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Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00950000183007.a.b.g.a.a ##37	ENSGT00950000183007.a.b.g.a.b.b #35	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509
Glires	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000183007.a.b.g.a.a ##37	ENSGT00950000183007.a.b.g.a.b.b #35	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509
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Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158124 #7	ENSGT00940000158245 #8	ENSGT00390000017923 #9	ENSGT00940000154451 #10	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000158124 #7	ENSGT00940000158245 #8	ENSGT00390000017923 #9	ENSGT00940000154451 #10	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000163610
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Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158124 #7	ENSGT00940000158245 #8	ENSGT00390000017923 #9	ENSGT00940000154451 #10	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00950000183007.a.b.g.b.d.a ##37	ENSGT00950000183007.a.b.g.a.b.b.i #35
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	21	Rapgef6 (ENSPEMG00000018231) #7	Cdc42se2 (ENSPEMG00000028684) #8	Lyrm7 (ENSPEMG00000015408) #9	Hint1 (ENSPEMG00000026673) #10	Gpx3 (ENSPEMG00000020568) #11	Tnip1 (ENSPEMG00000020685) #12	Anxa6 (ENSPEMG00000001728) #13	Ccdc69 (ENSPEMG00000020807) #14	Gm2a (ENSPEMG00000024547) #15	Slc36a3 (ENSPEMG00000014810) #16	Slc36a2 (ENSPEMG00000006570) #17	Slc36a1 (ENSPEMG00000027621) #18	Fat2 (ENSPEMG00000010255) #19	Sparc (ENSPEMG00000022374) #20	Atox1 (ENSPEMG00000015125) #21	G3bp1 (ENSPEMG00000020531) #22	Glra1 (ENSPEMG00000024408) #23	Nmur2 (ENSPEMG00000013761) #24	Gria1 (ENSPEMG00000020992) #25	Fam114a2 (ENSPEMG00000020352) #26	Mfap3 (ENSPEMG00000029755) #27	Galnt10 (ENSPEMG00000021112) #28	Sap30l (ENSPEMG00000029956) #29	Hand1 (ENSPEMG00000021867) #30	Larp1 (ENSPEMG00000022523) #31	Cnot8 (ENSPEMG00000021153) #32	Gemin5 (ENSPEMG00000014992) #33	Mrpl22 (ENSPEMG00000021188) #34	ENSPEMG00000028084 #35	ENSPEMG00000028532 #36	ENSPEMG00000028425 #37
Prairie vole	MODERN SPECIES	15	Rapgef6 (ENSMOCG00000002583) #7	Cdc42se2 (ENSMOCG00000019753) #8	ENSMOCG00000021969 #9	Hint1 (ENSMOCG00000015219) #10	Gpx3 (ENSMOCG00000012707) #11	Tnip1 (ENSMOCG00000019037) #12	Anxa6 (ENSMOCG00000022776) #13	Ccdc69 (ENSMOCG00000001057) #14	Gm2a (ENSMOCG00000021206) #15	Slc36a3 (ENSMOCG00000022181) #16	Slc36a2 (ENSMOCG00000019153) #17	Slc36a1 (ENSMOCG00000018359) #18	Fat2 (ENSMOCG00000004996) #19	Sparc (ENSMOCG00000014197) #20	Atox1 (ENSMOCG00000012051) #21	G3bp1 (ENSMOCG00000005709) #22	Glra1 (ENSMOCG00000022733) #23	Nmur2 (ENSMOCG00000020916) #24	Gria1 (ENSMOCG00000022383) #25	Fam114a2 (ENSMOCG00000003408) #26	Mfap3 (ENSMOCG00000022737) #27	Galnt10 (ENSMOCG00000022339) #28	Sap30l (ENSMOCG00000005889) #29	Hand1 (ENSMOCG00000012912) #30	Larp1 (ENSMOCG00000008920) #31	Gm12248 (ENSMOCG00000018783)	ENSMOCG00000002156 #32	Gemin5 (ENSMOCG00000018131) #33	Mrpl22 (ENSMOCG00000021016) #34	ENSMOCG00000014171 ##37	Irgm2 (ENSMOCG00000012064) #37
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158124 #7	ENSGT00940000158245 #8	ENSGT00390000017923 #9	ENSGT00940000154451 #10	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00950000183007.a.b.g.a.b.b.i #35	ENSGT00950000183007.a.b.g.b.d.a ##37
Chinese hamster chok1gshd	DUPLICATION
Chinese hamster chok1gshd	DUPLICATION
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Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	3	ENSCGRG00001010070	Mbnl2 (ENSCGRG00001015686)	Oxgr1 (ENSCGRG00001004650)	Hs6st3 (ENSCGRG00001019622)	Uggt2 (ENSCGRG00001016376)	Dnajc3 (ENSCGRG00001016665)	Dzip1 (ENSCGRG00001024642)	Cldn10 (ENSCGRG00001018980)	Abcc4 (ENSCGRG00001005625)	ENSCGRG00001022896	Sox21 (ENSCGRG00001001959)	Gpr180 (ENSCGRG00001013522)	Tgds (ENSCGRG00001000527)	Dct (ENSCGRG00001019389)	Gpc6 (ENSCGRG00001014308)	ENSCGRG00001022279 #22	Gpc5 (ENSCGRG00001012658)	ENSCGRG00001014085	ENSCGRG00001000596	Slitrk5 (ENSCGRG00001006071)	Slitrk6 (ENSCGRG00001002482)	Slitrk1 (ENSCGRG00001002013)	Trim52 (ENSCGRG00001002565)	ENSCGRG00001007508	Spry2 (ENSCGRG00001006571)	Ndfip2 (ENSCGRG00001023296)	Rbm26 (ENSCGRG00001018743)	Obi1 (ENSCGRG00001023032)	Pou4f1 (ENSCGRG00001018351)	ENSCGRG00001002516	Ednrb (ENSCGRG00001000051)
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Golden Hamster	MODERN SPECIES	627	Fnip1 (ENSMAUG00000008472)	Rapgef6 (ENSMAUG00000010508) #7	ENSMAUG00000015029	Lyrm7 (ENSMAUG00000015188) #9	Hint1 (ENSMAUG00000003917) #10	Gpx3 (ENSMAUG00000002070) #11	Tnip1 (ENSMAUG00000010278) #12	Anxa6 (ENSMAUG00000008199) #13	Gm2a (ENSMAUG00000007969) #15	Slc36a3 (ENSMAUG00000010340) #16	Slc36a2 (ENSMAUG00000012050) #17	Slc36a1 (ENSMAUG00000008064) #18	Fat2 (ENSMAUG00000001659) #19	Sparc (ENSMAUG00000015053) #20	Atox1 (ENSMAUG00000011916) #21	G3bp1 (ENSMAUG00000008655) #22	Glra1 (ENSMAUG00000001329) #23	ENSMAUG00000022058	Nmur2 (ENSMAUG00000001459) #24	Gria1 (ENSMAUG00000022238) #25	Fam114a2 (ENSMAUG00000003829) #26	Mfap3 (ENSMAUG00000022064) #27	Galnt10 (ENSMAUG00000022260) #28	Sap30l (ENSMAUG00000001548) #29	Hand1 (ENSMAUG00000022272) #30	Larp1 (ENSMAUG00000001385) #31	Gm12248 (ENSMAUG00000021997)	ENSMAUG00000022252 #32	Gemin5 (ENSMAUG00000005361) #33	Mrpl22 (ENSMAUG00000021980) #34	Igtp (ENSMAUG00000010911) ##37
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Mus_A	DUPLICATION
Mus_A	DUPLICATION
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158124 #7	ENSGT00940000158245 #8	ENSGT00390000017923 #9	ENSGT00940000154451 #10	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a.sb.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b.n #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00950000183007.a.b.g.b.d.a ##37
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	2	Rapgef6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016359) #7	Cdc42se2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016360) #8	Lyrm7 (MGP_CAROLIEiJ_G0016361) #9	Hint1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016362) #10	MGP_CAROLIEiJ_G0016363 #11	Tnip1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016364) #12	Anxa6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016365) #13	Ccdc69 (MGP_CAROLIEiJ_G0016366) #14	Gm2a (MGP_CAROLIEiJ_G0016367) #15	Slc36a3 (MGP_CAROLIEiJ_G0016368) #16	Slc36a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016369) #17	Slc36a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016370) #18	Fat2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016371) #19	Sparc (MGP_CAROLIEiJ_G0016372) #20	Atox1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016373) #21	G3bp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016374) #22	Glra1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016375) #23	Nmur2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016376) #24	Gria1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016377) #25	Fam114a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016378) #26	Mfap3 (MGP_CAROLIEiJ_G0016379) #27	Galnt10 (MGP_CAROLIEiJ_G0016380) #28	Sap30l (MGP_CAROLIEiJ_G0016381) #29	Hand1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016382) #30	Larp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016383) #31	Cnot8 (MGP_CAROLIEiJ_G0016384) #32	Gemin5 (MGP_CAROLIEiJ_G0016385) #33	Mrpl22 (MGP_CAROLIEiJ_G0016386) #34	MGP_CAROLIEiJ_G0016387	MGP_CAROLIEiJ_G0016388 #37	MGP_CAROLIEiJ_G0016389
