Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 401 ENSGT00730000112044 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000178201 ENSGT00940000162676.a.b ENSGT01030000234530 #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000177616 Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 186 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000014827 ENSGT00950000182866.D.d.b ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT01060000248608.b ENSGT00950000182866.D.d.b ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.b.b ##37 Acanthomorphata DUPLICATION Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155244.d ENSGT00940000153596.A ENSGT00530000063860.a ENSGT00940000164810 ENSGT00940000158869 ENSGT00940000167363 ENSGT00390000017284.b ENSGT00940000153322.B.d.a ENSGT00940000169511 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00390000003288 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182968.d.b.a #30 ENSGT01030000234530.a.d #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Ovalentaria DUPLICATION Ovalentaria DUPLICATION Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.A ##19 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a Cyprinodontiformes DUPLICATION Cyprinodontiformes DUPLICATION Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000029173 #37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006847 #15 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014575 ##37 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 497 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1678 ENSCVAG00000019870 ENSCVAG00000019862 #31 ENSCVAG00000019757 #29 ENSCVAG00000019750 ##37 ENSCVAG00000019737 #18 ENSCVAG00000019713 #22 Aplocheiloidei DUPLICATION Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000157891 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1610 ENSNFUG00015001950 aurkb (ENSNFUG00015001956) ENSNFUG00015001968 COPS6 (ENSNFUG00015002003) ENSNFUG00015002021 MCM7 (ENSNFUG00015002038) ENSNFUG00015002082 ENSNFUG00015002084 ENSNFUG00015002087 GPC6L (ENSNFUG00015002103) ENSNFUG00015002143 ENSNFUG00015002201 ##37 ENSNFUG00015002212 ENSNFUG00015002218 ##37 Nfu_g_1_004472 (ENSNFUG00015002237) #29 ENSNFUG00015002254 #22 ENSNFUG00015002290 #19 ENSNFUG00015002293 ENSNFUG00015002297 #34 slit3 (ENSNFUG00015002545) FGFRL1A (ENSNFUG00015003941) ENSNFUG00015003946 ENSNFUG00015003957 spon2b (ENSNFUG00015003985) ENSNFUG00015003988 ENSNFUG00015003989 zgc:136929 (ENSNFUG00015004023) maea (ENSNFUG00015004184) hnrnpa0b (ENSNFUG00015004193) ENSNFUG00015004196 KLHL3 (ENSNFUG00015004210) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Cyprinodontiformes DUPLICATION Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 221 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a #13 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 828 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 Amazon molly MODERN SPECIES 481 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Guppy MODERN SPECIES 440 COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 Platyfish MODERN SPECIES 15 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 ENSGT00390000003288 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 Amazon molly MODERN SPECIES 1285 ENSPFOG00000018912 #13 ENSPFOG00000023346 #12 ENSPFOG00000022639 #14 ENSPFOG00000018909 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 Guppy MODERN SPECIES 440 nkx3-2 (ENSPREG00000013893) ENSPREG00000013906 ENSPREG00000013936 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a.ab ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 Amazon molly MODERN SPECIES 481 nkx3-2 (ENSPFOG00000002882) ENSPFOG00000002857 aurkb (ENSPFOG00000002811) ENSPFOG00000002788 ENSPFOG00000002769 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Guppy MODERN SPECIES 440 HS3ST1 (ENSPREG00000013838) ENSPREG00000013861 nkx3-2 (ENSPREG00000013893) ENSPREG00000013906 ENSPREG00000013936 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 Platyfish DUPLICATION Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000021608 ENSXMAG00000016271 HS3ST1 (ENSXMAG00000026035) ENSXMAG00000016277 nkx3-2 (ENSXMAG00000023793) ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016271 HS3ST1 (ENSXMAG00000026035) ENSXMAG00000016277 nkx3-2 (ENSXMAG00000023793) ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a.ab ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1463 ENSCVAG00000010030 zgc:162895 (ENSCVAG00000010004) ENSCVAG00000009981 ENSCVAG00000009943 ENSCVAG00000009935 ##37 ENSCVAG00000009922 ##37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1463 ENSCVAG00000010030 zgc:162895 (ENSCVAG00000010004) ENSCVAG00000009981 ENSCVAG00000009943 ENSCVAG00000009935 ##37 ENSCVAG00000009922 ##37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 Platyfish DUPLICATION Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 Platyfish MODERN SPECIES 15 nkx3-2 (ENSXMAG00000023793) ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 DUPLICATION NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 Amazon molly DUPLICATION Amazon molly MODERN SPECIES 481 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Amazon molly MODERN SPECIES 481 ENSPFOG00000002788 ENSPFOG00000002769 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 ENSPLAG00000006020 nkx3-2 (ENSPLAG00000006028) ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.f ##37 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 ENSPLAG00000006020 nkx3-2 (ENSPLAG00000006028) ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000013936 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.a #10 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.a #10 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.a #10 Amazon molly MODERN SPECIES 481 ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Platyfish MODERN SPECIES 15 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 DUPLICATION NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 Sailfin molly DUPLICATION Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 nkx3-2 (ENSPLAG00000006028) ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Amazon molly MODERN SPECIES 481 ENSPFOG00000002769 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 828 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 Amazon molly MODERN SPECIES 481 ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Guppy DUPLICATION Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 Guppy MODERN SPECIES 440 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 Platyfish DUPLICATION Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 Amazon molly MODERN SPECIES 481 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a.ab ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.b ##37 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.b ##37 Mummichog MODERN SPECIES 1806 ENSFHEG00000006724 ##37 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000019121 aurkb (ENSKMAG00000019109) ENSKMAG00000019102 COPS6 (ENSKMAG00000019077) ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00940000156986 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a.ab ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 511 ENSCVAG00000001675 HS3ST1 (ENSCVAG00000001677) ENSCVAG00000001684 nkx3-2 (ENSCVAG00000001687) ENSCVAG00000001692 aurkb (ENSCVAG00000001696) ENSCVAG00000001698 ENSCVAG00000001703 mcm7 (ENSCVAG00000000067) ENSCVAG00000001715 ENSCVAG00000001717 gpc2 (ENSCVAG00000001724) ENSCVAG00000000069 ENSCVAG00000001728 ##37 ENSCVAG00000001735 ##37 ENSCVAG00000001749 ##37 ENSCVAG00000001757 ##37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 511 ENSCVAG00000001673 ENSCVAG00000001675 HS3ST1 (ENSCVAG00000001677) ENSCVAG00000001684 nkx3-2 (ENSCVAG00000001687) ENSCVAG00000001692 aurkb (ENSCVAG00000001696) ENSCVAG00000001698 ENSCVAG00000001703 mcm7 (ENSCVAG00000000067) ENSCVAG00000001715 ENSCVAG00000001717 gpc2 (ENSCVAG00000001724) ENSCVAG00000000069 ENSCVAG00000001728 ##37 ENSCVAG00000001735 ##37 ENSCVAG00000001749 ##37 ENSCVAG00000001757 ##37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 511 HS3ST1 (ENSCVAG00000001677) ENSCVAG00000001684 nkx3-2 (ENSCVAG00000001687) ENSCVAG00000001692 aurkb (ENSCVAG00000001696) ENSCVAG00000001698 ENSCVAG00000001703 mcm7 (ENSCVAG00000000067) ENSCVAG00000001715 ENSCVAG00000001717 gpc2 (ENSCVAG00000001724) ENSCVAG00000000069 ENSCVAG00000001728 ##37 ENSCVAG00000001735 ##37 ENSCVAG00000001749 ##37 ENSCVAG00000001757 ##37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 ENSPLAG00000006020 nkx3-2 (ENSPLAG00000006028) ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000013830 HS3ST1 (ENSPREG00000013838) ENSPREG00000013861 nkx3-2 (ENSPREG00000013893) ENSPREG00000013906 ENSPREG00000013936 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 Amazon molly MODERN SPECIES 481 ENSPFOG00000002857 aurkb (ENSPFOG00000002811) ENSPFOG00000002788 ENSPFOG00000002769 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 ENSPLAG00000006020 nkx3-2 (ENSPLAG00000006028) ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000013861 nkx3-2 (ENSPREG00000013893) ENSPREG00000013906 ENSPREG00000013936 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 Platyfish MODERN SPECIES 15 HS3ST1 (ENSXMAG00000026035) ENSXMAG00000016277 nkx3-2 (ENSXMAG00000023793) ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016277 nkx3-2 (ENSXMAG00000023793) ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 Amazon molly MODERN SPECIES 481 aurkb (ENSPFOG00000002811) ENSPFOG00000002788 ENSPFOG00000002769 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a.ab ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000168577 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000019139 nkx3-2 (ENSKMAG00000019133) ENSKMAG00000019121 aurkb (ENSKMAG00000019109) ENSKMAG00000019102 COPS6 (ENSKMAG00000019077) ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 HS3ST1 (ENSKMAG00000019173) ENSKMAG00000019139 nkx3-2 (ENSKMAG00000019133) ENSKMAG00000019121 aurkb (ENSKMAG00000019109) ENSKMAG00000019102 COPS6 (ENSKMAG00000019077) ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Cyprinodontiformes DUPLICATION Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000927 emx3 (ENSPLAG00000000925) Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006847 #15 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000022772 #35 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000023923 #35 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000162676.a.a Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014562 ##37 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006847 #15 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000022302 ##37 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000027622 #36 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000929 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006847 #15 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 497 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Mummichog DUPLICATION Mummichog MODERN SPECIES 1383 ENSFHEG00000022109 #18 ENSFHEG00000022119 #18 Mummichog MODERN SPECIES 1383 ENSFHEG00000022109 #18 ENSFHEG00000022119 #18 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1678 ENSCVAG00000019870 ENSCVAG00000019862 #31 ENSCVAG00000019757 #29 ENSCVAG00000019750 ##37 ENSCVAG00000019737 #18 ENSCVAG00000019713 #22 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 COPS6 (ENSKMAG00000019077) ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000019102 COPS6 (ENSKMAG00000019077) ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006847 #15 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000927 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014537 #37 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 Mummichog MODERN SPECIES 1837 ENSFHEG00000005460 ##37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000164241 Bicolor damselfish DUPLICATION Bicolor damselfish MODERN SPECIES 258 ENSSPAG00000003553 ##19 ENSSPAG00000003538 #28 ENSSPAG00000003530 ##37 ENSSPAG00000003507 gpc2 (ENSSPAG00000003121) ENSSPAG00000003046 ENSSPAG00000003027 mcm7 (ENSSPAG00000002973) ENSSPAG00000002955 COPS6 (ENSSPAG00000002910) ENSSPAG00000002899 aurkb (ENSSPAG00000002883) ENSSPAG00000002862 nkx3-2 (ENSSPAG00000002841) ENSSPAG00000002809 HS3ST1 (ENSSPAG00000002799) ENSSPAG00000002771 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2533 ENSSPAG00000019024 #29 ENSSPAG00000019039 ##37 ENSSPAG00000019080 #29 ENSSPAG00000019099 #34 ENSSPAG00000019110 #28 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000165013.b.b ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 Amphiprion DUPLICATION Amphiprion DUPLICATION Amphiprion DUPLICATION Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.o.b.b ENSGT00940000162676.a.a.o.b.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.b.a.a #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000165013.b.b ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000154669.b.b.a.a.j.a Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000002409 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003444 ENSAPEG00000003475 mcm7 (ENSAPEG00000003656) ENSAPEG00000003720 COPS6 (ENSAPEG00000003738) aurkb (ENSAPEG00000003753) ENSAPEG00000003785 ENSAPEG00000003803 nkx3-2 (ENSAPEG00000003825) RAB28 (ENSAPEG00000003839) ENSAPEG00000003881 HS3ST1 (ENSAPEG00000003896) Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 ENSAOCG00000019313 mcm7 (ENSAOCG00000001386) ENSAOCG00000019215 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.o.b.b ENSGT00940000162676.a.a.o.b.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.b.a.a #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000165013.b.b Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 ENSAOCG00000019313 mcm7 (ENSAOCG00000001386) ENSAOCG00000019215 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000002274 maea (ENSAPEG00000002314) zgc:136929 (ENSAPEG00000002347) spon2b (ENSAPEG00000002387) ENSAPEG00000002409 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003444 ENSAPEG00000003475 mcm7 (ENSAPEG00000003656) ENSAPEG00000003720 COPS6 (ENSAPEG00000003738) aurkb (ENSAPEG00000003753) ENSAPEG00000003785 ENSAPEG00000003803 Amphiprion DUPLICATION Amphiprion DUPLICATION Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.o.b.b ENSGT00940000162676.a.a.o.b.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.b.a.a #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000165013.b.b ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000154669.b.b.a.a.j.a ENSGT00940000160449 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003444 ENSAPEG00000003475 mcm7 (ENSAPEG00000003656) ENSAPEG00000003720 COPS6 (ENSAPEG00000003738) aurkb (ENSAPEG00000003753) ENSAPEG00000003785 ENSAPEG00000003803 nkx3-2 (ENSAPEG00000003825) RAB28 (ENSAPEG00000003839) ENSAPEG00000003881 HS3ST1 (ENSAPEG00000003896) ENSAPEG00000003907 Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 ENSAOCG00000019313 mcm7 (ENSAOCG00000001386) ENSAOCG00000019215 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.b.a.b #28 Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 ENSAOCG00000019313 mcm7 (ENSAOCG00000001386) ENSAOCG00000019215 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.b.b #28 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 fam13b (ENSAPEG00000002131) KLHL3 (ENSAPEG00000002167) ENSAPEG00000002224 ENSAPEG00000002274 maea (ENSAPEG00000002314) zgc:136929 (ENSAPEG00000002347) spon2b (ENSAPEG00000002387) ENSAPEG00000002409 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003444 ENSAPEG00000003475 mcm7 (ENSAPEG00000003656) ENSAPEG00000003720 COPS6 (ENSAPEG00000003738) Amphiprion DUPLICATION Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000167175.c ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.p ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.o.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.b #28 Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000002097 cxcl14 (ENSAPEG00000002109) fam13b (ENSAPEG00000002131) KLHL3 (ENSAPEG00000002167) ENSAPEG00000002224 ENSAPEG00000002274 maea (ENSAPEG00000002314) zgc:136929 (ENSAPEG00000002347) spon2b (ENSAPEG00000002387) ENSAPEG00000002409 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003444 ENSAPEG00000003475 mcm7 (ENSAPEG00000003656) Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000167175.c ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.p ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.o.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.b #28 Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 ENSAOCG00000019313 mcm7 (ENSAOCG00000001386) ENSAOCG00000019215 Spiny chromis MODERN SPECIES 2208 ENSAPOG00000008756 #34 ENSAPOG00000008705 #28 ENSAPOG00000008679 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Amazon molly MODERN SPECIES 287 emx3 (ENSPFOG00000007211) ENSPFOG00000007161 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007140 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014262 ##36 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000023983 #13 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 Mummichog MODERN SPECIES 1311 ENSFHEG00000009910 #28 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 260 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f #27 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Amazon molly DUPLICATION Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007140 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 emx3 (ENSPLAG00000000925) ENSPLAG00000000927 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000963 #15 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000029264 #8 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.a.a #25 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.a.a #25 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.a.a #25 Amazon molly DUPLICATION Amazon molly MODERN SPECIES 287 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000007140 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000027472 #10 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.a.b #26 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023409 #11 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 emx3 (ENSPLAG00000000925) ENSPLAG00000000927 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000963 #15 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000007161 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007140 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Platyfish MODERN SPECIES 15 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000021675 #9 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000021194 #12 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014252 #8 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f #27 Mummichog MODERN SPECIES 2055 ENSFHEG00000021364 #27 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 406 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.A ##19 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000018512 #28 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161846 Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a ##37 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 480 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.d ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.a ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000706 #31 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002564 ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 pcdh10b (ENSACLG00000007281) ENSACLG00000007138 immt (ENSACLG00000007052) ENSACLG00000007036 ENSACLG00000007027 Eastern happy MODERN SPECIES 11 tmem129 (ENSACLG00000007010) ENSACLG00000007027 ENSACLG00000007036 immt (ENSACLG00000007052) ENSACLG00000007138 pcdh10b (ENSACLG00000007281) ENSACLG00000007573 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007643 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000008571 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008702 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008712 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008780 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000013751 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014223 slit3 (ENSNBRG00000014236) fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) ENSNBRG00000014380 spon2b (ENSNBRG00000014396) Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000020948 slit3 (ENSONIG00000000988) fgfrl1a (ENSONIG00000001038) ENSONIG00000032367 ENSONIG00000042977 spon2b (ENSONIG00000001044) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) maea (ENSONIG00000001054) Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 171 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.c #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.d #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.m #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.b ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 HNRNPA0 (ENSMZEG00005001055) maea (ENSMZEG00005001004) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) spon2b (ENSMZEG00005000941) ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 178 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a ##37 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 maea (ENSACLG00000008954) ENSACLG00000008947 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 Zebra mbuna MODERN SPECIES 387 ENSMZEG00005028455 ENSMZEG00005028456 #36 ENSMZEG00005028457 #34 ENSMZEG00005028458 #30 ENSMZEG00005028459 ##37 ENSMZEG00005028460 ##37 ENSMZEG00005028461 ##37 ENSMZEG00005028463 ##37 ENSMZEG00005028464 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003822 ENSACLG00000004208 nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000000944 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.b ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 zgc:136929 (ENSONIG00000001046) spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.b ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini DUPLICATION Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.c.a ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1426 ENSHBUG00000011801 #30 ENSHBUG00000011848 ##37 ENSHBUG00000011862 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.c.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.c.a ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.c.b ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1332 ENSHBUG00000018279 ##37 ENSHBUG00000001151 ##37 ENSHBUG00000018403 ##37 ENSHBUG00000018420 ##37 ENSHBUG00000018441 ##37 ENSHBUG00000018468 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.c.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.c.b ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 170 ENSNBRG00000000645 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 118 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b Haplochromini_A DUPLICATION Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011833 ##37 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012321 ##37 hvcn1 (ENSPNYG00000012350) ENSPNYG00000012384 nkx1.2lb (ENSPNYG00000012402) uvssa (ENSPNYG00000012422) ENSPNYG00000012466 ENSPNYG00000012496 trappc11 (ENSPNYG00000012539) ENSPNYG00000012638 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000028895 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000002344 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1332 ENSHBUG00000018279 ##37 ENSHBUG00000001151 ##37 ENSHBUG00000018403 ##37 ENSHBUG00000018420 ##37 ENSHBUG00000018441 ##37 ENSHBUG00000018468 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 ENSNBRG00000013650 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 204 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1332 ENSHBUG00000018279 ##37 ENSHBUG00000001151 ##37 ENSHBUG00000018403 ##37 ENSHBUG00000018420 ##37 ENSHBUG00000018441 ##37 ENSHBUG00000018468 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011833 ##37 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012321 ##37 hvcn1 (ENSPNYG00000012350) ENSPNYG00000012384 nkx1.2lb (ENSPNYG00000012402) uvssa (ENSPNYG00000012422) ENSPNYG00000012466 ENSPNYG00000012496 trappc11 (ENSPNYG00000012539) ENSPNYG00000012638 ENSPNYG00000012661 ENSPNYG00000012717 zgc:154054 (ENSPNYG00000012918) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003822 ENSACLG00000004208 nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) uvssa (ENSACLG00000004230) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 178 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000030312 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003822 ENSACLG00000004208 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1332 ENSHBUG00000018279 ##37 ENSHBUG00000001151 ##37 ENSHBUG00000018403 ##37 ENSHBUG00000018420 ##37 ENSHBUG00000018441 ##37 ENSHBUG00000018468 ##37 Lyretail cichlid DUPLICATION Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 ENSNBRG00000013650 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 374 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 375 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 226 ENSGT01020000233681 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.b ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.b ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.a ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 422 ENSONIG00000037087 ##37 ENSONIG00000000953 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 420 ENSONIG00000019894 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000002344 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 Nile tilapia MODERN SPECIES 422 ENSONIG00000037087 ##37 ENSONIG00000000953 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 mcm7 (ENSONIG00000002357) ENSONIG00000042159 ENSONIG00000028895 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000002344 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 204 ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 217 ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161846 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000002344 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000028895 ENSONIG00000042159 mcm7 (ENSONIG00000002357) ENSONIG00000030352 COPS6 (ENSONIG00000002367) Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000175226 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 ENSNBRG00000013650 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000160288 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000160288 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003822 ENSACLG00000004208 nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) uvssa (ENSACLG00000004230) ENSACLG00000004263 spdl1 (ENSACLG00000004291) ENSACLG00000004344 Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) uvssa (ENSMZEG00005017618) ENSMZEG00005017613 spdl1 (ENSMZEG00005017607) trappc11 (ENSMZEG00005017572) ENSMZEG00005017562 ENSMZEG00005017557 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) uvssa (ENSMZEG00005017618) ENSMZEG00005017613 spdl1 (ENSMZEG00005017607) trappc11 (ENSMZEG00005017572) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000175226 ENSGT00940000160541 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1373 ENSHBUG00000015704 ##37 ENSHBUG00000015683 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000160288 ENSGT00390000004827 P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012321 ##37 hvcn1 (ENSPNYG00000012350) ENSPNYG00000012384 nkx1.2lb (ENSPNYG00000012402) uvssa (ENSPNYG00000012422) ENSPNYG00000012466 ENSPNYG00000012496 trappc11 (ENSPNYG00000012539) ENSPNYG00000012638 ENSPNYG00000012661 ENSPNYG00000012717 zgc:154054 (ENSPNYG00000012918) SCOC (ENSPNYG00000012973) mgst2 (ENSPNYG00000012985) setd7 (ENSPNYG00000013002) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000160288 ENSGT00390000004827 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003822 ENSACLG00000004208 nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) uvssa (ENSACLG00000004230) ENSACLG00000004263 spdl1 (ENSACLG00000004291) ENSACLG00000004344 trappc11 (ENSACLG00000004352) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) uvssa (ENSMZEG00005017618) ENSMZEG00005017613 spdl1 (ENSMZEG00005017607) trappc11 (ENSMZEG00005017572) ENSMZEG00005017562 Lyretail cichlid DUPLICATION Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 ENSNBRG00000013650 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 ENSNBRG00000013650 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000002344 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000028895 ENSONIG00000042159 mcm7 (ENSONIG00000002357) ENSONIG00000030352 COPS6 (ENSONIG00000002367) ENSONIG00000002370 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 17 ENSACLG00000026589 tp53rk (ENSACLG00000026597) ENSACLG00000026602 ENSACLG00000026615 stk35l (ENSACLG00000026625) ENSACLG00000026636 ENSACLG00000026734 apobec2a (ENSACLG00000026736) PLEKHA6 (ENSACLG00000026740) ENSACLG00000026784 ENSACLG00000026879 ENSACLG00000026884 fezf2 (ENSACLG00000026890) ENSACLG00000026899 fhit (ENSACLG00000026924) ENSACLG00000026929 ##37 ENSACLG00000026936 ##37 ENSACLG00000026941 ##37 ENSACLG00000026946 LDLRAD2 (ENSACLG00000026951) ENSACLG00000000044 camk1ga (ENSACLG00000000072) USP48 (ENSACLG00000000118) ENSACLG00000000215 cyb561d1 (ENSACLG00000000238) atxn7l2a (ENSACLG00000000256) sypl2a (ENSACLG00000000264) ENSACLG00000000290 ENSACLG00000000311 ENSACLG00000000325 nfasca (ENSACLG00000000344) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) uvssa (ENSMZEG00005017618) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 17 ENSACLG00000026602 ENSACLG00000026615 stk35l (ENSACLG00000026625) ENSACLG00000026636 ENSACLG00000026734 apobec2a (ENSACLG00000026736) PLEKHA6 (ENSACLG00000026740) ENSACLG00000026784 ENSACLG00000026879 ENSACLG00000026884 fezf2 (ENSACLG00000026890) ENSACLG00000026899 fhit (ENSACLG00000026924) ENSACLG00000026929 ##37 ENSACLG00000026936 ##37 ENSACLG00000026941 ##37 ENSACLG00000026946 LDLRAD2 (ENSACLG00000026951) ENSACLG00000000044 camk1ga (ENSACLG00000000072) USP48 (ENSACLG00000000118) ENSACLG00000000215 cyb561d1 (ENSACLG00000000238) atxn7l2a (ENSACLG00000000256) sypl2a (ENSACLG00000000264) ENSACLG00000000290 ENSACLG00000000311 ENSACLG00000000325 nfasca (ENSACLG00000000344) ENSACLG00000000593 ENSACLG00000000597 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017641 #36 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017630 nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) uvssa (ENSMZEG00005017618) ENSMZEG00005017613 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) ENSNBRG00000013675 ENSNBRG00000013650 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000034073 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000015232 ##37 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.b ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 178 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a ##37 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 1306 ENSACIG00000015460 ##37 ENSACIG00000015446 #35 ENSACIG00000015421 #34 ENSACIG00000015384 ##37 ENSACIG00000015374 ##30 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) gpc2 (ENSACIG00000003456) ENSACIG00000003487 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini DUPLICATION Haplochromini DUPLICATION Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.a ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1332 ENSHBUG00000018279 ##37 ENSHBUG00000001151 ##37 ENSHBUG00000018403 ##37 ENSHBUG00000018420 ##37 ENSHBUG00000018441 ##37 ENSHBUG00000018468 ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.a.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003800 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003822 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 387 ENSMZEG00005028455 ENSMZEG00005028456 #36 ENSMZEG00005028457 #34 ENSMZEG00005028458 #30 ENSMZEG00005028459 ##37 ENSMZEG00005028460 ##37 ENSMZEG00005028461 ##37 ENSMZEG00005028463 ##37 ENSMZEG00005028464 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.d ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.d ##37 P. nyererei MODERN SPECIES 1084 ENSPNYG00000021739 ##37 ENSPNYG00000021748 ENSPNYG00000021773 ##19 ENSPNYG00000021801 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000027440 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 224 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.c ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 163 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.c ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011833 ##37 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012321 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 480 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.a ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 zgc:136929 (ENSNBRG00000014412) spon2b (ENSNBRG00000014396) ENSNBRG00000014380 fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) slit3 (ENSNBRG00000014236) ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 373 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B #19 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 373 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B #19 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 204 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.a ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 pcdh10b (ENSACLG00000007281) ENSACLG00000007138 immt (ENSACLG00000007052) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 299 maea (ENSHBUG00000023869) zgc:136929 (ENSHBUG00000023870) spon2b (ENSHBUG00000023871) ENSHBUG00000023872 ENSHBUG00000023873 fgfrl1a (ENSHBUG00000023874) slit3 (ENSHBUG00000023875) ENSHBUG00000023877 ENSHBUG00000023878 #31 ENSHBUG00000023879 ##37 ENSHBUG00000023880 #34 ENSHBUG00000023881 #30 ENSHBUG00000023882 ENSHBUG00000023883 ##19 ENSHBUG00000023884 #36 ENSHBUG00000023831 ##37 ENSHBUG00000023795 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 204 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1426 ENSHBUG00000011801 #30 ENSHBUG00000011848 ##37 ENSHBUG00000011862 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011833 ##37 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012321 ##37 hvcn1 (ENSPNYG00000012350) ENSPNYG00000012384 nkx1.2lb (ENSPNYG00000012402) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) slit3 (ENSNBRG00000014236) ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 324 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.b.a ##37 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.b.b ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 226 ENSGT01020000233681 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.b ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 479 ENSGT01020000233681 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.b.b ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.b.b ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1543 ENSHBUG00000023652 ##37 ENSHBUG00000023681 ##19 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 171 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.a ##37 P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011833 ##37 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 pcdh10b (ENSACLG00000007281) ENSACLG00000007138 immt (ENSACLG00000007052) ENSACLG00000007036 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 pcdh10b (ENSACLG00000007281) ENSACLG00000007138 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.a ##37 Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 387 ENSMZEG00005028455 ENSMZEG00005028456 #36 ENSMZEG00005028457 #34 ENSMZEG00005028458 #30 ENSMZEG00005028459 ##37 ENSMZEG00005028460 ##37 ENSMZEG00005028461 ##37 ENSMZEG00005028463 ##37 ENSMZEG00005028464 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1909 ENSHBUG00000021475 ##37 Lyretail cichlid DUPLICATION Lyretail cichlid MODERN SPECIES 833 ENSNBRG00000003377 ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 maea (ENSNBRG00000014438) zgc:136929 (ENSNBRG00000014412) spon2b (ENSNBRG00000014396) ENSNBRG00000014380 fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) slit3 (ENSNBRG00000014236) ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 Fugu MODERN SPECIES 5 ENSTRUG00000015516 eif4ea (ENSTRUG00000024250) LINGO2 (ENSTRUG00000015501) cxcl14 (ENSTRUG00000024992) fam13b (ENSTRUG00000015447) KLHL3 (ENSTRUG00000015376) ENSTRUG00000021494 hnrnpa0b (ENSTRUG00000015362) zgc:136929 (ENSTRUG00000015287) spon2 (ENSTRUG00000015262) maea (ENSTRUG00000015332) ENSTRUG00000015229 ENSTRUG00000030160 fgfrl1a (ENSTRUG00000015192) slit3 (ENSTRUG00000014930) ENSTRUG00000014929 #28 ENSTRUG00000032931 ENSTRUG00000028984 #30 ENSTRUG00000029835 #30 ENSTRUG00000033377 #30 ENSTRUG00000026725 #30 ENSTRUG00000028475 ENSTRUG00000030501 ENSTRUG00000027453 #30 ENSTRUG00000030017 #29 ENSTRUG00000033022 ENSTRUG00000027161 #30 ENSTRUG00000033390 ENSTRUG00000030499 #30 ENSTRUG00000029980 #29 ENSTRUG00000003304 #30 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 1432 ENSLBEG00000007263 #28 ENSLBEG00000007317 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2560 ENSLBEG00000014573 #28 ENSLBEG00000014556 #28 ENSLBEG00000014528 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4134 ENSLBEG00000008794 #28 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1307 ENSLBEG00000024930 ##19 ENSLBEG00000024907 #28 ENSLBEG00000024889 ##37 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 3015 ENSLBEG00000003810 #29 ENSLBEG00000003830 #28 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2560 ENSLBEG00000014573 #28 ENSLBEG00000014556 #28 ENSLBEG00000014528 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2465 ENSLBEG00000010121 #29 ENSLBEG00000010141 #28 ENSLBEG00000010164 #28 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2465 ENSLBEG00000010121 #29 ENSLBEG00000010141 #28 ENSLBEG00000010164 #28 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153147.a.a Perciformes ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000171832 Pike perch DUPLICATION Pike perch MODERN SPECIES 18 ENSSLUG00000023984 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024103 ENSSLUG00000024108 gpc2 (ENSSLUG00000024133) STAG3 (ENSSLUG00000024162) mcm7 (ENSSLUG00000024175) ENSSLUG00000024236 COPS6 (ENSSLUG00000024239) ENSSLUG00000024249 aurkb (ENSSLUG00000024250) ENSSLUG00000024255 nkx3-2 (ENSSLUG00000024263) RAB28 (ENSSLUG00000024264) ENSSLUG00000024268 HS3ST1 (ENSSLUG00000024272) Pike perch MODERN SPECIES 18 zgc:136929 (ENSSLUG00000022877) spon2b (ENSSLUG00000023507) ENSSLUG00000023515 ENSSLUG00000023520 fgfrl1a (ENSSLUG00000023537) slit3 (ENSSLUG00000023660) ENSSLUG00000023984 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024103 ENSSLUG00000024108 gpc2 (ENSSLUG00000024133) STAG3 (ENSSLUG00000024162) mcm7 (ENSSLUG00000024175) ENSSLUG00000024236 COPS6 (ENSSLUG00000024239) ENSSLUG00000024249 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010461 #30 ENSCGOG00000010463 #30 ENSCGOG00000010468 #28 ENSCGOG00000010471 ITGA6 (ENSCGOG00000010473) gpc2 (ENSCGOG00000010481) ENSCGOG00000010601 mcm7 (ENSCGOG00000010623) ENSCGOG00000011038 COPS6 (ENSCGOG00000011047) ENSCGOG00000011321 aurkb (ENSCGOG00000011322) ENSCGOG00000011323 nkx3-2 (ENSCGOG00000011341) ENSCGOG00000011344 HS3ST1 (ENSCGOG00000011348) ENSCGOG00000004078 gsr (ENSCGOG00000004134) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.d #19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843.b ENSGT00940000161833 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 12 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005004592 ENSDLAG00005004589 ENSDLAG00005029521 ENSDLAG00005020573 ENSDLAG00005020136 ENSDLAG00005020297 ENSDLAG00005020125 ENSDLAG00005033094 ENSDLAG00005032113 ENSDLAG00005033938 ENSDLAG00005032393 ENSDLAG00005026937 ENSDLAG00005032696 ENSDLAG00005008799 ENSDLAG00005032824 ENSDLAG00005012890 #28 ENSDLAG00005028119 #28 ENSDLAG00005007247 ##37 ENSDLAG00005007257 ENSDLAG00005007414 ENSDLAG00005007639 ENSDLAG00005030731 ENSDLAG00005033009 ENSDLAG00005007695 ENSDLAG00005029672 ENSDLAG00005029287 ENSDLAG00005026855 NKX3-2 (ENSDLAG00005028615) RAB28 (ENSDLAG00005007730) HS3ST1 (ENSDLAG00005032596) ENSDLAG00005007753 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005016398 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005003204 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005002457 European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005004589 ENSDLAG00005029521 ENSDLAG00005020573 ENSDLAG00005020136 ENSDLAG00005020297 ENSDLAG00005020125 ENSDLAG00005033094 ENSDLAG00005032113 ENSDLAG00005033938 ENSDLAG00005032393 ENSDLAG00005026937 ENSDLAG00005032696 ENSDLAG00005008799 ENSDLAG00005032824 ENSDLAG00005012890 #28 ENSDLAG00005028119 #28 ENSDLAG00005007247 ##37 ENSDLAG00005007257 ENSDLAG00005007414 ENSDLAG00005007639 ENSDLAG00005030731 ENSDLAG00005033009 ENSDLAG00005007695 ENSDLAG00005029672 ENSDLAG00005029287 ENSDLAG00005026855 NKX3-2 (ENSDLAG00005028615) RAB28 (ENSDLAG00005007730) HS3ST1 (ENSDLAG00005032596) ENSDLAG00005007753 ENSDLAG00005007760 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker MODERN SPECIES 187 ENSLCRG00005016471 #28 ENSLCRG00005016472 #28 Large yellow croaker MODERN SPECIES 187 ENSLCRG00005016471 #28 ENSLCRG00005016472 #28 Large yellow croaker MODERN SPECIES 121 ENSLCRG00005009274 ENSLCRG00005009277 ##37 ENSLCRG00005009281 ##30 ENSLCRG00005009283 #28 ENSLCRG00005009286 #28 ENSLCRG00005009287 #28 ENSLCRG00005009290 Large yellow croaker MODERN SPECIES 121 ENSLCRG00005009290 ENSLCRG00005009287 #28 ENSLCRG00005009286 #28 ENSLCRG00005009283 #28 ENSLCRG00005009281 ##30 ENSLCRG00005009277 ##37 ENSLCRG00005009274 Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker MODERN SPECIES 121 ENSLCRG00005009290 ENSLCRG00005009287 #28 ENSLCRG00005009286 #28 ENSLCRG00005009283 #28 ENSLCRG00005009281 ##30 ENSLCRG00005009277 ##37 ENSLCRG00005009274 Large yellow croaker MODERN SPECIES nkx3-2 (ENSLCRG00005000501) ENSLCRG00005000500 aurkb (ENSLCRG00005000498) ENSLCRG00005000496 ENSLCRG00005000495 COPS6 (ENSLCRG00005000478) ENSLCRG00005000476 mcm7 (ENSLCRG00005000473) STAG3 (ENSLCRG00005000469) gpc2 (ENSLCRG00005000467) ENSLCRG00005000464 ENSLCRG00005000458 ##37 ENSLCRG00005000457 #19 ENSLCRG00005000455 #29 ENSLCRG00005000453 #19 ENSLCRG00005000448 #28 ENSLCRG00005000442 #29 ENSLCRG00005000441 #19 fzd5 (ENSLCRG00005000439) ccnyl1 (ENSLCRG00005000433) creb1a (ENSLCRG00005000428) klf7b (ENSLCRG00005000425) gdf3 (ENSLCRG00005000423) TRAPPC10 (ENSLCRG00005000269) CNGA4 (ENSLCRG00005000213) fhip1b (ENSLCRG00005000200) ENSLCRG00005000192 ENSLCRG00005000188 olig1 (ENSLCRG00005000184) ENSLCRG00005000179 olig2 (ENSLCRG00005000176) Large yellow croaker MODERN SPECIES 384 ENSLCRG00005001653 #28 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023015 #36 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023023 slit3 (ENSSAUG00010023026) fgfrl1a (ENSSAUG00010023271) ENSSAUG00010023273 ENSSAUG00010023275 spon2b (ENSSAUG00010023276) Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023013 #29 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022827 ENSSAUG00010022830 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023011 #30 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022965 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022830 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 RAB28 (ENSSAUG00010022821) nkx3-2 (ENSSAUG00010022822) ENSSAUG00010022824 ENSSAUG00010022827 ENSSAUG00010022830 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 HS3ST1 (ENSSAUG00010022817) RAB28 (ENSSAUG00010022821) nkx3-2 (ENSSAUG00010022822) ENSSAUG00010022824 ENSSAUG00010022827 ENSSAUG00010022830 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 nkx3-2 (ENSSAUG00010022822) ENSSAUG00010022824 ENSSAUG00010022827 ENSSAUG00010022830 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022824 ENSSAUG00010022827 ENSSAUG00010022830 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022960 ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023015 #36 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023023 slit3 (ENSSAUG00010023026) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161846 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 1096 ENSLCAG00010004503 ##37 ENSLCAG00010004513 #28 ENSLCAG00010004527 ##19 ENSLCAG00010004533 #28 ENSLCAG00010004545 #28 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022520 aurkb (ENSLCAG00010022522) ENSLCAG00010022544 ENSLCAG00010022555 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022520 aurkb (ENSLCAG00010022522) ENSLCAG00010022544 ENSLCAG00010022555 Barramundi perch MODERN SPECIES 1096 ENSLCAG00010004503 ##37 ENSLCAG00010004513 #28 ENSLCAG00010004527 ##19 ENSLCAG00010004533 #28 ENSLCAG00010004545 #28 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 1096 ENSLCAG00010004503 ##37 ENSLCAG00010004513 #28 ENSLCAG00010004527 ##19 ENSLCAG00010004533 #28 ENSLCAG00010004545 #28 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022520 aurkb (ENSLCAG00010022522) ENSLCAG00010022544 ENSLCAG00010022555 Seriola ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156986 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000162676.a.a.x.b ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.y ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.i #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a.x.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.j #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01040000242632 ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f Greater amberjack MODERN SPECIES 113 slc30a9 (ENSSDUG00000003564) gsr (ENSSDUG00000003522) HS3ST1 (ENSSDUG00000003509) ENSSDUG00000003477 nkx3-2 (ENSSDUG00000003467) ENSSDUG00000003457 aurkb (ENSSDUG00000003445) ENSSDUG00000003440 COPS6 (ENSSDUG00000003419) ENSSDUG00000003388 mcm7 (ENSSDUG00000003338) ENSSDUG00000003250 gpc2 (ENSSDUG00000003228) ENSSDUG00000003208 ENSSDUG00000003194 ENSSDUG00000003176 #28 ENSSDUG00000003103 ##30 ENSSDUG00000003071 ##37 ENSSDUG00000003047 #30 ENSSDUG00000002988 ENSSDUG00000002957 #30 ENSSDUG00000002940 #33 ENSSDUG00000002917 ##30 ENSSDUG00000002892 ENSSDUG00000002873 #33 ENSSDUG00000002855 ##37 ENSSDUG00000002835 #31 ENSSDUG00000002832 ENSSDUG00000002822 slit3 (ENSSDUG00000002721) fgfrl1a (ENSSDUG00000002673) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 gsr (ENSSLDG00000024121) ENSSLDG00000024139 HS3ST1 (ENSSLDG00000024142) RAB28 (ENSSLDG00000024149) nkx3-2 (ENSSLDG00000024167) ENSSLDG00000024171 aurkb (ENSSLDG00000024189) ENSSLDG00000024212 COPS6 (ENSSLDG00000024291) ENSSLDG00000024305 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024342 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024358 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024558 slit3 (ENSSLDG00000024564) fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) ENSSLDG00000024626 spon2b (ENSSLDG00000024633) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000160449 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 MAEA (ENSMAMG00000017757) CTBP1 (ENSMAMG00000027529) spon2b (ENSMAMG00000017786) ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000025090 #28 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000027195 ENSMAMG00000019040 HS3ST1 (ENSMAMG00000025247) ENSMAMG00000018996 nkx3-2 (ENSMAMG00000018984) ENSMAMG00000018930 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 HS3ST1 (ENSMAMG00000025247) ENSMAMG00000018996 nkx3-2 (ENSMAMG00000018984) ENSMAMG00000018930 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018006 ##37 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 nkx3-2 (ENSMAMG00000018984) ENSMAMG00000018930 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000018220 ##37 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000018930 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 spon2b (ENSMAMG00000017786) ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000018598 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000018779 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000019040 HS3ST1 (ENSMAMG00000025247) ENSMAMG00000018996 nkx3-2 (ENSMAMG00000018984) ENSMAMG00000018930 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 CTBP1 (ENSMAMG00000027529) spon2b (ENSMAMG00000017786) ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000026185 #28 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000017754 MAEA (ENSMAMG00000017757) CTBP1 (ENSMAMG00000027529) spon2b (ENSMAMG00000017786) ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.q ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000164241 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000001697 HS3ST1 (ENSATEG00000001734) ENSATEG00000001753 nkx3-2 (ENSATEG00000001782) ENSATEG00000025835 ENSATEG00000001816 aurkb (ENSATEG00000001897) ENSATEG00000001905 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000002471 ##30 Climbing perch MODERN SPECIES 1 nkx3-2 (ENSATEG00000001782) ENSATEG00000025835 ENSATEG00000001816 aurkb (ENSATEG00000001897) ENSATEG00000001905 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000025310 #28 Climbing perch MODERN SPECIES 1 HS3ST1 (ENSATEG00000001734) ENSATEG00000001753 nkx3-2 (ENSATEG00000001782) ENSATEG00000025835 ENSATEG00000001816 aurkb (ENSATEG00000001897) ENSATEG00000001905 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002428 ##30 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001905 aurkb (ENSATEG00000001897) ENSATEG00000001816 ENSATEG00000025835 nkx3-2 (ENSATEG00000001782) ENSATEG00000001753 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000001816 aurkb (ENSATEG00000001897) ENSATEG00000001905 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000002552 #34 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000001687 ENSATEG00000001697 HS3ST1 (ENSATEG00000001734) ENSATEG00000001753 nkx3-2 (ENSATEG00000001782) ENSATEG00000025835 ENSATEG00000001816 aurkb (ENSATEG00000001897) ENSATEG00000001905 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000001972 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001905 Climbing perch MODERN SPECIES 1 MAEA (ENSATEG00000003418) CTBP1 (ENSATEG00000003381) spon2b (ENSATEG00000003357) ENSATEG00000003335 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003059 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 Climbing perch MODERN SPECIES 1 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003059 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 gsr (ENSBSLG00000010224) ENSBSLG00000010356 ENSBSLG00000010626 HS3ST1 (ENSBSLG00000010754) ENSBSLG00000010781 nkx3-2 (ENSBSLG00000010875) ENSBSLG00000010887 aurkb (ENSBSLG00000010905) ENSBSLG00000010953 COPS6 (ENSBSLG00000011037) ENSBSLG00000011088 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011404 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011615 ##37 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012116 #37 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 ENSBSLG00000010626 HS3ST1 (ENSBSLG00000010754) ENSBSLG00000010781 nkx3-2 (ENSBSLG00000010875) ENSBSLG00000010887 aurkb (ENSBSLG00000010905) ENSBSLG00000010953 COPS6 (ENSBSLG00000011037) ENSBSLG00000011088 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011404 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011615 ##37 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012196 #34 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 ENSBSLG00000010356 ENSBSLG00000010626 HS3ST1 (ENSBSLG00000010754) ENSBSLG00000010781 nkx3-2 (ENSBSLG00000010875) ENSBSLG00000010887 aurkb (ENSBSLG00000010905) ENSBSLG00000010953 COPS6 (ENSBSLG00000011037) ENSBSLG00000011088 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011404 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011615 ##37 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012129 #34 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 HS3ST1 (ENSBSLG00000010754) ENSBSLG00000010781 nkx3-2 (ENSBSLG00000010875) ENSBSLG00000010887 aurkb (ENSBSLG00000010905) ENSBSLG00000010953 COPS6 (ENSBSLG00000011037) ENSBSLG00000011088 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011404 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011615 ##37 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012199 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000003288 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.g ##36 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000017869 ENSGT00940000160376 ENSGT00510000048283.c ENSGT00950000182938.b.b.a ENSGT00940000158129 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00390000003288 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 ENSCVAG00000006895 ENSCVAG00000006917 cplx2 (ENSCVAG00000006927) thoc3 (ENSCVAG00000006941) ENSCVAG00000006978 gm2a (ENSCVAG00000006983) PCDH12 (ENSCVAG00000006988) PCDH1 (ENSCVAG00000007012) tmem216 (ENSCVAG00000007021) tmed9 (ENSCVAG00000007041) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) emx3 (ENSCVAG00000007080) ENSCVAG00000007091 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007510 #30 Mummichog MODERN SPECIES 2389 ENSFHEG00000011163 tmem216 (ENSFHEG00000011139) TMED9 (ENSFHEG00000011132) b4galt7 (ENSFHEG00000011096) emx3 (ENSFHEG00000011050) ENSFHEG00000010972 ENSFHEG00000010963 ENSFHEG00000010937 ##37 ENSFHEG00000010848 ENSFHEG00000010834 ##36 ENSFHEG00000010811 #37 ENSFHEG00000010767 #36 ENSFHEG00000010752 #35 ENSFHEG00000010730 #35 ENSFHEG00000000648 #34 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00510000048283.c ENSGT00950000182938.b.b.a ENSGT00940000158129 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00390000003288 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 emx3 (ENSPLAG00000000925) ENSPLAG00000000927 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000963 #15 Guppy MODERN SPECIES 440 gm2a (ENSPREG00000014873) ENSPREG00000014862 PCDH12 (ENSPREG00000014853) ENSPREG00000014841 ENSPREG00000014830 PCDH1 (ENSPREG00000014812) tmed9 (ENSPREG00000014696) tmem216 (ENSPREG00000014683) TMED9 (ENSPREG00000014673) b4galt7 (ENSPREG00000014666) emx3 (ENSPREG00000014657) ENSPREG00000014646 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014401 #22 Platyfish MODERN SPECIES 15 thoc3 (ENSXMAG00000003232) ENSXMAG00000003236 gm2a (ENSXMAG00000003245) PCDH12 (ENSXMAG00000003252) ENSXMAG00000021428 PCDH1 (ENSXMAG00000016502) ENSXMAG00000022864 ENSXMAG00000016501 tmem216 (ENSXMAG00000016498) TMED9 (ENSXMAG00000022978) b4galt7 (ENSXMAG00000016477) emx3 (ENSXMAG00000016469) ENSXMAG00000027359 ENSXMAG00000019593 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1610 hnrnpa0b (ENSNFUG00015004193) maea (ENSNFUG00015004184) zgc:136929 (ENSNFUG00015004023) ENSNFUG00015003989 ENSNFUG00015003988 spon2b (ENSNFUG00015003985) ENSNFUG00015003957 ENSNFUG00015003946 FGFRL1A (ENSNFUG00015003941) slit3 (ENSNFUG00015002545) ENSNFUG00015002297 #34 ENSNFUG00015002293 ENSNFUG00015002290 #19 ENSNFUG00015002254 #22 Nfu_g_1_004472 (ENSNFUG00015002237) #29 ENSNFUG00015002218 ##37 ENSNFUG00015002212 ENSNFUG00015002201 ##37 ENSNFUG00015002143 GPC6L (ENSNFUG00015002103) ENSNFUG00015002087 ENSNFUG00015002084 ENSNFUG00015002082 MCM7 (ENSNFUG00015002038) ENSNFUG00015002021 COPS6 (ENSNFUG00015002003) ENSNFUG00015001968 aurkb (ENSNFUG00015001956) ENSNFUG00015001950 ENSNFUG00015001944 nkx3-2 (ENSNFUG00015001934) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 Haplochromini_A DUPLICATION Haplochromini_A DUPLICATION Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.c #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.d #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.m #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 fam13b (ENSACLG00000009048) KLHL3 (ENSACLG00000009006) ENSACLG00000008978 HNRNPA0 (ENSACLG00000008973) maea (ENSACLG00000008954) ENSACLG00000008947 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 P. nyererei MODERN SPECIES 315 ENSPNYG00000020903 eif4ea (ENSPNYG00000020891) LINGO2 (ENSPNYG00000020886) cxcl14 (ENSPNYG00000020877) fam13b (ENSPNYG00000020838) KLHL3 (ENSPNYG00000020787) ENSPNYG00000020763 ENSPNYG00000020729 maea (ENSPNYG00000020697) zgc:136929 (ENSPNYG00000020630) spon2b (ENSPNYG00000020614) ENSPNYG00000020600 fgfrl1a (ENSPNYG00000020579) slit3 (ENSPNYG00000020486) ENSPNYG00000020476 ENSPNYG00000020459 ##37 ENSPNYG00000020414 #34 ENSPNYG00000020369 #35 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005001221 cxcl14 (ENSMZEG00005001209) fam13b (ENSMZEG00005001152) KLHL3 (ENSMZEG00005001097) ENSMZEG00005001063 HNRNPA0 (ENSMZEG00005001055) maea (ENSMZEG00005001004) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) spon2b (ENSMZEG00005000941) ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 299 LINGO2 (ENSHBUG00000023863) cxcl14 (ENSHBUG00000023864) fam13b (ENSHBUG00000023865) ENSHBUG00000023866 ENSHBUG00000023867 HNRNPA0 (ENSHBUG00000023868) maea (ENSHBUG00000023869) zgc:136929 (ENSHBUG00000023870) spon2b (ENSHBUG00000023871) ENSHBUG00000023872 ENSHBUG00000023873 fgfrl1a (ENSHBUG00000023874) slit3 (ENSHBUG00000023875) ENSHBUG00000023877 ENSHBUG00000023878 #31 ENSHBUG00000023879 ##37 ENSHBUG00000023880 #34 ENSHBUG00000023881 #30 ENSHBUG00000023882 ENSHBUG00000023883 ##19 ENSHBUG00000023884 #36 ENSHBUG00000023831 ##37 ENSHBUG00000023795 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 fam13b (ENSONIG00000001068) KLHL3 (ENSONIG00000001059) ENSONIG00000042129 hnrnpa0b (ENSONIG00000037027) maea (ENSONIG00000001054) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000017620 ENSMAMG00000017630 cxcl14 (ENSMAMG00000027577) ENSMAMG00000017652 ENSMAMG00000017687 ENSMAMG00000017728 ENSMAMG00000017754 MAEA (ENSMAMG00000017757) CTBP1 (ENSMAMG00000027529) spon2b (ENSMAMG00000017786) ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Climbing perch MODERN SPECIES 1 cxcl14 (ENSATEG00000026931) ENSATEG00000003585 ENSATEG00000003526 ENSATEG00000003468 ENSATEG00000003423 MAEA (ENSATEG00000003418) CTBP1 (ENSATEG00000003381) spon2b (ENSATEG00000003357) ENSATEG00000003335 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003059 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 1569 ENSLBEG00000020992 ENSLBEG00000020980 ##37 ENSLBEG00000020928 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1645 ENSLBEG00000010371 ##37 ENSLBEG00000010337 ##37 ENSLBEG00000010291 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4127 ENSLBEG00000008517 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2035 ENSLBEG00000016762 ##37 ENSLBEG00000016714 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 3705 ENSLBEG00000012622 ##37 ENSLBEG00000012592 ##37 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161846 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Lumpfish MODERN SPECIES 1 gar1 (ENSCLMG00005007940) ENSCLMG00005007832 eif4ea (ENSCLMG00005007819) LINGO2 (ENSCLMG00005007816) cxcl14 (ENSCLMG00005007814) fam13b (ENSCLMG00005007813) KLHL3 (ENSCLMG00005007803) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) maea (ENSCLMG00005007778) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) spon2b (ENSCLMG00005004748) ENSCLMG00005004694 fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) slit3 (ENSCLMG00005004626) ENSCLMG00005004500 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017938 ##37 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000168781 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 HNRNPA0 (ENSCGOG00000010091) ENSCGOG00000010096 maea (ENSCGOG00000010098) zgc:136929 (ENSCGOG00000010199) spon2b (ENSCGOG00000010244) ENSCGOG00000010249 ENSCGOG00000010311 fgfrl1a (ENSCGOG00000010315) ENSCGOG00000010321 ENSCGOG00000010326 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010357 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010447 #30 Pike perch MODERN SPECIES 18 cxcl14 (ENSSLUG00000022709) fam13b (ENSSLUG00000022722) KLHL3 (ENSSLUG00000022764) ENSSLUG00000022773 hnrnpa0b (ENSSLUG00000022778) maea (ENSSLUG00000022782) zgc:136929 (ENSSLUG00000022877) spon2b (ENSSLUG00000023507) ENSSLUG00000023515 ENSSLUG00000023520 fgfrl1a (ENSSLUG00000023537) slit3 (ENSSLUG00000023660) ENSSLUG00000023984 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024103 ENSSLUG00000024108 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 cxcl14 (ENSSAUG00010024114) fam13b (ENSSAUG00010024105) KLHL3 (ENSSAUG00010024099) ENSSAUG00010024097 HNRNPA0 (ENSSAUG00010024095) maea (ENSSAUG00010024088) zgc:136929 (ENSSAUG00010023293) spon2b (ENSSAUG00010023276) ENSSAUG00010023275 ENSSAUG00010023273 fgfrl1a (ENSSAUG00010023271) slit3 (ENSSAUG00010023026) ENSSAUG00010023023 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005001983 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001313 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001119 slit3 (ENSMMDG00005021105) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) RNF212 (ENSMMDG00005021073) ENSMMDG00005021067 spon2b (ENSMMDG00005021051) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) maea (ENSMMDG00005020929) ENSMMDG00005020923 ENSMMDG00005020918 KLHL3 (ENSMMDG00005020871) fam13b (ENSMMDG00005020855) cxcl14 (ENSMMDG00005020852) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005020850 cxcl14 (ENSMMDG00005020852) fam13b (ENSMMDG00005020855) KLHL3 (ENSMMDG00005020871) ENSMMDG00005020918 ENSMMDG00005020923 maea (ENSMMDG00005020929) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) spon2b (ENSMMDG00005021051) ENSMMDG00005021067 RNF212 (ENSMMDG00005021073) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) slit3 (ENSMMDG00005021105) ENSMMDG00005001119 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001313 gpc2 (ENSMMDG00005001435) Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182968.d.b.a #30 ENSGT01030000234530.a.d #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Percomorphaceae DUPLICATION Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 94 ENSHCOG00000021061 nudt22 (ENSHCOG00000021007) dnajc4 (ENSHCOG00000020869) ENSHCOG00000020847 stx5a (ENSHCOG00000020831) zgc:162144 (ENSHCOG00000020820) ATG2A (ENSHCOG00000020808) trmt112 (ENSHCOG00000020792) ENSHCOG00000020778 KCNK4 (ENSHCOG00000000557) ENSHCOG00000020682 nxf1a (ENSHCOG00000020676) ENSHCOG00000020640 gpc2 (ENSHCOG00000020592) ENSHCOG00000020012 ENSHCOG00000019957 #31 Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Cichlidae DUPLICATION Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003309 ITGA6 (ENSACIG00000003330) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 118 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003782 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a.b ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000002763 ##37 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.a ##37 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022520 aurkb (ENSLCAG00010022522) ENSLCAG00010022544 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.b ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.b ##37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.b ##37 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.b ##37 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.a.b ##37 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022520 aurkb (ENSLCAG00010022522) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 LINGO2 (ENSONIG00000020949) cxcl14 (ENSONIG00000033809) fam13b (ENSONIG00000001068) KLHL3 (ENSONIG00000001059) ENSONIG00000042129 hnrnpa0b (ENSONIG00000037027) maea (ENSONIG00000001054) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 cxcl14 (ENSONIG00000033809) fam13b (ENSONIG00000001068) KLHL3 (ENSONIG00000001059) ENSONIG00000042129 hnrnpa0b (ENSONIG00000037027) maea (ENSONIG00000001054) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.c #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.d #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.m #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.b ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005001237 LINGO2 (ENSMZEG00005001231) ENSMZEG00005001221 cxcl14 (ENSMZEG00005001209) fam13b (ENSMZEG00005001152) KLHL3 (ENSMZEG00005001097) ENSMZEG00005001063 HNRNPA0 (ENSMZEG00005001055) maea (ENSMZEG00005001004) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) spon2b (ENSMZEG00005000941) ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 LINGO2 (ENSACLG00000009441) cxcl14 (ENSACLG00000009437) fam13b (ENSACLG00000009048) KLHL3 (ENSACLG00000009006) ENSACLG00000008978 HNRNPA0 (ENSACLG00000008973) maea (ENSACLG00000008954) ENSACLG00000008947 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.c #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.d #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.m #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.b ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 LINGO2 (ENSMZEG00005001231) ENSMZEG00005001221 cxcl14 (ENSMZEG00005001209) fam13b (ENSMZEG00005001152) KLHL3 (ENSMZEG00005001097) ENSMZEG00005001063 HNRNPA0 (ENSMZEG00005001055) maea (ENSMZEG00005001004) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) spon2b (ENSMZEG00005000941) ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 Eastern happy MODERN SPECIES 11 cxcl14 (ENSACLG00000009437) fam13b (ENSACLG00000009048) KLHL3 (ENSACLG00000009006) ENSACLG00000008978 HNRNPA0 (ENSACLG00000008973) maea (ENSACLG00000008954) ENSACLG00000008947 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 299 eif4ea (ENSHBUG00000023862) LINGO2 (ENSHBUG00000023863) cxcl14 (ENSHBUG00000023864) fam13b (ENSHBUG00000023865) ENSHBUG00000023866 ENSHBUG00000023867 HNRNPA0 (ENSHBUG00000023868) maea (ENSHBUG00000023869) zgc:136929 (ENSHBUG00000023870) spon2b (ENSHBUG00000023871) ENSHBUG00000023872 ENSHBUG00000023873 fgfrl1a (ENSHBUG00000023874) slit3 (ENSHBUG00000023875) ENSHBUG00000023877 ENSHBUG00000023878 #31 ENSHBUG00000023879 ##37 ENSHBUG00000023880 #34 ENSHBUG00000023881 #30 ENSHBUG00000023882 ENSHBUG00000023883 ##19 ENSHBUG00000023884 #36 ENSHBUG00000023831 ##37 ENSHBUG00000023795 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 eif4ea (ENSNBRG00000014676) LINGO2 (ENSNBRG00000014642) cxcl14 (ENSNBRG00000014631) fam13b (ENSNBRG00000014591) KLHL3 (ENSNBRG00000014552) ENSNBRG00000014522 ENSNBRG00000014469 maea (ENSNBRG00000014438) zgc:136929 (ENSNBRG00000014412) spon2b (ENSNBRG00000014396) ENSNBRG00000014380 fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) slit3 (ENSNBRG00000014236) ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158129 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00390000003288 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.g ##36 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 Sailfin molly DUPLICATION Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006847 #15 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 ENSGT00390000003288 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00940000158129 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Amazon molly MODERN SPECIES 1285 ENSPFOG00000018912 #13 ENSPFOG00000023346 #12 ENSPFOG00000022639 #14 ENSPFOG00000018909 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 ENSXMAG00000026155 #15 ENSXMAG00000022400 #16 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 emx3 (ENSPLAG00000000925) ENSPLAG00000000927 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000963 #15 Amazon molly MODERN SPECIES 287 tmem216 (ENSPFOG00000023783) TMED9 (ENSPFOG00000007314) b4galt7 (ENSPFOG00000007250) emx3 (ENSPFOG00000007211) ENSPFOG00000007161 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007140 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006847 #15 Guppy MODERN SPECIES 440 emx3 (ENSPREG00000014657) ENSPREG00000014646 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014271 #19 Platyfish MODERN SPECIES 15 emx3 (ENSXMAG00000016469) ENSXMAG00000027359 ENSXMAG00000019593 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000022400 #16 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018061 ##37 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 tmem216 (ENSCVAG00000007021) tmed9 (ENSCVAG00000007041) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) emx3 (ENSCVAG00000007080) ENSCVAG00000007091 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007510 #30 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1678 ENSCVAG00000019870 ENSCVAG00000019862 #31 ENSCVAG00000019757 #29 ENSCVAG00000019750 ##37 ENSCVAG00000019737 #18 ENSCVAG00000019713 #22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1083 ENSCVAG00000018039 ##37 ENSCVAG00000018025 ##37 ENSCVAG00000017998 ##37 ENSCVAG00000017984 ##37 ENSCVAG00000017956 ##37 ENSCVAG00000017928 ##37 ENSCVAG00000017880 ##37 ENSCVAG00000000949 ##37 ENSCVAG00000017813 ##37 ENSCVAG00000017800 ##37 ENSCVAG00000017783 ##37 ENSCVAG00000017753 ##37 ENSCVAG00000017736 ##19 ENSCVAG00000017725 #11 ENSCVAG00000000452 #31 ENSCVAG00000017666 #31 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 3887 ENSLBEG00000019536 ENSLBEG00000019502 #31 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2056 ENSLBEG00000019683 #31 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 2048 ENSLBEG00000017405 #31 Ballan wrasse MODERN SPECIES 3673 ENSLBEG00000010504 #31 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4198 ENSLBEG00000012317 #31 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 2890 ENSLBEG00000020865 ##37 ENSLBEG00000020832 #31 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2642 ENSLBEG00000005596 #31 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 4057 ENSLBEG00000004680 #31 Ballan wrasse MODERN SPECIES 3650 ENSLBEG00000009172 #31 Ballan wrasse MODERN SPECIES 3363 ENSLBEG00000004129 #31 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 182 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 Seriola ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01040000242632 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.j #33 ENSGT00940000162676.a.a.x.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.i #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.y ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.x.b ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 atox1 (ENSSLDG00000024991) SLC36A1 (ENSSLDG00000024977) mtnr1al (ENSSLDG00000024810) FAT2 (ENSSLDG00000024755) KLHL3 (ENSSLDG00000024720) ENSSLDG00000024705 ENSSLDG00000024685 maea (ENSSLDG00000024664) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) spon2b (ENSSLDG00000024633) ENSSLDG00000024626 fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) slit3 (ENSSLDG00000024564) ENSSLDG00000024558 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024358 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024342 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024305 COPS6 (ENSSLDG00000024291) Greater amberjack MODERN SPECIES 113 LINGO2 (ENSSDUG00000002227) cxcl14 (ENSSDUG00000002234) fam13b (ENSSDUG00000002262) KLHL3 (ENSSDUG00000002322) ENSSDUG00000002394 ENSSDUG00000002431 maea (ENSSDUG00000002472) zgc:136929 (ENSSDUG00000002539) spon2b (ENSSDUG00000002572) ENSSDUG00000002593 ENSSDUG00000002614 fgfrl1a (ENSSDUG00000002673) slit3 (ENSSDUG00000002721) ENSSDUG00000002822 ENSSDUG00000002832 ENSSDUG00000002835 #31 ENSSDUG00000002855 ##37 ENSSDUG00000002873 #33 ENSSDUG00000002892 ENSSDUG00000002917 ##30 ENSSDUG00000002940 #33 ENSSDUG00000002957 #30 ENSSDUG00000002988 ENSSDUG00000003047 #30 ENSSDUG00000003071 ##37 ENSSDUG00000003103 ##30 ENSSDUG00000003176 #28 ENSSDUG00000003194 ENSSDUG00000003208 gpc2 (ENSSDUG00000003228) ENSSDUG00000003250 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 slit3 (ENSLCAG00010021484) ENSLCAG00010021910 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002057 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000026575 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018884 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018868 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Atherinomorphae DUPLICATION Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 330 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 497 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Mummichog MODERN SPECIES 1464 ENSFHEG00000018085 ##37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1678 ENSCVAG00000019870 ENSCVAG00000019862 #31 ENSCVAG00000019757 #29 ENSCVAG00000019750 ##37 ENSCVAG00000019737 #18 ENSCVAG00000019713 #22 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000931 ##30 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 aurkb (ENSKMAG00000019109) ENSKMAG00000019102 COPS6 (ENSKMAG00000019077) ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 ENSKMAG00000018512 #28 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00950000183123 ENSGT00940000167175.a ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 Indian medaka DUPLICATION Indian medaka MODERN SPECIES 16 ENSOMEG00000000696 ENSOMEG00000012357 #30 ENSOMEG00000012340 #30 ENSOMEG00000012328 #30 ENSOMEG00000012300 #34 ENSOMEG00000012289 #30 ENSOMEG00000012272 #29 ENSOMEG00000000308 ##37 ENSOMEG00000012244 ##37 ENSOMEG00000012221 ##37 ENSOMEG00000012205 ##37 ENSOMEG00000012185 ##37 ENSOMEG00000012128 ##37 ENSOMEG00000012097 ##37 ENSOMEG00000012088 ##37 ENSOMEG00000012076 ##37 ENSOMEG00000012059 ##30 ENSOMEG00000012045 ENSOMEG00000012035 slit3 (ENSOMEG00000012015) fgfrl1a (ENSOMEG00000011920) ENSOMEG00000011856 ENSOMEG00000011827 spon2b (ENSOMEG00000011816) zgc:136929 (ENSOMEG00000011793) maea (ENSOMEG00000011733) ENSOMEG00000011670 KLHL3 (ENSOMEG00000011648) fam13b (ENSOMEG00000011594) cxcl14 (ENSOMEG00000011511) LINGO2 (ENSOMEG00000011496) Indian medaka MODERN SPECIES 16 gpc2 (ENSOMEG00000012394) ENSOMEG00000000696 ENSOMEG00000012357 #30 ENSOMEG00000012340 #30 ENSOMEG00000012328 #30 ENSOMEG00000012300 #34 ENSOMEG00000012289 #30 ENSOMEG00000012272 #29 ENSOMEG00000000308 ##37 ENSOMEG00000012244 ##37 ENSOMEG00000012221 ##37 ENSOMEG00000012205 ##37 ENSOMEG00000012185 ##37 ENSOMEG00000012128 ##37 ENSOMEG00000012097 ##37 ENSOMEG00000012088 ##37 ENSOMEG00000012076 ##37 ENSOMEG00000012059 ##30 ENSOMEG00000012045 ENSOMEG00000012035 slit3 (ENSOMEG00000012015) fgfrl1a (ENSOMEG00000011920) ENSOMEG00000011856 ENSOMEG00000011827 spon2b (ENSOMEG00000011816) zgc:136929 (ENSOMEG00000011793) maea (ENSOMEG00000011733) ENSOMEG00000011670 KLHL3 (ENSOMEG00000011648) fam13b (ENSOMEG00000011594) cxcl14 (ENSOMEG00000011511) Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 slit3 (ENSOJAG00000013112) fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) ENSOJAG00000016732 ENSOJAG00000016737 spon2b (ENSOJAG00000016747) zgc:136929 (ENSOJAG00000016765) maea (ENSOJAG00000016904) ENSOJAG00000016953 ENSOJAG00000016962 KLHL3 (ENSOJAG00000016974) fam13b (ENSOJAG00000017074) cxcl14 (ENSOJAG00000017121) Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 slit3 (ENSOJAG00000013112) fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) ENSOJAG00000016732 ENSOJAG00000016737 spon2b (ENSOJAG00000016747) zgc:136929 (ENSOJAG00000016765) maea (ENSOJAG00000016904) ENSOJAG00000016953 ENSOJAG00000016962 KLHL3 (ENSOJAG00000016974) fam13b (ENSOJAG00000017074) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 Japanese Medaka HdrR DUPLICATION Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000022885 #35 ENSORLG00000030644 slit3 (ENSORLG00000000335) ENSORLG00000028622 fgfrl1a (ENSORLG00000000305) ENSORLG00000000293 spon2b (ENSORLG00000000275) zgc:136929 (ENSORLG00000000259) maea (ENSORLG00000000230) ENSORLG00000022539 ENSORLG00000027074 ENSORLG00000024157 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000022885 #35 ENSORLG00000030644 slit3 (ENSORLG00000000335) ENSORLG00000028622 fgfrl1a (ENSORLG00000000305) ENSORLG00000000293 spon2b (ENSORLG00000000275) zgc:136929 (ENSORLG00000000259) maea (ENSORLG00000000230) ENSORLG00000022539 ENSORLG00000027074 ENSORLG00000024157 ENSORLG00000024793 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 260 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f #27 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014265 #11 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 emx3 (ENSPLAG00000000925) ENSPLAG00000000927 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000963 #15 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 Mummichog MODERN SPECIES 2135 ENSFHEG00000018560 ##37 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 Nile tilapia MODERN SPECIES 157 ENSONIG00000035237 ##37 ENSONIG00000037066 #29 ENSONIG00000015236 ENSONIG00000015233 ##37 ENSONIG00000039761 ENSONIG00000035758 ENSONIG00000041986 ENSONIG00000000943 ##37 ENSONIG00000037372 ##37 ENSONIG00000033589 ##37 ENSONIG00000013228 ##19 ENSONIG00000027311 ##37 ENSONIG00000030260 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000015016 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014014 ##37 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000013850 nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) uvssa (ENSNBRG00000013729) Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 pcdh10b (ENSACLG00000007281) ENSACLG00000007138 immt (ENSACLG00000007052) ENSACLG00000007036 ENSACLG00000007027 tmem129 (ENSACLG00000007010) tmem129 (ENSACLG00000007001) ENSACLG00000006995 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.a ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003472 #33 P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000011833 ##37 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012321 ##37 hvcn1 (ENSPNYG00000012350) ENSPNYG00000012384 nkx1.2lb (ENSPNYG00000012402) uvssa (ENSPNYG00000012422) ENSPNYG00000012466 ENSPNYG00000012496 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.a #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000014469 maea (ENSNBRG00000014438) zgc:136929 (ENSNBRG00000014412) spon2b (ENSNBRG00000014396) ENSNBRG00000014380 fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) slit3 (ENSNBRG00000014236) ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 171 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.a ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003381 #33 Zebra mbuna MODERN SPECIES 387 ENSMZEG00005028455 ENSMZEG00005028456 #36 ENSMZEG00005028457 #34 ENSMZEG00005028458 #30 ENSMZEG00005028459 ##37 ENSMZEG00005028460 ##37 ENSMZEG00005028461 ##37 ENSMZEG00005028463 ##37 ENSMZEG00005028464 ##37 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 pcdh10b (ENSACLG00000007281) Eastern happy MODERN SPECIES 11 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000007643 ENSACLG00000007638 ENSACLG00000007573 Zebra mbuna MODERN SPECIES 387 ENSMZEG00005028455 ENSMZEG00005028456 #36 ENSMZEG00005028457 #34 ENSMZEG00005028458 #30 ENSMZEG00005028459 ##37 ENSMZEG00005028460 ##37 ENSMZEG00005028461 ##37 ENSMZEG00005028463 ##37 ENSMZEG00005028464 ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.c #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.d #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.m #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.b ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 maea (ENSMZEG00005001004) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) spon2b (ENSMZEG00005000941) ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005017753 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003317 ##37 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000167175.c ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.p ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.o.