSTUG00000017149 SYT8 (ENSSTUG00000017135) tnni2a.1 (ENSSTUG00000017118) ##21 tnni2a.2 (ENSSTUG00000017106) ##21 ENSSTUG00000017036 ##21 ENSSTUG00000017023 tnnt3b (ENSSTUG00000016997) MYOD1 (ENSSTUG00000016988) zgc:172145 (ENSSTUG00000016985) ENSSTUG00000016981 LRTM2 (ENSSTUG00000016977) ENSSTUG00000015707 ENSSTUG00000013806 urahb (ENSSTUG00000013349) ENSSTUG00000013296 GLG1 (ENSSTUG00000012698) RFWD3 (ENSSTUG00000012610) MLKL (ENSSTUG00000012572) etfbkmt (ENSSTUG00000012566) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00590000083094.a.b.k.b ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.e.a ENSGT00940000155529.A.f ENSGT00550000074844.jb.b ENSGT00940000157682.B.b.b ENSGT00940000163706 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c.g.b ENSGT00940000164955.b ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892.f ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f ENSGT00940000158477.a.b.d ENSGT00950000182959.b.a.b.d ENSGT00920000149457.d ENSGT00940000155997.lb.b.v ENSGT00940000157572.a.b.d ENSGT00940000160625.r.a.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p ENSGT00390000011262.e.a.b.a ENSGT00390000008931.h ENSGT00390000016453.m Rainbow trout MODERN SPECIES 22 fezf1 (ENSOMYG00000042293) aass (ENSOMYG00000042455) PTPRZ1 (ENSOMYG00000044183) ENSOMYG00000044213 ENSOMYG00000053913 ENSOMYG00000044242 ENSOMYG00000051072 bet1l (ENSOMYG00000071324) deaf1 (ENSOMYG00000044258) drd4a (ENSOMYG00000044265) ENSOMYG00000044274 ENSOMYG00000044289 ENSOMYG00000070342 SYT8 (ENSOMYG00000044334) tnni2a.1 (ENSOMYG00000044342) ##21 ENSOMYG00000051621 ##21 ENSOMYG00000054158 ENSOMYG00000044366 TNNT3 (ENSOMYG00000044367) myod2 (ENSOMYG00000044372) zgc:172145 (ENSOMYG00000068802) ENSOMYG00000064959 ENSOMYG00000044396 ENSOMYG00000054081 ENSOMYG00000044518 urahb (ENSOMYG00000045245) ENSOMYG00000069462 ENSOMYG00000073315 GLG1 (ENSOMYG00000045338) ENSOMYG00000045422 MLKL (ENSOMYG00000045444) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00590000083094.a.b.k.b ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.e.a ENSGT00940000155529.A.f ENSGT00550000074844.jb.b ENSGT00940000157682.B.b.b ENSGT00940000163706 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c.g.b ENSGT00940000164955.b ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892.f ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f ENSGT00940000158477.a.b.d ENSGT00950000182959.b.a.b.d ENSGT00920000149457.d ENSGT00940000155997.lb.b.v ENSGT00940000157572.a.b.d ENSGT00940000160625.r.a.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p ENSGT00390000011262.e.a.b.a ENSGT00390000008931.h ENSGT00390000016453.m Coho salmon MODERN SPECIES 1 aass (ENSOKIG00005028706) PTPRZ1 (ENSOKIG00005031860) DLD (ENSOKIG00005032474) ENSOKIG00005032722 ENSOKIG00005032730 ticam1 (ENSOKIG00005032764) BET1L (ENSOKIG00005032895) deaf1 (ENSOKIG00005032919) drd4a (ENSOKIG00005032941) ENSOKIG00005032958 ENSOKIG00005032986 ENSOKIG00005032992 ENSOKIG00005033002 SYT8 (ENSOKIG00005033015) tnni2a.1 (ENSOKIG00005033031) ##21 tnni2a.2 (ENSOKIG00005033122) ##21 ENSOKIG00005033145 ##21 ENSOKIG00005033174 tnnt3b (ENSOKIG00005033212) MYOD1 (ENSOKIG00005033239) zgc:172145 (ENSOKIG00005033256) CACNA2D4 (ENSOKIG00005033316) LRTM2 (ENSOKIG00005034035) ENSOKIG00005034065 urahb (ENSOKIG00005034114) GLG1 (ENSOKIG00005034363) RFWD3 (ENSOKIG00005038361) MLKL (ENSOKIG00005038521) etfbkmt (ENSOKIG00005038535) amn1 (ENSOKIG00005038546) nfybb (ENSOKIG00005038602) Chinook salmon MODERN SPECIES CADPS2 (ENSOTSG00005000454) fezf1 (ENSOTSG00005000577) aass (ENSOTSG00005000626) PTPRZ1 (ENSOTSG00005007896) dldh (ENSOTSG00005008481) ENSOTSG00005009315 ENSOTSG00005009316 ticam1 (ENSOTSG00005009318) BET1L (ENSOTSG00005009320) deaf1 (ENSOTSG00005009322) drd4a (ENSOTSG00005009324) ENSOTSG00005009327 ENSOTSG00005009336 ENSOTSG00005009337 ENSOTSG00005009344 tnni2a.2 (ENSOTSG00005009347) ##21 TNNI2 (ENSOTSG00005009348) ##21 ENSOTSG00005009349 ENSOTSG00005009351 MYOD1 (ENSOTSG00005009353) zgc:172145 (ENSOTSG00005009354) CACNA2D4 (ENSOTSG00005009358) LRTM2 (ENSOTSG00005009493) ENSOTSG00005009504 urahb (ENSOTSG00005012417) GLG1 (ENSOTSG00005012421) RFWD3 (ENSOTSG00005014583) MLKL (ENSOTSG00005014585) etfbkmt (ENSOTSG00005014586) amn1 (ENSOTSG00005014587) ENSOTSG00005014589 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 519 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812.e ENSGT00940000158477.a.b.c ENSGT00950000182959.b.a.b.c ENSGT00920000149457.c ENSGT00940000157572.a.b.c ENSGT00940000155997.lb.b.u ENSGT00940000160625.r.a.b ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ENSGT00390000008931.g ENSGT00390000016453.n.b Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 544 ENSHHUG00000000310 tnni2a.1 (ENSHHUG00000000288) ##21 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000284) ##21 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000268) ##21 TNNI2 (ENSHHUG00000000259) ##21 TNNI2 (ENSHHUG00000000165) ##21 ENSHHUG00000000161 ENSHHUG00000000144 tnnt3b (ENSHHUG00000000132) MYOD1 (ENSHHUG00000000050) zgc:172145 (ENSHHUG00000000023) LRTM2 (ENSHHUG00000050722) CACNA2D4 (ENSHHUG00000050645) ENSHHUG00000050634 ENSHHUG00000050630 GLG1 (ENSHHUG00000050506) RFWD3 (ENSHHUG00000050492) Huchen MODERN SPECIES 544 ENSHHUG00000000310 tnni2a.1 (ENSHHUG00000000288) ##21 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000284) ##21 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000268) ##21 TNNI2 (ENSHHUG00000000259) ##21 TNNI2 (ENSHHUG00000000165) ##21 ENSHHUG00000000161 ENSHHUG00000000144 tnnt3b (ENSHHUG00000000132) MYOD1 (ENSHHUG00000000050) zgc:172145 (ENSHHUG00000000023) LRTM2 (ENSHHUG00000050722) CACNA2D4 (ENSHHUG00000050645) ENSHHUG00000050634 ENSHHUG00000050630 GLG1 (ENSHHUG00000050506) RFWD3 (ENSHHUG00000050492) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ENSGT00550000074844.jb.a ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.b 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ENSSSAG00000101363 GLG1 (ENSSSAG00000067039) ENSSSAG00000122167 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a.d.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ENSGT00550000074844.jb.a ENSGT00940000157682.B.b.a ENSGT00940000160974.b.c.g.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##21 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000167812.e ENSGT00940000158477.a.b.c ENSGT00950000182959.b.a.b.c ENSGT00920000149457.c ENSGT00940000155997.lb.b.u ENSGT00940000157572.a.b.c ENSGT00940000160625.r.a.b ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ENSGT00390000008931.g ENSGT00390000016453.n.a ENSGT00940000154917.fb.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01020000230364.a.b 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ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b 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ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.f ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b Seriola ANCESTRAL 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ENSSLDG00000010065 Greater amberjack MODERN SPECIES 160 znf277 (ENSSDUG00000000239) LRRN3 (ENSSDUG00000000228) immp2l (ENSSDUG00000000205) amfra (ENSSDUG00000000125) pdcd2l (ENSSDUG00000000081) ENSSDUG00000017439 DUS2 (ENSSDUG00000017399) SLC7A10 (ENSSDUG00000017375) faap24 (ENSSDUG00000017353) ENSSDUG00000017304 dldh (ENSSDUG00000017239) SYT8 (ENSSDUG00000017190) ENSSDUG00000017175 ENSSDUG00000017137 tnni2a.1 (ENSSDUG00000017118) ##21 tnni2a.2 (ENSSDUG00000017108) ##21 ENSSDUG00000017101 TNNI2 (ENSSDUG00000017087) ##21 TNNI2 (ENSSDUG00000017072) ##21 TNNI2 (ENSSDUG00000017051) ##21 TNNI2 (ENSSDUG00000017036) ##21 ENSSDUG00000016991 ENSSDUG00000016965 ENSSDUG00000016941 tnnt3a (ENSSDUG00000016913) myod1 (ENSSDUG00000016886) zgc:172145 (ENSSDUG00000016873) ENSSDUG00000016853 CACNA2D4 (ENSSDUG00000016797) ENSSDUG00000016707 urahb (ENSSDUG00000016691) Barramundi perch MODERN SPECIES 31 ASB15 (ENSLCAG00010000274) ASB15 (ENSLCAG00010000226) IQUB (ENSLCAG00010000189) ENSLCAG00010013451 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ENSCSEG00000002173 ENSCSEG00000002176 ENSCSEG00000002189 ENSCSEG00000002191 tnnt3a (ENSCSEG00000002198) myod1 (ENSCSEG00000002233) zgc:172145 (ENSCSEG00000002238) CACNA2D4 (ENSCSEG00000002252) LRTM2 (ENSCSEG00000002266) PEAK1 (ENSCSEG00000002269) syt12 (ENSCSEG00000002273) cat (ENSCSEG00000002281) Turbot MODERN SPECIES 1 wasla (ENSSMAG00000002064) lmod2a (ENSSMAG00000002140) ASB15 (ENSSMAG00000002167) ASB15 (ENSSMAG00000002199) IQUB (ENSSMAG00000002231) slc13a1 (ENSSMAG00000002260) ENSSMAG00000002312 CADPS2 (ENSSMAG00000020348) fezf1 (ENSSMAG00000025856) aass (ENSSMAG00000020423) PTPRZ1 (ENSSMAG00000020456) ENSSMAG00000021503 ENSSMAG00000005976 SYT8 (ENSSMAG00000006038) tnni2a.1 (ENSSMAG00000032761) ##21 tnni2a.2 (ENSSMAG00000006098) ##21 TNNI2 (ENSSMAG00000006177) ##21 TNNI2 (ENSSMAG00000006211) ##21 ENSSMAG00000006237 ENSSMAG00000006257 tnnt3a (ENSSMAG00000006288) ENSSMAG00000023239 ENSSMAG00000028689 ENSSMAG00000032749 ENSSMAG00000022264 ENSSMAG00000030166 ENSSMAG00000036791 ENSSMAG00000023873 smpd3 (ENSSMAG00000002332) ENSSMAG00000002348 septin15 (ENSSMAG00000002389) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a Zig-zag eel MODERN SPECIES 20 CADPS2 (ENSMAMG00000022799) fezf1 (ENSMAMG00000022795) aass (ENSMAMG00000022779) ENSMAMG00000022774 PTPRZ1 (ENSMAMG00000027911) ENSMAMG00000022767 ENSMAMG00000022758 ENSMAMG00000025915 ENSMAMG00000022762 ENSMAMG00000024786 ENSMAMG00000022760 ENSMAMG00000022756 SYT8 (ENSMAMG00000026620) ENSMAMG00000025933 tnni2a.1 (ENSMAMG00000022730) ##21 tnni2a.2 (ENSMAMG00000022728) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000028411) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000025267) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000022722) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000028574) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000024405) ##21 ENSMAMG00000026203 ENSMAMG00000025176 tnnt3a (ENSMAMG00000022716) myod1 (ENSMAMG00000025845) ENSMAMG00000022714 ENSMAMG00000022713 ENSMAMG00000022711 urahb (ENSMAMG00000022710) ENSMAMG00000025621 ENSMAMG00000022709 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b Siamese fighting fish MODERN SPECIES 17 deaf1 (ENSBSLG00000026455) drd4a (ENSBSLG00000026458) ENSBSLG00000026461 GRAMD4 (ENSBSLG00000026476) ENSBSLG00000026499 CERK (ENSBSLG00000026507) TAFA5 (ENSBSLG00000026512) brd1b (ENSBSLG00000026513) ftsj1 (ENSBSLG00000026514) ENSBSLG00000003773 ENSBSLG00000003875 ENSBSLG00000003923 ENSBSLG00000004129 ENSBSLG00000004149 tnni2a.1 (ENSBSLG00000004158) ##21 tnni2a.2 (ENSBSLG00000004174) ##21 TNNI2 (ENSBSLG00000004185) ##21 ENSBSLG00000004198 ##21 TNNI2 (ENSBSLG00000004211) ##21 ENSBSLG00000004751 ##21 ENSBSLG00000004764 ENSBSLG00000004780 ENSBSLG00000004819 tnnt3a (ENSBSLG00000004850) myod1 (ENSBSLG00000004886) CACNA2D4 (ENSBSLG00000005093) ENSBSLG00000005855 ENSBSLG00000005902 urahb (ENSBSLG00000005954) ENSBSLG00000006449 GLG1 (ENSBSLG00000006927) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01020000230364.a.b ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00940000157021 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000174622 ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234858 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ENSSPAG00000006936 ENSSPAG00000006900 CACNA2D4 (ENSSPAG00000005360) ENSSPAG00000005219 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000012498 ENSGT00940000158087 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000012498 ENSGT00940000158087 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ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 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mbuna MODERN SPECIES 1110 CMIP (ENSMZEG00005016284) GAN (ENSMZEG00005016250) ENSMZEG00005016243 foxl1 (ENSMZEG00005016238) kiaa0513 (ENSMZEG00005016224) slc13a1 (ENSMZEG00005016213) ENSMZEG00005016206 slc13a1 (ENSMZEG00005016201) ces3 (ENSMZEG00005016193) zfpm1 (ENSMZEG00005016182) ENSMZEG00005016163 dldh (ENSMZEG00005016147) SYT8 (ENSMZEG00005016137) ENSMZEG00005016129 tnni2a.1 (ENSMZEG00005016126) ##21 tnni2a.2 (ENSMZEG00005016116) ##21 TNNI2 (ENSMZEG00005016110) ##21 TNNI2 (ENSMZEG00005016101) ##21 TNNI2 (ENSMZEG00005016090) ##21 TNNI2 (ENSMZEG00005016082) ##21 TNNI2 (ENSMZEG00005016076) ##21 TNNI2 (ENSMZEG00005016067) ##21 ENSMZEG00005016060 ENSMZEG00005016057 ENSMZEG00005016053 ENSMZEG00005016049 tnnt3a (ENSMZEG00005016043) myod1 (ENSMZEG00005016037) LRTM2 (ENSMZEG00005016031) CACNA2D4 (ENSMZEG00005016019) ENSMZEG00005016011 P. nyererei MODERN SPECIES 524 dldh (ENSPNYG00000019274) SYT8 (ENSPNYG00000019335) ENSPNYG00000019407 tnni2a.1 (ENSPNYG00000019446) ##21 tnni2a.2 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ENSMMDG00005010949 tnnt3a (ENSMMDG00005010950) myod1 (ENSMMDG00005010952) zgc:172145 (ENSMMDG00005010974) CACNA2D4 (ENSMMDG00005010984) LRTM2 (ENSMMDG00005011155) ENSMMDG00005011190 urahb (ENSMMDG00005012437) acot19 (ENSMMDG00005012454) ENSMMDG00005012464 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00390000009663 ENSGT00940000165046.a ENSGT00940000161379 ENSGT00990000204217 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00390000014700.b.a.a.c ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.b ENSGT00940000162463 ENSGT00940000164955.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812.a ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000159916.d ENSGT00940000156870 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ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.f ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a Seriola ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000156482.c ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a.h ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00390000009456 ENSGT00420000029847 ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 Greater amberjack MODERN SPECIES 160 immp2l (ENSSDUG00000000205) amfra (ENSSDUG00000000125) pdcd2l (ENSSDUG00000000081) ENSSDUG00000017439 DUS2 (ENSSDUG00000017399) SLC7A10 (ENSSDUG00000017375) faap24 (ENSSDUG00000017353) ENSSDUG00000017304 dldh (ENSSDUG00000017239) SYT8 (ENSSDUG00000017190) ENSSDUG00000017175 ENSSDUG00000017137 tnni2a.1 (ENSSDUG00000017118) ##21 tnni2a.2 (ENSSDUG00000017108) ##21 ENSSDUG00000017101 TNNI2 (ENSSDUG00000017087) ##21 TNNI2 (ENSSDUG00000017072) ##21 TNNI2 (ENSSDUG00000017051) ##21 TNNI2 (ENSSDUG00000017036) ##21 ENSSDUG00000016991 ENSSDUG00000016965 ENSSDUG00000016941 tnnt3a (ENSSDUG00000016913) myod1 (ENSSDUG00000016886) zgc:172145 (ENSSDUG00000016873) ENSSDUG00000016853 CACNA2D4 (ENSSDUG00000016797) ENSSDUG00000016707 urahb (ENSSDUG00000016691) ENSSDUG00000016686 GLG1 (ENSSDUG00000016609) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 Turbot MODERN SPECIES 1 lmod2a (ENSSMAG00000002140) ASB15 (ENSSMAG00000002167) ASB15 (ENSSMAG00000002199) IQUB (ENSSMAG00000002231) slc13a1 (ENSSMAG00000002260) ENSSMAG00000002312 CADPS2 (ENSSMAG00000020348) fezf1 (ENSSMAG00000025856) aass (ENSSMAG00000020423) PTPRZ1 (ENSSMAG00000020456) ENSSMAG00000021503 ENSSMAG00000005976 SYT8 (ENSSMAG00000006038) tnni2a.1 (ENSSMAG00000032761) ##21 tnni2a.2 (ENSSMAG00000006098) ##21 TNNI2 (ENSSMAG00000006177) ##21 TNNI2 (ENSSMAG00000006211) ##21 ENSSMAG00000006237 ENSSMAG00000006257 tnnt3a (ENSSMAG00000006288) ENSSMAG00000023239 ENSSMAG00000028689 ENSSMAG00000032749 ENSSMAG00000022264 ENSSMAG00000030166 ENSSMAG00000036791 ENSSMAG00000023873 smpd3 (ENSSMAG00000002332) ENSSMAG00000002348 septin15 (ENSSMAG00000002389) ENSSMAG00000002399 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 20 aass (ENSMAMG00000022779) ENSMAMG00000022774 PTPRZ1 (ENSMAMG00000027911) ENSMAMG00000022767 ENSMAMG00000022758 ENSMAMG00000025915 ENSMAMG00000022762 ENSMAMG00000024786 ENSMAMG00000022760 ENSMAMG00000022756 SYT8 (ENSMAMG00000026620) ENSMAMG00000025933 tnni2a.1 (ENSMAMG00000022730) ##21 tnni2a.2 (ENSMAMG00000022728) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000028411) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000025267) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000022722) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000028574) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000024405) ##21 ENSMAMG00000026203 ENSMAMG00000025176 tnnt3a (ENSMAMG00000022716) myod1 (ENSMAMG00000025845) ENSMAMG00000022714 ENSMAMG00000022713 ENSMAMG00000022711 urahb (ENSMAMG00000022710) ENSMAMG00000025621 ENSMAMG00000022709 GLG1 (ENSMAMG00000022699) ENSMAMG00000022695 Zig-zag eel MODERN SPECIES 20 fezf1 (ENSMAMG00000022795) aass (ENSMAMG00000022779) ENSMAMG00000022774 PTPRZ1 (ENSMAMG00000027911) ENSMAMG00000022767 ENSMAMG00000022758 ENSMAMG00000025915 ENSMAMG00000022762 ENSMAMG00000024786 ENSMAMG00000022760 ENSMAMG00000022756 SYT8 (ENSMAMG00000026620) ENSMAMG00000025933 tnni2a.1 (ENSMAMG00000022730) ##21 tnni2a.2 (ENSMAMG00000022728) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000028411) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000025267) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000022722) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000028574) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000024405) ##21 ENSMAMG00000026203 ENSMAMG00000025176 tnnt3a (ENSMAMG00000022716) myod1 (ENSMAMG00000025845) ENSMAMG00000022714 ENSMAMG00000022713 ENSMAMG00000022711 urahb (ENSMAMG00000022710) ENSMAMG00000025621 ENSMAMG00000022709 GLG1 (ENSMAMG00000022699) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b 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(ENSBSLG00000004174) ##21 TNNI2 (ENSBSLG00000004185) ##21 ENSBSLG00000004198 ##21 TNNI2 (ENSBSLG00000004211) ##21 ENSBSLG00000004751 ##21 ENSBSLG00000004764 ENSBSLG00000004780 ENSBSLG00000004819 tnnt3a (ENSBSLG00000004850) myod1 (ENSBSLG00000004886) CACNA2D4 (ENSBSLG00000005093) ENSBSLG00000005855 ENSBSLG00000005902 urahb (ENSBSLG00000005954) ENSBSLG00000006449 GLG1 (ENSBSLG00000006927) RFWD3 (ENSBSLG00000007791) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 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MODERN SPECIES 4 TMED6 (ENSTNIG00000010418) MLKL (ENSTNIG00000010419) RFWD3 (ENSTNIG00000010420) ENSTNIG00000010421 ENSTNIG00000018798 ENSTNIG00000000428 ENSTNIG00000004682 CACNA2D4 (ENSTNIG00000004494) LRTM2 (ENSTNIG00000004493) SLC7A10 (ENSTNIG00000004495) dldh (ENSTNIG00000004496) ENSTNIG00000004497 ENSTNIG00000002815 tnni2a.1 (ENSTNIG00000002814) ##21 tnni2a.2 (ENSTNIG00000002813) ##21 ENSTNIG00000002812 ##21 ENSTNIG00000001405 ##21 TNNI2 (ENSTNIG00000002811) ##21 ENSTNIG00000002810 ##21 ENSTNIG00000000204 tnnt3a (ENSTNIG00000002809) myod1 (ENSTNIG00000002808) DUS2 (ENSTNIG00000005616) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 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##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.a ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00940000154617.B.d ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000157572.a.b 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Gilthead seabream MODERN SPECIES 22 ENSSAUG00010005878 ENSSAUG00010005877 ENSSAUG00010005876 ENSSAUG00010005875 ENSSAUG00010005873 ENSSAUG00010005872 ENSSAUG00010005871 ENSSAUG00010005869 ENSSAUG00010005868 dldh (ENSSAUG00010004955) ENSSAUG00010004939 ENSSAUG00010004937 ENSSAUG00010004936 ENSSAUG00010004935 ENSSAUG00010004932 tnni2a.3 (ENSSAUG00010004903) ##21 myod1 (ENSSAUG00010004893) zgc:172145 (ENSSAUG00010004889) LRTM2 (ENSSAUG00010004887) CACNA2D4 (ENSSAUG00010004611) ENSSAUG00010004583 urahb (ENSSAUG00010004577) ENSSAUG00010004574 ENSSAUG00010004572 ENSSAUG00010004567 ENSSAUG00010004565 ENSSAUG00010004562 ENSSAUG00010004558 GLG1 (ENSSAUG00010004416) RFWD3 (ENSSAUG00010004383) MLKL (ENSSAUG00010004319) Ballan wrasse MODERN SPECIES 74 ASB15 (ENSLBEG00000003875) ASB15 (ENSLBEG00000003921) IQUB (ENSLBEG00000003961) slc13a1 (ENSLBEG00000004005) CADPS2 (ENSLBEG00000004036) fezf1 (ENSLBEG00000004119) aass (ENSLBEG00000004152) ENSLBEG00000004277 ENSLBEG00000004441 ENSLBEG00000004466 dldh (ENSLBEG00000004489) SYT8 (ENSLBEG00000004542) ENSLBEG00000004567 tnni2a.1 (ENSLBEG00000004589) ##21 tnni2a.2 (ENSLBEG00000004628) ##21 TNNI2 (ENSLBEG00000004663) ##21 TNNI2 (ENSLBEG00000004685) ##21 TNNI2 (ENSLBEG00000004709) ##21 TNNI2 (ENSLBEG00000004734) ##21 ENSLBEG00000004756 ENSLBEG00000004792 tnnt3a (ENSLBEG00000004820) myod1 (ENSLBEG00000004859) zgc:172145 (ENSLBEG00000004893) CACNA2D4 (ENSLBEG00000004912) LRTM2 (ENSLBEG00000004951) ENSLBEG00000004962 ENSLBEG00000004986 urahb (ENSLBEG00000005026) ENSLBEG00000005041 GLG1 (ENSLBEG00000005124) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 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(ENSHBUG00000010717) ##21 ENSHBUG00000010706 ##21 ENSHBUG00000010695 ENSHBUG00000010683 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453.c Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453.c Zebra mbuna MODERN SPECIES 1110 GAN (ENSMZEG00005016250) ENSMZEG00005016243 foxl1 (ENSMZEG00005016238) kiaa0513 (ENSMZEG00005016224) slc13a1 (ENSMZEG00005016213) ENSMZEG00005016206 slc13a1 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(ENSPNYG00000020232) anpeplb (ENSPNYG00000020252) arpin (ENSPNYG00000020274) Midas cichlid MODERN SPECIES 258 frs2b (ENSACIG00000015503) nup160 (ENSACIG00000015433) slc13a1 (ENSACIG00000015361) ces3 (ENSACIG00000015245) ENSACIG00000015232 zfpm1 (ENSACIG00000015211) ENSACIG00000015203 ENSACIG00000015187 ENSACIG00000015131 ENSACIG00000015126 dldh (ENSACIG00000015096) SYT8 (ENSACIG00000015081) ENSACIG00000015057 tnni2a.1 (ENSACIG00000015042) ##21 tnni2a.2 (ENSACIG00000014981) ##21 TNNI2 (ENSACIG00000014860) ##21 TNNI2 (ENSACIG00000014837) ##21 TNNI2 (ENSACIG00000014818) ##21 ENSACIG00000014805 ##21 ENSACIG00000014797 ENSACIG00000014781 tnnt3a (ENSACIG00000014612) myod1 (ENSACIG00000014400) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 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ENSSPAG00000006900 CACNA2D4 (ENSSPAG00000005360) ENSSPAG00000005219 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a Clown anemonefish MODERN SPECIES 751 aass (ENSAOCG00000017468) PTPRZ1 (ENSAOCG00000017569) dldh (ENSAOCG00000002339) ENSAOCG00000002665 tnni2a.1 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(ENSAPEG00000015395) Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 496 DUS2 (ENSHCOG00000009462) SLC7A10 (ENSHCOG00000009496) urahb (ENSHCOG00000009505) ENSHCOG00000009602 ENSHCOG00000009616 LRTM2 (ENSHCOG00000009629) CACNA2D4 (ENSHCOG00000009660) ENSHCOG00000009665 MYOD1 (ENSHCOG00000009682) ENSHCOG00000009758 ENSHCOG00000009794 dldh (ENSHCOG00000009848) ENSHCOG00000009869 tnni2a.1 (ENSHCOG00000009875) ##21 tnni2a.2 (ENSHCOG00000009882) ##21 ENSHCOG00000009905 ##21 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 20 lmod2a (ENSMMDG00005013547) ASB15 (ENSMMDG00005004070) ASB15 (ENSMMDG00005004125) IQUB (ENSMMDG00005004156) slc13a1 (ENSMMDG00005004181) CADPS2 (ENSMMDG00005004524) fezf1 (ENSMMDG00005008356) aass (ENSMMDG00005008411) PTPRZ1 (ENSMMDG00005010843) dldh (ENSMMDG00005010882) ENSMMDG00005010938 ENSMMDG00005010939 SYT8 (ENSMMDG00005010940) tnni2a.1 (ENSMMDG00005010942) ##21 tnni2a.2 (ENSMMDG00005010943) ##21 ENSMMDG00005010944 ##21 ENSMMDG00005010945 ##21 ENSMMDG00005010946 ##21 ENSMMDG00005010947 ##21 TNNI2 (ENSMMDG00005010948) ##21 ENSMMDG00005010949 tnnt3a (ENSMMDG00005010950) myod1 (ENSMMDG00005010952) zgc:172145 (ENSMMDG00005010974) CACNA2D4 (ENSMMDG00005010984) LRTM2 (ENSMMDG00005011155) ENSMMDG00005011190 urahb (ENSMMDG00005012437) acot19 (ENSMMDG00005012454) ENSMMDG00005012464 ENSMMDG00005012488 Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT01100000264203 ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453 ENSGT00390000010961.c Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a 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Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453 Clown anemonefish MODERN SPECIES 751 aass (ENSAOCG00000017468) PTPRZ1 (ENSAOCG00000017569) dldh (ENSAOCG00000002339) 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DUS2 (ENSTRUG00000022441) SLC7A10 (ENSTRUG00000033356) ENSTRUG00000032988 dldh (ENSTRUG00000016659) SYT8 (ENSTRUG00000016657) ENSTRUG00000027114 tnni2a.1 (ENSTRUG00000022759) ##21 tnni2a.2 (ENSTRUG00000016644) ##21 ENSTRUG00000016632 ##21 ENSTRUG00000033030 ##21 ENSTRUG00000027588 ##21 ENSTRUG00000027670 ENSTRUG00000030147 tnnt3a (ENSTRUG00000016614) myod1 (ENSTRUG00000016609) LRTM2 (ENSTRUG00000029534) ENSTRUG00000016565 urahb (ENSTRUG00000021342) ENSTRUG00000030677 GLG1 (ENSTRUG00000016546) RFWD3 (ENSTRUG00000016541) TMED6 (ENSTRUG00000016539) ANKRD27 (ENSTRUG00000016516) ENSTRUG00000021888 ENSTRUG00000029018 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 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##21 ENSLBEG00000004756 ENSLBEG00000004792 tnnt3a (ENSLBEG00000004820) myod1 (ENSLBEG00000004859) zgc:172145 (ENSLBEG00000004893) CACNA2D4 (ENSLBEG00000004912) LRTM2 (ENSLBEG00000004951) ENSLBEG00000004962 ENSLBEG00000004986 urahb (ENSLBEG00000005026) ENSLBEG00000005041 GLG1 (ENSLBEG00000005124) RFWD3 (ENSLBEG00000005275) MLKL (ENSLBEG00000005305) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453 ENSGT00390000010961.c Perciformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000016791 ENSGT00390000010852 ENSGT00940000160513.b ENSGT00550000075044 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b 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(ENSAPEG00000015379) Spiny chromis MODERN SPECIES 1278 tnni2a.1 (ENSAPOG00000010015) ##21 ENSAPOG00000010022 tnni2a.2 (ENSAPOG00000010244) ##21 TNNI2 (ENSAPOG00000010262) ##21 ENSAPOG00000010281 ##21 TNNI2 (ENSAPOG00000010314) ##21 TNNI2 (ENSAPOG00000010340) ##21 tmem106bb (ENSAPOG00000010349) arl4ab (ENSAPOG00000010415) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 478 dldh (ENSSPAG00000007152) SYT8 (ENSSPAG00000007134) ENSSPAG00000007118 tnni2a.1 (ENSSPAG00000007097) ##21 tnni2a.2 (ENSSPAG00000007090) ##21 ENSSPAG00000007079 ##21 ENSSPAG00000007073 ##21 ENSSPAG00000007042 ##21 TNNI2 (ENSSPAG00000007029) ##21 ENSSPAG00000007019 ENSSPAG00000007014 tnnt3a (ENSSPAG00000006984) myod1 (ENSSPAG00000006959) ENSSPAG00000006936 ENSSPAG00000006900 CACNA2D4 (ENSSPAG00000005360) ENSSPAG00000005219 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 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ENSGT00390000016453 ENSGT00390000010961.c ENSGT00390000010961.d Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 Climbing perch MODERN SPECIES 19 fezf1 (ENSATEG00000009565) aass (ENSATEG00000009598) PTPRZ1 (ENSATEG00000009734) ENSATEG00000009981 ENSATEG00000009999 ENSATEG00000027494 ENSATEG00000010027 ENSATEG00000010089 ENSATEG00000026154 ENSATEG00000027850 ENSATEG00000027848 ENSATEG00000010140 SYT8 (ENSATEG00000010173) tnni2a.1 (ENSATEG00000010223) ##21 TNNI2 (ENSATEG00000010240) ##21 TNNI2 (ENSATEG00000010278) ##21 TNNI2 (ENSATEG00000010717) ##21 ENSATEG00000010747 ENSATEG00000010769 tnnt3a (ENSATEG00000010782) myod1 (ENSATEG00000010852) zgc:172145 (ENSATEG00000010861) ENSATEG00000010873 ENSATEG00000026163 ENSATEG00000027583 ENSATEG00000011010 urahb (ENSATEG00000027908) ENSATEG00000011076 GLG1 (ENSATEG00000011236) ENSATEG00000011399 MLKL (ENSATEG00000011422) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 17 ENSBSLG00000026461 GRAMD4 (ENSBSLG00000026476) ENSBSLG00000026499 CERK (ENSBSLG00000026507) TAFA5 (ENSBSLG00000026512) brd1b (ENSBSLG00000026513) ftsj1 (ENSBSLG00000026514) ENSBSLG00000003773 ENSBSLG00000003875 ENSBSLG00000003923 ENSBSLG00000004129 ENSBSLG00000004149 tnni2a.1 (ENSBSLG00000004158) ##21 tnni2a.2 (ENSBSLG00000004174) ##21 TNNI2 (ENSBSLG00000004185) ##21 ENSBSLG00000004198 ##21 TNNI2 (ENSBSLG00000004211) ##21 ENSBSLG00000004751 ##21 ENSBSLG00000004764 ENSBSLG00000004780 ENSBSLG00000004819 tnnt3a (ENSBSLG00000004850) myod1 (ENSBSLG00000004886) CACNA2D4 (ENSBSLG00000005093) ENSBSLG00000005855 ENSBSLG00000005902 urahb (ENSBSLG00000005954) ENSBSLG00000006449 GLG1 (ENSBSLG00000006927) RFWD3 (ENSBSLG00000007791) MLKL (ENSBSLG00000007872) Zig-zag eel MODERN SPECIES 20 ENSMAMG00000022774 PTPRZ1 (ENSMAMG00000027911) ENSMAMG00000022767 ENSMAMG00000022758 ENSMAMG00000025915 ENSMAMG00000022762 ENSMAMG00000024786 ENSMAMG00000022760 ENSMAMG00000022756 SYT8 (ENSMAMG00000026620) ENSMAMG00000025933 tnni2a.1 (ENSMAMG00000022730) ##21 tnni2a.2 (ENSMAMG00000022728) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000028411) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000025267) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000022722) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000028574) ##21 TNNI2 (ENSMAMG00000024405) ##21 ENSMAMG00000026203 ENSMAMG00000025176 tnnt3a (ENSMAMG00000022716) myod1 (ENSMAMG00000025845) ENSMAMG00000022714 ENSMAMG00000022713 ENSMAMG00000022711 urahb (ENSMAMG00000022710) ENSMAMG00000025621 ENSMAMG00000022709 GLG1 (ENSMAMG00000022699) ENSMAMG00000022695 MLKL (ENSMAMG00000022692) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 327 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT00940000180774 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000174622 ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293.ib ENSGT00940000158293.hb ENSGT00940000163716.c.a.a.a ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00390000010968.a ENSGT00940000178524 Mummichog MODERN SPECIES 2205 wnt2 (ENSFHEG00000009707) asz1 (ENSFHEG00000009691) cftr (ENSFHEG00000009671) ENSFHEG00000009567 ENSFHEG00000009557 ENSFHEG00000009543 ENSFHEG00000009504 BET1L (ENSFHEG00000009463) deaf1 (ENSFHEG00000009441) ENSFHEG00000009421 dldh (ENSFHEG00000009356) SYT8 (ENSFHEG00000009291) ENSFHEG00000009273 tnni2a.2 (ENSFHEG00000009249) ##21 TNNI2 (ENSFHEG00000009222) ##21 TNNI2 (ENSFHEG00000009184) ##21 ENSFHEG00000009159 ENSFHEG00000009155 ENSFHEG00000009147 ENSFHEG00000009127 tnnt3a (ENSFHEG00000009020) myod1 (ENSFHEG00000008982) ENSFHEG00000008951 LRTM2 (ENSFHEG00000008865) ENSFHEG00000008763 urahb (ENSFHEG00000008753) ENSFHEG00000008745 GRAMD4 (ENSFHEG00000008727) CERK (ENSFHEG00000008626) ENSFHEG00000008607 TAFA5 (ENSFHEG00000008597) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 545 tnni2a.2 (ENSCVAG00000019957) ##21 TNNI2 (ENSCVAG00000019942) ##21 TNNI2 (ENSCVAG00000019930) ##21 TNNI2 (ENSCVAG00000019892) ##21 ENSCVAG00000000969 ENSCVAG00000019873 tnnt3a (ENSCVAG00000019864) myod1 (ENSCVAG00000019855) CACNA2D4 (ENSCVAG00000019847) LRTM2 (ENSCVAG00000019558) ENSCVAG00000019550 ENSCVAG00000019533 GLG1 (ENSCVAG00000019526) RFWD3 (ENSCVAG00000019442) GRAMD4 (ENSCVAG00000019434) ENSCVAG00000019324 CERK (ENSCVAG00000019307) TAFA5 (ENSCVAG00000019290) Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159231 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000158567 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000154856.A.a.c.a.b.a.a.a ENSGT00940000154189.B ENSGT00940000158686 ENSGT00940000154527.a.a.b.b ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000164853.a.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01020000231746 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b 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MODERN SPECIES 474 ENSPFOG00000014905 st7 (ENSPFOG00000014750) wnt2 (ENSPFOG00000014710) asz1 (ENSPFOG00000014640) cftr (ENSPFOG00000014478) ENSPFOG00000014424 ENSPFOG00000014390 ENSPFOG00000014334 BET1L (ENSPFOG00000014322) deaf1 (ENSPFOG00000014257) ENSPFOG00000013986 dldh (ENSPFOG00000013896) SYT8 (ENSPFOG00000013827) tnni2a.2 (ENSPFOG00000013772) ##21 TNNI2 (ENSPFOG00000023624) ##21 TNNI2 (ENSPFOG00000013744) ##21 TNNI2 (ENSPFOG00000013698) ##21 ENSPFOG00000024450 ENSPFOG00000013655 tnnt3a (ENSPFOG00000013555) myod1 (ENSPFOG00000013532) LRTM2 (ENSPFOG00000013516) CACNA2D4 (ENSPFOG00000013433) ENSPFOG00000013283 urahb (ENSPFOG00000013262) ENSPFOG00000013224 GLG1 (ENSPFOG00000013019) RFWD3 (ENSPFOG00000012973) ENSPFOG00000012969 GRAMD4 (ENSPFOG00000012715) ENSPFOG00000012663 Sailfin molly MODERN SPECIES 1263 ENSPLAG00000001521 dldh (ENSPLAG00000001542) SYT8 (ENSPLAG00000001548) tnni2a.2 (ENSPLAG00000001553) ##21 ENSPLAG00000001556 ##21 ENSPLAG00000001562 ##21 ENSPLAG00000001570 ENSPLAG00000001576 tnnt3a (ENSPLAG00000001599) myod1 (ENSPLAG00000001610) Guppy MODERN SPECIES 458 wnt2 (ENSPREG00000002673) asz1 (ENSPREG00000002662) cftr (ENSPREG00000002638) CTTNBP2 (ENSPREG00000002579) ENSPREG00000002507 ENSPREG00000002490 ENSPREG00000002453 ENSPREG00000002425 deaf1 (ENSPREG00000002403) ENSPREG00000002322 dldh (ENSPREG00000002267) SYT8 (ENSPREG00000002242) ENSPREG00000002225 ENSPREG00000002208 ENSPREG00000002186 ##21 ENSPREG00000002158 ##21 TNNI2 (ENSPREG00000002134) ##21 ENSPREG00000002125 ENSPREG00000002107 tnnt3a (ENSPREG00000002040) myod1 (ENSPREG00000001997) ENSPREG00000001945 ENSPREG00000001932 ENSPREG00000001915 ENSPREG00000001880 ENSPREG00000001846 ENSPREG00000001828 GLG1 (ENSPREG00000001759) RFWD3 (ENSPREG00000001734) GRAMD4 (ENSPREG00000001575) ENSPREG00000001519 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 282 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b Turquoise killifish MODERN SPECIES 1623 dldh (ENSNFUG00015004817) ENSNFUG00015004770 ENSNFUG00015017402 PTPRZ1 (ENSNFUG00015017375) ENSNFUG00015017364 AASS (ENSNFUG00015016246) fezf1 (ENSNFUG00015016152) ENSNFUG00015016148 ENSNFUG00015016146 CADPS2 (ENSNFUG00015013246) slc13a1 (ENSNFUG00015012971) IQUB (ENSNFUG00015012926) ASB15 (ENSNFUG00015012906) ENSNFUG00015012893 tnni2a.1 (ENSNFUG00015012880) ##21 TNNI2 (ENSNFUG00015012847) ##21 BX004812.1 (ENSNFUG00015012831) ENSNFUG00015012822 TNNT3A (ENSNFUG00015012775) ENSNFUG00015012762 ANO1 (ENSNFUG00015011844) ENSNFUG00015011772 ENSNFUG00015011757 ENSNFUG00015011747 ENSNFUG00015011739 ripor1 (ENSNFUG00015011725) ctcf (ENSNFUG00015011705) ENSNFUG00015011697 carmil2 (ENSNFUG00015011647) RIC8A (ENSNFUG00015011583) ppp6r3 (ENSNFUG00015011328) Mangrove rivulus MODERN SPECIES 315 tnni2a.2 (ENSKMAG00000007528) ##21 ENSKMAG00000007513 ##21 ENSKMAG00000007502 ENSKMAG00000007473 ##21 ENSKMAG00000007450 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tnni2a.2 (ENSACIG00000014981) ##21 TNNI2 (ENSACIG00000014860) ##21 TNNI2 (ENSACIG00000014837) ##21 TNNI2 (ENSACIG00000014818) ##21 ENSACIG00000014805 ##21 ENSACIG00000014797 ENSACIG00000014781 tnnt3a (ENSACIG00000014612) myod1 (ENSACIG00000014400) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157517 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b 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##21 ENSSPAG00000007019 ENSSPAG00000007014 tnnt3a (ENSSPAG00000006984) myod1 (ENSSPAG00000006959) ENSSPAG00000006936 ENSSPAG00000006900 CACNA2D4 (ENSSPAG00000005360) ENSSPAG00000005219 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453.c ENSGT00390000010961.d Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 ENSGT00940000166187 ENSGT00530000063823.b.a ENSGT01040000240400.c.a.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453.c ENSGT00390000013269 ENSGT00940000164605 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000018220 ENSGT00940000155273 ENSGT00390000004877 ENSGT00940000162251 ENSGT00390000009535 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MODERN SPECIES 429 zfpm1 (ENSNBRG00000000569) ENSNBRG00000000542 dldh (ENSNBRG00000000346) SYT8 (ENSNBRG00000000324) ENSNBRG00000000308 tnni2a.2 (ENSNBRG00000000291) ##21 ENSNBRG00000000285 ##21 TNNI2 (ENSNBRG00000000275) ##21 ENSNBRG00000000267 ENSNBRG00000000262 ENSNBRG00000022480 tnnt3a (ENSNBRG00000022442) myod1 (ENSNBRG00000022428) ENSNBRG00000022414 ENSNBRG00000022400 urahb (ENSNBRG00000022377) ENSNBRG00000022322 GLG1 (ENSNBRG00000022286) RFWD3 (ENSNBRG00000022266) MLKL (ENSNBRG00000022248) si:dkey-12e7.1 (ENSNBRG00000022234) anpeplb (ENSNBRG00000022087) ENSNBRG00000022049 Midas cichlid MODERN SPECIES 258 ces3 (ENSACIG00000015245) ENSACIG00000015232 zfpm1 (ENSACIG00000015211) ENSACIG00000015203 ENSACIG00000015187 ENSACIG00000015131 ENSACIG00000015126 dldh (ENSACIG00000015096) SYT8 (ENSACIG00000015081) ENSACIG00000015057 tnni2a.1 (ENSACIG00000015042) ##21 tnni2a.2 (ENSACIG00000014981) ##21 TNNI2 (ENSACIG00000014860) ##21 TNNI2 (ENSACIG00000014837) ##21 TNNI2 (ENSACIG00000014818) 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znf277 (ENSOSIG00000009505) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 20 ENSORLG00000024966 ENSORLG00000024504 ENSORLG00000000450 dldh (ENSORLG00000000461) ENSORLG00000025976 grm8b (ENSORLG00000000478) pot1 (ENSORLG00000000493) GPR37 (ENSORLG00000027795) ENSORLG00000000501 HYAL4 (ENSORLG00000000515) hyal6 (ENSORLG00000000524) ENSORLG00000000533 tnni2a.1 (ENSORLG00000000545) ##21 tnni2a.2 (ENSORLG00000024626) ##21 TNNI2 (ENSORLG00000000559) ##21 TNNI2 (ENSORLG00000000591) ##21 ENSORLG00000024559 ENSORLG00000000599 ENSORLG00000025446 tnnt3a (ENSORLG00000000678) myod1 (ENSORLG00000000694) ENSORLG00000000721 ENSORLG00000027522 ENSORLG00000025119 RFWD3 (ENSORLG00000000737) GLG1 (ENSORLG00000000767) ENSORLG00000024437 ENSORLG00000000773 ENSORLG00000024074 urahb (ENSORLG00000029953) ENSORLG00000000787 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 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syt12 (ENSCSEG00000002273) cat (ENSCSEG00000002281) ifitm5 (ENSCSEG00000002289) ENSCSEG00000002294 ENSCSEG00000002298 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.f ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453 ENSGT00390000010961.c Barramundi perch MODERN SPECIES 31 ENSLCAG00010013451 slc13a1 (ENSLCAG00010013405) CADPS2 (ENSLCAG00010013231) fezf1 (ENSLCAG00010013213) aass (ENSLCAG00010013014) PTPRZ1 (ENSLCAG00010012605) ENSLCAG00010012479 ENSLCAG00010012477 ENSLCAG00010012473 dldh (ENSLCAG00010012352) SYT8 (ENSLCAG00010012305) ENSLCAG00010012295 tnni2a.2 (ENSLCAG00010012290) ##21 TNNI2 (ENSLCAG00010012275) ##21 TNNI2 (ENSLCAG00010012249) ##21 TNNI2 (ENSLCAG00010012232) ##21 ENSLCAG00010012229 ENSLCAG00010012227 ENSLCAG00010012223 tnnt3a (ENSLCAG00010012221) myod1 (ENSLCAG00010012215) zgc:172145 (ENSLCAG00010012212) CACNA2D4 (ENSLCAG00010012209) LRTM2 (ENSLCAG00010012207) Seriola ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000156482.c ENSGT00940000158339 ENSGT00940000156131.a.a.h ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156469.a ENSGT00390000009456 ENSGT00420000029847 ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 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ENSSDUG00000016991 ENSSDUG00000016965 ENSSDUG00000016941 tnnt3a (ENSSDUG00000016913) myod1 (ENSSDUG00000016886) zgc:172145 (ENSSDUG00000016873) ENSSDUG00000016853 CACNA2D4 (ENSSDUG00000016797) ENSSDUG00000016707 urahb (ENSSDUG00000016691) ENSSDUG00000016686 GLG1 (ENSSDUG00000016609) RFWD3 (ENSSDUG00000016584) MLKL (ENSSDUG00000016569) TMED6 (ENSSDUG00000016560) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3178 TNNI2 (ENSSLDG00000022266) ##21 TNNI2 (ENSSLDG00000022273) ##21 TNNI2 (ENSSLDG00000022278) ##21 TNNI2 (ENSSLDG00000022288) ##21 ENSSLDG00000022300 ENSSLDG00000022311 tnnt3a (ENSSLDG00000022320) myod1 (ENSSLDG00000022337) zgc:172145 (ENSSLDG00000022358) ENSSLDG00000022362 CACNA2D4 (ENSSLDG00000022368) LRTM2 (ENSSLDG00000022406) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.b ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 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ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453 ENSGT00390000010961.c ENSGT00390000010961.d Channel bull blenny MODERN SPECIES 20 pdcd2l (ENSCGOG00000009673) ENSCGOG00000009670 ENSCGOG00000009667 DUS2 (ENSCGOG00000009109) ENSCGOG00000009096 ENSCGOG00000009092 dldh (ENSCGOG00000008107) ENSCGOG00000008073 SLC7A10 (ENSCGOG00000007383) tnni2a.1 (ENSCGOG00000007358) ##21 ENSCGOG00000007345 tnni2a.2 (ENSCGOG00000007341) ##21 TNNI2 (ENSCGOG00000007334) ##21 TNNI2 (ENSCGOG00000007324) ##21 TNNI2 (ENSCGOG00000007317) ##21 TNNI2 (ENSCGOG00000007312) ##21 ENSCGOG00000007305 ENSCGOG00000007292 zgc:172145 (ENSCGOG00000007280) tnnt3a (ENSCGOG00000007130) myod1 (ENSCGOG00000007087) zgc:172145 (ENSCGOG00000007083) ENSCGOG00000007080 LRTM2 (ENSCGOG00000007053) CACNA2D4 (ENSCGOG00000007039) ENSCGOG00000006641 urahb (ENSCGOG00000006621) ENSCGOG00000006612 ENSCGOG00000006597 GLG1 (ENSCGOG00000005997) RFWD3 (ENSCGOG00000005985) Ballan wrasse MODERN SPECIES 74 slc13a1 (ENSLBEG00000004005) CADPS2 (ENSLBEG00000004036) fezf1 (ENSLBEG00000004119) aass (ENSLBEG00000004152) ENSLBEG00000004277 ENSLBEG00000004441 ENSLBEG00000004466 dldh (ENSLBEG00000004489) SYT8 (ENSLBEG00000004542) ENSLBEG00000004567 tnni2a.1 (ENSLBEG00000004589) ##21 tnni2a.2 (ENSLBEG00000004628) ##21 TNNI2 (ENSLBEG00000004663) ##21 TNNI2 (ENSLBEG00000004685) ##21 TNNI2 (ENSLBEG00000004709) ##21 TNNI2 (ENSLBEG00000004734) ##21 ENSLBEG00000004756 ENSLBEG00000004792 tnnt3a (ENSLBEG00000004820) myod1 (ENSLBEG00000004859) zgc:172145 (ENSLBEG00000004893) CACNA2D4 (ENSLBEG00000004912) LRTM2 (ENSLBEG00000004951) ENSLBEG00000004962 ENSLBEG00000004986 urahb (ENSLBEG00000005026) ENSLBEG00000005041 GLG1 (ENSLBEG00000005124) RFWD3 (ENSLBEG00000005275) MLKL (ENSLBEG00000005305) TMED6 (ENSLBEG00000005338) Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156469.a ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453 ENSGT00390000010961.d ENSGT00940000157021 ENSGT00420000029847 ENSGT00390000009456 Tetraodon MODERN SPECIES 4 ENSTNIG00000010421 ENSTNIG00000018798 ENSTNIG00000000428 ENSTNIG00000004682 CACNA2D4 (ENSTNIG00000004494) LRTM2 (ENSTNIG00000004493) SLC7A10 (ENSTNIG00000004495) dldh (ENSTNIG00000004496) ENSTNIG00000004497 ENSTNIG00000002815 tnni2a.1 (ENSTNIG00000002814) ##21 tnni2a.2 (ENSTNIG00000002813) ##21 ENSTNIG00000002812 ##21 ENSTNIG00000001405 ##21 TNNI2 (ENSTNIG00000002811) ##21 ENSTNIG00000002810 ##21 ENSTNIG00000000204 tnnt3a (ENSTNIG00000002809) myod1 (ENSTNIG00000002808) DUS2 (ENSTNIG00000005616) Fugu MODERN SPECIES 21 ENSTRUG00000031663 ENSTRUG00000032661 ccnd2a (ENSTRUG00000001816) ENSTRUG00000032400 ENSTRUG00000028185 DUS2 (ENSTRUG00000022441) SLC7A10 (ENSTRUG00000033356) ENSTRUG00000032988 dldh (ENSTRUG00000016659) SYT8 (ENSTRUG00000016657) ENSTRUG00000027114 tnni2a.1 (ENSTRUG00000022759) ##21 tnni2a.2 (ENSTRUG00000016644) ##21 ENSTRUG00000016632 ##21 ENSTRUG00000033030 ##21 ENSTRUG00000027588 ##21 ENSTRUG00000027670 ENSTRUG00000030147 tnnt3a (ENSTRUG00000016614) myod1 (ENSTRUG00000016609) LRTM2 (ENSTRUG00000029534) ENSTRUG00000016565 urahb (ENSTRUG00000021342) ENSTRUG00000030677 GLG1 (ENSTRUG00000016546) RFWD3 (ENSTRUG00000016541) TMED6 (ENSTRUG00000016539) ANKRD27 (ENSTRUG00000016516) ENSTRUG00000021888 ENSTRUG00000029018 ENSTRUG00000030993 Cod MODERN SPECIES 22 HYAL4 (ENSGMOG00000010316) hyal6 (ENSGMOG00000025679) wasla (ENSGMOG00000037020) ENSGMOG00000010258 IQUB (ENSGMOG00000019307) slc13a1 (ENSGMOG00000009178) CADPS2 (ENSGMOG00000035623) fezf1 (ENSGMOG00000023584) aass (ENSGMOG00000010875) ENSGMOG00000036942 PTPRZ1 (ENSGMOG00000010806) ENSGMOG00000016861 SYT8 (ENSGMOG00000016874) ENSGMOG00000031300 tnni2a.1 (ENSGMOG00000026765) ##21 ENSGMOG00000036471 ##21 ENSGMOG00000034763 ENSGMOG00000027097 tnnt3a (ENSGMOG00000016942) ENSGMOG00000030879 ENSGMOG00000003800 ENSGMOG00000024112 ENSGMOG00000003907 ENSGMOG00000003566 si:ch211-59o9.10 (ENSGMOG00000037257) ENSGMOG00000027867 actr6 (ENSGMOG00000003691) ENSGMOG00000031025 ENSGMOG00000034008 ENSGMOG00000031788 ENSGMOG00000035361 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00730000110895.b.a.o.a ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000169557 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b ##21 ENSGT00940000180774 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3178 TNNI2 (ENSSLDG00000022266) ##21 TNNI2 (ENSSLDG00000022273) ##21 TNNI2 (ENSSLDG00000022278) ##21 TNNI2 (ENSSLDG00000022288) ##21 ENSSLDG00000022300 ENSSLDG00000022311 tnnt3a (ENSSLDG00000022320) myod1 (ENSSLDG00000022337) zgc:172145 (ENSSLDG00000022358) ENSSLDG00000022362 CACNA2D4 (ENSSLDG00000022368) LRTM2 (ENSSLDG00000022406) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Indian medaka MODERN SPECIES 114 ENSOMEG00000009258 ##21 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00940000156567.a.b ENSGT00940000157073.a.b ENSGT00940000157073.a.a ENSGT00390000014326 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.A ENSGT00550000074844 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.b.e.a ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a Spiny chromis MODERN SPECIES 1278 tnni2a.1 (ENSAPOG00000010015) ##21 ENSAPOG00000010022 tnni2a.2 (ENSAPOG00000010244) ##21 TNNI2 (ENSAPOG00000010262) ##21 ENSAPOG00000010281 ##21 TNNI2 (ENSAPOG00000010314) ##21 TNNI2 (ENSAPOG00000010340) ##21 tmem106bb (ENSAPOG00000010349) arl4ab (ENSAPOG00000010415) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Lyretail cichlid DUPLICATION Lyretail cichlid MODERN SPECIES 1035 TNNI2 (ENSNBRG00000011263) ##21 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 429 zfpm1 (ENSNBRG00000000569) ENSNBRG00000000542 dldh (ENSNBRG00000000346) SYT8 (ENSNBRG00000000324) ENSNBRG00000000308 tnni2a.2 (ENSNBRG00000000291) ##21 ENSNBRG00000000285 ##21 TNNI2 (ENSNBRG00000000275) ##21 ENSNBRG00000000267 ENSNBRG00000000262 ENSNBRG00000022480 tnnt3a (ENSNBRG00000022442) myod1 (ENSNBRG00000022428) ENSNBRG00000022414 ENSNBRG00000022400 urahb (ENSNBRG00000022377) ENSNBRG00000022322 GLG1 (ENSNBRG00000022286) RFWD3 (ENSNBRG00000022266) MLKL (ENSNBRG00000022248) si:dkey-12e7.1 (ENSNBRG00000022234) anpeplb (ENSNBRG00000022087) Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.d ##21 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1110 foxl1 (ENSMZEG00005016238) kiaa0513 (ENSMZEG00005016224) slc13a1 (ENSMZEG00005016213) ENSMZEG00005016206 slc13a1 (ENSMZEG00005016201) ces3 (ENSMZEG00005016193) zfpm1 (ENSMZEG00005016182) ENSMZEG00005016163 dldh (ENSMZEG00005016147) SYT8 (ENSMZEG00005016137) ENSMZEG00005016129 tnni2a.1 (ENSMZEG00005016126) ##21 tnni2a.2 (ENSMZEG00005016116) ##21 TNNI2 (ENSMZEG00005016110) ##21 TNNI2 (ENSMZEG00005016101) ##21 TNNI2 (ENSMZEG00005016090) ##21 TNNI2 (ENSMZEG00005016082) ##21 TNNI2 (ENSMZEG00005016076) ##21 TNNI2 (ENSMZEG00005016067) ##21 ENSMZEG00005016060 ENSMZEG00005016057 ENSMZEG00005016053 ENSMZEG00005016049 tnnt3a (ENSMZEG00005016043) myod1 (ENSMZEG00005016037) LRTM2 (ENSMZEG00005016031) CACNA2D4 (ENSMZEG00005016019) ENSMZEG00005016011 urahb (ENSMZEG00005016003) ENSMZEG00005015977 GLG1 (ENSMZEG00005015951) Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000157682.B.b ENSGT00940000163706 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000164955.