Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487 #22 Vertebrata DUPLICATION Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.b #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 196 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000165890 ENSGT00390000010331 #23 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000017828 ENSGT00390000018225.A ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 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ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Pika MODERN SPECIES 3201 MAP2K1 (ENSOPRG00000007770) #22 SNAPC5 (ENSOPRG00000007781) #23 RPL4 (ENSOPRG00000007792) #24 ZWILCH (ENSOPRG00000007811) #25 LCTL (ENSOPRG00000007843) #26 Rabbit MODERN SPECIES 8 CLPX (ENSOCUG00000007293) CILP (ENSOCUG00000007302) PARP16 (ENSOCUG00000007306) IGDCC3 (ENSOCUG00000000310) IGDCC4 (ENSOCUG00000000312) DPP8 (ENSOCUG00000011751) HACD3 (ENSOCUG00000007513) INTS14 (ENSOCUG00000007520) ENSOCUG00000027844 DENND4A (ENSOCUG00000007953) RAB11A (ENSOCUG00000014755) MEGF11 (ENSOCUG00000014760) DIS3L (ENSOCUG00000002206) TIPIN (ENSOCUG00000002212) ENSOCUG00000023060 MAP2K1 (ENSOCUG00000008782) #22 SNAPC5 (ENSOCUG00000039231) #23 ENSOCUG00000008794 #24 ZWILCH (ENSOCUG00000008800) #25 LCTL (ENSOCUG00000021771) #26 ENSOCUG00000006134 ENSOCUG00000014186 SMAD3 (ENSOCUG00000029601) ENSOCUG00000039204 AAGAB (ENSOCUG00000006644) IQCH (ENSOCUG00000006647) MAP2K5 (ENSOCUG00000009024) PIAS1 (ENSOCUG00000000618) CLN6 (ENSOCUG00000017533) FEM1B (ENSOCUG00000026586) ITGA11 (ENSOCUG00000017726) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 20 Pdcd7 (ENSPEMG00000001830) Clpx (ENSPEMG00000021528) Cilp (ENSPEMG00000021273) Parp16 (ENSPEMG00000022071) Igdcc3 (ENSPEMG00000021097) Igdcc4 (ENSPEMG00000020857) Dpp8 (ENSPEMG00000024195) Hacd3 (ENSPEMG00000008076) Ints14 (ENSPEMG00000008550) Slc24a1 (ENSPEMG00000022814) Dennd4a (ENSPEMG00000022452) ENSPEMG00000021125 Megf11 (ENSPEMG00000017797) Dis3l (ENSPEMG00000001213) Tipin (ENSPEMG00000002370) Map2k1 (ENSPEMG00000007282) #22 Snapc5 (ENSPEMG00000007852) #23 Rpl4 (ENSPEMG00000012064) #24 Zwilch (ENSPEMG00000014485) #25 Lctl (ENSPEMG00000016229) #26 Smad6 (ENSPEMG00000017040) Smad3 (ENSPEMG00000028676) Aagab (ENSPEMG00000018465) ENSPEMG00000028831 Iqch (ENSPEMG00000005753) 2300009A05Rik (ENSPEMG00000009306) Map2k5 (ENSPEMG00000010361) Skor1 (ENSPEMG00000010499) Pias1 (ENSPEMG00000012119) Calml4 (ENSPEMG00000012833) Cln6 (ENSPEMG00000030484) Prairie vole MODERN SPECIES 13 Pdcd7 (ENSMOCG00000007159) Clpx (ENSMOCG00000011980) Cilp (ENSMOCG00000022194) Parp16 (ENSMOCG00000014635) Igdcc3 (ENSMOCG00000017628) Igdcc4 (ENSMOCG00000017733) Dpp8 (ENSMOCG00000018103) Hacd3 (ENSMOCG00000004995) Ints14 (ENSMOCG00000020364) Slc24a1 (ENSMOCG00000002968) Dennd4a (ENSMOCG00000008521) Rab11a (ENSMOCG00000021138) Megf11 (ENSMOCG00000003573) Dis3l (ENSMOCG00000005278) Tipin (ENSMOCG00000010343) Map2k1 (ENSMOCG00000013072) #22 Snapc5 (ENSMOCG00000015348) #23 ENSMOCG00000021901 #24 Zwilch (ENSMOCG00000017159) #25 Lctl (ENSMOCG00000004744) #26 Smad6 (ENSMOCG00000014458) Smad3 (ENSMOCG00000018490) Aagab (ENSMOCG00000021340) Iqch (ENSMOCG00000016873) 2300009A05Rik (ENSMOCG00000013991) Map2k5 (ENSMOCG00000022058) Skor1 (ENSMOCG00000018261) ENSMOCG00000019235 Pias1 (ENSMOCG00000022074) Calml4 (ENSMOCG00000018493) Cln6 (ENSMOCG00000021992) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145.kb #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Golden Hamster MODERN SPECIES 672 Clpx (ENSMAUG00000018798) ENSMAUG00000009833 Cilp (ENSMAUG00000019346) Parp16 (ENSMAUG00000014432) Igdcc3 (ENSMAUG00000019761) Igdcc4 (ENSMAUG00000021589) Dpp8 (ENSMAUG00000020059) Hacd3 (ENSMAUG00000004278) Ints14 (ENSMAUG00000020937) Slc24a1 (ENSMAUG00000012813) Dennd4a (ENSMAUG00000018527) Rab11a (ENSMAUG00000018551) Megf11 (ENSMAUG00000003129) Dis3l (ENSMAUG00000008265) Tipin (ENSMAUG00000012421) Map2k1 (ENSMAUG00000011379) #22 Snapc5 (ENSMAUG00000008645) #23 Rpl4 (ENSMAUG00000018867) #24 Zwilch (ENSMAUG00000021210) #25 Lctl (ENSMAUG00000009957) #26 Smad6 (ENSMAUG00000009859) Smad3 (ENSMAUG00000022258) Aagab (ENSMAUG00000005383) Iqch (ENSMAUG00000004333) Map2k5 (ENSMAUG00000015370) Skor1 (ENSMAUG00000020780) Pias1 (ENSMAUG00000000785) Calml4 (ENSMAUG00000015006) Cln6 (ENSMAUG00000009546) Itga11 (ENSMAUG00000002222) Coro2b (ENSMAUG00000009618) Murinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Mus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000154925.c.a ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859.e.b ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Mouse MODERN SPECIES 18 Clpx (ENSMUSG00000015357) Cilp (ENSMUSG00000042254) Parp16 (ENSMUSG00000032392) Igdcc3 (ENSMUSG00000032394) Igdcc4 (ENSMUSG00000032816) Dpp8 (ENSMUSG00000032393) Hacd3 (ENSMUSG00000033629) Ints14 (ENSMUSG00000034263) Slc24a1 (ENSMUSG00000034452) Dennd4a (ENSMUSG00000053641) Rab11a (ENSMUSG00000004771) Megf11 (ENSMUSG00000036466) Dis3l (ENSMUSG00000032396) Tipin (ENSMUSG00000032397) Uchl4 (ENSMUSG00000035337) Map2k1 (ENSMUSG00000004936) #22 Snapc5 (ENSMUSG00000032398) #23 Rpl4 (ENSMUSG00000032399) #24 Zwilch (ENSMUSG00000032400) #25 Lctl 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ENSGT00940000157859.e.b ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Steppe mouse MODERN SPECIES 3365 Clpx (ENSMSIG00000005427) Cilp (ENSMSIG00000005391) Parp16 (ENSMSIG00000005362) Igdcc3 (ENSMSIG00000005288) Igdcc4 (ENSMSIG00000005197) Dpp8 (ENSMSIG00000005153) Hacd3 (ENSMSIG00000005101) Ints14 (ENSMSIG00000005077) Slc24a1 (ENSMSIG00000005039) Dennd4a (ENSMSIG00000004975) Rab11a (ENSMSIG00000004938) Megf11 (ENSMSIG00000004481) Dis3l (ENSMSIG00000004353) Tipin (ENSMSIG00000004296) Uchl4 (ENSMSIG00000004289) Map2k1 (ENSMSIG00000004246) #22 Snapc5 (ENSMSIG00000004231) #23 Rpl4 (ENSMSIG00000004124) #24 Zwilch (ENSMSIG00000003872) #25 Lctl (ENSMSIG00000003776) #26 ENSMSIG00000003769 ENSMSIG00000003749 Smad6 (ENSMSIG00000003718) ENSMSIG00000003710 Smad3 (ENSMSIG00000003679) Aagab (ENSMSIG00000003642) ENSMSIG00000003630 Iqch (ENSMSIG00000002651) 2300009A05Rik (ENSMSIG00000002599) Map2k5 (ENSMSIG00000002321) Skor1 (ENSMSIG00000002179) spretus MODERN SPECIES 18 Clpx (MGP_SPRETEiJ_G0033495) Cilp (MGP_SPRETEiJ_G0033494) Parp16 (MGP_SPRETEiJ_G0033493) Igdcc3 (MGP_SPRETEiJ_G0033492) Igdcc4 (MGP_SPRETEiJ_G0033491) Dpp8 (MGP_SPRETEiJ_G0033490) Hacd3 (MGP_SPRETEiJ_G0033489) Ints14 (MGP_SPRETEiJ_G0033488) Slc24a1 (MGP_SPRETEiJ_G0033487) Dennd4a (MGP_SPRETEiJ_G0033486) Rab11a (MGP_SPRETEiJ_G0033485) Megf11 (MGP_SPRETEiJ_G0033484) Dis3l (MGP_SPRETEiJ_G0033483) Tipin (MGP_SPRETEiJ_G0033482) MGP_SPRETEiJ_G0033481 Map2k1 (MGP_SPRETEiJ_G0033480) #22 Snapc5 (MGP_SPRETEiJ_G0033479) #23 Rpl4 (MGP_SPRETEiJ_G0033478) #24 Zwilch (MGP_SPRETEiJ_G0033477) #25 Lctl (MGP_SPRETEiJ_G0033476) #26 Smad6 (MGP_SPRETEiJ_G0033475) Smad3 (MGP_SPRETEiJ_G0033474) Aagab (MGP_SPRETEiJ_G0033473) Iqch (MGP_SPRETEiJ_G0033472) 2300009A05Rik (MGP_SPRETEiJ_G0033471) Map2k5 (MGP_SPRETEiJ_G0033470) Skor1 (MGP_SPRETEiJ_G0033469) Pias1 (MGP_SPRETEiJ_G0033468) Calml4 (MGP_SPRETEiJ_G0033467) MGP_SPRETEiJ_G0033466 Cln6 (MGP_SPRETEiJ_G0033465) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 18 Clpx (MGP_CAROLIEiJ_G0032356) MGP_CAROLIEiJ_G0032355 Parp16 (MGP_CAROLIEiJ_G0032354) Igdcc3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032353) Igdcc4 (MGP_CAROLIEiJ_G0032352) Dpp8 (MGP_CAROLIEiJ_G0032351) Hacd3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032350) Ints14 (MGP_CAROLIEiJ_G0032349) Slc24a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032348) Dennd4a (MGP_CAROLIEiJ_G0032347) Rab11a (MGP_CAROLIEiJ_G0032346) Megf11 (MGP_CAROLIEiJ_G0032345) Dis3l (MGP_CAROLIEiJ_G0032344) Tipin (MGP_CAROLIEiJ_G0032343) MGP_CAROLIEiJ_G0032342 Map2k1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032341) #22 Snapc5 (MGP_CAROLIEiJ_G0032340) #23 Rpl4 (MGP_CAROLIEiJ_G0032339) #24 Zwilch (MGP_CAROLIEiJ_G0032338) #25 Lctl (MGP_CAROLIEiJ_G0032337) #26 Smad6 (MGP_CAROLIEiJ_G0032336) Smad3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032335) Aagab (MGP_CAROLIEiJ_G0032334) Iqch (MGP_CAROLIEiJ_G0032333) 2300009A05Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0032332) Map2k5 (MGP_CAROLIEiJ_G0032331) Skor1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032330) Pias1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032329) Calml4 (MGP_CAROLIEiJ_G0032328) Cln6 (MGP_CAROLIEiJ_G0032327) Fem1b (MGP_CAROLIEiJ_G0032326) Shrew mouse MODERN SPECIES 1 Pdcd7 (MGP_PahariEiJ_G0015222) Clpx 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SNAPC5 (ENSSVLG00005024729) #23 ENSSVLG00005024744 #24 ZWILCH (ENSSVLG00005024833) #25 LCTL (ENSSVLG00005024912) #26 SMAD6 (ENSSVLG00005024946) ENSSVLG00005024968 SMAD3 (ENSSVLG00005024991) AAGAB (ENSSVLG00005025018) IQCH (ENSSVLG00005025085) C15orf61 (ENSSVLG00005006592) MAP2K5 (ENSSVLG00005006656) SKOR1 (ENSSVLG00005006917) PIAS1 (ENSSVLG00005007019) CALML4 (ENSSVLG00005007109) CLN6 (ENSSVLG00005007215) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145.vb #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145.vb #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Guinea pig MODERN SPECIES 101 MINDY2 (ENSCPOG00000002287) CLPX (ENSCPOG00000003391) CILP (ENSCPOG00000036223) PARP16 (ENSCPOG00000025232) IGDCC3 (ENSCPOG00000006751) IGDCC4 (ENSCPOG00000004519) DPP8 (ENSCPOG00000014124) HACD3 (ENSCPOG00000013593) INTS14 (ENSCPOG00000000764) SLC24A1 (ENSCPOG00000013596) DENND4A (ENSCPOG00000013602) RAB11A (ENSCPOG00000037599) MEGF11 (ENSCPOG00000006468) DIS3L (ENSCPOG00000000250) TIPIN (ENSCPOG00000000251) MAP2K1 (ENSCPOG00000003053) #22 RPL4 (ENSCPOG00000003055) #24 ZWILCH (ENSCPOG00000001241) #25 LCTL (ENSCPOG00000001245) #26 ENSCPOG00000026722 ENSCPOG00000003533 ENSCPOG00000013176 ENSCPOG00000015403 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145.vb #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 157 PDCD7 (ENSCLAG00000007922) CLPX (ENSCLAG00000016601) CILP (ENSCLAG00000014495) PARP16 (ENSCLAG00000012092) IGDCC3 (ENSCLAG00000010244) IGDCC4 (ENSCLAG00000007751) DPP8 (ENSCLAG00000014937) HACD3 (ENSCLAG00000010725) INTS14 (ENSCLAG00000009395) SLC24A1 (ENSCLAG00000013073) DENND4A (ENSCLAG00000007003) RAB11A (ENSCLAG00000007435) MEGF11 (ENSCLAG00000013146) DIS3L (ENSCLAG00000005741) TIPIN (ENSCLAG00000004924) MAP2K1 (ENSCLAG00000013042) #22 SNAPC5 (ENSCLAG00000011660) #23 RPL4 (ENSCLAG00000010827) #24 ZWILCH (ENSCLAG00000010124) #25 LCTL (ENSCLAG00000004564) #26 ENSCLAG00000005550 SMAD3 (ENSCLAG00000005027) AAGAB (ENSCLAG00000008364) IQCH (ENSCLAG00000011031) C15orf61 (ENSCLAG00000008894) MAP2K5 (ENSCLAG00000005277) SKOR1 (ENSCLAG00000007488) PIAS1 (ENSCLAG00000008129) CALML4 (ENSCLAG00000008707) CLN6 (ENSCLAG00000007035) FEM1B (ENSCLAG00000004834) Degu MODERN SPECIES 67 CLPX (ENSODEG00000016361) CILP (ENSODEG00000016085) ENSODEG00000020368 PARP16 (ENSODEG00000016601) IGDCC3 (ENSODEG00000016285) IGDCC4 (ENSODEG00000016455) DPP8 (ENSODEG00000016356) HACD3 (ENSODEG00000016975) INTS14 (ENSODEG00000017006) SLC24A1 (ENSODEG00000016047) ENSODEG00000016544 ENSODEG00000016435 ENSODEG00000016878 MEGF11 (ENSODEG00000015967) DIS3L (ENSODEG00000015811) MAP2K1 (ENSODEG00000016739) #22 ENSODEG00000016495 #24 ZWILCH (ENSODEG00000016374) #25 LCTL (ENSODEG00000016271) #26 ENSODEG00000020317 SMAD6 (ENSODEG00000016272) SMAD3 (ENSODEG00000015739) ENSODEG00000015886 ENSODEG00000020336 IQCH (ENSODEG00000016134) C15orf61 (ENSODEG00000016721) ENSODEG00000016511 MAP2K5 (ENSODEG00000015607) SKOR1 (ENSODEG00000015903) PIAS1 (ENSODEG00000016418) CALML4 (ENSODEG00000015441) Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 19 CILP (ENSHGLG00000011932) PARP16 (ENSHGLG00000010657) IGDCC3 (ENSHGLG00000006674) IGDCC4 (ENSHGLG00000017462) DPP8 (ENSHGLG00000014997) HACD3 (ENSHGLG00000011870) INTS14 (ENSHGLG00000010722) SLC24A1 (ENSHGLG00000008872) DENND4A (ENSHGLG00000009810) ENSHGLG00000044288 RAB11A (ENSHGLG00000048551) MEGF11 (ENSHGLG00000011012) ENSHGLG00000007770 ENSHGLG00000005971 ENSHGLG00000048822 ENSHGLG00000010036 #22 ENSHGLG00000040904 #23 ENSHGLG00000008054 #24 ZWILCH (ENSHGLG00000016059) #25 LCTL (ENSHGLG00000015669) #26 SMAD6 (ENSHGLG00000008453) SMAD3 (ENSHGLG00000048787) AAGAB (ENSHGLG00000038898) ENSHGLG00000026352 C15orf61 (ENSHGLG00000038870) MAP2K5 (ENSHGLG00000006627) SKOR1 (ENSHGLG00000017297) Pias1 (ENSHGLG00000019002) Calml4 (ENSHGLG00000018794) CLN6 (ENSHGLG00000017958) FEM1B (ENSHGLG00000017948) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 17 WNK2 (ENSHGLG00000006602) ENSHGLG00000011629 NINJ1 (ENSHGLG00000046840) CARD19 (ENSHGLG00000036319) SUSD3 (ENSHGLG00000017913) FGD3 (ENSHGLG00000017946) ENSHGLG00000033729 ENSHGLG00000036816 ENSHGLG00000040445 ENSHGLG00000046071 ECM2 (ENSHGLG00000008935) ASPN (ENSHGLG00000010675) ENSHGLG00000011071 ENSHGLG00000006659 ENSHGLG00000047003 ENSHGLG00000046096 #22 ENSHGLG00000038940 ENSHGLG00000009033 ENSHGLG00000007231 SPIN1 (ENSHGLG00000045201) NXNL2 (ENSHGLG00000039721) ENSHGLG00000032550 SHC3 (ENSHGLG00000009124) CKS2 (ENSHGLG00000008721) ENSHGLG00000014380 ENSHGLG00000008542 SEMA4D (ENSHGLG00000007257) ENSHGLG00000006188 ENSHGLG00000004421 ENSHGLG00000012020 ENSHGLG00000036048 Tree shrew MODERN SPECIES 3607 MAP2K1 (ENSTBEG00000014266) #22 ENSTBEG00000014333 #23 RPL4 (ENSTBEG00000014392) #24 ZWILCH (ENSTBEG00000014432) #25 ENSTBEG00000014522 #26 Primates ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B 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ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145.cb.a #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a 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ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b Chimpanzee MODERN SPECIES 6 CLPX (ENSPTRG00000007176) CILP (ENSPTRG00000007177) PARP16 (ENSPTRG00000007178) IGDCC3 (ENSPTRG00000007179) IGDCC4 (ENSPTRG00000007180) DPP8 (ENSPTRG00000007182) HACD3 (ENSPTRG00000007183) INTS14 (ENSPTRG00000007184) SLC24A1 (ENSPTRG00000007185) DENND4A (ENSPTRG00000007186) RAB11A (ENSPTRG00000044358) MEGF11 (ENSPTRG00000007189) DIS3L (ENSPTRG00000007191) TIPIN (ENSPTRG00000007192) ENSPTRG00000051889 MAP2K1 (ENSPTRG00000007193) #22 ENSPTRG00000049603 SNAPC5 (ENSPTRG00000007194) #23 RPL4 (ENSPTRG00000007195) #24 ZWILCH (ENSPTRG00000007196) #25 LCTL (ENSPTRG00000007197) #26 SMAD6 (ENSPTRG00000007198) ENSPTRG00000044014 ENSPTRG00000047146 SMAD3 (ENSPTRG00000007199) AAGAB (ENSPTRG00000007202) IQCH (ENSPTRG00000007205) C15H15orf61 (ENSPTRG00000030250) MAP2K5 (ENSPTRG00000007207) ENSPTRG00000048990 SKOR1 (ENSPTRG00000007209) Bonobo MODERN SPECIES 6 CILP (ENSPPAG00000042751) PARP16 (ENSPPAG00000030232) IGDCC3 (ENSPPAG00000042057) IGDCC4 (ENSPPAG00000036548) DPP8 (ENSPPAG00000032419) HACD3 (ENSPPAG00000014660) INTS14 (ENSPPAG00000030391) SLC24A1 (ENSPPAG00000042941) DENND4A (ENSPPAG00000022752) RAB11A (ENSPPAG00000030195) MEGF11 (ENSPPAG00000043580) DIS3L (ENSPPAG00000019888) TIPIN (ENSPPAG00000033427) ENSPPAG00000041842 ENSPPAG00000038145 MAP2K1 (ENSPPAG00000028577) #22 ENSPPAG00000033063 SNAPC5 (ENSPPAG00000041196) #23 ENSPPAG00000035309 #24 ZWILCH (ENSPPAG00000033861) #25 LCTL (ENSPPAG00000040836) #26 SMAD6 (ENSPPAG00000027722) ENSPPAG00000036915 ENSPPAG00000020485 SMAD3 (ENSPPAG00000033769) AAGAB (ENSPPAG00000041055) IQCH (ENSPPAG00000042974) C15orf61 (ENSPPAG00000026999) MAP2K5 (ENSPPAG00000036945) ENSPPAG00000033373 ENSPPAG00000036055 Human MODERN SPECIES 6 PDCD7 (ENSG00000090470) CLPX (ENSG00000166855) CILP (ENSG00000138615) PARP16 (ENSG00000138617) IGDCC3 (ENSG00000174498) IGDCC4 (ENSG00000103742) DPP8 (ENSG00000074603) HACD3 (ENSG00000074696) INTS14 (ENSG00000138614) SLC24A1 (ENSG00000074621) DENND4A (ENSG00000174485) RAB11A (ENSG00000103769) MEGF11 (ENSG00000157890) DIS3L (ENSG00000166938) TIPIN (ENSG00000075131) MAP2K1 (ENSG00000169032) #22 SNAPC5 (ENSG00000174446) #23 RPL4 (ENSG00000174444) #24 ZWILCH (ENSG00000174442) #25 LCTL (ENSG00000188501) #26 SMAD6 (ENSG00000137834) SMAD3 (ENSG00000166949) AAGAB (ENSG00000103591) IQCH (ENSG00000103599) C15orf61 (ENSG00000189227) MAP2K5 (ENSG00000137764) SKOR1 (ENSG00000188779) PIAS1 (ENSG00000033800) ENSG00000260007 CALML4 (ENSG00000129007) CLN6 (ENSG00000128973) Gorilla MODERN SPECIES 6 CILP (ENSGGOG00000042968) PARP16 (ENSGGOG00000022851) IGDCC3 (ENSGGOG00000010452) IGDCC4 (ENSGGOG00000010463) DPP8 (ENSGGOG00000012470) HACD3 (ENSGGOG00000022837) INTS14 (ENSGGOG00000003838) SLC24A1 (ENSGGOG00000016389) DENND4A (ENSGGOG00000014870) ENSGGOG00000022841 RAB11A (ENSGGOG00000014252) MEGF11 (ENSGGOG00000000293) DIS3L (ENSGGOG00000001549) TIPIN (ENSGGOG00000000061) ENSGGOG00000024529 MAP2K1 (ENSGGOG00000003687) #22 ENSGGOG00000042752 SNAPC5 (ENSGGOG00000003693) #23 ENSGGOG00000003695 #24 ZWILCH (ENSGGOG00000003703) #25 LCTL (ENSGGOG00000006350) #26 SMAD6 (ENSGGOG00000013002) ENSGGOG00000038329 ENSGGOG00000012045 ENSGGOG00000004714 IQCH (ENSGGOG00000004722) C15orf61 (ENSGGOG00000004732) MAP2K5 (ENSGGOG00000004734) ENSGGOG00000042211 ENSGGOG00000027762 ENSGGOG00000004743 Orangutan MODERN SPECIES 6 PDCD7 (ENSPPYG00000006562) CLPX (ENSPPYG00000006563) CILP (ENSPPYG00000006564) PARP16 (ENSPPYG00000006565) IGDCC3 (ENSPPYG00000006566) IGDCC4 (ENSPPYG00000006567) DPP8 (ENSPPYG00000006568) HACD3 (ENSPPYG00000006569) INTS14 (ENSPPYG00000006570) SLC24A1 (ENSPPYG00000006571) DENND4A (ENSPPYG00000006572) RAB11A (ENSPPYG00000006573) MEGF11 (ENSPPYG00000039385) DIS3L (ENSPPYG00000006575) TIPIN (ENSPPYG00000031745) MAP2K1 (ENSPPYG00000006576) #22 ENSPPYG00000032290 SNAPC5 (ENSPPYG00000040277) #23 RPL4 (ENSPPYG00000006578) #24 ZWILCH (ENSPPYG00000006579) #25 LCTL (ENSPPYG00000006580) #26 ENSPPYG00000006581 ENSPPYG00000006582 SMAD3 (ENSPPYG00000006583) AAGAB (ENSPPYG00000006584) IQCH (ENSPPYG00000006585) C15orf61 (ENSPPYG00000006586) MAP2K5 (ENSPPYG00000006587) SKOR1 (ENSPPYG00000006588) PIAS1 (ENSPPYG00000006589) ENSPPYG00000006590 Gibbon MODERN SPECIES 21 CLPX (ENSNLEG00000012633) CILP (ENSNLEG00000012638) ENSNLEG00000034448 ENSNLEG00000012643 IGDCC3 (ENSNLEG00000012651) IGDCC4 (ENSNLEG00000012668) DPP8 (ENSNLEG00000012689) HACD3 (ENSNLEG00000012725) INTS14 (ENSNLEG00000012745) ENSNLEG00000012767 DENND4A (ENSNLEG00000012772) RAB11A (ENSNLEG00000012853) MEGF11 (ENSNLEG00000012863) DIS3L (ENSNLEG00000012891) TIPIN (ENSNLEG00000012909) MAP2K1 (ENSNLEG00000012913) #22 SNAPC5 (ENSNLEG00000033124) #23 ENSNLEG00000012938 #24 ZWILCH (ENSNLEG00000012950) #25 LCTL (ENSNLEG00000012956) #26 SMAD6 (ENSNLEG00000032864) ENSNLEG00000028836 SMAD3 (ENSNLEG00000012983) AAGAB (ENSNLEG00000013006) IQCH (ENSNLEG00000013025) C15orf61 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#22 ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 ENSGT00940000165777 ENSGT00940000159617 ENSGT00410000029064 ENSGT00390000011749 ENSGT00940000156986 ENSGT00390000013228.e.a.f ENSGT00390000018326 ENSGT00550000074618.a.b ENSGT00390000006260 ENSGT00950000183162.b ENSGT00940000159168 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00390000004380.m.a.b ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839.a ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b #22 ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 ENSGT00940000165777 ENSGT00940000159617 ENSGT00410000029064 ENSGT00390000011749 ENSGT00940000156986 ENSGT00390000018326 ENSGT00550000074618.a.b ENSGT00390000006260 ENSGT00950000183162.b ENSGT00940000159168 ENSGT00940000154314.l Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1551 SCARA5 (ENSRROG00000038278) NUGGC (ENSRROG00000035584) ELP3 (ENSRROG00000035502) PNOC (ENSRROG00000034843) ZNF395 (ENSRROG00000039052) FBXO16 (ENSRROG00000031695) FZD3 (ENSRROG00000042665) EXTL3 (ENSRROG00000037901) INTS9 (ENSRROG00000040531) HMBOX1 (ENSRROG00000031895) KIF13B (ENSRROG00000043696) DUSP4 (ENSRROG00000022122) ENSRROG00000023257 ENSRROG00000037428 #22 SARAF (ENSRROG00000027882) LEPROTL1 (ENSRROG00000029326) MBOAT4 (ENSRROG00000034165) DCTN6 (ENSRROG00000038808) ENSRROG00000041818 RBPMS (ENSRROG00000042518) SMIM18 (ENSRROG00000017435) GTF2E2 (ENSRROG00000042583) ENSRROG00000030996 GSR (ENSRROG00000038338) UBXN8 (ENSRROG00000037021) PPP2CB (ENSRROG00000031584) TEX15 (ENSRROG00000031020) PURG (ENSRROG00000040270) WRN (ENSRROG00000045381) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 159 DUSP4 (ENSRBIG00000040063) ENSRBIG00000035464 #22 SARAF (ENSRBIG00000034416) LEPROTL1 (ENSRBIG00000043780) MBOAT4 (ENSRBIG00000042055) DCTN6 (ENSRBIG00000019701) ENSRBIG00000032267 RBPMS (ENSRBIG00000038218) GTF2E2 (ENSRBIG00000043183) GSR (ENSRBIG00000043055) ENSRBIG00000026447 ENSRBIG00000042273 UBXN8 (ENSRBIG00000031406) PPP2CB (ENSRBIG00000032443) TEX15 (ENSRBIG00000004255) PURG (ENSRBIG00000028388) WRN (ENSRBIG00000031825) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b #22 ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 ENSGT00940000165777 ENSGT00940000159617 ENSGT00410000029064 ENSGT00390000011749 ENSGT00940000156986 ENSGT00390000013228.e.a.f ENSGT00390000018326 ENSGT00550000074618.a.b ENSGT00390000006260 ENSGT00950000183162.b ENSGT00940000159168 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.c ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b #22 ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 ENSGT00940000165777 ENSGT00940000159617 ENSGT00410000029064 ENSGT00390000011749 ENSGT00390000002517.a.b.b.c.a ENSGT00940000156986 ENSGT00390000013228.e.a.f ENSGT00390000018326 ENSGT00550000074618.a.b ENSGT00390000006260 ENSGT00950000183162.b Macaca ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.c ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b #22 ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 ENSGT00940000165777 ENSGT00940000159617 ENSGT00410000029064 ENSGT00390000011749 ENSGT00390000002517.a.b.b.c.a ENSGT00940000156986 ENSGT00390000018326 ENSGT00550000074618.a.b ENSGT00390000006260 ENSGT00950000183162.b ENSGT00940000159168 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 579 ENSMNEG00000007575 PBK (ENSMNEG00000043731) SCARA5 (ENSMNEG00000043810) NUGGC (ENSMNEG00000045452) ELP3 (ENSMNEG00000024316) ENSMNEG00000021099 PNOC (ENSMNEG00000032474) ZNF395 (ENSMNEG00000011767) FBXO16 (ENSMNEG00000045209) FZD3 (ENSMNEG00000040320) EXTL3 (ENSMNEG00000038935) INTS9 (ENSMNEG00000035204) HMBOX1 (ENSMNEG00000036228) KIF13B (ENSMNEG00000002442) DUSP4 (ENSMNEG00000039817) ENSMNEG00000037297 #22 SARAF (ENSMNEG00000010730) 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GTF2E2 (ENSMLEG00000032808) ENSMLEG00000038586 ENSMLEG00000028120 GSR (ENSMLEG00000007410) UBXN8 (ENSMLEG00000037958) PPP2CB (ENSMLEG00000034990) TEX15 (ENSMLEG00000036738) PURG (ENSMLEG00000015367) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.b.j #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.b.j #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.b.j #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.b.j #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.b.j #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.b.j #22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 17 ENSMFAG00000061482 IGDCC3 (ENSMFAG00000041666) IGDCC4 (ENSMFAG00000031165) DPP8 (ENSMFAG00000043661) HACD3 (ENSMFAG00000032102) INTS14 (ENSMFAG00000031689) SLC24A1 (ENSMFAG00000000105) DENND4A (ENSMFAG00000030601) ENSMFAG00000047947 ENSMFAG00000060677 ENSMFAG00000055472 RAB11A (ENSMFAG00000000699) MEGF11 (ENSMFAG00000038247) DIS3L (ENSMFAG00000035628) TIPIN (ENSMFAG00000031924) MAP2K1 (ENSMFAG00000036522) #22 ENSMFAG00000063036 SNAPC5 (ENSMFAG00000046383) #23 RPL4 (ENSMFAG00000036412) #24 ZWILCH (ENSMFAG00000036529) #25 LCTL (ENSMFAG00000000458) #26 ENSMFAG00000037066 ENSMFAG00000062655 SMAD3 (ENSMFAG00000001781) AAGAB (ENSMFAG00000040550) IQCH (ENSMFAG00000001124) C15orf61 (ENSMFAG00000053739) MAP2K5 (ENSMFAG00000030100) SKOR1 (ENSMFAG00000001347) PIAS1 (ENSMFAG00000038832) CLN6 (ENSMFAG00000042975) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.b.j #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.b.j #22 Orangutan MODERN SPECIES 21 CCDC25 (ENSPPYG00000018468) ESCO2 (ENSPPYG00000018469) PBK (ENSPPYG00000018470) SCARA5 (ENSPPYG00000018471) NUGGC (ENSPPYG00000018472) ELP3 (ENSPPYG00000018473) PNOC (ENSPPYG00000018475) ZNF395 (ENSPPYG00000018476) FBXO16 (ENSPPYG00000029855) FZD3 (ENSPPYG00000018477) EXTL3 (ENSPPYG00000018478) INTS9 (ENSPPYG00000018479) HMBOX1 (ENSPPYG00000018480) KIF13B (ENSPPYG00000018481) DUSP4 (ENSPPYG00000018482) ENSPPYG00000038802 #22 SARAF (ENSPPYG00000018483) LEPROTL1 (ENSPPYG00000018484) ENSPPYG00000032388 MBOAT4 (ENSPPYG00000018485) DCTN6 (ENSPPYG00000018486) ENSPPYG00000036415 ENSPPYG00000035281 ENSPPYG00000018487 GTF2E2 (ENSPPYG00000018488) ENSPPYG00000041487 GSR (ENSPPYG00000018489) UBXN8 (ENSPPYG00000018490) PPP2CB (ENSPPYG00000018491) TEX15 (ENSPPYG00000018492) PURG (ENSPPYG00000018493) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764.g.a.a ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 Mas night monkey MODERN SPECIES 599 PDCD7 (ENSANAG00000020593) CLPX (ENSANAG00000023812) CILP (ENSANAG00000022242) PARP16 (ENSANAG00000026820) IGDCC3 (ENSANAG00000021787) IGDCC4 (ENSANAG00000026571) DPP8 (ENSANAG00000038141) ENSANAG00000026926 INTS14 (ENSANAG00000038417) SLC24A1 (ENSANAG00000016940) DENND4A (ENSANAG00000037563) RAB11A (ENSANAG00000008429) MEGF11 (ENSANAG00000031211) DIS3L (ENSANAG00000024523) ENSANAG00000030739 MAP2K1 (ENSANAG00000023179) #22 ENSANAG00000023149 #23 ENSANAG00000029866 #24 ZWILCH (ENSANAG00000037776) #25 LCTL (ENSANAG00000029715) #26 ENSANAG00000038383 IL33 (ENSANAG00000019780) ENSANAG00000033312 KIAA2026 (ENSANAG00000028777) MLANA (ENSANAG00000036926) ERMP1 (ENSANAG00000034115) RIC1 (ENSANAG00000037454) ENSANAG00000025398 PDCD1LG2 (ENSANAG00000020809) ENSANAG00000019149 CD274 (ENSANAG00000028618) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00940000170330 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 Marmoset MODERN SPECIES 1 CLPX (ENSCJAG00000006870) CILP (ENSCJAG00000047691) PARP16 (ENSCJAG00000006929) IGDCC3 (ENSCJAG00000006940) IGDCC4 (ENSCJAG00000006951) DPP8 (ENSCJAG00000006987) HACD3 (ENSCJAG00000007084) INTS14 (ENSCJAG00000007118) SLC24A1 (ENSCJAG00000007180) DENND4A (ENSCJAG00000007209) RAB11A (ENSCJAG00000042037) ENSCJAG00000083582 MEGF11 (ENSCJAG00000007353) DIS3L (ENSCJAG00000007411) ENSCJAG00000085355 MAP2K1 (ENSCJAG00000007460) #22 SNAPC5 (ENSCJAG00000070895) #23 ENSCJAG00000007491 #24 ZWILCH (ENSCJAG00000007524) #25 LCTL (ENSCJAG00000007558) #26 SMAD6 (ENSCJAG00000044644) SMAD3 (ENSCJAG00000002088) AAGAB (ENSCJAG00000002113) IQCH (ENSCJAG00000002130) ENSCJAG00000051609 ENSCJAG00000073121 C15orf61 (ENSCJAG00000054412) MAP2K5 (ENSCJAG00000002156) SKOR1 (ENSCJAG00000002196) PIAS1 (ENSCJAG00000002224) CALML4 (ENSCJAG00000002243) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000008092.b ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 76 MAP2K1 (ENSSBOG00000023083) #22 SNAPC5 (ENSSBOG00000028815) #23 ENSSBOG00000015863 #24 ZWILCH (ENSSBOG00000033149) #25 ENSSBOG00000031231 LCTL (ENSSBOG00000023227) #26 ENSSBOG00000022363 SMAD3 (ENSSBOG00000020894) AAGAB (ENSSBOG00000035741) IQCH (ENSSBOG00000024935) C15orf61 (ENSSBOG00000022188) MAP2K5 (ENSSBOG00000028179) SKOR1 (ENSSBOG00000031705) ENSSBOG00000032111 PIAS1 (ENSSBOG00000030212) CALML4 (ENSSBOG00000031073) Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 248 IL17A (ENSCCAG00000021789) PKHD1 (ENSCCAG00000004027) TFAP2B (ENSCCAG00000036297) TFAP2D (ENSCCAG00000027869) DEFB110 (ENSCCAG00000030485) DEFB113 (ENSCCAG00000014271) DEFB114 (ENSCCAG00000027397) CRISP1 (ENSCCAG00000024689) PGK2 (ENSCCAG00000004646) CRISP3 (ENSCCAG00000027207) CRISP2 (ENSCCAG00000035454) RHAG (ENSCCAG00000027136) MAP2K1 (ENSCCAG00000024279) #22 SNAPC5 (ENSCCAG00000020529) #23 ENSCCAG00000022533 #24 ZWILCH (ENSCCAG00000027333) #25 LCTL (ENSCCAG00000000633) #26 SMAD6 (ENSCCAG00000026913) SMAD3 (ENSCCAG00000020767) AAGAB (ENSCCAG00000024283) Capuchin MODERN SPECIES 485 PDCD7 (ENSCCAG00000026810) ENSCCAG00000028918 CILP (ENSCCAG00000021521) PARP16 (ENSCCAG00000032095) IGDCC3 (ENSCCAG00000029122) IGDCC4 (ENSCCAG00000034061) DPP8 (ENSCCAG00000023015) HACD3 (ENSCCAG00000037841) INTS14 (ENSCCAG00000030079) SLC24A1 (ENSCCAG00000024899) DENND4A (ENSCCAG00000036137) ENSCCAG00000032078 RAB11A (ENSCCAG00000021286) MEGF11 (ENSCCAG00000029113) DIS3L (ENSCCAG00000037964) ENSCCAG00000018227 #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a 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#22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00910000147890 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00860000136046 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00960000188521 ENSGT00940000157505 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00860000136046 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00960000188521 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ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145.lc.a #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00950000185603 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218.m ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 Dingo MODERN SPECIES 205 CLPX (ENSCAFG00020008792) CILP (ENSCAFG00020008785) ENSCAFG00020008780 PARP16 (ENSCAFG00020008773) IGDCC3 (ENSCAFG00020008743) IGDCC4 (ENSCAFG00020008701) DPP8 (ENSCAFG00020008685) HACD3 (ENSCAFG00020008678) INTS14 (ENSCAFG00020008669) SLC24A1 (ENSCAFG00020008562) DENND4A (ENSCAFG00020008501) RAB11A (ENSCAFG00020008478) MEGF11 (ENSCAFG00020008443) DIS3L (ENSCAFG00020008413) TIPIN (ENSCAFG00020008398) MAP2K1 (ENSCAFG00020008392) #22 SNAPC5 (ENSCAFG00020008387) #23 ENSCAFG00020008355 #24 ZWILCH (ENSCAFG00020008215) #25 LCTL (ENSCAFG00020008195) #26 SMAD6 (ENSCAFG00020008193) SMAD3 (ENSCAFG00020008177) ENSCAFG00020008170 IQCH (ENSCAFG00020008118) C15orf61 (ENSCAFG00020008094) MAP2K5 (ENSCAFG00020008071) SKOR1 (ENSCAFG00020008049) PIAS1 (ENSCAFG00020008026) CALML4 (ENSCAFG00020008020) CLN6 (ENSCAFG00020008011) FEM1B (ENSCAFG00020008006) Dog MODERN SPECIES 23 CILP (ENSCAFG00845025013) AVPI1 (ENSCAFG00845025073) PARP16 (ENSCAFG00845025116) IGDCC3 (ENSCAFG00845025254) IGDCC4 (ENSCAFG00845025408) DPP8 (ENSCAFG00845025611) HACD3 (ENSCAFG00845025953) INTS14 (ENSCAFG00845026081) SLC24A1 (ENSCAFG00845026323) DENND4A (ENSCAFG00845026536) RAB11A (ENSCAFG00845027320) ENSCAFG00845014976 DIS3L (ENSCAFG00845015076) TIPIN (ENSCAFG00845015229) ENSCAFG00845015268 MAP2K1 (ENSCAFG00845015371) #22 SNAPC5 (ENSCAFG00845015512) #23 RPL4 (ENSCAFG00845015609) #24 ZWILCH (ENSCAFG00845015845) #25 ENSCAFG00845016122 LCTL (ENSCAFG00845016168) #26 SMAD6 (ENSCAFG00845016415) SMAD3 (ENSCAFG00845016639) AAGAB (ENSCAFG00845016886) IQCH (ENSCAFG00845017088) C15orf61 (ENSCAFG00845017380) MAP2K5 (ENSCAFG00845017514) SKOR1 (ENSCAFG00845017976) PIAS1 (ENSCAFG00845018319) CALML4 (ENSCAFG00845018790) CLN6 (ENSCAFG00845018935) Red fox MODERN SPECIES PDCD7 (ENSVVUG00000013851) CLPX (ENSVVUG00000013882) CILP (ENSVVUG00000014204) PARP16 (ENSVVUG00000014214) IGDCC3 (ENSVVUG00000014224) IGDCC4 (ENSVVUG00000014242) DPP8 (ENSVVUG00000014284) HACD3 (ENSVVUG00000014290) INTS14 (ENSVVUG00000014296) SLC24A1 (ENSVVUG00000014313) DENND4A (ENSVVUG00000014392) RAB11A (ENSVVUG00000014435) MEGF11 (ENSVVUG00000014448) DIS3L (ENSVVUG00000014492) TIPIN (ENSVVUG00000014501) MAP2K1 (ENSVVUG00000014514) #22 SNAPC5 (ENSVVUG00000014527) #23 ENSVVUG00000014531 #24 ZWILCH (ENSVVUG00000014559) #25 ENSVVUG00000014578 LCTL (ENSVVUG00000014585) #26 ENSVVUG00000014612 ENSVVUG00000014615 SMAD6 (ENSVVUG00000014625) SMAD3 (ENSVVUG00000014647) AAGAB (ENSVVUG00000014658) IQCH (ENSVVUG00000014665) C15orf61 (ENSVVUG00000014693) MAP2K5 (ENSVVUG00000014703) ENSVVUG00000014708 PIAS1 (ENSVVUG00000014713) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 American mink MODERN SPECIES 46 CLPX (ENSNVIG00000017631) CILP (ENSNVIG00000017597) PARP16 (ENSNVIG00000017580) ENSNVIG00000017573 IGDCC3 (ENSNVIG00000017539) IGDCC4 (ENSNVIG00000017489) DPP8 (ENSNVIG00000017340) HACD3 (ENSNVIG00000017259) CO044 (ENSNVIG00000017199) SLC24A1 (ENSNVIG00000017089) DENND4A (ENSNVIG00000016862) RAB11A (ENSNVIG00000016821) MEGF11 (ENSNVIG00000016583) DIS3L 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#23 ENSMPUG00000000337 #24 ZWILCH (ENSMPUG00000000333) #25 LCTL (ENSMPUG00000000312) #26 ENSMPUG00000000309 SMAD6 (ENSMPUG00000000307) SMAD3 (ENSMPUG00000000304) AAGAB (ENSMPUG00000000292) IQCH (ENSMPUG00000000289) C15orf61 (ENSMPUG00000000287) MAP2K5 (ENSMPUG00000000285) SKOR1 (ENSMPUG00000000283) PIAS1 (ENSMPUG00000000281) CALML4 (ENSMPUG00000000270) CLN6 (ENSMPUG00000000267) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B.p ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Giant Panda MODERN SPECIES 15 PDCD7 (ENSAMEG00000027984) CLPX (ENSAMEG00000002810) CILP (ENSAMEG00000002854) PARP16 (ENSAMEG00000002861) IGDCC3 (ENSAMEG00000002876) IGDCC4 (ENSAMEG00000002889) DPP8 (ENSAMEG00000002924) HACD3 (ENSAMEG00000002983) INTS14 (ENSAMEG00000003002) SLC24A1 (ENSAMEG00000003029) DENND4A (ENSAMEG00000003046) RAB11A (ENSAMEG00000003119) MEGF11 (ENSAMEG00000003131) DIS3L (ENSAMEG00000003166) TIPIN (ENSAMEG00000027725) MAP2K1 (ENSAMEG00000003218) #22 SNAPC5 (ENSAMEG00000003249) #23 ENSAMEG00000029170 #24 ZWILCH (ENSAMEG00000003251) #25 LCTL (ENSAMEG00000003300) #26 SMAD6 (ENSAMEG00000029979) SMAD3 (ENSAMEG00000003318) AAGAB (ENSAMEG00000028433) IQCH (ENSAMEG00000005044) C15orf61 (ENSAMEG00000029099) MAP2K5 (ENSAMEG00000005013) SKOR1 (ENSAMEG00000004996) PIAS1 (ENSAMEG00000014025) CALML4 (ENSAMEG00000014054) CLN6 (ENSAMEG00000014058) FEM1B (ENSAMEG00000014073) Ursus ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000008092.b ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B.p ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Polar bear MODERN SPECIES 320 ENSUMAG00000012533 CLPX (ENSUMAG00000012513) CILP (ENSUMAG00000012508) PARP16 (ENSUMAG00000012504) IGDCC3 (ENSUMAG00000012461) ENSUMAG00000012451 DPP8 (ENSUMAG00000012441) HACD3 (ENSUMAG00000012379) INTS14 (ENSUMAG00000012368) SLC24A1 (ENSUMAG00000012325) DENND4A (ENSUMAG00000012290) RAB11A (ENSUMAG00000012273) MEGF11 (ENSUMAG00000012242) DIS3L (ENSUMAG00000012227) TIPIN (ENSUMAG00000012215) MAP2K1 (ENSUMAG00000012208) #22 RPL4 (ENSUMAG00000012178) #24 ZWILCH (ENSUMAG00000012145) #25 LCTL (ENSUMAG00000012072) #26 ENSUMAG00000012057 AAGAB (ENSUMAG00000012048) IQCH (ENSUMAG00000012020) C15orf61 (ENSUMAG00000012016) MAP2K5 (ENSUMAG00000011992) ENSUMAG00000011983 PIAS1 (ENSUMAG00000011980) CALML4 (ENSUMAG00000011979) ENSUMAG00000011962 FEM1B (ENSUMAG00000011958) ITGA11 (ENSUMAG00000011792) CORO2B (ENSUMAG00000011755) American black bear DUPLICATION American black bear MODERN SPECIES 1271 ENSUAMG00000023229 #22 American black bear MODERN SPECIES 1272 ENSUAMG00000023250 #22 SNAPC5 (ENSUAMG00000023247) #23 RPL4 (ENSUAMG00000023236) #24 ZWILCH (ENSUAMG00000023230) #25 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914.db.a ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914.db.a ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914.db.a ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 24 PDCD7 (ENSRFEG00010007642) CLPX (ENSRFEG00010007597) CILP (ENSRFEG00010007498) PARP16 (ENSRFEG00010007410) IGDCC3 (ENSRFEG00010007254) IGDCC4 (ENSRFEG00010007212) DPP8 (ENSRFEG00010007043) HACD3 (ENSRFEG00010004527) INTS14 (ENSRFEG00010004454) SLC24A1 (ENSRFEG00010004368) DENND4A (ENSRFEG00010004242) ENSRFEG00010004168 MEGF11 (ENSRFEG00010004126) DIS3L (ENSRFEG00010004058) TIPIN (ENSRFEG00010004026) MAP2K1 (ENSRFEG00010004010) #22 SNAPC5 (ENSRFEG00010003999) #23 ENSRFEG00010003980 #24 ZWILCH (ENSRFEG00010003952) #25 LCTL (ENSRFEG00010003917) #26 ENSRFEG00010003900 SMAD6 (ENSRFEG00010003887) SMAD3 (ENSRFEG00010003872) AAGAB (ENSRFEG00010003850) IQCH (ENSRFEG00010003782) MAP2K5 (ENSRFEG00010003624) SKOR1 (ENSRFEG00010003500) ENSRFEG00010003474 ENSRFEG00010003431 ENSRFEG00010003398 CLN6 (ENSRFEG00010003356) Microbat MODERN SPECIES 1052 CILP (ENSMLUG00000008793) ENSMLUG00000008817 ENSMLUG00000008591 ENSMLUG00000028492 ENSMLUG00000028574 IGDCC3 (ENSMLUG00000000621) IGDCC4 (ENSMLUG00000000632) DPP8 (ENSMLUG00000009434) ENSMLUG00000015087 INTS14 (ENSMLUG00000015095) SLC24A1 (ENSMLUG00000015104) DENND4A (ENSMLUG00000015110) ENSMLUG00000008820 MEGF11 (ENSMLUG00000008226) ENSMLUG00000022949 MAP2K1 (ENSMLUG00000011790) #22 SNAPC5 (ENSMLUG00000011803) #23 ENSMLUG00000011809 #24 ZWILCH (ENSMLUG00000011819) #25 LCTL (ENSMLUG00000011849) #26 Megabat MODERN SPECIES 2135 MAP2K1 (ENSPVAG00000000065) #22 SNAPC5 (ENSPVAG00000000067) #23 RPL4 (ENSPVAG00000000068) #24 ZWILCH (ENSPVAG00000000070) #25 LCTL (ENSPVAG00000000072) #26 Equus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914.eb ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Horse MODERN SPECIES PDCD7 (ENSECAG00000026989) CLPX (ENSECAG00000016127) CILP (ENSECAG00000014515) PARP16 (ENSECAG00000011251) IGDCC3 (ENSECAG00000024763) IGDCC4 (ENSECAG00000024668) DPP8 (ENSECAG00000010846) HACD3 (ENSECAG00000023082) INTS14 (ENSECAG00000018884) SLC24A1 (ENSECAG00000013327) DENND4A (ENSECAG00000024306) RAB11A (ENSECAG00000023865) MEGF11 (ENSECAG00000000706) DIS3L (ENSECAG00000007302) TIPIN (ENSECAG00000004590) MAP2K1 (ENSECAG00000010640) #22 RPL4 (ENSECAG00000023179) #24 ZWILCH (ENSECAG00000018367) #25 LCTL (ENSECAG00000014254) #26 SMAD6 (ENSECAG00000013706) SMAD3 (ENSECAG00000020259) ENSECAG00000047849 AAGAB (ENSECAG00000013142) IQCH (ENSECAG00000007674) ENSECAG00000029823 MAP2K5 (ENSECAG00000022411) SKOR1 (ENSECAG00000036584) ENSECAG00000005747 PIAS1 (ENSECAG00000007993) CALML4 (ENSECAG00000021844) CLN6 (ENSECAG00000016991) Donkey MODERN SPECIES 11 PDCD7 (ENSEASG00005006486) CLPX (ENSEASG00005006483) CILP (ENSEASG00005006479) PARP16 (ENSEASG00005030198) IGDCC3 (ENSEASG00005006470) IGDCC4 (ENSEASG00005006466) DPP8 (ENSEASG00005006459) HACD3 (ENSEASG00005006456) INTS14 (ENSEASG00005006454) SLC24A1 (ENSEASG00005006448) DENND4A (ENSEASG00005006437) RAB11A (ENSEASG00005006431) MEGF11 (ENSEASG00005006429) DIS3L (ENSEASG00005006407) TIPIN (ENSEASG00005006396) MAP2K1 (ENSEASG00005006387) #22 SNAPC5 (ENSEASG00005006384) #23 RPL4 (ENSEASG00005006373) #24 ZWILCH (ENSEASG00005006339) #25 LCTL (ENSEASG00005006319) #26 ENSEASG00005025450 SMAD3 (ENSEASG00005006315) AAGAB (ENSEASG00005006311) IQCH (ENSEASG00005006301) ENSEASG00005006297 MAP2K5 (ENSEASG00005006290) SKOR1 (ENSEASG00005006277) ENSEASG00005006267 PIAS1 (ENSEASG00005006262) CALML4 (ENSEASG00005033729) CLN6 (ENSEASG00005034200) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Suina ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Pig MODERN SPECIES PDCD7 (ENSSSCG00000004926) CLPX (ENSSSCG00000004927) CILP (ENSSSCG00000004928) PARP16 (ENSSSCG00000004929) IGDCC3 (ENSSSCG00000054127) IGDCC4 (ENSSSCG00000004931) DPP8 (ENSSSCG00000004934) HACD3 (ENSSSCG00000004935) INTS14 (ENSSSCG00000004936) SLC24A1 (ENSSSCG00000004937) DENND4A (ENSSSCG00000004938) RAB11A (ENSSSCG00000032312) MEGF11 (ENSSSCG00000004939) DIS3L (ENSSSCG00000004941) TIPIN (ENSSSCG00000004942) MAP2K1 (ENSSSCG00000004943) #22 SNAPC5 (ENSSSCG00000038941) 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ENSGT00400000022240 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 Arabian camel MODERN SPECIES 32 PDCD7 (ENSCDRG00005001491) CLPX (ENSCDRG00005001522) CILP (ENSCDRG00005001549) PARP16 (ENSCDRG00005001584) IGDCC3 (ENSCDRG00005001651) IGDCC4 (ENSCDRG00005001726) DPP8 (ENSCDRG00005001839) HACD3 (ENSCDRG00005001929) INTS14 (ENSCDRG00005001994) SLC24A1 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ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 Siberian musk deer MODERN SPECIES 70 CILP (ENSMMSG00000019540) PARP16 (ENSMMSG00000019586) IGDCC3 (ENSMMSG00000000099) IGDCC4 (ENSMMSG00000000147) DPP8 (ENSMMSG00000000258) ENSMMSG00000000445 HACD3 (ENSMMSG00000000485) INTS14 (ENSMMSG00000000581) SLC24A1 (ENSMMSG00000000735) ENSMMSG00000000783 DENND4A (ENSMMSG00000000845) ENSMMSG00000000971 MEGF11 (ENSMMSG00000001023) DIS3L (ENSMMSG00000001148) TIPIN (ENSMMSG00000001178) MAP2K1 (ENSMMSG00000001210) #22 SNAPC5 (ENSMMSG00000001249) #23 ENSMMSG00000001277 #24 ZWILCH (ENSMMSG00000001358) #25 LCTL (ENSMMSG00000001442) #26 SMAD6 (ENSMMSG00000001473) SMAD3 (ENSMMSG00000001493) AAGAB (ENSMMSG00000001517) IQCH (ENSMMSG00000001575) C15orf61 (ENSMMSG00000001796) MAP2K5 (ENSMMSG00000001850) SKOR1 (ENSMMSG00000002112) PIAS1 (ENSMMSG00000002174) CALML4 (ENSMMSG00000002206) CLN6 (ENSMMSG00000002230) FEM1B (ENSMMSG00000002327) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 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#22 SNAPC5 (ENSBGRG00000024649) #23 ENSBGRG00000024489 #24 ZWILCH (ENSBGRG00000024356) #25 LCTL (ENSBGRG00000024229) #26 SMAD6 (ENSBGRG00000024050) SMAD3 (ENSBGRG00000023965) AAGAB (ENSBGRG00000023783) IQCH (ENSBGRG00000023490) ENSBGRG00000023451 ENSBGRG00000023428 MAP2K5 (ENSBGRG00000023013) SKOR1 (ENSBGRG00000022855) PIAS1 (ENSBGRG00000022493) CALML4 (ENSBGRG00000022400) CLN6 (ENSBGRG00000022143) Wild yak MODERN SPECIES 552 DIS3L (ENSBMUG00000005883) TIPIN (ENSBMUG00000005904) MAP2K1 (ENSBMUG00000005924) #22 SNAPC5 (ENSBMUG00000005936) #23 ENSBMUG00000005950 #24 ZWILCH (ENSBMUG00000006013) #25 LCTL (ENSBMUG00000006040) #26 ENSBMUG00000006090 SMAD3 (ENSBMUG00000006115) AAGAB (ENSBMUG00000006202) IQCH (ENSBMUG00000006265) ENSBMUG00000006346 MAP2K5 (ENSBMUG00000006406) SKOR1 (ENSBMUG00000006456) PIAS1 (ENSBMUG00000006486) CALML4 (ENSBMUG00000006499) CLN6 (ENSBMUG00000006571) FEM1B (ENSBMUG00000006589) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 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ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 230 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 Armadillo MODERN SPECIES 984 IGDCC4 (ENSDNOG00000015741) DPP8 (ENSDNOG00000001444) HACD3 (ENSDNOG00000001687) INTS14 (ENSDNOG00000001690) SLC24A1 (ENSDNOG00000000816) DENND4A (ENSDNOG00000019872) ENSDNOG00000038479 MEGF11 (ENSDNOG00000016951) DIS3L (ENSDNOG00000016967) TIPIN (ENSDNOG00000003177) MAP2K1 (ENSDNOG00000016563) #22 ENSDNOG00000006689 #23 ENSDNOG00000006693 #24 ZWILCH (ENSDNOG00000006711) #25 LCTL (ENSDNOG00000006740) #26 SMAD6 (ENSDNOG00000008227) Sloth MODERN SPECIES 5700 MAP2K1 (ENSCHOG00000002997) #22 SNAPC5 (ENSCHOG00000003006) #23 RPL4 (ENSCHOG00000003008) #24 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Hyrax MODERN SPECIES 5249 MAP2K1 (ENSPCAG00000000567) #22 SNAPC5 (ENSPCAG00000000608) #23 RPL4 (ENSPCAG00000000620) #24 ZWILCH (ENSPCAG00000000663) #25 LCTL (ENSPCAG00000000738) #26 Elephant MODERN SPECIES 466 KBTBD13 (ENSLAFG00000031048) PDCD7 (ENSLAFG00000004977) CLPX (ENSLAFG00000004978) CILP (ENSLAFG00000005873) PARP16 (ENSLAFG00000014938) IGDCC3 (ENSLAFG00000000244) IGDCC4 (ENSLAFG00000022955) DPP8 (ENSLAFG00000013000) HACD3 (ENSLAFG00000010226) INTS14 (ENSLAFG00000010235) DENND4A (ENSLAFG00000010247) RAB11A (ENSLAFG00000011418) MEGF11 (ENSLAFG00000011424) DIS3L (ENSLAFG00000006866) TIPIN (ENSLAFG00000026016) MAP2K1 (ENSLAFG00000006487) #22 SNAPC5 (ENSLAFG00000006491) #23 RPL4 (ENSLAFG00000006494) #24 LCTL (ENSLAFG00000012306) #26 SMAD6 (ENSLAFG00000013285) SMAD3 (ENSLAFG00000021903) AAGAB (ENSLAFG00000022590) IQCH (ENSLAFG00000011381) C15orf61 (ENSLAFG00000000737) MAP2K5 (ENSLAFG00000001427) SKOR1 (ENSLAFG00000018189) ENSLAFG00000029244 PIAS1 (ENSLAFG00000018150) CALML4 (ENSLAFG00000021943) CLN6 (ENSLAFG00000029055) FEM1B (ENSLAFG00000013998) Tenrec MODERN SPECIES 6225 MAP2K1 (ENSETEG00000000333) #22 SNAPC5 (ENSETEG00000000336) #23 RPL4 (ENSETEG00000000337) #24 ZWILCH (ENSETEG00000000342) #25 LCTL (ENSETEG00000000348) #26 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017392 ENSGT00390000017625 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 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ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000017828 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT01050000244841.A.a.a ENSGT00950000183129.a ENSGT00950000182960.b ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00950000186456 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 tuatara MODERN SPECIES 842 ENSSPUG00000013730 ENSSPUG00000013724 ENSSPUG00000013716 ENSSPUG00000013706 RAB11A (ENSSPUG00000013698) MEGF11 (ENSSPUG00000013679) DIS3L (ENSSPUG00000013652) TIPIN 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MODERN SPECIES 3174 ENSLLTG00000005527 ENSLLTG00000005532 #22 ENSLLTG00000005538 RPL4 (ENSLLTG00000005545) #24 ZWILCH (ENSLLTG00000005562) #25 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000156291 ENSGT00940000157540.A ENSGT00940000160523 ENSGT00940000156682 ENSGT00940000159268.d ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT00940000155836.B.m ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b.d #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000164138 ENSGT00940000155465.c ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b Eastern brown snake MODERN SPECIES 43 IGDCC3 (ENSPTXG00000015652) IGDCC4 (ENSPTXG00000015649) MCTP2 (ENSPTXG00000015590) NR2F2 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SMAD3 (ENSNNAG00000011272) AAGAB (ENSNNAG00000011287) ENSNNAG00000011356 IQCH (ENSNNAG00000011412) C15orf61 (ENSNNAG00000011603) MAP2K5 (ENSNNAG00000011631) SKOR1 (ENSNNAG00000011796) PIAS1 (ENSNNAG00000012101) CLN6 (ENSNNAG00000012206) ENSNNAG00000012296 ITGA11 (ENSNNAG00000012334) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT01050000244841.A.a.a ENSGT00950000183129.a ENSGT00950000182960.b.f ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00950000186456 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000017828 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT01050000244841.A.a.a ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00950000186456 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000017828 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT01050000244841.A.a.a ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b 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ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 painted turtle MODERN SPECIES 802 MTFMT (ENSCPBG00000014686) CILP (ENSCPBG00000014676) ENSCPBG00000014672 PARP16 (ENSCPBG00000014669) IGDCC3 (ENSCPBG00000014663) IGDCC4 (ENSCPBG00000014652) DPP8 (ENSCPBG00000014645) HACD3 (ENSCPBG00000014643) INTS14 (ENSCPBG00000014639) SLC24A1 (ENSCPBG00000014637) DENND4A (ENSCPBG00000014626) RAB11A (ENSCPBG00000014614) MEGF11 (ENSCPBG00000014150) DIS3L (ENSCPBG00000014111) ENSCPBG00000014108 MAP2K1 (ENSCPBG00000014102) #22 SNAPC5 (ENSCPBG00000014100) #23 RPL4 (ENSCPBG00000014091) #24 ZWILCH (ENSCPBG00000014089) #25 LCTL (ENSCPBG00000014087) #26 NADSYN1 (ENSCPBG00000014079) DHCR7 (ENSCPBG00000014076) ZDHHC13 (ENSCPBG00000014073) CSRP3 (ENSCPBG00000014072) E2F8 (ENSCPBG00000014068) NAV2 (ENSCPBG00000014050) DBX1 (ENSCPBG00000014043) HTATIP2 (ENSCPBG00000014041) PRMT3 (ENSCPBG00000014034) SLC6A5 (ENSCPBG00000014028) ENSCPBG00000014024 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 27 MTFMT (ENSTMTG00000007020) CILP (ENSTMTG00000007052) ENSTMTG00000007083 PARP16 (ENSTMTG00000007137) IGDCC3 (ENSTMTG00000007155) IGDCC4 (ENSTMTG00000007233) DPP8 (ENSTMTG00000007513) HACD3 (ENSTMTG00000007567) INTS14 (ENSTMTG00000007590) SLC24A1 (ENSTMTG00000007638) DENND4A (ENSTMTG00000007680) RAB11A (ENSTMTG00000007735) MEGF11 (ENSTMTG00000007756) DIS3L (ENSTMTG00000007906) ENSTMTG00000007940 MAP2K1 (ENSTMTG00000007966) #22 ENSTMTG00000007987 ENSTMTG00000008003 #24 ZWILCH (ENSTMTG00000008057) #25 LCTL (ENSTMTG00000008371) #26 SMAD6 (ENSTMTG00000008403) SMAD3 (ENSTMTG00000008413) AAGAB (ENSTMTG00000008426) IQCH (ENSTMTG00000008467) ENSTMTG00000008700 MAP2K5 (ENSTMTG00000008725) SKOR1 (ENSTMTG00000008807) PIAS1 (ENSTMTG00000008856) CALML4 (ENSTMTG00000008891) CLN6 (ENSTMTG00000008908) FEM1B (ENSTMTG00000008924) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000017828 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ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 Flycatcher MODERN SPECIES 1 MTFMT (ENSFALG00000010118) CILP (ENSFALG00000010116) ENSFALG00000010114 PARP16 (ENSFALG00000010108) IGDCC3 (ENSFALG00000010105) IGDCC4 (ENSFALG00000010102) DPP8 (ENSFALG00000010098) HACD3 (ENSFALG00000010085) INTS14 (ENSFALG00000010068) SLC24A1 (ENSFALG00000010063) DENND4A (ENSFALG00000010056) RAB11A (ENSFALG00000010052) MEGF11 (ENSFALG00000010040) DIS3L (ENSFALG00000010033) TIPIN (ENSFALG00000010027) MAP2K1 (ENSFALG00000028438) #22 SNAPC5 (ENSFALG00000025446) #23 ENSFALG00000028967 ENSFALG00000009988 ENSFALG00000009983 ENSFALG00000009980 ENSFALG00000009958 ENSFALG00000009937 ENSFALG00000009927 ENSFALG00000009916 ENSFALG00000029080 ENSFALG00000009902 ENSFALG00000009896 DUOXA2 (ENSFALG00000023603) ENSFALG00000009862 SORD (ENSFALG00000009847) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000017828 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT01050000244841.A.a.a ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT01060000252718 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240.oc ENSGT00940000164138 Medium ground finch MODERN SPECIES 69 MTFMT 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ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT01060000252718 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00960000188521 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240.nc ENSGT00940000161115 Zebra finch MODERN SPECIES 1 CILP (ENSTGUG00000009096) GNRHR (ENSTGUG00000020538) PARP16 (ENSTGUG00000009103) IGDCC3 (ENSTGUG00000009117) IGDCC4 (ENSTGUG00000009136) DPP8 (ENSTGUG00000009145) HACD3 (ENSTGUG00000009174) INTS14 (ENSTGUG00000009182) SLC24A1 (ENSTGUG00000009206) DENND4A (ENSTGUG00000009220) RAB11A (ENSTGUG00000009279) MEGF11 (ENSTGUG00000009293) DIS3L (ENSTGUG00000009315) TIPIN (ENSTGUG00000009358) ENSTGUG00000019914 MAP2K1 (ENSTGUG00000009363) #22 RPL4 (ENSTGUG00000009403) #24 ZWILCH (ENSTGUG00000009439) #25 LCTL (ENSTGUG00000009457) #26 SMAD6 (ENSTGUG00000009467) SMAD3 (ENSTGUG00000009470) AAGAB (ENSTGUG00000009497) IQCH (ENSTGUG00000009504) ENSTGUG00000009527 MAP2K5 (ENSTGUG00000009531) ENSTGUG00000025021 ENSTGUG00000009553 ENSTGUG00000029271 ENSTGUG00000021449 ENSTGUG00000024498 ENSTGUG00000009614 Common canary MODERN SPECIES 12 MTFMT (ENSSCAG00000010115) CILP (ENSSCAG00000010128) GNRHR (ENSSCAG00000010133) PARP16 (ENSSCAG00000010143) IGDCC3 (ENSSCAG00000010169) IGDCC4 (ENSSCAG00000010185) DPP8 (ENSSCAG00000010189) HACD3 (ENSSCAG00000010199) INTS14 (ENSSCAG00000010200) SLC24A1 (ENSSCAG00000010206) DENND4A (ENSSCAG00000010214) RAB11A (ENSSCAG00000010226) MEGF11 (ENSSCAG00000010255) DIS3L (ENSSCAG00000010324) TIPIN (ENSSCAG00000010328) MAP2K1 (ENSSCAG00000010333) #22 ENSSCAG00000010341 RPL4 (ENSSCAG00000010344) #24 ZWILCH (ENSSCAG00000010364) #25 LCTL (ENSSCAG00000010374) #26 ENSSCAG00000010394 ENSSCAG00000010404 SMAD6 (ENSSCAG00000010407) SMAD3 (ENSSCAG00000010414) AAGAB (ENSSCAG00000010418) IQCH (ENSSCAG00000010432) ENSSCAG00000010438 MAP2K5 (ENSSCAG00000010448) PIAS1 (ENSSCAG00000010481) CALML4 (ENSSCAG00000010490) ENSSCAG00000010493 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000017828 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT01050000244841.A.a.a ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 Golden eagle MODERN SPECIES 21 MTFMT (ENSACCG00020008908) CILP (ENSACCG00020008937) ENSACCG00020008952 PARP16 (ENSACCG00020008969) IGDCC3 (ENSACCG00020009002) IGDCC4 (ENSACCG00020009048) DPP8 (ENSACCG00020009512) HACD3 (ENSACCG00020009900) INTS14 (ENSACCG00020009917) SLC24A1 (ENSACCG00020009936) DENND4A (ENSACCG00020009959) RAB11A (ENSACCG00020009992) MEGF11 (ENSACCG00020010081) DIS3L (ENSACCG00020010156) TIPIN (ENSACCG00020010172) MAP2K1 (ENSACCG00020010187) #22 SNAPC5 (ENSACCG00020010201) #23 RPL4 (ENSACCG00020000310) #24 ZWILCH (ENSACCG00020000434) #25 LCTL (ENSACCG00020000480) #26 SMAD6 (ENSACCG00020000507) SMAD3 (ENSACCG00020000522) AAGAB (ENSACCG00020000560) C15orf61 (ENSACCG00020000661) MAP2K5 (ENSACCG00020000704) SKOR1 (ENSACCG00020000753) PIAS1 (ENSACCG00020000781) CALML4 (ENSACCG00020000839) CLN6 (ENSACCG00020000865) FEM1B (ENSACCG00020000880) ITGA11 (ENSACCG00020001060) Kakapo MODERN SPECIES 1 ENSSHBG00005014956 PARP16 (ENSSHBG00005014952) IGDCC3 (ENSSHBG00005014931) IGDCC4 (ENSSHBG00005014913) ENSSHBG00005014900 DPP8 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(ENSLLEG00000030012) ENSLLEG00000030071 NDUFAF1 (ENSLLEG00000030108) NUSAP1 (ENSLLEG00000030126) ENSLLEG00000030172 CHP1 (ENSLLEG00000030213) ENSLLEG00000030258 ENSLLEG00000030276 INO80 (ENSLLEG00000030322) ENSLLEG00000030402 CHAC1 (ENSLLEG00000030408) ENSLLEG00000030415 Frog MODERN SPECIES 3 XB5959486 [provisional] (ENSXETG00000006651) cilp (ENSXETG00000006650) gnrhr2/nmi (ENSXETG00000038283) parp16 (ENSXETG00000006648) igdcc3 (ENSXETG00000033022) igdcc4 (ENSXETG00000006647) dpp8 (ENSXETG00000006646) hacd3 (ENSXETG00000030041) ints14 (ENSXETG00000006644) slc24a1 (ENSXETG00000033301) dennd4a (ENSXETG00000006641) rab11a (ENSXETG00000006639) megf11 (ENSXETG00000015852) dis3l (ENSXETG00000015865) tipin (ENSXETG00000024752) map2k1 (ENSXETG00000015887) #22 snapc5 (ENSXETG00000015893) rpl4 (ENSXETG00000015898) #24 zwilch (ENSXETG00000015894) #25 lctl (ENSXETG00000015904) #26 smad6 (ENSXETG00000015939) smad3 (ENSXETG00000007804) aagab (ENSXETG00000007805) pnlip (ENSXETG00000007807) c15orf61 (ENSXETG00000030493) map2k5 (ENSXETG00000007809) ENSXETG00000044421 skor1 (ENSXETG00000007811) pias1 (ENSXETG00000007813) calml4 (ENSXETG00000007814) cln6 (ENSXETG00000029932) Coelacanth MODERN SPECIES 280 si:ch73-314g15.3 (ENSLACG00000016787) CILP (ENSLACG00000016729) gnrhr1 (ENSLACG00000016584) ENSLACG00000016540 PARP16 (ENSLACG00000016410) IGDCC3 (ENSLACG00000015818) IGDCC4 (ENSLACG00000014876) DPP8 (ENSLACG00000014154) HACD3 (ENSLACG00000013954) INTS14 (ENSLACG00000013825) DENND4A (ENSLACG00000012485) RAB11A (ENSLACG00000012184) MEGF11 (ENSLACG00000010981) DIS3L (ENSLACG00000007995) TIPIN (ENSLACG00000007807) MAP2K1 (ENSLACG00000006464) #22 RPL4 (ENSLACG00000006259) #24 ZWILCH (ENSLACG00000005435) #25 LCTL (ENSLACG00000005143) #26 crybgx (ENSLACG00000004693) SNAPC5 (ENSLACG00000004572) #23 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00390000008152.B.b ENSGT00950000183129.a ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 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lctla (ENSECRG00000017984) #26 crybgx (ENSECRG00000018775) snapc5 (ENSECRG00000018817) #23 smad6a (ENSECRG00000018835) smad3b (ENSECRG00000018886) aagab (ENSECRG00000019047) iqch (ENSECRG00000019116) zgc:162898 (ENSECRG00000019374) map2k5 (ENSECRG00000019409) ENSECRG00000019494 ENSECRG00000019525 PIAS1 (ENSECRG00000019551) calml4a (ENSECRG00000019589) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000156969 ENSGT00940000159637 ENSGT00940000160717 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000165149 ENSGT00940000166523 ENSGT00940000157244 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000153499.b.b.d ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000164138 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 Spotted gar MODERN SPECIES 669 ENSLOCG00000013767 eif3ja (ENSLOCG00000013769) cilp (ENSLOCG00000013772) ENSLOCG00000013774 parp16 (ENSLOCG00000013778) IGDCC3 (ENSLOCG00000013782) IGDCC4 (ENSLOCG00000013791) hacd3 (ENSLOCG00000013803) ints14 (ENSLOCG00000013812) SLC24A1 (ENSLOCG00000013820) dennd4a (ENSLOCG00000013827) rab11a (ENSLOCG00000013835) ENSLOCG00000013837 dis3l (ENSLOCG00000013846) tipin (ENSLOCG00000013854) map2k1 (ENSLOCG00000013858) #22 rpl4 (ENSLOCG00000013867) #24 zwilch (ENSLOCG00000013873) #25 lctla (ENSLOCG00000013878) #26 crybgx (ENSLOCG00000013888) snapc5 (ENSLOCG00000013891) #23 smad6a (ENSLOCG00000013892) smad3b (ENSLOCG00000013897) aagab (ENSLOCG00000013907) iqch (ENSLOCG00000013914) zgc:162898 (ENSLOCG00000013920) map2k5 (ENSLOCG00000013923) skor1a (ENSLOCG00000013929) PIAS1 (ENSLOCG00000013933) calml4a (ENSLOCG00000013940) CLN6 (ENSLOCG00000013946) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 148 ENSGT00940000156926.d ENSGT00940000155744 ENSGT00940000169185 ENSGT00440000038107 ENSGT00530000062962.b.a ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT01030000234532.B.e.b.e ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000153499.b.b.d ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT01030000234534.B.a.b ENSGT00950000182965.a.a ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000155837 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000156900.t ENSGT00940000158943.e.a.a ENSGT00390000008240.c ENSGT00940000163963.a ENSGT00550000074781 ENSGT00390000012336 ENSGT00940000155164.a.b ENSGT00530000063335.A.sb ENSGT00530000063675.a.n ENSGT01040000240503.A.a.a.e ENSGT00390000018400.