Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154102 #22 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT00940000169221 ENSGT00940000156861 ENSGT00940000153792.B ENSGT00940000154189.A ENSGT00940000157493 ENSGT00940000156194 ENSGT00940000159650 #23 ENSGT00940000157472 ENSGT00940000155056 ENSGT00940000159584 ENSGT00940000155325 ENSGT00940000162196 ENSGT00390000011228.a ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000160431 ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000159825 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00940000159650 #23 ENSGT00940000153394.c.a ENSGT00940000157472 ENSGT00940000160682.a ENSGT00940000155056 ENSGT00940000159584 ENSGT00940000155325 ENSGT00940000155264 ENSGT00990000203541.a.a.b ENSGT00390000012644 ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00940000162196 ENSGT00390000011228.a ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000160431 ENSGT00940000160784 ENSGT00940000154563 ENSGT00940000155199 ENSGT00390000016889 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ENSGT00940000156637 ENSGT00390000008224 Tiger MODERN SPECIES 245 NR5A2 (ENSPTIG00000016043) KIF14 (ENSPTIG00000018053) #16 DDX59 (ENSPTIG00000007021) #18 CAMSAP2 (ENSPTIG00000007466) #19 ENSPTIG00000009582 #22 KIF21B (ENSPTIG00000011877) #23 CACNA1S (ENSPTIG00000021055) #25 TMEM9 (ENSPTIG00000012372) #27 ENSPTIG00000014968 #28 PKP1 (ENSPTIG00000017481) #29 TNNT2 (ENSPTIG00000005262) #30 LAD1 (ENSPTIG00000013628) TNNI1 (ENSPTIG00000015711) PHLDA3 (ENSPTIG00000018883) CSRP1 (ENSPTIG00000019372) ENSPTIG00000000072 NAV1 (ENSPTIG00000021990) IPO9 (ENSPTIG00000009708) SHISA4 (ENSPTIG00000012401) LMOD1 (ENSPTIG00000013474) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00560000077332 ENSGT00550000075080 ENSGT00940000155152 ENSGT00940000155446 ENSGT00390000016548 ENSGT00940000158821 ENSGT00940000156725 ENSGT00940000160882 ENSGT00940000159457 ENSGT00940000153391.c.b.b ENSGT00940000161586 ENSGT00940000156834 #16 ENSGT00940000158639 #18 ENSGT00950000182975.a.a.a.b #19 ENSGT01050000244888.a.b #21 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PHLDA3 (ENSPLOG00000018122) CSRP1 (ENSPLOG00000018150) NAV1 (ENSPLOG00000018352) ENSPLOG00000018674 IPO9 (ENSPLOG00000018707) SHISA4 (ENSPLOG00000018738) Cat MODERN SPECIES 248 ZBTB41 (ENSFCAG00000005026) CRB1 (ENSFCAG00000000545) DENND1B (ENSFCAG00000019240) CF1H1orf53 (ENSFCAG00000044924) LHX9 (ENSFCAG00000001815) NEK7 (ENSFCAG00000040336) ATP6V1G3 (ENSFCAG00000035922) PTPRC (ENSFCAG00000015690) ENSFCAG00000029586 NR5A2 (ENSFCAG00000012604) ZNF281 (ENSFCAG00000028447) KIF14 (ENSFCAG00000025507) #16 DDX59 (ENSFCAG00000027373) #18 CAMSAP2 (ENSFCAG00000004594) #19 GPR25 (ENSFCAG00000026788) #21 INAVA (ENSFCAG00000004595) #22 ENSFCAG00000028284 KIF21B (ENSFCAG00000004597) #23 CACNA1S (ENSFCAG00000004605) #25 ASCL5 (ENSFCAG00000044334) #26 TMEM9 (ENSFCAG00000028386) #27 IGFN1 (ENSFCAG00000004609) #28 PKP1 (ENSFCAG00000004610) #29 TNNT2 (ENSFCAG00000004613) #30 LAD1 (ENSFCAG00000031969) TNNI1 (ENSFCAG00000034230) PHLDA3 (ENSFCAG00000036029) CSRP1 (ENSFCAG00000000442) NAV1 (ENSFCAG00000000443) ENSFCAG00000040636 IPO9 (ENSFCAG00000000444) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00560000077332 ENSGT00550000075080 ENSGT00940000155152 ENSGT00940000155446 ENSGT00390000016548 ENSGT00940000158821 ENSGT00940000156725 ENSGT00940000160882 ENSGT00940000159457 ENSGT00940000153391.c.b.b ENSGT00940000161586 ENSGT00940000156834 #16 ENSGT00940000158639 #18 ENSGT00950000182975.a.a.a.b #19 ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000163702 ENSGT00940000159650 #23 ENSGT00940000158289.b #25 ENSGT00940000163864 #26 ENSGT00390000000819.b #27 ENSGT00940000162073 #28 ENSGT00940000156735 #29 ENSGT00940000154709.a.a #30 ENSGT00390000005256 ENSGT01030000234588.b.a ENSGT00440000039564.a.a ENSGT00940000156777 ENSGT00900000143186 ENSGT00940000156637 ENSGT00390000008224 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00560000077332 ENSGT00550000075080 ENSGT00940000155152 ENSGT00940000155446 ENSGT00390000016548 ENSGT00940000158821 ENSGT00940000156725 ENSGT00940000160882 ENSGT00940000159457 ENSGT00940000153391.c.b.b ENSGT00940000161586 ENSGT00940000156834 #16 ENSGT00940000158639 #18 ENSGT00950000182975.a.a.a.b #19 ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000163702 ENSGT00940000159650 #23 ENSGT00940000158289.b #25 ENSGT00390000000819.b #27 ENSGT00940000162073 #28 ENSGT00940000156735 #29 ENSGT00940000154709.a.a #30 ENSGT00390000005256 ENSGT01030000234588.b.a ENSGT00440000039564.a.a ENSGT00940000156777 ENSGT00940000156637 ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825 Megabat MODERN SPECIES 1796 ENSPVAG00000012809 #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000154967.b ENSGT00560000077332 ENSGT00550000075080 ENSGT00940000155446 ENSGT00390000016548 ENSGT00940000158821 ENSGT00940000156725 ENSGT00940000160882 ENSGT00940000159457 ENSGT00940000153391.c.b.b ENSGT00940000161586 ENSGT00940000156834 #16 ENSGT00940000158639 #18 ENSGT00950000182975.a.a.a.b #19 ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000163702 ENSGT00940000159650 #23 ENSGT00940000158289.b #25 ENSGT00390000000819.b #27 ENSGT00940000162073 #28 ENSGT00940000156735 #29 ENSGT00940000154709.a.a #30 ENSGT00390000005256 ENSGT01030000234588.b.a ENSGT00440000039564.a.a ENSGT00940000156777 ENSGT00940000156637 ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 19 F13B (ENSRFEG00010017856) ASPM (ENSRFEG00010016875) ZBTB41 (ENSRFEG00010016831) DENND1B (ENSRFEG00010016561) C1orf53 (ENSRFEG00010016514) LHX9 (ENSRFEG00010016327) NEK7 (ENSRFEG00010016216) ATP6V1G3 (ENSRFEG00010016181) PTPRC (ENSRFEG00010015946) NR5A2 (ENSRFEG00010015719) ZNF281 (ENSRFEG00010015687) KIF14 (ENSRFEG00010014355) #16 DDX59 (ENSRFEG00010014264) #18 CAMSAP2 (ENSRFEG00010014100) #19 GPR25 (ENSRFEG00010014069) #21 INAVA (ENSRFEG00010014040) #22 ENSRFEG00010013943 KIF21B (ENSRFEG00010013731) #23 CACNA1S (ENSRFEG00010013548) #25 TMEM9 (ENSRFEG00010021896) #27 ENSRFEG00010021887 #28 PKP1 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ENSGT00940000162196 ENSGT00390000011228.a ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000159650 #23 ENSGT00940000158289.b #25 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234637.a.a ENSGT00960000192187 ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b ENSGT00940000156194 ENSGT00940000153189.C ENSGT00990000206767 ENSGT00940000154189.A ENSGT00940000157493 ENSGT00940000153792.B ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00940000162196 ENSGT00390000011228.a ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000159650 #23 ENSGT00940000158289.b #25 ENSGT00940000159117 ENSGT00950000185408 ENSGT00390000009166 ENSGT00950000182956.b.b.b ENSGT00940000158771 ENSGT00940000158726 ENSGT00390000003856.d ENSGT00390000012644 ENSGT00990000203541.a.a.b ENSGT00940000155264 ENSGT00940000155325 ENSGT00940000159584 ENSGT00940000155056 Laterata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159736 ENSGT01030000234637.a.a ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b ENSGT00940000156194 ENSGT00940000153189.C ENSGT00940000154189.A ENSGT00940000157493.x ENSGT00940000153792.B ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00940000162196.n ENSGT00940000162196.m ENSGT00390000011228.a ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000159650 #23 ENSGT00940000158289.b #25 ENSGT00940000160828.b ENSGT00390000008767.d ENSGT00940000159117 ENSGT00390000009166 ENSGT00950000182956.b.b.b ENSGT00940000158771 ENSGT00940000158726 ENSGT00390000003856.d ENSGT00390000012644 ENSGT00990000203541.a.a.b ENSGT00940000155264 ENSGT00940000155325 ENSGT00940000159584 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 16 SYPL2 (ENSSMRG00000018472) PSMA5 (ENSSMRG00000018473) SORT1 (ENSSMRG00000018474) ENSSMRG00000018475 ENSSMRG00000018476 PPIL1 (ENSSMRG00000018483) ENSSMRG00000018485 CELSR2 (ENSSMRG00000018486) ENSSMRG00000018491 SARS1 (ENSSMRG00000018492) ELAPOR1 (ENSSMRG00000018494) CFAP276 (ENSSMRG00000018497) TMEM167B (ENSSMRG00000018499) ENSSMRG00000018500 GPR25 (ENSSMRG00000018501) 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1 ENSGT00440000038072.d ENSGT00940000159736 ENSGT01030000234637.a.a ENSGT00960000192187 ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b ENSGT00940000156194 ENSGT00940000153189.C ENSGT00990000206767 ENSGT00940000157493 ENSGT00940000153792.B ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00940000162196 ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000159650.o #23 ENSGT00940000158289.b #25 ENSGT00390000008767.d ENSGT00940000159117 ENSGT00950000185408 ENSGT00390000009166 ENSGT00950000182956.b.b.b ENSGT00940000158771 ENSGT00940000158726 ENSGT00390000003856.d ENSGT00390000012644 ENSGT00990000203541.a.a.b ENSGT00940000155264.w.a ENSGT00940000155325 ENSGT00940000159584 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00440000038072.d ENSGT00940000159736.c ENSGT01030000234637.a.a ENSGT00960000192187 ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b ENSGT00940000156194 ENSGT00940000153189.C ENSGT00990000206767 ENSGT00940000157493.v ENSGT00940000153792.B ENSGT00940000156861 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ENSGT00950000183117.a.b ENSGT01030000234578.B.b ENSGT00390000017353 ENSGT00940000165883 ENSGT00940000157365 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00440000038072.d ENSGT00940000159736 ENSGT01030000234637.a.a ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b ENSGT00940000156194 ENSGT00940000153189.C ENSGT00940000154189.A ENSGT00940000157493 ENSGT00940000153792.B ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00940000162196 ENSGT00390000011228.a ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000159650.q #23 ENSGT00940000158289.b #25 ENSGT00940000163962 ENSGT00940000170563 ENSGT00390000009310 ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a ENSGT00950000182959.a.b.b.b ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a ENSGT00940000158040 ENSGT00950000182931.A ENSGT00950000183117.a.b ENSGT01030000234578.B.b ENSGT00390000017353 ENSGT00940000165883 ENSGT00940000157365.j Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00440000038072.d ENSGT00940000159736 ENSGT01030000234637.a.a ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b ENSGT00940000156194 ENSGT00940000153189.C ENSGT00940000154189.A ENSGT00940000157493 ENSGT00940000153792.B ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00940000162196 ENSGT00390000011228.a ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000159650.q #23 ENSGT00940000158289.b #25 ENSGT00940000163962 ENSGT00940000170563 ENSGT00390000009310 ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a ENSGT00950000182959.a.b.b.b ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a ENSGT00940000158040 ENSGT00950000182931.A ENSGT00950000183117.a.b ENSGT01030000234578.B.b ENSGT00390000017353 ENSGT00940000165883 ENSGT00940000157365.i Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 1765 GPR25 (ENSCABG00000002819) #21 INAVA (ENSCABG00000002821) #22 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 18 CYB561D1 (ENSGEVG00005007548) ATXN7L2 (ENSGEVG00005007567) SYPL2 (ENSGEVG00005007620) PSMA5 (ENSGEVG00005007669) SORT1 (ENSGEVG00005007949) CPNE5 (ENSGEVG00005008963) PPIL1 (ENSGEVG00005009053) ENSGEVG00005009078 CELSR2 (ENSGEVG00005009183) 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TULP1 (ENSPSIG00000006186) FKBP5 (ENSPSIG00000006195) ARMC12 (ENSPSIG00000006267) CLPS (ENSPSIG00000006319) LHFPL5 (ENSPSIG00000006348) SRPK1 (ENSPSIG00000006364) SLC26A8 (ENSPSIG00000006559) MAPK14 (ENSPSIG00000006647) MAPK13 (ENSPSIG00000006732) BRPF3 (ENSPSIG00000006906) ENSPSIG00000006910 SHISA4 (ENSPSIG00000006913) INAVA (ENSPSIG00000006943) #22 ENSPSIG00000006947 #27 ENSPSIG00000006984 ENSPSIG00000006989 PKP1 (ENSPSIG00000007049) #29 TNNT2 (ENSPSIG00000007199) #30 ENSPSIG00000007313 TNNI1 (ENSPSIG00000007323) CSRP1 (ENSPSIG00000007394) ENSPSIG00000000048 PPP1R12B (ENSPSIG00000007681) ENSPSIG00000007166 NAV1 (ENSPSIG00000007958) RNPEP (ENSPSIG00000010050) ELF3 (ENSPSIG00000010841) GPR37L1 (ENSPSIG00000011257) Archosauria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00440000038072.d ENSGT00940000159736 ENSGT01030000234637.a.a ENSGT00960000192187 ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b ENSGT00940000156194 ENSGT00940000153189.C ENSGT00940000154189.A ENSGT00940000157493 ENSGT00940000153792.B ENSGT00940000156861 ENSGT00940000162196 ENSGT00390000011228.a ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000155199 ENSGT00390000016889 ENSGT00950000182825.A.a.a ENSGT00940000157076 ENSGT00390000008224 ENSGT00940000158190 ENSGT00940000161810.a Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 52 ATXN7L2 (ENSCPRG00005003897) SYPL2 (ENSCPRG00005003913) ENSCPRG00005003915 PSMA5 (ENSCPRG00005003922) SORT1 (ENSCPRG00005003971) ENSCPRG00005004177 ENSCPRG00005004182 PPIL1 (ENSCPRG00005004183) PSRC1 (ENSCPRG00005004189) CELSR2 (ENSCPRG00005004196) SARS1 (ENSCPRG00005004226) ELAPOR1 (ENSCPRG00005004258) ENSCPRG00005004428 ENSCPRG00005004433 GPR25 (ENSCPRG00005004441) #21 INAVA (ENSCPRG00005004461) #22 KLHL12 (ENSCPRG00005004473) RABIF (ENSCPRG00005004486) ENSCPRG00005004491 KDM5B (ENSCPRG00005004504) IPO9 (ENSCPRG00005004522) LZTR1 (ENSCPRG00005004532) ENSCPRG00005004572 ASCL5 (ENSCPRG00005004650) #26 TMEM9 (ENSCPRG00005004662) #27 ENSCPRG00005004667 PKP1 (ENSCPRG00005004682) #29 TNNT2 (ENSCPRG00005004703) #30 TNNI1 (ENSCPRG00005004735) PHLDA3 (ENSCPRG00005004738) CSRP1 (ENSCPRG00005004741) Aves ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000153567.b.a.a ENSGT00950000182998.C.a ENSGT00950000183146.a.b ENSGT00940000159736 ENSGT01030000234637.a.a ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b ENSGT00940000156194 ENSGT00940000153189.C ENSGT00940000157493 ENSGT00940000153792.B ENSGT00940000156861 ENSGT00940000162196 ENSGT00390000011228.a ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825 ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000154563 ENSGT00940000167691 ENSGT00940000157365 ENSGT00940000165883 ENSGT00390000017353 ENSGT01030000234578.B.b ENSGT00950000183117.a.b ENSGT00950000182931.A ENSGT00940000158040 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a ENSGT00950000182959.a.b.b.b ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a Neognathae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000182998.C.a ENSGT00950000183146.a.b ENSGT00940000159736 ENSGT01030000234637.a.a ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b ENSGT00940000156194 ENSGT00940000153189.C ENSGT00990000205439 ENSGT00940000157493 ENSGT00940000153792.B ENSGT00940000156861 ENSGT00940000162196 ENSGT00390000011228.a ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825 ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000154563 ENSGT00940000167691 ENSGT00940000157365 ENSGT00940000165883 ENSGT00390000017353 ENSGT01030000234578.B.b ENSGT00950000183117.a.b ENSGT00950000182931.A ENSGT00940000158040 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a ENSGT00950000182959.a.b.b.b ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000182998.C.a ENSGT00950000183146.a.b ENSGT00940000159736 ENSGT01030000234637.a.a ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b ENSGT00940000156194 ENSGT00940000153189.C ENSGT00990000205439 ENSGT00940000157493 ENSGT00940000153792.B ENSGT00940000156861 ENSGT00940000162196 ENSGT00390000011228.a ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 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ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a ENSGT00950000182959.a.b.b.b ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a Golden eagle MODERN SPECIES 16 GNAI3 (ENSACCG00020008625) GPR61 (ENSACCG00020008640) AMIGO1 (ENSACCG00020008656) ATXN7L2 (ENSACCG00020008720) SYPL2 (ENSACCG00020008762) PSMA5 (ENSACCG00020008773) SORT1 (ENSACCG00020008892) CPNE5 (ENSACCG00020008968) PPIL1 (ENSACCG00020008987) ENSACCG00020009019 SARS1 (ENSACCG00020009031) ELAPOR1 (ENSACCG00020009057) TMEM167B (ENSACCG00020009088) ENSACCG00020009098 GPR25 (ENSACCG00020009108) #21 INAVA (ENSACCG00020009128) #22 SHISA4 (ENSACCG00020009162) LMOD1 (ENSACCG00020009182) ENSACCG00020009189 TIMM17A (ENSACCG00020009210) ADIPOR1 (ENSACCG00020009224) ENSACCG00020009239 UBE2T (ENSACCG00020009244) ENSACCG00020009265 LRIF1 (ENSACCG00020009289) DRAM2 (ENSACCG00020009306) CEPT1 (ENSACCG00020009330) DENND2D (ENSACCG00020009339) MYBPH (ENSACCG00020009357) ADORA1 (ENSACCG00020009375) MYOG (ENSACCG00020009387) Kakapo MODERN SPECIES 30 AMPD2 (ENSSHBG00005014588) GNAT2 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LRIF1 (ENSTGUG00000001402) DRAM2 (ENSTGUG00000001400) DENND2D (ENSTGUG00000001388) MYBPH (ENSTGUG00000001383) ADORA1 (ENSTGUG00000001381) MYOG (ENSTGUG00000001380) PPFIA4 (ENSTGUG00000001363) TMEM183A (ENSTGUG00000001354) Medium ground finch MODERN SPECIES 128 CPNE5 (ENSGFOG00000012836) PPIL1 (ENSGFOG00000012929) SARS1 (ENSGFOG00000012969) ENSGFOG00000012983 ENSGFOG00000012996 TMEM167B (ENSGFOG00000013003) INAVA (ENSGFOG00000013016) #22 ENSGFOG00000013023 SHISA4 (ENSGFOG00000013030) LMOD1 (ENSGFOG00000013038) TIMM17A (ENSGFOG00000013041) ADIPOR1 (ENSGFOG00000013047) ENSGFOG00000013065 UBE2T (ENSGFOG00000013070) ENSGFOG00000013076 LRIF1 (ENSGFOG00000013086) DRAM2 (ENSGFOG00000013088) CEPT1 (ENSGFOG00000001999) DENND2D (ENSGFOG00000002007) MYBPH (ENSGFOG00000002017) ADORA1 (ENSGFOG00000002030) MYOG (ENSGFOG00000002039) Flycatcher MODERN SPECIES 18 ENSFALG00000019885 ENSFALG00000002304 ENSFALG00000027630 CELSR2 (ENSFALG00000002331) ELAPOR1 (ENSFALG00000002345) ENSFALG00000002386 #22 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ENSGT01030000234637.a.a ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b ENSGT00940000156194 ENSGT00940000153189.C ENSGT00990000205439 ENSGT00940000157493 ENSGT00940000153792.B ENSGT00940000156861 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825 ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000154563 ENSGT00940000167691 ENSGT00940000157365 ENSGT00940000165883 ENSGT00390000017353 ENSGT01030000234578.B.b ENSGT00950000183117.a.b ENSGT00950000182931.A ENSGT00940000158040 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a ENSGT00950000182959.a.b.b.b ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a Chicken MODERN SPECIES 18 GNAI3 (ENSGALG00010027722) GPR61 (ENSGALG00010027719) ATXN7L2 (ENSGALG00010027717) SYPL2 (ENSGALG00010027714) PSMA5 (ENSGALG00010027709) SORT1 (ENSGALG00010024856) CPNE5 (ENSGALG00010024851) PPIL1 (ENSGALG00010024847) ENSGALG00010024841 ENSGALG00010027735 CELSR2 (ENSGALG00010024808) SARS1 (ENSGALG00010024787) KIAA1324 (ENSGALG00010024772) ENSGALG00010024743 ENSGALG00010024718 C26H1orf106 (ENSGALG00010024702) #22 SHISA4 (ENSGALG00010024683) LMOD1 (ENSGALG00010024863) TIMM17B (ENSGALG00010024828) ADIPOR1 (ENSGALG00010024810) ENSGALG00010024805 UBE2T (ENSGALG00010024783) ENSGALG00010024760 LRIF1 (ENSGALG00010024712) DRAM2 (ENSGALG00010024692) CEPT1 (ENSGALG00010024627) DENND2D (ENSGALG00010024608) MYBPHL (ENSGALG00010024595) ADORA1 (ENSGALG00010024589) MYOG (ENSGALG00010025215) PPFIA4 (ENSGALG00010025188) Turkey MODERN SPECIES 997 ENSMGAG00000021030 SARS1 (ENSMGAG00000013540) ENSMGAG00000019608 ENSMGAG00000021809 ENSMGAG00000020142 #22 Japanese quail MODERN SPECIES 18 AMPD2 (ENSCJPG00005009134) GNAT2 (ENSCJPG00005009133) GNAI3 (ENSCJPG00005009132) GPR61 (ENSCJPG00005009131) AMIGO1 (ENSCJPG00005009130) ATXN7L2 (ENSCJPG00005009129) SYPL2 (ENSCJPG00005009128) PSMA5 (ENSCJPG00005009127) SORT1 (ENSCJPG00005009126) CPNE5 (ENSCJPG00005009079) PPIL1 (ENSCJPG00005009078) ENSCJPG00005009077 CELSR2 (ENSCJPG00005009074) SARS1 (ENSCJPG00005009071) ELAPOR1 (ENSCJPG00005009070) INAVA (ENSCJPG00005009068) #22 SHISA4 (ENSCJPG00005009067) ENSCJPG00005009066 LMOD1 (ENSCJPG00005009065) TIMM17A (ENSCJPG00005009064) ADIPOR1 (ENSCJPG00005009063) ENSCJPG00005009062 UBE2T (ENSCJPG00005009061) ENSCJPG00005009060 LRIF1 (ENSCJPG00005009059) DRAM2 (ENSCJPG00005009058) CEPT1 (ENSCJPG00005009057) DENND2D (ENSCJPG00005009056) MYBPH (ENSCJPG00005009055) ADORA1 (ENSCJPG00005009054) MYOG (ENSCJPG00005009052) Anatidae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000159825 ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000154563 ENSGT00940000167691 ENSGT00940000157365 ENSGT00940000165883 ENSGT00390000017353 ENSGT01030000234578.B.b ENSGT00950000183117.a.b ENSGT00390000015714 ENSGT00390000006988 ENSGT00940000156616 ENSGT00390000012980.b ENSGT01090000260100.A ENSGT00940000157078 Duck MODERN SPECIES 815 INAVA (ENSAPLG00000027172) #22 Pink-footed goose MODERN SPECIES 237 GPR25 (ENSABRG00000011010) #21 INAVA (ENSABRG00000011020) #22 LMOD1 (ENSABRG00000011029) ENSABRG00000011035 TIMM17A (ENSABRG00000011050) ADIPOR1 (ENSABRG00000011082) ENSABRG00000011087 UBE2T (ENSABRG00000011089) ENSABRG00000011096 LRIF1 (ENSABRG00000011108) DRAM2 (ENSABRG00000011112) CEPT1 (ENSABRG00000011119) NFYA (ENSABRG00000011138) OARD1 (ENSABRG00000011155) APOBEC2 (ENSABRG00000011171) TSPO2 (ENSABRG00000011186) BAK1 (ENSABRG00000011204) Coelacanth MODERN SPECIES 248 GRM4 (ENSLACG00000003503) SMIM29 (ENSLACG00000009164) ENSLACG00000009323 NUDT3 (ENSLACG00000009589) ENSLACG00000022461 TMEM167B (ENSLACG00000022093) zgc:195245 (ENSLACG00000010320) GPR25 (ENSLACG00000010503) #21 INAVA (ENSLACG00000010848) #22 ENSLACG00000011027 RNPEP (ENSLACG00000011104) TIMM17A (ENSLACG00000011261) LMOD1 (ENSLACG00000011525) cyb5r1 (ENSLACG00000011674) ADIPOR1 (ENSLACG00000011871) KLHL12 (ENSLACG00000012003) KDM5B (ENSLACG00000012136) tuba5 (ENSLACG00000012222) IPO9 (ENSLACG00000012842) SHISA4 (ENSLACG00000013077) ENSLACG00000013243 ENSLACG00000013313 ENSLACG00000013724 SNRPC (ENSLACG00000013753) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 283 ENSGT00390000011228.a ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000160431 ENSGT00940000160784 ENSGT00940000154563 ENSGT00940000155199 ENSGT00390000016889 ENSGT00950000182825.A.a.a ENSGT00940000157076 ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825 ENSGT00390000017780.f Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 260 ENSGT00390000011228.a.a ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a #22 ENSGT00940000160431 ENSGT00940000160784 ENSGT00940000154563 ENSGT00940000155199 ENSGT00390000016889 ENSGT00950000182825.A.a.a ENSGT00940000157076 ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825 ENSGT00390000017780.f Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 262 ENSGT00940000156194.m.b ENSGT00940000159650 #23 ENSGT00990000203541.a.a.b.h ENSGT00940000155264 ENSGT00940000155325.a.b.a ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00940000162196 ENSGT00390000011228.a.b ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT00390000000819.b #27 ENSGT00940000158289.a.b ##25 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00940000162710.c.a ENSGT00940000155036 ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00390000012644 ENSGT00990000203541.a.a.b.g ENSGT00940000166975 ENSGT00940000155325.a.a.b ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00940000173571 ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00530000063722.a ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT00390000000819.b #27 ENSGT00940000158289.a.b.b ##25 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 171 ENSGT00940000166935 ENSGT00940000162710.c.a ENSGT00940000155036 ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00390000012644 ENSGT00990000203541.a.a.b.g ENSGT00940000166975 ENSGT00940000155325.a.a.b ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000006247 ENSGT00940000166935 ENSGT00940000155036 ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00390000012644 ENSGT00990000203541.a.a.b.g ENSGT00940000166975.i ENSGT00940000155325.a.a.b ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183062.a.b.b.a ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00940000153634.a ENSGT00940000160063.g.