Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652.f	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33
Equus	ANCESTRAL SPECIES	18														ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00950000186238 #27	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34	ENSGT00940000162403 #35
Horse	MODERN SPECIES	9														PTH2R (ENSECAG00000014395) #20	PIKFYVE (ENSECAG00000021430) #21	IDH1 (ENSECAG00000011931) #22	C18H2orf80 (ENSECAG00000011588) #23	CRYGB (ENSECAG00000010883) #24	ENSECAG00000049516 #25	CRYGA (ENSECAG00000009588) #26	ENSECAG00000039306 #27	FZD5 (ENSECAG00000007309) #28	PLEKHM3 (ENSECAG00000008108) #29	METTL21A (ENSECAG00000017536) #30	CREB1 (ENSECAG00000013667) #31	KLF7 (ENSECAG00000012215) #32	FASTKD2 (ENSECAG00000008822) #33	MDH1B (ENSECAG00000007491) #34	DYTN (ENSECAG00000006820) #35	FAM237A (ENSECAG00000050449) #36	ADAM23 (ENSECAG00000018514) #37
Donkey	MODERN SPECIES	24	PPP2R3B (ENSEASG00005007065)	GTPBP6 (ENSEASG00005007092)	ENSEASG00005007100	ENSEASG00005014354	ENSEASG00005038034	ENSEASG00005007510	ENSEASG00005029433	ENSEASG00005031510	ENSEASG00005013062	ENSEASG00005028249	ENSEASG00005033559	ENSEASG00005028429	ENSEASG00005031264	ENSEASG00005003104 #20	PIKFYVE (ENSEASG00005003072) #21	IDH1 (ENSEASG00005003064) #22	C2orf80 (ENSEASG00005003060) #23	ENSEASG00005033359 #24	CRYGB (ENSEASG00005028155) ##26	ENSEASG00005028742 #24	PLEKHM3 (ENSEASG00005003046) #29	ENSEASG00005003042 #27	FZD5 (ENSEASG00005003041) #28	CCNYL1 (ENSEASG00005003014)	ENSEASG00005024979 #30	CREB1 (ENSEASG00005002983) #31	KLF7 (ENSEASG00005002973) #32	FASTKD2 (ENSEASG00005002958) #33	MDH1B (ENSEASG00005002948) #34	DYTN (ENSEASG00005002938) #35	FAM237A (ENSEASG00005002935) #36
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652.f	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652.f	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34	ENSGT00940000162403 #35
Microbat	DUPLICATION
Microbat	MODERN SPECIES	131																ENSMLUG00000028815 #22
Microbat	MODERN SPECIES	940	IKZF2 (ENSMLUG00000012494)	ENSMLUG00000023988	ENSMLUG00000022171	ENSMLUG00000016092	CPS1 (ENSMLUG00000015090)	LANCL1 (ENSMLUG00000002650)	MYL1 (ENSMLUG00000002641)	ENSMLUG00000017730	ACADL (ENSMLUG00000014508)	KANSL1L (ENSMLUG00000014487)	ENSMLUG00000014477	UNC80 (ENSMLUG00000014442)	MAP2 (ENSMLUG00000014420)	PTH2R (ENSMLUG00000008536) #20	PIKFYVE (ENSMLUG00000000897) #21	ENSMLUG00000000891 #22	C2orf80 (ENSMLUG00000025398) #23	CRYGC (ENSMLUG00000015767) #26	ENSMLUG00000028817	PLEKHM3 (ENSMLUG00000011905) #29	ENSMLUG00000016122	METTL21A (ENSMLUG00000015747) #30	CREB1 (ENSMLUG00000016119) #31	KLF7 (ENSMLUG00000009436) #32	CPO (ENSMLUG00000009428)	FASTKD2 (ENSMLUG00000009411) #33	MDH1B (ENSMLUG00000009390) #34	DYTN (ENSMLUG00000028179) #35	FAM237A (ENSMLUG00000030140) #36	ADAM23 (ENSMLUG00000009364) #37	ZDBF2 (ENSMLUG00000014265)
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	26	ENSRFEG00010017533	ENSRFEG00010017581	ERBB4 (ENSRFEG00010017623)	ENSRFEG00010018450	CPS1 (ENSRFEG00010018496)	LANCL1 (ENSRFEG00010018871)	MYL1 (ENSRFEG00010018919)	ACADL (ENSRFEG00010019011)	KANSL1L (ENSRFEG00010019059)	ENSRFEG00010019086	UNC80 (ENSRFEG00010019184)	ENSRFEG00010019323	MAP2 (ENSRFEG00010019384)	PTH2R (ENSRFEG00010019527) #20	PIKFYVE (ENSRFEG00010019609) #21	IDH1 (ENSRFEG00010019714) #22	C2orf80 (ENSRFEG00010019768) #23	CRYGB (ENSRFEG00010019933) ##26	CRYGC (ENSRFEG00010019976) #26	PLEKHM3 (ENSRFEG00010020009) #29	FZD5 (ENSRFEG00010020064) #28	CCNYL1 (ENSRFEG00010020079)	METTL21A (ENSRFEG00010020119) #30	ENSRFEG00010020167	CREB1 (ENSRFEG00010020193) #31	KLF7 (ENSRFEG00010010310) #32	CPO (ENSRFEG00010010427)	FASTKD2 (ENSRFEG00010010475) #33	MDH1B (ENSRFEG00010010537) #34	DYTN (ENSRFEG00010010740) #35	FAM237A (ENSRFEG00010010918) #36
Megabat	MODERN SPECIES	2112														PTH2R (ENSPVAG00000008309) #20	PIKFYVE (ENSPVAG00000008304) #21	IDH1 (ENSPVAG00000008301) #22	C2orf80 (ENSPVAG00000008300) #23	CRYGA (ENSPVAG00000008299) #24
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a.c.b	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.cb	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b.bb	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	4			ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a.c.b	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.cb	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b.bb	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