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158124 #7	ENSGT00940000158245 #8	ENSGT00390000017923 #9	ENSGT00940000154451 #10	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a.sb.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b.n #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00950000183007.a.b.g.b.d.a ##37
Mouse	MODERN SPECIES	2	Rapgef6 (ENSMUSG00000037533) #7	Cdc42se2 (ENSMUSG00000052298) #8	Lyrm7 (ENSMUSG00000020268) #9	Hint1 (ENSMUSG00000020267) #10	Gpx3 (ENSMUSG00000018339) #11	Tnip1 (ENSMUSG00000020400) #12	Anxa6 (ENSMUSG00000018340) #13	Ccdc69 (ENSMUSG00000049588) #14	Gm2a (ENSMUSG00000000594) #15	Slc36a3 (ENSMUSG00000049491) #16	Slc36a2 (ENSMUSG00000020264) #17	Slc36a1 (ENSMUSG00000020261) #18	Fat2 (ENSMUSG00000055333) #19	Sparc (ENSMUSG00000018593) #20	Atox1 (ENSMUSG00000018585) #21	G3bp1 (ENSMUSG00000018583) #22	Glra1 (ENSMUSG00000000263) #23	Nmur2 (ENSMUSG00000037393) #24	Gria1 (ENSMUSG00000020524) #25	Fam114a2 (ENSMUSG00000020523) #26	Mfap3 (ENSMUSG00000020522) #27	Galnt10 (ENSMUSG00000020520) #28	Sap30l (ENSMUSG00000020519) #29	Hand1 (ENSMUSG00000037335) #30	Larp1 (ENSMUSG00000037331) #31	Gm12248 (ENSMUSG00000086962)	Cnot8 (ENSMUSG00000020515) #32	Gemin5 (ENSMUSG00000037275) #33	Mrpl22 (ENSMUSG00000020514) #34	Igtp (ENSMUSG00000078853) ##37	Irgm2 (ENSMUSG00000069874) #37
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158124 #7	ENSGT00940000158245 #8	ENSGT00390000017923 #9	ENSGT00940000154451 #10	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a.sb.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b.m #32	ENSGT00390000000080.a.b.n #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3255	Cdc42se2 (ENSMSIG00000008050) #8	ENSMSIG00000008083 #9	Hint1 (ENSMSIG00000008122) #10	Tnip1 (ENSMSIG00000008139) #12	Gpx3 (ENSMSIG00000008214) #11	Anxa6 (ENSMSIG00000008219) #13	ENSMSIG00000008354	Ccdc69 (ENSMSIG00000008369) #14	Gm2a (ENSMSIG00000008397) #15	Slc36a3 (ENSMSIG00000008419) #16	Slc36a2 (ENSMSIG00000008457) #17	Slc36a1 (ENSMSIG00000008490) #18	Fat2 (ENSMSIG00000008649) #19	ENSMSIG00000008765 #20	Atox1 (ENSMSIG00000008896) #21	G3bp1 (ENSMSIG00000008913) #22	Glra1 (ENSMSIG00000008952) #23	Nmur2 (ENSMSIG00000009215) #24
spretus	MODERN SPECIES	2	Rapgef6 (MGP_SPRETEiJ_G0017201) #7	Cdc42se2 (MGP_SPRETEiJ_G0017202) #8	Lyrm7 (MGP_SPRETEiJ_G0017203) #9	Hint1 (MGP_SPRETEiJ_G0017204) #10	MGP_SPRETEiJ_G0017205 #11	Tnip1 (MGP_SPRETEiJ_G0017206) #12	Anxa6 (MGP_SPRETEiJ_G0017207) #13	Ccdc69 (MGP_SPRETEiJ_G0017208) #14	Gm2a (MGP_SPRETEiJ_G0017209) #15	Slc36a3 (MGP_SPRETEiJ_G0017210) #16	Slc36a2 (MGP_SPRETEiJ_G0017211) #17	Slc36a1 (MGP_SPRETEiJ_G0017212) #18	Fat2 (MGP_SPRETEiJ_G0017213) #19	Sparc (MGP_SPRETEiJ_G0017214) #20	Atox1 (MGP_SPRETEiJ_G0017215) #21	G3bp1 (MGP_SPRETEiJ_G0017216) #22	Glra1 (MGP_SPRETEiJ_G0017217) #23	Nmur2 (MGP_SPRETEiJ_G0017218) #24	Gria1 (MGP_SPRETEiJ_G0017219) #25	Fam114a2 (MGP_SPRETEiJ_G0017220) #26	Mfap3 (MGP_SPRETEiJ_G0017221) #27	Galnt10 (MGP_SPRETEiJ_G0017222) #28	Sap30l (MGP_SPRETEiJ_G0017223) #29	Hand1 (MGP_SPRETEiJ_G0017224) #30	Larp1 (MGP_SPRETEiJ_G0017225) #31	Cnot8 (MGP_SPRETEiJ_G0017226) #32	Gemin5 (MGP_SPRETEiJ_G0017227) #33	Mrpl22 (MGP_SPRETEiJ_G0017228) #34	Igtp (MGP_SPRETEiJ_G0017229) ##37	Irgm2 (MGP_SPRETEiJ_G0017230) #37	MGP_SPRETEiJ_G0017231
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011365.a.sb.b #22
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011365.a.sb.b #22
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011365.a.sb.b #22
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3308													Ncald (ENSMSIG00000015269)	ENSMSIG00000015305	Grhl2 (ENSMSIG00000015315)	ENSMSIG00000015430 #22	ENSMSIG00000015453	ENSMSIG00000015497	Ywhaz (ENSMSIG00000015504)	ENSMSIG00000015546	ENSMSIG00000015548	Pabpc1 (ENSMSIG00000015570)	Snx31 (ENSMSIG00000015612)	ENSMSIG00000015663	Rnf19a (ENSMSIG00000015703)	Spag1 (ENSMSIG00000015763)	ENSMSIG00000015808	Fbxo43 (ENSMSIG00000015840)	Rgs22 (ENSMSIG00000015850)	ENSMSIG00000015927	Cox6c (ENSMSIG00000015963)
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011365.a.tb #22
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011365.a.tb #22
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011365.a.tb #22
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3164																ENSMSIG00000010609 #22	ENSMSIG00000010588
Rat	DUPLICATION
Rat	MODERN SPECIES	1	Rapgef6 (ENSRNOG00000009995) #7	Cdc42se2-ps1 (ENSRNOG00000042449) #8	Lyrm7 (ENSRNOG00000045961) #9	Tnip1 (ENSRNOG00000010370) #12	Anxa6 (ENSRNOG00000010668) #13	LOC100362400 (ENSRNOG00000064427)	Ybx1-ps20 (ENSRNOG00000032902)	Ccdc69 (ENSRNOG00000021370) #14	Gm2a (ENSRNOG00000052219) #15	Slc36a3 (ENSRNOG00000021310) #16	Slc36a2 (ENSRNOG00000011892) #17	Slc36a1 (ENSRNOG00000012356) #18	Fat2 (ENSRNOG00000012575) #19	Sparc (ENSRNOG00000012840) #20	Atox1 (ENSRNOG00000013118) #21	G3bp1 (ENSRNOG00000013186) #22	Glra1 (ENSRNOG00000013588) #23	RGD1563668 (ENSRNOG00000038478)	Nmur2 (ENSRNOG00000014081) #24	LOC102552619 (ENSRNOG00000027803)	LOC120095104 (ENSRNOG00000062939)	LOC102552882 (ENSRNOG00000038474)	ENSRNOG00000069020	Gria1 (ENSRNOG00000045816) #25	Fam114a2 (ENSRNOG00000002423) #26	Mfap3 (ENSRNOG00000002443) #27	Galnt10 (ENSRNOG00000002488) #28	Sap30l (ENSRNOG00000002575) #29	Hand1 (ENSRNOG00000002582) #30	Larp1 (ENSRNOG00000031544) #31	Atp5mk-ps2 (ENSRNOG00000042869)
Rat	MODERN SPECIES	14	LOC120102505 (ENSRNOG00000042804)	Grm7 (ENSRNOG00000005662)	Edem1 (ENSRNOG00000055365)	Arl8b (ENSRNOG00000055860)	Bhlhe40 (ENSRNOG00000007152)	AABR07061707.1 (ENSRNOG00000052718)	Itpr1 (ENSRNOG00000007104)	Sumf1 (ENSRNOG00000006813)	Setmar (ENSRNOG00000006806)	Lrrn1 (ENSRNOG00000006802)	Crbn (ENSRNOG00000006534)	Trnt1 (ENSRNOG00000006432)	Il5ra (ENSRNOG00000005954)	Cntn4 (ENSRNOG00000005652)	Cntn6 (ENSRNOG00000032517)	AABR07061614.1 (ENSRNOG00000032820) #22	ENSRNOG00000065903	Chl1 (ENSRNOG00000045771)	Cntn3 (ENSRNOG00000006144)	Pdzrn3 (ENSRNOG00000057556)	Ppp4r2 (ENSRNOG00000024647)	Gxylt2 (ENSRNOG00000005621)	Actg1-ps9 (ENSRNOG00000062691)	Shq1 (ENSRNOG00000005433)	LOC120102351 (ENSRNOG00000005353)	LOC120102174 (ENSRNOG00000033673)	Prok2 (ENSRNOG00000010898)	Ier3ip1-ps1 (ENSRNOG00000030004)	Gpr27 (ENSRNOG00000010880)	Eif4e3 (ENSRNOG00000010301)	Foxp1 (ENSRNOG00000009184)
Upper Galilee mountains blind mole rat	DUPLICATION
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1606		Cdc42se2 (ENSNGAG00000017742) #8	Lyrm7 (ENSNGAG00000022092) #9	Hint1 (ENSNGAG00000016071) #10	Gpx3 (ENSNGAG00000023218) #11	Tnip1 (ENSNGAG00000019234) #12	Anxa6 (ENSNGAG00000001390) #13	Ccdc69 (ENSNGAG00000004298) #14	Gm2a (ENSNGAG00000006698) #15	Slc36a3 (ENSNGAG00000000782) #16	Slc36a2 (ENSNGAG00000019725) #17	Slc36a1 (ENSNGAG00000018121) #18	Fat2 (ENSNGAG00000005998) #19	Sparc (ENSNGAG00000019526) #20	Atox1 (ENSNGAG00000019105) #21	G3bp1 (ENSNGAG00000010742) #22	Glra1 (ENSNGAG00000006117) #23
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1698												ENSNGAG00000023820	ENSNGAG00000022145	Olfm4 (ENSNGAG00000013517)	Pcdh8 (ENSNGAG00000000936)	ENSNGAG00000023431 #22	Cnmd (ENSNGAG00000022665)	Sugt1 (ENSNGAG00000021964)	Elf1 (ENSNGAG00000023108)	Wbp4 (ENSNGAG00000024369)	Kbtbd6 (ENSNGAG00000012119)	Kbtbd7 (ENSNGAG00000011545)	Mtrf1 (ENSNGAG00000014460)	Naa16 (ENSNGAG00000004140)	Rgcc (ENSNGAG00000022423)	Vwa8 (ENSNGAG00000010244)	Dgkh (ENSNGAG00000024075)	Akap11 (ENSNGAG00000010398)	Tnfsf11 (ENSNGAG00000023783)	ENSNGAG00000009242	Fam216b (ENSNGAG00000008030)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	133	Sec24a (ENSJJAG00000021996)	N4bp3 (ENSJJAG00000023037)	Rmnd5b (ENSJJAG00000017175)	Nhp2 (ENSJJAG00000016469)	Hnrnpab (ENSJJAG00000022240)	Phykpl (ENSJJAG00000014498)	Col23a1 (ENSJJAG00000020773)	Clk4 (ENSJJAG00000014522)	Zfp354a (ENSJJAG00000001494)	Prop1 (ENSJJAG00000018429)	Zfp354b (ENSJJAG00000018840)	Zfp2 (ENSJJAG00000005258)	Zfp454 (ENSJJAG00000005501)	Grm6 (ENSJJAG00000010828)	Zfp354c (ENSJJAG00000015911)	G3bp1 (ENSJJAG00000017035) #22	Glra1 (ENSJJAG00000010424) #23	ENSJJAG00000016616	Nmur2 (ENSJJAG00000006251) #24	Gria1 (ENSJJAG00000011336) #25	Fam114a2 (ENSJJAG00000018239) #26	Mfap3 (ENSJJAG00000011608) #27	Galnt10 (ENSJJAG00000011786) #28	Sap30l (ENSJJAG00000024095) #29	Hand1 (ENSJJAG00000023893) #30