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.b #28 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 cxcl14 (ENSAPEG00000002109) fam13b (ENSAPEG00000002131) KLHL3 (ENSAPEG00000002167) ENSAPEG00000002224 ENSAPEG00000002274 maea (ENSAPEG00000002314) zgc:136929 (ENSAPEG00000002347) spon2b (ENSAPEG00000002387) ENSAPEG00000002409 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003444 ENSAPEG00000003475 mcm7 (ENSAPEG00000003656) ENSAPEG00000003720 Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 ENSAOCG00000019337 ENSAOCG00000019313 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l Perciformes ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156835.l.a.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 Lumpfish DUPLICATION Lumpfish DUPLICATION Lumpfish DUPLICATION Lumpfish DUPLICATION Lumpfish DUPLICATION Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017543 aurkb (ENSCLMG00005017547) ENSCLMG00005017549 COPS6 (ENSCLMG00005017553) ENSCLMG00005017687 mcm7 (ENSCLMG00005017691) ENSCLMG00005017878 ENSCLMG00005017879 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017878 ENSCLMG00005017879 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) ENSCLMG00005004694 spon2b (ENSCLMG00005004748) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) maea (ENSCLMG00005007778) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) Lumpfish DUPLICATION Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) ENSCLMG00005004694 spon2b (ENSCLMG00005004748) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) maea (ENSCLMG00005007778) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) KLHL3 (ENSCLMG00005007803) fam13b (ENSCLMG00005007813) cxcl14 (ENSCLMG00005007814) LINGO2 (ENSCLMG00005007816) Lumpfish MODERN SPECIES 1 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) ENSCLMG00005004694 spon2b (ENSCLMG00005004748) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) maea (ENSCLMG00005007778) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) KLHL3 (ENSCLMG00005007803) fam13b (ENSCLMG00005007813) Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017879 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) ENSCLMG00005004694 spon2b (ENSCLMG00005004748) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) maea (ENSCLMG00005007778) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) KLHL3 (ENSCLMG00005007803) Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017687 mcm7 (ENSCLMG00005017691) ENSCLMG00005017878 ENSCLMG00005017879 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) ENSCLMG00005004694 spon2b (ENSCLMG00005004748) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) maea (ENSCLMG00005007778) Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017549 COPS6 (ENSCLMG00005017553) ENSCLMG00005017687 mcm7 (ENSCLMG00005017691) ENSCLMG00005017878 ENSCLMG00005017879 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 slit3 (ENSCLMG00005004626) fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) ENSCLMG00005004694 spon2b (ENSCLMG00005004748) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.d #19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843.b Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022962 #19 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023015 #36 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023023 slit3 (ENSSAUG00010023026) fgfrl1a (ENSSAUG00010023271) Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022964 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022963 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022971 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022961 #19 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker MODERN SPECIES 121 ENSLCRG00005009274 ENSLCRG00005009277 ##37 ENSLCRG00005009281 ##30 ENSLCRG00005009283 #28 ENSLCRG00005009286 #28 ENSLCRG00005009287 #28 ENSLCRG00005009290 Large yellow croaker MODERN SPECIES syk (ENSLCRG00005022703) chd1 (ENSLCRG00005022642) reep5 (ENSLCRG00005022635) hmgcs1 (ENSLCRG00005022632) tln1 (ENSLCRG00005021926) tpm2 (ENSLCRG00005021638) ENSLCRG00005021625 slc25a48 (ENSLCRG00005021623) cplx2 (ENSLCRG00005021622) thoc3 (ENSLCRG00005021620) ENSLCRG00005021616 ENSLCRG00005021613 PCDH12 (ENSLCRG00005021610) ENSLCRG00005021607 ENSLCRG00005021606 #30 ENSLCRG00005021603 ##37 ENSLCRG00005021597 #30 ache (ENSLCRG00005021593) ENSLCRG00005021591 zgc:92664 (ENSLCRG00005021587) rnaseka (ENSLCRG00005021584) alox12 (ENSLCRG00005021450) ENSLCRG00005021447 ENSLCRG00005021446 tmem144b (ENSLCRG00005021444) GASK1B (ENSLCRG00005021440) gria2b (ENSLCRG00005019791) glrbb (ENSLCRG00005019614) PDGFC (ENSLCRG00005019602) neil3 (ENSLCRG00005019575) aga (ENSLCRG00005019565) European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 12 CTBP1 (ENSDLAG00005001521) spon2b (ENSDLAG00005002407) ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005001313 MAEA (ENSDLAG00005001329) CTBP1 (ENSDLAG00005001521) spon2b (ENSDLAG00005002407) ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 European seabass MODERN SPECIES 12 spon2b (ENSDLAG00005002407) ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l Carangaria ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 Turbot DUPLICATION Turbot DUPLICATION Turbot DUPLICATION Turbot MODERN SPECIES 4 ENSSMAG00000010115 ENSSMAG00000010196 ENSSMAG00000010246 ENSSMAG00000010279 MAEA (ENSSMAG00000010319) CTBP1 (ENSSMAG00000010328) spon2b (ENSSMAG00000010439) ENSSMAG00000010473 ENSSMAG00000029602 fgfrl1a (ENSSMAG00000010509) ENSSMAG00000010540 ENSSMAG00000010820 #33 ENSSMAG00000010797 ##37 ENSSMAG00000024700 ##37 ENSSMAG00000010841 ##37 ENSSMAG00000023026 ##37 ENSSMAG00000010900 #34 ENSSMAG00000010934 ENSSMAG00000010978 ENSSMAG00000025298 MCM7 (ENSSMAG00000011017) ENSSMAG00000011041 ENSSMAG00000011068 ENSSMAG00000011116 ENSSMAG00000011168 ENSSMAG00000011199 NKX3-2 (ENSSMAG00000011278) RAB28 (ENSSMAG00000031249) ENSSMAG00000011334 HS3ST1 (ENSSMAG00000029254) ENSSMAG00000011355 Turbot MODERN SPECIES 4 ENSSMAG00000010054 cxcl14 (ENSSMAG00000010064) ENSSMAG00000010115 ENSSMAG00000010196 ENSSMAG00000010246 ENSSMAG00000010279 MAEA (ENSSMAG00000010319) CTBP1 (ENSSMAG00000010328) spon2b (ENSSMAG00000010439) ENSSMAG00000010473 ENSSMAG00000029602 fgfrl1a (ENSSMAG00000010509) ENSSMAG00000010540 ENSSMAG00000010820 #33 ENSSMAG00000010797 ##37 ENSSMAG00000024700 ##37 ENSSMAG00000010841 ##37 ENSSMAG00000023026 ##37 ENSSMAG00000010900 #34 ENSSMAG00000010934 ENSSMAG00000010978 ENSSMAG00000025298 MCM7 (ENSSMAG00000011017) ENSSMAG00000011041 ENSSMAG00000011068 ENSSMAG00000011116 ENSSMAG00000011168 ENSSMAG00000011199 NKX3-2 (ENSSMAG00000011278) RAB28 (ENSSMAG00000031249) ENSSMAG00000011334 Turbot MODERN SPECIES 4 ENSSMAG00000010015 ENSSMAG00000010054 cxcl14 (ENSSMAG00000010064) ENSSMAG00000010115 ENSSMAG00000010196 ENSSMAG00000010246 ENSSMAG00000010279 MAEA (ENSSMAG00000010319) CTBP1 (ENSSMAG00000010328) spon2b (ENSSMAG00000010439) ENSSMAG00000010473 ENSSMAG00000029602 fgfrl1a (ENSSMAG00000010509) ENSSMAG00000010540 ENSSMAG00000010820 #33 ENSSMAG00000010797 ##37 ENSSMAG00000024700 ##37 ENSSMAG00000010841 ##37 ENSSMAG00000023026 ##37 ENSSMAG00000010900 #34 ENSSMAG00000010934 ENSSMAG00000010978 ENSSMAG00000025298 MCM7 (ENSSMAG00000011017) ENSSMAG00000011041 ENSSMAG00000011068 ENSSMAG00000011116 ENSSMAG00000011168 ENSSMAG00000011199 NKX3-2 (ENSSMAG00000011278) RAB28 (ENSSMAG00000031249) Turbot MODERN SPECIES 4 cxcl14 (ENSSMAG00000010064) ENSSMAG00000010115 ENSSMAG00000010196 ENSSMAG00000010246 ENSSMAG00000010279 MAEA (ENSSMAG00000010319) CTBP1 (ENSSMAG00000010328) spon2b (ENSSMAG00000010439) ENSSMAG00000010473 ENSSMAG00000029602 fgfrl1a (ENSSMAG00000010509) ENSSMAG00000010540 ENSSMAG00000010820 #33 ENSSMAG00000010797 ##37 ENSSMAG00000024700 ##37 ENSSMAG00000010841 ##37 ENSSMAG00000023026 ##37 ENSSMAG00000010900 #34 ENSSMAG00000010934 ENSSMAG00000010978 ENSSMAG00000025298 MCM7 (ENSSMAG00000011017) ENSSMAG00000011041 ENSSMAG00000011068 ENSSMAG00000011116 ENSSMAG00000011168 ENSSMAG00000011199 NKX3-2 (ENSSMAG00000011278) RAB28 (ENSSMAG00000031249) ENSSMAG00000011334 HS3ST1 (ENSSMAG00000029254) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 Seriola ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01040000242632 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.j #33 ENSGT00940000162676.a.a.x.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.i #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.y ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.x.b ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 Greater amberjack MODERN SPECIES 113 ENSSDUG00000002593 ENSSDUG00000002614 fgfrl1a (ENSSDUG00000002673) slit3 (ENSSDUG00000002721) ENSSDUG00000002822 ENSSDUG00000002832 ENSSDUG00000002835 #31 ENSSDUG00000002855 ##37 ENSSDUG00000002873 #33 ENSSDUG00000002892 ENSSDUG00000002917 ##30 ENSSDUG00000002940 #33 ENSSDUG00000002957 #30 ENSSDUG00000002988 ENSSDUG00000003047 #30 ENSSDUG00000003071 ##37 ENSSDUG00000003103 ##30 ENSSDUG00000003176 #28 ENSSDUG00000003194 ENSSDUG00000003208 gpc2 (ENSSDUG00000003228) ENSSDUG00000003250 mcm7 (ENSSDUG00000003338) ENSSDUG00000003388 COPS6 (ENSSDUG00000003419) ENSSDUG00000003440 aurkb (ENSSDUG00000003445) ENSSDUG00000003457 nkx3-2 (ENSSDUG00000003467) ENSSDUG00000003477 HS3ST1 (ENSSDUG00000003509) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 ENSSLDG00000024685 maea (ENSSLDG00000024664) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) spon2b (ENSSLDG00000024633) ENSSLDG00000024626 fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) slit3 (ENSSLDG00000024564) ENSSLDG00000024558 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024358 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024342 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024305 COPS6 (ENSSLDG00000024291) ENSSLDG00000024212 aurkb (ENSSLDG00000024189) ENSSLDG00000024171 nkx3-2 (ENSSLDG00000024167) RAB28 (ENSSLDG00000024149) HS3ST1 (ENSSLDG00000024142) Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010021910 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022520 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 slit3 (ENSLCAG00010021484) ENSLCAG00010021910 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) gpc2 (ENSLCAG00010022484) ENSLCAG00010022488 ENSLCAG00010022496 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000164241 Anabantoidei DUPLICATION Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.q ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000156835.l.a.b ENSGT00940000160595.b Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000003423 MAEA (ENSATEG00000003418) CTBP1 (ENSATEG00000003381) spon2b (ENSATEG00000003357) ENSATEG00000003335 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003059 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 ENSBSLG00000016743 ENSBSLG00000016605 fgfrl1a (ENSBSLG00000016120) slit3 (ENSBSLG00000012410) ENSBSLG00000012210 ENSBSLG00000012199 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011615 ##37 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011404 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011088 COPS6 (ENSBSLG00000011037) ENSBSLG00000010953 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.r ##37 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 zgc:136929 (ENSBSLG00000017079) spon2b (ENSBSLG00000017015) ENSBSLG00000016743 ENSBSLG00000016605 fgfrl1a (ENSBSLG00000016120) slit3 (ENSBSLG00000012410) ENSBSLG00000012210 ENSBSLG00000012199 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011615 ##37 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011404 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011088 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182968.d.b.a #30 ENSGT01030000234530.a.d #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000175410 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b Oryzias DUPLICATION Oryzias ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000011404 HS3ST1 (ENSOJAG00000011421) RAB28 (ENSOJAG00000011456) nkx3-2 (ENSOJAG00000011493) ENSOJAG00000011497 ENSOJAG00000011516 aurkb (ENSOJAG00000011520) ENSOJAG00000011547 COPS6 (ENSOJAG00000011556) ENSOJAG00000011657 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 slit3 (ENSOJAG00000013112) Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000011396 ENSOJAG00000011404 HS3ST1 (ENSOJAG00000011421) RAB28 (ENSOJAG00000011456) nkx3-2 (ENSOJAG00000011493) ENSOJAG00000011497 ENSOJAG00000011516 aurkb (ENSOJAG00000011520) ENSOJAG00000011547 COPS6 (ENSOJAG00000011556) ENSOJAG00000011657 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 RAB28 (ENSOJAG00000011456) nkx3-2 (ENSOJAG00000011493) ENSOJAG00000011497 ENSOJAG00000011516 aurkb (ENSOJAG00000011520) ENSOJAG00000011547 COPS6 (ENSOJAG00000011556) ENSOJAG00000011657 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 slit3 (ENSOJAG00000013112) fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) ENSOJAG00000016732 Indian medaka MODERN SPECIES 16 HS3ST1 (ENSOMEG00000012752) ENSOMEG00000012725 RAB28 (ENSOMEG00000012673) nkx3-2 (ENSOMEG00000012613) ENSOMEG00000012592 ENSOMEG00000012574 COPS6 (ENSOMEG00000012556) ENSOMEG00000012520 mcm7 (ENSOMEG00000012495) ENSOMEG00000012446 gpc2 (ENSOMEG00000012394) ENSOMEG00000000696 ENSOMEG00000012357 #30 ENSOMEG00000012340 #30 ENSOMEG00000012328 #30 ENSOMEG00000012300 #34 ENSOMEG00000012289 #30 ENSOMEG00000012272 #29 ENSOMEG00000000308 ##37 ENSOMEG00000012244 ##37 ENSOMEG00000012221 ##37 ENSOMEG00000012205 ##37 ENSOMEG00000012185 ##37 ENSOMEG00000012128 ##37 ENSOMEG00000012097 ##37 ENSOMEG00000012088 ##37 ENSOMEG00000012076 ##37 ENSOMEG00000012059 ##30 ENSOMEG00000012045 ENSOMEG00000012035 slit3 (ENSOMEG00000012015) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a Japanese Medaka HdrR DUPLICATION Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000022874 ENSORLG00000000606 nkx3-2 (ENSORLG00000029707) ENSORLG00000022787 ENSORLG00000000588 aurkb (ENSORLG00000000578) ENSORLG00000029587 COPS6 (ENSORLG00000000554) ENSORLG00000000538 mcm7 (ENSORLG00000000527) ENSORLG00000000491 gpc2 (ENSORLG00000000476) ENSORLG00000000441 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 HS3ST1 (ENSORLG00000030296) ENSORLG00000022874 ENSORLG00000000606 nkx3-2 (ENSORLG00000029707) ENSORLG00000022787 ENSORLG00000000588 aurkb (ENSORLG00000000578) ENSORLG00000029587 COPS6 (ENSORLG00000000554) ENSORLG00000000538 mcm7 (ENSORLG00000000527) ENSORLG00000000491 gpc2 (ENSORLG00000000476) ENSORLG00000000441 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 Chinese medaka MODERN SPECIES 2145 ENSOSIG00000001380 #34 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 nkx3-2 (ENSORLG00000029707) ENSORLG00000022787 ENSORLG00000000588 aurkb (ENSORLG00000000578) ENSORLG00000029587 COPS6 (ENSORLG00000000554) ENSORLG00000000538 mcm7 (ENSORLG00000000527) ENSORLG00000000491 gpc2 (ENSORLG00000000476) ENSORLG00000000441 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000022885 #35 Chinese medaka MODERN SPECIES 2296 ENSOSIG00000013085 #34 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 HS3ST1 (ENSOJAG00000011421) RAB28 (ENSOJAG00000011456) nkx3-2 (ENSOJAG00000011493) ENSOJAG00000011497 ENSOJAG00000011516 aurkb (ENSOJAG00000011520) ENSOJAG00000011547 COPS6 (ENSOJAG00000011556) ENSOJAG00000011657 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 slit3 (ENSOJAG00000013112) fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1610 ENSNFUG00015004310 ENSNFUG00015004307 fam13b (ENSNFUG00015004254) KLHL3 (ENSNFUG00015004210) ENSNFUG00015004196 hnrnpa0b (ENSNFUG00015004193) maea (ENSNFUG00015004184) zgc:136929 (ENSNFUG00015004023) ENSNFUG00015003989 ENSNFUG00015003988 spon2b (ENSNFUG00015003985) ENSNFUG00015003957 ENSNFUG00015003946 FGFRL1A (ENSNFUG00015003941) slit3 (ENSNFUG00015002545) ENSNFUG00015002297 #34 ENSNFUG00015002293 ENSNFUG00015002290 #19 ENSNFUG00015002254 #22 Nfu_g_1_004472 (ENSNFUG00015002237) #29 ENSNFUG00015002218 ##37 ENSNFUG00015002212 ENSNFUG00015002201 ##37 ENSNFUG00015002143 GPC6L (ENSNFUG00015002103) ENSNFUG00015002087 ENSNFUG00015002084 ENSNFUG00015002082 MCM7 (ENSNFUG00015002038) ENSNFUG00015002021 COPS6 (ENSNFUG00015002003) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00510000048283.c ENSGT00950000182938.b.b.a ENSGT00940000158129 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00390000003288 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.g ##36 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 Platyfish MODERN SPECIES 15 tmem216 (ENSXMAG00000016498) TMED9 (ENSXMAG00000022978) b4galt7 (ENSXMAG00000016477) emx3 (ENSXMAG00000016469) ENSXMAG00000027359 ENSXMAG00000019593 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000021265 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000022266 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000029869 #19 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 Amazon molly MODERN SPECIES 287 PCDH1 (ENSPFOG00000007397) ENSPFOG00000021727 tmed9 (ENSPFOG00000007395) tmem216 (ENSPFOG00000023783) TMED9 (ENSPFOG00000007314) b4galt7 (ENSPFOG00000007250) emx3 (ENSPFOG00000007211) ENSPFOG00000007161 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007140 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000022801 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000006899 ##37 Guppy DUPLICATION Guppy MODERN SPECIES 440 tmem216 (ENSPREG00000014683) TMED9 (ENSPREG00000014673) b4galt7 (ENSPREG00000014666) emx3 (ENSPREG00000014657) ENSPREG00000014646 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014292 #15 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014891 gm2a (ENSPREG00000014873) ENSPREG00000014862 PCDH12 (ENSPREG00000014853) ENSPREG00000014841 ENSPREG00000014830 PCDH1 (ENSPREG00000014812) tmed9 (ENSPREG00000014696) tmem216 (ENSPREG00000014683) TMED9 (ENSPREG00000014673) b4galt7 (ENSPREG00000014666) emx3 (ENSPREG00000014657) ENSPREG00000014646 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014415 #27 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00390000003288 ENSGT00940000160403 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000159747 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000157425.A ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 PCDH12 (ENSCVAG00000006988) PCDH1 (ENSCVAG00000007012) tmem216 (ENSCVAG00000007021) tmed9 (ENSCVAG00000007041) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) emx3 (ENSCVAG00000007080) ENSCVAG00000007091 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007510 #30 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 gm2a (ENSCVAG00000006983) PCDH12 (ENSCVAG00000006988) PCDH1 (ENSCVAG00000007012) tmem216 (ENSCVAG00000007021) tmed9 (ENSCVAG00000007041) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) emx3 (ENSCVAG00000007080) ENSCVAG00000007091 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007510 #30 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 ENSCVAG00000006978 gm2a (ENSCVAG00000006983) PCDH12 (ENSCVAG00000006988) PCDH1 (ENSCVAG00000007012) tmem216 (ENSCVAG00000007021) tmed9 (ENSCVAG00000007041) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) emx3 (ENSCVAG00000007080) ENSCVAG00000007091 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007510 #30 Mummichog DUPLICATION Mummichog MODERN SPECIES 2389 ENSFHEG00000011163 tmem216 (ENSFHEG00000011139) TMED9 (ENSFHEG00000011132) b4galt7 (ENSFHEG00000011096) emx3 (ENSFHEG00000011050) ENSFHEG00000010972 ENSFHEG00000010963 ENSFHEG00000010937 ##37 ENSFHEG00000010848 ENSFHEG00000010834 ##36 ENSFHEG00000010811 #37 ENSFHEG00000010767 #36 ENSFHEG00000010752 #35 ENSFHEG00000010730 #35 ENSFHEG00000000648 #34 Mummichog MODERN SPECIES 1309 ENSFHEG00000009955 #34 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a ##37 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 299 cxcl14 (ENSHBUG00000023864) fam13b (ENSHBUG00000023865) ENSHBUG00000023866 ENSHBUG00000023867 HNRNPA0 (ENSHBUG00000023868) maea (ENSHBUG00000023869) zgc:136929 (ENSHBUG00000023870) spon2b (ENSHBUG00000023871) ENSHBUG00000023872 ENSHBUG00000023873 fgfrl1a (ENSHBUG00000023874) slit3 (ENSHBUG00000023875) ENSHBUG00000023877 ENSHBUG00000023878 #31 ENSHBUG00000023879 ##37 ENSHBUG00000023880 #34 ENSHBUG00000023881 #30 ENSHBUG00000023882 ENSHBUG00000023883 ##19 ENSHBUG00000023884 #36 ENSHBUG00000023831 ##37 ENSHBUG00000023795 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.c #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.d #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.m #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 KLHL3 (ENSACLG00000009006) ENSACLG00000008978 HNRNPA0 (ENSACLG00000008973) maea (ENSACLG00000008954) ENSACLG00000008947 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 KLHL3 (ENSMZEG00005001097) ENSMZEG00005001063 HNRNPA0 (ENSMZEG00005001055) maea (ENSMZEG00005001004) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) spon2b (ENSMZEG00005000941) ENSMZEG00005000921 fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) slit3 (ENSMZEG00005000754) ENSMZEG00005000725 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000054 ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT00940000159403 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 387 ENSMZEG00005028455 ENSMZEG00005028456 #36 ENSMZEG00005028457 #34 ENSMZEG00005028458 #30 ENSMZEG00005028459 ##37 ENSMZEG00005028460 ##37 ENSMZEG00005028461 ##37 ENSMZEG00005028463 ##37 ENSMZEG00005028464 ##37 P. nyererei MODERN SPECIES 315 eif4ea (ENSPNYG00000020891) LINGO2 (ENSPNYG00000020886) cxcl14 (ENSPNYG00000020877) fam13b (ENSPNYG00000020838) KLHL3 (ENSPNYG00000020787) ENSPNYG00000020763 ENSPNYG00000020729 maea (ENSPNYG00000020697) zgc:136929 (ENSPNYG00000020630) spon2b (ENSPNYG00000020614) ENSPNYG00000020600 fgfrl1a (ENSPNYG00000020579) slit3 (ENSPNYG00000020486) ENSPNYG00000020476 ENSPNYG00000020459 ##37 ENSPNYG00000020414 #34 ENSPNYG00000020369 #35 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000042129 hnrnpa0b (ENSONIG00000037027) maea (ENSONIG00000001054) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000029112 #29 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.a #33 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.a #33 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 287 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000002564 ##37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003137 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000008978 HNRNPA0 (ENSACLG00000008973) maea (ENSACLG00000008954) ENSACLG00000008947 zgc:136929 (ENSACLG00000008935) spon2b (ENSACLG00000008926) ENSACLG00000008916 ENSACLG00000008906 fgfrl1a (ENSACLG00000008895) slit3 (ENSACLG00000008796) ENSACLG00000008780 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008712 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008702 ##37 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008571 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 fam13b (ENSNBRG00000014591) KLHL3 (ENSNBRG00000014552) ENSNBRG00000014522 ENSNBRG00000014469 maea (ENSNBRG00000014438) zgc:136929 (ENSNBRG00000014412) spon2b (ENSNBRG00000014396) ENSNBRG00000014380 fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) slit3 (ENSNBRG00000014236) ENSNBRG00000014223 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013751 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000037748 LINGO2 (ENSONIG00000020949) cxcl14 (ENSONIG00000033809) fam13b (ENSONIG00000001068) KLHL3 (ENSONIG00000001059) ENSONIG00000042129 hnrnpa0b (ENSONIG00000037027) maea (ENSONIG00000001054) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) spon2b (ENSONIG00000001044) ENSONIG00000042977 ENSONIG00000032367 fgfrl1a (ENSONIG00000001038) slit3 (ENSONIG00000000988) ENSONIG00000020948 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000000950 ##37 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 1096 LINGO2 (ENSACIG00000021678) cxcl14 (ENSACIG00000021683) fam13b (ENSACIG00000021699) KLHL3 (ENSACIG00000021783) ENSACIG00000021815 HNRNPA0 (ENSACIG00000021834) maea (ENSACIG00000021858) zgc:136929 (ENSACIG00000021871) spon2b (ENSACIG00000021886) ENSACIG00000021900 fgfrl1a (ENSACIG00000021910) slit3 (ENSACIG00000021930) ENSACIG00000021992 ENSACIG00000021999 #30 ENSACIG00000022015 #37 ENSACIG00000022037 #34 Midas cichlid MODERN SPECIES 1306 ENSACIG00000015460 ##37 ENSACIG00000015446 #35 ENSACIG00000015421 #34 ENSACIG00000015384 ##37 ENSACIG00000015374 ##30 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2533 ENSSPAG00000019024 #29 ENSSPAG00000019039 ##37 ENSSPAG00000019080 #29 ENSSPAG00000019099 #34 ENSSPAG00000019110 #28 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00730000111223 ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000165013.b.b Spiny chromis DUPLICATION Spiny chromis MODERN SPECIES 2208 ENSAPOG00000008756 #34 ENSAPOG00000008705 #28 ENSAPOG00000008679 Spiny chromis MODERN SPECIES 357 zgc:136929 (ENSAPOG00000008144) spon2b (ENSAPOG00000008090) ENSAPOG00000008057 fgfrl1a (ENSAPOG00000008028) slit3 (ENSAPOG00000007984) ENSAPOG00000007863 #34 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00730000111223 ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000167175.c ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.p ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.o.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.b #28 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000001690 eif4ea (ENSAPEG00000001758) LINGO2 (ENSAPEG00000002091) ENSAPEG00000002097 cxcl14 (ENSAPEG00000002109) fam13b (ENSAPEG00000002131) KLHL3 (ENSAPEG00000002167) ENSAPEG00000002224 ENSAPEG00000002274 maea (ENSAPEG00000002314) zgc:136929 (ENSAPEG00000002347) spon2b (ENSAPEG00000002387) ENSAPEG00000002409 fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) slit3 (ENSAPEG00000002657) ENSAPEG00000002766 #34 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003274 ##37 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019354 Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019960 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000019448 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000160449 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000168781 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010461 #30 ENSCGOG00000010463 #30 ENSCGOG00000010468 #28 ENSCGOG00000010471 ITGA6 (ENSCGOG00000010473) gpc2 (ENSCGOG00000010481) ENSCGOG00000010601 mcm7 (ENSCGOG00000010623) ENSCGOG00000011038 COPS6 (ENSCGOG00000011047) Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 KLHL3 (ENSCGOG00000009950) HNRNPA0 (ENSCGOG00000010091) ENSCGOG00000010096 maea (ENSCGOG00000010098) zgc:136929 (ENSCGOG00000010199) spon2b (ENSCGOG00000010244) ENSCGOG00000010249 ENSCGOG00000010311 fgfrl1a (ENSCGOG00000010315) ENSCGOG00000010321 ENSCGOG00000010326 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010357 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010423 #30 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010461 #30 ENSCGOG00000010463 #30 ENSCGOG00000010468 #28 ENSCGOG00000010471 ITGA6 (ENSCGOG00000010473) gpc2 (ENSCGOG00000010481) ENSCGOG00000010601 mcm7 (ENSCGOG00000010623) ENSCGOG00000011038 COPS6 (ENSCGOG00000011047) ENSCGOG00000011321 aurkb (ENSCGOG00000011322) ENSCGOG00000011323 nkx3-2 (ENSCGOG00000011341) ENSCGOG00000011344 Pike perch DUPLICATION Pike perch MODERN SPECIES 18 LINGO2 (ENSSLUG00000022705) cxcl14 (ENSSLUG00000022709) fam13b (ENSSLUG00000022722) KLHL3 (ENSSLUG00000022764) ENSSLUG00000022773 hnrnpa0b (ENSSLUG00000022778) maea (ENSSLUG00000022782) zgc:136929 (ENSSLUG00000022877) spon2b (ENSSLUG00000023507) ENSSLUG00000023515 ENSSLUG00000023520 fgfrl1a (ENSSLUG00000023537) slit3 (ENSSLUG00000023660) ENSSLUG00000023984 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024103 Pike perch MODERN SPECIES 18 ENSSLUG00000022773 hnrnpa0b (ENSSLUG00000022778) maea (ENSSLUG00000022782) zgc:136929 (ENSSLUG00000022877) spon2b (ENSSLUG00000023507) ENSSLUG00000023515 ENSSLUG00000023520 fgfrl1a (ENSSLUG00000023537) slit3 (ENSSLUG00000023660) ENSSLUG00000023984 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024103 ENSSLUG00000024108 gpc2 (ENSSLUG00000024133) STAG3 (ENSSLUG00000024162) mcm7 (ENSSLUG00000024175) Pike perch MODERN SPECIES 18 ENSSLUG00000023515 ENSSLUG00000023520 fgfrl1a (ENSSLUG00000023537) slit3 (ENSSLUG00000023660) ENSSLUG00000023984 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024103 ENSSLUG00000024108 gpc2 (ENSSLUG00000024133) STAG3 (ENSSLUG00000024162) mcm7 (ENSSLUG00000024175) ENSSLUG00000024236 COPS6 (ENSSLUG00000024239) ENSSLUG00000024249 aurkb (ENSSLUG00000024250) ENSSLUG00000024255 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000170413.B.d #19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 HNRNPA0 (ENSSAUG00010024095) maea (ENSSAUG00010024088) zgc:136929 (ENSSAUG00010023293) spon2b (ENSSAUG00010023276) ENSSAUG00010023275 ENSSAUG00010023273 fgfrl1a (ENSSAUG00010023271) slit3 (ENSSAUG00010023026) ENSSAUG00010023023 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023275 ENSSAUG00010023273 fgfrl1a (ENSSAUG00010023271) slit3 (ENSSAUG00010023026) ENSSAUG00010023023 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023015 #36 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022986 ##37 ENSSAUG00010022983 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022974 #28 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 12 cxcl14 (ENSDLAG00005029354) ENSDLAG00005023239 ENSDLAG00005001234 ENSDLAG00005001297 ENSDLAG00005001313 MAEA (ENSDLAG00005001329) CTBP1 (ENSDLAG00005001521) spon2b (ENSDLAG00005002407) ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005001297 ENSDLAG00005001313 MAEA (ENSDLAG00005001329) CTBP1 (ENSDLAG00005001521) spon2b (ENSDLAG00005002407) ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005023239 ENSDLAG00005001234 ENSDLAG00005001297 ENSDLAG00005001313 MAEA (ENSDLAG00005001329) CTBP1 (ENSDLAG00005001521) spon2b (ENSDLAG00005002407) ENSDLAG00005002436 ENSDLAG00005002457 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005003204 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005016398 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 Turbot MODERN SPECIES 4 ENSSMAG00000010196 ENSSMAG00000010246 ENSSMAG00000010279 MAEA (ENSSMAG00000010319) CTBP1 (ENSSMAG00000010328) spon2b (ENSSMAG00000010439) ENSSMAG00000010473 ENSSMAG00000029602 fgfrl1a (ENSSMAG00000010509) ENSSMAG00000010540 ENSSMAG00000010820 #33 ENSSMAG00000010797 ##37 ENSSMAG00000024700 ##37 ENSSMAG00000010841 ##37 ENSSMAG00000023026 ##37 ENSSMAG00000010900 #34 ENSSMAG00000010934 ENSSMAG00000010978 ENSSMAG00000025298 MCM7 (ENSSMAG00000011017) ENSSMAG00000011041 ENSSMAG00000011068 ENSSMAG00000011116 ENSSMAG00000011168 ENSSMAG00000011199 NKX3-2 (ENSSMAG00000011278) RAB28 (ENSSMAG00000031249) ENSSMAG00000011334 HS3ST1 (ENSSMAG00000029254) ENSSMAG00000011355 ENSSMAG00000011360 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 390 slit3 (ENSLCAG00010021484) ENSLCAG00010021910 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 Barramundi perch MODERN SPECIES 390 slit3 (ENSLCAG00010021484) ENSLCAG00010021910 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021989 ##30 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010022186 #33 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022370 ##37 ITGA6 (ENSLCAG00010022410) Seriola ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01040000242632 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.j #33 ENSGT00940000162676.a.a.x.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.i #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.y ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.x.b ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 KLHL3 (ENSSLDG00000024720) ENSSLDG00000024705 ENSSLDG00000024685 maea (ENSSLDG00000024664) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) spon2b (ENSSLDG00000024633) ENSSLDG00000024626 fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) slit3 (ENSSLDG00000024564) ENSSLDG00000024558 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024358 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024342 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024305 COPS6 (ENSSLDG00000024291) ENSSLDG00000024212 aurkb (ENSSLDG00000024189) ENSSLDG00000024171 nkx3-2 (ENSSLDG00000024167) Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 maea (ENSSLDG00000024664) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) spon2b (ENSSLDG00000024633) ENSSLDG00000024626 fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) slit3 (ENSSLDG00000024564) ENSSLDG00000024558 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024358 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024342 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024305 COPS6 (ENSSLDG00000024291) ENSSLDG00000024212 aurkb (ENSSLDG00000024189) ENSSLDG00000024171 nkx3-2 (ENSSLDG00000024167) RAB28 (ENSSLDG00000024149) HS3ST1 (ENSSLDG00000024142) ENSSLDG00000024139 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 FAT2 (ENSSLDG00000024755) KLHL3 (ENSSLDG00000024720) ENSSLDG00000024705 ENSSLDG00000024685 maea (ENSSLDG00000024664) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) spon2b (ENSSLDG00000024633) ENSSLDG00000024626 fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) slit3 (ENSSLDG00000024564) ENSSLDG00000024558 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024358 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024342 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024305 COPS6 (ENSSLDG00000024291) ENSSLDG00000024212 aurkb (ENSSLDG00000024189) ENSSLDG00000024171 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT00940000170871 ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00990000205479 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000017599 ENSMAMG00000017620 ENSMAMG00000017630 cxcl14 (ENSMAMG00000027577) ENSMAMG00000017652 ENSMAMG00000017687 ENSMAMG00000017728 ENSMAMG00000017754 MAEA (ENSMAMG00000017757) CTBP1 (ENSMAMG00000027529) spon2b (ENSMAMG00000017786) ENSMAMG00000027564 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000017823 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000024852 #31 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156665.a ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.q ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 cxcl14 (ENSBSLG00000018003) fam13b (ENSBSLG00000017811) KLHL3 (ENSBSLG00000017755) ENSBSLG00000017722 ENSBSLG00000017718 maea (ENSBSLG00000017650) ENSBSLG00000017634 zgc:136929 (ENSBSLG00000017079) spon2b (ENSBSLG00000017015) ENSBSLG00000016743 ENSBSLG00000016605 fgfrl1a (ENSBSLG00000016120) slit3 (ENSBSLG00000012410) ENSBSLG00000012210 ENSBSLG00000012199 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011803 #28 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 fam13b (ENSBSLG00000017811) KLHL3 (ENSBSLG00000017755) ENSBSLG00000017722 ENSBSLG00000017718 maea (ENSBSLG00000017650) ENSBSLG00000017634 zgc:136929 (ENSBSLG00000017079) spon2b (ENSBSLG00000017015) ENSBSLG00000016743 ENSBSLG00000016605 fgfrl1a (ENSBSLG00000016120) slit3 (ENSBSLG00000012410) ENSBSLG00000012210 ENSBSLG00000012199 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011727 #28 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 1 CTBP1 (ENSATEG00000003381) spon2b (ENSATEG00000003357) ENSATEG00000003335 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003059 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 Climbing perch MODERN SPECIES 1 spon2b (ENSATEG00000003357) ENSATEG00000003335 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003059 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000001999 Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 COPS6 (ENSMMDG00005003442) ENSMMDG00005003440 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005001983 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001313 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001119 slit3 (ENSMMDG00005021105) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) RNF212 (ENSMMDG00005021073) ENSMMDG00005021067 spon2b (ENSMMDG00005021051) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) maea (ENSMMDG00005020929) ENSMMDG00005020923 ENSMMDG00005020918 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005001983 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001313 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001119 slit3 (ENSMMDG00005021105) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) RNF212 (ENSMMDG00005021073) ENSMMDG00005021067 spon2b (ENSMMDG00005021051) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) maea (ENSMMDG00005020929) ENSMMDG00005020923 ENSMMDG00005020918 KLHL3 (ENSMMDG00005020871) fam13b (ENSMMDG00005020855) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005020923 maea (ENSMMDG00005020929) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) spon2b (ENSMMDG00005021051) ENSMMDG00005021067 RNF212 (ENSMMDG00005021073) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) slit3 (ENSMMDG00005021105) ENSMMDG00005001119 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001313 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001983 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005003440 COPS6 (ENSMMDG00005003442) ENSMMDG00005003445 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 LINGO2 (ENSMMDG00005020847) ENSMMDG00005020850 cxcl14 (ENSMMDG00005020852) fam13b (ENSMMDG00005020855) KLHL3 (ENSMMDG00005020871) ENSMMDG00005020918 ENSMMDG00005020923 maea (ENSMMDG00005020929) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) spon2b (ENSMMDG00005021051) ENSMMDG00005021067 RNF212 (ENSMMDG00005021073) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) slit3 (ENSMMDG00005021105) ENSMMDG00005001119 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001313 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 slit3 (ENSMMDG00005021105) ENSMMDG00005001119 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001313 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001983 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005003440 COPS6 (ENSMMDG00005003442) ENSMMDG00005003445 aurkb (ENSMMDG00005003446) nkx3-2 (ENSMMDG00005003448) RAB28 (ENSMMDG00005003450) HS3ST1 (ENSMMDG00005003453) ENSMMDG00005003455 ENSMMDG00005003456 gsr (ENSMMDG00005003474) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000018996 nkx3-2 (ENSMAMG00000018984) ENSMAMG00000018930 aurkb (ENSMAMG00000026263) ENSMAMG00000025506 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010022555 ENSLCAG00010022544 aurkb (ENSLCAG00010022522) ENSLCAG00010022520 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022496 ENSLCAG00010022488 gpc2 (ENSLCAG00010022484) ITGA6 (ENSLCAG00010022410) ENSLCAG00010022370 ##37 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022186 #33 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010021989 ##30 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021962 #33 Barramundi perch MODERN SPECIES 1096 ENSLCAG00010004545 #28 ENSLCAG00010004533 #28 ENSLCAG00010004527 ##19 ENSLCAG00010004513 #28 ENSLCAG00010004503 ##37 Seriola ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000000618 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT01040000242632 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.j #33 ENSGT00940000162676.a.a.x.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.i #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000162676.a.a.y ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.x.b ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a Greater amberjack MODERN SPECIES 113 cxcl14 (ENSSDUG00000002234) fam13b (ENSSDUG00000002262) KLHL3 (ENSSDUG00000002322) ENSSDUG00000002394 ENSSDUG00000002431 maea (ENSSDUG00000002472) zgc:136929 (ENSSDUG00000002539) spon2b (ENSSDUG00000002572) ENSSDUG00000002593 ENSSDUG00000002614 fgfrl1a (ENSSDUG00000002673) slit3 (ENSSDUG00000002721) ENSSDUG00000002822 ENSSDUG00000002832 ENSSDUG00000002835 #31 ENSSDUG00000002855 ##37 ENSSDUG00000002873 #33 ENSSDUG00000002892 ENSSDUG00000002917 ##30 ENSSDUG00000002940 #33 ENSSDUG00000002957 #30 ENSSDUG00000002988 ENSSDUG00000003047 #30 ENSSDUG00000003071 ##37 ENSSDUG00000003103 ##30 ENSSDUG00000003176 #28 ENSSDUG00000003194 ENSSDUG00000003208 gpc2 (ENSSDUG00000003228) ENSSDUG00000003250 mcm7 (ENSSDUG00000003338) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 SLC36A1 (ENSSLDG00000024977) mtnr1al (ENSSLDG00000024810) FAT2 (ENSSLDG00000024755) KLHL3 (ENSSLDG00000024720) ENSSLDG00000024705 ENSSLDG00000024685 maea (ENSSLDG00000024664) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) spon2b (ENSSLDG00000024633) ENSSLDG00000024626 fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) slit3 (ENSSLDG00000024564) ENSSLDG00000024558 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024358 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024342 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024305 COPS6 (ENSSLDG00000024291) ENSSLDG00000024212 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Amazon molly MODERN SPECIES 481 COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Mummichog MODERN SPECIES 1450 ENSFHEG00000019066 ##37 ENSFHEG00000019085 ##19 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.c.a ##37 Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017938 ##37 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017933 #29 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017927 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017879 ENSCLMG00005017878 mcm7 (ENSCLMG00005017691) ENSCLMG00005017687 COPS6 (ENSCLMG00005017553) ENSCLMG00005017549 aurkb (ENSCLMG00005017547) ENSCLMG00005017543 nkx3-2 (ENSCLMG00005017542) RAB28 (ENSCLMG00005017539) HS3ST1 (ENSCLMG00005017538) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00390000003288 ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000169511 ENSGT00940000153322.B.d.a ENSGT00390000017284.b ENSGT00940000167363 ENSGT00940000158869 ENSGT00940000164810 ENSGT00530000063860.a Cod DUPLICATION Cod DUPLICATION Cod DUPLICATION Cod DUPLICATION Cod DUPLICATION Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 1 TIMM8A (ENSGMOG00000030334) ENSGMOG00000029418 ENSGMOG00000011494 ENSGMOG00000011503 ENSGMOG00000033444 ENSGMOG00000016206 spon2b (ENSGMOG00000028338) ENSGMOG00000017156 ENSGMOG00000025445 fgfrl1a (ENSGMOG00000023341) ENSGMOG00000018735 ENSGMOG00000034466 #37 ENSGMOG00000032320 ENSGMOG00000030450 #37 ENSGMOG00000023439 #37 ENSGMOG00000027232 #37 ENSGMOG00000017306 mtnr1al (ENSGMOG00000017372) ENSGMOG00000027688 atox1 (ENSGMOG00000023345) sparc (ENSGMOG00000019341) g3bp1 (ENSGMOG00000019345) glra1 (ENSGMOG00000015249) slc25a48 (ENSGMOG00000019144) ENSGMOG00000019154 ENSGMOG00000019136 ENSGMOG00000037214 ENSGMOG00000014209 ENSGMOG00000034137 SLC26A2 (ENSGMOG00000013680) pde6a (ENSGMOG00000013630) Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000011470 TIMM8A (ENSGMOG00000030334) ENSGMOG00000029418 ENSGMOG00000011494 ENSGMOG00000011503 ENSGMOG00000033444 ENSGMOG00000016206 spon2b (ENSGMOG00000028338) ENSGMOG00000017156 ENSGMOG00000025445 fgfrl1a (ENSGMOG00000023341) ENSGMOG00000018735 ENSGMOG00000034466 #37 ENSGMOG00000032320 ENSGMOG00000030450 #37 ENSGMOG00000023439 #37 ENSGMOG00000027232 #37 ENSGMOG00000017306 mtnr1al (ENSGMOG00000017372) ENSGMOG00000027688 atox1 (ENSGMOG00000023345) sparc (ENSGMOG00000019341) g3bp1 (ENSGMOG00000019345) glra1 (ENSGMOG00000015249) slc25a48 (ENSGMOG00000019144) ENSGMOG00000019154 ENSGMOG00000019136 ENSGMOG00000037214 ENSGMOG00000014209 ENSGMOG00000034137 SLC26A2 (ENSGMOG00000013680) Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000011463 ENSGMOG00000011470 TIMM8A (ENSGMOG00000030334) ENSGMOG00000029418 ENSGMOG00000011494 ENSGMOG00000011503 ENSGMOG00000033444 ENSGMOG00000016206 spon2b (ENSGMOG00000028338) ENSGMOG00000017156 ENSGMOG00000025445 fgfrl1a (ENSGMOG00000023341) ENSGMOG00000018735 ENSGMOG00000034466 #37 ENSGMOG00000032320 ENSGMOG00000030450 #37 ENSGMOG00000023439 #37 ENSGMOG00000027232 #37 ENSGMOG00000017306 mtnr1al (ENSGMOG00000017372) ENSGMOG00000027688 atox1 (ENSGMOG00000023345) sparc (ENSGMOG00000019341) g3bp1 (ENSGMOG00000019345) glra1 (ENSGMOG00000015249) slc25a48 (ENSGMOG00000019144) ENSGMOG00000019154 ENSGMOG00000019136 ENSGMOG00000037214 ENSGMOG00000014209 ENSGMOG00000034137 Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000018754 ENSGMOG00000027575 ENSGMOG00000018770 ENSGMOG00000018792 ENSGMOG00000018798 ENSGMOG00000027768 #37 ENSGMOG00000036584 #37 ENSGMOG00000019766 #37 ENSGMOG00000030647 #37 ENSGMOG00000032256 #37 ENSGMOG00000035721 #37 ENSGMOG00000003771 #37 ENSGMOG00000036956 #37 ENSGMOG00000035791 #37 ENSGMOG00000031398 #37 ENSGMOG00000030659 #37 ENSGMOG00000032065 ENSGMOG00000035215 ENSGMOG00000000314 ENSGMOG00000012256 ENSGMOG00000012259 ENSGMOG00000036362 b4galt7 (ENSGMOG00000014786) ENSGMOG00000014778 ENSGMOG00000011405 ENSGMOG00000005071 ENSGMOG00000019046 ENSGMOG00000024289 ENSGMOG00000026293 ARHGEF37 (ENSGMOG00000014487) ENSGMOG00000030539 Cod DUPLICATION Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 1 HS3ST1 (ENSGMOG00000019948) RAB28 (ENSGMOG00000018715) ENSGMOG00000034110 nkx3-2 (ENSGMOG00000026159) ENSGMOG00000018730 ENSGMOG00000025527 aurkb (ENSGMOG00000018737) ENSGMOG00000033146 ENSGMOG00000018754 ENSGMOG00000027575 ENSGMOG00000018770 ENSGMOG00000018792 ENSGMOG00000018798 ENSGMOG00000027768 #37 ENSGMOG00000036584 #37 ENSGMOG00000019766 #37 ENSGMOG00000030647 #37 ENSGMOG00000032256 #37 ENSGMOG00000035721 #37 ENSGMOG00000003771 #37 ENSGMOG00000036956 #37 ENSGMOG00000035791 #37 ENSGMOG00000031398 #37 ENSGMOG00000030659 #37 ENSGMOG00000032065 ENSGMOG00000035215 ENSGMOG00000000314 ENSGMOG00000012256 ENSGMOG00000012259 ENSGMOG00000036362 b4galt7 (ENSGMOG00000014786) Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000014778 b4galt7 (ENSGMOG00000014786) ENSGMOG00000036362 ENSGMOG00000012259 ENSGMOG00000012256 ENSGMOG00000000314 ENSGMOG00000035215 ENSGMOG00000032065 ENSGMOG00000030659 #37 ENSGMOG00000031398 #37 ENSGMOG00000035791 #37 ENSGMOG00000036956 #37 ENSGMOG00000003771 #37 ENSGMOG00000035721 #37 ENSGMOG00000032256 #37 ENSGMOG00000030647 #37 ENSGMOG00000019766 #37 ENSGMOG00000036584 #37 ENSGMOG00000027768 #37 ENSGMOG00000018798 ENSGMOG00000018792 ENSGMOG00000018770 ENSGMOG00000027575 ENSGMOG00000018754 ENSGMOG00000033146 aurkb (ENSGMOG00000018737) ENSGMOG00000025527 ENSGMOG00000018730 nkx3-2 (ENSGMOG00000026159) ENSGMOG00000034110 RAB28 (ENSGMOG00000018715) Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000025527 aurkb (ENSGMOG00000018737) ENSGMOG00000033146 ENSGMOG00000018754 ENSGMOG00000027575 ENSGMOG00000018770 ENSGMOG00000018792 ENSGMOG00000018798 ENSGMOG00000027768 #37 ENSGMOG00000036584 #37 ENSGMOG00000019766 #37 ENSGMOG00000030647 #37 ENSGMOG00000032256 #37 ENSGMOG00000035721 #37 ENSGMOG00000003771 #37 ENSGMOG00000036956 #37 ENSGMOG00000035791 #37 ENSGMOG00000031398 #37 ENSGMOG00000030659 #37 ENSGMOG00000032065 ENSGMOG00000035215 ENSGMOG00000000314 ENSGMOG00000012256 ENSGMOG00000012259 ENSGMOG00000036362 b4galt7 (ENSGMOG00000014786) ENSGMOG00000014778 ENSGMOG00000011405 ENSGMOG00000005071 ENSGMOG00000019046 ENSGMOG00000024289 Cod DUPLICATION Cod DUPLICATION Cod DUPLICATION Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000018730 ENSGMOG00000025527 aurkb (ENSGMOG00000018737) ENSGMOG00000033146 ENSGMOG00000018754 ENSGMOG00000027575 ENSGMOG00000018770 ENSGMOG00000018792 ENSGMOG00000018798 ENSGMOG00000027768 #37 ENSGMOG00000036584 #37 ENSGMOG00000019766 #37 ENSGMOG00000030647 #37 ENSGMOG00000032256 #37 ENSGMOG00000035721 #37 ENSGMOG00000003771 #37 ENSGMOG00000036956 #37 ENSGMOG00000035791 #37 ENSGMOG00000031398 #37 ENSGMOG00000030659 #37 ENSGMOG00000032065 ENSGMOG00000035215 ENSGMOG00000000314 ENSGMOG00000012256 ENSGMOG00000012259 ENSGMOG00000036362 b4galt7 (ENSGMOG00000014786) ENSGMOG00000014778 ENSGMOG00000011405 ENSGMOG00000005071 ENSGMOG00000019046 Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000036954 HS3ST1 (ENSGMOG00000019948) RAB28 (ENSGMOG00000018715) ENSGMOG00000034110 nkx3-2 (ENSGMOG00000026159) ENSGMOG00000018730 ENSGMOG00000025527 aurkb (ENSGMOG00000018737) ENSGMOG00000033146 ENSGMOG00000018754 ENSGMOG00000027575 ENSGMOG00000018770 ENSGMOG00000018792 ENSGMOG00000018798 ENSGMOG00000027768 #37 ENSGMOG00000036584 #37 ENSGMOG00000019766 #37 ENSGMOG00000030647 #37 ENSGMOG00000032256 #37 ENSGMOG00000035721 #37 ENSGMOG00000003771 #37 ENSGMOG00000036956 #37 ENSGMOG00000035791 #37 ENSGMOG00000031398 #37 ENSGMOG00000030659 #37 ENSGMOG00000032065 ENSGMOG00000035215 ENSGMOG00000000314 ENSGMOG00000012256 ENSGMOG00000012259 ENSGMOG00000036362 Cod DUPLICATION Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 1 nkx3-2 (ENSGMOG00000026159) ENSGMOG00000018730 ENSGMOG00000025527 aurkb (ENSGMOG00000018737) ENSGMOG00000033146 ENSGMOG00000018754 ENSGMOG00000027575 ENSGMOG00000018770 ENSGMOG00000018792 ENSGMOG00000018798 ENSGMOG00000027768 #37 ENSGMOG00000036584 #37 ENSGMOG00000019766 #37 ENSGMOG00000030647 #37 ENSGMOG00000032256 #37 ENSGMOG00000035721 #37 ENSGMOG00000003771 #37 ENSGMOG00000036956 #37 ENSGMOG00000035791 #37 ENSGMOG00000031398 #37 ENSGMOG00000030659 #37 ENSGMOG00000032065 ENSGMOG00000035215 ENSGMOG00000000314 ENSGMOG00000012256 ENSGMOG00000012259 ENSGMOG00000036362 b4galt7 (ENSGMOG00000014786) ENSGMOG00000014778 ENSGMOG00000011405 ENSGMOG00000005071 Cod MODERN SPECIES 1 aurkb (ENSGMOG00000018737) ENSGMOG00000033146 ENSGMOG00000018754 ENSGMOG00000027575 ENSGMOG00000018770 ENSGMOG00000018792 ENSGMOG00000018798 ENSGMOG00000027768 #37 ENSGMOG00000036584 #37 ENSGMOG00000019766 #37 ENSGMOG00000030647 #37 ENSGMOG00000032256 #37 ENSGMOG00000035721 #37 ENSGMOG00000003771 #37 ENSGMOG00000036956 #37 ENSGMOG00000035791 #37 ENSGMOG00000031398 #37 ENSGMOG00000030659 #37 ENSGMOG00000032065 ENSGMOG00000035215 ENSGMOG00000000314 ENSGMOG00000012256 ENSGMOG00000012259 ENSGMOG00000036362 b4galt7 (ENSGMOG00000014786) ENSGMOG00000014778 ENSGMOG00000011405 ENSGMOG00000005071 ENSGMOG00000019046 ENSGMOG00000024289 ENSGMOG00000026293 Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000033146 ENSGMOG00000018754 ENSGMOG00000027575 ENSGMOG00000018770 ENSGMOG00000018792 ENSGMOG00000018798 ENSGMOG00000027768 #37 ENSGMOG00000036584 #37 ENSGMOG00000019766 #37 ENSGMOG00000030647 #37 ENSGMOG00000032256 #37 ENSGMOG00000035721 #37 ENSGMOG00000003771 #37 ENSGMOG00000036956 #37 ENSGMOG00000035791 #37 ENSGMOG00000031398 #37 ENSGMOG00000030659 #37 ENSGMOG00000032065 ENSGMOG00000035215 ENSGMOG00000000314 ENSGMOG00000012256 ENSGMOG00000012259 ENSGMOG00000036362 b4galt7 (ENSGMOG00000014786) ENSGMOG00000014778 ENSGMOG00000011405 ENSGMOG00000005071 ENSGMOG00000019046 ENSGMOG00000024289 ENSGMOG00000026293 ARHGEF37 (ENSGMOG00000014487) Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000031231 ENSGMOG00000036954 HS3ST1 (ENSGMOG00000019948) RAB28 (ENSGMOG00000018715) ENSGMOG00000034110 nkx3-2 (ENSGMOG00000026159) ENSGMOG00000018730 ENSGMOG00000025527 aurkb (ENSGMOG00000018737) ENSGMOG00000033146 ENSGMOG00000018754 ENSGMOG00000027575 ENSGMOG00000018770 ENSGMOG00000018792 ENSGMOG00000018798 ENSGMOG00000027768 #37 ENSGMOG00000036584 #37 ENSGMOG00000019766 #37 ENSGMOG00000030647 #37 ENSGMOG00000032256 #37 ENSGMOG00000035721 #37 ENSGMOG00000003771 #37 ENSGMOG00000036956 #37 ENSGMOG00000035791 #37 ENSGMOG00000031398 #37 ENSGMOG00000030659 #37 ENSGMOG00000032065 ENSGMOG00000035215 ENSGMOG00000000314 ENSGMOG00000012256 ENSGMOG00000012259 Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000034110 nkx3-2 (ENSGMOG00000026159) ENSGMOG00000018730 ENSGMOG00000025527 aurkb (ENSGMOG00000018737) ENSGMOG00000033146 ENSGMOG00000018754 ENSGMOG00000027575 ENSGMOG00000018770 ENSGMOG00000018792 ENSGMOG00000018798 ENSGMOG00000027768 #37 ENSGMOG00000036584 #37 ENSGMOG00000019766 #37 ENSGMOG00000030647 #37 ENSGMOG00000032256 #37 ENSGMOG00000035721 #37 ENSGMOG00000003771 #37 ENSGMOG00000036956 #37 ENSGMOG00000035791 #37 ENSGMOG00000031398 #37 ENSGMOG00000030659 #37 ENSGMOG00000032065 ENSGMOG00000035215 ENSGMOG00000000314 ENSGMOG00000012256 ENSGMOG00000012259 ENSGMOG00000036362 b4galt7 (ENSGMOG00000014786) ENSGMOG00000014778 ENSGMOG00000011405 Cod MODERN SPECIES 1 glra4a (ENSGMOG00000011442) gla (ENSGMOG00000011455) ENSGMOG00000011463 ENSGMOG00000011470 TIMM8A (ENSGMOG00000030334) ENSGMOG00000029418 ENSGMOG00000011494 ENSGMOG00000011503 ENSGMOG00000033444 ENSGMOG00000016206 spon2b (ENSGMOG00000028338) ENSGMOG00000017156 ENSGMOG00000025445 fgfrl1a (ENSGMOG00000023341) ENSGMOG00000018735 ENSGMOG00000034466 #37 ENSGMOG00000032320 ENSGMOG00000030450 #37 ENSGMOG00000023439 #37 ENSGMOG00000027232 #37 ENSGMOG00000017306 mtnr1al (ENSGMOG00000017372) ENSGMOG00000027688 atox1 (ENSGMOG00000023345) sparc (ENSGMOG00000019341) g3bp1 (ENSGMOG00000019345) glra1 (ENSGMOG00000015249) slc25a48 (ENSGMOG00000019144) ENSGMOG00000019154 ENSGMOG00000019136 ENSGMOG00000037214 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d #37 ENSGT00950000182968.d.b.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a #31 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 aurkb (ENSMMDG00005003446) ENSMMDG00005003445 COPS6 (ENSMMDG00005003442) ENSMMDG00005003440 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005001983 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001313 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001119 slit3 (ENSMMDG00005021105) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) RNF212 (ENSMMDG00005021073) ENSMMDG00005021067 spon2b (ENSMMDG00005021051) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) maea (ENSMMDG00005020929) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 RAB28 (ENSMMDG00005003450) nkx3-2 (ENSMMDG00005003448) aurkb (ENSMMDG00005003446) ENSMMDG00005003445 COPS6 (ENSMMDG00005003442) ENSMMDG00005003440 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005001983 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001313 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001119 slit3 (ENSMMDG00005021105) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) RNF212 (ENSMMDG00005021073) ENSMMDG00005021067 spon2b (ENSMMDG00005021051) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 nkx3-2 (ENSMMDG00005003448) aurkb (ENSMMDG00005003446) ENSMMDG00005003445 COPS6 (ENSMMDG00005003442) ENSMMDG00005003440 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005001983 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001313 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001119 slit3 (ENSMMDG00005021105) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) RNF212 (ENSMMDG00005021073) ENSMMDG00005021067 spon2b (ENSMMDG00005021051) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 slc30a9 (ENSMMDG00005003625) gsr (ENSMMDG00005003474) ENSMMDG00005003456 ENSMMDG00005003455 HS3ST1 (ENSMMDG00005003453) RAB28 (ENSMMDG00005003450) nkx3-2 (ENSMMDG00005003448) aurkb (ENSMMDG00005003446) ENSMMDG00005003445 COPS6 (ENSMMDG00005003442) ENSMMDG00005003440 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005001983 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001313 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001119 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 HS3ST1 (ENSMMDG00005003453) RAB28 (ENSMMDG00005003450) nkx3-2 (ENSMMDG00005003448) aurkb (ENSMMDG00005003446) ENSMMDG00005003445 COPS6 (ENSMMDG00005003442) ENSMMDG00005003440 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005001983 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001313 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001119 slit3 (ENSMMDG00005021105) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) RNF212 (ENSMMDG00005021073) ENSMMDG00005021067 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005003456 ENSMMDG00005003455 HS3ST1 (ENSMMDG00005003453) RAB28 (ENSMMDG00005003450) nkx3-2 (ENSMMDG00005003448) aurkb (ENSMMDG00005003446) ENSMMDG00005003445 COPS6 (ENSMMDG00005003442) ENSMMDG00005003440 mcm7 (ENSMMDG00005002053) ENSMMDG00005001983 gpc2 (ENSMMDG00005001435) ENSMMDG00005001313 ENSMMDG00005001289 #37 ENSMMDG00005001280 #34 ENSMMDG00005001269 #37 ENSMMDG00005001227 #30 ENSMMDG00005001213 #37 ENSMMDG00005001189 #37 ENSMMDG00005001175 #37 ENSMMDG00005001160 #37 ENSMMDG00005001151 #34 ENSMMDG00005001140 #34 ENSMMDG00005001136 #29 ENSMMDG00005001133 #34 ENSMMDG00005001130 #28 ENSMMDG00005001124 #28 ENSMMDG00005001122 #34 ENSMMDG00005001119 slit3 (ENSMMDG00005021105) fgfrl1a (ENSMMDG00005021076) Percomorphaceae DUPLICATION Percomorphaceae DUPLICATION Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 ENSGT00390000003288 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00940000158129 ENSGT00950000182938.b.b.a ENSGT00510000048283.c ENSGT00940000160376 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000927 emx3 (ENSPLAG00000000925) Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022801 ##37 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000007140 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007161 emx3 (ENSPFOG00000007211) b4galt7 (ENSPFOG00000007250) TMED9 (ENSPFOG00000007314) tmem216 (ENSPFOG00000023783) tmed9 (ENSPFOG00000007395) ENSPFOG00000021727 PCDH1 (ENSPFOG00000007397) PCDH12 (ENSPFOG00000007422) Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014646 emx3 (ENSPREG00000014657) b4galt7 (ENSPREG00000014666) TMED9 (ENSPREG00000014673) tmem216 (ENSPREG00000014683) tmed9 (ENSPREG00000014696) Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000022266 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000021265 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000019593 ENSXMAG00000027359 emx3 (ENSXMAG00000016469) b4galt7 (ENSXMAG00000016477) TMED9 (ENSXMAG00000022978) tmem216 (ENSXMAG00000016498) ENSXMAG00000016501 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 ENSGT00390000003288 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00940000158129 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 ENSCVAG00000007510 #30 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007091 emx3 (ENSCVAG00000007080) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) tmed9 (ENSCVAG00000007041) tmem216 (ENSCVAG00000007021) PCDH1 (ENSCVAG00000007012) PCDH12 (ENSCVAG00000006988) gm2a (ENSCVAG00000006983) ENSCVAG00000006978 thoc3 (ENSCVAG00000006941) Mummichog DUPLICATION Mummichog MODERN SPECIES 2389 ENSFHEG00000000648 #34 ENSFHEG00000010730 #35 ENSFHEG00000010752 #35 ENSFHEG00000010767 #36 ENSFHEG00000010811 #37 ENSFHEG00000010834 ##36 ENSFHEG00000010848 ENSFHEG00000010937 ##37 ENSFHEG00000010963 ENSFHEG00000010972 emx3 (ENSFHEG00000011050) b4galt7 (ENSFHEG00000011096) TMED9 (ENSFHEG00000011132) tmem216 (ENSFHEG00000011139) ENSFHEG00000011163 Mummichog MODERN SPECIES 2389 ENSFHEG00000000648 #34 ENSFHEG00000010730 #35 ENSFHEG00000010752 #35 ENSFHEG00000010767 #36 ENSFHEG00000010811 #37 ENSFHEG00000010834 ##36 ENSFHEG00000010848 ENSFHEG00000010937 ##37 ENSFHEG00000010963 ENSFHEG00000010972 emx3 (ENSFHEG00000011050) b4galt7 (ENSFHEG00000011096) TMED9 (ENSFHEG00000011132) tmem216 (ENSFHEG00000011139) ENSFHEG00000011163 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a Mangrove rivulus MODERN SPECIES 40 ENSKMAG00000011274 #33 ENSKMAG00000011236 #30 ENSKMAG00000011206 #35 ENSKMAG00000011180 #37 ENSKMAG00000011160 #37 ENSKMAG00000011151 ##19 ENSKMAG00000011125 #30 ENSKMAG00000011105 #30 ENSKMAG00000011093 slit3 (ENSKMAG00000010979) fgfrl1a (ENSKMAG00000010924) ENSKMAG00000010913 spon2b (ENSKMAG00000010887) zgc:136929 (ENSKMAG00000010853) maea (ENSKMAG00000010808) ENSKMAG00000010760 KLHL3 (ENSKMAG00000010712) fam13b (ENSKMAG00000010593) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a Japanese Medaka HdrR DUPLICATION Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000022885 #35 ENSORLG00000030644 slit3 (ENSORLG00000000335) ENSORLG00000028622 fgfrl1a (ENSORLG00000000305) ENSORLG00000000293 spon2b (ENSORLG00000000275) zgc:136929 (ENSORLG00000000259) maea (ENSORLG00000000230) ENSORLG00000022539 ENSORLG00000027074 ENSORLG00000024157 ENSORLG00000024793 KLHL3 (ENSORLG00000000214) fam13b (ENSORLG00000000207) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000022885 #35 ENSORLG00000030644 slit3 (ENSORLG00000000335) ENSORLG00000028622 fgfrl1a (ENSORLG00000000305) ENSORLG00000000293 spon2b (ENSORLG00000000275) zgc:136929 (ENSORLG00000000259) maea (ENSORLG00000000230) ENSORLG00000022539 ENSORLG00000027074 ENSORLG00000024157 ENSORLG00000024793 KLHL3 (ENSORLG00000000214) fam13b (ENSORLG00000000207) cxcl14 (ENSORLG00000000201) Chinese medaka MODERN SPECIES 3795 ENSOSIG00000002112 #35 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00950000183123 ENSGT00940000167175.a ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 slit3 (ENSOJAG00000013112) fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) ENSOJAG00000016732 ENSOJAG00000016737 spon2b (ENSOJAG00000016747) zgc:136929 (ENSOJAG00000016765) maea (ENSOJAG00000016904) ENSOJAG00000016953 ENSOJAG00000016962 KLHL3 (ENSOJAG00000016974) fam13b (ENSOJAG00000017074) cxcl14 (ENSOJAG00000017121) LINGO2 (ENSOJAG00000017155) eif4ea (ENSOJAG00000017163) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.a #33 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.a #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 287 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002564 ##37 P. nyererei MODERN SPECIES 315 ENSPNYG00000020369 #35 ENSPNYG00000020414 #34 ENSPNYG00000020459 ##37 ENSPNYG00000020476 slit3 (ENSPNYG00000020486) fgfrl1a (ENSPNYG00000020579) ENSPNYG00000020600 spon2b (ENSPNYG00000020614) zgc:136929 (ENSPNYG00000020630) maea (ENSPNYG00000020697) ENSPNYG00000020729 ENSPNYG00000020763 KLHL3 (ENSPNYG00000020787) fam13b (ENSPNYG00000020838) cxcl14 (ENSPNYG00000020877) LINGO2 (ENSPNYG00000020886) Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000020948 slit3 (ENSONIG00000000988) fgfrl1a (ENSONIG00000001038) ENSONIG00000032367 ENSONIG00000042977 spon2b (ENSONIG00000001044) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) maea (ENSONIG00000001054) hnrnpa0b (ENSONIG00000037027) Midas cichlid MODERN SPECIES 1306 ENSACIG00000015374 ##30 ENSACIG00000015384 ##37 ENSACIG00000015421 #34 ENSACIG00000015446 #35 ENSACIG00000015460 ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 128 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000167175 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b Tongue sole MODERN SPECIES 6 ENSCSEG00000003156 nkx3-2 (ENSCSEG00000003170) ENSCSEG00000003174 ENSCSEG00000003190 ENSCSEG00000003193 aurkb (ENSCSEG00000003195) ENSCSEG00000003206 COPS6 (ENSCSEG00000003213) ENSCSEG00000003221 mcm7 (ENSCSEG00000003225) ENSCSEG00000003242 ENSCSEG00000003246 gpc2 (ENSCSEG00000003250) ITGA6 (ENSCSEG00000003251) ENSCSEG00000003264 #29 ENSCSEG00000003269 #35 ENSCSEG00000003285 #29 slit3 (ENSCSEG00000003303) ENSCSEG00000003359 fgfrl1a (ENSCSEG00000003362) ENSCSEG00000003375 ENSCSEG00000003385 maea (ENSCSEG00000003393) spon2b (ENSCSEG00000003405) zgc:136929 (ENSCSEG00000003417) hnrnpa0b (ENSCSEG00000003421) KLHL3 (ENSCSEG00000003437) ENSCSEG00000003453 tdo2a (ENSCSEG00000003467) asb5a (ENSCSEG00000003474) gpm6aa (ENSCSEG00000003489) Percomorphaceae DUPLICATION Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000167175 Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.q ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011615 ##37 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012199 ENSBSLG00000012210 slit3 (ENSBSLG00000012410) fgfrl1a (ENSBSLG00000016120) ENSBSLG00000016605 ENSBSLG00000016743 spon2b (ENSBSLG00000017015) zgc:136929 (ENSBSLG00000017079) ENSBSLG00000017634 maea (ENSBSLG00000017650) ENSBSLG00000017718 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 aurkb (ENSBSLG00000010905) ENSBSLG00000010953 COPS6 (ENSBSLG00000011037) ENSBSLG00000011088 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011404 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011615 ##37 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012199 ENSBSLG00000012210 slit3 (ENSBSLG00000012410) fgfrl1a (ENSBSLG00000016120) ENSBSLG00000016605 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 COPS6 (ENSBSLG00000011037) ENSBSLG00000011088 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011404 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011615 ##37 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012199 ENSBSLG00000012210 slit3 (ENSBSLG00000012410) fgfrl1a (ENSBSLG00000016120) ENSBSLG00000016605 ENSBSLG00000016743 spon2b (ENSBSLG00000017015) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012100 #36 ENSBSLG00000012116 #37 ENSBSLG00000012129 #34 ENSBSLG00000012196 #34 ENSBSLG00000012199 ENSBSLG00000012210 slit3 (ENSBSLG00000012410) fgfrl1a (ENSBSLG00000016120) ENSBSLG00000016605 ENSBSLG00000016743 spon2b (ENSBSLG00000017015) zgc:136929 (ENSBSLG00000017079) ENSBSLG00000017634 maea (ENSBSLG00000017650) ENSBSLG00000017718 ENSBSLG00000017722 KLHL3 (ENSBSLG00000017755) Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000018909 ENSMAMG00000018884 ENSMAMG00000018868 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000017992 ##37 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000018804 ENSMAMG00000018794 ENSMAMG00000018779 ENSMAMG00000018598 ENSMAMG00000026185 #28 ENSMAMG00000025090 #28 ENSMAMG00000018527 #28 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017823 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000028094 ##37 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017823 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000027564 spon2b (ENSMAMG00000017786) CTBP1 (ENSMAMG00000027529) MAEA (ENSMAMG00000017757) ENSMAMG00000017754 ENSMAMG00000017728 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000167175 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 ENSGT00390000003288 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00940000158129 ENSGT00950000182938.b.b.a Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 ENSGT00390000003288 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00940000158129 ENSGT00950000182938.b.b.a ENSGT00510000048283.c NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C Amazon molly DUPLICATION Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022801 ##37 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000007140 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007161 emx3 (ENSPFOG00000007211) b4galt7 (ENSPFOG00000007250) TMED9 (ENSPFOG00000007314) tmem216 (ENSPFOG00000023783) tmed9 (ENSPFOG00000007395) ENSPFOG00000021727 PCDH1 (ENSPFOG00000007397) PCDH12 (ENSPFOG00000007422) gm2a (ENSPFOG00000007444) ENSPFOG00000007502 thoc3 (ENSPFOG00000007685) cplx2 (ENSPFOG00000007799) Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022801 ##37 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000007140 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007161 emx3 (ENSPFOG00000007211) b4galt7 (ENSPFOG00000007250) TMED9 (ENSPFOG00000007314) tmem216 (ENSPFOG00000023783) tmed9 (ENSPFOG00000007395) ENSPFOG00000021727 PCDH1 (ENSPFOG00000007397) PCDH12 (ENSPFOG00000007422) gm2a (ENSPFOG00000007444) ENSPFOG00000007502 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000927 emx3 (ENSPLAG00000000925) Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014646 emx3 (ENSPREG00000014657) b4galt7 (ENSPREG00000014666) TMED9 (ENSPREG00000014673) tmem216 (ENSPREG00000014683) tmed9 (ENSPREG00000014696) PCDH1 (ENSPREG00000014812) ENSPREG00000014830 ENSPREG00000014841 Platyfish DUPLICATION Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000022266 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000021265 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000019593 ENSXMAG00000027359 emx3 (ENSXMAG00000016469) b4galt7 (ENSXMAG00000016477) TMED9 (ENSXMAG00000022978) tmem216 (ENSXMAG00000016498) ENSXMAG00000016501 ENSXMAG00000022864 PCDH1 (ENSXMAG00000016502) ENSXMAG00000021428 PCDH12 (ENSXMAG00000003252) gm2a (ENSXMAG00000003245) ENSXMAG00000003236 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000022266 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000021265 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000019593 ENSXMAG00000027359 emx3 (ENSXMAG00000016469) b4galt7 (ENSXMAG00000016477) TMED9 (ENSXMAG00000022978) tmem216 (ENSXMAG00000016498) ENSXMAG00000016501 ENSXMAG00000022864 PCDH1 (ENSXMAG00000016502) Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 ENSGT00390000003288 ENSGT00510000048167.b.b Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000175795 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000175795 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 ENSGT00390000003288 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00940000158129 ENSGT00950000182938.b.b.a ENSGT00510000048283.c Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022801 ##37 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000007140 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007161 emx3 (ENSPFOG00000007211) b4galt7 (ENSPFOG00000007250) TMED9 (ENSPFOG00000007314) tmem216 (ENSPFOG00000023783) tmed9 (ENSPFOG00000007395) ENSPFOG00000021727 PCDH1 (ENSPFOG00000007397) PCDH12 (ENSPFOG00000007422) gm2a (ENSPFOG00000007444) ENSPFOG00000007502 thoc3 (ENSPFOG00000007685) Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014646 emx3 (ENSPREG00000014657) b4galt7 (ENSPREG00000014666) TMED9 (ENSPREG00000014673) tmem216 (ENSPREG00000014683) tmed9 (ENSPREG00000014696) PCDH1 (ENSPREG00000014812) ENSPREG00000014830 ENSPREG00000014841 PCDH12 (ENSPREG00000014853) ENSPREG00000014862 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000022266 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000021265 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000019593 ENSXMAG00000027359 emx3 (ENSXMAG00000016469) b4galt7 (ENSXMAG00000016477) TMED9 (ENSXMAG00000022978) tmem216 (ENSXMAG00000016498) ENSXMAG00000016501 ENSXMAG00000022864 PCDH1 (ENSXMAG00000016502) ENSXMAG00000021428 PCDH12 (ENSXMAG00000003252) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 ENSGT00390000003288 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00940000158129 ENSGT00950000182938.b.b.a ENSGT00510000048283.c Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 ENSCVAG00000007510 #30 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007091 emx3 (ENSCVAG00000007080) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) tmed9 (ENSCVAG00000007041) tmem216 (ENSCVAG00000007021) PCDH1 (ENSCVAG00000007012) PCDH12 (ENSCVAG00000006988) gm2a (ENSCVAG00000006983) ENSCVAG00000006978 thoc3 (ENSCVAG00000006941) cplx2 (ENSCVAG00000006927) ENSCVAG00000006917 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 ENSCVAG00000007510 #30 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007091 emx3 (ENSCVAG00000007080) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) tmed9 (ENSCVAG00000007041) tmem216 (ENSCVAG00000007021) PCDH1 (ENSCVAG00000007012) PCDH12 (ENSCVAG00000006988) gm2a (ENSCVAG00000006983) ENSCVAG00000006978 thoc3 (ENSCVAG00000006941) cplx2 (ENSCVAG00000006927) Mummichog MODERN SPECIES 2389 ENSFHEG00000000648 #34 ENSFHEG00000010730 #35 ENSFHEG00000010752 #35 ENSFHEG00000010767 #36 ENSFHEG00000010811 #37 ENSFHEG00000010834 ##36 ENSFHEG00000010848 ENSFHEG00000010937 ##37 ENSFHEG00000010963 ENSFHEG00000010972 emx3 (ENSFHEG00000011050) b4galt7 (ENSFHEG00000011096) TMED9 (ENSFHEG00000011132) tmem216 (ENSFHEG00000011139) ENSFHEG00000011163 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus MODERN SPECIES 40 ENSKMAG00000011274 #33 ENSKMAG00000011236 #30 ENSKMAG00000011206 #35 ENSKMAG00000011180 #37 ENSKMAG00000011160 #37 ENSKMAG00000011151 ##19 ENSKMAG00000011125 #30 ENSKMAG00000011105 #30 ENSKMAG00000011093 slit3 (ENSKMAG00000010979) fgfrl1a (ENSKMAG00000010924) ENSKMAG00000010913 spon2b (ENSKMAG00000010887) zgc:136929 (ENSKMAG00000010853) maea (ENSKMAG00000010808) ENSKMAG00000010760 KLHL3 (ENSKMAG00000010712) fam13b (ENSKMAG00000010593) cxcl14 (ENSKMAG00000010539) Mangrove rivulus MODERN SPECIES 40 ENSKMAG00000011274 #33 ENSKMAG00000011236 #30 ENSKMAG00000011206 #35 ENSKMAG00000011180 #37 ENSKMAG00000011160 #37 ENSKMAG00000011151 ##19 ENSKMAG00000011125 #30 ENSKMAG00000011105 #30 ENSKMAG00000011093 slit3 (ENSKMAG00000010979) fgfrl1a (ENSKMAG00000010924) ENSKMAG00000010913 spon2b (ENSKMAG00000010887) zgc:136929 (ENSKMAG00000010853) maea (ENSKMAG00000010808) ENSKMAG00000010760 KLHL3 (ENSKMAG00000010712) fam13b (ENSKMAG00000010593) cxcl14 (ENSKMAG00000010539) LINGO2 (ENSKMAG00000010529) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175.d Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 Lyretail cichlid DUPLICATION Lyretail cichlid MODERN SPECIES 928 ENSNBRG00000007740 #37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014223 slit3 (ENSNBRG00000014236) fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) ENSNBRG00000014380 spon2b (ENSNBRG00000014396) zgc:136929 (ENSNBRG00000014412) maea (ENSNBRG00000014438) ENSNBRG00000014469 ENSNBRG00000014522 KLHL3 (ENSNBRG00000014552) fam13b (ENSNBRG00000014591) cxcl14 (ENSNBRG00000014631) LINGO2 (ENSNBRG00000014642) Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.a #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.m #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.d #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.c #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b Eastern happy MODERN SPECIES 11 pcdh18b (ENSACLG00000008084) ENSACLG00000008571 ENSACLG00000008586 ENSACLG00000008593 ENSACLG00000008627 ##37 ENSACLG00000008666 #30 ENSACLG00000008694 ##37 ENSACLG00000008702 ##37 nitr13 (ENSACLG00000008707) ##37 ENSACLG00000008712 ##37 ENSACLG00000008716 ##37 ENSACLG00000008718 ##37 ENSACLG00000008729 ##37 ENSACLG00000008745 ##30 ENSACLG00000008748 ##37 ENSACLG00000008752 #37 ENSACLG00000008759 #34 ENSACLG00000008764 #34 ENSACLG00000008768 ##37 ENSACLG00000008772 #31 ENSACLG00000008776 #31 ENSACLG00000008780 slit3 (ENSACLG00000008796) fgfrl1a (ENSACLG00000008895) ENSACLG00000008906 ENSACLG00000008916 spon2b (ENSACLG00000008926) zgc:136929 (ENSACLG00000008935) ENSACLG00000008947 maea (ENSACLG00000008954) HNRNPA0 (ENSACLG00000008973) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000725 slit3 (ENSMZEG00005000754) fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) ENSMZEG00005000921 spon2b (ENSMZEG00005000941) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) maea (ENSMZEG00005001004) HNRNPA0 (ENSMZEG00005001055) ENSMZEG00005001063 KLHL3 (ENSMZEG00005001097) fam13b (ENSMZEG00005001152) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002564 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002853 ENSACLG00000002812 ##37 ENSACLG00000002774 ##37 ENSACLG00000002739 ##37 ENSACLG00000002729 ##37 ENSACLG00000002690 #35 ENSACLG00000002643 #34 ENSACLG00000002588 #34 ENSACLG00000002580 #37 ENSACLG00000002569 #37 ENSACLG00000002564 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000491 ENSMZEG00005000509 ##37 ENSMZEG00005000536 ##37 ENSMZEG00005000558 #30 ENSMZEG00005000575 #34 ENSMZEG00005000596 #37 ENSMZEG00005000626 #37 ENSMZEG00005000644 ##37 ENSMZEG00005000650 #31 ENSMZEG00005000706 #31 ENSMZEG00005000725 slit3 (ENSMZEG00005000754) fgfrl1a (ENSMZEG00005000881) ENSMZEG00005000921 spon2b (ENSMZEG00005000941) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) maea (ENSMZEG00005001004) HNRNPA0 (ENSMZEG00005001055) ENSMZEG00005001063 KLHL3 (ENSMZEG00005001097) fam13b (ENSMZEG00005001152) cxcl14 (ENSMZEG00005001209) Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000020948 slit3 (ENSONIG00000000988) fgfrl1a (ENSONIG00000001038) ENSONIG00000032367 ENSONIG00000042977 spon2b (ENSONIG00000001044) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) maea (ENSONIG00000001054) hnrnpa0b (ENSONIG00000037027) ENSONIG00000042129 KLHL3 (ENSONIG00000001059) Midas cichlid MODERN SPECIES 1096 ENSACIG00000022037 #34 ENSACIG00000022015 #37 ENSACIG00000021999 #30 ENSACIG00000021992 slit3 (ENSACIG00000021930) fgfrl1a (ENSACIG00000021910) ENSACIG00000021900 spon2b (ENSACIG00000021886) zgc:136929 (ENSACIG00000021871) maea (ENSACIG00000021858) HNRNPA0 (ENSACIG00000021834) ENSACIG00000021815 KLHL3 (ENSACIG00000021783) fam13b (ENSACIG00000021699) cxcl14 (ENSACIG00000021683) LINGO2 (ENSACIG00000021678) eif4ea (ENSACIG00000021637) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 336 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A ##19 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.a #33 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.a #33 ENSGT00940000162676.a.a.n ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.j #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 415 ENSNBRG00000013751 ##37 ENSNBRG00000013761 ##37 ENSNBRG00000013782 ##37 ENSNBRG00000013807 ##37 ENSNBRG00000013873 ##37 ENSNBRG00000013890 ENSNBRG00000013915 ##37 ENSNBRG00000013935 #30 ENSNBRG00000013952 ##37 ENSNBRG00000013970 ##37 ENSNBRG00000013984 ##37 ENSNBRG00000014034 ##37 ENSNBRG00000014082 #33 ENSNBRG00000014111 ENSNBRG00000014119 #34 ENSNBRG00000014132 ENSNBRG00000014160 #37 ENSNBRG00000014173 #31 ENSNBRG00000014212 #19 ENSNBRG00000014223 slit3 (ENSNBRG00000014236) fgfrl1a (ENSNBRG00000014355) ENSNBRG00000014380 spon2b (ENSNBRG00000014396) zgc:136929 (ENSNBRG00000014412) maea (ENSNBRG00000014438) ENSNBRG00000014469 ENSNBRG00000014522 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 374 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 375 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT00940000173984 #29 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.a #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002875 ##37 ENSACLG00000002853 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003104 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000444 ##37 ENSMZEG00005000462 ENSMZEG00005000491 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000002344 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000156526.b ENSGT00940000159799 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00940000175226 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.c ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b.c.b ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003167 ENSACLG00000003137 ##37 ENSACLG00000003126 ##37 ENSACLG00000003104 ##37 ENSACLG00000003072 #30 ENSACLG00000003038 ##37 ENSACLG00000003021 #19 ENSACLG00000002999 ##37 ENSACLG00000002982 ##37 ENSACLG00000002875 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000003800 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003381 #33 ENSACLG00000003358 #33 ENSACLG00000003317 ##37 ENSACLG00000003297 ##19 ENSACLG00000003268 ##19 ENSACLG00000003186 ##37 ENSACLG00000003167 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000054 ##37 ENSMZEG00005000068 ##37 ENSMZEG00005000162 ##37 ENSMZEG00005000209 ##37 ENSMZEG00005000305 #30 ENSMZEG00005000336 ##37 ENSMZEG00005000367 ##37 ENSMZEG00005000391 ##37 ENSMZEG00005000412 ##37 ENSMZEG00005000444 ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1384 ENSHBUG00000014881 ##30 ENSHBUG00000014857 #33 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000034073 ENSONIG00000039937 ##37 ENSONIG00000029975 ##37 ENSONIG00000000954 ##30 ENSONIG00000000950 ##37 ENSONIG00000028685 ##37 ENSONIG00000034607 ##37 ENSONIG00000038524 ##37 ENSONIG00000039835 ##37 ENSONIG00000019890 #33 ENSONIG00000019888 ##37 ENSONIG00000043164 ##37 ENSONIG00000000946 ##37 ENSONIG00000000972 #35 ENSONIG00000000981 #34 ENSONIG00000000982 #37 ENSONIG00000000986 ##37 ENSONIG00000040469 #31 ENSONIG00000000987 #31 ENSONIG00000000979 #34 ENSONIG00000020948 slit3 (ENSONIG00000000988) fgfrl1a (ENSONIG00000001038) ENSONIG00000032367 ENSONIG00000042977 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 ENSGT00390000003288 ENSGT00510000048167.b.b ENSGT00940000158129 ENSGT00950000182938.b.b.a Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.a #17 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT00940000170413.B.a.a.b #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000175795 Platyfish DUPLICATION Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000029341 #17 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000022266 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000021265 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000019593 ENSXMAG00000027359 emx3 (ENSXMAG00000016469) b4galt7 (ENSXMAG00000016477) Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000026454 #18 ENSXMAG00000029869 #19 ENSXMAG00000022029 #20 ENSXMAG00000022445 #21 ENSXMAG00000027741 #22 ENSXMAG00000022659 #23 ENSXMAG00000021948 #24 ENSXMAG00000028078 #25 ENSXMAG00000025980 #26 ENSXMAG00000029771 #27 ENSXMAG00000030104 #28 ENSXMAG00000016459 #29 ENSXMAG00000025328 #30 ENSXMAG00000028746 #31 ENSXMAG00000016462 #32 ENSXMAG00000024773 #33 ENSXMAG00000016463 #34 ENSXMAG00000023923 #35 ENSXMAG00000027622 #36 ENSXMAG00000029173 #37 ENSXMAG00000022266 nitr13 (ENSXMAG00000025508) ##37 ENSXMAG00000021265 ENSXMAG00000016464 ##37 ENSXMAG00000016465 ##37 ENSXMAG00000023456 ENSXMAG00000019593 ENSXMAG00000027359 emx3 (ENSXMAG00000016469) b4galt7 (ENSXMAG00000016477) TMED9 (ENSXMAG00000022978) Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A Guppy DUPLICATION Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014646 emx3 (ENSPREG00000014657) b4galt7 (ENSPREG00000014666) TMED9 (ENSPREG00000014673) Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 ENSPREG00000014304 #14 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014646 emx3 (ENSPREG00000014657) b4galt7 (ENSPREG00000014666) NAME_6 DUPLICATION NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000927 emx3 (ENSPLAG00000000925) Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006847 #15 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022801 ##37 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000007140 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007161 emx3 (ENSPFOG00000007211) b4galt7 (ENSPFOG00000007250) TMED9 (ENSPFOG00000007314) tmem216 (ENSPFOG00000023783) tmed9 (ENSPFOG00000007395) NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.b #18 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000006891 #18 ENSPFOG00000006899 ##37 ENSPFOG00000006942 #20 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022801 ##37 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000007140 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007161 emx3 (ENSPFOG00000007211) b4galt7 (ENSPFOG00000007250) TMED9 (ENSPFOG00000007314) tmem216 (ENSPFOG00000023783) tmed9 (ENSPFOG00000007395) ENSPFOG00000021727 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000177190.f.b #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000160403 ENSGT00390000003288 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 122 ENSCVAG00000007510 #30 ENSCVAG00000007434 ENSCVAG00000007414 #31 ENSCVAG00000007361 #33 ENSCVAG00000007340 #34 ENSCVAG00000007327 #34 ENSCVAG00000007305 #34 ENSCVAG00000007288 #35 ENSCVAG00000007267 #37 ENSCVAG00000007177 #37 ENSCVAG00000007139 ##37 ENSCVAG00000007122 #29 ENSCVAG00000007107 ENSCVAG00000007091 emx3 (ENSCVAG00000007080) b4galt7 (ENSCVAG00000007063) tmed9 (ENSCVAG00000007041) tmem216 (ENSCVAG00000007021) PCDH1 (ENSCVAG00000007012) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 40 ENSKMAG00000011274 #33 ENSKMAG00000011236 #30 ENSKMAG00000011206 #35 ENSKMAG00000011180 #37 ENSKMAG00000011160 #37 ENSKMAG00000011151 ##19 ENSKMAG00000011125 #30 ENSKMAG00000011105 #30 ENSKMAG00000011093 slit3 (ENSKMAG00000010979) fgfrl1a (ENSKMAG00000010924) ENSKMAG00000010913 spon2b (ENSKMAG00000010887) zgc:136929 (ENSKMAG00000010853) maea (ENSKMAG00000010808) ENSKMAG00000010760 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a Carangaria ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 Turbot MODERN SPECIES 4 NKX3-2 (ENSSMAG00000011278) ENSSMAG00000011199 ENSSMAG00000011168 ENSSMAG00000011116 ENSSMAG00000011068 ENSSMAG00000011041 MCM7 (ENSSMAG00000011017) ENSSMAG00000025298 ENSSMAG00000010978 ENSSMAG00000010934 ENSSMAG00000010900 #34 ENSSMAG00000023026 ##37 ENSSMAG00000010841 ##37 ENSSMAG00000024700 ##37 ENSSMAG00000010797 ##37 ENSSMAG00000010820 #33 ENSSMAG00000010540 fgfrl1a (ENSSMAG00000010509) ENSSMAG00000029602 ENSSMAG00000010473 spon2b (ENSSMAG00000010439) CTBP1 (ENSSMAG00000010328) MAEA (ENSSMAG00000010319) ENSSMAG00000010279 ENSSMAG00000010246 ENSSMAG00000010196 ENSSMAG00000010115 cxcl14 (ENSSMAG00000010064) ENSSMAG00000010054 ENSSMAG00000010015 ENSSMAG00000009982 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000177190 #36 Seriola DUPLICATION Seriola ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000162676.a.a.x.b ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.y ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.i #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a.x.