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00940000157369 #26 ENSGT00940000165890 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b.d ENSGT00390000007218 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.a ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000155837 ENSGT00940000158844 P. kingsleyae MODERN SPECIES 146 ENTREP2 (ENSPKIG00000014858) GOLM2 (ENSPKIG00000014876) CTDSPL2 (ENSPKIG00000014916) ENSPKIG00000014991 EIF3J (ENSPKIG00000015047) RAB11A (ENSPKIG00000015102) ENSPKIG00000015215 ENSPKIG00000015455 dis3l (ENSPKIG00000015490) ENSPKIG00000015547 tipin (ENSPKIG00000015565) map2k1 (ENSPKIG00000015608) #22 rpl4 (ENSPKIG00000015644) #24 lctla (ENSPKIG00000015716) #26 smad6a (ENSPKIG00000015767) smad3b (ENSPKIG00000015799) aagab (ENSPKIG00000015838) zgc:162898 (ENSPKIG00000015892) map2k5 (ENSPKIG00000015970) ENSPKIG00000016124 skor1a 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ENSGT00940000157369.a #26 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o.f ENSGT00510000047881 Lumpfish MODERN SPECIES 21 islr2 (ENSCLMG00005001020) stra6 (ENSCLMG00005001018) ENSCLMG00005001017 cyp11a1.1 (ENSCLMG00005001002) stoml1 (ENSCLMG00005001000) nr2e3 (ENSCLMG00005000996) hexa (ENSCLMG00005000513) arih1 (ENSCLMG00005000474) ENSCLMG00005000456 ppcdc (ENSCLMG00005000450) hacd3 (ENSCLMG00005000359) ints14 (ENSCLMG00005000331) SLC24A1 (ENSCLMG00005000323) ENSCLMG00005000266 ENSCLMG00005000242 map2k1 (ENSCLMG00005000174) #22 RPL4 (ENSCLMG00005019911) #24 rpl4 (ENSCLMG00005019898) #24 zwilch (ENSCLMG00005019897) #25 LCTL (ENSCLMG00005019896) #26 snapc5 (ENSCLMG00005019894) #23 smad6b (ENSCLMG00005019893) smad3b (ENSCLMG00005019769) aagab (ENSCLMG00005019765) iqch 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TLE3 (ENSGACG00000005213) kif23 (ENSGACG00000005226) ddb2 (ENSGACG00000005252) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160967.e ENSGT00940000153246.a.a.a.c ENSGT00390000017366 ENSGT00940000158575 ENSGT01030000234614.C ENSGT00940000156926.c ENSGT00390000008107.c.b ENSGT00940000155744 ENSGT00940000169185 ENSGT00440000038107 ENSGT00530000062962.b.a.f ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369.a #26 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b.b ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o.f ENSGT00510000047881 Gilthead seabream MODERN SPECIES 22 islr2 (ENSSAUG00010007366) stra6 (ENSSAUG00010007368) ENSSAUG00010007372 cyp11a1.1 (ENSSAUG00010007387) nr2e3 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#25 LCTL (ENSDLAG00005005497) #26 snapc5 (ENSDLAG00005005541) #23 smad6b (ENSDLAG00005033513) smad3b (ENSDLAG00005005574) aagab (ENSDLAG00005005902) zgc:162898 (ENSDLAG00005031120) skor1b (ENSDLAG00005005972) PIAS1 (ENSDLAG00005006027) ENSDLAG00005006449 morf4l1 (ENSDLAG00005006479) ENSDLAG00005006914 ddb2 (ENSDLAG00005010094) kif23 (ENSDLAG00005007984) Large yellow croaker MODERN SPECIES 492 stra6 (ENSLCRG00005011201) ENSLCRG00005011197 cyp11a1.1 (ENSLCRG00005010309) stoml1 (ENSLCRG00005010303) nr2e3 (ENSLCRG00005010302) hexa (ENSLCRG00005010055) arih1 (ENSLCRG00005010040) ENSLCRG00005010032 ppcdc (ENSLCRG00005010030) hacd3 (ENSLCRG00005009991) ints14 (ENSLCRG00005009985) SLC24A1 (ENSLCRG00005009983) SLC24A1 (ENSLCRG00005009980) ENSLCRG00005009722 ENSLCRG00005009493 map2k1 (ENSLCRG00005009481) #22 rpl4 (ENSLCRG00005008994) #24 zwilch (ENSLCRG00005008990) #25 LCTL (ENSLCRG00005008987) #26 snapc5 (ENSLCRG00005008983) #23 smad6b (ENSLCRG00005008982) smad3b (ENSLCRG00005008972) aagab 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ENSGT00510000047881 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160967.e ENSGT00940000153246.a.a.a.c ENSGT00390000017366 ENSGT00940000158575 ENSGT01030000234614.C ENSGT00940000156926.c ENSGT00390000008107.c.b ENSGT00940000155744 ENSGT00940000169185 ENSGT00440000038107 ENSGT00530000062962.b.a.f ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369.a #26 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160967.e ENSGT00940000153246.a.a.a.c ENSGT00390000017366 ENSGT00940000158575 ENSGT01030000234614.C ENSGT00940000156926.c ENSGT00390000008107.c.b ENSGT00940000155744 ENSGT00940000169185 ENSGT00440000038107 ENSGT00530000062962.b.a.f ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369.a #26 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT00940000181062 ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o Barramundi perch MODERN SPECIES 17 islr2 (ENSLCAG00010011486) stra6 (ENSLCAG00010011487) ENSLCAG00010011491 cyp11a1.1 (ENSLCAG00010011508) nr2e3 (ENSLCAG00010011582) hexa (ENSLCAG00010011617) arih1 (ENSLCAG00010011638) ENSLCAG00010011674 ppcdc (ENSLCAG00010011677) hacd3 (ENSLCAG00010011684) ints14 (ENSLCAG00010011694) SLC24A1 (ENSLCAG00010011706) ENSLCAG00010011723 ENSLCAG00010011752 ENSLCAG00010011758 map2k1 (ENSLCAG00010011873) #22 rpl4 (ENSLCAG00010012306) #24 zwilch (ENSLCAG00010012324) #25 LCTL (ENSLCAG00010012337) #26 snapc5 (ENSLCAG00010012353) #23 smad6b (ENSLCAG00010012358) smad3b (ENSLCAG00010012407) aagab (ENSLCAG00010012566) iqch (ENSLCAG00010012573) zgc:162898 (ENSLCAG00010012578) skor1b (ENSLCAG00010012584) PIAS1 (ENSLCAG00010012593) morf4l1 (ENSLCAG00010012622) ENSLCAG00010012673 TLE3 (ENSLCAG00010012751) kif23 (ENSLCAG00010013211) Seriola ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160967.e ENSGT00940000153246.a.a.a.c ENSGT00390000017366 ENSGT00940000158575 ENSGT01030000234614.C ENSGT00940000156926.c ENSGT00390000008107.c.b ENSGT00940000155744 ENSGT00940000169185 ENSGT00440000038107 ENSGT00530000062962.b.a.f ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369.a #26 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT00940000181062 ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o Greater amberjack MODERN SPECIES 82 stra6 (ENSSDUG00000008630) ENSSDUG00000008592 cyp11a1.1 (ENSSDUG00000008603) stoml1 (ENSSDUG00000008576) nr2e3 (ENSSDUG00000008558) hexa (ENSSDUG00000008531) arih1 (ENSSDUG00000008436) ENSSDUG00000008409 ppcdc (ENSSDUG00000008384) hacd3 (ENSSDUG00000008342) ints14 (ENSSDUG00000008301) SLC24A1 (ENSSDUG00000008280) SLC24A1 (ENSSDUG00000008265) ENSSDUG00000008166 ENSSDUG00000008123 map2k1 (ENSSDUG00000008098) #22 RPL4 (ENSSDUG00000008061) #24 zwilch (ENSSDUG00000008041) #25 LCTL (ENSSDUG00000008008) #26 snapc5 (ENSSDUG00000008001) #23 smad6b (ENSSDUG00000007977) smad3b (ENSSDUG00000007957) aagab (ENSSDUG00000007934) iqch (ENSSDUG00000007847) zgc:162898 (ENSSDUG00000007821) skor1b (ENSSDUG00000007810) PIAS1 (ENSSDUG00000007716) morf4l1 (ENSSDUG00000007640) ENSSDUG00000007621 TLE3 (ENSSDUG00000007577) kif23 (ENSSDUG00000007360) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3044 stra6 (ENSSLDG00000024104) ENSSLDG00000024086 cyp11a1.1 (ENSSLDG00000024083) stoml1 (ENSSLDG00000024076) nr2e3 (ENSSLDG00000023960) hexa (ENSSLDG00000023910) arih1 (ENSSLDG00000023887) ENSSLDG00000023878 ppcdc (ENSSLDG00000023867) hacd3 (ENSSLDG00000023846) ints14 (ENSSLDG00000023818) ENSSLDG00000023813 SLC24A1 (ENSSLDG00000023774) ENSSLDG00000023736 ENSSLDG00000023706 map2k1 (ENSSLDG00000023678) #22 rpl4 (ENSSLDG00000023658) #24 zwilch (ENSSLDG00000023641) #25 LCTL (ENSSLDG00000023587) #26 snapc5 (ENSSLDG00000023570) #23 smad6b (ENSSLDG00000023557) smad3b (ENSSLDG00000023534) aagab (ENSSLDG00000023521) iqch (ENSSLDG00000023494) zgc:162898 (ENSSLDG00000023483) skor1b (ENSSLDG00000023468) PIAS1 (ENSSLDG00000023434) morf4l1 (ENSSLDG00000023383) ENSSLDG00000023373 TLE3 (ENSSLDG00000023328) kif23 (ENSSLDG00000023233) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015516 ENSGT00940000158358.a ENSGT00940000160967.e ENSGT00940000153246.a.a.a.c ENSGT00390000017366 ENSGT00940000158575 ENSGT01030000234614.C ENSGT00940000155744 ENSGT00940000169185 ENSGT00440000038107 ENSGT00530000062962.b.a.f ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369.a #26 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 Tongue sole MODERN SPECIES 16 neil1 (ENSCSEG00000006485) commd4 (ENSCSEG00000006503) sema7a (ENSCSEG00000006572) islr2 (ENSCSEG00000006581) stra6 (ENSCSEG00000006586) ENSCSEG00000006602 cyp11a1.1 (ENSCSEG00000006612) stoml1 (ENSCSEG00000006621) ARIH1 (ENSCSEG00000006629) ENSCSEG00000006651 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#22 rpl4 (ENSSMAG00000014547) #24 zwilch (ENSSMAG00000014527) #25 LCTL (ENSSMAG00000014482) #26 snapc5 (ENSSMAG00000014452) #23 smad6b (ENSSMAG00000014437) smad3b (ENSSMAG00000014385) aagab (ENSSMAG00000014364) iqch (ENSSMAG00000014326) zgc:162898 (ENSSMAG00000014311) skor1b (ENSSMAG00000014267) PIAS1 (ENSSMAG00000014246) morf4l1 (ENSSMAG00000014185) ENSSMAG00000013997 kif23 (ENSSMAG00000013831) ddb2 (ENSSMAG00000013800) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160967.e ENSGT00940000153246.a.a.a.c ENSGT00390000017366 ENSGT00940000158575 ENSGT01030000234614.C ENSGT00940000156926.c ENSGT00390000008107.c.b ENSGT00940000155744 ENSGT00940000169185 ENSGT00440000038107 ENSGT00530000062962.b.a.f ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369.a #26 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 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Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 368 stra6 (ENSHBUG00000013870) ENSHBUG00000013854 cyp11a1.1 (ENSHBUG00000013842) stoml1 (ENSHBUG00000013845) nr2e3 (ENSHBUG00000013798) hexa (ENSHBUG00000013611) arih1 (ENSHBUG00000013587) ENSHBUG00000013489 ppcdc (ENSHBUG00000013452) hacd3 (ENSHBUG00000013444) ints14 (ENSHBUG00000013409) SLC24A1 (ENSHBUG00000013345) ENSHBUG00000013307 ENSHBUG00000013075 ENSHBUG00000012853 map2k1 (ENSHBUG00000012769) #22 rpl4 (ENSHBUG00000012721) #24 zwilch (ENSHBUG00000012704) #25 LCTL (ENSHBUG00000012695) #26 snapc5 (ENSHBUG00000012617) #23 smad6b (ENSHBUG00000012608) ENSHBUG00000012576 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160967.e ENSGT00940000153246.a.a.a.c ENSGT00390000017366 ENSGT00940000158575 ENSGT01030000234614.C ENSGT00940000156926.c ENSGT00390000008107.c.b ENSGT00940000155744 ENSGT00940000169185 ENSGT00440000038107 ENSGT00530000062962.b.a.f ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b 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ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183151.a.a.b.b ENSGT00940000156356 ENSGT00940000157335 ENSGT01050000244866.C ENSGT00940000156011 ENSGT00390000015052 ENSGT00940000155744 ENSGT00940000169185 ENSGT00440000038107 ENSGT00530000062962.b.a.f ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369.a #26 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.i ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b.j ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000235447 ENSGT00940000157475.s.b Channel catfish MODERN SPECIES 23 sf3b3 (ENSIPUG00000020435) st3gal2 (ENSIPUG00000020529) aars (ENSIPUG00000020538) ENSIPUG00000020630 pllp (ENSIPUG00000020662) arl2bp (ENSIPUG00000020669) arih1 (ENSIPUG00000020676) c4h15orf39 (ENSIPUG00000021229) ppcdc (ENSIPUG00000021242) hacd3 (ENSIPUG00000021269) vwa9 (ENSIPUG00000021289) slc24a1 (ENSIPUG00000021316) dennd4a (ENSIPUG00000021338) Rab11a (ENSIPUG00000021401) megf11 (ENSIPUG00000021414) map2k1 (ENSIPUG00000021471) #22 rpl4-b (ENSIPUG00000021502) #24 zwilch (ENSIPUG00000021572) #25 LCTL (ENSIPUG00000021616) #26 snapc5 (ENSIPUG00000021633) #23 SMAD6 (ENSIPUG00000021637) smad3b (ENSIPUG00000021649) AAGAB (ENSIPUG00000021694) iqch (ENSIPUG00000021716) c4h15orf61 (ENSIPUG00000021762) skor1b (ENSIPUG00000022829) PIAS1 (ENSIPUG00000022852) morf4l1 (ENSIPUG00000022885) ENSIPUG00000022933 gro2 (ENSIPUG00000022942) kif23 (ENSIPUG00000022986) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183151.a.a.b.b ENSGT00940000156356 ENSGT00940000157335 ENSGT01050000244866.C ENSGT00940000156011 ENSGT00390000015052 ENSGT00940000155744 ENSGT00940000169185 ENSGT00440000038107 ENSGT00530000062962.b.a.f ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369.a #26 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.i ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b.j ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000235447 ENSGT00940000157475.s.b Electric eel MODERN SPECIES 655 ppcdc (ENSEEEG00000022669) hacd3 (ENSEEEG00000022666) ints14 (ENSEEEG00000022663) SLC24A1 (ENSEEEG00000022661) dennd4a (ENSEEEG00000022659) rab11a (ENSEEEG00000022658) ENSEEEG00000022657 ENSEEEG00000022655 map2k1 (ENSEEEG00000022402) #22 slc28a1 (ENSEEEG00000022360) ENSEEEG00000022359 ENSEEEG00000022358 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000183151.a.a.b.b ENSGT00940000156356 ENSGT00940000157335 ENSGT01050000244866.C ENSGT00940000156011 ENSGT00390000015052 ENSGT00940000155744 ENSGT00940000169185 ENSGT00440000038107 ENSGT00530000062962.b.a.f ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369.a #26 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.i ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b.j ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT00940000157475.t ENSGT01030000235447 Mexicana tetra MODERN SPECIES 9 sf3b3 (ENSAMXG00000003410) st3gal2 (ENSAMXG00000003386) aars1 (ENSAMXG00000003368) ENSAMXG00000003354 pllp (ENSAMXG00000037550) arl2bp (ENSAMXG00000039327) arih1 (ENSAMXG00000003281) ENSAMXG00000003257 ppcdc (ENSAMXG00000038023) hacd3 (ENSAMXG00000036622) ints14 (ENSAMXG00000003207) SLC24A1 (ENSAMXG00000003180) dennd4a (ENSAMXG00000003173) rab11a (ENSAMXG00000003155) ENSAMXG00000003031 map2k1 (ENSAMXG00000003000) #22 rpl4 (ENSAMXG00000029678) #24 zwilch (ENSAMXG00000042209) #25 LCTL (ENSAMXG00000002915) #26 snapc5 (ENSAMXG00000035746) #23 ENSAMXG00000042016 smad6b (ENSAMXG00000002889) smad3b (ENSAMXG00000002880) aagab (ENSAMXG00000034247) iqch (ENSAMXG00000002847) zgc:162898 (ENSAMXG00000002824) ENSAMXG00000039689 skor1b (ENSAMXG00000002804) PIAS1 (ENSAMXG00000002784) morf4l1 (ENSAMXG00000002753) ENSAMXG00000040454 Red-bellied piranha MODERN SPECIES sf3b3 (ENSPNAG00000015419) st3gal2 (ENSPNAG00000015314) aars1 (ENSPNAG00000015269) ENSPNAG00000015237 pllp (ENSPNAG00000015182) arl2bp (ENSPNAG00000015169) arih1 (ENSPNAG00000015135) ENSPNAG00000015080 ppcdc (ENSPNAG00000015060) hacd3 (ENSPNAG00000015056) ints14 (ENSPNAG00000015024) SLC24A1 (ENSPNAG00000003338) dennd4a (ENSPNAG00000014917) rab11a (ENSPNAG00000014863) ENSPNAG00000014837 map2k1 (ENSPNAG00000014728) #22 rpl4 (ENSPNAG00000014698) #24 zwilch (ENSPNAG00000014620) #25 LCTL (ENSPNAG00000003168) #26 snapc5 (ENSPNAG00000014521) #23 smad6b (ENSPNAG00000014508) smad3b (ENSPNAG00000003144) aagab (ENSPNAG00000014473) iqch (ENSPNAG00000014434) zgc:162898 (ENSPNAG00000003117) skor1b (ENSPNAG00000014398) PIAS1 (ENSPNAG00000014367) ENSPNAG00000014295 morf4l1 (ENSPNAG00000014280) ENSPNAG00000014247 tle3a (ENSPNAG00000003051) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183151.a.a.b.b ENSGT00940000156356 ENSGT00940000157335 ENSGT01050000244866.C ENSGT00940000156011 ENSGT00390000015052 ENSGT00940000155744 ENSGT00940000169185 ENSGT00440000038107 ENSGT00530000062962.b.a.f ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369.a #26 ENSGT00390000010331 #23 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.i ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b.j ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000235447 ENSGT00940000157475.s.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 123 ENSGT00950000183151.a.a.b.b.i ENSGT00940000156356.d ENSGT00940000157335.l ENSGT01050000244866.C.b ENSGT00940000156011.`b ENSGT00390000015052.b ENSGT00940000155744.g.a ENSGT00940000169185.a ENSGT00440000038107.o ENSGT00530000062962.b.a.f.a ENSGT00390000009486.e ENSGT01030000234532.B.e.b.f.b ENSGT00940000155836.B.c ENSGT00940000154914.tb ENSGT00940000155333.A.b.b ENSGT00940000153487.b.b.s #22 ENSGT00390000018145.f #24 ENSGT00940000157369.a.c #26 ENSGT00390000010331.n #23 ENSGT00940000158146.b.f ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.i.b ENSGT00390000007218.q ENSGT00390000008908.a Goldfish MODERN SPECIES 37 sf3b3 (ENSCARG00000065369) st3gal2 (ENSCARG00000065325) aars1 (ENSCARG00000065093) ENSCARG00000064321 pllp (ENSCARG00000064293) arl2bp (ENSCARG00000064261) arih1 (ENSCARG00000063977) ENSCARG00000063954 ppcdc (ENSCARG00000063932) hacd3 (ENSCARG00000063827) ints14 (ENSCARG00000063746) SLC24A1 (ENSCARG00000063727) dennd4a (ENSCARG00000062471) rab11a (ENSCARG00000062368) ENSCARG00000058612 map2k1 (ENSCARG00000057706) #22 rpl4 (ENSCARG00000057625) #24 LCTL (ENSCARG00000057492) #26 snapc5 (ENSCARG00000057463) #23 smad6b (ENSCARG00000057432) smad3b (ENSCARG00000057166) aagab (ENSCARG00000057137) ENSCARG00000057132 skor1b (ENSCARG00000057106) ENSCARG00000057077 ENSCARG00000057062 ric8b (ENSCARG00000057023) rfx4 (ENSCARG00000056887) mlycd (ENSCARG00000056868) clns1a (ENSCARG00000056853) aqp11 (ENSCARG00000056843) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 131 ENSGT00950000183151.a.a.b.b.i ENSGT00940000156356.d ENSGT00940000157335.l ENSGT01050000244866.C.b ENSGT00940000156011.`b ENSGT00390000015052.b ENSGT00940000155744.g.a ENSGT00940000169185.a ENSGT00440000038107.o ENSGT00530000062962.b.a.f.a ENSGT00390000009486.e ENSGT01030000234532.B.e.b.f.b ENSGT00940000155836.B.c ENSGT00940000154914.tb ENSGT00940000155333.A.b.b ENSGT00940000153487.b.b.s #22 ENSGT00390000018145.f #24 ENSGT00390000013696.f #25 ENSGT00940000157369.a.c #26 ENSGT00390000010331.n #23 ENSGT00940000158146.b.f ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.i.b ENSGT00390000007218.q ENSGT00390000008908.a Common carp reference MODERN SPECIES 9 sf3b3 (ENSCCRG00000024068) st3gal2 (ENSCCRG00000076295) aars1 (ENSCCRG00000005376) ENSCCRG00000006513 pllp (ENSCCRG00000005176) arl2bp (ENSCCRG00000005183) arih1 (ENSCCRG00000025952) ENSCCRG00000081007 ppcdc (ENSCCRG00000018299) hacd3 (ENSCCRG00000017852) ints14 (ENSCCRG00000047151) SLC24A1 (ENSCCRG00000066083) dennd4a (ENSCCRG00000020231) rab11a (ENSCCRG00000059058) ENSCCRG00000009371 map2k1 (ENSCCRG00000035016) #22 rpl4 (ENSCCRG00000034465) #24 LCTL (ENSCCRG00000034940) #26 snapc5 (ENSCCRG00000076911) #23 smad6b (ENSCCRG00000028531) smad3b (ENSCCRG00000014185) aagab (ENSCCRG00000014234) iqch (ENSCCRG00000014287) ENSCCRG00000064665 skor1b (ENSCCRG00000043233) PIAS1 (ENSCCRG00000043261) ENSCCRG00000031056 morf4l1 (ENSCCRG00000031057) ENSCCRG00000064433 ENSCCRG00000043403 tle3a (ENSCCRG00000029847) Golden-line barbel MODERN SPECIES 54 SF3B3 (ENSSGRG00000030799) ENSSGRG00000030794 ENSSGRG00000030795 st3gal2 (ENSSGRG00000030792) aars1 (ENSSGRG00000029996) ENSSGRG00000029983 arih1 (ENSSGRG00000029910) ENSSGRG00000029906 ppcdc (ENSSGRG00000029905) hacd3 (ENSSGRG00000029894) ints14 (ENSSGRG00000029760) SLC24A1 (ENSSGRG00000029751) dennd4a (ENSSGRG00000028490) rab11a (ENSSGRG00000028469) ENSSGRG00000028343 map2k1 (ENSSGRG00000026412) #22 rpl4 (ENSSGRG00000026237) #24 zwilch (ENSSGRG00000026228) #25 LCTL (ENSSGRG00000026226) #26 snapc5 (ENSSGRG00000026223) #23 smad6b (ENSSGRG00000026221) smad3b (ENSSGRG00000025385) aagab (ENSSGRG00000025352) iqch (ENSSGRG00000025341) zgc:162898 (ENSSGRG00000025335) skor1b (ENSSGRG00000025333) ENSSGRG00000025332 PIAS1 (ENSSGRG00000025330) morf4l1 (ENSSGRG00000025132) ENSSGRG00000025130 tle3a (ENSSGRG00000022755) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT00950000183151.a.a.b.b.j 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ENSGT00940000155333.A.b.a ENSGT00940000153487.b.b.t #22 ENSGT00390000018145.e #24 ENSGT00390000013696.e #25 ENSGT00940000157369.a.d #26 ENSGT00390000010331.m #23 ENSGT00940000158146.b.e ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.i.a ENSGT00390000007218.r ENSGT00390000008908.b ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00950000182965.a.b.a.a.c ENSGT01030000235447.a ENSGT00940000157475.s.b.b ENSGT01030000234519.e.b.j.b.a.b Golden-line barbel MODERN SPECIES 224 ppcdc (ENSSGRG00000053835) hacd3 (ENSSGRG00000053825) ints14 (ENSSGRG00000053784) SLC24A1 (ENSSGRG00000053777) dennd4a (ENSSGRG00000053530) rab11a (ENSSGRG00000053474) ENSSGRG00000053461 map2k1 (ENSSGRG00000053371) #22 rpl4 (ENSSGRG00000053329) #24 zwilch (ENSSGRG00000053327) #25 LCTL (ENSSGRG00000053324) #26 snapc5 (ENSSGRG00000053323) #23 smad6b (ENSSGRG00000053322) ENSSGRG00000053321 aagab (ENSSGRG00000053318) iqch (ENSSGRG00000053315) zgc:162898 (ENSSGRG00000053314) ENSSGRG00000053214 ENSSGRG00000053206 morf4l1 (ENSSGRG00000053205) ENSSGRG00000053204 tle3a (ENSSGRG00000051652) ENSSGRG00000051635 Common carp reference MODERN SPECIES 19 sf3b3 (ENSCCRG00000026756) st3gal2 (ENSCCRG00000077284) aars1 (ENSCCRG00000004748) ENSCCRG00000005086 arl2bp (ENSCCRG00000058906) arih1 (ENSCCRG00000005206) ENSCCRG00000071734 ppcdc (ENSCCRG00000072999) hacd3 (ENSCCRG00000047136) ints14 (ENSCCRG00000017792) SLC24A1 (ENSCCRG00000009282) ENSCCRG00000072431 dennd4a (ENSCCRG00000009528) rab11a (ENSCCRG00000009402) ENSCCRG00000073950 map2k1 (ENSCCRG00000077344) #22 zwilch (ENSCCRG00000034439) #25 LCTL (ENSCCRG00000017070) #26 snapc5 (ENSCCRG00000078719) #23 smad6b (ENSCCRG00000017061) smad3b (ENSCCRG00000067387) aagab (ENSCCRG00000016912) iqch (ENSCCRG00000077345) skor1b (ENSCCRG00000014176) PIAS1 (ENSCCRG00000030976) morf4l1 (ENSCCRG00000043359) ENSCCRG00000076672 tle3a (ENSCCRG00000030091) kif23 (ENSCCRG00000015859) ddb2 (ENSCCRG00000061260) kbtbd4 (ENSCCRG00000057703) Zebrafish MODERN SPECIES 9 aars1 (ENSDARG00000069142) ENSDARG00000093381 pllp (ENSDARG00000062756) arl2bp (ENSDARG00000025383) arih1 (ENSDARG00000003616) ENSDARG00000069168 ppcdc (ENSDARG00000033020) hacd3 (ENSDARG00000016038) ints14 (ENSDARG00000041429) SLC24A1 (ENSDARG00000041431) dennd4a (ENSDARG00000062721) ENSDARG00000092535 ENSDARG00000069189 rab11a (ENSDARG00000041450) ENSDARG00000062686 map2k1 (ENSDARG00000007825) #22 rpl4 (ENSDARG00000041182) #24 zwilch (ENSDARG00000057100) #25 LCTL (ENSDARG00000016337) #26 snapc5 (ENSDARG00000062476) #23 smad6b (ENSDARG00000031763) smad3b (ENSDARG00000010207) aagab (ENSDARG00000041170) iqch (ENSDARG00000015476) C18H15orf61 (ENSDARG00000111588) skor1b (ENSDARG00000062448) PIAS1 (ENSDARG00000062445) ENSDARG00000069246 morf4l1 (ENSDARG00000041155) ENSDARG00000069250 tle3a (ENSDARG00000002787) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000153246.a.a.a.c ENSGT00390000017366.cb ENSGT00940000158575 ENSGT01030000234614.C ENSGT00940000156926.c ENSGT00390000008107.c.b ENSGT00940000155744 ENSGT00940000169185 ENSGT00440000038107 ENSGT00530000062962.b.a.f ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT00940000155836.B.e ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b #22 ENSGT00390000018145 #24 ENSGT00390000013696 #25 ENSGT00940000157369.a #26 ENSGT00390000010331 #23 Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 19 ENSCHAG00000004932 ENSCHAG00000004915 cyp11a1.1 (ENSCHAG00000004846) stoml1 (ENSCHAG00000004806) nr2e3 (ENSCHAG00000004783) hexa (ENSCHAG00000004565) arih1 (ENSCHAG00000004536) ENSCHAG00000004518 ppcdc (ENSCHAG00000004502) hacd3 (ENSCHAG00000004038) ints14 (ENSCHAG00000003814) SLC24A1 (ENSCHAG00000003677) dennd4a (ENSCHAG00000003270) rab11a (ENSCHAG00000002433) ENSCHAG00000000584 map2k1 (ENSCHAG00000000220) #22 snapc5 (ENSCHAG00000000160) #23 LCTL (ENSCHAG00000000142) #26 zwilch (ENSCHAG00000000117) #25 rpl4 (ENSCHAG00000023757) #24 map2k1 (ENSCHAG00000023747) #22 smad6b (ENSCHAG00000023735) 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(ENSCHAG00000004502) ENSCHAG00000004518 arih1 (ENSCHAG00000004536) hexa (ENSCHAG00000004565) Denticle herring MODERN SPECIES 8 ENSDCDG00000032979 rag1 (ENSDCDG00000032976) rag2 (ENSDCDG00000032974) ENSDCDG00000032973 lrrc4ca (ENSDCDG00000032970) ehf (ENSDCDG00000032967) pdhx (ENSDCDG00000032954) ENSDCDG00000032947 slc1a2b (ENSDCDG00000032937) PAMR1 (ENSDCDG00000032928) FJX1 (ENSDCDG00000032922) trim44 (ENSDCDG00000032920) LDLRAD3 (ENSDCDG00000032916) ENSDCDG00000032901 gdpgp1 (ENSDCDG00000032893) map2k1 (ENSDCDG00000032785) #22 rpl4 (ENSDCDG00000032764) #24 zwilch (ENSDCDG00000032759) #25 LCTL (ENSDCDG00000032757) #26 snapc5 (ENSDCDG00000032755) #23 FBXO31 (ENSDCDG00000032703) fanci (ENSDCDG00000032690) POLG (ENSDCDG00000032684) rhcgb (ENSDCDG00000032660) hdhd5 (ENSDCDG00000032645) ccdc77 (ENSDCDG00000032627) ENSDCDG00000032625 ENSDCDG00000032624 ENSDCDG00000032622 avpr1ab (ENSDCDG00000032619) ppm1h (ENSDCDG00000032608) Elephant shark MODERN SPECIES 1490 gabpb1 (ENSCMIG00000018784) zgc:158482 (ENSCMIG00000018766) gatm (ENSCMIG00000018754) pde8a (ENSCMIG00000018732) ENSCMIG00000018718 ENSCMIG00000018715 HOMER2 (ENSCMIG00000018710) hacd3 (ENSCMIG00000018702) ints14 (ENSCMIG00000018688) SLC24A1 (ENSCMIG00000018682) dennd4a (ENSCMIG00000018666) rab11a (ENSCMIG00000018649) MEGF11 (ENSCMIG00000018640) dis3l (ENSCMIG00000018578) tipin (ENSCMIG00000018527) map2k1 (ENSCMIG00000018523) #22 zwilch (ENSCMIG00000018499) #25 rpl4 (ENSCMIG00000018485) #24 lctla (ENSCMIG00000018484) #26 crybgx (ENSCMIG00000018479) ENSCMIG00000018477 #23 si:ch211-107o10.3 (ENSCMIG00000018476) ENSCMIG00000018474 RASGRF1 (ENSCMIG00000018392) ctsh (ENSCMIG00000018300) ENSCMIG00000018282 BLM (ENSCMIG00000018273) ENSCMIG00000018267 FRMD5 (ENSCMIG00000018265) ENSCMIG00000018260 ctdspl2a (ENSCMIG00000018251) Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.a ##22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.a ##22 Lamprey MODERN SPECIES 5621 ENSPMAG00000000606 ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 301 ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000157006 ENSGT01030000234542.b.b.a.b Elephant shark MODERN SPECIES 1570 EPS15L1 (ENSCMIG00000018358) klf2a (ENSCMIG00000018504) ap1m1 (ENSCMIG00000018540) FAM32A (ENSCMIG00000018642) ENSCMIG00000018660 ctns (ENSCMIG00000018690) palm1b (ENSCMIG00000018692) PLPPR3 (ENSCMIG00000018693) ENSCMIG00000018694 ENSCMIG00000018701 ENSCMIG00000018717 ENSCMIG00000018722 sirt6 (ENSCMIG00000018726) rxfp3.2b (ENSCMIG00000018736) ENSCMIG00000018739 map2k2a (ENSCMIG00000018756) ##22 ZBTB7A (ENSCMIG00000018762) ENSCMIG00000018764 eef2 (ENSCMIG00000018833) ENSCMIG00000018922 ENSCMIG00000018924 ENSCMIG00000018925 ENSCMIG00000018973 ENSCMIG00000019127 ENSCMIG00000019213 ENSCMIG00000019261 ENSCMIG00000019263 ENSCMIG00000019266 dpp9 (ENSCMIG00000019315) rpl37 (ENSCMIG00000019413) elavl1b (ENSCMIG00000019418) Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00990000205656 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT00940000157006 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b ENSGT00390000002049.d ENSGT00940000156893 ENSGT00390000018360 ENSGT00390000011497 ENSGT00950000183094.a ENSGT00940000159348 ENSGT00940000161136 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00990000205656 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.b.b ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.a ENSGT00940000163917.b ENSGT00390000018044.b.b ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 Coelacanth MODERN SPECIES 723 STAP2 (ENSLACG00000002248) FSD1 (ENSLACG00000003071) SHD (ENSLACG00000005422) YJU2 (ENSLACG00000006741) EBI3 (ENSLACG00000007004) ANKRD24 (ENSLACG00000007315) SIRT6 (ENSLACG00000007794) rxfp3.2b (ENSLACG00000008427) CREB3L3 (ENSLACG00000009185) MAP2K2 (ENSLACG00000009760) ##22 ZBTB7A (ENSLACG00000010404) ENSLACG00000010819 PIAS4 (ENSLACG00000010963) ENSLACG00000011124 ATCAY (ENSLACG00000011669) ZFR2 (ENSLACG00000012528) MATK (ENSLACG00000013081) rx1 (ENSLACG00000013485) malt2 (ENSLACG00000013659) MRPL54 (ENSLACG00000013912) APBA3 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ENSGT00940000160775 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.a ENSGT00940000163917.b ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.B ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00390000003420.b ENSGT00940000161213 Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad MODERN SPECIES 8 ENSLLEG00000021560 ENSLLEG00000021602 ENSLLEG00000021646 ENSLLEG00000021855 MC4R (ENSLLEG00000011826) C5orf22 (ENSLLEG00000011880) DROSHA (ENSLLEG00000012129) CDH6 (ENSLLEG00000012511) ENSLLEG00000012591 ENSLLEG00000012612 ENSLLEG00000012632 ENSLLEG00000012660 CDH9 (ENSLLEG00000012695) ENSLLEG00000012816 ENSLLEG00000012829 ENSLLEG00000012847 ##22 CDH10 (ENSLLEG00000012889) ENSLLEG00000013098 ENSLLEG00000013141 ENSLLEG00000013184 ENSLLEG00000013196 ENSLLEG00000013265 ENSLLEG00000013286 ENSLLEG00000013316 CDH12 (ENSLLEG00000013338) ENSLLEG00000013489 ENSLLEG00000013506 CDH18 (ENSLLEG00000013553) ENSLLEG00000013707 BASP1 (ENSLLEG00000013754) MYO10 (ENSLLEG00000013821) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 2 ENSLLEG00000008683 ENSLLEG00000008806 ENSLLEG00000010502 ENSLLEG00000010529 PPP6R1 (ENSLLEG00000010593) HSPBP1 (ENSLLEG00000011041) ENSLLEG00000011177 ENSLLEG00000011381 TMEM150B (ENSLLEG00000011417) KMT5C (ENSLLEG00000011497) ENSLLEG00000011558 ENSLLEG00000011576 BCAT2 (ENSLLEG00000011616) HSD17B14 (ENSLLEG00000011697) ENSLLEG00000011759 ENSLLEG00000012012 ##22 KCNJ14 (ENSLLEG00000013122) ENSLLEG00000013150 ENSLLEG00000013194 ENSLLEG00000013569 ENSLLEG00000013878 ENSLLEG00000013958 LMTK3 (ENSLLEG00000014127) ENSLLEG00000014250 ENSLLEG00000014292 GRWD1 (ENSLLEG00000014350) GRIN2D (ENSLLEG00000014407) ENSLLEG00000014494 ENSLLEG00000014520 KDELR1 (ENSLLEG00000014551) TMEM143 (ENSLLEG00000014662) Leishan spiny toad MODERN SPECIES APBA3 (ENSLLEG00000005030) ENSLLEG00000004137 MRPL54 (ENSLLEG00000004133) ENSLLEG00000004130 ENSLLEG00000004129 ATCAY (ENSLLEG00000004102) ENSLLEG00000004087 ENSLLEG00000004084 ENSLLEG00000004080 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ENSGT00940000160775 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.a ENSGT00940000163917.b ENSGT00390000018044.b.b ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163917.b ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.B ENSGT01030000234559.a.a.a Platypus MODERN SPECIES 85 SMARCA4 (ENSOANG00000004355) TIMM29 (ENSOANG00000036642) YIPF2 (ENSOANG00000050867) CARM1 (ENSOANG00000045313) ENSOANG00000009834 TMED1 (ENSOANG00000037520) DNM2 (ENSOANG00000013365) ENSOANG00000006439 FSD1 (ENSOANG00000006431) SHD (ENSOANG00000014374) YJU2 (ENSOANG00000008914) EBI3 (ENSOANG00000028577) ANKRD24 (ENSOANG00000048879) SIRT6 (ENSOANG00000008787) CREB3L3 (ENSOANG00000013246) MAP2K2 (ENSOANG00000045918) ##22 ZBTB7A (ENSOANG00000045647) PIAS4 (ENSOANG00000031620) ENSOANG00000014032 DAPK3 (ENSOANG00000003319) NMRK2 (ENSOANG00000035130) ATCAY (ENSOANG00000006292) ENSOANG00000011220 MATK (ENSOANG00000010674) ENSOANG00000037708 APBA3 (ENSOANG00000006293) TJP3 (ENSOANG00000006294) PIP5K1C (ENSOANG00000006295) TBXA2R (ENSOANG00000037569) HMG20B (ENSOANG00000013515) ENSOANG00000014325 Theria ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163917.b ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.B ENSGT01030000234559.a.a.a Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163917.b ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00390000001450.h.a.b.b ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.B Opossum MODERN SPECIES 2 ENSMODG00000001022 PLIN5 (ENSMODG00000001016) ENSMODG00000000998 HDGFL2 (ENSMODG00000000988) ENSMODG00000000967 CHAF1A (ENSMODG00000000950) SH3GL1 (ENSMODG00000000931) MPND (ENSMODG00000000907) STAP2 (ENSMODG00000000895) FSD1 (ENSMODG00000000881) ENSMODG00000027838 SHD (ENSMODG00000000858) YJU2 (ENSMODG00000000841) ENSMODG00000024036 CREB3L3 (ENSMODG00000000817) MAP2K2 (ENSMODG00000000809) ##22 ZBTB7A (ENSMODG00000000778) ENSMODG00000045895 PIAS4 (ENSMODG00000000765) EEF2 (ENSMODG00000000750) DAPK3 (ENSMODG00000043143) NMRK2 (ENSMODG00000000709) ATCAY (ENSMODG00000000696) ZFR2 (ENSMODG00000000675) MATK (ENSMODG00000000637) ENSMODG00000000607 ENSMODG00000000602 APBA3 (ENSMODG00000000598) TJP3 (ENSMODG00000000580) VN2R501 (ENSMODG00000037853) monDomV1R1215 (ENSMODG00000039829) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163917.b ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000154650.d.f.d.a.a ENSGT00390000001450.h.a.b.b Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163917.b ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000154650.d.f.d.a.a ENSGT00390000001450.h.a.b.b Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163917.b ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000154650.d.f.d.a.a ENSGT00390000001450.h.a.b.b koala MODERN SPECIES 214 ENSPCIG00000012395 ENSPCIG00000003958 HDGFL2 (ENSPCIG00000003977) UBXN6 (ENSPCIG00000006287) CHAF1A (ENSPCIG00000006291) SH3GL1 (ENSPCIG00000006316) MPND (ENSPCIG00000006318) STAP2 (ENSPCIG00000006321) FSD1 (ENSPCIG00000006329) SHD (ENSPCIG00000006337) YJU2 (ENSPCIG00000006341) EBI3 (ENSPCIG00000036381) ENSPCIG00000035510 SIRT6 (ENSPCIG00000006432) CREB3L3 (ENSPCIG00000006434) MAP2K2 (ENSPCIG00000006438) ##22 ZBTB7A (ENSPCIG00000025417) PIAS4 (ENSPCIG00000025412) EEF2 (ENSPCIG00000025403) DAPK3 (ENSPCIG00000025399) NMRK2 (ENSPCIG00000025398) ATCAY (ENSPCIG00000025395) ZFR2 (ENSPCIG00000025388) MATK (ENSPCIG00000025386) ENSPCIG00000025384 MRPL54 (ENSPCIG00000025383) APBA3 (ENSPCIG00000025381) TJP3 (ENSPCIG00000025374) Common wonbat MODERN SPECIES 580 HDGFL2 (ENSVURG00010024626) UBXN6 (ENSVURG00010024630) ENSVURG00010024633 SH3GL1 (ENSVURG00010024635) MPND (ENSVURG00010024637) STAP2 (ENSVURG00010024642) FSD1 (ENSVURG00010024652) ENSVURG00010024655 SHD (ENSVURG00010024657) ENSVURG00010024660 YJU2 (ENSVURG00010024661) EBI3 (ENSVURG00010024663) ANKRD24 (ENSVURG00010024667) SIRT6 (ENSVURG00010024673) CREB3L3 (ENSVURG00010024676) MAP2K2 (ENSVURG00010024677) ##22 ZBTB7A (ENSVURG00010024681) PIAS4 (ENSVURG00010024683) EEF2 (ENSVURG00010024687) DAPK3 (ENSVURG00010024691) ATCAY (ENSVURG00010024696) ZFR2 (ENSVURG00010024701) MATK (ENSVURG00010024711) ENSVURG00010024713 MRPL54 (ENSVURG00010024716) APBA3 (ENSVURG00010024720) TJP3 (ENSVURG00010024727) ENSVURG00010024737 ENSVURG00010024739 ENSVURG00010024741 ENSVURG00010024743 Wallaby MODERN SPECIES 3377 ENSMEUG00000012103 ##22 Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000002056 PLIN5 (ENSSHAG00000003441) ENSSHAG00000027707 UBXN6 (ENSSHAG00000029235) CHAF1A (ENSSHAG00000000307) ENSSHAG00000000851 MPND (ENSSHAG00000000206) STAP2 (ENSSHAG00000023692) FSD1 (ENSSHAG00000030022) SHD (ENSSHAG00000010563) YJU2 (ENSSHAG00000010428) EBI3 (ENSSHAG00000027537) ANKRD24 (ENSSHAG00000010216) SIRT6 (ENSSHAG00000009965) CREB3L3 (ENSSHAG00000009874) MAP2K2 (ENSSHAG00000009251) ##22 ZBTB7A (ENSSHAG00000027505) PIAS4 (ENSSHAG00000024821) EEF2 (ENSSHAG00000007539) DAPK3 (ENSSHAG00000030421) ENSSHAG00000030604 ATCAY (ENSSHAG00000006184) ENSSHAG00000004724 MATK (ENSSHAG00000003362) ENSSHAG00000003118 MRPL54 (ENSSHAG00000002557) APBA3 (ENSSHAG00000002223) TJP3 (ENSSHAG00000001439) ENSSHAG00000024272 ENSSHAG00000030563 ENSSHAG00000030933 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00520000060565 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00520000060565 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Primates ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Coquerels sifaka MODERN SPECIES 348 ENSPCOG00000021711 HDGFL2 (ENSPCOG00000009336) UBXN6 (ENSPCOG00000027732) CHAF1A (ENSPCOG00000024961) SH3GL1 (ENSPCOG00000025140) MPND (ENSPCOG00000014436) STAP2 (ENSPCOG00000021854) FSD1 (ENSPCOG00000023842) TMIGD2 (ENSPCOG00000022704) SHD (ENSPCOG00000023655) YJU2 (ENSPCOG00000017988) EBI3 (ENSPCOG00000022898) ANKRD24 (ENSPCOG00000012089) SIRT6 (ENSPCOG00000028709) CREB3L3 (ENSPCOG00000017862) MAP2K2 (ENSPCOG00000004497) ##22 ZBTB7A (ENSPCOG00000027776) PIAS4 (ENSPCOG00000004662) EEF2 (ENSPCOG00000023522) DAPK3 (ENSPCOG00000023275) NMRK2 (ENSPCOG00000022831) ATCAY (ENSPCOG00000027482) ZFR2 (ENSPCOG00000016923) MATK (ENSPCOG00000018010) RAX2 (ENSPCOG00000022891) MRPL54 (ENSPCOG00000027550) APBA3 (ENSPCOG00000026721) TJP3 (ENSPCOG00000020238) PIP5K1C (ENSPCOG00000021588) CACTIN (ENSPCOG00000015989) TBXA2R (ENSPCOG00000015698) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 916 HDGFL2 (ENSPSMG00000019994) UBXN6 (ENSPSMG00000019891) CHAF1A (ENSPSMG00000019830) SH3GL1 (ENSPSMG00000019735) MPND (ENSPSMG00000019676) STAP2 (ENSPSMG00000019657) FSD1 (ENSPSMG00000019636) ENSPSMG00000019578 SHD (ENSPSMG00000019570) ENSPSMG00000019546 YJU2 (ENSPSMG00000019539) EBI3 (ENSPSMG00000019525) ANKRD24 (ENSPSMG00000019514) SIRT6 (ENSPSMG00000019501) CREB3L3 (ENSPSMG00000019448) MAP2K2 (ENSPSMG00000019412) ##22 ZBTB7A (ENSPSMG00000019360) PIAS4 (ENSPSMG00000019356) EEF2 (ENSPSMG00000019307) DAPK3 (ENSPSMG00000019258) NMRK2 (ENSPSMG00000019248) ATCAY (ENSPSMG00000019230) ZFR2 (ENSPSMG00000019220) MATK (ENSPSMG00000019201) RAX2 (ENSPSMG00000019159) MRPL54 (ENSPSMG00000019157) APBA3 (ENSPSMG00000019152) TJP3 (ENSPSMG00000019146) PIP5K1C (ENSPSMG00000019141) CACTIN (ENSPSMG00000019114) TBXA2R (ENSPSMG00000019078) Mouse lemur MODERN SPECIES 16 PLIN4 (ENSMICG00000028930) HDGFL2 (ENSMICG00000000325) UBXN6 (ENSMICG00000033666) CHAF1A (ENSMICG00000000323) SH3GL1 (ENSMICG00000000322) MPND (ENSMICG00000038621) STAP2 (ENSMICG00000028853) FSD1 (ENSMICG00000000316) TMIGD2 (ENSMICG00000045375) SHD (ENSMICG00000000315) YJU2 (ENSMICG00000030928) EBI3 (ENSMICG00000042883) ANKRD24 (ENSMICG00000001612) SIRT6 (ENSMICG00000003439) CREB3L3 (ENSMICG00000034622) MAP2K2 (ENSMICG00000028081) ##22 ZBTB7A (ENSMICG00000030503) PIAS4 (ENSMICG00000012799) EEF2 (ENSMICG00000012772) DAPK3 (ENSMICG00000046071) NMRK2 (ENSMICG00000037967) ATCAY (ENSMICG00000004504) ZFR2 (ENSMICG00000045224) MATK (ENSMICG00000014774) RAX2 (ENSMICG00000014768) MRPL54 (ENSMICG00000034581) APBA3 (ENSMICG00000014756) TJP3 (ENSMICG00000014731) PIP5K1C (ENSMICG00000028246) CACTIN (ENSMICG00000008291) TBXA2R (ENSMICG00000031426) Bushbaby MODERN SPECIES 144 ENSOGAG00000025449 HDGFL2 (ENSOGAG00000007380) ENSOGAG00000002199 CHAF1A (ENSOGAG00000002196) SH3GL1 (ENSOGAG00000002193) MPND (ENSOGAG00000014780) STAP2 (ENSOGAG00000001668) FSD1 (ENSOGAG00000001666) TMIGD2 (ENSOGAG00000001665) SHD (ENSOGAG00000001664) ENSOGAG00000001662 EBI3 (ENSOGAG00000001661) ANKRD24 (ENSOGAG00000024109) SIRT6 (ENSOGAG00000001660) CREB3L3 (ENSOGAG00000001659) MAP2K2 (ENSOGAG00000001658) ##22 ZBTB7A (ENSOGAG00000033963) PIAS4 (ENSOGAG00000001656) EEF2 (ENSOGAG00000010298) DAPK3 (ENSOGAG00000010293) NMRK2 (ENSOGAG00000017158) ATCAY (ENSOGAG00000017156) ZFR2 (ENSOGAG00000017150) MATK (ENSOGAG00000004396) RAX2 (ENSOGAG00000010138) ENSOGAG00000033519 APBA3 (ENSOGAG00000017147) TJP3 (ENSOGAG00000017146) PIP5K1C (ENSOGAG00000010393) CACTIN (ENSOGAG00000010382) TBXA2R (ENSOGAG00000026948) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Tarsier MODERN SPECIES 2381 MAP2K2 (ENSTSYG00000028430) ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.c ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Cebidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.c ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Marmoset MODERN SPECIES 14 PLIN5 (ENSCJAG00000017538) PLIN4 (ENSCJAG00000086686) HDGFL2 (ENSCJAG00000017556) UBXN6 (ENSCJAG00000007418) CHAF1A (ENSCJAG00000007402) SH3GL1 (ENSCJAG00000007394) MPND (ENSCJAG00000007387) STAP2 (ENSCJAG00000003656) FSD1 (ENSCJAG00000014650) SHD (ENSCJAG00000008444) YJU2 (ENSCJAG00000038170) EBI3 (ENSCJAG00000013202) ANKRD24 (ENSCJAG00000015134) SIRT6 (ENSCJAG00000015120) CREB3L3 (ENSCJAG00000015105) MAP2K2 (ENSCJAG00000015084) ##22 ZBTB7A (ENSCJAG00000036210) PIAS4 (ENSCJAG00000015065) EEF2 (ENSCJAG00000015045) DAPK3 (ENSCJAG00000015041) NMRK2 (ENSCJAG00000015033) ATCAY (ENSCJAG00000015022) ENSCJAG00000045089 MATK (ENSCJAG00000015004) ENSCJAG00000079224 RAX2 (ENSCJAG00000015003) MRPL54 (ENSCJAG00000014998) APBA3 (ENSCJAG00000014981) TJP3 (ENSCJAG00000014958) PIP5K1C (ENSCJAG00000014951) CACTIN (ENSCJAG00000014929) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.c ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Capuchin MODERN SPECIES 375 YJU2 (ENSCCAG00000015752) EBI3 (ENSCCAG00000016244) ANKRD24 (ENSCCAG00000019424) SIRT6 (ENSCCAG00000021654) CREB3L3 (ENSCCAG00000009229) ENSCCAG00000020186 ##22 ZBTB7A (ENSCCAG00000031015) PIAS4 (ENSCCAG00000031276) EEF2 (ENSCCAG00000034379) DAPK3 (ENSCCAG00000036778) NMRK2 (ENSCCAG00000027666) ATCAY (ENSCCAG00000030577) ZFR2 (ENSCCAG00000025541) MATK (ENSCCAG00000027658) RAX2 (ENSCCAG00000027035) MRPL54 (ENSCCAG00000000138) APBA3 (ENSCCAG00000033704) TJP3 (ENSCCAG00000020120) PIP5K1C (ENSCCAG00000019560) CACTIN (ENSCCAG00000028723) TBXA2R (ENSCCAG00000028722) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 150 PLIN4 (ENSSBOG00000020299) HDGFL2 (ENSSBOG00000000080) UBXN6 (ENSSBOG00000032557) CHAF1A (ENSSBOG00000027727) SH3GL1 (ENSSBOG00000019572) MPND (ENSSBOG00000027720) STAP2 (ENSSBOG00000025131) FSD1 (ENSSBOG00000023601) TMIGD2 (ENSSBOG00000035295) SHD (ENSSBOG00000022737) YJU2 (ENSSBOG00000023748) EBI3 (ENSSBOG00000024178) ANKRD24 (ENSSBOG00000029618) SIRT6 (ENSSBOG00000029532) CREB3L3 (ENSSBOG00000022378) MAP2K2 (ENSSBOG00000033682) ##22 ZBTB7A (ENSSBOG00000015331) PIAS4 (ENSSBOG00000028685) ENSSBOG00000006731 DAPK3 (ENSSBOG00000032686) NMRK2 (ENSSBOG00000016720) ATCAY (ENSSBOG00000031021) MATK (ENSSBOG00000030884) MRPL54 (ENSSBOG00000028081) APBA3 (ENSSBOG00000030975) TJP3 (ENSSBOG00000035488) PIP5K1C (ENSSBOG00000027787) CACTIN (ENSSBOG00000034076) GIPC3 (ENSSBOG00000021391) HMG20B (ENSSBOG00000034086) MFSD12 (ENSSBOG00000022502) Mas night monkey MODERN SPECIES 937 PLIN4 (ENSANAG00000034697) HDGFL2 (ENSANAG00000032673) UBXN6 (ENSANAG00000032835) CHAF1A (ENSANAG00000025401) SH3GL1 (ENSANAG00000035579) MPND (ENSANAG00000020972) STAP2 (ENSANAG00000036194) FSD1 (ENSANAG00000027398) ENSANAG00000022976 SHD (ENSANAG00000034629) YJU2 (ENSANAG00000034742) EBI3 (ENSANAG00000024033) ANKRD24 (ENSANAG00000036761) SIRT6 (ENSANAG00000037174) CREB3L3 (ENSANAG00000029114) MAP2K2 (ENSANAG00000036150) ##22 ZBTB7A (ENSANAG00000022927) PIAS4 (ENSANAG00000023065) EEF2 (ENSANAG00000037323) DAPK3 (ENSANAG00000029830) ENSANAG00000037878 ATCAY (ENSANAG00000029633) ZFR2 (ENSANAG00000028699) MATK (ENSANAG00000036207) RAX2 (ENSANAG00000029699) MRPL54 (ENSANAG00000028692) APBA3 (ENSANAG00000034636) TJP3 (ENSANAG00000028837) PIP5K1C (ENSANAG00000036860) CACTIN (ENSANAG00000034680) TBXA2R (ENSANAG00000009361) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.a.d ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.a.d ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.a.d ##22 Capuchin MODERN SPECIES 30 TM4SF1 (ENSCCAG00000033032) TM4SF4 (ENSCCAG00000028225) WWTR1 (ENSCCAG00000033257) COMMD2 (ENSCCAG00000030153) ENSCCAG00000024462 ANKUB1 (ENSCCAG00000032570) ENSCCAG00000020698 SLC38A5 (ENSCCAG00000032976) FTSJ1 (ENSCCAG00000027731) PORCN (ENSCCAG00000035069) EBP (ENSCCAG00000027079) TBC1D25 (ENSCCAG00000033507) RBM3 (ENSCCAG00000038019) WDR13 (ENSCCAG00000038091) WAS (ENSCCAG00000036792) ENSCCAG00000001345 ##22 SUV39H1 (ENSCCAG00000004739) GLOD5 (ENSCCAG00000033598) GATA1 (ENSCCAG00000032671) ENSCCAG00000037521 PCSK1N (ENSCCAG00000032016) TIMM17B (ENSCCAG00000030275) PQBP1 (ENSCCAG00000034951) SLC35A2 (ENSCCAG00000025257) PIM2 (ENSCCAG00000024329) OTUD5 (ENSCCAG00000033387) KCND1 (ENSCCAG00000037150) GRIPAP1 (ENSCCAG00000003776) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00910000147341 ENSGT00390000017269 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00910000147341 ENSGT00390000017269 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000158364 ENSGT00910000147666 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00910000147341 ENSGT00390000017269 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662.gb.a ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000158364 ENSGT00910000147666 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 Vervet Monkey MODERN SPECIES 25 PLIN4 (ENSCSAG00000010532) HDGFL2 (ENSCSAG00000010539) UBXN6 (ENSCSAG00000010549) CHAF1A (ENSCSAG00000010557) SH3GL1 (ENSCSAG00000010564) MPND (ENSCSAG00000010574) STAP2 (ENSCSAG00000010602) FSD1 (ENSCSAG00000010620) TMIGD2 (ENSCSAG00000010627) SHD (ENSCSAG00000010649) YJU2 (ENSCSAG00000010670) EBI3 (ENSCSAG00000010684) ANKRD24 (ENSCSAG00000010711) SIRT6 (ENSCSAG00000010757) CREB3L3 (ENSCSAG00000010762) MAP2K2 (ENSCSAG00000010771) ##22 ZBTB7A (ENSCSAG00000010775) ENSCSAG00000018816 PIAS4 (ENSCSAG00000010838) EEF2 (ENSCSAG00000010865) DAPK3 (ENSCSAG00000010873) NMRK2 (ENSCSAG00000010882) ATCAY (ENSCSAG00000010889) ZFR2 (ENSCSAG00000010914) MATK (ENSCSAG00000010938) RAX2 (ENSCSAG00000010944) MRPL54 (ENSCSAG00000010950) APBA3 (ENSCSAG00000010973) TJP3 (ENSCSAG00000011066) PIP5K1C (ENSCSAG00000011108) CACTIN (ENSCSAG00000011116) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00910000147341 ENSGT00390000017269 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662.gb.a ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000158364 ENSGT00910000147666 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 Macaca ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662.gb.a ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 76 PLIN5 (ENSMNEG00000033253) HDGFL2 (ENSMNEG00000034980) UBXN6 (ENSMNEG00000030532) CHAF1A (ENSMNEG00000039177) SH3GL1 (ENSMNEG00000003775) MPND (ENSMNEG00000014406) STAP2 (ENSMNEG00000033310) FSD1 (ENSMNEG00000026815) TMIGD2 (ENSMNEG00000041785) SHD (ENSMNEG00000032816) YJU2 (ENSMNEG00000036028) EBI3 (ENSMNEG00000044798) ANKRD24 (ENSMNEG00000044905) SIRT6 (ENSMNEG00000029466) CREB3L3 (ENSMNEG00000039631) MAP2K2 (ENSMNEG00000044105) ##22 ZBTB7A (ENSMNEG00000033804) PIAS4 (ENSMNEG00000030027) EEF2 (ENSMNEG00000021403) DAPK3 (ENSMNEG00000034480) NMRK2 (ENSMNEG00000033367) ENSMNEG00000018044 ENSMNEG00000016763 ATCAY (ENSMNEG00000027990) ZFR2 (ENSMNEG00000043770) MATK (ENSMNEG00000042873) RAX2 (ENSMNEG00000034075) MRPL54 (ENSMNEG00000039499) APBA3 (ENSMNEG00000028714) TJP3 (ENSMNEG00000029063) PIP5K1C (ENSMNEG00000023721) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000164709.a.b.b.a.a.b.b.b.b.a.b.a.d.a.a.a.a ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662.gb.a ENSGT00940000159842 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Rhesus MODERN SPECIES 10 HDGFL2 (ENSMMUG00000028925) UBXN6 (ENSMMUG00000016709) CHAF1A (ENSMMUG00000016706) SH3GL1 (ENSMMUG00000000273) MPND (ENSMMUG00000028926) ENSMMUG00000059812 STAP2 (ENSMMUG00000000271) FSD1 (ENSMMUG00000000268) TMIGD2 (ENSMMUG00000045860) SHD (ENSMMUG00000028927) YJU2 (ENSMMUG00000010100) ANKRD24 (ENSMMUG00000028928) SIRT6 (ENSMMUG00000019955) CREB3L3 (ENSMMUG00000019954) ENSMMUG00000063002 MAP2K2 (ENSMMUG00000019564) ##22 ZBTB7A (ENSMMUG00000063320) PIAS4 (ENSMMUG00000011018) EEF2 (ENSMMUG00000022767) ENSMMUG00000065079 DAPK3 (ENSMMUG00000022765) NMRK2 (ENSMMUG00000015273) ENSMMUG00000056147 ENSMMUG00000064233 ATCAY (ENSMMUG00000039195) ZFR2 (ENSMMUG00000054579) MATK (ENSMMUG00000001917) RAX2 (ENSMMUG00000056802) MRPL54 (ENSMMUG00000044080) APBA3 (ENSMMUG00000009672) TJP3 (ENSMMUG00000028930) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 10 PLIN5 (ENSMFAG00000000248) PLIN4 (ENSMFAG00000000239) HDGFL2 (ENSMFAG00000000309) SH3GL1 (ENSMFAG00000044037) MPND (ENSMFAG00000033303) STAP2 (ENSMFAG00000030521) FSD1 (ENSMFAG00000041951) SHD (ENSMFAG00000033388) YJU2 (ENSMFAG00000059349) TMIGD2 (ENSMFAG00000031969) EBI3 (ENSMFAG00000038770) ANKRD24 (ENSMFAG00000038641) SIRT6 (ENSMFAG00000001546) CREB3L3 (ENSMFAG00000040065) ENSMFAG00000053986 MAP2K2 (ENSMFAG00000039192) ##22 PIAS4 (ENSMFAG00000046119) NMRK2 (ENSMFAG00000033332) ENSMFAG00000028991 ENSMFAG00000052942 ENSMFAG00000040276 ATCAY (ENSMFAG00000002982) ZFR2 (ENSMFAG00000031215) RAX2 (ENSMFAG00000065615) MATK (ENSMFAG00000030470) MRPL54 (ENSMFAG00000003311) APBA3 (ENSMFAG00000044015) MFSD12 (ENSMFAG00000039649) TEKTIP1 (ENSMFAG00000036699) FZR1 (ENSMFAG00000003458) SMIM24 (ENSMFAG00000037612) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00910000147341 ENSGT00390000017269 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662.gb.a ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000158364 ENSGT00910000147666 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 Olive baboon MODERN SPECIES 12 SEMA6B (ENSPANG00000014342) LRG1 (ENSPANG00000038034) PLIN5 (ENSPANG00000019798) PLIN4 (ENSPANG00000018994) ENSPANG00000041390 UBXN6 (ENSPANG00000014343) SH3GL1 (ENSPANG00000030582) MPND (ENSPANG00000008881) FSD1 (ENSPANG00000019255) TMIGD2 (ENSPANG00000019801) YJU2 (ENSPANG00000009046) EBI3 (ENSPANG00000011050) ANKRD24 (ENSPANG00000007947) SIRT6 (ENSPANG00000004922) CREB3L3 (ENSPANG00000003567) MAP2K2 (ENSPANG00000008882) ##22 ZBTB7A (ENSPANG00000010574) PIAS4 (ENSPANG00000003087) EEF2 (ENSPANG00000007589) NMRK2 (ENSPANG00000013229) ATCAY (ENSPANG00000000280) ZFR2 (ENSPANG00000003088) MATK (ENSPANG00000017163) RAX2 (ENSPANG00000013783) MRPL54 (ENSPANG00000033944) APBA3 (ENSPANG00000003568) TJP3 (ENSPANG00000013784) NFIC (ENSPANG00000004923) SMIM44 (ENSPANG00000029842) DOHH (ENSPANG00000032446) FZR1 (ENSPANG00000004724) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00910000147341 ENSGT00390000017269 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662.gb.a ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000158364 ENSGT00910000147666 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 Sooty mangabey MODERN SPECIES 177 PLIN4 (ENSCATG00000032467) HDGFL2 (ENSCATG00000040769) UBXN6 (ENSCATG00000039313) CHAF1A (ENSCATG00000037940) SH3GL1 (ENSCATG00000038128) MPND (ENSCATG00000004001) STAP2 (ENSCATG00000036308) FSD1 (ENSCATG00000016062) TMIGD2 (ENSCATG00000031952) SHD (ENSCATG00000036509) YJU2 (ENSCATG00000041597) EBI3 (ENSCATG00000037867) ANKRD24 (ENSCATG00000044887) SIRT6 (ENSCATG00000039436) CREB3L3 (ENSCATG00000040399) MAP2K2 (ENSCATG00000030991) ##22 ZBTB7A (ENSCATG00000042184) ENSCATG00000041220 PIAS4 (ENSCATG00000038579) ENSCATG00000039972 DAPK3 (ENSCATG00000041841) NMRK2 (ENSCATG00000039387) ENSCATG00000034164 ATCAY (ENSCATG00000038400) ENSCATG00000024725 ZFR2 (ENSCATG00000028559) MATK (ENSCATG00000037452) RAX2 (ENSCATG00000038515) MRPL54 (ENSCATG00000014066) APBA3 (ENSCATG00000040664) TJP3 (ENSCATG00000038428) Drill MODERN SPECIES 1534 PLIN5 (ENSMLEG00000033803) PLIN4 (ENSMLEG00000037632) HDGFL2 (ENSMLEG00000040813) UBXN6 (ENSMLEG00000038954) CHAF1A (ENSMLEG00000037211) SH3GL1 (ENSMLEG00000024076) MPND (ENSMLEG00000035802) STAP2 (ENSMLEG00000028740) FSD1 (ENSMLEG00000039314) ENSMLEG00000013785 YJU2 (ENSMLEG00000017413) EBI3 (ENSMLEG00000032602) ANKRD24 (ENSMLEG00000022250) SIRT6 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ENSGT00910000147666 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1318 PLIN4 (ENSRROG00000041408) HDGFL2 (ENSRROG00000037992) UBXN6 (ENSRROG00000030534) CHAF1A (ENSRROG00000029710) SH3GL1 (ENSRROG00000040183) MPND (ENSRROG00000029655) STAP2 (ENSRROG00000031412) FSD1 (ENSRROG00000042651) TMIGD2 (ENSRROG00000039740) SHD (ENSRROG00000016590) YJU2 (ENSRROG00000020167) EBI3 (ENSRROG00000032150) ANKRD24 (ENSRROG00000024500) SIRT6 (ENSRROG00000000693) CREB3L3 (ENSRROG00000044737) MAP2K2 (ENSRROG00000031471) ##22 ZBTB7A (ENSRROG00000026824) ENSRROG00000031290 PIAS4 (ENSRROG00000032682) EEF2 (ENSRROG00000019319) DAPK3 (ENSRROG00000045681) NMRK2 (ENSRROG00000044574) ATCAY (ENSRROG00000042086) ZFR2 (ENSRROG00000039340) ENSRROG00000031786 MATK (ENSRROG00000038991) RAX2 (ENSRROG00000029798) MRPL54 (ENSRROG00000018776) APBA3 (ENSRROG00000033516) TJP3 (ENSRROG00000024434) PIP5K1C (ENSRROG00000032134) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1317 PLIN4 (ENSRBIG00000040411) HDGFL2 (ENSRBIG00000028930) UBXN6 (ENSRBIG00000029192) CHAF1A (ENSRBIG00000016297) SH3GL1 (ENSRBIG00000034946) MPND (ENSRBIG00000038275) STAP2 (ENSRBIG00000043595) FSD1 (ENSRBIG00000037917) TMIGD2 (ENSRBIG00000042843) SHD (ENSRBIG00000041984) YJU2 (ENSRBIG00000038718) EBI3 (ENSRBIG00000036125) ENSRBIG00000029412 SIRT6 (ENSRBIG00000029575) CREB3L3 (ENSRBIG00000043806) MAP2K2 (ENSRBIG00000029645) ##22 ZBTB7A (ENSRBIG00000032186) ENSRBIG00000034476 PIAS4 (ENSRBIG00000042254) EEF2 (ENSRBIG00000044754) DAPK3 (ENSRBIG00000042224) NMRK2 (ENSRBIG00000042328) ATCAY (ENSRBIG00000039841) ENSRBIG00000044760 ZFR2 (ENSRBIG00000038095) MATK (ENSRBIG00000002775) RAX2 (ENSRBIG00000038716) MRPL54 (ENSRBIG00000027038) APBA3 (ENSRBIG00000033828) TJP3 (ENSRBIG00000031586) PIP5K1C (ENSRBIG00000044337) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00910000147341 ENSGT00390000017269 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00910000147341 ENSGT00390000017269 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 Homo/Pan/Gorilla group DUPLICATION Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.e ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00910000147341 ENSGT00390000017269 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 Gorilla MODERN SPECIES 10 PLIN4 (ENSGGOG00000016988) HDGFL2 (ENSGGOG00000022122) UBXN6 (ENSGGOG00000009243) ENSGGOG00000040557 SH3GL1 (ENSGGOG00000008198) MPND (ENSGGOG00000008189) STAP2 (ENSGGOG00000012964) FSD1 (ENSGGOG00000012955) TMIGD2 (ENSGGOG00000040045) SHD (ENSGGOG00000010231) YJU2 (ENSGGOG00000000335) EBI3 (ENSGGOG00000011932) ANKRD24 (ENSGGOG00000013418) SIRT6 (ENSGGOG00000008838) CREB3L3 (ENSGGOG00000008831) MAP2K2 (ENSGGOG00000008832) ##22 ENSGGOG00000009097 ENSGGOG00000043433 ENSGGOG00000005124 PIAS4 (ENSGGOG00000007895) EEF2 (ENSGGOG00000012869) DAPK3 (ENSGGOG00000002018) NMRK2 (ENSGGOG00000004857) ENSGGOG00000038336 ATCAY (ENSGGOG00000006826) ZFR2 (ENSGGOG00000002866) MATK (ENSGGOG00000014700) RAX2 (ENSGGOG00000014727) MRPL54 (ENSGGOG00000014722) APBA3 (ENSGGOG00000004637) TJP3 (ENSGGOG00000004626) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.e ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00390000017269 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 Pan ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.e ##22 ENSGT00940000162053 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SPECIES 10 PLIN4 (ENSG00000167676) HDGFL2 (ENSG00000167674) UBXN6 (ENSG00000167671) CHAF1A (ENSG00000167670) SH3GL1 (ENSG00000141985) MPND (ENSG00000008382) STAP2 (ENSG00000178078) FSD1 (ENSG00000105255) TMIGD2 (ENSG00000167664) SHD (ENSG00000105251) YJU2 (ENSG00000105248) EBI3 (ENSG00000105246) ANKRD24 (ENSG00000089847) SIRT6 (ENSG00000077463) CREB3L3 (ENSG00000060566) MAP2K2 (ENSG00000126934) ##22 ZBTB7A (ENSG00000178951) PIAS4 (ENSG00000105229) EEF2 (ENSG00000167658) DAPK3 (ENSG00000167657) NMRK2 (ENSG00000077009) ATCAY (ENSG00000167654) ZFR2 (ENSG00000105278) MATK (ENSG00000007264) RAX2 (ENSG00000173976) MRPL54 (ENSG00000183617) APBA3 (ENSG00000011132) TJP3 (ENSG00000105289) PIP5K1C (ENSG00000186111) CACTIN (ENSG00000105298) TBXA2R (ENSG00000006638) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156059.k ENSGT00910000147243 ENSGT00940000162027 ENSGT00940000161477 ENSGT01010000222360.E.c ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ENSGT00940000159122 ENSGT00940000153588.a.b 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ENSNLEG00000002981 DAPK3 (ENSNLEG00000002973) NMRK2 (ENSNLEG00000002935) ENSNLEG00000027774 ATCAY (ENSNLEG00000002928) ZFR2 (ENSNLEG00000002912) MATK (ENSNLEG00000002816) RAX2 (ENSNLEG00000002811) ENSNLEG00000002809 APBA3 (ENSNLEG00000002776) TJP3 (ENSNLEG00000002720) ENSNLEG00000031233 ENSNLEG00000002565 Gibbon MODERN SPECIES 3 HILPDA (ENSNLEG00000028127) ENSNLEG00000012368 ENSNLEG00000012374 CALU (ENSNLEG00000012380) OPN1SW (ENSNLEG00000012417) CCDC136 (ENSNLEG00000012424) FLNC (ENSNLEG00000012428) ATP6V1F (ENSNLEG00000012442) ATP6V1FNB (ENSNLEG00000012447) KCP (ENSNLEG00000012449) IRF5 (ENSNLEG00000012454) TNPO3 (ENSNLEG00000012491) ENSNLEG00000027686 ENSNLEG00000031882 ENSNLEG00000028436 ENSNLEG00000012555 ##22 TSPAN33 (ENSNLEG00000012558) SMO (ENSNLEG00000012575) AHCYL2 (ENSNLEG00000012581) STRIP2 (ENSNLEG00000012629) ENSNLEG00000031314 SMKR1 (ENSNLEG00000018605) NRF1 (ENSNLEG00000012659) UBE2H (ENSNLEG00000012685) ZC3HC1 (ENSNLEG00000012698) KLHDC10 (ENSNLEG00000012718) ENSNLEG00000029386 TMEM209 (ENSNLEG00000012732) SSMEM1 (ENSNLEG00000012746) CPA2 (ENSNLEG00000012753) CPA4 (ENSNLEG00000012761) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Glires ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.a ##22 Pika DUPLICATION Pika MODERN SPECIES 1679 ENSOPRG00000011096 ##22 Pika MODERN SPECIES 8706 ENSOPRG00000019099 ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000160274 ENSGT00950000182964.a.b.b ENSGT01100000263497.E.a.b ENSGT00940000159915 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159037 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00500000044957 ENSGT00390000003403 ENSGT00940000154660.a ENSGT00950000182916.a.a Naked mole-rat female MODERN SPECIES 21 HDGFL2 (ENSHGLG00000010821) UBXN6 (ENSHGLG00000011971) ENSHGLG00000035324 CHAF1A (ENSHGLG00000005439) SH3GL1 (ENSHGLG00000005623) MPND (ENSHGLG00000006669) STAP2 (ENSHGLG00000008727) FSD1 (ENSHGLG00000006238) TMIGD2 (ENSHGLG00000036449) SHD (ENSHGLG00000007108) YJU2 (ENSHGLG00000008096) ENSHGLG00000005526 ANKRD24 (ENSHGLG00000010865) SIRT6 (ENSHGLG00000006696) CREB3L3 (ENSHGLG00000050546) MAP2K2 (ENSHGLG00000009089) ##22 ZBTB7A (ENSHGLG00000011811) PIAS4 (ENSHGLG00000006172) ENSHGLG00000007881 DAPK3 (ENSHGLG00000009769) ENSHGLG00000015025 GADD45B (ENSHGLG00000044805) GNG7 (ENSHGLG00000017287) DIRAS1 (ENSHGLG00000013381) SLC39A3 (ENSHGLG00000033652) SGTA (ENSHGLG00000018547) ENSHGLG00000040783 ENSHGLG00000019144 DOHH (ENSHGLG00000039512) SMIM44 (ENSHGLG00000040448) ENSHGLG00000036870 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000160274 ENSGT00950000182964.a.b.b ENSGT01100000263497.E.a.b ENSGT00940000159915 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159037 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00500000044957 ENSGT00940000154660.a ENSGT00950000182916.a.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000160274 ENSGT00950000182964.a.b.b ENSGT01100000263497.E.a.b ENSGT00940000159915 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159037 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00500000044957 ENSGT00940000154660.a ENSGT00950000182916.a.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 202 PLIN5 (ENSCLAG00000015835) HDGFL2 (ENSCLAG00000008598) UBXN6 (ENSCLAG00000010885) CHAF1A (ENSCLAG00000008702) SH3GL1 (ENSCLAG00000006871) MPND (ENSCLAG00000007417) STAP2 (ENSCLAG00000008850) FSD1 (ENSCLAG00000013151) TMIGD2 (ENSCLAG00000016455) SHD (ENSCLAG00000009664) YJU2 (ENSCLAG00000010329) EBI3 (ENSCLAG00000013574) ENSCLAG00000011806 SIRT6 (ENSCLAG00000008888) CREB3L3 (ENSCLAG00000011297) MAP2K2 (ENSCLAG00000011717) ##22 ZBTB7A (ENSCLAG00000012947) PIAS4 (ENSCLAG00000014404) EEF2 (ENSCLAG00000014112) DAPK3 (ENSCLAG00000009010) LMNB2 (ENSCLAG00000007920) GADD45B (ENSCLAG00000008923) GNG7 (ENSCLAG00000009115) DIRAS1 (ENSCLAG00000017925) SGTA (ENSCLAG00000010647) THOP1 (ENSCLAG00000015063) DOHH (ENSCLAG00000007817) SMIM24 (ENSCLAG00000007177) NFIC (ENSCLAG00000007526) CELF5 (ENSCLAG00000009940) NCLN (ENSCLAG00000008645) Degu MODERN SPECIES 91 PLIN5 (ENSODEG00000014740) PLIN4 (ENSODEG00000015715) ENSODEG00000015495 UBXN6 (ENSODEG00000015912) CHAF1A (ENSODEG00000015861) SH3GL1 (ENSODEG00000015344) MPND (ENSODEG00000014317) STAP2 (ENSODEG00000015068) FSD1 (ENSODEG00000014478) SHD (ENSODEG00000014897) YJU2 (ENSODEG00000014993) ENSODEG00000020237 EBI3 (ENSODEG00000014290) ENSODEG00000014163 SIRT6 (ENSODEG00000015363) MAP2K2 (ENSODEG00000014670) ##22 ZBTB7A (ENSODEG00000014027) PIAS4 (ENSODEG00000015061) ENSODEG00000014175 DAPK3 (ENSODEG00000014160) ENSODEG00000014763 GADD45B (ENSODEG00000014386) GNG7 (ENSODEG00000014141) DIRAS1 (ENSODEG00000020412) SLC39A3 (ENSODEG00000014274) SGTA (ENSODEG00000014332) THOP1 (ENSODEG00000013736) ENSODEG00000013996 DOHH (ENSODEG00000014181) ENSODEG00000015846 NFIC (ENSODEG00000015267) Guinea pig MODERN SPECIES 253 STAP2 (ENSCPOG00000025858) FSD1 (ENSCPOG00000019419) SHD (ENSCPOG00000008098) YJU2 (ENSCPOG00000000707) EBI3 (ENSCPOG00000000706) ENSCPOG00000006206 CREB3L3 (ENSCPOG00000010134) MAP2K2 (ENSCPOG00000025428) ##22 ZBTB7A (ENSCPOG00000035268) PIAS4 (ENSCPOG00000002364) EEF2 (ENSCPOG00000015697) DAPK3 (ENSCPOG00000031679) ENSCPOG00000037980 GADD45B (ENSCPOG00000034176) GNG7 (ENSCPOG00000033946) SLC39A3 (ENSCPOG00000034643) SGTA (ENSCPOG00000030366) THOP1 (ENSCPOG00000021762) DOHH (ENSCPOG00000035221) Sciuridae DUPLICATION Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.a.k ##22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 156 ENSSVLG00005015416 ENSSVLG00005015384 NAP1L2 (ENSSVLG00005015352) CDX4 (ENSSVLG00005015316) ENSSVLG00005015182 ZCCHC13 (ENSSVLG00005015163) SLC16A2 (ENSSVLG00005015129) RLIM (ENSSVLG00005015096) NEXMIF (ENSSVLG00005015017) ABCB7 (ENSSVLG00005014285) UPRT (ENSSVLG00005014152) ZDHHC15 (ENSSVLG00005014065) MAGEE2 (ENSSVLG00005014015) ENSSVLG00005013933 PBDC1 (ENSSVLG00005013885) ENSSVLG00005013840 ##22 MAGEE1 (ENSSVLG00005013812) ENSSVLG00005013720 ENSSVLG00005013671 ENSSVLG00005013604 ENSSVLG00005013555 FGF16 (ENSSVLG00005013490) ATRX (ENSSVLG00005013376) ENSSVLG00005012812 ENSSVLG00005012706 ENSSVLG00005012657 ENSSVLG00005012574 ENSSVLG00005012533 ATP7A (ENSSVLG00005012051) ENSSVLG00005011999 ENSSVLG00005011883 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.b ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.l ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 7 HDGFL2 (ENSSVLG00005018647) UBXN6 (ENSSVLG00005018509) CHAF1A (ENSSVLG00005018270) SH3GL1 (ENSSVLG00005018172) MPND (ENSSVLG00005017709) ENSSVLG00005017600 STAP2 (ENSSVLG00005017361) FSD1 (ENSSVLG00005017052) ENSSVLG00005017014 SHD (ENSSVLG00005016880) YJU2 (ENSSVLG00005016793) EBI3 (ENSSVLG00005024929) ANKRD24 (ENSSVLG00005024883) SIRT6 (ENSSVLG00005024827) CREB3L3 (ENSSVLG00005024770) ENSSVLG00005024698 ##22 ZBTB7A (ENSSVLG00005024657) PIAS4 (ENSSVLG00005024634) ENSSVLG00005024605 DAPK3 (ENSSVLG00005024571) ENSSVLG00005024541 ATCAY (ENSSVLG00005024510) ZFR2 (ENSSVLG00005024341) MATK (ENSSVLG00005024229) RAX2 (ENSSVLG00005024207) MRPL54 (ENSSVLG00005024184) TJP3 (ENSSVLG00005023962) PIP5K1C (ENSSVLG00005023887) CACTIN (ENSSVLG00005023836) TBXA2R (ENSSVLG00005023817) GIPC3 (ENSSVLG00005023804) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 13 FAM170B (ENSSVLG00005002335) VSTM4 (ENSSVLG00005002356) WDFY4 (ENSSVLG00005002424) LRRC18 (ENSSVLG00005002547) ARHGAP22 (ENSSVLG00005002587) ENSSVLG00005002634 MAPK8 (ENSSVLG00005002686) FRMPD2 (ENSSVLG00005002807) ENSSVLG00005003026 PTPN20 (ENSSVLG00005003065) GDF10 (ENSSVLG00005003156) GDF2 (ENSSVLG00005003178) RBP3 (ENSSVLG00005003192) ENSSVLG00005003212 ENSSVLG00005003224 ENSSVLG00005003322 ##22 ENSSVLG00005003335 ENSSVLG00005003349 ENSSVLG00005003360 ENSSVLG00005003375 ENSSVLG00005003408 ENSSVLG00005003415 ENSSVLG00005003421 ENSSVLG00005003435 ENSSVLG00005003459 ENSSVLG00005003469 ENSSVLG00005003498 ENSSVLG00005003511 ENSSVLG00005003522 ENSSVLG00005003534 ENSSVLG00005003579 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.b ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.l ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Alpin marmot MODERN SPECIES 88 MYDGF (ENSMMMG00000018460) ENSMMMG00000018426 LRG1 (ENSMMMG00000018424) ENSMMMG00000018410 HDGFL2 (ENSMMMG00000018325) UBXN6 (ENSMMMG00000018303) CHAF1A (ENSMMMG00000018263) SH3GL1 (ENSMMMG00000018246) MPND (ENSMMMG00000018208) STAP2 (ENSMMMG00000018200) FSD1 (ENSMMMG00000018181) SHD (ENSMMMG00000018157) YJU2 (ENSMMMG00000018139) ENSMMMG00000018130 ANKRD24 (ENSMMMG00000018078) MAP2K2 (ENSMMMG00000017211) ##22 PIAS4 (ENSMMMG00000017032) EEF2 (ENSMMMG00000017019) DAPK3 (ENSMMMG00000017015) NMRK2 (ENSMMMG00000017009) ZFR2 (ENSMMMG00000016959) APBA3 (ENSMMMG00000016885) TJP3 (ENSMMMG00000016855) CACTIN (ENSMMMG00000016832) ENSMMMG00000016827 GIPC3 (ENSMMMG00000016813) HMG20B (ENSMMMG00000016794) ENSMMMG00000016792 ENSMMMG00000016780 DOHH (ENSMMMG00000016778) ENSMMMG00000016774 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.b ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.l ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Squirrel MODERN SPECIES 188 ENSSTOG00000030331 HDGFL2 (ENSSTOG00000007383) UBXN6 (ENSSTOG00000014906) CHAF1A (ENSSTOG00000014889) SH3GL1 (ENSSTOG00000008579) MPND (ENSSTOG00000008666) STAP2 (ENSSTOG00000022594) FSD1 (ENSSTOG00000008010) SHD (ENSSTOG00000024753) YJU2 (ENSSTOG00000014684) EBI3 (ENSSTOG00000024345) ENSSTOG00000024418 ENSSTOG00000032271 SIRT6 (ENSSTOG00000022298) CREB3L3 (ENSSTOG00000028871) MAP2K2 (ENSSTOG00000002366) ##22 ZBTB7A (ENSSTOG00000026956) PIAS4 (ENSSTOG00000012472) EEF2 (ENSSTOG00000005050) DAPK3 (ENSSTOG00000005038) NMRK2 (ENSSTOG00000021661) ATCAY (ENSSTOG00000026376) ZFR2 (ENSSTOG00000025821) MATK (ENSSTOG00000011892) RAX2 (ENSSTOG00000024315) MRPL54 (ENSSTOG00000022378) APBA3 (ENSSTOG00000000352) TJP3 (ENSSTOG00000024962) PIP5K1C (ENSSTOG00000023021) CACTIN (ENSSTOG00000001235) TBXA2R (ENSSTOG00000028290) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 301 PLIN5 (ENSUPAG00010009919) ENSUPAG00010009913 HDGFL2 (ENSUPAG00010009901) UBXN6 (ENSUPAG00010009881) CHAF1A (ENSUPAG00010009868) SH3GL1 (ENSUPAG00010009851) MPND (ENSUPAG00010009625) STAP2 (ENSUPAG00010009594) FSD1 (ENSUPAG00010009576) SHD (ENSUPAG00010009570) YJU2 (ENSUPAG00010009548) EBI3 (ENSUPAG00010009541) ANKRD24 (ENSUPAG00010009488) SIRT6 (ENSUPAG00010009478) CREB3L3 (ENSUPAG00010009456) MAP2K2 (ENSUPAG00010009423) ##22 ZBTB7A (ENSUPAG00010009414) PIAS4 (ENSUPAG00010009393) EEF2 (ENSUPAG00010009366) DAPK3 (ENSUPAG00010009346) NMRK2 (ENSUPAG00010009304) ATCAY (ENSUPAG00010009286) ZFR2 (ENSUPAG00010009277) MATK (ENSUPAG00010008858) RAX2 (ENSUPAG00010008848) MRPL54 (ENSUPAG00010008838) APBA3 (ENSUPAG00010008831) TJP3 (ENSUPAG00010008756) PIP5K1C (ENSUPAG00010008552) CACTIN (ENSUPAG00010008542) TBXA2R (ENSUPAG00010008535) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 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ENSGT00510000047872 ENSGT00940000158753 ENSGT00940000159993 ENSGT00390000014000 ENSGT00940000160274 ENSGT00950000182964.a.b.b ENSGT01100000263497.E.a.b ENSGT00940000159915 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159037 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00390000003420.b Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000012911 ENSGT00940000159808 ENSGT00940000162661 ENSGT00510000047872 ENSGT00940000158753 ENSGT00940000159993 ENSGT00390000014000 ENSGT00940000160274 ENSGT00950000182964.a.b.b ENSGT01100000263497.E.a.b ENSGT00940000159915 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159037 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 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ENSGT00390000003420.b Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000012911 ENSGT00940000159808 ENSGT00940000162661 ENSGT00510000047872 ENSGT00940000158753.j ENSGT00940000159993 ENSGT00390000014000.l ENSGT00940000160274 ENSGT00950000182964.a.b.b ENSGT01100000263497.E.a.b ENSGT00940000159915 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159037 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00390000003420.b Northern American deer mouse MODERN SPECIES 14 Sf3a2 (ENSPEMG00000021288) Amh (ENSPEMG00000022697) Lingo3 (ENSPEMG00000013558) Lsm7 (ENSPEMG00000027858) ENSPEMG00000031069 ENSPEMG00000022141 Tmprss9 (ENSPEMG00000017231) Timm13 (ENSPEMG00000011224) Lmnb2 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ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00390000003420.b Golden Hamster MODERN SPECIES 764 Jsrp1 (ENSMAUG00000013914) Oaz1 (ENSMAUG00000011178) Lingo3 (ENSMAUG00000009853) Lsm7 (ENSMAUG00000009276) Sppl2b (ENSMAUG00000020905) Tmprss9 (ENSMAUG00000008320) Timm13 (ENSMAUG00000013865) Lmnb2 (ENSMAUG00000019979) Gadd45b (ENSMAUG00000015240) Gng7 (ENSMAUG00000009781) Diras1 (ENSMAUG00000021227) Slc39a3 (ENSMAUG00000021542) Sgta (ENSMAUG00000004385) Thop1 (ENSMAUG00000016713) Creb3l3 (ENSMAUG00000020928) Map2k2 (ENSMAUG00000011695) ##22 Zbtb7a (ENSMAUG00000019026) Pias4 (ENSMAUG00000012696) Eef2 (ENSMAUG00000007062) Dapk3 (ENSMAUG00000021234) Nmrk2 (ENSMAUG00000003333) Atcay (ENSMAUG00000017532) Zfr2 (ENSMAUG00000016438) Matk (ENSMAUG00000019712) Mrpl54 (ENSMAUG00000009543) Apba3 (ENSMAUG00000007859) Tjp3 (ENSMAUG00000010092) Pip5k1c (ENSMAUG00000014134) Cactin (ENSMAUG00000011643) Tbxa2r (ENSMAUG00000015276) Gipc3 (ENSMAUG00000021524) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 2 Jsrp1 (ENSCGRG00001012783) Oaz1 (ENSCGRG00001013579) Lingo3 (ENSCGRG00001011202) ENSCGRG00001000807 Sppl2b (ENSCGRG00001001858) Tmprss9 (ENSCGRG00001004422) Timm13 (ENSCGRG00001013045) Lmnb2 (ENSCGRG00001006502) Gadd45b (ENSCGRG00001024479) Gng7 (ENSCGRG00001003146) Diras1 (ENSCGRG00001010873) Slc39a3 (ENSCGRG00001010295) Sgta (ENSCGRG00001008900) Thop1 (ENSCGRG00001024327) Creb3l3 (ENSCGRG00001004276) Map2k2 (ENSCGRG00001013300) ##22 Zbtb7a (ENSCGRG00001019218) Pias4 (ENSCGRG00001019465) Eef2 (ENSCGRG00001021031) Dapk3 (ENSCGRG00001006998) Nmrk2 (ENSCGRG00001016553) Atcay (ENSCGRG00001017209) Zfr2 (ENSCGRG00001019870) Matk (ENSCGRG00001015278) Mrpl54 (ENSCGRG00001019482) Apba3 (ENSCGRG00001019836) Tjp3 (ENSCGRG00001001459) Pip5k1c (ENSCGRG00001017002) Cactin (ENSCGRG00001021287) Tbxa2r (ENSCGRG00001014446) Gipc3 (ENSCGRG00001016082) Murinae ANCESTRAL SPECIES 25 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ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00390000003420.b Mus_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000012911 ENSGT00940000159808 ENSGT00940000162661 ENSGT00510000047872 ENSGT00940000158753 ENSGT00940000159993 ENSGT00390000014000 ENSGT00940000160274 ENSGT00950000182964.a.b.b ENSGT01100000263497.E.a.b ENSGT00940000159915 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159037 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 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ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00730000111899 Felidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.b ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00730000111899 Panthera ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.b ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b 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ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00730000111899 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00730000111899 Red fox MODERN SPECIES 163 PLIN4 (ENSVVUG00000008610) HDGFL2 (ENSVVUG00000008590) UBXN6 (ENSVVUG00000008372) CHAF1A (ENSVVUG00000008352) SH3GL1 (ENSVVUG00000008332) MPND (ENSVVUG00000008330) STAP2 (ENSVVUG00000008284) FSD1 (ENSVVUG00000008262) 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ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662.y ENSGT00940000161753 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00730000111899 Dingo MODERN SPECIES 112 PLIN5 (ENSCAFG00020018636) PLIN4 (ENSCAFG00020018631) HDGFL2 (ENSCAFG00020018626) UBXN6 (ENSCAFG00020018624) CHAF1A (ENSCAFG00020018600) SH3GL1 (ENSCAFG00020018591) MPND (ENSCAFG00020018538) STAP2 (ENSCAFG00020018528) FSD1 (ENSCAFG00020018523) SHD (ENSCAFG00020018520) YJU2 (ENSCAFG00020018512) EBI3 (ENSCAFG00020018510) ANKRD24 (ENSCAFG00020018503) SIRT6 (ENSCAFG00020018493) CREB3L3 (ENSCAFG00020018486) MAP2K2 (ENSCAFG00020018484) ##22 ZBTB7A (ENSCAFG00020018481) PIAS4 (ENSCAFG00020018476) ENSCAFG00020018386 DAPK3 (ENSCAFG00020018374) ENSCAFG00020018372 ATCAY (ENSCAFG00020018366) ZFR2 (ENSCAFG00020018341) MATK (ENSCAFG00020018336) RAX2 (ENSCAFG00020018334) MRPL54 (ENSCAFG00020018333) APBA3 (ENSCAFG00020018330) TJP3 (ENSCAFG00020018326) PIP5K1C (ENSCAFG00020018324) CACTIN (ENSCAFG00020018320) TBXA2R (ENSCAFG00020018318) Dog MODERN SPECIES 12 PLIN4 (ENSCAFG00845014617) UBXN6 (ENSCAFG00845014671) CHAF1A (ENSCAFG00845014711) SH3GL1 (ENSCAFG00845014754) MPND (ENSCAFG00845014863) STAP2 (ENSCAFG00845015051) FSD1 (ENSCAFG00845015189) ENSCAFG00845006126 ENSCAFG00845006143 SHD (ENSCAFG00845006173) YJU2 (ENSCAFG00845006213) EBI3 (ENSCAFG00845006245) ANKRD24 (ENSCAFG00845006318) SIRT6 (ENSCAFG00845006500) CREB3L3 (ENSCAFG00845006598) MAP2K2 (ENSCAFG00845006651) ##22 ZBTB7A (ENSCAFG00845006749) PIAS4 (ENSCAFG00845006856) EEF2 (ENSCAFG00845007003) DAPK3 (ENSCAFG00845007165) ATCAY (ENSCAFG00845007239) ENSCAFG00845007313 ZFR2 (ENSCAFG00845007434) MATK (ENSCAFG00845007724) RAX2 (ENSCAFG00845008002) MRPL54 (ENSCAFG00845008032) APBA3 (ENSCAFG00845008066) TJP3 (ENSCAFG00845008169) PIP5K1C (ENSCAFG00845008444) CACTIN (ENSCAFG00845008863) TBXA2R (ENSCAFG00845008905) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00730000111899 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148.w ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00390000003420.b Ferret MODERN SPECIES 326 ENSMPUG00000005096 HDGFL2 (ENSMPUG00000005082) UBXN6 (ENSMPUG00000005027) CHAF1A (ENSMPUG00000005021) SH3GL1 (ENSMPUG00000005005) MPND (ENSMPUG00000004955) STAP2 (ENSMPUG00000004944) FSD1 (ENSMPUG00000004929) ENSMPUG00000004926 SHD (ENSMPUG00000004914) YJU2 (ENSMPUG00000004906) EBI3 (ENSMPUG00000004891) ANKRD24 (ENSMPUG00000004751) SIRT6 (ENSMPUG00000004740) CREB3L3 (ENSMPUG00000004723) MAP2K2 (ENSMPUG00000004715) ##22 ZBTB7A (ENSMPUG00000004703) PIAS4 (ENSMPUG00000004495) EEF2 (ENSMPUG00000004478) DAPK3 (ENSMPUG00000004467) ATCAY (ENSMPUG00000004453) ENSMPUG00000004305 MATK (ENSMPUG00000004170) MRPL54 (ENSMPUG00000004155) APBA3 (ENSMPUG00000004145) TJP3 (ENSMPUG00000004062) PIP5K1C (ENSMPUG00000004050) CACTIN (ENSMPUG00000004036) TBXA2R (ENSMPUG00000004032) GIPC3 (ENSMPUG00000003985) HMG20B (ENSMPUG00000003925) American mink MODERN SPECIES 175 A2GL (ENSNVIG00000008012) PLIN5 (ENSNVIG00000007989) HDGFL2 (ENSNVIG00000007923) UBXN6 (ENSNVIG00000007893) CHAF1A (ENSNVIG00000007855) SH3GL1 (ENSNVIG00000007791) MPND (ENSNVIG00000007709) STAP2 (ENSNVIG00000007652) FSD1 (ENSNVIG00000007558) SHD (ENSNVIG00000007523) YJU2 (ENSNVIG00000007508) EBI3 (ENSNVIG00000007465) ANKRD24 (ENSNVIG00000007410) SIRT6 (ENSNVIG00000007366) CREB3L3 (ENSNVIG00000007350) MAP2K2 (ENSNVIG00000007322) ##22 ZBTB7A (ENSNVIG00000007312) PIAS4 (ENSNVIG00000007291) EEF2 (ENSNVIG00000007264) DAPK3 (ENSNVIG00000007242) ATCAY (ENSNVIG00000007200) ZFR2 (ENSNVIG00000007143) MATK (ENSNVIG00000006982) RAX2 (ENSNVIG00000006966) MRPL54 (ENSNVIG00000006941) APBA3 (ENSNVIG00000006915) TJP3 (ENSNVIG00000006858) PIP5K1C (ENSNVIG00000006640) CACTIN (ENSNVIG00000006539) TBXA2R (ENSNVIG00000006523) GIPC3 (ENSNVIG00000006504) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00730000111899 Giant Panda MODERN SPECIES 14 PLIN5 (ENSAMEG00000001928) PLIN4 (ENSAMEG00000001943) HDGFL2 (ENSAMEG00000001946) UBXN6 (ENSAMEG00000001974) CHAF1A (ENSAMEG00000002002) SH3GL1 (ENSAMEG00000002020) MPND (ENSAMEG00000002047) FSD1 (ENSAMEG00000002072) TMIGD2 (ENSAMEG00000002105) SHD (ENSAMEG00000002106) YJU2 (ENSAMEG00000002124) ENSAMEG00000028708 ANKRD24 (ENSAMEG00000002152) SIRT6 (ENSAMEG00000002180) CREB3L3 (ENSAMEG00000002199) MAP2K2 (ENSAMEG00000002212) ##22 ZBTB7A (ENSAMEG00000026266) PIAS4 (ENSAMEG00000002251) EEF2 (ENSAMEG00000002286) DAPK3 (ENSAMEG00000006056) ATCAY (ENSAMEG00000006007) ZFR2 (ENSAMEG00000005974) MATK (ENSAMEG00000005916) RAX2 (ENSAMEG00000005914) MRPL54 (ENSAMEG00000028994) APBA3 (ENSAMEG00000005876) TJP3 (ENSAMEG00000005786) PIP5K1C (ENSAMEG00000005756) CACTIN (ENSAMEG00000005743) TBXA2R (ENSAMEG00000005733) ENSAMEG00000028252 Ursus ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000167684 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a American black bear MODERN SPECIES 1206 MAP2K2 (ENSUAMG00000022381) ##22 ZBTB7A (ENSUAMG00000022382) PIAS4 (ENSUAMG00000022383) EEF2 (ENSUAMG00000022409) DAPK3 (ENSUAMG00000023932) ATCAY (ENSUAMG00000023933) ENSUAMG00000023935 Polar bear MODERN SPECIES 455 HDGFL2 (ENSUMAG00000007753) UBXN6 (ENSUMAG00000007739) CHAF1A (ENSUMAG00000007691) SH3GL1 (ENSUMAG00000007676) MPND (ENSUMAG00000007663) STAP2 (ENSUMAG00000007652) FSD1 (ENSUMAG00000007632) ENSUMAG00000007621 SHD (ENSUMAG00000007615) ENSUMAG00000007611 YJU2 (ENSUMAG00000007607) ENSUMAG00000007603 ENSUMAG00000007602 SIRT6 (ENSUMAG00000007575) CREB3L3 (ENSUMAG00000007566) ENSUMAG00000007513 ##22 PIAS4 (ENSUMAG00000007484) EEF2 (ENSUMAG00000007474) ENSUMAG00000007459 ATCAY (ENSUMAG00000007452) ENSUMAG00000007447 ENSUMAG00000007440 MATK (ENSUMAG00000007427) ENSUMAG00000007421 MRPL54 (ENSUMAG00000007416) PIP5K1C (ENSUMAG00000007390) ENSUMAG00000007385 ENSUMAG00000007383 ENSUMAG00000007381 MFSD12 (ENSUMAG00000007358) TEKTIP1 (ENSUMAG00000007354) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00520000060565 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.b ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.b ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00960000192381 ENSGT00940000159004 ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 9 PLIN4 (ENSRFEG00010018695) HDGFL2 (ENSRFEG00010018715) ENSRFEG00010018772 UBXN6 (ENSRFEG00010018790) CHAF1A (ENSRFEG00010018850) SH3GL1 (ENSRFEG00010018888) MPND (ENSRFEG00010018966) STAP2 (ENSRFEG00010019155) FSD1 (ENSRFEG00010019207) ENSRFEG00010019258 SHD (ENSRFEG00010019283) EBI3 (ENSRFEG00010019381) ANKRD24 (ENSRFEG00010019433) SIRT6 (ENSRFEG00010019622) CREB3L3 (ENSRFEG00010019660) MAP2K2 (ENSRFEG00010019724) ##22 ENSRFEG00010019770 ZBTB7A (ENSRFEG00010019791) PIAS4 (ENSRFEG00010019828) EEF2 (ENSRFEG00010019895) DAPK3 (ENSRFEG00010020027) NMRK2 (ENSRFEG00010020068) ATCAY (ENSRFEG00010020101) ZFR2 (ENSRFEG00010020171) MATK (ENSRFEG00010020199) RAX2 (ENSRFEG00010020350) MRPL54 (ENSRFEG00010020373) APBA3 (ENSRFEG00010020395) TJP3 (ENSRFEG00010020437) PIP5K1C (ENSRFEG00010020492) CACTIN (ENSRFEG00010020557) Microbat MODERN SPECIES 1657 EBI3 (ENSMLUG00000008782) ANKRD24 (ENSMLUG00000008742) SIRT6 (ENSMLUG00000008726) CREB3L3 (ENSMLUG00000008703) MAP2K2 (ENSMLUG00000008679) ##22 ZBTB7A (ENSMLUG00000008667) PIAS4 (ENSMLUG00000008650) ENSMLUG00000014241 DAPK3 (ENSMLUG00000006239) NMRK2 (ENSMLUG00000016715) ATCAY (ENSMLUG00000003760) Megabat MODERN SPECIES 387 MAP2K2 (ENSPVAG00000002678) ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00520000060565 Horse MODERN SPECIES 28 PLIN4 (ENSECAG00000035223) HDGFL2 (ENSECAG00000028686) UBXN6 (ENSECAG00000021994) CHAF1A (ENSECAG00000014377) SH3GL1 (ENSECAG00000024773) MPND (ENSECAG00000029898) STAP2 (ENSECAG00000030351) FSD1 (ENSECAG00000046915) TMIGD2 (ENSECAG00000011606) SHD (ENSECAG00000005602) YJU2 (ENSECAG00000022785) EBI3 (ENSECAG00000018667) ANKRD24 (ENSECAG00000016048) SIRT6 (ENSECAG00000015304) CREB3L3 (ENSECAG00000015101) MAP2K2 (ENSECAG00000009157) ##22 ZBTB7A (ENSECAG00000040226) PIAS4 (ENSECAG00000018697) EEF2 (ENSECAG00000020547) DAPK3 (ENSECAG00000012570) NMRK2 (ENSECAG00000022841) ATCAY (ENSECAG00000015094) ZFR2 (ENSECAG00000007090) MATK (ENSECAG00000057591) RAX2 (ENSECAG00000027953) TJP3 (ENSECAG00000011885) APBA3 (ENSECAG00000021308) PIP5K1C (ENSECAG00000033728) CACTIN (ENSECAG00000039454) ENSECAG00000051988 TBXA2R (ENSECAG00000038039) Donkey MODERN SPECIES 12 ENSEASG00005024727 HDGFL2 (ENSEASG00005022459) UBXN6 (ENSEASG00005022450) CHAF1A (ENSEASG00005022431) SH3GL1 (ENSEASG00005022411) MPND (ENSEASG00005022406) STAP2 (ENSEASG00005024518) FSD1 (ENSEASG00005022397) ENSEASG00005025910 SHD (ENSEASG00005022388) YJU2 (ENSEASG00005022383) EBI3 (ENSEASG00005022379) ANKRD24 (ENSEASG00005038678) SIRT6 (ENSEASG00005022360) CREB3L3 (ENSEASG00005022352) ENSEASG00005025779 ##22 ZBTB7A (ENSEASG00005032317) PIAS4 (ENSEASG00005022327) EEF2 (ENSEASG00005022311) DAPK3 (ENSEASG00005022305) NMRK2 (ENSEASG00005031157) ATCAY (ENSEASG00005028112) ZFR2 (ENSEASG00005022296) MATK (ENSEASG00005022288) RAX2 (ENSEASG00005026320) MRPL54 (ENSEASG00005022283) APBA3 (ENSEASG00005022276) TJP3 (ENSEASG00005022268) PIP5K1C (ENSEASG00005022261) CACTIN (ENSEASG00005030573) TBXA2R (ENSEASG00005022250) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00520000060565 Suina ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Pig MODERN SPECIES 10 PLIN4 (ENSSSCG00000013512) HDGFL2 (ENSSSCG00000013511) UBXN6 (ENSSSCG00000013510) CHAF1A (ENSSSCG00000013509) SH3GL1 (ENSSSCG00000013508) MPND (ENSSSCG00000013507) STAP2 (ENSSSCG00000013506) FSD1 (ENSSSCG00000013505) TMIGD2 (ENSSSCG00000052810) SHD (ENSSSCG00000013503) YJU2 (ENSSSCG00000013499) EBI3 (ENSSSCG00000013498) ANKRD24 (ENSSSCG00000013497) SIRT6 (ENSSSCG00000013496) CREB3L3 (ENSSSCG00000013501) MAP2K2 (ENSSSCG00000027127) ##22 ZBTB7A (ENSSSCG00000029236) PIAS4 (ENSSSCG00000022066) ENSSSCG00000050591 EEF2 (ENSSSCG00000025675) DAPK3 (ENSSSCG00000032170) NMRK2 (ENSSSCG00000040860) ATCAY (ENSSSCG00000026754) ZFR2 (ENSSSCG00000013495) MATK (ENSSSCG00000013494) RAX2 (ENSSSCG00000032429) MRPL54 (ENSSSCG00000024242) APBA3 (ENSSSCG00000013492) TJP3 (ENSSSCG00000013491) PIP5K1C (ENSSSCG00000013490) ENSSSCG00000050486 Chacoan peccary MODERN SPECIES 770 HDGFL2 (ENSCWAG00000014443) UBXN6 (ENSCWAG00000014385) ENSCWAG00000014343 CHAF1A (ENSCWAG00000014211) SH3GL1 (ENSCWAG00000014104) MPND (ENSCWAG00000014062) STAP2 (ENSCWAG00000013947) FSD1 (ENSCWAG00000013697) ENSCWAG00000013636 SHD (ENSCWAG00000013499) YJU2 (ENSCWAG00000013462) EBI3 (ENSCWAG00000013400) ANKRD24 (ENSCWAG00000013213) SIRT6 (ENSCWAG00000013156) CREB3L3 (ENSCWAG00000012936) MAP2K2 (ENSCWAG00000012847) ##22 ZBTB7A (ENSCWAG00000012798) PIAS4 (ENSCWAG00000012745) EEF2 (ENSCWAG00000012682) DAPK3 (ENSCWAG00000012640) ENSCWAG00000012584 ATCAY (ENSCWAG00000012401) ZFR2 (ENSCWAG00000012053) MATK (ENSCWAG00000011572) RAX2 (ENSCWAG00000011537) MRPL54 (ENSCWAG00000011519) APBA3 (ENSCWAG00000011492) TJP3 (ENSCWAG00000011084) PIP5K1C (ENSCWAG00000011001) CACTIN (ENSCWAG00000010950) TBXA2R (ENSCWAG00000010917) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00520000060565 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00960000192381 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Arabian camel MODERN SPECIES 14 PLIN5 (ENSCDRG00005003696) HDGFL2 (ENSCDRG00005003845) UBXN6 (ENSCDRG00005003901) CHAF1A (ENSCDRG00005003943) SH3GL1 (ENSCDRG00005004008) MPND (ENSCDRG00005004145) STAP2 (ENSCDRG00005004207) FSD1 (ENSCDRG00005004266) ENSCDRG00005004340 SHD (ENSCDRG00005004404) YJU2 (ENSCDRG00005004442) EBI3 (ENSCDRG00005004472) ANKRD24 (ENSCDRG00005004507) ENSCDRG00005004643 CREB3L3 (ENSCDRG00005004679) MAP2K2 (ENSCDRG00005004746) ##22 ZBTB7A (ENSCDRG00005004798) PIAS4 (ENSCDRG00005004818) EEF2 (ENSCDRG00005004859) DAPK3 (ENSCDRG00005004913) NMRK2 (ENSCDRG00005004939) ATCAY (ENSCDRG00005005006) ZFR2 (ENSCDRG00005005063) MATK (ENSCDRG00005005153) RAX2 (ENSCDRG00005005226) MRPL54 (ENSCDRG00005005240) APBA3 (ENSCDRG00005005256) TJP3 (ENSCDRG00005005310) PIP5K1C (ENSCDRG00005005583) CACTIN (ENSCDRG00005005904) TBXA2R (ENSCDRG00005005933) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00520000060565 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000163425 ENSGT00940000162830.a.a.a ENSGT00940000162830.a.b.a ENSGT00940000162830.a.b.b ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.a Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000163425 ENSGT00940000162830.a.a.a ENSGT00940000162830.a.b.a ENSGT00940000162830.a.b.b ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.a Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000163425 ENSGT00940000162830.a.a.a ENSGT00940000162830.a.b.a ENSGT00940000162830.a.b.b ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.a.m Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 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ENSGT00940000162830.a.b.b ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.a.m Narwhal MODERN SPECIES 298 PLIN5 (ENSMMNG00015003463) PLIN4 (ENSMMNG00015003425) HDGFL2 (ENSMMNG00015003357) UBXN6 (ENSMMNG00015003306) CHAF1A (ENSMMNG00015003273) SH3GL1 (ENSMMNG00015003205) MPND (ENSMMNG00015003120) STAP2 (ENSMMNG00015003049) FSD1 (ENSMMNG00015002986) SHD (ENSMMNG00015002893) YJU2 (ENSMMNG00015002868) EBI3 (ENSMMNG00015002848) ANKRD24 (ENSMMNG00015002746) SIRT6 (ENSMMNG00015002692) CREB3L3 (ENSMMNG00015002644) MAP2K2 (ENSMMNG00015002569) ##22 ZBTB7A (ENSMMNG00015002508) PIAS4 (ENSMMNG00015002478) EEF2 (ENSMMNG00015002426) DAPK3 (ENSMMNG00015002394) ENSMMNG00015002371 ATCAY (ENSMMNG00015002321) ZFR2 (ENSMMNG00015002202) MATK (ENSMMNG00015002087) RAX2 (ENSMMNG00015002052) ZNF555 (ENSMMNG00015002028) ENSMMNG00015002004 ENSMMNG00015001988 ENSMMNG00015001966 ENSMMNG00015001925 TLE2 (ENSMMNG00015001829) Beluga whale MODERN SPECIES 62 PLIN5 (ENSDLEG00000020074) PLIN4 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Blue whale MODERN SPECIES 14 PLIN4 (ENSBMSG00010003769) HDGFL2 (ENSBMSG00010003814) UBXN6 (ENSBMSG00010003834) CHAF1A (ENSBMSG00010003859) SH3GL1 (ENSBMSG00010003891) MPND (ENSBMSG00010003950) STAP2 (ENSBMSG00010004012) FSD1 (ENSBMSG00010004028) TMIGD2 (ENSBMSG00010004047) SHD (ENSBMSG00010004056) YJU2 (ENSBMSG00010004085) EBI3 (ENSBMSG00010004101) ANKRD24 (ENSBMSG00010004125) SIRT6 (ENSBMSG00010004161) CREB3L3 (ENSBMSG00010004181) MAP2K2 (ENSBMSG00010004206) ##22 PIAS4 (ENSBMSG00010004230) EEF2 (ENSBMSG00010006690) ENSBMSG00010006760 ATCAY (ENSBMSG00010006778) ZFR2 (ENSBMSG00010006830) ZNF555 (ENSBMSG00010007047) ENSBMSG00010007074 ENSBMSG00010007090 ENSBMSG00010007121 ENSBMSG00010007140 ENSBMSG00010007156 ENSBMSG00010007176 TLE2 (ENSBMSG00010007244) TLE5 (ENSBMSG00010007577) GNA11 (ENSBMSG00010007614) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 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ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00520000060565 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Caprinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00960000192381 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 21 PLIN4 (ENSOARG00020014173) HDGFL2 (ENSOARG00020014218) UBXN6 (ENSOARG00020014307) CHAF1A (ENSOARG00020014361) SH3GL1 (ENSOARG00020014536) MPND (ENSOARG00020014684) STAP2 (ENSOARG00020015409) FSD1 (ENSOARG00020015484) ENSOARG00020015717 SHD (ENSOARG00020015785) YJU2 (ENSOARG00020015953) EBI3 (ENSOARG00020016010) ANKRD24 (ENSOARG00020016056) SIRT6 (ENSOARG00020016205) CREB3L3 (ENSOARG00020016282) MAP2K2 (ENSOARG00020016331) ##22 ZBTB7A (ENSOARG00020016414) PIAS4 (ENSOARG00020016478) EEF2 (ENSOARG00020016508) DAPK3 (ENSOARG00020016591) ENSOARG00020016636 ATCAY (ENSOARG00020016696) ZFR2 (ENSOARG00020016870) MATK (ENSOARG00020017085) RAX2 (ENSOARG00020017140) MRPL54 (ENSOARG00020017174) APBA3 (ENSOARG00020017206) TJP3 (ENSOARG00020017288) PIP5K1C (ENSOARG00020017829) CACTIN (ENSOARG00020018654) TBXA2R (ENSOARG00020018783) Goat MODERN SPECIES 26 PLIN5 (ENSCHIG00000020436) ENSCHIG00000010326 HDGFL2 (ENSCHIG00000019288) UBXN6 (ENSCHIG00000004865) CHAF1A (ENSCHIG00000013105) SH3GL1 (ENSCHIG00000027242) MPND (ENSCHIG00000015132) STAP2 (ENSCHIG00000010686) FSD1 (ENSCHIG00000020728) SHD (ENSCHIG00000016892) ENSCHIG00000016966 EBI3 (ENSCHIG00000026597) ANKRD24 (ENSCHIG00000022948) SIRT6 (ENSCHIG00000025871) CREB3L3 (ENSCHIG00000026228) MAP2K2 (ENSCHIG00000014919) ##22 ZBTB7A (ENSCHIG00000022661) PIAS4 (ENSCHIG00000015352) ENSCHIG00000013910 DAPK3 (ENSCHIG00000018026) NMRK2 (ENSCHIG00000008917) ATCAY (ENSCHIG00000026683) ZFR2 (ENSCHIG00000024368) MATK (ENSCHIG00000014576) RAX2 (ENSCHIG00000020868) MRPL54 (ENSCHIG00000026538) APBA3 (ENSCHIG00000014574) TJP3 (ENSCHIG00000017841) PIP5K1C (ENSCHIG00000022491) CACTIN (ENSCHIG00000026750) TBXA2R (ENSCHIG00000012747) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a Bos ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a Bos_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a Cow MODERN SPECIES 26 UBXN6 (ENSBTAG00000008186) CHAF1A (ENSBTAG00000008181) SH3GL1 (ENSBTAG00000006007) MPND (ENSBTAG00000006005) STAP2 (ENSBTAG00000006001) ENSBTAG00000054165 FSD1 (ENSBTAG00000005999) TMIGD2 (ENSBTAG00000004936) SHD (ENSBTAG00000039696) YJU2 (ENSBTAG00000012830) EBI3 (ENSBTAG00000012829) ENSBTAG00000054046 ENSBTAG00000052694 SIRT6 (ENSBTAG00000019909) CREB3L3 (ENSBTAG00000010215) MAP2K2 (ENSBTAG00000024450) ##22 ZBTB7A (ENSBTAG00000020117) PIAS4 (ENSBTAG00000000753) ENSBTAG00000045914 EEF2 (ENSBTAG00000004258) DAPK3 (ENSBTAG00000020417) NMRK2 (ENSBTAG00000031573) ATCAY (ENSBTAG00000018375) ZFR2 (ENSBTAG00000000755) MATK (ENSBTAG00000006619) RAX2 (ENSBTAG00000009750) MRPL54 (ENSBTAG00000008396) APBA3 (ENSBTAG00000008395) TJP3 (ENSBTAG00000018342) PIP5K1C (ENSBTAG00000000710) CACTIN (ENSBTAG00000010373) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 26 UBXN6 (ENSBIXG00005013594) CHAF1A (ENSBIXG00005001662) SH3GL1 (ENSBIXG00005013675) MPND (ENSBIXG00005013751) ENSBIXG00005013788 STAP2 (ENSBIXG00005013835) FSD1 (ENSBIXG00005013884) ENSBIXG00005013897 SHD (ENSBIXG00005013953) YJU2 (ENSBIXG00005013975) EBI3 (ENSBIXG00005007490) ENSBIXG00005014008 ANKRD24 (ENSBIXG00005014095) SIRT6 (ENSBIXG00005014147) CREB3L3 (ENSBIXG00005014171) MAP2K2 (ENSBIXG00005014227) ##22 ZBTB7A (ENSBIXG00005007496) PIAS4 (ENSBIXG00005014272) ENSBIXG00005001922 NMRK2 (ENSBIXG00005014431) ATCAY (ENSBIXG00005006129) ZFR2 (ENSBIXG00005007010) MATK (ENSBIXG00005014627) RAX2 (ENSBIXG00005014658) MRPL54 (ENSBIXG00005014674) APBA3 (ENSBIXG00005005496) TJP3 (ENSBIXG00005002143) PIP5K1C (ENSBIXG00005014985) CACTIN (ENSBIXG00005002202) TBXA2R (ENSBIXG00005015046) GIPC3 (ENSBIXG00005002213) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a Domestic yak MODERN SPECIES 27 PLIN4 (ENSBGRG00000014527) HDGFL2 (ENSBGRG00000014602) UBXN6 (ENSBGRG00000014883) CHAF1A (ENSBGRG00000015141) SH3GL1 (ENSBGRG00000015300) MPND (ENSBGRG00000015810) STAP2 (ENSBGRG00000016477) FSD1 (ENSBGRG00000016795) ENSBGRG00000017038 SHD (ENSBGRG00000017098) ENSBGRG00000017328 EBI3 (ENSBGRG00000017377) ANKRD24 (ENSBGRG00000017470) SIRT6 (ENSBGRG00000017784) CREB3L3 (ENSBGRG00000017902) MAP2K2 (ENSBGRG00000018429) ##22 ZBTB7A (ENSBGRG00000018478) PIAS4 (ENSBGRG00000018519) ENSBGRG00000018795 EEF2 (ENSBGRG00000018816) DAPK3 (ENSBGRG00000019101) NMRK2 (ENSBGRG00000019172) ATCAY (ENSBGRG00000019249) ZFR2 (ENSBGRG00000019327) MATK (ENSBGRG00000019523) RAX2 (ENSBGRG00000019785) MRPL54 (ENSBGRG00000019811) APBA3 (ENSBGRG00000019857) TJP3 (ENSBGRG00000019950) PIP5K1C (ENSBGRG00000020521) CACTIN (ENSBGRG00000020942) Wild yak MODERN SPECIES 763 PLIN4 (ENSBMUG00000019070) HDGFL2 (ENSBMUG00000019044) UBXN6 (ENSBMUG00000019018) CHAF1A (ENSBMUG00000018995) SH3GL1 (ENSBMUG00000018967) MPND (ENSBMUG00000018908) STAP2 (ENSBMUG00000018840) FSD1 (ENSBMUG00000018781) TMIGD2 (ENSBMUG00000018751) SHD (ENSBMUG00000018741) YJU2 (ENSBMUG00000018705) EBI3 (ENSBMUG00000018691) 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ENSGT00950000182920.b.a.a.c.b ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.a ##22 Armadillo MODERN SPECIES 2220 MAP2K2 (ENSDNOG00000013548) ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.b ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00950000182920.b.a.a.c.b ENSGT00950000182920.b.a.a.c.a.b.b ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000163572 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160384 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000159258 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT01030000234559.a.a.a Hyrax MODERN SPECIES 11406 MAP2K2 (ENSPCAG00000012529) ##22 Elephant MODERN SPECIES 60 PLIN5 (ENSLAFG00000020616) PLIN4 (ENSLAFG00000000789) HDGFL2 (ENSLAFG00000029578) UBXN6 (ENSLAFG00000028613) CHAF1A (ENSLAFG00000000293) SH3GL1 (ENSLAFG00000023065) MPND (ENSLAFG00000029255) STAP2 (ENSLAFG00000026115) FSD1 (ENSLAFG00000030096) SHD (ENSLAFG00000009357) YJU2 (ENSLAFG00000007891) EBI3 (ENSLAFG00000022621) ANKRD24 (ENSLAFG00000009676) SIRT6 (ENSLAFG00000026522) ENSLAFG00000010510 MAP2K2 (ENSLAFG00000015636) ##22 PIAS4 (ENSLAFG00000009166) EEF2 (ENSLAFG00000009159) DAPK3 (ENSLAFG00000029621) NMRK2 (ENSLAFG00000031525) ATCAY (ENSLAFG00000012399) ZFR2 (ENSLAFG00000020813) MATK (ENSLAFG00000022360) MRPL54 (ENSLAFG00000029657) APBA3 (ENSLAFG00000015080) TJP3 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ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154779.a.a ENSGT00940000153424.a.a.d ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000163125 ENSGT00950000182993.A.a ENSGT00550000075134 ENSGT00390000016128 ENSGT00940000166580 ENSGT01050000244879.a.a.a ENSGT00940000155332.A Aves ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000182920.b.a.a.d.d.a ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00950000186319 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000163125 ENSGT00950000182993.A.a ENSGT00550000075134 ENSGT00940000166580 ENSGT01050000244879.a.a.a ENSGT00940000155332.A ENSGT00940000158800 ENSGT00730000110920.b.a.a ENSGT00950000182907.b Neognathae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000182920.b.a.a.d.d.a ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00950000186319 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000163125 ENSGT00950000182993.A.a ENSGT00550000075134 ENSGT00940000166580 ENSGT01050000244879.a.a.a ENSGT00940000155332.A ENSGT00940000158800 ENSGT00730000110920.b.a.a ENSGT00950000182907.b Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000182920.b.a.a.d.d.a ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00950000186319 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050.k ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000163125 ENSGT00950000182993.A.a ENSGT00550000075134 ENSGT00960000189545 ENSGT00940000166580 ENSGT01050000244879.a.a.a ENSGT00940000155332.A ENSGT00940000158800 ENSGT00730000110920.b.a.a Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.c ENSGT00940000162613 ENSGT01030000234573.A.b.b.a ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00950000182920.b.a.a.d.d.a ENSGT00950000182920.b.a.a.d.d.b ENSGT00940000165355 ENSGT00940000159170 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000161259.B ENSGT00950000182870.a.a.a.a ENSGT00940000164530 ENSGT00510000049549 ENSGT00500000045074 ENSGT00940000160356 ENSGT00940000159142 ENSGT00940000156523.b ENSGT00390000008060 ENSGT00940000161721 ENSGT00940000157113 ENSGT00940000161332 ENSGT00940000162457 ENSGT00940000160580 ENSGT00940000154739.B Japanese quail MODERN SPECIES 20 TCF3 (ENSCJPG00005010314) UQCR11 (ENSCJPG00005010315) ENSCJPG00005010316 MEX3D (ENSCJPG00005010317) MIER2 (ENSCJPG00005010318) SH3GL1 (ENSCJPG00005010319) CHAF1A (ENSCJPG00005010320) UBXN6 (ENSCJPG00005010321) HDGFL2 (ENSCJPG00005010322) ENSCJPG00005010323 ENSCJPG00005010324 ENSCJPG00005010325 SEMA6B (ENSCJPG00005010326) SIRT6 (ENSCJPG00005010328) CREB3L3 (ENSCJPG00005010329) MAP2K2 (ENSCJPG00005010330) ##22 C2CD4C (ENSCJPG00005010331) ENSCJPG00005010332 ENSCJPG00005010333 ENSCJPG00005010334 TPGS1 (ENSCJPG00005010335) CDC34 (ENSCJPG00005010336) BSG (ENSCJPG00005010337) HCN2 (ENSCJPG00005010338) POLRMT (ENSCJPG00005010339) FGF22 (ENSCJPG00005010340) RNF126 (ENSCJPG00005010341) FSTL3 (ENSCJPG00005010342) PRSS57 (ENSCJPG00005010343) PALM (ENSCJPG00005010344) ENSCJPG00005010345 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.c ENSGT00940000162613 ENSGT01030000234573.A.b.b.a ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00950000182920.b.a.a.d.d.a ENSGT00950000182920.b.a.a.d.d.b ENSGT00940000165355 ENSGT00940000159170 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000161259.B ENSGT00950000182870.a.a.a.a ENSGT00940000164530 ENSGT00510000049549 ENSGT00500000045074 ENSGT00940000160356 ENSGT00940000159142 ENSGT00940000156523.b ENSGT00390000008060 ENSGT00940000161721 ENSGT00940000157113 ENSGT00940000161332 ENSGT00940000162457 ENSGT00940000160580 ENSGT00940000154739.B Turkey MODERN SPECIES 23 ENSMGAG00000019264 ENSMGAG00000018004 FSTL3 (ENSMGAG00000003378) ENSMGAG00000003385 FGF22 (ENSMGAG00000021556) ENSMGAG00000003312 HCN2 (ENSMGAG00000003181) ENSMGAG00000003243 BSG (ENSMGAG00000003132) ENSMGAG00000019149 ENSMGAG00000003104 ENSMGAG00000002676 ENSMGAG00000003095 ENSMGAG00000013112 ENSMGAG00000002308 ENSMGAG00000002951 ##22 ANKRD24 (ENSMGAG00000002898) ENSMGAG00000002932 CREB3L3 (ENSMGAG00000002752) ENSMGAG00000002886 ENSMGAG00000020137 ENSMGAG00000019508 ENSMGAG00000021893 ENSMGAG00000002817 ENSMGAG00000002850 ENSMGAG00000002708 ENSMGAG00000002775 SH3GL1 (ENSMGAG00000002570) ENSMGAG00000002532 ENSMGAG00000002325 ENSMGAG00000002493 Chicken MODERN SPECIES 20 UQCR11 (ENSGALG00010027746) MBD3 (ENSGALG00010027801) MEX3D (ENSGALG00010027811) MIER2 (ENSGALG00010027100) SH3GL1 (ENSGALG00010027192) CHAF1A (ENSGALG00010027202) UBXN6 (ENSGALG00010027208) HDGFRP2 (ENSGALG00010027211) PLIN4 (ENSGALG00010027214) ENSGALG00010028734 ENSGALG00010027216 SEMA6B (ENSGALG00010027217) ANKRD24 (ENSGALG00010027220) SIRT6 (ENSGALG00010027223) CREB3L3 (ENSGALG00010027225) MAP2K2 (ENSGALG00010027230) ##22 C2CD4C (ENSGALG00010027249) ENSGALG00010027258 ENSGALG00010028453 ENSGALG00010028467 TPGS1 (ENSGALG00010028471) CDC34 (ENSGALG00010028473) BSG (ENSGALG00010027468) HCN2 (ENSGALG00010027479) POLRMT (ENSGALG00010027511) FGF22 (ENSGALG00010027553) RNF126 (ENSGALG00010027358) FSTL3 (ENSGALG00010027364) PRSS57 (ENSGALG00010027371) PALM (ENSGALG00010027382) ENSGALG00010027401 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050.k ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000154595 ENSGT00390000000051 ENSGT00940000154412.C ENSGT00950000183158.B.b ENSGT01030000234515.a.b.b.c ENSGT01030000234515.a.b.b.d ENSGT00510000047872 ENSGT00940000158753 ENSGT00940000159993 ENSGT00390000014000 Pink-footed goose MODERN SPECIES 328 FSD1 (ENSABRG00000013237) ENSABRG00000013221 YJU2 (ENSABRG00000013209) EBI3 (ENSABRG00000013200) ANKRD24 (ENSABRG00000013170) SIRT6 (ENSABRG00000013168) CREB3L3 (ENSABRG00000013162) MAP2K2 (ENSABRG00000013052) ##22 ZBTB7A (ENSABRG00000013020) PIAS4 (ENSABRG00000013013) EEF2 (ENSABRG00000012999) DAPK3 (ENSABRG00000012994) NMRK2 (ENSABRG00000012985) HNRNPM (ENSABRG00000012911) TIMM44 (ENSABRG00000012895) CTXN1 (ENSABRG00000012885) FBN3 (ENSABRG00000012106) ENSABRG00000011913 ENSABRG00000011894 Duck MODERN SPECIES 171 MAP2K2 (ENSAPLG00000011045) ##22 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00950000186319 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000154595 ENSGT00390000000051 ENSGT00940000154412.C ENSGT00950000183158.B.b ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000163125 ENSGT00950000182993.A.a ENSGT00550000075134 ENSGT00940000166580 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ENSGT00940000154595 ENSGT00390000000051.l ENSGT00940000154412.C ENSGT00950000183158.B.b ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237.jb ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00950000182993.A.a ENSGT00550000075134 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a ENSGT00940000161872 ENSGT00950000185433 Flycatcher MODERN SPECIES 20 CHAF1A (ENSFALG00000001107) SH3GL1 (ENSFALG00000025015) MPND (ENSFALG00000024578) FSD1 (ENSFALG00000001075) ENSFALG00000025364 YJU2 (ENSFALG00000001069) ENSFALG00000001059 ENSFALG00000028285 ENSFALG00000001036 ENSFALG00000000957 EBI3 (ENSFALG00000000935) ENSFALG00000000929 ENSFALG00000026801 SIRT6 (ENSFALG00000000913) CREB3L3 (ENSFALG00000000900) MAP2K2 (ENSFALG00000000885) ##22 ZBTB7A (ENSFALG00000000874) PIAS4 (ENSFALG00000000872) DAPK3 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ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00950000182993.A.a ENSGT00550000075134 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000162806 ENSGT00940000166941 ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a Zebra finch MODERN SPECIES 21 ENSTGUG00000025953 ENSTGUG00000023253 ENSTGUG00000029047 ENSTGUG00000000935 HNRNPM (ENSTGUG00000000938) ATP5F1D (ENSTGUG00000000895) TIMM44 (ENSTGUG00000013849) ENSTGUG00000022997 ENSTGUG00000025566 ENSTGUG00000023585 ENSTGUG00000000946 EBI3 (ENSTGUG00000024855) ANKRD24 (ENSTGUG00000000981) SIRT6 (ENSTGUG00000000987) CREB3L3 (ENSTGUG00000000991) MAP2K2 (ENSTGUG00000000994) ##22 ZBTB7A (ENSTGUG00000022308) PIAS4 (ENSTGUG00000001000) EEF2 (ENSTGUG00000001004) DAPK3 (ENSTGUG00000001010) NMRK2 (ENSTGUG00000001014) ATCAY (ENSTGUG00000001016) NRTN (ENSTGUG00000001018) ENSTGUG00000023469 ENSTGUG00000028884 ENSTGUG00000026529 PDE4C (ENSTGUG00000024006) JUND (ENSTGUG00000023330) ENSTGUG00000001030 ENSTGUG00000022771 ENSTGUG00000022040 Common canary MODERN SPECIES 109 CRTC1 (ENSSCAG00000011818) ENSSCAG00000011873 KLHL26 (ENSSCAG00000011874) TMEM59L (ENSSCAG00000011880) CRLF1 (ENSSCAG00000011886) ENSSCAG00000011890 UBA52 (ENSSCAG00000011895) KXD1 (ENSSCAG00000011900) FKBP8 (ENSSCAG00000011929) ELL (ENSSCAG00000012011) ENSSCAG00000012020 EBI3 (ENSSCAG00000012039) ENSSCAG00000012041 SIRT6 (ENSSCAG00000012043) CREB3L3 (ENSSCAG00000012049) MAP2K2 (ENSSCAG00000012101) ##22 ZBTB7A (ENSSCAG00000012113) PIAS4 (ENSSCAG00000012119) EEF2 (ENSSCAG00000012124) DAPK3 (ENSSCAG00000012137) NMRK2 (ENSSCAG00000012140) CTXN1 (ENSSCAG00000012543) ENSSCAG00000012552 HNRNPM (ENSSCAG00000012564) ENSSCAG00000012572 Great tit MODERN SPECIES 21 HDGFL2 (ENSPMJG00000012872) UBXN6 (ENSPMJG00000012871) CHAF1A (ENSPMJG00000012870) SH3GL1 (ENSPMJG00000012869) MPND (ENSPMJG00000012868) FSD1 (ENSPMJG00000012867) SHD (ENSPMJG00000012866) YJU2 (ENSPMJG00000012865) HNRNPM (ENSPMJG00000012864) TIMM44 (ENSPMJG00000012863) CTXN1 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(ENSSHBG00005017159) TIMM13 (ENSSHBG00005017163) ENSSHBG00005017170 ENSSHBG00005017173 Golden eagle MODERN SPECIES 3 CHAF1A (ENSACCG00020015292) SH3GL1 (ENSACCG00020015308) MPND (ENSACCG00020015358) STAP2 (ENSACCG00020015392) FSD1 (ENSACCG00020015405) ENSACCG00020015425 SHD (ENSACCG00020015436) YJU2 (ENSACCG00020015454) TIMM44 (ENSACCG00020015520) CTXN1 (ENSACCG00020015575) FBN3 (ENSACCG00020015604) EBI3 (ENSACCG00020015642) ANKRD24 (ENSACCG00020015679) SIRT6 (ENSACCG00020015712) CREB3L3 (ENSACCG00020015724) MAP2K2 (ENSACCG00020015740) ##22 ZBTB7A (ENSACCG00020015748) PIAS4 (ENSACCG00020015756) EEF2 (ENSACCG00020015772) DAPK3 (ENSACCG00020015793) NMRK2 (ENSACCG00020015806) ATCAY (ENSACCG00020015815) ENSACCG00020015834 NRTN (ENSACCG00020015844) DUS3L (ENSACCG00020015859) ENSACCG00020015877 RFX2 (ENSACCG00020015906) ACSBG2 (ENSACCG00020015951) MLLT1 (ENSACCG00020015972) ACER1 (ENSACCG00020015987) ENSACCG00020015996 African ostrich MODERN SPECIES 700 ENSSCUG00000014917 ENSSCUG00000014937 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Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00950000186319 ENSGT00940000159004 ENSGT00960000189486 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00990000205656 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000163125 ENSGT00950000182993.A.a ENSGT00550000075134 ENSGT00390000016128 ENSGT00940000166580 ENSGT01050000244879.a.a.a ENSGT00940000155332.A ENSGT00940000158800 ENSGT00730000110920.b.a.a Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00950000186319 ENSGT00940000159004 ENSGT00960000189486 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00990000205656 ENSGT00940000159237 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ENSSMRG00000016357 ENSSMRG00000016358 MAP2K2 (ENSSMRG00000016359) ##22 ZBTB7A (ENSSMRG00000016360) PIAS4 (ENSSMRG00000016361) EEF2 (ENSSMRG00000016362) ENSSMRG00000016364 ENSSMRG00000016365 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a Lizard MODERN SPECIES 374 ENSACAG00000000286 ##22 Elapidae DUPLICATION Elapidae DUPLICATION Elapidae ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00390000003488.a.b.a ENSGT00390000000777 ENSGT00940000153321.b.a.t ENSGT00940000153321.b.a.u ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.q.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a Indian cobra MODERN SPECIES FSD1 (ENSNNAG00000002240) STAP2 (ENSNNAG00000002270) MPND (ENSNNAG00000002302) SH3GL1 (ENSNNAG00000002334) CHAF1A (ENSNNAG00000002363) UBXN6 (ENSNNAG00000002377) ENSNNAG00000002386 ENSNNAG00000002391 ENSNNAG00000002397 ENSNNAG00000002405 ENSNNAG00000002413 ENSNNAG00000002417 ANKRD24 (ENSNNAG00000002428) SIRT6 (ENSNNAG00000002440) CREB3L3 (ENSNNAG00000002452) ENSNNAG00000002482 ##22 ZBTB7A (ENSNNAG00000002492) PIAS4 (ENSNNAG00000002501) EEF2 (ENSNNAG00000002519) DAPK3 (ENSNNAG00000002558) ENSNNAG00000002566 ENSNNAG00000002577 ENSNNAG00000002600 ENSNNAG00000002674 ENSNNAG00000002684 ENSNNAG00000002692 ENSNNAG00000002708 ENSNNAG00000002720 ENSNNAG00000002731 ENSNNAG00000002741 ENSNNAG00000002753 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 135 ENSGT00390000003488.a.b.a ENSGT00390000000777 ENSGT00940000153321.b.a.t ENSGT00940000153321.b.a.u ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.q.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000153424.a.a.d ENSGT00940000154779.a.a Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 142 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.q.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000153424.a.a.d ENSGT00940000154779.a.a Mainland tiger snake MODERN SPECIES 364 ENSNSUG00000010144 SIRT6 (ENSNSUG00000010142) ENSNSUG00000010141 ##22 ZBTB7A (ENSNSUG00000010140) PIAS4 (ENSNSUG00000010139) EEF2 (ENSNSUG00000010137) DAPK3 (ENSNSUG00000010086) Eastern brown snake MODERN SPECIES 171 TNFAIP8L1 (ENSPTXG00000017715) MYDGF (ENSPTXG00000017716) ENSPTXG00000017717 ENSPTXG00000017718 ENSPTXG00000017719 ANKRD24 (ENSPTXG00000017721) CREB3L3 (ENSPTXG00000017722) MAP2K2 (ENSPTXG00000017723) ##22 ENSPTXG00000017724 ENSPTXG00000011168 PIAS4 (ENSPTXG00000011170) ENSPTXG00000011171 ENSPTXG00000011174 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.a.q.b ##22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.a.q.b ##22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.a.q.b ##22 Mainland tiger snake DUPLICATION Mainland tiger snake MODERN SPECIES 125 ENSNSUG00000007548 ENSNSUG00000007554 ENSNSUG00000007555 ENSNSUG00000007556 ENSNSUG00000007557 ENSNSUG00000007562 ENSNSUG00000007567 ENSNSUG00000007578 ENSNSUG00000007601 ENSNSUG00000007603 ENSNSUG00000008487 ENSNSUG00000008491 PRPF40A (ENSNSUG00000008493) ENSNSUG00000008494 ##22 ENSNSUG00000008495 ENSNSUG00000008496 ENSNSUG00000008519 ENSNSUG00000008520 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 124 ENSNSUG00000006991 ENSNSUG00000006993 ENSNSUG00000006995 ENSNSUG00000006996 ENSNSUG00000006997 ENSNSUG00000007000 ENSNSUG00000007012 ENSNSUG00000007030 ENSNSUG00000007037 ENSNSUG00000007038 ENSNSUG00000007040 ENSNSUG00000007393 ENSNSUG00000007412 ENSNSUG00000007421 ARL6IP6 (ENSNSUG00000007422) ENSNSUG00000007423 ##22 ENSNSUG00000007424 ENSNSUG00000007426 ENSNSUG00000007544 Indian cobra MODERN SPECIES ENSNNAG00000006910 LYPD6B (ENSNNAG00000006750) LYPD6 (ENSNNAG00000006713) MMADHC (ENSNNAG00000019078) ENSNNAG00000019076 RND3 (ENSNNAG00000019074) NMI (ENSNNAG00000019069) TNFAIP6 (ENSNNAG00000019067) NEB (ENSNNAG00000018647) ARL5A (ENSNNAG00000018385) CACNB4 (ENSNNAG00000018360) STAM2 (ENSNNAG00000018344) FMNL2 (ENSNNAG00000018336) ARL6IP6 (ENSNNAG00000018331) ENSNNAG00000018328 ENSNNAG00000018325 ##22 ENSNNAG00000018324 ENSNNAG00000018322 GALNT13 (ENSNNAG00000018312) KCNJ3 (ENSNNAG00000018307) NR4A2 (ENSNNAG00000018303) GPD2 (ENSNNAG00000018298) ENSNNAG00000018296 CYTIP (ENSNNAG00000018295) ACVR1C (ENSNNAG00000018291) ACVR1 (ENSNNAG00000018290) UPP2 (ENSNNAG00000018288) CCDC148 (ENSNNAG00000018282) PKP4 (ENSNNAG00000018276) DAPL1 (ENSNNAG00000018273) TANC1 (ENSNNAG00000018263) Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.a.r ##22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.b.a.r ##22 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 9104 MAP2K2 (ENSLLTG00000010579) ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 918 ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000162053 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 172 ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500 ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a ENSGT00940000153487.b.a ##22 ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036 ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905 ENSGT01100000264330 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000159179 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a Spotted gar MODERN SPECIES 657 CPAMD8 (ENSLOCG00000005716) odf3l2a (ENSLOCG00000005731) cks2 (ENSLOCG00000005754) shc2 (ENSLOCG00000005770) ENSLOCG00000005794 DOT1L (ENSLOCG00000005809) sf3a2 (ENSLOCG00000005835) ENSLOCG00000005854 oaz1a (ENSLOCG00000005874) org (ENSLOCG00000005893) lingo3a (ENSLOCG00000017635) ENSLOCG00000005917 ONECUT3 (ENSLOCG00000005935) foxq2 (ENSLOCG00000005947) pias4a (ENSLOCG00000005962) map2k2a (ENSLOCG00000005968) ##22 ENSLOCG00000005993 tcf3a (ENSLOCG00000006013) MBD3 (ENSLOCG00000006043) mbd3b (ENSLOCG00000006065) ENSLOCG00000006087 hmg20b (ENSLOCG00000006147) btbd2a (ENSLOCG00000006170) eef2b (ENSLOCG00000006185) creb3l3a (ENSLOCG00000006221) rxfp3.2b (ENSLOCG00000017636) ANKRD24 (ENSLOCG00000006239) ENSLOCG00000006256 shda (ENSLOCG00000006271) s1pr3a (ENSLOCG00000017637) ENSLOCG00000006291 Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 199 ENSGT00500000045074 ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000159808 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ENSGT00940000153487.b.a.s.a ##22 ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT01100000264330 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B 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(ENSCARG00000062598) pias4a (ENSCARG00000062636) map2k2a (ENSCARG00000062735) ##22 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 321 ENSGT00950000183049.C.a.a.g.b ENSGT00940000156705.c ENSGT00940000155914.c.a.c.b ENSGT00390000013515.f ENSGT00390000006337.a ENSGT00990000206265 ENSGT00940000159808.c ENSGT00390000006809.b ENSGT00940000164500.b.b ENSGT00940000164108.b.a.b ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b.c ENSGT00940000166634.b ENSGT01030000234539.a.a.a.f.f ENSGT00940000153487.b.a.s.a.b ##22 ENSGT00940000166752.c ENSGT00940000157036.e.a.a.a ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b.b ENSGT00940000155402.a.a.c ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213.b ENSGT00940000161905.a.b ENSGT00940000166909 ENSGT00940000161213.a ENSGT00940000159179.h.