Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 1009 ENSGT00940000163251.b ENSGT00520000055589.d.a.b #22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.a.b #22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.a.b #22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000165274.b ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT01060000249984 ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00390000004552 #16 ENSGT00530000063548.B #17 ENSGT00390000006641 #18 ENSGT00390000007071 ENSGT00940000156164.a #20 ENSGT00940000153232.a.b.a #21 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000157225 #23 ENSGT00940000157158 #24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000165274.b ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT01060000249984 ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00390000004552 #16 ENSGT00530000063548.B #17 ENSGT00390000006641 #18 ENSGT00390000007071 ENSGT00940000156164.a #20 ENSGT00940000153232.a.b.a #21 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000157225 #23 ENSGT00940000157158 #24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165274.b ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT01060000249984 ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00390000004552 #16 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ENSGT00940000157158 #24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Fugu MODERN SPECIES 8 lrata (ENSTRUG00000006052) ENSTRUG00000006036 npy2r (ENSTRUG00000005990) pdlim3a (ENSTRUG00000005644) SORBS2 (ENSTRUG00000005445) ENSTRUG00000005082 cyp4v2a (ENSTRUG00000004594) mtnr1aa (ENSTRUG00000004479) fat1a (ENSTRUG00000002421) ENSTRUG00000024959 frg1 (ENSTRUG00000016208) #16 pcm1 (ENSTRUG00000015999) #18 SART1 (ENSTRUG00000025047) osbp (ENSTRUG00000015950) #20 casp3a (ENSTRUG00000015915) #21 STOX2 (ENSTRUG00000015899) #22 tll1 (ENSTRUG00000015820) #23 cpe (ENSTRUG00000015779) #24 msmo1 (ENSTRUG00000015761) KLHL2 (ENSTRUG00000015659) med28 (ENSTRUG00000020930) lap3 (ENSTRUG00000015624) clrn2 (ENSTRUG00000022979) tapt1b (ENSTRUG00000015598) prom1b (ENSTRUG00000015548) fgfbp2b (ENSTRUG00000015544) ENSTRUG00000015541 anxa5b (ENSTRUG00000015464) uchl1 (ENSTRUG00000020388) ENSTRUG00000015361 tmem192 (ENSTRUG00000015356) Tetraodon MODERN SPECIES 10 lrata (ENSTNIG00000007118) ENSTNIG00000007119 NPY2R (ENSTNIG00000007120) pdlim3a (ENSTNIG00000007121) SORBS2 (ENSTNIG00000007122) ENSTNIG00000007123 cyp4v2a (ENSTNIG00000007124) mtnr1aa (ENSTNIG00000007125) fat1a (ENSTNIG00000007126) ctnna2 (ENSTNIG00000007127) frg1 (ENSTNIG00000007128) #16 asah1b (ENSTNIG00000007129) #17 pcm1 (ENSTNIG00000007130) #18 osbp (ENSTNIG00000007132) #20 casp3a (ENSTNIG00000007133) #21 STOX2 (ENSTNIG00000007134) #22 tll1 (ENSTNIG00000007135) #23 cpe (ENSTNIG00000004303) #24 msmo1 (ENSTNIG00000004302) KLHL2 (ENSTNIG00000004301) med28 (ENSTNIG00000004300) lap3 (ENSTNIG00000004299) tapt1b (ENSTNIG00000004298) prom1b (ENSTNIG00000004297) fgfbp2b (ENSTNIG00000004296) anxa5b (ENSTNIG00000004295) uchl1 (ENSTNIG00000004294) limch1a (ENSTNIG00000018660) tmem192 (ENSTNIG00000018661) ENSTNIG00000018662 tma16 (ENSTNIG00000018663) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00510000047351.a ENSGT00940000165274.b ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00390000004552 #16 ENSGT00530000063548.B #17 ENSGT00390000006641 #18 ENSGT00390000007071 ENSGT00940000156164.a #20 ENSGT00940000153232.a.b.a #21 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000157225 #23 ENSGT00940000157158 #24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Ballan wrasse MODERN SPECIES 275 mtnr1aa (ENSLBEG00000001653) ENSLBEG00000001611 ENSLBEG00000001573 ENSLBEG00000001548 frg1 (ENSLBEG00000001466) #16 asah1b (ENSLBEG00000001399) #17 pcm1 (ENSLBEG00000001227) #18 osbp (ENSLBEG00000000949) #20 casp3a (ENSLBEG00000000219) #21 STOX2 (ENSLBEG00000000165) #22 tll1 (ENSLBEG00000000111) #23 ENSLBEG00000000092 cpe (ENSLBEG00000000071) #24 msmo1 (ENSLBEG00000000063) KLHL2 (ENSLBEG00000027054) med28 (ENSLBEG00000027043) lap3 (ENSLBEG00000027013) clrn2 (ENSLBEG00000026998) tapt1b (ENSLBEG00000026978) prom1b (ENSLBEG00000026918) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000047351.a ENSGT00940000165274.b ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00390000004552 #16 ENSGT00530000063548.B #17 ENSGT00390000006641 #18 ENSGT00390000007071 ENSGT00940000156164.a #20 ENSGT00940000153232.a.b.a #21 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000157225 #23 ENSGT00940000157158 #24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a 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(ENSSAUG00010025559) pdlim3a (ENSSAUG00010025558) SORBS2 (ENSSAUG00010025549) ENSSAUG00010025539 cyp4v2a (ENSSAUG00010025520) mtnr1aa (ENSSAUG00010025513) fat1a (ENSSAUG00010024502) ENSSAUG00010024474 frg1 (ENSSAUG00010024448) #16 asah1b (ENSSAUG00010024421) #17 pcm1 (ENSSAUG00010024379) #18 sart1 (ENSSAUG00010024377) #19 osbp (ENSSAUG00010024375) #20 casp3a (ENSSAUG00010024374) #21 STOX2 (ENSSAUG00010024373) #22 tll1 (ENSSAUG00010020995) #23 cpe (ENSSAUG00010020944) #24 msmo1 (ENSSAUG00010020941) plrg1 (ENSSAUG00010020732) ENSSAUG00010020730 sfrp2 (ENSSAUG00010020729) ENSSAUG00010020728 FAM193A (ENSSAUG00010020692) arfip1 (ENSSAUG00010020674) FHDC1 (ENSSAUG00010020672) trim2a (ENSSAUG00010020412) mnd1 (ENSSAUG00010020408) TMEM131L (ENSSAUG00010020407) TLR2 (ENSSAUG00010020406) ENSSAUG00010020405 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00510000047351.a ENSGT00940000165274.b ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000166529 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Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00510000047351.a ENSGT00940000165274.b ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00390000004552 #16 ENSGT00530000063548.B #17 ENSGT00390000006641 #18 ENSGT00390000007071 ENSGT00940000156164.a #20 ENSGT00940000153232.a.b.a #21 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000157225 #23 ENSGT00940000157158 #24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Pike perch MODERN SPECIES 45 ENSSLUG00000004155 ENSSLUG00000004150 ENSSLUG00000004143 ENSSLUG00000004137 ENSSLUG00000004131 pcm1 (ENSSLUG00000004054) #18 SART1 (ENSSLUG00000004029) osbp (ENSSLUG00000003307) #20 