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000165955.b ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00970000193554 ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a Denticle herring MODERN SPECIES 1 lamtor5 (ENSDCDG00000014284) prok1 (ENSDCDG00000014292) PGA4 (ENSDCDG00000014358) ZNF335 (ENSDCDG00000015315) mmp9 (ENSDCDG00000015570) adora1b (ENSDCDG00000016788) dclre1b (ENSDCDG00000016789) cpne5a (ENSDCDG00000016801) CLPS (ENSDCDG00000016916) lhfpl5b (ENSDCDG00000016921) srpk1a (ENSDCDG00000016966) ENSDCDG00000020132 ELAPOR1 (ENSDCDG00000023069) ENSDCDG00000023111 zgc:195245 (ENSDCDG00000023120) ENSDCDG00000023124 #22 rpl10a (ENSDCDG00000023128) fance (ENSDCDG00000023149) ppardb (ENSDCDG00000023150) PDZD4 (ENSDCDG00000023153) porcn (ENSDCDG00000023156) kdm5c (ENSDCDG00000023187) renbp (ENSDCDG00000025727) zgc:162200 (ENSDCDG00000025745) apex2 (ENSDCDG00000025749) SLC38A5 (ENSDCDG00000025798) ENSDCDG00000028173 sema3ga (ENSDCDG00000028195) tspy (ENSDCDG00000029264) foxp3a (ENSDCDG00000029267) ENSDCDG00000029269 Atlantic herring MODERN SPECIES 20 rer1 (ENSCHAG00000022408) tp73 (ENSCHAG00000022349) wrap73 (ENSCHAG00000022313) TPRG1L (ENSCHAG00000022297) ENSCHAG00000022283 ENSCHAG00000022216 dclre1b (ENSCHAG00000022202) cpne5a (ENSCHAG00000022051) ENSCHAG00000022034 lhfpl5b (ENSCHAG00000022011) srpk1a (ENSCHAG00000021374) mapk14b (ENSCHAG00000020731) ELAPOR1 (ENSCHAG00000020561) si:ch211-163l21.7 (ENSCHAG00000020551) zgc:195245 (ENSCHAG00000020542) ENSCHAG00000020506 #22 ENSCHAG00000020495 rpl10a (ENSCHAG00000020440) fance (ENSCHAG00000020430) rad21l1 (ENSCHAG00000020420) ENSCHAG00000020406 mfsd2al2 (ENSCHAG00000020313) ENSCHAG00000020305 ENSCHAG00000020290 plp2b (ENSCHAG00000020276) sypb (ENSCHAG00000020268) ENSCHAG00000019578 praf2 (ENSCHAG00000019540) timm17b (ENSCHAG00000019513) mkrn4 (ENSCHAG00000019497) pqbp1 (ENSCHAG00000019490) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000162710.c.a ENSGT00940000155036 ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT00940000165930.B ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00390000012644 ENSGT00990000203541.a.a.b.g 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ENSGT00940000164911 ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000157898 ENSGT00390000015805.b ENSGT00940000154468.tb.b.b ENSGT00950000182844.a.a.b ENSGT00940000165387.a ENSGT00940000170563 ENSGT00550000074865 Channel catfish MODERN SPECIES 24 zmynd12 (ENSIPUG00000001040) SLC16A1 (ENSIPUG00000001030) ENSIPUG00000001014 lhfpl5b (ENSIPUG00000000993) col (ENSIPUG00000000976) ENSIPUG00000000973 cpne5a (ENSIPUG00000000871) dclre1b (ENSIPUG00000000854) adora1b (ENSIPUG00000000851) clps (ENSIPUG00000000843) lhfpl5b (ENSIPUG00000000841) srpk1a (ENSIPUG00000000830) MAPK14 (ENSIPUG00000000798) kiaa1324 (ENSIPUG00000000782) c5h1orf194 (ENSIPUG00000000768) ENSIPUG00000000762 #22 rpl10a (ENSIPUG00000000731) fance (ENSIPUG00000000720) mkrn4 (ENSIPUG00000000711) ppard (ENSIPUG00000000702) cfp (ENSIPUG00000000699) tbc1d25 (ENSIPUG00000000683) nt5dc2 (ENSIPUG00000000667) ccdc22 (ENSIPUG00000000650) ENSIPUG00000000644 SLC38A3 (ENSIPUG00000000602) WAS (ENSIPUG00000000568) sema3gb (ENSIPUG00000000541) foxp3 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reference MODERN SPECIES 23 prok1 (ENSCCRG00000028271) ENSCCRG00000066767 mmp9 (ENSCCRG00000027829) zgc:110353 (ENSCCRG00000028268) ENSCCRG00000055657 adora1b (ENSCCRG00000071109) dclre1b (ENSCCRG00000025460) cpne5a (ENSCCRG00000055259) ENSCCRG00000066748 lhfpl5b (ENSCCRG00000004971) srpk1a (ENSCCRG00000012836) ENSCCRG00000011952 ENSCCRG00000061142 ENSCCRG00000008100 si:ch211-163l21.7 (ENSCCRG00000008050) ENSCCRG00000050215 #22 rpl10a (ENSCCRG00000073150) fance (ENSCCRG00000050167) mkrn4 (ENSCCRG00000058734) ppardb (ENSCCRG00000050104) ENSCCRG00000074591 tbc1d25 (ENSCCRG00000081033) nt5dc2 (ENSCCRG00000001386) ccdc22 (ENSCCRG00000050028) slc38a5b (ENSCCRG00000048683) wasb (ENSCCRG00000048673) sema3gb (ENSCCRG00000047754) ENSCCRG00000074175 gpr173 (ENSCCRG00000065599) suv39h1a (ENSCCRG00000041194) ENSCCRG00000014191 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000158175.b ENSGT00940000156194.m.a.b ENSGT00940000166935.b ENSGT00940000158508.i ENSGT00940000157415.g ENSGT00940000165930.B.s 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Poecilia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157415.c ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00990000203541.a.a.b.g ENSGT00940000166975 ENSGT00940000155325.a.b.b ENSGT00940000156861 ENSGT00940000173571 ENSGT00550000074816.B ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT00530000068920 ENSGT00940000155440.c.b ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000162430 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000170524 ENSGT00940000161971 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000157415.c ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00990000203541.a.a.b.g ENSGT00940000166975 ENSGT00940000155325.a.b.b ENSGT00940000156861 ENSGT00940000173571 ENSGT00550000074816.B ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 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(ENSACIG00000000876) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158161.e.b ENSGT00940000158411 ENSGT00390000006247 ENSGT00940000166935 ENSGT00940000162710.c.a ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00990000203541.a.a.b.g ENSGT00940000166975 ENSGT00940000155325.a.a.b ENSGT00940000156861 ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT00530000068920 ENSGT00940000155440.c.b ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165418 ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000170524 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158161.e.b ENSGT00940000158411 ENSGT00390000006247 ENSGT00940000166935 ENSGT00940000162710.c.a ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00990000203541.a.a.b.g ENSGT00940000166975 ENSGT00940000155325.a.a.b ENSGT00940000156861 ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT00530000068920 ENSGT00940000155440.c.b ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165418 ENSGT00940000156263.k ENSGT01060000248949 ENSGT00940000170524 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000160669 ENSGT00940000158161.e.b ENSGT00940000158411 ENSGT00390000006247 ENSGT00940000166935 ENSGT00940000162710.c.a ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00940000166975 ENSGT00940000155325.a.a.b ENSGT00940000156861 ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00530000063722.a ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT00530000068920 ENSGT00940000155440.c.b ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165418 ENSGT00940000156263.k ENSGT01060000248949 Orange clownfish MODERN SPECIES 22 ENSAPEG00000020149 RBM15 (ENSAPEG00000020077) slc16a4 (ENSAPEG00000020058) lamtor5 (ENSAPEG00000020041) prok1 (ENSAPEG00000020014) ENSAPEG00000020000 ZNF335 (ENSAPEG00000019914) mmp9 (ENSAPEG00000019893) adora1b (ENSAPEG00000019884) dclre1b (ENSAPEG00000019877) cpne5a (ENSAPEG00000019725) srpk1a (ENSAPEG00000019620) MAPK14 (ENSAPEG00000019544) ELAPOR1 (ENSAPEG00000019511) zgc:195245 (ENSAPEG00000019478) INAVA (ENSAPEG00000019462) #22 ENSAPEG00000019450 rpl10a (ENSAPEG00000019421) fance (ENSAPEG00000019332) mkrn4 (ENSAPEG00000019319) ppardb (ENSAPEG00000019291) def6a (ENSAPEG00000019233) ENSAPEG00000019205 pfkma (ENSAPEG00000019092) ENSAPEG00000019058 asb8 (ENSAPEG00000019041) atf7a (ENSAPEG00000019006) dip2ba (ENSAPEG00000018911) ENSAPEG00000018750 ENSAPEG00000018722 SCN8A (ENSAPEG00000018655) Clown anemonefish MODERN SPECIES 702 srpk1a (ENSAOCG00000013884) MAPK14 (ENSAOCG00000013845) ELAPOR1 (ENSAOCG00000013781) zgc:195245 (ENSAOCG00000013739) INAVA (ENSAOCG00000013728) #22 rpl10a (ENSAOCG00000013690) fance (ENSAOCG00000013678) mkrn4 (ENSAOCG00000013661) ppardb (ENSAOCG00000000854) def6a (ENSAOCG00000013606) ENSAOCG00000013555 pfkma (ENSAOCG00000013524) ENSAOCG00000002408 asb8 (ENSAOCG00000013378) atf7a (ENSAOCG00000013353) dip2ba (ENSAOCG00000013302) ENSAOCG00000013191 SCN8A (ENSAOCG00000013169) ENSAOCG00000013064 ENSAOCG00000013048 Spiny chromis MODERN SPECIES 537 dclre1b (ENSAPOG00000005892) cpne5a (ENSAPOG00000005989) lhfpl5b (ENSAPOG00000006023) srpk1a (ENSAPOG00000006062) MAPK14 (ENSAPOG00000006083) ELAPOR1 (ENSAPOG00000006134) zgc:195245 (ENSAPOG00000006163) INAVA (ENSAPOG00000006175) #22 ENSAPOG00000006185 rpl10a (ENSAPOG00000006206) fance (ENSAPOG00000006220) mkrn4 (ENSAPOG00000006267) ppardb (ENSAPOG00000006313) def6a (ENSAPOG00000006367) ENSAPOG00000006389 pfkma (ENSAPOG00000007052) LARP4 (ENSAPOG00000007142) asb8 (ENSAPOG00000007180) atf7a (ENSAPOG00000007234) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 260 RBM15 (ENSSPAG00000004965) slc16a4 (ENSSPAG00000004978) lamtor5 (ENSSPAG00000005011) prok1 (ENSSPAG00000005026) ENSSPAG00000005119 ZNF335 (ENSSPAG00000006179) mmp9 (ENSSPAG00000006357) adora1b (ENSSPAG00000006385) dclre1b (ENSSPAG00000006390) cpne5a (ENSSPAG00000006402) lhfpl5b (ENSSPAG00000006448) srpk1a (ENSSPAG00000006475) mapk14a (ENSSPAG00000006594) ELAPOR1 (ENSSPAG00000006678) zgc:195245 (ENSSPAG00000006719) ENSSPAG00000006763 #22 rpl10a (ENSSPAG00000006785) fance (ENSSPAG00000006842) ppardb (ENSSPAG00000007008) def6a (ENSSPAG00000007036) ENSSPAG00000007065 pfkma (ENSSPAG00000007101) ENSSPAG00000007222 asb8 (ENSSPAG00000007576) atf7a (ENSSPAG00000007596) dip2ba (ENSSPAG00000007661) ENSSPAG00000007758 SCN8A (ENSSPAG00000007872) ENSSPAG00000007919 ENSSPAG00000007926 FIGNL2 (ENSSPAG00000007935) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000166935 ENSGT00940000162710.c.a ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00990000203541.a.a.b.g ENSGT00940000166975 ENSGT00940000155325.a.a.b ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00940000173571 ENSGT00550000074816.B ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT00530000068920 ENSGT00940000155440.c.b ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165418 ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000170524 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000166935 ENSGT00940000162710.c.a ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00990000203541.a.a.b.g ENSGT00940000166975 ENSGT00940000155325.a.a.b ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00940000173571 ENSGT00550000074816.B ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT00530000068920 ENSGT00940000155440.c.b ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165418 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000170524 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158411 ENSGT00390000006247 ENSGT00940000166935 ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00990000203541.a.a.b.g ENSGT00940000166975 ENSGT00940000155325.a.a.b ENSGT00940000156861 ENSGT00940000173571 ENSGT00550000074816.B ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b.m ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT00530000068920 ENSGT00940000155440.c.b ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000170524 ENSGT00940000161971 ENSGT01080000257420.C.b.a Fugu MODERN SPECIES 15 slc16a4 (ENSTRUG00000001770) lamtor5 (ENSTRUG00000023554) prok1 (ENSTRUG00000001689) ZNF335 (ENSTRUG00000001322) mmp9 (ENSTRUG00000000827) adora1b (ENSTRUG00000016343) dclre1b (ENSTRUG00000025152) cpne5a (ENSTRUG00000016323) lhfpl5b (ENSTRUG00000016319) srpk1a (ENSTRUG00000016288) ENSTRUG00000016218 ELAPOR1 (ENSTRUG00000032645) ENSTRUG00000021751 smc5 (ENSTRUG00000016193) zgc:195245 (ENSTRUG00000016189) ENSTRUG00000016183 #22 rpl10a (ENSTRUG00000016168) fance (ENSTRUG00000016161) mkrn4 (ENSTRUG00000025139) ppardb (ENSTRUG00000016146) def6a (ENSTRUG00000016125) ENSTRUG00000021701 ENSTRUG00000015939 atf7a 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stat6 (ENSTNIG00000015103) mipa (ENSTNIG00000015102) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000166935 ENSGT00940000162710.c.a ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00990000203541.a.a.b.g ENSGT00940000166975 ENSGT00940000155325.a.a.b ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00940000173571 ENSGT00550000074816.B ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT00530000068920 ENSGT00940000155440.c.b ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165418 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000170524 Ballan wrasse MODERN SPECIES 302 prok1 (ENSLBEG00000015712) ZNF335 (ENSLBEG00000015653) mmp9 (ENSLBEG00000015615) adora1b (ENSLBEG00000015584) dclre1b (ENSLBEG00000015562) cpne5a (ENSLBEG00000015441) 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ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165418 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000170524 Gilthead seabream MODERN SPECIES 21 lamtor5 (ENSSAUG00010026582) prok1 (ENSSAUG00010026581) ENSSAUG00010026579 ZNF335 (ENSSAUG00010026578) mmp9 (ENSSAUG00010026521) adora1b (ENSSAUG00010026518) dclre1b (ENSSAUG00010026517) cpne5a (ENSSAUG00010026515) lhfpl5b (ENSSAUG00010026514) srpk1a (ENSSAUG00010026300) MAPK14 (ENSSAUG00010025761) ELAPOR1 (ENSSAUG00010025655) ENSSAUG00010025645 ENSSAUG00010025297 zgc:195245 (ENSSAUG00010025287) ENSSAUG00010025286 #22 ENSSAUG00010025285 rpl10a (ENSSAUG00010025284) fance (ENSSAUG00010025283) mkrn4 (ENSSAUG00010025281) ppardb (ENSSAUG00010025277) def6a (ENSSAUG00010025274) ENSSAUG00010025267 pfkma (ENSSAUG00010025172) LARP4 (ENSSAUG00010025150) asb8 (ENSSAUG00010025148) atf7a (ENSSAUG00010025145) dip2ba (ENSSAUG00010023031) ENSSAUG00010022966 ENSSAUG00010022198 ENSSAUG00010022181 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000166935 ENSGT00940000162710.c.a ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00990000203541.a.a.b.g ENSGT00940000166975 ENSGT00940000155325.a.a.b ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00940000173571 ENSGT00550000074816.B ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT00530000068920 ENSGT00940000155440.c.b ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165418 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000170524 European seabass MODERN SPECIES 14 slc16a4 (ENSDLAG00005018916) lamtor5 (ENSDLAG00005033114) prok1 (ENSDLAG00005018880) ENSDLAG00005018846 ENSDLAG00005018827 mmp9 (ENSDLAG00005018682) dclre1b (ENSDLAG00005018673) cpne5a (ENSDLAG00005018098) lhfpl5b (ENSDLAG00005026336) srpk1a 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ENSGT00940000162710.c.a ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 ENSGT00940000156194.m.a ENSGT00990000203541.a.a.b.g ENSGT00940000166975 ENSGT00940000155325.a.a.b ENSGT00940000156861 ENSGT00940000173571 ENSGT00550000074816.B ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT00530000068920 ENSGT00940000155440.c.b ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165418 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 Zig-zag eel MODERN SPECIES 21 lamtor5 (ENSMAMG00000010745) prok1 (ENSMAMG00000010755) ENSMAMG00000010768 ENSMAMG00000010775 mmp9 (ENSMAMG00000010804) ENSMAMG00000010827 dclre1b (ENSMAMG00000010837) cpne5a (ENSMAMG00000010842) lhfpl5b (ENSMAMG00000010867) srpk1a (ENSMAMG00000010877) ENSMAMG00000010909 ENSMAMG00000010913 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ENSGT00940000155440.c.b ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000165418 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 18 prok1 (ENSBSLG00000004372) ENSBSLG00000004337 ENSBSLG00000004330 ZNF335 (ENSBSLG00000004324) mmp9 (ENSBSLG00000004091) adora1b (ENSBSLG00000004032) dclre1b (ENSBSLG00000004014) cpne5a (ENSBSLG00000003796) lhfpl5b (ENSBSLG00000003571) srpk1a (ENSBSLG00000003258) MAPK14 (ENSBSLG00000003167) ELAPOR1 (ENSBSLG00000003125) ENSBSLG00000003122 smc5 (ENSBSLG00000002683) zgc:195245 (ENSBSLG00000002478) ENSBSLG00000002434 #22 rpl10a (ENSBSLG00000002383) fance (ENSBSLG00000002342) ppardb (ENSBSLG00000002281) def6a (ENSBSLG00000002222) ENSBSLG00000002127 LARP4 (ENSBSLG00000002115) asb8 (ENSBSLG00000002113) atf7a (ENSBSLG00000002111) dip2ba (ENSBSLG00000001927) ENSBSLG00000000877 SCN8A (ENSBSLG00000000742) ENSBSLG00000000645 FIGNL2 (ENSBSLG00000000639) stat6 (ENSBSLG00000000609) mipa (ENSBSLG00000000576) Climbing perch MODERN SPECIES 20 lamtor5 (ENSATEG00000019373) prok1 (ENSATEG00000019390) ENSATEG00000019426 ENSATEG00000019547 ENSATEG00000020172 mmp9 (ENSATEG00000020195) ENSATEG00000020216 dclre1b (ENSATEG00000020224) cpne5a (ENSATEG00000020240) lhfpl5b (ENSATEG00000028783) srpk1a (ENSATEG00000020317) ENSATEG00000020380 ENSATEG00000020399 ENSATEG00000020410 zgc:195245 (ENSATEG00000025255) ENSATEG00000020469 #22 rpl10a (ENSATEG00000020485) fance (ENSATEG00000020500) mkrn4 (ENSATEG00000020555) ppardb (ENSATEG00000020562) DEF6 (ENSATEG00000020588) ENSATEG00000020608 pfkma (ENSATEG00000020657) ENSATEG00000020715 asb8 (ENSATEG00000026798) atf7a (ENSATEG00000020751) dip2ba (ENSATEG00000020804) ENSATEG00000020867 ENSATEG00000020885 ENSATEG00000027582 ENSATEG00000020946 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000166935 ENSGT00940000162710.c.a ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000158175 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ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000170524 Greater amberjack MODERN SPECIES 23 lamtor5 (ENSSDUG00000008806) prok1 (ENSSDUG00000008879) ENSSDUG00000008954 ZNF335 (ENSSDUG00000009971) mmp9 (ENSSDUG00000010010) adora1b (ENSSDUG00000010070) dclre1b (ENSSDUG00000010085) cpne5a (ENSSDUG00000010097) lhfpl5b (ENSSDUG00000010145) srpk1a (ENSSDUG00000010159) mapk14a (ENSSDUG00000010228) ELAPOR1 (ENSSDUG00000010265) ENSSDUG00000010308 ENSSDUG00000010320 zgc:195245 (ENSSDUG00000010356) ENSSDUG00000010379 #22 rpl10a (ENSSDUG00000010399) fance (ENSSDUG00000010430) mkrn4 (ENSSDUG00000010454) ppardb (ENSSDUG00000010478) def6a (ENSSDUG00000010519) pfkma (ENSSDUG00000010580) LARP4 (ENSSDUG00000010621) asb8 (ENSSDUG00000010667) atf7a (ENSSDUG00000010687) dip2ba (ENSSDUG00000010745) ENSSDUG00000010896 SCN8A (ENSSDUG00000010971) ENSSDUG00000011020 ENSSDUG00000011028 FIGNL2 (ENSSDUG00000011041) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3155 ENSSLDG00000002880 ZNF335 (ENSSLDG00000002903) ENSSLDG00000002973 mmp9 (ENSSLDG00000003000) adora1b (ENSSLDG00000003092) dclre1b (ENSSLDG00000003115) cpne5a (ENSSLDG00000003151) ENSSLDG00000003312 lhfpl5b (ENSSLDG00000003336) srpk1a (ENSSLDG00000003366) ENSSLDG00000003466 ELAPOR1 (ENSSLDG00000003995) ENSSLDG00000004012 ENSSLDG00000004041 zgc:195245 (ENSSLDG00000004088) ENSSLDG00000004179 #22 ENSSLDG00000004211 rpl10a (ENSSLDG00000004242) fance (ENSSLDG00000004550) mkrn4 (ENSSLDG00000004587) ppardb (ENSSLDG00000004607) def6a (ENSSLDG00000004712) ENSSLDG00000004791 pfkma (ENSSLDG00000004828) ENSSLDG00000004942 asb8 (ENSSLDG00000004994) atf7a (ENSSLDG00000005028) ENSSLDG00000005077 dip2ba (ENSSLDG00000005115) ENSSLDG00000005176 SCN8A (ENSSLDG00000005220) Barramundi perch MODERN SPECIES 102 lamtor5 (ENSLCAG00010005967) prok1 (ENSLCAG00010005978) ENSLCAG00010005986 ZNF335 (ENSLCAG00010006065) mmp9 (ENSLCAG00010006164) adora1b (ENSLCAG00010006710) dclre1b (ENSLCAG00010006713) ENSLCAG00010006715 cpne5a (ENSLCAG00010006766) lhfpl5b 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ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT00530000068920 ENSGT00940000155440.c.b ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000162777 ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000170524 Turbot MODERN SPECIES 2 prok1 (ENSSMAG00000019143) ENSSMAG00000025807 ENSSMAG00000019152 ENSSMAG00000019162 mmp9 (ENSSMAG00000019171) ENSSMAG00000019185 dclre1b (ENSSMAG00000036753) cpne5a (ENSSMAG00000019197) lhfpl5b (ENSSMAG00000019265) srpk1a (ENSSMAG00000019272) ENSSMAG00000019276 ENSSMAG00000019290 si:ch211-163l21.7 (ENSSMAG00000019310) ENSSMAG00000019316 zgc:195245 (ENSSMAG00000019329) ENSSMAG00000019340 #22 rpl10a (ENSSMAG00000019351) fance (ENSSMAG00000019359) mkrn4 (ENSSMAG00000019369) ppardb (ENSSMAG00000019375) DEF6 (ENSSMAG00000019391) ENSSMAG00000019407 pfkma (ENSSMAG00000019425) ENSSMAG00000019473 asb8 (ENSSMAG00000019500) atf7a (ENSSMAG00000019511) dip2ba 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ENSGMOG00000031180 ENSGMOG00000008271 ENSGMOG00000022320 ENSGMOG00000028523 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000153336.a.a.f.b ENSGT00940000163961.a.a.a ENSGT00940000157877.a ENSGT00940000162649.e.a.b ENSGT00990000203541.a.b.a.b ENSGT00940000159659.d.a ENSGT00940000153110.B.e.a ENSGT00940000156977.f ENSGT00950000183042.b.a ENSGT00940000161154.b ENSGT00940000155325.a.b.a ENSGT00940000156861 ENSGT01030000234625.A ENSGT00940000162196.c ENSGT00390000011228.a.a ENSGT00940000154102.a.g #22 ENSGT00390000008767 ENSGT00390000000705 ENSGT00950000183077.b ENSGT00940000156676.d ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a ENSGT01100000263685 ENSGT00940000155440.c.b ENSGT01090000259987.a.a.b.f ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000165418 ENSGT00940000156263.k Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000161090.B.c.a.a.h ENSGT00940000161090.B.c.b.a.b.b ENSGT00940000166426.h 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ENSGT00940000161971.q.a ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000156260.d.c River trout MODERN SPECIES 23 krt18a.1 (ENSSTUG00000045366) ENSSTUG00000045417 zgc:171775 (ENSSTUG00000045581) ENSSTUG00000045709 ENSSTUG00000046694 LHFPL4 (ENSSTUG00000046700) CPNE9 (ENSSTUG00000046715) klf15 (ENSSTUG00000046913) ENSSTUG00000046931 ENSSTUG00000046969 MAPK14 (ENSSTUG00000046979) ELAPOR1 (ENSSTUG00000047217) si:ch211-163l21.7 (ENSSTUG00000048091) ENSSTUG00000048097 zgc:195245 (ENSSTUG00000048103) ENSSTUG00000048110 #22 mkrn4 (ENSSTUG00000048122) ppardb (ENSSTUG00000048144) def6a (ENSSTUG00000048180) ENSSTUG00000048192 pfkma (ENSSTUG00000018386) ENSSTUG00000027689 asb8 (ENSSTUG00000027732) atf7a (ENSSTUG00000027744) dip2ba (ENSSTUG00000027970) SCN8A (ENSSTUG00000033206) ENSSTUG00000035298 FIGNL2 (ENSSTUG00000035309) stat6 (ENSSTUG00000035341) mipa (ENSSTUG00000035954) ptges3a (ENSSTUG00000035965) Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 ENSSSAG00000096461 krt8 (ENSSSAG00000064465) zgc:171775 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SPECIES 7 zgc:171775 (ENSOMYG00000018654) ENSOMYG00000018744 ENSOMYG00000019282 ENSOMYG00000019334 ENSOMYG00000019745 ENSOMYG00000062896 klf15 (ENSOMYG00000021895) ENSOMYG00000021925 ENSOMYG00000021948 ENSOMYG00000052810 ENSOMYG00000022088 ENSOMYG00000023071 si:ch211-163l21.7 (ENSOMYG00000025583) ENSOMYG00000025594 zgc:195245 (ENSOMYG00000025602) ENSOMYG00000025615 #22 ENSOMYG00000077164 ENSOMYG00000025668 ENSOMYG00000025767 ENSOMYG00000025844 ENSOMYG00000026144 pfkma (ENSOMYG00000026447) ENSOMYG00000065041 ENSOMYG00000028102 asb8 (ENSOMYG00000028129) atf7a (ENSOMYG00000028168) dip2ba (ENSOMYG00000030137) ENSOMYG00000036247 ENSOMYG00000039805 ENSOMYG00000039817 ENSOMYG00000039826 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 500 ENSGT00940000161154.b.e ENSGT00940000162464.n ENSGT00940000155325.a.a.a.a.b.b ENSGT00390000011228.a.a.f ENSGT00940000154102.a.g.f #22 ENSGT00390000008767.p ENSGT00390000000705 ENSGT00940000156676.d.c ENSGT00950000183017.b.b.a.b.a.e ENSGT01100000263685.a 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ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000159166 ENSGT00940000156024.i.