Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155244.d ENSGT00940000153596.A ENSGT00530000063860.a ENSGT00940000164810 ENSGT00940000158869 ENSGT00940000167363 ENSGT00390000017284.b ENSGT00940000153322.B.d.a ENSGT00940000169511 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00390000003288 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182968.d.b.a #30 ENSGT01030000234530.a.d #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Ovalentaria DUPLICATION Ovalentaria DUPLICATION Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.A ##19 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a Cyprinodontiformes DUPLICATION Cyprinodontiformes DUPLICATION Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000029173 #37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006847 #15 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014575 ##37 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 497 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1678 ENSCVAG00000019870 ENSCVAG00000019862 #31 ENSCVAG00000019757 #29 ENSCVAG00000019750 ##37 ENSCVAG00000019737 #18 ENSCVAG00000019713 #22 Aplocheiloidei DUPLICATION Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000157891 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1610 ENSNFUG00015001950 aurkb (ENSNFUG00015001956) ENSNFUG00015001968 COPS6 (ENSNFUG00015002003) ENSNFUG00015002021 MCM7 (ENSNFUG00015002038) ENSNFUG00015002082 ENSNFUG00015002084 ENSNFUG00015002087 GPC6L (ENSNFUG00015002103) ENSNFUG00015002143 ENSNFUG00015002201 ##37 ENSNFUG00015002212 ENSNFUG00015002218 ##37 Nfu_g_1_004472 (ENSNFUG00015002237) #29 ENSNFUG00015002254 #22 ENSNFUG00015002290 #19 ENSNFUG00015002293 ENSNFUG00015002297 #34 slit3 (ENSNFUG00015002545) FGFRL1A (ENSNFUG00015003941) ENSNFUG00015003946 ENSNFUG00015003957 spon2b (ENSNFUG00015003985) ENSNFUG00015003988 ENSNFUG00015003989 zgc:136929 (ENSNFUG00015004023) maea (ENSNFUG00015004184) hnrnpa0b (ENSNFUG00015004193) ENSNFUG00015004196 KLHL3 (ENSNFUG00015004210) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Cyprinodontiformes DUPLICATION Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 221 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a #13 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 828 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 Amazon molly MODERN SPECIES 481 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Guppy MODERN SPECIES 440 COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 Platyfish MODERN SPECIES 15 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 ENSGT00390000003288 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 Amazon molly MODERN SPECIES 1285 ENSPFOG00000018912 #13 ENSPFOG00000023346 #12 ENSPFOG00000022639 #14 ENSPFOG00000018909 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 Guppy MODERN SPECIES 440 nkx3-2 (ENSPREG00000013893) ENSPREG00000013906 ENSPREG00000013936 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a.ab ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 Amazon molly MODERN SPECIES 481 nkx3-2 (ENSPFOG00000002882) ENSPFOG00000002857 aurkb (ENSPFOG00000002811) ENSPFOG00000002788 ENSPFOG00000002769 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Guppy MODERN SPECIES 440 HS3ST1 (ENSPREG00000013838) ENSPREG00000013861 nkx3-2 (ENSPREG00000013893) ENSPREG00000013906 ENSPREG00000013936 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 Platyfish DUPLICATION Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000021608 ENSXMAG00000016271 HS3ST1 (ENSXMAG00000026035) ENSXMAG00000016277 nkx3-2 (ENSXMAG00000023793) ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016271 HS3ST1 (ENSXMAG00000026035) ENSXMAG00000016277 nkx3-2 (ENSXMAG00000023793) ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a.ab ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1463 ENSCVAG00000010030 zgc:162895 (ENSCVAG00000010004) ENSCVAG00000009981 ENSCVAG00000009943 ENSCVAG00000009935 ##37 ENSCVAG00000009922 ##37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1463 ENSCVAG00000010030 zgc:162895 (ENSCVAG00000010004) ENSCVAG00000009981 ENSCVAG00000009943 ENSCVAG00000009935 ##37 ENSCVAG00000009922 ##37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 Platyfish DUPLICATION Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 Platyfish MODERN SPECIES 15 nkx3-2 (ENSXMAG00000023793) ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 DUPLICATION NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 Amazon molly DUPLICATION Amazon molly MODERN SPECIES 481 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Amazon molly MODERN SPECIES 481 ENSPFOG00000002788 ENSPFOG00000002769 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 ENSPLAG00000006020 nkx3-2 (ENSPLAG00000006028) ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.f ##37 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 ENSPLAG00000006020 nkx3-2 (ENSPLAG00000006028) ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000013936 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.a #10 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.a #10 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.a #10 Amazon molly MODERN SPECIES 481 ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Platyfish MODERN SPECIES 15 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 DUPLICATION NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 Sailfin molly DUPLICATION Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 nkx3-2 (ENSPLAG00000006028) ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Amazon molly MODERN SPECIES 481 ENSPFOG00000002769 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 828 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 Amazon molly MODERN SPECIES 481 ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Guppy DUPLICATION Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 Guppy MODERN SPECIES 440 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 Platyfish DUPLICATION Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 Amazon molly MODERN SPECIES 481 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a.ab ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.b ##37 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.b ##37 Mummichog MODERN SPECIES 1806 ENSFHEG00000006724 ##37 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000019121 aurkb (ENSKMAG00000019109) ENSKMAG00000019102 COPS6 (ENSKMAG00000019077) ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00940000156986 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a.ab ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 511 ENSCVAG00000001675 HS3ST1 (ENSCVAG00000001677) ENSCVAG00000001684 nkx3-2 (ENSCVAG00000001687) ENSCVAG00000001692 aurkb (ENSCVAG00000001696) ENSCVAG00000001698 ENSCVAG00000001703 mcm7 (ENSCVAG00000000067) ENSCVAG00000001715 ENSCVAG00000001717 gpc2 (ENSCVAG00000001724) ENSCVAG00000000069 ENSCVAG00000001728 ##37 ENSCVAG00000001735 ##37 ENSCVAG00000001749 ##37 ENSCVAG00000001757 ##37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 511 ENSCVAG00000001673 ENSCVAG00000001675 HS3ST1 (ENSCVAG00000001677) ENSCVAG00000001684 nkx3-2 (ENSCVAG00000001687) ENSCVAG00000001692 aurkb (ENSCVAG00000001696) ENSCVAG00000001698 ENSCVAG00000001703 mcm7 (ENSCVAG00000000067) ENSCVAG00000001715 ENSCVAG00000001717 gpc2 (ENSCVAG00000001724) ENSCVAG00000000069 ENSCVAG00000001728 ##37 ENSCVAG00000001735 ##37 ENSCVAG00000001749 ##37 ENSCVAG00000001757 ##37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 511 HS3ST1 (ENSCVAG00000001677) ENSCVAG00000001684 nkx3-2 (ENSCVAG00000001687) ENSCVAG00000001692 aurkb (ENSCVAG00000001696) ENSCVAG00000001698 ENSCVAG00000001703 mcm7 (ENSCVAG00000000067) ENSCVAG00000001715 ENSCVAG00000001717 gpc2 (ENSCVAG00000001724) ENSCVAG00000000069 ENSCVAG00000001728 ##37 ENSCVAG00000001735 ##37 ENSCVAG00000001749 ##37 ENSCVAG00000001757 ##37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 ENSPLAG00000006020 nkx3-2 (ENSPLAG00000006028) ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000013830 HS3ST1 (ENSPREG00000013838) ENSPREG00000013861 nkx3-2 (ENSPREG00000013893) ENSPREG00000013906 ENSPREG00000013936 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 Amazon molly MODERN SPECIES 481 ENSPFOG00000002857 aurkb (ENSPFOG00000002811) ENSPFOG00000002788 ENSPFOG00000002769 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 ENSPLAG00000006020 nkx3-2 (ENSPLAG00000006028) ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000013861 nkx3-2 (ENSPREG00000013893) ENSPREG00000013906 ENSPREG00000013936 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 Platyfish MODERN SPECIES 15 HS3ST1 (ENSXMAG00000026035) ENSXMAG00000016277 nkx3-2 (ENSXMAG00000023793) ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016277 nkx3-2 (ENSXMAG00000023793) ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 Amazon molly MODERN SPECIES 481 aurkb (ENSPFOG00000002811) ENSPFOG00000002788 ENSPFOG00000002769 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a.ab ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000168577 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000019139 nkx3-2 (ENSKMAG00000019133) ENSKMAG00000019121 aurkb (ENSKMAG00000019109) ENSKMAG00000019102 COPS6 (ENSKMAG00000019077) ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 HS3ST1 (ENSKMAG00000019173) ENSKMAG00000019139 nkx3-2 (ENSKMAG00000019133) ENSKMAG00000019121 aurkb (ENSKMAG00000019109) ENSKMAG00000019102 COPS6 (ENSKMAG00000019077) ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Cyprinodontiformes DUPLICATION Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000927 emx3 (ENSPLAG00000000925) Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006847 #15 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000022772 #35 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000023923 #35 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000162676.a.a Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014562 ##37 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006847 #15 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000022302 ##37 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000027622 #36 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000929 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006847 #15 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 497 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Mummichog DUPLICATION Mummichog MODERN SPECIES 1383 ENSFHEG00000022109 #18 ENSFHEG00000022119 #18 Mummichog MODERN SPECIES 1383 ENSFHEG00000022109 #18 ENSFHEG00000022119 #18 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1678 ENSCVAG00000019870 ENSCVAG00000019862 #31 ENSCVAG00000019757 #29 ENSCVAG00000019750 ##37 ENSCVAG00000019737 #18 ENSCVAG00000019713 #22 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 COPS6 (ENSKMAG00000019077) ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000019102 COPS6 (ENSKMAG00000019077) ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006847 #15 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000927 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014537 #37 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 Mummichog MODERN SPECIES 1837 ENSFHEG00000005460 ##37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000164241 Bicolor damselfish DUPLICATION Bicolor damselfish MODERN SPECIES 258 ENSSPAG00000003553 ##19 ENSSPAG00000003538 #28 ENSSPAG00000003530 ##37 ENSSPAG00000003507 gpc2 (ENSSPAG00000003121) ENSSPAG00000003046 ENSSPAG00000003027 mcm7 (ENSSPAG00000002973) ENSSPAG00000002955 COPS6 (ENSSPAG00000002910) ENSSPAG00000002899 aurkb (ENSSPAG00000002883) ENSSPAG00000002862 nkx3-2 (ENSSPAG00000002841) ENSSPAG00000002809 HS3ST1 (ENSSPAG00000002799) ENSSPAG00000002771 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2533 ENSSPAG00000019024 #29 ENSSPAG00000019039 ##37 ENSSPAG00000019080 #29 ENSSPAG00000019099 #34 ENSSPAG00000019110 #28 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000165013.b.b ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 Amphiprion DUPLICATION Amphiprion DUPLICATION Amphiprion DUPLICATION Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.o.b.b ENSGT00940000162676.a.a.o.b.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.b.a.a #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000165013.b.b ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000154669.b.b.a.a.j.a Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000002409 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003444 ENSAPEG00000003475 mcm7 (ENSAPEG00000003656) ENSAPEG00000003720 COPS6 (ENSAPEG00000003738) aurkb (ENSAPEG00000003753) ENSAPEG00000003785 ENSAPEG00000003803 nkx3-2 (ENSAPEG00000003825) RAB28 (ENSAPEG00000003839) ENSAPEG00000003881 HS3ST1 (ENSAPEG00000003896) Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 ENSAOCG00000019313 mcm7 (ENSAOCG00000001386) ENSAOCG00000019215 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.o.b.b ENSGT00940000162676.a.a.o.b.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.b.a.a #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000165013.b.b Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 ENSAOCG00000019313 mcm7 (ENSAOCG00000001386) ENSAOCG00000019215 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000002274 maea (ENSAPEG00000002314) zgc:136929 (ENSAPEG00000002347) spon2b (ENSAPEG00000002387) ENSAPEG00000002409 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003444 ENSAPEG00000003475 mcm7 (ENSAPEG00000003656) ENSAPEG00000003720 COPS6 (ENSAPEG00000003738) aurkb (ENSAPEG00000003753) ENSAPEG00000003785 ENSAPEG00000003803 Amphiprion DUPLICATION Amphiprion DUPLICATION Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.o.b.b ENSGT00940000162676.a.a.o.b.