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.a.b ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453.m ENSGT00940000163501 ENSGT00730000111305 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 519 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812.e ENSGT00940000158477.a.b.c ENSGT00950000182959.b.a.b.c ENSGT00920000149457.c ENSGT00940000157572.a.b.c ENSGT00940000155997.lb.b.u ENSGT00940000160625.r.a.b ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ENSGT00390000008931.g ENSGT00390000016453.n.b Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00550000074844.jb.b ENSGT00940000157682.B.b.b ENSGT00940000163706 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c.g.b ENSGT00940000164955.b ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892.f ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.a ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f ENSGT00940000158477.a.b.d ENSGT00950000182959.b.a.b.d ENSGT00920000149457.d ENSGT00940000155997.lb.b.v ENSGT00940000157572.a.b.d ENSGT00940000160625.r.a.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p ENSGT00390000011262.e.a.b.a ENSGT00390000008931.h ENSGT00390000016453.m ENSGT00940000163501 ENSGT00730000111305 Salmo ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000014326 ENSGT00590000083094.a.b.l ENSGT00940000159477.c ENSGT00940000155529.A.e ENSGT00550000074844.jb.a ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.b ENSGT00940000157682.B.b.a ENSGT00940000160974.b.c.g.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.d ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b.d ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.a ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812.e ENSGT00940000158477.a.b.c ENSGT00950000182959.b.a.b.c ENSGT00920000149457.c ENSGT00940000157572.a.b.c ENSGT00940000155997.lb.b.u ENSGT00940000160625.r.a.b ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a.b.b ENSGT00390000008931.g ENSGT00390000016453.n.a ENSGT00940000154917.fb.a ENSGT00390000001285.j.c ENSGT00940000164030.i.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 15 fezf1 (ENSSSAG00000059944) aass (ENSSSAG00000056714) PTPRZ1 (ENSSSAG00000056177) ENSSSAG00000055366 ENSSSAG00000084730 ENSSSAG00000055331 ENSSSAG00000055330 deaf1 (ENSSSAG00000055310) drd4a (ENSSSAG00000055298) ENSSSAG00000122200 ENSSSAG00000055278 ENSSSAG00000055272 SYT8 (ENSSSAG00000119353) tnni2a.1 (ENSSSAG00000055259) ##21 ENSSSAG00000103611 TNNI2 (ENSSSAG00000055203) ##21 ENSSSAG00000055171 ENSSSAG00000055179 ENSSSAG00000100003 TNNT3 (ENSSSAG00000055126) myod2 (ENSSSAG00000055102) ENSSSAG00000007878 zgc:172145 (ENSSSAG00000055098) ENSSSAG00000092025 ENSSSAG00000054630 ENSSSAG00000052259 ENSSSAG00000115733 GLG1 (ENSSSAG00000004048) ENSSSAG00000088259 MLKL (ENSSSAG00000067010) etfbkmt (ENSSSAG00000103483) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000013249.e.a ENSGT00940000155529.A.f ENSGT00550000074844.jb.b ENSGT00940000157682.B.b.b ENSGT00940000163706 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c.g.b ENSGT00940000164955.b ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a 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nfybb (ENSSTUG00000007199) cnot2 (ENSSTUG00000006366) ENSSTUG00000006322 Salmo ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00590000083094.a.b.k.a.a.b ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.f ENSGT00940000155529.A.f ENSGT00550000074844.jb.b ENSGT00940000157682.B.b.b ENSGT00940000163706 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c.g.b ENSGT00940000164955.b ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892.f ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f ENSGT00940000158477.a.b.d ENSGT00950000182959.b.a.b.d ENSGT00920000149457.d ENSGT00940000155997.lb.b.v ENSGT00940000157572.a.b.d ENSGT00940000160625.r.a.a ENSGT00390000011262.e.a.b.a ENSGT00390000008931.h ENSGT00390000016453.m ENSGT00940000163501 ENSGT00730000111305 ENSGT00940000154917.fb.b ENSGT00950000183042.a.b.b River trout MODERN SPECIES 33 aass (ENSSTUG00000019952) ENSSTUG00000019843 PTPRZ1 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(ENSELUG00000007058) etfbkmt (ENSELUG00000007086) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00550000074844 ENSGT00940000157682.B.b ENSGT00940000163706 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c ENSGT00940000162463 ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000164955.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.a.b ENSGT00920000149457 ENSGT00940000155997.lb.b ENSGT00940000157572.a.b ENSGT00940000160625.r.a ENSGT00940000165218.b ENSGT00390000011262.e.a ENSGT00390000008931 ENSGT00390000016453.m ENSGT00940000163501 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 519 ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892.e ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.f ##21 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(ENSSSAG00000115245) ##21 TNNI2 (ENSSSAG00000080558) ##21 ENSSSAG00000110670 ENSSSAG00000080568 ENSSSAG00000102688 TNNT3 (ENSSSAG00000080578) myod1c (ENSSSAG00000080596) ENSSSAG00000111233 zgc:172145 (ENSSSAG00000080600) ENSSSAG00000080628 ENSSSAG00000096889 ENSSSAG00000080771 ENSSSAG00000101363 GLG1 (ENSSSAG00000067039) ENSSSAG00000122167 MLKL (ENSSSAG00000087130) Huchen MODERN SPECIES 544 ENSHHUG00000000310 tnni2a.1 (ENSHHUG00000000288) ##21 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000284) ##21 tnni2a.2 (ENSHHUG00000000268) ##21 TNNI2 (ENSHHUG00000000259) ##21 TNNI2 (ENSHHUG00000000165) ##21 ENSHHUG00000000161 ENSHHUG00000000144 tnnt3b (ENSHHUG00000000132) MYOD1 (ENSHHUG00000000050) zgc:172145 (ENSHHUG00000000023) LRTM2 (ENSHHUG00000050722) CACNA2D4 (ENSHHUG00000050645) ENSHHUG00000050634 ENSHHUG00000050630 GLG1 (ENSHHUG00000050506) RFWD3 (ENSHHUG00000050492) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163421.a.d.a.a ENSGT00940000159150.ab ENSGT00940000155010.a ENSGT01010000223078 ENSGT00390000004417.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.b ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892.f ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01000000216979 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.a.a ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B.j ENSGT00940000154914.vb Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b ##21 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.e.a ENSGT00940000155529.A.f ENSGT00550000074844.jb.b ENSGT00940000157682.B.b.b ENSGT00940000163706 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c.g.b ENSGT00940000164955.b ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892.f ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f ENSGT00940000158477.a.b.d ENSGT00950000182959.b.a.b.d ENSGT00920000149457.d ENSGT00940000155997.lb.b.v ENSGT00940000157572.a.b.d ENSGT00940000160625.r.a.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p ENSGT00390000011262.e.a.b.a ENSGT00390000008931.h ENSGT00390000016453.m ENSGT00940000163501 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000159477.d ENSGT00390000013249.e.a ENSGT00940000155529.A.f ENSGT00550000074844.jb.b ENSGT00940000157682.B.b.b ENSGT00940000163706 ENSGT00940000160208 ENSGT00940000159701 ENSGT00940000160974.b.c.g.b ENSGT00940000164955.b ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892.f ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a.e ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.a.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b.c ENSGT00940000167812.f ENSGT00940000158477.a.b.d ENSGT00950000182959.b.a.b.d ENSGT00920000149457.d ENSGT00940000155997.lb.b.v ENSGT00940000157572.a.b.d ENSGT00940000160625.r.a.a ENSGT00940000153229.A.a.a.a.p ENSGT00390000011262.e.a.b.a ENSGT00390000008931.h ENSGT00390000016453.m ENSGT00940000163501 Coho salmon MODERN SPECIES 1 PTPRZ1 (ENSOKIG00005031860) DLD (ENSOKIG00005032474) ENSOKIG00005032722 ENSOKIG00005032730 ticam1 (ENSOKIG00005032764) BET1L (ENSOKIG00005032895) deaf1 (ENSOKIG00005032919) drd4a (ENSOKIG00005032941) ENSOKIG00005032958 ENSOKIG00005032986 ENSOKIG00005032992 ENSOKIG00005033002 SYT8 (ENSOKIG00005033015) tnni2a.1 (ENSOKIG00005033031) ##21 tnni2a.2 (ENSOKIG00005033122) ##21 ENSOKIG00005033145 ##21 ENSOKIG00005033174 tnnt3b (ENSOKIG00005033212) MYOD1 (ENSOKIG00005033239) zgc:172145 (ENSOKIG00005033256) CACNA2D4 (ENSOKIG00005033316) LRTM2 (ENSOKIG00005034035) ENSOKIG00005034065 urahb (ENSOKIG00005034114) GLG1 (ENSOKIG00005034363) RFWD3 (ENSOKIG00005038361) MLKL (ENSOKIG00005038521) etfbkmt (ENSOKIG00005038535) amn1 (ENSOKIG00005038546) nfybb (ENSOKIG00005038602) ENSOKIG00005038688 Huchen MODERN SPECIES 889 ENSHHUG00000028029 ENSHHUG00000027755 SYT8 (ENSHHUG00000027747) ENSHHUG00000027744 tnni2a.1 (ENSHHUG00000027733) ##21 tnni2a.2 (ENSHHUG00000027724) ##21 TNNI2 (ENSHHUG00000027633) ##21 TNNI2 (ENSHHUG00000027573) ##21 ENSHHUG00000027566 ENSHHUG00000027560 TNNT3 (ENSHHUG00000027549) MYOD1 (ENSHHUG00000027540) CACNA2D4 (ENSHHUG00000027532) LRTM2 (ENSHHUG00000027521) ENSHHUG00000027515 ENSHHUG00000027513 ENSHHUG00000027507 urahb (ENSHHUG00000027499) GLG1 (ENSHHUG00000027478) RFWD3 (ENSHHUG00000027472) ENSHHUG00000027468 etfbkmt (ENSHHUG00000027465) Northern pike MODERN SPECIES 18 aass (ENSELUG00000005758) PTPRZ1 (ENSELUG00000005952) dldh (ENSELUG00000006023) ENSELUG00000006036 ENSELUG00000033613 ticam1 (ENSELUG00000006060) BET1L (ENSELUG00000032203) deaf1 (ENSELUG00000006122) drd4a (ENSELUG00000006156) ENSELUG00000000195 ENSELUG00000006280 ENSELUG00000006319 SYT8 (ENSELUG00000006343) ENSELUG00000006355 tnni2a.2 (ENSELUG00000006408) ##21 TNNI2 (ENSELUG00000006429) ##21 TNNI2 (ENSELUG00000006514) ##21 ENSELUG00000006582 ENSELUG00000024853 ENSELUG00000006610 tnnt3b (ENSELUG00000006673) MYOD1 (ENSELUG00000006737) zgc:172145 (ENSELUG00000028291) LRTM2 (ENSELUG00000006756) CACNA2D4 (ENSELUG00000006851) ENSELUG00000006919 urahb (ENSELUG00000034591) ENSELUG00000006933 GLG1 (ENSELUG00000006991) RFWD3 (ENSELUG00000007033) MLKL (ENSELUG00000007058) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.f ##21 Northern pike MODERN SPECIES 1 ENSELUG00000031353 ENSELUG00000028070 ENSELUG00000032595 ENSELUG00000018487 psmd13 (ENSELUG00000018515) sirt3 (ENSELUG00000018526) drd4b (ENSELUG00000018550) ENSELUG00000018575 ctsd (ENSELUG00000018601) ENSELUG00000028989 ENSELUG00000027344 ENSELUG00000033770 ENSELUG00000028980 ENSELUG00000028322 tnni2b.1 (ENSELUG00000018719) ##21 ENSELUG00000018743 ##21 ENSELUG00000018803 ENSELUG00000026443 TNNT3 (ENSELUG00000018827) MYOD1 (ENSELUG00000018844) OTOG (ENSELUG00000018933) aph1b (ENSELUG00000018962) ENSELUG00000018968 ENSELUG00000019041 NR2E3 (ENSELUG00000019079) arih1l (ENSELUG00000019125) HACD3 (ENSELUG00000019142) SLC24A1 (ENSELUG00000019158) dennd4a (ENSELUG00000000821) RAB11B (ENSELUG00000019240) ENSELUG00000019353 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.f ##21 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.f ##21 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.f ##21 Rainbow trout MODERN SPECIES 27 ENSOMYG00000064485 ENSOMYG00000073327 ENSOMYG00000063737 csnk2a2a (ENSOMYG00000073972) ENSOMYG00000030874 ENSOMYG00000077711 ENSOMYG00000062215 ENSOMYG00000030436 ENSOMYG00000030266 ENSOMYG00000072011 ENSOMYG00000050352 CTSD (ENSOMYG00000029741) ENSOMYG00000029435 ENSOMYG00000030025 ENSOMYG00000030016 ENSOMYG00000029399 ##21 ENSOMYG00000057374 ##35 ENSOMYG00000029082 ENSOMYG00000055514 TNNT3 (ENSOMYG00000049303) myod1 (ENSOMYG00000029242) ENSOMYG00000069614 ENSOMYG00000063706 ENSOMYG00000060149 ENSOMYG00000005082 ENSOMYG00000005006 ENSOMYG00000050119 ENSOMYG00000004974 ENSOMYG00000023825 HACD3 (ENSOMYG00000059785) SLC24A1 (ENSOMYG00000004858) Otomorpha DUPLICATION Otomorpha DUPLICATION Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h ##21 ENSGT00940000177178 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000159916 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A.f ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b.d ENSGT00940000159535.i ENSGT00440000039564.a.b.i ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a ENSGT00940000164715.b ENSGT00940000160745.d ENSGT00390000007739 ENSGT00950000183151.a.a.b.b Denticle herring MODERN SPECIES 8 ascl1b (ENSDCDG00000031153) CES3 (ENSDCDG00000031156) pdcd2l (ENSDCDG00000031158) banp (ENSDCDG00000031160) ENSDCDG00000031164 kras (ENSDCDG00000031166) RASSF8 (ENSDCDG00000031168) ENSDCDG00000031170 SYT8 (ENSDCDG00000031171) ENSDCDG00000031173 tnni2a.1 (ENSDCDG00000031175) ##21 tnni2a.2 (ENSDCDG00000031178) ##21 ENSDCDG00000031179 ##21 ENSDCDG00000031186 ##21 TNNI2 (ENSDCDG00000005638) ##21 tnni2a.4 (ENSDCDG00000005740) ##21 ENSDCDG00000006819 ENSDCDG00000006877 MYOD1 (ENSDCDG00000006890) zgc:172145 (ENSDCDG00000006912) ush1c (ENSDCDG00000007075) abcc8 (ENSDCDG00000007647) kcnj11 (ENSDCDG00000007731) mob2a (ENSDCDG00000007735) dusp8a (ENSDCDG00000007781) ENSDCDG00000007814 OSBPL5 (ENSDCDG00000008088) phlda2 (ENSDCDG00000013795) ENSDCDG00000013798 ENSDCDG00000013856 ENSDCDG00000014858 Atlantic herring MODERN SPECIES 19 RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 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ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.cc.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.cc.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368.m ENSGT00940000155200.cc.b.a ENSGT00940000155200.cc.b.b ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626.`b.b ENSGT00940000156626.`b.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000160004.f Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 23 FBXO31 (ENSAMXG00000036671) ENSAMXG00000035097 ENSAMXG00000030702 ENSAMXG00000029035 ENSAMXG00000042542 ENSAMXG00000038653 ENSAMXG00000042943 ENSAMXG00000037266 ENSAMXG00000017283 ENSAMXG00000037992 ENSAMXG00000017252 RASSF8 (ENSAMXG00000017235) kras (ENSAMXG00000017217) ENSAMXG00000041046 tnni2a.3 (ENSAMXG00000017131) ##21 tnni2a.4 (ENSAMXG00000039743) ##21 ENSAMXG00000042220 ENSAMXG00000034923 tnnt3a (ENSAMXG00000017067) myod1 (ENSAMXG00000017040) zgc:172145 (ENSAMXG00000037676) ush1c (ENSAMXG00000017009) abcc8 (ENSAMXG00000016995) kcnj11 (ENSAMXG00000016977) mob2a (ENSAMXG00000000963) dusp8a (ENSAMXG00000016953) ENSAMXG00000032145 igf2b (ENSAMXG00000031616) th (ENSAMXG00000016719) ENSAMXG00000016679 ENSAMXG00000016647 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1246 ENSAMXG00000039263 banp (ENSAMXG00000017170) pdcd2l (ENSAMXG00000017155) ENSAMXG00000017150 ENSAMXG00000037298 TNNI2 (ENSAMXG00000042297) ##21 tnni2a.4 (ENSAMXG00000017111) ##21 tnni2a.1 (ENSAMXG00000035063) ##21 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 65 FBXO31 (ENSPNAG00000028889) ENSPNAG00000028806 ENSPNAG00000028758 ENSPNAG00000004407 ENSPNAG00000004742 RASSF8 (ENSPNAG00000028666) kras (ENSPNAG00000028629) ENSPNAG00000006076 banp (ENSPNAG00000028568) pdcd2l (ENSPNAG00000004367) SYT8 (ENSPNAG00000028474) ENSPNAG00000028459 tnni2a.1 (ENSPNAG00000006788) ##21 tnni2a.2 (ENSPNAG00000028418) ##21 tnni2a.3 (ENSPNAG00000006873) ##21 tnni2a.4 (ENSPNAG00000028390) ##21 ENSPNAG00000006385 ENSPNAG00000028344 tnnt3a (ENSPNAG00000005106) myod1 (ENSPNAG00000006274) zgc:172145 (ENSPNAG00000005729) ush1c (ENSPNAG00000004979) abcc8 (ENSPNAG00000006867) dusp8a (ENSPNAG00000027990) ENSPNAG00000027977 Electric eel MODERN SPECIES 236 ENSEEEG00000007384 banp (ENSEEEG00000007385) pdcd2l (ENSEEEG00000007386) SYT8 (ENSEEEG00000007387) ENSEEEG00000007390 tnni2a.1 (ENSEEEG00000007391) ##21 tnni2a.2 (ENSEEEG00000007393) ##21 tnni2a.3 (ENSEEEG00000007394) ##21 tnni2a.4 (ENSEEEG00000007412) ##21 ENSEEEG00000007427 tnnt3a (ENSEEEG00000007429) myod1 (ENSEEEG00000007431) ush1c (ENSEEEG00000007432) abcc8 (ENSEEEG00000007434) kcnj11 (ENSEEEG00000007443) mob2a (ENSEEEG00000007448) dusp8a (ENSEEEG00000007456) ENSEEEG00000007463 OSBPL5 (ENSEEEG00000007471) phlda2 (ENSEEEG00000007614) nap1l4a (ENSEEEG00000007616) ENSEEEG00000007618 Channel catfish MODERN SPECIES 5 fanci (ENSIPUG00000004103) FBXO31 (ENSIPUG00000004197) ENSIPUG00000004211 rassf8 (ENSIPUG00000004240) kras (ENSIPUG00000004259) znf469 (ENSIPUG00000004306) ENSIPUG00000004314 banp (ENSIPUG00000004342) PDCD2L (ENSIPUG00000004421) SYT8 (ENSIPUG00000004448) ENSIPUG00000004455 TNNI2 (ENSIPUG00000004462) ##21 tnni2a.2 (ENSIPUG00000004477) ##21 TNNI2 (ENSIPUG00000004491) ##21 tnni2a.3 (ENSIPUG00000004514) ##21 tnni2 (ENSIPUG00000004539) ##21 ENSIPUG00000004583 ENSIPUG00000004645 ENSIPUG00000004650 tnnt3a (ENSIPUG00000004658) myod1 (ENSIPUG00000004693) zgc:172145 (ENSIPUG00000004699) ush1c (ENSIPUG00000004724) abcc8 (ENSIPUG00000004801) kcnj11 (ENSIPUG00000005009) mob2a (ENSIPUG00000005022) dusp8a (ENSIPUG00000005041) ENSIPUG00000005070 ENSIPUG00000005122 OSBPL5 (ENSIPUG00000005152) phlda2 (ENSIPUG00000005186) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00390000011067.B ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.ec.b ENSGT00940000155200.ec.a ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116.i ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00950000182959.b.a.a ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a.n ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a ENSGT00940000164715.b Zebrafish MODERN SPECIES 17 hsd17b12a (ENSDARG00000015709) alkbh3 (ENSDARG00000045606) C25H11orf96 (ENSDARG00000097208) pdia3 (ENSDARG00000102640) ENSDARG00000104818 ENSDARG00000101726 pdcd2l (ENSDARG00000002754) banp (ENSDARG00000017562) ENSDARG00000115365 kras (ENSDARG00000010844) RASSF8 (ENSDARG00000045596) ENSDARG00000110361 tnni2a.1 (ENSDARG00000045592) ##21 tnni2a.2 (ENSDARG00000005841) ##21 tnni2a.3 (ENSDARG00000013752) ##21 tnni2a.4 (ENSDARG00000029069) ##21 ENSDARG00000027310 ENSDARG00000097224 tnnt3a (ENSDARG00000030270) myod1 (ENSDARG00000030110) zgc:172145 (ENSDARG00000045586) lamb1a (ENSDARG00000101209) lamb4 (ENSDARG00000039133) acot19 (ENSDARG00000040427) ubl7a (ENSDARG00000024229) scamp5a (ENSDARG00000018743) parp16 (ENSDARG00000018593) ENSDARG00000097169 EIF3J (ENSDARG00000097988) eif3ja (ENSDARG00000012603) ENSDARG00000063314 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 1908 ENSGT01020000231746 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 1482 ENSGT01020000231746 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 Golden-line barbel MODERN SPECIES 366 cfap45 (ENSSGRG00000039288) tbrg1 (ENSSGRG00000039290) snrpa (ENSSGRG00000039361) zgc:153119 (ENSSGRG00000039362) itpkcb (ENSSGRG00000039365) kras (ENSSGRG00000039378) RASSF8 (ENSSGRG00000039425) ENSSGRG00000039426 ENSSGRG00000039427 ENSSGRG00000039428 tnni2a.4 (ENSSGRG00000039431) ##21 ENSSGRG00000039467 ENSSGRG00000039475 tnnt3a (ENSSGRG00000039479) myod1 (ENSSGRG00000039484) zgc:172145 (ENSSGRG00000039515) ush1c (ENSSGRG00000039517) abcc8 (ENSSGRG00000039570) kcnj11 (ENSSGRG00000039775) mob2a (ENSSGRG00000039776) dusp8a (ENSSGRG00000039777) ENSSGRG00000039787 OSBPL5 (ENSSGRG00000039818) phlda2 (ENSSGRG00000041036) nap1l4a (ENSSGRG00000041037) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l 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ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.f ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000169159 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00950000182844.b.b.b.b ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368 ENSGT00940000155200.cc.a ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 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ENSGT00390000000453 ENSGT00390000005855 ENSGT00390000001368.m ENSGT00940000155200.cc.b.a ENSGT00940000155200.cc.b.b ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00940000155871 ENSGT00530000065415 ENSGT00390000011116 ENSGT00940000158339 ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626.`b.b ENSGT00940000156626.`b.a ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT00940000160004.f Mexicana tetra MODERN SPECIES 23 ENSAMXG00000029137 FBXO31 (ENSAMXG00000036671) ENSAMXG00000035097 ENSAMXG00000030702 ENSAMXG00000029035 ENSAMXG00000042542 ENSAMXG00000038653 ENSAMXG00000042943 ENSAMXG00000037266 ENSAMXG00000017283 ENSAMXG00000037992 ENSAMXG00000017252 RASSF8 (ENSAMXG00000017235) kras 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ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h ##21 ENSGT00940000177178 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 1560 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h ##21 ENSGT00940000177178 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 1182 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h ##21 ENSGT00940000177178 Golden-line barbel MODERN SPECIES 198 ENSSGRG00000039108 dynlrb2 (ENSSGRG00000039107) FBXO31 (ENSSGRG00000039106) ENSSGRG00000039103 ENSSGRG00000039102 pdcd2l (ENSSGRG00000039101) ENSSGRG00000039100 ENSSGRG00000039099 kras (ENSSGRG00000039029) RASSF8 (ENSSGRG00000039023) ENSSGRG00000039021 ENSSGRG00000039020 tnni2a.1 (ENSSGRG00000039014) ##21 tnni2a.2 (ENSSGRG00000039009) ##21 tnni2a.3 (ENSSGRG00000039007) ##21 ENSSGRG00000039005 ##21 ENSSGRG00000039001 ENSSGRG00000039000 ENSSGRG00000038998 myod1 (ENSSGRG00000038991) zgc:172145 (ENSSGRG00000038989) ush1c (ENSSGRG00000038778) Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h ##21 Channel catfish MODERN SPECIES 5 rhcg1 (ENSIPUG00000004004) polg (ENSIPUG00000004036) fanci (ENSIPUG00000004103) FBXO31 (ENSIPUG00000004197) ENSIPUG00000004211 rassf8 (ENSIPUG00000004240) kras (ENSIPUG00000004259) znf469 (ENSIPUG00000004306) ENSIPUG00000004314 banp (ENSIPUG00000004342) PDCD2L (ENSIPUG00000004421) SYT8 (ENSIPUG00000004448) ENSIPUG00000004455 TNNI2 (ENSIPUG00000004462) ##21 tnni2a.2 (ENSIPUG00000004477) ##21 TNNI2 (ENSIPUG00000004491) ##21 tnni2a.3 (ENSIPUG00000004514) ##21 tnni2 (ENSIPUG00000004539) ##21 ENSIPUG00000004583 ENSIPUG00000004645 ENSIPUG00000004650 tnnt3a (ENSIPUG00000004658) myod1 (ENSIPUG00000004693) zgc:172145 (ENSIPUG00000004699) ush1c (ENSIPUG00000004724) abcc8 (ENSIPUG00000004801) kcnj11 (ENSIPUG00000005009) mob2a (ENSIPUG00000005022) dusp8a (ENSIPUG00000005041) ENSIPUG00000005070 ENSIPUG00000005122 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h ##21 Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h ##21 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1246 ENSAMXG00000039263 banp (ENSAMXG00000017170) pdcd2l (ENSAMXG00000017155) ENSAMXG00000017150 ENSAMXG00000037298 TNNI2 (ENSAMXG00000042297) ##21 tnni2a.4 (ENSAMXG00000017111) ##21 tnni2a.1 (ENSAMXG00000035063) ##21 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000155200 ENSGT00940000158339 ENSGT00390000011116 ENSGT00530000065415 ENSGT00940000155871 ENSGT00950000182839.B.a.a.l ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234858 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.h ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.g.