Vertebrata	DUPLICATION
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.a #22
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.a #22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.a #22
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.a #22
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.a #22
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00390000011228.a	ENSGT00940000162196	ENSGT01030000234625.A	ENSGT00940000156861	ENSGT00940000153792.B	ENSGT00940000157493	ENSGT00990000206767
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	41							ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT01030000234625.A	ENSGT00940000156861	ENSGT00940000153792.B	ENSGT00940000157493	ENSGT00940000154189.A	ENSGT01030000234563.a.a.c.b
Theria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Glires	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
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Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f.a.a #12	ENSGT00390000017780.f.a.b #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
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Squirrel	MODERN SPECIES	167	LGR6 (ENSSTOG00000027585)	PTPN7 (ENSSTOG00000027740) #7	ARL8A (ENSSTOG00000013990) #8	GPR37L1 (ENSSTOG00000009822) #9	ELF3 (ENSSTOG00000024484) #10	RNPEP (ENSSTOG00000009813) #11	ENSSTOG00000031975 #12	LMOD1 (ENSSTOG00000022103) #13	SHISA4 (ENSSTOG00000024090) #14	IPO9 (ENSSTOG00000009786) #15	NAV1 (ENSSTOG00000009754) #16	CSRP1 (ENSSTOG00000009746) #18	PHLDA3 (ENSSTOG00000020561) #19	TNNI1 (ENSSTOG00000012852) #20	LAD1 (ENSSTOG00000019836) #21	TNNT2 (ENSSTOG00000025070) #22	PKP1 (ENSSTOG00000012820) #23	ENSSTOG00000022283 #24	TMEM9 (ENSSTOG00000023985) #25	ASCL5 (ENSSTOG00000032112) #26	CACNA1S (ENSSTOG00000004823) #27	KIF21B (ENSSTOG00000011868) #28	ENSSTOG00000019817	INAVA (ENSSTOG00000026808) #29	GPR25 (ENSSTOG00000023200) #30	CAMSAP2 (ENSSTOG00000013058) #31	DDX59 (ENSSTOG00000027030) #33	ENSSTOG00000029716 #34	ZNF281 (ENSSTOG00000023051) #35	NR5A2 (ENSSTOG00000024925) #36	PTPRC (ENSSTOG00000031147)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	181	LGR6 (ENSUPAG00010008512)	PTPN7 (ENSUPAG00010008685) #7	ARL8A (ENSUPAG00010008698) #8	GPR37L1 (ENSUPAG00010008707) #9	ELF3 (ENSUPAG00010008713) #10	RNPEP (ENSUPAG00010008733) #11	ENSUPAG00010008782 #12	LMOD1 (ENSUPAG00010008800) #13	SHISA4 (ENSUPAG00010008814) #14	IPO9 (ENSUPAG00010008826) #15	NAV1 (ENSUPAG00010008863) #16	CSRP1 (ENSUPAG00010009066) #18	PHLDA3 (ENSUPAG00010009080) #19	ENSUPAG00010009091 #20	LAD1 (ENSUPAG00010009149) #21	TNNT2 (ENSUPAG00010009182) #22	PKP1 (ENSUPAG00010009781) #23	IGFN1 (ENSUPAG00010009795) #24	TMEM9 (ENSUPAG00010009811) #25	ASCL5 (ENSUPAG00010009821) #26	CACNA1S (ENSUPAG00010009832) #27	KIF21B (ENSUPAG00010010173) #28	ENSUPAG00010010216	INAVA (ENSUPAG00010010242) #29	GPR25 (ENSUPAG00010010255) #30	CAMSAP2 (ENSUPAG00010010267) #31	ENSUPAG00010010418	DDX59 (ENSUPAG00010010425) #33	KIF14 (ENSUPAG00010010451) #34
Alpin marmot	MODERN SPECIES	12	PTPN7 (ENSMMMG00000012755) #7	ARL8A (ENSMMMG00000012740) #8	GPR37L1 (ENSMMMG00000012733) #9	ELF3 (ENSMMMG00000012729) #10	RNPEP (ENSMMMG00000012694) #11	TIMM17A (ENSMMMG00000012674) #12	LMOD1 (ENSMMMG00000012662) #13	SHISA4 (ENSMMMG00000012653) #14	IPO9 (ENSMMMG00000012630) #15	ENSMMMG00000012624	NAV1 (ENSMMMG00000012492) #16	CSRP1 (ENSMMMG00000012480) #18	PHLDA3 (ENSMMMG00000012477) #19	TNNI1 (ENSMMMG00000012445) #20	LAD1 (ENSMMMG00000012435) #21	TNNT2 (ENSMMMG00000011614) #22	PKP1 (ENSMMMG00000011570) #23	ENSMMMG00000011539 #24	TMEM9 (ENSMMMG00000011525) #25	ASCL5 (ENSMMMG00000011524) #26	CACNA1S (ENSMMMG00000011045) #27	KIF21B (ENSMMMG00000010947) #28	ENSMMMG00000010908	INAVA (ENSMMMG00000010880) #29	CAMSAP2 (ENSMMMG00000010760) #31	ENSMMMG00000010749	DDX59 (ENSMMMG00000010740) #33	KIF14 (ENSMMMG00000010693) #34	ZNF281 (ENSMMMG00000010689) #35	ENSMMMG00000010688	NR5A2 (ENSMMMG00000010654) #36
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Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT00940000160882
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT00940000160882
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	113	PTPN7 (ENSCLAG00000012076) #7	ARL8A (ENSCLAG00000011411) #8	GPR37L1 (ENSCLAG00000010021) #9	ELF3 (ENSCLAG00000013075) #10	RNPEP (ENSCLAG00000010340) #11	BECN2 (ENSCLAG00000012324)	TIMM17A (ENSCLAG00000012191) #12	LMOD1 (ENSCLAG00000011784) #13	SHISA4 (ENSCLAG00000014882) #14	IPO9 (ENSCLAG00000015074) #15	NAV1 (ENSCLAG00000014432) #16	CSRP1 (ENSCLAG00000012369) #18	PHLDA3 (ENSCLAG00000013962) #19	TNNI1 (ENSCLAG00000011021) #20	LAD1 (ENSCLAG00000010186) #21	TNNT2 (ENSCLAG00000012059) #22	PKP1 (ENSCLAG00000012392) #23	ENSCLAG00000011986 #24	TMEM9 (ENSCLAG00000015016) #25	CACNA1S (ENSCLAG00000010859) #27	KIF21B (ENSCLAG00000011048) #28	ENSCLAG00000011608	INAVA (ENSCLAG00000011144) #29	GPR25 (ENSCLAG00000018046) #30	CAMSAP2 (ENSCLAG00000015462) #31	DDX59 (ENSCLAG00000011057) #33	KIF14 (ENSCLAG00000009896) #34	ZNF281 (ENSCLAG00000011950) #35	NR5A2 (ENSCLAG00000015239) #36	PTPRC (ENSCLAG00000016409)	ATP6V1G3 (ENSCLAG00000009890)
Degu	MODERN SPECIES	50	PTPN7 (ENSODEG00000012148) #7	ARL8A (ENSODEG00000011676) #8	GPR37L1 (ENSODEG00000011302) #9	ENSODEG00000011469 #10	RNPEP (ENSODEG00000012490) #11	TIMM17A (ENSODEG00000011642) #12	LMOD1 (ENSODEG00000010832) #13	SHISA4 (ENSODEG00000011253) #14	IPO9 (ENSODEG00000011377) #15	ENSODEG00000012083	NAV1 (ENSODEG00000010759) #16	ENSODEG00000012247 #18	PHLDA3 (ENSODEG00000019805) #19	TNNI1 (ENSODEG00000012147) #20	LAD1 (ENSODEG00000011384) #21	TNNT2 (ENSODEG00000010655) #22	ENSODEG00000012509 #23	ENSODEG00000011200 #23	ENSODEG00000019852	ENSODEG00000011293 #24	ENSODEG00000011456 #25	CACNA1S (ENSODEG00000011895) #27	KIF21B (ENSODEG00000010856) #28	ENSODEG00000010579	INAVA (ENSODEG00000010120) #29	GPR25 (ENSODEG00000019988) #30	CAMSAP2 (ENSODEG00000009640) #31	DDX59 (ENSODEG00000009771) #33	ENSODEG00000010595 #34	ZNF281 (ENSODEG00000010277) #35	ENSODEG00000019710
Guinea pig	MODERN SPECIES	12	LGR6 (ENSCPOG00000035804)	PTPN7 (ENSCPOG00000003034) #7	ARL8A (ENSCPOG00000023243) #8	GPR37L1 (ENSCPOG00000031335) #9	ELF3 (ENSCPOG00000022807) #10	RNPEP (ENSCPOG00000002589) #11	TIMM17A (ENSCPOG00000035786) #12	LMOD1 (ENSCPOG00000035527) #13	SHISA4 (ENSCPOG00000000765) #14	IPO9 (ENSCPOG00000000762) #15	NAV1 (ENSCPOG00000000758) #16	CSRP1 (ENSCPOG00000037754) #18	PHLDA3 (ENSCPOG00000036401) #19	TNNI1 (ENSCPOG00000026774) #20	LAD1 (ENSCPOG00000005299) #21	TNNT2 (ENSCPOG00000015324) #22	PKP1 (ENSCPOG00000008647) #23	TMEM9 (ENSCPOG00000015557) #25	CACNA1S (ENSCPOG00000024686) #27	KIF21B (ENSCPOG00000001811) #28	ENSCPOG00000022252	INAVA (ENSCPOG00000001810) #29	ENSCPOG00000021748 #30	CAMSAP2 (ENSCPOG00000001809) #31	DDX59 (ENSCPOG00000008420) #33	ENSCPOG00000001994	ENSCPOG00000034914 #34	ENSCPOG00000001993	NR5A2 (ENSCPOG00000008775) #36	PTPRC (ENSCPOG00000009460)	ATP6V1G3 (ENSCPOG00000036154)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	16	ARL8A (ENSHGLG00000004366) #8	GPR37L1 (ENSHGLG00000004730) #9	ENSHGLG00000005529 #10	ENSHGLG00000039596	ENSHGLG00000037733	TIMM17A (ENSHGLG00000048696) #12	LMOD1 (ENSHGLG00000008255) #13	ENSHGLG00000036592 #14	IPO9 (ENSHGLG00000011536) #15	ENSHGLG00000046641 #17	NAV1 (ENSHGLG00000011311) #16	CSRP1 (ENSHGLG00000033272) #18	PHLDA3 (ENSHGLG00000050870) #19	TNNI1 (ENSHGLG00000017757) #20	LAD1 (ENSHGLG00000006023) #21	TNNT2 (ENSHGLG00000007221) #22	PKP1 (ENSHGLG00000003695) #23	ENSHGLG00000003914 #24	TMEM9 (ENSHGLG00000004230) #25	ASCL5 (ENSHGLG00000004297) #26	CACNA1S (ENSHGLG00000005845) #27	KIF21B (ENSHGLG00000007186) #28	ENSHGLG00000009106	INAVA (ENSHGLG00000010860) #29	GPR25 (ENSHGLG00000013000) #30	CAMSAP2 (ENSHGLG00000014631) #31	DDX59 (ENSHGLG00000016068) #33	ENSHGLG00000047325	ENSHGLG00000021199	ENSHGLG00000011815	KIF14 (ENSHGLG00000018503) #34
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	354	Lgr6 (ENSDORG00000005413)	Ptpn7 (ENSDORG00000010483) #7	Arl8a (ENSDORG00000010481) #8	Gpr37l1 (ENSDORG00000010480) #9	Elf3 (ENSDORG00000013470) #10	Rnpep (ENSDORG00000013469) #11	ENSDORG00000013467 #12	Lmod1 (ENSDORG00000013465) #13	Shisa4 (ENSDORG00000013464) #14	ENSDORG00000025169	Nav1 (ENSDORG00000013461) #16	Csrp1 (ENSDORG00000016686) #18	Phlda3 (ENSDORG00000026191) #19	Tnni1 (ENSDORG00000006351) #20	Lad1 (ENSDORG00000006348) #21	Tnnt2 (ENSDORG00000006345) #22	Pkp1 (ENSDORG00000006343) #23	Tmem9 (ENSDORG00000003110) #25	ENSDORG00000028639 #26	Cacna1s (ENSDORG00000015402) #27	Kif21b (ENSDORG00000015395) #28	Mroh3 (ENSDORG00000030033)	ENSDORG00000011995 #29	Camsap2 (ENSDORG00000023981) #31	Ddx59 (ENSDORG00000007702) #33	ENSDORG00000028875 #34	Zfp281 (ENSDORG00000002833) #35	Nr5a2 (ENSDORG00000006587) #36	Ptprc (ENSDORG00000016235)	Atp6v1g3 (ENSDORG00000025262)	Nek7 (ENSDORG00000011235)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT01040000241084
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	2	Arl8a (ENSCGRG00001020777) #8	Gpr37l1 (ENSCGRG00001020435) #9	ENSCGRG00001002861	Elf3 (ENSCGRG00001021475) #10	Rnpep (ENSCGRG00001019333) #11	Timm17a (ENSCGRG00001014322) #12	Lmod1 (ENSCGRG00001013273) #13	Shisa4 (ENSCGRG00001011813) #14	Ipo9 (ENSCGRG00001019976) #15	Nav1 (ENSCGRG00001003396) #16	ENSCGRG00001021412 #17	Csrp1 (ENSCGRG00001022010) #18	Phlda3 (ENSCGRG00001002541) #19	Tnni1 (ENSCGRG00001014916) #20	Lad1 (ENSCGRG00001023271) #21	Tnnt2 (ENSCGRG00001018430) #22	Pkp1 (ENSCGRG00001014719) #23	Tmem9 (ENSCGRG00001012626) #25	Ascl5 (ENSCGRG00001002662) #26	Cacna1s (ENSCGRG00001000583) #27	ENSCGRG00001002509	Kif21b (ENSCGRG00001017388) #28	Mroh3 (ENSCGRG00001002341)	Inava (ENSCGRG00001018254) #29	Gpr25 (ENSCGRG00001002130) #30	Camsap2 (ENSCGRG00001012686) #31	Ddx59 (ENSCGRG00001012693) #33	Kif14 (ENSCGRG00001012823) #34	Zfp281 (ENSCGRG00001010400) #35	Nr5a2 (ENSCGRG00001014323) #36	Ptprc (ENSCGRG00001018920)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	656	Arl8a (ENSMAUG00000005741) #8	Gpr37l1 (ENSMAUG00000015811) #9	Rnpep (ENSMAUG00000008745) #11	Elf3 (ENSMAUG00000004082) #10	Timm17a (ENSMAUG00000000698) #12	ENSMAUG00000006910	Lmod1 (ENSMAUG00000009299) #13	Shisa4 (ENSMAUG00000015952) #14	Ipo9 (ENSMAUG00000020318) #15	Nav1 (ENSMAUG00000001179) #16	ENSMAUG00000008856 #17	Csrp1 (ENSMAUG00000013464) #18	Phlda3 (ENSMAUG00000017752) #19	Tnni1 (ENSMAUG00000012811) #20	Lad1 (ENSMAUG00000005981) #21	Tnnt2 (ENSMAUG00000009854) #22	Pkp1 (ENSMAUG00000013189) #23	Tmem9 (ENSMAUG00000011504) #25	Cacna1s (ENSMAUG00000004666) #27	Kif21b (ENSMAUG00000008131) #28	Mroh3 (ENSMAUG00000013385)	ENSMAUG00000013531 #29	Camsap2 (ENSMAUG00000009233) #31	Ddx59 (ENSMAUG00000015701) #33	ENSMAUG00000001105 #34	Zfp281 (ENSMAUG00000013077) #35	ENSMAUG00000008634 #36	Ptprc (ENSMAUG00000020268)	ENSMAUG00000020084	Atp6v1g3 (ENSMAUG00000018525)	Nek7 (ENSMAUG00000017907)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	2	Ptpn7 (ENSPEMG00000017641) #7	Arl8a (ENSPEMG00000009150) #8	Gpr37l1 (ENSPEMG00000011069) #9	Elf3 (ENSPEMG00000009981) #10	Rnpep (ENSPEMG00000009590) #11	Timm17a (ENSPEMG00000013557) #12	Lmod1 (ENSPEMG00000015971) #13	Shisa4 (ENSPEMG00000019105) #14	Ipo9 (ENSPEMG00000017658) #15	ENSPEMG00000024689	Nav1 (ENSPEMG00000019267) #16	Csrp1 (ENSPEMG00000017819) #18	Phlda3 (ENSPEMG00000019183) #19	Tnni1 (ENSPEMG00000012413) #20	Lad1 (ENSPEMG00000008947) #21	Tnnt2 (ENSPEMG00000017808) #22	Pkp1 (ENSPEMG00000017401) #23	Igfn1 (ENSPEMG00000026548) #24	Tmem9 (ENSPEMG00000010559) #25	Ascl5 (ENSPEMG00000024954) #26	Cacna1s (ENSPEMG00000010619) #27	Kif21b (ENSPEMG00000005001) #28	ENSPEMG00000029892	Mroh3 (ENSPEMG00000000462)	Inava (ENSPEMG00000000963) #29	Gpr25 (ENSPEMG00000026623) #30	Camsap2 (ENSPEMG00000011208) #31	Ddx59 (ENSPEMG00000010715) #33	Kif14 (ENSPEMG00000031000) #34	Zfp281 (ENSPEMG00000004890) #35	ENSPEMG00000027734
Prairie vole	MODERN SPECIES	14	Elf3 (ENSMOCG00000011101) #10	Rnpep (ENSMOCG00000022091) #11	ENSMOCG00000011417 #12	Lmod1 (ENSMOCG00000021948) #13	Shisa4 (ENSMOCG00000022223) #14	Ipo9 (ENSMOCG00000022988) #15	Nav1 (ENSMOCG00000020147) #16	ENSMOCG00000012209 #17	ENSMOCG00000003765	Rab7b (ENSMOCG00000015192)	ENSMOCG00000018588	Csrp1 (ENSMOCG00000003621) #18	Phlda3 (ENSMOCG00000007137) #19	Tnni1 (ENSMOCG00000013469) #20	Lad1 (ENSMOCG00000012808) #21	Tnnt2 (ENSMOCG00000012562) #22	Pkp1 (ENSMOCG00000016418) #23	Tmem9 (ENSMOCG00000021738) #25	Cacna1s (ENSMOCG00000022841) #27	Kif21b (ENSMOCG00000019937) #28	Mroh3 (ENSMOCG00000021368)	ENSMOCG00000015576 #29	Camsap2 (ENSMOCG00000016651) #31	ENSMOCG00000005363	Ddx59 (ENSMOCG00000016551) #33	ENSMOCG00000003804	ENSMOCG00000022166	ENSMOCG00000006538 #34	Zfp281 (ENSMOCG00000011619) #35	ENSMOCG00000006261	ENSMOCG00000010577 #36
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Mus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f.g #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES		Lgr6 (MGP_CAROLIEiJ_G0014630)	Ptpn7 (MGP_CAROLIEiJ_G0014631) #7	Arl8a (MGP_CAROLIEiJ_G0014632) #8	Gpr37l1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014633) #9	Elf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0014634) #10	Rnpep (MGP_CAROLIEiJ_G0014635) #11	Timm17a (MGP_CAROLIEiJ_G0014636) #12	Lmod1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014637) #13	Shisa4 (MGP_CAROLIEiJ_G0014638) #14	Ipo9 (MGP_CAROLIEiJ_G0014639) #15	Nav1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014640) #16	Csrp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014641) #18	Phlda3 (MGP_CAROLIEiJ_G0014642) #19	Tnni1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014643) #20	Lad1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014644) #21	Tnnt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014645) #22	Pkp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014646) #23	MGP_CAROLIEiJ_G0014647 #24	Tmem9 (MGP_CAROLIEiJ_G0014648) #25	Ascl5 (MGP_CAROLIEiJ_G0014649) #26	Cacna1s (MGP_CAROLIEiJ_G0014650) #27	Kif21b (MGP_CAROLIEiJ_G0014651) #28	MGP_CAROLIEiJ_G0014652	Inava (MGP_CAROLIEiJ_G0014653) #29	Gpr25 (MGP_CAROLIEiJ_G0014654) #30	Camsap2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014655) #31	Ddx59 (MGP_CAROLIEiJ_G0014656) #33	Kif14 (MGP_CAROLIEiJ_G0014657) #34	Zfp281 (MGP_CAROLIEiJ_G0014658) #35	Nr5a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014659) #36	Ptprc (MGP_CAROLIEiJ_G0014660)
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f.g #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Mouse	MODERN SPECIES		Ptprv (ENSMUSG00000097993)	Ptpn7 (ENSMUSG00000031506) #7	Arl8a (ENSMUSG00000026426) #8	Gpr37l1 (ENSMUSG00000026424) #9	Elf3 (ENSMUSG00000003051) #10	Rnpep (ENSMUSG00000041926) #11	Timm17a (ENSMUSG00000062580) #12	Lmod1 (ENSMUSG00000048096) #13	Shisa4 (ENSMUSG00000041889) #14	Ipo9 (ENSMUSG00000041879) #15	Nav1 (ENSMUSG00000009418) #16	Csrp1 (ENSMUSG00000026421) #18	Phlda3 (ENSMUSG00000041801) #19	Tnni1 (ENSMUSG00000026418) #20	Lad1 (ENSMUSG00000041782) #21	Tnnt2 (ENSMUSG00000026414) #22	Pkp1 (ENSMUSG00000026413) #23	Igfn1 (ENSMUSG00000051985) #24	Tmem9 (ENSMUSG00000026411) #25	Ascl5 (ENSMUSG00000097918) #26	Cacna1s (ENSMUSG00000026407) #27	Kif21b (ENSMUSG00000041642) #28	Mroh3 (ENSMUSG00000087230)	Inava (ENSMUSG00000041605) #29	Gpr25 (ENSMUSG00000052759) #30	Camsap2 (ENSMUSG00000041570) #31	Ddx59 (ENSMUSG00000026404) #33	Kif14 (ENSMUSG00000041498) #34	Zfp281 (ENSMUSG00000041483) #35	Nr5a2 (ENSMUSG00000026398) #36	Ptprc (ENSMUSG00000026395)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f.g #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
spretus	MODERN SPECIES		Lgr6 (MGP_SPRETEiJ_G0015437)	Ptpn7 (MGP_SPRETEiJ_G0015438) #7	Arl8a (MGP_SPRETEiJ_G0015439) #8	Gpr37l1 (MGP_SPRETEiJ_G0015440) #9	Elf3 (MGP_SPRETEiJ_G0015441) #10	Rnpep (MGP_SPRETEiJ_G0015442) #11	Timm17a (MGP_SPRETEiJ_G0015443) #12	Lmod1 (MGP_SPRETEiJ_G0015444) #13	Shisa4 (MGP_SPRETEiJ_G0015445) #14	Ipo9 (MGP_SPRETEiJ_G0015446) #15	Nav1 (MGP_SPRETEiJ_G0015447) #16	Csrp1 (MGP_SPRETEiJ_G0015448) #18	Phlda3 (MGP_SPRETEiJ_G0015449) #19	Tnni1 (MGP_SPRETEiJ_G0015450) #20	Lad1 (MGP_SPRETEiJ_G0015451) #21	Tnnt2 (MGP_SPRETEiJ_G0015452) #22	Pkp1 (MGP_SPRETEiJ_G0015453) #23	MGP_SPRETEiJ_G0015454 #24	Tmem9 (MGP_SPRETEiJ_G0015455) #25	Ascl5 (MGP_SPRETEiJ_G0015456) #26	Cacna1s (MGP_SPRETEiJ_G0015457) #27	Kif21b (MGP_SPRETEiJ_G0015458) #28	Mroh3 (MGP_SPRETEiJ_G0015459)	Inava (MGP_SPRETEiJ_G0015460) #29	Gpr25 (MGP_SPRETEiJ_G0015461) #30	Camsap2 (MGP_SPRETEiJ_G0015462) #31	Ddx59 (MGP_SPRETEiJ_G0015463) #33	Kif14 (MGP_SPRETEiJ_G0015464) #34	Zfp281 (MGP_SPRETEiJ_G0015465) #35	Nr5a2 (MGP_SPRETEiJ_G0015466) #36	Ptprc (MGP_SPRETEiJ_G0015467)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3299	Gpr37l1 (ENSMSIG00000016930) #9	Elf3 (ENSMSIG00000016889) #10	Rnpep (ENSMSIG00000016833) #11	ENSMSIG00000016819	Timm17a (ENSMSIG00000016796) #12	Lmod1 (ENSMSIG00000016771) #13	ENSMSIG00000016765 #14	Ipo9 (ENSMSIG00000016676) #15	ENSMSIG00000016668	ENSMSIG00000016660 #17	Nav1 (ENSMSIG00000016388) #16	Csrp1 (ENSMSIG00000016352) #18	Phlda3 (ENSMSIG00000016346) #19	Tnni1 (ENSMSIG00000016248) #20	Lad1 (ENSMSIG00000016232) #21	Tnnt2 (ENSMSIG00000013795) #22	Pkp1 (ENSMSIG00000013746) #23	Igfn1 (ENSMSIG00000013674) #24	ENSMSIG00000013605 #25	Ascl5 (ENSMSIG00000013596) #26	Cacna1s (ENSMSIG00000013188) #27	Kif21b (ENSMSIG00000012992) #28	Mroh3 (ENSMSIG00000012959)	Inava (ENSMSIG00000012900) #29	ENSMSIG00000012897	Gpr25 (ENSMSIG00000012892) #30	Camsap2 (ENSMSIG00000012647) #31	ENSMSIG00000012627	Ddx59 (ENSMSIG00000012596) #33	ENSMSIG00000012582	Kif14 (ENSMSIG00000012445) #34
Shrew mouse	MODERN SPECIES	18	Lgr6 (MGP_PahariEiJ_G0027866)	Ptpn7 (MGP_PahariEiJ_G0027867) #7	Arl8a (MGP_PahariEiJ_G0027868) #8	Gpr37l1 (MGP_PahariEiJ_G0027869) #9	Elf3 (MGP_PahariEiJ_G0027870) #10	Rnpep (MGP_PahariEiJ_G0027871) #11	Timm17a (MGP_PahariEiJ_G0027872) #12	Lmod1 (MGP_PahariEiJ_G0027873) #13	Shisa4 (MGP_PahariEiJ_G0027874) #14	Ipo9 (MGP_PahariEiJ_G0027875) #15	Nav1 (MGP_PahariEiJ_G0027876) #16	Csrp1 (MGP_PahariEiJ_G0027877) #18	Phlda3 (MGP_PahariEiJ_G0027878) #19	Tnni1 (MGP_PahariEiJ_G0027879) #20	Lad1 (MGP_PahariEiJ_G0027880) #21	Tnnt2 (MGP_PahariEiJ_G0027881) #22	Pkp1 (MGP_PahariEiJ_G0027882) #23	MGP_PahariEiJ_G0027883 #24	Tmem9 (MGP_PahariEiJ_G0027884) #25	Ascl5 (MGP_PahariEiJ_G0027885) #26	Cacna1s (MGP_PahariEiJ_G0027886) #27	Kif21b (MGP_PahariEiJ_G0027887) #28	MGP_PahariEiJ_G0027888	Inava (MGP_PahariEiJ_G0027889) #29	Gpr25 (MGP_PahariEiJ_G0027890) #30	Camsap2 (MGP_PahariEiJ_G0027891) #31	Ddx59 (MGP_PahariEiJ_G0027892) #33	Kif14 (MGP_PahariEiJ_G0027893) #34	Zfp281 (MGP_PahariEiJ_G0027894) #35	Nr5a2 (MGP_PahariEiJ_G0027895) #36	Ptprc (MGP_PahariEiJ_G0027896)
Rat	MODERN SPECIES	4	Ptpn7 (ENSRNOG00000005807) #7	Arl8a (ENSRNOG00000005988) #8	Gpr37l1 (ENSRNOG00000006237) #9	Elf3 (ENSRNOG00000006330) #10	Rnpep (ENSRNOG00000006720) #11	Timm17a (ENSRNOG00000007040) #12	Lmod1 (ENSRNOG00000051548) #13	Shisa4 (ENSRNOG00000007369) #14	Ipo9 (ENSRNOG00000007418) #15	Nav1 (ENSRNOG00000008425) #16	AABR07020999.1 (ENSRNOG00000026400) #17	Csrp1 (ENSRNOG00000008937) #18	Phlda3 (ENSRNOG00000009068) #19	Tnni1 (ENSRNOG00000009073) #20	Lad1 (ENSRNOG00000009144) #21	Tnnt2 (ENSRNOG00000033734) #22	Pkp1 (ENSRNOG00000010076) #23	Igfn1 (ENSRNOG00000026087) #24	Tmem9 (ENSRNOG00000010204) #25	Ascl5 (ENSRNOG00000033391) #26	Cacna1s (ENSRNOG00000046231) #27	Kif21b (ENSRNOG00000008471) #28	Mroh3 (ENSRNOG00000025987)	LOC103691922 (ENSRNOG00000025964)	Inava (ENSRNOG00000025948) #29	Gpr25 (ENSRNOG00000008603) #30	Camsap2 (ENSRNOG00000008741) #31	AABR07021008.1 (ENSRNOG00000030278)	Ddx59 (ENSRNOG00000042451) #33	Kif14 (ENSRNOG00000037211) #34	ENSRNOG00000069163
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	699	Lgr6 (ENSNGAG00000006200)	Ptpn7 (ENSNGAG00000021336) #7	Arl8a (ENSNGAG00000007576) #8	Gpr37l1 (ENSNGAG00000005067) #9	Elf3 (ENSNGAG00000019716) #10	Rnpep (ENSNGAG00000023647) #11	Timm17a (ENSNGAG00000020765) #12	Lmod1 (ENSNGAG00000004559) #13	Shisa4 (ENSNGAG00000014499) #14	Ipo9 (ENSNGAG00000014956) #15	Nav1 (ENSNGAG00000024038) #16	Csrp1 (ENSNGAG00000019381) #18	Phlda3 (ENSNGAG00000022425) #19	Tnni1 (ENSNGAG00000023756) #20	Lad1 (ENSNGAG00000024290) #21	Tnnt2 (ENSNGAG00000021109) #22	Pkp1 (ENSNGAG00000001435) #23	Tmem9 (ENSNGAG00000017087) #25	Cacna1s (ENSNGAG00000011324) #27	Kif21b (ENSNGAG00000023527) #28	Mroh3 (ENSNGAG00000024074)	ENSNGAG00000014587 #29	Gpr25 (ENSNGAG00000001594) #30	ENSNGAG00000022050	Camsap2 (ENSNGAG00000024043) #31	Ddx59 (ENSNGAG00000021782) #33	ENSNGAG00000014777 #34	Zfp281 (ENSNGAG00000020911) #35	ENSNGAG00000024180	ENSNGAG00000014002 #36	ENSNGAG00000002284
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	193	Lgr6 (ENSJJAG00000023003)	Ptpn7 (ENSJJAG00000020438) #7	Arl8a (ENSJJAG00000023105) #8	Gpr37l1 (ENSJJAG00000022800) #9	Elf3 (ENSJJAG00000021509) #10	Rnpep (ENSJJAG00000017365) #11	ENSJJAG00000016864 #12	Lmod1 (ENSJJAG00000015762) #13	Shisa4 (ENSJJAG00000015452) #14	Ipo9 (ENSJJAG00000012560) #15	Nav1 (ENSJJAG00000000946) #16	Csrp1 (ENSJJAG00000023165) #18	Phlda3 (ENSJJAG00000012425) #19	Tnni1 (ENSJJAG00000011268) #20	Lad1 (ENSJJAG00000010044) #21	Tnnt2 (ENSJJAG00000008781) #22	Pkp1 (ENSJJAG00000007707) #23	Igfn1 (ENSJJAG00000001570) #24
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT00940000160882	ENSGT00940000156725
Pika	MODERN SPECIES	2755															LAD1 (ENSOPRG00000011841) #21	TNNT2 (ENSOPRG00000011815) #22	PKP1 (ENSOPRG00000011792) #23	ENSOPRG00000011771 #24
Rabbit	MODERN SPECIES	7	ARL8A (ENSOCUG00000023009) #8	ENSOCUG00000029129 #9	ELF3 (ENSOCUG00000007502) #10	RNPEP (ENSOCUG00000022087) #11	ENSOCUG00000007498 #12	LMOD1 (ENSOCUG00000007492) #13	SHISA4 (ENSOCUG00000007489) #14	IPO9 (ENSOCUG00000007477) #15	NAV1 (ENSOCUG00000007461) #16	ENSOCUG00000036001 #17	ENSOCUG00000036541	CSRP1 (ENSOCUG00000010299) #18	PHLDA3 (ENSOCUG00000024503) #19	TNNI1 (ENSOCUG00000010424) #20	LAD1 (ENSOCUG00000007730) #21	ENSOCUG00000015634 #22	PKP1 (ENSOCUG00000021242) #23	TMEM9 (ENSOCUG00000005561) #25	CACNA1S (ENSOCUG00000003619) #27	KIF21B (ENSOCUG00000003606) #28	ENSOCUG00000025825	INAVA (ENSOCUG00000021508) #29	CAMSAP2 (ENSOCUG00000007754) #31	DDX59 (ENSOCUG00000016514) #33	KIF14 (ENSOCUG00000016491) #34	ZNF281 (ENSOCUG00000010120) #35	ENSOCUG00000006240 #36	ENSOCUG00000024252	PTPRC (ENSOCUG00000011981)	ATP6V1G3 (ENSOCUG00000000239)	ENSOCUG00000022991
Tree shrew	MODERN SPECIES	757															LAD1 (ENSTBEG00000009344) #21	TNNT2 (ENSTBEG00000008727) #22	PKP1 (ENSTBEG00000007703) #23	ENSTBEG00000006851 #24	TMEM9 (ENSTBEG00000006633) #25	CACNA1S (ENSTBEG00000004297) #27	KIF21B (ENSTBEG00000002055) #28	INAVA (ENSTBEG00000001191) #29	ENSTBEG00000009419 #31
Primates	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT00910000146522	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT00910000146522	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000155445.f	ENSGT00940000153391.c.b.b #36
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000155445.f	ENSGT00940000153391.c.b.b #36
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	85	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00910000146886	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00390000003897.s.b.a.a.b.f	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000155445.f
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1292	PTPN7 (ENSRBIG00000006954) #7	ARL8A (ENSRBIG00000044455) #8	GPR37L1 (ENSRBIG00000031674) #9	ELF3 (ENSRBIG00000040131) #10	RNPEP (ENSRBIG00000040090) #11	TIMM17A (ENSRBIG00000041192) #12	LMOD1 (ENSRBIG00000012326) #13	SHISA4 (ENSRBIG00000038365) #14	IPO9 (ENSRBIG00000038277) #15	ENSRBIG00000040606	NAV1 (ENSRBIG00000040225) #16	CSRP1 (ENSRBIG00000031901) #18	PHLDA3 (ENSRBIG00000024496) #19	TNNI1 (ENSRBIG00000028608) #20	LAD1 (ENSRBIG00000040690) #21	TNNT2 (ENSRBIG00000035257) #22	PKP1 (ENSRBIG00000032956) #23	IGFN1 (ENSRBIG00000008024) #24	TMEM9 (ENSRBIG00000008529) #25	ASCL5 (ENSRBIG00000016841) #26	CACNA1S (ENSRBIG00000026701) #27	ENSRBIG00000023840	KIF21B (ENSRBIG00000011702) #28	INAVA (ENSRBIG00000041196) #29	GPR25 (ENSRBIG00000014302) #30	ENSRBIG00000013689	CAMSAP2 (ENSRBIG00000035391) #31	DDX59 (ENSRBIG00000043232) #33	ENSRBIG00000027672	KIF14 (ENSRBIG00000035385) #34	ZNF281 (ENSRBIG00000033514) #35
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1033																TNNT2 (ENSRROG00000008727) #22	PKP1 (ENSRROG00000030958) #23	IGFN1 (ENSRROG00000045247) #24	TMEM9 (ENSRROG00000037404) #25	ASCL5 (ENSRROG00000023978) #26	CACNA1S (ENSRROG00000036248) #27	ENSRROG00000039751	KIF21B (ENSRROG00000035471) #28	INAVA (ENSRROG00000035907) #29	GPR25 (ENSRROG00000012284) #30	ENSRROG00000014110	CAMSAP2 (ENSRROG00000035363) #31	DDX59 (ENSRROG00000042119) #33	ENSRROG00000018645	KIF14 (ENSRROG00000040036) #34	ENSRROG00000037002
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000155445.f	ENSGT00940000153391.c.b.b #36
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	17	LGR6 (ENSCSAG00000014130)	PTPN7 (ENSCSAG00000014118) #7	ARL8A (ENSCSAG00000014093) #8	GPR37L1 (ENSCSAG00000014085) #9	ELF3 (ENSCSAG00000014076) #10	RNPEP (ENSCSAG00000014067) #11	LMOD1 (ENSCSAG00000014056) #13	SHISA4 (ENSCSAG00000014044) #14	IPO9 (ENSCSAG00000014031) #15	NAV1 (ENSCSAG00000014015) #16	ENSCSAG00000000254	CSRP1 (ENSCSAG00000014006) #18	PHLDA3 (ENSCSAG00000000253) #19	TNNI1 (ENSCSAG00000013998) #20	LAD1 (ENSCSAG00000013986) #21	TNNT2 (ENSCSAG00000013948) #22	PKP1 (ENSCSAG00000013888) #23	TMEM9 (ENSCSAG00000013860) #25	ASCL5 (ENSCSAG00000000252) #26	CACNA1S (ENSCSAG00000013846) #27	KIF21B (ENSCSAG00000013828) #28	INAVA (ENSCSAG00000013813) #29	GPR25 (ENSCSAG00000000251) #30	CAMSAP2 (ENSCSAG00000013807) #31	DDX59 (ENSCSAG00000013799) #33	KIF14 (ENSCSAG00000013776) #34	ZNF281 (ENSCSAG00000000250) #35	NR5A2 (ENSCSAG00000013702) #36	ENSCSAG00000000249	PTPRC (ENSCSAG00000013674)	ENSCSAG00000013661
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000155445.f	ENSGT00940000153391.c.b.b #36
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00910000146886	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000155445.f
Olive baboon	MODERN SPECIES		PTPN7 (ENSPANG00000015835) #7	ARL8A (ENSPANG00000006549) #8	GPR37L1 (ENSPANG00000017272) #9	ENSPANG00000037181	ELF3 (ENSPANG00000009054) #10	RNPEP (ENSPANG00000013414) #11	TIMM17A (ENSPANG00000021348) #12	LMOD1 (ENSPANG00000011450) #13	SHISA4 (ENSPANG00000009053) #14	IPO9 (ENSPANG00000026214) #15	NAV1 (ENSPANG00000005199) #16	CSRP1 (ENSPANG00000024051) #18	PHLDA3 (ENSPANG00000015274) #19	TNNI1 (ENSPANG00000020398) #20	LAD1 (ENSPANG00000013150) #21	TNNT2 (ENSPANG00000014888) #22	PKP1 (ENSPANG00000018373) #23	ENSPANG00000009052 #24	TMEM9 (ENSPANG00000046712) #25	ASCL5 (ENSPANG00000016203) #26	CACNA1S (ENSPANG00000017271) #27	KIF21B (ENSPANG00000018968) #28	ENSPANG00000050807	ENSPANG00000045170	INAVA (ENSPANG00000016202) #29	GPR25 (ENSPANG00000007959) #30	CAMSAP2 (ENSPANG00000001373) #31	DDX59 (ENSPANG00000017384) #33	KIF14 (ENSPANG00000017385) #34	ENSPANG00000045182	ZNF281 (ENSPANG00000017386) #35
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00910000146886	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000155445.f	ENSGT00940000153391.c.b.b #36
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	106	PTPN7 (ENSCATG00000042478) #7	ARL8A (ENSCATG00000041869) #8	GPR37L1 (ENSCATG00000036656) #9	ELF3 (ENSCATG00000035893) #10	RNPEP (ENSCATG00000028344) #11	TIMM17A (ENSCATG00000013023) #12	LMOD1 (ENSCATG00000039243) #13	SHISA4 (ENSCATG00000038919) #14	IPO9 (ENSCATG00000045312) #15	ENSCATG00000037262	NAV1 (ENSCATG00000019102) #16	CSRP1 (ENSCATG00000035500) #18	PHLDA3 (ENSCATG00000014459) #19	TNNI1 (ENSCATG00000018765) #20	LAD1 (ENSCATG00000008418) #21	TNNT2 (ENSCATG00000031720) #22	PKP1 (ENSCATG00000035705) #23	IGFN1 (ENSCATG00000031019) #24	TMEM9 (ENSCATG00000039769) #25	ASCL5 (ENSCATG00000015434) #26	CACNA1S (ENSCATG00000042068) #27	ENSCATG00000036317	KIF21B (ENSCATG00000029377) #28	INAVA (ENSCATG00000045224) #29	GPR25 (ENSCATG00000015537) #30	CAMSAP2 (ENSCATG00000044456) #31	DDX59 (ENSCATG00000039084) #33	KIF14 (ENSCATG00000041751) #34	NR5A2 (ENSCATG00000045134) #36	ENSCATG00000043649	PTPRC (ENSCATG00000024826)
Drill	MODERN SPECIES	1046	ELF3 (ENSMLEG00000011371) #10	RNPEP (ENSMLEG00000037728) #11	TIMM17A (ENSMLEG00000029422) #12	LMOD1 (ENSMLEG00000043462) #13	SHISA4 (ENSMLEG00000034649) #14	IPO9 (ENSMLEG00000030171) #15	ENSMLEG00000019453	NAV1 (ENSMLEG00000034018) #16	ENSMLEG00000039774	ENSMLEG00000034367	CSRP1 (ENSMLEG00000029334) #18	PHLDA3 (ENSMLEG00000023965) #19	ENSMLEG00000030504	TNNI1 (ENSMLEG00000029665) #20	LAD1 (ENSMLEG00000042833) #21	TNNT2 (ENSMLEG00000042858) #22	PKP1 (ENSMLEG00000038912) #23	ENSMLEG00000036496 #24	ENSMLEG00000036164	ASCL5 (ENSMLEG00000015159) #26	CACNA1S (ENSMLEG00000041379) #27	KIF21B (ENSMLEG00000039847) #28	ENSMLEG00000042363	INAVA (ENSMLEG00000012836) #29	GPR25 (ENSMLEG00000001037) #30	CAMSAP2 (ENSMLEG00000043071) #31	DDX59 (ENSMLEG00000042339) #33	KIF14 (ENSMLEG00000022344) #34	ZNF281 (ENSMLEG00000043050) #35	ENSMLEG00000040121	NR5A2 (ENSMLEG00000043238) #36
Macaca	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000155445.f	ENSGT00940000153391.c.b.b #36
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	113	ARL8A (ENSMNEG00000039827) #8	GPR37L1 (ENSMNEG00000028842) #9	ELF3 (ENSMNEG00000044616) #10	RNPEP (ENSMNEG00000034207) #11	TIMM17A (ENSMNEG00000038000) #12	LMOD1 (ENSMNEG00000039137) #13	SHISA4 (ENSMNEG00000041267) #14	IPO9 (ENSMNEG00000043396) #15	ENSMNEG00000024467	ENSMNEG00000034937	NAV1 (ENSMNEG00000040347) #16	CSRP1 (ENSMNEG00000037309) #18	PHLDA3 (ENSMNEG00000003230) #19	TNNI1 (ENSMNEG00000041578) #20	LAD1 (ENSMNEG00000044700) #21	TNNT2 (ENSMNEG00000041011) #22	PKP1 (ENSMNEG00000037688) #23	IGFN1 (ENSMNEG00000045262) #24	TMEM9 (ENSMNEG00000042765) #25	ASCL5 (ENSMNEG00000028774) #26	CACNA1S (ENSMNEG00000024910) #27	KIF21B (ENSMNEG00000030089) #28	INAVA (ENSMNEG00000033445) #29	GPR25 (ENSMNEG00000007644) #30	CAMSAP2 (ENSMNEG00000043467) #31	DDX59 (ENSMNEG00000040640) #33	KIF14 (ENSMNEG00000035969) #34	ZNF281 (ENSMNEG00000042566) #35	ENSMNEG00000044738	NR5A2 (ENSMNEG00000035152) #36	ENSMNEG00000041439
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00910000146522	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT01100000263539.b.b.b.b.a.a.b.a.b.c.b.a	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36
Rhesus	MODERN SPECIES		PTPN7 (ENSMMUG00000013789) #7	ARL8A (ENSMMUG00000031357) #8	GPR37L1 (ENSMMUG00000013788) #9	ELF3 (ENSMMUG00000001929) #10	RNPEP (ENSMMUG00000001926) #11	TIMM17A (ENSMMUG00000001924) #12	LMOD1 (ENSMMUG00000001923) #13	SHISA4 (ENSMMUG00000001921) #14	IPO9 (ENSMMUG00000001916) #15	NAV1 (ENSMMUG00000001908) #16	CSRP1 (ENSMMUG00000020772) #18	ENSMMUG00000047008	PHLDA3 (ENSMMUG00000061689) #19	TNNI1 (ENSMMUG00000046222) #20	LAD1 (ENSMMUG00000013507) #21	TNNT2 (ENSMMUG00000056199) #22	PKP1 (ENSMMUG00000013506) #23	IGFN1 (ENSMMUG00000013504) #24	TMEM9 (ENSMMUG00000013500) #25	ASCL5 (ENSMMUG00000017419) #26	CACNA1S (ENSMMUG00000017414) #27	KIF21B (ENSMMUG00000005921) #28	ENSMMUG00000052462	INAVA (ENSMMUG00000063678) #29	GPR25 (ENSMMUG00000012219) #30	CAMSAP2 (ENSMMUG00000012218) #31	DDX59 (ENSMMUG00000004268) #33	KIF14 (ENSMMUG00000004266) #34	ENSMMUG00000050830	ZNF281 (ENSMMUG00000007334) #35	NR5A2 (ENSMMUG00000016188) #36
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES		ENSMFAG00000061200	ELF3 (ENSMFAG00000037333) #10	RNPEP (ENSMFAG00000001997) #11	TIMM17A (ENSMFAG00000000231) #12	LMOD1 (ENSMFAG00000039790) #13	SHISA4 (ENSMFAG00000061611) #14	IPO9 (ENSMFAG00000035917) #15	ENSMFAG00000050385	NAV1 (ENSMFAG00000029861) #16	ENSMFAG00000062599	ENSMFAG00000048627	CSRP1 (ENSMFAG00000033632) #18	ENSMFAG00000024602	TNNI1 (ENSMFAG00000037331) #20	LAD1 (ENSMFAG00000044742) #21	TNNT2 (ENSMFAG00000003567) #22	PKP1 (ENSMFAG00000003596) #23	ENSMFAG00000045449 #24	TMEM9 (ENSMFAG00000041944) #25	CACNA1S (ENSMFAG00000037274) #27	KIF21B (ENSMFAG00000039907) #28	ENSMFAG00000057843	INAVA (ENSMFAG00000000317) #29	CAMSAP2 (ENSMFAG00000041258) #31	DDX59 (ENSMFAG00000035416) #33	KIF14 (ENSMFAG00000045576) #34	ENSMFAG00000059218	ZNF281 (ENSMFAG00000001954) #35	ENSMFAG00000051342	NR5A2 (ENSMFAG00000036373) #36	ENSMFAG00000049855
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00490000044158	ENSGT00440000034918.q.a.a.b.b.a	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT00910000146522	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00910000146886	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000155445.f	ENSGT00940000153391.c.b.b #36
Gibbon	MODERN SPECIES	24	ELF3 (ENSNLEG00000032926) #10	RNPEP (ENSNLEG00000018090) #11	TIMM17A (ENSNLEG00000029135) #12	LMOD1 (ENSNLEG00000018088) #13	SHISA4 (ENSNLEG00000018087) #14	IPO9 (ENSNLEG00000018086) #15	ENSNLEG00000034945	NAV1 (ENSNLEG00000018085) #16	ENSNLEG00000034335	ENSNLEG00000028192	ENSNLEG00000030945	CSRP1 (ENSNLEG00000018083) #18	PHLDA3 (ENSNLEG00000035700) #19	TNNI1 (ENSNLEG00000033080) #20	LAD1 (ENSNLEG00000018080) #21	ENSNLEG00000018079 #22	PKP1 (ENSNLEG00000018078) #23	ENSNLEG00000018077 #24	TMEM9 (ENSNLEG00000018076) #25	CACNA1S (ENSNLEG00000018075) #27	KIF21B (ENSNLEG00000018074) #28	ENSNLEG00000018073	INAVA (ENSNLEG00000018072) #29	CAMSAP2 (ENSNLEG00000018070) #31	DDX59 (ENSNLEG00000018069) #33	KIF14 (ENSNLEG00000018068) #34	ZNF281 (ENSNLEG00000018067) #35	ENSNLEG00000030544	NR5A2 (ENSNLEG00000018066) #36	PTPRC (ENSNLEG00000018065)	ATP6V1G3 (ENSNLEG00000018064)
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00490000044158	ENSGT00440000034918.q.a.a.b.b.a	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT00910000146522	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00910000146886	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00910000147495
Orangutan	MODERN SPECIES		GPR37L1 (ENSPPYG00000000353) #9	ELF3 (ENSPPYG00000000354) #10	RNPEP (ENSPPYG00000000355) #11	TIMM17A (ENSPPYG00000000356) #12	LMOD1 (ENSPPYG00000000357) #13	SHISA4 (ENSPPYG00000000358) #14	ENSPPYG00000035318	IPO9 (ENSPPYG00000029377) #15	NAV1 (ENSPPYG00000000359) #16	ENSPPYG00000040915	ENSPPYG00000034597	CSRP1 (ENSPPYG00000000361) #18	PHLDA3 (ENSPPYG00000000362) #19	TNNI1 (ENSPPYG00000010640) #20	LAD1 (ENSPPYG00000000363) #21	ENSPPYG00000000364 #22	PKP1 (ENSPPYG00000000365) #23	ENSPPYG00000000366 #24	TMEM9 (ENSPPYG00000000367) #25	ASCL5 (ENSPPYG00000040755) #26	CACNA1S (ENSPPYG00000000369) #27	KIF21B (ENSPPYG00000000371) #28	INAVA (ENSPPYG00000000372) #29	GPR25 (ENSPPYG00000000373) #30	CAMSAP2 (ENSPPYG00000000374) #31	DDX59 (ENSPPYG00000025828) #33	KIF14 (ENSPPYG00000000376) #34	ZNF281 (ENSPPYG00000030430) #35	NR5A2 (ENSPPYG00000000379) #36	PTPRC (ENSPPYG00000000380)	ATP6V1G3 (ENSPPYG00000000382)
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT00910000146522	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00910000146886	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00910000147495
Gorilla	MODERN SPECIES		GPR37L1 (ENSGGOG00000003800) #9	ELF3 (ENSGGOG00000014183) #10	RNPEP (ENSGGOG00000014172) #11	TIMM17A (ENSGGOG00000008415) #12	LMOD1 (ENSGGOG00000028449) #13	SHISA4 (ENSGGOG00000006801) #14	IPO9 (ENSGGOG00000006787) #15	ENSGGOG00000042885	NAV1 (ENSGGOG00000006773) #16	ENSGGOG00000022738	CSRP1 (ENSGGOG00000004840) #18	PHLDA3 (ENSGGOG00000037874) #19	ENSGGOG00000004839	TNNI1 (ENSGGOG00000012698) #20	LAD1 (ENSGGOG00000012687) #21	TNNT2 (ENSGGOG00000012669) #22	PKP1 (ENSGGOG00000012651) #23	ENSGGOG00000028604 #24	TMEM9 (ENSGGOG00000005804) #25	CACNA1S (ENSGGOG00000001201) #27	ENSGGOG00000042186	KIF21B (ENSGGOG00000001197) #28	INAVA (ENSGGOG00000027521) #29	ENSGGOG00000036548 #30	ENSGGOG00000038804 #30	CAMSAP2 (ENSGGOG00000010861) #31	DDX59 (ENSGGOG00000014615) #33	KIF14 (ENSGGOG00000013809) #34	ENSGGOG00000038922	NR5A2 (ENSGGOG00000010226) #36	ENSGGOG00000043998
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT00910000146522	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00910000146886	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00910000147495
Human	MODERN SPECIES		LGR6 (ENSG00000133067)	PTPN7 (ENSG00000143851) #7	ARL8A (ENSG00000143862) #8	GPR37L1 (ENSG00000170075) #9	ELF3 (ENSG00000163435) #10	RNPEP (ENSG00000176393) #11	TIMM17A (ENSG00000134375) #12	LMOD1 (ENSG00000163431) #13	SHISA4 (ENSG00000198892) #14	IPO9 (ENSG00000198700) #15	NAV1 (ENSG00000134369) #16	CSRP1 (ENSG00000159176) #18	PHLDA3 (ENSG00000174307) #19	TNNI1 (ENSG00000159173) #20	LAD1 (ENSG00000159166) #21	TNNT2 (ENSG00000118194) #22	PKP1 (ENSG00000081277) #23	IGFN1 (ENSG00000163395) #24	TMEM9 (ENSG00000116857) #25	ASCL5 (ENSG00000232237) #26	CACNA1S (ENSG00000081248) #27	KIF21B (ENSG00000116852) #28	INAVA (ENSG00000163362) #29	GPR25 (ENSG00000170128) #30	CAMSAP2 (ENSG00000118200) #31	DDX59 (ENSG00000118197) #33	KIF14 (ENSG00000118193) #34	ZNF281 (ENSG00000162702) #35	NR5A2 (ENSG00000116833) #36	PTPRC (ENSG00000081237)	ATP6V1G3 (ENSG00000151418)
Pan	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT00910000146522	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00910000146886	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000155445.f	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00910000147495
Chimpanzee	MODERN SPECIES		ARL8A (ENSPTRG00000001846) #8	GPR37L1 (ENSPTRG00000001845) #9	ELF3 (ENSPTRG00000001844) #10	RNPEP (ENSPTRG00000001843) #11	TIMM17A (ENSPTRG00000001842) #12	LMOD1 (ENSPTRG00000001841) #13	SHISA4 (ENSPTRG00000001839) #14	IPO9 (ENSPTRG00000023652) #15	NAV1 (ENSPTRG00000001837) #16	ENSPTRG00000048301	CSRP1 (ENSPTRG00000001836) #18	PHLDA3 (ENSPTRG00000047455) #19	ENSPTRG00000001835	TNNI1 (ENSPTRG00000001834) #20	LAD1 (ENSPTRG00000001833) #21	TNNT2 (ENSPTRG00000001832) #22	PKP1 (ENSPTRG00000001831) #23	IGFN1 (ENSPTRG00000049308) #24	TMEM9 (ENSPTRG00000001829) #25	ASCL5 (ENSPTRG00000051709) #26	CACNA1S (ENSPTRG00000001827) #27	KIF21B (ENSPTRG00000001825) #28	INAVA (ENSPTRG00000001824) #29	GPR25 (ENSPTRG00000001823) #30	CAMSAP2 (ENSPTRG00000001822) #31	DDX59 (ENSPTRG00000001821) #33	KIF14 (ENSPTRG00000001820) #34	NR5A2 (ENSPTRG00000001818) #36	ENSPTRG00000044327	ENSPTRG00000050013	PTPRC (ENSPTRG00000001817)
Bonobo	MODERN SPECIES		GPR37L1 (ENSPPAG00000037162) #9	ELF3 (ENSPPAG00000035813) #10	RNPEP (ENSPPAG00000038397) #11	TIMM17A (ENSPPAG00000027429) #12	LMOD1 (ENSPPAG00000035452) #13	SHISA4 (ENSPPAG00000041154) #14	IPO9 (ENSPPAG00000037356) #15	ENSPPAG00000033726	NAV1 (ENSPPAG00000032938) #16	ENSPPAG00000006393	CSRP1 (ENSPPAG00000008502) #18	PHLDA3 (ENSPPAG00000018747) #19	ENSPPAG00000012629	TNNI1 (ENSPPAG00000022888) #20	LAD1 (ENSPPAG00000029203) #21	ENSPPAG00000031050 #22	PKP1 (ENSPPAG00000013857) #23	ENSPPAG00000019723 #24	TMEM9 (ENSPPAG00000038561) #25	CACNA1S (ENSPPAG00000040299) #27	ENSPPAG00000035321	KIF21B (ENSPPAG00000040735) #28	INAVA (ENSPPAG00000029036) #29	GPR25 (ENSPPAG00000012221) #30	CAMSAP2 (ENSPPAG00000027662) #31	DDX59 (ENSPPAG00000031649) #33	KIF14 (ENSPPAG00000000158) #34	ENSPPAG00000032515	NR5A2 (ENSPPAG00000038856) #36	ENSPPAG00000034716	ENSPPAG00000032350
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT00910000146522	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00910000146886	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00730000110997.k.a.p.b	ENSGT00940000153391.c.b.b.o #36
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00730000110997.k.a.p.b	ENSGT00940000153391.c.b.b.o #36	ENSGT00940000163099.h
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00910000146850	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00910000144184.q.b.b.a.b.g.b	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00730000110997.k.a.p.b	ENSGT00940000153391.c.b.b.o #36	ENSGT00940000163099.h
Capuchin	MODERN SPECIES	257		ENSCCAG00000004495	ELF3 (ENSCCAG00000026383) #10	RNPEP (ENSCCAG00000032153) #11	TIMM17A (ENSCCAG00000029261) #12	LMOD1 (ENSCCAG00000020253) #13	SHISA4 (ENSCCAG00000010420) #14	IPO9 (ENSCCAG00000021455) #15	ENSCCAG00000023690	ENSCCAG00000025971	NAV1 (ENSCCAG00000036185) #16	ENSCCAG00000003885 #18	PHLDA3 (ENSCCAG00000000421) #19	TNNI1 (ENSCCAG00000023627) #20	LAD1 (ENSCCAG00000023575) #21	TNNT2 (ENSCCAG00000022583) #22	ENSCCAG00000019071	PKP1 (ENSCCAG00000019055) #23	ENSCCAG00000020090	ENSCCAG00000020569 #24	TMEM9 (ENSCCAG00000033719) #25	CACNA1S (ENSCCAG00000028827) #27	KIF21B (ENSCCAG00000032793) #28	INAVA (ENSCCAG00000025184) #29	GPR25 (ENSCCAG00000017997) #30	ENSCCAG00000032189	ENSCCAG00000025521	CAMSAP2 (ENSCCAG00000025301) #31	ENSCCAG00000029433	DDX59 (ENSCCAG00000026682) #33	KIF14 (ENSCCAG00000036921) #34
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	141	ARL8A (ENSSBOG00000021257) #8	GPR37L1 (ENSSBOG00000032756) #9	ENSSBOG00000018739	ELF3 (ENSSBOG00000035951) #10	RNPEP (ENSSBOG00000028407) #11	TIMM17A (ENSSBOG00000020540) #12	LMOD1 (ENSSBOG00000030087) #13	SHISA4 (ENSSBOG00000029406) #14	IPO9 (ENSSBOG00000023990) #15	ENSSBOG00000027515	NAV1 (ENSSBOG00000029966) #16	CSRP1 (ENSSBOG00000025818) #18	PHLDA3 (ENSSBOG00000006419) #19	TNNI1 (ENSSBOG00000025005) #20	LAD1 (ENSSBOG00000026021) #21	TNNT2 (ENSSBOG00000027536) #22	ENSSBOG00000028457	PKP1 (ENSSBOG00000036168) #23	IGFN1 (ENSSBOG00000013748) #24	TMEM9 (ENSSBOG00000018806) #25	CACNA1S (ENSSBOG00000012566) #27	KIF21B (ENSSBOG00000030857) #28	INAVA (ENSSBOG00000000914) #29	GPR25 (ENSSBOG00000027419) #30	ENSSBOG00000024998	CAMSAP2 (ENSSBOG00000034399) #31	DDX59 (ENSSBOG00000035527) #33	KIF14 (ENSSBOG00000030090) #34	ZNF281 (ENSSBOG00000001320) #35	ENSSBOG00000023904	ENSSBOG00000023922
Marmoset	MODERN SPECIES	10	ARL8A (ENSCJAG00000005865) #8	GPR37L1 (ENSCJAG00000005857) #9	ENSCJAG00000070204	ENSCJAG00000070884	ENSCJAG00000070333	RNPEP (ENSCJAG00000005745) #11	TIMM17A (ENSCJAG00000041477) #12	LMOD1 (ENSCJAG00000062096) #13	SHISA4 (ENSCJAG00000040532) #14	IPO9 (ENSCJAG00000005627) #15	NAV1 (ENSCJAG00000005585) #16	CSRP1 (ENSCJAG00000081518) #18	PHLDA3 (ENSCJAG00000038715) #19	TNNI1 (ENSCJAG00000045243) #20	LAD1 (ENSCJAG00000005479) #21	TNNT2 (ENSCJAG00000005458) #22	PKP1 (ENSCJAG00000005433) #23	ENSCJAG00000005404 #24	TMEM9 (ENSCJAG00000075235) #25	ASCL5 (ENSCJAG00000042298) #26	CACNA1S (ENSCJAG00000005329) #27	KIF21B (ENSCJAG00000005270) #28	INAVA (ENSCJAG00000005256) #29	GPR25 (ENSCJAG00000005252) #30	CAMSAP2 (ENSCJAG00000005196) #31	DDX59 (ENSCJAG00000005183) #33	KIF14 (ENSCJAG00000005114) #34	ENSCJAG00000074834	ZNF281 (ENSCJAG00000005104) #35	ENSCJAG00000064182	ENSCJAG00000083529
Mas night monkey	MODERN SPECIES	958	GPR37L1 (ENSANAG00000026435) #9	ELF3 (ENSANAG00000026758) #10	RNPEP (ENSANAG00000036242) #11	TIMM17A (ENSANAG00000030639) #12	LMOD1 (ENSANAG00000033606) #13	SHISA4 (ENSANAG00000033085) #14	IPO9 (ENSANAG00000032001) #15	ENSANAG00000018451	ENSANAG00000033537	NAV1 (ENSANAG00000035757) #16	CSRP1 (ENSANAG00000027361) #18	PHLDA3 (ENSANAG00000016926) #19	ENSANAG00000026569	TNNI1 (ENSANAG00000032590) #20	ENSANAG00000025220 #21	TNNT2 (ENSANAG00000026643) #22	ENSANAG00000024104	ENSANAG00000022332	PKP1 (ENSANAG00000022090) #23	ENSANAG00000032968 #24	TMEM9 (ENSANAG00000034099) #25	CACNA1S (ENSANAG00000028326) #27	KIF21B (ENSANAG00000023183) #28	ENSANAG00000025015	INAVA (ENSANAG00000023413) #29	GPR25 (ENSANAG00000018153) #30	CAMSAP2 (ENSANAG00000021100) #31	DDX59 (ENSANAG00000025559) #33	KIF14 (ENSANAG00000019508) #34	ENSANAG00000020588	NR5A2 (ENSANAG00000031667) #36
Tarsier	MODERN SPECIES	6006				ELF3 (ENSTSYG00000002998) #10	RNPEP (ENSTSYG00000029079) #11	TIMM17A (ENSTSYG00000011606) #12	LMOD1 (ENSTSYG00000029478) #13	SHISA4 (ENSTSYG00000033087) #14	IPO9 (ENSTSYG00000009534) #15	NAV1 (ENSTSYG00000014353) #16	CSRP1 (ENSTSYG00000006136) #18	PHLDA3 (ENSTSYG00000028139) #19	RPS20 (ENSTSYG00000030243)	TNNI1 (ENSTSYG00000037146) #20	LAD1 (ENSTSYG00000009029) #21	TNNT2 (ENSTSYG00000036459) #22	PKP1 (ENSTSYG00000004506) #23	ENSTSYG00000033602 #24	TMEM9 (ENSTSYG00000001525) #25	CACNA1S (ENSTSYG00000002790) #27	KIF21B (ENSTSYG00000006540) #28	INAVA (ENSTSYG00000005312) #29	CAMSAP2 (ENSTSYG00000008900) #31	DDX59 (ENSTSYG00000013832) #33	KIF14 (ENSTSYG00000008740) #34
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Mouse lemur	MODERN SPECIES	19	PTPN7 (ENSMICG00000007442) #7	ARL8A (ENSMICG00000038748) #8	GPR37L1 (ENSMICG00000027500) #9	ELF3 (ENSMICG00000003167) #10	RNPEP (ENSMICG00000003151) #11	ENSMICG00000045286 #12	LMOD1 (ENSMICG00000001547) #13	SHISA4 (ENSMICG00000048002) #14	IPO9 (ENSMICG00000009250) #15	NAV1 (ENSMICG00000009229) #16	CSRP1 (ENSMICG00000037004) #18	PHLDA3 (ENSMICG00000043447) #19	ENSMICG00000027041	TNNI1 (ENSMICG00000004497) #20	LAD1 (ENSMICG00000026613) #21	TNNT2 (ENSMICG00000002857) #22	PKP1 (ENSMICG00000034402) #23	IGFN1 (ENSMICG00000032380) #24	TMEM9 (ENSMICG00000000342) #25	CACNA1S (ENSMICG00000011685) #27	KIF21B (ENSMICG00000011648) #28	INAVA (ENSMICG00000031575) #29	CAMSAP2 (ENSMICG00000036731) #31	DDX59 (ENSMICG00000012110) #33	KIF14 (ENSMICG00000013951) #34	NR5A2 (ENSMICG00000036896) #36	PTPRC (ENSMICG00000009392)	ATP6V1G3 (ENSMICG00000009388)	NEK7 (ENSMICG00000029301)	LHX9 (ENSMICG00000000704)	C1orf53 (ENSMICG00000026611)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00910000147141	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	1027												CSRP1 (ENSPCOG00000012092) #18	PHLDA3 (ENSPCOG00000011876) #19	TNNI1 (ENSPCOG00000028138) #20	LAD1 (ENSPCOG00000019403) #21	TNNT2 (ENSPCOG00000024410) #22	PKP1 (ENSPCOG00000015736) #23	ENSPCOG00000017922 #24	TMEM9 (ENSPCOG00000016871) #25
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	19	GPR37L1 (ENSPSMG00000000609) #9	ELF3 (ENSPSMG00000000599) #10	RNPEP (ENSPSMG00000000549) #11	TIMM17A (ENSPSMG00000000499) #12	ENSPSMG00000000493 #13	SHISA4 (ENSPSMG00000000489) #14	IPO9 (ENSPSMG00000000483) #15	ENSPSMG00000000471	NAV1 (ENSPSMG00000000424) #16	ENSPSMG00000000232 #17	ENSPSMG00000000224	CSRP1 (ENSPSMG00000000197) #18	PHLDA3 (ENSPSMG00000000133) #19	TNNI1 (ENSPSMG00000000114) #20	LAD1 (ENSPSMG00000020071) #21	TNNT2 (ENSPSMG00000020011) #22	PKP1 (ENSPSMG00000019801) #23	ENSPSMG00000019757 #24	TMEM9 (ENSPSMG00000019712) #25	ASCL5 (ENSPSMG00000019702) #26	CACNA1S (ENSPSMG00000019681) #27
Bushbaby	MODERN SPECIES	170	ENSOGAG00000031244	PTPN7 (ENSOGAG00000025504) #7	ARL8A (ENSOGAG00000030870) #8	GPR37L1 (ENSOGAG00000001874) #9	ELF3 (ENSOGAG00000004794) #10	RNPEP (ENSOGAG00000004795) #11	ENSOGAG00000006176 #12	LMOD1 (ENSOGAG00000006170) #13	SHISA4 (ENSOGAG00000006169) #14	IPO9 (ENSOGAG00000006162) #15	NAV1 (ENSOGAG00000006152) #16	CSRP1 (ENSOGAG00000027109) #18	PHLDA3 (ENSOGAG00000028208) #19	TNNI1 (ENSOGAG00000014424) #20	LAD1 (ENSOGAG00000029505) #21	TNNT2 (ENSOGAG00000008844) #22	PKP1 (ENSOGAG00000008836) #23	ENSOGAG00000008832 #24	TMEM9 (ENSOGAG00000025006) #25	ASCL5 (ENSOGAG00000027579) #26	CACNA1S (ENSOGAG00000001855) #27	KIF21B (ENSOGAG00000001849) #28	ENSOGAG00000028982	INAVA (ENSOGAG00000024428) #29	GPR25 (ENSOGAG00000029134) #30	ENSOGAG00000033931	CAMSAP2 (ENSOGAG00000008928) #31	DDX59 (ENSOGAG00000008925) #33	KIF14 (ENSOGAG00000008914) #34	ZNF281 (ENSOGAG00000010366) #35	NR5A2 (ENSOGAG00000025622) #36
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.a #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	1955																TNNT2 (ENSEEUG00000009623) #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Suina	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Pig	MODERN SPECIES	1	PTPN7 (ENSSSCG00000037669) #7	ARL8A (ENSSSCG00000036967) #8	GPR37L1 (ENSSSCG00000038768) #9	ELF3 (ENSSSCG00000010922) #10	RNPEP (ENSSSCG00000034151) #11	TIMM17A (ENSSSCG00000037431) #12	LMOD1 (ENSSSCG00000031201) #13	SHISA4 (ENSSSCG00000054480) #14	IPO9 (ENSSSCG00000039843) #15	ENSSSCG00000031634 #17	NAV1 (ENSSSCG00000010915) #16	CSRP1 (ENSSSCG00000020976) #18	PHLDA3 (ENSSSCG00000057685) #19	TNNI1 (ENSSSCG00000024061) #20	ENSSSCG00000021624 #21	TNNT2 (ENSSSCG00000023031) #22	PKP1 (ENSSSCG00000030694) #23	ENSSSCG00000036948 #24	TMEM9 (ENSSSCG00000027928) #25	ASCL5 (ENSSSCG00000050131) #26	CACNA1S (ENSSSCG00000024784) #27	KIF21B (ENSSSCG00000021706) #28	ENSSSCG00000033737	INAVA (ENSSSCG00000032735) #29	GPR25 (ENSSSCG00000055738) #30	CAMSAP2 (ENSSSCG00000027314) #31	DDX59 (ENSSSCG00000024444) #33	KIF14 (ENSSSCG00000010912) #34	ZNF281 (ENSSSCG00000010911) #35	NR5A2 (ENSSSCG00000024975) #36	PTPRC (ENSSSCG00000010908)
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Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT01040000241084
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159939	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT01040000241084
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159939	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000154276.jb.a.c.b	ENSGT00940000159457
Narwhal	MODERN SPECIES	304	LGR6 (ENSMMNG00015006740)	PTPN7 (ENSMMNG00015006811) #7	ARL8A (ENSMMNG00015006858) #8	GPR37L1 (ENSMMNG00015006882) #9	ELF3 (ENSMMNG00015006948) #10	RNPEP (ENSMMNG00015006968) #11	TIMM17A (ENSMMNG00015007002) #12	LMOD1 (ENSMMNG00015007021) #13	SHISA4 (ENSMMNG00015007040) #14	IPO9 (ENSMMNG00015007070) #15	NAV1 (ENSMMNG00015007173) #16	CSRP1 (ENSMMNG00015007418) #18	PHLDA3 (ENSMMNG00015007455) #19	TNNI1 (ENSMMNG00015007478) #20	LAD1 (ENSMMNG00015007527) #21	TNNT2 (ENSMMNG00015007610) #22	PKP1 (ENSMMNG00015007798) #23	ENSMMNG00015007863 #24	TMEM9 (ENSMMNG00015007956) #25	ASCL5 (ENSMMNG00015007978) #26	CACNA1S (ENSMMNG00015008061) #27	KIF21B (ENSMMNG00015008258) #28	INAVA (ENSMMNG00015008375) #29	GPR25 (ENSMMNG00015008389) #30	CAMSAP2 (ENSMMNG00015008404) #31	DDX59 (ENSMMNG00015008435) #33	KIF14 (ENSMMNG00015008463) #34	ZNF281 (ENSMMNG00015008480) #35	NR5A2 (ENSMMNG00015008494) #36	ENSMMNG00015008512	PTPRC (ENSMMNG00015008549)
Beluga whale	MODERN SPECIES	88	LGR6 (ENSDLEG00000018577)	PTPN7 (ENSDLEG00000018522) #7	ARL8A (ENSDLEG00000018473) #8	GPR37L1 (ENSDLEG00000018462) #9	ELF3 (ENSDLEG00000018450) #10	RNPEP (ENSDLEG00000018432) #11	TIMM17A (ENSDLEG00000018424) #12	LMOD1 (ENSDLEG00000018414) #13	SHISA4 (ENSDLEG00000018401) #14	IPO9 (ENSDLEG00000018006) #15	NAV1 (ENSDLEG00000016948) #16	CSRP1 (ENSDLEG00000016900) #18	PHLDA3 (ENSDLEG00000016892) #19	TNNI1 (ENSDLEG00000016846) #20	LAD1 (ENSDLEG00000016820) #21	TNNT2 (ENSDLEG00000016787) #22	PKP1 (ENSDLEG00000016756) #23	ENSDLEG00000016632 #24	TMEM9 (ENSDLEG00000016598) #25	ASCL5 (ENSDLEG00000016589) #26	CACNA1S (ENSDLEG00000015694) #27	KIF21B (ENSDLEG00000011744) #28	INAVA (ENSDLEG00000011485) #29	GPR25 (ENSDLEG00000011479) #30	CAMSAP2 (ENSDLEG00000011414) #31	DDX59 (ENSDLEG00000011394) #33	KIF14 (ENSDLEG00000011293) #34	ZNF281 (ENSDLEG00000011278) #35	NR5A2 (ENSDLEG00000011266) #36	ENSDLEG00000011253	PTPRC (ENSDLEG00000011151)
Vaquita	MODERN SPECIES		LGR6 (ENSPSNG00000001971)	PTPN7 (ENSPSNG00000001920) #7	ARL8A (ENSPSNG00000001896) #8	GPR37L1 (ENSPSNG00000001866) #9	ELF3 (ENSPSNG00000001852) #10	RNPEP (ENSPSNG00000001822) #11	TIMM17A (ENSPSNG00000001798) #12	LMOD1 (ENSPSNG00000001777) #13	SHISA4 (ENSPSNG00000001762) #14	IPO9 (ENSPSNG00000001703) #15	NAV1 (ENSPSNG00000001494) #16	CSRP1 (ENSPSNG00000001358) #18	ENSPSNG00000001332 #19	TNNI1 (ENSPSNG00000001299) #20	ENSPSNG00000001250 #21	TNNT2 (ENSPSNG00000000969) #22	PKP1 (ENSPSNG00000000846) #23	ENSPSNG00000000770 #24	TMEM9 (ENSPSNG00000000699) #25	ASCL5 (ENSPSNG00000000672) #26	CACNA1S (ENSPSNG00000000547) #27	KIF21B (ENSPSNG00000000419) #28	INAVA (ENSPSNG00000000352) #29	GPR25 (ENSPSNG00000000336) #30	CAMSAP2 (ENSPSNG00000000269) #31	DDX59 (ENSPSNG00000000216) #33	KIF14 (ENSPSNG00000000173) #34	ZNF281 (ENSPSNG00000000068) #35	NR5A2 (ENSPSNG00000005973) #36	PTPRC (ENSPSNG00000005542)	ENSPSNG00000005435
