Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b #22
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	180		ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00390000005983	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00390000005983	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.a.a	ENSGT00940000157249
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	95	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00390000005983	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00390000005983	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000158781	ENSGT00940000160642	ENSGT00950000183014.f.a
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00960000187202	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190 #24	ENSGT00940000159232	ENSGT00940000163494.a.b.g.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00960000187202	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190 #24	ENSGT00940000159232	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00390000015769.B
Theria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00960000187202	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190 #24	ENSGT00940000159232	ENSGT00940000158720 #25	ENSGT00940000163272	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000163272	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508
Glires	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000158720.d #25	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00940000158781
Pika	MODERN SPECIES	4228															PIKFYVE (ENSOPRG00000015296) #21	IDH1 (ENSOPRG00000015277) #22	C2orf80 (ENSOPRG00000015261) #23	CRYGA (ENSOPRG00000015254) #24	CRYGD (ENSOPRG00000015247) #25	PLEKHM3 (ENSOPRG00000015223) #26	ENSOPRG00000015213 #27
Rabbit	MODERN SPECIES	18	ENSOCUG00000034291	ENSOCUG00000036328	ERBB4 (ENSOCUG00000009790)	ENSOCUG00000021317	ENSOCUG00000034876	CPS1 (ENSOCUG00000017716)	LANCL1 (ENSOCUG00000017711)	MYL1 (ENSOCUG00000014182)	KANSL1L (ENSOCUG00000017001)	ENSOCUG00000016995	UNC80 (ENSOCUG00000016966)	MAP2 (ENSOCUG00000005163)	ENSOCUG00000010967 ##25	ENSOCUG00000037560	PIKFYVE (ENSOCUG00000002676) #21	IDH1 (ENSOCUG00000002671) #22	ENSOCUG00000034990	C2orf80 (ENSOCUG00000010976) #23	CRYGA (ENSOCUG00000010973) #24	CRYGD (ENSOCUG00000029414) ##25	PLEKHM3 (ENSOCUG00000015383) #26	ENSOCUG00000036167	FZD5 (ENSOCUG00000027916)	ENSOCUG00000015013	ENSOCUG00000005431	CREB1 (ENSOCUG00000005427)	ENSOCUG00000027419	KLF7 (ENSOCUG00000009813)	CPO (ENSOCUG00000009806)	ENSOCUG00000010515	MDH1B (ENSOCUG00000010506)
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403
Prairie vole	MODERN SPECIES	354	Erbb4 (ENSMOCG00000016854)	Cps1 (ENSMOCG00000009767)	Lancl1 (ENSMOCG00000017471)	Myl1 (ENSMOCG00000021319)	Acadl (ENSMOCG00000022401)	Kansl1l (ENSMOCG00000020578)	Rpe (ENSMOCG00000013941)	Unc80 (ENSMOCG00000014746)	ENSMOCG00000006121	ENSMOCG00000017798	ENSMOCG00000022246	ENSMOCG00000014035	ENSMOCG00000016045	Pth2r (ENSMOCG00000006742)	Pikfyve (ENSMOCG00000014597) #21	IDH1 (ENSMOCG00000018153) #22	ENSMOCG00000008599 #23	ENSMOCG00000015565 #25	Crygc (ENSMOCG00000017760)	Crygd (ENSMOCG00000018181)	ENSMOCG00000018497	Plekhm3 (ENSMOCG00000013149) #26	Fzd5 (ENSMOCG00000013581)	Ccnyl1 (ENSMOCG00000016018)	Mettl21a (ENSMOCG00000017410)	Creb1 (ENSMOCG00000002192)	Klf7 (ENSMOCG00000009593)	ENSMOCG00000008631	Fastkd2 (ENSMOCG00000019859)	Mdh1b (ENSMOCG00000001314)	Dytn (ENSMOCG00000015652)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	4	ENSPEMG00000024657	Erbb4 (ENSPEMG00000017090)	Cps1 (ENSPEMG00000010458)	Lancl1 (ENSPEMG00000020372)	Myl1 (ENSPEMG00000016490)	Acadl (ENSPEMG00000012977)	Kansl1l (ENSPEMG00000000580)	Rpe (ENSPEMG00000021162)	Unc80 (ENSPEMG00000020306)	Map2 (ENSPEMG00000020588)	ENSPEMG00000024512	ENSPEMG00000024519	Pth2r (ENSPEMG00000008254)	ENSPEMG00000024955	Pikfyve (ENSPEMG00000021384) #21	Idh1 (ENSPEMG00000016518) #22	ENSPEMG00000001038	D630023F18Rik (ENSPEMG00000012946) #23	Cryga (ENSPEMG00000028371) #24	Crygb (ENSPEMG00000011613)	Crygc (ENSPEMG00000027882)	Crygd (ENSPEMG00000031321)	ENSPEMG00000029603	Plekhm3 (ENSPEMG00000009141) #26	Fzd5 (ENSPEMG00000026977)	Ccnyl1 (ENSPEMG00000022762)	Mettl21a (ENSPEMG00000027520)	Creb1 (ENSPEMG00000012416)	Klf7 (ENSPEMG00000028836)	ENSPEMG00000029845	Fastkd2 (ENSPEMG00000010593)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	1	Vwc2l (ENSCGRG00001022705)	ENSCGRG00001018870	Ikzf2 (ENSCGRG00001020531)	Erbb4 (ENSCGRG00001023006)	Cps1 (ENSCGRG00001019583)	Lancl1 (ENSCGRG00001018654)	Myl1 (ENSCGRG00001018385)	Acadl (ENSCGRG00001020753)	Kansl1l (ENSCGRG00001021527)	Rpe (ENSCGRG00001018221)	Unc80 (ENSCGRG00001024763)	Map2 (ENSCGRG00001019179)	ENSCGRG00001017914	Pth2r (ENSCGRG00001020290)	Pikfyve (ENSCGRG00001019851) #21	Idh1 (ENSCGRG00001018765) #22	D630023F18Rik (ENSCGRG00001021567) #23	Cryga (ENSCGRG00001018244) #24	ENSCGRG00001020560 ##24	Crygc (ENSCGRG00001020149)	Crygd (ENSCGRG00001020195)	ENSCGRG00001020657	Plekhm3 (ENSCGRG00001023068) #26	Fzd5 (ENSCGRG00001010794)	Ccnyl1 (ENSCGRG00001017467)	Mettl21a (ENSCGRG00001017438)	Creb1 (ENSCGRG00001018838)	ENSCGRG00001018665	Klf7 (ENSCGRG00001018794)	Fastkd2 (ENSCGRG00001020432)	Mdh1b (ENSCGRG00001017642)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	640	ENSMAUG00000010536	Ikzf2 (ENSMAUG00000017775)	Erbb4 (ENSMAUG00000021336)	Cps1 (ENSMAUG00000010923)	Lancl1 (ENSMAUG00000013753)	Myl1 (ENSMAUG00000018186)	Acadl (ENSMAUG00000018703)	Kansl1l (ENSMAUG00000013611)	Rpe (ENSMAUG00000011547)	ENSMAUG00000009679	ENSMAUG00000019100	Map2 (ENSMAUG00000012012)	ENSMAUG00000015143	Pth2r (ENSMAUG00000020947)	Pikfyve (ENSMAUG00000001410) #21	ENSMAUG00000001360 #22	D630023F18Rik (ENSMAUG00000022108) #23	Cryga (ENSMAUG00000019430) #24	ENSMAUG00000022086	Crygc (ENSMAUG00000009964)	Crygd (ENSMAUG00000020101)	ENSMAUG00000022028	Plekhm3 (ENSMAUG00000021638) #26	Fzd5 (ENSMAUG00000022033)	Mettl21a (ENSMAUG00000020877)	Creb1 (ENSMAUG00000018215)	Klf7 (ENSMAUG00000022037)	Fastkd2 (ENSMAUG00000009136)	Mdh1b (ENSMAUG00000016431)	Dytn (ENSMAUG00000021422)	Adam23 (ENSMAUG00000012410)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00390000015769.B
Mus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000163272.a.a.i	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000163272.a.a.j	ENSGT00940000153677.u.b.b.a.a.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00860000135862	ENSGT01030000234607.A.b
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000163272.a.a.i	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000163272.a.a.j	ENSGT00940000153677.u.b.b.a.a.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a.c	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00860000135862	ENSGT01030000234607.A.b
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000163272.a.a.i	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000163272.a.a.j	ENSGT00940000153677.u.b.b.a.a.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a.c	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00860000135862	ENSGT01030000234607.A.b
Mouse	MODERN SPECIES		Vwc2l (ENSMUSG00000045648)	Spag16 (ENSMUSG00000053153)	Ikzf2 (ENSMUSG00000025997)	Erbb4 (ENSMUSG00000062209)	Cps1 (ENSMUSG00000025991)	Lancl1 (ENSMUSG00000026000)	Myl1 (ENSMUSG00000061816)	Acadl (ENSMUSG00000026003)	Kansl1l (ENSMUSG00000026004)	Rpe (ENSMUSG00000026005)	Unc80 (ENSMUSG00000055567)	Map2 (ENSMUSG00000015222)	Crygf (ENSMUSG00000025945)	Pth2r (ENSMUSG00000025946)	Pikfyve (ENSMUSG00000025949) #21	Idh1 (ENSMUSG00000025950) #22	D630023F18Rik (ENSMUSG00000044816) #23	Gm28845 (ENSMUSG00000100846)	Cryga (ENSMUSG00000044429) #24	Crygb (ENSMUSG00000073658)	Crygc (ENSMUSG00000025952)	Crygd (ENSMUSG00000067299)	Cryge (ENSMUSG00000070870)	Akr1cl (ENSMUSG00000025955)	Plekhm3 (ENSMUSG00000051344) #26	Fzd5 (ENSMUSG00000045005)	Ccnyl1 (ENSMUSG00000070871)	Mettl21a (ENSMUSG00000025956)	Creb1 (ENSMUSG00000025958)	Klf7 (ENSMUSG00000025959)	Fastkd2 (ENSMUSG00000025962)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000163272.a.a.i	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000163272.a.a.j	ENSGT00940000153677.u.b.b.a.a.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a.c	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00860000135862	ENSGT01030000234607.A.b
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2933														Pth2r (ENSMSIG00000009418)	Pikfyve (ENSMSIG00000009459) #21	Idh1 (ENSMSIG00000009702) #22	D630023F18Rik (ENSMSIG00000009745) #23	Cryga (ENSMSIG00000009786) #24	Crygb (ENSMSIG00000009796)	Crygc (ENSMSIG00000009814)	Crygd (ENSMSIG00000009826)	Cryge (ENSMSIG00000009838)	Akr1cl (ENSMSIG00000009845)	Plekhm3 (ENSMSIG00000009894) #26	Fzd5 (ENSMSIG00000009924)	ENSMSIG00000009939	Mettl21a (ENSMSIG00000009970)	ENSMSIG00000009988	Creb1 (ENSMSIG00000009993)	Klf7 (ENSMSIG00000010033)	ENSMSIG00000010064
spretus	MODERN SPECIES		Vwc2l (MGP_SPRETEiJ_G0015042)	Spag16 (MGP_SPRETEiJ_G0015041)	Ikzf2 (MGP_SPRETEiJ_G0015040)	Erbb4 (MGP_SPRETEiJ_G0015039)	Cps1 (MGP_SPRETEiJ_G0015038)	Lancl1 (MGP_SPRETEiJ_G0015037)	Myl1 (MGP_SPRETEiJ_G0015036)	Acadl (MGP_SPRETEiJ_G0015035)	Kansl1l (MGP_SPRETEiJ_G0015034)	Rpe (MGP_SPRETEiJ_G0015033)	Unc80 (MGP_SPRETEiJ_G0015032)	Map2 (MGP_SPRETEiJ_G0015031)	Crygf (MGP_SPRETEiJ_G0015030)	Pth2r (MGP_SPRETEiJ_G0015029)	Pikfyve (MGP_SPRETEiJ_G0015028) #21	Idh1 (MGP_SPRETEiJ_G0015027) #22	MGP_SPRETEiJ_G0015026 #23	MGP_SPRETEiJ_G0015025 #23	Cryga (MGP_SPRETEiJ_G0015024) #24	Crygb (MGP_SPRETEiJ_G0015023)	Crygc (MGP_SPRETEiJ_G0015022)	Crygd (MGP_SPRETEiJ_G0015021)	Cryge (MGP_SPRETEiJ_G0015020)	Akr1cl (MGP_SPRETEiJ_G0015019)	Plekhm3 (MGP_SPRETEiJ_G0015018) #26	Fzd5 (MGP_SPRETEiJ_G0015017)	Ccnyl1 (MGP_SPRETEiJ_G0015016)	Mettl21a (MGP_SPRETEiJ_G0015015)	Creb1 (MGP_SPRETEiJ_G0015014)	Klf7 (MGP_SPRETEiJ_G0015013)	MGP_SPRETEiJ_G0015012
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES		Vwc2l (MGP_CAROLIEiJ_G0014235)	Spag16 (MGP_CAROLIEiJ_G0014234)	Ikzf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014233)	Erbb4 (MGP_CAROLIEiJ_G0014232)	Cps1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014231)	Lancl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014230)	Myl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014229)	Acadl (MGP_CAROLIEiJ_G0014228)	Kansl1l (MGP_CAROLIEiJ_G0014227)	Rpe (MGP_CAROLIEiJ_G0014226)	Unc80 (MGP_CAROLIEiJ_G0014225)	Map2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014224)	Crygf (MGP_CAROLIEiJ_G0014223)	Pth2r (MGP_CAROLIEiJ_G0014222)	Pikfyve (MGP_CAROLIEiJ_G0014221) #21	Idh1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014220) #22	MGP_CAROLIEiJ_G0014219 #23	MGP_CAROLIEiJ_G0014218 #23	Cryga (MGP_CAROLIEiJ_G0014217) #24	Crygb (MGP_CAROLIEiJ_G0014216)	Crygc (MGP_CAROLIEiJ_G0014215)	Crygd (MGP_CAROLIEiJ_G0014214)	Cryge (MGP_CAROLIEiJ_G0014213)	Akr1cl (MGP_CAROLIEiJ_G0014212)	Plekhm3 (MGP_CAROLIEiJ_G0014211) #26	Fzd5 (MGP_CAROLIEiJ_G0014210)	Ccnyl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014209)	Mettl21a (MGP_CAROLIEiJ_G0014208)	Creb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014207)	Klf7 (MGP_CAROLIEiJ_G0014206)	MGP_CAROLIEiJ_G0014205
Shrew mouse	MODERN SPECIES	18	Vwc2l (MGP_PahariEiJ_G0027473)	Spag16 (MGP_PahariEiJ_G0027472)	Ikzf2 (MGP_PahariEiJ_G0027471)	Erbb4 (MGP_PahariEiJ_G0027470)	Cps1 (MGP_PahariEiJ_G0027469)	Lancl1 (MGP_PahariEiJ_G0027468)	Myl1 (MGP_PahariEiJ_G0027467)	Acadl (MGP_PahariEiJ_G0027466)	Kansl1l (MGP_PahariEiJ_G0027465)	Rpe (MGP_PahariEiJ_G0027464)	Unc80 (MGP_PahariEiJ_G0027463)	Map2 (MGP_PahariEiJ_G0027462)	MGP_PahariEiJ_G0027461	MGP_PahariEiJ_G0027460	Pikfyve (MGP_PahariEiJ_G0027459) #21	Idh1 (MGP_PahariEiJ_G0027458) #22	MGP_PahariEiJ_G0027457 #23	MGP_PahariEiJ_G0027456 #23	Cryga (MGP_PahariEiJ_G0027455) #24	Crygb (MGP_PahariEiJ_G0027454)	Crygc (MGP_PahariEiJ_G0027453)	Crygd (MGP_PahariEiJ_G0027452)	MGP_PahariEiJ_G0027451	Akr1cl (MGP_PahariEiJ_G0027450)	Plekhm3 (MGP_PahariEiJ_G0027449) #26	Fzd5 (MGP_PahariEiJ_G0027448)	Ccnyl1 (MGP_PahariEiJ_G0027447)	Mettl21a (MGP_PahariEiJ_G0027446)	Creb1 (MGP_PahariEiJ_G0027445)	Klf7 (MGP_PahariEiJ_G0027444)	MGP_PahariEiJ_G0027443
Rat	MODERN SPECIES	19	Ikzf2 (ENSRNOG00000027430)	RGD1562431 (ENSRNOG00000032306)	Erbb4 (ENSRNOG00000014248)	Cps1 (ENSRNOG00000013704)	Lancl1 (ENSRNOG00000013557)	Myl1 (ENSRNOG00000013262)	Acadl (ENSRNOG00000012966)	Kansl1l (ENSRNOG00000028149)	Rpe (ENSRNOG00000038085)	Unc80 (ENSRNOG00000028362)	Map2 (ENSRNOG00000011841)	ENSRNOG00000068845	Crygf (ENSRNOG00000032869)	Pth2r (ENSRNOG00000015259)	Pikfyve (ENSRNOG00000015158) #21	Idh1 (ENSRNOG00000015020) #22	Cryga (ENSRNOG00000046343) #24	Crygb (ENSRNOG00000032926) ##24	Crygc (ENSRNOG00000014950)	Crygd (ENSRNOG00000032219)	Cryga (ENSRNOG00000014790)	Plekhm3 (ENSRNOG00000023760) #26	Fzd5 (ENSRNOG00000014678)	Ccnyl1 (ENSRNOG00000023807)	Mettl21a (ENSRNOG00000014212)	Creb1 (ENSRNOG00000013412)	LOC103690545 (ENSRNOG00000064370)	Klf7 (ENSRNOG00000046242)	ENSRNOG00000063607	Fastkd2 (ENSRNOG00000023923)	ENSRNOG00000063009
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1322		ENSNGAG00000011292	Ikzf2 (ENSNGAG00000016617)	Erbb4 (ENSNGAG00000012140)	Cps1 (ENSNGAG00000011164)	Lancl1 (ENSNGAG00000011473)	Myl1 (ENSNGAG00000014879)	ENSNGAG00000011216	Kansl1l (ENSNGAG00000015682)	Rpe (ENSNGAG00000011728)	Unc80 (ENSNGAG00000010725)	ENSNGAG00000019112	ENSNGAG00000018453	Pth2r (ENSNGAG00000017148)	Pikfyve (ENSNGAG00000013615) #21	Idh1 (ENSNGAG00000006870) #22	D630023F18Rik (ENSNGAG00000013154) #23	Crygc (ENSNGAG00000017419)	Plekhm3 (ENSNGAG00000007962) #26	Fzd5 (ENSNGAG00000014954)	Ccnyl1 (ENSNGAG00000004870)	ENSNGAG00000014167	Mettl21a (ENSNGAG00000013752)	Creb1 (ENSNGAG00000018967)	Klf7 (ENSNGAG00000016561)	Fastkd2 (ENSNGAG00000001279)	Mdh1b (ENSNGAG00000000139)	Adam23 (ENSNGAG00000014933)	Zdbf2 (ENSNGAG00000010826)	Cmklr2 (ENSNGAG00000014936)	Eef1b2 (ENSNGAG00000020801)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	52	Spag16 (ENSJJAG00000000768)	Ikzf2 (ENSJJAG00000015254)	Erbb4 (ENSJJAG00000021464)	ENSJJAG00000013028	ENSJJAG00000008457	Cps1 (ENSJJAG00000023728)	Lancl1 (ENSJJAG00000005677)	Myl1 (ENSJJAG00000000461)	Acadl (ENSJJAG00000021820)	Kansl1l (ENSJJAG00000020367)	ENSJJAG00000012686	Unc80 (ENSJJAG00000015201)	Map2 (ENSJJAG00000014034)	Pth2r (ENSJJAG00000009843)	Pikfyve (ENSJJAG00000019036) #21	Idh1 (ENSJJAG00000018017) #22	D630023F18Rik (ENSJJAG00000011180) #23	Cryga (ENSJJAG00000018493) #24	ENSJJAG00000013715 ##24	Crygc (ENSJJAG00000023810)	Crygd (ENSJJAG00000014362)	ENSJJAG00000021625	Plekhm3 (ENSJJAG00000012116) #26	Fzd5 (ENSJJAG00000004014)	Ccnyl1 (ENSJJAG00000024111)	ENSJJAG00000023618	Creb1 (ENSJJAG00000013846)	Klf7 (ENSJJAG00000011480)	ENSJJAG00000021742	Fastkd2 (ENSJJAG00000000986)	Mdh1b (ENSJJAG00000010713)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	320	Erbb4 (ENSDORG00000013025)	Cps1 (ENSDORG00000007835)	Lancl1 (ENSDORG00000009233)	Myl1 (ENSDORG00000027836)	ENSDORG00000024057	Acadl (ENSDORG00000005849)	Kansl1l (ENSDORG00000005847)	Rpe (ENSDORG00000005846)	Unc80 (ENSDORG00000005840)	Map2 (ENSDORG00000005837)	ENSDORG00000014386	ENSDORG00000029050	ENSDORG00000028731	Pth2r (ENSDORG00000005747)	Pikfyve (ENSDORG00000005745) #21	Idh1 (ENSDORG00000005744) #22	ENSDORG00000003879 #23	Cryga (ENSDORG00000028587) #24	ENSDORG00000023215 #25	Crygc (ENSDORG00000023173)	Crygd (ENSDORG00000003876)	ENSDORG00000027705	Plekhm3 (ENSDORG00000029697) #26	ENSDORG00000023690	Fzd5 (ENSDORG00000027490)	Ccnyl1 (ENSDORG00000009933)	Mettl21a (ENSDORG00000012543)	Creb1 (ENSDORG00000012535)	Klf7 (ENSDORG00000009634)	Fastkd2 (ENSDORG00000011295)	Mdh1b (ENSDORG00000011290)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Hystricomorpha	DUPLICATION
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.c #22	ENSGT00390000012547.b.d #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.c #22
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.c #22
Degu	MODERN SPECIES	57	ENSODEG00000013776	ENSODEG00000008980	CPS1 (ENSODEG00000007917)	ENSODEG00000008576	LANCL1 (ENSODEG00000013138)	MYL1 (ENSODEG00000007814)	ACADL (ENSODEG00000008088)	KANSL1L (ENSODEG00000008832)	ENSODEG00000008423	UNC80 (ENSODEG00000009853)	MAP2 (ENSODEG00000009342)	ENSODEG00000019840	ENSODEG00000019756	PTH2R (ENSODEG00000010800)	PIKFYVE (ENSODEG00000008877) #21	ENSODEG00000009512 #22	C2orf80 (ENSODEG00000009684) #23	CRYGA (ENSODEG00000009878) #24	ENSODEG00000009966 ##24	CRYGC (ENSODEG00000008672)	ENSODEG00000019682	ENSODEG00000019703	PLEKHM3 (ENSODEG00000010028) #26	FZD5 (ENSODEG00000019794)	ENSODEG00000009393	METTL21A (ENSODEG00000009859)	CREB1 (ENSODEG00000010264)	ENSODEG00000009302	ENSODEG00000009956	KLF7 (ENSODEG00000010345)	FASTKD2 (ENSODEG00000009880)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	17	LANCL1 (ENSHGLG00000036257)	MYL1 (ENSHGLG00000048085)	ENSHGLG00000004628	KANSL1L (ENSHGLG00000005747)	ENSHGLG00000008127	ENSHGLG00000018871	ENSHGLG00000009762	ENSHGLG00000044133	ENSHGLG00000008713	ENSHGLG00000037435 ##25	ENSHGLG00000012419	ENSHGLG00000012576	ENSHGLG00000020810	ENSHGLG00000005131	PIKFYVE (ENSHGLG00000005275) #21	IDH1 (ENSHGLG00000006766) #22	ENSHGLG00000047720	ENSHGLG00000036358	C2orf80 (ENSHGLG00000007437) #23	ENSHGLG00000007763 ##24	ENSHGLG00000008764	ENSHGLG00000009451 ##25	ENSHGLG00000017030 #26	ENSHGLG00000003916	ENSHGLG00000003008	ENSHGLG00000007875	ENSHGLG00000009221	PTPDC1 (ENSHGLG00000002865)	ENSHGLG00000003466	ENSHGLG00000048848	ENSHGLG00000048279
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.c #22	ENSGT00390000012547.b.d #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00390000015769.B
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	67	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.d #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00940000158781	ENSGT00940000160642
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.d #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00940000158781	ENSGT00940000160642
Degu	DUPLICATION
Degu	MODERN SPECIES	216															ENSODEG00000002756	ENSODEG00000002722 #22	ENSODEG00000002633	PCDH9 (ENSODEG00000002576)	ENSODEG00000018812
Degu	MODERN SPECIES	71	ENSODEG00000007585	LRRN1 (ENSODEG00000007430)	ENSODEG00000006737	ENSODEG00000008720	TRNT1 (ENSODEG00000007597)	IL5RA (ENSODEG00000006715)	CNTN4 (ENSODEG00000007155)	CNTN6 (ENSODEG00000006499)	ENSODEG00000007284	ENSODEG00000019383	CHL1 (ENSODEG00000010169)	ENSODEG00000019392	CNTN3 (ENSODEG00000006512)	PDZRN3 (ENSODEG00000008618)	ENSODEG00000006984	ENSODEG00000006618 #22	ENSODEG00000007939	ENSODEG00000007497	ENSODEG00000019359	GXYLT2 (ENSODEG00000008178)	SHQ1 (ENSODEG00000009192)	RYBP (ENSODEG00000008699)	PROK2 (ENSODEG00000007144)	GPR27 (ENSODEG00000006497)	EIF4E3 (ENSODEG00000006191)	FOXP1 (ENSODEG00000007047)	MDFIC2 (ENSODEG00000006638)	MITF (ENSODEG00000009287)	ENSODEG00000006902	FRMD4B (ENSODEG00000005588)	LMOD3 (ENSODEG00000005409)
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	164	VWC2L (ENSCLAG00000004321)	ENSCLAG00000004744	IKZF2 (ENSCLAG00000003632)	ERBB4 (ENSCLAG00000006948)	CPS1 (ENSCLAG00000003104)	LANCL1 (ENSCLAG00000005272)	MYL1 (ENSCLAG00000004096)	ACADL (ENSCLAG00000004230)	KANSL1L (ENSCLAG00000005749)	ENSCLAG00000003444	UNC80 (ENSCLAG00000004587)	MAP2 (ENSCLAG00000003473)	ENSCLAG00000003083	PTH2R (ENSCLAG00000003358)	PIKFYVE (ENSCLAG00000005225) #21	IDH1 (ENSCLAG00000013186) #22	C2orf80 (ENSCLAG00000012137) #23	CRYGA (ENSCLAG00000013039) #24	ENSCLAG00000010298 ##24	CRYGC (ENSCLAG00000010342)	PLEKHM3 (ENSCLAG00000010825) #26	FZD5 (ENSCLAG00000008821)	ENSCLAG00000004502	ENSCLAG00000005432	METTL21A (ENSCLAG00000005572)	CREB1 (ENSCLAG00000005853)	KLF7 (ENSCLAG00000006083)	FASTKD2 (ENSCLAG00000007036)	MDH1B (ENSCLAG00000003385)	DYTN (ENSCLAG00000003705)	ADAM23 (ENSCLAG00000004674)
Guinea pig	MODERN SPECIES	13	BARD1 (ENSCPOG00000011499)	VWC2L (ENSCPOG00000013515)	IKZF2 (ENSCPOG00000013506)	ERBB4 (ENSCPOG00000011232)	ENSCPOG00000035740	CPS1 (ENSCPOG00000004146)	LANCL1 (ENSCPOG00000009439)	MYL1 (ENSCPOG00000009446)	ACADL (ENSCPOG00000009871)	KANSL1L (ENSCPOG00000001503)	ENSCPOG00000001502	UNC80 (ENSCPOG00000008641)	ENSCPOG00000040677	PTH2R (ENSCPOG00000027198)	PIKFYVE (ENSCPOG00000003863) #21	IDH1 (ENSCPOG00000013587) #22	C2orf80 (ENSCPOG00000015050) #23	CRYGA (ENSCPOG00000015047) #24	ENSCPOG00000022025 ##24	CRYGC (ENSCPOG00000000186)	PLEKHM3 (ENSCPOG00000004119) #26	FZD5 (ENSCPOG00000038146)	ENSCPOG00000035156	METTL21A (ENSCPOG00000034803)	CREB1 (ENSCPOG00000010778)	KLF7 (ENSCPOG00000009080)	FASTKD2 (ENSCPOG00000005624)	MDH1B (ENSCPOG00000005608)	ADAM23 (ENSCPOG00000005871)	EEF1B2 (ENSCPOG00000014496)	NDUFS1 (ENSCPOG00000005555)
Naked mole-rat female	DUPLICATION
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES		ENSHGLG00000021037	ENSHGLG00000020868	ENSHGLG00000019647	ENSHGLG00000044369	ENSHGLG00000044639	ENSHGLG00000042688	ENSHGLG00000019680	ENSHGLG00000020888	ENSHGLG00000034476	ENSHGLG00000041081	ENSHGLG00000018891	ENSHGLG00000032616	ENSHGLG00000035640	ENSHGLG00000045321	ENSHGLG00000042358	ENSHGLG00000000746 #22	ENSHGLG00000020121	ENSHGLG00000032106	ENSHGLG00000041333	ENSHGLG00000044343	ENSHGLG00000035030	ENSHGLG00000019642	ENSHGLG00000009764	ENSHGLG00000036657	ENSHGLG00000044549	ENSHGLG00000000510	ENSHGLG00000019985	ENSHGLG00000046356	ENSHGLG00000009234	ENSHGLG00000043662	ENSHGLG00000041448
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	23	EGR4 (ENSHGLG00000009021)	FBXO41 (ENSHGLG00000010102)	CCT7 (ENSHGLG00000011761)	PRADC1 (ENSHGLG00000015353)	SMYD5 (ENSHGLG00000015439)	RAB11FIP5 (ENSHGLG00000016021)	SFXN5 (ENSHGLG00000007851)	EMX1 (ENSHGLG00000036309)	SPR (ENSHGLG00000041182)	ENSHGLG00000006121	ENSHGLG00000040821	ENSHGLG00000032593	ENSHGLG00000039406	EXOC6B (ENSHGLG00000011639)	CYP26B1 (ENSHGLG00000016604)	ENSHGLG00000043383 #22	DYSF (ENSHGLG00000007256)	ZNF638 (ENSHGLG00000015789)	ENSHGLG00000050708	ENSHGLG00000039175	ENSHGLG00000015917	TEX261 (ENSHGLG00000047338)	ANKRD53 (ENSHGLG00000015981)	ATP6V1B1 (ENSHGLG00000034993)	VAX2 (ENSHGLG00000038768)	CD207 (ENSHGLG00000017278)	CLEC4F (ENSHGLG00000015223)	FIGLA (ENSHGLG00000015232)	ADD2 (ENSHGLG00000015246)	TGFA (ENSHGLG00000006181)	FAM136A (ENSHGLG00000043927)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000163272.a.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000163272.a.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403
Alpin marmot	MODERN SPECIES	8	IKZF2 (ENSMMMG00000016182)	ENSMMMG00000016161	ENSMMMG00000016149	ENSMMMG00000016133	CPS1 (ENSMMMG00000016097)	LANCL1 (ENSMMMG00000016069)	MYL1 (ENSMMMG00000016062)	ACADL (ENSMMMG00000015744)	KANSL1L (ENSMMMG00000015671)	ENSMMMG00000015656	UNC80 (ENSMMMG00000015490)	MAP2 (ENSMMMG00000015268)	ENSMMMG00000015249	PTH2R (ENSMMMG00000015216)	PIKFYVE (ENSMMMG00000015121) #21	IDH1 (ENSMMMG00000015109) #22	C2orf80 (ENSMMMG00000015100) #23	CRYGB (ENSMMMG00000015095)	CRYGC (ENSMMMG00000015089)	ENSMMMG00000015075	PLEKHM3 (ENSMMMG00000015063) #26	ENSMMMG00000015050	CCNYL1 (ENSMMMG00000015025)	METTL21A (ENSMMMG00000015010)	CREB1 (ENSMMMG00000014914)	KLF7 (ENSMMMG00000014897)	CPO (ENSMMMG00000014874)	FASTKD2 (ENSMMMG00000014857)	MDH1B (ENSMMMG00000014852)	ENSMMMG00000014844	DYTN (ENSMMMG00000014828)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	274														ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000158720.c.a ##25
Squirrel	MODERN SPECIES	533														PTH2R (ENSSTOG00000012785)	PIKFYVE (ENSSTOG00000023868) #21	IDH1 (ENSSTOG00000033564) #22	C2orf80 (ENSSTOG00000008303) #23	CRYGA (ENSSTOG00000032300) #24	ENSSTOG00000003676	ENSSTOG00000033162
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	12	MYL1 (ENSSVLG00005005436)	ENSSVLG00005005403	HNRNPA2B1 (ENSSVLG00005005387)	ACADL (ENSSVLG00005005352)	KANSL1L (ENSSVLG00005005286)	ENSSVLG00005005150	ENSSVLG00005005077	UNC80 (ENSSVLG00005004348)	MAP2 (ENSSVLG00005003888)	ENSSVLG00005003797	ENSSVLG00005003780	ENSSVLG00005003758	ENSSVLG00005003733	PTH2R (ENSSVLG00005003700)	PIKFYVE (ENSSVLG00005003549) #21	IDH1 (ENSSVLG00005003436) #22	C2orf80 (ENSSVLG00005003394) #23	CRYGA (ENSSVLG00005003355) #24	CRYGB (ENSSVLG00005003340)	CRYGC (ENSSVLG00005003325)	CRYGD (ENSSVLG00005003312) ##25	ENSSVLG00005003302	ENSSVLG00005003291	PLEKHM3 (ENSSVLG00005003272) #26	FZD5 (ENSSVLG00005003258)	ENSSVLG00005003181	METTL21A (ENSSVLG00005003134)	CREB1 (ENSSVLG00005003093)	KLF7 (ENSSVLG00005003049)	CPO (ENSSVLG00005003015)	FASTKD2 (ENSSVLG00005002985)
Tree shrew	MODERN SPECIES	4678												ENSTBEG00000006254	ENSTBEG00000006024	ENSTBEG00000004425	PIKFYVE (ENSTBEG00000001303) #21	IDH1 (ENSTBEG00000000608) #22	C2orf80 (ENSTBEG00000008565) #23	CRYGA (ENSTBEG00000008413) #24	ENSTBEG00000008279 ##24	CRYGC (ENSTBEG00000008131)	ENSTBEG00000007887
Primates	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	847		ENSPCOG00000027398	CPS1 (ENSPCOG00000021968)	ENSPCOG00000028314	LANCL1 (ENSPCOG00000008331)	MYL1 (ENSPCOG00000018716)	ENSPCOG00000026981	ACADL (ENSPCOG00000021470)	KANSL1L (ENSPCOG00000012542)	ENSPCOG00000017484	UNC80 (ENSPCOG00000028748)	MAP2 (ENSPCOG00000020566)	PTH2R (ENSPCOG00000016298)	ENSPCOG00000014595	PIKFYVE (ENSPCOG00000021844) #21	IDH1 (ENSPCOG00000021282) #22	C2orf80 (ENSPCOG00000013784) #23	CRYGA (ENSPCOG00000028701) #24	ENSPCOG00000022043 ##24	CRYGC (ENSPCOG00000004093)	ENSPCOG00000017843 ##25	PLEKHM3 (ENSPCOG00000024736) #26	FZD5 (ENSPCOG00000011393)	ENSPCOG00000013286	METTL21A (ENSPCOG00000018442)	CREB1 (ENSPCOG00000021255)	KLF7 (ENSPCOG00000018231)	CPO (ENSPCOG00000028646)	FASTKD2 (ENSPCOG00000028714)	MDH1B (ENSPCOG00000017083)	DYTN (ENSPCOG00000020018)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	72											DTHD1 (ENSPSMG00000008279)	ARAP2 (ENSPSMG00000008166)	ENSPSMG00000008115 ##25	PTH2R (ENSPSMG00000008108)	PIKFYVE (ENSPSMG00000008024) #21	IDH1 (ENSPSMG00000007840) #22	C2orf80 (ENSPSMG00000007808) #23	CRYGA (ENSPSMG00000007753) #24	ENSPSMG00000007746 ##24	CRYGC (ENSPSMG00000007741)	CRYGD (ENSPSMG00000007725) ##25	ENSPSMG00000007717 ##25	PLEKHM3 (ENSPSMG00000007709) #26	ENSPSMG00000007677	FZD5 (ENSPSMG00000007673)	ENSPSMG00000007649	METTL21A (ENSPSMG00000007593)	KLF7 (ENSPSMG00000007540)	CPO (ENSPSMG00000007503)	FASTKD2 (ENSPSMG00000007493)	MDH1B (ENSPSMG00000007477)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	30	ATIC (ENSMICG00000014573)	IKZF2 (ENSMICG00000013862)	ENSMICG00000037305	ERBB4 (ENSMICG00000036699)	CPS1 (ENSMICG00000010886)	LANCL1 (ENSMICG00000033807)	MYL1 (ENSMICG00000010008)	ACADL (ENSMICG00000009991)	KANSL1L (ENSMICG00000009963)	ENSMICG00000009953	UNC80 (ENSMICG00000009921)	MAP2 (ENSMICG00000009887)	ENSMICG00000045866 ##25	PTH2R (ENSMICG00000029711)	PIKFYVE (ENSMICG00000009805) #21	IDH1 (ENSMICG00000031243) #22	C2orf80 (ENSMICG00000009794) #23	CRYGA (ENSMICG00000045154) #24	ENSMICG00000033287 ##24	CRYGC (ENSMICG00000037493)	CRYGD (ENSMICG00000043795) ##25	ENSMICG00000045926 ##25	PLEKHM3 (ENSMICG00000009771) #26	FZD5 (ENSMICG00000044967)	ENSMICG00000009744	METTL21A (ENSMICG00000009739)	CREB1 (ENSMICG00000009731)	KLF7 (ENSMICG00000037405)	CPO (ENSMICG00000015370)	FASTKD2 (ENSMICG00000026515)	MDH1B (ENSMICG00000009487)