casp3a (ENSSLUG00000003135) #21 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#24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00510000047351.a ENSGT00940000165274.b ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00390000004552 #16 ENSGT00530000063548.B #17 ENSGT00390000006641 #18 ENSGT00390000007071 ENSGT00940000156164.a #20 ENSGT00940000153232.a.b.a #21 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000157225 #23 ENSGT00390000008664 ENSGT00940000156947.i ENSGT00390000002365 ENSGT00530000063205.A ENSGT00940000161162 ENSGT00940000153167.A.b ENSGT00940000161391.b ENSGT00390000001316 ENSGT01070000253744.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000183060.a.a.d.a ENSGT00940000163679 ENSGT00950000183157.a.a.b.d ENSGT00940000163566.a.a ENSGT00940000157752 Turbot MODERN SPECIES 20 ENSSMAG00000001773 ENSSMAG00000023969 ENSSMAG00000001763 pdlim3a (ENSSMAG00000001737) ENSSMAG00000001442 ENSSMAG00000001352 cyp4v2a (ENSSMAG00000001303) mtnr1aa (ENSSMAG00000001284) fat1a (ENSSMAG00000001227) frg1 (ENSSMAG00000001213) #16 asah1b (ENSSMAG00000001181) #17 pcm1 (ENSSMAG00000001065) #18 ENSSMAG00000001043 ENSSMAG00000000918 #20 ENSSMAG00000024066 #21 ENSSMAG00000000827 #22 ENSSMAG00000000769 #23 ENSSMAG00000000742 ENSSMAG00000000727 THUMPD1 (ENSSMAG00000000723) ENSSMAG00000000718 REXO5 (ENSSMAG00000000709) ENSSMAG00000000685 ENSSMAG00000029954 ENSSMAG00000029300 ENSSMAG00000000655 ENSSMAG00000000652 ENSSMAG00000000639 ENSSMAG00000000631 ENSSMAG00000000584 ENSSMAG00000021545 Tongue sole MODERN SPECIES 19 lgals2b (ENSCSEG00000001454) ENSCSEG00000001457 GTPBP1 (ENSCSEG00000001459) ELFN2 (ENSCSEG00000001622) mfng (ENSCSEG00000001626) ENSCSEG00000001631 ENSCSEG00000001639 TRMT1 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ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000157225 #23 ENSGT00940000157158 #24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Barramundi perch MODERN SPECIES 130 frg1 (ENSLCAG00010017684) #16 asah1b (ENSLCAG00010017689) #17 SART1 (ENSLCAG00010017711) osbp (ENSLCAG00010017717) #20 casp3a (ENSLCAG00010017729) #21 STOX2 (ENSLCAG00010017740) #22 tll1 (ENSLCAG00010017777) #23 cpe (ENSLCAG00010017933) #24 msmo1 (ENSLCAG00010017935) KLHL2 (ENSLCAG00010017950) med28 (ENSLCAG00010018076) lap3 (ENSLCAG00010018095) clrn2 (ENSLCAG00010018138) tapt1b (ENSLCAG00010018143) prom1b (ENSLCAG00010018151) fgfbp2b (ENSLCAG00010018170) ENSLCAG00010018174 anxa5b (ENSLCAG00010018188) uchl1 (ENSLCAG00010018318) limch1a (ENSLCAG00010018324) tmem192 (ENSLCAG00010018335) Seriola ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000165274.b ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT01060000249984 ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00390000004552 #16 ENSGT00530000063548.B #17 ENSGT00390000006641 #18 ENSGT00390000007071 ENSGT00940000156164.a #20 ENSGT00940000153232.a.b.a #21 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000157225 #23 ENSGT00940000157158 #24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2966 lrata (ENSSLDG00000023840) ENSSLDG00000023845 NPY2R (ENSSLDG00000023852) pdlim3a (ENSSLDG00000023856) SORBS2 (ENSSLDG00000023875) ENSSLDG00000023966 cyp4v2a (ENSSLDG00000023976) mtnr1aa (ENSSLDG00000023995) fat1a (ENSSLDG00000024027) frg1 (ENSSLDG00000024191) #16 asah1b (ENSSLDG00000024198) #17 pcm1 (ENSSLDG00000024219) #18 SART1 (ENSSLDG00000024307) osbp (ENSSLDG00000024312) #20 casp3a (ENSSLDG00000024336) #21 STOX2 (ENSSLDG00000024348) #22 Greater amberjack DUPLICATION Greater amberjack MODERN SPECIES 13 ENSSDUG00000018346 NPY2R (ENSSDUG00000018353) pdlim3a (ENSSDUG00000018366) SORBS2 (ENSSDUG00000018399) ENSSDUG00000018517 ENSSDUG00000018554 cyp4v2a (ENSSDUG00000018773) mtnr1aa (ENSSDUG00000018799) fat1a (ENSSDUG00000018821) frg1 (ENSSDUG00000018886) #16 asah1b (ENSSDUG00000018904) #17 pcm1 (ENSSDUG00000018960) #18 SART1 (ENSSDUG00000019131) osbp (ENSSDUG00000019142) #20 casp3a (ENSSDUG00000019169) #21 STOX2 (ENSSDUG00000019182) #22 tll1 (ENSSDUG00000019232) #23 cpe (ENSSDUG00000019257) #24 msmo1 (ENSSDUG00000019270) KLHL2 (ENSSDUG00000019292) med28 (ENSSDUG00000019345) lap3 (ENSSDUG00000019362) clrn2 (ENSSDUG00000019399) tapt1b (ENSSDUG00000019416) prom1b 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ENSGT00390000013749 Zig-zag eel MODERN SPECIES ENSMAMG00000027399 ENSMAMG00000009642 ENSMAMG00000009665 pdlim3a (ENSMAMG00000009673) ENSMAMG00000009713 ENSMAMG00000009838 cyp4v2a (ENSMAMG00000009859) mtnr1aa (ENSMAMG00000009883) fat1a (ENSMAMG00000012299) frg1 (ENSMAMG00000012406) #16 asah1b (ENSMAMG00000012415) #17 pcm1 (ENSMAMG00000012436) #18 ENSMAMG00000012486 #19 ENSMAMG00000012504 #20 ENSMAMG00000012567 #21 ENSMAMG00000012601 #22 ENSMAMG00000012578 tll1 (ENSMAMG00000012656) #23 cpe (ENSMAMG00000012731) #24 msmo1 (ENSMAMG00000012760) KLHL2 (ENSMAMG00000012771) MED28 (ENSMAMG00000012833) ENSMAMG00000012875 CLRN2 (ENSMAMG00000012910) tapt1b (ENSMAMG00000012923) prom1b (ENSMAMG00000012934) fgfbp2b (ENSMAMG00000027078) FGFBP1 (ENSMAMG00000027135) anxa5b (ENSMAMG00000012987) uchl1 (ENSMAMG00000013032) ENSMAMG00000013059 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00510000047351.a ENSGT00940000165274.b ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000166529 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ENSOMYG00000010062 ENSOMYG00000060900 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT00610000086191 ENSGT00940000177365 ENSGT00940000159937.g ENSGT00940000153558.f ENSGT00950000182920.b.a.a.l ENSGT00390000009819.a.a.cc.b ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT00940000155429.a.b.f ENSGT00390000011412.l ENSGT00730000111645.b.a ENSGT00940000157294.c ENSGT00390000015958.c ENSGT00940000162224 ENSGT00940000155800.a.b.d.b ENSGT00940000155800.a.b.d.a ENSGT00520000055589.d.a.b.f #22 ENSGT00940000153232.a.b.a.e #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00940000154508.a.a.s.a.d ENSGT00940000160388.b ENSGT00940000165411.b ENSGT00520000055589.d.a.b.e #22 ENSGT00940000153232.a.b.a.f #21 ENSGT00940000154508.a.a.s.a.c ENSGT00940000160388.a ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.i.a.b.b ENSGT00730000111184 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000156660.d ENSGT00940000156351.l.b ENSGT01030000234543.A.a.g.a