Dolphin	MODERN SPECIES	3633															LAD1 (ENSTTRG00000001403) #21	TNNT2 (ENSTTRG00000001402) #22
Sperm whale	MODERN SPECIES	15	UBE2T (ENSPCTG00005004428)	LGR6 (ENSPCTG00005004452)	PTPN7 (ENSPCTG00005004500) #7	ARL8A (ENSPCTG00005004581) #8	GPR37L1 (ENSPCTG00005004617) #9	ELF3 (ENSPCTG00005004631) #10	RNPEP (ENSPCTG00005004672) #11	TIMM17A (ENSPCTG00005004795) #12	LMOD1 (ENSPCTG00005004826) #13	SHISA4 (ENSPCTG00005004845) #14	IPO9 (ENSPCTG00005004872) #15	NAV1 (ENSPCTG00005004971) #16	TMEM9 (ENSPCTG00005005640) #25	TNNI1 (ENSPCTG00005005662) #20	LAD1 (ENSPCTG00005005693) #21	TNNT2 (ENSPCTG00005005775) #22	PKP1 (ENSPCTG00005005833) #23	ENSPCTG00005005910 #28	ENSPCTG00005000216	INAVA (ENSPCTG00005000237) #29	GPR25 (ENSPCTG00005000267) #30	CAMSAP2 (ENSPCTG00005000406) #31	DDX59 (ENSPCTG00005000564) #33	KIF14 (ENSPCTG00005000675) #34	ZNF281 (ENSPCTG00005000947) #35	NR5A2 (ENSPCTG00005000979) #36	ENSPCTG00005001025	PTPRC (ENSPCTG00005001084)	ENSPCTG00005001241	ATP6V1G3 (ENSPCTG00005001258)	NEK7 (ENSPCTG00005001276)
Blue whale	DUPLICATION
Blue whale	MODERN SPECIES		GPR37L1 (ENSBMSG00010004434) #9	ELF3 (ENSBMSG00010004386) #10	RNPEP (ENSBMSG00010004329) #11	ENSBMSG00010004310 #12	LMOD1 (ENSBMSG00010004293) #13	SHISA4 (ENSBMSG00010004280) #14	IPO9 (ENSBMSG00010004243) #15	ENSBMSG00010004234 #17	NAV1 (ENSBMSG00010004070) #16	ENSBMSG00010004030	CSRP1 (ENSBMSG00010004016) #18	PHLDA3 (ENSBMSG00010004005) #19	TNNI1 (ENSBMSG00010003967) #20	LAD1 (ENSBMSG00010003924) #21	ENSBMSG00010003893 #22	ENSBMSG00010003631 #22	PKP1 (ENSBMSG00010003592) #23	ENSBMSG00010003500 #24	TMEM9 (ENSBMSG00010003466) #25	ASCL5 (ENSBMSG00010003459) #26	CACNA1S (ENSBMSG00010003329) #27	KIF21B (ENSBMSG00010002784) #28	ENSBMSG00010002702	INAVA (ENSBMSG00010002656) #29	GPR25 (ENSBMSG00010002638) #30	CAMSAP2 (ENSBMSG00010002599) #31	DDX59 (ENSBMSG00010002568) #33	KIF14 (ENSBMSG00010002487) #34	ZNF281 (ENSBMSG00010002478) #35	NR5A2 (ENSBMSG00010002371) #36	PTPRC (ENSBMSG00010002155)
Blue whale	MODERN SPECIES		ARL8A (ENSBMSG00010004456) #8	GPR37L1 (ENSBMSG00010004434) #9	ELF3 (ENSBMSG00010004386) #10	RNPEP (ENSBMSG00010004329) #11	ENSBMSG00010004310 #12	LMOD1 (ENSBMSG00010004293) #13	SHISA4 (ENSBMSG00010004280) #14	IPO9 (ENSBMSG00010004243) #15	ENSBMSG00010004234 #17	NAV1 (ENSBMSG00010004070) #16	ENSBMSG00010004030	CSRP1 (ENSBMSG00010004016) #18	PHLDA3 (ENSBMSG00010004005) #19	TNNI1 (ENSBMSG00010003967) #20	LAD1 (ENSBMSG00010003924) #21	ENSBMSG00010003893 #22	ENSBMSG00010003631 #22	PKP1 (ENSBMSG00010003592) #23	ENSBMSG00010003500 #24	TMEM9 (ENSBMSG00010003466) #25	ASCL5 (ENSBMSG00010003459) #26	CACNA1S (ENSBMSG00010003329) #27	KIF21B (ENSBMSG00010002784) #28	ENSBMSG00010002702	INAVA (ENSBMSG00010002656) #29	GPR25 (ENSBMSG00010002638) #30	CAMSAP2 (ENSBMSG00010002599) #31	DDX59 (ENSBMSG00010002568) #33	KIF14 (ENSBMSG00010002487) #34	ZNF281 (ENSBMSG00010002478) #35	NR5A2 (ENSBMSG00010002371) #36
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256.a.b #21	ENSGT00940000154709.a.a #22
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256.a.b #21	ENSGT00940000154709.a.a #22
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256.a.b #21	ENSGT00940000154709.a.a #22
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256.a.b #21	ENSGT00940000154709.a.a #22
Bos	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256.a.b #21	ENSGT00940000154709.a.a #22
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256.a.b #21	ENSGT00940000154709.a.a #22
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	7	PTPN7 (ENSBIXG00005019348) #7	ARL8A (ENSBIXG00005019330) #8	GPR37L1 (ENSBIXG00005003138) #9	ELF3 (ENSBIXG00005019288) #10	RNPEP (ENSBIXG00005019254) #11	TIMM17A (ENSBIXG00005019240) #12	LMOD1 (ENSBIXG00005019224) #13	SHISA4 (ENSBIXG00005003129) #14	IPO9 (ENSBIXG00005019192) #15	NAV1 (ENSBIXG00005019125) #16	ENSBIXG00005018849 #17	CSRP1 (ENSBIXG00005018838) #18	PHLDA3 (ENSBIXG00005018761) #19	TNNI1 (ENSBIXG00005018737) #20	ENSBIXG00005018579 #21	TNNT2 (ENSBIXG00005018552) #22	ENSBIXG00005018446	ENSBIXG00005018388
Cow	MODERN SPECIES	7	ARL8A (ENSBTAG00000006574) #8	GPR37L1 (ENSBTAG00000014992) #9	ENSBTAG00000052377	ELF3 (ENSBTAG00000008756) #10	RNPEP (ENSBTAG00000013726) #11	TIMM17A (ENSBTAG00000047059) #12	LMOD1 (ENSBTAG00000021576) #13	SHISA4 (ENSBTAG00000050933) #14	IPO9 (ENSBTAG00000004452) #15	NAV1 (ENSBTAG00000021919) #16	ENSBTAG00000049173 #17	CSRP1 (ENSBTAG00000016057) #18	PHLDA3 (ENSBTAG00000053086) #19	TNNI1 (ENSBTAG00000047231) #20	LAD1 (ENSBTAG00000024663) #21	TNNT2 (ENSBTAG00000045789) #22
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256.a.b #21	ENSGT00940000154709.a.a #22
Domestic yak	MODERN SPECIES	5	PTPN7 (ENSBGRG00000025844) #7	ARL8A (ENSBGRG00000025855) #8	GPR37L1 (ENSBGRG00000025872) #9	ELF3 (ENSBGRG00000025881) #10	RNPEP (ENSBGRG00000025901) #11	TIMM17A (ENSBGRG00000025944) #12	LMOD1 (ENSBGRG00000025951) #13	SHISA4 (ENSBGRG00000025959) #14	IPO9 (ENSBGRG00000025970) #15	NAV1 (ENSBGRG00000026038) #16	ENSBGRG00000026117 #17	CSRP1 (ENSBGRG00000026123) #18	PHLDA3 (ENSBGRG00000026131) #19	TNNI1 (ENSBGRG00000026141) #20	ENSBGRG00000026162 #21	TNNT2 (ENSBGRG00000026185) #22	ENSBGRG00000026223	ENSBGRG00000026232	TMEM183A (ENSBGRG00000026236)	PPFIA4 (ENSBGRG00000026254)	MYOG (ENSBGRG00000026269)	ENSBGRG00000026271	ENSBGRG00000026277	ENSBGRG00000026283	ADORA1 (ENSBGRG00000026296)	MYBPH (ENSBGRG00000026302)	CHI3L1 (ENSBGRG00000026316)	BTG2 (ENSBGRG00000026320)	FMOD (ENSBGRG00000026323)	PRELP (ENSBGRG00000007735)	OPTC (ENSBGRG00000007805)
Wild yak	MODERN SPECIES	2259																TNNT2 (ENSBMUG00000021815) #22	ENSBMUG00000021668
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256.a.b #21	ENSGT00940000154709.a.a #22
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	3	LGR6 (ENSOARG00020020999)	ARL8A (ENSOARG00020021359) #8	GPR37L1 (ENSOARG00020021479) #9	ELF3 (ENSOARG00020021509) #10	RNPEP (ENSOARG00020021541) #11	TIMM17A (ENSOARG00020021696) #12	LMOD1 (ENSOARG00020021739) #13	SHISA4 (ENSOARG00020021795) #14	IPO9 (ENSOARG00020021871) #15	NAV1 (ENSOARG00020022097) #16	ENSOARG00020022794 #17	CSRP1 (ENSOARG00020022818) #18	PHLDA3 (ENSOARG00020022868) #19	TNNI1 (ENSOARG00020022891) #20	ENSOARG00020023028 #21	TNNT2 (ENSOARG00020023133) #22
Goat	MODERN SPECIES	7	LGR6 (ENSCHIG00000024412)	ENSCHIG00000020312	PTPN7 (ENSCHIG00000013625) #7	ARL8A (ENSCHIG00000003028) #8	GPR37L1 (ENSCHIG00000010542) #9	NAV1 (ENSCHIG00000008057) #16	IPO9 (ENSCHIG00000015356) #15	LMOD1 (ENSCHIG00000007211) #13	TIMM17A (ENSCHIG00000010947) #12	RNPEP (ENSCHIG00000020776) #11	ELF3 (ENSCHIG00000010930) #10	CSRP1 (ENSCHIG00000020588) #18	PHLDA3 (ENSCHIG00000013383) #19	TNNI1 (ENSCHIG00000016517) #20	ENSCHIG00000003679 #21	TNNT2 (ENSCHIG00000020704) #22
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT00940000160882	ENSGT00940000156725	ENSGT00940000158821
Arabian camel	MODERN SPECIES	15	PTPN7 (ENSCDRG00005020059) #7	ARL8A (ENSCDRG00005020087) #8	GPR37L1 (ENSCDRG00005020122) #9	ELF3 (ENSCDRG00005020134) #10	RNPEP (ENSCDRG00005020217) #11	TIMM17A (ENSCDRG00005021099) #12	LMOD1 (ENSCDRG00005021102) #13	SHISA4 (ENSCDRG00005021109) #14	IPO9 (ENSCDRG00005021144) #15	NAV1 (ENSCDRG00005021260) #16	ENSCDRG00005021529	CSRP1 (ENSCDRG00005021534) #18	PHLDA3 (ENSCDRG00005021547) #19	TNNI1 (ENSCDRG00005021556) #20	LAD1 (ENSCDRG00005021572) #21	TNNT2 (ENSCDRG00005021583) #22	ENSCDRG00005021587	ENSCDRG00005021591 #23	ENSCDRG00005008917 #23	ENSCDRG00005008992 #24	TMEM9 (ENSCDRG00005009277) #25	CACNA1S (ENSCDRG00005009360) #27	KIF21B (ENSCDRG00005010084) #28	ENSCDRG00005010315	CAMSAP2 (ENSCDRG00005010867) #31	DDX59 (ENSCDRG00005011107) #33	KIF14 (ENSCDRG00005011188) #34	ENSCDRG00005011500	ZNF281 (ENSCDRG00005011534) #35	NR5A2 (ENSCDRG00005011572) #36	PTPRC (ENSCDRG00005011706)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777.i.a #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a.b #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b.j #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777.i.a #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a.b #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b.j #25	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650.w #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT00940000160882	ENSGT00940000156725	ENSGT00940000158821
Polar bear	MODERN SPECIES	119	PTPN7 (ENSUMAG00000004301) #7	ARL8A (ENSUMAG00000004297) #8	GPR37L1 (ENSUMAG00000004293) #9	ELF3 (ENSUMAG00000004291) #10	RNPEP (ENSUMAG00000004166) #11	TIMM17A (ENSUMAG00000004146) #12	LMOD1 (ENSUMAG00000004144) #13	ENSUMAG00000004142 #14	IPO9 (ENSUMAG00000003122) #15	ENSUMAG00000002999 #17	NAV1 (ENSUMAG00000002355) #16	CSRP1 (ENSUMAG00000002257) #18	PHLDA3 (ENSUMAG00000002242) #19	TNNI1 (ENSUMAG00000002193) #20	ENSUMAG00000002086 #21	TNNT2 (ENSUMAG00000002039) #22	PKP1 (ENSUMAG00000001991) #23	ENSUMAG00000001880 #24	TMEM9 (ENSUMAG00000001857) #25	CACNA1S (ENSUMAG00000001163) #27	KIF21B (ENSUMAG00000000108) #28	ENSUMAG00000025395	CAMSAP2 (ENSUMAG00000025377) #31	DDX59 (ENSUMAG00000025376) #33	KIF14 (ENSUMAG00000025374) #34	ZNF281 (ENSUMAG00000025373) #35	NR5A2 (ENSUMAG00000025370) #36	PTPRC (ENSUMAG00000025366)	ATP6V1G3 (ENSUMAG00000025365)	NEK7 (ENSUMAG00000025364)	LHX9 (ENSUMAG00000025362)
American black bear	MODERN SPECIES	250									ENSUAMG00000004304	NAV1 (ENSUAMG00000004315) #16	ENSUAMG00000004799 #17	CSRP1 (ENSUAMG00000004802) #18	PHLDA3 (ENSUAMG00000004805) #19	TNNI1 (ENSUAMG00000004814) #20	LAD1 (ENSUAMG00000004832) #21	TNNT2 (ENSUAMG00000004838) #22	PKP1 (ENSUAMG00000004844) #23	ENSUAMG00000004862 #24	TMEM9 (ENSUAMG00000004883) #25	CACNA1S (ENSUAMG00000004912) #27
Giant Panda	MODERN SPECIES	18	ENSAMEG00000011970 #8	GPR37L1 (ENSAMEG00000011979) #9	ELF3 (ENSAMEG00000011987) #10	RNPEP (ENSAMEG00000012001) #11	TIMM17A (ENSAMEG00000012030) #12	LMOD1 (ENSAMEG00000012044) #13	SHISA4 (ENSAMEG00000012048) #14	IPO9 (ENSAMEG00000012052) #15	ENSAMEG00000026338 #17	NAV1 (ENSAMEG00000012095) #16	ENSAMEG00000030436	ENSAMEG00000012114 #18	PHLDA3 (ENSAMEG00000019920) #19	TNNI1 (ENSAMEG00000012134) #20	LAD1 (ENSAMEG00000012147) #21	TNNT2 (ENSAMEG00000012160) #22	PKP1 (ENSAMEG00000012222) #23	ENSAMEG00000012240 #24	TMEM9 (ENSAMEG00000012248) #25	ASCL5 (ENSAMEG00000024919) #26	CACNA1S (ENSAMEG00000012260) #27	KIF21B (ENSAMEG00000012441) #28	ENSAMEG00000012549	INAVA (ENSAMEG00000023774) #29	GPR25 (ENSAMEG00000028427) #30	CAMSAP2 (ENSAMEG00000012560) #31	DDX59 (ENSAMEG00000012596) #33	KIF14 (ENSAMEG00000012611) #34	ZNF281 (ENSAMEG00000030714) #35	NR5A2 (ENSAMEG00000012650) #36	PTPRC (ENSAMEG00000012707)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
American mink	MODERN SPECIES	41	ARL8A (ENSNVIG00000014610) #8	GPR37L1 (ENSNVIG00000014599) #9	ELF3 (ENSNVIG00000014579) #10	RNPEP (ENSNVIG00000014525) #11	TIMM17A (ENSNVIG00000014506) #12	LMOD1 (ENSNVIG00000014488) #13	SHISA4 (ENSNVIG00000014476) #14	IPO9 (ENSNVIG00000014439) #15	ENSNVIG00000014434 #17	NAV1 (ENSNVIG00000014243) #16	ENSNVIG00000014233	CSRP1 (ENSNVIG00000014217) #18	PHLDA3 (ENSNVIG00000014203) #19	TNNI1 (ENSNVIG00000014154) #20	LAD1 (ENSNVIG00000014122) #21	TNNT2 (ENSNVIG00000013882) #22	PKP1 (ENSNVIG00000013826) #23	ENSNVIG00000013788 #24	TMEM9 (ENSNVIG00000013736) #25	ASCL5 (ENSNVIG00000013717) #26	CACNA1S (ENSNVIG00000013578) #27	KIF21B (ENSNVIG00000013391) #28	ENSNVIG00000013349	INAVA (ENSNVIG00000013329) #29	GPR25 (ENSNVIG00000013317) #30	CAMSAP2 (ENSNVIG00000013194) #31	DDX59 (ENSNVIG00000013171) #33	KIF14 (ENSNVIG00000013095) #34	NR5A2 (ENSNVIG00000013054) #36	ENSNVIG00000013032	PTPRC (ENSNVIG00000012972)
Ferret	MODERN SPECIES	215	PTPN7 (ENSMPUG00000010988) #7	ARL8A (ENSMPUG00000010959) #8	GPR37L1 (ENSMPUG00000010953) #9	ELF3 (ENSMPUG00000010932) #10	RNPEP (ENSMPUG00000010929) #11	TIMM17A (ENSMPUG00000010908) #12	LMOD1 (ENSMPUG00000010900) #13	SHISA4 (ENSMPUG00000010884) #14	IPO9 (ENSMPUG00000010874) #15	NAV1 (ENSMPUG00000010860) #16	ENSMPUG00000010859	CSRP1 (ENSMPUG00000010813) #18	PHLDA3 (ENSMPUG00000019256) #19	TNNI1 (ENSMPUG00000010809) #20	LAD1 (ENSMPUG00000010779) #21	TNNT2 (ENSMPUG00000010612) #22	PKP1 (ENSMPUG00000010604) #23	ENSMPUG00000010591 #24	TMEM9 (ENSMPUG00000010586) #25	CACNA1S (ENSMPUG00000010571) #27	KIF21B (ENSMPUG00000010558) #28	ENSMPUG00000010551	INAVA (ENSMPUG00000010532) #29	GPR25 (ENSMPUG00000019251) #30	ENSMPUG00000010529	CAMSAP2 (ENSMPUG00000010520) #31	DDX59 (ENSMPUG00000010489) #33	KIF14 (ENSMPUG00000010474) #34	ZNF281 (ENSMPUG00000019246) #35	NR5A2 (ENSMPUG00000010466) #36	PTPRC (ENSMPUG00000010447)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00550000074822.g
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Red fox	MODERN SPECIES	144	PTPN7 (ENSVVUG00000006391) #7	ARL8A (ENSVVUG00000006384) #8	GPR37L1 (ENSVVUG00000006382) #9	ELF3 (ENSVVUG00000006355) #10	RNPEP (ENSVVUG00000006350) #11	TIMM17A (ENSVVUG00000006338) #12	LMOD1 (ENSVVUG00000006318) #13	SHISA4 (ENSVVUG00000006311) #14	IPO9 (ENSVVUG00000006283) #15	NAV1 (ENSVVUG00000003520) #16	ENSVVUG00000003460	ENSVVUG00000003450 #18	PHLDA3 (ENSVVUG00000003445) #19	TNNI1 (ENSVVUG00000003441) #20	LAD1 (ENSVVUG00000003437) #21	TNNT2 (ENSVVUG00000003427) #22	PKP1 (ENSVVUG00000003417) #23	ENSVVUG00000003365 #24	TMEM9 (ENSVVUG00000003352) #25	CACNA1S (ENSVVUG00000001493) #27	ENSVVUG00000001308 #28	ENSVVUG00000001272 #28	ENSVVUG00000001254	CAMSAP2 (ENSVVUG00000001143) #31	DDX59 (ENSVVUG00000001095) #33	KIF14 (ENSVVUG00000000363) #34	ZNF281 (ENSVVUG00000000290) #35	ENSVVUG00000000226	NR5A2 (ENSVVUG00000000199) #36	ENSVVUG00000000137	PTPRC (ENSVVUG00000029677)
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Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT00940000160882
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Cat	MODERN SPECIES	248	PTPN7 (ENSFCAG00000045465) #7	ARL8A (ENSFCAG00000018232) #8	GPR37L1 (ENSFCAG00000000450) #9	ELF3 (ENSFCAG00000000449) #10	RNPEP (ENSFCAG00000000448) #11	TIMM17A (ENSFCAG00000026182) #12	LMOD1 (ENSFCAG00000000446) #13	SHISA4 (ENSFCAG00000000445) #14	IPO9 (ENSFCAG00000000444) #15	ENSFCAG00000040636 #17	NAV1 (ENSFCAG00000000443) #16	CSRP1 (ENSFCAG00000000442) #18	PHLDA3 (ENSFCAG00000036029) #19	TNNI1 (ENSFCAG00000034230) #20	LAD1 (ENSFCAG00000031969) #21	TNNT2 (ENSFCAG00000004613) #22	PKP1 (ENSFCAG00000004610) #23	IGFN1 (ENSFCAG00000004609) #24	TMEM9 (ENSFCAG00000028386) #25	ASCL5 (ENSFCAG00000044334) #26	CACNA1S (ENSFCAG00000004605) #27	KIF21B (ENSFCAG00000004597) #28	ENSFCAG00000028284	INAVA (ENSFCAG00000004595) #29	GPR25 (ENSFCAG00000026788) #30	CAMSAP2 (ENSFCAG00000004594) #31	DDX59 (ENSFCAG00000027373) #33	KIF14 (ENSFCAG00000025507) #34	ZNF281 (ENSFCAG00000028447) #35	NR5A2 (ENSFCAG00000012604) #36	ENSFCAG00000029586
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000157365	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT00940000160882
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000157365	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT00940000160882
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	19	ENSRFEG00010021326	LGR6 (ENSRFEG00010021358)	PTPN7 (ENSRFEG00010021384) #7	ARL8A (ENSRFEG00010021401) #8	GPR37L1 (ENSRFEG00010021415) #9	RNPEP (ENSRFEG00010021429) #11	TIMM17A (ENSRFEG00010021454) #12	LMOD1 (ENSRFEG00010021464) #13	SHISA4 (ENSRFEG00010021474) #14	IPO9 (ENSRFEG00010021489) #15	NAV1 (ENSRFEG00010021543) #16	CSRP1 (ENSRFEG00010021644) #18	PHLDA3 (ENSRFEG00010021661) #19	TNNI1 (ENSRFEG00010021669) #20	LAD1 (ENSRFEG00010021699) #21	TNNT2 (ENSRFEG00010021773) #22	PKP1 (ENSRFEG00010021880) #23	ENSRFEG00010021887 #24	TMEM9 (ENSRFEG00010021896) #25	CACNA1S (ENSRFEG00010013548) #27	KIF21B (ENSRFEG00010013731) #28	ENSRFEG00010013943	INAVA (ENSRFEG00010014040) #29	GPR25 (ENSRFEG00010014069) #30	CAMSAP2 (ENSRFEG00010014100) #31	DDX59 (ENSRFEG00010014264) #33	KIF14 (ENSRFEG00010014355) #34	ZNF281 (ENSRFEG00010015687) #35	NR5A2 (ENSRFEG00010015719) #36	PTPRC (ENSRFEG00010015946)	ATP6V1G3 (ENSRFEG00010016181)
Megabat	MODERN SPECIES	148														TNNI1 (ENSPVAG00000008372) #20	ENSPVAG00000008371 #21	TNNT2 (ENSPVAG00000008369) #22
Equus	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT00940000160882.f
Horse	MODERN SPECIES	23	PTPN7 (ENSECAG00000024331) #7	ARL8A (ENSECAG00000021194) #8	GPR37L1 (ENSECAG00000019422) #9	ELF3 (ENSECAG00000014608) #10	RNPEP (ENSECAG00000023740) #11	TIMM17A (ENSECAG00000021816) #12	LMOD1 (ENSECAG00000021583) #13	SHISA4 (ENSECAG00000021280) #14	IPO9 (ENSECAG00000024368) #15	ENSECAG00000050133 #17	NAV1 (ENSECAG00000015493) #16	CSRP1 (ENSECAG00000008944) #18	PHLDA3 (ENSECAG00000006734) #19	TNNI1 (ENSECAG00000034915) #20	LAD1 (ENSECAG00000013156) #21	TNNT2 (ENSECAG00000022125) #22	PKP1 (ENSECAG00000015220) #23	ENSECAG00000013767 #24	ASCL5 (ENSECAG00000040718) #26	CACNA1S (ENSECAG00000018762) #27	ENSECAG00000045507 #28	ENSECAG00000023530	INAVA (ENSECAG00000022618) #29	CAMSAP2 (ENSECAG00000012562) #31	DDX59 (ENSECAG00000006958) #33	KIF14 (ENSECAG00000024694) #34	ZNF281 (ENSECAG00000024354)	NR5A2 (ENSECAG00000015418) #36	PTPRC (ENSECAG00000007192)	ENSECAG00000023881	ENSECAG00000059953
Donkey	MODERN SPECIES	23	ENSEASG00005025203 #8	GPR37L1 (ENSEASG00005019713) #9	ELF3 (ENSEASG00005019716) #10	RNPEP (ENSEASG00005019742) #11	TIMM17A (ENSEASG00005019904) #12	LMOD1 (ENSEASG00005019905) #13	SHISA4 (ENSEASG00005019906) #14	IPO9 (ENSEASG00005019908) #15	ENSEASG00005019910	NAV1 (ENSEASG00005019916) #16	ENSEASG00005019923 #17	CSRP1 (ENSEASG00005019925) #18	ENSEASG00005036394 #19	TNNI1 (ENSEASG00005019927) #20	LAD1 (ENSEASG00005019930) #21	TNNT2 (ENSEASG00005031447) #22	PKP1 (ENSEASG00005000088) #23	ENSEASG00005000127 #24	ENSEASG00005000303 #25	ASCL5 (ENSEASG00005024194) #26	CACNA1S (ENSEASG00005000518) #27	KIF21B (ENSEASG00005003075) #28	ENSEASG00005003089	INAVA (ENSEASG00005003096) #29	GPR25 (ENSEASG00005026784) #30	CAMSAP2 (ENSEASG00005003109) #31	DDX59 (ENSEASG00005003122) #33	KIF14 (ENSEASG00005003131) #34	ENSEASG00005003150	NR5A2 (ENSEASG00005003166) #36	PTPRC (ENSEASG00005003180)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00490000044158	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.a #22
Armadillo	MODERN SPECIES	3890															ENSDNOG00000044046	TNNT2 (ENSDNOG00000044846) #22	ENSDNOG00000043629	PKP1 (ENSDNOG00000008503) #23	ENSDNOG00000040619 #24	TMEM9 (ENSDNOG00000037372) #25	ASCL5 (ENSDNOG00000047337) #26	CACNA1S (ENSDNOG00000005652) #27	KIF21B (ENSDNOG00000005611) #28	INAVA (ENSDNOG00000046632) #29	GPR25 (ENSDNOG00000037605) #30	CAMSAP2 (ENSDNOG00000014289) #31	ENSDNOG00000044172
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431.b #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT00940000160882
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431.b #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT00940000160882
Elephant	MODERN SPECIES	71	ENSLAFG00000029343	PTPN7 (ENSLAFG00000015048) #7	ARL8A (ENSLAFG00000015043) #8	GPR37L1 (ENSLAFG00000004350) #9	ELF3 (ENSLAFG00000017701) #10	RNPEP (ENSLAFG00000017697) #11	TIMM17A (ENSLAFG00000017314) #12	LMOD1 (ENSLAFG00000012569) #13	SHISA4 (ENSLAFG00000012568) #14	IPO9 (ENSLAFG00000012565) #15	NAV1 (ENSLAFG00000012549) #16	CSRP1 (ENSLAFG00000013572) #18	PHLDA3 (ENSLAFG00000016242) #19	TNNI1 (ENSLAFG00000010118) #20	LAD1 (ENSLAFG00000012730) #21	TNNT2 (ENSLAFG00000006534) #22	PKP1 (ENSLAFG00000012725) #23	ENSLAFG00000012716 #24	ENSLAFG00000032460 #24	TMEM9 (ENSLAFG00000005152) #25	CACNA1S (ENSLAFG00000014235) #27	KIF21B (ENSLAFG00000016500) #28	ENSLAFG00000031265	INAVA (ENSLAFG00000010442) #29	GPR25 (ENSLAFG00000022308) #30	CAMSAP2 (ENSLAFG00000009699) #31	DDX59 (ENSLAFG00000030362) #33	ENSLAFG00000016791 #33	KIF14 (ENSLAFG00000016770) #34	ZNF281 (ENSLAFG00000006851) #35	NR5A2 (ENSLAFG00000008809) #36
Hyrax	MODERN SPECIES	1497														TNNI1 (ENSPCAG00000003631) #20	ENSPCAG00000003563 #21	TNNT2 (ENSPCAG00000003493) #22
Tenrec	MODERN SPECIES	5055																ENSETEG00000000042 #22
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Opossum	MODERN SPECIES	1	GPR37L1 (ENSMODG00000000574) #9	ELF3 (ENSMODG00000000545) #10	RNPEP (ENSMODG00000000527) #11	TIMM17A (ENSMODG00000000517) #12	ENSMODG00000049194	LMOD1 (ENSMODG00000000505) #13	SHISA4 (ENSMODG00000000492) #14	IPO9 (ENSMODG00000000485) #15	ENSMODG00000000466	ENSMODG00000047527 #17	NAV1 (ENSMODG00000000459) #16	CSRP1 (ENSMODG00000000403) #18	PHLDA3 (ENSMODG00000024846) #19	TNNI1 (ENSMODG00000000395) #20	ENSMODG00000000386 #21	TNNT2 (ENSMODG00000000364) #22	PKP1 (ENSMODG00000000329) #23	ENSMODG00000000312 #24	TMEM9 (ENSMODG00000000181) #25	ASCL5 (ENSMODG00000000174) #26	CACNA1S (ENSMODG00000000170) #27	KIF21B (ENSMODG00000000144) #28	ENSMODG00000027326	INAVA (ENSMODG00000000006) #29	GNB1 (ENSMODG00000006881)	NADK (ENSMODG00000006845)	ENSMODG00000039082	SLC35E2B (ENSMODG00000006795)	ENSMODG00000006779	MMP23B (ENSMODG00000006736)	MIB2 (ENSMODG00000006713)
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000163702	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT00940000160882
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00390000017780.f #12	ENSGT00940000159825 #13	ENSGT00730000111186 #14	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26	ENSGT00940000158289.b #27	ENSGT00940000159650 #28	ENSGT00940000154102.a #29	ENSGT01050000244888.a.b #30	ENSGT00950000182975.a.a.a.b #31	ENSGT00940000158639 #33	ENSGT00940000156834 #34	ENSGT00940000161586 #35	ENSGT00940000153391.c.b.b #36	ENSGT00940000159457	ENSGT00940000160882
koala	MODERN SPECIES	99	ENSPCIG00000004945	PTPN7 (ENSPCIG00000004925) #7	ENSPCIG00000004915 #8	GPR37L1 (ENSPCIG00000004904) #9	ELF3 (ENSPCIG00000004892) #10	RNPEP (ENSPCIG00000025385) #11	TIMM17A (ENSPCIG00000025390) #12	LMOD1 (ENSPCIG00000025393) #13	IPO9 (ENSPCIG00000030448) #15	ENSPCIG00000030447	NAV1 (ENSPCIG00000030446) #16	CSRP1 (ENSPCIG00000030445) #18	PHLDA3 (ENSPCIG00000030443) #19	TNNI1 (ENSPCIG00000030441) #20	ENSPCIG00000033473 #21	TNNT2 (ENSPCIG00000003891) #22	PKP1 (ENSPCIG00000023671) #23	ENSPCIG00000003726 #24	TMEM9 (ENSPCIG00000030438) #25	ASCL5 (ENSPCIG00000035177) #26	CACNA1S (ENSPCIG00000030425) #27	KIF21B (ENSPCIG00000030397) #28	CAMSAP2 (ENSPCIG00000030391) #31	DDX59 (ENSPCIG00000030390) #33	KIF14 (ENSPCIG00000030389) #34	ENSPCIG00000030388	ZNF281 (ENSPCIG00000030386) #35	NR5A2 (ENSPCIG00000030383) #36	ENSPCIG00000021891
Common wonbat	MODERN SPECIES	1114	PTPN7 (ENSVURG00010003346) #7	ARL8A (ENSVURG00010003356) #8	GPR37L1 (ENSVURG00010003364) #9	ELF3 (ENSVURG00010003381) #10	RNPEP (ENSVURG00010003412) #11	TIMM17A (ENSVURG00010003443) #12	LMOD1 (ENSVURG00010003452) #13	SHISA4 (ENSVURG00010003461) #14	IPO9 (ENSVURG00010003477) #15	NAV1 (ENSVURG00010003559) #16	ENSVURG00010003649	CSRP1 (ENSVURG00010003663) #18	PHLDA3 (ENSVURG00010003675) #19	TNNI1 (ENSVURG00010003687) #20	LAD1 (ENSVURG00010003784) #21	TNNT2 (ENSVURG00010003821) #22	PKP1 (ENSVURG00010003953) #23	ENSVURG00010003973 #24	TMEM9 (ENSVURG00010004010) #25	ASCL5 (ENSVURG00010004015) #26	CACNA1S (ENSVURG00010004042) #27	ENSVURG00010004103	KIF21B (ENSVURG00010004167) #28	INAVA (ENSVURG00010004280) #29	GPR25 (ENSVURG00010004293) #30	CAMSAP2 (ENSVURG00010004314) #31	DDX59 (ENSVURG00010004351) #33	KIF14 (ENSVURG00010004390) #34	ZNF281 (ENSVURG00010004492) #35	NR5A2 (ENSVURG00010004531) #36	PTPRC (ENSVURG00010004608)
Wallaby	MODERN SPECIES	6392																ENSMEUG00000008528 #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	3	ENSSHAG00000026108 #7	ARL8A (ENSSHAG00000025922) #8	GPR37L1 (ENSSHAG00000024447) #9	ELF3 (ENSSHAG00000001003) #10	RNPEP (ENSSHAG00000011469) #11	TIMM17A (ENSSHAG00000024537) #12	LMOD1 (ENSSHAG00000010819) #13	ENSSHAG00000026950 #14	IPO9 (ENSSHAG00000010437) #15	ENSSHAG00000009916	NAV1 (ENSSHAG00000007215) #16	CSRP1 (ENSSHAG00000026233) #18	PHLDA3 (ENSSHAG00000025303) #19	TNNI1 (ENSSHAG00000022760) #20	ENSSHAG00000028054 #21	TNNT2 (ENSSHAG00000002049) #22	PKP1 (ENSSHAG00000027952) #23	ENSSHAG00000000455 #24	TMEM9 (ENSSHAG00000023108) #25	ASCL5 (ENSSHAG00000025864) #26	CACNA1S (ENSSHAG00000001786) #27	KIF21B (ENSSHAG00000002035) #28	ENSSHAG00000003922	INAVA (ENSSHAG00000013848) #29	GPR25 (ENSSHAG00000028456) #30	CAMSAP2 (ENSSHAG00000001294) #31	DDX59 (ENSSHAG00000014781) #33	KIF14 (ENSSHAG00000014403) #34	ENSSHAG00000029772	NR5A2 (ENSSHAG00000011399) #36	PTPRC (ENSSHAG00000015523)
Platypus	MODERN SPECIES	18	FAM237A (ENSOANG00000045785)	MDH1B (ENSOANG00000000659)	ENSOANG00000020472	KLF7 (ENSOANG00000047076)	TIMM17A (ENSOANG00000043200) #12	LMOD1 (ENSOANG00000041996) #13	SHISA4 (ENSOANG00000009360) #14	IPO9 (ENSOANG00000009358) #15	ENSOANG00000009356	ENSOANG00000048097 #17	NAV1 (ENSOANG00000009353) #16	ENSOANG00000009350 #18	PHLDA3 (ENSOANG00000009349) #19	TNNI1 (ENSOANG00000040983) #20	ENSOANG00000049867 #21	TNNT2 (ENSOANG00000012466) #22	PKP1 (ENSOANG00000038923) #23	ENSOANG00000005823 #24	TMEM9 (ENSOANG00000044717) #25	ASCL5 (ENSOANG00000046959) #26	CACNA1S (ENSOANG00000004594) #27	KIF21B (ENSOANG00000004596) #28	ENSOANG00000029469	INAVA (ENSOANG00000004597) #29	TMEM167B (ENSOANG00000042071)	ENSOANG00000041705	ELAPOR1 (ENSOANG00000012844)	SARS1 (ENSOANG00000009192)	ENSOANG00000000300	CELSR2 (ENSOANG00000046970)	SORT1 (ENSOANG00000015499)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00390000007725.A.b	ENSGT00940000157504	ENSGT00940000158152	ENSGT00970000193609	ENSGT00390000003368	ENSGT00940000163318	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00390000016950	ENSGT00940000158947	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00390000014494
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00390000007725.A.b	ENSGT00940000157504	ENSGT00940000158152	ENSGT00970000193609	ENSGT00390000003368	ENSGT00940000163318	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00390000016950	ENSGT00940000158947	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00390000014494
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00900000143186 #17	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00390000007725.A.b	ENSGT00940000157504	ENSGT00940000158152	ENSGT00970000193609	ENSGT00390000003368	ENSGT00960000191930	ENSGT00940000163318	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00390000016950	ENSGT00940000158947	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182931.B.a.b
Common wall lizard	MODERN SPECIES	14	ENSPMRG00000003722	PTPN7 (ENSPMRG00000003714) #7	ARL8A (ENSPMRG00000003695) #8	GPR37L1 (ENSPMRG00000003690) #9	ELF3 (ENSPMRG00000003684) #10	RNPEP (ENSPMRG00000003674) #11	ENSPMRG00000003671 #17	NAV1 (ENSPMRG00000003633) #16	SYT2 (ENSPMRG00000003620)	PPP1R12B (ENSPMRG00000003568)	ENSPMRG00000003543	CSRP1 (ENSPMRG00000003537) #18	PHLDA3 (ENSPMRG00000003529) #19	TNNI1 (ENSPMRG00000003517) #20	LAD1 (ENSPMRG00000003512) #21	TNNT2 (ENSPMRG00000003502) #22	PKP1 (ENSPMRG00000003493) #23	ENSPMRG00000003482 #24	TMEM9 (ENSPMRG00000003466) #25	NGF (ENSPMRG00000003457)	TSPAN2 (ENSPMRG00000003453)	TSHB (ENSPMRG00000003447)	ENSPMRG00000003438	ENSPMRG00000003434	ENSPMRG00000003428	ENSPMRG00000003424	ENSPMRG00000003399	SIKE1 (ENSPMRG00000003391)	CSDE1 (ENSPMRG00000003356)	NRAS (ENSPMRG00000003341)	AMPD1 (ENSPMRG00000003326)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	28	ENSSMRG00000003625	PTPN7 (ENSSMRG00000003633) #7	ARL8A (ENSSMRG00000003634) #8	GPR37L1 (ENSSMRG00000003636) #9	ELF3 (ENSSMRG00000003640) #10	RNPEP (ENSSMRG00000003643) #11	NAV1 (ENSSMRG00000003647) #16	ENSSMRG00000003676 #17	ENSSMRG00000003681	PPP1R12B (ENSSMRG00000003847)	CSRP1 (ENSSMRG00000003915) #18	PHLDA3 (ENSSMRG00000003920) #19	ENSSMRG00000003921	TNNI1 (ENSSMRG00000003922) #20	LAD1 (ENSSMRG00000003929) #21	TNNT2 (ENSSMRG00000003935) #22	PKP1 (ENSSMRG00000003987) #23	ENSSMRG00000004001	TMEM9 (ENSSMRG00000004014) #25	NGF (ENSSMRG00000004028)	TSPAN2 (ENSSMRG00000004037)	ENSSMRG00000004046	TSHB (ENSSMRG00000004051)	ADCY10 (ENSSMRG00000004063)	ENSSMRG00000004081	ENSSMRG00000004088	ENSSMRG00000004090	SIKE1 (ENSSMRG00000004095)	CSDE1 (ENSSMRG00000004102)	NRAS (ENSSMRG00000004105)	AMPD1 (ENSSMRG00000004108)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000169516	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00390000007725.A.b	ENSGT00940000157504	ENSGT00940000158152	ENSGT00390000003368	ENSGT00940000163318	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00390000016950	ENSGT00940000158947	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00390000014494	ENSGT00940000156361.B
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000169516	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00390000007725.A.b.b	ENSGT00940000157504	ENSGT00940000158152	ENSGT00390000003368	ENSGT00940000163318	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00390000016950	ENSGT00940000158947	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00390000014494	ENSGT00940000156361.B
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000169516	ENSGT00390000000819.b.o #25	ENSGT00390000000819.b.p #25	ENSGT00390000007725.A.b.b	ENSGT00940000157504	ENSGT00940000158152	ENSGT00390000003368	ENSGT00940000163318	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00390000016950	ENSGT00940000158947	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00390000014494
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000169516	ENSGT00390000000819.b.o #25	ENSGT00390000000819.b.p #25	ENSGT00390000007725.A.b.b	ENSGT00940000157504	ENSGT00940000158152	ENSGT00390000003368	ENSGT00940000163318	ENSGT00390000018003.a	ENSGT00390000016950	ENSGT00940000158947	ENSGT00950000183011.c.a.a	ENSGT00950000182931.B.a.b	ENSGT00390000014494
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	141	ENSNSUG00000002668	ENSNSUG00000002648	PTPN7 (ENSNSUG00000002638) #7	ARL8A (ENSNSUG00000002513) #8	GPR37L1 (ENSNSUG00000002512) #9	ENSNSUG00000002511	ELF3 (ENSNSUG00000002509) #10	RNPEP (ENSNSUG00000002228) #11	NAV1 (ENSNSUG00000002188) #16	SYT2 (ENSNSUG00000002025)	ENSNSUG00000002022	ENSNSUG00000002018	CSRP1 (ENSNSUG00000002016) #18	PHLDA3 (ENSNSUG00000002013) #19	TNNI1 (ENSNSUG00000002009) #20	TNNT2 (ENSNSUG00000002004) #22	PKP1 (ENSNSUG00000002001) #23	ENSNSUG00000001996	TMEM9 (ENSNSUG00000001994) #25	NGF (ENSNSUG00000001992)	ENSNSUG00000001991
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	57	LGR6 (ENSPTXG00000010042)	ENSPTXG00000010041	PTPN7 (ENSPTXG00000010040) #7	GPR37L1 (ENSPTXG00000010039) #9	ARL8A (ENSPTXG00000010038) #8	ELF3 (ENSPTXG00000010037) #10	RNPEP (ENSPTXG00000010036) #11	NAV1 (ENSPTXG00000007179) #16	SYT2 (ENSPTXG00000007169)	ENSPTXG00000007168	ENSPTXG00000007166	CSRP1 (ENSPTXG00000007698) #18	PHLDA3 (ENSPTXG00000007697) #19	TNNI1 (ENSPTXG00000007695) #20	LAD1 (ENSPTXG00000007693) #21	TNNT2 (ENSPTXG00000007691) #22	PKP1 (ENSPTXG00000007688) #23	ENSPTXG00000007683	ENSPTXG00000007682 #25	ENSPTXG00000007681 #25	ENSPTXG00000007680	TSPAN2 (ENSPTXG00000007679)	ENSPTXG00000007678	TSHB (ENSPTXG00000007677)	ENSPTXG00000007676	ENSPTXG00000007675	SIKE1 (ENSPTXG00000007673)	CSDE1 (ENSPTXG00000007667)	NRAS (ENSPTXG00000007664)	AMPD1 (ENSPTXG00000007663)	DENND2C (ENSPTXG00000007651)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	9925																TNNT2 (ENSLLTG00000013610) #22
Indian cobra	MODERN SPECIES	2	LGR6 (ENSNNAG00000017395)	ENSNNAG00000017432	PTPN7 (ENSNNAG00000017494) #7	ENSNNAG00000017501 #8	ARL8A (ENSNNAG00000017510) #8	GPR37L1 (ENSNNAG00000017515) #9	ELF3 (ENSNNAG00000017518) #10	RNPEP (ENSNNAG00000017525) #11	NAV1 (ENSNNAG00000017530) #16	SYT2 (ENSNNAG00000017543)	PPP1R12B (ENSNNAG00000017552)	CSRP1 (ENSNNAG00000017598) #18	PHLDA3 (ENSNNAG00000017603) #19	TNNI1 (ENSNNAG00000017605) #20	LAD1 (ENSNNAG00000017615) #21	TNNT2 (ENSNNAG00000017619) #22	PKP1 (ENSNNAG00000017633) #23	ENSNNAG00000017642	TMEM9 (ENSNNAG00000004791) #25	NGF (ENSNNAG00000004800)	TSPAN2 (ENSNNAG00000004813)	ENSNNAG00000004824	TSHB (ENSNNAG00000004836)	ENSNNAG00000004842	ENSNNAG00000004854	SIKE1 (ENSNNAG00000004872)	CSDE1 (ENSNNAG00000004895)	NRAS (ENSNNAG00000005069)	AMPD1 (ENSNNAG00000005107)	DENND2C (ENSNNAG00000005192)	BCAS2 (ENSNNAG00000005273)
Lizard	MODERN SPECIES	3	ENSACAG00000040586	ARL8A (ENSACAG00000004202) #8	GPR37L1 (ENSACAG00000035102) #9	ELF3 (ENSACAG00000004148) #10	RNPEP (ENSACAG00000004050) #11	ENSACAG00000037439	ENSACAG00000041397	ENSACAG00000003925 #16	ENSACAG00000003847	ENSACAG00000003745	CSRP1 (ENSACAG00000003710) #18	PHLDA3 (ENSACAG00000003708) #19	ENSACAG00000039029	TNNI1 (ENSACAG00000003672) #20	LAD1 (ENSACAG00000028869) #21	TNNT2 (ENSACAG00000003593) #22	PKP1 (ENSACAG00000003509) #23	ENSACAG00000003494	TMEM9 (ENSACAG00000003471) #25	NGF (ENSACAG00000003464)	ENSACAG00000041146	TSPAN2 (ENSACAG00000003435)	ENSACAG00000003406	TSHB (ENSACAG00000039387)	ENSACAG00000032973	ENSACAG00000043536	ENSACAG00000038160	ENSACAG00000003336	SIKE1 (ENSACAG00000003294)	ENSACAG00000036675	CSDE1 (ENSACAG00000003120)
tuatara	MODERN SPECIES	567	ELF3 (ENSSPUG00000008106) #10	RNPEP (ENSSPUG00000008150) #11	ENSSPUG00000008163 #16	ENSSPUG00000008175 #17	ENSSPUG00000008182	ENSSPUG00000008195 #16	ENSSPUG00000008228	ENSSPUG00000008246	ENSSPUG00000008255	ENSSPUG00000008259	ENSSPUG00000008264	ENSSPUG00000008269	CSRP1 (ENSSPUG00000008280) #18	PHLDA3 (ENSSPUG00000008286) #19	TNNI1 (ENSSPUG00000008293) #20	TNNT2 (ENSSPUG00000008315) #22	PKP1 (ENSSPUG00000008330) #23	TMEM9 (ENSSPUG00000008350) #25	NGF (ENSSPUG00000008362)	TSPAN2 (ENSSPUG00000008367)	ENSSPUG00000008374	TSHB (ENSSPUG00000008387)	ENSSPUG00000008400	ENSSPUG00000008449	SIKE1 (ENSSPUG00000008647)	CSDE1 (ENSSPUG00000008714)	NRAS (ENSSPUG00000008958)
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000163452	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000169516	ENSGT00390000000819.b #25
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000163452	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000169516	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000154679.f.b.a	ENSGT00940000160258	ENSGT00940000154679.f.a	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000158169	ENSGT00390000015805	ENSGT00950000182981.b.f.b	ENSGT00400000022095.b	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000156542	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000158161
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000163452	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000169516	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000154679.f.b.a	ENSGT00940000154679.f.a	ENSGT00940000157663	ENSGT00940000158169
painted turtle	MODERN SPECIES	2392													CSRP1 (ENSCPBG00000026341) #18	PHLDA3 (ENSCPBG00000026338) #19	TNNI1 (ENSCPBG00000026336) #20	TNNT2 (ENSCPBG00000026330) #22	ENSCPBG00000026328	TMEM168 (ENSCPBG00000026325)	ENSCPBG00000026323	LSMEM1 (ENSCPBG00000026321)	IFRD1 (ENSCPBG00000026318)	ZNF277 (ENSCPBG00000026314)	DOCK4 (ENSCPBG00000026305)	ENSCPBG00000026301	LRRN3 (ENSCPBG00000026300)	IMMP2L (ENSCPBG00000026298)	DNAJB9 (ENSCPBG00000026296)	THAP5 (ENSCPBG00000026295)	ENSCPBG00000026292	PNPLA8 (ENSCPBG00000026288)	NRCAM (ENSCPBG00000015741)
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	89	ENSTMTG00000011779	ENSTMTG00000011908	PTPN7 (ENSTMTG00000011982) #7	ARL8A (ENSTMTG00000012007) #8	GPR37L1 (ENSTMTG00000012023) #9	ELF3 (ENSTMTG00000012047) #10	RNPEP (ENSTMTG00000012090) #11	NAV1 (ENSTMTG00000012573) #16	SYT2 (ENSTMTG00000012634)	PPP1R12B (ENSTMTG00000012702)	ENSTMTG00000012796	CSRP1 (ENSTMTG00000012805) #18	PHLDA3 (ENSTMTG00000012821) #19	TNNI1 (ENSTMTG00000012834) #20	LAD1 (ENSTMTG00000012902) #21	TNNT2 (ENSTMTG00000012939) #22	PKP1 (ENSTMTG00000013130) #23	ENSTMTG00000013202	TMEM9 (ENSTMTG00000013259) #25	GSTM4 (ENSTMTG00000013282)	ENSTMTG00000013348	GPR25 (ENSTMTG00000013424) #30
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000157365.j	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000163452	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000169516	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000154679.f.b.a	ENSGT00940000160258	ENSGT00940000154679.f.b.b	ENSGT00940000158169	ENSGT00390000015805	ENSGT00950000182981.b.f.b	ENSGT00400000022095.b	ENSGT00940000160669	ENSGT00940000156542	ENSGT00940000158860	ENSGT00940000158161	ENSGT00940000158411
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	1653	ENSCABG00000016377	ENSCABG00000016380 #7	ENSCABG00000016382 #7	ARL8A (ENSCABG00000016386) #8	ENSCABG00000016387	GPR37L1 (ENSCABG00000016389) #9	ELF3 (ENSCABG00000016391) #10	RNPEP (ENSCABG00000016399) #11	NAV1 (ENSCABG00000016457) #16	SYT2 (ENSCABG00000016459)	PPP1R12B (ENSCABG00000016479)	ENSCABG00000016482	CSRP1 (ENSCABG00000016483) #18	PHLDA3 (ENSCABG00000016485) #19	TNNI1 (ENSCABG00000016486) #20	TNNT2 (ENSCABG00000016491) #22	PKP1 (ENSCABG00000016495) #23	ENSCABG00000016499
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	18	UBE2T (ENSGEVG00005017349)	LGR6 (ENSGEVG00005017430)	ENSGEVG00005017566	PTPN7 (ENSGEVG00005017694) #7	ARL8A (ENSGEVG00005017714) #8	GPR37L1 (ENSGEVG00005017731) #9	ELF3 (ENSGEVG00005017757) #10	RNPEP (ENSGEVG00005017826) #11	NAV1 (ENSGEVG00005018046) #16	SYT2 (ENSGEVG00005018141)	PPP1R12B (ENSGEVG00005018278)	ENSGEVG00005018515	CSRP1 (ENSGEVG00005018528) #18	PHLDA3 (ENSGEVG00005018545) #19	TNNI1 (ENSGEVG00005018561) #20	TNNT2 (ENSGEVG00005018652) #22	PKP1 (ENSGEVG00005018759) #23	ENSGEVG00005018819	TMEM9 (ENSGEVG00005018890) #25	ENSGEVG00005018945	GSTM1 (ENSGEVG00005018961)	ENSGEVG00005018977	ENSGEVG00005019005	AHCYL1 (ENSGEVG00005019047)	STRIP1 (ENSGEVG00005019070)	ALX3 (ENSGEVG00005019111)	SLC6A17 (ENSGEVG00005019135)	KCNC4 (ENSGEVG00005019164)	RBM15 (ENSGEVG00005019171)	SLC16A4 (ENSGEVG00005019205)	LAMTOR5 (ENSGEVG00005000171)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	500	UBE2T (ENSPSIG00000012646)	LGR6 (ENSPSIG00000011884)	ENSPSIG00000011801	PTPN7 (ENSPSIG00000011667) #7	ARL8A (ENSPSIG00000011488) #8	GPR37L1 (ENSPSIG00000011257) #9	ELF3 (ENSPSIG00000010841) #10	RNPEP (ENSPSIG00000010050) #11	NAV1 (ENSPSIG00000007958) #16	ENSPSIG00000007166	PPP1R12B (ENSPSIG00000007681)	ENSPSIG00000000048	CSRP1 (ENSPSIG00000007394) #18	TNNI1 (ENSPSIG00000007323) #20	ENSPSIG00000007313	TNNT2 (ENSPSIG00000007199) #22	PKP1 (ENSPSIG00000007049) #23	ENSPSIG00000006989	ENSPSIG00000006984	ENSPSIG00000006947 #25	INAVA (ENSPSIG00000006943) #29	SHISA4 (ENSPSIG00000006913) #14	ENSPSIG00000006910	BRPF3 (ENSPSIG00000006906)	MAPK13 (ENSPSIG00000006732)	MAPK14 (ENSPSIG00000006647)	SLC26A8 (ENSPSIG00000006559)	SRPK1 (ENSPSIG00000006364)	LHFPL5 (ENSPSIG00000006348)	CLPS (ENSPSIG00000006319)	ARMC12 (ENSPSIG00000006267)
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000164079	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000158955 #10	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163864 #26
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	52	DRAM2 (ENSCPRG00005006120)	CEPT1 (ENSCPRG00005006113)	DENND2D (ENSCPRG00005006083)	MYBPH (ENSCPRG00005006074)	ADORA1 (ENSCPRG00005006061)	MYOG (ENSCPRG00005006056)	PPFIA4 (ENSCPRG00005006022)	TMEM183A (ENSCPRG00005006010)	ENSCPRG00005006006	ENSCPRG00005006004	CACNA1S (ENSCPRG00005004909) #27	KIF21B (ENSCPRG00005004750) #28	CSRP1 (ENSCPRG00005004741) #18	PHLDA3 (ENSCPRG00005004738) #19	TNNI1 (ENSCPRG00005004735) #20	TNNT2 (ENSCPRG00005004703) #22	PKP1 (ENSCPRG00005004682) #23	ENSCPRG00005004667	TMEM9 (ENSCPRG00005004662) #25	ASCL5 (ENSCPRG00005004650) #26	ENSCPRG00005004572	LZTR1 (ENSCPRG00005004532)	IPO9 (ENSCPRG00005004522) #15	KDM5B (ENSCPRG00005004504)	ENSCPRG00005004491	RABIF (ENSCPRG00005004486)	KLHL12 (ENSCPRG00005004473)	INAVA (ENSCPRG00005004461) #29	GPR25 (ENSCPRG00005004441) #30	ENSCPRG00005004433	ENSCPRG00005004428
Aves	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000155199	ENSGT00390000016889	ENSGT00950000182825.A.a.a	ENSGT00940000157076	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163962	ENSGT00390000009310	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a	ENSGT00950000182959.a.b.b.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158040	ENSGT00950000182931.A	ENSGT00950000183117.a.b	ENSGT01030000234578.B.b	ENSGT00390000017353	ENSGT00940000165883	ENSGT00940000157365
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Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000155199	ENSGT00390000016889	ENSGT00950000182825.A.a.a	ENSGT00940000157076	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163962	ENSGT00390000009310	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a	ENSGT00950000182959.a.b.b.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158040	ENSGT00950000182931.A	ENSGT00950000183117.a.b	ENSGT01030000234578.B.b	ENSGT00390000017353	ENSGT00940000165883	ENSGT00940000157365
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000155199	ENSGT00390000016889	ENSGT00950000182825.A.a.a	ENSGT00940000157076	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163962	ENSGT00390000009310	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a	ENSGT00950000182959.a.b.b.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158040	ENSGT00950000182931.A	ENSGT00940000153835.a.b	ENSGT00470000042297	ENSGT00940000153835.a.a	ENSGT00940000158700	ENSGT00940000160187
Duck	MODERN SPECIES	18	ENSAPLG00000005477	LGR6 (ENSAPLG00000006712)	KLHL12 (ENSAPLG00000007219)	RABIF (ENSAPLG00000027144)	ENSAPLG00000007649	KDM5B (ENSAPLG00000007715)	IPO9 (ENSAPLG00000008676) #15	LZTR1 (ENSAPLG00000009376)	SYT2 (ENSAPLG00000011038)	ENSAPLG00000028213	ENSAPLG00000028831	CSRP1 (ENSAPLG00000012039) #18	PHLDA3 (ENSAPLG00000023295) #19	TNNI1 (ENSAPLG00000021735) #20	LAD1 (ENSAPLG00000021537) #21	TNNT2 (ENSAPLG00000012741) #22	ENSAPLG00000027664	PKP1 (ENSAPLG00000013591) #23	ENSAPLG00000014322 #24	TMEM9 (ENSAPLG00000022254) #25	ENSAPLG00000014428	TMEM183A (ENSAPLG00000014430)	PPFIA4 (ENSAPLG00000014630)	ADORA1 (ENSAPLG00000002300)	MYBPH (ENSAPLG00000002403)	DENND2D (ENSAPLG00000003672)	ENSAPLG00000008823	TREM2 (ENSAPLG00000008731)	ENSAPLG00000016642	ENSAPLG00000023534	ENSAPLG00000024889
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	153	LGR6 (ENSABRG00000016304)	KLHL12 (ENSABRG00000016321)	RABIF (ENSABRG00000016340)	ENSABRG00000016345	KDM5B (ENSABRG00000016464)	IPO9 (ENSABRG00000017254) #15	LZTR1 (ENSABRG00000017579)	RNPEP (ENSABRG00000017816) #11	NAV1 (ENSABRG00000017875) #16	SYT2 (ENSABRG00000017886)	PPP1R12B (ENSABRG00000017893)	CSRP1 (ENSABRG00000017898) #18	PHLDA3 (ENSABRG00000017905) #19	TNNI1 (ENSABRG00000017918) #20	LAD1 (ENSABRG00000017940) #21	TNNT2 (ENSABRG00000017950) #22	PKP1 (ENSABRG00000017968) #23	ENSABRG00000000085	TMEM9 (ENSABRG00000000096) #25	ENSABRG00000000098	TMEM183A (ENSABRG00000000101)	PPFIA4 (ENSABRG00000000109)	ENSABRG00000000164	MYOG (ENSABRG00000000170)	ADORA1 (ENSABRG00000000178)	MYBPH (ENSABRG00000000188)	DENND2D (ENSABRG00000000230)	ENSABRG00000000303	TREM2 (ENSABRG00000000340)	ENSABRG00000000347	FOXP4 (ENSABRG00000000369)
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Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158255	ENSGT00940000155199	ENSGT00390000016889	ENSGT00950000182825.A.a.a	ENSGT00940000157076	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163962	ENSGT00390000009310	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a	ENSGT00950000182959.a.b.b.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158040	ENSGT00950000182931.A	ENSGT00950000183117.a.b	ENSGT01030000234578.B.b	ENSGT00390000017353	ENSGT00940000165883	ENSGT00940000157365
Turkey	MODERN SPECIES	20	ENSMGAG00000005257	ENSMGAG00000005274	ENSMGAG00000005236	ENSMGAG00000005215	ENSMGAG00000005149	ENSMGAG00000005150	MYOG (ENSMGAG00000002212)	ENSMGAG00000002090	ENSMGAG00000002056 #25	ENSMGAG00000002066	ENSMGAG00000002067	CSRP1 (ENSMGAG00000002016) #18	PHLDA3 (ENSMGAG00000021472) #19	TNNI1 (ENSMGAG00000001811) #20	LAD1 (ENSMGAG00000001842) #21	TNNT2 (ENSMGAG00000001868) #22	PKP1 (ENSMGAG00000002027) #23	ENSMGAG00000002044 #24	ENSMGAG00000001642	ENSMGAG00000018354	ENSMGAG00000001598	ENSMGAG00000001543 #16	ENSMGAG00000001493	ENSMGAG00000001520 #11	ENSMGAG00000001445 #15	ENSMGAG00000001393	ENSMGAG00000001380	ENSMGAG00000017772	ENSMGAG00000001374	ENSMGAG00000022615	ENSMGAG00000001270
Chicken	MODERN SPECIES	18	NELFE (ENSGALG00010025929)	SKIC2 (ENSGALG00010025933)	KLHL12 (ENSGALG00010025970)	RABIF (ENSGALG00010026013)	TUBA5 (ENSGALG00010026036)	KDM5B (ENSGALG00010027872)	IPO9 (ENSGALG00010026102) #15	LZTR1 (ENSGALG00010026117)	RNPEP (ENSGALG00010026143) #11	NAV1 (ENSGALG00010026262) #16	SYT2 (ENSGALG00010026315)	PPP1R12B (ENSGALG00010026355)	CSRP1 (ENSGALG00010026508) #18	TNNI1 (ENSGALG00010026560) #20	LAD1 (ENSGALG00010026638) #21	TNNT2 (ENSGALG00010026743) #22	PKP1 (ENSGALG00010024891) #23	ENSGALG00010025003 #24	TMEM9 (ENSGALG00010025044) #25	MGAT4C (ENSGALG00010025115)	TMEM183A (ENSGALG00010025154)	PPFIA4 (ENSGALG00010025188)	MYOG (ENSGALG00010025215)	ADORA1 (ENSGALG00010024589)	MYBPHL (ENSGALG00010024595)	DENND2D (ENSGALG00010024608)	CEPT1 (ENSGALG00010024627)	DRAM2 (ENSGALG00010024692)	LRIF1 (ENSGALG00010024712)	ENSGALG00010024760	UBE2T (ENSGALG00010024783)
Japanese quail	MODERN SPECIES	18	LGR6 (ENSCJPG00005006846)	ENSCJPG00005006848	SKIC2 (ENSCJPG00005006849)	KLHL12 (ENSCJPG00005006915)	RABIF (ENSCJPG00005006917)	ENSCJPG00005006918	KDM5B (ENSCJPG00005006922)	LZTR1 (ENSCJPG00005007247)	RNPEP (ENSCJPG00005007249) #11	NAV1 (ENSCJPG00005007385) #16	SYT2 (ENSCJPG00005007448)	PPP1R12B (ENSCJPG00005007786)	CSRP1 (ENSCJPG00005007905) #18	PHLDA3 (ENSCJPG00005007906) #19	TNNI1 (ENSCJPG00005007907) #20	TNNT2 (ENSCJPG00005007908) #22	PKP1 (ENSCJPG00005007911) #23	ENSCJPG00005007994 #24	TMEM9 (ENSCJPG00005007995) #25	ENSCJPG00005007996	TMEM183A (ENSCJPG00005007997)	PPFIA4 (ENSCJPG00005008004)	MYOG (ENSCJPG00005009052)	ADORA1 (ENSCJPG00005009054)	MYBPH (ENSCJPG00005009055)	DENND2D (ENSCJPG00005009056)	CEPT1 (ENSCJPG00005009057)	DRAM2 (ENSCJPG00005009058)	LRIF1 (ENSCJPG00005009059)	ENSCJPG00005009060	UBE2T (ENSCJPG00005009061)
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000155199	ENSGT00390000016889	ENSGT00950000182825.A.a.a	ENSGT00940000157076	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163962	ENSGT00390000009310	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a	ENSGT00950000182959.a.b.b.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158040	ENSGT00950000182931.A	ENSGT00950000183117.a.b	ENSGT01030000234578.B.b	ENSGT00390000017353	ENSGT00940000165883	ENSGT00940000157365
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000155199	ENSGT00390000016889	ENSGT00950000182825.A.a.a	ENSGT00940000157076	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163962	ENSGT00390000009310	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a	ENSGT00950000182959.a.b.b.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158040	ENSGT00950000182931.A	ENSGT00950000183117.a.b	ENSGT01030000234578.B.b	ENSGT00390000017353	ENSGT00940000165883	ENSGT00940000157365
Great tit	MODERN SPECIES	19	KLHL12 (ENSPMJG00000007617)	RABIF (ENSPMJG00000007616)	ENSPMJG00000007615	KDM5B (ENSPMJG00000007609)	IPO9 (ENSPMJG00000006711) #15	LZTR1 (ENSPMJG00000006696)	RNPEP (ENSPMJG00000006695) #11	NAV1 (ENSPMJG00000004802) #16	SYT2 (ENSPMJG00000004789)	ENSPMJG00000004784	ENSPMJG00000004750	CSRP1 (ENSPMJG00000004741) #18	PHLDA3 (ENSPMJG00000004739) #19	TNNI1 (ENSPMJG00000004728) #20	ENSPMJG00000004724	TNNT2 (ENSPMJG00000004718) #22	PKP1 (ENSPMJG00000004713) #23	ENSPMJG00000004704	TMEM9 (ENSPMJG00000004702) #25	ENSPMJG00000004699	TMEM183A (ENSPMJG00000004698)	PPFIA4 (ENSPMJG00000004678)	MYOG (ENSPMJG00000004674)	ADORA1 (ENSPMJG00000004672)	MYBPH (ENSPMJG00000004664)	DENND2D (ENSPMJG00000004659)	CEPT1 (ENSPMJG00000004653)	DRAM2 (ENSPMJG00000004636)	LRIF1 (ENSPMJG00000004634)	ENSPMJG00000004623	UBE2T (ENSPMJG00000004613)
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000155199	ENSGT00390000016889	ENSGT00950000182825.A.a.a	ENSGT00940000157076	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163962	ENSGT00390000009310	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a	ENSGT00950000182959.a.b.b.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158040	ENSGT00950000182931.A	ENSGT00950000183117.a.b	ENSGT01030000234578.B.b	ENSGT00390000017353	ENSGT00940000165883	ENSGT00940000157365
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000155199	ENSGT00390000016889	ENSGT00950000182825.A.a.a	ENSGT00940000157076	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000169516	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163962	ENSGT00390000009310	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a	ENSGT00950000182959.a.b.b.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158040	ENSGT00950000182931.A	ENSGT00950000183117.a.b	ENSGT01030000234578.B.b	ENSGT00390000017353	ENSGT00940000165883	ENSGT00940000157365
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000155199	ENSGT00390000016889	ENSGT00950000182825.A.a.a	ENSGT00940000157076	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000169516	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163962	ENSGT00390000009310	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a	ENSGT00950000182959.a.b.b.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158040	ENSGT00950000182931.A	ENSGT00950000183117.a.b	ENSGT01030000234578.B.b	ENSGT00390000017353	ENSGT00940000165883	ENSGT00940000157365
Zebra finch	MODERN SPECIES	19	KLHL12 (ENSTGUG00000001234)	RABIF (ENSTGUG00000024844)	ENSTGUG00000001252	KDM5B (ENSTGUG00000001257)	IPO9 (ENSTGUG00000001278) #15	LZTR1 (ENSTGUG00000001281)	RNPEP (ENSTGUG00000001290) #11	NAV1 (ENSTGUG00000001299) #16	SYT2 (ENSTGUG00000001304)	ENSTGUG00000028728	PPP1R12B (ENSTGUG00000001309)	CSRP1 (ENSTGUG00000024671) #18	PHLDA3 (ENSTGUG00000001317) #19	TNNI1 (ENSTGUG00000001319) #20	ENSTGUG00000001329 #21	TNNT2 (ENSTGUG00000001330) #22	PKP1 (ENSTGUG00000001339) #23	ENSTGUG00000001343	TMEM9 (ENSTGUG00000024782) #25	ENSTGUG00000023392	ENSTGUG00000001350	TMEM183A (ENSTGUG00000001354)	PPFIA4 (ENSTGUG00000001363)	MYOG (ENSTGUG00000001380)	ADORA1 (ENSTGUG00000001381)	MYBPH (ENSTGUG00000001383)	DENND2D (ENSTGUG00000001388)	DRAM2 (ENSTGUG00000001400)	LRIF1 (ENSTGUG00000001402)	ENSTGUG00000001403	UBE2T (ENSTGUG00000001411)
Common canary	MODERN SPECIES	46	ENSSCAG00000006364	KDM5B (ENSSCAG00000006368)	IPO9 (ENSSCAG00000006416) #15	LZTR1 (ENSSCAG00000006664)	RNPEP (ENSSCAG00000006683) #11	NAV1 (ENSSCAG00000006798) #16	SYT2 (ENSSCAG00000006987)	ENSSCAG00000006990	ENSSCAG00000006994	ENSSCAG00000006997	CSRP1 (ENSSCAG00000007004) #18	PHLDA3 (ENSSCAG00000007008) #19	TNNI1 (ENSSCAG00000007010) #20	ENSSCAG00000007013	ENSSCAG00000007018	TNNT2 (ENSSCAG00000007026) #22	PKP1 (ENSSCAG00000007030) #23	ENSSCAG00000007038	ENSSCAG00000007046	TMEM9 (ENSSCAG00000007050) #25	ENSSCAG00000007055	TMEM183A (ENSSCAG00000007059)	PPFIA4 (ENSSCAG00000007064)	MYOG (ENSSCAG00000007079)	ADORA1 (ENSSCAG00000007082)	MYBPH (ENSSCAG00000007084)	DENND2D (ENSSCAG00000007088)	CEPT1 (ENSSCAG00000007093)	DRAM2 (ENSSCAG00000007097)	LRIF1 (ENSSCAG00000007100)	ENSSCAG00000007102
Medium ground finch	MODERN SPECIES	128	ENSGFOG00000007520	LGR6 (ENSGFOG00000007378)	KLHL12 (ENSGFOG00000007359)	ENSGFOG00000007347	KDM5B (ENSGFOG00000005418)	IPO9 (ENSGFOG00000005155) #15	LZTR1 (ENSGFOG00000003792)	RNPEP (ENSGFOG00000003613) #11	NAV1 (ENSGFOG00000003479) #16	SYT2 (ENSGFOG00000003458)	ENSGFOG00000003446	ENSGFOG00000003382	CSRP1 (ENSGFOG00000003369) #18	PHLDA3 (ENSGFOG00000003358) #19	TNNI1 (ENSGFOG00000003337) #20	TNNT2 (ENSGFOG00000003306) #22	PKP1 (ENSGFOG00000002225) #23	ENSGFOG00000002170	TMEM9 (ENSGFOG00000002156) #25	ENSGFOG00000002149	TMEM183A (ENSGFOG00000002132)	ENSGFOG00000002124	PPFIA4 (ENSGFOG00000002061)	MYOG (ENSGFOG00000002039)	ADORA1 (ENSGFOG00000002030)	MYBPH (ENSGFOG00000002017)	DENND2D (ENSGFOG00000002007)	CEPT1 (ENSGFOG00000001999)	DRAM2 (ENSGFOG00000013088)	LRIF1 (ENSGFOG00000013086)	ENSGFOG00000013076