Bushbaby	MODERN SPECIES	128	IKZF2 (ENSOGAG00000016680)	ENSOGAG00000010768	ENSOGAG00000028178	CPS1 (ENSOGAG00000005623)	LANCL1 (ENSOGAG00000005620)	MYL1 (ENSOGAG00000009848)	ENSOGAG00000027184	ACADL (ENSOGAG00000009844)	KANSL1L (ENSOGAG00000002780)	ENSOGAG00000002778	UNC80 (ENSOGAG00000002771)	ENSOGAG00000025605	ENSOGAG00000024989 ##25	PTH2R (ENSOGAG00000007106)	PIKFYVE (ENSOGAG00000014853) #21	IDH1 (ENSOGAG00000014848) #22	C2orf80 (ENSOGAG00000014847) #23	ENSOGAG00000014842 ##24	CRYGC (ENSOGAG00000014846)	CRYGD (ENSOGAG00000025720) ##25	ENSOGAG00000031316 ##25	ENSOGAG00000031869	PLEKHM3 (ENSOGAG00000003678) #26	FZD5 (ENSOGAG00000003677)	ENSOGAG00000003673	METTL21A (ENSOGAG00000007128)	CREB1 (ENSOGAG00000007121)	KLF7 (ENSOGAG00000017014)	CPO (ENSOGAG00000017012)	FASTKD2 (ENSOGAG00000017008)	MDH1B (ENSOGAG00000017006)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Tarsier	MODERN SPECIES	5159																IDH1 (ENSTSYG00000006696) #22	C2orf80 (ENSTSYG00000012358) #23	CRYGA (ENSTSYG00000011561) #24	ENSTSYG00000032161 ##24	ENSTSYG00000012485	PLEKHM3 (ENSTSYG00000027719) #26
Simiiformes	DUPLICATION
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.a #22
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.a #22
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.a #22
Gibbon	MODERN SPECIES	11	XRCC4 (ENSNLEG00000013239)	TMEM167A (ENSNLEG00000013231)	ENSNLEG00000027406	ENSNLEG00000013214	RPS23 (ENSNLEG00000013203)	ATG10 (ENSNLEG00000013189)	SSBP2 (ENSNLEG00000013116)	ACOT12 (ENSNLEG00000013095)	ZCCHC9 (ENSNLEG00000029214)	CKMT2 (ENSNLEG00000013077)	RASGRF2 (ENSNLEG00000013038)	ENSNLEG00000030277	MSH3 (ENSNLEG00000012994)	ENSNLEG00000012989	FAM151B (ENSNLEG00000012975)	ENSNLEG00000034030 #22	ZFYVE16 (ENSNLEG00000012945)	ENSNLEG00000018598	ENSNLEG00000033746	SPZ1 (ENSNLEG00000018597)	ENSNLEG00000012943	SERINC5 (ENSNLEG00000012931)	THBS4 (ENSNLEG00000012916)	ENSNLEG00000012915	CMYA5 (ENSNLEG00000012895)	TENT2 (ENSNLEG00000027224)	HOMER1 (ENSNLEG00000012860)	JMY (ENSNLEG00000012852)	BHMT (ENSNLEG00000012840)	BHMT2 (ENSNLEG00000012819)	DMGDH (ENSNLEG00000012801)
Simiiformes	DUPLICATION
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.b.a #22
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00910000147691	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249.d	ENSGT00940000157249.c	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.a
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157295	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000156150.f.a	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249.c	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.a
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157295	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000156150.f.a	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249.c	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.a
Capuchin	MODERN SPECIES	191					CPS1 (ENSCCAG00000027521)	ENSCCAG00000034724	LANCL1 (ENSCCAG00000028325)	MYL1 (ENSCCAG00000034680)	ENSCCAG00000036882	KANSL1L (ENSCCAG00000037601)	ENSCCAG00000033448	UNC80 (ENSCCAG00000025606)	MAP2 (ENSCCAG00000038055)	PTH2R (ENSCCAG00000036728)	PIKFYVE (ENSCCAG00000026780) #21	ENSCCAG00000000173 #22	ENSCCAG00000035005	C2orf80 (ENSCCAG00000021479) #23	CRYGA (ENSCCAG00000028117) #24	ENSCCAG00000028787 ##24	CRYGC (ENSCCAG00000033759)	CRYGD (ENSCCAG00000034553) ##25	ENSCCAG00000037061 ##25	PLEKHM3 (ENSCCAG00000019609) #26	ENSCCAG00000030735	FZD5 (ENSCCAG00000011362)	CCNYL1 (ENSCCAG00000037301)	METTL21A (ENSCCAG00000027925)	CREB1 (ENSCCAG00000024700)	ENSCCAG00000033506	CPO (ENSCCAG00000029100)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	56	BARD1 (ENSSBOG00000024817)	VWC2L (ENSSBOG00000027487)	SPAG16 (ENSSBOG00000028079)	IKZF2 (ENSSBOG00000020703)	ERBB4 (ENSSBOG00000030062)	CPS1 (ENSSBOG00000001070)	LANCL1 (ENSSBOG00000020922)	MYL1 (ENSSBOG00000033791)	KANSL1L (ENSSBOG00000033776)	ENSSBOG00000019098	UNC80 (ENSSBOG00000036149)	MAP2 (ENSSBOG00000036242)	ENSSBOG00000025322	PTH2R (ENSSBOG00000022880)	PIKFYVE (ENSSBOG00000031867) #21	ENSSBOG00000025738 #22	C2orf80 (ENSSBOG00000020763) #23	CRYGA (ENSSBOG00000026091) #24	CRYGB (ENSSBOG00000023184)	CRYGC (ENSSBOG00000026600)	ENSSBOG00000020159 ##25	PLEKHM3 (ENSSBOG00000027559) #26	ENSSBOG00000031757	CCNYL1 (ENSSBOG00000034567)	ENSSBOG00000033378	CREB1 (ENSSBOG00000034085)	ENSSBOG00000018885	ENSSBOG00000027628	CPO (ENSSBOG00000030310)	FASTKD2 (ENSSBOG00000029513)	MDH1B (ENSSBOG00000029880)
Marmoset	MODERN SPECIES	18	ENSCJAG00000010822	UNC80 (ENSCJAG00000010773)	MAP2 (ENSCJAG00000010689)	ENSCJAG00000010676	ENSCJAG00000082683	ENSCJAG00000075881	ENSCJAG00000071851	ENSCJAG00000002713	ENSCJAG00000041460	ENSCJAG00000079485	ENSCJAG00000060037	ENSCJAG00000038285	PTH2R (ENSCJAG00000002754)	PIKFYVE (ENSCJAG00000002759) #21	ENSCJAG00000075032	ENSCJAG00000002828 #22	ENSCJAG00000022999	ENSCJAG00000002855	ENSCJAG00000077681	ENSCJAG00000080445 ##25	ENSCJAG00000073032	PLEKHM3 (ENSCJAG00000002896) #26	FZD5 (ENSCJAG00000022490)	CCNYL1 (ENSCJAG00000002901)	METTL21A (ENSCJAG00000006072)	ENSCJAG00000086572	CREB1 (ENSCJAG00000006039)	ENSCJAG00000006023	CPO (ENSCJAG00000005991)	ENSCJAG00000073541	FASTKD2 (ENSCJAG00000005971)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	357	SPAG16 (ENSANAG00000021194)	IKZF2 (ENSANAG00000020083)	ERBB4 (ENSANAG00000034026)	CPS1 (ENSANAG00000036815)	ENSANAG00000036535	ENSANAG00000033281	MYL1 (ENSANAG00000032098)	ACADL (ENSANAG00000034362)	KANSL1L (ENSANAG00000028662)	ENSANAG00000021491	UNC80 (ENSANAG00000022890)	MAP2 (ENSANAG00000031569)	ENSANAG00000036032	PTH2R (ENSANAG00000026937)	PIKFYVE (ENSANAG00000034773) #21	ENSANAG00000029087 #22	ENSANAG00000033767	C2orf80 (ENSANAG00000021366) #23	CRYGA (ENSANAG00000020661) #24	CRYGB (ENSANAG00000001941)	CRYGC (ENSANAG00000035987)	CRYGD (ENSANAG00000036850) ##25	ENSANAG00000009967 ##25	PLEKHM3 (ENSANAG00000028108) #26	FZD5 (ENSANAG00000014539)	CCNYL1 (ENSANAG00000020995)	ENSANAG00000020586	CREB1 (ENSANAG00000025888)	KLF7 (ENSANAG00000036279)	CPO (ENSANAG00000023194)	FASTKD2 (ENSANAG00000034550)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000001263	ENSGT00940000163315	ENSGT00940000156849	ENSGT00390000012955.v	ENSGT00950000182848.c.b.a.a	ENSGT00940000163455	ENSGT00940000163681	ENSGT00940000157040	ENSGT00390000003564	ENSGT00390000016974	ENSGT00940000154703.e.a	ENSGT00940000156920	ENSGT00940000158768	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000154843.F	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000157075	ENSGT00390000001805	ENSGT00400000022103.a	ENSGT00940000157533	ENSGT00390000018605	ENSGT01050000244939.a.a.a	ENSGT00530000063853.a.a.b	ENSGT00940000158071	ENSGT00940000157289.a	ENSGT00940000163747	ENSGT00390000014167	ENSGT00940000155106	ENSGT00910000147523	ENSGT00940000155105	ENSGT00390000008360
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154772	ENSGT00390000001263	ENSGT00940000163315	ENSGT00940000156849	ENSGT00390000012955.v	ENSGT00950000182848.c.b.a.a	ENSGT00940000163455	ENSGT00940000157040	ENSGT00390000003564	ENSGT00390000016974	ENSGT00940000154703.e.a	ENSGT00940000156920	ENSGT00940000158768	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000154843.F	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000157075	ENSGT00390000001805	ENSGT00400000022103.a	ENSGT00940000157533	ENSGT00390000018605	ENSGT01050000244939.a.a.a	ENSGT00530000063853.a.a.b	ENSGT00940000158071	ENSGT00940000157289.a	ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.b.b.b	ENSGT00910000146968	ENSGT00940000169445	ENSGT00940000163747	ENSGT00390000014167	ENSGT00940000155106
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154772	ENSGT00390000001263	ENSGT00940000163315	ENSGT00940000156849	ENSGT00390000012955.v	ENSGT00950000182848.c.b.a.a	ENSGT00940000163455	ENSGT00940000157040	ENSGT00390000003564	ENSGT00390000016974	ENSGT00940000154703.e.a	ENSGT00940000156920	ENSGT00940000158768	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000154843.F	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000157075	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.s.a.a	ENSGT00390000001805	ENSGT00400000022103.a	ENSGT00940000157533	ENSGT00390000018605	ENSGT01050000244939.a.a.a	ENSGT00530000063853.a.a.b	ENSGT00940000158071	ENSGT00940000157289.a	ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.b.b.b	ENSGT00910000146968	ENSGT00940000169445	ENSGT00940000163747	ENSGT00390000014167
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154772	ENSGT00390000001263	ENSGT00940000163315	ENSGT00940000156849	ENSGT00390000012955.v	ENSGT00950000182848.c.b.a.a	ENSGT00940000163455	ENSGT00940000157040	ENSGT00390000003564	ENSGT00390000016974	ENSGT00940000154703.e.a	ENSGT00940000156920	ENSGT00940000158768.p	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000154843.F	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000157075	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.s.a.a.a	ENSGT00390000001805	ENSGT00400000022103.a	ENSGT00940000157533	ENSGT00940000153288.a.a.h.d	ENSGT00390000018605	ENSGT01050000244939.a.a.a	ENSGT00530000063853.a.a.b	ENSGT00940000158071	ENSGT00940000157289.a	ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.b.b.b	ENSGT00910000146968	ENSGT00940000169445	ENSGT00940000163747
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000163914.f.a	ENSGT00940000154772	ENSGT00390000001263	ENSGT00940000163315	ENSGT00940000156849	ENSGT00950000182848.c.b.a.a	ENSGT00940000163455	ENSGT00940000157040	ENSGT00390000003564	ENSGT00390000016974	ENSGT00940000154703.e.a	ENSGT00940000156920	ENSGT00940000158768.p	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000154843.F	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000157075	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.s.a.a.a	ENSGT00390000001805	ENSGT00400000022103.a	ENSGT00940000157533	ENSGT00940000153288.a.a.h.d	ENSGT00390000018605	ENSGT01050000244939.a.a.a	ENSGT00530000063853.a.a.b	ENSGT00940000158071	ENSGT00940000157289.a	ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.b.b.b	ENSGT00910000146968	ENSGT00940000169445	ENSGT00940000163747
Pan	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000163914.f.a	ENSGT00940000154772	ENSGT00390000001263	ENSGT00940000163315	ENSGT00940000156849	ENSGT00950000182848.c.b.a.a	ENSGT00940000163455	ENSGT00940000157040	ENSGT00390000003564	ENSGT00390000016974	ENSGT00940000154703.e.a	ENSGT00940000156920	ENSGT00940000158768.p	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000154843.F	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000157075	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.s.a.a.a	ENSGT00390000001805	ENSGT00400000022103.a	ENSGT00940000157533	ENSGT00940000153288.a.a.h.d	ENSGT00390000018605	ENSGT01050000244939.a.a.a	ENSGT00530000063853.a.a.b	ENSGT00390000008859.b.d.k.a.b.a	ENSGT00940000158071	ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.b.b.b	ENSGT00910000146968	ENSGT00940000169445	ENSGT00940000163747
Bonobo	MODERN SPECIES	19	ENSPPAG00000029483	TMEM14C (ENSPPAG00000038469)	PAK1IP1 (ENSPPAG00000027804)	C6orf52 (ENSPPAG00000028663)	GCNT2 (ENSPPAG00000041367)	ENSPPAG00000043300	ENSPPAG00000042636	SLC35B3 (ENSPPAG00000039344)	EEF1E1 (ENSPPAG00000035045)	BLOC1S5 (ENSPPAG00000027769)	ENSPPAG00000043373	TXNDC5 (ENSPPAG00000038633)	BMP6 (ENSPPAG00000002110)	SNRNP48 (ENSPPAG00000032873)	DSP (ENSPPAG00000031494)	ENSPPAG00000041327 #22	RIOK1 (ENSPPAG00000016349)	ENSPPAG00000039573	CAGE1 (ENSPPAG00000033711)	SSR1 (ENSPPAG00000031246)	RREB1 (ENSPPAG00000037017)	ENSPPAG00000041064	LY86 (ENSPPAG00000032346)	F13A1 (ENSPPAG00000002226)	ENSPPAG00000040029	ENSPPAG00000037456	ENSPPAG00000038177	FARS2 (ENSPPAG00000040551)	ENSPPAG00000028919	ENSPPAG00000009976	ENSPPAG00000035824
Chimpanzee	MODERN SPECIES	19	TMEM14B (ENSPTRG00000017721)	TMEM14C (ENSPTRG00000017720)	PAK1IP1 (ENSPTRG00000017719)	C6H6orf52 (ENSPTRG00000017718)	GCNT2 (ENSPTRG00000017717)	TFAP2A (ENSPTRG00000017714)	ENSPTRG00000017711	SLC35B3 (ENSPTRG00000017710)	EEF1E1 (ENSPTRG00000017709)	BLOC1S5 (ENSPTRG00000048795)	ENSPTRG00000044939	TXNDC5 (ENSPTRG00000017708)	BMP6 (ENSPTRG00000017705)	SNRNP48 (ENSPTRG00000017703)	DSP (ENSPTRG00000017702)	ENSPTRG00000050048 #22	RIOK1 (ENSPTRG00000017700)	ENSPTRG00000047374	CAGE1 (ENSPTRG00000017699)	SSR1 (ENSPTRG00000017698)	RREB1 (ENSPTRG00000017697)	ENSPTRG00000046122	LY86 (ENSPTRG00000017696)	F13A1 (ENSPTRG00000017694)	NRN1 (ENSPTRG00000017693)	ENSPTRG00000044064	ENSPTRG00000049807	FARS2 (ENSPTRG00000017692)	LYRM4 (ENSPTRG00000017691)	ENSPTRG00000049487	ENSPTRG00000045800
Gorilla	MODERN SPECIES	19	TMEM14C (ENSGGOG00000016952)	PAK1IP1 (ENSGGOG00000013026)	C6orf52 (ENSGGOG00000013899)	ENSGGOG00000004765	ENSGGOG00000013682	TFAP2A (ENSGGOG00000007542)	ENSGGOG00000006522	SLC35B3 (ENSGGOG00000011511)	ENSGGOG00000009591	BLOC1S5 (ENSGGOG00000040405)	ENSGGOG00000026610	TXNDC5 (ENSGGOG00000000906)	BMP6 (ENSGGOG00000000904)	SNRNP48 (ENSGGOG00000013220)	DSP (ENSGGOG00000013213)	ENSGGOG00000040077 #22	RIOK1 (ENSGGOG00000011037)	ENSGGOG00000022405	ENSGGOG00000038504	CAGE1 (ENSGGOG00000011030)	SSR1 (ENSGGOG00000004566)	RREB1 (ENSGGOG00000004561)	ENSGGOG00000022862	LY86 (ENSGGOG00000024223)	F13A1 (ENSGGOG00000001196)	ENSGGOG00000005223	ENSGGOG00000024909	ENSGGOG00000039665	FARS2 (ENSGGOG00000011842)	ENSGGOG00000041108	ENSGGOG00000034970
Gibbon	MODERN SPECIES	23	TMEM14C (ENSNLEG00000000564)	PAK1IP1 (ENSNLEG00000000550)	C6orf52 (ENSNLEG00000000544)	ENSNLEG00000000512	ENSNLEG00000028993	TFAP2A (ENSNLEG00000000503)	ENSNLEG00000000485	SLC35B3 (ENSNLEG00000030754)	EEF1E1 (ENSNLEG00000035609)	BLOC1S5 (ENSNLEG00000029882)	ENSNLEG00000027984	TXNDC5 (ENSNLEG00000011683)	ENSNLEG00000011672	SNRNP48 (ENSNLEG00000011667)	DSP (ENSNLEG00000011664)	ENSNLEG00000029272 #22	ENSNLEG00000011621	ENSNLEG00000027842	ENSNLEG00000027260	ENSNLEG00000032024	CAGE1 (ENSNLEG00000011592)	SSR1 (ENSNLEG00000011572)	RREB1 (ENSNLEG00000011554)	LY86 (ENSNLEG00000011547)	F13A1 (ENSNLEG00000011509)	NRN1 (ENSNLEG00000011502)	FARS2 (ENSNLEG00000011479)	ENSNLEG00000030412	ENSNLEG00000011472	ENSNLEG00000028872	PPP1R3G (ENSNLEG00000018873)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000001263	ENSGT00940000163315	ENSGT00940000156849	ENSGT00390000012955.v	ENSGT00950000182848.c.b.a.a	ENSGT00940000163455	ENSGT00940000163681	ENSGT00940000157040	ENSGT00390000003564	ENSGT00390000016974	ENSGT00940000154703.e.a	ENSGT00940000156920	ENSGT00940000158768	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000154843.F	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000157075	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.t	ENSGT00390000001805	ENSGT00400000022103.a	ENSGT00940000157533	ENSGT00390000018605	ENSGT01050000244939.a.a.a	ENSGT00530000063853.a.a.b	ENSGT00940000158071	ENSGT00940000157289.a	ENSGT00940000163747	ENSGT00390000014167	ENSGT00940000155106	ENSGT00910000147523	ENSGT00940000155105
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	271								ENSGT00940000157040	ENSGT00390000003564.j	ENSGT00390000016974	ENSGT00940000154703.e.a	ENSGT00940000156920	ENSGT00940000158768	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000154843.F	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000157075	ENSGT00390000001805	ENSGT00400000022103.a	ENSGT00940000157533	ENSGT00390000018605	ENSGT01050000244939.a.a.a	ENSGT00530000063853.a.a.b	ENSGT00940000158071	ENSGT00940000157289.a	ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.a.a.a.b	ENSGT00910000146968	ENSGT00950000183142.a.b.a.b.p
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	623								SLC35B3 (ENSRBIG00000031147)	ENSRBIG00000033472	BLOC1S5 (ENSRBIG00000037450)	ENSRBIG00000036820	TXNDC5 (ENSRBIG00000028339)	BMP6 (ENSRBIG00000030865)	SNRNP48 (ENSRBIG00000043856)	DSP (ENSRBIG00000040544)	ENSRBIG00000004417 #22	RIOK1 (ENSRBIG00000036685)	ENSRBIG00000033623	CAGE1 (ENSRBIG00000033392)	SSR1 (ENSRBIG00000028076)	TCF21 (ENSRBIG00000032927)	EYA4 (ENSRBIG00000023700)	RPS12 (ENSRBIG00000029886)	SLC18B1 (ENSRBIG00000006237)	VNN2 (ENSRBIG00000036583)	ENSRBIG00000044983	VNN1 (ENSRBIG00000036270)	TAAR2 (ENSRBIG00000038395)	TAAR5 (ENSRBIG00000003009)	TAAR6 (ENSRBIG00000033492)	TAAR9 (ENSRBIG00000040722)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2293								SLC35B3 (ENSRROG00000042188)	ENSRROG00000034778	BLOC1S5 (ENSRROG00000043572)	ENSRROG00000043599	TXNDC5 (ENSRROG00000032967)	BMP6 (ENSRROG00000032319)	SNRNP48 (ENSRROG00000043229)	DSP (ENSRROG00000038096)	ENSRROG00000039689 #22	RIOK1 (ENSRROG00000036611)	CAGE1 (ENSRROG00000044698)	ENSRROG00000037141	SSR1 (ENSRROG00000035450)	RREB1 (ENSRROG00000039603)	LY86 (ENSRROG00000002665)
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000001263	ENSGT00940000163315	ENSGT00940000156849	ENSGT00390000012955.v	ENSGT00950000182848.c.b.a.a	ENSGT00940000163455	ENSGT00940000163681	ENSGT00940000157040	ENSGT00390000003564	ENSGT00390000016974	ENSGT00940000154703.e.a	ENSGT00940000156920	ENSGT00940000158768	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000154843.F	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000157075	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.t	ENSGT00390000001805	ENSGT00400000022103.a	ENSGT00940000157533	ENSGT00390000018605	ENSGT01050000244939.a.a.a	ENSGT00530000063853.a.a.b	ENSGT00940000158071	ENSGT00940000157289.a	ENSGT00940000163747	ENSGT00390000014167	ENSGT00940000155106	ENSGT00910000147523	ENSGT00940000155105
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000001263	ENSGT00910000146788	ENSGT00940000163315	ENSGT00940000156849	ENSGT00390000012955.v	ENSGT00950000182848.c.b.a.a	ENSGT00940000163455	ENSGT00940000157040	ENSGT00390000003564	ENSGT00390000016974	ENSGT00940000154703.e.a	ENSGT00940000156920	ENSGT00940000158768	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000154843.F	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000157075	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.t.i	ENSGT00390000001805	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.t.h.a	ENSGT00400000022103.a	ENSGT00940000157533	ENSGT00390000018605	ENSGT01050000244939.a.a.a	ENSGT00530000063853.a.a.b	ENSGT00940000158071	ENSGT00940000157289.a	ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00910000146968	ENSGT00950000183142.a.b.a.b.p	ENSGT00910000147352
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00390000001263	ENSGT00910000146788	ENSGT00940000163315	ENSGT00940000156849	ENSGT00390000012955.v	ENSGT00950000182848.c.b.a.a	ENSGT00940000163455	ENSGT00940000157040	ENSGT00390000003564	ENSGT00390000016974	ENSGT00940000154703.e.a	ENSGT00940000156920	ENSGT00940000158768	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000154843.F	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000157075	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.t.h.a	ENSGT00390000001805	ENSGT00400000022103.a	ENSGT00940000157533	ENSGT00390000018605	ENSGT01050000244939.a.a.a	ENSGT00530000063853.a.a.b	ENSGT00940000158071	ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00910000146968	ENSGT00950000183142.a.b.a.b.p	ENSGT00910000147352	ENSGT00390000014167	ENSGT00940000155106
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00390000001263	ENSGT00910000146788	ENSGT00940000163315	ENSGT00940000156849	ENSGT00390000012955.v	ENSGT00950000182848.c.b.a.a	ENSGT00940000163455	ENSGT00940000157040	ENSGT00390000003564	ENSGT00390000016974	ENSGT00940000154703.e.a	ENSGT00940000156920	ENSGT00940000158768	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000154843.F	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000157075	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.t.h.a	ENSGT00390000001805	ENSGT00400000022103.a	ENSGT00940000157533	ENSGT00390000018605	ENSGT01050000244939.a.a.a	ENSGT00530000063853.a.a.b	ENSGT00940000158071	ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00910000146968	ENSGT00950000183142.a.b.a.b.p	ENSGT00910000147352	ENSGT00390000014167	ENSGT00940000155106
Drill	MODERN SPECIES	1017	ENSMLEG00000043808	C6orf52 (ENSMLEG00000029992)	GCNT2 (ENSMLEG00000041262)	ENSMLEG00000043784	TFAP2A (ENSMLEG00000042408)	ENSMLEG00000032653	SLC35B3 (ENSMLEG00000037638)	EEF1E1 (ENSMLEG00000032511)	BLOC1S5 (ENSMLEG00000033993)	ENSMLEG00000039944	TXNDC5 (ENSMLEG00000041843)	ENSMLEG00000014123	BMP6 (ENSMLEG00000042815)	SNRNP48 (ENSMLEG00000034004)	DSP (ENSMLEG00000041552)	ENSMLEG00000041390 #22	RIOK1 (ENSMLEG00000026327)	ENSMLEG00000032606	CAGE1 (ENSMLEG00000044083)	SSR1 (ENSMLEG00000038033)	RREB1 (ENSMLEG00000040965)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	385	C6orf52 (ENSCATG00000033015)	GCNT2 (ENSCATG00000045362)	ENSCATG00000026811	TFAP2A (ENSCATG00000040906)	ENSCATG00000031464	ENSCATG00000005265	ENSCATG00000036873	SLC35B3 (ENSCATG00000029745)	EEF1E1 (ENSCATG00000038260)	BLOC1S5 (ENSCATG00000043344)	ENSCATG00000039499	TXNDC5 (ENSCATG00000031520)	BMP6 (ENSCATG00000040011)	SNRNP48 (ENSCATG00000033947)	DSP (ENSCATG00000034897)	ENSCATG00000013581 #22	RIOK1 (ENSCATG00000001548)	ENSCATG00000037875	CAGE1 (ENSCATG00000030215)	SSR1 (ENSCATG00000037180)	RREB1 (ENSCATG00000043662)	LY86 (ENSCATG00000038100)	F13A1 (ENSCATG00000043896)	NRN1 (ENSCATG00000043786)	FARS2 (ENSCATG00000038588)	ENSCATG00000035234	ENSCATG00000043081	ENSCATG00000042252	RPP40 (ENSCATG00000038787)	CDYL (ENSCATG00000038624)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00910000146788	ENSGT00940000163315	ENSGT00940000156849	ENSGT00390000012955.v	ENSGT00950000182848.c.b.a.a	ENSGT00940000163455	ENSGT00390000004803.h	ENSGT00940000157040	ENSGT00390000003564	ENSGT00390000016974	ENSGT00940000154703.e.a	ENSGT00940000156920	ENSGT00940000158768	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000154843.F	ENSGT00390000012547.b.b.a #22	ENSGT00940000157075	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.t.i	ENSGT00390000001805	ENSGT00400000022103.a	ENSGT00940000157533	ENSGT00390000018605	ENSGT01050000244939.a.a.a	ENSGT00530000063853.a.a.b	ENSGT00940000158071	ENSGT00940000157289.a	ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00910000146968	ENSGT00950000183142.a.b.a.b.p	ENSGT00910000147352	ENSGT00940000163747
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	136	ENSMNEG00000037658	GCNT2 (ENSMNEG00000036260)	ENSMNEG00000033728	TFAP2A (ENSMNEG00000040025)	ENSMNEG00000044460	ENSMNEG00000037743	SLC35B3 (ENSMNEG00000005122)	EEF1E1 (ENSMNEG00000035493)	BLOC1S5 (ENSMNEG00000002839)	ENSMNEG00000039687	ENSMNEG00000037840	TXNDC5 (ENSMNEG00000032269)	BMP6 (ENSMNEG00000035190)	SNRNP48 (ENSMNEG00000042269)	DSP (ENSMNEG00000040416)	ENSMNEG00000028700 #22	RIOK1 (ENSMNEG00000034396)	ENSMNEG00000034466	CAGE1 (ENSMNEG00000033634)	SSR1 (ENSMNEG00000039105)	RREB1 (ENSMNEG00000038556)	LY86 (ENSMNEG00000045408)	F13A1 (ENSMNEG00000040730)	NRN1 (ENSMNEG00000041129)	FARS2 (ENSMNEG00000044897)	ENSMNEG00000042081	ENSMNEG00000041203	ENSMNEG00000045067	ENSMNEG00000003878	RPP40 (ENSMNEG00000041986)	CDYL (ENSMNEG00000038983)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00910000147691	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000161508
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00910000147691	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00910000147420	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.p.b	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00390000015257.s.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00910000147537	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000161508
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00910000147691	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00910000147420	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.q	ENSGT00390000001447.p.b	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00390000015257.s.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00910000146869	ENSGT00910000147537	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000161508
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.q	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00390000015257.s.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00910000147537	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000161508
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00910000148013	ENSGT00390000001447.p.b	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00390000015257.s.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00910000147537	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000161508
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00910000148013	ENSGT00390000001447.p.b	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00910000147537	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000161508
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.q	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a	ENSGT00960000191503.d	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00910000147537	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	3	IKZF2 (ENSMFAG00000049387)	ENSMFAG00000059453	ENSMFAG00000047331	ERBB4 (ENSMFAG00000042352)	CPS1 (ENSMFAG00000044079)	LANCL1 (ENSMFAG00000041765)	MYL1 (ENSMFAG00000031549)	KANSL1L (ENSMFAG00000031878)	ENSMFAG00000001492	UNC80 (ENSMFAG00000038823)	MAP2 (ENSMFAG00000037191)	ENSMFAG00000040051	ENSMFAG00000049469	PTH2R (ENSMFAG00000000697)	PIKFYVE (ENSMFAG00000041669) #21	IDH1 (ENSMFAG00000037839) #22	C2orf80 (ENSMFAG00000003892) #23	CRYGB (ENSMFAG00000052040)	CRYGC (ENSMFAG00000047676)	CRYGD (ENSMFAG00000052291) ##25	ENSMFAG00000065752 ##25	ENSMFAG00000064501	PLEKHM3 (ENSMFAG00000033450) #26	ENSMFAG00000009381	CCNYL1 (ENSMFAG00000001361)	CREB1 (ENSMFAG00000039629)	ENSMFAG00000041805	KLF7 (ENSMFAG00000039083)	CPO (ENSMFAG00000062349)	FASTKD2 (ENSMFAG00000033471)	ENSMFAG00000049460
Rhesus	MODERN SPECIES	3	IKZF2 (ENSMMUG00000000381)	ENSMMUG00000061342	ENSMMUG00000058114	ERBB4 (ENSMMUG00000001674)	CPS1 (ENSMMUG00000010508)	LANCL1 (ENSMMUG00000054937)	MYL1 (ENSMMUG00000010519)	KANSL1L (ENSMMUG00000010515)	RPE (ENSMMUG00000010513)	UNC80 (ENSMMUG00000002809)	MAP2 (ENSMMUG00000018741)	ENSMMUG00000004941	ENSMMUG00000051180	PTH2R (ENSMMUG00000005295)	PIKFYVE (ENSMMUG00000017524) #21	IDH1 (ENSMMUG00000016077) #22	C12H2orf80 (ENSMMUG00000014299) #23	CRYGA (ENSMMUG00000049611) #24	CRYGB (ENSMMUG00000010871)	CRYGC (ENSMMUG00000056938)	CRYGD (ENSMMUG00000052742) ##25	ENSMMUG00000045625 ##25	ENSMMUG00000059636	ENSMMUG00000060339	PLEKHM3 (ENSMMUG00000008113) #26	FZD5 (ENSMMUG00000057651)	CCNYL1 (ENSMMUG00000020211)	METTL21A (ENSMMUG00000022602)	CREB1 (ENSMMUG00000022601)	KLF7 (ENSMMUG00000000190)	ENSMMUG00000051957