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.b.a.a #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000165013.b.b ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000154669.b.b.a.a.j.a ENSGT00940000160449 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003444 ENSAPEG00000003475 mcm7 (ENSAPEG00000003656) ENSAPEG00000003720 COPS6 (ENSAPEG00000003738) aurkb (ENSAPEG00000003753) ENSAPEG00000003785 ENSAPEG00000003803 nkx3-2 (ENSAPEG00000003825) RAB28 (ENSAPEG00000003839) ENSAPEG00000003881 HS3ST1 (ENSAPEG00000003896) ENSAPEG00000003907 Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 ENSAOCG00000019313 mcm7 (ENSAOCG00000001386) ENSAOCG00000019215 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.b.a.b #28 Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 ENSAOCG00000019313 mcm7 (ENSAOCG00000001386) ENSAOCG00000019215 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.b.b #28 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 fam13b (ENSAPEG00000002131) KLHL3 (ENSAPEG00000002167) ENSAPEG00000002224 ENSAPEG00000002274 maea (ENSAPEG00000002314) zgc:136929 (ENSAPEG00000002347) spon2b (ENSAPEG00000002387) ENSAPEG00000002409 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003444 ENSAPEG00000003475 mcm7 (ENSAPEG00000003656) ENSAPEG00000003720 COPS6 (ENSAPEG00000003738) Amphiprion DUPLICATION Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000167175.c ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.p ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.o.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.b #28 Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000002097 cxcl14 (ENSAPEG00000002109) fam13b (ENSAPEG00000002131) KLHL3 (ENSAPEG00000002167) ENSAPEG00000002224 ENSAPEG00000002274 maea (ENSAPEG00000002314) zgc:136929 (ENSAPEG00000002347) spon2b (ENSAPEG00000002387) ENSAPEG00000002409 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003444 ENSAPEG00000003475 mcm7 (ENSAPEG00000003656) Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000167175.c ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.p ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.o.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.b #28 Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 ENSAOCG00000019313 mcm7 (ENSAOCG00000001386) ENSAOCG00000019215 Spiny chromis MODERN SPECIES 2208 ENSAPOG00000008756 #34 ENSAPOG00000008705 #28 ENSAPOG00000008679 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Amazon molly MODERN SPECIES 287 emx3 (ENSPFOG00000007211) ENSPFOG00000007161 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007140 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014262 ##36 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000023983 #13 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 Mummichog MODERN SPECIES 1311 ENSFHEG00000009910 #28 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 260 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f #27 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Amazon molly DUPLICATION Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007140 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 emx3 (ENSPLAG00000000925) ENSPLAG00000000927 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000963 #15 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000029264 #8 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.a.a #25 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.a.a #25 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.a.a #25 Amazon molly DUPLICATION Amazon molly MODERN SPECIES 287 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000007140 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000027472 #10 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.a.b #26 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023409 #11 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 emx3 (ENSPLAG00000000925) ENSPLAG00000000927 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000963 #15 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000007161 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007140 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Platyfish MODERN SPECIES 15 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000021675 #9 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000021194 #12 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014252 #8 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f #27 Mummichog MODERN SPECIES 2055 ENSFHEG00000021364 #27 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 406 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.A ##19 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000018512 #28 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161846 Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a ##37 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 480 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.d ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.a ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000706 #31 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002564 ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 pcdh10b (ENSACLG00000007281) ENSACLG00000007138 immt (ENSACLG00000007052) ENSACLG00000007036 ENSACLG00000007027 Eastern happy MODERN SPECIES 11 tmem129 (ENSACLG00000007010) ENSACLG00000007027 ENSACLG00000007036 immt (ENSACLG00000007052) ENSACLG00000007138 pcdh10b (ENSACLG00000007281) ENSACLG00000007573 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007643 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000008571 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008702 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008712 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008780 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000013751 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014223 slit3 (ENSNBRG00000014236) fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) ENSNBRG00000014380 spon2b (ENSNBRG00000014396) Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000020948 slit3 (ENSONIG00000000988) fgfrl1a (ENSONIG00000001038) ENSONIG00000032367 ENSONIG00000042977 spon2b (ENSONIG00000001044) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) maea (ENSONIG00000001054) Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 171 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.c #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.d #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.m #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.b ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 HNRNPA0 (ENSMZEG00005001055) maea (ENSMZEG00005001004) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) spon2b (ENSMZEG00005000941) ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 178 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a ##37 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 maea (ENSACLG00000008954) ENSACLG00000008947 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 Zebra mbuna MODERN SPECIES 387 ENSMZEG00005028455 ENSMZEG00005028456 #36 ENSMZEG00005028457 #34 ENSMZEG00005028458 #30 ENSMZEG00005028459 ##37 ENSMZEG00005028460 ##37 ENSMZEG00005028461 ##37 ENSMZEG00005028463 ##37 ENSMZEG00005028464 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003822 ENSACLG00000004208 nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000000944 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.b ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 zgc:136929 (ENSONIG00000001046) spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.b ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini DUPLICATION Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.c.a ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1426 ENSHBUG00000011801 #30 ENSHBUG00000011848 ##37 ENSHBUG00000011862 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.c.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.c.a ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.c.b ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1332 ENSHBUG00000018279 ##37 ENSHBUG00000001151 ##37 ENSHBUG00000018403 ##37 ENSHBUG00000018420 ##37 ENSHBUG00000018441 ##37 ENSHBUG00000018468 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.c.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.c.b ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 170 ENSNBRG00000000645 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 118 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b Haplochromini_A DUPLICATION Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011833 ##37 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012321 ##37 hvcn1 (ENSPNYG00000012350) ENSPNYG00000012384 nkx1.2lb (ENSPNYG00000012402) uvssa (ENSPNYG00000012422) ENSPNYG00000012466 ENSPNYG00000012496 trappc11 (ENSPNYG00000012539) ENSPNYG00000012638 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000028895 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000002344 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1332 ENSHBUG00000018279 ##37 ENSHBUG00000001151 ##37 ENSHBUG00000018403 ##37 ENSHBUG00000018420 ##37 ENSHBUG00000018441 ##37 ENSHBUG00000018468 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 ENSNBRG00000013650 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 204 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1332 ENSHBUG00000018279 ##37 ENSHBUG00000001151 ##37 ENSHBUG00000018403 ##37 ENSHBUG00000018420 ##37 ENSHBUG00000018441 ##37 ENSHBUG00000018468 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011833 ##37 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012321 ##37 hvcn1 (ENSPNYG00000012350) ENSPNYG00000012384 nkx1.2lb (ENSPNYG00000012402) uvssa (ENSPNYG00000012422) ENSPNYG00000012466 ENSPNYG00000012496 trappc11 (ENSPNYG00000012539) ENSPNYG00000012638 ENSPNYG00000012661 ENSPNYG00000012717 zgc:154054 (ENSPNYG00000012918) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003822 ENSACLG00000004208 nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) uvssa (ENSACLG00000004230) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 178 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000030312 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003822 ENSACLG00000004208 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1332 ENSHBUG00000018279 ##37 ENSHBUG00000001151 ##37 ENSHBUG00000018403 ##37 ENSHBUG00000018420 ##37 ENSHBUG00000018441 ##37 ENSHBUG00000018468 ##37 Lyretail cichlid DUPLICATION Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 ENSNBRG00000013650 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 374 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 375 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 226 ENSGT01020000233681 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.b ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.b ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.a ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 422 ENSONIG00000037087 ##37 ENSONIG00000000953 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 420 ENSONIG00000019894 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000002344 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 Nile tilapia MODERN SPECIES 422 ENSONIG00000037087 ##37 ENSONIG00000000953 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 mcm7 (ENSONIG00000002357) ENSONIG00000042159 ENSONIG00000028895 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000002344 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 204 ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 217 ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161846 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000002344 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000028895 ENSONIG00000042159 mcm7 (ENSONIG00000002357) ENSONIG00000030352 COPS6 (ENSONIG00000002367) Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000175226 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 ENSNBRG00000013650 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000160288 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000160288 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003822 ENSACLG00000004208 nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) uvssa (ENSACLG00000004230) ENSACLG00000004263 spdl1 (ENSACLG00000004291) ENSACLG00000004344 Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) uvssa (ENSMZEG00005017618) ENSMZEG00005017613 spdl1 (ENSMZEG00005017607) trappc11 (ENSMZEG00005017572) ENSMZEG00005017562 ENSMZEG00005017557 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) uvssa (ENSMZEG00005017618) ENSMZEG00005017613 spdl1 (ENSMZEG00005017607) trappc11 (ENSMZEG00005017572) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000175226 ENSGT00940000160541 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1373 ENSHBUG00000015704 ##37 ENSHBUG00000015683 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000160288 ENSGT00390000004827 P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012321 ##37 hvcn1 (ENSPNYG00000012350) ENSPNYG00000012384 nkx1.2lb (ENSPNYG00000012402) uvssa (ENSPNYG00000012422) ENSPNYG00000012466 ENSPNYG00000012496 trappc11 (ENSPNYG00000012539) ENSPNYG00000012638 ENSPNYG00000012661 ENSPNYG00000012717 zgc:154054 (ENSPNYG00000012918) SCOC (ENSPNYG00000012973) mgst2 (ENSPNYG00000012985) setd7 (ENSPNYG00000013002) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000160288 ENSGT00390000004827 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003822 ENSACLG00000004208 nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) uvssa (ENSACLG00000004230) ENSACLG00000004263 spdl1 (ENSACLG00000004291) ENSACLG00000004344 trappc11 (ENSACLG00000004352) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) uvssa (ENSMZEG00005017618) ENSMZEG00005017613 spdl1 (ENSMZEG00005017607) trappc11 (ENSMZEG00005017572) ENSMZEG00005017562 Lyretail cichlid DUPLICATION Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 ENSNBRG00000013650 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 ENSNBRG00000013650 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000002344 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000028895 ENSONIG00000042159 mcm7 (ENSONIG00000002357) ENSONIG00000030352 COPS6 (ENSONIG00000002367) ENSONIG00000002370 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 17 ENSACLG00000026589 tp53rk (ENSACLG00000026597) ENSACLG00000026602 ENSACLG00000026615 stk35l (ENSACLG00000026625) ENSACLG00000026636 ENSACLG00000026734 apobec2a (ENSACLG00000026736) PLEKHA6 (ENSACLG00000026740) ENSACLG00000026784 ENSACLG00000026879 ENSACLG00000026884 fezf2 (ENSACLG00000026890) ENSACLG00000026899 fhit (ENSACLG00000026924) ENSACLG00000026929 ##37 ENSACLG00000026936 ##37 ENSACLG00000026941 ##37 ENSACLG00000026946 LDLRAD2 (ENSACLG00000026951) ENSACLG00000000044 camk1ga (ENSACLG00000000072) USP48 (ENSACLG00000000118) ENSACLG00000000215 cyb561d1 (ENSACLG00000000238) atxn7l2a (ENSACLG00000000256) sypl2a (ENSACLG00000000264) ENSACLG00000000290 ENSACLG00000000311 ENSACLG00000000325 nfasca (ENSACLG00000000344) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) uvssa (ENSMZEG00005017618) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 17 ENSACLG00000026602 ENSACLG00000026615 stk35l (ENSACLG00000026625) ENSACLG00000026636 ENSACLG00000026734 apobec2a (ENSACLG00000026736) PLEKHA6 (ENSACLG00000026740) ENSACLG00000026784 ENSACLG00000026879 ENSACLG00000026884 fezf2 (ENSACLG00000026890) ENSACLG00000026899 fhit (ENSACLG00000026924) ENSACLG00000026929 ##37 ENSACLG00000026936 ##37 ENSACLG00000026941 ##37 ENSACLG00000026946 LDLRAD2 (ENSACLG00000026951) ENSACLG00000000044 camk1ga (ENSACLG00000000072) USP48 (ENSACLG00000000118) ENSACLG00000000215 cyb561d1 (ENSACLG00000000238) atxn7l2a (ENSACLG00000000256) sypl2a (ENSACLG00000000264) ENSACLG00000000290 ENSACLG00000000311 ENSACLG00000000325 nfasca (ENSACLG00000000344) ENSACLG00000000593 ENSACLG00000000597 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) uvssa (ENSMZEG00005017618) ENSMZEG00005017613 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 ENSNBRG00000013650 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000034073 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000015232 ##37 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.b ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 178 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a ##37 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 1306 ENSACIG00000015460 ##37 ENSACIG00000015446 #35 ENSACIG00000015421 #34 ENSACIG00000015384 ##37 ENSACIG00000015374 ##30 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini DUPLICATION Haplochromini DUPLICATION Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1332 ENSHBUG00000018279 ##37 ENSHBUG00000001151 ##37 ENSHBUG00000018403 ##37 ENSHBUG00000018420 ##37 ENSHBUG00000018441 ##37 ENSHBUG00000018468 ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003822 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 387 ENSMZEG00005028455 ENSMZEG00005028456 #36 ENSMZEG00005028457 #34 ENSMZEG00005028458 #30 ENSMZEG00005028459 ##37 ENSMZEG00005028460 ##37 ENSMZEG00005028461 ##37 ENSMZEG00005028463 ##37 ENSMZEG00005028464 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.d ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.d ##37 P. nyererei MODERN SPECIES 1084 ENSPNYG00000021739 ##37 ENSPNYG00000021748 ENSPNYG00000021773 ##19 ENSPNYG00000021801 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000027440 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 224 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.c ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 163 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.c ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011833 ##37 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012321 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 480 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.a ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 zgc:136929 (ENSNBRG00000014412) spon2b (ENSNBRG00000014396) ENSNBRG00000014380 fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) slit3 (ENSNBRG00000014236) ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 373 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B #19 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 373 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B #19 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 204 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.a ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 pcdh10b (ENSACLG00000007281) ENSACLG00000007138 immt (ENSACLG00000007052) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 299 maea (ENSHBUG00000023869) zgc:136929 (ENSHBUG00000023870) spon2b (ENSHBUG00000023871) ENSHBUG00000023872 ENSHBUG00000023873 fgfrl1a (ENSHBUG00000023874) slit3 (ENSHBUG00000023875) ENSHBUG00000023877 ENSHBUG00000023878 #31 ENSHBUG00000023879 ##37 ENSHBUG00000023880 #34 ENSHBUG00000023881 #30 ENSHBUG00000023882 ENSHBUG00000023883 ##19 ENSHBUG00000023884 #36 ENSHBUG00000023831 ##37 ENSHBUG00000023795 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 204 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1426 ENSHBUG00000011801 #30 ENSHBUG00000011848 ##37 ENSHBUG00000011862 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011833 ##37 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012321 ##37 hvcn1 (ENSPNYG00000012350) ENSPNYG00000012384 nkx1.2lb (ENSPNYG00000012402) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) slit3 (ENSNBRG00000014236) ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 324 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.b.a ##37 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.b.b ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 226 ENSGT01020000233681 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.b ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 479 ENSGT01020000233681 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.b.b ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.b.b ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1543 ENSHBUG00000023652 ##37 ENSHBUG00000023681 ##19 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 171 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.a ##37 P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011833 ##37 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 pcdh10b (ENSACLG00000007281) ENSACLG00000007138 immt (ENSACLG00000007052) ENSACLG00000007036 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 pcdh10b (ENSACLG00000007281) ENSACLG00000007138 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.a ##37 Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 387 ENSMZEG00005028455 ENSMZEG00005028456 #36 ENSMZEG00005028457 #34 ENSMZEG00005028458 #30 ENSMZEG00005028459 ##37 ENSMZEG00005028460 ##37 ENSMZEG00005028461 ##37 ENSMZEG00005028463 ##37 ENSMZEG00005028464 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1909 ENSHBUG00000021475 ##37 Lyretail cichlid DUPLICATION Lyretail cichlid MODERN SPECIES 833 ENSNBRG00000003377 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 maea (ENSNBRG00000014438) zgc:136929 (ENSNBRG00000014412) spon2b (ENSNBRG00000014396) ENSNBRG00000014380 fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) slit3 (ENSNBRG00000014236) ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 Fugu MODERN SPECIES 5 ENSTRUG00000015516 eif4ea (ENSTRUG00000024250) LINGO2 (ENSTRUG00000015501) cxcl14 (ENSTRUG00000024992) fam13b (ENSTRUG00000015447) KLHL3 (ENSTRUG00000015376) ENSTRUG00000021494 hnrnpa0b (ENSTRUG00000015362) zgc:136929 (ENSTRUG00000015287) spon2 (ENSTRUG00000015262) maea (ENSTRUG00000015332) ENSTRUG00000015229 ENSTRUG00000030160 fgfrl1a (ENSTRUG00000015192) slit3 (ENSTRUG00000014930) ENSTRUG00000014929 #28 ENSTRUG00000032931 ENSTRUG00000028984 #30 ENSTRUG00000029835 #30 ENSTRUG00000033377 #30 ENSTRUG00000026725 #30 ENSTRUG00000028475 ENSTRUG00000030501 ENSTRUG00000027453 #30 ENSTRUG00000030017 #29 ENSTRUG00000033022 ENSTRUG00000027161 #30 ENSTRUG00000033390 ENSTRUG00000030499 #30 ENSTRUG00000029980 #29 ENSTRUG00000003304 #30 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 1432 ENSLBEG00000007263 #28 ENSLBEG00000007317 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2560 ENSLBEG00000014573 #28 ENSLBEG00000014556 #28 ENSLBEG00000014528 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4134 ENSLBEG00000008794 #28 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1307 ENSLBEG00000024930 ##19 ENSLBEG00000024907 #28 ENSLBEG00000024889 ##37 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 3015 ENSLBEG00000003810 #29 ENSLBEG00000003830 #28 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2560 ENSLBEG00000014573 #28 ENSLBEG00000014556 #28 ENSLBEG00000014528 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2465 ENSLBEG00000010121 #29 ENSLBEG00000010141 #28 ENSLBEG00000010164 #28 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2465 ENSLBEG00000010121 #29 ENSLBEG00000010141 #28 ENSLBEG00000010164 #28 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153147.a.a Perciformes ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000171832 Pike perch DUPLICATION Pike perch MODERN SPECIES 18 ENSSLUG00000023984 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024103 ENSSLUG00000024108 gpc2 (ENSSLUG00000024133) STAG3 (ENSSLUG00000024162) mcm7 (ENSSLUG00000024175) ENSSLUG00000024236 COPS6 (ENSSLUG00000024239) ENSSLUG00000024249 aurkb (ENSSLUG00000024250) ENSSLUG00000024255 nkx3-2 (ENSSLUG00000024263) RAB28 (ENSSLUG00000024264) ENSSLUG00000024268 HS3ST1 (ENSSLUG00000024272) Pike perch MODERN SPECIES 18 zgc:136929 (ENSSLUG00000022877) spon2b (ENSSLUG00000023507) ENSSLUG00000023515 ENSSLUG00000023520 fgfrl1a (ENSSLUG00000023537) slit3 (ENSSLUG00000023660) ENSSLUG00000023984 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024103 ENSSLUG00000024108 gpc2 (ENSSLUG00000024133) STAG3 (ENSSLUG00000024162) mcm7 (ENSSLUG00000024175) ENSSLUG00000024236 COPS6 (ENSSLUG00000024239) ENSSLUG00000024249 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010461 #30 ENSCGOG00000010463 #30 ENSCGOG00000010468 #28 ENSCGOG00000010471 ITGA6 (ENSCGOG00000010473) gpc2 (ENSCGOG00000010481) ENSCGOG00000010601 mcm7 (ENSCGOG00000010623) ENSCGOG00000011038 COPS6 (ENSCGOG00000011047) ENSCGOG00000011321 aurkb (ENSCGOG00000011322) ENSCGOG00000011323 nkx3-2 (ENSCGOG00000011341) ENSCGOG00000011344 HS3ST1 (ENSCGOG00000011348) ENSCGOG00000004078 gsr (ENSCGOG00000004134) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.d #19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843.b ENSGT00940000161833 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 12 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005004592 ENSDLAG00005004589 ENSDLAG00005029521 ENSDLAG00005020573 ENSDLAG00005020136 ENSDLAG00005020297 ENSDLAG00005020125 ENSDLAG00005033094 ENSDLAG00005032113 ENSDLAG00005033938 ENSDLAG00005032393 ENSDLAG00005026937 ENSDLAG00005032696 ENSDLAG00005008799 ENSDLAG00005032824 ENSDLAG00005012890 #28 ENSDLAG00005028119 #28 ENSDLAG00005007247 ##37 ENSDLAG00005007257 ENSDLAG00005007414 ENSDLAG00005007639 ENSDLAG00005030731 ENSDLAG00005033009 ENSDLAG00005007695 ENSDLAG00005029672 ENSDLAG00005029287 ENSDLAG00005026855 NKX3-2 (ENSDLAG00005028615) RAB28 (ENSDLAG00005007730) HS3ST1 (ENSDLAG00005032596) ENSDLAG00005007753 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005016398 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005003204 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005002457 European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005004589 ENSDLAG00005029521 ENSDLAG00005020573 ENSDLAG00005020136 ENSDLAG00005020297 ENSDLAG00005020125 ENSDLAG00005033094 ENSDLAG00005032113 ENSDLAG00005033938 ENSDLAG00005032393 ENSDLAG00005026937 ENSDLAG00005032696 ENSDLAG00005008799 ENSDLAG00005032824 ENSDLAG00005012890 #28 ENSDLAG00005028119 #28 ENSDLAG00005007247 ##37 ENSDLAG00005007257 ENSDLAG00005007414 ENSDLAG00005007639 ENSDLAG00005030731 ENSDLAG00005033009 ENSDLAG00005007695 ENSDLAG00005029672 ENSDLAG00005029287 ENSDLAG00005026855 NKX3-2 (ENSDLAG00005028615) RAB28 (ENSDLAG00005007730) HS3ST1 (ENSDLAG00005032596) ENSDLAG00005007753 ENSDLAG00005007760 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker MODERN SPECIES 187 ENSLCRG00005016471 #28 ENSLCRG00005016472 #28 Large yellow croaker MODERN SPECIES 187 ENSLCRG00005016471 #28 ENSLCRG00005016472 #28 Large yellow croaker MODERN SPECIES 121 ENSLCRG00005009274 ENSLCRG00005009277 ##37 ENSLCRG00005009281 ##30 ENSLCRG00005009283 #28 ENSLCRG00005009286 #28 ENSLCRG00005009287 #28 ENSLCRG00005009290 Large yellow croaker MODERN SPECIES 121 ENSLCRG00005009290 ENSLCRG00005009287 #28 ENSLCRG00005009286 #28 ENSLCRG00005009283 #28 ENSLCRG00005009281 ##30 ENSLCRG00005009277 ##37 ENSLCRG00005009274 Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker MODERN SPECIES 121 ENSLCRG00005009290 ENSLCRG00005009287 #28 ENSLCRG00005009286 #28 ENSLCRG00005009283 #28 ENSLCRG00005009281 ##30 ENSLCRG00005009277 ##37 ENSLCRG00005009274 Large yellow croaker MODERN SPECIES nkx3-2 (ENSLCRG00005000501) ENSLCRG00005000500 aurkb (ENSLCRG00005000498) ENSLCRG00005000496 ENSLCRG00005000495 COPS6 (ENSLCRG00005000478) ENSLCRG00005000476 mcm7 (ENSLCRG00005000473) STAG3 (ENSLCRG00005000469) gpc2 (ENSLCRG00005000467) ENSLCRG00005000464 ENSLCRG00005000458 ##37 ENSLCRG00005000457 #19 ENSLCRG00005000455 #29 ENSLCRG00005000453 #19 ENSLCRG00005000448 #28 ENSLCRG00005000442 #29 ENSLCRG00005000441 #19 fzd5 (ENSLCRG00005000439) ccnyl1 (ENSLCRG00005000433) creb1a (ENSLCRG00005000428) klf7b (ENSLCRG00005000425) gdf3 (ENSLCRG00005000423) TRAPPC10 (ENSLCRG00005000269) CNGA4 (ENSLCRG00005000213) fhip1b (ENSLCRG00005000200) ENSLCRG00005000192 ENSLCRG00005000188 olig1 (ENSLCRG00005000184) ENSLCRG00005000179 olig2 (ENSLCRG00005000176) Large yellow croaker MODERN SPECIES 384 ENSLCRG00005001653 #28 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023015 #36 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023023 slit3 (ENSSAUG00010023026) fgfrl1a (ENSSAUG00010023271) ENSSAUG00010023273 ENSSAUG00010023275 spon2b (ENSSAUG00010023276) Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023013 #29 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022827 ENSSAUG00010022830 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023011 #30 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022965 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022830 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 RAB28 (ENSSAUG00010022821) nkx3-2 (ENSSAUG00010022822) ENSSAUG00010022824 ENSSAUG00010022827 ENSSAUG00010022830 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 HS3ST1 (ENSSAUG00010022817) RAB28 (ENSSAUG00010022821) nkx3-2 (ENSSAUG00010022822) ENSSAUG00010022824 ENSSAUG00010022827 ENSSAUG00010022830 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 nkx3-2 (ENSSAUG00010022822) ENSSAUG00010022824 ENSSAUG00010022827 ENSSAUG00010022830 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022824 ENSSAUG00010022827 ENSSAUG00010022830 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022960 ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023015 #36 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023023 slit3 (ENSSAUG00010023026) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161846 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 1096 ENSLCAG00010004503 ##37 ENSLCAG00010004513 #28 ENSLCAG00010004527 ##19 ENSLCAG00010004533 #28 ENSLCAG00010004545 #28 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022520 aurkb (ENSLCAG00010022522) ENSLCAG00010022544 ENSLCAG00010022555 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022520 aurkb (ENSLCAG00010022522) ENSLCAG00010022544 ENSLCAG00010022555 Barramundi perch MODERN SPECIES 1096 ENSLCAG00010004503 ##37 ENSLCAG00010004513 #28 ENSLCAG00010004527 ##19 ENSLCAG00010004533 #28 ENSLCAG00010004545 #28 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 1096 ENSLCAG00010004503 ##37 ENSLCAG00010004513 #28 ENSLCAG00010004527 ##19 ENSLCAG00010004533 #28 ENSLCAG00010004545 #28 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022520 aurkb (ENSLCAG00010022522) ENSLCAG00010022544 ENSLCAG00010022555 Seriola ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156986 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000162676.a.a.x.b ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.y ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.i #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a.x.