American black bear	MODERN SPECIES	401															PIKFYVE (ENSUAMG00000008557) #21	IDH1 (ENSUAMG00000009431) #22	C2orf80 (ENSUAMG00000009435) #23	CRYGA (ENSUAMG00000009437) #24	ENSUAMG00000009439 #25	CRYGC (ENSUAMG00000009446) #26	CRYGD (ENSUAMG00000009448)	PLEKHM3 (ENSUAMG00000009449) #29	FZD5 (ENSUAMG00000009450) #28	ENSUAMG00000009451
Polar bear	MODERN SPECIES	142	ENSUMAG00000023308	ENSUMAG00000023307	ENSUMAG00000023301	ENSUMAG00000023299	CPS1 (ENSUMAG00000023263)	LANCL1 (ENSUMAG00000023250)	MYL1 (ENSUMAG00000023244)	ACADL (ENSUMAG00000023226)	KANSL1L (ENSUMAG00000023220)	ENSUMAG00000023217	UNC80 (ENSUMAG00000023174)	MAP2 (ENSUMAG00000023131)	ENSUMAG00000023115	PTH2R (ENSUMAG00000023104) #20	PIKFYVE (ENSUMAG00000022735) #21	IDH1 (ENSUMAG00000022685) #22	C2orf80 (ENSUMAG00000022683) #23	CRYGA (ENSUMAG00000022681) #24	ENSUMAG00000022680 #25	CRYGC (ENSUMAG00000022675) #26	CRYGD (ENSUMAG00000022673)	ENSUMAG00000022672	PLEKHM3 (ENSUMAG00000022668) #29	ENSUMAG00000022665	CREB1 (ENSUMAG00000022656) #31	METTL21A (ENSUMAG00000022649) #30	KLF7 (ENSUMAG00000022629) #32	CPO (ENSUMAG00000022606)	FASTKD2 (ENSUMAG00000022590) #33	MDH1B (ENSUMAG00000022585) #34	DYTN (ENSUMAG00000022576) #35
Giant Panda	MODERN SPECIES	11	VWC2L (ENSAMEG00000003842)	SPAG16 (ENSAMEG00000008081)	IKZF2 (ENSAMEG00000008058)	ERBB4 (ENSAMEG00000007301)	CPS1 (ENSAMEG00000005080)	LANCL1 (ENSAMEG00000005046)	MYL1 (ENSAMEG00000005031)	ACADL (ENSAMEG00000004978)	KANSL1L (ENSAMEG00000004973)	ENSAMEG00000004965	UNC80 (ENSAMEG00000004864)	MAP2 (ENSAMEG00000014971)	ENSAMEG00000030710	PTH2R (ENSAMEG00000015327) #20	PIKFYVE (ENSAMEG00000015268) #21	IDH1 (ENSAMEG00000015244) #22	C2orf80 (ENSAMEG00000015239) #23	CRYGA (ENSAMEG00000028445) #24	ENSAMEG00000023505 #25	CRYGC (ENSAMEG00000025725) #26	CRYGD (ENSAMEG00000031493)	ENSAMEG00000023570	PLEKHM3 (ENSAMEG00000015216) #29	FZD5 (ENSAMEG00000015206) #28	ENSAMEG00000015175	METTL21A (ENSAMEG00000015168) #30	CREB1 (ENSAMEG00000015152) #31	KLF7 (ENSAMEG00000015148) #32	CPO (ENSAMEG00000015096)	FASTKD2 (ENSAMEG00000002917) #33	MDH1B (ENSAMEG00000002932) #34
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053.lb	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
American mink	MODERN SPECIES	40												MAP2 (ENSNVIG00000004578)	ENSNVIG00000004656	PTH2R (ENSNVIG00000004696) #20	PIKFYVE (ENSNVIG00000004742) #21	IDH1 (ENSNVIG00000004795) #22	C2orf80 (ENSNVIG00000004824) #23	CRYGA (ENSNVIG00000004882) #24	ENSNVIG00000004890	CRYGB (ENSNVIG00000004897) ##26	CRYGC (ENSNVIG00000004904) #26	CRYGD (ENSNVIG00000004910)	ENSNVIG00000004919	PKHM3 (ENSNVIG00000004953) #29	FZD5 (ENSNVIG00000004971) #28	ENSNVIG00000004981	ENSNVIG00000005020	METTL21A (ENSNVIG00000005027) #30	CREB1 (ENSNVIG00000005058) #31	KLF7 (ENSNVIG00000005091) #32	CBPO (ENSNVIG00000005106)
Ferret	MODERN SPECIES	265														PTH2R (ENSMPUG00000000524) #20	PIKFYVE (ENSMPUG00000000520) #21	IDH1 (ENSMPUG00000000516) #22	C2orf80 (ENSMPUG00000000512) #23	ENSMPUG00000000510	CRYGC (ENSMPUG00000000499) #26	CRYGD (ENSMPUG00000000497)	ENSMPUG00000000496	PLEKHM3 (ENSMPUG00000000492) #29	FZD5 (ENSMPUG00000018918) #28	ENSMPUG00000000489	ENSMPUG00000000487 #30	ENSMPUG00000018911	CREB1 (ENSMPUG00000000485) #31	KLF7 (ENSMPUG00000000483) #32	CPO (ENSMPUG00000000481)	FASTKD2 (ENSMPUG00000000477) #33	MDH1B (ENSMPUG00000000473) #34
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT01030000235022.a.b	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b.hb	ENSGT00940000158720.c.b.ib	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33
Dog	MODERN SPECIES	30	ENSCAFG00845018381	LANCL1 (ENSCAFG00845018274)	CPS1 (ENSCAFG00845017752)	MYL1 (ENSCAFG00845017241)	ENSCAFG00845017145	ACADL (ENSCAFG00845017093)	KANSL1L (ENSCAFG00845016965)	RPE (ENSCAFG00845016841)	ENSCAFG00845026723	UNC80 (ENSCAFG00845024595)	MAP2 (ENSCAFG00845024022)	ENSCAFG00845023938	ENSCAFG00845023908	PTH2R (ENSCAFG00845023795) #20	PIKFYVE (ENSCAFG00845023569) #21	IDH1 (ENSCAFG00845023478) #22	C37H2orf80 (ENSCAFG00845023251) #23	CRYGA (ENSCAFG00845023182) #24	CRYGB (ENSCAFG00845023028) #26	CRYGD (ENSCAFG00845022754)	ENSCAFG00845022685	PLEKHM3 (ENSCAFG00845022580) #29	FZD5 (ENSCAFG00845022521) #28	CCNYL1 (ENSCAFG00845022326)	METTL21A (ENSCAFG00845022171) #30	CREB1 (ENSCAFG00845022020) #31	KLF7 (ENSCAFG00845021900) #32	CPO (ENSCAFG00845021788)	FASTKD2 (ENSCAFG00845021685) #33	MDH1B (ENSCAFG00845021551) #34	DYTN (ENSCAFG00845021457) #35
