Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00940000167021 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000163251.b ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000165411.b ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000154593.a.b ENSGT00940000158368 ENSGT01080000257376.a.b.a.a ENSGT00390000006915.d ENSGT00940000158602 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158194 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ENSPREG00000000116 anxa5b (ENSPREG00000000117) uchl1 (ENSPREG00000000118) Platyfish MODERN SPECIES 19 fgg (ENSXMAG00000018949) ENSXMAG00000027870 NPY2R (ENSXMAG00000018941) pdlim3a (ENSXMAG00000018913) SORBS2 (ENSXMAG00000018882) ENSXMAG00000018871 cyp4v2a (ENSXMAG00000018848) mtnr1aa (ENSXMAG00000021449) fat1a (ENSXMAG00000018793) ENSXMAG00000024747 frg1 (ENSXMAG00000007751) #16 asah1b (ENSXMAG00000023084) #17 pcm1 (ENSXMAG00000007796) #18 osbp (ENSXMAG00000007816) #20 casp3a (ENSXMAG00000013953) #21 STOX2 (ENSXMAG00000013946) #22 tll1 (ENSXMAG00000007829) #23 cpe (ENSXMAG00000007857) #24 msmo1 (ENSXMAG00000007869) KLHL2 (ENSXMAG00000007874) med28 (ENSXMAG00000023776) lap3 (ENSXMAG00000007910) clrn2 (ENSXMAG00000020860) tapt1b (ENSXMAG00000007925) prom1b (ENSXMAG00000007940) ENSXMAG00000025458 ENSXMAG00000022552 anxa5b (ENSXMAG00000008002) uchl1 (ENSXMAG00000008035) limch1a (ENSXMAG00000008036) tmem192 (ENSXMAG00000029736) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00510000047351.a 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ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00510000047351.a ENSGT00940000165274.b ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00390000004552 #16 ENSGT00530000063548.B #17 ENSGT00390000006641 #18 ENSGT00390000007071 ENSGT00940000156164.a #20 ENSGT00940000153232.a.b.a #21 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000157225 #23 ENSGT00940000157158 #24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00510000047351.a ENSGT00940000165274.b ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00390000004552 #16 ENSGT00530000063548.B #17 ENSGT00390000006641 #18 ENSGT00390000007071 ENSGT00940000156164.a #20 ENSGT00940000153232.a.b.a #21 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000157225 #23 ENSGT00940000157158 #24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Fugu MODERN SPECIES 8 lrata (ENSTRUG00000006052) ENSTRUG00000006036 npy2r (ENSTRUG00000005990) pdlim3a (ENSTRUG00000005644) SORBS2 (ENSTRUG00000005445) ENSTRUG00000005082 cyp4v2a (ENSTRUG00000004594) mtnr1aa (ENSTRUG00000004479) fat1a 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ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000157225 #23 ENSGT00940000157158 #24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Gilthead seabream MODERN SPECIES ENSSAUG00010025561 NPY2R (ENSSAUG00010025559) pdlim3a (ENSSAUG00010025558) SORBS2 (ENSSAUG00010025549) ENSSAUG00010025539 cyp4v2a (ENSSAUG00010025520) mtnr1aa (ENSSAUG00010025513) fat1a (ENSSAUG00010024502) ENSSAUG00010024474 frg1 (ENSSAUG00010024448) #16 asah1b (ENSSAUG00010024421) #17 pcm1 (ENSSAUG00010024379) #18 sart1 (ENSSAUG00010024377) #19 osbp (ENSSAUG00010024375) #20 casp3a (ENSSAUG00010024374) #21 STOX2 (ENSSAUG00010024373) #22 tll1 (ENSSAUG00010020995) #23 cpe (ENSSAUG00010020944) #24 msmo1 (ENSSAUG00010020941) plrg1 (ENSSAUG00010020732) ENSSAUG00010020730 sfrp2 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ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Large yellow croaker MODERN SPECIES 481 fgg (ENSLCRG00005017696) lrata (ENSLCRG00005017697) ENSLCRG00005017699 NPY2R (ENSLCRG00005017700) pdlim3a (ENSLCRG00005017703) SORBS2 (ENSLCRG00005017711) tlr3 (ENSLCRG00005017721) cyp4v2a (ENSLCRG00005017729) mtnr1aa (ENSLCRG00005017735) fat1a (ENSLCRG00005017762) asah1b (ENSLCRG00005017934) #17 pcm1 (ENSLCRG00005018124) #18 sart1 (ENSLCRG00005018125) #19 osbp (ENSLCRG00005018126) #20 casp3a (ENSLCRG00005018141) #21 STOX2 (ENSLCRG00005018142) #22 tll1 (ENSLCRG00005018147) #23 cpe (ENSLCRG00005018297) #24 msmo1 (ENSLCRG00005018343) KLHL2 (ENSLCRG00005018351) med28 (ENSLCRG00005018669) ENSLCRG00005018674 ENSLCRG00005018858 ENSLCRG00005018860 ENSLCRG00005018862 ENSLCRG00005018863 ENSLCRG00005018864 ENSLCRG00005018865 ENSLCRG00005018867 ENSLCRG00005018868 SLC25A38 (ENSLCRG00005018870) European seabass MODERN SPECIES 20 ENSDLAG00005024744 ENSDLAG00005028405 pdlim3a (ENSDLAG00005024741) ENSDLAG00005024688 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ENSGT00390000007071 ENSGT00940000156164.a #20 ENSGT00940000153232.a.b.a #21 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000157225 #23 ENSGT00940000157158 #24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B ENSGT00850000132319.a.a.b ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00510000047351.a ENSGT00940000165274.b ENSGT00940000155973.b.d ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157278.s ENSGT00940000160321.c.a ENSGT00940000157733.a.b ENSGT00390000004552 #16 ENSGT00530000063548.B #17 ENSGT00390000006641 #18 ENSGT00390000007071 ENSGT00940000156164.a #20 ENSGT00940000153232.a.b.a #21 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000157225 #23 ENSGT00940000157158 #24 ENSGT00940000158012 ENSGT00940000156434 ENSGT00390000006192 ENSGT00530000063255.B 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ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c ENSGT00940000157306 ENSGT00950000183159.a.v.a ENSGT00390000013749 Climbing perch MODERN SPECIES ENSATEG00000010034 ENSATEG00000010048 pdlim3a (ENSATEG00000010060) ENSATEG00000010105 ENSATEG00000010153 cyp4v2a (ENSATEG00000010169) mtnr1aa (ENSATEG00000010218) fat1a (ENSATEG00000010280) ENSATEG00000029112 frg1 (ENSATEG00000010414) #16 asah1b (ENSATEG00000010450) #17 pcm1 (ENSATEG00000010492) #18 ENSATEG00000010608 #19 ENSATEG00000010615 #20 ENSATEG00000010624 #21 ENSATEG00000010636 #22 tll1 (ENSATEG00000010655) #23 cpe (ENSATEG00000010745) #24 msmo1 (ENSATEG00000010790) KLHL2 (ENSATEG00000010806) MED28 (ENSATEG00000010872) ENSATEG00000010883 CLRN2 (ENSATEG00000010965) tapt1b (ENSATEG00000010981) prom1b (ENSATEG00000011009) fgfbp2b (ENSATEG00000011279) ENSATEG00000028462 anxa5b (ENSATEG00000011309) uchl1 (ENSATEG00000011596) ENSATEG00000011637 tmem192 (ENSATEG00000011697) Siamese fighting fish MODERN SPECIES mab21l2 (ENSBSLG00000006055) ENSBSLG00000006070 nr3c2 (ENSBSLG00000006223) arhgap10 (ENSBSLG00000006233) prmt9 (ENSBSLG00000006682) tmem184c (ENSBSLG00000006941) ednraa (ENSBSLG00000007112) pou4f2 (ENSBSLG00000007128) fat1a (ENSBSLG00000007171) frg1 (ENSBSLG00000007607) #16 asah1b (ENSBSLG00000007859) #17 pcm1 (ENSBSLG00000008147) #18 sart1 (ENSBSLG00000008388) #19 osbp (ENSBSLG00000008418) #20 casp3a (ENSBSLG00000008672) #21 STOX2 (ENSBSLG00000008701) #22 tll1 (ENSBSLG00000009259) #23 cpe (ENSBSLG00000014212) #24 msmo1 (ENSBSLG00000014426) KLHL2 (ENSBSLG00000014440) med28 (ENSBSLG00000014542) lap3 (ENSBSLG00000014556) clrn2 (ENSBSLG00000014617) tapt1b (ENSBSLG00000014625) prom1b (ENSBSLG00000015309) fgfbp2b (ENSBSLG00000016071) ENSBSLG00000016073 anxa5b (ENSBSLG00000016091) limch1a (ENSBSLG00000016334) tmem192 (ENSBSLG00000016583) ENSBSLG00000016617 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 518 ENSHCOG00000006896 NPY2R (ENSHCOG00000006933) pdlim3a (ENSHCOG00000006953) SORBS2 (ENSHCOG00000007030) ENSHCOG00000007054 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MODERN SPECIES 2467 STOX2 (ENSHHUG00000051140) #22 casp3a (ENSHHUG00000051136) #21 acsl1a (ENSHHUG00000050701) helt (ENSHHUG00000050689) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000177365 ENSGT00940000170262 ENSGT00940000159937.g ENSGT00940000153558.f ENSGT00950000182920.b.a.a.l ENSGT00390000009819.a.a.cc.b ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT00940000155429.a.b.f.a ENSGT00390000011412.l ENSGT00730000111645.b.a ENSGT00940000157294.c ENSGT00390000015958.c ENSGT00940000162224 ENSGT00940000155800.a.b.d.b ENSGT00940000155800.a.b.d.a ENSGT00520000055589.d.a.b.e #22 ENSGT00940000153232.a.b.a.f #21 ENSGT00940000154508.a.a.s.a.c ENSGT00940000160388.a ENSGT00940000154622.a.a.q ENSGT00940000158285.f ENSGT00940000157483.f ENSGT00800000124172.j.a ENSGT00940000156337.d.e.a ENSGT00950000183027.b.a.a ENSGT00950000183054.a.a.a.b.b ENSGT00400000023138.b ENSGT00510000046787.e.a.h ENSGT00390000012242.b.a.d ENSGT00510000046908.a.b.a ENSGT00390000000973.a.b.h.