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00950000183002.A.f ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b.d ENSGT00940000159535.i ENSGT00440000039564.a.b.i ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.a ENSGT00940000164715.b ENSGT00940000160745.d ENSGT00390000007739 Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000015753 ENSCHAG00000015784 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) ##21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) ##21 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) ##21 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) MYOD1 (ENSCHAG00000016826) zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) ush1c (ENSCHAG00000016858) abcc8 (ENSCHAG00000017040) kcnj11 (ENSCHAG00000020282) Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000015739 ENSCHAG00000015753 ENSCHAG00000015784 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) ##21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) ##21 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) ##21 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) MYOD1 (ENSCHAG00000016826) zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) ush1c (ENSCHAG00000016858) abcc8 (ENSCHAG00000017040) Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000015577 ENSCHAG00000015724 ENSCHAG00000015739 ENSCHAG00000015753 ENSCHAG00000015784 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) ##21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) ##21 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) ##21 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) MYOD1 (ENSCHAG00000016826) zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000015784 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) ##21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) ##21 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) ##21 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) MYOD1 (ENSCHAG00000016826) zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) ush1c (ENSCHAG00000016858) abcc8 (ENSCHAG00000017040) kcnj11 (ENSCHAG00000020282) mob2a (ENSCHAG00000020294) Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000015724 ENSCHAG00000015739 ENSCHAG00000015753 ENSCHAG00000015784 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) ##21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) ##21 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) ##21 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) MYOD1 (ENSCHAG00000016826) zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) ush1c (ENSCHAG00000016858) Atlantic herring MODERN SPECIES 19 banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) ##21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016334) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016374) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016464) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016508) ##21 tnni2a.4 (ENSCHAG00000016547) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016750) ##21 ENSCHAG00000016765 ENSCHAG00000016791 tnnt3a (ENSCHAG00000016794) MYOD1 (ENSCHAG00000016826) zgc:172145 (ENSCHAG00000016847) ush1c (ENSCHAG00000016858) abcc8 (ENSCHAG00000017040) kcnj11 (ENSCHAG00000020282) mob2a (ENSCHAG00000020294) dusp8a (ENSCHAG00000020357) ENSCHAG00000020362 Atlantic herring MODERN SPECIES 19 pdcd2l (ENSCHAG00000015799) banp (ENSCHAG00000015817) ENSCHAG00000015837 kras (ENSCHAG00000015882) RASSF8 (ENSCHAG00000015912) ENSCHAG00000015915 SYT8 (ENSCHAG00000015924) ENSCHAG00000015954 tnni2a.1 (ENSCHAG00000015975) ##21 tnni2a.2 (ENSCHAG00000016153) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016160) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016193) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016209) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016273) ##21 TNNI2 (ENSCHAG00000016279) ##21 TNNI2 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ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.b ENSGT00940000167812 ENSGT00940000158477.a.b ENSGT00950000182959.b.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00920000149457 ENSGT00940000157490 ENSGT00950000183002.A ENSGT00940000156626 ENSGT00990000203615.a.a.a.b ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159535 ENSGT00440000039564.a.b ENSGT00940000160333 ENSGT00940000153362.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 564 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.b ENSGT00940000157490 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 261 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.a.a ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 303 ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 161 ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 136 ENSHCOG00000007050 prc1b (ENSHCOG00000007079) ptpmt1 (ENSHCOG00000000812) ndufs3 (ENSHCOG00000007117) slc22a18 (ENSHCOG00000007148) HACD3 (ENSHCOG00000000227) SLC24A1 (ENSHCOG00000007190) ENSHCOG00000007227 socs4 (ENSHCOG00000007249) wdhd1 (ENSHCOG00000007286) ENSHCOG00000007299 gch1 (ENSHCOG00000007311) SAMD4A (ENSHCOG00000007338) pacsin3 (ENSHCOG00000007361) GLG1 (ENSHCOG00000007399) tnni2b.1 (ENSHCOG00000007414) ##21 aph1b (ENSHCOG00000007434) OTOG (ENSHCOG00000007493) myod1 (ENSHCOG00000007505) TNNT3 (ENSHCOG00000007514) ENSHCOG00000007520 foxr1 (ENSHCOG00000007530) atp6v0d1 (ENSHCOG00000000254) ENSHCOG00000007547 ENSHCOG00000000257 ENSHCOG00000007798 ENSHCOG00000007856 ENSHCOG00000007893 c1qtnf4 (ENSHCOG00000007905) ENSHCOG00000007911 ist1 (ENSHCOG00000007934) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000161832.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.f.a ENSGT00940000163716.c.b.d.b.a ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.f.a ENSGT00940000163716.c.b.d.b.a ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 94 ENSKMAG00000020454 ENSKMAG00000020462 NR2E3 (ENSKMAG00000020481) slc22a18 (ENSKMAG00000020503) HACD3 (ENSKMAG00000020519) SAMD4A (ENSKMAG00000020543) gch1 (ENSKMAG00000020574) wdhd1 (ENSKMAG00000020604) socs4 (ENSKMAG00000020674) ENSKMAG00000020680 dennd4a (ENSKMAG00000020759) SLC24A1 (ENSKMAG00000020920) ero1a (ENSKMAG00000020950) pacsin3 (ENSKMAG00000021024) glg1b (ENSKMAG00000021075) tnni2b.1 (ENSKMAG00000021151) ##21 aph1b (ENSKMAG00000021168) OTOG (ENSKMAG00000021189) myod1 (ENSKMAG00000021238) TNNT3 (ENSKMAG00000021246) ENSKMAG00000000140 ENSKMAG00000000158 ENSKMAG00000000224 foxr1 (ENSKMAG00000000233) atp6v0d1 (ENSKMAG00000000274) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1616 WDHD1 (ENSNFUG00015004515) socs4 (ENSNFUG00015004506) ENSNFUG00015004502 dennd4a (ENSNFUG00015004412) SLC24A1 (ENSNFUG00015004331) PTPLAD1 (ENSNFUG00015004247) SLC22A18 (ENSNFUG00015004215) NR2E3 (ENSNFUG00015004197) STRA6 (ENSNFUG00015004168) ENSNFUG00015004153 MPPED2 (ENSNFUG00015004145) ZDHHC13 (ENSNFUG00015004092) CSRP3 (ENSNFUG00015004067) E2F8 (ENSNFUG00015004061) ENSNFUG00015004056 tnni2b.1 (ENSNFUG00015004041) ##21 ENSNFUG00015004036 aph1b (ENSNFUG00015004030) myod1 (ENSNFUG00015003991) TNNT3 (ENSNFUG00015003986) ENSNFUG00015003982 ENSNFUG00015003978 ENSNFUG00015003951 ENSNFUG00015003937 ENSNFUG00015003935 ENSNFUG00015003933 rnaset2 (ENSNFUG00015003928) MYOM2 (ENSNFUG00015003834) ENSNFUG00015003786 CSMD1 (ENSNFUG00015004499) ENSNFUG00015004374 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b.d.b.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.f.a ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000163716.c.b.d.b.b ENSGT00940000163716.c.b.d.a ENSGT00940000163716.c.b.c.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.f.b ENSGT00940000163716.c.b.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b.e ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030.l ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT00940000160333 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000160967.f ENSGT00390000007681.b.a.a Platyfish MODERN SPECIES 18 ENSXMAG00000028886 ENSXMAG00000017982 ENSXMAG00000019966 atp6v0d1 (ENSXMAG00000018770) foxr1 (ENSXMAG00000029193) ENSXMAG00000025525 ENSXMAG00000023777 ENSXMAG00000028813 ENSXMAG00000026706 ENSXMAG00000029307 ENSXMAG00000028640 TNNT3 (ENSXMAG00000027991) myod1 (ENSXMAG00000009780) OTOG (ENSXMAG00000009782) aph1b (ENSXMAG00000009804) tnni2b.1 (ENSXMAG00000009816) ##21 socs4 (ENSXMAG00000020189) wdhd1 (ENSXMAG00000009823) gch1 (ENSXMAG00000009846) SAMD4A (ENSXMAG00000009864) ENSXMAG00000023464 ero1a (ENSXMAG00000029457) pacsin3 (ENSXMAG00000022122) glg1b (ENSXMAG00000010415) dennd4a (ENSXMAG00000010376) SLC24A1 (ENSXMAG00000010371) 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ENSGT00940000163716.c.b.d.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b.e ENSGT00940000161051.a.a.b.a ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00940000163460.a.a.a.a.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030.l ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT00940000160333 ENSGT01090000260059.a.b.b.a.a.a.a.a.a.b.a.g.a.a.b.a.b.b.a.a.b.b.b.a.a.c ENSGT01090000260059.a.b.b.a.a.a.a.a.a.b.a.g.a.a.b.a.b.b.a.a.b.b.b.a.a.d.a ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000153246.a.a.a.d Sailfin molly MODERN SPECIES 1888 OTOG (ENSPLAG00000021180) aph1b (ENSPLAG00000021201) tnni2b.1 (ENSPLAG00000021212) ##21 socs4 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(ENSAPOG00000009198) ##21 aph1b (ENSAPOG00000009227) OTOG (ENSAPOG00000009407) myod1 (ENSAPOG00000000266) TNNT3 (ENSAPOG00000009460) ENSAPOG00000009481 ENSAPOG00000009501 ENSAPOG00000009515 ENSAPOG00000009535 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1388 SAMD4A (ENSSPAG00000007623) ero1a (ENSSPAG00000007676) pacsin3 (ENSSPAG00000007712) glg1b (ENSSPAG00000007737) TNNI2 (ENSSPAG00000007805) ##21 aph1b (ENSSPAG00000007820) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000161832.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a.o.b ENSGT00940000163716.c.b.b ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000161832.a ENSGT00940000163716.c.b.a ENSGT00940000163716.c.b.b ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030.o ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000177294 ENSGT00940000153901.a.b.a Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000161832.a ENSGT00940000163716.c.b.a ENSGT00940000163716.c.b.b ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030.o ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT00490000044642.a.a.a.a.a.b.a.a.b.h Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000161832.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a.o.b ENSGT01020000230593.B.a.a.b.a ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202.c ENSGT00390000002030.o ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT00490000044642.a.a.a.a.a.b.a.a.b.h Eastern happy MODERN SPECIES atp6v0d1 (ENSACLG00000008763) foxr1 (ENSACLG00000008771) ENSACLG00000008774 ENSACLG00000008777 ##35 HACD3 (ENSACLG00000008783) SLC24A1 (ENSACLG00000008823) ENSACLG00000008842 dennd4a (ENSACLG00000008854) socs4 (ENSACLG00000009024) wdhd1 (ENSACLG00000009036) gch1 (ENSACLG00000009069) SAMD4A (ENSACLG00000009089) ero1a (ENSACLG00000009207) pacsin3 (ENSACLG00000009240) glg1b (ENSACLG00000009342) tnni2b.1 (ENSACLG00000009427) ##21 aph1b (ENSACLG00000009435) OTOG (ENSACLG00000009449) myod1 (ENSACLG00000009487) TNNT3 (ENSACLG00000009498) ENSACLG00000009574 ENSACLG00000009580 ENSACLG00000009585 ENSACLG00000010176 celf1 (ENSACLG00000010181) mtfmt (ENSACLG00000010234) uqcrfs1 (ENSACLG00000010241) rasl12 (ENSACLG00000010244) ENSACLG00000010254 UBAP1L (ENSACLG00000010255) KBTBD13 (ENSACLG00000010261) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1091 c1qtnf4 (ENSMZEG00005015697) ENSMZEG00005015677 ENSMZEG00005015666 atp6v0d1 (ENSMZEG00005015650) foxr1 (ENSMZEG00005015635) HACD3 (ENSMZEG00005015600) SLC24A1 (ENSMZEG00005015586) dennd4a (ENSMZEG00005015311) socs4 (ENSMZEG00005015254) wdhd1 (ENSMZEG00005015228) gch1 (ENSMZEG00005015209) SAMD4A (ENSMZEG00005015188) ero1a (ENSMZEG00005015175) pacsin3 (ENSMZEG00005015162) glg1b (ENSMZEG00005015115) TNNI2 (ENSMZEG00005015093) ##21 aph1b (ENSMZEG00005015081) OTOG (ENSMZEG00005015041) myod1 (ENSMZEG00005015006) TNNT3 (ENSMZEG00005014820) ENSMZEG00005014810 ENSMZEG00005014803 ENSMZEG00005014794 ENSMZEG00005014786 ENSMZEG00005014779 ENSMZEG00005014767 slc22a18 (ENSMZEG00005014753) NR2E3 (ENSMZEG00005014737) ENSMZEG00005014718 ENSMZEG00005014709 mpped2a (ENSMZEG00005014683) P. nyererei MODERN SPECIES 604 SLC24A1 (ENSPNYG00000018952) dennd4a (ENSPNYG00000018998) socs4 (ENSPNYG00000019064) wdhd1 (ENSPNYG00000019115) gch1 (ENSPNYG00000019405) SAMD4A (ENSPNYG00000019428) ero1a (ENSPNYG00000019483) pacsin3 (ENSPNYG00000019526) glg1b 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ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000163723.A.f.b ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000155568.l ENSGT00390000017790 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000155405 ENSGT00940000165890 ENSGT00940000157369.b ENSGT00390000005764 ENSGT00530000063106.B ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00940000154914 ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000155907.b.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000163723.A.f.b ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000155568.l ENSGT00390000017790 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000155405 ENSGT00940000165890 ENSGT00940000157369.b ENSGT00390000005764 ENSGT00530000063106.B ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00940000154914 ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000155907.b.b Climbing perch MODERN SPECIES 16 mpped2a (ENSATEG00000021765) ENSATEG00000021774 ENSATEG00000021798 ENSATEG00000021837 ENSATEG00000021851 HACD3 (ENSATEG00000021866) SLC24A1 (ENSATEG00000021887) DENND4A (ENSATEG00000021908) socs4 (ENSATEG00000021970) wdhd1 (ENSATEG00000021986) gch1 (ENSATEG00000022027) SAMD4A (ENSATEG00000022040) ero1a (ENSATEG00000022081) ENSATEG00000022101 ENSATEG00000022132 ENSATEG00000022204 ##21 ENSATEG00000022233 ENSATEG00000022248 ENSATEG00000022262 ENSATEG00000022291 ENSATEG00000022355 crybgx (ENSATEG00000022426) lctla (ENSATEG00000022437) tipin (ENSATEG00000022453) dis3l (ENSATEG00000022464) ENSATEG00000022505 RAB11A (ENSATEG00000023730) ENSATEG00000022546 ENSATEG00000022559 ENSATEG00000022577 ENSATEG00000022648 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 14 NAV2 (ENSBSLG00000005804) e2f8 (ENSBSLG00000005446) csrp3 (ENSBSLG00000005399) zdhhc13 (ENSBSLG00000005203) mpped2a (ENSBSLG00000004960) ENSBSLG00000004906 ENSBSLG00000004802 ENSBSLG00000004363 dennd4a (ENSBSLG00000004135) socs4 (ENSBSLG00000004085) gch1 (ENSBSLG00000004073) SAMD4A (ENSBSLG00000004019) wdhd1 (ENSBSLG00000003779) pacsin3 (ENSBSLG00000003052) glg1b (ENSBSLG00000002553) tnni2b.1 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(ENSMAMG00000017203) dis3l (ENSMAMG00000017229) ENSMAMG00000017293 RAB11A (ENSMAMG00000027414) ENSMAMG00000017337 ENSMAMG00000025603 ENSMAMG00000017358 ENSMAMG00000026774 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000007681.b.a.a 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ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2714 sema6dl (ENSSLDG00000021909) ENSSLDG00000021886 slc24a5 (ENSSLDG00000021873) myef2 (ENSSLDG00000021862) ENSSLDG00000021852 CTXN2 (ENSSLDG00000021847) SLC12A1 (ENSSLDG00000021800) dennd4a (ENSSLDG00000021745) socs4 (ENSSLDG00000021736) wdhd1 (ENSSLDG00000021689) gch1 (ENSSLDG00000021679) SAMD4A (ENSSLDG00000021630) ero1a (ENSSLDG00000021600) pacsin3 (ENSSLDG00000021581) glg1b (ENSSLDG00000021532) TNNI2 (ENSSLDG00000021512) ##21 aph1b (ENSSLDG00000021492) OTOG (ENSSLDG00000021395) myod1 (ENSSLDG00000021376) TNNT3 (ENSSLDG00000021245) Greater amberjack MODERN SPECIES 3 ENSSDUG00000016457 ENSSDUG00000016485 NR2E3 (ENSSDUG00000016573) slc22a18 (ENSSDUG00000016604) HACD3 (ENSSDUG00000016623) SLC24A1 (ENSSDUG00000016668) dennd4a (ENSSDUG00000016708) socs4 (ENSSDUG00000016907) wdhd1 (ENSSDUG00000016996) gch1 (ENSSDUG00000017494) SAMD4A (ENSSDUG00000017510) ENSSDUG00000017549 ero1a (ENSSDUG00000017566) pacsin3 (ENSSDUG00000017630) glg1b (ENSSDUG00000017681) ENSSDUG00000017775 ##21 aph1b (ENSSDUG00000017793) OTOG (ENSSDUG00000017868) myod1 (ENSSDUG00000018276) TNNT3 (ENSSDUG00000018283) ENSSDUG00000018305 ENSSDUG00000018321 ENSSDUG00000018331 foxr1 (ENSSDUG00000018344) atp6v0d1 (ENSSDUG00000018360) ENSSDUG00000018375 ENSSDUG00000018386 ENSSDUG00000018406 ENSSDUG00000018427 ENSSDUG00000018441 c1qtnf4 (ENSSDUG00000018457) Barramundi perch MODERN SPECIES 96 mpped2a (ENSLCAG00010017716) ENSLCAG00010017710 ENSLCAG00010017694 NR2E3 (ENSLCAG00010017688) slc22a18 (ENSLCAG00010017678) HACD3 (ENSLCAG00010017676) SLC24A1 (ENSLCAG00010017673) dennd4a (ENSLCAG00010017670) socs4 (ENSLCAG00010017668) wdhd1 (ENSLCAG00010017654) gch1 (ENSLCAG00010017650) SAMD4A (ENSLCAG00010017642) ero1a (ENSLCAG00010017638) pacsin3 (ENSLCAG00010017636) glg1b (ENSLCAG00010017596) tnni2b.1 (ENSLCAG00010017526) ##21 aph1b (ENSLCAG00010017523) OTOG (ENSLCAG00010017486) myod1 (ENSLCAG00010017465) TNNT3 (ENSLCAG00010017455) ENSLCAG00010017452 ENSLCAG00010017447 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 Turbot MODERN SPECIES 17 zdhhc13 (ENSSMAG00000008013) mpped2a (ENSSMAG00000033645) ENSSMAG00000007996 ENSSMAG00000007972 ENSSMAG00000007954 ENSSMAG00000007929 HACD3 (ENSSMAG00000007882) SLC24A1 (ENSSMAG00000007857) DENND4A (ENSSMAG00000007433) wdhd1 (ENSSMAG00000007346) ENSSMAG00000034634 SAMD4A (ENSSMAG00000007254) ero1a (ENSSMAG00000007207) ENSSMAG00000007168 ENSSMAG00000006788 ENSSMAG00000006609 ##21 ENSSMAG00000006568 ENSSMAG00000027873 ENSSMAG00000006529 ENSSMAG00000006392 ENSSMAG00000006376 ENSSMAG00000006344 ENSSMAG00000006320 ENSSMAG00000027949 ENSSMAG00000006274 ENSSMAG00000006222 c1qtnf4 (ENSSMAG00000030864) ENSSMAG00000006194 ptpmt1 (ENSSMAG00000006187) prc1b (ENSSMAG00000006152) vps33b (ENSSMAG00000006116) Tongue sole MODERN SPECIES 25 adcy7 (ENSCSEG00000011379) tent4b (ENSCSEG00000011367) nip7 (ENSCSEG00000011356) ENSCSEG00000011338 ENSCSEG00000011313 ENSCSEG00000011305 BRSK2 (ENSCSEG00000011247) ENSCSEG00000011220 CORO2B (ENSCSEG00000011186) anp32a (ENSCSEG00000011176) glceb (ENSCSEG00000011164) paqr5a (ENSCSEG00000011095) ero1a (ENSCSEG00000011060) pacsin3 (ENSCSEG00000011036) glg1b (ENSCSEG00000010964) tnni2b.1 (ENSCSEG00000010949) ##21 aph1b (ENSCSEG00000010946) OTOG (ENSCSEG00000010918) myod1 (ENSCSEG00000010907) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161051.a.a.b.a.c ENSGT00940000161832.