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00940000155056.b ENSGT00940000163942.a ENSGT00940000158374.d ENSGT00940000166894 ENSGT00390000009278.a ENSGT00950000182834.C ENSGT00500000044947 ENSGT00940000166327 ENSGT00950000182903.b.a.z ENSGT00390000001509.a ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00940000157665.b ENSGT00940000158083.b ENSGT00940000160300.b.b ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a.h #22 ENSGT00940000158963.b.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000155317.a.a.b ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01000000214440.B ENSGT00530000063255.A ENSGT00940000155569.a.a ENSGT00390000001799 ENSGT00940000159809 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a Denticle herring MODERN SPECIES 3 PLCH2 (ENSDCDG00000019820) skib (ENSDCDG00000020056) tmem51b (ENSDCDG00000020058) kaznb (ENSDCDG00000020060) PRDM2 (ENSDCDG00000020063) 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(ENSCHAG00000011888) ENSCHAG00000011879 GPR25 (ENSCHAG00000011855) #21 ENSCHAG00000011837 inavab (ENSCHAG00000011825) #22 otud5b (ENSCHAG00000011755) grm6b (ENSCHAG00000011535) ENSCHAG00000011442 ENSCHAG00000010017 ccdc120b (ENSCHAG00000009963) ##22 mbd1b (ENSCHAG00000009904) STX16 (ENSCHAG00000009836) npepl1 (ENSCHAG00000009212) ENSCHAG00000009200 ctsz (ENSCHAG00000009119) nelfcd (ENSCHAG00000008753) ENSCHAG00000008741 ENSCHAG00000008726 mon1a (ENSCHAG00000008722) ENSCHAG00000008627 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00390000006896 ENSGT00950000182986.a.a ENSGT00940000161652.a ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a ENSGT00940000166479 ENSGT00940000157830.c ENSGT00940000154468.tb.a ENSGT00940000156368.a ENSGT00940000155740 ENSGT00950000182903.b.a.y.a ENSGT00390000001509.a ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00940000157665.b ENSGT00940000158083.b ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a.h #22 ENSGT00940000160431 ENSGT00390000016889 ENSGT00940000157076.j.c ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000162989.e ENSGT00920000149095 ENSGT00390000006896 ENSGT00950000182986.a.a ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a ENSGT00940000166479 ENSGT00940000157830.c ENSGT00940000154468.tb.a ENSGT00940000155740 ENSGT00950000182903.b.a.y.a ENSGT00390000001509.a ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00940000157665.b ENSGT00940000158083.b ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a.h #22 ENSGT00940000160431 ENSGT00940000157076.j.c.a ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b Channel catfish MODERN SPECIES 13 eif4g1a (ENSIPUG00000015470) opn1lw1 (ENSIPUG00000015456) gnl3l (ENSIPUG00000015441) ENSIPUG00000015425 ccdc120b (ENSIPUG00000015381) ##22 BRPF3 (ENSIPUG00000015329) MON1B (ENSIPUG00000015318) cxxc1b (ENSIPUG00000015280) ENSIPUG00000015243 olfml3 (ENSIPUG00000015231) ENSIPUG00000015222 inavab (ENSIPUG00000015200) #22 rabif (ENSIPUG00000015172) kdm5ba (ENSIPUG00000015005) Ipo9 (ENSIPUG00000014896) shisa4 (ENSIPUG00000014876) LMOD1 (ENSIPUG00000014866) timm17a (ENSIPUG00000014845) myg1 (ENSIPUG00000014822) ENSIPUG00000014816 ENSIPUG00000014805 kaznb (ENSIPUG00000014784) prdm2 (ENSIPUG00000014729) adnpa (ENSIPUG00000014716) fam83d (ENSIPUG00000014706) tmem51b (ENSIPUG00000014700) FOXJ3 (ENSIPUG00000014630) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00920000149095 ENSGT00390000006896 ENSGT00950000182986.a.a ENSGT00940000161652.a.d ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a ENSGT00940000166479 ENSGT00940000157830.c ENSGT00940000154468.tb.a ENSGT00940000155740 ENSGT00950000182903.b.a.y.a ENSGT00390000001509.a ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00940000157665.b ENSGT00940000158083.b ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a.h #22 ENSGT00940000160431 ENSGT00940000157076.j.c.a ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000167008 ENSGT00940000160885 ENSGT01060000252161 ENSGT00940000154129.gd ENSGT00940000159006.c.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000164582.a ENSGT00390000006896 ENSGT00950000182986.a.a ENSGT00940000161652.a.d ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a ENSGT00940000166479 ENSGT00940000157830.c ENSGT00940000154468.tb.a ENSGT00940000155740 ENSGT00950000182903.b.a.y.a ENSGT00390000001509.a ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00940000157665.b ENSGT00940000158083.b ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a.h #22 ENSGT00940000160431 ENSGT00940000157076.j.c.a ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000167008 ENSGT00940000160885 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 694 SYT6 (ENSPNAG00000003355) olfml3b (ENSPNAG00000015076) GPR25 (ENSPNAG00000015084) #21 inavab (ENSPNAG00000015114) #22 rnpep (ENSPNAG00000015194) cyb5r1 (ENSPNAG00000015257) adipor1a (ENSPNAG00000015273) rabif (ENSPNAG00000015292) kdm5ba (ENSPNAG00000015348) ipo9 (ENSPNAG00000015428) Mexicana tetra MODERN SPECIES 14 sox12 (ENSAMXG00000025593) ENSAMXG00000030138 ENSAMXG00000029362 pnp4a (ENSAMXG00000013706) ENSAMXG00000032717 rem1 (ENSAMXG00000035972) rbm39a (ENSAMXG00000013781) nfs1 (ENSAMXG00000013809) dvl1b (ENSAMXG00000030033) mxra8a (ENSAMXG00000034886) ENSAMXG00000029492 SYT6 (ENSAMXG00000013910) ENSAMXG00000042600 olfml3b (ENSAMXG00000031992) GPR25 (ENSAMXG00000038527) #21 inavab (ENSAMXG00000036669) #22 rnpep (ENSAMXG00000024736) ENSAMXG00000044066 cyb5r1 (ENSAMXG00000032554) ENSAMXG00000036879 adipor1a (ENSAMXG00000038988) rabif (ENSAMXG00000044109) kdm5ba (ENSAMXG00000024732) ipo9 (ENSAMXG00000024731) shisa4 (ENSAMXG00000024730) LMOD1 (ENSAMXG00000024729) timm17a (ENSAMXG00000031238) sulf2a (ENSAMXG00000024727) arhgap46a (ENSAMXG00000024726) ENSAMXG00000037164 ndrg3a (ENSAMXG00000024724) Electric eel MODERN SPECIES 185 pnp4a (ENSEEEG00000008006) ENSEEEG00000008007 rem1 (ENSEEEG00000008008) rbm39a (ENSEEEG00000008010) nfs1 (ENSEEEG00000008139) dvl1b (ENSEEEG00000008145) mxra8a (ENSEEEG00000008148) PLEKHG5 (ENSEEEG00000008154) SYT6 (ENSEEEG00000008171) olfml3b (ENSEEEG00000008180) GPR25 (ENSEEEG00000008182) #21 inavab (ENSEEEG00000008183) #22 rnpep (ENSEEEG00000008184) cyb5r1 (ENSEEEG00000008213) adipor1a (ENSEEEG00000008223) rabif (ENSEEEG00000008261) kdm5ba (ENSEEEG00000008312) ipo9 (ENSEEEG00000009328) shisa4 (ENSEEEG00000009584) LMOD1 (ENSEEEG00000009586) timm17a (ENSEEEG00000009589) sulf2a (ENSEEEG00000009590) arhgap46a (ENSEEEG00000009592) ENSEEEG00000009605 ndrg3a (ENSEEEG00000009609) ENSEEEG00000009680 AMHR2 (ENSEEEG00000009683) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000006896 ENSGT00950000182986.a.a ENSGT00940000161652.a ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a ENSGT00940000166479 ENSGT00940000157830.c.c ENSGT00940000154468.tb.a ENSGT00940000156368.a ENSGT00940000155740 ENSGT00950000182903.b.a.y.a ENSGT00390000001509.a ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00940000157665.b ENSGT00940000158083.b ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a.h #22 ENSGT00940000160431 ENSGT00940000153962.b ENSGT00940000154563 ENSGT00390000016889 ENSGT00940000157076.j.c ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000160331 ENSGT00390000018330 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00920000149095.d ENSGT00390000006896.ab.a ENSGT00950000182986.a.a.j ENSGT00940000161652.a.a ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a.f ENSGT00940000166479.b ENSGT00940000157830.c.c.a ENSGT00940000154468.tb.a.b ENSGT00940000155740.p ENSGT00950000182903.b.a.y.a.b ENSGT00390000001509.a.a ENSGT00510000046843.a.b.l.a ENSGT00940000157665.b.b ENSGT00940000158083.b.a ENSGT01050000244888.a.b.e #21 ENSGT00940000154102.a.h.a #22 ENSGT00940000160431.d ENSGT00940000153962.b.k.b ENSGT00940000154563.ib.b.b ENSGT00390000016889.m.b ENSGT00940000157076.j.c.c ENSGT00390000008224.e ENSGT00730000111186.a.a ENSGT00940000159825.a.b.b ENSGT00390000017780.f.db ENSGT00940000166926.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00920000149095.d ENSGT00390000006896.ab.a ENSGT00950000182986.a.a.j ENSGT00940000161652.a.a ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a.f ENSGT00940000166479.b ENSGT00940000157830.c.c.a ENSGT00940000154468.tb.a.b ENSGT00940000155740.p ENSGT00950000182903.b.a.y.a.b ENSGT00390000001509.a.a ENSGT00510000046843.a.b.l.a ENSGT00940000157665.b.b ENSGT00940000158083.b.a ENSGT01050000244888.a.b.e #21 ENSGT00940000154102.a.h.a #22 ENSGT00940000160431.d ENSGT00940000153962.b.k.b ENSGT00940000154563.ib.b.b ENSGT00390000016889.m.b ENSGT00940000157076.j.c.c ENSGT00390000008224.e ENSGT00730000111186.a.a ENSGT00940000159825.a.b.b ENSGT00390000017780.f.db ENSGT00940000166926.a ENSGT00940000164502.a.b.b ENSGT00940000156477.d.a.k.a.b ENSGT00940000156477.d.a.l ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.g.a ENSGT00940000160331.l Common carp reference MODERN SPECIES 42 ENSCCRG00000020338 ENSCCRG00000070871 zc3h11a (ENSCCRG00000022259) maf1a (ENSCCRG00000020312) sox12 (ENSCCRG00000020877) pnp4a (ENSCCRG00000074160) ENSCCRG00000020885 rem1 (ENSCCRG00000065702) rbm39a (ENSCCRG00000002686) nfs1 (ENSCCRG00000064687) dvl1b (ENSCCRG00000002587) mxra8a (ENSCCRG00000002558) ENSCCRG00000002410 ENSCCRG00000031917 olfml3b (ENSCCRG00000055204) inavab (ENSCCRG00000047975) #22 rnpep (ENSCCRG00000072647) cyb5r1 (ENSCCRG00000047979) ENSCCRG00000048238 kdm5ba (ENSCCRG00000048253) ipo9 (ENSCCRG00000048310) shisa4 (ENSCCRG00000076617) ENSCCRG00000059754 timm17a (ENSCCRG00000003079) sulf2a (ENSCCRG00000041869) arhgap46a (ENSCCRG00000003147) ENSCCRG00000039400 ndrg3a (ENSCCRG00000006676) trpc4apa (ENSCCRG00000017847) myh7ba (ENSCCRG00000017821) snai1a (ENSCCRG00000057413) Goldfish MODERN SPECIES 29 chia.2 (ENSCARG00000012636) ENSCARG00000012607 zc3h11a (ENSCARG00000012599) maf1a (ENSCARG00000012590) trib3 (ENSCARG00000012586) sox12 (ENSCARG00000012585) rem1 (ENSCARG00000012579) rbm39a (ENSCARG00000012367) nfs1 (ENSCARG00000012273) dvl1b (ENSCARG00000011617) mxra8a (ENSCARG00000011585) PLEKHG5 (ENSCARG00000011410) SYT6 (ENSCARG00000011342) olfml3b (ENSCARG00000011333) GPR25 (ENSCARG00000011329) #21 inavab (ENSCARG00000011315) #22 rnpep (ENSCARG00000009961) cyb5r1 (ENSCARG00000009711) adipor1a (ENSCARG00000009644) rabif (ENSCARG00000009636) kdm5ba (ENSCARG00000009486) ipo9 (ENSCARG00000009059) shisa4 (ENSCARG00000009025) LMOD1 (ENSCARG00000009015) timm17a (ENSCARG00000008998) sulf2a (ENSCARG00000008362) arpc4l (ENSCARG00000008278) tada3l (ENSCARG00000008264) rab7a (ENSCARG00000008208) slc25a26 (ENSCARG00000008169) LRIG1 (ENSCARG00000007107) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000006896.ab.b ENSGT00950000182986.a.a.i ENSGT00940000161652.a.b 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(ENSCARG00000020655) mxra8a (ENSCARG00000020602) ENSCARG00000020249 SYT6 (ENSCARG00000020200) olfml3b (ENSCARG00000020191) GPR25 (ENSCARG00000020181) #21 inavab (ENSCARG00000020166) #22 rnpep (ENSCARG00000020111) cyb5r1 (ENSCARG00000018428) adipor1a (ENSCARG00000018257) rabif (ENSCARG00000018237) kdm5ba (ENSCARG00000017231) shisa4 (ENSCARG00000017148) LMOD1 (ENSCARG00000017139) timm17a (ENSCARG00000017108) sulf2a (ENSCARG00000013910) arhgap46a (ENSCARG00000013733) ENSCARG00000013716 ndrg3a (ENSCARG00000011862) ENSCARG00000011729 trpc4apa (ENSCARG00000011552) snai1a (ENSCARG00000011521) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000006896.ab.b ENSGT00950000182986.a.a.i ENSGT00940000161652.a.b ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a.e ENSGT00940000166479.a ENSGT00940000157830.c.c.b ENSGT00940000154468.tb.a.a ENSGT00940000156368.a ENSGT00940000155740.q ENSGT00950000182903.b.a.y.a.a ENSGT00390000001509.a.b ENSGT00510000046843.a.b.l.b ENSGT00940000157665.b.a ENSGT00940000158083.b.b ENSGT01050000244888.a.b.f #21 ENSGT00940000154102.a.h.b #22 ENSGT00940000160431.c ENSGT00940000153962.b.k.a ENSGT00940000154563.ib.b.a ENSGT00390000016889.m.a ENSGT00940000157076.j.c.d ENSGT00390000008224.f ENSGT00730000111186.a.b ENSGT00940000159825.a.b.a ENSGT00390000017780.f.eb ENSGT00940000166926.b ENSGT00940000164502.a.b.a ENSGT00940000156477.d.a.k.a.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.h ENSGT00390000018330.n.a ENSGT00940000160318.c.a Common carp reference MODERN SPECIES 13 maf1a (ENSCCRG00000078975) trib3 (ENSCCRG00000068078) pnp4a (ENSCCRG00000074394) sox12 (ENSCCRG00000059447) ENSCCRG00000002901 rem1 (ENSCCRG00000002868) rbm39a (ENSCCRG00000059102) si:ch211-15p9.2 (ENSCCRG00000058733) nfs1 (ENSCCRG00000069924) dvl1b (ENSCCRG00000026785) mxra8a (ENSCCRG00000077142) ENSCCRG00000058955 ENSCCRG00000041823 olfml3b (ENSCCRG00000031911) ENSCCRG00000066386 #21 inavab (ENSCCRG00000001430) #22 rnpep (ENSCCRG00000001600) cyb5r1 (ENSCCRG00000072849) adipor1a (ENSCCRG00000004002) rabif (ENSCCRG00000048242) kdm5ba (ENSCCRG00000049606) ipo9 (ENSCCRG00000049729) shisa4 (ENSCCRG00000049278) ENSCCRG00000055207 timm17a (ENSCCRG00000077656) sulf2a (ENSCCRG00000003109) arhgap46a (ENSCCRG00000025393) ENSCCRG00000003164 ndrg3a (ENSCCRG00000003216) trpc4apa (ENSCCRG00000080700) ENSCCRG00000055230 Zebrafish MODERN SPECIES 2 maf1a (ENSDARG00000013122) trib3 (ENSDARG00000016200) sox12 (ENSDARG00000025847) pnp4a (ENSDARG00000057575) ENSDARG00000094037 rem1 (ENSDARG00000020544) rbm39a (ENSDARG00000011613) si:ch211-15p9.2 (ENSDARG00000062241) nfs1 (ENSDARG00000062237) dvl1b (ENSDARG00000055552) mxra8a (ENSDARG00000062222) PLEKHG5 (ENSDARG00000025902) SYT6 (ENSDARG00000031463) olfml3b (ENSDARG00000062171) GPR25 (ENSDARG00000057112) #21 inavab (ENSDARG00000070571) #22 rnpep (ENSDARG00000012506) cyb5r1 (ENSDARG00000018966) adipor1a (ENSDARG00000002912) rabif (ENSDARG00000002690) kdm5ba (ENSDARG00000057093) ipo9 (ENSDARG00000016753) shisa4 (ENSDARG00000006307) LMOD1 (ENSDARG00000077261) timm17a (ENSDARG00000029510) sulf2a (ENSDARG00000018423) arhgap46a (ENSDARG00000044874) ENSDARG00000002750 ndrg3a (ENSDARG00000013087) ENSDARG00000099887 trpc4apa (ENSDARG00000018840) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 301 ENSGT00940000157665.b ENSGT00940000158083.b ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a.h #22 ENSGT00940000160431 ENSGT00940000160784 ENSGT00940000154563 ENSGT00390000016889 ENSGT00940000157076.j ENSGT00390000001799 ENSGT00940000155569.a.a ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155637 ENSGT00390000006330.a.b ENSGT01020000230633 ENSGT00950000183038.a.b.a.g ENSGT00940000157144.c.a ENSGT00940000157144.c.b ENSGT00530000063647.B ENSGT00940000161079 ENSGT00950000182908.B.c.a ENSGT00390000006813.h.a ENSGT00940000164642 ENSGT00940000154657.C.h ENSGT00940000157665.b ENSGT00940000158083.b.c ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a.h #22 ENSGT00940000160431 ENSGT00940000160784 ENSGT00940000154563 ENSGT00390000016889 ENSGT00940000157076.j ENSGT00390000001799 ENSGT00940000155569.a.a ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00940000161297 ENSGT00940000155330.c ENSGT01040000240451.a.b.a.b.a ENSGT00940000159587 ENSGT01050000244940.a.a.g.a ENSGT00940000154971.v Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 467 ENSGT00940000157665.b.c ENSGT00940000158083.b.d ENSGT01050000244888.a.b.a #21 ENSGT00940000154102.a.h.c #22 ENSGT00940000160431.f ENSGT00940000160784.a.a ENSGT00940000154563.ab.a ENSGT00390000016889.p ENSGT00940000157076.j.a ENSGT00940000155569.a.a.g ENSGT00530000063255.A.l ENSGT01000000214440.B.c ENSGT00940000161297 ENSGT00940000155330.c.e ENSGT00940000154276.g.b ENSGT01040000240451.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000159587.k ENSGT01050000244940.a.a.g.a.b ENSGT00390000002215.j.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154347.a.d ENSGT00940000156785.`b ENSGT00940000155637.jb ENSGT00390000006330.a.b.a ENSGT01020000230633.a ENSGT00950000183167.a.b.b.b.r 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ENSGT00940000158083.b.d ENSGT01050000244888.a.b.a #21 ENSGT00940000154102.a.h.c #22 ENSGT00940000160431.f ENSGT00940000160784.a.a ENSGT00940000154563.ab.a ENSGT00390000016889.p ENSGT00940000157076.j.a ENSGT00390000001799.c ENSGT00940000155569.a.a.g ENSGT00530000063255.A.l ENSGT01000000214440.B.c ENSGT00940000161297 ENSGT00940000155330.c.e ENSGT00940000154276.g.b ENSGT01040000240451.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000159587.k ENSGT01050000244940.a.a.g.a.b River trout MODERN SPECIES 7 ENSSTUG00000013414 ENSSTUG00000013421 ENSSTUG00000013430 nab2 (ENSSTUG00000013444) ENSSTUG00000013450 ENSSTUG00000013461 NR4A1 (ENSSTUG00000013468) RNF41 (ENSSTUG00000013478) NABP2 (ENSSTUG00000013506) ANKRD52 (ENSSTUG00000013535) cs (ENSSTUG00000014032) cnpy2 (ENSSTUG00000014176) SYT6 (ENSSTUG00000014184) ENSSTUG00000014192 GPR25 (ENSSTUG00000014199) #21 inavab (ENSSTUG00000014214) #22 rnpep (ENSSTUG00000014225) CYB5R1 (ENSSTUG00000014240) adipor1a (ENSSTUG00000014307) rabif (ENSSTUG00000014351) kdm5ba 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nab2 (ENSOTSG00005009099) ENSOTSG00005009100 ENSOTSG00005009101 NR4A1 (ENSOTSG00005009102) DGKA (ENSOTSG00005009104) RNF41 (ENSOTSG00005009415) NABP2 (ENSOTSG00005009417) ANKRD52 (ENSOTSG00005009423) COQ10A (ENSOTSG00005010927) cs (ENSOTSG00005010929) cnpy2 (ENSOTSG00005010931) SYT6 (ENSOTSG00005000265) olfml3b (ENSOTSG00005000400) GPR25 (ENSOTSG00005000403) #21 inavab (ENSOTSG00005000652) #22 rnpep (ENSOTSG00005000667) cyb5r1 (ENSOTSG00005000695) adipor1a (ENSOTSG00005000698) kdm5ba (ENSOTSG00005000722) nelfcd (ENSOTSG00005000752) ctsz (ENSOTSG00005000985) npepl1 (ENSOTSG00005001190) STX16 (ENSOTSG00005001203) ENSOTSG00005001214 slc11a2 (ENSOTSG00005001258) HIGD1A (ENSOTSG00005001663) CTDSP2 (ENSOTSG00005001666) avil (ENSOTSG00005001689) TMBIM6 (ENSOTSG00005002357) ENSOTSG00005002363 Rainbow trout MODERN SPECIES 8 ENSOMYG00000012706 nab2 (ENSOMYG00000012721) ENSOMYG00000012726 ENSOMYG00000077753 ENSOMYG00000012729 ENSOMYG00000012847 RNF41 (ENSOMYG00000013704) NABP2 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ENSGT00390000003749 ENSGT00940000158593.a ENSGT00390000016940.c.a.b ENSGT00390000015124 ENSGT00940000160203 ENSGT00950000183188.A.a.a ENSGT00940000159517 ENSGT00940000166043 ENSGT00940000159587 ENSGT00940000158083.b ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a.h #22 ENSGT00940000154563 ENSGT00390000016889 ENSGT00940000157076.j ENSGT00390000001799 ENSGT00940000155569.a.a.e ENSGT00530000063255.A ENSGT00950000182908.B.c.a ENSGT00940000155330.c ENSGT00940000164642 ENSGT00940000161297 ENSGT01000000214440.B ENSGT00940000157144.c.a ENSGT00950000183038.a.b.a.g ENSGT01020000230633 ENSGT00390000006330.a.