Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	91	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT01050000245294	ENSGT00940000155375	ENSGT00940000168277	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538
Amniota	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT01050000245294	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00940000168322	ENSGT00940000159699	ENSGT00530000063484.b.b
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000159699	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C	ENSGT00940000159499
Theria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000159699	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C	ENSGT00940000159499
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000164247	ENSGT00940000154883.h	ENSGT00940000158538
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000163202	ENSGT00940000163254	ENSGT00940000159699	ENSGT00940000162825
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a	ENSGT00940000163515
Primates	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.k.a	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009.k.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.k.a	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009.k.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163202
Tarsier	MODERN SPECIES	2651																BCOR (ENSTSYG00000002020) #22
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.k.a.a	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009.k.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163202
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00390000018039.f	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00940000155017.y.a	ENSGT00940000154502.g.a.a	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000164052.d	ENSGT00910000147092	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000154156.d.m	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.k.a.a	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009.k.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163970.d
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000160782	ENSGT00390000018039.f	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00530000064570.d	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00940000155017.y.a	ENSGT00940000154502.g.a.a	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000164052.d	ENSGT00910000147092	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000154156.d.m	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.k.a.a	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009.k.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163970.d	ENSGT00940000165290
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160782	ENSGT00390000018039.f	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00530000064570.d	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00940000155017.y.a	ENSGT00940000154502.g.a.a	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000164052.d	ENSGT00910000147092	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000154156.d.m	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.k.a.a	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009.k.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163970.d	ENSGT00940000165290
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160782	ENSGT00390000018039.f	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00530000064570.d	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00940000155017.y.a	ENSGT00940000154502.g.a.a	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000164052.d	ENSGT00910000147092	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000154156.d.m	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.k.a.a	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009.k.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163970.d	ENSGT00940000165290
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00530000064570.d	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00940000155017.y.a	ENSGT00940000154502.g.a.a	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000164052.d	ENSGT00910000147092	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000154156.d.m	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009.k.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163970.d	ENSGT00940000165290	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000163970.c
Olive baboon	MODERN SPECIES	792	GPR34 (ENSPANG00000015410)	NYX (ENSPANG00000009956)	ENSPANG00000011805	DDX3X (ENSPANG00000023917)	ENSPANG00000050530	ENSPANG00000050425	USP9X (ENSPANG00000009041)	ENSPANG00000049298	ENSPANG00000040156	ENSPANG00000010629	ENSPANG00000043492	MED14 (ENSPANG00000024675)	CXorf38 (ENSPANG00000009515)	ATP6AP2 (ENSPANG00000009876)	ENSPANG00000003221	BCOR (ENSPANG00000023328) #22	ENSPANG00000049183	MID1IP1 (ENSPANG00000010851)	TSPAN7 (ENSPANG00000001627)	OTC (ENSPANG00000013609)	ENSPANG00000050468	SRPX (ENSPANG00000011869)	SYTL5 (ENSPANG00000006759)	H2AP (ENSPANG00000047171)	ENSPANG00000010726	CYBB (ENSPANG00000009957)	XK (ENSPANG00000015619)	PRRG1 (ENSPANG00000015320)	ENSPANG00000049828	ENSPANG00000039161	ENSPANG00000010727
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	164	ENSGT00390000018039.f	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00530000064570.d	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00940000155017.y.a	ENSGT00940000154502.g.a.a	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000164052.d	ENSGT00910000147092	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000154156.d.m	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417
Drill	MODERN SPECIES	781	ENSMLEG00000029956	NYX (ENSMLEG00000043211)	DDX3X (ENSMLEG00000044178)	ENSMLEG00000003594	USP9X (ENSMLEG00000029360)	ENSMLEG00000011061	ENSMLEG00000041765	ENSMLEG00000041667	ENSMLEG00000035769	ENSMLEG00000030436	MED14 (ENSMLEG00000037310)	CXorf38 (ENSMLEG00000029318)	MPC1L (ENSMLEG00000033791)	ATP6AP2 (ENSMLEG00000029677)	ENSMLEG00000043129	BCOR (ENSMLEG00000027853) #22	ENSMLEG00000024060	TSPAN7 (ENSMLEG00000041757)	OTC (ENSMLEG00000000589)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	233	CASK (ENSCATG00000043780)	ENSCATG00000029958	NYX (ENSCATG00000038924)	DDX3X (ENSCATG00000010148)	ENSCATG00000020614	USP9X (ENSCATG00000045108)	ENSCATG00000013830	ENSCATG00000002218	ENSCATG00000035935	ENSCATG00000039475	MED14 (ENSCATG00000015139)	CXorf38 (ENSCATG00000005533)	MPC1L (ENSCATG00000040875)	ATP6AP2 (ENSCATG00000033182)	ENSCATG00000034650	BCOR (ENSCATG00000035858) #22	MID1IP1 (ENSCATG00000019429)	TSPAN7 (ENSCATG00000040622)	OTC (ENSCATG00000040927)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000018039.f	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00530000064570.d	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00940000155017.y.a	ENSGT00940000154502.g.a.a	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000164052.d	ENSGT00910000147092	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000154156.d.m	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00910000146737	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.k.a.a	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000154652.e.a.b	ENSGT00390000013132.q.a.b	ENSGT00940000163202	ENSGT00940000165290
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000161627.b.a.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT01030000240144	ENSGT00940000154156.d.m	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00910000146737	ENSGT00940000156153	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.k.a.a	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000154652.e.a.b	ENSGT00390000013132.q.a.b	ENSGT00940000159699
Rhesus	MODERN SPECIES	327	GPR34 (ENSMMUG00000022583)	CASK (ENSMMUG00000022578)	NYX (ENSMMUG00000005304)	ENSMMUG00000055907	DDX3X (ENSMMUG00000017569)	ENSMMUG00000063721	USP9X (ENSMMUG00000013753)	ENSMMUG00000053153	ENSMMUG00000055801	MED14 (ENSMMUG00000005264)	CXHXorf38 (ENSMMUG00000005263)	MPC1L (ENSMMUG00000045877)	ATP6AP2 (ENSMMUG00000012762)	ENSMMUG00000063543	ENSMMUG00000000710	BCOR (ENSMMUG00000005292) #22	ENSMMUG00000060266	MID1IP1 (ENSMMUG00000003201)	OTC (ENSMMUG00000013493)	ENSMMUG00000013491	ENSMMUG00000062890	SRPX (ENSMMUG00000013135)	SYTL5 (ENSMMUG00000013131)	DYNLT3 (ENSMMUG00000013221)	ENSMMUG00000051757	CYBB (ENSMMUG00000013220)	XK (ENSMMUG00000061198)	LANCL3 (ENSMMUG00000006967)	PRRG1 (ENSMMUG00000006876)	ENSMMUG00000011104	ENSMMUG00000058853
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	175	ENSMFAG00000030357	ENSMFAG00000056067	PPP1R2C (ENSMFAG00000064193)	ENSMFAG00000058195	GPR82 (ENSMFAG00000023715)	GPR34 (ENSMFAG00000031644)	ENSMFAG00000035536	DDX3X (ENSMFAG00000034876)	ENSMFAG00000061620	USP9X (ENSMFAG00000025475)	ENSMFAG00000016940	MED14 (ENSMFAG00000000690)	ATP6AP2 (ENSMFAG00000038545)	ENSMFAG00000055028	ENSMFAG00000003022	BCOR (ENSMFAG00000042404) #22	ENSMFAG00000019253	ENSMFAG00000056528	ENSMFAG00000059834	ENSMFAG00000049434	TSPAN7 (ENSMFAG00000002802)	ENSMFAG00000051264	OTC (ENSMFAG00000040619)	ENSMFAG00000024781	SRPX (ENSMFAG00000032104)	SYTL5 (ENSMFAG00000031961)	ENSMFAG00000038542	CYBB (ENSMFAG00000040813)	ENSMFAG00000055398	XK (ENSMFAG00000047895)	ENSMFAG00000055015
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	84	NYX (ENSMNEG00000007266)	ENSMNEG00000021429	DDX3X (ENSMNEG00000031741)	ENSMNEG00000014066	USP9X (ENSMNEG00000035247)	ENSMNEG00000034064	ENSMNEG00000040368	ENSMNEG00000039282	ENSMNEG00000031988	ENSMNEG00000037768	MED14 (ENSMNEG00000030935)	CXorf38 (ENSMNEG00000028665)	MPC1L (ENSMNEG00000039097)	ATP6AP2 (ENSMNEG00000006275)	ENSMNEG00000031193	BCOR (ENSMNEG00000026958) #22	ENSMNEG00000038527	TSPAN7 (ENSMNEG00000019779)	OTC (ENSMNEG00000013646)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	203	KDM6A (ENSCSAG00000013878)	DUSP21 (ENSCSAG00000019561)	ENSCSAG00000013885	EFHC2 (ENSCSAG00000013922)	NDP (ENSCSAG00000013927)	MAOB (ENSCSAG00000013934)	MAOA (ENSCSAG00000013943)	GPR82 (ENSCSAG00000019560)	GPR34 (ENSCSAG00000019559)	NYX (ENSCSAG00000019558)	DDX3X (ENSCSAG00000013949)	USP9X (ENSCSAG00000013968)	MED14 (ENSCSAG00000013987)	CXorf38 (ENSCSAG00000013994)	ATP6AP2 (ENSCSAG00000014001)	BCOR (ENSCSAG00000014010) #22	MID1IP1 (ENSCSAG00000019557)	TSPAN7 (ENSCSAG00000014026)	OTC (ENSCSAG00000014036)	ENSCSAG00000019556	ENSCSAG00000014059	ENSCSAG00000014077	FAM47B (ENSCSAG00000019555)	TMEM47 (ENSCSAG00000014086)	FAM47A (ENSCSAG00000019554)	ENSCSAG00000014121	ENSCSAG00000019553	ENSCSAG00000014154	FTHL17 (ENSCSAG00000019552)	TAB3 (ENSCSAG00000014163)	GK (ENSCSAG00000014232)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	527								ENSGT00940000155017.y.a	ENSGT00940000154502.g.a.a	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b.a	ENSGT00940000164052.d	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000154156.d.m	ENSGT00940000153737.b #22
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1062					ENSRROG00000040975	ENSRROG00000000074	ENSRROG00000033360	ENSRROG00000041193	ENSRROG00000032361	ENSRROG00000035359	ENSRROG00000040312	MED14 (ENSRROG00000039257)	CXorf38 (ENSRROG00000035207)	ATP6AP2 (ENSRROG00000033213)	ENSRROG00000035146	BCOR (ENSRROG00000036755) #22
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2547																BCOR (ENSRBIG00000028551) #22
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00390000018039.f	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00940000155017.y.a	ENSGT00940000154502.g.a.a	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000164052.d	ENSGT00910000147092	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000154156.d.m.a	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00940000153112.D.n.a.a.a.b.c	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009.k.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163970.d
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00390000018039.f	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00940000154502.g.a.a	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000164052.d	ENSGT00910000147092	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000154156.d.m.a	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00940000153112.D.n.a.a.a.b.c	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009.k.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163970.d
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Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00390000018039.f	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000154156.d.m.a	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00940000153112.D.n.a.a.a.b.c	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009.k.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163970.d
Pan	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00910000146883.C	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00940000155017.z.b.a	ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a	ENSGT00940000154502.g.a.a	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000164052.d	ENSGT00910000147092	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000154156.d.m.a	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00940000153112.D.n.a.a.a.b.c	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009.k.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163970.d	ENSGT00940000163202
Chimpanzee	DUPLICATION
Chimpanzee	MODERN SPECIES	869																ENSPTRG00000046012 #22
Chimpanzee	MODERN SPECIES	972	NYX (ENSPTRG00000021811)	DDX3X (ENSPTRG00000049651)	ENSPTRG00000042802	USP9X (ENSPTRG00000045541)	ENSPTRG00000045378	ENSPTRG00000042923	ENSPTRG00000044980	ENSPTRG00000044764	ENSPTRG00000040752	ENSPTRG00000045194	MED14 (ENSPTRG00000021805)	CXHXorf38 (ENSPTRG00000021804)	MPC1L (ENSPTRG00000048113)	ATP6AP2 (ENSPTRG00000021803)	ENSPTRG00000052101	BCOR (ENSPTRG00000021802) #22	ENSPTRG00000039246	MID1IP1 (ENSPTRG00000047112)	TSPAN7 (ENSPTRG00000021800)	OTC (ENSPTRG00000021799)	ENSPTRG00000052456	SRPX (ENSPTRG00000021796)	SYTL5 (ENSPTRG00000021795)	H2AP (ENSPTRG00000021794)	DYNLT3 (ENSPTRG00000021793)	CYBB (ENSPTRG00000021792)	XK (ENSPTRG00000050517)	LANCL3 (ENSPTRG00000021790)	PRRG1 (ENSPTRG00000045419)	FAM47C (ENSPTRG00000028300)	CFAP47 (ENSPTRG00000028302)