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	409														PTH2R (ENSMNEG00000006024)	PIKFYVE (ENSMNEG00000040785) #21	IDH1 (ENSMNEG00000031883) #22	C2orf80 (ENSMNEG00000043879) #23	CRYGA (ENSMNEG00000041411) #24	ENSMNEG00000035721 ##24	CRYGC (ENSMNEG00000026158)	CRYGD (ENSMNEG00000029162) ##25	ENSMNEG00000037076 ##25	PLEKHM3 (ENSMNEG00000044217) #26	ENSMNEG00000044317	ENSMNEG00000028169	ENSMNEG00000045370	FZD5 (ENSMNEG00000024425)	CCNYL1 (ENSMNEG00000035559)	METTL21A (ENSMNEG00000034465)	CREB1 (ENSMNEG00000030274)	KLF7 (ENSMNEG00000027996)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT00510000046986.n.a.d.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00910000148013	ENSGT00390000001447.p.b	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00390000015257.s.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00910000147161	ENSGT00910000147691	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT00510000046986.n.a.d.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00910000148013	ENSGT00390000001447.p.b	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00390000015257.s.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Drill	MODERN SPECIES	1118														PTH2R (ENSMLEG00000037579)	PIKFYVE (ENSMLEG00000029250) #21	IDH1 (ENSMLEG00000013259) #22	C2orf80 (ENSMLEG00000028047) #23	CRYGA (ENSMLEG00000041636) #24	CRYGB (ENSMLEG00000028601)	CRYGC (ENSMLEG00000044264)	CRYGD (ENSMLEG00000027151) ##25	ENSMLEG00000040026 ##25	PLEKHM3 (ENSMLEG00000029115) #26	ENSMLEG00000039137	ENSMLEG00000039230	CCNYL1 (ENSMLEG00000041254)	METTL21A (ENSMLEG00000028195)	CREB1 (ENSMLEG00000033904)	KLF7 (ENSMLEG00000003421)	CPO (ENSMLEG00000034929)	FASTKD2 (ENSMLEG00000030777)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	570	ERBB4 (ENSCATG00000043272)	ENSCATG00000003304	CPS1 (ENSCATG00000033305)	LANCL1 (ENSCATG00000038900)	ENSCATG00000031803	MYL1 (ENSCATG00000044624)	ACADL (ENSCATG00000041550)	ENSCATG00000006457	KANSL1L (ENSCATG00000043995)	ENSCATG00000043868	UNC80 (ENSCATG00000041534)	MAP2 (ENSCATG00000042916)	ENSCATG00000043850	PTH2R (ENSCATG00000037593)	PIKFYVE (ENSCATG00000033498) #21	IDH1 (ENSCATG00000042214) #22	C2orf80 (ENSCATG00000038326) #23	CRYGA (ENSCATG00000043962) #24	CRYGB (ENSCATG00000038743)	CRYGC (ENSCATG00000036220)	CRYGD (ENSCATG00000037915) ##25	ENSCATG00000036671 ##25	PLEKHM3 (ENSCATG00000036070) #26	ENSCATG00000036323	FZD5 (ENSCATG00000004406)	CCNYL1 (ENSCATG00000037115)	METTL21A (ENSCATG00000041598)	CREB1 (ENSCATG00000037133)	KLF7 (ENSCATG00000041615)	CPO (ENSCATG00000043384)	FASTKD2 (ENSCATG00000038647)
Olive baboon	MODERN SPECIES	1	ENSPANG00000048059	ERBB4 (ENSPANG00000020599)	CPS1 (ENSPANG00000008478)	LANCL1 (ENSPANG00000043351)	ENSPANG00000050010	MYL1 (ENSPANG00000005181)	KANSL1L (ENSPANG00000000746)	ENSPANG00000005182	UNC80 (ENSPANG00000024759)	MAP2 (ENSPANG00000019944)	ENSPANG00000051073	ENSPANG00000039642	PTH2R (ENSPANG00000002436)	PIKFYVE (ENSPANG00000010442) #21	C2orf80 (ENSPANG00000033159) #23	IDH1 (ENSPANG00000005239) #22	CRYGB (ENSPANG00000049951)	CRYGC (ENSPANG00000051332)	CRYGD (ENSPANG00000039491) ##25	ENSPANG00000040505	ENSPANG00000041891 ##25	PLEKHM3 (ENSPANG00000020994) #26	ENSPANG00000049745	ENSPANG00000050051	FZD5 (ENSPANG00000004676)	CCNYL1 (ENSPANG00000011206)	ENSPANG00000050559	ENSPANG00000047863	METTL21A (ENSPANG00000024440)	CREB1 (ENSPANG00000009083)	KLF7 (ENSPANG00000005240)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	1	IKZF2 (ENSCSAG00000009405)	ENSCSAG00000009457	ENSCSAG00000009490	CPS1 (ENSCSAG00000009759)	LANCL1 (ENSCSAG00000009844)	MYL1 (ENSCSAG00000009850)	ACADL (ENSCSAG00000009898)	KANSL1L (ENSCSAG00000009924)	ENSCSAG00000009931	UNC80 (ENSCSAG00000009965)	MAP2 (ENSCSAG00000009974)	ENSCSAG00000009983 ##25	ENSCSAG00000018772	PTH2R (ENSCSAG00000010012)	PIKFYVE (ENSCSAG00000010033) #21	IDH1 (ENSCSAG00000010039) #22	C2orf80 (ENSCSAG00000010044) #23	CRYGA (ENSCSAG00000010050) #24	CRYGB (ENSCSAG00000010058)	CRYGC (ENSCSAG00000010063)	CRYGD (ENSCSAG00000010066) ##25	PLEKHM3 (ENSCSAG00000010071) #26	FZD5 (ENSCSAG00000018771)	CCNYL1 (ENSCSAG00000010093)	METTL21A (ENSCSAG00000010107)	CREB1 (ENSCSAG00000010111)	KLF7 (ENSCSAG00000010117)	CPO (ENSCSAG00000010143)	FASTKD2 (ENSCSAG00000010158)	MDH1B (ENSCSAG00000010163)	DYTN (ENSCSAG00000010181)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	73			ENSGT00940000157192	ENSGT00910000147691	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a.g	ENSGT00910000147420	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.p.b	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00390000015257.s.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	957				ENSRBIG00000040006	CPS1 (ENSRBIG00000034628)	LANCL1 (ENSRBIG00000041559)	MYL1 (ENSRBIG00000027883)	ACADL (ENSRBIG00000028829)	KANSL1L (ENSRBIG00000028308)	ENSRBIG00000004921	UNC80 (ENSRBIG00000042926)	MAP2 (ENSRBIG00000028156)	ENSRBIG00000029420	PTH2R (ENSRBIG00000033118)	PIKFYVE (ENSRBIG00000044045) #21	IDH1 (ENSRBIG00000029262) #22	C2orf80 (ENSRBIG00000035852) #23	CRYGA (ENSRBIG00000043634) #24	CRYGB (ENSRBIG00000006661)	CRYGC (ENSRBIG00000035767)	CRYGD (ENSRBIG00000036767) ##25	ENSRBIG00000038783 ##25	PLEKHM3 (ENSRBIG00000026856) #26	ENSRBIG00000031476	FZD5 (ENSRBIG00000022385)	CCNYL1 (ENSRBIG00000041496)	METTL21A (ENSRBIG00000038997)	CREB1 (ENSRBIG00000040701)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2001														PTH2R (ENSRROG00000038416)	PIKFYVE (ENSRROG00000044523) #21	IDH1 (ENSRROG00000033347) #22	C2orf80 (ENSRROG00000045563) #23	CRYGA (ENSRROG00000010431) #24	CRYGB (ENSRROG00000028311)	CRYGC (ENSRROG00000030163)	CRYGD (ENSRROG00000035794) ##25	ENSRROG00000042574 ##25
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00910000147420	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.p.b	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00910000147537	ENSGT00910000146869	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000161508
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00910000147420	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.q	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00910000146869	ENSGT00910000147537	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b	ENSGT00940000161508
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Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00910000148020	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00910000147420	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.p.b	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00910000146869	ENSGT00910000147537	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00950000182985.b.b.i.b.d.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b
Pan	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00910000148020	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00910000147420	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.p.b	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00910000146869	ENSGT00910000147537	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b.a	ENSGT00950000182985.b.b.i.b.d.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235.g.b
Bonobo	MODERN SPECIES	15	SPAG16 (ENSPPAG00000043643)	IKZF2 (ENSPPAG00000041873)	ENSPPAG00000023325	ERBB4 (ENSPPAG00000041527)	CPS1 (ENSPPAG00000037514)	LANCL1 (ENSPPAG00000039753)	MYL1 (ENSPPAG00000032667)	ENSPPAG00000009402	ACADL (ENSPPAG00000035916)	KANSL1L (ENSPPAG00000038917)	ENSPPAG00000034521	UNC80 (ENSPPAG00000038207)	MAP2 (ENSPPAG00000042145)	PTH2R (ENSPPAG00000000087)	PIKFYVE (ENSPPAG00000038724) #21	IDH1 (ENSPPAG00000039215) #22	C2orf80 (ENSPPAG00000035033) #23	CRYGA (ENSPPAG00000038408) #24	CRYGB (ENSPPAG00000019473)	CRYGC (ENSPPAG00000029445)	CRYGD (ENSPPAG00000030489) ##25	ENSPPAG00000019104 ##25	PLEKHM3 (ENSPPAG00000028938) #26	ENSPPAG00000034737	ENSPPAG00000004988	FZD5 (ENSPPAG00000000897)	CCNYL1 (ENSPPAG00000034051)	ENSPPAG00000029502	ENSPPAG00000010296	METTL21A (ENSPPAG00000041715)	CREB1 (ENSPPAG00000042817)
Chimpanzee	MODERN SPECIES	15	IKZF2 (ENSPTRG00000048797)	ENSPTRG00000050921	ERBB4 (ENSPTRG00000012883)	CPS1 (ENSPTRG00000012881)	LANCL1 (ENSPTRG00000012880)	MYL1 (ENSPTRG00000012879)	ENSPTRG00000044780	ACADL (ENSPTRG00000012876)	ENSPTRG00000043540	KANSL1L (ENSPTRG00000012875)	ENSPTRG00000048818	UNC80 (ENSPTRG00000012873)	MAP2 (ENSPTRG00000012869)	PTH2R (ENSPTRG00000012868)	PIKFYVE (ENSPTRG00000012866) #21	IDH1 (ENSPTRG00000012865) #22	C2orf80 (ENSPTRG00000012863) #23	CRYGA (ENSPTRG00000012862) #24	CRYGB (ENSPTRG00000012861)	CRYGC (ENSPTRG00000012859)	CRYGD (ENSPTRG00000012858) ##25	ENSPTRG00000049376 ##25	PLEKHM3 (ENSPTRG00000012857) #26	ENSPTRG00000043594	ENSPTRG00000049925	FZD5 (ENSPTRG00000012855)	CCNYL1 (ENSPTRG00000012853)	ENSPTRG00000045370	METTL21A (ENSPTRG00000012852)	CREB1 (ENSPTRG00000043959)	KLF7 (ENSPTRG00000012850)
Human	MODERN SPECIES	11	BARD1 (ENSG00000138376)	VWC2L (ENSG00000174453)	SPAG16 (ENSG00000144451)	IKZF2 (ENSG00000030419)	ERBB4 (ENSG00000178568)	CPS1 (ENSG00000021826)	LANCL1 (ENSG00000115365)	MYL1 (ENSG00000168530)	ACADL (ENSG00000115361)	KANSL1L (ENSG00000144445)	RPE (ENSG00000197713)	UNC80 (ENSG00000144406)	MAP2 (ENSG00000078018)	PTH2R (ENSG00000144407)	PIKFYVE (ENSG00000115020) #21	IDH1 (ENSG00000138413) #22	C2orf80 (ENSG00000188674) #23	CRYGA (ENSG00000168582) #24	CRYGB (ENSG00000182187)	CRYGC (ENSG00000163254)	CRYGD (ENSG00000118231) ##25	PLEKHM3 (ENSG00000178385) #26	FZD5 (ENSG00000163251)	CCNYL1 (ENSG00000163249)	METTL21A (ENSG00000144401)	CREB1 (ENSG00000118260)	KLF7 (ENSG00000118263)	CPO (ENSG00000144410)	FASTKD2 (ENSG00000118246)	MDH1B (ENSG00000138400)	DYTN (ENSG00000232125)
Gorilla	MODERN SPECIES	15	IKZF2 (ENSGGOG00000011301)	ENSGGOG00000039432	ERBB4 (ENSGGOG00000014309)	CPS1 (ENSGGOG00000028226)	LANCL1 (ENSGGOG00000041237)	MYL1 (ENSGGOG00000011991)	ENSGGOG00000036486	ACADL (ENSGGOG00000006541)	KANSL1L (ENSGGOG00000011150)	ENSGGOG00000043889	UNC80 (ENSGGOG00000010917)	MAP2 (ENSGGOG00000027310)	ENSGGOG00000028471 ##25	PTH2R (ENSGGOG00000016959)	PIKFYVE (ENSGGOG00000012992) #21	IDH1 (ENSGGOG00000012619) #22	C2orf80 (ENSGGOG00000004332) #23	CRYGA (ENSGGOG00000022179) #24	CRYGB (ENSGGOG00000008895)	CRYGC (ENSGGOG00000026944)	CRYGD (ENSGGOG00000027001) ##25	ENSGGOG00000040001 ##25	PLEKHM3 (ENSGGOG00000000998) #26	ENSGGOG00000043005	FZD5 (ENSGGOG00000042758)	CCNYL1 (ENSGGOG00000039803)	ENSGGOG00000022138	METTL21A (ENSGGOG00000015815)	CREB1 (ENSGGOG00000024394)	KLF7 (ENSGGOG00000009338)	CPO (ENSGGOG00000016053)
Orangutan	MODERN SPECIES	15	SPAG16 (ENSPPYG00000013141)	IKZF2 (ENSPPYG00000013139)	ENSPPYG00000035873	ERBB4 (ENSPPYG00000013138)	CPS1 (ENSPPYG00000013137)	LANCL1 (ENSPPYG00000033825)	MYL1 (ENSPPYG00000013135)	ENSPPYG00000013134	ACADL (ENSPPYG00000037453)	KANSL1L (ENSPPYG00000013133)	RPE (ENSPPYG00000030957)	UNC80 (ENSPPYG00000013131)	MAP2 (ENSPPYG00000013128)	PTH2R (ENSPPYG00000013127)	PIKFYVE (ENSPPYG00000013126) #21	IDH1 (ENSPPYG00000013125) #22	C2BH2orf80 (ENSPPYG00000013124) #23	CRYGA (ENSPPYG00000031928) #24	CRYGB (ENSPPYG00000013386)	CRYGC (ENSPPYG00000035452)	ENSPPYG00000040257 ##25	PLEKHM3 (ENSPPYG00000013121) #26	ENSPPYG00000013120	FZD5 (ENSPPYG00000013119)	CCNYL1 (ENSPPYG00000013118)	METTL21A (ENSPPYG00000013116)	CREB1 (ENSPPYG00000013115)	KLF7 (ENSPPYG00000013114)	CPO (ENSPPYG00000013113)	FASTKD2 (ENSPPYG00000013112)	MDH1B (ENSPPYG00000013111)
Gibbon	MODERN SPECIES	14	SPAG16 (ENSNLEG00000007201)	IKZF2 (ENSNLEG00000031188)	ERBB4 (ENSNLEG00000007195)	CPS1 (ENSNLEG00000007187)	LANCL1 (ENSNLEG00000007182)	MYL1 (ENSNLEG00000007180)	ENSNLEG00000007179	ACADL (ENSNLEG00000007175)	ENSNLEG00000007174	ENSNLEG00000027381	UNC80 (ENSNLEG00000007162)	MAP2 (ENSNLEG00000007156)	ENSNLEG00000035981 ##25	PTH2R (ENSNLEG00000007155)	PIKFYVE (ENSNLEG00000007150) #21	IDH1 (ENSNLEG00000007143) #22	ENSNLEG00000007142 #23	CRYGA (ENSNLEG00000007141) #24	CRYGB (ENSNLEG00000007137)	CRYGC (ENSNLEG00000007139)	ENSNLEG00000035688 ##25	PLEKHM3 (ENSNLEG00000007136) #26	ENSNLEG00000032494	ENSNLEG00000031847	ENSNLEG00000035287	FZD5 (ENSNLEG00000029167)	CCNYL1 (ENSNLEG00000007131)	METTL21A (ENSNLEG00000007129)	CREB1 (ENSNLEG00000007124)	KLF7 (ENSNLEG00000035258)	CPO (ENSNLEG00000007121)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	90																ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT01010000222287.B.b.a.a.b
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1003															ENSANAG00000030795	ENSANAG00000026597 #22	HTR1E (ENSANAG00000020260)	CGA (ENSANAG00000025451)	ZNF292 (ENSANAG00000023824)	SMIM8 (ENSANAG00000031913)	C6orf163 (ENSANAG00000020423)	ENSANAG00000036217	SLC35A1 (ENSANAG00000023414)	RARS2 (ENSANAG00000027711)	ORC3 (ENSANAG00000038422)	AKIRIN2 (ENSANAG00000030566)	ENSANAG00000027715	SPACA1 (ENSANAG00000022733)	ENSANAG00000022019	RNGTT (ENSANAG00000022118)	ENSANAG00000001631
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	85																ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT01010000222287.B.b.a.a.b
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00390000016421.b.b	ENSGT00390000000509	ENSGT00390000007224.a	ENSGT00950000183134.c.a.b	ENSGT00390000000155.b	ENSGT00950000183068.b	ENSGT00940000161538	ENSGT00940000155536	ENSGT00650000093438	ENSGT00390000009631	ENSGT00940000155566	ENSGT00530000063775	ENSGT00950000182856.a.b	ENSGT00940000153511.b	ENSGT00390000008099.w.a	ENSGT00390000012547.b.b.b #22	ENSGT01010000222287.B.b.a.a.b	ENSGT00390000012242	ENSGT00950000183034.C	ENSGT00390000011674	ENSGT00390000010837	ENSGT00390000016036.hb	ENSGT00950000182827.E	ENSGT00530000063407.a	ENSGT00390000011376.f	ENSGT00900000143774	ENSGT00940000156096	ENSGT00390000004211	ENSGT00940000156953	ENSGT00530000063881.a.a	ENSGT00940000160519
Capuchin	MODERN SPECIES	43	C6orf52 (ENSCCAG00000025777)	GCNT2 (ENSCCAG00000038039)	ENSCCAG00000024728	ENSCCAG00000029494	TFAP2A (ENSCCAG00000036532)	ENSCCAG00000026702	ENSCCAG00000026536	SLC35B3 (ENSCCAG00000026344)	ENSCCAG00000035126	ENSCCAG00000031071	BLOC1S5 (ENSCCAG00000023842)	TXNDC5 (ENSCCAG00000022735)	BMP6 (ENSCCAG00000024255)	SNRNP48 (ENSCCAG00000035652)	DSP (ENSCCAG00000002153)	ENSCCAG00000033486 #22	RIOK1 (ENSCCAG00000024061)	CAGE1 (ENSCCAG00000037882)	SSR1 (ENSCCAG00000030293)	RREB1 (ENSCCAG00000021905)	LY86 (ENSCCAG00000020400)	F13A1 (ENSCCAG00000036141)	NRN1 (ENSCCAG00000024735)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	49	DOP1A (ENSSBOG00000024864)	PGM3 (ENSSBOG00000029648)	RWDD2A (ENSSBOG00000033415)	ME1 (ENSSBOG00000022150)	PRSS35 (ENSSBOG00000007757)	SNAP91 (ENSSBOG00000029389)	RIPPLY2 (ENSSBOG00000034057)	CYB5R4 (ENSSBOG00000034068)	MRAP2 (ENSSBOG00000032325)	CEP162 (ENSSBOG00000028566)	TBX18 (ENSSBOG00000030588)	NT5E (ENSSBOG00000028109)	SNX14 (ENSSBOG00000025784)	SYNCRIP (ENSSBOG00000022984)	ENSSBOG00000030755	ENSSBOG00000024891 #22	HTR1E (ENSSBOG00000019342)	CGA (ENSSBOG00000020930)	ENSSBOG00000030795	ZNF292 (ENSSBOG00000032717)	SMIM8 (ENSSBOG00000031234)	C6orf163 (ENSSBOG00000000095)	ENSSBOG00000032943	SLC35A1 (ENSSBOG00000034765)	RARS2 (ENSSBOG00000006101)	ENSSBOG00000036022	ORC3 (ENSSBOG00000025705)	AKIRIN2 (ENSSBOG00000020946)	SPACA1 (ENSSBOG00000031936)	ENSSBOG00000032226	RNGTT (ENSSBOG00000021985)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	3608																IDH1 (ENSEEUG00000011994) #22
Common shrew	MODERN SPECIES	2719																IDH1 (ENSSARG00000011164) #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Suina	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Pig	MODERN SPECIES	6	ENSSSCG00000037703	ERBB4 (ENSSSCG00000016160)	CPS1 (ENSSSCG00000016159)	LANCL1 (ENSSSCG00000016158)	MYL1 (ENSSSCG00000016157)	ACADL (ENSSSCG00000016156)	ENSSSCG00000060126	KANSL1L (ENSSSCG00000022830)	ENSSSCG00000032311	UNC80 (ENSSSCG00000016153)	MAP2 (ENSSSCG00000016151)	ENSSSCG00000038814 ##25	ENSSSCG00000032020	PTH2R (ENSSSCG00000016148)	PIKFYVE (ENSSSCG00000016147) #21	IDH1 (ENSSSCG00000023264) #22	C2orf80 (ENSSSCG00000032040) #23	ENSSSCG00000039241 ##24	CRYGC (ENSSSCG00000039620)	CRYGD (ENSSSCG00000034967) ##25	ENSSSCG00000036186 ##25	PLEKHM3 (ENSSSCG00000016141) #26	FZD5 (ENSSSCG00000016140)	ENSSSCG00000024696	METTL21A (ENSSSCG00000036466)	CREB1 (ENSSSCG00000034395)	ENSSSCG00000042730	KLF7 (ENSSSCG00000029998)	CPO (ENSSSCG00000016135)	FASTKD2 (ENSSSCG00000016134)	MDH1B (ENSSSCG00000016133)
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	940	ERBB4 (ENSCWAG00000010989)	ENSCWAG00000011700	ENSCWAG00000011727	ENSCWAG00000011755	CPS1 (ENSCWAG00000011796)	LANCL1 (ENSCWAG00000012920)	MYL1 (ENSCWAG00000012965)	ACADL (ENSCWAG00000013051)	KANSL1L (ENSCWAG00000013105)	ENSCWAG00000013228	UNC80 (ENSCWAG00000013389)	ENSCWAG00000014500	ENSCWAG00000014678 ##25	PTH2R (ENSCWAG00000014718)	PIKFYVE (ENSCWAG00000014910) #21	IDH1 (ENSCWAG00000015021) #22	C2orf80 (ENSCWAG00000015065) #23	CRYGA (ENSCWAG00000015197) #24	CRYGB (ENSCWAG00000015245)	CRYGC (ENSCWAG00000015274)	CRYGD (ENSCWAG00000015313) ##25	PLEKHM3 (ENSCWAG00000015435) #26	FZD5 (ENSCWAG00000015512)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Arabian camel	MODERN SPECIES	31	IKZF2 (ENSCDRG00005010931)	ENSCDRG00005011221	ERBB4 (ENSCDRG00005011281)	ENSCDRG00005011902	CPS1 (ENSCDRG00005011935)	LANCL1 (ENSCDRG00005012357)	MYL1 (ENSCDRG00005012450)	ACADL (ENSCDRG00005012612)	KANSL1L (ENSCDRG00005012697)	ENSCDRG00005012826	UNC80 (ENSCDRG00005012995)	MAP2 (ENSCDRG00005014163)	ENSCDRG00005014776 ##25	PTH2R (ENSCDRG00005014818)	PIKFYVE (ENSCDRG00005014910) #21	IDH1 (ENSCDRG00005015742) #22	C2orf80 (ENSCDRG00005015804) #23	CRYGA (ENSCDRG00005015861) #24	CRYGB (ENSCDRG00005015889)	CRYGC (ENSCDRG00005015923)	CRYGD (ENSCDRG00005015948) ##25	ENSCDRG00005015995 ##25	PLEKHM3 (ENSCDRG00005016026) #26	FZD5 (ENSCDRG00005016088)	ENSCDRG00005016106	METTL21A (ENSCDRG00005016143)	CREB1 (ENSCDRG00005016249)	KLF7 (ENSCDRG00005016375)	CPO (ENSCDRG00005016423)	FASTKD2 (ENSCDRG00005016506)	MDH1B (ENSCDRG00005016545)
Alpaca	MODERN SPECIES	2534														PTH2R (ENSVPAG00000009705)	PIKFYVE (ENSVPAG00000009702) #21	IDH1 (ENSVPAG00000009700) #22	C2orf80 (ENSVPAG00000009699) #23	CRYGA (ENSVPAG00000009698) #24	ENSVPAG00000009697 ##24	CRYGC (ENSVPAG00000009696)	CRYGD (ENSVPAG00000009695) ##25	PLEKHM3 (ENSVPAG00000009694) #26
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330.d	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00530000065303.j	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330.d	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00390000006670.d	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00390000001958.n.a.g	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157137	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00530000065303.j	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330.d	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00390000004738.q.b	ENSGT00390000001958.n.a.g	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00530000065303.j	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330.d	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00390000006670.d	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00390000001958.n.a.g	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000002231.d.b	ENSGT00940000154695	ENSGT00530000065303.j	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.qb	ENSGT01030000235330.d	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.x ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b.w ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00390000001958.n.a.g	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00530000065303.j	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.qb	ENSGT01030000235330.d	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.x ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b.w ##25	ENSGT00390000006670.d	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00390000001958.n.a.g	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b
Narwhal	MODERN SPECIES	302	IKZF2 (ENSMMNG00015007711)	ERBB4 (ENSMMNG00015007770)	ENSMMNG00015007841	CPS1 (ENSMMNG00015007884)	LANCL1 (ENSMMNG00015008039)	MYL1 (ENSMMNG00015008068)	ENSMMNG00015008099	ACADL (ENSMMNG00015008110)	KANSL1L (ENSMMNG00015008134)	ENSMMNG00015008179	UNC80 (ENSMMNG00015008270)	MAP2 (ENSMMNG00015008438)	ENSMMNG00015008487 ##25	PTH2R (ENSMMNG00015008501)	PIKFYVE (ENSMMNG00015008559) #21	IDH1 (ENSMMNG00015008654) #22	C2orf80 (ENSMMNG00015008684) #23	CRYGA (ENSMMNG00015008711) #24	CRYGC (ENSMMNG00015008725)	ENSMMNG00015008733 ##25	PLEKHM3 (ENSMMNG00015008741) #26	ENSMMNG00015005195	FZD5 (ENSMMNG00015005204)	ENSMMNG00015005216	ENSMMNG00015005240	ENSMMNG00015005252	METTL21A (ENSMMNG00015005268)	CREB1 (ENSMMNG00015005293)	KLF7 (ENSMMNG00015005320)	FASTKD2 (ENSMMNG00015005336)	MDH1B (ENSMMNG00015005351)
Beluga whale	MODERN SPECIES	84	IKZF2 (ENSDLEG00000011195)	ERBB4 (ENSDLEG00000011065)	ENSDLEG00000011044	CPS1 (ENSDLEG00000010899)	LANCL1 (ENSDLEG00000010841)	ENSDLEG00000010817	ACADL (ENSDLEG00000010802)	KANSL1L (ENSDLEG00000010779)	ENSDLEG00000010744	ENSDLEG00000010732	UNC80 (ENSDLEG00000010609)	MAP2 (ENSDLEG00000010499)	ENSDLEG00000010475 ##25	PTH2R (ENSDLEG00000010408)	PIKFYVE (ENSDLEG00000010278) #21	IDH1 (ENSDLEG00000010202) #22	C2orf80 (ENSDLEG00000010165) #23	CRYGB (ENSDLEG00000010148) ##24	ENSDLEG00000010132	CRYGD (ENSDLEG00000010113) ##25	ENSDLEG00000010093 ##25	ENSDLEG00000010082	PLEKHM3 (ENSDLEG00000010056) #26	FZD5 (ENSDLEG00000010035)	CCNYL1 (ENSDLEG00000009986)	ENSDLEG00000009965	ENSDLEG00000009942	METTL21A (ENSDLEG00000009925)	CREB1 (ENSDLEG00000009895)	KLF7 (ENSDLEG00000009871)	FASTKD2 (ENSDLEG00000009822)
Vaquita	MODERN SPECIES	18	IKZF2 (ENSPSNG00000017845)	ENSPSNG00000017988	ERBB4 (ENSPSNG00000018144)	ENSPSNG00000018762	CPS1 (ENSPSNG00000018881)	LANCL1 (ENSPSNG00000019514)	MYL1 (ENSPSNG00000019567)	ACADL (ENSPSNG00000019649)	KANSL1L (ENSPSNG00000019694)	ENSPSNG00000019741	UNC80 (ENSPSNG00000020123)	MAP2 (ENSPSNG00000021466)	ENSPSNG00000021538 ##25	PTH2R (ENSPSNG00000021559)	PIKFYVE (ENSPSNG00000021640) #21	IDH1 (ENSPSNG00000021741) #22	C2orf80 (ENSPSNG00000021785) #23	CRYGB (ENSPSNG00000021815)	CRYGC (ENSPSNG00000021832)	CRYGD (ENSPSNG00000021845) ##25	ENSPSNG00000021854 ##25	PLEKHM3 (ENSPSNG00000021878) #26	ENSPSNG00000021899	ENSPSNG00000021913	ENSPSNG00000021936	ENSPSNG00000021964	ENSPSNG00000021984	METTL21A (ENSPSNG00000022000)	CREB1 (ENSPSNG00000022021)	KLF7 (ENSPSNG00000022054)	FASTKD2 (ENSPSNG00000022088)
Dolphin	MODERN SPECIES	2492														PTH2R (ENSTTRG00000016395)	PIKFYVE (ENSTTRG00000016391) #21	IDH1 (ENSTTRG00000016390) #22	C2orf80 (ENSTTRG00000016389) #23
Sperm whale	MODERN SPECIES	11	ERBB4 (ENSPCTG00005008147)	ENSPCTG00005008116	CPS1 (ENSPCTG00005007806)	LANCL1 (ENSPCTG00005007711)	ENSPCTG00005007695	ENSPCTG00005007683	MYL1 (ENSPCTG00005007638)	ACADL (ENSPCTG00005007603)	KANSL1L (ENSPCTG00005007546)	RPE (ENSPCTG00005007416)	UNC80 (ENSPCTG00005006733)	MAP2 (ENSPCTG00005006282)	ENSPCTG00005006233 ##25	PTH2R (ENSPCTG00005006194)	PIKFYVE (ENSPCTG00005005700) #21	IDH1 (ENSPCTG00005005612) #22	C2orf80 (ENSPCTG00005005458) #23	CRYGB (ENSPCTG00005005428)	ENSPCTG00005005404	CRYGC (ENSPCTG00005005389)	CRYGD (ENSPCTG00005005372) ##25	ENSPCTG00005005346 ##25	PLEKHM3 (ENSPCTG00005005303) #26	FZD5 (ENSPCTG00005005280)	CCNYL1 (ENSPCTG00005005234)	ENSPCTG00005005205	ENSPCTG00005005181	METTL21A (ENSPCTG00005005122)	CREB1 (ENSPCTG00005005085)	KLF7 (ENSPCTG00005005002)	FASTKD2 (ENSPCTG00005004965)
Blue whale	MODERN SPECIES	18	ENSBMSG00010003157	ERBB4 (ENSBMSG00010003029)	ENSBMSG00010002996	CPS1 (ENSBMSG00010002893)	LANCL1 (ENSBMSG00010002864)	MYL1 (ENSBMSG00010002843)	ENSBMSG00010002831	ACADL (ENSBMSG00010002817)	KANSL1L (ENSBMSG00010002800)	ENSBMSG00010002786	UNC80 (ENSBMSG00010002392)	MAP2 (ENSBMSG00010001833)	ENSBMSG00010001803 ##25	PTH2R (ENSBMSG00010001780)	PIKFYVE (ENSBMSG00010001711) #21	IDH1 (ENSBMSG00010001674) #22	ENSBMSG00010001666	ENSBMSG00010001661	METTL21A (ENSBMSG00010001644)	CREB1 (ENSBMSG00010001606)	KLF7 (ENSBMSG00010001534)	FASTKD2 (ENSBMSG00010001509)	MDH1B (ENSBMSG00010001465)	DYTN (ENSBMSG00010001424)	FAM237A (ENSBMSG00010001408)	ADAM23 (ENSBMSG00010001305)	ZDBF2 (ENSBMSG00010001246)	CMKLR2 (ENSBMSG00010001229)	EEF1B2 (ENSBMSG00010001199)	NDUFS1 (ENSBMSG00010001085)	ENSBMSG00010001036
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b.s ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Yarkand deer	DUPLICATION
Yarkand deer	DUPLICATION
Yarkand deer	MODERN SPECIES	31	CPS1 (ENSCHYG00000004084)	LANCL1 (ENSCHYG00000004128)	ENSCHYG00000004138	MYL1 (ENSCHYG00000004152)	ACADL (ENSCHYG00000004178)	ENSCHYG00000004220	KANSL1L (ENSCHYG00000004240)	ENSCHYG00000004274	UNC80 (ENSCHYG00000000452)	MAP2 (ENSCHYG00000000996)	ENSCHYG00000001066	ENSCHYG00000001080 ##25	PTH2R (ENSCHYG00000001108)	ENSCHYG00000001125	PIKFYVE (ENSCHYG00000001177) #21	ENSCHYG00000001240 #22	C2orf80 (ENSCHYG00000001293) #23	CRYGA (ENSCHYG00000001333) #24	ENSCHYG00000001348 ##24	CRYGC (ENSCHYG00000001360)	CRYGD (ENSCHYG00000001364) ##25	ENSCHYG00000001381 ##25	PLEKHM3 (ENSCHYG00000001407) #26	ENSCHYG00000001470	FZD5 (ENSCHYG00000001477)	ENSCHYG00000001504	CREB1 (ENSCHYG00000001543)	KLF7 (ENSCHYG00000001583)	CPO (ENSCHYG00000001618)	FASTKD2 (ENSCHYG00000001648)	MDH1B (ENSCHYG00000001680)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	5	ENSCHYG00000026976	CFAP74 (ENSCHYG00000026970)	GABRD (ENSCHYG00000026948)	PRKCZ (ENSCHYG00000026939)	ENSCHYG00000026917	SKI (ENSCHYG00000026910)	MORN1 (ENSCHYG00000026899)	RER1 (ENSCHYG00000026890)	ENSCHYG00000026862	PLCH2 (ENSCHYG00000026795)	PANK4 (ENSCHYG00000026707)	HES5 (ENSCHYG00000026669)	PRXL2B (ENSCHYG00000026618)	MMEL1 (ENSCHYG00000026544)	ENSCHYG00000026518	ENSCHYG00000026511 #22	ACTRT2 (ENSCHYG00000026506)	PRDM16 (ENSCHYG00000026484)	ARHGEF16 (ENSCHYG00000026434)	MEGF6 (ENSCHYG00000025807)	TPRG1L (ENSCHYG00000025690)	WRAP73 (ENSCHYG00000025638)	TP73 (ENSCHYG00000025502)	ENSCHYG00000025453	ENSCHYG00000025345	SMIM1 (ENSCHYG00000025319)	LRRC47 (ENSCHYG00000025295)	CEP104 (ENSCHYG00000025105)	DFFB (ENSCHYG00000025029)	C1orf174 (ENSCHYG00000025002)	AJAP1 (ENSCHYG00000024985)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	1	ENSCHYG00000007836	CD2BP2 (ENSCHYG00000007863)	TBC1D10B (ENSCHYG00000007925)	MYL11 (ENSCHYG00000007998)	SEPTIN1 (ENSCHYG00000008026)	ZNF48 (ENSCHYG00000008118)	ZNF771 (ENSCHYG00000008140)	DCTPP1 (ENSCHYG00000008164)	SEPHS2 (ENSCHYG00000008191)	ENSCHYG00000008208	ITGAL (ENSCHYG00000000773)	ENSCHYG00000001071	ENSCHYG00000001083	ZNF768 (ENSCHYG00000001097)	ENSCHYG00000001127	ENSCHYG00000001155 #22	PRR14 (ENSCHYG00000001185)	FBRS (ENSCHYG00000001258)	SRCAP (ENSCHYG00000001457)	ENSCHYG00000001599	PHKG2 (ENSCHYG00000001626)	ZNF629 (ENSCHYG00000001654)	CFAP119 (ENSCHYG00000001669)	RNF40 (ENSCHYG00000001704)	BCL7C (ENSCHYG00000001768)	FBXL19 (ENSCHYG00000001809)	ORAI3 (ENSCHYG00000001841)	SETD1A (ENSCHYG00000001856)	HSD3B7 (ENSCHYG00000001916)	STX1B (ENSCHYG00000001985)	STX4 (ENSCHYG00000002066)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b.s ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000153593.c.b	ENSGT00940000158720.c.b.s ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508