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000155199	ENSGT00390000016889	ENSGT00950000182825.A.a.a	ENSGT00940000157076	ENSGT00390000008224 #15	ENSGT00940000158190	ENSGT00940000160431 #11	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00390000005256 #21	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000162073 #24	ENSGT00940000169516	ENSGT00390000000819.b #25	ENSGT00940000163962	ENSGT00390000009310	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.a	ENSGT00950000182959.a.b.b.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158040	ENSGT00950000182931.A	ENSGT00950000183117.a.b	ENSGT01030000234578.B.b	ENSGT00390000017353	ENSGT00940000165883
Golden eagle	MODERN SPECIES	16	LGR6 (ENSACCG00020010867)	KLHL12 (ENSACCG00020010849)	RABIF (ENSACCG00020010837)	ENSACCG00020010825	KDM5B (ENSACCG00020010792)	IPO9 (ENSACCG00020010719) #15	LZTR1 (ENSACCG00020010619)	RNPEP (ENSACCG00020010556) #11	NAV1 (ENSACCG00020010203) #16	SYT2 (ENSACCG00020009791)	PPP1R12B (ENSACCG00020009734)	CSRP1 (ENSACCG00020009670) #18	PHLDA3 (ENSACCG00020009657) #19	TNNI1 (ENSACCG00020009637) #20	LAD1 (ENSACCG00020009588) #21	TNNT2 (ENSACCG00020009571) #22	PKP1 (ENSACCG00020009533) #23	ENSACCG00020009492 #24	ENSACCG00020009467	TMEM9 (ENSACCG00020009454) #25	TMEM183A (ENSACCG00020009442)	PPFIA4 (ENSACCG00020009414)	MYOG (ENSACCG00020009387)	ADORA1 (ENSACCG00020009375)	MYBPH (ENSACCG00020009357)	DENND2D (ENSACCG00020009339)	CEPT1 (ENSACCG00020009330)	DRAM2 (ENSACCG00020009306)	LRIF1 (ENSACCG00020009289)	ENSACCG00020009265	UBE2T (ENSACCG00020009244)
Kakapo	MODERN SPECIES	30	LGR6 (ENSSHBG00005017078)	KLHL12 (ENSSHBG00005017103)	RABIF (ENSSHBG00005017110)	ENSSHBG00005017114	KDM5B (ENSSHBG00005017122)	IPO9 (ENSSHBG00005017140) #15	LZTR1 (ENSSHBG00005017178)	RNPEP (ENSSHBG00005017185) #11	NAV1 (ENSSHBG00005017194) #16	SYT2 (ENSSHBG00005017201)	ENSSHBG00005017207	CSRP1 (ENSSHBG00005017211) #18	PHLDA3 (ENSSHBG00005017215) #19	TNNI1 (ENSSHBG00005017219) #20	LAD1 (ENSSHBG00005017228) #21	TNNT2 (ENSSHBG00005017231) #22	PKP1 (ENSSHBG00005017238) #23	ENSSHBG00005000789	TMEM9 (ENSSHBG00005000793) #25	ENSSHBG00005005726	TMEM183A (ENSSHBG00005005752)	PPFIA4 (ENSSHBG00005005805)	MYOG (ENSSHBG00005005843)	ADORA1 (ENSSHBG00005005858)	MYBPH (ENSSHBG00005005881)	DENND2D (ENSSHBG00005005926)	CEPT1 (ENSSHBG00005005944)	DRAM2 (ENSSHBG00005006023)	LRIF1 (ENSSHBG00005006034)	ENSSHBG00005006065	UBE2T (ENSSHBG00005006103)
African ostrich	MODERN SPECIES	337	LGR6 (ENSSCUG00000003240)	KLHL12 (ENSSCUG00000003238)	ENSSCUG00000003235	KDM5B (ENSSCUG00000003234)	IPO9 (ENSSCUG00000003226) #15	LZTR1 (ENSSCUG00000003154)	RNPEP (ENSSCUG00000003089) #11	NAV1 (ENSSCUG00000003069) #16	SYT2 (ENSSCUG00000003054)	ENSSCUG00000003053	ENSSCUG00000003051	CSRP1 (ENSSCUG00000003050) #18	PHLDA3 (ENSSCUG00000003049) #19	TNNI1 (ENSSCUG00000003046) #20	LAD1 (ENSSCUG00000003039) #21	TNNT2 (ENSSCUG00000003033) #22	PKP1 (ENSSCUG00000003030) #23	ENSSCUG00000003029	ENSSCUG00000003028	TMEM9 (ENSSCUG00000003027) #25	ENSSCUG00000003025	TMEM183A (ENSSCUG00000003024)	PPFIA4 (ENSSCUG00000003020)	MYOG (ENSSCUG00000003012)	ADORA1 (ENSSCUG00000003010)	MYBPH (ENSSCUG00000003007)	ENSSCUG00000003004	DENND2D (ENSSCUG00000003002)	CEPT1 (ENSSCUG00000003000)	DRAM2 (ENSSCUG00000002996)	LRIF1 (ENSSCUG00000002995)
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	44								ENSGT00940000161832.b	ENSGT00390000017324	ENSGT00940000156419	ENSGT00940000165530	ENSGT00940000155455	ENSGT00940000165780	ENSGT00530000063817.b	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00390000013899.a.a	ENSGT00940000165765	ENSGT00390000014700.a	ENSGT01050000244879.b.a.b.a	ENSGT00950000183132.A	ENSGT00530000063825.A.c	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00390000005178.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.b	ENSGT00940000158899	ENSGT00940000166645	ENSGT00940000158677	ENSGT00940000160423	ENSGT00940000153544.b	ENSGT00390000014557
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	58									ENSGT00390000017324	ENSGT00940000156419	ENSGT00940000165530	ENSGT00940000155455	ENSGT00940000165780	ENSGT00530000063817.b	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00390000013899.a.a	ENSGT00940000165765	ENSGT00390000014700.a	ENSGT01050000244879.b.a.b.a	ENSGT00950000183132.A	ENSGT00530000063825.A.c.f	ENSGT00530000063825.A.c.e	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00390000005178.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.b	ENSGT00940000158899	ENSGT00940000166645	ENSGT00940000158677	ENSGT00940000160423	ENSGT00940000153544.b
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	226										ENSGT00940000156419	ENSGT00940000165530	ENSGT00940000155455	ENSGT00940000165780	ENSGT00530000063817.b	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00390000013899.a.a	ENSGT00940000165765	ENSGT00390000014700.a	ENSGT01050000244879.b.a.b.a	ENSGT00950000183132.A	ENSGT00530000063825.A.c.f	ENSGT00530000063825.A.c.e	ENSGT00940000153962.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b	ENSGT00940000158899	ENSGT00940000158677	ENSGT00940000160423	ENSGT00940000153544.b	ENSGT00390000014557	ENSGT00390000008702
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	419													ENSGT00940000155455	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00390000013899.a.a	ENSGT00940000165765	ENSGT00390000014700.a	ENSGT01050000244879.b.a.b.a	ENSGT00530000063825.A.c.f	ENSGT00940000153962.b
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	20	ENSSFOG00015002124	cmasa (ENSSFOG00015002083)	kcnj8 (ENSSFOG00015002076)	TUBGCP6 (ENSSFOG00015002033)	drc1 (ENSSFOG00015032400)	ENSSFOG00015029875	si:ch211-214j24.10 (ENSSFOG00015001996)	mlc1 (ENSSFOG00015001979)	ENSSFOG00015030362	apex1 (ENSSFOG00015001948)	btbd11a (ENSSFOG00015001877)	cry1b (ENSSFOG00015001818)	zgc:153031 (ENSSFOG00015001770)	ENSSFOG00015001755	si:ch73-62b13.1 (ENSSFOG00015001750)	tnnt2c (ENSSFOG00015001731) #22	tmem263 (ENSSFOG00015029590)	ENSSFOG00015001714	ric8b (ENSSFOG00015001706)	rfx4 (ENSSFOG00015001604)	endouc (ENSSFOG00015001560)	cyb5r3 (ENSSFOG00015001511)	ENSSFOG00015001497	aldob (ENSSFOG00015001456)	ENSSFOG00015001323	ENSSFOG00015001306	prpf19 (ENSSFOG00015001236)	tcirg1b (ENSSFOG00015001219)	mrpl18 (ENSSFOG00015001208)	ENSSFOG00015028795	ANKRD13D (ENSSFOG00015001113)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	67												cry1b (ENSPKIG00000024586)	zgc:153031 (ENSPKIG00000024624)	si:ch73-62b13.1 (ENSPKIG00000024642)	ENSPKIG00000024647	tnnt2c (ENSPKIG00000024654) #22	tmem263 (ENSPKIG00000024668)	ENSPKIG00000024674	ric8b (ENSPKIG00000024699)	rfx4 (ENSPKIG00000024742)	endouc (ENSPKIG00000024767)	cyb5r3 (ENSPKIG00000024781)	ppfibp1b (ENSPKIG00000024823)	ENSPKIG00000024889	ENSPKIG00000024891	ENSPKIG00000024896	ENSPKIG00000024904	si:ch211-245j22.3 (ENSPKIG00000024907)	ITIH5 (ENSPKIG00000024913)	itih2 (ENSPKIG00000024927)	kin (ENSPKIG00000024945)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	620														ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00940000154709.a.a #22
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	30														ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000165344	ENSGT00940000158997	ENSGT00730000111007.a.a
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT00940000163513	ENSGT00950000183052.b.c.b.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000175478	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00940000168896	ENSGT00940000159081	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000172707.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT00940000172707.b	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093.i	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT00940000172707.b	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093.i	ENSGT00940000158804.m	ENSGT00730000112347
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT00940000172707.b	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093.i	ENSGT00940000158804.n	ENSGT00940000158804.m
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154983.c.b	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093.i	ENSGT00940000158804.n.b	ENSGT00940000158804.m
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Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	291	nrip2 (ENSNBRG00000011429)	itfg2 (ENSNBRG00000011398)	ascl1a (ENSNBRG00000011381)	pah (ENSNBRG00000011340)	th2 (ENSNBRG00000011203)	nup37 (ENSNBRG00000011131)	parpbp (ENSNBRG00000011099)	ENSNBRG00000011057	igf1 (ENSNBRG00000011029)	ENSNBRG00000011014	ENSNBRG00000010987	btbd11a (ENSNBRG00000010944)	ENSNBRG00000010937	MTERF2 (ENSNBRG00000010933)	cry1a (ENSNBRG00000010898)	tnnt2c (ENSNBRG00000010879) #22	syt10 (ENSNBRG00000010856)	ENSNBRG00000010848	ENSNBRG00000010794	cyb5r3 (ENSNBRG00000010756)	syt1a (ENSNBRG00000010739)	pawr (ENSNBRG00000010725)	ppp1r12a (ENSNBRG00000010670)	ENSNBRG00000010659	rps16 (ENSNBRG00000010637)	myf6 (ENSNBRG00000010629)	myf5 (ENSNBRG00000010621)	lin7a (ENSNBRG00000010602)	ENSNBRG00000010588	ACSS3 (ENSNBRG00000010540)	ppfia2 (ENSNBRG00000010460)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	8	nrip2 (ENSONIG00000030365)	itfg2 (ENSONIG00000017820)	ascl1a (ENSONIG00000021219)	ENSONIG00000038297	pah (ENSONIG00000017811)	th2 (ENSONIG00000017806)	nup37 (ENSONIG00000041645)	ENSONIG00000042831	parpbp (ENSONIG00000017803)	ENSONIG00000029183	igf1 (ENSONIG00000017800)	ENSONIG00000017799	btbd11a (ENSONIG00000017796)	cry1a (ENSONIG00000000075)	MTERF2 (ENSONIG00000020695)	tnnt2c (ENSONIG00000020696) #22	ENSONIG00000000001	syt10 (ENSONIG00000000002)	syt1a (ENSONIG00000000003)	pawr (ENSONIG00000028232)	ppp1r12a (ENSONIG00000000005)	foxm1 (ENSONIG00000027574)	foxm1 (ENSONIG00000000082)	ENSONIG00000031149	rps16 (ENSONIG00000000006)	myf6 (ENSONIG00000000007)	myf5 (ENSONIG00000038625)	lin7a (ENSONIG00000000078)	ACSS3 (ENSONIG00000000079)	ppfia2 (ENSONIG00000000080)	ENSONIG00000000081
Midas cichlid	MODERN SPECIES	737	klhl42 (ENSACIG00000013451)	nrip2 (ENSACIG00000013461)	itfg2 (ENSACIG00000013478)	ascl1a (ENSACIG00000013500)	pah (ENSACIG00000013511)	th2 (ENSACIG00000013549)	nup37 (ENSACIG00000013665)	parpbp (ENSACIG00000013691)	ENSACIG00000013710	igf1 (ENSACIG00000013728)	ENSACIG00000013740	ENSACIG00000013750	btbd11a (ENSACIG00000013768)	cry1a (ENSACIG00000013832)	MTERF2 (ENSACIG00000014189)	tnnt2c (ENSACIG00000014196) #22	syt10 (ENSACIG00000014226)	ENSACIG00000014242	ENSACIG00000014253	cyb5r3 (ENSACIG00000014298)	syt1a (ENSACIG00000014311)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00940000154983.c.b	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00940000168896	ENSGT00940000159081	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899.bb.b	ENSGT00940000158899.cb	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00940000154983.c.b	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00940000168896	ENSGT00940000159081	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899.cb	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154983.c.b	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00940000168896	ENSGT00940000159081	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899.cb	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	2919																tnnt2c (ENSAOCG00000008809) #22
Orange clownfish	MODERN SPECIES	13	klhl42 (ENSAPEG00000021941)	ENSAPEG00000021936	nrip2 (ENSAPEG00000021926)	itfg2 (ENSAPEG00000021902)	ascl1a (ENSAPEG00000021889)	pah (ENSAPEG00000021861)	th2 (ENSAPEG00000021831)	nup37 (ENSAPEG00000021794)	parpbp (ENSAPEG00000021705)	ENSAPEG00000021659	igf1 (ENSAPEG00000021610)	ENSAPEG00000021575	ENSAPEG00000021556	cry1a (ENSAPEG00000021519)	btbd11a (ENSAPEG00000021482)	tnnt2c (ENSAPEG00000021437) #22	syt10 (ENSAPEG00000021420)	ENSAPEG00000021411	cyb5r3 (ENSAPEG00000021367)	syt1a (ENSAPEG00000021322)	pawr (ENSAPEG00000021309)	ppp1r12a (ENSAPEG00000021244)	rps16 (ENSAPEG00000021214)	myf6 (ENSAPEG00000021158)	myf5 (ENSAPEG00000021137)	lin7a (ENSAPEG00000021115)	ACSS3 (ENSAPEG00000021054)	ppfia2 (ENSAPEG00000020985)	ENSAPEG00000020865	foxm1 (ENSAPEG00000020793)	rhno1 (ENSAPEG00000020771)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	1620															ENSAPOG00000019701	tnnt2c (ENSAPOG00000019758) #22	syt10 (ENSAPOG00000019813)	ENSAPOG00000019829
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	791															btbd11a (ENSSPAG00000023015)	tnnt2c (ENSSPAG00000023033) #22	syt10 (ENSSPAG00000023054)	syt10 (ENSSPAG00000023061)	ENSSPAG00000023074	cyb5r3 (ENSSPAG00000023109)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000154983.c.b	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00940000168896	ENSGT00940000159081	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154983.c.b	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00940000168896	ENSGT00940000159081	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158225.i.a	ENSGT00940000154983.c.b	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00940000168896	ENSGT00940000159081	ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
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Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154983.c.b	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00940000168896	ENSGT00940000159081	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g.c	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a.d	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Indian medaka	MODERN SPECIES	2	klhl42 (ENSOMEG00000003121)	nrip2 (ENSOMEG00000003128)	elapor2b (ENSOMEG00000003209)	itfg2 (ENSOMEG00000003265)	ascl1a (ENSOMEG00000003274)	pah (ENSOMEG00000003302)	th2 (ENSOMEG00000003320)	nup37 (ENSOMEG00000003353)	parpbp (ENSOMEG00000003398)	ENSOMEG00000003411	igf1 (ENSOMEG00000003424)	ENSOMEG00000003451	btbd11a (ENSOMEG00000003530)	cry1a (ENSOMEG00000003568)	ENSOMEG00000003581	tnnt2c (ENSOMEG00000003593) #22	syt10 (ENSOMEG00000003610)	ENSOMEG00000003669	cyb5r3 (ENSOMEG00000003698)	syt1a (ENSOMEG00000003714)	pawr (ENSOMEG00000003730)	ppp1r12a (ENSOMEG00000003801)	rps16 (ENSOMEG00000003840)	myf6 (ENSOMEG00000003855)	myf5 (ENSOMEG00000003862)	lin7a (ENSOMEG00000003884)	ACSS3 (ENSOMEG00000003964)	ppfia2 (ENSOMEG00000004094)	ENSOMEG00000004125	foxm1 (ENSOMEG00000004150)	ENSOMEG00000004155
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00940000172707.b	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406.d	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT01010000222336.b.a.b.a	ENSGT00390000002796	ENSGT00940000157659	ENSGT00940000158094	ENSGT00940000157502	ENSGT00940000158420	ENSGT00940000159226	ENSGT00940000157638
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Fugu	MODERN SPECIES	9	elapor2b (ENSTRUG00000014753)	klhl42 (ENSTRUG00000014743)	nrip2 (ENSTRUG00000023306)	itfg2 (ENSTRUG00000014649)	ascl1a (ENSTRUG00000012801)	pah (ENSTRUG00000014530)	th2 (ENSTRUG00000014467)	nup37 (ENSTRUG00000014428)	parpbp (ENSTRUG00000014361)	pmch (ENSTRUG00000014356)	igf1 (ENSTRUG00000022135)	ENSTRUG00000025881	btbd11a (ENSTRUG00000014167)	cry1a (ENSTRUG00000014032)	MTERF2 (ENSTRUG00000014030)	tnnt2c (ENSTRUG00000014014) #22	syt10 (ENSTRUG00000013939)	ENSTRUG00000013873	cyb5r3 (ENSTRUG00000020838)	syt1a (ENSTRUG00000013727)	pawr (ENSTRUG00000013694)	ppp1r12a (ENSTRUG00000013358)	rps16 (ENSTRUG00000028064)	acot14 (ENSTRUG00000013235)	ssbp1 (ENSTRUG00000013183)	creb3l2 (ENSTRUG00000013114)	RASSF3 (ENSTRUG00000012661)	gnsa (ENSTRUG00000012451)	TBC1D30 (ENSTRUG00000012364)	prkcq (ENSTRUG00000011933)	SFMBT2 (ENSTRUG00000011786)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000154983.c.b	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	288	btg1 (ENSLBEG00000021173)	fam3c (ENSLBEG00000021194)	ENSLBEG00000021230	dram1 (ENSLBEG00000021279)	washc3 (ENSLBEG00000021335)	ENSLBEG00000021362	ENSLBEG00000021382	ENSLBEG00000021405	mcat (ENSLBEG00000021435)	ENSLBEG00000021449	ttll1 (ENSLBEG00000021464)	pacsin2 (ENSLBEG00000021510)	arfgap3 (ENSLBEG00000021563)	IKBIP (ENSLBEG00000021638)	ENSLBEG00000021657	tnnt2c (ENSLBEG00000021670) #22	syt10 (ENSLBEG00000021731)	ENSLBEG00000021784	cyb5r3 (ENSLBEG00000021856)	syt1a (ENSLBEG00000021895)	pawr (ENSLBEG00000021925)	ppp1r12a (ENSLBEG00000021962)	rps16 (ENSLBEG00000022009)	myf6 (ENSLBEG00000022039)	myf5 (ENSLBEG00000022115)	lin7a (ENSLBEG00000022140)	ACSS3 (ENSLBEG00000022189)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000154983.c.b	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.b.s.b	ENSGT00400000022326.b.a.b.a.a	ENSGT00940000172707.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	5	klhl42 (ENSSAUG00010017856)	nrip2 (ENSSAUG00010017853)	itfg2 (ENSSAUG00010017851)	ascl1a (ENSSAUG00010017842)	ascl1a (ENSSAUG00010017839)	pah (ENSSAUG00010015550)	th2 (ENSSAUG00010015244)	nup37 (ENSSAUG00010015237)	parpbp (ENSSAUG00010015235)	pmch (ENSSAUG00010015234)	igf1 (ENSSAUG00010015109)	ENSSAUG00010015101	btbd11a (ENSSAUG00010014766)	cry1a (ENSSAUG00010012268)	ENSSAUG00010012243	tnnt2c (ENSSAUG00010012240) #22	syt10 (ENSSAUG00010012236)	ENSSAUG00010020501	cyb5r3 (ENSSAUG00010020421)	syt1a (ENSSAUG00010020377)	pawr (ENSSAUG00010020373)	ppp1r12a (ENSSAUG00010020166)	rps16 (ENSSAUG00010020153)	myf6 (ENSSAUG00010020152)	myf5 (ENSSAUG00010020150)	lin7a (ENSSAUG00010020149)	ACSS3 (ENSSAUG00010019831)	ppfia2 (ENSSAUG00010017685)	ENSSAUG00010017530	foxm1 (ENSSAUG00010017515)	rhno1 (ENSSAUG00010017512)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.b.s.b	ENSGT00400000022326.b.a.b.a.a	ENSGT00940000172707.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	491	elapor2b (ENSLCRG00005015142)	klhl42 (ENSLCRG00005015458)	itfg2 (ENSLCRG00005015463)	nrip2 (ENSLCRG00005015516)	ascl1a (ENSLCRG00005015517)	pah (ENSLCRG00005015533)	th2 (ENSLCRG00005017198)	nup37 (ENSLCRG00005017388)	parpbp (ENSLCRG00005017399)	ENSLCRG00005017401	igf1 (ENSLCRG00005017409)	ENSLCRG00005017539	btbd11a (ENSLCRG00005017547)	cry1a (ENSLCRG00005017690)	MTERF2 (ENSLCRG00005017798)	tnnt2c (ENSLCRG00005017799) #22	syt10 (ENSLCRG00005017801)	ENSLCRG00005017806	cyb5r3 (ENSLCRG00005017871)	syt1a (ENSLCRG00005018056)	ENSLCRG00005018060	ENSLCRG00005018062	pawr (ENSLCRG00005018063)	ENSLCRG00005018065	ppp1r12a (ENSLCRG00005018071)	rps16 (ENSLCRG00005018085)	myf6 (ENSLCRG00005018091)	myf5 (ENSLCRG00005018093)	lin7a (ENSLCRG00005018096)	ACSS3 (ENSLCRG00005018098)	ppfia2 (ENSLCRG00005018255)
European seabass	MODERN SPECIES	23	ENSDLAG00005023868	ENSDLAG00005023668	ENSDLAG00005027813	ENSDLAG00005026892	igf1 (ENSDLAG00005023625)	pmch (ENSDLAG00005023620)	parpbp (ENSDLAG00005023617)	NUP37 (ENSDLAG00005023603)	th2 (ENSDLAG00005023520)	pah (ENSDLAG00005022732)	ENSDLAG00005022698	ENSDLAG00005027036	ENSDLAG00005022693	ENSDLAG00005022472	ENSDLAG00005022457	ENSDLAG00005022452 #22	ENSDLAG00005022430	ENSDLAG00005022300	ENSDLAG00005022253	ENSDLAG00005022245	PAWR (ENSDLAG00005022241)	ppp1r12a (ENSDLAG00005028115)	ENSDLAG00005022222	myf6 (ENSDLAG00005034355)	myf5 (ENSDLAG00005022213)	lin7a (ENSDLAG00005031546)	ACSS3 (ENSDLAG00005021975)	ppfia2 (ENSDLAG00005020955)	ENSDLAG00005020737	ENSDLAG00005020722	ENSDLAG00005020708
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000154983.c.b	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00940000168896	ENSGT00940000159081	ENSGT00840000130048.b	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Lumpfish	MODERN SPECIES	15	mtpn (ENSCLMG00005022629)	chrm2a (ENSCLMG00005022632)	ptn (ENSCLMG00005022634)	ENSCLMG00005022635	ENSCLMG00005022636	TULP3 (ENSCLMG00005022637)	rhno1 (ENSCLMG00005022638)	foxm1 (ENSCLMG00005022640)	ENSCLMG00005022642	ppfia2 (ENSCLMG00005022654)	ACSS3 (ENSCLMG00005022661)	lin7a (ENSCLMG00005022672)	myf5 (ENSCLMG00005022673)	myf6 (ENSCLMG00005022674)	rps16 (ENSCLMG00005022675)	tnnt2c (ENSCLMG00005022676) #22	syt10 (ENSCLMG00005022677)	ENSCLMG00005022678	ENSCLMG00005022685	cyb5r3 (ENSCLMG00005022705)	syt1a (ENSCLMG00005022718)	ENSCLMG00005022719	pawr (ENSCLMG00005022721)	ppp1r12a (ENSCLMG00005022725)	tcp11l2 (ENSCLMG00005022733)	FUT9 (ENSCLMG00005022735)	ENSCLMG00005022740	ENSCLMG00005010584	ENSCLMG00005010600	ENSCLMG00005010604	si:dkeyp-38g8.5 (ENSCLMG00005010605)
Stickleback	MODERN SPECIES	3	tspan9b (ENSGACG00000020053)	elapor2b (ENSGACG00000020052)	klhl42 (ENSGACG00000020051)	nrip2 (ENSGACG00000020050)	itfg2 (ENSGACG00000020049)	ascl1a (ENSGACG00000020048)	th2 (ENSGACG00000020047)	nup37 (ENSGACG00000020046)	parpbp (ENSGACG00000020045)	ENSGACG00000020044	igf1 (ENSGACG00000020042)	ENSGACG00000020041	btbd11a (ENSGACG00000020040)	cry1a (ENSGACG00000020037)	ENSGACG00000020036	tnnt2c (ENSGACG00000020034) #22	syt10 (ENSGACG00000020031)	ENSGACG00000020026	cyb5r3 (ENSGACG00000020019)	syt1a (ENSGACG00000020017)	pawr (ENSGACG00000020015)	ppp1r12a (ENSGACG00000020012)	rps16 (ENSGACG00000020009)	myf6 (ENSGACG00000020008)	lin7a (ENSGACG00000020007)	ACSS3 (ENSGACG00000019999)	ppfia2 (ENSGACG00000019995)	ENSGACG00000019993	llph (ENSGACG00000019992)	hcls1 (ENSGACG00000019990)	ENSGACG00000019988
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154983.c.b	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	15	amdhd1 (ENSCGOG00000022850)	snrpf (ENSCGOG00000022853)	ntn4 (ENSCGOG00000022863)	usp44 (ENSCGOG00000022864)	ENSCGOG00000022865	metap2b (ENSCGOG00000022870)	vezt (ENSCGOG00000022915)	fgd6 (ENSCGOG00000022921)	ndufa12 (ENSCGOG00000022941)	TMCC3 (ENSCGOG00000022948)	eri1 (ENSCGOG00000022952)	LAMB1 (ENSCGOG00000022966)	dclre1c (ENSCGOG00000023371)	meig1 (ENSCGOG00000023503)	tmem243b (ENSCGOG00000023504)	tnnt2c (ENSCGOG00000002697) #22	syt10 (ENSCGOG00000002710)	ENSCGOG00000002901	cyb5r3 (ENSCGOG00000005612)	syt1a (ENSCGOG00000005760)	pawr (ENSCGOG00000005900)	ppp1r12a (ENSCGOG00000005924)	rps16 (ENSCGOG00000006422)	myf6 (ENSCGOG00000006445)	myf5 (ENSCGOG00000006451)	lin7a (ENSCGOG00000006454)	ACSS3 (ENSCGOG00000006462)	ppfia2 (ENSCGOG00000006725)	ENSCGOG00000011470	foxm1 (ENSCGOG00000012088)	rhno1 (ENSCGOG00000012090)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00940000172707.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT00940000163513	ENSGT00950000183169.A.a.a	ENSGT00940000172707.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT00940000163513	ENSGT00950000183169.A.a.a	ENSGT00940000172707.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000157779	ENSGT00940000158580	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.a.d.a.b.b
Climbing perch	MODERN SPECIES	14	ENSATEG00000022701	klhl42 (ENSATEG00000022766)	ENSATEG00000022782	itfg2 (ENSATEG00000022806)	ENSATEG00000022825	pah (ENSATEG00000022831)	th2 (ENSATEG00000022864)	NUP37 (ENSATEG00000022933)	parpbp (ENSATEG00000022956)	pmch (ENSATEG00000022998)	igf1 (ENSATEG00000023026)	ENSATEG00000023044	ENSATEG00000029039	btbd11a (ENSATEG00000023064)	ENSATEG00000023083	tnnt2c (ENSATEG00000023096) #22	ENSATEG00000023107	ENSATEG00000026602	ENSATEG00000023121	ENSATEG00000023152	ENSATEG00000023170	ENSATEG00000023210	ENSATEG00000023226	ENSATEG00000023236	myf6 (ENSATEG00000023242)	myf5 (ENSATEG00000023249)	lin7a (ENSATEG00000023252)	ACSS3 (ENSATEG00000023260)	ppfia2 (ENSATEG00000023284)	ENSATEG00000023298	ENSATEG00000025485
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	15	ENSMAMG00000026753	ENSMAMG00000016348	klhl42 (ENSMAMG00000016338)	ENSMAMG00000016311	itfg2 (ENSMAMG00000016273)	ENSMAMG00000016256	pah (ENSMAMG00000016220)	th2 (ENSMAMG00000016040)	nup37 (ENSMAMG00000016017)	parpbp (ENSMAMG00000016003)	pmch (ENSMAMG00000015727)	igf1 (ENSMAMG00000015704)	ENSMAMG00000015670	btbd11a (ENSMAMG00000015616)	ENSMAMG00000015580	tnnt2c (ENSMAMG00000015546) #22	ENSMAMG00000015509	ENSMAMG00000024270	ENSMAMG00000015433	ENSMAMG00000015393	ENSMAMG00000015373	ENSMAMG00000015337	ppp1r12a (ENSMAMG00000015240)	ENSMAMG00000015224	myf6 (ENSMAMG00000015217)	myf5 (ENSMAMG00000015202)	lin7a (ENSMAMG00000015174)	ACSS3 (ENSMAMG00000015114)	ppfia2 (ENSMAMG00000014966)	ENSMAMG00000014909	ENSMAMG00000014899
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00940000172707.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154983.c.b	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Turbot	MODERN SPECIES	11	klhl42 (ENSSMAG00000005334)	ENSSMAG00000022137	itfg2 (ENSSMAG00000005257)	ENSSMAG00000005248	pah (ENSSMAG00000005207)	th2 (ENSSMAG00000005181)	nup37 (ENSSMAG00000005160)	parpbp (ENSSMAG00000005145)	pmch (ENSSMAG00000022672)	igf1 (ENSSMAG00000005115)	ENSSMAG00000030625	ENSSMAG00000005081	btbd11a (ENSSMAG00000005012)	ENSSMAG00000004964	ENSSMAG00000005003	tnnt2c (ENSSMAG00000004942) #22	ENSSMAG00000004931	ENSSMAG00000004880	ENSSMAG00000004819	ENSSMAG00000004787	ENSSMAG00000004775	ENSSMAG00000032576	myf6 (ENSSMAG00000024612)	myf5 (ENSSMAG00000004563)	ENSSMAG00000004633	lin7a (ENSSMAG00000004519)	ACSS3 (ENSSMAG00000004487)	ppfia2 (ENSSMAG00000004417)	ENSSMAG00000030237	ENSSMAG00000032625	ENSSMAG00000004385
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000160124	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000005378	ENSGT00940000166611	ENSGT00950000182885.B	ENSGT00950000182885.C.b	ENSGT00390000010777	ENSGT00390000006088	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00940000172707.b	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Barramundi perch	MODERN SPECIES	292	tspan9b (ENSLCAG00010026930)	nrip2 (ENSLCAG00010026932)	itfg2 (ENSLCAG00010026936)	ascl1a (ENSLCAG00010026942)	pah (ENSLCAG00010026972)	th2 (ENSLCAG00010027029)	nup37 (ENSLCAG00010027047)	parpbp (ENSLCAG00010027051)	pmch (ENSLCAG00010027053)	igf1 (ENSLCAG00010027059)	ENSLCAG00010027073	ENSLCAG00010027076	btbd11a (ENSLCAG00010027077)	cry1a (ENSLCAG00010027085)	MTERF2 (ENSLCAG00010027093)	tnnt2c (ENSLCAG00010027095) #22	syt10 (ENSLCAG00010027097)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000018424	ENSGT01010000222336.b.a.b.a	ENSGT01050000244882.a.a.a.a.b	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.b	ENSGT00390000009583	ENSGT00390000017998	ENSGT00940000157998	ENSGT01010000222533	ENSGT00530000064318	ENSGT00730000111164	ENSGT00390000012080	ENSGT00530000063539.b	ENSGT01020000230394.e.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156680.b	ENSGT00990000203615.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b.c	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000013067.l.l	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00940000157479	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000166093	ENSGT00940000158804	ENSGT00730000112347
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2835					kics2 (ENSSLDG00000017050)	TMEM19 (ENSSLDG00000017011)	rab3ip (ENSSLDG00000016943)	ENSSLDG00000016908	UPF2 (ENSSLDG00000016866)	slc35e3 (ENSSLDG00000016840)	nup107 (ENSSLDG00000016797)	mdm2 (ENSSLDG00000016771)	plxnb2a.1 (ENSSLDG00000016700)	abcc9 (ENSSLDG00000016593)	kcnj8 (ENSSLDG00000016562)	tnnt2c (ENSSLDG00000016544) #22	syt10 (ENSSLDG00000016524)	ENSSLDG00000016502
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	433	amdhd1 (ENSHCOG00000018637)	tspan9b (ENSHCOG00000018619)	elapor2b (ENSHCOG00000018591)	ENSHCOG00000018560	itfg2 (ENSHCOG00000018527)	ENSHCOG00000018511	ascl1a (ENSHCOG00000018503)	pah (ENSHCOG00000018488)	th2 (ENSHCOG00000018465)	nup37 (ENSHCOG00000018356)	parpbp (ENSHCOG00000018307)	igf1 (ENSHCOG00000018270)	ENSHCOG00000018199	btbd11a (ENSHCOG00000018163)	cry1a (ENSHCOG00000018111)	tnnt2c (ENSHCOG00000018063) #22	syt10 (ENSHCOG00000018057)	ENSHCOG00000018040	ENSHCOG00000017982	TULP3 (ENSHCOG00000017974)	ENSHCOG00000017961	foxm1 (ENSHCOG00000017947)	ENSHCOG00000017941	ppfia2 (ENSHCOG00000017898)	ACSS3 (ENSHCOG00000017835)	lin7a (ENSHCOG00000017797)	myf5 (ENSHCOG00000017783)	myf6 (ENSHCOG00000017768)	rps16 (ENSHCOG00000017762)	ppp1r12a (ENSHCOG00000017732)	pawr (ENSHCOG00000017688)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	15	elapor2b (ENSMMDG00005018739)	klhl42 (ENSMMDG00005018749)	nrip2 (ENSMMDG00005018750)	itfg2 (ENSMMDG00005018758)	ascl1a (ENSMMDG00005018763)	pah (ENSMMDG00005018768)	th2 (ENSMMDG00005018778)	nup37 (ENSMMDG00005018813)	parpbp (ENSMMDG00005018818)	ENSMMDG00005018820	igf1 (ENSMMDG00005018826)	ENSMMDG00005018912	btbd11a (ENSMMDG00005018917)	cry1a (ENSMMDG00005018951)	MTERF2 (ENSMMDG00005020073)	tnnt2c (ENSMMDG00005020074) #22	syt10 (ENSMMDG00005020079)	ENSMMDG00005020084	ENSMMDG00005020134	cyb5r3 (ENSMMDG00005020515)	syt1a (ENSMMDG00005020740)	pawr (ENSMMDG00005020744)	ppp1r12a (ENSMMDG00005020751)	rps16 (ENSMMDG00005020764)	ENSMMDG00005020765	myf6 (ENSMMDG00005020767)	myf5 (ENSMMDG00005020770)	lin7a (ENSMMDG00005020771)	ACSS3 (ENSMMDG00005020784)	ppfia2 (ENSMMDG00005021115)	ENSMMDG00005023019
Cod	MODERN SPECIES	17	cradd (ENSGMOG00000010443)	socs2 (ENSGMOG00000025287)	ncaph2 (ENSGMOG00000003228)	sco2 (ENSGMOG00000003285)	ntn4 (ENSGMOG00000009327)	ENSGMOG00000007741	amdhd1 (ENSGMOG00000007738)	pah (ENSGMOG00000001263)	th2 (ENSGMOG00000001233)	nup37 (ENSGMOG00000001219)	parpbp (ENSGMOG00000001191)	IGF1 (ENSGMOG00000030090)	ENSGMOG00000001151	btbd11a (ENSGMOG00000001108)	ENSGMOG00000001088	tnnt2c (ENSGMOG00000001076) #22	ENSGMOG00000003257	ENSGMOG00000010347	ENSGMOG00000034372	ENSGMOG00000028775	ENSGMOG00000014279	ENSGMOG00000035632	ENSGMOG00000029906	ENSGMOG00000032127	ENSGMOG00000030892	ENSGMOG00000031826	ENSGMOG00000034711	ENSGMOG00000022997	ENSGMOG00000026861	ENSGMOG00000007316	ENSGMOG00000032228
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158039.h	ENSGT00390000004044	ENSGT00940000157862	ENSGT00990000203541.a.a.a.a.a	ENSGT00390000009380	ENSGT00940000164333	ENSGT00730000111007.a.a	ENSGT00940000158997	ENSGT00940000165344	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000157479	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00390000013067.l	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00940000158899	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153962.b	ENSGT00940000155394.i.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00400000022326.b.a.a	ENSGT00940000154649.A.r	ENSGT01030000234982	ENSGT00940000157275.a	ENSGT00390000005848	ENSGT00940000156334.a.b	ENSGT00390000003290	ENSGT00940000155016	ENSGT00940000160526
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	90	ENSGT00730000111007.a.a.k.b	ENSGT00940000158997.f	ENSGT00940000165344.c	ENSGT00730000111007.a.a.l	ENSGT00940000158997.e.b	ENSGT00940000165344.d	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000157479.d	ENSGT00940000157479.c	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00950000182959.a.a.e	ENSGT00950000182959.a.a.f	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00390000013067.l.j	ENSGT00390000013067.l.i	ENSGT00940000154709.a.a.e #22	ENSGT00940000158899.i.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b.h	ENSGT00940000153962.b.e.b	ENSGT00940000155394.i.a.f	ENSGT00390000000406.i.b	ENSGT00940000164178.h.a.a.b	ENSGT00940000156120.a.g	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.r	ENSGT00390000018272.j.b	ENSGT00400000022326.b.a.a.a	ENSGT00940000154649.A.r.b.b.a.b	ENSGT00940000154649.A.r.b.b.b.a	ENSGT01030000234982.j.b	ENSGT00940000154649.A.r.a	ENSGT00940000157275.a.a
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	167											ENSGT00940000157479.c	ENSGT00940000153222.a.a.cb	ENSGT00950000182959.a.a.f	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00390000013067.l.j	ENSGT00940000154709.a.a.e #22	ENSGT00940000158899.i.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b.h	ENSGT00940000153962.b.e.b	ENSGT00940000155394.i.a.f	ENSGT00390000000406.i.a	ENSGT00940000164178.h.a.a.a	ENSGT00940000156120.a.h	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00400000022326.b.a.a.b	ENSGT00940000154649.A.r.b.b.a.a
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158039.h.u	ENSGT00390000004044.h	ENSGT00940000157862.v	ENSGT00990000203541.a.a.a.a.a.k	ENSGT00390000009380.e.b	ENSGT00940000164333.f	ENSGT00730000111007.a.a.l.b	ENSGT00940000158997.e.b.a	ENSGT00940000165344.d.b	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb.i.a	ENSGT00940000157479.c	ENSGT00940000153222.a.a.cb	ENSGT00950000182959.a.a.f	ENSGT00950000182959.a.b.b.a.c	ENSGT00390000013067.l.j	ENSGT00940000154709.a.a.e #22	ENSGT00940000158899.i.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b.h	ENSGT00940000153962.b.e.b	ENSGT00940000155394.i.a.f	ENSGT00390000000406.i.a	ENSGT00940000164178.h.a.a.a	ENSGT00940000156120.a.h	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.r.a.b.c.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.r.a.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.r.a.b.d	ENSGT00940000167339	ENSGT01100000263549.k.b	ENSGT00390000018272.j.b	ENSGT01090000260033.b.h.b.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00390000004044.h	ENSGT00940000157862.v	ENSGT00990000203541.a.a.a.a.a.k	ENSGT00390000009380.e.b	ENSGT00940000164333.f	ENSGT00730000111007.a.a.l.b	ENSGT00940000158997.e.b.a	ENSGT00940000158997.e.a	ENSGT00940000165344.d.b	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb.i.a	ENSGT00940000157479.c	ENSGT00940000153222.a.a.cb	ENSGT00950000182959.a.a.f	ENSGT00950000182959.a.b.b.a.c	ENSGT00390000013067.l.j	ENSGT00940000154709.a.a.e #22	ENSGT00940000158899.i.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b.h	ENSGT00940000153962.b.e.b	ENSGT00940000155394.i.a.f	ENSGT00390000000406.i.a	ENSGT00940000164178.h.a.a.a	ENSGT00940000156120.a.h	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.r.a.b.c.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.r.a.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.r.a.b.d	ENSGT00940000167339	ENSGT01100000263549.k.b	ENSGT00390000018272.j.b	ENSGT01090000260033.b.h.b.a
Chinook salmon	MODERN SPECIES	8	ENSOTSG00005034153	lhfpl3 (ENSOTSG00005034151)	orc5 (ENSOTSG00005034150)	guca1a (ENSOTSG00005034149)	ENSOTSG00005020017	hcls1 (ENSOTSG00005020015)	ENSOTSG00005020014	llph (ENSOTSG00005020013)	ENSOTSG00005020012	ppfia2 (ENSOTSG00005020005)	ACSS3 (ENSOTSG00005018688)	lin7a (ENSOTSG00005018677)	myf5 (ENSOTSG00005018671)	myf6 (ENSOTSG00005018667)	rps16 (ENSOTSG00005018664)	tnnt2c (ENSOTSG00005018663) #22	syt10 (ENSOTSG00005018655)	ENSOTSG00005011764	cyb5r3 (ENSOTSG00005010535)	syt1a (ENSOTSG00005010532)	pawr (ENSOTSG00005010530)	ENSOTSG00005010529	ppp1r12a (ENSOTSG00005010523)	MTERF2 (ENSOTSG00005010519)	ENSOTSG00005010518	ENSOTSG00005010517	ENSOTSG00005010515	ENSOTSG00005010516	kitlgb (ENSOTSG00005010514)	ENSOTSG00005010513	ENSOTSG00005010512
Coho salmon	MODERN SPECIES	10	KDM7A (ENSOKIG00005037241)	ndufb2 (ENSOKIG00005037334)	ENSOKIG00005037359	lhfpl3 (ENSOKIG00005037430)	orc5 (ENSOKIG00005037458)	guca1a (ENSOKIG00005037538)	ENSOKIG00005037557	hcls1 (ENSOKIG00005037631)	llph (ENSOKIG00005037949)	ppfia2 (ENSOKIG00005038115)	ACSS3 (ENSOKIG00005042154)	lin7a (ENSOKIG00005042387)	myf5 (ENSOKIG00005042418)	myf6 (ENSOKIG00005042479)	rps16 (ENSOKIG00005042520)	tnnt2c (ENSOKIG00005042597) #22	syt10 (ENSOKIG00005042620)	ENSOKIG00005042681	CYB5R3 (ENSOKIG00005043270)	SYT1 (ENSOKIG00005044230)	pawr (ENSOKIG00005044327)	ENSOKIG00005044330	PPP1R12A (ENSOKIG00005044359)	ENSOKIG00005044459	MTERF2 (ENSOKIG00005044462)	ENSOKIG00005044470	ENSOKIG00005044496	ENSOKIG00005044503	kitlgb (ENSOKIG00005044521)	ENSOKIG00005044574	ENSOKIG00005044586
Rainbow trout	MODERN SPECIES	6	ENSOMYG00000013028	ndufb2 (ENSOMYG00000013001)	ENSOMYG00000012992	lhfpl3 (ENSOMYG00000012982)	orc5 (ENSOMYG00000012964)	guca1a (ENSOMYG00000012949)	ENSOMYG00000012933	hcls1 (ENSOMYG00000012684)	llph (ENSOMYG00000012619)	ppfia2 (ENSOMYG00000010771)	ACSS3 (ENSOMYG00000009811)	lin7a (ENSOMYG00000009534)	myf5 (ENSOMYG00000009433)	myf6 (ENSOMYG00000009391)	ENSOMYG00000009357	ENSOMYG00000009249 #22	ENSOMYG00000009238	ENSOMYG00000068663	ENSOMYG00000063310	ENSOMYG00000009103	ENSOMYG00000008300	ENSOMYG00000053625	ENSOMYG00000007440	ENSOMYG00000007233	ENSOMYG00000007180	ENSOMYG00000073880	ENSOMYG00000006902	ENSOMYG00000006374	ENSOMYG00000006344	ENSOMYG00000006309	ENSOMYG00000006243
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	81	ENSGT00390000004044.g	ENSGT00940000157862.s.a	ENSGT00990000203541.a.a.a.a.a.i	ENSGT00390000009380.e.b	ENSGT00940000164333.f	ENSGT00730000111007.a.a.k.a	ENSGT00940000158997.e.a.b	ENSGT00940000158997.e.a.a	ENSGT00940000165344.d	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb.g	ENSGT00940000157479.c	ENSGT00940000153222.a.a.cb	ENSGT00950000182959.a.a.f	ENSGT00950000182959.a.b.b.a.f	ENSGT00390000013067.l.j	ENSGT00940000154709.a.a.e #22	ENSGT00940000158899.i.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b.h	ENSGT00940000153962.b.e.b	ENSGT00940000155394.i.a.f.a	ENSGT00390000000406.i.a	ENSGT00940000164178.h.a.a.a	ENSGT00940000156120.a.h	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.r.a.b.a	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.r.a.a
River trout	MODERN SPECIES	34	ndufb2 (ENSSTUG00000023507)	ENSSTUG00000023522	lhfpl3 (ENSSTUG00000023639)	orc5 (ENSSTUG00000023660)	guca1a (ENSSTUG00000023885)	ENSSTUG00000023891	hcls1 (ENSSTUG00000023940)	llph (ENSSTUG00000024017)	ppfia2 (ENSSTUG00000024089)	ACSS3 (ENSSTUG00000025813)	ENSSTUG00000026102	lin7a (ENSSTUG00000026114)	myf5 (ENSSTUG00000026178)	myf6 (ENSSTUG00000026265)	rps16 (ENSSTUG00000026299)	tnnt2c (ENSSTUG00000026330) #22	syt10 (ENSSTUG00000026383)	ENSSTUG00000026446	cyb5r3 (ENSSTUG00000027246)	syt1a (ENSSTUG00000027446)	pawr (ENSSTUG00000027495)	ENSSTUG00000027503	ppp1r12a (ENSSTUG00000027550)	ENSSTUG00000027757	ENSSTUG00000027774	ENSSTUG00000027792	ENSSTUG00000027803	kitlgb (ENSSTUG00000027812)	ENSSTUG00000027916	ENSSTUG00000027922	ENSSTUG00000027931
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	8	ENSSSAG00000002335	lhfpl3 (ENSSSAG00000064408)	orc5 (ENSSSAG00000006811)	guca1a (ENSSSAG00000121021)	ENSSSAG00000006792	hcls1 (ENSSSAG00000064251)	llph (ENSSSAG00000006778)	ENSSSAG00000006772	ppfia2 (ENSSSAG00000006415)	ENSSSAG00000092189	acss3 (ENSSSAG00000006095)	myf5 (ENSSSAG00000059922)	myf6 (ENSSSAG00000066608)	ENSSSAG00000066580	ENSSSAG00000089629	ENSSSAG00000113707 #22	ENSSSAG00000095543	ENSSSAG00000083937	ENSSSAG00000059732	ENSSSAG00000059420	ENSSSAG00000059333	ENSSSAG00000111955	ENSSSAG00000049822	ENSSSAG00000059204	ENSSSAG00000059181	ENSSSAG00000059156	ENSSSAG00000059129	ENSSSAG00000059114	ENSSSAG00000048853	ENSSSAG00000083093	ENSSSAG00000083617
Huchen	MODERN SPECIES	1610													myf5 (ENSHHUG00000041246)	myf6 (ENSHHUG00000041254)	rps16 (ENSHHUG00000041325)	tnnt2c (ENSHHUG00000041347) #22	syt10 (ENSHHUG00000041360)	ENSHHUG00000041391	cyb5r3 (ENSHHUG00000041465)	syt1a (ENSHHUG00000041492)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	924															ENSGT00940000164822.eb	ENSGT00940000154709.a.a.f #22	ENSGT00940000158899.i.a	ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b.g	ENSGT00940000153962.b.e.a	ENSGT00940000155394.i.a.e
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000004044.g	ENSGT00940000157862	ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b.b.b	ENSGT00990000203541.a.a.a.a.a	ENSGT00390000009380.e.a	ENSGT00940000164333.e	ENSGT00730000111007.a.a.l	ENSGT00940000158997.e.b	ENSGT00940000165344.d	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb	ENSGT00940000157479.d	ENSGT00940000153222.a.a.bb	ENSGT00950000182959.a.a.e	ENSGT00390000013067.l.i	ENSGT00940000164822.eb	ENSGT00940000154709.a.a.f #22	ENSGT00940000158899.i.a	ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b.g	ENSGT00940000153962.b.e.a	ENSGT00390000000406.i.b	ENSGT00940000164178.h.a.a.b	ENSGT00940000156120.a.g	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.r.a.b	ENSGT00940000167339	ENSGT01100000263549.k	ENSGT00390000018272.j.a	ENSGT00400000022326.b.a.a.a	ENSGT00940000154649.A.r.b.b.a.b	ENSGT00940000154649.A.r.b.b.b.a	ENSGT01030000234982.j.b
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000004044.g	ENSGT00940000157862.u.a	ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b.b.b	ENSGT00990000203541.a.a.a.a.a.l	ENSGT00390000009380.e.a	ENSGT00940000164333.e	ENSGT00730000111007.a.a.l.a	ENSGT00940000158997.e.b.b	ENSGT00940000165344.d.a	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb.i.b	ENSGT00940000153222.a.a.bb	ENSGT00950000182959.a.a.e	ENSGT00950000182959.a.b.b.a.d	ENSGT00390000013067.l.i	ENSGT00940000164822.eb	ENSGT00940000154709.a.a.f #22	ENSGT00940000158899.i.a	ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b.g	ENSGT00940000153962.b.e.a	ENSGT00390000000406.i.b	ENSGT00940000164178.h.a.a.b	ENSGT00940000156120.a.g	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.r.a.b.c.b	ENSGT01100000263549.k.a	ENSGT00940000175977	ENSGT01030000234589.h.f.b.b.a.a.a.b.b.b.a	ENSGT01090000260033.b.g.b.a.b.a.b.b.b.b.b	ENSGT01090000260033.b.g.b.b.b.a.b.a.d	ENSGT01030000234589.h.f.b.b.a.a.a.b.b.b.b	ENSGT00400000022326.b.a.a.a
Rainbow trout	MODERN SPECIES	13	lhfpl3 (ENSOMYG00000013630)	orc5 (ENSOMYG00000077068)	ENSOMYG00000013697	guca1a (ENSOMYG00000013888)	hcls1 (ENSOMYG00000013975)	llph (ENSOMYG00000013636)	ppfia2 (ENSOMYG00000014291)	ENSOMYG00000004734	ENSOMYG00000050420	lin7a (ENSOMYG00000014904)	Myf5 (ENSOMYG00000014917)	ENSOMYG00000074848	myf6 (ENSOMYG00000014934)	ENSOMYG00000014948	ENSOMYG00000014963	ENSOMYG00000014972 #22	ENSOMYG00000014985	ENSOMYG00000014997	ENSOMYG00000015082	ENSOMYG00000015363	ENSOMYG00000015469	ENSOMYG00000015520	ENSOMYG00000015530	ENSOMYG00000015664	ENSOMYG00000015860	ENSOMYG00000015882	ENSOMYG00000015887	ENSOMYG00000015906	ENSOMYG00000048940	ENSOMYG00000015959	ENSOMYG00000015961
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00390000004044.g	ENSGT00940000157862.u.a	ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b.b.b	ENSGT00990000203541.a.a.a.a.a.l	ENSGT00390000009380.e.a	ENSGT00940000164333.e	ENSGT00730000111007.a.a.l.a	ENSGT00940000158997.e.b.b	ENSGT00940000165344.d.a	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb.i.b	ENSGT00940000153222.a.a.bb	ENSGT00950000182959.a.a.e	ENSGT00950000182959.a.b.b.a.d	ENSGT00390000013067.l.i	ENSGT00940000164822.eb	ENSGT00940000154709.a.a.f #22	ENSGT00940000158899.i.a	ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b.g	ENSGT00940000153962.b.e.a	ENSGT00390000000406.i.b	ENSGT00940000164178.h.a.a.b	ENSGT00940000156120.a.g	ENSGT01100000263549.k.a	ENSGT00940000175977	ENSGT01030000234589.h.f.b.b.a.a.a.b.b.b.a	ENSGT01090000260033.b.g.b.a.b.a.b.b.b.b.b	ENSGT01090000260033.b.g.b.b.b.a.b.a.d	ENSGT01030000234589.h.f.b.b.a.a.a.b.b.b.b	ENSGT00400000022326.b.a.a.a	ENSGT00940000154649.A.r.b.b.a.b
Coho salmon	MODERN SPECIES	29	ndufb2 (ENSOKIG00005005858)	ENSOKIG00005005876	ENSOKIG00005005890	LHFPL3 (ENSOKIG00005005900)	orc5 (ENSOKIG00005005916)	guca1a (ENSOKIG00005006054)	ENSOKIG00005006075	hcls1 (ENSOKIG00005006199)	llph (ENSOKIG00005007027)	ppfia2 (ENSOKIG00005007307)	lin7a (ENSOKIG00005010877)	myf5 (ENSOKIG00005010902)	myf6 (ENSOKIG00005010942)	RPS16 (ENSOKIG00005010963)	ENSOKIG00005010986	ENSOKIG00005010999 #22	ENSOKIG00005011022	ENSOKIG00005011026	ENSOKIG00005011037	ENSOKIG00005011075	cyb5r3 (ENSOKIG00005011252)	syt1a (ENSOKIG00005012455)	PAWR (ENSOKIG00005012477)	ENSOKIG00005012494	ppp1r12a (ENSOKIG00005012576)	ENSOKIG00005012738	ENSOKIG00005012743	ENSOKIG00005012764	ENSOKIG00005012772	ENSOKIG00005012777	ENSOKIG00005012780
Chinook salmon	MODERN SPECIES	6	si:dkey-97m3.1 (ENSOTSG00005004350)	ergic2 (ENSOTSG00005004353)	KDM7A (ENSOTSG00005004384)	ndufb2 (ENSOTSG00005004411)	ENSOTSG00005004413	ENSOTSG00005004414	lhfpl3 (ENSOTSG00005004416)	orc5 (ENSOTSG00005004419)	guca1a (ENSOTSG00005004448)	ENSOTSG00005004450	lin7a (ENSOTSG00005004455)	myf5 (ENSOTSG00005004458)	myf6 (ENSOTSG00005004560)	rps16 (ENSOTSG00005004561)	ENSOTSG00005004562	tnnt2c (ENSOTSG00005004568) #22	syt10 (ENSOTSG00005004578)	ENSOTSG00005004580	ENSOTSG00005004581	ENSOTSG00005004585	cyb5r3 (ENSOTSG00005004729)	ENSOTSG00005006364	zgc:113263 (ENSOTSG00005006366)	ENSOTSG00005006367	ENSOTSG00005006370	ENSOTSG00005006371	ENSOTSG00005006373	ENSOTSG00005006375	ENSOTSG00005006377	ENSOTSG00005006379	ENSOTSG00005006391
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000157862.s.b	ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b.b.b	ENSGT00990000203541.a.a.a.a.a.j	ENSGT00390000009380.e.a	ENSGT00940000164333.e	ENSGT00730000111007.a.a.k.b	ENSGT00940000158997.e.b	ENSGT00940000165344.c	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb.h	ENSGT00940000157479.d	ENSGT00940000153222.a.a.bb	ENSGT00950000182959.a.a.e	ENSGT00950000182959.a.b.b.a.e	ENSGT00390000013067.l.i	ENSGT00940000164822.eb.a	ENSGT00940000154709.a.a.f #22	ENSGT00940000158899.i.b	ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b.g	ENSGT00940000153962.b.e.a	ENSGT00940000155394.i.a.f.b	ENSGT00390000000406.i.b	ENSGT00940000164178.h.a.a.b	ENSGT00940000156120.a.g	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.r.a.b.b	ENSGT00940000167339.r	ENSGT01100000263549.k	ENSGT00390000018272.j.a	ENSGT01090000260033.b.g.b.a.b.a.b.b.b.b.b	ENSGT01090000260033.b.g.b.b.b.a.b.a.a.b	ENSGT01030000234589.h.e.a.b
River trout	MODERN SPECIES	38	ENSSTUG00000035873	ENSSTUG00000035865	lhfpl3 (ENSSTUG00000035854)	orc5 (ENSSTUG00000035808)	guca1a (ENSSTUG00000035796)	ENSSTUG00000035760	hcls1 (ENSSTUG00000035213)	llph (ENSSTUG00000035187)	ppfia2 (ENSSTUG00000032738)	ACSS3 (ENSSTUG00000032599)	lin7a (ENSSTUG00000032580)	myf5 (ENSSTUG00000032573)	myf6 (ENSSTUG00000032558)	rps16 (ENSSTUG00000032534)	ENSSTUG00000032519	tnnt2c (ENSSTUG00000032501) #22	syt10 (ENSSTUG00000032485)	ENSSTUG00000032479	ENSSTUG00000031897	cyb5r3 (ENSSTUG00000030947)	syt1a (ENSSTUG00000030907)	pawr (ENSSTUG00000030899)	ENSSTUG00000030863	ppp1r12a (ENSSTUG00000030696)	ENSSTUG00000030667	ENSSTUG00000030613	ENSSTUG00000030624	ENSSTUG00000030595	ENSSTUG00000030588	ENSSTUG00000027335	ENSSTUG00000027327
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	26	ENSSSAG00000069201	ENSSSAG00000064417	lhfpl3 (ENSSSAG00000082371)	orc5 (ENSSSAG00000064371)	guca1a (ENSSSAG00000085222)	ENSSSAG00000064357	hcls1 (ENSSSAG00000005879)	llph (ENSSSAG00000064235)	ppfia2 (ENSSSAG00000060373)	ACSS3 (ENSSSAG00000060026)	lin7a (ENSSSAG00000086615)	myf5 (ENSSSAG00000006004)	myf6 (ENSSSAG00000059887)	ENSSSAG00000109892	ENSSSAG00000059832	ENSSSAG00000090411 #22	ENSSSAG00000059802	ENSSSAG00000059783	ENSSSAG00000050368	ENSSSAG00000049921	ENSSSAG00000120466	ENSSSAG00000092375	ENSSSAG00000099338	ENSSSAG00000108147	ENSSSAG00000059264	ENSSSAG00000049032	ENSSSAG00000048969	ENSSSAG00000101043	ENSSSAG00000048963	ENSSSAG00000048939	ENSSSAG00000092724
Huchen	MODERN SPECIES	843										ACSS3 (ENSHHUG00000043852)	lin7a (ENSHHUG00000043859)	myf5 (ENSHHUG00000043862)	myf6 (ENSHHUG00000043876)	rps16 (ENSHHUG00000043904)	ENSHHUG00000043915	tnnt2c (ENSHHUG00000043922) #22	syt10 (ENSHHUG00000043941)	ENSHHUG00000043988	ENSHHUG00000043992	cyb5r3 (ENSHHUG00000044032)	syt1a (ENSHHUG00000044047)
Northern pike	MODERN SPECIES	22	ndufb2 (ENSELUG00000002225)	ENSELUG00000002258	ENSELUG00000026586	ENSELUG00000028784	lhfpl3 (ENSELUG00000002269)	orc5 (ENSELUG00000002281)	guca1a (ENSELUG00000002288)	ENSELUG00000002315	hcls1 (ENSELUG00000002347)	llph (ENSELUG00000026094)	ppfia2 (ENSELUG00000002421)	ACSS3 (ENSELUG00000002474)	lin7a (ENSELUG00000002488)	myf5 (ENSELUG00000002500)	rps16 (ENSELUG00000002505)	tnnt2c (ENSELUG00000002535) #22	syt10 (ENSELUG00000002545)	ENSELUG00000002578	cyb5r3 (ENSELUG00000001118)	syt1a (ENSELUG00000002624)	pawr (ENSELUG00000002637)	ppp1r12a (ENSELUG00000002794)	ENSELUG00000002871	kitlgb (ENSELUG00000002894)	ENSELUG00000031374	ENSELUG00000028990	ENSELUG00000024788	ENSELUG00000028612	ENSELUG00000030654	ENSELUG00000027779	ENSELUG00000002914
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	486												ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00530000063825.A.c.e	ENSGT00940000153962.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158899
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	211													ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00530000063817.b.b	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00530000063825.A.c.e	ENSGT00940000153962.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158899	ENSGT00390000002793	ENSGT00940000158969	ENSGT00390000017324	ENSGT00940000167467	ENSGT00940000165713	ENSGT00540000070023.c.b	ENSGT00940000155210.a.b	ENSGT00950000182839.B.a.a.k	ENSGT00940000158677	ENSGT00940000160423.b	ENSGT00940000153544.b
Denticle herring	MODERN SPECIES	6	gch2 (ENSDCDG00000021253)	socs5a (ENSDCDG00000021257)	CCR8 (ENSDCDG00000021316)	OPN4 (ENSDCDG00000021327)	ldb3b (ENSDCDG00000021348)	BMPR1A (ENSDCDG00000021374)	SNCG (ENSDCDG00000022668)	glud1b (ENSDCDG00000022676)	ppm1bb (ENSDCDG00000022702)	ENSDCDG00000022707	six2b (ENSDCDG00000022710)	PRKCE (ENSDCDG00000022722)	ENSDCDG00000022903	btbd11a (ENSDCDG00000022910)	cry1a (ENSDCDG00000023919)	tnnt2c (ENSDCDG00000024879) #22	si:dkey-222f8.3 (ENSDCDG00000024882)	cyb5r3 (ENSDCDG00000024886)	ENSDCDG00000024927	syt10 (ENSDCDG00000025399)	ints13 (ENSDCDG00000025410)	ANO6 (ENSDCDG00000026083)	COG5 (ENSDCDG00000026302)	gpr22a (ENSDCDG00000026390)	dus4l (ENSDCDG00000026392)	bcap29 (ENSDCDG00000026394)	slco1c1 (ENSDCDG00000026401)	PDE3A (ENSDCDG00000026646)	ENSDCDG00000026655	aebp2 (ENSDCDG00000026658)	plekha5 (ENSDCDG00000026675)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	7	ENSCHAG00000017986	ENSCHAG00000018002	pwp2h (ENSCHAG00000018030)	ENSCHAG00000018277	ENSCHAG00000018339	ENSCHAG00000018343	ENSCHAG00000018365	ENSCHAG00000018393	rpap3 (ENSCHAG00000018420)	ENSCHAG00000018460	ENSCHAG00000018478	ENSCHAG00000018506	btbd11a (ENSCHAG00000018552)	cry1a (ENSCHAG00000019111)	ENSCHAG00000019339	tnnt2c (ENSCHAG00000019347) #22	si:dkey-222f8.3 (ENSCHAG00000019390)	slc26a3.1 (ENSCHAG00000019565)	slc26a4 (ENSCHAG00000020573)	ENSCHAG00000021131	ENSCHAG00000021139	ENSCHAG00000021147	mcat (ENSCHAG00000021150)	ENSCHAG00000021158	ttll1 (ENSCHAG00000021160)	pacsin2 (ENSCHAG00000000898)	arfgap3 (ENSCHAG00000001497)	ENSCHAG00000001748	uhrf1bp1l (ENSCHAG00000002645)	ENSCHAG00000005835	anks1b (ENSCHAG00000005896)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	269													ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00530000063825.A.c.e	ENSGT00940000153962.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158899	ENSGT00530000063745.b	ENSGT00390000006546	ENSGT00440000033504.B.b	ENSGT00940000155867.a.b.e	ENSGT00940000161249	ENSGT00940000167336	ENSGT00620000087961.a.b.a.b.a	ENSGT00940000153969.a	ENSGT00950000182994.B.a.b	ENSGT00940000160326.c.b	ENSGT00940000160326.c.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000011980.a.i.b	ENSGT00940000153908.a	ENSGT00440000033863	ENSGT00940000161146	ENSGT00940000159018.c	ENSGT00940000154822.a	ENSGT00950000183077.a.a	ENSGT00940000162201.o.d	ENSGT00390000000068.a.a	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.f	ENSGT00390000011401	ENSGT00940000156154	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00530000063825.A.c.e	ENSGT00940000153962.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158899	ENSGT00940000157963	ENSGT00940000163299.B.b.b.j	ENSGT00940000156144.a.b	ENSGT00530000063745.b	ENSGT00390000006546	ENSGT00440000033504.B.b	ENSGT00940000155867.a.b.e	ENSGT00940000161249	ENSGT00940000167336	ENSGT00620000087961.a.b.a.b.a	ENSGT00940000153969.a