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.j #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01040000242632 ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000165646.B Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 RAB28 (ENSSLDG00000024149) nkx3-2 (ENSSLDG00000024167) ENSSLDG00000024171 aurkb (ENSSLDG00000024189) ENSSLDG00000024212 COPS6 (ENSSLDG00000024291) ENSSLDG00000024305 mcm7 (ENSSLDG00000024311) ENSSLDG00000024342 gpc2 (ENSSLDG00000024350) ENSSLDG00000024358 ENSSLDG00000024372 ENSSLDG00000024384 #28 ENSSLDG00000024400 #34 ENSSLDG00000024417 ##37 ENSSLDG00000024426 #33 ENSSLDG00000024442 #34 ENSSLDG00000024474 #34 ENSSLDG00000024484 ENSSLDG00000024534 ##37 ENSSLDG00000024543 #31 ENSSLDG00000024549 ENSSLDG00000024558 slit3 (ENSSLDG00000024564) fgfrl1a (ENSSLDG00000024618) ENSSLDG00000024626 spon2b (ENSSLDG00000024633) zgc:136929 (ENSSLDG00000024644) maea (ENSSLDG00000024664) ENSSLDG00000024685 ENSSLDG00000024705 Greater amberjack MODERN SPECIES 113 aurkb (ENSSDUG00000003445) ENSSDUG00000003440 COPS6 (ENSSDUG00000003419) ENSSDUG00000003388 mcm7 (ENSSDUG00000003338) ENSSDUG00000003250 gpc2 (ENSSDUG00000003228) ENSSDUG00000003208 ENSSDUG00000003194 ENSSDUG00000003176 #28 ENSSDUG00000003103 ##30 ENSSDUG00000003071 ##37 ENSSDUG00000003047 #30 ENSSDUG00000002988 ENSSDUG00000002957 #30 ENSSDUG00000002940 #33 ENSSDUG00000002917 ##30 ENSSDUG00000002892 ENSSDUG00000002873 #33 ENSSDUG00000002855 ##37 ENSSDUG00000002835 #31 ENSSDUG00000002832 ENSSDUG00000002822 slit3 (ENSSDUG00000002721) fgfrl1a (ENSSDUG00000002673) ENSSDUG00000002614 ENSSDUG00000002593 spon2b (ENSSDUG00000002572) zgc:136929 (ENSSDUG00000002539) maea (ENSSDUG00000002472) ENSSDUG00000002431 Seriola ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000162676.a.a.x.b ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.y ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.i #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a.x.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.j #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01040000242632 ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 938 ENSSLDG00000011435 #33 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 1555 ENSSLDG00000002853 #33 Greater amberjack MODERN SPECIES 113 ENSSDUG00000003388 mcm7 (ENSSDUG00000003338) ENSSDUG00000003250 gpc2 (ENSSDUG00000003228) ENSSDUG00000003208 ENSSDUG00000003194 ENSSDUG00000003176 #28 ENSSDUG00000003103 ##30 ENSSDUG00000003071 ##37 ENSSDUG00000003047 #30 ENSSDUG00000002988 ENSSDUG00000002957 #30 ENSSDUG00000002940 #33 ENSSDUG00000002917 ##30 ENSSDUG00000002892 ENSSDUG00000002873 #33 ENSSDUG00000002855 ##37 ENSSDUG00000002835 #31 ENSSDUG00000002832 ENSSDUG00000002822 slit3 (ENSSDUG00000002721) fgfrl1a (ENSSDUG00000002673) ENSSDUG00000002614 ENSSDUG00000002593 spon2b (ENSSDUG00000002572) zgc:136929 (ENSSDUG00000002539) maea (ENSSDUG00000002472) ENSSDUG00000002431 ENSSDUG00000002394 KLHL3 (ENSSDUG00000002322) fam13b (ENSSDUG00000002262) Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022186 #33 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010021989 ##30 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021910 slit3 (ENSLCAG00010021484) Barramundi perch MODERN SPECIES 390 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022496 ENSLCAG00010022488 gpc2 (ENSLCAG00010022484) ITGA6 (ENSLCAG00010022410) ENSLCAG00010022370 ##37 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022186 #33 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010021989 ##30 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021910 slit3 (ENSLCAG00010021484) Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010022488 gpc2 (ENSLCAG00010022484) ITGA6 (ENSLCAG00010022410) ENSLCAG00010022370 ##37 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022186 #33 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010021989 ##30 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021910 slit3 (ENSLCAG00010021484) Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022186 #33 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010021989 ##30 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021910 slit3 (ENSLCAG00010021484) Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022186 #33 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010021989 ##30 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021910 slit3 (ENSLCAG00010021484) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000157645.e.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156835.l.a.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.q ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003059 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003059 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003335 spon2b (ENSATEG00000003357) CTBP1 (ENSATEG00000003381) MAEA (ENSATEG00000003418) ENSATEG00000003423 ENSATEG00000003468 Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003059 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003335 spon2b (ENSATEG00000003357) CTBP1 (ENSATEG00000003381) MAEA (ENSATEG00000003418) ENSATEG00000003423 ENSATEG00000003468 ENSATEG00000003526 ENSATEG00000003585 cxcl14 (ENSATEG00000026931) ENSATEG00000003631 ENSATEG00000003645 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003059 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003335 spon2b (ENSATEG00000003357) CTBP1 (ENSATEG00000003381) MAEA (ENSATEG00000003418) ENSATEG00000003423 ENSATEG00000003468 ENSATEG00000003526 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000028743 #31 ENSATEG00000002390 #31 ENSATEG00000002471 ##30 ENSATEG00000002428 ##30 ENSATEG00000002523 #33 ENSATEG00000025310 #28 ENSATEG00000029997 ##19 ENSATEG00000002552 #34 ENSATEG00000002604 #34 ENSATEG00000002646 #28 ENSATEG00000002759 ##37 ENSATEG00000002839 #33 ENSATEG00000030030 #33 ENSATEG00000002846 ##30 ENSATEG00000002959 ##37 ENSATEG00000027620 #33 ENSATEG00000002929 #33 ENSATEG00000003017 ENSATEG00000003020 ENSATEG00000003059 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003335 spon2b (ENSATEG00000003357) CTBP1 (ENSATEG00000003381) MAEA (ENSATEG00000003418) ENSATEG00000003423 ENSATEG00000003468 ENSATEG00000003526 ENSATEG00000003585 cxcl14 (ENSATEG00000026931) ENSATEG00000003631 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.B.d #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker MODERN SPECIES vax1 (ENSLCRG00005012631) kcnk18 (ENSLCRG00005012633) slc18a2 (ENSLCRG00005012637) ENSLCRG00005012641 PDZD8 (ENSLCRG00005012642) ENSLCRG00005012644 exo1 (ENSLCRG00005012648) yipf4 (ENSLCRG00005012663) BIRC6 (ENSLCRG00005012670) ttc27 (ENSLCRG00005012900) LTBP1 (ENSLCRG00005014005) rasgrp3 (ENSLCRG00005014015) ENSLCRG00005015236 ENSLCRG00005016153 ENSLCRG00005016154 #30 ENSLCRG00005016157 ##37 ENSLCRG00005016158 ##30 ENSLCRG00005016159 #36 ENSLCRG00005016160 #36 ENSLCRG00005016161 ##37 ENSLCRG00005016163 ENSLCRG00005016165 SRP72 (ENSLCRG00005016171) zgc:92045 (ENSLCRG00005016300) FAT4 (ENSLCRG00005016302) ENSLCRG00005016303 ENSLCRG00005016305 ANKRD50 (ENSLCRG00005016307) ENSLCRG00005016309 spry1 (ENSLCRG00005016311) SPATA5 (ENSLCRG00005016313) Large yellow croaker MODERN SPECIES PDZD8 (ENSLCRG00005012642) ENSLCRG00005012644 exo1 (ENSLCRG00005012648) yipf4 (ENSLCRG00005012663) BIRC6 (ENSLCRG00005012670) ttc27 (ENSLCRG00005012900) LTBP1 (ENSLCRG00005014005) rasgrp3 (ENSLCRG00005014015) ENSLCRG00005015236 ENSLCRG00005016153 ENSLCRG00005016154 #30 ENSLCRG00005016157 ##37 ENSLCRG00005016158 ##30 ENSLCRG00005016159 #36 ENSLCRG00005016160 #36 ENSLCRG00005016161 ##37 ENSLCRG00005016163 ENSLCRG00005016165 SRP72 (ENSLCRG00005016171) zgc:92045 (ENSLCRG00005016300) FAT4 (ENSLCRG00005016302) ENSLCRG00005016303 ENSLCRG00005016305 ANKRD50 (ENSLCRG00005016307) ENSLCRG00005016309 spry1 (ENSLCRG00005016311) SPATA5 (ENSLCRG00005016313) nudt6 (ENSLCRG00005016349) fgf2 (ENSLCRG00005016350) BBS12 (ENSLCRG00005016351) ENSLCRG00005016355 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005016398 ENSDLAG00005018500 #28 ENSDLAG00005004047 #28 ENSDLAG00005007241 #28 ENSDLAG00005004032 ##37 ENSDLAG00005018323 ##37 ENSDLAG00005007108 #30 ENSDLAG00005031729 ##37 ENSDLAG00005027547 #34 ENSDLAG00005016849 ##37 ENSDLAG00005016829 #34 ENSDLAG00005009257 #34 ENSDLAG00005009255 ENSDLAG00005009253 ENSDLAG00005009247 ENSDLAG00005003204 fgfrl1a (ENSDLAG00005002545) ENSDLAG00005002457 ENSDLAG00005002436 spon2b (ENSDLAG00005002407) CTBP1 (ENSDLAG00005001521) MAEA (ENSDLAG00005001329) ENSDLAG00005001313 ENSDLAG00005001297 ENSDLAG00005001234 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156986 ENSGT00940000171832 ENSGT00940000156835.l.a.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a Lumpfish DUPLICATION Lumpfish DUPLICATION Lumpfish DUPLICATION Lumpfish DUPLICATION Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005004694 fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) slit3 (ENSCLMG00005004626) ENSCLMG00005004500 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017938 ##37 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017933 #29 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017927 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017879 ENSCLMG00005017878 mcm7 (ENSCLMG00005017691) ENSCLMG00005017687 COPS6 (ENSCLMG00005017553) ENSCLMG00005017549 aurkb (ENSCLMG00005017547) Lumpfish MODERN SPECIES 1 eif4ea (ENSCLMG00005007819) LINGO2 (ENSCLMG00005007816) cxcl14 (ENSCLMG00005007814) fam13b (ENSCLMG00005007813) KLHL3 (ENSCLMG00005007803) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) maea (ENSCLMG00005007778) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) spon2b (ENSCLMG00005004748) ENSCLMG00005004694 fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) slit3 (ENSCLMG00005004626) ENSCLMG00005004500 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017938 ##37 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017933 #29 Lumpfish MODERN SPECIES 1 cxcl14 (ENSCLMG00005007814) fam13b (ENSCLMG00005007813) KLHL3 (ENSCLMG00005007803) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) maea (ENSCLMG00005007778) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) spon2b (ENSCLMG00005004748) ENSCLMG00005004694 fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) slit3 (ENSCLMG00005004626) ENSCLMG00005004500 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017938 ##37 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017933 #29 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017927 Lumpfish MODERN SPECIES 1 hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) maea (ENSCLMG00005007778) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) spon2b (ENSCLMG00005004748) ENSCLMG00005004694 fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) slit3 (ENSCLMG00005004626) ENSCLMG00005004500 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017938 ##37 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017933 #29 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017927 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017879 ENSCLMG00005017878 mcm7 (ENSCLMG00005017691) Lumpfish DUPLICATION Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005007832 eif4ea (ENSCLMG00005007819) LINGO2 (ENSCLMG00005007816) cxcl14 (ENSCLMG00005007814) fam13b (ENSCLMG00005007813) KLHL3 (ENSCLMG00005007803) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) maea (ENSCLMG00005007778) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) spon2b (ENSCLMG00005004748) ENSCLMG00005004694 fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) slit3 (ENSCLMG00005004626) ENSCLMG00005004500 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017938 ##37 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 Lumpfish MODERN SPECIES 1 RAB28 (ENSCLMG00005017539) nkx3-2 (ENSCLMG00005017542) ENSCLMG00005017543 aurkb (ENSCLMG00005017547) ENSCLMG00005017549 COPS6 (ENSCLMG00005017553) ENSCLMG00005017687 mcm7 (ENSCLMG00005017691) ENSCLMG00005017878 ENSCLMG00005017879 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 ENSCLMG00005004442 ##37 ENSCLMG00005004469 ##37 ENSCLMG00005004500 ##37 Stickleback DUPLICATION Stickleback DUPLICATION Stickleback DUPLICATION Stickleback DUPLICATION Stickleback MODERN SPECIES 3 zgc:77938 (ENSGACG00000016479) ENSGACG00000016474 eif4ea (ENSGACG00000016472) LINGO2 (ENSGACG00000016470) cxcl14 (ENSGACG00000016464) fam13b (ENSGACG00000016458) KLHL3 (ENSGACG00000016452) ENSGACG00000016449 hnrnpa0b (ENSGACG00000016447) maea (ENSGACG00000016443) zgc:136929 (ENSGACG00000016437) spon2b (ENSGACG00000016431) ENSGACG00000016428 fgfrl1a (ENSGACG00000016426) ENSGACG00000016424 ENSGACG00000016423 ##37 ENSGACG00000016422 ##37 ENSGACG00000016419 ##37 slit3 (ENSGACG00000016411) ENSGACG00000016409 ##37 ENSGACG00000016407 ##37 gpc2 (ENSGACG00000016402) mcm7 (ENSGACG00000016398) COPS6 (ENSGACG00000016388) ENSGACG00000016387 aurkb (ENSGACG00000016381) ENSGACG00000016380 nkx3-2 (ENSGACG00000016378) ENSGACG00000016372 emx3 (ENSGACG00000016370) b4galt7 (ENSGACG00000016366) Stickleback MODERN SPECIES 3 gm2a (ENSGACG00000016356) PCDH12 (ENSGACG00000016358) PCDH1 (ENSGACG00000016360) tmem216 (ENSGACG00000016362) tmed9 (ENSGACG00000016363) b4galt7 (ENSGACG00000016366) emx3 (ENSGACG00000016370) ENSGACG00000016372 nkx3-2 (ENSGACG00000016378) ENSGACG00000016380 aurkb (ENSGACG00000016381) ENSGACG00000016387 COPS6 (ENSGACG00000016388) mcm7 (ENSGACG00000016398) gpc2 (ENSGACG00000016402) ENSGACG00000016407 ##37 ENSGACG00000016409 ##37 slit3 (ENSGACG00000016411) ENSGACG00000016419 ##37 ENSGACG00000016422 ##37 ENSGACG00000016423 ##37 ENSGACG00000016424 fgfrl1a (ENSGACG00000016426) ENSGACG00000016428 spon2b (ENSGACG00000016431) zgc:136929 (ENSGACG00000016437) maea (ENSGACG00000016443) hnrnpa0b (ENSGACG00000016447) ENSGACG00000016449 KLHL3 (ENSGACG00000016452) fam13b (ENSGACG00000016458) Stickleback MODERN SPECIES 3 PCDH12 (ENSGACG00000016358) PCDH1 (ENSGACG00000016360) tmem216 (ENSGACG00000016362) tmed9 (ENSGACG00000016363) b4galt7 (ENSGACG00000016366) emx3 (ENSGACG00000016370) ENSGACG00000016372 nkx3-2 (ENSGACG00000016378) ENSGACG00000016380 aurkb (ENSGACG00000016381) ENSGACG00000016387 COPS6 (ENSGACG00000016388) mcm7 (ENSGACG00000016398) gpc2 (ENSGACG00000016402) ENSGACG00000016407 ##37 ENSGACG00000016409 ##37 slit3 (ENSGACG00000016411) ENSGACG00000016419 ##37 ENSGACG00000016422 ##37 ENSGACG00000016423 ##37 ENSGACG00000016424 fgfrl1a (ENSGACG00000016426) ENSGACG00000016428 spon2b (ENSGACG00000016431) zgc:136929 (ENSGACG00000016437) maea (ENSGACG00000016443) hnrnpa0b (ENSGACG00000016447) ENSGACG00000016449 KLHL3 (ENSGACG00000016452) fam13b (ENSGACG00000016458) cxcl14 (ENSGACG00000016464) Stickleback DUPLICATION Stickleback MODERN SPECIES 3 tmed9 (ENSGACG00000016363) b4galt7 (ENSGACG00000016366) emx3 (ENSGACG00000016370) ENSGACG00000016372 nkx3-2 (ENSGACG00000016378) ENSGACG00000016380 aurkb (ENSGACG00000016381) ENSGACG00000016387 COPS6 (ENSGACG00000016388) mcm7 (ENSGACG00000016398) gpc2 (ENSGACG00000016402) ENSGACG00000016407 ##37 ENSGACG00000016409 ##37 slit3 (ENSGACG00000016411) ENSGACG00000016419 ##37 ENSGACG00000016422 ##37 ENSGACG00000016423 ##37 ENSGACG00000016424 fgfrl1a (ENSGACG00000016426) ENSGACG00000016428 spon2b (ENSGACG00000016431) zgc:136929 (ENSGACG00000016437) maea (ENSGACG00000016443) hnrnpa0b (ENSGACG00000016447) ENSGACG00000016449 KLHL3 (ENSGACG00000016452) fam13b (ENSGACG00000016458) cxcl14 (ENSGACG00000016464) LINGO2 (ENSGACG00000016470) eif4ea (ENSGACG00000016472) ENSGACG00000016474 Stickleback MODERN SPECIES 546 ENSGACG00000000763 ##37 Stickleback MODERN SPECIES 3 eif4ea (ENSGACG00000016472) LINGO2 (ENSGACG00000016470) cxcl14 (ENSGACG00000016464) fam13b (ENSGACG00000016458) KLHL3 (ENSGACG00000016452) ENSGACG00000016449 hnrnpa0b (ENSGACG00000016447) maea (ENSGACG00000016443) zgc:136929 (ENSGACG00000016437) spon2b (ENSGACG00000016431) ENSGACG00000016428 fgfrl1a (ENSGACG00000016426) ENSGACG00000016424 ENSGACG00000016423 ##37 ENSGACG00000016422 ##37 ENSGACG00000016419 ##37 slit3 (ENSGACG00000016411) ENSGACG00000016409 ##37 ENSGACG00000016407 ##37 gpc2 (ENSGACG00000016402) mcm7 (ENSGACG00000016398) COPS6 (ENSGACG00000016388) ENSGACG00000016387 aurkb (ENSGACG00000016381) ENSGACG00000016380 nkx3-2 (ENSGACG00000016378) ENSGACG00000016372 emx3 (ENSGACG00000016370) b4galt7 (ENSGACG00000016366) tmed9 (ENSGACG00000016363) tmem216 (ENSGACG00000016362) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 Pike perch DUPLICATION Pike perch MODERN SPECIES 18 ENSSLUG00000024236 mcm7 (ENSSLUG00000024175) STAG3 (ENSSLUG00000024162) gpc2 (ENSSLUG00000024133) ENSSLUG00000024108 ENSSLUG00000024103 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023984 slit3 (ENSSLUG00000023660) fgfrl1a (ENSSLUG00000023537) ENSSLUG00000023520 ENSSLUG00000023515 spon2b (ENSSLUG00000023507) zgc:136929 (ENSSLUG00000022877) maea (ENSSLUG00000022782) hnrnpa0b (ENSSLUG00000022778) Pike perch MODERN SPECIES 18 aurkb (ENSSLUG00000024250) ENSSLUG00000024249 COPS6 (ENSSLUG00000024239) ENSSLUG00000024236 mcm7 (ENSSLUG00000024175) STAG3 (ENSSLUG00000024162) gpc2 (ENSSLUG00000024133) ENSSLUG00000024108 ENSSLUG00000024103 ENSSLUG00000024073 ENSSLUG00000024058 #28 ENSSLUG00000024052 ##30 ENSSLUG00000024046 #30 ENSSLUG00000024037 ENSSLUG00000024028 #34 ENSSLUG00000024027 ##37 ENSSLUG00000024024 #28 ENSSLUG00000024021 #30 ENSSLUG00000024018 ##37 ENSSLUG00000024010 #34 ENSSLUG00000024006 ENSSLUG00000023998 ENSSLUG00000023993 ##37 ENSSLUG00000023988 #34 ENSSLUG00000023986 ENSSLUG00000023984 slit3 (ENSSLUG00000023660) fgfrl1a (ENSSLUG00000023537) ENSSLUG00000023520 ENSSLUG00000023515 spon2b (ENSSLUG00000023507) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 149 ENSHCOG00000010656 ENSHCOG00000010622 ##37 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s ##37 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000173984 #29 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000165013.b.b ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a Amphiprion DUPLICATION Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.b #28 ENSGT00940000162676.a.a.o.a ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00940000162676.a.a.p ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.d.a #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000167175.c ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019448 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019960 #34 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000003444 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003274 ##37 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002766 #34 slit3 (ENSAPEG00000002657) fgfrl1a (ENSAPEG00000002453) ENSAPEG00000002409 spon2b (ENSAPEG00000002387) zgc:136929 (ENSAPEG00000002347) maea (ENSAPEG00000002314) ENSAPEG00000002274 ENSAPEG00000002224 KLHL3 (ENSAPEG00000002167) fam13b (ENSAPEG00000002131) cxcl14 (ENSAPEG00000002109) ENSAPEG00000002097 LINGO2 (ENSAPEG00000002091) eif4ea (ENSAPEG00000001758) Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000154669.b.b.a.a.j.a ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000165013.b.b ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.b.a.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.a #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.a.o.b.a ENSGT00940000162676.a.a.o.b.b ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.c.a.b #28 Clown anemonefish MODERN SPECIES 467 ENSAOCG00000019215 mcm7 (ENSAOCG00000001386) ENSAOCG00000019313 ENSAOCG00000019337 ENSAOCG00000019354 ITGA6 (ENSAOCG00000019416) ENSAOCG00000019448 ENSAOCG00000019524 ##37 ENSAOCG00000001421 #28 ENSAOCG00000019575 #28 ENSAOCG00000019590 #28 ENSAOCG00000019623 ENSAOCG00000019647 #28 ENSAOCG00000019676 #28 ENSAOCG00000019731 ENSAOCG00000019749 #29 ENSAOCG00000001437 ENSAOCG00000002491 ##37 ENSAOCG00000019808 #28 ENSAOCG00000019868 #34 ENSAOCG00000019930 ##37 ENSAOCG00000019960 #34 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000003923 ENSAPEG00000003907 HS3ST1 (ENSAPEG00000003896) ENSAPEG00000003881 RAB28 (ENSAPEG00000003839) nkx3-2 (ENSAPEG00000003825) ENSAPEG00000003803 ENSAPEG00000003785 aurkb (ENSAPEG00000003753) COPS6 (ENSAPEG00000003738) ENSAPEG00000003720 mcm7 (ENSAPEG00000003656) ENSAPEG00000003475 ENSAPEG00000003444 ITGA6 (ENSAPEG00000003294) ENSAPEG00000003274 ##37 ENSAPEG00000003254 #28 ENSAPEG00000003229 #28 ENSAPEG00000003212 ##30 ENSAPEG00000003185 ENSAPEG00000003169 ENSAPEG00000003140 #28 ENSAPEG00000003078 ENSAPEG00000003067 ENSAPEG00000003030 #28 ENSAPEG00000002954 ##37 ENSAPEG00000002935 #28 ENSAPEG00000002882 #30 ENSAPEG00000002814 ##37 ENSAPEG00000002766 #34 slit3 (ENSAPEG00000002657) Spiny chromis MODERN SPECIES 1130 ENSAPOG00000010099 nkx3-2 (ENSAPOG00000010072) ENSAPOG00000010033 b2m (ENSAPOG00000010002) aurkb (ENSAPOG00000009991) ENSAPOG00000009957 COPS6 (ENSAPOG00000009944) ENSAPOG00000009895 mcm7 (ENSAPOG00000000284) ENSAPOG00000009795 gpc2 (ENSAPOG00000009765) ENSAPOG00000009750 ENSAPOG00000009719 ENSAPOG00000009703 ENSAPOG00000009686 ##37 ENSAPOG00000009616 ##19 Bicolor damselfish DUPLICATION Bicolor damselfish DUPLICATION Bicolor damselfish MODERN SPECIES 258 ENSSPAG00000002764 ENSSPAG00000002771 HS3ST1 (ENSSPAG00000002799) ENSSPAG00000002809 nkx3-2 (ENSSPAG00000002841) ENSSPAG00000002862 aurkb (ENSSPAG00000002883) ENSSPAG00000002899 COPS6 (ENSSPAG00000002910) ENSSPAG00000002955 mcm7 (ENSSPAG00000002973) ENSSPAG00000003027 ENSSPAG00000003046 gpc2 (ENSSPAG00000003121) ENSSPAG00000003507 ENSSPAG00000003530 ##37 ENSSPAG00000003538 #28 ENSSPAG00000003553 ##19 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2533 ENSSPAG00000019110 #28 ENSSPAG00000019099 #34 ENSSPAG00000019080 #29 ENSSPAG00000019039 ##37 ENSSPAG00000019024 #29 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2364 ENSSPAG00000016634 ##37 ENSSPAG00000016651 slit3 (ENSSPAG00000016704) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000003487 gpc2 (ENSACIG00000003456) ITGA6 (ENSACIG00000003330) ENSACIG00000003309 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000003487 gpc2 (ENSACIG00000003456) ITGA6 (ENSACIG00000003330) ENSACIG00000003309 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002925 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000003487 gpc2 (ENSACIG00000003456) ITGA6 (ENSACIG00000003330) ENSACIG00000003309 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000003487 gpc2 (ENSACIG00000003456) ITGA6 (ENSACIG00000003330) ENSACIG00000003309 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002891 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000003487 gpc2 (ENSACIG00000003456) ITGA6 (ENSACIG00000003330) ENSACIG00000003309 ENSACIG00000003298 ##37 ENSACIG00000003279 ##37 ENSACIG00000003261 ##37 ENSACIG00000003232 ##37 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1306 ENSACIG00000015374 ##30 ENSACIG00000015384 ##37 ENSACIG00000015421 #34 ENSACIG00000015446 #35 ENSACIG00000015460 ##37 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.a ##37 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 RAB28 (ENSONIG00000002380) nkx3-2 (ENSONIG00000041276) ENSONIG00000032183 aurkb (ENSONIG00000041999) ENSONIG00000002370 COPS6 (ENSONIG00000002367) ENSONIG00000030352 mcm7 (ENSONIG00000002357) ENSONIG00000042159 ENSONIG00000028895 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000002344 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 nkx3-2 (ENSONIG00000041276) ENSONIG00000032183 aurkb (ENSONIG00000041999) ENSONIG00000002370 COPS6 (ENSONIG00000002367) ENSONIG00000030352 mcm7 (ENSONIG00000002357) ENSONIG00000042159 ENSONIG00000028895 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000002344 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000034441 ENSONIG00000040942 HS3ST1 (ENSONIG00000020857) RAB28 (ENSONIG00000002380) nkx3-2 (ENSONIG00000041276) ENSONIG00000032183 aurkb (ENSONIG00000041999) ENSONIG00000002370 COPS6 (ENSONIG00000002367) ENSONIG00000030352 mcm7 (ENSONIG00000002357) ENSONIG00000042159 ENSONIG00000028895 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000002344 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.a ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.a ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 mgst2 (ENSACLG00000005667) zgc:154054 (ENSACLG00000005382) ENSACLG00000004555 ENSACLG00000004492 ENSACLG00000004473 trappc11 (ENSACLG00000004352) ENSACLG00000004344 spdl1 (ENSACLG00000004291) ENSACLG00000004263 uvssa (ENSACLG00000004230) nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) ENSACLG00000004208 ENSACLG00000003822 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003800 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003497 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1332 ENSHBUG00000018468 ##37 ENSHBUG00000018441 ##37 ENSHBUG00000018420 ##37 ENSHBUG00000018403 ##37 ENSHBUG00000001151 ##37 ENSHBUG00000018279 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000159799 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a.a ##37 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 17 ENSACLG00000000593 nfasca (ENSACLG00000000344) ENSACLG00000000325 ENSACLG00000000311 ENSACLG00000000290 sypl2a (ENSACLG00000000264) atxn7l2a (ENSACLG00000000256) cyb561d1 (ENSACLG00000000238) ENSACLG00000000215 USP48 (ENSACLG00000000118) camk1ga (ENSACLG00000000072) ENSACLG00000000044 LDLRAD2 (ENSACLG00000026951) ENSACLG00000026946 ENSACLG00000026941 ##37 ENSACLG00000026936 ##37 ENSACLG00000026929 ##37 fhit (ENSACLG00000026924) ENSACLG00000026899 fezf2 (ENSACLG00000026890) ENSACLG00000026884 ENSACLG00000026879 ENSACLG00000026784 PLEKHA6 (ENSACLG00000026740) apobec2a (ENSACLG00000026736) ENSACLG00000026734 ENSACLG00000026636 stk35l (ENSACLG00000026625) ENSACLG00000026615 ENSACLG00000026602 tp53rk (ENSACLG00000026597) Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000004263 uvssa (ENSACLG00000004230) nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) ENSACLG00000004208 ENSACLG00000003822 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003800 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003398 ##37 ENSACLG00000003381 #33 Eastern happy MODERN SPECIES 11 spdl1 (ENSACLG00000004291) ENSACLG00000004263 uvssa (ENSACLG00000004230) nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) ENSACLG00000004208 ENSACLG00000003822 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003800 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 ENSACLG00000003430 ##37 ENSACLG00000003415 ##37 ENSACLG00000003398 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005017495 ENSMZEG00005017524 ENSMZEG00005017557 ENSMZEG00005017562 trappc11 (ENSMZEG00005017572) spdl1 (ENSMZEG00005017607) ENSMZEG00005017613 uvssa (ENSMZEG00005017618) nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) ENSMZEG00005017630 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017641 #36 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 P. nyererei MODERN SPECIES 1084 ENSPNYG00000021801 ##37 ENSPNYG00000021773 ##19 ENSPNYG00000021748 ENSPNYG00000021739 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000029112 #29 ENSONIG00000015232 ##37 ENSONIG00000033739 ##37 ENSONIG00000027440 ##37 ENSONIG00000000944 ENSONIG00000030312 ##37 ENSONIG00000028485 ##37 ENSONIG00000000942 ##37 ENSONIG00000027608 ##37 ENSONIG00000042994 ENSONIG00000041419 ENSONIG00000036697 ENSONIG00000043007 ENSONIG00000030085 ENSONIG00000019882 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 11 aurkb (ENSONIG00000041999) ENSONIG00000002370 COPS6 (ENSONIG00000002367) ENSONIG00000030352 mcm7 (ENSONIG00000002357) ENSONIG00000042159 ENSONIG00000028895 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000002344 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000030352 mcm7 (ENSONIG00000002357) ENSONIG00000042159 ENSONIG00000028895 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000002344 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 ENSONIG00000000964 ##37 ENSONIG00000028339 ##37 ENSONIG00000019887 ##37 ENSONIG00000019886 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00940000175226 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000013650 ENSNBRG00000013675 uvssa (ENSNBRG00000013729) nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) ENSNBRG00000013850 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000014014 ##37 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000015016 ##37 Haplochromini DUPLICATION Haplochromini DUPLICATION Haplochromini DUPLICATION Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00390000008183 ENSGT00390000004827 ENSGT00940000160288 ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000156526.b ENSGT00940000159799 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000004473 trappc11 (ENSACLG00000004352) ENSACLG00000004344 spdl1 (ENSACLG00000004291) ENSACLG00000004263 uvssa (ENSACLG00000004230) nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) ENSACLG00000004208 ENSACLG00000003822 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003800 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003459 ##37 ENSACLG00000003442 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005017486 ENSMZEG00005017495 ENSMZEG00005017524 ENSMZEG00005017557 ENSMZEG00005017562 trappc11 (ENSMZEG00005017572) spdl1 (ENSMZEG00005017607) ENSMZEG00005017613 uvssa (ENSMZEG00005017618) nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) ENSMZEG00005017630 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017641 #36 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1627 ENSHBUG00000015651 ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000156526.b ENSGT00940000159799 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000156526.b ENSGT00940000159799 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.u.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.i.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.n #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c.c ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.v.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b.b.a ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 spdl1 (ENSMZEG00005017607) ENSMZEG00005017613 uvssa (ENSMZEG00005017618) nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) ENSMZEG00005017630 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017641 #36 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 ENSMZEG00005017734 ##37 ENSMZEG00005017739 #33 ENSMZEG00005017742 ##37 ENSMZEG00005017747 #33 ENSMZEG00005017753 ##37 ENSMZEG00005000051 ##30 ENSMZEG00005000052 ENSMZEG00005000054 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 49 ENSACLG00000008083 ##19 ENSACLG00000008089 ##37 ENSACLG00000008093 ENSACLG00000008098 ENSACLG00000008111 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000008183 ENSGT00390000004827 ENSGT00940000160288 ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000156526.b ENSGT00940000159799 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.a.d ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a P. nyererei MODERN SPECIES 532 zgc:113425 (ENSPNYG00000013036) setd7 (ENSPNYG00000013002) mgst2 (ENSPNYG00000012985) SCOC (ENSPNYG00000012973) zgc:154054 (ENSPNYG00000012918) ENSPNYG00000012717 ENSPNYG00000012661 ENSPNYG00000012638 trappc11 (ENSPNYG00000012539) ENSPNYG00000012496 ENSPNYG00000012466 uvssa (ENSPNYG00000012422) nkx1.2lb (ENSPNYG00000012402) ENSPNYG00000012384 hvcn1 (ENSPNYG00000012350) ENSPNYG00000012321 ##37 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000156526.b ENSGT00940000159799 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.b ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1373 ENSHBUG00000015683 ##37 ENSHBUG00000015704 ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.d ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.d ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.d ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000004492 ENSACLG00000004473 trappc11 (ENSACLG00000004352) ENSACLG00000004344 spdl1 (ENSACLG00000004291) ENSACLG00000004263 uvssa (ENSACLG00000004230) nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) ENSACLG00000004208 ENSACLG00000003822 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003800 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003472 #33 ENSACLG00000003459 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000032183 aurkb (ENSONIG00000041999) ENSONIG00000002370 COPS6 (ENSONIG00000002367) ENSONIG00000030352 mcm7 (ENSONIG00000002357) ENSONIG00000042159 ENSONIG00000028895 gpc2 (ENSONIG00000002348) ENSONIG00000002344 ENSONIG00000002343 ##37 ENSONIG00000031686 ENSONIG00000038873 ENSONIG00000002342 ##37 ENSONIG00000002341 ##37 ENSONIG00000038164 ##37 ENSONIG00000002339 ##37 ENSONIG00000002338 ##37 ENSONIG00000002335 ##37 ENSONIG00000019884 ##37 ENSONIG00000000965 ##37 ENSONIG00000019891 ##30 ENSONIG00000002334 ##37 ENSONIG00000036198 ##37 ENSONIG00000019892 #33 ENSONIG00000037476 ##37 ENSONIG00000019889 ##37 ENSONIG00000019883 ##37 ENSONIG00000038393 ##37 ENSONIG00000019885 ##37 ENSONIG00000038683 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000160288 ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000156526.b ENSGT00940000159799 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00940000175226 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.a ##19 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 534 ENSNBRG00000013650 ENSNBRG00000013675 uvssa (ENSNBRG00000013729) nkx1.2lb (ENSNBRG00000013800) ENSNBRG00000013850 hvcn1 (ENSNBRG00000013900) ENSNBRG00000014014 ##37 ENSNBRG00000014062 ENSNBRG00000014164 ##30 ENSNBRG00000014301 ##37 ENSNBRG00000014370 ##37 ENSNBRG00000014465 ##37 ENSNBRG00000014515 ##37 ENSNBRG00000014634 ##37 ENSNBRG00000014796 ##37 ENSNBRG00000014867 ##37 ENSNBRG00000014953 ##37 ENSNBRG00000015016 ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000004827 ENSGT00940000160288 ENSGT00390000008828.fb.a ENSGT00940000156526.b ENSGT00940000159799 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00390000006550 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000153909.b ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.a.c.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.g.b ##37 ENSGT00940000170413.A.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.b.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.A.b ##19 ENSGT00940000162676.a.a.m.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.a.a.a.a.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.m.b Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 216 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 216 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.h.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.d ##30 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000004555 ENSACLG00000004492 ENSACLG00000004473 trappc11 (ENSACLG00000004352) ENSACLG00000004344 spdl1 (ENSACLG00000004291) ENSACLG00000004263 uvssa (ENSACLG00000004230) nkx1.2lb (ENSACLG00000004216) ENSACLG00000004208 ENSACLG00000003822 hvcn1 (ENSACLG00000003806) ENSACLG00000003800 ENSACLG00000003793 ##37 ENSACLG00000003782 ENSACLG00000003762 ##37 ENSACLG00000003713 ##37 ENSACLG00000003690 ##37 ENSACLG00000003673 ##37 ENSACLG00000003665 ##37 ENSACLG00000003639 ##37 ENSACLG00000003626 ##37 ENSACLG00000003610 ##37 ENSACLG00000003592 ##37 ENSACLG00000003580 ##37 ENSACLG00000003561 ##37 ENSACLG00000003539 ##37 ENSACLG00000003516 #33 ENSACLG00000003497 ##37 ENSACLG00000003480 ##37 ENSACLG00000003472 #33 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005017476 ENSMZEG00005017482 ENSMZEG00005017486 ENSMZEG00005017495 ENSMZEG00005017524 ENSMZEG00005017557 ENSMZEG00005017562 trappc11 (ENSMZEG00005017572) spdl1 (ENSMZEG00005017607) ENSMZEG00005017613 uvssa (ENSMZEG00005017618) nkx1.2lb (ENSMZEG00005017625) ENSMZEG00005017630 hvcn1 (ENSMZEG00005017638) ENSMZEG00005017641 #36 ENSMZEG00005017647 ##37 ENSMZEG00005017656 ##30 ENSMZEG00005017665 ##37 ENSMZEG00005017677 ##37 ENSMZEG00005017680 ENSMZEG00005017682 ##37 ENSMZEG00005017687 ##37 ENSMZEG00005017690 ##37 ENSMZEG00005017696 ##37 ENSMZEG00005017700 ##37 ENSMZEG00005017707 ##37 ENSMZEG00005017713 ##37 ENSMZEG00005017720 ##37 ENSMZEG00005017723 ##37 ENSMZEG00005017727 ##37 ENSMZEG00005017731 #36 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1421 ENSHBUG00000011927 ##37 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b #22 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT00940000170413.A ##19 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 Poeciliinae DUPLICATION Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.a #15 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000156986 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 Amazon molly MODERN SPECIES 481 ENSPFOG00000002910 nkx3-2 (ENSPFOG00000002882) ENSPFOG00000002857 aurkb (ENSPFOG00000002811) ENSPFOG00000002788 ENSPFOG00000002769 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 ENSPLAG00000006020 nkx3-2 (ENSPLAG00000006028) ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Guppy MODERN SPECIES 440 gsr (ENSPREG00000013744) ENSPREG00000013830 HS3ST1 (ENSPREG00000013838) ENSPREG00000013861 nkx3-2 (ENSPREG00000013893) ENSPREG00000013906 ENSPREG00000013936 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 ENSPREG00000014292 #15 Platyfish MODERN SPECIES 15 gsr (ENSXMAG00000016221) ENSXMAG00000021608 ENSXMAG00000016271 HS3ST1 (ENSXMAG00000026035) ENSXMAG00000016277 nkx3-2 (ENSXMAG00000023793) ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 ENSXMAG00000024915 #14 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156986 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.b #7 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000156986 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.a #8 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00390000008346 ENSGT00940000156986 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980.nb ENSGT00390000003354.j ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 Amazon molly MODERN SPECIES 481 HS3ST1 (ENSPFOG00000020423) ENSPFOG00000002910 nkx3-2 (ENSPFOG00000002882) ENSPFOG00000002857 aurkb (ENSPFOG00000002811) ENSPFOG00000002788 ENSPFOG00000002769 aurkb (ENSPFOG00000002658) ENSPFOG00000002646 COPS6 (ENSPFOG00000002582) COPS6 (ENSPFOG00000002531) ENSPFOG00000002504 mcm7 (ENSPFOG00000002340) ENSPFOG00000001981 gpc2 (ENSPFOG00000001609) ENSPFOG00000001461 ##37 ENSPFOG00000001430 ##37 ENSPFOG00000023733 ##37 ENSPFOG00000001406 ##37 ENSPFOG00000024489 ##37 ENSPFOG00000023936 ##37 ENSPFOG00000001384 #11 ENSPFOG00000001364 ##37 ENSPFOG00000022775 #11 ENSPFOG00000001351 #8 ENSPFOG00000001313 ##37 ENSPFOG00000021852 #10 ENSPFOG00000022985 #7 Sailfin molly MODERN SPECIES 1462 ENSPLAG00000006020 nkx3-2 (ENSPLAG00000006028) ENSPLAG00000006043 aurkb (ENSPLAG00000006058) ENSPLAG00000006075 COPS6 (ENSPLAG00000006100) ENSPLAG00000006118 mcm7 (ENSPLAG00000006162) ENSPLAG00000006201 gpc2 (ENSPLAG00000006226) ENSPLAG00000000840 ##37 ENSPLAG00000006258 ##37 ENSPLAG00000006270 ##37 ENSPLAG00000006290 ##37 ENSPLAG00000006301 ##37 ENSPLAG00000006321 ##37 ENSPLAG00000006335 #11 ENSPLAG00000006355 #11 ENSPLAG00000006437 #13 ENSPLAG00000006454 #12 ENSPLAG00000006466 #14 Guppy MODERN SPECIES 440 slc30a9 (ENSPREG00000013639) gsr (ENSPREG00000013744) ENSPREG00000013830 HS3ST1 (ENSPREG00000013838) ENSPREG00000013861 nkx3-2 (ENSPREG00000013893) ENSPREG00000013906 ENSPREG00000013936 aurkb (ENSPREG00000013954) COPS6 (ENSPREG00000014024) ENSPREG00000014042 ENSPREG00000014058 mcm7 (ENSPREG00000014071) ENSPREG00000014094 gpc2 (ENSPREG00000014107) ENSPREG00000014136 ##37 ENSPREG00000014155 ##37 ENSPREG00000014166 ##37 ENSPREG00000014178 ##37 ENSPREG00000014210 ##37 ENSPREG00000014217 ##37 ENSPREG00000014228 ##19 ENSPREG00000014236 ##37 ENSPREG00000014245 #11 ENSPREG00000014252 #8 ENSPREG00000014262 ##36 ENSPREG00000014265 #11 ENSPREG00000014268 #12 ENSPREG00000014271 #19 ENSPREG00000014278 ##19 ENSPREG00000014282 #13 Platyfish MODERN SPECIES 15 slc30a9 (ENSXMAG00000016198) gsr (ENSXMAG00000016221) ENSXMAG00000021608 ENSXMAG00000016271 HS3ST1 (ENSXMAG00000026035) ENSXMAG00000016277 nkx3-2 (ENSXMAG00000023793) ENSXMAG00000016291 aurkb (ENSXMAG00000016292) ENSXMAG00000016307 COPS6 (ENSXMAG00000021939) ENSXMAG00000022228 mcm7 (ENSXMAG00000016334) ENSXMAG00000025123 gpc2 (ENSXMAG00000016419) ENSXMAG00000021486 ##37 ENSXMAG00000016450 ##37 ENSXMAG00000028811 ##37 ENSXMAG00000025629 ##37 ENSXMAG00000029048 ##37 ENSXMAG00000027440 ##37 ENSXMAG00000025013 ##37 ENSXMAG00000022441 ##37 ENSXMAG00000029391 ##19 ENSXMAG00000021581 #7 ENSXMAG00000029264 #8 ENSXMAG00000021675 #9 ENSXMAG00000027472 #10 ENSXMAG00000023409 #11 ENSXMAG00000021194 #12 ENSXMAG00000023983 #13 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00390000008346 ENSGT00940000156986 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a.ab ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b #11 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 511 gsr (ENSCVAG00000001672) ENSCVAG00000001673 ENSCVAG00000001675 HS3ST1 (ENSCVAG00000001677) ENSCVAG00000001684 nkx3-2 (ENSCVAG00000001687) ENSCVAG00000001692 aurkb (ENSCVAG00000001696) ENSCVAG00000001698 ENSCVAG00000001703 mcm7 (ENSCVAG00000000067) ENSCVAG00000001715 ENSCVAG00000001717 gpc2 (ENSCVAG00000001724) ENSCVAG00000000069 ENSCVAG00000001728 ##37 ENSCVAG00000001735 ##37 ENSCVAG00000001749 ##37 ENSCVAG00000001757 ##37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.a.a #16 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.b #27 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.f ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.b ##19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.q ##30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00950000183026.A.a.b ENSGT00940000157425.A ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00940000153899.a.a Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000014350 ##37 ENSPREG00000014368 #18 ENSPREG00000014374 ##37 ENSPREG00000014385 #16 ENSPREG00000014390 #21 ENSPREG00000014401 #22 ENSPREG00000014415 #27 ENSPREG00000014427 #28 ENSPREG00000014443 ##37 ENSPREG00000014462 #29 ENSPREG00000014472 #31 ENSPREG00000014482 #33 ENSPREG00000014484 #33 ENSPREG00000014492 #34 ENSPREG00000014508 #35 ENSPREG00000014524 ##37 ENSPREG00000014528 ENSPREG00000014537 #37 ENSPREG00000014550 ENSPREG00000014562 ##37 ENSPREG00000014575 ##37 ENSPREG00000014588 #34 ENSPREG00000014622 ENSPREG00000014632 ENSPREG00000014646 emx3 (ENSPREG00000014657) b4galt7 (ENSPREG00000014666) TMED9 (ENSPREG00000014673) tmem216 (ENSPREG00000014683) tmed9 (ENSPREG00000014696) PCDH1 (ENSPREG00000014812) NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.a #20 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a.a.b #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.a #23 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.f.a.b.b #24 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.a.e #28 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a.r.b #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.f #31 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.g #33 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.h #33 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.j ##37 ENSGT00940000177190.g ##36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a.e #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b.e.b #14 ENSGT00940000170413.B.a.b.a.a #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.a.a.b #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.b.a.b.a #11 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.b.a.a.e ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.i.b ##37 ENSGT01050000244897.a.a.a Sailfin molly MODERN SPECIES 766 ENSPLAG00000000963 #15 ENSPLAG00000000961 #15 ENSPLAG00000000959 ##37 ENSPLAG00000000007 #18 ENSPLAG00000000956 ##37 ENSPLAG00000000955 #20 ENSPLAG00000000952 #23 ENSPLAG00000000950 #24 ENSPLAG00000000948 ##37 ENSPLAG00000000945 #31 ENSPLAG00000000944 #33 ENSPLAG00000000941 ##37 ENSPLAG00000000939 #35 ENSPLAG00000000006 ##37 ENSPLAG00000000937 ##36 ENSPLAG00000000935 ##36 ENSPLAG00000000934 #37 ENSPLAG00000000931 ##30 ENSPLAG00000000929 ENSPLAG00000000927 emx3 (ENSPLAG00000000925) Amazon molly MODERN SPECIES 287 ENSPFOG00000024138 #21 ENSPFOG00000023811 #22 ENSPFOG00000006944 #23 ENSPFOG00000006966 #25 ENSPFOG00000022211 #25 ENSPFOG00000006971 #23 ENSPFOG00000023066 #24 ENSPFOG00000023484 #28 ENSPFOG00000023581 #29 ENSPFOG00000006980 #30 ENSPFOG00000023120 #31 ENSPFOG00000021950 #33 ENSPFOG00000007015 #33 ENSPFOG00000007044 #34 ENSPFOG00000022772 #35 ENSPFOG00000022302 ##37 ENSPFOG00000007078 #37 ENSPFOG00000022801 ##37 nitr13 (ENSPFOG00000007086) #37 ENSPFOG00000007140 ENSPFOG00000007146 ENSPFOG00000007161 emx3 (ENSPFOG00000007211) b4galt7 (ENSPFOG00000007250) TMED9 (ENSPFOG00000007314) tmem216 (ENSPFOG00000023783) tmed9 (ENSPFOG00000007395) ENSPFOG00000021727 PCDH1 (ENSPFOG00000007397) PCDH12 (ENSPFOG00000007422) gm2a (ENSPFOG00000007444) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000168577 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000170413.B.a.b #12 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.b.a #13 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.b.a #21 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.t.b.a.a.a #22 ENSGT00940000170413.B.a.a #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a Mangrove rivulus MODERN SPECIES 10 ENSKMAG00000019183 HS3ST1 (ENSKMAG00000019173) ENSKMAG00000019139 nkx3-2 (ENSKMAG00000019133) ENSKMAG00000019121 aurkb (ENSKMAG00000019109) ENSKMAG00000019102 COPS6 (ENSKMAG00000019077) ENSKMAG00000019054 mcm7 (ENSKMAG00000018958) ENSKMAG00000018936 ENSKMAG00000018916 ENSKMAG00000018900 ENSKMAG00000018881 gpc2 (ENSKMAG00000018862) ENSKMAG00000018834 ##37 ENSKMAG00000018816 ##37 ENSKMAG00000018801 ##37 ENSKMAG00000018786 #12 ENSKMAG00000018770 #13 ENSKMAG00000018755 ##37 ENSKMAG00000018747 #21 ENSKMAG00000018729 #21 ENSKMAG00000018715 #21 ENSKMAG00000018704 #21 ENSKMAG00000018688 #21 ENSKMAG00000018668 #21 ENSKMAG00000018608 #22 ENSKMAG00000018577 #22 ENSKMAG00000018560 ##19 ENSKMAG00000018539 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1610 ENSNFUG00015001883 ENSNFUG00015001917 nkx3-2 (ENSNFUG00015001934) ENSNFUG00015001944 ENSNFUG00015001950 aurkb (ENSNFUG00015001956) ENSNFUG00015001968 COPS6 (ENSNFUG00015002003) ENSNFUG00015002021 MCM7 (ENSNFUG00015002038) ENSNFUG00015002082 ENSNFUG00015002084 ENSNFUG00015002087 GPC6L (ENSNFUG00015002103) ENSNFUG00015002143 ENSNFUG00015002201 ##37 ENSNFUG00015002212 ENSNFUG00015002218 ##37 Nfu_g_1_004472 (ENSNFUG00015002237) #29 ENSNFUG00015002254 #22 ENSNFUG00015002290 #19 ENSNFUG00015002293 ENSNFUG00015002297 #34 slit3 (ENSNFUG00015002545) FGFRL1A (ENSNFUG00015003941) ENSNFUG00015003946 ENSNFUG00015003957 spon2b (ENSNFUG00015003985) ENSNFUG00015003988 ENSNFUG00015003989 zgc:136929 (ENSNFUG00015004023) Oryzias DUPLICATION Oryzias DUPLICATION Oryzias DUPLICATION Oryzias ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 maea (ENSORLG00000000230) zgc:136929 (ENSORLG00000000259) spon2b (ENSORLG00000000275) ENSORLG00000000293 fgfrl1a (ENSORLG00000000305) ENSORLG00000028622 slit3 (ENSORLG00000000335) ENSORLG00000030644 ENSORLG00000022885 #35 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000366 ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 ENSORLG00000000389 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000000441 gpc2 (ENSORLG00000000476) ENSORLG00000000491 Chinese medaka MODERN SPECIES 772 ENSOSIG00000007529 ##37 ENSOSIG00000007530 ##37 ENSOSIG00000007533 ##37 ENSOSIG00000007534 ##37 ENSOSIG00000007537 ##37 ENSOSIG00000007541 ##37 ENSOSIG00000007546 #29 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000167175.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a Indian medaka MODERN SPECIES 16 ENSOMEG00000011670 maea (ENSOMEG00000011733) zgc:136929 (ENSOMEG00000011793) spon2b (ENSOMEG00000011816) ENSOMEG00000011827 ENSOMEG00000011856 fgfrl1a (ENSOMEG00000011920) slit3 (ENSOMEG00000012015) ENSOMEG00000012035 ENSOMEG00000012045 ENSOMEG00000012059 ##30 ENSOMEG00000012076 ##37 ENSOMEG00000012088 ##37 ENSOMEG00000012097 ##37 ENSOMEG00000012128 ##37 ENSOMEG00000012185 ##37 ENSOMEG00000012205 ##37 ENSOMEG00000012221 ##37 ENSOMEG00000012244 ##37 ENSOMEG00000000308 ##37 ENSOMEG00000012272 #29 ENSOMEG00000012289 #30 ENSOMEG00000012300 #34 ENSOMEG00000012328 #30 ENSOMEG00000012340 #30 ENSOMEG00000012357 #30 ENSOMEG00000000696 gpc2 (ENSOMEG00000012394) ENSOMEG00000012446 mcm7 (ENSOMEG00000012495) ENSOMEG00000012520 Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000016953 maea (ENSOJAG00000016904) zgc:136929 (ENSOJAG00000016765) spon2b (ENSOJAG00000016747) ENSOJAG00000016737 ENSOJAG00000016732 fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) slit3 (ENSOJAG00000013112) ENSOJAG00000012872 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012457 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012382 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000011657 COPS6 (ENSOJAG00000011556) ENSOJAG00000011547 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 Indian medaka MODERN SPECIES 16 maea (ENSOMEG00000011733) zgc:136929 (ENSOMEG00000011793) spon2b (ENSOMEG00000011816) ENSOMEG00000011827 ENSOMEG00000011856 fgfrl1a (ENSOMEG00000011920) slit3 (ENSOMEG00000012015) ENSOMEG00000012035 ENSOMEG00000012045 ENSOMEG00000012059 ##30 ENSOMEG00000012076 ##37 ENSOMEG00000012088 ##37 ENSOMEG00000012097 ##37 ENSOMEG00000012128 ##37 ENSOMEG00000012185 ##37 ENSOMEG00000012205 ##37 ENSOMEG00000012221 ##37 ENSOMEG00000012244 ##37 ENSOMEG00000000308 ##37 ENSOMEG00000012272 #29 ENSOMEG00000012289 #30 ENSOMEG00000012300 #34 ENSOMEG00000012328 #30 ENSOMEG00000012340 #30 ENSOMEG00000012357 #30 ENSOMEG00000000696 gpc2 (ENSOMEG00000012394) ENSOMEG00000012446 mcm7 (ENSOMEG00000012495) ENSOMEG00000012520 COPS6 (ENSOMEG00000012556) Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 maea (ENSOJAG00000016904) zgc:136929 (ENSOJAG00000016765) spon2b (ENSOJAG00000016747) ENSOJAG00000016737 ENSOJAG00000016732 fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) slit3 (ENSOJAG00000013112) ENSOJAG00000012872 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012457 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012382 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000011657 COPS6 (ENSOJAG00000011556) ENSOJAG00000011547 aurkb (ENSOJAG00000011520) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a Chinese medaka MODERN SPECIES 772 ENSOSIG00000007529 ##37 ENSOSIG00000007530 ##37 ENSOSIG00000007533 ##37 ENSOSIG00000007534 ##37 ENSOSIG00000007537 ##37 ENSOSIG00000007541 ##37 ENSOSIG00000007546 #29 Oryzias DUPLICATION Oryzias ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a Japanese Medaka HdrR DUPLICATION Japanese Medaka HdrR DUPLICATION Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 COPS6 (ENSORLG00000000554) ENSORLG00000000538 mcm7 (ENSORLG00000000527) ENSORLG00000000491 gpc2 (ENSORLG00000000476) ENSORLG00000000441 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000022885 #35 ENSORLG00000030644 slit3 (ENSORLG00000000335) ENSORLG00000028622 fgfrl1a (ENSORLG00000000305) ENSORLG00000000293 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000000538 mcm7 (ENSORLG00000000527) ENSORLG00000000491 gpc2 (ENSORLG00000000476) ENSORLG00000000441 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000022885 #35 ENSORLG00000030644 slit3 (ENSORLG00000000335) ENSORLG00000028622 fgfrl1a (ENSORLG00000000305) ENSORLG00000000293 spon2b (ENSORLG00000000275) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 fgfrl1a (ENSORLG00000000305) ENSORLG00000028622 slit3 (ENSORLG00000000335) ENSORLG00000030644 ENSORLG00000022885 #35 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000366 ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 ENSORLG00000000389 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000000441 gpc2 (ENSORLG00000000476) ENSORLG00000000491 mcm7 (ENSORLG00000000527) ENSORLG00000000538 COPS6 (ENSORLG00000000554) ENSORLG00000029587 Chinese medaka MODERN SPECIES 772 ENSOSIG00000007546 #29 ENSOSIG00000007541 ##37 ENSOSIG00000007537 ##37 ENSOSIG00000007534 ##37 ENSOSIG00000007533 ##37 ENSOSIG00000007530 ##37 ENSOSIG00000007529 ##37 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833 Indian medaka DUPLICATION Indian medaka MODERN SPECIES 16 ENSOMEG00000011827 ENSOMEG00000011856 fgfrl1a (ENSOMEG00000011920) slit3 (ENSOMEG00000012015) ENSOMEG00000012035 ENSOMEG00000012045 ENSOMEG00000012059 ##30 ENSOMEG00000012076 ##37 ENSOMEG00000012088 ##37 ENSOMEG00000012097 ##37 ENSOMEG00000012128 ##37 ENSOMEG00000012185 ##37 ENSOMEG00000012205 ##37 ENSOMEG00000012221 ##37 ENSOMEG00000012244 ##37 ENSOMEG00000000308 ##37 ENSOMEG00000012272 #29 ENSOMEG00000012289 #30 ENSOMEG00000012300 #34 ENSOMEG00000012328 #30 ENSOMEG00000012340 #30 ENSOMEG00000012357 #30 ENSOMEG00000000696 gpc2 (ENSOMEG00000012394) ENSOMEG00000012446 mcm7 (ENSOMEG00000012495) ENSOMEG00000012520 COPS6 (ENSOMEG00000012556) ENSOMEG00000012574 ENSOMEG00000012592 nkx3-2 (ENSOMEG00000012613) Indian medaka MODERN SPECIES 16 ENSOMEG00000012592 ENSOMEG00000012574 COPS6 (ENSOMEG00000012556) ENSOMEG00000012520 mcm7 (ENSOMEG00000012495) ENSOMEG00000012446 gpc2 (ENSOMEG00000012394) ENSOMEG00000000696 ENSOMEG00000012357 #30 ENSOMEG00000012340 #30 ENSOMEG00000012328 #30 ENSOMEG00000012300 #34 ENSOMEG00000012289 #30 ENSOMEG00000012272 #29 ENSOMEG00000000308 ##37 ENSOMEG00000012244 ##37 ENSOMEG00000012221 ##37 ENSOMEG00000012205 ##37 ENSOMEG00000012185 ##37 ENSOMEG00000012128 ##37 ENSOMEG00000012097 ##37 ENSOMEG00000012088 ##37 ENSOMEG00000012076 ##37 ENSOMEG00000012059 ##30 ENSOMEG00000012045 ENSOMEG00000012035 slit3 (ENSOMEG00000012015) fgfrl1a (ENSOMEG00000011920) ENSOMEG00000011856 ENSOMEG00000011827 spon2b (ENSOMEG00000011816) Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000016737 ENSOJAG00000016732 fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) slit3 (ENSOJAG00000013112) ENSOJAG00000012872 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012457 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012382 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000011657 COPS6 (ENSOJAG00000011556) ENSOJAG00000011547 aurkb (ENSOJAG00000011520) ENSOJAG00000011516 ENSOJAG00000011497 nkx3-2 (ENSOJAG00000011493) Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000011497 ENSOJAG00000011516 aurkb (ENSOJAG00000011520) ENSOJAG00000011547 COPS6 (ENSOJAG00000011556) ENSOJAG00000011657 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 slit3 (ENSOJAG00000013112) fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) ENSOJAG00000016732 ENSOJAG00000016737 spon2b (ENSOJAG00000016747) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 gpc2 (ENSORLG00000000476) ENSORLG00000000441 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000022885 #35 ENSORLG00000030644 slit3 (ENSORLG00000000335) ENSORLG00000028622 fgfrl1a (ENSORLG00000000305) ENSORLG00000000293 spon2b (ENSORLG00000000275) zgc:136929 (ENSORLG00000000259) maea (ENSORLG00000000230) ENSORLG00000022539 Chinese medaka MODERN SPECIES 772 ENSOSIG00000007546 #29 ENSOSIG00000007541 ##37 ENSOSIG00000007537 ##37 ENSOSIG00000007534 ##37 ENSOSIG00000007533 ##37 ENSOSIG00000007530 ##37 ENSOSIG00000007529 ##37 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00950000183123 ENSGT00940000167175.a ENSGT00940000157891 Indian medaka MODERN SPECIES 16 mcm7 (ENSOMEG00000012495) ENSOMEG00000012446 gpc2 (ENSOMEG00000012394) ENSOMEG00000000696 ENSOMEG00000012357 #30 ENSOMEG00000012340 #30 ENSOMEG00000012328 #30 ENSOMEG00000012300 #34 ENSOMEG00000012289 #30 ENSOMEG00000012272 #29 ENSOMEG00000000308 ##37 ENSOMEG00000012244 ##37 ENSOMEG00000012221 ##37 ENSOMEG00000012205 ##37 ENSOMEG00000012185 ##37 ENSOMEG00000012128 ##37 ENSOMEG00000012097 ##37 ENSOMEG00000012088 ##37 ENSOMEG00000012076 ##37 ENSOMEG00000012059 ##30 ENSOMEG00000012045 ENSOMEG00000012035 slit3 (ENSOMEG00000012015) fgfrl1a (ENSOMEG00000011920) ENSOMEG00000011856 ENSOMEG00000011827 spon2b (ENSOMEG00000011816) zgc:136929 (ENSOMEG00000011793) maea (ENSOMEG00000011733) ENSOMEG00000011670 KLHL3 (ENSOMEG00000011648) Oryzias DUPLICATION Oryzias ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 ENSGT00940000161843 Indian medaka MODERN SPECIES 16 zgc:136929 (ENSOMEG00000011793) spon2b (ENSOMEG00000011816) ENSOMEG00000011827 ENSOMEG00000011856 fgfrl1a (ENSOMEG00000011920) slit3 (ENSOMEG00000012015) ENSOMEG00000012035 ENSOMEG00000012045 ENSOMEG00000012059 ##30 ENSOMEG00000012076 ##37 ENSOMEG00000012088 ##37 ENSOMEG00000012097 ##37 ENSOMEG00000012128 ##37 ENSOMEG00000012185 ##37 ENSOMEG00000012205 ##37 ENSOMEG00000012221 ##37 ENSOMEG00000012244 ##37 ENSOMEG00000000308 ##37 ENSOMEG00000012272 #29 ENSOMEG00000012289 #30 ENSOMEG00000012300 #34 ENSOMEG00000012328 #30 ENSOMEG00000012340 #30 ENSOMEG00000012357 #30 ENSOMEG00000000696 gpc2 (ENSOMEG00000012394) ENSOMEG00000012446 mcm7 (ENSOMEG00000012495) ENSOMEG00000012520 COPS6 (ENSOMEG00000012556) ENSOMEG00000012574 Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 zgc:136929 (ENSOJAG00000016765) spon2b (ENSOJAG00000016747) ENSOJAG00000016737 ENSOJAG00000016732 fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) slit3 (ENSOJAG00000013112) ENSOJAG00000012872 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012457 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012382 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000011657 COPS6 (ENSOJAG00000011556) ENSOJAG00000011547 aurkb (ENSOJAG00000011520) ENSOJAG00000011516 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000159900 ENSGT00940000160999 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00940000158980 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117 Chinese medaka MODERN SPECIES 772 ENSOSIG00000007529 ##37 ENSOSIG00000007530 ##37 ENSOSIG00000007533 ##37 ENSOSIG00000007534 ##37 ENSOSIG00000007537 ##37 ENSOSIG00000007541 ##37 ENSOSIG00000007546 #29 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 zgc:136929 (ENSORLG00000000259) spon2b (ENSORLG00000000275) ENSORLG00000000293 fgfrl1a (ENSORLG00000000305) ENSORLG00000028622 slit3 (ENSORLG00000000335) ENSORLG00000030644 ENSORLG00000022885 #35 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000366 ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 ENSORLG00000000389 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000000441 gpc2 (ENSORLG00000000476) ENSORLG00000000491 mcm7 (ENSORLG00000000527) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00950000183123 ENSGT00940000167175.a ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b Indian medaka MODERN SPECIES 16 ENSOMEG00000012446 gpc2 (ENSOMEG00000012394) ENSOMEG00000000696 ENSOMEG00000012357 #30 ENSOMEG00000012340 #30 ENSOMEG00000012328 #30 ENSOMEG00000012300 #34 ENSOMEG00000012289 #30 ENSOMEG00000012272 #29 ENSOMEG00000000308 ##37 ENSOMEG00000012244 ##37 ENSOMEG00000012221 ##37 ENSOMEG00000012205 ##37 ENSOMEG00000012185 ##37 ENSOMEG00000012128 ##37 ENSOMEG00000012097 ##37 ENSOMEG00000012088 ##37 ENSOMEG00000012076 ##37 ENSOMEG00000012059 ##30 ENSOMEG00000012045 ENSOMEG00000012035 slit3 (ENSOMEG00000012015) fgfrl1a (ENSOMEG00000011920) ENSOMEG00000011856 ENSOMEG00000011827 spon2b (ENSOMEG00000011816) zgc:136929 (ENSOMEG00000011793) maea (ENSOMEG00000011733) ENSOMEG00000011670 KLHL3 (ENSOMEG00000011648) fam13b (ENSOMEG00000011594) Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000011657 mcm7 (ENSOJAG00000011699) ENSOJAG00000012382 gpc2 (ENSOJAG00000012393) ENSOJAG00000012457 ENSOJAG00000012515 #34 ENSOJAG00000012531 #34 ENSOJAG00000012563 #34 ENSOJAG00000012570 #34 ENSOJAG00000012631 ##37 ENSOJAG00000012681 ##37 ENSOJAG00000012697 ##37 ENSOJAG00000012775 ##37 ENSOJAG00000012802 ##37 ENSOJAG00000012812 #36 ENSOJAG00000012823 ##37 ENSOJAG00000012833 ##37 ENSOJAG00000012844 ##37 ENSOJAG00000012857 #29 ENSOJAG00000012862 #35 ENSOJAG00000012872 slit3 (ENSOJAG00000013112) fgfrl1a (ENSOJAG00000016722) ENSOJAG00000016732 ENSOJAG00000016737 spon2b (ENSOJAG00000016747) zgc:136929 (ENSOJAG00000016765) maea (ENSOJAG00000016904) ENSOJAG00000016953 ENSOJAG00000016962 KLHL3 (ENSOJAG00000016974) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.a #34 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b.b #34 ENSGT00940000173984.r.a #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.k.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b.l.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000173984.r.b #29 ENSGT01030000234530.a.d.e.a #35 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b Chinese medaka MODERN SPECIES 772 ENSOSIG00000007546 #29 ENSOSIG00000007541 ##37 ENSOSIG00000007537 ##37 ENSOSIG00000007534 ##37 ENSOSIG00000007533 ##37 ENSOSIG00000007530 ##37 ENSOSIG00000007529 ##37 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000000441 ENSORLG00000023542 ENSORLG00000029652 #34 ENSORLG00000026228 #34 ENSORLG00000018227 #30 ENSORLG00000027500 #34 ENSORLG00000029650 #30 ENSORLG00000026771 ENSORLG00000022449 #29 ENSORLG00000027260 ##37 ENSORLG00000025501 ##37 ENSORLG00000000389 ##37 nitr22 (ENSORLG00000000381) ##37 nitr20 (ENSORLG00000000367) ##37 ENSORLG00000000366 ##37 ENSORLG00000000357 ##37 ENSORLG00000000348 ##37 ENSORLG00000020285 ##37 ENSORLG00000025336 #29 ENSORLG00000028138 #35 ENSORLG00000022885 #35 ENSORLG00000030644 slit3 (ENSORLG00000000335) ENSORLG00000028622 fgfrl1a (ENSORLG00000000305) ENSORLG00000000293 spon2b (ENSORLG00000000275) zgc:136929 (ENSORLG00000000259) maea (ENSORLG00000000230) ENSORLG00000022539 ENSORLG00000027074 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00950000183123 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B.c #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000171832 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000168781 ENSGT00940000157891 Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010468 #28 ENSCGOG00000010463 #30 ENSCGOG00000010461 #30 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010357 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010326 ENSCGOG00000010321 fgfrl1a (ENSCGOG00000010315) ENSCGOG00000010311 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010463 #30 ENSCGOG00000010461 #30 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010357 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010326 ENSCGOG00000010321 fgfrl1a (ENSCGOG00000010315) ENSCGOG00000010311 ENSCGOG00000010249 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010357 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010326 ENSCGOG00000010321 fgfrl1a (ENSCGOG00000010315) ENSCGOG00000010311 ENSCGOG00000010249 spon2b (ENSCGOG00000010244) zgc:136929 (ENSCGOG00000010199) maea (ENSCGOG00000010098) Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010461 #30 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010357 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010326 ENSCGOG00000010321 fgfrl1a (ENSCGOG00000010315) ENSCGOG00000010311 ENSCGOG00000010249 spon2b (ENSCGOG00000010244) Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ITGA6 (ENSCGOG00000010473) ENSCGOG00000010471 ENSCGOG00000010468 #28 ENSCGOG00000010463 #30 ENSCGOG00000010461 #30 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010357 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010326 ENSCGOG00000010321 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010357 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010326 ENSCGOG00000010321 fgfrl1a (ENSCGOG00000010315) ENSCGOG00000010311 ENSCGOG00000010249 spon2b (ENSCGOG00000010244) zgc:136929 (ENSCGOG00000010199) maea (ENSCGOG00000010098) ENSCGOG00000010096 Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010471 ENSCGOG00000010468 #28 ENSCGOG00000010463 #30 ENSCGOG00000010461 #30 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010357 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010326 ENSCGOG00000010321 fgfrl1a (ENSCGOG00000010315) Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010357 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010326 ENSCGOG00000010321 fgfrl1a (ENSCGOG00000010315) ENSCGOG00000010311 ENSCGOG00000010249 spon2b (ENSCGOG00000010244) zgc:136929 (ENSCGOG00000010199) Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 gpc2 (ENSCGOG00000010481) ITGA6 (ENSCGOG00000010473) ENSCGOG00000010471 ENSCGOG00000010468 #28 ENSCGOG00000010463 #30 ENSCGOG00000010461 #30 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010357 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010326 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 zp3f.2 (ENSCGOG00000010329) ENSCGOG00000010357 ENSCGOG00000010360 ENSCGOG00000010361 ENSCGOG00000010364 #34 ENSCGOG00000010370 ##37 ENSCGOG00000010373 ##37 ENSCGOG00000010379 ##37 ENSCGOG00000010382 ##37 ENSCGOG00000010387 ##37 ENSCGOG00000010388 ##37 ENSCGOG00000010389 ##37 ENSCGOG00000010390 ##37 ENSCGOG00000010393 ##37 ENSCGOG00000010394 ##37 ENSCGOG00000010395 ##37 ENSCGOG00000010398 #36 ENSCGOG00000010399 #30 ENSCGOG00000010418 #34 ENSCGOG00000010423 #30 ENSCGOG00000010447 #30 ENSCGOG00000010453 ENSCGOG00000010454 #36 ENSCGOG00000010459 #34 ENSCGOG00000010461 #30 ENSCGOG00000010463 #30 ENSCGOG00000010468 #28 ENSCGOG00000010471 ITGA6 (ENSCGOG00000010473) gpc2 (ENSCGOG00000010481) ENSCGOG00000010601 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT00940000173984 #29 Lumpfish MODERN SPECIES 1 slc30a9 (ENSCLMG00005016743) gsr (ENSCLMG00005017530) HS3ST1 (ENSCLMG00005017538) RAB28 (ENSCLMG00005017539) nkx3-2 (ENSCLMG00005017542) ENSCLMG00005017543 aurkb (ENSCLMG00005017547) ENSCLMG00005017549 COPS6 (ENSCLMG00005017553) ENSCLMG00005017687 mcm7 (ENSCLMG00005017691) ENSCLMG00005017878 ENSCLMG00005017879 gpc2 (ENSCLMG00005017882) ENSCLMG00005017927 ENSCLMG00005017932 ##37 ENSCLMG00005017933 #29 nitr13 (ENSCLMG00005017936) ##37 ENSCLMG00005017938 ##37 ENSCLMG00005017939 ENSCLMG00005017941 ##37 ENSCLMG00005017943 ##37 ENSCLMG00005017946 ##37 ENSCLMG00005017948 #36 ENSCLMG00005017949 ##37 ENSCLMG00005017952 ##37 ENSCLMG00005004268 ##37 ENSCLMG00005004277 ##37 ENSCLMG00005004288 ##37 ENSCLMG00005004328 ##37 ENSCLMG00005004425 ##37 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843.b ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000177190 #36 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000170413.B.d #19 ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a.b ENSGT00940000157645.e.b ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843.b ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005007774 ENSDLAG00005007760 ENSDLAG00005007753 HS3ST1 (ENSDLAG00005032596) RAB28 (ENSDLAG00005007730) NKX3-2 (ENSDLAG00005028615) ENSDLAG00005026855 ENSDLAG00005029287 ENSDLAG00005029672 ENSDLAG00005007695 ENSDLAG00005033009 ENSDLAG00005030731 ENSDLAG00005007639 ENSDLAG00005007414 ENSDLAG00005007257 ENSDLAG00005007247 ##37 ENSDLAG00005028119 #28 ENSDLAG00005012890 #28 ENSDLAG00005032824 ENSDLAG00005008799 ENSDLAG00005032696 ENSDLAG00005026937 ENSDLAG00005032393 ENSDLAG00005033938 ENSDLAG00005032113 ENSDLAG00005033094 ENSDLAG00005020125 ENSDLAG00005020297 ENSDLAG00005020136 ENSDLAG00005020573 ENSDLAG00005029521 Large yellow croaker MODERN SPECIES ENSLCRG00005000513 ENSLCRG00005000511 HS3ST1 (ENSLCRG00005000508) RAB28 (ENSLCRG00005000504) nkx3-2 (ENSLCRG00005000501) ENSLCRG00005000500 aurkb (ENSLCRG00005000498) ENSLCRG00005000496 ENSLCRG00005000495 COPS6 (ENSLCRG00005000478) ENSLCRG00005000476 mcm7 (ENSLCRG00005000473) STAG3 (ENSLCRG00005000469) gpc2 (ENSLCRG00005000467) ENSLCRG00005000464 ENSLCRG00005000458 ##37 ENSLCRG00005000457 #19 ENSLCRG00005000455 #29 ENSLCRG00005000453 #19 ENSLCRG00005000448 #28 ENSLCRG00005000442 #29 ENSLCRG00005000441 #19 fzd5 (ENSLCRG00005000439) ccnyl1 (ENSLCRG00005000433) creb1a (ENSLCRG00005000428) klf7b (ENSLCRG00005000425) gdf3 (ENSLCRG00005000423) TRAPPC10 (ENSLCRG00005000269) CNGA4 (ENSLCRG00005000213) fhip1b (ENSLCRG00005000200) ENSLCRG00005000192 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022990 ##37 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023015 #36 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023023 slit3 (ENSSAUG00010023026) fgfrl1a (ENSSAUG00010023271) ENSSAUG00010023273 ENSSAUG00010023275 spon2b (ENSSAUG00010023276) zgc:136929 (ENSSAUG00010023293) maea (ENSSAUG00010024088) HNRNPA0 (ENSSAUG00010024095) ENSSAUG00010024097 KLHL3 (ENSSAUG00010024099) Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010022992 ##37 ENSSAUG00010022994 ##37 ENSSAUG00010022996 #28 ENSSAUG00010022999 #28 ENSSAUG00010023002 #19 ENSSAUG00010023004 #28 ENSSAUG00010023006 ##37 ENSSAUG00010023007 #29 ENSSAUG00010023008 #34 ENSSAUG00010023009 #28 ENSSAUG00010023011 #30 ENSSAUG00010023013 #29 ENSSAUG00010023014 #34 ENSSAUG00010023015 #36 nitr13 (ENSSAUG00010023016) ##37 ENSSAUG00010023018 ##37 ENSSAUG00010023019 ##37 ENSSAUG00010023020 ENSSAUG00010023022 ENSSAUG00010023023 slit3 (ENSSAUG00010023026) fgfrl1a (ENSSAUG00010023271) ENSSAUG00010023273 ENSSAUG00010023275 spon2b (ENSSAUG00010023276) zgc:136929 (ENSSAUG00010023293) maea (ENSSAUG00010024088) HNRNPA0 (ENSSAUG00010024095) ENSSAUG00010024097 KLHL3 (ENSSAUG00010024099) fam13b (ENSSAUG00010024105) Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 gsr (ENSSAUG00010022782) ENSSAUG00010022815 ENSSAUG00010022816 HS3ST1 (ENSSAUG00010022817) RAB28 (ENSSAUG00010022821) nkx3-2 (ENSSAUG00010022822) ENSSAUG00010022824 ENSSAUG00010022827 ENSSAUG00010022830 COPS6 (ENSSAUG00010022836) ENSSAUG00010022853 mcm7 (ENSSAUG00010022857) ENSSAUG00010022859 gpc2 (ENSSAUG00010022862) ENSSAUG00010022943 ENSSAUG00010022960 ##37 ENSSAUG00010022961 #19 ENSSAUG00010022962 #19 ENSSAUG00010022963 #28 ENSSAUG00010022964 #28 ENSSAUG00010022965 #28 ENSSAUG00010022967 #28 ENSSAUG00010022968 #28 ENSSAUG00010022970 #28 ENSSAUG00010022971 #28 nitr13 (ENSSAUG00010022972) #28 ENSSAUG00010022974 #28 ENSSAUG00010022976 #28 ENSSAUG00010022980 #28 ENSSAUG00010022981 #28 ENSSAUG00010022983 #28 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 1794 ENSLBEG00000022491 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1645 ENSLBEG00000010291 ENSLBEG00000010337 ##37 ENSLBEG00000010371 ##37 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 1569 ENSLBEG00000020928 ##37 ENSLBEG00000020980 ##37 ENSLBEG00000020992 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2890 ENSLBEG00000020832 #31 ENSLBEG00000020865 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 3705 ENSLBEG00000012592 ##37 ENSLBEG00000012622 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1946 ENSLBEG00000008805 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2035 ENSLBEG00000016714 ##37 ENSLBEG00000016762 ##37 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 1432 ENSLBEG00000007317 ##37 ENSLBEG00000007263 #28 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2560 ENSLBEG00000014528 ##37 ENSLBEG00000014556 #28 ENSLBEG00000014573 #28 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2517 ENSLBEG00000012691 ##37 ENSLBEG00000012723 #19 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4597 ENSLBEG00000029085 ##37 ENSLBEG00000029086 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1307 ENSLBEG00000024889 ##37 ENSLBEG00000024907 #28 ENSLBEG00000024930 ##19 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.a.b #31 ENSGT00950000182968.d.b.