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161051.a.a.b.a.c ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 Tetraodon MODERN SPECIES 20 zdhhc13 (ENSTNIG00000002121) mpped2a (ENSTNIG00000005247) ENSTNIG00000005152 ENSTNIG00000005151 NR2E3 (ENSTNIG00000005150) HACD3 (ENSTNIG00000001644) SLC24A1 (ENSTNIG00000018806) dennd4a (ENSTNIG00000018805) socs4 (ENSTNIG00000002432) wdhd1 (ENSTNIG00000018803) gch1 (ENSTNIG00000018802) SAMD4A (ENSTNIG00000018801) ero1a (ENSTNIG00000018800) pacsin3 (ENSTNIG00000018799) glg1b (ENSTNIG00000018797) tnni2b.1 (ENSTNIG00000018796) ##21 aph1b (ENSTNIG00000018795) OTOG (ENSTNIG00000018794) myod1 (ENSTNIG00000018793) TNNT3 (ENSTNIG00000018792) ENSTNIG00000018791 foxr1 (ENSTNIG00000018790) atp6v0d1 (ENSTNIG00000018789) ENSTNIG00000018788 ENSTNIG00000018787 ENSTNIG00000018786 c1qtnf4 (ENSTNIG00000018785) ndufs3 (ENSTNIG00000018784) prc1b (ENSTNIG00000018783) ENSTNIG00000018782 hddc3 (ENSTNIG00000018781) Fugu MODERN SPECIES 4 mpped2a (ENSTRUG00000015686) ENSTRUG00000020949 ENSTRUG00000015637 NR2E3 (ENSTRUG00000015582) slc22a18 (ENSTRUG00000015561) HACD3 (ENSTRUG00000015510) SLC24A1 (ENSTRUG00000015482) dennd4a (ENSTRUG00000015436) socs4 (ENSTRUG00000015433) wdhd1 (ENSTRUG00000015390) gch1 (ENSTRUG00000015367) SAMD4A (ENSTRUG00000015288) ero1a (ENSTRUG00000015220) pacsin3 (ENSTRUG00000015184) glg1b (ENSTRUG00000015083) tnni2b.1 (ENSTRUG00000015041) ##21 aph1b (ENSTRUG00000014985) myod1 (ENSTRUG00000014891) TNNT3 (ENSTRUG00000014861) ENSTRUG00000021513 ENSTRUG00000031897 foxr1 (ENSTRUG00000014847) ENSTRUG00000014811 ENSTRUG00000014775 fgc6ast1 (ENSTRUG00000014710) c1qtnf4 (ENSTRUG00000030667) ndufs3 (ENSTRUG00000014669) ptpmt1 (ENSTRUG00000021942) prc1b (ENSTRUG00000014588) vps33b (ENSTRUG00000014506) hddc3 (ENSTRUG00000021476) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 Ballan wrasse MODERN SPECIES 142 ENSLBEG00000024342 ENSLBEG00000024389 NR2E3 (ENSLBEG00000024468) slc22a18 (ENSLBEG00000024489) HACD3 (ENSLBEG00000024570) SLC24A1 (ENSLBEG00000024638) dennd4a (ENSLBEG00000024700) socs4 (ENSLBEG00000024771) wdhd1 (ENSLBEG00000024847) gch1 (ENSLBEG00000024950) SAMD4A (ENSLBEG00000025062) ero1a (ENSLBEG00000025153) pacsin3 (ENSLBEG00000025230) glg1b (ENSLBEG00000025302) tnni2b.1 (ENSLBEG00000025369) ##21 aph1b (ENSLBEG00000025401) ENSLBEG00000025428 ENSLBEG00000025444 ENSLBEG00000025461 myod1 (ENSLBEG00000025479) TNNT3 (ENSLBEG00000025517) ENSLBEG00000025581 ENSLBEG00000025615 foxr1 (ENSLBEG00000025631) atp6v0d1 (ENSLBEG00000025653) ENSLBEG00000025684 ENSLBEG00000025703 ENSLBEG00000025718 c1qtnf4 (ENSLBEG00000025735) ndufs3 (ENSLBEG00000025754) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b ENSGT00940000156813 ENSGT00390000011608 Lumpfish MODERN SPECIES 18 TSPAN18 (ENSCLMG00005003451) ENSCLMG00005003428 ENSCLMG00005003412 ENSCLMG00005003411 ENSCLMG00005003410 ENSCLMG00005003408 ENSCLMG00005003406 ENSCLMG00005003404 socs4 (ENSCLMG00005003403) wdhd1 (ENSCLMG00005003392) gch1 (ENSCLMG00005003387) SAMD4A (ENSCLMG00005003385) ero1a (ENSCLMG00005003328) pacsin3 (ENSCLMG00005003323) glg1b (ENSCLMG00005003173) tnni2b.1 (ENSCLMG00005003095) ##21 aph1b (ENSCLMG00005003089) OTOG (ENSCLMG00005003067) MYOD1 (ENSCLMG00005003056) TNNT3 (ENSCLMG00005003049) ENSCLMG00005003043 ENSCLMG00005003037 ENSCLMG00005003032 foxr1 (ENSCLMG00005003021) atp6v0d1 (ENSCLMG00005002959) ENSCLMG00005002921 ENSCLMG00005002881 c1qtnf4 (ENSCLMG00005002868) ENSCLMG00005002846 ENSCLMG00005002820 ENSCLMG00005012057 Stickleback MODERN SPECIES 1 ccnb2 (ENSGACG00000017292) crybgx (ENSGACG00000017294) ENSGACG00000017296 ENSGACG00000017297 ENSGACG00000017302 dapk2a (ENSGACG00000017307) ENSGACG00000017310 ENSGACG00000017313 dis3l (ENSGACG00000017315) socs4 (ENSGACG00000017319) wdhd1 (ENSGACG00000017321) gch1 (ENSGACG00000017325) ENSGACG00000017331 pacsin3 (ENSGACG00000017333) GLG1 (ENSGACG00000017337) tnni2b.1 (ENSGACG00000017338) ##21 aph1b (ENSGACG00000017339) OTOG (ENSGACG00000017343) myod1 (ENSGACG00000017350) TNNT3 (ENSGACG00000017352) ENSGACG00000017354 foxr1 (ENSGACG00000017356) atp6v0d1 (ENSGACG00000017358) ENSGACG00000017378 c1qtnf4 (ENSGACG00000017381) ndufs3 (ENSGACG00000017384) ptpmt1 (ENSGACG00000017391) prc1b (ENSGACG00000017394) vps33b (ENSGACG00000017403) hddc3 (ENSGACG00000017413) mfap1 (ENSGACG00000017419) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00960000186692 ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 ENSGT00390000009453.fb.b Pike perch MODERN SPECIES 42 mpped2a (ENSSLUG00000014219) ENSSLUG00000014232 ENSSLUG00000014234 NR2E3 (ENSSLUG00000014245) slc22a18 (ENSSLUG00000014266) HACD3 (ENSSLUG00000014295) SLC24A1 (ENSSLUG00000014312) dennd4a (ENSSLUG00000014340) socs4 (ENSSLUG00000014357) wdhd1 (ENSSLUG00000014371) gch1 (ENSSLUG00000014411) SAMD4A (ENSSLUG00000014423) ero1a (ENSSLUG00000014452) pacsin3 (ENSSLUG00000014868) glg1b (ENSSLUG00000014927) tnni2b.1 (ENSSLUG00000015288) ##21 aph1b (ENSSLUG00000015292) OTOG (ENSSLUG00000015304) myod1 (ENSSLUG00000015360) TNNT3 (ENSSLUG00000015377) ENSSLUG00000015385 foxr1 (ENSSLUG00000015392) atp6v0d1 (ENSSLUG00000015419) ENSSLUG00000015470 ENSSLUG00000015477 ENSSLUG00000015482 c1qtnf4 (ENSSLUG00000015485) ndufs3 (ENSSLUG00000015488) ptpmt1 (ENSSLUG00000015495) prc1b (ENSSLUG00000015534) vps33b (ENSSLUG00000015798) Channel bull blenny MODERN SPECIES 17 mpped2a (ENSCGOG00000001116) ENSCGOG00000001115 ENSCGOG00000001114 NR2E3 (ENSCGOG00000001111) slc22a18 (ENSCGOG00000001108) HACD3 (ENSCGOG00000001094) SLC24A1 (ENSCGOG00000001085) dennd4a (ENSCGOG00000000880) socs4 (ENSCGOG00000000851) wdhd1 (ENSCGOG00000000697) gch1 (ENSCGOG00000000646) SAMD4A (ENSCGOG00000000470) ero1a (ENSCGOG00000000411) pacsin3 (ENSCGOG00000000368) glg1b (ENSCGOG00000000287) tnni2b.1 (ENSCGOG00000000244) ##21 aph1b (ENSCGOG00000000232) OTOG (ENSCGOG00000000174) myod1 (ENSCGOG00000000126) TNNT3 (ENSCGOG00000000102) ENSCGOG00000000089 ENSCGOG00000000084 ENSCGOG00000000074 ENSCGOG00000019539 foxr1 (ENSCGOG00000019537) atp6v0d1 (ENSCGOG00000019523) ENSCGOG00000019501 c1qtnf4 (ENSCGOG00000019498) ndufs3 (ENSCGOG00000019478) ptpmt1 (ENSCGOG00000019475) prc1b (ENSCGOG00000019399) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000161051.a.a.b.a.c ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 Gilthead seabream MODERN SPECIES 18 ENSSAUG00010011775 ENSSAUG00010011783 NR2E3 (ENSSAUG00010011796) slc22a18 (ENSSAUG00010011801) HACD3 (ENSSAUG00010011805) SLC24A1 (ENSSAUG00010011812) dennd4a (ENSSAUG00010011836) GFUS (ENSSAUG00010012034) socs4 (ENSSAUG00010012526) wdhd1 (ENSSAUG00010012535) gch1 (ENSSAUG00010012542) SAMD4A (ENSSAUG00010012545) ero1a (ENSSAUG00010012573) pacsin3 (ENSSAUG00010012825) glg1b (ENSSAUG00010012845) TNNI2 (ENSSAUG00010012899) ##21 aph1b (ENSSAUG00010012901) myod1 (ENSSAUG00010012905) TNNT3 (ENSSAUG00010012907) ENSSAUG00010012908 ENSSAUG00010012909 ENSSAUG00010012913 ENSSAUG00010012915 ppef1 (ENSSAUG00010012918) ENSSAUG00010012923 ENSSAUG00010012925 cdkl5 (ENSSAUG00010012926) SCML2 (ENSSAUG00010012942) NHS (ENSSAUG00010012957) ace2 (ENSSAUG00010013032) ENSSAUG00010017573 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000160333 ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000166202 ENSGT00390000002030 ENSGT00390000013481.c.a ENSGT00940000157933 ENSGT00390000007753.b ENSGT00950000182973.b.a ENSGT00390000011262.e.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000157490 ENSGT00950000182959.b.b.e.b ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000163460.a.a.a.a ENSGT00940000177294 ENSGT00960000186692 ENSGT00940000162993 ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000163716.c.b ENSGT00940000154856.A.a.c.b ENSGT00940000161832.a ENSGT00390000017480 ENSGT00390000014065 Large yellow croaker MODERN SPECIES 480 csrp3 (ENSLCRG00005002604) mpped2a (ENSLCRG00005002608) ENSLCRG00005002609 ENSLCRG00005002613 NR2E3 (ENSLCRG00005002635) slc22a18 (ENSLCRG00005002671) HACD3 (ENSLCRG00005002710) SLC24A1 (ENSLCRG00005002811) dennd4a (ENSLCRG00005002845) socs4 (ENSLCRG00005002924) gch1 (ENSLCRG00005002929) SAMD4A (ENSLCRG00005002932) ero1a (ENSLCRG00005002944) pacsin3 (ENSLCRG00005002960) glg1b (ENSLCRG00005002969) tnni2b.1 (ENSLCRG00005003007) ##21 aph1b (ENSLCRG00005003009) aph1b (ENSLCRG00005003014) OTOG (ENSLCRG00005003017) nqo1 (ENSLCRG00005003029) ENSLCRG00005003039 ENSLCRG00005003042 ENSLCRG00005003045 ENSLCRG00005003048 rpl12 (ENSLCRG00005003051) pole3 (ENSLCRG00005003071) kmt5b (ENSLCRG00005003072) ccnb2 (ENSLCRG00005003075) cd82a (ENSLCRG00005003078) tspan18a (ENSLCRG00005003082) ENSLCRG00005003084 European seabass MODERN SPECIES 18 ENSDLAG00005026438 ENSDLAG00005031744 ENSDLAG00005017548 ENSDLAG00005017617 ENSDLAG00005030198 HACD3 (ENSDLAG00005032938) SLC24A1 (ENSDLAG00005029857) DENND4A 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(ENSMMDG00005002738) ENSMMDG00005002761 ENSMMDG00005002781 Cod MODERN SPECIES 5 ENSGMOG00000036674 dhx38 (ENSGMOG00000002840) zfhx3b (ENSGMOG00000002909) ENSGMOG00000002967 ENSGMOG00000003144 ENSGMOG00000003176 ENSGMOG00000003209 ENSGMOG00000006331 ENSGMOG00000006346 ENSGMOG00000025333 ENSGMOG00000006378 ENSGMOG00000025002 ENSGMOG00000006402 ENSGMOG00000018911 ENSGMOG00000018961 tnni2b.1 (ENSGMOG00000018981) ##21 ENSGMOG00000028561 TNNT3 (ENSGMOG00000011393) ENSGMOG00000035611 ENSGMOG00000011350 ENSGMOG00000011343 ENSGMOG00000013397 spon1a (ENSGMOG00000013410) ENSGMOG00000012262 hipk3b (ENSGMOG00000012267) cstf3 (ENSGMOG00000012275) QSER1 (ENSGMOG00000024870) prrg4 (ENSGMOG00000012288) eif3m (ENSGMOG00000012291) wt1b (ENSGMOG00000012296) pax6b (ENSGMOG00000012304) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00390000002381.b.c ENSGT00940000156938.e ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000159150 ENSGT00940000155010.a ENSGT00390000004417.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00940000178634 ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01000000216979 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.a.a ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914.vb ENSGT00940000155333.A.a Northern pike MODERN SPECIES 1 IP6K1 (ENSELUG00000018463) ENSELUG00000031353 ENSELUG00000028070 ENSELUG00000032595 ENSELUG00000018487 psmd13 (ENSELUG00000018515) sirt3 (ENSELUG00000018526) drd4b (ENSELUG00000018550) ENSELUG00000018575 ctsd (ENSELUG00000018601) ENSELUG00000028989 ENSELUG00000027344 ENSELUG00000033770 ENSELUG00000028980 ENSELUG00000028322 tnni2b.1 (ENSELUG00000018719) ##21 ENSELUG00000018743 ##21 ENSELUG00000018803 ENSELUG00000026443 TNNT3 (ENSELUG00000018827) MYOD1 (ENSELUG00000018844) OTOG (ENSELUG00000018933) aph1b (ENSELUG00000018962) ENSELUG00000018968 ENSELUG00000019041 NR2E3 (ENSELUG00000019079) arih1l (ENSELUG00000019125) HACD3 (ENSELUG00000019142) SLC24A1 (ENSELUG00000019158) dennd4a (ENSELUG00000000821) RAB11B (ENSELUG00000019240) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159150.ab ENSGT00940000155010.a ENSGT01010000223078 ENSGT00390000004417.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.b ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00390000001802 ENSGT00940000159464 ENSGT00940000160974.b.d ENSGT00940000162463 ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892.f ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b.c ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.e.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01000000216979 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.a.a ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b ENSGT00940000160967.f ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B.j ENSGT00940000154914.vb ENSGT00940000155333.A.a Huchen MODERN SPECIES 5021 ENSHHUG00000049094 ENSHHUG00000049095 tnni2b.2 (ENSHHUG00000049097) ##21 Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.a ##21 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.a ##21 Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 ENSSSAG00000009794 ENSSSAG00000009832 ENSSSAG00000092045 ENSSSAG00000010218 CTSD (ENSSSAG00000010227) ENSSSAG00000040098 ENSSSAG00000095829 ENSSSAG00000013813 ENSSSAG00000110591 ENSSSAG00000114143 ENSSSAG00000120009 ENSSSAG00000111535 ENSSSAG00000096849 ENSSSAG00000102508 tnni2b.2 (ENSSSAG00000115361) ##21 TNNI2 (ENSSSAG00000009799) ##21 ENSSSAG00000108614 ENSSSAG00000084840 myod1 (ENSSSAG00000040107) TNNT3 (ENSSSAG00000010002) ENSSSAG00000096205 ENSSSAG00000113698 ENSSSAG00000104282 ENSSSAG00000094543 ENSSSAG00000101082 ENSSSAG00000072984 ENSSSAG00000099816 HACD3 (ENSSSAG00000009594) SLC24A1 (ENSSSAG00000009849) DENND4A (ENSSSAG00000100635) RAB11A (ENSSSAG00000099276) River trout MODERN SPECIES 21 ENSSTUG00000034226 ENSSTUG00000034239 MATCAP1 (ENSSTUG00000034251) csnk2a2a (ENSSTUG00000034328) SLC7A5 (ENSSTUG00000034374) ENSSTUG00000035009 psmd13 (ENSSTUG00000035024) sirt3 (ENSSTUG00000035121) ENSSTUG00000035126 drd4b (ENSSTUG00000003691) ENSSTUG00000003710 ctsd (ENSSTUG00000003756) ENSSTUG00000004269 ENSSTUG00000004274 TNNI2 (ENSSTUG00000004289) ##21 tnni2b.1 (ENSSTUG00000004312) ##21 ENSSTUG00000004360 ENSSTUG00000004371 TNNT3 (ENSSTUG00000004390) myod1 (ENSSTUG00000004466) aph1b (ENSSTUG00000004478) ENSSTUG00000004484 ENSSTUG00000004489 NR2E3 (ENSSTUG00000004529) ARIH1 (ENSSTUG00000004569) HACD3 (ENSSTUG00000004705) SLC24A1 (ENSSTUG00000004931) dennd4a (ENSSTUG00000004971) rab11a (ENSSTUG00000005754) ENSSTUG00000005780 dis3l (ENSSTUG00000005812) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000158999.k 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ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##21 ENSGT01000000216979 ENSGT00940000158477.a.a ENSGT00950000182959.b.a.a Coho salmon DUPLICATION Coho salmon MODERN SPECIES 32 ENSOKIG00005019949 ENSOKIG00005019939 ENSOKIG00005019931 ENSOKIG00005019921 MATCAP1 (ENSOKIG00005019906) ENSOKIG00005019859 ENSOKIG00005019845 ENSOKIG00005019823 psmd13 (ENSOKIG00005019710) SIRT3 (ENSOKIG00005019692) drd4b (ENSOKIG00005019681) ENSOKIG00005019667 CTSD (ENSOKIG00005018062) ENSOKIG00005017964 ENSOKIG00005017958 TNNI2 (ENSOKIG00005017950) ##21 tnni2b.1 (ENSOKIG00005017934) ##21 tnni2b.1 (ENSOKIG00005017921) ##21 ENSOKIG00005017897 TNNT3 (ENSOKIG00005017863) MYOD1 (ENSOKIG00005017854) ENSOKIG00005017845 OTOG (ENSOKIG00005017697) aph1b (ENSOKIG00005017675) ENSOKIG00005017668 ENSOKIG00005017602 NR2E3 (ENSOKIG00005043003) arih1l (ENSOKIG00005042766) HACD3 (ENSOKIG00005042645) SLC24A1 (ENSOKIG00005042621) ENSOKIG00005042607 Coho salmon MODERN SPECIES 1214 GABARAPL2 (ENSOKIG00005030715) ENSOKIG00005030643 ENSOKIG00005030608 ENSOKIG00005030599 MATCAP1 (ENSOKIG00005030586) csnk2a2a (ENSOKIG00005030555) ZNF319 (ENSOKIG00005030534) ENSOKIG00005030527 PSMD13 (ENSOKIG00005030286) sirt3 (ENSOKIG00005030244) DRD4 (ENSOKIG00005030231) ENSOKIG00005030193 ctsd (ENSOKIG00005028120) ENSOKIG00005028028 ENSOKIG00005028020 ENSOKIG00005028012 ##21 TNNI2 (ENSOKIG00005027999) ##21 Chinook salmon MODERN SPECIES 1563 TNNI2 (ENSOTSG00005032801) ##21 Salmo ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000160974.b.d.j ENSGT00940000162463.a ENSGT00940000163911.b.c.a.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.b ##21 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000158477.a.a.d ENSGT01000000216979.a ENSGT00940000158477.a.a.c ENSGT00950000182959.b.a.a ENSGT00940000157490 ENSGT00390000002049.c.b.l ENSGT00940000160967.f.b ENSGT00940000153246.a.a.a.d ENSGT00940000156926.d.b ENSGT00940000155744.t.a ENSGT00530000062962.b.a.e.a ENSGT01030000234532.B.e.b.e River trout DUPLICATION River trout MODERN SPECIES 21 GABARAPL2 (ENSSTUG00000034205) ENSSTUG00000034226 ENSSTUG00000034239 MATCAP1 (ENSSTUG00000034251) csnk2a2a (ENSSTUG00000034328) SLC7A5 (ENSSTUG00000034374) ENSSTUG00000035009 psmd13 (ENSSTUG00000035024) sirt3 (ENSSTUG00000035121) ENSSTUG00000035126 drd4b (ENSSTUG00000003691) ENSSTUG00000003710 ctsd (ENSSTUG00000003756) ENSSTUG00000004269 ENSSTUG00000004274 TNNI2 (ENSSTUG00000004289) ##21 tnni2b.1 (ENSSTUG00000004312) ##21 ENSSTUG00000004360 ENSSTUG00000004371 TNNT3 (ENSSTUG00000004390) myod1 (ENSSTUG00000004466) aph1b (ENSSTUG00000004478) ENSSTUG00000004484 ENSSTUG00000004489 NR2E3 (ENSSTUG00000004529) ARIH1 (ENSSTUG00000004569) HACD3 (ENSSTUG00000004705) SLC24A1 (ENSSTUG00000004931) dennd4a (ENSSTUG00000004971) rab11a (ENSSTUG00000005754) ENSSTUG00000005780 River trout MODERN SPECIES 3 ENSSTUG00000001246 MATCAP1 (ENSSTUG00000001264) csnk2a2a (ENSSTUG00000001279) ZNF319 (ENSSTUG00000001305) SLC7A5 (ENSSTUG00000001349) ENSSTUG00000001580 psmd13 (ENSSTUG00000001588) sirt3 (ENSSTUG00000001668) drd4b (ENSSTUG00000001673) ENSSTUG00000001681 ENSSTUG00000001686 ctsd (ENSSTUG00000001706) ENSSTUG00000001858 ENSSTUG00000001870 ENSSTUG00000001875 TNNI2 (ENSSTUG00000001889) ##21 tnni2b.1 (ENSSTUG00000001896) ##21 ENSSTUG00000001903 ENSSTUG00000001917 myod1 (ENSSTUG00000001933) OTOG (ENSSTUG00000001950) aph1b (ENSSTUG00000002066) ENSSTUG00000002075 ENSSTUG00000002080 NR2E3 (ENSSTUG00000002100) arih1l (ENSSTUG00000002114) HACD3 (ENSSTUG00000002183) SLC24A1 (ENSSTUG00000002229) dennd4a (ENSSTUG00000002300) rab11a (ENSSTUG00000004309) ENSSTUG00000004325 Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 18 ENSSSAG00000113380 ENSSSAG00000118511 ENSSSAG00000084012 CCL13 (ENSSSAG00000099932) ENSSSAG00000107416 ENSSSAG00000086363 ENSSSAG00000107601 ENSSSAG00000105539 ENSSSAG00000105548 ENSSSAG00000058230 ENSSSAG00000094753 ENSSSAG00000102956 ENSSSAG00000027269 ENSSSAG00000009981 ENSSSAG00000101599 tnni2b.2 (ENSSSAG00000010154) ##21 TNNI2 (ENSSSAG00000010176) ##21 TNNI2 (ENSSSAG00000084513) ##21 ENSSSAG00000095150 ENSSSAG00000103815 ENSSSAG00000108582 TNNT3 (ENSSSAG00000009998) ENSSSAG00000010004 ENSSSAG00000056579 ENSSSAG00000104869 ENSSSAG00000010246 ENSSSAG00000119131 ENSSSAG00000009811 ENSSSAG00000009961 ENSSSAG00000095519 HACD3 (ENSSSAG00000095799) Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 ENSSSAG00000115358 ENSSSAG00000009794 ENSSSAG00000009832 ENSSSAG00000092045 ENSSSAG00000010218 CTSD (ENSSSAG00000010227) ENSSSAG00000040098 ENSSSAG00000095829 ENSSSAG00000013813 ENSSSAG00000110591 ENSSSAG00000114143 ENSSSAG00000120009 ENSSSAG00000111535 ENSSSAG00000096849 ENSSSAG00000102508 tnni2b.2 (ENSSSAG00000115361) ##21 TNNI2 (ENSSSAG00000009799) ##21 ENSSSAG00000108614 ENSSSAG00000084840 myod1 (ENSSSAG00000040107) TNNT3 (ENSSSAG00000010002) ENSSSAG00000096205 ENSSSAG00000113698 ENSSSAG00000104282 ENSSSAG00000094543 ENSSSAG00000101082 ENSSSAG00000072984 ENSSSAG00000099816 HACD3 (ENSSSAG00000009594) SLC24A1 (ENSSSAG00000009849) DENND4A (ENSSSAG00000100635) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 542 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000158477.a.b.b ENSGT00950000182959.b.a.b ENSGT00950000182959.b.a.a ENSGT00940000157490 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 541 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.b.b ENSGT00950000182959.b.a.b ENSGT00950000182959.b.a.a ENSGT00940000157490 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000001032 pdcd5 (ENSCHAG00000001089) mvda (ENSCHAG00000001207) cyba (ENSCHAG00000001263) tcf25 (ENSCHAG00000001359) mc1r (ENSCHAG00000002013) ENSCHAG00000002030 def8 (ENSCHAG00000002070) ENSCHAG00000002366 ENSCHAG00000004200 DBNDD1 (ENSCHAG00000004207) ENSCHAG00000004218 ENSCHAG00000004224 ENSCHAG00000004256 ENSCHAG00000004279 tnni2b.1 (ENSCHAG00000004290) ##21 ENSCHAG00000004434 ENSCHAG00000004444 tnnt3b (ENSCHAG00000004458) MYOD1 (ENSCHAG00000004523) OTOG (ENSCHAG00000004569) ABCC8 (ENSCHAG00000005413) KCNJ11 (ENSCHAG00000013212) mob2b (ENSCHAG00000013224) DUSP8 (ENSCHAG00000013334) PTPN5 (ENSCHAG00000013347) ENSCHAG00000013402 OSBPL5 (ENSCHAG00000013553) slc22a18 (ENSCHAG00000015000) PHLDA2 (ENSCHAG00000015121) PHLDA2 (ENSCHAG00000015146) Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 7 ccnd1 (ENSDCDG00000022299) ENSDCDG00000022301 lto1 (ENSDCDG00000022303) fgf19 (ENSDCDG00000022305) fgf4 (ENSDCDG00000022308) fgf3 (ENSDCDG00000022315) zgc:153993 (ENSDCDG00000022398) ano1a (ENSDCDG00000022511) FADD (ENSDCDG00000026252) pacsin3 (ENSDCDG00000026254) ACSF3 (ENSDCDG00000026303) CBFA2T3 (ENSDCDG00000026480) PABPN1L (ENSDCDG00000026482) trappc2l (ENSDCDG00000026484) galns (ENSDCDG00000026497) tnni2b.2 (ENSDCDG00000026548) ##21 tnni2b.1 (ENSDCDG00000026551) ##21 ENSDCDG00000026552 ENSDCDG00000026554 ENSDCDG00000026556 tnnt3b (ENSDCDG00000026571) myod1 (ENSDCDG00000026580) OTOG (ENSDCDG00000026583) ABCC8 (ENSDCDG00000026610) ENSDCDG00000026869 chrna5 (ENSDCDG00000026872) ENSDCDG00000026877 ENSDCDG00000026881 CHRNA3 (ENSDCDG00000026890) CHRNB4 (ENSDCDG00000026897) ube2q1 (ENSDCDG00000026915) Denticle herring MODERN SPECIES 7 ENSDCDG00000022301 lto1 (ENSDCDG00000022303) fgf19 (ENSDCDG00000022305) fgf4 (ENSDCDG00000022308) fgf3 (ENSDCDG00000022315) zgc:153993 (ENSDCDG00000022398) ano1a (ENSDCDG00000022511) FADD (ENSDCDG00000026252) pacsin3 (ENSDCDG00000026254) ACSF3 (ENSDCDG00000026303) CBFA2T3 (ENSDCDG00000026480) PABPN1L (ENSDCDG00000026482) trappc2l (ENSDCDG00000026484) galns (ENSDCDG00000026497) tnni2b.2 (ENSDCDG00000026548) ##21 tnni2b.1 (ENSDCDG00000026551) ##21 ENSDCDG00000026552 ENSDCDG00000026554 ENSDCDG00000026556 tnnt3b (ENSDCDG00000026571) myod1 (ENSDCDG00000026580) OTOG (ENSDCDG00000026583) ABCC8 (ENSDCDG00000026610) ENSDCDG00000026869 chrna5 (ENSDCDG00000026872) ENSDCDG00000026877 ENSDCDG00000026881 CHRNA3 (ENSDCDG00000026890) CHRNB4 (ENSDCDG00000026897) ube2q1 (ENSDCDG00000026915) ENSDCDG00000026948 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000164059 ENSGT00940000160630 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000016223 ENSGT00940000158446 ENSGT00940000155889.c ENSGT00940000157433 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.b.b ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333 ENSGT00940000159916 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000164059 ENSGT00940000160630 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000016223 ENSGT00940000158446 ENSGT00940000155889.c ENSGT00940000157433 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.b.b ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000162611.a.a.a ENSGT00530000063604.A ENSGT00950000182852.A.a.b.c ENSGT01090000260076.b.b.a ENSGT00390000015719.d.c ENSGT00940000162114 ENSGT00940000155850 ENSGT00940000155009.b Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000164059 ENSGT00940000160630 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000016223 ENSGT00940000158446 ENSGT00940000155889.c ENSGT00940000157433 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.b.b ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000162611.a.a.a ENSGT00940000162611.b ENSGT00570000079239 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00390000002970 ENSGT00940000155080 ENSGT00940000169924 ENSGT00940000160615.b.b.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000160630 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000016223 ENSGT00940000158446 ENSGT00940000155889.c ENSGT01100000263547.a.a.b.a.a.a.b.b ENSGT00940000157433 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT00940000177294 ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.b.b ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159916 ENSGT00940000162611.a.a.a ENSGT00940000162611.b ENSGT00570000079239 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00390000002970 ENSGT00940000155080 ENSGT00940000169924 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 158 atg13 (ENSPNAG00000004830) harbi1 (ENSPNAG00000026033) zgc:110699 (ENSPNAG00000026018) phf21aa (ENSPNAG00000025960) creb3l1 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tnni2b.1 (ENSAMXG00000021577) ##21 ENSAMXG00000021578 ENSAMXG00000042231 ENSAMXG00000040476 tnnt3b (ENSAMXG00000021580) OTOG (ENSAMXG00000021582) slc22a18 (ENSAMXG00000021590) ptprja (ENSAMXG00000021591) PTPN5 (ENSAMXG00000021598) ENSAMXG00000021599 ENSAMXG00000038272 hoga1 (ENSAMXG00000021600) FILIP1L (ENSAMXG00000021602) il1rapl1b (ENSAMXG00000008715) nr0b1 (ENSAMXG00000008711) ENSAMXG00000008687 Electric eel MODERN SPECIES 154 MAL (ENSEEEG00000006836) ENSEEEG00000006832 slc8a1a (ENSEEEG00000006788) tmem178a (ENSEEEG00000006782) ENSEEEG00000006781 ENSEEEG00000006775 pecr (ENSEEEG00000006768) ENSEEEG00000006765 tmem169a (ENSEEEG00000006764) cflara (ENSEEEG00000006760) ENSEEEG00000006756 ENSEEEG00000006755 acp2 (ENSEEEG00000006752) SNX1 (ENSEEEG00000006183) SLC8B1 (ENSEEEG00000006165) tnni2b.1 (ENSEEEG00000006164) ##21 ENSEEEG00000006163 ENSEEEG00000006162 tnnt3b (ENSEEEG00000006155) OTOG (ENSEEEG00000006154) slc22a18 (ENSEEEG00000006153) PTPN5 (ENSEEEG00000006152) ENSEEEG00000006151 ENSEEEG00000006150 hoga1 (ENSEEEG00000006148) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000164059.d ENSGT00940000160630 ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000154348.c.b.a.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000156124.c.a ENSGT00940000159848 ENSGT00940000156152.e.a.