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	102	ENSGT00940000153908.a	ENSGT00440000033863	ENSGT00940000161146	ENSGT00940000159018.c	ENSGT00940000154822.a	ENSGT00950000183077.a.a	ENSGT00940000162201.o.d	ENSGT00390000000068.a.a	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.f	ENSGT00390000011401	ENSGT00940000156154	ENSGT00390000008061.j.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00530000063825.A.c.e	ENSGT00940000153962.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158899
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	96	ENSGT00940000153908.a	ENSGT00440000033863	ENSGT00940000161146	ENSGT00940000159018.c	ENSGT00940000154822.a	ENSGT00950000183077.a.a	ENSGT00940000162201.o.d	ENSGT00390000000068.a.a	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.f	ENSGT00390000011401	ENSGT00940000156154	ENSGT00390000008061.j.a	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00530000063825.A.c.e	ENSGT00940000153962.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158899
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	41	mgst1.1 (ENSPNAG00000008768)	lmo3 (ENSPNAG00000001182)	ENSPNAG00000008739	arhgef39 (ENSPNAG00000001177)	rergla (ENSPNAG00000008726)	ENSPNAG00000001170	TMEM121B (ENSPNAG00000008710)	mkrn1 (ENSPNAG00000008708)	ENSPNAG00000008695	cnot4b (ENSPNAG00000008679)	tmem178bb (ENSPNAG00000001136)	mrps33 (ENSPNAG00000008638)	braf (ENSPNAG00000008630)	btbd11a (ENSPNAG00000001119)	cry1a (ENSPNAG00000006718)	tnnt2c (ENSPNAG00000001084) #22	si:dkey-222f8.3 (ENSPNAG00000008556)	cyb5r3 (ENSPNAG00000008543)	ENSPNAG00000008523	syt10 (ENSPNAG00000001045)	ENSPNAG00000005178	ENSPNAG00000008459
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	22							TMEM178B (ENSAMXG00000043186)	mrps33 (ENSAMXG00000043198)	braf (ENSAMXG00000011513)	ENSAMXG00000024989	btbd11a (ENSAMXG00000043749)	ENSAMXG00000005431	cry1a (ENSAMXG00000005406)	ENSAMXG00000043474	ENSAMXG00000031949	tnnt2c (ENSAMXG00000025742) #22	si:dkey-222f8.3 (ENSAMXG00000005380)	cyb5r3 (ENSAMXG00000037793)	ENSAMXG00000005360	syt10 (ENSAMXG00000000324)	ENSAMXG00000029987	ENSAMXG00000031709	ENSAMXG00000000926	ENSAMXG00000036009	ENSAMXG00000000922	ENSAMXG00000040305	ENSAMXG00000030640	ENSAMXG00000010368	prmt8b (ENSAMXG00000019502)	tspan11 (ENSAMXG00000010362)	sema3aa (ENSAMXG00000010349)
Electric eel	MODERN SPECIES	58	ENSEEEG00000017778	lmo3 (ENSEEEG00000017775)	arhgef39 (ENSEEEG00000017773)	rergla (ENSEEEG00000017769)	ENSEEEG00000017762	TMEM121B (ENSEEEG00000017757)	mkrn1 (ENSEEEG00000017755)	ENSEEEG00000017754	cnot4b (ENSEEEG00000017741)	tmem178bb (ENSEEEG00000017739)	mrps33 (ENSEEEG00000017738)	braf (ENSEEEG00000017556)	ENSEEEG00000017536	btbd11a (ENSEEEG00000017533)	cry1a (ENSEEEG00000017367)	tnnt2c (ENSEEEG00000017363) #22	si:dkey-222f8.3 (ENSEEEG00000017362)	cyb5r3 (ENSEEEG00000017318)	ENSEEEG00000017290	ENSEEEG00000017287	syt10 (ENSEEEG00000017286)	ENSEEEG00000017284
Channel catfish	MODERN SPECIES	10	dera (ENSIPUG00000016710)	mgst1 (ENSIPUG00000016739)	lmo3 (ENSIPUG00000016756)	arhgef39 (ENSIPUG00000016797)	rergl (ENSIPUG00000016826)	Il17ra (ENSIPUG00000016862)	cecr6 (ENSIPUG00000016945)	mkrn1 (ENSIPUG00000016956)	ENSIPUG00000016980	cnot4b (ENSIPUG00000016994)	tmem178b (ENSIPUG00000017092)	Mrps33 (ENSIPUG00000017102)	braf (ENSIPUG00000017122)	btbd11a (ENSIPUG00000017196)	cry1a (ENSIPUG00000017249)	tnnt2c (ENSIPUG00000017363) #22	si:dkey-222f8.3 (ENSIPUG00000017413)	si:dkey-222f8.3 (ENSIPUG00000017464)	Cyb5r3 (ENSIPUG00000017567)	ENSIPUG00000017624	ENSIPUG00000017723	ENSIPUG00000017728	ENSIPUG00000017740	spag6 (ENSIPUG00000017752)	syt10 (ENSIPUG00000017790)	ENSIPUG00000017809	ENSIPUG00000017834	tmtc2 (ENSIPUG00000017846)	mettl25 (ENSIPUG00000017885)	ccdc59 (ENSIPUG00000017904)	ENSIPUG00000017914
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00390000006546	ENSGT00940000164603	ENSGT00940000155867.a.b.e	ENSGT00940000161249	ENSGT00940000167336	ENSGT00620000087961.a.b.a.b.a	ENSGT00940000153969.a	ENSGT00950000182994.B.a.b	ENSGT00940000160326.c.b	ENSGT00940000160326.c.a	ENSGT00940000155849.h	ENSGT00390000001702	ENSGT00730000111314	ENSGT00940000156419.b	ENSGT00940000155455.g	ENSGT00940000154709.a.a #22	ENSGT00530000063825.A.c.e	ENSGT00940000156154	ENSGT00390000011401	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.f	ENSGT00390000000068.a.a	ENSGT00940000162201.o.d	ENSGT00950000183077.a.a	ENSGT00940000154822.a	ENSGT00940000165644.f	ENSGT00940000161146	ENSGT00440000033863	ENSGT00940000153908.a	ENSGT00390000011980.a.i.b	ENSGT00390000011980.a.i.a	ENSGT00390000007878
Cyprininae	DUPLICATION
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Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	123	ENSGT00940000156144.a.b	ENSGT00530000063745.b.d	ENSGT00390000006546	ENSGT00940000155867.a.b.e.b	ENSGT00940000161249.h	ENSGT00940000167336.h	ENSGT00620000087961.a.b.a.b.a.a	ENSGT00940000153969.a.c	ENSGT00950000182994.B.a.b.jb	ENSGT00940000160326.c.b	ENSGT00940000155849.h.f	ENSGT00390000001702.m.b	ENSGT00940000153962.b.l.a	ENSGT00940000156419.b.b	ENSGT00940000155455.g.b	ENSGT00940000154709.a.a.g #22	ENSGT00530000063825.A.c.e.e	ENSGT00940000156154.j	ENSGT00390000011401.tb	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.f.b	ENSGT00390000000068.a.a.b	ENSGT00940000162201.o.d.a	ENSGT00950000183077.a.a.d	ENSGT00940000154822.a.a	ENSGT00940000165644.f.a	ENSGT00940000161146.b	ENSGT00440000033863.b	ENSGT00940000153908.a.h	ENSGT00390000011980.a.i.b.b	ENSGT00390000007878.k	ENSGT00390000006913.i.a
Golden-line barbel	MODERN SPECIES		ENSSGRG00000000050	prmt8b (ENSSGRG00000000051)	tspan11 (ENSSGRG00000000052)	sema3aa (ENSSGRG00000000053)	ENSSGRG00000000054	ankrd16 (ENSSGRG00000000055)	gdi2 (ENSSGRG00000000056)	ENSSGRG00000000057	ENSSGRG00000000058	net1 (ENSSGRG00000000059)	mkln1 (ENSSGRG00000000061)	ENSSGRG00000000062	cyb5r3 (ENSSGRG00000000063)	btbd11a (ENSSGRG00000000064)	cry1a (ENSSGRG00000000066)	tnnt2c (ENSSGRG00000000067) #22	si:dkey-222f8.3 (ENSSGRG00000000068)	braf (ENSSGRG00000000069)	mrps33 (ENSSGRG00000000070)	mrps33 (ENSSGRG00000000071)	tmem178bb (ENSSGRG00000000073)	cnot4b (ENSSGRG00000000074)	ENSSGRG00000000083	mkrn1 (ENSSGRG00000000108)	TMEM121B (ENSSGRG00000000178)	ENSSGRG00000000184	rergla (ENSSGRG00000000198)	arhgef39 (ENSSGRG00000000213)	lmo3 (ENSSGRG00000000230)	mgst1.1 (ENSSGRG00000000245)	mgst1.2 (ENSSGRG00000000248)
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Goldfish	DUPLICATION
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Goldfish	DUPLICATION
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Vertebrata	DUPLICATION
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.a ##22
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.a ##22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.a ##22
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.a ##22
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	79	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000157365	ENSGT00940000159939	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a	ENSGT00940000158771	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00390000009166	ENSGT00940000158040	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a ##22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000157882	ENSGT00440000034918	ENSGT00950000182973.a.c.a	ENSGT00940000157549	ENSGT00490000043415	ENSGT00730000110997	ENSGT00600000084428.a	ENSGT00390000013228	ENSGT00940000155806	ENSGT00940000160792	ENSGT00940000153185.a.a.b
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	62				ENSGT00940000160123.e.a	ENSGT00390000013981	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000166065.b	ENSGT00940000157586.f	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a ##20	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	296			ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.a ##20	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	76									ENSGT00390000003422	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.a ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166.b	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00970000197066	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	224				ENSGT00530000064134.a.b	ENSGT00940000165387.b	ENSGT00950000182932.C.a	ENSGT00940000160725	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00940000156230.o	ENSGT00390000003422	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166.b	ENSGT01030000234588.a.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00390000009166.a	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b.c	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c	ENSGT00940000160210.d.b
Atlantic herring	MODERN SPECIES	21	ENSCHAG00000008206	ENSCHAG00000008144	ENSCHAG00000008125	ncoa5 (ENSCHAG00000008101)	ENSCHAG00000006389	ENSCHAG00000006283	ENSCHAG00000006248	cyp24a1 (ENSCHAG00000006093)	ENSCHAG00000006059	manbal (ENSCHAG00000006040)	SYT2 (ENSCHAG00000006015)	mybphb (ENSCHAG00000005891)	NAV1 (ENSCHAG00000003705) #16	csrp1b (ENSCHAG00000003604) #18	tnni1b (ENSCHAG00000003533) ##20	ENSCHAG00000003507 ##22	ENSCHAG00000003484	PKP1 (ENSCHAG00000003411) #23	smpd2a (ENSCHAG00000003372)	tead3b (ENSCHAG00000003280)	ENSCHAG00000003247	ENSCHAG00000003199	ADORA3 (ENSCHAG00000003099)	ENSCHAG00000003052	ENSCHAG00000002987	rplp2 (ENSCHAG00000002973)	KCNA10 (ENSCHAG00000002880)	KCNA2 (ENSCHAG00000002805)	KCNA3 (ENSCHAG00000002783)	INKA2 (ENSCHAG00000002763)	si:ch1073-376c22.1 (ENSCHAG00000002725)
Denticle herring	MODERN SPECIES	3	itcha (ENSDCDG00000015061)	NECAB3 (ENSDCDG00000015678)	cbfa2t2 (ENSDCDG00000015692)	SNTA1 (ENSDCDG00000016443)	tlr22 (ENSDCDG00000016451)	tox2 (ENSDCDG00000016457)	RALGAPB (ENSDCDG00000016481)	KCNQ2 (ENSDCDG00000016550)	ENSDCDG00000016691	arfrp1 (ENSDCDG00000016693)	STMN3 (ENSDCDG00000016696)	HELZ2 (ENSDCDG00000016701)	ENSDCDG00000016704	csrp1b (ENSDCDG00000016707) #18	tnni1b (ENSDCDG00000016712) ##20	ENSDCDG00000016714 ##22	ENSDCDG00000016717 #23	ENSDCDG00000016719	tead3b (ENSDCDG00000016722)	ENSDCDG00000016750	ENSDCDG00000016757	ENSDCDG00000016758	ENSDCDG00000016760	rplp2 (ENSDCDG00000016763)	KCNA10 (ENSDCDG00000016767)	KCNA2 (ENSDCDG00000016768)	KCNA3 (ENSDCDG00000016770)	INKA2 (ENSDCDG00000016771)	rap1ab (ENSDCDG00000016773)	timm17a (ENSDCDG00000016774) #12	LMOD1 (ENSDCDG00000016777) #13
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01100000263545.a.b.d.b	ENSGT00390000016206	ENSGT00510000047836	ENSGT00930000150941	ENSGT00940000153725.a.a	ENSGT00730000111020.b.b	ENSGT00940000156230.o	ENSGT00940000157616.i	ENSGT00390000003422	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.a ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166.b	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.a	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000154347.a	ENSGT00730000110997	ENSGT00940000155806.c.b	ENSGT00940000177480.b	ENSGT00490000043415.l	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00880000138014.b	ENSGT01100000263545.a.b.d.b	ENSGT00390000016206	ENSGT00510000047836	ENSGT00930000150941	ENSGT00940000153725.a.a	ENSGT00730000111020.b.b	ENSGT00940000156230.o	ENSGT00940000157616.i	ENSGT00390000003422	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.a ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166.b	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.a	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211
Channel catfish	MODERN SPECIES	2	ENSIPUG00000024733	ncoa5 (ENSIPUG00000024739)	ctsa (ENSIPUG00000024743)	pltp (ENSIPUG00000024747)	pcif1 (ENSIPUG00000024749)	dnttip1 (ENSIPUG00000024754)	ube2c (ENSIPUG00000024760)	zgc:109913 (ENSIPUG00000024761)	ENSIPUG00000024764	MANBAL (ENSIPUG00000024766)	SYT2 (ENSIPUG00000024768)	mybph (ENSIPUG00000024771)	NAV1 (ENSIPUG00000024775) #16	csrp1 (ENSIPUG00000024780) #18	tnni1b (ENSIPUG00000024785) ##20	ENSIPUG00000024788 ##22	pkp1 (ENSIPUG00000024791) #23	ENSIPUG00000024794	tead3 (ENSIPUG00000024800)	tulp1 (ENSIPUG00000024810)	ENSIPUG00000024845	sys1 (ENSIPUG00000024848)	snrpc (ENSIPUG00000024851)	ENSIPUG00000024853	c11h6orf106 (ENSIPUG00000024857)	SPDEF (ENSIPUG00000024860)	pacsin1b (ENSIPUG00000024866)	rps10 (ENSIPUG00000024872)	NUDT3 (ENSIPUG00000024874)	hmga1b (ENSIPUG00000024877)	Tusc2 (ENSIPUG00000024880)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000064134.a.b	ENSGT00880000138014.b	ENSGT01100000263545.a.b.d.b	ENSGT00390000016206	ENSGT00510000047836	ENSGT00930000150941	ENSGT00940000153725.a.a	ENSGT00730000111020.b.b	ENSGT00940000156230.o	ENSGT00390000003422	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.a ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166.b	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.a	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000165387.b	ENSGT00530000064134.a.b	ENSGT00880000138014.b	ENSGT01100000263545.a.b.d.b	ENSGT00390000016206	ENSGT00510000047836	ENSGT00930000150941	ENSGT00940000153725.a.a	ENSGT00940000157616.i	ENSGT00390000003422	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.a ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166.b	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.b.a	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.b.b	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	413												mybphb (ENSPNAG00000000639)	NAV1 (ENSPNAG00000000618) #16	csrp1b (ENSPNAG00000008029) #18	tnni1b (ENSPNAG00000005776) ##20	ENSPNAG00000000586 ##22	PKP1 (ENSPNAG00000007994) #23	ENSPNAG00000007986	tead3b (ENSPNAG00000000568)	TULP1 (ENSPNAG00000000542)	ENSPNAG00000007943	ENSPNAG00000007932
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	4	ENSAMXG00000015416	ENSAMXG00000015395	BPTF (ENSAMXG00000015334)	nol11 (ENSAMXG00000015289)	PITPNC1 (ENSAMXG00000015250)	TEX2 (ENSAMXG00000015207)	ENSAMXG00000026305	AXIN2 (ENSAMXG00000015178)	ENSAMXG00000000747	manbal (ENSAMXG00000038402)	SYT2 (ENSAMXG00000000707)	mybphb (ENSAMXG00000000680)	NAV1 (ENSAMXG00000000662) #16	csrp1b (ENSAMXG00000031677) #18	tnni1b (ENSAMXG00000043187) ##20	ENSAMXG00000030775 ##22	PKP1 (ENSAMXG00000038111) #23	ENSAMXG00000013614	tead3b (ENSAMXG00000039402)	ENSAMXG00000039314	ENSAMXG00000004314	ENSAMXG00000036368	ENSAMXG00000036826	ENSAMXG00000039349	ENSAMXG00000031217	ENSAMXG00000037152	ENSAMXG00000013451	ENSAMXG00000038612	ENSAMXG00000031459	sys1 (ENSAMXG00000035009)	snrpc (ENSAMXG00000032641)
Electric eel	MODERN SPECIES	44	ctsa (ENSEEEG00000007635)	pltp (ENSEEEG00000007548)	pcif1 (ENSEEEG00000007486)	DNTTIP1 (ENSEEEG00000007359)	ube2c (ENSEEEG00000007338)	zgc:109913 (ENSEEEG00000007335)	ENSEEEG00000007334	ENSEEEG00000007332	manbal (ENSEEEG00000007329)	SYT2 (ENSEEEG00000007325)	mybphb (ENSEEEG00000007321)	ENSEEEG00000007320	NAV1 (ENSEEEG00000007218) #16	csrp1b (ENSEEEG00000007213) #18	tnni1b (ENSEEEG00000007212) ##20	ENSEEEG00000007207 ##22	PKP1 (ENSEEEG00000007206) #23	ENSEEEG00000007204	tead3b (ENSEEEG00000007197)	ENSEEEG00000007195	ADORA3 (ENSEEEG00000007194)	ENSEEEG00000007193	ENSEEEG00000007192	ENSEEEG00000007190	snrpc (ENSEEEG00000007187)	ENSEEEG00000007184	ENSEEEG00000007183	ilrun (ENSEEEG00000007182)	SPDEF (ENSEEEG00000007181)	pacsin1b (ENSEEEG00000007180)	rps10 (ENSEEEG00000007178)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000016206.e	ENSGT00510000047836	ENSGT00930000150941	ENSGT00940000153725.a.a	ENSGT00730000111020.b.b	ENSGT00940000156230.o	ENSGT00390000003422.h	ENSGT00940000157616.i	ENSGT00390000003422.g	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.a ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166.b	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00390000009166.a	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.a	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000154347.a	ENSGT00730000110997	ENSGT00940000155806.c.b	ENSGT00490000043415.l	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c
Cyprininae	DUPLICATION
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Goldfish	DUPLICATION
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Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	123									ENSGT00390000010053	ENSGT00390000011897	ENSGT00940000159941	ENSGT00940000157444	ENSGT00940000157238.a	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.j	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906.e
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	80									ENSGT00390000010053	ENSGT00390000011897	ENSGT00940000159941	ENSGT00940000157444	ENSGT00940000157238.a	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.j	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906.e
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	3583										cenpp (ENSAOCG00000014756)	ECM2 (ENSAOCG00000014729)	aspn (ENSAOCG00000014711)	ogna (ENSAOCG00000014691)	csrp1b (ENSAOCG00000014640) #18	tnni1b (ENSAOCG00000014613) ##20	ENSAOCG00000014588 ##22	ENSAOCG00000000959 #23	smpd2a (ENSAOCG00000014544)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	20	ENSAPEG00000023473	pdhb (ENSAPEG00000023492)	pxk (ENSAPEG00000023540)	HTD2 (ENSAPEG00000023579)	rpp14 (ENSAPEG00000023583)	ABHD6 (ENSAPEG00000023596)	ENSAPEG00000023602	ENSAPEG00000023611	ippk (ENSAPEG00000023634)	ENSAPEG00000023654	ECM2 (ENSAPEG00000023682)	aspn (ENSAPEG00000023706)	ogna (ENSAPEG00000023714)	csrp1b (ENSAPEG00000023731) #18	tnni1b (ENSAPEG00000023739) ##20	ENSAPEG00000023752 ##22	smpd2a (ENSAPEG00000023764)	tead3b (ENSAPEG00000023789)	ENSAPEG00000023840	ENSAPEG00000023846	ENSAPEG00000023884	rplp2 (ENSAPEG00000023899)	KCNA10 (ENSAPEG00000023909)	KCNA2 (ENSAPEG00000000340)	KCNA3 (ENSAPEG00000001678)	ENSAPEG00000001723	ngfb (ENSAPEG00000001729)	tspan2a (ENSAPEG00000001748)	slc25a55a (ENSAPEG00000001778)	tshba (ENSAPEG00000001820)	slc5a8l (ENSAPEG00000001831)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	415										ENSAPOG00000015703	ECM2 (ENSAPOG00000015711)	aspn (ENSAPOG00000015719)	ogna (ENSAPOG00000015818)	cenpp (ENSAPOG00000015835)	csrp1b (ENSAPOG00000015858) #18	ENSAPOG00000015866 ##22	ENSAPOG00000015878 #23	ENSAPOG00000000440	tead3b (ENSAPOG00000000743)	ENSAPOG00000016015	ADORA3 (ENSAPOG00000016019)	ENSAPOG00000016025	rplp2 (ENSAPOG00000016049)	KCNA10 (ENSAPOG00000000885)	KCNA3 (ENSAPOG00000016088)	ngfb (ENSAPOG00000016109)	tspan2a (ENSAPOG00000016115)	slc25a55a (ENSAPOG00000016158)	tshba (ENSAPOG00000016169)	slc5a8l (ENSAPOG00000016318)	slc5a8l (ENSAPOG00000016430)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	241	SPDEF (ENSSPAG00000000942)	pacsin1b (ENSSPAG00000000962)	rps10 (ENSSPAG00000001013)	nudt3b (ENSSPAG00000001034)	GRM4 (ENSSPAG00000001061)	ENSSPAG00000001122	ENSSPAG00000001273	ENSSPAG00000001329	ENSSPAG00000001532	ENSSPAG00000001630	SYT2 (ENSSPAG00000001643)	mybphb (ENSSPAG00000001684)	NAV1 (ENSSPAG00000001711) #16	csrp1b (ENSSPAG00000001776) #18	tnni1b (ENSSPAG00000001794) ##20	ENSSPAG00000001813 ##22	ENSSPAG00000001837 #23	smpd2a (ENSSPAG00000001844)	tead3b (ENSSPAG00000001869)	ENSSPAG00000001974	ADORA3 (ENSSPAG00000001996)	ENSSPAG00000002001	rplp2 (ENSSPAG00000002018)	KCNA10 (ENSSPAG00000002032)	KCNA2 (ENSSPAG00000002046)	KCNA3 (ENSSPAG00000002061)	ngfb (ENSSPAG00000002078)	tspan2a (ENSSPAG00000002082)	slc25a55a (ENSSPAG00000002090)	tshba (ENSSPAG00000002131)	slc5a8l (ENSSPAG00000002151)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00490000043415.k.b	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.n	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00490000043415.k.b	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.n	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00490000043415.k.b	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.n	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00490000043415.k.b	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.n	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	290	ilrun (ENSHBUG00000011627)	SPDEF (ENSHBUG00000011607)	pacsin1b (ENSHBUG00000011583)	rps10 (ENSHBUG00000011566)	nudt3b (ENSHBUG00000011550)	GRM4 (ENSHBUG00000011533)	ENSHBUG00000011488	ENSHBUG00000011389	ENSHBUG00000011298	ENSHBUG00000011017	SYT2 (ENSHBUG00000011009)	mybphb (ENSHBUG00000010955)	NAV1 (ENSHBUG00000010887) #16	csrp1b (ENSHBUG00000010771) #18	tnni1b (ENSHBUG00000010748) ##20	ENSHBUG00000010708 ##22	ENSHBUG00000010676	tead3b (ENSHBUG00000010605)	ENSHBUG00000010377
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00490000043415.k.b	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.n	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00490000043415.k.b	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.n	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906	ENSGT00390000003368
Eastern happy	MODERN SPECIES	17	ilrun (ENSACLG00000000818)	SPDEF (ENSACLG00000000801)	pacsin1b (ENSACLG00000000768)	rps10 (ENSACLG00000000755)	nudt3b (ENSACLG00000000730)	GRM4 (ENSACLG00000000676)	ENSACLG00000000512	ENSACLG00000000387	ENSACLG00000000179	ENSACLG00000000150	SYT2 (ENSACLG00000000137)	mybphb (ENSACLG00000000129)	NAV1 (ENSACLG00000000040) #16	csrp1b (ENSACLG00000023130) #18	tnni1b (ENSACLG00000023120) ##20	ENSACLG00000022933 ##22	PKP1 (ENSACLG00000022905) #23	smpd2a (ENSACLG00000022892)	tead3b (ENSACLG00000022697)	ENSACLG00000022662	ADORA3 (ENSACLG00000022638)	ENSACLG00000022602	rplp2 (ENSACLG00000022594)	KCNA10 (ENSACLG00000022568)	KCNA3 (ENSACLG00000022558)	ngfb (ENSACLG00000022549)	tspan2a (ENSACLG00000022516)	slc25a55a (ENSACLG00000022495)	tshba (ENSACLG00000022453)	slc5a8l (ENSACLG00000022325)	sycp1 (ENSACLG00000022159)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1108	ilrun (ENSMZEG00005002206)	SPDEF (ENSMZEG00005002226)	pacsin1b (ENSMZEG00005002257)	rps10 (ENSMZEG00005002276)	nudt3b (ENSMZEG00005002284)	GRM4 (ENSMZEG00005002311)	ENSMZEG00005002358	ENSMZEG00005002367	ENSMZEG00005002451	ENSMZEG00005002589	SYT2 (ENSMZEG00005002615)	mybphb (ENSMZEG00005002628)	NAV1 (ENSMZEG00005002646) #16	csrp1b (ENSMZEG00005002716) #18	tnni1b (ENSMZEG00005002731) ##20	ENSMZEG00005002768 ##22	PKP1 (ENSMZEG00005002931) #23	smpd2a (ENSMZEG00005002958)	tead3b (ENSMZEG00005002990)	ENSMZEG00005003077	ADORA3 (ENSMZEG00005003103)	ENSMZEG00005003192	rplp2 (ENSMZEG00005003204)	KCNA10 (ENSMZEG00005003225)	KCNA3 (ENSMZEG00005003236)	ENSMZEG00005003246	ngfb (ENSMZEG00005003275)	tspan2a (ENSMZEG00005003292)	slc25a55a (ENSMZEG00005003310)	tshba (ENSMZEG00005003348)	slc5a8l (ENSMZEG00005003413)
P. nyererei	MODERN SPECIES	329	ilrun (ENSPNYG00000004926)	SPDEF (ENSPNYG00000004949)	pacsin1b (ENSPNYG00000004974)	rps10 (ENSPNYG00000005008)	nudt3b (ENSPNYG00000005021)	GRM4 (ENSPNYG00000005053)	ENSPNYG00000005106	ENSPNYG00000005137	ENSPNYG00000005207	ENSPNYG00000005289	SYT2 (ENSPNYG00000005311)	mybphb (ENSPNYG00000005332)	NAV1 (ENSPNYG00000005359) #16	csrp1b (ENSPNYG00000005431) #18	tnni1b (ENSPNYG00000005459) ##20	ENSPNYG00000005495 ##22	PKP1 (ENSPNYG00000005548) #23	smpd2a (ENSPNYG00000005567)	tead3b (ENSPNYG00000005612)	ENSPNYG00000005670	ADORA3 (ENSPNYG00000005712)	ENSPNYG00000005735	ENSPNYG00000005740	rplp2 (ENSPNYG00000005747)	KCNA10 (ENSPNYG00000005767)	KCNA2 (ENSPNYG00000005782)	KCNA3 (ENSPNYG00000005818)	ngfb (ENSPNYG00000005847)	tspan2a (ENSPNYG00000005861)	slc25a55a (ENSPNYG00000005887)	tshba (ENSPNYG00000005929)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	294	ilrun (ENSNBRG00000009272)	SPDEF (ENSNBRG00000009239)	pacsin1b (ENSNBRG00000009125)	rps10 (ENSNBRG00000009084)	nudt3b (ENSNBRG00000009064)	GRM4 (ENSNBRG00000009022)	ENSNBRG00000008957	ENSNBRG00000008881	ENSNBRG00000008779	ENSNBRG00000008745	SYT2 (ENSNBRG00000008667)	mybphb (ENSNBRG00000008627)	NAV1 (ENSNBRG00000008543) #16	csrp1b (ENSNBRG00000008508) #18	tnni1b (ENSNBRG00000008476) ##20	ENSNBRG00000008446 ##22	ENSNBRG00000008424 #23	smpd2a (ENSNBRG00000008403)	tead3b (ENSNBRG00000008369)	ENSNBRG00000008303	ENSNBRG00000008293	ENSNBRG00000008273	rplp2 (ENSNBRG00000008259)	KCNA10 (ENSNBRG00000008239)	KCNA2 (ENSNBRG00000008222)	KCNA3 (ENSNBRG00000008205)	ngfb (ENSNBRG00000008188)	tspan2a (ENSNBRG00000008171)	slc25a55a (ENSNBRG00000008140)	tshba (ENSNBRG00000008075)	slc5a8l (ENSNBRG00000007929)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	17	ilrun (ENSONIG00000014754)	SPDEF (ENSONIG00000014752)	pacsin1b (ENSONIG00000014749)	rps10 (ENSONIG00000014744)	nudt3b (ENSONIG00000014742)	GRM4 (ENSONIG00000014738)	igfn1.1 (ENSONIG00000014736)	ENSONIG00000014732	ENSONIG00000031324	ENSONIG00000022671	SYT2 (ENSONIG00000029530)	mybphb (ENSONIG00000014722)	NAV1 (ENSONIG00000014720) #16	csrp1b (ENSONIG00000014714) #18	tnni1b (ENSONIG00000014712) ##20	ENSONIG00000014705 ##22	ENSONIG00000014703 #23	smpd2a (ENSONIG00000014702)	tead3b (ENSONIG00000014698)	ENSONIG00000014697	ENSONIG00000014695	ENSONIG00000033512	rplp2 (ENSONIG00000014692)	KCNA10 (ENSONIG00000037871)	KCNA2 (ENSONIG00000020980)	KCNA3 (ENSONIG00000020979)	ngfb (ENSONIG00000020978)	tspan2a (ENSONIG00000014689)	slc25a55a (ENSONIG00000014686)	tshba (ENSONIG00000024421)	slc5a8l (ENSONIG00000014680)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	867	snrpc (ENSACIG00000010867)	ilrun (ENSACIG00000010853)	SPDEF (ENSACIG00000010833)	pacsin1b (ENSACIG00000010810)	rps10 (ENSACIG00000010800)	nudt3b (ENSACIG00000010785)	GRM4 (ENSACIG00000010762)	ENSACIG00000010704	ENSACIG00000010651	ENSACIG00000010493	SYT2 (ENSACIG00000010463)	mybphb (ENSACIG00000010317)	NAV1 (ENSACIG00000010245) #16	csrp1b (ENSACIG00000010225) #18	tnni1b (ENSACIG00000010207) ##20	ENSACIG00000010133 ##22	ENSACIG00000010117 #23	smpd2a (ENSACIG00000010069)	tead3b (ENSACIG00000009716)	ENSACIG00000009656	ENSACIG00000009649	ENSACIG00000009643	ENSACIG00000009636	rplp2 (ENSACIG00000009622)	KCNA10 (ENSACIG00000009599)	KCNA2 (ENSACIG00000009587)	KCNA3 (ENSACIG00000009560)	ngfb (ENSACIG00000009543)	tspan2a (ENSACIG00000009520)	slc25a55a (ENSACIG00000009485)	tshba (ENSACIG00000009449)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c.f	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c.f	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00490000043415.k.b	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c.f	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	11	ilrun (ENSKMAG00000016339)	SPDEF (ENSKMAG00000016328)	pacsin1b (ENSKMAG00000016303)	rps10 (ENSKMAG00000016280)	nudt3b (ENSKMAG00000016261)	GRM4 (ENSKMAG00000016235)	ENSKMAG00000016195	ENSKMAG00000016152	ENSKMAG00000016084	ENSKMAG00000016052	SYT2 (ENSKMAG00000016008)	mybphb (ENSKMAG00000015946)	NAV1 (ENSKMAG00000015887) #16	csrp1b (ENSKMAG00000015872) #18	tnni1b (ENSKMAG00000015857) ##20	ENSKMAG00000015840 ##22	ENSKMAG00000015800 #23	smpd2a (ENSKMAG00000015753)	tead3b (ENSKMAG00000015659)	ENSKMAG00000015621	ADORA3 (ENSKMAG00000015595)	ENSKMAG00000015583	rplp2 (ENSKMAG00000015576)	KCNA10 (ENSKMAG00000015569)	KCNA2 (ENSKMAG00000015562)	KCNA3 (ENSKMAG00000015537)	ngfb (ENSKMAG00000015520)	tspan2a (ENSKMAG00000015495)	slc25a55a (ENSKMAG00000015465)	tshba (ENSKMAG00000015445)	slc5a8l (ENSKMAG00000015410)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1619	ENSNFUG00015012008	ENSNFUG00015012022	ENSNFUG00015012054	ENSNFUG00015012063	ENSNFUG00015012067	ENSNFUG00015012077	ENSNFUG00015012095	SYT2 (ENSNFUG00015012105)	ENSNFUG00015012117	MYBPHB (ENSNFUG00015012140)	NAV1 (ENSNFUG00015012296) #16	ENSNFUG00015012617	ENSNFUG00015012620	csrp1b (ENSNFUG00015012634) #18	tnni1b (ENSNFUG00015012645) ##20	ENSNFUG00015012657 ##22	PKP1B (ENSNFUG00015012667) #23	SMPD2 (ENSNFUG00015012700)	tead3b (ENSNFUG00015012808)	TULP1 (ENSNFUG00015012867)	CR847944.3 (ENSNFUG00015012873)	RPLP2 (ENSNFUG00015012879)	KCNA10 (ENSNFUG00015012889)	KCNA2 (ENSNFUG00015012896)	KCNA3 (ENSNFUG00015012907)	ngfb (ENSNFUG00015012914)	TSPAN2 (ENSNFUG00015012922)	slc25a55a (ENSNFUG00015012930)	tshba (ENSNFUG00015012950)	slc5a8l (ENSNFUG00015013015)	sycp1 (ENSNFUG00015013481)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.f	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c.f	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.f	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c.f	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Mummichog	MODERN SPECIES	2219	SPDEF (ENSFHEG00000016716)	pacsin1b (ENSFHEG00000016757)	rps10 (ENSFHEG00000016772)	nudt3b (ENSFHEG00000016797)	GRM4 (ENSFHEG00000016829)	ENSFHEG00000016931	ENSFHEG00000016955	ENSFHEG00000017091	ENSFHEG00000017103	SYT2 (ENSFHEG00000017200)	mybphb (ENSFHEG00000017210)	NAV1 (ENSFHEG00000017293) #16	ENSFHEG00000017309	csrp1b (ENSFHEG00000000435) #18	tnni1b (ENSFHEG00000017364) ##20	ENSFHEG00000017375 ##22	ENSFHEG00000017390 #23	smpd2a (ENSFHEG00000017395)	tead3b (ENSFHEG00000017537)	TULP1 (ENSFHEG00000017564)	ADORA3 (ENSFHEG00000017578)	ENSFHEG00000000445	rplp2 (ENSFHEG00000017602)	KCNA10 (ENSFHEG00000000447)	KCNA2 (ENSFHEG00000017631)	ngfb (ENSFHEG00000017645)	tspan2a (ENSFHEG00000017683)	slc25a55a (ENSFHEG00000017711)	tshba (ENSFHEG00000017718)	slc5a8l (ENSFHEG00000000456)	sycp1 (ENSFHEG00000017806)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	353	ilrun (ENSCVAG00000014325)	SPDEF (ENSCVAG00000014366)	pacsin1b (ENSCVAG00000014401)	rps10 (ENSCVAG00000014422)	nudt3b (ENSCVAG00000014455)	GRM4 (ENSCVAG00000014517)	ENSCVAG00000014626	ENSCVAG00000014957	ENSCVAG00000015086	ENSCVAG00000015096	SYT2 (ENSCVAG00000015118)	mybphb (ENSCVAG00000015134)	NAV1 (ENSCVAG00000015186) #16	csrp1b (ENSCVAG00000015201) #18	tnni1b (ENSCVAG00000015214) ##20	ENSCVAG00000015221 ##22	PKP1 (ENSCVAG00000015234) #23
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00490000043415.k.b	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.f	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c.f	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00490000043415.k.b	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000176218	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.f	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c.f	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00490000043415.k.b	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000176218	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.f	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c.f	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Sailfin molly	MODERN SPECIES	633														csrp1b (ENSPLAG00000014810) #18	tnni1b (ENSPLAG00000014830) ##20	ENSPLAG00000014932 ##22	ENSPLAG00000014940 #23	smpd2a (ENSPLAG00000014950)	tead3b (ENSPLAG00000014972)	ENSPLAG00000014987	ADORA3 (ENSPLAG00000015002)	ENSPLAG00000015025	rplp2 (ENSPLAG00000015037)	KCNA10 (ENSPLAG00000015047)	KCNA2 (ENSPLAG00000015062)	KCNA3 (ENSPLAG00000015074)	ngfb (ENSPLAG00000015077)	tspan2a (ENSPLAG00000015100)	slc25a55a (ENSPLAG00000015123)
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Guppy	MODERN SPECIES	457	snrpc (ENSPREG00000013017)	ilrun (ENSPREG00000013006)	SPDEF (ENSPREG00000012986)	pacsin1b (ENSPREG00000012958)	rps10 (ENSPREG00000012922)	nudt3b (ENSPREG00000012890)	GRM4 (ENSPREG00000012856)	ENSPREG00000012772	ENSPREG00000012733	ENSPREG00000012569	SYT2 (ENSPREG00000012505)	mybphb (ENSPREG00000012361)	NAV1 (ENSPREG00000012290) #16	csrp1b (ENSPREG00000012264) #18	tnni1b (ENSPREG00000012241) ##20	ENSPREG00000012219 ##22	PKP1 (ENSPREG00000012195) #23	smpd2a (ENSPREG00000012181)	tead3b (ENSPREG00000012159)	ENSPREG00000012151	ENSPREG00000012085	ADORA3 (ENSPREG00000012070)	ENSPREG00000012012	rplp2 (ENSPREG00000011980)	KCNA10 (ENSPREG00000011972)	KCNA2 (ENSPREG00000011945)	KCNA3 (ENSPREG00000011932)	ngfb (ENSPREG00000011920)	tspan2a (ENSPREG00000011900)	slc25a55a (ENSPREG00000011876)	tshba (ENSPREG00000011859)
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Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00390000013981.b	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.o.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00390000013981.b	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.o.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	34	pacsin1b (ENSLBEG00000023960)	rps10 (ENSLBEG00000023993)	nudt3b (ENSLBEG00000024017)	GRM4 (ENSLBEG00000024040)	igfn1.1 (ENSLBEG00000024087)	ENSLBEG00000024125	ENSLBEG00000024164	ENSLBEG00000024254	ENSLBEG00000024358	ENSLBEG00000024372	SYT2 (ENSLBEG00000024399)	mybphb (ENSLBEG00000024428)	NAV1 (ENSLBEG00000024475) #16	csrp1b (ENSLBEG00000024634) #18	tnni1b (ENSLBEG00000024764) ##20	ENSLBEG00000024791 ##22	ENSLBEG00000024852 #23	smpd2a (ENSLBEG00000024878)	tead3b (ENSLBEG00000024973)	ENSLBEG00000024995	ENSLBEG00000025011	ENSLBEG00000025024	rplp2 (ENSLBEG00000025032)	KCNA10 (ENSLBEG00000025052)	KCNA3 (ENSLBEG00000025065)	ngfb (ENSLBEG00000025079)	tspan2a (ENSLBEG00000025094)	slc25a55a (ENSLBEG00000025114)	tshba (ENSLBEG00000025145)	slc5a8l (ENSLBEG00000025179)	ENSLBEG00000025264
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00390000013981.b	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.o.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00390000013981.b	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.o.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	20	SPDEF (ENSSAUG00010026285)	pacsin1b (ENSSAUG00010026293)	rps10 (ENSSAUG00010026324)	nudt3b (ENSSAUG00010026327)	GRM4 (ENSSAUG00010026332)	igfn1.1 (ENSSAUG00010026345)	ENSSAUG00010026348	ENSSAUG00010026355	ENSSAUG00010026357	ENSSAUG00010026358	SYT2 (ENSSAUG00010026359)	mybphb (ENSSAUG00010026361)	NAV1 (ENSSAUG00010026401) #16	csrp1b (ENSSAUG00010026534) #18	tnni1b (ENSSAUG00010026535) ##20	ENSSAUG00010026537 ##22	ENSSAUG00010026540 #23	smpd2a (ENSSAUG00010026543)	tead3b (ENSSAUG00010026550)	ENSSAUG00010026554	ADORA3 (ENSSAUG00010026555)	ENSSAUG00010026556	rplp2 (ENSSAUG00010026557)	KCNA10 (ENSSAUG00010026558)	KCNA2 (ENSSAUG00010026559)	KCNA3 (ENSSAUG00010026561)	ngfb (ENSSAUG00010026563)	tspan2a (ENSSAUG00010026565)	slc25a55a (ENSSAUG00010026566)	TSHb (ENSSAUG00010026567)	slc5a8l (ENSSAUG00010026569)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00390000013981.b	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.p	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
European seabass	MODERN SPECIES	10	pacsin1b (ENSDLAG00005006128)	rps10 (ENSDLAG00005006104)	nudt3b (ENSDLAG00005006096)	ENSDLAG00005004899	ENSDLAG00005004718	ENSDLAG00005027867	ENSDLAG00005004587	ENSDLAG00005004437	ENSDLAG00005030077	ENSDLAG00005023606	mybphb (ENSDLAG00005023570)	ENSDLAG00005023560	ENSDLAG00005023257 #16	CSRP1 (ENSDLAG00005023237) #18	tnni1b (ENSDLAG00005023229) ##20	ENSDLAG00005030074 ##22	ENSDLAG00005023209 #23	ENSDLAG00005023191	tead3b (ENSDLAG00005023164)	ENSDLAG00005029494	ENSDLAG00005029712	ADORA1 (ENSDLAG00005033545)	RLA2 (ENSDLAG00005029038)	KCNA10 (ENSDLAG00005030482)	KCNA2 (ENSDLAG00005033935)	KCNA3 (ENSDLAG00005023131)	NGF (ENSDLAG00005033955)	tspan2a (ENSDLAG00005023119)	SLC25A22 (ENSDLAG00005033712)	TSHB (ENSDLAG00005034142)	slc5a8l (ENSDLAG00005022911)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	478	pacsin1b (ENSLCRG00005020820)	rps10 (ENSLCRG00005020747)	nudt3b (ENSLCRG00005020741)	GRM4 (ENSLCRG00005019967)	igfn1.1 (ENSLCRG00005019960)	ENSLCRG00005019958	ENSLCRG00005019945	ENSLCRG00005019937	ENSLCRG00005019931	ENSLCRG00005019920	SYT2 (ENSLCRG00005019919)	mybphb (ENSLCRG00005019916)	NAV1 (ENSLCRG00005019619) #16	csrp1b (ENSLCRG00005019571) #18	tnni1b (ENSLCRG00005019546) ##20	ENSLCRG00005019543 ##22	ENSLCRG00005019536 #23	smpd2a (ENSLCRG00005019534)	tead3b (ENSLCRG00005019514)	ENSLCRG00005019512	ENSLCRG00005019509	ENSLCRG00005019508	ENSLCRG00005019506	PANK4 (ENSLCRG00005019451)	draxina (ENSLCRG00005019449)	agtrap (ENSLCRG00005019447)	ENSLCRG00005019445	RNF207 (ENSLCRG00005019435)	RPL22 (ENSLCRG00005019417)	ENSLCRG00005010614	ARHGEF10L (ENSLCRG00005006871)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00390000013981.b	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.o.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00390000013981.b	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.p	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Lumpfish	MODERN SPECIES	20	pacsin1b (ENSCLMG00005017138)	rps10 (ENSCLMG00005017133)	nudt3b (ENSCLMG00005017132)	GRM4 (ENSCLMG00005017130)	igfn1.1 (ENSCLMG00005017129)	ENSCLMG00005017127	ENSCLMG00005017124	ENSCLMG00005017123	zgc:66479 (ENSCLMG00005017119)	ENSCLMG00005017117	SYT2 (ENSCLMG00005017115)	mybphb (ENSCLMG00005017109)	ENSCLMG00005017104 #16	csrp1b (ENSCLMG00005017095) #18	tnni1b (ENSCLMG00005017092) ##20	ENSCLMG00005017083 ##22	ENSCLMG00005017079 #23	smpd2a (ENSCLMG00005017078)	tead3b (ENSCLMG00005017074)	ENSCLMG00005017071	ADORA3 (ENSCLMG00005017069)	ENSCLMG00005017068	rplp2 (ENSCLMG00005017066)	KCNA10 (ENSCLMG00005017064)	KCNA2 (ENSCLMG00005017063)	ngfb (ENSCLMG00005017061)	tspan2a (ENSCLMG00005017059)	slc25a55a (ENSCLMG00005017000)	tshba (ENSCLMG00005016995)	slc5a8l (ENSCLMG00005016926)	ENSCLMG00005016918
Stickleback	MODERN SPECIES	17	ilrun (ENSGACG00000004904)	SPDEF (ENSGACG00000004912)	pacsin1b (ENSGACG00000004918)	rps10 (ENSGACG00000004926)	nudt3b (ENSGACG00000004941)	GRM4 (ENSGACG00000004954)	igfn1.1 (ENSGACG00000004985)	ENSGACG00000004994	ENSGACG00000005003	ENSGACG00000005005	SYT2 (ENSGACG00000005015)	mybphb (ENSGACG00000005023)	NAV1 (ENSGACG00000005034) #16	csrp1b (ENSGACG00000005056) #18	tnni1b (ENSGACG00000005095) ##20	ENSGACG00000005105 ##22	PKP1 (ENSGACG00000005123) #23	smpd2a (ENSGACG00000005132)	tead3b (ENSGACG00000005144)	ENSGACG00000005153	ADORA3 (ENSGACG00000005160)	ENSGACG00000005174	rplp2 (ENSGACG00000005189)	KCNA10 (ENSGACG00000005218)	KCNA2 (ENSGACG00000005222)	KCNA3 (ENSGACG00000005230)	ngfb (ENSGACG00000005234)	tspan2a (ENSGACG00000005236)	slc25a55a (ENSGACG00000005247)	tshba (ENSGACG00000005276)	slc5a8l (ENSGACG00000005284)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000178767	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.o.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Pike perch	MODERN SPECIES	17	pacsin1b (ENSSLUG00000024170)	rps10 (ENSSLUG00000024159)	nudt3b (ENSSLUG00000024156)	GRM4 (ENSSLUG00000024152)	igfn1.1 (ENSSLUG00000024147)	ENSSLUG00000024134	ENSSLUG00000024095	ENSSLUG00000024054	ENSSLUG00000024038	SYT2 (ENSSLUG00000024032)	mybphb (ENSSLUG00000024013)	ENSSLUG00000024004	NAV1 (ENSSLUG00000023954) #16	csrp1b (ENSSLUG00000023929) #18	tnni1b (ENSSLUG00000023922) ##20	ENSSLUG00000023907 ##22	PKP1 (ENSSLUG00000023901) #23	smpd2a (ENSSLUG00000023896)	tead3b (ENSSLUG00000023882)	ENSSLUG00000023814	ADORA3 (ENSSLUG00000023799)	ENSSLUG00000023793	rplp2 (ENSSLUG00000023787)	KCNA10 (ENSSLUG00000023783)	KCNA2 (ENSSLUG00000023779)	KCNA3 (ENSSLUG00000023774)	ngfb (ENSSLUG00000023769)	tspan2a (ENSSLUG00000023764)	slc25a55a (ENSSLUG00000023724)	tshba (ENSSLUG00000023711)	slc5a8l (ENSSLUG00000023703)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	19	pacsin1b (ENSCGOG00000001328)	rps10 (ENSCGOG00000001296)	nudt3b (ENSCGOG00000001261)	GRM4 (ENSCGOG00000000991)	igfn1.1 (ENSCGOG00000000956)	ENSCGOG00000000952	ENSCGOG00000000946	ENSCGOG00000000937	ENSCGOG00000000935	ENSCGOG00000000934	SYT2 (ENSCGOG00000000933)	mybphb (ENSCGOG00000000926)	NAV1 (ENSCGOG00000000826) #16	csrp1b (ENSCGOG00000000758) #18	tnni1b (ENSCGOG00000000746) ##20	ENSCGOG00000000737 ##22	ENSCGOG00000000734 #23	smpd2a (ENSCGOG00000000726)	tead3b (ENSCGOG00000000716)	ENSCGOG00000000681	ADORA3 (ENSCGOG00000000673)	ENSCGOG00000000671	rplp2 (ENSCGOG00000000667)	KCNA10 (ENSCGOG00000000663)	KCNA2 (ENSCGOG00000000659)	KCNA3 (ENSCGOG00000000655)	ngfb (ENSCGOG00000000652)	tspan2a (ENSCGOG00000000650)	slc25a55a (ENSCGOG00000000559)	tshba (ENSCGOG00000000527)	slc5a8l (ENSCGOG00000000478)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00390000013981.b	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.o.a	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00390000013981.b	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.o.a	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.o.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	57				ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00390000013981.b	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.o.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	106	ENSGT00390000003368	ENSGT00940000165906	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00550000074828.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.o.b	ENSGT00940000158771	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00390000009166	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00390000013981.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.b
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2953	slc16a1a (ENSSLDG00000008865)	ENSSLDG00000008911	slc5a8l (ENSSLDG00000009027)	tshba (ENSSLDG00000009097)	slc25a55a (ENSSLDG00000009107)	tspan2a (ENSSLDG00000009148)	ngfb (ENSSLDG00000009167)	KCNA3 (ENSSLDG00000009181)	KCNA2 (ENSSLDG00000009214)	KCNA10 (ENSSLDG00000009230)	rplp2 (ENSSLDG00000009252)	ENSSLDG00000009265	ENSSLDG00000009277	tead3b (ENSSLDG00000009368)	smpd2a (ENSSLDG00000009497)	ENSSLDG00000009568 ##22	ENSSLDG00000009659 #23	tnni1b (ENSSLDG00000009682) ##20	csrp1b (ENSSLDG00000009719) #18	ENSSLDG00000009753	NAV1 (ENSSLDG00000009784) #16	mybphb (ENSSLDG00000009887)	SYT2 (ENSSLDG00000010054)	ENSSLDG00000010091	ENSSLDG00000010106	ENSSLDG00000010166	ENSSLDG00000010416	ENSSLDG00000010527	ENSSLDG00000010757
Greater amberjack	MODERN SPECIES	25	ENSSDUG00000021616	sycp1 (ENSSDUG00000021624)	slc5a8l (ENSSDUG00000021639)	tshba (ENSSDUG00000021649)	slc25a55a (ENSSDUG00000021668)	tspan2a (ENSSDUG00000021674)	ngfb (ENSSDUG00000021688)	KCNA3 (ENSSDUG00000021692)	KCNA10 (ENSSDUG00000021695)	rplp2 (ENSSDUG00000021700)	ENSSDUG00000021703	ADORA3 (ENSSDUG00000021706)	ENSSDUG00000021715	tead3b (ENSSDUG00000021724)	smpd2a (ENSSDUG00000000098)	ENSSDUG00000000182 ##22	ENSSDUG00000000472 #23	NAV1 (ENSSDUG00000000535) #16	tnni1b (ENSSDUG00000000673) ##20	csrp1b (ENSSDUG00000000774) #18	ENSSDUG00000000802	mybphb (ENSSDUG00000000825)	SYT2 (ENSSDUG00000000839)	ENSSDUG00000000888	ENSSDUG00000000896	ENSSDUG00000000923	ENSSDUG00000001103	ENSSDUG00000001168	ENSSDUG00000001310
Barramundi perch	MODERN SPECIES	299			ENSLCAG00010005636	ENSLCAG00010005620	ENSLCAG00010005601	ENSLCAG00010005595	ENSLCAG00010005590	ENSLCAG00010005587	ENSLCAG00010005584	SYT2 (ENSLCAG00010005583)	mybphb (ENSLCAG00010005580)	ENSLCAG00010005577	csrp1b (ENSLCAG00010005572) #18	tnni1b (ENSLCAG00010005568) ##20	NAV1 (ENSLCAG00010005486) #16	ENSLCAG00010005464 ##22	ENSLCAG00010005460 #23	smpd2a (ENSLCAG00010005450)	tead3b (ENSLCAG00010005415)	ENSLCAG00010005404	ADORA3 (ENSLCAG00010005397)	ENSLCAG00010005395	rplp2 (ENSLCAG00010005389)	KCNA10 (ENSLCAG00010005387)	KCNA2 (ENSLCAG00010005382)	KCNA3 (ENSLCAG00010005381)	ngfb (ENSLCAG00010005378)	tspan2a (ENSLCAG00010005372)	slc25a55a (ENSLCAG00010005368)	tshba (ENSLCAG00010005364)	slc5a8l (ENSLCAG00010005353)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.o.a	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Tongue sole	MODERN SPECIES	2	yod1 (ENSCSEG00000016326)	ENSCSEG00000016313	ENSCSEG00000016301	igfn1.1 (ENSCSEG00000016287)	ENSCSEG00000016272	ENSCSEG00000016213	ENSCSEG00000016157	ENSCSEG00000016143	SYT2 (ENSCSEG00000016136)	mybphb (ENSCSEG00000016121)	NAV1 (ENSCSEG00000016086) #16	csrp1b (ENSCSEG00000016075) #18	KLHL10 (ENSCSEG00000016070)	KLHL10 (ENSCSEG00000016064)	tnni1b (ENSCSEG00000016059) ##20	ENSCSEG00000016050 ##22	PKP1 (ENSCSEG00000016044) #23	smpd2a (ENSCSEG00000016030)	tead3b (ENSCSEG00000015987)	ENSCSEG00000015977	ENSCSEG00000015974	rplp2 (ENSCSEG00000015968)	KCNA10 (ENSCSEG00000015517)	KCNA2 (ENSCSEG00000015513)	KCNA3 (ENSCSEG00000015506)	ngfb (ENSCSEG00000015499)	ENSCSEG00000015492	tspan2a (ENSCSEG00000015485)	slc25a55a (ENSCSEG00000015468)	ENSCSEG00000015458	ENSCSEG00000015455
Turbot	MODERN SPECIES	18	SPDEF (ENSSMAG00000008095)	pacsin1b (ENSSMAG00000008113)	nudt3b (ENSSMAG00000008184)	ENSSMAG00000008192	igfn1.1 (ENSSMAG00000008245)	ENSSMAG00000008370	ENSSMAG00000008481	ENSSMAG00000008517	ENSSMAG00000008636	ENSSMAG00000008642	mybphb (ENSSMAG00000008659)	ENSSMAG00000008943 #23	ENSSMAG00000032805	csrp1b (ENSSMAG00000008808) #18	tnni1b (ENSSMAG00000008824) ##20	ENSSMAG00000008926 ##22	ENSSMAG00000008963	tead3b (ENSSMAG00000008989)	ENSSMAG00000009166	ENSSMAG00000009183	ENSSMAG00000034864	rplp2 (ENSSMAG00000022743)	ENSSMAG00000009205	ngfb (ENSSMAG00000009233)	tspan2a (ENSSMAG00000009241)	slc25a55a (ENSSMAG00000009250)	tshba (ENSSMAG00000036345)	slc5a8l (ENSSMAG00000009288)	sycp1 (ENSSMAG00000009380)	slc16a1a (ENSSMAG00000009425)	TAFA3 (ENSSMAG00000009933)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.p	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	19	ilrun (ENSMAMG00000003871)	SPDEF (ENSMAMG00000003895)	pacsin1b (ENSMAMG00000003911)	rps10 (ENSMAMG00000003945)	nudt3b (ENSMAMG00000003977)	ENSMAMG00000003997	igfn1.1 (ENSMAMG00000004051)	ENSMAMG00000004123	ENSMAMG00000004257	ENSMAMG00000004418	ENSMAMG00000004441	mybphb (ENSMAMG00000004460)	ENSMAMG00000004474 #16	csrp1b (ENSMAMG00000004531) #18	tnni1b (ENSMAMG00000004575) ##20	ENSMAMG00000004593 ##22	ENSMAMG00000004698 #23	ENSMAMG00000004710	tead3b (ENSMAMG00000004744)	ENSMAMG00000004910	ENSMAMG00000026371	ENSMAMG00000025618	rplp2 (ENSMAMG00000004953)	ENSMAMG00000004976	ENSMAMG00000005030	ngfb (ENSMAMG00000005074)	tspan2a (ENSMAMG00000005086)	slc25a55a (ENSMAMG00000005110)	tshba (ENSMAMG00000005143)	slc5a8l (ENSMAMG00000005189)	ENSMAMG00000005204
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157549.a	ENSGT00950000182973.a.c.a.c	ENSGT00440000034918	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.p	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c.e	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	16	ENSBSLG00000015691	ENSBSLG00000015686	ENSBSLG00000015684	nudt3b (ENSBSLG00000015667)	GRM4 (ENSBSLG00000015615)	igfn1.1 (ENSBSLG00000015574)	ENSBSLG00000015544	ENSBSLG00000015486	ENSBSLG00000015446	ENSBSLG00000015409	SYT2 (ENSBSLG00000015394)	mybphb (ENSBSLG00000015262)	NAV1 (ENSBSLG00000014725) #16	csrp1b (ENSBSLG00000014634) #18	tnni1b (ENSBSLG00000014621) ##20	ENSBSLG00000014614 ##22	PKP1 (ENSBSLG00000014611) #23	smpd2a (ENSBSLG00000014593)	tead3b (ENSBSLG00000014537)	ENSBSLG00000014524	ADORA3 (ENSBSLG00000014516)	ENSBSLG00000014508	rplp2 (ENSBSLG00000014503)	KCNA10 (ENSBSLG00000014497)	KCNA2 (ENSBSLG00000014491)	KCNA3 (ENSBSLG00000014490)	ngfb (ENSBSLG00000014485)	tspan2a (ENSBSLG00000014465)	slc25a55a (ENSBSLG00000014415)	tshba (ENSBSLG00000014404)	slc5a8l (ENSBSLG00000014336)
Climbing perch	MODERN SPECIES	18	rps10 (ENSATEG00000029580)	nudt3b (ENSATEG00000025128)	ENSATEG00000025127	ENSATEG00000027622	ENSATEG00000025126	igfn1.1 (ENSATEG00000025125)	ENSATEG00000025124	ENSATEG00000025123	ENSATEG00000025122	ENSATEG00000025121	ENSATEG00000025120	mybphb (ENSATEG00000025119)	ENSATEG00000025118 #16	csrp1b (ENSATEG00000025117) #18	tnni1b (ENSATEG00000025116) ##20	ENSATEG00000025115 ##22	ENSATEG00000025114 #23	ENSATEG00000025113	tead3b (ENSATEG00000025112)	ENSATEG00000025111	ENSATEG00000025110	ENSATEG00000025109	rplp2 (ENSATEG00000025108)	ENSATEG00000025107	ENSATEG00000025105	ngfb (ENSATEG00000025104)	tspan2a (ENSATEG00000025103)	slc25a55a (ENSATEG00000025102)	tshba (ENSATEG00000025743)	slc5a8l (ENSATEG00000025100)	ENSATEG00000025099
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	19	pacsin1b (ENSMMDG00005001120)	rps10 (ENSMMDG00005001117)	nudt3b (ENSMMDG00005001114)	GRM4 (ENSMMDG00005001100)	igfn1.1 (ENSMMDG00005001096)	ENSMMDG00005001085	ENSMMDG00005001079	ENSMMDG00005001074	zgc:66479 (ENSMMDG00005001066)	ENSMMDG00005001064	SYT2 (ENSMMDG00005001062)	mybphb (ENSMMDG00005001055)	ENSMMDG00005001053	NAV1 (ENSMMDG00005001052) #16	csrp1b (ENSMMDG00005001050) #18	ENSMMDG00005001048 ##22	ENSMMDG00005001041 #23	smpd2a (ENSMMDG00005001033)	tead3b (ENSMMDG00005001028)	ENSMMDG00005001024	ADORA3 (ENSMMDG00005001020)	ENSMMDG00005001019	rplp2 (ENSMMDG00005001015)	KCNA10 (ENSMMDG00005001011)	KCNA2 (ENSMMDG00005001006)	KCNA3 (ENSMMDG00005001004)	ngfb (ENSMMDG00005001001)	tspan2a (ENSMMDG00005000997)	slc25a55a (ENSMMDG00005000987)	tshba (ENSMMDG00005000984)	slc5a8l (ENSMMDG00005000972)
Cod	MODERN SPECIES	4	nudt3b (ENSGMOG00000031793)	rps10 (ENSGMOG00000000113)	nudt3b (ENSGMOG00000026842)	ENSGMOG00000006162	ENSGMOG00000014887	ENSGMOG00000014926	ENSGMOG00000014978	ENSGMOG00000014996	ENSGMOG00000028656	ENSGMOG00000025882	mybphb (ENSGMOG00000015057)	ENSGMOG00000028764	ENSGMOG00000015079 #16	csrp1b (ENSGMOG00000015173) #18	tnni1b (ENSGMOG00000015185) ##20	ENSGMOG00000015197 ##22	ENSGMOG00000015210 #23	ENSGMOG00000028122	tead3b (ENSGMOG00000023663)	ENSGMOG00000015304	ENSGMOG00000036320	ENSGMOG00000033353	rplp2 (ENSGMOG00000015348)	ENSGMOG00000026097	ENSGMOG00000019917	ENSGMOG00000015379	ngfb (ENSGMOG00000029485)	ENSGMOG00000004987	ENSGMOG00000004997	ENSGMOG00000005004	EFCC1 (ENSGMOG00000030912)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00440000034918.g.a	ENSGT00940000157882	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b	ENSGT00940000160123.e.b.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.b	ENSGT00940000160123.e.b.a.a.a	ENSGT00390000013981.b	ENSGT00940000166065.a	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.a ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b.e.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	599									ENSGT00940000166065.a.a	ENSGT00940000157586.e.h	ENSGT00940000158040.d.a	ENSGT00940000156637.b.c #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c.a #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.a.c ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c.e #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a.i.a	ENSGT00940000158771.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.q	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b.e	ENSGT00550000074828.b.e.a.a	ENSGT00940000159534.f.a
Huchen	MODERN SPECIES	1213								ENSHHUG00000035244	SYT2 (ENSHHUG00000035224)	mybphb (ENSHHUG00000035171)	ENSHHUG00000035158 #16	ENSHHUG00000035154	ENSHHUG00000035112 #16	csrp1b (ENSHHUG00000035084) #18	tnni1b (ENSHHUG00000035061) ##20	ENSHHUG00000035050 ##22	PKP1 (ENSHHUG00000035044) #23	SMPD2 (ENSHHUG00000035033)	tead3b (ENSHHUG00000034921)	ENSHHUG00000034894	ADORA3 (ENSHHUG00000034878)	ENSHHUG00000034877	rplp2 (ENSHHUG00000034873)	KCNA10 (ENSHHUG00000034854)
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000158156.b.b.d	ENSGT00730000110997.j	ENSGT00490000043415.k.b.a	ENSGT00940000157549.a.b	ENSGT00950000182973.a.c.a.c.a	ENSGT00440000034918.g.a.b	ENSGT00940000157882.i.a	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b.h	ENSGT00940000166065.a.a	ENSGT00940000157586.e.h	ENSGT00940000158040.d.a	ENSGT00940000156637.b.c #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c.a #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.a.c ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c.e #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a.i.a	ENSGT00940000158771.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.q	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b.e	ENSGT00550000074828.b.e.a.a	ENSGT00550000074828.b.e.b.b	ENSGT00940000159534.f.a	ENSGT00940000158688.c.c.a	ENSGT00940000160210.d.b.a	ENSGT00390000007725.A.b.c.d	ENSGT00940000157504.c.b.c	ENSGT00940000164224.a.g	ENSGT00940000158152.a.a.c