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00990000205479 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00940000170871 ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000025389 #28 ENSMAMG00000026318 #28 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017823 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000027564 spon2b (ENSMAMG00000017786) CTBP1 (ENSMAMG00000027529) MAEA (ENSMAMG00000017757) ENSMAMG00000017754 ENSMAMG00000017728 ENSMAMG00000017687 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000028334 #28 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017823 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000027564 spon2b (ENSMAMG00000017786) CTBP1 (ENSMAMG00000027529) MAEA (ENSMAMG00000017757) ENSMAMG00000017754 ENSMAMG00000017728 ENSMAMG00000017687 ENSMAMG00000017652 cxcl14 (ENSMAMG00000027577) Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000027554 #30 ENSMAMG00000018383 #37 ENSMAMG00000024852 #31 ENSMAMG00000025016 #31 ENSMAMG00000026187 #37 ENSMAMG00000018403 ENSMAMG00000018159 #28 ENSMAMG00000018577 #28 ENSMAMG00000024275 #28 ENSMAMG00000026889 #28 ENSMAMG00000026853 #28 ENSMAMG00000018102 #37 ENSMAMG00000018220 ##37 ENSMAMG00000018422 ##30 ENSMAMG00000018006 ##37 ENSMAMG00000017999 ##37 ENSMAMG00000017992 ##37 ENSMAMG00000017973 #34 ENSMAMG00000017967 ENSMAMG00000017823 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000027564 spon2b (ENSMAMG00000017786) CTBP1 (ENSMAMG00000027529) MAEA (ENSMAMG00000017757) ENSMAMG00000017754 ENSMAMG00000017728 ENSMAMG00000017687 ENSMAMG00000017652 cxcl14 (ENSMAMG00000027577) ENSMAMG00000017630 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156986 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000156835.l.a.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000164241 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.q ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00940000170413.B #19 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT00940000173984 #29 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.a #30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000157645.e.a ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 Climbing perch MODERN SPECIES 1 slc30a9 (ENSATEG00000001679) ENSATEG00000001687 ENSATEG00000001697 HS3ST1 (ENSATEG00000001734) ENSATEG00000001753 nkx3-2 (ENSATEG00000001782) ENSATEG00000025835 ENSATEG00000001816 aurkb (ENSATEG00000001897) ENSATEG00000001905 ENSATEG00000001917 ENSATEG00000001972 ENSATEG00000001999 ENSATEG00000026575 ENSATEG00000002057 ENSATEG00000002100 ##37 ENSATEG00000002105 #28 ENSATEG00000028861 #28 ENSATEG00000025448 #28 ENSATEG00000002195 #28 ENSATEG00000002212 #28 ENSATEG00000002171 #19 ENSATEG00000025471 #28 ENSATEG00000002253 ENSATEG00000002264 #28 ENSATEG00000027224 ENSATEG00000002292 #28 ENSATEG00000002309 #34 ENSATEG00000002319 #31 ENSATEG00000002346 #31 ENSATEG00000028743 #31 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 slc30a9 (ENSBSLG00000010158) gsr (ENSBSLG00000010224) ENSBSLG00000010356 ENSBSLG00000010626 HS3ST1 (ENSBSLG00000010754) ENSBSLG00000010781 nkx3-2 (ENSBSLG00000010875) ENSBSLG00000010887 aurkb (ENSBSLG00000010905) ENSBSLG00000010953 COPS6 (ENSBSLG00000011037) ENSBSLG00000011088 mcm7 (ENSBSLG00000011105) ENSBSLG00000011404 gpc2 (ENSBSLG00000011423) ENSBSLG00000011615 ##37 ENSBSLG00000011661 #28 ENSBSLG00000011727 #28 ENSBSLG00000011803 #28 ENSBSLG00000011846 #28 ENSBSLG00000011871 #29 ENSBSLG00000011884 #30 ENSBSLG00000011901 ENSBSLG00000011914 #37 ENSBSLG00000011941 ##37 ENSBSLG00000011950 #37 ENSBSLG00000011965 ##37 ENSBSLG00000011989 ENSBSLG00000012034 #30 ENSBSLG00000012092 #37 ENSBSLG00000012100 #36 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000177190 #36 ENSGT00940000159322 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00950000183123 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000157891 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b #33 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b #28 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.b #34 ENSGT00940000177190 #36 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022220 #36 ENSLCAG00010022186 #33 mcm7 (ENSLCAG00010022033) ENSLCAG00010021989 ##30 ENSLCAG00010021987 ##37 ENSLCAG00010021981 #33 ENSLCAG00010021962 #33 ENSLCAG00010021924 #34 ENSLCAG00010021913 #31 ENSLCAG00010021910 slit3 (ENSLCAG00010021484) Barramundi perch MODERN SPECIES 390 ENSLCAG00010022555 ENSLCAG00010022544 aurkb (ENSLCAG00010022522) ENSLCAG00010022520 COPS6 (ENSLCAG00010022501) ENSLCAG00010022496 ENSLCAG00010022488 gpc2 (ENSLCAG00010022484) ITGA6 (ENSLCAG00010022410) ENSLCAG00010022370 ##37 ENSLCAG00010022366 #28 ENSLCAG00010022353 #28 ENSLCAG00010022337 #28 ENSLCAG00010022334 ##19 ENSLCAG00010022332 ##19 ENSLCAG00010022329 ##37 ENSLCAG00010022327 ##37 ENSLCAG00010022321 ##37 ENSLCAG00010022318 ##37 ENSLCAG00010022287 #33 ENSLCAG00010022271 ##37 ENSLCAG00010022251 #33 ENSLCAG00010022236 ENSLCAG00010022224 #34 ENSLCAG00010022220 #36 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 335 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b ##30 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 1350 ENSACIG00000003206 ##37 ENSACIG00000003191 ##37 ENSACIG00000003180 ##37 ENSACIG00000003159 ##37 ENSACIG00000003143 ##37 ENSACIG00000003112 ##37 ENSACIG00000003075 ##37 ENSACIG00000003021 ##37 ENSACIG00000003001 ##37 ENSACIG00000002980 ##37 ENSACIG00000002953 ##37 ENSACIG00000002925 ##37 ENSACIG00000002904 ##30 ENSACIG00000002891 ##37 ENSACIG00000002874 ##37 ENSACIG00000002844 ##37 ENSACIG00000002833 ##37 ENSACIG00000002808 ##37 ENSACIG00000002798 #29 ENSACIG00000002787 ##37 ENSACIG00000002763 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.a.b ##37 ENSGT01030000234530.a.c.b.b.a.a.b.d.a.a ##37 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.b #33 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 224 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.c ##30 ENSGT01030000234530.a.d.e.b.a.a.b.b.a.b #33 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 163 ENSGT01030000234530.a.d.f ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.a.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.c.b.a.b.s.b.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.b.a.b.c ##30 P. nyererei MODERN SPECIES 532 ENSPNYG00000012384 hvcn1 (ENSPNYG00000012350) ENSPNYG00000012321 ##37 ENSPNYG00000012307 ##37 ENSPNYG00000012289 ##19 ENSPNYG00000012274 ##19 ENSPNYG00000012216 ##37 ENSPNYG00000012182 ##19 ENSPNYG00000012165 ##30 ENSPNYG00000012151 ##37 ENSPNYG00000012108 ##30 ENSPNYG00000012080 ##37 ENSPNYG00000012037 ENSPNYG00000012008 #29 ENSPNYG00000011971 ##37 ENSPNYG00000011938 ##37 ENSPNYG00000011891 ##30 ENSPNYG00000011867 ##37 ENSPNYG00000011854 ##30 ENSPNYG00000011833 ##37 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000156835.l.a.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT01060000248608.b ENSGT00950000182866.D.d.b ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a #37 ENSGT00940000157645.f ENSGT00940000155521.a.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 355 ENSGT00940000161833.b.a ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117.a ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00390000003354.e ENSGT00950000183073.a.a.b.f.a ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b.a ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT00940000157645.f.a ENSGT00940000155521.a.a Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000156835.l.a.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833.b.a ENSGT00940000161843 ENSGT00390000003354.e ENSGT00950000183073.a.a.b.f.a ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.a #37 ENSGT01010000225053 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT00940000157645.f.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00390000008582.e Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C.e ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000154615.i.b.f.g ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00390000008582.e ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000157357.e.b ENSGT00940000159674.s ENSGT00950000183162.a.a.d.f ENSGT00940000158778.d.d ENSGT00940000164878.a.m ENSGT00390000011180 Rainbow trout MODERN SPECIES 5 ENSOMYG00000063323 ENSOMYG00000063521 RAB28 (ENSOMYG00000061686) NKX3-2 (ENSOMYG00000061493) ENSOMYG00000035603 ENSOMYG00000066660 ENSOMYG00000035613 ENSOMYG00000035619 csn6 (ENSOMYG00000035631) ENSOMYG00000035638 ENSOMYG00000035735 ENSOMYG00000036382 ENSOMYG00000036405 ENSOMYG00000049577 ENSOMYG00000036495 ENSOMYG00000036606 #37 ENSOMYG00000051413 ENSOMYG00000077548 ENSOMYG00000058518 ENSOMYG00000036630 #37 ENSOMYG00000036645 #37 sirpb2 (ENSOMYG00000036661) #37 ENSOMYG00000036666 #37 ENSOMYG00000036637 #37 ENSOMYG00000036669 #37 ENSOMYG00000036676 #37 ENSOMYG00000056006 #37 ENSOMYG00000064046 ENSOMYG00000036687 #37 ENSOMYG00000054028 ENSOMYG00000036711 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.a ENSGT00530000064449.A.a.i.f.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C.e ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000155412.a.a.a.a.d ENSGT00940000160234.a.a.b.a ENSGT00940000154615.i.b.f.g ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00390000008582.e ENSGT00940000165110.b.c.b.a.a ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000157357.e.b ENSGT00940000159674.s ENSGT00950000183162.a.a.d.f Coho salmon MODERN SPECIES 10 ENSOKIG00005010158 HS3ST1 (ENSOKIG00005010176) RAB28 (ENSOKIG00005010189) nkx3-2 (ENSOKIG00005010222) ENSOKIG00005010235 ENSOKIG00005010281 ENSOKIG00005010327 ENSOKIG00005010332 ENSOKIG00005010337 COPS6 (ENSOKIG00005010343) ENSOKIG00005010357 ENSOKIG00005010364 mcm7 (ENSOKIG00005010408) gpc2 (ENSOKIG00005010983) rnasel3 (ENSOKIG00005011201) ENSOKIG00005011205 #37 ENSOKIG00005011219 #37 ENSOKIG00005011227 ENSOKIG00005011238 ENSOKIG00005011244 #37 ENSOKIG00005011253 #37 nitr13 (ENSOKIG00005011266) #37 ENSOKIG00005011274 #37 ENSOKIG00005011310 ENSOKIG00005011329 #37 PCDH1 (ENSOKIG00005011344) ENSOKIG00005011367 MFAP4 (ENSOKIG00005011371) ENSOKIG00005011377 brd8b (ENSOKIG00005011381) ENSOKIG00005011402 Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 13 atp8a1 (ENSOTSG00005031508) GRXCR1 (ENSOTSG00005033583) slc30a9 (ENSOTSG00005033585) emx1 (ENSOTSG00005033603) noto (ENSOTSG00005033604) nkx3-2 (ENSOTSG00005033605) ENSOTSG00005033607 ENSOTSG00005033610 ENSOTSG00005033611 COPS6 (ENSOTSG00005033613) ENSOTSG00005033614 mcm7 (ENSOTSG00005033622) ENSOTSG00005034167 gpc2 (ENSOTSG00005034170) rnasel3 (ENSOTSG00005034217) ENSOTSG00005034219 #37 ENSOTSG00005034221 ENSOTSG00005034223 #37 ENSOTSG00005034225 #37 ENSOTSG00005034228 #37 ENSOTSG00005034234 #37 ENSOTSG00005034240 #37 ENSOTSG00005034250 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005034254) ENSOTSG00005034255 PCDH1 (ENSOTSG00005034257) WNT8A (ENSOTSG00005034262) ENSOTSG00005034265 zgc:194246 (ENSOTSG00005034268) ENSOTSG00005034269 ENSOTSG00005034272 Chinook salmon MODERN SPECIES 13 fhl1a (ENSOTSG00005009883) slc9a6a (ENSOTSG00005009419) ENSOTSG00005009410 drp2 (ENSOTSG00005009406) nkx3-2 (ENSOTSG00005009404) ENSOTSG00005009402 ENSOTSG00005009400 ENSOTSG00005009399 ENSOTSG00005009398 COPS6 (ENSOTSG00005009396) ENSOTSG00005009394 mcm7 (ENSOTSG00005008384) ENSOTSG00005008377 gpc2 (ENSOTSG00005008362) rnasel3 (ENSOTSG00005008359) ENSOTSG00005008357 #37 ENSOTSG00005008347 ENSOTSG00005008344 #37 ENSOTSG00005008341 #37 ENSOTSG00005008337 #37 ENSOTSG00005008325 #37 ENSOTSG00005008319 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005008318) ENSOTSG00005008315 #37 ENSOTSG00005008312 ENSOTSG00005008311 ENSOTSG00005008308 ENSOTSG00005008307 ENSOTSG00005004814 ENSOTSG00005004769 prpf19 (ENSOTSG00005004574) Salmo ANCESTRAL SPECIES 848 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.a #37 ENSGT01010000225053 Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ENSSSAG00000005838 ENSSSAG00000005824 HS3ST1 (ENSSSAG00000109723) rab28 (ENSSSAG00000005777) NKX3-2 (ENSSSAG00000091968) ENSSSAG00000104763 ENSSSAG00000005741 ENSSSAG00000005735 ENSSSAG00000005511 ENSSSAG00000005407 ENSSSAG00000003171 ENSSSAG00000002657 ENSSSAG00000002635 #37 ENSSSAG00000083945 #37 ENSSSAG00000002617 #37 ENSSSAG00000010613 #37 ENSSSAG00000002609 ENSSSAG00000002600 #37 ENSSSAG00000092040 #37 ENSSSAG00000002765 ENSSSAG00000002590 #37 ENSSSAG00000002578 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000002508 #37 ang1 (ENSSSAG00000010876) ang1 (ENSSSAG00000096267) ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000102640) ang1 (ENSSSAG00000090024) ang1 (ENSSSAG00000101055) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.a #37 ENSGT01010000225053 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT00940000157645.f.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00390000008582.e ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000157357.e.b ENSGT00940000159674.s ENSGT00950000183162.a.a.d.f Salmo ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.a ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT00940000157645.f.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000157357.e.b ENSGT00940000159674.s ENSGT00950000183162.a.a.d.f ENSGT00940000158778.d.d Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ENSSSAG00000005407 ENSSSAG00000003171 ENSSSAG00000002657 ENSSSAG00000002635 #37 ENSSSAG00000083945 #37 ENSSSAG00000002617 #37 ENSSSAG00000010613 #37 ENSSSAG00000002609 ENSSSAG00000002600 #37 ENSSSAG00000092040 #37 ENSSSAG00000002765 ENSSSAG00000002590 #37 ENSSSAG00000002578 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000002508 #37 ang1 (ENSSSAG00000010876) ang1 (ENSSSAG00000096267) ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000102640) ang1 (ENSSSAG00000090024) ang1 (ENSSSAG00000101055) ENSSSAG00000002505 ENSSSAG00000002464 #37 ENSSSAG00000002449 #37 ENSSSAG00000085191 ENSSSAG00000002442 ENSSSAG00000089970 #37 ENSSSAG00000084675 brd8b (ENSSSAG00000045271) ddt4l (ENSSSAG00000045308) River trout MODERN SPECIES 22 mcm7 (ENSSTUG00000003025) ENSSTUG00000002988 gpc2 (ENSSTUG00000002698) ENSSTUG00000002632 #37 ENSSTUG00000002580 #37 ENSSTUG00000002568 ENSSTUG00000002510 ENSSTUG00000002491 ENSSTUG00000002476 #37 ENSSTUG00000002463 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002440) #37 ENSSTUG00000002435 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002421) #37 ENSSTUG00000002369 #37 ENSSTUG00000002360 #37 ENSSTUG00000002354 #37 rnasel3 (ENSSTUG00000002350) ENSSTUG00000002339 #37 ENSSTUG00000002331 #37 ENSSTUG00000002324 #37 ENSSTUG00000002318 PCDH1 (ENSSTUG00000002293) MFAP4 (ENSSTUG00000002284) brd8b (ENSSTUG00000002244) ENSSTUG00000002233 ppp3cb (ENSSTUG00000002159) ube2d2 (ENSSTUG00000002138) zgc:110843 (ENSSTUG00000002128) ENSSTUG00000002122 ENSSTUG00000002120 ENSSTUG00000002115 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.c #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.d #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 Rainbow trout MODERN SPECIES 5 ENSOMYG00000035735 ENSOMYG00000036382 ENSOMYG00000036405 ENSOMYG00000049577 ENSOMYG00000036495 ENSOMYG00000036606 #37 ENSOMYG00000051413 ENSOMYG00000077548 ENSOMYG00000058518 ENSOMYG00000036630 #37 ENSOMYG00000036645 #37 sirpb2 (ENSOMYG00000036661) #37 ENSOMYG00000036666 #37 ENSOMYG00000036637 #37 ENSOMYG00000036669 #37 ENSOMYG00000036676 #37 ENSOMYG00000056006 #37 ENSOMYG00000064046 ENSOMYG00000036687 #37 ENSOMYG00000054028 ENSOMYG00000036711 ENSOMYG00000049751 ENSOMYG00000077090 brd8b (ENSOMYG00000011171) ENSOMYG00000011149 sting1 (ENSOMYG00000011053) ppp3cb (ENSOMYG00000055833) ube2d2 (ENSOMYG00000010994) zgc:110843 (ENSOMYG00000010975) ENSOMYG00000010967 ENSOMYG00000010962 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 326 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.d #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 13 ENSOTSG00005033610 ENSOTSG00005033611 COPS6 (ENSOTSG00005033613) ENSOTSG00005033614 mcm7 (ENSOTSG00005033622) ENSOTSG00005034167 gpc2 (ENSOTSG00005034170) rnasel3 (ENSOTSG00005034217) ENSOTSG00005034219 #37 ENSOTSG00005034221 ENSOTSG00005034223 #37 ENSOTSG00005034225 #37 ENSOTSG00005034228 #37 ENSOTSG00005034234 #37 ENSOTSG00005034240 #37 ENSOTSG00005034250 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005034254) ENSOTSG00005034255 PCDH1 (ENSOTSG00005034257) WNT8A (ENSOTSG00005034262) ENSOTSG00005034265 zgc:194246 (ENSOTSG00005034268) ENSOTSG00005034269 ENSOTSG00005034272 ENSOTSG00005034279 SLC16A2 (ENSOTSG00005034281) ENSOTSG00005034283 ENSOTSG00005034284 ENSOTSG00005034287 pola2 (ENSOTSG00005034293) dpf2l (ENSOTSG00005035158) Chinook salmon MODERN SPECIES 13 ENSOTSG00005009400 ENSOTSG00005009399 ENSOTSG00005009398 COPS6 (ENSOTSG00005009396) ENSOTSG00005009394 mcm7 (ENSOTSG00005008384) ENSOTSG00005008377 gpc2 (ENSOTSG00005008362) rnasel3 (ENSOTSG00005008359) ENSOTSG00005008357 #37 ENSOTSG00005008347 ENSOTSG00005008344 #37 ENSOTSG00005008341 #37 ENSOTSG00005008337 #37 ENSOTSG00005008325 #37 ENSOTSG00005008319 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005008318) ENSOTSG00005008315 #37 ENSOTSG00005008312 ENSOTSG00005008311 ENSOTSG00005008308 ENSOTSG00005008307 ENSOTSG00005004814 ENSOTSG00005004769 prpf19 (ENSOTSG00005004574) tcirg1b (ENSOTSG00005004491) mrpl18 (ENSOTSG00005004484) ENSOTSG00005004483 grhpra (ENSOTSG00005003001) tomm5 (ENSOTSG00005002985) ENSOTSG00005002983 Coho salmon MODERN SPECIES 10 ENSOKIG00005010281 ENSOKIG00005010327 ENSOKIG00005010332 ENSOKIG00005010337 COPS6 (ENSOKIG00005010343) ENSOKIG00005010357 ENSOKIG00005010364 mcm7 (ENSOKIG00005010408) gpc2 (ENSOKIG00005010983) rnasel3 (ENSOKIG00005011201) ENSOKIG00005011205 #37 ENSOKIG00005011219 #37 ENSOKIG00005011227 ENSOKIG00005011238 ENSOKIG00005011244 #37 ENSOKIG00005011253 #37 nitr13 (ENSOKIG00005011266) #37 ENSOKIG00005011274 #37 ENSOKIG00005011310 ENSOKIG00005011329 #37 PCDH1 (ENSOKIG00005011344) ENSOKIG00005011367 MFAP4 (ENSOKIG00005011371) ENSOKIG00005011377 brd8b (ENSOKIG00005011381) ENSOKIG00005011402 sting1 (ENSOKIG00005011411) ppp3cb (ENSOKIG00005011430) ube2d2 (ENSOKIG00005011544) zgc:110843 (ENSOKIG00005011618) ENSOKIG00005011645 Huchen MODERN SPECIES 1089 gpc2 (ENSHHUG00000029675) ENSHHUG00000029668 ENSHHUG00000029618 ENSHHUG00000029613 #37 ENSHHUG00000029604 #37 nitr13 (ENSHHUG00000029598) #37 ENSHHUG00000029577 #37 ENSHHUG00000029574 #37 ENSHHUG00000029563 #37 ENSHHUG00000029548 #37 ENSHHUG00000029542 ENSHHUG00000029539 ENSHHUG00000029472 #37 ENSHHUG00000029466 #37 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1109 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000183073.a.a.b.f.a ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.a #37 ENSGT01010000225053 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT00940000157645.f.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00390000008582.e ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000157357.e.b ENSGT00940000159674.s Salmo DUPLICATION Salmo ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.a ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT00940000157645.f.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000157357.e.b ENSGT00940000159674.s ENSGT00950000183162.a.a.d.f Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ENSSSAG00000005735 ENSSSAG00000005511 ENSSSAG00000005407 ENSSSAG00000003171 ENSSSAG00000002657 ENSSSAG00000002635 #37 ENSSSAG00000083945 #37 ENSSSAG00000002617 #37 ENSSSAG00000010613 #37 ENSSSAG00000002609 ENSSSAG00000002600 #37 ENSSSAG00000092040 #37 ENSSSAG00000002765 ENSSSAG00000002590 #37 ENSSSAG00000002578 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000002508 #37 ang1 (ENSSSAG00000010876) ang1 (ENSSSAG00000096267) ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000102640) ang1 (ENSSSAG00000090024) ang1 (ENSSSAG00000101055) ENSSSAG00000002505 ENSSSAG00000002464 #37 ENSSSAG00000002449 #37 ENSSSAG00000085191 ENSSSAG00000002442 ENSSSAG00000089970 #37 ENSSSAG00000084675 River trout MODERN SPECIES 22 ENSSTUG00000003349 mcm7 (ENSSTUG00000003025) ENSSTUG00000002988 gpc2 (ENSSTUG00000002698) ENSSTUG00000002632 #37 ENSSTUG00000002580 #37 ENSSTUG00000002568 ENSSTUG00000002510 ENSSTUG00000002491 ENSSTUG00000002476 #37 ENSSTUG00000002463 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002440) #37 ENSSTUG00000002435 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002421) #37 ENSSTUG00000002369 #37 ENSSTUG00000002360 #37 ENSSTUG00000002354 #37 rnasel3 (ENSSTUG00000002350) ENSSTUG00000002339 #37 ENSSTUG00000002331 #37 ENSSTUG00000002324 #37 ENSSTUG00000002318 PCDH1 (ENSSTUG00000002293) MFAP4 (ENSSTUG00000002284) brd8b (ENSSTUG00000002244) ENSSTUG00000002233 ppp3cb (ENSSTUG00000002159) ube2d2 (ENSSTUG00000002138) zgc:110843 (ENSSTUG00000002128) ENSSTUG00000002122 ENSSTUG00000002120 Salmo ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000161843 ENSGT00530000067117.a ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.a ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT00940000157645.f.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000154108.a.c.b River trout MODERN SPECIES 22 ENSSTUG00000003393 COPS6 (ENSSTUG00000003356) ENSSTUG00000003349 mcm7 (ENSSTUG00000003025) ENSSTUG00000002988 gpc2 (ENSSTUG00000002698) ENSSTUG00000002632 #37 ENSSTUG00000002580 #37 ENSSTUG00000002568 ENSSTUG00000002510 ENSSTUG00000002491 ENSSTUG00000002476 #37 ENSSTUG00000002463 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002440) #37 ENSSTUG00000002435 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002421) #37 ENSSTUG00000002369 #37 ENSSTUG00000002360 #37 ENSSTUG00000002354 #37 rnasel3 (ENSSTUG00000002350) ENSSTUG00000002339 #37 ENSSTUG00000002331 #37 ENSSTUG00000002324 #37 ENSSTUG00000002318 PCDH1 (ENSSTUG00000002293) MFAP4 (ENSSTUG00000002284) brd8b (ENSSTUG00000002244) ENSSTUG00000002233 ppp3cb (ENSSTUG00000002159) ube2d2 (ENSSTUG00000002138) zgc:110843 (ENSSTUG00000002128) Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 rab28 (ENSSSAG00000005777) NKX3-2 (ENSSSAG00000091968) ENSSSAG00000104763 ENSSSAG00000005741 ENSSSAG00000005735 ENSSSAG00000005511 ENSSSAG00000005407 ENSSSAG00000003171 ENSSSAG00000002657 ENSSSAG00000002635 #37 ENSSSAG00000083945 #37 ENSSSAG00000002617 #37 ENSSSAG00000010613 #37 ENSSSAG00000002609 ENSSSAG00000002600 #37 ENSSSAG00000092040 #37 ENSSSAG00000002765 ENSSSAG00000002590 #37 ENSSSAG00000002578 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000002508 #37 ang1 (ENSSSAG00000010876) ang1 (ENSSSAG00000096267) ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000102640) ang1 (ENSSSAG00000090024) ang1 (ENSSSAG00000101055) ENSSSAG00000002505 ENSSSAG00000002464 #37 ENSSSAG00000002449 #37 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.c #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.d #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 326 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.d #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 Coho salmon DUPLICATION Coho salmon MODERN SPECIES 10 ENSOKIG00005010332 ENSOKIG00005010337 COPS6 (ENSOKIG00005010343) ENSOKIG00005010357 ENSOKIG00005010364 mcm7 (ENSOKIG00005010408) gpc2 (ENSOKIG00005010983) rnasel3 (ENSOKIG00005011201) ENSOKIG00005011205 #37 ENSOKIG00005011219 #37 ENSOKIG00005011227 ENSOKIG00005011238 ENSOKIG00005011244 #37 ENSOKIG00005011253 #37 nitr13 (ENSOKIG00005011266) #37 ENSOKIG00005011274 #37 ENSOKIG00005011310 ENSOKIG00005011329 #37 PCDH1 (ENSOKIG00005011344) ENSOKIG00005011367 MFAP4 (ENSOKIG00005011371) ENSOKIG00005011377 brd8b (ENSOKIG00005011381) ENSOKIG00005011402 sting1 (ENSOKIG00005011411) ppp3cb (ENSOKIG00005011430) ube2d2 (ENSOKIG00005011544) zgc:110843 (ENSOKIG00005011618) ENSOKIG00005011645 ENSOKIG00005011667 PSD2 (ENSOKIG00005011727) Coho salmon MODERN SPECIES 10 ENSOKIG00005010327 ENSOKIG00005010332 ENSOKIG00005010337 COPS6 (ENSOKIG00005010343) ENSOKIG00005010357 ENSOKIG00005010364 mcm7 (ENSOKIG00005010408) gpc2 (ENSOKIG00005010983) rnasel3 (ENSOKIG00005011201) ENSOKIG00005011205 #37 ENSOKIG00005011219 #37 ENSOKIG00005011227 ENSOKIG00005011238 ENSOKIG00005011244 #37 ENSOKIG00005011253 #37 nitr13 (ENSOKIG00005011266) #37 ENSOKIG00005011274 #37 ENSOKIG00005011310 ENSOKIG00005011329 #37 PCDH1 (ENSOKIG00005011344) ENSOKIG00005011367 MFAP4 (ENSOKIG00005011371) ENSOKIG00005011377 brd8b (ENSOKIG00005011381) ENSOKIG00005011402 sting1 (ENSOKIG00005011411) ppp3cb (ENSOKIG00005011430) ube2d2 (ENSOKIG00005011544) zgc:110843 (ENSOKIG00005011618) ENSOKIG00005011645 ENSOKIG00005011667 Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 13 nkx3-2 (ENSOTSG00005033605) ENSOTSG00005033607 ENSOTSG00005033610 ENSOTSG00005033611 COPS6 (ENSOTSG00005033613) ENSOTSG00005033614 mcm7 (ENSOTSG00005033622) ENSOTSG00005034167 gpc2 (ENSOTSG00005034170) rnasel3 (ENSOTSG00005034217) ENSOTSG00005034219 #37 ENSOTSG00005034221 ENSOTSG00005034223 #37 ENSOTSG00005034225 #37 ENSOTSG00005034228 #37 ENSOTSG00005034234 #37 ENSOTSG00005034240 #37 ENSOTSG00005034250 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005034254) ENSOTSG00005034255 PCDH1 (ENSOTSG00005034257) WNT8A (ENSOTSG00005034262) ENSOTSG00005034265 zgc:194246 (ENSOTSG00005034268) ENSOTSG00005034269 ENSOTSG00005034272 ENSOTSG00005034279 SLC16A2 (ENSOTSG00005034281) ENSOTSG00005034283 ENSOTSG00005034284 ENSOTSG00005034287 Chinook salmon MODERN SPECIES 13 nkx3-2 (ENSOTSG00005009404) ENSOTSG00005009402 ENSOTSG00005009400 ENSOTSG00005009399 ENSOTSG00005009398 COPS6 (ENSOTSG00005009396) ENSOTSG00005009394 mcm7 (ENSOTSG00005008384) ENSOTSG00005008377 gpc2 (ENSOTSG00005008362) rnasel3 (ENSOTSG00005008359) ENSOTSG00005008357 #37 ENSOTSG00005008347 ENSOTSG00005008344 #37 ENSOTSG00005008341 #37 ENSOTSG00005008337 #37 ENSOTSG00005008325 #37 ENSOTSG00005008319 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005008318) ENSOTSG00005008315 #37 ENSOTSG00005008312 ENSOTSG00005008311 ENSOTSG00005008308 ENSOTSG00005008307 ENSOTSG00005004814 ENSOTSG00005004769 prpf19 (ENSOTSG00005004574) tcirg1b (ENSOTSG00005004491) mrpl18 (ENSOTSG00005004484) ENSOTSG00005004483 grhpra (ENSOTSG00005003001) Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 5 ENSOMYG00000035638 ENSOMYG00000035735 ENSOMYG00000036382 ENSOMYG00000036405 ENSOMYG00000049577 ENSOMYG00000036495 ENSOMYG00000036606 #37 ENSOMYG00000051413 ENSOMYG00000077548 ENSOMYG00000058518 ENSOMYG00000036630 #37 ENSOMYG00000036645 #37 sirpb2 (ENSOMYG00000036661) #37 ENSOMYG00000036666 #37 ENSOMYG00000036637 #37 ENSOMYG00000036669 #37 ENSOMYG00000036676 #37 ENSOMYG00000056006 #37 ENSOMYG00000064046 ENSOMYG00000036687 #37 ENSOMYG00000054028 ENSOMYG00000036711 ENSOMYG00000049751 ENSOMYG00000077090 brd8b (ENSOMYG00000011171) ENSOMYG00000011149 sting1 (ENSOMYG00000011053) ppp3cb (ENSOMYG00000055833) ube2d2 (ENSOMYG00000010994) zgc:110843 (ENSOMYG00000010975) ENSOMYG00000010967 Rainbow trout MODERN SPECIES 5 csn6 (ENSOMYG00000035631) ENSOMYG00000035638 ENSOMYG00000035735 ENSOMYG00000036382 ENSOMYG00000036405 ENSOMYG00000049577 ENSOMYG00000036495 ENSOMYG00000036606 #37 ENSOMYG00000051413 ENSOMYG00000077548 ENSOMYG00000058518 ENSOMYG00000036630 #37 ENSOMYG00000036645 #37 sirpb2 (ENSOMYG00000036661) #37 ENSOMYG00000036666 #37 ENSOMYG00000036637 #37 ENSOMYG00000036669 #37 ENSOMYG00000036676 #37 ENSOMYG00000056006 #37 ENSOMYG00000064046 ENSOMYG00000036687 #37 ENSOMYG00000054028 ENSOMYG00000036711 ENSOMYG00000049751 ENSOMYG00000077090 brd8b (ENSOMYG00000011171) ENSOMYG00000011149 sting1 (ENSOMYG00000011053) ppp3cb (ENSOMYG00000055833) ube2d2 (ENSOMYG00000010994) zgc:110843 (ENSOMYG00000010975) Rainbow trout MODERN SPECIES 5 ENSOMYG00000035613 ENSOMYG00000035619 csn6 (ENSOMYG00000035631) ENSOMYG00000035638 ENSOMYG00000035735 ENSOMYG00000036382 ENSOMYG00000036405 ENSOMYG00000049577 ENSOMYG00000036495 ENSOMYG00000036606 #37 ENSOMYG00000051413 ENSOMYG00000077548 ENSOMYG00000058518 ENSOMYG00000036630 #37 ENSOMYG00000036645 #37 sirpb2 (ENSOMYG00000036661) #37 ENSOMYG00000036666 #37 ENSOMYG00000036637 #37 ENSOMYG00000036669 #37 ENSOMYG00000036676 #37 ENSOMYG00000056006 #37 ENSOMYG00000064046 ENSOMYG00000036687 #37 ENSOMYG00000054028 ENSOMYG00000036711 ENSOMYG00000049751 ENSOMYG00000077090 brd8b (ENSOMYG00000011171) ENSOMYG00000011149 sting1 (ENSOMYG00000011053) ppp3cb (ENSOMYG00000055833) Huchen MODERN SPECIES 1089 gpc2 (ENSHHUG00000029675) ENSHHUG00000029668 ENSHHUG00000029618 ENSHHUG00000029613 #37 ENSHHUG00000029604 #37 nitr13 (ENSHHUG00000029598) #37 ENSHHUG00000029577 #37 ENSHHUG00000029574 #37 ENSHHUG00000029563 #37 ENSHHUG00000029548 #37 ENSHHUG00000029542 ENSHHUG00000029539 ENSHHUG00000029472 #37 ENSHHUG00000029466 #37 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 2220 ENSGT01010000225053 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.a #37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833.b.a ENSGT00940000161843 ENSGT00390000003354.e ENSGT00950000183073.a.a.b.f.a ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.a #37 ENSGT01010000225053 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT00940000157645.f.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00390000008582.e ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00940000153169.B.m.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 900 ENSGT01010000225053 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.a #37 Rainbow trout MODERN SPECIES 5 ENSOMYG00000010333 ENSOMYG00000010962 ENSOMYG00000010967 zgc:110843 (ENSOMYG00000010975) ube2d2 (ENSOMYG00000010994) ppp3cb (ENSOMYG00000055833) sting1 (ENSOMYG00000011053) ENSOMYG00000011149 brd8b (ENSOMYG00000011171) ENSOMYG00000077090 ENSOMYG00000049751 ENSOMYG00000036711 ENSOMYG00000054028 ENSOMYG00000036687 #37 ENSOMYG00000064046 ENSOMYG00000056006 #37 ENSOMYG00000036676 #37 ENSOMYG00000036669 #37 ENSOMYG00000036637 #37 ENSOMYG00000036666 #37 sirpb2 (ENSOMYG00000036661) #37 ENSOMYG00000036645 #37 ENSOMYG00000036630 #37 ENSOMYG00000058518 ENSOMYG00000077548 ENSOMYG00000051413 ENSOMYG00000036606 #37 ENSOMYG00000036495 ENSOMYG00000049577 ENSOMYG00000036405 ENSOMYG00000036382 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 985 ENSGT01010000225053 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.a #37 Coho salmon MODERN SPECIES 10 sting1 (ENSOKIG00005011411) ENSOKIG00005011402 brd8b (ENSOKIG00005011381) ENSOKIG00005011377 MFAP4 (ENSOKIG00005011371) ENSOKIG00005011367 PCDH1 (ENSOKIG00005011344) ENSOKIG00005011329 #37 ENSOKIG00005011310 ENSOKIG00005011274 #37 nitr13 (ENSOKIG00005011266) #37 ENSOKIG00005011253 #37 ENSOKIG00005011244 #37 ENSOKIG00005011238 ENSOKIG00005011227 ENSOKIG00005011219 #37 ENSOKIG00005011205 #37 rnasel3 (ENSOKIG00005011201) gpc2 (ENSOKIG00005010983) mcm7 (ENSOKIG00005010408) ENSOKIG00005010364 ENSOKIG00005010357 COPS6 (ENSOKIG00005010343) ENSOKIG00005010337 ENSOKIG00005010332 ENSOKIG00005010327 ENSOKIG00005010281 ENSOKIG00005010235 nkx3-2 (ENSOKIG00005010222) RAB28 (ENSOKIG00005010189) HS3ST1 (ENSOKIG00005010176) Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 355 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT00950000182972.a.b.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00950000183073.a.a.b.f.a ENSGT00390000003354.e ENSGT00940000156198.c.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000011180 ENSGT00940000164878.a.m ENSGT00940000158778.d.d ENSGT00950000183162.a.a.d.f ENSGT00940000159674.s ENSGT00940000157357.e.b ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00390000008582.e ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.a #37 ENSGT01010000225053 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000164681.e ENSGT00390000011180 ENSGT00940000164878.a.m ENSGT00940000158778.d.d ENSGT00950000183162.a.a.d.f ENSGT00940000159674.s ENSGT00940000157357.e.b ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.b #37 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.a ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 nrg2b (ENSSSAG00000049517) ENSSSAG00000111384 ENSSSAG00000048137 ENSSSAG00000110985 ENSSSAG00000048081 zgc:110843 (ENSSSAG00000048056) UB2D2 (ENSSSAG00000063564) ppp3cb (ENSSSAG00000079655) ENSSSAG00000045320 ddt4l (ENSSSAG00000045308) brd8b (ENSSSAG00000045271) ENSSSAG00000084675 ENSSSAG00000089970 #37 ENSSSAG00000002442 ENSSSAG00000085191 ENSSSAG00000002449 #37 ENSSSAG00000002464 #37 ENSSSAG00000002505 ang1 (ENSSSAG00000101055) ang1 (ENSSSAG00000090024) ang1 (ENSSSAG00000102640) ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000096267) ang1 (ENSSSAG00000010876) ENSSSAG00000002508 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002578 #37 ENSSSAG00000002590 #37 ENSSSAG00000002765 ENSSSAG00000092040 #37 River trout MODERN SPECIES 22 nrg2b (ENSSTUG00000001739) PURA (ENSSTUG00000001758) PSD2 (ENSSTUG00000001791) ENSSTUG00000002115 ENSSTUG00000002120 ENSSTUG00000002122 zgc:110843 (ENSSTUG00000002128) ube2d2 (ENSSTUG00000002138) ppp3cb (ENSSTUG00000002159) ENSSTUG00000002233 brd8b (ENSSTUG00000002244) MFAP4 (ENSSTUG00000002284) PCDH1 (ENSSTUG00000002293) ENSSTUG00000002318 ENSSTUG00000002324 #37 ENSSTUG00000002331 #37 ENSSTUG00000002339 #37 rnasel3 (ENSSTUG00000002350) ENSSTUG00000002354 #37 ENSSTUG00000002360 #37 ENSSTUG00000002369 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002421) #37 ENSSTUG00000002435 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002440) #37 ENSSTUG00000002463 #37 ENSSTUG00000002476 #37 ENSSTUG00000002491 ENSSTUG00000002510 ENSSTUG00000002568 ENSSTUG00000002580 #37 ENSSTUG00000002632 #37 Huchen MODERN SPECIES 1089 ENSHHUG00000029466 #37 ENSHHUG00000029472 #37 ENSHHUG00000029539 ENSHHUG00000029542 ENSHHUG00000029548 #37 ENSHHUG00000029563 #37 ENSHHUG00000029574 #37 ENSHHUG00000029577 #37 nitr13 (ENSHHUG00000029598) #37 ENSHHUG00000029604 #37 ENSHHUG00000029613 #37 ENSHHUG00000029618 ENSHHUG00000029668 gpc2 (ENSHHUG00000029675) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.b #37 Huchen MODERN SPECIES 1089 gpc2 (ENSHHUG00000029675) ENSHHUG00000029668 ENSHHUG00000029618 ENSHHUG00000029613 #37 ENSHHUG00000029604 #37 nitr13 (ENSHHUG00000029598) #37 ENSHHUG00000029577 #37 ENSHHUG00000029574 #37 ENSHHUG00000029563 #37 ENSHHUG00000029548 #37 ENSHHUG00000029542 ENSHHUG00000029539 ENSHHUG00000029472 #37 ENSHHUG00000029466 #37 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.a.b #37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.a.b #37 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.a.b #37 Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ctsw (ENSSSAG00000049689) eif1ad (ENSSSAG00000049667) ENSSSAG00000114421 nrg2b (ENSSSAG00000049517) ENSSSAG00000111384 ENSSSAG00000048137 ENSSSAG00000110985 ENSSSAG00000048081 zgc:110843 (ENSSSAG00000048056) UB2D2 (ENSSSAG00000063564) ppp3cb (ENSSSAG00000079655) ENSSSAG00000045320 ddt4l (ENSSSAG00000045308) brd8b (ENSSSAG00000045271) ENSSSAG00000084675 ENSSSAG00000089970 #37 ENSSSAG00000002442 ENSSSAG00000085191 ENSSSAG00000002449 #37 ENSSSAG00000002464 #37 ENSSSAG00000002505 ang1 (ENSSSAG00000101055) ang1 (ENSSSAG00000090024) ang1 (ENSSSAG00000102640) ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000096267) ang1 (ENSSSAG00000010876) ENSSSAG00000002508 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002578 #37 River trout MODERN SPECIES 22 ENSSTUG00000001735 nrg2b (ENSSTUG00000001739) PURA (ENSSTUG00000001758) PSD2 (ENSSTUG00000001791) ENSSTUG00000002115 ENSSTUG00000002120 ENSSTUG00000002122 zgc:110843 (ENSSTUG00000002128) ube2d2 (ENSSTUG00000002138) ppp3cb (ENSSTUG00000002159) ENSSTUG00000002233 brd8b (ENSSTUG00000002244) MFAP4 (ENSSTUG00000002284) PCDH1 (ENSSTUG00000002293) ENSSTUG00000002318 ENSSTUG00000002324 #37 ENSSTUG00000002331 #37 ENSSTUG00000002339 #37 rnasel3 (ENSSTUG00000002350) ENSSTUG00000002354 #37 ENSSTUG00000002360 #37 ENSSTUG00000002369 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002421) #37 ENSSTUG00000002435 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002440) #37 ENSSTUG00000002463 #37 ENSSTUG00000002476 #37 ENSSTUG00000002491 ENSSTUG00000002510 ENSSTUG00000002568 ENSSTUG00000002580 #37 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1109 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00390000008582.e ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.a #37 ENSGT01010000225053 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00950000183073.a.a.b.f.a ENSGT00390000003354.e ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833.b.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.b #37 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.a ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00530000067117.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833.b.a ENSGT00940000160449 ENSGT00940000156835.l.a.b ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000156986 River trout DUPLICATION River trout MODERN SPECIES 22 brd8b (ENSSTUG00000002244) MFAP4 (ENSSTUG00000002284) PCDH1 (ENSSTUG00000002293) ENSSTUG00000002318 ENSSTUG00000002324 #37 ENSSTUG00000002331 #37 ENSSTUG00000002339 #37 rnasel3 (ENSSTUG00000002350) ENSSTUG00000002354 #37 ENSSTUG00000002360 #37 ENSSTUG00000002369 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002421) #37 ENSSTUG00000002435 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002440) #37 ENSSTUG00000002463 #37 ENSSTUG00000002476 #37 ENSSTUG00000002491 ENSSTUG00000002510 ENSSTUG00000002568 ENSSTUG00000002580 #37 ENSSTUG00000002632 #37 gpc2 (ENSSTUG00000002698) ENSSTUG00000002988 mcm7 (ENSSTUG00000003025) ENSSTUG00000003349 COPS6 (ENSSTUG00000003356) ENSSTUG00000003393 ENSSTUG00000003397 ENSSTUG00000003405 nkx3-2 (ENSSTUG00000003434) RAB28 (ENSSTUG00000003454) River trout MODERN SPECIES 22 ENSSTUG00000002331 #37 ENSSTUG00000002339 #37 rnasel3 (ENSSTUG00000002350) ENSSTUG00000002354 #37 ENSSTUG00000002360 #37 ENSSTUG00000002369 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002421) #37 ENSSTUG00000002435 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002440) #37 ENSSTUG00000002463 #37 ENSSTUG00000002476 #37 ENSSTUG00000002491 ENSSTUG00000002510 ENSSTUG00000002568 ENSSTUG00000002580 #37 ENSSTUG00000002632 #37 gpc2 (ENSSTUG00000002698) ENSSTUG00000002988 mcm7 (ENSSTUG00000003025) ENSSTUG00000003349 COPS6 (ENSSTUG00000003356) ENSSTUG00000003393 ENSSTUG00000003397 ENSSTUG00000003405 nkx3-2 (ENSSTUG00000003434) RAB28 (ENSSTUG00000003454) HS3ST1 (ENSSTUG00000003474) ENSSTUG00000003491 ENSSTUG00000003507 gsr (ENSSTUG00000003572) slc30a9 (ENSSTUG00000004494) Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000096267) ang1 (ENSSSAG00000010876) ENSSSAG00000002508 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002578 #37 ENSSSAG00000002590 #37 ENSSSAG00000002765 ENSSSAG00000092040 #37 ENSSSAG00000002600 #37 ENSSSAG00000002609 ENSSSAG00000010613 #37 ENSSSAG00000002617 #37 ENSSSAG00000083945 #37 ENSSSAG00000002635 #37 ENSSSAG00000002657 ENSSSAG00000003171 ENSSSAG00000005407 ENSSSAG00000005511 ENSSSAG00000005735 ENSSSAG00000005741 ENSSSAG00000104763 NKX3-2 (ENSSSAG00000091968) rab28 (ENSSSAG00000005777) HS3ST1 (ENSSSAG00000109723) ENSSSAG00000005824 ENSSSAG00000005838 ENSSSAG00000117028 slc30a9 (ENSSSAG00000005870) GRXCR1 (ENSSSAG00000006661) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.d #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.c #37 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 326 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.d #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 13 SLC16A2 (ENSOTSG00005034281) ENSOTSG00005034279 ENSOTSG00005034272 ENSOTSG00005034269 zgc:194246 (ENSOTSG00005034268) ENSOTSG00005034265 WNT8A (ENSOTSG00005034262) PCDH1 (ENSOTSG00005034257) ENSOTSG00005034255 rnasel3 (ENSOTSG00005034254) ENSOTSG00005034250 #37 ENSOTSG00005034240 #37 ENSOTSG00005034234 #37 ENSOTSG00005034228 #37 ENSOTSG00005034225 #37 ENSOTSG00005034223 #37 ENSOTSG00005034221 ENSOTSG00005034219 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005034217) gpc2 (ENSOTSG00005034170) ENSOTSG00005034167 mcm7 (ENSOTSG00005033622) ENSOTSG00005033614 COPS6 (ENSOTSG00005033613) ENSOTSG00005033611 ENSOTSG00005033610 ENSOTSG00005033607 nkx3-2 (ENSOTSG00005033605) noto (ENSOTSG00005033604) emx1 (ENSOTSG00005033603) slc30a9 (ENSOTSG00005033585) Chinook salmon MODERN SPECIES 13 mrpl18 (ENSOTSG00005004484) tcirg1b (ENSOTSG00005004491) prpf19 (ENSOTSG00005004574) ENSOTSG00005004769 ENSOTSG00005004814 ENSOTSG00005008307 ENSOTSG00005008308 ENSOTSG00005008311 ENSOTSG00005008312 ENSOTSG00005008315 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005008318) ENSOTSG00005008319 #37 ENSOTSG00005008325 #37 ENSOTSG00005008337 #37 ENSOTSG00005008341 #37 ENSOTSG00005008344 #37 ENSOTSG00005008347 ENSOTSG00005008357 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005008359) gpc2 (ENSOTSG00005008362) ENSOTSG00005008377 mcm7 (ENSOTSG00005008384) ENSOTSG00005009394 COPS6 (ENSOTSG00005009396) ENSOTSG00005009398 ENSOTSG00005009399 ENSOTSG00005009400 ENSOTSG00005009402 nkx3-2 (ENSOTSG00005009404) drp2 (ENSOTSG00005009406) ENSOTSG00005009410 Huchen MODERN SPECIES 1089 ENSHHUG00000029466 #37 ENSHHUG00000029472 #37 ENSHHUG00000029539 ENSHHUG00000029542 ENSHHUG00000029548 #37 ENSHHUG00000029563 #37 ENSHHUG00000029574 #37 ENSHHUG00000029577 #37 nitr13 (ENSHHUG00000029598) #37 ENSHHUG00000029604 #37 ENSHHUG00000029613 #37 ENSHHUG00000029618 ENSHHUG00000029668 gpc2 (ENSHHUG00000029675) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.b #37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.b #37 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.b #37 Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 brd8b (ENSSSAG00000045271) ENSSSAG00000084675 ENSSSAG00000089970 #37 ENSSSAG00000002442 ENSSSAG00000085191 ENSSSAG00000002449 #37 ENSSSAG00000002464 #37 ENSSSAG00000002505 ang1 (ENSSSAG00000101055) ang1 (ENSSSAG00000090024) ang1 (ENSSSAG00000102640) ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000096267) ang1 (ENSSSAG00000010876) ENSSSAG00000002508 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002578 #37 ENSSSAG00000002590 #37 ENSSSAG00000002765 ENSSSAG00000092040 #37 ENSSSAG00000002600 #37 ENSSSAG00000002609 ENSSSAG00000010613 #37 ENSSSAG00000002617 #37 ENSSSAG00000083945 #37 ENSSSAG00000002635 #37 ENSSSAG00000002657 ENSSSAG00000003171 ENSSSAG00000005407 ENSSSAG00000005511 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 355 ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT00950000182972.a.b.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00950000183073.a.a.b.f.a ENSGT00390000003354.e ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00530000067117.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000164878.a.m ENSGT00940000158778.d.d ENSGT00950000183162.a.a.d.f ENSGT00940000159674.s ENSGT00940000157357.e.b ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00390000008582.e ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.a #37 ENSGT01010000225053 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000011180 ENSGT00940000164878.a.m ENSGT00940000158778.d.d ENSGT00950000183162.a.a.d.f ENSGT00940000159674.s ENSGT00940000157357.e.b ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.b #37 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.a ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244824.C Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ENSSSAG00000111384 ENSSSAG00000048137 ENSSSAG00000110985 ENSSSAG00000048081 zgc:110843 (ENSSSAG00000048056) UB2D2 (ENSSSAG00000063564) ppp3cb (ENSSSAG00000079655) ENSSSAG00000045320 ddt4l (ENSSSAG00000045308) brd8b (ENSSSAG00000045271) ENSSSAG00000084675 ENSSSAG00000089970 #37 ENSSSAG00000002442 ENSSSAG00000085191 ENSSSAG00000002449 #37 ENSSSAG00000002464 #37 ENSSSAG00000002505 ang1 (ENSSSAG00000101055) ang1 (ENSSSAG00000090024) ang1 (ENSSSAG00000102640) ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000096267) ang1 (ENSSSAG00000010876) ENSSSAG00000002508 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002578 #37 ENSSSAG00000002590 #37 ENSSSAG00000002765 ENSSSAG00000092040 #37 ENSSSAG00000002600 #37 River trout MODERN SPECIES 22 PURA (ENSSTUG00000001758) PSD2 (ENSSTUG00000001791) ENSSTUG00000002115 ENSSTUG00000002120 ENSSTUG00000002122 zgc:110843 (ENSSTUG00000002128) ube2d2 (ENSSTUG00000002138) ppp3cb (ENSSTUG00000002159) ENSSTUG00000002233 brd8b (ENSSTUG00000002244) MFAP4 (ENSSTUG00000002284) PCDH1 (ENSSTUG00000002293) ENSSTUG00000002318 ENSSTUG00000002324 #37 ENSSTUG00000002331 #37 ENSSTUG00000002339 #37 rnasel3 (ENSSTUG00000002350) ENSSTUG00000002354 #37 ENSSTUG00000002360 #37 ENSSTUG00000002369 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002421) #37 ENSSTUG00000002435 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002440) #37 ENSSTUG00000002463 #37 ENSSTUG00000002476 #37 ENSSTUG00000002491 ENSSTUG00000002510 ENSSTUG00000002568 ENSSTUG00000002580 #37 ENSSTUG00000002632 #37 gpc2 (ENSSTUG00000002698) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.d #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.c #37 Rainbow trout MODERN SPECIES 5 nrg2b (ENSOMYG00000010035) ENSOMYG00000010081 ENSOMYG00000010333 ENSOMYG00000010962 ENSOMYG00000010967 zgc:110843 (ENSOMYG00000010975) ube2d2 (ENSOMYG00000010994) ppp3cb (ENSOMYG00000055833) sting1 (ENSOMYG00000011053) ENSOMYG00000011149 brd8b (ENSOMYG00000011171) ENSOMYG00000077090 ENSOMYG00000049751 ENSOMYG00000036711 ENSOMYG00000054028 ENSOMYG00000036687 #37 ENSOMYG00000064046 ENSOMYG00000056006 #37 ENSOMYG00000036676 #37 ENSOMYG00000036669 #37 ENSOMYG00000036637 #37 ENSOMYG00000036666 #37 sirpb2 (ENSOMYG00000036661) #37 ENSOMYG00000036645 #37 ENSOMYG00000036630 #37 ENSOMYG00000058518 ENSOMYG00000077548 ENSOMYG00000051413 ENSOMYG00000036606 #37 ENSOMYG00000036495 ENSOMYG00000049577 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 326 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.d #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 Coho salmon MODERN SPECIES 10 nrg2b (ENSOKIG00005012643) PURA (ENSOKIG00005012639) PSD2 (ENSOKIG00005011727) ENSOKIG00005011667 ENSOKIG00005011645 zgc:110843 (ENSOKIG00005011618) ube2d2 (ENSOKIG00005011544) ppp3cb (ENSOKIG00005011430) sting1 (ENSOKIG00005011411) ENSOKIG00005011402 brd8b (ENSOKIG00005011381) ENSOKIG00005011377 MFAP4 (ENSOKIG00005011371) ENSOKIG00005011367 PCDH1 (ENSOKIG00005011344) ENSOKIG00005011329 #37 ENSOKIG00005011310 ENSOKIG00005011274 #37 nitr13 (ENSOKIG00005011266) #37 ENSOKIG00005011253 #37 ENSOKIG00005011244 #37 ENSOKIG00005011238 ENSOKIG00005011227 ENSOKIG00005011219 #37 ENSOKIG00005011205 #37 rnasel3 (ENSOKIG00005011201) gpc2 (ENSOKIG00005010983) mcm7 (ENSOKIG00005010408) ENSOKIG00005010364 ENSOKIG00005010357 COPS6 (ENSOKIG00005010343) Huchen MODERN SPECIES 1089 ENSHHUG00000029466 #37 ENSHHUG00000029472 #37 ENSHHUG00000029539 ENSHHUG00000029542 ENSHHUG00000029548 #37 ENSHHUG00000029563 #37 ENSHHUG00000029574 #37 ENSHHUG00000029577 #37 nitr13 (ENSHHUG00000029598) #37 ENSHHUG00000029604 #37 ENSHHUG00000029613 #37 ENSHHUG00000029618 ENSHHUG00000029668 gpc2 (ENSHHUG00000029675) Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a #37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00390000008582.e ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.a #37 ENSGT01010000225053 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00950000183073.a.a.b.f.a ENSGT00390000003354.e ENSGT00940000161843 Salmo DUPLICATION Salmo ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.b #37 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.a ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00530000067117.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833.b.a River trout MODERN SPECIES 22 ube2d2 (ENSSTUG00000002138) ppp3cb (ENSSTUG00000002159) ENSSTUG00000002233 brd8b (ENSSTUG00000002244) MFAP4 (ENSSTUG00000002284) PCDH1 (ENSSTUG00000002293) ENSSTUG00000002318 ENSSTUG00000002324 #37 ENSSTUG00000002331 #37 ENSSTUG00000002339 #37 rnasel3 (ENSSTUG00000002350) ENSSTUG00000002354 #37 ENSSTUG00000002360 #37 ENSSTUG00000002369 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002421) #37 ENSSTUG00000002435 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002440) #37 ENSSTUG00000002463 #37 ENSSTUG00000002476 #37 ENSSTUG00000002491 ENSSTUG00000002510 ENSSTUG00000002568 ENSSTUG00000002580 #37 ENSSTUG00000002632 #37 gpc2 (ENSSTUG00000002698) ENSSTUG00000002988 mcm7 (ENSSTUG00000003025) ENSSTUG00000003349 COPS6 (ENSSTUG00000003356) ENSSTUG00000003393 ENSSTUG00000003397 Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ENSSSAG00000002464 #37 ENSSSAG00000002505 ang1 (ENSSSAG00000101055) ang1 (ENSSSAG00000090024) ang1 (ENSSSAG00000102640) ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000096267) ang1 (ENSSSAG00000010876) ENSSSAG00000002508 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002578 #37 ENSSSAG00000002590 #37 ENSSSAG00000002765 ENSSSAG00000092040 #37 ENSSSAG00000002600 #37 ENSSSAG00000002609 ENSSSAG00000010613 #37 ENSSSAG00000002617 #37 ENSSSAG00000083945 #37 ENSSSAG00000002635 #37 ENSSSAG00000002657 ENSSSAG00000003171 ENSSSAG00000005407 ENSSSAG00000005511 ENSSSAG00000005735 ENSSSAG00000005741 ENSSSAG00000104763 NKX3-2 (ENSSSAG00000091968) rab28 (ENSSSAG00000005777) HS3ST1 (ENSSSAG00000109723) Salmo ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.b #37 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.a ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00530000067117.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833.b.a ENSGT00940000160449 River trout MODERN SPECIES 22 ENSSTUG00000002233 brd8b (ENSSTUG00000002244) MFAP4 (ENSSTUG00000002284) PCDH1 (ENSSTUG00000002293) ENSSTUG00000002318 ENSSTUG00000002324 #37 ENSSTUG00000002331 #37 ENSSTUG00000002339 #37 rnasel3 (ENSSTUG00000002350) ENSSTUG00000002354 #37 ENSSTUG00000002360 #37 ENSSTUG00000002369 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002421) #37 ENSSTUG00000002435 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002440) #37 ENSSTUG00000002463 #37 ENSSTUG00000002476 #37 ENSSTUG00000002491 ENSSTUG00000002510 ENSSTUG00000002568 ENSSTUG00000002580 #37 ENSSTUG00000002632 #37 gpc2 (ENSSTUG00000002698) ENSSTUG00000002988 mcm7 (ENSSTUG00000003025) ENSSTUG00000003349 COPS6 (ENSSTUG00000003356) ENSSTUG00000003393 ENSSTUG00000003397 ENSSTUG00000003405 nkx3-2 (ENSSTUG00000003434) Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ang1 (ENSSSAG00000102640) ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000096267) ang1 (ENSSSAG00000010876) ENSSSAG00000002508 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002578 #37 ENSSSAG00000002590 #37 ENSSSAG00000002765 ENSSSAG00000092040 #37 ENSSSAG00000002600 #37 ENSSSAG00000002609 ENSSSAG00000010613 #37 ENSSSAG00000002617 #37 ENSSSAG00000083945 #37 ENSSSAG00000002635 #37 ENSSSAG00000002657 ENSSSAG00000003171 ENSSSAG00000005407 ENSSSAG00000005511 ENSSSAG00000005735 ENSSSAG00000005741 ENSSSAG00000104763 NKX3-2 (ENSSSAG00000091968) rab28 (ENSSSAG00000005777) HS3ST1 (ENSSSAG00000109723) ENSSSAG00000005824 ENSSSAG00000005838 ENSSSAG00000117028 slc30a9 (ENSSSAG00000005870) Oncorhynchus DUPLICATION Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.d #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.c #37 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.c #37 Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 13 ENSOTSG00005034284 ENSOTSG00005034283 SLC16A2 (ENSOTSG00005034281) ENSOTSG00005034279 ENSOTSG00005034272 ENSOTSG00005034269 zgc:194246 (ENSOTSG00005034268) ENSOTSG00005034265 WNT8A (ENSOTSG00005034262) PCDH1 (ENSOTSG00005034257) ENSOTSG00005034255 rnasel3 (ENSOTSG00005034254) ENSOTSG00005034250 #37 ENSOTSG00005034240 #37 ENSOTSG00005034234 #37 ENSOTSG00005034228 #37 ENSOTSG00005034225 #37 ENSOTSG00005034223 #37 ENSOTSG00005034221 ENSOTSG00005034219 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005034217) gpc2 (ENSOTSG00005034170) ENSOTSG00005034167 mcm7 (ENSOTSG00005033622) ENSOTSG00005033614 COPS6 (ENSOTSG00005033613) ENSOTSG00005033611 ENSOTSG00005033610 ENSOTSG00005033607 nkx3-2 (ENSOTSG00005033605) noto (ENSOTSG00005033604) Chinook salmon MODERN SPECIES 13 KLB (ENSOTSG00005002980) ENSOTSG00005002981 ENSOTSG00005002983 tomm5 (ENSOTSG00005002985) grhpra (ENSOTSG00005003001) ENSOTSG00005004483 mrpl18 (ENSOTSG00005004484) tcirg1b (ENSOTSG00005004491) prpf19 (ENSOTSG00005004574) ENSOTSG00005004769 ENSOTSG00005004814 ENSOTSG00005008307 ENSOTSG00005008308 ENSOTSG00005008311 ENSOTSG00005008312 ENSOTSG00005008315 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005008318) ENSOTSG00005008319 #37 ENSOTSG00005008325 #37 ENSOTSG00005008337 #37 ENSOTSG00005008341 #37 ENSOTSG00005008344 #37 ENSOTSG00005008347 ENSOTSG00005008357 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005008359) gpc2 (ENSOTSG00005008362) ENSOTSG00005008377 mcm7 (ENSOTSG00005008384) ENSOTSG00005009394 COPS6 (ENSOTSG00005009396) ENSOTSG00005009398 Rainbow trout MODERN SPECIES 5 sting1 (ENSOMYG00000011053) ENSOMYG00000011149 brd8b (ENSOMYG00000011171) ENSOMYG00000077090 ENSOMYG00000049751 ENSOMYG00000036711 ENSOMYG00000054028 ENSOMYG00000036687 #37 ENSOMYG00000064046 ENSOMYG00000056006 #37 ENSOMYG00000036676 #37 ENSOMYG00000036669 #37 ENSOMYG00000036637 #37 ENSOMYG00000036666 #37 sirpb2 (ENSOMYG00000036661) #37 ENSOMYG00000036645 #37 ENSOMYG00000036630 #37 ENSOMYG00000058518 ENSOMYG00000077548 ENSOMYG00000051413 ENSOMYG00000036606 #37 ENSOMYG00000036495 ENSOMYG00000049577 ENSOMYG00000036405 ENSOMYG00000036382 ENSOMYG00000035735 ENSOMYG00000035638 csn6 (ENSOMYG00000035631) ENSOMYG00000035619 ENSOMYG00000035613 ENSOMYG00000066660 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.d #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.c #37 Rainbow trout MODERN SPECIES 5 ENSOMYG00000011149 brd8b (ENSOMYG00000011171) ENSOMYG00000077090 ENSOMYG00000049751 ENSOMYG00000036711 ENSOMYG00000054028 ENSOMYG00000036687 #37 ENSOMYG00000064046 ENSOMYG00000056006 #37 ENSOMYG00000036676 #37 ENSOMYG00000036669 #37 ENSOMYG00000036637 #37 ENSOMYG00000036666 #37 sirpb2 (ENSOMYG00000036661) #37 ENSOMYG00000036645 #37 ENSOMYG00000036630 #37 ENSOMYG00000058518 ENSOMYG00000077548 ENSOMYG00000051413 ENSOMYG00000036606 #37 ENSOMYG00000036495 ENSOMYG00000049577 ENSOMYG00000036405 ENSOMYG00000036382 ENSOMYG00000035735 ENSOMYG00000035638 csn6 (ENSOMYG00000035631) ENSOMYG00000035619 ENSOMYG00000035613 ENSOMYG00000066660 ENSOMYG00000035603 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 326 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.d #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 Coho salmon DUPLICATION Coho salmon MODERN SPECIES 742 ENSOKIG00005042793 #37 ENSOKIG00005042781 #37 ENSOKIG00005042773 Coho salmon MODERN SPECIES 10 zgc:110843 (ENSOKIG00005011618) ube2d2 (ENSOKIG00005011544) ppp3cb (ENSOKIG00005011430) sting1 (ENSOKIG00005011411) ENSOKIG00005011402 brd8b (ENSOKIG00005011381) ENSOKIG00005011377 MFAP4 (ENSOKIG00005011371) ENSOKIG00005011367 PCDH1 (ENSOKIG00005011344) ENSOKIG00005011329 #37 ENSOKIG00005011310 ENSOKIG00005011274 #37 nitr13 (ENSOKIG00005011266) #37 ENSOKIG00005011253 #37 ENSOKIG00005011244 #37 ENSOKIG00005011238 ENSOKIG00005011227 ENSOKIG00005011219 #37 ENSOKIG00005011205 #37 rnasel3 (ENSOKIG00005011201) gpc2 (ENSOKIG00005010983) mcm7 (ENSOKIG00005010408) ENSOKIG00005010364 ENSOKIG00005010357 COPS6 (ENSOKIG00005010343) ENSOKIG00005010337 ENSOKIG00005010332 ENSOKIG00005010327 ENSOKIG00005010281 ENSOKIG00005010235 Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 13 ENSOTSG00005004483 mrpl18 (ENSOTSG00005004484) tcirg1b (ENSOTSG00005004491) prpf19 (ENSOTSG00005004574) ENSOTSG00005004769 ENSOTSG00005004814 ENSOTSG00005008307 ENSOTSG00005008308 ENSOTSG00005008311 ENSOTSG00005008312 ENSOTSG00005008315 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005008318) ENSOTSG00005008319 #37 ENSOTSG00005008325 #37 ENSOTSG00005008337 #37 ENSOTSG00005008341 #37 ENSOTSG00005008344 #37 ENSOTSG00005008347 ENSOTSG00005008357 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005008359) gpc2 (ENSOTSG00005008362) ENSOTSG00005008377 mcm7 (ENSOTSG00005008384) ENSOTSG00005009394 COPS6 (ENSOTSG00005009396) ENSOTSG00005009398 ENSOTSG00005009399 ENSOTSG00005009400 ENSOTSG00005009402 nkx3-2 (ENSOTSG00005009404) drp2 (ENSOTSG00005009406) Chinook salmon MODERN SPECIES 13 ENSOTSG00005034283 SLC16A2 (ENSOTSG00005034281) ENSOTSG00005034279 ENSOTSG00005034272 ENSOTSG00005034269 zgc:194246 (ENSOTSG00005034268) ENSOTSG00005034265 WNT8A (ENSOTSG00005034262) PCDH1 (ENSOTSG00005034257) ENSOTSG00005034255 rnasel3 (ENSOTSG00005034254) ENSOTSG00005034250 #37 ENSOTSG00005034240 #37 ENSOTSG00005034234 #37 ENSOTSG00005034228 #37 ENSOTSG00005034225 #37 ENSOTSG00005034223 #37 ENSOTSG00005034221 ENSOTSG00005034219 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005034217) gpc2 (ENSOTSG00005034170) ENSOTSG00005034167 mcm7 (ENSOTSG00005033622) ENSOTSG00005033614 COPS6 (ENSOTSG00005033613) ENSOTSG00005033611 ENSOTSG00005033610 ENSOTSG00005033607 nkx3-2 (ENSOTSG00005033605) noto (ENSOTSG00005033604) emx1 (ENSOTSG00005033603) Huchen MODERN SPECIES 1089 ENSHHUG00000029466 #37 ENSHHUG00000029472 #37 ENSHHUG00000029539 ENSHHUG00000029542 ENSHHUG00000029548 #37 ENSHHUG00000029563 #37 ENSHHUG00000029574 #37 ENSHHUG00000029577 #37 nitr13 (ENSHHUG00000029598) #37 ENSHHUG00000029604 #37 ENSHHUG00000029613 #37 ENSHHUG00000029618 ENSHHUG00000029668 gpc2 (ENSHHUG00000029675) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1109 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 Salmo ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00940000157645.f.a ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.b #37 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.a ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244824.C ENSGT00390000005067.a ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00530000067117.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000161833.b.a ENSGT00940000160449 ENSGT00940000156835.l.a.b ENSGT00940000160595.b River trout MODERN SPECIES 22 ENSSTUG00000002324 #37 ENSSTUG00000002331 #37 ENSSTUG00000002339 #37 rnasel3 (ENSSTUG00000002350) ENSSTUG00000002354 #37 ENSSTUG00000002360 #37 ENSSTUG00000002369 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002421) #37 ENSSTUG00000002435 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002440) #37 ENSSTUG00000002463 #37 ENSSTUG00000002476 #37 ENSSTUG00000002491 ENSSTUG00000002510 ENSSTUG00000002568 ENSSTUG00000002580 #37 ENSSTUG00000002632 #37 gpc2 (ENSSTUG00000002698) ENSSTUG00000002988 mcm7 (ENSSTUG00000003025) ENSSTUG00000003349 COPS6 (ENSSTUG00000003356) ENSSTUG00000003393 ENSSTUG00000003397 ENSSTUG00000003405 nkx3-2 (ENSSTUG00000003434) RAB28 (ENSSTUG00000003454) HS3ST1 (ENSSTUG00000003474) ENSSTUG00000003491 ENSSTUG00000003507 gsr (ENSSTUG00000003572) Huchen MODERN SPECIES 1089 ENSHHUG00000029466 #37 ENSHHUG00000029472 #37 ENSHHUG00000029539 ENSHHUG00000029542 ENSHHUG00000029548 #37 ENSHHUG00000029563 #37 ENSHHUG00000029574 #37 ENSHHUG00000029577 #37 nitr13 (ENSHHUG00000029598) #37 ENSHHUG00000029604 #37 ENSHHUG00000029613 #37 ENSHHUG00000029618 ENSHHUG00000029668 gpc2 (ENSHHUG00000029675) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1109 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000003354.e ENSGT00950000183073.a.a.b.f.a ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.a #37 ENSGT01010000225053 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT00940000157645.f.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00390000008582.e ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000157357.e.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.c #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.d #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 Rainbow trout MODERN SPECIES 5 ENSOMYG00000035619 csn6 (ENSOMYG00000035631) ENSOMYG00000035638 ENSOMYG00000035735 ENSOMYG00000036382 ENSOMYG00000036405 ENSOMYG00000049577 ENSOMYG00000036495 ENSOMYG00000036606 #37 ENSOMYG00000051413 ENSOMYG00000077548 ENSOMYG00000058518 ENSOMYG00000036630 #37 ENSOMYG00000036645 #37 sirpb2 (ENSOMYG00000036661) #37 ENSOMYG00000036666 #37 ENSOMYG00000036637 #37 ENSOMYG00000036669 #37 ENSOMYG00000036676 #37 ENSOMYG00000056006 #37 ENSOMYG00000064046 ENSOMYG00000036687 #37 ENSOMYG00000054028 ENSOMYG00000036711 ENSOMYG00000049751 ENSOMYG00000077090 brd8b (ENSOMYG00000011171) ENSOMYG00000011149 sting1 (ENSOMYG00000011053) ppp3cb (ENSOMYG00000055833) ube2d2 (ENSOMYG00000010994) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 Coho salmon MODERN SPECIES 742 ENSOKIG00005042773 ENSOKIG00005042781 #37 ENSOKIG00005042793 #37 Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 13 ENSOTSG00005009402 ENSOTSG00005009400 ENSOTSG00005009399 ENSOTSG00005009398 COPS6 (ENSOTSG00005009396) ENSOTSG00005009394 mcm7 (ENSOTSG00005008384) ENSOTSG00005008377 gpc2 (ENSOTSG00005008362) rnasel3 (ENSOTSG00005008359) ENSOTSG00005008357 #37 ENSOTSG00005008347 ENSOTSG00005008344 #37 ENSOTSG00005008341 #37 ENSOTSG00005008337 #37 ENSOTSG00005008325 #37 ENSOTSG00005008319 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005008318) ENSOTSG00005008315 #37 ENSOTSG00005008312 ENSOTSG00005008311 ENSOTSG00005008308 ENSOTSG00005008307 ENSOTSG00005004814 ENSOTSG00005004769 prpf19 (ENSOTSG00005004574) tcirg1b (ENSOTSG00005004491) mrpl18 (ENSOTSG00005004484) ENSOTSG00005004483 grhpra (ENSOTSG00005003001) tomm5 (ENSOTSG00005002985) Chinook salmon MODERN SPECIES 13 ENSOTSG00005033607 ENSOTSG00005033610 ENSOTSG00005033611 COPS6 (ENSOTSG00005033613) ENSOTSG00005033614 mcm7 (ENSOTSG00005033622) ENSOTSG00005034167 gpc2 (ENSOTSG00005034170) rnasel3 (ENSOTSG00005034217) ENSOTSG00005034219 #37 ENSOTSG00005034221 ENSOTSG00005034223 #37 ENSOTSG00005034225 #37 ENSOTSG00005034228 #37 ENSOTSG00005034234 #37 ENSOTSG00005034240 #37 ENSOTSG00005034250 #37 rnasel3 (ENSOTSG00005034254) ENSOTSG00005034255 PCDH1 (ENSOTSG00005034257) WNT8A (ENSOTSG00005034262) ENSOTSG00005034265 zgc:194246 (ENSOTSG00005034268) ENSOTSG00005034269 ENSOTSG00005034272 ENSOTSG00005034279 SLC16A2 (ENSOTSG00005034281) ENSOTSG00005034283 ENSOTSG00005034284 ENSOTSG00005034287 pola2 (ENSOTSG00005034293) Salmo ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.a ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT00940000157645.f.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000157357.e.b ENSGT00940000159674.s River trout MODERN SPECIES 22 ENSSTUG00000003405 ENSSTUG00000003397 ENSSTUG00000003393 COPS6 (ENSSTUG00000003356) ENSSTUG00000003349 mcm7 (ENSSTUG00000003025) ENSSTUG00000002988 gpc2 (ENSSTUG00000002698) ENSSTUG00000002632 #37 ENSSTUG00000002580 #37 ENSSTUG00000002568 ENSSTUG00000002510 ENSSTUG00000002491 ENSSTUG00000002476 #37 ENSSTUG00000002463 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002440) #37 ENSSTUG00000002435 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002421) #37 ENSSTUG00000002369 #37 ENSSTUG00000002360 #37 ENSSTUG00000002354 #37 rnasel3 (ENSSTUG00000002350) ENSSTUG00000002339 #37 ENSSTUG00000002331 #37 ENSSTUG00000002324 #37 ENSSTUG00000002318 PCDH1 (ENSSTUG00000002293) MFAP4 (ENSSTUG00000002284) brd8b (ENSSTUG00000002244) ENSSTUG00000002233 ppp3cb (ENSSTUG00000002159) Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ENSSSAG00000117028 ENSSSAG00000005838 ENSSSAG00000005824 HS3ST1 (ENSSSAG00000109723) rab28 (ENSSSAG00000005777) NKX3-2 (ENSSSAG00000091968) ENSSSAG00000104763 ENSSSAG00000005741 ENSSSAG00000005735 ENSSSAG00000005511 ENSSSAG00000005407 ENSSSAG00000003171 ENSSSAG00000002657 ENSSSAG00000002635 #37 ENSSSAG00000083945 #37 ENSSSAG00000002617 #37 ENSSSAG00000010613 #37 ENSSSAG00000002609 ENSSSAG00000002600 #37 ENSSSAG00000092040 #37 ENSSSAG00000002765 ENSSSAG00000002590 #37 ENSSSAG00000002578 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000002508 #37 ang1 (ENSSSAG00000010876) ang1 (ENSSSAG00000096267) ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000102640) ang1 (ENSSSAG00000090024) Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ENSSSAG00000005741 ENSSSAG00000005735 ENSSSAG00000005511 ENSSSAG00000005407 ENSSSAG00000003171 ENSSSAG00000002657 ENSSSAG00000002635 #37 ENSSSAG00000083945 #37 ENSSSAG00000002617 #37 ENSSSAG00000010613 #37 ENSSSAG00000002609 ENSSSAG00000002600 #37 ENSSSAG00000092040 #37 ENSSSAG00000002765 ENSSSAG00000002590 #37 ENSSSAG00000002578 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000002508 #37 ang1 (ENSSSAG00000010876) ang1 (ENSSSAG00000096267) ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000102640) ang1 (ENSSSAG00000090024) ang1 (ENSSSAG00000101055) ENSSSAG00000002505 ENSSSAG00000002464 #37 ENSSSAG00000002449 #37 ENSSSAG00000085191 ENSSSAG00000002442 ENSSSAG00000089970 #37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.b.b.b #37 Salmo ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00530000067117.a ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.b ENSGT00390000003354.f ENSGT00950000183073.a.a.b.f.b ENSGT00390000005067.a ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.b #37 ENSGT00950000182866.D.d.b.`b.a ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.a.b.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000157645.f.b ENSGT01030000234530.a.b.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.a.a.b.b.a #37 ENSGT00940000157645.f.a ENSGT00940000155521.a.a ENSGT00530000064262.pc.b.o ENSGT00530000063652.a.b.f ENSGT00940000165110.b.c.b.b ENSGT00940000153169.B.m.b ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000154108.a.c.b ENSGT00940000157357.e.b River trout MODERN SPECIES 22 COPS6 (ENSSTUG00000003356) ENSSTUG00000003349 mcm7 (ENSSTUG00000003025) ENSSTUG00000002988 gpc2 (ENSSTUG00000002698) ENSSTUG00000002632 #37 ENSSTUG00000002580 #37 ENSSTUG00000002568 ENSSTUG00000002510 ENSSTUG00000002491 ENSSTUG00000002476 #37 ENSSTUG00000002463 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002440) #37 ENSSTUG00000002435 #37 nitr13 (ENSSTUG00000002421) #37 ENSSTUG00000002369 #37 ENSSTUG00000002360 #37 ENSSTUG00000002354 #37 rnasel3 (ENSSTUG00000002350) ENSSTUG00000002339 #37 ENSSTUG00000002331 #37 ENSSTUG00000002324 #37 ENSSTUG00000002318 PCDH1 (ENSSTUG00000002293) MFAP4 (ENSSTUG00000002284) brd8b (ENSSTUG00000002244) ENSSTUG00000002233 ppp3cb (ENSSTUG00000002159) ube2d2 (ENSSTUG00000002138) zgc:110843 (ENSSTUG00000002128) ENSSTUG00000002122 Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ENSSSAG00000104763 ENSSSAG00000005741 ENSSSAG00000005735 ENSSSAG00000005511 ENSSSAG00000005407 ENSSSAG00000003171 ENSSSAG00000002657 ENSSSAG00000002635 #37 ENSSSAG00000083945 #37 ENSSSAG00000002617 #37 ENSSSAG00000010613 #37 ENSSSAG00000002609 ENSSSAG00000002600 #37 ENSSSAG00000092040 #37 ENSSSAG00000002765 ENSSSAG00000002590 #37 ENSSSAG00000002578 #37 ENSSSAG00000092852 #37 ENSSSAG00000002523 #37 ENSSSAG00000002508 #37 ang1 (ENSSSAG00000010876) ang1 (ENSSSAG00000096267) ENSSSAG00000089603 ang1 (ENSSSAG00000102640) ang1 (ENSSSAG00000090024) ang1 (ENSSSAG00000101055) ENSSSAG00000002505 ENSSSAG00000002464 #37 ENSSSAG00000002449 #37 ENSSSAG00000085191 ENSSSAG00000002442 Huchen MODERN SPECIES 1089 gpc2 (ENSHHUG00000029675) ENSHHUG00000029668 ENSHHUG00000029618 ENSHHUG00000029613 #37 ENSHHUG00000029604 #37 nitr13 (ENSHHUG00000029598) #37 ENSHHUG00000029577 #37 ENSHHUG00000029574 #37 ENSHHUG00000029563 #37 ENSHHUG00000029548 #37 ENSHHUG00000029542 ENSHHUG00000029539 ENSHHUG00000029472 #37 ENSHHUG00000029466 #37 Otomorpha DUPLICATION Otomorpha DUPLICATION Otomorpha DUPLICATION Otomorpha DUPLICATION Otomorpha DUPLICATION Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a #37 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a #37 Atlantic herring MODERN SPECIES 9 ENSCHAG00000004527 tex261 (ENSCHAG00000004592) ENSCHAG00000004665 ENSCHAG00000004676 f13a1b (ENSCHAG00000004689) ENSCHAG00000004830 sec24d (ENSCHAG00000004959) ENSCHAG00000008323 myoz2a (ENSCHAG00000008335) USP53 (ENSCHAG00000008350) frem1a (ENSCHAG00000008421) ENSCHAG00000008727 tspan5a (ENSCHAG00000010440) RAP1GDS1 (ENSCHAG00000010733) ENSCHAG00000010891 nitr2a (ENSCHAG00000010911) #37 ENSCHAG00000011292 ENSCHAG00000011301 ENSCHAG00000011307 ENSCHAG00000011327 ENSCHAG00000011343 ENSCHAG00000011359 ENSCHAG00000011373 ENSCHAG00000011387 ENSCHAG00000011403 ENSCHAG00000011426 ENSCHAG00000011449 ENSCHAG00000011461 ENSCHAG00000011483 ENSCHAG00000011501 pde5ab (ENSCHAG00000011553) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 471 ENSGT00950000182968.d.b.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a #37 Cyprinoidei DUPLICATION Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 211 ENSGT00920000150729.B ENSGT00920000150729.A ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a ##30 ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT01030000235316 ENSGT00940000162676.a.a.k.b ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a #37 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae DUPLICATION Cyprininae DUPLICATION Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 890 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.a.k.b.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.a #37 Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 47 ENSCARG00000001146 ENSCARG00000001147 ENSCARG00000001151 KCNJ10 (ENSCARG00000001159) pnp5a (ENSCARG00000001162) ENSCARG00000001164 dusp19b (ENSCARG00000001167) capn1 (ENSCARG00000001183) sf3b2 (ENSCARG00000001328) nitr8 (ENSCARG00000001601) ##30 nitr3a (ENSCARG00000001611) ENSCARG00000001630 #37 ENSCARG00000001633 #37 ENSCARG00000001635 #37 ENSCARG00000001641 ENSCARG00000001645 #37 ENSCARG00000001648 #37 nitr5 (ENSCARG00000001654) #37 nitr5 (ENSCARG00000001658) #37 ENSCARG00000001665 ENSCARG00000001670 ENSCARG00000001672 map4k2 (ENSCARG00000001749) men1 (ENSCARG00000002588) ENSCARG00000002596 ENSCARG00000002609 ecsit (ENSCARG00000002618) EML3 (ENSCARG00000002929) mta2 (ENSCARG00000010491) cth1 (ENSCARG00000010580) taf6l (ENSCARG00000010594) Goldfish MODERN SPECIES 47 ENSCARG00000001147 ENSCARG00000001151 KCNJ10 (ENSCARG00000001159) pnp5a (ENSCARG00000001162) ENSCARG00000001164 dusp19b (ENSCARG00000001167) capn1 (ENSCARG00000001183) sf3b2 (ENSCARG00000001328) nitr8 (ENSCARG00000001601) ##30 nitr3a (ENSCARG00000001611) ENSCARG00000001630 #37 ENSCARG00000001633 #37 ENSCARG00000001635 #37 ENSCARG00000001641 ENSCARG00000001645 #37 ENSCARG00000001648 #37 nitr5 (ENSCARG00000001654) #37 nitr5 (ENSCARG00000001658) #37 ENSCARG00000001665 ENSCARG00000001670 ENSCARG00000001672 map4k2 (ENSCARG00000001749) men1 (ENSCARG00000002588) ENSCARG00000002596 ENSCARG00000002609 ecsit (ENSCARG00000002618) EML3 (ENSCARG00000002929) mta2 (ENSCARG00000010491) cth1 (ENSCARG00000010580) taf6l (ENSCARG00000010594) rab1ba (ENSCARG00000010671) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 687 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.a.k.b.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.a #37 Common carp reference MODERN SPECIES ENSCCRG00000055324 ENSCCRG00000071278 ENSCCRG00000013007 ENSCCRG00000067517 ENSCCRG00000013002 ENSCCRG00000012993 nitr9 (ENSCCRG00000012989) #37 ENSCCRG00000066823 ##30 ENSCCRG00000070449 ##30 nitr3a (ENSCCRG00000043872) nitr3a (ENSCCRG00000051634) ENSCCRG00000022836 #37 ENSCCRG00000023206 #37 ENSCCRG00000045565 #37 ENSCCRG00000033802 ENSCCRG00000009451 #37 ENSCCRG00000009453 #37 nitr5 (ENSCCRG00000009446) #37 nitr5 (ENSCCRG00000026962) #37 ENSCCRG00000069657 ENSCCRG00000003433 ENSCCRG00000029411 men1 (ENSCCRG00000005649) ENSCCRG00000069097 ecsit (ENSCCRG00000029397) ENSCCRG00000027689 mta2 (ENSCCRG00000041877) cth1 (ENSCCRG00000045834) taf6l (ENSCCRG00000045842) ENSCCRG00000016405 ENSCCRG00000017370 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 890 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.a.k.b.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.a #37 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 687 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.a.k.b.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.a #37 Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES htatip2 (ENSCCRG00000061029) prmt3 (ENSCCRG00000000806) slc6a5 (ENSCCRG00000078373) ENSCCRG00000055324 ENSCCRG00000071278 ENSCCRG00000013007 ENSCCRG00000067517 ENSCCRG00000013002 ENSCCRG00000012993 nitr9 (ENSCCRG00000012989) #37 ENSCCRG00000066823 ##30 ENSCCRG00000070449 ##30 nitr3a (ENSCCRG00000043872) nitr3a (ENSCCRG00000051634) ENSCCRG00000022836 #37 ENSCCRG00000023206 #37 ENSCCRG00000045565 #37 ENSCCRG00000033802 ENSCCRG00000009451 #37 ENSCCRG00000009453 #37 nitr5 (ENSCCRG00000009446) #37 nitr5 (ENSCCRG00000026962) #37 ENSCCRG00000069657 ENSCCRG00000003433 ENSCCRG00000029411 men1 (ENSCCRG00000005649) ENSCCRG00000069097 ecsit (ENSCCRG00000029397) ENSCCRG00000027689 mta2 (ENSCCRG00000041877) cth1 (ENSCCRG00000045834) Common carp reference MODERN SPECIES ENSCCRG00000071278 ENSCCRG00000013007 ENSCCRG00000067517 ENSCCRG00000013002 ENSCCRG00000012993 nitr9 (ENSCCRG00000012989) #37 ENSCCRG00000066823 ##30 ENSCCRG00000070449 ##30 nitr3a (ENSCCRG00000043872) nitr3a (ENSCCRG00000051634) ENSCCRG00000022836 #37 ENSCCRG00000023206 #37 ENSCCRG00000045565 #37 ENSCCRG00000033802 ENSCCRG00000009451 #37 ENSCCRG00000009453 #37 nitr5 (ENSCCRG00000009446) #37 nitr5 (ENSCCRG00000026962) #37 ENSCCRG00000069657 ENSCCRG00000003433 ENSCCRG00000029411 men1 (ENSCCRG00000005649) ENSCCRG00000069097 ecsit (ENSCCRG00000029397) ENSCCRG00000027689 mta2 (ENSCCRG00000041877) cth1 (ENSCCRG00000045834) taf6l (ENSCCRG00000045842) ENSCCRG00000016405 ENSCCRG00000017370 rab1ba (ENSCCRG00000065291) Goldfish MODERN SPECIES 47 ENSCARG00000001135 ENSCARG00000001141 ENSCARG00000001143 ENSCARG00000001146 ENSCARG00000001147 ENSCARG00000001151 KCNJ10 (ENSCARG00000001159) pnp5a (ENSCARG00000001162) ENSCARG00000001164 dusp19b (ENSCARG00000001167) capn1 (ENSCARG00000001183) sf3b2 (ENSCARG00000001328) nitr8 (ENSCARG00000001601) ##30 nitr3a (ENSCARG00000001611) ENSCARG00000001630 #37 ENSCARG00000001633 #37 ENSCARG00000001635 #37 ENSCARG00000001641 ENSCARG00000001645 #37 ENSCARG00000001648 #37 nitr5 (ENSCARG00000001654) #37 nitr5 (ENSCARG00000001658) #37 ENSCARG00000001665 ENSCARG00000001670 ENSCARG00000001672 map4k2 (ENSCARG00000001749) men1 (ENSCARG00000002588) ENSCARG00000002596 ENSCARG00000002609 ecsit (ENSCARG00000002618) EML3 (ENSCARG00000002929) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 890 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.a.k.b.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.a #37 Goldfish MODERN SPECIES 47 ENSCARG00000001127 ENSCARG00000001135 ENSCARG00000001141 ENSCARG00000001143 ENSCARG00000001146 ENSCARG00000001147 ENSCARG00000001151 KCNJ10 (ENSCARG00000001159) pnp5a (ENSCARG00000001162) ENSCARG00000001164 dusp19b (ENSCARG00000001167) capn1 (ENSCARG00000001183) sf3b2 (ENSCARG00000001328) nitr8 (ENSCARG00000001601) ##30 nitr3a (ENSCARG00000001611) ENSCARG00000001630 #37 ENSCARG00000001633 #37 ENSCARG00000001635 #37 ENSCARG00000001641 ENSCARG00000001645 #37 ENSCARG00000001648 #37 nitr5 (ENSCARG00000001654) #37 nitr5 (ENSCARG00000001658) #37 ENSCARG00000001665 ENSCARG00000001670 ENSCARG00000001672 map4k2 (ENSCARG00000001749) men1 (ENSCARG00000002588) ENSCARG00000002596 ENSCARG00000002609 ecsit (ENSCARG00000002618) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 687 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.a.k.b.