Caprinae	DUPLICATION
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT01010000228811	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447.lb.a	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b.g #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000153593.c.b	ENSGT00940000158720.c.b.s ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Goat	MODERN SPECIES	11	IKZF2 (ENSCHIG00000008623)	ENSCHIG00000025711	ENSCHIG00000015255	CPS1 (ENSCHIG00000025029)	LANCL1 (ENSCHIG00000015499)	MYL1 (ENSCHIG00000016096)	ACADL (ENSCHIG00000012492)	KANSL1L (ENSCHIG00000025531)	ENSCHIG00000017628	UNC80 (ENSCHIG00000023318)	MAP2 (ENSCHIG00000000510)	ENSCHIG00000015978 ##25	PTH2R (ENSCHIG00000003956)	ENSCHIG00000011874	PIKFYVE (ENSCHIG00000018742) #21	ENSCHIG00000018336 #22	C2orf80 (ENSCHIG00000012414) #23	CRYGA (ENSCHIG00000010538) #24	ENSCHIG00000006930 ##24	ENSCHIG00000018066	ENSCHIG00000014620 ##25	ENSCHIG00000012148	ENSCHIG00000012358 ##25	PLEKHM3 (ENSCHIG00000008278) #26	FZD5 (ENSCHIG00000007513)	ENSCHIG00000011033	METTL21A (ENSCHIG00000003332)	CREB1 (ENSCHIG00000027161)	KLF7 (ENSCHIG00000006619)	CPO (ENSCHIG00000020644)	ENSCHIG00000026347
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	11	ENSOARG00020022071	ENSOARG00020022058	CPS1 (ENSOARG00020021614)	LANCL1 (ENSOARG00020021560)	MYL1b (ENSOARG00020021419)	ACADL (ENSOARG00020021309)	KANSL1L (ENSOARG00020021126)	RPE (ENSOARG00020021044)	UNC80 (ENSOARG00020019570)	MAP2 (ENSOARG00020019287)	ENSOARG00020019223	ENSOARG00020019192 ##25	PTH2R (ENSOARG00020018956)	ENSOARG00020018915	PIKFYVE (ENSOARG00020017062) #21	IDH1 (ENSOARG00020016933) #22	C2orf80 (ENSOARG00020016679) #23	CRYGA (ENSOARG00020016623) #24	CRYGB (ENSOARG00020016583)	CRYGC (ENSOARG00020016523)	CRYGD (ENSOARG00020016483) ##25	ENSOARG00020016435 ##25	PLEKHM3 (ENSOARG00020016241) #26	FZD5 (ENSOARG00020016197)	ENSOARG00020016023	METTL21A (ENSOARG00020015859)	CREB1 (ENSOARG00020015664)	KLF7 (ENSOARG00020015555)	CPO (ENSOARG00020015466)	FASTKD2 (ENSOARG00020015403)	MDH1B (ENSOARG00020015160)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.h #22
Goat	MODERN SPECIES	22	ENSCHIG00000013344	ANGPTL3 (ENSCHIG00000018304)	DOCK7 (ENSCHIG00000022741)	USP1 (ENSCHIG00000015997)	KANK4 (ENSCHIG00000026610)	ENSCHIG00000012571	PATJ (ENSCHIG00000023685)	TM2D1 (ENSCHIG00000026504)	ENSCHIG00000012418	NFIA (ENSCHIG00000011380)	C1orf87 (ENSCHIG00000023812)	CYP2J26 (ENSCHIG00000021521)	CYP2J29 (ENSCHIG00000009032)	CYP2J30 (ENSCHIG00000022554)	HOOK1 (ENSCHIG00000025016)	ENSCHIG00000018971 #22	FGGY (ENSCHIG00000022252)	JUN (ENSCHIG00000004093)	MYSM1 (ENSCHIG00000007198)	TACSTD2 (ENSCHIG00000012887)	OMA1 (ENSCHIG00000015440)	ENSCHIG00000025606	DAB1 (ENSCHIG00000024663)	C8B (ENSCHIG00000012131)	C8A (ENSCHIG00000025838)	PRKAA2 (ENSCHIG00000014436)	PLPP3 (ENSCHIG00000022600)	ENSCHIG00000015710	USP24 (ENSCHIG00000021161)	BSND (ENSCHIG00000027205)	TMEM61 (ENSCHIG00000020700)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00950000182965.b	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000153593.c.b	ENSGT00940000158720.c.b.s ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Bos	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b.s ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b.s ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Domestic yak	MODERN SPECIES	11	SPAG16 (ENSBGRG00000003519)	IKZF2 (ENSBGRG00000003601)	ENSBGRG00000003764	ERBB4 (ENSBGRG00000003801)	CPS1 (ENSBGRG00000004265)	LANCL1 (ENSBGRG00000004687)	MYL1 (ENSBGRG00000004749)	ACADL (ENSBGRG00000004885)	KANSL1L (ENSBGRG00000004930)	ENSBGRG00000005051	UNC80 (ENSBGRG00000005202)	MAP2 (ENSBGRG00000005995)	ENSBGRG00000006119 ##25	PTH2R (ENSBGRG00000006150)	PIKFYVE (ENSBGRG00000006248) #21	IDH1 (ENSBGRG00000006637) #22	C2orf80 (ENSBGRG00000006683) #23	CRYGA (ENSBGRG00000006786) #24	ENSBGRG00000006816 ##24	CRYGC (ENSBGRG00000006857)	CRYGD (ENSBGRG00000006881) ##25	ENSBGRG00000006903 ##25	PLEKHM3 (ENSBGRG00000006928) #26	ENSBGRG00000007042	FZD5 (ENSBGRG00000007062)	ENSBGRG00000007199	METTL21A (ENSBGRG00000007457)	CREB1 (ENSBGRG00000007627)	KLF7 (ENSBGRG00000007842)	ENSBGRG00000007943	CPO (ENSBGRG00000007969)
Wild yak	MODERN SPECIES	2028																IDH1 (ENSBMUG00000010416) #22	C2orf80 (ENSBMUG00000010376) #23	CRYGA (ENSBMUG00000010314) #24	CRYGB (ENSBMUG00000010304)	CRYGC (ENSBMUG00000010295)	CRYGD (ENSBMUG00000010261) ##25	ENSBMUG00000010238 ##25	PLEKHM3 (ENSBMUG00000010222) #26	FZD5 (ENSBMUG00000010190)	ENSBMUG00000010178	METTL21A (ENSBMUG00000010151)	CREB1 (ENSBMUG00000010114)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000154471.a.b.a.a	ENSGT00940000159597	ENSGT00390000006976	ENSGT00390000016408	ENSGT00940000158892.b	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.t ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00950000182965.b	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b.s ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	11	ERBB4 (ENSBIXG00005026738)	CPS1 (ENSBIXG00005027520)	LANCL1 (ENSBIXG00005027712)	MYL1 (ENSBIXG00005027778)	ENSBIXG00005004776	ENSBIXG00005027813	ENSBIXG00005027821	ACADL (ENSBIXG00005027851)	KANSL1L (ENSBIXG00005004802)	ENSBIXG00005004817	UNC80 (ENSBIXG00005007598)	ENSBIXG00005028747 ##25	PTH2R (ENSBIXG00005028831)	ENSBIXG00005002284	PIKFYVE (ENSBIXG00005029111) #21	IDH1 (ENSBIXG00005001809) #22	C2orf80 (ENSBIXG00005005242) #23	CRYGA (ENSBIXG00005001634) #24	ENSBIXG00005029217 ##24	CRYGC (ENSBIXG00005029223)	CRYGD (ENSBIXG00005005265) ##25	ENSBIXG00005005279 ##25	PLEKHM3 (ENSBIXG00005001556) #26	ENSBIXG00005001549	ENSBIXG00005031627	FZD5 (ENSBIXG00005031625)	CREB1 (ENSBIXG00005031624)	ENSBIXG00005031623	KLF7 (ENSBIXG00005031620)	CPO (ENSBIXG00005031618)	FASTKD2 (ENSBIXG00005031617)
Cow	MODERN SPECIES	11	ERBB4 (ENSBTAG00000012647)	CPS1 (ENSBTAG00000016662)	LANCL1 (ENSBTAG00000015066)	MYL1 (ENSBTAG00000009707)	ENSBTAG00000010722	ACADL (ENSBTAG00000010579)	KANSL1L (ENSBTAG00000021600)	RPE (ENSBTAG00000054647)	UNC80 (ENSBTAG00000015415)	MAP2 (ENSBTAG00000018130)	ENSBTAG00000052197 ##25	PTH2R (ENSBTAG00000011992)	ENSBTAG00000002180	PIKFYVE (ENSBTAG00000002177) #21	ENSBTAG00000055312	IDH1 (ENSBTAG00000020527) #22	C2H2orf80 (ENSBTAG00000012888) #23	CRYGA (ENSBTAG00000049076) #24	CRYGB (ENSBTAG00000021770) ##24	CRYGC (ENSBTAG00000014783)	CRYGD (ENSBTAG00000015054) ##25	ENSBTAG00000049856 ##25	PLEKHM3 (ENSBTAG00000007830) #26	FZD5 (ENSBTAG00000020957)	CCNYL1 (ENSBTAG00000016297)	METTL21A (ENSBTAG00000052083)	CREB1 (ENSBTAG00000005474)	KLF7 (ENSBTAG00000044097)	CPO (ENSBTAG00000019190)	FASTKD2 (ENSBTAG00000016193)	MDH1B (ENSBTAG00000016192)
American bison	MODERN SPECIES	3330	SPAG16 (ENSBBBG00000000106)	IKZF2 (ENSBBBG00000000044)	ERBB4 (ENSBBBG00000010300)	CPS1 (ENSBBBG00000010353)	LANCL1 (ENSBBBG00000010389)	MYL1 (ENSBBBG00000010407)	ACADL (ENSBBBG00000001806)	KANSL1L (ENSBBBG00000010441)	ENSBBBG00000007586	UNC80 (ENSBBBG00000010561)	MAP2 (ENSBBBG00000010617)	ENSBBBG00000010626 ##25	PTH2R (ENSBBBG00000010642)	ENSBBBG00000010646	PIKFYVE (ENSBBBG00000010714) #21	IDH1 (ENSBBBG00000010731) #22	C2orf80 (ENSBBBG00000010761) #23	CRYGA (ENSBBBG00000010767) #24	CRYGB (ENSBBBG00000010771)	CRYGC (ENSBBBG00000001889)	CRYGD (ENSBBBG00000010778) ##25	ENSBBBG00000010781	ENSBBBG00000010792 ##25	PLEKHM3 (ENSBBBG00000010799) #26	FZD5 (ENSBBBG00000010805)	ENSBBBG00000010833	METTL21A (ENSBBBG00000010854)	CREB1 (ENSBBBG00000010873)	KLF7 (ENSBBBG00000010885)	ENSBBBG00000010890	CPO (ENSBBBG00000010898)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	352	ERBB4 (ENSMMSG00000020665)	ENSMMSG00000020623	CPS1 (ENSMMSG00000020103)	LANCL1 (ENSMMSG00000020057)	MYL1 (ENSMMSG00000019985)	ACADL (ENSMMSG00000019943)	ENSMMSG00000019930	KANSL1L (ENSMMSG00000019864)	ENSMMSG00000019805	UNC80 (ENSMMSG00000019152)	MAP2 (ENSMMSG00000018946)	ENSMMSG00000018909 ##25	PTH2R (ENSMMSG00000018791)	ENSMMSG00000018713	PIKFYVE (ENSMMSG00000018585) #21	IDH1 (ENSMMSG00000018507) #22	C2orf80 (ENSMMSG00000018380) #23	CRYGA (ENSMMSG00000018345) #24	CRYGB (ENSMMSG00000018324)	CRYGC (ENSMMSG00000018298)	CRYGD (ENSMMSG00000018278) ##25	ENSMMSG00000018240 ##25	PLEKHM3 (ENSMMSG00000018216) #26	ENSMMSG00000018199	FZD5 (ENSMMSG00000018190)	ENSMMSG00000018078	ENSMMSG00000017981	CREB1 (ENSMMSG00000017935)	ENSMMSG00000017910	KLF7 (ENSMMSG00000017874)	CPO (ENSMMSG00000017798)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a.c.b	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.cb ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b.bb ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	4			ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a.c.b	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.cb ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b.bb ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
American black bear	MODERN SPECIES	401															PIKFYVE (ENSUAMG00000008557) #21	IDH1 (ENSUAMG00000009431) #22	C2orf80 (ENSUAMG00000009435) #23	CRYGA (ENSUAMG00000009437) #24	ENSUAMG00000009439 ##24	CRYGC (ENSUAMG00000009446)	CRYGD (ENSUAMG00000009448) ##25	PLEKHM3 (ENSUAMG00000009449) #26	FZD5 (ENSUAMG00000009450)	ENSUAMG00000009451
Polar bear	MODERN SPECIES	142	ENSUMAG00000023308	ENSUMAG00000023307	ENSUMAG00000023301	ENSUMAG00000023299	CPS1 (ENSUMAG00000023263)	LANCL1 (ENSUMAG00000023250)	MYL1 (ENSUMAG00000023244)	ACADL (ENSUMAG00000023226)	KANSL1L (ENSUMAG00000023220)	ENSUMAG00000023217	UNC80 (ENSUMAG00000023174)	MAP2 (ENSUMAG00000023131)	ENSUMAG00000023115 ##25	PTH2R (ENSUMAG00000023104)	PIKFYVE (ENSUMAG00000022735) #21	IDH1 (ENSUMAG00000022685) #22	C2orf80 (ENSUMAG00000022683) #23	CRYGA (ENSUMAG00000022681) #24	ENSUMAG00000022680 ##24	CRYGC (ENSUMAG00000022675)	CRYGD (ENSUMAG00000022673) ##25	ENSUMAG00000022672 ##25	PLEKHM3 (ENSUMAG00000022668) #26	ENSUMAG00000022665	CREB1 (ENSUMAG00000022656)	METTL21A (ENSUMAG00000022649)	KLF7 (ENSUMAG00000022629)	CPO (ENSUMAG00000022606)	FASTKD2 (ENSUMAG00000022590)	MDH1B (ENSUMAG00000022585)	DYTN (ENSUMAG00000022576)
Giant Panda	MODERN SPECIES	11	VWC2L (ENSAMEG00000003842)	SPAG16 (ENSAMEG00000008081)	IKZF2 (ENSAMEG00000008058)	ERBB4 (ENSAMEG00000007301)	CPS1 (ENSAMEG00000005080)	LANCL1 (ENSAMEG00000005046)	MYL1 (ENSAMEG00000005031)	ACADL (ENSAMEG00000004978)	KANSL1L (ENSAMEG00000004973)	ENSAMEG00000004965	UNC80 (ENSAMEG00000004864)	MAP2 (ENSAMEG00000014971)	ENSAMEG00000030710 ##25	PTH2R (ENSAMEG00000015327)	PIKFYVE (ENSAMEG00000015268) #21	IDH1 (ENSAMEG00000015244) #22	C2orf80 (ENSAMEG00000015239) #23	CRYGA (ENSAMEG00000028445) #24	ENSAMEG00000023505 ##24	CRYGC (ENSAMEG00000025725)	CRYGD (ENSAMEG00000031493) ##25	ENSAMEG00000023570 ##25	PLEKHM3 (ENSAMEG00000015216) #26	FZD5 (ENSAMEG00000015206)	ENSAMEG00000015175	METTL21A (ENSAMEG00000015168)	CREB1 (ENSAMEG00000015152)	KLF7 (ENSAMEG00000015148)	CPO (ENSAMEG00000015096)	FASTKD2 (ENSAMEG00000002917)	MDH1B (ENSAMEG00000002932)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053.lb	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
American mink	MODERN SPECIES	40												MAP2 (ENSNVIG00000004578)	ENSNVIG00000004656 ##25	PTH2R (ENSNVIG00000004696)	PIKFYVE (ENSNVIG00000004742) #21	IDH1 (ENSNVIG00000004795) #22	C2orf80 (ENSNVIG00000004824) #23	CRYGA (ENSNVIG00000004882) #24	ENSNVIG00000004890	CRYGB (ENSNVIG00000004897)	CRYGC (ENSNVIG00000004904)	CRYGD (ENSNVIG00000004910) ##25	ENSNVIG00000004919 ##25	PKHM3 (ENSNVIG00000004953) #26	FZD5 (ENSNVIG00000004971)	ENSNVIG00000004981	ENSNVIG00000005020	METTL21A (ENSNVIG00000005027)	CREB1 (ENSNVIG00000005058)	KLF7 (ENSNVIG00000005091)	CBPO (ENSNVIG00000005106)
Ferret	MODERN SPECIES	265														PTH2R (ENSMPUG00000000524)	PIKFYVE (ENSMPUG00000000520) #21	IDH1 (ENSMPUG00000000516) #22	C2orf80 (ENSMPUG00000000512) #23	ENSMPUG00000000510	CRYGC (ENSMPUG00000000499)	CRYGD (ENSMPUG00000000497) ##25	ENSMPUG00000000496 ##25	PLEKHM3 (ENSMPUG00000000492) #26	FZD5 (ENSMPUG00000018918)	ENSMPUG00000000489	ENSMPUG00000000487	ENSMPUG00000018911	CREB1 (ENSMPUG00000000485)	KLF7 (ENSMPUG00000000483)	CPO (ENSMPUG00000000481)	FASTKD2 (ENSMPUG00000000477)	MDH1B (ENSMPUG00000000473)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT01030000235022.a.b	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b.hb ##25	ENSGT00940000158720.c.b.ib ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Dog	MODERN SPECIES	30	ENSCAFG00845018381	LANCL1 (ENSCAFG00845018274)	CPS1 (ENSCAFG00845017752)	MYL1 (ENSCAFG00845017241)	ENSCAFG00845017145	ACADL (ENSCAFG00845017093)	KANSL1L (ENSCAFG00845016965)	RPE (ENSCAFG00845016841)	ENSCAFG00845026723	UNC80 (ENSCAFG00845024595)	MAP2 (ENSCAFG00845024022)	ENSCAFG00845023938	ENSCAFG00845023908 ##25	PTH2R (ENSCAFG00845023795)	PIKFYVE (ENSCAFG00845023569) #21	IDH1 (ENSCAFG00845023478) #22	C37H2orf80 (ENSCAFG00845023251) #23	CRYGA (ENSCAFG00845023182) #24	CRYGB (ENSCAFG00845023028)	CRYGD (ENSCAFG00845022754) ##25	ENSCAFG00845022685 ##25	PLEKHM3 (ENSCAFG00845022580) #26	FZD5 (ENSCAFG00845022521)	CCNYL1 (ENSCAFG00845022326)	METTL21A (ENSCAFG00845022171)	CREB1 (ENSCAFG00845022020)	KLF7 (ENSCAFG00845021900)	CPO (ENSCAFG00845021788)	FASTKD2 (ENSCAFG00845021685)	MDH1B (ENSCAFG00845021551)	DYTN (ENSCAFG00845021457)
Dingo	MODERN SPECIES	398	ENSCAFG00020027302	IKZF2 (ENSCAFG00020027304)	ERBB4 (ENSCAFG00020027318)	ENSCAFG00020027327	CPS1 (ENSCAFG00020027329)	LANCL1 (ENSCAFG00020027334)	MYL1 (ENSCAFG00020027336)	ACADL (ENSCAFG00020027340)	KANSL1L (ENSCAFG00020027344)	ENSCAFG00020027348	UNC80 (ENSCAFG00020027361)	MAP2 (ENSCAFG00020027372)	ENSCAFG00020027373 ##25	PTH2R (ENSCAFG00020027375)	PIKFYVE (ENSCAFG00020027378) #21	IDH1 (ENSCAFG00020027389) #22	C2orf80 (ENSCAFG00020027395) #23	CRYGA (ENSCAFG00020027398) #24	ENSCAFG00020027399 ##24	CRYGC (ENSCAFG00020027402)	CRYGD (ENSCAFG00020027405) ##25	ENSCAFG00020027409 ##25	PLEKHM3 (ENSCAFG00020027411) #26	FZD5 (ENSCAFG00020027413)	ENSCAFG00020027415	METTL21A (ENSCAFG00020027418)	CREB1 (ENSCAFG00020027420)	KLF7 (ENSCAFG00020027423)	CPO (ENSCAFG00020027425)	FASTKD2 (ENSCAFG00020027426)	MDH1B (ENSCAFG00020027429)
Red fox	MODERN SPECIES	39	ENSVVUG00000009126	IKZF2 (ENSVVUG00000009142)	ERBB4 (ENSVVUG00000009194)	ENSVVUG00000009222	CPS1 (ENSVVUG00000009235)	LANCL1 (ENSVVUG00000009273)	ENSVVUG00000009278	MYL1 (ENSVVUG00000009295)	ACADL (ENSVVUG00000009345)	KANSL1L (ENSVVUG00000009477)	RPE (ENSVVUG00000009490)	UNC80 (ENSVVUG00000009630)	MAP2 (ENSVVUG00000009866)	PTH2R (ENSVVUG00000009949)	PIKFYVE (ENSVVUG00000010033) #21	IDH1 (ENSVVUG00000011802) #22	CUNH2orf80 (ENSVVUG00000011811) #23	CRYGA (ENSVVUG00000011815) #24	ENSVVUG00000011820 ##24	CRYGC (ENSVVUG00000011828)	CRYGD (ENSVVUG00000011838) ##25	PLEKHM3 (ENSVVUG00000011844) #26	FZD5 (ENSVVUG00000011856)	CCNYL1 (ENSVVUG00000011860)	ENSVVUG00000011880	METTL21A (ENSVVUG00000011888)	CREB1 (ENSVVUG00000011892)	KLF7 (ENSVVUG00000011906)	CPO (ENSVVUG00000011923)	FASTKD2 (ENSVVUG00000011933)	MDH1B (ENSVVUG00000011942)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.`b ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b.ab ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000158720.c.b.`b ##25	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b.ab ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b
Tiger	MODERN SPECIES	313															PIKFYVE (ENSPTIG00000011629) #21	IDH1 (ENSPTIG00000011718) #22	C2orf80 (ENSPTIG00000011733) #23	CRYGA (ENSPTIG00000011747) #24	CRYGB (ENSPTIG00000011753)	CRYGC (ENSPTIG00000011760)	CRYGD (ENSPTIG00000011767) ##25	PLEKHM3 (ENSPTIG00000011775) #26	ENSPTIG00000011797	METTL21A (ENSPTIG00000011823)	CREB1 (ENSPTIG00000011848)	KLF7 (ENSPTIG00000011869)	CPO (ENSPTIG00000011884)	FASTKD2 (ENSPTIG00000011891)	MDH1B (ENSPTIG00000011902)	DYTN (ENSPTIG00000011914)	FAM237A (ENSPTIG00000011920)
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b.`b ##25	ENSGT00940000158720.c.b.ab ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
leopard	MODERN SPECIES	12	VWC2L (ENSPPRG00000000428)	SPAG16 (ENSPPRG00000000338)	IKZF2 (ENSPPRG00000022962)	ERBB4 (ENSPPRG00000021619)	CPS1 (ENSPPRG00000017782)	LANCL1 (ENSPPRG00000014545)	MYL1 (ENSPPRG00000014175)	ACADL (ENSPPRG00000014114)	KANSL1L (ENSPPRG00000013126)	ENSPPRG00000012984	UNC80 (ENSPPRG00000012259)	MAP2 (ENSPPRG00000010961)	ENSPPRG00000009415 ##25	PTH2R (ENSPPRG00000009093)	PIKFYVE (ENSPPRG00000008871) #21	IDH1 (ENSPPRG00000008143) #22	C2orf80 (ENSPPRG00000007937) #23	CRYGA (ENSPPRG00000007869) #24	ENSPPRG00000007792 ##24	CRYGC (ENSPPRG00000007729)	CRYGD (ENSPPRG00000007631) ##25	ENSPPRG00000007573 ##25	PLEKHM3 (ENSPPRG00000007268) #26	ENSPPRG00000007043	METTL21A (ENSPPRG00000006796)	CREB1 (ENSPPRG00000006712)	KLF7 (ENSPPRG00000006377)	CPO (ENSPPRG00000006106)	FASTKD2 (ENSPPRG00000006075)	MDH1B (ENSPPRG00000005932)	DYTN (ENSPPRG00000005491)
lion	MODERN SPECIES	8	SPAG16 (ENSPLOG00000022723)	IKZF2 (ENSPLOG00000022726)	ERBB4 (ENSPLOG00000022728)	CPS1 (ENSPLOG00000022730)	LANCL1 (ENSPLOG00000022731)	MYL1 (ENSPLOG00000022732)	ACADL (ENSPLOG00000005365)	KANSL1L (ENSPLOG00000005446)	ENSPLOG00000005504	UNC80 (ENSPLOG00000005686)	MAP2 (ENSPLOG00000006126)	ENSPLOG00000006284 ##25	ENSPLOG00000006368 ##25	PTH2R (ENSPLOG00000006401)	PIKFYVE (ENSPLOG00000006516) #21	IDH1 (ENSPLOG00000006638) #22	C2orf80 (ENSPLOG00000006690) #23	CRYGA (ENSPLOG00000006776) #24	CRYGB (ENSPLOG00000006808)	CRYGC (ENSPLOG00000006841)	ENSPLOG00000006864 ##25	ENSPLOG00000006884 ##25	PLEKHM3 (ENSPLOG00000006915) #26	FZD5 (ENSPLOG00000006965)	ENSPLOG00000006998	METTL21A (ENSPLOG00000007061)	CREB1 (ENSPLOG00000007090)	KLF7 (ENSPLOG00000007130)	CPO (ENSPLOG00000007242)	FASTKD2 (ENSPLOG00000007345)	MDH1B (ENSPLOG00000007375)
Cat	MODERN SPECIES	239	SPAG16 (ENSFCAG00000015155)	ENSFCAG00000048148	IKZF2 (ENSFCAG00000036602)	ERBB4 (ENSFCAG00000027902)	CPS1 (ENSFCAG00000027460)	LANCL1 (ENSFCAG00000023129)	MYL1 (ENSFCAG00000036039)	ACADL (ENSFCAG00000024046)	KANSL1L (ENSFCAG00000027585)	ENSFCAG00000009135	UNC80 (ENSFCAG00000031298)	MAP2 (ENSFCAG00000024249)	ENSFCAG00000041864 ##25	PTH2R (ENSFCAG00000003978)	PIKFYVE (ENSFCAG00000003977) #21	IDH1 (ENSFCAG00000003976) #22	CC1H2orf80 (ENSFCAG00000003974) #23	CRYGA (ENSFCAG00000003973) #24	CRYGB (ENSFCAG00000003972)	CRYGC (ENSFCAG00000040128)	CRYGD (ENSFCAG00000042141) ##25	ENSFCAG00000046445 ##25	PLEKHM3 (ENSFCAG00000002716) #26	FZD5 (ENSFCAG00000037566)	ENSFCAG00000039577	CCNYL1 (ENSFCAG00000028003)	METTL21A (ENSFCAG00000035900)	CREB1 (ENSFCAG00000008220)	KLF7 (ENSFCAG00000002514)	CPO (ENSFCAG00000002513)	FASTKD2 (ENSFCAG00000015373)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652.f	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652.f	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.a ##25	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652.f	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000154453.b.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403
Microbat	DUPLICATION
Microbat	MODERN SPECIES	131																ENSMLUG00000028815 #22
Microbat	MODERN SPECIES	940	IKZF2 (ENSMLUG00000012494)	ENSMLUG00000023988	ENSMLUG00000022171	ENSMLUG00000016092	CPS1 (ENSMLUG00000015090)	LANCL1 (ENSMLUG00000002650)	MYL1 (ENSMLUG00000002641)	ENSMLUG00000017730	ACADL (ENSMLUG00000014508)	KANSL1L (ENSMLUG00000014487)	ENSMLUG00000014477	UNC80 (ENSMLUG00000014442)	MAP2 (ENSMLUG00000014420)	PTH2R (ENSMLUG00000008536)	PIKFYVE (ENSMLUG00000000897) #21	ENSMLUG00000000891 #22	C2orf80 (ENSMLUG00000025398) #23	CRYGC (ENSMLUG00000015767)	ENSMLUG00000028817 ##25	PLEKHM3 (ENSMLUG00000011905) #26	ENSMLUG00000016122	METTL21A (ENSMLUG00000015747)	CREB1 (ENSMLUG00000016119)	KLF7 (ENSMLUG00000009436)	CPO (ENSMLUG00000009428)	FASTKD2 (ENSMLUG00000009411)	MDH1B (ENSMLUG00000009390)	DYTN (ENSMLUG00000028179)	FAM237A (ENSMLUG00000030140)	ADAM23 (ENSMLUG00000009364)	ZDBF2 (ENSMLUG00000014265)
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	26	ENSRFEG00010017533	ENSRFEG00010017581	ERBB4 (ENSRFEG00010017623)	ENSRFEG00010018450	CPS1 (ENSRFEG00010018496)	LANCL1 (ENSRFEG00010018871)	MYL1 (ENSRFEG00010018919)	ACADL (ENSRFEG00010019011)	KANSL1L (ENSRFEG00010019059)	ENSRFEG00010019086	UNC80 (ENSRFEG00010019184)	ENSRFEG00010019323	MAP2 (ENSRFEG00010019384)	PTH2R (ENSRFEG00010019527)	PIKFYVE (ENSRFEG00010019609) #21	IDH1 (ENSRFEG00010019714) #22	C2orf80 (ENSRFEG00010019768) #23	CRYGB (ENSRFEG00010019933)	CRYGC (ENSRFEG00010019976)	PLEKHM3 (ENSRFEG00010020009) #26	FZD5 (ENSRFEG00010020064)	CCNYL1 (ENSRFEG00010020079)	METTL21A (ENSRFEG00010020119)	ENSRFEG00010020167	CREB1 (ENSRFEG00010020193)	KLF7 (ENSRFEG00010010310)	CPO (ENSRFEG00010010427)	FASTKD2 (ENSRFEG00010010475)	MDH1B (ENSRFEG00010010537)	DYTN (ENSRFEG00010010740)	FAM237A (ENSRFEG00010010918)
Megabat	MODERN SPECIES	2112														PTH2R (ENSPVAG00000008309)	PIKFYVE (ENSPVAG00000008304) #21	IDH1 (ENSPVAG00000008301) #22	C2orf80 (ENSPVAG00000008300) #23	CRYGA (ENSPVAG00000008299) #24
Equus	ANCESTRAL SPECIES	18														ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.h #24	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000156190.g ##24	ENSGT00940000159232.h.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00950000186238	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403
Horse	MODERN SPECIES	9														PTH2R (ENSECAG00000014395)	PIKFYVE (ENSECAG00000021430) #21	IDH1 (ENSECAG00000011931) #22	C18H2orf80 (ENSECAG00000011588) #23	CRYGB (ENSECAG00000010883) #24	ENSECAG00000049516 ##24	CRYGA (ENSECAG00000009588)	ENSECAG00000039306	FZD5 (ENSECAG00000007309)	PLEKHM3 (ENSECAG00000008108) #26	METTL21A (ENSECAG00000017536)	CREB1 (ENSECAG00000013667)	KLF7 (ENSECAG00000012215)	FASTKD2 (ENSECAG00000008822)	MDH1B (ENSECAG00000007491)	DYTN (ENSECAG00000006820)	FAM237A (ENSECAG00000050449)	ADAM23 (ENSECAG00000018514)
Donkey	MODERN SPECIES	24	PPP2R3B (ENSEASG00005007065)	GTPBP6 (ENSEASG00005007092)	ENSEASG00005007100	ENSEASG00005014354	ENSEASG00005038034	ENSEASG00005007510	ENSEASG00005029433	ENSEASG00005031510	ENSEASG00005013062	ENSEASG00005028249	ENSEASG00005033559	ENSEASG00005028429	ENSEASG00005031264	ENSEASG00005003104	PIKFYVE (ENSEASG00005003072) #21	IDH1 (ENSEASG00005003064) #22	C2orf80 (ENSEASG00005003060) #23	ENSEASG00005033359 #24	CRYGB (ENSEASG00005028155)	ENSEASG00005028742 #24	PLEKHM3 (ENSEASG00005003046) #26	ENSEASG00005003042	FZD5 (ENSEASG00005003041)	CCNYL1 (ENSEASG00005003014)	ENSEASG00005024979	CREB1 (ENSEASG00005002983)	KLF7 (ENSEASG00005002973)	FASTKD2 (ENSEASG00005002958)	MDH1B (ENSEASG00005002948)	DYTN (ENSEASG00005002938)	FAM237A (ENSEASG00005002935)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000158720.c.b ##25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.a.b	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00940000158781	ENSGT00440000037606.b
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b #22
Sloth	MODERN SPECIES	3168																IDH1 (ENSCHOG00000004574) #22
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00940000158781	ENSGT00440000037606.b	ENSGT00940000160642
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000159232.h.a	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00940000158781	ENSGT00440000037606.b	ENSGT00940000160642
Elephant	MODERN SPECIES	301	ENSLAFG00000010985	IKZF2 (ENSLAFG00000008236)	ENSLAFG00000032609	ENSLAFG00000030559	ENSLAFG00000006617	CPS1 (ENSLAFG00000005505)	LANCL1 (ENSLAFG00000018697)	MYL1 (ENSLAFG00000005451)	ACADL (ENSLAFG00000015099)	KANSL1L (ENSLAFG00000014134)	ENSLAFG00000014127	UNC80 (ENSLAFG00000008065)	MAP2 (ENSLAFG00000027965)	PTH2R (ENSLAFG00000009988)	PIKFYVE (ENSLAFG00000016887) #21	IDH1 (ENSLAFG00000016882) #22	C2orf80 (ENSLAFG00000016878) #23	ENSLAFG00000016874	ENSLAFG00000016869	PLEKHM3 (ENSLAFG00000030211) #26	FZD5 (ENSLAFG00000017105)	ENSLAFG00000021558	METTL21A (ENSLAFG00000017103)	CREB1 (ENSLAFG00000013257)	KLF7 (ENSLAFG00000005822)	CPO (ENSLAFG00000009772)	FASTKD2 (ENSLAFG00000005198)	MDH1B (ENSLAFG00000015578)	DYTN (ENSLAFG00000032161)	ADAM23 (ENSLAFG00000014452)	ZDBF2 (ENSLAFG00000014253)
Hyrax	MODERN SPECIES	9038																IDH1 (ENSPCAG00000010628) #22
Tenrec	MODERN SPECIES	17285																IDH1 (ENSETEG00000016494) #22
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Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00960000187202	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.j #24	ENSGT00940000156190.i #24	ENSGT00940000159232.e	ENSGT00940000159232.f	ENSGT00940000158720.a #25	ENSGT00940000158720.b #25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00960000187202	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.j #24	ENSGT00940000156190.i #24	ENSGT00940000159232.e	ENSGT00940000159232.f	ENSGT00940000158720.a #25	ENSGT00940000158720.b #25	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508
koala	MODERN SPECIES	132		ENSPCIG00000000504	IKZF2 (ENSPCIG00000000561)	ERBB4 (ENSPCIG00000024251)	CPS1 (ENSPCIG00000013468)	LANCL1 (ENSPCIG00000013464)	MYL1 (ENSPCIG00000013463)	ACADL (ENSPCIG00000013461)	KANSL1L (ENSPCIG00000013458)	ENSPCIG00000013457	UNC80 (ENSPCIG00000013438)	MAP2 (ENSPCIG00000035392)	ENSPCIG00000004335	PTH2R (ENSPCIG00000037126)	PIKFYVE (ENSPCIG00000012094) #21	IDH1 (ENSPCIG00000012090) #22	ENSPCIG00000012086	ENSPCIG00000012083 #23	ENSPCIG00000012080 #24	ENSPCIG00000012076 #24	ENSPCIG00000034463	ENSPCIG00000036210	ENSPCIG00000031919 #25	ENSPCIG00000035095 #25	PLEKHM3 (ENSPCIG00000012063) #26	FZD5 (ENSPCIG00000012060)	ENSPCIG00000012056	METTL21A (ENSPCIG00000018395)	CREB1 (ENSPCIG00000032499)	KLF7 (ENSPCIG00000018773)	CPO (ENSPCIG00000018775)
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Wallaby	MODERN SPECIES	4559																IDH1 (ENSMEUG00000009863) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	2	ENSSHAG00000025155	ENSSHAG00000004079	IKZF2 (ENSSHAG00000001687)	ERBB4 (ENSSHAG00000014078)	ENSSHAG00000025581	CPS1 (ENSSHAG00000017472)	LANCL1 (ENSSHAG00000021780)	MYL1 (ENSSHAG00000017951)	ACADL (ENSSHAG00000024844)	KANSL1L (ENSSHAG00000001897)	ENSSHAG00000025167	UNC80 (ENSSHAG00000029699)	MAP2 (ENSSHAG00000008479)	ENSSHAG00000003999	PIKFYVE (ENSSHAG00000009450) #21	IDH1 (ENSSHAG00000010387) #22	ENSSHAG00000026792	ENSSHAG00000021554 #24	ENSSHAG00000028589 #24	ENSSHAG00000026286	ENSSHAG00000011184	CRYGD (ENSSHAG00000028541) #25	ENSSHAG00000011379	PLEKHM3 (ENSSHAG00000011794) #26	FZD5 (ENSSHAG00000027632)	ENSSHAG00000013219	METTL21A (ENSSHAG00000013828)	CREB1 (ENSSHAG00000013905)	KLF7 (ENSSHAG00000015861)	CPO (ENSSHAG00000026232)	ENSSHAG00000022521