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158208.a.b ENSGT00390000017840 ENSGT00950000182905.a.a.b ENSGT00390000005536 ENSGT00390000003749 ENSGT00940000158593.a ENSGT00390000016940.c.a.b ENSGT00390000015124 ENSGT00940000160203 ENSGT00950000183188.A.a.a ENSGT00940000159517 ENSGT00940000158083.b ENSGT00940000159587 ENSGT00940000166043 ENSGT01050000244888.a.b #21 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SPECIES 12 ENSXMAG00000025551 mettl1 (ENSXMAG00000029038) cyp27b1 (ENSXMAG00000005176) mcrs1 (ENSXMAG00000005219) suox (ENSXMAG00000023558) MMP19 (ENSXMAG00000003262) ENSXMAG00000026888 timeless (ENSXMAG00000003280) prph (ENSXMAG00000003304) pmela (ENSXMAG00000003314) cdk2 (ENSXMAG00000003326) olfml3b (ENSXMAG00000003333) avil (ENSXMAG00000003335) gdf11 (ENSXMAG00000027063) GPR25 (ENSXMAG00000027619) #21 inavab (ENSXMAG00000003363) #22 adipor1a (ENSXMAG00000003364) rabif (ENSXMAG00000023532) kdm5ba (ENSXMAG00000003378) nelfcd (ENSXMAG00000003398) ctsz (ENSXMAG00000003406) npepl1 (ENSXMAG00000003419) ANKRD52 (ENSXMAG00000003445) slc11a2 (ENSXMAG00000003484) cnpy2 (ENSXMAG00000024768) ENSXMAG00000003535 STX16 (ENSXMAG00000027841) DGKA (ENSXMAG00000003548) NR4A1 (ENSXMAG00000003578) ENSXMAG00000023227 nab2 (ENSXMAG00000003591) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158208.a.b ENSGT00390000017840 ENSGT00950000182905.a.a.b ENSGT00390000005536 ENSGT00390000003749 ENSGT00940000158593.a 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Siamese fighting fish MODERN SPECIES 16 cdk4 (ENSBSLG00000002570) MARCHF9 (ENSBSLG00000002562) mettl1 (ENSBSLG00000002537) cyp27b1 (ENSBSLG00000002414) mcrs1 (ENSBSLG00000002231) suox (ENSBSLG00000002138) MMP19 (ENSBSLG00000001951) ENSBSLG00000001946 timeless (ENSBSLG00000001523) prph (ENSBSLG00000001482) pmela (ENSBSLG00000001478) cdk2 (ENSBSLG00000001470) olfml3b (ENSBSLG00000001465) gdf11 (ENSBSLG00000001276) ENSBSLG00000001269 #21 inavab (ENSBSLG00000001252) #22 adipor1a (ENSBSLG00000001221) rabif (ENSBSLG00000001143) kdm5ba (ENSBSLG00000001084) nelfcd (ENSBSLG00000001018) ctsz (ENSBSLG00000001014) npepl1 (ENSBSLG00000001010) ANKRD52 (ENSBSLG00000001001) slc11a2 (ENSBSLG00000000963) cnpy2 (ENSBSLG00000000945) ENSBSLG00000000940 STX16 (ENSBSLG00000000932) DGKA (ENSBSLG00000000729) NR4A1 (ENSBSLG00000018194) ENSBSLG00000018177 nab2 (ENSBSLG00000017870) Zig-zag eel MODERN SPECIES 19 ENSMAMG00000004476 ENSMAMG00000004543 ENSMAMG00000004647 ENSMAMG00000004712 ENSMAMG00000004739 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ENSGT00390000015124 ENSGT00940000160203 ENSGT00950000183188.A.a.a ENSGT00940000159517 ENSGT00940000158083.b ENSGT00940000159587 ENSGT00940000166043 ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a.h #22 ENSGT00940000154563 ENSGT00390000016889 ENSGT00940000157076.j ENSGT00390000001799 ENSGT00940000155569.a.a.e ENSGT00530000063255.A ENSGT00950000182908.B.c.a ENSGT00940000155330.c ENSGT00940000164642 ENSGT00940000161297 ENSGT01000000214440.B ENSGT00940000157144.c.a ENSGT00950000183038.a.b.a.g ENSGT00670000099474 ENSGT00390000006330.a.b Channel bull blenny MODERN SPECIES 19 MARCHF9 (ENSCGOG00000023550) mettl1 (ENSCGOG00000023551) cyp27b1 (ENSCGOG00000023555) mcrs1 (ENSCGOG00000023563) suox (ENSCGOG00000023643) MMP19 (ENSCGOG00000023646) ENSCGOG00000023652 ENSCGOG00000023654 timeless (ENSCGOG00000023667) prph (ENSCGOG00000023820) pmela (ENSCGOG00000023834) cdk2 (ENSCGOG00000023846) olfml3b (ENSCGOG00000023891) avil (ENSCGOG00000023912) gdf11 (ENSCGOG00000023971) inavab (ENSCGOG00000023973) 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(ENSMMDG00005023594) Cod MODERN SPECIES 4 ENSGMOG00000002079 ENSGMOG00000002066 ENSGMOG00000002044 ENSGMOG00000002018 ENSGMOG00000033752 ENSGMOG00000001993 ENSGMOG00000001982 ENSGMOG00000001928 ENSGMOG00000001632 ENSGMOG00000001598 ENSGMOG00000001579 ENSGMOG00000014504 ENSGMOG00000031137 ENSGMOG00000014522 ENSGMOG00000014555 inavab (ENSGMOG00000036578) #22 adipor1a (ENSGMOG00000001524) rabif (ENSGMOG00000027448) kdm5ba (ENSGMOG00000001476) ENSGMOG00000001444 ENSGMOG00000024774 ENSGMOG00000022887 ABHD6 (ENSGMOG00000010616) rpp14 (ENSGMOG00000010625) HTD2 (ENSGMOG00000010633) pxk (ENSGMOG00000010634) pdhb (ENSGMOG00000000301) ENSGMOG00000023699 stab1 (ENSGMOG00000006376) ENSGMOG00000003352 nol8 (ENSGMOG00000025541) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 701 ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000154102.a.h #22 P. kingsleyae MODERN SPECIES 302 ENSPKIG00000024145 ENSPKIG00000024151 ENSPKIG00000024160 ADORA1 (ENSPKIG00000024204) cpne5b (ENSPKIG00000024212) KIF21B (ENSPKIG00000024261) #23 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rabif (ENSLOCG00000010143) tuba5 (ENSLOCG00000010138) kdm5ba (ENSLOCG00000010123) ipo9 (ENSLOCG00000010108) shisa4 (ENSLOCG00000010094) Reedfish MODERN SPECIES 11 SPATS2 (ENSECRG00000013261) suox (ENSECRG00000013286) pym1 (ENSECRG00000013299) MMP19 (ENSECRG00000013308) ENSECRG00000013327 timeless (ENSECRG00000013352) prph (ENSECRG00000013439) TUBA1C (ENSECRG00000013537) tuba1b (ENSECRG00000013560) ENSECRG00000013574 PMEL (ENSECRG00000013583) ENSECRG00000013600 cdk2 (ENSECRG00000013609) RAB5B (ENSECRG00000013616) ENSECRG00000013626 inavab (ENSECRG00000013643) #22 tmem167b (ENSECRG00000013678) si:ch211-163l21.7 (ENSECRG00000013736) ELAPOR1 (ENSECRG00000013758) ENSECRG00000013791 ENSECRG00000013812 ENSECRG00000013848 ENSECRG00000013919 slc16a1a (ENSECRG00000013957) bcas2 (ENSECRG00000013970) trim33 (ENSECRG00000014052) SYT6 (ENSECRG00000014427) olfml3a (ENSECRG00000014715) ENSECRG00000014742 ENSECRG00000014832 ENSECRG00000014928 Elephant shark MODERN SPECIES 1518 sars1 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ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000159912 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000163982 ENSGT00730000111212 ENSGT00940000158293 ENSGT00940000158567 ENSGT01030000238252 ENSGT00880000138051.a ENSGT00940000159231 ENSGT00390000000873.a.b Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159128 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00730000111146 ENSGT00940000166825 ENSGT01030000234564.a.a.b.a ENSGT00530000063715.a ENSGT00940000159173 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153634.a ENSGT00390000017639 ENSGT01030000234648.a.b.a.b ENSGT00390000002062 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00940000164755.C ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159128 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00730000111146 ENSGT00940000166825 ENSGT01030000234564.a.a.b.a ENSGT00530000063715.a ENSGT00940000159173 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153634.a ENSGT00390000017639 ENSGT01030000234648.a.b.a.b ENSGT00390000002062 Laterata ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00940000164755.C ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159128 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00730000111146 ENSGT00940000166825 ENSGT01030000234564.a.a.b.a ENSGT00530000063715.a ENSGT00940000159173 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153634.a ENSGT00390000017639 ENSGT01030000234648.a.b.a.b ENSGT00390000002062 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 12 ENSSMRG00000019219 ENSSMRG00000019220 ENSSMRG00000019221 HDAC6 (ENSSMRG00000019223) ENSSMRG00000019226 CDK20 (ENSSMRG00000019227) ENSSMRG00000019228 TIMM17B (ENSSMRG00000019229) PQBP1 (ENSSMRG00000019230) SLC35A2 (ENSSMRG00000019231) PIM2 (ENSSMRG00000019232) OTUD5 (ENSSMRG00000019233) ENSSMRG00000019235 GRIPAP1 (ENSSMRG00000019236) TFE3 (ENSSMRG00000019237) CCDC120 (ENSSMRG00000019239) ##22 PRAF2 (ENSSMRG00000019240) WDR45 (ENSSMRG00000019241) GPKOW (ENSSMRG00000019242) FTSJ1 (ENSSMRG00000019243) ENSSMRG00000019244 PORCN (ENSSMRG00000019245) EBP (ENSSMRG00000019246) TBC1D25 (ENSSMRG00000019248) SLC38A5 (ENSSMRG00000019251) SUV39H1 (ENSSMRG00000019258) WDR13 (ENSSMRG00000019261) ENSSMRG00000019264 GRM6 (ENSSMRG00000019270) ABT1 (ENSSMRG00000019377) ENSSMRG00000019378 Common wall lizard MODERN SPECIES 8 ENSPMRG00000019185 ENSPMRG00000019180 HDAC6 (ENSPMRG00000019050) ENSPMRG00000019014 GATA1 (ENSPMRG00000019007) CDK20 (ENSPMRG00000018996) ENSPMRG00000018984 TIMM17B (ENSPMRG00000018977) PQBP1 (ENSPMRG00000018963) PIM2 (ENSPMRG00000018956) OTUD5 (ENSPMRG00000018946) SLC35A2 (ENSPMRG00000018937) ENSPMRG00000018926 GRIPAP1 (ENSPMRG00000018908) TFE3 (ENSPMRG00000018894) CCDC120 (ENSPMRG00000018879) ##22 ENSPMRG00000018863 PRAF2 (ENSPMRG00000018857) WDR45 (ENSPMRG00000018757) GPKOW (ENSPMRG00000018732) FTSJ1 (ENSPMRG00000018723) ENSPMRG00000018717 PORCN (ENSPMRG00000018707) EBP (ENSPMRG00000018698) ENSPMRG00000018690 ENSPMRG00000018683 SLC38A5 (ENSPMRG00000018673) ENSPMRG00000018667 WAS (ENSPMRG00000018659) SUV39H1 (ENSPMRG00000018649) WDR13 (ENSPMRG00000018635) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00940000164755.C ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159128 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00730000111146 ENSGT00940000166825 ENSGT01030000234564.a.a.b.a ENSGT00530000063715.a ENSGT00940000159173 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153634.a ENSGT00390000017639 ENSGT01030000234648.a.b.a.b ENSGT00390000002062 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00940000164755.C ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159128 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00730000111146 ENSGT00940000166825 ENSGT00530000063715.a.t ENSGT01030000234564.a.a.b.a ENSGT00530000063715.a.s ENSGT00940000159173 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153634.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b ENSGT00390000002062 Indian cobra MODERN SPECIES 1 PRICKLE3 (ENSNNAG00000011671) ENSNNAG00000011654 ENSNNAG00000011607 HDAC6 (ENSNNAG00000011493) GATA1 (ENSNNAG00000011453) CDK20 (ENSNNAG00000011421) ENSNNAG00000011393 TIMM17B (ENSNNAG00000011378) PQBP1 (ENSNNAG00000011352) SLC35A2 (ENSNNAG00000011331) PIM2 (ENSNNAG00000011316) OTUD5 (ENSNNAG00000011281) ENSNNAG00000011249 GRIPAP1 (ENSNNAG00000010983) TFE3 (ENSNNAG00000010930) CCDC120 (ENSNNAG00000010874) ##22 PRAF2 (ENSNNAG00000010800) WDR45 (ENSNNAG00000010759) GPKOW (ENSNNAG00000010730) FTSJ1 (ENSNNAG00000010700) ENSNNAG00000010677 ENSNNAG00000010633 PORCN (ENSNNAG00000010535) ENSNNAG00000010495 TBC1D25 (ENSNNAG00000010438) SLC38A5 (ENSNNAG00000009453) WAS (ENSNNAG00000009371) SUV39H1 (ENSNNAG00000009353) WDR13 (ENSNNAG00000009312) GRM6 (ENSNNAG00000008590) ABT1 (ENSNNAG00000008508) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00940000164755.C ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159128 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00730000111146 ENSGT00530000063715.a.t ENSGT01030000234564.a.a.b.a ENSGT00530000063715.a.s ENSGT00940000159173 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153634.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b ENSGT00390000002062 ENSGT00940000153524.b.b Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00940000164755.C ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159128 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00730000111146 ENSGT00530000063715.a.t ENSGT01030000234564.a.a.b.a ENSGT00530000063715.a.s ENSGT00940000159173 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153634.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b ENSGT00390000002062 ENSGT00940000153524.b.b Eastern brown snake MODERN SPECIES 52 PRICKLE3 (ENSPTXG00000007910) ENSPTXG00000007914 ENSPTXG00000007920 HDAC6 (ENSPTXG00000007959) GATA1 (ENSPTXG00000008186) CDK20 (ENSPTXG00000008188) ENSPTXG00000008189 TIMM17B (ENSPTXG00000008191) PQBP1 (ENSPTXG00000008194) 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Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000155170 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155614 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000164196 ENSGT00390000002034 ENSGT00390000012715.a ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00730000111146 ENSGT01030000234564.a.a.b.a ENSGT00530000063715.a ENSGT00940000159173 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153634.a ENSGT00390000017639 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.e ENSGT01030000234648.a.b.a.b.f ENSGT00390000002062 ENSGT00940000153832.e.b ENSGT00940000153832.e.a Emydidae ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000162770.p ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000155170 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155614 ENSGT00950000185120 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000164196 ENSGT00390000012715.a ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00730000111146 ENSGT01030000234564.a.a.b.a ENSGT00530000063715.a.q ENSGT00940000159173 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153634.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.f ENSGT00390000002062 ENSGT00940000153832.e.b ENSGT00940000153832.e.a ENSGT00730000111044 ENSGT00390000006665.b Three-toed box turtle MODERN SPECIES 391 IQSEC2 (ENSTMTG00000009314) TFE3 (ENSTMTG00000009292) CCDC120 (ENSTMTG00000009271) ##22 PRAF2 (ENSTMTG00000009258) FTSJ1 (ENSTMTG00000009233) PORCN (ENSTMTG00000009200) ENSTMTG00000009189 SUV39H1 (ENSTMTG00000009156) WDR13 (ENSTMTG00000009137) ABT1 (ENSTMTG00000009130) ENSTMTG00000009117 ENSTMTG00000009100 CXXC1 (ENSTMTG00000009049) MON1B (ENSTMTG00000009039) ENSTMTG00000009005 IMP4 (ENSTMTG00000008990) ENSTMTG00000007887 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000162770.p ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000159912 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000155170 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155614 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000164196 ENSGT00390000002034 ENSGT00390000012715.a ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00730000111146 ENSGT01030000234564.a.a.b.a ENSGT00530000063715.a ENSGT00940000159173 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153634.a ENSGT00390000017639 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.e ENSGT01030000234648.a.b.a.b.f ENSGT00390000002062 ENSGT00940000153832.e.b ENSGT00940000153832.e.a Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2751 PHF8 (ENSCABG00000014528) ENSCABG00000014540 ENSCABG00000014710 APEX2 (ENSCABG00000014713) ENSCABG00000014719 PRICKLE3 (ENSCABG00000014742) PLP2 (ENSCABG00000014746) GPKOW (ENSCABG00000014748) HSD17B10 (ENSCABG00000014750) RIBC1 (ENSCABG00000014752) SMC1A (ENSCABG00000014810) IQSEC2 (ENSCABG00000016172) 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ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a Armadillo MODERN SPECIES 2193 SUV39H1 (ENSDNOG00000024286) ENSDNOG00000010600 ENSDNOG00000040933 GATA1 (ENSDNOG00000046529) HDAC6 (ENSDNOG00000002754) ERAS (ENSDNOG00000014657) PCSK1N (ENSDNOG00000045077) TIMM17B (ENSDNOG00000047305) PQBP1 (ENSDNOG00000015637) SLC35A2 (ENSDNOG00000015641) PIM2 (ENSDNOG00000015644) OTUD5 (ENSDNOG00000032210) KCND1 (ENSDNOG00000033902) GRIPAP1 (ENSDNOG00000038321) TFE3 (ENSDNOG00000039173) CCDC120 (ENSDNOG00000017059) ##22 PRAF2 (ENSDNOG00000031883) WDR45 (ENSDNOG00000046908) GPKOW (ENSDNOG00000016647) ENSDNOG00000039101 MAGIX (ENSDNOG00000036078) PLP2 (ENSDNOG00000002320) ENSDNOG00000031352 ENSDNOG00000045007 SYP (ENSDNOG00000032408) CACNA1F (ENSDNOG00000006166) CCDC22 (ENSDNOG00000044674) FOXP3 (ENSDNOG00000012826) PPP1R3F (ENSDNOG00000019332) ENSDNOG00000007200 ENSDNOG00000003715 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00940000160063 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 Tenrec MODERN SPECIES 4228 CCDC120 (ENSETEG00000002060) ##22 WDR45 (ENSETEG00000002062) Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000160063 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 Elephant MODERN SPECIES 453 SUV39H1 (ENSLAFG00000005118) WAS (ENSLAFG00000010329) GLOD5 (ENSLAFG00000011866) GATA1 (ENSLAFG00000029714) HDAC6 (ENSLAFG00000003822) ERAS (ENSLAFG00000003828) PCSK1N (ENSLAFG00000030200) TIMM17B (ENSLAFG00000007531) PQBP1 (ENSLAFG00000007534) SLC35A2 (ENSLAFG00000007537) PIM2 (ENSLAFG00000007542) OTUD5 (ENSLAFG00000012103) KCND1 (ENSLAFG00000010111) GRIPAP1 (ENSLAFG00000032036) TFE3 (ENSLAFG00000025585) CCDC120 (ENSLAFG00000027582) ##22 PRAF2 (ENSLAFG00000010856) WDR45 (ENSLAFG00000010857) GPKOW (ENSLAFG00000005896) MAGIX (ENSLAFG00000023267) PLP2 (ENSLAFG00000004483) PRICKLE3 (ENSLAFG00000022874) SYP (ENSLAFG00000003496) CACNA1F (ENSLAFG00000030961) CCDC22 (ENSLAFG00000003501) FOXP3 (ENSLAFG00000003504) ENSLAFG00000003507 USP27X (ENSLAFG00000021827) ENSLAFG00000030490 CLCN5 (ENSLAFG00000018161) AKAP4 (ENSLAFG00000029253) Hyrax MODERN SPECIES 3531 CCDC120 (ENSPCAG00000002320) ##22 PRAF2 (ENSPCAG00000002370) WDR45 (ENSPCAG00000002394) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 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ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a Felidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a Panthera ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a leopard MODERN SPECIES 69 WAS (ENSPPRG00000012043) SUV39H1 (ENSPPRG00000011651) GLOD5 (ENSPPRG00000011142) GATA1 (ENSPPRG00000010828) HDAC6 (ENSPPRG00000010597) ERAS (ENSPPRG00000022016) PCSK1N (ENSPPRG00000010202) TIMM17B (ENSPPRG00000010152) PQBP1 (ENSPPRG00000009961) SLC35A2 (ENSPPRG00000007850) PIM2 (ENSPPRG00000005796) OTUD5 (ENSPPRG00000005742) KCND1 (ENSPPRG00000003846) GRIPAP1 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(ENSMPUG00000014078) CLCN5 (ENSMPUG00000014089) AKAP4 (ENSMPUG00000014092) American mink MODERN SPECIES 349 WDR13 (ENSNVIG00000006529) WAS (ENSNVIG00000006554) SUV39H1 (ENSNVIG00000006587) GLOD5 (ENSNVIG00000006614) GATA1 (ENSNVIG00000006621) HDAC6 (ENSNVIG00000006646) ERAS (ENSNVIG00000006780) TIMM17B (ENSNVIG00000006794) PQBP1 (ENSNVIG00000006825) SLC35A2 (ENSNVIG00000006862) PIM2 (ENSNVIG00000006922) OTUD5 (ENSNVIG00000006935) KCND1 (ENSNVIG00000006987) GRIPAP1 (ENSNVIG00000007030) TFE3 (ENSNVIG00000007224) CCDC120 (ENSNVIG00000007235) ##22 WDR45 (ENSNVIG00000007299) GPKOW (ENSNVIG00000007543) MAGIX (ENSNVIG00000007559) ENSNVIG00000007591 PRICKLE3 (ENSNVIG00000007646) SYP (ENSNVIG00000007686) CACNA1F (ENSNVIG00000007734) CCDC22 (ENSNVIG00000008019) FOXP3 (ENSNVIG00000008122) PPP1R3F (ENSNVIG00000008233) ENSNVIG00000008273 USP27X (ENSNVIG00000008292) CLCN5 (ENSNVIG00000008302) AKAP4 (ENSNVIG00000008367) ENSNVIG00000008387 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00730000110895.b.b 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ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a.e Megabat MODERN SPECIES 4890 CCDC120 (ENSPVAG00000003190) ##22 PRAF2 (ENSPVAG00000003194) WDR45 (ENSPVAG00000003196) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a.e ENSGT00940000153313.C.a.f Microbat MODERN SPECIES 1133 WAS (ENSMLUG00000016537) SUV39H1 (ENSMLUG00000016544) GLOD5 (ENSMLUG00000030029) ENSMLUG00000009063 HDAC6 (ENSMLUG00000009081) ERAS (ENSMLUG00000028170) PCSK1N (ENSMLUG00000009125) ENSMLUG00000009148 PQBP1 (ENSMLUG00000009159) SLC35A2 (ENSMLUG00000025042) PIM2 (ENSMLUG00000009174) OTUD5 (ENSMLUG00000009195) KCND1 (ENSMLUG00000009225) GRIPAP1 (ENSMLUG00000009232) TFE3 (ENSMLUG00000030217) CCDC120 (ENSMLUG00000010924) ##22 PRAF2 (ENSMLUG00000029904) ENSMLUG00000030743 MAGIX (ENSMLUG00000028142) ENSMLUG00000009327 PRICKLE3 (ENSMLUG00000009343) SYP (ENSMLUG00000005688) CACNA1F (ENSMLUG00000005694) CCDC22 (ENSMLUG00000009356) FOXP3 (ENSMLUG00000005709) PPP1R3F (ENSMLUG00000005716) USP27X (ENSMLUG00000009859) CLCN5 (ENSMLUG00000006702) ENSMLUG00000024612 AKAP4 (ENSMLUG00000027875) ENSMLUG00000001661 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES WAS (ENSRFEG00010000800) SUV39H1 (ENSRFEG00010000760) GLOD5 (ENSRFEG00010000744) GATA1 (ENSRFEG00010000723) HDAC6 (ENSRFEG00010000672) ERAS (ENSRFEG00010000648) PCSK1N (ENSRFEG00010000636) ENSRFEG00010000594 PQBP1 (ENSRFEG00010000576) SLC35A2 (ENSRFEG00010000550) PIM2 (ENSRFEG00010000535) OTUD5 (ENSRFEG00010000513) KCND1 (ENSRFEG00010000496) GRIPAP1 (ENSRFEG00010000438) TFE3 (ENSRFEG00010000384) CCDC120 (ENSRFEG00010000349) ##22 PRAF2 (ENSRFEG00010000329) WDR45 (ENSRFEG00010000248) GPKOW (ENSRFEG00010000184) MAGIX (ENSRFEG00010000174) ENSRFEG00010000171 PRICKLE3 (ENSRFEG00010000159) SYP (ENSRFEG00010000144) CACNA1F (ENSRFEG00010000113) CCDC22 (ENSRFEG00010000096) FOXP3 (ENSRFEG00010003350) PPP1R3F (ENSRFEG00010003283) ENSRFEG00010003265 USP27X (ENSRFEG00010003231) CLCN5 (ENSRFEG00010003194) ENSRFEG00010003169 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a Suina ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a Pig MODERN SPECIES 300 WAS (ENSSSCG00000036747) SUV39H1 (ENSSSCG00000032453) GLOD5 (ENSSSCG00000031477) GATA1 (ENSSSCG00000027237) HDAC6 (ENSSSCG00000025545) ERAS (ENSSSCG00000042563) PCSK1N (ENSSSCG00000021328) TIMM17B (ENSSSCG00000022647) PQBP1 (ENSSSCG00000025264) SLC35A2 (ENSSSCG00000024841) PIM2 (ENSSSCG00000028964) OTUD5 (ENSSSCG00000021934) KCND1 (ENSSSCG00000028284) GRIPAP1 (ENSSSCG00000021106) TFE3 (ENSSSCG00000012287) CCDC120 (ENSSSCG00000012288) ##22 WDR45 (ENSSSCG00000012290) GPKOW (ENSSSCG00000012291) MAGIX (ENSSSCG00000012295) PLP2 (ENSSSCG00000012294) PRICKLE3 (ENSSSCG00000012293) SYP (ENSSSCG00000012292) CACNA1F (ENSSSCG00000012298) CCDC22 (ENSSSCG00000012297) FOXP3 (ENSSSCG00000012300) PPP1R3F (ENSSSCG00000022584) ENSSSCG00000028340 PAGE4 (ENSSSCG00000012303) USP27X (ENSSSCG00000012305) CLCN5 (ENSSSCG00000023026) ENSSSCG00000059900 Chacoan peccary MODERN SPECIES 107 WAS (ENSCWAG00000012161) SUV39H1 (ENSCWAG00000012092) GLOD5 (ENSCWAG00000012021) GATA1 (ENSCWAG00000011923) HDAC6 (ENSCWAG00000011826) ERAS (ENSCWAG00000011794) PCSK1N (ENSCWAG00000011786) TIMM17B (ENSCWAG00000011732) PQBP1 (ENSCWAG00000011665) SLC35A2 (ENSCWAG00000011361) PIM2 (ENSCWAG00000011270) OTUD5 (ENSCWAG00000011041) KCND1 (ENSCWAG00000010930) GRIPAP1 (ENSCWAG00000010204) TFE3 (ENSCWAG00000010121) CCDC120 (ENSCWAG00000009998) ##22 WDR45 (ENSCWAG00000009600) GPKOW (ENSCWAG00000009496) MAGIX (ENSCWAG00000009434) ENSCWAG00000009394 PRICKLE3 (ENSCWAG00000009321) SYP (ENSCWAG00000009225) CACNA1F (ENSCWAG00000008087) CCDC22 (ENSCWAG00000007981) FOXP3 (ENSCWAG00000007552) PPP1R3F (ENSCWAG00000007486) ENSCWAG00000007458 ENSCWAG00000007438 USP27X (ENSCWAG00000007427) CLCN5 (ENSCWAG00000007314) AKAP4 (ENSCWAG00000007257) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a Camelidae ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 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ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963.e ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154.e ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000154277.a.b.b.n.k.b Beluga whale MODERN SPECIES 58 WAS (ENSDLEG00000014970) SUV39H1 (ENSDLEG00000015013) GLOD5 (ENSDLEG00000015027) GATA1 (ENSDLEG00000015042) HDAC6 (ENSDLEG00000015075) ERAS (ENSDLEG00000015182) PCSK1N (ENSDLEG00000015194) TIMM17B (ENSDLEG00000015207) PQBP1 (ENSDLEG00000015219) SLC35A2 (ENSDLEG00000015242) PIM2 (ENSDLEG00000015254) OTUD5 (ENSDLEG00000015262) KCND1 (ENSDLEG00000015277) GRIPAP1 (ENSDLEG00000015299) TFE3 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ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000006247.e.b ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000011943.a.b ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000006247.e.b ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000011943.a.b ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000006247.e.b ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000011943.a.b ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000006247.e.b ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000011943.a.b ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 Bos ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000006247.e.b ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000011943.a.b ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000006247.e.b ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000011943.a.b ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 Wild yak MODERN SPECIES 100 WAS (ENSBMUG00000005376) SUV39H1 (ENSBMUG00000005366) GLOD5 (ENSBMUG00000005358) GATA1 (ENSBMUG00000005353) HDAC6 (ENSBMUG00000005294) ERAS (ENSBMUG00000005191) ENSBMUG00000005166 TIMM17B (ENSBMUG00000005154) PQBP1 (ENSBMUG00000005136) SLC35A2 (ENSBMUG00000005102) PIM2 (ENSBMUG00000005005) OTUD5 (ENSBMUG00000004985) KCND1 (ENSBMUG00000004963) GRIPAP1 (ENSBMUG00000004899) TFE3 (ENSBMUG00000004711) CCDC120 (ENSBMUG00000004689) ##22 WDR45 (ENSBMUG00000004596) ENSBMUG00000004464 GPKOW (ENSBMUG00000004443) MAGIX (ENSBMUG00000004416) ENSBMUG00000004390 PRICKLE3 (ENSBMUG00000004376) SYP (ENSBMUG00000004369) CACNA1F (ENSBMUG00000004312) CCDC22 (ENSBMUG00000004239) FOXP3 (ENSBMUG00000004204) ENSBMUG00000004150 ENSBMUG00000004133 PAGE4 (ENSBMUG00000004121) USP27X (ENSBMUG00000004091) CLCN5 (ENSBMUG00000004010) Domestic yak MODERN SPECIES 69 SUV39H1 (ENSBGRG00000019464) GLOD5 (ENSBGRG00000019638) GATA1 (ENSBGRG00000019786) HDAC6 (ENSBGRG00000019900) ERAS (ENSBGRG00000017973) PCSK1N (ENSBGRG00000017992) ENSBGRG00000018026 TIMM17B (ENSBGRG00000018055) PQBP1 (ENSBGRG00000018132) SLC35A2 (ENSBGRG00000018196) PIM2 (ENSBGRG00000018477) OTUD5 (ENSBGRG00000018572) KCND1 (ENSBGRG00000018827) GRIPAP1 (ENSBGRG00000018956) TFE3 (ENSBGRG00000019914) CCDC120 (ENSBGRG00000020146) ##22 PRAF2 (ENSBGRG00000020422) WDR45 (ENSBGRG00000020477) ENSBGRG00000020721 GPKOW (ENSBGRG00000020742) ENSBGRG00000020865 ENSBGRG00000020922 PRICKLE3 (ENSBGRG00000021159) SYP (ENSBGRG00000021237) CACNA1F (ENSBGRG00000021471) CCDC22 (ENSBGRG00000025162) FOXP3 (ENSBGRG00000025258) PPP1R3F (ENSBGRG00000025406) ENSBGRG00000025419 