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000153558.e 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ENSGT00730000111184 ENSGT00940000158285.e ENSGT00940000157483.e ENSGT00800000124172.j.b ENSGT00940000156337.d.f River trout MODERN SPECIES 33 ENSSTUG00000023865 ENSSTUG00000023852 ENSSTUG00000023848 dnaja1 (ENSSTUG00000023788) ENSSTUG00000023560 rps6 (ENSSTUG00000023472) tspan5b (ENSSTUG00000023336) ENSSTUG00000023319 mttp (ENSSTUG00000021829) C4orf54 (ENSSTUG00000021705) lgi2b (ENSSTUG00000020742) CCDC149 (ENSSTUG00000020634) SOD3 (ENSSTUG00000020624) dhx15 (ENSSTUG00000019852) casp3a (ENSSTUG00000019813) #21 STOX2 (ENSSTUG00000019784) #22 acsl1a (ENSSTUG00000018889) helt (ENSSTUG00000018870) slc25a4 (ENSSTUG00000018852) cfap97 (ENSSTUG00000018844) ankrd37 (ENSSTUG00000018841) ufsp2 (ENSSTUG00000018625) nxpe3 (ENSSTUG00000018605) ENSSTUG00000018587 map9 (ENSSTUG00000018554) gucy1a1 (ENSSTUG00000018547) gucy1b1 (ENSSTUG00000018498) fabp2 (ENSSTUG00000018492) ENSSTUG00000018474 myoz2b (ENSSTUG00000018459) SYNPO2 (ENSSTUG00000018412) Atlantic salmon MODERN SPECIES 23 ENSSSAG00000045602 ENSSSAG00000005502 ENSSSAG00000096375 ENSSSAG00000010182 ENSSSAG00000045653 ENSSSAG00000045683 ENSSSAG00000063298 ENSSSAG00000113463 ENSSSAG00000045334 ENSSSAG00000043456 ENSSSAG00000111674 LGI2 (ENSSSAG00000043307) CCDC149 (ENSSSAG00000043249) sod3 (ENSSSAG00000103400) DHX15 (ENSSSAG00000041774) ENSSSAG00000041721 #22 ENSSSAG00000109184 CASP3 (ENSSSAG00000041689) #21 PRIMPOL (ENSSSAG00000041666) acsl1a (ENSSSAG00000006503) helt (ENSSSAG00000005991) ENSSSAG00000005978 slc25a4 (ENSSSAG00000005953) cfap97 (ENSSSAG00000005936) ankrd37 (ENSSSAG00000120002) ufsp2 (ENSSSAG00000005892) ENSSSAG00000005880 map9 (ENSSSAG00000005872) ENSSSAG00000005859 gucy1b1 (ENSSSAG00000005775) MYOZ2 (ENSSSAG00000005695) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00610000086191 ENSGT00940000159937.g ENSGT00940000153558.f ENSGT00950000182920.b.a.a.l.a.a ENSGT00950000182920.b.a.a.l.a.b ENSGT00390000009819.a.a.cc.b ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT00940000155429.a.b.f.a ENSGT00390000011412.l ENSGT00730000111645.b.a 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cfap97 (ENSOMYG00000041084) ankrd37 (ENSOMYG00000041104) ufsp2 (ENSOMYG00000041122) ENSOMYG00000041137 ENSOMYG00000050587 map9 (ENSOMYG00000041140) gucy1a1 (ENSOMYG00000041145) gucy1b1 (ENSOMYG00000041152) ENSOMYG00000063280 fabp2 (ENSOMYG00000041163) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00610000086191 ENSGT00940000159937.g ENSGT00940000153558.f ENSGT00950000182920.b.a.a.l.a.a ENSGT00950000182920.b.a.a.l.a.b ENSGT00390000009819.a.a.cc.b ENSGT01100000265707 ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT00940000155429.a.b.f.a ENSGT00390000011412.l ENSGT00730000111645.b.a ENSGT00940000157294.c ENSGT00390000015958.c ENSGT00940000162224 ENSGT00940000155800.a.b.d.b ENSGT00520000055589.d.a.b.f #22 ENSGT00940000154508.a.a.s.a.d.a.a ENSGT00940000153232.a.b.a.e #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00940000154508.a.a.s.a.d.b ENSGT00940000160388.b ENSGT00940000165411.b ENSGT00940000154622.a.a.r ENSGT00390000010356 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.i.a.b.b ENSGT00730000111184 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ENSGT00390000000470.m ENSGT00390000015958.c ENSGT00940000158194 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000158602 ENSGT00390000006915.d.j.a ENSGT00940000158368 ENSGT00940000154593.a.b ENSGT00390000009873 ENSGT00940000158356 ENSGT00940000160772 ENSGT00390000009191 ENSGT00940000154466.cc ENSGT00940000158105 ENSGT00940000155038 ENSGT00390000000973.a.b ENSGT00510000046908.a.b ENSGT00510000046787.e.a ENSGT00990000208074 Denticle herring MODERN SPECIES 14 ENSDCDG00000015743 fgfbp2b (ENSDCDG00000015738) prom1b (ENSDCDG00000015558) ENSDCDG00000015483 limch1a (ENSDCDG00000015502) uchl1 (ENSDCDG00000015454) anxa5b (ENSDCDG00000011068) ENSDCDG00000010819 fgfbp2b (ENSDCDG00000010816) prom1b (ENSDCDG00000009012) tapt1b (ENSDCDG00000006115) ldb2b (ENSDCDG00000005617) qdprb.4 (ENSDCDG00000005606) ccdc149b (ENSDCDG00000005589) ING2 (ENSDCDG00000005583) STOX2 (ENSDCDG00000005579) #22 wdr17 (ENSDCDG00000005508) GPM6A (ENSDCDG00000005496) glra3 (ENSDCDG00000005262) hpgd (ENSDCDG00000005237) cep44 (ENSDCDG00000005235) fbxo8 (ENSDCDG00000005234) hand2 (ENSDCDG00000005232) hmgb2a (ENSDCDG00000005230) galnt7 (ENSDCDG00000004931) galntl6 (ENSDCDG00000004905) FAM193A (ENSDCDG00000004875) ENSDCDG00000004850 sparcl1 (ENSDCDG00000004794) scpp9 (ENSDCDG00000004780) cnga1a (ENSDCDG00000034690) Channel catfish MODERN SPECIES 22 ZFP91 (ENSIPUG00000002257) ENSIPUG00000002260 cntf (ENSIPUG00000002265) ENSIPUG00000002271 ENSIPUG00000002279 ENSIPUG00000002287 ENSIPUG00000002292 pdcd4a (ENSIPUG00000002299) ENSIPUG00000002324 ccdc149b (ENSIPUG00000002331) lgi2b (ENSIPUG00000002354) cdk2ap2 (ENSIPUG00000002396) aip (ENSIPUG00000002402) SOD3 (ENSIPUG00000002419) ing2 (ENSIPUG00000002434) stox2 (ENSIPUG00000002443) #22 tmem134 (ENSIPUG00000002462) irf2a (ENSIPUG00000002472) Dctd (ENSIPUG00000002486) ENSIPUG00000002498 TENM3 (ENSIPUG00000002505) ENSIPUG00000002575 VEGFC (ENSIPUG00000002582) SPCS3 (ENSIPUG00000002609) tapbp (ENSIPUG00000002618) asb5 (ENSIPUG00000002631) wdr17 (ENSIPUG00000002658) ENSIPUG00000002687 ENSIPUG00000002694 ENSIPUG00000002705 ENSIPUG00000002708 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 334 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00390000011766 ENSGT00940000159063.f ENSGT00940000153676.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.a ENSGT00940000156167.b ENSGT00390000009223 ENSGT00940000165059.A ENSGT00940000158602 Mexicana tetra MODERN SPECIES 112 tenm3 (ENSAMXG00000042335) ENSAMXG00000021222 dctd (ENSAMXG00000035628) irf2a (ENSAMXG00000043646) tmem134 (ENSAMXG00000036971) STOX2 (ENSAMXG00000000664) #22 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 148 ccdc149b (ENSPNAG00000013818) ENSPNAG00000005080 cntf (ENSPNAG00000013789) ENSPNAG00000013782 ENSPNAG00000002937 CASP6 (ENSPNAG00000002925) pla2g12a (ENSPNAG00000002908) ENSPNAG00000002898 dnajb14 (ENSPNAG00000002897) STOX2 (ENSPNAG00000013674) #22 tmem134 (ENSPNAG00000013649) irf2a (ENSPNAG00000013591) dctd (ENSPNAG00000013575) ENSPNAG00000002794 ENSPNAG00000002786 TENM3 (ENSPNAG00000013487) vegfc (ENSPNAG00000013302) spcs3 (ENSPNAG00000013292) asb5b (ENSPNAG00000013273) wdr17 (ENSPNAG00000013253) Electric eel MODERN SPECIES 229 pcdh19 (ENSEEEG00000021731) tnmd (ENSEEEG00000021726) elf1 (ENSEEEG00000021724) taf7 (ENSEEEG00000021664) ENSEEEG00000021624 STOX2 (ENSEEEG00000021619) #22 tmem134 (ENSEEEG00000021617) irf2a (ENSEEEG00000021615) snapc3 (ENSEEEG00000021613) PSIP1 (ENSEEEG00000021611) bnc2 (ENSEEEG00000021609) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000011517.a.a.c.a.b.a.d ENSGT00940000154259.b.b ENSGT00940000162502.a ENSGT00940000157807.g.b ENSGT01100000263483.F.a.eb ENSGT01100000263483.E.b.a.c.a.a ENSGT01100000263483.E.b.a.c.b.a.b ENSGT01100000263483.E.b.a.c.b.a.a ENSGT00940000156393.a.b.c ENSGT00520000058756 ENSGT00540000073610.A ENSGT00980000198603.B ENSGT00940000160334 ENSGT00390000001289.a ENSGT00940000158194 ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00390000011766 ENSGT00940000159063.f ENSGT00940000153676.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00940000156167.b ENSGT00390000009223 ENSGT00940000165059.A ENSGT00940000158602 ENSGT00390000006915.d.i ENSGT01080000257376.a.b.a.a ENSGT00940000158368 ENSGT00940000154593.a.b ENSGT00390000009873 ENSGT00940000158356 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 164 ENSGT01100000263483.E.b.a.c.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000156393.a.b.c.a ENSGT00520000058756 ENSGT00940000156393.a.b.d ENSGT00540000073610.A.b ENSGT00980000198603.B ENSGT00390000015958.c.b ENSGT00940000157294.c.a ENSGT00940000160334.o ENSGT00390000001289.a.e ENSGT00940000162224.h ENSGT00940000158194.i.a ENSGT00520000055589.d.a.b.a #22 ENSGT00390000011766.g ENSGT00940000159063.f.a.b ENSGT00940000153676.