Bonobo	MODERN SPECIES	369	CASK (ENSPPAG00000039799)	ENSPPAG00000032293	ENSPPAG00000028671	DDX3X (ENSPPAG00000041809)	ENSPPAG00000037641	USP9X (ENSPPAG00000039671)	ENSPPAG00000042937	ENSPPAG00000028929	ENSPPAG00000041897	ENSPPAG00000040577	MED14 (ENSPPAG00000044133)	CXorf38 (ENSPPAG00000044103)	MPC1L (ENSPPAG00000019631)	ATP6AP2 (ENSPPAG00000039969)	ENSPPAG00000009962	BCOR (ENSPPAG00000027608) #22	ENSPPAG00000030291	MID1IP1 (ENSPPAG00000010366)	TSPAN7 (ENSPPAG00000011857)	OTC (ENSPPAG00000030732)	ENSPPAG00000009040	SRPX (ENSPPAG00000036711)	SYTL5 (ENSPPAG00000042432)	H2AP (ENSPPAG00000001985)	ENSPPAG00000016400	CYBB (ENSPPAG00000028375)	XK (ENSPPAG00000012195)	LANCL3 (ENSPPAG00000027681)	PRRG1 (ENSPPAG00000039979)	CFAP47 (ENSPPAG00000011197)	MAGEB16 (ENSPPAG00000036358)
Human	MODERN SPECIES	1827	EFHC2 (ENSG00000183690)	NDP (ENSG00000124479)	MAOB (ENSG00000069535)	MAOA (ENSG00000189221)	PPP1R2C (ENSG00000102055)	GPR82 (ENSG00000171657)	GPR34 (ENSG00000171659)	CASK (ENSG00000147044)	NYX (ENSG00000188937)	DDX3X (ENSG00000215301)	USP9X (ENSG00000124486)	MED14 (ENSG00000180182)	CXorf38 (ENSG00000185753)	MPC1L (ENSG00000238205)	ATP6AP2 (ENSG00000182220)	BCOR (ENSG00000183337) #22	MID1IP1 (ENSG00000165175)	TSPAN7 (ENSG00000156298)	OTC (ENSG00000036473)	RPGR (ENSG00000156313)	SRPX (ENSG00000101955)	SYTL5 (ENSG00000147041)	H2AL3 (ENSG00000229674)	H2AP (ENSG00000187516)	DYNLT3 (ENSG00000165169)	CYBB (ENSG00000165168)	XK (ENSG00000047597)	LANCL3 (ENSG00000147036)	ENSG00000250349	PRRG1 (ENSG00000130962)	FAM47C (ENSG00000198173)
Gorilla	MODERN SPECIES	523	NYX (ENSGGOG00000008559)	DDX3X (ENSGGOG00000003181)	ENSGGOG00000043590	ENSGGOG00000043505	ENSGGOG00000039583	USP9X (ENSGGOG00000004363)	ENSGGOG00000024562	ENSGGOG00000037299	ENSGGOG00000024940	ENSGGOG00000043097	ENSGGOG00000042324	MED14 (ENSGGOG00000004125)	CXorf38 (ENSGGOG00000013906)	ATP6AP2 (ENSGGOG00000000532)	IMPDH (ENSGGOG00000040015)	BCOR (ENSGGOG00000014889) #22	ENSGGOG00000042064	ENSGGOG00000039451	ENSGGOG00000028188	TSPAN7 (ENSGGOG00000013841)	OTC (ENSGGOG00000011703)	RPGR (ENSGGOG00000023793)	SRPX (ENSGGOG00000007123)	SYTL5 (ENSGGOG00000002396)	CYBB (ENSGGOG00000007874)	XK (ENSGGOG00000016059)	LANCL3 (ENSGGOG00000024460)	PRRG1 (ENSGGOG00000010895)	CFAP47 (ENSGGOG00000039948)	MAGEB16 (ENSGGOG00000003549)	FAM47B (ENSGGOG00000001615)
Orangutan	MODERN SPECIES	242	MAOB (ENSPPYG00000020264)	MAOA (ENSPPYG00000020263)	PPP1R2C (ENSPPYG00000020262)	GPR82 (ENSPPYG00000020261)	GPR34 (ENSPPYG00000020260)	CASK (ENSPPYG00000020259)	NYX (ENSPPYG00000020258)	DDX3X (ENSPPYG00000020257)	USP9X (ENSPPYG00000020256)	ENSPPYG00000020255	MED14 (ENSPPYG00000020254)	CXorf38 (ENSPPYG00000020253)	MPC1L (ENSPPYG00000020252)	ATP6AP2 (ENSPPYG00000020251)	ENSPPYG00000031470	BCOR (ENSPPYG00000020250) #22	ENSPPYG00000035758	ENSPPYG00000038144	TSPAN7 (ENSPPYG00000020247)	OTC (ENSPPYG00000020246)	ENSPPYG00000020245	SRPX (ENSPPYG00000020244)	SYTL5 (ENSPPYG00000020243)	DYNLT3 (ENSPPYG00000020241)	CYBB (ENSPPYG00000020240)	XK (ENSPPYG00000036239)	LANCL3 (ENSPPYG00000020238)	PRRG1 (ENSPPYG00000020235)	ENSPPYG00000020233	CFAP47 (ENSPPYG00000020227)	MAGEB16 (ENSPPYG00000020226)
Gibbon	MODERN SPECIES	449	GPR82 (ENSNLEG00000002258)	NYX (ENSNLEG00000001945)	ENSNLEG00000001923	DDX3X (ENSNLEG00000001876)	USP9X (ENSNLEG00000001837)	ENSNLEG00000032912	ENSNLEG00000030859	ENSNLEG00000030171	ENSNLEG00000028978	ENSNLEG00000030923	MED14 (ENSNLEG00000001575)	CXorf38 (ENSNLEG00000001550)	MPC1L (ENSNLEG00000019041)	ATP6AP2 (ENSNLEG00000001441)	ENSNLEG00000001433	BCOR (ENSNLEG00000001372) #22	ENSNLEG00000033266	MID1IP1 (ENSNLEG00000034964)	TSPAN7 (ENSNLEG00000032727)	OTC (ENSNLEG00000001180)	ENSNLEG00000001110	SRPX (ENSNLEG00000001074)	SYTL5 (ENSNLEG00000001002)	ENSNLEG00000000985	CYBB (ENSNLEG00000000927)	XK (ENSNLEG00000000925)	LANCL3 (ENSNLEG00000000916)	PRRG1 (ENSNLEG00000000909)	ENSNLEG00000034838	CFAP47 (ENSNLEG00000000347)	MAGEB16 (ENSNLEG00000000359)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00670000098076.i.b	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00440000034918.q.a.a.b.b.b	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.k.a.a	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163970.b	ENSGT00940000163254	ENSGT00940000159699
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000166930	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00440000034918.q.a.a.b.b.b	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.k.a.a	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163970.b	ENSGT00940000163254	ENSGT00940000159699
Marmoset	MODERN SPECIES	78	CASK (ENSCJAG00000008892)	ENSCJAG00000073156	NYX (ENSCJAG00000009048)	ENSCJAG00000073650	ENSCJAG00000070284	ENSCJAG00000015787	USP9X (ENSCJAG00000004005)	ENSCJAG00000083416	ENSCJAG00000078955	ENSCJAG00000075384	ENSCJAG00000084856	ENSCJAG00000084787	CXorf38 (ENSCJAG00000047750)	MPC1L (ENSCJAG00000043940)	ATP6AP2 (ENSCJAG00000003800)	BCOR (ENSCJAG00000003758) #22	MID1IP1 (ENSCJAG00000042767)	TSPAN7 (ENSCJAG00000000758)	ENSCJAG00000054093	OTC (ENSCJAG00000020777)	RPGR (ENSCJAG00000020771)	SRPX (ENSCJAG00000005292)	ENSCJAG00000061898	SYTL5 (ENSCJAG00000005242)	ENSCJAG00000071073	CYBB (ENSCJAG00000005191)	XK (ENSCJAG00000005150)	PRRG1 (ENSCJAG00000005132)	ENSCJAG00000076353	ENSCJAG00000081049	ENSCJAG00000080618
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	36						ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00440000034918.q.a.a.b.b.b	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856.i	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.k.a.a	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163970.b	ENSGT00940000163254	ENSGT00940000159699	ENSGT00940000162825
Capuchin	MODERN SPECIES	366															ENSCCAG00000021490	BCOR (ENSCCAG00000029256) #22	ENSCCAG00000023926	MID1IP1 (ENSCCAG00000025857)	TSPAN7 (ENSCCAG00000034790)	OTC (ENSCCAG00000027286)	RPGR (ENSCCAG00000022978)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	51	ENSSBOG00000016740	ENSSBOG00000004894	CASK (ENSSBOG00000024108)	GPR34 (ENSSBOG00000018759)	NYX (ENSSBOG00000003432)	ENSSBOG00000019095	ENSSBOG00000024292	ENSSBOG00000034438	ENSSBOG00000026314	ENSSBOG00000026638	USP9X (ENSSBOG00000031035)	ENSSBOG00000027711	MED14 (ENSSBOG00000035627)	ENSSBOG00000034566	ATP6AP2 (ENSSBOG00000032565)	BCOR (ENSSBOG00000016929) #22	MID1IP1 (ENSSBOG00000010248)	ENSSBOG00000034245	TSPAN7 (ENSSBOG00000020077)	OTC (ENSSBOG00000029990)	RPGR (ENSSBOG00000022649)	SRPX (ENSSBOG00000027895)	SYTL5 (ENSSBOG00000021200)	ENSSBOG00000021839	CYBB (ENSSBOG00000026782)	XK (ENSSBOG00000028983)	LANCL3 (ENSSBOG00000020149)	PRRG1 (ENSSBOG00000025979)	ENSSBOG00000030535	ENSSBOG00000033616	ENSSBOG00000023497
Mas night monkey	MODERN SPECIES	678	MAOA (ENSANAG00000031969)	ENSANAG00000031554	ENSANAG00000033764	ENSANAG00000025353	GPR34 (ENSANAG00000019752)	CASK (ENSANAG00000021037)	NYX (ENSANAG00000032296)	DDX3X (ENSANAG00000017441)	ENSANAG00000038233	USP9X (ENSANAG00000036319)	MED14 (ENSANAG00000024459)	CXorf38 (ENSANAG00000030365)	ENSANAG00000004121	ATP6AP2 (ENSANAG00000036929)	ENSANAG00000035058	BCOR (ENSANAG00000020198) #22	MID1IP1 (ENSANAG00000018677)	TSPAN7 (ENSANAG00000026194)	OTC (ENSANAG00000038446)	RPGR (ENSANAG00000027653)	SRPX (ENSANAG00000022863)	ENSANAG00000037306	SYTL5 (ENSANAG00000032000)	ENSANAG00000037346	CYBB (ENSANAG00000030601)	XK (ENSANAG00000024021)	LANCL3 (ENSANAG00000032493)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000155202.i.b	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b.r	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.l	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009.k.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a	ENSGT00940000163515
Bushbaby	MODERN SPECIES	273							DDX3X (ENSOGAG00000005311)	ENSOGAG00000027756	USP9X (ENSOGAG00000027364)	ENSOGAG00000027162	ENSOGAG00000033744	ENSOGAG00000000027	ENSOGAG00000009294	CXorf38 (ENSOGAG00000009290)	ATP6AP2 (ENSOGAG00000000341)	ENSOGAG00000006761 #22	MID1IP1 (ENSOGAG00000014244)	TSPAN7 (ENSOGAG00000008547)	ENSOGAG00000033631	OTC (ENSOGAG00000008763)	ENSOGAG00000008761	SRPX (ENSOGAG00000010711)	SYTL5 (ENSOGAG00000010705)	ENSOGAG00000026644	ENSOGAG00000026602	CYBB (ENSOGAG00000010695)	XK (ENSOGAG00000024974)	LANCL3 (ENSOGAG00000003551)	ENSOGAG00000024752	ENSOGAG00000024398	ENSOGAG00000027726
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000155202.i.b	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b.r	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.l.c.a	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538
Mouse lemur	MODERN SPECIES	169	MAOA (ENSMICG00000002042)	ENSMICG00000046904	ENSMICG00000034936	CASK (ENSMICG00000000276)	NYX (ENSMICG00000008813)	DDX3X (ENSMICG00000032772)	USP9X (ENSMICG00000027320)	ENSMICG00000027461	ENSMICG00000032741	ENSMICG00000030704	ENSMICG00000044341	MED14 (ENSMICG00000015221)	CXorf38 (ENSMICG00000015213)	ATP6AP2 (ENSMICG00000014583)	ENSMICG00000038133	BCOR (ENSMICG00000006169) #22	MID1IP1 (ENSMICG00000042367)	TSPAN7 (ENSMICG00000011737)	OTC (ENSMICG00000011724)	ENSMICG00000026397	SRPX (ENSMICG00000001454)	SYTL5 (ENSMICG00000045851)	ENSMICG00000033194	CYBB (ENSMICG00000026872)	XK (ENSMICG00000047814)	LANCL3 (ENSMICG00000005180)	PRRG1 (ENSMICG00000043549)	ENSMICG00000032179	ENSMICG00000034748	ENSMICG00000031482	ENSMICG00000035221
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	141	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545.b	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b.r	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000010165.i.b.b.a	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.l.c.a	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00950000182841.b.a.a.a	ENSGT00530000063484.b.b
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	244													CXorf38 (ENSPCOG00000015213)	MPC1L (ENSPCOG00000024568)	ATP6AP2 (ENSPCOG00000022938)	BCOR (ENSPCOG00000013589) #22	MID1IP1 (ENSPCOG00000005169)	TSPAN7 (ENSPCOG00000022623)	OTC (ENSPCOG00000021444)	ENSPCOG00000016634	SRPX (ENSPCOG00000016159)	ENSPCOG00000018181	SYTL5 (ENSPCOG00000005779)	DYNLT3 (ENSPCOG00000019680)	CYBB (ENSPCOG00000006604)	XK (ENSPCOG00000020894)	LANCL3 (ENSPCOG00000025427)	PRRG1 (ENSPCOG00000028202)	ENSPCOG00000020162	ENSPCOG00000027051
Greater bamboo lemur	DUPLICATION
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	553																BCOR (ENSPSMG00000009584) #22
Greater bamboo lemur	DUPLICATION
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	45																ENSPSMG00000011810 #22	ENSPSMG00000011800 #22
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	45															ENSPSMG00000011810 #22	ENSPSMG00000011800 #22
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a	ENSGT00940000163515
Tree shrew	MODERN SPECIES	4434																BCOR (ENSTBEG00000008171) #22
Glires	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a	ENSGT00940000163515
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a	ENSGT00940000163515
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163515
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163515
Muroidea	DUPLICATION
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b.o #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153.q	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.i.a	ENSGT00940000158538
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b.o #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153.q	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.i.b	ENSGT00940000163515.j
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545.f	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b.o #22	ENSGT00940000153737.b.p #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153.q	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492.e	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.i.b
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000163638	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545.f	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b.o #22	ENSGT00940000153737.b.p #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153.q	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492.e	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.i.b	ENSGT00940000163515.j
Golden Hamster	MODERN SPECIES	717	Efhc2 (ENSMAUG00000020354)	Ndp (ENSMAUG00000001320)	Maob (ENSMAUG00000017384)	Maoa (ENSMAUG00000017953)	ENSMAUG00000008252	Cask (ENSMAUG00000018107)	Gpr82 (ENSMAUG00000003517)	Gpr34 (ENSMAUG00000020755)	Ddx3x (ENSMAUG00000021962)	Usp9x (ENSMAUG00000015465)	ENSMAUG00000003759	Med14 (ENSMAUG00000011652)	ENSMAUG00000018384	1810030O07Rik (ENSMAUG00000018848)	Atp6ap2 (ENSMAUG00000021791)	ENSMAUG00000008014 #22	ENSMAUG00000008218 #22	Mid1ip1 (ENSMAUG00000014237)	Tspan7 (ENSMAUG00000016617)	Otc (ENSMAUG00000009398)	Rpgr (ENSMAUG00000001619)	ENSMAUG00000020752	ENSMAUG00000008638	Dynlt3 (ENSMAUG00000015141)	ENSMAUG00000011704	Xk (ENSMAUG00000018870)	Lancl3 (ENSMAUG00000020917)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	175	Ndp (ENSCGRG00001012325)	Maob (ENSCGRG00001012026)	Maoa (ENSCGRG00001003371)	Gpr82 (ENSCGRG00001008634)	Gpr34 (ENSCGRG00001009221)	Cask (ENSCGRG00001018099)	Nyx (ENSCGRG00001023872)	ENSCGRG00001020496	Ddx3x (ENSCGRG00001022185)	Usp9x (ENSCGRG00001022402)	E330021D16Rik (ENSCGRG00001005473)	Med14 (ENSCGRG00001000873)	1810030O07Rik (ENSCGRG00001022070)	ENSCGRG00001010043	Atp6ap2 (ENSCGRG00001008860)	Bcor (ENSCGRG00001017450) #22	ENSCGRG00001003048	Mid1ip1 (ENSCGRG00001009863)	Tspan7 (ENSCGRG00001017377)	ENSCGRG00001010548	Otc (ENSCGRG00001001226)	Rpgr (ENSCGRG00001017432)	Sytl5 (ENSCGRG00001023173)	ENSCGRG00001011543	H2ap (ENSCGRG00001003645)	Dynlt3 (ENSCGRG00001016040)	Cybb (ENSCGRG00001014092)	Xk (ENSCGRG00001022297)	Lancl3 (ENSCGRG00001020578)	ENSCGRG00001001938	ENSCGRG00001004165
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545.f	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b.o #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153.q	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492.e	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.i.b	ENSGT00940000163515.j	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.i.a
