Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 567 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 428 ENSGT00940000154784.D.a.a.a ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 481 ENSGT00530000069620 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 257 ENSGT00530000069620 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 Amniota DUPLICATION Amniota DUPLICATION Amniota ANCESTRAL SPECIES 12 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SPECIES 7 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00600000085213 #33 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 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ENSGT00940000153141.A Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A ENSGT00940000160098 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 4 LRRC73 (ENSHGLG00000019162) #7 YIPF3 (ENSHGLG00000019245) #8 POLR1C (ENSHGLG00000039530) #9 XPO5 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DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 19 Slc40a1 (ENSRNOG00000003872) Wdr75 (ENSRNOG00000003825) Col5a2 (ENSRNOG00000003736) Col3a1 (ENSRNOG00000003357) Gulp1 (ENSRNOG00000003242) Mettl21cl1 (ENSRNOG00000022762) Ercc5 (ENSRNOG00000022812) Bivm (ENSRNOG00000022894) Poglut2 (ENSRNOG00000011740) Tex30 (ENSRNOG00000011658) Ccdc168 (ENSRNOG00000063478) Mettl21c (ENSRNOG00000011591) Tpp2 (ENSRNOG00000011194) Ecrg4 (ENSRNOG00000023576) Nck2 (ENSRNOG00000017155) Hsp90ab1-ps13 (ENSRNOG00000067665) #22 Fhl2 (ENSRNOG00000016866) RGD1310553 (ENSRNOG00000016447) Tgfbrap1 (ENSRNOG00000024562) Gpr45 (ENSRNOG00000016446) Arpc5l-ps1 (ENSRNOG00000067388) Mrps9 (ENSRNOG00000016201) Pou3f3 (ENSRNOG00000038909) Tmem182 (ENSRNOG00000028945) Mfsd9 (ENSRNOG00000023129) Slc9a2 (ENSRNOG00000015567) Slc9a4 (ENSRNOG00000015306) Il18rap (ENSRNOG00000054218) Il18r1 (ENSRNOG00000015027) Il1rl1 (ENSRNOG00000014835) AABR07067459.1 (ENSRNOG00000061227) Rat MODERN SPECIES 13 ENSRNOG00000071171 Rif1 (ENSRNOG00000054901) Neb 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ENSNGAG00000017075 Cfc1 (ENSNGAG00000021104) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 633 Tjap1 (ENSNGAG00000001708) Lrrc73 (ENSNGAG00000023998) #7 Yipf3 (ENSNGAG00000023784) #8 Polr1c (ENSNGAG00000023487) #9 Xpo5 (ENSNGAG00000015950) #10 Polh (ENSNGAG00000022986) #11 Gtpbp2 (ENSNGAG00000021674) #12 Mad2l1bp (ENSNGAG00000021195) #13 Rsph9 (ENSNGAG00000020871) #14 Mrps18a (ENSNGAG00000020052) #15 Vegfa (ENSNGAG00000018293) #16 Mrpl14 (ENSNGAG00000016826) #17 Tmem63b (ENSNGAG00000014742) #18 Capn11 (ENSNGAG00000007388) #19 Slc29a1 (ENSNGAG00000021923) #21 Hsp90ab1 (ENSNGAG00000017929) #22 Slc35b2 (ENSNGAG00000016794) #23 Nfkbie (ENSNGAG00000021559) #24 Tmem151b (ENSNGAG00000021240) #25 Tcte1 (ENSNGAG00000017387) #26 Aars2 (ENSNGAG00000018985) #27 Spats1 (ENSNGAG00000016503) #28 ENSNGAG00000015764 #29 Supt3 (ENSNGAG00000014275) #30 Runx2 (ENSNGAG00000023853) #34 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1152 Sp8 (ENSNGAG00000023792) ENSNGAG00000011468 Sp4 (ENSNGAG00000018832) Dnah11 (ENSNGAG00000022296) Cdca7l (ENSNGAG00000017622) Rapgef5 (ENSNGAG00000021880) ENSNGAG00000010751 ENSNGAG00000014079 Il6 (ENSNGAG00000019366) Tomm7 (ENSNGAG00000021558) Hycc1 (ENSNGAG00000021302) ENSNGAG00000023135 #22 Klhl7 (ENSNGAG00000008147) Nupl2 (ENSNGAG00000023883) Gpnmb (ENSNGAG00000014694) Malsu1 (ENSNGAG00000022280) Igf2bp3 (ENSNGAG00000023578) Tra2a (ENSNGAG00000023805) ENSNGAG00000006097 Ccdc126 (ENSNGAG00000021704) Fam221a (ENSNGAG00000022352) Stk31 (ENSNGAG00000024195) ENSNGAG00000008884 Npy (ENSNGAG00000009749) Pals2 (ENSNGAG00000024039) ENSNGAG00000024064 ENSNGAG00000024141 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 Pika MODERN SPECIES 5176 ENSOPRG00000015013 #22 Tree shrew MODERN SPECIES 4180 HSP90AB1 (ENSTBEG00000014873) #22 SLC35B2 (ENSTBEG00000015761) #23 TCTE1 (ENSTBEG00000015850) #26 AARS2 (ENSTBEG00000016385) #27 TMEM151B (ENSTBEG00000017321) #25 SPATS1 (ENSTBEG00000017396) #28 CDC5L (ENSTBEG00000017422) #29 Primates ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00910000147751 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00910000147751 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000005085 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000001158 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00910000147751 ENSGT00940000159767 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048.i #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000005085 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000001158 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A Mas night monkey MODERN SPECIES 678 ENSANAG00000027185 ENSANAG00000027302 ENSANAG00000026212 ENSANAG00000025977 DIPK2B (ENSANAG00000021306) ENSANAG00000002274 KDM6A (ENSANAG00000027908) ENSANAG00000025278 FUNDC1 (ENSANAG00000035033) EFHC2 (ENSANAG00000026366) ENSANAG00000038387 NDP (ENSANAG00000023159) MAOB (ENSANAG00000034907) MAOA (ENSANAG00000031969) ENSANAG00000031554 ENSANAG00000033764 #22 ENSANAG00000025353 GPR34 (ENSANAG00000019752) CASK (ENSANAG00000021037) NYX (ENSANAG00000032296) DDX3X (ENSANAG00000017441) ENSANAG00000038233 USP9X (ENSANAG00000036319) MED14 (ENSANAG00000024459) CXorf38 (ENSANAG00000030365) ENSANAG00000004121 ATP6AP2 (ENSANAG00000036929) ENSANAG00000035058 BCOR (ENSANAG00000020198) MID1IP1 (ENSANAG00000018677) TSPAN7 (ENSANAG00000026194) Cebidae DUPLICATION Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000006753.B ENSGT00940000159700 ENSGT00950000183158.E ENSGT00940000155742 ENSGT00520000057704 ENSGT00940000154412.A ENSGT00390000003837 ENSGT00940000157703 ENSGT00390000014940 ENSGT00940000159206 ENSGT00940000157199 ENSGT00390000006935 ENSGT00390000011084 ENSGT00940000154938.k.a ENSGT00940000156980 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a.k.a #22 ENSGT00390000008748.a ENSGT00940000160646 ENSGT00390000009378 ENSGT01090000260115 ENSGT00940000155852 ENSGT00940000159786 ENSGT00390000001280.b ENSGT00940000155798 ENSGT00390000001485 ENSGT00530000064208.b ENSGT00940000164652 ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000006478.e ENSGT00910000144204.a ENSGT00940000162220 Marmoset MODERN SPECIES 11 MEGF10 (ENSCJAG00000019171) ENSCJAG00000065191 MARCHF3 (ENSCJAG00000019167) LMNB1 (ENSCJAG00000019144) ENSCJAG00000085687 TEX43 (ENSCJAG00000011071) ENSCJAG00000082285 PHAX (ENSCJAG00000055757) ENSCJAG00000011102 ENSCJAG00000069820 ENSCJAG00000008280 ENSCJAG00000073070 ENSCJAG00000085599 ENSCJAG00000022376 ENSCJAG00000068510 ENSCJAG00000056580 #22 ZNF608 (ENSCJAG00000008225) CSNK1G3 (ENSCJAG00000017348) CEP120 (ENSCJAG00000017322) ENSCJAG00000074435 PRDM6 (ENSCJAG00000017318) PPIC (ENSCJAG00000065144) SNX2 (ENSCJAG00000017239) ENSCJAG00000076221 ENSCJAG00000039670 SNCAIP (ENSCJAG00000017196) ENSCJAG00000081497 LOX (ENSCJAG00000043472) SRFBP1 (ENSCJAG00000017177) ENSCJAG00000077985 FTMT (ENSCJAG00000074582) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000006753.B ENSGT00940000159700 ENSGT00950000183158.E ENSGT00940000155742 ENSGT00520000057704 ENSGT00940000154412.A ENSGT00390000003837 ENSGT00940000157703 ENSGT00390000014940 ENSGT00940000159206 ENSGT00940000157199 ENSGT00390000006935 ENSGT00390000011084 ENSGT00940000154938.k.a ENSGT00940000156980 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a.k.a #22 ENSGT00390000008748.a ENSGT00940000157258.m.b ENSGT00940000160646 ENSGT00390000009378 ENSGT00940000155852 ENSGT00940000159786 ENSGT00390000001280.b ENSGT00940000155798 ENSGT00390000001485 ENSGT00530000064208.b ENSGT00940000164652 ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00390000006478.e ENSGT00910000144204.a ENSGT00940000162220 Capuchin MODERN SPECIES 513 ENSCCAG00000028278 #22 ZNF608 (ENSCCAG00000024234) ENSCCAG00000023781 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a.k.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a.k.b #22 Capuchin MODERN SPECIES 268 TMEFF2 (ENSCCAG00000038026) CAVIN2 (ENSCCAG00000001667) NABP1 (ENSCCAG00000027125) ENSCCAG00000033789 #22 MYO1B (ENSCCAG00000031385) STAT4 (ENSCCAG00000034110) STAT1 (ENSCCAG00000031342) GLS (ENSCCAG00000024542) NAB1 (ENSCCAG00000001929) NEMP2 (ENSCCAG00000031311) MFSD6 (ENSCCAG00000025410) INPP1 (ENSCCAG00000015156) HIBCH (ENSCCAG00000034853) MSTN (ENSCCAG00000036474) PMS1 (ENSCCAG00000025273) ORMDL1 (ENSCCAG00000023195) OSGEPL1 (ENSCCAG00000025842) ANKAR (ENSCCAG00000020879) ASNSD1 (ENSCCAG00000034482) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153766.A #8 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monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 43 SLC12A2 (ENSSBOG00000025766) CCDC192 (ENSSBOG00000003863) CTXN3 (ENSSBOG00000018099) PRRC1 (ENSSBOG00000020636) ENSSBOG00000005225 MEGF10 (ENSSBOG00000019175) ENSSBOG00000030929 ENSSBOG00000035116 C5orf63 (ENSSBOG00000000968) MARCHF3 (ENSSBOG00000023895) LMNB1 (ENSSBOG00000026468) TEX43 (ENSSBOG00000023843) PHAX (ENSSBOG00000019981) ENSSBOG00000032179 GRAMD2B (ENSSBOG00000034731) ENSSBOG00000024091 #22 ZNF608 (ENSSBOG00000023375) ENSSBOG00000022267 ENSSBOG00000027659 CSNK1G3 (ENSSBOG00000033420) CEP120 (ENSSBOG00000032810) PRDM6 (ENSSBOG00000036108) ENSSBOG00000032176 PPIC (ENSSBOG00000035731) SNX24 (ENSSBOG00000027967) SNX2 (ENSSBOG00000023789) ENSSBOG00000032671 SNCAIP (ENSSBOG00000030798) ENSSBOG00000033668 ZNF474 (ENSSBOG00000021556) LOX (ENSSBOG00000025774) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 177 TMEFF2 (ENSSBOG00000032615) CAVIN2 (ENSSBOG00000027082) NABP1 (ENSSBOG00000029846) 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#29 ENSTSYG00000000815 #30 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00910000147751 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A Bushbaby MODERN SPECIES 116 ENSOGAG00000024204 GRM5 (ENSOGAG00000003814) CTSC (ENSOGAG00000009168) RAB38 (ENSOGAG00000004961) ENSOGAG00000027235 ENSOGAG00000027554 TMEM135 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Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 305 LRRC73 (ENSPSMG00000017951) #7 YIPF3 (ENSPSMG00000017965) #8 POLR1C (ENSPSMG00000018003) #9 XPO5 (ENSPSMG00000018128) #10 POLH (ENSPSMG00000018199) #11 GTPBP2 (ENSPSMG00000018214) #12 MAD2L1BP (ENSPSMG00000018221) #13 RSPH9 (ENSPSMG00000018228) #14 MRPS18A (ENSPSMG00000018246) #15 VEGFA (ENSPSMG00000018375) #16 MRPL14 (ENSPSMG00000018525) #17 TMEM63B (ENSPSMG00000018668) #18 CAPN11 (ENSPSMG00000018791) #19 MYMX (ENSPSMG00000018800) #20 SLC29A1 (ENSPSMG00000018858) #21 HSP90AB1 (ENSPSMG00000018961) #22 SLC35B2 (ENSPSMG00000019040) #23 NFKBIE (ENSPSMG00000019044) #24 TMEM151B (ENSPSMG00000019047) #25 TCTE1 (ENSPSMG00000019053) #26 AARS2 (ENSPSMG00000019100) #27 SPATS1 (ENSPSMG00000019112) #28 CDC5L (ENSPSMG00000019139) #29 SUPT3H (ENSPSMG00000019156) #30 RUNX2 (ENSPSMG00000019192) #34 CLIC5 (ENSPSMG00000019221) #35 ENPP4 (ENSPSMG00000019241) #36 ENPP5 (ENSPSMG00000019246) #37 ENSPSMG00000019249 RCAN2 (ENSPSMG00000019260) CYP39A1 (ENSPSMG00000019279) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00500000045766 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00600000085213 #33 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00740000116630 ENSGT00940000158831 #36 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A.d #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00500000045766 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00600000085213 #33 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00740000116630 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 Suina ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A.d #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A ENSGT00940000160098 Chacoan peccary MODERN SPECIES 781 LRRC73 (ENSCWAG00000015949) #7 YIPF3 (ENSCWAG00000015909) #8 POLR1C (ENSCWAG00000015847) #9 XPO5 (ENSCWAG00000015792) #10 POLH (ENSCWAG00000015745) #11 GTPBP2 (ENSCWAG00000015681) #12 MAD2L1BP (ENSCWAG00000015648) #13 RSPH9 (ENSCWAG00000015624) #14 MRPS18A (ENSCWAG00000015571) #15 VEGFA (ENSCWAG00000015280) #16 MRPL14 (ENSCWAG00000014930) #17 TMEM63B (ENSCWAG00000014863) #18 CAPN11 (ENSCWAG00000014460) #19 MYMX (ENSCWAG00000014424) #20 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(ENSSSCG00000001700) #21 HSP90AB1 (ENSSSCG00000001701) #22 SLC35B2 (ENSSSCG00000001702) #23 NFKBIE (ENSSSCG00000001703) #24 TMEM151B (ENSSSCG00000040047) #25 TCTE1 (ENSSSCG00000001705) #26 AARS2 (ENSSSCG00000001706) #27 SPATS1 (ENSSSCG00000039903) #28 CDC5L (ENSSSCG00000001708) #29 SUPT3H (ENSSSCG00000001709) #30 RUNX2 (ENSSSCG00000001710) #34 CLIC5 (ENSSSCG00000037416) #35 ENPP4 (ENSSSCG00000025788) #36 ENPP5 (ENSSSCG00000001715) #37 RCAN2 (ENSSSCG00000001716) ENSSSCG00000046246 CYP39A1 (ENSSSCG00000001718) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A.d #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A ENSGT00940000160098 Alpaca MODERN SPECIES 2354 HSP90AB1 (ENSVPAG00000002953) #22 Arabian camel MODERN SPECIES 12 LRRC73 (ENSCDRG00005014167) #7 YIPF3 (ENSCDRG00005014231) #8 POLR1C (ENSCDRG00005014297) #9 XPO5 (ENSCDRG00005014588) #10 POLH (ENSCDRG00005014731) #11 GTPBP2 (ENSCDRG00005014856) #12 MAD2L1BP (ENSCDRG00005014925) #13 RSPH9 (ENSCDRG00005014999) #14 MRPS18A (ENSCDRG00005015039) #15 VEGFA (ENSCDRG00005015143) #16 ENSCDRG00005015582 #17 TMEM63B (ENSCDRG00005015620) #18 CAPN11 (ENSCDRG00005015801) #19 MYMX (ENSCDRG00005015949) #20 SLC29A1 (ENSCDRG00005015969) #21 HSP90AB1 (ENSCDRG00005016031) #22 SLC35B2 (ENSCDRG00005016257) #23 NFKBIE (ENSCDRG00005016296) #24 TMEM151B (ENSCDRG00005016345) #25 TCTE1 (ENSCDRG00005016461) #26 AARS2 (ENSCDRG00005016509) #27 SPATS1 (ENSCDRG00005016556) #28 CDC5L (ENSCDRG00005016628) #29 SUPT3H (ENSCDRG00005016695) #30 ENSCDRG00005016813 RUNX2 (ENSCDRG00005016851) #34 ENSCDRG00005017081 CLIC5 (ENSCDRG00005017124) #35 ENPP4 (ENSCDRG00005017329) #36 ENPP5 (ENSCDRG00005017349) #37 RCAN2 (ENSCDRG00005017371) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 211 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT01020000230401.a.a.b.b.t.b.e.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156096 ENSGT00390000011376 ENSGT00530000063407.a ENSGT00950000182827.E ENSGT00390000016036 ENSGT00390000010837 ENSGT00390000011674 ENSGT01030000234513.A.a.b ENSGT00950000183034.C ENSGT00390000003897.s.b.b ENSGT00390000012242 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.b ENSGT00940000153511.b 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ENSGT00940000157142 ENSGT00390000018613.b.t ENSGT00940000154347.b.a ENSGT00940000159800 ENSGT00390000012396 ENSGT00390000004986.a Goat MODERN SPECIES 28 AKIRIN2 (ENSCHIG00000020845) ORC3 (ENSCHIG00000024178) RARS2 (ENSCHIG00000011962) SLC35A1 (ENSCHIG00000018065) CFAP206 (ENSCHIG00000020295) C6orf163 (ENSCHIG00000009309) ENSCHIG00000011932 GJB7 (ENSCHIG00000023473) ZNF292 (ENSCHIG00000014500) ENSCHIG00000009117 CGA (ENSCHIG00000018180) HTR1E (ENSCHIG00000009343) SYNCRIP (ENSCHIG00000024654) SNX14 (ENSCHIG00000017765) NT5E (ENSCHIG00000010651) ENSCHIG00000016419 #22 TBX18 (ENSCHIG00000012016) CEP162 (ENSCHIG00000013232) MRAP2 (ENSCHIG00000005238) CYB5R4 (ENSCHIG00000025247) RIPPLY2 (ENSCHIG00000020687) ENSCHIG00000017248 THEMIS (ENSCHIG00000019900) PTPRK (ENSCHIG00000012147) ENSCHIG00000009496 ENSCHIG00000014607 LAMA2 (ENSCHIG00000011086) ARHGAP18 (ENSCHIG00000027143) ENSCHIG00000004894 L3MBTL3 (ENSCHIG00000022911) SAMD3 (ENSCHIG00000014064) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156096 ENSGT00390000011376 ENSGT00530000063407.a ENSGT00950000182827.E ENSGT00390000016036 ENSGT00390000010837 ENSGT00390000011674 ENSGT01030000234513.A.a.b ENSGT00950000183034.C ENSGT00390000003897.s.b.b ENSGT00390000012242 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.b ENSGT00940000153511.b ENSGT00950000182856.a.b ENSGT00530000063775 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000155566 ENSGT00390000009631 ENSGT00650000093438 ENSGT00940000155536 ENSGT00940000161538 ENSGT00530000063770.c.b ENSGT00940000156249 ENSGT00940000155362 ENSGT00940000157142 ENSGT00940000154347.b.a ENSGT00940000155856.f ENSGT00940000159800 ENSGT00390000012396 ENSGT00530000063698.a.a ENSGT00560000078592 American bison MODERN SPECIES 2973 AKIRIN2 (ENSBBBG00000021059) ORC3 (ENSBBBG00000021131) RARS2 (ENSBBBG00000008669) SLC35A1 (ENSBBBG00000021194) CFAP206 (ENSBBBG00000021214) C6orf163 (ENSBBBG00000007631) SMIM8 (ENSBBBG00000021231) GJB7 (ENSBBBG00000021253) ZNF292 (ENSBBBG00000021267) ENSBBBG00000007632 CGA (ENSBBBG00000021274) HTR1E (ENSBBBG00000021278) SYNCRIP (ENSBBBG00000021311) SNX14 (ENSBBBG00000005764) NT5E (ENSBBBG00000021770) ENSBBBG00000021781 #22 TBX18 (ENSBBBG00000021805) CEP162 (ENSBBBG00000021885) ENSBBBG00000021902 CYB5R4 (ENSBBBG00000021936) RIPPLY2 (ENSBBBG00000021945) THEMIS (ENSBBBG00000021982) PTPRK (ENSBBBG00000022624) LAMA2 (ENSBBBG00000023137) ARHGAP18 (ENSBBBG00000000466) TMEM244 (ENSBBBG00000000435) ENSBBBG00000000427 L3MBTL3 (ENSBBBG00000023292) ENSBBBG00000006098 TMEM200A (ENSBBBG00000006100) EPB41L2 (ENSBBBG00000024307) Bos ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156096 ENSGT00390000011376 ENSGT00530000063407.a ENSGT00950000182827.E ENSGT00390000016036 ENSGT00390000010837 ENSGT00390000011674 ENSGT01030000234513.A.a.b ENSGT00950000183034.C ENSGT00390000003897.s.b.b ENSGT00390000012242 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.b ENSGT00940000153511.b ENSGT00950000182856.a.b ENSGT00530000063775 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT01020000230401.a.a.b.b.t.b.e.b ##22 ENSGT00940000155566 ENSGT00390000009631 ENSGT00650000093438 ENSGT00940000155536 ENSGT00940000161538 ENSGT00530000063770.c.b ENSGT00940000156249 ENSGT00940000155362 ENSGT00940000157142.c ENSGT00940000154347.b.a ENSGT00940000155856.f ENSGT00940000159800 ENSGT00390000012396 ENSGT00530000063698.a.a Bos_a ANCESTRAL SPECIES 307 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT01020000230401.a.a.b.b.t.b.e.b ##22 Wild yak MODERN SPECIES 932 PTCHD1 (ENSBMUG00000018851) ENSBMUG00000018827 ENSBMUG00000018805 ENSBMUG00000018792 PHEX (ENSBMUG00000018766) SMS (ENSBMUG00000018739) ENSBMUG00000018702 SMPX (ENSBMUG00000018671) CNKSR2 (ENSBMUG00000017867) ENSBMUG00000017291 ENSBMUG00000017283 ENSBMUG00000017276 #22 ENSBMUG00000017267 ##22 RPS6KA3 (ENSBMUG00000017229) EIF1AX (ENSBMUG00000017161) MAP7D2 (ENSBMUG00000017083) BCLAF3 (ENSBMUG00000016986) SH3KBP1 (ENSBMUG00000016923) MAP3K15 (ENSBMUG00000016858) PDHA1 (ENSBMUG00000016808) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000004211 ENSGT00940000156096 ENSGT00390000011376 ENSGT00530000063407.a ENSGT00950000182827.E ENSGT00390000016036 ENSGT00390000010837 ENSGT00390000011674 ENSGT00950000183034.C ENSGT00390000003897.s.b.b ENSGT00390000012242 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.b ENSGT00940000153511.b ENSGT00950000182856.a.b ENSGT00530000063775 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000155566 ENSGT00390000009631 ENSGT00650000093438 ENSGT00940000155536 ENSGT00940000161538 ENSGT00530000063770.c.b ENSGT00940000156249 ENSGT00940000155362 ENSGT00940000157142.c ENSGT00940000154347.b.a ENSGT00940000159800 ENSGT00390000012396 ENSGT00530000063698.a.a ENSGT00560000078592 ENSGT00940000155617.B Cow MODERN SPECIES 28 SPACA1 (ENSBTAG00000019469) AKIRIN2 (ENSBTAG00000003764) ORC3 (ENSBTAG00000016969) RARS2 (ENSBTAG00000016967) SLC35A1 (ENSBTAG00000014057) CFAP206 (ENSBTAG00000014054) C9H6orf163 (ENSBTAG00000017879) SMIM8 (ENSBTAG00000021663) ZNF292 (ENSBTAG00000046612) ENSBTAG00000000609 CGA (ENSBTAG00000016138) HTR1E (ENSBTAG00000026580) SYNCRIP (ENSBTAG00000006672) SNX14 (ENSBTAG00000018408) NT5E (ENSBTAG00000048655) ENSBTAG00000050176 #22 ENSBTAG00000006386 ENSBTAG00000054339 TBX18 (ENSBTAG00000018161) CEP162 (ENSBTAG00000003384) MRAP2 (ENSBTAG00000000257) CYB5R4 (ENSBTAG00000013591) RIPPLY2 (ENSBTAG00000004795) ENSBTAG00000026578 THEMIS (ENSBTAG00000015615) PTPRK (ENSBTAG00000020829) LAMA2 (ENSBTAG00000010229) ENSBTAG00000054952 ARHGAP18 (ENSBTAG00000015381) ENSBTAG00000021446 L3MBTL3 (ENSBTAG00000017393) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159623 ENSGT00530000063749.c.b ENSGT00390000004950 ENSGT00940000157873 ENSGT00390000018878 ENSGT00530000063974.b ENSGT00940000159243 ENSGT00940000160006 ENSGT00940000153662.B ENSGT00390000012541 ENSGT00390000015874 ENSGT00390000014003 ENSGT01030000234638.b.b.c.b ENSGT00940000154585.a ENSGT00940000154997 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299 ENSGT00940000157592 ENSGT00530000064469 ENSGT00390000005782 ENSGT00390000009048.a.b ENSGT00940000160670 ENSGT00940000156369 ENSGT01080000257410.D.d ENSGT01080000257410.D.c ENSGT00940000166553 ENSGT01030000234535.F.b ENSGT00730000111385 ENSGT00940000156579 ENSGT00410000028909 Sperm whale MODERN SPECIES 19 REEP5 (ENSPCTG00005000397) DCP2 (ENSPCTG00005020453) MCC (ENSPCTG00005020366) ENSPCTG00005020326 STARD4 (ENSPCTG00005020274) CAMK4 (ENSPCTG00005020188) WDR36 (ENSPCTG00005019946) TSLP (ENSPCTG00005019870) SLC25A46 (ENSPCTG00005019783) ENSPCTG00005019766 MAN2A1 (ENSPCTG00005019727) PJA2 (ENSPCTG00005019636) ENSPCTG00005019606 ENSPCTG00005019584 FER (ENSPCTG00005019310) ENSPCTG00005019238 #22 FBXL17 (ENSPCTG00005019115) EFNA5 (ENSPCTG00005019013) ENSPCTG00005018881 NUDT12 (ENSPCTG00005018749) ENSPCTG00005018641 MACIR (ENSPCTG00005018615) PPIP5K2 (ENSPCTG00005018254) GIN1 (ENSPCTG00005018108) PAM (ENSPCTG00005017932) ENSPCTG00005017892 ENSPCTG00005017801 SLCO4C1 (ENSPCTG00005017683) ENSPCTG00005017643 ST8SIA4 (ENSPCTG00005017612) FAM174A (ENSPCTG00005017576) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159623 ENSGT00530000063749.c.b ENSGT00390000004950 ENSGT00940000157873 ENSGT00390000018878 ENSGT00530000063974.b ENSGT00940000159243 ENSGT00940000160006 ENSGT00940000153662.B ENSGT00390000012541 ENSGT00390000015874 ENSGT00390000014003 ENSGT01030000234638.b.b.c.b ENSGT00940000154585.a ENSGT00940000154997 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299 ENSGT00940000157592 ENSGT00530000064469 ENSGT00390000005782 ENSGT00390000009048.a.b ENSGT00940000160670 ENSGT00940000156369 ENSGT01080000257410.D.d ENSGT01080000257410.D.c ENSGT00940000166553 ENSGT01030000234535.F.b ENSGT00730000111385 ENSGT00940000156579 ENSGT00950000183112.b.a.b Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063749.c.b ENSGT00390000004950 ENSGT00940000157873 ENSGT00390000018878 ENSGT00530000063974.b ENSGT00940000159243 ENSGT00940000160006 ENSGT00950000183120.e.a.b ENSGT00940000153662.B ENSGT00390000012541 ENSGT00390000015874 ENSGT00390000014003 ENSGT01030000234638.b.b.c.b ENSGT00940000154585.a ENSGT00940000154997 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299 ENSGT00940000157592 ENSGT00530000064469 ENSGT00390000005782 ENSGT00390000009048.a.b ENSGT00940000160670 ENSGT00940000156369 ENSGT01080000257410.D.d ENSGT01080000257410.D.c ENSGT00940000166553 ENSGT01030000234535.F.b ENSGT00730000111385 ENSGT00390000006621.n.b.a ENSGT00940000156579 Vaquita MODERN SPECIES 14 REEP5 (ENSPSNG00000000865) DCP2 (ENSPSNG00000000895) MCC (ENSPSNG00000000920) ENSPSNG00000000948 STARD4 (ENSPSNG00000000986) CAMK4 (ENSPSNG00000001024) ENSPSNG00000001052 WDR36 (ENSPSNG00000001075) ENSPSNG00000001125 TSLP (ENSPSNG00000001134) SLC25A46 (ENSPSNG00000001156) ENSPSNG00000001191 MAN2A1 (ENSPSNG00000001253) PJA2 (ENSPSNG00000001288) FER (ENSPSNG00000001378) ENSPSNG00000001489 #22 FBXL17 (ENSPSNG00000001512) EFNA5 (ENSPSNG00000001567) ENSPSNG00000001615 NUDT12 (ENSPSNG00000001659) ENSPSNG00000001685 MACIR (ENSPSNG00000001722) PPIP5K2 (ENSPSNG00000001820) GIN1 (ENSPSNG00000001953) PAM (ENSPSNG00000002039) SLCO6A1 (ENSPSNG00000002226) SLCO4C1 (ENSPSNG00000002326) ENSPSNG00000002367 ST8SIA4 (ENSPSNG00000002383) FAM174A (ENSPSNG00000002394) ENSPSNG00000002406 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063749.c.b ENSGT00390000004950 ENSGT00940000157873 ENSGT00390000018878 ENSGT00530000063974.b ENSGT00940000159243 ENSGT00940000160006 ENSGT00950000183120.e.a.b ENSGT00940000153662.B ENSGT00390000012541 ENSGT00390000015874 ENSGT00390000014003 ENSGT01030000234638.b.b.c.b ENSGT00940000154585.a ENSGT00940000154997 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000156973 ENSGT00940000157299 ENSGT00510000047602.s.b ENSGT00940000157592 ENSGT00530000064469 ENSGT00390000005782 ENSGT00390000009048.a.b ENSGT00940000160670 ENSGT00940000156369.e ENSGT01080000257410.D.d ENSGT01080000257410.D.c ENSGT00940000166553 ENSGT01030000234535.F.b ENSGT00730000111385 ENSGT00390000006621.n.b.a Beluga whale MODERN SPECIES 71 APC (ENSDLEG00000020083) SRP19 (ENSDLEG00000020121) REEP5 (ENSDLEG00000020126) DCP2 (ENSDLEG00000020133) MCC (ENSDLEG00000020140) STARD4 (ENSDLEG00000020146) CAMK4 (ENSDLEG00000020148) ENSDLEG00000020153 WDR36 (ENSDLEG00000020158) TSLP (ENSDLEG00000020169) SLC25A46 (ENSDLEG00000020174) TMEM232 (ENSDLEG00000020181) MAN2A1 (ENSDLEG00000020197) PJA2 (ENSDLEG00000020210) FER (ENSDLEG00000020214) ENSDLEG00000020247 #22 FBXL17 (ENSDLEG00000020248) EFNA5 (ENSDLEG00000020263) ENSDLEG00000020279 ENSDLEG00000020282 ENSDLEG00000020287 NUDT12 (ENSDLEG00000020299) ENSDLEG00000020303 CUNH5orf30 (ENSDLEG00000020309) PPIP5K2 (ENSDLEG00000020464) GIN1 (ENSDLEG00000021464) ENSDLEG00000021470 SLCO6A1 (ENSDLEG00000021482) SLCO4C1 (ENSDLEG00000021484) ENSDLEG00000021487 ST8SIA4 (ENSDLEG00000021492) Narwhal MODERN SPECIES 298 DCP2 (ENSMMNG00015000618) MCC (ENSMMNG00015000540) STARD4 (ENSMMNG00015000480) ENSMMNG00015000430 CAMK4 (ENSMMNG00015000415) WDR36 (ENSMMNG00015000364) TSLP (ENSMMNG00015000325) SLC25A46 (ENSMMNG00015000274) ENSMMNG00015000240 ENSMMNG00015000211 ENSMMNG00015000169 MAN2A1 (ENSMMNG00015000086) ENSMMNG00015008330 PJA2 (ENSMMNG00015008316) FER (ENSMMNG00015008249) ENSMMNG00015008217 #22 FBXL17 (ENSMMNG00015008187) EFNA5 (ENSMMNG00015008142) ENSMMNG00015008119 ENSMMNG00015008107 ENSMMNG00015008096 ENSMMNG00015008079 ENSMMNG00015008059 ENSMMNG00015008042 NUDT12 (ENSMMNG00015008002) ENSMMNG00015007981 PPIP5K2 (ENSMMNG00015007856) GIN1 (ENSMMNG00015007787) ENSMMNG00015007750 SLCO6A1 (ENSMMNG00015007635) SLCO4C1 (ENSMMNG00015007574) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A.d #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00500000045766 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00600000085213 #33 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00740000116630 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A.d #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00500000045766 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00600000085213 #33 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A.d #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00500000045766 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A Megabat MODERN SPECIES 4068 SLC29A1 (ENSPVAG00000016829) #21 HSP90AB1 (ENSPVAG00000016831) #22 SLC35B2 (ENSPVAG00000016834) #23 NFKBIE (ENSPVAG00000016835) #24 TMEM151B (ENSPVAG00000016836) #25 ENSPVAG00000016837 ENSPVAG00000016838 #26 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A.d #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A ENSGT00940000160098 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 24 EXD1 (ENSRFEG00010002546) INO80 (ENSRFEG00010002604) CHAC1 (ENSRFEG00010002702) DLL4 (ENSRFEG00010002739) VPS18 (ENSRFEG00010002778) RHOV (ENSRFEG00010002796) SPINT1 (ENSRFEG00010002815) PPP1R14D (ENSRFEG00010002830) ZFYVE19 (ENSRFEG00010002887) ENSRFEG00010002972 C15orf62 (ENSRFEG00010002988) ENSRFEG00010003006 RMDN3 (ENSRFEG00010003044) RAD51 (ENSRFEG00010003094) KNL1 (ENSRFEG00010003147) ENSRFEG00010003187 #22 RPUSD2 (ENSRFEG00010003203) CCDC32 (ENSRFEG00010003235) BAHD1 (ENSRFEG00010003284) IVD (ENSRFEG00010003336) KNSTRN (ENSRFEG00010003391) DISP2 (ENSRFEG00010003424) CCDC9B (ENSRFEG00010003444) INAFM2 (ENSRFEG00010003470) PLCB2 (ENSRFEG00010003518) ANKRD63 (ENSRFEG00010003557) PAK6 (ENSRFEG00010003580) BUB1B (ENSRFEG00010003619) BMF (ENSRFEG00010003649) SRP14 (ENSRFEG00010003680) EIF2AK4 (ENSRFEG00010003851) Microbat MODERN SPECIES 1178 MRPL14 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ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Sloth MODERN SPECIES 11062 ENSCHOG00000010601 ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Tenrec MODERN SPECIES 14349 ENSETEG00000001960 ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234613.b.a.a ENSGT00900000143542 ENSGT01030000234613.b.a.b ENSGT00610000087423 ENSGT01030000234517.H.a ENSGT00390000007463 ENSGT00940000160538 ENSGT00940000155654 ENSGT00390000018116 ENSGT00940000157283 ENSGT00390000015784 ENSGT00390000002751 ENSGT00940000159582 ENSGT00390000007686.b.d ENSGT01020000230401.a.a.b.b.s.b ##22 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT01020000230401.a.a.b.b.t ##22 ENSGT00520000057711 ENSGT00940000156103 ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a ENSGT00950000183173.O ENSGT00530000068548 ENSGT00520000062039 ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000161760 ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000159694 ENSGT00940000157766 ENSGT00940000154763 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158373 ENSGT00950000183128.A ENSGT00940000153988.B ENSGT00940000155120.mb ENSGT00940000158626 ENSGT00940000165590 ENSGT00940000158463 ENSGT00390000018226 ENSGT00390000016654 ENSGT00970000193421.C.a ENSGT00910000148135 ENSGT00940000160535 ENSGT00940000160347.b ENSGT00390000001500 ENSGT00940000156565 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT00390000006867 ENSGT00390000000096.a ENSGT00390000003488.a.b.b ENSGT00940000158343 ENSGT00940000162220 ENSGT00910000144204.a ENSGT00940000167085 ENSGT00940000163120 ENSGT00390000006478 ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00530000064208.a ENSGT00530000064208.b.d ENSGT00390000001485 ENSGT00940000155798 ENSGT00390000001280.b Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158373 ENSGT00950000183128.A ENSGT00940000153988.B ENSGT00940000155120.mb ENSGT00940000158626 ENSGT00940000165590 ENSGT00940000158463 ENSGT00390000018226 ENSGT00390000016654 ENSGT00970000193421.C.a ENSGT00910000148135 ENSGT00940000160535 ENSGT00940000160347.b ENSGT00390000001500 ENSGT00940000156565 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT00390000006867 ENSGT00390000000096.a ENSGT00390000003488.a.b.b ENSGT00940000158343 ENSGT00940000162220 ENSGT00910000144204.a ENSGT00940000167085 ENSGT00940000163120.b ENSGT00390000006478 ENSGT00940000154779.a.b.a ENSGT00530000064208.a ENSGT00530000064208.b.d ENSGT00390000001485 ENSGT00940000155798 ENSGT00390000001280.b Dog MODERN SPECIES 2 ENSCAFG00845011485 FEM1C (ENSCAFG00845011535) ENSCAFG00845005298 TICAM2 (ENSCAFG00845005311) TMED7 (ENSCAFG00845005331) CDO1 (ENSCAFG00845005340) ENSCAFG00845005354 ATG12 (ENSCAFG00845005357) AP3S1 (ENSCAFG00845005379) ENSCAFG00845005391 LVRN (ENSCAFG00845005410) ARL14EPL (ENSCAFG00845005437) COMMD10 (ENSCAFG00845005464) SEMA6A (ENSCAFG00845005513) ENSCAFG00845005748 ENSCAFG00845005791 ##22 DTWD2 (ENSCAFG00845005903) DMXL1 (ENSCAFG00845006156) TNFAIP8 (ENSCAFG00845006569) HSD17B4 (ENSCAFG00845006702) ENSCAFG00845006896 ENSCAFG00845006930 ENSCAFG00845007037 ENSCAFG00845007068 ENSCAFG00845007095 ENSCAFG00845007148 PRR16 (ENSCAFG00845007330) ENSCAFG00845007375 ENSCAFG00845007449 ENSCAFG00845007575 ENSCAFG00845007624 Dingo MODERN SPECIES 238 ENSCAFG00020004008 ENSCAFG00020004013 FEM1C (ENSCAFG00020004021) ENSCAFG00020004023 TMED7 (ENSCAFG00020004025) ENSCAFG00020004028 CDO1 (ENSCAFG00020004035) ATG12 (ENSCAFG00020004037) AP3S1 (ENSCAFG00020004039) ENSCAFG00020004047 LVRN (ENSCAFG00020004057) ARL14EPL (ENSCAFG00020004094) COMMD10 (ENSCAFG00020004104) ENSCAFG00020004122 ENSCAFG00020004131 ENSCAFG00020004183 ##22 ENSCAFG00020004192 DTWD2 (ENSCAFG00020004203) DMXL1 (ENSCAFG00020004223) TNFAIP8 (ENSCAFG00020004646) HSD17B4 (ENSCAFG00020004649) ENSCAFG00020004661 Red fox MODERN SPECIES 111 TRIM36 (ENSVVUG00000000084) PGGT1B (ENSVVUG00000000052) CCDC112 (ENSVVUG00000019638) ENSVVUG00000019634 FEM1C (ENSVVUG00000019633) ENSVVUG00000019628 TMED7 (ENSVVUG00000019625) CDO1 (ENSVVUG00000019615) ATG12 (ENSVVUG00000019613) ENSVVUG00000019611 AP3S1 (ENSVVUG00000019605) LVRN (ENSVVUG00000019479) ARL14EPL (ENSVVUG00000019464) COMMD10 (ENSVVUG00000019460) SEMA6A (ENSVVUG00000019437) ENSVVUG00000019417 ##22 ENSVVUG00000019403 DTWD2 (ENSVVUG00000019378) DMXL1 (ENSVVUG00000019328) TNFAIP8 (ENSVVUG00000019318) HSD17B4 (ENSVVUG00000019308) FAM170A (ENSVVUG00000019296) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1129 ENSAMEG00000028559 ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Megabat MODERN SPECIES 4694 ENSPVAG00000002984 ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Microbat MODERN SPECIES 956 ENSMLUG00000030582 ZAR1L (ENSMLUG00000010357) FRY (ENSMLUG00000011686) RXFP2 (ENSMLUG00000013834) B3GLCT (ENSMLUG00000012104) ENSMLUG00000023344 HSPH1 (ENSMLUG00000007926) TEX26 (ENSMLUG00000008800) MEDAG (ENSMLUG00000008786) ENSMLUG00000028124 ALOX5AP (ENSMLUG00000006023) USPL1 (ENSMLUG00000012347) HMGB1 (ENSMLUG00000025979) KATNAL1 (ENSMLUG00000006028) UBL3 (ENSMLUG00000009645) ENSMLUG00000013428 ##22 SLC7A1 (ENSMLUG00000014626) ENSMLUG00000014608 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 9 ENSMMSG00000008613 ENSMMSG00000009216 PABPC5 (ENSMMSG00000009243) ENSMMSG00000009265 ##22 ENSMMSG00000009313 ENSMMSG00000009352 ENSMMSG00000009361 KLHL4 (ENSMMSG00000009371) DACH2 (ENSMMSG00000009445) CHM (ENSMMSG00000009948) ENSMMSG00000010099 ENSMMSG00000010127 ENSMMSG00000010293 POF1B (ENSMMSG00000010335) ZNF711 (ENSMMSG00000010430) ENSMMSG00000010476 APOOL (ENSMMSG00000010528) ENSMMSG00000010593 HDX (ENSMMSG00000010697) Siberian musk deer MODERN SPECIES 389 CCDC85C (ENSMMSG00000006131) HHIPL1 (ENSMMSG00000006083) CYP46A1 (ENSMMSG00000005996) EML1 (ENSMMSG00000005874) EVL (ENSMMSG00000005537) DEGS2 (ENSMMSG00000005476) ENSMMSG00000005448 SLC25A29 (ENSMMSG00000005366) SLC25A47 (ENSMMSG00000005298) WARS1 (ENSMMSG00000005239) WDR25 (ENSMMSG00000005204) BEGAIN (ENSMMSG00000005068) DLK1 (ENSMMSG00000004971) RTL1 (ENSMMSG00000004882) ENSMMSG00000011795 ENSMMSG00000011776 ##22 ENSMMSG00000011754 ##22 PPP2R5C (ENSMMSG00000011586) DYNC1H1 (ENSMMSG00000011288) ENSMMSG00000011232 HSP90AA1 (ENSMMSG00000011173) ##22 WDR20 (ENSMMSG00000011116) MOK (ENSMMSG00000011038) CINP (ENSMMSG00000010822) ENSMMSG00000010794 RBP7 (ENSMMSG00000010775) ENSMMSG00000010768 ENSMMSG00000010744 NMNAT1 (ENSMMSG00000010699) LZIC (ENSMMSG00000010660) CTNNBIP1 (ENSMMSG00000010639) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Bolivian squirrel monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 310 ENSSBOG00000024758 ##22 ENSSBOG00000015677 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 278 ENSSBOG00000032954 ##22 ENSSBOG00000036107 POLR1H (ENSSBOG00000020995) PPP1R11 (ENSSBOG00000025133) RNF39 (ENSSBOG00000031929) TRIM40 (ENSSBOG00000019751) TRIM10 (ENSSBOG00000032530) TRIM15 (ENSSBOG00000029202) TRIM26 (ENSSBOG00000023103) ENSSBOG00000031746 RPP21 (ENSSBOG00000024099) Capuchin MODERN SPECIES 440 ENSCCAG00000020518 UBD (ENSCCAG00000032833) GABBR1 (ENSCCAG00000034539) ENSCCAG00000020495 MOG (ENSCCAG00000037313) ZFP57 (ENSCCAG00000031559) ENSCCAG00000032961 ENSCCAG00000026148 ENSCCAG00000024286 ENSCCAG00000030847 ENSCCAG00000031464 ##22 ENSCCAG00000019819 ENSCCAG00000024925 ENSCCAG00000035451 #22 ENSCCAG00000037839 ENSCCAG00000030236 ENSCCAG00000037512 POLR1H (ENSCCAG00000029119) PPP1R11 (ENSCCAG00000028101) RNF39 (ENSCCAG00000023355) ENSCCAG00000023734 TRIM40 (ENSCCAG00000023524) TRIM10 (ENSCCAG00000033421) TRIM15 (ENSCCAG00000021338) TRIM26 (ENSCCAG00000025143) TRIM39 (ENSCCAG00000036784) Mas night monkey MODERN SPECIES 543 ENSANAG00000034779 ##22 ENSANAG00000024653 ENSANAG00000030339 ENSANAG00000033118 ENSANAG00000021905 POLR1H (ENSANAG00000022928) PPP1R11 (ENSANAG00000027122) RNF39 (ENSANAG00000028285) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.b.b ENSGT00940000161623 ENSGT00390000014853.c ENSGT00390000000483.b ENSGT00940000158750 ENSGT00390000003477 ENSGT00390000012901 ENSGT00940000159350 ENSGT00940000157037.a ENSGT00940000159192 ENSGT00390000009416 ENSGT00940000154531.y.b.b ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000160357 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000155482 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000164387 ENSGT00390000017291.b ENSGT00390000017291.a ENSGT00940000154372.a.b ENSGT00940000154372.a.a ENSGT00530000063586.b ENSGT00390000010628 ENSGT00950000183208.A.c.a.f Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.b.b ENSGT00940000161623 ENSGT00390000014853.c ENSGT00390000000483.b ENSGT00940000158750 ENSGT00390000003477 ENSGT00390000012901 ENSGT00940000159350 ENSGT00940000157037.a ENSGT00940000159192 ENSGT00390000009416 ENSGT00940000154531.y.b.b ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000160357 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000155482 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000164387 ENSGT00390000017291.b ENSGT00390000017291.a ENSGT00940000154372.a.b ENSGT00940000154372.a.a ENSGT00530000063586.b ENSGT00390000010628 ENSGT00950000183208.A.c.a.f Hominidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.b.b ENSGT00940000161623 ENSGT00390000014853.c ENSGT00390000000483.b ENSGT00940000158750 ENSGT00390000003477 ENSGT00390000012901 ENSGT00940000159350 ENSGT00940000157037.a ENSGT00940000159192 ENSGT00390000009416 ENSGT00940000154531.y.b.b ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000160357 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000155482 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000164387 ENSGT00390000017291.b ENSGT00390000017291.a ENSGT00940000154372.a.b ENSGT00940000154372.a.a ENSGT00530000063586.b ENSGT00390000010628 ENSGT00390000005639.a.a Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182850.a.b.a.a ENSGT00530000063812.A ENSGT00940000159570 ENSGT00940000159423 ENSGT00390000000645 ENSGT00950000183001.b ENSGT00940000156391 ENSGT00940000162580 ENSGT00940000157037.a.a ENSGT00940000159192 ENSGT00390000009416 ENSGT00940000154531.y.b.b ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000160357 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000155482 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000164387 ENSGT00390000017291.b ENSGT00390000017291.a ENSGT00940000154372.a.b ENSGT00940000154372.a.a ENSGT00530000063586.b ENSGT00390000010628 ENSGT00390000017515.o.