ENSGT00940000161705.d 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ENSSSAG00000005859 gucy1b1 (ENSSSAG00000005775) MYOZ2 (ENSSSAG00000005695) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00610000086191 ENSGT00940000159937.g ENSGT00940000153558.f ENSGT00950000182920.b.a.a.l.a.a ENSGT00950000182920.b.a.a.l.a.b ENSGT00390000009819.a.a.cc.b ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT00940000155429.a.b.f.a ENSGT00390000011412.l ENSGT00730000111645.b.a ENSGT00940000157294.c ENSGT00390000015958.c ENSGT00940000162224 ENSGT00940000155800.a.b.d.b ENSGT00520000055589.d.a.b.f #22 ENSGT00940000154508.a.a.s.a.d.a.a ENSGT00940000153232.a.b.a.e #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00940000154508.a.a.s.a.d.b ENSGT00940000160388.b ENSGT00940000165411.b ENSGT00940000154622.a.a.r ENSGT00390000010356 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.i.a.b.b ENSGT00730000111184 ENSGT00940000158285.e ENSGT00940000157483.e ENSGT00800000124172.j.b Rainbow trout MODERN SPECIES 1 ENSOMYG00000030426 ENSOMYG00000056690 ENSOMYG00000030595 ENSOMYG00000030607 ENSOMYG00000030626 ENSOMYG00000066350 ENSOMYG00000030756 ENSOMYG00000030713 ENSOMYG00000030915 ENSOMYG00000054828 ENSOMYG00000031930 LGI2 (ENSOMYG00000031986) CCDC149 (ENSOMYG00000032030) SOD3 (ENSOMYG00000032164) DHX15 (ENSOMYG00000032089) ENSOMYG00000032187 #22 ENSOMYG00000032208 #21 acsl1a (ENSOMYG00000033197) helt (ENSOMYG00000041072) ENSOMYG00000041074 slc25a4 (ENSOMYG00000041078) cfap97 (ENSOMYG00000041084) ankrd37 (ENSOMYG00000041104) ufsp2 (ENSOMYG00000041122) ENSOMYG00000041137 ENSOMYG00000050587 map9 (ENSOMYG00000041140) gucy1a1 (ENSOMYG00000041145) gucy1b1 (ENSOMYG00000041152) ENSOMYG00000063280 fabp2 (ENSOMYG00000041163) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00610000086191 ENSGT00940000159937.g ENSGT00940000153558.f ENSGT00950000182920.b.a.a.l.a.a ENSGT00950000182920.b.a.a.l.a.b ENSGT00390000009819.a.a.cc.b ENSGT01100000265707 ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT00940000155429.a.b.f.a ENSGT00390000011412.l ENSGT00730000111645.b.a ENSGT00940000157294.c ENSGT00390000015958.c ENSGT00940000162224 ENSGT00940000155800.a.b.d.b ENSGT00520000055589.d.a.b.f #22 ENSGT00940000154508.a.a.s.a.d.a.a ENSGT00940000153232.a.b.a.e #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00940000154508.a.a.s.a.d.b ENSGT00940000160388.b ENSGT00940000165411.b ENSGT00940000154622.a.a.r ENSGT00390000010356 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.i.a.b.b ENSGT00730000111184 ENSGT00940000158285.e ENSGT00940000157483.e ENSGT00800000124172.j.b Coho salmon MODERN SPECIES 3 ENSOKIG00005023941 ENSOKIG00005023978 DNAJA1 (ENSOKIG00005024068) ENSOKIG00005024186 ENSOKIG00005024224 rps6 (ENSOKIG00005024250) ENSOKIG00005024297 ENSOKIG00005024312 ENSOKIG00005024333 mttp (ENSOKIG00005024462) C4orf54 (ENSOKIG00005026267) lgi2b (ENSOKIG00005026320) ccdc149b (ENSOKIG00005026389) SOD3 (ENSOKIG00005026417) DHX15 (ENSOKIG00005026440) STOX2 (ENSOKIG00005026616) #22 casp3a (ENSOKIG00005026644) #21 acsl1a (ENSOKIG00005026721) helt (ENSOKIG00005027479) ENSOKIG00005027502 slc25a4 (ENSOKIG00005027537) cfap97 