Opossum	MODERN SPECIES	6	ENSMODG00000015663	ENSMODG00000025486	IKZF2 (ENSMODG00000015683)	ERBB4 (ENSMODG00000015755)	ENSMODG00000028496	CPS1 (ENSMODG00000015793)	LANCL1 (ENSMODG00000015804)	MYL1 (ENSMODG00000015807)	ACADL (ENSMODG00000015819)	KANSL1L (ENSMODG00000015823)	ENSMODG00000015827	UNC80 (ENSMODG00000015849)	ENSMODG00000049580	PTH2R (ENSMODG00000015872)	PIKFYVE (ENSMODG00000015918) #21	IDH1 (ENSMODG00000015928) #22	ENSMODG00000041817	ENSMODG00000015937 #23	CRYGA (ENSMODG00000015939) #24	ENSMODG00000049632	ENSMODG00000044652	CRYGD (ENSMODG00000051256) #25	ENSMODG00000024830	PLEKHM3 (ENSMODG00000027343) #26	FZD5 (ENSMODG00000015949)	ENSMODG00000015954	METTL21A (ENSMODG00000015959)	CREB1 (ENSMODG00000015970)	KLF7 (ENSMODG00000015982)	CPO (ENSMODG00000015987)	FASTKD2 (ENSMODG00000015997)
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Sauria	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00960000187202	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190 #24	ENSGT00940000159232	ENSGT00940000163494.a.b.g.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00990000210950	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000158781	ENSGT00440000037606.b	ENSGT00940000160642	ENSGT00950000183014.f.a	ENSGT00940000153514.b
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00990000210950	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000158781	ENSGT00940000160642	ENSGT00950000183014.f.a	ENSGT00940000153514.b	ENSGT00940000157974
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	42														ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000158781	ENSGT00940000160642	ENSGT00950000183014.f.a
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	12	RFTN2 (ENSSMRG00000020265)	MOB4 (ENSSMRG00000020267)	HSPE1 (ENSSMRG00000020269)	HSPD1 (ENSSMRG00000020273)	COQ10B (ENSSMRG00000020275)	SF3B1 (ENSSMRG00000020276)	ANKRD44 (ENSSMRG00000020279)	PGAP1 (ENSSMRG00000020281)	CFLAR (ENSSMRG00000020283)	ENSSMRG00000020284	TRAK2 (ENSSMRG00000020286)	MLNR (ENSSMRG00000020287)	ENSSMRG00000020288	PTH2R (ENSSMRG00000020291)	PIKFYVE (ENSSMRG00000020308) #21	IDH1 (ENSSMRG00000020311) #22	ENSSMRG00000020312	C2orf80 (ENSSMRG00000020315) #23	PLEKHM3 (ENSSMRG00000020318) #26	ENSSMRG00000020321	ENSSMRG00000020322	METTL21A (ENSSMRG00000020324)	CREB1 (ENSSMRG00000020325)	KLF7 (ENSSMRG00000020327)	FASTKD2 (ENSSMRG00000020328)	MDH1B (ENSSMRG00000020330)	FAM237A (ENSSMRG00000020332)	ADAM23 (ENSSMRG00000020333)	CMKLR2 (ENSSMRG00000020632)	EEF1B2 (ENSSMRG00000020633)	NDUFS1 (ENSSMRG00000020638)
Common wall lizard	MODERN SPECIES		RAB17 (ENSPMRG00000002014)	ENSPMRG00000002010	MLPH (ENSPMRG00000001979)	COPS8 (ENSPMRG00000001949)	ENSPMRG00000001932	IQCA1 (ENSPMRG00000001911)	ASB18 (ENSPMRG00000001902)	GBX2 (ENSPMRG00000001897)	ENSPMRG00000001891	AGAP1 (ENSPMRG00000001831)	TRPM8 (ENSPMRG00000001779)	ENSPMRG00000001769	ARL4C (ENSPMRG00000001763)	PTH2R (ENSPMRG00000001701)	PIKFYVE (ENSPMRG00000000782) #21	IDH1 (ENSPMRG00000000420) #22	C2orf80 (ENSPMRG00000000402) #23	PLEKHM3 (ENSPMRG00000000374) #26	ENSPMRG00000000354	ENSPMRG00000000317	ENSPMRG00000000296	METTL21A (ENSPMRG00000000269)	CREB1 (ENSPMRG00000000233)	KLF7 (ENSPMRG00000000188)	FASTKD2 (ENSPMRG00000000149)	ENSPMRG00000000143	ENSPMRG00000000134	DYTN (ENSPMRG00000000114)	FAM237A (ENSPMRG00000009266)	ADAM23 (ENSPMRG00000009258)	NDUFS1 (ENSPMRG00000009096)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00990000210950	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00940000158781	ENSGT00940000160642	ENSGT00950000183014.f.a	ENSGT00940000153514.b	ENSGT00940000157974	ENSGT00940000155270
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137.e	ENSGT00940000157137.f	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00990000210950	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00960000187202	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000158781	ENSGT00940000160642	ENSGT00950000183014.f.a	ENSGT00940000153514.b	ENSGT00940000157974	ENSGT00940000155270
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137.e	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00990000210950	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b.g #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00960000187202	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000158781	ENSGT00940000160642	ENSGT00950000183014.f.a	ENSGT00940000153514.b	ENSGT00940000157974	ENSGT00940000155270
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137.e	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00990000210950	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00990000211987	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b.g #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00960000187202	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000158781	ENSGT00940000160642	ENSGT00950000183014.f.a	ENSGT00940000153514.b	ENSGT00940000157974	ENSGT00940000155270
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	50	IKZF2 (ENSNSUG00000004175)	ENSNSUG00000004221	ERBB4 (ENSNSUG00000004236)	CPS1 (ENSNSUG00000004536)	ENSNSUG00000004700	LANCL1 (ENSNSUG00000004707)	MYL1 (ENSNSUG00000004715)	ACADL (ENSNSUG00000004717)	KANSL1L (ENSNSUG00000004719)	ENSNSUG00000004721	ENSNSUG00000004723	UNC80 (ENSNSUG00000004726)	ENSNSUG00000004751	PTH2R (ENSNSUG00000004799)	PIKFYVE (ENSNSUG00000004809) #21	IDH1 (ENSNSUG00000004817) #22	ENSNSUG00000004820	ENSNSUG00000004822	PLEKHM3 (ENSNSUG00000004824) #26	ENSNSUG00000004832	ENSNSUG00000004833	ENSNSUG00000004835	METTL21A (ENSNSUG00000004836)	CREB1 (ENSNSUG00000004838)	KLF7 (ENSNSUG00000004849)	FASTKD2 (ENSNSUG00000004850)	MDH1B (ENSNSUG00000004966)	ADAM23 (ENSNSUG00000004968)	CMKLR2 (ENSNSUG00000004973)	EEF1B2 (ENSNSUG00000004974)	NDUFS1 (ENSNSUG00000004982)
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	36	SPAG16 (ENSPTXG00000007151)	IKZF2 (ENSPTXG00000007156)	ERBB4 (ENSPTXG00000007162)	CPS1 (ENSPTXG00000007248)	ENSPTXG00000007250	LANCL1 (ENSPTXG00000007251)	MYL1 (ENSPTXG00000007252)	ACADL (ENSPTXG00000007253)	KANSL1L (ENSPTXG00000007254)	ENSPTXG00000007255	ENSPTXG00000007256	UNC80 (ENSPTXG00000007262)	ENSPTXG00000007270	PTH2R (ENSPTXG00000007351)	PIKFYVE (ENSPTXG00000007358) #21	IDH1 (ENSPTXG00000008132) #22	PLEKHM3 (ENSPTXG00000008135) #26	ENSPTXG00000008136	ENSPTXG00000008137	METTL21A (ENSPTXG00000008138)	CREB1 (ENSPTXG00000008139)	KLF7 (ENSPTXG00000008140)	FASTKD2 (ENSPTXG00000008144)	MDH1B (ENSPTXG00000008146)	ADAM23 (ENSPTXG00000008147)	CMKLR2 (ENSPTXG00000008154)	EEF1B2 (ENSPTXG00000008156)	NDUFS1 (ENSPTXG00000008161)	INO80D (ENSPTXG00000008163)	NRP2 (ENSPTXG00000008167)	PARD3B (ENSPTXG00000008179)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	5434																IDH1 (ENSLLTG00000015007) #22	ENSLLTG00000015003
Indian cobra	MODERN SPECIES		ENSNNAG00000004078	IKZF2 (ENSNNAG00000004094)	ENSNNAG00000004158	ERBB4 (ENSNNAG00000004204)	CPS1 (ENSNNAG00000004686)	ENSNNAG00000004905	LANCL1 (ENSNNAG00000004916)	MYL1 (ENSNNAG00000004947)	ACADL (ENSNNAG00000005029)	KANSL1L (ENSNNAG00000005103)	ENSNNAG00000005141	UNC80 (ENSNNAG00000005183)	ENSNNAG00000005292	PTH2R (ENSNNAG00000005410)	PIKFYVE (ENSNNAG00000005522) #21	IDH1 (ENSNNAG00000005790) #22	ENSNNAG00000005828	ENSNNAG00000005842	PLEKHM3 (ENSNNAG00000005905) #26	ENSNNAG00000005932	ENSNNAG00000005945	METTL21A (ENSNNAG00000005999)	CREB1 (ENSNNAG00000006029)	KLF7 (ENSNNAG00000006050)	FASTKD2 (ENSNNAG00000006083)	MDH1B (ENSNNAG00000006119)	ADAM23 (ENSNNAG00000006219)	CMKLR2 (ENSNNAG00000006981)	EEF1B2 (ENSNNAG00000006992)	NDUFS1 (ENSNNAG00000007093)	INO80D (ENSNNAG00000007613)
Lizard	MODERN SPECIES	3	GCLM (ENSACAG00000005305)	ENSACAG00000005267	ABCA4 (ENSACAG00000005200)	ARHGAP29 (ENSACAG00000005112)	ENSACAG00000043414	ABCD3 (ENSACAG00000004947)	F3 (ENSACAG00000004924)	SLC44A3 (ENSACAG00000004877)	CNN3 (ENSACAG00000004856)	ALG14 (ENSACAG00000004845)	TLCD4 (ENSACAG00000037070)	ENSACAG00000004808	RWDD3 (ENSACAG00000004789)	PTH2R (ENSACAG00000011092)	PIKFYVE (ENSACAG00000009917) #21	IDH1 (ENSACAG00000009873) #22	ENSACAG00000029434	C2orf80 (ENSACAG00000028731) #23	POFUT2 (ENSACAG00000009812)	ENSACAG00000009710	ENSACAG00000009709	ENSACAG00000037091	ENSACAG00000035048	ENSACAG00000041896	ENSACAG00000038004	ENSACAG00000035141	PTBP2 (ENSACAG00000005600)	ENSACAG00000041271	DPYD (ENSACAG00000005513)	ENSACAG00000035101	ENSACAG00000039514
tuatara	MODERN SPECIES	12													PIKFYVE (ENSSPUG00000004794) #21	ENSSPUG00000004851	ENSSPUG00000004857	IDH1 (ENSSPUG00000004871) #22	ENSSPUG00000004882	ENSSPUG00000004889	ENSSPUG00000004902	ENSSPUG00000004993	PLEKHM3 (ENSSPUG00000005079) #26	ENSSPUG00000005100	ENSSPUG00000005111	METTL21A (ENSSPUG00000005152)	CREB1 (ENSSPUG00000005164)
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00960000189051	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00960000187202	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000163494.a.b.g.a	ENSGT00940000163322.a.b	ENSGT00940000156190 #24	ENSGT00940000159232	ENSGT00940000163494.a.b.g.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00960000189051	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT01030000235330	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00960000187202	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00390000015769.B	ENSGT00940000158781	ENSGT00440000037606.b	ENSGT00940000160642
Aves	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00960000189051	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b.j.b	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000159232	ENSGT00940000163494.a.b.g.b	ENSGT00940000155041	ENSGT00390000017619	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552	ENSGT00530000063873.A	ENSGT00530000063873.B	ENSGT00390000000801	ENSGT00950000183214.a.b.a.b	ENSGT00940000155270	ENSGT00940000157974
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00440000038972	ENSGT00730000111148	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00940000155611.r.b	ENSGT00940000153458.B	ENSGT00940000155392	ENSGT00940000158443	ENSGT00940000157578.o	ENSGT00940000160478	ENSGT00940000158532	ENSGT00940000160192	ENSGT00940000157043	ENSGT00940000155558	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b.j.b	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000163494.a.b.g.b	ENSGT00940000155041	ENSGT00390000017619	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552	ENSGT00530000063873.A	ENSGT00530000063873.B	ENSGT00390000000801	ENSGT00950000183214.a.b.a.b	ENSGT00940000155270	ENSGT00940000157974	ENSGT00940000153514.b
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00730000111148	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00940000155611.r.b	ENSGT00940000153458.B	ENSGT00940000155392	ENSGT00940000158443	ENSGT00940000157578.o	ENSGT00940000157578.p	ENSGT00940000160478	ENSGT00940000158532	ENSGT00940000160192	ENSGT00940000157043	ENSGT00940000155558	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b.j.b	ENSGT00940000155041	ENSGT00390000017619	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552	ENSGT00530000063873.A	ENSGT00530000063873.B	ENSGT00390000000801	ENSGT00950000183214.a.b.a.b	ENSGT00940000155270	ENSGT00940000157974	ENSGT00940000153514.b	ENSGT00950000183014.f.a	ENSGT00970000193449
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01100000263523.A	ENSGT00440000038972	ENSGT00730000111148	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00940000153458.B	ENSGT00940000155392	ENSGT00940000158443	ENSGT00940000157578.o	ENSGT00940000157578.p	ENSGT00940000160478	ENSGT00940000158532	ENSGT00940000160192	ENSGT00940000157043	ENSGT00940000155558	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b.j.b	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000163494.a.b.g.b	ENSGT00940000155041	ENSGT00390000017619	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552	ENSGT00530000063873.A	ENSGT00530000063873.B	ENSGT00390000000801	ENSGT00950000183214.a.b.a.b	ENSGT00940000155270	ENSGT00940000157974	ENSGT00940000153514.b
Golden eagle	MODERN SPECIES	22	ENSACCG00020003103	ENSACCG00020003079	SESTD1 (ENSACCG00020003049)	ZNF385B (ENSACCG00020003027)	CWC22 (ENSACCG00020002902)	UBE2E3 (ENSACCG00020002761)	ENSACCG00020002749	ENSACCG00020002721	ENSACCG00020002697	ENSACCG00020002671	NEUROD1 (ENSACCG00020002645)	ITPRID2 (ENSACCG00020002630)	PDE1A (ENSACCG00020002575)	DNAJC10 (ENSACCG00020002475)	PIKFYVE (ENSACCG00020002433) #21	IDH1 (ENSACCG00020002412) #22	ENSACCG00020002399	ENSACCG00020002387	ENSACCG00020002374	ENSACCG00020002359	NBEAL1 (ENSACCG00020001867)	ENSACCG00020001270	CYP20A1 (ENSACCG00020001252)	ABI2 (ENSACCG00020001210)	RAPH1 (ENSACCG00020001057)	CD28 (ENSACCG00020000853)	CTLA4 (ENSACCG00020000823)	ICOS (ENSACCG00020000759)	PARD3B (ENSACCG00020000685)	NRP2 (ENSACCG00020000561)	INO80D (ENSACCG00020000521)
Kakapo	MODERN SPECIES	22	ZNF385B (ENSSHBG00005008869)	CWC22 (ENSSHBG00005008856)	UBE2E3 (ENSSHBG00005008848)	ENSSHBG00005008841	ENSSHBG00005008833	ENSSHBG00005008821	ENSSHBG00005008817	ENSSHBG00005008779	NEUROD1 (ENSSHBG00005008762)	ITPRID2 (ENSSHBG00005007068)	PPP1R1C (ENSSHBG00005006867)	PDE1A (ENSSHBG00005005190)	ENSSHBG00005005130	ENSSHBG00005005122	ENSSHBG00005005117	IDH1 (ENSSHBG00005005110) #22	ENSSHBG00005005104	C2orf80 (ENSSHBG00005005096) #23	ENSSHBG00005005091	NBEAL1 (ENSSHBG00005003608)	ENSSHBG00005002906	CYP20A1 (ENSSHBG00005002889)	ABI2 (ENSSHBG00005002858)	RAPH1 (ENSSHBG00005002809)	CTLA4 (ENSSHBG00005002762)	ICOS (ENSSHBG00005002727)	PARD3B (ENSSHBG00005002706)	ENSSHBG00005002675	NRP2 (ENSSHBG00005002621)	INO80D (ENSSHBG00005002582)	NDUFS1 (ENSSHBG00005002546)
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00730000111148	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00940000155611.r.b	ENSGT00940000153458.B	ENSGT00940000155392	ENSGT00940000158443	ENSGT00940000157578.o	ENSGT00940000157578.p	ENSGT00940000160478	ENSGT00940000158532	ENSGT00940000160192	ENSGT00940000157043	ENSGT00940000155558	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b.j.b	ENSGT00940000155041	ENSGT00390000017619	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552	ENSGT00530000063873.A	ENSGT00530000063873.B	ENSGT00390000000801	ENSGT00950000183214.a.b.a.b	ENSGT00940000155270	ENSGT00940000157974	ENSGT00940000153514.b	ENSGT00950000183014.f.a	ENSGT00970000193449
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Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00440000038972	ENSGT00730000111148	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00940000155611.r.b	ENSGT00940000153458.B	ENSGT00940000155392	ENSGT00940000158443	ENSGT00940000157578.o	ENSGT00940000160478	ENSGT00940000158532	ENSGT00940000160192	ENSGT00940000157043	ENSGT00940000155558	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00940000177631	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b.j.b	ENSGT00940000155041.n	ENSGT00390000017619	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552	ENSGT00530000063873.A	ENSGT00530000063873.B	ENSGT00390000000801	ENSGT00950000183214.a.b.a.b	ENSGT00940000155270	ENSGT00940000157974	ENSGT00940000153514.b	ENSGT00950000183014.f.a	ENSGT00970000193449
Common canary	MODERN SPECIES	8	ENSSCAG00000000382	SESTD1 (ENSSCAG00000000419)	ENSSCAG00000000430	ENSSCAG00000000441	CWC22 (ENSSCAG00000000535)	UBE2E3 (ENSSCAG00000000814)	ITGA4 (ENSSCAG00000000942)	ENSSCAG00000001329	ENSSCAG00000001339	NEUROD1 (ENSSCAG00000001352)	ITPRID2 (ENSSCAG00000001386)	PPP1R1C (ENSSCAG00000001436)	PDE1A (ENSSCAG00000001471)	DNAJC10 (ENSSCAG00000001534)	PIKFYVE (ENSSCAG00000001572) #21	IDH1 (ENSSCAG00000001636) #22	ENSSCAG00000001645	NBEAL1 (ENSSCAG00000001665)	ENSSCAG00000001706	CYP20A1 (ENSSCAG00000001710)	ABI2 (ENSSCAG00000001723)	RAPH1 (ENSSCAG00000001749)	CD28 (ENSSCAG00000001788)	CTLA4 (ENSSCAG00000001805)	ICOS (ENSSCAG00000001811)	PARD3B (ENSSCAG00000001874)	NRP2 (ENSSCAG00000002055)	INO80D (ENSSCAG00000002336)	NDUFS1 (ENSSCAG00000002344)	EEF1B2 (ENSSCAG00000002352)	ENSSCAG00000002359
Zebra finch	MODERN SPECIES	29	ENSTGUG00000023081	CCDC141 (ENSTGUG00000009285)	SESTD1 (ENSTGUG00000009296)	ZNF385B (ENSTGUG00000009316)	CWC22 (ENSTGUG00000009340)	UBE2E3 (ENSTGUG00000023515)	ITGA4 (ENSTGUG00000009384)	CERKL (ENSTGUG00000009459)	NEUROD1 (ENSTGUG00000018920)	ITPRID2 (ENSTGUG00000009469)	PPP1R1C (ENSTGUG00000025209)	PDE1A (ENSTGUG00000009501)	DNAJC10 (ENSTGUG00000009565)	PIKFYVE (ENSTGUG00000009607) #21	ENSTGUG00000028065	IDH1 (ENSTGUG00000023800) #22	ENSTGUG00000018851	NBEAL1 (ENSTGUG00000029141)	ENSTGUG00000025723	CYP20A1 (ENSTGUG00000009709)	ABI2 (ENSTGUG00000009728)	RAPH1 (ENSTGUG00000009747)	CD28 (ENSTGUG00000016732)	CTLA4 (ENSTGUG00000009756)	ICOS (ENSTGUG00000009766)	ENSTGUG00000025370	PARD3B (ENSTGUG00000009770)	NRP2 (ENSTGUG00000009797)	INO80D (ENSTGUG00000009890)	NDUFS1 (ENSTGUG00000009895)	EEF1B2 (ENSTGUG00000009931)
Medium ground finch	MODERN SPECIES	1	ENSGFOG00000002781	CCDC141 (ENSGFOG00000002806)	SESTD1 (ENSGFOG00000002928)	ENSGFOG00000002977	ZNF385B (ENSGFOG00000002990)	CWC22 (ENSGFOG00000003009)	UBE2E3 (ENSGFOG00000003037)	ITGA4 (ENSGFOG00000003107)	ENSGFOG00000004303	NEUROD1 (ENSGFOG00000004323)	ITPRID2 (ENSGFOG00000004331)	PPP1R1C (ENSGFOG00000004599)	PDE1A (ENSGFOG00000004634)	DNAJC10 (ENSGFOG00000004722)	PIKFYVE (ENSGFOG00000004768) #21	IDH1 (ENSGFOG00000004936) #22	ENSGFOG00000004948	NBEAL1 (ENSGFOG00000005037)	ENSGFOG00000006136	CYP20A1 (ENSGFOG00000006144)	ABI2 (ENSGFOG00000006158)	RAPH1 (ENSGFOG00000006191)	CD28 (ENSGFOG00000006204)	CTLA4 (ENSGFOG00000006210)	ICOS (ENSGFOG00000006216)	ENSGFOG00000006219	PARD3B (ENSGFOG00000006247)	NRP2 (ENSGFOG00000006567)	INO80D (ENSGFOG00000006596)	NDUFS1 (ENSGFOG00000006610)	EEF1B2 (ENSGFOG00000006636)
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.d	ENSGT01100000263523.A	ENSGT00440000038972	ENSGT00730000111148	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00940000153458.B	ENSGT00940000155392	ENSGT00940000158443	ENSGT00940000157578.o	ENSGT00940000160478	ENSGT00940000158532	ENSGT00940000160192	ENSGT00940000157043	ENSGT00940000155558	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b.j.b	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000163494.a.b.g.b	ENSGT00940000155041	ENSGT00390000017619	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552	ENSGT00530000063873.A	ENSGT00530000063873.B	ENSGT00390000000801	ENSGT00950000183214.a.b.a.b	ENSGT00940000155270	ENSGT00940000157974	ENSGT00940000153514.b
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.d	ENSGT01100000263523.A	ENSGT00440000038972	ENSGT00730000111148	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00940000153458.B	ENSGT00940000155392	ENSGT00940000158443	ENSGT00940000157578.o	ENSGT00940000160478	ENSGT00940000158532	ENSGT00940000160192	ENSGT00940000157043	ENSGT00940000155558	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b.j.b	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000163494.a.b.g.b	ENSGT00940000155041	ENSGT00390000017619	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552	ENSGT00530000063873.A	ENSGT00530000063873.B	ENSGT00390000000801	ENSGT00950000183214.a.b.a.b	ENSGT00940000155270	ENSGT00940000157974	ENSGT00940000153514.b
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	20	ENSABRG00000004343	ENSABRG00000004369	CCDC141 (ENSABRG00000004385)	SESTD1 (ENSABRG00000004572)	ZNF385B (ENSABRG00000004629)	CWC22 (ENSABRG00000004650)	UBE2E3 (ENSABRG00000004707)	ITGA4 (ENSABRG00000004733)	CERKL (ENSABRG00000004753)	NEUROD1 (ENSABRG00000004771)	ITPRID2 (ENSABRG00000004783)	ENSABRG00000004846	PDE1A (ENSABRG00000004850)	DNAJC10 (ENSABRG00000004922)	PIKFYVE (ENSABRG00000005739) #21	IDH1 (ENSABRG00000006852) #22	ENSABRG00000006873	C2orf80 (ENSABRG00000006880) #23	ENSABRG00000006883	NBEAL1 (ENSABRG00000007015)	ENSABRG00000008369	ENSABRG00000008403
Duck	MODERN SPECIES	25	BIN1 (ENSAPLG00000012452)	CYP27C1 (ENSAPLG00000012186)	ERCC3 (ENSAPLG00000012068)	THSD7B (ENSAPLG00000002773)	UBE2E3 (ENSAPLG00000011305)	ITGA4 (ENSAPLG00000011547)	ENSAPLG00000026156	ENSAPLG00000012428	NEUROD1 (ENSAPLG00000020272)	ITPRID2 (ENSAPLG00000012488)	PPP1R1C (ENSAPLG00000028661)	PDE1A (ENSAPLG00000012827)	ENSAPLG00000013405	ENSAPLG00000028706	PIKFYVE (ENSAPLG00000014164) #21	IDH1 (ENSAPLG00000014810) #22	ENSAPLG00000015011	ENSAPLG00000018471	ENSAPLG00000024504	ENSAPLG00000017302	ENSAPLG00000027901	ENSAPLG00000025723	ENSAPLG00000025132	CYP20A1 (ENSAPLG00000015942)	ABI2 (ENSAPLG00000016216)	RAPH1 (ENSAPLG00000000860)	CD28 (ENSAPLG00000001723)	CTLA4 (ENSAPLG00000001966)	ICOS (ENSAPLG00000002410)	PARD3B (ENSAPLG00000002583)	NRP2 (ENSAPLG00000002735)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.d	ENSGT01100000263523.A	ENSGT00440000038972	ENSGT00730000111148	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00940000153458.B	ENSGT00940000155392	ENSGT00940000158443	ENSGT00940000157578.o	ENSGT00940000160478	ENSGT00940000158532	ENSGT00940000160192	ENSGT00940000157043	ENSGT00940000155558	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b.j.b	ENSGT00940000155041	ENSGT00390000017619	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552	ENSGT00530000063873.A	ENSGT00530000063873.B	ENSGT00390000000801	ENSGT00950000183214.a.b.a.b	ENSGT00940000155270	ENSGT00940000157974	ENSGT00940000153514.b	ENSGT00950000183014.f.a	ENSGT00940000160642
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.d	ENSGT01100000263523.A	ENSGT00440000038972	ENSGT00730000111148	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00940000153458.B	ENSGT00940000155392	ENSGT00940000158443	ENSGT00940000157578.o	ENSGT00940000160478	ENSGT00940000158532	ENSGT00940000160192	ENSGT00940000157043	ENSGT00940000155558	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b.j.b	ENSGT00940000155041	ENSGT00390000017619	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000156089	ENSGT00940000156552	ENSGT00530000063873.A	ENSGT00530000063873.B	ENSGT00390000000801	ENSGT00950000183214.a.b.a.b	ENSGT00940000155270	ENSGT00940000157974	ENSGT00940000153514.b	ENSGT00950000183014.f.a	ENSGT00940000160642
Chicken	MODERN SPECIES	36	PLEKHA3 (ENSGALG00010023496)	TTN (ENSGALG00010022969)	CCDC141 (ENSGALG00010026242)	SESTD1 (ENSGALG00010026183)	ZNF385B (ENSGALG00010026154)	CWC22 (ENSGALG00010026114)	UBE2E3 (ENSGALG00010026078)	ITGA4 (ENSGALG00010026062)	CERKL (ENSGALG00010026044)	NEUROD1 (ENSGALG00010026026)	ITPRID2 (ENSGALG00010022406)	PPP1R1C (ENSGALG00010022396)	PDE1A (ENSGALG00010022334)	DNAJC10 (ENSGALG00010022293)	PIKFYVE (ENSGALG00010022245) #21	IDH1 (ENSGALG00010022213) #22	ENSGALG00010022181	NBEAL1 (ENSGALG00010022149)	ENSGALG00010022124	CYP20A1 (ENSGALG00010022116)	ABI2 (ENSGALG00010022079)	RAPH1 (ENSGALG00010022033)	CD28 (ENSGALG00010021995)	CTLA4 (ENSGALG00010021983)	ICOS (ENSGALG00010021971)	PARD3B (ENSGALG00010021734)	NRP2 (ENSGALG00010026008)	INO80D (ENSGALG00010025994)	NDUFS1 (ENSGALG00010025984)	EEF1B2 (ENSGALG00010025974)	GPR1 (ENSGALG00010025960)
Turkey	MODERN SPECIES	27	ENSMGAG00000022099	ENSMGAG00000019104	ENSMGAG00000019342	ENSMGAG00000016742	CCDC141 (ENSMGAG00000009304)	SESTD1 (ENSMGAG00000009282)	ZNF385B (ENSMGAG00000009267)	CWC22 (ENSMGAG00000009220)	UBE2E3 (ENSMGAG00000009214)	ENSMGAG00000009146	CERKL (ENSMGAG00000009130)	ITPRID2 (ENSMGAG00000009083)	PPP1R1C (ENSMGAG00000009069)	PDE1A (ENSMGAG00000009032)	ENSMGAG00000008939 #21	ENSMGAG00000008920 #22	ENSMGAG00000008985	ENSMGAG00000019768	NBEAL1 (ENSMGAG00000008870)	ENSMGAG00000019797	CYP20A1 (ENSMGAG00000008831)	ABI2 (ENSMGAG00000008821)	RAPH1 (ENSMGAG00000008794)	CD28 (ENSMGAG00000008783)	CTLA4 (ENSMGAG00000008759)	ICOS (ENSMGAG00000008751)	ENSMGAG00000021009	PARD3B (ENSMGAG00000008728)	INO80D (ENSMGAG00000008621)	NDUFS1 (ENSMGAG00000008573)	EEF1B2 (ENSMGAG00000008548)
Japanese quail	MODERN SPECIES	25	ENSCJPG00005017331	ENSCJPG00005017330	CCDC141 (ENSCJPG00005017329)	SESTD1 (ENSCJPG00005017328)	ZNF385B (ENSCJPG00005017319)	CWC22 (ENSCJPG00005017318)	UBE2E3 (ENSCJPG00005017308)	ITGA4 (ENSCJPG00005016736)	CERKL (ENSCJPG00005016733)	NEUROD1 (ENSCJPG00005016724)	ITPRID2 (ENSCJPG00005016723)	PPP1R1C (ENSCJPG00005016722)	PDE1A (ENSCJPG00005016432)	DNAJC10 (ENSCJPG00005016431)	PIKFYVE (ENSCJPG00005016284) #21	IDH1 (ENSCJPG00005016283) #22	ENSCJPG00005016282	NBEAL1 (ENSCJPG00005015909)	ENSCJPG00005015898	CYP20A1 (ENSCJPG00005015897)	ABI2 (ENSCJPG00005015864)	EEF1B2 (ENSCJPG00005015859)	NDUFS1 (ENSCJPG00005015858)	INO80D (ENSCJPG00005015857)	NRP2 (ENSCJPG00005015851)	ENSCJPG00005015848	ENSCJPG00005015847	ENSCJPG00005015846	PARD3B (ENSCJPG00005015409)	ICOS (ENSCJPG00005015381)	CTLA4 (ENSCJPG00005015379)
African ostrich	MODERN SPECIES	1071	BARD1 (ENSSCUG00000013356)	VWC2L (ENSSCUG00000013355)	SPAG16 (ENSSCUG00000013354)	IKZF2 (ENSSCUG00000013350)	ERBB4 (ENSSCUG00000013317)	CPS1 (ENSSCUG00000013255)	LANCL1 (ENSSCUG00000013218)	MYL1 (ENSSCUG00000013213)	ACADL (ENSSCUG00000013211)	KANSL1L (ENSSCUG00000013205)	ENSSCUG00000013202	UNC80 (ENSSCUG00000013197)	MAP2 (ENSSCUG00000013191)	PTH2R (ENSSCUG00000013187)	PIKFYVE (ENSSCUG00000013177) #21	IDH1 (ENSSCUG00000013175) #22	ENSSCUG00000013173	C2orf80 (ENSSCUG00000013171) #23	ENSSCUG00000013166	ENSSCUG00000013162	NBEAL1 (ENSSCUG00000013063)	ABI2 (ENSSCUG00000013010)	RAPH1 (ENSSCUG00000013003)	CD28 (ENSSCUG00000012996)	CTLA4 (ENSSCUG00000012995)	ENSSCUG00000012993	PARD3B (ENSSCUG00000012989)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	66	ENSCPRG00005003324	ENSCPRG00005003312	ENSCPRG00005003294	IKZF2 (ENSCPRG00005003290)	ERBB4 (ENSCPRG00005003197)	CPS1 (ENSCPRG00005002612)	LANCL1 (ENSCPRG00005002510)	MYL1 (ENSCPRG00005002506)	ACADL (ENSCPRG00005002494)	KANSL1L (ENSCPRG00005002482)	ENSCPRG00005002478	ENSCPRG00005002476	UNC80 (ENSCPRG00005002350)	ENSCPRG00005002217	PIKFYVE (ENSCPRG00005002112) #21	IDH1 (ENSCPRG00005002078) #22	ENSCPRG00005002066	C2orf80 (ENSCPRG00005002051) #23	ENSCPRG00005002039	CRYGA (ENSCPRG00005002034) #24	ENSCPRG00005002022	ENSCPRG00005002018	PLEKHM3 (ENSCPRG00005002005) #26	ENSCPRG00005002000	ENSCPRG00005001990	METTL21A (ENSCPRG00005001979)	CREB1 (ENSCPRG00005001961)	KLF7 (ENSCPRG00005001954)	CPO (ENSCPRG00005001934)	FASTKD2 (ENSCPRG00005001926)	MDH1B (ENSCPRG00005001923)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00960000189051	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190 #24	ENSGT00940000159232	ENSGT00940000163494.a.b.g.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403	ENSGT00390000015769.B
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00960000189051	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000163494.a.b.g.a	ENSGT00940000163322.a.b	ENSGT00940000156190 #24	ENSGT00940000159232	ENSGT00940000163494.a.b.g.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156532	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000156190.c.a #24	ENSGT00940000159232	ENSGT00940000163494.a.b.g.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508	ENSGT01030000234607.A.b	ENSGT00530000063410.b	ENSGT00940000162403