Dingo	MODERN SPECIES	398	ENSCAFG00020027302	IKZF2 (ENSCAFG00020027304)	ERBB4 (ENSCAFG00020027318)	ENSCAFG00020027327	CPS1 (ENSCAFG00020027329)	LANCL1 (ENSCAFG00020027334)	MYL1 (ENSCAFG00020027336)	ACADL (ENSCAFG00020027340)	KANSL1L (ENSCAFG00020027344)	ENSCAFG00020027348	UNC80 (ENSCAFG00020027361)	MAP2 (ENSCAFG00020027372)	ENSCAFG00020027373	PTH2R (ENSCAFG00020027375) #20	PIKFYVE (ENSCAFG00020027378) #21	IDH1 (ENSCAFG00020027389) #22	C2orf80 (ENSCAFG00020027395) #23	CRYGA (ENSCAFG00020027398) #24	ENSCAFG00020027399 #25	CRYGC (ENSCAFG00020027402) #26	CRYGD (ENSCAFG00020027405)	ENSCAFG00020027409	PLEKHM3 (ENSCAFG00020027411) #29	FZD5 (ENSCAFG00020027413) #28	ENSCAFG00020027415	METTL21A (ENSCAFG00020027418) #30	CREB1 (ENSCAFG00020027420) #31	KLF7 (ENSCAFG00020027423) #32	CPO (ENSCAFG00020027425)	FASTKD2 (ENSCAFG00020027426) #33	MDH1B (ENSCAFG00020027429) #34
Red fox	MODERN SPECIES	39	ENSVVUG00000009126	IKZF2 (ENSVVUG00000009142)	ERBB4 (ENSVVUG00000009194)	ENSVVUG00000009222	CPS1 (ENSVVUG00000009235)	LANCL1 (ENSVVUG00000009273)	ENSVVUG00000009278	MYL1 (ENSVVUG00000009295)	ACADL (ENSVVUG00000009345)	KANSL1L (ENSVVUG00000009477)	RPE (ENSVVUG00000009490)	UNC80 (ENSVVUG00000009630)	MAP2 (ENSVVUG00000009866)	PTH2R (ENSVVUG00000009949) #20	PIKFYVE (ENSVVUG00000010033) #21	IDH1 (ENSVVUG00000011802) #22	CUNH2orf80 (ENSVVUG00000011811) #23	CRYGA (ENSVVUG00000011815) #24	ENSVVUG00000011820 #25	CRYGC (ENSVVUG00000011828) #26	CRYGD (ENSVVUG00000011838)	PLEKHM3 (ENSVVUG00000011844) #29	FZD5 (ENSVVUG00000011856) #28	CCNYL1 (ENSVVUG00000011860)	ENSVVUG00000011880	METTL21A (ENSVVUG00000011888) #30	CREB1 (ENSVVUG00000011892) #31	KLF7 (ENSVVUG00000011906) #32	CPO (ENSVVUG00000011923)	FASTKD2 (ENSVVUG00000011933) #33	MDH1B (ENSVVUG00000011942) #34
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Tiger	MODERN SPECIES	313															PIKFYVE (ENSPTIG00000011629) #21	IDH1 (ENSPTIG00000011718) #22	C2orf80 (ENSPTIG00000011733) #23	CRYGA (ENSPTIG00000011747) #24	CRYGB (ENSPTIG00000011753) ##26	CRYGC (ENSPTIG00000011760) #26	CRYGD (ENSPTIG00000011767)	PLEKHM3 (ENSPTIG00000011775) #29	ENSPTIG00000011797	METTL21A (ENSPTIG00000011823) #30	CREB1 (ENSPTIG00000011848) #31	KLF7 (ENSPTIG00000011869) #32	CPO (ENSPTIG00000011884)	FASTKD2 (ENSPTIG00000011891) #33	MDH1B (ENSPTIG00000011902) #34	DYTN (ENSPTIG00000011914) #35	FAM237A (ENSPTIG00000011920) #36
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leopard	MODERN SPECIES	12	VWC2L (ENSPPRG00000000428)	SPAG16 (ENSPPRG00000000338)	IKZF2 (ENSPPRG00000022962)	ERBB4 (ENSPPRG00000021619)	CPS1 (ENSPPRG00000017782)	LANCL1 (ENSPPRG00000014545)	MYL1 (ENSPPRG00000014175)	ACADL (ENSPPRG00000014114)	KANSL1L (ENSPPRG00000013126)	ENSPPRG00000012984	UNC80 (ENSPPRG00000012259)	MAP2 (ENSPPRG00000010961)	ENSPPRG00000009415	PTH2R (ENSPPRG00000009093) #20	PIKFYVE (ENSPPRG00000008871) #21	IDH1 (ENSPPRG00000008143) #22	C2orf80 (ENSPPRG00000007937) #23	CRYGA (ENSPPRG00000007869) #24	ENSPPRG00000007792 #25	CRYGC (ENSPPRG00000007729) #26	CRYGD (ENSPPRG00000007631)	ENSPPRG00000007573	PLEKHM3 (ENSPPRG00000007268) #29	ENSPPRG00000007043	METTL21A (ENSPPRG00000006796) #30	CREB1 (ENSPPRG00000006712) #31	KLF7 (ENSPPRG00000006377) #32	CPO (ENSPPRG00000006106)	FASTKD2 (ENSPPRG00000006075) #33	MDH1B (ENSPPRG00000005932) #34	DYTN (ENSPPRG00000005491) #35
lion	MODERN SPECIES	8	SPAG16 (ENSPLOG00000022723)	IKZF2 (ENSPLOG00000022726)	ERBB4 (ENSPLOG00000022728)	CPS1 (ENSPLOG00000022730)	LANCL1 (ENSPLOG00000022731)	MYL1 (ENSPLOG00000022732)	ACADL (ENSPLOG00000005365)	KANSL1L (ENSPLOG00000005446)	ENSPLOG00000005504	UNC80 (ENSPLOG00000005686)	MAP2 (ENSPLOG00000006126)	ENSPLOG00000006284	ENSPLOG00000006368	PTH2R (ENSPLOG00000006401) #20	PIKFYVE (ENSPLOG00000006516) #21	IDH1 (ENSPLOG00000006638) #22	C2orf80 (ENSPLOG00000006690) #23	CRYGA (ENSPLOG00000006776) #24	CRYGB (ENSPLOG00000006808) ##26	CRYGC (ENSPLOG00000006841) #26	ENSPLOG00000006864	ENSPLOG00000006884	PLEKHM3 (ENSPLOG00000006915) #29	FZD5 (ENSPLOG00000006965) #28	ENSPLOG00000006998	METTL21A (ENSPLOG00000007061) #30	CREB1 (ENSPLOG00000007090) #31	KLF7 (ENSPLOG00000007130) #32	CPO (ENSPLOG00000007242)	FASTKD2 (ENSPLOG00000007345) #33	MDH1B (ENSPLOG00000007375) #34