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00950000183049.C.a.a.g.a ENSGT00940000156705.d ENSGT00940000155914.c.a.c.a ENSGT00390000013515.e ENSGT00390000006337.b ENSGT00990000206265 ENSGT00940000159808.c ENSGT00390000006809.b 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ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ENSGT00940000153487.b.a.s.a ##22 ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT01100000264042 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 ENSGT00390000002629 ENSGT00950000182925.C.a.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 8 tmem59l (ENSKMAG00000002932) ssbp4 (ENSKMAG00000002949) fkbp8 (ENSKMAG00000002964) ell (ENSKMAG00000002974) DOT1L (ENSKMAG00000002991) amh (ENSKMAG00000003028) oaz1a (ENSKMAG00000003091) ENSKMAG00000003113 org (ENSKMAG00000003127) lingo3a (ENSKMAG00000003141) nfil3-4 (ENSKMAG00000003148) ENSKMAG00000003171 ONECUT3 (ENSKMAG00000003238) foxq2 (ENSKMAG00000003247) pias4a 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ENSGT00940000177291 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000008279.b ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ENSGT00940000153487.b.a.s.a ##22 ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000161905.a ENSGT00940000166909 ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00950000183049.C.b.b ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 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ENSGT00940000162487 ENSGT00390000002629 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808.g ENSGT00990000206265 ENSGT00940000159808.h ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ENSGT00940000153487.b.a.s.a ##22 ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 ENSGT00390000002629 Zig-zag eel MODERN SPECIES 18 crlf1b (ENSMAMG00000019897) tmem59l (ENSMAMG00000019855) ssbp4 (ENSMAMG00000019813) fkbp8 (ENSMAMG00000019806) ell (ENSMAMG00000019802) DOT1L (ENSMAMG00000019781) amh 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ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 ENSGT00390000002629 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 15 tmem59l (ENSBSLG00000020107) ssbp4 (ENSBSLG00000020131) fkbp8 (ENSBSLG00000020358) ell (ENSBSLG00000020371) DOT1L (ENSBSLG00000020487) amh (ENSBSLG00000020545) oaz1a (ENSBSLG00000000482) org (ENSBSLG00000000508) lingo3a (ENSBSLG00000000528) nfil3-4 (ENSBSLG00000000543) ENSBSLG00000000554 ENSBSLG00000000564 ONECUT3 (ENSBSLG00000000585) foxq2 (ENSBSLG00000000594) pias4a (ENSBSLG00000000614) map2k2a (ENSBSLG00000000681) ##22 ENSBSLG00000000752 tcf3b (ENSBSLG00000000772) ENSBSLG00000000795 mbd3b (ENSBSLG00000000820) ENSBSLG00000000972 hmg20b (ENSBSLG00000001058) ENSBSLG00000001069 rxfp3.2b 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Carangaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ENSGT00940000153487.b.a.s.a ##22 ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000161905.a ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 ENSGT00390000002629 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a 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(ENSSAUG00010006216) micos13 (ENSSAUG00010006210) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT01030000236343 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ENSGT00940000153487.b.a.s.a ##22 ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 ENSGT00390000002629 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ENSGT00940000153487.b.a.s.a ##22 ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 ENSGT00390000002629 Channel bull blenny MODERN SPECIES 18 ssbp4 (ENSCGOG00000009536) fkbp8 (ENSCGOG00000009474) ell (ENSCGOG00000009470) DOT1L (ENSCGOG00000008368) amh (ENSCGOG00000008344) oaz1a (ENSCGOG00000008337) ENSCGOG00000008332 org (ENSCGOG00000008327) lingo3a (ENSCGOG00000008324) nfil3-4 (ENSCGOG00000008321) ENSCGOG00000008319 ENSCGOG00000008285 ONECUT3 (ENSCGOG00000008282) foxq2 (ENSCGOG00000008279) pias4a (ENSCGOG00000008268) map2k2a (ENSCGOG00000007606) ##22 ENSCGOG00000007572 tcf3b (ENSCGOG00000007482) ENSCGOG00000007477 ENSCGOG00000007471 mbd3b (ENSCGOG00000007465) ENSCGOG00000004133 hmg20b (ENSCGOG00000004009) ENSCGOG00000003282 rxfp3.2b (ENSCGOG00000003232) creb3l3a (ENSCGOG00000003219) celf5a (ENSCGOG00000003127) ENSCGOG00000003124 rgmd (ENSCGOG00000003121) hsd11b1la (ENSCGOG00000003118) micos13 (ENSCGOG00000003115) Pike perch MODERN SPECIES 34 crlf1b (ENSSLUG00000012614) tmem59l (ENSSLUG00000012619) ssbp4 (ENSSLUG00000012627) fkbp8 (ENSSLUG00000012664) ell (ENSSLUG00000012675) DOT1L (ENSSLUG00000012762) amh (ENSSLUG00000012781) oaz1a (ENSSLUG00000012785) org (ENSSLUG00000012790) lingo3a (ENSSLUG00000012793) ENSSLUG00000012796 ENSSLUG00000012797 ONECUT3 (ENSSLUG00000012802) foxq2 (ENSSLUG00000012804) pias4a (ENSSLUG00000012813) map2k2a (ENSSLUG00000012846) ##22 ENSSLUG00000013000 tcf3b (ENSSLUG00000013013) ENSSLUG00000013074 ENSSLUG00000013084 mbd3b (ENSSLUG00000013102) ENSSLUG00000013172 hmg20b (ENSSLUG00000013466) 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ENSGACG00000012506 ssbp4 (ENSGACG00000012509) fkbp8 (ENSGACG00000012561) ell (ENSGACG00000012588) DOT1L (ENSGACG00000012616) amh (ENSGACG00000012629) ENSGACG00000012639 oaz1a (ENSGACG00000012643) ENSGACG00000012649 org (ENSGACG00000012651) lingo3a (ENSGACG00000012652) ENSGACG00000012656 ENSGACG00000012658 ONECUT3 (ENSGACG00000012671) pias4a (ENSGACG00000012681) map2k2a (ENSGACG00000012686) ##22 ENSGACG00000012730 tcf3b (ENSGACG00000012737) ENSGACG00000012755 mbd3b (ENSGACG00000012760) hmg20b (ENSGACG00000012785) ENSGACG00000012793 rxfp3.2b (ENSGACG00000012856) creb3l3a (ENSGACG00000012860) celf5a (ENSGACG00000012870) rgmd (ENSGACG00000012876) hsd11b1la (ENSGACG00000012884) ENSGACG00000012902 ENSGACG00000012927 ENSGACG00000012935 ENSGACG00000012948 Lumpfish MODERN SPECIES 19 crlf1b (ENSCLMG00005016733) tmem59l (ENSCLMG00005016760) ssbp4 (ENSCLMG00005016764) fkbp8 (ENSCLMG00005016767) ell (ENSCLMG00005016774) DOT1L (ENSCLMG00005016800) amh (ENSCLMG00005016820) oaz1a (ENSCLMG00005016821) 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ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ENSGT00940000153487.b.a.s.a ##22 ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000154662.d.l.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154716.hc ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156569.a.b.b.f ENSGT00390000008279.b.c ENSGT00950000183049.C.a.a.a ENSGT00940000156705.f ENSGT00940000155914.c.a.b ENSGT00390000013515.g ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808.e ENSGT00940000159808.f.a ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b.c ENSGT00950000183103.d.b.a.b.a ENSGT00940000166634.e ENSGT01030000234539.a.a.a.f.a ENSGT00940000153487.b.a.s.a.c ##22 ENSGT00940000166752.e ENSGT00940000157036.e.a.d ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b.c ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B.g.a ENSGT00940000161213.c ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000154662.d.l.a.a ENSGT00940000159261.d.a.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.a ENSGT00950000183112.b.a.a.a.d ENSGT00940000162487.t.a ENSGT00390000002629.u Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000008279.b.c ENSGT00950000183049.C.a.a.a ENSGT00940000156705.f ENSGT00940000155914.c.a.b ENSGT00390000013515.g ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808.f.a ENSGT00610000087460 ENSGT00940000159808.e ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b.c ENSGT00940000164108.b.a.c ENSGT00950000183103.d.b.a.b.a ENSGT00940000166634.e ENSGT01030000234539.a.a.a.f.a ENSGT00940000153487.b.a.s.a.c ##22 ENSGT00940000166752.e ENSGT00940000157036.e.a.d ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b.c ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B.g.a ENSGT00940000161213.c ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000154662.d.l.a.a ENSGT00940000159261.d.a.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.a ENSGT00950000183112.b.a.a.a.d ENSGT00940000162487.t.a ENSGT00390000002629.u Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01000000219677 ENSGT00940000156569.a.b.b.f ENSGT00390000008279.b.c ENSGT00950000183049.C.a.a.a ENSGT00940000156705.f ENSGT00940000155914.c.a.b ENSGT00390000013515.g ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808.e ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b.c ENSGT00940000164108.b.a.c ENSGT00950000183103.d.b.a.b.a ENSGT00940000166634.e ENSGT01030000234539.a.a.a.f.a ENSGT00940000153487.b.a.s.a.c ##22 ENSGT00940000166752.e ENSGT00940000157036.e.a.d ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b.c ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B.g.a ENSGT00940000161213.c ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000154662.d.l.a.a ENSGT00940000159261.d.a.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.a ENSGT00950000183112.b.a.a.a.d ENSGT00940000162487.t.a ENSGT00390000002629.u Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156569.a.b.b.f ENSGT00390000008279.b.c ENSGT00950000183049.C.a.a.a ENSGT00940000156705.f ENSGT00940000155914.c.a.b ENSGT00390000013515.g ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808.f.a ENSGT00940000159808.e ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b.c ENSGT00940000164108.b.a.c ENSGT00950000183103.d.b.a.a.b ENSGT00940000166634.e ENSGT01030000234539.a.a.a.f.a ENSGT00940000153487.b.a.s.a.c ##22 ENSGT00940000166752.e ENSGT00940000157036.e.a.d ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b.c ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B.g.a ENSGT00940000161213.c ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000154662.d.l.a.a ENSGT00940000159261.d.a.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.a ENSGT00950000183112.b.a.a.a.d ENSGT00940000162487.t.a ENSGT00390000002629.u Chinook salmon MODERN SPECIES 29 shdb (ENSOTSG00005041892) ENSOTSG00005041891 ENSOTSG00005041890 ENSOTSG00005041889 shc2 (ENSOTSG00005041888) cks2 (ENSOTSG00005041887) ENSOTSG00005041886 ENSOTSG00005041884 ENSOTSG00005041883 crlf1b (ENSOTSG00005041882) tmem59l (ENSOTSG00005041881) ENSOTSG00005041880 ENSOTSG00005041878 foxq2 (ENSOTSG00005041877) pias4a (ENSOTSG00005041876) map2k2a (ENSOTSG00005041842) ##22 ENSOTSG00005041839 tcf3b (ENSOTSG00005041813) UQCR11 (ENSOTSG00005041812) ENSOTSG00005041801 mbd3b (ENSOTSG00005032354) ENSOTSG00005028127 hmg20b (ENSOTSG00005028095) btbd2a (ENSOTSG00005027995) eef2b (ENSOTSG00005027841) creb3l3a (ENSOTSG00005027839) rxfp3.2b (ENSOTSG00005027837) ENSOTSG00005027836 celf5a (ENSOTSG00005027834) rgmd (ENSOTSG00005027833) hsd11b1la (ENSOTSG00005027832) Coho salmon MODERN SPECIES 4 tmem59l (ENSOKIG00005039865) ENSOKIG00005039907 ssbp4 (ENSOKIG00005039948) fkbp8 (ENSOKIG00005040657) ell (ENSOKIG00005040869) DOT1L (ENSOKIG00005041013) amh (ENSOKIG00005041367) ENSOKIG00005041381 oaz1a (ENSOKIG00005041388) org (ENSOKIG00005041463) lingo3a (ENSOKIG00005041488) nfil3-4 (ENSOKIG00005041496) ONECUT3 (ENSOKIG00005041534) foxq2 (ENSOKIG00005041552) pias4a (ENSOKIG00005041570) map2k2a (ENSOKIG00005041689) ##22 ENSOKIG00005041909 ENSOKIG00005041921 tcf3b (ENSOKIG00005041972) UQCR11 (ENSOKIG00005042395) ENSOKIG00005042430 mbd3b (ENSOKIG00005042554) eef2b (ENSOKIG00005042682) ENSOKIG00005043088 hmg20b (ENSOKIG00005045048) btbd2a (ENSOKIG00005045078) creb3l3a (ENSOKIG00005045180) rxfp3.2b (ENSOKIG00005003851) celf5a (ENSOKIG00005003859) ENSOKIG00005003868 rgmd (ENSOKIG00005003870) Rainbow trout MODERN SPECIES 26 crlf1b (ENSOMYG00000025390) tmem59l (ENSOMYG00000025330) ssbp4 (ENSOMYG00000028010) fkbp8 (ENSOMYG00000027698) ell (ENSOMYG00000027667) ENSOMYG00000027287 amh (ENSOMYG00000027120) oaz1a (ENSOMYG00000027112) org (ENSOMYG00000027097) lingo3a (ENSOMYG00000027063) nfil3-4 (ENSOMYG00000027055) ENSOMYG00000027045 foxq2 (ENSOMYG00000027035) ENSOMYG00000069495 pias4a (ENSOMYG00000026996) map2k2a (ENSOMYG00000026830) ##22 ENSOMYG00000026747 tcf3b (ENSOMYG00000026566) ENSOMYG00000026379 ENSOMYG00000026298 mbd3b (ENSOMYG00000025002) ENSOMYG00000067858 ENSOMYG00000018017 hmg20b (ENSOMYG00000017483) btbd2a (ENSOMYG00000017261) ENSOMYG00000016947 ENSOMYG00000067523 creb3l3a (ENSOMYG00000016901) rxfp3.2b (ENSOMYG00000016896) celf5a (ENSOMYG00000016886) ENSOMYG00000014600 Salmo ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160988 ENSGT00940000156569.a.b.b.f ENSGT00390000008279.b.c ENSGT00950000183049.C.a.a.a ENSGT00940000156705.f ENSGT00940000155914.c.a.b ENSGT00390000013515.g ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808.e ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b.c ENSGT00940000164108.b.a.c ENSGT00950000183103.d.b.a.b.a ENSGT00940000166634.e ENSGT01030000234539.a.a.a.f.a ENSGT00940000153487.b.a.s.a.c ##22 ENSGT00940000166752.e ENSGT00940000157036.e.a.d ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b.c ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B.g.a ENSGT00940000161213.c ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000154662.d.l.a.a ENSGT00940000159261.d.a.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00990000213636 ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.a ENSGT00950000183112.b.a.a.a.d ENSGT00940000162487.t.a River trout MODERN SPECIES 14 ENSSTUG00000032392 crlf1b (ENSSTUG00000032330) tmem59l (ENSSTUG00000032268) ssbp4 (ENSSTUG00000031717) fkbp8 (ENSSTUG00000031560) ell (ENSSTUG00000031460) DOT1L (ENSSTUG00000031330) ENSSTUG00000031279 oaz1a (ENSSTUG00000031277) ENSSTUG00000031273 org (ENSSTUG00000031263) lingo3a (ENSSTUG00000031260) ONECUT3 (ENSSTUG00000048688) foxq2 (ENSSTUG00000048684) pias4a (ENSSTUG00000048663) map2k2a (ENSSTUG00000048587) ##22 ENSSTUG00000048578 ENSSTUG00000048574 tcf3b (ENSSTUG00000048478) UQCR11 (ENSSTUG00000048458) ENSSTUG00000048402 mbd3b (ENSSTUG00000048309) ENSSTUG00000045917 hmg20b (ENSSTUG00000045734) btbd2a 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(ENSSSAG00000121503) Huchen MODERN SPECIES 64 crlf1b (ENSHHUG00000042845) tmem59l (ENSHHUG00000042830) ssbp4 (ENSHHUG00000042772) fkbp8 (ENSHHUG00000042751) ell (ENSHHUG00000042721) DOT1L (ENSHHUG00000042663) amh (ENSHHUG00000042652) oaz1a (ENSHHUG00000042642) ENSHHUG00000042639 org (ENSHHUG00000042630) lingo3a (ENSHHUG00000042627) ENSHHUG00000042624 ONECUT3 (ENSHHUG00000042617) foxq2 (ENSHHUG00000042609) pias4a (ENSHHUG00000042579) map2k2a (ENSHHUG00000042167) ##22 ENSHHUG00000042158 tcf3b (ENSHHUG00000042110) UQCR11 (ENSHHUG00000042104) ENSHHUG00000042074 mbd3b (ENSHHUG00000041665) ENSHHUG00000041423 hmg20b (ENSHHUG00000041407) btbd2a (ENSHHUG00000041383) eef2b (ENSHHUG00000041336) creb3l3a (ENSHHUG00000041330) rxfp3.2b (ENSHHUG00000041329) celf5a (ENSHHUG00000041316) rgmd (ENSHHUG00000041314) hsd11b1la (ENSHHUG00000041313) micos13 (ENSHHUG00000041311) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000156569.a.b.b.e ENSGT00390000008279.b.d ENSGT00950000183049.C.a.a.b ENSGT00940000156705.e ENSGT00940000155914.c.a.a ENSGT00390000013515.h ENSGT00940000179866 ENSGT00940000159808.f.b ENSGT00940000164500.b.d ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b.b ENSGT00940000166634.f ENSGT01030000234539.a.a.a.f.b ENSGT00940000153487.b.a.s.a.d ##22 ENSGT00940000166752.f ENSGT00940000157036.e.a.c ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b.d ENSGT00940000161905.a Huchen MODERN SPECIES 2056 ENSHHUG00000002729 ENSHHUG00000002757 foxq2 (ENSHHUG00000002763) pias4a (ENSHHUG00000002772) map2k2a (ENSHHUG00000002801) ##22 ENSHHUG00000003181 tcf3b (ENSHHUG00000003206) ENSHHUG00000003358 ENSHHUG00000003376 ENSHHUG00000003458 ENSHHUG00000003479 unc13a (ENSHHUG00000003518) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000008279.b.d ENSGT00950000183049.C.a.a.b ENSGT00940000156705.e ENSGT00940000155914.c.a.a ENSGT00390000013515.h ENSGT00940000179866.a ENSGT00940000159808.f.b ENSGT01010000226535 ENSGT00940000164500.b.d ENSGT00940000164108.b.a.d ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b.b ENSGT00940000166634.f ENSGT01030000234539.a.a.a.f.b ENSGT00940000153487.b.a.s.a.d ##22 ENSGT00940000166752.f ENSGT00940000157036.e.a.c ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b.d ENSGT00940000154929.B.g.b ENSGT00940000161213.d ENSGT00940000154662.d.l.a.b ENSGT00940000159261.d.a.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154716.hc ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.b ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a.c ENSGT00940000162487.t.b ENSGT00390000002629.v Salmo ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000008279.b.d ENSGT00950000183049.C.a.a.b ENSGT00940000156705.e ENSGT00940000155914.c.a.a ENSGT00390000013515.h ENSGT00940000179866.a ENSGT00940000159808.f.b ENSGT01010000226535 ENSGT00940000164500.b.d ENSGT00940000164108.b.a.d ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b.b ENSGT00940000166634.f ENSGT01030000234539.a.a.a.f.b ENSGT00940000153487.b.a.s.a.d ##22 ENSGT00940000166752.f ENSGT00940000157036.e.a.c ENSGT01100000264042 ENSGT00950000183005.b.b.d ENSGT00940000154929.B.g.b ENSGT00940000161213.d ENSGT00940000154662.d.l.a.b ENSGT00940000159261.d.a.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154716.hc ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.b ENSGT00950000183112.b.a.a.a.c ENSGT00940000177291 ENSGT00940000162487.t.b ENSGT00390000002629.v Atlantic salmon MODERN SPECIES 15 ENSSSAG00000118135 ssbp4 (ENSSSAG00000009016) ENSSSAG00000108322 ell (ENSSSAG00000009143) ENSSSAG00000009382 oaz1s (ENSSSAG00000009700) ENSSSAG00000009718 ENSSSAG00000009764 lingo3a (ENSSSAG00000110799) ENSSSAG00000082536 ENSSSAG00000112330 ENSSSAG00000101819 ENSSSAG00000009895 ENSSSAG00000009906 foxq2 (ENSSSAG00000009926) mp2k2 (ENSSSAG00000009933) ##22 tcf3b (ENSSSAG00000010042) ENSSSAG00000094304 ENSSSAG00000105808 ENSSSAG00000010477 hmg20b (ENSSSAG00000017779) ef2 (ENSSSAG00000017975) creb3l3a (ENSSSAG00000018991) celf5a (ENSSSAG00000019628) rgmd (ENSSSAG00000020190) ENSSSAG00000020311 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ENSGT00390000008279.b.d ENSGT00950000183049.C.a.a.b ENSGT00940000156705.e ENSGT00940000155914.c.a.a ENSGT00390000013515.h ENSGT00940000159808.f.b ENSGT01010000226535 ENSGT00940000164500.b.d ENSGT00940000164108.b.a.d ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b.b ENSGT00940000166634.f ENSGT01030000234539.a.a.a.f.b ENSGT00940000153487.b.a.s.a.d ##22 ENSGT00940000166752.f ENSGT00940000157036.e.a.c ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b.d ENSGT00940000154929.B.g.b ENSGT00940000161213.d ENSGT00940000154662.d.l.a.b ENSGT00940000159261.d.a.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154716.hc.f ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.b ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a.c ENSGT00940000162487.t.b ENSGT00390000002629.v Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000166035 ENSGT00940000156569.a.b.b.e ENSGT00390000008279.b.d ENSGT00950000183049.C.a.a.b ENSGT00940000156705.e ENSGT00940000155914.c.a.a ENSGT00390000013515.h ENSGT00940000159808.f.b 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SPECIES 7 tmem59l (ENSELUG00000017649) ENSELUG00000027587 ssbp4 (ENSELUG00000017751) fkbp8 (ENSELUG00000017800) ell (ENSELUG00000017856) DOT1L (ENSELUG00000017947) amh (ENSELUG00000001523) oaz1a (ENSELUG00000018009) org (ENSELUG00000018048) lingo3a (ENSELUG00000031632) nfil3-4 (ENSELUG00000018073) ENSELUG00000018163 ONECUT3 (ENSELUG00000018173) foxq2 (ENSELUG00000000758) pias4a (ENSELUG00000018209) map2k2a (ENSELUG00000018291) ##22 ENSELUG00000018331 tcf3b (ENSELUG00000000785) UQCR11 (ENSELUG00000018436) ENSELUG00000018490 mbd3b (ENSELUG00000018581) unc13a (ENSELUG00000018664) hmg20b (ENSELUG00000018708) btbd2a (ENSELUG00000018789) eef2b (ENSELUG00000018859) creb3l3a (ENSELUG00000018885) rxfp3.2b (ENSELUG00000018897) celf5a (ENSELUG00000018986) rgmd (ENSELUG00000019027) hsd11b1la (ENSELUG00000019096) micos13 (ENSELUG00000025803) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808.i ENSGT00940000157066.p ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ENSGT00940000153487.b.a.s.a ##22 ENSGT00940000166752.a ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000162613.c ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d.d.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000002629 ENSGT00910000144271.A ENSGT00910000144271.B Asian bonytongue MODERN SPECIES 24 ssbp4 (ENSSFOG00015029509) fkbp8 (ENSSFOG00015003342) ell (ENSSFOG00015003353) ENSSFOG00015027631 DOT1L (ENSSFOG00015003432) amh (ENSSFOG00015003441) oaz1a (ENSSFOG00015003448) ENSSFOG00015003472 org (ENSSFOG00015003484) lingo3a (ENSSFOG00015026385) nfil3-4 (ENSSFOG00015027003) ENSSFOG00015003531 ENSSFOG00015003587 foxq2 (ENSSFOG00015003608) pias4a 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ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00940000157113.d ENSGT00410000025695.a Otophysi ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01100000263491.a.b.a.b.a.b ENSGT01100000263491.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000165396.B ENSGT00940000161411 ENSGT01100000263495.A.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.b.a.a ENSGT00390000012355.A.b ENSGT00390000018395 ENSGT00500000045074 ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00410000028808 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.a.e ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00390000002913 ENSGT00940000158163.a ENSGT00940000158649.a.b ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000159946.h ENSGT00950000183110.b.a.d Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01100000263491.a.b.a.b.a.b ENSGT01100000263491.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000165396.B ENSGT00940000161411 ENSGT01100000263495.A.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.b.a.a ENSGT00390000012355.A.b ENSGT00390000018395 ENSGT00500000045074 ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00410000028808 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.a.e ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00390000002913 ENSGT00940000158163.a ENSGT00940000158649.a.b ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000159946.h ENSGT00950000183110.b.a.d ENSGT00390000013841 ENSGT00940000161913 Channel catfish MODERN SPECIES 12 ENSIPUG00000018967 si:ch211-155e24.3 (ENSIPUG00000018973) ENSIPUG00000018980 ENSIPUG00000018985 ENSIPUG00000018996 ENSIPUG00000019007 ENSIPUG00000019011 isyna1 (ENSIPUG00000019018) Tpgs1 (ENSIPUG00000019039) plekhj1 (ENSIPUG00000019044) sf3a2 (ENSIPUG00000019071) ENSIPUG00000019085 ENSIPUG00000019097 ONECUT3 (ENSIPUG00000019104) pias4b (ENSIPUG00000019122) 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ENSEEEG00000016119 tcf3a (ENSEEEG00000016117) UQCR11 (ENSEEEG00000016115) mbd3a (ENSEEEG00000016069) MEX3D (ENSEEEG00000016066) ENSEEEG00000016064 BTBD2 (ENSEEEG00000016046) ARMC6 (ENSEEEG00000016041) slc25a42 (ENSEEEG00000016040) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00940000157535.m.b ENSGT01100000263491.a.b.a.b.a.b ENSGT01100000263491.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000165396.B ENSGT01100000263495.A.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.b.a.a ENSGT00390000012355.A.b ENSGT00390000018395 ENSGT00500000045074 ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00410000028808 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.a.e ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00390000002913 ENSGT00940000158163.a ENSGT00940000158649.a.b.a ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000159946.h ENSGT00950000183110.b.a.d Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 487 ENSGT00940000153487.b.a.s.b.a ##22 ENSGT00940000157036.e.b.h ENSGT01000000214836 ENSGT00950000183005.b.a.b ENSGT00940000162613.f ENSGT00940000161905.b.b ENSGT00940000159179.g.b ENSGT00940000154662.d.u ENSGT00940000159261.d.a.a ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.c ENSGT00940000154716.hc.b ENSGT00950000183112.b.a.a.a.a ENSGT00940000162487.u.a ENSGT00390000002629.ab ENSGT00910000144271.A.b.f ENSGT00910000144271.B.a.b.b.a.b Goldfish MODERN SPECIES 19 ENSCARG00000007831 ENSCARG00000007840 ENSCARG00000007855 ENSCARG00000007868 ENSCARG00000007876 ENSCARG00000007884 ENSCARG00000007894 ENSCARG00000007901 ISYNA1 (ENSCARG00000007917) plekhj1 (ENSCARG00000007964) sf3a2 (ENSCARG00000007972) ENSCARG00000007980 ONECUT3 (ENSCARG00000007986) ENSCARG00000007994 ENSCARG00000008001 map2k2b (ENSCARG00000008010) ##22 tcf3a (ENSCARG00000008083) UQCR11 (ENSCARG00000008133) mbd3a (ENSCARG00000008142) MEX3D (ENSCARG00000008158) UNC13A (ENSCARG00000008314) BTBD2 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ENSGT00950000183110.b.a.d.b ENSGT00940000161913.d.a.b ENSGT00940000159258.c.b ENSGT00940000163126.a.a.a.a Common carp reference MODERN SPECIES 29 ENSCCRG00000034048 fcer1gl (ENSCCRG00000040516) ENSCCRG00000071475 ENSCCRG00000082820 ENSCCRG00000069403 ENSCCRG00000026464 ENSCCRG00000062737 sf3a2 (ENSCCRG00000040628) plekhj1 (ENSCCRG00000064151) ENSCCRG00000020966 ONECUT3 (ENSCCRG00000020970) ENSCCRG00000079964 ENSCCRG00000079287 ENSCCRG00000073979 ENSCCRG00000062410 map2k2b (ENSCCRG00000014252) ##22 tcf3a (ENSCCRG00000035581) mbd3a (ENSCCRG00000035518) ENSCCRG00000055311 eef2b (ENSCCRG00000064570) MEX3D (ENSCCRG00000055684) ENSCCRG00000070880 ENSCCRG00000014462 ENSCCRG00000035161 slc25a42 (ENSCCRG00000082753) ENSCCRG00000001521 tm6sf2a (ENSCCRG00000061917) sbno2a (ENSCCRG00000078397) ENSCCRG00000022982 gpx4b (ENSCCRG00000058980) ENSCCRG00000037725 Golden-line barbel MODERN SPECIES 455 ENSSGRG00000054296 ENSSGRG00000054336 ENSSGRG00000054337 ENSSGRG00000054338 ENSSGRG00000000121 ENSSGRG00000000124 ENSSGRG00000000126 ISYNA1 (ENSSGRG00000000134) plekhj1 (ENSSGRG00000000148) sf3a2 (ENSSGRG00000000165) ENSSGRG00000000180 ENSSGRG00000000191 map2k2b (ENSSGRG00000000219) ##22 tcf3a (ENSSGRG00000000322) ENSSGRG00000000377 MEX3D (ENSSGRG00000000455) BTBD2 (ENSSGRG00000000457) eef2b (ENSSGRG00000000497) ARMC6 (ENSSGRG00000001841) slc25a42 (ENSSGRG00000001842) ENSSGRG00000001845 tm6sf2a (ENSSGRG00000001851) sbno2a (ENSSGRG00000001866) ARHGAP45 (ENSSGRG00000002091) gpx4b (ENSSGRG00000002092) ENSSGRG00000002108 rab11bb (ENSSGRG00000004582) CTXN1 (ENSSGRG00000004684) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 366 ENSGT00940000157535.m.b.c ENSGT01100000263491.