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.j #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01040000242632 ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f Greater amberjack MODERN SPECIES 113 slc30a9 (ENSSDUG00000003564) gsr (ENSSDUG00000003522) HS3ST1 (ENSSDUG00000003509) ENSSDUG00000003477 nkx3-2 (ENSSDUG00000003467) ENSSDUG00000003457 aurkb (ENSSDUG00000003445) ENSSDUG00000003440 COPS6 (ENSSDUG00000003419) ENSSDUG00000003388 mcm7 (ENSSDUG00000003338) ENSSDUG00000003250 gpc2 (ENSSDUG00000003228) ENSSDUG00000003208 ENSSDUG00000003194 ENSSDUG00000003176 #28 ENSSDUG00000003103 ##30 ENSSDUG00000003071 ##37 ENSSDUG00000003047 #30 ENSSDUG00000002988 ENSSDUG00000002957 #30 ENSSDUG00000002940 #33 ENSSDUG00000002917 ##30 ENSSDUG00000002892 ENSSDUG00000002873 #33 ENSSDUG00000002855 ##37 ENSSDUG00000002835 #31 ENSSDUG00000002832 ENSSDUG00000002822 slit3 (ENSSDUG00000002721) fgfrl1a (ENSSDUG00000002673) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 gsr (ENSSLDG00000024121) ENSSLDG00000024139 HS3ST1 (ENSSLDG00000024142) RAB28 (ENSSLDG00000024149) nkx3-2 (ENSSLDG00000024167) ENSSLDG00000024171 aurkb (ENSSLDG00000024189) ENSSLDG00000024212 COPS6 (ENSSLDG00000024291) ENSSLDG00000024305 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024342 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024358 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024558 slit3 (ENSSLDG00000024564) fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) ENSSLDG00000024626 spon2b (ENSSLDG00000024633) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000160449 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 MAEA (ENSMAMG00000017757) CTBP1 (ENSMAMG00000027529) spon2b (ENSMAMG00000017786) ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000025090 #28 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000027195 ENSMAMG00000019040 HS3ST1 (ENSMAMG00000025247) ENSMAMG00000018996 nkx3-2 (ENSMAMG00000018984) ENSMAMG00000018930 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 HS3ST1 (ENSMAMG00000025247) ENSMAMG00000018996 nkx3-2 (ENSMAMG00000018984) ENSMAMG00000018930 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018006 ##37 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 nkx3-2 (ENSMAMG00000018984) ENSMAMG00000018930 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000018220 ##37 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000018930 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 spon2b (ENSMAMG00000017786) ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000018598 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000018779 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000019040 HS3ST1 (ENSMAMG00000025247) ENSMAMG00000018996 nkx3-2 (ENSMAMG00000018984) ENSMAMG00000018930 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 CTBP1 (ENSMAMG00000027529) spon2b (ENSMAMG00000017786) ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000026185 #28 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000017754 MAEA (ENSMAMG00000017757) CTBP1 (ENSMAMG00000027529) spon2b (ENSMAMG00000017786) ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.q ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000164241 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000001697 HS3ST1 (ENSATEG00000001734) ENSATEG00000001753 nkx3-2 (ENSATEG00000001782) ENSATEG00000025835 ENSATEG00000001816 aurkb (ENSATEG00000001897) ENSATEG00000001905 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000002471 ##30 Climbing perch MODERN SPECIES 1 nkx3-2 (ENSATEG00000001782) ENSATEG00000025835 ENSATEG00000001816 aurkb (ENSATEG00000001897) ENSATEG00000001905 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000025310 #28 Climbing perch MODERN SPECIES 1 HS3ST1 (ENSATEG00000001734) ENSATEG00000001753 nkx3-2 (ENSATEG00000001782) ENSATEG00000025835 ENSATEG00000001816 aurkb (ENSATEG00000001897) ENSATEG00000001905 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002428 ##30 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001905 aurkb (ENSATEG00000001897) ENSATEG00000001816 ENSATEG00000025835 nkx3-2 (ENSATEG00000001782) ENSATEG00000001753 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000001816 aurkb (ENSATEG00000001897) ENSATEG00000001905 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000002552 #34 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000001687 ENSATEG00000001697 HS3ST1 (ENSATEG00000001734) ENSATEG00000001753 nkx3-2 (ENSATEG00000001782) ENSATEG00000025835 ENSATEG00000001816 aurkb (ENSATEG00000001897) ENSATEG00000001905 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000001972 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001905 Climbing perch MODERN SPECIES 1 MAEA (ENSATEG00000003418) CTBP1 (ENSATEG00000003381) spon2b (ENSATEG00000003357) ENSATEG00000003335 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003059 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 Climbing perch MODERN SPECIES 1 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003059 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 gsr (ENSBSLG00000010224) ENSBSLG00000010356 ENSBSLG00000010626 HS3ST1 (ENSBSLG00000010754) ENSBSLG00000010781 nkx3-2 (ENSBSLG00000010875) ENSBSLG00000010887 aurkb (ENSBSLG00000010905) ENSBSLG00000010953 COPS6 (ENSBSLG00000011037) ENSBSLG00000011088 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011404 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011615 ##37 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012116 #37 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 ENSBSLG00000010626 HS3ST1 (ENSBSLG00000010754) ENSBSLG00000010781 nkx3-2 (ENSBSLG00000010875) ENSBSLG00000010887 aurkb (ENSBSLG00000010905) ENSBSLG00000010953 COPS6 (ENSBSLG00000011037) ENSBSLG00000011088 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011404 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011615 ##37 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012196 #34 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 ENSBSLG00000010356 ENSBSLG00000010626 HS3ST1 (ENSBSLG00000010754) ENSBSLG00000010781 nkx3-2 (ENSBSLG00000010875) ENSBSLG00000010887 aurkb (ENSBSLG00000010905) ENSBSLG00000010953 COPS6 (ENSBSLG00000011037) ENSBSLG00000011088 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011404 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011615 ##37 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012129 #34 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 HS3ST1 (ENSBSLG00000010754) ENSBSLG00000010781 nkx3-2 (ENSBSLG00000010875) ENSBSLG00000010887 aurkb (ENSBSLG00000010905) ENSBSLG00000010953 COPS6 (ENSBSLG00000011037) ENSBSLG00000011088 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011404 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011615 ##37 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012199 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000003288 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.g ##36 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000017869 ENSGT00940000160376 ENSGT00510000048283.c ENSGT00950000182938.b.b.a ENSGT00940000158129 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00390000003288 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 ENSCVAG00000006895 ENSCVAG00000006917 cplx2 (ENSCVAG00000006927) thoc3 (ENSCVAG00000006941) ENSCVAG00000006978 gm2a (ENSCVAG00000006983) PCDH12 (ENSCVAG00000006988) PCDH1 (ENSCVAG00000007012) tmem216 (ENSCVAG00000007021) tmed9 (ENSCVAG00000007041) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) emx3 (ENSCVAG00000007080) ENSCVAG00000007091 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007510 #30 Mummichog MODERN SPECIES 2389 ENSFHEG00000011163 tmem216 (ENSFHEG00000011139) TMED9 (ENSFHEG00000011132) b4galt7 (ENSFHEG00000011096) emx3 (ENSFHEG00000011050) ENSFHEG00000010972 ENSFHEG00000010963 ENSFHEG00000010937 ##37 ENSFHEG00000010848 ENSFHEG00000010834 ##36 ENSFHEG00000010811 #37 ENSFHEG00000010767 #36 ENSFHEG00000010752 #35 ENSFHEG00000010730 #35 ENSFHEG00000000648 #34 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00510000048283.c ENSGT00950000182938.b.b.a ENSGT00940000158129 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00390000003288 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 emx3 (ENSPLAG00000000925) ENSPLAG00000000927 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000963 #15 Guppy MODERN SPECIES 440 gm2a (ENSPREG00000014873) ENSPREG00000014862 PCDH12 (ENSPREG00000014853) ENSPREG00000014841 ENSPREG00000014830 PCDH1 (ENSPREG00000014812) tmed9 (ENSPREG00000014696) tmem216 (ENSPREG00000014683) TMED9 (ENSPREG00000014673) b4galt7 (ENSPREG00000014666) emx3 (ENSPREG00000014657) ENSPREG00000014646 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014401 #22 Platyfish MODERN SPECIES 15 thoc3 (ENSXMAG00000003232) ENSXMAG00000003236 gm2a (ENSXMAG00000003245) PCDH12 (ENSXMAG00000003252) ENSXMAG00000021428 PCDH1 (ENSXMAG00000016502) ENSXMAG00000022864 ENSXMAG00000016501 tmem216 (ENSXMAG00000016498) TMED9 (ENSXMAG00000022978) b4galt7 (ENSXMAG00000016477) emx3 (ENSXMAG00000016469) ENSXMAG00000027359 ENSXMAG00000019593 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1610 hnrnpa0b (ENSNFUG00015004193) maea (ENSNFUG00015004184) zgc:136929 (ENSNFUG00015004023) ENSNFUG00015003989 ENSNFUG00015003988 spon2b (ENSNFUG00015003985) ENSNFUG00015003957 ENSNFUG00015003946 FGFRL1A (ENSNFUG00015003941) slit3 (ENSNFUG00015002545) ENSNFUG00015002297 #34 ENSNFUG00015002293 ENSNFUG00015002290 #19 ENSNFUG00015002254 #22 Nfu_g_1_004472 (ENSNFUG00015002237) #29 ENSNFUG00015002218 ##37 ENSNFUG00015002212 ENSNFUG00015002201 ##37 ENSNFUG00015002143 GPC6L (ENSNFUG00015002103) ENSNFUG00015002087 ENSNFUG00015002084 ENSNFUG00015002082 MCM7 (ENSNFUG00015002038) ENSNFUG00015002021 COPS6 (ENSNFUG00015002003) ENSNFUG00015001968 aurkb (ENSNFUG00015001956) ENSNFUG00015001950 ENSNFUG00015001944 nkx3-2 (ENSNFUG00015001934) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 Haplochromini_A DUPLICATION Haplochromini_A DUPLICATION Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.c #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.d #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.m #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 fam13b (ENSACLG00000009048) KLHL3 (ENSACLG00000009006) ENSACLG00000008978 HNRNPA0 (ENSACLG00000008973) maea (ENSACLG00000008954) ENSACLG00000008947 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 P. nyererei MODERN SPECIES 315 ENSPNYG00000020903 eif4ea (ENSPNYG00000020891) LINGO2 (ENSPNYG00000020886) cxcl14 (ENSPNYG00000020877) fam13b (ENSPNYG00000020838) KLHL3 (ENSPNYG00000020787) ENSPNYG00000020763 ENSPNYG00000020729 maea (ENSPNYG00000020697) zgc:136929 (ENSPNYG00000020630) spon2b (ENSPNYG00000020614) ENSPNYG00000020600 fgfrl1a (ENSPNYG00000020579) slit3 (ENSPNYG00000020486) ENSPNYG00000020476 ENSPNYG00000020459 ##37 ENSPNYG00000020414 #34 ENSPNYG00000020369 #35 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005001221 cxcl14 (ENSMZEG00005001209) fam13b (ENSMZEG00005001152) KLHL3 (ENSMZEG00005001097) ENSMZEG00005001063 HNRNPA0 (ENSMZEG00005001055) maea (ENSMZEG00005001004) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) spon2b (ENSMZEG00005000941) ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 299 LINGO2 (ENSHBUG00000023863) cxcl14 (ENSHBUG00000023864) fam13b (ENSHBUG00000023865) ENSHBUG00000023866 ENSHBUG00000023867 HNRNPA0 (ENSHBUG00000023868) maea (ENSHBUG00000023869) zgc:136929 (ENSHBUG00000023870) spon2b (ENSHBUG00000023871) ENSHBUG00000023872 ENSHBUG00000023873 fgfrl1a (ENSHBUG00000023874) slit3 (ENSHBUG00000023875) ENSHBUG00000023877 ENSHBUG00000023878 #31 ENSHBUG00000023879 ##37 ENSHBUG00000023880 #34 ENSHBUG00000023881 #30 ENSHBUG00000023882 ENSHBUG00000023883 ##19 ENSHBUG00000023884 #36 ENSHBUG00000023831 ##37 ENSHBUG00000023795 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 fam13b (ENSONIG00000001068) KLHL3 (ENSONIG00000001059) ENSONIG00000042129 hnrnpa0b (ENSONIG00000037027) maea (ENSONIG00000001054) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000017620 ENSMAMG00000017630 cxcl14 (ENSMAMG00000027577) ENSMAMG00000017652 ENSMAMG00000017687 ENSMAMG00000017728 ENSMAMG00000017754 MAEA (ENSMAMG00000017757) CTBP1 (ENSMAMG00000027529) spon2b (ENSMAMG00000017786) ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Climbing perch MODERN SPECIES 1 cxcl14 (ENSATEG00000026931) ENSATEG00000003585 ENSATEG00000003526 ENSATEG00000003468 ENSATEG00000003423 MAEA (ENSATEG00000003418) CTBP1 (ENSATEG00000003381) spon2b (ENSATEG00000003357) ENSATEG00000003335 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003059 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 1569 ENSLBEG00000020992 ENSLBEG00000020980 ##37 ENSLBEG00000020928 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1645 ENSLBEG00000010371 ##37 ENSLBEG00000010337 ##37 ENSLBEG00000010291 