Cat	MODERN SPECIES	239	SPAG16 (ENSFCAG00000015155)	ENSFCAG00000048148	IKZF2 (ENSFCAG00000036602)	ERBB4 (ENSFCAG00000027902)	CPS1 (ENSFCAG00000027460)	LANCL1 (ENSFCAG00000023129)	MYL1 (ENSFCAG00000036039)	ACADL (ENSFCAG00000024046)	KANSL1L (ENSFCAG00000027585)	ENSFCAG00000009135	UNC80 (ENSFCAG00000031298)	MAP2 (ENSFCAG00000024249)	ENSFCAG00000041864	PTH2R (ENSFCAG00000003978) #20	PIKFYVE (ENSFCAG00000003977) #21	IDH1 (ENSFCAG00000003976) #22	CC1H2orf80 (ENSFCAG00000003974) #23	CRYGA (ENSFCAG00000003973) #24	CRYGB (ENSFCAG00000003972) ##26	CRYGC (ENSFCAG00000040128) #26	CRYGD (ENSFCAG00000042141)	ENSFCAG00000046445	PLEKHM3 (ENSFCAG00000002716) #29	FZD5 (ENSFCAG00000037566) #28	ENSFCAG00000039577	CCNYL1 (ENSFCAG00000028003)	METTL21A (ENSFCAG00000035900) #30	CREB1 (ENSFCAG00000008220) #31	KLF7 (ENSFCAG00000002514) #32	CPO (ENSFCAG00000002513)	FASTKD2 (ENSFCAG00000015373) #33
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33
Suina	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
Pig	MODERN SPECIES	6	ENSSSCG00000037703	ERBB4 (ENSSSCG00000016160)	CPS1 (ENSSSCG00000016159)	LANCL1 (ENSSSCG00000016158)	MYL1 (ENSSSCG00000016157)	ACADL (ENSSSCG00000016156)	ENSSSCG00000060126	KANSL1L (ENSSSCG00000022830)	ENSSSCG00000032311	UNC80 (ENSSSCG00000016153)	MAP2 (ENSSSCG00000016151)	ENSSSCG00000038814	ENSSSCG00000032020	PTH2R (ENSSSCG00000016148) #20	PIKFYVE (ENSSSCG00000016147) #21	IDH1 (ENSSSCG00000023264) #22	C2orf80 (ENSSSCG00000032040) #23	ENSSSCG00000039241 #25	CRYGC (ENSSSCG00000039620) #26	CRYGD (ENSSSCG00000034967)	ENSSSCG00000036186	PLEKHM3 (ENSSSCG00000016141) #29	FZD5 (ENSSSCG00000016140) #28	ENSSSCG00000024696	METTL21A (ENSSSCG00000036466) #30	CREB1 (ENSSSCG00000034395) #31	ENSSSCG00000042730	KLF7 (ENSSSCG00000029998) #32	CPO (ENSSSCG00000016135)	FASTKD2 (ENSSSCG00000016134) #33	MDH1B (ENSSSCG00000016133) #34
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	940	ERBB4 (ENSCWAG00000010989)	ENSCWAG00000011700	ENSCWAG00000011727	ENSCWAG00000011755	CPS1 (ENSCWAG00000011796)	LANCL1 (ENSCWAG00000012920)	MYL1 (ENSCWAG00000012965)	ACADL (ENSCWAG00000013051)	KANSL1L (ENSCWAG00000013105)	ENSCWAG00000013228	UNC80 (ENSCWAG00000013389)	ENSCWAG00000014500	ENSCWAG00000014678	PTH2R (ENSCWAG00000014718) #20	PIKFYVE (ENSCWAG00000014910) #21	IDH1 (ENSCWAG00000015021) #22	C2orf80 (ENSCWAG00000015065) #23	CRYGA (ENSCWAG00000015197) #24	CRYGB (ENSCWAG00000015245) ##26	CRYGC (ENSCWAG00000015274) #26	CRYGD (ENSCWAG00000015313)	PLEKHM3 (ENSCWAG00000015435) #29	FZD5 (ENSCWAG00000015512) #28
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33
Arabian camel	MODERN SPECIES	31	IKZF2 (ENSCDRG00005010931)	ENSCDRG00005011221	ERBB4 (ENSCDRG00005011281)	ENSCDRG00005011902	CPS1 (ENSCDRG00005011935)	LANCL1 (ENSCDRG00005012357)	MYL1 (ENSCDRG00005012450)	ACADL (ENSCDRG00005012612)	KANSL1L (ENSCDRG00005012697)	ENSCDRG00005012826	UNC80 (ENSCDRG00005012995)	MAP2 (ENSCDRG00005014163)	ENSCDRG00005014776	PTH2R (ENSCDRG00005014818) #20	PIKFYVE (ENSCDRG00005014910) #21	IDH1 (ENSCDRG00005015742) #22	C2orf80 (ENSCDRG00005015804) #23	CRYGA (ENSCDRG00005015861) #24	CRYGB (ENSCDRG00005015889) ##26	CRYGC (ENSCDRG00005015923) #26	CRYGD (ENSCDRG00005015948)	ENSCDRG00005015995	PLEKHM3 (ENSCDRG00005016026) #29	FZD5 (ENSCDRG00005016088) #28	ENSCDRG00005016106	METTL21A (ENSCDRG00005016143) #30	CREB1 (ENSCDRG00005016249) #31	KLF7 (ENSCDRG00005016375) #32	CPO (ENSCDRG00005016423)	FASTKD2 (ENSCDRG00005016506) #33	MDH1B (ENSCDRG00005016545) #34
Alpaca	MODERN SPECIES	2534														PTH2R (ENSVPAG00000009705) #20	PIKFYVE (ENSVPAG00000009702) #21	IDH1 (ENSVPAG00000009700) #22	C2orf80 (ENSVPAG00000009699) #23	CRYGA (ENSVPAG00000009698) #24	ENSVPAG00000009697 #25	CRYGC (ENSVPAG00000009696) #26	CRYGD (ENSVPAG00000009695)	PLEKHM3 (ENSVPAG00000009694) #29
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330.d	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00530000065303.j	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330.d	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00390000006670.d	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00390000001958.n.a.g	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT01030000234607.A.b #33