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00550000074784.b.e.b.a.b	ENSGT00940000158156.b.b.d	ENSGT00730000110997.j	ENSGT00490000043415.k.b.a	ENSGT00940000157549.a.b	ENSGT00950000182973.a.c.a.c.a	ENSGT00440000034918.g.a.b	ENSGT00940000157882.i.a	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b.h	ENSGT00940000166065.a.a	ENSGT00940000157586.e.h	ENSGT00940000158040.d.a	ENSGT00940000156637.b.c #16	ENSGT00940000156777.c.a #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.a.c ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c.e #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a.i.a	ENSGT00940000158771.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.q	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b.e	ENSGT00550000074828.b.e.a.a	ENSGT00940000159534.f.a	ENSGT00940000158688.c.c.a	ENSGT00940000160210.d.b.a	ENSGT00390000007725.A.b.c.d	ENSGT00940000157504.c.b.c	ENSGT00940000164224.a.g	ENSGT00940000158152.a.a.c	ENSGT00940000165906.h
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	14	rps23 (ENSSSAG00000007090)	atp6ap1la (ENSSSAG00000074146)	RU1C (ENSSSAG00000074153)	ilrun (ENSSSAG00000007069)	SPDEF (ENSSSAG00000074163)	pacsin1b (ENSSSAG00000090207)	rps10 (ENSSSAG00000074172)	nudt3b (ENSSSAG00000084577)	ENSSSAG00000074204	ENSSSAG00000108666	ENSSSAG00000075099	mybphb (ENSSSAG00000075107)	NAV1 (ENSSSAG00000075240) #16	csrp1b (ENSSSAG00000102520) #18	tnni1b (ENSSSAG00000115603) ##20	ENSSSAG00000076994 ##22	PKP1 (ENSSSAG00000076999) #23	ENSSSAG00000077001	tead3b (ENSSSAG00000077012)	ENSSSAG00000109092	ENSSSAG00000106632	ENSSSAG00000117259	rplp2 (ENSSSAG00000107879)	KCNA10 (ENSSSAG00000077173)	ENSSSAG00000110717	KCNA3 (ENSSSAG00000089250)	ngfb (ENSSSAG00000089293)	tspan2a (ENSSSAG00000109688)	slc25a55a (ENSSSAG00000077193)	tshba (ENSSSAG00000050784)	slc5a8l (ENSSSAG00000050797)
River trout	MODERN SPECIES	7	atp6ap1la (ENSSTUG00000026331)	snrpc (ENSSTUG00000026313)	ilrun (ENSSTUG00000026291)	SPDEF (ENSSTUG00000026287)	pacsin1b (ENSSTUG00000026171)	rps10 (ENSSTUG00000026057)	nudt3b (ENSSTUG00000026003)	GRM4 (ENSSTUG00000025710)	ENSSTUG00000025681	ENSSTUG00000025641	SYT2 (ENSSTUG00000025631)	mybphb (ENSSTUG00000025361)	NAV1 (ENSSTUG00000021698) #16	csrp1b (ENSSTUG00000021573) #18	tnni1b (ENSSTUG00000021493) ##20	ENSSTUG00000021480 ##22	PKP1 (ENSSTUG00000021463) #23	smpd2a (ENSSTUG00000021445)	TEAD3 (ENSSTUG00000021317)	ENSSTUG00000021246	ADORA3 (ENSSTUG00000021200)	ENSSTUG00000021193	rplp2 (ENSSTUG00000021189)	ENSSTUG00000021185	KCNA10 (ENSSTUG00000021176)	KCNA2 (ENSSTUG00000021158)	ngfb (ENSSTUG00000021151)	tspan2a (ENSSTUG00000021138)	slc25a55a (ENSSTUG00000021094)	tshba (ENSSTUG00000021072)	slc5a8l (ENSSTUG00000020686)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158156.b.b.d	ENSGT00730000110997.j	ENSGT00490000043415.k.b.a	ENSGT00940000157549.a.b	ENSGT00950000182973.a.c.a.c.a	ENSGT00440000034918.g.a.b	ENSGT00940000157882.i.a	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b.h	ENSGT00940000166065.a.a	ENSGT00940000157586.e.h	ENSGT00940000158040.d.a	ENSGT00940000156637.b.c #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c.a #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.a.c ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c.e #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a.i.a	ENSGT00940000158771.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.q	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b.e	ENSGT00550000074828.b.e.a.a	ENSGT00550000074828.b.e.b.b	ENSGT00940000159534.f.a	ENSGT00940000158688.c.c.a	ENSGT00940000160210.d.b.a	ENSGT00390000007725.A.b.c.d	ENSGT00940000157504.c.b.c	ENSGT00940000164224.a.g	ENSGT00940000158152.a.a.c
Rainbow trout	MODERN SPECIES	28	ilrun (ENSOMYG00000030435)	SPDEF (ENSOMYG00000030457)	pacsin1b (ENSOMYG00000030525)	rps10 (ENSOMYG00000030562)	nudt3b (ENSOMYG00000030583)	ENSOMYG00000030638	ENSOMYG00000030686	ENSOMYG00000030692	ENSOMYG00000030699	ENSOMYG00000060994	mybphb (ENSOMYG00000030760)	NAV1 (ENSOMYG00000031075) #16	ENSOMYG00000059254	csrp1b (ENSOMYG00000032147) #18	tnni1b (ENSOMYG00000032167) ##20	ENSOMYG00000032181 ##22	PKP1 (ENSOMYG00000032188) #23	ENSOMYG00000072636	ENSOMYG00000032211	tead3b (ENSOMYG00000032250)	ENSOMYG00000059435	ENSOMYG00000052804	ENSOMYG00000032281	ENSOMYG00000032298	ENSOMYG00000032302	ENSOMYG00000032313	ENSOMYG00000032329	KCNA10 (ENSOMYG00000032335)	ENSOMYG00000032342	KCNA3 (ENSOMYG00000032348)	ngfb (ENSOMYG00000032361)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00550000074784.b.e.a	ENSGT00940000158156.b.b.d	ENSGT00730000110997.j	ENSGT00490000043415.k.b.a	ENSGT00940000157549.a.b	ENSGT00950000182973.a.c.a.c.a	ENSGT00440000034918.g.a.b	ENSGT00940000157882.i.a	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.b.h	ENSGT00940000166065.a.a	ENSGT00940000157586.e.h	ENSGT00940000158040.d.a	ENSGT00940000156637.b.c #16	ENSGT00940000156777.c.a #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.a.c ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c.e #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a.i.a	ENSGT00940000158771.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c.q	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b.e	ENSGT00550000074828.b.e.a.a	ENSGT00550000074828.b.e.b.b	ENSGT00940000159534.f.a	ENSGT00940000158688.c.c.a	ENSGT00940000160210.d.b.a	ENSGT00390000007725.A.b.c.d	ENSGT00940000157504.c.b.c	ENSGT00940000164224.a.g	ENSGT00940000158152.a.a.c
Chinook salmon	MODERN SPECIES	31	rps23 (ENSOTSG00005041547)	atp6ap1la (ENSOTSG00005041548)	snrpc (ENSOTSG00005041549)	ilrun (ENSOTSG00005041551)	SPDEF (ENSOTSG00005041552)	pacsin1b (ENSOTSG00005041553)	rps10 (ENSOTSG00005041555)	nudt3b (ENSOTSG00005041556)	GRM4 (ENSOTSG00005041557)	ENSOTSG00005041558	SYT2 (ENSOTSG00005041559)	mybphb (ENSOTSG00005041560)	NAV1 (ENSOTSG00005041561) #16	csrp1b (ENSOTSG00005041968) #18	tnni1b (ENSOTSG00005041969) ##20	ENSOTSG00005041971 ##22	PKP1 (ENSOTSG00005041973) #23	smpd2a (ENSOTSG00005041975)	tead3b (ENSOTSG00005041977)	ENSOTSG00005029629	ADORA3 (ENSOTSG00005029644)	ENSOTSG00005029660	rplp2 (ENSOTSG00005029661)	KCNA10 (ENSOTSG00005029663)	ENSOTSG00005029664	KCNA2 (ENSOTSG00005029665)	KCNA3 (ENSOTSG00005029666)	ngfb (ENSOTSG00005029667)	tspan2a (ENSOTSG00005029668)	slc25a55a (ENSOTSG00005029669)	tshba (ENSOTSG00005029697)
Coho salmon	MODERN SPECIES	25	ENSOKIG00005003379	atp6ap1la (ENSOKIG00005003393)	snrpc (ENSOKIG00005003398)	ilrun (ENSOKIG00005003404)	SPDEF (ENSOKIG00005003413)	pacsin1b (ENSOKIG00005003426)	rps10 (ENSOKIG00005003466)	nudt3b (ENSOKIG00005003491)	GRM4 (ENSOKIG00005003510)	ENSOKIG00005003545	SYT2 (ENSOKIG00005003554)	mybphb (ENSOKIG00005003578)	NAV1 (ENSOKIG00005003723) #16	csrp1b (ENSOKIG00005005410) #18	tnni1b (ENSOKIG00005005423) ##20	ENSOKIG00005005450 ##22	PKP1 (ENSOKIG00005005456) #23	smpd2a (ENSOKIG00005005468)	TEAD3 (ENSOKIG00005005515)	ENSOKIG00005005644	ADORA3 (ENSOKIG00005005688)	ENSOKIG00005005692	rplp2 (ENSOKIG00005005696)	ENSOKIG00005005699	KCNA10 (ENSOKIG00005005703)	KCNA2 (ENSOKIG00005005711)	KCNA3 (ENSOKIG00005005725)	ngfb (ENSOKIG00005005728)	tspan2a (ENSOKIG00005005735)	slc25a55a (ENSOKIG00005005760)	ENSOKIG00005005807
Northern pike	MODERN SPECIES	16	GRM4 (ENSELUG00000020642)	nudt3b (ENSELUG00000020596)	rps10 (ENSELUG00000020573)	pacsin1b (ENSELUG00000020536)	SPDEF (ENSELUG00000001273)	ilrun (ENSELUG00000020501)	ENSELUG00000031687	snrpc (ENSELUG00000020489)	ENSELUG00000020468	ENSELUG00000021134	SYT2 (ENSELUG00000021160)	mybphb (ENSELUG00000021224)	NAV1 (ENSELUG00000021348) #16	csrp1b (ENSELUG00000021388) #18	tnni1b (ENSELUG00000021412) ##20	ENSELUG00000021424 ##22	PKP1 (ENSELUG00000021481) #23	smpd2a (ENSELUG00000021534)	tead3b (ENSELUG00000021598)	b3galt6 (ENSELUG00000019507)	tmem167b (ENSELUG00000019528)	MAPK14 (ENSELUG00000019598)	cpne5b (ENSELUG00000019675)	KIF21B (ENSELUG00000019762) #28	ENSELUG00000030045	LHFPL5 (ENSELUG00000019788)	srpk1b (ENSELUG00000019820)	ENSELUG00000025399	ADORA1 (ENSELUG00000019846)	ENSELUG00000026400	CCDC66 (ENSELUG00000019898)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	10	ENSSFOG00015030537	ENSSFOG00015022611	ENSSFOG00015030251	SYT2 (ENSSFOG00015022645)	ENSSFOG00015032618	ENSSFOG00015028965	SYT2 (ENSSFOG00015031201)	ENSSFOG00015022684	ENSSFOG00015022653	ENSSFOG00015022740	MYBPH (ENSSFOG00015022754)	NAV1 (ENSSFOG00015022785) #16	csrp1a (ENSSFOG00015022832) #18	phlda3 (ENSSFOG00015022839) #19	ENSSFOG00015022857 ##20	ENSSFOG00015022863 ##22	PKP1 (ENSSFOG00015022873) #23	smpd2a (ENSSFOG00015022890)	TEAD3 (ENSSFOG00015022910)	TULP1 (ENSSFOG00015022949)	ENSSFOG00015022960	ENSSFOG00015022963	dclre1b (ENSSFOG00015022972)	ENSSFOG00015022987	LGR6 (ENSSFOG00015023007)	ube2t (ENSSFOG00015023023)	ENSSFOG00015025741	zgc:194242 (ENSSFOG00015024222)	etv7 (ENSSFOG00015023048)	ENSSFOG00015023054	KCNA10 (ENSSFOG00015003292)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	62	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000166065.b	ENSGT00940000157586.f	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT01010000223242	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a ##20	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000160828	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688	ENSGT00940000160210.d.b
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	90	ENSGT00940000157882	ENSGT00940000157392.p	ENSGT00410000025882.b	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.a	ENSGT00940000160123.e.a	ENSGT00390000013981	ENSGT00940000166065.b	ENSGT00940000157586.f	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000160828	ENSGT00940000163467.a.b.b.a.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c	ENSGT00940000160210.d.b
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	157	ENSGT00940000157392.p	ENSGT00410000025882.b	ENSGT00940000167932	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.a.f.a	ENSGT00940000160123.e.a	ENSGT00390000013981	ENSGT00940000166065.b	ENSGT00940000157586.f	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.a.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00390000009166.a	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000155662.f	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	224	ENSGT00940000165387.b	ENSGT00950000182932.C.a	ENSGT00940000160725	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00940000156230.o	ENSGT00390000003422	ENSGT00940000157586.e	ENSGT00940000158040.d	ENSGT00940000156637.b #16	ENSGT00940000156777.c #18	ENSGT01030000234588.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.a ##22	ENSGT00940000156735.c #23	ENSGT00390000009166.b	ENSGT01030000234588.a.a.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00390000009166.a	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b.c	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c	ENSGT00940000160210.d.b
Atlantic herring	MODERN SPECIES	20	ENSCHAG00000026079	ngfa (ENSCHAG00000026081)	rab1ab (ENSCHAG00000026087)	KCNA3 (ENSCHAG00000026091)	KCNA10 (ENSCHAG00000026098)	ENSCHAG00000000702	etv7 (ENSCHAG00000001036)	zgc:194242 (ENSCHAG00000001069)	ENSCHAG00000001088	ube2t (ENSCHAG00000001110)	LGR6 (ENSCHAG00000001142)	ENSCHAG00000001181	ENSCHAG00000001195	ENSCHAG00000001237	TEAD3 (ENSCHAG00000001518)	tnnt2a (ENSCHAG00000001562) ##22	NAV1 (ENSCHAG00000001738) #16	mybpha (ENSCHAG00000005301)	ENSCHAG00000005698	ENSCHAG00000005721	ENSCHAG00000005745	SYT2 (ENSCHAG00000005753)	ENSCHAG00000005820	ENSCHAG00000005848	ENSCHAG00000005879	GRM4 (ENSCHAG00000006184)	ENSCHAG00000006521	SMIM29 (ENSCHAG00000006534)	ENSCHAG00000006563	nudt3a (ENSCHAG00000006577)	rps10 (ENSCHAG00000006608)
Denticle herring	MODERN SPECIES	1	ENSDCDG00000019865	atp2b3b (ENSDCDG00000018838)	ENSDCDG00000018773	emd (ENSDCDG00000018765)	FLNA (ENSDCDG00000018366)	rpl10 (ENSDCDG00000018336)	ENSDCDG00000018325	dnase1l1 (ENSDCDG00000018302)	dnaaf4 (ENSDCDG00000018281)	ENSDCDG00000018261	UQCC5 (ENSDCDG00000018257)	kctd6b (ENSDCDG00000018255)	slmapb (ENSDCDG00000018249)	DNAH12 (ENSDCDG00000018209)	ENSDCDG00000018197 ##20	tnnt2a (ENSDCDG00000018185) ##22	ENSDCDG00000018087 #23	smpd2a (ENSDCDG00000018082)	TEAD3 (ENSDCDG00000017900)	ENSDCDG00000017895	ADORA3 (ENSDCDG00000017893)	ENSDCDG00000017892	LGR6 (ENSDCDG00000017890)	ube2t (ENSDCDG00000017888)	zgc:194242 (ENSDCDG00000017886)	etv7 (ENSDCDG00000017877)	ENSDCDG00000017874	KCNA10 (ENSDCDG00000017870)	kcna2b (ENSDCDG00000017867)	KCNA3 (ENSDCDG00000017864)	ngfa (ENSDCDG00000017860)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	190							ENSGT00940000166065.b	ENSGT00940000157586.f	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.a.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00390000009166.a	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000155662.f	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156037.b	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00390000001787	ENSGT00980000202953	ENSGT00940000156490.b.a	ENSGT00940000166065.b	ENSGT00940000157586.f	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.a.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000155662.f	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b	ENSGT00940000158152.a.b	ENSGT00940000167901
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	168																ENSGT00940000154709.a.b.a.b.a ##22	ENSGT00940000156735.d.a #23	ENSGT00390000009166.a.b	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a.a.a	ENSGT00940000158771.h	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b.a	ENSGT00940000159939.e	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211.e	ENSGT00940000155662.f.b	ENSGT00940000159534.e.a	ENSGT00940000158688.d.b.b	ENSGT00940000160210.d.a.c	ENSGT00390000007725.A.b.d.b	ENSGT00940000157504.c.a.b
Goldfish	MODERN SPECIES	2599	ENSCARG00000052928	ENSCARG00000052918	baz2a (ENSCARG00000052773)	ENSCARG00000052725	mipb (ENSCARG00000052705)	rbm38 (ENSCARG00000052687)	bmp7b (ENSCARG00000052667)	ENSCARG00000052658	SYT2 (ENSCARG00000052639)	ENSCARG00000052625	ENSCARG00000052565	NAV1 (ENSCARG00000050622) #16	csrp1a (ENSCARG00000050487) #18	phlda3 (ENSCARG00000050464) #19	ENSCARG00000050411 ##20	tnnt2a (ENSCARG00000050382) ##22	PKP1 (ENSCARG00000050334) #23	smpd2a (ENSCARG00000050220)	TEAD3 (ENSCARG00000050026)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	252			ENSGT00390000014570.b.c.a	ENSGT00940000154256.ac.b	ENSGT00940000159490.d	ENSGT00940000156037.b.b	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000156245.b.b	ENSGT00940000156490.b.a.a	ENSGT00940000157586.f.e	ENSGT00940000165428.c.a.f	ENSGT00940000156637.a.b #16	ENSGT00940000156777.d.b #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.a.a.b.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b.a ##22	ENSGT00940000156735.d.a #23	ENSGT00390000009166.a.b	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a.a.a.b	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a.a.b	ENSGT00940000158771.h.b	ENSGT00940000155067.b.b.b	ENSGT00940000159939.f	ENSGT00940000157365	ENSGT00990000210392	ENSGT00940000162211.f	ENSGT00940000155662.f.a	ENSGT00940000159534.e.b	ENSGT00940000158688.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d.a	ENSGT00940000157504.c.a.a
Common carp reference	MODERN SPECIES	11	p4htma (ENSCCRG00000016906)	ptges3b (ENSCCRG00000033021)	baz2a (ENSCCRG00000023984)	ENSCCRG00000062859	mipb (ENSCCRG00000060982)	ENSCCRG00000062503	ENSCCRG00000068590	bmp7b (ENSCCRG00000058050)	ENSCCRG00000061035	ENSCCRG00000075955	ENSCCRG00000045792	NAV1 (ENSCCRG00000080293) #16	csrp1a (ENSCCRG00000074776) #18	phlda3 (ENSCCRG00000065304) #19	ENSCCRG00000073583 ##20	tnnt2a (ENSCCRG00000021079) ##22	PKP1 (ENSCCRG00000055680) #23	smpd2a (ENSCCRG00000043661)	ENSCCRG00000039281	ENSCCRG00000028001	ENSCCRG00000054877	ENSCCRG00000018728	ube2t (ENSCCRG00000015001)	etv7 (ENSCCRG00000014997)	ENSCCRG00000019309	KCNA10 (ENSCCRG00000067494)	ENSCCRG00000067613	KCNA3 (ENSCCRG00000061809)	ENSCCRG00000060195	NGF (ENSCCRG00000042681)	ENSCCRG00000026493
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	244	ENSSGRG00000003720	arhgap11a (ENSSGRG00000001791)	EIF2AK4 (ENSSGRG00000001330)	ENSSGRG00000001243	bmf1 (ENSSGRG00000001233)	cyp1c1 (ENSSGRG00000001213)	cyp1c2 (ENSSGRG00000001206)	gchfr (ENSSGRG00000001172)	ENSSGRG00000001149	SYT2 (ENSSGRG00000001129)	mybpha (ENSSGRG00000048923)	NAV1 (ENSSGRG00000048904) #16	csrp1a (ENSSGRG00000048903) #18	phlda3 (ENSSGRG00000048902) #19	ENSSGRG00000048901 ##20	tnnt2a (ENSSGRG00000048874) ##22	ENSSGRG00000048871 #23	smpd2a (ENSSGRG00000048870)	TEAD3 (ENSSGRG00000048634)	ENSSGRG00000048568	ENSSGRG00000048566	LGR6 (ENSSGRG00000048565)	ube2t (ENSSGRG00000048564)	ENSSGRG00000048563	etv7 (ENSSGRG00000048561)	ENSSGRG00000048560	KCNA10 (ENSSGRG00000048559)	kcna2b (ENSSGRG00000048558)	KCNA3 (ENSSGRG00000048557)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	444	ENSGT00940000156260.c	ENSGT00940000158489.a.a	ENSGT00390000001787	ENSGT00980000202953	ENSGT00940000156490.b.a.b	ENSGT00940000166065.b.a	ENSGT00940000157586.f.f	ENSGT00940000165428.c.a.e	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a.a #16	ENSGT00940000156777.d.a #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.a.a.a.b.a ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b.b ##22	ENSGT00940000156735.d.b #23	ENSGT00390000009166.a.a	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a.a.b
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	79	ENSGT00940000154256.ac.a	ENSGT00940000159490.c	ENSGT00940000156037.b.a	ENSGT00940000156245.b.a	ENSGT00390000001787	ENSGT00980000202953	ENSGT00940000156490.b.a.b	ENSGT00940000166065.b.a	ENSGT00940000157586.f.f	ENSGT00940000165428.c.a.e	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a.a #16	ENSGT00940000156777.d.a #18	ENSGT01030000234588.a.a.a.b.a ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b.b ##22	ENSGT00940000156735.d.b #23	ENSGT00390000009166.a.a	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a.a.a.a	ENSGT00940000158771.h.a	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b.a	ENSGT00940000159939.e	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211.e	ENSGT00940000155662.f.b	ENSGT00940000159534.e.a	ENSGT00940000158688.d.b.b	ENSGT00940000160210.d.a.c	ENSGT00390000007725.A.b.d.b	ENSGT00940000157504.c.a.b
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	674												ENSSGRG00000003960	csrp1a (ENSSGRG00000003810) #18	phlda3 (ENSSGRG00000003798) #19	ENSSGRG00000003797 ##20	tnnt2a (ENSSGRG00000003788) ##22	PKP1 (ENSSGRG00000003776) #23	smpd2a (ENSSGRG00000003716)	TEAD3 (ENSSGRG00000003702)	ENSSGRG00000003696	ADORA3 (ENSSGRG00000003692)	ENSSGRG00000003689	LGR6 (ENSSGRG00000003685)	ENSSGRG00000003682	zgc:194242 (ENSSGRG00000003680)	etv7 (ENSSGRG00000003678)	ENSSGRG00000003675	KCNA10 (ENSSGRG00000003672)
Common carp reference	MODERN SPECIES	49	ENSCCRG00000066721	mipb (ENSCCRG00000034271)	ENSCCRG00000033001	spo11 (ENSCCRG00000032997)	ENSCCRG00000082599	bmp7b (ENSCCRG00000032992)	ENSCCRG00000064226	ENSCCRG00000043377	ENSCCRG00000049998	mybpha (ENSCCRG00000027337)	NAV1 (ENSCCRG00000020440) #16	csrp1a (ENSCCRG00000016243) #18	phlda3 (ENSCCRG00000069865) #19	ENSCCRG00000055856 ##20	lad1 (ENSCCRG00000070756)	tnnt2a (ENSCCRG00000016222) ##22	ENSCCRG00000012316 #23	smpd2a (ENSCCRG00000005650)	ENSCCRG00000005670	ENSCCRG00000005678	ENSCCRG00000015724	ENSCCRG00000015722	ENSCCRG00000082709	zgc:194242 (ENSCCRG00000019284)	etv7 (ENSCCRG00000010653)	ENSCCRG00000010656	KCNA10 (ENSCCRG00000060935)	ENSCCRG00000056428	KCNA3 (ENSCCRG00000054021)	ENSCCRG00000030071	ENSCCRG00000070731
Goldfish	MODERN SPECIES	15	ENSCARG00000016556	ptges3b (ENSCARG00000016543)	baz2a (ENSCARG00000016456)	mipb (ENSCARG00000016436)	rbm38 (ENSCARG00000016431)	spo11 (ENSCARG00000016377)	bmp7b (ENSCARG00000016336)	ENSCARG00000016314	SYT2 (ENSCARG00000016303)	ENSCARG00000016244	mybpha (ENSCARG00000015946)	NAV1 (ENSCARG00000015794) #16	csrp1a (ENSCARG00000015751) #18	phlda3 (ENSCARG00000015745) #19	ENSCARG00000015709 ##20	tnnt2a (ENSCARG00000015698) ##22	PKP1 (ENSCARG00000015689) #23	smpd2a (ENSCARG00000015656)	TEAD3 (ENSCARG00000015267)	ENSCARG00000015239	ENSCARG00000015226	ENSCARG00000015219	LGR6 (ENSCARG00000015202)	ube2t (ENSCARG00000015185)	zgc:194242 (ENSCARG00000015163)	etv7 (ENSCARG00000015136)	ENSCARG00000015130	KCNA10 (ENSCARG00000015119)	kcna2b (ENSCARG00000015104)	ENSCARG00000015093	KCNA3 (ENSCARG00000015082)
Zebrafish	MODERN SPECIES	15	ENSDARG00000103927	mipb (ENSDARG00000013963)	rbm38 (ENSDARG00000058818)	spo11 (ENSDARG00000013837)	bmp7b (ENSDARG00000063230)	ENSDARG00000117155	SYT2 (ENSDARG00000025206)	ENSDARG00000071261	mybpha (ENSDARG00000058799)	NAV1 (ENSDARG00000078011) #16	csrp1a (ENSDARG00000006603) #18	phlda3 (ENSDARG00000037804) #19	ENSDARG00000074360	ENSDARG00000000474 ##20	lad1 (ENSDARG00000022698)	tnnt2a (ENSDARG00000020610) ##22	ENSDARG00000090598 #23	smpd2a (ENSDARG00000040523)	TEAD3 (ENSDARG00000074321)	ENSDARG00000075295	zgc:194242 (ENSDARG00000079532)	ube2t (ENSDARG00000063285)	etv7 (ENSDARG00000089434)	kcna2b (ENSDARG00000102064)	ngfa (ENSDARG00000058961)	tafazzin (ENSDARG00000041421)	atp6ap1a (ENSDARG00000041417)	tnnc1a (ENSDARG00000011400)	slc6a1a (ENSDARG00000045944)	VGLL4 (ENSDARG00000094332)	syn2a (ENSDARG00000045945)
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22
Electric eel	MODERN SPECIES	261												arhgap25 (ENSEEEG00000023672)	bmp10 (ENSEEEG00000023675)	ENSEEEG00000023677	ERLIN2 (ENSEEEG00000023680)	tnnt2a (ENSEEEG00000023714) ##22	ENSEEEG00000023715	atp6ap1b (ENSEEEG00000023716)	ENSEEEG00000023728	ccn5 (ENSEEEG00000023783)	ada (ENSEEEG00000023790)	ENSEEEG00000023800	ttpal (ENSEEEG00000023801)	hnf4a (ENSEEEG00000023803)	R3HDML (ENSEEEG00000023806)	fitm2 (ENSEEEG00000023807)	ENSEEEG00000023808	rbms2b (ENSEEEG00000023809)	LRP1 (ENSEEEG00000023828)	ENSEEEG00000023910	fmnl3 (ENSEEEG00000023915)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	146										ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000160828	ENSGT00940000163467.a.b.b.a.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.c	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.c	ENSGT00940000160210.d.b
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000155662.f	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00980000201100	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000155662.f	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	21	tmem51a (ENSMMDG00005005746)	ENSMMDG00005005800	ela2l (ENSMMDG00005006129)	ela2 (ENSMMDG00005006139)	ENSMMDG00005006851	ebp (ENSMMDG00005007053)	ENSMMDG00005007058	apobec2b (ENSMMDG00005007061)	ENSMMDG00005007064	ENSMMDG00005007069	mybpha (ENSMMDG00005007074)	NAV1 (ENSMMDG00005007086) #16	csrp1a (ENSMMDG00005007267) #18	phlda3 (ENSMMDG00005007268) #19	ENSMMDG00005007270 ##20	tnnt2a (ENSMMDG00005007275) ##22	PKP1 (ENSMMDG00005007364) #23	TEAD3 (ENSMMDG00005007365)	ENSMMDG00005000152	LGR6 (ENSMMDG00005000168)	ube2t (ENSMMDG00005000190)	zgc:194242 (ENSMMDG00005000209)	etv7 (ENSMMDG00005000220)	ENSMMDG00005000230	ENSMMDG00005000241	KCNA10 (ENSMMDG00005000258)	kcna2b (ENSMMDG00005000262)	KCNA3 (ENSMMDG00005000303)	ngfa (ENSMMDG00005000308)	ENSMMDG00005000314	slc25a55b (ENSMMDG00005000326)
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00980000201100	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000155662.f	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	404	ENSHCOG00000002791	tmem82 (ENSHCOG00000002778)	ENSHCOG00000002764	mad2l2 (ENSHCOG00000002752)	ENSHCOG00000002741	ENSHCOG00000002734	ebp (ENSHCOG00000002727)	ccdc115 (ENSHCOG00000002719)	apobec2b (ENSHCOG00000002712)	ENSHCOG00000002700	mybpha (ENSHCOG00000002677)	NAV1 (ENSHCOG00000002589) #16	csrp1a (ENSHCOG00000002560) #18	phlda3 (ENSHCOG00000002548) #19	ENSHCOG00000002539 ##20	tnnt2a (ENSHCOG00000002529) ##22	PKP1 (ENSHCOG00000002507) #23	TEAD3 (ENSHCOG00000002497)	ENSHCOG00000002485	LGR6 (ENSHCOG00000002470)	ube2t (ENSHCOG00000002427)	ENSHCOG00000002421	KCNA10 (ENSHCOG00000000574)	kcna2b (ENSHCOG00000002400)	KCNA3 (ENSHCOG00000002388)	ngfa (ENSHCOG00000002384)	ENSHCOG00000002375	slc25a55b (ENSHCOG00000002363)	ENSHCOG00000002346	uba1 (ENSHCOG00000002312)	arhgef3l (ENSHCOG00000002263)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00980000201100	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b.d	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b.d	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b.d	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b.d	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
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Sailfin molly	MODERN SPECIES	199					WNT2B (ENSPLAG00000002097)	ENSPLAG00000002092	ebp (ENSPLAG00000002090)	ccdc115 (ENSPLAG00000002084)	apobec2b (ENSPLAG00000002074)	ENSPLAG00000002061	mybpha (ENSPLAG00000002030)	NAV1 (ENSPLAG00000001948) #16	csrp1a (ENSPLAG00000001930) #18	phlda3 (ENSPLAG00000001921) #19	ENSPLAG00000001914 ##20	tnnt2a (ENSPLAG00000001896) ##22	ENSPLAG00000001884 #23	TEAD3 (ENSPLAG00000001870)	ENSPLAG00000001847	LGR6 (ENSPLAG00000001836)	ube2t (ENSPLAG00000001813)	zgc:194242 (ENSPLAG00000001800)	ENSPLAG00000001797	ENSPLAG00000001791	KCNA10 (ENSPLAG00000001784)	kcna2b (ENSPLAG00000001777)
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Guppy	MODERN SPECIES	459	zgc:174906 (ENSPREG00000020167)	tafa3b (ENSPREG00000020139)	ENSPREG00000020122	mov10b.1 (ENSPREG00000020106)	wnt2bb (ENSPREG00000020095)	ENSPREG00000020087	ebp (ENSPREG00000020071)	ccdc115 (ENSPREG00000020064)	apobec2b (ENSPREG00000020060)	ENSPREG00000020034	mybpha (ENSPREG00000020009)	NAV1 (ENSPREG00000019950) #16	csrp1a (ENSPREG00000019919) #18	phlda3 (ENSPREG00000019915) #19	ENSPREG00000019893 ##20	tnnt2a (ENSPREG00000019877) ##22	PKP1 (ENSPREG00000019858) #23	TEAD3 (ENSPREG00000019842)	ENSPREG00000019834	ENSPREG00000019827	ENSPREG00000019817	LGR6 (ENSPREG00000019790)	zgc:194242 (ENSPREG00000019758)	etv7 (ENSPREG00000019735)	ENSPREG00000019726	KCNA10 (ENSPREG00000019718)	kcna2b (ENSPREG00000019713)	KCNA3 (ENSPREG00000019707)	ngfa (ENSPREG00000019684)	ENSPREG00000019654	ENSPREG00000019628
Platyfish	MODERN SPECIES		ENSXMAG00000025267	tafa3b (ENSXMAG00000021478)	ENSXMAG00000019368	mov10b.1 (ENSXMAG00000024782)	wnt2bb (ENSXMAG00000008113)	ENSXMAG00000008129	ebp (ENSXMAG00000008130)	ccdc115 (ENSXMAG00000008131)	apobec2b (ENSXMAG00000008134)	ENSXMAG00000008141	mybpha (ENSXMAG00000008144)	NAV1 (ENSXMAG00000008152) #16	csrp1a (ENSXMAG00000008165) #18	phlda3 (ENSXMAG00000019456) #19	ENSXMAG00000008174 ##20	tnnt2a (ENSXMAG00000008178) ##22	PKP1 (ENSXMAG00000008184) #23	TEAD3 (ENSXMAG00000008189)	ADORA3 (ENSXMAG00000022918)	ENSXMAG00000008205	LGR6 (ENSXMAG00000026538)	ube2t (ENSXMAG00000008235)	zgc:194242 (ENSXMAG00000008239)	etv7 (ENSXMAG00000008241)	ENSXMAG00000027066	KCNA10 (ENSXMAG00000019458)	kcna2b (ENSXMAG00000019460)	KCNA3 (ENSXMAG00000019464)	ngfa (ENSXMAG00000027286)	ENSXMAG00000026349	slc25a55b (ENSXMAG00000008253)
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Mummichog	MODERN SPECIES	252	ENSFHEG00000005408	ENSFHEG00000005425	ENSFHEG00000005435	WNT2B (ENSFHEG00000005451)	ENSFHEG00000005457	ENSFHEG00000005462	ebp (ENSFHEG00000005469)	ccdc115 (ENSFHEG00000005475)	apobec2b (ENSFHEG00000005492)	ENSFHEG00000005523	mybpha (ENSFHEG00000005550)	NAV1 (ENSFHEG00000005605) #16	csrp1a (ENSFHEG00000005645) #18	phlda3 (ENSFHEG00000005663) #19	ENSFHEG00000005670 ##20	tnnt2a (ENSFHEG00000005802) ##22	PKP1 (ENSFHEG00000005831) #23	TEAD3 (ENSFHEG00000005865)	ENSFHEG00000005872	ENSFHEG00000005878	LGR6 (ENSFHEG00000005898)	ube2t (ENSFHEG00000005943)	zgc:194242 (ENSFHEG00000005954)	ENSFHEG00000000162	ENSFHEG00000005972	KCNA10 (ENSFHEG00000005987)	kcna2b (ENSFHEG00000006017)	KCNA3 (ENSFHEG00000006023)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1171														ENSCVAG00000015275 #18	ENSCVAG00000015260 ##20	tnnt2a (ENSCVAG00000015253) ##22	ENSCVAG00000015218 #23	TEAD3 (ENSCVAG00000015212)	ENSCVAG00000015193	LGR6 (ENSCVAG00000015180)	ube2t (ENSCVAG00000015148)	zgc:194242 (ENSCVAG00000015131)	ENSCVAG00000015123	ENSCVAG00000015107
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b.d	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000155662.f	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	32	zgc:174906 (ENSKMAG00000020786)	tafa3b (ENSKMAG00000020773)	ENSKMAG00000020750	MOV10 (ENSKMAG00000020712)	WNT2B (ENSKMAG00000020684)	ebp (ENSKMAG00000020660)	ENSKMAG00000020646	ENSKMAG00000020637	apobec2b (ENSKMAG00000020631)	ENSKMAG00000020605	mybpha (ENSKMAG00000020591)	NAV1 (ENSKMAG00000020493) #16	csrp1a (ENSKMAG00000020434) #18	phlda3 (ENSKMAG00000020415) #19	ENSKMAG00000020388 ##20	tnnt2a (ENSKMAG00000020366) ##22	PKP1 (ENSKMAG00000020344) #23	TEAD3 (ENSKMAG00000020323)	ENSKMAG00000020307	LGR6 (ENSKMAG00000020288)	ube2t (ENSKMAG00000020271)	zgc:194242 (ENSKMAG00000020260)	etv7 (ENSKMAG00000020242)	ENSKMAG00000020227	KCNA10 (ENSKMAG00000020211)	kcna2b (ENSKMAG00000020202)	KCNA3 (ENSKMAG00000020195)	ngfa (ENSKMAG00000020180)	ENSKMAG00000020161	slc25a55b (ENSKMAG00000020135)	TSHB (ENSKMAG00000020124)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1624	MOV10 (ENSNFUG00015017875)	ENSNFUG00015018189	ENSNFUG00015018195	EBP (ENSNFUG00015018200)	CCDC115 (ENSNFUG00015018203)	Nfu_g_1_010288 (ENSNFUG00015018208)	apobec2b (ENSNFUG00015018212)	ENSNFUG00015018220	ENSNFUG00015018233	mybpha (ENSNFUG00015018236)	NAV1 (ENSNFUG00015018250) #16	ENSNFUG00015018268	CSRP1A (ENSNFUG00015018271) #18	phlda3 (ENSNFUG00015004777) #19	ENSNFUG00015004801 ##20	tnnt2a (ENSNFUG00015004855) ##22	PKP1 (ENSNFUG00015004884) #23	TEAD3 (ENSNFUG00015004924)	ENSNFUG00015004986	ENSNFUG00015004997	LGR6 (ENSNFUG00015005033)	ube2t (ENSNFUG00015005236)	OLA.12299 (ENSNFUG00015005250)	etv7 (ENSNFUG00015005258)	ENSNFUG00015005279	ENSNFUG00015005289	KCNA10 (ENSNFUG00015005298)	KCNA3 (ENSNFUG00015005325)	ENSNFUG00015005330	ngfa (ENSNFUG00015005335)	ENSNFUG00015005407
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b	ENSGT00940000176091
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b	ENSGT00940000158152.a.b
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	21	ENSOJAG00000018604	mov10b.1 (ENSOJAG00000018636)	ENSOJAG00000018819	wnt2bb (ENSOJAG00000018835)	ebp (ENSOJAG00000018874)	ccdc115 (ENSOJAG00000018893)	ENSOJAG00000018899	ENSOJAG00000018909	apobec2b (ENSOJAG00000018922)	ENSOJAG00000018929	mybpha (ENSOJAG00000018941)	NAV1 (ENSOJAG00000019010) #16	csrp1a (ENSOJAG00000019379) #18	phlda3 (ENSOJAG00000019415) #19	ENSOJAG00000019449 ##20	tnnt2a (ENSOJAG00000019525) ##22	PKP1 (ENSOJAG00000019589) #23	TEAD3 (ENSOJAG00000019600)	ENSOJAG00000019690	LGR6 (ENSOJAG00000019715)	ube2t (ENSOJAG00000019858)	etv7 (ENSOJAG00000019890)	zgc:194242 (ENSOJAG00000019901)	ENSOJAG00000019909	KCNA10 (ENSOJAG00000019947)	kcna2b (ENSOJAG00000019950)	KCNA3 (ENSOJAG00000019965)	ngfa (ENSOJAG00000019979)	ENSOJAG00000019982	slc25a55b (ENSOJAG00000019994)	ENSOJAG00000020043
Indian medaka	MODERN SPECIES	23	tafa3b (ENSOMEG00000015707)	ENSOMEG00000015673	mov10b.1 (ENSOMEG00000015634)	wnt2bb (ENSOMEG00000015549)	ENSOMEG00000015530	ebp (ENSOMEG00000015512)	ccdc115 (ENSOMEG00000015493)	ENSOMEG00000015467	apobec2b (ENSOMEG00000015449)	ENSOMEG00000015404	mybpha (ENSOMEG00000015334)	NAV1 (ENSOMEG00000015259) #16	csrp1a (ENSOMEG00000015070) #18	phlda3 (ENSOMEG00000015044) #19	ENSOMEG00000015033 ##20	tnnt2a (ENSOMEG00000014969) ##22	PKP1 (ENSOMEG00000014881) #23	TEAD3 (ENSOMEG00000014856)	ENSOMEG00000014822	LGR6 (ENSOMEG00000014783)	ube2t (ENSOMEG00000014691)	zgc:194242 (ENSOMEG00000014673)	etv7 (ENSOMEG00000014660)	ENSOMEG00000014633	KCNA10 (ENSOMEG00000014613)	KCNA3 (ENSOMEG00000014600)	ngfa (ENSOMEG00000014591)	ENSOMEG00000014570	slc25a55b (ENSOMEG00000014553)	TSHB (ENSOMEG00000014509)	ENSOMEG00000014473
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00540000073797	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b	ENSGT00940000176091
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	21	zgc:174906 (ENSORLG00000024306)	tafa3b (ENSORLG00000008062)	rhocb (ENSORLG00000002742)	ENSORLG00000008101	wnt2bb (ENSORLG00000008125)	ENSORLG00000008134	ebp (ENSORLG00000008139)	ccdc115 (ENSORLG00000008147)	apobec2b (ENSORLG00000022372)	ENSORLG00000023824	mybpha (ENSORLG00000008186)	NAV1 (ENSORLG00000008252) #16	csrp1a (ENSORLG00000022573) #18	phlda3 (ENSORLG00000026910) #19	ENSORLG00000008327 ##20	tnnt2a (ENSORLG00000024544) ##22	PKP1 (ENSORLG00000008336) #23	ENSORLG00000008361	ENSORLG00000008369	lgr6 (ENSORLG00000008434)	ube2t (ENSORLG00000008444)	zgc:194242 (ENSORLG00000008448)	etv7 (ENSORLG00000008468)	ENSORLG00000008473	KCNA10 (ENSORLG00000008479)	ENSORLG00000008486	KCNA3 (ENSORLG00000008487)	ngfa (ENSORLG00000008499)	ENSORLG00000029885	ENSORLG00000025050	slc25a55b (ENSORLG00000008520)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	1092	znf740b (ENSOSIG00000010656)	csad (ENSOSIG00000009929)	zgc:174906 (ENSOSIG00000009909)	tafa3b (ENSOSIG00000009907)	ENSOSIG00000009905	MOV10 (ENSOSIG00000009903)	wnt2bb (ENSOSIG00000009898)	ENSOSIG00000009897	ebp (ENSOSIG00000009895)	ccdc115 (ENSOSIG00000009892)	apobec2b (ENSOSIG00000009888)	ENSOSIG00000009886	NAV1 (ENSOSIG00000008702) #16	csrp1a (ENSOSIG00000008696) #18	phlda3 (ENSOSIG00000008694) #19	tnnt2a (ENSOSIG00000008689) ##22	PKP1 (ENSOSIG00000008685) #23	TEAD3 (ENSOSIG00000008655)	ENSOSIG00000008652	LGR6 (ENSOSIG00000008648)	ube2t (ENSOSIG00000008646)	zgc:194242 (ENSOSIG00000008645)	etv7 (ENSOSIG00000008644)	ENSOSIG00000008643	KCNA10 (ENSOSIG00000008642)	kcna2b (ENSOSIG00000008641)	ngfa (ENSOSIG00000008639)	ENSOSIG00000008638	slc25a55b (ENSOSIG00000008632)	ENSOSIG00000008631	ENSOSIG00000008629
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Orange clownfish	MODERN SPECIES	22	ENSAPEG00000004482	mov10b.1 (ENSAPEG00000004492)	WNT2B (ENSAPEG00000004514)	ENSAPEG00000004529	ebp (ENSAPEG00000004537)	ccdc115 (ENSAPEG00000004554)	apobec2b (ENSAPEG00000004591)	ENSAPEG00000004570	mybpha (ENSAPEG00000004604)	ENSAPEG00000004749 #16	csrp1a (ENSAPEG00000004787) #18	phlda3 (ENSAPEG00000004819) #19	ENSAPEG00000004837	ENSAPEG00000004889 ##20	lad1 (ENSAPEG00000004917)	tnnt2a (ENSAPEG00000004959) ##22	ENSAPEG00000005020 #23	TEAD3 (ENSAPEG00000005038)	ADORA3 (ENSAPEG00000005052)	ENSAPEG00000005072	LGR6 (ENSAPEG00000005098)	ube2t (ENSAPEG00000005182)	zgc:194242 (ENSAPEG00000005200)	etv7 (ENSAPEG00000005230)	ENSAPEG00000005256	KCNA3 (ENSAPEG00000005277)	KCNA10 (ENSAPEG00000005301)	ngfa (ENSAPEG00000005319)	ENSAPEG00000005356	slc25a55b (ENSAPEG00000005380)	ENSAPEG00000005426
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1382								ENSAOCG00000023299	mybpha (ENSAOCG00000023280)	NAV1 (ENSAOCG00000023262) #16	csrp1a (ENSAOCG00000023245) #18	phlda3 (ENSAOCG00000023231) #19	ENSAOCG00000023226	ENSAOCG00000023215 ##20	lad1 (ENSAOCG00000023203)	tnnt2a (ENSAOCG00000002251) ##22	ENSAOCG00000023159 #23	TEAD3 (ENSAOCG00000023137)	ENSAOCG00000023107	ENSAOCG00000023099	LGR6 (ENSAOCG00000023083)	ube2t (ENSAOCG00000023041)	zgc:194242 (ENSAOCG00000023023)	etv7 (ENSAOCG00000023013)	ENSAOCG00000022994	KCNA10 (ENSAOCG00000022984)	kcna2b (ENSAOCG00000002739)	KCNA3 (ENSAOCG00000022970)	ngfa (ENSAOCG00000022967)	ENSAOCG00000022953	slc25a55b (ENSAOCG00000022937)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	114								apobec2b (ENSAPOG00000019390)	ENSAPOG00000019372	mybpha (ENSAPOG00000019311)	NAV1 (ENSAPOG00000019258) #16	csrp1a (ENSAPOG00000019068) #18	phlda3 (ENSAPOG00000019035) #19	ENSAPOG00000019024 ##20	lad1 (ENSAPOG00000018828)	tnnt2a (ENSAPOG00000018777) ##22	PKP1 (ENSAPOG00000018730) #23	TEAD3 (ENSAPOG00000018718)	ENSAPOG00000018701	LGR6 (ENSAPOG00000018672)	ube2t (ENSAPOG00000018604)	zgc:194242 (ENSAPOG00000018594)	etv7 (ENSAPOG00000018584)	ENSAPOG00000018568	KCNA10 (ENSAPOG00000001016)	kcna2b (ENSAPOG00000018509)	KCNA3 (ENSAPOG00000018502)	ngfa (ENSAPOG00000018491)	ENSAPOG00000018482	slc25a55b (ENSAPOG00000018471)	ENSAPOG00000018420
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	671										mybpha (ENSSPAG00000023523)	NAV1 (ENSSPAG00000023521) #16	csrp1a (ENSSPAG00000023519) #18	phlda3 (ENSSPAG00000023517) #19	ENSSPAG00000023516	ENSSPAG00000023515 ##20	tnnt2a (ENSSPAG00000023513) ##22	ENSSPAG00000023512 #23	TEAD3 (ENSSPAG00000023509)	ADORA3 (ENSSPAG00000023506)	ENSSPAG00000023505	LGR6 (ENSSPAG00000023502)	ube2t (ENSSPAG00000023500)	zgc:194242 (ENSSPAG00000023499)	ENSSPAG00000023497	ENSSPAG00000023495	KCNA10 (ENSSPAG00000023493)	kcna2b (ENSSPAG00000023492)	KCNA3 (ENSSPAG00000023491)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Nile tilapia	MODERN SPECIES	12	tafa3b (ENSONIG00000036941)	ENSONIG00000012272	mov10b.1 (ENSONIG00000012274)	WNT2B (ENSONIG00000003906)	ENSONIG00000012284	ebp (ENSONIG00000012285)	ccdc115 (ENSONIG00000034538)	ENSONIG00000038500	apobec2b (ENSONIG00000012289)	ENSONIG00000012291	mybpha (ENSONIG00000012294)	NAV1 (ENSONIG00000012297) #16	csrp1a (ENSONIG00000012304) #18	phlda3 (ENSONIG00000020541) #19	TNNI1 (ENSONIG00000012306) ##20	tnnt2a (ENSONIG00000012310) ##22	PKP1 (ENSONIG00000012321) #23	TEAD3 (ENSONIG00000012323)	ENSONIG00000012328	ENSONIG00000037061	LGR6 (ENSONIG00000012329)	ube2t (ENSONIG00000041983)	zgc:194242 (ENSONIG00000012343)	ENSONIG00000042216	KCNA10 (ENSONIG00000012354)	kcna2b (ENSONIG00000020542)	KCNA3 (ENSONIG00000020543)	ENSONIG00000041998	ngfa (ENSONIG00000020544)	ENSONIG00000012355	slc25a55b (ENSONIG00000012357)
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	277	csad (ENSHBUG00000005789)	zgc:174906 (ENSHBUG00000005800)	tafa3b (ENSHBUG00000000145)	ENSHBUG00000005847	mov10b.1 (ENSHBUG00000005915)	WNT2B (ENSHBUG00000005937)	ENSHBUG00000005952	ebp (ENSHBUG00000005979)	ccdc115 (ENSHBUG00000005990)	apobec2b (ENSHBUG00000005993)	mybpha (ENSHBUG00000006003)	NAV1 (ENSHBUG00000006096) #16	csrp1a (ENSHBUG00000006143) #18	phlda3 (ENSHBUG00000006149) #19	ENSHBUG00000000151 ##20	tnnt2a (ENSHBUG00000006203) ##22	PKP1 (ENSHBUG00000006214) #23	TEAD3 (ENSHBUG00000006501)	ENSHBUG00000006534	ENSHBUG00000006548	LGR6 (ENSHBUG00000006576)	ube2t (ENSHBUG00000006606)	zgc:194242 (ENSHBUG00000006618)	etv7 (ENSHBUG00000006623)	ENSHBUG00000006633	KCNA10 (ENSHBUG00000006638)	kcna2b (ENSHBUG00000006642)	KCNA3 (ENSHBUG00000006651)	ngfa (ENSHBUG00000006657)	ENSHBUG00000006663	slc25a55b (ENSHBUG00000006715)
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
P. nyererei	MODERN SPECIES	342	zgc:174906 (ENSPNYG00000016872)	tafa3b (ENSPNYG00000016834)	ENSPNYG00000016821	mov10b.1 (ENSPNYG00000016801)	WNT2B (ENSPNYG00000016787)	ENSPNYG00000016778	ebp (ENSPNYG00000016762)	ccdc115 (ENSPNYG00000016756)	apobec2b (ENSPNYG00000016747)	ENSPNYG00000016739	mybpha (ENSPNYG00000016722)	NAV1 (ENSPNYG00000016685) #16	csrp1a (ENSPNYG00000016657) #18	phlda3 (ENSPNYG00000016646) #19	ENSPNYG00000016551 ##20	tnnt2a (ENSPNYG00000016519) ##22	PKP1 (ENSPNYG00000016498) #23	TEAD3 (ENSPNYG00000016344)	ENSPNYG00000016259	LGR6 (ENSPNYG00000016209)	ube2t (ENSPNYG00000016185)	zgc:194242 (ENSPNYG00000016170)	etv7 (ENSPNYG00000016140)	ENSPNYG00000016099	KCNA10 (ENSPNYG00000016078)	kcna2b (ENSPNYG00000016065)	KCNA3 (ENSPNYG00000016041)	ngfa (ENSPNYG00000016034)	ENSPNYG00000016016	slc25a55b (ENSPNYG00000015988)	ENSPNYG00000015528
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000162700.f	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Eastern happy	MODERN SPECIES	12	tafa3b (ENSACLG00000007244)	ENSACLG00000007550	mov10b.1 (ENSACLG00000007569)	WNT2B (ENSACLG00000007593)	ENSACLG00000007606	ebp (ENSACLG00000007614)	ccdc115 (ENSACLG00000007624)	apobec2b (ENSACLG00000007634)	ENSACLG00000007648	mybpha (ENSACLG00000007672)	NAV1 (ENSACLG00000007688) #16	csrp1a (ENSACLG00000008160) #18	phlda3 (ENSACLG00000008171) #19	ENSACLG00000008177 ##20	lad1 (ENSACLG00000008186)	tnnt2a (ENSACLG00000008198) ##22	PKP1 (ENSACLG00000008220) #23	TEAD3 (ENSACLG00000008230)	ENSACLG00000008241	ENSACLG00000008262	LGR6 (ENSACLG00000008273)	ube2t (ENSACLG00000008284)	zgc:194242 (ENSACLG00000008295)	etv7 (ENSACLG00000008304)	ENSACLG00000008309	KCNA10 (ENSACLG00000008313)	kcna2b (ENSACLG00000008315)	KCNA3 (ENSACLG00000008318)	ngfa (ENSACLG00000008570)	ENSACLG00000008589	slc25a55b (ENSACLG00000008604)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1103	zgc:174906 (ENSMZEG00005027168)	tafa3b (ENSMZEG00005027166)	ENSMZEG00005027165	ENSMZEG00005027164	WNT2B (ENSMZEG00005027163)	ENSMZEG00005027162	ebp (ENSMZEG00005027161)	ccdc115 (ENSMZEG00005027160)	apobec2b (ENSMZEG00005027159)	ENSMZEG00005027158	mybpha (ENSMZEG00005027157)	NAV1 (ENSMZEG00005027156) #16	csrp1a (ENSMZEG00005027155) #18	phlda3 (ENSMZEG00005027154) #19	ENSMZEG00005027153 ##20	tnnt2a (ENSMZEG00005027152) ##22	PKP1 (ENSMZEG00005027151) #23	TEAD3 (ENSMZEG00005027150)	ENSMZEG00005027147	ENSMZEG00005027146	LGR6 (ENSMZEG00005027145)	ube2t (ENSMZEG00005027144)	zgc:194242 (ENSMZEG00005027143)	etv7 (ENSMZEG00005027142)	ENSMZEG00005027141	KCNA10 (ENSMZEG00005027140)	kcna2b (ENSMZEG00005027139)	KCNA3 (ENSMZEG00005027138)	ENSMZEG00005027137	ngfa (ENSMZEG00005027136)	ENSMZEG00005027135
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	298	zgc:174906 (ENSNBRG00000018553)	tafa3b (ENSNBRG00000018567)	ENSNBRG00000018580	mov10b.1 (ENSNBRG00000018612)	ENSNBRG00000018732	ENSNBRG00000018752	ebp (ENSNBRG00000018758)	ccdc115 (ENSNBRG00000018779)	apobec2b (ENSNBRG00000018806)	ENSNBRG00000018827	mybpha (ENSNBRG00000018859)	ENSNBRG00000018924 #16	csrp1a (ENSNBRG00000018955) #18	phlda3 (ENSNBRG00000018971) #19	ENSNBRG00000019006 ##20	tnnt2a (ENSNBRG00000019113) ##22	TEAD3 (ENSNBRG00000019170)	ENSNBRG00000019282	ENSNBRG00000019294	LGR6 (ENSNBRG00000019313)	ube2t (ENSNBRG00000019354)	zgc:194242 (ENSNBRG00000019381)	ENSNBRG00000019391	ENSNBRG00000019409	KCNA10 (ENSNBRG00000019427)	kcna2b (ENSNBRG00000019440)	KCNA3 (ENSNBRG00000019456)	ENSNBRG00000019488	slc25a55b (ENSNBRG00000019504)	ENSNBRG00000019545	ENSNBRG00000019667
Midas cichlid	MODERN SPECIES	145	AJAP1 (ENSACIG00000015510)	GABRD (ENSACIG00000015485)	ENSACIG00000015440	gnb1a (ENSACIG00000015414)	nadka (ENSACIG00000015386)	ENSACIG00000015369	SLC35E2B (ENSACIG00000015348)	ENSACIG00000015338	ENSACIG00000015328	ENSACIG00000015318	ENSACIG00000015189	csrp1a (ENSACIG00000015172) #18	phlda3 (ENSACIG00000015163) #19	ENSACIG00000015061 ##20	lad1 (ENSACIG00000015023)	tnnt2a (ENSACIG00000014877) ##22	ENSACIG00000014856	PKP1 (ENSACIG00000014836) #23	TEAD3 (ENSACIG00000014741)	ENSACIG00000014710	ENSACIG00000014678	LGR6 (ENSACIG00000014597)	ube2t (ENSACIG00000014570)	zgc:194242 (ENSACIG00000014556)	etv7 (ENSACIG00000014537)	ENSACIG00000014504	KCNA10 (ENSACIG00000014493)	kcna2b (ENSACIG00000014469)	KCNA3 (ENSACIG00000014441)	ENSACIG00000014423	ngfa (ENSACIG00000014418)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00980000201100	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3093	ENSSLDG00000003562	ENSSLDG00000003521	ENSSLDG00000003441	WNT2B (ENSSLDG00000003413)	ENSSLDG00000003403	ebp (ENSSLDG00000003388)	ccdc115 (ENSSLDG00000003357)	ENSSLDG00000003334	apobec2b (ENSSLDG00000003321)	mybpha (ENSSLDG00000003280)	NAV1 (ENSSLDG00000003183) #16	csrp1a (ENSSLDG00000003139) #18	phlda3 (ENSSLDG00000003113) #19	ENSSLDG00000003096 ##20	lad1 (ENSSLDG00000003041)	tnnt2a (ENSSLDG00000002845) ##22	PKP1 (ENSSLDG00000002826) #23	TEAD3 (ENSSLDG00000002454)	ADORA3 (ENSSLDG00000002352)	ENSSLDG00000002336	LGR6 (ENSSLDG00000002260)	ube2t (ENSSLDG00000002234)	zgc:194242 (ENSSLDG00000002221)	etv7 (ENSSLDG00000002196)	ENSSLDG00000002166	KCNA10 (ENSSLDG00000002153)	kcna2b (ENSSLDG00000002142)	KCNA3 (ENSSLDG00000002105)	ngfa (ENSSLDG00000002096)	ENSSLDG00000002090	slc25a55b (ENSSLDG00000002050)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	23	ENSSDUG00000014362	MOV10 (ENSSDUG00000014383)	ENSSDUG00000014418	WNT2B (ENSSDUG00000014473)	ENSSDUG00000014492	ebp (ENSSDUG00000014525)	ccdc115 (ENSSDUG00000014537)	apobec2b (ENSSDUG00000014543)	ENSSDUG00000014556	mybpha (ENSSDUG00000014584)	NAV1 (ENSSDUG00000014606) #16	csrp1a (ENSSDUG00000014638) #18	phlda3 (ENSSDUG00000014656) #19	ENSSDUG00000014657 ##20	lad1 (ENSSDUG00000014670)	tnnt2a (ENSSDUG00000014693) ##22	PKP1 (ENSSDUG00000014753) #23	TEAD3 (ENSSDUG00000014772)	ENSSDUG00000014808	ENSSDUG00000014829	ENSSDUG00000014839	LGR6 (ENSSDUG00000014853)	ube2t (ENSSDUG00000014902)	zgc:194242 (ENSSDUG00000014923)	etv7 (ENSSDUG00000014938)	ENSSDUG00000014960	KCNA10 (ENSSDUG00000014981)	kcna2b (ENSSDUG00000014997)	KCNA3 (ENSSDUG00000015008)	ngfa (ENSSDUG00000015020)	ENSSDUG00000015023
Barramundi perch	MODERN SPECIES	136											mybpha (ENSLCAG00010018449)	NAV1 (ENSLCAG00010018452) #16	csrp1a (ENSLCAG00010018463) #18	phlda3 (ENSLCAG00010018471) #19	ENSLCAG00010018476 ##20	tnnt2a (ENSLCAG00010018498) ##22	ENSLCAG00010018541 #23	ENSLCAG00010018547	TEAD3 (ENSLCAG00010018552)	ENSLCAG00010018566	LGR6 (ENSLCAG00010018603)	ube2t (ENSLCAG00010018623)	zgc:194242 (ENSLCAG00010018625)	etv7 (ENSLCAG00010018629)	ENSLCAG00010018635	KCNA10 (ENSLCAG00010018640)	kcna2b (ENSLCAG00010018642)	KCNA3 (ENSLCAG00010018643)	ngfa (ENSLCAG00010018647)	ENSLCAG00010018656	slc25a55b (ENSLCAG00010018660)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00540000073797	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000166364	ENSGT00940000159166	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939.h	ENSGT00940000157365	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.d	ENSGT00940000164224.b	ENSGT00940000158152.a.b	ENSGT00940000165541
Tongue sole	MODERN SPECIES	1	ENSCSEG00000000625	ENSCSEG00000000631	ENSCSEG00000000636	ENSCSEG00000000638	ENSCSEG00000000640	acss2 (ENSCSEG00000000649)	WNT2B (ENSCSEG00000000675)	ebp (ENSCSEG00000000681)	ccdc115 (ENSCSEG00000000687)	apobec2b (ENSCSEG00000000690)	ENSCSEG00000000697	mybpha (ENSCSEG00000000704)	NAV1 (ENSCSEG00000000720) #16	ENSCSEG00000000738 #23	ENSCSEG00000000762 ##20	tnnt2a (ENSCSEG00000000775) ##22	TEAD3 (ENSCSEG00000000878)	ENSCSEG00000001085	ENSCSEG00000001090	ENSCSEG00000001096	pim1 (ENSCSEG00000001104)	TCTE1 (ENSCSEG00000001107)	tbpl1 (ENSCSEG00000001115)	gss (ENSCSEG00000001125)	zgc:103759 (ENSCSEG00000001153)	ARHGAP4 (ENSCSEG00000001164)	ENSCSEG00000001235	ENSCSEG00000001240	fam50a (ENSCSEG00000001241)	ptges3a (ENSCSEG00000001251)	dtx3 (ENSCSEG00000001255)
Turbot	MODERN SPECIES	2	tafa3b (ENSSMAG00000004885)	ENSSMAG00000033443	ENSSMAG00000004913	ENSSMAG00000005039	ENSSMAG00000005032	ebp (ENSSMAG00000005050)	ccdc115 (ENSSMAG00000005059)	ENSSMAG00000027541	apobec2b (ENSSMAG00000005110)	ENSSMAG00000035937	mybpha (ENSSMAG00000005120)	ENSSMAG00000005154 #16	ENSSMAG00000005320	phlda3 (ENSSMAG00000005338) #19	ENSSMAG00000005343 ##20	tnnt2a (ENSSMAG00000005351) ##22	ENSSMAG00000005381 #23	ENSSMAG00000005449	ENSSMAG00000005763	ENSSMAG00000037231	ENSSMAG00000005874	ube2t (ENSSMAG00000006044)	etv7 (ENSSMAG00000006052)	ENSSMAG00000006064	KCNA10 (ENSSMAG00000006119)	ENSSMAG00000006136	KCNA3 (ENSSMAG00000006145)	ENSSMAG00000006160	ENSSMAG00000006163	ENSSMAG00000006201	TSHB (ENSSMAG00000006247)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	21	tafa3b (ENSMAMG00000007786)	ENSMAMG00000026132	ENSMAMG00000007807	ENSMAMG00000007824	ENSMAMG00000007866	ENSMAMG00000007890	ebp (ENSMAMG00000026843)	ccdc115 (ENSMAMG00000007913)	apobec2b (ENSMAMG00000007926)	ENSMAMG00000007968	mybpha (ENSMAMG00000008003)	NAV1 (ENSMAMG00000008140) #16	csrp1a (ENSMAMG00000008204) #18	phlda3 (ENSMAMG00000008224) #19	ENSMAMG00000008231 ##20	tnnt2a (ENSMAMG00000008247) ##22	PKP1 (ENSMAMG00000008273) #23	ENSMAMG00000008285	ENSMAMG00000026539	ENSMAMG00000008335	ENSMAMG00000008356	ENSMAMG00000008422	zgc:194242 (ENSMAMG00000008445)	zgc:194242 (ENSMAMG00000008456)	etv7 (ENSMAMG00000008460)	ENSMAMG00000008480	KCNA10 (ENSMAMG00000008534)	ENSMAMG00000025139	KCNA3 (ENSMAMG00000008569)	NGF (ENSMAMG00000027569)	ENSMAMG00000008595
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Climbing perch	MODERN SPECIES	20	ENSATEG00000023014	ENSATEG00000027142	ENSATEG00000023028	ENSATEG00000023033	ebp (ENSATEG00000023035)	ccdc115 (ENSATEG00000023039)	ENSATEG00000029676	apobec2b (ENSATEG00000023043)	ENSATEG00000023072	ENSATEG00000029160	mybpha (ENSATEG00000023168)	NAV1 (ENSATEG00000023222) #16	csrp1a (ENSATEG00000023266) #18	phlda3 (ENSATEG00000023269) #19	ENSATEG00000023274 ##20	tnnt2a (ENSATEG00000023286) ##22	PKP1 (ENSATEG00000023297) #23	ENSATEG00000023330	ENSATEG00000023401	ENSATEG00000023406	ENSATEG00000023416	zgc:194242 (ENSATEG00000023424)	etv7 (ENSATEG00000023430)	ENSATEG00000023440	KCNA10 (ENSATEG00000023447)	ENSATEG00000023450	KCNA3 (ENSATEG00000023452)	NGF (ENSATEG00000023461)	ENSATEG00000030149	ENSATEG00000023467	TSHB (ENSATEG00000023473)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	18	ENSBSLG00000009770	mov10b.1 (ENSBSLG00000009530)	WNT2B (ENSBSLG00000009490)	ENSBSLG00000009478	ebp (ENSBSLG00000009466)	ccdc115 (ENSBSLG00000009462)	ENSBSLG00000009454	apobec2b (ENSBSLG00000009447)	ENSBSLG00000009438	ENSBSLG00000009413	mybpha (ENSBSLG00000009365)	NAV1 (ENSBSLG00000008607) #16	csrp1a (ENSBSLG00000008550) #18	phlda3 (ENSBSLG00000008525) #19	ENSBSLG00000008494 ##20	tnnt2a (ENSBSLG00000008433) ##22	PKP1 (ENSBSLG00000008376) #23	TEAD3 (ENSBSLG00000008225)	ENSBSLG00000008216	ENSBSLG00000020548	LGR6 (ENSBSLG00000020541)	ube2t (ENSBSLG00000020539)	zgc:194242 (ENSBSLG00000020536)	etv7 (ENSBSLG00000020531)	ENSBSLG00000020522	KCNA10 (ENSBSLG00000020521)	KCNA2 (ENSBSLG00000020518)	KCNA3 (ENSBSLG00000020513)	ngfa (ENSBSLG00000020509)	ENSBSLG00000020501	slc25a55b (ENSBSLG00000020497)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00980000201100	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00980000201100	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	75	ENSLBEG00000009704	ENSLBEG00000009630	ENSLBEG00000009539	ENSLBEG00000009500	ebp (ENSLBEG00000009483)	ENSLBEG00000009469	ccdc115 (ENSLBEG00000009450)	ENSLBEG00000009435	apobec2b (ENSLBEG00000009422)	ENSLBEG00000009320	mybpha (ENSLBEG00000009255)	ENSLBEG00000009209 #16	csrp1a (ENSLBEG00000009147) #18	phlda3 (ENSLBEG00000009127) #19	ENSLBEG00000009090 ##20	tnnt2a (ENSLBEG00000009060) ##22	ENSLBEG00000009021 #23	TEAD3 (ENSLBEG00000008926)	ENSLBEG00000008872	ENSLBEG00000008847	LGR6 (ENSLBEG00000008806)	ube2t (ENSLBEG00000008650)	zgc:194242 (ENSLBEG00000008626)	etv7 (ENSLBEG00000008581)	ENSLBEG00000008543	KCNA10 (ENSLBEG00000008524)	kcna2b (ENSLBEG00000008514)	KCNA3 (ENSLBEG00000008500)	ngfa (ENSLBEG00000008487)	ENSLBEG00000008468	slc25a55b (ENSLBEG00000008428)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00980000201100	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00980000201100	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	21	DOCK3 (ENSSAUG00010018906)	DCAF1 (ENSSAUG00010023866)	ssuh2rs1 (ENSSAUG00010023883)	rpl32 (ENSSAUG00010023884)	grip2a (ENSSAUG00010023896)	ENSSAUG00010024556	ABTB1 (ENSSAUG00010024559)	dnase1l4.1 (ENSSAUG00010024563)	ENSSAUG00010024574	ENSSAUG00010024575	cers5 (ENSSAUG00010024578)	slmapb (ENSSAUG00010024652)	abhd6b (ENSSAUG00010024654)	kctd6b (ENSSAUG00010024658)	ENSSAUG00010024661 ##20	tnnt2a (ENSSAUG00010024667) ##22	PKP1 (ENSSAUG00010024669) #23	TEAD3 (ENSSAUG00010024675)	ENSSAUG00010024688	LGR6 (ENSSAUG00010004126)	ube2t (ENSSAUG00010004315)	zgc:194242 (ENSSAUG00010004321)	etv7 (ENSSAUG00010004327)	ENSSAUG00010004333	KCNA10 (ENSSAUG00010004341)	kcna2b (ENSSAUG00010004345)	KCNA3 (ENSSAUG00010004354)	ngfa (ENSSAUG00010004356)	ENSSAUG00010004358	slc25a55b (ENSSAUG00010004368)	TSHB (ENSSAUG00010004400)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000156024.i.a.f	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
