Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00930000151037	ENSGT00390000012439 #8	ENSGT00940000157931 #9	ENSGT00940000160929 #10	ENSGT00940000159408 #11	ENSGT00940000159980 #12	ENSGT00940000153395.b #13	ENSGT00390000013828 #14	ENSGT00390000017402 #15	ENSGT00390000012490 #16	ENSGT00940000159291 #17	ENSGT00940000154513.B #18	ENSGT00940000154513.A #19	ENSGT00390000007643 #20	ENSGT01030000234558.A.a.a.b #21	ENSGT00390000013727.c #22	ENSGT00390000003768 #23	ENSGT00510000049215 #24	ENSGT00940000161800 #26	ENSGT00950000183083.b #27	ENSGT00940000158724 #28	ENSGT00940000157630 #30	ENSGT00940000162160 #31	ENSGT00390000014553 #32	ENSGT01030000234531.A.b.b.b.f.b.b #33	ENSGT00940000162571 #34	ENSGT00390000000013 #35	ENSGT00940000159410 #36	ENSGT00940000154570.a.b ##37	ENSGT00940000154570.b #37	ENSGT00390000009278
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES		ANGPTL7 (ENSSVLG00005005951) #7	UBIAD1 (ENSSVLG00005005985) #8	DISP3 (ENSSVLG00005006030) #9	FBXO2 (ENSSVLG00005006137) #10	FBXO44 (ENSSVLG00005006188) #11	FBXO6 (ENSSVLG00005006238) #12	MAD2L2 (ENSSVLG00005006268) #13	DRAXIN (ENSSVLG00005006297) #14	AGTRAP (ENSSVLG00005006342) #15	MTHFR (ENSSVLG00005006411) #16	CLCN6 (ENSSVLG00005006533) #17	NPPA (ENSSVLG00005006599) #18	NPPB (ENSSVLG00005006653) #19	KIAA2013 (ENSSVLG00005006695) #20	PLOD1 (ENSSVLG00005006729) #21	MFN2 (ENSSVLG00005006764) #22	MIIP (ENSSVLG00005006797) #23	TNFRSF8 (ENSSVLG00005006831) #24	ENSSVLG00005006934 #25	TNFRSF1B (ENSSVLG00005006983) #26	VPS13D (ENSSVLG00005007158) #27	DHRS3 (ENSSVLG00005007738) #28	ENSSVLG00005007795 #29	ENSSVLG00005007846 #30	AADACL3 (ENSSVLG00005007922) #31	CFAP107 (ENSSVLG00005007956) #32	ENSSVLG00005008079 #33	LRRC38 (ENSSVLG00005008488) #34	PDPN (ENSSVLG00005008527) #35	PRDM2 (ENSSVLG00005008674) #36	KAZN (ENSSVLG00005008929) #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00930000151037	ENSGT00390000012439 #8	ENSGT00940000157931 #9	ENSGT00940000160929 #10	ENSGT00940000159408 #11	ENSGT00940000159980 #12	ENSGT00940000153395.b #13	ENSGT00390000013828 #14	ENSGT00390000017402 #15	ENSGT00390000012490 #16	ENSGT00940000159291 #17	ENSGT00940000154513.B #18	ENSGT00940000154513.A #19	ENSGT00390000007643 #20	ENSGT01030000234558.A.a.a.b #21	ENSGT00390000013727.c #22	ENSGT00390000003768 #23	ENSGT00510000049215 #24	ENSGT00940000161800 #26	ENSGT00950000183083.b #27	ENSGT00940000158724 #28	ENSGT00940000157630.c #30	ENSGT00940000162160 #31	ENSGT00390000014553 #32	ENSGT00940000162571 #34	ENSGT00390000000013 #35	ENSGT00940000159410 #36	ENSGT00940000154570.a.b ##37	ENSGT00940000154570.b #37	ENSGT00390000009278	ENSGT00940000154171.A