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	475	Ndp (ENSPEMG00000031057)	Maob (ENSPEMG00000000761)	Maoa (ENSPEMG00000006637)	ENSPEMG00000026824	Gpr82 (ENSPEMG00000013070)	Gpr34 (ENSPEMG00000010219)	Cask (ENSPEMG00000012945)	Nyx (ENSPEMG00000013523)	Ddx3x (ENSPEMG00000014021)	Usp9x (ENSPEMG00000016337)	E330021D16Rik (ENSPEMG00000013160)	Med14 (ENSPEMG00000009411)	1810030O07Rik (ENSPEMG00000010471)	ENSPEMG00000029718	Atp6ap2 (ENSPEMG00000011119)	Bcor (ENSPEMG00000011517) #22	ENSPEMG00000012951	Mid1ip1 (ENSPEMG00000025115)	Tspan7 (ENSPEMG00000013653)	Otc (ENSPEMG00000013040)	Rpgr (ENSPEMG00000015885)	Sytl5 (ENSPEMG00000018805)	ENSPEMG00000010876	H2ap (ENSPEMG00000025123)	Dynlt3 (ENSPEMG00000006624)	Cybb (ENSPEMG00000007459)	Xk (ENSPEMG00000010546)	Lancl3 (ENSPEMG00000013414)	ENSPEMG00000026990	ENSPEMG00000013747	ENSPEMG00000005513
Prairie vole	MODERN SPECIES	1	Gpr82 (ENSMOCG00000003874)	Gpr34 (ENSMOCG00000016433)	Cask (ENSMOCG00000007637)	Nyx (ENSMOCG00000018188)	Ddx3x (ENSMOCG00000014170)	ENSMOCG00000008046	Usp9x (ENSMOCG00000009609)	E330021D16Rik (ENSMOCG00000006042)	ENSMOCG00000005802	ENSMOCG00000016742	ENSMOCG00000016696	1810030O07Rik (ENSMOCG00000009974)	Atp6ap2 (ENSMOCG00000010803)	ENSMOCG00000009697	ENSMOCG00000021841 #22	ENSMOCG00000021216 #22	ENSMOCG00000010154	ENSMOCG00000007720	Mid1ip1 (ENSMOCG00000009515)	Tspan7 (ENSMOCG00000021984)	Otc (ENSMOCG00000020681)	Rpgr (ENSMOCG00000015129)	Srpx (ENSMOCG00000000503)	Sytl5 (ENSMOCG00000020078)	Dynlt3 (ENSMOCG00000013937)	ENSMOCG00000005328	ENSMOCG00000002347	Xk (ENSMOCG00000021048)	Lancl3 (ENSMOCG00000018888)	ENSMOCG00000015166	Slc38a5 (ENSMOCG00000015897)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b.o #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153.q	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.i.b	ENSGT00940000163515.j
Mus	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000163638	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b.o #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153.q	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00950000183845	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.i.a.a	ENSGT00940000166424
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00390000016779.b.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b.o #22	ENSGT00940000162492.g.b	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153.q	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00950000183845	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00940000162492.h	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000169466
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00390000016779.b.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b.o #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153.q	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00950000183845	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000162492.h	ENSGT00940000160244	ENSGT00940000162492.g.b.a.a.a.a	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000169466
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000163638	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b.o #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153.q	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00950000183845	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000162492.h	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00860000135843	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000169466
Steppe mouse	MODERN SPECIES	1541																Bcor (ENSMSIG00000022531) #22
spretus	MODERN SPECIES	19	Fundc1 (MGP_SPRETEiJ_G0034102)	Efhc2 (MGP_SPRETEiJ_G0034101)	Ndp (MGP_SPRETEiJ_G0034100)	Maob (MGP_SPRETEiJ_G0034099)	Maoa (MGP_SPRETEiJ_G0034098)	MGP_SPRETEiJ_G0034097	Gpr82 (MGP_SPRETEiJ_G0034096)	Gpr34 (MGP_SPRETEiJ_G0034095)	Cask (MGP_SPRETEiJ_G0034094)	Nyx (MGP_SPRETEiJ_G0034093)	Ddx3x (MGP_SPRETEiJ_G0034092)	Usp9x (MGP_SPRETEiJ_G0034091)	Med14 (MGP_SPRETEiJ_G0034090)	1810030O07Rik (MGP_SPRETEiJ_G0034089)	Atp6ap2 (MGP_SPRETEiJ_G0034088)	Bcor (MGP_SPRETEiJ_G0034087) #22	Mid1ip1 (MGP_SPRETEiJ_G0034086)	Tspan7 (MGP_SPRETEiJ_G0034085)	Otc (MGP_SPRETEiJ_G0034084)	Rpgr (MGP_SPRETEiJ_G0034083)	Srpx (MGP_SPRETEiJ_G0034082)	Sytl5 (MGP_SPRETEiJ_G0034081)	H2al3 (MGP_SPRETEiJ_G0034080)	H2ap (MGP_SPRETEiJ_G0034079)	Dynlt3 (MGP_SPRETEiJ_G0034078)	MGP_SPRETEiJ_G0034077	Cybb (MGP_SPRETEiJ_G0034076)	Xk (MGP_SPRETEiJ_G0034075)	MGP_SPRETEiJ_G0034074	Lancl3 (MGP_SPRETEiJ_G0034073)	4930402K13Rik (MGP_SPRETEiJ_G0034072)
Mouse	MODERN SPECIES	37	Efhc2 (ENSMUSG00000025038)	Ndp (ENSMUSG00000040138)	Maob (ENSMUSG00000040147)	Maoa (ENSMUSG00000025037)	Cypt1 (ENSMUSG00000023257)	H2al1n (ENSMUSG00000078346)	Gpr82 (ENSMUSG00000047678)	Gpr34 (ENSMUSG00000040229)	Cask (ENSMUSG00000031012)	Nyx (ENSMUSG00000051228)	Ddx3x (ENSMUSG00000000787)	Usp9x (ENSMUSG00000031010)	Med14 (ENSMUSG00000064127)	1810030O07Rik (ENSMUSG00000044148)	Atp6ap2 (ENSMUSG00000031007)	Bcor (ENSMUSG00000040363) #22	H2al1j (ENSMUSG00000069038)	H2al1i (ENSMUSG00000095445)	H2al1h (ENSMUSG00000099443)	H2al1g (ENSMUSG00000095662)	H2al1f (ENSMUSG00000095655)	H2al1e (ENSMUSG00000095413)	H2al1d (ENSMUSG00000094904)	H2al1c (ENSMUSG00000096097)	H2al1b (ENSMUSG00000101819)	H2al1a (ENSMUSG00000100626)	Mid1ip1 (ENSMUSG00000008035)	Tspan7 (ENSMUSG00000058254)	Otc (ENSMUSG00000031173)	Rpgr (ENSMUSG00000031174)	Srpx (ENSMUSG00000090084)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	19	Ndp (MGP_CAROLIEiJ_G0032951)	Maob (MGP_CAROLIEiJ_G0032950)	Maoa (MGP_CAROLIEiJ_G0032949)	MGP_CAROLIEiJ_G0032948	Cypt1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032947)	MGP_CAROLIEiJ_G0032946	Gpr82 (MGP_CAROLIEiJ_G0032945)	Gpr34 (MGP_CAROLIEiJ_G0032944)	Cask (MGP_CAROLIEiJ_G0032943)	Nyx (MGP_CAROLIEiJ_G0032942)	Ddx3x (MGP_CAROLIEiJ_G0032941)	MGP_CAROLIEiJ_G0032940	Med14 (MGP_CAROLIEiJ_G0032939)	1810030O07Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0032938)	Atp6ap2 (MGP_CAROLIEiJ_G0032937)	Bcor (MGP_CAROLIEiJ_G0032936) #22	MGP_CAROLIEiJ_G0032935	Mid1ip1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032934)	Tspan7 (MGP_CAROLIEiJ_G0032933)	Otc (MGP_CAROLIEiJ_G0032932)	Rpgr (MGP_CAROLIEiJ_G0032931)	Srpx (MGP_CAROLIEiJ_G0032930)	Sytl5 (MGP_CAROLIEiJ_G0032929)	MGP_CAROLIEiJ_G0032928	H2ap (MGP_CAROLIEiJ_G0032927)	Dynlt3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032926)	Cybb (MGP_CAROLIEiJ_G0032925)	MGP_CAROLIEiJ_G0032924	MGP_CAROLIEiJ_G0032923	Lancl3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032922)	4930402K13Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0032921)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	23	Dusp21 (MGP_PahariEiJ_G0031497)	Fundc1 (MGP_PahariEiJ_G0031496)	Efhc2 (MGP_PahariEiJ_G0031495)	Ndp (MGP_PahariEiJ_G0031494)	Maob (MGP_PahariEiJ_G0031493)	Maoa (MGP_PahariEiJ_G0031492)	Gpr82 (MGP_PahariEiJ_G0031491)	Gpr34 (MGP_PahariEiJ_G0031490)	Cask (MGP_PahariEiJ_G0031489)	Nyx (MGP_PahariEiJ_G0031488)	Ddx3x (MGP_PahariEiJ_G0031487)	Usp9x (MGP_PahariEiJ_G0031486)	Med14 (MGP_PahariEiJ_G0031485)	1810030O07Rik (MGP_PahariEiJ_G0031484)	Atp6ap2 (MGP_PahariEiJ_G0031483)	Bcor (MGP_PahariEiJ_G0031482) #22	Mid1ip1 (MGP_PahariEiJ_G0031481)	Tspan7 (MGP_PahariEiJ_G0031480)	Otc (MGP_PahariEiJ_G0031479)	Rpgr (MGP_PahariEiJ_G0031478)	Srpx (MGP_PahariEiJ_G0031477)	Sytl5 (MGP_PahariEiJ_G0031476)	MGP_PahariEiJ_G0031475	H2ap (MGP_PahariEiJ_G0031474)	Dynlt3 (MGP_PahariEiJ_G0031473)	Cybb (MGP_PahariEiJ_G0031472)	MGP_PahariEiJ_G0031471	Lancl3 (MGP_PahariEiJ_G0031470)	B630019K06Rik (MGP_PahariEiJ_G0031469)	Slc38a5 (MGP_PahariEiJ_G0031468)	Ftsj1 (MGP_PahariEiJ_G0031467)
Rat	MODERN SPECIES	46	Maoa (ENSRNOG00000002848)	RGD1562289 (ENSRNOG00000068449)	Ppp1r2-ps1 (ENSRNOG00000069720)	AABR07036974.1 (ENSRNOG00000030819)	Cask (ENSRNOG00000060946)	Gpr82 (ENSRNOG00000039762)	Gpr34 (ENSRNOG00000039759)	Nyx (ENSRNOG00000009646)	Ddx3x (ENSRNOG00000023383)	Usp9x (ENSRNOG00000003261)	Med14 (ENSRNOG00000003792)	RGD1565685 (ENSRNOG00000023187)	AABR07037058.1 (ENSRNOG00000023163)	Atp6ap2 (ENSRNOG00000003858)	ENSRNOG00000064902	Bcor (ENSRNOG00000034240) #22	AABR07037073.1 (ENSRNOG00000003227)	Mid1ip1 (ENSRNOG00000003228)	Tspan7 (ENSRNOG00000003229)	RGD1561661 (ENSRNOG00000023094)	Otc (ENSRNOG00000003370)	Rpgr (ENSRNOG00000003013)	Sytl5 (ENSRNOG00000003585)	Dynlt3 (ENSRNOG00000003611)	Cybb (ENSRNOG00000003622)	Xk (ENSRNOG00000003749)	Lancl3 (ENSRNOG00000003756)	RGD1561106 (ENSRNOG00000063120)	LOC120099305 (ENSRNOG00000063778)	LOC102552474 (ENSRNOG00000039615)	LOC120099271 (ENSRNOG00000066456)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	461	ENSNGAG00000018371	ENSNGAG00000015190	Gpr82 (ENSNGAG00000018110)	Gpr34 (ENSNGAG00000018163)	Cask (ENSNGAG00000008097)	Nyx (ENSNGAG00000011629)	Ddx3x (ENSNGAG00000018077)	Usp9x (ENSNGAG00000012060)	ENSNGAG00000022683	E330021D16Rik (ENSNGAG00000005804)	Med14 (ENSNGAG00000000544)	1810030O07Rik (ENSNGAG00000018470)	Atp6ap2 (ENSNGAG00000014902)	ENSNGAG00000017147	ENSNGAG00000014390 #22	ENSNGAG00000013284 #22	Mid1ip1 (ENSNGAG00000012989)
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153737.b.p #22
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153737.b.p #22
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545.f	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b.o #22	ENSGT00940000153737.b.p #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153.q	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492.e	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.i.b	ENSGT00940000163515.j
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153737.b.p #22
Prairie vole	MODERN SPECIES	1	ENSMOCG00000016039	Gpr82 (ENSMOCG00000003874)	Gpr34 (ENSMOCG00000016433)	Cask (ENSMOCG00000007637)	Nyx (ENSMOCG00000018188)	Ddx3x (ENSMOCG00000014170)	ENSMOCG00000008046	Usp9x (ENSMOCG00000009609)	E330021D16Rik (ENSMOCG00000006042)	ENSMOCG00000005802	ENSMOCG00000016742	ENSMOCG00000016696	1810030O07Rik (ENSMOCG00000009974)	Atp6ap2 (ENSMOCG00000010803)	ENSMOCG00000009697	ENSMOCG00000021841 #22	ENSMOCG00000021216 #22	ENSMOCG00000010154	ENSMOCG00000007720	Mid1ip1 (ENSMOCG00000009515)	Tspan7 (ENSMOCG00000021984)	Otc (ENSMOCG00000020681)	Rpgr (ENSMOCG00000015129)	Srpx (ENSMOCG00000000503)	Sytl5 (ENSMOCG00000020078)	Dynlt3 (ENSMOCG00000013937)	ENSMOCG00000005328	ENSMOCG00000002347	Xk (ENSMOCG00000021048)	Lancl3 (ENSMOCG00000018888)	ENSMOCG00000015166
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545.f	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b.o #22	ENSGT00940000153737.b.p #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153.q	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492.e	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.i.b	ENSGT00940000163515.j	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.i.a
Golden Hamster	MODERN SPECIES	717	Ndp (ENSMAUG00000001320)	Maob (ENSMAUG00000017384)	Maoa (ENSMAUG00000017953)	ENSMAUG00000008252	Cask (ENSMAUG00000018107)	Gpr82 (ENSMAUG00000003517)	Gpr34 (ENSMAUG00000020755)	Ddx3x (ENSMAUG00000021962)	Usp9x (ENSMAUG00000015465)	ENSMAUG00000003759	Med14 (ENSMAUG00000011652)	ENSMAUG00000018384	1810030O07Rik (ENSMAUG00000018848)	Atp6ap2 (ENSMAUG00000021791)	ENSMAUG00000008014 #22	ENSMAUG00000008218 #22	Mid1ip1 (ENSMAUG00000014237)	Tspan7 (ENSMAUG00000016617)	Otc (ENSMAUG00000009398)	Rpgr (ENSMAUG00000001619)	ENSMAUG00000020752	ENSMAUG00000008638	Dynlt3 (ENSMAUG00000015141)	ENSMAUG00000011704	Xk (ENSMAUG00000018870)	Lancl3 (ENSMAUG00000020917)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	461	Maoa (ENSNGAG00000013137)	ENSNGAG00000018371	ENSNGAG00000015190	Gpr82 (ENSNGAG00000018110)	Gpr34 (ENSNGAG00000018163)	Cask (ENSNGAG00000008097)	Nyx (ENSNGAG00000011629)	Ddx3x (ENSNGAG00000018077)	Usp9x (ENSNGAG00000012060)	ENSNGAG00000022683	E330021D16Rik (ENSNGAG00000005804)	Med14 (ENSNGAG00000000544)	1810030O07Rik (ENSNGAG00000018470)	Atp6ap2 (ENSNGAG00000014902)	ENSNGAG00000017147	ENSNGAG00000014390 #22	ENSNGAG00000013284 #22	Mid1ip1 (ENSNGAG00000012989)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	124	Maob (ENSJJAG00000012262)	Maoa (ENSJJAG00000011331)	ENSJJAG00000010951	ENSJJAG00000010745	ENSJJAG00000010651	ENSJJAG00000010094	Gpr34 (ENSJJAG00000013331)	Cask (ENSJJAG00000022808)	Nyx (ENSJJAG00000020005)	Ddx3x (ENSJJAG00000019645)	Usp9x (ENSJJAG00000023449)	E330021D16Rik (ENSJJAG00000013240)	Med14 (ENSJJAG00000020727)	1810030O07Rik (ENSJJAG00000019402)	ENSJJAG00000019088	Bcor (ENSJJAG00000018755) #22	Mid1ip1 (ENSJJAG00000013196)	ENSJJAG00000018161	Tspan7 (ENSJJAG00000017974)	Otc (ENSJJAG00000017566)	Rpgr (ENSJJAG00000014640)	Srpx (ENSJJAG00000012346)	Sytl5 (ENSJJAG00000009155)	ENSJJAG00000003835	Dynlt3 (ENSJJAG00000000829)	Cybb (ENSJJAG00000000492)	Xk (ENSJJAG00000000183)	Lancl3 (ENSJJAG00000022937)	ENSJJAG00000009500
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	415										ENSDORG00000028747	Ddx3x (ENSDORG00000029882)	Usp9x (ENSDORG00000002122)	Med14 (ENSDORG00000016439)	1810030O07Rik (ENSDORG00000005555)	ENSDORG00000024862	Bcor (ENSDORG00000028994) #22	Mid1ip1 (ENSDORG00000029503)	ENSDORG00000029598	ENSDORG00000014052	Rpgr (ENSDORG00000003222)	Srpx (ENSDORG00000015046)	Sytl5 (ENSDORG00000015043)	ENSDORG00000028985	Dynlt3 (ENSDORG00000028646)	Cybb (ENSDORG00000012634)	Xk (ENSDORG00000002044)	Lancl3 (ENSDORG00000024001)	Prrg1 (ENSDORG00000028715)	ENSDORG00000023260	Cfap47 (ENSDORG00000014353)	Tmem47 (ENSDORG00000026085)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000163202	ENSGT00940000163254	ENSGT00940000159699	ENSGT00940000162825.h	ENSGT00950000183442	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000154517.i	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.n.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000162492
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00940000154517.i	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000163202	ENSGT00940000163254
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	112							ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856.d	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	273																BCOR (ENSCLAG00000000121) #22	MID1IP1 (ENSCLAG00000000110)	TSPAN7 (ENSCLAG00000000106)
