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Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158594 #7	ENSGT00940000161730 #8	ENSGT00940000157307 #9	ENSGT00940000160998 #10	ENSGT00940000155813 #11	ENSGT00950000183122.C #12	ENSGT00940000157282 #13	ENSGT00950000182979.a.b.b.a #14	ENSGT00940000154272.B #15	ENSGT00920000149129.g #16	ENSGT00390000001347.z.a #17	ENSGT00940000153657.A #18	ENSGT00940000163470 #19	ENSGT00940000155618 #20	ENSGT00940000155497 #21	ENSGT00940000153840.a.b #22	ENSGT00940000154464.b #23	ENSGT00440000039203 #24	ENSGT00390000018542.a #25	ENSGT00940000156578 #26	ENSGT00940000154208.d #27	ENSGT00390000018518 #28	ENSGT00940000154892 #29	ENSGT00390000004383 #30	ENSGT00390000000022.b #31	ENSGT00390000002918.a.b #32	ENSGT00730000111100 #33	ENSGT00940000153239.B #34	ENSGT00550000074840.y.b.a.a #35	ENSGT00390000002077 #37	ENSGT00390000020164
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	120	CACNA1I (ENSCLAG00000016706) #7	ENTHD1 (ENSCLAG00000016698) #8	GRAP2 (ENSCLAG00000016753) #9	FAM83F (ENSCLAG00000016721) #10	TNRC6B (ENSCLAG00000016942) #11	ADSL (ENSCLAG00000016908) #12	SGSM3 (ENSCLAG00000016510) #13	MRTFA (ENSCLAG00000016828) #14	MCHR1 (ENSCLAG00000016672) #15	SLC25A17 (ENSCLAG00000016789) #16	ST13 (ENSCLAG00000016711) #17	XPNPEP3 (ENSCLAG00000016993) #18	DNAJB7 (ENSCLAG00000016674) #19	ENSCLAG00000016739 #20	EP300 (ENSCLAG00000016995) #21	L3MBTL2 (ENSCLAG00000017319) #22	CHADL (ENSCLAG00000016821) #23	RANGAP1 (ENSCLAG00000017330) #24	ZC3H7B (ENSCLAG00000015052) #25	TEF (ENSCLAG00000016418) #26	TOB2 (ENSCLAG00000016670) #27	ENSCLAG00000016714 #28	ACO2 (ENSCLAG00000016998) #29	POLR3H (ENSCLAG00000016948) #30	CSDC2 (ENSCLAG00000016705) #31	PMM1 (ENSCLAG00000016748) #32	DESI1 (ENSCLAG00000016871) #33	XRCC6 (ENSCLAG00000016669) #34	SNU13 (ENSCLAG00000017182) #35	ENSCLAG00000016769 #36	ENSCLAG00000017166 #37
Degu	MODERN SPECIES	197	MROH7 (ENSODEG00000011770)	FAM151A (ENSODEG00000011460)	ACOT11 (ENSODEG00000011967)	ENSODEG00000020148	SSBP3 (ENSODEG00000011890)	MRPL37 (ENSODEG00000013096)	CYB5RL (ENSODEG00000013330)	CDCP2 (ENSODEG00000012753)	TCEANC2 (ENSODEG00000013526)	ENSODEG00000013663	LDLRAD1 (ENSODEG00000011774)	LRRC42 (ENSODEG00000012283)	IFT25 (ENSODEG00000013069)	DIO1 (ENSODEG00000012387)	ENSODEG00000019895	L3MBTL2 (ENSODEG00000013665) #22	CHADL (ENSODEG00000012116) #23	RANGAP1 (ENSODEG00000014583) #24	ZC3H7B (ENSODEG00000012411) #25	TEF (ENSODEG00000014126) #26	TOB2 (ENSODEG00000020030) #27	ENSODEG00000013125 #28	ACO2 (ENSODEG00000012550) #29	ENSODEG00000013641 #30	CSDC2 (ENSODEG00000015733) #31	PMM1 (ENSODEG00000012155) #32	DESI1 (ENSODEG00000012652) #33	XRCC6 (ENSODEG00000015847) #34	SNU13 (ENSODEG00000015632) #35	ENSODEG00000012993 #37	CCDC134 (ENSODEG00000013183)
Guinea pig	MODERN SPECIES	28	RPS19BP1 (ENSCPOG00000037075)	CACNA1I (ENSCPOG00000011963) #7	ENTHD1 (ENSCPOG00000014129) #8	GRAP2 (ENSCPOG00000040713) #9	FAM83F (ENSCPOG00000014133) #10	TNRC6B (ENSCPOG00000005705) #11	ADSL (ENSCPOG00000005715) #12	SGSM3 (ENSCPOG00000009876) #13	MRTFA (ENSCPOG00000009883) #14	MCHR1 (ENSCPOG00000012166) #15	SLC25A17 (ENSCPOG00000002289) #16	ENSCPOG00000002290 #17	XPNPEP3 (ENSCPOG00000002291) #18	RBX1 (ENSCPOG00000035978) #20	EP300 (ENSCPOG00000005438) #21	L3MBTL2 (ENSCPOG00000021063) #22	CHADL (ENSCPOG00000026967) #23	RANGAP1 (ENSCPOG00000004404) #24	ZC3H7B (ENSCPOG00000004413) #25	TEF (ENSCPOG00000020591) #26	TOB2 (ENSCPOG00000031873) #27	PHF5A (ENSCPOG00000033309) #28	ACO2 (ENSCPOG00000012642) #29	POLR3H (ENSCPOG00000012650) #30	CSDC2 (ENSCPOG00000037976) #31	PMM1 (ENSCPOG00000014618) #32	DESI1 (ENSCPOG00000038083) #33	XRCC6 (ENSCPOG00000003542) #34	SNU13 (ENSCPOG00000040165) ##35	ENSCPOG00000010113 #37	CCDC134 (ENSCPOG00000000617)