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USP53 (ENSOTSG00005018458) myoz2b (ENSOTSG00005018465) Huchen MODERN SPECIES 2923 dhx15 (ENSHHUG00000040874) STOX2 (ENSHHUG00000040873) #22 Northern pike MODERN SPECIES 24 dnaja1 (ENSELUG00000031126) ENSELUG00000018262 ENSELUG00000018462 ENSELUG00000018491 rps6 (ENSELUG00000018736) ENSELUG00000018767 mttp (ENSELUG00000018848) ENSELUG00000018872 C4orf54 (ENSELUG00000018882) lgi2b (ENSELUG00000018919) ccdc149b (ENSELUG00000018976) SOD3 (ENSELUG00000018985) dhx15 (ENSELUG00000019138) ENSELUG00000012630 STOX2 (ENSELUG00000002398) #22 casp3a (ENSELUG00000029606) #21 primpol (ENSELUG00000004867) map9 (ENSELUG00000004842) ufsp2 (ENSELUG00000004813) ankrd37 (ENSELUG00000004805) cfap97 (ENSELUG00000004787) slc25a4 (ENSELUG00000004766) ENSELUG00000004756 helt (ENSELUG00000000136) acsl1a (ENSELUG00000000135) gucy1a1 (ENSELUG00000004621) gucy1b1 (ENSELUG00000004589) fabp2 (ENSELUG00000032130) USP53 (ENSELUG00000004528) myoz2 (ENSELUG00000029471) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 760 ENSGT00940000158194 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156167.b ENSGT00390000009223 ENSGT00990000207961 ENSGT00940000159958.c ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00940000157306 ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00390000010628.a ENSGT00390000005639.a.a.n ENSGT00390000000470.m ENSGT00390000015958.c ENSGT00940000158194 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000158602 ENSGT00390000006915.d.j.a ENSGT00940000158368 ENSGT00940000154593.a.b ENSGT00390000009873 ENSGT00940000158356 ENSGT00940000160772 ENSGT00390000009191 ENSGT00940000154466.cc ENSGT00940000158105 ENSGT00940000155038 ENSGT00390000000973.a.b ENSGT00510000046908.a.b ENSGT00510000046787.e.a ENSGT00990000208074 Atlantic herring MODERN SPECIES 14 asb5b (ENSCHAG00000006570) ACER2 (ENSCHAG00000006517) ENSCHAG00000006496 ENSCHAG00000006480 limch1a (ENSCHAG00000005837) uchl1 (ENSCHAG00000005743) anxa5b (ENSCHAG00000002839) ENSCHAG00000002566 fgfbp2b 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pdcd4a (ENSIPUG00000002299) ENSIPUG00000002324 ccdc149b (ENSIPUG00000002331) lgi2b (ENSIPUG00000002354) cdk2ap2 (ENSIPUG00000002396) aip (ENSIPUG00000002402) SOD3 (ENSIPUG00000002419) ing2 (ENSIPUG00000002434) stox2 (ENSIPUG00000002443) #22 tmem134 (ENSIPUG00000002462) irf2a (ENSIPUG00000002472) Dctd (ENSIPUG00000002486) ENSIPUG00000002498 TENM3 (ENSIPUG00000002505) ENSIPUG00000002575 VEGFC (ENSIPUG00000002582) SPCS3 (ENSIPUG00000002609) tapbp (ENSIPUG00000002618) asb5 (ENSIPUG00000002631) wdr17 (ENSIPUG00000002658) ENSIPUG00000002687 ENSIPUG00000002694 ENSIPUG00000002705 ENSIPUG00000002708 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00390000011766 ENSGT00940000159063.f ENSGT00940000153676.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.a ENSGT00940000156167.b ENSGT00390000009223 ENSGT00940000165059.A ENSGT00940000158602 ENSGT00390000006915.d.j.a ENSGT00940000158368 ENSGT00940000154593.a.b ENSGT00390000009873 ENSGT00940000158356 ENSGT00940000160772 ENSGT00390000009191 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 334 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00390000011766 ENSGT00940000159063.f ENSGT00940000153676.