Degu	MODERN SPECIES	273		CASK (ENSODEG00000002069)	GPR82 (ENSODEG00000002230)	GPR34 (ENSODEG00000018828)	NYX (ENSODEG00000001332)	ENSODEG00000001355	USP9X (ENSODEG00000001431)	ENSODEG00000018682	ENSODEG00000001518	ENSODEG00000001529	ENSODEG00000001539	MED14 (ENSODEG00000001567)	CXorf38 (ENSODEG00000001590)	ENSODEG00000001615	ENSODEG00000001626	BCOR (ENSODEG00000001651) #22	ENSODEG00000001662
Guinea pig	MODERN SPECIES	33	ENSCPOG00000001385	FUNDC1 (ENSCPOG00000030724)	EFHC2 (ENSCPOG00000014599)	NDP (ENSCPOG00000040535)	MAOB (ENSCPOG00000000980)	MAOA (ENSCPOG00000001030)	ENSCPOG00000007290	CASK (ENSCPOG00000010851)	NYX (ENSCPOG00000010847)	ENSCPOG00000013557	USP9X (ENSCPOG00000033622)	MED14 (ENSCPOG00000031296)	CXorf38 (ENSCPOG00000014304)	MPC1L (ENSCPOG00000022729)	ATP6AP2 (ENSCPOG00000000756)	BCOR (ENSCPOG00000003878) #22	ENSCPOG00000038948	MID1IP1 (ENSCPOG00000026903)	TSPAN7 (ENSCPOG00000000183)	ENSCPOG00000023154	OTC (ENSCPOG00000012895)	ENSCPOG00000023879	SRPX (ENSCPOG00000013055)	SYTL5 (ENSCPOG00000013051)	ENSCPOG00000020434	DYNLT3 (ENSCPOG00000036885)	CYBB (ENSCPOG00000001930)	XK (ENSCPOG00000033355)	LANCL3 (ENSCPOG00000004631)	ENSCPOG00000026096	PRRG1 (ENSCPOG00000035849)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	31	GPR82 (ENSHGLG00000018778)	GPR34 (ENSHGLG00000041208)	ENSHGLG00000047643	CASK (ENSHGLG00000008006)	ENSHGLG00000037147	ENSHGLG00000016669	NYX (ENSHGLG00000004422)	ENSHGLG00000034784	Ddx3x (ENSHGLG00000004805)	USP9X (ENSHGLG00000005613)	MED14 (ENSHGLG00000005145)	CXorf38 (ENSHGLG00000005921)	MPC1L (ENSHGLG00000020388)	ATP6AP2 (ENSHGLG00000009344)	ENSHGLG00000044824	BCOR (ENSHGLG00000004759) #22	ENSHGLG00000005272	MID1IP1 (ENSHGLG00000047790)	ENSHGLG00000045058	TSPAN7 (ENSHGLG00000008684)	ENSHGLG00000020377	OTC (ENSHGLG00000006935)	ENSHGLG00000043721	ENSHGLG00000020528	ENSHGLG00000009243	SYTL5 (ENSHGLG00000014015)	ENSHGLG00000047419	ENSHGLG00000040369	ENSHGLG00000043135	ENSHGLG00000013401	CYBB (ENSHGLG00000042638)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000163638	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00940000155600.b.q	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.k.b	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163515
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b.q	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.k.b	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000162492
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	94	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b.q	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.k.b	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000162492
Squirrel	MODERN SPECIES	102	NDP (ENSSTOG00000010960)	MAOB (ENSSTOG00000004985)	MAOA (ENSSTOG00000004958)	GPR82 (ENSSTOG00000028760)	GPR34 (ENSSTOG00000001566)	CASK (ENSSTOG00000005927)	NYX (ENSSTOG00000027262)	ENSSTOG00000029381	DDX3X (ENSSTOG00000008094)	USP9X (ENSSTOG00000000797)	MED14 (ENSSTOG00000022333)	CXorf38 (ENSSTOG00000005469)	MPC1L (ENSSTOG00000026402)	ENSSTOG00000031229	ATP6AP2 (ENSSTOG00000005456)	BCOR (ENSSTOG00000003219) #22	MID1IP1 (ENSSTOG00000027194)	TSPAN7 (ENSSTOG00000012077)	ENSSTOG00000019432	OTC (ENSSTOG00000004056)	ENSSTOG00000022470	SRPX (ENSSTOG00000007767)	ENSSTOG00000023192	SYTL5 (ENSSTOG00000029210)	DYNLT3 (ENSSTOG00000028818)	CYBB (ENSSTOG00000019548)	XK (ENSSTOG00000021262)	LANCL3 (ENSSTOG00000012636)	ENSSTOG00000021050	PRRG1 (ENSSTOG00000021592)	ENSSTOG00000026116
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	50	NDP (ENSUPAG00010001702)	MAOB (ENSUPAG00010001680)	MAOA (ENSUPAG00010001649)	ENSUPAG00010001628	GPR82 (ENSUPAG00010001592)	GPR34 (ENSUPAG00010001586)	CASK (ENSUPAG00010001389)	NYX (ENSUPAG00010001369)	ENSUPAG00010001364	DDX3X (ENSUPAG00010001313)	USP9X (ENSUPAG00010001270)	MED14 (ENSUPAG00010001193)	CXorf38 (ENSUPAG00010001158)	MPC1L (ENSUPAG00010001147)	ATP6AP2 (ENSUPAG00010001133)	ENSUPAG00010001115 #22	TSPAN7 (ENSUPAG00010001001)	ENSUPAG00010000980	OTC (ENSUPAG00010000958)	ENSUPAG00010000022	SYTL5 (ENSUPAG00010017470)	ENSUPAG00010017463	DYNLT3 (ENSUPAG00010017456)	CYBB (ENSUPAG00010017438)	XK (ENSUPAG00010017431)	LANCL3 (ENSUPAG00010017422)	PRRG1 (ENSUPAG00010017415)	ENSUPAG00010017410	MAGEB16 (ENSUPAG00010017404)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	21	NDP (ENSMMMG00000011581)	MAOB (ENSMMMG00000011245)	MAOA (ENSMMMG00000011225)	ENSMMMG00000011202	GPR82 (ENSMMMG00000011172)	GPR34 (ENSMMMG00000011165)	CASK (ENSMMMG00000010916)	ENSMMMG00000010906	ENSMMMG00000010902	DDX3X (ENSMMMG00000010865)	USP9X (ENSMMMG00000010802)	MED14 (ENSMMMG00000010703)	MPC1L (ENSMMMG00000010695)	ENSMMMG00000010690	ATP6AP2 (ENSMMMG00000010656)	BCOR (ENSMMMG00000010519) #22	TSPAN7 (ENSMMMG00000010451)	ENSMMMG00000010431	OTC (ENSMMMG00000010392)	ENSMMMG00000010133	SRPX (ENSMMMG00000010108)	SYTL5 (ENSMMMG00000010054)	ENSMMMG00000010049	DYNLT3 (ENSMMMG00000010004)	ENSMMMG00000010001	ENSMMMG00000009990	XK (ENSMMMG00000009986)	ENSMMMG00000009942	ENSMMMG00000009939	PRRG1 (ENSMMMG00000009880)	ENSMMMG00000009849
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	156	NDP (ENSSVLG00005015288)	MAOB (ENSSVLG00005015336)	MAOA (ENSSVLG00005015484)	ENSSVLG00005015713	ENSSVLG00005015798	CASK (ENSSVLG00005015944)	GPR82 (ENSSVLG00005016259)	GPR34 (ENSSVLG00005016276)	NYX (ENSSVLG00005016295)	ENSSVLG00005016422	USP9X (ENSSVLG00005018130)	MED14 (ENSSVLG00005018208)	ENSSVLG00005018247	MPC1L (ENSSVLG00005018339)	ATP6AP2 (ENSSVLG00005018414)	BCOR (ENSSVLG00005018727) #22	MID1IP1 (ENSSVLG00005018779)	ENSSVLG00005018801	OTC (ENSSVLG00005018838)	ENSSVLG00005018959	SRPX (ENSSVLG00005019058)	SYTL5 (ENSSVLG00005019419)	ENSSVLG00005019604	DYNLT3 (ENSSVLG00005019706)	CYBB (ENSSVLG00005019783)	ENSSVLG00005019919	XK (ENSSVLG00005019963)	LANCL3 (ENSSVLG00005020024)	ENSSVLG00005020166	ENSSVLG00005020177	ENSSVLG00005020217
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000158538
Rabbit	MODERN SPECIES	1401	MAOB (ENSOCUG00000001436)	MAOA (ENSOCUG00000001429)	ENSOCUG00000012846	ENSOCUG00000025629	ENSOCUG00000030365	GPR82 (ENSOCUG00000003218)	GPR34 (ENSOCUG00000003220)	CASK (ENSOCUG00000004864)	NYX (ENSOCUG00000004856)	DDX3X (ENSOCUG00000012338)	USP9X (ENSOCUG00000007198)	MED14 (ENSOCUG00000015286)	CXorf38 (ENSOCUG00000015277)	MPC1L (ENSOCUG00000015273)	ATP6AP2 (ENSOCUG00000015259)	BCOR (ENSOCUG00000017052) #22	MID1IP1 (ENSOCUG00000002707)	TSPAN7 (ENSOCUG00000008424)	OTC (ENSOCUG00000010532)	ENSOCUG00000021720	SRPX (ENSOCUG00000008272)	SYTL5 (ENSOCUG00000008263)	ENSOCUG00000000454	ENSOCUG00000009787	CYBB (ENSOCUG00000032490)	XK (ENSOCUG00000006566)	LANCL3 (ENSOCUG00000006562)	ENSOCUG00000015848	ENSOCUG00000030366	PRRG1 (ENSOCUG00000015462)	ENSOCUG00000033693
Pika	MODERN SPECIES	3946																ENSOPRG00000005064 #22
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00900000143309	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000163202	ENSGT00940000163254	ENSGT00940000159699	ENSGT00940000162825	ENSGT00950000183442	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153737.b #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	7514																BCOR (ENSEEUG00000009100) #22
Common shrew	MODERN SPECIES	5889																BCOR (ENSSARG00000002328) #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000163202	ENSGT00940000163254	ENSGT00940000159699	ENSGT00940000162825	ENSGT00940000165165	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000164247
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b	ENSGT00940000163515	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.a.b
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000165165	ENSGT00940000162825	ENSGT00940000159699	ENSGT00940000163254	ENSGT00940000163202
Arabian camel	MODERN SPECIES	204	EFHC2 (ENSCDRG00005020588)	NDP (ENSCDRG00005020582)	MAOB (ENSCDRG00005020569)	MAOA (ENSCDRG00005020544)	ENSCDRG00005020530	GPR82 (ENSCDRG00005020521)	GPR34 (ENSCDRG00005020516)	CASK (ENSCDRG00005020425)	NYX (ENSCDRG00005020391)	DDX3X (ENSCDRG00005020330)	USP9X (ENSCDRG00005020300)	MED14 (ENSCDRG00005020243)	CXorf38 (ENSCDRG00005020221)	ENSCDRG00005020200	ATP6AP2 (ENSCDRG00005020065)	BCOR (ENSCDRG00005019988) #22	MID1IP1 (ENSCDRG00005019974)	TSPAN7 (ENSCDRG00005019956)	ENSCDRG00005019945	OTC (ENSCDRG00005019934)	ENSCDRG00005019467	SRPX (ENSCDRG00005019346)	ENSCDRG00005019328	SYTL5 (ENSCDRG00005019261)	DYNLT3 (ENSCDRG00005019230)	CYBB (ENSCDRG00005019198)	XK (ENSCDRG00005019184)	LANCL3 (ENSCDRG00005019168)	ENSCDRG00005019150	ENSCDRG00005019124	ENSCDRG00005019108
Alpaca	MODERN SPECIES	2359																ENSVPAG00000007332 #22
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000158538
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00390000008496.j.b.b.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000165165	ENSGT00950000183442
Blue whale	DUPLICATION
Blue whale	MODERN SPECIES	40	ENSBMSG00010017638	ENSBMSG00010017593	GPR82 (ENSBMSG00010017574)	GPR34 (ENSBMSG00010017560)	ENSBMSG00010017550	CASK (ENSBMSG00010017223)	ENSBMSG00010017131	NYX (ENSBMSG00010017109)	ENSBMSG00010017095	DDX3X (ENSBMSG00010016859)	USP9X (ENSBMSG00010016782)	MED14 (ENSBMSG00010016504)	CXorf38 (ENSBMSG00010016418)	ENSBMSG00010016374	ENSBMSG00010016238	BCOR (ENSBMSG00010016120) #22	MID1IP1 (ENSBMSG00010016089)	TSPAN7 (ENSBMSG00010015967)	OTC (ENSBMSG00010015883)	ENSBMSG00010015841	SRPX (ENSBMSG00010015775)	SYTL5 (ENSBMSG00010015570)	DYNLT3 (ENSBMSG00010015528)	CYBB (ENSBMSG00010015459)	XK (ENSBMSG00010015432)	LANCL3 (ENSBMSG00010015378)	ENSBMSG00010015365	ENSBMSG00010015341	ENSBMSG00010015318	PRRG1 (ENSBMSG00010015289)	ENSBMSG00010015259
Blue whale	MODERN SPECIES	41	ENSBMSG00010021766	ENSBMSG00010021769	USP9Y (ENSBMSG00010021776)	ZFY (ENSBMSG00010021784)	ENSBMSG00010021794	ENSBMSG00010021801	ENSBMSG00010021804	ENSBMSG00010021806	ENSBMSG00010021808	ENSBMSG00010021813	ENSBMSG00010021814	ENSBMSG00010021816	ENSBMSG00010021821	ENSBMSG00010021851	ENSBMSG00010021884	ENSBMSG00010021896 #22	KDM5D (ENSBMSG00010021903)	ENSBMSG00010021920	ENSBMSG00010013831
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00940000156461.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00390000008496.j.b.b.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000154631.c.a	ENSGT00940000162825	ENSGT00940000158854.i.b
Sperm whale	MODERN SPECIES	13	MAOA (ENSPCTG00005020779)	ENSPCTG00005020767	ENSPCTG00005020757	ENSPCTG00005020704	ENSPCTG00005020656	GPR82 (ENSPCTG00005020637)	CASK (ENSPCTG00005020288)	NYX (ENSPCTG00005020229)	DDX3X (ENSPCTG00005019909)	USP9X (ENSPCTG00005019450)	MED14 (ENSPCTG00005019253)	C21HXorf38 (ENSPCTG00005019204)	MPC1L (ENSPCTG00005019188)	ATP6AP2 (ENSPCTG00005018902)	ENSPCTG00005018851	BCOR (ENSPCTG00005018771) #22	MID1IP1 (ENSPCTG00005018748)	TSPAN7 (ENSPCTG00005018713)	OTC (ENSPCTG00005018601)	ENSPCTG00005018504	SRPX (ENSPCTG00005018362)	ENSPCTG00005018307	SYTL5 (ENSPCTG00005018211)	DYNLT3 (ENSPCTG00005018153)	CYBB (ENSPCTG00005018038)	XK (ENSPCTG00005018000)	LANCL3 (ENSPCTG00005017895)	PRRG1 (ENSPCTG00005017841)	ENSPCTG00005017773	ENSPCTG00005017743	ENSPCTG00005017688
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00940000156461.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00390000008496.j.b.b.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000154631.c.a	ENSGT00940000162825	ENSGT00940000158854.i.b
Dolphin	MODERN SPECIES	4867																BCOR (ENSTTRG00000013183) #22
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00940000156461.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00390000008496.j.b.b.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00390000001332.n	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000159951.e.a.a	ENSGT00940000154631.c.a
Vaquita	MODERN SPECIES	34	HMGN1 (ENSPSNG00000016153)	MAOB (ENSPSNG00000016109)	MAOA (ENSPSNG00000015774)	ENSPSNG00000015618	ENSPSNG00000015528	GPR82 (ENSPSNG00000015496)	CASK (ENSPSNG00000015050)	ENSPSNG00000014987	NYX (ENSPSNG00000014932)	DDX3X (ENSPSNG00000014476)	USP9X (ENSPSNG00000013676)	ENSPSNG00000013458	CXorf38 (ENSPSNG00000013381)	ENSPSNG00000021202	ATP6AP2 (ENSPSNG00000021047)	BCOR (ENSPSNG00000020930) #22	MID1IP1 (ENSPSNG00000020892)	TSPAN7 (ENSPSNG00000020865)	OTC (ENSPSNG00000020795)	ENSPSNG00000020756	SRPX (ENSPSNG00000020642)	ENSPSNG00000020588	SYTL5 (ENSPSNG00000020543)	ENSPSNG00000020516	DYNLT3 (ENSPSNG00000020495)	CYBB (ENSPSNG00000020418)	XK (ENSPSNG00000020390)	LANCL3 (ENSPSNG00000020277)	ENSPSNG00000020262	ENSPSNG00000020244	PRRG1 (ENSPSNG00000020215)
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00940000156461.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00390000008496.j.b.b.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00390000001332.n	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.a.a.d	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000159951.e.a.a
Beluga whale	MODERN SPECIES	58	NDP (ENSDLEG00000019876)	MAOB (ENSDLEG00000019843)	MAOA (ENSDLEG00000019834)	ENSDLEG00000019829	ENSDLEG00000019826	GPR82 (ENSDLEG00000019820)	CASK (ENSDLEG00000017934)	NYX (ENSDLEG00000017648)	DDX3X (ENSDLEG00000017612)	ENSDLEG00000017591	USP9X (ENSDLEG00000014783)	MED14 (ENSDLEG00000013718)	CUNHXorf38 (ENSDLEG00000013605)	ENSDLEG00000013589	ATP6AP2 (ENSDLEG00000013556)	BCOR (ENSDLEG00000013499) #22	MID1IP1 (ENSDLEG00000013488)	TSPAN7 (ENSDLEG00000013478)	OTC (ENSDLEG00000013458)	RPGR (ENSDLEG00000013393)	SRPX (ENSDLEG00000013368)	ENSDLEG00000013338	SYTL5 (ENSDLEG00000013025)	DYNLT3 (ENSDLEG00000012975)	XK (ENSDLEG00000012944)	LANCL3 (ENSDLEG00000012905)	ENSDLEG00000012893	ENSDLEG00000012888	ENSDLEG00000012878	ENSDLEG00000012845	ENSDLEG00000012838
Narwhal	DUPLICATION
Narwhal	MODERN SPECIES	309	MAOB (ENSMMNG00015010558)	MAOA (ENSMMNG00015010524)	ENSMMNG00015010495	GPR82 (ENSMMNG00015010460)	GPR34 (ENSMMNG00015010454)	CASK (ENSMMNG00015010172)	ENSMMNG00015010052	NYX (ENSMMNG00015010048)	ENSMMNG00015010041	DDX3X (ENSMMNG00015010005)	USP9X (ENSMMNG00015009970)	MED14 (ENSMMNG00015009892)	CXorf38 (ENSMMNG00015009866)	ENSMMNG00015009857	ATP6AP2 (ENSMMNG00015009785)	BCOR (ENSMMNG00015009731) #22	MID1IP1 (ENSMMNG00015009716)	TSPAN7 (ENSMMNG00015009703)	ENSMMNG00015009683	OTC (ENSMMNG00015009674)	RPGR (ENSMMNG00015009649)	SRPX (ENSMMNG00015009593)	ENSMMNG00015009557	SYTL5 (ENSMMNG00015009525)	DYNLT3 (ENSMMNG00015009487)	CYBB (ENSMMNG00015009458)	XK (ENSMMNG00015009443)	LANCL3 (ENSMMNG00015009431)	ENSMMNG00015009412	PRRG1 (ENSMMNG00015009403)	ENSMMNG00015009377