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	495	ENSDORG00000012701 #7	Cdc42se2 (ENSDORG00000027349) #8	Lyrm7 (ENSDORG00000026901) #9	ENSDORG00000011944 #10	Gpx3 (ENSDORG00000028624) #11	Tnip1 (ENSDORG00000006740) #12	Anxa6 (ENSDORG00000016572) #13	ENSDORG00000016699 #14	Gm2a (ENSDORG00000012628) #15	Slc36a3 (ENSDORG00000012630) #16	Slc36a2 (ENSDORG00000012631) #17	Slc36a1 (ENSDORG00000012735) #18	Fat2 (ENSDORG00000023995) #19	Sparc (ENSDORG00000001562) #20	Atox1 (ENSDORG00000002944) #21	G3bp1 (ENSDORG00000025959) #22	Glra1 (ENSDORG00000012396) #23	Nmur2 (ENSDORG00000024711) #24
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000158124 #7	ENSGT00940000158245 #8	ENSGT00390000017923 #9	ENSGT00940000154451 #10	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000158124 #7	ENSGT00940000158245 #8	ENSGT00390000017923 #9	ENSGT00940000154451 #10	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d.a #24	ENSGT01100000263484.A.d.b #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000158245 #8	ENSGT00390000017923 #9	ENSGT00940000154451 #10	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00940000154772.bb	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d.a #24	ENSGT01100000263484.A.d.b #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	96									ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00940000154772.bb	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d.a #24	ENSGT01100000263484.A.d.b #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	57										SLC36A2 (ENSUPAG00010018020) #17	SLC36A1 (ENSUPAG00010018012) #18	FAT2 (ENSUPAG00010017980) #19	ENSUPAG00010017975	SPARC (ENSUPAG00010017938) #20	ENSUPAG00010017925 #21	G3BP1 (ENSUPAG00010017917) #22	GLRA1 (ENSUPAG00010017888) #23	ENSUPAG00010017877 #24	ENSUPAG00010017870 #24	GRIA1 (ENSUPAG00010017762) #25	FAM114A2 (ENSUPAG00010017716) #26	MFAP3 (ENSUPAG00010017713) #27	GALNT10 (ENSUPAG00010017696) #28	ENSUPAG00010017692	SAP30L (ENSUPAG00010017689) #29	HAND1 (ENSUPAG00010017683) #30	LARP1 (ENSUPAG00010017672) #31	FAXDC2 (ENSUPAG00010017661)	CNOT8 (ENSUPAG00010017652) #32	GEMIN5 (ENSUPAG00010017079) #33	MRPL22 (ENSUPAG00010017071) #34
Squirrel	DUPLICATION
Squirrel	MODERN SPECIES	115									SLC36A3 (ENSSTOG00000006878) #16	SLC36A2 (ENSSTOG00000006895) #17	SLC36A1 (ENSSTOG00000006917) #18	FAT2 (ENSSTOG00000019388) #19	ENSSTOG00000029374	SPARC (ENSSTOG00000007002) #20	ATOX1 (ENSSTOG00000029382) #21	G3BP1 (ENSSTOG00000015928) #22	GLRA1 (ENSSTOG00000015938) #23	ENSSTOG00000000400 #24	ENSSTOG00000020908 #24	GRIA1 (ENSSTOG00000008747) #25	FAM114A2 (ENSSTOG00000006924) #26	MFAP3 (ENSSTOG00000006964) #27	GALNT10 (ENSSTOG00000008893) #28	SAP30L (ENSSTOG00000020584) #29	HAND1 (ENSSTOG00000025850) #30	LARP1 (ENSSTOG00000005678) #31	FAXDC2 (ENSSTOG00000005732)	ENSSTOG00000005745 #32	GEMIN5 (ENSSTOG00000005759) #33	MRPL22 (ENSSTOG00000005822) #34	SGCD (ENSSTOG00000004356)
Squirrel	MODERN SPECIES	102	FUNDC1 (ENSSTOG00000025782)	EFHC2 (ENSSTOG00000014917)	NDP (ENSSTOG00000010960)	MAOB (ENSSTOG00000004985)	MAOA (ENSSTOG00000004958)	GPR82 (ENSSTOG00000028760)	GPR34 (ENSSTOG00000001566)	CASK (ENSSTOG00000005927)	NYX (ENSSTOG00000027262)	ENSSTOG00000029381	DDX3X (ENSSTOG00000008094)	USP9X (ENSSTOG00000000797)	MED14 (ENSSTOG00000022333)	CXorf38 (ENSSTOG00000005469)	MPC1L (ENSSTOG00000026402)	ENSSTOG00000031229 #22	ATP6AP2 (ENSSTOG00000005456)	BCOR (ENSSTOG00000003219)	MID1IP1 (ENSSTOG00000027194)	TSPAN7 (ENSSTOG00000012077)	ENSSTOG00000019432	OTC (ENSSTOG00000004056)	ENSSTOG00000022470	SRPX (ENSSTOG00000007767)	ENSSTOG00000023192	SYTL5 (ENSSTOG00000029210)	DYNLT3 (ENSSTOG00000028818)	CYBB (ENSSTOG00000019548)	XK (ENSSTOG00000021262)	LANCL3 (ENSSTOG00000012636)	ENSSTOG00000021050
Alpin marmot	DUPLICATION
Alpin marmot	DUPLICATION
Alpin marmot	MODERN SPECIES	31	CDC42SE2 (ENSMMMG00000014356) #8	LYRM7 (ENSMMMG00000014350) #9	HINT1 (ENSMMMG00000014343) #10	GPX3 (ENSMMMG00000014332) #11	TNIP1 (ENSMMMG00000014297) #12	ANXA6 (ENSMMMG00000014262) #13	CCDC69 (ENSMMMG00000014256) #14	GM2A (ENSMMMG00000014247) #15	SLC36A3 (ENSMMMG00000014222) #16	SLC36A2 (ENSMMMG00000014208) #17	SLC36A1 (ENSMMMG00000014187) #18	FAT2 (ENSMMMG00000014141) #19	ENSMMMG00000014108	SPARC (ENSMMMG00000014038) #20	ATOX1 (ENSMMMG00000014027) #21	ENSMMMG00000014015 #22	GLRA1 (ENSMMMG00000013990) #23	ENSMMMG00000013969 #24	ENSMMMG00000013957 #24	GRIA1 (ENSMMMG00000013882) #25	FAM114A2 (ENSMMMG00000013837) #26	MFAP3 (ENSMMMG00000013826) #27	GALNT10 (ENSMMMG00000013815) #28	SAP30L (ENSMMMG00000013804) #29	HAND1 (ENSMMMG00000013794) #30	LARP1 (ENSMMMG00000013777) #31	FAXDC2 (ENSMMMG00000013743)	CNOT8 (ENSMMMG00000013723) #32	GEMIN5 (ENSMMMG00000013554) #33	MRPL22 (ENSMMMG00000013526) #34	SGCD (ENSMMMG00000013502)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	6	BMP10 (ENSMMMG00000005486)	ENSMMMG00000005514	ARHGAP25 (ENSMMMG00000005520)	ENSMMMG00000005553	APLF (ENSMMMG00000005578)	FBXO48 (ENSMMMG00000005580)	PLEK (ENSMMMG00000005592)	CNRIP1 (ENSMMMG00000005618)	ENSMMMG00000005630	PPP3R1 (ENSMMMG00000005651)	PNO1 (ENSMMMG00000005661)	DNAAF10 (ENSMMMG00000005668)	C1D (ENSMMMG00000005685)	ETAA1 (ENSMMMG00000005704)	ENSMMMG00000005754	ENSMMMG00000005757 #22	MEIS1 (ENSMMMG00000005763)	ENSMMMG00000005870	ENSMMMG00000005873	SPRED2 (ENSMMMG00000005882)	ENSMMMG00000005906	ACTR2 (ENSMMMG00000005910)	RAB1A (ENSMMMG00000005929)	CEP68 (ENSMMMG00000005980)	SLC1A4 (ENSMMMG00000006026)	ENSMMMG00000006042	ENSMMMG00000006048	AFTPH (ENSMMMG00000006097)	LGALSL (ENSMMMG00000006152)	PELI1 (ENSMMMG00000006175)	VPS54 (ENSMMMG00000006188)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	21	ENSMMMG00000011611	EFHC2 (ENSMMMG00000011586)	NDP (ENSMMMG00000011581)	MAOB (ENSMMMG00000011245)	MAOA (ENSMMMG00000011225)	ENSMMMG00000011202	GPR82 (ENSMMMG00000011172)	GPR34 (ENSMMMG00000011165)	CASK (ENSMMMG00000010916)	ENSMMMG00000010906	ENSMMMG00000010902	DDX3X (ENSMMMG00000010865)	USP9X (ENSMMMG00000010802)	MED14 (ENSMMMG00000010703)	MPC1L (ENSMMMG00000010695)	ENSMMMG00000010690 #22	ATP6AP2 (ENSMMMG00000010656)	BCOR (ENSMMMG00000010519)	TSPAN7 (ENSMMMG00000010451)	ENSMMMG00000010431	OTC (ENSMMMG00000010392)	ENSMMMG00000010133	SRPX (ENSMMMG00000010108)	SYTL5 (ENSMMMG00000010054)	ENSMMMG00000010049	DYNLT3 (ENSMMMG00000010004)	ENSMMMG00000010001	ENSMMMG00000009990	XK (ENSMMMG00000009986)	ENSMMMG00000009942	ENSMMMG00000009939
Eurasian red squirrel	DUPLICATION
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Eurasian red squirrel	DUPLICATION
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Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	23	TCF7 (ENSHGLG00000047039)	ENSHGLG00000046526	PPP2CA (ENSHGLG00000049249)	ENSHGLG00000018175	UBE2B (ENSHGLG00000015894)	CDKN2AIPNL (ENSHGLG00000015833)	ENSHGLG00000043843	SAR1B (ENSHGLG00000047696)	ENSHGLG00000016500	ENSHGLG00000045552	ENSHGLG00000041388 #18	ENSHGLG00000015818 #19	SPARC (ENSHGLG00000016693) #20	ATOX1 (ENSHGLG00000015116) #21	ENSHGLG00000033423	G3BP1 (ENSHGLG00000014921) #22	GLRA1 (ENSHGLG00000016730) #23	ENSHGLG00000046430	NMUR2 (ENSHGLG00000016664) #24	ENSHGLG00000040393	ENSHGLG00000049292	GRIA1 (ENSHGLG00000008564) #25	FAM114A2 (ENSHGLG00000005817) #26	MFAP3 (ENSHGLG00000012228) #27	GALNT10 (ENSHGLG00000011151) #28	SAP30L (ENSHGLG00000040967) #29	HAND1 (ENSHGLG00000008657) #30	LARP1 (ENSHGLG00000006267) #31	ENSHGLG00000050510	ENSHGLG00000047467	ENSHGLG00000044881