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.a #37 Common carp reference MODERN SPECIES dbx1a (ENSCCRG00000079124) htatip2 (ENSCCRG00000061029) prmt3 (ENSCCRG00000000806) slc6a5 (ENSCCRG00000078373) ENSCCRG00000055324 ENSCCRG00000071278 ENSCCRG00000013007 ENSCCRG00000067517 ENSCCRG00000013002 ENSCCRG00000012993 nitr9 (ENSCCRG00000012989) #37 ENSCCRG00000066823 ##30 ENSCCRG00000070449 ##30 nitr3a (ENSCCRG00000043872) nitr3a (ENSCCRG00000051634) ENSCCRG00000022836 #37 ENSCCRG00000023206 #37 ENSCCRG00000045565 #37 ENSCCRG00000033802 ENSCCRG00000009451 #37 ENSCCRG00000009453 #37 nitr5 (ENSCCRG00000009446) #37 nitr5 (ENSCCRG00000026962) #37 ENSCCRG00000069657 ENSCCRG00000003433 ENSCCRG00000029411 men1 (ENSCCRG00000005649) ENSCCRG00000069097 ecsit (ENSCCRG00000029397) ENSCCRG00000027689 mta2 (ENSCCRG00000041877) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 370 ENSGT00940000162676.a.a.l ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT01030000235316.a ENSGT01030000235316.b.a ENSGT00940000162676.a.a.k.b.b ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT00940000166658.b.d ENSGT00390000014237.c ENSGT00940000157482.e.a ENSGT00600000084617.a.b ENSGT00390000005147.a ENSGT00940000159589.b ENSGT01030000234573.B.c.b.b.h ENSGT00940000166499.b Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 1295 nitr3b (ENSCARG00000051661) ENSCARG00000051639 #37 ENSCARG00000051627 #37 ENSCARG00000051602 #37 ENSCARG00000051552 #37 ENSCARG00000051537 ENSCARG00000051522 #37 nitr5 (ENSCARG00000051460) #37 Goldfish MODERN SPECIES 25 slc6a5 (ENSCARG00000008298) ENSCARG00000008279 ENSCARG00000008271 ENSCARG00000008266 ENSCARG00000008257 nitr8 (ENSCARG00000008243) ##30 ENSCARG00000008234 nitr9 (ENSCARG00000008220) #37 nitr8 (ENSCARG00000008185) ##30 ENSCARG00000008168 ENSCARG00000008157 nitr3a (ENSCARG00000008138) nitr3a (ENSCARG00000008121) nitr3b (ENSCARG00000008114) nitr3b (ENSCARG00000008087) ENSCARG00000008072 #37 ENSCARG00000008066 #37 ENSCARG00000008044 #37 ENSCARG00000008036 #37 nitr5 (ENSCARG00000008024) #37 ENSCARG00000008018 #37 nitr4a (ENSCARG00000007995) #37 ENSCARG00000007984 #37 ADISSP (ENSCARG00000007971) ENSCARG00000007960 PCSK6 (ENSCARG00000006373) snrpa1 (ENSCARG00000005870) selenos (ENSCARG00000005841) chsy1 (ENSCARG00000039813) LRRK1 (ENSCARG00000039479) aldh1a3 (ENSCARG00000036263) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 686 ENSGT01030000235316.b.a ENSGT00940000162676.a.a.k.b.b ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a.a #37 ENSGT01030000235316.b.b Common carp reference MODERN SPECIES 6 prmt3 (ENSCCRG00000047050) slc6a5 (ENSCCRG00000012923) ENSCCRG00000028084 ENSCCRG00000028079 ENSCCRG00000058044 ENSCCRG00000066730 ENSCCRG00000074683 ENSCCRG00000026616 ENSCCRG00000044706 ENSCCRG00000043853 #37 nitr8 (ENSCCRG00000043858) ##30 ENSCCRG00000043869 ENSCCRG00000060153 nitr3a (ENSCCRG00000051636) nitr3b (ENSCCRG00000036870) ENSCCRG00000043893 #37 ENSCCRG00000009450 #37 ENSCCRG00000047828 #37 ENSCCRG00000014123 ENSCCRG00000045558 #37 ENSCCRG00000014129 #37 nitr5 (ENSCCRG00000081378) #37 nitr5 (ENSCCRG00000026995) #37 ENSCCRG00000026999 #37 nitr4a (ENSCCRG00000027007) #37 ENSCCRG00000077430 #37 nitr6a (ENSCCRG00000027020) ##30 map4k2 (ENSCCRG00000027092) men1 (ENSCCRG00000030597) ENSCCRG00000073273 ENSCCRG00000079668 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 370 ENSGT00940000162676.a.a.l ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT01030000235316.a ENSGT01030000235316.b.a ENSGT00940000162676.a.a.k.b.b ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT00940000166658.b.d ENSGT00390000014237.c ENSGT00940000157482.e.a ENSGT00600000084617.a.b ENSGT00390000005147.a ENSGT00940000159589.b ENSGT01030000234573.B.c.b.b.h ENSGT00940000166499.b ENSGT00640000091486.a.j Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 686 ENSGT01030000235316.b.a ENSGT00940000162676.a.a.k.b.b ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a.a #37 ENSGT01030000235316.b.b Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 340 commd7 (ENSSGRG00000040690) ENSSGRG00000040701 zdhhc13 (ENSSGRG00000040702) csrp3 (ENSSGRG00000040715) e2f8 (ENSSGRG00000040718) NAV2 (ENSSGRG00000040720) dbx1a (ENSSGRG00000040722) prmt3 (ENSSGRG00000040723) slc6a5 (ENSSGRG00000040833) ENSSGRG00000040874 nitr9 (ENSSGRG00000040884) #37 nitr8 (ENSSGRG00000040886) ##30 ENSSGRG00000040887 ENSSGRG00000040888 nitr3b (ENSSGRG00000040889) ENSSGRG00000040893 #37 ENSSGRG00000040896 #37 ENSSGRG00000040970 #37 ENSSGRG00000040973 #37 ENSSGRG00000040976 ENSSGRG00000040977 #37 ENSSGRG00000040978 #37 nitr5 (ENSSGRG00000040992) #37 nitr5 (ENSSGRG00000041000) #37 ENSSGRG00000041003 #37 nitr4a (ENSSGRG00000041101) #37 Golden-line barbel MODERN SPECIES 340 NAV2 (ENSSGRG00000040720) dbx1a (ENSSGRG00000040722) prmt3 (ENSSGRG00000040723) slc6a5 (ENSSGRG00000040833) ENSSGRG00000040874 nitr9 (ENSSGRG00000040884) #37 nitr8 (ENSSGRG00000040886) ##30 ENSSGRG00000040887 ENSSGRG00000040888 nitr3b (ENSSGRG00000040889) ENSSGRG00000040893 #37 ENSSGRG00000040896 #37 ENSSGRG00000040970 #37 ENSSGRG00000040973 #37 ENSSGRG00000040976 ENSSGRG00000040977 #37 ENSSGRG00000040978 #37 nitr5 (ENSSGRG00000040992) #37 nitr5 (ENSSGRG00000041000) #37 ENSSGRG00000041003 #37 nitr4a (ENSSGRG00000041101) #37 Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 6 slc6a5 (ENSCCRG00000012923) ENSCCRG00000028084 ENSCCRG00000028079 ENSCCRG00000058044 ENSCCRG00000066730 ENSCCRG00000074683 ENSCCRG00000026616 ENSCCRG00000044706 ENSCCRG00000043853 #37 nitr8 (ENSCCRG00000043858) ##30 ENSCCRG00000043869 ENSCCRG00000060153 nitr3a (ENSCCRG00000051636) nitr3b (ENSCCRG00000036870) ENSCCRG00000043893 #37 ENSCCRG00000009450 #37 ENSCCRG00000047828 #37 ENSCCRG00000014123 ENSCCRG00000045558 #37 ENSCCRG00000014129 #37 nitr5 (ENSCCRG00000081378) #37 nitr5 (ENSCCRG00000026995) #37 ENSCCRG00000026999 #37 nitr4a (ENSCCRG00000027007) #37 ENSCCRG00000077430 #37 nitr6a (ENSCCRG00000027020) ##30 map4k2 (ENSCCRG00000027092) men1 (ENSCCRG00000030597) ENSCCRG00000073273 ENSCCRG00000079668 ecsit (ENSCCRG00000030615) Common carp reference MODERN SPECIES 6 ENSCCRG00000058044 ENSCCRG00000066730 ENSCCRG00000074683 ENSCCRG00000026616 ENSCCRG00000044706 ENSCCRG00000043853 #37 nitr8 (ENSCCRG00000043858) ##30 ENSCCRG00000043869 ENSCCRG00000060153 nitr3a (ENSCCRG00000051636) nitr3b (ENSCCRG00000036870) ENSCCRG00000043893 #37 ENSCCRG00000009450 #37 ENSCCRG00000047828 #37 ENSCCRG00000014123 ENSCCRG00000045558 #37 ENSCCRG00000014129 #37 nitr5 (ENSCCRG00000081378) #37 nitr5 (ENSCCRG00000026995) #37 ENSCCRG00000026999 #37 nitr4a (ENSCCRG00000027007) #37 ENSCCRG00000077430 #37 nitr6a (ENSCCRG00000027020) ##30 map4k2 (ENSCCRG00000027092) men1 (ENSCCRG00000030597) ENSCCRG00000073273 ENSCCRG00000079668 ecsit (ENSCCRG00000030615) ENSCCRG00000030751 mta2 (ENSCCRG00000070119) taf6l (ENSCCRG00000079995) Goldfish DUPLICATION Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 1295 nitr3b (ENSCARG00000051661) ENSCARG00000051639 #37 ENSCARG00000051627 #37 ENSCARG00000051602 #37 ENSCARG00000051552 #37 ENSCARG00000051537 ENSCARG00000051522 #37 nitr5 (ENSCARG00000051460) #37 Goldfish MODERN SPECIES 25 ENSCARG00000008279 ENSCARG00000008271 ENSCARG00000008266 ENSCARG00000008257 nitr8 (ENSCARG00000008243) ##30 ENSCARG00000008234 nitr9 (ENSCARG00000008220) #37 nitr8 (ENSCARG00000008185) ##30 ENSCARG00000008168 ENSCARG00000008157 nitr3a (ENSCARG00000008138) nitr3a (ENSCARG00000008121) nitr3b (ENSCARG00000008114) nitr3b (ENSCARG00000008087) ENSCARG00000008072 #37 ENSCARG00000008066 #37 ENSCARG00000008044 #37 ENSCARG00000008036 #37 nitr5 (ENSCARG00000008024) #37 ENSCARG00000008018 #37 nitr4a (ENSCARG00000007995) #37 ENSCARG00000007984 #37 ADISSP (ENSCARG00000007971) ENSCARG00000007960 PCSK6 (ENSCARG00000006373) snrpa1 (ENSCARG00000005870) selenos (ENSCARG00000005841) chsy1 (ENSCARG00000039813) LRRK1 (ENSCARG00000039479) aldh1a3 (ENSCARG00000036263) asb7 (ENSCARG00000036155) Goldfish MODERN SPECIES 1295 nitr3b (ENSCARG00000051661) ENSCARG00000051639 #37 ENSCARG00000051627 #37 ENSCARG00000051602 #37 ENSCARG00000051552 #37 ENSCARG00000051537 ENSCARG00000051522 #37 nitr5 (ENSCARG00000051460) #37 Zebrafish DUPLICATION Zebrafish MODERN SPECIES 22 slc6a5 (ENSDARG00000067964) nitr12 (ENSDARG00000098626) nitr9 (ENSDARG00000028333) #37 ENSDARG00000099748 ENSDARG00000103653 ENSDARG00000087920 nitr11a (ENSDARG00000100389) nitr8 (ENSDARG00000036748) ##30 ENSDARG00000103252 ENSDARG00000103866 nitr7a (ENSDARG00000036743) nitr7b (ENSDARG00000067977) nitr3a (ENSDARG00000077998) nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 ENSDARG00000112323 nitr1b (ENSDARG00000115144) #37 ENSDARG00000112065 #37 nitr1f (ENSDARG00000079517) #37 nitr1i (ENSDARG00000033963) #37 nitr1k (ENSDARG00000110393) #37 ENSDARG00000117125 #37 nitr1m (ENSDARG00000087631) #37 nitr1o (ENSDARG00000069773) #37 nitr5 (ENSDARG00000077557) #37 nitr4a (ENSDARG00000075288) #37 ENSDARG00000111430 ##30 ENSDARG00000110751 ##30 nitr6a (ENSDARG00000076846) ##30 Zebrafish MODERN SPECIES 22 prmt3 (ENSDARG00000019791) slc6a5 (ENSDARG00000067964) nitr12 (ENSDARG00000098626) nitr9 (ENSDARG00000028333) #37 ENSDARG00000099748 ENSDARG00000103653 ENSDARG00000087920 nitr11a (ENSDARG00000100389) nitr8 (ENSDARG00000036748) ##30 ENSDARG00000103252 ENSDARG00000103866 nitr7a (ENSDARG00000036743) nitr7b (ENSDARG00000067977) nitr3a (ENSDARG00000077998) nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 ENSDARG00000112323 nitr1b (ENSDARG00000115144) #37 ENSDARG00000112065 #37 nitr1f (ENSDARG00000079517) #37 nitr1i (ENSDARG00000033963) #37 nitr1k (ENSDARG00000110393) #37 ENSDARG00000117125 #37 nitr1m (ENSDARG00000087631) #37 nitr1o (ENSDARG00000069773) #37 nitr5 (ENSDARG00000077557) #37 nitr4a (ENSDARG00000075288) #37 ENSDARG00000111430 ##30 ENSDARG00000110751 ##30 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 211 ENSGT00920000150729.B ENSGT00920000150729.A ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a ##30 ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT01030000235316 ENSGT00940000162676.a.a.k.b ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a #37 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 370 ENSGT00940000162676.a.a.l ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT01030000235316.a ENSGT01030000235316.b.a ENSGT00940000162676.a.a.k.b.b ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT00940000166658.b.d ENSGT00390000014237.c ENSGT00940000157482.e.a ENSGT00600000084617.a.b ENSGT00390000005147.a ENSGT00940000159589.b ENSGT01030000234573.B.c.b.b.h ENSGT00940000166499.b ENSGT00640000091486.a.j ENSGT00940000155293.b Cyprininae_a DUPLICATION Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 686 ENSGT01030000235316.b.a ENSGT00940000162676.a.a.k.b.b ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a.a #37 ENSGT01030000235316.b.b Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 340 ENSSGRG00000040701 zdhhc13 (ENSSGRG00000040702) csrp3 (ENSSGRG00000040715) e2f8 (ENSSGRG00000040718) NAV2 (ENSSGRG00000040720) dbx1a (ENSSGRG00000040722) prmt3 (ENSSGRG00000040723) slc6a5 (ENSSGRG00000040833) ENSSGRG00000040874 nitr9 (ENSSGRG00000040884) #37 nitr8 (ENSSGRG00000040886) ##30 ENSSGRG00000040887 ENSSGRG00000040888 nitr3b (ENSSGRG00000040889) ENSSGRG00000040893 #37 ENSSGRG00000040896 #37 ENSSGRG00000040970 #37 ENSSGRG00000040973 #37 ENSSGRG00000040976 ENSSGRG00000040977 #37 ENSSGRG00000040978 #37 nitr5 (ENSSGRG00000040992) #37 nitr5 (ENSSGRG00000041000) #37 ENSSGRG00000041003 #37 nitr4a (ENSSGRG00000041101) #37 Golden-line barbel MODERN SPECIES 340 zdhhc13 (ENSSGRG00000040702) csrp3 (ENSSGRG00000040715) e2f8 (ENSSGRG00000040718) NAV2 (ENSSGRG00000040720) dbx1a (ENSSGRG00000040722) prmt3 (ENSSGRG00000040723) slc6a5 (ENSSGRG00000040833) ENSSGRG00000040874 nitr9 (ENSSGRG00000040884) #37 nitr8 (ENSSGRG00000040886) ##30 ENSSGRG00000040887 ENSSGRG00000040888 nitr3b (ENSSGRG00000040889) ENSSGRG00000040893 #37 ENSSGRG00000040896 #37 ENSSGRG00000040970 #37 ENSSGRG00000040973 #37 ENSSGRG00000040976 ENSSGRG00000040977 #37 ENSSGRG00000040978 #37 nitr5 (ENSSGRG00000040992) #37 nitr5 (ENSSGRG00000041000) #37 ENSSGRG00000041003 #37 nitr4a (ENSSGRG00000041101) #37 Golden-line barbel MODERN SPECIES 340 csrp3 (ENSSGRG00000040715) e2f8 (ENSSGRG00000040718) NAV2 (ENSSGRG00000040720) dbx1a (ENSSGRG00000040722) prmt3 (ENSSGRG00000040723) slc6a5 (ENSSGRG00000040833) ENSSGRG00000040874 nitr9 (ENSSGRG00000040884) #37 nitr8 (ENSSGRG00000040886) ##30 ENSSGRG00000040887 ENSSGRG00000040888 nitr3b (ENSSGRG00000040889) ENSSGRG00000040893 #37 ENSSGRG00000040896 #37 ENSSGRG00000040970 #37 ENSSGRG00000040973 #37 ENSSGRG00000040976 ENSSGRG00000040977 #37 ENSSGRG00000040978 #37 nitr5 (ENSSGRG00000040992) #37 nitr5 (ENSSGRG00000041000) #37 ENSSGRG00000041003 #37 nitr4a (ENSSGRG00000041101) #37 Common carp reference MODERN SPECIES 6 ENSCCRG00000028084 ENSCCRG00000028079 ENSCCRG00000058044 ENSCCRG00000066730 ENSCCRG00000074683 ENSCCRG00000026616 ENSCCRG00000044706 ENSCCRG00000043853 #37 nitr8 (ENSCCRG00000043858) ##30 ENSCCRG00000043869 ENSCCRG00000060153 nitr3a (ENSCCRG00000051636) nitr3b (ENSCCRG00000036870) ENSCCRG00000043893 #37 ENSCCRG00000009450 #37 ENSCCRG00000047828 #37 ENSCCRG00000014123 ENSCCRG00000045558 #37 ENSCCRG00000014129 #37 nitr5 (ENSCCRG00000081378) #37 nitr5 (ENSCCRG00000026995) #37 ENSCCRG00000026999 #37 nitr4a (ENSCCRG00000027007) #37 ENSCCRG00000077430 #37 nitr6a (ENSCCRG00000027020) ##30 map4k2 (ENSCCRG00000027092) men1 (ENSCCRG00000030597) ENSCCRG00000073273 ENSCCRG00000079668 ecsit (ENSCCRG00000030615) ENSCCRG00000030751 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00940000159533.o ENSGT00940000158651.c ENSGT00940000155663.f.b.c ENSGT00950000183093.B.a.b.d.b ENSGT00950000183093.B.a.b.d.a.a ENSGT00390000008184.a ENSGT00940000156825.h ENSGT00940000154963.f ENSGT00920000150729.A.a ENSGT00940000162676.b.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.a.l ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT01030000235316.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT00940000166658.b.d ENSGT00390000014237.c ENSGT00940000157482.e.a ENSGT00600000084617.a.b Golden-line barbel MODERN SPECIES 340 dbx1a (ENSSGRG00000040722) prmt3 (ENSSGRG00000040723) slc6a5 (ENSSGRG00000040833) ENSSGRG00000040874 nitr9 (ENSSGRG00000040884) #37 nitr8 (ENSSGRG00000040886) ##30 ENSSGRG00000040887 ENSSGRG00000040888 nitr3b (ENSSGRG00000040889) ENSSGRG00000040893 #37 ENSSGRG00000040896 #37 ENSSGRG00000040970 #37 ENSSGRG00000040973 #37 ENSSGRG00000040976 ENSSGRG00000040977 #37 ENSSGRG00000040978 #37 nitr5 (ENSSGRG00000040992) #37 nitr5 (ENSSGRG00000041000) #37 ENSSGRG00000041003 #37 nitr4a (ENSSGRG00000041101) #37 Common carp reference MODERN SPECIES 6 ENSCCRG00000066730 ENSCCRG00000074683 ENSCCRG00000026616 ENSCCRG00000044706 ENSCCRG00000043853 #37 nitr8 (ENSCCRG00000043858) ##30 ENSCCRG00000043869 ENSCCRG00000060153 nitr3a (ENSCCRG00000051636) nitr3b (ENSCCRG00000036870) ENSCCRG00000043893 #37 ENSCCRG00000009450 #37 ENSCCRG00000047828 #37 ENSCCRG00000014123 ENSCCRG00000045558 #37 ENSCCRG00000014129 #37 nitr5 (ENSCCRG00000081378) #37 nitr5 (ENSCCRG00000026995) #37 ENSCCRG00000026999 #37 nitr4a (ENSCCRG00000027007) #37 ENSCCRG00000077430 #37 nitr6a (ENSCCRG00000027020) ##30 map4k2 (ENSCCRG00000027092) men1 (ENSCCRG00000030597) ENSCCRG00000073273 ENSCCRG00000079668 ecsit (ENSCCRG00000030615) ENSCCRG00000030751 mta2 (ENSCCRG00000070119) taf6l (ENSCCRG00000079995) ENSCCRG00000012014 Goldfish DUPLICATION Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 25 ENSCARG00000008266 ENSCARG00000008257 nitr8 (ENSCARG00000008243) ##30 ENSCARG00000008234 nitr9 (ENSCARG00000008220) #37 nitr8 (ENSCARG00000008185) ##30 ENSCARG00000008168 ENSCARG00000008157 nitr3a (ENSCARG00000008138) nitr3a (ENSCARG00000008121) nitr3b (ENSCARG00000008114) nitr3b (ENSCARG00000008087) ENSCARG00000008072 #37 ENSCARG00000008066 #37 ENSCARG00000008044 #37 ENSCARG00000008036 #37 nitr5 (ENSCARG00000008024) #37 ENSCARG00000008018 #37 nitr4a (ENSCARG00000007995) #37 ENSCARG00000007984 #37 ADISSP (ENSCARG00000007971) ENSCARG00000007960 PCSK6 (ENSCARG00000006373) snrpa1 (ENSCARG00000005870) selenos (ENSCARG00000005841) chsy1 (ENSCARG00000039813) LRRK1 (ENSCARG00000039479) aldh1a3 (ENSCARG00000036263) asb7 (ENSCARG00000036155) ADAMTS17 (ENSCARG00000035908) MINAR1 (ENSCARG00000035854) Goldfish MODERN SPECIES 1295 nitr3b (ENSCARG00000051661) ENSCARG00000051639 #37 ENSCARG00000051627 #37 ENSCARG00000051602 #37 ENSCARG00000051552 #37 ENSCARG00000051537 ENSCARG00000051522 #37 nitr5 (ENSCARG00000051460) #37 Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 1295 nitr3b (ENSCARG00000051661) ENSCARG00000051639 #37 ENSCARG00000051627 #37 ENSCARG00000051602 #37 ENSCARG00000051552 #37 ENSCARG00000051537 ENSCARG00000051522 #37 nitr5 (ENSCARG00000051460) #37 Goldfish MODERN SPECIES 25 ENSCARG00000008271 ENSCARG00000008266 ENSCARG00000008257 nitr8 (ENSCARG00000008243) ##30 ENSCARG00000008234 nitr9 (ENSCARG00000008220) #37 nitr8 (ENSCARG00000008185) ##30 ENSCARG00000008168 ENSCARG00000008157 nitr3a (ENSCARG00000008138) nitr3a (ENSCARG00000008121) nitr3b (ENSCARG00000008114) nitr3b (ENSCARG00000008087) ENSCARG00000008072 #37 ENSCARG00000008066 #37 ENSCARG00000008044 #37 ENSCARG00000008036 #37 nitr5 (ENSCARG00000008024) #37 ENSCARG00000008018 #37 nitr4a (ENSCARG00000007995) #37 ENSCARG00000007984 #37 ADISSP (ENSCARG00000007971) ENSCARG00000007960 PCSK6 (ENSCARG00000006373) snrpa1 (ENSCARG00000005870) selenos (ENSCARG00000005841) chsy1 (ENSCARG00000039813) LRRK1 (ENSCARG00000039479) aldh1a3 (ENSCARG00000036263) asb7 (ENSCARG00000036155) ADAMTS17 (ENSCARG00000035908) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 890 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.a.k.b.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.a #37 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 687 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.a.k.b.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.b #37 ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.a.a.a #37 Common carp reference MODERN SPECIES prmt3 (ENSCCRG00000000806) slc6a5 (ENSCCRG00000078373) ENSCCRG00000055324 ENSCCRG00000071278 ENSCCRG00000013007 ENSCCRG00000067517 ENSCCRG00000013002 ENSCCRG00000012993 nitr9 (ENSCCRG00000012989) #37 ENSCCRG00000066823 ##30 ENSCCRG00000070449 ##30 nitr3a (ENSCCRG00000043872) nitr3a (ENSCCRG00000051634) ENSCCRG00000022836 #37 ENSCCRG00000023206 #37 ENSCCRG00000045565 #37 ENSCCRG00000033802 ENSCCRG00000009451 #37 ENSCCRG00000009453 #37 nitr5 (ENSCCRG00000009446) #37 nitr5 (ENSCCRG00000026962) #37 ENSCCRG00000069657 ENSCCRG00000003433 ENSCCRG00000029411 men1 (ENSCCRG00000005649) ENSCCRG00000069097 ecsit (ENSCCRG00000029397) ENSCCRG00000027689 mta2 (ENSCCRG00000041877) cth1 (ENSCCRG00000045834) taf6l (ENSCCRG00000045842) Goldfish MODERN SPECIES 47 ENSCARG00000001141 ENSCARG00000001143 ENSCARG00000001146 ENSCARG00000001147 ENSCARG00000001151 KCNJ10 (ENSCARG00000001159) pnp5a (ENSCARG00000001162) ENSCARG00000001164 dusp19b (ENSCARG00000001167) capn1 (ENSCARG00000001183) sf3b2 (ENSCARG00000001328) nitr8 (ENSCARG00000001601) ##30 nitr3a (ENSCARG00000001611) ENSCARG00000001630 #37 ENSCARG00000001633 #37 ENSCARG00000001635 #37 ENSCARG00000001641 ENSCARG00000001645 #37 ENSCARG00000001648 #37 nitr5 (ENSCARG00000001654) #37 nitr5 (ENSCARG00000001658) #37 ENSCARG00000001665 ENSCARG00000001670 ENSCARG00000001672 map4k2 (ENSCARG00000001749) men1 (ENSCARG00000002588) ENSCARG00000002596 ENSCARG00000002609 ecsit (ENSCARG00000002618) EML3 (ENSCARG00000002929) mta2 (ENSCARG00000010491) Zebrafish DUPLICATION Zebrafish DUPLICATION Zebrafish DUPLICATION Zebrafish DUPLICATION Zebrafish DUPLICATION Zebrafish DUPLICATION Zebrafish MODERN SPECIES 22 ENSDARG00000099748 ENSDARG00000103653 ENSDARG00000087920 nitr11a (ENSDARG00000100389) nitr8 (ENSDARG00000036748) ##30 ENSDARG00000103252 ENSDARG00000103866 nitr7a (ENSDARG00000036743) nitr7b (ENSDARG00000067977) nitr3a (ENSDARG00000077998) nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 ENSDARG00000112323 nitr1b (ENSDARG00000115144) #37 ENSDARG00000112065 #37 nitr1f (ENSDARG00000079517) #37 nitr1i (ENSDARG00000033963) #37 nitr1k (ENSDARG00000110393) #37 ENSDARG00000117125 #37 nitr1m (ENSDARG00000087631) #37 nitr1o (ENSDARG00000069773) #37 nitr5 (ENSDARG00000077557) #37 nitr4a (ENSDARG00000075288) #37 ENSDARG00000111430 ##30 ENSDARG00000110751 ##30 nitr6a (ENSDARG00000076846) ##30 ENSDARG00000109301 ##30 map4k2 (ENSDARG00000001234) men1 (ENSDARG00000089456) Zebrafish MODERN SPECIES 22 nitr8 (ENSDARG00000036748) ##30 ENSDARG00000103252 ENSDARG00000103866 nitr7a (ENSDARG00000036743) nitr7b (ENSDARG00000067977) nitr3a (ENSDARG00000077998) nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 ENSDARG00000112323 nitr1b (ENSDARG00000115144) #37 ENSDARG00000112065 #37 nitr1f (ENSDARG00000079517) #37 nitr1i (ENSDARG00000033963) #37 nitr1k (ENSDARG00000110393) #37 ENSDARG00000117125 #37 nitr1m (ENSDARG00000087631) #37 nitr1o (ENSDARG00000069773) #37 nitr5 (ENSDARG00000077557) #37 nitr4a (ENSDARG00000075288) #37 ENSDARG00000111430 ##30 ENSDARG00000110751 ##30 nitr6a (ENSDARG00000076846) ##30 ENSDARG00000109301 ##30 map4k2 (ENSDARG00000001234) men1 (ENSDARG00000089456) rtn3 (ENSDARG00000091348) ENSDARG00000088036 ENSDARG00000104840 ecsit (ENSDARG00000062834) Zebrafish MODERN SPECIES 22 ENSDARG00000087920 nitr11a (ENSDARG00000100389) nitr8 (ENSDARG00000036748) ##30 ENSDARG00000103252 ENSDARG00000103866 nitr7a (ENSDARG00000036743) nitr7b (ENSDARG00000067977) nitr3a (ENSDARG00000077998) nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 ENSDARG00000112323 nitr1b (ENSDARG00000115144) #37 ENSDARG00000112065 #37 nitr1f (ENSDARG00000079517) #37 nitr1i (ENSDARG00000033963) #37 nitr1k (ENSDARG00000110393) #37 ENSDARG00000117125 #37 nitr1m (ENSDARG00000087631) #37 nitr1o (ENSDARG00000069773) #37 nitr5 (ENSDARG00000077557) #37 nitr4a (ENSDARG00000075288) #37 ENSDARG00000111430 ##30 ENSDARG00000110751 ##30 nitr6a (ENSDARG00000076846) ##30 ENSDARG00000109301 ##30 map4k2 (ENSDARG00000001234) men1 (ENSDARG00000089456) rtn3 (ENSDARG00000091348) ENSDARG00000088036 Zebrafish MODERN SPECIES 22 nitr12 (ENSDARG00000098626) nitr9 (ENSDARG00000028333) #37 ENSDARG00000099748 ENSDARG00000103653 ENSDARG00000087920 nitr11a (ENSDARG00000100389) nitr8 (ENSDARG00000036748) ##30 ENSDARG00000103252 ENSDARG00000103866 nitr7a (ENSDARG00000036743) nitr7b (ENSDARG00000067977) nitr3a (ENSDARG00000077998) nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 ENSDARG00000112323 nitr1b (ENSDARG00000115144) #37 ENSDARG00000112065 #37 nitr1f (ENSDARG00000079517) #37 nitr1i (ENSDARG00000033963) #37 nitr1k (ENSDARG00000110393) #37 ENSDARG00000117125 #37 nitr1m (ENSDARG00000087631) #37 nitr1o (ENSDARG00000069773) #37 nitr5 (ENSDARG00000077557) #37 nitr4a (ENSDARG00000075288) #37 ENSDARG00000111430 ##30 ENSDARG00000110751 ##30 nitr6a (ENSDARG00000076846) ##30 ENSDARG00000109301 ##30 Zebrafish DUPLICATION Zebrafish MODERN SPECIES 22 ENSDARG00000103653 ENSDARG00000087920 nitr11a (ENSDARG00000100389) nitr8 (ENSDARG00000036748) ##30 ENSDARG00000103252 ENSDARG00000103866 nitr7a (ENSDARG00000036743) nitr7b (ENSDARG00000067977) nitr3a (ENSDARG00000077998) nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 ENSDARG00000112323 nitr1b (ENSDARG00000115144) #37 ENSDARG00000112065 #37 nitr1f (ENSDARG00000079517) #37 nitr1i (ENSDARG00000033963) #37 nitr1k (ENSDARG00000110393) #37 ENSDARG00000117125 #37 nitr1m (ENSDARG00000087631) #37 nitr1o (ENSDARG00000069773) #37 nitr5 (ENSDARG00000077557) #37 nitr4a (ENSDARG00000075288) #37 ENSDARG00000111430 ##30 ENSDARG00000110751 ##30 nitr6a (ENSDARG00000076846) ##30 ENSDARG00000109301 ##30 map4k2 (ENSDARG00000001234) men1 (ENSDARG00000089456) rtn3 (ENSDARG00000091348) Zebrafish MODERN SPECIES 22 nitr11a (ENSDARG00000100389) nitr8 (ENSDARG00000036748) ##30 ENSDARG00000103252 ENSDARG00000103866 nitr7a (ENSDARG00000036743) nitr7b (ENSDARG00000067977) nitr3a (ENSDARG00000077998) nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 ENSDARG00000112323 nitr1b (ENSDARG00000115144) #37 ENSDARG00000112065 #37 nitr1f (ENSDARG00000079517) #37 nitr1i (ENSDARG00000033963) #37 nitr1k (ENSDARG00000110393) #37 ENSDARG00000117125 #37 nitr1m (ENSDARG00000087631) #37 nitr1o (ENSDARG00000069773) #37 nitr5 (ENSDARG00000077557) #37 nitr4a (ENSDARG00000075288) #37 ENSDARG00000111430 ##30 ENSDARG00000110751 ##30 nitr6a (ENSDARG00000076846) ##30 ENSDARG00000109301 ##30 map4k2 (ENSDARG00000001234) men1 (ENSDARG00000089456) rtn3 (ENSDARG00000091348) ENSDARG00000088036 ENSDARG00000104840 Zebrafish DUPLICATION Zebrafish MODERN SPECIES 22 ENSDARG00000103866 nitr7a (ENSDARG00000036743) nitr7b (ENSDARG00000067977) nitr3a (ENSDARG00000077998) nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 ENSDARG00000112323 nitr1b (ENSDARG00000115144) #37 ENSDARG00000112065 #37 nitr1f (ENSDARG00000079517) #37 nitr1i (ENSDARG00000033963) #37 nitr1k (ENSDARG00000110393) #37 ENSDARG00000117125 #37 nitr1m (ENSDARG00000087631) #37 nitr1o (ENSDARG00000069773) #37 nitr5 (ENSDARG00000077557) #37 nitr4a (ENSDARG00000075288) #37 ENSDARG00000111430 ##30 ENSDARG00000110751 ##30 nitr6a (ENSDARG00000076846) ##30 ENSDARG00000109301 ##30 map4k2 (ENSDARG00000001234) men1 (ENSDARG00000089456) rtn3 (ENSDARG00000091348) ENSDARG00000088036 ENSDARG00000104840 ecsit (ENSDARG00000062834) EML3 (ENSDARG00000058038) mta2 (ENSDARG00000013031) Zebrafish MODERN SPECIES 22 ENSDARG00000103252 ENSDARG00000103866 nitr7a (ENSDARG00000036743) nitr7b (ENSDARG00000067977) nitr3a (ENSDARG00000077998) nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 ENSDARG00000112323 nitr1b (ENSDARG00000115144) #37 ENSDARG00000112065 #37 nitr1f (ENSDARG00000079517) #37 nitr1i (ENSDARG00000033963) #37 nitr1k (ENSDARG00000110393) #37 ENSDARG00000117125 #37 nitr1m (ENSDARG00000087631) #37 nitr1o (ENSDARG00000069773) #37 nitr5 (ENSDARG00000077557) #37 nitr4a (ENSDARG00000075288) #37 ENSDARG00000111430 ##30 ENSDARG00000110751 ##30 nitr6a (ENSDARG00000076846) ##30 ENSDARG00000109301 ##30 map4k2 (ENSDARG00000001234) men1 (ENSDARG00000089456) rtn3 (ENSDARG00000091348) ENSDARG00000088036 ENSDARG00000104840 ecsit (ENSDARG00000062834) EML3 (ENSDARG00000058038) Zebrafish MODERN SPECIES 22 nitr7a (ENSDARG00000036743) nitr7b (ENSDARG00000067977) nitr3a (ENSDARG00000077998) nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 ENSDARG00000112323 nitr1b (ENSDARG00000115144) #37 ENSDARG00000112065 #37 nitr1f (ENSDARG00000079517) #37 nitr1i (ENSDARG00000033963) #37 nitr1k (ENSDARG00000110393) #37 ENSDARG00000117125 #37 nitr1m (ENSDARG00000087631) #37 nitr1o (ENSDARG00000069773) #37 nitr5 (ENSDARG00000077557) #37 nitr4a (ENSDARG00000075288) #37 ENSDARG00000111430 ##30 ENSDARG00000110751 ##30 nitr6a (ENSDARG00000076846) ##30 ENSDARG00000109301 ##30 map4k2 (ENSDARG00000001234) men1 (ENSDARG00000089456) rtn3 (ENSDARG00000091348) ENSDARG00000088036 ENSDARG00000104840 ecsit (ENSDARG00000062834) EML3 (ENSDARG00000058038) mta2 (ENSDARG00000013031) cth1 (ENSDARG00000057328) Characiphysae DUPLICATION Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 252 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 Characiphysae_b DUPLICATION Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.a #37 Characoidei DUPLICATION Characoidei ANCESTRAL SPECIES 198 ENSGT00940000166499 ENSGT00640000091486.a ENSGT00940000155293.b ENSGT00940000161027.b ENSGT00940000155078.b ENSGT00950000183050.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000004124.j ENSGT00940000156996.f.a.b ENSGT00940000156819.b ENSGT01100000263495.E ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.b.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.d ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.c ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.a.a #37 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 374 taf6l (ENSPNAG00000013142) ENSPNAG00000002557 ENSPNAG00000013075 rab1ba (ENSPNAG00000013004) PELI3 (ENSPNAG00000012992) RCE1 (ENSPNAG00000012958) cd248a (ENSPNAG00000002462) ENSPNAG00000002458 znf16l (ENSPNAG00000012914) ENSPNAG00000012894 #37 ENSPNAG00000012849 ##30 ENSPNAG00000012586 #37 ENSPNAG00000012512 nitr8 (ENSPNAG00000002273) ##30 nitr9 (ENSPNAG00000012469) #37 ENSPNAG00000012456 #37 ENSPNAG00000012422 #37 ENSPNAG00000012324 #37 ENSPNAG00000012299 #37 ENSPNAG00000002150 #37 ENSPNAG00000012183 #37 ENSPNAG00000012164 #37 ENSPNAG00000012077 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 374 ENSPNAG00000002557 ENSPNAG00000013075 rab1ba (ENSPNAG00000013004) PELI3 (ENSPNAG00000012992) RCE1 (ENSPNAG00000012958) cd248a (ENSPNAG00000002462) ENSPNAG00000002458 znf16l (ENSPNAG00000012914) ENSPNAG00000012894 #37 ENSPNAG00000012849 ##30 ENSPNAG00000012586 #37 ENSPNAG00000012512 nitr8 (ENSPNAG00000002273) ##30 nitr9 (ENSPNAG00000012469) #37 ENSPNAG00000012456 #37 ENSPNAG00000012422 #37 ENSPNAG00000012324 #37 ENSPNAG00000012299 #37 ENSPNAG00000002150 #37 ENSPNAG00000012183 #37 ENSPNAG00000012164 #37 ENSPNAG00000012077 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 374 ENSPNAG00000013075 rab1ba (ENSPNAG00000013004) PELI3 (ENSPNAG00000012992) RCE1 (ENSPNAG00000012958) cd248a (ENSPNAG00000002462) ENSPNAG00000002458 znf16l (ENSPNAG00000012914) ENSPNAG00000012894 #37 ENSPNAG00000012849 ##30 ENSPNAG00000012586 #37 ENSPNAG00000012512 nitr8 (ENSPNAG00000002273) ##30 nitr9 (ENSPNAG00000012469) #37 ENSPNAG00000012456 #37 ENSPNAG00000012422 #37 ENSPNAG00000012324 #37 ENSPNAG00000012299 #37 ENSPNAG00000002150 #37 ENSPNAG00000012183 #37 ENSPNAG00000012164 #37 ENSPNAG00000012077 #37 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000026079 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000001461 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000042296 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000026079 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000001461 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000042296 #37 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 692 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.a.b #37 ENSGT00940000179135 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 328 ENSAMXG00000034596 #37 ENSAMXG00000001537 #37 ENSAMXG00000041036 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000026079 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000001461 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000042296 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000026079 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000001461 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000042296 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000042296 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001461 #37 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000026079 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 701 ENSAMXG00000037271 ENSAMXG00000037119 ENSAMXG00000037299 #37 ENSAMXG00000020358 #37 ENSAMXG00000041611 #37 ENSAMXG00000043944 #37 ENSAMXG00000020314 #37 ENSAMXG00000036625 #37 ENSAMXG00000020266 #37 ENSAMXG00000042688 ENSAMXG00000020251 #37 ENSAMXG00000043699 #37 ENSAMXG00000020224 #37 ENSAMXG00000044062 #37 ENSAMXG00000020190 #37 ENSAMXG00000043095 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1185 ENSAMXG00000029042 #37 ENSAMXG00000035653 #37 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 328 ENSAMXG00000034596 #37 ENSAMXG00000001537 #37 ENSAMXG00000041036 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 701 ENSAMXG00000037271 ENSAMXG00000037119 ENSAMXG00000037299 #37 ENSAMXG00000020358 #37 ENSAMXG00000041611 #37 ENSAMXG00000043944 #37 ENSAMXG00000020314 #37 ENSAMXG00000036625 #37 ENSAMXG00000020266 #37 ENSAMXG00000042688 ENSAMXG00000020251 #37 ENSAMXG00000043699 #37 ENSAMXG00000020224 #37 ENSAMXG00000044062 #37 ENSAMXG00000020190 #37 ENSAMXG00000043095 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1004 ENSAMXG00000020279 #37 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 1287 ENSAMXG00000041501 #37 ENSAMXG00000041080 Mexicana tetra MODERN SPECIES 701 ENSAMXG00000037271 ENSAMXG00000037119 ENSAMXG00000037299 #37 ENSAMXG00000020358 #37 ENSAMXG00000041611 #37 ENSAMXG00000043944 #37 ENSAMXG00000020314 #37 ENSAMXG00000036625 #37 ENSAMXG00000020266 #37 ENSAMXG00000042688 ENSAMXG00000020251 #37 ENSAMXG00000043699 #37 ENSAMXG00000020224 #37 ENSAMXG00000044062 #37 ENSAMXG00000020190 #37 ENSAMXG00000043095 #37 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 701 ENSAMXG00000043095 #37 ENSAMXG00000020190 #37 ENSAMXG00000044062 #37 ENSAMXG00000020224 #37 ENSAMXG00000043699 #37 ENSAMXG00000020251 #37 ENSAMXG00000042688 ENSAMXG00000020266 #37 ENSAMXG00000036625 #37 ENSAMXG00000020314 #37 ENSAMXG00000043944 #37 ENSAMXG00000041611 #37 ENSAMXG00000020358 #37 ENSAMXG00000037299 #37 ENSAMXG00000037119 ENSAMXG00000037271 Mexicana tetra MODERN SPECIES 701 ENSAMXG00000037271 ENSAMXG00000037119 ENSAMXG00000037299 #37 ENSAMXG00000020358 #37 ENSAMXG00000041611 #37 ENSAMXG00000043944 #37 ENSAMXG00000020314 #37 ENSAMXG00000036625 #37 ENSAMXG00000020266 #37 ENSAMXG00000042688 ENSAMXG00000020251 #37 ENSAMXG00000043699 #37 ENSAMXG00000020224 #37 ENSAMXG00000044062 #37 ENSAMXG00000020190 #37 ENSAMXG00000043095 #37 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 328 ENSAMXG00000041036 #37 ENSAMXG00000001537 #37 ENSAMXG00000034596 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 701 ENSAMXG00000037271 ENSAMXG00000037119 ENSAMXG00000037299 #37 ENSAMXG00000020358 #37 ENSAMXG00000041611 #37 ENSAMXG00000043944 #37 ENSAMXG00000020314 #37 ENSAMXG00000036625 #37 ENSAMXG00000020266 #37 ENSAMXG00000042688 ENSAMXG00000020251 #37 ENSAMXG00000043699 #37 ENSAMXG00000020224 #37 ENSAMXG00000044062 #37 ENSAMXG00000020190 #37 ENSAMXG00000043095 #37 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 1185 ENSAMXG00000035653 #37 ENSAMXG00000029042 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000026079 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000001461 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000042296 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000026079 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000001461 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000042296 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 701 ENSAMXG00000037271 ENSAMXG00000037119 ENSAMXG00000037299 #37 ENSAMXG00000020358 #37 ENSAMXG00000041611 #37 ENSAMXG00000043944 #37 ENSAMXG00000020314 #37 ENSAMXG00000036625 #37 ENSAMXG00000020266 #37 ENSAMXG00000042688 ENSAMXG00000020251 #37 ENSAMXG00000043699 #37 ENSAMXG00000020224 #37 ENSAMXG00000044062 #37 ENSAMXG00000020190 #37 ENSAMXG00000043095 #37 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000042296 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001461 #37 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000026079 Mexicana tetra MODERN SPECIES 701 ENSAMXG00000037271 ENSAMXG00000037119 ENSAMXG00000037299 #37 ENSAMXG00000020358 #37 ENSAMXG00000041611 #37 ENSAMXG00000043944 #37 ENSAMXG00000020314 #37 ENSAMXG00000036625 #37 ENSAMXG00000020266 #37 ENSAMXG00000042688 ENSAMXG00000020251 #37 ENSAMXG00000043699 #37 ENSAMXG00000020224 #37 ENSAMXG00000044062 #37 ENSAMXG00000020190 #37 ENSAMXG00000043095 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 701 ENSAMXG00000037271 ENSAMXG00000037119 ENSAMXG00000037299 #37 ENSAMXG00000020358 #37 ENSAMXG00000041611 #37 ENSAMXG00000043944 #37 ENSAMXG00000020314 #37 ENSAMXG00000036625 #37 ENSAMXG00000020266 #37 ENSAMXG00000042688 ENSAMXG00000020251 #37 ENSAMXG00000043699 #37 ENSAMXG00000020224 #37 ENSAMXG00000044062 #37 ENSAMXG00000020190 #37 ENSAMXG00000043095 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000042296 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001461 #37 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000026079 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023201 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1508 ENSPNAG00000005936 #37 ENSPNAG00000017254 #37 ENSPNAG00000017271 #37 ENSPNAG00000017284 #37 ENSPNAG00000017308 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023201 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1508 ENSPNAG00000005936 #37 ENSPNAG00000017254 #37 ENSPNAG00000017271 #37 ENSPNAG00000017284 #37 ENSPNAG00000017308 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000022436 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023201 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1508 ENSPNAG00000005936 #37 ENSPNAG00000017254 #37 ENSPNAG00000017271 #37 ENSPNAG00000017284 #37 ENSPNAG00000017308 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000022436 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023201 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000022436 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023201 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023201 #37 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1508 ENSPNAG00000005936 #37 ENSPNAG00000017254 #37 ENSPNAG00000017271 #37 ENSPNAG00000017284 #37 ENSPNAG00000017308 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023201 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 374 ENSPNAG00000012077 #37 ENSPNAG00000012164 #37 ENSPNAG00000012183 #37 ENSPNAG00000002150 #37 ENSPNAG00000012299 #37 ENSPNAG00000012324 #37 ENSPNAG00000012422 #37 ENSPNAG00000012456 #37 nitr9 (ENSPNAG00000012469) #37 nitr8 (ENSPNAG00000002273) ##30 ENSPNAG00000012512 ENSPNAG00000012586 #37 ENSPNAG00000012849 ##30 ENSPNAG00000012894 #37 znf16l (ENSPNAG00000012914) ENSPNAG00000002458 cd248a (ENSPNAG00000002462) RCE1 (ENSPNAG00000012958) PELI3 (ENSPNAG00000012992) Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000022436 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023201 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023201 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 374 ENSPNAG00000012077 #37 ENSPNAG00000012164 #37 ENSPNAG00000012183 #37 ENSPNAG00000002150 #37 ENSPNAG00000012299 #37 ENSPNAG00000012324 #37 ENSPNAG00000012422 #37 ENSPNAG00000012456 #37 nitr9 (ENSPNAG00000012469) #37 nitr8 (ENSPNAG00000002273) ##30 ENSPNAG00000012512 ENSPNAG00000012586 #37 ENSPNAG00000012849 ##30 ENSPNAG00000012894 #37 znf16l (ENSPNAG00000012914) ENSPNAG00000002458 cd248a (ENSPNAG00000002462) RCE1 (ENSPNAG00000012958) PELI3 (ENSPNAG00000012992) rab1ba (ENSPNAG00000013004) Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 374 ENSPNAG00000012077 #37 ENSPNAG00000012164 #37 ENSPNAG00000012183 #37 ENSPNAG00000002150 #37 ENSPNAG00000012299 #37 ENSPNAG00000012324 #37 ENSPNAG00000012422 #37 ENSPNAG00000012456 #37 nitr9 (ENSPNAG00000012469) #37 nitr8 (ENSPNAG00000002273) ##30 ENSPNAG00000012512 ENSPNAG00000012586 #37 ENSPNAG00000012849 ##30 ENSPNAG00000012894 #37 znf16l (ENSPNAG00000012914) ENSPNAG00000002458 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 374 ENSPNAG00000012077 #37 ENSPNAG00000012164 #37 ENSPNAG00000012183 #37 ENSPNAG00000002150 #37 ENSPNAG00000012299 #37 ENSPNAG00000012324 #37 ENSPNAG00000012422 #37 ENSPNAG00000012456 #37 nitr9 (ENSPNAG00000012469) #37 nitr8 (ENSPNAG00000002273) ##30 ENSPNAG00000012512 ENSPNAG00000012586 #37 ENSPNAG00000012849 ##30 ENSPNAG00000012894 #37 znf16l (ENSPNAG00000012914) ENSPNAG00000002458 cd248a (ENSPNAG00000002462) RCE1 (ENSPNAG00000012958) Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000022436 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023201 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000022436 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023201 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 374 ENSPNAG00000012077 #37 ENSPNAG00000012164 #37 ENSPNAG00000012183 #37 ENSPNAG00000002150 #37 ENSPNAG00000012299 #37 ENSPNAG00000012324 #37 ENSPNAG00000012422 #37 ENSPNAG00000012456 #37 nitr9 (ENSPNAG00000012469) #37 nitr8 (ENSPNAG00000002273) ##30 ENSPNAG00000012512 ENSPNAG00000012586 #37 ENSPNAG00000012849 ##30 ENSPNAG00000012894 #37 znf16l (ENSPNAG00000012914) ENSPNAG00000002458 cd248a (ENSPNAG00000002462) Characiphysae_b DUPLICATION Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00600000084617 ENSGT00650000094910 ENSGT00390000005147 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000166499 ENSGT00640000091486.a ENSGT00940000155293.b ENSGT00940000161027.b ENSGT00940000155078.b ENSGT00950000183050.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000004124.j ENSGT00940000156996.f.a.b ENSGT00940000156819.b ENSGT01100000263495.E ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.c ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT00940000162676.a.a.j.a ENSGT01030000234530.a.e.a.b.b.a #37 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 198 ENSGT00390000005147 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000166499 ENSGT00640000091486.a ENSGT00940000155293.b ENSGT00940000161027.b ENSGT00940000155078.b ENSGT00950000183050.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000004124.j ENSGT00940000156996.f.a.b ENSGT00940000156819.b ENSGT01100000263495.E ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.b.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.d ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.c ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.a.a #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 374 ecsit (ENSPNAG00000002668) EML3 (ENSPNAG00000002659) mta2 (ENSPNAG00000013218) cth1 (ENSPNAG00000013147) taf6l (ENSPNAG00000013142) ENSPNAG00000002557 ENSPNAG00000013075 rab1ba (ENSPNAG00000013004) PELI3 (ENSPNAG00000012992) RCE1 (ENSPNAG00000012958) cd248a (ENSPNAG00000002462) ENSPNAG00000002458 znf16l (ENSPNAG00000012914) ENSPNAG00000012894 #37 ENSPNAG00000012849 ##30 ENSPNAG00000012586 #37 ENSPNAG00000012512 nitr8 (ENSPNAG00000002273) ##30 nitr9 (ENSPNAG00000012469) #37 ENSPNAG00000012456 #37 ENSPNAG00000012422 #37 ENSPNAG00000012324 #37 ENSPNAG00000012299 #37 ENSPNAG00000002150 #37 ENSPNAG00000012183 #37 ENSPNAG00000012164 #37 ENSPNAG00000012077 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000026079 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000001461 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000042296 #37 Electric eel MODERN SPECIES 277 ecsit (ENSEEEG00000016711) EML3 (ENSEEEG00000016866) mta2 (ENSEEEG00000019238) cth1 (ENSEEEG00000020017) taf6l (ENSEEEG00000020018) ENSEEEG00000020020 ENSEEEG00000020023 ENSEEEG00000020026 rab1ba (ENSEEEG00000020028) PELI3 (ENSEEEG00000020034) RCE1 (ENSEEEG00000020036) cd248a (ENSEEEG00000020039) ENSEEEG00000020040 znf16l (ENSEEEG00000020041) ENSEEEG00000020042 #37 ENSEEEG00000020043 #37 nitr8 (ENSEEEG00000020045) ##30 ENSEEEG00000020046 #37 ENSEEEG00000020048 #37 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 546 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.b.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.d ##30 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 198 ENSGT00600000084617 ENSGT00650000094910 ENSGT00390000005147 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000166499 ENSGT00640000091486.a ENSGT00940000155293.b ENSGT00940000161027.b ENSGT00940000155078.b ENSGT00950000183050.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000004124.j ENSGT00940000156996.f.a.b ENSGT00940000156819.b ENSGT01100000263495.E ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.b.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.d ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.c ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.a.a #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 374 ENSPNAG00000013290 ENSPNAG00000002679 ecsit (ENSPNAG00000002668) EML3 (ENSPNAG00000002659) mta2 (ENSPNAG00000013218) cth1 (ENSPNAG00000013147) taf6l (ENSPNAG00000013142) ENSPNAG00000002557 ENSPNAG00000013075 rab1ba (ENSPNAG00000013004) PELI3 (ENSPNAG00000012992) RCE1 (ENSPNAG00000012958) cd248a (ENSPNAG00000002462) ENSPNAG00000002458 znf16l (ENSPNAG00000012914) ENSPNAG00000012894 #37 ENSPNAG00000012849 ##30 ENSPNAG00000012586 #37 ENSPNAG00000012512 nitr8 (ENSPNAG00000002273) ##30 nitr9 (ENSPNAG00000012469) #37 ENSPNAG00000012456 #37 ENSPNAG00000012422 #37 ENSPNAG00000012324 #37 ENSPNAG00000012299 #37 ENSPNAG00000002150 #37 ENSPNAG00000012183 #37 ENSPNAG00000012164 #37 ENSPNAG00000012077 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000026079 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000001461 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000042296 #37 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.d #37 Channel catfish MODERN SPECIES 26 chchd7 (ENSIPUG00000016484) Sdr16c5 (ENSIPUG00000016516) penkb (ENSIPUG00000016558) ENSIPUG00000016568 sdcbp (ENSIPUG00000016607) ASPH (ENSIPUG00000016950) ggh (ENSIPUG00000016985) Nsmaf (ENSIPUG00000017014) ENSIPUG00000017145 ENSIPUG00000017188 camk2d1 (ENSIPUG00000017278) ARSJ (ENSIPUG00000017638) mad2l1 (ENSIPUG00000017647) pde5a (ENSIPUG00000017710) nitr2 (ENSIPUG00000017759) #37 nitr4 (ENSIPUG00000017774) #37 znf16l (ENSIPUG00000017815) ENSIPUG00000017826 cd248a (ENSIPUG00000017847) rce1 (ENSIPUG00000017856) PELI3 (ENSIPUG00000017878) Rab1A (ENSIPUG00000017890) ENSIPUG00000017910 ENSIPUG00000017944 ENSIPUG00000017999 taf6l (ENSIPUG00000018008) cth1 (ENSIPUG00000018040) mta2 (ENSIPUG00000018051) eml3 (ENSIPUG00000018130) ecsit (ENSIPUG00000018206) ENSIPUG00000018240 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.d #37 Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 277 cth1 (ENSEEEG00000020017) taf6l (ENSEEEG00000020018) ENSEEEG00000020020 ENSEEEG00000020023 ENSEEEG00000020026 rab1ba (ENSEEEG00000020028) PELI3 (ENSEEEG00000020034) RCE1 (ENSEEEG00000020036) cd248a (ENSEEEG00000020039) ENSEEEG00000020040 znf16l (ENSEEEG00000020041) ENSEEEG00000020042 #37 ENSEEEG00000020043 #37 nitr8 (ENSEEEG00000020045) ##30 ENSEEEG00000020046 #37 ENSEEEG00000020048 #37 Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 1530 ENSEEEG00000008725 ENSEEEG00000008726 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1587 ENSEEEG00000010681 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1517 ENSEEEG00000008618 #37 Electric eel MODERN SPECIES 277 ZFTA (ENSEEEG00000016710) ecsit (ENSEEEG00000016711) EML3 (ENSEEEG00000016866) mta2 (ENSEEEG00000019238) cth1 (ENSEEEG00000020017) taf6l (ENSEEEG00000020018) ENSEEEG00000020020 ENSEEEG00000020023 ENSEEEG00000020026 rab1ba (ENSEEEG00000020028) PELI3 (ENSEEEG00000020034) RCE1 (ENSEEEG00000020036) cd248a (ENSEEEG00000020039) ENSEEEG00000020040 znf16l (ENSEEEG00000020041) ENSEEEG00000020042 #37 ENSEEEG00000020043 #37 nitr8 (ENSEEEG00000020045) ##30 ENSEEEG00000020046 #37 ENSEEEG00000020048 #37 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b #37 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b #37 Cyprinoidei DUPLICATION Cyprinoidei DUPLICATION Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 211 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT00940000162676.a.a.k.b ENSGT01030000235316 ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a ##30 ENSGT00920000150729.A ENSGT00920000150729.B Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 370 ENSGT00940000161027.b.g ENSGT00940000155293.b ENSGT00640000091486.a.j ENSGT00940000166499.b ENSGT01030000234573.B.c.b.b.h ENSGT00940000159589.b ENSGT00390000005147.a ENSGT00600000084617.a.b ENSGT00940000157482.e.a ENSGT00390000014237.c ENSGT00940000166658.b.d ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT00940000162676.a.a.k.b.b ENSGT01030000235316.b.a ENSGT01030000235316.a ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00940000162676.a.a.l Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 1295 nitr5 (ENSCARG00000051460) #37 ENSCARG00000051522 #37 ENSCARG00000051537 ENSCARG00000051552 #37 ENSCARG00000051602 #37 ENSCARG00000051627 #37 ENSCARG00000051639 #37 nitr3b (ENSCARG00000051661) Goldfish MODERN SPECIES 25 mthfs (ENSCARG00000035838) MINAR1 (ENSCARG00000035854) ADAMTS17 (ENSCARG00000035908) asb7 (ENSCARG00000036155) aldh1a3 (ENSCARG00000036263) LRRK1 (ENSCARG00000039479) chsy1 (ENSCARG00000039813) selenos (ENSCARG00000005841) snrpa1 (ENSCARG00000005870) PCSK6 (ENSCARG00000006373) ENSCARG00000007960 ADISSP (ENSCARG00000007971) ENSCARG00000007984 #37 nitr4a (ENSCARG00000007995) #37 ENSCARG00000008018 #37 nitr5 (ENSCARG00000008024) #37 ENSCARG00000008036 #37 ENSCARG00000008044 #37 ENSCARG00000008066 #37 ENSCARG00000008072 #37 nitr3b (ENSCARG00000008087) nitr3b (ENSCARG00000008114) nitr3a (ENSCARG00000008121) nitr3a (ENSCARG00000008138) ENSCARG00000008157 ENSCARG00000008168 nitr8 (ENSCARG00000008185) ##30 nitr9 (ENSCARG00000008220) #37 ENSCARG00000008234 nitr8 (ENSCARG00000008243) ##30 ENSCARG00000008257 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00600000084617.a.b ENSGT00940000157482.e.a ENSGT00390000014237.c ENSGT00940000166658.b.d ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000235316.a ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00940000162676.a.a.l ENSGT00940000162676.b.a.b.a.a ENSGT00920000150729.A.a ENSGT00940000154963.f ENSGT00940000156825.h ENSGT00390000008184.a ENSGT00950000183093.B.a.b.d.a.a ENSGT00950000183093.B.a.b.d.b ENSGT00940000155663.f.b.c ENSGT00940000158651.c Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 340 nitr4a (ENSSGRG00000041101) #37 ENSSGRG00000041003 #37 nitr5 (ENSSGRG00000041000) #37 nitr5 (ENSSGRG00000040992) #37 ENSSGRG00000040978 #37 ENSSGRG00000040977 #37 ENSSGRG00000040976 ENSSGRG00000040973 #37 ENSSGRG00000040970 #37 ENSSGRG00000040896 #37 ENSSGRG00000040893 #37 nitr3b (ENSSGRG00000040889) ENSSGRG00000040888 ENSSGRG00000040887 nitr8 (ENSSGRG00000040886) ##30 nitr9 (ENSSGRG00000040884) #37 ENSSGRG00000040874 slc6a5 (ENSSGRG00000040833) Golden-line barbel MODERN SPECIES 340 nitr4a (ENSSGRG00000041101) #37 ENSSGRG00000041003 #37 nitr5 (ENSSGRG00000041000) #37 nitr5 (ENSSGRG00000040992) #37 ENSSGRG00000040978 #37 ENSSGRG00000040977 #37 ENSSGRG00000040976 ENSSGRG00000040973 #37 ENSSGRG00000040970 #37 ENSSGRG00000040896 #37 ENSSGRG00000040893 #37 nitr3b (ENSSGRG00000040889) ENSSGRG00000040888 ENSSGRG00000040887 nitr8 (ENSSGRG00000040886) ##30 nitr9 (ENSSGRG00000040884) #37 ENSSGRG00000040874 slc6a5 (ENSSGRG00000040833) prmt3 (ENSSGRG00000040723) Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 6 ENSCCRG00000017445 rab1ba (ENSCCRG00000054045) ENSCCRG00000012014 taf6l (ENSCCRG00000079995) mta2 (ENSCCRG00000070119) ENSCCRG00000030751 ecsit (ENSCCRG00000030615) ENSCCRG00000079668 ENSCCRG00000073273 men1 (ENSCCRG00000030597) map4k2 (ENSCCRG00000027092) nitr6a (ENSCCRG00000027020) ##30 ENSCCRG00000077430 #37 nitr4a (ENSCCRG00000027007) #37 ENSCCRG00000026999 #37 nitr5 (ENSCCRG00000026995) #37 nitr5 (ENSCCRG00000081378) #37 ENSCCRG00000014129 #37 ENSCCRG00000045558 #37 ENSCCRG00000014123 ENSCCRG00000047828 #37 ENSCCRG00000009450 #37 ENSCCRG00000043893 #37 nitr3b (ENSCCRG00000036870) nitr3a (ENSCCRG00000051636) ENSCCRG00000060153 ENSCCRG00000043869 nitr8 (ENSCCRG00000043858) ##30 ENSCCRG00000043853 #37 ENSCCRG00000044706 ENSCCRG00000026616 Common carp reference MODERN SPECIES 6 rab1ba (ENSCCRG00000054045) ENSCCRG00000012014 taf6l (ENSCCRG00000079995) mta2 (ENSCCRG00000070119) ENSCCRG00000030751 ecsit (ENSCCRG00000030615) ENSCCRG00000079668 ENSCCRG00000073273 men1 (ENSCCRG00000030597) map4k2 (ENSCCRG00000027092) nitr6a (ENSCCRG00000027020) ##30 ENSCCRG00000077430 #37 nitr4a (ENSCCRG00000027007) #37 ENSCCRG00000026999 #37 nitr5 (ENSCCRG00000026995) #37 nitr5 (ENSCCRG00000081378) #37 ENSCCRG00000014129 #37 ENSCCRG00000045558 #37 ENSCCRG00000014123 ENSCCRG00000047828 #37 ENSCCRG00000009450 #37 ENSCCRG00000043893 #37 nitr3b (ENSCCRG00000036870) nitr3a (ENSCCRG00000051636) ENSCCRG00000060153 ENSCCRG00000043869 nitr8 (ENSCCRG00000043858) ##30 ENSCCRG00000043853 #37 ENSCCRG00000044706 ENSCCRG00000026616 ENSCCRG00000074683 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.b.a #37 Goldfish MODERN SPECIES 47 PELI3 (ENSCARG00000010775) rab1ba (ENSCARG00000010671) taf6l (ENSCARG00000010594) cth1 (ENSCARG00000010580) mta2 (ENSCARG00000010491) EML3 (ENSCARG00000002929) ecsit (ENSCARG00000002618) ENSCARG00000002609 ENSCARG00000002596 men1 (ENSCARG00000002588) map4k2 (ENSCARG00000001749) ENSCARG00000001672 ENSCARG00000001670 ENSCARG00000001665 nitr5 (ENSCARG00000001658) #37 nitr5 (ENSCARG00000001654) #37 ENSCARG00000001648 #37 ENSCARG00000001645 #37 ENSCARG00000001641 ENSCARG00000001635 #37 ENSCARG00000001633 #37 ENSCARG00000001630 #37 nitr3a (ENSCARG00000001611) nitr8 (ENSCARG00000001601) ##30 sf3b2 (ENSCARG00000001328) capn1 (ENSCARG00000001183) dusp19b (ENSCARG00000001167) ENSCARG00000001164 pnp5a (ENSCARG00000001162) KCNJ10 (ENSCARG00000001159) ENSCARG00000001151 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.b.a #37 Common carp reference MODERN SPECIES ENSCCRG00000027524 rab1ba (ENSCCRG00000065291) ENSCCRG00000017370 ENSCCRG00000016405 taf6l (ENSCCRG00000045842) cth1 (ENSCCRG00000045834) mta2 (ENSCCRG00000041877) ENSCCRG00000027689 ecsit (ENSCCRG00000029397) ENSCCRG00000069097 men1 (ENSCCRG00000005649) ENSCCRG00000029411 ENSCCRG00000003433 ENSCCRG00000069657 nitr5 (ENSCCRG00000026962) #37 nitr5 (ENSCCRG00000009446) #37 ENSCCRG00000009453 #37 ENSCCRG00000009451 #37 ENSCCRG00000033802 ENSCCRG00000045565 #37 ENSCCRG00000023206 #37 ENSCCRG00000022836 #37 nitr3a (ENSCCRG00000051634) nitr3a (ENSCCRG00000043872) ENSCCRG00000070449 ##30 ENSCCRG00000066823 ##30 nitr9 (ENSCCRG00000012989) #37 ENSCCRG00000012993 ENSCCRG00000013002 ENSCCRG00000067517 ENSCCRG00000013007 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.b.b #37 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.b.b #37 Common carp reference MODERN SPECIES ENSCCRG00000071880 ENSCCRG00000027524 rab1ba (ENSCCRG00000065291) ENSCCRG00000017370 ENSCCRG00000016405 taf6l (ENSCCRG00000045842) cth1 (ENSCCRG00000045834) mta2 (ENSCCRG00000041877) ENSCCRG00000027689 ecsit (ENSCCRG00000029397) ENSCCRG00000069097 men1 (ENSCCRG00000005649) ENSCCRG00000029411 ENSCCRG00000003433 ENSCCRG00000069657 nitr5 (ENSCCRG00000026962) #37 nitr5 (ENSCCRG00000009446) #37 ENSCCRG00000009453 #37 ENSCCRG00000009451 #37 ENSCCRG00000033802 ENSCCRG00000045565 #37 ENSCCRG00000023206 #37 ENSCCRG00000022836 #37 nitr3a (ENSCCRG00000051634) nitr3a (ENSCCRG00000043872) ENSCCRG00000070449 ##30 ENSCCRG00000066823 ##30 nitr9 (ENSCCRG00000012989) #37 ENSCCRG00000012993 ENSCCRG00000013002 ENSCCRG00000067517 Goldfish MODERN SPECIES 47 RCE1 (ENSCARG00000010785) PELI3 (ENSCARG00000010775) rab1ba (ENSCARG00000010671) taf6l (ENSCARG00000010594) cth1 (ENSCARG00000010580) mta2 (ENSCARG00000010491) EML3 (ENSCARG00000002929) ecsit (ENSCARG00000002618) ENSCARG00000002609 ENSCARG00000002596 men1 (ENSCARG00000002588) map4k2 (ENSCARG00000001749) ENSCARG00000001672 ENSCARG00000001670 ENSCARG00000001665 nitr5 (ENSCARG00000001658) #37 nitr5 (ENSCARG00000001654) #37 ENSCARG00000001648 #37 ENSCARG00000001645 #37 ENSCARG00000001641 ENSCARG00000001635 #37 ENSCARG00000001633 #37 ENSCARG00000001630 #37 nitr3a (ENSCARG00000001611) nitr8 (ENSCARG00000001601) ##30 sf3b2 (ENSCARG00000001328) capn1 (ENSCARG00000001183) dusp19b (ENSCARG00000001167) ENSCARG00000001164 pnp5a (ENSCARG00000001162) KCNJ10 (ENSCARG00000001159) Zebrafish MODERN SPECIES 22 taf6l (ENSDARG00000079684) cth1 (ENSDARG00000057328) mta2 (ENSDARG00000013031) EML3 (ENSDARG00000058038) ecsit (ENSDARG00000062834) ENSDARG00000104840 ENSDARG00000088036 rtn3 (ENSDARG00000091348) men1 (ENSDARG00000089456) map4k2 (ENSDARG00000001234) ENSDARG00000109301 ##30 nitr6a (ENSDARG00000076846) ##30 ENSDARG00000110751 ##30 ENSDARG00000111430 ##30 nitr4a (ENSDARG00000075288) #37 nitr5 (ENSDARG00000077557) #37 nitr1o (ENSDARG00000069773) #37 nitr1m (ENSDARG00000087631) #37 ENSDARG00000117125 #37 nitr1k (ENSDARG00000110393) #37 nitr1i (ENSDARG00000033963) #37 nitr1f (ENSDARG00000079517) #37 ENSDARG00000112065 #37 nitr1b (ENSDARG00000115144) #37 ENSDARG00000112323 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr3a (ENSDARG00000077998) nitr7b (ENSDARG00000067977) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 370 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.b.b.h ENSGT00940000155078.b.f.a ENSGT00940000161027.b.g ENSGT00940000155293.b ENSGT00640000091486.a.j ENSGT00940000166499.b ENSGT01030000234573.B.c.b.b.h ENSGT00940000159589.b ENSGT00390000005147.a ENSGT00600000084617.a.b ENSGT00940000157482.e.a ENSGT00390000014237.c ENSGT00940000166658.b.d ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT00940000162676.a.a.k.b.b ENSGT01030000235316.b.a ENSGT01030000235316.a ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00940000162676.a.a.l Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00600000084617.a.b ENSGT00940000157482.e.a ENSGT00390000014237.c ENSGT00940000166658.b.d ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000235316.a ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00940000162676.a.a.l ENSGT00940000162676.b.a.b.a.a ENSGT00920000150729.A.a ENSGT00940000154963.f ENSGT00940000156825.h ENSGT00390000008184.a ENSGT00950000183093.B.a.b.d.a.a ENSGT00950000183093.B.a.b.d.b Golden-line barbel MODERN SPECIES 340 nitr4a (ENSSGRG00000041101) #37 ENSSGRG00000041003 #37 nitr5 (ENSSGRG00000041000) #37 nitr5 (ENSSGRG00000040992) #37 ENSSGRG00000040978 #37 ENSSGRG00000040977 #37 ENSSGRG00000040976 ENSSGRG00000040973 #37 ENSSGRG00000040970 #37 ENSSGRG00000040896 #37 ENSSGRG00000040893 #37 nitr3b (ENSSGRG00000040889) ENSSGRG00000040888 ENSSGRG00000040887 nitr8 (ENSSGRG00000040886) ##30 nitr9 (ENSSGRG00000040884) #37 Common carp reference MODERN SPECIES 6 cd248a (ENSCCRG00000063147) ENSCCRG00000027529 ENSCCRG00000017445 rab1ba (ENSCCRG00000054045) ENSCCRG00000012014 taf6l (ENSCCRG00000079995) mta2 (ENSCCRG00000070119) ENSCCRG00000030751 ecsit (ENSCCRG00000030615) ENSCCRG00000079668 ENSCCRG00000073273 men1 (ENSCCRG00000030597) map4k2 (ENSCCRG00000027092) nitr6a (ENSCCRG00000027020) ##30 ENSCCRG00000077430 #37 nitr4a (ENSCCRG00000027007) #37 ENSCCRG00000026999 #37 nitr5 (ENSCCRG00000026995) #37 nitr5 (ENSCCRG00000081378) #37 ENSCCRG00000014129 #37 ENSCCRG00000045558 #37 ENSCCRG00000014123 ENSCCRG00000047828 #37 ENSCCRG00000009450 #37 ENSCCRG00000043893 #37 nitr3b (ENSCCRG00000036870) nitr3a (ENSCCRG00000051636) ENSCCRG00000060153 ENSCCRG00000043869 nitr8 (ENSCCRG00000043858) ##30 ENSCCRG00000043853 #37 Goldfish DUPLICATION Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 25 ARNT2 (ENSCARG00000035177) fah (ENSCARG00000035462) mthfs (ENSCARG00000035838) MINAR1 (ENSCARG00000035854) ADAMTS17 (ENSCARG00000035908) asb7 (ENSCARG00000036155) aldh1a3 (ENSCARG00000036263) LRRK1 (ENSCARG00000039479) chsy1 (ENSCARG00000039813) selenos (ENSCARG00000005841) snrpa1 (ENSCARG00000005870) PCSK6 (ENSCARG00000006373) ENSCARG00000007960 ADISSP (ENSCARG00000007971) ENSCARG00000007984 #37 nitr4a (ENSCARG00000007995) #37 ENSCARG00000008018 #37 nitr5 (ENSCARG00000008024) #37 ENSCARG00000008036 #37 ENSCARG00000008044 #37 ENSCARG00000008066 #37 ENSCARG00000008072 #37 nitr3b (ENSCARG00000008087) nitr3b (ENSCARG00000008114) nitr3a (ENSCARG00000008121) nitr3a (ENSCARG00000008138) ENSCARG00000008157 ENSCARG00000008168 nitr8 (ENSCARG00000008185) ##30 nitr9 (ENSCARG00000008220) #37 ENSCARG00000008234 Goldfish MODERN SPECIES 25 nmbb (ENSCARG00000020992) FRMD5 (ENSCARG00000020661) tmed3 (ENSCARG00000020637) si:ch211-107o10.3 (ENSCARG00000020627) wdr76 (ENSCARG00000020608) ZNF710 (ENSCARG00000020601) terb2 (ENSCARG00000020571) APBA2 (ENSCARG00000018898) mcee (ENSCARG00000018783) mphosph10 (ENSCARG00000018154) mtmr10 (ENSCARG00000016698) ENSCARG00000016664 map4k2 (ENSCARG00000016617) ENSCARG00000016606 ##30 ENSCARG00000016590 #37 nitr4a (ENSCARG00000016550) #37 ENSCARG00000016545 #37 ENSCARG00000016513 znf16l (ENSCARG00000016504) ENSCARG00000016469 msantd1 (ENSCARG00000016458) dtx4a (ENSCARG00000016451) coro1b (ENSCARG00000016440) ENSCARG00000016435 trmt10a (ENSCARG00000016415) C4orf54 (ENSCARG00000016406) mllt3 (ENSCARG00000016390) ENSCARG00000014867 hacd4 (ENSCARG00000069401) ENSCARG00000069393 ENSCARG00000069392 Goldfish MODERN SPECIES 523 map4k2 (ENSCARG00000052885) ENSCARG00000052865 ##30 ENSCARG00000052852 #37 nitr4a (ENSCARG00000052750) #37 Zebrafish MODERN SPECIES 22 ENSDARG00000057331 taf6l (ENSDARG00000079684) cth1 (ENSDARG00000057328) mta2 (ENSDARG00000013031) EML3 (ENSDARG00000058038) ecsit (ENSDARG00000062834) ENSDARG00000104840 ENSDARG00000088036 rtn3 (ENSDARG00000091348) men1 (ENSDARG00000089456) map4k2 (ENSDARG00000001234) ENSDARG00000109301 ##30 nitr6a (ENSDARG00000076846) ##30 ENSDARG00000110751 ##30 ENSDARG00000111430 ##30 nitr4a (ENSDARG00000075288) #37 nitr5 (ENSDARG00000077557) #37 nitr1o (ENSDARG00000069773) #37 nitr1m (ENSDARG00000087631) #37 ENSDARG00000117125 #37 nitr1k (ENSDARG00000110393) #37 nitr1i (ENSDARG00000033963) #37 nitr1f (ENSDARG00000079517) #37 ENSDARG00000112065 #37 nitr1b (ENSDARG00000115144) #37 ENSDARG00000112323 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr3a (ENSDARG00000077998) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 370 ENSGT00940000155078.b.f.a ENSGT00940000161027.b.g ENSGT00940000155293.b ENSGT00640000091486.a.j ENSGT00940000166499.b ENSGT01030000234573.B.c.b.b.h ENSGT00940000159589.b ENSGT00390000005147.a ENSGT00600000084617.a.b ENSGT00940000157482.e.a ENSGT00390000014237.c ENSGT00940000166658.b.d ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT00940000162676.a.a.k.b.b ENSGT01030000235316.b.a ENSGT01030000235316.a ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00940000162676.a.a.l Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00600000084617.a.b ENSGT00940000157482.e.a ENSGT00390000014237.c ENSGT00940000166658.b.d ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000235316.a ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00940000162676.a.a.l ENSGT00940000162676.b.a.b.a.a ENSGT00920000150729.A.a ENSGT00940000154963.f ENSGT00940000156825.h ENSGT00390000008184.a ENSGT00950000183093.B.a.b.d.a.a ENSGT00950000183093.B.a.b.d.b ENSGT00940000155663.f.b.c Common carp reference MODERN SPECIES 6 ENSCCRG00000027529 ENSCCRG00000017445 rab1ba (ENSCCRG00000054045) ENSCCRG00000012014 taf6l (ENSCCRG00000079995) mta2 (ENSCCRG00000070119) ENSCCRG00000030751 ecsit (ENSCCRG00000030615) ENSCCRG00000079668 ENSCCRG00000073273 men1 (ENSCCRG00000030597) map4k2 (ENSCCRG00000027092) nitr6a (ENSCCRG00000027020) ##30 ENSCCRG00000077430 #37 nitr4a (ENSCCRG00000027007) #37 ENSCCRG00000026999 #37 nitr5 (ENSCCRG00000026995) #37 nitr5 (ENSCCRG00000081378) #37 ENSCCRG00000014129 #37 ENSCCRG00000045558 #37 ENSCCRG00000014123 ENSCCRG00000047828 #37 ENSCCRG00000009450 #37 ENSCCRG00000043893 #37 nitr3b (ENSCCRG00000036870) nitr3a (ENSCCRG00000051636) ENSCCRG00000060153 ENSCCRG00000043869 nitr8 (ENSCCRG00000043858) ##30 ENSCCRG00000043853 #37 ENSCCRG00000044706 Golden-line barbel MODERN SPECIES 340 nitr4a (ENSSGRG00000041101) #37 ENSSGRG00000041003 #37 nitr5 (ENSSGRG00000041000) #37 nitr5 (ENSSGRG00000040992) #37 ENSSGRG00000040978 #37 ENSSGRG00000040977 #37 ENSSGRG00000040976 ENSSGRG00000040973 #37 ENSSGRG00000040970 #37 ENSSGRG00000040896 #37 ENSSGRG00000040893 #37 nitr3b (ENSSGRG00000040889) ENSSGRG00000040888 ENSSGRG00000040887 nitr8 (ENSSGRG00000040886) ##30 nitr9 (ENSSGRG00000040884) #37 ENSSGRG00000040874 Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 25 fah (ENSCARG00000035462) mthfs (ENSCARG00000035838) MINAR1 (ENSCARG00000035854) ADAMTS17 (ENSCARG00000035908) asb7 (ENSCARG00000036155) aldh1a3 (ENSCARG00000036263) LRRK1 (ENSCARG00000039479) chsy1 (ENSCARG00000039813) selenos (ENSCARG00000005841) snrpa1 (ENSCARG00000005870) PCSK6 (ENSCARG00000006373) ENSCARG00000007960 ADISSP (ENSCARG00000007971) ENSCARG00000007984 #37 nitr4a (ENSCARG00000007995) #37 ENSCARG00000008018 #37 nitr5 (ENSCARG00000008024) #37 ENSCARG00000008036 #37 ENSCARG00000008044 #37 ENSCARG00000008066 #37 ENSCARG00000008072 #37 nitr3b (ENSCARG00000008087) nitr3b (ENSCARG00000008114) nitr3a (ENSCARG00000008121) nitr3a (ENSCARG00000008138) ENSCARG00000008157 ENSCARG00000008168 nitr8 (ENSCARG00000008185) ##30 nitr9 (ENSCARG00000008220) #37 ENSCARG00000008234 nitr8 (ENSCARG00000008243) ##30 Goldfish MODERN SPECIES 25 FRMD5 (ENSCARG00000020661) tmed3 (ENSCARG00000020637) si:ch211-107o10.3 (ENSCARG00000020627) wdr76 (ENSCARG00000020608) ZNF710 (ENSCARG00000020601) terb2 (ENSCARG00000020571) APBA2 (ENSCARG00000018898) mcee (ENSCARG00000018783) mphosph10 (ENSCARG00000018154) mtmr10 (ENSCARG00000016698) ENSCARG00000016664 map4k2 (ENSCARG00000016617) ENSCARG00000016606 ##30 ENSCARG00000016590 #37 nitr4a (ENSCARG00000016550) #37 ENSCARG00000016545 #37 ENSCARG00000016513 znf16l (ENSCARG00000016504) ENSCARG00000016469 msantd1 (ENSCARG00000016458) dtx4a (ENSCARG00000016451) coro1b (ENSCARG00000016440) ENSCARG00000016435 trmt10a (ENSCARG00000016415) C4orf54 (ENSCARG00000016406) mllt3 (ENSCARG00000016390) ENSCARG00000014867 hacd4 (ENSCARG00000069401) ENSCARG00000069393 ENSCARG00000069392 fcer1g (ENSCARG00000069388) Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b #37 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b #37 Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 1441 ENSEEEG00000006493 #37 ENSEEEG00000006485 Electric eel MODERN SPECIES 1651 ENSEEEG00000002055 #37 ENSEEEG00000002056 #37 Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 1637 ENSEEEG00000001207 #37 Electric eel MODERN SPECIES 2012 ENSEEEG00000000364 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1914 ENSEEEG00000003381 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1834 ENSEEEG00000003151 #37 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 950 ENSGT00950000182968.d.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 471 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a ##30 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 252 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c #37 Channel catfish MODERN SPECIES 26 PLAG1 (ENSIPUG00000016450) chchd7 (ENSIPUG00000016484) Sdr16c5 (ENSIPUG00000016516) penkb (ENSIPUG00000016558) ENSIPUG00000016568 sdcbp (ENSIPUG00000016607) ASPH (ENSIPUG00000016950) ggh (ENSIPUG00000016985) Nsmaf (ENSIPUG00000017014) ENSIPUG00000017145 ENSIPUG00000017188 camk2d1 (ENSIPUG00000017278) ARSJ (ENSIPUG00000017638) mad2l1 (ENSIPUG00000017647) pde5a (ENSIPUG00000017710) nitr2 (ENSIPUG00000017759) #37 nitr4 (ENSIPUG00000017774) #37 znf16l (ENSIPUG00000017815) ENSIPUG00000017826 cd248a (ENSIPUG00000017847) rce1 (ENSIPUG00000017856) PELI3 (ENSIPUG00000017878) Rab1A (ENSIPUG00000017890) ENSIPUG00000017910 ENSIPUG00000017944 ENSIPUG00000017999 taf6l (ENSIPUG00000018008) cth1 (ENSIPUG00000018040) mta2 (ENSIPUG00000018051) eml3 (ENSIPUG00000018130) ecsit (ENSIPUG00000018206) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01030000234530.a.e.a.b.b.a #37 ENSGT00940000162676.a.a.j.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.c ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.b.a #37 ENSGT01100000263495.E ENSGT00940000156819.b ENSGT00940000156996.f.a.b ENSGT00390000004124.j ENSGT00950000183050.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000155078.b ENSGT00940000161027.b ENSGT00940000155293.b ENSGT00640000091486.a ENSGT00940000166499 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159589 ENSGT00390000005147 Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 1469 ENSEEEG00000007255 ENSEEEG00000007252 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1904 ENSEEEG00000003315 #37 Electric eel MODERN SPECIES 277 mta2 (ENSEEEG00000019238) cth1 (ENSEEEG00000020017) taf6l (ENSEEEG00000020018) ENSEEEG00000020020 ENSEEEG00000020023 ENSEEEG00000020026 rab1ba (ENSEEEG00000020028) PELI3 (ENSEEEG00000020034) RCE1 (ENSEEEG00000020036) cd248a (ENSEEEG00000020039) ENSEEEG00000020040 znf16l (ENSEEEG00000020041) ENSEEEG00000020042 #37 ENSEEEG00000020043 #37 nitr8 (ENSEEEG00000020045) ##30 ENSEEEG00000020046 #37 ENSEEEG00000020048 #37 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 198 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.c ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.b.a #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.d ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.b.b #37 ENSGT01100000263495.E ENSGT00940000156819.b ENSGT00940000156996.f.a.b ENSGT00390000004124.j ENSGT00950000183050.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000155078.b ENSGT00940000161027.b ENSGT00940000155293.b ENSGT00640000091486.a ENSGT00940000166499 ENSGT01030000234573.B.c.b.b Red-bellied piranha MODERN SPECIES 374 ENSPNAG00000012077 #37 ENSPNAG00000012164 #37 ENSPNAG00000012183 #37 ENSPNAG00000002150 #37 ENSPNAG00000012299 #37 ENSPNAG00000012324 #37 ENSPNAG00000012422 #37 ENSPNAG00000012456 #37 nitr9 (ENSPNAG00000012469) #37 nitr8 (ENSPNAG00000002273) ##30 ENSPNAG00000012512 ENSPNAG00000012586 #37 ENSPNAG00000012849 ##30 ENSPNAG00000012894 #37 znf16l (ENSPNAG00000012914) ENSPNAG00000002458 cd248a (ENSPNAG00000002462) RCE1 (ENSPNAG00000012958) PELI3 (ENSPNAG00000012992) rab1ba (ENSPNAG00000013004) ENSPNAG00000013075 ENSPNAG00000002557 taf6l (ENSPNAG00000013142) cth1 (ENSPNAG00000013147) Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000042296 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001461 #37 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000026079 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000001443 ENSGT00550000075025 ENSGT01040000240385.A.b.b.b.a.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00950000183093.B.b ENSGT00940000155663.f.a ENSGT00390000007681.b.a.a ENSGT00530000063074.b.a ENSGT00940000159533 ENSGT00940000158651 ENSGT00940000155663.f.b ENSGT00950000183093.B.a.b ENSGT00390000008184 ENSGT00940000156825 ENSGT00940000154963 ENSGT00940000162676.a.a.l ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT00940000166658.b ENSGT00390000014237 ENSGT00940000157482.e ENSGT00600000084617 ENSGT00650000094910 ENSGT00390000005147 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000166499 ENSGT00640000091486.a ENSGT00940000155293.b ENSGT00940000161027.b ENSGT00940000153370.a.a Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00390000007681.b.a.a.m.a.b.a ENSGT00530000063074.b.a.i ENSGT00940000159533.p ENSGT00940000158651.d ENSGT00940000155663.f.b.d ENSGT00950000183093.B.a.b.c ENSGT00390000008184.b ENSGT00940000156825.g ENSGT00940000154963.e ENSGT00920000150729.A.b ENSGT00940000162676.b.a.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.c #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.b ##30 ENSGT00940000166658.b.c ENSGT00390000014237.d ENSGT00940000157482.e.b.a ENSGT00600000084617.a.a ENSGT00390000005147.b ENSGT00940000159589.a ENSGT01030000234573.B.c.b.b.g ENSGT00940000166499.a ENSGT00640000091486.a.i ENSGT00940000161027.b.h ENSGT00940000155669.k ENSGT00940000155078.b.f.b ENSGT00950000183050.b.b.b.a.b.b.g ENSGT00390000004124.j.k Goldfish MODERN SPECIES 47 ENSCARG00000054586 ENSCARG00000054449 mpped2a (ENSCARG00000054421) zdhhc13 (ENSCARG00000054036) csrp3 (ENSCARG00000053989) NAV2 (ENSCARG00000049872) dbx1a (ENSCARG00000049641) htatip2 (ENSCARG00000049617) prmt3 (ENSCARG00000049364) slc6a5 (ENSCARG00000049048) ENSCARG00000048993 ENSCARG00000048977 ENSCARG00000048968 ENSCARG00000048958 ENSCARG00000048940 nitr9 (ENSCARG00000048927) #37 nitr8 (ENSCARG00000048895) ##30 dock11 (ENSCARG00000048778) il13ra1 (ENSCARG00000048743) kirrel1a (ENSCARG00000010990) fcer1g (ENSCARG00000010935) ENSCARG00000010931 ENSCARG00000010928 zgc:194252 (ENSCARG00000010924) mllt3 (ENSCARG00000010906) C4orf54 (ENSCARG00000010896) trmt10a (ENSCARG00000010887) ENSCARG00000010869 coro1b (ENSCARG00000010856) dtx4a (ENSCARG00000010846) msantd1 (ENSCARG00000010837) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT01040000240385.A.b.b.b.a.a.b.a.b.a.b.a.a.a.b ENSGT00390000007681.b.a.a.m.a.b.a ENSGT00530000063074.b.a.i ENSGT00940000159533.p ENSGT00940000158651.d ENSGT00940000155663.f.b.d ENSGT00950000183093.B.a.b.c ENSGT00390000008184.b ENSGT00940000156825.g ENSGT00940000154963.e ENSGT00920000150729.A.b ENSGT00940000162676.b.a.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.c #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.b ##30 ENSGT00940000166658.b.c ENSGT00390000014237.d ENSGT00940000157482.e.b.a ENSGT00600000084617.a.a ENSGT00390000005147.b ENSGT00940000159589.a ENSGT01030000234573.B.c.b.b.g ENSGT00940000166499.a ENSGT00640000091486.a.i ENSGT00940000161027.b.h ENSGT00940000155669.k ENSGT00940000155078.b.f.b ENSGT00950000183050.b.b.b.a.b.b.g ENSGT00390000004124.j.k Golden-line barbel MODERN SPECIES 51 ENSSGRG00000019462 ENSSGRG00000019460 nitr9 (ENSSGRG00000019458) #37 ENSSGRG00000019456 ##30 ENSSGRG00000019453 ENSSGRG00000019451 rwdd (ENSSGRG00000019441) rell1 (ENSSGRG00000019439) zgc:194930 (ENSSGRG00000019437) NWD2 (ENSSGRG00000019436) ENSSGRG00000019435 pcxb (ENSSGRG00000018635) brms1 (ENSSGRG00000018629) ppp1r14bb (ENSSGRG00000018628) plcb3 (ENSSGRG00000018269) slc8a4b (ENSSGRG00000018260) cct7 (ENSSGRG00000018258) hspa12b (ENSSGRG00000018257) Common carp reference MODERN SPECIES mpped2a (ENSCCRG00000079412) zdhhc13 (ENSCCRG00000019248) csrp3 (ENSCCRG00000019258) e2f8 (ENSCCRG00000000111) NAV2 (ENSCCRG00000000970) dbx1a (ENSCCRG00000079124) htatip2 (ENSCCRG00000061029) prmt3 (ENSCCRG00000000806) slc6a5 (ENSCCRG00000078373) ENSCCRG00000055324 ENSCCRG00000071278 ENSCCRG00000013007 ENSCCRG00000067517 ENSCCRG00000013002 ENSCCRG00000012993 nitr9 (ENSCCRG00000012989) #37 ENSCCRG00000066823 ##30 ENSCCRG00000070449 ##30 nitr3a (ENSCCRG00000043872) nitr3a (ENSCCRG00000051634) ENSCCRG00000022836 #37 ENSCCRG00000023206 #37 ENSCCRG00000045565 #37 ENSCCRG00000033802 ENSCCRG00000009451 #37 ENSCCRG00000009453 #37 nitr5 (ENSCCRG00000009446) #37 nitr5 (ENSCCRG00000026962) #37 ENSCCRG00000069657 ENSCCRG00000003433 ENSCCRG00000029411 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 370 ENSGT00940000162676.a.a.l ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT01030000235316.a ENSGT01030000235316.b.a ENSGT00940000162676.a.a.k.b.b ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT00940000166658.b.d Goldfish DUPLICATION Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 25 ENSCARG00000010733 mpped2a (ENSCARG00000010730) zdhhc13 (ENSCARG00000010375) csrp3 (ENSCARG00000010339) NAV2 (ENSCARG00000009679) dbx1a (ENSCARG00000009615) htatip2 (ENSCARG00000009602) prmt3 (ENSCARG00000008406) slc6a5 (ENSCARG00000008298) ENSCARG00000008279 ENSCARG00000008271 ENSCARG00000008266 ENSCARG00000008257 nitr8 (ENSCARG00000008243) ##30 ENSCARG00000008234 nitr9 (ENSCARG00000008220) #37 nitr8 (ENSCARG00000008185) ##30 ENSCARG00000008168 ENSCARG00000008157 nitr3a (ENSCARG00000008138) nitr3a (ENSCARG00000008121) nitr3b (ENSCARG00000008114) nitr3b (ENSCARG00000008087) ENSCARG00000008072 #37 ENSCARG00000008066 #37 ENSCARG00000008044 #37 ENSCARG00000008036 #37 nitr5 (ENSCARG00000008024) #37 ENSCARG00000008018 #37 nitr4a (ENSCARG00000007995) #37 ENSCARG00000007984 #37 Goldfish MODERN SPECIES 2858 ENSCARG00000046870 ENSCARG00000046883 nitr8 (ENSCARG00000046911) ##30 ENSCARG00000046939 nitr9 (ENSCARG00000046963) #37 Goldfish MODERN SPECIES 1185 nitr9 (ENSCARG00000044463) #37 nitr8 (ENSCARG00000044494) ##30 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT01040000240385.A.b.b.b.a.a.b.a.b.a.b.a.a.b ENSGT01040000240385.A.b.b.b.a.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a ENSGT00390000007681.b.a.a.m.b ENSGT00530000063074.b.a.j ENSGT00940000159533.o ENSGT00940000158651.c ENSGT00940000155663.f.b.c ENSGT00950000183093.B.a.b.d.b ENSGT00950000183093.B.a.b.d.a.a ENSGT00390000008184.a ENSGT00940000156825.h ENSGT00940000154963.f ENSGT00920000150729.A.a ENSGT00940000162676.b.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.a.l ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT01030000235316.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT00940000166658.b.d ENSGT00390000014237.c ENSGT00940000157482.e.a ENSGT00600000084617.a.b Common carp reference MODERN SPECIES 6 e2f8 (ENSCCRG00000055364) NAV2 (ENSCCRG00000000859) ENSCCRG00000074396 ENSCCRG00000056021 dbx1a (ENSCCRG00000000835) htatip2 (ENSCCRG00000000812) prmt3 (ENSCCRG00000047050) slc6a5 (ENSCCRG00000012923) ENSCCRG00000028084 ENSCCRG00000028079 ENSCCRG00000058044 ENSCCRG00000066730 ENSCCRG00000074683 ENSCCRG00000026616 ENSCCRG00000044706 ENSCCRG00000043853 #37 nitr8 (ENSCCRG00000043858) ##30 ENSCCRG00000043869 ENSCCRG00000060153 nitr3a (ENSCCRG00000051636) nitr3b (ENSCCRG00000036870) ENSCCRG00000043893 #37 ENSCCRG00000009450 #37 ENSCCRG00000047828 #37 ENSCCRG00000014123 ENSCCRG00000045558 #37 ENSCCRG00000014129 #37 nitr5 (ENSCCRG00000081378) #37 nitr5 (ENSCCRG00000026995) #37 ENSCCRG00000026999 #37 nitr4a (ENSCCRG00000027007) #37 Golden-line barbel MODERN SPECIES 340 ENSSGRG00000040373 cdc42l2 (ENSSGRG00000040406) ENSSGRG00000040512 ENSSGRG00000040515 dnmt3bb.1 (ENSSGRG00000040533) commd7 (ENSSGRG00000040690) ENSSGRG00000040701 zdhhc13 (ENSSGRG00000040702) csrp3 (ENSSGRG00000040715) e2f8 (ENSSGRG00000040718) NAV2 (ENSSGRG00000040720) dbx1a (ENSSGRG00000040722) prmt3 (ENSSGRG00000040723) slc6a5 (ENSSGRG00000040833) ENSSGRG00000040874 nitr9 (ENSSGRG00000040884) #37 nitr8 (ENSSGRG00000040886) ##30 ENSSGRG00000040887 ENSSGRG00000040888 nitr3b (ENSSGRG00000040889) ENSSGRG00000040893 #37 ENSSGRG00000040896 #37 ENSSGRG00000040970 #37 ENSSGRG00000040973 #37 ENSSGRG00000040976 ENSSGRG00000040977 #37 ENSSGRG00000040978 #37 nitr5 (ENSSGRG00000040992) #37 nitr5 (ENSSGRG00000041000) #37 ENSSGRG00000041003 #37 nitr4a (ENSSGRG00000041101) #37 Zebrafish MODERN SPECIES 22 ENSDARG00000105564 ENSDARG00000060962 btr05 (ENSDARG00000074813) btr06 (ENSDARG00000054184) ENSDARG00000105558 mpped2a (ENSDARG00000006889) zdhhc13 (ENSDARG00000101144) csrp3 (ENSDARG00000101706) e2f8 (ENSDARG00000057323) NAV2 (ENSDARG00000073688) dbx1a (ENSDARG00000086393) htatip2 (ENSDARG00000028386) prmt3 (ENSDARG00000019791) slc6a5 (ENSDARG00000067964) nitr12 (ENSDARG00000098626) nitr9 (ENSDARG00000028333) #37 ENSDARG00000099748 ENSDARG00000103653 ENSDARG00000087920 nitr11a (ENSDARG00000100389) nitr8 (ENSDARG00000036748) ##30 ENSDARG00000103252 ENSDARG00000103866 nitr7a (ENSDARG00000036743) nitr7b (ENSDARG00000067977) nitr3a (ENSDARG00000077998) nitr3b (ENSDARG00000057620) nitr2a (ENSDARG00000043398) #37 nitr2b (ENSDARG00000000460) #37 nitr1a (ENSDARG00000069848) #37 ENSDARG00000112323 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.b #37 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.b #37 Characiphysae DUPLICATION Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.b.a #37 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.b.a #37 Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.b.a #37 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000026079 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000001461 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000042296 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 411 ENSAMXG00000026079 znf16l (ENSAMXG00000037237) ENSAMXG00000001461 #37 ENSAMXG00000001470 #37 ENSAMXG00000001481 #37 ENSAMXG00000033628 #37 ENSAMXG00000001500 #37 ENSAMXG00000031193 #37 ENSAMXG00000001506 #37 ENSAMXG00000001514 #37 ENSAMXG00000038763 #37 ENSAMXG00000001527 #37 ENSAMXG00000042415 #37 ENSAMXG00000029196 #37 ENSAMXG00000042023 #37 ENSAMXG00000042296 #37 Characiphysae DUPLICATION Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.b.b.a #37 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01030000234530.a.e.a.b.b.a #37 ENSGT00940000162676.a.a.j.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a.c ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c.b.a #37 ENSGT01100000263495.E ENSGT00940000156819.b ENSGT00940000156996.f.a.b ENSGT00390000004124.j ENSGT00950000183050.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000155078.b ENSGT00940000161027.b ENSGT00940000155293.b ENSGT00640000091486.a ENSGT00940000166499 ENSGT01030000234573.B.c.b.b Characoidei DUPLICATION Characoidei ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT01030000234530.a.e.a.b.b.