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00530000065303.j	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330.d	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00390000004738.q.b	ENSGT00390000001958.n.a.g	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT01030000234607.A.b #33
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00530000065303.j	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330.d	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00390000006670.d	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00390000001958.n.a.g	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00530000065303.j	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.qb	ENSGT01030000235330.d	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.x	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b.w	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00390000001958.n.a.g	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00530000065303.j	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.qb	ENSGT01030000235330.d	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.x	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b.w	ENSGT00390000006670.d	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00390000001958.n.a.g	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT01030000234607.A.b #33
Narwhal	MODERN SPECIES	302	IKZF2 (ENSMMNG00015007711)	ERBB4 (ENSMMNG00015007770)	ENSMMNG00015007841	CPS1 (ENSMMNG00015007884)	LANCL1 (ENSMMNG00015008039)	MYL1 (ENSMMNG00015008068)	ENSMMNG00015008099	ACADL (ENSMMNG00015008110)	KANSL1L (ENSMMNG00015008134)	ENSMMNG00015008179	UNC80 (ENSMMNG00015008270)	MAP2 (ENSMMNG00015008438)	ENSMMNG00015008487	PTH2R (ENSMMNG00015008501) #20	PIKFYVE (ENSMMNG00015008559) #21	IDH1 (ENSMMNG00015008654) #22	C2orf80 (ENSMMNG00015008684) #23	CRYGA (ENSMMNG00015008711) #24	CRYGC (ENSMMNG00015008725) #26	ENSMMNG00015008733	PLEKHM3 (ENSMMNG00015008741) #29	ENSMMNG00015005195	FZD5 (ENSMMNG00015005204) #28	ENSMMNG00015005216	ENSMMNG00015005240	ENSMMNG00015005252	METTL21A (ENSMMNG00015005268) #30	CREB1 (ENSMMNG00015005293) #31	KLF7 (ENSMMNG00015005320) #32	FASTKD2 (ENSMMNG00015005336) #33	MDH1B (ENSMMNG00015005351) #34
Beluga whale	MODERN SPECIES	84	IKZF2 (ENSDLEG00000011195)	ERBB4 (ENSDLEG00000011065)	ENSDLEG00000011044	CPS1 (ENSDLEG00000010899)	LANCL1 (ENSDLEG00000010841)	ENSDLEG00000010817	ACADL (ENSDLEG00000010802)	KANSL1L (ENSDLEG00000010779)	ENSDLEG00000010744	ENSDLEG00000010732	UNC80 (ENSDLEG00000010609)	MAP2 (ENSDLEG00000010499)	ENSDLEG00000010475	PTH2R (ENSDLEG00000010408) #20	PIKFYVE (ENSDLEG00000010278) #21	IDH1 (ENSDLEG00000010202) #22	C2orf80 (ENSDLEG00000010165) #23	CRYGB (ENSDLEG00000010148) #25	ENSDLEG00000010132 #26	CRYGD (ENSDLEG00000010113)	ENSDLEG00000010093	ENSDLEG00000010082	PLEKHM3 (ENSDLEG00000010056) #29	FZD5 (ENSDLEG00000010035) #28	CCNYL1 (ENSDLEG00000009986)	ENSDLEG00000009965	ENSDLEG00000009942	METTL21A (ENSDLEG00000009925) #30	CREB1 (ENSDLEG00000009895) #31	KLF7 (ENSDLEG00000009871) #32	FASTKD2 (ENSDLEG00000009822) #33
Vaquita	MODERN SPECIES	18	IKZF2 (ENSPSNG00000017845)	ENSPSNG00000017988	ERBB4 (ENSPSNG00000018144)	ENSPSNG00000018762	CPS1 (ENSPSNG00000018881)	LANCL1 (ENSPSNG00000019514)	MYL1 (ENSPSNG00000019567)	ACADL (ENSPSNG00000019649)	KANSL1L (ENSPSNG00000019694)	ENSPSNG00000019741	UNC80 (ENSPSNG00000020123)	MAP2 (ENSPSNG00000021466)	ENSPSNG00000021538	PTH2R (ENSPSNG00000021559) #20	PIKFYVE (ENSPSNG00000021640) #21	IDH1 (ENSPSNG00000021741) #22	C2orf80 (ENSPSNG00000021785) #23	CRYGB (ENSPSNG00000021815) ##26	CRYGC (ENSPSNG00000021832) #26	CRYGD (ENSPSNG00000021845)	ENSPSNG00000021854	PLEKHM3 (ENSPSNG00000021878) #29	ENSPSNG00000021899	ENSPSNG00000021913	ENSPSNG00000021936	ENSPSNG00000021964	ENSPSNG00000021984	METTL21A (ENSPSNG00000022000) #30	CREB1 (ENSPSNG00000022021) #31	KLF7 (ENSPSNG00000022054) #32	FASTKD2 (ENSPSNG00000022088) #33
Dolphin	MODERN SPECIES	2492														PTH2R (ENSTTRG00000016395) #20	PIKFYVE (ENSTTRG00000016391) #21	IDH1 (ENSTTRG00000016390) #22	C2orf80 (ENSTTRG00000016389) #23