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00940000161317	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000160154	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577.l #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509	ENSGT00940000161609
Guinea pig	MODERN SPECIES	81	TCF7 (ENSCPOG00000020029)	SKP1 (ENSCPOG00000005164)	PPP2CA (ENSCPOG00000039543)	ENSCPOG00000007474	UBE2B (ENSCPOG00000030926)	CDKN2AIPNL (ENSCPOG00000015544)	JADE2 (ENSCPOG00000008323)	SAR1B (ENSCPOG00000038655)	SEC24A (ENSCPOG00000014716)	ENSCPOG00000023450 ##37	ENSCPOG00000034856 ##37	SLC36A1 (ENSCPOG00000014430) #18	FAT2 (ENSCPOG00000014431) #19	SPARC (ENSCPOG00000025242) #20	ATOX1 (ENSCPOG00000034767) #21	G3BP1 (ENSCPOG00000006626) #22	GLRA1 (ENSCPOG00000013725) #23	ENSCPOG00000009931 #24	KCNA4 (ENSCPOG00000039821)	FSHB (ENSCPOG00000007723)	ARL14EP (ENSCPOG00000007727)	MPPED2 (ENSCPOG00000034992)	DNAJC24 (ENSCPOG00000005159)	IMMP1L (ENSCPOG00000020043)	ELP4 (ENSCPOG00000007237)	PAX6 (ENSCPOG00000007245)	RCN1 (ENSCPOG00000033869)	WT1 (ENSCPOG00000033316)	EIF3M (ENSCPOG00000003846)	ENSCPOG00000038368	ENSCPOG00000024691
Hystricomorpha_b	DUPLICATION
Hystricomorpha_b	DUPLICATION
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011365.a.cc.a #22
Degu	DUPLICATION
Degu	MODERN SPECIES	49	IL17RE (ENSODEG00000018313)	IL17RC (ENSODEG00000018144)	CRELD1 (ENSODEG00000018113)	PRRT3 (ENSODEG00000018225)	EMC3 (ENSODEG00000018222)	FANCD2 (ENSODEG00000018239)	FANCD2OS (ENSODEG00000020518)	BRK1 (ENSODEG00000018259)	VHL (ENSODEG00000018122)	IRAK2 (ENSODEG00000018213)	TATDN2 (ENSODEG00000018189)	GHRL (ENSODEG00000018237)	SEC13 (ENSODEG00000018136)	ATP2B2 (ENSODEG00000018205)	PNRC2 (ENSODEG00000018295)	ENSODEG00000018116 #22	COL6A5 (ENSODEG00000018227)	COL6A6 (ENSODEG00000018195)	PIK3R4 (ENSODEG00000018106)	ENSODEG00000018196	ATP2C1 (ENSODEG00000018139)	ASTE1 (ENSODEG00000018421)	NEK11 (ENSODEG00000018206)	ENSODEG00000018084	ENSODEG00000018115	ENSODEG00000018142	CPNE4 (ENSODEG00000018164)	ACP3 (ENSODEG00000018182)	DNAJC13 (ENSODEG00000018220)	ACKR4 (ENSODEG00000020509)	ACAD11 (ENSODEG00000018150)
Degu	MODERN SPECIES	186				ARMC3 (ENSODEG00000002341)	MSRB2 (ENSODEG00000002295)	PTF1A (ENSODEG00000002261)	OTUD1 (ENSODEG00000002122)	ENSODEG00000003530	KIAA1217 (ENSODEG00000003130)	ARHGAP21 (ENSODEG00000003667)	PRTFDC1 (ENSODEG00000003390)	ENSODEG00000003316	ENSODEG00000003305	ENSODEG00000003243	ENKUR (ENSODEG00000003177)	ENSODEG00000004103 #22	GPR158 (ENSODEG00000004004)	MYO3A (ENSODEG00000003447)	GAD2 (ENSODEG00000002488)	ENSODEG00000002425	ENSODEG00000002394	ENSODEG00000018879	ENSODEG00000002334	APBB1IP (ENSODEG00000002301)	PDSS1 (ENSODEG00000003307)	ABI1 (ENSODEG00000002843)	MASTL (ENSODEG00000002698)	YME1L1 (ENSODEG00000002663)	KLF6 (ENSODEG00000002443)	ENSODEG00000002426	ENSODEG00000002407
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	144	DDIT4 (ENSCLAG00000016774)	DNAJB12 (ENSCLAG00000015705)	MICU1 (ENSCLAG00000010346)	MCU (ENSCLAG00000010032)	OIT3 (ENSCLAG00000009749)	PLA2G12B (ENSCLAG00000014642)	P4HA1 (ENSCLAG00000017260)	NUDT13 (ENSCLAG00000014108)	ECD (ENSCLAG00000016794)	FAM149B1 (ENSCLAG00000010159)	DNAJC9 (ENSCLAG00000010943)	MRPS16 (ENSCLAG00000010443)	ENSCLAG00000009460	ENSCLAG00000011543	ENSCLAG00000011356	ENSCLAG00000012120 #22	PPP3CB (ENSCLAG00000016643)	USP54 (ENSCLAG00000010343)	MYOZ1 (ENSCLAG00000009444)	SYNPO2L (ENSCLAG00000011472)	ENSCLAG00000009991	FUT11 (ENSCLAG00000009545)	CHCHD1 (ENSCLAG00000012183)	ZSWIM8 (ENSCLAG00000011062)	NDST2 (ENSCLAG00000010841)	CAMK2G (ENSCLAG00000009687)	PLAU (ENSCLAG00000010993)	VCL (ENSCLAG00000009895)	AP3M1 (ENSCLAG00000010102)	ADK (ENSCLAG00000011462)	KAT6B (ENSCLAG00000012921)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000011365.a.cc.b #22
Degu	MODERN SPECIES	70	ENSODEG00000008982	ENSODEG00000019628	CDKL3 (ENSODEG00000009715)	UBE2B (ENSODEG00000009143)	ENSODEG00000008488	ENSODEG00000019739	JADE2 (ENSODEG00000009149)	SAR1B (ENSODEG00000009764)	SEC24A (ENSODEG00000008665)	ENSODEG00000019626	SLC36A1 (ENSODEG00000010341) #18	FAT2 (ENSODEG00000010366) #19	SPARC (ENSODEG00000009746) #20	ENSODEG00000009104 #21	ENSODEG00000019553	ENSODEG00000008869 #22	GLRA1 (ENSODEG00000009543) #23	NMUR2 (ENSODEG00000009849) #24	GRIA1 (ENSODEG00000009490) #25	ENSODEG00000009084 #26	MFAP3 (ENSODEG00000009031) #27	GALNT10 (ENSODEG00000008896) #28	SAP30L (ENSODEG00000008855) #29	HAND1 (ENSODEG00000009445) #30	LARP1 (ENSODEG00000010824) #31	FAXDC2 (ENSODEG00000009137)	ENSODEG00000009965 #32	GEMIN5 (ENSODEG00000009311) #33	ENSODEG00000009212	ENSODEG00000010239	SGCD (ENSODEG00000011784)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00940000161317	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000160154	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a.dc #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577.l #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509	ENSGT00940000161609
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	115	ENSCLAG00000011602	TCF7 (ENSCLAG00000015886)	ENSCLAG00000012399	PPP2CA (ENSCLAG00000015668)	CDKL3 (ENSCLAG00000013562)	UBE2B (ENSCLAG00000015390)	CDKN2AIPNL (ENSCLAG00000015651)	JADE2 (ENSCLAG00000014619)	ENSCLAG00000015791	SEC24A (ENSCLAG00000013518)	ENSCLAG00000017958 ##37	SLC36A1 (ENSCLAG00000013787) #18	FAT2 (ENSCLAG00000015326) #19	SPARC (ENSCLAG00000012628) #20	ATOX1 (ENSCLAG00000011704) #21	G3BP1 (ENSCLAG00000012636) #22	GLRA1 (ENSCLAG00000015181) #23	GRIA1 (ENSCLAG00000017069) #25	FAM114A2 (ENSCLAG00000013645) #26	MFAP3 (ENSCLAG00000014677) #27	GALNT10 (ENSCLAG00000013273) #28	SAP30L (ENSCLAG00000011128) #29	HAND1 (ENSCLAG00000011515) #30	LARP1 (ENSCLAG00000012755) #31	FAXDC2 (ENSCLAG00000011632)	CNOT8 (ENSCLAG00000012116) #32	GEMIN5 (ENSCLAG00000011942) #33	MRPL22 (ENSCLAG00000011777) #34	SGCD (ENSCLAG00000014749)	HAVCR2 (ENSCLAG00000016115)	MED7 (ENSCLAG00000016147)
Degu	DUPLICATION
Degu	MODERN SPECIES	42	DIMT1 (ENSODEG00000016626)	ENSODEG00000016524	IPO11 (ENSODEG00000017269)	ENSODEG00000020362	ENSODEG00000017157	ENSODEG00000020425	ENSODEG00000016461	HTR1A (ENSODEG00000020427)	ENSODEG00000016704	RGS7BP (ENSODEG00000016411)	SHISAL2B (ENSODEG00000016823)	SREK1IP1 (ENSODEG00000016833)	ENSODEG00000016422	ENSODEG00000017174	ADAMTS6 (ENSODEG00000016583)	ENSODEG00000016266 #22	ENSODEG00000016993	PPWD1 (ENSODEG00000016437)	TRIM23 (ENSODEG00000016997)	TRAPPC13 (ENSODEG00000016684)	ENSODEG00000017310	NLN (ENSODEG00000016710)	ERBIN (ENSODEG00000016275)	ENSODEG00000016218	SREK1 (ENSODEG00000016450)	ENSODEG00000016202	ENSODEG00000016250	CD180 (ENSODEG00000016416)	PIK3R1 (ENSODEG00000016166)	SLC30A5 (ENSODEG00000016100)	ENSODEG00000016101
Degu	MODERN SPECIES	167	ENSODEG00000010636	ZDHHC3 (ENSODEG00000011476)	EXOSC7 (ENSODEG00000011518)	CLEC3B (ENSODEG00000010796)	CDCP1 (ENSODEG00000011634)	LARS2 (ENSODEG00000009801)	ENSODEG00000020146	LIMD1 (ENSODEG00000010780)	SACM1L (ENSODEG00000011936)	ENSODEG00000012454	ENSODEG00000011510	LZTFL1 (ENSODEG00000012308)	CCR9 (ENSODEG00000012001)	ENSODEG00000011549	ENSODEG00000019807	ENSODEG00000011464 #22	LTF (ENSODEG00000010708)	ENSODEG00000011624	ENSODEG00000010788	LRRC2 (ENSODEG00000011758)	ENSODEG00000010965	FAM240A (ENSODEG00000012493)	ALS2CL (ENSODEG00000010499)	TMIE (ENSODEG00000012279)	PRSS50 (ENSODEG00000013184)	ENSODEG00000010624	ENSODEG00000011281	MYL3 (ENSODEG00000013412)	PTH1R (ENSODEG00000011074)	CCDC12 (ENSODEG00000012202)	ENSODEG00000011621