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000000645 ENSGT00950000183001.b ENSGT00940000156391 ENSGT00940000162580 ENSGT00940000163626.f.b ENSGT00390000009472.b ENSGT00940000160995.b.e.b ENSGT00390000001538.a ENSGT00940000157037.a.a ENSGT00940000159192 ENSGT00390000009416 ENSGT00940000154531.y.b.b ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000160357 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000155482 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000164387 ENSGT00390000017291.b ENSGT00390000017291.a ENSGT00940000154372.a.b ENSGT00940000154372.a.a ENSGT00530000063586.b ENSGT00390000010628 ENSGT00390000017515.o.b Pan ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000000645 ENSGT00950000183001.b ENSGT00940000156391 ENSGT00940000162580 ENSGT00940000163626.f.a.b ENSGT00390000009472.b.a ENSGT00940000160995.b.e.b ENSGT00390000001538.a ENSGT00940000157037.a.a ENSGT00940000159192 ENSGT00390000009416 ENSGT00940000154531.y.b.b ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000160357 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000155482 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000164387 ENSGT00390000017291.b ENSGT00390000017291.a ENSGT00940000154372.a.b ENSGT00940000154372.a.a ENSGT00530000063586.b ENSGT00390000010628 ENSGT00390000017515.o.b Bonobo MODERN SPECIES 17 ABLIM2 (ENSPPAG00000034667) SH3TC1 (ENSPPAG00000028783) HTRA3 (ENSPPAG00000031446) ACOX3 (ENSPPAG00000011697) TRMT44 (ENSPPAG00000028201) GPR78 (ENSPPAG00000031581) CPZ (ENSPPAG00000036243) ENSPPAG00000015865 ENSPPAG00000031253 DRD5 (ENSPPAG00000023786) SLC2A9 (ENSPPAG00000031738) WDR1 (ENSPPAG00000030082) ENSPPAG00000043338 CLNK (ENSPPAG00000037951) HS3ST1 (ENSPPAG00000008014) ENSPPAG00000010911 ##22 RAB28 (ENSPPAG00000043705) NKX3-2 (ENSPPAG00000039595) BOD1L1 (ENSPPAG00000014926) ENSPPAG00000009844 C1QTNF7 (ENSPPAG00000000881) CC2D2A (ENSPPAG00000039745) FBXL5 (ENSPPAG00000007317) FAM200B (ENSPPAG00000012482) BST1 (ENSPPAG00000034960) CD38 (ENSPPAG00000036378) ENSPPAG00000035131 FGFBP1 (ENSPPAG00000023092) FGFBP2 (ENSPPAG00000012344) PROM1 (ENSPPAG00000032761) TAPT1 (ENSPPAG00000027508) Chimpanzee MODERN SPECIES 17 CPZ (ENSPTRG00000015909) HMX1 (ENSPTRG00000042875) ENSPTRG00000034308 ENSPTRG00000031265 DEFB130A (ENSPTRG00000034363) DEFB131A (ENSPTRG00000015911) DRD5 (ENSPTRG00000031262) SLC2A9 (ENSPTRG00000015915) WDR1 (ENSPTRG00000015916) ENSPTRG00000050777 ZNF518B (ENSPTRG00000044037) CLNK (ENSPTRG00000015918) ENSPTRG00000046326 ENSPTRG00000047064 HS3ST1 (ENSPTRG00000015919) ENSPTRG00000042951 ##22 RAB28 (ENSPTRG00000015920) NKX3-2 (ENSPTRG00000048496) BOD1L1 (ENSPTRG00000015922) CPEB2 (ENSPTRG00000015924) C1QTNF7 (ENSPTRG00000015925) CC2D2A (ENSPTRG00000015926) FBXL5 (ENSPTRG00000015927) FAM200B (ENSPTRG00000044690) BST1 (ENSPTRG00000015929) CD38 (ENSPTRG00000015930) FGFBP1 (ENSPTRG00000015931) FGFBP2 (ENSPTRG00000031250) PROM1 (ENSPTRG00000015932) TAPT1 (ENSPTRG00000015933) ENSPTRG00000049952 Gorilla MODERN SPECIES 17 ACOX3 (ENSGGOG00000008003) TRMT44 (ENSGGOG00000008016) GPR78 (ENSGGOG00000008058) CPZ (ENSGGOG00000008061) ENSGGOG00000036477 ENSGGOG00000022821 ENSGGOG00000039268 DRD5 (ENSGGOG00000007931) SLC2A9 (ENSGGOG00000015358) WDR1 (ENSGGOG00000015364) ENSGGOG00000039866 ZNF518B (ENSGGOG00000040283) CLNK (ENSGGOG00000006844) ENSGGOG00000026421 HS3ST1 (ENSGGOG00000015625) ENSGGOG00000026811 ##22 RAB28 (ENSGGOG00000024190) NKX3-2 (ENSGGOG00000008589) BOD1L1 (ENSGGOG00000027616) CPEB2 (ENSGGOG00000004449) C1QTNF7 (ENSGGOG00000005890) CC2D2A (ENSGGOG00000002758) FBXL5 (ENSGGOG00000010962) FAM200B (ENSGGOG00000027844) BST1 (ENSGGOG00000008845) CD38 (ENSGGOG00000006165) FGFBP1 (ENSGGOG00000016135) FGFBP2 (ENSGGOG00000028579) PROM1 (ENSGGOG00000016139) TAPT1 (ENSGGOG00000011812) ENSGGOG00000039503 Gibbon MODERN SPECIES 12 STX18 (ENSNLEG00000016132) ENSNLEG00000016136 ZBTB49 (ENSNLEG00000016142) LYAR (ENSNLEG00000016149) TMEM128 (ENSNLEG00000035157) OTOP1 (ENSNLEG00000016176) ENSNLEG00000029276 SLC2A9 (ENSNLEG00000034367) WDR1 (ENSNLEG00000016183) ENSNLEG00000016203 ENSNLEG00000031634 ENSNLEG00000031957 ZNF518B (ENSNLEG00000027103) CLNK (ENSNLEG00000016205) HS3ST1 (ENSNLEG00000016241) ENSNLEG00000030301 ##22 RAB28 (ENSNLEG00000016243) NKX3-2 (ENSNLEG00000016256) BOD1L1 (ENSNLEG00000016260) ENSNLEG00000030451 ENSNLEG00000016275 C1QTNF7 (ENSNLEG00000016288) CC2D2A (ENSNLEG00000016292) FBXL5 (ENSNLEG00000016352) FAM200B (ENSNLEG00000018958) BST1 (ENSNLEG00000016391) CD38 (ENSNLEG00000032175) ENSNLEG00000027474 PROM1 (ENSNLEG00000016422) TAPT1 (ENSNLEG00000016541) ENSNLEG00000029526 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 1028 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT00940000161833 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1102 ENSRBIG00000036396 ##22 RAB28 (ENSRBIG00000028381) ENSRBIG00000001204 NKX3-2 (ENSRBIG00000010607) BOD1L1 (ENSRBIG00000000058) ENSRBIG00000038269 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2080 ENSRROG00000042584 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000000483.b ENSGT00940000158750 ENSGT00390000003477 ENSGT00910000147402 ENSGT00390000012901 ENSGT00940000159350 ENSGT00940000157037.a ENSGT00940000159192 ENSGT00390000009416 ENSGT00940000154531.y.b.b ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00910000147172 ENSGT00910000148058 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000160357 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000155482 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000164387 ENSGT00390000017291.b ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a.g.a ENSGT00390000017291.a ENSGT00940000154372.a.b ENSGT00940000154372.a.a ENSGT00530000063586.b ENSGT00390000010628 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000000483.b ENSGT00940000158750 ENSGT00390000003477 ENSGT00910000147402 ENSGT00390000012901 ENSGT00940000159350 ENSGT00940000157037.a ENSGT00940000159192 ENSGT00390000009416 ENSGT00940000154531.y.b.b ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00910000147172 ENSGT00910000148058 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000160357 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000155482 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000164387 ENSGT00390000017291.b ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a.g.a ENSGT00390000017291.a ENSGT00940000154372.a.b ENSGT00940000154372.a.a ENSGT00530000063586.b ENSGT00390000010628 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00390000000483.b ENSGT00940000158750 ENSGT00390000003477 ENSGT00910000147402 ENSGT00390000012901 ENSGT00940000159350 ENSGT00940000157037.a ENSGT00940000159192 ENSGT00390000009416 ENSGT00940000154531.y.b.b ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00910000147172 ENSGT00910000148058 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000160357 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000155482 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000164387 ENSGT00390000017291.b ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a.g.a ENSGT00390000017291.a ENSGT00940000154372.a.a ENSGT00530000063586.b ENSGT00390000010628 ENSGT00950000183208.A.c.a.f Sooty mangabey MODERN SPECIES 551 ENSCATG00000037968 STX18 (ENSCATG00000042652) NSG1 (ENSCATG00000039746) ZBTB49 (ENSCATG00000011176) LYAR (ENSCATG00000032402) ENSCATG00000016643 TMEM128 (ENSCATG00000040757) OTOP1 (ENSCATG00000037566) SLC2A9 (ENSCATG00000037675) WDR1 (ENSCATG00000031767) ENSCATG00000031260 ZNF518B (ENSCATG00000015987) CLNK (ENSCATG00000039603) HS3ST1 (ENSCATG00000020814) ENSCATG00000033901 ENSCATG00000013123 ##22 RAB28 (ENSCATG00000038542) NKX3-2 (ENSCATG00000042215) BOD1L1 (ENSCATG00000040508) ENSCATG00000019681 CPEB2 (ENSCATG00000040126) C1QTNF7 (ENSCATG00000014989) CC2D2A (ENSCATG00000037758) FBXL5 (ENSCATG00000041236) FAM200B (ENSCATG00000020983) BST1 (ENSCATG00000003303) ENSCATG00000030711 CD38 (ENSCATG00000045367) PROM1 (ENSCATG00000035341) TAPT1 (ENSCATG00000042001) ENSCATG00000040373 Drill MODERN SPECIES 886 ENSMLEG00000030955 ENSMLEG00000037845 ##22 ENSMLEG00000043131 RAB28 (ENSMLEG00000039521) NKX3-2 (ENSMLEG00000032257) BOD1L1 (ENSMLEG00000028382) ENSMLEG00000026496 C1QTNF7 (ENSMLEG00000035184) CC2D2A (ENSMLEG00000030949) FBXL5 (ENSMLEG00000035701) FAM200B (ENSMLEG00000001723) BST1 (ENSMLEG00000043994) ENSMLEG00000041465 CD38 (ENSMLEG00000040865) FGFBP2 (ENSMLEG00000024485) PROM1 (ENSMLEG00000042255) TAPT1 (ENSMLEG00000022768) Macaca ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000014853.c ENSGT00390000000483.b ENSGT00940000158750 ENSGT00390000003477 ENSGT00910000147402 ENSGT00390000012901 ENSGT00940000159350 ENSGT00940000157037.a ENSGT00940000159192 ENSGT00390000009416 ENSGT00940000160595.b ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160449 ENSGT00910000147172 ENSGT00910000148058 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00390000012691.c.b.n ENSGT00940000160357 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000155482 ENSGT00390000006172 ENSGT00940000164387 ENSGT00390000017291.b ENSGT00940000153675.a.a.b.e.a.g.a ENSGT00390000017291.a ENSGT00940000154372.a.b ENSGT00940000154372.a.a ENSGT00530000063586.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 141 ZNF518B (ENSMNEG00000025880) CLNK (ENSMNEG00000031084) HS3ST1 (ENSMNEG00000021861) ENSMNEG00000002182 ENSMNEG00000038062 ENSMNEG00000031439 ##22 RAB28 (ENSMNEG00000028531) NKX3-2 (ENSMNEG00000037382) BOD1L1 (ENSMNEG00000037331) ENSMNEG00000006879 ENSMNEG00000029766 CPEB2 (ENSMNEG00000041798) C1QTNF7 (ENSMNEG00000041355) CC2D2A (ENSMNEG00000043856) FBXL5 (ENSMNEG00000041054) FAM200B (ENSMNEG00000007314) BST1 (ENSMNEG00000028047) ENSMNEG00000045107 CD38 (ENSMNEG00000042584) PROM1 (ENSMNEG00000044286) TAPT1 (ENSMNEG00000030185) Tarsier MODERN SPECIES 5799 MTPN (ENSTSYG00000026171) ENSTSYG00000036885 ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 2590 ENSTBEG00000003152 ##22 IPO5 (ENSTBEG00000001498) Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 303 AKAP9 (ENSODEG00000001339) CYP51A1 (ENSODEG00000001187) ENSODEG00000001141 KRIT1 (ENSODEG00000001084) ANKIB1 (ENSODEG00000001042) ENSODEG00000000916 ENSODEG00000000896 PEX1 (ENSODEG00000001278) ENSODEG00000001236 ENSODEG00000001167 CDK6 (ENSODEG00000001138) ENSODEG00000001113 HEPACAM2 (ENSODEG00000001098) VPS50 (ENSODEG00000001066) CALCR (ENSODEG00000001037) ENSODEG00000001006 ##22 TFPI2 (ENSODEG00000000988) GNGT1 (ENSODEG00000000972) GNG11 (ENSODEG00000000955) ENSODEG00000000944 ENSODEG00000000924 Degu MODERN SPECIES 47 KIAA0232 (ENSODEG00000009378) ENSODEG00000013573 MAN2B2 (ENSODEG00000010318) PPP2R2C (ENSODEG00000011119) WFS1 (ENSODEG00000012808) JAKMIP1 (ENSODEG00000010138) CRMP1 (ENSODEG00000009439) EVC (ENSODEG00000008913) EVC2 (ENSODEG00000010011) ENSODEG00000009080 ENSODEG00000008718 ENSODEG00000009511 STK32B (ENSODEG00000009197) ENSODEG00000008457 CYTL1 (ENSODEG00000009597) ENSODEG00000009744 ##22 MSX1 (ENSODEG00000009346) STX18 (ENSODEG00000010096) NSG1 (ENSODEG00000009246) ZBTB49 (ENSODEG00000010729) ENSODEG00000010523 TMEM128 (ENSODEG00000008766) OTOP1 (ENSODEG00000009177) DRD5 (ENSODEG00000019688) SLC2A9 (ENSODEG00000009108) ENSODEG00000010858 WDR1 (ENSODEG00000008420) HS3ST1 (ENSODEG00000019871) ENSODEG00000008482 NKX3-2 (ENSODEG00000010309) BOD1L1 (ENSODEG00000009613) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Rat MODERN SPECIES 11 Fnip2 (ENSRNOG00000027833) Ppid (ENSRNOG00000027408) Etfdh (ENSRNOG00000009538) C2h4orf46 (ENSRNOG00000010071) Rxfp1 (ENSRNOG00000024120) Tmem144 (ENSRNOG00000010081) Gask1b (ENSRNOG00000010183) Gria2 (ENSRNOG00000054204) Glrb (ENSRNOG00000010199) Pdgfc (ENSRNOG00000010695) Ctso (ENSRNOG00000066128) Tdo2 (ENSRNOG00000011612) Asic5 (ENSRNOG00000011842) Gucy1b1 (ENSRNOG00000012060) Gucy1a1 (ENSRNOG00000012302) ENSRNOG00000069812 ##22 Map9 (ENSRNOG00000012982) ENSRNOG00000063783 Rbm46 (ENSRNOG00000025823) Lrat (ENSRNOG00000025608) Fgg (ENSRNOG00000025074) Fga (ENSRNOG00000024848) Fgb (ENSRNOG00000007092) Plrg1 (ENSRNOG00000006655) LOC100909434 (ENSRNOG00000047473) Sfrp2 (ENSRNOG00000009465) Tlr2 (ENSRNOG00000009822) Tmem131l (ENSRNOG00000009837) Mnd1 (ENSRNOG00000024733) Trim2 (ENSRNOG00000010124) Fhdc1 (ENSRNOG00000024594) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 150 ENSMOCG00000004125 ##22 Adcyap1 (ENSMOCG00000003306) Yes1 (ENSMOCG00000002556) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.b ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 619 Cdh2 (ENSMAUG00000014636) Dsc3 (ENSMAUG00000013762) Dsc2 (ENSMAUG00000010434) Dsc1 (ENSMAUG00000000925) ENSMAUG00000021176 Dsg4 (ENSMAUG00000010495) Dsg3 (ENSMAUG00000011710) Dsg2 (ENSMAUG00000018653) Ttr (ENSMAUG00000011770) B4galt6 (ENSMAUG00000016396) Trappc8 (ENSMAUG00000016177) ENSMAUG00000009622 Rnf138 (ENSMAUG00000017310) Mep1b (ENSMAUG00000000729) Garem1 (ENSMAUG00000007666) ENSMAUG00000005894 ##22 Klhl14 (ENSMAUG00000021235) Ccdc178 (ENSMAUG00000012600) Asxl3 (ENSMAUG00000010440) Nol4 (ENSMAUG00000009837) ENSMAUG00000021323 Mapre2 (ENSMAUG00000018436) Zfp397 (ENSMAUG00000008052) ENSMAUG00000001016 Zfp35 (ENSMAUG00000010194) Zfp24 (ENSMAUG00000020280) Ino80c (ENSMAUG00000014168) ENSMAUG00000016647 Rprd1a (ENSMAUG00000005675) Slc39a6 (ENSMAUG00000011501) Elp2 (ENSMAUG00000020988) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a #22 koala MODERN SPECIES 38 ENSPCIG00000036832 ENSPCIG00000017033 SVIL (ENSPCIG00000017018) ENSPCIG00000032227 ZEB1 (ENSPCIG00000011050) ARHGAP12 (ENSPCIG00000020000) KIF5B (ENSPCIG00000020005) EPC1 (ENSPCIG00000020008) ENSPCIG00000025558 ENSPCIG00000036745 ITGB1 (ENSPCIG00000015501) NRP1 (ENSPCIG00000015535) ENSPCIG00000031890 PARD3 (ENSPCIG00000016072) ENSPCIG00000016086 ENSPCIG00000016087 #22 CUL2 (ENSPCIG00000016089) CREM (ENSPCIG00000007139) ENSPCIG00000035090 CCNY (ENSPCIG00000007147) GJD4 (ENSPCIG00000007153) FZD8 (ENSPCIG00000030914) MAD2L1 (ENSPCIG00000011256) KLF6 (ENSPCIG00000029814) PITRM1 (ENSPCIG00000029829) PFKP (ENSPCIG00000029839) ENSPCIG00000035492 ENSPCIG00000028565 ENSPCIG00000003216 ENSPCIG00000012535 ENSPCIG00000026077 Amniota ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000175262 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000002210.c.a ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000165659 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000164045 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000165659 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992 Platypus MODERN SPECIES 10 ENSOANG00000051088 LRRC73 (ENSOANG00000043842) #7 YIPF3 (ENSOANG00000045097) #8 POLR1C (ENSOANG00000003043) #9 XPO5 (ENSOANG00000012106) #10 POLH (ENSOANG00000041331) #11 GTPBP2 (ENSOANG00000037369) #12 MAD2L1BP (ENSOANG00000001957) #13 RSPH9 (ENSOANG00000001956) #14 MRPS18A (ENSOANG00000043266) #15 ENSOANG00000044033 #16 MRPL14 (ENSOANG00000012556) #17 TMEM63B (ENSOANG00000049821) #18 CAPN11 (ENSOANG00000009824) #19 SLC29A1 (ENSOANG00000007211) #21 ENSOANG00000048138 ##22 SLC35B2 (ENSOANG00000047499) #23 NFKBIE (ENSOANG00000048935) #24 TCTE1 (ENSOANG00000009454) #26 AARS2 (ENSOANG00000043101) #27 RNF8 (ENSOANG00000031743) CMTR1 (ENSOANG00000013822) CCDC167 (ENSOANG00000048275) MDGA1 (ENSOANG00000013169) ZFAND3 (ENSOANG00000013168) BTBD9 (ENSOANG00000013167) GLO1 (ENSOANG00000039552) DNAH8 (ENSOANG00000013163) ENSOANG00000013161 KCNK5 (ENSOANG00000037169) ENSOANG00000049604 Theria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000164045 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00600000085213 #33 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000166577 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160761 ENSGT00940000164045 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922.a #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000166577 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A Opossum MODERN SPECIES 5 VPS35L (ENSMODG00000006477) CCP110 (ENSMODG00000006278) GDE1 (ENSMODG00000006250) TMC5 (ENSMODG00000006227) TMC7 (ENSMODG00000006207) COQ7 (ENSMODG00000006166) ITPRIPL2 (ENSMODG00000025107) SYT17 (ENSMODG00000006147) ENSMODG00000051307 ENSMODG00000040296 SMG1 (ENSMODG00000006102) ARL6IP1 (ENSMODG00000005944) RPS15A (ENSMODG00000005920) XYLT1 (ENSMODG00000005904) ENSMODG00000025119 ENSMODG00000044938 ##22 ENSMODG00000050357 ABCC6 (ENSMODG00000005815) ECPAS (ENSMODG00000005682) DNAJC25 (ENSMODG00000005635) GNG10 (ENSMODG00000005623) SHOC1 (ENSMODG00000005617) UGCG (ENSMODG00000005539) SUSD1 (ENSMODG00000005525) PTBP3 (ENSMODG00000005502) HSDL2 (ENSMODG00000005316) ENSMODG00000037172 KIAA1958 (ENSMODG00000004849) INIP (ENSMODG00000004831) SNX30 (ENSMODG00000004826) SLC46A2 (ENSMODG00000004815) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160761 ENSGT00940000164045 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922.a #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000166577 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A Tasmanian devil MODERN SPECIES 3 DLK2 (ENSSHAG00000014178) ENSSHAG00000020933 LRRC73 (ENSSHAG00000023876) #7 YIPF3 (ENSSHAG00000014415) #8 POLR1C (ENSSHAG00000014456) #9 XPO5 (ENSSHAG00000014472) #10 POLH (ENSSHAG00000014751) #11 GTPBP2 (ENSSHAG00000024911) #12 MAD2L1BP (ENSSHAG00000030158) #13 RSPH9 (ENSSHAG00000014967) #14 MRPS18A (ENSSHAG00000030116) #15 ENSSHAG00000015515 #16 MRPL14 (ENSSHAG00000001453) #17 TMEM63B (ENSSHAG00000017114) #18 SLC29A1 (ENSSHAG00000017372) #21 ENSSHAG00000017428 ##22 SLC35B2 (ENSSHAG00000023658) #23 TMEM151B (ENSSHAG00000024559) #25 NFKBIE (ENSSHAG00000021391) #24 AARS2 (ENSSHAG00000017514) #27 ENSSHAG00000030708 #28 CDC5L (ENSSHAG00000017642) #29 SUPT3H (ENSSHAG00000003305) #30 RUNX2 (ENSSHAG00000009950) #34 ENPP4 (ENSSHAG00000032374) #36 CLIC5 (ENSSHAG00000025348) #35 ENPP5 (ENSSHAG00000014884) #37 ENSSHAG00000014961 RCAN2 (ENSSHAG00000029688) ENSSHAG00000016942 TDRD6 (ENSSHAG00000016901) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000160761 ENSGT00940000164045 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b.e #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922.a #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A ENSGT00940000159049 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000160761 ENSGT00940000164045 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b.e #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922.a #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A ENSGT00940000159049 Common wonbat MODERN SPECIES 1061 ABCC10 (ENSVURG00010005277) DLK2 (ENSVURG00010005262) ENSVURG00010005241 LRRC73 (ENSVURG00010005229) #7 YIPF3 (ENSVURG00010005213) #8 POLR1C (ENSVURG00010005191) #9 XPO5 (ENSVURG00010005144) #10 POLH (ENSVURG00010005103) #11 GTPBP2 (ENSVURG00010005065) #12 MAD2L1BP (ENSVURG00010005048) #13 RSPH9 (ENSVURG00010005039) 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ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00500000045766 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00600000085213 #33 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00740000116630 ENSGT00940000158831 #36 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00500000045766 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00600000085213 #33 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00740000116630 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 