Narwhal	DUPLICATION
Narwhal	MODERN SPECIES	26														ENSMMNG00015000858	ENSMMNG00015000833 #22	ENSMMNG00015000814 #22	KDM5D (ENSMMNG00015000748)	ENSMMNG00015000722	ENSMMNG00015000708	ENSMMNG00015000554	ENSMMNG00015000477
Narwhal	MODERN SPECIES	26															ENSMMNG00015000858	ENSMMNG00015000833 #22	ENSMMNG00015000814 #22	KDM5D (ENSMMNG00015000748)	ENSMMNG00015000722	ENSMMNG00015000708	ENSMMNG00015000554	ENSMMNG00015000477
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.k	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b.a.b	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000158538
Yarkand deer	MODERN SPECIES	1323	ENSCHYG00000020373	ENSCHYG00000020396	ENSCHYG00000020427	CASK (ENSCHYG00000020609)	GPR82 (ENSCHYG00000021859)	GPR34 (ENSCHYG00000021879)	NYX (ENSCHYG00000021892)	ENSCHYG00000021956	ENSCHYG00000021990	DDX3X (ENSCHYG00000022010)	USP9X (ENSCHYG00000022165)	MED14 (ENSCHYG00000022394)	CXorf38 (ENSCHYG00000022966)	MPC1L (ENSCHYG00000023023)	ENSCHYG00000023066	BCOR (ENSCHYG00000023328) #22	ENSCHYG00000023432	MID1IP1 (ENSCHYG00000023473)	TSPAN7 (ENSCHYG00000023486)	ENSCHYG00000023583	OTC (ENSCHYG00000023594)	ENSCHYG00000023658	SYTL5 (ENSCHYG00000024135)	ENSCHYG00000024198	DYNLT3 (ENSCHYG00000024212)	CYBB (ENSCHYG00000024252)	LANCL3 (ENSCHYG00000024391)	ENSCHYG00000024427	ENSCHYG00000024437	PRRG1 (ENSCHYG00000024453)	ENSCHYG00000024484
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.k	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b.a.b	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000158538
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	92	NDP (ENSMMSG00000010499)	MAOB (ENSMMSG00000010531)	MAOA (ENSMMSG00000010581)	ENSMMSG00000010690	CASK (ENSMMSG00000010789)	GPR82 (ENSMMSG00000011393)	NYX (ENSMMSG00000011402)	ENSMMSG00000011570	ENSMMSG00000014674	USP9X (ENSMMSG00000014689)	MED14 (ENSMMSG00000014735)	CXorf38 (ENSMMSG00000014873)	MPC1L (ENSMMSG00000014899)	ENSMMSG00000014938	ENSMMSG00000015149	BCOR (ENSMMSG00000008193) #22	MID1IP1 (ENSMMSG00000008268)	ENSMMSG00000008279	ENSMMSG00000008301	OTC (ENSMMSG00000008328)	ENSMMSG00000008393	SRPX (ENSMMSG00000008427)	SYTL5 (ENSMMSG00000008508)	ENSMMSG00000008724
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000165666	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.k	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b.a.b	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000158538
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00390000001627.b	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a.mb	ENSGT00940000165666	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.k	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b.a.a.a.b	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492.v	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b.a.a.a.a	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000158538
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	205	NDP (ENSOARG00020020392)	MAOB (ENSOARG00020020199)	MAOA (ENSOARG00020020034)	ENSOARG00020019978	ENSOARG00020019953	ENSOARG00020019938	GPR82 (ENSOARG00020019888)	CASK (ENSOARG00020018716)	NYX (ENSOARG00020018604)	DDX3X (ENSOARG00020017500)	USP9X (ENSOARG00020017297)	MED14 (ENSOARG00020016379)	CXorf38 (ENSOARG00020016232)	ENSOARG00020016210	ENSOARG00020015636	BCOR (ENSOARG00020015351) #22	ENSOARG00020015318	MID1IP1 (ENSOARG00020021499)	TSPAN7 (ENSOARG00020021392)	ENSOARG00020021363	ENSOARG00020021326	OTC (ENSOARG00020021238)	ENSOARG00020021214	ENSOARG00020021200	ENSOARG00020021165	ENSOARG00020021153	ENSOARG00020021142	SRPX (ENSOARG00020020935)	SYTL5 (ENSOARG00020020775)	ENSOARG00020020752	DYNLT3 (ENSOARG00020020658)
Goat	MODERN SPECIES	248																BCOR (ENSCHIG00000009752) #22
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000165666	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.k	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492.w	ENSGT00940000155009.i	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b.a.b	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000158538
Bos	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000165666	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.k	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492.w	ENSGT00940000155009.i	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b.a.b	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000158538
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.k	ENSGT00390000018390.fb	ENSGT00390000013208.nb	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492.w	ENSGT00940000155009.i	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b.a.b	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000158538	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b.a.a.a.b
Domestic yak	MODERN SPECIES	69	NDP (ENSBGRG00000012838)	MAOB (ENSBGRG00000012905)	ENSBGRG00000013578	ENSBGRG00000013880	CASK (ENSBGRG00000013967)	GPR34 (ENSBGRG00000015052)	NYX (ENSBGRG00000015080)	DDX3X (ENSBGRG00000015328)	USP9X (ENSBGRG00000018694)	ENSBGRG00000018910	MED14 (ENSBGRG00000018963)	CXorf38 (ENSBGRG00000019239)	ENSBGRG00000019336	ENSBGRG00000019474	ENSBGRG00000020907	ENSBGRG00000020948 #22	MID1IP1 (ENSBGRG00000021050)	TSPAN7 (ENSBGRG00000021078)	ENSBGRG00000021188	OTC (ENSBGRG00000021238)	ENSBGRG00000021428	SYTL5 (ENSBGRG00000021997)	ENSBGRG00000022166	ENSBGRG00000007060	ENSBGRG00000007080	CYBB (ENSBGRG00000007179)	LANCL3 (ENSBGRG00000007763)	ENSBGRG00000007860	ENSBGRG00000007894	PRRG1 (ENSBGRG00000007941)	ENSBGRG00000008034
Wild yak	MODERN SPECIES	231							DDX3X (ENSBMUG00000012662)	ENSBMUG00000012360	USP9X (ENSBMUG00000012333)	MED14 (ENSBMUG00000011761)	CXorf38 (ENSBMUG00000011127)	ENSBMUG00000011102	ENSBMUG00000011085	ENSBMUG00000010990	ENSBMUG00000010978	BCOR (ENSBMUG00000010961) #22	MID1IP1 (ENSBMUG00000010893)	TSPAN7 (ENSBMUG00000010880)	ENSBMUG00000010865	OTC (ENSBMUG00000010860)	ENSBMUG00000010833	ENSBMUG00000010733	PRRG1 (ENSBMUG00000010717)	ENSBMUG00000010652	ENSBMUG00000010639	LANCL3 (ENSBMUG00000010625)	XK (ENSBMUG00000010604)	CYBB (ENSBMUG00000010563)	ENSBMUG00000010536	ENSBMUG00000010530	SYTL5 (ENSBMUG00000010520)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a.jb	ENSGT00940000165666	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.a.a.b	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856.k	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492.w	ENSGT00940000155009.i	ENSGT00940000160244	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b.a.b	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000158538	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.b.a.a.b	ENSGT00940000162492.x
Cow	MODERN SPECIES	177	MAOA (ENSBTAG00000016206)	PPP1R2C (ENSBTAG00000037883)	CASK (ENSBTAG00000020136)	GPR82 (ENSBTAG00000045934)	GPR34 (ENSBTAG00000020144)	NYX (ENSBTAG00000046407)	DDX3X (ENSBTAG00000035907)	ENSBTAG00000053853	USP9X (ENSBTAG00000006242)	ENSBTAG00000049862	ENSBTAG00000030490	MED14 (ENSBTAG00000011790)	CXHXorf38 (ENSBTAG00000011788)	MPC1L (ENSBTAG00000011783)	ATP6AP2 (ENSBTAG00000017801)	BCOR (ENSBTAG00000047339) #22	MID1IP1 (ENSBTAG00000011463)	TSPAN7 (ENSBTAG00000008966)	ENSBTAG00000053054	ENSBTAG00000046998	OTC (ENSBTAG00000001488)	ENSBTAG00000045867	SRPX (ENSBTAG00000004280)	ENSBTAG00000055069	SYTL5 (ENSBTAG00000004955)	H2AL3 (ENSBTAG00000052113)	DYNLT3 (ENSBTAG00000038156)	CYBB (ENSBTAG00000019953)	ENSBTAG00000052354	LANCL3 (ENSBTAG00000003088)	ENSBTAG00000055305
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	315	ENSBIXG00005002595	GPR82 (ENSBIXG00005000078)	GPR34 (ENSBIXG00005016346)	CASK (ENSBIXG00005016500)	NYX (ENSBIXG00005016606)	ENSBIXG00005016992	ENSBIXG00005017050	ENSBIXG00005017068	USP9X (ENSBIXG00005017112)	ENSBIXG00005017168	MED14 (ENSBIXG00005017250)	CXorf38 (ENSBIXG00005017280)	ENSBIXG00005017292	ENSBIXG00005017517	ENSBIXG00005017652	BCOR (ENSBIXG00005017741) #22	MID1IP1 (ENSBIXG00005017816)	ENSBIXG00005002892	TSPAN7 (ENSBIXG00005017860)	OTC (ENSBIXG00005017899)	ENSBIXG00005018003	ENSBIXG00005018049	SRPX (ENSBIXG00005002934)	SYTL5 (ENSBIXG00005018140)	DYNLT3 (ENSBIXG00005018193)	ENSBIXG00005018198	CYBB (ENSBIXG00005018235)	LANCL3 (ENSBIXG00005018256)	ENSBIXG00005002960	ENSBIXG00005018292	PRRG1 (ENSBIXG00005018330)
American bison	MODERN SPECIES	1760																ENSBBBG00000023232 #22
Suina	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.a.a.f	ENSGT00940000163515	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.a.a.e
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	107	ENSCWAG00000011927	ENSCWAG00000011966	ENSCWAG00000012006	ENSCWAG00000012037	CASK (ENSCWAG00000012127)	GPR82 (ENSCWAG00000012925)	GPR34 (ENSCWAG00000012940)	NYX (ENSCWAG00000012958)	DDX3X (ENSCWAG00000013025)	ENSCWAG00000013536	USP9X (ENSCWAG00000013600)	MED14 (ENSCWAG00000013978)	CXorf38 (ENSCWAG00000014219)	ENSCWAG00000014300	ENSCWAG00000014416	BCOR (ENSCWAG00000014765) #22	MID1IP1 (ENSCWAG00000014895)	TSPAN7 (ENSCWAG00000014915)	OTC (ENSCWAG00000014946)	ENSCWAG00000015040	SRPX (ENSCWAG00000015090)	SYTL5 (ENSCWAG00000015258)	ENSCWAG00000015537	DYNLT3 (ENSCWAG00000015552)	CYBB (ENSCWAG00000015585)	XK (ENSCWAG00000015685)	LANCL3 (ENSCWAG00000015722)	ENSCWAG00000015786	ENSCWAG00000015803	ENSCWAG00000015825	PRRG1 (ENSCWAG00000015845)
Pig	DUPLICATION
Pig	MODERN SPECIES	300	MAOB (ENSSSCG00000023215)	ENSSSCG00000012257	ENSSSCG00000046344	GPR82 (ENSSSCG00000012254)	GPR34 (ENSSSCG00000022309)	CASK (ENSSSCG00000012253)	NYX (ENSSSCG00000021460)	DDX3X (ENSSSCG00000012252)	USP9X (ENSSSCG00000012251)	ENSSSCG00000053694	ENSSSCG00000056852	MED14 (ENSSSCG00000012250)	CXorf38 (ENSSSCG00000012249)	MPC1L (ENSSSCG00000012248)	ATP6AP2 (ENSSSCG00000012247)	BCOR (ENSSSCG00000012241) #22	MID1IP1 (ENSSSCG00000025447)	ENSSSCG00000057929	TSPAN7 (ENSSSCG00000012238)	ENSSSCG00000056736	OTC (ENSSSCG00000012236)	ENSSSCG00000050812	ENSSSCG00000012235	ENSSSCG00000044870	SRPX (ENSSSCG00000012234)	ENSSSCG00000056304	SYTL5 (ENSSSCG00000012233)	DYNLT3 (ENSSSCG00000028908)	GP91-PHOX (ENSSSCG00000036246)	XK (ENSSSCG00000031868)	LANCL3 (ENSSSCG00000037269)
Pig	MODERN SPECIES	301				ENSSSCG00000060796	ENSSSCG00000062133	ENSSSCG00000056875	ENSSSCG00000055051	ENSSSCG00000034141	ENSSSCG00000061633	ENSSSCG00000035670	ENSSSCG00000059393	SRY (ENSSSCG00000057000)	ENSSSCG00000023819	ENSSSCG00000040795	ENSSSCG00000038249	ENSSSCG00000036928 #22	KDM5D (ENSSSCG00000032354)	ENSSSCG00000034853	ENSSSCG00000055256	ENSSSCG00000054075	ENSSSCG00000058541	ENSSSCG00000057343	ENSSSCG00000052287	ENSSSCG00000060627	ENSSSCG00000060430	ENSSSCG00000043614	ENSSSCG00000046033	ENSSSCG00000063394	ENSSSCG00000044850	ENSSSCG00000055786	ENSSSCG00000056475
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d	ENSGT00940000163515
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154517	ENSGT00940000155616.c.b	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000158538
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.n.b	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163515	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.n.a	ENSGT00940000159499
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.n.b	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163515	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.n.a	ENSGT00940000159499	ENSGT01000000214434.B.b.e.a
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES		ENSRFEG00010002926	ENSRFEG00010002935	CASK (ENSRFEG00010003118)	GPR82 (ENSRFEG00010003342)	GPR34 (ENSRFEG00010003355)	NYX (ENSRFEG00010003367)	DDX3X (ENSRFEG00010003399)	ENSRFEG00010003454	USP9X (ENSRFEG00010003479)	ENSRFEG00010003529	MED14 (ENSRFEG00010003564)	ENSRFEG00010003637	CXorf38 (ENSRFEG00010003652)	MPC1L (ENSRFEG00010003673)	ATP6AP2 (ENSRFEG00010003719)	BCOR (ENSRFEG00010003802) #22	ENSRFEG00010003854	MID1IP1 (ENSRFEG00010003860)	ENSRFEG00010003871	TSPAN7 (ENSRFEG00010003881)	OTC (ENSRFEG00010003907)	ENSRFEG00010003964	SRPX (ENSRFEG00010004024)	ENSRFEG00010000094	SYTL5 (ENSRFEG00010000104)	DYNLT3 (ENSRFEG00010000111)	CYBB (ENSRFEG00010000117)	XK (ENSRFEG00010000127)	LANCL3 (ENSRFEG00010000132)	ENSRFEG00010000138	ENSRFEG00010000143
Microbat	MODERN SPECIES	1013	ENSMLUG00000015847	MAOB (ENSMLUG00000001434)	MAOA (ENSMLUG00000001427)	ENSMLUG00000022321	ENSMLUG00000023913	GPR82 (ENSMLUG00000003016)	GPR34 (ENSMLUG00000003012)	CASK (ENSMLUG00000002989)	ENSMLUG00000029310	DDX3X (ENSMLUG00000010216)	USP9X (ENSMLUG00000010139)	MED14 (ENSMLUG00000001167)	CXorf38 (ENSMLUG00000001164)	MPC1L (ENSMLUG00000030672)	ATP6AP2 (ENSMLUG00000001159)	BCOR (ENSMLUG00000014376) #22	TSPAN7 (ENSMLUG00000009730)	OTC (ENSMLUG00000009014)	ENSMLUG00000025649	SRPX (ENSMLUG00000008997)
Megabat	MODERN SPECIES	4439																BCOR (ENSPVAG00000003896) #22
Equus	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT01090000261478	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b.a	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.k.a.a.b	ENSGT00940000163515	ENSGT00940000158538
Horse	MODERN SPECIES	480	EFHC2 (ENSECAG00000016627)	NDP (ENSECAG00000016176)	MAOB (ENSECAG00000000132)	MAOA (ENSECAG00000022277)	GPR82 (ENSECAG00000003381)	GPR34 (ENSECAG00000003173)	CASK (ENSECAG00000013894)	NYX (ENSECAG00000031529)	DDX3X (ENSECAG00000009901)	USP9X (ENSECAG00000005549)	ENSECAG00000030185	MED14 (ENSECAG00000014191)	CXorf38 (ENSECAG00000058683)	MPC1L (ENSECAG00000003094)	ATP6AP2 (ENSECAG00000019889)	BCOR (ENSECAG00000005995) #22	MID1IP1 (ENSECAG00000002992)	TSPAN7 (ENSECAG00000016573)	ENSECAG00000046542	OTC (ENSECAG00000022838)	ENSECAG00000017318	SRPX (ENSECAG00000018935)	ENSECAG00000055649	SYTL5 (ENSECAG00000011264)	DYNLT3 (ENSECAG00000010650)	CYBB (ENSECAG00000017917)	XK (ENSECAG00000014332)	LANCL3 (ENSECAG00000013279)	ENSECAG00000038581	ENSECAG00000053585	ENSECAG00000045152
Donkey	DUPLICATION
Donkey	MODERN SPECIES	36	EFHC2 (ENSEASG00005036483)	MAOB (ENSEASG00005020127)	ENSEASG00005020177	PPP1R2C (ENSEASG00005034956)	GPR82 (ENSEASG00005034863)	GPR34 (ENSEASG00005027088)	CASK (ENSEASG00005009875)	NYX (ENSEASG00005027095)	DDX3X (ENSEASG00005009841)	USP9X (ENSEASG00005026963)	ENSEASG00005008337	MED14 (ENSEASG00005011439)	CXorf38 (ENSEASG00005011443)	MPC1L (ENSEASG00005011445)	ATP6AP2 (ENSEASG00005011447)	BCOR (ENSEASG00005011454) #22	MID1IP1 (ENSEASG00005031295)	ENSEASG00005027817	ENSEASG00005025852	OTC (ENSEASG00005011647)	ENSEASG00005011654	SRPX (ENSEASG00005028148)	SYTL5 (ENSEASG00005017962)	ENSEASG00005024089	DYNLT3 (ENSEASG00005037646)	CYBB (ENSEASG00005018016)	ENSEASG00005033185	ENSEASG00005018021	ENSEASG00005025594	ENSEASG00005038050	ENSEASG00005017724