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00930000151037	ENSGT00390000012439 #8	ENSGT00940000157931 #9	ENSGT00940000160929 #10	ENSGT00940000159408 #11	ENSGT00940000159980 #12	ENSGT00940000153395.b #13	ENSGT00390000013828 #14	ENSGT00390000017402 #15	ENSGT00390000012490 #16	ENSGT00940000159291 #17	ENSGT00940000154513.B #18	ENSGT00940000154513.A #19	ENSGT00390000007643 #20	ENSGT01030000234558.A.a.a.b #21	ENSGT00390000013727.c #22	ENSGT00390000003768 #23	ENSGT00510000049215 #24	ENSGT00940000161800 #26	ENSGT00950000183083.b #27	ENSGT00940000158724 #28	ENSGT00940000157630.c #30	ENSGT00940000162160 #31	ENSGT00390000014553 #32	ENSGT00940000162571 #34	ENSGT00390000000013 #35	ENSGT00940000159410 #36	ENSGT00940000154570.a.b ##37	ENSGT00940000154570.b #37	ENSGT00390000009278	ENSGT00940000154171.A
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	192	MTOR (ENSUPAG00010003456)	ANGPTL7 (ENSUPAG00010003518) #7	UBIAD1 (ENSUPAG00010003527) #8	DISP3 (ENSUPAG00010003537) #9	FBXO2 (ENSUPAG00010003569) #10	FBXO6 (ENSUPAG00010003574) #12	MAD2L2 (ENSUPAG00010003610) #13	DRAXIN (ENSUPAG00010003632) #14	ENSUPAG00010003642	MTHFR (ENSUPAG00010003678) #16	CLCN6 (ENSUPAG00010003705) #17	NPPA (ENSUPAG00010003768) #18	ENSUPAG00010003781 #19	KIAA2013 (ENSUPAG00010003792) #20	PLOD1 (ENSUPAG00010003800) #21	MFN2 (ENSUPAG00010003824) #22	MIIP (ENSUPAG00010003861) #23	TNFRSF8 (ENSUPAG00010003869) #24	TNFRSF1B (ENSUPAG00010003884) #26	VPS13D (ENSUPAG00010003922) #27	DHRS3 (ENSUPAG00010004636) #28	ENSUPAG00010004669 #30	ENSUPAG00010004670 #30	AADACL3 (ENSUPAG00010004684) #31	ENSUPAG00010004689
Squirrel	MODERN SPECIES	74	ANGPTL7 (ENSSTOG00000005589) #7	UBIAD1 (ENSSTOG00000022240) #8	DISP3 (ENSSTOG00000009265) #9	FBXO2 (ENSSTOG00000025486) #10	FBXO44 (ENSSTOG00000009941) #11	FBXO6 (ENSSTOG00000009949) #12	MAD2L2 (ENSSTOG00000009961) #13	DRAXIN (ENSSTOG00000001281) #14	AGTRAP (ENSSTOG00000030212) #15	MTHFR (ENSSTOG00000007591) #16	CLCN6 (ENSSTOG00000007614) #17	ENSSTOG00000007663 #18	NPPB (ENSSTOG00000020778) #19	KIAA2013 (ENSSTOG00000027586) #20	PLOD1 (ENSSTOG00000009927) #21	MFN2 (ENSSTOG00000005705) #22	MIIP (ENSSTOG00000024734) #23	TNFRSF1B (ENSSTOG00000024605) #26	VPS13D (ENSSTOG00000005519) #27	DHRS3 (ENSSTOG00000016015) #28	AADACL4 (ENSSTOG00000019534) #30	AADACL3 (ENSSTOG00000007059) #31	CFAP107 (ENSSTOG00000009816) #32	LRRC38 (ENSSTOG00000023111) #34	PDPN (ENSSTOG00000032629) #35	PRDM2 (ENSSTOG00000019848) #36	ENSSTOG00000023112 #37	ENSSTOG00000030433 #37	TMEM51 (ENSSTOG00000020167)	FHAD1 (ENSSTOG00000023646)	EFHD2 (ENSSTOG00000025403)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	73	ANGPTL7 (ENSMMMG00000016833) #7	MTOR (ENSMMMG00000016791)	UBIAD1 (ENSMMMG00000016787) #8	DISP3 (ENSMMMG00000016764) #9	FBXO2 (ENSMMMG00000016755) #10	FBXO44 (ENSMMMG00000016734) #11	FBXO6 (ENSMMMG00000016731) #12	MAD2L2 (ENSMMMG00000016711) #13	DRAXIN (ENSMMMG00000016699) #14	AGTRAP (ENSMMMG00000016693) #15	MTHFR (ENSMMMG00000016671) #16	CLCN6 (ENSMMMG00000016637) #17	NPPA (ENSMMMG00000016626) #18	ENSMMMG00000016621 #19	PLOD1 (ENSMMMG00000016602) #21	MFN2 (ENSMMMG00000016567) #22	TNFRSF8 (ENSMMMG00000016534) #24	TNFRSF1B (ENSMMMG00000016525) #26	VPS13D (ENSMMMG00000016395) #27	DHRS3 (ENSMMMG00000016372) #28	AADACL4 (ENSMMMG00000016366) #30	AADACL3 (ENSMMMG00000016361) #31	CFAP107 (ENSMMMG00000016358) #32