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000006954	ENSGT00950000183007.a.b.g.a.b.a ##37	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509	ENSGT00940000161609
Pika	MODERN SPECIES	6314																G3BP1 (ENSOPRG00000010562) #22
Rabbit	DUPLICATION
Rabbit	MODERN SPECIES	14	MYOZ3 (ENSOCUG00000013346)	RBM22 (ENSOCUG00000011532)	DCTN4 (ENSOCUG00000013510)	ENSOCUG00000024432 ##37	ENSOCUG00000028024 #37	ZNF300 (ENSOCUG00000037473)	ENSOCUG00000037867 #11	ANXA6 (ENSOCUG00000005379) #13	ENSOCUG00000015837 #15	SLC36A3 (ENSOCUG00000015841) #16	SLC36A2 (ENSOCUG00000015850) #17	SLC36A1 (ENSOCUG00000012093) #18	FAT2 (ENSOCUG00000012103) #19	ATOX1 (ENSOCUG00000038763) #21	SPARC (ENSOCUG00000012120) #20	ENSOCUG00000022143 #22	GLRA1 (ENSOCUG00000002648) #23	ENSOCUG00000029929	NMUR2 (ENSOCUG00000013507) #24	ENSOCUG00000024649	ENSOCUG00000031731	GRIA1 (ENSOCUG00000016780) #25	FAM114A2 (ENSOCUG00000016788) #26	MFAP3 (ENSOCUG00000027241) #27	ENSOCUG00000036053	GALNT10 (ENSOCUG00000011091) #28	SAP30L (ENSOCUG00000011095) #29	HAND1 (ENSOCUG00000011099) #30	LARP1 (ENSOCUG00000013066) #31	FAXDC2 (ENSOCUG00000013078)	CNOT8 (ENSOCUG00000027257) #32
Rabbit	DUPLICATION
Rabbit	DUPLICATION
Rabbit	DUPLICATION
Rabbit	MODERN SPECIES	1401	ENSOCUG00000013489	TCEAL9 (ENSOCUG00000003712)	ENSOCUG00000005663	ENSOCUG00000022702	ENSOCUG00000002210	TCEAL1 (ENSOCUG00000000553)	MORF4L2 (ENSOCUG00000014778)	ENSOCUG00000014781	PLP1 (ENSOCUG00000014800)	ENSOCUG00000027425	FAM133A (ENSOCUG00000010073)	NAP1L3 (ENSOCUG00000025516)	ENSOCUG00000039408	ENSOCUG00000003437	PABPC5 (ENSOCUG00000010919)	ENSOCUG00000031835 #22	ENSOCUG00000010894	ENSOCUG00000035263	ENSOCUG00000023356	ENSOCUG00000027741	ENSOCUG00000014194	ENSOCUG00000010616	ENSOCUG00000009298	ENSOCUG00000001978	ENSOCUG00000032103	ENSOCUG00000014565	ENSOCUG00000005772	ENSOCUG00000035409	ENSOCUG00000032789	ENSOCUG00000029146	ENSOCUG00000001826
Rabbit	MODERN SPECIES	464			ENSOCUG00000016676	ENSOCUG00000031590	MTM1 (ENSOCUG00000016688)	MTMR1 (ENSOCUG00000016698)	CD99L2 (ENSOCUG00000016710)	ENSOCUG00000005986	GPR50 (ENSOCUG00000005566)	ENSOCUG00000000669	VMA21 (ENSOCUG00000015201)	ENSOCUG00000035408	ENSOCUG00000029659	CNGA2 (ENSOCUG00000009436)	ENSOCUG00000016680	ENSOCUG00000029792 #22	GABRE (ENSOCUG00000009667)	GABRA3 (ENSOCUG00000008480)	ENSOCUG00000036442	GABRQ (ENSOCUG00000007888)	ENSOCUG00000024582	CETN2 (ENSOCUG00000007897)	NSDHL (ENSOCUG00000007899)
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Rabbit	MODERN SPECIES	14	TP53INP1 (ENSOCUG00000016241)	CCNE2 (ENSOCUG00000005398)	INTS8 (ENSOCUG00000005386)	DPY19L4 (ENSOCUG00000001317)	ESRP1 (ENSOCUG00000001316)	VIRMA (ENSOCUG00000016495)	RAD54B (ENSOCUG00000016478)	GEM (ENSOCUG00000001030)	CDH17 (ENSOCUG00000001029)	PDP1 (ENSOCUG00000003939)	TMEM67 (ENSOCUG00000010390)	RBM12B (ENSOCUG00000010353)	CIBAR1 (ENSOCUG00000010331)	ENSOCUG00000039147	TRIQK (ENSOCUG00000034527)	ENSOCUG00000022069 #22	RUNX1T1 (ENSOCUG00000003754)	ENSOCUG00000027627	SLC26A7 (ENSOCUG00000012527)	LRRC69 (ENSOCUG00000028994)	OTUD6B (ENSOCUG00000000218)	ENSOCUG00000000723	ENSOCUG00000030280	ENSOCUG00000023574	NECAB1 (ENSOCUG00000001277)	ENSOCUG00000006890	ENSOCUG00000021479	ENSOCUG00000006341	ENSOCUG00000006333	NBN (ENSOCUG00000009935)	OSGIN2 (ENSOCUG00000009931)
Tree shrew	MODERN SPECIES	3023																G3BP1 (ENSTBEG00000004386) #22	GLRA1 (ENSTBEG00000004976) #23
Primates	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00390000017153.b	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00910000147868	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00860000135878	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00910000147868	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509
Tarsier	DUPLICATION
Tarsier	MODERN SPECIES	2168														SPARC (ENSTSYG00000032004) #20	ENSTSYG00000006968 #21	G3BP1 (ENSTSYG00000004570) #22	GLRA1 (ENSTSYG00000004584) #23
Tarsier	MODERN SPECIES	3140																ENSTSYG00000030090 #22
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00860000135878	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00910000147868	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00390000010047.a.b.a.b	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000006631	ENSGT00950000182860.a.b.b	ENSGT00390000008033	ENSGT00940000157521.b	ENSGT00950000182883.b.a.a	ENSGT00940000155953	ENSGT00390000008527.k.a.d	ENSGT00390000002862	ENSGT00940000159262	ENSGT01050000244848.C.a	ENSGT01030000234618.F	ENSGT01050000244824.D.b	ENSGT00940000155324	ENSGT00940000160205	ENSGT00940000156095	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000158559	ENSGT00940000168614	ENSGT00390000006705	ENSGT00940000160383	ENSGT00940000155759	ENSGT00490000043417	ENSGT00910000147620	ENSGT00390000001170	ENSGT00910000147097	ENSGT00940000153470.a.a.a.a	ENSGT00530000063607.b	ENSGT00390000002215	ENSGT01030000235139	ENSGT01100000263518.A.a.b	ENSGT00390000005949
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000182860.a.b.b	ENSGT00390000008033	ENSGT00940000157521.b	ENSGT00950000182883.b.a.a	ENSGT00940000155953	ENSGT00390000002862	ENSGT00940000159262	ENSGT00940000163355	ENSGT00940000153434.a.b.a.b.l	ENSGT01050000244848.C.a	ENSGT01030000234618.F	ENSGT01050000244824.D.b	ENSGT00940000155324	ENSGT00940000160205	ENSGT00940000156095	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000158559	ENSGT00940000168614	ENSGT00390000006705	ENSGT00940000160383	ENSGT00940000155759	ENSGT00490000043417	ENSGT00390000001170	ENSGT00910000147097	ENSGT00940000153470.a.a.a.a	ENSGT00530000063607.b	ENSGT00390000002215	ENSGT01100000263518.A.a.b	ENSGT00390000005949	ENSGT00940000155065	ENSGT00940000154657.D
Gibbon	DUPLICATION
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Gibbon	MODERN SPECIES	11	ENSNLEG00000036335	SMIM3 (ENSNLEG00000018481)	ENSNLEG00000032698	ZNF300 (ENSNLEG00000010439)	GPX3 (ENSNLEG00000031591) #11	TNIP1 (ENSNLEG00000010529) #12	ANXA6 (ENSNLEG00000010757) #13	CCDC69 (ENSNLEG00000033034) #14	GM2A (ENSNLEG00000034956) #15	SLC36A3 (ENSNLEG00000010981) #16	SLC36A2 (ENSNLEG00000011003) #17	FAT2 (ENSNLEG00000011039) #19	SPARC (ENSNLEG00000016420) #20	ATOX1 (ENSNLEG00000016467) #21	ENSNLEG00000036070	G3BP1 (ENSNLEG00000027246) #22	ENSNLEG00000027671	GLRA1 (ENSNLEG00000016483) #23	NMUR2 (ENSNLEG00000016499) #24	GRIA1 (ENSNLEG00000016504) #25	FAM114A2 (ENSNLEG00000016540) #26	MFAP3 (ENSNLEG00000035100) #27	GALNT10 (ENSNLEG00000016565) #28	SAP30L (ENSNLEG00000016582) #29	HAND1 (ENSNLEG00000016584) #30	ENSNLEG00000031190	LARP1 (ENSNLEG00000016588) #31	FAXDC2 (ENSNLEG00000016609)	CNOT8 (ENSNLEG00000016626) #32	GEMIN5 (ENSNLEG00000016630) #33	MRPL22 (ENSNLEG00000029916) #34
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00910000147868	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00940000163712	ENSGT00910000148764	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000164190	ENSGT00940000158509