Donkey	MODERN SPECIES	37	ENSEASG00005030729	ENSEASG00005010760	ENSEASG00005038269	ENSEASG00005037796	ENSEASG00005025009	ENSEASG00005022529	ENSEASG00005017764	ENSEASG00005026200	ENSEASG00005035173	ENSEASG00005037328	ENSEASG00005034241	ENSEASG00005014703	ENSEASG00005023765	SRY (ENSEASG00005035549)	ENSEASG00005013112	ENSEASG00005013111 #22	ENSEASG00005013108	ENSEASG00005032894	ENSEASG00005014271	ENSEASG00005037424	ENSEASG00005027762
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00390000010165.i.b.b.a	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d	ENSGT00940000158538
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00390000010165.i.b.b.a	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00390000015623	ENSGT00390000005568.gb.a.b	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.i.b
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00390000010165.i.b.b.a	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00390000015623	ENSGT00390000005568.gb.a.b	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244.e.a	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.i.b	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.j.a.b	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.i.a
Tiger	MODERN SPECIES	223																ENSPTIG00000007721 #22	TSPAN7 (ENSPTIG00000007706)	OTC (ENSPTIG00000007681)	ENSPTIG00000007576	SRPX (ENSPTIG00000007460)	SYTL5 (ENSPTIG00000007275)	ENSPTIG00000007218	DYNLT3 (ENSPTIG00000007206)	CYBB (ENSPTIG00000007020)	XK (ENSPTIG00000006977)	LANCL3 (ENSPTIG00000006903)	ENSPTIG00000008617	ENSPTIG00000006896	ENSPTIG00000006862	PRRG1 (ENSPTIG00000006756)	ENSPTIG00000006691
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00390000010165.i.b.b.a	ENSGT00390000008732.a.a.c.b.b	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00390000015623	ENSGT00390000005568.gb.a.b	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244.f	ENSGT00940000160244.e.b	ENSGT00390000003231.b
leopard	DUPLICATION
leopard	MODERN SPECIES	69	NDP (ENSPPRG00000013089)	MAOB (ENSPPRG00000013398)	MAOA (ENSPPRG00000017638)	GPR82 (ENSPPRG00000015625)	CASK (ENSPPRG00000002674)	NYX (ENSPPRG00000003109)	DDX3X (ENSPPRG00000005269)	USP9X (ENSPPRG00000007696)	MED14 (ENSPPRG00000008958)	CXorf38 (ENSPPRG00000009176)	MPC1L (ENSPPRG00000016022)	ATP6AP2 (ENSPPRG00000013645)	ENSPPRG00000016148	ENSPPRG00000013998	ENSPPRG00000014228 #22	ENSPPRG00000016522 #22	MID1IP1 (ENSPPRG00000016216)	TSPAN7 (ENSPPRG00000018929)	OTC (ENSPPRG00000021854)	ENSPPRG00000000830	SRPX (ENSPPRG00000002131)	SYTL5 (ENSPPRG00000002666)	ENSPPRG00000016440	DYNLT3 (ENSPPRG00000002882)	ENSPPRG00000003423	ENSPPRG00000003758	XK (ENSPPRG00000003832)
leopard	MODERN SPECIES	69	EFHC2 (ENSPPRG00000012443)	NDP (ENSPPRG00000013089)	MAOB (ENSPPRG00000013398)	MAOA (ENSPPRG00000017638)	GPR82 (ENSPPRG00000015625)	CASK (ENSPPRG00000002674)	NYX (ENSPPRG00000003109)	DDX3X (ENSPPRG00000005269)	USP9X (ENSPPRG00000007696)	MED14 (ENSPPRG00000008958)	CXorf38 (ENSPPRG00000009176)	MPC1L (ENSPPRG00000016022)	ATP6AP2 (ENSPPRG00000013645)	ENSPPRG00000016148	ENSPPRG00000013998	ENSPPRG00000014228 #22	ENSPPRG00000016522 #22	MID1IP1 (ENSPPRG00000016216)	TSPAN7 (ENSPPRG00000018929)	OTC (ENSPPRG00000021854)	ENSPPRG00000000830	SRPX (ENSPPRG00000002131)	SYTL5 (ENSPPRG00000002666)	ENSPPRG00000016440	DYNLT3 (ENSPPRG00000002882)	ENSPPRG00000003423	ENSPPRG00000003758	XK (ENSPPRG00000003832)
lion	MODERN SPECIES	88	MAOB (ENSPLOG00000022444)	MAOA (ENSPLOG00000022433)	ENSPLOG00000022424	GPR82 (ENSPLOG00000022412)	GPR34 (ENSPLOG00000022409)	CASK (ENSPLOG00000022343)	NYX (ENSPLOG00000022299)	DDX3X (ENSPLOG00000022152)	USP9X (ENSPLOG00000022020)	MED14 (ENSPLOG00000021938)	CXorf38 (ENSPLOG00000021911)	MPC1L (ENSPLOG00000021900)	ATP6AP2 (ENSPLOG00000021715)	ENSPLOG00000021686	ENSPLOG00000021673	BCOR (ENSPLOG00000021643) #22	MID1IP1 (ENSPLOG00000021611)	TSPAN7 (ENSPLOG00000021583)	OTC (ENSPLOG00000021548)	ENSPLOG00000021386	SYTL5 (ENSPLOG00000021282)	ENSPLOG00000021262	ENSPLOG00000021250	DYNLT3 (ENSPLOG00000021233)	CYBB (ENSPLOG00000021184)	RPS6KA3 (ENSPLOG00000021031)	EIF1AX (ENSPLOG00000020933)	MAP7D2 (ENSPLOG00000020581)	BCLAF3 (ENSPLOG00000020503)	SH3KBP1 (ENSPLOG00000020327)	MAP3K15 (ENSPLOG00000020043)
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Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00390000010165.i.b.b.a	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d	ENSGT00940000158538
Canidae	DUPLICATION
Canidae	DUPLICATION
Canidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153737.b.`b.a #22
Red fox	DUPLICATION
Red fox	MODERN SPECIES	349														ENSVVUG00000011444	ENSVVUG00000011761 #22	ENSVVUG00000011766 #22
Red fox	MODERN SPECIES	349															ENSVVUG00000011444	ENSVVUG00000011761 #22	ENSVVUG00000011766 #22
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153737.b.`b.a #22
Dog	MODERN SPECIES	120					ENSCAFG00845022690	ENSCAFG00845022779	ENSCAFG00845022823	ENSCAFG00845022918	ENSCAFG00845023065	ENSCAFG00845023246	ENSCAFG00845023304	ENSCAFG00845023401	ENSCAFG00845023675	ENSCAFG00845023905	ENSCAFG00845024395	ENSCAFG00845024454 #22	ENSCAFG00845024730	ENSCAFG00845025033
Canidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153737.b.`b.b #22
Red fox	MODERN SPECIES	307												ENSVVUG00000004232	ENSVVUG00000004151	ENSVVUG00000003210	ENSVVUG00000003137	ENSVVUG00000003121 #22
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153737.b.`b.b #22
Dog	MODERN SPECIES	111		ENSCAFG00845022629	UTY (ENSCAFG00845022496)	ENSCAFG00845022201	ENSCAFG00845022119	ENSCAFG00845021099	ENSCAFG00845020782	ENSCAFG00845020666	ENSCAFG00845020564	ENSCAFG00845020384	ENSCAFG00845020336	ENSCAFG00845020312	ENSCAFG00845019704	ENSCAFG00845019559	ENSCAFG00845019481	ENSCAFG00845019244 #22	ENSCAFG00845018760	ENSCAFG00845018537
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00390000010165.i.b.b.a	ENSGT00940000153737.b.ab #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492.ib	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d	ENSGT00940000158538
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00950000182869.e.b.b.p	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00940000154530.g.a	ENSGT00390000008856	ENSGT00390000010165.i.b.b.a	ENSGT00940000153737.b.ab #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492.ib	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d	ENSGT00940000158538
Dingo	MODERN SPECIES	247	ENSCAFG00020027202	CASK (ENSCAFG00020027207)	GPR82 (ENSCAFG00020027220)	GPR34 (ENSCAFG00020027221)	NYX (ENSCAFG00020027223)	ENSCAFG00020027225	DDX3X (ENSCAFG00020027227)	ENSCAFG00020027228	USP9X (ENSCAFG00020027230)	MED14 (ENSCAFG00020027233)	CXorf38 (ENSCAFG00020027255)	MPC1L (ENSCAFG00020027259)	ENSCAFG00020027261	ATP6AP2 (ENSCAFG00020027263)	ENSCAFG00020027265	BCOR (ENSCAFG00020027271) #22
Dog	MODERN SPECIES	144	MAOB (ENSCAFG00845027440)	MAOA (ENSCAFG00845027245)	ENSCAFG00845027065	PPP1R2C (ENSCAFG00845026949)	GPR82 (ENSCAFG00845026872)	CASK (ENSCAFG00845025610)	NYX (ENSCAFG00845025424)	ENSCAFG00845025399	DDX3X (ENSCAFG00845024733)	MED14 (ENSCAFG00845027192)	CXHXorf38 (ENSCAFG00845027009)	ENSCAFG00845026994	ENSCAFG00845026922	ATP6AP2 (ENSCAFG00845026626)	ENSCAFG00845026522	BCOR (ENSCAFG00845026046) #22	MID1IP1 (ENSCAFG00845025983)	TSPAN7 (ENSCAFG00845025872)	ENSCAFG00845025837	OTC (ENSCAFG00845025700)	RPGR (ENSCAFG00845024867)	ENSCAFG00845024670	SYTL5 (ENSCAFG00845024105)	DYNLT3 (ENSCAFG00845023973)	CYBB (ENSCAFG00845023727)	XK (ENSCAFG00845023672)	LANCL3 (ENSCAFG00845023634)	ENSCAFG00845023501	PRRG1 (ENSCAFG00845023418)	ENSCAFG00845023392	ENSCAFG00845023375
Red fox	MODERN SPECIES	90	ENSVVUG00000011769	ENSVVUG00000011758	ENSVVUG00000011751	GPR82 (ENSVVUG00000011730)	CASK (ENSVVUG00000011654)	NYX (ENSVVUG00000011642)	DDX3X (ENSVVUG00000011589)	USP9X (ENSVVUG00000011477)	ENSVVUG00000011458	MED14 (ENSVVUG00000011442)	CUNHXorf38 (ENSVVUG00000011436)	ENSVVUG00000011426	MPC1L (ENSVVUG00000011425)	ATP6AP2 (ENSVVUG00000011420)	ENSVVUG00000011413	BCOR (ENSVVUG00000011387) #22	MID1IP1 (ENSVVUG00000011361)	TSPAN7 (ENSVVUG00000011357)	ENSVVUG00000011344	OTC (ENSVVUG00000011334)	ENSVVUG00000011276	SRPX (ENSVVUG00000011256)	ENSVVUG00000011248	SYTL5 (ENSVVUG00000011212)	DYNLT3 (ENSVVUG00000011181)	CYBB (ENSVVUG00000011104)	XK (ENSVVUG00000011101)	LANCL3 (ENSVVUG00000011088)	ENSVVUG00000011052	ENSVVUG00000011050	ENSVVUG00000011040
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00390000010165.i.b.b.a	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a.b	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000163202	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	62	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00390000010165.i.b.b.a	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a.b	ENSGT00940000156153	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000162492	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.g
American mink	MODERN SPECIES	51	NDP (ENSNVIG00000016370)	MAOB (ENSNVIG00000016341)	MAOA (ENSNVIG00000016336)	PPP1R2C (ENSNVIG00000016330)	GPR82 (ENSNVIG00000016317)	GPR34 (ENSNVIG00000016312)	CASK (ENSNVIG00000015419)	NYX (ENSNVIG00000015374)	DDX3X (ENSNVIG00000015149)	USP9X (ENSNVIG00000014969)	MED14 (ENSNVIG00000014911)	CXorf38 (ENSNVIG00000014887)	ENSNVIG00000014838	ATP6AP2 (ENSNVIG00000014721)	ENSNVIG00000014714	BCOR (ENSNVIG00000014624) #22	MID1IP1 (ENSNVIG00000014608)	TSPAN7 (ENSNVIG00000014585)	ENSNVIG00000014575	OTC (ENSNVIG00000014541)	ENSNVIG00000014513	SRPX (ENSNVIG00000014383)	SYTL5 (ENSNVIG00000014351)	ENSNVIG00000014344	DYNLT3 (ENSNVIG00000014335)	CYBB (ENSNVIG00000014317)	XK (ENSNVIG00000014299)	LANCL3 (ENSNVIG00000014275)
Ferret	MODERN SPECIES	209	NDP (ENSMPUG00000012912)	MAOB (ENSMPUG00000012731)	MAOA (ENSMPUG00000012650)	ENSMPUG00000012643	PPP1R2C (ENSMPUG00000018947)	GPR82 (ENSMPUG00000018942)	GPR34 (ENSMPUG00000018938)	CASK (ENSMPUG00000012639)	NYX (ENSMPUG00000012634)	DDX3X (ENSMPUG00000012631)	USP9X (ENSMPUG00000012622)	MED14 (ENSMPUG00000012615)	MPC1L (ENSMPUG00000018930)	ATP6AP2 (ENSMPUG00000012611)	ENSMPUG00000018921	BCOR (ENSMPUG00000012607) #22	ENSMPUG00000012606	ENSMPUG00000012603	MID1IP1 (ENSMPUG00000018915)	TSPAN7 (ENSMPUG00000012601)	ENSMPUG00000012599	ENSMPUG00000018907	OTC (ENSMPUG00000012597)	ENSMPUG00000012593	SRPX (ENSMPUG00000012580)	SYTL5 (ENSMPUG00000012573)	DYNLT3 (ENSMPUG00000012560)	CYBB (ENSMPUG00000012430)	XK (ENSMPUG00000012428)	LANCL3 (ENSMPUG00000012424)	ENSMPUG00000018901
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00390000010165.i.b.b.a	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a.b	ENSGT00940000156153.b	ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b	ENSGT00510000047417.j	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00390000015623	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.a.b.p	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163515
Giant Panda	MODERN SPECIES	2288	ENSAMEG00000016407	ENSAMEG00000029934	ENSAMEG00000019618	ENSAMEG00000027699	GPR82 (ENSAMEG00000019558)	GPR34 (ENSAMEG00000019565)	CASK (ENSAMEG00000006693)	NYX (ENSAMEG00000006799)	DDX3X (ENSAMEG00000006801)	USP9X (ENSAMEG00000006858)	MED14 (ENSAMEG00000006962)	CXorf38 (ENSAMEG00000024408)	MPC1L (ENSAMEG00000019591)	ATP6AP2 (ENSAMEG00000007010)	ENSAMEG00000019614	BCOR (ENSAMEG00000007027) #22	MID1IP1 (ENSAMEG00000007076)	ENSAMEG00000007116	TSPAN7 (ENSAMEG00000007078)	ENSAMEG00000019648	OTC (ENSAMEG00000007121)	ENSAMEG00000007169	SYTL5 (ENSAMEG00000007236)	DYNLT3 (ENSAMEG00000028852)	CYBB (ENSAMEG00000007284)	XK (ENSAMEG00000007328)	LANCL3 (ENSAMEG00000007341)	ENSAMEG00000028870	PRRG1 (ENSAMEG00000028623)	ENSAMEG00000025258	ENSAMEG00000019574
Ursus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153737.b #22
American black bear	MODERN SPECIES	7440																ENSUAMG00000003394 #22
Polar bear	MODERN SPECIES	499																ENSUMAG00000015302 #22
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	72	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	69	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000164483	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443.b.a	ENSGT00940000155375.c	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302
Elephant	MODERN SPECIES	453	MAOA (ENSLAFG00000000503)	PPP1R2C (ENSLAFG00000004738)	CASK (ENSLAFG00000006945)	GPR82 (ENSLAFG00000006951)	GPR34 (ENSLAFG00000006949)	NYX (ENSLAFG00000015300)	DDX3X (ENSLAFG00000017378)	ENSLAFG00000017387	USP9X (ENSLAFG00000008552)	ENSLAFG00000027634	MED14 (ENSLAFG00000012068)	CXorf38 (ENSLAFG00000012064)	MPC1L (ENSLAFG00000027876)	ATP6AP2 (ENSLAFG00000017858)	ENSLAFG00000030399	BCOR (ENSLAFG00000014446) #22	MID1IP1 (ENSLAFG00000030491)	TSPAN7 (ENSLAFG00000006016)	OTC (ENSLAFG00000009919)	ENSLAFG00000023163	SRPX (ENSLAFG00000002956)
Hyrax	MODERN SPECIES	9375																BCOR (ENSPCAG00000004323) #22
Tenrec	MODERN SPECIES	7391																BCOR (ENSETEG00000005739) #22
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153737.b #22
Armadillo	MODERN SPECIES	1646															ENSDNOG00000025629	BCOR (ENSDNOG00000038847) #22
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000155202.j	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.g.b	ENSGT00940000155009.h	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000159699	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.j
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000155202.j	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.g.b	ENSGT00940000155009.h	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.j	ENSGT00940000154342.C.i
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.g.b	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00530000063484.b.b
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000161545	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00940000163590	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616.`d	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009.g.b	ENSGT00940000155009.g.a	ENSGT00940000160244.g	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00530000063484.b.b