2221 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 Common shrew DUPLICATION Common shrew MODERN SPECIES 7362 ENSSARG00000003905 ##22 SLC35B2 (ENSSARG00000003939) #23 Common shrew MODERN SPECIES 11335 ENSSARG00000003334 ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A.d #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a #22 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00500000045766 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00600000085213 #33 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00740000116630 ENSGT00940000158831 #36 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155426 ENSGT00390000008679 ENSGT00390000012559 ENSGT00390000013149 ENSGT01080000258056 ENSGT00940000157405 ENSGT00390000010991 ENSGT00390000006196 ENSGT00940000154860 ENSGT00940000157226 ENSGT00390000016821 ENSGT00940000162841 ENSGT00940000161101 ENSGT00940000156620 ENSGT00940000159662 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000158481 ENSGT00940000157667 ENSGT00390000017249 ENSGT00940000159837 ENSGT00940000160226 ENSGT00940000161262 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(ENSFCAG00000026308) CRY2 (ENSFCAG00000003188) MAPK8IP1 (ENSFCAG00000003189) FREY1 (ENSFCAG00000041581) PEX16 (ENSFCAG00000003190) LARGE2 (ENSFCAG00000021941) PHF21A (ENSFCAG00000027311) CREB3L1 (ENSFCAG00000018794) DGKZ (ENSFCAG00000013634) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Red fox MODERN SPECIES 7 LRRC73 (ENSVVUG00000028906) #7 YIPF3 (ENSVVUG00000028909) #8 POLR1C (ENSVVUG00000028922) #9 XPO5 (ENSVVUG00000028952) #10 POLH (ENSVVUG00000029086) #11 GTPBP2 (ENSVVUG00000029087) #12 MAD2L1BP (ENSVVUG00000029089) #13 RSPH9 (ENSVVUG00000029090) #14 MRPS18A (ENSVVUG00000029092) #15 VEGFA (ENSVVUG00000029100) #16 MRPL14 (ENSVVUG00000029108) #17 TMEM63B (ENSVVUG00000029109) #18 CAPN11 (ENSVVUG00000029116) #19 MYMX (ENSVVUG00000029121) #20 SLC29A1 (ENSVVUG00000029123) #21 ENSVVUG00000029141 ##22 SLC35B2 (ENSVVUG00000029223) #23 NFKBIE (ENSVVUG00000029224) #24 TMEM151B (ENSVVUG00000029226) #25 TCTE1 (ENSVVUG00000029227) #26 AARS2 (ENSVVUG00000029231) #27 SPATS1 (ENSVVUG00000029239) #28 ENSVVUG00000029240 CDC5L (ENSVVUG00000029242) #29 SUPT3H (ENSVVUG00000029245) #30 ENSVVUG00000029248 ENSVVUG00000029249 #33 RUNX2 (ENSVVUG00000029252) #34 CLIC5 (ENSVVUG00000029276) #35 ENPP4 (ENSVVUG00000029286) #36 ENPP5 (ENSVVUG00000029287) #37 Canis_lupus DUPLICATION Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00730000111042 ENSGT00910000144211.n.b.c ENSGT00940000157893 ENSGT00950000183087.B ENSGT00940000155549.b ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000159740 ENSGT00940000155935.h ENSGT00520000055634.a ENSGT00390000004040 ENSGT00940000157594 ENSGT00390000011748.j.b ENSGT00390000007776 ENSGT01100000263484.B.b.b ENSGT00530000063880.b ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b.g ##22 ENSGT00390000011922.f ENSGT00390000002661.b ENSGT00940000159194 ENSGT00940000158117 ENSGT00390000015984 ENSGT00940000155187.B ENSGT00530000063823.b.b ENSGT00940000158307 ENSGT01030000234527.A.a.a.a ENSGT00940000153269.b.b ENSGT00940000155236 ENSGT00390000005711 ENSGT00920000149145 ENSGT00390000018094 ENSGT00940000158485 Dingo MODERN SPECIES 88 ENSCAFG00020004080 ENSCAFG00020004048 ENSCAFG00020004032 CSMD3 (ENSCAFG00020003854) ENSCAFG00020003786 ENSCAFG00020003768 KCNV1 (ENSCAFG00020003748) ENSCAFG00020003744 SYBU (ENSCAFG00020003730) EBAG9 (ENSCAFG00020003724) PKHD1L1 (ENSCAFG00020003456) ENY2 (ENSCAFG00020003420) NUDCD1 (ENSCAFG00020003417) TRHR (ENSCAFG00020003402) TMEM74 (ENSCAFG00020003393) ENSCAFG00020003374 ##22 ENSCAFG00020003360 EIF3E (ENSCAFG00020003350) RSPO2 (ENSCAFG00020003341) ANGPT1 (ENSCAFG00020003297) ABRA (ENSCAFG00020003289) OXR1 (ENSCAFG00020003286) ZFPM2 (ENSCAFG00020003252) LRP12 (ENSCAFG00020003246) DPYS (ENSCAFG00020003238) DCSTAMP (ENSCAFG00020003225) RIMS2 (ENSCAFG00020003071) ENSCAFG00020003051 DCAF13 (ENSCAFG00020003044) SLC25A32 (ENSCAFG00020003015) CTHRC1 (ENSCAFG00020002983) Dog MODERN SPECIES 4 TRPS1 (ENSCAFG00845014104) ENSCAFG00845014042 CSMD3 (ENSCAFG00845013880) ENSCAFG00845013806 ENSCAFG00845013779 ENSCAFG00845013759 KCNV1 (ENSCAFG00845013731) ENSCAFG00845013714 SYBU (ENSCAFG00845013598) EBAG9 (ENSCAFG00845013428) PKHD1L1 (ENSCAFG00845011869) ENY2 (ENSCAFG00845011444) NUDCD1 (ENSCAFG00845011288) TRHR (ENSCAFG00845011196) TMEM74 (ENSCAFG00845011167) ENSCAFG00845011139 ##22 EMC2 (ENSCAFG00845011107) EIF3E (ENSCAFG00845011027) RSPO2 (ENSCAFG00845010981) ANGPT1 (ENSCAFG00845010910) SF3A3 (ENSCAFG00845010874) ABRA (ENSCAFG00845010850) OXR1 (ENSCAFG00845010507) ENSCAFG00845010384 ZFPM2 (ENSCAFG00845010270) LRP12 (ENSCAFG00845010152) DPYS (ENSCAFG00845010050) DCSTAMP (ENSCAFG00845010012) RIMS2 (ENSCAFG00845008955) ENSCAFG00845008711 DCAF13 (ENSCAFG00845008632) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b.h ##22 Dog MODERN SPECIES 144 CHM (ENSCAFG00845024883) DACH2 (ENSCAFG00845025244) ENSCAFG00845025538 ENSCAFG00845025670 KLHL4 (ENSCAFG00845025779) ENSCAFG00845025970 PABPC5 (ENSCAFG00845026000) ENSCAFG00845026042 FAM133A (ENSCAFG00845026207) ENSCAFG00845026229 ENSCAFG00845026288 ENSCAFG00845026333 ENSCAFG00845026405 ENSCAFG00845026782 ENSCAFG00845026879 ENSCAFG00845026948 ##22 ENSCAFG00845026974 ENSCAFG00845015511 ENSCAFG00845015550 ENSCAFG00845015610 ENSCAFG00845015773 PCDH19 (ENSCAFG00845015810) ENSCAFG00845015858 TNMD (ENSCAFG00845015896) TSPAN6 (ENSCAFG00845015955) SRPX2 (ENSCAFG00845016052) SYTL4 (ENSCAFG00845016183) ENSCAFG00845016316 CSTF2 (ENSCAFG00845016395) NOX1 (ENSCAFG00845016545) ENSCAFG00845016714 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 10 LRRC73 (ENSAMEG00000012262) #7 YIPF3 (ENSAMEG00000012224) #8 POLR1C (ENSAMEG00000012205) #9 XPO5 (ENSAMEG00000012197) #10 POLH (ENSAMEG00000012174) #11 GTPBP2 (ENSAMEG00000012148) #12 MAD2L1BP (ENSAMEG00000030881) #13 RSPH9 (ENSAMEG00000012125) #14 MRPS18A (ENSAMEG00000012117) #15 VEGFA (ENSAMEG00000027031) #16 MRPL14 (ENSAMEG00000012068) #17 TMEM63B (ENSAMEG00000012014) #18 CAPN11 (ENSAMEG00000011874) #19 MYMX (ENSAMEG00000019314) #20 SLC29A1 (ENSAMEG00000011849) #21 ENSAMEG00000011809 ##22 SLC35B2 (ENSAMEG00000023493) #23 NFKBIE (ENSAMEG00000011785) #24 TCTE1 (ENSAMEG00000011776) #26 AARS2 (ENSAMEG00000011742) #27 SPATS1 (ENSAMEG00000025375) #28 CDC5L (ENSAMEG00000011685) #29 SUPT3H (ENSAMEG00000011671) #30 RUNX2 (ENSAMEG00000009223) #34 CLIC5 (ENSAMEG00000005172) #35 ENPP4 (ENSAMEG00000005187) #36 ENPP5 (ENSAMEG00000005193) #37 RCAN2 (ENSAMEG00000030595) CYP39A1 (ENSAMEG00000001708) SLC25A27 (ENSAMEG00000001695) TDRD6 (ENSAMEG00000001687) Giant Panda MODERN SPECIES 18 B3GALT2 (ENSAMEG00000020281) GLRX2 (ENSAMEG00000015878) RO60 (ENSAMEG00000015881) UCHL5 (ENSAMEG00000015914) RGS2 (ENSAMEG00000030281) RGS13 (ENSAMEG00000015942) RGS1 (ENSAMEG00000029940) RGS21 (ENSAMEG00000015611) RGS18 (ENSAMEG00000015615) ENSAMEG00000017115 ENSAMEG00000015715 ENSAMEG00000028395 ESRRG (ENSAMEG00000001292) GPATCH2 (ENSAMEG00000000532) SPATA17 (ENSAMEG00000000550) ENSAMEG00000000583 ##22 TGFB2 (ENSAMEG00000010879) LYPLAL1 (ENSAMEG00000010866) ENSAMEG00000028876 EPRS1 (ENSAMEG00000009983) BPNT1 (ENSAMEG00000010036) IARS2 (ENSAMEG00000010055) RAB3GAP2 (ENSAMEG00000010098) MARK1 (ENSAMEG00000010174) C1orf115 (ENSAMEG00000027678) MTARC2 (ENSAMEG00000010246) MTARC1 (ENSAMEG00000029752) HLX (ENSAMEG00000028397) DUSP10 (ENSAMEG00000006928) HHIPL2 (ENSAMEG00000006909) TAF1A (ENSAMEG00000006886) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 American mink MODERN SPECIES 421 ENSNVIG00000024574 ##22 ENSNVIG00000024573 ENSNVIG00000024571 GRM7 (ENSNVIG00000024565) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 21 POLR1C (ENSRFEG00010005036) #9 YIPF3 (ENSRFEG00010005052) #8 XPO5 (ENSRFEG00010005070) #10 POLH (ENSRFEG00010005154) #11 GTPBP2 (ENSRFEG00010005213) #12 MAD2L1BP (ENSRFEG00010005237) #13 RSPH9 (ENSRFEG00010005257) #14 MRPS18A (ENSRFEG00010005273) #15 VEGFA (ENSRFEG00010005317) #16 ENSRFEG00010005409 MRPL14 (ENSRFEG00010005426) #17 TMEM63B (ENSRFEG00010005508) #18 CAPN11 (ENSRFEG00010005643) #19 MYMX (ENSRFEG00010005710) #20 SLC29A1 (ENSRFEG00010005739) #21 ENSRFEG00010005791 ##22 SLC35B2 (ENSRFEG00010005829) #23 NFKBIE (ENSRFEG00010005871) #24 TMEM151B (ENSRFEG00010005887) #25 TCTE1 (ENSRFEG00010005907) #26 AARS2 (ENSRFEG00010006015) #27 SPATS1 (ENSRFEG00010006160) #28 CDC5L (ENSRFEG00010006193) #29 SUPT3H (ENSRFEG00010006235) #30 RUNX2 (ENSRFEG00010006335) #34 CLIC5 (ENSRFEG00010006585) #35 ENPP4 (ENSRFEG00010006685) #36 ENPP5 (ENSRFEG00010006712) #37 RCAN2 (ENSRFEG00010006786) CYP39A1 (ENSRFEG00010006864) SLC25A27 (ENSRFEG00010006968) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 7 ENSRFEG00010011801 ZNF25 (ENSRFEG00010011763) ENSRFEG00010011685 ZNF248 (ENSRFEG00010011566) BMS1 (ENSRFEG00010011495) RET (ENSRFEG00010011349) CSGALNACT2 (ENSRFEG00010011283) RASGEF1A (ENSRFEG00010011163) ENSRFEG00010011052 HNRNPF (ENSRFEG00010011029) ZNF239 (ENSRFEG00010010939) ZNF32 (ENSRFEG00010010896) CXCL12 (ENSRFEG00010010755) ENSRFEG00010010625 ##22 TMEM72 (ENSRFEG00010010406) DEPP1 (ENSRFEG00010010371) RASSF4 (ENSRFEG00010021862) ZNF22 (ENSRFEG00010021856) ALOX5 (ENSRFEG00010021847) MARCHF8 (ENSRFEG00010021833) ENSRFEG00010021821 ZFAND4 (ENSRFEG00010021817) ENSRFEG00010021737 ENSRFEG00010021683 MSMB (ENSRFEG00010021675) NCOA4 (ENSRFEG00010021668) ENSRFEG00010021647 PARG (ENSRFEG00010021634) OGDHL (ENSRFEG00010021583) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A.d #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A ENSGT00940000160098 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Pig MODERN SPECIES 10 HOMER1 (ENSSSCG00000014113) JMY (ENSSSCG00000014112) BHMT (ENSSSCG00000014108) ENSSSCG00000053764 BHMT2 (ENSSSCG00000054426) DMGDH (ENSSSCG00000014110) ARSB (ENSSSCG00000038535) LHFPL2 (ENSSSCG00000028536) SCAMP1 (ENSSSCG00000034795) AP3B1 (ENSSSCG00000014101) ENSSSCG00000034241 TBCA (ENSSSCG00000014100) OTP (ENSSSCG00000014099) ENSSSCG00000014098 ENSSSCG00000051837 ENSSSCG00000014096 ##22 PDE8B (ENSSSCG00000014097) ENSSSCG00000050058 AGGF1 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AARS2 (ENSDLEG00000000444) #27 SPATS1 (ENSDLEG00000000518) #28 CDC5L (ENSDLEG00000000545) #29 ENSDLEG00000000570 SUPT3H (ENSDLEG00000000591) #30 RUNX2 (ENSDLEG00000000630) #34 CLIC5 (ENSDLEG00000000664) #35 ENPP4 (ENSDLEG00000000685) #36 ENPP5 (ENSDLEG00000000700) #37 RCAN2 (ENSDLEG00000000717) CYP39A1 (ENSDLEG00000000731) Narwhal MODERN SPECIES 310 LRRC73 (ENSMMNG00015010202) #7 YIPF3 (ENSMMNG00015010162) #8 POLR1C (ENSMMNG00015010142) #9 XPO5 (ENSMMNG00015010045) #10 POLH (ENSMMNG00015010012) #11 GTPBP2 (ENSMMNG00015009992) #12 MAD2L1BP (ENSMMNG00015009979) #13 RSPH9 (ENSMMNG00015009969) #14 MRPS18A (ENSMMNG00015009954) #15 VEGFA (ENSMMNG00015009915) #16 MRPL14 (ENSMMNG00015009865) #17 TMEM63B (ENSMMNG00015009841) #18 CAPN11 (ENSMMNG00015009805) #19 MYMX (ENSMMNG00015009791) #20 SLC29A1 (ENSMMNG00015009769) #21 ENSMMNG00015009748 ##22 SLC35B2 (ENSMMNG00015009735) #23 NFKBIE (ENSMMNG00015009718) #24 TCTE1 (ENSMMNG00015009711) #26 TMEM151B (ENSMMNG00015009694) #25 AARS (ENSMMNG00015018169) #27 SPATS1 (ENSMMNG00015018108) #28 CDC5L (ENSMMNG00015018065) #29 ENSMMNG00015018032 SUPT3H (ENSMMNG00015017962) #30 RUNX2 (ENSMMNG00015017775) #34 CLIC5 (ENSMMNG00015017682) #35 ENPP4 (ENSMMNG00015017642) #36 ENPP5 (ENSMMNG00015017627) #37 RCAN2 (ENSMMNG00015017593) CYP39A1 (ENSMMNG00015017512) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00600000085213 #33 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 3 LRRC73 (ENSOCUG00000005243) #7 YIPF3 (ENSOCUG00000005499) #8 POLR1C (ENSOCUG00000005504) #9 XPO5 (ENSOCUG00000005510) #10 POLH (ENSOCUG00000005525) #11 GTPBP2 (ENSOCUG00000005529) #12 MAD2L1BP (ENSOCUG00000005532) #13 RSPH9 (ENSOCUG00000005537) #14 MRPS18A (ENSOCUG00000005544) #15 VEGFA (ENSOCUG00000011610) #16 TMEM63B (ENSOCUG00000003464) #18 ENSOCUG00000015740 #17 CAPN11 (ENSOCUG00000017535) #19 MYMX (ENSOCUG00000034679) #20 SLC29A1 (ENSOCUG00000017891) #21 HSP90AB1 (ENSOCUG00000012842) ##22 SLC35B2 (ENSOCUG00000017893) #23 NFKBIE (ENSOCUG00000017894) #24 TMEM151B (ENSOCUG00000024837) #25 TCTE1 (ENSOCUG00000017899) #26 AARS2 (ENSOCUG00000021422) #27 ENSOCUG00000017227 #28 ENSOCUG00000038161 CDC5L (ENSOCUG00000017240) #29 ENSOCUG00000035183 SUPT3H (ENSOCUG00000014574) #30 ENSOCUG00000031467 #33 RUNX2 (ENSOCUG00000011739) #34 CLIC5 (ENSOCUG00000022531) #35 ENPP4 (ENSOCUG00000012928) #36 ENPP5 (ENSOCUG00000012939) #37 Rabbit MODERN SPECIES 9 PAPSS2 (ENSOCUG00000012078) ENSOCUG00000035355 SGMS1 (ENSOCUG00000010965) ENSOCUG00000017169 A1CF (ENSOCUG00000011587) ENSOCUG00000027463 PRKG1 (ENSOCUG00000011473) DKK1 (ENSOCUG00000011487) MBL2 (ENSOCUG00000012742) ENSOCUG00000027170 ENSOCUG00000023765 PCDH15 (ENSOCUG00000000268) ENSOCUG00000038084 ZWINT (ENSOCUG00000006806) ENSOCUG00000033494 ENSOCUG00000008290 ##22 ENSOCUG00000033571 IPMK (ENSOCUG00000006432) CISD1 (ENSOCUG00000002949) ENSOCUG00000036397 TFAM (ENSOCUG00000014405) BICC1 (ENSOCUG00000013696) PHYHIPL (ENSOCUG00000001539) FAM13C (ENSOCUG00000001543) SLC16A9 (ENSOCUG00000013648) ENSOCUG00000015313 MRLN (ENSOCUG00000032475) CCDC6 (ENSOCUG00000005508) ANK3 (ENSOCUG00000003521) CDK1 (ENSOCUG00000002858) RHOBTB1 (ENSOCUG00000011533) Rabbit MODERN SPECIES 13 PPM1F (ENSOCUG00000001026) TOP3B (ENSOCUG00000012288) ENSOCUG00000009596 ENSOCUG00000034647 ENSOCUG00000029701 ENSOCUG00000037857 MORN3 (ENSOCUG00000001918) ORAI1 (ENSOCUG00000001914) KDM2B (ENSOCUG00000005961) RNF34 (ENSOCUG00000005957) ANAPC5 (ENSOCUG00000002722) CAMKK2 (ENSOCUG00000025635) P2RX4 (ENSOCUG00000002220) IFT81 (ENSOCUG00000009802) P2RX7 (ENSOCUG00000008823) ENSOCUG00000009115 ##22 ATP2A2 (ENSOCUG00000015082) ANAPC7 (ENSOCUG00000014301) ARPC3 (ENSOCUG00000011908) GPN3 (ENSOCUG00000011913) FAM216A (ENSOCUG00000011921) VPS29 (ENSOCUG00000011924) ENSOCUG00000011929 PPTC7 (ENSOCUG00000011935) TCTN1 (ENSOCUG00000011938) HVCN1 (ENSOCUG00000011941) PPP1CC (ENSOCUG00000009275) CCDC63 (ENSOCUG00000022705) MYL2 (ENSOCUG00000025586) CUX2 (ENSOCUG00000021923) SH2B3 (ENSOCUG00000002851) Pika MODERN SPECIES 6663 ENSOPRG00000011312 ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 6 ENSSVLG00005018792 PTPRD (ENSSVLG00005016434) ENSSVLG00005016242 DMAC1 (ENSSVLG00005016213) ENSSVLG00005025401 KDM4C (ENSSVLG00005025382) ENSSVLG00005025367 ENSSVLG00005025356 GLDC (ENSSVLG00005025320) UHRF2 (ENSSVLG00005025301) TPD52L3 (ENSSVLG00005025288) ENSSVLG00005025282 ENSSVLG00005025276 IL33 (ENSSVLG00005025230) ENSSVLG00005025194 ENSSVLG00005025185 ##22 ENSSVLG00005025173 KIAA2026 (ENSSVLG00005025155) MLANA (ENSSVLG00005025137) ERMP1 (ENSSVLG00005025117) RIC1 (ENSSVLG00005025040) PDCD1LG2 (ENSSVLG00005024955) CD274 (ENSSVLG00005024930) PLGRKT (ENSSVLG00005024908) ENSSVLG00005024871 INSL6 (ENSSVLG00005024849) JAK2 (ENSSVLG00005024808) RCL1 (ENSSVLG00005024752) ENSSVLG00005024721 CDC37L1 (ENSSVLG00005024699) PLPP6 (ENSSVLG00005024689) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Arctic ground squirrel DUPLICATION Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 138 RSPH9 (ENSUPAG00010003487) #14 MRPS18A (ENSUPAG00010003493) #15 VEGFA (ENSUPAG00010003509) #16 ENSUPAG00010003659 MRPL14 (ENSUPAG00010003668) #17 TMEM63B (ENSUPAG00010003679) #18 CAPN11 (ENSUPAG00010003744) #19 MYMX (ENSUPAG00010003794) #20 SLC29A1 (ENSUPAG00010003804) #21 ENSUPAG00010004079 ##22 ENSUPAG00010004086 ##22 SLC35B2 (ENSUPAG00010004089) #23 NFKBIE (ENSUPAG00010004104) #24 TMEM151B (ENSUPAG00010004120) #25 ENSUPAG00010004124 #26 AARS2 (ENSUPAG00010004131) #27 SPATS1 (ENSUPAG00010004153) #28 CDC5L (ENSUPAG00010004167) #29 SUPT3H (ENSUPAG00010004183) #30 RUNX2 (ENSUPAG00010004197) #34 CLIC5 (ENSUPAG00010004493) #35 ENPP4 (ENSUPAG00010004511) #36 ENPP5 (ENSUPAG00010004521) #37 RCAN2 (ENSUPAG00010004530) CYP39A1 (ENSUPAG00010004555) SLC25A27 (ENSUPAG00010004665) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 138 RSPH9 (ENSUPAG00010003487) #14 MRPS18A (ENSUPAG00010003493) #15 VEGFA (ENSUPAG00010003509) #16 ENSUPAG00010003659 MRPL14 (ENSUPAG00010003668) #17 TMEM63B (ENSUPAG00010003679) #18 CAPN11 (ENSUPAG00010003744) #19 MYMX (ENSUPAG00010003794) #20 SLC29A1 (ENSUPAG00010003804) #21 ENSUPAG00010004079 ##22 ENSUPAG00010004086 ##22 SLC35B2 (ENSUPAG00010004089) #23 NFKBIE (ENSUPAG00010004104) #24 TMEM151B (ENSUPAG00010004120) #25 ENSUPAG00010004124 #26 AARS2 (ENSUPAG00010004131) #27 SPATS1 (ENSUPAG00010004153) #28 CDC5L (ENSUPAG00010004167) #29 SUPT3H (ENSUPAG00010004183) #30 RUNX2 (ENSUPAG00010004197) #34 CLIC5 (ENSUPAG00010004493) #35 ENPP4 (ENSUPAG00010004511) #36 ENPP5 (ENSUPAG00010004521) #37 RCAN2 (ENSUPAG00010004530) CYP39A1 (ENSUPAG00010004555) Alpin marmot MODERN SPECIES 20 RCAN2 (ENSMMMG00000024592) CYP39A1 (ENSMMMG00000024593) SLC25A27 (ENSMMMG00000024594) TDRD6 (ENSMMMG00000024595) PLA2G7 (ENSMMMG00000024596) ANKRD66 (ENSMMMG00000024598) ENSMMMG00000024599 ADGRF5 (ENSMMMG00000024600) ADGRF1 (ENSMMMG00000024601) TNFRSF21 (ENSMMMG00000024602) ENSMMMG00000024603 ENSMMMG00000024604 ADGRF4 (ENSMMMG00000024605) OPN5 (ENSMMMG00000024606) PTCHD4 (ENSMMMG00000024608) ENSMMMG00000024610 ##22 MMUT (ENSMMMG00000024611) ENSMMMG00000024612 GLYATL3 (ENSMMMG00000024613) ENSMMMG00000024614 ENSMMMG00000024615 RHAG (ENSMMMG00000024616) ENSMMMG00000024617 CRISP2 (ENSMMMG00000024618) CRISP3 (ENSMMMG00000024619) ENSMMMG00000024620 ENSMMMG00000024621 CRISP1 (ENSMMMG00000024622) DEFB114 (ENSMMMG00000024623) ENSMMMG00000024624 TFAP2B (ENSMMMG00000024628) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 13 ENSHGLG00000047166 ENSHGLG00000034628 PPP1R42 (ENSHGLG00000008475) ENSHGLG00000040951 COPS5 (ENSHGLG00000005737) CSPP1 (ENSHGLG00000015719) ENSHGLG00000033370 ARFGEF1 (ENSHGLG00000011784) ENSHGLG00000007434 ENSHGLG00000036421 ENSHGLG00000010754 ENSHGLG00000039642 ENSHGLG00000032157 ENSHGLG00000009795 ENSHGLG00000018481 ENSHGLG00000039218 ##22 ENSHGLG00000042606 SULF1 (ENSHGLG00000015701) SLCO5A1 (ENSHGLG00000007007) ENSHGLG00000047939 PRDM14 (ENSHGLG00000016615) NCOA2 (ENSHGLG00000016603) ENSHGLG00000035853 ENSHGLG00000021028 ENSHGLG00000047012 TRAM1 (ENSHGLG00000008235) ENSHGLG00000006207 XKR9 (ENSHGLG00000033679) ENSHGLG00000018393 EYA1 (ENSHGLG00000019347) ENSHGLG00000038455 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 1 ANXA13 (ENSHGLG00000011810) ENSHGLG00000007964 FER1L6 (ENSHGLG00000005537) ENSHGLG00000014989 TRMT12 (ENSHGLG00000047505) ENSHGLG00000006171 RNF139 (ENSHGLG00000005311) ENSHGLG00000018372 NDUFB9 (ENSHGLG00000014922) MTSS1 (ENSHGLG00000012623) ZNF572 (ENSHGLG00000011462) SQLE (ENSHGLG00000008484) WASHC5 (ENSHGLG00000013191) NSMCE2 (ENSHGLG00000019000) TRIB1 (ENSHGLG00000038354) ENSHGLG00000016266 ##22 ENSHGLG00000003612 LRATD2 (ENSHGLG00000016236) MYC (ENSHGLG00000006922) GSDMC (ENSHGLG00000044963) FAM49B (ENSHGLG00000050014) ASAP1 (ENSHGLG00000010778) ENSHGLG00000006351 ENSHGLG00000035028 ENSHGLG00000033561 ENSHGLG00000034097 ENSHGLG00000019086 ENSHGLG00000016070 HHLA1 (ENSHGLG00000014927) KCNQ3 (ENSHGLG00000011144) ENSHGLG00000046229 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 46 TJAP1 (ENSODEG00000016503) LRRC73 (ENSODEG00000015609) #7 YIPF3 (ENSODEG00000016177) #8 ENSODEG00000015831 #9 XPO5 (ENSODEG00000017078) #10 POLH (ENSODEG00000015994) #11 GTPBP2 (ENSODEG00000015979) #12 MAD2L1BP (ENSODEG00000015761) #13 RSPH9 (ENSODEG00000015426) #14 MRPS18A (ENSODEG00000015388) #15 ENSODEG00000016904 #16 MRPL14 (ENSODEG00000015718) #17 TMEM63B (ENSODEG00000015474) #18 CAPN11 (ENSODEG00000015728) #19 ENSODEG00000015863 ENSODEG00000015488 ##22 SLC35B2 (ENSODEG00000015458) #23 NFKBIE (ENSODEG00000015243) #24 TMEM151B (ENSODEG00000015150) #25 TCTE1 (ENSODEG00000015122) #26 AARS2 (ENSODEG00000015674) #27 SPATS1 (ENSODEG00000016233) #28 CDC5L (ENSODEG00000017235) #29 ENSODEG00000016394 SUPT3H (ENSODEG00000015634) #30 RUNX2 (ENSODEG00000015699) #34 CLIC5 (ENSODEG00000015858) #35 ENPP4 (ENSODEG00000015367) #36 ENPP5 (ENSODEG00000014866) #37 RCAN2 (ENSODEG00000015507) CYP39A1 (ENSODEG00000015974) Degu MODERN SPECIES 363 ENSODEG00000003788 ##22 ENSODEG00000003845 ENSODEG00000003858 ZNF606 (ENSODEG00000003901) ENSODEG00000004032 ENSODEG00000000867 ZNF8 (ENSODEG00000000881) RPS5 (ENSODEG00000000899) ENSODEG00000000911 ZNF446 (ENSODEG00000000926) SLC27A5 (ENSODEG00000000949) ENSODEG00000000978 TRIM28 (ENSODEG00000001020) CHMP2A (ENSODEG00000001073) UBE2M (ENSODEG00000001092) MZF1 (ENSODEG00000001110) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 103 Uqcrfs1 (ENSJJAG00000000535) ENSJJAG00000000322 ENSJJAG00000000074 ENSJJAG00000013602 ENSJJAG00000020950 ENSJJAG00000020634 ENSJJAG00000020121 Zic1 (ENSJJAG00000012204) Zic4 (ENSJJAG00000011859) ENSJJAG00000008994 ENSJJAG00000005647 ENSJJAG00000004591 ENSJJAG00000000877 ##22 Plscr5 (ENSJJAG00000000244) ENSJJAG00000020887 ENSJJAG00000020283 1700057G04Rik (ENSJJAG00000020060) ENSJJAG00000017330 ENSJJAG00000017891 Plscr4 (ENSJJAG00000017748) Plod2 (ENSJJAG00000013305) ENSJJAG00000010643 ENSJJAG00000010488 ENSJJAG00000010214 ENSJJAG00000009762 ENSJJAG00000009483 Slc9a9 (ENSJJAG00000022538) Chst2 (ENSJJAG00000021652) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Cricetidae DUPLICATION Cricetidae DUPLICATION Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b.cb.