Orangutan	MODERN SPECIES	18	DCTN4 (ENSPPYG00000036615)	ZNF300 (ENSPPYG00000015957)	ENSPPYG00000030333	GPX3 (ENSPPYG00000015958) #11	ENSPPYG00000015959 #12	ANXA6 (ENSPPYG00000015960) #13	CCDC69 (ENSPPYG00000015961) #14	GM2A (ENSPPYG00000015962) #15	SLC36A3 (ENSPPYG00000015963) #16	SLC36A2 (ENSPPYG00000015964) #17	SLC36A1 (ENSPPYG00000015965) #18	FAT2 (ENSPPYG00000015966) #19	SPARC (ENSPPYG00000030691) #20	ENSPPYG00000034727 #21	ENSPPYG00000030979	G3BP1 (ENSPPYG00000015968) #22	GLRA1 (ENSPPYG00000015969) #23	NMUR2 (ENSPPYG00000031597) #24	GRIA1 (ENSPPYG00000015970) #25	FAM114A2 (ENSPPYG00000015971) #26	MFAP3 (ENSPPYG00000015972) #27	GALNT10 (ENSPPYG00000015973) #28	SAP30L (ENSPPYG00000015974) #29	HAND1 (ENSPPYG00000015975) #30	LARP1 (ENSPPYG00000036339) #31	FAXDC2 (ENSPPYG00000015976)	CNOT8 (ENSPPYG00000015977) #32	GEMIN5 (ENSPPYG00000015978) #33	MRPL22 (ENSPPYG00000015979) #34	KIF4B (ENSPPYG00000015980)	SGCD (ENSPPYG00000015981)
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Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00910000147868	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00940000163712	ENSGT00910000148764	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000164190	ENSGT00940000158509
Human	MODERN SPECIES	17	DCTN4 (ENSG00000132912)	SMIM3 (ENSG00000256235)	IRGM (ENSG00000237693) #37	ZNF300 (ENSG00000145908)	GPX3 (ENSG00000211445) #11	TNIP1 (ENSG00000145901) #12	ANXA6 (ENSG00000197043) #13	CCDC69 (ENSG00000198624) #14	GM2A (ENSG00000196743) #15	SLC36A3 (ENSG00000186334) #16	SLC36A2 (ENSG00000186335) #17	SLC36A1 (ENSG00000123643) #18	FAT2 (ENSG00000086570) #19	SPARC (ENSG00000113140) #20	ATOX1 (ENSG00000177556) #21	G3BP1 (ENSG00000145907) #22	GLRA1 (ENSG00000145888) #23	NMUR2 (ENSG00000132911) #24	GRIA1 (ENSG00000155511) #25	FAM114A2 (ENSG00000055147) #26	MFAP3 (ENSG00000037749) #27	GALNT10 (ENSG00000164574) #28	SAP30L (ENSG00000164576) #29	HAND1 (ENSG00000113196) #30	LARP1 (ENSG00000155506) #31	FAXDC2 (ENSG00000170271)	CNOT8 (ENSG00000155508) #32	GEMIN5 (ENSG00000082516) #33	MRPL22 (ENSG00000082515) #34	KIF4B (ENSG00000226650)	SGCD (ENSG00000170624)
Pan	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00910000147868	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00940000163712	ENSGT00910000148764	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509	ENSGT00390000004757.`b.b.b.d
Chimpanzee	DUPLICATION
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Bonobo	DUPLICATION
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Gorilla	DUPLICATION
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Gorilla	MODERN SPECIES	18	IRGM (ENSGGOG00000022924) #37	ZNF300 (ENSGGOG00000008304)	GPX3 (ENSGGOG00000000889) #11	TNIP1 (ENSGGOG00000000891) #12	ANXA6 (ENSGGOG00000005109) #13	CCDC69 (ENSGGOG00000006494) #14	GM2A (ENSGGOG00000015302) #15	SLC36A3 (ENSGGOG00000004915) #16	SLC36A2 (ENSGGOG00000038419) #17	SLC36A1 (ENSGGOG00000006356) #18	FAT2 (ENSGGOG00000006362) #19	SPARC (ENSGGOG00000016149) #20	ATOX1 (ENSGGOG00000008760) #21	ENSGGOG00000026958	ENSGGOG00000038918	G3BP1 (ENSGGOG00000022952) #22	GLRA1 (ENSGGOG00000014389) #23	NMUR2 (ENSGGOG00000006717) #24	GRIA1 (ENSGGOG00000014845) #25	ENSGGOG00000007198 #26	MFAP3 (ENSGGOG00000011060) #27	GALNT10 (ENSGGOG00000014438) #28	SAP30L (ENSGGOG00000004441) #29	HAND1 (ENSGGOG00000004311) #30	ENSGGOG00000043297	LARP1 (ENSGGOG00000006048) #31	FAXDC2 (ENSGGOG00000006063)	CNOT8 (ENSGGOG00000010459) #32	GEMIN5 (ENSGGOG00000010687) #33	MRPL22 (ENSGGOG00000042383) #34	ENSGGOG00000037690
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000182860.a.b.b	ENSGT00390000008033	ENSGT00940000157521.b	ENSGT00950000182883.b.a.a	ENSGT00940000155953	ENSGT00940000159262	ENSGT00940000163355	ENSGT00940000153434.a.b.b	ENSGT01050000244848.C.a	ENSGT01030000234618.F	ENSGT01050000244824.D.b	ENSGT00940000155324	ENSGT00940000160205	ENSGT00940000156095	ENSGT00940000162517.l #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000158559	ENSGT00390000006705	ENSGT00940000160383	ENSGT00940000155759	ENSGT00490000043417	ENSGT00390000001170	ENSGT00910000147620	ENSGT00910000147097	ENSGT00940000153470.a.a.a.a	ENSGT00390000011864.o.b	ENSGT00530000063607.b	ENSGT00390000002215	ENSGT01030000235139	ENSGT01100000263518.A.a.b	ENSGT00390000005949
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00390000009443	ENSGT00860000135878	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517.l #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00390000010047.a.b.a.b	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00730000111135.h	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34
Golden snub-nosed monkey	DUPLICATION
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Black snub-nosed monkey	DUPLICATION
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Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	531	SMIM3 (ENSRBIG00000016271)	ENSRBIG00000012227	IRGM (ENSRBIG00000042496) #37	ZNF300 (ENSRBIG00000044234)	GPX3 (ENSRBIG00000044997) #11	TNIP1 (ENSRBIG00000027176) #12	ANXA6 (ENSRBIG00000041548) #13	CCDC69 (ENSRBIG00000026946) #14	GM2A (ENSRBIG00000044207) #15	SLC36A3 (ENSRBIG00000030720) #16	SLC36A2 (ENSRBIG00000044519) #17	SLC36A1 (ENSRBIG00000039053) #18	FAT2 (ENSRBIG00000038121) #19	SPARC (ENSRBIG00000043589) #20	ATOX1 (ENSRBIG00000033555) #21	G3BP1 (ENSRBIG00000042268) #22	ENSRBIG00000033185	GLRA1 (ENSRBIG00000032053) #23	NMUR2 (ENSRBIG00000035659) #24	GRIA1 (ENSRBIG00000040984) #25	FAM114A2 (ENSRBIG00000040474) #26	MFAP3 (ENSRBIG00000037406) #27	GALNT10 (ENSRBIG00000042569) #28	SAP30L (ENSRBIG00000040566) #29	HAND1 (ENSRBIG00000030949) #30	ENSRBIG00000039741	LARP1 (ENSRBIG00000038005) #31	FAXDC2 (ENSRBIG00000026691)	CNOT8 (ENSRBIG00000036678) #32	GEMIN5 (ENSRBIG00000040382) #33	MRPL22 (ENSRBIG00000028736) #34
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000008033	ENSGT00940000157521.b	ENSGT00950000182883.b.a.a	ENSGT00940000155953	ENSGT00390000002862.i.a	ENSGT00940000159262	ENSGT00940000163355	ENSGT00940000153434.a.b.b	ENSGT01050000244848.C.a	ENSGT01030000234618.F	ENSGT01050000244824.D.b	ENSGT00940000155324	ENSGT00940000160205	ENSGT00940000156095	ENSGT00940000162517.l #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000158559	ENSGT00390000006705	ENSGT00940000160383	ENSGT00940000155759	ENSGT00490000043417	ENSGT00910000147620	ENSGT00390000001170	ENSGT00910000147097	ENSGT00940000153470.a.a.a.a	ENSGT00390000011864.o.b	ENSGT00530000063607.b	ENSGT00390000002215	ENSGT01030000235139	ENSGT01100000263518.A.a.b	ENSGT00390000005949
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	15	MYOZ3 (ENSCSAG00000011410)	ENSCSAG00000011379	ENSCSAG00000011322	SMIM3 (ENSCSAG00000019719)	ZNF300 (ENSCSAG00000011310)	TNIP1 (ENSCSAG00000011301) #12	ANXA6 (ENSCSAG00000011217) #13	CCDC69 (ENSCSAG00000010986) #14	GM2A (ENSCSAG00000010976) #15	SLC36A3 (ENSCSAG00000010946) #16	SLC36A2 (ENSCSAG00000010922) #17	SLC36A1 (ENSCSAG00000010911) #18	FAT2 (ENSCSAG00000010900) #19	SPARC (ENSCSAG00000010892) #20	ENSCSAG00000010885 #21	G3BP1 (ENSCSAG00000010876) #22	GLRA1 (ENSCSAG00000010864) #23	NMUR2 (ENSCSAG00000010855) #24	GRIA1 (ENSCSAG00000010848) #25	FAM114A2 (ENSCSAG00000010839) #26	MFAP3 (ENSCSAG00000010825) #27	GALNT10 (ENSCSAG00000010818) #28	SAP30L (ENSCSAG00000010808) #29	HAND1 (ENSCSAG00000010805) #30	LARP1 (ENSCSAG00000010800) #31	FAXDC2 (ENSCSAG00000010785)	CNOT8 (ENSCSAG00000010779) #32	GEMIN5 (ENSCSAG00000010767) #33	MRPL22 (ENSCSAG00000010752) #34	KIF4B (ENSCSAG00000019720)	SGCD (ENSCSAG00000010741)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00910000147617	ENSGT00390000015060.m.d	ENSGT00950000182883.b.a.a	ENSGT00940000155953	ENSGT00390000002862.i.a	ENSGT00940000159262	ENSGT00940000163355	ENSGT00940000153434.a.b.b	ENSGT01050000244848.C.a	ENSGT01030000234618.F	ENSGT01050000244824.D.b	ENSGT00940000155324	ENSGT00940000160205	ENSGT00940000156095	ENSGT00940000162517.l #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000158559	ENSGT00390000006705	ENSGT00940000160383	ENSGT00940000155759	ENSGT00490000043417	ENSGT00910000147620	ENSGT00390000001170	ENSGT00910000147097	ENSGT00940000153470.a.a.a.a	ENSGT00390000011864.o.b	ENSGT00530000063607.b	ENSGT00390000002215	ENSGT01030000235139	ENSGT01100000263518.A.a.b	ENSGT00390000005949