koala	MODERN SPECIES	171				CASK (ENSPCIG00000027325)	GPR82 (ENSPCIG00000027441)	GPR34 (ENSPCIG00000027440)	NYX (ENSPCIG00000027323)	ENSPCIG00000000219	ENSPCIG00000007577	ENSPCIG00000031419	MED14 (ENSPCIG00000026469)	CXorf38 (ENSPCIG00000026470)	ENSPCIG00000026471	ATP6AP2 (ENSPCIG00000026472)	ENSPCIG00000028682	BCOR (ENSPCIG00000028680) #22	ENSPCIG00000028677	ENSPCIG00000026765	ENSPCIG00000033898
Common wonbat	MODERN SPECIES	1045	FUNDC1 (ENSVURG00010003091)	EFHC2 (ENSVURG00010003046)	NDP (ENSVURG00010003022)	MAOB (ENSVURG00010003002)	MAOA (ENSVURG00010002971)	GPR82 (ENSVURG00010002911)	GPR34 (ENSVURG00010002909)	CASK (ENSVURG00010002778)	NYX (ENSVURG00010002738)	ENSVURG00010002608	ENSVURG00010002143	MED14 (ENSVURG00010001935)	CXorf38 (ENSVURG00010001865)	ENSVURG00010001857	ATP6AP2 (ENSVURG00010001783)	BCOR (ENSVURG00010001750) #22	MID1IP1 (ENSVURG00010001731)	TSPAN7 (ENSVURG00010001721)	OTC (ENSVURG00010001699)	ENSVURG00010001658	SRPX (ENSVURG00010001650)	SYTL5 (ENSVURG00010001564)	ENSVURG00010001501	CYBB (ENSVURG00010001492)	XK (ENSVURG00010001487)	LANCL3 (ENSVURG00010001478)	PRRG1 (ENSVURG00010001468)	TMEM47 (ENSVURG00010001439)
Wallaby	MODERN SPECIES	8932																BCOR (ENSMEUG00000002045) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	2	EFHC2 (ENSSHAG00000008161)	NDP (ENSSHAG00000031625)	MAOB (ENSSHAG00000004738)	MAOA (ENSSHAG00000005829)	ENSSHAG00000025933	ENSSHAG00000002228	GPR82 (ENSSHAG00000006459)	GPR34 (ENSSHAG00000025728)	NYX (ENSSHAG00000024777)	ENSSHAG00000007623	ENSSHAG00000008762	MED14 (ENSSHAG00000003470)	ENSSHAG00000031563	ATP6AP2 (ENSSHAG00000005689)	ENSSHAG00000028827	BCOR (ENSSHAG00000010865) #22	ENSSHAG00000022083	MID1IP1 (ENSSHAG00000031170)	TSPAN7 (ENSSHAG00000012655)	OTC (ENSSHAG00000013760)	ENSSHAG00000026580	ENSSHAG00000000010	SRPX (ENSSHAG00000001996)	SYTL5 (ENSSHAG00000005032)	DYNLT3 (ENSSHAG00000024546)	CYBB (ENSSHAG00000008469)	XK (ENSSHAG00000028050)	LANCL3 (ENSSHAG00000024649)	PRRG1 (ENSSHAG00000021020)	ENSSHAG00000012460	ENSSHAG00000021064
Opossum	MODERN SPECIES	3	EFHC2 (ENSMODG00000021090)	NDP (ENSMODG00000050774)	MAOB (ENSMODG00000021092)	MAOA (ENSMODG00000021093)	ENSMODG00000021094	CASK (ENSMODG00000021095)	ENSMODG00000027545	GPR82 (ENSMODG00000025314)	GPR34 (ENSMODG00000025313)	NYX (ENSMODG00000025311)	ENSMODG00000021097	ENSMODG00000021098	MED14 (ENSMODG00000021099)	CXorf38 (ENSMODG00000021100)	ATP6AP2 (ENSMODG00000021101)	BCOR (ENSMODG00000021102) #22	MID1IP1 (ENSMODG00000025295)	TSPAN7 (ENSMODG00000021103)	ENSMODG00000027349	OTC (ENSMODG00000021104)	ENSMODG00000021106	SRPX (ENSMODG00000021107)	SYTL5 (ENSMODG00000021108)	ENSMODG00000037846	ENSMODG00000040016	CYBB (ENSMODG00000021110)	XK (ENSMODG00000021111)	LANCL3 (ENSMODG00000021112)	PRRG1 (ENSMODG00000042372)	ENSMODG00000021118	ENSMODG00000045072
Platypus	MODERN SPECIES	9	ENSOANG00000006481	FUNDC1 (ENSOANG00000006482)	EFHC2 (ENSOANG00000006483)	NDP (ENSOANG00000040395)	MAOB (ENSOANG00000006486)	MAOA (ENSOANG00000006490)	CASK (ENSOANG00000011267)	GPR82 (ENSOANG00000011271)	GPR34 (ENSOANG00000011272)	ENSOANG00000011274	ENSOANG00000011275	ENSOANG00000045652	MED14 (ENSOANG00000011278)	ENSOANG00000046445	ATP6AP2 (ENSOANG00000046394)	BCOR (ENSOANG00000011281) #22	ENSOANG00000048021	TSPAN7 (ENSOANG00000005230)	OTC (ENSOANG00000007118)	ENSOANG00000007117	SRPX (ENSOANG00000007116)	SYTL5 (ENSOANG00000007114)	DYNLT3 (ENSOANG00000007112)	CYBB (ENSOANG00000007111)	XK (ENSOANG00000007110)	ENSOANG00000007109	ENSOANG00000045768	TMEM131 (ENSOANG00000007104)	ENSOANG00000007103	ENSOANG00000049950	ENSOANG00000008733
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT01050000245294	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00940000168322	ENSGT00940000159699	ENSGT00530000063484.b.b
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00940000168322	ENSGT00940000159699	ENSGT00530000063484.b.b
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.b	ENSGT00940000154342.C.g.a
Aves	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00940000159699	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.a
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00940000159699	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.a
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.a	ENSGT00940000159499
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155202.j	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.a	ENSGT00940000159499
Golden eagle	MODERN SPECIES	23	ENSACCG00020001083	FUNDC1 (ENSACCG00020001207)	EFHC2 (ENSACCG00020001221)	ENSACCG00020001244	ENSACCG00020001263	MAOA (ENSACCG00020001289)	CASK (ENSACCG00020001395)	GPR82 (ENSACCG00020001511)	GPR34 (ENSACCG00020001520)	NYX (ENSACCG00020001529)	ENSACCG00020001544	RPL8 (ENSACCG00020001569)	ENSACCG00020001597	MED14 (ENSACCG00020001656)	ATP6AP2 (ENSACCG00020001686)	BCOR (ENSACCG00020001710) #22	MID1IP1 (ENSACCG00020001728)	TSPAN7 (ENSACCG00020001754)	OTC (ENSACCG00020001784)	RPGR (ENSACCG00020001852)	SRPX (ENSACCG00020001907)	SYTL5 (ENSACCG00020001928)	DYNLT3 (ENSACCG00020001948)	CYBB (ENSACCG00020001963)	XK (ENSACCG00020001992)	LANCL3 (ENSACCG00020002008)	PRRG1 (ENSACCG00020002029)	ENSACCG00020002054	TMEM47 (ENSACCG00020002066)	DMD (ENSACCG00020002395)	ENSACCG00020002732
Kakapo	MODERN SPECIES	11	ENSSHBG00005010530	FUNDC1 (ENSSHBG00005011082)	EFHC2 (ENSSHBG00005011127)	ENSSHBG00005011220	ENSSHBG00005011242	MAOA (ENSSHBG00005011266)	CASK (ENSSHBG00005011323)	GPR82 (ENSSHBG00005011382)	GPR34 (ENSSHBG00005011397)	NYX (ENSSHBG00005011405)	ENSSHBG00005011417	RPL8 (ENSSHBG00005011456)	ENSSHBG00005011490	MED14 (ENSSHBG00005011636)	ATP6AP2 (ENSSHBG00005011811)	BCOR (ENSSHBG00005011884) #22	MID1IP1 (ENSSHBG00005011919)	TSPAN7 (ENSSHBG00005011925)	OTC (ENSSHBG00005011954)	ENSSHBG00005011981	SRPX (ENSSHBG00005012000)	SYTL5 (ENSSHBG00005012039)	DYNLT3 (ENSSHBG00005012057)	CYBB (ENSSHBG00005012082)	XK (ENSSHBG00005012120)	LANCL3 (ENSSHBG00005012137)	PRRG1 (ENSSHBG00005012151)	ENSSHBG00005012172	TMEM47 (ENSSHBG00005012194)	ENSSHBG00005012222	ENSSHBG00005012283
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000159699	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.a	ENSGT00940000159499
Great tit	MODERN SPECIES		EFHC2 (ENSPMJG00000010882)	ENSPMJG00000010883	ENSPMJG00000010884	ENSPMJG00000010923	MAOA (ENSPMJG00000010926)	CASK (ENSPMJG00000010956)	GPR82 (ENSPMJG00000010961)	GPR34 (ENSPMJG00000010963)	NYX (ENSPMJG00000010964)	ENSPMJG00000010965	RPL8 (ENSPMJG00000010969)	ENSPMJG00000010988	MED14 (ENSPMJG00000011006)	ENSPMJG00000011008	ATP6AP2 (ENSPMJG00000011009)	BCOR (ENSPMJG00000011039) #22	MID1IP1 (ENSPMJG00000011079)	TSPAN7 (ENSPMJG00000011099)	OTC (ENSPMJG00000011100)	RPGR (ENSPMJG00000011101)	SRPX (ENSPMJG00000011102)	SYTL5 (ENSPMJG00000011112)	DYNLT3 (ENSPMJG00000011119)	CYBB (ENSPMJG00000011120)	XK (ENSPMJG00000011123)	LANCL3 (ENSPMJG00000011125)	PRRG1 (ENSPMJG00000011139)	ENSPMJG00000011149	TMEM47 (ENSPMJG00000011155)	DMD (ENSPMJG00000011167)	TAB3 (ENSPMJG00000011173)
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000159699	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.a
Flycatcher	MODERN SPECIES		FUNDC1 (ENSFALG00000001471)	EFHC2 (ENSFALG00000001472)	ENSFALG00000001480	MAOA (ENSFALG00000001499)	ENSFALG00000024766	CASK (ENSFALG00000001525)	GPR34 (ENSFALG00000014501)	NYX (ENSFALG00000014515)	ENSFALG00000001530	ENSFALG00000001533	ENSFALG00000001538	ENSFALG00000028154	MED14 (ENSFALG00000001545)	ATP6AP2 (ENSFALG00000001550)	ENSFALG00000028892	BCOR (ENSFALG00000001552) #22	MID1IP1 (ENSFALG00000014532)	TSPAN7 (ENSFALG00000001555)	OTC (ENSFALG00000001568)	SRPX (ENSFALG00000001588)	SYTL5 (ENSFALG00000001593)	DYNLT3 (ENSFALG00000028099)	CYBB (ENSFALG00000001596)	XK (ENSFALG00000028337)	LANCL3 (ENSFALG00000001604)	PRRG1 (ENSFALG00000001606)	ENSFALG00000001612	ENSFALG00000027838	TMEM47 (ENSFALG00000024238)	DMD (ENSFALG00000002410)	TAB3 (ENSFALG00000002394)
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000155202.j	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.a	ENSGT00940000159499
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000161590	ENSGT00520000055625.a	ENSGT00940000155202.j	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000159699	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.a
Zebra finch	MODERN SPECIES		ENSTGUG00000006075	FUNDC1 (ENSTGUG00000006139)	EFHC2 (ENSTGUG00000006145)	ENSTGUG00000023894	ENSTGUG00000006169	MAOA (ENSTGUG00000006274)	GPR82 (ENSTGUG00000006431)	GPR34 (ENSTGUG00000006433)	CASK (ENSTGUG00000006375)	NYX (ENSTGUG00000006438)	ENSTGUG00000006442	RPL8 (ENSTGUG00000006502)	ENSTGUG00000006522	MED14 (ENSTGUG00000006619)	ATP6AP2 (ENSTGUG00000006635)	BCOR (ENSTGUG00000006646) #22	TSPAN7 (ENSTGUG00000006670)	OTC (ENSTGUG00000006707)	RPGR (ENSTGUG00000006724)	SRPX (ENSTGUG00000006739)	SYTL5 (ENSTGUG00000006759)	DYNLT3 (ENSTGUG00000027281)	CYBB (ENSTGUG00000006788)	XK (ENSTGUG00000022942)	LANCL3 (ENSTGUG00000020123)	PRRG1 (ENSTGUG00000023878)	ENSTGUG00000006861	TMEM47 (ENSTGUG00000026052)	DMD (ENSTGUG00000006887)	TAB3 (ENSTGUG00000007013)	ENSTGUG00000007017
Common canary	MODERN SPECIES	11	ENSSCAG00000011328	DIPK2B (ENSSCAG00000011357)	ENSSCAG00000011378	FUNDC1 (ENSSCAG00000011418)	EFHC2 (ENSSCAG00000011425)	ENSSCAG00000011430	ENSSCAG00000011433	MAOA (ENSSCAG00000011441)	CASK (ENSSCAG00000011458)	GPR82 (ENSSCAG00000011488)	GPR34 (ENSSCAG00000011492)	NYX (ENSSCAG00000011494)	ENSSCAG00000011500	RPL8 (ENSSCAG00000011507)	ENSSCAG00000011516	BCOR (ENSSCAG00000011536) #22	MID1IP1 (ENSSCAG00000011544)	TSPAN7 (ENSSCAG00000011549)	ENSSCAG00000011558	RPGR (ENSSCAG00000011562)	SRPX (ENSSCAG00000011573)	SYTL5 (ENSSCAG00000011582)	DYNLT3 (ENSSCAG00000011589)	CYBB (ENSSCAG00000011590)	XK (ENSSCAG00000011594)	LANCL3 (ENSSCAG00000011596)	PRRG1 (ENSSCAG00000011600)	ENSSCAG00000011616	ENSSCAG00000011627	ENSSCAG00000011633	TMEM47 (ENSSCAG00000011647)
Medium ground finch	MODERN SPECIES	77					ENSGFOG00000013043	GPR82 (ENSGFOG00000013040)	GPR34 (ENSGFOG00000013037)	CASK (ENSGFOG00000012986)	NYX (ENSGFOG00000012975)	ENSGFOG00000011577	RPL8 (ENSGFOG00000011502)	ENSGFOG00000011466	MED14 (ENSGFOG00000011449)	ATP6AP2 (ENSGFOG00000011434)	ENSGFOG00000011425	BCOR (ENSGFOG00000011411) #22	TSPAN7 (ENSGFOG00000011401)	OTC (ENSGFOG00000011383)	RPGR (ENSGFOG00000011376)	SRPX (ENSGFOG00000011347)	SYTL5 (ENSGFOG00000011338)	DYNLT3 (ENSGFOG00000011333)	CYBB (ENSGFOG00000011281)	ENSGFOG00000011277	PRRG1 (ENSGFOG00000011274)	ENSGFOG00000011270	TMEM47 (ENSGFOG00000011267)	ENSGFOG00000011181
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000155202.j	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000159699	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.a	ENSGT00940000159499
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00390000004304	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000159699	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.a	ENSGT00940000159499
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	12	ENSABRG00000010917	FUNDC1 (ENSABRG00000010568)	EFHC2 (ENSABRG00000010543)	ENSABRG00000010523	ENSABRG00000010502	MAOA (ENSABRG00000010487)	GPR34 (ENSABRG00000010454)	CASK (ENSABRG00000010365)	NYX (ENSABRG00000010347)	ENSABRG00000010314	RPL8 (ENSABRG00000010296)	ENSABRG00000009718	ENSABRG00000009680	MED14 (ENSABRG00000009636)	ATP6AP2 (ENSABRG00000009630)	BCOR (ENSABRG00000009596) #22	MID1IP1 (ENSABRG00000009582)	ENSABRG00000009578	TSPAN7 (ENSABRG00000009569)	OTC (ENSABRG00000009549)	RPGR (ENSABRG00000009520)	SRPX (ENSABRG00000009514)	SYTL5 (ENSABRG00000009499)	ENSABRG00000009495	DYNLT3 (ENSABRG00000009482)	CYBB (ENSABRG00000009463)	XK (ENSABRG00000009456)	LANCL3 (ENSABRG00000009443)	PRRG1 (ENSABRG00000009424)	ENSABRG00000009334	TMEM47 (ENSABRG00000009299)
Duck	MODERN SPECIES		ENSAPLG00000027576	FUNDC1 (ENSAPLG00000012067)	EFHC2 (ENSAPLG00000012158)	NDP (ENSAPLG00000030151)	ENSAPLG00000012540	MAOA (ENSAPLG00000013230)	GPR82 (ENSAPLG00000019460)	GPR34 (ENSAPLG00000002101)	CASK (ENSAPLG00000013996)	NYX (ENSAPLG00000002105)	ENSAPLG00000014240	RPL8 (ENSAPLG00000014582)	ENSAPLG00000014792	MED14 (ENSAPLG00000015774)	ATP6AP2 (ENSAPLG00000015929)	BCOR (ENSAPLG00000004502) #22	ENSAPLG00000022499	MID1IP1 (ENSAPLG00000024750)	TSPAN7 (ENSAPLG00000010353)	OTC (ENSAPLG00000010113)	RPGR (ENSAPLG00000010057)	SRPX (ENSAPLG00000009886)	ENSAPLG00000027765	SYTL5 (ENSAPLG00000009713)	DYNLT3 (ENSAPLG00000031155)	CYBB (ENSAPLG00000008961)	XK (ENSAPLG00000022338)	LANCL3 (ENSAPLG00000008878)	PRRG1 (ENSAPLG00000008867)	ENSAPLG00000031160	ENSAPLG00000022060
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155202.j.b	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000159699	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.a	ENSGT00940000159499
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155202.j.a	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.a	ENSGT00940000159499
Chicken	MODERN SPECIES		ENSGALG00010011421	FUNDC1 (ENSGALG00010011440)	EFHC2 (ENSGALG00010011468)	NDP (ENSGALG00010011475)	MAOB (ENSGALG00010011533)	MAOA (ENSGALG00010011546)	CASK (ENSGALG00010002424)	GPR82 (ENSGALG00010002439)	GPR34 (ENSGALG00010002434)	NYX (ENSGALG00010002455)	DDX3X (ENSGALG00010002476)	RPL8 (ENSGALG00010002492)	USP9Y (ENSGALG00010002504)	MED14 (ENSGALG00010002528)	ATP6AP2 (ENSGALG00010002546)	BCOR (ENSGALG00010002571) #22	MID1IP1 (ENSGALG00010002623)	TSPAN7 (ENSGALG00010002725)	OTC (ENSGALG00010002770)	RPGR (ENSGALG00010003719)	SRPX (ENSGALG00010002840)	SYTL5 (ENSGALG00010002935)	DYNLT3 (ENSGALG00010002978)	CYBB (ENSGALG00010001865)	XK (ENSGALG00010001878)	PRRG1 (ENSGALG00010002310)	ENSGALG00010002331	TMEM47 (ENSGALG00010002335)	DMD (ENSGALG00010001982)	ENSGALG00010002147	ENSGALG00010003690