Sperm whale	MODERN SPECIES	11	ERBB4 (ENSPCTG00005008147)	ENSPCTG00005008116	CPS1 (ENSPCTG00005007806)	LANCL1 (ENSPCTG00005007711)	ENSPCTG00005007695	ENSPCTG00005007683	MYL1 (ENSPCTG00005007638)	ACADL (ENSPCTG00005007603)	KANSL1L (ENSPCTG00005007546)	RPE (ENSPCTG00005007416)	UNC80 (ENSPCTG00005006733)	MAP2 (ENSPCTG00005006282)	ENSPCTG00005006233	PTH2R (ENSPCTG00005006194) #20	PIKFYVE (ENSPCTG00005005700) #21	IDH1 (ENSPCTG00005005612) #22	C2orf80 (ENSPCTG00005005458) #23	CRYGB (ENSPCTG00005005428) ##26	ENSPCTG00005005404 ##26	CRYGC (ENSPCTG00005005389) #26	CRYGD (ENSPCTG00005005372)	ENSPCTG00005005346	PLEKHM3 (ENSPCTG00005005303) #29	FZD5 (ENSPCTG00005005280) #28	CCNYL1 (ENSPCTG00005005234)	ENSPCTG00005005205	ENSPCTG00005005181	METTL21A (ENSPCTG00005005122) #30	CREB1 (ENSPCTG00005005085) #31	KLF7 (ENSPCTG00005005002) #32	FASTKD2 (ENSPCTG00005004965) #33
Blue whale	MODERN SPECIES	18	ENSBMSG00010003157	ERBB4 (ENSBMSG00010003029)	ENSBMSG00010002996	CPS1 (ENSBMSG00010002893)	LANCL1 (ENSBMSG00010002864)	MYL1 (ENSBMSG00010002843)	ENSBMSG00010002831	ACADL (ENSBMSG00010002817)	KANSL1L (ENSBMSG00010002800)	ENSBMSG00010002786	UNC80 (ENSBMSG00010002392)	MAP2 (ENSBMSG00010001833)	ENSBMSG00010001803	PTH2R (ENSBMSG00010001780) #20	PIKFYVE (ENSBMSG00010001711) #21	IDH1 (ENSBMSG00010001674) #22	ENSBMSG00010001666	ENSBMSG00010001661	METTL21A (ENSBMSG00010001644) #30	CREB1 (ENSBMSG00010001606) #31	KLF7 (ENSBMSG00010001534) #32	FASTKD2 (ENSBMSG00010001509) #33	MDH1B (ENSBMSG00010001465) #34	DYTN (ENSBMSG00010001424) #35	FAM237A (ENSBMSG00010001408) #36	ADAM23 (ENSBMSG00010001305) #37	ZDBF2 (ENSBMSG00010001246)	CMKLR2 (ENSBMSG00010001229)	EEF1B2 (ENSBMSG00010001199)	NDUFS1 (ENSBMSG00010001085)	ENSBMSG00010001036
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b.s	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33
Yarkand deer	DUPLICATION
Yarkand deer	DUPLICATION
Yarkand deer	MODERN SPECIES	31	CPS1 (ENSCHYG00000004084)	LANCL1 (ENSCHYG00000004128)	ENSCHYG00000004138	MYL1 (ENSCHYG00000004152)	ACADL (ENSCHYG00000004178)	ENSCHYG00000004220	KANSL1L (ENSCHYG00000004240)	ENSCHYG00000004274	UNC80 (ENSCHYG00000000452)	MAP2 (ENSCHYG00000000996)	ENSCHYG00000001066	ENSCHYG00000001080	PTH2R (ENSCHYG00000001108) #20	ENSCHYG00000001125	PIKFYVE (ENSCHYG00000001177) #21	ENSCHYG00000001240 #22	C2orf80 (ENSCHYG00000001293) #23	CRYGA (ENSCHYG00000001333) #24	ENSCHYG00000001348 #25	CRYGC (ENSCHYG00000001360) #26	CRYGD (ENSCHYG00000001364)	ENSCHYG00000001381	PLEKHM3 (ENSCHYG00000001407) #29	ENSCHYG00000001470	FZD5 (ENSCHYG00000001477) #28	ENSCHYG00000001504 #30	CREB1 (ENSCHYG00000001543) #31	KLF7 (ENSCHYG00000001583) #32	CPO (ENSCHYG00000001618)	FASTKD2 (ENSCHYG00000001648) #33	MDH1B (ENSCHYG00000001680) #34
Yarkand deer	MODERN SPECIES	5	ENSCHYG00000026976	CFAP74 (ENSCHYG00000026970)	GABRD (ENSCHYG00000026948)	PRKCZ (ENSCHYG00000026939)	ENSCHYG00000026917	SKI (ENSCHYG00000026910)	MORN1 (ENSCHYG00000026899)	RER1 (ENSCHYG00000026890)	ENSCHYG00000026862	PLCH2 (ENSCHYG00000026795)	PANK4 (ENSCHYG00000026707)	HES5 (ENSCHYG00000026669)	PRXL2B (ENSCHYG00000026618)	MMEL1 (ENSCHYG00000026544)	ENSCHYG00000026518	ENSCHYG00000026511 #22	ACTRT2 (ENSCHYG00000026506)	PRDM16 (ENSCHYG00000026484)	ARHGEF16 (ENSCHYG00000026434)	MEGF6 (ENSCHYG00000025807)	TPRG1L (ENSCHYG00000025690)	WRAP73 (ENSCHYG00000025638)	TP73 (ENSCHYG00000025502)	ENSCHYG00000025453	ENSCHYG00000025345	SMIM1 (ENSCHYG00000025319)	LRRC47 (ENSCHYG00000025295)	CEP104 (ENSCHYG00000025105)	DFFB (ENSCHYG00000025029)	C1orf174 (ENSCHYG00000025002)	AJAP1 (ENSCHYG00000024985)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	1	ENSCHYG00000007836	CD2BP2 (ENSCHYG00000007863)	TBC1D10B (ENSCHYG00000007925)	MYL11 (ENSCHYG00000007998)	SEPTIN1 (ENSCHYG00000008026)	ZNF48 (ENSCHYG00000008118)	ZNF771 (ENSCHYG00000008140)	DCTPP1 (ENSCHYG00000008164)	SEPHS2 (ENSCHYG00000008191)	ENSCHYG00000008208	ITGAL (ENSCHYG00000000773)	ENSCHYG00000001071	ENSCHYG00000001083	ZNF768 (ENSCHYG00000001097)	ENSCHYG00000001127	ENSCHYG00000001155 #22	PRR14 (ENSCHYG00000001185)	FBRS (ENSCHYG00000001258)	SRCAP (ENSCHYG00000001457)	ENSCHYG00000001599	PHKG2 (ENSCHYG00000001626)	ZNF629 (ENSCHYG00000001654)	CFAP119 (ENSCHYG00000001669)	RNF40 (ENSCHYG00000001704)	BCL7C (ENSCHYG00000001768)	FBXL19 (ENSCHYG00000001809)	ORAI3 (ENSCHYG00000001841)	SETD1A (ENSCHYG00000001856)	HSD3B7 (ENSCHYG00000001916)	STX1B (ENSCHYG00000001985)	STX4 (ENSCHYG00000002066)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b.s	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000153593.c.b	ENSGT00940000158720.c.b.s	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508
Caprinae	DUPLICATION