ENSBGRG00000025435 USP27X (ENSBGRG00000025445) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000006247.e.b ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000011943.a.b ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 315 ENSBIXG00005000431 GLOD5 (ENSBIXG00005009242) GATA1 (ENSBIXG00005009261) HDAC6 (ENSBIXG00005000532) ERAS (ENSBIXG00005009662) PCSK1N (ENSBIXG00005009686) ENSBIXG00005007464 TIMM17B (ENSBIXG00005009725) PQBP1 (ENSBIXG00005009781) SLC35A2 (ENSBIXG00005009832) PIM2 (ENSBIXG00005009846) OTUD5 (ENSBIXG00005009869) KCND1 (ENSBIXG00005009897) GRIPAP1 (ENSBIXG00005010105) TFE3 (ENSBIXG00005010183) CCDC120 (ENSBIXG00005010246) ##22 WDR45 (ENSBIXG00005010398) ENSBIXG00005000884 GPKOW (ENSBIXG00005007520) MAGIX (ENSBIXG00005010541) ENSBIXG00005000710 PRICKLE3 (ENSBIXG00005010598) SYP (ENSBIXG00005010626) CACNA1F (ENSBIXG00005010972) CCDC22 (ENSBIXG00005011010) FOXP3 (ENSBIXG00005001010) PPP1R3F (ENSBIXG00005011099) ENSBIXG00005011113 PAGE4 (ENSBIXG00005011158) USP27X (ENSBIXG00005011172) CLCN5 (ENSBIXG00005011268) Cow MODERN SPECIES 177 SUV39H1 (ENSBTAG00000004706) GLOD5 (ENSBTAG00000052110) GATA1 (ENSBTAG00000003184) HDAC6 (ENSBTAG00000013244) ERAS (ENSBTAG00000012954) PCSK1N (ENSBTAG00000013250) ENSBTAG00000049284 TIMM17B (ENSBTAG00000018496) PQBP1 (ENSBTAG00000018498) SLC35A2 (ENSBTAG00000002768) PIM2 (ENSBTAG00000004597) OTUD5 (ENSBTAG00000004600) KCND1 (ENSBTAG00000009024) GRIPAP1 (ENSBTAG00000007788) TFE3 (ENSBTAG00000008523) CCDC120 (ENSBTAG00000002561) ##22 PRAF2 (ENSBTAG00000002562) WDR45 (ENSBTAG00000002563) ENSBTAG00000002565 GPKOW (ENSBTAG00000002568) MAGIX (ENSBTAG00000013278) PLP2 (ENSBTAG00000016093) PRICKLE3 (ENSBTAG00000016095) SYP (ENSBTAG00000016096) CACNA1F (ENSBTAG00000016097) CCDC22 (ENSBTAG00000013277) FOXP3 (ENSBTAG00000013279) PPP1R3F (ENSBTAG00000021100) ENSBTAG00000052071 PAGE4 (ENSBTAG00000037728) USP27X (ENSBTAG00000039391) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000006247.e.b ENSGT00390000017780.e.s ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000011943.a.b ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528.y.a.d ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 205 SUV39H1 (ENSOARG00020019775) GLOD5 (ENSOARG00020019731) GATA1 (ENSOARG00020019687) HDAC6 (ENSOARG00020019522) ERAS (ENSOARG00020019493) PCSK1N (ENSOARG00020019460) ENSOARG00020019438 TIMM17B (ENSOARG00020019398) PQBP1 (ENSOARG00020019308) SLC35A2 (ENSOARG00020018735) PIM2 (ENSOARG00020018673) OTUD5 (ENSOARG00020018505) KCND1 (ENSOARG00020018421) GRIPAP1 (ENSOARG00020017638) TFE3 (ENSOARG00020017512) CCDC120 (ENSOARG00020016906) ##22 PRAF2 (ENSOARG00020016835) WDR45 (ENSOARG00020016450) ENSOARG00020016383 GPKOW (ENSOARG00020016283) MAGIX (ENSOARG00020015816) ENSOARG00020015731 PRICKLE3 (ENSOARG00020015597) SYP (ENSOARG00020015519) CACNA1F (ENSOARG00020014375) CCDC22 (ENSOARG00020014199) FOXP3 (ENSOARG00020014024) PPP1R3F (ENSOARG00020013933) ENSOARG00020013855 ENSOARG00020013820 ENSOARG00020013763 Goat MODERN SPECIES 89 GRIPAP1 (ENSCHIG00000026013) TFE3 (ENSCHIG00000025202) CCDC120 (ENSCHIG00000014699) ##22 PRAF2 (ENSCHIG00000024416) WDR45 (ENSCHIG00000014300) ENSCHIG00000009813 GPKOW (ENSCHIG00000013277) Siberian musk deer MODERN SPECIES 140 ENSMMSG00000014613 GATA1 (ENSMMSG00000014634) HDAC6 (ENSMMSG00000014675) ERAS (ENSMMSG00000014709) PCSK1N (ENSMMSG00000014718) ENSMMSG00000014734 ENSMMSG00000014746 ENSMMSG00000014758 PQBP1 (ENSMMSG00000014787) SLC35A2 (ENSMMSG00000014825) PIM2 (ENSMMSG00000014885) OTUD5 (ENSMMSG00000014915) KCND1 (ENSMMSG00000014993) GRIPAP1 (ENSMMSG00000015045) TFE3 (ENSMMSG00000015192) CCDC120 (ENSMMSG00000015230) ##22 PRAF2 (ENSMMSG00000015369) WDR45 (ENSMMSG00000015407) ENSMMSG00000015576 GPKOW (ENSMMSG00000015597) MAGIX (ENSMMSG00000015649) ENSMMSG00000015749 PRICKLE3 (ENSMMSG00000015766) SYP (ENSMMSG00000015801) CACNA1F (ENSMMSG00000015856) CCDC22 (ENSMMSG00000016382) FOXP3 (ENSMMSG00000016471) PPP1R3F (ENSMMSG00000017199) ENSMMSG00000017228 ENSMMSG00000017251 ENSMMSG00000017270 Yarkand deer MODERN SPECIES 1323 ENSCHYG00000011491 GLOD5 (ENSCHYG00000011409) GATA1 (ENSCHYG00000011351) HDAC6 (ENSCHYG00000011007) ERAS (ENSCHYG00000010970) PCSK1N (ENSCHYG00000010927) ENSCHYG00000010894 TIMM17B (ENSCHYG00000010797) PQBP1 (ENSCHYG00000010724) SLC35A2 (ENSCHYG00000010376) PIM2 (ENSCHYG00000010311) OTUD5 (ENSCHYG00000010124) KCND1 (ENSCHYG00000010050) ENSCHYG00000009761 TFE3 (ENSCHYG00000009588) CCDC120 (ENSCHYG00000009246) ##22 PRAF2 (ENSCHYG00000009137) WDR45 (ENSCHYG00000008790) ENSCHYG00000008752 GPKOW (ENSCHYG00000008726) MAGIX (ENSCHYG00000020421) ENSCHYG00000020330 PRICKLE3 (ENSCHYG00000020251) SYP (ENSCHYG00000020176) CACNA1F (ENSCHYG00000018942) CCDC22 (ENSCHYG00000018761) FOXP3 (ENSCHYG00000018492) PPP1R3F (ENSCHYG00000018407) ENSCHYG00000018347 ENSCHYG00000018255 USP27X (ENSCHYG00000018226) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 1879 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 4365 ENSEEUG00000004984 ENSEEUG00000005059 ##22 Common shrew MODERN SPECIES 3336 ENSSARG00000009501 ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a Primates ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00910000145701 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b ENSGT00940000153097.A.f.b ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00910000145701 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e.e.a ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b ENSGT00940000153097.A.f.b ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000162674 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00910000145701 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e.e.a ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 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ENSGT00910000145701 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e.e.a ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b ENSGT00940000153097.A.f.a.a ENSGT00940000153097.A.f.a.b.a.b ENSGT00940000153097.A.f.b Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e.e.a ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b ENSGT00940000153097.A.f.a.a ENSGT00940000153097.A.f.a.b.a.b ENSGT00940000153097.A.f.b Olive baboon MODERN SPECIES 792 WAS (ENSPANG00000005276) SUV39H1 (ENSPANG00000004841) GLOD5 (ENSPANG00000035690) GATA1 (ENSPANG00000017368) HDAC6 (ENSPANG00000007274) ERAS (ENSPANG00000018181) PCSK1N (ENSPANG00000015256) TIMM17B (ENSPANG00000015318) PQBP1 (ENSPANG00000013632) SLC35A2 (ENSPANG00000003149) PIM2 (ENSPANG00000009952) OTUD5 (ENSPANG00000023327) KCND1 (ENSPANG00000003598) GRIPAP1 (ENSPANG00000013631) TFE3 (ENSPANG00000013676) CCDC120 (ENSPANG00000003148) ##22 PRAF2 (ENSPANG00000040259) WDR45 (ENSPANG00000008540) GPKOW (ENSPANG00000013477) MAGIX (ENSPANG00000012032) PLP2 (ENSPANG00000000993) PRICKLE3 (ENSPANG00000005946) SYP (ENSPANG00000005848) CACNA1F (ENSPANG00000031129) CCDC22 (ENSPANG00000010966) FOXP3 (ENSPANG00000010672) PPP1R3F (ENSPANG00000012950) ENSPANG00000003147 ENSPANG00000038972 PAGE1 (ENSPANG00000005945) PAGE4 (ENSPANG00000023042) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e.e.a ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b ENSGT00940000153097.A.f.a.a ENSGT00940000153097.A.f.a.b.a.b ENSGT00940000153097.A.f.b ENSGT00940000153097.C Drill MODERN SPECIES 1065 WAS (ENSMLEG00000032594) SUV39H1 (ENSMLEG00000036097) GLOD5 (ENSMLEG00000041222) GATA1 (ENSMLEG00000031222) HDAC6 (ENSMLEG00000036773) ERAS (ENSMLEG00000027363) TIMM17B (ENSMLEG00000039526) PQBP1 (ENSMLEG00000028927) SLC35A2 (ENSMLEG00000038781) PIM2 (ENSMLEG00000029129) OTUD5 (ENSMLEG00000041141) KCND1 (ENSMLEG00000043942) GRIPAP1 (ENSMLEG00000043249) TFE3 (ENSMLEG00000037046) ENSMLEG00000021075 CCDC120 (ENSMLEG00000035115) ##22 WDR45 (ENSMLEG00000042347) GPKOW (ENSMLEG00000033293) MAGIX (ENSMLEG00000036554) PLP2 (ENSMLEG00000031572) PRICKLE3 (ENSMLEG00000034066) SYP (ENSMLEG00000041502) CACNA1F (ENSMLEG00000035025) CCDC22 (ENSMLEG00000033689) FOXP3 (ENSMLEG00000029413) PPP1R3F (ENSMLEG00000033512) ENSMLEG00000003102 PAGE1 (ENSMLEG00000011128) PAGE4 (ENSMLEG00000028507) USP27X (ENSMLEG00000000154) CLCN5 (ENSMLEG00000006896) Sooty mangabey MODERN SPECIES 404 WAS (ENSCATG00000044972) SUV39H1 (ENSCATG00000036142) GLOD5 (ENSCATG00000037814) GATA1 (ENSCATG00000025362) HDAC6 (ENSCATG00000043307) ERAS (ENSCATG00000015662) PCSK1N (ENSCATG00000036843) TIMM17B (ENSCATG00000035492) PQBP1 (ENSCATG00000044182) SLC35A2 (ENSCATG00000040690) PIM2 (ENSCATG00000038525) OTUD5 (ENSCATG00000033103) KCND1 (ENSCATG00000011996) GRIPAP1 (ENSCATG00000024072) TFE3 (ENSCATG00000029548) CCDC120 (ENSCATG00000030130) ##22 WDR45 (ENSCATG00000006794) GPKOW (ENSCATG00000041433) MAGIX (ENSCATG00000031631) PLP2 (ENSCATG00000036523) PRICKLE3 (ENSCATG00000037428) SYP (ENSCATG00000036435) CACNA1F (ENSCATG00000023410) CCDC22 (ENSCATG00000017721) FOXP3 (ENSCATG00000011681) PPP1R3F (ENSCATG00000031820) ENSCATG00000010065 ENSCATG00000016896 Macaca ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00910000145701 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e.e.a ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b ENSGT00940000153097.A.f.a.b.a.a ENSGT00940000153097.A.f.a.a ENSGT00940000153097.A.f.a.b.a.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 207 WAS (ENSMNEG00000034263) SUV39H1 (ENSMNEG00000013732) GLOD5 (ENSMNEG00000029463) GATA1 (ENSMNEG00000043842) HDAC6 (ENSMNEG00000045060) ERAS (ENSMNEG00000004089) PCSK1N (ENSMNEG00000035990) TIMM17B (ENSMNEG00000038509) PQBP1 (ENSMNEG00000035279) SLC35A2 (ENSMNEG00000033235) PIM2 (ENSMNEG00000036646) OTUD5 (ENSMNEG00000042421) KCND1 (ENSMNEG00000044552) GRIPAP1 (ENSMNEG00000028228) TFE3 (ENSMNEG00000034885) CCDC120 (ENSMNEG00000033523) ##22 WDR45 (ENSMNEG00000034464) GPKOW (ENSMNEG00000004803) MAGIX (ENSMNEG00000029713) PLP2 (ENSMNEG00000035489) PRICKLE3 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(ENSMMUG00000019767) SUV39H1 (ENSMMUG00000019768) GLOD5 (ENSMMUG00000007505) GATA1 (ENSMMUG00000016464) HDAC6 (ENSMMUG00000016465) ERAS (ENSMMUG00000016467) PCSK1N (ENSMMUG00000016469) TIMM17B (ENSMMUG00000004547) PQBP1 (ENSMMUG00000004548) SLC35A2 (ENSMMUG00000004553) PIM2 (ENSMMUG00000053345) OTUD5 (ENSMMUG00000004558) KCND1 (ENSMMUG00000004559) GRIPAP1 (ENSMMUG00000020059) TFE3 (ENSMMUG00000023494) CCDC120 (ENSMMUG00000010617) ##22 WDR45 (ENSMMUG00000010620) PRAF2 (ENSMMUG00000055688) GPKOW (ENSMMUG00000020557) MAGIX (ENSMMUG00000023021) PLP2 (ENSMMUG00000023022) PRICKLE3 (ENSMMUG00000023024) SYP (ENSMMUG00000023025) CACNA1F (ENSMMUG00000008618) CCDC22 (ENSMMUG00000008623) FOXP3 (ENSMMUG00000008624) PPP1R3F (ENSMMUG00000052252) ENSMMUG00000060311 ENSMMUG00000041376 PAGE1 (ENSMMUG00000017015) PAGE4 (ENSMMUG00000003082) Vervet Monkey MODERN SPECIES 203 WAS (ENSCSAG00000013227) SUV39H1 (ENSCSAG00000013221) GLOD5 (ENSCSAG00000013213) GATA1 (ENSCSAG00000013203) HDAC6 (ENSCSAG00000013197) ERAS (ENSCSAG00000019564) PCSK1N (ENSCSAG00000013181) TIMM17B (ENSCSAG00000013171) PQBP1 (ENSCSAG00000013159) SLC35A2 (ENSCSAG00000013155) PIM2 (ENSCSAG00000013149) OTUD5 (ENSCSAG00000013145) KCND1 (ENSCSAG00000013138) GRIPAP1 (ENSCSAG00000013107) TFE3 (ENSCSAG00000013021) CCDC120 (ENSCSAG00000013004) ##22 PRAF2 (ENSCSAG00000012978) WDR45 (ENSCSAG00000012964) GPKOW (ENSCSAG00000012926) MAGIX (ENSCSAG00000012916) PRICKLE3 (ENSCSAG00000012891) PLP2 (ENSCSAG00000012883) SYP (ENSCSAG00000012877) ENSCSAG00000012869 CCDC22 (ENSCSAG00000012858) FOXP3 (ENSCSAG00000012845) PPP1R3F (ENSCSAG00000012839) ENSCSAG00000012831 ENSCSAG00000012821 PAGE1 (ENSCSAG00000012814) PAGE4 (ENSCSAG00000012798) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 250 ENSGT00390000017780.e.e.a ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00940000155882.a.a.ab ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b ENSGT00940000153097.A.f.a.b.a.a Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1030 TIMM17B (ENSRROG00000043298) PQBP1 (ENSRROG00000032738) SLC35A2 (ENSRROG00000040193) PIM2 (ENSRROG00000035407) OTUD5 (ENSRROG00000036291) KCND1 (ENSRROG00000044167) GRIPAP1 (ENSRROG00000043232) TFE3 (ENSRROG00000031147) CCDC120 (ENSRROG00000024468) ##22 WDR45 (ENSRROG00000033808) GPKOW (ENSRROG00000037604) MAGIX (ENSRROG00000044725) PLP2 (ENSRROG00000034045) PRICKLE3 (ENSRROG00000036095) SYP (ENSRROG00000034159) CACNA1F (ENSRROG00000040934) CCDC22 (ENSRROG00000002384) FOXP3 (ENSRROG00000038704) PPP1R3F (ENSRROG00000035940) ENSRROG00000030476 ENSRROG00000040030 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 908 ENSRBIG00000042421 PQBP1 (ENSRBIG00000033349) SLC35A2 (ENSRBIG00000036415) PIM2 (ENSRBIG00000043349) OTUD5 (ENSRBIG00000040797) KCND1 (ENSRBIG00000034428) GRIPAP1 (ENSRBIG00000041228) TFE3 (ENSRBIG00000036898) CCDC120 (ENSRBIG00000026662) ##22 PRAF2 (ENSRBIG00000034849) WDR45 (ENSRBIG00000036165) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e.e.a ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b.c ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b.d ENSGT00940000153097.A.f.b ENSGT00940000153097.C Hominidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e.e.a ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b.c ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b.d ENSGT00940000153097.A.f.b ENSGT00940000153097.C Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT01030000234626.D.l ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e.e.a ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b.c ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b.d ENSGT00940000153097.A.f.b ENSGT00940000153097.C Gorilla MODERN SPECIES 523 WAS (ENSGGOG00000039779) SUV39H1 (ENSGGOG00000027774) GLOD5 (ENSGGOG00000007330) ENSGGOG00000040202 GATA1 (ENSGGOG00000023559) HDAC6 (ENSGGOG00000004525) ERAS (ENSGGOG00000004536) PCSK1N (ENSGGOG00000004538) ENSGGOG00000011427 PQBP1 (ENSGGOG00000011431) SLC35A2 (ENSGGOG00000011437) PIM2 (ENSGGOG00000011440) ENSGGOG00000002727 GRIPAP1 (ENSGGOG00000023074) TFE3 (ENSGGOG00000014023) CCDC120 (ENSGGOG00000000586) ##22 WDR45 (ENSGGOG00000000589) GPKOW (ENSGGOG00000013685) MAGIX (ENSGGOG00000009033) PLP2 (ENSGGOG00000024000) PRICKLE3 (ENSGGOG00000039081) SYP (ENSGGOG00000001279) CACNA1F (ENSGGOG00000000907) CCDC22 (ENSGGOG00000000912) FOXP3 (ENSGGOG00000000913) PPP1R3F (ENSGGOG00000000915) ENSGGOG00000026597 PAGE1 (ENSGGOG00000007917) PAGE4 (ENSGGOG00000000239) USP27X (ENSGGOG00000012167) CLCN5 (ENSGGOG00000016419) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160063.a ENSGT00940000153941.a.b ENSGT01030000234626.D.l ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e.e.a ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b.c ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b.d ENSGT00940000153097.A.f.b ENSGT00940000153097.C Human MODERN SPECIES 1827 WAS (ENSG00000015285) SUV39H1 (ENSG00000101945) GLOD5 (ENSG00000171433) GATA1 (ENSG00000102145) HDAC6 (ENSG00000094631) ERAS (ENSG00000187682) PCSK1N (ENSG00000102109) PQBP1 (ENSG00000102103) TIMM17B (ENSG00000126768) SLC35A2 (ENSG00000102100) PIM2 (ENSG00000102096) OTUD5 (ENSG00000068308) KCND1 (ENSG00000102057) GRIPAP1 (ENSG00000068400) TFE3 (ENSG00000068323) CCDC120 (ENSG00000147144) ##22 PRAF2 (ENSG00000243279) ENSG00000288053 WDR45 (ENSG00000196998) GPKOW (ENSG00000068394) MAGIX (ENSG00000269313) PLP2 (ENSG00000102007) PRICKLE3 (ENSG00000012211) SYP (ENSG00000102003) CACNA1F (ENSG00000102001) CCDC22 (ENSG00000101997) FOXP3 (ENSG00000049768) ENSG00000290184 PPP1R3F (ENSG00000049769) GAGE10 (ENSG00000215274) GAGE12J (ENSG00000224659) Pan ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160063.a ENSGT00940000153941.a.b ENSGT01030000234626.D.l ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e.e.a ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00910000147473 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00940000162625 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b.c ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a Chimpanzee MODERN SPECIES 972 ENSPTRG00000021867 GLOD5 (ENSPTRG00000045013) ENSPTRG00000049494 GATA1 (ENSPTRG00000048542) ENSPTRG00000021870 ERAS (ENSPTRG00000049150) PCSK1N (ENSPTRG00000049734) TIMM17B (ENSPTRG00000021872) PQBP1 (ENSPTRG00000021873) SLC35A2 (ENSPTRG00000021874) PIM2 (ENSPTRG00000021875) OTUD5 (ENSPTRG00000021876) KCND1 (ENSPTRG00000021877) GRIPAP1 (ENSPTRG00000051549) TFE3 (ENSPTRG00000021879) CCDC120 (ENSPTRG00000021880) ##22 WDR45 (ENSPTRG00000021882) GPKOW (ENSPTRG00000047603) MAGIX (ENSPTRG00000047576) PLP2 (ENSPTRG00000021885) PRICKLE3 (ENSPTRG00000045748) SYP (ENSPTRG00000021887) CACNA1F (ENSPTRG00000021888) ENSPTRG00000049813 CCDC22 (ENSPTRG00000021889) FOXP3 (ENSPTRG00000021890) PPP1R3F (ENSPTRG00000046513) GAGE10 (ENSPTRG00000021892) ENSPTRG00000048439 ENSPTRG00000045256 ENSPTRG00000021894 Bonobo MODERN SPECIES 369 SUV39H1 (ENSPPAG00000030054) GLOD5 (ENSPPAG00000042162) ENSPPAG00000035139 GATA1 (ENSPPAG00000034872) HDAC6 (ENSPPAG00000033426) ERAS (ENSPPAG00000026637) PCSK1N (ENSPPAG00000034344) ENSPPAG00000036547 PQBP1 (ENSPPAG00000038832) SLC35A2 (ENSPPAG00000026694) PIM2 (ENSPPAG00000041108) ENSPPAG00000043025 KCND1 (ENSPPAG00000035010) GRIPAP1 (ENSPPAG00000040230) TFE3 (ENSPPAG00000028832) CCDC120 (ENSPPAG00000026576) ##22 WDR45 (ENSPPAG00000042027) GPKOW (ENSPPAG00000040116) MAGIX (ENSPPAG00000037324) PLP2 (ENSPPAG00000040820) PRICKLE3 (ENSPPAG00000040750) SYP (ENSPPAG00000033248) CACNA1F (ENSPPAG00000027619) CCDC22 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(ENSPPYG00000020346) Gibbon MODERN SPECIES 449 WAS (ENSNLEG00000007859) SUV39H1 (ENSNLEG00000007864) GLOD5 (ENSNLEG00000007868) GATA1 (ENSNLEG00000007871) ENSNLEG00000027392 ERAS (ENSNLEG00000018585) PCSK1N (ENSNLEG00000007899) ENSNLEG00000007902 PQBP1 (ENSNLEG00000007912) SLC35A2 (ENSNLEG00000007922) PIM2 (ENSNLEG00000007927) OTUD5 (ENSNLEG00000031362) KCND1 (ENSNLEG00000007958) GRIPAP1 (ENSNLEG00000007939) TFE3 (ENSNLEG00000007963) CCDC120 (ENSNLEG00000007975) ##22 ENSNLEG00000007994 GPKOW (ENSNLEG00000007998) ENSNLEG00000008017 SYP (ENSNLEG00000008024) CACNA1F (ENSNLEG00000008028) CCDC22 (ENSNLEG00000008043) FOXP3 (ENSNLEG00000008046) PPP1R3F (ENSNLEG00000031049) ENSNLEG00000033633 ENSNLEG00000030515 ENSNLEG00000027762 ENSNLEG00000027542 PAGE1 (ENSNLEG00000008094) PAGE4 (ENSNLEG00000008101) USP27X (ENSNLEG00000028156) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00910000145701.b ENSGT00940000159563.m ENSGT00940000162901 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Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 157 WDR13 (ENSSBOG00000035999) WAS (ENSSBOG00000032308) SUV39H1 (ENSSBOG00000003145) GLOD5 (ENSSBOG00000035107) GATA1 (ENSSBOG00000020278) ENSSBOG00000023772 PCSK1N (ENSSBOG00000035004) TIMM17B (ENSSBOG00000029876) PQBP1 (ENSSBOG00000024905) SLC35A2 (ENSSBOG00000025776) PIM2 (ENSSBOG00000013515) OTUD5 (ENSSBOG00000006541) KCND1 (ENSSBOG00000026039) GRIPAP1 (ENSSBOG00000036112) TFE3 (ENSSBOG00000035668) CCDC120 (ENSSBOG00000017789) ##22 WDR45 (ENSSBOG00000020972) ENSSBOG00000032042 MAGIX (ENSSBOG00000034505) PLP2 (ENSSBOG00000027809) PRICKLE3 (ENSSBOG00000024198) SYP (ENSSBOG00000019771) CACNA1F (ENSSBOG00000024504) CCDC22 (ENSSBOG00000020858) FOXP3 (ENSSBOG00000010629) PPP1R3F (ENSSBOG00000033342) ENSSBOG00000035389 ENSSBOG00000020097 ENSSBOG00000026770 PAGE1 (ENSSBOG00000028199) PAGE4 (ENSSBOG00000024804) Capuchin MODERN SPECIES 909 TFE3 (ENSCCAG00000025855) CCDC120 (ENSCCAG00000027618) ##22 WDR45 (ENSCCAG00000026589) ENSCCAG00000028458 ENSCCAG00000029525 ENSCCAG00000029073 Marmoset MODERN SPECIES 78 WAS (ENSCJAG00000002365) SUV39H1 (ENSCJAG00000002376) GLOD5 (ENSCJAG00000042238) GATA1 (ENSCJAG00000040521) ENSCJAG00000077383 HDAC6 (ENSCJAG00000002395) ERAS (ENSCJAG00000040987) PCSK1N (ENSCJAG00000047969) TIMM17B (ENSCJAG00000002426) PQBP1 (ENSCJAG00000002452) SLC35A2 (ENSCJAG00000002479) OTUD5 (ENSCJAG00000002507) KCND1 (ENSCJAG00000002523) GRIPAP1 (ENSCJAG00000002531) ENSCJAG00000084243 CCDC120 (ENSCJAG00000002605) ##22 PRAF2 (ENSCJAG00000078035) WDR45 (ENSCJAG00000002633) GPKOW (ENSCJAG00000002656) MAGIX (ENSCJAG00000002679) PLP2 (ENSCJAG00000002681) PRICKLE3 (ENSCJAG00000040589) CACNA1F (ENSCJAG00000002728) CCDC22 (ENSCJAG00000002771) FOXP3 (ENSCJAG00000002813) PPP1R3F (ENSCJAG00000002866) ENSCJAG00000077893 ENSCJAG00000002889 ENSCJAG00000071901 ENSCJAG00000085129 ENSCJAG00000044748 Mas night monkey MODERN SPECIES 1206 WDR13 (ENSANAG00000029097) WAS (ENSANAG00000007111) SUV39H1 (ENSANAG00000022001) GLOD5 (ENSANAG00000022210) GATA1 (ENSANAG00000032139) HDAC6 (ENSANAG00000021233) PCSK1N (ENSANAG00000031176) TIMM17B (ENSANAG00000030275) ENSANAG00000027490 SLC35A2 (ENSANAG00000037954) PIM2 (ENSANAG00000025623) OTUD5 (ENSANAG00000033729) KCND1 (ENSANAG00000027103) GRIPAP1 (ENSANAG00000036795) TFE3 (ENSANAG00000037525) CCDC120 (ENSANAG00000021812) ##22 WDR45 (ENSANAG00000036620) ENSANAG00000030473 MAGIX (ENSANAG00000038043) PLP2 (ENSANAG00000029245) PRICKLE3 (ENSANAG00000024859) SYP (ENSANAG00000034953) CACNA1F (ENSANAG00000020527) CCDC22 (ENSANAG00000028058) FOXP3 (ENSANAG00000036359) PPP1R3F (ENSANAG00000027387) ENSANAG00000029419 ENSANAG00000030824 ENSANAG00000031014 ENSANAG00000037052 PAGE1 (ENSANAG00000024656) Tarsier MODERN SPECIES 1273 CCDC120 (ENSTSYG00000028409) ##22 WDR45 (ENSTSYG00000007029) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160063 ENSGT01100000263546.d.b.a.a.a.b ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 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268 SUV39H1 (ENSOGAG00000033074) BPIFA3 (ENSOGAG00000027244) GLOD5 (ENSOGAG00000013859) GATA1 (ENSOGAG00000025595) HDAC6 (ENSOGAG00000013860) ERAS (ENSOGAG00000008196) PCSK1N (ENSOGAG00000034785) TIMM17B (ENSOGAG00000009604) PQBP1 (ENSOGAG00000009606) SLC35A2 (ENSOGAG00000009610) PIM2 (ENSOGAG00000009613) ENSOGAG00000009614 KCND1 (ENSOGAG00000026877) GRIPAP1 (ENSOGAG00000032089) TFE3 (ENSOGAG00000031330) CCDC120 (ENSOGAG00000029309) ##22 PRAF2 (ENSOGAG00000012183) WDR45 (ENSOGAG00000012184) GPKOW (ENSOGAG00000003644) MAGIX (ENSOGAG00000006325) PLP2 (ENSOGAG00000003865) PRICKLE3 (ENSOGAG00000024638) SYP (ENSOGAG00000003584) CACNA1F (ENSOGAG00000010170) CCDC22 (ENSOGAG00000030116) FOXP3 (ENSOGAG00000029651) PPP1R3F (ENSOGAG00000027545) USP27X (ENSOGAG00000028141) CLCN5 (ENSOGAG00000007202) AKAP4 (ENSOGAG00000029364) CCNB3 (ENSOGAG00000003110) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 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ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000153634.a ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00980000200212 ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a Rabbit MODERN SPECIES 1401 WDR13 (ENSOCUG00000014470) WAS (ENSOCUG00000015393) SUV39H1 (ENSOCUG00000003807) GLOD5 (ENSOCUG00000008902) GATA1 (ENSOCUG00000025597) HDAC6 (ENSOCUG00000010141) PCSK1N (ENSOCUG00000009021) TIMM17B (ENSOCUG00000027418) PQBP1 (ENSOCUG00000011703) SLC35A2 (ENSOCUG00000011709) ENSOCUG00000015757 