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4127 ENSLBEG00000008517 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2035 ENSLBEG00000016762 ##37 ENSLBEG00000016714 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 3705 ENSLBEG00000012622 ##37 ENSLBEG00000012592 ##37 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161846 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Lumpfish MODERN SPECIES 1 gar1 (ENSCLMG00005007940) ENSCLMG00005007832 eif4ea (ENSCLMG00005007819) LINGO2 (ENSCLMG00005007816) cxcl14 (ENSCLMG00005007814) fam13b (ENSCLMG00005007813) KLHL3 (ENSCLMG00005007803) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) maea (ENSCLMG00005007778) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) spon2b (ENSCLMG00005004748) ENSCLMG00005004694 fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) slit3 (ENSCLMG00005004626) ENSCLMG00005004500 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017938 ##37 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000168781 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 HNRNPA0 (ENSCGOG00000010091) ENSCGOG00000010096 maea (ENSCGOG00000010098) zgc:136929 (ENSCGOG00000010199) spon2b (ENSCGOG00000010244) ENSCGOG00000010249 ENSCGOG00000010311 fgfrl1a (ENSCGOG00000010315) ENSCGOG00000010321 ENSCGOG00000010326 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010357 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010447 #30 Pike perch MODERN SPECIES 18 cxcl14 (ENSSLUG00000022709) fam13b (ENSSLUG00000022722) KLHL3 (ENSSLUG00000022764) ENSSLUG00000022773 hnrnpa0b (ENSSLUG00000022778) maea (ENSSLUG00000022782) zgc:136929 (ENSSLUG00000022877) spon2b (ENSSLUG00000023507) ENSSLUG00000023515 ENSSLUG00000023520 fgfrl1a (ENSSLUG00000023537) slit3 (ENSSLUG00000023660) ENSSLUG00000023984 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024103 ENSSLUG00000024108 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 cxcl14 (ENSSAUG00010024114) fam13b (ENSSAUG00010024105) KLHL3 (ENSSAUG00010024099) ENSSAUG00010024097 HNRNPA0 (ENSSAUG00010024095) maea (ENSSAUG00010024088) zgc:136929 (ENSSAUG00010023293) spon2b (ENSSAUG00010023276) ENSSAUG00010023275 ENSSAUG00010023273 fgfrl1a (ENSSAUG00010023271) slit3 (ENSSAUG00010023026) ENSSAUG00010023023 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005001983 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001313 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001119 slit3 (ENSMMDG00005021105) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) RNF212 (ENSMMDG00005021073) ENSMMDG00005021067 spon2b (ENSMMDG00005021051) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) maea (ENSMMDG00005020929) ENSMMDG00005020923 ENSMMDG00005020918 KLHL3 (ENSMMDG00005020871) fam13b (ENSMMDG00005020855) cxcl14 (ENSMMDG00005020852) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005020850 cxcl14 (ENSMMDG00005020852) fam13b (ENSMMDG00005020855) KLHL3 (ENSMMDG00005020871) ENSMMDG00005020918 ENSMMDG00005020923 maea (ENSMMDG00005020929) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) spon2b (ENSMMDG00005021051) ENSMMDG00005021067 RNF212 (ENSMMDG00005021073) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) slit3 (ENSMMDG00005021105) ENSMMDG00005001119 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001313 gpc2 (ENSMMDG00005001435) Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182968.d.b.a #30 ENSGT01030000234530.a.d #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Percomorphaceae DUPLICATION Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 94 ENSHCOG00000021061 nudt22 (ENSHCOG00000021007) dnajc4 (ENSHCOG00000020869) ENSHCOG00000020847 stx5a (ENSHCOG00000020831) zgc:162144 (ENSHCOG00000020820) ATG2A (ENSHCOG00000020808) trmt112 (ENSHCOG00000020792) ENSHCOG00000020778 KCNK4 (ENSHCOG00000000557) ENSHCOG00000020682 nxf1a (ENSHCOG00000020676) ENSHCOG00000020640 gpc2 (ENSHCOG00000020592) ENSHCOG00000020012 ENSHCOG00000019957 #31 Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 118 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.b ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022520 aurkb (ENSLCAG00010022522) ENSLCAG00010022544 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.b ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.b ##37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.b ##37 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.b ##37 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.b ##37 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022520 aurkb (ENSLCAG00010022522) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 LINGO2 (ENSONIG00000020949) cxcl14 (ENSONIG00000033809) fam13b (ENSONIG00000001068) KLHL3 (ENSONIG00000001059) ENSONIG00000042129 hnrnpa0b (ENSONIG00000037027) maea (ENSONIG00000001054) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 cxcl14 (ENSONIG00000033809) fam13b (ENSONIG00000001068) KLHL3 (ENSONIG00000001059) ENSONIG00000042129 hnrnpa0b (ENSONIG00000037027) maea (ENSONIG00000001054) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.c #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.d #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.m #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.b ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005001237 LINGO2 (ENSMZEG00005001231) ENSMZEG00005001221 cxcl14 (ENSMZEG00005001209) fam13b (ENSMZEG00005001152) KLHL3 (ENSMZEG00005001097) ENSMZEG00005001063 HNRNPA0 (ENSMZEG00005001055) maea (ENSMZEG00005001004) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) spon2b (ENSMZEG00005000941) ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 LINGO2 (ENSACLG00000009441) cxcl14 (ENSACLG00000009437) fam13b (ENSACLG00000009048) KLHL3 (ENSACLG00000009006) ENSACLG00000008978 HNRNPA0 (ENSACLG00000008973) maea (ENSACLG00000008954) ENSACLG00000008947 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.c #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.d #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.m #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.b ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 LINGO2 (ENSMZEG00005001231) ENSMZEG00005001221 cxcl14 (ENSMZEG00005001209) fam13b (ENSMZEG00005001152) KLHL3 (ENSMZEG00005001097) ENSMZEG00005001063 HNRNPA0 (ENSMZEG00005001055) maea (ENSMZEG00005001004) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) spon2b (ENSMZEG00005000941) ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 Eastern happy MODERN SPECIES 11 cxcl14 (ENSACLG00000009437) fam13b (ENSACLG00000009048) KLHL3 (ENSACLG00000009006) ENSACLG00000008978 HNRNPA0 (ENSACLG00000008973) maea (ENSACLG00000008954) ENSACLG00000008947 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 299 eif4ea (ENSHBUG00000023862) LINGO2 (ENSHBUG00000023863) cxcl14 (ENSHBUG00000023864) fam13b (ENSHBUG00000023865) ENSHBUG00000023866 ENSHBUG00000023867 HNRNPA0 (ENSHBUG00000023868) maea (ENSHBUG00000023869) zgc:136929 (ENSHBUG00000023870) spon2b (ENSHBUG00000023871) ENSHBUG00000023872 ENSHBUG00000023873 fgfrl1a (ENSHBUG00000023874) slit3 (ENSHBUG00000023875) ENSHBUG00000023877 ENSHBUG00000023878 #31 ENSHBUG00000023879 ##37 ENSHBUG00000023880 #34 ENSHBUG00000023881 #30 ENSHBUG00000023882 ENSHBUG00000023883 ##19 ENSHBUG00000023884 #36 ENSHBUG00000023831 ##37 ENSHBUG00000023795 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 eif4ea (ENSNBRG00000014676) LINGO2 (ENSNBRG00000014642) cxcl14 (ENSNBRG00000014631) fam13b (ENSNBRG00000014591) KLHL3 (ENSNBRG00000014552) ENSNBRG00000014522 ENSNBRG00000014469 maea (ENSNBRG00000014438) zgc:136929 (ENSNBRG00000014412) spon2b (ENSNBRG00000014396) ENSNBRG00000014380 fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) slit3 (ENSNBRG00000014236) ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158129 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00390000003288 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.g ##36 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 Sailfin molly DUPLICATION Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006847 #15 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 ENSGT00390000003288 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00940000158129 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Amazon molly MODERN SPECIES 1285 ENSPFOG00000018912 #13 ENSPFOG00000023346 #12 ENSPFOG00000022639 #14 ENSPFOG00000018909 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 emx3 (ENSPLAG00000000925) ENSPLAG00000000927 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000963 #15 Amazon molly MODERN SPECIES 287 tmem216 (ENSPFOG00000023783) TMED9 (ENSPFOG00000007314) b4galt7 (ENSPFOG00000007250) emx3 (ENSPFOG00000007211) ENSPFOG00000007161 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007140 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Guppy MODERN SPECIES 440 emx3 (ENSPREG00000014657) ENSPREG00000014646 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014271 #19 Platyfish MODERN SPECIES 15 emx3 (ENSXMAG00000016469) ENSXMAG00000027359 ENSXMAG00000019593 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 tmem216 (ENSCVAG00000007021) tmed9 (ENSCVAG00000007041) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) emx3 (ENSCVAG00000007080) ENSCVAG00000007091 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007510 #30 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1678 ENSCVAG00000019870 ENSCVAG00000019862 #31 ENSCVAG00000019757 #29 ENSCVAG00000019750 ##37 ENSCVAG00000019737 #18 ENSCVAG00000019713 #22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 3887 ENSLBEG00000019536 ENSLBEG00000019502 #31 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2056 ENSLBEG00000019683 #31 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 2048 ENSLBEG00000017405 #31 Ballan wrasse MODERN SPECIES 3673 ENSLBEG00000010504 #31 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4198 ENSLBEG00000012317 #31 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 2890 ENSLBEG00000020865 ##37 ENSLBEG00000020832 #31 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2642 ENSLBEG00000005596 #31 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 4057 ENSLBEG00000004680 #31 Ballan wrasse MODERN SPECIES 3650 ENSLBEG00000009172 #31 Ballan wrasse MODERN SPECIES 3363 ENSLBEG00000004129 #31 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 182 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 Seriola ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01040000242632 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.j #33 ENSGT00940000162676.a.a.x.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.i #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.y ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.x.b ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 atox1 (ENSSLDG00000024991) SLC36A1 (ENSSLDG00000024977) mtnr1al (ENSSLDG00000024810) FAT2 (ENSSLDG00000024755) KLHL3 (ENSSLDG00000024720) ENSSLDG00000024705 ENSSLDG00000024685 maea (ENSSLDG00000024664) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) spon2b (ENSSLDG00000024633) ENSSLDG00000024626 fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) slit3 (ENSSLDG00000024564) ENSSLDG00000024558 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024358 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024342 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024305 COPS6 (ENSSLDG00000024291) Greater amberjack MODERN SPECIES 113 LINGO2 (ENSSDUG00000002227) cxcl14 (ENSSDUG00000002234) fam13b (ENSSDUG00000002262) KLHL3 (ENSSDUG00000002322) ENSSDUG00000002394 ENSSDUG00000002431 maea (ENSSDUG00000002472) zgc:136929 (ENSSDUG00000002539) spon2b (ENSSDUG00000002572) ENSSDUG00000002593 ENSSDUG00000002614 fgfrl1a (ENSSDUG00000002673) slit3 (ENSSDUG00000002721) ENSSDUG00000002822 ENSSDUG00000002832 ENSSDUG00000002835 #31 ENSSDUG00000002855 ##37 ENSSDUG00000002873 #33 ENSSDUG00000002892 ENSSDUG00000002917 ##30 ENSSDUG00000002940 #33 ENSSDUG00000002957 #30 ENSSDUG00000002988 ENSSDUG00000003047 #30 ENSSDUG00000003071 ##37 ENSSDUG00000003103 ##30 ENSSDUG00000003176 #28 ENSSDUG00000003194 ENSSDUG00000003208 gpc2 (ENSSDUG00000003228) ENSSDUG00000003250 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 slit3 (ENSLCAG00010021484) ENSLCAG00010021910 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002057 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000026575 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018884 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018868 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Atherinomorphae DUPLICATION Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 330 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 497 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Mummichog MODERN SPECIES 1464 ENSFHEG00000018085 ##37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1678 ENSCVAG00000019870 ENSCVAG00000019862 #31 ENSCVAG00000019757 #29 ENSCVAG00000019750 ##37 ENSCVAG00000019737 #18 ENSCVAG00000019713 #22 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000931 ##30 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 aurkb (ENSKMAG00000019109) ENSKMAG00000019102 COPS6 (ENSKMAG00000019077) ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00950000183123 ENSGT00940000167175.a ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 Indian medaka DUPLICATION Indian medaka MODERN SPECIES 16 ENSOMEG00000000696 ENSOMEG00000012357 #30 ENSOMEG00000012340 #30 ENSOMEG00000012328 #30 ENSOMEG00000012300 #34 ENSOMEG00000012289 #30 ENSOMEG00000012272 #29 ENSOMEG00000000308 ##37 ENSOMEG00000012244 ##37 ENSOMEG00000012221 ##37 ENSOMEG00000012205 ##37 ENSOMEG00000012185 ##37 ENSOMEG00000012128 ##37 ENSOMEG00000012097 ##37 ENSOMEG00000012088 ##37 ENSOMEG00000012076 ##37 ENSOMEG00000012059 ##30 ENSOMEG00000012045 ENSOMEG00000012035 slit3 (ENSOMEG00000012015) fgfrl1a (ENSOMEG00000011920) ENSOMEG00000011856 ENSOMEG00000011827 spon2b (ENSOMEG00000011816) zgc:136929 (ENSOMEG00000011793) maea (ENSOMEG00000011733) ENSOMEG00000011670 KLHL3 (ENSOMEG00000011648) fam13b (ENSOMEG00000011594) cxcl14 (ENSOMEG00000011511) LINGO2 (ENSOMEG00000011496) Indian medaka MODERN SPECIES 16 gpc2 (ENSOMEG00000012394) ENSOMEG00000000696 ENSOMEG00000012357 #30 ENSOMEG00000012340 #30 ENSOMEG00000012328 #30 ENSOMEG00000012300 #34 ENSOMEG00000012289 #30 ENSOMEG00000012272 #29 ENSOMEG00000000308 ##37 ENSOMEG00000012244 ##37 ENSOMEG00000012221 ##37 ENSOMEG00000012205 ##37 ENSOMEG00000012185 ##37 ENSOMEG00000012128 ##37 ENSOMEG00000012097 ##37 ENSOMEG00000012088 ##37 ENSOMEG00000012076 ##37 ENSOMEG00000012059 ##30 ENSOMEG00000012045 ENSOMEG00000012035 slit3 (ENSOMEG00000012015) fgfrl1a (ENSOMEG00000011920) ENSOMEG00000011856 ENSOMEG00000011827 spon2b (ENSOMEG00000011816) zgc:136929 (ENSOMEG00000011793) maea (ENSOMEG00000011733) ENSOMEG00000011670 KLHL3 (ENSOMEG00000011648) fam13b (ENSOMEG00000011594) cxcl14 (ENSOMEG00000011511) Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 slit3 (ENSOJAG00000013112) fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) ENSOJAG00000016732 ENSOJAG00000016737 spon2b (ENSOJAG00000016747) zgc:136929 (ENSOJAG00000016765) maea (ENSOJAG00000016904) ENSOJAG00000016953 ENSOJAG00000016962 KLHL3 (ENSOJAG00000016974) fam13b (ENSOJAG00000017074) cxcl14 (ENSOJAG00000017121) Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 slit3 (ENSOJAG00000013112) fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) ENSOJAG00000016732 ENSOJAG00000016737 spon2b (ENSOJAG00000016747) zgc:136929 (ENSOJAG00000016765) maea (ENSOJAG00000016904) ENSOJAG00000016953 ENSOJAG00000016962 KLHL3 (ENSOJAG00000016974) fam13b (ENSOJAG00000017074) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 Japanese Medaka HdrR DUPLICATION Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000022885 #35 ENSORLG00000030644 slit3 (ENSORLG00000000335) ENSORLG00000028622 fgfrl1a (ENSORLG00000000305) ENSORLG00000000293 spon2b (ENSORLG00000000275) zgc:136929 (ENSORLG00000000259) maea (ENSORLG00000000230) ENSORLG00000022539 ENSORLG00000027074 ENSORLG00000024157 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000022885 #35 ENSORLG00000030644 slit3 (ENSORLG00000000335) ENSORLG00000028622 fgfrl1a (ENSORLG00000000305) ENSORLG00000000293 spon2b (ENSORLG00000000275) zgc:136929 (ENSORLG00000000259) maea (ENSORLG00000000230) ENSORLG00000022539 ENSORLG00000027074 ENSORLG00000024157 ENSORLG00000024793 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 260 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f #27 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014265 #11 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 emx3 (ENSPLAG00000000925) ENSPLAG00000000927 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000963 #15 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 Mummichog MODERN SPECIES 2135 ENSFHEG00000018560 ##37 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 pcdh10b (ENSACLG00000007281) ENSACLG00000007138 immt (ENSACLG00000007052) ENSACLG00000007036 ENSACLG00000007027 tmem129 (ENSACLG00000007010) tmem129 (ENSACLG00000007001) ENSACLG00000006995 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.a ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011833 ##37 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012321 ##37 hvcn1 (ENSPNYG00000012350) ENSPNYG00000012384 nkx1.2lb (ENSPNYG00000012402) uvssa (ENSPNYG00000012422) ENSPNYG00000012466 ENSPNYG00000012496 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.a #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000014469 maea (ENSNBRG00000014438) zgc:136929 (ENSNBRG00000014412) spon2b (ENSNBRG00000014396) ENSNBRG00000014380 fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) slit3 (ENSNBRG00000014236) ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 171 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.a ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 Zebra mbuna MODERN SPECIES 387 ENSMZEG00005028455 ENSMZEG00005028456 #36 ENSMZEG00005028457 #34 ENSMZEG00005028458 #30 ENSMZEG00005028459 ##37 ENSMZEG00005028460 ##37 ENSMZEG00005028461 ##37 ENSMZEG00005028463 ##37 ENSMZEG00005028464 ##37 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 pcdh10b (ENSACLG00000007281) Eastern happy MODERN SPECIES 11 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 Zebra mbuna MODERN SPECIES 387 ENSMZEG00005028455 ENSMZEG00005028456 #36 ENSMZEG00005028457 #34 ENSMZEG00005028458 #30 ENSMZEG00005028459 ##37 ENSMZEG00005028460 ##37 ENSMZEG00005028461 ##37 ENSMZEG00005028463 ##37 ENSMZEG00005028464 ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.c #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.d #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.m #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.b ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 maea (ENSMZEG00005001004) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) spon2b (ENSMZEG00005000941) ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000167175.c ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.p ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.o.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.b #28 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 cxcl14 (ENSAPEG00000002109) fam13b (ENSAPEG00000002131) KLHL3 (ENSAPEG00000002167) ENSAPEG00000002224 ENSAPEG00000002274 maea (ENSAPEG00000002314) zgc:136929 (ENSAPEG00000002347) spon2b (ENSAPEG00000002387) ENSAPEG00000002409 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003444 ENSAPEG00000003475 mcm7 (ENSAPEG00000003656) ENSAPEG00000003720 Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 ENSAOCG00000019313 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l Perciformes ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156835.l.a.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 Lumpfish DUPLICATION Lumpfish DUPLICATION Lumpfish DUPLICATION Lumpfish DUPLICATION Lumpfish DUPLICATION Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017543 aurkb (ENSCLMG00005017547) ENSCLMG00005017549 COPS6 (ENSCLMG00005017553) ENSCLMG00005017687 mcm7 (ENSCLMG00005017691) ENSCLMG00005017878 ENSCLMG00005017879 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017878 ENSCLMG00005017879 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) ENSCLMG00005004694 spon2b (ENSCLMG00005004748) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) maea (ENSCLMG00005007778) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) Lumpfish DUPLICATION Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) ENSCLMG00005004694 spon2b (ENSCLMG00005004748) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) maea (ENSCLMG00005007778) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) KLHL3 (ENSCLMG00005007803) fam13b (ENSCLMG00005007813) cxcl14 (ENSCLMG00005007814) LINGO2 (ENSCLMG00005007816) Lumpfish MODERN SPECIES 1 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) ENSCLMG00005004694 spon2b (ENSCLMG00005004748) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) maea (ENSCLMG00005007778) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) KLHL3 (ENSCLMG00005007803) fam13b (ENSCLMG00005007813) Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017879 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) ENSCLMG00005004694 spon2b (ENSCLMG00005004748) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) maea (ENSCLMG00005007778) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) KLHL3 (ENSCLMG00005007803) Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017687 mcm7 (ENSCLMG00005017691) ENSCLMG00005017878 ENSCLMG00005017879 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) ENSCLMG00005004694 spon2b (ENSCLMG00005004748) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) maea (ENSCLMG00005007778) Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017549 COPS6 (ENSCLMG00005017553) ENSCLMG00005017687 mcm7 (ENSCLMG00005017691) ENSCLMG00005017878 ENSCLMG00005017879 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) ENSCLMG00005004694 spon2b (ENSCLMG00005004748) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.d #19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843.b Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022962 #19 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023015 #36 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023023 slit3 (ENSSAUG00010023026) fgfrl1a (ENSSAUG00010023271) Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022964 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022963 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022961 #19 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker MODERN SPECIES 121 ENSLCRG00005009274 ENSLCRG00005009277 ##37 ENSLCRG00005009281 ##30 ENSLCRG00005009283 #28 ENSLCRG00005009286 #28 ENSLCRG00005009287 #28 ENSLCRG00005009290 Large yellow croaker MODERN SPECIES syk (ENSLCRG00005022703) chd1 (ENSLCRG00005022642) reep5 (ENSLCRG00005022635) hmgcs1 (ENSLCRG00005022632) tln1 (ENSLCRG00005021926) tpm2 (ENSLCRG00005021638) ENSLCRG00005021625 slc25a48 (ENSLCRG00005021623) cplx2 (ENSLCRG00005021622) thoc3 (ENSLCRG00005021620) ENSLCRG00005021616 ENSLCRG00005021613 PCDH12 (ENSLCRG00005021610) ENSLCRG00005021607 ENSLCRG00005021606 #30 ENSLCRG00005021603 ##37 ENSLCRG00005021597 #30 ache (ENSLCRG00005021593) ENSLCRG00005021591 zgc:92664 (ENSLCRG00005021587) rnaseka (ENSLCRG00005021584) alox12 (ENSLCRG00005021450) ENSLCRG00005021447 ENSLCRG00005021446 tmem144b (ENSLCRG00005021444) GASK1B (ENSLCRG00005021440) gria2b (ENSLCRG00005019791) glrbb (ENSLCRG00005019614) PDGFC (ENSLCRG00005019602) neil3 (ENSLCRG00005019575) aga (ENSLCRG00005019565) European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 12 CTBP1 (ENSDLAG00005001521) spon2b (ENSDLAG00005002407) ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005001313 MAEA (ENSDLAG00005001329) CTBP1 (ENSDLAG00005001521) spon2b (ENSDLAG00005002407) ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 European seabass MODERN SPECIES 12 spon2b (ENSDLAG00005002407) ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l Carangaria ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 Turbot DUPLICATION Turbot DUPLICATION Turbot DUPLICATION Turbot MODERN SPECIES 4 ENSSMAG00000010115 ENSSMAG00000010196 ENSSMAG00000010246 ENSSMAG00000010279 MAEA (ENSSMAG00000010319) CTBP1 (ENSSMAG00000010328) spon2b (ENSSMAG00000010439) ENSSMAG00000010473 ENSSMAG00000029602 fgfrl1a (ENSSMAG00000010509) ENSSMAG00000010540 ENSSMAG00000010820 #33 ENSSMAG00000010797 ##37 ENSSMAG00000024700 ##37 ENSSMAG00000010841 ##37 ENSSMAG00000023026 ##37 ENSSMAG00000010900 #34 ENSSMAG00000010934 ENSSMAG00000010978 ENSSMAG00000025298 MCM7 (ENSSMAG00000011017) ENSSMAG00000011041 ENSSMAG00000011068 ENSSMAG00000011116 ENSSMAG00000011168 ENSSMAG00000011199 NKX3-2 (ENSSMAG00000011278) RAB28 (ENSSMAG00000031249) ENSSMAG00000011334 HS3ST1 (ENSSMAG00000029254) ENSSMAG00000011355 Turbot MODERN SPECIES 4 ENSSMAG00000010054 cxcl14 (ENSSMAG00000010064) ENSSMAG00000010115 ENSSMAG00000010196 ENSSMAG00000010246 ENSSMAG00000010279 MAEA (ENSSMAG00000010319) CTBP1 (ENSSMAG00000010328) spon2b (ENSSMAG00000010439) ENSSMAG00000010473 ENSSMAG00000029602 fgfrl1a (ENSSMAG00000010509) ENSSMAG00000010540 ENSSMAG00000010820 #33 ENSSMAG00000010797 ##37 ENSSMAG00000024700 ##37 ENSSMAG00000010841 ##37 ENSSMAG00000023026 ##37 ENSSMAG00000010900 #34 ENSSMAG00000010934 ENSSMAG00000010978 ENSSMAG00000025298 MCM7 (ENSSMAG00000011017) ENSSMAG00000011041 ENSSMAG00000011068 ENSSMAG00000011116 ENSSMAG00000011168 ENSSMAG00000011199 NKX3-2 (ENSSMAG00000011278) RAB28 (ENSSMAG00000031249) ENSSMAG00000011334 Turbot MODERN SPECIES 4 ENSSMAG00000010015 ENSSMAG00000010054 cxcl14 (ENSSMAG00000010064) ENSSMAG00000010115 ENSSMAG00000010196 ENSSMAG00000010246 ENSSMAG00000010279 MAEA (ENSSMAG00000010319) CTBP1 (ENSSMAG00000010328) spon2b (ENSSMAG00000010439) ENSSMAG00000010473 ENSSMAG00000029602 fgfrl1a (ENSSMAG00000010509) ENSSMAG00000010540 ENSSMAG00000010820 #33 ENSSMAG00000010797 ##37 ENSSMAG00000024700 ##37 ENSSMAG00000010841 ##37 ENSSMAG00000023026 ##37 ENSSMAG00000010900 #34 ENSSMAG00000010934 ENSSMAG00000010978 ENSSMAG00000025298 MCM7 (ENSSMAG00000011017) ENSSMAG00000011041 ENSSMAG00000011068 ENSSMAG00000011116 ENSSMAG00000011168 ENSSMAG00000011199 NKX3-2 (ENSSMAG00000011278) RAB28 (ENSSMAG00000031249) Turbot MODERN SPECIES 4 cxcl14 (ENSSMAG00000010064) ENSSMAG00000010115 ENSSMAG00000010196 ENSSMAG00000010246 ENSSMAG00000010279 MAEA (ENSSMAG00000010319) CTBP1 (ENSSMAG00000010328) spon2b (ENSSMAG00000010439) ENSSMAG00000010473 ENSSMAG00000029602 fgfrl1a (ENSSMAG00000010509) ENSSMAG00000010540 ENSSMAG00000010820 #33 ENSSMAG00000010797 ##37 ENSSMAG00000024700 ##37 ENSSMAG00000010841 ##37 ENSSMAG00000023026 ##37 ENSSMAG00000010900 #34 ENSSMAG00000010934 ENSSMAG00000010978 ENSSMAG00000025298 MCM7 (ENSSMAG00000011017) ENSSMAG00000011041 ENSSMAG00000011068 ENSSMAG00000011116 ENSSMAG00000011168 ENSSMAG00000011199 NKX3-2 (ENSSMAG00000011278) RAB28 (ENSSMAG00000031249) ENSSMAG00000011334 HS3ST1 (ENSSMAG00000029254) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 Seriola ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01040000242632 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.j #33 ENSGT00940000162676.a.a.x.