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Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153657.A #7	ENSGT00940000155618 #8	ENSGT00940000155497 #9	ENSGT00940000153840.a.b #10	ENSGT00940000154464.b #11	ENSGT00440000039203 #12	ENSGT00390000018542.a #13	ENSGT00940000156578 #14	ENSGT00940000154208.d #15	ENSGT00390000018518 #16	ENSGT00940000154892 #17	ENSGT00390000004383 #18	ENSGT00390000000022.b #19	ENSGT00390000002918.a.b #20	ENSGT00730000111100 #21	ENSGT00940000153239.B #22	ENSGT00550000074840.y.b.b #23	ENSGT00900000141218 #24	ENSGT00390000002077 #25	ENSGT00390000020164 #26	ENSGT00940000157339 #27	ENSGT00940000163233 #28	ENSGT00940000154485.A #29	ENSGT00390000017504 #30	ENSGT00420000030724 #31	ENSGT00940000158004 #32	ENSGT00530000063718.a.b #33	ENSGT00390000008751.a	ENSGT00940000162686	ENSGT00390000017489	ENSGT00390000018898
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153657.A #7	ENSGT00940000155618 #8	ENSGT00940000155497 #9	ENSGT00940000153840.a.b #10	ENSGT00940000154464.b #11	ENSGT00440000039203 #12	ENSGT00390000018542.a #13	ENSGT00940000156578 #14	ENSGT00940000154208.d #15	ENSGT00390000018518 #16	ENSGT00940000154892 #17	ENSGT00390000004383 #18	ENSGT00390000000022.b #19	ENSGT00390000002918.a.b #20	ENSGT00730000111100 #21	ENSGT00940000153239.B #22	ENSGT00550000074840.y.b.b #23	ENSGT00900000141218 #24	ENSGT00390000002077 #25	ENSGT00390000020164 #26	ENSGT00940000157339 #27	ENSGT00940000163233 #28	ENSGT00940000154485.A #29	ENSGT00390000017504 #30	ENSGT00420000030724 #31	ENSGT00940000158004 #32	ENSGT00530000063718.a.b #33
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	328	XPNPEP3 (ENSUPAG00010006211) #7	RBX1 (ENSUPAG00010006183) #8	EP300 (ENSUPAG00010006142) #9	L3MBTL2 (ENSUPAG00010006102) #10	CHADL (ENSUPAG00010006094) #11	RANGAP1 (ENSUPAG00010006037) #12	ZC3H7B (ENSUPAG00010006013) #13	TEF (ENSUPAG00010005998) #14	TOB2 (ENSUPAG00010005994) #15	PHF5A (ENSUPAG00010005980) #16	ACO2 (ENSUPAG00010005914) #17	POLR3H (ENSUPAG00010005893) #18	CSDC2 (ENSUPAG00010005885) #19	PMM1 (ENSUPAG00010005870) #20	DESI1 (ENSUPAG00010005863) #21	XRCC6 (ENSUPAG00010005843) #22	SNU13 (ENSUPAG00010005841) #23	ENSUPAG00010005838 #24	MEI1 (ENSUPAG00010005795) #25	CCDC134 (ENSUPAG00010005788) #26	SREBF2 (ENSUPAG00010005777) #27	SHISA8 (ENSUPAG00010005772) #28	TNFRSF13C (ENSUPAG00010005768) #29	CENPM (ENSUPAG00010005746) #30	SMIM45 (ENSUPAG00010005741) #31	ENSUPAG00010005721 #32	ENSUPAG00010005713 #33	ENSUPAG00010005707 #34	ENSUPAG00010005703 #35