OTUD5 (ENSOCUG00000015767) KCND1 (ENSOCUG00000015777) GRIPAP1 (ENSOCUG00000015788) TFE3 (ENSOCUG00000015807) CCDC120 (ENSOCUG00000004644) ##22 PRAF2 (ENSOCUG00000035406) WDR45 (ENSOCUG00000023611) GPKOW (ENSOCUG00000010422) MAGIX (ENSOCUG00000026212) ENSOCUG00000001393 CACNA1F (ENSOCUG00000005231) CCDC22 (ENSOCUG00000027728) FOXP3 (ENSOCUG00000010135) ENSOCUG00000037564 USP27X (ENSOCUG00000000066) CLCN5 (ENSOCUG00000017336) GPR173 (ENSOCUG00000006716) TSPYL2 (ENSOCUG00000027476) KANTR (ENSOCUG00000037007) KDM5C (ENSOCUG00000010139) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C 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Glod5 (ENSMOCG00000018812) Gata1 (ENSMOCG00000018101) Hdac6 (ENSMOCG00000022461) Eras (ENSMOCG00000017489) Pcsk1n (ENSMOCG00000016403) Timm17b (ENSMOCG00000022137) Pqbp1 (ENSMOCG00000020123) Slc35a2 (ENSMOCG00000015110) Pim2 (ENSMOCG00000005351) Otud5 (ENSMOCG00000011416) ENSMOCG00000018971 Kcnd1 (ENSMOCG00000002342) Gripap1 (ENSMOCG00000007615) Tfe3 (ENSMOCG00000013907) Ccdc120 (ENSMOCG00000008950) ##22 Wdr45 (ENSMOCG00000014028) ENSMOCG00000004994 Gpkow (ENSMOCG00000019251) Magix (ENSMOCG00000016030) ENSMOCG00000013471 Prickle3 (ENSMOCG00000022909) Syp (ENSMOCG00000001534) Cacna1f (ENSMOCG00000003974) Ccdc22 (ENSMOCG00000012776) Foxp3 (ENSMOCG00000008698) Ppp1r3f (ENSMOCG00000002362) Usp27x (ENSMOCG00000006681) ENSMOCG00000013352 Clcn5 (ENSMOCG00000015506) Akap4 (ENSMOCG00000018265) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 Was (ENSPEMG00000017673) Suv39h1 (ENSPEMG00000012820) Glod5 (ENSPEMG00000014471) Gata1 (ENSPEMG00000010138) Hdac6 (ENSPEMG00000002814) Eras 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ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 spretus MODERN SPECIES 19 Glod5 (MGP_SPRETEiJ_G0034059) Gata1 (MGP_SPRETEiJ_G0034058) Hdac6 (MGP_SPRETEiJ_G0034057) Eras (MGP_SPRETEiJ_G0034056) Pcsk1n (MGP_SPRETEiJ_G0034055) MGP_SPRETEiJ_G0034054 MGP_SPRETEiJ_G0034053 Timm17b (MGP_SPRETEiJ_G0034052) Pqbp1 (MGP_SPRETEiJ_G0034051) MGP_SPRETEiJ_G0034050 Pim2 (MGP_SPRETEiJ_G0034049) Otud5 (MGP_SPRETEiJ_G0034048) Kcnd1 (MGP_SPRETEiJ_G0034047) Gripap1 (MGP_SPRETEiJ_G0034046) Tfe3 (MGP_SPRETEiJ_G0034045) Ccdc120 (MGP_SPRETEiJ_G0034044) ##22 Praf2 (MGP_SPRETEiJ_G0034043) Wdr45 (MGP_SPRETEiJ_G0034042) MGP_SPRETEiJ_G0034041 Magix (MGP_SPRETEiJ_G0034040) MGP_SPRETEiJ_G0034038 MGP_SPRETEiJ_G0034039 Prickle3 (MGP_SPRETEiJ_G0034037) Syp (MGP_SPRETEiJ_G0034036) Cacna1f (MGP_SPRETEiJ_G0034035) Ccdc22 (MGP_SPRETEiJ_G0034034) Foxp3 (MGP_SPRETEiJ_G0034033) Ppp1r3f (MGP_SPRETEiJ_G0034032) Usp27x (MGP_SPRETEiJ_G0034031) Clcn5 (MGP_SPRETEiJ_G0034030) Akap4 (MGP_SPRETEiJ_G0034029) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 19 Suv39h1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032911) Glod5 (MGP_CAROLIEiJ_G0032910) Gata1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032909) Hdac6 (MGP_CAROLIEiJ_G0032908) Eras (MGP_CAROLIEiJ_G0032907) Pcsk1n (MGP_CAROLIEiJ_G0032906) MGP_CAROLIEiJ_G0032905 Timm17b (MGP_CAROLIEiJ_G0032904) Pqbp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032903) Slc35a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0032902) Pim2 (MGP_CAROLIEiJ_G0032901) Otud5 (MGP_CAROLIEiJ_G0032900) Kcnd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032899) Gripap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032898) Tfe3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032897) Ccdc120 (MGP_CAROLIEiJ_G0032896) ##22 Praf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0032895) Wdr45 (MGP_CAROLIEiJ_G0032894) Gpkow (MGP_CAROLIEiJ_G0032893) Magix (MGP_CAROLIEiJ_G0032892) MGP_CAROLIEiJ_G0032890 MGP_CAROLIEiJ_G0032891 Prickle3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032889) Syp (MGP_CAROLIEiJ_G0032888) Cacna1f (MGP_CAROLIEiJ_G0032887) Ccdc22 (MGP_CAROLIEiJ_G0032886) Foxp3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032885) Ppp1r3f (MGP_CAROLIEiJ_G0032884) Usp27x (MGP_CAROLIEiJ_G0032883) Clcn5 (MGP_CAROLIEiJ_G0032882) Akap4 (MGP_CAROLIEiJ_G0032881) Shrew mouse MODERN SPECIES 23 Was 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ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 156 WAS (ENSSVLG00005021256) SUV39H1 (ENSSVLG00005021209) GLOD5 (ENSSVLG00005021145) GATA1 (ENSSVLG00005021013) HDAC6 (ENSSVLG00005020953) ERAS (ENSSVLG00005020927) PCSK1N (ENSSVLG00005020895) TIMM17B (ENSSVLG00005020828) PQBP1 (ENSSVLG00005020775) SLC35A2 (ENSSVLG00005020649) PIM2 (ENSSVLG00005020572) OTUD5 (ENSSVLG00005020359) KCND1 (ENSSVLG00005020301) GRIPAP1 (ENSSVLG00005020144) TFE3 (ENSSVLG00005020065) CCDC120 (ENSSVLG00005019933) ##22 PRAF2 (ENSSVLG00005019896) ENSSVLG00005019742 GPKOW (ENSSVLG00005019537) MAGIX (ENSSVLG00005019436) PLP2 (ENSSVLG00005019309) PRICKLE3 (ENSSVLG00005019231) SYP (ENSSVLG00005019132) CACNA1F (ENSSVLG00005017838) CCDC22 (ENSSVLG00005017751) FOXP3 (ENSSVLG00005017363) PPP1R3F (ENSSVLG00005017275) USP27X (ENSSVLG00005017235) CLCN5 (ENSSVLG00005017046) AKAP4 (ENSSVLG00005016895) ENSSVLG00005016807 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901.c ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 120 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00940000162901.c ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 Squirrel MODERN SPECIES 321 WAS (ENSSTOG00000028043) SUV39H1 (ENSSTOG00000015328) GLOD5 (ENSSTOG00000014150) GATA1 (ENSSTOG00000026993) HDAC6 (ENSSTOG00000014156) PCSK1N (ENSSTOG00000025546) ERAS (ENSSTOG00000028430) TIMM17B (ENSSTOG00000014173) PQBP1 (ENSSTOG00000034920) SLC35A2 (ENSSTOG00000014179) PIM2 (ENSSTOG00000014191) OTUD5 (ENSSTOG00000014202) KCND1 (ENSSTOG00000019883) GRIPAP1 (ENSSTOG00000014221) TFE3 (ENSSTOG00000014237) CCDC120 (ENSSTOG00000020841) ##22 PRAF2 (ENSSTOG00000009679) WDR45 (ENSSTOG00000009683) ENSSTOG00000010517 GPKOW (ENSSTOG00000014593) MAGIX (ENSSTOG00000004371) PLP2 (ENSSTOG00000014609) PRICKLE3 (ENSSTOG00000014600) SYP (ENSSTOG00000004361) CACNA1F (ENSSTOG00000023000) CCDC22 (ENSSTOG00000004377) FOXP3 (ENSSTOG00000004416) PPP1R3F (ENSSTOG00000004440) USP27X (ENSSTOG00000023186) CLCN5 (ENSSTOG00000013403) AKAP4 (ENSSTOG00000027547) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 341 SUV39H1 (ENSUPAG00010002798) ENSUPAG00010002821 GLOD5 (ENSUPAG00010002824) GATA1 (ENSUPAG00010002837) HDAC6 (ENSUPAG00010002848) ERAS (ENSUPAG00010002926) PCSK1N (ENSUPAG00010002932) TIMM17B (ENSUPAG00010002940) PQBP1 (ENSUPAG00010002947) SLC35A2 (ENSUPAG00010002977) PIM2 (ENSUPAG00010002998) OTUD5 (ENSUPAG00010003005) KCND1 (ENSUPAG00010003047) GRIPAP1 (ENSUPAG00010003056) ENSUPAG00010003193 CCDC120 (ENSUPAG00010003364) ##22 PRAF2 (ENSUPAG00010003375) WDR45 (ENSUPAG00010003384) ENSUPAG00010003688 GPKOW (ENSUPAG00010003718) MAGIX (ENSUPAG00010003732) PLP2 (ENSUPAG00010003832) PRICKLE3 (ENSUPAG00010003840) SYP (ENSUPAG00010003851) CACNA1F (ENSUPAG00010003865) CCDC22 (ENSUPAG00010004020) FOXP3 (ENSUPAG00010004085) PPP1R3F (ENSUPAG00010004546) USP27X (ENSUPAG00010004551) CLCN5 (ENSUPAG00010004559) AKAP4 (ENSUPAG00010004604) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153634.a ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154.k ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a ENSGT01090000262464 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 31 SUV39H1 (ENSHGLG00000007605) ENSHGLG00000008268 GLOD5 (ENSHGLG00000035331) GATA1 (ENSHGLG00000009775) HDAC6 (ENSHGLG00000010523) PCSK1N (ENSHGLG00000002975) ENSHGLG00000020012 TIMM17B (ENSHGLG00000040054) PQBP1 (ENSHGLG00000001252) SLC35A2 (ENSHGLG00000001312) PIM2 (ENSHGLG00000001519) ENSHGLG00000001569 KCND1 (ENSHGLG00000001895) GRIPAP1 (ENSHGLG00000002058) TFE3 (ENSHGLG00000001383) CCDC120 (ENSHGLG00000001767) ##22 PRAF2 (ENSHGLG00000001998) ENSHGLG00000001929 ENSHGLG00000002746 ENSHGLG00000036929 ENSHGLG00000003300 PRICKLE3 (ENSHGLG00000043601) SYP (ENSHGLG00000042103) CACNA1F (ENSHGLG00000001768) CCDC22 (ENSHGLG00000003047) FOXP3 (ENSHGLG00000003258) ENSHGLG00000003448 ENSHGLG00000020403 ENSHGLG00000001475 ENSHGLG00000001525 ENSHGLG00000001827 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000153634.a ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154.k ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 Guinea pig MODERN SPECIES 132 WDR13 (ENSCPOG00000005101) WAS (ENSCPOG00000023506) SUV39H1 (ENSCPOG00000013555) GLOD5 (ENSCPOG00000003997) GATA1 (ENSCPOG00000007573) HDAC6 (ENSCPOG00000008955) PCSK1N (ENSCPOG00000007567) TIMM17B (ENSCPOG00000008768) PQBP1 (ENSCPOG00000032410) SLC35A2 (ENSCPOG00000020236) PIM2 (ENSCPOG00000006111) OTUD5 (ENSCPOG00000027082) KCND1 (ENSCPOG00000013271) GRIPAP1 (ENSCPOG00000013274) TFE3 (ENSCPOG00000012410) CCDC120 (ENSCPOG00000012416) ##22 PRAF2 (ENSCPOG00000030120) WDR45 (ENSCPOG00000012419) GPKOW (ENSCPOG00000013270) PLP2 (ENSCPOG00000022812) PRICKLE3 (ENSCPOG00000026750) SYP (ENSCPOG00000006941) CACNA1F (ENSCPOG00000021685) CCDC22 (ENSCPOG00000024536) FOXP3 (ENSCPOG00000006945) PPP1R3F (ENSCPOG00000014516) USP27X (ENSCPOG00000034700) CLCN5 (ENSCPOG00000009929) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00940000153634.a ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000160063 ENSGT00940000153941.a.b ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159563 ENSGT00390000013488 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00390000008631.b ENSGT00940000155657 ENSGT00390000015154.k ENSGT00940000162529 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000162262 Degu MODERN SPECIES 304 CCDC120 (ENSODEG00000001185) ##22 PRAF2 (ENSODEG00000001165) WDR45 (ENSODEG00000001091) ENSODEG00000018621 MAGIX (ENSODEG00000001017) PLP2 (ENSODEG00000001003) PRICKLE3 (ENSODEG00000001845) SYP (ENSODEG00000001808) ENSODEG00000001692 CCDC22 (ENSODEG00000001642) FOXP3 (ENSODEG00000001628) PPP1R3F (ENSODEG00000001563) ENSODEG00000018700 ENSODEG00000018701 ENSODEG00000018712 USP27X (ENSODEG00000001537) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 250 WAS (ENSCLAG00000003232) SUV39H1 (ENSCLAG00000004044) GLOD5 (ENSCLAG00000002227) GATA1 (ENSCLAG00000002473) HDAC6 (ENSCLAG00000002563) PCSK1N (ENSCLAG00000003392) TIMM17B (ENSCLAG00000003552) PQBP1 (ENSCLAG00000004380) SLC35A2 (ENSCLAG00000004591) PIM2 (ENSCLAG00000005773) OTUD5 (ENSCLAG00000006102) KCND1 (ENSCLAG00000002203) GRIPAP1 (ENSCLAG00000002364) ENSCLAG00000017539 TFE3 (ENSCLAG00000002396) CCDC120 (ENSCLAG00000003931) ##22 PRAF2 (ENSCLAG00000004889) WDR45 (ENSCLAG00000005420) ENSCLAG00000002220 MAGIX (ENSCLAG00000002281) PLP2 (ENSCLAG00000002630) PRICKLE3 (ENSCLAG00000003916) SYP (ENSCLAG00000004119) CACNA1F (ENSCLAG00000002756) CCDC22 (ENSCLAG00000003978) FOXP3 (ENSCLAG00000005172) PPP1R3F (ENSCLAG00000002068) ENSCLAG00000002546 CLCN5 (ENSCLAG00000002896) AKAP4 (ENSCLAG00000010688) DGKK (ENSCLAG00000003053) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000161233 ENSGT00940000159173 ENSGT00530000063715.a ENSGT01030000234564.a.a.b.a ENSGT00940000159563 ENSGT00940000161156 ENSGT00940000159128 ENSGT00390000017780.e ENSGT00950000183102.C.f ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963 ENSGT00940000162057 ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000164196 ENSGT00940000159667 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b Opossum MODERN SPECIES 627 ENSMODG00000010292 TBC1D25 (ENSMODG00000010259) EBP (ENSMODG00000010248) PORCN (ENSMODG00000010236) HDAC6 (ENSMODG00000010166) ENSMODG00000044553 GATA1 (ENSMODG00000010099) CDK20 (ENSMODG00000010092) TIMM17B (ENSMODG00000010069) ENSMODG00000010063 SLC35A2 (ENSMODG00000010048) PIM2 (ENSMODG00000010037) ENSMODG00000010033 GRIPAP1 (ENSMODG00000010018) TFE3 (ENSMODG00000009925) CCDC120 (ENSMODG00000009910) ##22 CCDC22 (ENSMODG00000009860) SYP (ENSMODG00000009899) ENSMODG00000009847 ENSMODG00000027767 GPR173 (ENSMODG00000046505) IQSEC2 (ENSMODG00000009707) ENSMODG00000041970 ERCC6L (ENSMODG00000010916) PIN4 (ENSMODG00000050934) NHSL2 (ENSMODG00000022846) ENSMODG00000011070 ENSMODG00000011092 ENSMODG00000045536 ENSMODG00000011104 ENSMODG00000011116 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00940000163382 ENSGT00940000163928 ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.C ENSGT00950000183004.a.b.a.a ENSGT00940000157480 ENSGT00390000015216 ENSGT00940000156619 ENSGT00510000047764 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000164196.g ENSGT00940000159667 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00940000163382 ENSGT00940000163928 ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.C ENSGT00950000183004.a.b.a.a ENSGT00940000157480 ENSGT00390000015216 ENSGT00940000156619 ENSGT00510000047764 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000164196.g ENSGT00940000159667 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00940000163382 ENSGT00940000163928 ENSGT00590000083094.a.b ENSGT00940000159477 ENSGT00390000013249 ENSGT00940000155529.C ENSGT00950000183004.a.b.a.a ENSGT00940000157480 ENSGT00390000015216 ENSGT00940000156619 ENSGT00510000047764 ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00720000108868 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00940000158528 ENSGT00940000153629.a.b ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000159855 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000013859 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000164196.g ENSGT00940000159667 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 Common wonbat MODERN SPECIES 1079 SLC38A5 (ENSVURG00010010329) TBC1D25 (ENSVURG00010010343) EBP (ENSVURG00010010353) PORCN (ENSVURG00010010369) HDAC6 (ENSVURG00010010455) GATA1 (ENSVURG00010010465) CDK20 (ENSVURG00010010475) TIMM17B (ENSVURG00010010486) ENSVURG00010010494 SLC35A2 (ENSVURG00010010497) PIM2 (ENSVURG00010010500) ENSVURG00010010507 ENSVURG00010010519 GRIPAP1 (ENSVURG00010010555) TFE3 (ENSVURG00010010649) CCDC120 (ENSVURG00010010671) ##22 ENSVURG00010010696 PRICKLE3 (ENSVURG00010010711) SYP (ENSVURG00010010730) CACNA1F (ENSVURG00010011168) CCDC22 (ENSVURG00010021103) FOXP3 (ENSVURG00010021112) ENSVURG00010021119 GPR173 (ENSVURG00010021126) ENSVURG00010021134 ENSVURG00010021171 ENSVURG00010021180 koala MODERN SPECIES 294 SLC38A5 (ENSPCIG00000007378) TBC1D25 (ENSPCIG00000027924) EBP (ENSPCIG00000027919) PORCN (ENSPCIG00000027915) HDAC6 (ENSPCIG00000027912) GATA1 (ENSPCIG00000027911) CDK20 (ENSPCIG00000027909) TIMM17B (ENSPCIG00000027908) ENSPCIG00000027905 ENSPCIG00000027902 PIM2 (ENSPCIG00000027897) OTUD5 (ENSPCIG00000027896) ENSPCIG00000027895 GRIPAP1 (ENSPCIG00000027893) TFE3 (ENSPCIG00000027889) CCDC120 (ENSPCIG00000027887) ##22 PLP2 (ENSPCIG00000027886) PRICKLE3 (ENSPCIG00000027884) SYP (ENSPCIG00000027881) CACNA1F (ENSPCIG00000005925) CCDC22 (ENSPCIG00000014475) FOXP3 (ENSPCIG00000014474) ENSPCIG00000014472 GPR173 (ENSPCIG00000014470) ENSPCIG00000014467 IQSEC2 (ENSPCIG00000014460) ENSPCIG00000013007 HSD17B10 (ENSPCIG00000013010) Wallaby MODERN SPECIES 1173 KCND1 (ENSMEUG00000002064) GRIPAP1 (ENSMEUG00000002074) ENSMEUG00000002094 ##22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 21 ENSSHAG00000022637 ENSSHAG00000002882 ENSSHAG00000000940 ENSSHAG00000032369 ENSSHAG00000001709 ENSSHAG00000001040 ENSSHAG00000021720 ENSSHAG00000021486 ENSSHAG00000001555 ENSSHAG00000021727 OTUD5 (ENSSHAG00000024529) PIM2 (ENSSHAG00000022404) ENSSHAG00000002843 GRIPAP1 (ENSSHAG00000003080) TFE3 (ENSSHAG00000003327) ENSSHAG00000031604 ##22 ENSSHAG00000027473 ENSSHAG00000004508 SYP (ENSSHAG00000025026) CACNA1F (ENSSHAG00000001197) CCDC22 (ENSSHAG00000029776) FOXP3 (ENSSHAG00000002680) ENSSHAG00000029754 ENSSHAG00000026834 ENSSHAG00000004827 ENSSHAG00000005098 ENSSHAG00000005899 HSD17B10 (ENSSHAG00000005913) ENSSHAG00000006004 HUWE1 (ENSSHAG00000001097) PHF8 (ENSSHAG00000004701) Anura ANCESTRAL SPECIES 570 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 Frog MODERN SPECIES 8 rpl10 (ENSXETG00000010878) #17 dnase1l1 (ENSXETG00000045715) DNASE1L1 (ENSXETG00000048321) slc25a20l (ENSXETG00000049485) tafazzin (ENSXETG00000003378) atp6ap1.2 (ENSXETG00000003377) gdi1 (ENSXETG00000003376) fam50a (ENSXETG00000003375) plxna3 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ENSGT00950000182994.B.a.a.a ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650 ENSGT00950000182846.a.a.a.a.b ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a ENSGT00390000003897 #17 ENSGT00940000153588.b ENSGT00510000050141 Reedfish MODERN SPECIES 2 ENSECRG00000007908 gata1a (ENSECRG00000007886) cdk20 (ENSECRG00000007865) si:dkey-13a21.4 (ENSECRG00000007855) HCFC1 (ENSECRG00000007822) TMEM187 (ENSECRG00000007796) ENSECRG00000007782 IRAK1 (ENSECRG00000007760) mecp2 (ENSECRG00000007685) gnl3l (ENSECRG00000007644) FGD1 (ENSECRG00000007611) ENSECRG00000007589 cxxc1a (ENSECRG00000020205) ENSECRG00000020187 tfe3a (ENSECRG00000020165) ccdc120b (ENSECRG00000020130) ##22 abcd1 (ENSECRG00000020092) ENSECRG00000020026 SRPK3 (ENSECRG00000019992) opn1lw1 (ENSECRG00000019957) opn1sw2 (ENSECRG00000019604) suv39h1b (ENSECRG00000019506) ENSECRG00000019467 gpr173 (ENSECRG00000019448) ENSECRG00000019430 ENSECRG00000019376 ccdc22 (ENSECRG00000019320) ENSECRG00000019275 wasb (ENSECRG00000019242) tspy (ENSECRG00000019185) sema3ga (ENSECRG00000019132) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 374 ENSGT00990000210258 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000157503 ENSGT00940000154102.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g Spotted gar MODERN SPECIES 647 gata1a (ENSLOCG00000014759) cdk20 (ENSLOCG00000014752) si:dkey-13a21.4 (ENSLOCG00000014749) HCFC1 (ENSLOCG00000014733) TMEM187 (ENSLOCG00000017979) IRAK1 (ENSLOCG00000014730) mecp2 (ENSLOCG00000014725) opn1sw2 (ENSLOCG00000014721) opn1lw1 (ENSLOCG00000014714) ENSLOCG00000014710 gnl3l (ENSLOCG00000014702) FGD1 (ENSLOCG00000014698) tfe3a (ENSLOCG00000014691) zgc:113363 (ENSLOCG00000014689) cxxc1a (ENSLOCG00000014684) ENSLOCG00000014682 ##22 abcd1 (ENSLOCG00000014676) PLXNB3 (ENSLOCG00000014660) SRPK3 (ENSLOCG00000014658) ENSLOCG00000014656 IQSEC2 (ENSLOCG00000014645) ENSLOCG00000014644 ENSLOCG00000014641 ENSLOCG00000014638 idh3g (ENSLOCG00000014632) plxna3 (ENSLOCG00000014612) PNCK (ENSLOCG00000014603) slc6a8 (ENSLOCG00000014590) bcap31 (ENSLOCG00000014585) slc35a2 (ENSLOCG00000014583) pim2 (ENSLOCG00000014577) Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 356 ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000167532 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00390000003348 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000157503.i.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 257 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000159809 ENSGT00390000001799 ENSGT00940000155569.a.a ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.b ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158963.b.a ENSGT00940000154102.a.h #22 ENSGT01050000244888.a.b #21 ENSGT00940000160300.b.b ENSGT00940000158083.b ENSGT00940000157665.b ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00390000001509.a ENSGT00950000182903.b.a.z ENSGT00940000166327 ENSGT00500000044947 ENSGT00950000182834.C Denticle herring MODERN SPECIES 3 ENSDCDG00000015409 uroc1 (ENSDCDG00000015360) arl8bb (ENSDCDG00000015351) ENSDCDG00000015348 SEMA3F (ENSDCDG00000021551) camkvb (ENSDCDG00000021439) ENSDCDG00000021427 mon1a (ENSDCDG00000021422) ENSDCDG00000021417 ENSDCDG00000021412 nelfcd (ENSDCDG00000021242) ctsz (ENSDCDG00000021228) npepl1 (ENSDCDG00000021220) STX16 (ENSDCDG00000021217) mbd1b (ENSDCDG00000021207) ccdc120b (ENSDCDG00000021198) ##22 SRPK3 (ENSDCDG00000021100) comtb (ENSDCDG00000021086) grm6b (ENSDCDG00000020548) otud5b (ENSDCDG00000020507) inavab (ENSDCDG00000020505) #22 GPR25 (ENSDCDG00000020501) #21 ENSDCDG00000020498 olfml3b (ENSDCDG00000020495) SYT6 (ENSDCDG00000020492) PLEKHG5 (ENSDCDG00000020321) mxra8a (ENSDCDG00000020313) dvl1b (ENSDCDG00000020176) utp3 (ENSDCDG00000020147) ppcs (ENSDCDG00000020135) foxj3 (ENSDCDG00000020106) Atlantic herring MODERN SPECIES 21 uroc1 (ENSCHAG00000001574) ENSCHAG00000002190 SEMA3F (ENSCHAG00000002507) camkvb (ENSCHAG00000008371) ENSCHAG00000008556 ENSCHAG00000008627 mon1a (ENSCHAG00000008722) ENSCHAG00000008726 ENSCHAG00000008741 nelfcd (ENSCHAG00000008753) ctsz (ENSCHAG00000009119) ENSCHAG00000009200 npepl1 (ENSCHAG00000009212) STX16 (ENSCHAG00000009836) mbd1b (ENSCHAG00000009904) ccdc120b (ENSCHAG00000009963) ##22 ENSCHAG00000010017 ENSCHAG00000011442 grm6b (ENSCHAG00000011535) otud5b (ENSCHAG00000011755) inavab (ENSCHAG00000011825) #22 ENSCHAG00000011837 GPR25 (ENSCHAG00000011855) #21 ENSCHAG00000011879 olfml3b (ENSCHAG00000011888) ENSCHAG00000011906 ENSCHAG00000011913 ENSCHAG00000011957 mxra8a (ENSCHAG00000012742) ENSCHAG00000012766 ENSCHAG00000012774 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 303 ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158963.b.a ENSGT00390000006665.b.g ENSGT00940000155056.b ENSGT00940000163942.a ENSGT00940000158374.d ENSGT00940000166894 ENSGT00390000009278.a ENSGT00940000154570.a.a ENSGT00940000159410 ENSGT00940000165157 ENSGT00950000182834.C ENSGT00500000044947 ENSGT00940000160611 ENSGT00940000162210 Channel catfish MODERN SPECIES 13 ENSIPUG00000014816 myg1 (ENSIPUG00000014822) timm17a (ENSIPUG00000014845) LMOD1 (ENSIPUG00000014866) shisa4 (ENSIPUG00000014876) Ipo9 (ENSIPUG00000014896) kdm5ba (ENSIPUG00000015005) rabif (ENSIPUG00000015172) inavab (ENSIPUG00000015200) #22 ENSIPUG00000015222 olfml3 (ENSIPUG00000015231) ENSIPUG00000015243 cxxc1b (ENSIPUG00000015280) MON1B (ENSIPUG00000015318) BRPF3 (ENSIPUG00000015329) ccdc120b (ENSIPUG00000015381) ##22 ENSIPUG00000015425 gnl3l (ENSIPUG00000015441) opn1lw1 (ENSIPUG00000015456) eif4g1a (ENSIPUG00000015470) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 214 ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158963.b.a ENSGT00390000006665.b.g ENSGT00940000155056.b ENSGT00940000163942.a ENSGT00940000158374.d Red-bellied piranha MODERN SPECIES 622 mbd1b (ENSPNAG00000018075) ccdc120b (ENSPNAG00000018137) ##22 comtb (ENSPNAG00000018256) grm6b (ENSPNAG00000018295) otud5b (ENSPNAG00000018357) MON1B (ENSPNAG00000018371) BRPF3 (ENSPNAG00000018439) ENSPNAG00000018493 PLCH2 (ENSPNAG00000018519) Mexicana tetra MODERN SPECIES 14 ephb2b (ENSAMXG00000006326) fam83d (ENSAMXG00000036827) adnpa (ENSAMXG00000006355) gata1a (ENSAMXG00000040272) si:dkey-13a21.4 (ENSAMXG00000032663) opn1sw2 (ENSAMXG00000037260) opn1lw1 (ENSAMXG00000006368) gnl3l (ENSAMXG00000006376) tfe3b (ENSAMXG00000020781) cxxc1b (ENSAMXG00000006383) ccdc120b (ENSAMXG00000042805) ##22 grm6b (ENSAMXG00000006398) MON1B (ENSAMXG00000006415) BRPF3 (ENSAMXG00000041882) ENSAMXG00000031120 PLCH2 (ENSAMXG00000006425) ENSAMXG00000024789 LACTBL1 (ENSAMXG00000004600) ENSAMXG00000043590 ENSAMXG00000029622 smarcd1 (ENSAMXG00000004577) gpd1b (ENSAMXG00000029979) cers5 (ENSAMXG00000004553) ENSAMXG00000025806 BCDIN3D (ENSAMXG00000004546) ENSAMXG00000038993 Electric eel MODERN SPECIES 17 yod1 (ENSEEEG00000012711) zgc:158258 (ENSEEEG00000012714) ENSEEEG00000012723 sh2d5 (ENSEEEG00000012730) hp1bp3 (ENSEEEG00000012732) ENSEEEG00000012734 ENSEEEG00000012736 ENSEEEG00000012739 pdrg1 (ENSEEEG00000012746) PPP1R3D (ENSEEEG00000012747) ENSEEEG00000012749 opn1lw1 (ENSEEEG00000012760) gnl3l (ENSEEEG00000012891) tfe3b (ENSEEEG00000012904) cxxc1b (ENSEEEG00000012972) ccdc120b (ENSEEEG00000013153) ##22 ENSEEEG00000013154 EPB41L1 (ENSEEEG00000013208) KCND3 (ENSEEEG00000013250) INKA2 (ENSEEEG00000013252) ENSEEEG00000013253 rap1ab (ENSEEEG00000013259) PANK4 (ENSEEEG00000013280) draxina (ENSEEEG00000013282) agtrap (ENSEEEG00000013283) RNF207 (ENSEEEG00000013285) ENSEEEG00000013289 CHD5 (ENSEEEG00000013292) ARHGEF10L (ENSEEEG00000013300) ENSEEEG00000013303 igsf21a (ENSEEEG00000013304) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000161531.b ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT01060000253577 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000169444 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156963.a.b ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158963.b.a ENSGT00390000006665.b.g ENSGT00940000155056.b ENSGT00940000163942.a ENSGT00940000158374.d Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155006.e.a.e ENSGT00950000182893.a.a.b.b.a ENSGT00940000158405.f ENSGT00940000161531.b.b ENSGT00940000164411.a ENSGT00530000063631.b.n.a.b ENSGT00940000166313.a.b ENSGT00940000166196.e ENSGT00940000164702.b.