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517.k #21	ENSGT00910000148764	ENSGT00940000162517.l #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509	ENSGT00940000161609
Pig-tailed macaque	DUPLICATION
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	192	ENSMNEG00000007981	NXPH2 (ENSMNEG00000042710)	SPOPL (ENSMNEG00000039162)	ENSMNEG00000037114	ENSMNEG00000043854	ENSMNEG00000043214	ENSMNEG00000045373	THSD7B (ENSMNEG00000030691)	ENSMNEG00000028907	CXCR4 (ENSMNEG00000032574)	DARS1 (ENSMNEG00000028601)	MCM6 (ENSMNEG00000030267)	LCT (ENSMNEG00000041995)	UBXN4 (ENSMNEG00000009382)	R3HDM1 (ENSMNEG00000027793)	ENSMNEG00000042994 #22	ZRANB3 (ENSMNEG00000015978)	RAB3GAP1 (ENSMNEG00000031864)	MAP3K19 (ENSMNEG00000033333)	CCNT2 (ENSMNEG00000042821)	ACMSD (ENSMNEG00000028900)	TMEM163 (ENSMNEG00000032280)	MGAT5 (ENSMNEG00000035554)	ENSMNEG00000042204	NCKAP5 (ENSMNEG00000040558)	LYPD1 (ENSMNEG00000016693)	GPR39 (ENSMNEG00000038370)	SLC35F5 (ENSMNEG00000028365)	ACTR3 (ENSMNEG00000012040)	ENSMNEG00000018068	DPP10 (ENSMNEG00000034709)
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	383	SMIM3 (ENSMNEG00000009006)	ENSMNEG00000003762	IRGM (ENSMNEG00000035125) #37	ZNF300 (ENSMNEG00000037153)	GPX3 (ENSMNEG00000030683) #11	TNIP1 (ENSMNEG00000022961) #12	ANXA6 (ENSMNEG00000035257) #13	CCDC69 (ENSMNEG00000044666) #14	GM2A (ENSMNEG00000030396) #15	SLC36A3 (ENSMNEG00000029091) #16	SLC36A2 (ENSMNEG00000032236) #17	SLC36A1 (ENSMNEG00000029317) #18	FAT2 (ENSMNEG00000045400) #19	SPARC (ENSMNEG00000014038) #20	ATOX1 (ENSMNEG00000039738) #21	G3BP1 (ENSMNEG00000021253) #22	ENSMNEG00000003877	GLRA1 (ENSMNEG00000034655) #23	NMUR2 (ENSMNEG00000028673) #24
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000002792	ENSGT00390000006954	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00940000162517.k #21	ENSGT00910000148764	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT01100000263539.b.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT01100000263539.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.a.b.b
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	16	DCTN4 (ENSMFAG00000037111)	ZNF300 (ENSMFAG00000041051)	ENSMFAG00000061550 #11	TNIP1 (ENSMFAG00000030366) #12	ANXA6 (ENSMFAG00000037015) #13	CCDC69 (ENSMFAG00000029997) #14	GM2A (ENSMFAG00000032758) #15	ENSMFAG00000047173	SLC36A3 (ENSMFAG00000003733) #16	SLC36A2 (ENSMFAG00000046152) #17	SLC36A1 (ENSMFAG00000010715) #18	FAT2 (ENSMFAG00000039681) #19	SPARC (ENSMFAG00000038613) #20	ATOX1 (ENSMFAG00000050498) #21	ENSMFAG00000052929	G3BP1 (ENSMFAG00000036965) #22	GLRA1 (ENSMFAG00000033181) #23	ENSMFAG00000063206	NMUR2 (ENSMFAG00000043345) #24	GRIA1 (ENSMFAG00000043353) #25	FAM114A2 (ENSMFAG00000043590) #26	MFAP3 (ENSMFAG00000002609) #27	GALNT10 (ENSMFAG00000035971) #28	ENSMFAG00000059801 #29	HAND1 (ENSMFAG00000000456) #30	ENSMFAG00000064816	LARP1 (ENSMFAG00000031651) #31	ENSMFAG00000054032	FAXDC2 (ENSMFAG00000031322)	ENSMFAG00000062178	ENSMFAG00000027665
Rhesus	MODERN SPECIES	16	DCTN4 (ENSMMUG00000019764)	ENSMMUG00000057434	ZNF300 (ENSMMUG00000012696)	GPX3 (ENSMMUG00000042643) #11	TNIP1 (ENSMMUG00000021051) #12	ENSMMUG00000053139	ANXA6 (ENSMMUG00000021053) #13	CCDC69 (ENSMMUG00000050884) #14	GM2A (ENSMMUG00000022869) #15	SLC36A3 (ENSMMUG00000022870) #16	SLC36A2 (ENSMMUG00000005567) #17	SLC36A1 (ENSMMUG00000003499) #18	FAT2 (ENSMMUG00000003497) #19	SPARC (ENSMMUG00000053367) #20	ATOX1 (ENSMMUG00000054302) #21	G3BP1 (ENSMMUG00000014701) #22	GLRA1 (ENSMMUG00000014704) #23	ENSMMUG00000029761	ENSMMUG00000061338	NMUR2 (ENSMMUG00000013880) #24	GRIA1 (ENSMMUG00000009287) #25	FAM114A2 (ENSMMUG00000011988) #26	MFAP3 (ENSMMUG00000011989) #27	GALNT10 (ENSMMUG00000010615) #28	ENSMMUG00000063477	SAP30L (ENSMMUG00000056369) #29	HAND1 (ENSMMUG00000010621) #30	ENSMMUG00000057932	ENSMMUG00000045056	LARP1 (ENSMMUG00000009411) #31	ENSMMUG00000054082
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b.c.b #20	ENSGT00940000162517.k.b #21	ENSGT00510000046787.e.b.c.a #20	ENSGT00940000162517.l #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00390000010047.a.b.a.b	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT00390000010047.b.o	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33
Olive baboon	MODERN SPECIES	15	DCTN4 (ENSPANG00000020110)	ENSPANG00000048468	SMIM3 (ENSPANG00000029980)	ZNF300 (ENSPANG00000026071)	TNIP1 (ENSPANG00000010161) #12	GPX3 (ENSPANG00000034534) #11	ANXA6 (ENSPANG00000013721) #13	CCDC69 (ENSPANG00000016192) #14	GM2A (ENSPANG00000003592) #15	SLC36A3 (ENSPANG00000016764) #16	SLC36A2 (ENSPANG00000023734) #17	SLC36A1 (ENSPANG00000009511) #18	FAT2 (ENSPANG00000003561) #19	ENSPANG00000008874 #20	ENSPANG00000003198 #21	G3BP1 (ENSPANG00000017662) #22	GLRA1 (ENSPANG00000007038) #23	ENSPANG00000029435	NMUR2 (ENSPANG00000002471) #24	GRIA1 (ENSPANG00000017117) #25	ENSPANG00000047451	FAM114A2 (ENSPANG00000006589) #26	MFAP3 (ENSPANG00000047235) #27	ENSPANG00000017611	GALNT10 (ENSPANG00000013928) #28	SAP30L (ENSPANG00000005222) #29	HAND1 (ENSPANG00000046299) #30	ENSPANG00000047695	ENSPANG00000050331	LARP1 (ENSPANG00000008080) #31	FAXDC2 (ENSPANG00000002470)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	90	ENSGT00390000009443	ENSGT00860000135878	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b.c.a #20	ENSGT00940000162517.l #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00390000010047.a.b.a.b	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT00390000010047.b.o	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00910000147387	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32
Drill	DUPLICATION
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Sooty mangabey	DUPLICATION
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	156						ENSCATG00000021593	ENSCATG00000012682	ENSCATG00000011087	ENSCATG00000041113	CXCR4 (ENSCATG00000010566)	DARS1 (ENSCATG00000038494)	MCM6 (ENSCATG00000029528)	LCT (ENSCATG00000032713)	UBXN4 (ENSCATG00000008333)	R3HDM1 (ENSCATG00000023642)	ENSCATG00000039913 #22	ENSCATG00000029602	ZRANB3 (ENSCATG00000041950)	RAB3GAP1 (ENSCATG00000035248)	MAP3K19 (ENSCATG00000036468)	CCNT2 (ENSCATG00000026405)	ACMSD (ENSCATG00000034488)	ENSCATG00000024289	TMEM163 (ENSCATG00000038921)	ENSCATG00000037791	MGAT5 (ENSCATG00000033052)	ENSCATG00000038961	NCKAP5 (ENSCATG00000038828)	LYPD1 (ENSCATG00000035955)	GPR39 (ENSCATG00000041836)	SLC35F5 (ENSCATG00000033787)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	150	SMIM3 (ENSCATG00000017533)	ENSCATG00000041536	IRGM (ENSCATG00000041689) #37	ZNF300 (ENSCATG00000006978)	GPX3 (ENSCATG00000013573) #11	TNIP1 (ENSCATG00000042774) #12	ANXA6 (ENSCATG00000042117) #13	CCDC69 (ENSCATG00000040897) #14	GM2A (ENSCATG00000041023) #15	SLC36A3 (ENSCATG00000034422) #16	SLC36A2 (ENSCATG00000025179) #17	SLC36A1 (ENSCATG00000034672) #18	FAT2 (ENSCATG00000044962) #19	SPARC (ENSCATG00000031975) #20	ENSCATG00000041465	G3BP1 (ENSCATG00000018373) #22	GLRA1 (ENSCATG00000037389) #23	ENSCATG00000034503	NMUR2 (ENSCATG00000010286) #24	ENSCATG00000036023	GRIA1 (ENSCATG00000038910) #25	FAM114A2 (ENSCATG00000034701) #26	MFAP3 (ENSCATG00000045176) #27	GALNT10 (ENSCATG00000021578) #28	SAP30L (ENSCATG00000037026) #29	HAND1 (ENSCATG00000033921) #30	LARP1 (ENSCATG00000030675) #31	ENSCATG00000021010	FAXDC2 (ENSCATG00000027891)	CNOT8 (ENSCATG00000038091) #32	GEMIN5 (ENSCATG00000038574) #33