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.a ENSGT00940000156167.b ENSGT00390000009223 ENSGT00940000165059.A ENSGT00940000158602 Mexicana tetra MODERN SPECIES 112 tenm3 (ENSAMXG00000042335) ENSAMXG00000021222 dctd (ENSAMXG00000035628) irf2a (ENSAMXG00000043646) tmem134 (ENSAMXG00000036971) STOX2 (ENSAMXG00000000664) #22 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 148 ccdc149b (ENSPNAG00000013818) ENSPNAG00000005080 cntf (ENSPNAG00000013789) ENSPNAG00000013782 ENSPNAG00000002937 CASP6 (ENSPNAG00000002925) pla2g12a (ENSPNAG00000002908) ENSPNAG00000002898 dnajb14 (ENSPNAG00000002897) STOX2 (ENSPNAG00000013674) #22 tmem134 (ENSPNAG00000013649) irf2a (ENSPNAG00000013591) dctd (ENSPNAG00000013575) ENSPNAG00000002794 ENSPNAG00000002786 TENM3 (ENSPNAG00000013487) vegfc (ENSPNAG00000013302) spcs3 (ENSPNAG00000013292) asb5b (ENSPNAG00000013273) wdr17 (ENSPNAG00000013253) Electric eel MODERN SPECIES 229 pcdh19 (ENSEEEG00000021731) tnmd (ENSEEEG00000021726) elf1 (ENSEEEG00000021724) taf7 (ENSEEEG00000021664) ENSEEEG00000021624 STOX2 (ENSEEEG00000021619) #22 tmem134 (ENSEEEG00000021617) irf2a (ENSEEEG00000021615) snapc3 (ENSEEEG00000021613) PSIP1 (ENSEEEG00000021611) bnc2 (ENSEEEG00000021609) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000011517.a.a.c.a.b.a.d ENSGT00940000154259.b.b ENSGT00940000162502.a ENSGT00940000157807.g.b ENSGT01100000263483.F.a.eb ENSGT01100000263483.E.b.a.c.a.a ENSGT01100000263483.E.b.a.c.b.a.b ENSGT01100000263483.E.b.a.c.b.a.a ENSGT00940000156393.a.b.c ENSGT00520000058756 ENSGT00540000073610.A ENSGT00980000198603.B ENSGT00940000160334 ENSGT00390000001289.a ENSGT00940000158194 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00390000011766 ENSGT00940000159063.f ENSGT00940000153676.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00940000156167.b ENSGT00390000009223 ENSGT00940000165059.A ENSGT00940000158602 ENSGT00390000006915.d.i ENSGT01080000257376.a.b.a.a ENSGT00940000158368 ENSGT00940000154593.a.b ENSGT00390000009873 ENSGT00940000158356 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 164 ENSGT01100000263483.E.b.a.c.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000156393.a.b.c.a ENSGT00520000058756 ENSGT00940000156393.a.b.d ENSGT00540000073610.A.b ENSGT00980000198603.B ENSGT00390000015958.c.b ENSGT00940000157294.c.a ENSGT00940000160334.o ENSGT00390000001289.a.e ENSGT00940000162224.h ENSGT00940000158194.i.a ENSGT00520000055589.d.a.b.a #22 ENSGT00390000011766.g ENSGT00940000159063.f.a.b ENSGT00940000153676.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.a.m ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00940000156167.b.a ENSGT00390000009223.rb ENSGT00940000165059.A.a ENSGT00940000158602.i ENSGT00390000006915.d.i.a ENSGT01080000257376.a.b.a.a ENSGT00940000158368.c ENSGT00940000154593.a.b.j ENSGT00390000009873.l ENSGT00940000158356.l Goldfish MODERN SPECIES 277 ENSCARG00000044810 TESK1 (ENSCARG00000044823) ENSCARG00000044849 ENSCARG00000044862 ENSCARG00000044869 ENSCARG00000044891 ENSCARG00000044914 