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.i #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.y ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.x.b ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 Greater amberjack MODERN SPECIES 113 ENSSDUG00000002593 ENSSDUG00000002614 fgfrl1a (ENSSDUG00000002673) slit3 (ENSSDUG00000002721) ENSSDUG00000002822 ENSSDUG00000002832 ENSSDUG00000002835 #31 ENSSDUG00000002855 ##37 ENSSDUG00000002873 #33 ENSSDUG00000002892 ENSSDUG00000002917 ##30 ENSSDUG00000002940 #33 ENSSDUG00000002957 #30 ENSSDUG00000002988 ENSSDUG00000003047 #30 ENSSDUG00000003071 ##37 ENSSDUG00000003103 ##30 ENSSDUG00000003176 #28 ENSSDUG00000003194 ENSSDUG00000003208 gpc2 (ENSSDUG00000003228) ENSSDUG00000003250 mcm7 (ENSSDUG00000003338) ENSSDUG00000003388 COPS6 (ENSSDUG00000003419) ENSSDUG00000003440 aurkb (ENSSDUG00000003445) ENSSDUG00000003457 nkx3-2 (ENSSDUG00000003467) ENSSDUG00000003477 HS3ST1 (ENSSDUG00000003509) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 ENSSLDG00000024685 maea (ENSSLDG00000024664) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) spon2b (ENSSLDG00000024633) ENSSLDG00000024626 fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) slit3 (ENSSLDG00000024564) ENSSLDG00000024558 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024358 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024342 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024305 COPS6 (ENSSLDG00000024291) ENSSLDG00000024212 aurkb (ENSSLDG00000024189) ENSSLDG00000024171 nkx3-2 (ENSSLDG00000024167) RAB28 (ENSSLDG00000024149) HS3ST1 (ENSSLDG00000024142) Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010021910 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022520 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 slit3 (ENSLCAG00010021484) ENSLCAG00010021910 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000164241 Anabantoidei DUPLICATION Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.q ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000156835.l.a.b ENSGT00940000160595.b Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000003423 MAEA (ENSATEG00000003418) CTBP1 (ENSATEG00000003381) spon2b (ENSATEG00000003357) ENSATEG00000003335 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003059 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 ENSBSLG00000016743 ENSBSLG00000016605 fgfrl1a (ENSBSLG00000016120) slit3 (ENSBSLG00000012410) ENSBSLG00000012210 ENSBSLG00000012199 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011615 ##37 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011404 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011088 COPS6 (ENSBSLG00000011037) ENSBSLG00000010953 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.r ##37 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 zgc:136929 (ENSBSLG00000017079) spon2b (ENSBSLG00000017015) ENSBSLG00000016743 ENSBSLG00000016605 fgfrl1a (ENSBSLG00000016120) slit3 (ENSBSLG00000012410) ENSBSLG00000012210 ENSBSLG00000012199 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011615 ##37 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011404 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011088 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182968.d.b.a #30 ENSGT01030000234530.a.d #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b Oryzias DUPLICATION Oryzias ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000011404 HS3ST1 (ENSOJAG00000011421) RAB28 (ENSOJAG00000011456) nkx3-2 (ENSOJAG00000011493) ENSOJAG00000011497 ENSOJAG00000011516 aurkb (ENSOJAG00000011520) ENSOJAG00000011547 COPS6 (ENSOJAG00000011556) ENSOJAG00000011657 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 slit3 (ENSOJAG00000013112) Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000011396 ENSOJAG00000011404 HS3ST1 (ENSOJAG00000011421) RAB28 (ENSOJAG00000011456) nkx3-2 (ENSOJAG00000011493) ENSOJAG00000011497 ENSOJAG00000011516 aurkb (ENSOJAG00000011520) ENSOJAG00000011547 COPS6 (ENSOJAG00000011556) ENSOJAG00000011657 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 RAB28 (ENSOJAG00000011456) nkx3-2 (ENSOJAG00000011493) ENSOJAG00000011497 ENSOJAG00000011516 aurkb (ENSOJAG00000011520) ENSOJAG00000011547 COPS6 (ENSOJAG00000011556) ENSOJAG00000011657 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 slit3 (ENSOJAG00000013112) fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) ENSOJAG00000016732 Indian medaka MODERN SPECIES 16 HS3ST1 (ENSOMEG00000012752) ENSOMEG00000012725 RAB28 (ENSOMEG00000012673) nkx3-2 (ENSOMEG00000012613) ENSOMEG00000012592 ENSOMEG00000012574 COPS6 (ENSOMEG00000012556) ENSOMEG00000012520 mcm7 (ENSOMEG00000012495) ENSOMEG00000012446 gpc2 (ENSOMEG00000012394) ENSOMEG00000000696 ENSOMEG00000012357 #30 ENSOMEG00000012340 #30 ENSOMEG00000012328 #30 ENSOMEG00000012300 #34 ENSOMEG00000012289 #30 ENSOMEG00000012272 #29 ENSOMEG00000000308 ##37 ENSOMEG00000012244 ##37 ENSOMEG00000012221 ##37 ENSOMEG00000012205 ##37 ENSOMEG00000012185 ##37 ENSOMEG00000012128 ##37 ENSOMEG00000012097 ##37 ENSOMEG00000012088 ##37 ENSOMEG00000012076 ##37 ENSOMEG00000012059 ##30 ENSOMEG00000012045 ENSOMEG00000012035 slit3 (ENSOMEG00000012015) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a Japanese Medaka HdrR DUPLICATION Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000022874 ENSORLG00000000606 nkx3-2 (ENSORLG00000029707) ENSORLG00000022787 ENSORLG00000000588 aurkb (ENSORLG00000000578) ENSORLG00000029587 COPS6 (ENSORLG00000000554) ENSORLG00000000538 mcm7 (ENSORLG00000000527) ENSORLG00000000491 gpc2 (ENSORLG00000000476) ENSORLG00000000441 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 HS3ST1 (ENSORLG00000030296) ENSORLG00000022874 ENSORLG00000000606 nkx3-2 (ENSORLG00000029707) ENSORLG00000022787 ENSORLG00000000588 aurkb (ENSORLG00000000578) ENSORLG00000029587 COPS6 (ENSORLG00000000554) ENSORLG00000000538 mcm7 (ENSORLG00000000527) ENSORLG00000000491 gpc2 (ENSORLG00000000476) ENSORLG00000000441 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 Chinese medaka MODERN SPECIES 2145 ENSOSIG00000001380 #34 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 nkx3-2 (ENSORLG00000029707) ENSORLG00000022787 ENSORLG00000000588 aurkb (ENSORLG00000000578) ENSORLG00000029587 COPS6 (ENSORLG00000000554) ENSORLG00000000538 mcm7 (ENSORLG00000000527) ENSORLG00000000491 gpc2 (ENSORLG00000000476) ENSORLG00000000441 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000022885 #35 Chinese medaka MODERN SPECIES 2296 ENSOSIG00000013085 #34 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 HS3ST1 (ENSOJAG00000011421) RAB28 (ENSOJAG00000011456) nkx3-2 (ENSOJAG00000011493) ENSOJAG00000011497 ENSOJAG00000011516 aurkb (ENSOJAG00000011520) ENSOJAG00000011547 COPS6 (ENSOJAG00000011556) ENSOJAG00000011657 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 slit3 (ENSOJAG00000013112) fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1610 ENSNFUG00015004310 ENSNFUG00015004307 fam13b (ENSNFUG00015004254) KLHL3 (ENSNFUG00015004210) ENSNFUG00015004196 hnrnpa0b (ENSNFUG00015004193) maea (ENSNFUG00015004184) zgc:136929 (ENSNFUG00015004023) ENSNFUG00015003989 ENSNFUG00015003988 spon2b (ENSNFUG00015003985) ENSNFUG00015003957 ENSNFUG00015003946 FGFRL1A (ENSNFUG00015003941) slit3 (ENSNFUG00015002545) ENSNFUG00015002297 #34 ENSNFUG00015002293 ENSNFUG00015002290 #19 ENSNFUG00015002254 #22 Nfu_g_1_004472 (ENSNFUG00015002237) #29 ENSNFUG00015002218 ##37 ENSNFUG00015002212 ENSNFUG00015002201 ##37 ENSNFUG00015002143 GPC6L (ENSNFUG00015002103) ENSNFUG00015002087 ENSNFUG00015002084 ENSNFUG00015002082 MCM7 (ENSNFUG00015002038) ENSNFUG00015002021 COPS6 (ENSNFUG00015002003) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00510000048283.c ENSGT00950000182938.b.b.a ENSGT00940000158129 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00390000003288 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.g ##36 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 Platyfish MODERN SPECIES 15 tmem216 (ENSXMAG00000016498) TMED9 (ENSXMAG00000022978) b4galt7 (ENSXMAG00000016477) emx3 (ENSXMAG00000016469) ENSXMAG00000027359 ENSXMAG00000019593 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 Amazon molly MODERN SPECIES 287 PCDH1 (ENSPFOG00000007397) ENSPFOG00000021727 tmed9 (ENSPFOG00000007395) tmem216 (ENSPFOG00000023783) TMED9 (ENSPFOG00000007314) b4galt7 (ENSPFOG00000007250) emx3 (ENSPFOG00000007211) ENSPFOG00000007161 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007140 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 Guppy DUPLICATION Guppy MODERN SPECIES 440 tmem216 (ENSPREG00000014683) TMED9 (ENSPREG00000014673) b4galt7 (ENSPREG00000014666) emx3 (ENSPREG00000014657) ENSPREG00000014646 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014292 #15 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014891 gm2a (ENSPREG00000014873) ENSPREG00000014862 PCDH12 (ENSPREG00000014853) ENSPREG00000014841 ENSPREG00000014830 PCDH1 (ENSPREG00000014812) tmed9 (ENSPREG00000014696) tmem216 (ENSPREG00000014683) TMED9 (ENSPREG00000014673) b4galt7 (ENSPREG00000014666) emx3 (ENSPREG00000014657) ENSPREG00000014646 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00390000003288 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 PCDH12 (ENSCVAG00000006988) PCDH1 (ENSCVAG00000007012) tmem216 (ENSCVAG00000007021) tmed9 (ENSCVAG00000007041) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) emx3 (ENSCVAG00000007080) ENSCVAG00000007091 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007510 #30 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 gm2a (ENSCVAG00000006983) PCDH12 (ENSCVAG00000006988) PCDH1 (ENSCVAG00000007012) tmem216 (ENSCVAG00000007021) tmed9 (ENSCVAG00000007041) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) emx3 (ENSCVAG00000007080) ENSCVAG00000007091 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007510 #30 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 ENSCVAG00000006978 gm2a (ENSCVAG00000006983) PCDH12 (ENSCVAG00000006988) PCDH1 (ENSCVAG00000007012) tmem216 (ENSCVAG00000007021) tmed9 (ENSCVAG00000007041) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) emx3 (ENSCVAG00000007080) ENSCVAG00000007091 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007510 #30 Mummichog DUPLICATION Mummichog MODERN SPECIES 2389 ENSFHEG00000011163 tmem216 (ENSFHEG00000011139) TMED9 (ENSFHEG00000011132) b4galt7 (ENSFHEG00000011096) emx3 (ENSFHEG00000011050) ENSFHEG00000010972 ENSFHEG00000010963 ENSFHEG00000010937 ##37 ENSFHEG00000010848 ENSFHEG00000010834 ##36 ENSFHEG00000010811 #37 ENSFHEG00000010767 #36 ENSFHEG00000010752 #35 ENSFHEG00000010730 #35 ENSFHEG00000000648 #34 Mummichog MODERN SPECIES 1309 ENSFHEG00000009955 #34 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a ##37 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 299 cxcl14 (ENSHBUG00000023864) fam13b (ENSHBUG00000023865) ENSHBUG00000023866 ENSHBUG00000023867 HNRNPA0 (ENSHBUG00000023868) maea (ENSHBUG00000023869) zgc:136929 (ENSHBUG00000023870) spon2b (ENSHBUG00000023871) ENSHBUG00000023872 ENSHBUG00000023873 fgfrl1a (ENSHBUG00000023874) slit3 (ENSHBUG00000023875) ENSHBUG00000023877 ENSHBUG00000023878 #31 ENSHBUG00000023879 ##37 ENSHBUG00000023880 #34 ENSHBUG00000023881 #30 ENSHBUG00000023882 ENSHBUG00000023883 ##19 ENSHBUG00000023884 #36 ENSHBUG00000023831 ##37 ENSHBUG00000023795 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.c #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.d #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.m #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 KLHL3 (ENSACLG00000009006) ENSACLG00000008978 HNRNPA0 (ENSACLG00000008973) maea (ENSACLG00000008954) ENSACLG00000008947 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 KLHL3 (ENSMZEG00005001097) ENSMZEG00005001063 HNRNPA0 (ENSMZEG00005001055) maea (ENSMZEG00005001004) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) spon2b (ENSMZEG00005000941) ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 387 ENSMZEG00005028455 ENSMZEG00005028456 #36 ENSMZEG00005028457 #34 ENSMZEG00005028458 #30 ENSMZEG00005028459 ##37 ENSMZEG00005028460 ##37 ENSMZEG00005028461 ##37 ENSMZEG00005028463 ##37 ENSMZEG00005028464 ##37 P. nyererei MODERN SPECIES 315 eif4ea (ENSPNYG00000020891) LINGO2 (ENSPNYG00000020886) cxcl14 (ENSPNYG00000020877) fam13b (ENSPNYG00000020838) KLHL3 (ENSPNYG00000020787) ENSPNYG00000020763 ENSPNYG00000020729 maea (ENSPNYG00000020697) zgc:136929 (ENSPNYG00000020630) spon2b (ENSPNYG00000020614) ENSPNYG00000020600 fgfrl1a (ENSPNYG00000020579) slit3 (ENSPNYG00000020486) ENSPNYG00000020476 ENSPNYG00000020459 ##37 ENSPNYG00000020414 #34 ENSPNYG00000020369 #35 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000042129 hnrnpa0b (ENSONIG00000037027) maea (ENSONIG00000001054) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.a #33 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.a #33 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 287 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000008978 HNRNPA0 (ENSACLG00000008973) maea (ENSACLG00000008954) ENSACLG00000008947 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 fam13b (ENSNBRG00000014591) KLHL3 (ENSNBRG00000014552) ENSNBRG00000014522 ENSNBRG00000014469 maea (ENSNBRG00000014438) zgc:136929 (ENSNBRG00000014412) spon2b (ENSNBRG00000014396) ENSNBRG00000014380 fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) slit3 (ENSNBRG00000014236) ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000037748 LINGO2 (ENSONIG00000020949) cxcl14 (ENSONIG00000033809) fam13b (ENSONIG00000001068) KLHL3 (ENSONIG00000001059) ENSONIG00000042129 hnrnpa0b (ENSONIG00000037027) maea (ENSONIG00000001054) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 1096 LINGO2 (ENSACIG00000021678) cxcl14 (ENSACIG00000021683) fam13b (ENSACIG00000021699) KLHL3 (ENSACIG00000021783) ENSACIG00000021815 HNRNPA0 (ENSACIG00000021834) maea (ENSACIG00000021858) zgc:136929 (ENSACIG00000021871) spon2b (ENSACIG00000021886) ENSACIG00000021900 fgfrl1a (ENSACIG00000021910) slit3 (ENSACIG00000021930) ENSACIG00000021992 ENSACIG00000021999 #30 ENSACIG00000022015 #37 ENSACIG00000022037 #34 Midas cichlid MODERN SPECIES 1306 ENSACIG00000015460 ##37 ENSACIG00000015446 #35 ENSACIG00000015421 #34 ENSACIG00000015384 ##37 ENSACIG00000015374 ##30 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2533 ENSSPAG00000019024 #29 ENSSPAG00000019039 ##37 ENSSPAG00000019080 #29 ENSSPAG00000019099 #34 ENSSPAG00000019110 #28 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00730000111223 ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000165013.b.b Spiny chromis DUPLICATION Spiny chromis MODERN SPECIES 2208 ENSAPOG00000008756 #34 ENSAPOG00000008705 #28 ENSAPOG00000008679 Spiny chromis MODERN SPECIES 357 zgc:136929 (ENSAPOG00000008144) spon2b (ENSAPOG00000008090) ENSAPOG00000008057 fgfrl1a (ENSAPOG00000008028) slit3 (ENSAPOG00000007984) ENSAPOG00000007863 #34 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00730000111223 ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000167175.c ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.p ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.o.