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a.j.a ENSGT00940000177616.b ENSGT00940000155475.h ENSGT00940000153395.a ENSGT00940000159954 ENSGT00940000159769.b ENSGT00940000155279.C.a.a ENSGT00940000155059 ENSGT00490000043388.b.b ENSGT00940000156304.d ENSGT00940000164997.a ENSGT00950000183149.A.e ENSGT00940000156731.q.a ENSGT00390000001029 ENSGT00940000159246 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 201 ENSPNAG00000006755 #37 ENSPNAG00000019614 #37 ENSPNAG00000019677 #37 ENSPNAG00000019832 #37 ENSPNAG00000019860 #37 ENSPNAG00000019881 #37 ENSPNAG00000019893 #37 ENSPNAG00000020141 #37 ENSPNAG00000020156 ENSPNAG00000020166 ENSPNAG00000020188 pde5ab (ENSPNAG00000020235) mad2l1 (ENSPNAG00000020264) ARSJ (ENSPNAG00000020268) ENSPNAG00000020498 ANK2 (ENSPNAG00000020648) NSMAF (ENSPNAG00000020786) ggh (ENSPNAG00000005848) ASPH (ENSPNAG00000020878) sdcbp (ENSPNAG00000020907) ENSPNAG00000020924 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 201 ENSPNAG00000006755 #37 ENSPNAG00000019614 #37 ENSPNAG00000019677 #37 ENSPNAG00000019832 #37 ENSPNAG00000019860 #37 ENSPNAG00000019881 #37 ENSPNAG00000019893 #37 ENSPNAG00000020141 #37 ENSPNAG00000020156 ENSPNAG00000020166 ENSPNAG00000020188 pde5ab (ENSPNAG00000020235) mad2l1 (ENSPNAG00000020264) ARSJ (ENSPNAG00000020268) ENSPNAG00000020498 ANK2 (ENSPNAG00000020648) NSMAF (ENSPNAG00000020786) ggh (ENSPNAG00000005848) ASPH (ENSPNAG00000020878) sdcbp (ENSPNAG00000020907) ENSPNAG00000020924 penkb (ENSPNAG00000020928) sdr16c5b (ENSPNAG00000020957) Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 201 ENSPNAG00000006755 #37 ENSPNAG00000019614 #37 ENSPNAG00000019677 #37 ENSPNAG00000019832 #37 ENSPNAG00000019860 #37 ENSPNAG00000019881 #37 ENSPNAG00000019893 #37 ENSPNAG00000020141 #37 ENSPNAG00000020156 ENSPNAG00000020166 ENSPNAG00000020188 pde5ab (ENSPNAG00000020235) mad2l1 (ENSPNAG00000020264) ARSJ (ENSPNAG00000020268) ENSPNAG00000020498 ANK2 (ENSPNAG00000020648) NSMAF (ENSPNAG00000020786) ggh (ENSPNAG00000005848) ASPH (ENSPNAG00000020878) sdcbp (ENSPNAG00000020907) ENSPNAG00000020924 penkb (ENSPNAG00000020928) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 201 ENSPNAG00000006755 #37 ENSPNAG00000019614 #37 ENSPNAG00000019677 #37 ENSPNAG00000019832 #37 ENSPNAG00000019860 #37 ENSPNAG00000019881 #37 ENSPNAG00000019893 #37 ENSPNAG00000020141 #37 ENSPNAG00000020156 ENSPNAG00000020166 ENSPNAG00000020188 pde5ab (ENSPNAG00000020235) mad2l1 (ENSPNAG00000020264) ARSJ (ENSPNAG00000020268) ENSPNAG00000020498 ANK2 (ENSPNAG00000020648) NSMAF (ENSPNAG00000020786) ggh (ENSPNAG00000005848) ASPH (ENSPNAG00000020878) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 201 ENSPNAG00000006755 #37 ENSPNAG00000019614 #37 ENSPNAG00000019677 #37 ENSPNAG00000019832 #37 ENSPNAG00000019860 #37 ENSPNAG00000019881 #37 ENSPNAG00000019893 #37 ENSPNAG00000020141 #37 ENSPNAG00000020156 ENSPNAG00000020166 ENSPNAG00000020188 pde5ab (ENSPNAG00000020235) mad2l1 (ENSPNAG00000020264) ARSJ (ENSPNAG00000020268) ENSPNAG00000020498 ANK2 (ENSPNAG00000020648) NSMAF (ENSPNAG00000020786) ggh (ENSPNAG00000005848) ASPH (ENSPNAG00000020878) sdcbp (ENSPNAG00000020907) Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 7 TMEM236 (ENSAMXG00000007219) hacd1 (ENSAMXG00000039794) COLEC12 (ENSAMXG00000007230) ENSAMXG00000007236 tyms (ENSAMXG00000007245) enosf1 (ENSAMXG00000007242) YES1 (ENSAMXG00000007250) adcyap1a (ENSAMXG00000007261) METTL4 (ENSAMXG00000002844) SMCHD1 (ENSAMXG00000002900) ENSAMXG00000034441 LPIN2 (ENSAMXG00000031472) ENSAMXG00000043648 ENSAMXG00000036899 ENSAMXG00000037397 #37 ENSAMXG00000042808 #37 ENSAMXG00000017775 ENSAMXG00000031153 ENSAMXG00000037354 ENSAMXG00000036222 ENSAMXG00000035923 ENSAMXG00000033518 ENSAMXG00000030755 pde5ab (ENSAMXG00000017789) mad2l1 (ENSAMXG00000017812) ARSJ (ENSAMXG00000025064) cacnb2a (ENSAMXG00000010460) ENSAMXG00000010451 arl8 (ENSAMXG00000010445) ENSAMXG00000033784 NFIB (ENSAMXG00000007288) Mexicana tetra MODERN SPECIES 426 ENSAMXG00000034209 #37 ENSAMXG00000042555 ENSAMXG00000037038 #37 ENSAMXG00000029424 ENSAMXG00000009283 #37 ENSAMXG00000034942 #37 ENSAMXG00000033192 #37 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 7 MRC1 (ENSAMXG00000007199) TMEM236 (ENSAMXG00000007219) hacd1 (ENSAMXG00000039794) COLEC12 (ENSAMXG00000007230) ENSAMXG00000007236 tyms (ENSAMXG00000007245) enosf1 (ENSAMXG00000007242) YES1 (ENSAMXG00000007250) adcyap1a (ENSAMXG00000007261) METTL4 (ENSAMXG00000002844) SMCHD1 (ENSAMXG00000002900) ENSAMXG00000034441 LPIN2 (ENSAMXG00000031472) ENSAMXG00000043648 ENSAMXG00000036899 ENSAMXG00000037397 #37 ENSAMXG00000042808 #37 ENSAMXG00000017775 ENSAMXG00000031153 ENSAMXG00000037354 ENSAMXG00000036222 ENSAMXG00000035923 ENSAMXG00000033518 ENSAMXG00000030755 pde5ab (ENSAMXG00000017789) mad2l1 (ENSAMXG00000017812) ARSJ (ENSAMXG00000025064) cacnb2a (ENSAMXG00000010460) ENSAMXG00000010451 arl8 (ENSAMXG00000010445) ENSAMXG00000033784 Mexicana tetra MODERN SPECIES 426 ENSAMXG00000034209 #37 ENSAMXG00000042555 ENSAMXG00000037038 #37 ENSAMXG00000029424 ENSAMXG00000009283 #37 ENSAMXG00000034942 #37 ENSAMXG00000033192 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 426 ENSAMXG00000034209 #37 ENSAMXG00000042555 ENSAMXG00000037038 #37 ENSAMXG00000029424 ENSAMXG00000009283 #37 ENSAMXG00000034942 #37 ENSAMXG00000033192 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 426 ENSAMXG00000034209 #37 ENSAMXG00000042555 ENSAMXG00000037038 #37 ENSAMXG00000029424 ENSAMXG00000009283 #37 ENSAMXG00000034942 #37 ENSAMXG00000033192 #37 Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.b.b.a.b #37 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 201 ENSPNAG00000006755 #37 ENSPNAG00000019614 #37 ENSPNAG00000019677 #37 ENSPNAG00000019832 #37 ENSPNAG00000019860 #37 ENSPNAG00000019881 #37 ENSPNAG00000019893 #37 ENSPNAG00000020141 #37 ENSPNAG00000020156 ENSPNAG00000020166 ENSPNAG00000020188 pde5ab (ENSPNAG00000020235) mad2l1 (ENSPNAG00000020264) ARSJ (ENSPNAG00000020268) ENSPNAG00000020498 ANK2 (ENSPNAG00000020648) NSMAF (ENSPNAG00000020786) ggh (ENSPNAG00000005848) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 201 ENSPNAG00000006755 #37 ENSPNAG00000019614 #37 ENSPNAG00000019677 #37 ENSPNAG00000019832 #37 ENSPNAG00000019860 #37 ENSPNAG00000019881 #37 ENSPNAG00000019893 #37 ENSPNAG00000020141 #37 ENSPNAG00000020156 ENSPNAG00000020166 ENSPNAG00000020188 pde5ab (ENSPNAG00000020235) mad2l1 (ENSPNAG00000020264) ARSJ (ENSPNAG00000020268) ENSPNAG00000020498 ANK2 (ENSPNAG00000020648) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022436 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 201 ENSPNAG00000006755 #37 ENSPNAG00000019614 #37 ENSPNAG00000019677 #37 ENSPNAG00000019832 #37 ENSPNAG00000019860 #37 ENSPNAG00000019881 #37 ENSPNAG00000019893 #37 ENSPNAG00000020141 #37 ENSPNAG00000020156 ENSPNAG00000020166 ENSPNAG00000020188 pde5ab (ENSPNAG00000020235) mad2l1 (ENSPNAG00000020264) ARSJ (ENSPNAG00000020268) ENSPNAG00000020498 ANK2 (ENSPNAG00000020648) NSMAF (ENSPNAG00000020786) Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 1954 ENSEEEG00000003468 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1651 ENSEEEG00000002055 #37 ENSEEEG00000002056 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1590 ENSEEEG00000010793 #37 Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 1816 ENSEEEG00000003097 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1948 ENSEEEG00000003457 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1960 ENSEEEG00000003478 #37 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.b.b.b #37 Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 17 ENSIPUG00000017793 ENSIPUG00000017845 kcnk5b (ENSIPUG00000017880) ENSIPUG00000017895 rdh14b (ENSIPUG00000017916) si:dkey-174m14.3 (ENSIPUG00000017925) Crip2 (ENSIPUG00000017931) ptger2b (ENSIPUG00000017963) psmc6 (ENSIPUG00000017970) cgrrf1 (ENSIPUG00000017983) ENSIPUG00000017997 ddhd1 (ENSIPUG00000018026) stxbp6l (ENSIPUG00000018060) ENSIPUG00000018068 ENSIPUG00000018108 ENSIPUG00000018124 #37 olfcb1 (ENSIPUG00000018141) ENSIPUG00000018155 cdca4 (ENSIPUG00000018165) si:dkey-177p2.6 (ENSIPUG00000018168) ahsa1a (ENSIPUG00000018182) sel1l (ENSIPUG00000018364) ENSIPUG00000018432 chga (ENSIPUG00000018452) itpk1a (ENSIPUG00000018467) tmem251 (ENSIPUG00000018495) si:dkeyp-55f12.3 (ENSIPUG00000018503) ubr7 (ENSIPUG00000018517) btbd7 (ENSIPUG00000018527) ENSIPUG00000018544 ENSIPUG00000018552 Channel catfish MODERN SPECIES 207 nitr3 (ENSIPUG00000010322) #37 nitr1 (ENSIPUG00000010300) #37 Channel catfish MODERN SPECIES 207 nitr3 (ENSIPUG00000010322) #37 nitr1 (ENSIPUG00000010300) #37 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.b.b.b #37 Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.e.a.b.b.b #37 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 701 ENSAMXG00000043095 #37 ENSAMXG00000020190 #37 ENSAMXG00000044062 #37 ENSAMXG00000020224 #37 ENSAMXG00000043699 #37 ENSAMXG00000020251 #37 ENSAMXG00000042688 ENSAMXG00000020266 #37 ENSAMXG00000036625 #37 ENSAMXG00000020314 #37 ENSAMXG00000043944 #37 ENSAMXG00000041611 #37 ENSAMXG00000020358 #37 ENSAMXG00000037299 #37 ENSAMXG00000037119 ENSAMXG00000037271 Mexicana tetra MODERN SPECIES 701 ENSAMXG00000043095 #37 ENSAMXG00000020190 #37 ENSAMXG00000044062 #37 ENSAMXG00000020224 #37 ENSAMXG00000043699 #37 ENSAMXG00000020251 #37 ENSAMXG00000042688 ENSAMXG00000020266 #37 ENSAMXG00000036625 #37 ENSAMXG00000020314 #37 ENSAMXG00000043944 #37 ENSAMXG00000041611 #37 ENSAMXG00000020358 #37 ENSAMXG00000037299 #37 ENSAMXG00000037119 ENSAMXG00000037271 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 701 ENSAMXG00000043095 #37 ENSAMXG00000020190 #37 ENSAMXG00000044062 #37 ENSAMXG00000020224 #37 ENSAMXG00000043699 #37 ENSAMXG00000020251 #37 ENSAMXG00000042688 ENSAMXG00000020266 #37 ENSAMXG00000036625 #37 ENSAMXG00000020314 #37 ENSAMXG00000043944 #37 ENSAMXG00000041611 #37 ENSAMXG00000020358 #37 ENSAMXG00000037299 #37 ENSAMXG00000037119 ENSAMXG00000037271 Mexicana tetra MODERN SPECIES 426 ENSAMXG00000034209 #37 ENSAMXG00000042555 ENSAMXG00000037038 #37 ENSAMXG00000029424 ENSAMXG00000009283 #37 ENSAMXG00000034942 #37 ENSAMXG00000033192 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 701 ENSAMXG00000043095 #37 ENSAMXG00000020190 #37 ENSAMXG00000044062 #37 ENSAMXG00000020224 #37 ENSAMXG00000043699 #37 ENSAMXG00000020251 #37 ENSAMXG00000042688 ENSAMXG00000020266 #37 ENSAMXG00000036625 #37 ENSAMXG00000020314 #37 ENSAMXG00000043944 #37 ENSAMXG00000041611 #37 ENSAMXG00000020358 #37 ENSAMXG00000037299 #37 ENSAMXG00000037119 ENSAMXG00000037271 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2188 ENSPNAG00000016994 #37 ENSPNAG00000017009 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000023201 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022436 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000023201 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022436 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2188 ENSPNAG00000016994 #37 ENSPNAG00000017009 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000023201 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022436 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022436 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022436 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022436 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000023201 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022436 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 728 ENSPNAG00000023201 #37 ENSPNAG00000023157 #37 ENSPNAG00000023134 #37 ENSPNAG00000006600 #37 ENSPNAG00000023006 #37 ENSPNAG00000022982 #37 ENSPNAG00000022944 #37 ENSPNAG00000022920 #37 ENSPNAG00000022848 #37 ENSPNAG00000022815 #37 ENSPNAG00000022808 #37 ENSPNAG00000003734 #37 ENSPNAG00000022770 #37 ENSPNAG00000022711 #37 ENSPNAG00000022679 #37 ENSPNAG00000022663 #37 ENSPNAG00000022578 #37 ENSPNAG00000022560 #37 ENSPNAG00000022522 #37 ENSPNAG00000022443 #37 ENSPNAG00000022436 Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 1850 ENSEEEG00000003173 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1599 ENSEEEG00000000287 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1926 ENSEEEG00000003424 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1833 ENSEEEG00000003149 #37 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 211 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000014827.b ENSGT00950000182866.D.d.b.cb ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.e.b #37 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 621 ENSGT01030000234530.a.e.b #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT00950000182968.c ##30 Denticle herring DUPLICATION Denticle herring DUPLICATION Denticle herring DUPLICATION Denticle herring DUPLICATION Denticle herring DUPLICATION Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES ENSDCDG00000017471 ENSDCDG00000017444 ENSDCDG00000017433 ENSDCDG00000017431 ENSDCDG00000017417 #37 ENSDCDG00000017408 ENSDCDG00000017404 #37 ENSDCDG00000017172 #37 ENSDCDG00000017156 #37 ENSDCDG00000017033 #37 ENSDCDG00000017009 #37 ENSDCDG00000016804 #37 ENSDCDG00000016075 #37 ENSDCDG00000015429 #37 ENSDCDG00000015423 #37 ENSDCDG00000015422 #37 ENSDCDG00000015419 #37 pde5ab (ENSDCDG00000012512) mad2l1 (ENSDCDG00000012324) ENSDCDG00000012313 ENSDCDG00000012306 cbln6 (ENSDCDG00000012299) ENSDCDG00000034235 ENSDCDG00000034234 znf219 (ENSDCDG00000034233) ENSDCDG00000034231 btr12 (ENSDCDG00000034230) ENSDCDG00000034228 ENSDCDG00000034226 ENSDCDG00000034225 casq1b (ENSDCDG00000034104) Denticle herring MODERN SPECIES ENSDCDG00000017478 ENSDCDG00000017471 ENSDCDG00000017444 ENSDCDG00000017433 ENSDCDG00000017431 ENSDCDG00000017417 #37 ENSDCDG00000017408 ENSDCDG00000017404 #37 ENSDCDG00000017172 #37 ENSDCDG00000017156 #37 ENSDCDG00000017033 #37 ENSDCDG00000017009 #37 ENSDCDG00000016804 #37 ENSDCDG00000016075 #37 ENSDCDG00000015429 #37 ENSDCDG00000015423 #37 ENSDCDG00000015422 #37 ENSDCDG00000015419 #37 pde5ab (ENSDCDG00000012512) mad2l1 (ENSDCDG00000012324) ENSDCDG00000012313 ENSDCDG00000012306 cbln6 (ENSDCDG00000012299) ENSDCDG00000034235 ENSDCDG00000034234 znf219 (ENSDCDG00000034233) ENSDCDG00000034231 btr12 (ENSDCDG00000034230) ENSDCDG00000034228 ENSDCDG00000034226 ENSDCDG00000034225 Denticle herring DUPLICATION Denticle herring DUPLICATION Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES cldnd1a (ENSDCDG00000017612) ACY3 (ENSDCDG00000017512) ENSDCDG00000017505 ENSDCDG00000017484 ENSDCDG00000017478 ENSDCDG00000017471 ENSDCDG00000017444 ENSDCDG00000017433 ENSDCDG00000017431 ENSDCDG00000017417 #37 ENSDCDG00000017408 ENSDCDG00000017404 #37 ENSDCDG00000017172 #37 ENSDCDG00000017156 #37 ENSDCDG00000017033 #37 ENSDCDG00000017009 #37 ENSDCDG00000016804 #37 ENSDCDG00000016075 #37 ENSDCDG00000015429 #37 ENSDCDG00000015423 #37 ENSDCDG00000015422 #37 ENSDCDG00000015419 #37 pde5ab (ENSDCDG00000012512) mad2l1 (ENSDCDG00000012324) ENSDCDG00000012313 ENSDCDG00000012306 cbln6 (ENSDCDG00000012299) ENSDCDG00000034235 ENSDCDG00000034234 znf219 (ENSDCDG00000034233) ENSDCDG00000034231 Denticle herring MODERN SPECIES dtx4a (ENSDCDG00000017699) coro1b (ENSDCDG00000017621) cldnd1a (ENSDCDG00000017612) ACY3 (ENSDCDG00000017512) ENSDCDG00000017505 ENSDCDG00000017484 ENSDCDG00000017478 ENSDCDG00000017471 ENSDCDG00000017444 ENSDCDG00000017433 ENSDCDG00000017431 ENSDCDG00000017417 #37 ENSDCDG00000017408 ENSDCDG00000017404 #37 ENSDCDG00000017172 #37 ENSDCDG00000017156 #37 ENSDCDG00000017033 #37 ENSDCDG00000017009 #37 ENSDCDG00000016804 #37 ENSDCDG00000016075 #37 ENSDCDG00000015429 #37 ENSDCDG00000015423 #37 ENSDCDG00000015422 #37 ENSDCDG00000015419 #37 pde5ab (ENSDCDG00000012512) mad2l1 (ENSDCDG00000012324) ENSDCDG00000012313 ENSDCDG00000012306 cbln6 (ENSDCDG00000012299) ENSDCDG00000034235 ENSDCDG00000034234 Denticle herring MODERN SPECIES ENSDCDG00000017505 ENSDCDG00000017484 ENSDCDG00000017478 ENSDCDG00000017471 ENSDCDG00000017444 ENSDCDG00000017433 ENSDCDG00000017431 ENSDCDG00000017417 #37 ENSDCDG00000017408 ENSDCDG00000017404 #37 ENSDCDG00000017172 #37 ENSDCDG00000017156 #37 ENSDCDG00000017033 #37 ENSDCDG00000017009 #37 ENSDCDG00000016804 #37 ENSDCDG00000016075 #37 ENSDCDG00000015429 #37 ENSDCDG00000015423 #37 ENSDCDG00000015422 #37 ENSDCDG00000015419 #37 pde5ab (ENSDCDG00000012512) mad2l1 (ENSDCDG00000012324) ENSDCDG00000012313 ENSDCDG00000012306 cbln6 (ENSDCDG00000012299) ENSDCDG00000034235 ENSDCDG00000034234 znf219 (ENSDCDG00000034233) ENSDCDG00000034231 btr12 (ENSDCDG00000034230) ENSDCDG00000034228 Denticle herring MODERN SPECIES msantd1 (ENSDCDG00000017704) dtx4a (ENSDCDG00000017699) coro1b (ENSDCDG00000017621) cldnd1a (ENSDCDG00000017612) ACY3 (ENSDCDG00000017512) ENSDCDG00000017505 ENSDCDG00000017484 ENSDCDG00000017478 ENSDCDG00000017471 ENSDCDG00000017444 ENSDCDG00000017433 ENSDCDG00000017431 ENSDCDG00000017417 #37 ENSDCDG00000017408 ENSDCDG00000017404 #37 ENSDCDG00000017172 #37 ENSDCDG00000017156 #37 ENSDCDG00000017033 #37 ENSDCDG00000017009 #37 ENSDCDG00000016804 #37 ENSDCDG00000016075 #37 ENSDCDG00000015429 #37 ENSDCDG00000015423 #37 ENSDCDG00000015422 #37 ENSDCDG00000015419 #37 pde5ab (ENSDCDG00000012512) mad2l1 (ENSDCDG00000012324) ENSDCDG00000012313 ENSDCDG00000012306 cbln6 (ENSDCDG00000012299) ENSDCDG00000034235 Denticle herring DUPLICATION Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES coro1b (ENSDCDG00000017621) cldnd1a (ENSDCDG00000017612) ACY3 (ENSDCDG00000017512) ENSDCDG00000017505 ENSDCDG00000017484 ENSDCDG00000017478 ENSDCDG00000017471 ENSDCDG00000017444 ENSDCDG00000017433 ENSDCDG00000017431 ENSDCDG00000017417 #37 ENSDCDG00000017408 ENSDCDG00000017404 #37 ENSDCDG00000017172 #37 ENSDCDG00000017156 #37 ENSDCDG00000017033 #37 ENSDCDG00000017009 #37 ENSDCDG00000016804 #37 ENSDCDG00000016075 #37 ENSDCDG00000015429 #37 ENSDCDG00000015423 #37 ENSDCDG00000015422 #37 ENSDCDG00000015419 #37 pde5ab (ENSDCDG00000012512) mad2l1 (ENSDCDG00000012324) ENSDCDG00000012313 ENSDCDG00000012306 cbln6 (ENSDCDG00000012299) ENSDCDG00000034235 ENSDCDG00000034234 znf219 (ENSDCDG00000034233) Denticle herring MODERN SPECIES ACY3 (ENSDCDG00000017512) ENSDCDG00000017505 ENSDCDG00000017484 ENSDCDG00000017478 ENSDCDG00000017471 ENSDCDG00000017444 ENSDCDG00000017433 ENSDCDG00000017431 ENSDCDG00000017417 #37 ENSDCDG00000017408 ENSDCDG00000017404 #37 ENSDCDG00000017172 #37 ENSDCDG00000017156 #37 ENSDCDG00000017033 #37 ENSDCDG00000017009 #37 ENSDCDG00000016804 #37 ENSDCDG00000016075 #37 ENSDCDG00000015429 #37 ENSDCDG00000015423 #37 ENSDCDG00000015422 #37 ENSDCDG00000015419 #37 pde5ab (ENSDCDG00000012512) mad2l1 (ENSDCDG00000012324) ENSDCDG00000012313 ENSDCDG00000012306 cbln6 (ENSDCDG00000012299) ENSDCDG00000034235 ENSDCDG00000034234 znf219 (ENSDCDG00000034233) ENSDCDG00000034231 btr12 (ENSDCDG00000034230) Denticle herring MODERN SPECIES ENSDCDG00000017484 ENSDCDG00000017478 ENSDCDG00000017471 ENSDCDG00000017444 ENSDCDG00000017433 ENSDCDG00000017431 ENSDCDG00000017417 #37 ENSDCDG00000017408 ENSDCDG00000017404 #37 ENSDCDG00000017172 #37 ENSDCDG00000017156 #37 ENSDCDG00000017033 #37 ENSDCDG00000017009 #37 ENSDCDG00000016804 #37 ENSDCDG00000016075 #37 ENSDCDG00000015429 #37 ENSDCDG00000015423 #37 ENSDCDG00000015422 #37 ENSDCDG00000015419 #37 pde5ab (ENSDCDG00000012512) mad2l1 (ENSDCDG00000012324) ENSDCDG00000012313 ENSDCDG00000012306 cbln6 (ENSDCDG00000012299) ENSDCDG00000034235 ENSDCDG00000034234 znf219 (ENSDCDG00000034233) ENSDCDG00000034231 btr12 (ENSDCDG00000034230) ENSDCDG00000034228 ENSDCDG00000034226 Denticle herring MODERN SPECIES msantd1 (ENSDCDG00000017716) ENSDCDG00000017714 ENSDCDG00000017710 msantd1 (ENSDCDG00000017704) dtx4a (ENSDCDG00000017699) coro1b (ENSDCDG00000017621) cldnd1a (ENSDCDG00000017612) ACY3 (ENSDCDG00000017512) ENSDCDG00000017505 ENSDCDG00000017484 ENSDCDG00000017478 ENSDCDG00000017471 ENSDCDG00000017444 ENSDCDG00000017433 ENSDCDG00000017431 ENSDCDG00000017417 #37 ENSDCDG00000017408 ENSDCDG00000017404 #37 ENSDCDG00000017172 #37 ENSDCDG00000017156 #37 ENSDCDG00000017033 #37 ENSDCDG00000017009 #37 ENSDCDG00000016804 #37 ENSDCDG00000016075 #37 ENSDCDG00000015429 #37 ENSDCDG00000015423 #37 ENSDCDG00000015422 #37 ENSDCDG00000015419 #37 pde5ab (ENSDCDG00000012512) mad2l1 (ENSDCDG00000012324) ENSDCDG00000012313 Denticle herring MODERN SPECIES ENSDCDG00000017444 ENSDCDG00000017433 ENSDCDG00000017431 ENSDCDG00000017417 #37 ENSDCDG00000017408 ENSDCDG00000017404 #37 ENSDCDG00000017172 #37 ENSDCDG00000017156 #37 ENSDCDG00000017033 #37 ENSDCDG00000017009 #37 ENSDCDG00000016804 #37 ENSDCDG00000016075 #37 ENSDCDG00000015429 #37 ENSDCDG00000015423 #37 ENSDCDG00000015422 #37 ENSDCDG00000015419 #37 pde5ab (ENSDCDG00000012512) mad2l1 (ENSDCDG00000012324) ENSDCDG00000012313 ENSDCDG00000012306 cbln6 (ENSDCDG00000012299) ENSDCDG00000034235 ENSDCDG00000034234 znf219 (ENSDCDG00000034233) ENSDCDG00000034231 btr12 (ENSDCDG00000034230) ENSDCDG00000034228 ENSDCDG00000034226 ENSDCDG00000034225 casq1b (ENSDCDG00000034104) PEA15 (ENSDCDG00000034088) Denticle herring MODERN SPECIES ENSDCDG00000017710 msantd1 (ENSDCDG00000017704) dtx4a (ENSDCDG00000017699) coro1b (ENSDCDG00000017621) cldnd1a (ENSDCDG00000017612) ACY3 (ENSDCDG00000017512) ENSDCDG00000017505 ENSDCDG00000017484 ENSDCDG00000017478 ENSDCDG00000017471 ENSDCDG00000017444 ENSDCDG00000017433 ENSDCDG00000017431 ENSDCDG00000017417 #37 ENSDCDG00000017408 ENSDCDG00000017404 #37 ENSDCDG00000017172 #37 ENSDCDG00000017156 #37 ENSDCDG00000017033 #37 ENSDCDG00000017009 #37 ENSDCDG00000016804 #37 ENSDCDG00000016075 #37 ENSDCDG00000015429 #37 ENSDCDG00000015423 #37 ENSDCDG00000015422 #37 ENSDCDG00000015419 #37 pde5ab (ENSDCDG00000012512) mad2l1 (ENSDCDG00000012324) ENSDCDG00000012313 ENSDCDG00000012306 cbln6 (ENSDCDG00000012299) Otomorpha DUPLICATION Otomorpha DUPLICATION Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 211 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000014827.b ENSGT00950000182866.D.d.b.cb ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.e.b #37 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 621 ENSGT01030000234530.a.e.b #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT00950000182968.c ##30 Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 22 sting1 (ENSCHAG00000008386) ENSCHAG00000008370 brd8b (ENSCHAG00000008258) ENSCHAG00000008223 ENSCHAG00000008218 ENSCHAG00000008194 PCDH1 (ENSCHAG00000008178) ENSCHAG00000008157 ENSCHAG00000007685 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005565 ##30 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 brd8b (ENSCHAG00000008258) ENSCHAG00000008223 ENSCHAG00000008218 ENSCHAG00000008194 PCDH1 (ENSCHAG00000008178) ENSCHAG00000008157 ENSCHAG00000007685 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005489 #37 Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000008218 ENSCHAG00000008194 PCDH1 (ENSCHAG00000008178) ENSCHAG00000008157 ENSCHAG00000007685 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005475 #37 ENSCHAG00000005463 ##30 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000008408 sting1 (ENSCHAG00000008386) ENSCHAG00000008370 brd8b (ENSCHAG00000008258) ENSCHAG00000008223 ENSCHAG00000008218 ENSCHAG00000008194 PCDH1 (ENSCHAG00000008178) ENSCHAG00000008157 ENSCHAG00000007685 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 PCDH1 (ENSCHAG00000008178) ENSCHAG00000008157 ENSCHAG00000007685 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005475 #37 ENSCHAG00000005463 ##30 ENSCHAG00000005444 ENSCHAG00000005402 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 zgc:110843 (ENSCHAG00000009122) ENSCHAG00000008941 ENSCHAG00000008408 sting1 (ENSCHAG00000008386) ENSCHAG00000008370 brd8b (ENSCHAG00000008258) ENSCHAG00000008223 ENSCHAG00000008218 ENSCHAG00000008194 PCDH1 (ENSCHAG00000008178) ENSCHAG00000008157 ENSCHAG00000007685 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 PURA (ENSCHAG00000009544) PSD2 (ENSCHAG00000009199) zgc:92242 (ENSCHAG00000009179) CXXC5 (ENSCHAG00000009174) zgc:110843 (ENSCHAG00000009122) ENSCHAG00000008941 ENSCHAG00000008408 sting1 (ENSCHAG00000008386) ENSCHAG00000008370 brd8b (ENSCHAG00000008258) ENSCHAG00000008223 ENSCHAG00000008218 ENSCHAG00000008194 PCDH1 (ENSCHAG00000008178) ENSCHAG00000008157 ENSCHAG00000007685 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000008194 PCDH1 (ENSCHAG00000008178) ENSCHAG00000008157 ENSCHAG00000007685 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005475 #37 ENSCHAG00000005463 ##30 ENSCHAG00000005444 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000008370 brd8b (ENSCHAG00000008258) ENSCHAG00000008223 ENSCHAG00000008218 ENSCHAG00000008194 PCDH1 (ENSCHAG00000008178) ENSCHAG00000008157 ENSCHAG00000007685 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005510 #37 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 PSD2 (ENSCHAG00000009199) zgc:92242 (ENSCHAG00000009179) CXXC5 (ENSCHAG00000009174) zgc:110843 (ENSCHAG00000009122) ENSCHAG00000008941 ENSCHAG00000008408 sting1 (ENSCHAG00000008386) ENSCHAG00000008370 brd8b (ENSCHAG00000008258) ENSCHAG00000008223 ENSCHAG00000008218 ENSCHAG00000008194 PCDH1 (ENSCHAG00000008178) ENSCHAG00000008157 ENSCHAG00000007685 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000008223 ENSCHAG00000008218 ENSCHAG00000008194 PCDH1 (ENSCHAG00000008178) ENSCHAG00000008157 ENSCHAG00000007685 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005475 #37 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005475 #37 ENSCHAG00000005463 ##30 ENSCHAG00000005444 ENSCHAG00000005402 ENSCHAG00000005352 ENSCHAG00000005278 ENSCHAG00000005200 #37 ENSCHAG00000004871 #37 ENSCHAG00000004479 gpc2 (ENSCHAG00000004265) ENSCHAG00000004232 gpc2 (ENSCHAG00000004005) ENSCHAG00000003913 ENSCHAG00000003877 Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005475 #37 ENSCHAG00000005463 ##30 ENSCHAG00000005444 ENSCHAG00000005402 ENSCHAG00000005352 ENSCHAG00000005278 ENSCHAG00000005200 #37 ENSCHAG00000004871 #37 ENSCHAG00000004479 gpc2 (ENSCHAG00000004265) ENSCHAG00000004232 gpc2 (ENSCHAG00000004005) ENSCHAG00000003913 ENSCHAG00000003877 PIGG (ENSCHAG00000003773) fnta (ENSCHAG00000003134) GSTP1 (ENSCHAG00000003083) ENSCHAG00000002694 trpc3 (ENSCHAG00000001600) ENSCHAG00000001522 adra2da (ENSCHAG00000001508) SLC34A1 (ENSCHAG00000001119) Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005475 #37 ENSCHAG00000005463 ##30 ENSCHAG00000005444 ENSCHAG00000005402 ENSCHAG00000005352 ENSCHAG00000005278 ENSCHAG00000005200 #37 ENSCHAG00000004871 #37 ENSCHAG00000004479 gpc2 (ENSCHAG00000004265) ENSCHAG00000004232 gpc2 (ENSCHAG00000004005) ENSCHAG00000003913 ENSCHAG00000003877 PIGG (ENSCHAG00000003773) fnta (ENSCHAG00000003134) GSTP1 (ENSCHAG00000003083) ENSCHAG00000002694 trpc3 (ENSCHAG00000001600) ENSCHAG00000001522 adra2da (ENSCHAG00000001508) SLC34A1 (ENSCHAG00000001119) ENSCHAG00000000925 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 238 ENSGT00940000158417.a ENSGT00940000156892.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT00940000156736.d ENSGT00940000166427 ENSGT00940000156944.a.b ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.a ENSGT00730000111223 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000181162 ENSGT00940000163364 ENSGT00940000158578 ENSGT00940000160322 ENSGT00390000006394 ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 252 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c #37 Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018720 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 ENSIPUG00000018820 #37 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018868 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018938 ENSIPUG00000018983 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 ENSIPUG00000019032 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019047 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 ENSIPUG00000019073 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019092 #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 adra1bb (ENSIPUG00000003153) ENSIPUG00000003144 PCDH10 (ENSIPUG00000003095) ENSIPUG00000003060 PCDH18 (ENSIPUG00000003024) Slc7a11 (ENSIPUG00000002978) FGFRL1 (ENSIPUG00000002959) nitr13 (ENSIPUG00000002953) #37 ENSIPUG00000002947 #37 ENSIPUG00000002938 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019073 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 ENSIPUG00000019047 #37 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019032 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 ENSIPUG00000018983 #37 ENSIPUG00000018938 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 ENSIPUG00000018868 #37 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018846 Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018720 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 ENSIPUG00000018820 #37 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018868 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018938 ENSIPUG00000018983 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 ENSIPUG00000019032 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019047 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 ENSIPUG00000019073 #37 ENSIPUG00000019082 Channel catfish MODERN SPECIES 27 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018529 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 ENSIPUG00000018393 #37 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018381 ENSIPUG00000018359 #37 ENSIPUG00000018351 ENSIPUG00000018342 #37 ENSIPUG00000018331 ENSIPUG00000018284 hnrnph1 (ENSIPUG00000018262) eif4ebp3l (ENSIPUG00000018246) HNRNPAB (ENSIPUG00000018218) nme5 (ENSIPUG00000018174) rack1 (ENSIPUG00000018129) ENSIPUG00000018112 ENSIPUG00000018012 Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018820 #37 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018868 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018938 ENSIPUG00000018983 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 ENSIPUG00000019032 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019047 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 ENSIPUG00000019073 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000002938 ENSIPUG00000002947 #37 nitr13 (ENSIPUG00000002953) #37 FGFRL1 (ENSIPUG00000002959) Slc7a11 (ENSIPUG00000002978) PCDH18 (ENSIPUG00000003024) ENSIPUG00000003060 Channel catfish MODERN SPECIES 27 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 ENSIPUG00000018868 #37 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018820 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018529 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018720 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 ENSIPUG00000018820 #37 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018868 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018938 ENSIPUG00000018983 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 ENSIPUG00000019032 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019047 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 ENSIPUG00000019073 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000002938 Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018381 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018393 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 ENSIPUG00000018529 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018582 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018720 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 ENSIPUG00000018820 #37 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018868 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000003295 tomm5 (ENSIPUG00000003275) grhpra (ENSIPUG00000003223) LINGO2 (ENSIPUG00000003219) gar1 (ENSIPUG00000003194) adh5 (ENSIPUG00000003169) eif4ea (ENSIPUG00000003156) adra1bb (ENSIPUG00000003153) ENSIPUG00000003144 PCDH10 (ENSIPUG00000003095) ENSIPUG00000003060 PCDH18 (ENSIPUG00000003024) Slc7a11 (ENSIPUG00000002978) FGFRL1 (ENSIPUG00000002959) nitr13 (ENSIPUG00000002953) #37 ENSIPUG00000002947 #37 ENSIPUG00000002938 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019073 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 ENSIPUG00000019047 #37 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019032 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 ENSIPUG00000018983 #37 ENSIPUG00000018938 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018359 #37 ENSIPUG00000018381 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018393 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 ENSIPUG00000018529 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018582 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018720 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 ENSIPUG00000018820 #37 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018868 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 grhpra (ENSIPUG00000003223) LINGO2 (ENSIPUG00000003219) gar1 (ENSIPUG00000003194) adh5 (ENSIPUG00000003169) eif4ea (ENSIPUG00000003156) adra1bb (ENSIPUG00000003153) ENSIPUG00000003144 PCDH10 (ENSIPUG00000003095) ENSIPUG00000003060 PCDH18 (ENSIPUG00000003024) Slc7a11 (ENSIPUG00000002978) FGFRL1 (ENSIPUG00000002959) nitr13 (ENSIPUG00000002953) #37 ENSIPUG00000002947 #37 ENSIPUG00000002938 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019073 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 ENSIPUG00000019047 #37 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019032 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 ENSIPUG00000018983 #37 ENSIPUG00000018938 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018393 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 ENSIPUG00000018529 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018582 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018720 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 ENSIPUG00000018820 #37 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018868 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 27 eif4ea (ENSIPUG00000003156) adra1bb (ENSIPUG00000003153) ENSIPUG00000003144 PCDH10 (ENSIPUG00000003095) ENSIPUG00000003060 PCDH18 (ENSIPUG00000003024) Slc7a11 (ENSIPUG00000002978) FGFRL1 (ENSIPUG00000002959) nitr13 (ENSIPUG00000002953) #37 ENSIPUG00000002947 #37 ENSIPUG00000002938 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019073 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 ENSIPUG00000019047 #37 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019032 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 ENSIPUG00000018983 #37 ENSIPUG00000018938 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 ENSIPUG00000018868 #37 ENSIPUG00000018850 Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018720 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 ENSIPUG00000018820 #37 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018868 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018938 ENSIPUG00000018983 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 ENSIPUG00000019032 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019047 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 ENSIPUG00000019073 #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 adh5 (ENSIPUG00000003169) eif4ea (ENSIPUG00000003156) adra1bb (ENSIPUG00000003153) ENSIPUG00000003144 PCDH10 (ENSIPUG00000003095) ENSIPUG00000003060 PCDH18 (ENSIPUG00000003024) Slc7a11 (ENSIPUG00000002978) FGFRL1 (ENSIPUG00000002959) nitr13 (ENSIPUG00000002953) #37 ENSIPUG00000002947 #37 ENSIPUG00000002938 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019073 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 ENSIPUG00000019047 #37 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019032 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 ENSIPUG00000018983 #37 ENSIPUG00000018938 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 ENSIPUG00000018868 #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018529 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 ENSIPUG00000018393 #37 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018381 ENSIPUG00000018359 #37 ENSIPUG00000018351 ENSIPUG00000018342 #37 ENSIPUG00000018331 ENSIPUG00000018284 hnrnph1 (ENSIPUG00000018262) eif4ebp3l (ENSIPUG00000018246) HNRNPAB (ENSIPUG00000018218) Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 27 mrpl18 (ENSIPUG00000003341) ENSIPUG00000003295 tomm5 (ENSIPUG00000003275) grhpra (ENSIPUG00000003223) LINGO2 (ENSIPUG00000003219) gar1 (ENSIPUG00000003194) adh5 (ENSIPUG00000003169) eif4ea (ENSIPUG00000003156) adra1bb (ENSIPUG00000003153) ENSIPUG00000003144 PCDH10 (ENSIPUG00000003095) ENSIPUG00000003060 PCDH18 (ENSIPUG00000003024) Slc7a11 (ENSIPUG00000002978) FGFRL1 (ENSIPUG00000002959) nitr13 (ENSIPUG00000002953) #37 ENSIPUG00000002947 #37 ENSIPUG00000002938 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019073 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 ENSIPUG00000019047 #37 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019032 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 ENSIPUG00000018983 #37 ENSIPUG00000018938 Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 ENSIPUG00000018529 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018582 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018720 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 ENSIPUG00000018820 #37 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018868 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018938 ENSIPUG00000018983 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 184 nitr13 (ENSIPUG00000009380) #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018820 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018529 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 ENSIPUG00000018393 #37 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018381 ENSIPUG00000018359 #37 ENSIPUG00000018351 ENSIPUG00000018342 #37 ENSIPUG00000018331 ENSIPUG00000018284 hnrnph1 (ENSIPUG00000018262) Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018820 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018529 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 ENSIPUG00000018393 #37 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018381 ENSIPUG00000018359 #37 ENSIPUG00000018351 ENSIPUG00000018342 #37 ENSIPUG00000018331 ENSIPUG00000018284 Channel catfish MODERN SPECIES 27 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 ENSIPUG00000018983 #37 ENSIPUG00000018938 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 ENSIPUG00000018868 #37 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018820 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018529 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 27 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 ENSIPUG00000018820 #37 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018868 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018938 ENSIPUG00000018983 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 ENSIPUG00000019032 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019047 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 ENSIPUG00000019073 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000002938 ENSIPUG00000002947 #37 nitr13 (ENSIPUG00000002953) #37 FGFRL1 (ENSIPUG00000002959) Slc7a11 (ENSIPUG00000002978) Channel catfish MODERN SPECIES 27 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 ENSIPUG00000018820 #37 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018868 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018938 ENSIPUG00000018983 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 ENSIPUG00000019032 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019047 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 ENSIPUG00000019073 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000002938 ENSIPUG00000002947 #37 nitr13 (ENSIPUG00000002953) #37 FGFRL1 (ENSIPUG00000002959) Slc7a11 (ENSIPUG00000002978) PCDH18 (ENSIPUG00000003024) Channel catfish MODERN SPECIES 27 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 ENSIPUG00000018983 #37 ENSIPUG00000018938 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 ENSIPUG00000018868 #37 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018820 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018529 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018938 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 ENSIPUG00000018868 #37 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018820 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018529 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018529 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 ENSIPUG00000018393 #37 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018381 ENSIPUG00000018359 #37 ENSIPUG00000018351 ENSIPUG00000018342 #37 ENSIPUG00000018331 ENSIPUG00000018284 hnrnph1 (ENSIPUG00000018262) eif4ebp3l (ENSIPUG00000018246) HNRNPAB (ENSIPUG00000018218) nme5 (ENSIPUG00000018174) rack1 (ENSIPUG00000018129) ENSIPUG00000018112 Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 27 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 ENSIPUG00000018820 #37 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018868 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018938 ENSIPUG00000018983 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 ENSIPUG00000019032 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019047 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 ENSIPUG00000019073 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000002938 ENSIPUG00000002947 #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018983 #37 ENSIPUG00000018938 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 ENSIPUG00000018868 #37 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018820 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018529 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018529 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 ENSIPUG00000018393 #37 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018381 ENSIPUG00000018359 #37 ENSIPUG00000018351 ENSIPUG00000018342 #37 ENSIPUG00000018331 ENSIPUG00000018284 hnrnph1 (ENSIPUG00000018262) eif4ebp3l (ENSIPUG00000018246) HNRNPAB (ENSIPUG00000018218) nme5 (ENSIPUG00000018174) rack1 (ENSIPUG00000018129) Channel catfish MODERN SPECIES 27 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018529 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 ENSIPUG00000018393 #37 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018381 ENSIPUG00000018359 #37 ENSIPUG00000018351 ENSIPUG00000018342 #37 ENSIPUG00000018331 ENSIPUG00000018284 hnrnph1 (ENSIPUG00000018262) eif4ebp3l (ENSIPUG00000018246) HNRNPAB (ENSIPUG00000018218) nme5 (ENSIPUG00000018174) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 337 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a.i Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 1657 ENSEEEG00000002079 ENSEEEG00000002080 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1464 ENSEEEG00000007164 #37 ENSEEEG00000007166 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1614 ENSEEEG00000001028 #37 Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 1748 ENSEEEG00000002903 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1932 ENSEEEG00000003436 #37 Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 1464 ENSEEEG00000007164 #37 ENSEEEG00000007166 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1694 ENSEEEG00000002684 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1915 ENSEEEG00000003383 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1797 ENSEEEG00000003023 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1545 ENSEEEG00000009064 #37 ENSEEEG00000009062 #37 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 482 ENSGT00950000182968.c ##30 ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a.i Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 16 hbegfa (ENSAMXG00000034387) ENSAMXG00000002449 hnrnph1 (ENSAMXG00000002483) hnrnpaba (ENSAMXG00000002560) eif4ebp3l (ENSAMXG00000042158) nme5 (ENSAMXG00000029229) rack1 (ENSAMXG00000002584) ENSAMXG00000002614 ENSAMXG00000002754 ENSAMXG00000003013 ENSAMXG00000029021 ENSAMXG00000003015 chrnb3b (ENSAMXG00000003040) ENSAMXG00000003086 ENSAMXG00000030942 nitr13 (ENSAMXG00000036603) #37 nitr13 (ENSAMXG00000003112) #37 nitr13 (ENSAMXG00000031058) #37 ENSAMXG00000035882 ENSAMXG00000029629 ENSAMXG00000030554 ENSAMXG00000043494 pcdh18b (ENSAMXG00000012165) ENSAMXG00000039325 Mexicana tetra MODERN SPECIES 16 ENSAMXG00000002449 hnrnph1 (ENSAMXG00000002483) hnrnpaba (ENSAMXG00000002560) eif4ebp3l (ENSAMXG00000042158) nme5 (ENSAMXG00000029229) rack1 (ENSAMXG00000002584) ENSAMXG00000002614 ENSAMXG00000002754 ENSAMXG00000003013 ENSAMXG00000029021 ENSAMXG00000003015 chrnb3b (ENSAMXG00000003040) ENSAMXG00000003086 ENSAMXG00000030942 nitr13 (ENSAMXG00000036603) #37 nitr13 (ENSAMXG00000003112) #37 nitr13 (ENSAMXG00000031058) #37 ENSAMXG00000035882 ENSAMXG00000029629 ENSAMXG00000030554 ENSAMXG00000043494 pcdh18b (ENSAMXG00000012165) ENSAMXG00000039325 Mexicana tetra MODERN SPECIES 16 hnrnph1 (ENSAMXG00000002483) hnrnpaba (ENSAMXG00000002560) eif4ebp3l (ENSAMXG00000042158) nme5 (ENSAMXG00000029229) rack1 (ENSAMXG00000002584) ENSAMXG00000002614 ENSAMXG00000002754 ENSAMXG00000003013 ENSAMXG00000029021 ENSAMXG00000003015 chrnb3b (ENSAMXG00000003040) ENSAMXG00000003086 ENSAMXG00000030942 nitr13 (ENSAMXG00000036603) #37 nitr13 (ENSAMXG00000003112) #37 nitr13 (ENSAMXG00000031058) #37 ENSAMXG00000035882 ENSAMXG00000029629 ENSAMXG00000030554 ENSAMXG00000043494 pcdh18b (ENSAMXG00000012165) ENSAMXG00000039325 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 1218 ENSAMXG00000033664 #37 ENSAMXG00000039578 #37 ENSAMXG00000043017 Mexicana tetra MODERN SPECIES 547 ENSAMXG00000037046 #37 ENSAMXG00000036771 #37 ENSAMXG00000006521 #37 ENSAMXG00000031509 #37 fgfrl1b (ENSAMXG00000040060) Mexicana tetra MODERN SPECIES 547 ENSAMXG00000037046 #37 ENSAMXG00000036771 #37 ENSAMXG00000006521 #37 ENSAMXG00000031509 #37 fgfrl1b (ENSAMXG00000040060) Mexicana tetra MODERN SPECIES 547 ENSAMXG00000037046 #37 ENSAMXG00000036771 #37 ENSAMXG00000006521 #37 ENSAMXG00000031509 #37 fgfrl1b (ENSAMXG00000040060) Mexicana tetra MODERN SPECIES 806 ENSAMXG00000033819 #37 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 269 ENSAMXG00000033837 #37 ENSAMXG00000035777 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1218 ENSAMXG00000033664 #37 ENSAMXG00000039578 #37 ENSAMXG00000043017 Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra DUPLICATION Mexicana tetra MODERN SPECIES 269 ENSAMXG00000033837 #37 ENSAMXG00000035777 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 188 ENSAMXG00000032342 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 547 ENSAMXG00000037046 #37 ENSAMXG00000036771 #37 ENSAMXG00000006521 #37 ENSAMXG00000031509 #37 fgfrl1b (ENSAMXG00000040060) Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2361 ENSPNAG00000024243 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1895 ENSPNAG00000010928 #37 ENSPNAG00000001465 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1649 ENSPNAG00000026234 ENSPNAG00000026261 #37 ENSPNAG00000026284 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1959 ENSPNAG00000027543 #37 ENSPNAG00000027519 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1649 ENSPNAG00000026234 ENSPNAG00000026261 #37 ENSPNAG00000026284 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1959 ENSPNAG00000027543 #37 ENSPNAG00000027519 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2104 ENSPNAG00000020249 #37 ENSPNAG00000020234 #37 ENSPNAG00000020221 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1489 ENSPNAG00000021574 #37 ENSPNAG00000021604 ENSPNAG00000021661 #37 ENSPNAG00000021685 ENSPNAG00000021701 ENSPNAG00000021716 #37 ENSPNAG00000021752 #37 ENSPNAG00000003696 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1770 ENSPNAG00000018930 #37 ENSPNAG00000018973 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 21 hbegfa (ENSPNAG00000007729) ENSPNAG00000007744 hnrnph1 (ENSPNAG00000000439) eif4ebp3l (ENSPNAG00000007774) hnrnpaba (ENSPNAG00000000458) nme5 (ENSPNAG00000007792) rack1 (ENSPNAG00000000469) ENSPNAG00000007194 ENSPNAG00000007836 ENSPNAG00000007842 ENSPNAG00000007850 chrnb3b (ENSPNAG00000007860) ENSPNAG00000007870 ENSPNAG00000000527 ##30 nitr13 (ENSPNAG00000007879) #37 ENSPNAG00000007883 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1851 ENSPNAG00000001976 #37 ENSPNAG00000001993 #37 ENSPNAG00000011914 ENSPNAG00000011925 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1489 ENSPNAG00000021574 #37 ENSPNAG00000021604 ENSPNAG00000021661 #37 ENSPNAG00000021685 ENSPNAG00000021701 ENSPNAG00000021716 #37 ENSPNAG00000021752 #37 ENSPNAG00000003696 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1743 ENSPNAG00000020340 #37 ENSPNAG00000020356 #37 ENSPNAG00000020377 #37 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1489 ENSPNAG00000021574 #37 ENSPNAG00000021604 ENSPNAG00000021661 #37 ENSPNAG00000021685 ENSPNAG00000021701 ENSPNAG00000021716 #37 ENSPNAG00000021752 #37 ENSPNAG00000003696 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1142 ENSPNAG00000023000 ENSPNAG00000023020 #37 ENSPNAG00000023086 #37 ENSPNAG00000023102 #37 ENSPNAG00000023139 #37 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2047 ENSPNAG00000021891 #37 ENSPNAG00000021871 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2380 ENSPNAG00000017075 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1489 ENSPNAG00000021574 #37 ENSPNAG00000021604 ENSPNAG00000021661 #37 ENSPNAG00000021685 ENSPNAG00000021701 ENSPNAG00000021716 #37 ENSPNAG00000021752 #37 ENSPNAG00000003696 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1696 ENSPNAG00000022500 #37 ENSPNAG00000022470 #37 ENSPNAG00000022447 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 21 ENSPNAG00000029577 hbegfa (ENSPNAG00000007729) ENSPNAG00000007744 hnrnph1 (ENSPNAG00000000439) eif4ebp3l (ENSPNAG00000007774) hnrnpaba (ENSPNAG00000000458) nme5 (ENSPNAG00000007792) rack1 (ENSPNAG00000000469) ENSPNAG00000007194 ENSPNAG00000007836 ENSPNAG00000007842 ENSPNAG00000007850 chrnb3b (ENSPNAG00000007860) ENSPNAG00000007870 ENSPNAG00000000527 ##30 nitr13 (ENSPNAG00000007879) #37 ENSPNAG00000007883 #37 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1743 ENSPNAG00000020340 #37 ENSPNAG00000020356 #37 ENSPNAG00000020377 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1489 ENSPNAG00000021574 #37 ENSPNAG00000021604 ENSPNAG00000021661 #37 ENSPNAG00000021685 ENSPNAG00000021701 ENSPNAG00000021716 #37 ENSPNAG00000021752 #37 ENSPNAG00000003696 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1856 ENSPNAG00000001924 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1696 ENSPNAG00000022500 #37 ENSPNAG00000022470 #37 ENSPNAG00000022447 #37 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1828 ENSPNAG00000003162 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1770 ENSPNAG00000018930 #37 ENSPNAG00000018973 #37 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1884 ENSPNAG00000001557 #37 ENSPNAG00000011132 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2539 ENSPNAG00000013970 #37 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2371 ENSPNAG00000017265 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1696 ENSPNAG00000022500 #37 ENSPNAG00000022470 #37 ENSPNAG00000022447 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2414 ENSPNAG00000016236 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2120 ENSPNAG00000019822 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1142 ENSPNAG00000023000 ENSPNAG00000023020 #37 ENSPNAG00000023086 #37 ENSPNAG00000023102 #37 ENSPNAG00000023139 #37 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2105 ENSPNAG00000003641 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1970 ENSPNAG00000025945 #37 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1674 ENSPNAG00000024155 ENSPNAG00000024148 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1670 ENSPNAG00000024328 ENSPNAG00000006904 ENSPNAG00000006541 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1142 ENSPNAG00000023000 ENSPNAG00000023020 #37 ENSPNAG00000023086 #37 ENSPNAG00000023102 #37 ENSPNAG00000023139 #37 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1851 ENSPNAG00000001976 #37 ENSPNAG00000001993 #37 ENSPNAG00000011914 ENSPNAG00000011925 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1743 ENSPNAG00000020340 #37 ENSPNAG00000020356 #37 ENSPNAG00000020377 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1767 ENSPNAG00000019072 #37 ENSPNAG00000019081 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2104 ENSPNAG00000020249 #37 ENSPNAG00000020234 #37 ENSPNAG00000020221 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2352 ENSPNAG00000024464 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 2101 ENSPNAG00000020321 ENSPNAG00000020304 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1142 ENSPNAG00000023000 ENSPNAG00000023020 #37 ENSPNAG00000023086 #37 ENSPNAG00000023102 #37 ENSPNAG00000023139 #37 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000001289.b.a ENSGT00940000153467.a.b ENSGT00390000013235 ENSGT00940000154325.a ENSGT00940000161284 ENSGT00390000003231.a ENSGT00940000165729 ENSGT00940000158987 ENSGT00940000153737.a ENSGT00500000044890.b ENSGT00940000159092 ENSGT00940000158417.a ENSGT00940000156892.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT00940000156736.d ENSGT00940000166427 ENSGT00940000156295.h ENSGT00940000158277.a ENSGT01030000234904 ENSGT00940000156944.a.b ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.a ENSGT00730000111223 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000181162 ENSGT00940000163364 ENSGT00940000158578 ENSGT00390000009327 ENSGT00390000008346 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 265 ENSGT00940000154325.a ENSGT00940000161284.h ENSGT00390000003231.a.j ENSGT00940000165729.b ENSGT00940000158987.j ENSGT00940000161284.g ENSGT00390000003231.a.i ENSGT00940000165729.a ENSGT00940000158987.i ENSGT00940000153737.a.j ENSGT00500000044890.b.a ENSGT00940000159092.m ENSGT00940000158417.a.f ENSGT00940000156892.a.g ENSGT00940000155353.b.a.a ENSGT01030000234530.a.f.a.a.k #37 ENSGT00940000155353.b.b ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.a.l #37 ENSGT00940000156736.d ENSGT00940000166427.c ENSGT00940000156295.h.b ENSGT00940000166427.d ENSGT00940000156295.h.a ENSGT00940000158277.a.c ENSGT01030000234904 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 286 ENSGT00940000157039.a.a ENSGT00940000160861.o ENSGT00390000001289.b.a.d ENSGT00940000153467.a.b.j ENSGT00390000013235.f ENSGT00940000161284.g ENSGT00390000003231.a.i ENSGT00940000165729.a ENSGT00940000158987.i ENSGT00940000153737.a.j ENSGT00500000044890.b.a ENSGT00940000159092.m ENSGT00940000158417.a.f ENSGT00940000156892.a.g ENSGT00940000155353.b.a.a ENSGT01030000234530.a.f.a.a.k #37 ENSGT00940000156736.d.c ENSGT00940000166427.d ENSGT00940000156295.h.a ENSGT00940000158277.a.c Common carp reference MODERN SPECIES 20 elf1 (ENSCCRG00000043041) taf7 (ENSCCRG00000001921) drp2 (ENSCCRG00000062292) ENSCCRG00000048168 arl13a (ENSCCRG00000048181) xkrx (ENSCCRG00000056912) nox1 (ENSCCRG00000043239) cstf2 (ENSCCRG00000066582) ENSCCRG00000076464 mid1ip1l (ENSCCRG00000062801) tspan7 (ENSCCRG00000069656) ENSCCRG00000073639 ENSCCRG00000048610 chrnb3b (ENSCCRG00000048599) ENSCCRG00000048613 nitr13 (ENSCCRG00000048614) #37 fgfrl1b (ENSCCRG00000048617) ENSCCRG00000027023 pcdh18b (ENSCCRG00000016363) pcdh10b (ENSCCRG00000007685) eif4ea (ENSCCRG00000072212) adra1bb (ENSCCRG00000043054) adh5 (ENSCCRG00000042995) gar1 (ENSCCRG00000081409) ENSCCRG00000076279 ENSCCRG00000081979 grhpra (ENSCCRG00000081963) slc30a9 (ENSCCRG00000045583) GRXCR1 (ENSCCRG00000039025) ATP8A1 (ENSCCRG00000047630) shisa3 (ENSCCRG00000079663) Goldfish MODERN SPECIES 2347 drp2 (ENSCARG00000042530) ENSCARG00000045193 CENPI (ENSCARG00000045215) tmem35 (ENSCARG00000045412) arl13a (ENSCARG00000045433) xkrx (ENSCARG00000045461) nox1 (ENSCARG00000035441) cstf2 (ENSCARG00000035787) ENSCARG00000035863 ENSCARG00000035875 mid1ip1l (ENSCARG00000035880) tspan7 (ENSCARG00000035892) ENSCARG00000035921 chrnb3b (ENSCARG00000035937) ITGA6 (ENSCARG00000035981) nitr13 (ENSCARG00000036000) #37 ENSCARG00000036010 #37 ENSCARG00000036024 ENSCARG00000036048 ENSCARG00000036166 pcdh18b (ENSCARG00000038614) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 265 ENSGT00940000165729.b ENSGT00940000158987.j ENSGT00940000161284.g ENSGT00390000003231.a.i ENSGT00940000165729.a ENSGT00940000158987.i ENSGT00940000153737.a.j ENSGT00500000044890.b.a ENSGT00940000159092.m ENSGT00940000158417.a.f ENSGT00940000156892.a.g ENSGT00940000155353.b.a.a ENSGT01030000234530.a.f.a.a.k #37 ENSGT00940000155353.b.b ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.a.l #37 ENSGT00940000156736.d ENSGT00940000166427.c ENSGT00940000156295.h.b ENSGT00940000166427.d ENSGT00940000156295.h.a ENSGT00940000158277.a.c ENSGT01030000234904 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00390000001289.b.a.c ENSGT00940000153467.a.b.i ENSGT00390000013235.e ENSGT00940000154325.a ENSGT00940000161284.h ENSGT00390000003231.a.j ENSGT00940000165729.b ENSGT00940000158987.j ENSGT00940000153737.a.i ENSGT00500000044890.b.b ENSGT00940000159092.n ENSGT00940000158417.a.e ENSGT00940000156892.a.h ENSGT00940000155353.b.b ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.a.l #37 ENSGT00940000156736.d.d ENSGT00940000166427.c ENSGT00940000156295.h.b ENSGT00940000158277.a.d ENSGT00940000156944.a.b.c ENSGT00940000154194.c.a.i ENSGT00940000164379.e.a.c ENSGT00730000111223.o ENSGT00940000156665.a.a ENSGT00940000158578.g ENSGT00390000009327 ENSGT00390000008346.h ENSGT00940000159219.b.a ENSGT00940000157110.u ENSGT00940000161360.g.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 166 taf7 (ENSSGRG00000052896) ENSSGRG00000052897 CENPI (ENSSGRG00000052916) tmem35 (ENSSGRG00000052922) arl13a (ENSSGRG00000052924) xkrx (ENSSGRG00000052926) nox1 (ENSSGRG00000052928) cstf2 (ENSSGRG00000052929) ENSSGRG00000052935 mid1ip1l (ENSSGRG00000052936) tspan7 (ENSSGRG00000052940) ENSSGRG00000052944 chrnb3b (ENSSGRG00000052947) ENSSGRG00000052951 ENSSGRG00000052952 #37 nitr13 (ENSSGRG00000052953) #37 fgfrl1b (ENSSGRG00000052954) ENSSGRG00000052956 pcdh18b (ENSSGRG00000053000) Common carp reference MODERN SPECIES 35 ENSCCRG00000001916 drp2 (ENSCCRG00000078233) CENPI (ENSCCRG00000001964) tmem35 (ENSCCRG00000077271) arl13a (ENSCCRG00000043199) xkrx (ENSCCRG00000043208) nox1 (ENSCCRG00000048201) cstf2 (ENSCCRG00000048547) ENSCCRG00000048570 mid1ip1l (ENSCCRG00000064546) tspan7 (ENSCCRG00000082814) ENSCCRG00000070027 chrnb3b (ENSCCRG00000075212) ENSCCRG00000053279 ENSCCRG00000048630 #37 nitr13 (ENSCCRG00000058341) #37 ENSCCRG00000072985 ENSCCRG00000048852 ENSCCRG00000054707 pcdh18b (ENSCCRG00000057920) ENSCCRG00000075886 pcdh10b (ENSCCRG00000066502) ENSCCRG00000067193 adra1bb (ENSCCRG00000050301) eif4ea (ENSCCRG00000050308) adh5 (ENSCCRG00000078416) gar1 (ENSCCRG00000063304) ENSCCRG00000064655 grhpra (ENSCCRG00000053276) zgc:195212 (ENSCCRG00000002082) slc30a9 (ENSCCRG00000045705) Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 5 taf7 (ENSCARG00000039871) ENSCARG00000039839 drp2 (ENSCARG00000037929) CENPI (ENSCARG00000037290) tmem35 (ENSCARG00000037211) arl13a (ENSCARG00000037146) xkrx (ENSCARG00000037084) nox1 (ENSCARG00000035764) cstf2 (ENSCARG00000035547) ENSCARG00000035512 mid1ip1l (ENSCARG00000035500) tspan7 (ENSCARG00000035485) ENSCARG00000035472 chrnb3b (ENSCARG00000035457) ENSCARG00000035447 nitr13 (ENSCARG00000035431) #37 fgfrl1b (ENSCARG00000035424) ENSCARG00000035327 ENSCARG00000035308 LINGO2 (ENSCARG00000035295) tomm5 (ENSCARG00000035288) grhpra (ENSCARG00000035236) ENSCARG00000035228 slc30a9 (ENSCARG00000033726) GRXCR1 (ENSCARG00000033589) ATP8A1 (ENSCARG00000026416) SHISA3 (ENSCARG00000026209) BEND4 (ENSCARG00000026197) ENSCARG00000026193 sfxn5b (ENSCARG00000025852) zgc:153018 (ENSCARG00000025815) Goldfish MODERN SPECIES 2506 ENSCARG00000040422 nitr13 (ENSCARG00000040443) #37 fgfrl1b (ENSCARG00000040455) Zebrafish MODERN SPECIES 5 taf7 (ENSDARG00000019572) ENSDARG00000098164 drp2 (ENSDARG00000101419) CENPI (ENSDARG00000052565) tmem35 (ENSDARG00000052567) arl13a (ENSDARG00000052575) xkrx (ENSDARG00000044011) nox1 (ENSDARG00000087574) cstf2 (ENSDARG00000090788) ENSDARG00000077912 mid1ip1l (ENSDARG00000018145) tspan7 (ENSDARG00000015759) ENSDARG00000021392 chrnb3b (ENSDARG00000038508) ENSDARG00000056018 nitr13 (ENSDARG00000036125) #37 fgfrl1b (ENSDARG00000052556) ENSDARG00000071384 pcdh18b (ENSDARG00000052494) ENSDARG00000114583 pcdh10b (ENSDARG00000102824) adra1bb (ENSDARG00000041173) eif4ea (ENSDARG00000077012) adh5 (ENSDARG00000080010) gar1 (ENSDARG00000076526) LINGO2 (ENSDARG00000074535) si:dkey-109l4.3 (ENSDARG00000102753) tomm5 (ENSDARG00000068265) grhpra (ENSDARG00000068264) zgc:195212 (ENSDARG00000075203) slc30a9 (ENSDARG00000057272) Otomorpha DUPLICATION Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 1020 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT00950000182968.c ##30 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 621 ENSGT01030000234530.a.e.b #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT00950000182968.c ##30 Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000005278 ENSCHAG00000005352 ENSCHAG00000005402 ENSCHAG00000005444 ENSCHAG00000005463 ##30 ENSCHAG00000005475 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007685 #37 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005475 #37 ENSCHAG00000005463 ##30 ENSCHAG00000005444 ENSCHAG00000005402 ENSCHAG00000005352 ENSCHAG00000005278 ENSCHAG00000005200 #37 ENSCHAG00000004871 #37 ENSCHAG00000004479 gpc2 (ENSCHAG00000004265) ENSCHAG00000004232 gpc2 (ENSCHAG00000004005) ENSCHAG00000003913 ENSCHAG00000003877 PIGG (ENSCHAG00000003773) fnta (ENSCHAG00000003134) Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000005200 #37 ENSCHAG00000005278 ENSCHAG00000005352 ENSCHAG00000005402 ENSCHAG00000005444 ENSCHAG00000005463 ##30 ENSCHAG00000005475 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007482 #37 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 gpc2 (ENSCHAG00000004265) ENSCHAG00000004479 ENSCHAG00000004871 #37 ENSCHAG00000005200 #37 ENSCHAG00000005278 ENSCHAG00000005352 ENSCHAG00000005402 ENSCHAG00000005444 ENSCHAG00000005463 ##30 ENSCHAG00000005475 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007449 #37 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000004479 ENSCHAG00000004871 #37 ENSCHAG00000005200 #37 ENSCHAG00000005278 ENSCHAG00000005352 ENSCHAG00000005402 ENSCHAG00000005444 ENSCHAG00000005463 ##30 ENSCHAG00000005475 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007471 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005475 #37 ENSCHAG00000005463 ##30 ENSCHAG00000005444 ENSCHAG00000005402 ENSCHAG00000005352 ENSCHAG00000005278 ENSCHAG00000005200 #37 ENSCHAG00000004871 #37 ENSCHAG00000004479 gpc2 (ENSCHAG00000004265) ENSCHAG00000004232 gpc2 (ENSCHAG00000004005) ENSCHAG00000003913 ENSCHAG00000003877 PIGG (ENSCHAG00000003773) Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000008157 ENSCHAG00000007685 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 ENSCHAG00000005712 #37 ENSCHAG00000005690 #37 ENSCHAG00000005671 ENSCHAG00000005593 ENSCHAG00000005565 ##30 ENSCHAG00000005510 #37 ENSCHAG00000005489 #37 ENSCHAG00000005475 #37 ENSCHAG00000005463 ##30 ENSCHAG00000005444 ENSCHAG00000005402 ENSCHAG00000005352 Denticle herring MODERN SPECIES 302 ENSDCDG00000026081 #37 MID2 (ENSDCDG00000026086) TSC22D3 (ENSDCDG00000026280) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 238 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000158645 ENSGT00390000006394 ENSGT00940000160322 ENSGT00940000158578 ENSGT00940000163364 ENSGT00940000181162 ENSGT00940000156665.a ENSGT00730000111223 ENSGT00940000164379.e.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156944.a.b ENSGT00940000166427 ENSGT00940000156736.d ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000156892.a ENSGT00940000158417.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 252 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.c #37 ENSGT00950000182968.d.b.b.a ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000003144 PCDH10 (ENSIPUG00000003095) ENSIPUG00000003060 PCDH18 (ENSIPUG00000003024) Slc7a11 (ENSIPUG00000002978) FGFRL1 (ENSIPUG00000002959) nitr13 (ENSIPUG00000002953) #37 ENSIPUG00000002947 #37 ENSIPUG00000002938 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019073 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 ENSIPUG00000019047 #37 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019032 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 ENSIPUG00000018983 #37 ENSIPUG00000018938 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 ENSIPUG00000018868 #37 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018834 Channel catfish MODERN SPECIES 430 ENSIPUG00000013229 #37 Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 208 ENSIPUG00000010352 #37 Channel catfish MODERN SPECIES 216 ENSIPUG00000010430 #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 c1qtnf2 (ENSIPUG00000017941) slu7 (ENSIPUG00000017949) HBEGF (ENSIPUG00000017990) ENSIPUG00000018001 ENSIPUG00000018012 ENSIPUG00000018112 rack1 (ENSIPUG00000018129) nme5 (ENSIPUG00000018174) HNRNPAB (ENSIPUG00000018218) eif4ebp3l (ENSIPUG00000018246) hnrnph1 (ENSIPUG00000018262) ENSIPUG00000018284 ENSIPUG00000018331 ENSIPUG00000018342 #37 ENSIPUG00000018351 ENSIPUG00000018359 #37 ENSIPUG00000018381 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018393 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 ENSIPUG00000018529 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018582 ENSIPUG00000018611 #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 FGFRL1 (ENSIPUG00000002959) nitr13 (ENSIPUG00000002953) #37 ENSIPUG00000002947 #37 ENSIPUG00000002938 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019073 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 ENSIPUG00000019047 #37 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019032 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 ENSIPUG00000018983 #37 ENSIPUG00000018938 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 ENSIPUG00000018868 #37 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018820 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 elf2 (ENSIPUG00000017922) Ccrn4l (ENSIPUG00000017932) c1qtnf2 (ENSIPUG00000017941) slu7 (ENSIPUG00000017949) HBEGF (ENSIPUG00000017990) ENSIPUG00000018001 ENSIPUG00000018012 ENSIPUG00000018112 rack1 (ENSIPUG00000018129) nme5 (ENSIPUG00000018174) HNRNPAB (ENSIPUG00000018218) eif4ebp3l (ENSIPUG00000018246) hnrnph1 (ENSIPUG00000018262) ENSIPUG00000018284 ENSIPUG00000018331 ENSIPUG00000018342 #37 ENSIPUG00000018351 ENSIPUG00000018359 #37 ENSIPUG00000018381 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018393 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 ENSIPUG00000018529 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) Channel catfish MODERN SPECIES 27 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 ENSIPUG00000019047 #37 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019032 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 ENSIPUG00000018983 #37 ENSIPUG00000018938 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 ENSIPUG00000018868 #37 ENSIPUG00000018850 ENSIPUG00000018846 ENSIPUG00000018834 ENSIPUG00000018824 ENSIPUG00000018820 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 Channel catfish MODERN SPECIES 27 gar1 (ENSIPUG00000003194) adh5 (ENSIPUG00000003169) eif4ea (ENSIPUG00000003156) adra1bb (ENSIPUG00000003153) ENSIPUG00000003144 PCDH10 (ENSIPUG00000003095) ENSIPUG00000003060 PCDH18 (ENSIPUG00000003024) Slc7a11 (ENSIPUG00000002978) FGFRL1 (ENSIPUG00000002959) nitr13 (ENSIPUG00000002953) #37 ENSIPUG00000002947 #37 ENSIPUG00000002938 ENSIPUG00000019092 #37 ENSIPUG00000019082 ENSIPUG00000019073 #37 nitr13 (ENSIPUG00000019065) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019057) #37 ENSIPUG00000019047 #37 ENSIPUG00000019041 #37 ENSIPUG00000019032 nitr13 (ENSIPUG00000019024) #37 nitr13 (ENSIPUG00000019010) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018988) #37 ENSIPUG00000018983 #37 ENSIPUG00000018938 nitr13 (ENSIPUG00000018924) #37 ENSIPUG00000018919 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018913) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018907) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018896) #37 Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018001 ENSIPUG00000018012 ENSIPUG00000018112 rack1 (ENSIPUG00000018129) nme5 (ENSIPUG00000018174) HNRNPAB (ENSIPUG00000018218) eif4ebp3l (ENSIPUG00000018246) hnrnph1 (ENSIPUG00000018262) ENSIPUG00000018284 ENSIPUG00000018331 ENSIPUG00000018342 #37 ENSIPUG00000018351 ENSIPUG00000018359 #37 ENSIPUG00000018381 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018393 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 ENSIPUG00000018529 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018582 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018720 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000009327 ENSGT00940000158578 ENSGT00940000163364 ENSGT00940000181162 ENSGT00940000156665.a ENSGT00730000111223 ENSGT00940000164379.e.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156944.a.b ENSGT01030000234904 ENSGT00940000158277.a ENSGT00940000156295.h ENSGT00940000166427 ENSGT00940000156736.d ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT00940000155353.b ENSGT00940000156892.a ENSGT00940000158417.a ENSGT00940000159092 ENSGT00500000044890.b ENSGT00940000153737.a ENSGT00940000158987 ENSGT00940000165729 ENSGT00390000003231.a ENSGT00940000161284 ENSGT00940000154325.a ENSGT00390000013235 ENSGT00940000153467.a.b ENSGT00390000001289.b.a ENSGT00940000160861 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 265 ENSGT01030000234904 ENSGT00940000158277.a.c ENSGT00940000156295.h.a ENSGT00940000166427.d ENSGT00940000156295.h.b ENSGT00940000166427.c ENSGT00940000156736.d ENSGT01030000234530.a.f.a.a.l #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT00940000155353.b.b ENSGT01030000234530.a.f.a.a.k #37 ENSGT00940000155353.b.a.a ENSGT00940000156892.a.g ENSGT00940000158417.a.f ENSGT00940000159092.m ENSGT00500000044890.b.a ENSGT00940000153737.a.j ENSGT00940000158987.i ENSGT00940000165729.a ENSGT00390000003231.a.i ENSGT00940000161284.g ENSGT00940000158987.j ENSGT00940000165729.b ENSGT00390000003231.a.j Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00940000157110.u ENSGT00940000159219.b.a ENSGT00390000008346.h ENSGT00390000009327 ENSGT00940000158578.g ENSGT00940000156665.a.a ENSGT00730000111223.o ENSGT00940000164379.e.a.c ENSGT00940000154194.c.a.i ENSGT00940000156944.a.b.c ENSGT00940000158277.a.d ENSGT00940000156295.h.b ENSGT00940000166427.c ENSGT00940000156736.d.d ENSGT01030000234530.a.f.a.a.l #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.a #37 ENSGT00940000155353.b.b ENSGT00940000156892.a.h ENSGT00940000158417.a.e ENSGT00940000159092.n ENSGT00500000044890.b.b ENSGT00940000153737.a.i ENSGT00940000158987.j ENSGT00940000165729.b ENSGT00390000003231.a.j ENSGT00940000161284.h ENSGT00940000154325.a ENSGT00390000013235.e ENSGT00940000153467.a.b.i ENSGT00390000001289.b.a.c ENSGT00940000160861.p Common carp reference MODERN SPECIES 35 zgc:195212 (ENSCCRG00000002082) grhpra (ENSCCRG00000053276) ENSCCRG00000064655 gar1 (ENSCCRG00000063304) adh5 (ENSCCRG00000078416) eif4ea (ENSCCRG00000050308) adra1bb (ENSCCRG00000050301) ENSCCRG00000067193 pcdh10b (ENSCCRG00000066502) ENSCCRG00000075886 pcdh18b (ENSCCRG00000057920) ENSCCRG00000054707 ENSCCRG00000048852 ENSCCRG00000072985 nitr13 (ENSCCRG00000058341) #37 ENSCCRG00000048630 #37 ENSCCRG00000053279 chrnb3b (ENSCCRG00000075212) ENSCCRG00000070027 tspan7 (ENSCCRG00000082814) mid1ip1l (ENSCCRG00000064546) ENSCCRG00000048570 cstf2 (ENSCCRG00000048547) nox1 (ENSCCRG00000048201) xkrx (ENSCCRG00000043208) arl13a (ENSCCRG00000043199) tmem35 (ENSCCRG00000077271) CENPI (ENSCCRG00000001964) drp2 (ENSCCRG00000078233) ENSCCRG00000001916 elf1 (ENSCCRG00000076887) Golden-line barbel MODERN SPECIES 166 pcdh18b (ENSSGRG00000053000) ENSSGRG00000052956 fgfrl1b (ENSSGRG00000052954) nitr13 (ENSSGRG00000052953) #37 ENSSGRG00000052952 #37 ENSSGRG00000052951 chrnb3b (ENSSGRG00000052947) ENSSGRG00000052944 tspan7 (ENSSGRG00000052940) mid1ip1l (ENSSGRG00000052936) ENSSGRG00000052935 cstf2 (ENSSGRG00000052929) nox1 (ENSSGRG00000052928) xkrx (ENSSGRG00000052926) arl13a (ENSSGRG00000052924) tmem35 (ENSSGRG00000052922) CENPI (ENSSGRG00000052916) ENSSGRG00000052897 taf7 (ENSSGRG00000052896) elf1 (ENSSGRG00000052894) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.f.a.b.b #37 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.f.a.b.b #37 Characiphysae DUPLICATION Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.f.a.b.b.a #37 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 337 ENSGT01030000234530.a.f.a.b.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.f.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a.i Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 1545 ENSEEEG00000009064 #37 ENSEEEG00000009062 #37 Electric eel MODERN SPECIES 1728 ENSEEEG00000002793 #37 Channel catfish DUPLICATION Channel catfish MODERN SPECIES 27 ENSIPUG00000018820 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018804) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018784) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018772) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018761) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018731) #37 ENSIPUG00000018720 ENSIPUG00000018703 #37 ENSIPUG00000018690 #37 ENSIPUG00000018611 #37 ENSIPUG00000018582 chrnb3b (ENSIPUG00000018554) ENSIPUG00000018529 nitr13 (ENSIPUG00000018523) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018499) #37 ENSIPUG00000018491 #37 nitr13 (ENSIPUG00000018462) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018454) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018429) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018421) #37 nitr13 (ENSIPUG00000018406) #37 ENSIPUG00000018393 #37 ENSIPUG00000018386 ENSIPUG00000018381 ENSIPUG00000018359 #37 ENSIPUG00000018351 ENSIPUG00000018342 #37 ENSIPUG00000018331 ENSIPUG00000018284 hnrnph1 (ENSIPUG00000018262) eif4ebp3l (ENSIPUG00000018246) Channel catfish MODERN SPECIES 447 ENSIPUG00000013384 #37 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.f.a.b.b.b #37 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.f.a.b.b.b #37 Electric eel MODERN SPECIES 1566 ENSEEEG00000009742 ENSEEEG00000009743 #37 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.f.a.b.b #37 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.f.a.b.b #37 Goldfish MODERN SPECIES 2347 pcdh18b (ENSCARG00000038614) ENSCARG00000036166 ENSCARG00000036048 ENSCARG00000036024 ENSCARG00000036010 #37 nitr13 (ENSCARG00000036000) #37 ITGA6 (ENSCARG00000035981) chrnb3b (ENSCARG00000035937) ENSCARG00000035921 tspan7 (ENSCARG00000035892) mid1ip1l (ENSCARG00000035880) ENSCARG00000035875 ENSCARG00000035863 cstf2 (ENSCARG00000035787) nox1 (ENSCARG00000035441) xkrx (ENSCARG00000045461) arl13a (ENSCARG00000045433) tmem35 (ENSCARG00000045412) CENPI (ENSCARG00000045215) ENSCARG00000045193 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.f.a.b.b #37 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 zgc:92242 (ENSCHAG00000009179) CXXC5 (ENSCHAG00000009174) zgc:110843 (ENSCHAG00000009122) ENSCHAG00000008941 ENSCHAG00000008408 sting1 (ENSCHAG00000008386) ENSCHAG00000008370 brd8b (ENSCHAG00000008258) ENSCHAG00000008223 ENSCHAG00000008218 ENSCHAG00000008194 PCDH1 (ENSCHAG00000008178) ENSCHAG00000008157 ENSCHAG00000007685 #37 ENSCHAG00000007482 #37 ENSCHAG00000007467 #37 ENSCHAG00000007471 ENSCHAG00000007449 #37 ENSCHAG00000007443 ENSCHAG00000007382 #37 ENSCHAG00000007139 #37 ENSCHAG00000006927 #37 ENSCHAG00000006909 #37 ENSCHAG00000006464 #37 ENSCHAG00000006331 #37 ENSCHAG00000006295 #37 ENSCHAG00000005813 #37 ENSCHAG00000005797 #37 ENSCHAG00000005776 #37 ENSCHAG00000005742 #37 ENSCHAG00000005731 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.f.b #37 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.f.b #37 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.a.f.b #37 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 370 ENSGT00390000004124.j.l ENSGT00950000183050.b.b.b.a.b.b.h ENSGT00940000155078.b.f.a ENSGT00940000161027.b.g ENSGT00940000155293.b ENSGT00640000091486.a.j ENSGT00940000166499.b ENSGT01030000234573.B.c.b.b.h ENSGT00940000159589.b ENSGT00390000005147.a ENSGT00600000084617.a.b ENSGT00940000157482.e.a ENSGT00390000014237.c ENSGT00940000166658.b.d ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.a.a.b #37 ENSGT00940000162676.a.a.k.a ENSGT00940000162676.a.a.k.b.b ENSGT01030000235316.b.a ENSGT01030000235316.a ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00940000162676.a.a.l Goldfish DUPLICATION Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 25 tspan3b (ENSCARG00000020995) nmbb (ENSCARG00000020992) FRMD5 (ENSCARG00000020661) tmed3 (ENSCARG00000020637) si:ch211-107o10.3 (ENSCARG00000020627) wdr76 (ENSCARG00000020608) ZNF710 (ENSCARG00000020601) terb2 (ENSCARG00000020571) APBA2 (ENSCARG00000018898) mcee (ENSCARG00000018783) mphosph10 (ENSCARG00000018154) mtmr10 (ENSCARG00000016698) ENSCARG00000016664 map4k2 (ENSCARG00000016617) ENSCARG00000016606 ##30 ENSCARG00000016590 #37 nitr4a (ENSCARG00000016550) #37 ENSCARG00000016545 #37 ENSCARG00000016513 znf16l (ENSCARG00000016504) ENSCARG00000016469 msantd1 (ENSCARG00000016458) dtx4a (ENSCARG00000016451) coro1b (ENSCARG00000016440) ENSCARG00000016435 trmt10a (ENSCARG00000016415) C4orf54 (ENSCARG00000016406) mllt3 (ENSCARG00000016390) ENSCARG00000014867 hacd4 (ENSCARG00000069401) ENSCARG00000069393 Goldfish MODERN SPECIES 25 aldh1a2 (ENSCARG00000035139) ARNT2 (ENSCARG00000035177) fah (ENSCARG00000035462) mthfs (ENSCARG00000035838) MINAR1 (ENSCARG00000035854) ADAMTS17 (ENSCARG00000035908) asb7 (ENSCARG00000036155) aldh1a3 (ENSCARG00000036263) LRRK1 (ENSCARG00000039479) chsy1 (ENSCARG00000039813) selenos (ENSCARG00000005841) snrpa1 (ENSCARG00000005870) PCSK6 (ENSCARG00000006373) ENSCARG00000007960 ADISSP (ENSCARG00000007971) ENSCARG00000007984 #37 nitr4a (ENSCARG00000007995) #37 ENSCARG00000008018 #37 nitr5 (ENSCARG00000008024) #37 ENSCARG00000008036 #37 ENSCARG00000008044 #37 ENSCARG00000008066 #37 ENSCARG00000008072 #37 nitr3b (ENSCARG00000008087) nitr3b (ENSCARG00000008114) nitr3a (ENSCARG00000008121) nitr3a (ENSCARG00000008138) ENSCARG00000008157 ENSCARG00000008168 nitr8 (ENSCARG00000008185) ##30 nitr9 (ENSCARG00000008220) #37 Goldfish MODERN SPECIES 523 map4k2 (ENSCARG00000052885) ENSCARG00000052865 ##30 ENSCARG00000052852 #37 nitr4a (ENSCARG00000052750) #37 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00600000084617.a.b ENSGT00940000157482.e.a ENSGT00390000014237.c ENSGT00940000166658.b.d ENSGT00950000182968.d.b.b.b ##30 ENSGT01030000234530.a.f.