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000165396.B.s ENSGT01100000263491.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000165396.B.t.a ENSGT01100000263495.A.a.b.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00390000018395.a ENSGT00500000045074 ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823.k.a ENSGT00940000164500.a.a.a ENSGT00720000108823.k.b ENSGT00940000164500.a.a.b ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.a.e ENSGT00940000153487.b.a.s.b.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b.g ENSGT00950000183005.b.a.a ENSGT00940000162613.e ENSGT00940000161905.b.a ENSGT00940000159179.g.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 347 ENSGT00390000014633.a.a ENSGT00980000199858.b ENSGT00940000157535.m.b.c ENSGT01100000263491.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000165396.B.s ENSGT01100000263491.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000165396.B.t.a ENSGT01100000263495.A.a.b.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00390000018395.a ENSGT00500000045074 ENSGT00390000005235.h ENSGT00720000108823.k.a ENSGT00940000164500.a.a.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a.i ENSGT01030000234539.a.a.a.e ENSGT00940000153487.b.a.s.b.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b.g ENSGT00950000183005.b.a.a ENSGT00940000162613.e ENSGT00940000161905.b.a ENSGT00940000159179.g.a Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 2598 map2k2b (ENSSGRG00000009456) ##22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 4316 map2k2b (ENSSGRG00000001610) ##22 Common carp reference MODERN SPECIES 21 pnp5b (ENSCCRG00000065090) ENSCCRG00000058515 ENSCCRG00000054097 ENSCCRG00000042353 si:ch211-155e24.3 (ENSCCRG00000066415) ENSCCRG00000040566 ENSCCRG00000069822 ENSCCRG00000040609 tpgs1 (ENSCCRG00000062131) plekhj1 (ENSCCRG00000040625) sf3a2 (ENSCCRG00000070094) ENSCCRG00000064800 ENSCCRG00000063966 ENSCCRG00000029100 pias4b (ENSCCRG00000020596) map2k2b (ENSCCRG00000020612) ##22 tcf3a (ENSCCRG00000035505) ENSCCRG00000079293 MEX3D (ENSCCRG00000058664) ENSCCRG00000039392 ENSCCRG00000035403 eef2b (ENSCCRG00000035228) ENSCCRG00000011585 slc25a42 (ENSCCRG00000080212) ENSCCRG00000065346 tm6sf2a (ENSCCRG00000073164) sbno2a (ENSCCRG00000020152) ARHGAP45 (ENSCCRG00000012460) ENSCCRG00000012408 gpx4b (ENSCCRG00000071825) ENSCCRG00000045930 Zebrafish MODERN SPECIES 11 ENSDARG00000103284 fcer1gl (ENSDARG00000104077) ENSDARG00000103148 si:ch211-155e24.3 (ENSDARG00000105127) ENSDARG00000074846 ENSDARG00000079930 ENSDARG00000092766 ENSDARG00000038476 tpgs1 (ENSDARG00000027547) plekhj1 (ENSDARG00000025593) sf3a2 (ENSDARG00000021107) ENSDARG00000095024 ENSDARG00000067815 ONECUT3 (ENSDARG00000091059) pias4b (ENSDARG00000042215) map2k2b (ENSDARG00000068918) ##22 tcf3a (ENSDARG00000005915) mbd3a (ENSDARG00000061774) BTBD2 (ENSDARG00000104653) eef2b (ENSDARG00000100371) ARMC6 (ENSDARG00000103770) slc25a42 (ENSDARG00000099368) ENSDARG00000115552 tm6sf2a (ENSDARG00000105208) sbno2a (ENSDARG00000098801) ARHGAP45 (ENSDARG00000052496) POLR2E (ENSDARG00000074274) gpx4b (ENSDARG00000076836) PIP5K1C (ENSDARG00000100313) rab11bb (ENSDARG00000090086) ctxn1 (ENSDARG00000113270) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 177 ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT01000000214836 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234518.B.a.a ENSGT00940000160088 ENSGT00940000154716.hc.a.a ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00940000157113.d ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000158050 Denticle herring MODERN SPECIES 14 foxl2b (ENSDCDG00000030447) per2 (ENSDCDG00000030438) hes6 (ENSDCDG00000030425) itm2cb (ENSDCDG00000030421) lpar5a (ENSDCDG00000030419) GPR55 (ENSDCDG00000030418) gigyf2 (ENSDCDG00000030413) ENSDCDG00000030408 ENSDCDG00000030406 ENSDCDG00000030405 ENSDCDG00000030403 crygn1 (ENSDCDG00000030401) ACVR2B (ENSDCDG00000029001) ENSDCDG00000028958 scn12aa (ENSDCDG00000028915) map2k2b (ENSDCDG00000028530) ##22 tcf3a (ENSDCDG00000028515) ENSDCDG00000028511 mbd3a (ENSDCDG00000028507) MEX3D (ENSDCDG00000028502) UNC13A (ENSDCDG00000023562) BTBD2 (ENSDCDG00000023410) eef2b (ENSDCDG00000023176) ENSDCDG00000023174 ENSDCDG00000023172 RXFP3 (ENSDCDG00000023171) sirt6 (ENSDCDG00000023165) ENSDCDG00000022621 HSD11B1L (ENSDCDG00000022481) ENSDCDG00000022463 ENSDCDG00000022346 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 427 ENSGT01030000234539.a.a.a.e ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT01000000214836 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT01030000234567.B.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000163253.b.c.a.b ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.a.e ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT01000000214836 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d.l.b ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT01030000234518.B.a.a.d ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 182 ENSGT00720000108823.i ENSGT00940000164500.a.e ENSGT00950000183103.d.b.a.a.a.a ENSGT00940000153487.b.a.s.b.c ##22 ENSGT00940000157036.e.b.a ENSGT00950000183005.b.a.e ENSGT00940000162613.g ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g.c ENSGT00940000154662.d.l.b.a ENSGT00940000159261.d.b ENSGT00940000160088.c ENSGT00940000164811.a.b.b.d ENSGT00950000183102.B.e ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g.c ENSGT00940000164939.a.b.c ENSGT01040000240444.A.b.a.b.g.a ENSGT00940000159170.d.c Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000164495.c.a.e ENSGT00940000157246.a.e ENSGT00940000160466.d ENSGT00390000005847.e ENSGT00390000009230.b.f ENSGT00940000158050.h.a.b ENSGT00410000025695.a.c ENSGT00940000157113.d.g ENSGT00940000156523.b.d.c ENSGT00950000182925.C.a.a.c.a ENSGT00940000162487.s.b ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a.a ENSGT00720000108823.i ENSGT00940000164500.a.e ENSGT00950000183103.d.b.a.a.a.a ENSGT00940000153487.b.a.s.b.c ##22 ENSGT00940000157036.e.b.a ENSGT00950000183005.b.a.e ENSGT00940000162613.g ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g.c ENSGT00940000154662.d.l.b.a ENSGT00940000159261.d.b ENSGT00940000160088.c ENSGT00940000164811.a.b.b.d ENSGT00950000183102.B.e ENSGT00940000159179.g.d ENSGT00940000154662.d.l.b.b ENSGT01030000234518.B.a.a.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088.d Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160486.c.b ENSGT00950000182893.a.a.b.a.d ENSGT00730000111114.f ENSGT00730000111114.e.a.a ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a.c.a ENSGT00940000158050.h.a.b ENSGT00410000025695.a.c ENSGT00940000157113.d.g ENSGT00940000156523.b.d.c ENSGT00950000182925.C.a.a.c.a ENSGT00940000162487.s.b ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a.a ENSGT00720000108823.i ENSGT00940000164500.a.e ENSGT00950000183103.d.b.a.a.a.a ENSGT00940000153487.b.a.s.b.c ##22 ENSGT00940000157036.e.b.a ENSGT00950000183005.b.a.e ENSGT00940000162613.g ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g.d ENSGT00940000154662.d.l.b.b ENSGT01030000234518.B.a.a.d ENSGT00940000164811.a.b.b.c ENSGT00950000183102.B.f ENSGT00940000165656 ENSGT00940000154737.c.g.d ENSGT00940000164939.a.b.d ENSGT01040000240444.A.b.a.b.g.b ENSGT00940000159170.d.d ENSGT00940000155854.b.a.b.d Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000164495.c.a.e ENSGT00940000160466.d ENSGT00390000005847.e ENSGT00950000183067.a.b.b.vb.b ENSGT00940000158588.d.b.a ENSGT00940000158050.h.a.b ENSGT00410000025695.a.c ENSGT00940000157113.d.g ENSGT00940000156523.b.d.c ENSGT00950000182925.C.a.a.c.a ENSGT00940000162487.s.b ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a.a ENSGT00720000108823.i ENSGT00940000164500.a.e ENSGT00950000183103.d.b.a.a.a.a ENSGT00940000153487.b.a.s.b.c ##22 ENSGT00940000157036.e.b.a ENSGT00950000183005.b.a.e ENSGT00940000162613.g ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g.d ENSGT00940000154662.d.l.b.b ENSGT01030000234518.B.a.a.d ENSGT00940000164811.a.b.b.c ENSGT00950000183102.B.f ENSGT00940000165656 ENSGT00940000154737.c.g.d ENSGT00940000164939.a.b.d ENSGT01040000240444.A.b.a.b.g.b ENSGT00940000156565.t ENSGT00940000155854.b.a.b.d Coho salmon MODERN SPECIES 19 ENSOKIG00005047957 ENSOKIG00005047964 CIB3 (ENSOKIG00005047974) pnhd (ENSOKIG00005048003) ENSOKIG00005048011 RANBP3 (ENSOKIG00005048041) STK11 (ENSOKIG00005048064) ENSOKIG00005048082 RNF126 (ENSOKIG00005037713) ENSOKIG00005037817 ENSOKIG00005037877 ENSOKIG00005037904 ENSOKIG00005037950 sf3a2 (ENSOKIG00005038153) ENSOKIG00005038182 map2k2b (ENSOKIG00005038237) ##22 tcf3a (ENSOKIG00005038925) mbd3a (ENSOKIG00005039227) MEX3D (ENSOKIG00005039248) eef2b (ENSOKIG00005040779) BTBD2 (ENSOKIG00005041142) ENSOKIG00005041410 ENSOKIG00005041426 sirt6 (ENSOKIG00005041455) cdc34b (ENSOKIG00005041582) cactin (ENSOKIG00005041624) stap2a (ENSOKIG00005041672) sh3gl1a (ENSOKIG00005041721) rorcb (ENSOKIG00005041778) ENSOKIG00005041807 SEMA6B (ENSOKIG00005041814) Chinook salmon MODERN SPECIES 20 ENSOTSG00005013370 ENSOTSG00005013371 ENSOTSG00005013380 loxl5b (ENSOTSG00005016013) klf2b (ENSOTSG00005016015) stk11 (ENSOTSG00005016016) ENSOTSG00005016017 rnf126 (ENSOTSG00005016028) ENSOTSG00005016037 ENSOTSG00005016048 ENSOTSG00005016051 fzr1a (ENSOTSG00005016057) sf3a2 (ENSOTSG00005016319) ENSOTSG00005016320 ENSOTSG00005016321 map2k2b (ENSOTSG00005016323) ##22 tcf3a (ENSOTSG00005016324) mbd3a (ENSOTSG00005016345) MEX3D (ENSOTSG00005016346) ENSOTSG00005016347 ENSOTSG00005016348 BTBD2 (ENSOTSG00005016354) eef2b (ENSOTSG00005016745) ENSOTSG00005016747 sirt6 (ENSOTSG00005035921) ENSOTSG00005035923 cactin (ENSOTSG00005035926) stap2a (ENSOTSG00005035930) sh3gl1a (ENSOTSG00005035932) rorcb (ENSOTSG00005035934) ENSOTSG00005035936 Rainbow trout MODERN SPECIES 20 ENSOMYG00000019320 ENSOMYG00000019220 ENSOMYG00000075714 ENSOMYG00000019510 ENSOMYG00000019570 ENSOMYG00000019626 ENSOMYG00000019684 ENSOMYG00000066967 ENSOMYG00000019727 ENSOMYG00000019806 sf3a2 (ENSOMYG00000020220) ENSOMYG00000020229 ENSOMYG00000067324 ENSOMYG00000020232 ENSOMYG00000020234 map2k2b (ENSOMYG00000020235) ##22 tcf3a (ENSOMYG00000020336) mbd3a (ENSOMYG00000020713) MEX3D (ENSOMYG00000020732) ENSOMYG00000012382 ENSOMYG00000021835 eef2b (ENSOMYG00000027146) ENSOMYG00000027393 ENSOMYG00000062249 ENSOMYG00000027418 cactin 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SPECIES 24 rnf114 (ENSSTUG00000014796) ENSSTUG00000014803 mafba (ENSSTUG00000014810) zhx3b (ENSSTUG00000014823) ENSSTUG00000014850 ENSSTUG00000015186 stk11 (ENSSTUG00000015207) SUGP1 (ENSSTUG00000015272) rnf126 (ENSSTUG00000015294) ENSSTUG00000015315 ENSSTUG00000015383 ENSSTUG00000015393 fzr1a (ENSSTUG00000015478) sf3a2 (ENSSTUG00000016194) ENSSTUG00000016203 map2k2b (ENSSTUG00000016240) ##22 tcf3a (ENSSTUG00000016901) mbd3a (ENSSTUG00000017305) MEX3D (ENSSTUG00000017314) UNC13A (ENSSTUG00000017341) BTBD2 (ENSSTUG00000018179) eef2b (ENSSTUG00000018799) ENSSTUG00000019080 sirt6 (ENSSTUG00000019106) ENSSTUG00000019210 cactin (ENSSTUG00000019247) stap2a (ENSSTUG00000019274) sh3gl1a (ENSSTUG00000019324) rorcb (ENSSTUG00000019392) ENSSTUG00000019414 SEMA6B (ENSSTUG00000019423) Atlantic salmon MODERN SPECIES 22 ENSSSAG00000049450 ENSSSAG00000081335 ENSSSAG00000101882 ENSSSAG00000081329 ENSSSAG00000081319 ENSSSAG00000085746 ENSSSAG00000081313 ENSSSAG00000090795 ENSSSAG00000093405 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(ENSELUG00000008193) ENSELUG00000008151 BTBD2 (ENSELUG00000008136) eef2b (ENSELUG00000008109) ENSELUG00000008076 ENSELUG00000008052 sirt6 (ENSELUG00000008030) cdc34b (ENSELUG00000008006) cactin (ENSELUG00000007984) sema4e (ENSELUG00000001612) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00410000028808 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000157036.f ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00410000028808 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000157036.f ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00410000028808 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000157036.f ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165622 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00410000028808 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 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ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000004097.a.f ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 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ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b Climbing perch MODERN SPECIES 8 ENSATEG00000014918 NDUFA13 (ENSATEG00000014957) ENSATEG00000026515 ENSATEG00000015018 ENSATEG00000027548 ENSATEG00000015056 ENSATEG00000015089 ENSATEG00000015159 ENSATEG00000015205 ENSATEG00000015349 ENSATEG00000015362 plekhj1 (ENSATEG00000015419) sf3a2 (ENSATEG00000015449) ENSATEG00000015455 ONECUT3 (ENSATEG00000015466) map2k2b (ENSATEG00000015486) ##22 tcf3a (ENSATEG00000015526) UQCR11 (ENSATEG00000029685) mbd3a (ENSATEG00000015604) MEX3D (ENSATEG00000015620) ENSATEG00000015705 ENSATEG00000015797 eef2b (ENSATEG00000015820) ENSATEG00000015848 ENSATEG00000015870 ENSATEG00000015911 cactin (ENSATEG00000015933) sema4e (ENSATEG00000016033) stap2a (ENSATEG00000016062) sh3gl1a (ENSATEG00000016098) rorcb (ENSATEG00000016141) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 8 prg4a (ENSBSLG00000024773) odr4 (ENSBSLG00000024872) dpydb (ENSBSLG00000024910) ENSBSLG00000025384 ENSBSLG00000025402 stk11 (ENSBSLG00000025416) SUGP1 (ENSBSLG00000025481) rnf126 (ENSBSLG00000025588) ENSBSLG00000025594 ENSBSLG00000025614 fzr1a (ENSBSLG00000025629) plekhj1 (ENSBSLG00000025663) sf3a2 (ENSBSLG00000025671) ENSBSLG00000025674 ONECUT3 (ENSBSLG00000025676) map2k2b (ENSBSLG00000004962) ##22 tcf3a (ENSBSLG00000005655) UQCR11 (ENSBSLG00000005816) mbd3a (ENSBSLG00000005818) MEX3D (ENSBSLG00000005827) UNC13A (ENSBSLG00000007074) BTBD2 (ENSBSLG00000011004) eef2b (ENSBSLG00000011206) ENSBSLG00000011288 ENSBSLG00000011298 sirt6 (ENSBSLG00000011309) cdc34b (ENSBSLG00000011413) cactin (ENSBSLG00000011429) sema4e (ENSBSLG00000011432) stap2a (ENSBSLG00000011436) sh3gl1a (ENSBSLG00000011800) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT01000000214836 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT01000000214836 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2574 NDUFA13 (ENSSLDG00000011337) cirbpa (ENSSLDG00000011320) ENSSLDG00000011306 ENSSLDG00000011275 stk11 (ENSSLDG00000011238) SUGP1 (ENSSLDG00000011109) rnf126 (ENSSLDG00000011057) ENSSLDG00000011003 ENSSLDG00000010978 fzr1a (ENSSLDG00000010925) plekhj1 (ENSSLDG00000010898) sf3a2 (ENSSLDG00000010874) ENSSLDG00000010855 ENSSLDG00000010824 ENSSLDG00000010623 map2k2b (ENSSLDG00000010536) ##22 tcf3a (ENSSLDG00000010354) ENSSLDG00000010298 mbd3a (ENSSLDG00000010277) MEX3D (ENSSLDG00000010251) Greater amberjack MODERN SPECIES 83 NDUFA13 (ENSSDUG00000016119) cirbpa (ENSSDUG00000016099) ENSSDUG00000016081 ENSSDUG00000016066 stk11 (ENSSDUG00000016044) SUGP1 (ENSSDUG00000016002) rnf126 (ENSSDUG00000015961) ENSSDUG00000015921 ENSSDUG00000015903 fzr1a (ENSSDUG00000015856) plekhj1 (ENSSDUG00000015836) sf3a2 (ENSSDUG00000015810) ENSSDUG00000015791 ENSSDUG00000015775 ENSSDUG00000015751 map2k2b (ENSSDUG00000015722) ##22 tcf3a (ENSSDUG00000015626) ENSSDUG00000015612 mbd3a 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(ENSLCAG00010017822) cdc34b (ENSLCAG00010017831) cactin (ENSLCAG00010017844) sema4e (ENSLCAG00010017856) stap2a (ENSLCAG00010017883) sh3gl1a (ENSLCAG00010017885) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234518.B.a.a.d ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g Turbot MODERN SPECIES 19 ENSSMAG00000002301 ENSSMAG00000002373 ENSSMAG00000002412 ENSSMAG00000002439 ENSSMAG00000002450 ENSSMAG00000002464 ENSSMAG00000002495 ENSSMAG00000002519 ENSSMAG00000002539 ENSSMAG00000031477 ENSSMAG00000002573 sf3a2 (ENSSMAG00000027073) ENSSMAG00000002644 ENSSMAG00000002648 ENSSMAG00000002680 map2k2b (ENSSMAG00000002878) ##22 tcf3a (ENSSMAG00000002954) UQCR11 (ENSSMAG00000003012) mbd3a (ENSSMAG00000003031) MEX3D (ENSSMAG00000003087) ENSSMAG00000003126 ENSSMAG00000003277 eef2b (ENSSMAG00000003334) ENSSMAG00000003391 ENSSMAG00000003407 ENSSMAG00000003421 ENSSMAG00000003468 cactin (ENSSMAG00000003498) sema4e (ENSSMAG00000003518) stap2a (ENSSMAG00000003544) ENSSMAG00000025205 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000165622.f ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00410000028808 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000154929.C ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622.f ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000154929.C ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b Ballan wrasse MODERN SPECIES 63 cirbpa (ENSLBEG00000000292) ENSLBEG00000000316 ENSLBEG00000000323 stk11 (ENSLBEG00000000328) SUGP1 (ENSLBEG00000000335) rnf126 (ENSLBEG00000000394) ENSLBEG00000000459 ENSLBEG00000000513 fzr1a (ENSLBEG00000000585) plekhj1 (ENSLBEG00000000642) sf3a2 (ENSLBEG00000000677) ENSLBEG00000000719 ENSLBEG00000000734 ENSLBEG00000000750 ENSLBEG00000000761 map2k2b (ENSLBEG00000000771) ##22 tcf3a (ENSLBEG00000000838) ENSLBEG00000000943 mbd3a (ENSLBEG00000000961) MEX3D (ENSLBEG00000000974) UNC13A (ENSLBEG00000001037) BTBD2 (ENSLBEG00000001142) eef2b (ENSLBEG00000001176) ENSLBEG00000001250 ENSLBEG00000001274 sirt6 (ENSLBEG00000001292) cdc34b (ENSLBEG00000001317) cactin (ENSLBEG00000001359) sema4e (ENSLBEG00000001394) stap2a (ENSLBEG00000001413) sh3gl1a (ENSLBEG00000001422) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622.e ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000154929.C ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622.e.a.a ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT01000000214836 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000154929.C ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622.e.b ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT01000000214836 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g Channel bull blenny MODERN SPECIES 8 NDUFA13 (ENSCGOG00000011572) cirbpa (ENSCGOG00000011580) ENSCGOG00000011585 ENSCGOG00000011587 stk11 (ENSCGOG00000011588) SUGP1 (ENSCGOG00000011646) rnf126 (ENSCGOG00000011710) ENSCGOG00000011782 ENSCGOG00000011788 fzr1a (ENSCGOG00000011798) plekhj1 (ENSCGOG00000012289) sf3a2 (ENSCGOG00000012305) ENSCGOG00000012340 ENSCGOG00000012345 ENSCGOG00000012348 map2k2b (ENSCGOG00000012380) ##22 tcf3a (ENSCGOG00000013317) ENSCGOG00000013325 mbd3a (ENSCGOG00000013327) MEX3D (ENSCGOG00000013329) UNC13A (ENSCGOG00000013383) BTBD2 (ENSCGOG00000016013) eef2b (ENSCGOG00000016161) RXFP3 (ENSCGOG00000016486) sirt6 (ENSCGOG00000016503) cdc34b (ENSCGOG00000016747) cactin (ENSCGOG00000016766) sema4e (ENSCGOG00000016781) stap2a (ENSCGOG00000016839) sh3gl1a (ENSCGOG00000016844) rorcb (ENSCGOG00000016857) Pike perch MODERN SPECIES 55 NDUFA13 (ENSSLUG00000002790) ENSSLUG00000002796 ENSSLUG00000002806 ENSSLUG00000002816 stk11 (ENSSLUG00000002824) SUGP1 (ENSSLUG00000002833) rnf126 (ENSSLUG00000002851) ENSSLUG00000002863 ENSSLUG00000002883 fzr1a (ENSSLUG00000002951) plekhj1 (ENSSLUG00000003469) sf3a2 (ENSSLUG00000003480) ENSSLUG00000003493 ENSSLUG00000003505 ENSSLUG00000003577 map2k2b (ENSSLUG00000003610) ##22 tcf3a (ENSSLUG00000003689) ENSSLUG00000003703 mbd3a (ENSSLUG00000003717) MEX3D (ENSSLUG00000003737) UNC13A (ENSSLUG00000004076) BTBD2 (ENSSLUG00000009938) eef2b (ENSSLUG00000009959) ENSSLUG00000009985 sirt6 (ENSSLUG00000010006) ENSSLUG00000010036 cdc34b (ENSSLUG00000010043) cactin (ENSSLUG00000010052) sema4e (ENSSLUG00000010059) stap2a (ENSSLUG00000010072) sh3gl1a (ENSSLUG00000010082) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000004097.a.f ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622.e.a.a ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT01000000214836 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000154929.C ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g Stickleback MODERN SPECIES 2 NDUFA13 (ENSGACG00000015203) cirbpa (ENSGACG00000015206) ENSGACG00000015211 stk11 (ENSGACG00000015219) SUGP1 (ENSGACG00000015222) rnf126 (ENSGACG00000015225) ENSGACG00000015230 ENSGACG00000015231 fzr1a (ENSGACG00000015236) plekhj1 (ENSGACG00000015244) sf3a2 (ENSGACG00000015255) ENSGACG00000015265 zp3f.1 (ENSGACG00000015267) 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(ENSCLMG00005007134) ENSCLMG00005007135 BTBD2 (ENSCLMG00005007136) eef2b (ENSCLMG00005007360) ENSCLMG00005007362 sirt6 (ENSCLMG00005007368) cdc34b (ENSCLMG00005007372) cactin (ENSCLMG00005007374) sema4e (ENSCLMG00005007375) stap2a (ENSCLMG00005007377) sh3gl1a (ENSCLMG00005007378) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622.f ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 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sirt6 (ENSSAUG00010018575) cdc34b (ENSSAUG00010018577) cactin (ENSSAUG00010018579) sema4e (ENSSAUG00010018580) stap2a (ENSSAUG00010018581) sh3gl1a (ENSSAUG00010018582) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000165622 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00410000028808 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622 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SPECIES 1 NDUFA13 (ENSAPEG00000011952) cirbpa (ENSAPEG00000011989) ENSAPEG00000012024 ENSAPEG00000012060 stk11 (ENSAPEG00000012073) SUGP1 (ENSAPEG00000012114) rnf126 (ENSAPEG00000012142) ENSAPEG00000012186 ENSAPEG00000012230 fzr1a (ENSAPEG00000012263) plekhj1 (ENSAPEG00000012320) sf3a2 (ENSAPEG00000012336) ENSAPEG00000012351 ENSAPEG00000012371 ENSAPEG00000012394 map2k2b (ENSAPEG00000012403) ##22 tcf3a (ENSAPEG00000012450) UQCR11 (ENSAPEG00000012488) mbd3a (ENSAPEG00000012496) MEX3D (ENSAPEG00000012520) UNC13A (ENSAPEG00000012677) BTBD2 (ENSAPEG00000012786) eef2b (ENSAPEG00000012820) ENSAPEG00000012872 sirt6 (ENSAPEG00000012889) cdc34b (ENSAPEG00000012916) cactin (ENSAPEG00000012929) sema4e (ENSAPEG00000012955) stap2a (ENSAPEG00000012974) sh3gl1a (ENSAPEG00000013013) rorcb (ENSAPEG00000013062) Clown anemonefish MODERN SPECIES 1295 NDUFA13 (ENSAOCG00000016234) cirbpa (ENSAOCG00000016212) ENSAOCG00000016195 ENSAOCG00000016184 stk11 (ENSAOCG00000016166) SUGP1 (ENSAOCG00000016128) rnf126 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map2k2b (ENSSPAG00000005154) ##22 tcf3a (ENSSPAG00000005180) ENSSPAG00000005242 mbd3a (ENSSPAG00000005249) MEX3D (ENSSPAG00000005264) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000165622 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d.f ENSGT00940000157113.d.e ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000165622 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d.f ENSGT00940000157113.d.e ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a 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ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622 ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d.e ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT00940000163251.b ENSGT00940000153487.b.a.s.b ##22 ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b ENSGT00940000154737.c.g ENSGT00940000164939.a.b Zebra mbuna MODERN SPECIES 1100 NDUFA13 (ENSMZEG00005025576) ENSMZEG00005025577 ENSMZEG00005025580 ENSMZEG00005025583 stk11 (ENSMZEG00005025586) SUGP1 (ENSMZEG00005025588) rnf126 (ENSMZEG00005025594) ENSMZEG00005025597 ENSMZEG00005025600 fzr1a (ENSMZEG00005025605) plekhj1 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ENSCHAG00000007878 Reedfish MODERN SPECIES 3 ENSECRG00000017496 ENSECRG00000017514 ENSECRG00000017530 ENSECRG00000017545 ENSECRG00000017584 ENSECRG00000017657 ENSECRG00000017679 ENSECRG00000017696 ENSECRG00000017716 ENSECRG00000017749 ENSECRG00000017874 ONECUT3 (ENSECRG00000018237) foxq2 (ENSECRG00000018258) ENSECRG00000018276 pias4a (ENSECRG00000018290) map2k2a (ENSECRG00000018359) ##22 ZBTB7A (ENSECRG00000018510) tcf3b (ENSECRG00000018537) UQCR11 (ENSECRG00000018568) MBD3 (ENSECRG00000018591) MEX3D (ENSECRG00000018631) mbd3b (ENSECRG00000018689) ENSECRG00000018977 hmg20b (ENSECRG00000019498) btbd2a (ENSECRG00000019539) ENSECRG00000019632 creb3l3a (ENSECRG00000019697) ENSECRG00000019730 sirt6 (ENSECRG00000019747) ENSECRG00000019776 ENSECRG00000019805 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.a ##22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153487.a ##22 Lamprey DUPLICATION Lamprey MODERN SPECIES 1134 ENSPMAG00000004309 ENSPMAG00000004255 ##22 ndufs4 (ENSPMAG00000004237) Lamprey MODERN SPECIES 2842 ENSPMAG00000009800 ##22 Hagfish MODERN SPECIES 587 ENSEBUG00000001620 ENSEBUG00000003274 NEMF (ENSEBUG00000008640) ENSEBUG00000010188 ENSEBUG00000008144 WDR20 (ENSEBUG00000008374) ENSEBUG00000003431 ENSEBUG00000003169 ENSEBUG00000012438 ENSEBUG00000007284 map2k1 (ENSEBUG00000007971) ##22 ENSEBUG00000015557 ENSEBUG00000011549 AAGAB (ENSEBUG00000006969) mesd (ENSEBUG00000011166) ENSEBUG00000013813 ENSEBUG00000008870 ENSEBUG00000002408 ENSEBUG00000012058 sccpdhb (ENSEBUG00000002018) ENSEBUG00000003875 ENSEBUG00000003764 ENSEBUG00000002774 ENSEBUG00000005506 Ciona ANCESTRAL SPECIES 1117 ENSGT00940000153487 #22 ENSGT00390000011364.k Ciona savignyi MODERN SPECIES 1 ENSCSAVG00000007851 ENSCSAVG00000007855 ENSCSAVG00000007869 ENSCSAVG00000007872 ENSCSAVG00000007875 ENSCSAVG00000007877 ENSCSAVG00000007880 ENSCSAVG00000007883 ENSCSAVG00000007904 ENSCSAVG00000007913 ENSCSAVG00000008137 ENSCSAVG00000008138 ENSCSAVG00000008293 ENSCSAVG00000008429 ENSCSAVG00000008432 ENSCSAVG00000008439 #22 ENSCSAVG00000008450 ENSCSAVG00000008453 ENSCSAVG00000008465 ENSCSAVG00000008466 ENSCSAVG00000008468 ENSCSAVG00000008471 ENSCSAVG00000008474 ENSCSAVG00000008683 ENSCSAVG00000008686 ENSCSAVG00000008687 ENSCSAVG00000008692 ENSCSAVG00000008696 ENSCSAVG00000008698 ENSCSAVG00000008708 ENSCSAVG00000008713 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 67 ENSCING00000003630 ENSCING00000003622 ENSCING00000022987 ENSCING00000023510 ENSCING00000021081 ENSCING00000003609 ENSCING00000003605 ENSCING00000020136 ENSCING00000020855 ENSCING00000004100 ENSCING00000014785 ENSCING00000004104 ENSCING00000021355 mapkk1/2 (ENSCING00000004105) #22 ENSCING00000024533 ENSCING00000014794 ENSCING00000004136 ENSCING00000004128 ENSCING00000014806 ENSCING00000004122 ENSCING00000004117 ENSCING00000014795 ENSCING00000024574 ENSCING00000004114 ENSCING00000025149 ENSCING00000022538 ENSCING00000020218 ENSCING00000014813 ENSCING00000021412