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	25	VWC2L (ENSTMTG00000002929)	ENSTMTG00000002921	ENSTMTG00000002912	IKZF2 (ENSTMTG00000002878)	ERBB4 (ENSTMTG00000002803)	CPS1 (ENSTMTG00000002766)	LANCL1 (ENSTMTG00000002758)	MYL1 (ENSTMTG00000002746)	ACADL (ENSTMTG00000002733)	KANSL1L (ENSTMTG00000002723)	ENSTMTG00000002718	UNC80 (ENSTMTG00000002568)	ENSTMTG00000002484	PTH2R (ENSTMTG00000002463)	PIKFYVE (ENSTMTG00000001522) #21	IDH1 (ENSTMTG00000001317) #22	C2orf80 (ENSTMTG00000001308) #23	ENSTMTG00000001300 #24	ENSTMTG00000001290 #24	ENSTMTG00000001279 #24	ENSTMTG00000001256	ENSTMTG00000001219	PLEKHM3 (ENSTMTG00000001191) #26	ENSTMTG00000001184	ENSTMTG00000001162	METTL21A (ENSTMTG00000001153)	CREB1 (ENSTMTG00000001136)	KLF7 (ENSTMTG00000001122)	CPO (ENSTMTG00000001098)	FASTKD2 (ENSTMTG00000001072)	MDH1B (ENSTMTG00000001002)
painted turtle	MODERN SPECIES	805														PTH2R (ENSCPBG00000021250)	PIKFYVE (ENSCPBG00000021070) #21	IDH1 (ENSCPBG00000020969) #22	ENSCPBG00000020937	C2orf80 (ENSCPBG00000020892) #23	ENSCPBG00000020867	ENSCPBG00000020845 #25	ENSCPBG00000020830 #25	ENSCPBG00000020799	ENSCPBG00000020642	CRYGA (ENSCPBG00000020534) #24	ENSCPBG00000020500	ENSCPBG00000020472	PLEKHM3 (ENSCPBG00000020373) #26	ENSCPBG00000020270	ENSCPBG00000020210	METTL21A (ENSCPBG00000020196)	CREB1 (ENSCPBG00000020191)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00720000108792.B	ENSGT00940000155053	ENSGT00940000157137	ENSGT00940000154695	ENSGT00940000157192	ENSGT00960000189051	ENSGT00530000063186.b.b	ENSGT01030000234570.d.a	ENSGT00940000157652	ENSGT00530000063688.a	ENSGT00390000001447	ENSGT00640000091496	ENSGT00940000156597.b	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000154107.b	ENSGT00390000004840 #23	ENSGT00940000163322.a.b.f	ENSGT00940000163494.a.b.g.a	ENSGT00940000163322.a.b.e	ENSGT00940000156190 #24	ENSGT00960000190368	ENSGT00940000163494.a.b.g.b	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161508
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	2	VWC2L (ENSGEVG00005014438)	ENSGEVG00005014460	ENSGEVG00005014540	IKZF2 (ENSGEVG00005014648)	ERBB4 (ENSGEVG00005015015)	CPS1 (ENSGEVG00005015920)	ENSGEVG00005016107	LANCL1 (ENSGEVG00005016202)	MYL1 (ENSGEVG00005016236)	ACADL (ENSGEVG00005016296)	KANSL1L (ENSGEVG00005016332)	ENSGEVG00005016355	UNC80 (ENSGEVG00005004294)	ENSGEVG00005004848	PTH2R (ENSGEVG00005005111)	IDH1 (ENSGEVG00005005468) #22	C2orf80 (ENSGEVG00005005500) #23	ENSGEVG00005005557	ENSGEVG00005005635	ENSGEVG00005005668	CRYGA (ENSGEVG00005005709) #24	ENSGEVG00005005746	ENSGEVG00005005756	PLEKHM3 (ENSGEVG00005005792) #26	ENSGEVG00005005818	ENSGEVG00005005842	METTL21A (ENSGEVG00005005862)	CREB1 (ENSGEVG00005005883)	KLF7 (ENSGEVG00005005958)	CPO (ENSGEVG00005005978)	FASTKD2 (ENSGEVG00005006068)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2493						CPS1 (ENSCABG00000020978)	LANCL1 (ENSCABG00000021026)	MYL1 (ENSCABG00000021030)	ACADL (ENSCABG00000021048)	KANSL1L (ENSCABG00000021161)	ENSCABG00000021164	UNC80 (ENSCABG00000021168)	ENSCABG00000021179	PTH2R (ENSCABG00000021190)	PIKFYVE (ENSCABG00000021210) #21	IDH1 (ENSCABG00000021521) #22	ENSCABG00000021522	C2orf80 (ENSCABG00000021523) #23	ENSCABG00000021525 #24	ENSCABG00000021527 #24	ENSCABG00000021528	CRYGD (ENSCABG00000021530) #25	ENSCABG00000021532	ENSCABG00000021534 #24	ENSCABG00000021536	ENSCABG00000021540	PLEKHM3 (ENSCABG00000021546) #26	ENSCABG00000021547	ENSCABG00000021553	METTL21A (ENSCABG00000021568)	CREB1 (ENSCABG00000021569)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	386													CTLA4 (ENSPSIG00000004610)	ENSPSIG00000004603	PIKFYVE (ENSPSIG00000004497) #21	IDH1 (ENSPSIG00000004318) #22
Anura	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00680000100065	ENSGT00390000007295	ENSGT00390000012446	ENSGT00390000015143.e	ENSGT00390000015143.f	ENSGT00390000006303	ENSGT00940000155675	ENSGT00940000161229	ENSGT00940000156186	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000156404.v.a	ENSGT00940000159094	ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000162667.f	ENSGT00940000163322.a.b.c.b.b.b	ENSGT00940000161508.c.b	ENSGT00940000161508.c.a	ENSGT00940000163494.a.b.e.a.a.a.b	ENSGT00940000163322.a.b.c.b.b.a	ENSGT00940000163322.a.b.d	ENSGT00940000163494.a.b.e.a.a.a.a.a	ENSGT00940000163494.a.b.e.a.a.a.a.b	ENSGT00940000163322.a.b.c.b.a	ENSGT00940000163494.a.b.e.a.a.b	ENSGT00940000163494.a.b.f	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.b
Frog	MODERN SPECIES	9	slc40a1 (ENSXETG00000009874)	ENSXETG00000041263	wdr75 (ENSXETG00000009873)	trhd (ENSXETG00000045658)	col5a2 (ENSXETG00000010784)	col3a1 (ENSXETG00000010783)	gulp1 (ENSXETG00000042528)	ENSXETG00000046687	ENSXETG00000042824	cfap410 (ENSXETG00000015297)	trpm2 (ENSXETG00000035657)	pth2r (ENSXETG00000008019)	ENSXETG00000049336	ENSXETG00000049218	pikfyve (ENSXETG00000025548) #21	idh1 (ENSXETG00000008032) #22	ENSXETG00000038131	cryga.1 (ENSXETG00000049476)	cpo.2 (ENSXETG00000030825)	cpo.1 (ENSXETG00000025544)	cryga.3 (ENSXETG00000042441)	cryga.4 (ENSXETG00000025543)	cryga.5 (ENSXETG00000042016)	cryga.6 (ENSXETG00000038861)	ENSXETG00000040211	ENSXETG00000044470	ENSXETG00000043212	plekhm3 (ENSXETG00000016380) #26	ccnyl1 (ENSXETG00000016385)	fzd5 (ENSXETG00000046962)	mettl21a (ENSXETG00000046854)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	10	ENSLLEG00000019642	ENSLLEG00000019577	PTH2R (ENSLLEG00000019196)	ENSLLEG00000019144	ENSLLEG00000019123	ENSLLEG00000019085	ENSLLEG00000019061	ENSLLEG00000019044	PIKFYVE (ENSLLEG00000017459) #21	ENSLLEG00000017337	ENSLLEG00000017264	ENSLLEG00000017233	ENSLLEG00000017162	ENSLLEG00000017150	ENSLLEG00000017133	IDH1 (ENSLLEG00000017047) #22	ENSLLEG00000016954	ENSLLEG00000016899	ENSLLEG00000016735	ENSLLEG00000016710	ENSLLEG00000016595	ENSLLEG00000016093	ENSLLEG00000029520	ENSLLEG00000029500	ENSLLEG00000029474	ENSLLEG00000029459	ENSLLEG00000029447	ENSLLEG00000029432	ENSLLEG00000029411	ENSLLEG00000029402	CREB1 (ENSLLEG00000029361)
Coelacanth	MODERN SPECIES	767										rpe (ENSLACG00000002800)	ENSLACG00000005077	ENSLACG00000005980	MAP2 (ENSLACG00000007670)	PTH2R (ENSLACG00000012537)	PIKFYVE (ENSLACG00000013832) #21	IDH1 (ENSLACG00000014588) #22	ENSLACG00000015093
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	142															ENSGT00940000156307.b #21	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.a.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000154349	ENSGT00940000159224	ENSGT00940000165690	ENSGT00390000007989	ENSGT00940000155752	ENSGT00940000157295	ENSGT00940000156532
Reedfish	MODERN SPECIES	16	tsn (ENSECRG00000016831)	ENSECRG00000016817	ENSECRG00000016787	nifk (ENSECRG00000016758)	CLASP1 (ENSECRG00000016717)	tfcp2l1 (ENSECRG00000016675)	gli2b (ENSECRG00000016646)	inhbb (ENSECRG00000016627)	ralba (ENSECRG00000016609)	epb41l5 (ENSECRG00000016552)	ptpn4a (ENSECRG00000016477)	tmem177 (ENSECRG00000016443)	MRAS (ENSECRG00000016411)	pth2ra (ENSECRG00000015866)	pikfyve (ENSECRG00000015628) #21	idh1 (ENSECRG00000015540) #22	PLEKHM3 (ENSECRG00000015515) #26	ENSECRG00000015484	ENSECRG00000015123	mettl21a (ENSECRG00000015070)	creb1b (ENSECRG00000015035)	klf7b (ENSECRG00000015008)	zgc:162396 (ENSECRG00000014641)	zgc:162396 (ENSECRG00000014558)	ube2f (ENSECRG00000014448)	ramp1 (ENSECRG00000014413)	pofut2 (ENSECRG00000014386)	MYO1B (ENSECRG00000014259)	ENSECRG00000014140	BARD1 (ENSECRG00000014092)	vwc2l (ENSECRG00000009136)
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00530000063480.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.a.b.a	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000165586	ENSGT00940000154349	ENSGT00940000159224	ENSGT00940000165690	ENSGT00390000007989	ENSGT00940000155752	ENSGT00940000157295	ENSGT00940000156532
Spotted gar	MODERN SPECIES	650	hspe1 (ENSLOCG00000003954)	mob4 (ENSLOCG00000003970)	rftn2 (ENSLOCG00000003988)	BOLL (ENSLOCG00000004003)	PLCL1 (ENSLOCG00000004019)	satb2 (ENSLOCG00000004032)	dnajb11 (ENSLOCG00000004052)	tbccd1 (ENSLOCG00000004084)	crygs1 (ENSLOCG00000004099)	lcmt2 (ENSLOCG00000004108)	rab5b (ENSLOCG00000004128)	dbr1 (ENSLOCG00000004160)	armc8 (ENSLOCG00000004183)	ENSLOCG00000004199	ENSLOCG00000004209	idh1 (ENSLOCG00000004227) #22	PLEKHM3 (ENSLOCG00000004251) #26	ccnyl1 (ENSLOCG00000004267)	mettl21a (ENSLOCG00000004303)	creb1b (ENSLOCG00000004320)	zgc:162396 (ENSLOCG00000004335)	si:ch211-93g23.2 (ENSLOCG00000004350)	ube2f (ENSLOCG00000004366)	ramp1 (ENSLOCG00000004383)	ENSLOCG00000004395	pofut2 (ENSLOCG00000004410)	MYO1B (ENSLOCG00000004425)	ABCA12 (ENSLOCG00000004451)	BARD1 (ENSLOCG00000004470)	vwc2l (ENSLOCG00000004485)	IKZF2 (ENSLOCG00000004501)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	157	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00530000063480.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000155408	ENSGT00940000155235	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.b	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000165586	ENSGT00940000154349	ENSGT00940000159224
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	105	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a.j	ENSGT00530000063480.a	ENSGT00940000158407.a	ENSGT00390000008096.B.c	ENSGT00940000155792.a	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096.a	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a	ENSGT00940000155408.n	ENSGT00940000155235.j	ENSGT00940000178681	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000155408.m	ENSGT00940000155235.i.a	ENSGT00940000163794
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	224																idh1 (ENSPKIG00000014476) #22	PLEKHM3 (ENSPKIG00000014532) #26	ENSPKIG00000014565	ccnyl1 (ENSPKIG00000014613)	mettl21a (ENSPKIG00000014696)	CREB1 (ENSPKIG00000014731)	klf7b (ENSPKIG00000014765)	zgc:162396 (ENSPKIG00000014798)	ramp1 (ENSPKIG00000014837)	MYO1B (ENSPKIG00000014870)	ABCA12 (ENSPKIG00000014965)	IKZF2 (ENSPKIG00000015042)	ERBB4 (ENSPKIG00000015110)	lancl1 (ENSPKIG00000015217)	mylz3 (ENSPKIG00000015263)	ENSPKIG00000015285
Asian bonytongue	MODERN SPECIES		ENSSFOG00015025383	ENSSFOG00015029157	ENSSFOG00015024264	mob4 (ENSSFOG00015023335)	rftn2 (ENSSFOG00015023346)	BOLL (ENSSFOG00015023350)	PLCL1 (ENSSFOG00015025704)	satb2 (ENSSFOG00015023364)	dnajb11 (ENSSFOG00015023379)	tbccd1 (ENSSFOG00015023390)	crygs1 (ENSSFOG00015023395)	lcmt2 (ENSSFOG00015023406)	rab5b (ENSSFOG00015032251)	armc8 (ENSSFOG00015023426)	ENSSFOG00015023440	idh1 (ENSSFOG00015023448) #22	PLEKHM3 (ENSSFOG00015023455) #26	ENSSFOG00015023459	ccnyl1 (ENSSFOG00015023466)	mettl21a (ENSSFOG00015023473)	CREB1 (ENSSFOG00015011346)	KLF7 (ENSSFOG00015023491)	ENSSFOG00015030572	zgc:162396 (ENSSFOG00015023495)	zgc:162396 (ENSSFOG00015023503)	ENSSFOG00015027079	ENSSFOG00015031043	ENSSFOG00015031304	ENSSFOG00015027479	H2BC7 (ENSSFOG00015031099)	si:dkey-261m9.17 (ENSSFOG00015026224)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	61	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000177416	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a	ENSGT00940000155235.k.a	ENSGT00940000178681	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000165586.a	ENSGT00940000154349	ENSGT00940000159224.a	ENSGT00940000156332	ENSGT00940000157211.l	ENSGT00390000010354	ENSGT00940000156353.u.a	ENSGT00940000159094.f
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	342												ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a	ENSGT00940000155235.k.a	ENSGT00940000178681	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000165586.a	ENSGT00940000159224.a	ENSGT00940000156332	ENSGT00940000157211.l	ENSGT00390000010354	ENSGT00940000156353.u.a	ENSGT00940000159094.f
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	384												ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a	ENSGT00940000155235.k.a	ENSGT00940000165586.a	ENSGT00940000159224.a
Denticle herring	MODERN SPECIES	12	ENSDCDG00000033488	ENSDCDG00000033491	actr3 (ENSDCDG00000033512)	ENSDCDG00000033821	ENSDCDG00000034555	ddx18 (ENSDCDG00000034704)	ccdc93 (ENSDCDG00000034741)	insig2 (ENSDCDG00000034849)	C1QL2 (ENSDCDG00000034850)	ENSDCDG00000034851	dbi (ENSDCDG00000034852)	rab5b (ENSDCDG00000034854)	dbr1 (ENSDCDG00000034859)	armc8 (ENSDCDG00000034867)	ENSDCDG00000035004	idh1 (ENSDCDG00000035020) #22	PLEKHM3 (ENSDCDG00000035092) #26	ENSDCDG00000035094	ccnyl1 (ENSDCDG00000035108)	creb1b (ENSDCDG00000035137)	klf7b (ENSDCDG00000035138)	ENSDCDG00000035139	zgc:162780 (ENSDCDG00000035140)	ramp1 (ENSDCDG00000035141)	epb41l5 (ENSDCDG00000035144)	LIX1L (ENSDCDG00000035149)	afp4 (ENSDCDG00000035151)	vps72a (ENSDCDG00000035152)	mrpl9 (ENSDCDG00000035154)	sema6d (ENSDCDG00000035200)	ENSDCDG00000035312
Atlantic herring	MODERN SPECIES	11	ENSCHAG00000010246	ENSCHAG00000010278	LACC1 (ENSCHAG00000010303)	ENOX1 (ENSCHAG00000010315)	dnajc15 (ENSCHAG00000010734)	ENSCHAG00000010737	ENSCHAG00000010767	AKAP11 (ENSCHAG00000010780)	DGKH (ENSCHAG00000010814)	ENSCHAG00000011245	vwa8 (ENSCHAG00000011274)	uchl3 (ENSCHAG00000011554)	ccdc93 (ENSCHAG00000011620)	CLN5 (ENSCHAG00000011784)	PLEKHM3 (ENSCHAG00000011790) #26	idh1 (ENSCHAG00000011802) #22	armc8 (ENSCHAG00000012456)	dbr1 (ENSCHAG00000014689)	rab5b (ENSCHAG00000014710)	ENSCHAG00000014724	ENSCHAG00000014734	ENSCHAG00000014741	ENSCHAG00000014850	mycbp2 (ENSCHAG00000015025)	ENSCHAG00000020927	tnfrsfa (ENSCHAG00000020945)	mzt2b (ENSCHAG00000020982)	rfc2 (ENSCHAG00000021012)	epb41l5 (ENSCHAG00000021611)	c9 (ENSCHAG00000021678)	ENSCHAG00000021681
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	98	ENSGT00390000001083	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.a	ENSGT00390000007644	ENSGT00940000163874	ENSGT00940000158318	ENSGT00980000203459	ENSGT00950000182906.b.b	ENSGT00390000016696	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000160342.e	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a	ENSGT00940000155235.k.a	ENSGT00940000178681	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000165586.a	ENSGT00940000159224.a	ENSGT00940000156332	ENSGT00940000157211.l	ENSGT00390000010354	ENSGT00940000156353.u.a	ENSGT00940000159094.f	ENSGT01030000234621.F.d
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	71	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.a	ENSGT00940000166466.e.a	ENSGT00390000007644	ENSGT00940000163874	ENSGT00940000158318	ENSGT00980000203459	ENSGT00950000182906.b.b	ENSGT00390000016696	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000160342.e	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a	ENSGT00940000155235.k.a	ENSGT00940000178681	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000165586.a	ENSGT00940000159224.a	ENSGT00940000156332	ENSGT00940000157211.l	ENSGT00390000010354	ENSGT01000000221562	ENSGT00940000156353.u.a	ENSGT00940000159094.f
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	421									ENSGT00940000162599.a	ENSGT00940000160342.e.a	ENSGT00470000042284.a	ENSGT00940000166096.c	ENSGT00510000047481.h	ENSGT00390000003033.e	ENSGT00940000165242.h.b	ENSGT00390000012547.b.k #22	ENSGT00940000159743.b #26	ENSGT00940000162639.d	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.d.b	ENSGT00940000155408.o.a.b	ENSGT00940000155235.k.a.a	ENSGT00940000178681	ENSGT00940000163794.t	ENSGT00940000165586.a.j	ENSGT00940000159224.a.c.b	ENSGT00940000156332.w	ENSGT00940000157211.l.e	ENSGT00390000010354.f	ENSGT00940000156353.u.a.d	ENSGT00940000159094.f.d	ENSGT01030000234621.F.d.a
Goldfish	DUPLICATION
Goldfish	MODERN SPECIES	49	ENSCARG00000008149	ASIC4 (ENSCARG00000008153)	ENSCARG00000008182	gmppaa (ENSCARG00000008196)	ENSCARG00000008237	ENSCARG00000008250	dars1 (ENSCARG00000008291)	cxcr4b (ENSCARG00000008619)	THSD7B (ENSCARG00000008641)	hnmt (ENSCARG00000008777)	spopla (ENSCARG00000008804)	NXPH2 (ENSCARG00000008838)	ugt1a2 (ENSCARG00000008848)	ENSCARG00000008883	igsf3 (ENSCARG00000008887)	idh1 (ENSCARG00000008906) #22	PLEKHM3 (ENSCARG00000008996) #26	ccnyl1 (ENSCARG00000009019)	creb1b (ENSCARG00000009031)	klf7b (ENSCARG00000009055)	zgc:162396 (ENSCARG00000009075)	zgc:162780 (ENSCARG00000009082)	ENSCARG00000009190	hao2 (ENSCARG00000012074)	ENSCARG00000012090	ENSCARG00000012100	pla1a (ENSCARG00000012110)	popdc2 (ENSCARG00000012124)	ska3 (ENSCARG00000012149)	ENSCARG00000012192	ENSCARG00000012207
Goldfish	MODERN SPECIES	2528																idh1 (ENSCARG00000054347) #22	PLEKHM3 (ENSCARG00000054684) #26	fzd5 (ENSCARG00000054708)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	425								ENSGT00390000016696.h	ENSGT00940000162599.b	ENSGT00940000160342.e.a	ENSGT00470000042284.a	ENSGT00940000166096.c	ENSGT00510000047481.h	ENSGT00390000003033.e	ENSGT00940000165242.h.b	ENSGT00390000012547.b.k #22	ENSGT00940000159743.b #26	ENSGT00940000162639.d	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.d.b	ENSGT00940000155408.o.a.b	ENSGT00940000155235.k.a.a	ENSGT00940000163794.t	ENSGT00940000165586.a.j	ENSGT00940000159224.a.c.b	ENSGT00940000156332.w	ENSGT00940000157211.l.e	ENSGT00390000010354.f	ENSGT00940000156353.u.a.d
Common carp reference	MODERN SPECIES	46	ENSCCRG00000080738	slc10a2 (ENSCCRG00000014101)	nepro (ENSCCRG00000014097)	ENSCCRG00000014090	poglut2 (ENSCCRG00000055120)	ENSCCRG00000078112	stxbp5l (ENSCCRG00000028134)	gtf2e1 (ENSCCRG00000006759)	lcmt2 (ENSCCRG00000006763)	crygs2 (ENSCCRG00000006767)	tbccd1 (ENSCCRG00000023688)	rab5b (ENSCCRG00000056165)	dbr1 (ENSCCRG00000066411)	armc8 (ENSCCRG00000023590)	ENSCCRG00000065082	idh1 (ENSCCRG00000045459) #22	fzd5 (ENSCCRG00000055353)	ccnyl1 (ENSCCRG00000009722)	creb1b (ENSCCRG00000058435)	PLEKHM3 (ENSCCRG00000009711) #26	klf7b (ENSCCRG00000009770)	ENSCCRG00000081845	ENSCCRG00000071648	zgc:162396 (ENSCCRG00000060012)	zgc:162780 (ENSCCRG00000032512)	ramp1 (ENSCCRG00000069316)	epb41l5 (ENSCCRG00000007840)	ptpn4a (ENSCCRG00000055603)	tmem177 (ENSCCRG00000078708)	ENSCCRG00000007865	ENSCCRG00000058810
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	437								gtf2e1 (ENSSGRG00000055277)	lcmt2 (ENSSGRG00000055276)	crygs2 (ENSSGRG00000055275)	tbccd1 (ENSSGRG00000055274)	rab5b (ENSSGRG00000055273)	dbr1 (ENSSGRG00000055272)	armc8 (ENSSGRG00000055269)	ENSSGRG00000055256	idh1 (ENSSGRG00000055252) #22	PLEKHM3 (ENSSGRG00000055251) #26	fzd5 (ENSSGRG00000055250)	ccnyl1 (ENSSGRG00000055248)	creb1b (ENSSGRG00000055244)	klf7b (ENSSGRG00000055243)	zgc:162396 (ENSSGRG00000055242)	zgc:162780 (ENSSGRG00000055241)	epb41l5 (ENSSGRG00000055239)	ptpn4a (ENSSGRG00000055234)	MRAS (ENSSGRG00000055233)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155868.f.b.b	ENSGT00390000001083	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.a.h	ENSGT00390000007644.c	ENSGT00940000163874	ENSGT00940000158318	ENSGT00950000182906.b.b.j	ENSGT00950000182906.b.b.i	ENSGT00390000016696.g	ENSGT00940000160342.e.b	ENSGT00470000042284.b	ENSGT00940000166096.d	ENSGT00510000047481.g	ENSGT00390000003033.f	ENSGT00940000165242.g	ENSGT00390000012547.b.l #22	ENSGT00940000159743.a #26	ENSGT00940000162639.c	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.d.a	ENSGT00940000155408.o.a.a	ENSGT00940000155235.k.a.b	ENSGT00940000163794.s	ENSGT00940000165586.a.i	ENSGT00940000159224.a.c.a	ENSGT00940000156332.x	ENSGT00940000157211.l.f	ENSGT01000000221562	ENSGT00940000156353.u.a.c	ENSGT00940000159094.f.c	ENSGT01030000234621.F.d.b	ENSGT00950000183071.a.a.a.e.b.h.b
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	263			ENSGT00950000182808.a.a.a.a.a.h	ENSGT00390000007644.c	ENSGT00940000163874	ENSGT00940000158318.a	ENSGT00950000182906.b.b.i	ENSGT00390000016696.g	ENSGT00940000162599.a	ENSGT00940000160342.e.b	ENSGT00470000042284.b	ENSGT00940000166096.d	ENSGT00510000047481.g	ENSGT00390000003033.f	ENSGT00940000165242.g	ENSGT00390000012547.b.l #22	ENSGT00940000159743.a #26	ENSGT00940000162639.c	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.d.a	ENSGT00940000155408.o.a.a	ENSGT00940000155235.k.a.b	ENSGT00940000178681	ENSGT00940000163794.s	ENSGT00940000165586.a.i	ENSGT00940000159224.a.c.a	ENSGT00940000156332.x	ENSGT00940000157211.l.f	ENSGT00940000156353.u.a.c	ENSGT00940000159094.f.c	ENSGT01030000234621.F.d.b	ENSGT00950000183071.a.a.a.e.b.h.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	41	gtdc1 (ENSCCRG00000028168)	arglu1a (ENSCCRG00000060356)	efnb2a (ENSCCRG00000074165)	ENSCCRG00000062032	gtpbp8 (ENSCCRG00000055105)	slc10a2 (ENSCCRG00000006965)	tlr20.2 (ENSCCRG00000081428)	stxbp5l (ENSCCRG00000006964)	gtf2e1 (ENSCCRG00000028740)	crygs2 (ENSCCRG00000028289)	tbccd1 (ENSCCRG00000023575)	rab5b (ENSCCRG00000067152)	dbr1 (ENSCCRG00000023585)	armc8 (ENSCCRG00000031008)	ENSCCRG00000009637	idh1 (ENSCCRG00000042062) #22	PLEKHM3 (ENSCCRG00000053344) #26	fzd5 (ENSCCRG00000009717)	ccnyl1 (ENSCCRG00000017631)	creb1b (ENSCCRG00000080481)	klf7b (ENSCCRG00000017608)	ENSCCRG00000079145	zgc:162780 (ENSCCRG00000076123)	ramp1 (ENSCCRG00000072552)	epb41l5 (ENSCCRG00000010102)	ptpn4a (ENSCCRG00000009957)	ENSCCRG00000073082	tmem177 (ENSCCRG00000007859)	pth2ra (ENSCCRG00000009944)	OXGR1 (ENSCCRG00000081838)	hs6st3b (ENSCCRG00000080155)
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Goldfish	MODERN SPECIES	27	ENSCARG00000046707	gtpbp8 (ENSCARG00000046699)	slc10a2 (ENSCARG00000046667)	tlr20.2 (ENSCARG00000046638)	ENSCARG00000046628	ENSCARG00000046617	stxbp5l (ENSCARG00000046351)	gtf2e1 (ENSCARG00000046283)	crygs2 (ENSCARG00000046258)	tbccd1 (ENSCARG00000046247)	rab5b (ENSCARG00000046225)	dbr1 (ENSCARG00000046187)	ENSCARG00000046167	armc8 (ENSCARG00000044069)	ENSCARG00000043684	idh1 (ENSCARG00000043124) #22	PLEKHM3 (ENSCARG00000043070) #26	fzd5 (ENSCARG00000043055)	ccnyl1 (ENSCARG00000043035)	creb1b (ENSCARG00000042956)	ENSCARG00000042942	ENSCARG00000042932	klf7b (ENSCARG00000042858)	zgc:162396 (ENSCARG00000042830)	zgc:162780 (ENSCARG00000042820)	ramp1 (ENSCARG00000042805)	epb41l5 (ENSCARG00000042513)	ENSCARG00000042443	ptpn4a (ENSCARG00000042140)	ENSCARG00000042065	MRAS (ENSCARG00000042029)
Zebrafish	MODERN SPECIES	24	ENSDARG00000030636	poglut2 (ENSDARG00000031971)	ENSDARG00000094791	stxbp5l (ENSDARG00000006383)	gtf2e1 (ENSDARG00000000542)	lcmt2 (ENSDARG00000000747)	crygs2 (ENSDARG00000041171)	tbccd1 (ENSDARG00000056886)	rab5b (ENSDARG00000016059)	ENSDARG00000094291	ENSDARG00000056907	ENSDARG00000056917	dbr1 (ENSDARG00000056923)	armc8 (ENSDARG00000062258)	ENSDARG00000069560	idh1 (ENSDARG00000025375) #22	PLEKHM3 (ENSDARG00000030633) #26	fzd5 (ENSDARG00000025420)	ccnyl1 (ENSDARG00000099692)	creb1b (ENSDARG00000093420)	klf7b (ENSDARG00000043821)	ENSDARG00000094554	ENSDARG00000093998	ENSDARG00000093465	zgc:162396 (ENSDARG00000069549)	zgc:162780 (ENSDARG00000069548)	ramp1 (ENSDARG00000056704)	epb41l5 (ENSDARG00000032324)	ptpn4a (ENSDARG00000000631)	tmem177 (ENSDARG00000069301)	MRAS (ENSDARG00000075285)
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Channel catfish	MODERN SPECIES	25	ENSIPUG00000023806	ENSIPUG00000023804	Slc10a2 (ENSIPUG00000023801)	nepro (ENSIPUG00000023796)	tex30 (ENSIPUG00000023795)	kdelc1 (ENSIPUG00000023791)	stxbp5l (ENSIPUG00000023779)	gtf2e1 (ENSIPUG00000023774)	lcmt2 (ENSIPUG00000023772)	crygs (ENSIPUG00000023764)	tbccd1 (ENSIPUG00000023760)	RAB5B (ENSIPUG00000023753)	dbr1 (ENSIPUG00000023749)	armc8 (ENSIPUG00000023744)	ENSIPUG00000023740	idh1 (ENSIPUG00000023732) #22	PLEKHM3 (ENSIPUG00000023726) #26	fzd5 (ENSIPUG00000023723)	ccnyl1 (ENSIPUG00000023709)	creb1 (ENSIPUG00000023702)	klf7b (ENSIPUG00000023698)	nifk (ENSIPUG00000023690)	clasp1a (ENSIPUG00000023671)	tfcp2l1 (ENSIPUG00000023667)	ENSIPUG00000023665	ENSIPUG00000023664	gli2 (ENSIPUG00000023662)	inhbb (ENSIPUG00000023661)	ENSIPUG00000023659	ralb (ENSIPUG00000023656)	ENSIPUG00000023652
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	82	ENSGT00390000001083	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.a	ENSGT00390000007644	ENSGT00940000163874	ENSGT00940000158318	ENSGT00980000203459	ENSGT00950000182906.b.b	ENSGT00390000016696	ENSGT00940000160342.e	ENSGT00940000162599	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a	ENSGT00940000155235.k.a	ENSGT00940000178681	ENSGT00940000163794.q	ENSGT00940000163794.r	ENSGT00940000165586.a	ENSGT00940000159224.a	ENSGT00940000156332	ENSGT00940000157211.l	ENSGT00390000010354	ENSGT00940000156353.u.a	ENSGT00940000159094.f
Electric eel	MODERN SPECIES	22	tbl1x (ENSEEEG00000018342)	si:ch211-165i18.2 (ENSEEEG00000018420)	GPR143 (ENSEEEG00000018421)	gtpbp8 (ENSEEEG00000018422)	nepro (ENSEEEG00000018450)	poglut2 (ENSEEEG00000018460)	stxbp5l (ENSEEEG00000018514)	gtf2e1 (ENSEEEG00000018634)	lcmt2 (ENSEEEG00000018635)	ENSEEEG00000018637	tbccd1 (ENSEEEG00000018638)	rab5b (ENSEEEG00000018641)	dbr1 (ENSEEEG00000018643)	armc8 (ENSEEEG00000018647)	ENSEEEG00000018708	idh1 (ENSEEEG00000018742) #22	PLEKHM3 (ENSEEEG00000018978) #26	ENSEEEG00000018980	ccnyl1 (ENSEEEG00000018984)	creb1b (ENSEEEG00000018990)	klf7b (ENSEEEG00000018997)	zgc:162396 (ENSEEEG00000019000)	zgc:162780 (ENSEEEG00000019002)	ramp1 (ENSEEEG00000019006)	epb41l5 (ENSEEEG00000019007)	ptpn4a (ENSEEEG00000019009)	tmem177 (ENSEEEG00000019013)	MRAS (ENSEEEG00000019014)	pth2ra (ENSEEEG00000019015)	ENSEEEG00000019017	gli2a (ENSEEEG00000019021)
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	123	ENSGT00390000001083	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.a	ENSGT00390000007644	ENSGT00940000163874	ENSGT00940000158318	ENSGT00980000203459	ENSGT00950000182906.b.b	ENSGT00390000016696	ENSGT00940000160342.e	ENSGT00940000162599	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000161191.B	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a	ENSGT00940000155235.k.a	ENSGT00940000178681	ENSGT00940000163794.q	ENSGT00940000163794.r	ENSGT00940000165586.a	ENSGT00940000159224.a	ENSGT00940000156332	ENSGT00940000157211.l	ENSGT00390000010354	ENSGT00940000156353.u.a	ENSGT00940000159094.f
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	10	gtpbp8 (ENSAMXG00000014566)	slc10a2 (ENSAMXG00000014586)	ENSAMXG00000043131	nepro (ENSAMXG00000014664)	ENSAMXG00000039195	poglut2 (ENSAMXG00000014717)	stxbp5l (ENSAMXG00000014830)	gtf2e1 (ENSAMXG00000030823)	crygs2 (ENSAMXG00000014976)	lcmt2 (ENSAMXG00000014916)	tbccd1 (ENSAMXG00000036543)	rab5b (ENSAMXG00000014983)	dbr1 (ENSAMXG00000030736)	armc8 (ENSAMXG00000015101)	ENSAMXG00000015182	idh1 (ENSAMXG00000015280) #22	PLEKHM3 (ENSAMXG00000015306) #26	ENSAMXG00000026259	ccnyl1 (ENSAMXG00000015352)	creb1b (ENSAMXG00000040978)	klf7b (ENSAMXG00000015449)	ENSAMXG00000043008	ENSAMXG00000031822	zgc:162396 (ENSAMXG00000037578)	zgc:162396 (ENSAMXG00000030552)	zgc:162780 (ENSAMXG00000040257)	ramp1 (ENSAMXG00000037528)	epb41l5 (ENSAMXG00000010854)	ptpn4a (ENSAMXG00000010885)	tmem177 (ENSAMXG00000039287)	MRAS (ENSAMXG00000033764)
Red-bellied piranha	DUPLICATION
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	2406																ENSPNAG00000016494 #22