Squirrel	MODERN SPECIES	92	XPNPEP3 (ENSSTOG00000003200) #7	ENSSTOG00000015580 #8	EP300 (ENSSTOG00000000722) #9	L3MBTL2 (ENSSTOG00000000242) #10	CHADL (ENSSTOG00000026534) #11	RANGAP1 (ENSSTOG00000016191) #12	ZC3H7B (ENSSTOG00000016196) #13	TEF (ENSSTOG00000019642) #14	ENSSTOG00000016206 #15	PHF5A (ENSSTOG00000016207) #16	ACO2 (ENSSTOG00000016210) #17	POLR3H (ENSSTOG00000016215) #18	CSDC2 (ENSSTOG00000020429) #19	PMM1 (ENSSTOG00000026025) #20	DESI1 (ENSSTOG00000009480) #21	XRCC6 (ENSSTOG00000009490) #22	SNU13 (ENSSTOG00000009514) #23	MEI1 (ENSSTOG00000012870) #25	CCDC134 (ENSSTOG00000012907) #26	ENSSTOG00000012916 #27	SHISA8 (ENSSTOG00000019466) #28	ENSSTOG00000033610 #29	CENPM (ENSSTOG00000012933) #30	SMIM45 (ENSSTOG00000034807) #31	ENSSTOG00000012963 #32
Alpin marmot	MODERN SPECIES	76	DNAJB7 (ENSMMMG00000004165)	XPNPEP3 (ENSMMMG00000004122) #7	RBX1 (ENSMMMG00000004102) #8	EP300 (ENSMMMG00000004029) #9	L3MBTL2 (ENSMMMG00000003930) #10	RANGAP1 (ENSMMMG00000003853) #12	ZC3H7B (ENSMMMG00000003824) #13	TEF (ENSMMMG00000003810) #14	TOB2 (ENSMMMG00000003805) #15	PHF5A (ENSMMMG00000003799) #16	ACO2 (ENSMMMG00000003764) #17	POLR3H (ENSMMMG00000003743) #18	CSDC2 (ENSMMMG00000003735) #19	PMM1 (ENSMMMG00000003696) #20	DESI1 (ENSMMMG00000003682) #21	ENSMMMG00000003671 #22	SNU13 (ENSMMMG00000003647) #23	ENSMMMG00000003627 #24	MEI1 (ENSMMMG00000003545) #25	CCDC134 (ENSMMMG00000003517) #26	SREBF2 (ENSMMMG00000003454) #27	SHISA8 (ENSMMMG00000003440) #28	CENPM (ENSMMMG00000003399) #30	SMIM45 (ENSMMMG00000003396) #31	ENSMMMG00000003339 #32	ENSMMMG00000003326 #33	NAGA (ENSMMMG00000003269)	SMDT1 (ENSMMMG00000003226)	NDUFA6 (ENSMMMG00000003211)	ENSMMMG00000003138	TCF20 (ENSMMMG00000003101)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	14	ENSSVLG00005020321	EP300 (ENSSVLG00005020397) #9	L3MBTL2 (ENSSVLG00005020580) #10	CHADL (ENSSVLG00005020628) #11	ENSSVLG00005020695 #12	ENSSVLG00005020791 #12	ZC3H7B (ENSSVLG00005020817) #13	TEF (ENSSVLG00005020887) #14	TOB2 (ENSSVLG00005020946) #15	PHF5A (ENSSVLG00005020965) #16	ACO2 (ENSSVLG00005021008) #17	POLR3H (ENSSVLG00005021062) #18	CSDC2 (ENSSVLG00005021115) #19	PMM1 (ENSSVLG00005021168) #20	DESI1 (ENSSVLG00005021220) #21	XRCC6 (ENSSVLG00005021287) #22	ENSSVLG00005021427 ##23	MEI1 (ENSSVLG00005021530) #25	CCDC134 (ENSSVLG00005021846) #26	SREBF2 (ENSSVLG00005021885) #27	ENSSVLG00005021918	SHISA8 (ENSSVLG00005021957) #28	TNFRSF13C (ENSSVLG00005021994) #29	CENPM (ENSSVLG00005022024) #30	SMIM45 (ENSSVLG00005022101) #31	SEPTIN3 (ENSSVLG00005003473) #32	WBP2NL (ENSSVLG00005003578) #33	ENSSVLG00005003601 #35	NAGA (ENSSVLG00005003614)	PHETA2 (ENSSVLG00005003635)	SMDT1 (ENSSVLG00005003647)