European seabass	MODERN SPECIES	14	csad (ENSDLAG00005001675)	tafa3b (ENSDLAG00005001591)	ENSDLAG00005028545	ENSDLAG00005001459	ENSDLAG00005001340	ENSDLAG00005001302	ENSDLAG00005027955	ENSDLAG00005031740	ENSDLAG00005001246	apobec2b (ENSDLAG00005033881)	mybpha (ENSDLAG00005020002)	csrp1a (ENSDLAG00005033635) #18	phlda3 (ENSDLAG00005019951) #19	NAV1 (ENSDLAG00005019975) #16	ENSDLAG00005019930 ##20	ENSDLAG00005019918 ##22	ENSDLAG00005019908 #23	ENSDLAG00005019690	ENSDLAG00005030911	ENSDLAG00005031154	ENSDLAG00005019632	ube2t (ENSDLAG00005034496)	zgc:194242 (ENSDLAG00005019617)	etv7 (ENSDLAG00005019610)	ENSDLAG00005019604	KCNA10 (ENSDLAG00005032423)	ENSDLAG00005029620	KCNA3 (ENSDLAG00005029576)	ENSDLAG00005033887	ENSDLAG00005019568	ENSDLAG00005019548
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	487	MOV10 (ENSLCRG00005005754)	ENSLCRG00005005736	wnt2bb (ENSLCRG00005005735)	ENSLCRG00005005733	ebp (ENSLCRG00005005731)	ccdc115 (ENSLCRG00005005716)	ENSLCRG00005005715	apobec2b (ENSLCRG00005005714)	ENSLCRG00005005713	mybpha (ENSLCRG00005005711)	NAV1 (ENSLCRG00005005250) #16	ENSLCRG00005005249 #18	csrp1a (ENSLCRG00005005174) #18	phlda3 (ENSLCRG00005005171) #19	ENSLCRG00005005170 ##20	tnnt2a (ENSLCRG00005005169) ##22	PKP1 (ENSLCRG00005005166) #23	TEAD3 (ENSLCRG00005004455)	ENSLCRG00005004447	ENSLCRG00005004446	LGR6 (ENSLCRG00005004444)	ube2t (ENSLCRG00005004439)	zgc:194242 (ENSLCRG00005004437)	ENSLCRG00005004435	ENSLCRG00005004431	KCNA10 (ENSLCRG00005004428)	KCNA3 (ENSLCRG00005004425)	ngfa (ENSLCRG00005004423)	ENSLCRG00005004421	slc25a55b (ENSLCRG00005004351)	ENSLCRG00005004347
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.d	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b
Pike perch	MODERN SPECIES	257					WNT2B (ENSSLUG00000012306)	ENSSLUG00000012301	ebp (ENSSLUG00000012297)	ccdc115 (ENSSLUG00000012292)	ENSSLUG00000012290	apobec2b (ENSSLUG00000012289)	ENSSLUG00000012277	mybpha (ENSSLUG00000012250)	csrp1a (ENSSLUG00000012169) #18	phlda3 (ENSSLUG00000012166) #19	ENSSLUG00000012153 ##20	tnnt2a (ENSSLUG00000012147) ##22	PKP1 (ENSSLUG00000012132) #23	TEAD3 (ENSSLUG00000012074)	ENSSLUG00000012067	ENSSLUG00000012062	LGR6 (ENSSLUG00000012051)	ube2t (ENSSLUG00000012047)	zgc:194242 (ENSSLUG00000012046)	etv7 (ENSSLUG00000012042)	ENSSLUG00000012039	KCNA10 (ENSSLUG00000012033)	KCNA2 (ENSSLUG00000012028)	KCNA3 (ENSSLUG00000012022)	ngfa (ENSSLUG00000012017)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	21	ENSCGOG00000011024	mov10b.1 (ENSCGOG00000009843)	WNT2B (ENSCGOG00000009756)	ENSCGOG00000009746	ebp (ENSCGOG00000009729)	ccdc115 (ENSCGOG00000009711)	ENSCGOG00000009700	apobec2b (ENSCGOG00000009696)	ENSCGOG00000009666	mybpha (ENSCGOG00000009628)	NAV1 (ENSCGOG00000009617) #16	ENSCGOG00000009612	csrp1a (ENSCGOG00000009604) #18	phlda3 (ENSCGOG00000009599) #19	ENSCGOG00000009593 ##20	tnnt2a (ENSCGOG00000009111) ##22	PKP1 (ENSCGOG00000009065) #23	TEAD3 (ENSCGOG00000008922)	ENSCGOG00000008904	ENSCGOG00000008900	LGR6 (ENSCGOG00000008871)	ube2t (ENSCGOG00000008863)	zgc:194242 (ENSCGOG00000008858)	ENSCGOG00000008850	ENSCGOG00000008836	KCNA10 (ENSCGOG00000008816)	KCNA3 (ENSCGOG00000008800)	ngfa (ENSCGOG00000008792)	ngfa (ENSCGOG00000008788)	ENSCGOG00000008780	slc25a55b (ENSCGOG00000008738)
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156024.i.a.e	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b	ENSGT00940000158152.a.b
Stickleback	MODERN SPECIES	11	mov10b.1 (ENSGACG00000009612)	WNT2B (ENSGACG00000009636)	ENSGACG00000009645	ebp (ENSGACG00000009646)	ccdc115 (ENSGACG00000009654)	ENSGACG00000009660	apobec2b (ENSGACG00000009663)	ENSGACG00000009673	mybpha (ENSGACG00000009683)	NAV1 (ENSGACG00000009691) #16	csrp1a (ENSGACG00000009706) #18	phlda3 (ENSGACG00000009727) #19	ENSGACG00000009730 ##20	ENSGACG00000009740	ENSGACG00000009743	tnnt2a (ENSGACG00000009747) ##22	PKP1 (ENSGACG00000009752) #23	TEAD3 (ENSGACG00000009758)	ENSGACG00000009805	LGR6 (ENSGACG00000009806)	ube2t (ENSGACG00000009813)	etv7 (ENSGACG00000009831)	KCNA10 (ENSGACG00000009836)	kcna2b (ENSGACG00000009837)	ngfa (ENSGACG00000009843)	ENSGACG00000009844	slc25a55b (ENSGACG00000009866)	TSHB (ENSGACG00000009897)	ENSGACG00000009900	uba1 (ENSGACG00000009903)	arhgef3l (ENSGACG00000009911)
Lumpfish	MODERN SPECIES	22	csad (ENSCLMG00005009685)	zgc:174906 (ENSCLMG00005011792)	tafa3b (ENSCLMG00005011793)	ENSCLMG00005011796	mov10b.1 (ENSCLMG00005011806)	WNT2B (ENSCLMG00005013614)	ENSCLMG00005013616	ebp (ENSCLMG00005013618)	ccdc115 (ENSCLMG00005013619)	apobec2b (ENSCLMG00005013620)	ENSCLMG00005013621	NAV1 (ENSCLMG00005013665) #16	csrp1a (ENSCLMG00005013668) #18	phlda3 (ENSCLMG00005013669) #19	ENSCLMG00005013671 ##20	tnnt2a (ENSCLMG00005013674) ##22	PKP1 (ENSCLMG00005013675) #23	TEAD3 (ENSCLMG00005013677)	ENSCLMG00005013678	LGR6 (ENSCLMG00005013679)	ube2t (ENSCLMG00005013680)	zgc:194242 (ENSCLMG00005013681)	etv7 (ENSCLMG00005013682)	ENSCLMG00005013683	KCNA10 (ENSCLMG00005013684)	KCNA3 (ENSCLMG00005013686)	ngfa (ENSCLMG00005013687)	ENSCLMG00005013692	slc25a55b (ENSCLMG00005013844)	TSHB (ENSCLMG00005002875)	ENSCLMG00005002941
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158240	ENSGT00940000155644.a.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000166364	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000158431.a.b	ENSGT00940000156616.j	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.c	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.b	ENSGT00940000155067.b.b	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00390000010372	ENSGT00940000162211	ENSGT00940000165158.a	ENSGT00940000159534.e	ENSGT00940000158688.d	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000007725.A.b.d	ENSGT00940000157504.c.a	ENSGT00940000164224.b	ENSGT00940000165541
Tetraodon	MODERN SPECIES	24	nfe2 (ENSTNIG00000015046)	copz1 (ENSTNIG00000015045)	znf740b (ENSTNIG00000015044)	csad (ENSTNIG00000015043)	TAFA3 (ENSTNIG00000015042)	ENSTNIG00000015041	wnt2bb (ENSTNIG00000015040)	ENSTNIG00000015039	ENSTNIG00000001385	APOBEC2 (ENSTNIG00000015038)	ENSTNIG00000001468	mybpha (ENSTNIG00000015037)	NAV1 (ENSTNIG00000015036) #16	ENSTNIG00000015035 ##20	lad1 (ENSTNIG00000015034)	tnnt2a (ENSTNIG00000015033) ##22	PKP1 (ENSTNIG00000015032) #23	TEAD3 (ENSTNIG00000015031)	ENSTNIG00000015030	LGR6 (ENSTNIG00000015029)	ube2t (ENSTNIG00000015028)	zgc:194242 (ENSTNIG00000015027)	etv7 (ENSTNIG00000000806)	ENSTNIG00000015026	KCNA10 (ENSTNIG00000015025)	KCNA2 (ENSTNIG00000015024)	KCNA3 (ENSTNIG00000015023)	ngfa (ENSTNIG00000015022)	ENSTNIG00000000025	ENSTNIG00000015021	slc25a55b (ENSTNIG00000015020)
Fugu	MODERN SPECIES	15	nfe2 (ENSTRUG00000002120)	copz1 (ENSTRUG00000001750)	znf740b (ENSTRUG00000023765)	csad (ENSTRUG00000001632)	TAFA3 (ENSTRUG00000030232)	ENSTRUG00000013021	ENSTRUG00000023655	ebp (ENSTRUG00000012886)	ccdc115 (ENSTRUG00000012873)	apobec2b (ENSTRUG00000012839)	ENSTRUG00000021854	mybpha (ENSTRUG00000012696)	NAV1 (ENSTRUG00000012261) #16	phlda3 (ENSTRUG00000012258) #19	ENSTRUG00000012124 ##20	tnnt2a (ENSTRUG00000011858) ##22	PKP1 (ENSTRUG00000022957) #23	TEAD3 (ENSTRUG00000011546)	ENSTRUG00000021009	LGR6 (ENSTRUG00000011356)	ube2t (ENSTRUG00000011353)	etv7 (ENSTRUG00000011237)	ENSTRUG00000021204	KCNA10 (ENSTRUG00000011224)	kcna2b (ENSTRUG00000011204)	KCNA3 (ENSTRUG00000011200)	ngfa (ENSTRUG00000011155)	ENSTRUG00000026479	slc25a55b (ENSTRUG00000002605)	ENSTRUG00000011045	uba1 (ENSTRUG00000010472)
Cod	MODERN SPECIES		ENSGMOG00000036072	fam43b (ENSGMOG00000006813)	ENSGMOG00000025197	ENSGMOG00000015456	ENSGMOG00000015468	pink1 (ENSGMOG00000015483)	agmat (ENSGMOG00000030462)	ENSGMOG00000016743	CASP9 (ENSGMOG00000016718)	ENSGMOG00000011630	tmem269 (ENSGMOG00000011623)	ENSGMOG00000003699	ENSGMOG00000018508	phlda3 (ENSGMOG00000020342) #19	ENSGMOG00000010682 ##20	ENSGMOG00000010706 ##22	ENSGMOG00000010719 #23	ENSGMOG00000010731	ENSGMOG00000010743	ENSGMOG00000020561	ENSGMOG00000010870	ube2t (ENSGMOG00000010895)	zgc:194242 (ENSGMOG00000010904)	etv7 (ENSGMOG00000034395)	ENSGMOG00000010927	KCNA10 (ENSGMOG00000032500)	ENSGMOG00000010986	KCNA3 (ENSGMOG00000020562)	ENSGMOG00000028506	ENSGMOG00000010990	ENSGMOG00000011003
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	161	ENSGT00940000159534.e.c	ENSGT00940000158688.c.d.b	ENSGT00940000160210.d.a	ENSGT00390000003937	ENSGT00940000153588.b.f.a	ENSGT00390000003897.o.b	ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156650.j.j	ENSGT00390000018621.u	ENSGT00940000155170	ENSGT00940000164454	ENSGT00530000063168.a.a.b.p	ENSGT00940000154955.b	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000166364	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	111	ENSGT00530000063808.a.n	ENSGT00940000163962	ENSGT00940000165254.d	ENSGT00390000003937	ENSGT00940000153588.b.f.a	ENSGT00390000003897.o.b	ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156650.j.j	ENSGT00390000018621.u	ENSGT00940000155170.f	ENSGT00940000164454	ENSGT00530000063168.a.a.b.p	ENSGT00940000154955.b	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000166364	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22
Rainbow trout	MODERN SPECIES	7	ENSOMYG00000061227	ENSOMYG00000067096	ENSOMYG00000005219	ENSOMYG00000074022	ENSOMYG00000071151	FLNA (ENSOMYG00000007274)	ENSOMYG00000035700	DNASE1L1 (ENSOMYG00000053459)	ENSOMYG00000077694	ENSOMYG00000008736	ENSOMYG00000008689	ENSOMYG00000058456	ENSOMYG00000008570	ENSOMYG00000008595	ENSOMYG00000008620	ENSOMYG00000008465 ##22
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	256									ENSGT00940000156650.j.j.a	ENSGT00940000155170.f	ENSGT00940000164454	ENSGT00530000063168.a.a.b.p	ENSGT00940000154955.b	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000166364	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22
Coho salmon	MODERN SPECIES	16		NPBWR2 (ENSOKIG00005006957)	ENSOKIG00005006950	atp6ap1a (ENSOKIG00005006939)	hsd17b10 (ENSOKIG00005006931)	ENSOKIG00005006927	ENSOKIG00005006916	ENSOKIG00005006909	ENSOKIG00005006902	ENSOKIG00005006898	FAM120C (ENSOKIG00005006302)	SLC16A1 (ENSOKIG00005006225)	ccdc115 (ENSOKIG00005006203)	ENSOKIG00005006187	ENSOKIG00005006180	ENSOKIG00005006162 ##22	ENSOKIG00005047134	ENSOKIG00005047127	rpl10 (ENSOKIG00005047069)	FLNA (ENSOKIG00005046407)	ENSOKIG00005046323	ENSOKIG00005046317	ENSOKIG00005046314	ENSOKIG00005046308	ENSOKIG00005046289	ngfa (ENSOKIG00005046277)	ENSOKIG00005046271	KCNA2 (ENSOKIG00005046252)	KCNA10 (ENSOKIG00005046244)	ENSOKIG00005046239	ENSOKIG00005046189
Chinook salmon	MODERN SPECIES		ENSOTSG00005023039	ENSOTSG00005023038	ENSOTSG00005023033	pdap1a (ENSOTSG00005023031)	ENSOTSG00005023029	PLBD1 (ENSOTSG00005021728)	ENSOTSG00005021719	ENSOTSG00005017639	CSDC2 (ENSOTSG00005017611)	aco2 (ENSOTSG00005014323)	phf5a (ENSOTSG00005014318)	tefa (ENSOTSG00005014317)	ZC3H7B (ENSOTSG00005014316)	RANGAP1 (ENSOTSG00005014308)	ENSOTSG00005014305	ENSOTSG00005014303 ##22	chadlb (ENSOTSG00005014302)	l3mbtl2 (ENSOTSG00005014144)	EP300 (ENSOTSG00005014113)	ENSOTSG00005014103	josd1 (ENSOTSG00005014101)	xrcc6 (ENSOTSG00005014078)	desi1b (ENSOTSG00005014077)	ENSOTSG00005014074	mrtfab (ENSOTSG00005014071)	ENSOTSG00005014069	tha1 (ENSOTSG00005014068)	eef2k (ENSOTSG00005014062)	polr3e (ENSOTSG00005014038)	CDR2 (ENSOTSG00005014036)	ENSOTSG00005014035
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	154	ENSGT00940000157504.c.a.d	ENSGT00530000063808.a.n	ENSGT00940000163962	ENSGT00940000165254.d	ENSGT01060000248869	ENSGT00940000153588.b.f.a	ENSGT00390000003897.o.b	ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156650.j.j	ENSGT00940000155170	ENSGT00940000164454	ENSGT00530000063168.a.a.b.p	ENSGT00940000154955.b	ENSGT00390000012929	ENSGT00940000166364	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	4	ENSSSAG00000092814	ENSSSAG00000100895	ENSSSAG00000044135	FLNA (ENSSSAG00000044359)	rpl10 (ENSSSAG00000054819)	ENSSSAG00000104261	ENSSSAG00000050346	hsd17b10 (ENSSSAG00000041427)	ENSSSAG00000052495	ENSSSAG00000081966	ENSSSAG00000091092	ENSSSAG00000099605	ccdc115 (ENSSSAG00000059076)	ENSSSAG00000009522	ENSSSAG00000068264	ENSSSAG00000068269 ##22	ENSSSAG00000082478	ENSSSAG00000013353	ENSSSAG00000042378	ENSSSAG00000106480	KCNA10 (ENSSSAG00000101897)	ENSSSAG00000041646	KCNA3 (ENSSSAG00000101969)	ENSSSAG00000118211	ENSSSAG00000041270	ENSSSAG00000055506	ENSSSAG00000050662	ENSSSAG00000041442	ENSSSAG00000110115	tkt (ENSSSAG00000043688)	ENSSSAG00000093666
River trout	MODERN SPECIES	23	ENSSTUG00000011837	ENSSTUG00000011848	FLNA (ENSSTUG00000011907)	rpl10 (ENSSTUG00000013034)	DNASE1L1 (ENSSTUG00000013122)	ENSSTUG00000013240	ENSSTUG00000013249	hsd17b10 (ENSSTUG00000013339)	ENSSTUG00000013448	FAM120C (ENSSTUG00000013483)	slc16a1b (ENSSTUG00000013840)	ccdc115 (ENSSTUG00000013856)	ENSSTUG00000013864	ENSSTUG00000013867	ENSSTUG00000013874	ENSSTUG00000013883 ##22	ENSSTUG00000013987
Northern pike	MODERN SPECIES	11	sephs3 (ENSELUG00000020249)	ENSELUG00000031420	ikbkg (ENSELUG00000020223)	ENSELUG00000020197	LGR6 (ENSELUG00000020164)	ube2t (ENSELUG00000001213)	etv7 (ENSELUG00000020000)	mov10b.1 (ENSELUG00000000566)	WNT2B (ENSELUG00000015488)	ENSELUG00000015513	ebp (ENSELUG00000015525)	ccdc115 (ENSELUG00000015591)	ENSELUG00000032781	mybpha (ENSELUG00000015671)	NAV1 (ENSELUG00000015750) #16	tnnt2a (ENSELUG00000015772) ##22	ENSELUG00000000590 #23	ENSELUG00000031633	ENSELUG00000015830	ENSELUG00000033887
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	191									ENSGT00980000199670	ENSGT00940000165428.c.a	ENSGT00940000158040.a	ENSGT00940000156637.a #16	ENSGT00940000156777.d #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.a.b ##20	ENSGT00940000154709.a.b.a.b ##22	ENSGT00940000156735.d #23	ENSGT00390000009166	ENSGT00950000182956.b.b.b.e.a	ENSGT00940000158771	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a.e	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.b	ENSGT00550000074828.b	ENSGT00940000159534.f	ENSGT00940000158688.b	ENSGT00940000160210.d.b	ENSGT00390000007725.A.b.c	ENSGT00940000157504.c.b	ENSGT00940000164224.a	ENSGT00940000158152.a.a	ENSGT00940000165906
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	29				KLHL10 (ENSPKIG00000010076)	ENSPKIG00000010099	ENSPKIG00000010126	ENSPKIG00000010179	SYT2 (ENSPKIG00000010300)	ENSPKIG00000010357	ENSPKIG00000010407	ENSPKIG00000010497	ENSPKIG00000010549 #23	NAV1 (ENSPKIG00000010793) #16	csrp1a (ENSPKIG00000011163) #18	phlda3 (ENSPKIG00000011186) #19	tnnt2a (ENSPKIG00000011216) ##22	ENSPKIG00000011263 ##20	smpd2a (ENSPKIG00000011322)	TEAD3 (ENSPKIG00000011427)	ENSPKIG00000011543	ENSPKIG00000011573	ENSPKIG00000011607	ENSPKIG00000011591	LGR6 (ENSPKIG00000011663)	ube2t (ENSPKIG00000011750)	zgc:194242 (ENSPKIG00000011817)	etv7 (ENSPKIG00000011834)	KCNA10 (ENSPKIG00000011851)	KCNA2 (ENSPKIG00000011866)	KCNA3 (ENSPKIG00000011884)	ngfa (ENSPKIG00000011902)
Spotted gar	MODERN SPECIES	669	LGR6 (ENSLOCG00000009662)	ENSLOCG00000009673	ENSLOCG00000009685	ENSLOCG00000009694	ENSLOCG00000009705	ENSLOCG00000009717	ENSLOCG00000009723	tead3b (ENSLOCG00000009736)	smpd2a (ENSLOCG00000009741)	mybpha (ENSLOCG00000009756)	NAV1 (ENSLOCG00000009769) #16	csrp1a (ENSLOCG00000009788) #18	phlda3 (ENSLOCG00000018057) #19	TNNI1 (ENSLOCG00000009801) #20	lad1 (ENSLOCG00000009808)	tnnt2a (ENSLOCG00000009812) ##22	PKP1 (ENSLOCG00000009825) #23	ENSLOCG00000009840	ENSLOCG00000009848	ENSLOCG00000009857	ENSLOCG00000009867	ENSLOCG00000009878	ENSLOCG00000009888	ENSLOCG00000009895	ENSLOCG00000009899	GRM4 (ENSLOCG00000009910)	hmga1a (ENSLOCG00000009932)	SMIM29 (ENSLOCG00000009940)	ENSLOCG00000009945	nudt3a (ENSLOCG00000009949)	rps10 (ENSLOCG00000009959)
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.a ##22
Lamprey	MODERN SPECIES	5822																ENSPMAG00000004746 ##22
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.b ##22
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	620													ENSGT01030000234588.b.b.b.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b ##22	ENSGT00940000156735 #23	ENSGT00940000160123
Elephant shark	DUPLICATION
Elephant shark	MODERN SPECIES	1518	KCNA3 (ENSCMIG00000000474)	ENSCMIG00000000480	KCNA10 (ENSCMIG00000000491)	ENSCMIG00000000541	ENSCMIG00000000588	ENSCMIG00000000608	ENSCMIG00000000659	ENSCMIG00000000814	ENSCMIG00000000818	NAV1 (ENSCMIG00000000857) #16	ENSCMIG00000000946	csrp1 (ENSCMIG00000000955) #18	phlda3 (ENSCMIG00000000966) #19	TNNI1 (ENSCMIG00000000968) #20	ENSCMIG00000000975	ENSCMIG00000000982 ##22	ENSCMIG00000000988 #23	ENSCMIG00000000992 #23	ENSCMIG00000001006	ENSCMIG00000001024	ENSCMIG00000001033	ENSCMIG00000001039	LGR6 (ENSCMIG00000001050)	ube2t (ENSCMIG00000001059)	arl8a (ENSCMIG00000001067) #8	GPR37L1 (ENSCMIG00000001074) #9	ENSCMIG00000001079	ENSCMIG00000001083	itpr3 (ENSCMIG00000001206)	ENSCMIG00000001379	nudt3a (ENSCMIG00000001383)
Elephant shark	MODERN SPECIES	1604	ENSCMIG00000012697	ENSCMIG00000012692	ndufa9 (ENSCMIG00000012667)	ENSCMIG00000012655	KCNA1 (ENSCMIG00000012654)	KCNA5 (ENSCMIG00000012652)	ntf3 (ENSCMIG00000012649)	ano2b (ENSCMIG00000012617)	VWF (ENSCMIG00000012486)	cd9 (ENSCMIG00000012373)	cwf19l1 (ENSCMIG00000012296)	ENSCMIG00000012262 ##20	tnni4a (ENSCMIG00000012259) ##20	bpgm (ENSCMIG00000012257)	CALD1 (ENSCMIG00000012255)	ENSCMIG00000012249 ##22	si:cabz01085950.1 (ENSCMIG00000012246)	ENSCMIG00000012244	PTPRO (ENSCMIG00000012157)	eps8a (ENSCMIG00000012069)	strap (ENSCMIG00000012009)	dera (ENSCMIG00000011884)	SLC15A5 (ENSCMIG00000011848)	mgst1.1 (ENSCMIG00000011845)	lmo3 (ENSCMIG00000011829)	arhgef39 (ENSCMIG00000011819)	ENSCMIG00000011806	rergla (ENSCMIG00000011798)	PLCZ1 (ENSCMIG00000011796)	plekha5 (ENSCMIG00000011784)	ENSCMIG00000011777
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000159401	ENSGT00390000006865	ENSGT00940000160161	ENSGT00940000164299	ENSGT00940000158576	ENSGT00940000161860	ENSGT00390000007725.A.a	ENSGT00940000155840.C	ENSGT00940000155810	ENSGT00940000155083.b	ENSGT00940000156000	ENSGT01030000234588.b.b.a ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b ##22	ENSGT00940000159750	ENSGT00940000154814.b	ENSGT00940000156403.b	ENSGT00940000155197	ENSGT00390000007878	ENSGT00940000158916	ENSGT00390000011980.a	ENSGT00940000153908.a	ENSGT00440000033863	ENSGT00940000159982	ENSGT00940000159950	ENSGT00940000155728	ENSGT00510000048519	ENSGT01030000234874	ENSGT00940000156628
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	461													ENSGT01030000234588.b.b.b.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b ##22	ENSGT00940000159750	ENSGT00940000154814.b	ENSGT00940000156403.b
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000157682.B	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000010382	ENSGT00390000005941	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000167703	ENSGT00390000010852	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000164174	ENSGT00940000160513	ENSGT00550000075044	ENSGT01030000234588.b.b.b.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b ##22	ENSGT00940000155504	ENSGT00940000156246	ENSGT00940000164630	ENSGT01050000244882.b.d	ENSGT00940000154738.a	ENSGT00940000155419	ENSGT00940000155915	ENSGT00950000183062.a.a.b	ENSGT00940000156242	ENSGT00390000013995.b.b	ENSGT00390000016228.b	ENSGT00940000157529	ENSGT00940000158636	ENSGT00530000063554.b	ENSGT00940000158792
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000010382	ENSGT00390000005941	ENSGT00390000010852	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00550000075044	ENSGT00940000160513	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b ##22	ENSGT00940000155504	ENSGT00940000156246	ENSGT00940000164630	ENSGT01050000244882.b.d	ENSGT00940000154738.a.r	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419	ENSGT00940000155915.b	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.a	ENSGT00390000013995.b.b.l	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00940000156242.c.b
Clupeocephala	DUPLICATION
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	399										ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT00940000175224	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000154098.a.f	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00810000125439.B.c.a	ENSGT00950000182818.B.a
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000002915	ENSGT00390000014507.a.a	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000168203	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT01100000263537.b.a.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000014507.a.a	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT01100000263537.b.a.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT01100000263537.b.a.b
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Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
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Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000014507.a.a	ENSGT00940000177912	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT01100000266314	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
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Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Turbot	MODERN SPECIES	1	ldhbb (ENSSMAG00000008730)	tmpob (ENSSMAG00000022767)	pthlhb (ENSSMAG00000008692)	ENSSMAG00000008686	ENSSMAG00000037334	ENSSMAG00000008668	ENSSMAG00000008614	zgc:136858 (ENSSMAG00000008577)	ENSSMAG00000008563	ENSSMAG00000008539 ##20	ENSSMAG00000008521 ##20	ENSSMAG00000026823 ##20	ENSSMAG00000022935 ##20	bpgm (ENSSMAG00000031971)	ENSSMAG00000028897	tnnt2d (ENSSMAG00000008403) ##22	dnm1l (ENSSMAG00000008336)	dnajb9a (ENSSMAG00000030394)	ENSSMAG00000008292	NRCAM (ENSSMAG00000008243)	CNTN1 (ENSSMAG00000008140)	PDZRN4 (ENSSMAG00000008100)	GXYLT1 (ENSSMAG00000008062)	YAF2 (ENSSMAG00000008054)	PRICKLE1 (ENSSMAG00000008028)	PPHLN1 (ENSSMAG00000008043)	ENSSMAG00000008018	ADAMTS20 (ENSSMAG00000007900)	irak4 (ENSSMAG00000007871)	twf1a (ENSSMAG00000007848)	TMEM117 (ENSSMAG00000007827)
Tongue sole	MODERN SPECIES	16	ldhbb (ENSCSEG00000015220)	tmpob (ENSCSEG00000015206)	pthlhb (ENSCSEG00000015200)	ENSCSEG00000015191	ENSCSEG00000015184	KCNA1 (ENSCSEG00000015180)	KCNA1 (ENSCSEG00000015175)	CNOT4 (ENSCSEG00000015080)	zgc:136858 (ENSCSEG00000015037)	ENSCSEG00000015010	ENSCSEG00000014981 ##20	ENSCSEG00000014973 ##20	bpgm (ENSCSEG00000014964)	ENSCSEG00000014958	ENSCSEG00000014946	tnnt2d (ENSCSEG00000014535) ##22	dnm1l (ENSCSEG00000014488)	ENSCSEG00000014481	ENSCSEG00000014473	IMPDH1 (ENSCSEG00000014337)	ENSCSEG00000014305	ENSCSEG00000014293	banp (ENSCSEG00000014270)	ENSCSEG00000014259	FBXO31 (ENSCSEG00000014249)	polg (ENSCSEG00000014041)	RHCG (ENSCSEG00000014006)	gdpgp1 (ENSCSEG00000014002)	cib1 (ENSCSEG00000013996)	ENSCSEG00000013901	ENSCSEG00000013875
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Barramundi perch	MODERN SPECIES	144	ldhbb (ENSLCAG00010021256)	tmpob (ENSLCAG00010021266)	pthlhb (ENSLCAG00010021268)	ENSLCAG00010021270	ENSLCAG00010021271	KCNA1 (ENSLCAG00010021273)	CNOT4 (ENSLCAG00010021275)	zgc:136858 (ENSLCAG00010021280)	ENSLCAG00010021288	tnni4a (ENSLCAG00010021290) ##20	ENSLCAG00010021291 ##20	ENSLCAG00010021295 ##20	ENSLCAG00010021296 ##20	ENSLCAG00010021299 ##20	bpgm (ENSLCAG00010021300)	tnnt2d (ENSLCAG00010021309) ##22	dnm1l (ENSLCAG00010021454)	dnajb9a (ENSLCAG00010021915)	ENSLCAG00010021917	NRCAM (ENSLCAG00010022373)	CNTN1 (ENSLCAG00010023704)	PDZRN4 (ENSLCAG00010023738)	GXYLT1 (ENSLCAG00010023741)	YAF2 (ENSLCAG00010023745)	PPHLN1 (ENSLCAG00010023747)	prickle1a (ENSLCAG00010023751)	ENSLCAG00010023754	ADAMTS20 (ENSLCAG00010023794)	irak4 (ENSLCAG00010023870)	twf1a (ENSLCAG00010023877)	TMEM117 (ENSLCAG00010023881)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2437							KCNA1 (ENSSLDG00000015831)	CNOT4 (ENSSLDG00000015770)	zgc:136858 (ENSSLDG00000015664)	ENSSLDG00000015608	tnni4a (ENSSLDG00000015533) ##20	ENSSLDG00000015473 ##20	ENSSLDG00000015355 ##20	bpgm (ENSSLDG00000015303)	CALD1 (ENSSLDG00000015268)	tnnt2d (ENSSLDG00000014957) ##22	dnm1l (ENSSLDG00000014797)	dnajb9a (ENSSLDG00000014747)	ENSSLDG00000014736	ENSSLDG00000014372	CNTN1 (ENSSLDG00000014221)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	86	ldhbb (ENSSDUG00000022601)	tmpob (ENSSDUG00000022606)	pthlhb (ENSSDUG00000022610)	ENSSDUG00000022615	ENSSDUG00000022622	KCNA1 (ENSSDUG00000022629)	CNOT4 (ENSSDUG00000022635)	zgc:136858 (ENSSDUG00000022651)	ENSSDUG00000022674	tnni4a (ENSSDUG00000022686) ##20	ENSSDUG00000022691 ##20	ENSSDUG00000022700 ##20	ENSSDUG00000022704 ##20	bpgm (ENSSDUG00000022717)	CALD1 (ENSSDUG00000022720)	tnnt2d (ENSSDUG00000022739) ##22	dnm1l (ENSSDUG00000022859)	dnajb9a (ENSSDUG00000022878)	PNPLA8 (ENSSDUG00000022881)	NRCAM (ENSSDUG00000022888)	CNTN1 (ENSSDUG00000022906)	PDZRN4 (ENSSDUG00000022923)	GXYLT1 (ENSSDUG00000022929)	YAF2 (ENSSDUG00000022939)	PPHLN1 (ENSSDUG00000022947)	prickle1a (ENSSDUG00000022955)	ENSSDUG00000022967	ADAMTS20 (ENSSDUG00000022977)	irak4 (ENSSDUG00000023039)	twf1a (ENSSDUG00000023046)	TMEM117 (ENSSDUG00000023052)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00990000208084	ENSGT00940000168203	ENSGT00390000013995.b.b.l	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000000903.a.j	ENSGT00390000002915	ENSGT00390000014507.a.a	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT01100000263518.C ##9	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000167414.e	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00990000208084	ENSGT00940000168203	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b
Fugu	MODERN SPECIES	21	ENSTRUG00000016881	slc35b4 (ENSTRUG00000016876)	golt1bb (ENSTRUG00000016875)	ldhbb (ENSTRUG00000016868)	tmpob (ENSTRUG00000028971)	pthlhb (ENSTRUG00000016866)	ENSTRUG00000033461 ##9	ENSTRUG00000029325	KCNA1 (ENSTRUG00000016864)	CNOT4 (ENSTRUG00000016861)	zgc:136858 (ENSTRUG00000016859)	ENSTRUG00000016855 ##20	ENSTRUG00000016854 ##20	bpgm (ENSTRUG00000016853)	ENSTRUG00000023529	tnnt2d (ENSTRUG00000016845) ##22	dnm1l (ENSTRUG00000016834)	ENSTRUG00000022853	ENSTRUG00000016812	CNTN1 (ENSTRUG00000016799)	PDZRN4 (ENSTRUG00000016792)	GXYLT1 (ENSTRUG00000016788)	YAF2 (ENSTRUG00000016786)	ENSTRUG00000023687	prickle1a (ENSTRUG00000016783)	ENSTRUG00000023125	ADAMTS20 (ENSTRUG00000016748)	irak4 (ENSTRUG00000025150)	twf1a (ENSTRUG00000025657)	TMEM117 (ENSTRUG00000016723)	NELL2 (ENSTRUG00000016697)
Tetraodon	MODERN SPECIES	4	ENSTNIG00000016009	taf3 (ENSTNIG00000016008)	ASB13 (ENSTNIG00000016007)	NET1 (ENSTNIG00000016006)	slc35b4 (ENSTNIG00000016005)	ldhbb (ENSTNIG00000016004)	tmpob (ENSTNIG00000016003)	pthlhb (ENSTNIG00000016002)	KCNA1 (ENSTNIG00000016001)	CNOT4 (ENSTNIG00000016000)	zgc:136858 (ENSTNIG00000015999)	ENSTNIG00000000259 ##20	ENSTNIG00000015998 ##20	bpgm (ENSTNIG00000015997)	ENSTNIG00000015996	tnnt2d (ENSTNIG00000015995) ##22	dnm1l (ENSTNIG00000015994)	ENSTNIG00000015993	ENSTNIG00000015992	CNTN1 (ENSTNIG00000015991)	PDZRN4 (ENSTNIG00000015990)	GXYLT1 (ENSTNIG00000015989)	YAF2 (ENSTNIG00000015988)	ENSTNIG00000015987	ENSTNIG00000015986	prickle1a (ENSTNIG00000015985)	ADAMTS20 (ENSTNIG00000015984)	irak4 (ENSTNIG00000015983)	twf1a (ENSTNIG00000015982)	TMEM117 (ENSTNIG00000015981)	NELL2 (ENSTNIG00000015980)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a.f	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00990000208084	ENSGT00940000168203	ENSGT00390000013995.b.b.l	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	15	tmpob (ENSLBEG00000010183)	pthlhb (ENSLBEG00000010155)	ENSLBEG00000010135	ENSLBEG00000010097	KCNA1 (ENSLBEG00000010081)	CNOT4 (ENSLBEG00000009999)	zgc:136858 (ENSLBEG00000009831)	ENSLBEG00000009735	ENSLBEG00000009522 ##20	ENSLBEG00000009453 ##20	ENSLBEG00000009437	ENSLBEG00000009423 ##20	ENSLBEG00000009399 ##20	bpgm (ENSLBEG00000009382)	ENSLBEG00000009310	tnnt2d (ENSLBEG00000008713) ##22	dnm1l (ENSLBEG00000008434)	dnajb9a (ENSLBEG00000008376)	ENSLBEG00000008315	NRCAM (ENSLBEG00000007863)	CNTN1 (ENSLBEG00000007683)	PDZRN4 (ENSLBEG00000007631)	GXYLT1 (ENSLBEG00000007556)	YAF2 (ENSLBEG00000007500)	ENSLBEG00000007482	prickle1a (ENSLBEG00000007417)	ENSLBEG00000007381
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a.f	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00990000208084	ENSGT00940000168203	ENSGT00390000013995.b.b.l	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000164736	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a.f	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	22	golt1bb (ENSSAUG00010010527)	ldhbb (ENSSAUG00010010530)	tmpob (ENSSAUG00010010532)	PTHrP (ENSSAUG00010010533)	ENSSAUG00010010534	KCNA1 (ENSSAUG00010010536)	CNOT4 (ENSSAUG00010010539)	zgc:136858 (ENSSAUG00010010549)	ENSSAUG00010010551	tnni4a (ENSSAUG00010010554) ##20	ENSSAUG00010010556 ##20	ENSSAUG00010010558 ##20	ENSSAUG00010010600 ##20	bpgm (ENSSAUG00010010602)	ENSSAUG00010010603	sTnT2 (ENSSAUG00010010604) ##22	dnm1l (ENSSAUG00010010614)	dnajb9a (ENSSAUG00010010717)	ENSSAUG00010010719	ENSSAUG00010011084	CNTN1 (ENSSAUG00010023482)	PDZRN4 (ENSSAUG00010024511)	GXYLT1 (ENSSAUG00010024512)	YAF2 (ENSSAUG00010024514)	YAF2 (ENSSAUG00010024515)	ENSSAUG00010024516	prickle1a (ENSSAUG00010024517)	ENSSAUG00010024519	ADAMTS20 (ENSSAUG00010024533)	irak4 (ENSSAUG00010024737)	twf1a (ENSSAUG00010024746)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000164736	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a.f	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
European seabass	MODERN SPECIES	19	slc35b4 (ENSDLAG00005024790)	ENSDLAG00005026737	ldhbb (ENSDLAG00005024801)	ENSDLAG00005024805	pthlhb (ENSDLAG00005024806)	ENSDLAG00005024807	ENSDLAG00005027000	ENSDLAG00005024813	zgc:136858 (ENSDLAG00005024820)	ENSDLAG00005034999	ENSDLAG00005031077 ##20	ENSDLAG00005028687 ##20	ENSDLAG00005024834 ##20	bpgm (ENSDLAG00005024838)	ENSDLAG00005029387	tnnt2d (ENSDLAG00005024843) ##22	dnm1l (ENSDLAG00005024853)	dnajb9a (ENSDLAG00005024892)	ENSDLAG00005024898	ENSDLAG00005025086	CNTN1 (ENSDLAG00005010046)	PDZRN4 (ENSDLAG00005013514)	GXYLT1 (ENSDLAG00005013545)	PPHLN1 (ENSDLAG00005013563)	PRICKLE1 (ENSDLAG00005013602)	ENSDLAG00005013615	ADAMTS20 (ENSDLAG00005013654)	irak4 (ENSDLAG00005014882)	twf1a (ENSDLAG00005015040)	TMEM117 (ENSDLAG00005015089)	ENSDLAG00005027608
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	492	ENSLCRG00005012119	ldhbb (ENSLCRG00005012117)	tmpob (ENSLCRG00005012116)	pthlhb (ENSLCRG00005012114)	ENSLCRG00005020084	ENSLCRG00005020083	KCNA1 (ENSLCRG00005020082)	CNOT4 (ENSLCRG00005020063)	zgc:136858 (ENSLCRG00005020060)	ENSLCRG00005020059	tnni4a (ENSLCRG00005020058) ##20	ENSLCRG00005020056 ##20	ENSLCRG00005020054 ##20	bpgm (ENSLCRG00005020053)	ENSLCRG00005020052 ##20	tnnt2d (ENSLCRG00005020050) ##22	dnm1l (ENSLCRG00005019883)	dnajb9a (ENSLCRG00005019873)	ENSLCRG00005019659	NRCAM (ENSLCRG00005019196)	CNTN1 (ENSLCRG00005019070)	PDZRN4 (ENSLCRG00005019063)	GXYLT1 (ENSLCRG00005019061)	YAF2 (ENSLCRG00005019058)	ENSLCRG00005019054	prickle1a (ENSLCRG00005019050)	PPHLN1 (ENSLCRG00005019041)	ENSLCRG00005019040	ENSLCRG00005019037	ADAMTS20 (ENSLCRG00005018756)	irak4 (ENSLCRG00005018744)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a.f	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00990000208084	ENSGT00940000168203	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000014507.a.a	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000167414.e	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00990000208084	ENSGT00940000168203	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792
Lumpfish	MODERN SPECIES	21	ENSCLMG00005001990	slc35b4 (ENSCLMG00005001980)	golt1bb (ENSCLMG00005001976)	ldhbb (ENSCLMG00005001969)	tmpob (ENSCLMG00005001968)	pthlhb (ENSCLMG00005001967)	ENSCLMG00005001966	KCNA1 (ENSCLMG00005001965)	CNOT4 (ENSCLMG00005001931)	zgc:136858 (ENSCLMG00005001925)	ENSCLMG00005001919	ENSCLMG00005001915 ##20	ENSCLMG00005001855 ##20	ENSCLMG00005001800 ##20	bpgm (ENSCLMG00005001797)	tnnt2d (ENSCLMG00005001794) ##22	dnm1l (ENSCLMG00005001448)	dnajb9a (ENSCLMG00005001306)	ENSCLMG00005001196	ENSCLMG00005000608	CNTN1 (ENSCLMG00005000220)	PDZRN4 (ENSCLMG00005000134)	GXYLT1 (ENSCLMG00005000113)	YAF2 (ENSCLMG00005000104)	PPHLN1 (ENSCLMG00005000074)	prickle1a (ENSCLMG00005020032)	ENSCLMG00005020028	ADAMTS20 (ENSCLMG00005020015)	ENSCLMG00005020012	irak4 (ENSCLMG00005020008)	twf1a (ENSCLMG00005019979)
Stickleback	MODERN SPECIES	14	chchd3b (ENSGACG00000004357)	slc35b4 (ENSGACG00000004350)	golt1bb (ENSGACG00000004333)	ldhbb (ENSGACG00000004329)	tmpob (ENSGACG00000004325)	pthlhb (ENSGACG00000004317)	ENSGACG00000004313	ENSGACG00000004310	KCNA1 (ENSGACG00000004302)	CNOT4 (ENSGACG00000004276)	zgc:136858 (ENSGACG00000004250)	ENSGACG00000004247 ##20	ENSGACG00000004229 ##20	bpgm (ENSGACG00000004215)	ENSGACG00000004208	tnnt2d (ENSGACG00000004200) ##22	dnm1l (ENSGACG00000004145)	dnajb9a (ENSGACG00000004142)	ENSGACG00000004140	CNTN1 (ENSGACG00000004129)	PDZRN4 (ENSGACG00000004122)	GXYLT1 (ENSGACG00000004112)	YAF2 (ENSGACG00000004103)	ENSGACG00000004099	ENSGACG00000004098	prickle1a (ENSGACG00000004088)	ADAMTS20 (ENSGACG00000004063)	irak4 (ENSGACG00000004050)	twf1a (ENSGACG00000004028)	ENSGACG00000004026	TMEM117 (ENSGACG00000004020)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000177912	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a.f	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	20	golt1bb (ENSCGOG00000014935)	ldhbb (ENSCGOG00000014963)	tmpob (ENSCGOG00000015003)	pthlhb (ENSCGOG00000015004)	ENSCGOG00000015010	ENSCGOG00000015012	KCNA1 (ENSCGOG00000015018)	CNOT4 (ENSCGOG00000015027)	zgc:136858 (ENSCGOG00000015305)	ENSCGOG00000015309	tnni4a (ENSCGOG00000015310) ##20	ENSCGOG00000015351 ##20	ENSCGOG00000015353 ##20	ENSCGOG00000015361 ##20	bpgm (ENSCGOG00000015396)	tnnt2d (ENSCGOG00000015400) ##22	dnm1l (ENSCGOG00000015520)	dnajb9a (ENSCGOG00000017397)	ENSCGOG00000017399	NRCAM (ENSCGOG00000017428)	CNTN1 (ENSCGOG00000018721)	PDZRN4 (ENSCGOG00000019879)	GXYLT1 (ENSCGOG00000019881)	YAF2 (ENSCGOG00000019886)	PPHLN1 (ENSCGOG00000019889)	prickle1a (ENSCGOG00000019892)	ENSCGOG00000019897	ADAMTS20 (ENSCGOG00000019903)	irak4 (ENSCGOG00000020003)	twf1a (ENSCGOG00000020181)	TMEM117 (ENSCGOG00000020246)
Pike perch	MODERN SPECIES	6	golt1bb (ENSSLUG00000018091)	ENSSLUG00000018100	ldhbb (ENSSLUG00000018108)	tmpob (ENSSLUG00000018115)	pthlhb (ENSSLUG00000018119)	KCNA1 (ENSSLUG00000018123)	CNOT4 (ENSSLUG00000018127)	zgc:136858 (ENSSLUG00000018154)	ENSSLUG00000018174	tnni4a (ENSSLUG00000018184) ##20	ENSSLUG00000018187	ENSSLUG00000018191 ##20	ENSSLUG00000018197 ##20	ENSSLUG00000018200 ##20	bpgm (ENSSLUG00000018205)	tnnt2d (ENSSLUG00000018211) ##22	dnm1l (ENSSLUG00000018225)	dnajb9a (ENSSLUG00000018283)	ENSSLUG00000018300	ENSSLUG00000018562	CNTN1 (ENSSLUG00000021304)	PDZRN4 (ENSSLUG00000023424)	ENSSLUG00000023430	GXYLT1 (ENSSLUG00000004900)	YAF2 (ENSSLUG00000004904)	PPHLN1 (ENSSLUG00000004908)	prickle1a (ENSSLUG00000004921)	ENSSLUG00000004927	ADAMTS20 (ENSSLUG00000004961)	irak4 (ENSSLUG00000005222)	twf1a (ENSSLUG00000005325)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000164736	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT01030000234621.E
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000164736	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT01030000234621.E
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000164736	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT01030000234621.E
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000164736	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000164736	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Guppy	MODERN SPECIES	458	ENSPREG00000008015	ldhbb (ENSPREG00000008039)	tmpob (ENSPREG00000008109)	pthlhb (ENSPREG00000008124)	ENSPREG00000008133	ENSPREG00000008147	KCNA1 (ENSPREG00000008157)	CNOT4 (ENSPREG00000008171)	zgc:136858 (ENSPREG00000008221)	ENSPREG00000008257	tnni4a (ENSPREG00000008272) ##20	ENSPREG00000008289 ##20	ENSPREG00000008365 ##20	ENSPREG00000008493 ##20	bpgm (ENSPREG00000008515)	tnnt2d (ENSPREG00000008538) ##22	dnm1l (ENSPREG00000008602)	dnajb9a (ENSPREG00000008699)	PNPLA8 (ENSPREG00000008719)	NRCAM (ENSPREG00000008863)	CNTN1 (ENSPREG00000009441)	PDZRN4 (ENSPREG00000009526)	GXYLT1 (ENSPREG00000009558)	YAF2 (ENSPREG00000009617)	PPHLN1 (ENSPREG00000009629)	prickle1a (ENSPREG00000009636)	ENSPREG00000009646	ADAMTS20 (ENSPREG00000009700)	irak4 (ENSPREG00000009873)	twf1a (ENSPREG00000009901)	TMEM117 (ENSPREG00000009931)
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Sailfin molly	MODERN SPECIES	138			lgr4 (ENSPLAG00000001871)	mybpc3 (ENSPLAG00000001818)	ENSPLAG00000001794	KCNA1 (ENSPLAG00000001790)	CNOT4 (ENSPLAG00000001780)	zgc:136858 (ENSPLAG00000001763)	ENSPLAG00000001751	tnni4a (ENSPLAG00000001747) ##20	ENSPLAG00000001740 ##20	ENSPLAG00000001733 ##20	ENSPLAG00000001729 ##20	bpgm (ENSPLAG00000001718)	CALD1 (ENSPLAG00000001710)	tnnt2d (ENSPLAG00000001701) ##22	dnm1l (ENSPLAG00000001690)	dnajb9a (ENSPLAG00000001668)	PNPLA8 (ENSPLAG00000001659)	NRCAM (ENSPLAG00000001644)	CNTN1 (ENSPLAG00000001621)
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Platyfish	MODERN SPECIES	11	ldhbb (ENSXMAG00000016966)	ENSXMAG00000029981	tmpob (ENSXMAG00000016975)	pthlhb (ENSXMAG00000016979)	ENSXMAG00000016904	ENSXMAG00000019895	KCNA1 (ENSXMAG00000019897)	CNOT4 (ENSXMAG00000016984)	zgc:136858 (ENSXMAG00000016998)	ENSXMAG00000025969	tnni4a (ENSXMAG00000025114) ##20	ENSXMAG00000024483 ##20	ENSXMAG00000017021 ##20	ENSXMAG00000026716 ##20	bpgm (ENSXMAG00000023031)	tnnt2d (ENSXMAG00000017044) ##22	dnm1l (ENSXMAG00000017047)	dnajb9a (ENSXMAG00000028221)	ENSXMAG00000021559	NRCAM (ENSXMAG00000017134)	CNTN1 (ENSXMAG00000017213)	PDZRN4 (ENSXMAG00000029582)	GXYLT1 (ENSXMAG00000017282)	YAF2 (ENSXMAG00000025433)	PPHLN1 (ENSXMAG00000029948)	ENSXMAG00000028228	prickle1a (ENSXMAG00000017299)	ENSXMAG00000021158	ADAMTS20 (ENSXMAG00000017324)	irak4 (ENSXMAG00000028973)	twf1a (ENSXMAG00000017399)
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Mummichog	MODERN SPECIES	2447	golt1bb (ENSFHEG00000006866)	ldhbb (ENSFHEG00000006831)	tmpob (ENSFHEG00000006728)	pthlhb (ENSFHEG00000006716)	ENSFHEG00000006696	KCNA1 (ENSFHEG00000006686)	CNOT4 (ENSFHEG00000006608)	zgc:136858 (ENSFHEG00000006533)	ENSFHEG00000006438	tnni4a (ENSFHEG00000006404) ##20	ENSFHEG00000006396 ##20	ENSFHEG00000006387 ##20	ENSFHEG00000006369 ##20	bpgm (ENSFHEG00000006360)	ENSFHEG00000006342	tnnt2d (ENSFHEG00000006322) ##22	dnm1l (ENSFHEG00000006283)	ENSFHEG00000006099	dnajb9a (ENSFHEG00000006089)	PNPLA8 (ENSFHEG00000006070)	NRCAM (ENSFHEG00000006042)	CNTN1 (ENSFHEG00000005703)	GXYLT1 (ENSFHEG00000005428)	YAF2 (ENSFHEG00000005397)	PPHLN1 (ENSFHEG00000005379)	prickle1a (ENSFHEG00000005349)	ENSFHEG00000005273
Sheepshead minnow	DUPLICATION
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	858																tnnt2d (ENSCVAG00000021229) ##22	dnm1l (ENSCVAG00000021070)	dnajb9a (ENSCVAG00000020911)	PNPLA8 (ENSCVAG00000020900)	NRCAM (ENSCVAG00000020854)	CNTN1 (ENSCVAG00000020502)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	632	golt1bb (ENSCVAG00000009272)	ENSCVAG00000009288	ldhbb (ENSCVAG00000009309)	tmpob (ENSCVAG00000009330)	pthlhb (ENSCVAG00000009336)	ENSCVAG00000009343	KCNA1 (ENSCVAG00000009347)	CNOT4 (ENSCVAG00000009399)	zgc:136858 (ENSCVAG00000009439)	ENSCVAG00000009456	tnni4a (ENSCVAG00000009468) ##20	ENSCVAG00000009474 ##20	ENSCVAG00000009490 ##20	ENSCVAG00000009510 ##20	bpgm (ENSCVAG00000009514)	tnnt2d (ENSCVAG00000009633) ##22	dnm1l (ENSCVAG00000009840)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000002915	ENSGT00390000014507.a.a	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000164736	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1622	ENSNFUG00015022628	slc35b4 (ENSNFUG00015022625)	ENSNFUG00015022635	GOLT1BB (ENSNFUG00015022644)	LDHB (ENSNFUG00015022653)	TMPOB (ENSNFUG00015022658)	PTHLH (ENSNFUG00015022661)	ENSNFUG00015022664	KCNA1 (ENSNFUG00015022665)	CNOT4 (ENSNFUG00015022672)	zgc:136858 (ENSNFUG00015022688)	ENSNFUG00015022692	tnni4a (ENSNFUG00015022701) ##20	ENSNFUG00015022759 ##20	BPGM (ENSNFUG00015022761)	tnnt2d (ENSNFUG00015022764) ##22	dnm1l (ENSNFUG00015022771)	DNAJB9 (ENSNFUG00015022799)	PNPLA8 (ENSNFUG00015022803)	ENSNFUG00015022817	NRCAM (ENSNFUG00015022871)	CNTN1 (ENSNFUG00015023371)	PDZRN4 (ENSNFUG00015024360)	ENSNFUG00015024374	GXYLT1B (ENSNFUG00015024376)	YAF2 (ENSNFUG00015024379)	ENSNFUG00015024381	ADAMTS20 (ENSNFUG00015024443)	twf1a (ENSNFUG00015024697)	IRAK4 (ENSNFUG00015024700)	TMEM117 (ENSNFUG00015024705)
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	6	golt1bb (ENSKMAG00000004346)	slc35b4 (ENSKMAG00000004389)	ldhbb (ENSKMAG00000004441)	tmpob (ENSKMAG00000004488)	pthlhb (ENSKMAG00000004512)	ENSKMAG00000004526	ENSKMAG00000004550	KCNA1 (ENSKMAG00000004556)	CNOT4 (ENSKMAG00000004581)	zgc:136858 (ENSKMAG00000004663)	ENSKMAG00000004737	tnni4a (ENSKMAG00000004784) ##20	ENSKMAG00000004834 ##20	bpgm (ENSKMAG00000004859)	ENSKMAG00000004875	tnnt2d (ENSKMAG00000004908) ##22	dnm1l (ENSKMAG00000004994)	ENSKMAG00000005089	dnajb9a (ENSKMAG00000005139)	NRCAM (ENSKMAG00000005274)	CNTN1 (ENSKMAG00000005644)	PDZRN4 (ENSKMAG00000005705)	GXYLT1 (ENSKMAG00000005749)	YAF2 (ENSKMAG00000005787)	PPHLN1 (ENSKMAG00000005806)	prickle1a (ENSKMAG00000005861)	ENSKMAG00000005935	ADAMTS20 (ENSKMAG00000005969)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000177912	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000164736	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000175224	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052	ENSGT00810000125439.B.c.b
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000177912	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000164736	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000175224	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.c	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052	ENSGT00810000125439.B.c.b
Indian medaka	MODERN SPECIES	15	ldhbb (ENSOMEG00000011239)	tmpob (ENSOMEG00000011188)	pthlhb (ENSOMEG00000011153)	ENSOMEG00000011146	ENSOMEG00000011129	KCNA1 (ENSOMEG00000011109)	CNOT4 (ENSOMEG00000011084)	zgc:136858 (ENSOMEG00000011025)	ENSOMEG00000010987	tnni4a (ENSOMEG00000010945) ##20	ENSOMEG00000010901	ENSOMEG00000010797 ##20	ENSOMEG00000010772 ##20	bpgm (ENSOMEG00000010725)	ENSOMEG00000010686	tnnt2d (ENSOMEG00000010502) ##22	dnm1l (ENSOMEG00000010635)	ENSOMEG00000010476	ENSOMEG00000010365	CNTN1 (ENSOMEG00000010258)	PDZRN4 (ENSOMEG00000010211)	GXYLT1 (ENSOMEG00000010162)	YAF2 (ENSOMEG00000010094)	PPHLN1 (ENSOMEG00000010079)	prickle1a (ENSOMEG00000010059)	ENSOMEG00000010016	ADAMTS20 (ENSOMEG00000009983)	irak4 (ENSOMEG00000009757)	twf1a (ENSOMEG00000009732)	TMEM117 (ENSOMEG00000009692)	NELL2 (ENSOMEG00000009595)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	20	ENSOJAG00000000331	golt1bb (ENSOJAG00000000317)	ENSOJAG00000000303	ldhbb (ENSOJAG00000000294)	tmpob (ENSOJAG00000000281)	pthlhb (ENSOJAG00000000274)	ENSOJAG00000000271	KCNA1 (ENSOJAG00000000266)	CNOT4 (ENSOJAG00000000245)	zgc:136858 (ENSOJAG00000000205)	ENSOJAG00000000125 ##20	ENSOJAG00000022616 ##20	ENSOJAG00000022607	bpgm (ENSOJAG00000022606)	ENSOJAG00000022603	tnnt2d (ENSOJAG00000022590) ##22	dnm1l (ENSOJAG00000022533)	ENSOJAG00000022436	NRCAM (ENSOJAG00000019980)	CNTN1 (ENSOJAG00000018970)	ENSOJAG00000018907	ENSOJAG00000018889	PDZRN4 (ENSOJAG00000018862)	GXYLT1 (ENSOJAG00000018836)	YAF2 (ENSOJAG00000018820)	prickle1a (ENSOJAG00000018801)	ENSOJAG00000018778	ADAMTS20 (ENSOJAG00000017500)	irak4 (ENSOJAG00000017320)	twf1a (ENSOJAG00000017105)	TMEM117 (ENSOJAG00000017018)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000000903.a.j	ENSGT00390000002915	ENSGT00390000014507.a.a	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000155533.d.r	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Chinese medaka	MODERN SPECIES	766	NET1 (ENSOSIG00000014457)	chchd3b (ENSOSIG00000016670)	slc35b4 (ENSOSIG00000016673)	ldhbb (ENSOSIG00000016681)	tmpob (ENSOSIG00000016688)	pthlhb (ENSOSIG00000016689)	ENSOSIG00000016690	KCNA1 (ENSOSIG00000016691)	CNOT4 (ENSOSIG00000016695)	zgc:136858 (ENSOSIG00000016721)	ENSOSIG00000016725	tnni4a (ENSOSIG00000016730) ##20	ENSOSIG00000016731 ##20	ENSOSIG00000016734 ##20	ENSOSIG00000016735 ##20	tnnt2d (ENSOSIG00000016739) ##22	ENSOSIG00000016741	DNAH5 (ENSOSIG00000016749)	ENSOSIG00000016760	NRCAM (ENSOSIG00000017271)	CNTN1 (ENSOSIG00000022126)	GXYLT1 (ENSOSIG00000022950)	YAF2 (ENSOSIG00000022954)	PPHLN1 (ENSOSIG00000022959)	prickle1a (ENSOSIG00000022962)	ENSOSIG00000022964	ADAMTS20 (ENSOSIG00000023063)	irak4 (ENSOSIG00000023217)	twf1a (ENSOSIG00000023236)	TMEM117 (ENSOSIG00000023243)	NELL2 (ENSOSIG00000023255)
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	20	golt1bb (ENSORLG00000003792)	ENSORLG00000023935	ldhbb (ENSORLG00000022136)	tmpob (ENSORLG00000003751)	pthlhb (ENSORLG00000025229)	ENSORLG00000003741	ENSORLG00000003738	ENSORLG00000003735	CNOT4 (ENSORLG00000003727)	zgc:136858 (ENSORLG00000003706)	ENSORLG00000029963	tnni4a (ENSORLG00000030419) ##20	ENSORLG00000003693 ##20	ENSORLG00000003676 ##20	bpgm (ENSORLG00000003667)	tnnt2d (ENSORLG00000003649) ##22	dnm1l (ENSORLG00000003624)	DNAH5 (ENSORLG00000003542)	ENSORLG00000003382	ENSORLG00000003354	CNTN1 (ENSORLG00000003308)	PDZRN4 (ENSORLG00000003283)	GXYLT1 (ENSORLG00000003267)	ENSORLG00000025720	ENSORLG00000024063	ENSORLG00000026898	ENSORLG00000022854	ENSORLG00000023834	YAF2 (ENSORLG00000003255)	PPHLN1 (ENSORLG00000003241)	prickle1a (ENSORLG00000003229)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000014507.a.a	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000014507.a.a	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000014507.a.a	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000014507.a.a	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a.e.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	542	chchd3b (ENSHBUG00000002205)	slc35b4 (ENSHBUG00000002193)	golt1bb (ENSHBUG00000002179)	ldhbb (ENSHBUG00000002168)	tmpob (ENSHBUG00000002160)	pthlhb (ENSHBUG00000002154)	ENSHBUG00000002148	CNOT4 (ENSHBUG00000000027)	zgc:136858 (ENSHBUG00000002096)	ENSHBUG00000002071	ENSHBUG00000002059 ##20	ENSHBUG00000000025 ##20	ENSHBUG00000002040 ##20	bpgm (ENSHBUG00000002034)	CALD1 (ENSHBUG00000000020)	tnnt2d (ENSHBUG00000001979) ##22	dnm1l (ENSHBUG00000001952)	dnajb9a (ENSHBUG00000001914)	ENSHBUG00000001910	NRCAM (ENSHBUG00000001859)	CNTN1 (ENSHBUG00000001731)	PDZRN4 (ENSHBUG00000001717)	GXYLT1 (ENSHBUG00000001705)	YAF2 (ENSHBUG00000001690)	PPHLN1 (ENSHBUG00000001684)	prickle1a (ENSHBUG00000001677)	ENSHBUG00000001665	ADAMTS20 (ENSHBUG00000001654)
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000002915	ENSGT00390000014507.a.a	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a.e.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
P. nyererei	MODERN SPECIES	322	NET1 (ENSPNYG00000002745)	slc35b4 (ENSPNYG00000002843)	golt1bb (ENSPNYG00000002882)	ldhbb (ENSPNYG00000002953)	tmpob (ENSPNYG00000004229)	pthlhb (ENSPNYG00000004239)	ENSPNYG00000004251	KCNA1 (ENSPNYG00000004255)	CNOT4 (ENSPNYG00000004276)	zgc:136858 (ENSPNYG00000004314)	ENSPNYG00000004344	ENSPNYG00000004373 ##20	ENSPNYG00000004391 ##20	ENSPNYG00000004430 ##20	bpgm (ENSPNYG00000004447)	tnnt2d (ENSPNYG00000004458) ##22	dnm1l (ENSPNYG00000004502)	dnajb9a (ENSPNYG00000004724)	ENSPNYG00000004741	NRCAM (ENSPNYG00000004759)	CNTN1 (ENSPNYG00000004847)	PDZRN4 (ENSPNYG00000005050)	GXYLT1 (ENSPNYG00000005077)	YAF2 (ENSPNYG00000005107)	PPHLN1 (ENSPNYG00000005128)	prickle1a (ENSPNYG00000005140)	ENSPNYG00000005157	ADAMTS20 (ENSPNYG00000005239)	irak4 (ENSPNYG00000005723)	twf1a (ENSPNYG00000005936)	TMEM117 (ENSPNYG00000005964)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000002915	ENSGT00390000014507.a.a	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a.e.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000170627	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1110	slc35b4 (ENSMZEG00005007167)	golt1bb (ENSMZEG00005007199)	ldhbb (ENSMZEG00005007213)	tmpob (ENSMZEG00005007239)	pthlhb (ENSMZEG00005007256)	ENSMZEG00005007266	ENSMZEG00005007273	KCNA1 (ENSMZEG00005007277)	CNOT4 (ENSMZEG00005007312)	zgc:136858 (ENSMZEG00005007356)	ENSMZEG00005007402	tnni4a (ENSMZEG00005007450) ##20	ENSMZEG00005007456 ##20	ENSMZEG00005007465 ##20	bpgm (ENSMZEG00005007479)	tnnt2d (ENSMZEG00005007504) ##22	dnm1l (ENSMZEG00005007753)	dnajb9a (ENSMZEG00005007813)	ENSMZEG00005007830	NRCAM (ENSMZEG00005007891)	CNTN1 (ENSMZEG00005008112)	ENSMZEG00005008199	PDZRN4 (ENSMZEG00005008227)	GXYLT1 (ENSMZEG00005008242)	YAF2 (ENSMZEG00005008258)	prickle1a (ENSMZEG00005008270)	ENSMZEG00005008290	ADAMTS20 (ENSMZEG00005008339)	irak4 (ENSMZEG00005008598)	twf1a (ENSMZEG00005008622)	TMEM117 (ENSMZEG00005008658)
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	slc35b4 (ENSACLG00000002691)	golt1bb (ENSACLG00000002654)	ldhbb (ENSACLG00000002635)	tmpob (ENSACLG00000002624)	pthlhb (ENSACLG00000002618)	ENSACLG00000002585 ##9	ENSACLG00000002561	KCNA1 (ENSACLG00000002552)	CNOT4 (ENSACLG00000002514)	zgc:136858 (ENSACLG00000002477)	ENSACLG00000002447	tnni4a (ENSACLG00000002420) ##20	ENSACLG00000002341 ##20	ENSACLG00000002089 ##20	bpgm (ENSACLG00000002071)	tnnt2d (ENSACLG00000001473) ##22	dnm1l (ENSACLG00000001401)	dnajb9a (ENSACLG00000001384)	ENSACLG00000001359	NRCAM (ENSACLG00000000954)	CNTN1 (ENSACLG00000000904)	PDZRN4 (ENSACLG00000000551)	ENSACLG00000000539	GXYLT1 (ENSACLG00000000481)	YAF2 (ENSACLG00000000456)	PPHLN1 (ENSACLG00000000449)	prickle1a (ENSACLG00000000425)	ENSACLG00000000409	ADAMTS20 (ENSACLG00000000156)	irak4 (ENSACLG00000000097)	twf1a (ENSACLG00000027122)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	293	golt1bb (ENSNBRG00000021222)	ldhbb (ENSNBRG00000021207)	tmpob (ENSNBRG00000021195)	pthlhb (ENSNBRG00000021185)	ENSNBRG00000021178	ENSNBRG00000021177	KCNA1 (ENSNBRG00000021172)	CNOT4 (ENSNBRG00000021144)	zgc:136858 (ENSNBRG00000021096)	ENSNBRG00000021081	tnni4a (ENSNBRG00000021067) ##20	ENSNBRG00000021050 ##20	ENSNBRG00000021031 ##20	bpgm (ENSNBRG00000021024)	ENSNBRG00000021005	tnnt2d (ENSNBRG00000020994) ##22	dnm1l (ENSNBRG00000020969)	dnajb9a (ENSNBRG00000020956)	ENSNBRG00000020948	NRCAM (ENSNBRG00000020897)	CNTN1 (ENSNBRG00000020792)	ENSNBRG00000020773	PDZRN4 (ENSNBRG00000020749)	GXYLT1 (ENSNBRG00000020710)	YAF2 (ENSNBRG00000020680)	PPHLN1 (ENSNBRG00000020669)	prickle1a (ENSNBRG00000020651)	ENSNBRG00000020637	ADAMTS20 (ENSNBRG00000019988)	irak4 (ENSNBRG00000019813)	twf1a (ENSNBRG00000019791)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	chchd3b (ENSONIG00000028078)	slc35b4 (ENSONIG00000030209)	golt1bb (ENSONIG00000008642)	ldhbb (ENSONIG00000008643)	tmpob (ENSONIG00000032413)	pthlhb (ENSONIG00000042695)	ENSONIG00000021089	ENSONIG00000021090	CNOT4 (ENSONIG00000008656)	zgc:136858 (ENSONIG00000008662)	ENSONIG00000028524	ENSONIG00000008665 ##20	ENSONIG00000037691 ##20	ENSONIG00000029190 ##20	bpgm (ENSONIG00000038991)	tnnt2d (ENSONIG00000008670) ##22	dnm1l (ENSONIG00000008672)	dnajb9a (ENSONIG00000041184)	ENSONIG00000008681	NRCAM (ENSONIG00000008686)	CNTN1 (ENSONIG00000008695)	PDZRN4 (ENSONIG00000008705)	GXYLT1 (ENSONIG00000008707)	YAF2 (ENSONIG00000008709)	PPHLN1 (ENSONIG00000025900)	prickle1a (ENSONIG00000008712)	ENSONIG00000021092	ADAMTS20 (ENSONIG00000008715)	irak4 (ENSONIG00000008733)	twf1a (ENSONIG00000008739)	TMEM117 (ENSONIG00000008743)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	108	slc35b4 (ENSACIG00000003198)	golt1bb (ENSACIG00000003117)	ldhbb (ENSACIG00000003094)	tmpob (ENSACIG00000003078)	pthlhb (ENSACIG00000003066)	ENSACIG00000003061	ENSACIG00000003049	KCNA1 (ENSACIG00000003044)	CNOT4 (ENSACIG00000003011)	zgc:136858 (ENSACIG00000002966)	ENSACIG00000002933	ENSACIG00000002926 ##20	ENSACIG00000002911 ##20	ENSACIG00000002893 ##20	bpgm (ENSACIG00000002886)	tnnt2d (ENSACIG00000002862) ##22	dnm1l (ENSACIG00000002828)	dnajb9a (ENSACIG00000002817)	ENSACIG00000002797	NRCAM (ENSACIG00000002744)	CNTN1 (ENSACIG00000002688)	PDZRN4 (ENSACIG00000002668)	GXYLT1 (ENSACIG00000002649)	YAF2 (ENSACIG00000002635)	ENSACIG00000002610	prickle1a (ENSACIG00000002591)	ENSACIG00000002579	ADAMTS20 (ENSACIG00000002491)	irak4 (ENSACIG00000002462)	twf1a (ENSACIG00000002443)	TMEM117 (ENSACIG00000002428)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000177912	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00950000182857.a.a.b.b	ENSGT00390000007126	ENSGT00940000162677	ENSGT00530000063576.A	ENSGT00390000005941.d	ENSGT00390000010382	ENSGT00940000157682.B.b