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.b.fb ENSGT00940000155877.a ENSGT00940000157503.i.b.a ENSGT00940000166392.b ENSGT00950000183005.a.a.e ENSGT00940000154102.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000155317.a.a.j.b ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000158963.b.a.b ENSGT00390000006665.b.g.a ENSGT00940000155056.b.b ENSGT00940000163942.a.a ENSGT00940000158374.d.b ENSGT00940000166894.b ENSGT00390000009278.a.a ENSGT00940000154570.a.a.d ENSGT00940000159410.p ENSGT00940000165157.cb ENSGT00950000182834.C.b ENSGT00500000044947 ENSGT00940000160611.m Goldfish MODERN SPECIES 2 top1a (ENSCARG00000011328) ENSCARG00000011309 fam83d (ENSCARG00000011289) mafbb (ENSCARG00000011282) ENSCARG00000011231 adnpa (ENSCARG00000011224) gata1a (ENSCARG00000011209) si:dkey-13a21.4 (ENSCARG00000011198) hcfc1a (ENSCARG00000010684) opn1sw2 (ENSCARG00000010620) ENSCARG00000010595 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ENSGT00940000155317.a.a.j.b ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000158963.b.a.b ENSGT00390000006665.b.g.a ENSGT00940000155056.b.b ENSGT00940000163942.a.a ENSGT00940000158374.d.b ENSGT00940000166894.b ENSGT00390000009278.a.a ENSGT00940000154570.a.a.d ENSGT00940000159410.p ENSGT00940000165157.cb ENSGT00950000182834.C.b ENSGT00500000044947 ENSGT00940000160611.m Common carp reference MODERN SPECIES 13 ENSCCRG00000043281 top1a (ENSCCRG00000043096) ENSCCRG00000043267 fam83d (ENSCCRG00000043259) mafbb (ENSCCRG00000071188) ENSCCRG00000062076 adnpa (ENSCCRG00000067055) gata1a (ENSCCRG00000005129) si:dkey-13a21.4 (ENSCCRG00000005132) hcfc1a (ENSCCRG00000018417) ENSCCRG00000034762 gnl3l (ENSCCRG00000034764) tfe3b (ENSCCRG00000042182) cxxc1b (ENSCCRG00000040395) mbd1b (ENSCCRG00000040434) ccdc120b (ENSCCRG00000041901) ##22 comtb (ENSCCRG00000058467) grm6b (ENSCCRG00000039534) otud5b (ENSCCRG00000055331) ENSCCRG00000040483 ENSCCRG00000056706 ENSCCRG00000082610 ENSCCRG00000039484 skib 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rbm12 (ENSSGRG00000053282) cpne1 (ENSSGRG00000053287) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT00950000182893.a.a.b.b.b ENSGT00940000158405.e ENSGT00940000161531.b.a ENSGT00940000164411.b ENSGT00530000063631.b.n.a.a ENSGT00940000166313.a.a ENSGT00940000166196.f ENSGT00940000164702.b.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b.gb ENSGT00940000155877.b ENSGT00940000157503.i.b.b ENSGT01060000253577 ENSGT00940000166392.a ENSGT00950000183005.a.a.f ENSGT00940000154102.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000155317.a.a.j.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.b ENSGT00940000158963.b.a.a ENSGT00390000006665.b.g.b ENSGT00940000155056.b.a ENSGT00940000163942.a.b ENSGT00940000158374.d.a ENSGT00940000166894.a ENSGT00390000009278.a.b ENSGT00940000154570.a.a.c ENSGT00940000159410.o ENSGT00940000165157.db ENSGT00950000182834.C.a ENSGT00940000160611.n ENSGT00940000162210.a Goldfish MODERN SPECIES 142 snai1a (ENSCARG00000035323) tp53inp2 (ENSCARG00000035332) ENSCARG00000035337 top1a (ENSCARG00000035362) 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comtb (ENSCCRG00000055844) grm6b (ENSCCRG00000040460) otud5b (ENSCCRG00000039550) ENSCCRG00000039580 ENSCCRG00000039624 ENSCCRG00000066958 ENSCCRG00000040353 skib (ENSCCRG00000055470) kaznb (ENSCCRG00000048175) ENSCCRG00000002530 foxj3 (ENSCCRG00000002519) ppcs (ENSCCRG00000007743) rbm12 (ENSCCRG00000052976) cpne1 (ENSCCRG00000029688) ENSCCRG00000029635 Golden-line barbel MODERN SPECIES 1 snai1a (ENSSGRG00000030274) tp53inp2 (ENSSGRG00000030273) top1a (ENSSGRG00000029390) fam83d (ENSSGRG00000029370) mafbb (ENSSGRG00000029369) ENSSGRG00000029368 ENSSGRG00000029367 si:dkey-13a21.4 (ENSSGRG00000029365) hcfc1a (ENSSGRG00000028465) opn1sw2 (ENSSGRG00000028454) LWS1 (ENSSGRG00000028050) gnl3l (ENSSGRG00000028038) tfe3b (ENSSGRG00000028032) cxxc1b (ENSSGRG00000027621) mbd1b (ENSSGRG00000027615) ccdc120b (ENSSGRG00000027614) ##22 comtb (ENSSGRG00000027613) grm6b (ENSSGRG00000027612) otud5b (ENSSGRG00000027407) ENSSGRG00000027405 BRPF3 (ENSSGRG00000027403) ENSSGRG00000027402 ENSSGRG00000027280 skib (ENSSGRG00000027272) tmem51b (ENSSGRG00000027271) ENSSGRG00000027270 kaznb (ENSSGRG00000027269) Zebrafish MODERN SPECIES 2 fam83d (ENSDARG00000077883) mafbb (ENSDARG00000070542) ENSDARG00000070541 adnpa (ENSDARG00000062002) gata1a (ENSDARG00000013477) si:dkey-13a21.4 (ENSDARG00000026098) hcfc1a (ENSDARG00000015990) opn1sw2 (ENSDARG00000017274) opn1lw1 (ENSDARG00000044862) opn1lw2 (ENSDARG00000044861) gnl3l (ENSDARG00000020595) tfe3b (ENSDARG00000019457) si:dkey-245f22.3 (ENSDARG00000097510) cxxc1b (ENSDARG00000025718) mbd1b (ENSDARG00000025699) ccdc120b (ENSDARG00000032856) ##22 comtb (ENSDARG00000025679) grm6b (ENSDARG00000025671) otud5b (ENSDARG00000056840) MON1B (ENSDARG00000077434) BRPF3 (ENSDARG00000070513) ENSDARG00000070511 PLCH2 (ENSDARG00000056805) skib (ENSDARG00000008034) tmem51b (ENSDARG00000061916) kaznb (ENSDARG00000006601) PRDM2 (ENSDARG00000076451) foxj3 (ENSDARG00000075774) ppcs (ENSDARG00000061889) utp3 (ENSDARG00000056720) cpne1 (ENSDARG00000075536) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000177280 ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d ENSGT01050000244882.b.c.a.a Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000177280 ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000177280 ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 fam83d (ENSMMDG00005007889) MAFB (ENSMMDG00005007892) ENSMMDG00005007895 adnpa (ENSMMDG00005007898) BCL2L1 (ENSMMDG00005007904) gata1a (ENSMMDG00005007905) si:dkey-13a21.4 (ENSMMDG00005007907) hcfc1a (ENSMMDG00005007918) opn1sw2 (ENSMMDG00005007982) opn1sw2 (ENSMMDG00005008017) opn1lw1 (ENSMMDG00005008024) gnl3l (ENSMMDG00005008026) tfe3b (ENSMMDG00005008031) cxxc1b (ENSMMDG00005008061) mbd1b (ENSMMDG00005008899) ccdc120b (ENSMMDG00005008902) ##22 SRPK3 (ENSMMDG00005008906) comtb (ENSMMDG00005008931) grm6b (ENSMMDG00005008936) traip (ENSMMDG00005008941) mon1a (ENSMMDG00005008952) ENSMMDG00005008960 camkvb (ENSMMDG00005008983) SEMA3F (ENSMMDG00005008991) arl8bb (ENSMMDG00005008996) NAAA (ENSMMDG00005009008) bhlhe40 (ENSMMDG00005009011) ITPR1 (ENSMMDG00005009020) ENSMMDG00005009072 setmar (ENSMMDG00005009073) lrrn1 (ENSMMDG00005009074) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000177280 ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 280 fam83d (ENSHCOG00000003731) MAFB (ENSHCOG00000003739) adnpa (ENSHCOG00000003771) ENSHCOG00000003780 gata1a (ENSHCOG00000003808) HCFC1 (ENSHCOG00000003837) opn1sw2 (ENSHCOG00000005841) opn1sw2 (ENSHCOG00000006937) opn1sw2 (ENSHCOG00000007007) ENSHCOG00000008361 ENSHCOG00000009761 gnl3l (ENSHCOG00000009877) tfe3b (ENSHCOG00000009907) cxxc1b (ENSHCOG00000009945) mbd1b (ENSHCOG00000009952) ccdc120b (ENSHCOG00000000314) ##22 SRPK3 (ENSHCOG00000009982) comtb (ENSHCOG00000010157) grm6b (ENSHCOG00000010199) traip (ENSHCOG00000010255) mon1a (ENSHCOG00000010263) ENSHCOG00000010321 camkvb (ENSHCOG00000010400) SEMA3F (ENSHCOG00000010442) arl8bb (ENSHCOG00000010468) ENSHCOG00000010474 bhlhe40 (ENSHCOG00000010486) ENSHCOG00000000326 ITPR1 (ENSHCOG00000010574) ENSHCOG00000010596 setmar (ENSHCOG00000010603) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063631.b.n.a 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ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000181580 ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000177280 ENSGT00940000162663 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000177280 ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d Mangrove rivulus MODERN SPECIES 139 fam83d (ENSKMAG00000021120) MAFB (ENSKMAG00000021111) ENSKMAG00000021087 adnpa (ENSKMAG00000021072) BCL2L1 (ENSKMAG00000021065) gata1a (ENSKMAG00000021051) si:dkey-13a21.4 (ENSKMAG00000021039) hcfc1a (ENSKMAG00000020984) opn1sw2 (ENSKMAG00000020951) opn1lw1 (ENSKMAG00000020908) gnl3l (ENSKMAG00000020874) tfe3b (ENSKMAG00000020858) ENSKMAG00000020845 cxxc1b (ENSKMAG00000020802) mbd1b (ENSKMAG00000020760) ccdc120b (ENSKMAG00000020721) ##22 SRPK3 (ENSKMAG00000020698) ENSKMAG00000020685 comtb (ENSKMAG00000020662) grm6b (ENSKMAG00000020636) traip (ENSKMAG00000020606) mon1a (ENSKMAG00000020581) ENSKMAG00000020521 camkvb (ENSKMAG00000020494) SEMA3F (ENSKMAG00000020412) arl8bb (ENSKMAG00000020329) ENSKMAG00000020310 bhlhe40 (ENSKMAG00000020298) ITPR1 (ENSKMAG00000020220) setmar (ENSKMAG00000020186) lrrn1 (ENSKMAG00000020176) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1619 FAM83D (ENSNFUG00015015187) MAFBB (ENSNFUG00015015180) adnpa (ENSNFUG00015015148) BCL2L1 (ENSNFUG00015015141) GATA1A (ENSNFUG00015015117) si:dkey-13a21.4 (ENSNFUG00015015097) HCFC1 (ENSNFUG00015014937) opn1sw2 (ENSNFUG00015014885) opn1sw2 (ENSNFUG00015014824) ENSNFUG00015014685 Nfu_g_1_021486 (ENSNFUG00015014616) GNL3L (ENSNFUG00015014553) tfe3b (ENSNFUG00015014314) CXXC1 (ENSNFUG00015014008) ENSNFUG00015013989 CCDC120 (ENSNFUG00015013984) ##22 SRPK3 (ENSNFUG00015013920) COMTB (ENSNFUG00015013912) grm6b (ENSNFUG00015013210) TRAIP (ENSNFUG00015013172) MON1A (ENSNFUG00015013166) ENSNFUG00015013156 ITGA5 (ENSNFUG00015013119) BIN2B (ENSNFUG00015013099) TXNRD1 (ENSNFUG00015010795) CHST13 (ENSNFUG00015010692) SLC41A3 (ENSNFUG00015010690) ENSNFUG00015010685 ENSNFUG00015010670 acot8 (ENSNFUG00015010580) IFT52 (ENSNFUG00015019857) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A.l ENSGT00530000063548.A.k ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411.f ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b.s ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A.l ENSGT00530000063548.A.k ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d Mummichog MODERN SPECIES 313 tfe3b (ENSFHEG00000020182) cxxc1b (ENSFHEG00000020144) mbd1b (ENSFHEG00000020120) ccdc120b (ENSFHEG00000020101) ##22 ENSFHEG00000020017 comtb (ENSFHEG00000020002) grm6b (ENSFHEG00000019995) traip (ENSFHEG00000019960) mon1a (ENSFHEG00000019845) ENSFHEG00000019818 camkvb (ENSFHEG00000019743) SEMA3F (ENSFHEG00000019657) ENSFHEG00000019608 arl8bb (ENSFHEG00000019579) ENSFHEG00000019555 NAAA (ENSFHEG00000019547) bhlhe40 (ENSFHEG00000019542) ITPR1 (ENSFHEG00000019522) setmar (ENSFHEG00000019347) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 141 ENSCVAG00000001145 adnpa (ENSCVAG00000001146) BCL2L1 (ENSCVAG00000001147) gata1a (ENSCVAG00000001149) si:dkey-13a21.4 (ENSCVAG00000001150) 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snai1a (ENSCSEG00000009739) myh7ba (ENSCSEG00000009595) trpc4apa (ENSCSEG00000009550) ENSCSEG00000009539 ndrg3a (ENSCSEG00000009496) ENSCSEG00000009421 arhgap46a (ENSCSEG00000009402) sulf2a (ENSCSEG00000009315) id1 (ENSCSEG00000009288) NCOA3 (ENSCSEG00000009220) cxxc1b (ENSCSEG00000009093) ENSCSEG00000009082 ccdc120b (ENSCSEG00000009074) ##22 dnali1 (ENSCSEG00000009037) txnrd3 (ENSCSEG00000008988) CHST13 (ENSCSEG00000008981) ENSCSEG00000008922 phactr3b (ENSCSEG00000008904) acot8 (ENSCSEG00000008882) ift52 (ENSCSEG00000008846) mybl2b (ENSCSEG00000008826) rpn2 (ENSCSEG00000008798) ghrh (ENSCSEG00000008769) cdk5rap1 (ENSCSEG00000008739) ENSCSEG00000008691 ENSCSEG00000008669 ENSCSEG00000008660 FRMD4B (ENSCSEG00000008619) Turbot MODERN SPECIES 18 fam83d (ENSSMAG00000013878) ENSSMAG00000013891 ENSSMAG00000013903 ENSSMAG00000013917 ENSSMAG00000028451 gata1a (ENSSMAG00000013930) si:dkey-13a21.4 (ENSSMAG00000013945) hcfc1a (ENSSMAG00000013953) opn1sw2 (ENSSMAG00000014006) opn1sw2 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ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000181580 ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d Zig-zag eel MODERN SPECIES 19 ENSMAMG00000021047 ENSMAMG00000027960 ENSMAMG00000024557 gata1a (ENSMAMG00000021092) si:dkey-13a21.4 (ENSMAMG00000021095) hcfc1a (ENSMAMG00000021100) opn1sw2 (ENSMAMG00000026245) opn1sw2 (ENSMAMG00000021134) ENSMAMG00000022442 ENSMAMG00000022455 gnl3l (ENSMAMG00000023332) tfe3b (ENSMAMG00000023336) ENSMAMG00000023337 cxxc1b (ENSMAMG00000023339) ENSMAMG00000027411 ccdc120b (ENSMAMG00000024568) ##22 ENSMAMG00000023345 comtb (ENSMAMG00000023349) grm6b (ENSMAMG00000023356) mon1a (ENSMAMG00000023358) traip (ENSMAMG00000023357) ENSMAMG00000023360 camkvb (ENSMAMG00000023367) ENSMAMG00000023374 arl8bb (ENSMAMG00000027917) ENSMAMG00000023382 ENSMAMG00000023384 bhlhe40 (ENSMAMG00000023386) ENSMAMG00000024536 ITPR1 (ENSMAMG00000023390) setmar (ENSMAMG00000023395) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d ENSGT01050000244882.b.c.a.a Siamese fighting fish MODERN SPECIES 16 fam83d (ENSBSLG00000023822) MAFB (ENSBSLG00000023841) ENSBSLG00000023864 adnpa (ENSBSLG00000023899) BCL2L1 (ENSBSLG00000023910) gata1a (ENSBSLG00000023916) si:dkey-13a21.4 (ENSBSLG00000007864) hcfc1a (ENSBSLG00000007920) opn1sw2 (ENSBSLG00000008108) opn1sw2 (ENSBSLG00000008155) opn1lw1 (ENSBSLG00000008207) gnl3l (ENSBSLG00000008417) tfe3b (ENSBSLG00000008528) cxxc1b (ENSBSLG00000008835) mbd1b (ENSBSLG00000009328) ccdc120b (ENSBSLG00000009387) ##22 SRPK3 (ENSBSLG00000009779) comtb (ENSBSLG00000010327) grm6b (ENSBSLG00000010337) traip (ENSBSLG00000010544) mon1a (ENSBSLG00000010555) ENSBSLG00000010560 camkvb (ENSBSLG00000010678) SEMA3F (ENSBSLG00000010913) arl8bb (ENSBSLG00000013136) NAAA (ENSBSLG00000013286) bhlhe40 (ENSBSLG00000013372) ITPR1 (ENSBSLG00000013775) setmar (ENSBSLG00000020708) lrrn1 (ENSBSLG00000020709) ENSBSLG00000020712 Climbing perch MODERN SPECIES 18 fam83d (ENSATEG00000015038) ENSATEG00000029851 adnpa (ENSATEG00000015001) ENSATEG00000014989 gata1a 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ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a 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(ENSTNIG00000007342) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d Ballan wrasse MODERN SPECIES 61 ENSLBEG00000017950 fam83d (ENSLBEG00000017964) MAFB (ENSLBEG00000017971) ENSLBEG00000017986 adnpa (ENSLBEG00000018017) BCL2L1 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ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a 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ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d ENSGT01050000244882.b.c.a.a European seabass MODERN SPECIES 10 fam83d (ENSDLAG00005025742) ENSDLAG00005025739 MAFB (ENSDLAG00005029273) adnpa (ENSDLAG00005025737) ENSDLAG00005025736 gata1a (ENSDLAG00005025735) RAB7A (ENSDLAG00005031533) hcfc1a (ENSDLAG00005025731) opn1sw2 (ENSDLAG00005025729) opn1sw2 (ENSDLAG00005025726) opn1lw1 (ENSDLAG00005025724) gnl3l (ENSDLAG00005025705) tfe3b (ENSDLAG00005025703) ENSDLAG00005025682 mbd1b (ENSDLAG00005025679) ccdc120b (ENSDLAG00005025677) ##22 ENSDLAG00005025559 grm6b (ENSDLAG00005025480) traip (ENSDLAG00005025462) ENSDLAG00005025454 CAMKV (ENSDLAG00005025437) ENSDLAG00005025304 ARL8B (ENSDLAG00005034963) ENSDLAG00005025286 bhlhe40 (ENSDLAG00005025285) ITPR1 (ENSDLAG00005024685) setmar (ENSDLAG00005032118) LRRN1 (ENSDLAG00005032471) trnt1 (ENSDLAG00005026509) arl6ip5a (ENSDLAG00005024563) FRMD4B (ENSDLAG00005024483) Large yellow croaker MODERN SPECIES 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si:dkey-13a21.4 (ENSSAUG00010014358) hcfc1a (ENSSAUG00010014373) opn1sw2 (ENSSAUG00010014432) opn1sw2 (ENSSAUG00010014437) opn1lw1 (ENSSAUG00010014442) gnl3l (ENSSAUG00010014448) tfe3b (ENSSAUG00010014478) cxxc1b (ENSSAUG00010014492) mbd1b (ENSSAUG00010014539) ccdc120b (ENSSAUG00010014546) ##22 SRPK3 (ENSSAUG00010014567) comtb (ENSSAUG00010017170) grm6b (ENSSAUG00010017188) traip (ENSSAUG00010017395) mon1a (ENSSAUG00010017406) ENSSAUG00010017412 camkvb (ENSSAUG00010017420) SEMA3F (ENSSAUG00010017498) arl8bb (ENSSAUG00010018930) ENSSAUG00010018932 bhlhe40 (ENSSAUG00010018934) ITPR1 (ENSSAUG00010018947) setmar (ENSSAUG00010020167) lrrn1 (ENSSAUG00010020168) ENSSAUG00010020169 Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000181969 ENSGT00940000166392 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d ENSGT01050000244882.b.c.a.a Lumpfish MODERN SPECIES 20 MAFB (ENSCLMG00005013128) ENSCLMG00005013112 ENSCLMG00005013109 BCL2L1 (ENSCLMG00005013107) gata1a (ENSCLMG00005013105) si:dkey-13a21.4 (ENSCLMG00005013104) HCFC1 (ENSCLMG00005012898) opn1sw2 (ENSCLMG00005012893) opn1sw2 (ENSCLMG00005012891) opn1lw1 (ENSCLMG00005012888) gnl3l (ENSCLMG00005012879) tfe3b (ENSCLMG00005012790) ENSCLMG00005012788 cxxc1b (ENSCLMG00005012498) ENSCLMG00005012492 ccdc120b (ENSCLMG00005012490) ##22 ENSCLMG00005012489 ENSCLMG00005012487 SRPK3 (ENSCLMG00005012486) comtb (ENSCLMG00005012436) grm6b (ENSCLMG00005012426) traip (ENSCLMG00005012422) mon1a (ENSCLMG00005012421) ENSCLMG00005012418 camkvb (ENSCLMG00005012417) SEMA3F (ENSCLMG00005012021) arl8bb (ENSCLMG00005012010) NAAA (ENSCLMG00005012008) ENSCLMG00005012006 tpra1 (ENSCLMG00005011990) ENSCLMG00005011985 Stickleback MODERN SPECIES 17 gnat1 (ENSGACG00000012301) edem1 (ENSGACG00000012289) arl8ba (ENSGACG00000012267) ENSGACG00000012265 ddi2 (ENSGACG00000012259) cplane2 (ENSGACG00000012256) epha2a (ENSGACG00000012225) H6PD (ENSGACG00000012197) cenps (ENSGACG00000012180) tardbpb (ENSGACG00000012164) gnb1b (ENSGACG00000012145) cxxc1b (ENSGACG00000012117) ENSGACG00000012106 ccdc120b (ENSGACG00000012102) ##22 SRPK3 (ENSGACG00000012098) comtb (ENSGACG00000012090) grm6b (ENSGACG00000012070) traip (ENSGACG00000012044) mon1a (ENSGACG00000012037) ENSGACG00000012007 camkvb (ENSGACG00000011998) SEMA3F (ENSGACG00000011989) arl8bb (ENSGACG00000011972) NAAA (ENSGACG00000011964) ENSGACG00000011962 bhlhe40 (ENSGACG00000011940) ITPR1 (ENSGACG00000011921) setmar (ENSGACG00000011919) lrrn1 (ENSGACG00000011915) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d Channel bull blenny MODERN SPECIES 19 ENSCGOG00000001432 MAFB (ENSCGOG00000001430) adnpa (ENSCGOG00000001427) BCL2L1 (ENSCGOG00000001425) gata1a (ENSCGOG00000001418) si:dkey-13a21.4 (ENSCGOG00000001417) hcfc1a (ENSCGOG00000001124) opn1sw2 (ENSCGOG00000001101) opn1sw2 (ENSCGOG00000001089) opn1lw1 (ENSCGOG00000001051) gnl3l (ENSCGOG00000001042) tfe3b (ENSCGOG00000001023) cxxc1a (ENSCGOG00000000995) ENSCGOG00000000992 ENSCGOG00000000965 ccdc120b (ENSCGOG00000000963) ##22 SRPK3 (ENSCGOG00000000936) comtb (ENSCGOG00000000932) grm6b (ENSCGOG00000000769) traip (ENSCGOG00000000727) mon1a (ENSCGOG00000000725) ENSCGOG00000000720 camkvb (ENSCGOG00000000660) SEMA3F (ENSCGOG00000000535) arl8bb (ENSCGOG00000023683) NAAA (ENSCGOG00000023679) bhlhe40 (ENSCGOG00000023677) ENSCGOG00000023674 ITPR1 (ENSCGOG00000021328) setmar (ENSCGOG00000021226) lrrn1 (ENSCGOG00000021224) Pike perch MODERN SPECIES 11 ENSSLUG00000021816 adnpa (ENSSLUG00000021822) BCL2L1 (ENSSLUG00000021825) gata1a (ENSSLUG00000021830) si:dkey-13a21.4 (ENSSLUG00000021834) hcfc1a (ENSSLUG00000021854) opn1sw2 (ENSSLUG00000021888) ENSSLUG00000021893 ENSSLUG00000021896 ENSSLUG00000021899 ENSSLUG00000021917 gnl3l (ENSSLUG00000021972) tfe3b (ENSSLUG00000022004) CXXC1 (ENSSLUG00000022049) mbd1b (ENSSLUG00000022140) ccdc120b (ENSSLUG00000022153) ##22 SRPK3 (ENSSLUG00000022192) comtb (ENSSLUG00000022361) grm6b (ENSSLUG00000022374) traip (ENSSLUG00000022387) mon1a (ENSSLUG00000022403) ENSSLUG00000022410 camkvb (ENSSLUG00000005084) SEMA3F (ENSSLUG00000005295) arl8bb (ENSSLUG00000007380) NAAA (ENSSLUG00000007391) bhlhe40 (ENSSLUG00000007397) ITPR1 (ENSSLUG00000007574) setmar (ENSSLUG00000010262) lrrn1 (ENSSLUG00000010263) ENSSLUG00000010265 Cod MODERN SPECIES 4 ENSGMOG00000017894 fam83d (ENSGMOG00000025512) ENSGMOG00000033843 ENSGMOG00000017945 adnpa (ENSGMOG00000036285) ENSGMOG00000025656 gata1a (ENSGMOG00000029187) si:dkey-13a21.4 (ENSGMOG00000024459) ENSGMOG00000018011 opn1sw2 (ENSGMOG00000018045) opn1sw2 (ENSGMOG00000018054) gnl3l (ENSGMOG00000018085) tfe3b (ENSGMOG00000018115) cxxc1b (ENSGMOG00000002734) ENSGMOG00000036759 ccdc120b (ENSGMOG00000029914) ##22 ENSGMOG00000002647 ENSGMOG00000011937 ENSGMOG00000020337 ENSGMOG00000002636 grm6b (ENSGMOG00000002607) traip (ENSGMOG00000002576) mon1a (ENSGMOG00000024519) ENSGMOG00000032890 camkvb (ENSGMOG00000002479) ENSGMOG00000002430 arl8bb (ENSGMOG00000002416) ENSGMOG00000002389 bhlhe40 (ENSGMOG00000031170) ITPR1 (ENSGMOG00000002239) setmar (ENSGMOG00000034115) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158405 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000164411 ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000161383.d.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000166392.c ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00940000158384.d ENSGT00940000155071.C ENSGT00940000162663 ENSGT00940000157154.d ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00390000009678 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000018123.b.c ENSGT00940000155006.e.a.c ENSGT00950000182893.a.a.b.b.f ENSGT00940000158405.g ENSGT00940000160486.d.a ENSGT00940000164411.c ENSGT00530000063631.b.n.a.c ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.c ENSGT00940000166313.a.c ENSGT00940000161383.d.a.a 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##22 ENSGT00940000157877.b.h.g ENSGT00940000155317.a.a.q.b ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.e ENSGT00980000202247 ENSGT00390000006665.a.a ENSGT00940000157842.b.e ENSGT00940000156468.f.d ENSGT00940000156703.e.a.a ENSGT00940000154861.n.a ENSGT00940000158384.d.d ENSGT00940000155071.C.e ENSGT00940000162663.c ENSGT00940000157154.d.f ENSGT01050000244882.b.c.a.a.c ENSGT00390000009678 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00950000182893.a.a.b.b.e ENSGT00940000158405.h ENSGT00940000160486.d.b ENSGT00940000164411.d ENSGT00530000063631.b.n.a.d ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.d ENSGT00940000166313.a.d ENSGT00940000161383.d.