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b.cb.a ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 142 ENSMOCG00000007736 ENSMOCG00000000123 ##22 Fmr1 (ENSMOCG00000005190) ENSMOCG00000006594 Slitrk2 (ENSMOCG00000002229) 4930447F04Rik (ENSMOCG00000000394) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b.cb.a ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 229 Rrm2 (ENSCGRG00001007841) Hpcal1 (ENSCGRG00001023170) ENSCGRG00001015979 Nol10 (ENSCGRG00001009928) Atp6v1c2 (ENSCGRG00001021615) Pdia6 (ENSCGRG00001017472) Kcnf1 (ENSCGRG00001014274) 2410004P03Rik (ENSCGRG00001003389) Pqlc3 (ENSCGRG00001018327) Rock2 (ENSCGRG00001016725) E2f6 (ENSCGRG00001013963) Greb1 (ENSCGRG00001018970) Ntsr2 (ENSCGRG00001012327) Lpin1 (ENSCGRG00001000692) Trib2 (ENSCGRG00001024816) ENSCGRG00001013482 ##22 ENSCGRG00001013069 ENSCGRG00001002169 Nbas (ENSCGRG00001001919) Ddx1 (ENSCGRG00001013025) Mycn (ENSCGRG00001018130) Cyria (ENSCGRG00001014064) ENSCGRG00001012128 Vsnl1 (ENSCGRG00001017035) Smc6 (ENSCGRG00001024287) ENSCGRG00001019699 Msgn1 (ENSCGRG00001003369) Kcns3 (ENSCGRG00001004289) ENSCGRG00001006912 Rdh14 (ENSCGRG00001024177) Nt5c1b (ENSCGRG00001016775) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b.cb.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b.cb.b ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 360 Fancb (ENSMOCG00000009876) Glra2 (ENSMOCG00000014319) ENSMOCG00000002885 Gemin8 (ENSMOCG00000008859) Gpm6b (ENSMOCG00000021327) ENSMOCG00000010470 Ofd1 (ENSMOCG00000021375) Trappc2 (ENSMOCG00000000407) Rab9 (ENSMOCG00000015920) Tceanc (ENSMOCG00000010877) Egfl6 (ENSMOCG00000003880) Tmsb4x (ENSMOCG00000019156) Tlr8 (ENSMOCG00000012840) Tlr7 (ENSMOCG00000011354) Prps2 (ENSMOCG00000000951) ENSMOCG00000004642 ##22 Frmpd4 (ENSMOCG00000000587) ENSMOCG00000001883 Msl3 (ENSMOCG00000000342) ENSMOCG00000014859 Amelx (ENSMOCG00000018778) Arhgap6 (ENSMOCG00000012668) Hccs (ENSMOCG00000006338) Mid1 (ENSMOCG00000001681) Clcn4 (ENSMOCG00000016495) ENSMOCG00000017564 ENSMOCG00000012172 Zmat1 (ENSMOCG00000000169) Nxf2 (ENSMOCG00000016364) ENSMOCG00000019053 ENSMOCG00000014416 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b.db ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b.db ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 Slc25a43 (ENSPEMG00000015112) ENSPEMG00000019013 Akap17b (ENSPEMG00000011437) Pgrmc1 (ENSPEMG00000012525) ENSPEMG00000027055 Lonrf3 (ENSPEMG00000000247) Zcchc12 (ENSPEMG00000014570) Il13ra1 (ENSPEMG00000022107) Dock11 (ENSPEMG00000012116) ENSPEMG00000023191 Wdr44 (ENSPEMG00000022311) Klhl13 (ENSPEMG00000021674) ENSPEMG00000025048 Prr32 (ENSPEMG00000015245) Dcaf12l1 (ENSPEMG00000026236) ENSPEMG00000026691 ##22 Dcaf12l2 (ENSPEMG00000025693) Tex13c1 (ENSPEMG00000016262) Tenm1 (ENSPEMG00000006985) Sh2d1a (ENSPEMG00000010822) Stag2 (ENSPEMG00000004299) ENSPEMG00000027841 Xiap (ENSPEMG00000020438) Thoc2 (ENSPEMG00000007626) Gria3 (ENSPEMG00000020768) ENSPEMG00000025713 ENSPEMG00000026463 C1galt1c1 (ENSPEMG00000003943) Mcts1 (ENSPEMG00000014914) Cul4b (ENSPEMG00000008902) ENSPEMG00000030809 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Rat MODERN SPECIES 16 Xdh (ENSRNOG00000007081) Srd5a2 (ENSRNOG00000027042) Memo1 (ENSRNOG00000006340) Dpy30 (ENSRNOG00000027126) ENSRNOG00000066517 Spast (ENSRNOG00000027136) Slc30a6 (ENSRNOG00000005856) Nlrc4 (ENSRNOG00000005810) Yipf4 (ENSRNOG00000005610) Birc6 (ENSRNOG00000027191) Ttc27 (ENSRNOG00000042932) Ltbp1 (ENSRNOG00000033090) Rasgrp3 (ENSRNOG00000032703) Fam98a (ENSRNOG00000030328) ENSRNOG00000062904 ENSRNOG00000067489 ##22 Crim1 (ENSRNOG00000004208) Fez2 (ENSRNOG00000004577) Vit (ENSRNOG00000004706) Strn (ENSRNOG00000004806) Heatr5b (ENSRNOG00000025926) Gpatch11 (ENSRNOG00000025317) Eif2ak2 (ENSRNOG00000048315) Sult6b1 (ENSRNOG00000049335) ENSRNOG00000066755 Cebpzos (ENSRNOG00000064368) Cebpz (ENSRNOG00000005087) Ndufaf7 (ENSRNOG00000005279) Prkd3 (ENSRNOG00000005289) Qpct (ENSRNOG00000005705) LOC679690 (ENSRNOG00000062020) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 9 Yipf3 (MGP_PahariEiJ_G0020655) #8 Polr1c (MGP_PahariEiJ_G0020654) #9 Xpo5 (MGP_PahariEiJ_G0020653) #10 Polh (MGP_PahariEiJ_G0020652) #11 Gtpbp2 (MGP_PahariEiJ_G0020651) #12 Mad2l1bp (MGP_PahariEiJ_G0020650) #13 Rsph9 (MGP_PahariEiJ_G0020649) #14 Mrps18a (MGP_PahariEiJ_G0020648) #15 Vegfa (MGP_PahariEiJ_G0020647) #16 1600014C23Rik (MGP_PahariEiJ_G0020646) Mrpl14 (MGP_PahariEiJ_G0020645) #17 Tmem63b (MGP_PahariEiJ_G0020644) #18 Capn11 (MGP_PahariEiJ_G0020643) #19 MGP_PahariEiJ_G0020642 #20 Slc29a1 (MGP_PahariEiJ_G0020641) #21 MGP_PahariEiJ_G0020640 ##22 Slc35b2 (MGP_PahariEiJ_G0020639) #23 Nfkbie (MGP_PahariEiJ_G0020638) #24 Tmem151b (MGP_PahariEiJ_G0020637) #25 Tcte1 (MGP_PahariEiJ_G0020636) #26 Aars2 (MGP_PahariEiJ_G0020635) #27 MGP_PahariEiJ_G0020634 MGP_PahariEiJ_G0020633 #29 Supt3 (MGP_PahariEiJ_G0020632) #30 Runx2 (MGP_PahariEiJ_G0020631) #34 MGP_PahariEiJ_G0020630 #35 Enpp4 (MGP_PahariEiJ_G0020629) #36 Enpp5 (MGP_PahariEiJ_G0020628) #37 Rcan2 (MGP_PahariEiJ_G0020627) MGP_PahariEiJ_G0020626 Slc25a27 (MGP_PahariEiJ_G0020625) Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 69 ENSMSIG00000004525 ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 882 XPO5 (ENSANAG00000029648) #10 POLH (ENSANAG00000036689) #11 GTPBP2 (ENSANAG00000037352) #12 MAD2L1BP (ENSANAG00000031169) #13 RSPH9 (ENSANAG00000034070) #14 MRPS18A (ENSANAG00000030889) #15 ENSANAG00000019769 VEGFA (ENSANAG00000021825) #16 ENSANAG00000026877 MRPL14 (ENSANAG00000025052) #17 TMEM63B (ENSANAG00000025745) #18 ENSANAG00000022828 CAPN11 (ENSANAG00000021503) #19 MYMX (ENSANAG00000019285) #20 SLC29A1 (ENSANAG00000027374) #21 ENSANAG00000036841 ##22 SLC35B2 (ENSANAG00000030995) #23 NFKBIE (ENSANAG00000035565) #24 TCTE1 (ENSANAG00000037976) #26 TMEM151B (ENSANAG00000031535) #25 AARS2 (ENSANAG00000019918) #27 SPATS1 (ENSANAG00000025333) #28 CDC5L (ENSANAG00000028499) #29 ENSANAG00000038340 SUPT3H (ENSANAG00000035432) #30 RUNX2 (ENSANAG00000034292) #34 CLIC5 (ENSANAG00000028093) #35 ENPP4 (ENSANAG00000035380) #36 ENPP5 (ENSANAG00000016883) #37 RCAN2 (ENSANAG00000038243) CYP39A1 (ENSANAG00000037879) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 49 POLR1C (ENSSBOG00000025735) #9 XPO5 (ENSSBOG00000004763) #10 POLH (ENSSBOG00000021399) #11 GTPBP2 (ENSSBOG00000033640) #12 MAD2L1BP (ENSSBOG00000029545) #13 RSPH9 (ENSSBOG00000031703) #14 MRPS18A (ENSSBOG00000019943) #15 ENSSBOG00000030789 #16 ENSSBOG00000029474 MRPL14 (ENSSBOG00000028248) #17 TMEM63B (ENSSBOG00000035379) #18 CAPN11 (ENSSBOG00000026495) #19 ENSSBOG00000033471 MYMX (ENSSBOG00000019228) #20 SLC29A1 (ENSSBOG00000025930) #21 ENSSBOG00000023571 ##22 SLC35B2 (ENSSBOG00000028774) #23 NFKBIE (ENSSBOG00000005172) #24 TMEM151B (ENSSBOG00000020161) #25 TCTE1 (ENSSBOG00000030713) #26 AARS2 (ENSSBOG00000018590) #27 SPATS1 (ENSSBOG00000035876) #28 CDC5L (ENSSBOG00000031265) #29 ENSSBOG00000023875 SUPT3H (ENSSBOG00000035860) #30 ENSSBOG00000020940 RUNX2 (ENSSBOG00000032519) #34 CLIC5 (ENSSBOG00000025831) #35 ENPP4 (ENSSBOG00000033707) #36 ENPP5 (ENSSBOG00000032948) #37 RCAN2 (ENSSBOG00000024215) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000154200.A.a ENSGT00390000017163 ENSGT00940000157563 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b ENSGT01100000263536.C ENSGT00950000182999.b.b ENSGT00940000155972.B ENSGT00940000155995 ENSGT00940000153476.b.m.a ENSGT00940000155318 ENSGT00390000016292.g.b ENSGT00940000155502 ENSGT00940000160594 ENSGT00950000182897.B.a.b.b ENSGT01030000234621.F ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00900000143726 ENSGT00950000183071.a.a.a ENSGT00390000004600.b.b ENSGT00910000147734 ENSGT00940000159806 ENSGT00940000156862 ENSGT00940000155232 ENSGT00940000153931.b ENSGT00940000162795 ENSGT00910000147378 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000156856 ENSGT01050000244897.a.b.b.b ENSGT01050000244955.a.a Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000017163 ENSGT00940000157563 ENSGT00910000147518 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b ENSGT01100000263536.C ENSGT00950000182999.b.b ENSGT00940000155972.B ENSGT00940000155995 ENSGT00940000153476.b.m.a ENSGT00940000155318 ENSGT00390000016292.g.b ENSGT00940000155502 ENSGT00940000160594 ENSGT00950000182897.B.a.b.b ENSGT01030000234621.F ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00900000143726 ENSGT00950000183071.a.a.a ENSGT00390000004600.b.b ENSGT00910000147734 ENSGT00940000159806 ENSGT00940000156862 ENSGT00940000155232 ENSGT00940000153931.b ENSGT00940000162795 ENSGT00910000147378 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000156856 ENSGT01050000244897.a.b.b.b ENSGT01050000244955.a.a Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000017163 ENSGT00940000157563 ENSGT00910000147518 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b ENSGT01100000263536.C ENSGT00950000182999.b.b ENSGT00940000155972.B ENSGT00940000155995 ENSGT00940000153476.b.m.a ENSGT00940000155318 ENSGT00390000016292.g.b.a ENSGT00940000155502 ENSGT00940000160594 ENSGT00950000182897.B.a.b.b ENSGT01030000234621.F ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00900000143726 ENSGT00950000183071.a.a.a ENSGT00390000004600.b.b ENSGT00910000147734 ENSGT00940000159806 ENSGT00940000156862 ENSGT00940000155232 ENSGT00940000153931.b ENSGT00940000162795 ENSGT00910000147378 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000156856 ENSGT01050000244897.a.b.b.b ENSGT01050000244955.a.a Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000017163 ENSGT00940000157563 ENSGT00910000147518 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b ENSGT01100000263536.C ENSGT00950000182999.b.b ENSGT00940000155972.B ENSGT00940000155995 ENSGT00940000153476.b.m.a ENSGT00940000155318 ENSGT00390000016292.g.b.a ENSGT00940000155502 ENSGT00940000160594 ENSGT00950000182897.B.a.b.b ENSGT01030000234621.F ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00900000143726 ENSGT00950000183071.a.a.a ENSGT00950000182803.B.d.b.v.a ENSGT00390000004600.b.b ENSGT00910000147734 ENSGT00940000159806 ENSGT00940000156862 ENSGT00940000155232 ENSGT00940000153931.b ENSGT00940000162795 ENSGT00910000147378 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000156856 ENSGT01050000244897.a.b.b.b Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000157563 ENSGT00950000182999.b.b ENSGT00910000147518 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b ENSGT01100000263536.C ENSGT00900000140979.a.a.`b.a.o.b ENSGT00940000155972.B ENSGT00940000155995 ENSGT00940000153476.b.m.a ENSGT00940000155318 ENSGT00390000016292.g.b.a ENSGT00940000155502 ENSGT00940000160594 ENSGT00950000182897.B.a.b.b ENSGT01030000234621.F ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00900000143726 ENSGT00950000183071.a.a.a ENSGT00950000182803.B.d.b.v.a ENSGT00390000004600.b.b 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Drill MODERN SPECIES 1701 ENSMLEG00000007177 MBNL2 (ENSMLEG00000030404) ENSMLEG00000044418 OXGR1 (ENSMLEG00000006730) ENSMLEG00000030624 ##22 ENSMLEG00000002331 ENSMLEG00000026770 ENSMLEG00000032086 ENSMLEG00000034078 Macaca ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000017163 ENSGT00940000157563 ENSGT00910000147518 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b ENSGT01100000263536.C ENSGT00950000182999.b.b ENSGT00940000155972.B ENSGT00940000155995 ENSGT00940000153476.b.m.a ENSGT00940000155318 ENSGT00390000016292.g.b.a ENSGT00940000155502 ENSGT00940000160594 ENSGT00950000182897.B.a.b.b ENSGT01030000234621.F ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00900000143726 ENSGT00950000183071.a.a.a ENSGT00950000182803.B.d.b.v.a ENSGT00390000004600.b.b ENSGT00910000147734 ENSGT00940000159806 ENSGT00940000156862 ENSGT00940000155232 ENSGT00940000153931.b ENSGT00940000162795 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000156856 ENSGT01050000244897.a.b.b.b ENSGT01050000244955.a.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 100 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ENSGT00940000153476.b.m.a ENSGT00940000155318 ENSGT00390000016292.g.b ENSGT00940000155502 ENSGT00940000160594 ENSGT00950000182897.B.a.b.b ENSGT01030000234621.F ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00900000143726 ENSGT00950000183071.a.a.a ENSGT00390000004600.b.b ENSGT00910000147734 ENSGT00940000159806 ENSGT00940000156862 ENSGT00940000155232 ENSGT00940000153931.b ENSGT00940000162795 ENSGT00910000147378 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000156856 ENSGT01050000244897.a.b.b.b ENSGT01050000244955.a.a Hominidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000154200.A.a ENSGT00390000017163 ENSGT00940000157563 ENSGT00950000182999.b.b ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b ENSGT01100000263536.C ENSGT00940000155972.B ENSGT00940000155995 ENSGT00940000153476.b.m.a ENSGT00940000155318 ENSGT00390000016292.g.b ENSGT00940000155502 ENSGT00940000160594 ENSGT00950000182897.B.a.b.b ENSGT01030000234621.F ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00900000143726 ENSGT00950000183071.a.a.a ENSGT00390000004600.b.b ENSGT00940000159806 ENSGT00940000156862 ENSGT00940000155232 ENSGT00940000153931.b ENSGT00940000162795 ENSGT00910000147378 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000156856 ENSGT01050000244897.a.b.b.b ENSGT01050000244955.a.a ENSGT00940000158453.a Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000154200.A.a ENSGT00390000017163 ENSGT00940000157563 ENSGT00950000182999.b.b ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b ENSGT01100000263536.C ENSGT00940000155972.B ENSGT00940000155995 ENSGT00940000153476.b.m.a ENSGT00940000155318 ENSGT00390000016292.g.b ENSGT00940000155502.g ENSGT00940000160594 ENSGT00950000182897.B.a.b.b ENSGT01030000234621.F ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00900000143726 ENSGT00950000183071.a.a.a ENSGT00390000004600.b.b ENSGT00940000159806 ENSGT00940000156862 ENSGT00940000155232 ENSGT00940000153931.b ENSGT00940000162795 ENSGT00910000147378 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000156856 ENSGT01050000244897.a.b.b.b ENSGT01050000244955.a.a ENSGT00390000016209.d Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154200.A.a ENSGT00390000017163 ENSGT00940000157563 ENSGT00950000182999.b.b ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b ENSGT01100000263536.C ENSGT00940000155972.B ENSGT00940000155995 ENSGT00940000153476.b.m.a ENSGT00940000155318 ENSGT00390000016292.g.b ENSGT00940000155502.g ENSGT00940000160594 ENSGT00950000182897.B.a.b.b ENSGT01030000234621.F ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00900000143726 ENSGT00950000183071.a.a.a ENSGT00390000004600.b.b ENSGT00940000159806 ENSGT00940000156862 ENSGT00940000155232 ENSGT00940000153931.b ENSGT00940000162795 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000156856 ENSGT01050000244897.a.b.b.b ENSGT01050000244955.a.a ENSGT00390000016209.d ENSGT00940000155099.b Pan ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000017163 ENSGT00940000157563 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b ENSGT01100000263536.C ENSGT00950000182999.b.b ENSGT00910000147984 ENSGT00940000155972.B ENSGT00940000155995 ENSGT00940000153476.b.m.a ENSGT00940000155318 ENSGT00390000016292.g.b ENSGT00940000155502.g ENSGT00940000160594 ENSGT00950000182897.B.a.b.b ENSGT01030000234621.F ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00900000143726 ENSGT00950000183071.a.a.a ENSGT00390000004600.b.b ENSGT00940000159806 ENSGT00940000156862 ENSGT00940000155232 ENSGT00940000153931.b ENSGT00910000147378 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000156856 ENSGT01050000244897.a.b.b.b ENSGT01050000244955.a.a ENSGT00390000016209.d ENSGT00940000155099.b Chimpanzee MODERN SPECIES 4 CLYBL (ENSPTRG00000005998) TM9SF2 (ENSPTRG00000005997) GPR183 (ENSPTRG00000005996) GPR18 (ENSPTRG00000005995) UBAC2 (ENSPTRG00000005994) ENSPTRG00000039913 DOCK9 (ENSPTRG00000005991) SLC15A1 (ENSPTRG00000005990) STK24 (ENSPTRG00000005988) FARP1 (ENSPTRG00000005985) RNF113B (ENSPTRG00000005987) IPO5 (ENSPTRG00000005984) RAP2A (ENSPTRG00000005983) MBNL2 (ENSPTRG00000005982) OXGR1 (ENSPTRG00000044436) ENSPTRG00000050891 ##22 ENSPTRG00000045000 HS6ST3 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4 ZIC5 (ENSPPYG00000036876) CLYBL (ENSPPYG00000005469) TM9SF2 (ENSPPYG00000005468) GPR183 (ENSPPYG00000005467) GPR18 (ENSPPYG00000005466) UBAC2 (ENSPPYG00000005465) DOCK9 (ENSPPYG00000005463) SLC15A1 (ENSPPYG00000005462) STK24 (ENSPPYG00000005461) RNF113B (ENSPPYG00000005460) FARP1 (ENSPPYG00000005459) IPO5 (ENSPPYG00000005458) RAP2A (ENSPPYG00000031802) MBNL2 (ENSPPYG00000005456) OXGR1 (ENSPPYG00000005455) ENSPPYG00000005454 ##22 HS6ST3 (ENSPPYG00000032530) UGGT2 (ENSPPYG00000005452) DNAJC3 (ENSPPYG00000005451) DZIP1 (ENSPPYG00000005450) CLDN10 (ENSPPYG00000005449) ABCC4 (ENSPPYG00000005448) SOX21 (ENSPPYG00000005446) GPR180 (ENSPPYG00000005445) TGDS (ENSPPYG00000005444) DCT (ENSPPYG00000005443) GPC6 (ENSPPYG00000005442) GPC5 (ENSPPYG00000005441) SLITRK5 (ENSPPYG00000005437) SLITRK6 (ENSPPYG00000005436) SLITRK1 (ENSPPYG00000005434) Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 7 LRRC73 (ENSNLEG00000004080) #7 ENSNLEG00000004074 #8 POLR1C (ENSNLEG00000004035) #9 XPO5 (ENSNLEG00000003966) #10 POLH (ENSNLEG00000003958) #11 GTPBP2 (ENSNLEG00000003909) #12 MAD2L1BP (ENSNLEG00000033665) #13 ENSNLEG00000003901 #14 MRPS18A (ENSNLEG00000003865) #15 VEGFA (ENSNLEG00000003829) #16 ENSNLEG00000003824 TMEM63B (ENSNLEG00000003801) #18 ENSNLEG00000003797 #19 MYMX (ENSNLEG00000019018) #20 SLC29A1 (ENSNLEG00000003716) #21 ENSNLEG00000029372 ##22 SLC35B2 (ENSNLEG00000003703) #23 ENSNLEG00000003672 #24 TMEM151B (ENSNLEG00000003670) #25 TCTE1 (ENSNLEG00000003668) #26 AARS2 (ENSNLEG00000026583) #27 SPATS1 (ENSNLEG00000003651) #28 CDC5L (ENSNLEG00000003627) #29 ENSNLEG00000019017 SUPT3H (ENSNLEG00000032331) #30 ENSNLEG00000003611 #34 ENSNLEG00000003594 #35 ENPP4 (ENSNLEG00000003581) #36 STK39 (ENSNLEG00000003560) ENSNLEG00000032686 B3GALT1 (ENSNLEG00000019016) Gibbon MODERN SPECIES 20 TM9SF2 (ENSNLEG00000007789) ENSNLEG00000007988 GPR18 (ENSNLEG00000007985) ENSNLEG00000035777 UBAC2 (ENSNLEG00000007978) DOCK9 (ENSNLEG00000007865) SLC15A1 (ENSNLEG00000007860) STK24 (ENSNLEG00000007854) FARP1 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(ENSOGAG00000024589) #17 TMEM63B (ENSOGAG00000001281) #18 CAPN11 (ENSOGAG00000012715) #19 SLC29A1 (ENSOGAG00000011955) #21 ENSOGAG00000011961 ##22 SLC35B2 (ENSOGAG00000029873) #23 NFKBIE (ENSOGAG00000028890) #24 TMEM151B (ENSOGAG00000032467) #25 TCTE1 (ENSOGAG00000034227) #26 AARS2 (ENSOGAG00000008197) #27 SPATS1 (ENSOGAG00000008206) #28 CDC5L (ENSOGAG00000008211) #29 SUPT3H (ENSOGAG00000003895) #30 RUNX2 (ENSOGAG00000003900) #34 CLIC5 (ENSOGAG00000014373) #35 ENPP4 (ENSOGAG00000014378) #36 ENPP5 (ENSOGAG00000014380) #37 RCAN2 (ENSOGAG00000024331) CYP39A1 (ENSOGAG00000000401) SLC25A27 (ENSOGAG00000000402) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Mouse lemur MODERN SPECIES 28 LRRC73 (ENSMICG00000005015) #7 YIPF3 (ENSMICG00000005021) #8 POLR1C (ENSMICG00000005027) #9 XPO5 (ENSMICG00000005032) #10 POLH (ENSMICG00000005044) #11 GTPBP2 (ENSMICG00000005049) #12 MAD2L1BP (ENSMICG00000005055) #13 ENSMICG00000036804 RSPH9 (ENSMICG00000005058) #14 MRPS18A (ENSMICG00000005062) #15 VEGFA (ENSMICG00000005068) #16 MRPL14 (ENSMICG00000013022) #17 TMEM63B (ENSMICG00000013024) #18 CAPN11 (ENSMICG00000013043) #19 SLC29A1 (ENSMICG00000038074) #21 ENSMICG00000013394 ##22 SLC35B2 (ENSMICG00000027103) #23 NFKBIE (ENSMICG00000013421) #24 TCTE1 (ENSMICG00000013443) #26 TMEM151B (ENSMICG00000033230) #25 AARS2 (ENSMICG00000013453) #27 ENSMICG00000042468 SPATS1 (ENSMICG00000043772) #28 CDC5L (ENSMICG00000006933) #29 SUPT3H (ENSMICG00000012239) #30 RUNX2 (ENSMICG00000012251) #34 CLIC5 (ENSMICG00000034568) #35 ENPP4 (ENSMICG00000031250) #36 ENPP5 (ENSMICG00000017751) #37 RCAN2 (ENSMICG00000030471) TDRD6 (ENSMICG00000030777) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 471 CHCHD3 (ENSPCOG00000019179) ENSPCOG00000020008 ENSPCOG00000019479 ENSPCOG00000016376 ##22 LRGUK (ENSPCOG00000022323) SLC35B4 (ENSPCOG00000015654) AKR1B1 (ENSPCOG00000022399) ENSPCOG00000009761 ENSPCOG00000018599 BPGM (ENSPCOG00000013140) CALD1 (ENSPCOG00000018522) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Sloth MODERN SPECIES 188 ENSCHOG00000002871 ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 11182 ENSETEG00000008004 ##22 Tenrec MODERN SPECIES 216 ENSETEG00000014886 ##22 SLC35B2 (ENSETEG00000014892) #23 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000002210.c.a ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992.c ENSGT00940000161009 ENSGT00390000004313 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000002210.c.a ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992.c ENSGT00940000161009 ENSGT00390000004313 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000002210.c.a ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992.c ENSGT00940000161009 ENSGT00390000004313 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 17 POLR1C (ENSGEVG00005013418) #9 XPO5 (ENSGEVG00005013480) #10 POLH (ENSGEVG00005013584) #11 ENSGEVG00005013611 GTPBP2 (ENSGEVG00005013624) #12 MAD2L1BP (ENSGEVG00005013653) #13 ENSGEVG00005013690 RSPH9 (ENSGEVG00005013714) #14 MRPS18A (ENSGEVG00005013782) #15 VEGFA (ENSGEVG00005013826) #16 MRPL14 (ENSGEVG00005013942) #17 TMEM63B (ENSGEVG00005013984) #18 CAPN11 (ENSGEVG00005014087) #19 SLC29A1 (ENSGEVG00005014138) #21 ENSGEVG00005014173 ENSGEVG00005014206 ##22 SLC35B2 (ENSGEVG00005008272) #23 NFKBIE (ENSGEVG00005008291) #24 TMEM151B (ENSGEVG00005008355) #25 ENSGEVG00005008368 #26 AARS2 (ENSGEVG00005008393) #27 RNF8 (ENSGEVG00005008442) CMTR1 (ENSGEVG00005008520) CCDC167 (ENSGEVG00005008606) MDGA1 (ENSGEVG00005008636) ZFAND3 (ENSGEVG00005008696) BTBD9 (ENSGEVG00005008712) GLO1 (ENSGEVG00005008732) DNAH8 (ENSGEVG00005008974) ENSGEVG00005011273 GLP1R (ENSGEVG00005011309) Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2777 ENSCABG00000022008 ##22 SLC35B2 (ENSCABG00000022007) #23 NFKBIE (ENSCABG00000022006) #24 TMEM151B (ENSCABG00000022005) #25 ENSCABG00000022004 #26 AARS2 (ENSCABG00000021920) #27 ENSCABG00000021892 CMTR1 (ENSCABG00000021891) CCDC167 (ENSCABG00000021890) MDGA1 (ENSCABG00000021886) ZFAND3 (ENSCABG00000021884) ENSCABG00000021883 Emydidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000002210.c.a ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00940000170208 ENSGT00950000182841.b.b.a.d ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992.c ENSGT00940000161009 ENSGT00390000004313 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 31 YIPF3 (ENSTMTG00000002751) #8 POLR1C (ENSTMTG00000002745) #9 XPO5 (ENSTMTG00000002578) #10 POLH (ENSTMTG00000002520) #11 GTPBP2 (ENSTMTG00000002512) #12 MAD2L1BP (ENSTMTG00000002503) #13 ENSTMTG00000002495 RSPH9 (ENSTMTG00000002489) #14 MRPS18A (ENSTMTG00000002483) #15 VEGFA (ENSTMTG00000002476) #16 MRPL14 (ENSTMTG00000002471) #17 TMEM63B (ENSTMTG00000002440) #18 CAPN11 (ENSTMTG00000002428) #19 ENSTMTG00000002425 SLC29A1 (ENSTMTG00000002421) #21 ENSTMTG00000002413 ##22 SLC35B2 (ENSTMTG00000002409) #23 NFKBIE (ENSTMTG00000002403) #24 TMEM151B (ENSTMTG00000002396) #25 ENSTMTG00000002394 #26 AARS2 (ENSTMTG00000001781) #27 RNF8 (ENSTMTG00000001686) CMTR1 (ENSTMTG00000001267) CCDC167 (ENSTMTG00000001171) MDGA1 (ENSTMTG00000001143) ZFAND3 (ENSTMTG00000001106) BTBD9 (ENSTMTG00000001089) GLO1 (ENSTMTG00000001075) DNAH8 (ENSTMTG00000000515) GLP1R (ENSTMTG00000000179) SAYSD1 (ENSTMTG00000000149) painted turtle MODERN SPECIES 12 POLR1C (ENSCPBG00000025203) #9 XPO5 (ENSCPBG00000025210) #10 POLH (ENSCPBG00000025219) #11 GTPBP2 (ENSCPBG00000025223) #12 MAD2L1BP (ENSCPBG00000025229) #13 ENSCPBG00000025231 RSPH9 (ENSCPBG00000025233) #14 MRPS18A (ENSCPBG00000025243) #15 VEGFA (ENSCPBG00000025256) #16 MRPL14 (ENSCPBG00000025263) #17 TMEM63B (ENSCPBG00000025267) #18 CAPN11 (ENSCPBG00000025283) #19 ENSCPBG00000025291 ENSCPBG00000025302 SLC29A1 (ENSCPBG00000025308) #21 ENSCPBG00000025313 ##22 SLC35B2 (ENSCPBG00000025319) #23 NFKBIE (ENSCPBG00000025322) #24 TMEM151B (ENSCPBG00000025324) #25 TCTE1 (ENSCPBG00000025325) #26 AARS2 (ENSCPBG00000025329) #27 RNF8 (ENSCPBG00000025331) CMTR1 (ENSCPBG00000025335) CCDC167 (ENSCPBG00000025336) MDGA1 (ENSCPBG00000025341) ENSCPBG00000025344 ENSCPBG00000025346 ZFAND3 (ENSCPBG00000025349) BTBD9 (ENSCPBG00000025356) ENSCPBG00000025358 GLO1 (ENSCPBG00000025360) Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 60 LRRC73 (ENSCPRG00005012658) #7 YIPF3 (ENSCPRG00005012654) #8 POLR1C (ENSCPRG00005012578) #9 XPO5 (ENSCPRG00005012025) #10 POLH (ENSCPRG00005011913) #11 GTPBP2 (ENSCPRG00005011854) #12 MAD2L1BP (ENSCPRG00005011837) #13 ENSCPRG00005011829 RSPH9 (ENSCPRG00005011824) #14 MRPS18A (ENSCPRG00005011796) #15 VEGFA (ENSCPRG00005011788) #16 MRPL14 (ENSCPRG00005011733) #17 TMEM63B (ENSCPRG00005011287) #18 CAPN11 (ENSCPRG00005010843) #19 SLC29A1 (ENSCPRG00005010797) #21 ENSCPRG00005010794 ##22 SLC35B2 (ENSCPRG00005010751) #23 NFKBIE (ENSCPRG00005010740) #24 TMEM151B (ENSCPRG00005010737) #25 ENSCPRG00005010733 #26 ENSCPRG00005010731 #26 AARS2 (ENSCPRG00005010614) #27 RNF8 (ENSCPRG00005010593) CMTR1 (ENSCPRG00005010330) CCDC167 (ENSCPRG00005010285) MDGA1 (ENSCPRG00005010199) ZFAND3 (ENSCPRG00005010175) BTBD9 (ENSCPRG00005010169) GLO1 (ENSCPRG00005010152) ENSCPRG00005010150 DNAH8 (ENSCPRG00005010032) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 tuatara MODERN SPECIES 565 MRPL14 (ENSSPUG00000006479) #17 TMEM63B (ENSSPUG00000006598) #18 CAPN11 (ENSSPUG00000007252) #19 ENSSPUG00000007311 #21 ENSSPUG00000007461 ##22 SLC35B2 (ENSSPUG00000007489) #23 NFKBIE (ENSSPUG00000007504) #24 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b ##22 Lizard MODERN SPECIES 3 ENSACAG00000044431 SDC4 (ENSACAG00000012456) ENSACAG00000042017 ENSACAG00000027208 ENSACAG00000027958 ENSACAG00000013632 ENSACAG00000042879 ENSACAG00000036155 ENSACAG00000014094 ENSACAG00000041144 ENSACAG00000014095 ENSACAG00000041645 ENSACAG00000042744 ACTR5 (ENSACAG00000014155) PPP1R16B (ENSACAG00000014183) ENSACAG00000014264 ##22 FAM83D (ENSACAG00000038167) DHX35 (ENSACAG00000014298) ENSACAG00000045290 ENSACAG00000022716 ENSACAG00000000160 PHTF1 (ENSACAG00000000153) RSBN1 (ENSACAG00000000150) PTPN22 (ENSACAG00000000141) ENSACAG00000044404 ENSACAG00000014335 ENSACAG00000028253 ENSACAG00000009750 ENSACAG00000009733 ENSACAG00000042738 ENSACAG00000009716 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000175262 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000002210.c.a ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992 ENSGT00940000161009 ENSGT00390000004313 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000002210.c.a ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992 ENSGT00940000161009 ENSGT00390000004313 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000002210.c.a ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00530000069620 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992 ENSGT00940000161009 ENSGT00390000004313 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000002210.c.a ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 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#21 ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992 ENSGT00940000161009 ENSGT00390000004313 Flycatcher MODERN SPECIES 21 HNRNPU (ENSFALG00000011528) DESI2 (ENSFALG00000011507) ADSS2 (ENSFALG00000011484) ZBTB18 (ENSFALG00000011473) AKT3 (ENSFALG00000011439) ENSFALG00000011420 CEP170 (ENSFALG00000011398) PLD5 (ENSFALG00000011379) RSPH9 (ENSFALG00000025305) #14 MRPS18A (ENSFALG00000011356) #15 VEGFA (ENSFALG00000027112) #16 MRPL14 (ENSFALG00000011324) #17 TMEM63B (ENSFALG00000011313) #18 CAPN11 (ENSFALG00000011310) #19 SLC29A1 (ENSFALG00000011304) #21 HSP90AB1 (ENSFALG00000011300) ##22 SLC35B2 (ENSFALG00000023207) #23 NFKBIE (ENSFALG00000011284) #24 TMEM151B (ENSFALG00000011278) #25 TCTE1 (ENSFALG00000011264) #26 AARS2 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ENSGT00940000161009 ENSGT00390000004313 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016158 ENSGT00730000111005 ENSGT00390000015553.a.a.b ENSGT00940000155092.b ENSGT00940000157060 ENSGT00940000164292 ENSGT00940000155103.a.b ENSGT00950000183059.b.a.b ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992 ENSGT00940000161009 ENSGT00390000004313 Common canary MODERN SPECIES 1 COX20 (ENSSCAG00000013270) DESI2 (ENSSCAG00000013277) ADSS2 (ENSSCAG00000013319) ZBTB18 (ENSSCAG00000013375) AKT3 (ENSSCAG00000013390) ENSSCAG00000013409 CEP170 (ENSSCAG00000013445) PLD5 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RNF8 (ENSACCG00020011117) CMTR1 (ENSACCG00020011104) CCDC167 (ENSACCG00020011089) MDGA1 (ENSACCG00020011076) ZFAND3 (ENSACCG00020011055) BTBD9 (ENSACCG00020011038) GLO1 (ENSACCG00020011024) DNAH8 (ENSACCG00020010954) GLP1R (ENSACCG00020010841) KCNK5 (ENSACCG00020010781) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000175262 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000002210.c.a ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992 ENSGT00940000161009 ENSGT00390000004313 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000175262 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000002210.c.a ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992 ENSGT00940000161009 ENSGT00940000156775 Pink-footed goose MODERN SPECIES 64 YIPF3 (ENSABRG00000019216) #8 POLR1C (ENSABRG00000019257) #9 XPO5 (ENSABRG00000019302) #10 POLH (ENSABRG00000019452) #11 GTPBP2 (ENSABRG00000019486) #12 MAD2L1BP (ENSABRG00000019569) #13 ENSABRG00000019574 RSPH9 (ENSABRG00000019585) #14 MRPS18A (ENSABRG00000019591) #15 VEGFA (ENSABRG00000019601) #16 MRPL14 (ENSABRG00000019610) #17 TMEM63B (ENSABRG00000019612) #18 CAPN11 (ENSABRG00000019619) #19 SLC35B2 (ENSABRG00000019639) #23 SLC29A1 (ENSABRG00000019642) #21 HSP90AB1 (ENSABRG00000019643) ##22 NFKBIE (ENSABRG00000019651) #24 TMEM151B (ENSABRG00000019652) #25 TCTE1 (ENSABRG00000019654) #26 AARS2 (ENSABRG00000019656) #27 RNF8 (ENSABRG00000019659) CMTR1 (ENSABRG00000019660) CCDC167 (ENSABRG00000019661) MDGA1 (ENSABRG00000019666) ZFAND3 (ENSABRG00000019686) BTBD9 (ENSABRG00000019690) GLO1 (ENSABRG00000019695) DNAH8 (ENSABRG00000019752) GLP1R (ENSABRG00000019903) KCNK5 (ENSABRG00000019910) KCNK17 (ENSABRG00000019916) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003256 #7 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000002210.c.a ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084.a #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992.b ENSGT00940000161009 ENSGT00390000004313 Japanese quail MODERN SPECIES 21 LRRC73 (ENSCJPG00005011357) #7 YIPF3 (ENSCJPG00005011353) #8 POLR1C (ENSCJPG00005011351) #9 XPO5 (ENSCJPG00005011348) #10 POLH (ENSCJPG00005011345) #11 GTPBP2 (ENSCJPG00005011329) #12 MAD2L1BP (ENSCJPG00005011328) #13 ENSCJPG00005011327 RSPH9 (ENSCJPG00005011325) #14 MRPS18A (ENSCJPG00005011323) #15 VEGFA (ENSCJPG00005011306) #16 MRPL14 (ENSCJPG00005011305) #17 TMEM63B (ENSCJPG00005010350) #18 CAPN11 (ENSCJPG00005010310) #19 SLC29A1 (ENSCJPG00005010306) #21 HSP90AB1 (ENSCJPG00005010305) ##22 SLC35B2 (ENSCJPG00005010304) #23 NFKBIE (ENSCJPG00005010303) #24 TMEM151B (ENSCJPG00005010302) #25 TCTE1 (ENSCJPG00005010301) #26 AARS2 (ENSCJPG00005010300) #27 RNF8 (ENSCJPG00005010299) CMTR1 (ENSCJPG00005010298) MDGA1 (ENSCJPG00005010297) ZFAND3 (ENSCJPG00005010290) BTBD9 (ENSCJPG00005010289) GLO1 (ENSCJPG00005010288) DNAH8 (ENSCJPG00005010208) GLP1R (ENSCJPG00005010207) SAYSD1 (ENSCJPG00005010206) KCNK5 (ENSCJPG00005010203) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153766.A #8 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000002210.c.a ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084.a #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00940000170208 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157172 ENSGT00390000010210 ENSGT00940000159201 ENSGT00390000014679 ENSGT00940000158298 ENSGT00390000009312 ENSGT00940000158992.b ENSGT00940000161009 ENSGT00390000004313 Turkey MODERN SPECIES 11 ENSMGAG00000022899 ENSMGAG00000021198 ENSMGAG00000010691 ENSMGAG00000018769 ENSMGAG00000010700 ENSMGAG00000010712 MDGA1 (ENSMGAG00000010714) ENSMGAG00000010739 ENSMGAG00000021709 ENSMGAG00000010761 TMEM151B (ENSMGAG00000015826) #25 ENSMGAG00000010796 #26 AARS2 (ENSMGAG00000010762) #27 NFKBIE (ENSMGAG00000010800) #24 SLC29A1 (ENSMGAG00000010815) #21 ENSMGAG00000010808 ##22 SLC35B2 (ENSMGAG00000010805) #23 ENSMGAG00000010826 #19 ENSMGAG00000021459 #18 ENSMGAG00000010869 #18 ENSMGAG00000010889 #17 VEGFA (ENSMGAG00000010893) #16 ENSMGAG00000015828 #14 ENSMGAG00000010915 #15 MAD2L1BP (ENSMGAG00000010914) #13 ENSMGAG00000010904 ENSMGAG00000010927 #11 ENSMGAG00000010916 #12 ENSMGAG00000011020 #9 XPO5 (ENSMGAG00000010938) #10 ENSMGAG00000011023 #8 Chicken MODERN SPECIES 22 YIPF3 (ENSGALG00010009719) #8 POLR1C (ENSGALG00010009699) #9 XPO5 (ENSGALG00010009623) #10 POLH (ENSGALG00010006998) #11 GTPBP2 (ENSGALG00010006983) #12 MAD2L1BP (ENSGALG00010019832) #13 EPHX1L (ENSGALG00010019813) RSPH9 (ENSGALG00010019794) #14 MRPS18A (ENSGALG00010019761) #15 VEGFA (ENSGALG00010019716) #16 MRPL14 (ENSGALG00010019659) #17 TMEM63B (ENSGALG00010019649) #18 CAPN11 (ENSGALG00010019641) #19 ENSGALG00010019621 SLC29A1 (ENSGALG00010019602) #21 HSP90AB1 (ENSGALG00010019591) ##22 SLC35B2 (ENSGALG00010019581) #23 NFKBIE (ENSGALG00010019572) #24 TMEM151B (ENSGALG00010018337) #25 TCTE1 (ENSGALG00010018363) #26 AARS2 (ENSGALG00010018354) #27 RNF8 (ENSGALG00010021606) CMTR1 (ENSGALG00010020548) CCDC167 (ENSGALG00010020537) MDGA1 (ENSGALG00010021262) ZFAND3 (ENSGALG00010021245) BTBD9 (ENSGALG00010021236) GLO1 (ENSGALG00010021229) DNAH8 (ENSGALG00010020768) GLP1R (ENSGALG00010021673) GLP1R (ENSGALG00010020690) Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Common shrew MODERN SPECIES 12691 ENSSARG00000000297 ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 24 ENSOARG00020014587 SLC35A1 (ENSOARG00020014650) CFAP206 (ENSOARG00020014818) C6orf163 (ENSOARG00020014940) SMIM8 (ENSOARG00020015006) GJB7 (ENSOARG00020015040) ZNF292 (ENSOARG00020015103) ENSOARG00020015144 CGA (ENSOARG00020015174) HTR1E (ENSOARG00020015292) ENSOARG00020003014 ENSOARG00020003026 SYNCRIP (ENSOARG00020003105) SNX14 (ENSOARG00020003203) NT5E (ENSOARG00020003599) ENSOARG00020003650 ##22 TBX18 (ENSOARG00020003702) CEP162 (ENSOARG00020003753) MRAP2 (ENSOARG00020003941) ENSOARG00020003961 RIPPLY2 (ENSOARG00020003983) THEMIS (ENSOARG00020004049) PTPRK (ENSOARG00020004343) ENSOARG00020007374 LAMA2 (ENSOARG00020007456) ARHGAP18 (ENSOARG00020008175) ENSOARG00020008645 TMEM244 (ENSOARG00020008680) L3MBTL3 (ENSOARG00020008744) SAMD3 (ENSOARG00020009013) ENSOARG00020009066 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Cat MODERN SPECIES 236 LRRC73 (ENSFCAG00000033302) #7 YIPF3 (ENSFCAG00000009731) #8 POLR1C (ENSFCAG00000009735) #9 XPO5 (ENSFCAG00000009737) #10 POLH (ENSFCAG00000009740) #11 GTPBP2 (ENSFCAG00000009742) #12 MAD2L1BP (ENSFCAG00000009744) #13 RSPH9 (ENSFCAG00000009746) #14 MRPS18A (ENSFCAG00000036031) #15 VEGFA (ENSFCAG00000026462) #16 ENSFCAG00000037864 MRPL14 (ENSFCAG00000009755) #17 TMEM63B (ENSFCAG00000009756) #18 CAPN11 (ENSFCAG00000009759) #19 MYMX (ENSFCAG00000042737) #20 ENSFCAG00000009764 ##22 SLC35B2 (ENSFCAG00000038971) #23 NFKBIE (ENSFCAG00000009769) #24 TMEM151B (ENSFCAG00000046702) #25 TCTE1 (ENSFCAG00000009772) #26 AARS2 (ENSFCAG00000009773) #27 SPATS1 (ENSFCAG00000009776) #28 CDC5L (ENSFCAG00000009570) #29 SUPT3H (ENSFCAG00000009577) #30 RUNX2 (ENSFCAG00000041932) #34 ENSFCAG00000035385 CLIC5 (ENSFCAG00000037193) #35 ENPP4 (ENSFCAG00000033409) #36 ENPP5 (ENSFCAG00000024284) #37 RCAN2 (ENSFCAG00000027072) CYP39A1 (ENSFCAG00000011052) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 American mink MODERN SPECIES 50 POLR1C (ENSNVIG00000010123) #9 XPO5 (ENSNVIG00000010082) #10 POLH (ENSNVIG00000010078) #11 GTPBP2 (ENSNVIG00000010057) #12 ENSNVIG00000010051 MAD2L1BP (ENSNVIG00000010045) #13 RSPH9 (ENSNVIG00000010032) #14 MRPS18A (ENSNVIG00000010007) #15 VEGFA (ENSNVIG00000009743) #16 MRPL14 (ENSNVIG00000009675) #17 TMEM63B (ENSNVIG00000009636) #18 CAPN11 (ENSNVIG00000009603) #19 MYMX (ENSNVIG00000009592) #20 SLC29A1 (ENSNVIG00000009505) #21 SLC35B2 (ENSNVIG00000009456) #23 ENSNVIG00000009448 ##22 NFKBIE (ENSNVIG00000009421) #24 