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.b #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.b.a.a.a #37 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.a.a.b.a.b #37 ENSGT01030000235316.a ENSGT00940000163460.c.c.a.b ENSGT00950000182968.d.b.b.a.a.b ##30 ENSGT01030000234530.a.e.a.a.b.d #37 ENSGT00940000162676.a.a.l ENSGT00940000162676.b.a.b.a.a ENSGT00920000150729.A.a ENSGT00940000154963.f ENSGT00940000156825.h ENSGT00390000008184.a ENSGT00950000183093.B.a.b.d.a.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 4770 ENSSGRG00000004720 #37 Common carp reference MODERN SPECIES 6 ENSCCRG00000079632 cd248a (ENSCCRG00000063147) ENSCCRG00000027529 ENSCCRG00000017445 rab1ba (ENSCCRG00000054045) ENSCCRG00000012014 taf6l (ENSCCRG00000079995) mta2 (ENSCCRG00000070119) ENSCCRG00000030751 ecsit (ENSCCRG00000030615) ENSCCRG00000079668 ENSCCRG00000073273 men1 (ENSCCRG00000030597) map4k2 (ENSCCRG00000027092) nitr6a (ENSCCRG00000027020) ##30 ENSCCRG00000077430 #37 nitr4a (ENSCCRG00000027007) #37 ENSCCRG00000026999 #37 nitr5 (ENSCCRG00000026995) #37 nitr5 (ENSCCRG00000081378) #37 ENSCCRG00000014129 #37 ENSCCRG00000045558 #37 ENSCCRG00000014123 ENSCCRG00000047828 #37 ENSCCRG00000009450 #37 ENSCCRG00000043893 #37 nitr3b (ENSCCRG00000036870) nitr3a (ENSCCRG00000051636) ENSCCRG00000060153 ENSCCRG00000043869 nitr8 (ENSCCRG00000043858) ##30 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 186 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT00390000014827 ENSGT00950000182866.D.d.b ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b Euteleosteomorpha DUPLICATION Euteleosteomorpha DUPLICATION Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 648 ENSGT01030000234530.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 632 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.a.a.a ##37 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.a.a ##37 Huchen MODERN SPECIES 5081 ENSHHUG00000050810 ENSHHUG00000050832 ENSHHUG00000050838 ENSHHUG00000050844 ##37 ENSHHUG00000050846 ENSHHUG00000050850 ENSHHUG00000050856 ENSHHUG00000050860 ##37 ENSHHUG00000050896 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.a.a ##37 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.a.a ##37 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.a.a ##37 Coho salmon MODERN SPECIES 29 fgf11a (ENSOKIG00005002227) chrnb1 (ENSOKIG00005002283) chrnb1l (ENSOKIG00005002436) cldn7a (ENSOKIG00005002450) ENSOKIG00005002456 ENSOKIG00005002459 ENSOKIG00005002468 ENSOKIG00005002474 PTGDR2 (ENSOKIG00005002482) ENSOKIG00005002487 FXR2 (ENSOKIG00005002610) ponzr6 (ENSOKIG00005003344) rbm4.3 (ENSOKIG00005003347) ENSOKIG00005003355 ENSOKIG00005003364 ENSOKIG00005003372 ##37 ENSOKIG00005003388 ENSOKIG00005003400 ENSOKIG00005003438 ENSOKIG00005003453 ENSOKIG00005003459 ENSOKIG00005003480 ENSOKIG00005003515 ENSOKIG00005003520 ##37 ENSOKIG00005003526 ENSOKIG00005003537 ENSOKIG00005003558 ##37 ENSOKIG00005003579 ENSOKIG00005003592 ENSOKIG00005003604 ENSOKIG00005003609 ##37 Chinook salmon MODERN SPECIES 6 ENSOTSG00005027936 NEURL4 (ENSOTSG00005027659) ENSOTSG00005027655 ENSOTSG00005027653 ndufs2 (ENSOTSG00005027463) ENSOTSG00005027460 dock11 (ENSOTSG00005023088) ENSOTSG00005023047 ENSOTSG00005023046 ##37 ENSOTSG00005023045 ENSOTSG00005023044 ENSOTSG00005023043 ENSOTSG00005022931 ##37 ENSOTSG00005022923 ##37 ENSOTSG00005022921 ENSOTSG00005022920 ##37 ENSOTSG00005022919 ##37 ENSOTSG00005022917 ##37 ENSOTSG00005015871 ENSOTSG00005015870 ENSOTSG00005015869 ##37 ENSOTSG00005015868 ENSOTSG00005015865 ENSOTSG00005015864 ENSOTSG00005015817 ENSOTSG00005015814 ENSOTSG00005015813 ENSOTSG00005015812 rbm4.3 (ENSOTSG00005015811) ponzr6 (ENSOTSG00005015810) fxr2 (ENSOTSG00005014173) Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000159866.b ENSGT01100000263520.b.b.f.k.b ENSGT00940000157535.m.a.b ENSGT01090000260120 ENSGT00390000009529.h.b ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT00940000178201 ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000018418.i ENSGT00440000037582.m ENSGT00940000158001.g ENSGT00510000050706.c ENSGT00940000163503.A.a.a.a ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.j ENSGT00940000159866.b ENSGT01100000263520.b.b.f.k.b ENSGT00940000157535.m.a.b ENSGT01090000260120 ENSGT00390000009529.h.b ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 847 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 ENSSSAG00000054599 ##37 ENSSSAG00000054586 ENSSSAG00000088055 ##37 ENSSSAG00000054560 ENSSSAG00000054518 ##37 ENSSSAG00000112574 ENSSSAG00000054373 ##37 ENSSSAG00000054365 ##37 ENSSSAG00000054244 ENSSSAG00000054233 ENSSSAG00000054226 ENSSSAG00000054222 ##37 ENSSSAG00000054216 ENSSSAG00000054196 ENSSSAG00000081588 ENSSSAG00000054173 ##37 ENSSSAG00000054158 ENSSSAG00000082179 ENSSSAG00000098161 ENSSSAG00000086607 ENSSSAG00000102680 dock11 (ENSSSAG00000049786) ENSSSAG00000049672 ENSSSAG00000049622 kirrel1a (ENSSSAG00000048490) ndufs2 (ENSSSAG00000048443) ENSSSAG00000048434 ENSSSAG00000081072 ENSSSAG00000048380 ENSSSAG00000048400 ENSSSAG00000104814 Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 ENSSSAG00000105625 ##37 ENSSSAG00000120008 ENSSSAG00000054627 ##37 ENSSSAG00000054617 ENSSSAG00000054599 ##37 ENSSSAG00000054586 ENSSSAG00000088055 ##37 ENSSSAG00000054560 ENSSSAG00000054518 ##37 ENSSSAG00000112574 ENSSSAG00000054373 ##37 ENSSSAG00000054365 ##37 ENSSSAG00000054244 ENSSSAG00000054233 ENSSSAG00000054226 ENSSSAG00000054222 ##37 ENSSSAG00000054216 ENSSSAG00000054196 ENSSSAG00000081588 ENSSSAG00000054173 ##37 ENSSSAG00000054158 ENSSSAG00000082179 ENSSSAG00000098161 ENSSSAG00000086607 ENSSSAG00000102680 dock11 (ENSSSAG00000049786) ENSSSAG00000049672 ENSSSAG00000049622 kirrel1a (ENSSSAG00000048490) ndufs2 (ENSSSAG00000048443) ENSSSAG00000048434 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00440000037582.m ENSGT00940000158001.g ENSGT00510000050706.c ENSGT00800000125278 ENSGT00940000163503.A.a.a.a ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.j ENSGT00940000159866.b ENSGT01100000263520.b.b.f.k.b ENSGT00940000157535.m.a.b ENSGT01090000260120 ENSGT00390000009529.h.b ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01000000214950.B ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00440000037582.m ENSGT00940000158001.g ENSGT00510000050706.c ENSGT00800000125278 ENSGT00940000163503.A.a.a.a ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.j ENSGT00940000159866.b ENSGT01100000263520.b.b.f.k.b ENSGT00940000157535.m.a.b ENSGT01090000260120 ENSGT00390000009529.h.b ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01000000214950.B ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.d ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b Chinook salmon MODERN SPECIES 1 dnajc3b (ENSOTSG00005002398) naa38 (ENSOTSG00005002389) cyb5d1 (ENSOTSG00005002377) tnfsf12 (ENSOTSG00005002342) ENSOTSG00005002337 ENSOTSG00005002326 NEURL4 (ENSOTSG00005001903) ENSOTSG00005001881 ENSOTSG00005001871 ENSOTSG00005001861 ndufs2 (ENSOTSG00005001814) kirrel1a (ENSOTSG00005001277) ENSOTSG00005001256 ENSOTSG00005001244 dock11 (ENSOTSG00005001212) ENSOTSG00005001194 ##37 ENSOTSG00005001135 ENSOTSG00005001124 ##37 ENSOTSG00005001116 ENSOTSG00005001109 ENSOTSG00005001101 ENSOTSG00005001088 ENSOTSG00005001079 ENSOTSG00005001074 ufm1 (ENSOTSG00005001065) ENSOTSG00005001057 ENSOTSG00005001037 ENSOTSG00005000807 ##37 ENSOTSG00005017655 ENSOTSG00005017654 ##37 ENSOTSG00005017653 Coho salmon MODERN SPECIES 7 ENSOKIG00005037237 ENSOKIG00005037262 ENSOKIG00005037288 ##37 ENSOKIG00005037326 ENSOKIG00005037337 ENSOKIG00005037369 ENSOKIG00005037395 ENSOKIG00005037609 ##37 ENSOKIG00005037622 ENSOKIG00005037636 ENSOKIG00005037648 ##37 ENSOKIG00005037668 ENSOKIG00005037688 ##37 ENSOKIG00005037717 ENSOKIG00005037769 ##37 ENSOKIG00005037816 ##37 ENSOKIG00005037844 ENSOKIG00005037874 ENSOKIG00005037901 ENSOKIG00005037970 ENSOKIG00005038173 ENSOKIG00005038189 kirrel1a (ENSOKIG00005038277) ndufs2 (ENSOKIG00005038691) ENSOKIG00005038729 ENSOKIG00005004296 ENSOKIG00005004325 ENSOKIG00005004348 NEURL4 (ENSOKIG00005004443) ENSOKIG00005004634 ENSOKIG00005004657 Huchen MODERN SPECIES 2609 ENSHHUG00000011038 dock11 (ENSHHUG00000011085) ENSHHUG00000013331 ##37 ENSHHUG00000013342 ENSHHUG00000013345 ##37 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 2219 ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.a.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.b ##37 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.b ##37 Atlantic salmon MODERN SPECIES 26 ENSSSAG00000090985 ENSSSAG00000108996 ENSSSAG00000081558 ENSSSAG00000092267 ENSSSAG00000113629 ENSSSAG00000081551 ##37 ENSSSAG00000081565 ENSSSAG00000081567 ENSSSAG00000081569 ##37 ENSSSAG00000081562 ENSSSAG00000081574 ##37 ENSSSAG00000081576 ENSSSAG00000081581 ENSSSAG00000081563 ENSSSAG00000054184 ENSSSAG00000085081 ##37 ENSSSAG00000081589 TIFA (ENSSSAG00000081590) rbm4.3 (ENSSSAG00000081591) ponzr6 (ENSSSAG00000081592) ENSSSAG00000081596 ENSSSAG00000098606 ENSSSAG00000081607 ENSSSAG00000093788 ENSSSAG00000088265 ENSSSAG00000081609 cldn7a (ENSSSAG00000081611) chrnb1l (ENSSSAG00000099212) ENSSSAG00000097107 chrnb1 (ENSSSAG00000081612) fgf11a (ENSSSAG00000081614) River trout MODERN SPECIES 38 ENSSTUG00000045482 ##37 ENSSTUG00000045490 ENSSTUG00000045508 ENSSTUG00000045521 ##30 ENSSTUG00000045530 ENSSTUG00000045540 ##37 ENSSTUG00000045547 ENSSTUG00000045557 ENSSTUG00000045565 ENSSTUG00000045603 ENSSTUG00000045650 ENSSTUG00000045679 ##37 ENSSTUG00000045685 ##37 ENSSTUG00000045692 ENSSTUG00000045745 ENSSTUG00000045755 ##37 ENSSTUG00000045816 ENSSTUG00000045820 TIFA (ENSSTUG00000045821) rbm4.3 (ENSSTUG00000045823) ponzr6 (ENSSTUG00000045832) ponzr6 (ENSSTUG00000045872) fxr2 (ENSSTUG00000045929) PTGDR2 (ENSSTUG00000046850) ENSSTUG00000046855 ENSSTUG00000046863 ENSSTUG00000046871 cldn7a (ENSSTUG00000046881) chrnb1l (ENSSTUG00000046886) chrnb1 (ENSSTUG00000046898) fgf11a (ENSSTUG00000046978) Huchen MODERN SPECIES 354 ENSHHUG00000000993 ENSHHUG00000000961 ENSHHUG00000000936 ENSHHUG00000000898 ENSHHUG00000000818 ENSHHUG00000000810 ENSHHUG00000000796 ENSHHUG00000000784 ENSHHUG00000000772 ENSHHUG00000000760 ENSHHUG00000000685 ENSHHUG00000000670 ENSHHUG00000000662 ENSHHUG00000000659 ENSHHUG00000000616 ENSHHUG00000000578 ##37 ENSHHUG00000000569 ENSHHUG00000000495 ##37 ENSHHUG00000000412 ENSHHUG00000000396 ##37 ENSHHUG00000000384 ##37 ENSHHUG00000000242 ##37 ENSHHUG00000000216 ENSHHUG00000000157 ##37 ENSHHUG00000000113 ENSHHUG00000000107 ##37 ENSHHUG00000000087 ##37 ENSHHUG00000000082 ##37 ENSHHUG00000000073 ENSHHUG00000000014 ENSHHUG00000051732 ##37 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 Northern pike DUPLICATION Northern pike DUPLICATION Northern pike MODERN SPECIES 23 NEURL4 (ENSELUG00000020001) ENSELUG00000020017 ENSELUG00000020043 ENSELUG00000020062 ndufs2 (ENSELUG00000020079) kirrel1a (ENSELUG00000020129) ENSELUG00000020199 il13ra1 (ENSELUG00000020240) ENSELUG00000031077 il13ra1 (ENSELUG00000020274) ENSELUG00000020368 ENSELUG00000030563 il13ra1 (ENSELUG00000020430) dock11 (ENSELUG00000000903) ENSELUG00000021929 ##37 ENSELUG00000020860 ##37 ENSELUG00000021959 ENSELUG00000020897 ##37 ENSELUG00000028765 ##37 ENSELUG00000030037 ENSELUG00000020914 ##37 ENSELUG00000020937 ENSELUG00000033573 ENSELUG00000020952 ENSELUG00000021454 ##37 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 Northern pike MODERN SPECIES 23 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 ENSELUG00000020684 ##37 ENSELUG00000021529 ENSELUG00000021522 ##37 ENSELUG00000034484 ENSELUG00000021824 ##37 ENSELUG00000025442 ENSELUG00000021869 ##30 ENSELUG00000021904 ##37 ENSELUG00000021504 ##37 ENSELUG00000021265 ##37 ENSELUG00000021988 ENSELUG00000022142 ENSELUG00000022093 ##37 ENSELUG00000026414 ENSELUG00000022109 ENSELUG00000022132 rbm4.3 (ENSELUG00000022150) ENSELUG00000022162 rbm4.3 (ENSELUG00000022168) ponzr6 (ENSELUG00000022989) ponzr6 (ENSELUG00000022425) fxr2 (ENSELUG00000023014) PTGDR2 (ENSELUG00000023025) ENSELUG00000023036 ugt5g1 (ENSELUG00000023037) ENSELUG00000023059 ENSELUG00000031040 cldn7a (ENSELUG00000023089) Northern pike DUPLICATION Northern pike DUPLICATION Northern pike MODERN SPECIES 23 ENSELUG00000020914 ##37 ENSELUG00000020937 ENSELUG00000033573 ENSELUG00000020952 ENSELUG00000021454 ##37 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 ENSELUG00000020684 ##37 ENSELUG00000021529 ENSELUG00000021522 ##37 ENSELUG00000034484 ENSELUG00000021824 ##37 ENSELUG00000025442 ENSELUG00000021869 ##30 ENSELUG00000021904 ##37 ENSELUG00000021504 ##37 ENSELUG00000021265 ##37 ENSELUG00000021988 ENSELUG00000022142 ENSELUG00000022093 ##37 ENSELUG00000026414 ENSELUG00000022109 ENSELUG00000022132 rbm4.3 (ENSELUG00000022150) ENSELUG00000022162 rbm4.3 (ENSELUG00000022168) ponzr6 (ENSELUG00000022989) Northern pike MODERN SPECIES 23 ENSELUG00000020952 ENSELUG00000021454 ##37 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 ENSELUG00000020684 ##37 ENSELUG00000021529 ENSELUG00000021522 ##37 ENSELUG00000034484 ENSELUG00000021824 ##37 ENSELUG00000025442 ENSELUG00000021869 ##30 ENSELUG00000021904 ##37 ENSELUG00000021504 ##37 ENSELUG00000021265 ##37 ENSELUG00000021988 ENSELUG00000022142 ENSELUG00000022093 ##37 ENSELUG00000026414 ENSELUG00000022109 ENSELUG00000022132 rbm4.3 (ENSELUG00000022150) ENSELUG00000022162 rbm4.3 (ENSELUG00000022168) ponzr6 (ENSELUG00000022989) ponzr6 (ENSELUG00000022425) fxr2 (ENSELUG00000023014) PTGDR2 (ENSELUG00000023025) Northern pike DUPLICATION Northern pike DUPLICATION Northern pike MODERN SPECIES 23 ENSELUG00000020043 ENSELUG00000020062 ndufs2 (ENSELUG00000020079) kirrel1a (ENSELUG00000020129) ENSELUG00000020199 il13ra1 (ENSELUG00000020240) ENSELUG00000031077 il13ra1 (ENSELUG00000020274) ENSELUG00000020368 ENSELUG00000030563 il13ra1 (ENSELUG00000020430) dock11 (ENSELUG00000000903) ENSELUG00000021929 ##37 ENSELUG00000020860 ##37 ENSELUG00000021959 ENSELUG00000020897 ##37 ENSELUG00000028765 ##37 ENSELUG00000030037 ENSELUG00000020914 ##37 ENSELUG00000020937 ENSELUG00000033573 ENSELUG00000020952 ENSELUG00000021454 ##37 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 ENSELUG00000020684 ##37 ENSELUG00000021529 Northern pike MODERN SPECIES 23 ENSELUG00000020062 ndufs2 (ENSELUG00000020079) kirrel1a (ENSELUG00000020129) ENSELUG00000020199 il13ra1 (ENSELUG00000020240) ENSELUG00000031077 il13ra1 (ENSELUG00000020274) ENSELUG00000020368 ENSELUG00000030563 il13ra1 (ENSELUG00000020430) dock11 (ENSELUG00000000903) ENSELUG00000021929 ##37 ENSELUG00000020860 ##37 ENSELUG00000021959 ENSELUG00000020897 ##37 ENSELUG00000028765 ##37 ENSELUG00000030037 ENSELUG00000020914 ##37 ENSELUG00000020937 ENSELUG00000033573 ENSELUG00000020952 ENSELUG00000021454 ##37 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 ENSELUG00000020684 ##37 ENSELUG00000021529 ENSELUG00000021522 ##37 Northern pike MODERN SPECIES 23 kirrel1a (ENSELUG00000020129) ENSELUG00000020199 il13ra1 (ENSELUG00000020240) ENSELUG00000031077 il13ra1 (ENSELUG00000020274) ENSELUG00000020368 ENSELUG00000030563 il13ra1 (ENSELUG00000020430) dock11 (ENSELUG00000000903) ENSELUG00000021929 ##37 ENSELUG00000020860 ##37 ENSELUG00000021959 ENSELUG00000020897 ##37 ENSELUG00000028765 ##37 ENSELUG00000030037 ENSELUG00000020914 ##37 ENSELUG00000020937 ENSELUG00000033573 ENSELUG00000020952 ENSELUG00000021454 ##37 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 ENSELUG00000020684 ##37 ENSELUG00000021529 ENSELUG00000021522 ##37 ENSELUG00000034484 ENSELUG00000021824 ##37 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000155658.k ENSGT00940000178201 ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000163701.b.b.d ENSGT00940000166258.d.b ENSGT00940000158661.b.g ENSGT00940000158058.a.a.a Huchen MODERN SPECIES 354 ENSHHUG00000000662 ENSHHUG00000000659 ENSHHUG00000000616 ENSHHUG00000000578 ##37 ENSHHUG00000000569 ENSHHUG00000000495 ##37 ENSHHUG00000000412 ENSHHUG00000000396 ##37 ENSHHUG00000000384 ##37 ENSHHUG00000000242 ##37 ENSHHUG00000000216 ENSHHUG00000000157 ##37 ENSHHUG00000000113 ENSHHUG00000000107 ##37 ENSHHUG00000000087 ##37 ENSHHUG00000000082 ##37 ENSHHUG00000000073 ENSHHUG00000000014 ENSHHUG00000051732 ##37 ENSHHUG00000051596 ENSHHUG00000051590 ENSHHUG00000051581 ENSHHUG00000051580 rbm4.3 (ENSHHUG00000051562) fxr2 (ENSHHUG00000051250) PTGDR2 (ENSHHUG00000051235) ENSHHUG00000051232 ugt5g1 (ENSHHUG00000051231) ENSHHUG00000051227 ENSHHUG00000051225 cldn7a (ENSHHUG00000051224) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000165455.a.p.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000163701.b.b.d Salmo ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.a ENSGT00990000204231.D ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000165455.a.p.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A River trout MODERN SPECIES 35 ENSSTUG00000047244 ENSSTUG00000047260 ##37 ENSSTUG00000047264 ##37 ENSSTUG00000047270 ENSSTUG00000047283 ENSSTUG00000047330 ENSSTUG00000047375 ##37 ENSSTUG00000047378 ENSSTUG00000047382 ##37 ENSSTUG00000000059 ##37 ENSSTUG00000000090 ENSSTUG00000000232 ENSSTUG00000000247 ##37 ENSSTUG00000000267 ##37 ENSSTUG00000000289 ##37 ENSSTUG00000000290 ##37 ENSSTUG00000000296 ENSSTUG00000000312 ENSSTUG00000000324 ENSSTUG00000000354 ENSSTUG00000000392 ENSSTUG00000000393 rbm4.3 (ENSSTUG00000000400) ENSSTUG00000000415 ENSSTUG00000000419 rbm4.3 (ENSSTUG00000000424) rbm4.3 (ENSSTUG00000000429) ENSSTUG00000000437 fxr2 (ENSSTUG00000000567) PTGDR2 (ENSSTUG00000001746) ENSSTUG00000001747 Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 ENSSSAG00000054233 ENSSSAG00000054244 ENSSSAG00000054365 ##37 ENSSSAG00000054373 ##37 ENSSSAG00000112574 ENSSSAG00000054518 ##37 ENSSSAG00000054560 ENSSSAG00000088055 ##37 ENSSSAG00000054586 ENSSSAG00000054599 ##37 ENSSSAG00000054617 ENSSSAG00000054627 ##37 ENSSSAG00000120008 ENSSSAG00000105625 ##37 ENSSSAG00000024942 ENSSSAG00000089136 ##37 ENSSSAG00000054651 ENSSSAG00000054401 ENSSSAG00000054667 ENSSSAG00000054681 ENSSSAG00000054687 ##37 ENSSSAG00000054692 ENSSSAG00000054701 ENSSSAG00000054639 ##37 ENSSSAG00000054737 ENSSSAG00000054741 ENSSSAG00000098693 RBM4B (ENSSSAG00000051434) ENSSSAG00000113070 ENSSSAG00000054769 ENSSSAG00000117989 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000155658.k ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01000000214950.B ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.o.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000163701.b.b.d ENSGT00940000166258.d.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000155658.k ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01000000214950.B ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.d ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00990000204231.D ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.o.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000163701.b.b.d Coho salmon MODERN SPECIES 7 kirrel1a (ENSOKIG00005038277) ENSOKIG00005038189 ENSOKIG00005038173 ENSOKIG00005037970 ENSOKIG00005037901 ENSOKIG00005037874 ENSOKIG00005037844 ENSOKIG00005037816 ##37 ENSOKIG00005037769 ##37 ENSOKIG00005037717 ENSOKIG00005037688 ##37 ENSOKIG00005037668 ENSOKIG00005037648 ##37 ENSOKIG00005037636 ENSOKIG00005037622 ENSOKIG00005037609 ##37 ENSOKIG00005037395 ENSOKIG00005037369 ENSOKIG00005037337 ENSOKIG00005037326 ENSOKIG00005037288 ##37 ENSOKIG00005037262 ENSOKIG00005037237 rbm4.3 (ENSOKIG00005037175) fxr2 (ENSOKIG00005034803) PTGDR2 (ENSOKIG00005034705) ENSOKIG00005034673 ugt5g1 (ENSOKIG00005034665) ENSOKIG00005034655 ENSOKIG00005034645 cldn7a (ENSOKIG00005034623) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 615 ENSGT01030000234530.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160598 ENSGT00390000000334 ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b ENSGT00940000158058.a ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158661.b ENSGT00940000166258 ENSGT00940000174541 ENSGT00940000163701.a ENSGT00940000163701.b.b ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a ENSGT00940000166282.C ENSGT00940000166282.A ENSGT00950000183136.b.a.b ENSGT00940000162009.a ENSGT01030000234530.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.a ENSGT00940000165455.a ENSGT00940000154589.b ENSGT00940000165455.b ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a ENSGT00390000014634 ENSGT00940000155658 ENSGT00730000112044 ENSGT00940000155795.f ENSGT00390000009529 Percomorphaceae DUPLICATION Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000154390.G.a ENSGT00940000160598 ENSGT00390000000334 ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b ENSGT00940000158058.a ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158661.b ENSGT00940000166258 ENSGT00940000174541 ENSGT00940000163701.a ENSGT00940000163701.b.b ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a ENSGT00940000166282.C ENSGT00950000183136.b.a.b ENSGT00940000162009.a ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.a ENSGT00940000165455.a ENSGT00940000154589.b ENSGT00940000165455.b ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a ENSGT00390000014634 ENSGT00940000155658 ENSGT00730000112044 ENSGT00940000155795.f ENSGT00390000009529 ENSGT01090000260120 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000166282.C ENSGT00950000183136.b.a.b ENSGT00940000162009.a ENSGT00940000162676.a.b.a ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.a ENSGT00950000182968.d.a.a.a.c ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.a ##30 ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.b.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.a ENSGT00950000182968.d.b.b.f ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.b ##30 ENSGT00950000182968.d.b.b.e ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.b ##30 ENSGT01090000260121 ENSGT01090000260182 ENSGT00940000174690 ENSGT01090000260327 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b ENSGT00940000158058.a ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158661.b ENSGT00940000166258 ENSGT00940000174541 ENSGT00940000163701.a ENSGT00940000163701.b.b ENSGT00940000166282.C ENSGT00950000183136.b.a.b ENSGT00940000162009.a ENSGT00940000162676.a.b.a ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.a ##30 ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.a ENSGT00950000182968.d.b.b.f ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.b ##30 ENSGT00950000182968.d.b.b.e ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.b ##30 ENSGT01090000260121 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.b Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 326 ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.b Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154390.G.a ENSGT00940000160598 ENSGT00390000000334 ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b ENSGT00940000158058.a ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158661.b ENSGT00940000166258 ENSGT00940000174541 ENSGT00940000163701.a ENSGT00940000163701.b.b ENSGT00940000166282.C.d ENSGT00940000166282.C.c ENSGT00950000183136.b.a.b ENSGT00940000162009.a ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.a ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.b.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.b.b.f ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.b ##30 ENSGT00950000182968.d.b.b.e ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.b ##30 ENSGT01090000260121 ENSGT01090000260182 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000154390.G.a.fb ENSGT00940000160598 ENSGT00390000000334 ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b ENSGT00940000158058.a ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158661.b.c ENSGT00940000166258 ENSGT00940000174541 ENSGT00940000163701.a ENSGT00940000163701.b.b ENSGT00940000166282.C.d ENSGT00940000166282.C.c ENSGT00950000183136.b.a.b ENSGT00940000162009.a ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.a ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.b.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.b.b.f.b ##30 ENSGT00950000182968.d.b.b.f.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.b ##30 ENSGT00950000182968.d.b.b.e ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.b ##30 ENSGT01090000260121 Clown anemonefish MODERN SPECIES 3448 ENSAOCG00000008643 ENSAOCG00000008622 PTGDR2 (ENSAOCG00000008607) ENSAOCG00000002762 ##37 ENSAOCG00000008566 ##30 ENSAOCG00000008534 ENSAOCG00000008446 ##30 ENSAOCG00000008376 ENSAOCG00000008364 ##30 ENSAOCG00000008350 ##30 ENSAOCG00000002698 ##30 ENSAOCG00000008315 ##30 ENSAOCG00000008289 ##30 ENSAOCG00000008265 ##30 ENSAOCG00000008256 ##37 ENSAOCG00000008245 ENSAOCG00000008211 ENSAOCG00000002426 ENSAOCG00000008179 Orange clownfish MODERN SPECIES 15 ENSAPEG00000018797 nlgn2a (ENSAPEG00000018764) tmem256 (ENSAPEG00000018757) tmem102 (ENSAPEG00000018745) fgf11a (ENSAPEG00000018720) chrnb1 (ENSAPEG00000018702) chrnb1l (ENSAPEG00000018544) cldn7a (ENSAPEG00000018514) ENSAPEG00000018506 ENSAPEG00000018457 ponzr3 (ENSAPEG00000018431) ENSAPEG00000018419 ENSAPEG00000018327 PTGDR2 (ENSAPEG00000018315) ENSAPEG00000018295 ENSAPEG00000018233 ##37 ENSAPEG00000018192 ##30 ENSAPEG00000018114 ##30 ENSAPEG00000018033 ##30 ENSAPEG00000017914 ##30 ENSAPEG00000017893 ENSAPEG00000017856 ENSAPEG00000017841 ##30 ENSAPEG00000017750 ##30 ENSAPEG00000017708 ##30 ENSAPEG00000017678 ##30 ENSAPEG00000017650 ##30 ENSAPEG00000017626 ##30 ENSAPEG00000017551 ENSAPEG00000017504 ENSAPEG00000017486 Spiny chromis MODERN SPECIES 1809 ugt5g2 (ENSAPOG00000002276) ENSAPOG00000002271 PTGDR2 (ENSAPOG00000002263) ENSAPOG00000002236 ##37 ENSAPOG00000002172 ENSAPOG00000002156 ENSAPOG00000002134 ##30 ENSAPOG00000002089 ##30 ENSAPOG00000000039 ENSAPOG00000002070 ENSAPOG00000002031 ##30 ENSAPOG00000001897 ENSAPOG00000001885 ##30 ENSAPOG00000001874 ##30 ENSAPOG00000001857 ##30 ENSAPOG00000001841 ##30 ENSAPOG00000001830 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00510000048483 ENSGT00940000154390.G.a.db.a ENSGT00940000160598 ENSGT00390000000334 ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b ENSGT00940000158058.a ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158661.b ENSGT00940000166258 ENSGT00940000174541 ENSGT00940000163701.a ENSGT00940000166282.C ENSGT00950000183136.b.a.b ENSGT00940000162009.a ENSGT00940000162676.a.b.a ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.a.c Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000154390.G.a.db.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000154390.G.a.db.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000160598 ENSGT00390000000334 ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b ENSGT00940000158058.a ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158661.b ENSGT00940000166258 ENSGT00940000174541 ENSGT00940000163701.a ENSGT00940000180591 ENSGT00940000166282.C ENSGT00950000183136.b.a.b ENSGT00940000162009.a ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.b.b.a.d.a.a ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.b.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.a.b ##30 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000017226 ENSGT00940000154390.G.a.db.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000160598 ENSGT00390000000334 ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b ENSGT00940000158058.a ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158661.b ENSGT00940000166258 ENSGT00940000174541 ENSGT00940000163701.a ENSGT00940000180591 ENSGT00940000166282.C ENSGT00950000183136.b.a.b ENSGT00940000162009.a ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.b.c.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.a.d.b.b.a ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.b.c.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.a.d.b.b.b ENSGT00990000204066.B ENSGT00990000204066.A ENSGT00940000154589.b.t ENSGT00940000165455.a ENSGT00940000154589.b.s ENSGT00940000165455.b ENSGT00950000183189.a.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000154390.G.a.db.a.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000154390.G.a.db.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000160598 ENSGT00390000000334 ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b ENSGT00940000158058.a ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158661.b ENSGT00940000166258 ENSGT00940000174541 ENSGT00940000163701.a ENSGT00940000180591 ENSGT00940000166282.C.e ENSGT00950000183136.b.a.b ENSGT00940000162009.a ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.b.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.b.b.a.d.a.a ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.b.a ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.a.b.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.b.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.a.b.a ##30 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 552 ENSHBUG00000006010 ENSHBUG00000006026 tmem256 (ENSHBUG00000006041) tmem102 (ENSHBUG00000006055) fgf11a (ENSHBUG00000006085) chrnb1 (ENSHBUG00000006136) chrnb1l (ENSHBUG00000006253) cldn7a (ENSHBUG00000006272) ENSHBUG00000006287 ENSHBUG00000006303 ugt5g1 (ENSHBUG00000006315) ENSHBUG00000006321 PTGDR2 (ENSHBUG00000006327) ENSHBUG00000006338 ##37 ENSHBUG00000006351 ##30 ENSHBUG00000006416 ##30 ENSHBUG00000006437 ##30 ENSHBUG00000006453 ##30 ENSHBUG00000006549 ##30 ENSHBUG00000006583 ENSHBUG00000006646 ENSHBUG00000006675 ENSHBUG00000006706 ##30 ENSHBUG00000006721 ##30 ENSHBUG00000006736 ENSHBUG00000006752 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000154390.G.a.db.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000160598 ENSGT00390000000334 ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b ENSGT00940000158058.a ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158661.b ENSGT00940000166258 ENSGT00940000174541 ENSGT00940000163701.a ENSGT00940000180591 ENSGT00940000166282.C.e ENSGT00940000166282.C.f ENSGT00950000183136.b.a.b ENSGT00940000162009.a ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.b.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.b.g ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.b.a ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.a.b.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.b.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.a.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.b.c.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.a.d.b.b.a Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000154390.G.a.db.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000160598.l.a ENSGT00390000000334 ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b ENSGT00940000158058.a ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158661.b ENSGT00940000166258 ENSGT00940000174541 ENSGT00940000163701.a ENSGT00940000180591 ENSGT00940000166282.C.e ENSGT00940000166282.C.f ENSGT00950000183136.b.a.b ENSGT00940000162009.a ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.a ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.b.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.b.g ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.b.h ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.a.d.a.a ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.a.a.c ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b.a.a.b.b.a.a ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.a.a.a.a.b.b ##30 Eastern happy MODERN SPECIES 15 ENSACLG00000018578 nlgn2a (ENSACLG00000018516) tmem256 (ENSACLG00000018478) tmem102 (ENSACLG00000018425) fgf11a (ENSACLG00000018390) chrnb1 (ENSACLG00000018351) chrnb1l (ENSACLG00000018241) cldn7a (ENSACLG00000018232) ENSACLG00000018211 ENSACLG00000018204 ENSACLG00000018183 ENSACLG00000018172 ENSACLG00000018164 ENSACLG00000018146 PTGDR2 (ENSACLG00000018141) ENSACLG00000018126 ##37 ENSACLG00000018105 ##30 ENSACLG00000018087 ##30 ENSACLG00000018003 ##30 ENSACLG00000017986 ##30 ENSACLG00000017959 ##30 ENSACLG00000017949 ENSACLG00000017926 ENSACLG00000017896 ##30 ENSACLG00000017883 ENSACLG00000017845 ENSACLG00000017779 ##30 ENSACLG00000017666 ENSACLG00000017655 ENSACLG00000017474 ##30 ENSACLG00000017443 ##30 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1106 ENSMZEG00005005198 nlgn2a (ENSMZEG00005005210) ENSMZEG00005005241 tmem256 (ENSMZEG00005005255) tmem102 (ENSMZEG00005005258) fgf11a (ENSMZEG00005005318) chrnb1 (ENSMZEG00005005340) chrnb1l (ENSMZEG00005005387) cldn7a (ENSMZEG00005005469) ENSMZEG00005005477 ENSMZEG00005005488 ENSMZEG00005005497 ENSMZEG00005005508 ENSMZEG00005005522 PTGDR2 (ENSMZEG00005005526) ENSMZEG00005005535 ##37 ENSMZEG00005005547 ##30 ENSMZEG00005005573 ##30 ENSMZEG00005005592 ##30 ENSMZEG00005005600 ##30 ENSMZEG00005005618 ##30 ENSMZEG00005005641 ##30 ENSMZEG00005005680 ENSMZEG00005005693 ENSMZEG00005005712 ##30 ENSMZEG00005005763 ENSMZEG00005005815 ##30 ENSMZEG00005005838 ##30 ENSMZEG00005005884 ##30 ENSMZEG00005005895 ENSMZEG00005005931 ##30 P. nyererei MODERN SPECIES 555 ENSPNYG00000016680 ENSPNYG00000016655 tmem102 (ENSPNYG00000016628) fgf11a (ENSPNYG00000016580) chrnb1 (ENSPNYG00000016550) chrnb1l (ENSPNYG00000016471) cldn7a (ENSPNYG00000016398) ENSPNYG00000016386 ENSPNYG00000016357 ENSPNYG00000016331 ENSPNYG00000016300 ENSPNYG00000016203 ENSPNYG00000016184 PTGDR2 (ENSPNYG00000016165) ENSPNYG00000016141 ##37 ENSPNYG00000016127 ##30 ENSPNYG00000016096 ENSPNYG00000016057 ##30 ENSPNYG00000016003 ##30 ENSPNYG00000015956 ##30 ENSPNYG00000015937 ENSPNYG00000015895 ENSPNYG00000015863 ##30 ENSPNYG00000015844 ENSPNYG00000015664 ENSPNYG00000015596 ##30 ENSPNYG00000015584 ENSPNYG00000015550 ##30 ENSPNYG00000015535 ENSPNYG00000015513 Nile tilapia MODERN SPECIES 15 ENSONIG00000006396 nlgn2a (ENSONIG00000041697) ENSONIG00000040395 nlgn2a (ENSONIG00000005495) tmem256 (ENSONIG00000018440) tmem102 (ENSONIG00000018439) fgf11a (ENSONIG00000018437) chrnb1 (ENSONIG00000018434) chrnb1l (ENSONIG00000018430) cldn7a (ENSONIG00000018428) ENSONIG00000018427 ENSONIG00000037330 ugt5g2 (ENSONIG00000033604) ENSONIG00000028521 PTGDR2 (ENSONIG00000021243) ENSONIG00000018425 ##37 ENSONIG00000018423 ##30 ENSONIG00000018422 ##30 ENSONIG00000018421 ##30 ENSONIG00000031410 ##30 ENSONIG00000036370 ENSONIG00000040497 ##30 ENSONIG00000030735 ENSONIG00000041308 ENSONIG00000031377 ENSONIG00000018412 ENSONIG00000029969 ENSONIG00000018411 ##30 ENSONIG00000041163 ENSONIG00000018415 ENSONIG00000030101 ##30 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00950000182968.d.a.a.a.d.a.a.b.a.a.b.a ##30 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b.a ##30 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 135 ENSKMAG00000017498 ENSKMAG00000017483 TIFA (ENSKMAG00000017474) rbm4.3 (ENSKMAG00000017468) rbm4.3 (ENSKMAG00000017456) ENSKMAG00000017442 ##37 ENSKMAG00000017433 ##30 ENSKMAG00000017409 ##30 ENSKMAG00000017393 ENSKMAG00000017315 ##30 ENSKMAG00000017266 ENSKMAG00000017196 ENSKMAG00000017169 ENSKMAG00000017148 ENSKMAG00000017135 ENSKMAG00000017122 ENSKMAG00000017110 ENSKMAG00000017102 ENSKMAG00000017095 ENSKMAG00000017085 ENSKMAG00000017071 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 220 ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b.a ##30 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 627 ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b.a ##30 Mummichog MODERN SPECIES 373 ENSFHEG00000020577 ENSFHEG00000020563 ENSFHEG00000020550 ##30 ENSFHEG00000020511 ##37 ENSFHEG00000020496 ##30 ENSFHEG00000000581 ENSFHEG00000020429 ENSFHEG00000020351 ENSFHEG00000020325 ENSFHEG00000020282 ENSFHEG00000020259 ##30 ENSFHEG00000020237 ENSFHEG00000020198 ENSFHEG00000020183 si:dkey-23a13.16 (ENSFHEG00000020151) ENSFHEG00000020136 mrpl48 (ENSFHEG00000020130) ENSFHEG00000020084 ENSFHEG00000020072 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.c ##37 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 9 ENSORLG00000026430 ENSORLG00000023721 ENSORLG00000027965 ENSORLG00000024960 ENSORLG00000027459 ENSORLG00000019485 ENSORLG00000028105 ENSORLG00000026835 ENSORLG00000019041 nitr14 (ENSORLG00000019048) ##30 ENSORLG00000027281 ENSORLG00000019063 ##30 ENSORLG00000019083 ##30 ENSORLG00000019090 ##30 ENSORLG00000028751 ENSORLG00000022175 ##37 ENSORLG00000025241 ENSORLG00000022660 ENSORLG00000028059 nitr17 (ENSORLG00000020634) nitr9 (ENSORLG00000028801) ##30 ENSORLG00000023392 ENSORLG00000029250 ENSORLG00000026424 ENSORLG00000029847 ENSORLG00000022157 ENSORLG00000025582 ENSORLG00000020629 ##30 ENSORLG00000029264 ##30 ENSORLG00000023601 ENSORLG00000023587 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 150 ufsp1 (ENSHCOG00000010093) epoa (ENSHCOG00000010118) pop7 (ENSHCOG00000010137) nlgn2a (ENSHCOG00000010163) tmem256 (ENSHCOG00000010174) tmem102 (ENSHCOG00000010189) fgf11a (ENSHCOG00000010205) chrnb1 (ENSHCOG00000010209) chrnb1l (ENSHCOG00000010231) cldn7a (ENSHCOG00000010288) ENSHCOG00000010304 ENSHCOG00000010313 ponzr3 (ENSHCOG00000010319) ugt5g2 (ENSHCOG00000010325) ENSHCOG00000010336 ENSHCOG00000010344 ##37 rbm4.3 (ENSHCOG00000010349) ENSHCOG00000010359 rbm4.3 (ENSHCOG00000010363) fxr2 (ENSHCOG00000010418) haus4 (ENSHCOG00000010489) ENSHCOG00000010513 ENSHCOG00000010529 ENSHCOG00000010571 ENSHCOG00000010605 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 492 ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.a.j.a.b ENSGT00940000162676.a.b.b.b.a.j.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.c.h.a ##30 Mummichog MODERN SPECIES 2187 ACO1 (ENSFHEG00000005619) ENSFHEG00000005568 camk2d1 (ENSFHEG00000005414) ARSJ (ENSFHEG00000005333) mad2l1 (ENSFHEG00000005319) pde5ab (ENSFHEG00000005298) zcchc4 (ENSFHEG00000005245) ENSFHEG00000005226 ABLIM2 (ENSFHEG00000005197) AFAP1 (ENSFHEG00000005086) MTMR1 (ENSFHEG00000005004) mtm1 (ENSFHEG00000004972) NAT16 (ENSFHEG00000004930) acox3 (ENSFHEG00000004904) znf16l (ENSFHEG00000004859) ENSFHEG00000004851 ##37 ENSFHEG00000004838 ENSFHEG00000004812 ENSFHEG00000004735 ##30 ENSFHEG00000004718 ENSFHEG00000000603 ENSFHEG00000004671 ENSFHEG00000004661 ENSFHEG00000004648 ENSFHEG00000004637 ENSFHEG00000023234 ENSFHEG00000023171 ENSFHEG00000023152 ##30 rbm4.3 (ENSFHEG00000023137) ENSFHEG00000023116 ENSFHEG00000000753 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 15 ENSACLG00000016486 ENSACLG00000016502 ENSACLG00000016544 ENSACLG00000016635 ENSACLG00000016673 ENSACLG00000016683 ENSACLG00000016727 ENSACLG00000016743 ENSACLG00000016767 ENSACLG00000016870 ENSACLG00000016890 ENSACLG00000016901 ENSACLG00000016924 ENSACLG00000017055 ENSACLG00000017091 ENSACLG00000017112 ##37 ENSACLG00000017126 ##30 ENSACLG00000017152 ##30 ENSACLG00000017168 ##30 ENSACLG00000017214 ##30 ENSACLG00000017262 ##30 ENSACLG00000017275 ENSACLG00000017286 ##30 ENSACLG00000017317 ##30 ENSACLG00000017307 ##30 ENSACLG00000017328 ENSACLG00000017356 ##30 ENSACLG00000017389 ##30 ENSACLG00000017404 ##30 ENSACLG00000017443 ##30 ENSACLG00000017474 ##30 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Spiny chromis DUPLICATION Spiny chromis MODERN SPECIES 4420 ENSAPOG00000010122 ##37 Spiny chromis MODERN SPECIES 4422 ENSAPOG00000010090 ##37 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Clown anemonefish MODERN SPECIES 3448 haus4 (ENSAOCG00000007924) fxr2 (ENSAOCG00000007975) rbm4.3 (ENSAOCG00000007992) ENSAOCG00000007996 ENSAOCG00000008010 rbm4.3 (ENSAOCG00000008015) ENSAOCG00000008061 ENSAOCG00000008092 ENSAOCG00000008120 ENSAOCG00000008156 ENSAOCG00000008168 ENSAOCG00000008179 ENSAOCG00000002426 ENSAOCG00000008211 ENSAOCG00000008245 ENSAOCG00000008256 ##37 ENSAOCG00000008265 ##30 ENSAOCG00000008289 ##30 ENSAOCG00000008315 ##30 ENSAOCG00000002698 ##30 ENSAOCG00000008350 ##30 ENSAOCG00000008364 ##30 ENSAOCG00000008376 ENSAOCG00000008446 ##30 ENSAOCG00000008534 ENSAOCG00000008566 ##30 ENSAOCG00000002762 ##37 PTGDR2 (ENSAOCG00000008607) ENSAOCG00000008622 ENSAOCG00000008643 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 725 rbm4.3 (ENSSPAG00000008062) ENSSPAG00000008076 ENSSPAG00000008090 ENSSPAG00000008157 ENSSPAG00000008167 ENSSPAG00000008177 ENSSPAG00000008188 ENSSPAG00000008209 ENSSPAG00000008218 ENSSPAG00000008240 ENSSPAG00000008255 ENSSPAG00000008275 ENSSPAG00000008295 ENSSPAG00000008325 ENSSPAG00000008427 ENSSPAG00000008533 ##37 ENSSPAG00000008543 ##30 ENSSPAG00000008601 ##30 ENSSPAG00000008642 ##30 ENSSPAG00000008675 ##30 ENSSPAG00000008698 ##30 ENSSPAG00000008724 ENSSPAG00000008765 ##30 ENSSPAG00000008813 ##30 ENSSPAG00000008833 ##30 ENSSPAG00000008923 ##30 ENSSPAG00000008933 ##30 ENSSPAG00000008954 PTGDR2 (ENSSPAG00000008971) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.a.d ##37 Large yellow croaker MODERN SPECIES 485 ENSLCRG00005020702 ENSLCRG00005020707 dock11 (ENSLCRG00005021731) haus4 (ENSLCRG00005023850) fxr2 (ENSLCRG00005023851) rbm4.3 (ENSLCRG00005023854) ENSLCRG00005023855 rbm4.3 (ENSLCRG00005023857) ENSLCRG00005023858 ENSLCRG00005023859 ENSLCRG00005023861 ENSLCRG00005023862 ENSLCRG00005023863 ENSLCRG00005023864 ENSLCRG00005023865 ENSLCRG00005023866 ##37 ENSLCRG00005023867 ENSLCRG00005023868 ##30 ENSLCRG00005023869 ##30 ENSLCRG00005023870 ##30 ENSLCRG00005003201 ##30 ENSLCRG00005003215 ENSLCRG00005003275 ##30 ENSLCRG00005003318 ##30 ENSLCRG00005003358 ##30 ENSLCRG00005003369 PTGDR2 (ENSLCRG00005003374) ENSLCRG00005003392 ugt5g1 (ENSLCRG00005003399) ponzr3 (ENSLCRG00005003404) ENSLCRG00005003410 Ballan wrasse MODERN SPECIES 241 ENSLBEG00000001412 ndufs2 (ENSLBEG00000001348) kirrel1a (ENSLBEG00000001300) ENSLBEG00000001254 dock11 (ENSLBEG00000001111) haus4 (ENSLBEG00000001087) rbm4.3 (ENSLBEG00000001071) ENSLBEG00000001049 rbm4.3 (ENSLBEG00000001025) fxr2 (ENSLBEG00000000923) ENSLBEG00000000889 ENSLBEG00000000779 ENSLBEG00000000711 ENSLBEG00000000692 ENSLBEG00000000625 ENSLBEG00000000601 ##37 ENSLBEG00000000570 ##30 ENSLBEG00000000509 ##30 ENSLBEG00000000444 ##30 ENSLBEG00000000333 ##30 ENSLBEG00000000308 ##30 ENSLBEG00000000264 ##30 ENSLBEG00000000243 ##30 ENSLBEG00000000192 ##30 ENSLBEG00000000162 ENSLBEG00000000151 ##30 ENSLBEG00000000147 ##30 ENSLBEG00000000141 ENSLBEG00000000136 ##30 ENSLBEG00000000078 ##30 ENSLBEG00000000069 ##30 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000157535.m.a ENSGT01090000260120 ENSGT00390000009529 ENSGT00940000155795.f ENSGT00730000112044 ENSGT00940000155658 ENSGT00940000178201 ENSGT01030000234530.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b ENSGT00950000182968.d.b.b ##30 ENSGT00940000154589.b ENSGT00940000165455.a ENSGT00940000165455.b ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a ENSGT00940000158661.b ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158058.a ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b ENSGT01060000250223 ENSGT01030000234592.A.b.b.a.a ENSGT01030000234592.A.b.b.a.b.b.a Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 253 ENSGT00950000182968.d.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c ENSGT01030000234530.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 294 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00940000165455.b.a ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a.g ENSGT00940000162009.a.a ENSGT00950000183136.b.a.b.g ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000163701.b.b.c ENSGT00940000166258.d.a ENSGT00940000158661.b.h ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158058.a.a.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.a ##37 ENSGT00990000204231.J.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.b ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00940000165455.b.a ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a.g ENSGT00940000162009.a.a ENSGT00950000183136.b.a.b.g ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000163701.b.b.c ENSGT00940000166258.d.a ENSGT00940000158661.b.h ENSGT00940000158661.a Rainbow trout MODERN SPECIES 13 ENSOMYG00000022171 dock11 (ENSOMYG00000015977) ENSOMYG00000015486 ##37 ENSOMYG00000015256 ENSOMYG00000052918 ##37 ENSOMYG00000059858 ENSOMYG00000051101 ENSOMYG00000015437 ##37 ENSOMYG00000015397 ##37 ENSOMYG00000015298 ENSOMYG00000067677 ENSOMYG00000056555 nitr1 (ENSOMYG00000015208) ENSOMYG00000015198 ##37 ENSOMYG00000070461 ##37 ENSOMYG00000015194 ##37 ENSOMYG00000015178 ENSOMYG00000015102 ENSOMYG00000015125 ##37 ENSOMYG00000063413 ##37 ENSOMYG00000055156 ENSOMYG00000015086 ENSOMYG00000054572 ENSOMYG00000015080 ENSOMYG00000069459 ENSOMYG00000015065 ENSOMYG00000015027 ENSOMYG00000015000 ENSOMYG00000014983 ENSOMYG00000014965 rbm4.3 (ENSOMYG00000014956) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT00990000204231.J.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT01000000215121.a.a.b.a.b ENSGT00990000204231.A ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.b ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00990000204231.C ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00940000165455.b.a ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a.g ENSGT00940000162009.a.a ENSGT00950000183136.b.a.b.g Chinook salmon MODERN SPECIES 6 ENSOTSG00005027655 ENSOTSG00005027653 ndufs2 (ENSOTSG00005027463) ENSOTSG00005027460 dock11 (ENSOTSG00005023088) ENSOTSG00005023047 ENSOTSG00005023046 ##37 ENSOTSG00005023045 ENSOTSG00005023044 ENSOTSG00005023043 ENSOTSG00005022931 ##37 ENSOTSG00005022923 ##37 ENSOTSG00005022921 ENSOTSG00005022920 ##37 ENSOTSG00005022919 ##37 ENSOTSG00005022917 ##37 ENSOTSG00005015871 ENSOTSG00005015870 ENSOTSG00005015869 ##37 ENSOTSG00005015868 ENSOTSG00005015865 ENSOTSG00005015864 ENSOTSG00005015817 ENSOTSG00005015814 ENSOTSG00005015813 ENSOTSG00005015812 rbm4.3 (ENSOTSG00005015811) ponzr6 (ENSOTSG00005015810) fxr2 (ENSOTSG00005014173) PTGDR2 (ENSOTSG00005014168) ENSOTSG00005014166 Coho salmon MODERN SPECIES 29 ENSOKIG00005009077 ENSOKIG00005009054 ndufs2 (ENSOKIG00005008787) kirrel1a (ENSOKIG00005008088) ENSOKIG00005008043 dock11 (ENSOKIG00005003840) ENSOKIG00005003645 ENSOKIG00005003633 ENSOKIG00005003627 ##37 ENSOKIG00005003623 ENSOKIG00005003618 ##37 ENSOKIG00005003609 ##37 ENSOKIG00005003604 ENSOKIG00005003592 ENSOKIG00005003579 ENSOKIG00005003558 ##37 ENSOKIG00005003537 ENSOKIG00005003526 ENSOKIG00005003520 ##37 ENSOKIG00005003515 ENSOKIG00005003480 ENSOKIG00005003459 ENSOKIG00005003453 ENSOKIG00005003438 ENSOKIG00005003400 ENSOKIG00005003388 ENSOKIG00005003372 ##37 ENSOKIG00005003364 ENSOKIG00005003355 rbm4.3 (ENSOKIG00005003347) ponzr6 (ENSOKIG00005003344) Salmo ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b.a.b ##37 ENSGT00990000204231.G ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a ENSGT00950000182968.d.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00990000204231.A ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.d ##37 Atlantic salmon MODERN SPECIES 26 ENSSSAG00000080612 ENSSSAG00000080728 ENSSSAG00000119719 ENSSSAG00000081061 ENSSSAG00000081071 ENSSSAG00000110509 ndufs2 (ENSSSAG00000081079) kirrel1a (ENSSSAG00000081111) il13ra1 (ENSSSAG00000081176) dock11 (ENSSSAG00000081371) ENSSSAG00000081547 ##37 ENSSSAG00000116437 ENSSSAG00000081572 ENSSSAG00000081556 ##37 ENSSSAG00000025481 ##37 ENSSSAG00000081561 ##37 ENSSSAG00000120710 ##37 ENSSSAG00000090985 ENSSSAG00000108996 ENSSSAG00000081558 ENSSSAG00000092267 ENSSSAG00000113629 ENSSSAG00000081551 ##37 ENSSSAG00000081565 ENSSSAG00000081567 ENSSSAG00000081569 ##37 ENSSSAG00000081562 ENSSSAG00000081574 ##37 ENSSSAG00000081576 ENSSSAG00000081581 ENSSSAG00000081563 River trout MODERN SPECIES 38 ENSSTUG00000034232 ENSSTUG00000034299 ENSSTUG00000034395 NEURL4 (ENSSTUG00000037710) ENSSTUG00000037865 ENSSTUG00000037881 ENSSTUG00000037898 ndufs2 (ENSSTUG00000037932) kirrel1a (ENSSTUG00000038617) ENSSTUG00000038809 dock11 (ENSSTUG00000038939) ENSSTUG00000045383 ENSSTUG00000045422 ##37 ENSSTUG00000045452 ENSSTUG00000045458 ##37 ENSSTUG00000045464 ##37 ENSSTUG00000045482 ##37 ENSSTUG00000045490 ENSSTUG00000045508 ENSSTUG00000045521 ##30 ENSSTUG00000045530 ENSSTUG00000045540 ##37 ENSSTUG00000045547 ENSSTUG00000045557 ENSSTUG00000045565 ENSSTUG00000045603 ENSSTUG00000045650 ENSSTUG00000045679 ##37 ENSSTUG00000045685 ##37 ENSSTUG00000045692 ENSSTUG00000045745 Huchen MODERN SPECIES 3758 ENSHHUG00000035274 ENSHHUG00000035283 ENSHHUG00000035288 ##37 ENSHHUG00000035295 ENSHHUG00000035296 ENSHHUG00000035306 ENSHHUG00000035312 ENSHHUG00000035324 ##37 ENSHHUG00000035383 ENSHHUG00000035402 ##37 Northern pike DUPLICATION Northern pike DUPLICATION Northern pike MODERN SPECIES 23 il13ra1 (ENSELUG00000020274) ENSELUG00000020368 ENSELUG00000030563 il13ra1 (ENSELUG00000020430) dock11 (ENSELUG00000000903) ENSELUG00000021929 ##37 ENSELUG00000020860 ##37 ENSELUG00000021959 ENSELUG00000020897 ##37 ENSELUG00000028765 ##37 ENSELUG00000030037 ENSELUG00000020914 ##37 ENSELUG00000020937 ENSELUG00000033573 ENSELUG00000020952 ENSELUG00000021454 ##37 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 ENSELUG00000020684 ##37 ENSELUG00000021529 ENSELUG00000021522 ##37 ENSELUG00000034484 ENSELUG00000021824 ##37 ENSELUG00000025442 ENSELUG00000021869 ##30 ENSELUG00000021904 ##37 ENSELUG00000021504 ##37 Northern pike MODERN SPECIES 23 il13ra1 (ENSELUG00000020430) dock11 (ENSELUG00000000903) ENSELUG00000021929 ##37 ENSELUG00000020860 ##37 ENSELUG00000021959 ENSELUG00000020897 ##37 ENSELUG00000028765 ##37 ENSELUG00000030037 ENSELUG00000020914 ##37 ENSELUG00000020937 ENSELUG00000033573 ENSELUG00000020952 ENSELUG00000021454 ##37 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 ENSELUG00000020684 ##37 ENSELUG00000021529 ENSELUG00000021522 ##37 ENSELUG00000034484 ENSELUG00000021824 ##37 ENSELUG00000025442 ENSELUG00000021869 ##30 ENSELUG00000021904 ##37 ENSELUG00000021504 ##37 ENSELUG00000021265 ##37 ENSELUG00000021988 ENSELUG00000022142 Northern pike MODERN SPECIES 23 ENSELUG00000028765 ##37 ENSELUG00000030037 ENSELUG00000020914 ##37 ENSELUG00000020937 ENSELUG00000033573 ENSELUG00000020952 ENSELUG00000021454 ##37 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 ENSELUG00000020684 ##37 ENSELUG00000021529 ENSELUG00000021522 ##37 ENSELUG00000034484 ENSELUG00000021824 ##37 ENSELUG00000025442 ENSELUG00000021869 ##30 ENSELUG00000021904 ##37 ENSELUG00000021504 ##37 ENSELUG00000021265 ##37 ENSELUG00000021988 ENSELUG00000022142 ENSELUG00000022093 ##37 ENSELUG00000026414 ENSELUG00000022109 ENSELUG00000022132 rbm4.3 (ENSELUG00000022150) ENSELUG00000022162 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.b.b ##37 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.b.b ##37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.b.b ##37 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 403 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.b.a.b.b ##37 Rainbow trout MODERN SPECIES 13 kirrel1a (ENSOMYG00000022275) ENSOMYG00000022171 dock11 (ENSOMYG00000015977) ENSOMYG00000015486 ##37 ENSOMYG00000015256 ENSOMYG00000052918 ##37 ENSOMYG00000059858 ENSOMYG00000051101 ENSOMYG00000015437 ##37 ENSOMYG00000015397 ##37 ENSOMYG00000015298 ENSOMYG00000067677 ENSOMYG00000056555 nitr1 (ENSOMYG00000015208) ENSOMYG00000015198 ##37 ENSOMYG00000070461 ##37 ENSOMYG00000015194 ##37 ENSOMYG00000015178 ENSOMYG00000015102 ENSOMYG00000015125 ##37 ENSOMYG00000063413 ##37 ENSOMYG00000055156 ENSOMYG00000015086 ENSOMYG00000054572 ENSOMYG00000015080 ENSOMYG00000069459 ENSOMYG00000015065 ENSOMYG00000015027 ENSOMYG00000015000 ENSOMYG00000014983 ENSOMYG00000014965 Salmo ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b.a.b ##37 ENSGT00990000204231.G ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a ENSGT00950000182968.d.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00990000204231.A ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.d ##37 Atlantic salmon MODERN SPECIES 26 zpax4 (ENSSSAG00000076578) ENSSSAG00000080612 ENSSSAG00000080728 ENSSSAG00000119719 ENSSSAG00000081061 ENSSSAG00000081071 ENSSSAG00000110509 ndufs2 (ENSSSAG00000081079) kirrel1a (ENSSSAG00000081111) il13ra1 (ENSSSAG00000081176) dock11 (ENSSSAG00000081371) ENSSSAG00000081547 ##37 ENSSSAG00000116437 ENSSSAG00000081572 ENSSSAG00000081556 ##37 ENSSSAG00000025481 ##37 ENSSSAG00000081561 ##37 ENSSSAG00000120710 ##37 ENSSSAG00000090985 ENSSSAG00000108996 ENSSSAG00000081558 ENSSSAG00000092267 ENSSSAG00000113629 ENSSSAG00000081551 ##37 ENSSSAG00000081565 ENSSSAG00000081567 ENSSSAG00000081569 ##37 ENSSSAG00000081562 ENSSSAG00000081574 ##37 ENSSSAG00000081576 ENSSSAG00000081581 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT01030000234530.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b ENSGT00950000182968.d.b.b ##30 ENSGT00940000154589.b ENSGT00940000165455.a ENSGT00940000165455.b ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a ENSGT00390000014634 ENSGT00940000155658 ENSGT00730000112044 ENSGT00940000155795.f ENSGT00390000009529 ENSGT01090000260120 ENSGT00940000157535.m.a Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158058.a ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158661.b ENSGT00940000166258 ENSGT00940000174541 ENSGT00940000163701.a ENSGT00940000163701.b.b ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a ENSGT00940000166282.C ENSGT00940000166282.A ENSGT00950000183136.b.a.b ENSGT00940000162009.a ENSGT01030000234530.b.a.a ##37 ENSGT00950000182968.d.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b ##37 ENSGT00950000182968.d.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.b.a ENSGT00940000165455.a ENSGT00940000154589.b ENSGT00940000165455.b ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a ENSGT00390000014634 ENSGT00940000155658 ENSGT00730000112044 ENSGT00940000155795.f ENSGT00390000009529 ENSGT01090000260120 ENSGT00940000157535.m.a ENSGT00390000006979.a Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 9 ENSMMDG00005016975 ENSMMDG00005016968 ugt5g1 (ENSMMDG00005016966) ENSMMDG00005016964 PTGDR2 (ENSMMDG00005016961) ENSMMDG00005016958 ##30 ENSMMDG00005016955 ENSMMDG00005016954 ##30 ENSMMDG00005016918 ##30 ENSMMDG00005016915 ENSMMDG00005016909 ##30 ENSMMDG00005016894 ##30 ENSMMDG00005016806 ENSMMDG00005016803 ##30 ENSMMDG00005016798 ##30 ENSMMDG00005016794 ##37 ENSMMDG00005016789 ##30 ENSMMDG00005016782 ENSMMDG00005016761 ENSMMDG00005016711 ##30 ENSMMDG00005016708 ##37 ENSMMDG00005016694 ##30 ENSMMDG00005016683 ##37 ENSMMDG00005016663 ##30 ENSMMDG00005016659 ##37 ENSMMDG00005016657 ##37 ENSMMDG00005016650 ##30 ENSMMDG00005016648 ##30 ENSMMDG00005016643 ##37 ENSMMDG00005016640 ##37 ENSMMDG00005016637 ##37 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 9 ENSMMDG00005016958 ##30 ENSMMDG00005016955 ENSMMDG00005016954 ##30 ENSMMDG00005016918 ##30 ENSMMDG00005016915 ENSMMDG00005016909 ##30 ENSMMDG00005016894 ##30 ENSMMDG00005016806 ENSMMDG00005016803 ##30 ENSMMDG00005016798 ##30 ENSMMDG00005016794 ##37 ENSMMDG00005016789 ##30 ENSMMDG00005016782 ENSMMDG00005016761 ENSMMDG00005016711 ##30 ENSMMDG00005016708 ##37 ENSMMDG00005016694 ##30 ENSMMDG00005016683 ##37 ENSMMDG00005016663 ##30 ENSMMDG00005016659 ##37 ENSMMDG00005016657 ##37 ENSMMDG00005016650 ##30 ENSMMDG00005016648 ##30 ENSMMDG00005016643 ##37 ENSMMDG00005016640 ##37 ENSMMDG00005016637 ##37 ENSMMDG00005016633 ##37 ENSMMDG00005016630 ##30 ponzr6 (ENSMMDG00005016626) ENSMMDG00005016622 ENSMMDG00005016620 Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 9 ENSMMDG00005016915 ENSMMDG00005016909 ##30 ENSMMDG00005016894 ##30 ENSMMDG00005016806 ENSMMDG00005016803 ##30 ENSMMDG00005016798 ##30 ENSMMDG00005016794 ##37 ENSMMDG00005016789 ##30 ENSMMDG00005016782 ENSMMDG00005016761 ENSMMDG00005016711 ##30 ENSMMDG00005016708 ##37 ENSMMDG00005016694 ##30 ENSMMDG00005016683 ##37 ENSMMDG00005016663 ##30 ENSMMDG00005016659 ##37 ENSMMDG00005016657 ##37 ENSMMDG00005016650 ##30 ENSMMDG00005016648 ##30 ENSMMDG00005016643 ##37 ENSMMDG00005016640 ##37 ENSMMDG00005016637 ##37 ENSMMDG00005016633 ##37 ENSMMDG00005016630 ##30 ponzr6 (ENSMMDG00005016626) ENSMMDG00005016622 ENSMMDG00005016620 rbm4.3 (ENSMMDG00005016617) ponzr6 (ENSMMDG00005016443) fxr2 (ENSMMDG00005014133) haus4 (ENSMMDG00005014076) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 9 ENSMMDG00005016909 ##30 ENSMMDG00005016894 ##30 ENSMMDG00005016806 ENSMMDG00005016803 ##30 ENSMMDG00005016798 ##30 ENSMMDG00005016794 ##37 ENSMMDG00005016789 ##30 ENSMMDG00005016782 ENSMMDG00005016761 ENSMMDG00005016711 ##30 ENSMMDG00005016708 ##37 ENSMMDG00005016694 ##30 ENSMMDG00005016683 ##37 ENSMMDG00005016663 ##30 ENSMMDG00005016659 ##37 ENSMMDG00005016657 ##37 ENSMMDG00005016650 ##30 ENSMMDG00005016648 ##30 ENSMMDG00005016643 ##37 ENSMMDG00005016640 ##37 ENSMMDG00005016637 ##37 ENSMMDG00005016633 ##37 ENSMMDG00005016630 ##30 ponzr6 (ENSMMDG00005016626) ENSMMDG00005016622 ENSMMDG00005016620 rbm4.3 (ENSMMDG00005016617) ponzr6 (ENSMMDG00005016443) fxr2 (ENSMMDG00005014133) haus4 (ENSMMDG00005014076) ENSMMDG00005014075 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 9 ENSMMDG00005016954 ##30 ENSMMDG00005016918 ##30 ENSMMDG00005016915 ENSMMDG00005016909 ##30 ENSMMDG00005016894 ##30 ENSMMDG00005016806 ENSMMDG00005016803 ##30 ENSMMDG00005016798 ##30 ENSMMDG00005016794 ##37 ENSMMDG00005016789 ##30 ENSMMDG00005016782 ENSMMDG00005016761 ENSMMDG00005016711 ##30 ENSMMDG00005016708 ##37 ENSMMDG00005016694 ##30 ENSMMDG00005016683 ##37 ENSMMDG00005016663 ##30 ENSMMDG00005016659 ##37 ENSMMDG00005016657 ##37 ENSMMDG00005016650 ##30 ENSMMDG00005016648 ##30 ENSMMDG00005016643 ##37 ENSMMDG00005016640 ##37 ENSMMDG00005016637 ##37 ENSMMDG00005016633 ##37 ENSMMDG00005016630 ##30 ponzr6 (ENSMMDG00005016626) ENSMMDG00005016622 ENSMMDG00005016620 rbm4.3 (ENSMMDG00005016617) ponzr6 (ENSMMDG00005016443) Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 9 ENSMMDG00005016803 ##30 ENSMMDG00005016798 ##30 ENSMMDG00005016794 ##37 ENSMMDG00005016789 ##30 ENSMMDG00005016782 ENSMMDG00005016761 ENSMMDG00005016711 ##30 ENSMMDG00005016708 ##37 ENSMMDG00005016694 ##30 ENSMMDG00005016683 ##37 ENSMMDG00005016663 ##30 ENSMMDG00005016659 ##37 ENSMMDG00005016657 ##37 ENSMMDG00005016650 ##30 ENSMMDG00005016648 ##30 ENSMMDG00005016643 ##37 ENSMMDG00005016640 ##37 ENSMMDG00005016637 ##37 ENSMMDG00005016633 ##37 ENSMMDG00005016630 ##30 ponzr6 (ENSMMDG00005016626) ENSMMDG00005016622 ENSMMDG00005016620 rbm4.3 (ENSMMDG00005016617) ponzr6 (ENSMMDG00005016443) fxr2 (ENSMMDG00005014133) haus4 (ENSMMDG00005014076) ENSMMDG00005014075 dock11 (ENSMMDG00005014005) ENSMMDG00005013979 ENSMMDG00005013969 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 9 ENSMMDG00005016789 ##30 ENSMMDG00005016782 ENSMMDG00005016761 ENSMMDG00005016711 ##30 ENSMMDG00005016708 ##37 ENSMMDG00005016694 ##30 ENSMMDG00005016683 ##37 ENSMMDG00005016663 ##30 ENSMMDG00005016659 ##37 ENSMMDG00005016657 ##37 ENSMMDG00005016650 ##30 ENSMMDG00005016648 ##30 ENSMMDG00005016643 ##37 ENSMMDG00005016640 ##37 ENSMMDG00005016637 ##37 ENSMMDG00005016633 ##37 ENSMMDG00005016630 ##30 ponzr6 (ENSMMDG00005016626) ENSMMDG00005016622 ENSMMDG00005016620 rbm4.3 (ENSMMDG00005016617) ponzr6 (ENSMMDG00005016443) fxr2 (ENSMMDG00005014133) haus4 (ENSMMDG00005014076) ENSMMDG00005014075 dock11 (ENSMMDG00005014005) ENSMMDG00005013979 ENSMMDG00005013969 kirrel1a (ENSMMDG00005013955) ndufs2 (ENSMMDG00005010958) ENSMMDG00005010930 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 9 ENSMMDG00005016794 ##37 ENSMMDG00005016789 ##30 ENSMMDG00005016782 ENSMMDG00005016761 ENSMMDG00005016711 ##30 ENSMMDG00005016708 ##37 ENSMMDG00005016694 ##30 ENSMMDG00005016683 ##37 ENSMMDG00005016663 ##30 ENSMMDG00005016659 ##37 ENSMMDG00005016657 ##37 ENSMMDG00005016650 ##30 ENSMMDG00005016648 ##30 ENSMMDG00005016643 ##37 ENSMMDG00005016640 ##37 ENSMMDG00005016637 ##37 ENSMMDG00005016633 ##37 ENSMMDG00005016630 ##30 ponzr6 (ENSMMDG00005016626) ENSMMDG00005016622 ENSMMDG00005016620 rbm4.3 (ENSMMDG00005016617) ponzr6 (ENSMMDG00005016443) fxr2 (ENSMMDG00005014133) haus4 (ENSMMDG00005014076) ENSMMDG00005014075 dock11 (ENSMMDG00005014005) ENSMMDG00005013979 ENSMMDG00005013969 kirrel1a (ENSMMDG00005013955) ndufs2 (ENSMMDG00005010958) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 9 ENSMMDG00005016798 ##30 ENSMMDG00005016794 ##37 ENSMMDG00005016789 ##30 ENSMMDG00005016782 ENSMMDG00005016761 ENSMMDG00005016711 ##30 ENSMMDG00005016708 ##37 ENSMMDG00005016694 ##30 ENSMMDG00005016683 ##37 ENSMMDG00005016663 ##30 ENSMMDG00005016659 ##37 ENSMMDG00005016657 ##37 ENSMMDG00005016650 ##30 ENSMMDG00005016648 ##30 ENSMMDG00005016643 ##37 ENSMMDG00005016640 ##37 ENSMMDG00005016637 ##37 ENSMMDG00005016633 ##37 ENSMMDG00005016630 ##30 ponzr6 (ENSMMDG00005016626) ENSMMDG00005016622 ENSMMDG00005016620 rbm4.3 (ENSMMDG00005016617) ponzr6 (ENSMMDG00005016443) fxr2 (ENSMMDG00005014133) haus4 (ENSMMDG00005014076) ENSMMDG00005014075 dock11 (ENSMMDG00005014005) ENSMMDG00005013979 ENSMMDG00005013969 kirrel1a (ENSMMDG00005013955) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.b ##37 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.b ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.b ##37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.b ##37 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.a.b ##37 Zig-zag eel MODERN SPECIES 9 ENSMAMG00000006265 ##30 ENSMAMG00000006241 ENSMAMG00000006009 ##30 ENSMAMG00000027685 ENSMAMG00000028027 ##30 ENSMAMG00000027968 ENSMAMG00000026765 ENSMAMG00000026735 ##30 ENSMAMG00000024291 ENSMAMG00000027345 ENSMAMG00000026139 ENSMAMG00000026799 ENSMAMG00000026208 ENSMAMG00000024708 ENSMAMG00000005367 ENSMAMG00000005362 ##37 ENSMAMG00000005352 ENSMAMG00000005330 ENSMAMG00000005295 ENSMAMG00000005279 ENSMAMG00000005255 ENSMAMG00000004853 ENSMAMG00000028315 ENSMAMG00000004973 ENSMAMG00000005151 ENSMAMG00000005004 ENSMAMG00000005102 ENSMAMG00000005174 ENSMAMG00000005112 ENSMAMG00000005230 ENSMAMG00000026976 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000067117 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000158980 ENSGT01060000248608.b ENSGT00950000182866.D.d.b ENSGT00390000003354 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000005067.a ENSGT00940000175410 ENSGT01050000244824.C ENSGT00950000182972.a.b ENSGT01050000244897.a.a.a ENSGT00940000155353.b ENSGT01030000234530.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.b.b ##37 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 253 ENSGT00950000182968.d.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c ENSGT01030000234530.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1461 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 336 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.a ENSGT00990000204231.D ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000165455.a.p.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000163701.b.b.d ENSGT00940000166258.d.b ENSGT00940000158661.b.g Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 ENSSSAG00000054518 ##37 ENSSSAG00000054560 ENSSSAG00000088055 ##37 ENSSSAG00000054586 ENSSSAG00000054599 ##37 ENSSSAG00000054617 ENSSSAG00000054627 ##37 ENSSSAG00000120008 ENSSSAG00000105625 ##37 ENSSSAG00000024942 ENSSSAG00000089136 ##37 ENSSSAG00000054651 ENSSSAG00000054401 ENSSSAG00000054667 ENSSSAG00000054681 ENSSSAG00000054687 ##37 ENSSSAG00000054692 ENSSSAG00000054701 ENSSSAG00000054639 ##37 ENSSSAG00000054737 ENSSSAG00000054741 ENSSSAG00000098693 RBM4B (ENSSSAG00000051434) ENSSSAG00000113070 ENSSSAG00000054769 ENSSSAG00000117989 ENSSSAG00000054776 ENSSSAG00000054893 ENSSSAG00000091446 ugt5g1 (ENSSSAG00000065510) ENSSSAG00000065514 Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 ENSSSAG00000054586 ENSSSAG00000054599 ##37 ENSSSAG00000054617 ENSSSAG00000054627 ##37 ENSSSAG00000120008 ENSSSAG00000105625 ##37 ENSSSAG00000024942 ENSSSAG00000089136 ##37 ENSSSAG00000054651 ENSSSAG00000054401 ENSSSAG00000054667 ENSSSAG00000054681 ENSSSAG00000054687 ##37 ENSSSAG00000054692 ENSSSAG00000054701 ENSSSAG00000054639 ##37 ENSSSAG00000054737 ENSSSAG00000054741 ENSSSAG00000098693 RBM4B (ENSSSAG00000051434) ENSSSAG00000113070 ENSSSAG00000054769 ENSSSAG00000117989 ENSSSAG00000054776 ENSSSAG00000054893 ENSSSAG00000091446 ugt5g1 (ENSSSAG00000065510) ENSSSAG00000065514 ENSSSAG00000065517 cldn7a (ENSSSAG00000084211) chrnb1l (ENSSSAG00000065525) River trout MODERN SPECIES 35 ENSSTUG00000000312 ENSSTUG00000000296 ENSSTUG00000000290 ##37 ENSSTUG00000000289 ##37 ENSSTUG00000000267 ##37 ENSSTUG00000000247 ##37 ENSSTUG00000000232 ENSSTUG00000000090 ENSSTUG00000000059 ##37 ENSSTUG00000047382 ##37 ENSSTUG00000047378 ENSSTUG00000047375 ##37 ENSSTUG00000047330 ENSSTUG00000047283 ENSSTUG00000047270 ENSSTUG00000047264 ##37 ENSSTUG00000047260 ##37 ENSSTUG00000047244 ENSSTUG00000047238 ENSSTUG00000047235 ENSSTUG00000047230 ENSSTUG00000047214 ENSSTUG00000047205 ENSSTUG00000047201 ENSSTUG00000047188 ENSSTUG00000047174 ##30 ENSSTUG00000047170 dock11 (ENSSTUG00000044137) ENSSTUG00000044059 ENSSTUG00000044057 ENSSTUG00000044040 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000155658.k ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000165455.a.p.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01000000214950.B ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.o.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.b Rainbow trout MODERN SPECIES 30 ENSOMYG00000002666 ENSOMYG00000075815 ENSOMYG00000002591 ENSOMYG00000069538 ENSOMYG00000051464 ENSOMYG00000002350 ENSOMYG00000002474 ENSOMYG00000070359 ##30 ENSOMYG00000002365 ##37 ENSOMYG00000002524 ENSOMYG00000002320 ENSOMYG00000002253 ##37 ENSOMYG00000002244 ##37 ENSOMYG00000002225 ENSOMYG00000002208 ##37 ENSOMYG00000071959 ##37 ENSOMYG00000002138 ##30 ENSOMYG00000001884 ENSOMYG00000001742 nitr3 (ENSOMYG00000001590) ##37 nitr2 (ENSOMYG00000016105) ENSOMYG00000016102 ENSOMYG00000016096 ENSOMYG00000044646 ENSOMYG00000016056 ENSOMYG00000016035 ENSOMYG00000015279 ENSOMYG00000015216 ENSOMYG00000015209 ugt5g1 (ENSOMYG00000015204) ENSOMYG00000051368 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01000000214950.B ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.d ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00990000204231.D ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.o.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A Chinook salmon MODERN SPECIES 1 ENSOTSG00005001101 ENSOTSG00005001088 ENSOTSG00005001079 ENSOTSG00005001074 ufm1 (ENSOTSG00005001065) ENSOTSG00005001057 ENSOTSG00005001037 ENSOTSG00005000807 ##37 ENSOTSG00005017655 ENSOTSG00005017654 ##37 ENSOTSG00005017653 ENSOTSG00005017652 ##37 ENSOTSG00005017651 ENSOTSG00005017650 ##37 ENSOTSG00005017648 ENSOTSG00005017647 ##37 ENSOTSG00005017646 ENSOTSG00005017344 ENSOTSG00005017335 ENSOTSG00005017307 ENSOTSG00005017299 ##37 ENSOTSG00005017291 ENSOTSG00005017287 ENSOTSG00005017284 rbm4.3 (ENSOTSG00005017281) rbm4.3 (ENSOTSG00005017272) fxr2 (ENSOTSG00005008383) PTGDR2 (ENSOTSG00005008356) ENSOTSG00005008355 ugt5g1 (ENSOTSG00005008354) ENSOTSG00005008352 Huchen MODERN SPECIES 354 ENSHHUG00000000670 ENSHHUG00000000662 ENSHHUG00000000659 ENSHHUG00000000616 ENSHHUG00000000578 ##37 ENSHHUG00000000569 ENSHHUG00000000495 ##37 ENSHHUG00000000412 ENSHHUG00000000396 ##37 ENSHHUG00000000384 ##37 ENSHHUG00000000242 ##37 ENSHHUG00000000216 ENSHHUG00000000157 ##37 ENSHHUG00000000113 ENSHHUG00000000107 ##37 ENSHHUG00000000087 ##37 ENSHHUG00000000082 ##37 ENSHHUG00000000073 ENSHHUG00000000014 ENSHHUG00000051732 ##37 ENSHHUG00000051596 ENSHHUG00000051590 ENSHHUG00000051581 ENSHHUG00000051580 rbm4.3 (ENSHHUG00000051562) fxr2 (ENSHHUG00000051250) PTGDR2 (ENSHHUG00000051235) ENSHHUG00000051232 ugt5g1 (ENSHHUG00000051231) ENSHHUG00000051227 ENSHHUG00000051225 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000163701.b.b.d ENSGT00940000166258.d.b ENSGT00940000158661.b.g ENSGT00940000158058.a.a.a ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b.g ENSGT00390000000334.e ENSGT00940000166430.bb.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000165455.a.p.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000163701.b.b.d ENSGT00940000166258.d.b ENSGT00940000158661.b.g ENSGT00940000158058.a.a.a ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b.g Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.o.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000163701.b.b.d ENSGT00940000166258.d.b ENSGT00940000158661.b.g ENSGT00940000158058.a.a.a ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b.g ENSGT00390000000334.e Rainbow trout MODERN SPECIES 30 ENSOMYG00000051464 ENSOMYG00000002350 ENSOMYG00000002474 ENSOMYG00000070359 ##30 ENSOMYG00000002365 ##37 ENSOMYG00000002524 ENSOMYG00000002320 ENSOMYG00000002253 ##37 ENSOMYG00000002244 ##37 ENSOMYG00000002225 ENSOMYG00000002208 ##37 ENSOMYG00000071959 ##37 ENSOMYG00000002138 ##30 ENSOMYG00000001884 ENSOMYG00000001742 nitr3 (ENSOMYG00000001590) ##37 nitr2 (ENSOMYG00000016105) ENSOMYG00000016102 ENSOMYG00000016096 ENSOMYG00000044646 ENSOMYG00000016056 ENSOMYG00000016035 ENSOMYG00000015279 ENSOMYG00000015216 ENSOMYG00000015209 ugt5g1 (ENSOMYG00000015204) ENSOMYG00000051368 ENSOMYG00000055562 ENSOMYG00000015193 cldn7a (ENSOMYG00000068124) ENSOMYG00000055505 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.d ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00990000204231.D ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.o.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000163701.b.b.d ENSGT00940000166258.d.b ENSGT00940000158661.b.g ENSGT00940000158058.a.a.a ENSGT01050000244976.b.b.b.a.b.g Chinook salmon MODERN SPECIES 1 ENSOTSG00005001057 ENSOTSG00005001037 ENSOTSG00005000807 ##37 ENSOTSG00005017655 ENSOTSG00005017654 ##37 ENSOTSG00005017653 ENSOTSG00005017652 ##37 ENSOTSG00005017651 ENSOTSG00005017650 ##37 ENSOTSG00005017648 ENSOTSG00005017647 ##37 ENSOTSG00005017646 ENSOTSG00005017344 ENSOTSG00005017335 ENSOTSG00005017307 ENSOTSG00005017299 ##37 ENSOTSG00005017291 ENSOTSG00005017287 ENSOTSG00005017284 rbm4.3 (ENSOTSG00005017281) rbm4.3 (ENSOTSG00005017272) fxr2 (ENSOTSG00005008383) PTGDR2 (ENSOTSG00005008356) ENSOTSG00005008355 ugt5g1 (ENSOTSG00005008354) ENSOTSG00005008352 ENSOTSG00005008349 cldn7a (ENSOTSG00005008348) chrnb1l (ENSOTSG00005008346) fgf11a (ENSOTSG00005008342) ENSOTSG00005008338 Coho salmon MODERN SPECIES 7 ENSOKIG00005037874 ENSOKIG00005037844 ENSOKIG00005037816 ##37 ENSOKIG00005037769 ##37 ENSOKIG00005037717 ENSOKIG00005037688 ##37 ENSOKIG00005037668 ENSOKIG00005037648 ##37 ENSOKIG00005037636 ENSOKIG00005037622 ENSOKIG00005037609 ##37 ENSOKIG00005037395 ENSOKIG00005037369 ENSOKIG00005037337 ENSOKIG00005037326 ENSOKIG00005037288 ##37 ENSOKIG00005037262 ENSOKIG00005037237 rbm4.3 (ENSOKIG00005037175) fxr2 (ENSOKIG00005034803) PTGDR2 (ENSOKIG00005034705) ENSOKIG00005034673 ugt5g1 (ENSOKIG00005034665) ENSOKIG00005034655 ENSOKIG00005034645 cldn7a (ENSOKIG00005034623) chrnb1l (ENSOKIG00005034575) fgf11a (ENSOKIG00005034545) tmem102 (ENSOKIG00005034540) tmem256 (ENSOKIG00005034534) ENSOKIG00005033864 Huchen MODERN SPECIES 354 ENSHHUG00000000578 ##37 ENSHHUG00000000569 ENSHHUG00000000495 ##37 ENSHHUG00000000412 ENSHHUG00000000396 ##37 ENSHHUG00000000384 ##37 ENSHHUG00000000242 ##37 ENSHHUG00000000216 ENSHHUG00000000157 ##37 ENSHHUG00000000113 ENSHHUG00000000107 ##37 ENSHHUG00000000087 ##37 ENSHHUG00000000082 ##37 ENSHHUG00000000073 ENSHHUG00000000014 ENSHHUG00000051732 ##37 ENSHHUG00000051596 ENSHHUG00000051590 ENSHHUG00000051581 ENSHHUG00000051580 rbm4.3 (ENSHHUG00000051562) fxr2 (ENSHHUG00000051250) PTGDR2 (ENSHHUG00000051235) ENSHHUG00000051232 ugt5g1 (ENSHHUG00000051231) ENSHHUG00000051227 ENSHHUG00000051225 cldn7a (ENSHHUG00000051224) chrnb1l (ENSHHUG00000051219) ENSHHUG00000051213 fgf11a (ENSHHUG00000051210) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1921 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 803 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.a ENSGT00990000204231.D ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000165455.a.p.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 ENSSSAG00000054222 ##37 ENSSSAG00000054226 ENSSSAG00000054233 ENSSSAG00000054244 ENSSSAG00000054365 ##37 ENSSSAG00000054373 ##37 ENSSSAG00000112574 ENSSSAG00000054518 ##37 ENSSSAG00000054560 ENSSSAG00000088055 ##37 ENSSSAG00000054586 ENSSSAG00000054599 ##37 ENSSSAG00000054617 ENSSSAG00000054627 ##37 ENSSSAG00000120008 ENSSSAG00000105625 ##37 ENSSSAG00000024942 ENSSSAG00000089136 ##37 ENSSSAG00000054651 ENSSSAG00000054401 ENSSSAG00000054667 ENSSSAG00000054681 ENSSSAG00000054687 ##37 ENSSSAG00000054692 ENSSSAG00000054701 ENSSSAG00000054639 ##37 ENSSSAG00000054737 ENSSSAG00000054741 ENSSSAG00000098693 RBM4B (ENSSSAG00000051434) ENSSSAG00000113070 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000157535.m.a.b ENSGT01090000260120 ENSGT00390000009529.h.b ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT00940000178201 ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h Huchen MODERN SPECIES 354 fxr2 (ENSHHUG00000051250) rbm4.3 (ENSHHUG00000051562) ENSHHUG00000051580 ENSHHUG00000051581 ENSHHUG00000051590 ENSHHUG00000051596 ENSHHUG00000051732 ##37 ENSHHUG00000000014 ENSHHUG00000000073 ENSHHUG00000000082 ##37 ENSHHUG00000000087 ##37 ENSHHUG00000000107 ##37 ENSHHUG00000000113 ENSHHUG00000000157 ##37 ENSHHUG00000000216 ENSHHUG00000000242 ##37 ENSHHUG00000000384 ##37 ENSHHUG00000000396 ##37 ENSHHUG00000000412 ENSHHUG00000000495 ##37 ENSHHUG00000000569 ENSHHUG00000000578 ##37 ENSHHUG00000000616 ENSHHUG00000000659 ENSHHUG00000000662 ENSHHUG00000000670 ENSHHUG00000000685 ENSHHUG00000000760 ENSHHUG00000000772 ENSHHUG00000000784 ENSHHUG00000000796 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000155658.k ENSGT00980000199875.a ENSGT00730000112044.f ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00390000009529.h.b ENSGT01090000260120 ENSGT00940000157535.m.a.b ENSGT01100000263520.b.b.f.k.b ENSGT00940000159866.b ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.j ENSGT00940000163503.A.a.a.a Salmo DUPLICATION Salmo ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000165455.a.p.b ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00990000204231.D ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.b.a River trout MODERN SPECIES 35 ENSSTUG00000000419 ENSSTUG00000000415 rbm4.3 (ENSSTUG00000000400) ENSSTUG00000000393 ENSSTUG00000000392 ENSSTUG00000000354 ENSSTUG00000000324 ENSSTUG00000000312 ENSSTUG00000000296 ENSSTUG00000000290 ##37 ENSSTUG00000000289 ##37 ENSSTUG00000000267 ##37 ENSSTUG00000000247 ##37 ENSSTUG00000000232 ENSSTUG00000000090 ENSSTUG00000000059 ##37 ENSSTUG00000047382 ##37 ENSSTUG00000047378 ENSSTUG00000047375 ##37 ENSSTUG00000047330 ENSSTUG00000047283 ENSSTUG00000047270 ENSSTUG00000047264 ##37 ENSSTUG00000047260 ##37 ENSSTUG00000047244 ENSSTUG00000047238 ENSSTUG00000047235 ENSSTUG00000047230 ENSSTUG00000047214 ENSSTUG00000047205 ENSSTUG00000047201 Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 ENSSSAG00000054737 ENSSSAG00000054639 ##37 ENSSSAG00000054701 ENSSSAG00000054692 ENSSSAG00000054687 ##37 ENSSSAG00000054681 ENSSSAG00000054667 ENSSSAG00000054401 ENSSSAG00000054651 ENSSSAG00000089136 ##37 ENSSSAG00000024942 ENSSSAG00000105625 ##37 ENSSSAG00000120008 ENSSSAG00000054627 ##37 ENSSSAG00000054617 ENSSSAG00000054599 ##37 ENSSSAG00000054586 ENSSSAG00000088055 ##37 ENSSSAG00000054560 ENSSSAG00000054518 ##37 ENSSSAG00000112574 ENSSSAG00000054373 ##37 ENSSSAG00000054365 ##37 ENSSSAG00000054244 ENSSSAG00000054233 ENSSSAG00000054226 ENSSSAG00000054222 ##37 ENSSSAG00000054216 ENSSSAG00000054196 ENSSSAG00000081588 ENSSSAG00000054173 ##37 Salmo ANCESTRAL SPECIES 294 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b ##37 Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 ENSSSAG00000054667 ENSSSAG00000054401 ENSSSAG00000054651 ENSSSAG00000089136 ##37 ENSSSAG00000024942 ENSSSAG00000105625 ##37 ENSSSAG00000120008 ENSSSAG00000054627 ##37 ENSSSAG00000054617 ENSSSAG00000054599 ##37 ENSSSAG00000054586 ENSSSAG00000088055 ##37 ENSSSAG00000054560 ENSSSAG00000054518 ##37 ENSSSAG00000112574 ENSSSAG00000054373 ##37 ENSSSAG00000054365 ##37 ENSSSAG00000054244 ENSSSAG00000054233 ENSSSAG00000054226 ENSSSAG00000054222 ##37 ENSSSAG00000054216 ENSSSAG00000054196 ENSSSAG00000081588 ENSSSAG00000054173 ##37 ENSSSAG00000054158 ENSSSAG00000082179 ENSSSAG00000098161 ENSSSAG00000086607 ENSSSAG00000102680 dock11 (ENSSSAG00000049786) Oncorhynchus DUPLICATION Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00940000165455.a.o.a ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.b ##37 ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01000000214950.B ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000155658.k ENSGT00980000199875.a ENSGT00730000112044.f ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00390000009529.h.b ENSGT01090000260120 ENSGT00940000157535.m.a.