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.a.m ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00940000156167.b.a ENSGT00390000009223.rb ENSGT00940000165059.A.a ENSGT00940000158602.i ENSGT00390000006915.d.i.a ENSGT01080000257376.a.b.a.a ENSGT00940000158368.c ENSGT00940000154593.a.b.j ENSGT00390000009873.l ENSGT00940000158356.l Goldfish MODERN SPECIES 277 ENSCARG00000044810 TESK1 (ENSCARG00000044823) ENSCARG00000044849 ENSCARG00000044862 ENSCARG00000044869 ENSCARG00000044891 ENSCARG00000044914 cntf (ENSCARG00000044968) ccdc149b (ENSCARG00000045020) lgi2b (ENSCARG00000045315) cdk2ap2 (ENSCARG00000045363) aip (ENSCARG00000045389) SOD3 (ENSCARG00000045423) ing2 (ENSCARG00000045436) ENSCARG00000045456 #22 irf2a (ENSCARG00000045479) tmem134 (ENSCARG00000045521) dctd (ENSCARG00000045635) ENSCARG00000046010 vegfc (ENSCARG00000048535) ENSCARG00000048565 spcs3 (ENSCARG00000048575) ENSCARG00000048603 asb5b (ENSCARG00000018865) wdr17 (ENSCARG00000018888) gpm6ab (ENSCARG00000018978) glra3 (ENSCARG00000019237) ENSCARG00000019464 hpgd (ENSCARG00000019468) cep44 (ENSCARG00000019483) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 157 ENSGT01100000263483.E.b.a.c.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000156393.a.b.c.a ENSGT00520000058756 ENSGT00940000156393.a.b.d ENSGT00540000073610.A.b ENSGT00980000198603.B ENSGT00390000015958.c.b ENSGT00940000157294.c.a ENSGT00940000160334.o ENSGT00390000001289.a.e ENSGT00940000162224.h ENSGT00940000158194.i.a ENSGT00520000055589.d.a.b.a #22 ENSGT00390000011766.g ENSGT00940000159063.f.a.b ENSGT00940000153676.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.a.m ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00940000156167.b.a ENSGT00390000009223.rb ENSGT00940000165059.A.a ENSGT00940000158602.i ENSGT00390000006915.d.i.a ENSGT01080000257376.a.b.a.a ENSGT00940000158368.c ENSGT00940000154593.a.b.j ENSGT00390000009873.l ENSGT00940000158356.l Common carp reference MODERN SPECIES 27 ENSCCRG00000004413 ENSCCRG00000053249 ENSCCRG00000023488 ENSCCRG00000025732 ENSCCRG00000054934 ENSCCRG00000057879 ENSCCRG00000077428 cntf (ENSCCRG00000025703) ENSCCRG00000067650 ccdc149b (ENSCCRG00000051986) lgi2b (ENSCCRG00000054335) aip (ENSCCRG00000051967) cdk2ap2 (ENSCCRG00000064036) ing2 (ENSCCRG00000005204) ENSCCRG00000081924 ENSCCRG00000051974 #22 tmem134 (ENSCCRG00000081609) irf2a (ENSCCRG00000076801) ENSCCRG00000045193 ENSCCRG00000041144 tenm3 (ENSCCRG00000059959) vegfc (ENSCCRG00000075544) spcs3 (ENSCCRG00000032030) asb5b (ENSCCRG00000058956) wdr17 (ENSCCRG00000031139) gpm6ab (ENSCCRG00000024308) ENSCCRG00000058509 glra3 (ENSCCRG00000049689) hpgd (ENSCCRG00000061983) fbxo8 (ENSCCRG00000065697) cep44 (ENSCCRG00000002666) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 662 ENSGT01100000263483.E.b.a.c.a.a.a ENSGT01100000263483.E.b.a.c.b.a.a.b ENSGT00940000156393.a.b.c.b ENSGT00540000073610.A.a ENSGT00390000015958.c.a ENSGT00940000157294.c.b ENSGT00940000160334.p ENSGT00390000001289.a.f ENSGT00950000182996.b.a.a.b.d.a.f.a.a.a.a.b.b.a ENSGT00940000158194.i.b ENSGT00520000055589.d.a.b.b #22 ENSGT00390000011766.h ENSGT00940000159063.f.a.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.a.n Golden-line barbel MODERN SPECIES 691 zgc:56493 (ENSSGRG00000051333) faah2a (ENSSGRG00000051336) ENSSGRG00000051337 ENSSGRG00000051339 ENSSGRG00000051340 ENSSGRG00000051341 ENSSGRG00000051342 ENSSGRG00000051343 cntf (ENSSGRG00000051344) ccdc149b (ENSSGRG00000051346) lgi2b (ENSSGRG00000051347) ENSSGRG00000051348 cdk2ap2 (ENSSGRG00000051349) aip (ENSSGRG00000051350) STOX2 (ENSSGRG00000051351) #22 tmem134 (ENSSGRG00000051353) irf2a (ENSSGRG00000051354) irf2a (ENSSGRG00000051355) dctd (ENSSGRG00000051356) TENM3 (ENSSGRG00000051410) Zebrafish MODERN SPECIES ENSDARG00000074610 ENSDARG00000109438 ENSDARG00000095065 zgc:194443 (ENSDARG00000078182) zgc:152658 (ENSDARG00000018587) ENSDARG00000079631 ENSDARG00000076585 cntf (ENSDARG00000074662) ENSDARG00000093120 ccdc149b (ENSDARG00000020857) lgi2b (ENSDARG00000069701) cdk2ap2 (ENSDARG00000103145) aip (ENSDARG00000104437) SOD3 (ENSDARG00000079183) ing2 (ENSDARG00000104907) STOX2 (ENSDARG00000070162) #22 tmem134 (ENSDARG00000024828) irf2a (ENSDARG00000007387) dctd (ENSDARG00000036990) tenm3 (ENSDARG00000005479) ENSDARG00000104657 vegfc (ENSDARG00000069640) spcs3 (ENSDARG00000089976) asb5b (ENSDARG00000053222) wdr17 (ENSDARG00000075098) gpm6ab (ENSDARG00000004621) glra3 (ENSDARG00000011066) hpgd (ENSDARG00000012016) cep44 (ENSDARG00000053106) fbxo8 (ENSDARG00000007477) hand2 (ENSDARG00000008305) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000163251.b ENSGT00520000055589.d.a.b #22 ENSGT00940000159063.g.a ENSGT00940000153232.b ##21 ENSGT00940000153232.a.b.a #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b.b ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00940000156741 ENSGT00940000157056.a ENSGT00940000166529 ENSGT00940000157278.s Asian bonytongue MODERN SPECIES 7 SCRG1 (ENSSFOG00015029537) hand2 (ENSSFOG00015019807) fbxo8 (ENSSFOG00015025727) cep44 (ENSSFOG00015019847) hpgd (ENSSFOG00015019878) glra3 (ENSSFOG00015019945) GPM6A (ENSSFOG00015019961) wdr17 (ENSSFOG00015020006) asb5b (ENSSFOG00015027571) spcs3 (ENSSFOG00015020226) vegfc (ENSSFOG00015020236) TENM3 (ENSSFOG00015020254) WWC2 (ENSSFOG00015020303) trappc11 (ENSSFOG00015020365) ENSSFOG00015020518 STOX2 (ENSSFOG00015020536) #22 IRF2 (ENSSFOG00015032334) ENSSFOG00015020576 ##21 casp3a (ENSSFOG00015020608) #21 ENSSFOG00015028201 primpol (ENSSFOG00015020632) acsl1b (ENSSFOG00015020657) helt (ENSSFOG00015024516) slc25a4 (ENSSFOG00015005428) cfap97 (ENSSFOG00015030570) SNX25 (ENSSFOG00015020775) ankrd37 (ENSSFOG00015026212) ufsp2 (ENSSFOG00015020811) pdlim3a (ENSSFOG00015020818) SORBS2 (ENSSFOG00015025985) tlr3 (ENSSFOG00015020904) P. kingsleyae MODERN SPECIES 259 ing2 (ENSPKIG00000023141) trappc11 (ENSPKIG00000023190) ENSPKIG00000023279 ENSPKIG00000023325 STOX2 (ENSPKIG00000023367) #22 IRF2 (ENSPKIG00000023423) casp3a (ENSPKIG00000023466) #21 primpol (ENSPKIG00000023486) acsl1b (ENSPKIG00000023514) helt (ENSPKIG00000023547) slc25a4 (ENSPKIG00000023568) cfap97 (ENSPKIG00000023583) SNX25 (ENSPKIG00000023610) ufsp2 (ENSPKIG00000023651) ankrd37 (ENSPKIG00000023670) pdlim3a (ENSPKIG00000023684) ENSPKIG00000023802 tlr3 (ENSPKIG00000024029) cyp4v2a (ENSPKIG00000024082) mtnr1aa (ENSPKIG00000024139) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 384 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000006413 ENSGT00390000014635 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d.b ##22 ENSGT00940000163251.b.j ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000154508.a.a.s.b ENSGT00390000015511 ENSGT00940000153232.a.b.b ##21 ENSGT00940000159063.e ENSGT00940000158457 ENSGT00950000182856.a.a.b Otophysi ANCESTRAL SPECIES 304 ENSGT00940000165110.b ENSGT00390000008582 ENSGT00530000063652.a.b ENSGT00530000064262.pc.b ENSGT00940000165282.a ENSGT00940000159225 ENSGT00390000005922.b ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d.b ##22 ENSGT00940000163251.b.j ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000154508.a.a.s.b ENSGT00950000183027.a.a.b ENSGT00940000165461 ENSGT00940000177027 ENSGT00940000164577.b ENSGT00940000166254.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00940000159784 ENSGT00940000162460.s ENSGT01060000248588.a.c.b.e ENSGT00940000154108.a.d.f ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000153169.B ENSGT00940000165110.b ENSGT00390000008582 ENSGT00530000063652.a.b ENSGT00530000064262.pc.b ENSGT00940000165282.a ENSGT00940000159225 ENSGT00390000005922.b ENSGT00390000006550 ENSGT00940000163251.b.j ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000154508.a.a.s.b ENSGT00950000183027.a.a.b ENSGT00940000165461 ENSGT00940000177027 ENSGT00940000164577.b ENSGT00940000166254.a ENSGT00940000178677 ENSGT00950000183177.a.a.a.a.g ENSGT00940000164356.b ENSGT00940000164356.a ENSGT00390000014412.l ENSGT00940000158996 ENSGT00390000005989.a.b.b ENSGT00940000154998.a.b ENSGT00940000164716.A Channel catfish MODERN SPECIES 5 KDM1B (ENSIPUG00000011710) cfap69 (ENSIPUG00000011653) sfxn1 (ENSIPUG00000011608) SEPT8b (ENSIPUG00000011324) CCNG1 (ENSIPUG00000011238) nudcd2 (ENSIPUG00000011272) gabra6a (ENSIPUG00000011213) gabrb2a (ENSIPUG00000011129) ATP10B (ENSIPUG00000011091) ENSIPUG00000011079 trappc11 (ENSIPUG00000010843) hars (ENSIPUG00000010757) dnd1 (ENSIPUG00000010743) gfra3 (ENSIPUG00000010739) ENSIPUG00000010715 STOX2 (ENSIPUG00000010694) ##22 acsl1b (ENSIPUG00000010613) ENSIPUG00000010567 ENSIPUG00000010512 ENSIPUG00000010492 rgs14a (ENSIPUG00000010477) ENSIPUG00000010459 SLC34A1 (ENSIPUG00000010376) ENSIPUG00000010353 bnip1 (ENSIPUG00000010328) nkx2-5 (ENSIPUG00000010324) STC2 (ENSIPUG00000010313) cpeb4a (ENSIPUG00000010268) MSX2 (ENSIPUG00000010256) DRD1 (ENSIPUG00000010246) KIF3A (ENSIPUG00000010161) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000159784 ENSGT00940000162460.s ENSGT01060000248588.a.c.b.e ENSGT00940000154108.a.d.f ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000153169.B ENSGT00940000165110.b ENSGT00390000008582 ENSGT00530000063652.a.b ENSGT00530000064262.pc.b ENSGT00940000165282.a ENSGT00940000159225 ENSGT00390000005922.b ENSGT00390000006550 ENSGT00940000163251.b.j ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000154508.a.a.s.b ENSGT00940000177027 ENSGT00940000164577.b ENSGT00940000166254.a ENSGT00940000178677 ENSGT00950000183177.a.a.a.a.g ENSGT00940000164356.b ENSGT00940000164356.a ENSGT00390000014412.l ENSGT00940000158996 ENSGT00390000005989.a.b.b ENSGT00940000154998.a.b ENSGT00940000164716.A ENSGT00940000159824 ENSGT00940000155857.f.