Japanese quail	MODERN SPECIES		ENSCJPG00005009018	FUNDC1 (ENSCJPG00005012620)	EFHC2 (ENSCJPG00005012621)	ENSCJPG00005012623	ENSCJPG00005012624	MAOA (ENSCJPG00005012625)	CASK (ENSCJPG00005012631)	GPR82 (ENSCJPG00005012632)	GPR34 (ENSCJPG00005012633)	NYX (ENSCJPG00005012634)	ENSCJPG00005012635	RPL8 (ENSCJPG00005012636)	ENSCJPG00005012674	MED14 (ENSCJPG00005016643)	ATP6AP2 (ENSCJPG00005016734)	BCOR (ENSCJPG00005016737) #22	MID1IP1 (ENSCJPG00005016826)	ENSCJPG00005016827	TSPAN7 (ENSCJPG00005016849)	OTC (ENSCJPG00005016851)	RPGR (ENSCJPG00005016852)	SRPX (ENSCJPG00005016855)	SYTL5 (ENSCJPG00005016856)	DYNLT3 (ENSCJPG00005016899)	CYBB (ENSCJPG00005016900)	XK (ENSCJPG00005016901)	LANCL3 (ENSCJPG00005016902)	PRRG1 (ENSCJPG00005016903)	ENSCJPG00005016960	TMEM47 (ENSCJPG00005016988)	DMD (ENSCJPG00005017058)
African ostrich	MODERN SPECIES	1017																BCOR (ENSSCUG00000012659) #22	TSPAN7 (ENSSCUG00000012634)	OTC (ENSSCUG00000012627)	RPGR (ENSSCUG00000012622)	SRPX (ENSSCUG00000012617)	SYTL5 (ENSSCUG00000012612)	DYNLT3 (ENSSCUG00000012610)	CYBB (ENSSCUG00000012605)	XK (ENSSCUG00000012603)	LANCL3 (ENSSCUG00000012601)	PRRG1 (ENSSCUG00000012598)	ENSSCUG00000012581	TMEM47 (ENSSCUG00000012571)	ENSSCUG00000016097
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	27	EFHC2 (ENSCPRG00005017502)	ENSCPRG00005017509	ENSCPRG00005017515	MAOA (ENSCPRG00005017529)	CASK (ENSCPRG00005017561)	GPR82 (ENSCPRG00005017600)	GPR34 (ENSCPRG00005000263)	NYX (ENSCPRG00005000354)	ENSCPRG00005000367	RPL8 (ENSCPRG00005000443)	ENSCPRG00005000793	ENSCPRG00005002699	MED14 (ENSCPRG00005002703)	CXorf38 (ENSCPRG00005002714)	ATP6AP2 (ENSCPRG00005002720)	BCOR (ENSCPRG00005002755) #22	MID1IP1 (ENSCPRG00005002803)	TSPAN7 (ENSCPRG00005002808)	OTC (ENSCPRG00005002828)	RPGR (ENSCPRG00005002844)	SRPX (ENSCPRG00005002901)	SYTL5 (ENSCPRG00005002904)	DYNLT3 (ENSCPRG00005002934)	CYBB (ENSCPRG00005002940)	XK (ENSCPRG00005002947)	LANCL3 (ENSCPRG00005002954)	PRRG1 (ENSCPRG00005002975)	ENSCPRG00005003012	TMEM47 (ENSCPRG00005003045)	ENSCPRG00005003194	ENSCPRG00005003590
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000161188.c.a.a.b	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.b
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244.a	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000161188.c.a.a.b	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.b
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244.a	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000161188.c.a.a.b	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.b
Three-toed box turtle	DUPLICATION
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	9	ENSTMTG00000011611	ENSTMTG00000011592	ENSTMTG00000011586	ENSTMTG00000011563	ENSTMTG00000010314	ENSTMTG00000010302	ENSTMTG00000010016	ENSTMTG00000009979	ENSTMTG00000009906	ENSTMTG00000009889	ENSTMTG00000008086	ENSTMTG00000007954	ENSTMTG00000007931	ENSTMTG00000007910	ENSTMTG00000007888	ENSTMTG00000007822 #22	ENSTMTG00000007810	ENSTMTG00000007789	ENSTMTG00000007747	ENSTMTG00000007736	ENSTMTG00000007508	ENSTMTG00000007477
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	7	FUNDC1 (ENSTMTG00000001463)	ENSTMTG00000001440	ENSTMTG00000001430	ENSTMTG00000001354	ENSTMTG00000001327	ENSTMTG00000001318	GPR34 (ENSTMTG00000001312)	ENSTMTG00000001227	ENSTMTG00000001207	ENSTMTG00000001163	ENSTMTG00000001142	ENSTMTG00000000802	ENSTMTG00000000692	ENSTMTG00000000659	ENSTMTG00000000644	ENSTMTG00000000489 #22	ENSTMTG00000000430	ENSTMTG00000000411	ENSTMTG00000000385	ENSTMTG00000000356	ENSTMTG00000000130	ENSTMTG00000000024
painted turtle	MODERN SPECIES	2389	ZBTB21 (ENSCPBG00000012923)	UMODL1 (ENSCPBG00000012927)	ABCG1 (ENSCPBG00000012934)	TFF3 (ENSCPBG00000012936)	PDE9A (ENSCPBG00000012938)	WDR4 (ENSCPBG00000012943)	ENSCPBG00000012948	PKNOX1 (ENSCPBG00000012951)	ENSCPBG00000012954	ENSCPBG00000012957	CBS (ENSCPBG00000012958)	U2AF1 (ENSCPBG00000012960)	CRYAA (ENSCPBG00000012962)	SIK1 (ENSCPBG00000012966)	HSF2BP (ENSCPBG00000012970)	BCOR (ENSCPBG00000012975) #22	MID1IP1 (ENSCPBG00000013263)	TSPAN7 (ENSCPBG00000013267)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00900000143309	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00950000185494	ENSGT00940000154194.j	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244.b	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000161188.c.a.a.b	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.b
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	1914									RPL8 (ENSCABG00000004485)	ENSCABG00000004463	ENSCABG00000004456	ENSCABG00000004453	MED14 (ENSCABG00000004450)	CXorf38 (ENSCABG00000004447)	ATP6AP2 (ENSCABG00000004442)	BCOR (ENSCABG00000004434) #22	MID1IP1 (ENSCABG00000004431)	TSPAN7 (ENSCABG00000004429)
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES		ENSGEVG00005000168	ENSGEVG00005000126	MAOA (ENSGEVG00005000038)	ENSGEVG00005000013	GPR82 (ENSGEVG00005005110)	GPR34 (ENSGEVG00005005096)	CASK (ENSGEVG00005004833)	NYX (ENSGEVG00005004729)	ENSGEVG00005004661	RPL8 (ENSGEVG00005004617)	ENSGEVG00005004490	ENSGEVG00005004433	MED14 (ENSGEVG00005004375)	CXorf38 (ENSGEVG00005004344)	ATP6AP2 (ENSGEVG00005004331)	BCOR (ENSGEVG00005004258) #22	ENSGEVG00005004163	MID1IP1 (ENSGEVG00005004153)	TSPAN7 (ENSGEVG00005004133)	OTC (ENSGEVG00005004101)	SRPX (ENSGEVG00005004078)	SYTL5 (ENSGEVG00005004057)	DYNLT3 (ENSGEVG00005004036)	CYBB (ENSGEVG00005004006)	LANCL3 (ENSGEVG00005003980)	ENSGEVG00005003935	PRRG1 (ENSGEVG00005003895)	ENSGEVG00005003889	TMEM47 (ENSGEVG00005003875)	ENSGEVG00005003859	ENSGEVG00005003808
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1925									NYX (ENSPSIG00000000735)	ENSPSIG00000011217	RPL8 (ENSPSIG00000010752)	ENSPSIG00000007248	MED14 (ENSPSIG00000005470)	CXorf38 (ENSPSIG00000015656)	ATP6AP2 (ENSPSIG00000015449)	BCOR (ENSPSIG00000014929) #22	MID1IP1 (ENSPSIG00000014801)	TSPAN7 (ENSPSIG00000014341)	ENSPSIG00000014291	OTC (ENSPSIG00000013045)	RPGR (ENSPSIG00000011226)	SRPX (ENSPSIG00000010787)	SYTL5 (ENSPSIG00000010590)	ENSPSIG00000010132	DYNLT3 (ENSPSIG00000009975)	CYBB (ENSPSIG00000007475)	XK (ENSPSIG00000006861)	LANCL3 (ENSPSIG00000006814)	ENSPSIG00000005091	ENSPSIG00000014055	PRRG1 (ENSPSIG00000013767)
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT01050000245294	ENSGT00940000155375	ENSGT00940000168277	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.b	ENSGT00940000154342.C.g.a
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00940000168277	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.b	ENSGT00940000154342.C.g.a
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00520000055625.a	ENSGT00940000155202.j	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.a	ENSGT00940000159499
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000162228	ENSGT00520000055625.a	ENSGT00940000155202.j	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00960000191651	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302.c	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254
Indian cobra	MODERN SPECIES	4	ENSNNAG00000008743	ENSNNAG00000008579	FUNDC1 (ENSNNAG00000008553)	EFHC2 (ENSNNAG00000008477)	ENSNNAG00000008469	ENSNNAG00000008250	MAOA (ENSNNAG00000007840)	CASK (ENSNNAG00000006518)	NYX (ENSNNAG00000006392)	ENSNNAG00000006345	RPL8 (ENSNNAG00000006316)	ENSNNAG00000005644	ENSNNAG00000005294	MED14 (ENSNNAG00000004433)	ENSNNAG00000003520	BCOR (ENSNNAG00000003419) #22	ENSNNAG00000003402	MID1IP1 (ENSNNAG00000003392)	TSPAN7 (ENSNNAG00000003384)	OTC (ENSNNAG00000003359)	ENSNNAG00000003346	RPGR (ENSNNAG00000003318)	ENSNNAG00000003271	SYTL5 (ENSNNAG00000003249)	DYNLT3 (ENSNNAG00000003215)	CYBB (ENSNNAG00000003186)	XK (ENSNNAG00000003172)	PRRG1 (ENSNNAG00000003158)	ENSNNAG00000003148	ENSNNAG00000003132
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00940000162228	ENSGT00520000055625.a	ENSGT00940000155202.j.h	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B.jc	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00960000191651	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302.c	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00940000162228	ENSGT00520000055625.a	ENSGT00940000155202.j.h	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B.jc	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00960000191651	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302.c	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	58	EFHC2 (ENSNSUG00000019304)	ENSNSUG00000019305	ENSNSUG00000019306	MAOA (ENSNSUG00000019311)	ENSNSUG00000019313	ENSNSUG00000019315	ENSNSUG00000019316	ENSNSUG00000019317	ENSNSUG00000019318	NYX (ENSNSUG00000019319)	ENSNSUG00000019320	ENSNSUG00000019321	ENSNSUG00000019331	MED14 (ENSNSUG00000019760)	ATP6AP2 (ENSNSUG00000019894)	BCOR (ENSNSUG00000019896) #22	MID1IP1 (ENSNSUG00000019902)	TSPAN7 (ENSNSUG00000019903)	ENSNSUG00000019904	ENSNSUG00000019905
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	62	ENSPTXG00000010638	FUNDC1 (ENSPTXG00000010639)	EFHC2 (ENSPTXG00000010640)	ENSPTXG00000010643	ENSPTXG00000010645	MAOA (ENSPTXG00000010646)	ENSPTXG00000010647	CASK (ENSPTXG00000010648)	NYX (ENSPTXG00000010650)	ENSPTXG00000010651	ENSPTXG00000010653	ENSPTXG00000010654	ENSPTXG00000010659	MED14 (ENSPTXG00000010663)	ATP6AP2 (ENSPTXG00000010670)	BCOR (ENSPTXG00000010672) #22	MID1IP1 (ENSPTXG00000010676)	TSPAN7 (ENSPTXG00000010677)	ENSPTXG00000010680	RPGR (ENSPTXG00000010681)	SRPX (ENSPTXG00000010686)	SYTL5 (ENSPTXG00000010690)	CYBB (ENSPTXG00000010692)	XK (ENSPTXG00000010694)	PRRG1 (ENSPTXG00000010696)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	4295															ENSLLTG00000009696	BCOR (ENSLLTG00000009615) #22
Lizard	MODERN SPECIES	2	ENSACAG00000036285	ENSACAG00000044024	CASK (ENSACAG00000017924)	NYX (ENSACAG00000017927)	ENSACAG00000017928	ENSACAG00000038257	ENSACAG00000017933	ENSACAG00000017937	ENSACAG00000040704	ENSACAG00000042779	MED14 (ENSACAG00000014283)	CXorf38 (ENSACAG00000014405)	ATP6AP2 (ENSACAG00000014415)	ENSACAG00000044616	ENSACAG00000036780	BCOR (ENSACAG00000014487) #22	ENSACAG00000044415	ENSACAG00000040266	ENSACAG00000041547	ENSACAG00000037264	ENSACAG00000039512	ENSACAG00000038895	MID1IP1 (ENSACAG00000014537)	ENSACAG00000045009	TSPAN7 (ENSACAG00000014546)	OTC (ENSACAG00000014619)	RPGR (ENSACAG00000014702)	ENSACAG00000045194	SRPX (ENSACAG00000014714)	SYTL5 (ENSACAG00000014773)	DYNLT3 (ENSACAG00000040903)
Laterata	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514	ENSGT00950000183055.a.b	ENSGT00530000063582.a	ENSGT01060000248589.C	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00940000168277	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000160244	ENSGT00390000003231.b	ENSGT00530000063186.a	ENSGT00940000158538	ENSGT00940000163254	ENSGT00530000063484.b.b	ENSGT00940000154342.C.g.b	ENSGT00940000154342.C.g.a
Common wall lizard	MODERN SPECIES	12	FUNDC1 (ENSPMRG00000003536)	EFHC2 (ENSPMRG00000003549)	ENSPMRG00000003579	ENSPMRG00000003590	MAOA (ENSPMRG00000003608)	CASK (ENSPMRG00000003626)	GPR34 (ENSPMRG00000003660)	NYX (ENSPMRG00000003663)	ENSPMRG00000003667	RPL8 (ENSPMRG00000003688)	ENSPMRG00000003693	ENSPMRG00000003708	MED14 (ENSPMRG00000003716)	CXorf38 (ENSPMRG00000003747)	ATP6AP2 (ENSPMRG00000003753)	BCOR (ENSPMRG00000003763) #22	MID1IP1 (ENSPMRG00000003776)	TSPAN7 (ENSPMRG00000003780)	OTC (ENSPMRG00000003796)	RPGR (ENSPMRG00000003884)	SRPX (ENSPMRG00000003903)	ENSPMRG00000003912	SYTL5 (ENSPMRG00000003917)	DYNLT3 (ENSPMRG00000003925)	CYBB (ENSPMRG00000003940)	ENSPMRG00000004025	LANCL3 (ENSPMRG00000004032)	PRRG1 (ENSPMRG00000004037)	ENSPMRG00000004042	ENSPMRG00000004047	ENSPMRG00000004048
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES		ENSSMRG00000022891	FUNDC1 (ENSSMRG00000022890)	EFHC2 (ENSSMRG00000022889)	ENSSMRG00000022888	ENSSMRG00000022887	MAOA (ENSSMRG00000022886)	GPR34 (ENSSMRG00000022884)	CASK (ENSSMRG00000022883)	NYX (ENSSMRG00000022882)	ENSSMRG00000022881	RPL8 (ENSSMRG00000022880)	ENSSMRG00000022879	MED14 (ENSSMRG00000022878)	CXorf38 (ENSSMRG00000022877)	ATP6AP2 (ENSSMRG00000022876)	BCOR (ENSSMRG00000022873) #22	MID1IP1 (ENSSMRG00000022870)	TSPAN7 (ENSSMRG00000022869)	OTC (ENSSMRG00000022867)	ENSSMRG00000022866	RPGR (ENSSMRG00000022865)	SRPX (ENSSMRG00000022864)	SYTL5 (ENSSMRG00000022863)	DYNLT3 (ENSSMRG00000022862)	CYBB (ENSSMRG00000022861)	XK (ENSSMRG00000022860)	LANCL3 (ENSSMRG00000022859)	PRRG1 (ENSSMRG00000022858)	ENSSMRG00000022856	TMEM47 (ENSSMRG00000022854)	ENSSMRG00000022852
Anura	ANCESTRAL SPECIES	94	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166930	ENSGT00940000166107	ENSGT00940000160514.i	ENSGT00940000155600.b	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT00940000160782	ENSGT00940000154443	ENSGT00940000153244.B	ENSGT00940000155375	ENSGT00390000001021	ENSGT00390000006290	ENSGT00390000008856	ENSGT00940000153737.b #22	ENSGT00500000044890.a.a	ENSGT00940000156153	ENSGT00510000047417	ENSGT00940000159616	ENSGT00940000160302	ENSGT00940000158618	ENSGT00940000155009	ENSGT00940000155821	ENSGT00940000158265	ENSGT00410000025556.a.b	ENSGT00940000161922.j	ENSGT00390000005717	ENSGT00940000155212
Frog	MODERN SPECIES	2	ndp (ENSXETG00000035295)	maob (ENSXETG00000004839)	maoa (ENSXETG00000038968)	cask (ENSXETG00000004852)	GPR82 (ENSXETG00000038965)	gpr34 (ENSXETG00000025816)	ENSXETG00000034719	nyx (ENSXETG00000025815)	ddx3x (ENSXETG00000015477)	rpl8 (ENSXETG00000015483)	usp9x (ENSXETG00000015489)	med14 (ENSXETG00000015502)	cxorf38 (ENSXETG00000032391)	atp6ap2 (ENSXETG00000015523)	ENSXETG00000046966	bcor (ENSXETG00000015528) #22	ENSXETG00000045040	ENSXETG00000042704	mid1ip1 (ENSXETG00000044688)	tspan7 (ENSXETG00000008591)	ENSXETG00000045064	otc (ENSXETG00000008592)	RPGR (ENSXETG00000047992)	srpx (ENSXETG00000008596)	sytl5 (ENSXETG00000008597)	dynlt3 (ENSXETG00000041328)	mid1 (ENSXETG00000015715)	clcn4 (ENSXETG00000015727)	ENSXETG00000044045	wwc3 (ENSXETG00000015746)	ENSXETG00000012563
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	5	ENSLLEG00000003202	ENSLLEG00000003298	ENSLLEG00000003656	ENSLLEG00000003670	ENSLLEG00000003711	MED14 (ENSLLEG00000003854)	CXorf38 (ENSLLEG00000003991)	ATP6AP2 (ENSLLEG00000003996)	ENSLLEG00000004003	ENSLLEG00000004006	ENSLLEG00000004013	ENSLLEG00000004016	ENSLLEG00000004018	ENSLLEG00000004021	ENSLLEG00000004024	BCOR (ENSLLEG00000004034) #22	ENSLLEG00000004050	MID1IP1 (ENSLLEG00000004053)	ENSLLEG00000004057	TSPAN7 (ENSLLEG00000004061)	OTC (ENSLLEG00000004071)	RPGR (ENSLLEG00000004085)	SRPX (ENSLLEG00000004120)	ENSLLEG00000004127	SYTL5 (ENSLLEG00000004136)	DYNLT3 (ENSLLEG00000004151)	MID1 (ENSLLEG00000004154)	CLCN4 (ENSLLEG00000004159)	WWC3 (ENSLLEG00000004164)	ENSLLEG00000004185	SHROOM2 (ENSLLEG00000004191)