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00940000165455.a.o.a ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00990000204231.D ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.d ##37 ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01000000214950.B ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000155658.k ENSGT00980000199875.a ENSGT00730000112044.f ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00390000009529.h.b ENSGT01090000260120 ENSGT00940000157535.m.a.b Chinook salmon MODERN SPECIES 1 fxr2 (ENSOTSG00005008383) rbm4.3 (ENSOTSG00005017272) rbm4.3 (ENSOTSG00005017281) ENSOTSG00005017284 ENSOTSG00005017287 ENSOTSG00005017291 ENSOTSG00005017299 ##37 ENSOTSG00005017307 ENSOTSG00005017335 ENSOTSG00005017344 ENSOTSG00005017646 ENSOTSG00005017647 ##37 ENSOTSG00005017648 ENSOTSG00005017650 ##37 ENSOTSG00005017651 ENSOTSG00005017652 ##37 ENSOTSG00005017653 ENSOTSG00005017654 ##37 ENSOTSG00005017655 ENSOTSG00005000807 ##37 ENSOTSG00005001037 ENSOTSG00005001057 ufm1 (ENSOTSG00005001065) ENSOTSG00005001074 ENSOTSG00005001079 ENSOTSG00005001088 ENSOTSG00005001101 ENSOTSG00005001109 ENSOTSG00005001116 ENSOTSG00005001124 ##37 ENSOTSG00005001135 Rainbow trout MODERN SPECIES 30 ENSOMYG00000015216 ENSOMYG00000015279 ENSOMYG00000016035 ENSOMYG00000016056 ENSOMYG00000044646 ENSOMYG00000016096 ENSOMYG00000016102 nitr2 (ENSOMYG00000016105) nitr3 (ENSOMYG00000001590) ##37 ENSOMYG00000001742 ENSOMYG00000001884 ENSOMYG00000002138 ##30 ENSOMYG00000071959 ##37 ENSOMYG00000002208 ##37 ENSOMYG00000002225 ENSOMYG00000002244 ##37 ENSOMYG00000002253 ##37 ENSOMYG00000002320 ENSOMYG00000002524 ENSOMYG00000002365 ##37 ENSOMYG00000070359 ##30 ENSOMYG00000002474 ENSOMYG00000002350 ENSOMYG00000051464 ENSOMYG00000069538 ENSOMYG00000002591 ENSOMYG00000075815 ENSOMYG00000002666 dock11 (ENSOMYG00000002723) il13ra1b (ENSOMYG00000002756) il13ra1a (ENSOMYG00000002779) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 235 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.d ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.b.b Rainbow trout MODERN SPECIES 30 ENSOMYG00000044646 ENSOMYG00000016096 ENSOMYG00000016102 nitr2 (ENSOMYG00000016105) nitr3 (ENSOMYG00000001590) ##37 ENSOMYG00000001742 ENSOMYG00000001884 ENSOMYG00000002138 ##30 ENSOMYG00000071959 ##37 ENSOMYG00000002208 ##37 ENSOMYG00000002225 ENSOMYG00000002244 ##37 ENSOMYG00000002253 ##37 ENSOMYG00000002320 ENSOMYG00000002524 ENSOMYG00000002365 ##37 ENSOMYG00000070359 ##30 ENSOMYG00000002474 ENSOMYG00000002350 ENSOMYG00000051464 ENSOMYG00000069538 ENSOMYG00000002591 ENSOMYG00000075815 ENSOMYG00000002666 dock11 (ENSOMYG00000002723) il13ra1b (ENSOMYG00000002756) il13ra1a (ENSOMYG00000002779) kirrel1a (ENSOMYG00000002886) ndufs2 (ENSOMYG00000002973) ENSOMYG00000002979 ENSOMYG00000056224 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00990000204231.D ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.d ##37 ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01000000214950.B ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000155658.k ENSGT00980000199875.a ENSGT00730000112044.f ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00390000009529.h.b ENSGT01090000260120 ENSGT00940000157535.m.a.b ENSGT01100000263520.b.b.f.k.b ENSGT00940000159866.b ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.j ENSGT00940000163503.A.a.a.a Chinook salmon MODERN SPECIES 1 ENSOTSG00005017287 ENSOTSG00005017291 ENSOTSG00005017299 ##37 ENSOTSG00005017307 ENSOTSG00005017335 ENSOTSG00005017344 ENSOTSG00005017646 ENSOTSG00005017647 ##37 ENSOTSG00005017648 ENSOTSG00005017650 ##37 ENSOTSG00005017651 ENSOTSG00005017652 ##37 ENSOTSG00005017653 ENSOTSG00005017654 ##37 ENSOTSG00005017655 ENSOTSG00005000807 ##37 ENSOTSG00005001037 ENSOTSG00005001057 ufm1 (ENSOTSG00005001065) ENSOTSG00005001074 ENSOTSG00005001079 ENSOTSG00005001088 ENSOTSG00005001101 ENSOTSG00005001109 ENSOTSG00005001116 ENSOTSG00005001124 ##37 ENSOTSG00005001135 ENSOTSG00005001194 ##37 dock11 (ENSOTSG00005001212) ENSOTSG00005001244 ENSOTSG00005001256 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.b ##37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.b ##37 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.b ##37 River trout MODERN SPECIES 35 ENSSTUG00000047238 ENSSTUG00000047244 ENSSTUG00000047260 ##37 ENSSTUG00000047264 ##37 ENSSTUG00000047270 ENSSTUG00000047283 ENSSTUG00000047330 ENSSTUG00000047375 ##37 ENSSTUG00000047378 ENSSTUG00000047382 ##37 ENSSTUG00000000059 ##37 ENSSTUG00000000090 ENSSTUG00000000232 ENSSTUG00000000247 ##37 ENSSTUG00000000267 ##37 ENSSTUG00000000289 ##37 ENSSTUG00000000290 ##37 ENSSTUG00000000296 ENSSTUG00000000312 ENSSTUG00000000324 ENSSTUG00000000354 ENSSTUG00000000392 ENSSTUG00000000393 rbm4.3 (ENSSTUG00000000400) ENSSTUG00000000415 ENSSTUG00000000419 rbm4.3 (ENSSTUG00000000424) rbm4.3 (ENSSTUG00000000429) ENSSTUG00000000437 fxr2 (ENSSTUG00000000567) PTGDR2 (ENSSTUG00000001746) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000159866.b ENSGT01100000263520.b.b.f.k.b ENSGT00940000157535.m.a.b ENSGT01090000260120 ENSGT00390000009529.h.b ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT00940000178201 ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 336 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.a River trout DUPLICATION River trout MODERN SPECIES 35 kirrel1a (ENSSTUG00000043684) ENSSTUG00000044040 ENSSTUG00000044057 ENSSTUG00000044059 dock11 (ENSSTUG00000044137) ENSSTUG00000047170 ENSSTUG00000047174 ##30 ENSSTUG00000047188 ENSSTUG00000047201 ENSSTUG00000047205 ENSSTUG00000047214 ENSSTUG00000047230 ENSSTUG00000047235 ENSSTUG00000047238 ENSSTUG00000047244 ENSSTUG00000047260 ##37 ENSSTUG00000047264 ##37 ENSSTUG00000047270 ENSSTUG00000047283 ENSSTUG00000047330 ENSSTUG00000047375 ##37 ENSSTUG00000047378 ENSSTUG00000047382 ##37 ENSSTUG00000000059 ##37 ENSSTUG00000000090 ENSSTUG00000000232 ENSSTUG00000000247 ##37 ENSSTUG00000000267 ##37 ENSSTUG00000000289 ##37 ENSSTUG00000000290 ##37 ENSSTUG00000000296 River trout MODERN SPECIES 35 fxr2 (ENSSTUG00000000567) ENSSTUG00000000437 rbm4.3 (ENSSTUG00000000429) rbm4.3 (ENSSTUG00000000424) ENSSTUG00000000419 ENSSTUG00000000415 rbm4.3 (ENSSTUG00000000400) ENSSTUG00000000393 ENSSTUG00000000392 ENSSTUG00000000354 ENSSTUG00000000324 ENSSTUG00000000312 ENSSTUG00000000296 ENSSTUG00000000290 ##37 ENSSTUG00000000289 ##37 ENSSTUG00000000267 ##37 ENSSTUG00000000247 ##37 ENSSTUG00000000232 ENSSTUG00000000090 ENSSTUG00000000059 ##37 ENSSTUG00000047382 ##37 ENSSTUG00000047378 ENSSTUG00000047375 ##37 ENSSTUG00000047330 ENSSTUG00000047283 ENSSTUG00000047270 ENSSTUG00000047264 ##37 ENSSTUG00000047260 ##37 ENSSTUG00000047244 ENSSTUG00000047238 ENSSTUG00000047235 Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 ENSSSAG00000049672 dock11 (ENSSSAG00000049786) ENSSSAG00000102680 ENSSSAG00000086607 ENSSSAG00000098161 ENSSSAG00000082179 ENSSSAG00000054158 ENSSSAG00000054173 ##37 ENSSSAG00000081588 ENSSSAG00000054196 ENSSSAG00000054216 ENSSSAG00000054222 ##37 ENSSSAG00000054226 ENSSSAG00000054233 ENSSSAG00000054244 ENSSSAG00000054365 ##37 ENSSSAG00000054373 ##37 ENSSSAG00000112574 ENSSSAG00000054518 ##37 ENSSSAG00000054560 ENSSSAG00000088055 ##37 ENSSSAG00000054586 ENSSSAG00000054599 ##37 ENSSSAG00000054617 ENSSSAG00000054627 ##37 ENSSSAG00000120008 ENSSSAG00000105625 ##37 ENSSSAG00000024942 ENSSSAG00000089136 ##37 ENSSSAG00000054651 ENSSSAG00000054401 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 460 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.b Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.b ##37 River trout MODERN SPECIES 38 ENSSTUG00000046871 ENSSTUG00000046863 ENSSTUG00000046855 PTGDR2 (ENSSTUG00000046850) fxr2 (ENSSTUG00000045929) ponzr6 (ENSSTUG00000045872) ponzr6 (ENSSTUG00000045832) rbm4.3 (ENSSTUG00000045823) TIFA (ENSSTUG00000045821) ENSSTUG00000045820 ENSSTUG00000045816 ENSSTUG00000045755 ##37 ENSSTUG00000045745 ENSSTUG00000045692 ENSSTUG00000045685 ##37 ENSSTUG00000045679 ##37 ENSSTUG00000045650 ENSSTUG00000045603 ENSSTUG00000045565 ENSSTUG00000045557 ENSSTUG00000045547 ENSSTUG00000045540 ##37 ENSSTUG00000045530 ENSSTUG00000045521 ##30 ENSSTUG00000045508 ENSSTUG00000045490 ENSSTUG00000045482 ##37 ENSSTUG00000045464 ##37 ENSSTUG00000045458 ##37 ENSSTUG00000045452 ENSSTUG00000045422 ##37 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.b ##37 ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01000000214950.B ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000155658.k ENSGT00980000199875.a ENSGT00730000112044.f ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00390000009529.h.b ENSGT01090000260120 ENSGT00940000157535.m.a.b ENSGT01100000263520.b.b.f.k.b ENSGT00940000159866.b ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.j ENSGT00940000163503.A.a.a.a Rainbow trout MODERN SPECIES 13 ENSOMYG00000037023 ENSOMYG00000037030 ENSOMYG00000037383 ponzr6 (ENSOMYG00000040081) rbm4.3 (ENSOMYG00000014956) ENSOMYG00000014965 ENSOMYG00000014983 ENSOMYG00000015000 ENSOMYG00000015027 ENSOMYG00000015065 ENSOMYG00000069459 ENSOMYG00000015080 ENSOMYG00000054572 ENSOMYG00000015086 ENSOMYG00000055156 ENSOMYG00000063413 ##37 ENSOMYG00000015125 ##37 ENSOMYG00000015102 ENSOMYG00000015178 ENSOMYG00000015194 ##37 ENSOMYG00000070461 ##37 ENSOMYG00000015198 ##37 nitr1 (ENSOMYG00000015208) ENSOMYG00000056555 ENSOMYG00000067677 ENSOMYG00000015298 ENSOMYG00000015397 ##37 ENSOMYG00000015437 ##37 ENSOMYG00000051101 ENSOMYG00000059858 ENSOMYG00000052918 ##37 Huchen MODERN SPECIES 354 ENSHHUG00000000685 ENSHHUG00000000670 ENSHHUG00000000662 ENSHHUG00000000659 ENSHHUG00000000616 ENSHHUG00000000578 ##37 ENSHHUG00000000569 ENSHHUG00000000495 ##37 ENSHHUG00000000412 ENSHHUG00000000396 ##37 ENSHHUG00000000384 ##37 ENSHHUG00000000242 ##37 ENSHHUG00000000216 ENSHHUG00000000157 ##37 ENSHHUG00000000113 ENSHHUG00000000107 ##37 ENSHHUG00000000087 ##37 ENSHHUG00000000082 ##37 ENSHHUG00000000073 ENSHHUG00000000014 ENSHHUG00000051732 ##37 ENSHHUG00000051596 ENSHHUG00000051590 ENSHHUG00000051581 ENSHHUG00000051580 rbm4.3 (ENSHHUG00000051562) fxr2 (ENSHHUG00000051250) PTGDR2 (ENSHHUG00000051235) ENSHHUG00000051232 ugt5g1 (ENSHHUG00000051231) ENSHHUG00000051227 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT00940000178201 ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000163701.b.b.d ENSGT00940000166258.d.b Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000155658.k ENSGT00980000199875.a ENSGT00730000112044.f ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00390000009529.h.b ENSGT01090000260120 ENSGT00940000157535.m.a.b ENSGT01100000263520.b.b.f.k.b ENSGT00940000159866.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 294 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b ##37 Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 ENSSSAG00000054687 ##37 ENSSSAG00000054681 ENSSSAG00000054667 ENSSSAG00000054401 ENSSSAG00000054651 ENSSSAG00000089136 ##37 ENSSSAG00000024942 ENSSSAG00000105625 ##37 ENSSSAG00000120008 ENSSSAG00000054627 ##37 ENSSSAG00000054617 ENSSSAG00000054599 ##37 ENSSSAG00000054586 ENSSSAG00000088055 ##37 ENSSSAG00000054560 ENSSSAG00000054518 ##37 ENSSSAG00000112574 ENSSSAG00000054373 ##37 ENSSSAG00000054365 ##37 ENSSSAG00000054244 ENSSSAG00000054233 ENSSSAG00000054226 ENSSSAG00000054222 ##37 ENSSSAG00000054216 ENSSSAG00000054196 ENSSSAG00000081588 ENSSSAG00000054173 ##37 ENSSSAG00000054158 ENSSSAG00000082179 ENSSSAG00000098161 ENSSSAG00000086607 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 737 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 856 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 Coho salmon MODERN SPECIES 7 rbm4.3 (ENSOKIG00005037175) ENSOKIG00005037237 ENSOKIG00005037262 ENSOKIG00005037288 ##37 ENSOKIG00005037326 ENSOKIG00005037337 ENSOKIG00005037369 ENSOKIG00005037395 ENSOKIG00005037609 ##37 ENSOKIG00005037622 ENSOKIG00005037636 ENSOKIG00005037648 ##37 ENSOKIG00005037668 ENSOKIG00005037688 ##37 ENSOKIG00005037717 ENSOKIG00005037769 ##37 ENSOKIG00005037816 ##37 ENSOKIG00005037844 ENSOKIG00005037874 ENSOKIG00005037901 ENSOKIG00005037970 ENSOKIG00005038173 ENSOKIG00005038189 kirrel1a (ENSOKIG00005038277) ndufs2 (ENSOKIG00005038691) ENSOKIG00005038729 ENSOKIG00005004296 ENSOKIG00005004325 ENSOKIG00005004348 NEURL4 (ENSOKIG00005004443) ENSOKIG00005004634 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p.b ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000155658.k ENSGT00980000199875.a ENSGT00730000112044.f ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00390000009529.h.b ENSGT01090000260120 ENSGT00940000157535.m.a.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 294 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b ##37 River trout MODERN SPECIES 35 ENSSTUG00000000393 ENSSTUG00000000392 ENSSTUG00000000354 ENSSTUG00000000324 ENSSTUG00000000312 ENSSTUG00000000296 ENSSTUG00000000290 ##37 ENSSTUG00000000289 ##37 ENSSTUG00000000267 ##37 ENSSTUG00000000247 ##37 ENSSTUG00000000232 ENSSTUG00000000090 ENSSTUG00000000059 ##37 ENSSTUG00000047382 ##37 ENSSTUG00000047378 ENSSTUG00000047375 ##37 ENSSTUG00000047330 ENSSTUG00000047283 ENSSTUG00000047270 ENSSTUG00000047264 ##37 ENSSTUG00000047260 ##37 ENSSTUG00000047244 ENSSTUG00000047238 ENSSTUG00000047235 ENSSTUG00000047230 ENSSTUG00000047214 ENSSTUG00000047205 ENSSTUG00000047201 ENSSTUG00000047188 ENSSTUG00000047174 ##30 ENSSTUG00000047170 Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 ENSSSAG00000054701 ENSSSAG00000054692 ENSSSAG00000054687 ##37 ENSSSAG00000054681 ENSSSAG00000054667 ENSSSAG00000054401 ENSSSAG00000054651 ENSSSAG00000089136 ##37 ENSSSAG00000024942 ENSSSAG00000105625 ##37 ENSSSAG00000120008 ENSSSAG00000054627 ##37 ENSSSAG00000054617 ENSSSAG00000054599 ##37 ENSSSAG00000054586 ENSSSAG00000088055 ##37 ENSSSAG00000054560 ENSSSAG00000054518 ##37 ENSSSAG00000112574 ENSSSAG00000054373 ##37 ENSSSAG00000054365 ##37 ENSSSAG00000054244 ENSSSAG00000054233 ENSSSAG00000054226 ENSSSAG00000054222 ##37 ENSSSAG00000054216 ENSSSAG00000054196 ENSSSAG00000081588 ENSSSAG00000054173 ##37 ENSSSAG00000054158 ENSSSAG00000082179 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 354 ENSHHUG00000051580 ENSHHUG00000051581 ENSHHUG00000051590 ENSHHUG00000051596 ENSHHUG00000051732 ##37 ENSHHUG00000000014 ENSHHUG00000000073 ENSHHUG00000000082 ##37 ENSHHUG00000000087 ##37 ENSHHUG00000000107 ##37 ENSHHUG00000000113 ENSHHUG00000000157 ##37 ENSHHUG00000000216 ENSHHUG00000000242 ##37 ENSHHUG00000000384 ##37 ENSHHUG00000000396 ##37 ENSHHUG00000000412 ENSHHUG00000000495 ##37 ENSHHUG00000000569 ENSHHUG00000000578 ##37 ENSHHUG00000000616 ENSHHUG00000000659 ENSHHUG00000000662 ENSHHUG00000000670 ENSHHUG00000000685 ENSHHUG00000000760 ENSHHUG00000000772 ENSHHUG00000000784 ENSHHUG00000000796 ENSHHUG00000000810 ENSHHUG00000000818 Huchen MODERN SPECIES 354 ENSHHUG00000051590 ENSHHUG00000051596 ENSHHUG00000051732 ##37 ENSHHUG00000000014 ENSHHUG00000000073 ENSHHUG00000000082 ##37 ENSHHUG00000000087 ##37 ENSHHUG00000000107 ##37 ENSHHUG00000000113 ENSHHUG00000000157 ##37 ENSHHUG00000000216 ENSHHUG00000000242 ##37 ENSHHUG00000000384 ##37 ENSHHUG00000000396 ##37 ENSHHUG00000000412 ENSHHUG00000000495 ##37 ENSHHUG00000000569 ENSHHUG00000000578 ##37 ENSHHUG00000000616 ENSHHUG00000000659 ENSHHUG00000000662 ENSHHUG00000000670 ENSHHUG00000000685 ENSHHUG00000000760 ENSHHUG00000000772 ENSHHUG00000000784 ENSHHUG00000000796 ENSHHUG00000000810 ENSHHUG00000000818 ENSHHUG00000000898 ENSHHUG00000000936 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00390000009529.h.b ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT00940000178201 ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h ENSGT00940000166282.A ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00940000165455.a.p.a ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p.b ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000155658.k ENSGT00980000199875.a ENSGT00730000112044.f ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00390000009529.h.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000165455.a.o.a ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.b ##37 ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01000000214950.B ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000155658.k ENSGT00980000199875.a ENSGT00730000112044.f ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00390000009529.h.b ENSGT01090000260120 ENSGT00940000157535.m.a.b ENSGT01100000263520.b.b.f.k.b ENSGT00940000159866.b Rainbow trout MODERN SPECIES 30 ENSOMYG00000015279 ENSOMYG00000016035 ENSOMYG00000016056 ENSOMYG00000044646 ENSOMYG00000016096 ENSOMYG00000016102 nitr2 (ENSOMYG00000016105) nitr3 (ENSOMYG00000001590) ##37 ENSOMYG00000001742 ENSOMYG00000001884 ENSOMYG00000002138 ##30 ENSOMYG00000071959 ##37 ENSOMYG00000002208 ##37 ENSOMYG00000002225 ENSOMYG00000002244 ##37 ENSOMYG00000002253 ##37 ENSOMYG00000002320 ENSOMYG00000002524 ENSOMYG00000002365 ##37 ENSOMYG00000070359 ##30 ENSOMYG00000002474 ENSOMYG00000002350 ENSOMYG00000051464 ENSOMYG00000069538 ENSOMYG00000002591 ENSOMYG00000075815 ENSOMYG00000002666 dock11 (ENSOMYG00000002723) il13ra1b (ENSOMYG00000002756) il13ra1a (ENSOMYG00000002779) kirrel1a (ENSOMYG00000002886) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00990000204231.D ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.d ##37 ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01000000214950.B ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000155658.k ENSGT00980000199875.a ENSGT00730000112044.f ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00390000009529.h.b ENSGT01090000260120 ENSGT00940000157535.m.a.b ENSGT01100000263520.b.b.f.k.b ENSGT00940000159866.b Coho salmon MODERN SPECIES 7 PTGDR2 (ENSOKIG00005034705) fxr2 (ENSOKIG00005034803) rbm4.3 (ENSOKIG00005037175) ENSOKIG00005037237 ENSOKIG00005037262 ENSOKIG00005037288 ##37 ENSOKIG00005037326 ENSOKIG00005037337 ENSOKIG00005037369 ENSOKIG00005037395 ENSOKIG00005037609 ##37 ENSOKIG00005037622 ENSOKIG00005037636 ENSOKIG00005037648 ##37 ENSOKIG00005037668 ENSOKIG00005037688 ##37 ENSOKIG00005037717 ENSOKIG00005037769 ##37 ENSOKIG00005037816 ##37 ENSOKIG00005037844 ENSOKIG00005037874 ENSOKIG00005037901 ENSOKIG00005037970 ENSOKIG00005038173 ENSOKIG00005038189 kirrel1a (ENSOKIG00005038277) ndufs2 (ENSOKIG00005038691) ENSOKIG00005038729 ENSOKIG00005004296 ENSOKIG00005004325 ENSOKIG00005004348 Chinook salmon MODERN SPECIES 1 rbm4.3 (ENSOTSG00005017281) ENSOTSG00005017284 ENSOTSG00005017287 ENSOTSG00005017291 ENSOTSG00005017299 ##37 ENSOTSG00005017307 ENSOTSG00005017335 ENSOTSG00005017344 ENSOTSG00005017646 ENSOTSG00005017647 ##37 ENSOTSG00005017648 ENSOTSG00005017650 ##37 ENSOTSG00005017651 ENSOTSG00005017652 ##37 ENSOTSG00005017653 ENSOTSG00005017654 ##37 ENSOTSG00005017655 ENSOTSG00005000807 ##37 ENSOTSG00005001037 ENSOTSG00005001057 ufm1 (ENSOTSG00005001065) ENSOTSG00005001074 ENSOTSG00005001079 ENSOTSG00005001088 ENSOTSG00005001101 ENSOTSG00005001109 ENSOTSG00005001116 ENSOTSG00005001124 ##37 ENSOTSG00005001135 ENSOTSG00005001194 ##37 dock11 (ENSOTSG00005001212) Salmo ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00990000204231.D ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.a ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.b.a River trout MODERN SPECIES 35 ENSSTUG00000000415 rbm4.3 (ENSSTUG00000000400) ENSSTUG00000000393 ENSSTUG00000000392 ENSSTUG00000000354 ENSSTUG00000000324 ENSSTUG00000000312 ENSSTUG00000000296 ENSSTUG00000000290 ##37 ENSSTUG00000000289 ##37 ENSSTUG00000000267 ##37 ENSSTUG00000000247 ##37 ENSSTUG00000000232 ENSSTUG00000000090 ENSSTUG00000000059 ##37 ENSSTUG00000047382 ##37 ENSSTUG00000047378 ENSSTUG00000047375 ##37 ENSSTUG00000047330 ENSSTUG00000047283 ENSSTUG00000047270 ENSSTUG00000047264 ##37 ENSSTUG00000047260 ##37 ENSSTUG00000047244 ENSSTUG00000047238 ENSSTUG00000047235 ENSSTUG00000047230 ENSSTUG00000047214 ENSSTUG00000047205 ENSSTUG00000047201 ENSSTUG00000047188 Huchen MODERN SPECIES 354 rbm4.3 (ENSHHUG00000051562) ENSHHUG00000051580 ENSHHUG00000051581 ENSHHUG00000051590 ENSHHUG00000051596 ENSHHUG00000051732 ##37 ENSHHUG00000000014 ENSHHUG00000000073 ENSHHUG00000000082 ##37 ENSHHUG00000000087 ##37 ENSHHUG00000000107 ##37 ENSHHUG00000000113 ENSHHUG00000000157 ##37 ENSHHUG00000000216 ENSHHUG00000000242 ##37 ENSHHUG00000000384 ##37 ENSHHUG00000000396 ##37 ENSHHUG00000000412 ENSHHUG00000000495 ##37 ENSHHUG00000000569 ENSHHUG00000000578 ##37 ENSHHUG00000000616 ENSHHUG00000000659 ENSHHUG00000000662 ENSHHUG00000000670 ENSHHUG00000000685 ENSHHUG00000000760 ENSHHUG00000000772 ENSHHUG00000000784 ENSHHUG00000000796 ENSHHUG00000000810 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.a.b ##37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.a.b ##37 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.a.b ##37 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.a.b ##37 Chinook salmon MODERN SPECIES 1 ENSOTSG00005017651 ENSOTSG00005017652 ##37 ENSOTSG00005017653 ENSOTSG00005017654 ##37 ENSOTSG00005017655 ENSOTSG00005000807 ##37 ENSOTSG00005001037 ENSOTSG00005001057 ufm1 (ENSOTSG00005001065) ENSOTSG00005001074 ENSOTSG00005001079 ENSOTSG00005001088 ENSOTSG00005001101 ENSOTSG00005001109 ENSOTSG00005001116 ENSOTSG00005001124 ##37 ENSOTSG00005001135 ENSOTSG00005001194 ##37 dock11 (ENSOTSG00005001212) ENSOTSG00005001244 ENSOTSG00005001256 kirrel1a (ENSOTSG00005001277) ndufs2 (ENSOTSG00005001814) ENSOTSG00005001861 ENSOTSG00005001871 ENSOTSG00005001881 NEURL4 (ENSOTSG00005001903) ENSOTSG00005002326 ENSOTSG00005002337 tnfsf12 (ENSOTSG00005002342) cyb5d1 (ENSOTSG00005002377) Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 294 ENSGT00940000158001.h ENSGT00510000050706.d ENSGT00950000183121.a.c.b ENSGT00800000125278 ENSGT00650000094881 ENSGT00940000166283 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 Huchen MODERN SPECIES 2609 ENSHHUG00000011038 dock11 (ENSHHUG00000011085) ENSHHUG00000013331 ##37 ENSHHUG00000013342 ENSHHUG00000013345 ##37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.b.a ##37 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158001.h.a ENSGT00510000050706.d ENSGT00950000183121.a.c.b ENSGT00650000094881 ENSGT00940000166283.a ENSGT00940000166283.b ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.a ##37 ENSGT00990000204231.J.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.b ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00940000165455.b.a Rainbow trout MODERN SPECIES 13 ENSOMYG00000071905 ENSOMYG00000027256 tnfsf12 (ENSOMYG00000026336) sat2a.2 (ENSOMYG00000062679) ENSOMYG00000026320 zpax4 (ENSOMYG00000026148) ENSOMYG00000026030 ENSOMYG00000025684 ENSOMYG00000024387 ENSOMYG00000024156 ENSOMYG00000024148 ndufs2 (ENSOMYG00000022934) kirrel1a (ENSOMYG00000022275) ENSOMYG00000022171 dock11 (ENSOMYG00000015977) ENSOMYG00000015486 ##37 ENSOMYG00000015256 ENSOMYG00000052918 ##37 ENSOMYG00000059858 ENSOMYG00000051101 ENSOMYG00000015437 ##37 ENSOMYG00000015397 ##37 ENSOMYG00000015298 ENSOMYG00000067677 ENSOMYG00000056555 nitr1 (ENSOMYG00000015208) ENSOMYG00000015198 ##37 ENSOMYG00000070461 ##37 ENSOMYG00000015194 ##37 ENSOMYG00000015178 ENSOMYG00000015102 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 294 ENSGT00650000094881 ENSGT00940000166283 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00650000094881 ENSGT00940000166283 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00940000165455.b.a ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a.g ENSGT00940000162009.a.a ENSGT00950000183136.b.a.b.g ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000163701.b.b.c ENSGT00940000166258.d.a ENSGT00940000158661.b.h Oncorhynchus DUPLICATION Oncorhynchus DUPLICATION Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 403 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.a.a ##37 ENSGT01030000234530.b.a.b.b ##37 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000166258.d.a ENSGT00940000163701.b.b.c ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183136.b.a.b.g ENSGT00940000162009.a.a ENSGT00950000183189.a.a.g ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00940000165455.b.a ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00990000204231.C ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.a.a ##37 ENSGT00990000204231.A ENSGT01000000215121.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00990000204231.J.a ENSGT00940000155658.j ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000157535.m.a.a Chinook salmon MODERN SPECIES 6 cldn7a (ENSOTSG00005014162) ponzr3 (ENSOTSG00005014164) ENSOTSG00005014165 ENSOTSG00005014166 PTGDR2 (ENSOTSG00005014168) fxr2 (ENSOTSG00005014173) ponzr6 (ENSOTSG00005015810) rbm4.3 (ENSOTSG00005015811) ENSOTSG00005015812 ENSOTSG00005015813 ENSOTSG00005015814 ENSOTSG00005015817 ENSOTSG00005015864 ENSOTSG00005015865 ENSOTSG00005015868 ENSOTSG00005015869 ##37 ENSOTSG00005015870 ENSOTSG00005015871 ENSOTSG00005022917 ##37 ENSOTSG00005022919 ##37 ENSOTSG00005022920 ##37 ENSOTSG00005022921 ENSOTSG00005022923 ##37 ENSOTSG00005022931 ##37 ENSOTSG00005023043 ENSOTSG00005023044 ENSOTSG00005023045 ENSOTSG00005023046 ##37 ENSOTSG00005023047 dock11 (ENSOTSG00005023088) ENSOTSG00005027460 Coho salmon MODERN SPECIES 29 PTGDR2 (ENSOKIG00005002482) ENSOKIG00005002487 FXR2 (ENSOKIG00005002610) ponzr6 (ENSOKIG00005003344) rbm4.3 (ENSOKIG00005003347) ENSOKIG00005003355 ENSOKIG00005003364 ENSOKIG00005003372 ##37 ENSOKIG00005003388 ENSOKIG00005003400 ENSOKIG00005003438 ENSOKIG00005003453 ENSOKIG00005003459 ENSOKIG00005003480 ENSOKIG00005003515 ENSOKIG00005003520 ##37 ENSOKIG00005003526 ENSOKIG00005003537 ENSOKIG00005003558 ##37 ENSOKIG00005003579 ENSOKIG00005003592 ENSOKIG00005003604 ENSOKIG00005003609 ##37 ENSOKIG00005003618 ##37 ENSOKIG00005003623 ENSOKIG00005003627 ##37 ENSOKIG00005003633 ENSOKIG00005003645 dock11 (ENSOKIG00005003840) ENSOKIG00005008043 kirrel1a (ENSOKIG00005008088) Rainbow trout MODERN SPECIES 13 ndufs2 (ENSOMYG00000022934) kirrel1a (ENSOMYG00000022275) ENSOMYG00000022171 dock11 (ENSOMYG00000015977) ENSOMYG00000015486 ##37 ENSOMYG00000015256 ENSOMYG00000052918 ##37 ENSOMYG00000059858 ENSOMYG00000051101 ENSOMYG00000015437 ##37 ENSOMYG00000015397 ##37 ENSOMYG00000015298 ENSOMYG00000067677 ENSOMYG00000056555 nitr1 (ENSOMYG00000015208) ENSOMYG00000015198 ##37 ENSOMYG00000070461 ##37 ENSOMYG00000015194 ##37 ENSOMYG00000015178 ENSOMYG00000015102 ENSOMYG00000015125 ##37 ENSOMYG00000063413 ##37 ENSOMYG00000055156 ENSOMYG00000015086 ENSOMYG00000054572 ENSOMYG00000015080 ENSOMYG00000069459 ENSOMYG00000015065 ENSOMYG00000015027 ENSOMYG00000015000 ENSOMYG00000014983 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 899 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00990000204231.A Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.a.b ##37 Chinook salmon MODERN SPECIES 6 NEURL4 (ENSOTSG00005027659) ENSOTSG00005027655 ENSOTSG00005027653 ndufs2 (ENSOTSG00005027463) ENSOTSG00005027460 dock11 (ENSOTSG00005023088) ENSOTSG00005023047 ENSOTSG00005023046 ##37 ENSOTSG00005023045 ENSOTSG00005023044 ENSOTSG00005023043 ENSOTSG00005022931 ##37 ENSOTSG00005022923 ##37 ENSOTSG00005022921 ENSOTSG00005022920 ##37 ENSOTSG00005022919 ##37 ENSOTSG00005022917 ##37 ENSOTSG00005015871 ENSOTSG00005015870 ENSOTSG00005015869 ##37 ENSOTSG00005015868 ENSOTSG00005015865 ENSOTSG00005015864 ENSOTSG00005015817 ENSOTSG00005015814 ENSOTSG00005015813 ENSOTSG00005015812 rbm4.3 (ENSOTSG00005015811) ponzr6 (ENSOTSG00005015810) fxr2 (ENSOTSG00005014173) PTGDR2 (ENSOTSG00005014168) Rainbow trout MODERN SPECIES 13 ENSOMYG00000037030 ENSOMYG00000037383 ponzr6 (ENSOMYG00000040081) rbm4.3 (ENSOMYG00000014956) ENSOMYG00000014965 ENSOMYG00000014983 ENSOMYG00000015000 ENSOMYG00000015027 ENSOMYG00000015065 ENSOMYG00000069459 ENSOMYG00000015080 ENSOMYG00000054572 ENSOMYG00000015086 ENSOMYG00000055156 ENSOMYG00000063413 ##37 ENSOMYG00000015125 ##37 ENSOMYG00000015102 ENSOMYG00000015178 ENSOMYG00000015194 ##37 ENSOMYG00000070461 ##37 ENSOMYG00000015198 ##37 nitr1 (ENSOMYG00000015208) ENSOMYG00000056555 ENSOMYG00000067677 ENSOMYG00000015298 ENSOMYG00000015397 ##37 ENSOMYG00000015437 ##37 ENSOMYG00000051101 ENSOMYG00000059858 ENSOMYG00000052918 ##37 ENSOMYG00000015256 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000166283.a ENSGT00940000166283.b ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.a ##37 ENSGT00990000204231.J.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.b ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00940000165455.b.a ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a.g ENSGT00940000162009.a.a ENSGT00950000183136.b.a.b.g Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183121.a.c.b ENSGT00650000094881 ENSGT00940000166283.a.a ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT00990000204231.J.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT01000000215121.a.a.b.a.b ENSGT00990000204231.A ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.b ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00990000204231.C ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00940000165455.b.a Coho salmon MODERN SPECIES 29 zpax4 (ENSOKIG00005014449) ENSOKIG00005014441 ENSOKIG00005014391 ENSOKIG00005009362 NEURL4 (ENSOKIG00005009091) ENSOKIG00005009077 ENSOKIG00005009054 ndufs2 (ENSOKIG00005008787) kirrel1a (ENSOKIG00005008088) ENSOKIG00005008043 dock11 (ENSOKIG00005003840) ENSOKIG00005003645 ENSOKIG00005003633 ENSOKIG00005003627 ##37 ENSOKIG00005003623 ENSOKIG00005003618 ##37 ENSOKIG00005003609 ##37 ENSOKIG00005003604 ENSOKIG00005003592 ENSOKIG00005003579 ENSOKIG00005003558 ##37 ENSOKIG00005003537 ENSOKIG00005003526 ENSOKIG00005003520 ##37 ENSOKIG00005003515 ENSOKIG00005003480 ENSOKIG00005003459 ENSOKIG00005003453 ENSOKIG00005003438 ENSOKIG00005003400 ENSOKIG00005003388 Chinook salmon MODERN SPECIES 6 TYRP1 (ENSOTSG00005033164) LURAP1L (ENSOTSG00005033163) MPDZ (ENSOTSG00005027964) ENSOTSG00005027936 NEURL4 (ENSOTSG00005027659) ENSOTSG00005027655 ENSOTSG00005027653 ndufs2 (ENSOTSG00005027463) ENSOTSG00005027460 dock11 (ENSOTSG00005023088) ENSOTSG00005023047 ENSOTSG00005023046 ##37 ENSOTSG00005023045 ENSOTSG00005023044 ENSOTSG00005023043 ENSOTSG00005022931 ##37 ENSOTSG00005022923 ##37 ENSOTSG00005022921 ENSOTSG00005022920 ##37 ENSOTSG00005022919 ##37 ENSOTSG00005022917 ##37 ENSOTSG00005015871 ENSOTSG00005015870 ENSOTSG00005015869 ##37 ENSOTSG00005015868 ENSOTSG00005015865 ENSOTSG00005015864 ENSOTSG00005015817 ENSOTSG00005015814 ENSOTSG00005015813 ENSOTSG00005015812 Rainbow trout MODERN SPECIES 13 zpax4 (ENSOMYG00000026148) ENSOMYG00000026030 ENSOMYG00000025684 ENSOMYG00000024387 ENSOMYG00000024156 ENSOMYG00000024148 ndufs2 (ENSOMYG00000022934) kirrel1a (ENSOMYG00000022275) ENSOMYG00000022171 dock11 (ENSOMYG00000015977) ENSOMYG00000015486 ##37 ENSOMYG00000015256 ENSOMYG00000052918 ##37 ENSOMYG00000059858 ENSOMYG00000051101 ENSOMYG00000015437 ##37 ENSOMYG00000015397 ##37 ENSOMYG00000015298 ENSOMYG00000067677 ENSOMYG00000056555 nitr1 (ENSOMYG00000015208) ENSOMYG00000015198 ##37 ENSOMYG00000070461 ##37 ENSOMYG00000015194 ##37 ENSOMYG00000015178 ENSOMYG00000015102 ENSOMYG00000015125 ##37 ENSOMYG00000063413 ##37 ENSOMYG00000055156 ENSOMYG00000015086 ENSOMYG00000054572 Salmo DUPLICATION Salmo DUPLICATION Salmo DUPLICATION Salmo ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b.a.b ##37 ENSGT00990000204231.G ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a ENSGT00950000182968.d.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00990000204231.A ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.d ##37 Atlantic salmon MODERN SPECIES 26 zpax4 (ENSSSAG00000106648) zpax4 (ENSSSAG00000076578) ENSSSAG00000080612 ENSSSAG00000080728 ENSSSAG00000119719 ENSSSAG00000081061 ENSSSAG00000081071 ENSSSAG00000110509 ndufs2 (ENSSSAG00000081079) kirrel1a (ENSSSAG00000081111) il13ra1 (ENSSSAG00000081176) dock11 (ENSSSAG00000081371) ENSSSAG00000081547 ##37 ENSSSAG00000116437 ENSSSAG00000081572 ENSSSAG00000081556 ##37 ENSSSAG00000025481 ##37 ENSSSAG00000081561 ##37 ENSSSAG00000120710 ##37 ENSSSAG00000090985 ENSSSAG00000108996 ENSSSAG00000081558 ENSSSAG00000092267 ENSSSAG00000113629 ENSSSAG00000081551 ##37 ENSSSAG00000081565 ENSSSAG00000081567 ENSSSAG00000081569 ##37 ENSSSAG00000081562 ENSSSAG00000081574 ##37 ENSSSAG00000081576 River trout MODERN SPECIES 38 ENSSTUG00000037898 ndufs2 (ENSSTUG00000037932) kirrel1a (ENSSTUG00000038617) ENSSTUG00000038809 dock11 (ENSSTUG00000038939) ENSSTUG00000045383 ENSSTUG00000045422 ##37 ENSSTUG00000045452 ENSSTUG00000045458 ##37 ENSSTUG00000045464 ##37 ENSSTUG00000045482 ##37 ENSSTUG00000045490 ENSSTUG00000045508 ENSSTUG00000045521 ##30 ENSSTUG00000045530 ENSSTUG00000045540 ##37 ENSSTUG00000045547 ENSSTUG00000045557 ENSSTUG00000045565 ENSSTUG00000045603 ENSSTUG00000045650 ENSSTUG00000045679 ##37 ENSSTUG00000045685 ##37 ENSSTUG00000045692 ENSSTUG00000045745 ENSSTUG00000045755 ##37 ENSSTUG00000045816 ENSSTUG00000045820 TIFA (ENSSTUG00000045821) rbm4.3 (ENSSTUG00000045823) ponzr6 (ENSSTUG00000045832) Salmo ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00940000158661.a ENSGT00940000158661.b.h ENSGT00940000166258.d.a ENSGT00940000163701.b.b.c ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183136.b.a.b.g ENSGT00940000162009.a.a ENSGT00950000183189.a.a.g ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00940000165455.b.a ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00990000204231.B.a ENSGT01000000215121.b.b.b ENSGT01000000215121.a.a.b.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.c.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.b ENSGT00990000204231.F River trout MODERN SPECIES 38 sat2a.2 (ENSSTUG00000034220) ENSSTUG00000034232 ENSSTUG00000034299 ENSSTUG00000034395 NEURL4 (ENSSTUG00000037710) ENSSTUG00000037865 ENSSTUG00000037881 ENSSTUG00000037898 ndufs2 (ENSSTUG00000037932) kirrel1a (ENSSTUG00000038617) ENSSTUG00000038809 dock11 (ENSSTUG00000038939) ENSSTUG00000045383 ENSSTUG00000045422 ##37 ENSSTUG00000045452 ENSSTUG00000045458 ##37 ENSSTUG00000045464 ##37 ENSSTUG00000045482 ##37 ENSSTUG00000045490 ENSSTUG00000045508 ENSSTUG00000045521 ##30 ENSSTUG00000045530 ENSSTUG00000045540 ##37 ENSSTUG00000045547 ENSSTUG00000045557 ENSSTUG00000045565 ENSSTUG00000045603 ENSSTUG00000045650 ENSSTUG00000045679 ##37 ENSSTUG00000045685 ##37 ENSSTUG00000045692 Atlantic salmon MODERN SPECIES 26 ENSSSAG00000093788 ENSSSAG00000081607 ENSSSAG00000098606 ENSSSAG00000081596 ponzr6 (ENSSSAG00000081592) rbm4.3 (ENSSSAG00000081591) TIFA (ENSSSAG00000081590) ENSSSAG00000081589 ENSSSAG00000085081 ##37 ENSSSAG00000054184 ENSSSAG00000081563 ENSSSAG00000081581 ENSSSAG00000081576 ENSSSAG00000081574 ##37 ENSSSAG00000081562 ENSSSAG00000081569 ##37 ENSSSAG00000081567 ENSSSAG00000081565 ENSSSAG00000081551 ##37 ENSSSAG00000113629 ENSSSAG00000092267 ENSSSAG00000081558 ENSSSAG00000108996 ENSSSAG00000090985 ENSSSAG00000120710 ##37 ENSSSAG00000081561 ##37 ENSSSAG00000025481 ##37 ENSSSAG00000081556 ##37 ENSSSAG00000081572 ENSSSAG00000116437 ENSSSAG00000081547 ##37 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.c.b ##37 River trout MODERN SPECIES 38 ENSSTUG00000045452 ENSSTUG00000045458 ##37 ENSSTUG00000045464 ##37 ENSSTUG00000045482 ##37 ENSSTUG00000045490 ENSSTUG00000045508 ENSSTUG00000045521 ##30 ENSSTUG00000045530 ENSSTUG00000045540 ##37 ENSSTUG00000045547 ENSSTUG00000045557 ENSSTUG00000045565 ENSSTUG00000045603 ENSSTUG00000045650 ENSSTUG00000045679 ##37 ENSSTUG00000045685 ##37 ENSSTUG00000045692 ENSSTUG00000045745 ENSSTUG00000045755 ##37 ENSSTUG00000045816 ENSSTUG00000045820 TIFA (ENSSTUG00000045821) rbm4.3 (ENSSTUG00000045823) ponzr6 (ENSSTUG00000045832) ponzr6 (ENSSTUG00000045872) fxr2 (ENSSTUG00000045929) PTGDR2 (ENSSTUG00000046850) ENSSTUG00000046855 ENSSTUG00000046863 ENSSTUG00000046871 cldn7a (ENSSTUG00000046881) Atlantic salmon MODERN SPECIES 26 ENSSSAG00000081572 ENSSSAG00000081556 ##37 ENSSSAG00000025481 ##37 ENSSSAG00000081561 ##37 ENSSSAG00000120710 ##37 ENSSSAG00000090985 ENSSSAG00000108996 ENSSSAG00000081558 ENSSSAG00000092267 ENSSSAG00000113629 ENSSSAG00000081551 ##37 ENSSSAG00000081565 ENSSSAG00000081567 ENSSSAG00000081569 ##37 ENSSSAG00000081562 ENSSSAG00000081574 ##37 ENSSSAG00000081576 ENSSSAG00000081581 ENSSSAG00000081563 ENSSSAG00000054184 ENSSSAG00000085081 ##37 ENSSSAG00000081589 TIFA (ENSSSAG00000081590) rbm4.3 (ENSSSAG00000081591) ponzr6 (ENSSSAG00000081592) ENSSSAG00000081596 ENSSSAG00000098606 ENSSSAG00000081607 ENSSSAG00000093788 ENSSSAG00000088265 ENSSSAG00000081609 Salmo ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.d ##37 ENSGT00990000204231.A ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.c.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT00950000182968.d.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00990000204231.G ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b.a.b ##37 ENSGT00940000155658.j ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00390000009529.h.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 26 ENSSSAG00000081596 ponzr6 (ENSSSAG00000081592) rbm4.3 (ENSSSAG00000081591) TIFA (ENSSSAG00000081590) ENSSSAG00000081589 ENSSSAG00000085081 ##37 ENSSSAG00000054184 ENSSSAG00000081563 ENSSSAG00000081581 ENSSSAG00000081576 ENSSSAG00000081574 ##37 ENSSSAG00000081562 ENSSSAG00000081569 ##37 ENSSSAG00000081567 ENSSSAG00000081565 ENSSSAG00000081551 ##37 ENSSSAG00000113629 ENSSSAG00000092267 ENSSSAG00000081558 ENSSSAG00000108996 ENSSSAG00000090985 ENSSSAG00000120710 ##37 ENSSSAG00000081561 ##37 ENSSSAG00000025481 ##37 ENSSSAG00000081556 ##37 ENSSSAG00000081572 ENSSSAG00000116437 ENSSSAG00000081547 ##37 dock11 (ENSSSAG00000081371) il13ra1 (ENSSSAG00000081176) kirrel1a (ENSSSAG00000081111) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158001.h ENSGT00510000050706.d ENSGT00950000183121.a.c.b ENSGT00800000125278 ENSGT00650000094881 ENSGT00940000166283 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00940000165455.b.a ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a.g ENSGT00940000162009.a.a ENSGT00950000183136.b.a.b.g Salmo DUPLICATION Salmo DUPLICATION Salmo ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00950000183121.a.c.b ENSGT00800000125278 ENSGT00650000094881 ENSGT00940000166283 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b.a.b ##37 ENSGT00990000204231.G ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a ENSGT00950000182968.d.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00990000204231.A ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.d ##37 Atlantic salmon MODERN SPECIES 26 ENSSSAG00000080728 ENSSSAG00000119719 ENSSSAG00000081061 ENSSSAG00000081071 ENSSSAG00000110509 ndufs2 (ENSSSAG00000081079) kirrel1a (ENSSSAG00000081111) il13ra1 (ENSSSAG00000081176) dock11 (ENSSSAG00000081371) ENSSSAG00000081547 ##37 ENSSSAG00000116437 ENSSSAG00000081572 ENSSSAG00000081556 ##37 ENSSSAG00000025481 ##37 ENSSSAG00000081561 ##37 ENSSSAG00000120710 ##37 ENSSSAG00000090985 ENSSSAG00000108996 ENSSSAG00000081558 ENSSSAG00000092267 ENSSSAG00000113629 ENSSSAG00000081551 ##37 ENSSSAG00000081565 ENSSSAG00000081567 ENSSSAG00000081569 ##37 ENSSSAG00000081562 ENSSSAG00000081574 ##37 ENSSSAG00000081576 ENSSSAG00000081581 ENSSSAG00000081563 ENSSSAG00000054184 River trout MODERN SPECIES 38 ENSSTUG00000034299 ENSSTUG00000034395 NEURL4 (ENSSTUG00000037710) ENSSTUG00000037865 ENSSTUG00000037881 ENSSTUG00000037898 ndufs2 (ENSSTUG00000037932) kirrel1a (ENSSTUG00000038617) ENSSTUG00000038809 dock11 (ENSSTUG00000038939) ENSSTUG00000045383 ENSSTUG00000045422 ##37 ENSSTUG00000045452 ENSSTUG00000045458 ##37 ENSSTUG00000045464 ##37 ENSSTUG00000045482 ##37 ENSSTUG00000045490 ENSSTUG00000045508 ENSSTUG00000045521 ##30 ENSSTUG00000045530 ENSSTUG00000045540 ##37 ENSSTUG00000045547 ENSSTUG00000045557 ENSSTUG00000045565 ENSSTUG00000045603 ENSSTUG00000045650 ENSSTUG00000045679 ##37 ENSSTUG00000045685 ##37 ENSSTUG00000045692 ENSSTUG00000045745 ENSSTUG00000045755 ##37 Salmo ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000158001.h ENSGT00510000050706.d ENSGT00950000183121.a.c.b ENSGT00800000125278 ENSGT00650000094881 ENSGT00940000166283 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b.a.b ##37 ENSGT00990000204231.G ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a ENSGT00950000182968.d.a.a.b ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.c.a.a ##37 ENSGT01030000234530.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00990000204231.A ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.d ##37 River trout MODERN SPECIES 38 CHD3 (ENSSTUG00000031509) tnfsf12 (ENSSTUG00000034203) sat2a.2 (ENSSTUG00000034220) ENSSTUG00000034232 ENSSTUG00000034299 ENSSTUG00000034395 NEURL4 (ENSSTUG00000037710) ENSSTUG00000037865 ENSSTUG00000037881 ENSSTUG00000037898 ndufs2 (ENSSTUG00000037932) kirrel1a (ENSSTUG00000038617) ENSSTUG00000038809 dock11 (ENSSTUG00000038939) ENSSTUG00000045383 ENSSTUG00000045422 ##37 ENSSTUG00000045452 ENSSTUG00000045458 ##37 ENSSTUG00000045464 ##37 ENSSTUG00000045482 ##37 ENSSTUG00000045490 ENSSTUG00000045508 ENSSTUG00000045521 ##30 ENSSTUG00000045530 ENSSTUG00000045540 ##37 ENSSTUG00000045547 ENSSTUG00000045557 ENSSTUG00000045565 ENSSTUG00000045603 ENSSTUG00000045650 ENSSTUG00000045679 ##37 Salmo ANCESTRAL SPECIES 670 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 26 ENSSSAG00000089323 ENSSSAG00000080602 ENSSSAG00000080604 zpax4 (ENSSSAG00000106648) zpax4 (ENSSSAG00000076578) ENSSSAG00000080612 ENSSSAG00000080728 ENSSSAG00000119719 ENSSSAG00000081061 ENSSSAG00000081071 ENSSSAG00000110509 ndufs2 (ENSSSAG00000081079) kirrel1a (ENSSSAG00000081111) il13ra1 (ENSSSAG00000081176) dock11 (ENSSSAG00000081371) ENSSSAG00000081547 ##37 ENSSSAG00000116437 ENSSSAG00000081572 ENSSSAG00000081556 ##37 ENSSSAG00000025481 ##37 ENSSSAG00000081561 ##37 ENSSSAG00000120710 ##37 ENSSSAG00000090985 ENSSSAG00000108996 ENSSSAG00000081558 ENSSSAG00000092267 ENSSSAG00000113629 ENSSSAG00000081551 ##37 ENSSSAG00000081565 ENSSSAG00000081567 ENSSSAG00000081569 ##37 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000166283.b ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.a ##37 ENSGT00990000204231.J.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.b ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00940000165455.b.a ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a.g ENSGT00940000162009.a.a ENSGT00950000183136.b.a.b.g ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.a Rainbow trout MODERN SPECIES 13 ENSOMYG00000026030 ENSOMYG00000025684 ENSOMYG00000024387 ENSOMYG00000024156 ENSOMYG00000024148 ndufs2 (ENSOMYG00000022934) kirrel1a (ENSOMYG00000022275) ENSOMYG00000022171 dock11 (ENSOMYG00000015977) ENSOMYG00000015486 ##37 ENSOMYG00000015256 ENSOMYG00000052918 ##37 ENSOMYG00000059858 ENSOMYG00000051101 ENSOMYG00000015437 ##37 ENSOMYG00000015397 ##37 ENSOMYG00000015298 ENSOMYG00000067677 ENSOMYG00000056555 nitr1 (ENSOMYG00000015208) ENSOMYG00000015198 ##37 ENSOMYG00000070461 ##37 ENSOMYG00000015194 ##37 ENSOMYG00000015178 ENSOMYG00000015102 ENSOMYG00000015125 ##37 ENSOMYG00000063413 ##37 ENSOMYG00000055156 ENSOMYG00000015086 ENSOMYG00000054572 ENSOMYG00000015080 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b ##37 Chinook salmon MODERN SPECIES 6 LURAP1L (ENSOTSG00005033163) MPDZ (ENSOTSG00005027964) ENSOTSG00005027936 NEURL4 (ENSOTSG00005027659) ENSOTSG00005027655 ENSOTSG00005027653 ndufs2 (ENSOTSG00005027463) ENSOTSG00005027460 dock11 (ENSOTSG00005023088) ENSOTSG00005023047 ENSOTSG00005023046 ##37 ENSOTSG00005023045 ENSOTSG00005023044 ENSOTSG00005023043 ENSOTSG00005022931 ##37 ENSOTSG00005022923 ##37 ENSOTSG00005022921 ENSOTSG00005022920 ##37 ENSOTSG00005022919 ##37 ENSOTSG00005022917 ##37 ENSOTSG00005015871 ENSOTSG00005015870 ENSOTSG00005015869 ##37 ENSOTSG00005015868 ENSOTSG00005015865 ENSOTSG00005015864 ENSOTSG00005015817 ENSOTSG00005015814 ENSOTSG00005015813 ENSOTSG00005015812 rbm4.3 (ENSOTSG00005015811) Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.a ##37 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 3758 ENSHHUG00000035274 ENSHHUG00000035283 ENSHHUG00000035288 ##37 ENSHHUG00000035295 ENSHHUG00000035296 ENSHHUG00000035306 ENSHHUG00000035312 ENSHHUG00000035324 ##37 ENSHHUG00000035383 ENSHHUG00000035402 ##37 Huchen MODERN SPECIES 3758 ENSHHUG00000035402 ##37 ENSHHUG00000035383 ENSHHUG00000035324 ##37 ENSHHUG00000035312 ENSHHUG00000035306 ENSHHUG00000035296 ENSHHUG00000035295 ENSHHUG00000035288 ##37 ENSHHUG00000035283 ENSHHUG00000035274 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000183121.a.c.b ENSGT00800000125278 ENSGT00650000094881 ENSGT00940000166283 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00940000165455.b.a ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a.g ENSGT00940000162009.a.a ENSGT00950000183136.b.a.b.g ENSGT00940000163701.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000163701.b.b.c Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.a ##37 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00650000094881 ENSGT00940000166283.a.a ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT00990000204231.J.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT01000000215121.a.a.b.a.b ENSGT00990000204231.A ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.b ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00990000204231.C ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00940000165455.b.a ENSGT00940000163927.a.b Coho salmon MODERN SPECIES 29 ENSOKIG00005014441 ENSOKIG00005014391 ENSOKIG00005009362 NEURL4 (ENSOKIG00005009091) ENSOKIG00005009077 ENSOKIG00005009054 ndufs2 (ENSOKIG00005008787) kirrel1a (ENSOKIG00005008088) ENSOKIG00005008043 dock11 (ENSOKIG00005003840) ENSOKIG00005003645 ENSOKIG00005003633 ENSOKIG00005003627 ##37 ENSOKIG00005003623 ENSOKIG00005003618 ##37 ENSOKIG00005003609 ##37 ENSOKIG00005003604 ENSOKIG00005003592 ENSOKIG00005003579 ENSOKIG00005003558 ##37 ENSOKIG00005003537 ENSOKIG00005003526 ENSOKIG00005003520 ##37 ENSOKIG00005003515 ENSOKIG00005003480 ENSOKIG00005003459 ENSOKIG00005003453 ENSOKIG00005003438 ENSOKIG00005003400 ENSOKIG00005003388 ENSOKIG00005003372 ##37 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 294 ENSGT00950000183121.a.c.b ENSGT00800000125278 ENSGT00650000094881 ENSGT00940000166283 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 719 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183121.a.c.b ENSGT00650000094881 ENSGT00940000166283.a ENSGT00940000166283.b ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT01030000234530.b.b.a.b.a ##37 ENSGT00990000204231.J.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.b ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00940000154589.b.w ENSGT00940000165455.b.a ENSGT00940000163927.a.b ENSGT00950000183189.a.a.g Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158001.h.a ENSGT00510000050706.d ENSGT00950000183121.a.c.b ENSGT00650000094881 ENSGT00940000166283.a.a ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a.i ENSGT00940000165211 ENSGT00940000159866.a ENSGT01100000263520.b.b.f.k.a ENSGT00940000157535.m.a.a ENSGT00390000009529.h.a ENSGT00940000155795.f.c ENSGT00730000112044.e.a.a ENSGT00940000155658.j ENSGT00990000204231.J.a ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.b ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.b.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.a.b.a ##37 ENSGT01000000215121.a.a.b.a.b ENSGT00990000204231.A ENSGT01030000234530.b.b.a.b.b.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.b ENSGT01000000215121.a.a.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.b ENSGT01000000215121.b.b.a ENSGT00990000204231.C Coho salmon MODERN SPECIES 29 ENSOKIG00005014591 zpax4 (ENSOKIG00005014498) zpax4 (ENSOKIG00005014449) ENSOKIG00005014441 ENSOKIG00005014391 ENSOKIG00005009362 NEURL4 (ENSOKIG00005009091) ENSOKIG00005009077 ENSOKIG00005009054 ndufs2 (ENSOKIG00005008787) kirrel1a (ENSOKIG00005008088) ENSOKIG00005008043 dock11 (ENSOKIG00005003840) ENSOKIG00005003645 ENSOKIG00005003633 ENSOKIG00005003627 ##37 ENSOKIG00005003623 ENSOKIG00005003618 ##37 ENSOKIG00005003609 ##37 ENSOKIG00005003604 ENSOKIG00005003592 ENSOKIG00005003579 ENSOKIG00005003558 ##37 ENSOKIG00005003537 ENSOKIG00005003526 ENSOKIG00005003520 ##37 ENSOKIG00005003515 ENSOKIG00005003480 ENSOKIG00005003459 ENSOKIG00005003453 ENSOKIG00005003438 Chinook salmon MODERN SPECIES 6 SYNPO2 (ENSOTSG00005047760) MYOZ2 (ENSOTSG00005047759) USP53 (ENSOTSG00005047758) PTPRD (ENSOTSG00005033249) TYRP1 (ENSOTSG00005033164) LURAP1L (ENSOTSG00005033163) MPDZ (ENSOTSG00005027964) ENSOTSG00005027936 NEURL4 (ENSOTSG00005027659) ENSOTSG00005027655 ENSOTSG00005027653 ndufs2 (ENSOTSG00005027463) ENSOTSG00005027460 dock11 (ENSOTSG00005023088) ENSOTSG00005023047 ENSOTSG00005023046 ##37 ENSOTSG00005023045 ENSOTSG00005023044 ENSOTSG00005023043 ENSOTSG00005022931 ##37 ENSOTSG00005022923 ##37 ENSOTSG00005022921 ENSOTSG00005022920 ##37 ENSOTSG00005022919 ##37 ENSOTSG00005022917 ##37 ENSOTSG00005015871 ENSOTSG00005015870 ENSOTSG00005015869 ##37 ENSOTSG00005015868 ENSOTSG00005015865 ENSOTSG00005015864 Rainbow trout MODERN SPECIES 13 tnfsf12 (ENSOMYG00000026336) sat2a.2 (ENSOMYG00000062679) ENSOMYG00000026320 zpax4 (ENSOMYG00000026148) ENSOMYG00000026030 ENSOMYG00000025684 ENSOMYG00000024387 ENSOMYG00000024156 ENSOMYG00000024148 ndufs2 (ENSOMYG00000022934) kirrel1a (ENSOMYG00000022275) ENSOMYG00000022171 dock11 (ENSOMYG00000015977) ENSOMYG00000015486 ##37 ENSOMYG00000015256 ENSOMYG00000052918 ##37 ENSOMYG00000059858 ENSOMYG00000051101 ENSOMYG00000015437 ##37 ENSOMYG00000015397 ##37 ENSOMYG00000015298 ENSOMYG00000067677 ENSOMYG00000056555 nitr1 (ENSOMYG00000015208) ENSOMYG00000015198 ##37 ENSOMYG00000070461 ##37 ENSOMYG00000015194 ##37 ENSOMYG00000015178 ENSOMYG00000015102 ENSOMYG00000015125 ##37 ENSOMYG00000063413 ##37 Huchen MODERN SPECIES 5081 ENSHHUG00000050810 ENSHHUG00000050832 ENSHHUG00000050838 ENSHHUG00000050844 ##37 ENSHHUG00000050846 ENSHHUG00000050850 ENSHHUG00000050856 ENSHHUG00000050860 ##37 ENSHHUG00000050896 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000159866.b ENSGT01100000263520.b.b.f.k.b ENSGT00940000157535.m.a.b ENSGT01090000260120 ENSGT00390000009529.h.b ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT00940000178201 ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT00950000182968.d.a.a.a.a ##30 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000165455.a.p.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.a ENSGT00990000204231.D ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000165455.a.p.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.p.a ENSGT00940000165455.b.b River trout MODERN SPECIES 35 ENSSTUG00000047230 ENSSTUG00000047235 ENSSTUG00000047238 ENSSTUG00000047244 ENSSTUG00000047260 ##37 ENSSTUG00000047264 ##37 ENSSTUG00000047270 ENSSTUG00000047283 ENSSTUG00000047330 ENSSTUG00000047375 ##37 ENSSTUG00000047378 ENSSTUG00000047382 ##37 ENSSTUG00000000059 ##37 ENSSTUG00000000090 ENSSTUG00000000232 ENSSTUG00000000247 ##37 ENSSTUG00000000267 ##37 ENSSTUG00000000289 ##37 ENSSTUG00000000290 ##37 ENSSTUG00000000296 ENSSTUG00000000312 ENSSTUG00000000324 ENSSTUG00000000354 ENSSTUG00000000392 ENSSTUG00000000393 rbm4.3 (ENSSTUG00000000400) ENSSTUG00000000415 ENSSTUG00000000419 rbm4.3 (ENSSTUG00000000424) rbm4.3 (ENSSTUG00000000429) ENSSTUG00000000437 Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 ENSSSAG00000054196 ENSSSAG00000054216 ENSSSAG00000054222 ##37 ENSSSAG00000054226 ENSSSAG00000054233 ENSSSAG00000054244 ENSSSAG00000054365 ##37 ENSSSAG00000054373 ##37 ENSSSAG00000112574 ENSSSAG00000054518 ##37 ENSSSAG00000054560 ENSSSAG00000088055 ##37 ENSSSAG00000054586 ENSSSAG00000054599 ##37 ENSSSAG00000054617 ENSSSAG00000054627 ##37 ENSSSAG00000120008 ENSSSAG00000105625 ##37 ENSSSAG00000024942 ENSSSAG00000089136 ##37 ENSSSAG00000054651 ENSSSAG00000054401 ENSSSAG00000054667 ENSSSAG00000054681 ENSSSAG00000054687 ##37 ENSSSAG00000054692 ENSSSAG00000054701 ENSSSAG00000054639 ##37 ENSSSAG00000054737 ENSSSAG00000054741 ENSSSAG00000098693 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000009529.h.b ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01000000214950.B ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.b.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.o.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b ENSGT00950000183136.b.a.b.h Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000009529.h.b ENSGT00940000155795.f.d ENSGT00730000112044.f ENSGT00980000199875.a ENSGT00940000155658.k ENSGT01030000234530.b.a.a.a.b.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.b.a.b ENSGT01000000214950.B ENSGT01000000214950.C.c ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.d ##37 ENSGT00940000162676.a.b.d ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.a.jb.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.c ##37 ENSGT00940000162676.a.a.ib.a ENSGT01030000234530.b.b.b ##37 ENSGT00990000214068 ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234530.b.a.a.b ##37 ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000162676.a.b.c.a.a.a.b.a.a ENSGT01030000234530.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00990000204231.D ENSGT00940000162676.a.a.ib.b.b.b ENSGT00940000154589.b.x ENSGT00940000165455.a.o.a ENSGT00940000165455.b.b ENSGT00950000183189.a.a.h ENSGT00940000162009.a.b Coho salmon MODERN SPECIES 7 ENSOKIG00005004296 ENSOKIG00005038729 ndufs2 (ENSOKIG00005038691) kirrel1a (ENSOKIG00005038277) ENSOKIG00005038189 ENSOKIG00005038173 ENSOKIG00005037970 ENSOKIG00005037901 ENSOKIG00005037874 ENSOKIG00005037844 ENSOKIG00005037816 ##37 ENSOKIG00005037769 ##37 ENSOKIG00005037717 ENSOKIG00005037688 ##37 ENSOKIG00005037668 ENSOKIG00005037648 ##37 ENSOKIG00005037636 ENSOKIG00005037622 ENSOKIG00005037609 ##37 ENSOKIG00005037395 ENSOKIG00005037369 ENSOKIG00005037337 ENSOKIG00005037326 ENSOKIG00005037288 ##37 ENSOKIG00005037262 ENSOKIG00005037237 rbm4.3 (ENSOKIG00005037175) fxr2 (ENSOKIG00005034803) PTGDR2 (ENSOKIG00005034705) ENSOKIG00005034673 ugt5g1 (ENSOKIG00005034665) Chinook salmon MODERN SPECIES 1 ENSOTSG00005001116 ENSOTSG00005001109 ENSOTSG00005001101 ENSOTSG00005001088 ENSOTSG00005001079 ENSOTSG00005001074 ufm1 (ENSOTSG00005001065) ENSOTSG00005001057 ENSOTSG00005001037 ENSOTSG00005000807 ##37 ENSOTSG00005017655 ENSOTSG00005017654 ##37 ENSOTSG00005017653 ENSOTSG00005017652 ##37 ENSOTSG00005017651 ENSOTSG00005017650 ##37 ENSOTSG00005017648 ENSOTSG00005017647 ##37 ENSOTSG00005017646 ENSOTSG00005017344 ENSOTSG00005017335 ENSOTSG00005017307 ENSOTSG00005017299 ##37 ENSOTSG00005017291 ENSOTSG00005017287 ENSOTSG00005017284 rbm4.3 (ENSOTSG00005017281) rbm4.3 (ENSOTSG00005017272) fxr2 (ENSOTSG00005008383) PTGDR2 (ENSOTSG00005008356) ENSOTSG00005008355 Rainbow trout MODERN SPECIES 30 dock11 (ENSOMYG00000002723) ENSOMYG00000002666 ENSOMYG00000075815 ENSOMYG00000002591 ENSOMYG00000069538 ENSOMYG00000051464 ENSOMYG00000002350 ENSOMYG00000002474 ENSOMYG00000070359 ##30 ENSOMYG00000002365 ##37 ENSOMYG00000002524 ENSOMYG00000002320 ENSOMYG00000002253 ##37 ENSOMYG00000002244 ##37 ENSOMYG00000002225 ENSOMYG00000002208 ##37 ENSOMYG00000071959 ##37 ENSOMYG00000002138 ##30 ENSOMYG00000001884 ENSOMYG00000001742 nitr3 (ENSOMYG00000001590) ##37 nitr2 (ENSOMYG00000016105) ENSOMYG00000016102 ENSOMYG00000016096 ENSOMYG00000044646 ENSOMYG00000016056 ENSOMYG00000016035 ENSOMYG00000015279 ENSOMYG00000015216 ENSOMYG00000015209 ugt5g1 (ENSOMYG00000015204) Huchen MODERN SPECIES 354 ENSHHUG00000000772 ENSHHUG00000000760 ENSHHUG00000000685 ENSHHUG00000000670 ENSHHUG00000000662 ENSHHUG00000000659 ENSHHUG00000000616 ENSHHUG00000000578 ##37 ENSHHUG00000000569 ENSHHUG00000000495 ##37 ENSHHUG00000000412 ENSHHUG00000000396 ##37 ENSHHUG00000000384 ##37 ENSHHUG00000000242 ##37 ENSHHUG00000000216 ENSHHUG00000000157 ##37 ENSHHUG00000000113 ENSHHUG00000000107 ##37 ENSHHUG00000000087 ##37 ENSHHUG00000000082 ##37 ENSHHUG00000000073 ENSHHUG00000000014 ENSHHUG00000051732 ##37 ENSHHUG00000051596 ENSHHUG00000051590 ENSHHUG00000051581 ENSHHUG00000051580 rbm4.3 (ENSHHUG00000051562) fxr2 (ENSHHUG00000051250) PTGDR2 (ENSHHUG00000051235) ENSHHUG00000051232 Northern pike DUPLICATION Northern pike DUPLICATION Northern pike DUPLICATION Northern pike MODERN SPECIES 23 dock11 (ENSELUG00000000903) ENSELUG00000021929 ##37 ENSELUG00000020860 ##37 ENSELUG00000021959 ENSELUG00000020897 ##37 ENSELUG00000028765 ##37 ENSELUG00000030037 ENSELUG00000020914 ##37 ENSELUG00000020937 ENSELUG00000033573 ENSELUG00000020952 ENSELUG00000021454 ##37 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 ENSELUG00000020684 ##37 ENSELUG00000021529 ENSELUG00000021522 ##37 ENSELUG00000034484 ENSELUG00000021824 ##37 ENSELUG00000025442 ENSELUG00000021869 ##30 ENSELUG00000021904 ##37 ENSELUG00000021504 ##37 ENSELUG00000021265 ##37 ENSELUG00000021988 ENSELUG00000022142 ENSELUG00000022093 ##37 Northern pike MODERN SPECIES 23 ENSELUG00000021959 ENSELUG00000020897 ##37 ENSELUG00000028765 ##37 ENSELUG00000030037 ENSELUG00000020914 ##37 ENSELUG00000020937 ENSELUG00000033573 ENSELUG00000020952 ENSELUG00000021454 ##37 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 ENSELUG00000020684 ##37 ENSELUG00000021529 ENSELUG00000021522 ##37 ENSELUG00000034484 ENSELUG00000021824 ##37 ENSELUG00000025442 ENSELUG00000021869 ##30 ENSELUG00000021904 ##37 ENSELUG00000021504 ##37 ENSELUG00000021265 ##37 ENSELUG00000021988 ENSELUG00000022142 ENSELUG00000022093 ##37 ENSELUG00000026414 ENSELUG00000022109 ENSELUG00000022132 Northern pike DUPLICATION Northern pike MODERN SPECIES 23 ENSELUG00000021454 ##37 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 ENSELUG00000020684 ##37 ENSELUG00000021529 ENSELUG00000021522 ##37 ENSELUG00000034484 ENSELUG00000021824 ##37 ENSELUG00000025442 ENSELUG00000021869 ##30 ENSELUG00000021904 ##37 ENSELUG00000021504 ##37 ENSELUG00000021265 ##37 ENSELUG00000021988 ENSELUG00000022142 ENSELUG00000022093 ##37 ENSELUG00000026414 ENSELUG00000022109 ENSELUG00000022132 rbm4.3 (ENSELUG00000022150) ENSELUG00000022162 rbm4.3 (ENSELUG00000022168) ponzr6 (ENSELUG00000022989) ponzr6 (ENSELUG00000022425) fxr2 (ENSELUG00000023014) PTGDR2 (ENSELUG00000023025) ENSELUG00000023036 Northern pike MODERN SPECIES 23 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 ENSELUG00000021300 ENSELUG00000020684 ##37 ENSELUG00000021529 ENSELUG00000021522 ##37 ENSELUG00000034484 ENSELUG00000021824 ##37 ENSELUG00000025442 ENSELUG00000021869 ##30 ENSELUG00000021904 ##37 ENSELUG00000021504 ##37 ENSELUG00000021265 ##37 ENSELUG00000021988 ENSELUG00000022142 ENSELUG00000022093 ##37 ENSELUG00000026414 ENSELUG00000022109 ENSELUG00000022132 rbm4.3 (ENSELUG00000022150) ENSELUG00000022162 rbm4.3 (ENSELUG00000022168) ponzr6 (ENSELUG00000022989) ponzr6 (ENSELUG00000022425) fxr2 (ENSELUG00000023014) PTGDR2 (ENSELUG00000023025) ENSELUG00000023036 ugt5g1 (ENSELUG00000023037) Northern pike MODERN SPECIES 23 ENSELUG00000019925 NEURL4 (ENSELUG00000020001) ENSELUG00000020017 ENSELUG00000020043 ENSELUG00000020062 ndufs2 (ENSELUG00000020079) kirrel1a (ENSELUG00000020129) ENSELUG00000020199 il13ra1 (ENSELUG00000020240) ENSELUG00000031077 il13ra1 (ENSELUG00000020274) ENSELUG00000020368 ENSELUG00000030563 il13ra1 (ENSELUG00000020430) dock11 (ENSELUG00000000903) ENSELUG00000021929 ##37 ENSELUG00000020860 ##37 ENSELUG00000021959 ENSELUG00000020897 ##37 ENSELUG00000028765 ##37 ENSELUG00000030037 ENSELUG00000020914 ##37 ENSELUG00000020937 ENSELUG00000033573 ENSELUG00000020952 ENSELUG00000021454 ##37 ENSELUG00000027914 ENSELUG00000021234 ENSELUG00000021272 ##37 ENSELUG00000032546 ##37 ENSELUG00000021284 Osteoglossiformes DUPLICATION Osteoglossiformes DUPLICATION Osteoglossiformes DUPLICATION Osteoglossiformes DUPLICATION Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 493 ENSGT00940000157645.c.b ENSGT01030000234530.c.a.b #37 ENSGT00940000157645.c.a ENSGT01030000234530.c.b #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.c.a.a.a #37 Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 JADE2 (ENSSFOG00015032730) sar1b (ENSSFOG00015025146) camlg (ENSSFOG00015018116) C5orf24 (ENSSFOG00015020164) ENSSFOG00015018097 pitx1 (ENSSFOG00015028155) LARP1 (ENSSFOG00015018058) SAP30L (ENSSFOG00015018047) ENSSFOG00015018033 CNPY3 (ENSSFOG00015018018) ENSSFOG00015017988 ENSSFOG00015033046 ENSSFOG00015017969 ENSSFOG00015029005 dock11 (ENSSFOG00015017881) ENSSFOG00015017468 #37 ENSSFOG00015017706 ENSSFOG00015028084 #37 ENSSFOG00015027670 #37 ENSSFOG00015017791 #37 ENSSFOG00015017644 #37 ENSSFOG00015017586 #37 ENSSFOG00015027523 #37 ENSSFOG00015017769 #37 ENSSFOG00015017520 #37 ENSSFOG00015017851 #37 ENSSFOG00015017439 ENSSFOG00015017424 ENSSFOG00015028093 ENSSFOG00015017404 #37 map4k2 (ENSSFOG00015017368) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015016885 ENSSFOG00015016924 ENSSFOG00015017089 taf6l (ENSSFOG00015017112) cth1 (ENSSFOG00015017190) mta2 (ENSSFOG00015017206) EML3 (ENSSFOG00015017272) ZFTA (ENSSFOG00015017298) rtn3 (ENSSFOG00015017327) men1 (ENSSFOG00015017346) map4k2 (ENSSFOG00015017368) ENSSFOG00015017404 #37 ENSSFOG00015028093 ENSSFOG00015017424 ENSSFOG00015017439 ENSSFOG00015017851 #37 ENSSFOG00015017520 #37 ENSSFOG00015017769 #37 ENSSFOG00015027523 #37 ENSSFOG00015017586 #37 ENSSFOG00015017644 #37 ENSSFOG00015017791 #37 ENSSFOG00015027670 #37 ENSSFOG00015028084 #37 ENSSFOG00015017706 ENSSFOG00015017468 #37 dock11 (ENSSFOG00015017881) ENSSFOG00015029005 ENSSFOG00015017969 ENSSFOG00015033046 ENSSFOG00015017988 Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ZFTA (ENSSFOG00015017298) rtn3 (ENSSFOG00015017327) men1 (ENSSFOG00015017346) map4k2 (ENSSFOG00015017368) ENSSFOG00015017404 #37 ENSSFOG00015028093 ENSSFOG00015017424 ENSSFOG00015017439 ENSSFOG00015017851 #37 ENSSFOG00015017520 #37 ENSSFOG00015017769 #37 ENSSFOG00015027523 #37 ENSSFOG00015017586 #37 ENSSFOG00015017644 #37 ENSSFOG00015017791 #37 ENSSFOG00015027670 #37 ENSSFOG00015028084 #37 ENSSFOG00015017706 ENSSFOG00015017468 #37 dock11 (ENSSFOG00015017881) ENSSFOG00015029005 ENSSFOG00015017969 ENSSFOG00015033046 ENSSFOG00015017988 CNPY3 (ENSSFOG00015018018) ENSSFOG00015018033 SAP30L (ENSSFOG00015018047) LARP1 (ENSSFOG00015018058) pitx1 (ENSSFOG00015028155) ENSSFOG00015018097 C5orf24 (ENSSFOG00015020164) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 camlg (ENSSFOG00015018116) C5orf24 (ENSSFOG00015020164) ENSSFOG00015018097 pitx1 (ENSSFOG00015028155) LARP1 (ENSSFOG00015018058) SAP30L (ENSSFOG00015018047) ENSSFOG00015018033 CNPY3 (ENSSFOG00015018018) ENSSFOG00015017988 ENSSFOG00015033046 ENSSFOG00015017969 ENSSFOG00015029005 dock11 (ENSSFOG00015017881) ENSSFOG00015017468 #37 ENSSFOG00015017706 ENSSFOG00015028084 #37 ENSSFOG00015027670 #37 ENSSFOG00015017791 #37 ENSSFOG00015017644 #37 ENSSFOG00015017586 #37 ENSSFOG00015027523 #37 ENSSFOG00015017769 #37 ENSSFOG00015017520 #37 ENSSFOG00015017851 #37 ENSSFOG00015017439 ENSSFOG00015017424 ENSSFOG00015028093 ENSSFOG00015017404 #37 map4k2 (ENSSFOG00015017368) men1 (ENSSFOG00015017346) rtn3 (ENSSFOG00015017327) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 pitx1 (ENSSFOG00015028155) LARP1 (ENSSFOG00015018058) SAP30L (ENSSFOG00015018047) ENSSFOG00015018033 CNPY3 (ENSSFOG00015018018) ENSSFOG00015017988 ENSSFOG00015033046 ENSSFOG00015017969 ENSSFOG00015029005 dock11 (ENSSFOG00015017881) ENSSFOG00015017468 #37 ENSSFOG00015017706 ENSSFOG00015028084 #37 ENSSFOG00015027670 #37 ENSSFOG00015017791 #37 ENSSFOG00015017644 #37 ENSSFOG00015017586 #37 ENSSFOG00015027523 #37 ENSSFOG00015017769 #37 ENSSFOG00015017520 #37 ENSSFOG00015017851 #37 ENSSFOG00015017439 ENSSFOG00015017424 ENSSFOG00015028093 ENSSFOG00015017404 #37 map4k2 (ENSSFOG00015017368) men1 (ENSSFOG00015017346) rtn3 (ENSSFOG00015017327) ZFTA (ENSSFOG00015017298) EML3 (ENSSFOG00015017272) mta2 (ENSSFOG00015017206) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015016924 ENSSFOG00015017089 taf6l (ENSSFOG00015017112) cth1 (ENSSFOG00015017190) mta2 (ENSSFOG00015017206) EML3 (ENSSFOG00015017272) ZFTA (ENSSFOG00015017298) rtn3 (ENSSFOG00015017327) men1 (ENSSFOG00015017346) map4k2 (ENSSFOG00015017368) ENSSFOG00015017404 #37 ENSSFOG00015028093 ENSSFOG00015017424 ENSSFOG00015017439 ENSSFOG00015017851 #37 ENSSFOG00015017520 #37 ENSSFOG00015017769 #37 ENSSFOG00015027523 #37 ENSSFOG00015017586 #37 ENSSFOG00015017644 #37 ENSSFOG00015017791 #37 ENSSFOG00015027670 #37 ENSSFOG00015028084 #37 ENSSFOG00015017706 ENSSFOG00015017468 #37 dock11 (ENSSFOG00015017881) ENSSFOG00015029005 ENSSFOG00015017969 ENSSFOG00015033046 ENSSFOG00015017988 CNPY3 (ENSSFOG00015018018) P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 1221 ENSPKIG00000000383 #37 P. kingsleyae MODERN SPECIES 1497 ENSPKIG00000023936 #37 P. kingsleyae MODERN SPECIES 814 ENSPKIG00000007326 #37 P. kingsleyae MODERN SPECIES 979 ENSPKIG00000008845 #37 ENSPKIG00000008862 P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 769 ENSPKIG00000023752 #37 P. kingsleyae MODERN SPECIES 1012 ENSPKIG00000012645 #37 ENSPKIG00000012655 P. kingsleyae MODERN SPECIES 1008 ENSPKIG00000012392 #37 P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 851 ENSPKIG00000024584 #37 P. kingsleyae MODERN SPECIES 1171 ENSPKIG00000017518 #37 P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 912 ENSPKIG00000012628 #37 P. kingsleyae MODERN SPECIES 846 ENSPKIG00000022058 #37 P. kingsleyae MODERN SPECIES 992 ENSPKIG00000014562 #37 P. kingsleyae MODERN SPECIES 860 ENSPKIG00000005710 #37 ENSPKIG00000005732 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.c.a.a.b #37 Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 LARP1 (ENSSFOG00015018058) SAP30L (ENSSFOG00015018047) ENSSFOG00015018033 CNPY3 (ENSSFOG00015018018) ENSSFOG00015017988 ENSSFOG00015033046 ENSSFOG00015017969 ENSSFOG00015029005 dock11 (ENSSFOG00015017881) ENSSFOG00015017468 #37 ENSSFOG00015017706 ENSSFOG00015028084 #37 ENSSFOG00015027670 #37 ENSSFOG00015017791 #37 ENSSFOG00015017644 #37 ENSSFOG00015017586 #37 ENSSFOG00015027523 #37 ENSSFOG00015017769 #37 ENSSFOG00015017520 #37 ENSSFOG00015017851 #37 ENSSFOG00015017439 ENSSFOG00015017424 ENSSFOG00015028093 ENSSFOG00015017404 #37 map4k2 (ENSSFOG00015017368) men1 (ENSSFOG00015017346) rtn3 (ENSSFOG00015017327) ZFTA (ENSSFOG00015017298) EML3 (ENSSFOG00015017272) mta2 (ENSSFOG00015017206) cth1 (ENSSFOG00015017190) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015018097 pitx1 (ENSSFOG00015028155) LARP1 (ENSSFOG00015018058) SAP30L (ENSSFOG00015018047) ENSSFOG00015018033 CNPY3 (ENSSFOG00015018018) ENSSFOG00015017988 ENSSFOG00015033046 ENSSFOG00015017969 ENSSFOG00015029005 dock11 (ENSSFOG00015017881) ENSSFOG00015017468 #37 ENSSFOG00015017706 ENSSFOG00015028084 #37 ENSSFOG00015027670 #37 ENSSFOG00015017791 #37 ENSSFOG00015017644 #37 ENSSFOG00015017586 #37 ENSSFOG00015027523 #37 ENSSFOG00015017769 #37 ENSSFOG00015017520 #37 ENSSFOG00015017851 #37 ENSSFOG00015017439 ENSSFOG00015017424 ENSSFOG00015028093 ENSSFOG00015017404 #37 map4k2 (ENSSFOG00015017368) men1 (ENSSFOG00015017346) rtn3 (ENSSFOG00015017327) ZFTA (ENSSFOG00015017298) EML3 (ENSSFOG00015017272) P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 773 ENSPKIG00000023953 ENSPKIG00000023944 #37 P. kingsleyae MODERN SPECIES 977 ENSPKIG00000008782 #37 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 493 ENSGT01030000234530.c.a.a.a #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.c.b #37 ENSGT00940000157645.c.a ENSGT01030000234530.c.a.b #37 ENSGT00940000157645.c.b Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015000558 #37 ENSSFOG00015000429 #37 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015030221 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015001757 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015017823 #37 ENSSFOG00015002535 #37 ENSSFOG00015008105 ENSSFOG00015002638 rnasel3 (ENSSFOG00015002656) PCDH1 (ENSSFOG00015002669) ENSSFOG00015002714 lect2.1 (ENSSFOG00015002754) F2RL3 (ENSSFOG00015002782) rnf130 (ENSSFOG00015002791) TBC1D9B (ENSSFOG00015002823) ENSSFOG00015002861 sqstm1 (ENSSFOG00015002854) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 mgat4b (ENSSFOG00015002873) sqstm1 (ENSSFOG00015002854) ENSSFOG00015002861 TBC1D9B (ENSSFOG00015002823) rnf130 (ENSSFOG00015002791) F2RL3 (ENSSFOG00015002782) lect2.1 (ENSSFOG00015002754) ENSSFOG00015002714 PCDH1 (ENSSFOG00015002669) rnasel3 (ENSSFOG00015002656) ENSSFOG00015002638 ENSSFOG00015008105 ENSSFOG00015002535 #37 ENSSFOG00015017823 #37 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001757 #37 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015030221 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000429 #37 Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015030221 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015001757 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015017823 #37 ENSSFOG00015002535 #37 ENSSFOG00015008105 ENSSFOG00015002638 rnasel3 (ENSSFOG00015002656) PCDH1 (ENSSFOG00015002669) ENSSFOG00015002714 lect2.1 (ENSSFOG00015002754) F2RL3 (ENSSFOG00015002782) rnf130 (ENSSFOG00015002791) TBC1D9B (ENSSFOG00015002823) ENSSFOG00015002861 sqstm1 (ENSSFOG00015002854) mgat4b (ENSSFOG00015002873) canx (ENSSFOG00015002970) Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001757 #37 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015030221 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000429 #37 ENSSFOG00015000558 #37 gpc2 (ENSSFOG00015000591) ENSSFOG00015000645 MCM7 (ENSSFOG00015000141) ENSSFOG00015000081 ENSSFOG00015000072 ENSSFOG00015024481 TMEM107 (ENSSFOG00015000069) aurkb (ENSSFOG00015018843) VAMP2 (ENSSFOG00015018818) per1b (ENSSFOG00015018769) pcolceb (ENSSFOG00015018752) PAQR9 (ENSSFOG00015018744) ENSSFOG00015018698 Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015017823 #37 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001757 #37 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015030221 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000429 #37 ENSSFOG00015000558 #37 gpc2 (ENSSFOG00015000591) ENSSFOG00015000645 MCM7 (ENSSFOG00015000141) ENSSFOG00015000081 ENSSFOG00015000072 ENSSFOG00015024481 TMEM107 (ENSSFOG00015000069) aurkb (ENSSFOG00015018843) VAMP2 (ENSSFOG00015018818) per1b (ENSSFOG00015018769) pcolceb (ENSSFOG00015018752) PAQR9 (ENSSFOG00015018744) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001757 #37 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015030221 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000429 #37 ENSSFOG00015000558 #37 gpc2 (ENSSFOG00015000591) ENSSFOG00015000645 MCM7 (ENSSFOG00015000141) ENSSFOG00015000081 ENSSFOG00015000072 ENSSFOG00015024481 TMEM107 (ENSSFOG00015000069) aurkb (ENSSFOG00015018843) VAMP2 (ENSSFOG00015018818) per1b (ENSSFOG00015018769) pcolceb (ENSSFOG00015018752) PAQR9 (ENSSFOG00015018744) ENSSFOG00015018698 tm4sf5 (ENSSFOG00015018670) tmem88b (ENSSFOG00015018662) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015030221 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015001757 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015017823 #37 ENSSFOG00015002535 #37 ENSSFOG00015008105 ENSSFOG00015002638 rnasel3 (ENSSFOG00015002656) PCDH1 (ENSSFOG00015002669) ENSSFOG00015002714 lect2.1 (ENSSFOG00015002754) F2RL3 (ENSSFOG00015002782) rnf130 (ENSSFOG00015002791) TBC1D9B (ENSSFOG00015002823) ENSSFOG00015002861 sqstm1 (ENSSFOG00015002854) mgat4b (ENSSFOG00015002873) canx (ENSSFOG00015002970) MAML1 (ENSSFOG00015030618) LTC4S (ENSSFOG00015031429) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015030221 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015001757 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015017823 #37 ENSSFOG00015002535 #37 ENSSFOG00015008105 ENSSFOG00015002638 rnasel3 (ENSSFOG00015002656) PCDH1 (ENSSFOG00015002669) ENSSFOG00015002714 lect2.1 (ENSSFOG00015002754) F2RL3 (ENSSFOG00015002782) rnf130 (ENSSFOG00015002791) TBC1D9B (ENSSFOG00015002823) ENSSFOG00015002861 sqstm1 (ENSSFOG00015002854) mgat4b (ENSSFOG00015002873) canx (ENSSFOG00015002970) MAML1 (ENSSFOG00015030618) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015002535 #37 ENSSFOG00015017823 #37 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001757 #37 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015030221 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000429 #37 ENSSFOG00015000558 #37 gpc2 (ENSSFOG00015000591) ENSSFOG00015000645 MCM7 (ENSSFOG00015000141) ENSSFOG00015000081 ENSSFOG00015000072 ENSSFOG00015024481 TMEM107 (ENSSFOG00015000069) aurkb (ENSSFOG00015018843) VAMP2 (ENSSFOG00015018818) per1b (ENSSFOG00015018769) pcolceb (ENSSFOG00015018752) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001757 #37 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015030221 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000429 #37 ENSSFOG00015000558 #37 gpc2 (ENSSFOG00015000591) ENSSFOG00015000645 MCM7 (ENSSFOG00015000141) ENSSFOG00015000081 ENSSFOG00015000072 ENSSFOG00015024481 TMEM107 (ENSSFOG00015000069) aurkb (ENSSFOG00015018843) VAMP2 (ENSSFOG00015018818) per1b (ENSSFOG00015018769) pcolceb (ENSSFOG00015018752) PAQR9 (ENSSFOG00015018744) ENSSFOG00015018698 tm4sf5 (ENSSFOG00015018670) Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015000645 gpc2 (ENSSFOG00015000591) ENSSFOG00015000558 #37 ENSSFOG00015000429 #37 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015030221 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015001757 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015017823 #37 ENSSFOG00015002535 #37 ENSSFOG00015008105 ENSSFOG00015002638 rnasel3 (ENSSFOG00015002656) PCDH1 (ENSSFOG00015002669) ENSSFOG00015002714 lect2.1 (ENSSFOG00015002754) F2RL3 (ENSSFOG00015002782) rnf130 (ENSSFOG00015002791) TBC1D9B (ENSSFOG00015002823) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 gpc2 (ENSSFOG00015000591) ENSSFOG00015000558 #37 ENSSFOG00015000429 #37 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015030221 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015001757 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015017823 #37 ENSSFOG00015002535 #37 ENSSFOG00015008105 ENSSFOG00015002638 rnasel3 (ENSSFOG00015002656) PCDH1 (ENSSFOG00015002669) ENSSFOG00015002714 lect2.1 (ENSSFOG00015002754) F2RL3 (ENSSFOG00015002782) rnf130 (ENSSFOG00015002791) TBC1D9B (ENSSFOG00015002823) ENSSFOG00015002861 Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 SAP30L (ENSSFOG00015018047) ENSSFOG00015018033 CNPY3 (ENSSFOG00015018018) ENSSFOG00015017988 ENSSFOG00015033046 ENSSFOG00015017969 ENSSFOG00015029005 dock11 (ENSSFOG00015017881) ENSSFOG00015017468 #37 ENSSFOG00015017706 ENSSFOG00015028084 #37 ENSSFOG00015027670 #37 ENSSFOG00015017791 #37 ENSSFOG00015017644 #37 ENSSFOG00015017586 #37 ENSSFOG00015027523 #37 ENSSFOG00015017769 #37 ENSSFOG00015017520 #37 ENSSFOG00015017851 #37 ENSSFOG00015017439 ENSSFOG00015017424 ENSSFOG00015028093 ENSSFOG00015017404 #37 map4k2 (ENSSFOG00015017368) men1 (ENSSFOG00015017346) rtn3 (ENSSFOG00015017327) ZFTA (ENSSFOG00015017298) EML3 (ENSSFOG00015017272) mta2 (ENSSFOG00015017206) cth1 (ENSSFOG00015017190) taf6l (ENSSFOG00015017112) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015017089 taf6l (ENSSFOG00015017112) cth1 (ENSSFOG00015017190) mta2 (ENSSFOG00015017206) EML3 (ENSSFOG00015017272) ZFTA (ENSSFOG00015017298) rtn3 (ENSSFOG00015017327) men1 (ENSSFOG00015017346) map4k2 (ENSSFOG00015017368) ENSSFOG00015017404 #37 ENSSFOG00015028093 ENSSFOG00015017424 ENSSFOG00015017439 ENSSFOG00015017851 #37 ENSSFOG00015017520 #37 ENSSFOG00015017769 #37 ENSSFOG00015027523 #37 ENSSFOG00015017586 #37 ENSSFOG00015017644 #37 ENSSFOG00015017791 #37 ENSSFOG00015027670 #37 ENSSFOG00015028084 #37 ENSSFOG00015017706 ENSSFOG00015017468 #37 dock11 (ENSSFOG00015017881) ENSSFOG00015029005 ENSSFOG00015017969 ENSSFOG00015033046 ENSSFOG00015017988 CNPY3 (ENSSFOG00015018018) ENSSFOG00015018033 Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015008105 ENSSFOG00015002535 #37 ENSSFOG00015017823 #37 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001757 #37 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015030221 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000429 #37 ENSSFOG00015000558 #37 gpc2 (ENSSFOG00015000591) ENSSFOG00015000645 MCM7 (ENSSFOG00015000141) ENSSFOG00015000081 ENSSFOG00015000072 ENSSFOG00015024481 TMEM107 (ENSSFOG00015000069) aurkb (ENSSFOG00015018843) VAMP2 (ENSSFOG00015018818) per1b (ENSSFOG00015018769) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015000081 MCM7 (ENSSFOG00015000141) ENSSFOG00015000645 gpc2 (ENSSFOG00015000591) ENSSFOG00015000558 #37 ENSSFOG00015000429 #37 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015030221 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015001757 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015017823 #37 ENSSFOG00015002535 #37 ENSSFOG00015008105 ENSSFOG00015002638 rnasel3 (ENSSFOG00015002656) PCDH1 (ENSSFOG00015002669) ENSSFOG00015002714 lect2.1 (ENSSFOG00015002754) F2RL3 (ENSSFOG00015002782) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015000072 ENSSFOG00015000081 MCM7 (ENSSFOG00015000141) ENSSFOG00015000645 gpc2 (ENSSFOG00015000591) ENSSFOG00015000558 #37 ENSSFOG00015000429 #37 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015030221 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015001757 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015017823 #37 ENSSFOG00015002535 #37 ENSSFOG00015008105 ENSSFOG00015002638 rnasel3 (ENSSFOG00015002656) PCDH1 (ENSSFOG00015002669) ENSSFOG00015002714 lect2.1 (ENSSFOG00015002754) Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 MCM7 (ENSSFOG00015000141) ENSSFOG00015000645 gpc2 (ENSSFOG00015000591) ENSSFOG00015000558 #37 ENSSFOG00015000429 #37 ENSSFOG00015000367 #37 ENSSFOG00015000306 #37 ENSSFOG00015024306 #37 ENSSFOG00015000245 #37 ENSSFOG00015001581 ENSSFOG00015001605 ENSSFOG00015030221 rnasel2 (ENSSFOG00015001739) ENSSFOG00015001757 #37 ENSSFOG00015001801 #37 ENSSFOG00015001888 #37 ENSSFOG00015001919 #37 ENSSFOG00015001964 #37 ENSSFOG00015002040 #37 ENSSFOG00015002193 #37 ENSSFOG00015002258 #37 ENSSFOG00015017823 #37 ENSSFOG00015002535 #37 ENSSFOG00015008105 ENSSFOG00015002638 rnasel3 (ENSSFOG00015002656) PCDH1 (ENSSFOG00015002669) ENSSFOG00015002714 lect2.1 (ENSSFOG00015002754) F2RL3 (ENSSFOG00015002782) rnf130 (ENSSFOG00015002791) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 493 ENSGT00940000157645.c.b ENSGT01030000234530.c.a.b #37 ENSGT00940000157645.c.a ENSGT01030000234530.c.b #37 ENSGT00940000162676.a.a ENSGT01030000234530.c.a.a.a #37 P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 686 ENSPKIG00000007040 #37 ENSPKIG00000007011 #37 ENSPKIG00000006992 P. kingsleyae MODERN SPECIES 686 ENSPKIG00000007040 #37 ENSPKIG00000007011 #37 ENSPKIG00000006992 P. kingsleyae MODERN SPECIES 585 ENSPKIG00000000354 ENSPKIG00000000336 ENSPKIG00000000325 ENSPKIG00000000309 #37 ENSPKIG00000000282 #37 ENSPKIG00000000255 ENSPKIG00000000231 #37 ENSPKIG00000000193 P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 585 ENSPKIG00000000354 ENSPKIG00000000336 ENSPKIG00000000325 ENSPKIG00000000309 #37 ENSPKIG00000000282 #37 ENSPKIG00000000255 ENSPKIG00000000231 #37 ENSPKIG00000000193 P. kingsleyae MODERN SPECIES 585 ENSPKIG00000000354 ENSPKIG00000000336 ENSPKIG00000000325 ENSPKIG00000000309 #37 ENSPKIG00000000282 #37 ENSPKIG00000000255 ENSPKIG00000000231 #37 ENSPKIG00000000193 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234530.d #37 Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015029528 ENSSFOG00015024464 ENSSFOG00015016837 ENSSFOG00015016858 ENSSFOG00015016885 ENSSFOG00015016924 ENSSFOG00015017089 taf6l (ENSSFOG00015017112) cth1 (ENSSFOG00015017190) mta2 (ENSSFOG00015017206) EML3 (ENSSFOG00015017272) ZFTA (ENSSFOG00015017298) rtn3 (ENSSFOG00015017327) men1 (ENSSFOG00015017346) map4k2 (ENSSFOG00015017368) ENSSFOG00015017404 #37 ENSSFOG00015028093 ENSSFOG00015017424 ENSSFOG00015017439 ENSSFOG00015017851 #37 ENSSFOG00015017520 #37 ENSSFOG00015017769 #37 ENSSFOG00015027523 #37 ENSSFOG00015017586 #37 ENSSFOG00015017644 #37 ENSSFOG00015017791 #37 ENSSFOG00015027670 #37 ENSSFOG00015028084 #37 ENSSFOG00015017706 ENSSFOG00015017468 #37 dock11 (ENSSFOG00015017881) P. kingsleyae MODERN SPECIES 699 ENSPKIG00000002032 #37 ENSPKIG00000002051 ENSPKIG00000002062 ENSPKIG00000002092 ENSPKIG00000002132