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000159784 ENSGT00940000162460.s ENSGT01060000248588.a.c.b.e ENSGT00940000154108.a.d.f ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000153169.B ENSGT00940000165110.b ENSGT00390000008582 ENSGT00530000063652.a.b ENSGT00530000064262.pc.b ENSGT00940000165282.a ENSGT00940000159225 ENSGT00390000005922.b ENSGT00390000006550 ENSGT00940000163251.b.j ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000154508.a.a.s.b ENSGT00940000177027 ENSGT00940000164577.b ENSGT00940000166254.a ENSGT00940000178677 ENSGT00950000183177.a.a.a.a.g ENSGT00940000164356.a.g ENSGT00390000014412.l ENSGT00940000158996 ENSGT00390000005989.a.b.b ENSGT00940000154998.a.b ENSGT00940000159824 ENSGT00940000155857.f.a ENSGT00940000156386 ENSGT00940000155875 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 95 trappc11 (ENSPNAG00000009830) ENSPNAG00000009865 STOX2 (ENSPNAG00000009894) ##22 acsl1b (ENSPNAG00000009971) RBM22 (ENSPNAG00000010001) ENSPNAG00000010016 ENSPNAG00000010045 ENSPNAG00000010054 arl3l2 (ENSPNAG00000010083) rgs14a (ENSPNAG00000010119) SLC34A1 (ENSPNAG00000010150) ENSPNAG00000010184 BNIP1 (ENSPNAG00000010213) nkx2.5 (ENSPNAG00000010223) stc2a (ENSPNAG00000010234) cpeb4a (ENSPNAG00000010337) MSX2 (ENSPNAG00000010350) DRD1 (ENSPNAG00000010364) Mexicana tetra MODERN SPECIES 23 zgc:92242 (ENSAMXG00000030327) CXXC5 (ENSAMXG00000039163) ENSAMXG00000031777 zgc:110843 (ENSAMXG00000029462) ube2d2 (ENSAMXG00000030550) ppp3cb (ENSAMXG00000034364) sting1 (ENSAMXG00000035008) ENSAMXG00000018794 brd8b (ENSAMXG00000018774) ENSAMXG00000036623 gfra3 (ENSAMXG00000018757) dnd1 (ENSAMXG00000018752) hars (ENSAMXG00000018719) trappc11 (ENSAMXG00000018665) ENSAMXG00000031413 STOX2 (ENSAMXG00000018621) ##22 acsl1b (ENSAMXG00000018560) RBM22 (ENSAMXG00000018529) ENSAMXG00000033466 ENSAMXG00000039734 ENSAMXG00000041314 ENSAMXG00000036134 arl3l2 (ENSAMXG00000018516) rgs14a (ENSAMXG00000034408) ENSAMXG00000044001 SLC34A1 (ENSAMXG00000018474) adra2db (ENSAMXG00000025107) BNIP1 (ENSAMXG00000038546) nkx2.5 (ENSAMXG00000030019) stc2a (ENSAMXG00000037057) ENSAMXG00000043304 Electric eel MODERN SPECIES 274 zgc:92242 (ENSEEEG00000014301) CXXC5 (ENSEEEG00000014300) zgc:110843 (ENSEEEG00000014298) ube2d2 (ENSEEEG00000014054) ppp3cb (ENSEEEG00000013950) sting1 (ENSEEEG00000013947) ENSEEEG00000013946 brd8b (ENSEEEG00000013936) gfra3 (ENSEEEG00000013932) dnd1 (ENSEEEG00000013898) hars (ENSEEEG00000013558) trappc11 (ENSEEEG00000013539) ENSEEEG00000013533 STOX2 (ENSEEEG00000013530) ##22 acsl1b (ENSEEEG00000012946) RBM22 (ENSEEEG00000012898) ENSEEEG00000012895 rgs14a (ENSEEEG00000012893) SLC34A1 (ENSEEEG00000012885) adra2da (ENSEEEG00000012884) BNIP1 (ENSEEEG00000012883) nkx2.5 (ENSEEEG00000012882) stc2a (ENSEEEG00000012880) cpeb4a (ENSEEEG00000012864) msx2a (ENSEEEG00000012862) DRD1 (ENSEEEG00000012860) Cyprinoidei DUPLICATION Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 45 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ENSGT00520000055589.d.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000164681.b ENSGT00390000002731.c Goldfish MODERN SPECIES 5 PURA (ENSCARG00000026567) PSD2 (ENSCARG00000026185) zgc:92242 (ENSCARG00000026124) CXXC5 (ENSCARG00000026111) zgc:110843 (ENSCARG00000026090) ube2d2 (ENSCARG00000025785) ppp3cb (ENSCARG00000024722) sting1 (ENSCARG00000024650) ENSCARG00000024636 brd8b (ENSCARG00000024187) gfra3 (ENSCARG00000024160) dnd1 (ENSCARG00000024154) hars (ENSCARG00000022940) trappc11 (ENSCARG00000022826) ENSCARG00000022817 ##22 ENSCARG00000022813 ##22 ctsf (ENSCARG00000022779) trpt1 (ENSCARG00000022760) hbegfa (ENSCARG00000022744) ENSCARG00000022417 hnrnph1 (ENSCARG00000022373) eif4ebp3l (ENSCARG00000022352) hnrnpaba (ENSCARG00000022341) nme5 (ENSCARG00000022323) rack1 (ENSCARG00000022235) ENSCARG00000021962 ENSCARG00000021947 hmx2 (ENSCARG00000021933) hmx3a (ENSCARG00000021922) ikzf5 (ENSCARG00000021911) ENSCARG00000021876 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 520 ENSGT00530000063652.a.b.g 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ENSCARG00000070331 ##22 trpt1 (ENSCARG00000070330) hbegfa (ENSCARG00000070328) ctsf (ENSCARG00000070302) ENSCARG00000070261 ENSCARG00000070248 eif4ebp3l (ENSCARG00000070247) hnrnpaba (ENSCARG00000070242) rack1 (ENSCARG00000070227) gfCLK4a (ENSCARG00000070209) ENSCARG00000070200 ENSCARG00000070199 thg1l (ENSCARG00000070197) ENSCARG00000070196 nipsnap3a (ENSCARG00000070191) ABCA1 (ENSCARG00000069753) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00950000183162.a.a.d.a ENSGT00940000159674.k ENSGT00940000161678.a.b ENSGT00940000154108.a.d.f.b ENSGT00940000154445.b.c ENSGT00940000153169.B.e ENSGT00940000165110.b.g ENSGT00390000008582.a ENSGT00530000063652.a.b.h ENSGT00530000064262.pc.b.q ENSGT00940000165282.a.a ENSGT00940000159225.s ENSGT00390000005922.b.g ENSGT00390000006550.d ENSGT00520000055589.c.h ##22 ENSGT00520000055589.d.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000164681.a ENSGT00390000002731.d ENSGT00940000156901.A.d.b ENSGT00940000158334.e ENSGT00940000165206.d.e.b ENSGT00940000163328.c.d ENSGT00940000154735.d.b.b ENSGT00940000159595 ENSGT00940000154461.tc.a.a ENSGT00940000165778.f ENSGT00940000159624.d ENSGT00390000011705.g.b ENSGT01030000234799.e ENSGT00950000183018.b.i ENSGT00940000154658.b.i.a.b Common carp reference MODERN SPECIES 20 nrg2b (ENSCCRG00000017661) ENSCCRG00000061845 PSD2 (ENSCCRG00000050724) zgc:92242 (ENSCCRG00000063209) ENSCCRG00000050781 zgc:110843 (ENSCCRG00000050782) ENSCCRG00000050789 ppp3cb (ENSCCRG00000042184) sting1 (ENSCCRG00000059466) ENSCCRG00000054648 brd8b (ENSCCRG00000023071) gfra3 (ENSCCRG00000018333) dnd1 (ENSCCRG00000034954) hars (ENSCCRG00000057390) trappc11 (ENSCCRG00000034877) ENSCCRG00000022407 ##22 ctsf (ENSCCRG00000024650) trpt1 (ENSCCRG00000078840) hbegfa (ENSCCRG00000030451) ENSCCRG00000036268 hnrnph1 (ENSCCRG00000022763) eif4ebp3l (ENSCCRG00000036257) hnrnpaba (ENSCCRG00000066529) rack1 (ENSCCRG00000036241) ENSCCRG00000035988 ENSCCRG00000031662 ENSCCRG00000055662 ENSCCRG00000015276 thg1l (ENSCCRG00000016202) ENSCCRG00000055060 nipsnap3a (ENSCCRG00000081347) Golden-line barbel MODERN SPECIES 678 PURA (ENSSGRG00000022148) PSD2 (ENSSGRG00000022150) zgc:92242 (ENSSGRG00000022152) CXXC5 (ENSSGRG00000022153) zgc:110843 (ENSSGRG00000022154) ENSSGRG00000022155 ppp3cb (ENSSGRG00000022164) sting1 (ENSSGRG00000022563) ENSSGRG00000022565 brd8b (ENSSGRG00000022569) gfra3 (ENSSGRG00000022572) dnd1 (ENSSGRG00000022574) hars (ENSSGRG00000022583) trappc11 (ENSSGRG00000022830) ENSSGRG00000023984 ##22 STOX2 (ENSSGRG00000023985) ##22 ctsf (ENSSGRG00000023990) trpt1 (ENSSGRG00000024475) hbegfa (ENSSGRG00000024476) ENSSGRG00000024480 ENSSGRG00000024482 ENSSGRG00000024485 hnrnph1 (ENSSGRG00000024486) hnrnpaba (ENSSGRG00000024488) nme5 (ENSSGRG00000024489) rack1 (ENSSGRG00000024499) ENSSGRG00000024920 Zebrafish MODERN SPECIES 5 nrg2b (ENSDARG00000086585) PURA (ENSDARG00000099614) PSD2 (ENSDARG00000063036) zgc:92242 (ENSDARG00000029443) ENSDARG00000075735 zgc:110843 (ENSDARG00000073845) ube2d2 (ENSDARG00000043484) 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ENSGT00520000055589.d.a.a.b ##22 ENSGT00520000055589.d.b ##22 ENSGT00520000055589.d.a.a.a ##22 ENSGT00940000164681 ENSGT00390000002731 ENSGT00940000168499.c ENSGT00940000156901.A.d ENSGT00940000158334 ENSGT00940000165206.d.e ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000154735.d.b ENSGT00940000159595 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.a.a.b ##22 Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 367 ENSCARG00000065859 ENSCARG00000065857 ##22 Goldfish MODERN SPECIES 5 nrg2b (ENSCARG00000026579) PURA (ENSCARG00000026567) PSD2 (ENSCARG00000026185) zgc:92242 (ENSCARG00000026124) CXXC5 (ENSCARG00000026111) zgc:110843 (ENSCARG00000026090) ube2d2 (ENSCARG00000025785) ppp3cb (ENSCARG00000024722) sting1 (ENSCARG00000024650) ENSCARG00000024636 brd8b (ENSCARG00000024187) gfra3 (ENSCARG00000024160) dnd1 (ENSCARG00000024154) hars (ENSCARG00000022940) trappc11 (ENSCARG00000022826) ENSCARG00000022817 ##22 ENSCARG00000022813 ##22 ctsf (ENSCARG00000022779) trpt1 (ENSCARG00000022760) hbegfa 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ENSGT00940000165075.a.b ENSGT00940000160001 Denticle herring MODERN SPECIES 9 ENSDCDG00000013772 PCDH12 (ENSDCDG00000013775) LTC4S (ENSDCDG00000013776) MAML1 (ENSDCDG00000013778) canx (ENSDCDG00000013790) mgat4b (ENSDCDG00000014646) sqstm1 (ENSDCDG00000015336) POLR1A (ENSDCDG00000015349) ptcd3 (ENSDCDG00000015393) immt (ENSDCDG00000015430) rnf103 (ENSDCDG00000016994) abhd18 (ENSDCDG00000016997) trappc11 (ENSDCDG00000017017) ENSDCDG00000017048 ENSDCDG00000017056 STOX2 (ENSDCDG00000017061) ##22 acsl1b (ENSDCDG00000017140) aldob (ENSDCDG00000023422) rmnd5b (ENSDCDG00000023430) N4BP3 (ENSDCDG00000023447) ENSDCDG00000023448 ENSDCDG00000023450 anxa6 (ENSDCDG00000023630) tnip1 (ENSDCDG00000029206) gpx3 (ENSDCDG00000029209) dctn4 (ENSDCDG00000029222) tspan17 (ENSDCDG00000029406) ENSDCDG00000029434 ctnna1 (ENSDCDG00000029458) LRRTM2 (ENSDCDG00000029861) sncb (ENSDCDG00000029863) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00390000009871 ENSGT00390000008738 ENSGT00390000013284 ENSGT00940000161151 ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000006413 ENSGT00390000014635 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000163251.b ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000154508.a.a.s.b ENSGT00390000015511 ENSGT00940000153232.a.b.b ##21 ENSGT00940000159063 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00390000010980 ENSGT00940000157056.b ENSGT00530000063727.B ENSGT00940000157278.t ENSGT00940000160321.c.b ENSGT00940000157733.a.a ENSGT00940000164070.a ENSGT00940000163551.i.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000153203.B.j ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861.q ENSGT00940000157944.f ENSGT00390000009871 ENSGT00390000008738.a ENSGT00390000013284 ENSGT00940000161151.d ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000006413 ENSGT00390000014635 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d.a.a.c ##22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000154508.a.a.s.b ENSGT00390000015511 ENSGT00940000153232.a.b.b.l ##21 ENSGT00940000159063.d ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00390000010980 ENSGT00940000156741.d ENSGT00940000157056.b ENSGT00530000063727.B ENSGT00940000157278.t ENSGT00940000160321.c.b ENSGT00940000157733.a.a ENSGT00940000164070.a Huchen MODERN SPECIES 1161 STOX2 (ENSHHUG00000001847) ##22 enpp6 (ENSHHUG00000001851) acsl1b (ENSHHUG00000001882) ENSHHUG00000002379 CASP3 (ENSHHUG00000002389) ##21 irf2 (ENSHHUG00000002419) snx25 (ENSHHUG00000002447) lrp2bp (ENSHHUG00000002571) zgc:153146 (ENSHHUG00000002594) pdlim3b (ENSHHUG00000002597) ENSHHUG00000002608 ENSHHUG00000002618 FAM149A (ENSHHUG00000002670) cyp4v2b (ENSHHUG00000002682) MTNR1A (ENSHHUG00000002833) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000153203.B.j ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861.q ENSGT00940000157944.f ENSGT00390000009871 ENSGT00390000008738.a ENSGT00390000013284 ENSGT00940000161151.d ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000006413 ENSGT00390000014635 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d.a.a.c ##22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000154508.a.a.s.b ENSGT00390000015511 ENSGT00940000153232.a.b.b.l ##21 ENSGT00940000159063.d ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00390000010980 ENSGT00940000156741.d ENSGT00940000157056.b ENSGT00530000063727.B ENSGT00940000157278.t ENSGT00940000160321.c.b ENSGT00940000157733.a.a ENSGT00940000163551.i.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000153203.B.j ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861.q ENSGT00940000157944.f ENSGT00390000009871 ENSGT00390000008738.a ENSGT00390000013284 ENSGT00940000161151.d ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000006413 ENSGT00390000014635 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d.a.a.c ##22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000154508.a.a.s.b ENSGT00390000015511 ENSGT00940000153232.a.b.b.l ##21 ENSGT00940000159063.d ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00390000010980 ENSGT00940000156741.d ENSGT00940000157056.b ENSGT00530000063727.B ENSGT00940000157278.t ENSGT00940000160321.c.b ENSGT00940000157733.a.a ENSGT00940000163551.i.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 MAEA (ENSSSAG00000063575) uvssa (ENSSSAG00000063629) nkx1.2lb (ENSSSAG00000109158) ENSSSAG00000063870 al3a2 (ENSSSAG00000063675) slbp (ENSSSAG00000063884) tmem129 (ENSSSAG00000063892) atoh8 (ENSSSAG00000099210) st3gal5 (ENSSSAG00000063904) POLR1A (ENSSSAG00000063915) ptcd3 (ENSSSAG00000063940) immt (ENSSSAG00000063954) ENSSSAG00000064109 rnf103 (ENSSSAG00000063970) abhd18 (ENSSSAG00000063977) stox2 (ENSSSAG00000069705) ##22 ENSSSAG00000069734 ACSL1 (ENSSSAG00000070232) ENSSSAG00000071426 ##21 irf2 (ENSSSAG00000071432) snx25 (ENSSSAG00000071488) lrp2bp (ENSSSAG00000106561) zgc:153146 (ENSSSAG00000111648) pdlim3 (ENSSSAG00000072246) SORBS2 (ENSSSAG00000072262) ENSSSAG00000072321 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SPECIES 34 ENSGT00940000153203.B.j ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861.q ENSGT00940000157944.f ENSGT00390000009871 ENSGT00390000008738.a ENSGT00390000013284 ENSGT00940000161151.d ENSGT00940000157929 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000006413 ENSGT00390000014635 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d.a.a.c ##22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000154508.a.a.s.b ENSGT00390000015511 ENSGT00940000153232.a.b.b.l ##21 ENSGT00940000159063.d ENSGT00950000182856.a.a.b.i ENSGT00390000013490 ENSGT00390000010980 ENSGT00940000156741.d ENSGT00940000157056.b ENSGT00530000063727.B ENSGT00940000157278.t ENSGT00940000160321.c.b ENSGT00940000157733.a.a ENSGT00940000163551.i.a Chinook salmon MODERN SPECIES 32 maea (ENSOTSG00005046540) uvssa (ENSOTSG00005046539) nkx1.2lb (ENSOTSG00005046538) ALDH3A2 (ENSOTSG00005046535) ENSOTSG00005046534 slbp (ENSOTSG00005046533) tmem129 (ENSOTSG00005046531) atoh8 (ENSOTSG00005046530) st3gal5 (ENSOTSG00005046529) POLR1A 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ENSGT00390000008183 ENSGT00390000004827 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000156295.h ENSGT00940000158277.a ENSGT00940000158825.d ENSGT00390000002313 ENSGT00390000008738 ENSGT00390000009871 ENSGT00390000013284 ENSGT00940000161151 ENSGT00390000014635 ENSGT00390000006413 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000002414 ENSGT00390000013163 ENSGT00940000153700 ENSGT01030000234957 ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000154953.a ENSGT00940000177743 ENSGT00990000203833 ENSGT00940000175899 ENSGT00950000183174.B.a.f ENSGT00390000002932 ENSGT00390000005922.b ENSGT00940000159225 ENSGT00940000165282.a ENSGT00510000049866.g.a.a.a ENSGT00940000157090.g ENSGT00390000008183 ENSGT00390000004827 ENSGT00940000160288 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 702 ENSHBUG00000003583 immt (ENSHBUG00000003549) ENSHBUG00000003338 ENSHBUG00000003325 tmem129 (ENSHBUG00000003311) ENSHBUG00000003281 abhd18 (ENSHBUG00000003275) rnf103 (ENSHBUG00000003231) magt1 (ENSHBUG00000003200) FBXO38 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SPECIES 1102 pcdh10b (ENSMZEG00005017243) ENSMZEG00005017250 immt (ENSMZEG00005017255) ENSMZEG00005017261 ENSMZEG00005017266 tmem129 (ENSMZEG00005017272) ENSMZEG00005017274 abhd18 (ENSMZEG00005017279) rnf103 (ENSMZEG00005017289) magt1 (ENSMZEG00005017296) igbp1 (ENSMZEG00005017300) FBXO38 (ENSMZEG00005017310) csnk1a1 (ENSMZEG00005017333) ENSMZEG00005017343 STOX2 (ENSMZEG00005017346) ##22 enpp6 (ENSMZEG00005017351) ENSMZEG00005017353 ENSMZEG00005017360 naa15a (ENSMZEG00005017368) ENSMZEG00005017388 mlsl (ENSMZEG00005017393) hars (ENSMZEG00005017419) ENSMZEG00005017434 dnd1 (ENSMZEG00005017442) gfra3 (ENSMZEG00005017454) ENSMZEG00005017462 pcdh18b (ENSMZEG00005017468) ENSMZEG00005017476 ENSMZEG00005017482 ENSMZEG00005017486 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000007138 