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	88	gtpbp8 (ENSPNAG00000024943)	slc10a2 (ENSPNAG00000006311)	nepro (ENSPNAG00000024981)	ENSPNAG00000024991	poglut2 (ENSPNAG00000025035)	ENSPNAG00000005194	stxbp5l (ENSPNAG00000025420)	gtf2e1 (ENSPNAG00000005342)	crygs2 (ENSPNAG00000007074)	lcmt2 (ENSPNAG00000006606)	tbccd1 (ENSPNAG00000025549)	rab5b (ENSPNAG00000025574)	dbr1 (ENSPNAG00000025595)	armc8 (ENSPNAG00000025710)	ENSPNAG00000006768	idh1 (ENSPNAG00000025794) #22	PLEKHM3 (ENSPNAG00000025800) #26	ENSPNAG00000025811	ccnyl1 (ENSPNAG00000025879)	creb1b (ENSPNAG00000025949)	klf7b (ENSPNAG00000005674)	ENSPNAG00000025990	zgc:162396 (ENSPNAG00000004920)	zgc:162396 (ENSPNAG00000026074)	zgc:162780 (ENSPNAG00000026108)	ramp1 (ENSPNAG00000004965)	epb41l5 (ENSPNAG00000026135)	ptpn4a (ENSPNAG00000007077)	tmem177 (ENSPNAG00000026272)	MRAS (ENSPNAG00000026295)	pth2ra (ENSPNAG00000026419)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000177416	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a	ENSGT00940000155235.k.a	ENSGT00940000178681	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000165586.a	ENSGT00940000154349	ENSGT00940000159224.a	ENSGT00940000156332	ENSGT00940000157211.l	ENSGT00390000010354	ENSGT00940000156353.u.a	ENSGT00940000159094.f
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000177416	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a
Cod	MODERN SPECIES	12	SF3B1 (ENSGMOG00000006773)	hspd1 (ENSGMOG00000006801)	coq10b (ENSGMOG00000034755)	mob4 (ENSGMOG00000006816)	rftn2 (ENSGMOG00000006824)	ENSGMOG00000034812	satb2 (ENSGMOG00000024031)	dnajb11 (ENSGMOG00000006890)	ENSGMOG00000006900	CRYGS (ENSGMOG00000023223)	rab5b (ENSGMOG00000006918)	dbr1 (ENSGMOG00000006925)	armc8 (ENSGMOG00000006940)	ENSGMOG00000033757	ENSGMOG00000019406	idh1 (ENSGMOG00000006982) #22	ENSGMOG00000034114	ENSGMOG00000035585	AKAP11 (ENSGMOG00000032401)	DGKH (ENSGMOG00000007040)	vwa8 (ENSGMOG00000007060)	rgcc (ENSGMOG00000003645)	f5 (ENSGMOG00000031996)	f5 (ENSGMOG00000034559)	f5 (ENSGMOG00000031050)	slc35a5 (ENSGMOG00000007111)	ccdc80 (ENSGMOG00000031614)	ENSGMOG00000007134	fundc1 (ENSGMOG00000007162)	ENSGMOG00000007170	ENSGMOG00000009640
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000177416	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	13	hspe1 (ENSMMDG00005013681)	MOB4 (ENSMMDG00005013679)	rftn2 (ENSMMDG00005013675)	ENSMMDG00005025042	PLCL1 (ENSMMDG00005025041)	ENSMMDG00005025040	satb2 (ENSMMDG00005025039)	dnajb11 (ENSMMDG00005025038)	tbccd1 (ENSMMDG00005025037)	CRYGS (ENSMMDG00005025036)	lcmt2 (ENSMMDG00005025035)	rab5b (ENSMMDG00005025034)	dbr1 (ENSMMDG00005025033)	armc8 (ENSMMDG00005025024)	ENSMMDG00005025023	idh1 (ENSMMDG00005024964) #22	TNFSF11 (ENSMMDG00005024963)	ENSMMDG00005024962	DGKH (ENSMMDG00005024961)	vwa8 (ENSMMDG00005024960)	rgcc (ENSMMDG00005024959)	ENSMMDG00005024958	f5 (ENSMMDG00005024951)	slc35a5 (ENSMMDG00005024950)	ccdc80 (ENSMMDG00005024949)	ENSMMDG00005024947	ENSMMDG00005024946	DIPK2B (ENSMMDG00005024945)	KDM6A (ENSMMDG00005024287)	fundc1 (ENSMMDG00005024199)	efhc2 (ENSMMDG00005024196)
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Tiger tail seahorse	DUPLICATION
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	140				PLCL1 (ENSHCOG00000004445)	satb2 (ENSHCOG00000004316)	dnajb11 (ENSHCOG00000004275)	tbccd1 (ENSHCOG00000004241)	crygs1 (ENSHCOG00000004229)	ENSHCOG00000004226	ENSHCOG00000004196	rab5b (ENSHCOG00000004191)	dbr1 (ENSHCOG00000004179)	armc8 (ENSHCOG00000004160)	ENSHCOG00000004103	ENSHCOG00000003918	idh1 (ENSHCOG00000003904) #22	ENSHCOG00000003880	ENSHCOG00000003874	AKAP11 (ENSHCOG00000003860)	DGKH (ENSHCOG00000003845)	ENSHCOG00000003792	rgcc (ENSHCOG00000003759)	ENSHCOG00000003748	ENSHCOG00000003714
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	527																idh1 (ENSHCOG00000012581) #22
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Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000177416	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000177416	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C.g.a
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350.h	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000177416	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a
Pleuronectoidei	DUPLICATION
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.q #22
Tongue sole	MODERN SPECIES	219																ENSCSEG00000007166 #22
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350.h	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000177416	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b.r #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601.r	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00940000155600.b
Turbot	MODERN SPECIES	5	SF3B1 (ENSSMAG00000013977)	coq10b (ENSSMAG00000014009)	hspd1 (ENSSMAG00000014018)	mob4 (ENSSMAG00000014056)	rftn2 (ENSSMAG00000014086)	PLCL1 (ENSSMAG00000015766)	ENSSMAG00000032902	satb2 (ENSSMAG00000015799)	dnajb11 (ENSSMAG00000015925)	ENSSMAG00000015967	ENSSMAG00000016033	rab5b (ENSSMAG00000016057)	dbr1 (ENSSMAG00000016078)	armc8 (ENSSMAG00000016119)	ENSSMAG00000038066	idh1 (ENSSMAG00000014096) #22	ENSSMAG00000027027	ENSSMAG00000022333	ENSSMAG00000014138	CASK (ENSSMAG00000015722)	gpr34b (ENSSMAG00000024816)	NYX (ENSSMAG00000015702)	ddx3xa (ENSSMAG00000015674)	ENSSMAG00000015651	dnajc10 (ENSSMAG00000015551)	frzb (ENSSMAG00000015533)	dusp19a (ENSSMAG00000016328)	ENSSMAG00000016339	ENSSMAG00000016374	ENSSMAG00000016399	ENSSMAG00000016424
Tongue sole	MODERN SPECIES	7	prkra (ENSCSEG00000002954)	OSBPL6 (ENSCSEG00000002934)	cycsb (ENSCSEG00000002929)	ENSCSEG00000002906	ENSCSEG00000002899	ccdc80 (ENSCSEG00000002896)	slc35a5 (ENSCSEG00000002889)	f5 (ENSCSEG00000002876)	rgcc (ENSCSEG00000002871)	vwa8 (ENSCSEG00000002839)	lcmt2 (ENSCSEG00000002829)	rab5b (ENSCSEG00000002821)	dbr1 (ENSCSEG00000002813)	armc8 (ENSCSEG00000002786)	ENSCSEG00000002781	idh1 (ENSCSEG00000002775) #22	ENSCSEG00000002772	AKAP11 (ENSCSEG00000002767)	DGKH (ENSCSEG00000002739)	ENSCSEG00000002729	ENSCSEG00000002725	KDM6A (ENSCSEG00000001099)	fundc1 (ENSCSEG00000001014)	efhc2 (ENSCSEG00000000997)	ENSCSEG00000000990	mao (ENSCSEG00000000966)	ENSCSEG00000000959	gpr34b (ENSCSEG00000000956)	ENSCSEG00000000944	nup35 (ENSCSEG00000000938)	ddx3xa (ENSCSEG00000000900)
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350.h	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C.g.a
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350.h	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158361	ENSGT01100000263568.b.a.c.b.b	ENSGT01030000234640.a.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.f	ENSGT01030000234640.a.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.e	ENSGT01030000234640.a.b.a.a.a.a.b.a.a.a	ENSGT01030000234640.a.b.a.a.a.a.a.a.j.a.a	ENSGT01030000234640.a.b.a.a.a.a.a.a.j.a.b	ENSGT01030000234640.a.b.a.a.a.a.b.a.a.b	ENSGT01030000234640.a.b.a.a.a.a.b.a.b	ENSGT01030000234640.a.b.a.a.a.a.a.a.k	ENSGT01030000234640.a.b.a.a.a.a.a.b.b.j	ENSGT01030000234640.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.d	ENSGT01030000234640.a.b.a.a.a.a.a.b.a.a.a
Greater amberjack	MODERN SPECIES	21	coq10b (ENSSDUG00000017471)	hspd1 (ENSSDUG00000017487)	hspe1 (ENSSDUG00000017512)	mob4 (ENSSDUG00000017533)	rftn2 (ENSSDUG00000017560)	PLCL1 (ENSSDUG00000017579)	satb2 (ENSSDUG00000017615)	dnajb11 (ENSSDUG00000017646)	tbccd1 (ENSSDUG00000017677)	crygs1 (ENSSDUG00000017704)	lcmt2 (ENSSDUG00000017764)	rab5b (ENSSDUG00000017822)	dbr1 (ENSSDUG00000017849)	armc8 (ENSSDUG00000017908)	ENSSDUG00000017952	idh1 (ENSSDUG00000017961) #22	ENSSDUG00000017996	AKAP11 (ENSSDUG00000018051)	ENSSDUG00000018084	itgav (ENSSDUG00000018160)	ENSSDUG00000018302	ENSSDUG00000018315	ENSSDUG00000018342	ENSSDUG00000018376	ENSSDUG00000018381	ENSSDUG00000018417	ENSSDUG00000018438	ENSSDUG00000018468	ENSSDUG00000018511	ENSSDUG00000018542	ENSSDUG00000018556
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2895	hspe1 (ENSSLDG00000019614)	ENSSLDG00000019627	mob4 (ENSSLDG00000019644)	rftn2 (ENSSLDG00000019682)	PLCL1 (ENSSLDG00000019704)	satb2 (ENSSLDG00000019724)	dnajb11 (ENSSLDG00000019771)	tbccd1 (ENSSLDG00000019797)	CRYGS (ENSSLDG00000019817)	lcmt2 (ENSSLDG00000019839)	ENSSLDG00000019862	rab5b (ENSSLDG00000019873)	dbr1 (ENSSLDG00000019891)	armc8 (ENSSLDG00000019925)	ENSSLDG00000020000	idh1 (ENSSLDG00000020025) #22	ENSSLDG00000020053	AKAP11 (ENSSLDG00000020069)	itgav (ENSSLDG00000020113)	ENSSLDG00000020165	ENSSLDG00000020186	ENSSLDG00000020219	ENSSLDG00000020229	ENSSLDG00000020255	ENSSLDG00000020270	ENSSLDG00000020282	ENSSLDG00000020314	ENSSLDG00000020345	ENSSLDG00000020379	ENSSLDG00000020396	ENSSLDG00000020410
Barramundi perch	MODERN SPECIES	281		coq10b (ENSLCAG00010008330)	hspd1 (ENSLCAG00010008343)	hspe1 (ENSLCAG00010008372)	mob4 (ENSLCAG00010008394)	rftn2 (ENSLCAG00010008404)	satb2 (ENSLCAG00010008438)	dnajb11 (ENSLCAG00010008457)	tbccd1 (ENSLCAG00010008467)	CRYGS (ENSLCAG00010008468)	lcmt2 (ENSLCAG00010008471)	rab5b (ENSLCAG00010008481)	dbr1 (ENSLCAG00010008484)	armc8 (ENSLCAG00010008532)	ENSLCAG00010008774	idh1 (ENSLCAG00010008801) #22	ENSLCAG00010008861	ENSLCAG00010008872	DGKH (ENSLCAG00010008991)	vwa8 (ENSLCAG00010009674)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C.g.a
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	13	hspd1 (ENSMAMG00000010371)	hspe1 (ENSMAMG00000010406)	mob4 (ENSMAMG00000010425)	rftn2 (ENSMAMG00000010459)	ENSMAMG00000010504	satb2 (ENSMAMG00000011861)	dnajb11 (ENSMAMG00000011906)	tbccd1 (ENSMAMG00000011948)	CRYGS (ENSMAMG00000011966)	lcmt2 (ENSMAMG00000012158)	rab5b (ENSMAMG00000028405)	dbr1 (ENSMAMG00000012205)	armc8 (ENSMAMG00000012239)	ENSMAMG00000025939	ENSMAMG00000012317	idh1 (ENSMAMG00000012331) #22	ENSMAMG00000028176	AKAP11 (ENSMAMG00000012363)	DGKH (ENSMAMG00000012402)	vwa8 (ENSMAMG00000012489)	rgcc (ENSMAMG00000012629)	f5 (ENSMAMG00000012640)	slc35a5 (ENSMAMG00000012659)	ccdc80 (ENSMAMG00000012690)	ENSMAMG00000012717	KDM6A (ENSMAMG00000012742)	fundc1 (ENSMAMG00000012838)	efhc2 (ENSMAMG00000012855)	ENSMAMG00000012883	mao (ENSMAMG00000026614)	ENSMAMG00000012963
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156444.d	ENSGT00390000005159.i	ENSGT00940000156089.e.b	ENSGT00390000006356	ENSGT00950000183097.a.a.b	ENSGT00550000075118.l	ENSGT00940000160136.p	ENSGT00950000183115.b.a.m.a	ENSGT00390000012063	ENSGT00390000010170.a.b	ENSGT01050000244937.a.a	ENSGT00390000011864	ENSGT00940000159528	ENSGT00940000160585	ENSGT01050000244823.d.b.b.a.a.a.b.a.b.a	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C.g.a
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	11	ABI2 (ENSBSLG00000014132)	cnot11 (ENSBSLG00000014286)	lcp1 (ENSBSLG00000014328)	alg11 (ENSBSLG00000014648)	itm2bb (ENSBSLG00000014695)	med4 (ENSBSLG00000014758)	sucla2 (ENSBSLG00000014782)	ENSBSLG00000015158	ENSBSLG00000015206	HTR2A (ENSBSLG00000015230)	esd (ENSBSLG00000015273)	ENSBSLG00000015404	RUBCNL (ENSBSLG00000016667)	ENSBSLG00000016864	ENSBSLG00000016890	idh1 (ENSBSLG00000016925) #22	ENSBSLG00000017121	AKAP11 (ENSBSLG00000017135)	DGKH (ENSBSLG00000017216)	vwa8 (ENSBSLG00000017995)	rgcc (ENSBSLG00000019007)	f5 (ENSBSLG00000019040)	slc35a5 (ENSBSLG00000019119)	ccdc80 (ENSBSLG00000016836)	ENSBSLG00000016966	KDM6A (ENSBSLG00000017055)	fundc1 (ENSBSLG00000018369)	efhc2 (ENSBSLG00000018387)	ENSBSLG00000018465	mao (ENSBSLG00000018478)	ENSBSLG00000019075
Climbing perch	MODERN SPECIES	12	ENSATEG00000014714	ENSATEG00000014726	ENSATEG00000014802	ENSATEG00000014759	ITM2B (ENSATEG00000014812)	med4 (ENSATEG00000014823)	SUCLA2 (ENSATEG00000014852)	ENSATEG00000014893	esd (ENSATEG00000014923)	ENSATEG00000014972	RUBCNL (ENSATEG00000015021)	ENSATEG00000015058	ENSATEG00000015072	ENSATEG00000015143	ENSATEG00000015155	ENSATEG00000015169 #22	ENSATEG00000029378	ENSATEG00000028330	AKAP11 (ENSATEG00000015217)	DGKH (ENSATEG00000015272)	vwa8 (ENSATEG00000015448)	rgcc (ENSATEG00000015656)	f5 (ENSATEG00000015701)	ENSATEG00000028955	ccdc80 (ENSATEG00000015991)	slc35a5 (ENSATEG00000028318)	ccdc80 (ENSATEG00000025900)	KDM6A (ENSATEG00000016273)	fundc1 (ENSATEG00000016392)	efhc2 (ENSATEG00000016421)	ENSATEG00000028137
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a
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Tetraodon	MODERN SPECIES	13	ENSTNIG00000011544	crygm3 (ENSTNIG00000011545)	ENSTNIG00000011546	ENSTNIG00000011547	ENSTNIG00000011548	ENSTNIG00000011549	ENSTNIG00000011550	ENSTNIG00000011551	zgc:153846 (ENSTNIG00000011552)	si:dkey-57a22.15 (ENSTNIG00000011553)	ENSTNIG00000011554	sh3bp4 (ENSTNIG00000011555)	usp37 (ENSTNIG00000011556)	ybey (ENSTNIG00000001620)	ENSTNIG00000011557	idh1 (ENSTNIG00000011558) #22	ENSTNIG00000011559	ENSTNIG00000011560	vwa8 (ENSTNIG00000011561)	f5 (ENSTNIG00000011562)	slc35a5 (ENSTNIG00000011563)	ccdc80 (ENSTNIG00000011564)	dusp19a (ENSTNIG00000011565)	frzb (ENSTNIG00000011566)	ENSTNIG00000011567	ENSTNIG00000001467	nup35 (ENSTNIG00000011568)	ddx3xa (ENSTNIG00000011569)	nyx (ENSTNIG00000011570)	mao (ENSTNIG00000011571)	ENSTNIG00000011572
Fugu	MODERN SPECIES		ENSTRUG00000016089	ENSTRUG00000022219	ENSTRUG00000023922	ENSTRUG00000030660	zgc:153846 (ENSTRUG00000000230)	si:dkey-57a22.15 (ENSTRUG00000027681)	ENSTRUG00000032703	sh3bp4 (ENSTRUG00000000489)	ENSTRUG00000031348	arl4cb (ENSTRUG00000003085)	ENSTRUG00000027764	ENSTRUG00000004307	usp37 (ENSTRUG00000004918)	ybey (ENSTRUG00000030235)	ENSTRUG00000005210	idh1 (ENSTRUG00000005863) #22	ENSTRUG00000021409	ENSTRUG00000021217	vwa8 (ENSTRUG00000006143)	f5 (ENSTRUG00000014416)	slc35a5 (ENSTRUG00000014370)	ccdc80 (ENSTRUG00000014296)	dusp19a (ENSTRUG00000014275)	frzb (ENSTRUG00000014200)	dnajc10 (ENSTRUG00000014113)	nup35 (ENSTRUG00000014111)	ddx3xa (ENSTRUG00000014001)	nyx (ENSTRUG00000013984)	ENSTRUG00000031114	mao (ENSTRUG00000013814)	ENSTRUG00000013800
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Ballan wrasse	DUPLICATION
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Ballan wrasse	MODERN SPECIES	3874																idh1 (ENSLBEG00000019003) #22	ENSLBEG00000019027
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a	ENSGT01060000248589.C.g.a
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Gilthead seabream	MODERN SPECIES	23	coq10b (ENSSAUG00010024956)	hspd1 (ENSSAUG00010024953)	HSP10 (ENSSAUG00010024941)	mob4 (ENSSAUG00010024939)	rftn2 (ENSSAUG00010024938)	PLCL1 (ENSSAUG00010024936)	satb2 (ENSSAUG00010024934)	dnajb11 (ENSSAUG00010024928)	tbccd1 (ENSSAUG00010024920)	CRYGS (ENSSAUG00010024919)	lcmt2 (ENSSAUG00010024917)	rab5b (ENSSAUG00010024915)	dbr1 (ENSSAUG00010024912)	armc8 (ENSSAUG00010024769)	ENSSAUG00010024755	idh1 (ENSSAUG00010024665) #22	ENSSAUG00010024649	ENSSAUG00010024648	AKAP11 (ENSSAUG00010024645)	DGKH (ENSSAUG00010024376)	ENSSAUG00010024355	vwa8 (ENSSAUG00010023822)	rgcc (ENSSAUG00010023801)	f5 (ENSSAUG00010022483)	slc35a5 (ENSSAUG00010022479)	ENSSAUG00010022478	ccdc80 (ENSSAUG00010022425)	KDM6A (ENSSAUG00010002756)	fundc1 (ENSSAUG00010002378)	efhc2 (ENSSAUG00010002242)	ENSSAUG00010002229
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Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000177416	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a
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Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00940000177416	ENSGT00530000063609.a	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00390000006350	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000018393	ENSGT00950000182908.D	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00940000155600.a.b
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	244																ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	161		ENSKMAG00000004320	ENSKMAG00000004359	ENSKMAG00000004370	ENSKMAG00000004391	ENSKMAG00000004414	ENSKMAG00000004459	ENSKMAG00000004511	ENSKMAG00000004562	ENSKMAG00000004583	ENSKMAG00000004626	ENSKMAG00000004675	armc8 (ENSKMAG00000004743)	ENSKMAG00000004850	dbr1 (ENSKMAG00000004869)	idh1 (ENSKMAG00000004893) #22	ENSKMAG00000004931	AKAP11 (ENSKMAG00000004949)	DGKH (ENSKMAG00000004995)	ENSKMAG00000005165	vwa8 (ENSKMAG00000005204)	rgcc (ENSKMAG00000005314)	f5 (ENSKMAG00000005353)	slc35a5 (ENSKMAG00000005385)	ccdc80 (ENSKMAG00000005417)	ENSKMAG00000005433
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1623	COQ10B (ENSNFUG00015004906)	HSPD1 (ENSNFUG00015004867)	hspe1 (ENSNFUG00015004832)	MOB4 (ENSNFUG00015004812)	rftn2 (ENSNFUG00015004796)	ENSNFUG00015004775	satb2 (ENSNFUG00015022276)	DNAJB11 (ENSNFUG00015022262)	TBCCD1 (ENSNFUG00015022248)	crygs1 (ENSNFUG00015022246)	TNFAIP6 (ENSNFUG00015022242)	ITGB5 (ENSNFUG00015020515)	ETV5A (ENSNFUG00015020396)	ENSNFUG00015020391	DGKG (ENSNFUG00015016687)	idh1 (ENSNFUG00015016215) #22	ENSNFUG00015016196	insig2 (ENSNFUG00015016192)	si:dkey-251i10.3 (ENSNFUG00015016189)	CCDC93 (ENSNFUG00015016164)	ENSNFUG00015016043	pknox1.1 (ENSNFUG00015016032)	ENSNFUG00015016025	ENSNFUG00015015997	ENSNFUG00015015983	si:dkey-57a22.15 (ENSNFUG00015015975)	ENSNFUG00015015968	KALRN (ENSNFUG00015011459)	ahr2 (ENSNFUG00015011148)	ENSNFUG00015011134	ndufa10 (ENSNFUG00015011066)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00940000177416	ENSGT00530000063609.a	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00390000006350	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000018393	ENSGT00950000182908.D	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00940000155600.a.b
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155792	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00530000063609.a	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00390000006350	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000018393	ENSGT00950000182908.D	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00940000155600.a.b
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000155792	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00530000063609.a	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00390000006350	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000018393	ENSGT00950000182908.D	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106.r.a	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00940000155600.a.b
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	471																ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106.r.a
Amazon molly	MODERN SPECIES	737														ENSPFOG00000022638	vwa8 (ENSPFOG00000002911)	idh1 (ENSPFOG00000002594) #22	ENSPFOG00000023478	ENSPFOG00000002571	AKAP11 (ENSPFOG00000002476)	DGKH (ENSPFOG00000001800)
Sailfin molly	MODERN SPECIES	881																idh1 (ENSPLAG00000023100) #22	ENSPLAG00000023115	ENSPLAG00000023135	AKAP11 (ENSPLAG00000023146)	DGKH (ENSPLAG00000023211)
Guppy	MODERN SPECIES	450	satb2 (ENSPREG00000019334)	ENSPREG00000019403	ENSPREG00000019497	ENSPREG00000019507	rftn2 (ENSPREG00000019526)	mob4 (ENSPREG00000019579)	hspe1 (ENSPREG00000019607)	hspd1 (ENSPREG00000019620)	SF3B1 (ENSPREG00000019652)	ANKRD44 (ENSPREG00000019808)	lcmt2 (ENSPREG00000020123)	rab5b (ENSPREG00000020141)	dbr1 (ENSPREG00000020157)	armc8 (ENSPREG00000020189)	ENSPREG00000020257	idh1 (ENSPREG00000020304) #22	ENSPREG00000020325	AKAP11 (ENSPREG00000020336)	DGKH (ENSPREG00000020352)	vwa8 (ENSPREG00000020438)	rgcc (ENSPREG00000020557)	f5 (ENSPREG00000020574)	slc35a5 (ENSPREG00000020604)	ccdc80 (ENSPREG00000020628)	KDM6A (ENSPREG00000020669)	fundc1 (ENSPREG00000020691)	efhc2 (ENSPREG00000020717)	ENSPREG00000020735	mao (ENSPREG00000020746)	CASK (ENSPREG00000020791)	GPR82 (ENSPREG00000020823)
Platyfish	MODERN SPECIES	21	satb2 (ENSXMAG00000007412)	PLCL1 (ENSXMAG00000007406)	ENSXMAG00000028420	rftn2 (ENSXMAG00000007403)	mob4 (ENSXMAG00000007395)	hspe1 (ENSXMAG00000005889)	hspd1 (ENSXMAG00000005891)	coq10b (ENSXMAG00000028301)	SF3B1 (ENSXMAG00000007369)	ANKRD44 (ENSXMAG00000007341)	lcmt2 (ENSXMAG00000007328)	rab5b (ENSXMAG00000022199)	dbr1 (ENSXMAG00000007311)	armc8 (ENSXMAG00000007274)	ENSXMAG00000007272	idh1 (ENSXMAG00000007256) #22	EPSTI1 (ENSXMAG00000029717)	ENSXMAG00000000329	AKAP11 (ENSXMAG00000027331)	DGKH (ENSXMAG00000007213)	vwa8 (ENSXMAG00000007176)	rgcc (ENSXMAG00000007172)	f5 (ENSXMAG00000007139)	slc35a5 (ENSXMAG00000007127)	ccdc80 (ENSXMAG00000007110)	KDM6A (ENSXMAG00000007003)	fundc1 (ENSXMAG00000006986)	efhc2 (ENSXMAG00000006963)	ENSXMAG00000024891	mao (ENSXMAG00000006915)	CASK (ENSXMAG00000029578)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	163	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00940000177416	ENSGT00530000063609.a	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00390000006350	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000018393	ENSGT00950000182908.D	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb
Mummichog	MODERN SPECIES	2364										ENSFHEG00000001725	lcmt2 (ENSFHEG00000001732)	rab5b (ENSFHEG00000001739)	dbr1 (ENSFHEG00000001743)	armc8 (ENSFHEG00000001770)	ENSFHEG00000001877	idh1 (ENSFHEG00000001904) #22	ENSFHEG00000001913	AKAP11 (ENSFHEG00000001932)	DGKH (ENSFHEG00000001969)	vwa8 (ENSFHEG00000002129)	rgcc (ENSFHEG00000000067)	f5 (ENSFHEG00000002224)	slc35a5 (ENSFHEG00000002238)	ccdc80 (ENSFHEG00000002273)	ENSFHEG00000002293	KDM6A (ENSFHEG00000002342)	fundc1 (ENSFHEG00000002361)	ENSFHEG00000002371
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1972																idh1 (ENSCVAG00000002425) #22	ENSCVAG00000000073
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	61	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481.d	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT01070000253816.a.a.b
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	72	ENSGT00390000005727.a.a	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481.d	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000154801.p
Indian medaka	MODERN SPECIES	378																idh1 (ENSOMEG00000011210) #22	ENSOMEG00000011243	AKAP11 (ENSOMEG00000011317)	kif5c (ENSOMEG00000011517)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	8	pnp5b (ENSOJAG00000004883)	ENSOJAG00000004866	ENSOJAG00000004816	ENSOJAG00000004770	ENSOJAG00000004746	ENSOJAG00000004721	ENSOJAG00000004685	PLCL1 (ENSOJAG00000004658)	satb2 (ENSOJAG00000004485)	tbccd1 (ENSOJAG00000004328)	crygs1 (ENSOJAG00000004187)	lcmt2 (ENSOJAG00000004082)	rab5b (ENSOJAG00000004045)	armc8 (ENSOJAG00000003372)	ENSOJAG00000003231	idh1 (ENSOJAG00000003097) #22	ENSOJAG00000003073	AKAP11 (ENSOJAG00000003063)	kif5c (ENSOJAG00000002875)	ENSOJAG00000002855	ENSOJAG00000002809	zeb2a (ENSOJAG00000002773)	gtdc1 (ENSOJAG00000002753)	ENSOJAG00000002656	tp53rk (ENSOJAG00000002627)	ENSOJAG00000002617	ENSOJAG00000002610	ENSOJAG00000002596	ENSOJAG00000002527	ENSOJAG00000002482	ACO1 (ENSOJAG00000002137)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	196																ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT01070000253816.a.a.b
Chinese medaka	MODERN SPECIES	259																idh1 (ENSOSIG00000010419) #22	ENSOSIG00000010417
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000177416	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	52							ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599.f	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00940000155600.a.b
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	69							ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599.f	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	61						ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b.b	ENSGT00940000160342.g.b.a	ENSGT00940000162599.f	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.c	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a
Orange clownfish	MODERN SPECIES	3	ENSAPEG00000022401	ENSAPEG00000022338	ENSAPEG00000022305	ENSAPEG00000022279	ENSAPEG00000022263	ENSAPEG00000022244	satb2 (ENSAPEG00000022191)	dnajb11 (ENSAPEG00000022169)	tbccd1 (ENSAPEG00000022111)	CRYGS (ENSAPEG00000022108)	lcmt2 (ENSAPEG00000022076)	rab5b (ENSAPEG00000021965)	dbr1 (ENSAPEG00000021944)	armc8 (ENSAPEG00000021898)	ENSAPEG00000021607	idh1 (ENSAPEG00000021529) #22	ENSAPEG00000021507	ENSAPEG00000021497	AKAP11 (ENSAPEG00000021480)	DGKH (ENSAPEG00000021400)	vwa8 (ENSAPEG00000021150)	rgcc (ENSAPEG00000021108)	f5 (ENSAPEG00000020981)	slc35a5 (ENSAPEG00000020922)	ccdc80 (ENSAPEG00000020910)	KDM6A (ENSAPEG00000020685)	fundc1 (ENSAPEG00000020645)	efhc2 (ENSAPEG00000020493)	ENSAPEG00000020473	mao (ENSAPEG00000020420)	GPR82 (ENSAPEG00000020396)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	2758																idh1 (ENSAOCG00000006379) #22
Spiny chromis	MODERN SPECIES	880																idh1 (ENSAPOG00000022757) #22	ENSAPOG00000022707	ENSAPOG00000022693	ENSAPOG00000022682	ENSAPOG00000022661	AKAP11 (ENSAPOG00000022655)	ENSAPOG00000022639
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1596																idh1 (ENSSPAG00000009178) #22	ENSSPAG00000009213	AKAP11 (ENSSPAG00000009230)	ENSSPAG00000009282
Cichlidae	DUPLICATION
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	52																ENSGT00390000012547.b.u #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.b	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.b	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b.j	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b.i	ENSGT00940000163148.a.a.b	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b	ENSGT00940000163322.a.a.a	ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a	ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c	ENSGT00940000156768	ENSGT00940000165279.c	ENSGT00940000177452	ENSGT01090000259987.b.b.a.b	ENSGT00940000157201	ENSGT00390000012204	ENSGT00390000012547.b.u #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446	ENSGT00990000203619.A.a
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.b	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.b	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b.j	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b.i	ENSGT00940000163148.a.a.b	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b	ENSGT00940000163322.a.a.a	ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a	ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c	ENSGT00940000156768	ENSGT00940000165279.c	ENSGT00940000177452	ENSGT01090000259987.b.b.a.b	ENSGT00940000157201	ENSGT00390000012204	ENSGT00390000012547.b.u #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446.d.b	ENSGT00990000203619.A.a.e
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.b	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b.j	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b.i	ENSGT00940000163148.a.a.b	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b	ENSGT00940000163322.a.a.a	ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a	ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c	ENSGT00390000019406.w.b	ENSGT00940000156768	ENSGT00940000165279.c	ENSGT00940000177452	ENSGT01090000259987.b.b.a.b	ENSGT00940000157201	ENSGT00390000012204	ENSGT00390000012547.b.u #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT01100000267124	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446.d.a	ENSGT00990000203619.A.a.e