cntf (ENSCARG00000044968) ccdc149b (ENSCARG00000045020) lgi2b (ENSCARG00000045315) cdk2ap2 (ENSCARG00000045363) aip (ENSCARG00000045389) SOD3 (ENSCARG00000045423) ing2 (ENSCARG00000045436) ENSCARG00000045456 #22 irf2a (ENSCARG00000045479) tmem134 (ENSCARG00000045521) dctd (ENSCARG00000045635) ENSCARG00000046010 vegfc (ENSCARG00000048535) ENSCARG00000048565 spcs3 (ENSCARG00000048575) ENSCARG00000048603 asb5b (ENSCARG00000018865) wdr17 (ENSCARG00000018888) gpm6ab (ENSCARG00000018978) glra3 (ENSCARG00000019237) ENSCARG00000019464 hpgd (ENSCARG00000019468) cep44 (ENSCARG00000019483) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 157 ENSGT01100000263483.E.b.a.c.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000156393.a.b.c.a ENSGT00520000058756 ENSGT00940000156393.a.b.d ENSGT00540000073610.A.b ENSGT00980000198603.B ENSGT00390000015958.c.b ENSGT00940000157294.c.a ENSGT00940000160334.o ENSGT00390000001289.a.e ENSGT00940000162224.h ENSGT00940000158194.i.a ENSGT00520000055589.d.a.b.a #22 ENSGT00390000011766.g ENSGT00940000159063.f.a.b ENSGT00940000153676.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.a.m ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00940000156167.b.a ENSGT00390000009223.rb ENSGT00940000165059.A.a ENSGT00940000158602.i ENSGT00390000006915.d.i.a ENSGT01080000257376.a.b.a.a ENSGT00940000158368.c ENSGT00940000154593.a.b.j ENSGT00390000009873.l ENSGT00940000158356.l Common carp reference MODERN SPECIES 27 ENSCCRG00000004413 ENSCCRG00000053249 ENSCCRG00000023488 ENSCCRG00000025732 ENSCCRG00000054934 ENSCCRG00000057879 ENSCCRG00000077428 cntf (ENSCCRG00000025703) ENSCCRG00000067650 ccdc149b (ENSCCRG00000051986) lgi2b (ENSCCRG00000054335) aip (ENSCCRG00000051967) cdk2ap2 (ENSCCRG00000064036) ing2 (ENSCCRG00000005204) ENSCCRG00000081924 ENSCCRG00000051974 #22 tmem134 (ENSCCRG00000081609) irf2a (ENSCCRG00000076801) ENSCCRG00000045193 ENSCCRG00000041144 tenm3 (ENSCCRG00000059959) vegfc (ENSCCRG00000075544) spcs3 (ENSCCRG00000032030) asb5b 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(ENSSGRG00000032939) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 662 ENSGT01100000263483.E.b.a.c.a.a.a ENSGT01100000263483.E.b.a.c.b.a.a.b ENSGT00940000156393.a.b.c.b ENSGT00540000073610.A.a ENSGT00390000015958.c.a ENSGT00940000157294.c.b ENSGT00940000160334.p ENSGT00390000001289.a.f ENSGT00950000182996.b.a.a.b.d.a.f.a.a.a.a.b.b.a ENSGT00940000158194.i.b ENSGT00520000055589.d.a.b.b #22 ENSGT00390000011766.h ENSGT00940000159063.f.a.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.a.n Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00950000183201.b.a.b.d ENSGT00390000011517.a.a.c.a.b.a.c ENSGT00390000011517.a.a.c.a.b.a.d ENSGT00940000154259.b.b.a ENSGT00940000162502.a.a ENSGT00940000157807.g.b.l ENSGT01100000263483.E.b.a.c.b.a.b ENSGT01100000263483.E.b.a.c.b.a.a.b ENSGT00940000156393.a.b.c.b ENSGT00540000073610.A.a ENSGT00390000015958.c.a ENSGT00940000157294.c.b ENSGT00940000160334.p ENSGT00390000001289.a.f ENSGT00950000182996.b.a.a.b.d.a.f.a.a.a.a.b.b.a ENSGT00520000055589.d.a.b.b #22 ENSGT00390000011766.h 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