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT01010000228811	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.lb.a	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.g #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000153593.c.b	ENSGT00940000158720.c.b.s	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33
Goat	MODERN SPECIES	11	IKZF2 (ENSCHIG00000008623)	ENSCHIG00000025711	ENSCHIG00000015255	CPS1 (ENSCHIG00000025029)	LANCL1 (ENSCHIG00000015499)	MYL1 (ENSCHIG00000016096)	ACADL (ENSCHIG00000012492)	KANSL1L (ENSCHIG00000025531)	ENSCHIG00000017628	UNC80 (ENSCHIG00000023318)	MAP2 (ENSCHIG00000000510)	ENSCHIG00000015978	PTH2R (ENSCHIG00000003956) #20	ENSCHIG00000011874	PIKFYVE (ENSCHIG00000018742) #21	ENSCHIG00000018336 #22	C2orf80 (ENSCHIG00000012414) #23	CRYGA (ENSCHIG00000010538) #24	ENSCHIG00000006930 #25	ENSCHIG00000018066 #26	ENSCHIG00000014620	ENSCHIG00000012148	ENSCHIG00000012358	PLEKHM3 (ENSCHIG00000008278) #29	FZD5 (ENSCHIG00000007513) #28	ENSCHIG00000011033	METTL21A (ENSCHIG00000003332) #30	CREB1 (ENSCHIG00000027161) #31	KLF7 (ENSCHIG00000006619) #32	CPO (ENSCHIG00000020644)	ENSCHIG00000026347
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	11	ENSOARG00020022071	ENSOARG00020022058	CPS1 (ENSOARG00020021614)	LANCL1 (ENSOARG00020021560)	MYL1b (ENSOARG00020021419)	ACADL (ENSOARG00020021309)	KANSL1L (ENSOARG00020021126)	RPE (ENSOARG00020021044)	UNC80 (ENSOARG00020019570)	MAP2 (ENSOARG00020019287)	ENSOARG00020019223	ENSOARG00020019192	PTH2R (ENSOARG00020018956) #20	ENSOARG00020018915	PIKFYVE (ENSOARG00020017062) #21	IDH1 (ENSOARG00020016933) #22	C2orf80 (ENSOARG00020016679) #23	CRYGA (ENSOARG00020016623) #24	CRYGB (ENSOARG00020016583) ##26	CRYGC (ENSOARG00020016523) #26	CRYGD (ENSOARG00020016483)	ENSOARG00020016435	PLEKHM3 (ENSOARG00020016241) #29	FZD5 (ENSOARG00020016197) #28	ENSOARG00020016023	METTL21A (ENSOARG00020015859) #30	CREB1 (ENSOARG00020015664) #31	KLF7 (ENSOARG00020015555) #32	CPO (ENSOARG00020015466)	FASTKD2 (ENSOARG00020015403) #33	MDH1B (ENSOARG00020015160) #34
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.h #22
Goat	MODERN SPECIES	22	ENSCHIG00000013344	ANGPTL3 (ENSCHIG00000018304)	DOCK7 (ENSCHIG00000022741)	USP1 (ENSCHIG00000015997)	KANK4 (ENSCHIG00000026610)	ENSCHIG00000012571	PATJ (ENSCHIG00000023685)	TM2D1 (ENSCHIG00000026504)	ENSCHIG00000012418	NFIA (ENSCHIG00000011380)	C1orf87 (ENSCHIG00000023812)	CYP2J26 (ENSCHIG00000021521)	CYP2J29 (ENSCHIG00000009032)	CYP2J30 (ENSCHIG00000022554)	HOOK1 (ENSCHIG00000025016)	ENSCHIG00000018971 #22	FGGY (ENSCHIG00000022252)	JUN (ENSCHIG00000004093)	MYSM1 (ENSCHIG00000007198)	TACSTD2 (ENSCHIG00000012887)	OMA1 (ENSCHIG00000015440)	ENSCHIG00000025606	DAB1 (ENSCHIG00000024663)	C8B (ENSCHIG00000012131)	C8A (ENSCHIG00000025838)	PRKAA2 (ENSCHIG00000014436)	PLPP3 (ENSCHIG00000022600)	ENSCHIG00000015710	USP24 (ENSCHIG00000021161)	BSND (ENSCHIG00000027205)	TMEM61 (ENSCHIG00000020700)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00950000182965.b	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000153593.c.b	ENSGT00940000158720.c.b.s	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33
Bos	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b.s	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a ##26	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b.s	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
Domestic yak	MODERN SPECIES	11	SPAG16 (ENSBGRG00000003519)	IKZF2 (ENSBGRG00000003601)	ENSBGRG00000003764	ERBB4 (ENSBGRG00000003801)	CPS1 (ENSBGRG00000004265)	LANCL1 (ENSBGRG00000004687)	MYL1 (ENSBGRG00000004749)	ACADL (ENSBGRG00000004885)	KANSL1L (ENSBGRG00000004930)	ENSBGRG00000005051	UNC80 (ENSBGRG00000005202)	MAP2 (ENSBGRG00000005995)	ENSBGRG00000006119	PTH2R (ENSBGRG00000006150) #20	PIKFYVE (ENSBGRG00000006248) #21	IDH1 (ENSBGRG00000006637) #22	C2orf80 (ENSBGRG00000006683) #23	CRYGA (ENSBGRG00000006786) #24	ENSBGRG00000006816 #25	CRYGC (ENSBGRG00000006857) #26	CRYGD (ENSBGRG00000006881)	ENSBGRG00000006903	PLEKHM3 (ENSBGRG00000006928) #29	ENSBGRG00000007042	FZD5 (ENSBGRG00000007062) #28	ENSBGRG00000007199	METTL21A (ENSBGRG00000007457) #30	CREB1 (ENSBGRG00000007627) #31	KLF7 (ENSBGRG00000007842) #32	ENSBGRG00000007943	CPO (ENSBGRG00000007969)