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000016223 ENSGT00940000158446 ENSGT00940000155889.c ENSGT00940000157433 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477.a.b.b ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333 ENSGT00940000156870 ENSGT00940000159916 ENSGT00390000018549 ENSGT00940000157250 ENSGT01100000263482.F ENSGT00940000154521.A ENSGT00940000157318 ENSGT00390000005589.a.a ENSGT01030000234563.b.a.a ENSGT00940000164582.a Zebrafish DUPLICATION Zebrafish MODERN SPECIES 22 znf408 (ENSDARG00000036043) f2 (ENSDARG00000036041) arhgap1 (ENSDARG00000024324) ENSDARG00000104129 atg13 (ENSDARG00000036040) harbi1 (ENSDARG00000036038) zgc:110699 (ENSDARG00000017474) phf21aa (ENSDARG00000006878) creb3l1 (ENSDARG00000015793) DGKZ (ENSDARG00000014439) mdka (ENSDARG00000036036) CHRM4 (ENSDARG00000069254) ambra1a (ENSDARG00000008322) acp2 (ENSDARG00000007244) ENSDARG00000105584 tnni2b.2 (ENSDARG00000029995) ##21 tnni2b.1 (ENSDARG00000035958) ##21 ENSDARG00000099385 tnnt3b (ENSDARG00000068457) OTOG (ENSDARG00000068460) slc22a18 (ENSDARG00000052271) ptprja (ENSDARG00000033042) PTPN5 (ENSDARG00000074866) kiaa0232 (ENSDARG00000052244) TBC1D14 (ENSDARG00000003520) ccl36.1 (ENSDARG00000105263) ENSDARG00000098818 ccdc96 (ENSDARG00000035963) tada2b (ENSDARG00000003769) grpel1 (ENSDARG00000010021) SORCS2 (ENSDARG00000077465) Zebrafish MODERN SPECIES 22 f2 (ENSDARG00000036041) arhgap1 (ENSDARG00000024324) ENSDARG00000104129 atg13 (ENSDARG00000036040) harbi1 (ENSDARG00000036038) zgc:110699 (ENSDARG00000017474) phf21aa (ENSDARG00000006878) creb3l1 (ENSDARG00000015793) DGKZ (ENSDARG00000014439) mdka (ENSDARG00000036036) CHRM4 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ENSGT00940000157433.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.g.a ##21 ENSGT01030000234990.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.h.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a.e ENSGT00940000158477.a.b.b.b.a.b ENSGT01030000234990.a ENSGT00940000158477.a.b.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.h.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a.f ENSGT00940000158477.a.b.b.b.a.a ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333.b ENSGT00940000156870.bb.a.b ENSGT00940000159916.f ENSGT00390000018549.i ENSGT00940000157250.a Goldfish MODERN SPECIES 25 ENSCARG00000008645 ENSCARG00000008650 ENSCARG00000008659 trmt44 (ENSCARG00000008686) rpl34 (ENSCARG00000008836) ggh (ENSCARG00000008845) ENSCARG00000008871 ENSCARG00000008880 plag1 (ENSCARG00000008890) RPS20 (ENSCARG00000008893) ENSCARG00000008903 lypla1 (ENSCARG00000008922) ENSCARG00000009042 ENSCARG00000009045 SLC8B1 (ENSCARG00000009053) tnni2b.2 (ENSCARG00000009099) ##21 tnni2b.1 (ENSCARG00000009119) ##21 ENSCARG00000009136 ENSCARG00000009162 tnnt3b (ENSCARG00000009176) slc22a18 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ENSGT00390000018549.i ENSGT00940000157250.a ENSGT01100000263482.F.h ENSGT00940000154521.A Common carp reference MODERN SPECIES 6 fbxo3 (ENSCCRG00000018601) ENSCCRG00000010445 znf408 (ENSCCRG00000065505) f2 (ENSCCRG00000010428) ENSCCRG00000067668 atg13 (ENSCCRG00000010356) harbi1 (ENSCCRG00000076161) phf21aa (ENSCCRG00000016773) creb3l1 (ENSCCRG00000016767) DGKZ (ENSCCRG00000021059) mdka (ENSCCRG00000028278) ambra1a (ENSCCRG00000056784) acp2 (ENSCCRG00000018091) ENSCCRG00000014050 ENSCCRG00000002459 tnni2b.2 (ENSCCRG00000036681) ##21 ENSCCRG00000056847 ENSCCRG00000002518 tnnt3b (ENSCCRG00000053333) ENSCCRG00000073086 slc22a18 (ENSCCRG00000022637) ptprja (ENSCCRG00000022622) ENSCCRG00000027619 kiaa0232 (ENSCCRG00000080085) TBC1D14 (ENSCCRG00000045074) tada2b (ENSCCRG00000076351) grpel1 (ENSCCRG00000007651) SORCS2 (ENSCCRG00000034005) shrprbck1r (ENSCCRG00000004071) maf1b (ENSCCRG00000051252) ENSCCRG00000053637 Golden-line barbel MODERN SPECIES 507 cd59 (ENSSGRG00000041437) fbxo3 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SPECIES 47 syt13 (ENSCARG00000053828) znf408 (ENSCARG00000053851) arhgap1 (ENSCARG00000053898) ENSCARG00000054858 atg13 (ENSCARG00000054881) zgc:110699 (ENSCARG00000055097) phf21aa (ENSCARG00000055122) creb3l1 (ENSCARG00000055149) DGKZ (ENSCARG00000055485) mdka (ENSCARG00000061706) CHRM4 (ENSCARG00000061743) ambra1a (ENSCARG00000061763) acp2 (ENSCARG00000061934) SNX1 (ENSCARG00000062323) SLC8B1 (ENSCARG00000063159) tnni2b.2 (ENSCARG00000063408) ##21 tnni2b.1 (ENSCARG00000063440) ##21 ENSCARG00000063477 ENSCARG00000063533 tnnt3b (ENSCARG00000063547) slc22a18 (ENSCARG00000063760) ptprja (ENSCARG00000063875) PTPN5 (ENSCARG00000064009) kiaa0232 (ENSCARG00000064289) TBC1D14 (ENSCARG00000064324) ccl36.1 (ENSCARG00000064858) ccdc96 (ENSCARG00000064867) tada2b (ENSCARG00000064869) grpel1 (ENSCARG00000064878) SORCS2 (ENSCARG00000064928) shrprbck1r (ENSCARG00000065342) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000164059.d.b ENSGT00940000160630.g.a ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055.g 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ENSGT01030000234990.b.b ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.h.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a.e ENSGT00940000158477.a.b.b.b.a.b ENSGT01030000234990.a ENSGT00940000158477.a.b.b.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.h.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b.a.f ENSGT00940000158477.a.b.b.b.a.a ENSGT00940000157490 ENSGT00940000160333.b ENSGT00940000156870.bb.a.b ENSGT00940000159916.f ENSGT00390000018549.i ENSGT00940000157250.a ENSGT01100000263482.F.h ENSGT00940000154521.A ENSGT00940000157318.d ENSGT00390000005589.a.a.u ENSGT01030000234563.b.a.a.o.b ENSGT00940000164582.a.b ENSGT00390000006896.`b.a Goldfish MODERN SPECIES 47 znf408 (ENSCARG00000053851) arhgap1 (ENSCARG00000053898) ENSCARG00000054858 atg13 (ENSCARG00000054881) zgc:110699 (ENSCARG00000055097) phf21aa (ENSCARG00000055122) creb3l1 (ENSCARG00000055149) DGKZ (ENSCARG00000055485) mdka (ENSCARG00000061706) CHRM4 (ENSCARG00000061743) ambra1a (ENSCARG00000061763) acp2 (ENSCARG00000061934) SNX1 (ENSCARG00000062323) SLC8B1 (ENSCARG00000063159) tnni2b.2 (ENSCARG00000063408) ##21 tnni2b.1 (ENSCARG00000063440) ##21 ENSCARG00000063477 ENSCARG00000063533 tnnt3b (ENSCARG00000063547) slc22a18 (ENSCARG00000063760) ptprja (ENSCARG00000063875) PTPN5 (ENSCARG00000064009) kiaa0232 (ENSCARG00000064289) TBC1D14 (ENSCARG00000064324) ccl36.1 (ENSCARG00000064858) ccdc96 (ENSCARG00000064867) tada2b (ENSCARG00000064869) grpel1 (ENSCARG00000064878) SORCS2 (ENSCARG00000064928) shrprbck1r (ENSCARG00000065342) maf1b (ENSCARG00000000237) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.b.h.a ##21 Golden-line barbel MODERN SPECIES 4216 tnni2b.1 (ENSSGRG00000006764) ##21 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00940000160630.g.a ENSGT01030000234629.E.b ENSGT00390000007055.h ENSGT00940000166946.b ENSGT00940000156124.c.a.c ENSGT00940000159848.c ENSGT00940000156152.e.a.a.a ENSGT00390000007640.b.a.a ENSGT00940000160394.a.c ENSGT00390000016223.o.b ENSGT00940000158446.w ENSGT00940000155889.c.c ENSGT00940000157433.a 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SPECIES 304 ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00390000017767.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00940000164327 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000165300 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000156076.b ENSGT00940000163235.E ENSGT00940000162219 ENSGT00940000156076.a.b ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00390000017767.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000167812 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT01030000234990 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00940000164327 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000158300 ENSGT00940000160333 ENSGT00440000039564.a.b 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ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160434 ENSGT00390000012069 ENSGT00950000182838.A.a.b ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00390000017767.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00940000164327 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 ENSGT00940000161001 ENSGT00940000162677 ENSGT00940000160333 koala MODERN SPECIES 209 ENSPCIG00000010332 ENSPCIG00000010334 ENSPCIG00000033582 TOLLIP (ENSPCIG00000030152) BRSK2 (ENSPCIG00000027380) MOB2 (ENSPCIG00000027379) DUSP8 (ENSPCIG00000022967) ENSPCIG00000009697 CTSD (ENSPCIG00000009702) ENSPCIG00000027376 TNNI2 (ENSPCIG00000027375) ##21 ENSPCIG00000027367 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ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 ENSGT00940000161001 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000172063 ENSGT00940000167573.a ENSGT00860000134527 ENSGT01050000245245 ENSGT00940000164129 ENSGT00940000164776 ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00390000016804 ENSGT00940000167688 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 ENSGT00940000161001 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.l ENSGT00940000164129.c.b ENSGT01050000245245 ENSGT00940000164129.c.a ENSGT00940000164776 ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00390000016804 ENSGT00940000167688 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000000843 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012069 ENSGT00950000182838.A.a.b ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.l ENSGT00910000147131 ENSGT00940000164129.c.b ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00940000167688 ENSGT00390000016804 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000000843 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000163661 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.l ENSGT00940000164776 ENSGT00860000134527.c ENSGT00940000164129.c.b ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00940000167688 ENSGT00390000016804 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000000843 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.l ENSGT00910000147131 ENSGT00940000164129.d ENSGT00860000134527.c.a.a ENSGT00940000164776.a ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00390000016727 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00940000167688 ENSGT00390000016804 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000000843 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 Macaca ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182838.A.a.b ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000163661 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.l ENSGT00940000164776.a ENSGT00860000134527.c.a.a ENSGT00860000134527.c.a.b ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00390000016804 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000000843 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 ENSGT00950000183210.d.b ENSGT00940000161001 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000163661 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.l ENSGT01050000248445 ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00860000134527.c.a.a ENSGT00860000134527.c.a.b ENSGT00940000164776.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000000843 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 ENSGT00950000183210.d.b ENSGT00940000161001 ENSGT00620000089395 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 5 ENSMFAG00000054645 ENSMFAG00000049123 TOLLIP (ENSMFAG00000031200) ENSMFAG00000045568 ENSMFAG00000033274 DUSP8 (ENSMFAG00000002727) ENSMFAG00000047180 ENSMFAG00000050980 ENSMFAG00000053522 ENSMFAG00000065575 ENSMFAG00000003693 ENSMFAG00000039972 CTSD (ENSMFAG00000002481) ENSMFAG00000065854 SYT8 (ENSMFAG00000003669) TNNI2 (ENSMFAG00000039833) ##21 LSP1 (ENSMFAG00000037652) TNNT3 (ENSMFAG00000038686) ENSMFAG00000034529 ENSMFAG00000052630 IGF2 (ENSMFAG00000044613) INS (ENSMFAG00000000997) TH (ENSMFAG00000042448) C11orf21 (ENSMFAG00000033732) ENSMFAG00000031437 CD81 (ENSMFAG00000007233) TSSC4 (ENSMFAG00000038372) TRPM5 (ENSMFAG00000042635) KCNQ1 (ENSMFAG00000044043) ENSMFAG00000000298 ENSMFAG00000037563 Rhesus MODERN SPECIES 5 AP2A2 (ENSMMUG00000003620) ENSMMUG00000062468 ENSMMUG00000043846 ENSMMUG00000057247 MUC5B 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ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000000843 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 ENSGT00940000161001 Olive baboon MODERN SPECIES 3 IGF2 (ENSPANG00000005120) ENSPANG00000037714 INS (ENSPANG00000014163) TH (ENSPANG00000006616) TOLLIP (ENSPANG00000006962) BRSK2 (ENSPANG00000019206) MOB2 (ENSPANG00000048746) DUSP8 (ENSPANG00000022957) ENSPANG00000047185 ENSPANG00000049191 ENSPANG00000035685 CTSD (ENSPANG00000012977) RPL36AL (ENSPANG00000048580) ACTB (ENSPANG00000041673) SYT8 (ENSPANG00000007903) TNNI2 (ENSPANG00000008021) ##21 PRR33 (ENSPANG00000046567) LSP1 (ENSPANG00000021118) TNNT3 (ENSPANG00000007734) ENSPANG00000018813 ASCL2 (ENSPANG00000019205) C11orf21 (ENSPANG00000034344) TSPAN32 (ENSPANG00000013063) CD81 (ENSPANG00000012976) TSSC4 (ENSPANG00000042853) TRPM5 (ENSPANG00000007388) ENSPANG00000037475 KCNQ1 (ENSPANG00000006760) ENSPANG00000041515 SLC22A18 (ENSPANG00000023336) PHLDA2 (ENSPANG00000031929) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004.l ENSGT00910000147131 ENSGT00940000164129.d ENSGT00860000134527.c.a.a ENSGT00940000164776.a ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00390000016804 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000000843 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 ENSGT00940000161001 ENSGT00950000183210.d.b Sooty mangabey MODERN SPECIES 518 AP2A2 (ENSCATG00000042459) MUC6 (ENSCATG00000029866) MUC2 (ENSCATG00000042905) ENSCATG00000034858 MUC5B (ENSCATG00000031049) TOLLIP (ENSCATG00000031539) BRSK2 (ENSCATG00000041353) MOB2 (ENSCATG00000043655) DUSP8 (ENSCATG00000044229) ENSCATG00000030719 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ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 Chimpanzee MODERN SPECIES 2 ENSPTRG00000046549 TOLLIP (ENSPTRG00000043986) BRSK2 (ENSPTRG00000051746) MOB2 (ENSPTRG00000003153) ENSPTRG00000003154 ENSPTRG00000040750 ENSPTRG00000028492 KRTAP5-3 (ENSPTRG00000004015) ENSPTRG00000028760 ENSPTRG00000044179 ENSPTRG00000047383 KRTAP5-6 (ENSPTRG00000042477) ENSPTRG00000045353 ENSPTRG00000044605 SYT8 (ENSPTRG00000003160) TNNI2 (ENSPTRG00000003161) ##21 ENSPTRG00000046165 PRR33 (ENSPTRG00000039326) TNNT3 (ENSPTRG00000003166) MRPL23 (ENSPTRG00000033746) ENSPTRG00000047636 IGF2 (ENSPTRG00000047625) ENSPTRG00000003171 INS (ENSPTRG00000003172) TH (ENSPTRG00000003173) ASCL2 (ENSPTRG00000044950) C11H11orf21 (ENSPTRG00000048114) TSPAN32 (ENSPTRG00000044879) CD81 (ENSPTRG00000003177) TSSC4 (ENSPTRG00000003178) TRPM5 (ENSPTRG00000003179) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000012069 ENSGT00950000182838.A.a.b ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000164129 ENSGT01050000245245 ENSGT00860000134527 ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 ENSGT00940000161001 ENSGT00940000162677 ENSGT00530000067982 Mas night monkey MODERN SPECIES 949 ENSANAG00000027769 ENSANAG00000027339 IFITM10 (ENSANAG00000028527) CTSD (ENSANAG00000025938) SYT8 (ENSANAG00000032269) TNNI2 (ENSANAG00000035741) ##21 LSP1 (ENSANAG00000029264) PRR33 (ENSANAG00000020013) TNNT3 (ENSANAG00000037734) ENSANAG00000010507 IGF2 (ENSANAG00000015793) INS (ENSANAG00000028907) TH (ENSANAG00000020359) ASCL2 (ENSANAG00000036360) TSPAN32 (ENSANAG00000021121) CD81 (ENSANAG00000037171) 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SLC22A18 (ENSSBOG00000026078) NAP1L4 (ENSSBOG00000024050) Marmoset MODERN SPECIES 2 ENSCJAG00000082459 ENSCJAG00000080132 ENSCJAG00000075857 TOLLIP (ENSCJAG00000080238) ENSCJAG00000087024 BRSK2 (ENSCJAG00000083781) MOB2 (ENSCJAG00000018357) DUSP8 (ENSCJAG00000040604) ENSCJAG00000081856 ENSCJAG00000072739 ENSCJAG00000011489 ENSCJAG00000079301 ENSCJAG00000047201 ENSCJAG00000069765 CTSD (ENSCJAG00000018407) ENSCJAG00000018413 ##21 PRR33 (ENSCJAG00000059882) ENSCJAG00000012447 TNNT3 (ENSCJAG00000018439) ENSCJAG00000056349 ENSCJAG00000018424 INS (ENSCJAG00000035804) TH (ENSCJAG00000018412) ASCL2 (ENSCJAG00000079397) ENSCJAG00000072782 TSPAN32 (ENSCJAG00000083464) CD81 (ENSCJAG00000014738) TSSC4 (ENSCJAG00000052019) TRPM5 (ENSCJAG00000014749) KCNQ1 (ENSCJAG00000011708) CDKN1C (ENSCJAG00000011703) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000164129 ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b 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ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 ENSGT00940000161001 ENSGT00940000162677 ENSGT00940000160333 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 520 TMEM80 (ENSPCOG00000023957) DEAF1 (ENSPCOG00000022066) DRD4 (ENSPCOG00000026078) SCT (ENSPCOG00000022911) IRF7 (ENSPCOG00000017072) PHRF1 (ENSPCOG00000000125) RASSF7 (ENSPCOG00000023558) LMNTD2 (ENSPCOG00000017293) LRRC56 (ENSPCOG00000017036) HRAS (ENSPCOG00000021838) ENSPCOG00000021353 ENSPCOG00000010578 IFITM10 (ENSPCOG00000020792) CTSD (ENSPCOG00000001430) SYT8 (ENSPCOG00000021242) TNNI2 (ENSPCOG00000020276) ##21 ENSPCOG00000010747 TNNT3 (ENSPCOG00000011270) ENSPCOG00000026555 IGF2 (ENSPCOG00000027915) INS (ENSPCOG00000016945) TH (ENSPCOG00000024538) TSPAN32 (ENSPCOG00000021732) CD81 (ENSPCOG00000017246) ENSPCOG00000025931 TRPM5 (ENSPCOG00000013713) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1037 CTSD (ENSPSMG00000020390) SYT8 (ENSPSMG00000020274) TNNI2 (ENSPSMG00000020263) ##21 LSP1 (ENSPSMG00000020256) PRR33 (ENSPSMG00000020251) TNNT3 (ENSPSMG00000020169) ENSPSMG00000019999 IGF2 (ENSPSMG00000019987) INS (ENSPSMG00000019979) TH (ENSPSMG00000019967) ASCL2 (ENSPSMG00000019879) ENSPSMG00000019871 Bushbaby MODERN SPECIES 249 ENSOGAG00000032111 ENSOGAG00000028381 IFITM10 (ENSOGAG00000028031) CTSD (ENSOGAG00000002296) SYT8 (ENSOGAG00000028777) TNNI2 (ENSOGAG00000027546) ##21 LSP1 (ENSOGAG00000033321) TNNT3 (ENSOGAG00000025597) ENSOGAG00000029988 ENSOGAG00000033140 INS (ENSOGAG00000034796) TH (ENSOGAG00000017051) ASCL2 (ENSOGAG00000034847) TSPAN32 (ENSOGAG00000027394) CD81 (ENSOGAG00000015774) TSSC4 (ENSOGAG00000026523) TRPM5 (ENSOGAG00000015780) KCNQ1 (ENSOGAG00000001375) CDKN1C (ENSOGAG00000029305) SLC22A18 (ENSOGAG00000000084) PHLDA2 (ENSOGAG00000028822) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000012069 ENSGT00950000182838.A.a.b ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000163661 ENSGT00940000156076.a.a.b 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ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000012069 ENSGT00950000182838.A.a.b ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000163661 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT01050000246519 ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00950000185956 ENSGT00940000160745 ENSGT00940000167688 ENSGT00920000150769 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000164077.b ENSGT00940000164129.b ENSGT00940000164077.a 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ENSGT00950000185956 ENSGT00940000160745 ENSGT00390000016804 ENSGT00940000167688 ENSGT00920000150769 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00950000186366 ENSGT00940000160004 ENSGT00940000172063 ENSGT00940000164129.h ENSGT01050000245245 ENSGT00940000164776 ENSGT00940000164129.g.a ENSGT00940000164129.g.b ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00390000009708 ENSGT00950000185956 ENSGT00940000160745 ENSGT00940000167688 ENSGT00920000150769 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 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ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00950000186366 ENSGT00940000160004 ENSGT00940000172063 ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00940000167688 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 ENSGT00940000161001 ENSGT00940000162677 lion MODERN SPECIES 22 IFITM10 (ENSPLOG00000013971) CTSD (ENSPLOG00000013990) SYT8 (ENSPLOG00000014064) TNNI2 (ENSPLOG00000014273) ##21 LSP1 (ENSPLOG00000014379) PRR33 (ENSPLOG00000014398) TNNT3 (ENSPLOG00000014504) ENSPLOG00000015398 IGF2 (ENSPLOG00000015453) ENSPLOG00000015514 INS (ENSPLOG00000015551) TH (ENSPLOG00000015600) ASCL2 (ENSPLOG00000015795) ENSPLOG00000015815 CD81 (ENSPLOG00000015845) TSSC4 (ENSPLOG00000015891) TRPM5 (ENSPLOG00000015974) KCNQ1 (ENSPLOG00000016496) ENSPLOG00000016594 leopard MODERN SPECIES 203 TOLLIP (ENSPPRG00000017137) BRSK2 (ENSPPRG00000016500) MOB2 (ENSPPRG00000015350) DUSP8 (ENSPPRG00000015274) ENSPPRG00000015056 IFITM10 (ENSPPRG00000014971) CTSD (ENSPPRG00000014874) SYT8 (ENSPPRG00000014268) TNNI2 (ENSPPRG00000014107) ##21 ENSPPRG00000014006 PRR33 (ENSPPRG00000012391) TNNT3 (ENSPPRG00000013750) ENSPPRG00000013232 IGF2 (ENSPPRG00000013191) INS (ENSPPRG00000013093) TH (ENSPPRG00000013064) ASCL2 (ENSPPRG00000012351) ENSPPRG00000012468 CD81 (ENSPPRG00000012362) ENSPPRG00000012297 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000164129.h ENSGT01050000245245 ENSGT00940000164776 ENSGT00940000164129.g.a ENSGT00940000164129.g.b ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00950000185421 ENSGT00950000185565 ENSGT00940000160745 ENSGT00940000167688 ENSGT00920000150769 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 Caniformia_b DUPLICATION Caniformia_b DUPLICATION Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.g.a ##21 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.g.a ##21 Giant Panda MODERN SPECIES 1777 ENSAMEG00000025530 ##21 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160434 ENSGT00390000012069 ENSGT00950000182838.A.a.b ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000164129.g.b ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.g.b ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00950000185421 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ENSMPUG00000005587 CD81 (ENSMPUG00000005360) TSSC4 (ENSMPUG00000019035) ENSMPUG00000019034 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.h ##21 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.h ##21 Giant Panda MODERN SPECIES 1771 ENSAMEG00000024216 ##21 Canidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000007087 ENSGT00940000160434 ENSGT00390000012069 ENSGT00950000182838.A.a.b ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00950000185421 ENSGT00940000160745 ENSGT00940000167688 ENSGT00920000150769 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 Red fox MODERN SPECIES 49 POLR2L (ENSVVUG00000000205) TSPAN4 (ENSVVUG00000000266) CHID1 (ENSVVUG00000000574) AP2A2 (ENSVVUG00000000592) ENSVVUG00000000617 ENSVVUG00000000878 ENSVVUG00000001468 ENSVVUG00000001833 TOLLIP (ENSVVUG00000002119) BRSK2 (ENSVVUG00000002149) MOB2 (ENSVVUG00000002238) DUSP8 (ENSVVUG00000002265) IFITM10 (ENSVVUG00000002300) CTSD (ENSVVUG00000002315) SYT8 (ENSVVUG00000002353) TNNI2 (ENSVVUG00000002451) ##21 LSP1 (ENSVVUG00000002477) ENSVVUG00000002540 TNNT3 (ENSVVUG00000002560) ENSVVUG00000002581 ENSVVUG00000002602 IGF2 (ENSVVUG00000002631) ENSVVUG00000002672 INS (ENSVVUG00000002675) TH (ENSVVUG00000002704) ASCL2 (ENSVVUG00000002778) ENSVVUG00000002786 CD81 (ENSVVUG00000002853) ENSVVUG00000002862 TRPM5 (ENSVVUG00000002887) KCNQ1 (ENSVVUG00000003078) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007087 ENSGT00940000160434 ENSGT00390000012069 ENSGT00950000182838.A.a.b ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 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SPECIES 20 ENSGT00940000160434 ENSGT00390000012069 ENSGT00950000182838.A.a.b ENSGT00940000161708 ENSGT00940000163661 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00390000009708 ENSGT00990000213591 ENSGT00940000160745 ENSGT00940000167688 ENSGT00920000150769 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007087 ENSGT00940000160434 ENSGT00390000012069 ENSGT00950000182838.A.a.b ENSGT00940000161708 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000156076.a.a.