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1217			ldhbb (ENSSPAG00000012436)	tmpob (ENSSPAG00000012406)	pthlhb (ENSSPAG00000012395)	ENSSPAG00000012390	KCNA1 (ENSSPAG00000012387)	CNOT4 (ENSSPAG00000012329)	zgc:136858 (ENSSPAG00000012273)	ENSSPAG00000012226	ENSSPAG00000012204 ##20	ENSSPAG00000012175 ##20	ENSSPAG00000012160 ##20	bpgm (ENSSPAG00000012146)	ENSSPAG00000012130	tnnt2d (ENSSPAG00000012090) ##22	dnm1l (ENSSPAG00000012049)	dnajb9a (ENSSPAG00000012033)	ENSSPAG00000012015
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000162649.f.b.d	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00950000182857.a.a.b.b	ENSGT00390000007126	ENSGT00940000162677	ENSGT00530000063576.A	ENSGT00390000005941.d	ENSGT00390000010382	ENSGT00940000157682.B.b
Spiny chromis	MODERN SPECIES	141			ALDH1L2 (ENSAPOG00000000452)	pthlhb (ENSAPOG00000016163)	ENSAPOG00000016181	KCNA1 (ENSAPOG00000016187)	ENSAPOG00000016198	CNOT4 (ENSAPOG00000016272)	zgc:136858 (ENSAPOG00000016393)	ENSAPOG00000016427 ##20	ENSAPOG00000016449 ##20	ENSAPOG00000016478 ##20	bpgm (ENSAPOG00000016493)	ENSAPOG00000016511	ENSAPOG00000016532	tnnt2d (ENSAPOG00000016573) ##22	dnm1l (ENSAPOG00000016682)	dnajb9a (ENSAPOG00000016699)	ENSAPOG00000016711	NRCAM (ENSAPOG00000016917)	CNTN1 (ENSAPOG00000016941)	PDZRN4 (ENSAPOG00000016980)	GXYLT1 (ENSAPOG00000017039)	YAF2 (ENSAPOG00000016986)	ifitm5 (ENSAPOG00000017051)	ENSAPOG00000017126	cdkn1ca (ENSAPOG00000017162)
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162649.f.b.d.c	ENSGT00940000162649.f.b.d.d	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00950000183129.a.f	ENSGT00950000182857.a.a.b.b	ENSGT00390000007126.e	ENSGT00940000162677	ENSGT00530000063576.A	ENSGT00390000005941.d	ENSGT00390000010382
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	707					ENSAOCG00000010845	KCNA1 (ENSAOCG00000010828)	CNOT4 (ENSAOCG00000010792)	zgc:136858 (ENSAOCG00000010735)	ENSAOCG00000010680	ENSAOCG00000010646 ##20	tnni4a (ENSAOCG00000010625) ##20	ENSAOCG00000010561 ##20	ENSAOCG00000000643 ##20	bpgm (ENSAOCG00000010343)	ENSAOCG00000010325	tnnt2d (ENSAOCG00000010295) ##22	dnm1l (ENSAOCG00000010262)	dnajb9a (ENSAOCG00000010215)	PNPLA8 (ENSAOCG00000010204)	NRCAM (ENSAOCG00000010166)	CNTN1 (ENSAOCG00000009886)	PDZRN4 (ENSAOCG00000009846)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	18	ENSAPEG00000003879	ENSAPEG00000004069	tmpob (ENSAPEG00000004590)	pthlhb (ENSAPEG00000004595)	ENSAPEG00000004610	ENSAPEG00000004622	KCNA1 (ENSAPEG00000004635)	CNOT4 (ENSAPEG00000004680)	zgc:136858 (ENSAPEG00000004724)	ENSAPEG00000004806	tnni4a (ENSAPEG00000004854) ##20	ENSAPEG00000004911 ##20	ENSAPEG00000005086 ##20	bpgm (ENSAPEG00000005108)	CALD1 (ENSAPEG00000005119)	tnnt2d (ENSAPEG00000005151) ##22	dnm1l (ENSAPEG00000005223)	dnajb9a (ENSAPEG00000005364)	ENSAPEG00000005407	NRCAM (ENSAPEG00000005494)	CNTN1 (ENSAPEG00000005725)	PDZRN4 (ENSAPEG00000005775)	GXYLT1 (ENSAPEG00000005812)	YAF2 (ENSAPEG00000005856)	parp16 (ENSAPEG00000005885)	ifitm5 (ENSAPEG00000005898)	ENSAPEG00000005914	cdkn1ca (ENSAPEG00000005955)	ptdss2 (ENSAPEG00000005973)	TMEM168 (ENSAPEG00000006023)	bmt2 (ENSAPEG00000006043)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	20	ENSMMDG00005022014	ldhbb (ENSMMDG00005022017)	slc25a3b (ENSMMDG00005022022)	tmpob (ENSMMDG00005022032)	pthlhb (ENSMMDG00005022033)	ENSMMDG00005022038	KCNA1 (ENSMMDG00005022042)	CNOT4 (ENSMMDG00005022049)	zgc:136858 (ENSMMDG00005022097)	ENSMMDG00005022105	tnni4a (ENSMMDG00005022107) ##20	ENSMMDG00005000116 ##20	ENSMMDG00005000125 ##20	ENSMMDG00005000128 ##20	bpgm (ENSMMDG00005000142)	tnnt2d (ENSMMDG00005000172) ##22	dnm1l (ENSMMDG00005000248)	dnajb9a (ENSMMDG00005000306)	ENSMMDG00005000313	NRCAM (ENSMMDG00005000496)	CNTN1 (ENSMMDG00005001022)	PDZRN4 (ENSMMDG00005001054)	GXYLT1 (ENSMMDG00005001060)	YAF2 (ENSMMDG00005001063)	PPHLN1 (ENSMMDG00005001065)	prickle1a (ENSMMDG00005001069)	ENSMMDG00005001071	ADAMTS20 (ENSMMDG00005001076)	irak4 (ENSMMDG00005001094)	twf1a (ENSMMDG00005001693)	TMEM117 (ENSMMDG00005001729)
Cod	MODERN SPECIES	22	slc35b4 (ENSGMOG00000001429)	golt1bb (ENSGMOG00000001414)	ldhbb (ENSGMOG00000001392)	tmpob (ENSGMOG00000033733)	pthlhb (ENSGMOG00000001359)	ENSGMOG00000022272	ENSGMOG00000001351	ENSGMOG00000019796	ENSGMOG00000034360	zgc:136858 (ENSGMOG00000001299)	ENSGMOG00000001224	ENSGMOG00000001148 ##20	ENSGMOG00000001131 ##20	bpgm (ENSGMOG00000023831)	ENSGMOG00000030388	tnnt2d (ENSGMOG00000001057) ##22	dnm1l (ENSGMOG00000001033)	dnajb9a (ENSGMOG00000036854)	ENSGMOG00000028053	NRCAM (ENSGMOG00000000846)	CNTN1 (ENSGMOG00000000812)	PDZRN4 (ENSGMOG00000030299)	GXYLT1 (ENSGMOG00000000771)	YAF2 (ENSGMOG00000000765)	PRICKLE1 (ENSGMOG00000000750)	ENSGMOG00000019794	ENSGMOG00000009177	ADAMTS20 (ENSGMOG00000009121)	irak4 (ENSGMOG00000009110)	twf1a (ENSGMOG00000009101)	ENSGMOG00000030565
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000153525.i.b	ENSGT00390000008708.a	ENSGT00940000154098.a.e	ENSGT00390000004933.k.b	ENSGT00940000160916	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a.g	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT01010000222986	ENSGT00390000014700.b.a.a	ENSGT00940000157816.a.a	ENSGT00940000158825.d
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	171	ENSGT00390000014507.a.a.h	ENSGT00940000153525.i.b.f	ENSGT00390000008708.a.b	ENSGT00940000154098.a.e.i	ENSGT00390000004933.k.b.d	ENSGT00940000160916	ENSGT00940000164299.b.b.a	ENSGT00940000158576.a.b.a	ENSGT00390000000068.a.b.d	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.g ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a ##20	ENSGT00950000182926.a.o	ENSGT00940000154709.a.b.b.c.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a.c	ENSGT00940000156246.c.a.c	ENSGT00940000154738.a.q.c	ENSGT00940000155419.c.a.h	ENSGT00940000155915.a.d	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.f	ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.a	ENSGT00390000016228.a.b.b	ENSGT00940000157529.i.a.f	ENSGT01010000222986.a	ENSGT00390000014700.b.a.a
Huchen	MODERN SPECIES	1737													ENSHHUG00000043534 ##20	bpgm (ENSHHUG00000043527)	ENSHHUG00000043519	tnnt2d (ENSHHUG00000043515) ##22	dnm1l (ENSHHUG00000043459)	dnajb9a (ENSHHUG00000043455)	PNPLA8 (ENSHHUG00000043439)
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00390000014507.a.a.h	ENSGT00940000153525.i.b.f	ENSGT00390000008708.a.b	ENSGT00940000154098.a.e.i	ENSGT00390000004933.k.b.d	ENSGT00940000160916	ENSGT00940000164299.b.b.a	ENSGT00940000158576.a.b.a	ENSGT00390000000068.a.b.d	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.g ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a ##20	ENSGT00950000182926.a.o	ENSGT00940000154709.a.b.b.c.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a.c	ENSGT00940000156246.c.a.c	ENSGT00940000154738.a.q.c	ENSGT00940000155419.c.a.h	ENSGT00940000155915.a.d	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.f	ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.a	ENSGT00390000016228.a.b.b	ENSGT00940000157529.i.a.f	ENSGT01010000222986.a	ENSGT00390000014700.b.a.a	ENSGT00940000159763.o	ENSGT00940000157816.a.a.a	ENSGT00940000158825.d.a	ENSGT00940000161128.f.b
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00390000014507.a.a.h	ENSGT00940000153525.i.b.f	ENSGT00390000008708.a.b	ENSGT00940000154098.a.e.i	ENSGT00390000004933.k.b.d	ENSGT00940000160916	ENSGT00940000164299.b.b.a	ENSGT00940000158576.a.b.a	ENSGT00390000000068.a.b.d	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.g ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a ##20	ENSGT00950000182926.a.o	ENSGT00940000154709.a.b.b.c.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a.c	ENSGT00940000156246.c.a.c	ENSGT00940000154738.a.q.c	ENSGT00940000155419.c.a.h	ENSGT00940000155915.a.d	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.f	ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.a	ENSGT00940000168203.a.a	ENSGT00940000157529.i.a.f	ENSGT01010000222986.a	ENSGT00390000014700.b.a.a	ENSGT00940000159763.o	ENSGT00940000157816.a.a.a	ENSGT00940000158825.d.a	ENSGT00940000161128.f.b
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	1	golt1bb (ENSSSAG00000082709)	ldhbb (ENSSSAG00000071409)	slc25a3b (ENSSSAG00000079558)	tmpob (ENSSSAG00000079549)	ENSSSAG00000095361	pthlhb (ENSSSAG00000111398)	ENSSSAG00000079511	ENSSSAG00000113251	ENSSSAG00000121992	ENSSSAG00000079490	zgc:136858 (ENSSSAG00000079479)	ENSSSAG00000079473	ENSSSAG00000079470 ##20	ENSSSAG00000079469 ##20	bpgm (ENSSSAG00000120740)	tnnt2d (ENSSSAG00000079466) ##22	dnm1l (ENSSSAG00000078961)	dnajb9a (ENSSSAG00000101678)	ENSSSAG00000078845	NRCAM (ENSSSAG00000077488)	CNTN1 (ENSSSAG00000075823)	ENSSSAG00000085342	YAF2 (ENSSSAG00000121965)	ENSSSAG00000075773	ENSSSAG00000075776	ENSSSAG00000075764	ric8a (ENSSSAG00000075692)	TPCN2 (ENSSSAG00000075685)	TPCN2 (ENSSSAG00000119661)	TPCN2 (ENSSSAG00000101120)	CCND1 (ENSSSAG00000087603)
River trout	MODERN SPECIES	37	slc35b4 (ENSSTUG00000014039)	golt1bb (ENSSTUG00000014009)	slc25a3b (ENSSTUG00000051258)	tmpob (ENSSTUG00000051257)	pthlhb (ENSSTUG00000051256)	ENSSTUG00000051255	ENSSTUG00000051254	KCNA1 (ENSSTUG00000051253)	CNOT4 (ENSSTUG00000051252)	zgc:136858 (ENSSTUG00000051251)	ENSSTUG00000051250	tnni4a (ENSSTUG00000051249) ##20	ENSSTUG00000051248 ##20	tnni4b.2 (ENSSTUG00000051247) ##20	bpgm (ENSSTUG00000051246)	tnnt2d (ENSSTUG00000051245) ##22	dnm1l (ENSSTUG00000051244)	ENSSTUG00000051243	NRCAM (ENSSTUG00000051155)	CNTN1 (ENSSTUG00000051085)	ENSSTUG00000051080	ENSSTUG00000051079	YAF2 (ENSSTUG00000051078)	ENSSTUG00000051077	PRICKLE1 (ENSSTUG00000051076)	ENSSTUG00000051075	ric8a (ENSSTUG00000051074)	ENSSTUG00000051073	CCND1 (ENSSTUG00000051072)	FGF4 (ENSSTUG00000051071)	FGF3 (ENSSTUG00000051069)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000002915.e	ENSGT00390000014507.a.a.h	ENSGT00390000008708.a.b	ENSGT00940000154098.a.e.i	ENSGT00390000004933.k.b.d	ENSGT00940000160916	ENSGT00940000164299.b.b.a	ENSGT00940000158576.a.b.a	ENSGT00390000000068.a.b.d	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.g ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a ##20	ENSGT00950000182926.a.o	ENSGT00940000154709.a.b.b.c.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a.c	ENSGT00940000156246.c.a.c	ENSGT00940000154738.a.q.c	ENSGT00940000155419.c.a.h	ENSGT00940000155915.a.d	ENSGT01080000258033.b	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.f	ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.a	ENSGT00390000016228.a.b.b	ENSGT00940000157529.i.a.f	ENSGT01010000222986.a	ENSGT00390000014700.b.a.a	ENSGT00940000159763.o	ENSGT00940000157816.a.a.a	ENSGT00940000158825.d.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000002915.e	ENSGT00390000014507.a.a.h	ENSGT00390000008708.a.b	ENSGT00940000154098.a.e.i	ENSGT00390000004933.k.b.d	ENSGT00940000160916	ENSGT00940000164299.b.b.a	ENSGT00940000158576.a.b.a	ENSGT00390000000068.a.b.d	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.g ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a ##20	ENSGT00950000182926.a.o	ENSGT00940000154709.a.b.b.c.c ##22	ENSGT00940000155504.k.a.c	ENSGT00940000156246.c.a.c	ENSGT00940000154738.a.q.c	ENSGT00940000155419.c.a.h	ENSGT00940000155915.a.d	ENSGT01080000258033.b	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.f	ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.a	ENSGT00390000016228.a.b.b	ENSGT00940000157529.i.a.f	ENSGT01010000222986.a	ENSGT00390000014700.b.a.a	ENSGT00940000157816.a.a.a	ENSGT00940000158825.d.a	ENSGT00940000161128.f.b
Chinook salmon	MODERN SPECIES	10	slc35b4 (ENSOTSG00005002559)	golt1bb (ENSOTSG00005002556)	slc25a3b (ENSOTSG00005002470)	tmpob (ENSOTSG00005002461)	pthlhb (ENSOTSG00005002457)	AGBL3 (ENSOTSG00005002448)	ENSOTSG00005002441	KCNA1 (ENSOTSG00005002438)	CNOT4 (ENSOTSG00005002413)	zgc:136858 (ENSOTSG00005002403)	ENSOTSG00005002397	tnni4a (ENSOTSG00005002083) ##20	ENSOTSG00005026375 ##20	tnni4b.2 (ENSOTSG00005026374) ##20	bpgm (ENSOTSG00005026373)	tnnt2d (ENSOTSG00005026372) ##22	dnm1l (ENSOTSG00005026295)	dnajb9a (ENSOTSG00005026291)	ENSOTSG00005026288	ENSOTSG00005026285	ENSOTSG00005024758	NRCAM (ENSOTSG00005024072)	PDZRN4 (ENSOTSG00005024063)	YAF2 (ENSOTSG00005024058)	PPHLN1 (ENSOTSG00005024056)	ENSOTSG00005024054	prickle1a (ENSOTSG00005024053)	ENSOTSG00005024052	tmem179ba (ENSOTSG00005024045)	ENSOTSG00005024043	ric8a (ENSOTSG00005024041)
Coho salmon	MODERN SPECIES	14	golt1bb (ENSOKIG00005016467)	slc25a3b (ENSOKIG00005016396)	tmpob (ENSOKIG00005016372)	ENSOKIG00005016360	pthlhb (ENSOKIG00005016357)	ENSOKIG00005016181	ENSOKIG00005016167	KCNA1 (ENSOKIG00005016156)	CNOT4 (ENSOKIG00005016111)	zgc:136858 (ENSOKIG00005016086)	ENSOKIG00005016072	tnni4a (ENSOKIG00005016061) ##20	ENSOKIG00005016053 ##20	tnni4b.2 (ENSOKIG00005015961) ##20	bpgm (ENSOKIG00005015943)	tnnt2d (ENSOKIG00005015934) ##22	ENSOKIG00005015928	dnm1l (ENSOKIG00005015703)	ENSOKIG00005015144	NRCAM (ENSOKIG00005012642)	CNTN1 (ENSOKIG00005011606)	ENSOKIG00005011460	PDZRN4 (ENSOKIG00005011445)	ENSOKIG00005011437	YAF2 (ENSOKIG00005011425)	PPHLN1 (ENSOKIG00005011412)	PRICKLE1 (ENSOKIG00005011404)	ENSOKIG00005011399	ENSOKIG00005011389	ric8a (ENSOKIG00005011374)	ENSOKIG00005011368
Rainbow trout	MODERN SPECIES	11	slc25a3b (ENSOMYG00000009202)	tmpob (ENSOMYG00000009068)	pthlhb (ENSOMYG00000052478)	ENSOMYG00000008988	ENSOMYG00000008920	ENSOMYG00000008911	ENSOMYG00000008877	zgc:136858 (ENSOMYG00000008802)	ENSOMYG00000048948	ENSOMYG00000067016	ENSOMYG00000008715	ENSOMYG00000008691 ##20	ENSOMYG00000008682 ##20	tnni4b.2 (ENSOMYG00000008671) ##20	bpgm (ENSOMYG00000008621)	tnnt2d (ENSOMYG00000008532) ##22	dnm1l (ENSOMYG00000008421)	dnajb9a (ENSOMYG00000063751)	ENSOMYG00000008104	ENSOMYG00000057517	NRCAM (ENSOMYG00000007983)	CNTN1 (ENSOMYG00000007478)	ENSOMYG00000064508	PDZRN4 (ENSOMYG00000006668)	YAF2 (ENSOMYG00000006598)	PPHLN1 (ENSOMYG00000006575)	PRICKLE1 (ENSOMYG00000006515)	ENSOMYG00000006496	ENSOMYG00000006457	ENSOMYG00000054271	CCND1 (ENSOMYG00000052324)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	344	ENSGT00950000182994.B.a.b.pb.a	ENSGT00530000063735.b.g	ENSGT00390000002915.f	ENSGT00390000014507.a.a.g	ENSGT00940000153525.i.b.e	ENSGT00390000008708.a.a	ENSGT00940000154098.a.e.j	ENSGT00390000004933.k.b.c	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b.b	ENSGT00940000158576.a.b.b	ENSGT00390000000068.a.b.c	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.h ##20	ENSGT00950000182926.a.p	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c.d ##22	ENSGT00940000155504.k.a.d	ENSGT00940000156246.c.a.d	ENSGT00940000154738.a.q.d	ENSGT00940000155419.c.a.g.b	ENSGT00940000155915.a.c	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.e	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.b	ENSGT00390000016228.a.b.a	ENSGT00940000157529.i.a.e	ENSGT01010000222986.b
Huchen	MODERN SPECIES	422	ENSHHUG00000001370	slc35b4 (ENSHHUG00000001317)	golt1bb (ENSHHUG00000001304)	ldhbb (ENSHHUG00000000706)	slc25a3b (ENSHHUG00000000548)	tmpob (ENSHHUG00000000532)	pthlhb (ENSHHUG00000000523)	ENSHHUG00000000516	ENSHHUG00000000510	KCNA1 (ENSHHUG00000000489)	CNOT4 (ENSHHUG00000000444)	ENSHHUG00000000418 ##20	ENSHHUG00000000401	bpgm (ENSHHUG00000000382)	ENSHHUG00000000361	tnnt2d (ENSHHUG00000000257) ##22	dnm1l (ENSHHUG00000000243)
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	83	ENSGT00950000182994.B.a.b.pb.a	ENSGT00530000063735.b.g	ENSGT00390000002915.f	ENSGT00390000014507.a.a.g	ENSGT00940000153525.i.b.e	ENSGT00390000008708.a.a	ENSGT00940000154098.a.e.j	ENSGT00390000004933.k.b.c	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b.b	ENSGT00940000158576.a.b.b	ENSGT00390000000068.a.b.c	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.h ##20	ENSGT00950000182926.a.p	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c.d ##22	ENSGT00940000155504.k.a.d	ENSGT00940000156246.c.a.d	ENSGT00940000154738.a.q.d	ENSGT00940000155419.c.a.g.b	ENSGT00940000155915.a.c	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.e	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.b	ENSGT00940000168203.a.b	ENSGT00390000016228.a.b.a	ENSGT00940000157529.i.a.e	ENSGT01010000222986.b	ENSGT00940000157816.a.a.b	ENSGT00940000158825.d.b	ENSGT00940000161128.f.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00950000182994.B.a.b.pb.a	ENSGT00530000063735.b.g	ENSGT00390000002915.f	ENSGT00390000014507.a.a.g	ENSGT00940000153525.i.b.e	ENSGT00390000008708.a.a	ENSGT00940000154098.a.e.j	ENSGT00390000004933.k.b.c	ENSGT00940000159286.a.a	ENSGT00940000164299.b.b.b	ENSGT00940000158576.a.b.b	ENSGT00390000000068.a.b.c	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b.h ##20	ENSGT00950000182926.a.p	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c.d ##22	ENSGT00940000155504.k.a.d	ENSGT00940000156246.c.a.d	ENSGT00940000154738.a.q.d	ENSGT00940000155419.c.a.g.b	ENSGT00940000155915.a.c	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b.e	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.a.c.b	ENSGT00940000168203.a.b	ENSGT00940000157529.i.a.e	ENSGT01010000222986.b	ENSGT00940000157816.a.a.b	ENSGT00940000158825.d.b	ENSGT00940000161128.f.a	ENSGT00940000157182.g.a.e
River trout	MODERN SPECIES	8	taf3 (ENSSTUG00000038874)	gdi2 (ENSSTUG00000038817)	ENSSTUG00000038795	slc35b4 (ENSSTUG00000038749)	golt1bb (ENSSTUG00000038711)	ldhbb (ENSSTUG00000038692)	slc25a3b (ENSSTUG00000038654)	tmpob (ENSSTUG00000038631)	pthlhb (ENSSTUG00000038622)	ENSSTUG00000038616	KCNA1 (ENSSTUG00000038609)	CNOT4 (ENSSTUG00000038542)	ENSSTUG00000038528 ##20	bpgm (ENSSTUG00000038520)	ENSSTUG00000038517	tnnt2d (ENSSTUG00000038509) ##22	dnm1l (ENSSTUG00000038282)	dnajb9a (ENSSTUG00000038242)	ENSSTUG00000038210	NRCAM (ENSSTUG00000036375)	CNTN1 (ENSSTUG00000031778)	ENSSTUG00000031557	GXYLT1 (ENSSTUG00000031535)	YAF2 (ENSSTUG00000031524)	ENSSTUG00000031512	prickle1a (ENSSTUG00000031503)	ENSSTUG00000031490	CCND1 (ENSSTUG00000031480)	FGF4 (ENSSTUG00000031452)	FGF3 (ENSSTUG00000031430)	ANO1 (ENSSTUG00000028543)
Northern pike	MODERN SPECIES	18	ENSELUG00000029450	golt1bb (ENSELUG00000008613)	ldhbb (ENSELUG00000008561)	slc25a3b (ENSELUG00000008650)	tmpob (ENSELUG00000008664)	pthlhb (ENSELUG00000008679)	ENSELUG00000000332	ENSELUG00000008708	KCNA1 (ENSELUG00000008711)	CNOT4 (ENSELUG00000008742)	zgc:136858 (ENSELUG00000008826)	ENSELUG00000008902	tnni4b.2 (ENSELUG00000008923) ##20	bpgm (ENSELUG00000008952)	CALD1 (ENSELUG00000029365)	tnnt2d (ENSELUG00000015595) ##22	dnm1l (ENSELUG00000009177)	dnajb9a (ENSELUG00000030103)	ENSELUG00000009230	NRCAM (ENSELUG00000009528)	CNTN1 (ENSELUG00000009649)	PDZRN4 (ENSELUG00000009706)	GXYLT1 (ENSELUG00000009783)	YAF2 (ENSELUG00000009802)	ENSELUG00000009809	prickle1a (ENSELUG00000009843)	ENSELUG00000009865	ric8a (ENSELUG00000009893)	TPCN2 (ENSELUG00000009976)	CCND1 (ENSELUG00000010020)	FGF4 (ENSELUG00000029727)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	150					ENSGT00940000158686.d	ENSGT00940000154189.B	ENSGT00940000159839.d.b	ENSGT00390000010968.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000159018.d	ENSGT00940000175224	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000155025.A	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.l	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00810000125439.B.c.a
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	139	ENSGT00940000158686.d	ENSGT00940000154189.B	ENSGT00940000159839.d.b	ENSGT00390000010968.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000175224	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000155025.A	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00530000063554.a	ENSGT00940000160061	ENSGT00950000183194.a.a	ENSGT00950000183194.b	ENSGT00390000006791	ENSGT01020000230394.e.a.a.a.a.a	ENSGT00940000157810
Denticle herring	MODERN SPECIES	8	KCNA1 (ENSDCDG00000033135)	tmem178ba (ENSDCDG00000033136)	CNOT4 (ENSDCDG00000033138)	ENSDCDG00000033146	ENSDCDG00000033148	ENSDCDG00000033149	ENSDCDG00000033151	zgc:136858 (ENSDCDG00000033153)	ENSDCDG00000033158 ##20	ENSDCDG00000033159 ##20	ENSDCDG00000033161 ##20	ENSDCDG00000033162 ##20	tnni4b.2 (ENSDCDG00000033163) ##20	bpgm (ENSDCDG00000033165)	CALD1 (ENSDCDG00000033169)	tnnt2d (ENSDCDG00000033173) ##22	dnm1l (ENSDCDG00000033194)	dnajb9a (ENSDCDG00000033272)	ENSDCDG00000012665	ENSDCDG00000012785	ENSDCDG00000013496	CNTN1 (ENSDCDG00000027377)	ENSDCDG00000027473	PDZRN4 (ENSDCDG00000027474)	GXYLT1 (ENSDCDG00000027476)	pus7 (ENSDCDG00000027483)	hdac10 (ENSDCDG00000027612)	ENSDCDG00000027700	parvg (ENSDCDG00000027702)	SHISAL1 (ENSDCDG00000027705)	plxnb2b (ENSDCDG00000027888)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	19	gtse1 (ENSCHAG00000006220)	ENSCHAG00000004490	GRAMD4 (ENSCHAG00000002310)	ENSCHAG00000002221	KCNA1 (ENSCHAG00000002201)	tmem178ba (ENSCHAG00000002185)	CNOT4 (ENSCHAG00000002097)	ENSCHAG00000002073	ENSCHAG00000002049	zgc:136858 (ENSCHAG00000001892)	ENSCHAG00000001832 ##20	tnni4b.2 (ENSCHAG00000001623) ##20	ENSCHAG00000001241 ##20	bpgm (ENSCHAG00000001141)	ENSCHAG00000001093	tnnt2d (ENSCHAG00000000865) ##22	dnm1l (ENSCHAG00000027213)	dnajb9a (ENSCHAG00000027196)	ENSCHAG00000027195	ENSCHAG00000027160	NRCAM (ENSCHAG00000024494)	CNTN1 (ENSCHAG00000022843)	PDZRN4 (ENSCHAG00000022707)	ENSCHAG00000022702	GXYLT1 (ENSCHAG00000022694)	pus7 (ENSCHAG00000021961)	hdac10 (ENSCHAG00000021810)	parvb (ENSCHAG00000021676)	parvg (ENSCHAG00000021655)	SHISAL1 (ENSCHAG00000021649)	ahcyl2a (ENSCHAG00000021159)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	104	ENSGT00950000183004.a.b.b	ENSGT00510000047522	ENSGT00940000159839.d.b	ENSGT00390000010968.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000165644.e	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00390000011620.b.e.h	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.b	ENSGT00940000157431.c.a	ENSGT00390000016435	ENSGT00530000064192	ENSGT00530000063113.A	ENSGT00940000155057.wb.f	ENSGT00940000153567.a.a.b.a	ENSGT00940000153567.a.a.b.b.b	ENSGT00940000158940.b
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000158686.d	ENSGT00640000091774.a.c.a	ENSGT00940000159839.d.b	ENSGT00390000010968.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000165644.e	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00390000011620.b.e.h	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.b	ENSGT00940000157431.c.a	ENSGT00390000016435	ENSGT00530000064192	ENSGT00530000063113.A	ENSGT00940000155057.wb.f	ENSGT00940000153567.a.a.b.a	ENSGT00940000153567.a.a.b.b.b	ENSGT00940000158940.b
Channel catfish	MODERN SPECIES	27	ENSIPUG00000006567	ENSIPUG00000006537	GRAMD4 (ENSIPUG00000006473)	ENSIPUG00000006451	KCNA1 (ENSIPUG00000006446)	tmem178ba (ENSIPUG00000006428)	cnot4 (ENSIPUG00000006393)	zgc:136858 (ENSIPUG00000006339)	ENSIPUG00000006327	ENSIPUG00000006305 ##20	tnni4b.2 (ENSIPUG00000006254) ##20	ENSIPUG00000006229 ##20	ENSIPUG00000006197 ##20	bpgm (ENSIPUG00000006178)	ENSIPUG00000006161	tnnt2d (ENSIPUG00000006128) ##22	dnm1l (ENSIPUG00000006021)	Dnajb9 (ENSIPUG00000006006)	ENSIPUG00000005936	kctd15l (ENSIPUG00000005894)	CHST8 (ENSIPUG00000005881)	adal (ENSIPUG00000005795)	cplx3 (ENSIPUG00000005778)	csk (ENSIPUG00000005716)	edc3 (ENSIPUG00000005695)	kxd1 (ENSIPUG00000005659)	ergic2 (ENSIPUG00000005608)	MAGI2 (ENSIPUG00000005235)	gnaia (ENSIPUG00000004369)	CHRM2 (ENSIPUG00000004348)	fbxl14a (ENSIPUG00000004339)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000158686.d	ENSGT00640000091774.a.c.a	ENSGT00940000159839.d.b	ENSGT00390000010968.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000165644.e	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00390000011620.b.e.h	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.b	ENSGT00940000157431.c.a	ENSGT00390000016435	ENSGT00530000064192	ENSGT00530000063113.A	ENSGT00940000155057.wb.f	ENSGT00940000153567.a.a.b.a	ENSGT00940000153567.a.a.b.b.b	ENSGT00940000158940.b
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00640000091774.a.c.b	ENSGT00950000183004.a.b.b	ENSGT00940000159839.d.b	ENSGT00390000010968.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000165644.e	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00390000011620.b.e.h	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.b	ENSGT00940000157431.c.a	ENSGT00390000016435	ENSGT00530000064192	ENSGT00530000063113.A	ENSGT00940000155057.wb.f	ENSGT00940000153567.a.a.b.a	ENSGT00940000153567.a.a.b.b.b	ENSGT00940000158940.b
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	16	zgc:101783 (ENSAMXG00000033552)	ENSAMXG00000009402	ENSAMXG00000009342	GRAMD4 (ENSAMXG00000034463)	ENSAMXG00000035147	ENSAMXG00000033288	KCNA1 (ENSAMXG00000024909)	CNOT4 (ENSAMXG00000001373)	tmem178ba (ENSAMXG00000001358)	zgc:136858 (ENSAMXG00000001386)	ENSAMXG00000001401	ENSAMXG00000001410 ##20	ENSAMXG00000041360 ##20	bpgm (ENSAMXG00000043597)	ENSAMXG00000001442	tnnt2d (ENSAMXG00000001452) ##22	dnm1l (ENSAMXG00000001473)	dnajb9a (ENSAMXG00000041051)	ENSAMXG00000001498	kctd15a (ENSAMXG00000001523)	CHST8 (ENSAMXG00000041509)	adal (ENSAMXG00000001538)	cplx3a (ENSAMXG00000040195)	csk (ENSAMXG00000001554)	edc3 (ENSAMXG00000001589)	kxd1 (ENSAMXG00000031268)	ergic2 (ENSAMXG00000034586)	MAGI2 (ENSAMXG00000001699)	gnaia (ENSAMXG00000040807)	CHRM2 (ENSAMXG00000001797)	fbxl14a (ENSAMXG00000030520)
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	14	zgc:101783 (ENSPNAG00000020851)	ENSPNAG00000020670	GRAMD4 (ENSPNAG00000020639)	ENSPNAG00000020490	KCNA1 (ENSPNAG00000020478)	tmem178ba (ENSPNAG00000020457)	CNOT4 (ENSPNAG00000020433)	zgc:136858 (ENSPNAG00000020362)	ENSPNAG00000005186	ENSPNAG00000020311 ##20	tnni4b.2 (ENSPNAG00000020281) ##20	ENSPNAG00000020275 ##20	ENSPNAG00000020254 ##20	bpgm (ENSPNAG00000020232)	ENSPNAG00000020214	tnnt2d (ENSPNAG00000020179) ##22	dnm1l (ENSPNAG00000020017)	dnajb9a (ENSPNAG00000019951)	ENSPNAG00000019924	kctd15a (ENSPNAG00000019793)	CHST8 (ENSPNAG00000019778)	adal (ENSPNAG00000019774)	cplx3a (ENSPNAG00000003608)	csk (ENSPNAG00000019720)	edc3 (ENSPNAG00000019657)	kxd1 (ENSPNAG00000019635)	ergic2 (ENSPNAG00000019558)	MAGI2 (ENSPNAG00000019454)	gnaia (ENSPNAG00000018193)	CHRM2 (ENSPNAG00000018150)	PRR5 (ENSPNAG00000018123)
Electric eel	MODERN SPECIES	210	zgc:101783 (ENSEEEG00000021638)	ENSEEEG00000021640	ENSEEEG00000021646	ENSEEEG00000021676	GRAMD4 (ENSEEEG00000021680)	ENSEEEG00000021741	KCNA1 (ENSEEEG00000021742)	tmem178ba (ENSEEEG00000021744)	CNOT4 (ENSEEEG00000021750)	zgc:136858 (ENSEEEG00000021808)	ENSEEEG00000021811	ENSEEEG00000021812 ##20	tnni4b.2 (ENSEEEG00000021817) ##20	bpgm (ENSEEEG00000021875)	ENSEEEG00000021880	tnnt2d (ENSEEEG00000021889) ##22	dnm1l (ENSEEEG00000021907)	dnajb9a (ENSEEEG00000021919)	ENSEEEG00000021922	kctd15a (ENSEEEG00000021924)	CHST8 (ENSEEEG00000021927)	adal (ENSEEEG00000021931)	cplx3a (ENSEEEG00000021934)	csk (ENSEEEG00000021940)	edc3 (ENSEEEG00000021958)	kxd1 (ENSEEEG00000021960)	ergic2 (ENSEEEG00000021964)	MAGI2 (ENSEEEG00000021972)	ENSEEEG00000021977	gnaia (ENSEEEG00000021980)	CHRM2 (ENSEEEG00000021997)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00940000164201.c.b.a.e.b.a	ENSGT00950000183004.a.b.b	ENSGT00940000159839.d.b	ENSGT00390000010968.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e	ENSGT00390000000068.a.b	ENSGT00390000007427	ENSGT00940000165644.e	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c ##22	ENSGT00940000155504.j	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00390000011620.b.e.h	ENSGT00940000159496.l	ENSGT00940000159100.h	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.b	ENSGT00940000157431.c.a	ENSGT00390000016435	ENSGT00530000064192	ENSGT00530000063113.A	ENSGT00940000155057.wb.e.b	ENSGT00940000153567.a.a.b.b.b	ENSGT00940000158940.b.a	ENSGT00940000159857.a.b
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	152	ENSGT00640000091774.a.c.b.a	ENSGT00950000183004.a.b.b.a	ENSGT00510000047522.d.a	ENSGT00940000159839.d.b.a	ENSGT00390000010968.a.a	ENSGT00940000164299.b.b	ENSGT00940000158576.a.b.e	ENSGT00390000015299.a.b.b.a.e.b	ENSGT00390000000068.a.b.b	ENSGT00390000007427.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.n.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b ##20	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a.a.a ##20	ENSGT00950000182926.a.q	ENSGT00940000153901.a.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.c.e ##22	ENSGT00940000155504.j.b	ENSGT00940000156246.c.a.a	ENSGT00390000011620.b.e.h.b	ENSGT00940000159496.l.a	ENSGT00940000159100.h.a	ENSGT00950000182938.b.b.b.b.a.e.b	ENSGT00940000157431.c.a.b	ENSGT00390000016435.f	ENSGT00530000064192	ENSGT00530000063113.A.s.b	ENSGT00940000155057.wb.e.b	ENSGT00940000153567.a.a.b.b.b.b	ENSGT00940000158940.b.a.b	ENSGT00940000159857.a.b.a	ENSGT00530000063981.a.h.a
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Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	76	ENSGT01060000248530.C.d	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.b	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504	ENSGT00940000156246.c.a	ENSGT00940000154738.a.q	ENSGT00940000155419.c.a	ENSGT00940000155915.a	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156242.c.a	ENSGT00390000013995.b.b.k.b	ENSGT00390000016228.a.b	ENSGT00940000157529.i.a	ENSGT00940000158636	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT00390000013052	ENSGT01100000263537.b.a.b
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	286	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659.g	ENSGT00940000160513.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659.g	ENSGT00940000160513.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000157013	ENSGT00390000014507.a.b	ENSGT00390000012501	ENSGT00390000018612.a.b	ENSGT00940000178181	ENSGT00940000153525.i.a	ENSGT00390000008708.h.b	ENSGT00940000154098.a.f	ENSGT00940000155197	ENSGT00950000182939.b.a.b	ENSGT00940000156122	ENSGT00390000009532.A.d.a	ENSGT00530000063722.a	ENSGT00390000004708	ENSGT00390000001810.b
Denticle herring	MODERN SPECIES	6	STRIP2 (ENSDCDG00000022128)	ahcyl2b (ENSDCDG00000023271)	tmem209 (ENSDCDG00000025975)	tfec (ENSDCDG00000026525)	mdfic (ENSDCDG00000026535)	foxp2 (ENSDCDG00000026542)	ENSDCDG00000026565	ENSDCDG00000026567	gpr85 (ENSDCDG00000026568)	tmem168a (ENSDCDG00000026569)	ifrd1 (ENSDCDG00000026576)	dock4b (ENSDCDG00000027114)	LRRN3 (ENSDCDG00000029156)	tnni4a (ENSDCDG00000029158) ##20	ENSDCDG00000029166	tnnt2e (ENSDCDG00000029186) ##22	recql (ENSDCDG00000029263)	golt1ba (ENSDCDG00000029386)	spx (ENSDCDG00000029392)	gys2 (ENSDCDG00000029426)	ENSDCDG00000029502	LDHB (ENSDCDG00000029505)	slc25a3a (ENSDCDG00000029507)	tmpoa (ENSDCDG00000029526)	strap (ENSDCDG00000029544)	ETNK1 (ENSDCDG00000029568)	sox5 (ENSDCDG00000029652)	bcat1 (ENSDCDG00000031700)	bcat1 (ENSDCDG00000031716)	lrmp (ENSDCDG00000031732)	dnai7 (ENSDCDG00000031761)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	7	ENSCHAG00000002119	ttll12 (ENSCHAG00000001935)	tfec (ENSCHAG00000001890)	mdfic (ENSCHAG00000001867)	foxp2 (ENSCHAG00000001700)	ENSCHAG00000001675	gpr85 (ENSCHAG00000001657)	tmem168a (ENSCHAG00000001632)	ENSCHAG00000001589	ENSCHAG00000001572	ifrd1 (ENSCHAG00000000859)	dock4b (ENSCHAG00000025982)	LRRN3 (ENSCHAG00000025932)	tnni4a (ENSCHAG00000025931) ##20	ENSCHAG00000025913	tnnt2e (ENSCHAG00000025894) ##22	recql (ENSCHAG00000025656)	golt1ba (ENSCHAG00000025646)	spx (ENSCHAG00000025633)	gys2 (ENSCHAG00000025612)	ENSCHAG00000025606	LDHB (ENSCHAG00000025589)	slc25a3a (ENSCHAG00000025575)	tmpoa (ENSCHAG00000025573)	strap (ENSCHAG00000025561)	ETNK1 (ENSCHAG00000025552)	ENSCHAG00000025547	sox5 (ENSCHAG00000024830)	bcat1 (ENSCHAG00000024785)	lrmp (ENSCHAG00000024767)	dnai7 (ENSCHAG00000024762)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	197	ENSGT00940000155834.i.a	ENSGT00940000157129.f.a	ENSGT00940000156375	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659.g	ENSGT00940000160513.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155118	ENSGT00390000016813	ENSGT00940000155166.A	ENSGT00390000001810.b
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000155834.i.a	ENSGT00940000157129.f.a	ENSGT00940000156375	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659.g	ENSGT00940000160513.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155118	ENSGT00390000016813	ENSGT00940000155166.A	ENSGT00390000001810.b	ENSGT00390000013963	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000155083.b.b	ENSGT00940000155840.B	ENSGT00940000178699	ENSGT00390000007725.A.a	ENSGT00940000159226	ENSGT00940000158420	ENSGT00940000157502
Channel catfish	MODERN SPECIES	10	lta4h (ENSIPUG00000014626)	tfec (ENSIPUG00000014576)	mdfic (ENSIPUG00000014546)	foxp2 (ENSIPUG00000014449)	ENSIPUG00000014435	ppp1r3a (ENSIPUG00000014427)	ENSIPUG00000014420	gpr85 (ENSIPUG00000014414)	tmem168a (ENSIPUG00000014388)	ifrd1 (ENSIPUG00000014358)	dock4b (ENSIPUG00000014272)	ENSIPUG00000014253	LRRN3 (ENSIPUG00000014248)	ENSIPUG00000014221	tnni4a (ENSIPUG00000014198) ##20	tnnt2e (ENSIPUG00000013872) ##22	arl1 (ENSIPUG00000013834)	UTP20 (ENSIPUG00000013717)	SLC5A8 (ENSIPUG00000013614)	lyrm5a (ENSIPUG00000013599)	tmem209 (ENSIPUG00000013541)	ahcyl2 (ENSIPUG00000013498)	strip2 (ENSIPUG00000013388)	ENSIPUG00000013372	cd9b (ENSIPUG00000013348)	ENSIPUG00000013339	ano2b (ENSIPUG00000013298)	ENSIPUG00000013287	ntf3 (ENSIPUG00000013282)	tbc1d30 (ENSIPUG00000013150)	GNS (ENSIPUG00000012877)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00940000155834.i.a	ENSGT00940000157129.f.a	ENSGT00940000156375	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659.g	ENSGT00940000160513.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155118	ENSGT00390000016813	ENSGT00940000155166.A.k	ENSGT00390000001810.b	ENSGT00390000013963	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000155083.b.b	ENSGT00940000155840.B	ENSGT00940000178699	ENSGT00390000007725.A.a	ENSGT00940000159226	ENSGT00940000158420	ENSGT00440000039984.b
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	52						ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659.g	ENSGT00940000160513.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155118	ENSGT00390000016813	ENSGT00940000155166.A.k	ENSGT00390000001810.b	ENSGT00390000013963	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000155083.b.b	ENSGT00940000155840.B	ENSGT00940000178699	ENSGT00390000007725.A.a	ENSGT00940000159226	ENSGT00940000158420	ENSGT00440000039984.b
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	30	FHL3 (ENSPNAG00000027762)	utp11 (ENSPNAG00000027810)	pou3f1 (ENSPNAG00000027843)	ENSPNAG00000027868	mdfic (ENSPNAG00000006070)	foxp2 (ENSPNAG00000027970)	ENSPNAG00000027984	ENSPNAG00000027993	gpr85 (ENSPNAG00000028005)	tmem168a (ENSPNAG00000028041)	ifrd1 (ENSPNAG00000028124)	dock4b (ENSPNAG00000028644)	LRRN3 (ENSPNAG00000006170)	tnni4a (ENSPNAG00000004412) ##20	ENSPNAG00000028724	tnnt2e (ENSPNAG00000028755) ##22	arl1 (ENSPNAG00000028795)	UTP20 (ENSPNAG00000006176)	SLC5A8 (ENSPNAG00000004576)	lyrm5a (ENSPNAG00000004582)	tmem209 (ENSPNAG00000029451)	ahcyl2b (ENSPNAG00000029543)	ENSPNAG00000029649	SMKR1 (ENSPNAG00000029660)	cd9b (ENSPNAG00000029669)	ano2b (ENSPNAG00000029696)	ENSPNAG00000029728	ntf3 (ENSPNAG00000029730)	TBC1D30 (ENSPNAG00000005653)	gnsa (ENSPNAG00000029802)	RASSF3 (ENSPNAG00000029822)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	22	NUAK1 (ENSAMXG00000037988)	ENSAMXG00000037561	plxnb2a.1 (ENSAMXG00000019507)	ENSAMXG00000030722	abcc9 (ENSAMXG00000019554)	kcnj8 (ENSAMXG00000019562)	cmasa (ENSAMXG00000042802)	shisal1a (ENSAMXG00000033946)	ENSAMXG00000033252	tmem168a (ENSAMXG00000040874)	ifrd1 (ENSAMXG00000020926)	dock4b (ENSAMXG00000020829)	LRRN3 (ENSAMXG00000025297)	tnni4a (ENSAMXG00000038183) ##20	CALD1 (ENSAMXG00000020776)	tnnt2e (ENSAMXG00000020761) ##22	ENSAMXG00000038902	phyh (ENSAMXG00000003955)	ENSAMXG00000029918	mcm10 (ENSAMXG00000003979)	pparaa (ENSAMXG00000034838)	ENSAMXG00000030973	atxn10 (ENSAMXG00000004019)	ENSAMXG00000004027	slc26a4 (ENSAMXG00000004033)	slc26a4 (ENSAMXG00000043653)	slc26a3.2 (ENSAMXG00000004041)	slc26a3.1 (ENSAMXG00000004068)	cbll1 (ENSAMXG00000004083)	ENSAMXG00000042950	cdpf1 (ENSAMXG00000004088)
Electric eel	MODERN SPECIES	248													dock4b (ENSEEEG00000001986)	tnni4a (ENSEEEG00000001939) ##20	ENSEEEG00000001938	tnnt2e (ENSEEEG00000001937) ##22	arl1 (ENSEEEG00000001931)	UTP20 (ENSEEEG00000001926)	tmem209 (ENSEEEG00000001759)	ahcyl2b (ENSEEEG00000001226)	STRIP2 (ENSEEEG00000001198)	ENSEEEG00000001196	cd9b (ENSEEEG00000001194)	ano2b (ENSEEEG00000001191)	ano2b (ENSEEEG00000001189)	ntf3 (ENSEEEG00000001188)	TBC1D30 (ENSEEEG00000001186)	gnsa (ENSEEEG00000000998)	SLC5A8 (ENSEEEG00000000931)	ENSEEEG00000000922	ENSEEEG00000000920
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00940000155834.i.a	ENSGT00940000157129.f.a	ENSGT00940000156375	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659.g	ENSGT00940000160513.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155118	ENSGT00390000016813	ENSGT00940000155166.A	ENSGT00390000001810.b	ENSGT00940000165907	ENSGT00510000049725	ENSGT00730000112347	ENSGT00940000158804	ENSGT00940000166093	ENSGT00390000000509	ENSGT00940000164536.a.a	ENSGT00940000155625	ENSGT00950000182919.A.p.g.b	ENSGT00940000164385.a.b	ENSGT00940000158416.q.b
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	468	ENSGT01030000234852.i	ENSGT00940000155834.i.a.f	ENSGT00940000157129.f.a.c	ENSGT00940000156375.f	ENSGT00940000159404.f	ENSGT00940000158685.s.b	ENSGT00940000155480.d.g.b	ENSGT00940000157682.B.a.d	ENSGT00890000139436.B.i	ENSGT00390000005941.c.f	ENSGT00390000013347.a.m	ENSGT00940000155659.g.a	ENSGT00940000160513.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.m.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.a.a ##22	ENSGT00940000155118	ENSGT00390000016813
Goldfish	MODERN SPECIES	21	ENSCARG00000068135	nrcama (ENSCARG00000056635)	cntn1b (ENSCARG00000055828)	pdzrn4 (ENSCARG00000055814)	yaf2 (ENSCARG00000055798)	pphln1 (ENSCARG00000055722)	prickle1b (ENSCARG00000055699)	pus7l (ENSCARG00000055654)	twf1b (ENSCARG00000055610)	ENSCARG00000055564	ENSCARG00000055548	optn (ENSCARG00000055531)	ccdc3a (ENSCARG00000055522)	tnni4a (ENSCARG00000055431) ##20	ENSCARG00000055404	tnnt2e (ENSCARG00000055169) ##22	ARL1 (ENSCARG00000055137)	UTP20 (ENSCARG00000055081)	lyrm5a (ENSCARG00000055052)	ENSCARG00000055033	rhno1 (ENSCARG00000055013)	tmem209 (ENSCARG00000054634)	ahcyl2b (ENSCARG00000054196)	ENSCARG00000053978	ENSCARG00000053954	mapk11 (ENSCARG00000053468)	mapk12b (ENSCARG00000052337)	si:dkey-14d8.6 (ENSCARG00000052284)	ENSCARG00000052272	aebp2 (ENSCARG00000052207)	ENSCARG00000052190
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	155	ENSGT01030000234852.i	ENSGT00940000155834.i.a.f	ENSGT00940000157129.f.a.c	ENSGT00940000156375.f	ENSGT00940000159404.f	ENSGT00940000158685.s.b	ENSGT00940000155480.d.g.a.b	ENSGT00940000157682.B.a.d	ENSGT00890000139436.B.i.a	ENSGT00390000005941.c.f	ENSGT00390000013347.a.m	ENSGT00940000155659.g.a	ENSGT00940000160513.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.m.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.a.a ##22	ENSGT00940000155118	ENSGT00390000016813
Common carp reference	MODERN SPECIES	36	cdk17 (ENSCCRG00000015572)	elk3 (ENSCCRG00000015512)	lta4h (ENSCCRG00000072108)	tfec (ENSCCRG00000011650)	mdfic (ENSCCRG00000066981)	foxp2 (ENSCCRG00000026505)	ENSCCRG00000081791	gpr85 (ENSCCRG00000032331)	tmem168a (ENSCCRG00000050299)	ifrd1 (ENSCCRG00000082433)	dock4b (ENSCCRG00000027896)	ENSCCRG00000056699	LRRN3 (ENSCCRG00000060299)	tnni4a (ENSCCRG00000063388) ##20	ENSCCRG00000047556	tnnt2e (ENSCCRG00000075873) ##22	ENSCCRG00000051073	ENSCCRG00000047446	ENSCCRG00000047433	foxm1 (ENSCCRG00000077458)	ENSCCRG00000063094	pgm3 (ENSCCRG00000011475)	ngs (ENSCCRG00000011465)	ccnc (ENSCCRG00000011463)	ENSCCRG00000035783	ENSCCRG00000035817	ENSCCRG00000035815	tmem63a (ENSCCRG00000057082)	rsph9 (ENSCCRG00000016902)	mrps18a (ENSCCRG00000016908)	vegfab (ENSCCRG00000074007)
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000155834.i.a.e	ENSGT00940000157129.f.a.d	ENSGT00940000156375.e	ENSGT00940000159404.e	ENSGT00940000158685.s.a	ENSGT00940000155480.d.g.a.a	ENSGT00940000157682.B.a.c	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B.j	ENSGT00390000005941.c.e	ENSGT00390000013347.a.n	ENSGT00940000155659.g.b	ENSGT00940000160513.a.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.m.a ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.a.b.a ##22	ENSGT00940000155166.A	ENSGT00390000001810.b	ENSGT00940000165907.b	ENSGT00510000049725.b	ENSGT00730000112347.d	ENSGT00940000158804.o	ENSGT00940000166093.s	ENSGT00390000000509.f	ENSGT00940000164536.a.a.a	ENSGT00940000155625.mb	ENSGT00950000182919.A.p.g.b.d	ENSGT00940000164385.a.b.a	ENSGT00940000158416.q.b	ENSGT00940000159576.c	ENSGT00390000018686.c
Goldfish	MODERN SPECIES	33	ENSCARG00000020644	cdk17 (ENSCARG00000020493)	elk3 (ENSCARG00000020464)	lta4h (ENSCARG00000020220)	tfec (ENSCARG00000020165)	mdfic (ENSCARG00000020149)	foxp2 (ENSCARG00000020033)	ENSCARG00000020009	gpr85 (ENSCARG00000020003)	tmem168a (ENSCARG00000019994)	ifrd1 (ENSCARG00000019937)	dock4b (ENSCARG00000009018)	LRRN3 (ENSCARG00000008598)	tnni4a (ENSCARG00000008581) ##20	ENSCARG00000008540	tnnt2e (ENSCARG00000008526) ##22	arl1 (ENSCARG00000008447)	SLC5A8 (ENSCARG00000006736)	lyrm5a (ENSCARG00000006646)	ENSCARG00000006592	pex26 (ENSCARG00000006573)	rhno1 (ENSCARG00000006553)	foxm1 (ENSCARG00000006536)	ENSCARG00000006486	pgm3 (ENSCARG00000006382)	ngs (ENSCARG00000006314)	ccnc (ENSCARG00000006243)	FAXC (ENSCARG00000006223)	pou3f2a (ENSCARG00000006209)	tmem63a (ENSCARG00000006046)	rsph9 (ENSCARG00000006017)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	136	ENSGT00940000155834.i.a.e	ENSGT00940000157129.f.a.d	ENSGT00940000156375.e	ENSGT00940000159404.e	ENSGT00940000158685.s.a	ENSGT00940000155480.d.g.a.a	ENSGT00940000157682.B.a.c	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B.j	ENSGT00390000005941.c.e	ENSGT00390000013347.a.n	ENSGT00940000155659.g.b	ENSGT00940000160513.a.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.m.a ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.a.b.a ##22
Common carp reference	MODERN SPECIES	8	elk3 (ENSCCRG00000076749)	lta4h (ENSCCRG00000061234)	lta4h (ENSCCRG00000060859)	tfec (ENSCCRG00000043524)	mdfic (ENSCCRG00000015476)	foxp2 (ENSCCRG00000015401)	ENSCCRG00000032329	ENSCCRG00000038927	gpr85 (ENSCCRG00000075623)	tmem168a (ENSCCRG00000026446)	ifrd1 (ENSCCRG00000027614)	dock4b (ENSCCRG00000019452)	LRRN3 (ENSCCRG00000076945)	tnni4a (ENSCCRG00000079834) ##20	ENSCCRG00000025497	tnnt2e (ENSCCRG00000071307) ##22	arl1 (ENSCCRG00000047537)	ENSCCRG00000051096	ENSCCRG00000051283	pex26 (ENSCCRG00000051288)	rhno1 (ENSCCRG00000051292)	foxm1 (ENSCCRG00000063193)	ENSCCRG00000065583	pgm3 (ENSCCRG00000051654)	ngs (ENSCCRG00000051678)	ccnc (ENSCCRG00000051681)	ENSCCRG00000035821	pou3f2a (ENSCCRG00000035785)	tmem63a (ENSCCRG00000035809)	rsph9 (ENSCCRG00000012854)	mrps18a (ENSCCRG00000082439)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.a.b.b ##22
Goldfish	MODERN SPECIES	33	opn1sw1 (ENSCARG00000069872)	tnpo3 (ENSCARG00000069857)	irf5 (ENSCARG00000069845)	ENSCARG00000069841	ENSCARG00000069832	nrcama (ENSCARG00000069031)	cntn1b (ENSCARG00000068699)	ENSCARG00000068674	gpr85 (ENSCARG00000068666)	tmem168a (ENSCARG00000068661)	ifrd1 (ENSCARG00000068532)	dock4b (ENSCARG00000058171)	LRRN3 (ENSCARG00000057520)	tnni4a (ENSCARG00000057495) ##20	ENSCARG00000057430	tnnt2e (ENSCARG00000057414) ##22	ARL1 (ENSCARG00000057305)	ENSCARG00000056857	ENSCARG00000056759	pex26 (ENSCARG00000056742)	rhno1 (ENSCARG00000056728)	foxm1 (ENSCARG00000056708)	ENSCARG00000056662	pgm3 (ENSCARG00000056520)	ngs (ENSCARG00000056434)	ccnc (ENSCARG00000056349)	FAXC (ENSCARG00000056318)	tspan9b (ENSCARG00000056278)	svopl (ENSCARG00000055836)	ENSCARG00000055762	parp12b (ENSCARG00000055746)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.b ##22
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.b ##22
Golden-line barbel	DUPLICATION
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	4615																tnnt2e (ENSSGRG00000003179) ##22
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	4558																tnnt2e (ENSSGRG00000004257) ##22
Zebrafish	MODERN SPECIES	19	SLC5A8 (ENSDARG00000087120)	UTP20 (ENSDARG00000099280)	arl1 (ENSDARG00000101680)	tfec (ENSDARG00000098745)	mdfic (ENSDARG00000074223)	foxp2 (ENSDARG00000005453)	ENSDARG00000090468	ENSDARG00000099281	gpr85 (ENSDARG00000068701)	tmem168a (ENSDARG00000068705)	ifrd1 (ENSDARG00000068708)	dock4b (ENSDARG00000024874)	LRRN3 (ENSDARG00000102702)	ENSDARG00000101296	tnni4a (ENSDARG00000099870) ##20	tnnt2e (ENSDARG00000045822) ##22	lta4h (ENSDARG00000006029)	elk3 (ENSDARG00000018688)	cdk17 (ENSDARG00000079470)	si:ch1073-67j19.1 (ENSDARG00000105096)	si:ch1073-67j19.2 (ENSDARG00000104976)	phyh (ENSDARG00000086740)	ucmaa (ENSDARG00000027799)	mcm10 (ENSDARG00000045815)	nudt5 (ENSDARG00000078073)	cdc123 (ENSDARG00000075025)	camk1da (ENSDARG00000074905)	ccdc3a (ENSDARG00000026052)	optn (ENSDARG00000002663)	si:ch211-240l19.8 (ENSDARG00000074547)	si:ch211-240l19.7 (ENSDARG00000076313)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	204	ENSGT00980000198695	ENSGT00550000076278	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b
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Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00980000198695	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT01060000248530.C.d	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT01060000248530.C.d	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h
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Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00940000177916
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Spiny chromis	MODERN SPECIES	44													dock4b (ENSAPOG00000023197)	LRRN3 (ENSAPOG00000023024)	ENSAPOG00000023015	tnnt2e (ENSAPOG00000022967) ##22	dnm1l (ENSAPOG00000022905)	ENSAPOG00000022861	ENSAPOG00000022847	DHX57 (ENSAPOG00000022824)	morn2 (ENSAPOG00000022743)	ENSAPOG00000022710	AHCYL2 (ENSAPOG00000022534)	tmem209 (ENSAPOG00000022461)	prdm4 (ENSAPOG00000022415)	ASCL4 (ENSAPOG00000000754)	ENSAPOG00000022387	plxnb2a.1 (ENSAPOG00000022360)	ENSAPOG00000022234	ENSAPOG00000022174	ENSAPOG00000022065
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000174997
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	2724																tnnt2e (ENSAOCG00000011179) ##22
Orange clownfish	MODERN SPECIES	13	ENSAPEG00000017338	dnajb9b (ENSAPEG00000017314)	akr1b1.1 (ENSAPEG00000017280)	akr1b1.2 (ENSAPEG00000017222)	tfec (ENSAPEG00000017199)	mdfic (ENSAPEG00000017157)	foxp2 (ENSAPEG00000016507)	ENSAPEG00000016467	ENSAPEG00000016439	gpr85 (ENSAPEG00000016427)	tmem168a (ENSAPEG00000016401)	ifrd1 (ENSAPEG00000016335)	dock4b (ENSAPEG00000016166)	LRRN3 (ENSAPEG00000016130)	ENSAPEG00000016064	tnnt2e (ENSAPEG00000015600) ##22	dnm1l (ENSAPEG00000015504)	stmp1 (ENSAPEG00000015477)	SMKR1 (ENSAPEG00000015470)	DHX57 (ENSAPEG00000015386)	ENSAPEG00000015358	ENSAPEG00000015318	ahcyl2b (ENSAPEG00000015248)	tmem209 (ENSAPEG00000015171)	prdm4 (ENSAPEG00000015155)	ASCL4 (ENSAPEG00000015141)	ENSAPEG00000015118	ENSAPEG00000015112	ENSAPEG00000015053	ENSAPEG00000015015	ENSAPEG00000014959
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	436														LRRN3 (ENSSPAG00000020374)	ENSSPAG00000020348	tnnt2e (ENSSPAG00000019936) ##22
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00940000177916
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00940000177916
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00940000177916
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00940000177916
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	280	ENSHBUG00000005745	ENSHBUG00000005730	dnajb9b (ENSHBUG00000005727)	akr1b1.1 (ENSHBUG00000005711)	akr1b1.2 (ENSHBUG00000005672)	tfec (ENSHBUG00000005635)	mdfic (ENSHBUG00000005627)	foxp2 (ENSHBUG00000005609)	ENSHBUG00000005526	gpr85 (ENSHBUG00000005512)	tmem168a (ENSHBUG00000005503)	ifrd1 (ENSHBUG00000005487)	dock4b (ENSHBUG00000005422)	LRRN3 (ENSHBUG00000004989)	ENSHBUG00000004978	tnnt2e (ENSHBUG00000004949) ##22	dnm1l (ENSHBUG00000004929)	stmp1 (ENSHBUG00000004884)	SMKR1 (ENSHBUG00000004872)	DHX57 (ENSHBUG00000004865)	morn2 (ENSHBUG00000004850)	STRIP2 (ENSHBUG00000004835)	AHCYL2 (ENSHBUG00000004699)	tmem209 (ENSHBUG00000004626)	ASCL4 (ENSHBUG00000004583)	prdm4 (ENSHBUG00000004561)	ENSHBUG00000004477	ENSHBUG00000004462	ENSHBUG00000004436	ENSHBUG00000004425	ENSHBUG00000004416
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00940000177916
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000003444	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00940000177916
Eastern happy	MODERN SPECIES	8	akr1b1.1 (ENSACLG00000001787)	akr1b1.2 (ENSACLG00000001828)	ENSACLG00000001858	tfec (ENSACLG00000001863)	mdfic (ENSACLG00000001895)	FOXP2 (ENSACLG00000001915)	ENSACLG00000001955	ENSACLG00000002237	gpr85 (ENSACLG00000002246)	tmem168a (ENSACLG00000002257)	ifrd1 (ENSACLG00000002285)	dock4b (ENSACLG00000002603)	LRRN3 (ENSACLG00000002898)	ENSACLG00000002901	ENSACLG00000002932	tnnt2e (ENSACLG00000002987) ##22	dnm1l (ENSACLG00000003008)	stmp1 (ENSACLG00000003048)	SMKR1 (ENSACLG00000003057)	DHX57 (ENSACLG00000003064)	morn2 (ENSACLG00000003082)	STRIP2 (ENSACLG00000003100)	AHCYL2 (ENSACLG00000003261)	ENSACLG00000003304	tmem209 (ENSACLG00000003311)	ASCL4 (ENSACLG00000003356)	prdm4 (ENSACLG00000003370)	ENSACLG00000003420	ENSACLG00000003437	ENSACLG00000003446	ENSACLG00000003496
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1099	ENSMZEG00005011229	ENSMZEG00005011234	dnajb9b (ENSMZEG00005011241)	akr1b1.1 (ENSMZEG00005011254)	akr1b1.2 (ENSMZEG00005011270)	tfec (ENSMZEG00005011293)	mdfic (ENSMZEG00005011311)	foxp2 (ENSMZEG00005011353)	ENSMZEG00005011463	gpr85 (ENSMZEG00005011484)	tmem168a (ENSMZEG00005011494)	ifrd1 (ENSMZEG00005011509)	dock4b (ENSMZEG00005011585)	LRRN3 (ENSMZEG00005011752)	ENSMZEG00005011782	tnnt2e (ENSMZEG00005011806) ##22	ENSMZEG00005011823	stmp1 (ENSMZEG00005011835)	SMKR1 (ENSMZEG00005011842)	DHX57 (ENSMZEG00005011852)	morn2 (ENSMZEG00005011896)	STRIP2 (ENSMZEG00005011929)	AHCYL2 (ENSMZEG00005011981)	tmem209 (ENSMZEG00005012010)	ASCL4 (ENSMZEG00005012039)	prdm4 (ENSMZEG00005012045)	ENSMZEG00005012066	ENSMZEG00005012083	ENSMZEG00005012095	ENSMZEG00005012125	ENSMZEG00005012157
P. nyererei	MODERN SPECIES	309	dnajb9b (ENSPNYG00000007855)	akr1b1.1 (ENSPNYG00000007832)	akr1b1.2 (ENSPNYG00000007804)	tfec (ENSPNYG00000007751)	mdfic (ENSPNYG00000007716)	foxp2 (ENSPNYG00000007581)	ENSPNYG00000007555	ENSPNYG00000007538	gpr85 (ENSPNYG00000007523)	tmem168a (ENSPNYG00000007505)	ifrd1 (ENSPNYG00000007466)	dock4b (ENSPNYG00000007206)	ENSPNYG00000007137	LRRN3 (ENSPNYG00000007132)	ENSPNYG00000007102	tnnt2e (ENSPNYG00000007037) ##22	dnm1l (ENSPNYG00000006979)	stmp1 (ENSPNYG00000006967)	SMKR1 (ENSPNYG00000006964)	DHX57 (ENSPNYG00000006926)	morn2 (ENSPNYG00000006897)	STRIP2 (ENSPNYG00000006858)	AHCYL2 (ENSPNYG00000006798)	tmem209 (ENSPNYG00000006758)	ENSPNYG00000006735	prdm4 (ENSPNYG00000006704)	ENSPNYG00000006679	ENSPNYG00000006663	ENSPNYG00000006647	ENSPNYG00000006625	ENSPNYG00000006617