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00860000135878	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00910000147868	ENSGT00940000162517.j #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00390000010047.a.b.a.b	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34
Mas night monkey	DUPLICATION
Mas night monkey	MODERN SPECIES	966	ENSANAG00000028510	ZNF300 (ENSANAG00000029643)	GPX3 (ENSANAG00000033799) #11	TNIP1 (ENSANAG00000037058) #12	ANXA6 (ENSANAG00000033032) #13	CCDC69 (ENSANAG00000033186) #14	GM2A (ENSANAG00000034354) #15	SLC36A3 (ENSANAG00000032963) #16	SLC36A2 (ENSANAG00000021675) #17	SLC36A1 (ENSANAG00000032041) #18	FAT2 (ENSANAG00000036708) #19	ENSANAG00000012093	SPARC (ENSANAG00000021448) #20	ENSANAG00000035619	ATOX1 (ENSANAG00000035371) #21	ENSANAG00000022416 #22	ENSANAG00000036739	GLRA1 (ENSANAG00000023410) #23	NMUR2 (ENSANAG00000034858) #24	ENSANAG00000009431	ENSANAG00000011813	GRIA1 (ENSANAG00000029178) #25	FAM114A2 (ENSANAG00000027510) #26	MFAP3 (ENSANAG00000036628) #27	GALNT10 (ENSANAG00000033725) #28	SAP30L (ENSANAG00000032719) #29	HAND1 (ENSANAG00000031480) #30	ENSANAG00000031793	ENSANAG00000026082	ENSANAG00000027998	LARP1 (ENSANAG00000029949) #31
Mas night monkey	MODERN SPECIES	326														PMP22 (ENSANAG00000020946)	ENSANAG00000001461	ENSANAG00000035880 #22	ENSANAG00000027382	HS3ST3B1 (ENSANAG00000021778)	COX10 (ENSANAG00000028998)	HS3ST3A1 (ENSANAG00000026271)	ENSANAG00000035552	ELAC2 (ENSANAG00000036642)	ARHGAP44 (ENSANAG00000028017)	MYOCD (ENSANAG00000037357)	MAP2K4 (ENSANAG00000036533)	ZNF18 (ENSANAG00000025684)	ENSANAG00000020005	DNAH9 (ENSANAG00000033880)	ENSANAG00000020724	ENSANAG00000037536	TMEM220 (ENSANAG00000036133)
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000006954	ENSGT00390000009443	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00910000147868	ENSGT00940000162517.j #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509
Marmoset	DUPLICATION
Marmoset	MODERN SPECIES	11	ENSCJAG00000078025	GPX3 (ENSCJAG00000020924) #11	TNIP1 (ENSCJAG00000020905) #12	ANXA6 (ENSCJAG00000020887) #13	ENSCJAG00000070086	CCDC69 (ENSCJAG00000015512) #14	GM2A (ENSCJAG00000073480) #15	SLC36A3 (ENSCJAG00000015538) #16	SLC36A2 (ENSCJAG00000015624) #17	ENSCJAG00000076411	ENSCJAG00000048432	SLC36A1 (ENSCJAG00000015590) #18	FAT2 (ENSCJAG00000015562) #19	SPARC (ENSCJAG00000042722) #20	ATOX1 (ENSCJAG00000015505) #21	G3BP1 (ENSCJAG00000015407) #22	GLRA1 (ENSCJAG00000015379) #23	NMUR2 (ENSCJAG00000086451) #24	ENSCJAG00000077707	GRIA1 (ENSCJAG00000004624) #25	ENSCJAG00000039293	ENSCJAG00000044423	FAM114A2 (ENSCJAG00000004547) #26	MFAP3 (ENSCJAG00000056328) #27	ENSCJAG00000041761	GALNT10 (ENSCJAG00000004500) #28	SAP30L (ENSCJAG00000042193) #29	HAND1 (ENSCJAG00000078853) #30	CNOT8 (ENSCJAG00000007417) #32	ENSCJAG00000074999	LARP1 (ENSCJAG00000004454) #31
Marmoset	MODERN SPECIES	78	SMARCA1 (ENSCJAG00000002868)	ENSCJAG00000074249	ENSCJAG00000086881	ENSCJAG00000085274	ENSCJAG00000087225	PRR32 (ENSCJAG00000002938)	TEX13C (ENSCJAG00000040019)	TENM1 (ENSCJAG00000020589)	SH2D1A (ENSCJAG00000077252)	STAG2 (ENSCJAG00000020559)	XIAP (ENSCJAG00000020553)	ENSCJAG00000016157	GRIA3 (ENSCJAG00000016110)	ENSCJAG00000054890	ENSCJAG00000086896	ENSCJAG00000075024 #22	ENSCJAG00000056596	ENSCJAG00000078239	C1GALT1C1 (ENSCJAG00000002590)	MCTS1 (ENSCJAG00000002593)	CUL4B (ENSCJAG00000002596)	LAMP2 (ENSCJAG00000002638)	ATP1B4 (ENSCJAG00000014233)	TMEM255A (ENSCJAG00000085725)	ZBTB33 (ENSCJAG00000076101)	ENSCJAG00000083966	ENSCJAG00000004920	NKAP (ENSCJAG00000004941)	AKAP14 (ENSCJAG00000004955)	ENSCJAG00000077125	UPF3B (ENSCJAG00000004975)
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	135																ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00730000111241	ENSGT00390000000341	ENSGT00460000041594.e.a.a	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00910000147868	ENSGT00940000162517.j #21
Capuchin	MODERN SPECIES	126								ENSCCAG00000024070	ENSCCAG00000026554	ENSCCAG00000034732	SLC36A1 (ENSCCAG00000025920) #18	FAT2 (ENSCCAG00000032964) #19	SPARC (ENSCCAG00000032787) #20	ENSCCAG00000024371	ATOX1 (ENSCCAG00000028503) #21	G3BP1 (ENSCCAG00000028702) #22	GLRA1 (ENSCCAG00000036960) #23	NMUR2 (ENSCCAG00000033342) #24	GRIA1 (ENSCCAG00000037364) #25	MRM2 (ENSCCAG00000032721)	ENSCCAG00000020483	ENSCCAG00000034458	ENSCCAG00000016701	ENSCCAG00000025695	ENSCCAG00000023837	FAM114A2 (ENSCCAG00000007197) #26	MFAP3 (ENSCCAG00000032732) #27	GALNT10 (ENSCCAG00000032842) #28	SAP30L (ENSCCAG00000006073) #29	HAND1 (ENSCCAG00000036939) #30	ENSCCAG00000023634
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	103	TNIP1 (ENSSBOG00000034852) #12	ANXA6 (ENSSBOG00000026080) #13	CCDC69 (ENSSBOG00000021927) #14	ENSSBOG00000025174	GM2A (ENSSBOG00000013460) #15	SLC36A3 (ENSSBOG00000017155) #16	SLC36A2 (ENSSBOG00000036047) #17	ENSSBOG00000020482	NUDT1 (ENSSBOG00000033662)	ENSSBOG00000028038	SLC36A1 (ENSSBOG00000025643) #18	FAT2 (ENSSBOG00000022466) #19	SPARC (ENSSBOG00000030157) #20	ENSSBOG00000026315	ATOX1 (ENSSBOG00000017626) #21	G3BP1 (ENSSBOG00000029969) #22	GLRA1 (ENSSBOG00000030214) #23	NMUR2 (ENSSBOG00000030249) #24	GRIA1 (ENSSBOG00000035431) #25	ENSSBOG00000023653	ENSSBOG00000035630	FAM114A2 (ENSSBOG00000035995) #26	MFAP3 (ENSSBOG00000022464) #27	GALNT10 (ENSSBOG00000033607) #28	SAP30L (ENSSBOG00000019963) #29	HAND1 (ENSSBOG00000024034) #30	ENSSBOG00000025459	LARP1 (ENSSBOG00000019816) #31	FAXDC2 (ENSSBOG00000035971)	CNOT8 (ENSSBOG00000026293) #32	GEMIN5 (ENSSBOG00000020897) #33
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00390000017153.b	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00910000147868	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24	ENSGT00940000157342 #25	ENSGT00390000010054.a #26	ENSGT00390000011576.b #27	ENSGT00940000156690 #28	ENSGT00390000006633.a #29	ENSGT00940000161111 #30	ENSGT00940000159577 #31	ENSGT00950000183345	ENSGT00940000157328.C	ENSGT00390000000080.a.b #32	ENSGT00620000088064 #33	ENSGT00390000002110 #34	ENSGT00940000158509
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Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00860000135878	ENSGT00950000183007.a.b.g.b #37	ENSGT00940000162678	ENSGT00940000161754 #11	ENSGT00510000046908.a.a.a #12	ENSGT00940000158770 #13	ENSGT00950000183026.A.a.b #14	ENSGT00390000003288 #15	ENSGT00940000162406 #16	ENSGT00940000162044 #17	ENSGT00940000156583 #18	ENSGT00940000158507 #19	ENSGT00510000046787.e.b #20	ENSGT00910000147868	ENSGT00940000162517 #21	ENSGT00390000011365.a #22	ENSGT00940000159047 #23	ENSGT01100000263484.A.d #24
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Mouse lemur	DUPLICATION
Mouse lemur	DUPLICATION
Mouse lemur	MODERN SPECIES	1	RCL1 (ENSMICG00000015562)	JAK2 (ENSMICG00000003885)	INSL6 (ENSMICG00000044551)	ENSMICG00000043730	PLGRKT (ENSMICG00000031798)	CD274 (ENSMICG00000035171)	PDCD1LG2 (ENSMICG00000004284)	RIC1 (ENSMICG00000016293)	ENSMICG00000030745	ERMP1 (ENSMICG00000016329)	MLANA (ENSMICG00000048054)	KIAA2026 (ENSMICG00000032366)	ENSMICG00000026566	IL33 (ENSMICG00000009247)	ENSMICG00000035564	ENSMICG00000033153 #22	TPD52L3 (ENSMICG00000000600)	UHRF2 (ENSMICG00000036338)	GLDC (ENSMICG00000000602)	KDM4C (ENSMICG00000010464)	DMAC1 (ENSMICG00000035725)	ENSMICG00000035188	ENSMICG00000031481	PTPRD (ENSMICG00000006128)	FBP2 (ENSMICG00000001148)	ENSMICG00000014909	ENSMICG00000047245	ENSMICG00000035231	PRUNE2 (ENSMICG00000042329)	FOXB2 (ENSMICG00000032613)	VPS13A (ENSMICG00000003937)
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