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00950000182857.a.a.a 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ENSBTAG00000050966 ENSBTAG00000054135 ENSBTAG00000052368 MOB2 (ENSBTAG00000011249) DUSP8 (ENSBTAG00000051211) ENSBTAG00000054020 ENSBTAG00000019579 IFITM10 (ENSBTAG00000047996) CTSD (ENSBTAG00000007622) SYT8 (ENSBTAG00000040103) TNNI2 (ENSBTAG00000010880) ##21 LSP1 (ENSBTAG00000010447) PRR33 (ENSBTAG00000048504) TNNT3 (ENSBTAG00000022158) MRPL23 (ENSBTAG00000000103) IGF2 (ENSBTAG00000013066) INS (ENSBTAG00000013003) TH (ENSBTAG00000026768) ASCL2 (ENSBTAG00000026769) TSPAN32 (ENSBTAG00000002702) CD81 (ENSBTAG00000047495) TSSC4 (ENSBTAG00000047793) TRPM5 (ENSBTAG00000046662) KCNQ1 (ENSBTAG00000010986) CDKN1C (ENSBTAG00000031184) SLC22A18 (ENSBTAG00000012742) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 21 ENSBIXG00005027528 ENSBIXG00005027229 ENSBIXG00005004561 ENSBIXG00005007646 ENSBIXG00005026629 BRSK2 (ENSBIXG00005026537) ENSBIXG00005026422 MOB2 (ENSBIXG00005026411) DUSP8 (ENSBIXG00005026372) ENSBIXG00005026360 ENSBIXG00005004499 ENSBIXG00005026322 ENSBIXG00005026313 IFITM10 (ENSBIXG00005026268) CTSD (ENSBIXG00005026248) TNNI2 (ENSBIXG00005026138) ##21 LSP1 (ENSBIXG00005026072) ENSBIXG00005026023 TNNT3 (ENSBIXG00005025991) ENSBIXG00005025601 IGF2 (ENSBIXG00005025520) INS (ENSBIXG00005025465) TH (ENSBIXG00005025424) ASCL2 (ENSBIXG00005025321) ENSBIXG00005004304 CD81 (ENSBIXG00005025283) TSSC4 (ENSBIXG00005004292) TRPM5 (ENSBIXG00005025223) KCNQ1 (ENSBIXG00005004279) ENSBIXG00005025103 ENSBIXG00005025052 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000012831 ENSGT00940000161196 ENSGT00940000161780 ENSGT00940000160155 ENSGT00440000033504.A ENSGT00940000157760 ENSGT00390000007087 ENSGT00940000168900 ENSGT00940000160434 ENSGT00390000012069 ENSGT00950000182838.A.a.b ENSGT00940000161708 ENSGT00940000163661 ENSGT00950000182857.a.a.a ENSGT00940000155733.a.a ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00980000199390 ENSGT00940000160745 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 ENSGT00940000161001 ENSGT00940000162677 ENSGT00940000160333 ENSGT00440000039564.a.b Wild yak MODERN SPECIES 1531 IFITM10 (ENSBMUG00000019721) CTSD (ENSBMUG00000019738) ENSBMUG00000019794 ##21 ENSBMUG00000019811 ENSBMUG00000019820 ENSBMUG00000019825 TNNT3 (ENSBMUG00000020092) ENSBMUG00000020299 IGF2 (ENSBMUG00000020373) INS (ENSBMUG00000020393) TH (ENSBMUG00000020405) Domestic yak MODERN SPECIES 21 SIGIRR (ENSBGRG00000016510) PTDSS2 (ENSBGRG00000016733) HRAS (ENSBGRG00000016884) ENSBGRG00000019448 ENSBGRG00000019516 GATD1 (ENSBGRG00000021403) ENSBGRG00000022819 CD151 (ENSBGRG00000022849) POLR2L (ENSBGRG00000022872) ENSBGRG00000023276 ENSBGRG00000023425 ENSBGRG00000007012 ENSBGRG00000007458 ENSBGRG00000007682 ENSBGRG00000007731 ENSBGRG00000009727 ##21 ENSBGRG00000009994 ENSBGRG00000010016 ENSBGRG00000010062 ENSBGRG00000010105 INS (ENSBGRG00000010351) ENSBGRG00000012167 ENSBGRG00000012314 ENSBGRG00000014821 ENSBGRG00000015190 ENSBGRG00000015239 ENSBGRG00000015824 ENSBGRG00000017907 DHCR7 (ENSBGRG00000017928) FADD (ENSBGRG00000023022) ENSBGRG00000024302 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 129 ENSGT00940000156076.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00390000007739 ENSGT00940000160745 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00940000156076.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00940000160745 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 164 ENSGT00940000156076.b ENSGT00940000162219 ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C ENSGT01050000244956.a.a ENSGT00940000160004 ENSGT00940000155733.a.a ENSGT00940000160892 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 ENSGT00940000153901.a.b ENSGT00390000016727 ENSGT00940000158477 ENSGT00940000160745 ENSGT00390000015440 ENSGT00950000182885.C.a ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 Elephant MODERN SPECIES 102 ENSLAFG00000020983 ENSLAFG00000023377 TOLLIP (ENSLAFG00000016888) BRSK2 (ENSLAFG00000031304) MOB2 (ENSLAFG00000022413) DUSP8 (ENSLAFG00000028791) ENSLAFG00000013955 CTSD (ENSLAFG00000031882) SYT8 (ENSLAFG00000012461) TNNI2 (ENSLAFG00000012463) ##21 LSP1 (ENSLAFG00000031556) ENSLAFG00000027103 TNNT3 (ENSLAFG00000021993) IGF2 (ENSLAFG00000011306) INS (ENSLAFG00000020914) TH (ENSLAFG00000028582) ASCL2 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Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 64 ENSCPRG00005016897 ENSCPRG00005016920 ENSCPRG00005016925 TOLLIP (ENSCPRG00005016932) ENSCPRG00005016936 ENSCPRG00005016942 ENSCPRG00005016947 MOB2 (ENSCPRG00005016959) DUSP8 (ENSCPRG00005016964) ENSCPRG00005016970 IFITM10 (ENSCPRG00005016972) CTSD (ENSCPRG00005016976) ENSCPRG00005016980 SYT8 (ENSCPRG00005016981) ENSCPRG00005016984 TNNI2 (ENSCPRG00005016987) ##21 LSP1 (ENSCPRG00005016994) TNNT3 (ENSCPRG00005016999) ENSCPRG00005017003 IGF2 (ENSCPRG00005017008) ENSCPRG00005017011 TH (ENSCPRG00005017012) CD81 (ENSCPRG00005017019) TSSC4 (ENSCPRG00005017025) TRPM5 (ENSCPRG00005017030) KCNQ1 (ENSCPRG00005017043) SLC22A18 (ENSCPRG00005017050) PHLDA2 (ENSCPRG00005017053) NAP1L4 (ENSCPRG00005017058) CARS1 (ENSCPRG00005017107) ENSCPRG00005017195 Aves ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156289 ENSGT00940000163235.E ENSGT00940000162219 ENSGT00940000156076.a.a.b.c ENSGT00940000156076.a.a.b.d ENSGT00940000156076.b ENSGT00390000013104 ENSGT00940000157462.C 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SPECIES 25 ENSMGAG00000007819 ENSMGAG00000020925 ENSMGAG00000019751 ENSMGAG00000007871 ENSMGAG00000007900 ENSMGAG00000022591 ENSMGAG00000007908 ENSMGAG00000007939 IGF2 (ENSMGAG00000007945) ENSMGAG00000007978 ENSMGAG00000022896 ENSMGAG00000007988 ENSMGAG00000021604 ENSMGAG00000018824 ENSMGAG00000008238 ENSMGAG00000008269 ##21 ENSMGAG00000020427 ENSMGAG00000008348 ENSMGAG00000008398 ENSMGAG00000022955 ENSMGAG00000008501 ENSMGAG00000005223 OLFML1 (ENSMGAG00000005226) ENSMGAG00000017103 ENSMGAG00000019459 ENSMGAG00000005234 OVCH2 (ENSMGAG00000005290) ENSMGAG00000018742 ENSMGAG00000019146 FAR1 (ENSMGAG00000020802) ENSMGAG00000005303 Japanese quail MODERN SPECIES 23 CHID1 (ENSCJPG00005018491) AP2A2 (ENSCJPG00005018498) MUC6 (ENSCJPG00005018500) MUC2 (ENSCJPG00005018506) ENSCJPG00005018508 ENSCJPG00005018510 TOLLIP (ENSCJPG00005018512) BRSK2 (ENSCJPG00005018513) MOB2 (ENSCJPG00005018514) DUSP8 (ENSCJPG00005018515) IFITM10 (ENSCJPG00005018516) CTSD (ENSCJPG00005018517) ENSCJPG00005018571 SYT8 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ENSPTXG00000001002 CDKN1C (ENSPTXG00000001001) Mainland tiger snake MODERN SPECIES 22 TSPAN4 (ENSNSUG00000016605) CHID1 (ENSNSUG00000016606) AP2A2 (ENSNSUG00000016607) MUC6 (ENSNSUG00000017403) MUC2 (ENSNSUG00000017404) ENSNSUG00000017405 ENSNSUG00000017410 TOLLIP (ENSNSUG00000017411) BRSK2 (ENSNSUG00000017416) MOB2 (ENSNSUG00000017417) DUSP8 (ENSNSUG00000017419) IFITM10 (ENSNSUG00000017435) CTSD (ENSNSUG00000017436) ENSNSUG00000017437 SYT8 (ENSNSUG00000017438) TNNI2 (ENSNSUG00000017439) ##21 ENSNSUG00000017440 ENSNSUG00000017441 TNNT3 (ENSNSUG00000017442) ENSNSUG00000017443 IGF2 (ENSNSUG00000017444) ENSNSUG00000017445 TH (ENSNSUG00000017446) ASCL2 (ENSNSUG00000017447) ENSNSUG00000017448 CD81 (ENSNSUG00000017449) ENSNSUG00000017450 TSSC4 (ENSNSUG00000017451) TRPM5 (ENSNSUG00000017452) KCNQ1 (ENSNSUG00000017457) ENSNSUG00000017458 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 5264 ENSLLTG00000007536 TNNI2 (ENSLLTG00000007570) ##21 Indian cobra MODERN SPECIES ENSNNAG00000007390 ENSNNAG00000007408 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ENSGT00940000163041 ENSGT00390000003287 ENSGT00940000158805.a ENSGT00390000011846 ENSGT00940000160588 ENSGT00940000161001 ENSGT00940000162677 ENSGT00940000160333 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 3 MUC2 (ENSSMRG00000014147) ENSSMRG00000014148 ENSSMRG00000014149 ENSSMRG00000014150 ENSSMRG00000014152 TOLLIP (ENSSMRG00000014153) ENSSMRG00000014154 BRSK2 (ENSSMRG00000014155) MOB2 (ENSSMRG00000014156) DUSP8 (ENSSMRG00000014158) IFITM10 (ENSSMRG00000014159) CTSD (ENSSMRG00000014160) ENSSMRG00000014161 SYT8 (ENSSMRG00000014162) ENSSMRG00000014163 TNNI2 (ENSSMRG00000014164) ##21 LSP1 (ENSSMRG00000014165) ENSSMRG00000014166 TNNT3 (ENSSMRG00000014167) ENSSMRG00000014168 IGF2 (ENSSMRG00000014170) ENSSMRG00000014171 TH (ENSSMRG00000014172) ENSSMRG00000014174 TSPAN32 (ENSSMRG00000014175) CD81 (ENSSMRG00000014176) TSSC4 (ENSSMRG00000014177) TRPM5 (ENSSMRG00000014178) KCNQ1 (ENSSMRG00000014179) CDKN1C (ENSSMRG00000014181) SLC22A18 (ENSSMRG00000014182) Common wall lizard MODERN SPECIES ENSPMRG00000006471 ENSPMRG00000006437 MUC2 (ENSPMRG00000006260) ENSPMRG00000006188 ENSPMRG00000006011 ENSPMRG00000005915 TOLLIP (ENSPMRG00000005894) BRSK2 (ENSPMRG00000005839) MOB2 (ENSPMRG00000005809) DUSP8 (ENSPMRG00000005796) IFITM10 (ENSPMRG00000005789) CTSD (ENSPMRG00000005778) ENSPMRG00000005763 SYT8 (ENSPMRG00000005754) ENSPMRG00000005739 TNNI2 (ENSPMRG00000005730) ##21 LSP1 (ENSPMRG00000005701) PRR33 (ENSPMRG00000005685) TNNT3 (ENSPMRG00000005639) ENSPMRG00000005626 IGF2 (ENSPMRG00000005623) ENSPMRG00000005613 TH (ENSPMRG00000005605) ASCL2 (ENSPMRG00000005594) TSPAN32 (ENSPMRG00000005573) ENSPMRG00000005562 CD81 (ENSPMRG00000005553) TSSC4 (ENSPMRG00000005548) TRPM5 (ENSPMRG00000005535) KCNQ1 (ENSPMRG00000005509) CDKN1C (ENSPMRG00000005499) Coelacanth MODERN SPECIES 1267 CTSD (ENSLACG00000002616) ENSLACG00000003877 SYT8 (ENSLACG00000005323) TNNI2 (ENSLACG00000007413) ##21 LSP1 (ENSLACG00000022579) ENSLACG00000010167 TNNT3 (ENSLACG00000010682) mrpl23 (ENSLACG00000011528) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a ##21 Hagfish MODERN SPECIES 1513 SDHAF2 (ENSEBUG00000003827) cnot2 (ENSEBUG00000004355) ENSEBUG00000012000 ENSEBUG00000012816 ##21 cct2 (ENSEBUG00000005326) ENSEBUG00000009852 syt7b (ENSEBUG00000002955) DAGLA (ENSEBUG00000008828) Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 Ciona ANCESTRAL SPECIES 238 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000169382 ENSGT01080000257365.b.c.a ENSGT00940000168948 ENSGT00390000018436 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 2 ENSCING00000021213 ENSCING00000016242 ENSCING00000009676 ENSCING00000020674 ENSCING00000024253 ENSCING00000021894 ENSCING00000019266 ENSCING00000017557 ENSCING00000024498 ENSCING00000020939 ENSCING00000019680 ENSCING00000024382 ENSCING00000020453 ENSCING00000021823 ENSCING00000019444 ENSCING00000022966 ##21 mlx (ENSCING00000019532) ENSCING00000010035 ENSCING00000021126 ENSCING00000020197 ENSCING00000003034 ENSCING00000003029 ENSCING00000024907 ENSCING00000003026 ENSCING00000021152 ENSCING00000022568 ci-zf(phd)-21 (ENSCING00000019847) ENSCING00000019147 ENSCING00000023267 ENSCING00000024365 ENSCING00000010863 Ciona savignyi MODERN SPECIES 82 ENSCSAVG00000011642 ENSCSAVG00000011644 ENSCSAVG00000011645 ENSCSAVG00000011646 ENSCSAVG00000011647 ENSCSAVG00000011649 ENSCSAVG00000011650 ENSCSAVG00000011651 ENSCSAVG00000011652 ENSCSAVG00000011653 ENSCSAVG00000011654 ENSCSAVG00000011655 ENSCSAVG00000011656 ENSCSAVG00000011657 ENSCSAVG00000011658 ENSCSAVG00000011659 ##21 ENSCSAVG00000011660 ENSCSAVG00000011661 ENSCSAVG00000011662 ENSCSAVG00000011663 ENSCSAVG00000011669 ENSCSAVG00000011670 ENSCSAVG00000011672 ENSCSAVG00000011673 ENSCSAVG00000011677 ENSCSAVG00000011679 ENSCSAVG00000011683 ENSCSAVG00000011691 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 273 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 Anura ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000161485 ENSGT00940000159620.b.a ENSGT00550000074829 ENSGT01030000234564.a.b ENSGT01050000244894.a.a.a.a ENSGT00510000048131 ENSGT00390000014743 ENSGT00550000075069 ENSGT00390000016605 Frog MODERN SPECIES 7 ENSXETG00000048636 ENSXETG00000049232 znf865 (ENSXETG00000019138) ENSXETG00000037892 ENSXETG00000043772 ccdc106 (ENSXETG00000031266) ENSXETG00000044778 u2af2 (ENSXETG00000019128) epn1 (ENSXETG00000019123) mpv17l (ENSXETG00000038084) myh14 (ENSXETG00000019058) uts2rl3 (ENSXETG00000019036) ENSXETG00000031895 syt5 (ENSXETG00000003212) dnaaf3 (ENSXETG00000024675) tnni3 (ENSXETG00000024676) ##21 ENSXETG00000040532 tnnt1 (ENSXETG00000003199) ppp1r12c (ENSXETG00000003197) eps8l1 (ENSXETG00000003193) cd37 (ENSXETG00000003177) ndufa3 (ENSXETG00000024677) mboat7 (ENSXETG00000036938) tmc4 (ENSXETG00000003172) leng1 (ENSXETG00000003171) cnot3 (ENSXETG00000003166) ENSXETG00000045364 prpf31 (ENSXETG00000010916) tfpt (ENSXETG00000003165) ENSXETG00000045137 rpl18 (ENSXETG00000003164) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 2 ENSLLEG00000028575 GYS1 (ENSLLEG00000028607) ENSLLEG00000028691 ENSLLEG00000028800 ENSLLEG00000028837 ENSLLEG00000028851 ENSLLEG00000028874 ENSLLEG00000028907 ENSLLEG00000028929 RPS9 (ENSLLEG00000028999) ENSLLEG00000029089 MBOAT7 (ENSLLEG00000029110) TMC4 (ENSLLEG00000029144) SYT5 (ENSLLEG00000029186) DNAAF3 (ENSLLEG00000029231) TNNI3 (ENSLLEG00000029264) ##21 TNNT1 (ENSLLEG00000029305) PPP1R12C (ENSLLEG00000029435) ENSLLEG00000029478 ENSLLEG00000029502 ENSLLEG00000029594 TFPT (ENSLLEG00000029613) PRPF31 (ENSLLEG00000029631) CNOT3 (ENSLLEG00000008453) ENSLLEG00000008683 ENSLLEG00000008806 ENSLLEG00000010502 ENSLLEG00000010529 PPP6R1 (ENSLLEG00000010593) HSPBP1 (ENSLLEG00000011041) ENSLLEG00000011177 Amniota ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00390000001450.g ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000162969 ENSGT00390000010577 ENSGT00390000008006 ENSGT00950000183060.a.b.b.b ENSGT00940000159620.b.a ENSGT00550000074829 Sauria ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000008006 ENSGT00390000010577 ENSGT00940000162969 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000160609 ENSGT00390000001450.g ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000161866 ENSGT00390000009532.A.d.b ENSGT00940000161346 ENSGT00940000161121 ENSGT00940000154404.a ENSGT00390000001927.b ENSGT00940000161908 ENSGT00390000007946 ENSGT00390000010799 ENSGT00940000159110 ENSGT00510000048192 ENSGT00940000166966 ENSGT00940000166365 ENSGT00950000185347 ENSGT00990000204711 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000010577 ENSGT00940000162969 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000160609 ENSGT00390000001450.g ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000164511.C ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000161866 ENSGT00390000009532.A.d.b ENSGT00940000161346 ENSGT00940000161121 ENSGT00940000154404.a ENSGT00390000001927.b ENSGT00940000161908 ENSGT00390000007946 ENSGT00390000010799 ENSGT00940000159110 ENSGT00510000048192 ENSGT00940000166966 ENSGT00940000166365 ENSGT00950000185347 ENSGT00990000204711 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000162969 ENSGT00940000158125.e ENSGT00940000158125.f ENSGT00940000161425 ENSGT00940000160609 ENSGT00390000001450.g ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000164511.C ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000161866 ENSGT00390000009532.A.d.b ENSGT00940000161346 ENSGT00940000161121 ENSGT00940000154404.a ENSGT00390000001927.b ENSGT00940000161908 ENSGT00390000007946 ENSGT00390000010799 ENSGT00940000159110 ENSGT00510000048192 ENSGT00940000166966 ENSGT00530000064424 ENSGT00940000166365 ENSGT00950000185347 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000162969 ENSGT00940000158125.e ENSGT00940000158125.f ENSGT00940000161425 ENSGT00940000160609 ENSGT00390000001450.g.h.b ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000164511.C ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00390000001450.g.h.a.a.a.a.b ENSGT00390000001450.g.h.a.a.a.b.a ENSGT00940000161866 ENSGT00390000009532.A.d.b ENSGT00940000161346 ENSGT00940000161121 ENSGT00940000154404.a ENSGT00390000001927.b ENSGT00940000161908 ENSGT00390000007946.f ENSGT00390000010799 ENSGT00390000007946.e ENSGT00940000159110 ENSGT00510000048192 ENSGT00940000166966 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00390000001450.g.g.a ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00390000001450.g.h.a.a.a.a.b ENSGT00390000001450.g.h.a.a.a.b.a ENSGT00940000161866 ENSGT00390000009532.A.d.b ENSGT00940000161346 ENSGT00940000154404.a ENSGT00390000001927.b ENSGT00940000161908 ENSGT00390000007946.f ENSGT00390000010799 ENSGT00390000007946.e ENSGT00940000159110 ENSGT00510000048192 ENSGT00940000166966 ENSGT00530000064424 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 138 PPP1R12C (ENSGEVG00005014836) TNNT1 (ENSGEVG00005014885) ENSGEVG00005015012 ENSGEVG00005015049 ENSGEVG00005015084 ENSGEVG00005015127 KMT5C (ENSGEVG00005015166) TMEM150B (ENSGEVG00005015189) ENSGEVG00005015289 HSPBP1 (ENSGEVG00005015610) PPP6R1 (ENSGEVG00005015635) TMEM86B (ENSGEVG00005015752) ENSGEVG00005015794 SYT5 (ENSGEVG00005015820) DNAAF3 (ENSGEVG00005015900) TNNI3 (ENSGEVG00005016040) ##21 ENSGEVG00005016088 ENSGEVG00005016140 ENSGEVG00005016187 ENSGEVG00005016210 BCAT2 (ENSGEVG00005016261) HSD17B14 (ENSGEVG00005016294) ENSGEVG00005016325 ENSGEVG00005016341 RPL13A (ENSGEVG00005016372) DHDH (ENSGEVG00005016429) SLC17A7 (ENSGEVG00005016456) PIH1D1 (ENSGEVG00005016578) ENSGEVG00005010725 ENSGEVG00005010773 ENSGEVG00005010788 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2359 ENSCABG00000000052 ENSCABG00000000138 KMT5C (ENSCABG00000000173) HSPBP1 (ENSCABG00000000201) PPP6R1 (ENSCABG00000000259) ENSCABG00000000329 SYT5 (ENSCABG00000000370) DNAAF3 (ENSCABG00000000408) TNNI3 (ENSCABG00000000503) ##21 ENSCABG00000000539 ENSCABG00000000548 ENSCABG00000000552 BCAT2 (ENSCABG00000000570) ENSCABG00000000590 ENSCABG00000000596 NUCB1 (ENSCABG00000000601) ENSCABG00000000609 ENSCABG00000000613 RPL13A (ENSCABG00000000617) ENSCABG00000000628 SLC17A7 (ENSCABG00000000757) PIH1D1 (ENSCABG00000000768) ENSCABG00000000776 ENSCABG00000000791 Emydidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 painted turtle MODERN SPECIES 2191 TNNI3 (ENSCPBG00000006092) ##21 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00390000006753.A ENSGT00940000162254 ENSGT00940000157149 ENSGT00940000159441 ENSGT00390000008732.b ENSGT00940000161700 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 Aves ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00390000006753.A ENSGT00940000162254 ENSGT00940000157149 ENSGT00940000159441 ENSGT00390000008732.b ENSGT00940000161700 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00390000006753.A ENSGT00940000162254 ENSGT00940000157149 ENSGT00940000159441 ENSGT00390000008732.b ENSGT00940000161700 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00940000161700 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000161700 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00940000161700 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 111 ENSGT00940000161700 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000161700 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 Zebra finch MODERN SPECIES 24 ENSTGUG00000029399 RASIP1 (ENSTGUG00000028587) ENSTGUG00000024568 ISOC2 (ENSTGUG00000022600) ENSTGUG00000027428 UBE2S (ENSTGUG00000024004) ENSTGUG00000028256 ENSTGUG00000021677 ENSTGUG00000028612 U2AF2 (ENSTGUG00000019395) LENG8 (ENSTGUG00000018887) ENSTGUG00000020983 KMT5C (ENSTGUG00000021288) HSPBP1 (ENSTGUG00000025040) ENSTGUG00000019160 TNNI3 (ENSTGUG00000023974) ##21 ENSTGUG00000023382 ENSTGUG00000019094 ENSTGUG00000029386 RPS9 (ENSTGUG00000027604) ENSTGUG00000022956 ENSTGUG00000025910 ENSTGUG00000020492 ENSTGUG00000023966 ENSTGUG00000022322 ENSTGUG00000029158 ENSTGUG00000026564 ENSTGUG00000019190 ENSTGUG00000028952 ENSTGUG00000023482 ENSTGUG00000020795 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000161866 ENSGT00390000009532.A.d.b ENSGT00940000161346 ENSGT00940000161121 ENSGT00940000154404.a ENSGT00390000001927.b ENSGT00940000161908 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ENSSMRG00000004165 tuatara MODERN SPECIES 247 PPP6R1 (ENSSPUG00000002612) ENSSPUG00000002662 ENSSPUG00000002671 TNNI3 (ENSSPUG00000002711) ##21 ENSSPUG00000002727 TTYH1 (ENSSPUG00000002737) LENG8 (ENSSPUG00000002749) LENG9 (ENSSPUG00000002762) CDC42EP5 (ENSSPUG00000002770) EPS8L1 (ENSSPUG00000002794) ENSSPUG00000002932 ENSSPUG00000002949 ENSSPUG00000002984 ENSSPUG00000003005 ENSSPUG00000003024 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000163198 ENSGT00940000153306.B ENSGT00940000154852.b ENSGT00940000161663 ENSGT00940000162592 ENSGT00950000182932.A.b.b ENSGT00910000144307 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000162969 ENSGT00390000010577 ENSGT00390000008006 ENSGT00950000183060.a.b.b.b ENSGT00550000074829 ENSGT00390000003912 ENSGT00940000166541 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ENSSHAG00000029811 ENSSHAG00000029320 ENSSHAG00000021195 PPP6R1 (ENSSHAG00000003824) ENSSHAG00000030335 DNAAF3 (ENSSHAG00000001262) ENSSHAG00000022075 ##21 ENSSHAG00000032103 ENSSHAG00000002420 ENSSHAG00000031067 ENSSHAG00000000366 ENSSHAG00000024323 ENSSHAG00000002632 ENSSHAG00000003623 ENSSHAG00000027353 ENSSHAG00000027185 ENSSHAG00000029011 ENSSHAG00000000691 ENSSHAG00000020562 ENSSHAG00000024263 ENSSHAG00000023882 ENSSHAG00000002630 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000164511.C ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000162969 ENSGT00390000010577 ENSGT00390000008006 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ENSPCTG00005022618 Blue whale MODERN SPECIES 10 UBE2S (ENSBMSG00010014413) KMT5C (ENSBMSG00010014483) TMEM238 (ENSBMSG00010014567) TMEM190 (ENSBMSG00010014585) IL11 (ENSBMSG00010014629) ENSBMSG00010014670 ENSBMSG00010014699 TMEM150B (ENSBMSG00010014730) BRSK1 (ENSBMSG00010014787) HSPBP1 (ENSBMSG00010015014) PPP6R1 (ENSBMSG00010015058) ENSBMSG00010015153 ENSBMSG00010015188 SYT5 (ENSBMSG00010015237) DNAAF3 (ENSBMSG00010015271) TNNI3 (ENSBMSG00010015355) ##21 TNNT1 (ENSBMSG00010015457) PPP1R12C (ENSBMSG00010015571) EPS8L1 (ENSBMSG00010015674) RDH13 (ENSBMSG00010016022) ENSBMSG00010016074 ENSBMSG00010016193 NCR1 (ENSBMSG00010016405) FCAR (ENSBMSG00010016780) ENSBMSG00010017345 CDC42EP5 (ENSBMSG00010017983) LENG9 (ENSBMSG00010017994) LENG8 (ENSBMSG00010018060) TTYH1 (ENSBMSG00010018104) ENSBMSG00010018278 ENSBMSG00010018308 Pecora ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00910000148545 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 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Camelidae ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000157149 ENSGT00390000008732.a.a.d ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609.a ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT00940000167523 ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.d ENSGT00940000162693 ENSGT00950000183060.a.b.b.b ENSGT00390000008006 Arabian camel MODERN SPECIES 35 UBE2S (ENSCDRG00005007952) ENSCDRG00005007899 TMEM190 (ENSCDRG00005007703) IL11 (ENSCDRG00005007629) ENSCDRG00005007569 COX6B2 (ENSCDRG00005007530) KMT5C 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ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01000000218424 ENSGT00950000183060.a.b.b.b ENSGT00390000008006 ENSGT00390000010577 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00390000008732.a.a.c.a ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000161714.