Wild yak	MODERN SPECIES	2028																IDH1 (ENSBMUG00000010416) #22	C2orf80 (ENSBMUG00000010376) #23	CRYGA (ENSBMUG00000010314) #24	CRYGB (ENSBMUG00000010304) ##26	CRYGC (ENSBMUG00000010295) #26	CRYGD (ENSBMUG00000010261)	ENSBMUG00000010238	PLEKHM3 (ENSBMUG00000010222) #29	FZD5 (ENSBMUG00000010190) #28	ENSBMUG00000010178	METTL21A (ENSBMUG00000010151) #30	CREB1 (ENSBMUG00000010114) #31
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000154471.a.b.a.a	ENSGT00940000159597	ENSGT00390000006976	ENSGT00390000016408	ENSGT00940000158892.b	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t	ENSGT00940000159094 #20	ENSGT00950000182965.b	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g #25	ENSGT00940000159232.h.b #26	ENSGT00940000158720.c.a	ENSGT00940000158720.c.b.s	ENSGT00940000159743 #29	ENSGT00940000162639 #28	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249 #30	ENSGT00940000155408 #31	ENSGT00940000155235 #32	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00530000063410.b #34
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	11	ERBB4 (ENSBIXG00005026738)	CPS1 (ENSBIXG00005027520)	LANCL1 (ENSBIXG00005027712)	MYL1 (ENSBIXG00005027778)	ENSBIXG00005004776	ENSBIXG00005027813	ENSBIXG00005027821	ACADL (ENSBIXG00005027851)	KANSL1L (ENSBIXG00005004802)	ENSBIXG00005004817	UNC80 (ENSBIXG00005007598)	ENSBIXG00005028747	PTH2R (ENSBIXG00005028831) #20	ENSBIXG00005002284	PIKFYVE (ENSBIXG00005029111) #21	IDH1 (ENSBIXG00005001809) #22	C2orf80 (ENSBIXG00005005242) #23	CRYGA (ENSBIXG00005001634) #24	ENSBIXG00005029217 #25	CRYGC (ENSBIXG00005029223) #26	CRYGD (ENSBIXG00005005265)	ENSBIXG00005005279	PLEKHM3 (ENSBIXG00005001556) #29	ENSBIXG00005001549	ENSBIXG00005031627	FZD5 (ENSBIXG00005031625) #28	CREB1 (ENSBIXG00005031624) #31	ENSBIXG00005031623	KLF7 (ENSBIXG00005031620) #32	CPO (ENSBIXG00005031618)	FASTKD2 (ENSBIXG00005031617) #33
Cow	MODERN SPECIES	11	ERBB4 (ENSBTAG00000012647)	CPS1 (ENSBTAG00000016662)	LANCL1 (ENSBTAG00000015066)	MYL1 (ENSBTAG00000009707)	ENSBTAG00000010722	ACADL (ENSBTAG00000010579)	KANSL1L (ENSBTAG00000021600)	RPE (ENSBTAG00000054647)	UNC80 (ENSBTAG00000015415)	MAP2 (ENSBTAG00000018130)	ENSBTAG00000052197	PTH2R (ENSBTAG00000011992) #20	ENSBTAG00000002180	PIKFYVE (ENSBTAG00000002177) #21	ENSBTAG00000055312	IDH1 (ENSBTAG00000020527) #22	C2H2orf80 (ENSBTAG00000012888) #23	CRYGA (ENSBTAG00000049076) #24	CRYGB (ENSBTAG00000021770) #25	CRYGC (ENSBTAG00000014783) #26	CRYGD (ENSBTAG00000015054)	ENSBTAG00000049856	PLEKHM3 (ENSBTAG00000007830) #29	FZD5 (ENSBTAG00000020957) #28	CCNYL1 (ENSBTAG00000016297)	METTL21A (ENSBTAG00000052083) #30	CREB1 (ENSBTAG00000005474) #31	KLF7 (ENSBTAG00000044097) #32	CPO (ENSBTAG00000019190)	FASTKD2 (ENSBTAG00000016193) #33	MDH1B (ENSBTAG00000016192) #34
American bison	MODERN SPECIES	3330	SPAG16 (ENSBBBG00000000106)	IKZF2 (ENSBBBG00000000044)	ERBB4 (ENSBBBG00000010300)	CPS1 (ENSBBBG00000010353)	LANCL1 (ENSBBBG00000010389)	MYL1 (ENSBBBG00000010407)	ACADL (ENSBBBG00000001806)	KANSL1L (ENSBBBG00000010441)	ENSBBBG00000007586	UNC80 (ENSBBBG00000010561)	MAP2 (ENSBBBG00000010617)	ENSBBBG00000010626	PTH2R (ENSBBBG00000010642) #20	ENSBBBG00000010646	PIKFYVE (ENSBBBG00000010714) #21	IDH1 (ENSBBBG00000010731) #22	C2orf80 (ENSBBBG00000010761) #23	CRYGA (ENSBBBG00000010767) #24	CRYGB (ENSBBBG00000010771) ##26	CRYGC (ENSBBBG00000001889) #26	CRYGD (ENSBBBG00000010778)	ENSBBBG00000010781	ENSBBBG00000010792	PLEKHM3 (ENSBBBG00000010799) #29	FZD5 (ENSBBBG00000010805) #28	ENSBBBG00000010833	METTL21A (ENSBBBG00000010854) #30	CREB1 (ENSBBBG00000010873) #31	KLF7 (ENSBBBG00000010885) #32	ENSBBBG00000010890	CPO (ENSBBBG00000010898)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	352	ERBB4 (ENSMMSG00000020665)	ENSMMSG00000020623	CPS1 (ENSMMSG00000020103)	LANCL1 (ENSMMSG00000020057)	MYL1 (ENSMMSG00000019985)	ACADL (ENSMMSG00000019943)	ENSMMSG00000019930	KANSL1L (ENSMMSG00000019864)	ENSMMSG00000019805	UNC80 (ENSMMSG00000019152)	MAP2 (ENSMMSG00000018946)	ENSMMSG00000018909	PTH2R (ENSMMSG00000018791) #20	ENSMMSG00000018713	PIKFYVE (ENSMMSG00000018585) #21	IDH1 (ENSMMSG00000018507) #22	C2orf80 (ENSMMSG00000018380) #23	CRYGA (ENSMMSG00000018345) #24	CRYGB (ENSMMSG00000018324) ##26	CRYGC (ENSMMSG00000018298) #26	CRYGD (ENSMMSG00000018278)	ENSMMSG00000018240	PLEKHM3 (ENSMMSG00000018216) #29	ENSMMSG00000018199	FZD5 (ENSMMSG00000018190) #28	ENSMMSG00000018078	ENSMMSG00000017981 #30	CREB1 (ENSMMSG00000017935) #31	ENSMMSG00000017910	KLF7 (ENSMMSG00000017874) #32	CPO (ENSMMSG00000017798)