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.a ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b.d ENSGT00940000166392.c.a ENSGT00950000183005.a.a.d ENSGT00940000154102.b.a.a.d ##22 ENSGT00940000157877.b.h.g ENSGT00940000155317.a.a.q.b ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.e ENSGT00980000202247 ENSGT00390000006665.a.a 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(ENSELUG00000004375) ccdc120b (ENSELUG00000004322) ##22 SRPK3 (ENSELUG00000001310) comtb (ENSELUG00000004237) grm6b (ENSELUG00000004228) ENSELUG00000004204 mon1a (ENSELUG00000004180) ENSELUG00000004158 ENSELUG00000033830 ENSELUG00000004107 camkvb (ENSELUG00000004070) SEMA3F (ENSELUG00000004030) arl8bb (ENSELUG00000003984) bhlhe40 (ENSELUG00000001165) ITPR1 (ENSELUG00000003888) setmar (ENSELUG00000003826) lrrn1 (ENSELUG00000003813) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00390000009278.a ENSGT00390000012058.c.b.c ENSGT00390000009368 ENSGT00940000172767 ENSGT00940000153341.l.a ENSGT01030000234571.a.b.f ENSGT00940000160408.g ENSGT00390000017213.B.b ENSGT00730000111482.a ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137.y ENSGT00940000154343.fb ENSGT00510000048007 ENSGT00940000158963.b.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ##22 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000155877 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000161383.c.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000153629.a.b.d ENSGT00940000158528 ENSGT01030000234637.b.c.h ENSGT00940000159855 ENSGT00940000166169 ENSGT00390000008631.b ENSGT00390000017780.e.ab ENSGT00950000183102.C Asian bonytongue MODERN SPECIES 14 tmem51b (ENSSFOG00015008050) efhd2 (ENSSFOG00015008084) taf10 (ENSSFOG00015008108) ENSSFOG00015008150 ybx1 (ENSSFOG00015008173) ARHGEF16 (ENSSFOG00015008185) espn (ENSSFOG00015008210) GPR153 (ENSSFOG00015008256) ENSSFOG00015008268 tas1r2.1 (ENSSFOG00015008301) RER1 (ENSSFOG00015008467) tardbpb (ENSSFOG00015008512) cenps (ENSSFOG00015026443) otud5b (ENSSFOG00015027588) ENSSFOG00015008591 ccdc120b (ENSSFOG00015008622) ##22 tfe3b (ENSSFOG00015008689) gnl3l (ENSSFOG00015008883) ENSSFOG00015008893 ENSSFOG00015008941 ENSSFOG00015032823 ENSSFOG00015009394 opn1sw2 (ENSSFOG00015009411) HCFC1 (ENSSFOG00015009466) si:dkey-13a21.4 (ENSSFOG00015009566) gata1a (ENSSFOG00015009587) PRICKLE3 (ENSSFOG00015009613) plp2b (ENSSFOG00015024717) sypb (ENSSFOG00015009670) 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ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00600000085663 ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000159128 ENSGT00940000161383.d.b ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00390000003348 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000157503.i.a ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156963.a.b ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000160485 ENSGT00390000005780.a ENSGT00390000018078 ENSGT00940000157571 ENSGT00940000165528 ENSGT00940000158963.b.b ENSGT00940000161689 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 149 ENSGT00940000158963.b.b ENSGT00940000165528 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00390000005780.a ENSGT00940000160485 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00940000161383.d.b ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000159563 ENSGT00990000203541.b ENSGT00600000085663 ENSGT00940000169444 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156963.a.b ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT00600000085663 ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000159128 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00390000003348 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000157503.i.a ENSGT00730000111044 ENSGT00940000169444 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156963.a.b ENSGT00390000002062 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000160485 ENSGT00390000005780.a ENSGT00390000018078 ENSGT00940000157571 ENSGT00940000165528 ENSGT00940000158963.b.b ENSGT00940000163427.c ENSGT00950000182827.B Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 168 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ENSOMYG00000071167 ENSOMYG00000005652 ENSOMYG00000005600 ENSOMYG00000062107 ENSOMYG00000050570 ENSOMYG00000001446 ENSOMYG00000054478 ENSOMYG00000069993 ENSOMYG00000005309 ENSOMYG00000061902 TSHB (ENSOMYG00000005878) ENSOMYG00000066198 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000006349 ENSGT00950000183062.a.b.b.b ENSGT00940000159667.a.e ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g.g.a ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000161383.d.b.a.b ENSGT00530000063687.b.b.b.q ENSGT00390000003348 ENSGT00940000159438.db.a.b ENSGT00940000157503.i.a.f ENSGT00940000158685.ib ENSGT00940000169444 ENSGT00940000154102.b.a.b.a ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b.e ENSGT00940000161969.q ENSGT00940000165571 ENSGT00940000165405.i.a.c ENSGT00940000158152.a.b ENSGT00940000157504.c.a.c ENSGT00390000007725.A.b.d.g ENSGT00390000010372.p ENSGT00940000158688.c.d.a ENSGT00940000159534.e.d ENSGT00550000074828.b.f ENSGT00940000162211 ENSGT00940000157365 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ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b.e ENSGT00940000161969.q ENSGT00940000159748 ENSGT00940000160369.l.a ENSGT00950000182945.b.a.a.a.b.b.c.a ENSGT00940000165571 ENSGT00940000165405.i.a ENSGT00940000165541.e.b ENSGT00940000165158.a.a ENSGT00940000158152.a.b ENSGT00940000157504.c.a.c ENSGT00390000007725.A.b.d.g ENSGT00390000010372.p ENSGT00940000158688.c.d.a River trout MODERN SPECIES 20 ENSSTUG00000010855 ENSSTUG00000010803 sypa (ENSSTUG00000010775) ENSSTUG00000010770 ENSSTUG00000010493 cdk20 (ENSSTUG00000010459) hcfc1b (ENSSTUG00000010191) mecp2 (ENSSTUG00000010178) ENSSTUG00000010152 FGD1 (ENSSTUG00000009868) tfe3a (ENSSTUG00000009833) ENSSTUG00000009827 zgc:113363 (ENSSTUG00000009818) ENSSTUG00000009814 ENSSTUG00000009737 ENSSTUG00000009695 ##22 abcd1 (ENSSTUG00000009273) ENSSTUG00000008731 tktb (ENSSTUG00000007986) lrrc23 (ENSSTUG00000007951) ENSSTUG00000007936 rhoac (ENSSTUG00000007921) arhgef3l (ENSSTUG00000007901) uba1 (ENSSTUG00000006950) ENSSTUG00000006927 ENSSTUG00000006900 ENSSTUG00000006887 ENSSTUG00000006878 TSHB (ENSSTUG00000006861) ENSSTUG00000006859 ENSSTUG00000006854 Atlantic salmon MODERN SPECIES 6 ENSSSAG00000085576 syp (ENSSSAG00000047322) ENSSSAG00000047337 ENSSSAG00000046878 ENSSSAG00000046839 ENSSSAG00000046394 mecp2 (ENSSSAG00000046352) ENSSSAG00000046323 ENSSSAG00000085513 ENSSSAG00000116135 tfe3a (ENSSSAG00000056524) ENSSSAG00000084733 zgc:113363 (ENSSSAG00000081927) ENSSSAG00000106351 ENSSSAG00000048105 ENSSSAG00000048040 ##22 abcd1 (ENSSSAG00000047976) ENSSSAG00000106860 ENSSSAG00000095322 ENSSSAG00000048260 ENSSSAG00000048162 ENSSSAG00000118767 ENSSSAG00000108197 ENSSSAG00000116020 arhgef3l (ENSSSAG00000083682) ENSSSAG00000095191 ENSSSAG00000097310 ENSSSAG00000095161 ENSSSAG00000097464 ENSSSAG00000101085 ENSSSAG00000039599 Huchen MODERN SPECIES 6925 ENSHHUG00000011674 ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154102.b.a.b.b ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154102.b.a.b.b ##22 Salmo ANCESTRAL 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ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159128 ENSGT00940000170958 ENSGT01070000253760.b.a.a.a.a.b.b.k.b.a.a.a ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 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ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ENSGT01070000253766.B.f.a ENSGT00390000016168.b ENSGT00400000022086.b.a.a ENSGT01030000234941.c ENSGT00940000154285.a.a.c.a.e.a ENSGT01030000234941.d ENSGT00950000182888.a.a.a.f Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000170958 ENSGT01070000253760.b.a.a.a.a.b.b.k.b.a.a.a ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g.e ENSGT01030000234637.b.c.g.f ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ENSGT01070000253766.B.f.a ENSGT00390000016168.b ENSGT00400000022086.b.a.a ENSGT01030000234941.c 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(ENSACIG00000004421) FGD1 (ENSACIG00000004445) ENSACIG00000004515 ENSACIG00000004533 ENSACIG00000004554 ENSACIG00000004586 ENSACIG00000004604 ##22 abcd1 (ENSACIG00000004632) PLXNB3 (ENSACIG00000004668) SRPK3 (ENSACIG00000004837) ENSACIG00000004868 tsr2 (ENSACIG00000004880) grm6a (ENSACIG00000004895) rad51c (ENSACIG00000004925) abt1 (ENSACIG00000004935) CDK16 (ENSACIG00000004946) ENSACIG00000004977 xkr7b (ENSACIG00000004985) CCM2L (ENSACIG00000005002) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563.j ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000175919 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156805 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156963.a.b ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a.a 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ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156805 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156963.a.b ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156478 ENSGT00390000007823 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000160318.c.a ENSGT00940000157078 ENSGT01100000263518.B.b.a.a Clown anemonefish MODERN SPECIES 971 ENSAOCG00000015786 ##22 ENSAOCG00000015730 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000159247.m ENSGT00940000169444 ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000159247.m ENSGT00940000169444 ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT00940000164472.a.a.b.b.a.a.a.a ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 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ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT00940000164472.a.a.b.b.a.a.a.a ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b Guppy MODERN SPECIES 9 ENSPREG00000012108 ENSPREG00000012119 cacna1fb (ENSPREG00000012143) ENSPREG00000012233 sypa (ENSPREG00000012259) ENSPREG00000012354 HDAC6 (ENSPREG00000012414) cxxc1a (ENSPREG00000012472) ENSPREG00000012507 ENSPREG00000012514 FGD1 (ENSPREG00000012524) ENSPREG00000012549 mecp2 (ENSPREG00000012585) ENSPREG00000012629 ENSPREG00000012748 ENSPREG00000012777 ##22 abcd1 (ENSPREG00000012807) ENSPREG00000012865 ENSPREG00000012909 ENSPREG00000012919 SRPK3 (ENSPREG00000012974) tsr2 (ENSPREG00000013009) grm6a (ENSPREG00000013021) rad51c (ENSPREG00000013050) abt1 (ENSPREG00000013063) CDK16 (ENSPREG00000013083) NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 397 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b Sailfin molly MODERN SPECIES 1954 ENSPLAG00000007839 UXT (ENSPLAG00000001916) ENSPLAG00000001908 SYP (ENSPLAG00000001894) ENSPLAG00000001876 ##22 abcd1 (ENSPLAG00000001866) Platyfish MODERN SPECIES ENSXMAG00000029137 ENSXMAG00000022561 ENSXMAG00000024741 ENSXMAG00000021723 sypa (ENSXMAG00000001545) ENSXMAG00000006655 ENSXMAG00000013014 cxxc1a (ENSXMAG00000013043) ENSXMAG00000021186 ENSXMAG00000003547 FGD1 (ENSXMAG00000003528) ENSXMAG00000025932 ENSXMAG00000021429 ENSXMAG00000003511 ENSXMAG00000021127 ENSXMAG00000024465 ##22 abcd1 (ENSXMAG00000003466) PLXNB3 (ENSXMAG00000003393) SRPK3 (ENSXMAG00000003381) tsr2 (ENSXMAG00000024827) grm6a (ENSXMAG00000003346) rad51c (ENSXMAG00000003344) abt1 (ENSXMAG00000003341) CDK16 (ENSXMAG00000003320) ENSXMAG00000021516 ENSXMAG00000027352 ENSXMAG00000024715 ENSXMAG00000027647 ENSXMAG00000028679 ENSXMAG00000029701 ENSXMAG00000029059 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00940000159247.m ENSGT00940000164755.C ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000164472.a.a.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b Sheepshead minnow MODERN SPECIES 140 ENSCVAG00000008653 ENSCVAG00000008649 ENSCVAG00000008635 cacna1fb (ENSCVAG00000008470) sypa (ENSCVAG00000002124) ENSCVAG00000002115 ENSCVAG00000002108 cxxc1a (ENSCVAG00000002083) ENSCVAG00000001963 TFE3 (ENSCVAG00000001957) FGD1 (ENSCVAG00000001930) ENSCVAG00000001919 mecp2 (ENSCVAG00000001916) ENSCVAG00000001909 ENSCVAG00000001900 ENSCVAG00000001895 ##22 abcd1 (ENSCVAG00000001887) PLXNB3 (ENSCVAG00000001870) SRPK3 (ENSCVAG00000001855) tsr2 (ENSCVAG00000001845) grm6a (ENSCVAG00000001842) ENSCVAG00000001832 abt1 (ENSCVAG00000001828) CDK16 (ENSCVAG00000001825) NXPE3 (ENSCVAG00000001817) ENSCVAG00000001812 cmah (ENSCVAG00000001810) ENSCVAG00000001803 kcnc2 (ENSCVAG00000001799) phax (ENSCVAG00000001794) pmpcb (ENSCVAG00000001788) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 947 ENSKMAG00000011452 ENSKMAG00000011502 ##22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000181187 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00990000210258 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000181187 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00990000210258 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000181187 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00990000210258 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b Ballan wrasse MODERN SPECIES 972 ENSLBEG00000021274 ENSLBEG00000021214 ENSLBEG00000021185 ##22 abcd1 (ENSLBEG00000021153) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000181187 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00990000210258 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000158963.a ENSGT00940000165528 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000156315.f ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00730000111044 ENSGT00940000159563 ENSGT00990000203541.b ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156805 ENSGT00940000156963.a.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00940000166313.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000164702.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT00940000155877 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00730000111044 ENSGT00940000159563 ENSGT00990000203541.b ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ENSGT00940000156805 Pike perch MODERN SPECIES 96 ENSSLUG00000001620 ENSSLUG00000001658 ENSSLUG00000001667 FGD1 (ENSSLUG00000001674) ENSSLUG00000001688 ENSSLUG00000001694 ENSSLUG00000001700 cxxc1a (ENSSLUG00000001738) ENSSLUG00000001926 ENSSLUG00000002307 sypa (ENSSLUG00000002310) ENSSLUG00000002315 ENSSLUG00000002325 ENSSLUG00000002337 ENSSLUG00000002355 ENSSLUG00000002492 ##22 abcd1 (ENSSLUG00000002614) ENSSLUG00000004185 SRPK3 (ENSSLUG00000005919) tsr2 (ENSSLUG00000006530) GRM6 (ENSSLUG00000006540) abt1 (ENSSLUG00000006557) CDK16 (ENSSLUG00000006596) rad51c (ENSSLUG00000006868) ENSSLUG00000006872 ENSSLUG00000006879 ENSSLUG00000006885 sult1st6 (ENSSLUG00000006894) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000165528 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00390000003348 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000157503.j ENSGT00730000111044 ENSGT00940000159563 ENSGT00990000203541.b ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00940000160502 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156805 ENSGT00940000156963.a.b Lumpfish MODERN SPECIES 22 cdk20 (ENSCLMG00005000555) cacna1fb (ENSCLMG00005000553) mecp2 (ENSCLMG00005000547) ENSCLMG00005000541 FGD1 (ENSCLMG00005000537) TFE3 (ENSCLMG00005000535) ENSCLMG00005000534 cxxc1a (ENSCLMG00005000489) ENSCLMG00005000208 ENSCLMG00005000133 sypa (ENSCLMG00005000117) ENSCLMG00005000110 ENSCLMG00005000096 ENSCLMG00005000075 ENSCLMG00005017751 ENSCLMG00005017746 ##22 ENSCLMG00005017745 abcd1 (ENSCLMG00005017334) PLXNB3 (ENSCLMG00005016945) SRPK3 (ENSCLMG00005013236) tsr2 (ENSCLMG00005013178) ENSCLMG00005013176 GRM6 (ENSCLMG00005013175) abt1 (ENSCLMG00005013173) rad51c (ENSCLMG00005013172) CDK16 (ENSCLMG00005012987) ENSCLMG00005012971 samhd1 (ENSCLMG00005011739) snai1b (ENSCLMG00005011734) TP53INP2 (ENSCLMG00005011732) GGT7 (ENSCLMG00005011681) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000181187 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b Gilthead seabream MODERN SPECIES 21 slc35a2 (ENSSAUG00010000411) pim2 (ENSSAUG00010000399) otud5a (ENSSAUG00010000379) ENSSAUG00010000363 uxt (ENSSAUG00010000346) cdk20 (ENSSAUG00010000332) ENSSAUG00010000310 ENSSAUG00010022056 ENSSAUG00010022054 cacna1fb (ENSSAUG00010020946) ENSSAUG00010020930 ENSSAUG00010020928 ENSSAUG00010020876 ENSSAUG00010020874 ENSSAUG00010020873 ENSSAUG00010020871 ##22 ENSSAUG00010020828 ENSSAUG00010020809 abcd1 (ENSSAUG00010020753) ENSSAUG00010020751 ENSSAUG00010020741 SRPK3 (ENSSAUG00010019271) tsr2 (ENSSAUG00010019259) grm6a (ENSSAUG00010018563) rad51c (ENSSAUG00010018550) abt1 (ENSSAUG00010018548) CDK16 (ENSSAUG00010018454) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000181187 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b European seabass MODERN SPECIES 14 ENSDLAG00005031568 ENSDLAG00005033843 ENSDLAG00005035007 sypa (ENSDLAG00005010429) ENSDLAG00005024640 ENSDLAG00005031629 cxxc1a (ENSDLAG00005031159) ENSDLAG00005028920 ENSDLAG00005030977 ENSDLAG00005034191 ENSDLAG00005028443 ENSDLAG00005031463 ENSDLAG00005004067 ENSDLAG00005033657 ENSDLAG00005004085 ENSDLAG00005029985 ##22 abcd1 (ENSDLAG00005016340) ENSDLAG00005030649 SRPK3 (ENSDLAG00005031799) tsr2 (ENSDLAG00005029437) ENSDLAG00005014385 ENSDLAG00005014357 ENSDLAG00005027640 abt1 (ENSDLAG00005014326) ENSDLAG00005014307 ENSDLAG00005013270 ENSDLAG00005034043 ENSDLAG00005021803 ENSDLAG00005027562 ENSDLAG00005035011 ENSDLAG00005014655 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000156315.f ENSGT00940000169444 ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b Zig-zag eel MODERN SPECIES 21 ENSMAMG00000012218 ENSMAMG00000012168 ENSMAMG00000012150 ENSMAMG00000012089 sypa (ENSMAMG00000012046) ENSMAMG00000011945 ENSMAMG00000011914 cxxc1a (ENSMAMG00000011895) ENSMAMG00000011870 ENSMAMG00000011838 ENSMAMG00000011823 ENSMAMG00000011807 ENSMAMG00000011796 ENSMAMG00000011744 ENSMAMG00000011723 ENSMAMG00000011700 ##22 abcd1 (ENSMAMG00000011668) ENSMAMG00000011573 SRPK3 (ENSMAMG00000011547) tsr2 (ENSMAMG00000011540) grm6a (ENSMAMG00000011504) ENSMAMG00000011498 ENSMAMG00000011460 ENSMAMG00000011416 ENSMAMG00000025721 ENSMAMG00000011361 ENSMAMG00000011315 dip2ba (ENSMAMG00000011261) atf7a (ENSMAMG00000011234) asb8 (ENSMAMG00000027831) ENSMAMG00000011206 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 21 ENSMMDG00005019551 ENSMMDG00005019548 cacna1fb (ENSMMDG00005019540) SYP (ENSMMDG00005019406) ENSMMDG00005019395 ENSMMDG00005019393 HDAC6 (ENSMMDG00005018921) cxxc1a (ENSMMDG00005018914) ENSMMDG00005018911 FGD1 (ENSMMDG00005018890) ENSMMDG00005018884 ENSMMDG00005018881 mecp2 (ENSMMDG00005018815) ENSMMDG00005018810 hcfc1b (ENSMMDG00005018736) ENSMMDG00005018732 ##22 abcd1 (ENSMMDG00005017973) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 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ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156963.a.b ENSGT00390000002062 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000160485 ENSGT00390000005780.a ENSGT00390000018078 ENSGT00940000157571 ENSGT00940000165528 ENSGT00940000158963.b.b ENSGT00940000163427.c ENSGT00950000182827.B Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 20 CDK20 (ENSDCDG00000029248) hcfc1b (ENSDCDG00000029255) ENSDCDG00000029479 mecp2 (ENSDCDG00000029481) ENSDCDG00000029482 FGD1 (ENSDCDG00000029484) ENSDCDG00000029512 tfe3a (ENSDCDG00000029513) mbd1a (ENSDCDG00000029515) ENSDCDG00000029521 ##22 abcd1 (ENSDCDG00000029532) Denticle herring MODERN SPECIES 1 ENSDCDG00000003340 cacna1fb (ENSDCDG00000003632) sypa (ENSDCDG00000007864) ENSDCDG00000007895 HDAC6 (ENSDCDG00000008185) ENSDCDG00000012998 cdk20 (ENSDCDG00000013012) hcfc1b (ENSDCDG00000013119) ENSDCDG00000013911 mecp2 (ENSDCDG00000013979) ENSDCDG00000014265 FGD1 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ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000160485 ENSGT00390000005780.a ENSGT00390000018078 ENSGT00940000157571 ENSGT00940000165528 Electric eel MODERN SPECIES 111 slc6a6a (ENSEEEG00000001044) grip2a (ENSEEEG00000003094) ssuh2rs1 (ENSEEEG00000003111) ENSEEEG00000003112 ENSEEEG00000003118 ENSEEEG00000003556 cdk20 (ENSEEEG00000003560) hcfc1b (ENSEEEG00000003562) ENSEEEG00000003563 mecp2 (ENSEEEG00000003570) ENSEEEG00000003583 FGD1 (ENSEEEG00000003585) tfe3a (ENSEEEG00000003588) zgc:113363 (ENSEEEG00000003590) cxxc1a (ENSEEEG00000003597) ENSEEEG00000003704 ##22 abcd1 (ENSEEEG00000003708) ENSEEEG00000003712 ENSEEEG00000003718 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000235233 ENSGT00600000085663 ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000159128 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00390000003348 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000157503.i.a ENSGT00940000158685 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000169444 ENSGT00940000154102.b.a.b ##22 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156963.a.b ENSGT00390000002062 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 358 ENSPNAG00000024874 ENSPNAG00000006252 ENSPNAG00000024820 cdk20 (ENSPNAG00000005669) hcfc1b (ENSPNAG00000024755) ENSPNAG00000024736 mecp2 (ENSPNAG00000024721) ENSPNAG00000024681 FGD1 (ENSPNAG00000005886) tfe3a (ENSPNAG00000024609) zgc:113363 (ENSPNAG00000005751) cxxc1a (ENSPNAG00000006542) mbd1a (ENSPNAG00000024566) ENSPNAG00000003831 ##22 abcd1 (ENSPNAG00000024508) PLXNB3 (ENSPNAG00000024448) SRPK3 (ENSPNAG00000004866) tsr2 (ENSPNAG00000024167) CDK16 (ENSPNAG00000024144) ENSPNAG00000024081 comta (ENSPNAG00000024067) abt1 (ENSPNAG00000005087) Mexicana tetra MODERN SPECIES 21 tfe3a (ENSAMXG00000038236) zgc:113363 (ENSAMXG00000035901) cxxc1a (ENSAMXG00000016944) ENSAMXG00000016916 ##22 abcd1 (ENSAMXG00000040510) PLXNB3 (ENSAMXG00000016869) SRPK3 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ENSGT00940000154102.b.b ##22 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154102.b.b ##22 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154102.b.b ##22 Mummichog MODERN SPECIES 1785 ENSFHEG00000007188 ##22 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154102.b.b ##22 Asian bonytongue MODERN SPECIES 11 snx21 (ENSSFOG00015025990) srsf6a (ENSSFOG00015019681) L3MBTL1 (ENSSFOG00015019701) sgk2a (ENSSFOG00015019734) ENSSFOG00015019760 ENSSFOG00015019810 ENSSFOG00015019933 ENSSFOG00015019983 CNTN4 (ENSSFOG00015020161) PDZRN3 (ENSSFOG00015024646) ppp4r2a (ENSSFOG00015020511) rybpb (ENSSFOG00015025246) eif4e3 (ENSSFOG00015029780) ENSSFOG00015020554 MITF (ENSSFOG00015026327) ENSSFOG00015028695 ##22 LMOD3 (ENSSFOG00015020628) arl6ip5b (ENSSFOG00015026174) UBA3 (ENSSFOG00015020666) tafa4b (ENSSFOG00015020753) TAFA1 (ENSSFOG00015020770) slc16a7 (ENSSFOG00015020802) kbtbd8 (ENSSFOG00015026870) ENSSFOG00015028939 MAGI1 (ENSSFOG00015020854) prickle2a (ENSSFOG00015029054) ENSSFOG00015025196 ATXN7 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