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.b.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.d ENSGT01100000263562.b.a.b Megabat MODERN SPECIES 1693 UBE2S (ENSPVAG00000007320) RPL28 (ENSPVAG00000007315) TMEM190 (ENSPVAG00000007313) IL11 (ENSPVAG00000007308) ENSPVAG00000007307 COX6B2 (ENSPVAG00000007306) KMT5C (ENSPVAG00000007305) TMEM150B (ENSPVAG00000007304) BRSK1 (ENSPVAG00000007303) HSPBP1 (ENSPVAG00000007302) PPP6R1 (ENSPVAG00000007301) TMEM86B (ENSPVAG00000007300) ENSPVAG00000007299 SYT5 (ENSPVAG00000007297) DNAAF3 (ENSPVAG00000007296) TNNI3 (ENSPVAG00000007294) ##21 TNNT1 (ENSPVAG00000007292) PPP1R12C (ENSPVAG00000007289) EPS8L1 (ENSPVAG00000007287) RDH13 (ENSPVAG00000007285) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00390000008732.a.a.c.a ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000161714.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.b ENSGT00550000074829 ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.b.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.d ENSGT01100000263562.b.a.b Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 6 ENSRFEG00010018653 TMEM238 (ENSRFEG00010018633) TMEM190 (ENSRFEG00010018584) IL11 (ENSRFEG00010018500) GARIN5B (ENSRFEG00010018399) COX6B2 (ENSRFEG00010018344) KMT5C (ENSRFEG00010018293) ENSRFEG00010018253 BRSK1 (ENSRFEG00010017988) HSPBP1 (ENSRFEG00010017938) PPP6R1 (ENSRFEG00010017867) TMEM86B (ENSRFEG00010017826) PTPRH (ENSRFEG00010017321) SYT5 (ENSRFEG00010017140) DNAAF3 (ENSRFEG00010016317) TNNI3 (ENSRFEG00010016024) ##21 TNNT1 (ENSRFEG00010015784) PPP1R12C (ENSRFEG00010015728) EPS8L1 (ENSRFEG00010015399) ENSRFEG00010015343 RDH13 (ENSRFEG00010015233) ENSRFEG00010015159 NLRP2 (ENSRFEG00010014517) ENSRFEG00010014486 ENSRFEG00010014407 ENSRFEG00010013450 NCR1 (ENSRFEG00010013100) FCAR (ENSRFEG00010012892) ENSRFEG00010011766 ENSRFEG00010011275 CDC42EP5 (ENSRFEG00010011252) Equus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000008732.a.a.d ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.b.f.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.b.f.a.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.b.f.b ENSGT00940000161714.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.b.c ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.b.b.k.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.d.t.a.a.a.b Donkey MODERN SPECIES 18 TMEM238 (ENSEASG00005028140) RPL28 (ENSEASG00005035483) TMEM190 (ENSEASG00005020784) IL11 (ENSEASG00005020788) GARIN5B (ENSEASG00005036909) ENSEASG00005020794 KMT5C (ENSEASG00005020797) TMEM150B (ENSEASG00005020800) BRSK1 (ENSEASG00005020845) HSPBP1 (ENSEASG00005020921) PPP6R1 (ENSEASG00005020928) TMEM86B (ENSEASG00005027183) PTPRH (ENSEASG00005020951) SYT5 (ENSEASG00005020964) DNAAF3 (ENSEASG00005020976) TNNI3 (ENSEASG00005026389) ##21 TNNT1 (ENSEASG00005020996) PPP1R12C (ENSEASG00005021028) EPS8L1 (ENSEASG00005021072) RDH13 (ENSEASG00005021074) ENSEASG00005021077 NLRP2 (ENSEASG00005038452) ENSEASG00005032310 ENSEASG00005028412 ENSEASG00005027994 ENSEASG00005025534 ENSEASG00005024601 ENSEASG00005021091 ENSEASG00005021154 ENSEASG00005021416 ENSEASG00005021428 Horse MODERN SPECIES 1 ISOC2 (ENSECAG00000015928) SHISA7 (ENSECAG00000015918) ENSECAG00000044515 RPL28 (ENSECAG00000026938) TMEM190 (ENSECAG00000037361) IL11 (ENSECAG00000014511) GARIN5B (ENSECAG00000014099) KMT5C (ENSECAG00000013820) TMEM150B (ENSECAG00000013225) BRSK1 (ENSECAG00000001444) HSPBP1 (ENSECAG00000058656) PPP6R1 (ENSECAG00000015843) TMEM86B (ENSECAG00000040978) PTPRH (ENSECAG00000009454) SYT5 (ENSECAG00000003943) TNNI3 (ENSECAG00000017232) ##21 TNNT1 (ENSECAG00000015657) PPP1R12C (ENSECAG00000001869) EPS8L1 (ENSECAG00000000532) RDH13 (ENSECAG00000023146) GP6 (ENSECAG00000022569) NLRP2 (ENSECAG00000020087) ENSECAG00000042978 ENSECAG00000051897 ENSECAG00000047012 ENSECAG00000049240 ENSECAG00000041909 ENSECAG00000050209 ENSECAG00000016792 NCR1 (ENSECAG00000013762) FCAR (ENSECAG00000052490) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00910000148545 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT00940000167523 ENSGT00940000161714.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263562.b.a.b ENSGT00940000162969 ENSGT00390000010577 ENSGT00390000008006 ENSGT00950000183060.a.b.b.b ENSGT00550000074829 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00910000148545 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT00940000167523 ENSGT00940000161714.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.d ENSGT00940000162693 ENSGT01100000263562.b.a.b ENSGT00940000162969 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00910000148545 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT00940000161714.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.d ENSGT00940000162693 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(ENSCAFG00020017086) ENSCAFG00020017173 Felidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00910000148545 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT00940000167523 ENSGT00940000161714.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.d.l.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.d.l.b ENSGT00940000162969 ENSGT00390000010577 Panthera ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000008732.a.a.c.a ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 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ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT00940000161714.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.d.l.b.a ENSGT00940000162969 ENSGT00390000010577 ENSGT00390000008006 ENSGT00950000183060.a.b.b.b lion MODERN SPECIES 243 ENSPLOG00000019104 TMEM238 (ENSPLOG00000019156) TMEM190 (ENSPLOG00000019166) IL11 (ENSPLOG00000019267) ENSPLOG00000019333 COX6B2 (ENSPLOG00000019386) KMT5C (ENSPLOG00000019426) TMEM150B (ENSPLOG00000019498) BRSK1 (ENSPLOG00000019542) HSPBP1 (ENSPLOG00000019858) PPP6R1 (ENSPLOG00000019899) TMEM86B (ENSPLOG00000019952) ENSPLOG00000019990 SYT5 (ENSPLOG00000020078) DNAAF3 (ENSPLOG00000020149) TNNI3 (ENSPLOG00000020177) ##21 TNNT1 (ENSPLOG00000020273) PPP1R12C (ENSPLOG00000020371) EPS8L1 (ENSPLOG00000020589) RDH13 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ENSGT00940000162969 ENSGT00390000010577 ENSGT00390000008006 ENSGT00950000183060.a.b.b.b ENSGT00960000189577 Primates ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000008732.a.a.b ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT00940000161714.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.a.b ENSGT01100000263562.b.a.b ENSGT00940000162969 ENSGT00390000010577 ENSGT00390000008006 ENSGT00950000183060.a.b.b.b Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000008732.a.a.b ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 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ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT00940000161619.f.b ENSGT00940000161714.a.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ENSGT00940000162969 ENSGT00390000008006 ENSGT00950000183060.a.b.b.b Mouse lemur MODERN SPECIES 14 TMEM238 (ENSMICG00000000995) TMEM190 (ENSMICG00000047668) IL11 (ENSMICG00000030455) GARIN5B (ENSMICG00000016719) ENSMICG00000016705 ENSMICG00000044547 KMT5C (ENSMICG00000044871) TMEM150B (ENSMICG00000016692) BRSK1 (ENSMICG00000016602) HSPBP1 (ENSMICG00000029358) PPP6R1 (ENSMICG00000043408) TMEM86B (ENSMICG00000035710) PTPRH (ENSMICG00000016632) SYT5 (ENSMICG00000016599) DNAAF3 (ENSMICG00000016558) TNNI3 (ENSMICG00000030348) ##21 TNNT1 (ENSMICG00000016550) 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ENSOGAG00000030920 ENSOGAG00000013373 ENSOGAG00000031188 ENSOGAG00000013367 ENSOGAG00000001290 NCR1 (ENSOGAG00000001287) ENSOGAG00000027124 ENSOGAG00000002713 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000008732.a.a.b ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT00940000161714.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.a.b ENSGT01100000263562.b.a.b ENSGT00940000162969 ENSGT00390000010577 ENSGT00390000008006 ENSGT00950000183060.a.b.b.b Tarsier MODERN SPECIES 5671 TMEM150B (ENSTSYG00000029950) BRSK1 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SPECIES ENSGT00390000008732.a.a.b.r ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT00940000164627 ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.a.b.i.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.b.c Gibbon MODERN SPECIES UBE2S (ENSNLEG00000010512) ENSNLEG00000010503 ENSNLEG00000031085 ENSNLEG00000010462 GARIN5B 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ENSMFAG00000042843 ##21 EPS8L1 (ENSMFAG00000000977) ENSMFAG00000032822 ENSMFAG00000062830 ENSMFAG00000042036 NLRP2 (ENSMFAG00000029871) ENSMFAG00000049313 NLRP7 (ENSMFAG00000003765) NCR1 (ENSMFAG00000044133) ENSMFAG00000061734 FCAR (ENSMFAG00000044829) ENSMFAG00000042271 ENSMFAG00000041610 ENSMFAG00000044434 ENSMFAG00000003194 ENSMFAG00000038087 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000008732.a.a.b.r ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT00550000074840.y.a ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT00940000164627 ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.b.b.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.b.b.a ENSGT01100000263562.b.a.b Mas night monkey MODERN SPECIES 696 SHISA7 (ENSANAG00000029205) UBE2S (ENSANAG00000031507) ENSANAG00000034536 TMEM190 (ENSANAG00000024460) IL11 (ENSANAG00000025610) COX6B2 (ENSANAG00000034717) KMT5C (ENSANAG00000023018) TMEM150B (ENSANAG00000000054) BRSK1 (ENSANAG00000031900) HSPBP1 (ENSANAG00000022512) PPP6R1 (ENSANAG00000025017) TMEM86B (ENSANAG00000026036) PTPRH (ENSANAG00000020970) SYT5 (ENSANAG00000022116) DNAAF3 (ENSANAG00000029227) TNNI3 (ENSANAG00000035198) ##21 TNNT1 (ENSANAG00000029555) PPP1R12C (ENSANAG00000005728) EPS8L1 (ENSANAG00000025304) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000008732.a.a.b.r ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 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NLRP2 (ENSCCAG00000023902) NLRP7 (ENSCCAG00000022157) ENSCCAG00000028021 NCR1 (ENSCCAG00000033853) ENSCCAG00000026501 ENSCCAG00000023061 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 265 SHISA7 (ENSSBOG00000029983) ENSSBOG00000031440 ENSSBOG00000028286 TMEM190 (ENSSBOG00000020513) IL11 (ENSSBOG00000025620) ENSSBOG00000024209 ENSSBOG00000021048 KMT5C (ENSSBOG00000029609) BRSK1 (ENSSBOG00000028046) HSPBP1 (ENSSBOG00000019133) PPP6R1 (ENSSBOG00000020672) TMEM86B (ENSSBOG00000021009) PTPRH (ENSSBOG00000021195) SYT5 (ENSSBOG00000035476) DNAAF3 (ENSSBOG00000027253) TNNI3 (ENSSBOG00000011438) ##21 TNNT1 (ENSSBOG00000027674) PPP1R12C (ENSSBOG00000018452) EPS8L1 (ENSSBOG00000021929) RDH13 (ENSSBOG00000031646) Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 14 SHISA7 (ENSCJAG00000048648) UBE2S (ENSCJAG00000068677) RPL28 (ENSCJAG00000000869) TMEM238 (ENSCJAG00000022190) IL11 (ENSCJAG00000000858) ENSCJAG00000077878 COX6B2 (ENSCJAG00000079874) KMT5C (ENSCJAG00000000843) TMEM150B (ENSCJAG00000072186) BRSK1 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ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.a.a.f.b.a Golden Hamster MODERN SPECIES 780 Tmem190 (ENSMAUG00000012404) Il11 (ENSMAUG00000011999) Garin5b (ENSMAUG00000008250) Cox6b2 (ENSMAUG00000015631) Kmt5c (ENSMAUG00000017071) Tmem150b (ENSMAUG00000010769) Brsk1 (ENSMAUG00000021219) Hspbp1 (ENSMAUG00000011739) ENSMAUG00000017712 Tmem86b (ENSMAUG00000001471) ENSMAUG00000001061 ENSMAUG00000006393 Syt5 (ENSMAUG00000021598) ENSMAUG00000007012 Dnaaf3 (ENSMAUG00000008314) Tnni3 (ENSMAUG00000015860) ##21 Tnnt1 (ENSMAUG00000020911) Ppp1r12c (ENSMAUG00000021347) ENSMAUG00000019917 ENSMAUG00000017155 Rdh13 (ENSMAUG00000008074) Gp6 (ENSMAUG00000022015) ENSMAUG00000020114 Lilra5 (ENSMAUG00000013497) Cdc42ep5 (ENSMAUG00000018334) Leng8 (ENSMAUG00000012241) Ttyh1 (ENSMAUG00000012921) Lair1 (ENSMAUG00000021810) ENSMAUG00000011608 ENSMAUG00000012428 Tsen34 (ENSMAUG00000019716) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 291 Tmem190 (ENSCGRG00001000742) Il11 (ENSCGRG00001001006) Garin5b (ENSCGRG00001003270) Cox6b2 (ENSCGRG00001005078) Kmt5c (ENSCGRG00001006665) ENSCGRG00001009751 Brsk1 (ENSCGRG00001010166) ENSCGRG00001010330 ENSCGRG00001010604 Hspbp1 (ENSCGRG00001016579) Ppp6r1 (ENSCGRG00001017539) Tmem86b (ENSCGRG00001020804) ENSCGRG00001021207 Dnaaf3 (ENSCGRG00001022238) Syt5 (ENSCGRG00001000314) Tnni3 (ENSCGRG00001001291) ##21 Tnnt1 (ENSCGRG00001007905) Ppp1r12c (ENSCGRG00001014724) Eps8l1 (ENSCGRG00001016460) Rdh13 (ENSCGRG00001000111) Gp6 (ENSCGRG00001017468) Ncr1 (ENSCGRG00001018023) ENSCGRG00001018494 ENSCGRG00001019445 ENSCGRG00001020505 Lilra5 (ENSCGRG00001020886) Cdc42ep5 (ENSCGRG00001000629) Leng9 (ENSCGRG00001004238) Leng8 (ENSCGRG00001023984) Ttyh1 (ENSCGRG00001003580) ENSCGRG00001011672 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000157149 ENSGT00390000008732.a.a.b.e.a.a ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254.c ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b Northern American deer mouse MODERN SPECIES 49 Dnaaf3 (ENSPEMG00000016555) Tnni3 (ENSPEMG00000023164) ##21 Tnnt1 (ENSPEMG00000028109) Eps8l1 (ENSPEMG00000011445) Rdh13 (ENSPEMG00000002264) Prairie vole MODERN SPECIES 130 ENSMOCG00000002346 Rpl28 (ENSMOCG00000006245) Tmem238 (ENSMOCG00000000051) Tmem190 (ENSMOCG00000000461) Il11 (ENSMOCG00000012859) ENSMOCG00000019215 Cox6b2 (ENSMOCG00000007830) Kmt5c (ENSMOCG00000013978) Tmem150b (ENSMOCG00000006716) Brsk1 (ENSMOCG00000012734) Hspbp1 (ENSMOCG00000016855) Ppp6r1 (ENSMOCG00000021392) Tmem86b (ENSMOCG00000007183) Syt5 (ENSMOCG00000015939) Dnaaf3 (ENSMOCG00000018937) Tnni3 (ENSMOCG00000003904) ##21 Tnnt1 (ENSMOCG00000016771) Ppp1r12c (ENSMOCG00000021994) ENSMOCG00000019191 Rdh13 (ENSMOCG00000001774) ENSMOCG00000006750 ##33 Gp6 (ENSMOCG00000005915) Ncr1 (ENSMOCG00000015667) ENSMOCG00000010977 Murinae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000008732.a.a.b.e.a.a ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.b.a ENSGT00940000162969 ENSGT00390000010577 ENSGT00390000008006 ENSGT00950000183060.a.b.b.b ENSGT00960000189577 ENSGT00940000162693 ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.a.a Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000008732.a.a.b.e.a.a ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.b.a ENSGT00940000162969 ENSGT00390000010577 ENSGT00390000008006 ENSGT00950000183060.a.b.b.b ENSGT00960000189577 ENSGT00940000162693 ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.a.a Mus_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000008732.a.a.b.e.a.a ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 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(MGP_CAROLIEiJ_G0029114) Ppp1r12c (MGP_CAROLIEiJ_G0029113) Eps8l1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029112) MGP_CAROLIEiJ_G0029111 MGP_CAROLIEiJ_G0029110 Ncr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029109) MGP_CAROLIEiJ_G0029108 Cdc42ep5 (MGP_CAROLIEiJ_G0029107) Leng9 (MGP_CAROLIEiJ_G0029106) Leng8 (MGP_CAROLIEiJ_G0029105) Ttyh1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029104) Lair1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029103) MGP_CAROLIEiJ_G0029102 MGP_CAROLIEiJ_G0029101 Rps9 (MGP_CAROLIEiJ_G0029100) Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000008732.a.a.b.e.a.a ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.b.a 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Lilra6 (ENSMUSG00000030427) Pira12 (ENSMUSG00000074417) Pira2 (ENSMUSG00000089942) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000008732.a.a.b.e.a.a ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.b.a ENSGT00940000162969 ENSGT00390000010577 ENSGT00390000008006 ENSGT00950000183060.a.b.b.b ENSGT00960000189577 ENSGT00940000162693 ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.a.a ENSGT00550000074829.q Steppe mouse MODERN SPECIES 2558 Tmem238 (ENSMSIG00000001964) Tmem190 (ENSMSIG00000001978) Il11 (ENSMSIG00000002035) Garin5b (ENSMSIG00000002061) 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MODERN SPECIES 249 ENSJJAG00000019857 Rpl28 (ENSJJAG00000019841) Tmem190 (ENSJJAG00000019474) Il11 (ENSJJAG00000018984) ENSJJAG00000018518 Cox6b2 (ENSJJAG00000001150) Kmt5c (ENSJJAG00000000222) Tmem150b (ENSJJAG00000023317) Brsk1 (ENSJJAG00000021973) Hspbp1 (ENSJJAG00000020815) ENSJJAG00000020637 Tmem86b (ENSJJAG00000020487) Ptprh (ENSJJAG00000015231) Syt5 (ENSJJAG00000014748) Dnaaf3 (ENSJJAG00000013059) Tnni3 (ENSJJAG00000011375) ##21 Tnnt1 (ENSJJAG00000014149) Ppp1r12c (ENSJJAG00000010783) ENSJJAG00000009977 ENSJJAG00000008371 Gp6 (ENSJJAG00000003429) Ncr1 (ENSJJAG00000001068) Kangaroo rat MODERN SPECIES 508 ENSDORG00000012815 Shisa7 (ENSDORG00000026157) ENSDORG00000012810 Rpl28 (ENSDORG00000012809) Tmem190 (ENSDORG00000012807) Il11 (ENSDORG00000012806) Cox6b2 (ENSDORG00000012804) Kmt5c (ENSDORG00000027615) Tmem150b (ENSDORG00000012800) Brsk1 (ENSDORG00000012799) Hspbp1 (ENSDORG00000012796) ENSDORG00000005202 Tmem86b (ENSDORG00000005200) Syt5 (ENSDORG00000011579) Dnaaf3 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ENSGT00910000148545 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000164511.C ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT00940000161714.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.b.e ENSGT00940000162969 ENSGT00390000010577 ENSGT00390000008006 ENSGT00960000189577 ENSGT00950000183060.a.b.b.b ENSGT00940000162693 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00910000148545 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000164511.C ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 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SPECIES 8 TMEM190 (ENSSVLG00005023734) IL11 (ENSSVLG00005023677) ENSSVLG00005023651 ENSSVLG00005023607 COX6B2 (ENSSVLG00005023567) KMT5C (ENSSVLG00005023510) TMEM150B (ENSSVLG00005023454) BRSK1 (ENSSVLG00005023255) HSPBP1 (ENSSVLG00005023210) PPP6R1 (ENSSVLG00005023166) TMEM86B (ENSSVLG00005023109) ENSSVLG00005023056 PTPRH (ENSSVLG00005022817) SYT5 (ENSSVLG00005022694) DNAAF3 (ENSSVLG00005022610) TNNI3 (ENSSVLG00005022449) ##21 TNNT1 (ENSSVLG00005022059) PPP1R12C (ENSSVLG00005021865) EPS8L1 (ENSSVLG00005021551) ENSSVLG00005021428 ENSSVLG00005021353 ENSSVLG00005021319 ENSSVLG00005021146 ENSSVLG00005020398 NCR1 (ENSSVLG00005020048) ENSSVLG00005019962 ENSSVLG00005017947 CDC42EP5 (ENSSVLG00005017646) LENG9 (ENSSVLG00005017610) LENG8 (ENSSVLG00005017575) ENSSVLG00005017533 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000008732.a.a.b.a.b ENSGT00940000162720.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b 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ENSGT01030000234564.a.b ENSGT01050000244894.a.a.a.a Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00390000008732.a.a.b.a.b ENSGT00390000008732.a.a.b.b ENSGT00390000006710 ENSGT00390000007165 ENSGT00940000163150 ENSGT00940000162621 ENSGT00940000161700 ENSGT01030000234578.A.b.b ENSGT00940000161254 ENSGT00940000153909.a ENSGT00390000009899.a.c ENSGT00390000007101.d.a ENSGT00940000162227 ENSGT00940000161816 ENSGT00390000002069 ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b ##21 ENSGT00940000160609 ENSGT00940000161425 ENSGT00940000158125 ENSGT00940000159641 ENSGT01100000263478.b.a.b.a ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.b.c ENSGT01100000263478.b.a.b.b.b.a.a.b.c.b.d.a.a ENSGT00940000162693 ENSGT00950000183060.a.b.b.b ENSGT00390000008006 Degu MODERN SPECIES 361 ISOC2 (ENSODEG00000010105) ENSODEG00000011615 ENSODEG00000010391 TMEM190 (ENSODEG00000009911) IL11 (ENSODEG00000010163) COX6B2 (ENSODEG00000010701) KMT5C (ENSODEG00000010521) TMEM150B (ENSODEG00000010863) BRSK1 (ENSODEG00000014498) HSPBP1 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ENSCLAG00000001600 ENSCLAG00000000651 ENSCLAG00000000660 TTYH1 (ENSCLAG00000000526) LENG8 (ENSCLAG00000000796) ENSCLAG00000000967 ENSCLAG00000001111 Guinea pig MODERN SPECIES 70 UBE2S (ENSCPOG00000012837) ENSCPOG00000012833 TMEM238 (ENSCPOG00000019669) TMEM190 (ENSCPOG00000015468) IL11 (ENSCPOG00000009123) COX6B2 (ENSCPOG00000009105) KMT5C (ENSCPOG00000009102) TMEM150B (ENSCPOG00000039123) BRSK1 (ENSCPOG00000009088) HSPBP1 (ENSCPOG00000030758) PPP6R1 (ENSCPOG00000021924) TMEM86B (ENSCPOG00000009709) ENSCPOG00000026559 SYT5 (ENSCPOG00000009084) DNAAF3 (ENSCPOG00000009082) TNNI3 (ENSCPOG00000020449) ##21 TNNT1 (ENSCPOG00000022114) PPP1R12C (ENSCPOG00000027133) ENSCPOG00000006835 RDH13 (ENSCPOG00000012153) NCR1 (ENSCPOG00000001319) ENSCPOG00000007412 ENSCPOG00000030847 LENG8 (ENSCPOG00000011788) TTYH1 (ENSCPOG00000021106) ENSCPOG00000000212 ENSCPOG00000037060 ENSCPOG00000000328 ENSCPOG00000033005 ENSCPOG00000007087 RPS9 (ENSCPOG00000020893) Platypus MODERN SPECIES 1 FIZ1 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ENSEBUG00000011257 nfya (ENSEBUG00000015438) tbc1d17 (ENSEBUG00000012472) rab21 (ENSEBUG00000002375) ENSEBUG00000007294 ENSEBUG00000004650 ENSEBUG00000002013 ENSEBUG00000005369 ##21 ENSEBUG00000012940 ENSEBUG00000005113 ENSEBUG00000015305 ENSEBUG00000003052 si:cabz01085950.1 (ENSEBUG00000004331) ENSEBUG00000011453 ENSEBUG00000016866 ENSEBUG00000008445 ENSEBUG00000005982 ENSEBUG00000014902 ENSEBUG00000011776 ENSEBUG00000014963 ENSEBUG00000015415 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234588.b.b.b.b.b.d ##21 Hagfish MODERN SPECIES 264 ENSEBUG00000011118 ENSEBUG00000009711 ENSEBUG00000007557 ap3s2 (ENSEBUG00000010217) ENSEBUG00000013356 samm50l (ENSEBUG00000004210) ENSEBUG00000005360 prmt1 (ENSEBUG00000002597) CD151 (ENSEBUG00000004231) TSPAN4 (ENSEBUG00000013847) ENSEBUG00000015323 ENSEBUG00000015267 ENSEBUG00000017088 ENSEBUG00000013390 ##21 ENSEBUG00000009819 gatd1 (ENSEBUG00000000296) tnnt3a (ENSEBUG00000005308) ENSEBUG00000008088 PDE9A (ENSEBUG00000000859) lcp1 (ENSEBUG00000001977) ENSEBUG00000009313 ENSEBUG00000016793