TMEM151B (ENSNVIG00000009412) #25 TCTE1 (ENSNVIG00000009393) #26 AARS2 (ENSNVIG00000009313) #27 SPATS1 (ENSNVIG00000009280) #28 ENSNVIG00000009273 ENSNVIG00000009264 ENSNVIG00000009258 CDC5L (ENSNVIG00000009224) #29 ENSNVIG00000009209 SUPT3H (ENSNVIG00000009185) #30 RUNX2 (ENSNVIG00000009164) #34 CLIC5 (ENSNVIG00000009122) #35 ENPP4 (ENSNVIG00000009079) #36 ENPP5 (ENSNVIG00000009051) #37 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 1965 ENSAMEG00000027391 ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 2277 ENSAMEG00000025295 ##22 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 1632 ENSAMEG00000027358 ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 975 ENSAMEG00000025682 ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 60 WDR35 (ENSODEG00000012693) MATN3 (ENSODEG00000008451) LAPTM4A (ENSODEG00000008579) #31 SDC1 (ENSODEG00000010758) ENSODEG00000008774 PUM2 (ENSODEG00000007823) ENSODEG00000010362 RHOB (ENSODEG00000019841) HS1BP3 (ENSODEG00000010003) GDF7 (ENSODEG00000008847) ENSODEG00000008523 APOB (ENSODEG00000008337) ENSODEG00000019494 ENSODEG00000007994 ENSODEG00000019450 ENSODEG00000007428 ##22 KLHL29 (ENSODEG00000009928) ENSODEG00000008786 ENSODEG00000009834 ENSODEG00000008643 ENSODEG00000007644 ENSODEG00000007455 ENSODEG00000008882 ENSODEG00000010244 SF3B6 (ENSODEG00000009547) ENSODEG00000007981 PFN4 (ENSODEG00000008303) ENSODEG00000007545 ENSODEG00000007584 NCOA1 (ENSODEG00000008181) PTRHD1 (ENSODEG00000007805) Degu MODERN SPECIES 76 ENSODEG00000014255 TPST1 (ENSODEG00000015532) KCTD7 (ENSODEG00000014785) RABGEF1 (ENSODEG00000015206) ENSODEG00000016093 ENSODEG00000015687 ENSODEG00000014729 CALN1 (ENSODEG00000015050) GALNT17 (ENSODEG00000016292) ENSODEG00000020191 AUTS2 (ENSODEG00000016622) ENSODEG00000014737 ENSODEG00000014150 ENSODEG00000020176 ENSODEG00000020215 ENSODEG00000014573 ##22 ENSODEG00000020386 ENSODEG00000015156 CASTOR2 (ENSODEG00000014375) RCC1L (ENSODEG00000014434) ENSODEG00000014736 NCF1 (ENSODEG00000015696) GTF2I (ENSODEG00000015405) GTF2IRD1 (ENSODEG00000015635) CLIP2 (ENSODEG00000015462) ENSODEG00000015354 ENSODEG00000016042 ENSODEG00000015854 LIMK1 (ENSODEG00000015076) ELN (ENSODEG00000016045) ENSODEG00000015892 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 8 CREB1 (ENSMMMG00000014914) KLF7 (ENSMMMG00000014897) CPO (ENSMMMG00000014874) FASTKD2 (ENSMMMG00000014857) MDH1B (ENSMMMG00000014852) ENSMMMG00000014844 DYTN (ENSMMMG00000014828) FAM237A (ENSMMMG00000014819) ADAM23 (ENSMMMG00000014678) ZDBF2 (ENSMMMG00000014650) CMKLR2 (ENSMMMG00000014632) ENSMMMG00000014596 NDUFS1 (ENSMMMG00000014566) INO80D (ENSMMMG00000014555) NRP2 (ENSMMMG00000013924) ENSMMMG00000013911 ##22 PARD3B (ENSMMMG00000013680) ICOS (ENSMMMG00000013624) CTLA4 (ENSMMMG00000013609) CD28 (ENSMMMG00000013599) ENSMMMG00000013568 ABI2 (ENSMMMG00000013329) CYP20A1 (ENSMMMG00000013312) NBEAL1 (ENSMMMG00000013229) CARF (ENSMMMG00000013161) WDR12 (ENSMMMG00000013110) ICA1L (ENSMMMG00000013064) ENSMMMG00000013060 ENSMMMG00000013051 ENSMMMG00000013017 BMPR2 (ENSMMMG00000012999) Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 8 CA7 (ENSSVLG00005025581) NAE1 (ENSSVLG00005025610) TERB1 (ENSSVLG00005025637) DYNC1LI2 (ENSSVLG00005025665) CMTM4 (ENSSVLG00005025679) CMTM3 (ENSSVLG00005025691) ENSSVLG00005025706 CKLF (ENSSVLG00005025721) TK2 (ENSSVLG00005025748) BEAN1 (ENSSVLG00005016934) ENSSVLG00005016998 CDH5 (ENSSVLG00005017067) CDH11 (ENSSVLG00005017448) CDH8 (ENSSVLG00005017549) ENSSVLG00005017795 ENSSVLG00005017835 ##22 GOT2 (ENSSVLG00005017895) ENSSVLG00005017936 SLC38A7 (ENSSVLG00005017988) CNOT1 (ENSSVLG00005018264) SETD6 (ENSSVLG00005018395) NDRG4 (ENSSVLG00005018581) GINS3 (ENSSVLG00005018840) PRSS54 (ENSSVLG00005018883) CCDC113 (ENSSVLG00005018943) ENSSVLG00005019189 ENSSVLG00005019222 ENSSVLG00005019291 MMP15 (ENSSVLG00005019370) USB1 (ENSSVLG00005019676) ZNF319 (ENSSVLG00005019911) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 18 ART3 (ENSSVLG00005011676) NUP54 (ENSSVLG00005011566) ENSSVLG00005011467 SCARB2 (ENSSVLG00005011224) ENSSVLG00005011125 STBD1 (ENSSVLG00005011092) CCDC158 (ENSSVLG00005024597) SHROOM3 (ENSSVLG00005024547) SOWAHB (ENSSVLG00005024521) SEPTIN11 (ENSSVLG00005024472) CCNI (ENSSVLG00005024437) CCNG2 (ENSSVLG00005024382) CXCL13 (ENSSVLG00005024355) ENSSVLG00005024335 ENSSVLG00005024208 ENSSVLG00005024181 ##22 ENSSVLG00005024131 ENSSVLG00005024108 FRAS1 (ENSSVLG00005023684) ENSSVLG00005023616 ANXA3 (ENSSVLG00005023519) BMP2K (ENSSVLG00005023420) PAQR3 (ENSSVLG00005023375) ENSSVLG00005023346 NAA11 (ENSSVLG00005023333) ENSSVLG00005023309 ANTXR2 (ENSSVLG00005023242) ENSSVLG00005023206 FGF5 (ENSSVLG00005023174) CFAP299 (ENSSVLG00005023128) BMP3 (ENSSVLG00005023094) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 5 Gm266 (ENSPEMG00000029489) Tnfaip2 (ENSPEMG00000000511) Exoc3l4 (ENSPEMG00000006944) Lbhd2 (ENSPEMG00000024190) Cdc42bpb (ENSPEMG00000023339) Amn (ENSPEMG00000006540) Traf3 (ENSPEMG00000022996) Rcor1 (ENSPEMG00000028079) Ankrd9 (ENSPEMG00000024255) Tecpr2 (ENSPEMG00000021467) Cinp (ENSPEMG00000022134) Zfp839 (ENSPEMG00000024097) Mok (ENSPEMG00000022583) ENSPEMG00000021942 ENSPEMG00000021846 ENSPEMG00000027442 ##22 ENSPEMG00000030091 ##22 1700001K19Rik (ENSPEMG00000022271) ENSPEMG00000030636 Dync1h1 (ENSPEMG00000021903) Ppp2r5c (ENSPEMG00000021897) ENSPEMG00000027756 ENSPEMG00000029257 ENSPEMG00000017089 ENSPEMG00000014708 Begain (ENSPEMG00000014247) Wdr25 (ENSPEMG00000001827) Wars1 (ENSPEMG00000009239) Slc25a47 (ENSPEMG00000013819) Slc25a29 (ENSPEMG00000015407) Yy1 (ENSPEMG00000027618) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 5 Tnfaip2 (ENSPEMG00000000511) Exoc3l4 (ENSPEMG00000006944) Lbhd2 (ENSPEMG00000024190) Cdc42bpb (ENSPEMG00000023339) Amn (ENSPEMG00000006540) Traf3 (ENSPEMG00000022996) Rcor1 (ENSPEMG00000028079) Ankrd9 (ENSPEMG00000024255) Tecpr2 (ENSPEMG00000021467) Cinp (ENSPEMG00000022134) Zfp839 (ENSPEMG00000024097) Mok (ENSPEMG00000022583) ENSPEMG00000021942 ENSPEMG00000021846 ENSPEMG00000027442 ##22 ENSPEMG00000030091 ##22 1700001K19Rik (ENSPEMG00000022271) ENSPEMG00000030636 Dync1h1 (ENSPEMG00000021903) Ppp2r5c (ENSPEMG00000021897) ENSPEMG00000027756 ENSPEMG00000029257 ENSPEMG00000017089 ENSPEMG00000014708 Begain (ENSPEMG00000014247) Wdr25 (ENSPEMG00000001827) Wars1 (ENSPEMG00000009239) Slc25a47 (ENSPEMG00000013819) Slc25a29 (ENSPEMG00000015407) Yy1 (ENSPEMG00000027618) ENSPEMG00000029084 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3324 Tmem63b (ENSMSIG00000023301) #18 Capn11 (ENSMSIG00000023352) #19 Mymx (ENSMSIG00000023403) #20 Slc29a1 (ENSMSIG00000023420) #21 ENSMSIG00000023496 ##22 Slc35b2 (ENSMSIG00000023500) #23 Nfkbie (ENSMSIG00000023528) #24 Tmem151b (ENSMSIG00000023557) #25 Tcte1 (ENSMSIG00000023567) #26 Aars2 (ENSMSIG00000023583) #27 Spats1 (ENSMSIG00000023603) #28 ENSMSIG00000023672 ENSMSIG00000023679 Cdc5l (ENSMSIG00000023681) #29 ENSMSIG00000023729 Supt3 (ENSMSIG00000023732) #30 ENSMSIG00000023769 #34 ENSMSIG00000023907 #35 ENSMSIG00000023915 #36 Enpp5 (ENSMSIG00000023926) #37 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Mouse lemur MODERN SPECIES 61 ENSMICG00000034227 ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 351 ENSOGAG00000026960 ENSOGAG00000025304 ##22 IGSF10 (ENSOGAG00000002958) MED12L (ENSOGAG00000002947) P2RY12 (ENSOGAG00000004975) P2RY13 (ENSOGAG00000033079) GPR87 (ENSOGAG00000002957) P2RY14 (ENSOGAG00000002956) GPR171 (ENSOGAG00000002955) CLRN1 (ENSOGAG00000002963) MINDY4B (ENSOGAG00000033668) SIAH2 (ENSOGAG00000002961) ERICH6 (ENSOGAG00000010157) SELENOT (ENSOGAG00000010153) EIF2A (ENSOGAG00000010148) ENSOGAG00000032851 TSC22D2 (ENSOGAG00000030692) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000005085 ENSGT00910000148752 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000001158 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 ENSGT00910000147751 Pan ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183100.B #9 ENSGT00940000153408.A #10 ENSGT00940000157048 #11 ENSGT00940000155636 #12 ENSGT00390000003812 #13 ENSGT00390000018686 #14 ENSGT00390000006493 #15 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000005085 ENSGT00910000148752 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00940000158672 #19 ENSGT00490000044373 #20 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00390000013762.b.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00940000158246 #27 ENSGT00390000006786 #28 ENSGT00550000074922 #29 ENSGT00390000001158 ENSGT00390000010738 #30 ENSGT00940000160171 #34 ENSGT00940000156406.b #35 ENSGT00940000158831 #36 ENSGT00940000160562 #37 ENSGT00940000159767 ENSGT00910000147751 Bonobo MODERN SPECIES 19 XPO5 (ENSPPAG00000039971) #10 ENSPPAG00000040669 POLH (ENSPPAG00000038133) #11 GTPBP2 (ENSPPAG00000034475) #12 MAD2L1BP (ENSPPAG00000041364) #13 ENSPPAG00000040963 #14 MRPS18A (ENSPPAG00000036291) #15 VEGFA (ENSPPAG00000027018) #16 ENSPPAG00000033753 ENSPPAG00000041620 MRPL14 (ENSPPAG00000036858) #17 TMEM63B (ENSPPAG00000027102) #18 CAPN11 (ENSPPAG00000035892) #19 MYMX (ENSPPAG00000026302) #20 SLC29A1 (ENSPPAG00000033742) #21 ENSPPAG00000033123 ##22 SLC35B2 (ENSPPAG00000027390) #23 ENSPPAG00000028804 #24 ENSPPAG00000041269 #25 TCTE1 (ENSPPAG00000034916) #26 AARS2 (ENSPPAG00000011981) #27 SPATS1 (ENSPPAG00000007633) #28 CDC5L (ENSPPAG00000031456) #29 ENSPPAG00000016263 ENSPPAG00000030879 #30 RUNX2 (ENSPPAG00000036423) #34 ENSPPAG00000025002 #35 ENPP4 (ENSPPAG00000032184) #36 ENPP5 (ENSPPAG00000032683) #37 RCAN2 (ENSPPAG00000028781) ENSPPAG00000027012 Chimpanzee MODERN SPECIES 19 XPO5 (ENSPTRG00000018204) #10 ENSPTRG00000047136 POLH (ENSPTRG00000018205) #11 GTPBP2 (ENSPTRG00000018206) #12 MAD2L1BP (ENSPTRG00000018207) #13 RSPH9 (ENSPTRG00000052351) #14 MRPS18A (ENSPTRG00000018209) #15 VEGFA (ENSPTRG00000043213) #16 LINC03040 (ENSPTRG00000044964) ENSPTRG00000046423 MRPL14 (ENSPTRG00000018213) #17 TMEM63B (ENSPTRG00000018214) #18 CAPN11 (ENSPTRG00000018215) #19 MYMX (ENSPTRG00000043831) #20 SLC29A1 (ENSPTRG00000018216) #21 HSP90AB1 (ENSPTRG00000018217) ##22 SLC35B2 (ENSPTRG00000045028) #23 NFKBIE (ENSPTRG00000018219) #24 TMEM151B (ENSPTRG00000018220) #25 TCTE1 (ENSPTRG00000018221) #26 AARS2 (ENSPTRG00000018222) #27 SPATS1 (ENSPTRG00000018223) #28 CDC5L (ENSPTRG00000018224) #29 ENSPTRG00000049163 SUPT3H (ENSPTRG00000023379) #30 RUNX2 (ENSPTRG00000018228) #34 CLIC5 (ENSPTRG00000018230) #35 ENPP4 (ENSPTRG00000018231) #36 ENPP5 (ENSPTRG00000018232) #37 RCAN2 (ENSPTRG00000018233) ENSPTRG00000049833 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 586 ENSRBIG00000043365 ZNF365 (ENSRBIG00000020873) ENSRBIG00000012841 ADO (ENSRBIG00000027588) EGR2 (ENSRBIG00000031709) ENSRBIG00000001190 ENSRBIG00000023798 JMJD1C (ENSRBIG00000023967) REEP3 (ENSRBIG00000040518) ENSRBIG00000039137 ENSRBIG00000042554 ##22 ENSRBIG00000028859 ENSRBIG00000000807 FBN2 (ENSRBIG00000037592) SLC12A2 (ENSRBIG00000041699) CCDC192 (ENSRBIG00000029179) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 966 CCDC192 (ENSANAG00000022419) CTXN3 (ENSANAG00000018463) PRRC1 (ENSANAG00000023916) MEGF10 (ENSANAG00000025606) ENSANAG00000037891 MARCHF3 (ENSANAG00000021896) LMNB1 (ENSANAG00000006147) ENSANAG00000017917 ENSANAG00000018071 TEX43 (ENSANAG00000020432) ENSANAG00000022879 ENSANAG00000024922 ENSANAG00000026615 GRAMD2B (ENSANAG00000025780) ENSANAG00000021766 ENSANAG00000021414 ##22 ZNF608 (ENSANAG00000026653) ENSANAG00000022607 CSNK1G3 (ENSANAG00000024113) CEP120 (ENSANAG00000027276) ENSANAG00000021690 PRDM6 (ENSANAG00000025903) PPIC (ENSANAG00000022145) SNX24 (ENSANAG00000023745) SNX2 (ENSANAG00000023132) ENSANAG00000026792 SNCAIP (ENSANAG00000023615) ENSANAG00000026917 LOX (ENSANAG00000022215) SRFBP1 (ENSANAG00000022485) PRR16 (ENSANAG00000022482) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Marmoset MODERN SPECIES ATXN10 (ENSCJAG00000012879) FBLN1 (ENSCJAG00000012893) RIBC2 (ENSCJAG00000022546) SMC1B (ENSCJAG00000000550) FAM118A (ENSCJAG00000000548) UPK3A (ENSCJAG00000000546) ENSCJAG00000042242 PRR5 (ENSCJAG00000056936) ARHGAP8 (ENSCJAG00000016200) PHF21B (ENSCJAG00000016227) ENSCJAG00000080411 ENSCJAG00000016242 KIAA0930 (ENSCJAG00000016255) CERK (ENSCJAG00000002195) TBC1D22A (ENSCJAG00000002185) ENSCJAG00000070586 ##22 TAFA5 (ENSCJAG00000048177) ENSCJAG00000058146 BRD1 (ENSCJAG00000016639) ZBED4 (ENSCJAG00000083912) ALG12 (ENSCJAG00000016677) CRELD2 (ENSCJAG00000016693) PIM3 (ENSCJAG00000044399) MOV10L1 (ENSCJAG00000003399) ENSCJAG00000073587 PANX2 (ENSCJAG00000003392) TRABD (ENSCJAG00000003384) SELENOO (ENSCJAG00000003360) TUBGCP6 (ENSCJAG00000003351) HDAC10 (ENSCJAG00000003337) MAPK12 (ENSCJAG00000003322) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01020000230401.a.a.a.j ##22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1086 BAMBI (ENSVURG00010024352) MAP3K8 (ENSVURG00010024347) MTPAP (ENSVURG00010024344) ENSVURG00010024343 ENSVURG00010024338 SVIL (ENSVURG00010024042) ENSVURG00010023999 ZEB1 (ENSVURG00010023993) ARHGAP12 (ENSVURG00010023985) KIF5B (ENSVURG00010023979) EPC1 (ENSVURG00010023973) ITGB1 (ENSVURG00010023964) NRP1 (ENSVURG00010023955) ENSVURG00010023942 ENSVURG00010023939 ENSVURG00010023934 ##22 ENSVURG00010023932 CUL2 (ENSVURG00010023920) CREM (ENSVURG00010023893) ENSVURG00010023882 ENSVURG00010023881 CCNY (ENSVURG00010023876) ENSVURG00010023871 FZD8 (ENSVURG00010023869) ENSVURG00010023867 KLF6 (ENSVURG00010023865) PITRM1 (ENSVURG00010023852) PFKP (ENSVURG00010023845) ENSVURG00010023843 ENSVURG00010023842 ENSVURG00010023841 Common wonbat MODERN SPECIES 1066 ENSVURG00010006661 ENSVURG00010006647 ENSVURG00010006632 ENSVURG00010006621 ENSVURG00010006602 CAAP1 (ENSVURG00010006584) PLAA (ENSVURG00010006575) LRRC19 (ENSVURG00010006571) IFT74 (ENSVURG00010006558) TEK (ENSVURG00010006447) ENSVURG00010006427 MOB3B (ENSVURG00010006420) C9orf72 (ENSVURG00010006400) ENSVURG00010006387 LINGO2 (ENSVURG00010006377) ENSVURG00010006349 ##22 ENSVURG00010006340 ACO1 (ENSVURG00010006312) RIGI (ENSVURG00010006292) TOPORS (ENSVURG00010006285) NDUFB6 (ENSVURG00010006272) TMEM215 (ENSVURG00010006242) PTGR1 (ENSVURG00010006233) ENSVURG00010006205 ENSVURG00010006199 ENSVURG00010006195 ENSVURG00010006186 ENSVURG00010006178 ENSVURG00010006174 ENSVURG00010006165 ENSVURG00010006161 Opossum DUPLICATION Opossum MODERN SPECIES 1 TDRD5 (ENSMODG00000006180) NPHS2 (ENSMODG00000006156) ENSMODG00000006139 ENSMODG00000006124 ABL2 (ENSMODG00000006090) TOR3A (ENSMODG00000006073) FAM20B (ENSMODG00000006053) ANGPTL1 (ENSMODG00000006041) ENSMODG00000038285 RALGPS2 (ENSMODG00000006032) ENSMODG00000005974 ENSMODG00000050410 ENSMODG00000005831 ENSMODG00000005823 ENSMODG00000002478 ENSMODG00000024962 ##22 BRINP2 (ENSMODG00000005732) ASTN1 (ENSMODG00000005711) PAPPA2 (ENSMODG00000005626) COP1 (ENSMODG00000005579) TNR (ENSMODG00000005481) ENSMODG00000040449 KIAA0040 (ENSMODG00000048385) TNN (ENSMODG00000004446) MRPS14 (ENSMODG00000004390) ENSMODG00000004383 RABGAP1L (ENSMODG00000004361) RC3H1 (ENSMODG00000004289) SERPINC1 (ENSMODG00000004202) ZBTB37 (ENSMODG00000004228) ENSMODG00000024978 Opossum MODERN SPECIES 1 LRRC73 (ENSMODG00000018969) #7 YIPF3 (ENSMODG00000018967) #8 POLR1C (ENSMODG00000018964) #9 XPO5 (ENSMODG00000018963) #10 POLH (ENSMODG00000018961) #11 GTPBP2 (ENSMODG00000018959) #12 MAD2L1BP (ENSMODG00000018956) #13 RSPH9 (ENSMODG00000018954) #14 ENSMODG00000038008 MRPS18A (ENSMODG00000018952) #15 VEGFA (ENSMODG00000018950) #16 ENSMODG00000025685 MRPL14 (ENSMODG00000018945) #17 TMEM63B (ENSMODG00000018941) #18 ENSMODG00000018935 #21 ENSMODG00000018933 ##22 SLC35B2 (ENSMODG00000018930) #23 NFKBIE (ENSMODG00000018929) #24 TMEM151B (ENSMODG00000037039) #25 ENSMODG00000023532 #26 AARS2 (ENSMODG00000018926) #27 ENSMODG00000040746 #28 ENSMODG00000018923 #29 SUPT3H (ENSMODG00000018921) #30 RUNX2 (ENSMODG00000018912) #34 ENSMODG00000018910 #35 ENPP4 (ENSMODG00000018909) #36 ENPP5 (ENSMODG00000018907) #37 ENSMODG00000027577 RCAN2 (ENSMODG00000039825) CYP39A1 (ENSMODG00000018894) Anura ANCESTRAL SPECIES 298 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #21 ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120 #24 ENSGT00940000157084 #18 ENSGT00390000001121 #17 ENSGT00940000157284 #16 ENSGT00390000006493 #15 Frog MODERN SPECIES 5 xpo5.2 (ENSXETG00000010884) #10 ENSXETG00000003957 #10 xpo5 (ENSXETG00000010883) #10 polh (ENSXETG00000048334) #11 ENSXETG00000045079 gtpbp2 (ENSXETG00000048908) #12 MAD2L1BP (ENSXETG00000048874) #13 tcte1 (ENSXETG00000010891) #26 ENSXETG00000045823 #25 slc29a1 (ENSXETG00000043518) #21 ENSXETG00000042133 ENSXETG00000042425 ENSXETG00000041556 ENSXETG00000044329 ENSXETG00000047432 hsp90ab1 (ENSXETG00000010896) #22 slc35b2 (ENSXETG00000010892) #23 nfkbie (ENSXETG00000043278) #24 ENSXETG00000047357 ENSXETG00000040833 capn11 (ENSXETG00000046602) #19 TMEM63B (ENSXETG00000047984) #18 mrpl14 (ENSXETG00000045512) #17 ENSXETG00000043483 ENSXETG00000047957 ENSXETG00000045940 vegfa (ENSXETG00000016375) #16 ENSXETG00000044002 ENSXETG00000039536 rsph9 (ENSXETG00000010879) #14 mrps18a (ENSXETG00000047905) #15 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 7 ENSLLEG00000014383 ENSLLEG00000014313 TTBK1 (ENSLLEG00000014211) ENSLLEG00000014193 ENSLLEG00000014176 ENSLLEG00000014044 ENSLLEG00000014007 SLC29A1 (ENSLLEG00000013708) #21 HSP90AB1 (ENSLLEG00000013134) #22 ENSLLEG00000013093 SLC35B2 (ENSLLEG00000012956) #23 ENSLLEG00000012906 #24 ENSLLEG00000012887 ENSLLEG00000012879 ENSLLEG00000012856 TMEM63B (ENSLLEG00000012509) #18 MRPL14 (ENSLLEG00000012448) #17 ENSLLEG00000012434 ENSLLEG00000012410 ENSLLEG00000015257 VEGFA (ENSLLEG00000014939) #16 MRPS18A (ENSLLEG00000014816) #15 ENSLLEG00000014766 ENSLLEG00000014577 Coelacanth MODERN SPECIES 1475 SLC29A1 (ENSLACG00000011264) #21 HSP90AB1 (ENSLACG00000010351) #22 SLC35B2 (ENSLACG00000009044) #23 NFKBIE (ENSLACG00000007650) #24 TMEM151B (ENSLACG00000006138) #25 TCTE1 (ENSLACG00000004331) #26 ENSLACG00000000163 #27 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00390000008684 ENSGT00390000007395 ENSGT00940000155369.A ENSGT00940000161931 ENSGT01030000235595 ENSGT00940000158830 ENSGT00390000007341.a ENSGT00510000048466 ENSGT00940000157509 ENSGT00390000012435 ENSGT00940000157150 ENSGT00390000018516 ENSGT00940000159582 ENSGT00390000007686.b.d ENSGT01020000230401.a.a.b.a.b ##22 ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT01020000230401.a.a.b.b ##22 ENSGT01030000234906 ENSGT01020000230703 ENSGT01030000235064 ENSGT00940000156103 ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000165081 ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000173691 ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000159694 ENSGT00940000157766 ENSGT00940000154763 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 901 ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT01020000230401.a.a.b.b ##22 Spotted gar MODERN SPECIES 647 PPP2R5A (ENSLOCG00000016361) pacc1 (ENSLOCG00000016363) nenf (ENSLOCG00000016364) opn8c (ENSLOCG00000016365) tagapb (ENSLOCG00000016367) rsph3 (ENSLOCG00000016370) ezra (ENSLOCG00000016372) SYTL3 (ENSLOCG00000016375) enpp1 (ENSLOCG00000016378) ENSLOCG00000016382 kcnk3a (ENSLOCG00000016383) slc35f6 (ENSLOCG00000016385) MTARC2 (ENSLOCG00000016389) hlx1 (ENSLOCG00000016392) DUSP10 (ENSLOCG00000016394) hsp90ab1 (ENSLOCG00000016396) #22 slc35b2 (ENSLOCG00000016398) #23 nfkbie (ENSLOCG00000016399) #24 tmem151ba (ENSLOCG00000016400) #25 TCTE1 (ENSLOCG00000016401) #26 rnf8 (ENSLOCG00000016402) ENSLOCG00000017996 zgc:136872 (ENSLOCG00000016403) ENSLOCG00000017997 ENSLOCG00000017998 ENSLOCG00000016406 ENSLOCG00000017999 susd4 (ENSLOCG00000016408) TLR5 (ENSLOCG00000018000) disp1 (ENSLOCG00000016410) FAM177B (ENSLOCG00000016412) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 1134 ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT01020000230401.a.a.b.b ##22 Osteoglossiformes DUPLICATION Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 96 ENSGT00940000155428.a ENSGT00940000156426 ENSGT00950000182899.A ENSGT00940000158656 ENSGT01020000230401.a.