Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00830000128402 #8	ENSGT00520000055955 #9	ENSGT00940000157547 #10	ENSGT00390000018436.a.a #11	ENSGT00950000182808.a.a.b.a #12	ENSGT00940000158275.g #13	ENSGT00940000157120 #14	ENSGT00740000115643	ENSGT00950000183017.a #15	ENSGT00390000010094.a #16	ENSGT00390000003316.d #17	ENSGT00940000158846 #18	ENSGT00390000014318 #19	ENSGT00950000182900.A.b.c #20	ENSGT00940000155548 #21	ENSGT00940000155076.a #22	ENSGT00940000160169 #23	ENSGT00920000149143 #24	ENSGT00940000161505 #25	ENSGT00940000158191 #26	ENSGT00950000183192.a.a #27	ENSGT00950000183195.b.a #28	ENSGT00390000011890 #29	ENSGT00940000159456 #30	ENSGT00390000010899.a.a #31	ENSGT00940000157229 #32	ENSGT00390000007015 #33	ENSGT00390000010770 #34	ENSGT00940000156087 #35	ENSGT00940000161537 #36	ENSGT00390000016577 #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	173		SYNJ2BP (ENSCLAG00000006437) #8	COX16 (ENSCLAG00000006541) #9	SLC8A3 (ENSCLAG00000007692) #10	SMOC1 (ENSCLAG00000004341) #11	SLC10A1 (ENSCLAG00000004713) #12	SRSF5 (ENSCLAG00000004755) #13	SUSD6 (ENSCLAG00000004857) #14	PLEKHD1 (ENSCLAG00000004907) #15	SLC39A9 (ENSCLAG00000005465) #16	ERH (ENSCLAG00000005504) #17	GALNT16 (ENSCLAG00000005540) #18	EXD2 (ENSCLAG00000005648) #19	DCAF5 (ENSCLAG00000006604) #20	ACTN1 (ENSCLAG00000006716) #21	ZFP36L1 (ENSCLAG00000003695) #22	RAD51B (ENSCLAG00000003791) #23	ZFYVE26 (ENSCLAG00000004494) #24	RDH12 (ENSCLAG00000003201) #25	RDH11 (ENSCLAG00000003299) #26	VTI1B (ENSCLAG00000003374) #27	ARG2 (ENSCLAG00000003480) #28	PIGH (ENSCLAG00000003559) #29	PLEKHH1 (ENSCLAG00000002676) #30	TMEM229B (ENSCLAG00000003112) #31	PLEK2 (ENSCLAG00000003176) #32	EIF2S1 (ENSCLAG00000003254) #33	ATP6V1D (ENSCLAG00000003466) #34	PALS1 (ENSCLAG00000004043) #35	GARIN2 (ENSCLAG00000004319) #36	GPHN (ENSCLAG00000004765) #37
Degu	MODERN SPECIES	48	SLC10A1 (ENSODEG00000013278) #12	ENSODEG00000013469 #13	SUSD6 (ENSODEG00000012522) #14	ENSODEG00000020078	CCDC177 (ENSODEG00000014037)	PLEKHD1 (ENSODEG00000015081) #15	SLC39A9 (ENSODEG00000013611) #16	ENSODEG00000012922 #17	GALNT16 (ENSODEG00000012688) #18	EXD2 (ENSODEG00000014245) #19	ENSODEG00000012626	DCAF5 (ENSODEG00000013978) ##20	ENSODEG00000012783	ENSODEG00000013534	ACTN1 (ENSODEG00000012961) #21	ZFP36L1 (ENSODEG00000014162) #22	ENSODEG00000020233	RAD51B (ENSODEG00000013988) #23	ENSODEG00000013117	ZFYVE26 (ENSODEG00000013072) #24	RDH12 (ENSODEG00000012984) #25	RDH11 (ENSODEG00000013053) #26	VTI1B (ENSODEG00000013143) #27	ARG2 (ENSODEG00000014261) #28	ENSODEG00000014130	PLEKHH1 (ENSODEG00000015158) #30	TMEM229B (ENSODEG00000020052) #31	ENSODEG00000014817 #32	EIF2S1 (ENSODEG00000013168) #33	ENSODEG00000013948 #34	PALS1 (ENSODEG00000014070) #35