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.b #28 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000001690 eif4ea (ENSAPEG00000001758) LINGO2 (ENSAPEG00000002091) ENSAPEG00000002097 cxcl14 (ENSAPEG00000002109) fam13b (ENSAPEG00000002131) KLHL3 (ENSAPEG00000002167) ENSAPEG00000002224 ENSAPEG00000002274 maea (ENSAPEG00000002314) zgc:136929 (ENSAPEG00000002347) spon2b (ENSAPEG00000002387) ENSAPEG00000002409 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000168781 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010461 #30 ENSCGOG00000010463 #30 ENSCGOG00000010468 #28 ENSCGOG00000010471 ITGA6 (ENSCGOG00000010473) gpc2 (ENSCGOG00000010481) ENSCGOG00000010601 mcm7 (ENSCGOG00000010623) ENSCGOG00000011038 COPS6 (ENSCGOG00000011047) Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 KLHL3 (ENSCGOG00000009950) HNRNPA0 (ENSCGOG00000010091) ENSCGOG00000010096 maea (ENSCGOG00000010098) zgc:136929 (ENSCGOG00000010199) spon2b (ENSCGOG00000010244) ENSCGOG00000010249 ENSCGOG00000010311 fgfrl1a (ENSCGOG00000010315) ENSCGOG00000010321 ENSCGOG00000010326 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010357 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010423 #30 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010461 #30 ENSCGOG00000010463 #30 ENSCGOG00000010468 #28 ENSCGOG00000010471 ITGA6 (ENSCGOG00000010473) gpc2 (ENSCGOG00000010481) ENSCGOG00000010601 mcm7 (ENSCGOG00000010623) ENSCGOG00000011038 COPS6 (ENSCGOG00000011047) ENSCGOG00000011321 aurkb (ENSCGOG00000011322) ENSCGOG00000011323 nkx3-2 (ENSCGOG00000011341) ENSCGOG00000011344 Pike perch DUPLICATION Pike perch MODERN SPECIES 18 LINGO2 (ENSSLUG00000022705) cxcl14 (ENSSLUG00000022709) fam13b (ENSSLUG00000022722) KLHL3 (ENSSLUG00000022764) ENSSLUG00000022773 hnrnpa0b (ENSSLUG00000022778) maea (ENSSLUG00000022782) zgc:136929 (ENSSLUG00000022877) spon2b (ENSSLUG00000023507) ENSSLUG00000023515 ENSSLUG00000023520 fgfrl1a (ENSSLUG00000023537) slit3 (ENSSLUG00000023660) ENSSLUG00000023984 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024103 Pike perch MODERN SPECIES 18 ENSSLUG00000022773 hnrnpa0b (ENSSLUG00000022778) maea (ENSSLUG00000022782) zgc:136929 (ENSSLUG00000022877) spon2b (ENSSLUG00000023507) ENSSLUG00000023515 ENSSLUG00000023520 fgfrl1a (ENSSLUG00000023537) slit3 (ENSSLUG00000023660) ENSSLUG00000023984 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024103 ENSSLUG00000024108 gpc2 (ENSSLUG00000024133) STAG3 (ENSSLUG00000024162) mcm7 (ENSSLUG00000024175) Pike perch MODERN SPECIES 18 ENSSLUG00000023515 ENSSLUG00000023520 fgfrl1a (ENSSLUG00000023537) slit3 (ENSSLUG00000023660) ENSSLUG00000023984 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024103 ENSSLUG00000024108 gpc2 (ENSSLUG00000024133) STAG3 (ENSSLUG00000024162) mcm7 (ENSSLUG00000024175) ENSSLUG00000024236 COPS6 (ENSSLUG00000024239) ENSSLUG00000024249 aurkb (ENSSLUG00000024250) ENSSLUG00000024255 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.d #19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 HNRNPA0 (ENSSAUG00010024095) maea (ENSSAUG00010024088) zgc:136929 (ENSSAUG00010023293) spon2b (ENSSAUG00010023276) ENSSAUG00010023275 ENSSAUG00010023273 fgfrl1a (ENSSAUG00010023271) slit3 (ENSSAUG00010023026) ENSSAUG00010023023 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023275 ENSSAUG00010023273 fgfrl1a (ENSSAUG00010023271) slit3 (ENSSAUG00010023026) ENSSAUG00010023023 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 12 cxcl14 (ENSDLAG00005029354) ENSDLAG00005023239 ENSDLAG00005001234 ENSDLAG00005001297 ENSDLAG00005001313 MAEA (ENSDLAG00005001329) CTBP1 (ENSDLAG00005001521) spon2b (ENSDLAG00005002407) ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005001297 ENSDLAG00005001313 MAEA (ENSDLAG00005001329) CTBP1 (ENSDLAG00005001521) spon2b (ENSDLAG00005002407) ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005023239 ENSDLAG00005001234 ENSDLAG00005001297 ENSDLAG00005001313 MAEA (ENSDLAG00005001329) CTBP1 (ENSDLAG00005001521) spon2b (ENSDLAG00005002407) ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 Turbot MODERN SPECIES 4 ENSSMAG00000010196 ENSSMAG00000010246 ENSSMAG00000010279 MAEA (ENSSMAG00000010319) CTBP1 (ENSSMAG00000010328) spon2b (ENSSMAG00000010439) ENSSMAG00000010473 ENSSMAG00000029602 fgfrl1a (ENSSMAG00000010509) ENSSMAG00000010540 ENSSMAG00000010820 #33 ENSSMAG00000010797 ##37 ENSSMAG00000024700 ##37 ENSSMAG00000010841 ##37 ENSSMAG00000023026 ##37 ENSSMAG00000010900 #34 ENSSMAG00000010934 ENSSMAG00000010978 ENSSMAG00000025298 MCM7 (ENSSMAG00000011017) ENSSMAG00000011041 ENSSMAG00000011068 ENSSMAG00000011116 ENSSMAG00000011168 ENSSMAG00000011199 NKX3-2 (ENSSMAG00000011278) RAB28 (ENSSMAG00000031249) ENSSMAG00000011334 HS3ST1 (ENSSMAG00000029254) ENSSMAG00000011355 ENSSMAG00000011360 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 390 slit3 (ENSLCAG00010021484) ENSLCAG00010021910 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 slit3 (ENSLCAG00010021484) ENSLCAG00010021910 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) Seriola ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01040000242632 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.j #33 ENSGT00940000162676.a.a.x.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.i #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.y ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.x.b ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 KLHL3 (ENSSLDG00000024720) ENSSLDG00000024705 ENSSLDG00000024685 maea (ENSSLDG00000024664) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) spon2b (ENSSLDG00000024633) ENSSLDG00000024626 fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) slit3 (ENSSLDG00000024564) ENSSLDG00000024558 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024358 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024342 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024305 COPS6 (ENSSLDG00000024291) ENSSLDG00000024212 aurkb (ENSSLDG00000024189) ENSSLDG00000024171 nkx3-2 (ENSSLDG00000024167) Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 maea (ENSSLDG00000024664) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) spon2b (ENSSLDG00000024633) ENSSLDG00000024626 fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) slit3 (ENSSLDG00000024564) ENSSLDG00000024558 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024358 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024342 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024305 COPS6 (ENSSLDG00000024291) ENSSLDG00000024212 aurkb (ENSSLDG00000024189) ENSSLDG00000024171 nkx3-2 (ENSSLDG00000024167) RAB28 (ENSSLDG00000024149) HS3ST1 (ENSSLDG00000024142) ENSSLDG00000024139 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 FAT2 (ENSSLDG00000024755) KLHL3 (ENSSLDG00000024720) ENSSLDG00000024705 ENSSLDG00000024685 maea (ENSSLDG00000024664) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) spon2b (ENSSLDG00000024633) ENSSLDG00000024626 fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) slit3 (ENSSLDG00000024564) ENSSLDG00000024558 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024358 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024342 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024305 COPS6 (ENSSLDG00000024291) ENSSLDG00000024212 aurkb (ENSSLDG00000024189) ENSSLDG00000024171 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000017599 ENSMAMG00000017620 ENSMAMG00000017630 cxcl14 (ENSMAMG00000027577) ENSMAMG00000017652 ENSMAMG00000017687 ENSMAMG00000017728 ENSMAMG00000017754 MAEA (ENSMAMG00000017757) CTBP1 (ENSMAMG00000027529) spon2b (ENSMAMG00000017786) ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.q ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 cxcl14 (ENSBSLG00000018003) fam13b (ENSBSLG00000017811) KLHL3 (ENSBSLG00000017755) ENSBSLG00000017722 ENSBSLG00000017718 maea (ENSBSLG00000017650) ENSBSLG00000017634 zgc:136929 (ENSBSLG00000017079) spon2b (ENSBSLG00000017015) ENSBSLG00000016743 ENSBSLG00000016605 fgfrl1a (ENSBSLG00000016120) slit3 (ENSBSLG00000012410) ENSBSLG00000012210 ENSBSLG00000012199 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011803 #28 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 fam13b (ENSBSLG00000017811) KLHL3 (ENSBSLG00000017755) ENSBSLG00000017722 ENSBSLG00000017718 maea (ENSBSLG00000017650) ENSBSLG00000017634 zgc:136929 (ENSBSLG00000017079) spon2b (ENSBSLG00000017015) ENSBSLG00000016743 ENSBSLG00000016605 fgfrl1a (ENSBSLG00000016120) slit3 (ENSBSLG00000012410) ENSBSLG00000012210 ENSBSLG00000012199 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011727 #28 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 1 CTBP1 (ENSATEG00000003381) spon2b (ENSATEG00000003357) ENSATEG00000003335 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003059 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 Climbing perch MODERN SPECIES 1 spon2b (ENSATEG00000003357) ENSATEG00000003335 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003059 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000001999 Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 COPS6 (ENSMMDG00005003442) ENSMMDG00005003440 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005001983 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001313 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001119 slit3 (ENSMMDG00005021105) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) RNF212 (ENSMMDG00005021073) ENSMMDG00005021067 spon2b (ENSMMDG00005021051) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) maea (ENSMMDG00005020929) ENSMMDG00005020923 ENSMMDG00005020918 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005001983 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001313 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001119 slit3 (ENSMMDG00005021105) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) RNF212 (ENSMMDG00005021073) ENSMMDG00005021067 spon2b (ENSMMDG00005021051) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) maea (ENSMMDG00005020929) ENSMMDG00005020923 ENSMMDG00005020918 KLHL3 (ENSMMDG00005020871) fam13b (ENSMMDG00005020855) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005020923 maea (ENSMMDG00005020929) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) spon2b (ENSMMDG00005021051) ENSMMDG00005021067 RNF212 (ENSMMDG00005021073) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) slit3 (ENSMMDG00005021105) ENSMMDG00005001119 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001313 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001983 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005003440 COPS6 (ENSMMDG00005003442) ENSMMDG00005003445 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 LINGO2 (ENSMMDG00005020847) ENSMMDG00005020850 cxcl14 (ENSMMDG00005020852) fam13b (ENSMMDG00005020855) KLHL3 (ENSMMDG00005020871) ENSMMDG00005020918 ENSMMDG00005020923 maea (ENSMMDG00005020929) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) spon2b (ENSMMDG00005021051) ENSMMDG00005021067 RNF212 (ENSMMDG00005021073) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) slit3 (ENSMMDG00005021105) ENSMMDG00005001119 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001313 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 slit3 (ENSMMDG00005021105) ENSMMDG00005001119 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001313 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001983 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005003440 COPS6 (ENSMMDG00005003442) ENSMMDG00005003445 aurkb (ENSMMDG00005003446) nkx3-2 (ENSMMDG00005003448) RAB28 (ENSMMDG00005003450) HS3ST1 (ENSMMDG00005003453) ENSMMDG00005003455 ENSMMDG00005003456 gsr (ENSMMDG00005003474) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000018996 nkx3-2 (ENSMAMG00000018984) ENSMAMG00000018930 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010022555 ENSLCAG00010022544 aurkb (ENSLCAG00010022522) ENSLCAG00010022520 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022496 ENSLCAG00010022488 gpc2 (ENSLCAG00010022484) ITGA6 (ENSLCAG00010022410) ENSLCAG00010022370 ##37 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022186 #33 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010021989 ##30 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021962 #33 Barramundi perch MODERN SPECIES 1096 ENSLCAG00010004545 #28 ENSLCAG00010004533 #28 ENSLCAG00010004527 ##19 ENSLCAG00010004513 #28 ENSLCAG00010004503 ##37 Seriola ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01040000242632 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.j #33 ENSGT00940000162676.a.a.x.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.i #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.y ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.x.b ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a Greater amberjack MODERN SPECIES 113 cxcl14 (ENSSDUG00000002234) fam13b (ENSSDUG00000002262) KLHL3 (ENSSDUG00000002322) ENSSDUG00000002394 ENSSDUG00000002431 maea (ENSSDUG00000002472) zgc:136929 (ENSSDUG00000002539) spon2b (ENSSDUG00000002572) ENSSDUG00000002593 ENSSDUG00000002614 fgfrl1a (ENSSDUG00000002673) slit3 (ENSSDUG00000002721) ENSSDUG00000002822 ENSSDUG00000002832 ENSSDUG00000002835 #31 ENSSDUG00000002855 ##37 ENSSDUG00000002873 #33 ENSSDUG00000002892 ENSSDUG00000002917 ##30 ENSSDUG00000002940 #33 ENSSDUG00000002957 #30 ENSSDUG00000002988 ENSSDUG00000003047 #30 ENSSDUG00000003071 ##37 ENSSDUG00000003103 ##30 ENSSDUG00000003176 #28 ENSSDUG00000003194 ENSSDUG00000003208 gpc2 (ENSSDUG00000003228) ENSSDUG00000003250 mcm7 (ENSSDUG00000003338) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 SLC36A1 (ENSSLDG00000024977) mtnr1al (ENSSLDG00000024810) FAT2 (ENSSLDG00000024755) KLHL3 (ENSSLDG00000024720) ENSSLDG00000024705 ENSSLDG00000024685 maea (ENSSLDG00000024664) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) spon2b (ENSSLDG00000024633) ENSSLDG00000024626 fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) slit3 (ENSSLDG00000024564) ENSSLDG00000024558 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024358 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024342 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024305 COPS6 (ENSSLDG00000024291) ENSSLDG00000024212 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Amazon molly MODERN SPECIES 481 COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Mummichog MODERN SPECIES 1450 ENSFHEG00000019066 ##37 ENSFHEG00000019085 ##19 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017938 ##37 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017933 #29 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017927 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017879 ENSCLMG00005017878 mcm7 (ENSCLMG00005017691) ENSCLMG00005017687 COPS6 (ENSCLMG00005017553) ENSCLMG00005017549 aurkb (ENSCLMG00005017547) ENSCLMG00005017543 nkx3-2 (ENSCLMG00005017542) RAB28 (ENSCLMG00005017539) HS3ST1 (ENSCLMG00005017538)