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120.f #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00400000022349 ENSGT00830000128368.a ENSGT00940000160410 ENSGT00940000162464 ENSGT00940000157407 ENSGT00600000084860.C ENSGT00940000170226 ENSGT00390000006681 ENSGT00390000016465 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 P. kingsleyae MODERN SPECIES 117 UBXN2A (ENSPKIG00000003981) ATAD2B (ENSPKIG00000003888) KLHL29 (ENSPKIG00000003836) TRIB2 (ENSPKIG00000003804) GZF1 (ENSPKIG00000003781) NAPB (ENSPKIG00000003699) gpcpd1 (ENSPKIG00000003553) ENSPKIG00000003486 trmt6 (ENSPKIG00000003441) FERMT1 (ENSPKIG00000003382) bmp2b (ENSPKIG00000003359) PLCB1 (ENSPKIG00000003149) PLCB4 (ENSPKIG00000002806) LAMP5 (ENSPKIG00000002715) pak5 (ENSPKIG00000002658) hsp90ab1 (ENSPKIG00000002622) #22 slc35b2 (ENSPKIG00000002605) #23 nfkbie (ENSPKIG00000002594) #24 tmem151ba (ENSPKIG00000002586) #25 TCTE1 (ENSPKIG00000002579) #26 rnf8 (ENSPKIG00000002550) ENSPKIG00000002520 susd4 (ENSPKIG00000002487) TLR5 (ENSPKIG00000002471) disp1 (ENSPKIG00000002410) ENSPKIG00000002355 brox (ENSPKIG00000002272) aida (ENSPKIG00000002195) ENSPKIG00000002065 taf1a (ENSPKIG00000001964) DUSP10 (ENSPKIG00000001920) Asian bonytongue MODERN SPECIES UBXN2A (ENSSFOG00015027985) ATAD2B (ENSSFOG00015008768) KLHL29 (ENSSFOG00015008685) TRIB2 (ENSSFOG00015024330) GZF1 (ENSSFOG00015008631) NAPB (ENSSFOG00015028911) gpcpd1 (ENSSFOG00015008522) trmt6 (ENSSFOG00015008429) FERMT1 (ENSSFOG00015008381) bmp2b (ENSSFOG00015008348) PLCB1 (ENSSFOG00015008271) ENSSFOG00015025763 PLCB4 (ENSSFOG00015008060) LAMP5 (ENSSFOG00015007995) pak5 (ENSSFOG00015007930) hsp90ab1 (ENSSFOG00015007867) #22 slc35b2 (ENSSFOG00015026051) #23 nfkbie (ENSSFOG00015007828) #24 TCTE1 (ENSSFOG00015007792) #26 tmem151ba (ENSSFOG00015007807) #25 rnf8 (ENSSFOG00015007776) ENSSFOG00015007747 susd4 (ENSSFOG00015007691) TLR5 (ENSSFOG00015007678) disp1 (ENSSFOG00015007631) ENSSFOG00015028205 ENSSFOG00015007545 brox (ENSSFOG00015007501) aida (ENSSFOG00015007446) MIA3 (ENSSFOG00015007416) taf1a (ENSSFOG00015007406) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 834 ENSGT01020000230401.a.a.a.b #22 ENSGT01020000230401.a.a.b.b ##22 P. kingsleyae MODERN SPECIES 134 PPM1A (ENSPKIG00000019744) ENSPKIG00000019770 ENSPKIG00000019792 ENSPKIG00000019827 ENSPKIG00000019839 PPP1R13B (ENSPKIG00000019886) daam1b (ENSPKIG00000020048) ENSPKIG00000020224 ENSPKIG00000020229 L3HYPDH (ENSPKIG00000020240) ENSPKIG00000020258 ENSPKIG00000020307 ENSPKIG00000020373 ENSPKIG00000020379 WDR20 (ENSPKIG00000020400) ENSPKIG00000020420 #22 ENSPKIG00000020484 ##22 ENSPKIG00000020519 ##22 ENSPKIG00000020610 ENSPKIG00000020701 ENSPKIG00000020751 ENSPKIG00000020771 ENSPKIG00000020791 ENSPKIG00000020844 ENSPKIG00000020859 ENSPKIG00000020899 ENSPKIG00000020923 hist1h2a4 (ENSPKIG00000020999) ENSPKIG00000021055 ENSPKIG00000021091 si:dkey-174m14.3 (ENSPKIG00000021131) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154928.c.a.b ENSGT00390000001445 ENSGT00940000156692 ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000005052 ENSGT00910000144260 ENSGT01030000234532.A.a.b.a ENSGT00390000003866.a.b.b ENSGT00940000176161 ENSGT00530000063737.l.a ENSGT00390000016577.b.b ENSGT00940000156087.a.b ENSGT00390000010770 ENSGT00390000007015 ENSGT00730000111019.e.b ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120.f #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00400000022349 ENSGT00390000007341.b ENSGT00830000128368.a ENSGT00940000162464 ENSGT00940000157407 ENSGT00390000016736.b ENSGT00600000084860.C ENSGT00940000170226 ENSGT00390000006681 ENSGT00390000016465 ENSGT00940000170599 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000166942 ENSGT00940000156692 ENSGT00390000005052 ENSGT00390000000083.a ENSGT01010000224599 ENSGT00910000144260 ENSGT01030000234532.A.a.b.a ENSGT00390000003866.a.b.b ENSGT00940000176161 ENSGT00530000063737.l.a ENSGT00390000016577.b.b ENSGT00940000156087.a.b ENSGT00390000010770 ENSGT00390000007015 ENSGT00730000111019.e.b ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120.f #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00400000022349 ENSGT00390000016465 ENSGT00940000170599 ENSGT00940000169554 ENSGT00390000011405 ENSGT00950000182767.a ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00390000016736.a.j ENSGT00550000074807.d.a.a.a ENSGT00940000163080.a ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120.f #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.a #25 ENSGT00940000159341 #26 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(ENSOKIG00005013592) ENSOKIG00005013568 Chinook salmon MODERN SPECIES 29 klf11a (ENSOTSG00005037944) GRHL1 (ENSOTSG00005037941) ENSOTSG00005037935 ENSOTSG00005037931 ASAP2 (ENSOTSG00005032397) mboat2b (ENSOTSG00005032377) kidins220b (ENSOTSG00005032347) id2b (ENSOTSG00005032336) ENSOTSG00005032335 sox11b (ENSOTSG00005032334) ENSOTSG00005032332 ENSOTSG00005032331 zgc:153383 (ENSOTSG00005032327) psma6b (ENSOTSG00005032296) nfkbiaa (ENSOTSG00005032290) hsp90ab1 (ENSOTSG00005029732) #22 slc35b2 (ENSOTSG00005029725) #23 nfkbie (ENSOTSG00005029724) #24 tmem151ba (ENSOTSG00005029723) #25 TCTE1 (ENSOTSG00005029722) #26 rnf8 (ENSOTSG00005029721) ENSOTSG00005029720 ENSOTSG00005029719 DUSP10 (ENSOTSG00005029718) hlx1 (ENSOTSG00005029717) slc35f6 (ENSOTSG00005029716) kcnk3a (ENSOTSG00005029714) enpp1 (ENSOTSG00005025173) SYTL3 (ENSOTSG00005025141) ezrb (ENSOTSG00005025138) rsph3 (ENSOTSG00005025132) Rainbow trout MODERN SPECIES 29 ENSOMYG00000043141 ENSOMYG00000053723 ASAP2 (ENSOMYG00000040908) 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Clown anemonefish MODERN SPECIES 3621 ACSF2 (ENSAOCG00000020184) ENSAOCG00000001475 metrnla (ENSAOCG00000019958) PTS (ENSAOCG00000019937) ENSAOCG00000019895 ENSAOCG00000019878 ENSAOCG00000019823 ENSAOCG00000001449 ENSAOCG00000019790 gphnb (ENSAOCG00000019671) ENSAOCG00000019472 pals1b (ENSAOCG00000019449) atp6v1d (ENSAOCG00000019384) eif2s1b (ENSAOCG00000019340) rbm25b (ENSAOCG00000019308) hsp90ab1 (ENSAOCG00000019247) #22 slc35b2 (ENSAOCG00000019182) #23 nfkbie (ENSAOCG00000019158) #24 tmem151ba (ENSAOCG00000019144) #25 TCTE1 (ENSAOCG00000019131) #26 rnf8 (ENSAOCG00000019107) aida (ENSAOCG00000019087) ENSAOCG00000019042 ENSAOCG00000019010 taf1a (ENSAOCG00000002292) DUSP10 (ENSAOCG00000018952) hlx1 (ENSAOCG00000018931) ccdc25 (ENSAOCG00000018902) esco2 (ENSAOCG00000018882) pbk (ENSAOCG00000018856) scara5 (ENSAOCG00000018809) Orange clownfish MODERN SPECIES 2 syt14b (ENSAPEG00000009078) extl3 (ENSAPEG00000009097) riox1 (ENSAPEG00000009125) NDUFB1 (ENSAPEG00000009140) cpsf2 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ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00400000022349 ENSGT00390000016465 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000165081.b ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000166942 ENSGT00940000156692 ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000005052 ENSGT00910000144260 ENSGT01030000234532.A.a.b.a ENSGT00390000003866.a.b.b ENSGT00530000063737.l.a ENSGT00390000016577.b.b ENSGT00940000156087.a.b ENSGT00390000010770 ENSGT00390000007015 ENSGT00730000111019.e.b ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120.f #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00400000022349 ENSGT00390000016465 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b Climbing perch MODERN SPECIES 15 si:dkey-174m14.3 (ENSATEG00000017958) ENSATEG00000028950 syt14b (ENSATEG00000017806) extl3 (ENSATEG00000017782) riox1 (ENSATEG00000017710) NDUFB1 (ENSATEG00000017695) cpsf2 (ENSATEG00000017644) SLC24A4 (ENSATEG00000017588) tmem121ab (ENSATEG00000017581) FUT8 (ENSATEG00000017543) gphnb (ENSATEG00000017456) pals1b (ENSATEG00000017424) atp6v1d (ENSATEG00000017393) eif2s1b (ENSATEG00000028199) rbm25b (ENSATEG00000017312) hsp90ab1 (ENSATEG00000017267) #22 slc35b2 (ENSATEG00000017247) #23 nfkbie (ENSATEG00000017217) #24 tmem151ba (ENSATEG00000017208) #25 TCTE1 (ENSATEG00000017200) #26 rnf8 (ENSATEG00000017178) aida (ENSATEG00000017144) ENSATEG00000026096 taf1a (ENSATEG00000017068) DUSP10 (ENSATEG00000017056) HLX (ENSATEG00000017038) ENSATEG00000017020 kcnk3a (ENSATEG00000017011) enpp1 (ENSATEG00000016939) ENSATEG00000026406 ezrb (ENSATEG00000016839) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 13 si:dkey-174m14.3 (ENSBSLG00000007844) nt5c1ba (ENSBSLG00000007785) 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tfap2b (ENSSMAG00000003234) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000165081.b ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000166942 ENSGT00940000156692 ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000005052 ENSGT00910000144260 ENSGT01030000234532.A.a.b.a ENSGT00390000003866.a.b.b ENSGT00530000063737.l.a ENSGT00390000016577.b.b ENSGT00940000156087.a.b ENSGT00390000010770 ENSGT00390000007015 ENSGT00730000111019.e.b ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120.f #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00400000022349 ENSGT00390000016465 ENSGT00950000182767.a ENSGT00940000169554 ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000165081.b ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000166942 ENSGT00940000156692 ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000005052 ENSGT00910000144260.f ENSGT01030000234532.A.a.b.a ENSGT00390000003866.a.b.b ENSGT00530000063737.l.a ENSGT00390000016577.b.b ENSGT00940000156087.a.b ENSGT00390000010770 ENSGT00390000007015 ENSGT00730000111019.e.b ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00390000015102.a.a ENSGT00940000156048.e.a.b.a ENSGT00940000155312.a.b ENSGT00390000009816 ENSGT00940000154209.a.a.h ENSGT00940000154289.A.a.b ENSGT00940000155507.a.b ENSGT00390000003299 ENSGT00940000158450.d.b ENSGT00390000017490 ENSGT00390000012351.bb ENSGT00950000182998.B ENSGT00940000155832.c Fugu MODERN SPECIES 7 nt5c1ba (ENSTRUG00000020898) syt14b (ENSTRUG00000004506) extl3 (ENSTRUG00000004305) riox1 (ENSTRUG00000004204) NDUFB1 (ENSTRUG00000023861) cpsf2 (ENSTRUG00000003742) SLC24A4 (ENSTRUG00000002992) tmem121ab (ENSTRUG00000002967) ENSTRUG00000033198 fut8 (ENSTRUG00000017922) gphnb (ENSTRUG00000017929) pals1b (ENSTRUG00000017940) atp6v1d (ENSTRUG00000019923) eif2s1b (ENSTRUG00000017958) rbm25b (ENSTRUG00000017964) hsp90ab1 (ENSTRUG00000017978) #22 ak7a (ENSTRUG00000017984) ACTA1 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ENSTNIG00000012214 aven (ENSTNIG00000001386) chrm5b (ENSTNIG00000012213) emc7b (ENSTNIG00000012212) katnbl1 (ENSTNIG00000012211) gpr176 (ENSTNIG00000012210) THBS1 (ENSTNIG00000012209) SCARA3 (ENSTNIG00000012208) clu (ENSTNIG00000012207) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000165081.b ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000166942 ENSGT00940000156692 ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000005052 ENSGT00910000144260 ENSGT01030000234532.A.a.b.a ENSGT00390000003866.a.b.b ENSGT00530000063737.l.a ENSGT00390000016577.b.b ENSGT00940000156087.a.b ENSGT00390000010770 ENSGT00390000007015 ENSGT00730000111019.e.b ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120.f #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00400000022349 ENSGT00390000016465 ENSGT00950000182767.a ENSGT00940000169554 ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 Ballan wrasse MODERN SPECIES 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slc35b2 (ENSMMDG00005020694) #23 nfkbie (ENSMMDG00005020696) #24 tmem151ba (ENSMMDG00005020702) #25 TCTE1 (ENSMMDG00005020708) #26 rnf8 (ENSMMDG00005020711) aida (ENSMMDG00005020714) ENSMMDG00005020719 taf1a (ENSMMDG00005020731) DUSP10 (ENSMMDG00005020735) hlx1 (ENSMMDG00005020736) slc35f6 (ENSMMDG00005020738) kcnk3a (ENSMMDG00005020739) enpp1 (ENSMMDG00005020752) ENSMMDG00005021190 ezrb (ENSMMDG00005021202) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00940000154928.c.a.b ENSGT00390000001445 ENSGT00940000156692 ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000005052 ENSGT00910000144260 ENSGT01030000234532.A.a.b.a ENSGT00390000003866.a.b.b ENSGT00940000176161 ENSGT00530000063737.l.a ENSGT00390000016577.b.b ENSGT00940000156087.a.b ENSGT00390000010770 ENSGT00390000007015.x ENSGT00730000111019.e.b ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120.f #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00400000022349 ENSGT00390000007341.b ENSGT00830000128368.a ENSGT00940000162464 ENSGT00940000157407 ENSGT00390000016736.b ENSGT00600000084860.C ENSGT00940000170226 ENSGT00390000006681 ENSGT00940000167697 ENSGT00390000011405 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 352 ENSGT00940000154928.c.a.b ENSGT00390000001445 ENSGT00940000156692 ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000005052 ENSGT00910000144260 ENSGT01030000234532.A.a.b.a ENSGT00390000003866.a.b.b ENSGT00530000063737.l.a ENSGT00390000016577.b.b ENSGT00940000156087.a.b ENSGT00390000010770 ENSGT00390000007015.x ENSGT00730000111019.e.b ENSGT01020000230401.a.a.a #22 Atlantic herring MODERN SPECIES 6 HMBOX1 (ENSCHAG00000026418) ints9 (ENSCHAG00000026434) extl3 (ENSCHAG00000002367) riox1 (ENSCHAG00000002553) NDUFB1 (ENSCHAG00000003539) cpsf2 (ENSCHAG00000003572) ENSCHAG00000004655 SLC24A4 (ENSCHAG00000004667) tmem121ab (ENSCHAG00000004684) FUT8 (ENSCHAG00000004716) gphnb (ENSCHAG00000005071) atp6v1d (ENSCHAG00000011859) pals1b (ENSCHAG00000011960) eif2s1b (ENSCHAG00000011974) rbm25b (ENSCHAG00000012039) 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(ENSDCDG00000005614) ENSDCDG00000005607 ENSDCDG00000005600 dlat (ENSDCDG00000005590) chek1 (ENSDCDG00000005581) ENSDCDG00000005578 ENSDCDG00000005534 ENSDCDG00000005523 ENSDCDG00000005520 nectin1a (ENSDCDG00000005517) CAPN5 (ENSDCDG00000005196) CUL5 (ENSDCDG00000005181) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155500.f ENSGT00390000001445 ENSGT00940000156692 ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000005052 ENSGT00910000144260 ENSGT01030000234532.A.a.b.a ENSGT00390000003866.a.b.b ENSGT00940000176161 ENSGT00530000063737.l.a ENSGT00390000016577.b.b ENSGT00940000156087.a.b ENSGT00390000010770 ENSGT00390000007015.x ENSGT00730000111019.e.b ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120.f #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00400000022349 ENSGT00390000007341.b ENSGT00830000128368.a ENSGT00940000162464 ENSGT00940000157407 ENSGT00390000016736.b ENSGT00390000006681 ENSGT00940000167697 ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000155500.f ENSGT00390000001445 ENSGT00940000156692 ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000005052 ENSGT00910000144260 ENSGT01030000234532.A.a.b.a ENSGT00390000003866.a.b.b ENSGT00940000176161 ENSGT00530000063737.l.a ENSGT00390000016577.b.b ENSGT00940000156087.a.b ENSGT00390000010770 ENSGT00390000007015.x ENSGT00730000111019.e.b ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120.f #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157993 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b.e.a.b ENSGT01100000263861 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00960000186817 Channel catfish MODERN SPECIES 17 henmt1 (ENSIPUG00000020668) #32 srp9 (ENSIPUG00000020674) ENSIPUG00000020697 filip1 (ENSIPUG00000020801) ENSIPUG00000020823 riox1 (ENSIPUG00000020831) NDUFB1 (ENSIPUG00000020852) cpsf2 (ENSIPUG00000020857) SLC24A4 (ENSIPUG00000020880) tmem121ab (ENSIPUG00000020887) FUT8 (ENSIPUG00000020898) gphnb (ENSIPUG00000020908) atp6v1d (ENSIPUG00000020970) eif2s1b (ENSIPUG00000021013) rbm25b (ENSIPUG00000021051) hsp90ab1 (ENSIPUG00000021071) #22 slc35b2 (ENSIPUG00000021155) #23 nfkbie (ENSIPUG00000021162) #24 tmem151b (ENSIPUG00000021167) #25 ENSIPUG00000021175 TCTE1 (ENSIPUG00000021758) #26 rnf8 (ENSIPUG00000021771) tagapb (ENSIPUG00000021794) Ppp2r5a (ENSIPUG00000021816) dtl (ENSIPUG00000021844) ints7 (ENSIPUG00000021865) lpgat1 (ENSIPUG00000021893) nek2 (ENSIPUG00000021927) Slc30a1 (ENSIPUG00000021968) ENSIPUG00000021972 rd3 (ENSIPUG00000021975) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000155500.f ENSGT00390000001445 ENSGT00940000156692 ENSGT00390000000083.a ENSGT00390000005052 ENSGT00910000144260 ENSGT01030000234532.A.a.b.a ENSGT00390000003866.a.b.b ENSGT00940000176161 ENSGT00530000063737.l.a ENSGT00390000016577.b.b ENSGT00940000156087.a.b ENSGT00390000010770 ENSGT00390000007015.x ENSGT00730000111019.e.b ENSGT01020000230401.a.a.a #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120.f #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.a #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00400000022349 ENSGT00940000157993 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b.e.a.b ENSGT01100000263861 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a Electric eel MODERN SPECIES 11 FRRS1 (ENSEEEG00000011711) entpd3 (ENSEEEG00000011744) GASK1A (ENSEEEG00000011758) pomgnt2 (ENSEEEG00000011760) snrka (ENSEEEG00000011762) ano10a (ENSEEEG00000011770) ABHD5 (ENSEEEG00000011782) SLC24A4 (ENSEEEG00000011785) tmem121ab (ENSEEEG00000011786) ENSEEEG00000011787 FUT8 (ENSEEEG00000011788) gphnb (ENSEEEG00000011841) atp6v1d (ENSEEEG00000012603) eif2s1b (ENSEEEG00000012778) rbm25b (ENSEEEG00000012786) hsp90ab1 (ENSEEEG00000012819) #22 slc35b2 (ENSEEEG00000013788) #23 nfkbie (ENSEEEG00000013789) #24 TMEM151B (ENSEEEG00000013790) #25 TCTE1 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ENSCARG00000039720 TCTE1 (ENSCARG00000039660) #26 rnf8 (ENSCARG00000039625) ENSCARG00000039615 ENSCARG00000039605 disp1 (ENSCARG00000039570) ENSCARG00000039557 ENSCARG00000039544 brox (ENSCARG00000039523) aida (ENSCARG00000039492) ENSCARG00000039404 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 142 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000156692.c ENSGT00390000000083.a.c ENSGT00390000005052.y ENSGT00910000144260.b ENSGT00390000005052.z.a.a.b ENSGT01030000234532.A.a.b.a.a ENSGT00390000003866.a.b.b.a ENSGT00530000063737.l.a.a ENSGT00940000163467.b.a.a.a.b ENSGT00390000016577.b.b.f ENSGT00940000156087.a.b.a ENSGT00390000010770.g ENSGT00390000007015.x.a.a ENSGT00730000111019.e.b.d ENSGT01020000230401.a.a.a.g #22 ENSGT00940000157927 #23 ENSGT00940000159120.f.b #24 ENSGT00390000013762.b.a.a.a.c #25 ENSGT00940000159341 #26 ENSGT00400000022349.b ENSGT00830000128368.a.o ENSGT00940000157407.b ENSGT00390000016736.b ENSGT00390000006681.e ENSGT00390000016465.sb.a ENSGT00950000182767.a.e ENSGT00390000011405 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