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	51	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.b	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.b	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b.j	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b.i	ENSGT00940000163148.a.a.b	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b	ENSGT00940000163322.a.a.a	ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a	ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c	ENSGT00390000019406.w.b	ENSGT00940000156768	ENSGT00940000165279.c	ENSGT01090000259987.b.b.a.b	ENSGT00940000157201	ENSGT00390000012204	ENSGT00390000012547.b.u #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT01100000267124	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446.d.a	ENSGT00940000166446.d.b
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b.i	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.b.h	ENSGT00940000163148.a.a.b	ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b	ENSGT00940000163322.a.a.a	ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a	ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c	ENSGT00390000019406.w.b	ENSGT00940000180828	ENSGT00940000156768	ENSGT00940000165279.c	ENSGT00940000177452	ENSGT01090000259987.b.b.a.b	ENSGT00940000157201	ENSGT00390000012204	ENSGT00390000012547.b.u #22	ENSGT00390000013820	ENSGT01070000253816.a.a.b	ENSGT00940000153313.B	ENSGT00940000158106	ENSGT00390000006601	ENSGT00390000011709.gb	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000182827.A	ENSGT00940000164470.a	ENSGT00940000155202	ENSGT00940000154517.mb	ENSGT00530000063528.B	ENSGT00940000166292	ENSGT00940000166446.c.b.b	ENSGT00940000166446.c.a
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1098	ENSMZEG00005021176	ENSMZEG00005021171	ENSMZEG00005021116	ENSMZEG00005021114	ENSMZEG00005021113	crygm3 (ENSMZEG00005021001)	crygs4 (ENSMZEG00005020993)	crygs3 (ENSMZEG00005020992)	sqor (ENSMZEG00005020989)	ENSMZEG00005020986	DGKG (ENSMZEG00005020981)	etv5a (ENSMZEG00005020974)	itgb5 (ENSMZEG00005020966)	tnfaip6 (ENSMZEG00005020957)	rif1 (ENSMZEG00005020920)	idh1 (ENSMZEG00005020906) #22	EPSTI1 (ENSMZEG00005020903)	ENSMZEG00005020900	ENSMZEG00005020896	AKAP11 (ENSMZEG00005020893)	DGKH (ENSMZEG00005020873)	vwa8 (ENSMZEG00005020838)	rgcc (ENSMZEG00005020831)	f5 (ENSMZEG00005020824)	slc35a5 (ENSMZEG00005020821)	ccdc80 (ENSMZEG00005020819)	KDM6A (ENSMZEG00005020798)	fundc1 (ENSMZEG00005020791)	efhc2 (ENSMZEG00005020787)	ENSMZEG00005020784	mao (ENSMZEG00005020779)
Eastern happy	MODERN SPECIES	7	ENSACLG00000011989	efhc2 (ENSACLG00000011880)	fundc1 (ENSACLG00000011814)	KDM6A (ENSACLG00000011692)	ccdc80 (ENSACLG00000011459)	slc35a5 (ENSACLG00000011451)	f5 (ENSACLG00000011439)	rgcc (ENSACLG00000011410)	vwa8 (ENSACLG00000011362)	DGKH (ENSACLG00000010870)	ENSACLG00000010849	AKAP11 (ENSACLG00000010835)	ENSACLG00000010828	ENSACLG00000010762	idh1 (ENSACLG00000010612) #22	idh1 (ENSACLG00000010579) #22	ENSACLG00000010557	ENSACLG00000010549	RAPH1 (ENSACLG00000010455)	ENSACLG00000010242	ENSACLG00000010228	ENSACLG00000010174	ENSACLG00000010162	ENSACLG00000010153	ENSACLG00000010148	ENSACLG00000010137	ENSACLG00000009871	ENSACLG00000009868	ENSACLG00000009858	ENSACLG00000009851	ENSACLG00000009846
P. nyererei	MODERN SPECIES	455																idh1 (ENSPNYG00000011180) #22	ENSPNYG00000011205	AKAP11 (ENSPNYG00000011223)	DGKH (ENSPNYG00000011257)	vwa8 (ENSPNYG00000011389)	ENSPNYG00000011660	rgcc (ENSPNYG00000011675)	f5 (ENSPNYG00000011696)	slc35a5 (ENSPNYG00000011741)	ccdc80 (ENSPNYG00000011778)	KDM6A (ENSPNYG00000011879)	fundc1 (ENSPNYG00000011956)	efhc2 (ENSPNYG00000011988)	ENSPNYG00000012013	mao (ENSPNYG00000012032)	ENSPNYG00000012071
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	548																idh1 (ENSHBUG00000014969) #22	ENSHBUG00000014948	ENSHBUG00000000949	AKAP11 (ENSHBUG00000014928)	DGKH (ENSHBUG00000014882)	vwa8 (ENSHBUG00000014695)	ENSHBUG00000014596	rgcc (ENSHBUG00000014585)	f5 (ENSHBUG00000000424)	slc35a5 (ENSHBUG00000014527)	ccdc80 (ENSHBUG00000014497)	KDM6A (ENSHBUG00000014387)	fundc1 (ENSHBUG00000012775)	efhc2 (ENSHBUG00000012733)	ENSHBUG00000012711	ENSHBUG00000012699
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	439																idh1 (ENSNBRG00000019389) #22	ENSNBRG00000019415	AKAP11 (ENSNBRG00000019442)	DGKH (ENSNBRG00000019470)	vwa8 (ENSNBRG00000019546)	rgcc (ENSNBRG00000019647)	f5 (ENSNBRG00000019729)	slc35a5 (ENSNBRG00000020014)	ccdc80 (ENSNBRG00000020040)	KDM6A (ENSNBRG00000020087)	fundc1 (ENSNBRG00000020128)	efhc2 (ENSNBRG00000020155)	ENSNBRG00000020193	ENSNBRG00000020201	ENSNBRG00000020219	CASK (ENSNBRG00000020260)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	7	si:dkey-57a22.15 (ENSONIG00000033087)	zgc:153846 (ENSONIG00000013736)	ENSONIG00000032763	ENSONIG00000043101	crygm5 (ENSONIG00000037083)	crygm3 (ENSONIG00000013724)	ENSONIG00000037982	crygs4 (ENSONIG00000013721)	crygs3 (ENSONIG00000013719)	ENSONIG00000013705	etv5a (ENSONIG00000013700)	ENSONIG00000024723	itgb5 (ENSONIG00000013667)	tnfaip6 (ENSONIG00000013664)	rif1 (ENSONIG00000013657)	idh1 (ENSONIG00000016369) #22	EPSTI1 (ENSONIG00000042475)	ENSONIG00000016368	AKAP11 (ENSONIG00000016365)	DGKH (ENSONIG00000016354)	vwa8 (ENSONIG00000016347)	rgcc (ENSONIG00000016346)	f5 (ENSONIG00000016333)	slc35a5 (ENSONIG00000016329)	ccdc80 (ENSONIG00000016325)	ENSONIG00000038809	ENSONIG00000034785	KDM6A (ENSONIG00000016301)	fundc1 (ENSONIG00000016299)	efhc2 (ENSONIG00000016295)	ndp (ENSONIG00000036280)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1136																idh1 (ENSACIG00000007114) #22	ENSACIG00000007103	AKAP11 (ENSACIG00000007030)	DGKH (ENSACIG00000006953)	vwa8 (ENSACIG00000006776)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.v #22
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.v #22
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.v #22
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.v #22
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.v #22
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.v #22
Eastern happy	MODERN SPECIES	7	ENSACLG00000009851	ENSACLG00000009858	ENSACLG00000009868	ENSACLG00000009871	ENSACLG00000010137	ENSACLG00000010148	ENSACLG00000010153	ENSACLG00000010162	ENSACLG00000010174	ENSACLG00000010228	ENSACLG00000010242	RAPH1 (ENSACLG00000010455)	ENSACLG00000010549	ENSACLG00000010557	idh1 (ENSACLG00000010579) #22	idh1 (ENSACLG00000010612) #22	ENSACLG00000010762	ENSACLG00000010828	AKAP11 (ENSACLG00000010835)	ENSACLG00000010849	DGKH (ENSACLG00000010870)	vwa8 (ENSACLG00000011362)	rgcc (ENSACLG00000011410)	f5 (ENSACLG00000011439)	slc35a5 (ENSACLG00000011451)	ccdc80 (ENSACLG00000011459)	KDM6A (ENSACLG00000011692)	fundc1 (ENSACLG00000011814)	efhc2 (ENSACLG00000011880)	ENSACLG00000011989	mao (ENSACLG00000012011)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	49																idh1 (ENSACIG00000015438) #22	dolpp1 (ENSACIG00000015452)	NTNG2 (ENSACIG00000015470)	rapgef1b (ENSACIG00000015498)	uck1 (ENSACIG00000015555)	dnlz (ENSACIG00000015579)	lrrc8aa (ENSACIG00000015591)	phyhd1 (ENSACIG00000015609)	dolk (ENSACIG00000015640)	NUP188 (ENSACIG00000015653)	ENSACIG00000015759	ENSACIG00000015778	B3GALT9 (ENSACIG00000015792)	psmd5 (ENSACIG00000015802)	KCNT1 (ENSACIG00000015879)	ENSACIG00000015922
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000155367	ENSGT00390000005727.b	ENSGT00390000006350	ENSGT01050000244956.b	ENSGT00530000063609.a	ENSGT00940000158407	ENSGT00390000008096.B.e.a	ENSGT00940000155792	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000165242.e	ENSGT00390000012547.b #22	ENSGT00940000159743 #26	ENSGT00940000162639.a	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a	ENSGT00940000155235.k.a	ENSGT00940000178681	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000165586.a	ENSGT00940000154349	ENSGT00940000159224.a	ENSGT00940000156332	ENSGT00940000157211.l	ENSGT00390000010354	ENSGT00940000156353.u.a	ENSGT00940000159094.f
Northern pike	MODERN SPECIES	15	coq10b (ENSELUG00000005921)	hspd1 (ENSELUG00000005904)	hspe1 (ENSELUG00000005886)	MOB4 (ENSELUG00000005831)	rftn2 (ENSELUG00000005798)	PLCL1 (ENSELUG00000001594)	satb2 (ENSELUG00000005722)	dnajb11 (ENSELUG00000005667)	tbccd1 (ENSELUG00000005651)	CRYGS (ENSELUG00000005634)	lcmt2 (ENSELUG00000005620)	rab5b (ENSELUG00000033798)	dbr1 (ENSELUG00000005587)	armc8 (ENSELUG00000005566)	ENSELUG00000005519	idh1 (ENSELUG00000005492) #22	PLEKHM3 (ENSELUG00000005453) #26	ENSELUG00000005440	ccnyl1 (ENSELUG00000005420)	creb1b (ENSELUG00000005394)	klf7b (ENSELUG00000005383)	ENSELUG00000027165	ENSELUG00000026268	zgc:162396 (ENSELUG00000005372)	zgc:162780 (ENSELUG00000005357)	ube2f (ENSELUG00000005321)	ramp1 (ENSELUG00000005272)	epb41l5 (ENSELUG00000005243)	ptpn4a (ENSELUG00000005149)	tmem177 (ENSELUG00000005098)	MRAS (ENSELUG00000005090)
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.w #22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.w #22
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.w #22
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b.w #22
Chinook salmon	MODERN SPECIES	1963																ENSOTSG00005024444 #22
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	744												ENSGT00940000166096.g	ENSGT00510000047481.f.a	ENSGT00390000003033.c	ENSGT00940000165242.e.b.a.a	ENSGT00390000012547.b.x.a #22	ENSGT00940000159743.c.b #26	ENSGT00940000159743.d #26	ENSGT00940000162639.a	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a.f	ENSGT00940000155235.k.a.d
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000182908.D.o	ENSGT00390000018393.db	ENSGT00940000155367.f	ENSGT00390000005727.b.e	ENSGT00390000006350.f	ENSGT01050000244956.b.u.b	ENSGT00530000063609.a.h	ENSGT00940000158407.g	ENSGT00390000008096.B.e.a.d	ENSGT00940000155792.h	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000166096.g	ENSGT00510000047481.f.a	ENSGT00390000003033.c	ENSGT00940000165242.e.b.a.a	ENSGT00390000012547.b.x.a #22	ENSGT00940000159743.c.b #26	ENSGT00940000161191.B.a.a	ENSGT00940000159743.d #26	ENSGT00940000162639.a.b	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a.f	ENSGT00940000155235.k.a.d	ENSGT00940000178681.a.b	ENSGT00940000165586.a.a	ENSGT00940000154349.c.b	ENSGT00940000159224.a.a.a	ENSGT00940000156332.r	ENSGT00940000157211.l.b	ENSGT00390000010354.d	ENSGT00940000156353.u.a.b
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000018393.db	ENSGT00940000155367.f	ENSGT00390000005727.b.e	ENSGT00390000006350.f	ENSGT01050000244956.b.u.b	ENSGT00530000063609.a.h	ENSGT00940000158407.g	ENSGT00390000008096.B.e.a.d	ENSGT00940000155792.h	ENSGT00470000042284	ENSGT01000000220382	ENSGT00940000166096.g	ENSGT00510000047481.f.a	ENSGT00390000003033.c	ENSGT00940000165242.e.b.b	ENSGT00390000012547.b.x.a #22	ENSGT00940000159743.c.b #26	ENSGT00940000162639.a.b	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a.f	ENSGT00940000155235.k.a.d	ENSGT00940000178681.a.b	ENSGT00940000165586.a.a	ENSGT00940000154349.c.b	ENSGT00940000159224.a.a.a	ENSGT00940000159224.a.b	ENSGT00940000156332.r	ENSGT00940000157211.l.b	ENSGT00390000010354.d	ENSGT00940000156353.u.a.b	ENSGT00940000159094.f.b
Rainbow trout	MODERN SPECIES	14	ANKRD44 (ENSOMYG00000019539)	SF3B1 (ENSOMYG00000019571)	coq10b (ENSOMYG00000019601)	hspd1 (ENSOMYG00000019648)	mob3 (ENSOMYG00000019689)	rftn2 (ENSOMYG00000056375)	ENSOMYG00000019746	satb2 (ENSOMYG00000068548)	dnajb11 (ENSOMYG00000019756)	ENSOMYG00000019760	ENSOMYG00000019765	rab5b (ENSOMYG00000019771)	dbr1 (ENSOMYG00000019774)	armc8 (ENSOMYG00000019919)	ENSOMYG00000064355	idh1 (ENSOMYG00000022000) #22	PLEKHM3 (ENSOMYG00000022306) #26	ENSOMYG00000071556	fzd5 (ENSOMYG00000073763)	ccnyl1 (ENSOMYG00000022318)	creb1b (ENSOMYG00000022353)	ENSOMYG00000076803	klf7b (ENSOMYG00000022387)	ENSOMYG00000054520	ENSOMYG00000051532	ENSOMYG00000050926	ENSOMYG00000060013	zgc:162780 (ENSOMYG00000022420)	ube2f (ENSOMYG00000022455)	ramp1 (ENSOMYG00000022499)	ENSOMYG00000077770
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00950000182908.D.o	ENSGT00390000018393.db	ENSGT00940000155367.f	ENSGT00390000005727.b.e	ENSGT00390000006350.f	ENSGT01050000244956.b.u.b	ENSGT00530000063609.a.h	ENSGT00940000158407.g	ENSGT00390000008096.B.e.a.d	ENSGT00940000155792.h	ENSGT00470000042284	ENSGT01000000220382	ENSGT00940000166096.g	ENSGT00510000047481.f.a	ENSGT00390000003033.c	ENSGT00390000012547.b.x.a #22	ENSGT00940000159743.c.b #26	ENSGT00940000162639.a.b	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a.f	ENSGT00940000155235.k.a.d	ENSGT00940000178681.a.b	ENSGT00940000165586.a.a	ENSGT00940000154349.c.b	ENSGT00940000159224.a.b	ENSGT00940000156332.r	ENSGT00940000157211.l.b	ENSGT00390000010354.d	ENSGT00940000156353.u.a.b	ENSGT00940000159094.f.b	ENSGT00390000001170.a.a.d.b.a
Chinook salmon	DUPLICATION
Chinook salmon	MODERN SPECIES	111												ENSOTSG00005012634	rab5b (ENSOTSG00005012633)	dbr1 (ENSOTSG00005012630)	armc8 (ENSOTSG00005012628)	idh1 (ENSOTSG00005012626) #22	ENSOTSG00005012625 #26
Chinook salmon	MODERN SPECIES	2997											dnajb11 (ENSOTSG00005046652)	tbccd1 (ENSOTSG00005046675)	rab5b (ENSOTSG00005046676)	dbr1 (ENSOTSG00005046678)	armc8 (ENSOTSG00005046679)	idh1 (ENSOTSG00005046680) #22	ENSOTSG00005046681 #26
Coho salmon	MODERN SPECIES	18	ANKRD44 (ENSOKIG00005017701)	SF3B1 (ENSOKIG00005020547)	coq10b (ENSOKIG00005020582)	hspd1 (ENSOKIG00005020599)	hspe1 (ENSOKIG00005020651)	MOB4 (ENSOKIG00005020680)	rftn2 (ENSOKIG00005020694)	PLCL1 (ENSOKIG00005020711)	satb2 (ENSOKIG00005020774)	dnajb11 (ENSOKIG00005020809)	tbccd1 (ENSOKIG00005020923)	ENSOKIG00005020949	rab5b (ENSOKIG00005020965)	dbr1 (ENSOKIG00005021000)	armc8 (ENSOKIG00005021250)	idh1 (ENSOKIG00005024323) #22	PLEKHM3 (ENSOKIG00005024517) #26	fzd5 (ENSOKIG00005024531)	ccnyl1 (ENSOKIG00005024540)	creb1b (ENSOKIG00005024554)	klf7b (ENSOKIG00005024600)	ENSOKIG00005024623	ENSOKIG00005024634	zgc:162780 (ENSOKIG00005024648)	ube2f (ENSOKIG00005024682)	epb41l5 (ENSOKIG00005024768)	ptpn4a (ENSOKIG00005024895)	tmem177 (ENSOKIG00005025174)	MRAS (ENSOKIG00005025188)	ENSOKIG00005025223	pth2ra (ENSOKIG00005025342)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000018393.db	ENSGT00940000155367.f	ENSGT00390000005727.b.e	ENSGT00390000006350.f	ENSGT01050000244956.b.u.b	ENSGT00530000063609.a.h	ENSGT00940000158407.g	ENSGT00390000008096.B.e.a.d	ENSGT00940000155792.h	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000162599.n	ENSGT00940000166096.g	ENSGT00510000047481.f.a	ENSGT00390000003033.c	ENSGT00940000165242.e.b.a.a	ENSGT00390000012547.b.x.a #22	ENSGT00940000159743.c.b #26	ENSGT00940000161191.B.a.a	ENSGT00940000159743.d #26	ENSGT00940000162639.a.b	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000155408.o.a.f	ENSGT00940000155235.k.a.d	ENSGT00940000178681.a.b	ENSGT00940000165586.a.a	ENSGT00940000154349.c.b	ENSGT00940000159224.a.a.a	ENSGT00940000156332.r	ENSGT00940000157211.l.b	ENSGT00390000010354.d	ENSGT00940000156353.u.a.b
River trout	MODERN SPECIES	12	SF3B1 (ENSSTUG00000012136)	coq10b (ENSSTUG00000012103)	hspd1 (ENSSTUG00000012049)	hspe1 (ENSSTUG00000012021)	MOB4 (ENSSTUG00000012002)	rftn2 (ENSSTUG00000011987)	PLCL1 (ENSSTUG00000011969)	satb2 (ENSSTUG00000011931)	dnajb11 (ENSSTUG00000011647)	tbccd1 (ENSSTUG00000011632)	ENSSTUG00000011626	rab5b (ENSSTUG00000011617)	dbr1 (ENSSTUG00000011595)	armc8 (ENSSTUG00000010289)	ENSSTUG00000010236	idh1 (ENSSTUG00000010124) #22	PLEKHM3 (ENSSTUG00000010086) #26	ENSSTUG00000010079	ccnyl1 (ENSSTUG00000009996)	creb1b (ENSSTUG00000009944)	klf7b (ENSSTUG00000009938)	ENSSTUG00000009931	zgc:162780 (ENSSTUG00000009925)	ube2f (ENSSTUG00000009893)	ramp1 (ENSSTUG00000009887)	epb41l5 (ENSSTUG00000009747)	ptpn4a (ENSSTUG00000009601)	tmem177 (ENSSTUG00000009587)	MRAS (ENSSTUG00000009578)	ENSSTUG00000009573	pth2ra (ENSSTUG00000009522)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	13	hspe1 (ENSSSAG00000081441)	MOB4 (ENSSSAG00000081444)	rftn2 (ENSSSAG00000111108)	ENSSSAG00000094048	PLCL1 (ENSSSAG00000053340)	ENSSSAG00000088810	ENSSSAG00000053311	satb2 (ENSSSAG00000053203)	dnajb11 (ENSSSAG00000111994)	ENSSSAG00000116518	ENSSSAG00000052141	rab5b (ENSSSAG00000084227)	dbr1 (ENSSSAG00000052088)	armc8 (ENSSSAG00000049392)	ENSSSAG00000049141	idh1 (ENSSSAG00000048877) #22	ENSSSAG00000091454 #26	ENSSSAG00000104346 #26	fzd5 (ENSSSAG00000120506)	ccnyl1 (ENSSSAG00000053909)	creb1b (ENSSSAG00000112465)	klf7b (ENSSSAG00000053939)	ENSSSAG00000088624	ENSSSAG00000106907	ENSSSAG00000105234	zgc:162780 (ENSSSAG00000053955)	ube2f (ENSSSAG00000053963)	ramp1 (ENSSSAG00000082319)	ENSSSAG00000095459	ENSSSAG00000119082	epb41l5 (ENSSSAG00000053983)
Huchen	MODERN SPECIES	2702																idh1 (ENSHHUG00000046746) #22	PLEKHM3 (ENSHHUG00000046733) #26	ENSHHUG00000046730 #26
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000005727.b.f	ENSGT01050000244956.b.u.a	ENSGT00530000063609.a.g	ENSGT00940000158407.h	ENSGT00390000008096.B.e.a.c	ENSGT00940000155792.g	ENSGT00390000008096.B.e.a.d	ENSGT00940000155792.h	ENSGT00470000042284	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096.h	ENSGT00510000047481.f.b	ENSGT00390000003033.d	ENSGT00940000165242.e.a	ENSGT00390000012547.b.x.b #22	ENSGT00940000159743.c.a #26	ENSGT00940000161191.B.a	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000155408.o.a.e	ENSGT00940000155235.k.a.c	ENSGT00940000178681.a.a	ENSGT00940000178681.b	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000165586.a.b	ENSGT00940000154349.c.a	ENSGT00940000159224.a.a.b	ENSGT00940000156332.q	ENSGT00940000157211.l.a	ENSGT00390000010354.c	ENSGT00940000156353.u.a.a
Huchen	MODERN SPECIES	217	SF3B1 (ENSHHUG00000025858)	coq10b (ENSHHUG00000025850)	ENSHHUG00000025846	hspd1 (ENSHHUG00000025817)	MOB4 (ENSHHUG00000025751)	rftn2 (ENSHHUG00000025735)	PLCL1 (ENSHHUG00000025727)	satb2 (ENSHHUG00000025718)	dnajb11 (ENSHHUG00000025637)	tbccd1 (ENSHHUG00000025625)	crygs1 (ENSHHUG00000025604)	rab5b (ENSHHUG00000025599)	dbr1 (ENSHHUG00000025565)	armc8 (ENSHHUG00000025392)	ENSHHUG00000025387	idh1 (ENSHHUG00000025267) #22	PLEKHM3 (ENSHHUG00000025257) #26
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000018393.eb	ENSGT00940000155367.e	ENSGT00390000005727.b.f	ENSGT00390000006350.e	ENSGT01050000244956.b.u.a	ENSGT00530000063609.a.g	ENSGT00940000158407.h	ENSGT00390000008096.B.e.a.c	ENSGT00940000155792.g	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599	ENSGT00940000166096.h	ENSGT00510000047481.f.b	ENSGT00390000003033.d	ENSGT00940000165242.e.a	ENSGT00390000012547.b.x.b #22	ENSGT00940000159743.c.a #26	ENSGT00940000161191.B.a.b	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000155408.o.a.e	ENSGT00940000155235.k.a.c	ENSGT00940000178681.a.a	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000165586.a.b	ENSGT00940000154349.c.a	ENSGT00940000159224.a.a.b	ENSGT00940000156332.q	ENSGT00940000157211.l.a	ENSGT00390000010354.c	ENSGT00940000156353.u.a.a	ENSGT00940000159094.f.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000182908.D.p	ENSGT00390000018393.eb	ENSGT00940000155367.e	ENSGT00390000005727.b.f	ENSGT00390000006350.e	ENSGT01050000244956.b.u.a	ENSGT00530000063609.a.g	ENSGT00940000158407.h	ENSGT00390000008096.B.e.a.c	ENSGT00940000155792.g	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT00940000162599.m	ENSGT00940000166096.h	ENSGT00390000003033.d	ENSGT00940000165242.e.a	ENSGT00390000012547.b.x.b #22	ENSGT00940000159743.c.a #26	ENSGT00940000162639.a.a	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000155408.o.a.e	ENSGT00940000155235.k.a.c	ENSGT00940000178681.a.a	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000154349.c.a	ENSGT00940000159224.a.a.b	ENSGT00940000156332.q	ENSGT00940000157211.l.a	ENSGT00390000010354.c	ENSGT00940000156353.u.a.a	ENSGT00940000159094.f.a	ENSGT00390000001170.a.a.d.a
River trout	MODERN SPECIES	16	ANKRD44 (ENSSTUG00000011891)	SF3B1 (ENSSTUG00000011735)	coq10b (ENSSTUG00000011723)	hspd1 (ENSSTUG00000011643)	hspe1 (ENSSTUG00000011583)	MOB4 (ENSSTUG00000011613)	rftn2 (ENSSTUG00000011566)	PLCL1 (ENSSTUG00000011559)	satb2 (ENSSTUG00000011531)	dnajb11 (ENSSTUG00000011283)	CRYGS (ENSSTUG00000011277)	lcmt2 (ENSSTUG00000011225)	rab5b (ENSSTUG00000011218)	armc8 (ENSSTUG00000010764)	ENSSTUG00000010728	idh1 (ENSSTUG00000010572) #22	PLEKHM3 (ENSSTUG00000010559) #26	ENSSTUG00000010547	ccnyl1 (ENSSTUG00000010491)	creb1b (ENSSTUG00000010469)	klf7b (ENSSTUG00000010461)	zgc:162396 (ENSSTUG00000010404)	ube2f (ENSSTUG00000010326)	ramp1 (ENSSTUG00000010313)	epb41l5 (ENSSTUG00000010250)	ptpn4a (ENSSTUG00000010013)	tmem177 (ENSSTUG00000009990)	MRAS (ENSSTUG00000009970)	pth2ra (ENSSTUG00000009752)	tmem163a (ENSSTUG00000009717)	ccnt2a (ENSSTUG00000009693)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	17	ANKRD44 (ENSSSAG00000053961)	SF3B1 (ENSSSAG00000053819)	coq10b (ENSSSAG00000053811)	hspd1 (ENSSSAG00000053792)	hspe1 (ENSSSAG00000053757)	rftn2 (ENSSSAG00000053726)	ENSSSAG00000083923	ENSSSAG00000099049	satb2 (ENSSSAG00000050749)	dnajb11 (ENSSSAG00000103574)	ENSSSAG00000103538	ENSSSAG00000050803	ENSSSAG00000084004	armc8 (ENSSSAG00000050879)	ENSSSAG00000090279	idh1 (ENSSSAG00000053426) #22	plekhm3 (ENSSSAG00000048838) #26	fzd5 (ENSSSAG00000106789)	ccnyl1 (ENSSSAG00000048803)	creb1b (ENSSSAG00000089906)	ENSSSAG00000083151	klf7b (ENSSSAG00000048735)	ENSSSAG00000106485	zgc:162396 (ENSSSAG00000102136)	zgc:162396 (ENSSSAG00000048731)	Y3374 (ENSSSAG00000048703)	ube2f (ENSSSAG00000048635)	ramp1 (ENSSSAG00000048622)	epb41l5 (ENSSSAG00000048574)	ptpn4a (ENSSSAG00000046847)	tmem177 (ENSSSAG00000046807)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000018393.eb	ENSGT00940000155367.e	ENSGT00390000005727.b.f	ENSGT00390000006350.e	ENSGT01050000244956.b.u.a	ENSGT00530000063609.a.g	ENSGT00940000158407.h	ENSGT00390000008096.B.e.a.c	ENSGT00940000155792.g	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT01060000253581	ENSGT00940000166096.h	ENSGT00510000047481.f.b	ENSGT00390000003033.d	ENSGT00940000165242.e.a	ENSGT00390000012547.b.x.b #22	ENSGT00940000159743.c.a #26	ENSGT00940000161191.B.a.b	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000155408.o.a.e	ENSGT00940000155235.k.a.c	ENSGT00940000178681.a.a	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000165586.a.b	ENSGT00940000154349.c.a	ENSGT00940000159224.a.a.b	ENSGT00940000156332.q	ENSGT00940000157211.l.a	ENSGT01000000221562	ENSGT00940000156353.u.a.a	ENSGT00940000159094.f.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00950000182908.D.p	ENSGT00390000018393.eb	ENSGT00940000155367.e	ENSGT00390000005727.b.f	ENSGT00390000006350.e	ENSGT01050000244956.b.u.a	ENSGT00530000063609.a.g	ENSGT00940000158407.h	ENSGT00390000008096.B.e.a.c	ENSGT00940000155792.g	ENSGT00940000160342.g.b	ENSGT01060000253581	ENSGT00940000166096.h	ENSGT00390000003033.d	ENSGT00940000165242.e.a	ENSGT00390000012547.b.x.b #22	ENSGT00940000159743.c.a #26	ENSGT00940000161191.B.a.b	ENSGT00940000154453.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000155408.o.a.e	ENSGT00940000155235.k.a.c	ENSGT00940000178681.a.a	ENSGT00940000178681.b	ENSGT00940000163794	ENSGT00940000165586.a.b	ENSGT00940000154349.c.a	ENSGT00940000159224.a.a.b	ENSGT00940000156332.q	ENSGT00940000157211.l.a	ENSGT01000000221562	ENSGT00940000156353.u.a.a
Coho salmon	MODERN SPECIES	11	ANKRD44 (ENSOKIG00005000788)	SF3B1 (ENSOKIG00005000295)	coq10b (ENSOKIG00005000190)	hspd1 (ENSOKIG00005000168)	hspe1 (ENSOKIG00005000118)	MOB4 (ENSOKIG00005000137)	rftn2 (ENSOKIG00005049193)	PLCL1 (ENSOKIG00005049189)	ENSOKIG00005049184	satb2 (ENSOKIG00005049182)	dnajb11 (ENSOKIG00005049174)	CRYGS (ENSOKIG00005049171)	ENSOKIG00005049169	armc8 (ENSOKIG00005049098)	ENSOKIG00005049075	idh1 (ENSOKIG00005048897) #22	PLEKHM3 (ENSOKIG00005048849) #26	ENSOKIG00005048845	ENSOKIG00005048842	ccnyl1 (ENSOKIG00005048836)	creb1b (ENSOKIG00005048824)	klf7b (ENSOKIG00005048819)	ENSOKIG00005048815	ENSOKIG00005048810	ENSOKIG00005048806	zgc:162396 (ENSOKIG00005048801)	zgc:162396 (ENSOKIG00005048773)	UBE2F (ENSOKIG00005048755)	ramp1 (ENSOKIG00005048750)	epb41l5 (ENSOKIG00005048712)	ptpn4a (ENSOKIG00005048629)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	22	ANKRD44 (ENSOTSG00005017574)	SF3B1 (ENSOTSG00005017538)	coq10b (ENSOTSG00005017537)	hspd1 (ENSOTSG00005017536)	hspe1 (ENSOTSG00005017509)	MOB4 (ENSOTSG00005017530)	rftn2 (ENSOTSG00005017506)	PLCL1 (ENSOTSG00005017505)	satb2 (ENSOTSG00005017465)	dnajb11 (ENSOTSG00005017458)	crygs1 (ENSOTSG00005017442)	ENSOTSG00005017439	rab5b (ENSOTSG00005017438)	armc8 (ENSOTSG00005015018)	ENSOTSG00005014983	idh1 (ENSOTSG00005014777) #22	PLEKHM3 (ENSOTSG00005014772) #26	ENSOTSG00005014768	ccnyl1 (ENSOTSG00005014763)	creb1b (ENSOTSG00005014751)	klf7b (ENSOTSG00005014750)	ENSOTSG00005014749	ENSOTSG00005014748	ENSOTSG00005014747	zgc:162780 (ENSOTSG00005014746)	zgc:162396 (ENSOTSG00005014732)	ube2f (ENSOTSG00005014729)	ramp1 (ENSOTSG00005014727)	epb41l5 (ENSOTSG00005014721)	ptpn4a (ENSOTSG00005014710)	MRAS (ENSOTSG00005014704)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	21	coq10b (ENSOMYG00000017107)	ENSOMYG00000017102	hspd1 (ENSOMYG00000017062)	MOB4 (ENSOMYG00000017003)	rftn2 (ENSOMYG00000016981)	ENSOMYG00000016971	satb2 (ENSOMYG00000016906)	dnajb11 (ENSOMYG00000016827)	ENSOMYG00000016813	ENSOMYG00000016754	rab5b (ENSOMYG00000016734)	dbr1 (ENSOMYG00000016707)	armc8 (ENSOMYG00000016390)	ENSOMYG00000056558	ENSOMYG00000016169	idh1 (ENSOMYG00000015786) #22	ENSOMYG00000015759 #26	ENSOMYG00000056930	ENSOMYG00000015746	ccnyl1 (ENSOMYG00000077832)	creb1b (ENSOMYG00000015698)	ENSOMYG00000058316	klf7b (ENSOMYG00000015674)	ENSOMYG00000059937	zgc:162780 (ENSOMYG00000015651)	zgc:162396 (ENSOMYG00000015599)	ENSOMYG00000061607	ENSOMYG00000015542	ENSOMYG00000053831	ramp1 (ENSOMYG00000015533)	ptpn4a (ENSOMYG00000015383)
Elephant shark	MODERN SPECIES	1561		SPAG16 (ENSCMIG00000014893)	IKZF2 (ENSCMIG00000014890)	erbb4a (ENSCMIG00000014584)	ENSCMIG00000014428	CPS1 (ENSCMIG00000014321)	lancl1 (ENSCMIG00000014218)	mylz3 (ENSCMIG00000014198)	acadl (ENSCMIG00000014191)	ENSCMIG00000014187	rpe (ENSCMIG00000014183)	UNC80 (ENSCMIG00000014165)	ENSCMIG00000014152	pth2ra (ENSCMIG00000014149)	pikfyve (ENSCMIG00000013940) #21	idh1 (ENSCMIG00000013750) #22	ENSCMIG00000013744	ENSCMIG00000013740	ENSCMIG00000013735	ENSCMIG00000013734	ENSCMIG00000013707	ENSCMIG00000013657	ENSCMIG00000013628	ENSCMIG00000013608	ENSCMIG00000013566	ENSCMIG00000013559	ENSCMIG00000013535	ENSCMIG00000013493	ENSCMIG00000013464	ENSCMIG00000013438	ENSCMIG00000013418
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000012547.b #22
Lamprey	MODERN SPECIES	97				zgc:171772 (ENSPMAG00000000001)	ENSPMAG00000000002	ENSPMAG00000000003	ENSPMAG00000000004	ccdc12 (ENSPMAG00000000005)	NBEAL2 (ENSPMAG00000000006)	ENSPMAG00000000007	GCNT3 (ENSPMAG00000010396)	ENSPMAG00000000008	kat2b (ENSPMAG00000000009)	TRPM7 (ENSPMAG00000000010)	ostf1 (ENSPMAG00000000011)	idh1 (ENSPMAG00000000012) #22	sppl2 (ENSPMAG00000000013)	ENSPMAG00000010398	ENSPMAG00000000014
Hagfish	MODERN SPECIES	345												ENSEBUG00000013599	ENSEBUG00000013183	ENSEBUG00000002132	kat2b (ENSEBUG00000004234)	idh1 (ENSEBUG00000012038) #22	ENSEBUG00000012567	ENSEBUG00000006429	ENSEBUG00000008309	ENSEBUG00000015497	ENSEBUG00000003579	gfm1 (ENSEBUG00000012794)	ENSEBUG00000013583