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	291	ENSNBRG00000001084	dnajb9b (ENSNBRG00000001079)	akr1b1.1 (ENSNBRG00000001047)	akr1b1.2 (ENSNBRG00000001013)	tfec (ENSNBRG00000000942)	mdfic (ENSNBRG00000000910)	foxp2 (ENSNBRG00000000809)	ENSNBRG00000000797	ENSNBRG00000000786	gpr85 (ENSNBRG00000000778)	tmem168a (ENSNBRG00000000752)	ifrd1 (ENSNBRG00000000694)	dock4b (ENSNBRG00000000533)	LRRN3 (ENSNBRG00000000524)	ENSNBRG00000000471	tnnt2e (ENSNBRG00000000415) ##22	dnm1l (ENSNBRG00000000347)	stmp1 (ENSNBRG00000000338)	SMKR1 (ENSNBRG00000000331)	DHX57 (ENSNBRG00000000229)	morn2 (ENSNBRG00000023508)	ENSNBRG00000023497	ahcyl2b (ENSNBRG00000023486)	tmem209 (ENSNBRG00000023476)	ASCL4 (ENSNBRG00000023470)	prdm4 (ENSNBRG00000023458)	ENSNBRG00000023429	ENSNBRG00000023421	ENSNBRG00000023413	ENSNBRG00000023410	cdpf1 (ENSNBRG00000023404)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	8	akr1b1.2 (ENSONIG00000016805)	ENSONIG00000035906	tfec (ENSONIG00000016803)	mdfic (ENSONIG00000031776)	foxp2 (ENSONIG00000016789)	ENSONIG00000029820	ENSONIG00000035806	gpr85 (ENSONIG00000021154)	tmem168a (ENSONIG00000016787)	ifrd1 (ENSONIG00000016783)	dock4b (ENSONIG00000016768)	ENSONIG00000027820	ENSONIG00000041640	LRRN3 (ENSONIG00000021153)	ENSONIG00000016765	tnnt2e (ENSONIG00000042639) ##22	dnm1l (ENSONIG00000016752)	ENSONIG00000030362	DHX57 (ENSONIG00000016747)	morn2 (ENSONIG00000016746)	STRIP2 (ENSONIG00000016736)	AHCYL2 (ENSONIG00000016733)	tmem209 (ENSONIG00000016730)	ASCL4 (ENSONIG00000041066)	prdm4 (ENSONIG00000016726)	ENSONIG00000034588	ENSONIG00000016725	ENSONIG00000016722	ENSONIG00000016719	ENSONIG00000029777	cdpf1 (ENSONIG00000016718)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	634														LRRN3 (ENSACIG00000010257)	CALD1 (ENSACIG00000010232)	tnnt2e (ENSACIG00000010160) ##22	dnm1l (ENSACIG00000010115)	stmp1 (ENSACIG00000010098)	DHX57 (ENSACIG00000010054)	morn2 (ENSACIG00000010039)	ENSACIG00000009983	ahcyl2b (ENSACIG00000009943)	ENSACIG00000009931	tmem209 (ENSACIG00000009899)	ASCL4 (ENSACIG00000009887)	prdm4 (ENSACIG00000009863)	ENSACIG00000009850	ENSACIG00000009839	ENSACIG00000009808	ENSACIG00000009784	ENSACIG00000009777
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00940000177916
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000153272.a.b.d.i.a	ENSGT00940000153272.a.b.d.j	ENSGT00940000153272.a.b.d.i.b	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000174997	ENSGT00390000007925	ENSGT00940000157097.h
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000153272.a.b.d.i.a	ENSGT00940000153272.a.b.d.j	ENSGT00940000153272.a.b.d.i.b	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000178921	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00940000156883	ENSGT00940000175780	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00390000007925	ENSGT00940000157097.h
Indian medaka	MODERN SPECIES	2	akr1b1.2 (ENSOMEG00000012798)	tfec (ENSOMEG00000012835)	ENSOMEG00000012882	foxp2 (ENSOMEG00000013259)	ENSOMEG00000013376	ENSOMEG00000013395	gpr85 (ENSOMEG00000013407)	tmem168a (ENSOMEG00000013435)	ENSOMEG00000013463	ENSOMEG00000013479	ifrd1 (ENSOMEG00000013514)	dock4b (ENSOMEG00000013619)	ENSOMEG00000013651	LRRN3 (ENSOMEG00000013659)	CALD1 (ENSOMEG00000013682)	tnnt2e (ENSOMEG00000013798) ##22	dnm1l (ENSOMEG00000013872)	stmp1 (ENSOMEG00000013885)	DHX57 (ENSOMEG00000013994)	ENSOMEG00000014018	STRIP2 (ENSOMEG00000014079)	ahcyl2b (ENSOMEG00000014140)	tmem209 (ENSOMEG00000014204)	prdm4 (ENSOMEG00000014225)	ENSOMEG00000014237	ENSOMEG00000014246	ENSOMEG00000014280	ENSOMEG00000014326	cdpf1 (ENSOMEG00000014341)	pparaa (ENSOMEG00000014360)	ENSOMEG00000014396
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	15	akr1b1.1 (ENSOJAG00000021393)	akr1b1.2 (ENSOJAG00000021209)	tfec (ENSOJAG00000021165)	ENSOJAG00000021154	ENSOJAG00000021148	foxp2 (ENSOJAG00000021037)	ENSOJAG00000021020	ENSOJAG00000021015	gpr85 (ENSOJAG00000021011)	tmem168a (ENSOJAG00000021002)	ifrd1 (ENSOJAG00000020949)	ENSOJAG00000020942	dock4b (ENSOJAG00000017313)	LRRN3 (ENSOJAG00000017120)	ENSOJAG00000016959	tnnt2e (ENSOJAG00000016710) ##22	dnm1l (ENSOJAG00000015409)	stmp1 (ENSOJAG00000015312)	ENSOJAG00000015188	STRIP2 (ENSOJAG00000015001)	ENSOJAG00000014482	tmem209 (ENSOJAG00000014308)	prdm4 (ENSOJAG00000014277)	ASCL4 (ENSOJAG00000014262)	ENSOJAG00000014242	ENSOJAG00000014215	ENSOJAG00000013772	cdpf1 (ENSOJAG00000013711)	pparaa (ENSOJAG00000013653)	ENSOJAG00000013571	atxn10 (ENSOJAG00000013509)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153272.a.b.d.i.a	ENSGT00940000153272.a.b.d.j	ENSGT00940000153272.a.b.d.i.b	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00940000163139	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000174997	ENSGT00390000007925
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	15	mdfic (ENSORLG00000010468)	foxp2 (ENSORLG00000010494)	ENSORLG00000010500	ENSORLG00000029323	gpr85 (ENSORLG00000010504)	TMEM168 (ENSORLG00000010520)	ENSORLG00000026543	ENSORLG00000028313	ifrd1 (ENSORLG00000028032)	dock4b (ENSORLG00000010596)	ENSORLG00000026529	ENSORLG00000023842	ENSORLG00000030347	LRRN3 (ENSORLG00000010610)	ENSORLG00000010644	tnnt2e (ENSORLG00000010664) ##22	ENSORLG00000027144	ENSORLG00000010705	stmp1 (ENSORLG00000026396)	ENSORLG00000026676	DHX57 (ENSORLG00000010748)	morn2 (ENSORLG00000021992)	ENSORLG00000010825	AHCYL2 (ENSORLG00000010860)	ENSORLG00000026758	tmem209 (ENSORLG00000010977)	ENSORLG00000024483	prdm4 (ENSORLG00000011007)	ASCL4 (ENSORLG00000011010)	ENSORLG00000011013	ENSORLG00000011050
Chinese medaka	MODERN SPECIES	30	akr1b1.1 (ENSOSIG00000023416)	akr1b1.2 (ENSOSIG00000023389)	tfec (ENSOSIG00000023365)	mdfic (ENSOSIG00000023359)	foxp2 (ENSOSIG00000023354)	ENSOSIG00000023344	ENSOSIG00000023338	gpr85 (ENSOSIG00000023337)	tmem168a (ENSOSIG00000023335)	ENSOSIG00000023332	ifrd1 (ENSOSIG00000023329)	dock4b (ENSOSIG00000023257)	LRRN3 (ENSOSIG00000023227)	ENSOSIG00000023225	ENSOSIG00000023224	tnnt2e (ENSOSIG00000023213) ##22	dnm1l (ENSOSIG00000023052)	stmp1 (ENSOSIG00000022999)	ENSOSIG00000022972	ENSOSIG00000022967	AHCYL2 (ENSOSIG00000022382)	prdm4 (ENSOSIG00000022233)	ASCL4 (ENSOSIG00000022199)	ENSOSIG00000022196	ENSOSIG00000022169	ENSOSIG00000022143	ENSOSIG00000022141	ENSOSIG00000022138	cdpf1 (ENSOSIG00000022137)	pparaa (ENSOSIG00000022135)	ENSOSIG00000022128
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00940000177916
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	151														ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00980000198695	ENSGT00940000156883.l	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	992																ENSCVAG00000011542 ##22	dnm1l (ENSCVAG00000011641)	stmp1 (ENSCVAG00000011654)	ENSCVAG00000011666	DHX57 (ENSCVAG00000011692)	morn2 (ENSCVAG00000011704)	STRIP2 (ENSCVAG00000011752)	ahcyl2b (ENSCVAG00000011790)	tmem209 (ENSCVAG00000011799)	prdm4 (ENSCVAG00000011812)	ASCL4 (ENSCVAG00000011823)	ENSCVAG00000011827	ENSCVAG00000011846	ENSCVAG00000011873	ENSCVAG00000011911	ENSCVAG00000011916
Mummichog	MODERN SPECIES	2317														LRRN3 (ENSFHEG00000000775)	ENSFHEG00000009479	ENSFHEG00000009464 ##22	dnm1l (ENSFHEG00000009442)	stmp1 (ENSFHEG00000009379)	DHX57 (ENSFHEG00000009368)	ENSFHEG00000000799	ENSFHEG00000009322	AHCYL2 (ENSFHEG00000009123)	ENSFHEG00000009080	tmem209 (ENSFHEG00000009066)	prdm4 (ENSFHEG00000008963)	ASCL4 (ENSFHEG00000008828)	ENSFHEG00000008821	ENSFHEG00000008798	ENSFHEG00000008767	ENSFHEG00000008740	cdpf1 (ENSFHEG00000008733)
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.b.k	ENSGT01100000263568.b.b.s.a	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00940000175780	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.b.l	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.b.k.a	ENSGT01100000263568.b.b.s.a	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT01050000244882.b.d	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00940000175780	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.b.l	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.b.k.a	ENSGT01100000263568.b.b.s.a	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554
Amazon molly	MODERN SPECIES	261	akr1b1.1 (ENSPFOG00000014667)	akr1b1.2 (ENSPFOG00000014569)	tfec (ENSPFOG00000014522)	mdfic (ENSPFOG00000014519)	foxp2 (ENSPFOG00000014402)	ENSPFOG00000023718	ENSPFOG00000023543	gpr85 (ENSPFOG00000020328)	tmem168a (ENSPFOG00000014368)	ifrd1 (ENSPFOG00000014323)	dock4b (ENSPFOG00000013275)	ENSPFOG00000024187	LRRN3 (ENSPFOG00000013199)	LRRN3 (ENSPFOG00000013191)	ENSPFOG00000013096	tnnt2e (ENSPFOG00000012993) ##22	dnm1l (ENSPFOG00000012922)	DHX57 (ENSPFOG00000012729)	ENSPFOG00000012709	STRIP2 (ENSPFOG00000012218)	AHCYL2 (ENSPFOG00000022311)	tmem209 (ENSPFOG00000012122)	prdm4 (ENSPFOG00000012068)	ENSPFOG00000023711	ENSPFOG00000023842	ENSPFOG00000024168	ASCL4 (ENSPFOG00000020327)	ENSPFOG00000012060	ENSPFOG00000011953	ENSPFOG00000011829	ENSPFOG00000011822
Sailfin molly	MODERN SPECIES	92														LRRN3 (ENSPLAG00000012490)	CALD1 (ENSPLAG00000012529)	tnnt2e (ENSPLAG00000012536) ##22	dnm1l (ENSPLAG00000012587)	stmp1 (ENSPLAG00000012604)	SMKR1 (ENSPLAG00000012611)	DHX57 (ENSPLAG00000012656)	ENSPLAG00000012679	STRIP2 (ENSPLAG00000012693)	AHCYL2 (ENSPLAG00000012733)	tmem209 (ENSPLAG00000012772)	prdm4 (ENSPLAG00000012786)	ENSPLAG00000012840	ENSPLAG00000012858	ENSPLAG00000000809	ENSPLAG00000000298	ENSPLAG00000012879	ENSPLAG00000012931
Guppy	MODERN SPECIES	454	ENSPREG00000011004	dnajb9b (ENSPREG00000010993)	akr1b1.1 (ENSPREG00000010966)	akr1b1.2 (ENSPREG00000010944)	tfec (ENSPREG00000010907)	mdfic (ENSPREG00000010890)	foxp2 (ENSPREG00000010330)	ENSPREG00000010253	ENSPREG00000010247	gpr85 (ENSPREG00000010245)	tmem168a (ENSPREG00000010238)	ifrd1 (ENSPREG00000010212)	dock4b (ENSPREG00000009970)	LRRN3 (ENSPREG00000009905)	CALD1 (ENSPREG00000009894)	tnnt2e (ENSPREG00000009887) ##22	dnm1l (ENSPREG00000009857)	stmp1 (ENSPREG00000009842)	ENSPREG00000009838	DHX57 (ENSPREG00000009775)	ENSPREG00000009753	STRIP2 (ENSPREG00000009714)	ahcyl2b (ENSPREG00000009690)	tmem209 (ENSPREG00000009624)	prdm4 (ENSPREG00000009610)	ENSPREG00000009553	ENSPREG00000009543	ENSPREG00000009512	ASCL4 (ENSPREG00000009502)	ENSPREG00000009490	ENSPREG00000009484
Platyfish	MODERN SPECIES	8	ENSXMAG00000009216	dnajb9b (ENSXMAG00000021574)	akr1b1.1 (ENSXMAG00000009184)	akr1b1.2 (ENSXMAG00000009158)	tfec (ENSXMAG00000023033)	mdfic (ENSXMAG00000029243)	foxp2 (ENSXMAG00000029750)	ENSXMAG00000023114	ENSXMAG00000023078	gpr85 (ENSXMAG00000019539)	tmem168a (ENSXMAG00000009083)	ifrd1 (ENSXMAG00000009043)	dock4b (ENSXMAG00000008974)	LRRN3 (ENSXMAG00000019537)	CALD1 (ENSXMAG00000008962)	tnnt2e (ENSXMAG00000008943) ##22	eri1 (ENSXMAG00000008936)	TMCC3 (ENSXMAG00000008932)	ndufa12 (ENSXMAG00000008922)	fgd6 (ENSXMAG00000008908)	vezt (ENSXMAG00000008904)	metap2b (ENSXMAG00000015392)	usp44 (ENSXMAG00000015410)	ENSXMAG00000023948	ntn4 (ENSXMAG00000015415)	snrpf (ENSXMAG00000015448)	amdhd1 (ENSXMAG00000015455)	tspan9b (ENSXMAG00000026102)	elapor2b (ENSXMAG00000003572)	klhl42 (ENSXMAG00000003606)	nrip2 (ENSXMAG00000025434)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01050000244882.b.d	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00960000187403	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00940000177916	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000174997
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	308														CALD1L (ENSNFUG00015009449)	ENSNFUG00015009468	tnnt2e (ENSNFUG00015009475) ##22
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	80	avpr2l (ENSKMAG00000021460)	ENSKMAG00000021465	dnajb9b (ENSKMAG00000021468)	akr1b1.1 (ENSKMAG00000021474)	akr1b1.2 (ENSKMAG00000021483)	tfec (ENSKMAG00000021497)	mdfic (ENSKMAG00000021511)	foxp2 (ENSKMAG00000021547)	ENSKMAG00000021628	gpr85 (ENSKMAG00000021632)	tmem168a (ENSKMAG00000021634)	ifrd1 (ENSKMAG00000021640)	dock4b (ENSKMAG00000021669)	LRRN3 (ENSKMAG00000021751)	ENSKMAG00000021756	tnnt2e (ENSKMAG00000021759) ##22	dnm1l (ENSKMAG00000021767)	DHX57 (ENSKMAG00000021791)	stmp1 (ENSKMAG00000021812)	MORN2 (ENSKMAG00000021815)	ENSKMAG00000021824	ahcyl2b (ENSKMAG00000021841)	tmem209 (ENSKMAG00000021850)	prdm4 (ENSKMAG00000021856)	ASCL4 (ENSKMAG00000000146)	ENSKMAG00000000239	ENSKMAG00000000251	ENSKMAG00000000328	ENSKMAG00000000353	ENSKMAG00000000400	cdpf1 (ENSKMAG00000000422)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00980000198695	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000174997
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00980000199777	ENSGT00980000198695	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	131												dock4b (ENSLBEG00000028285)	LRRN3 (ENSLBEG00000028324)	ENSLBEG00000028326	CALD1 (ENSLBEG00000028328)	tnnt2e (ENSLBEG00000028332) ##22	dnm1l (ENSLBEG00000028335)	stmp1 (ENSLBEG00000028339)	SMKR1 (ENSLBEG00000028340)	DHX57 (ENSLBEG00000028343)	morn2 (ENSLBEG00000028347)	STRIP2 (ENSLBEG00000028350)	ahcyl2b (ENSLBEG00000028359)	tmem209 (ENSLBEG00000028364)	prdm4 (ENSLBEG00000028369)	ASCL4 (ENSLBEG00000028371)	ENSLBEG00000028375	ENSLBEG00000028377	ENSLBEG00000028379	ENSLBEG00000028383	ENSLBEG00000028385
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	3411																ENSLBEG00000007149 ##22
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00980000199777	ENSGT00980000198695	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000174997
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00980000198695	ENSGT00940000156883	ENSGT00940000175780	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000174997	ENSGT00390000007925
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00980000198695	ENSGT00940000156883	ENSGT00940000175780	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000174997	ENSGT00390000007925
Pike perch	MODERN SPECIES	64	avpr2l (ENSSLUG00000019787)	ENSSLUG00000019789	dnajb9b (ENSSLUG00000019791)	akr1b1.2 (ENSSLUG00000019807)	tfec (ENSSLUG00000019830)	mdfic (ENSSLUG00000019833)	foxp2 (ENSSLUG00000019842)	ENSSLUG00000019863	ENSSLUG00000019865	gpr85 (ENSSLUG00000019868)	tmem168a (ENSSLUG00000019873)	ifrd1 (ENSSLUG00000019879)	dock4b (ENSSLUG00000020120)	LRRN3 (ENSSLUG00000023102)	ENSSLUG00000023104	tnnt2e (ENSSLUG00000023116) ##22	dnm1l (ENSSLUG00000023153)	stmp1 (ENSSLUG00000023297)	ENSSLUG00000023299	DHX57 (ENSSLUG00000023334)	ENSSLUG00000023549	ENSSLUG00000023583	ahcyl2b (ENSSLUG00000023855)	tmem209 (ENSSLUG00000024349)	prdm4 (ENSSLUG00000024466)	ENSSLUG00000024471	ENSSLUG00000024472	ENSSLUG00000024477	ENSSLUG00000024494	ENSSLUG00000024525	cdpf1 (ENSSLUG00000024527)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	15	ENSCGOG00000003841	dnajb9b (ENSCGOG00000003839)	akr1b1.1 (ENSCGOG00000003829)	akr1b1.2 (ENSCGOG00000003081)	tfec (ENSCGOG00000003059)	mdfic (ENSCGOG00000003058)	foxp2 (ENSCGOG00000002743)	ENSCGOG00000024577	ENSCGOG00000024575	gpr85 (ENSCGOG00000024571)	tmem168a (ENSCGOG00000024569)	ifrd1 (ENSCGOG00000024559)	dock4b (ENSCGOG00000024415)	LRRN3 (ENSCGOG00000024386)	ENSCGOG00000024384	tnnt2e (ENSCGOG00000024383) ##22	dnm1l (ENSCGOG00000024369)	ENSCGOG00000024366	ENSCGOG00000024364	DHX57 (ENSCGOG00000024355)	ENSCGOG00000024352	ENSCGOG00000024298	ENSCGOG00000024286	ahcyl2b (ENSCGOG00000024080)	tmem209 (ENSCGOG00000023970)	prdm4 (ENSCGOG00000023968)	ASCL4 (ENSCGOG00000023967)	ENSCGOG00000023966	ENSCGOG00000023965	ENSCGOG00000023956	cdpf1 (ENSCGOG00000023955)
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01050000244882.b.d	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00980000199777	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00940000175997	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000174997	ENSGT00390000007925	ENSGT00940000157097.h
Lumpfish	MODERN SPECIES	15	ENSCLMG00005009664	ENSCLMG00005009665	dnajb9b (ENSCLMG00005009666)	akr1b1.1 (ENSCLMG00005009668)	akr1b1.2 (ENSCLMG00005009727)	tfec (ENSCLMG00005010122)	mdfic (ENSCLMG00005010123)	foxp2 (ENSCLMG00005010124)	ENSCLMG00005010178	gpr85 (ENSCLMG00005010181)	tmem168a (ENSCLMG00005010183)	ifrd1 (ENSCLMG00005010208)	dock4b (ENSCLMG00005010525)	LRRN3 (ENSCLMG00005021582)	ENSCLMG00005021583	tnnt2e (ENSCLMG00005021584) ##22	dnm1l (ENSCLMG00005021602)	ENSCLMG00005021613	SMKR1 (ENSCLMG00005021614)	DHX57 (ENSCLMG00005021617)	ENSCLMG00005021620	STRIP2 (ENSCLMG00005021625)	ahcyl2b (ENSCLMG00005022214)	tmem209 (ENSCLMG00005022309)	prdm4 (ENSCLMG00005022325)	rad51ap1 (ENSCLMG00005022326)	fgf6b (ENSCLMG00005022328)	fgf23 (ENSCLMG00005022329)	tigarb (ENSCLMG00005022330)	ccnd2b (ENSCLMG00005022331)	ENSCLMG00005022332
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00980000199777	ENSGT00980000198695	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000174997	ENSGT00390000007925
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	5	ENSSAUG00010025292	dnajb9b (ENSSAUG00010025291)	akr1b1.1 (ENSSAUG00010025197)	akr1b1.2 (ENSSAUG00010024464)	tfec (ENSSAUG00010024447)	mdfic (ENSSAUG00010024445)	foxp2 (ENSSAUG00010024420)	ENSSAUG00010024404	ENSSAUG00010024401	gpr85 (ENSSAUG00010024400)	tmem168a (ENSSAUG00010024397)	ifrd1 (ENSSAUG00010024222)	dock4b (ENSSAUG00010018456)	LRRN3 (ENSSAUG00010018372)	ENSSAUG00010018369	tnnt2e (ENSSAUG00010018361) ##22	dnm1l (ENSSAUG00010016480)	ENSSAUG00010016448	ENSSAUG00010016447	DHX57 (ENSSAUG00010016349)	morn2 (ENSSAUG00010016347)	ENSSAUG00010013864	AHCYL2 (ENSSAUG00010011302)	tmem209 (ENSSAUG00010011238)	prdm4 (ENSSAUG00010011231)	ENSSAUG00010011229	ENSSAUG00010011227	ENSSAUG00010011212	ENSSAUG00010011195	ENSSAUG00010011192	cdpf1 (ENSSAUG00010011191)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT01050000244882.b.d	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00980000199777	ENSGT00980000198695	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000174997	ENSGT00390000007925
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	491	ENSLCRG00005021105	dnajb9b (ENSLCRG00005021106)	akr1b1.1 (ENSLCRG00005021110)	akr1b1.2 (ENSLCRG00005021201)	tfec (ENSLCRG00005021206)	ENSLCRG00005021207	mdfic (ENSLCRG00005021208)	foxp2 (ENSLCRG00005021210)	ENSLCRG00005021215	ENSLCRG00005021216	tmem168a (ENSLCRG00005021218)	ifrd1 (ENSLCRG00005021222)	dock4b (ENSLCRG00005021242)	LRRN3 (ENSLCRG00005021259)	ENSLCRG00005021261	tnnt2e (ENSLCRG00005021263) ##22	dnm1l (ENSLCRG00005021264)	ENSLCRG00005021328	ENSLCRG00005021329	DHX57 (ENSLCRG00005021334)	ENSLCRG00005021365	ENSLCRG00005021372	AHCYL2 (ENSLCRG00005021771)	tmem209 (ENSLCRG00005022408)	prdm4 (ENSLCRG00005022461)	ASCL4 (ENSLCRG00005022464)	ENSLCRG00005022465	ENSLCRG00005022472	ENSLCRG00005022522	ENSLCRG00005022644	cdpf1 (ENSLCRG00005022645)
European seabass	MODERN SPECIES	23	ENSDLAG00005021649	ENSDLAG00005021644	DNAJB9 (ENSDLAG00005021636)	ENSDLAG00005021624	ENSDLAG00005021549	tfec (ENSDLAG00005021524)	mdfic (ENSDLAG00005032951)	ENSDLAG00005029379	foxp2 (ENSDLAG00005021461)	gpr85 (ENSDLAG00005021450)	tmem168a (ENSDLAG00005021445)	ifrd1 (ENSDLAG00005021402)	dock4b (ENSDLAG00005018999)	LRRN3 (ENSDLAG00005030733)	ENSDLAG00005018888	tnnt2e (ENSDLAG00005028164) ##22	ENSDLAG00005016748	ENSDLAG00005016808	ENSDLAG00005016639	ENSDLAG00005016627	ENSDLAG00005015917	ENSDLAG00005015318	tmem209 (ENSDLAG00005015206)	ENSDLAG00005015191	ENSDLAG00005015188	ENSDLAG00005015167	ENSDLAG00005014879	ENSDLAG00005014485	ENSDLAG00005014462	cdpf1 (ENSDLAG00005031949)	pparaa (ENSDLAG00005028792)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00550000076278	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01060000248530.C.d	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000174997	ENSGT00390000007925
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT01050000244882.b.d	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00550000076278	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01060000248530.C.d	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000174997	ENSGT00390000007925
Climbing perch	MODERN SPECIES	14	ENSATEG00000011965	DNAJB9 (ENSATEG00000011954)	ENSATEG00000025212	ENSATEG00000011865	ENSATEG00000011831	tfec (ENSATEG00000011808)	mdfic (ENSATEG00000011796)	foxp2 (ENSATEG00000010954)	ENSATEG00000029307	gpr85 (ENSATEG00000028342)	tmem168a (ENSATEG00000010777)	ifrd1 (ENSATEG00000010696)	dock4b (ENSATEG00000010514)	LRRN3 (ENSATEG00000010479)	ENSATEG00000010392	tnnt2e (ENSATEG00000010349) ##22	ENSATEG00000010243	ENSATEG00000010145	ENSATEG00000010135	ENSATEG00000010072	ENSATEG00000010056	ENSATEG00000010028	tmem209 (ENSATEG00000010021)	ENSATEG00000009933	ENSATEG00000009918	ENSATEG00000009907	ENSATEG00000009897	ENSATEG00000009840	ENSATEG00000027329	ENSATEG00000009816	CDPF1 (ENSATEG00000027046)
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	15	ENSMAMG00000026859	DNAJB9 (ENSMAMG00000008672)	ENSMAMG00000008634	ENSMAMG00000008607	tfec (ENSMAMG00000008568)	mdfic (ENSMAMG00000008528)	foxp2 (ENSMAMG00000007153)	ENSMAMG00000007117	ENSMAMG00000007112	gpr85 (ENSMAMG00000025428)	tmem168a (ENSMAMG00000007081)	ifrd1 (ENSMAMG00000007052)	dock4b (ENSMAMG00000006894)	LRRN3 (ENSMAMG00000006880)	ENSMAMG00000006776	tnnt2e (ENSMAMG00000006731) ##22	ENSMAMG00000006639	ENSMAMG00000027498	ENSMAMG00000006556	ENSMAMG00000026243	ENSMAMG00000006470	ENSMAMG00000006413	tmem209 (ENSMAMG00000006382)	ENSMAMG00000006352	ENSMAMG00000006342	ENSMAMG00000025069	ENSMAMG00000006295	ENSMAMG00000006278	ENSMAMG00000025302	CDPF1 (ENSMAMG00000026818)	pparaa (ENSMAMG00000006236)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554	ENSGT00950000182931.B.a.a.h
Barramundi perch	MODERN SPECIES	405																tnnt2e (ENSLCAG00010024794) ##22	dnm1l (ENSLCAG00010024662)	stmp1 (ENSLCAG00010024621)	DHX57 (ENSLCAG00010024592)	morn2 (ENSLCAG00010024581)	ENSLCAG00010024301	ahcyl2b (ENSLCAG00010024151)	tmem209 (ENSLCAG00010024052)	prdm4 (ENSLCAG00010024026)	ASCL4 (ENSLCAG00010024019)	ENSLCAG00010024016	ENSLCAG00010024013	ENSLCAG00010024003	ENSLCAG00010023988	ENSLCAG00010023981	cdpf1 (ENSLCAG00010023978)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00940000175997	ENSGT00940000175780	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554
Greater amberjack	MODERN SPECIES	60	ENSSDUG00000007442	dnajb9b (ENSSDUG00000007469)	akr1b1.1 (ENSSDUG00000007485)	akr1b1.2 (ENSSDUG00000007526)	tfec (ENSSDUG00000007554)	mdfic (ENSSDUG00000007608)	foxp2 (ENSSDUG00000007696)	ENSSDUG00000008399	ENSSDUG00000008407	gpr85 (ENSSDUG00000008414)	tmem168a (ENSSDUG00000008439)	ifrd1 (ENSSDUG00000008463)	dock4b (ENSSDUG00000008528)	LRRN3 (ENSSDUG00000008855)	ENSSDUG00000008875	tnnt2e (ENSSDUG00000008903) ##22	dnm1l (ENSSDUG00000008937)	stmp1 (ENSSDUG00000008994)	SMKR1 (ENSSDUG00000009004)	DHX57 (ENSSDUG00000009022)	ENSSDUG00000009096	STRIP2 (ENSSDUG00000009129)	ahcyl2b (ENSSDUG00000009242)	tmem209 (ENSSDUG00000009300)	prdm4 (ENSSDUG00000009342)	ENSSDUG00000009355	ENSSDUG00000009361	ENSSDUG00000009371	ENSSDUG00000009393	ENSSDUG00000009435	ENSSDUG00000009453
Yellowtail amberjack	DUPLICATION
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2971	ENSSLDG00000012488	dnajb9b (ENSSLDG00000012510)	akr1b1.1 (ENSSLDG00000012530)	akr1b1.2 (ENSSLDG00000012569)	tfec (ENSSLDG00000012618)	mdfic (ENSSLDG00000012667)	foxp2 (ENSSLDG00000012825)	ENSSLDG00000013437	ENSSLDG00000013455	gpr85 (ENSSLDG00000013464)	tmem168a (ENSSLDG00000013477)	ifrd1 (ENSSLDG00000013518)	dock4b (ENSSLDG00000013589)	LRRN3 (ENSSLDG00000013674)	ENSSLDG00000013703	tnnt2e (ENSSLDG00000013947) ##22
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	1019																ENSSLDG00000002545 ##22
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000164630	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c	ENSGT00940000159404	ENSGT00940000158685	ENSGT00940000155480.d	ENSGT00940000157682.B.a	ENSGT01090000260145	ENSGT00890000139436.B	ENSGT00390000005941.c	ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00550000076278	ENSGT00640000091917	ENSGT00940000156883	ENSGT00390000006619	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a	ENSGT01030000235325	ENSGT00390000013963	ENSGT00940000156443	ENSGT00940000162902	ENSGT00960000187403	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000165554
Turbot	MODERN SPECIES	11	DNAJB9 (ENSSMAG00000036252)	ENSSMAG00000020191	ENSSMAG00000020184	ENSSMAG00000020178	tfec (ENSSMAG00000020155)	mdfic (ENSSMAG00000020149)	foxp2 (ENSSMAG00000020063)	ENSSMAG00000020029	ENSSMAG00000020027	gpr85 (ENSSMAG00000020024)	tmem168a (ENSSMAG00000020012)	ifrd1 (ENSSMAG00000019994)	dock4b (ENSSMAG00000019953)	LRRN3 (ENSSMAG00000019951)	ENSSMAG00000019938	tnnt2e (ENSSMAG00000019935) ##22	ENSSMAG00000019922	ENSSMAG00000019918	ENSSMAG00000019913	ENSSMAG00000019791	ENSSMAG00000019781	ENSSMAG00000019749	ENSSMAG00000019703	tmem209 (ENSSMAG00000019682)	ENSSMAG00000024325	ENSSMAG00000019642	ENSSMAG00000019635	ENSSMAG00000019497	ENSSMAG00000019483	alg10 (ENSSMAG00000035827)	tprkb (ENSSMAG00000032716)
Tongue sole	MODERN SPECIES	18	akr1b1.1 (ENSCSEG00000010653)	akr1b1.2 (ENSCSEG00000010668)	akr1b1.2 (ENSCSEG00000010691)	tfec (ENSCSEG00000010707)	rab3db (ENSCSEG00000010770)	mdfic (ENSCSEG00000010777)	foxp2 (ENSCSEG00000010811)	ENSCSEG00000011185	gpr85 (ENSCSEG00000011192)	ENSCSEG00000011199	tmem168a (ENSCSEG00000011202)	ifrd1 (ENSCSEG00000011224)	dock4b (ENSCSEG00000011240)	LRRN3 (ENSCSEG00000011289)	CALD1 (ENSCSEG00000011293)	tnnt2e (ENSCSEG00000011303) ##22	dnm1l (ENSCSEG00000011310)	stmp1 (ENSCSEG00000011328)	SMKR1 (ENSCSEG00000011333)	DHX57 (ENSCSEG00000011346)	ENSCSEG00000011408	STRIP2 (ENSCSEG00000011417)	ahcyl2b (ENSCSEG00000011479)	ENSCSEG00000011492	AHCYL2 (ENSCSEG00000011502)	ENSCSEG00000011510	tmem209 (ENSCSEG00000011517)	prdm4 (ENSCSEG00000011532)	ASCL4 (ENSCSEG00000011539)	ENSCSEG00000011542	ENSCSEG00000011547
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	15	avpr2l (ENSMMDG00005010312)	ENSMMDG00005010314	dnajb9b (ENSMMDG00005010315)	akr1b1.1 (ENSMMDG00005010316)	akr1b1.2 (ENSMMDG00005010318)	tfec (ENSMMDG00005010432)	mdfic (ENSMMDG00005010435)	foxp2 (ENSMMDG00005010451)	ENSMMDG00005010530	gpr85 (ENSMMDG00005010532)	tmem168a (ENSMMDG00005010535)	ifrd1 (ENSMMDG00005010561)	dock4b (ENSMMDG00005011890)	LRRN3 (ENSMMDG00005012043)	ENSMMDG00005012045	tnnt2e (ENSMMDG00005012053) ##22	dnm1l (ENSMMDG00005012070)	stmp1 (ENSMMDG00005012565)	DHX57 (ENSMMDG00005012583)	morn2 (ENSMMDG00005012813)	ENSMMDG00005012856	AHCYL2 (ENSMMDG00005015009)	tmem209 (ENSMMDG00005018314)	prdm4 (ENSMMDG00005018484)	ASCL4 (ENSMMDG00005018490)	ENSMMDG00005018491	ENSMMDG00005018496	ENSMMDG00005018507	ENSMMDG00005018713	ENSMMDG00005018714	cdpf1 (ENSMMDG00005018715)
Cod	MODERN SPECIES	10	ENSGMOG00000006514	ENSGMOG00000033942	mdfic (ENSGMOG00000030598)	ENSGMOG00000027930	gpr85 (ENSGMOG00000020238)	tmem168a (ENSGMOG00000012118)	ENSGMOG00000029663	ENSGMOG00000030314	ENSGMOG00000036335	ENSGMOG00000031129	ifrd1 (ENSGMOG00000012120)	dock4b (ENSGMOG00000012124)	LRRN3 (ENSGMOG00000019944)	tnni4a (ENSGMOG00000022189) ##20	ENSGMOG00000028711	tnnt2e (ENSGMOG00000036744) ##22	ENSGMOG00000001805	ENSGMOG00000033478	ENSGMOG00000029905	ENSGMOG00000001839	ENSGMOG00000026839	ENSGMOG00000001900	ENSGMOG00000025077	ENSGMOG00000001955	ENSGMOG00000029124	ENSGMOG00000016475	cacna1c (ENSGMOG00000016407)	ENSGMOG00000023626	LRTM2 (ENSGMOG00000012975)	ENSGMOG00000034296	ENSGMOG00000022264
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	52			ENSGT00390000011239.j	ENSGT00940000155529.B	ENSGT00390000004094	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b	ENSGT00940000166253	ENSGT00390000018424	ENSGT00390000002796	ENSGT00940000157659	ENSGT00940000158094	ENSGT00940000155659	ENSGT00940000160513.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d ##22	ENSGT00940000155504.k.b	ENSGT00940000156246.c.b	ENSGT00940000165554	ENSGT00940000159918.a.a	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000162902	ENSGT00940000156443	ENSGT00390000013963	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a.c	ENSGT00400000022095.a	ENSGT00640000091917	ENSGT00980000198695	ENSGT00550000076278	ENSGT00940000153272.a.b.d	ENSGT00940000153272.a.b.c.i
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	1686															ENSGT00940000153901.a.a.b.d	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.g ##22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	614															ENSGT00940000153901.a.a.b.d	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.g ##22
Salmo	DUPLICATION
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156858.a	ENSGT00940000158160.j.b	ENSGT00390000002417	ENSGT00390000011239.j.b	ENSGT00940000155529.B.d.b	ENSGT00390000004094.j	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b.c	ENSGT00940000166253.f	ENSGT00390000002796.ib.b	ENSGT00940000157659.c	ENSGT00940000158094.db	ENSGT00940000155659.e.a.a	ENSGT00940000160513.a.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.a.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b.d	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.g.a ##22	ENSGT00940000155504.k.b.b	ENSGT00940000156246.c.b.d	ENSGT00940000165554.a	ENSGT00940000159918.a.a.d	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000162902.l.a	ENSGT00940000156443.q	ENSGT00390000013963.i	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a.c.a	ENSGT00400000022095.a.f	ENSGT00980000198695.a	ENSGT00940000153272.a.b.d.h	ENSGT00940000153272.a.b.c.i.b.b	ENSGT00940000159404.i	ENSGT00940000158685.hb.a
River trout	MODERN SPECIES	38	pik3cg (ENSSTUG00000024034)	PRKAR2B (ENSSTUG00000023985)	HBP1 (ENSSTUG00000023964)	ENSSTUG00000023376	coa6 (ENSSTUG00000023358)	slc13a4 (ENSSTUG00000022802)	ENSSTUG00000022772	ENSSTUG00000022764	ssbp1 (ENSSTUG00000022704)	creb3l2 (ENSSTUG00000022617)	ENSSTUG00000016676	dock4b (ENSSTUG00000014385)	LRRN3 (ENSSTUG00000014319)	ENSSTUG00000014311 ##20	ENSSTUG00000014262	tnnt2e (ENSSTUG00000014248) ##22	dnm1l (ENSSTUG00000014109)	dnajb9b (ENSSTUG00000014103)	ENSSTUG00000013993	ENSSTUG00000013978	ENSSTUG00000013968	ENSSTUG00000013966	prdm4 (ENSSTUG00000013922)	tmem209 (ENSSTUG00000013388)	AHCYL2 (ENSSTUG00000011572)	ENSSTUG00000011087	ENSSTUG00000011071	ENSSTUG00000011069	akr1b1.1 (ENSSTUG00000011047)	akr1b1.2 (ENSSTUG00000010716)	tfec (ENSSTUG00000010690)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	26	HBP1 (ENSSSAG00000098080)	ENSSSAG00000055514	ENSSSAG00000087012	ENSSSAG00000105698	slc13a4 (ENSSSAG00000055377)	ENSSSAG00000107921	ENSSSAG00000111577	ssbp1 (ENSSSAG00000055342)	cr3l2 (ENSSSAG00000055328)	ENSSSAG00000048131	dock4b (ENSSSAG00000089355)	LRRN3 (ENSSSAG00000096334)	ENSSSAG00000008074 ##20	ENSSSAG00000092268	ENSSSAG00000008044	tnnt2 (ENSSSAG00000008019) ##22	ENSSSAG00000007989	ENSSSAG00000116748	ENSSSAG00000121101	ENSSSAG00000007718	ENSSSAG00000007714	ENSSSAG00000007709	ENSSSAG00000106805	tmem209 (ENSSSAG00000007616)	ENSSSAG00000005207	ENSSSAG00000003801	ENSSSAG00000003733	ENSSSAG00000096735	ENSSSAG00000003702	ALDR (ENSSSAG00000003668)	tfec (ENSSSAG00000003647)
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Atlantic salmon	MODERN SPECIES	8	PRKAR2B (ENSSSAG00000073587)	HBP1 (ENSSSAG00000073585)	ENSSSAG00000073419	CA031 (ENSSSAG00000073369)	slc13a4 (ENSSSAG00000073127)	ENSSSAG00000111136	ENSSSAG00000073114	ssbp1 (ENSSSAG00000073105)	creb3l2 (ENSSSAG00000073100)	ENSSSAG00000072954	ENSSSAG00000098935	LRRN3 (ENSSSAG00000119001)	tnni1 (ENSSSAG00000081743) ##20	ENSSSAG00000108118	ENSSSAG00000059652	ENSSSAG00000059482 ##22	ENSSSAG00000059444	ENSSSAG00000059432	ENSSSAG00000059346	CDN1C (ENSSSAG00000059313)	ENSSSAG00000059303	ENSSSAG00000059239	tmem209 (ENSSSAG00000115201)	ENSSSAG00000056443	strip2 (ENSSSAG00000053294)	ENSSSAG00000053143	ENSSSAG00000052829	ENSSSAG00000052697	tfec (ENSSSAG00000052657)	mdfic (ENSSSAG00000101591)	foxp2 (ENSSSAG00000051234)
River trout	MODERN SPECIES	34	PRKAR2B (ENSSTUG00000039919)	HBP1 (ENSSTUG00000040042)	ENSSTUG00000040106	coa6 (ENSSTUG00000041120)	slc13a4 (ENSSTUG00000041180)	ENSSTUG00000042335	ENSSTUG00000042344	ssbp1 (ENSSTUG00000042372)	creb3l2 (ENSSTUG00000042466)	ENSSTUG00000042948	dock4b (ENSSTUG00000047435)	ENSSTUG00000047782	LRRN3 (ENSSTUG00000047787)	ENSSTUG00000047793 ##20	ENSSTUG00000047809	tnnt2e (ENSSTUG00000047879) ##22	dnm1l (ENSSTUG00000047897)	DNAJB9 (ENSSTUG00000047922)	ENSSTUG00000047931	ENSSTUG00000047956	ASCL4 (ENSSTUG00000047971)	prdm4 (ENSSTUG00000047976)	tmem209 (ENSSTUG00000048019)	ahcyl2b (ENSSTUG00000048452)	ENSSTUG00000048644	ENSSTUG00000049165	stmp1 (ENSSTUG00000049170)	akr1b1.1 (ENSSTUG00000049173)	ENSSTUG00000049177	ENSSTUG00000049184	akr1b1.2 (ENSSTUG00000049193)
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	319												ENSGT00940000155659.e.a.a	ENSGT00940000160513.a.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.a.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b.c.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.h.a.a ##22	ENSGT00940000155504.k.b.b	ENSGT00940000156246.c.b.d	ENSGT00940000165554.a	ENSGT00940000159918.a.a.d	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000162902.l.a	ENSGT00940000156443.q	ENSGT00390000013963.i	ENSGT00940000153272.a.b.d.h	ENSGT00940000153272.a.b.c.i.b.b	ENSGT00940000159404.i	ENSGT00940000158685.hb.a	ENSGT00940000155480.d.a.a.a	ENSGT00940000155480.d.a.a.b.b.a	ENSGT00940000157682.B.a
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000002417	ENSGT00940000158160.j.b	ENSGT00390000011239.j.b	ENSGT00940000155529.B.d.a.b	ENSGT00390000004094.j	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b.c	ENSGT00940000166253.f	ENSGT00390000002796.ib.b	ENSGT00940000157659.c	ENSGT00940000158094.db	ENSGT00940000155659.f	ENSGT00940000155659.e.a.a	ENSGT00940000160513.a.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.a.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b.c.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.h.a.a ##22	ENSGT00940000155504.k.b.b	ENSGT00940000156246.c.b.d	ENSGT00940000165554.a	ENSGT00940000159918.a.a.d	ENSGT00940000177041	ENSGT00940000162902.l.a	ENSGT00940000156443.q	ENSGT00390000013963.i	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a.c.a	ENSGT00400000022095.a.f	ENSGT00940000153272.a.b.d.h	ENSGT00940000153272.a.b.c.i.b.b	ENSGT00940000159404.i	ENSGT00940000158685.hb.a	ENSGT00940000155480.d.a.a.a
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153456.b.a.bb.a.b	ENSGT00940000156858.a	ENSGT00940000158160.j.b	ENSGT00390000011239.j.b.a	ENSGT00940000155529.B.d.a.b	ENSGT00390000004094.j	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b.c	ENSGT00940000166253.f	ENSGT00390000002796.ib.b	ENSGT00940000157659.c	ENSGT00940000158094.db	ENSGT00940000155659.f	ENSGT00940000160513.a.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.a.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b.c.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.h.a.a ##22	ENSGT00940000155504.k.b.b	ENSGT00940000156246.c.b.d	ENSGT00940000165554.a	ENSGT00940000159918.a.a.d	ENSGT00940000162902.l.a	ENSGT00940000156443.q	ENSGT00390000013963.i	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a.c.a	ENSGT00400000022095.a.f	ENSGT00940000153272.a.b.d.h	ENSGT00940000153272.a.b.c.i.b.b	ENSGT00940000159404.i	ENSGT00940000158685.hb.a	ENSGT00940000155480.d.a.a.b.b.a	ENSGT00940000157682.B.a.f
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153456.b.a.bb.a.b	ENSGT00940000156858.a	ENSGT00940000158160.j.b	ENSGT00390000011239.j.b.a	ENSGT00940000155529.B.d.a.b	ENSGT00390000004094.j	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b.c	ENSGT00940000166253.f	ENSGT00390000002796.ib.b	ENSGT00940000157659.c	ENSGT00940000158094.db	ENSGT00940000155659.f	ENSGT00940000160513.a.d	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.a.b ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b.c.b	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.h.a.a ##22	ENSGT00940000155504.k.b.b	ENSGT00940000156246.c.b.d	ENSGT00940000165554.a	ENSGT00940000159918.a.a.d	ENSGT00940000162902.l.a	ENSGT00940000156443.q	ENSGT00390000013963.i	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a.c.a	ENSGT00940000153272.a.b.d.h	ENSGT00940000153272.a.b.c.i.b.b	ENSGT00940000159404.i	ENSGT00940000158685.hb.a	ENSGT00940000155480.d.a.a.b.b.a	ENSGT00940000157682.B.a.f	ENSGT00990000209739
Chinook salmon	MODERN SPECIES	6	pik3cg (ENSOTSG00005016600)	PRKAR2B (ENSOTSG00005017076)	HBP1 (ENSOTSG00005017099)	ENSOTSG00005017105	coa6 (ENSOTSG00005017107)	slc13a4 (ENSOTSG00005017112)	ENSOTSG00005018105	ssbp1 (ENSOTSG00005018106)	creb3l2 (ENSOTSG00005018108)	ENSOTSG00005018114	dock4b (ENSOTSG00005018274)	ENSOTSG00005030535	LRRN3 (ENSOTSG00005030537)	ENSOTSG00005030538 ##20	ENSOTSG00005030539	tnnt2e (ENSOTSG00005030547) ##22	dnm1l (ENSOTSG00005030548)	dnajb9b (ENSOTSG00005030795)	ENSOTSG00005030797	ASCL4 (ENSOTSG00005001631)	prdm4 (ENSOTSG00005001809)	tmem209 (ENSOTSG00005001868)	ENSOTSG00005004282	akr1b1.1 (ENSOTSG00005005725)	akr1b1.2 (ENSOTSG00005005732)	tfec (ENSOTSG00005007571)	mdfic (ENSOTSG00005007572)	foxp2 (ENSOTSG00005007573)	ENSOTSG00005007600	ENSOTSG00005007601	gpr85 (ENSOTSG00005007603)
Coho salmon	MODERN SPECIES	29	PRKAR2B (ENSOKIG00005002519)	HBP1 (ENSOKIG00005002563)	ENSOKIG00005002589	ENSOKIG00005002668	coa6 (ENSOKIG00005003187)	slc13a4 (ENSOKIG00005003245)	ENSOKIG00005003638	ssbp1 (ENSOKIG00005003642)	creb3l2 (ENSOKIG00005003650)	ENSOKIG00005003879	dock4b (ENSOKIG00005008084)	ENSOKIG00005008820	LRRN3 (ENSOKIG00005008839)	ENSOKIG00005008847 ##20	ENSOKIG00005008884	tnnt2e (ENSOKIG00005008958) ##22	DNM1L (ENSOKIG00005009036)	dnajb9b (ENSOKIG00005009225)	ENSOKIG00005009240	ENSOKIG00005009295	ASCL4 (ENSOKIG00005009312)	prdm4 (ENSOKIG00005009316)	tmem209 (ENSOKIG00005009344)	ENSOKIG00005009540	ENSOKIG00005009977	ENSOKIG00005010135	ENSOKIG00005010140	AKR1B1 (ENSOKIG00005010163)	ENSOKIG00005010219	akr1b1.2 (ENSOKIG00005010238)	tfec (ENSOKIG00005010580)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	13	HBP1 (ENSOMYG00000045282)	ENSOMYG00000045285	cin (ENSOMYG00000045303)	slc13a4 (ENSOMYG00000045311)	ENSOMYG00000062020	ssbp1 (ENSOMYG00000045332)	creb3l2 (ENSOMYG00000045344)	ENSOMYG00000045396	dock4b (ENSOMYG00000045919)	ENSOMYG00000077788	LRRN3 (ENSOMYG00000046860)	ENSOMYG00000064458	ENSOMYG00000046868 ##20	ENSOMYG00000061383	ENSOMYG00000046875	tnnt2e (ENSOMYG00000046883) ##22	ENSOMYG00000046956	ENSOMYG00000005634	ENSOMYG00000005672	ENSOMYG00000005704	ENSOMYG00000005712	ENSOMYG00000005784	tmem209 (ENSOMYG00000006089)	ENSOMYG00000006402	ENSOMYG00000007906	ENSOMYG00000008997	ENSOMYG00000009003	ENSOMYG00000009009	ENSOMYG00000009178	tfec (ENSOMYG00000009698)	mdfic (ENSOMYG00000009721)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	468	ENSGT00940000158160.j.a	ENSGT00390000011239.j.a	ENSGT00940000155529.B.c	ENSGT00390000004094.i	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b.d	ENSGT00940000166253.e	ENSGT00390000018424	ENSGT00390000002796.ib.a	ENSGT00940000157659.d	ENSGT00940000158094.eb	ENSGT00940000155659.e.b	ENSGT00940000155659.e.a.b	ENSGT00940000160513.a.c	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.a.a ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b.c.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.h.a.b ##22	ENSGT00940000155504.k.b.a	ENSGT00940000156246.c.b.c	ENSGT00940000165554.b	ENSGT00940000159918.a.a.c
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158160.j.a	ENSGT00390000011239.j.a	ENSGT00940000155529.B.c	ENSGT00390000004094.i	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b.d	ENSGT00940000166253.e	ENSGT00390000018424	ENSGT00390000002796.ib.a	ENSGT00940000157659.d	ENSGT00940000158094.eb	ENSGT00940000155659.e.a.b	ENSGT00940000155659.e.b	ENSGT00940000160513.a.c	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.a.a ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b.c.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.h.a.b ##22	ENSGT00940000155504.k.b.a	ENSGT00940000156246.c.b.c	ENSGT00940000165554.b	ENSGT00940000159918.a.a.c	ENSGT00940000162902.l.b	ENSGT00940000156443.r	ENSGT00390000013963.j	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a.c.b	ENSGT00400000022095.a.e	ENSGT00640000091917	ENSGT00980000198695	ENSGT00550000076278	ENSGT00940000153272.a.b.d.g	ENSGT00940000153272.a.b.c.i.a	ENSGT00940000159404.j
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000002417	ENSGT00940000158160.j.a	ENSGT00390000011239.j.b.b	ENSGT00940000155529.B.c	ENSGT00390000004094.i	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b.d	ENSGT00940000166253.e	ENSGT00390000018424	ENSGT00390000002796.ib.a	ENSGT00940000157659.d	ENSGT00940000158094.eb	ENSGT00940000155659.e.b	ENSGT00940000160513.a.c	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.a.a ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b.c.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.h.a.b ##22	ENSGT00940000155504.k.b.a	ENSGT00940000156246.c.b.c	ENSGT00940000165554.b	ENSGT00940000159918.a.a.c	ENSGT00940000162902.l.b	ENSGT00940000156443.r	ENSGT00390000013963.j	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a.c.b	ENSGT00400000022095.a.e	ENSGT00640000091917	ENSGT00980000198695	ENSGT00550000076278	ENSGT00940000153272.a.b.d.g	ENSGT00940000153272.a.b.c.i.a	ENSGT00940000159404.j
Rainbow trout	MODERN SPECIES	6	PRKAR2B (ENSOMYG00000042055)	HBP1 (ENSOMYG00000041943)	ENSOMYG00000041928	coa6 (ENSOMYG00000041922)	slc13a4 (ENSOMYG00000041597)	ENSOMYG00000041576	ENSOMYG00000041571	ssbp1 (ENSOMYG00000041550)	creb3l2 (ENSOMYG00000041524)	ENSOMYG00000041269	ENSOMYG00000051967	dock4b (ENSOMYG00000040012)	LRRN3 (ENSOMYG00000039349)	ENSOMYG00000039330 ##20	ENSOMYG00000039309	tnnt2e (ENSOMYG00000039291) ##22	ENSOMYG00000057640	ENSOMYG00000036710	ENSOMYG00000036426	ENSOMYG00000036409	ENSOMYG00000036385	ENSOMYG00000036369	tmem209 (ENSOMYG00000035038)	ENSOMYG00000036378	ENSOMYG00000033660	ENSOMYG00000032745	ENSOMYG00000032567	ENSOMYG00000032566	ENSOMYG00000069371	ENSOMYG00000029817	tfec (ENSOMYG00000029029)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00390000002417	ENSGT00940000158160.j.a	ENSGT00390000011239.j.b.b	ENSGT00940000155529.B.c	ENSGT00390000004094.i	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.b.d	ENSGT00940000166253.e	ENSGT00390000018424	ENSGT00390000002796.ib.a	ENSGT00940000157659.d	ENSGT00940000158094.eb	ENSGT00940000155659.e.b	ENSGT00940000160513.a.c	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b.a.a ##20	ENSGT00940000153901.a.a.b.c.a	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.h.a.b ##22	ENSGT00940000155504.k.b.a	ENSGT00940000156246.c.b.c	ENSGT00940000165554.b	ENSGT00940000159918.a.a.c	ENSGT00940000162902.l.b	ENSGT00940000156443.r	ENSGT00390000013963.j	ENSGT00950000182981.b.f.a.c.a.c.b	ENSGT00400000022095.a.e	ENSGT00640000091917	ENSGT00980000198695	ENSGT00550000076278	ENSGT00940000153272.a.b.d.g	ENSGT00940000153272.a.b.c.i.a	ENSGT00940000159404.j
Chinook salmon	MODERN SPECIES	8	PRKAR2B (ENSOTSG00005027747)	HBP1 (ENSOTSG00005027746)	ENSOTSG00005027744	ENSOTSG00005027742	slc13a4 (ENSOTSG00005026954)	ENSOTSG00005026941	ENSOTSG00005026938	ssbp1 (ENSOTSG00005026937)	creb3l2 (ENSOTSG00005026934)	ENSOTSG00005026932	ENSOTSG00005026931	dock4b (ENSOTSG00005009077)	LRRN3 (ENSOTSG00005009057)	ENSOTSG00005009056 ##20	ENSOTSG00005009054	tnnt2e (ENSOTSG00005009052) ##22	dnm1l (ENSOTSG00005009045)	DNAJB9 (ENSOTSG00005009044)	ENSOTSG00005009027	ENSOTSG00005009023	ASCL4 (ENSOTSG00005009020)	prdm4 (ENSOTSG00005009015)	tmem209 (ENSOTSG00005008725)	ahcyl2b (ENSOTSG00005008147)	ENSOTSG00005006102	ENSOTSG00005006098	stmp1 (ENSOTSG00005006097)	akr1b1.1 (ENSOTSG00005005935)	ENSOTSG00005005929	tfec (ENSOTSG00005005926)	mdfic (ENSOTSG00005005924)
Coho salmon	MODERN SPECIES	10	ENSOKIG00005027058	PRKAR2B (ENSOKIG00005027080)	HBP1 (ENSOKIG00005027101)	ENSOKIG00005027211	coa6 (ENSOKIG00005027830)	slc13a4 (ENSOKIG00005027925)	ENSOKIG00005028937	ENSOKIG00005028948	ssbp1 (ENSOKIG00005028968)	creb3l2 (ENSOKIG00005028990)	ENSOKIG00005029185	dock4b (ENSOKIG00005031585)	LRRN3 (ENSOKIG00005038963)	ENSOKIG00005038977 ##20	ENSOKIG00005039009	tnnt2e (ENSOKIG00005039031) ##22	DNM1L (ENSOKIG00005039154)	ENSOKIG00005039311	ENSOKIG00005039335	ENSOKIG00005039425	ENSOKIG00005039456	ENSOKIG00005039471	PRDM4 (ENSOKIG00005039497)	tmem209 (ENSOKIG00005039611)	ahcyl2b (ENSOKIG00005040707)	ENSOKIG00005041483	SMKR1 (ENSOKIG00005043353)	akr1b1.1 (ENSOKIG00005043395)	ENSOKIG00005043509	akr1b1.2 (ENSOKIG00005043530)	ENSOKIG00005005871
Huchen	MODERN SPECIES	147											dock4b (ENSHHUG00000034368)	LRRN3 (ENSHHUG00000034282)	ENSHHUG00000034275	ENSHHUG00000034264 ##20	ENSHHUG00000034228	tnnt2e (ENSHHUG00000034200) ##22	dnm1l (ENSHHUG00000033951)	ENSHHUG00000033947	DNAJB9 (ENSHHUG00000033887)	ENSHHUG00000033834	ENSHHUG00000033819	ASCL4 (ENSHHUG00000033814)	prdm4 (ENSHHUG00000033812)	tmem209 (ENSHHUG00000033789)	ENSHHUG00000033605	ENSHHUG00000033323	akr1b1.1 (ENSHHUG00000033254)	akr1b1.2 (ENSHHUG00000033213)	tfec (ENSHHUG00000033178)	mdfic (ENSHHUG00000033172)	FOXP2 (ENSHHUG00000033042)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.b.d.h.b ##22
Huchen	MODERN SPECIES	644											ENSHHUG00000040865	dock4b (ENSHHUG00000040880)	LRRN3 (ENSHHUG00000041204)	ENSHHUG00000041208 ##20	ENSHHUG00000041219	tnnt2e (ENSHHUG00000041260) ##22	ENSHHUG00000041305	ENSHHUG00000041306	dnajb9b (ENSHHUG00000041309)	ENSHHUG00000041312
Northern pike	MODERN SPECIES	22	PRKAR2B (ENSELUG00000017069)	HBP1 (ENSELUG00000017031)	ENSELUG00000033637	ENSELUG00000016969	coa6 (ENSELUG00000016866)	slc13a4 (ENSELUG00000016831)	zgc:162331 (ENSELUG00000016748)	ENSELUG00000016678	ssbp1 (ENSELUG00000016596)	creb3l2 (ENSELUG00000016552)	ENSELUG00000016463	dock4b (ENSELUG00000016080)	ENSELUG00000028344	LRRN3 (ENSELUG00000015687)	ENSELUG00000015677	tnnt2e (ENSELUG00000027376) ##22	dnm1l (ENSELUG00000015446)	dnajb9b (ENSELUG00000015371)	ENSELUG00000015356	ENSELUG00000015332	ENSELUG00000015310	ASCL4 (ENSELUG00000015293)	prdm4 (ENSELUG00000015265)	akr1b1.2 (ENSELUG00000015187)	akr1b1.1 (ENSELUG00000015104)	ENSELUG00000015122	ENSELUG00000015052	ENSELUG00000015044	ENSELUG00000015026	ahcyl2b (ENSELUG00000001512)	ENSELUG00000026631
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	78									ENSGT00390000013347.a	ENSGT00940000155659.i	ENSGT00940000160513.c	ENSGT00550000075044	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.a ##20	ENSGT00950000182926.a.t	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00940000154709.a.b.b ##22	ENSGT00940000155504.g	ENSGT00940000156246	ENSGT00940000154738.a.q.b	ENSGT00940000155419.b	ENSGT00940000155915.b	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.a.a	ENSGT00940000156242.c.b	ENSGT00390000013995.b.b.l	ENSGT00730000111061	ENSGT00940000157529.h	ENSGT00940000158636.c	ENSGT00530000063554.b	ENSGT00940000158792	ENSGT00530000063868.b	ENSGT01100000263537.b.a.b
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	277		mdfic (ENSPKIG00000011284)	foxp2 (ENSPKIG00000011260)	ENSPKIG00000011225	gpr85 (ENSPKIG00000011194)	ifrd1 (ENSPKIG00000011125)	DOCK4 (ENSPKIG00000011039)	ENSPKIG00000011004	LRRN3 (ENSPKIG00000010996)	immp2l (ENSPKIG00000010962)	ENSPKIG00000010928	ENSPKIG00000010896 ##20	tnni4b.2 (ENSPKIG00000010867) ##20	BPGM (ENSPKIG00000010857)	CALD1 (ENSPKIG00000010762)	tnnt2e (ENSPKIG00000010693) ##22	dnm1l (ENSPKIG00000010643)	dnajb9a (ENSPKIG00000010622)	ENSPKIG00000010599	NRCAM (ENSPKIG00000010362)	cntn1b (ENSPKIG00000010270)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	11	ENSSFOG00015025216	tmem209 (ENSSFOG00015003806)	tfec (ENSSFOG00015003909)	mdfic (ENSSFOG00015003924)	foxp2 (ENSSFOG00015028287)	ENSSFOG00015004031	gpr85 (ENSSFOG00015028854)	ifrd1 (ENSSFOG00015004065)	DOCK4 (ENSSFOG00015004127)	immp2l (ENSSFOG00015004251)	LRRN3 (ENSSFOG00015004288)	tnni4a (ENSSFOG00015029160) ##20	tnni4b.2 (ENSSFOG00015004323) ##20	BPGM (ENSSFOG00015025855)	ENSSFOG00015004354	tnnt2e (ENSSFOG00015004428) ##22	dnm1l (ENSSFOG00015004634)	dnajb9a (ENSSFOG00015026036)	PNPLA8 (ENSSFOG00015004728)	NRCAM (ENSSFOG00015004774)	cntn1b (ENSSFOG00015004987)	pdzrn4 (ENSSFOG00015005067)	gxylt1b (ENSSFOG00015005096)	yaf2 (ENSSFOG00015005138)	zcrb1 (ENSSFOG00015005150)	PRICKLE1 (ENSSFOG00015005176)	ADAMTS20 (ENSSFOG00015005220)	pus7l (ENSSFOG00015005598)	IRAK4 (ENSSFOG00015005625)	ENSSFOG00015033023	twf1b (ENSSFOG00015005694)
Spotted gar	MODERN SPECIES	237													tnni4b.2 (ENSLOCG00000000803) ##20	bpgm (ENSLOCG00000000860)	CALD1 (ENSLOCG00000000883)	tnnt2d (ENSLOCG00000000913) ##22	dnm1l (ENSLOCG00000000949)	dnajb9a (ENSLOCG00000001014)	ENSLOCG00000001060	ENSLOCG00000001076	PNPLA8 (ENSLOCG00000001102)	nrcama (ENSLOCG00000001143)	cntn1b (ENSLOCG00000001255)	ENSLOCG00000001323	pdzrn4 (ENSLOCG00000001340)	gxylt1b (ENSLOCG00000001360)	yaf2 (ENSLOCG00000001370)	zcrb1 (ENSLOCG00000001409)	pphln1 (ENSLOCG00000001448)	prickle1a (ENSLOCG00000001460)	ENSLOCG00000001494
Reedfish	MODERN SPECIES		HTD2 (ENSECRG00000007680)	rpp14 (ENSECRG00000007673)	ckmb (ENSECRG00000007659)	dnali1 (ENSECRG00000007642)	dnali1 (ENSECRG00000007590)	dnali1 (ENSECRG00000007569)	ercc2 (ENSECRG00000007546)	arhgef39 (ENSECRG00000007528)	lmo3 (ENSECRG00000007496)	mgst1.1 (ENSECRG00000007469)	SLC15A5 (ENSECRG00000007455)	dera (ENSECRG00000007440)	strap (ENSECRG00000007427)	bpgm (ENSECRG00000007417)	CALD1 (ENSECRG00000007402)	tnnt2d (ENSECRG00000007289) ##22	ENSECRG00000007258	si:cabz01085950.1 (ENSECRG00000007234)	kiaa0930 (ENSECRG00000007197)	pparaa (ENSECRG00000007145)	WNT7B (ENSECRG00000007123)	ENSECRG00000007113	ATXN10 (ENSECRG00000007096)	fbln1 (ENSECRG00000007080)	TRIM24 (ENSECRG00000007071)	AKR1D1 (ENSECRG00000007056)	GGCX (ENSECRG00000006898)	STARD7 (ENSECRG00000006831)	tmem127 (ENSECRG00000006814)	ciao1 (ENSECRG00000006802)	snrnp200 (ENSECRG00000006664)
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	249		ENSGT00940000158955 #10	ENSGT01100000263518.B.b.a #9	ENSGT00940000159657.d #8	ENSGT00940000160979 #7	ENSGT00940000159939	ENSGT00940000157365	ENSGT00940000157067	ENSGT00940000166065	ENSGT00940000157586	ENSGT00940000156637 #16	ENSGT00940000156777 #18	ENSGT00440000039564.a.a #19	ENSGT01030000234588.b.a #20	ENSGT00730000112095	ENSGT00940000154709.a.b.b ##22	ENSGT00940000156735 #23
Coelacanth	MODERN SPECIES	480							MAPK13 (ENSLACG00000000703)	BRPF3 (ENSLACG00000002077)	TBC1D22B (ENSLACG00000007409)	PIM1 (ENSLACG00000008114)	ENSLACG00000009626	MTCH1 (ENSLACG00000010021)	ENSLACG00000010562	TNNI1 (ENSLACG00000010851) #20	ENSLACG00000010982	tnnt2d (ENSLACG00000011163) ##22	ENSLACG00000011620 #23	ENSLACG00000012055	LHFPL5 (ENSLACG00000012471)	SRPK1 (ENSLACG00000012628)	CSRP1 (ENSLACG00000012973) #18	ENSLACG00000013429 #16	NAV1 (ENSLACG00000013985) #16	ELF3 (ENSLACG00000014528) #10	GPR37L1 (ENSLACG00000014791) #9	ARL8A (ENSLACG00000014881) #8	PTPN7 (ENSLACG00000014965) #7	LGR6 (ENSLACG00000015257)	UBE2T (ENSLACG00000015472)	ENSLACG00000015518	SYT2 (ENSLACG00000015670)
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154709.a.b.b ##22
Lamprey	MODERN SPECIES	1738																ENSPMAG00000007126 ##22	gatd1 (ENSPMAG00000007121)
Hagfish	MODERN SPECIES	512										ENSEBUG00000014103	ENSEBUG00000003552	ENSEBUG00000004718	ENSEBUG00000014937	ENSEBUG00000011690	ENSEBUG00000007800	ENSEBUG00000008305 ##22	med21 (ENSEBUG00000011071)	ruvbl2 (ENSEBUG00000006263)	ENSEBUG00000006425	ENSEBUG00000011746	yeats4 (ENSEBUG00000016489)	ENSEBUG00000013947	get4 (ENSEBUG00000010400)	ENSEBUG00000009466	ENSEBUG00000008562	ENSEBUG00000003498	ENSEBUG00000001200	ENSEBUG00000016568	ENSEBUG00000000918	ENSEBUG00000002551	ENSEBUG00000001490