immt (ENSACLG00000007052) ENSACLG00000007036 ENSACLG00000007027 tmem129 (ENSACLG00000007010) tmem129 (ENSACLG00000007001) ENSACLG00000006995 abhd18 (ENSACLG00000006974) rnf103 (ENSACLG00000006946) magt1 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158 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000162861 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000153909.b ENSGT00510000047951 ENSGT00390000006550 ENSGT00940000160541 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000159799 ENSGT00940000156526.b ENSGT00390000004827 ENSGT00940000157090.g ENSGT00920000149123.d ENSGT00940000153700.g ENSGT01030000234957 ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus MODERN SPECIES 629 ENSKMAG00000010956 ##22 STOX2 (ENSKMAG00000010917) ##22 FBXO38 (ENSKMAG00000010890) magt1 (ENSKMAG00000010839) Mangrove rivulus MODERN SPECIES 629 ENSKMAG00000010956 ##22 STOX2 (ENSKMAG00000010917) ##22 FBXO38 (ENSKMAG00000010890) magt1 (ENSKMAG00000010839) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1610 zgc:154054 (ENSNFUG00015013929) SETD7 (ENSNFUG00015013934) RNF103 (ENSNFUG00015013940) GFRA3 (ENSNFUG00015013945) ENSNFUG00015013948 ENSNFUG00015013950 enpp6 (ENSNFUG00015013956) ENSNFUG00015013965 RAB33B (ENSNFUG00015013969) HSPA9 (ENSNFUG00015013978) csnk1a1 (ENSNFUG00015014011) 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ENSGT00390000009871 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000008738 ENSGT00980000198976 ENSGT00940000158277.a ENSGT00940000156295.h ENSGT00940000166427 ENSGT00940000155249.h ENSGT00940000154953.a ENSGT00440000037338 ENSGT00940000177743 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00390000013284 ENSGT00390000013163 ENSGT00940000153700 ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00390000002414 ENSGT00940000158457 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 582 ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00390000002414 ENSGT00940000158457 Amazon molly MODERN SPECIES 1117 STOX2 (ENSPFOG00000004907) ##22 igbp1 (ENSPFOG00000004875) enpp6 (ENSPFOG00000004864) Guppy MODERN SPECIES 27 tmem129 (ENSPREG00000002708) ENSPREG00000002718 FBXO38 (ENSPREG00000002737) csnk1a1 (ENSPREG00000002798) STOX2 (ENSPREG00000002841) ##22 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000012021 magt1 (ENSXMAG00000022759) rnf103 (ENSXMAG00000012043) ENSXMAG00000019079 tmem129 (ENSXMAG00000019071) FBXO38 (ENSXMAG00000016231) csnk1a1 (ENSXMAG00000028098) STOX2 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enpp6 (ENSOMEG00000011026) abhd18 (ENSOMEG00000011045) igbp1 (ENSOMEG00000011062) tmem129 (ENSOMEG00000011099) csnk1a1 (ENSOMEG00000011213) ENSOMEG00000011116 magt1 (ENSOMEG00000011253) rnf103 (ENSOMEG00000011292) FBXO38 (ENSOMEG00000011335) ENSOMEG00000011350 gfra3 (ENSOMEG00000011363) dnd1 (ENSOMEG00000011374) hars (ENSOMEG00000011434) mlsl (ENSOMEG00000011463) ENSOMEG00000011471 Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 b4galt1l (ENSOJAG00000019811) exosc3 (ENSOJAG00000019792) tgfbi (ENSOJAG00000019238) ENSOJAG00000019207 pcdh10b (ENSOJAG00000018751) pcdh18b (ENSOJAG00000018654) ENSOJAG00000018545 NOCT (ENSOJAG00000018529) ENSOJAG00000018495 ENSOJAG00000018477 immt (ENSOJAG00000018422) ENSOJAG00000018410 ENSOJAG00000018349 csnk1a1 (ENSOJAG00000018263) ENSOJAG00000018248 STOX2 (ENSOJAG00000018218) ##22 enpp6 (ENSOJAG00000018146) abhd18 (ENSOJAG00000018082) igbp1 (ENSOJAG00000018068) tmem129 (ENSOJAG00000018057) ENSOJAG00000018053 rnf103 (ENSOJAG00000017970) gfra3 (ENSOJAG00000017863) dnd1 (ENSOJAG00000017775) hars (ENSOJAG00000017365) mlsl (ENSOJAG00000017188) ENSOJAG00000017175 eif4ea (ENSOJAG00000017163) LINGO2 (ENSOJAG00000017155) cxcl14 (ENSOJAG00000017121) fam13b (ENSOJAG00000017074) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00390000002313 ENSGT00390000008738 ENSGT00390000009871 ENSGT00940000153700 ENSGT00980000199752 ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000158457 ENSGT00390000014635.d ENSGT00390000002414 ENSGT00390000013284 ENSGT00940000161151 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000006413 ENSGT00940000165282.a ENSGT00940000159225 ENSGT00390000005922.b ENSGT00390000002932 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00940000156627.a ENSGT00940000158366 ENSGT01050000244965.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000027074 ENSORLG00000024157 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ENSGT00970000197643 ENSGT00390000002414 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000013163 ENSGT00940000153700 ENSGT01030000234957 ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000158457 Seriola ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00940000175899 ENSGT00940000170279 ENSGT00940000154953.a ENSGT00940000155249.h ENSGT00390000008738 ENSGT00390000009871 ENSGT00390000013284 ENSGT00940000161151 ENSGT00390000006413 ENSGT00390000014635 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000002414 ENSGT00390000013163 ENSGT00940000153700 ENSGT01030000234957 ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000158457 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2970 ENSSLDG00000007624 elf2a (ENSSLDG00000007600) NOCT (ENSSLDG00000007584) ENSSLDG00000007554 ENSSLDG00000007530 tmem129 (ENSSLDG00000007481) ENSSLDG00000007452 rnf103 (ENSSLDG00000007423) abhd18 (ENSSLDG00000007391) magt1 (ENSSLDG00000007327) igbp1 (ENSSLDG00000007301) FBXO38 (ENSSLDG00000007253) csnk1a1 (ENSSLDG00000007114) ENSSLDG00000007086 ENSSLDG00000007072 STOX2 (ENSSLDG00000007026) ##22 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SPECIES 9 ENSSAUG00010012136 tmem129 (ENSSAUG00010012134) ENSSAUG00010012131 ENSSAUG00010012129 rnf103 (ENSSAUG00010012125) abhd18 (ENSSAUG00010012123) ENSSAUG00010012121 ENSSAUG00010012120 smtla (ENSSAUG00010012050) igbp1 (ENSSAUG00010012047) magt1 (ENSSAUG00010011903) ENSSAUG00010011898 FBXO38 (ENSSAUG00010011844) csnk1a1 (ENSSAUG00010011837) ENSSAUG00010011833 STOX2 (ENSSAUG00010011832) ##22 enpp6 (ENSSAUG00010011824) ENSSAUG00010011818 hspa9 (ENSSAUG00010009803) rab33ba (ENSSAUG00010009761) zgc:113425 (ENSSAUG00010009760) setd7 (ENSSAUG00010009757) mgst2 (ENSSAUG00010009755) SCOC (ENSSAUG00010009753) zgc:154054 (ENSSAUG00010009749) ENSSAUG00010009745 ENSSAUG00010009740 ENSSAUG00010009739 trappc11 (ENSSAUG00010009736) spdl1 (ENSSAUG00010009734) SLITRK2 (ENSSAUG00010009731) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00390000013284 ENSGT00940000161151 ENSGT00390000006413 ENSGT00390000014635 ENSGT00390000002414 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000013163 ENSGT00940000153700 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ENSGT00940000157733.a.a Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 153 ENSGT00940000160971 ENSGT00940000161248 ENSGT00920000149123.d ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d.b ##22 ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000158277.a ENSGT01030000234904 ENSGT00980000198976 ENSGT00940000156295.h ENSGT00940000166427 ENSGT00940000155249.h ENSGT00940000154953.a ENSGT00440000037338 ENSGT00940000175899 ENSGT00950000183174.B.a.f ENSGT00390000002932 ENSGT00940000157090.g ENSGT00390000008183 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000178312 ENSGT00510000047951 ENSGT00940000164256 ENSGT00940000162861 ENSGT00570000079101.a.b ENSGT00940000159403 ENSGT00390000010980 ENSGT00940000165282.a ENSGT00940000159225 ENSGT00390000005922.b ENSGT00990000205617 ENSGT00940000159799 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d.b ##22 ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000158277.a ENSGT01030000234904 ENSGT00980000198976 ENSGT00940000156295.h ENSGT00940000166427 ENSGT00940000155249.h ENSGT00940000154953.a ENSGT00440000037338 ENSGT00940000170279 ENSGT00940000175899 ENSGT00950000183174.B.a.f ENSGT00390000002932 ENSGT00940000157090.g Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005006668 spdl1 (ENSMMDG00005006667) uvssa (ENSMMDG00005006663) nkx1.2lb (ENSMMDG00005006662) ENSMMDG00005006660 hvcn1 (ENSMMDG00005006658) zgc:153146 (ENSMMDG00005006655) gfra3 (ENSMMDG00005006653) ENSMMDG00005006651 dnd1 (ENSMMDG00005006554) hars (ENSMMDG00005001930) ENSMMDG00005001824 ENSMMDG00005001819 ENSMMDG00005001817 trappc11 (ENSMMDG00005001630) ENSMMDG00005001552 ##22 STOX2 (ENSMMDG00005001543) ##22 enpp6 (ENSMMDG00005001474) pcdh10b (ENSMMDG00005001459) ENSMMDG00005001449 pcdh18b (ENSMMDG00005001301) ENSMMDG00005001142 NOCT (ENSMMDG00005001131) elf2a (ENSMMDG00005001127) ENSMMDG00005016362 ENSMMDG00005016359 naa15a (ENSMMDG00005015567) mlsl (ENSMMDG00005015540) rab33ba (ENSMMDG00005015538) zgc:113425 (ENSMMDG00005015536) setd7 (ENSMMDG00005015535) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 194 ENSGT00520000055589.d.b ##22 ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000158457 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Spiny chromis MODERN SPECIES 1443 csnk1a1 (ENSAPOG00000010870) ENSAPOG00000010824 ##22 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 P. nyererei MODERN SPECIES 1363 ENSPNYG00000024159 ##22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Tongue sole MODERN SPECIES 19 ADAP1 (ENSCSEG00000001442) lgals2b (ENSCSEG00000001454) ENSCSEG00000001457 GTPBP1 (ENSCSEG00000001459) ELFN2 (ENSCSEG00000001622) mfng (ENSCSEG00000001626) ENSCSEG00000001631 ENSCSEG00000001639 TRMT1 (ENSCSEG00000001643) NACC1 (ENSCSEG00000001656) spag6 (ENSCSEG00000001658) pcm1 (ENSCSEG00000001839) #18 sart1 (ENSCSEG00000001968) #19 osbp (ENSCSEG00000001971) #20 casp3a (ENSCSEG00000001986) #21 ENSCSEG00000001991 ##22 STOX2 (ENSCSEG00000001992) #22 tll1 (ENSCSEG00000001997) #23 GTF3C1 (ENSCSEG00000002019) AXIN1 (ENSCSEG00000002030) thumpd1 (ENSCSEG00000002041) ENSCSEG00000002050 ENSCSEG00000002060 parn (ENSCSEG00000002064) ELFN1 (ENSCSEG00000002085) mad1l1 (ENSCSEG00000002091) ENSCSEG00000002109 ENSCSEG00000002113 ttyh3b (ENSCSEG00000002117) ENSCSEG00000002122 ENSCSEG00000002128 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00520000055589.d.b ##22 ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000158277.a ENSGT00940000156295.h ENSGT00940000166427 ENSGT00940000155249.h ENSGT00940000154953.a ENSGT00990000203833 ENSGT00940000175899 ENSGT00950000183174.B.a.f ENSGT00390000002932 ENSGT00390000005922.b ENSGT00940000159225 ENSGT00940000165282.a ENSGT00390000010980 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 gfra3 (ENSMAMG00000001806) ENSMAMG00000001857 hars (ENSMAMG00000002252) mlsl (ENSMAMG00000002318) naa15a (ENSMAMG00000002371) ENSMAMG00000002435 ENSMAMG00000002448 ENSMAMG00000002474 elf2a (ENSMAMG00000002486) ENSMAMG00000002501 ENSMAMG00000002510 ENSMAMG00000002528 ENSMAMG00000002609 ENSMAMG00000002657 ENSMAMG00000028617 ENSMAMG00000027418 ##22 ENSMAMG00000025421 ##22 ENSMAMG00000002716 pcdh10b (ENSMAMG00000002725) ENSMAMG00000002847 ENSMAMG00000002886 ENSMAMG00000002946 ENSMAMG00000026830 ENSMAMG00000002999 ENSMAMG00000003052 ENSMAMG00000003022 ENSMAMG00000003061 ENSMAMG00000027356 ENSMAMG00000026993 ENSMAMG00000003475 ENSMAMG00000003501 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 384 ENSGT00920000149138 ENSGT00390000016876 ENSGT00390000002313 ENSGT00390000006413 ENSGT00390000014635 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d.b ##22 ENSGT00940000163251.b.j ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000154508.a.a.s.b ENSGT00390000015511 ENSGT00940000153232.a.b.b ##21 ENSGT00940000159063.e ENSGT00940000158457 ENSGT00950000182856.a.a.b Otophysi ANCESTRAL SPECIES 304 ENSGT00940000165110.b ENSGT00390000008582 ENSGT00530000063652.a.b ENSGT00530000064262.pc.b ENSGT00940000165282.a ENSGT00940000159225 ENSGT00390000005922.b ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d.b ##22 ENSGT00940000163251.b.j ENSGT00520000055589.d.a.a ##22 ENSGT00940000154508.a.a.s.b ENSGT00950000183027.a.a.b ENSGT00940000165461 ENSGT00940000177027 ENSGT00940000164577.b ENSGT00940000166254.a Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00950000183162.a.a.d ENSGT00940000159674 ENSGT00940000161678 ENSGT00940000154108.a.d.f ENSGT00940000154445.b ENSGT00940000153169.B.f ENSGT00940000165110.b ENSGT00390000008582 ENSGT00530000063652.a.b ENSGT00530000064262.pc.b ENSGT00940000165282.a ENSGT00940000159225 ENSGT00390000005922.b ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d.a.a.b ##22 ENSGT00520000055589.d.b ##22 ENSGT00520000055589.d.a.a.a ##22 ENSGT00940000164681 ENSGT00390000002731 ENSGT00940000168499.c ENSGT00940000156901.A.d ENSGT00940000158334 ENSGT00940000165206.d.e ENSGT00940000163328.c ENSGT00940000154735.d.b ENSGT00940000159595 Zebrafish MODERN SPECIES 5 ENSDARG00000089094 nrg2b (ENSDARG00000086585) PURA (ENSDARG00000099614) PSD2 (ENSDARG00000063036) zgc:92242 (ENSDARG00000029443) ENSDARG00000075735 zgc:110843 (ENSDARG00000073845) ube2d2 (ENSDARG00000043484) ppp3cb (ENSDARG00000025106) sting1 (ENSDARG00000091058) brd8b (ENSDARG00000025071) gfra3 (ENSDARG00000087704) dnd1 (ENSDARG00000022813) hars (ENSDARG00000003693) trappc11 (ENSDARG00000004726) ENSDARG00000099304 ##22 STOX2 (ENSDARG00000078572) ##22 ctsf (ENSDARG00000063095) trpt1 (ENSDARG00000037628) ENSDARG00000100596 hbegfa (ENSDARG00000075121) RUFY1 (ENSDARG00000078685) hnrnph1 (ENSDARG00000040881) eif4ebp3l (ENSDARG00000041607) hnrnpaba (ENSDARG00000007960) nme5 (ENSDARG00000041617) rack1 (ENSDARG00000041619) ENSDARG00000089372 ENSDARG00000100249 ENSDARG00000095339 ENSDARG00000092493 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00520000055589.d.b ##22 Goldfish MODERN SPECIES 3420 cdk2ap2 (ENSCARG00000044629) aip (ENSCARG00000044636) SOD3 (ENSCARG00000044649) ing2 (ENSCARG00000044655) ENSCARG00000044671 ##22 Spotted gar MODERN SPECIES 670 gpm6aa (ENSLOCG00000013615) wdr17 (ENSLOCG00000013618) spata4 (ENSLOCG00000013625) ASB5 (ENSLOCG00000013627) spcs3 (ENSLOCG00000013631) vegfc (ENSLOCG00000013634) neil3 (ENSLOCG00000013638) aga (ENSLOCG00000013645) TENM3 (ENSLOCG00000013649) dctd (ENSLOCG00000013678) WWC2 (ENSLOCG00000013682) ENSLOCG00000013696 rwdd (ENSLOCG00000013699) trappc11 (ENSLOCG00000013704) ENSLOCG00000013715 STOX2 (ENSLOCG00000013723) #22 enpp6 (ENSLOCG00000013730) irf2 (ENSLOCG00000013738) casp3a (ENSLOCG00000013742) #21 primpol (ENSLOCG00000013749) ENSLOCG00000013756 acsl1b (ENSLOCG00000013758) helt (ENSLOCG00000013768) ENSLOCG00000013771 slc25a4 (ENSLOCG00000013773) cfap97 (ENSLOCG00000013777) snx25 (ENSLOCG00000013780) lrp2bp (ENSLOCG00000013790) ufsp2 (ENSLOCG00000013795) zgc:153146 (ENSLOCG00000013800) ENSLOCG00000013804 Reedfish MODERN SPECIES 13 aga (ENSECRG00000002913) ENSECRG00000002907 ENSECRG00000002899 ENSECRG00000002892 tenm3 (ENSECRG00000002887) ENSECRG00000002879 ENSECRG00000002850 ENSECRG00000002811 dctd (ENSECRG00000002775) WWC2 (ENSECRG00000002739) ing2 (ENSECRG00000002724) rwdd (ENSECRG00000002715) trappc11 (ENSECRG00000002691) ENSECRG00000002642 ENSECRG00000002611 STOX2 (ENSECRG00000002588) #22 enpp6 (ENSECRG00000002573) IRF2 (ENSECRG00000002559) ENSECRG00000002535 ##21 ENSECRG00000002525 casp3a (ENSECRG00000002508) #21 primpol (ENSECRG00000002487) ENSECRG00000002428 ENSECRG00000002395 ACSL1 (ENSECRG00000002363) helt (ENSECRG00000002338) slc25a4 (ENSECRG00000002323) cfap97 (ENSECRG00000002315) snx25 (ENSECRG00000002276) lrp2bp (ENSECRG00000002243) ankrd37 (ENSECRG00000002233) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT01030000234566.f ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00940000167021 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000165411.a.a ENSGT00940000165411.b ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 Coelacanth MODERN SPECIES 266 ENSLACG00000018317 tenm3 (ENSLACG00000017160) ENSLACG00000016037 ENSLACG00000015225 DCTD (ENSLACG00000015221) WWC2 (ENSLACG00000013542) cldn26 (ENSLACG00000013420) CDKN2AIP (ENSLACG00000013042) ING2 (ENSLACG00000012661) ENSLACG00000011736 RWDD4 (ENSLACG00000011062) TRAPPC11 (ENSLACG00000010124) ENSLACG00000009998 ENSLACG00000009311 ENSLACG00000008761 ##22 STOX2 (ENSLACG00000002298) #22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00940000167021 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000165411.a.a ENSGT00940000165411.b ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 Anura ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00940000167021 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00940000153232.b ##21 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000165411.a.a ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 Frog MODERN SPECIES aga (ENSXETG00000009427) ENSXETG00000048545 tenm3 (ENSXETG00000031472) dctd (ENSXETG00000019042) wwc2 (ENSXETG00000025753) ENSXETG00000044938 ENSXETG00000034028 cdkn2aip (ENSXETG00000019049) ENSXETG00000041521 ing2 (ENSXETG00000019052) ENSXETG00000039273 rwdd4 (ENSXETG00000019065) trappc11 (ENSXETG00000019069) ENSXETG00000048300 ENSXETG00000042755 stox2 (ENSXETG00000001533) #22 irf2 (ENSXETG00000045571) enpp6 (ENSXETG00000001536) casp3.2 (ENSXETG00000045371) #21 primpol (ENSXETG00000001535) ENSXETG00000038298 casp3.1 (ENSXETG00000030678) ##21 cenpu (ENSXETG00000031559) acsl1 (ENSXETG00000001539) helt (ENSXETG00000030981) ENSXETG00000037366 slc25a4 (ENSXETG00000025740) cfap97 (ENSXETG00000034114) snx25 (ENSXETG00000031703) lrp2bp (ENSXETG00000001561) ankrd37 (ENSXETG00000025738) Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad MODERN SPECIES ENSLLEG00000019020 ENSLLEG00000019056 ENSLLEG00000019325 ENSLLEG00000020690 DCTD (ENSLLEG00000020780) WWC2 (ENSLLEG00000020987) ENSLLEG00000021452 ENSLLEG00000021589 ENSLLEG00000021624 CDKN2AIP (ENSLLEG00000021640) ING2 (ENSLLEG00000021707) ENSLLEG00000021774 ENSLLEG00000022848 RWDD4 (ENSLLEG00000022920) TRAPPC11 (ENSLLEG00000023088) ENSLLEG00000023910 #22 ENSLLEG00000023953 STOX2 (ENSLLEG00000024013) #22 ENSLLEG00000024153 ENPP6 (ENSLLEG00000024207) IRF2 (ENSLLEG00000000038) CASP3 (ENSLLEG00000000059) #21 PRIMPOL (ENSLLEG00000000076) ENSLLEG00000000097 ##21 ENSLLEG00000000120 ##21 ENSLLEG00000000155 ENSLLEG00000000225 ENSLLEG00000000408 HELT (ENSLLEG00000000418) SLC25A4 (ENSLLEG00000000431) ENSLLEG00000000450 Leishan spiny toad MODERN SPECIES ENSLLEG00000019325 ENSLLEG00000020690 DCTD (ENSLLEG00000020780) WWC2 (ENSLLEG00000020987) ENSLLEG00000021452 ENSLLEG00000021589 ENSLLEG00000021624 CDKN2AIP (ENSLLEG00000021640) ING2 (ENSLLEG00000021707) ENSLLEG00000021774 ENSLLEG00000022848 RWDD4 (ENSLLEG00000022920) TRAPPC11 (ENSLLEG00000023088) ENSLLEG00000023910 #22 ENSLLEG00000023953 STOX2 (ENSLLEG00000024013) #22 ENSLLEG00000024153 ENPP6 (ENSLLEG00000024207) IRF2 (ENSLLEG00000000038) CASP3 (ENSLLEG00000000059) #21 PRIMPOL (ENSLLEG00000000076) ENSLLEG00000000097 ##21 ENSLLEG00000000120 ##21 ENSLLEG00000000155 ENSLLEG00000000225 ENSLLEG00000000408 HELT (ENSLLEG00000000418) SLC25A4 (ENSLLEG00000000431) ENSLLEG00000000450 CFAP97 (ENSLLEG00000000463) SNX25 (ENSLLEG00000000476) Amniota ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00940000167021 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT01050000246068 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Sauria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00940000167021 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT01050000246068 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00940000167021 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT00950000183866 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00940000167021 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT00950000183866 Laterata ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00950000185893 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT00950000183866 Common wall lizard MODERN SPECIES 17 NEIL3 (ENSPMRG00000010325) AGA (ENSPMRG00000010319) ENSPMRG00000010312 ENSPMRG00000010303 ENSPMRG00000010294 ENSPMRG00000010196 DCTD (ENSPMRG00000010175) WWC2 (ENSPMRG00000009963) ENSPMRG00000009913 ENSPMRG00000009910 ENSPMRG00000009905 ING2 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ENSGT00940000158602 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT00950000183866 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2701 ENSCABG00000013836 ING2 (ENSCABG00000013832) RWDD4 (ENSCABG00000013827) TRAPPC11 (ENSCABG00000012506) STOX2 (ENSCABG00000012427) #22 ENPP6 (ENSCABG00000012420) IRF2 (ENSCABG00000012417) Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 19 SPCS3 (ENSGEVG00005003340) VEGFC 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ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00950000185893 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT01050000246068 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 26 ASB5 (ENSTMTG00000005377) SPCS3 (ENSTMTG00000005407) VEGFC (ENSTMTG00000005414) ENSTMTG00000005431 AGA (ENSTMTG00000005446) TENM3 (ENSTMTG00000005465) DCTD (ENSTMTG00000005516) WWC2 (ENSTMTG00000005538) ENSTMTG00000005586 ENSTMTG00000005598 ENSTMTG00000005613 ING2 (ENSTMTG00000005641) ENSTMTG00000005652 RWDD4 (ENSTMTG00000005667) TRAPPC11 (ENSTMTG00000005709) STOX2 (ENSTMTG00000005793) #22 ENPP6 (ENSTMTG00000005829) IRF2 (ENSTMTG00000006062) CASP3 (ENSTMTG00000006087) #21 PRIMPOL 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MODERN SPECIES 1610 NEIL3 (ENSPSIG00000012155) AGA (ENSPSIG00000012881) ENSPSIG00000001159 ENSPSIG00000001162 TENM3 (ENSPSIG00000012946) DCTD (ENSPSIG00000008907) WWC2 (ENSPSIG00000009796) ENSPSIG00000001171 CDKN2AIP (ENSPSIG00000010378) ING2 (ENSPSIG00000001178) RWDD4 (ENSPSIG00000010480) TRAPPC11 (ENSPSIG00000010510) STOX2 (ENSPSIG00000014957) #22 ENPP6 (ENSPSIG00000016255) IRF2 (ENSPSIG00000016830) Archosauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000161922.i.b.a ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00950000185893 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT00950000183866 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 33 ASB5 (ENSCPRG00005011420) SPCS3 (ENSCPRG00005011423) VEGFC (ENSCPRG00005011429) NEIL3 (ENSCPRG00005011433) AGA (ENSCPRG00005011436) ENSCPRG00005011461 ENSCPRG00005011479 DCTD (ENSCPRG00005000066) WWC2 (ENSCPRG00005000071) ENSCPRG00005000087 ENSCPRG00005000093 ING2 (ENSCPRG00005000098) ENSCPRG00005000104 RWDD4 (ENSCPRG00005000113) TRAPPC11 (ENSCPRG00005000128) STOX2 (ENSCPRG00005000172) #22 ENPP6 (ENSCPRG00005000200) IRF2 (ENSCPRG00005000275) CASP3 (ENSCPRG00005000281) #21 PRIMPOL (ENSCPRG00005000286) CENPU (ENSCPRG00005000304) ACSL1 (ENSCPRG00005000347) SLC25A4 (ENSCPRG00005000360) CFAP97 (ENSCPRG00005000362) SNX25 (ENSCPRG00005000365) Aves ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 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(ENSSCUG00000007511) IRF2 (ENSSCUG00000007518) PRIMPOL (ENSSCUG00000007520) CASP3 (ENSSCUG00000007522) #21 CENPU (ENSSCUG00000007526) ACSL1 (ENSSCUG00000007538) ENSSCUG00000007558 CFAP97 (ENSSCUG00000007566) SNX25 (ENSSCUG00000007573) LRP2BP (ENSSCUG00000007580) ANKRD37 (ENSSCUG00000007585) UFSP2 (ENSSCUG00000007589) C4orf47 (ENSSCUG00000007593) ENSSCUG00000007598 PDLIM3 (ENSSCUG00000007600) Neognathae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b.b ENSGT00940000161922.i.b.a ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 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ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b.b ENSGT00940000161922.i.b.a ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000157115 ENSGT00940000153745.b ENSGT00940000154108.b.a.a ENSGT00940000160003 Japanese quail MODERN SPECIES 22 HMGB2 (ENSCJPG00005009916) GALNT7 (ENSCJPG00005009913) GALNTL6 (ENSCJPG00005009911) NEIL3 (ENSCJPG00005009892) AGA (ENSCJPG00005009890) ENSCJPG00005009875 ENSCJPG00005009627 ENSCJPG00005009622 DCTD (ENSCJPG00005009621) WWC2 (ENSCJPG00005009619) ENSCJPG00005009615 CDKN2AIP (ENSCJPG00005009613) ING2 (ENSCJPG00005009611) RWDD4 (ENSCJPG00005009609) TRAPPC11 (ENSCJPG00005009608) STOX2 (ENSCJPG00005009607) #22 ENPP6 (ENSCJPG00005009606) IRF2 (ENSCJPG00005009605) CASP3 (ENSCJPG00005009604) #21 PRIMPOL (ENSCJPG00005009603) CENPU (ENSCJPG00005009602) ACSL1 (ENSCJPG00005009601) HELT (ENSCJPG00005009600) SLC25A4 (ENSCJPG00005009599) CFAP97 (ENSCJPG00005009598) SNX25 (ENSCJPG00005009597) LRP2BP (ENSCJPG00005009596) UFSP2 (ENSCJPG00005009595) TACR3 (ENSCJPG00005009592) CXXC4 (ENSCJPG00005009588) TET2 (ENSCJPG00005009585) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000006633.b ENSGT00940000154466 ENSGT00940000158105 ENSGT00940000155038 ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b.b ENSGT00940000161922.i.b.a ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000157115 ENSGT00940000153745.b ENSGT00940000154108.b.a.a ENSGT00940000160003 Chicken MODERN SPECIES 33 HMGB2 (ENSGALG00010002939) GALNT7 (ENSGALG00010002937) ENSGALG00010002932 GALNTL6 (ENSGALG00010002926) NEIL3 (ENSGALG00010004472) AGA (ENSGALG00010004457) TENM3 (ENSGALG00010007480) DCTD (ENSGALG00010007416) WWC2 (ENSGALG00010007399) ENSGALG00010008525 ENSGALG00010007394 CDKN2AIP (ENSGALG00010007376) ING2 (ENSGALG00010007353) RWDD4 (ENSGALG00010007326) TRAPPC11 (ENSGALG00010007294) STOX2 (ENSGALG00010007283) #22 ENPP6 (ENSGALG00010007187) IRF2 (ENSGALG00010007130) CASP3 (ENSGALG00010007067) #21 PRIMPOL (ENSGALG00010007085) CENPU (ENSGALG00010007038) ACSL1 (ENSGALG00010007007) HELT (ENSGALG00010006955) SLC25A4 (ENSGALG00010005880) CFAP97 (ENSGALG00010005858) SNX25 (ENSGALG00010005849) LRP2BP (ENSGALG00010005826) UFSP2 (ENSGALG00010005799) TACR3 (ENSGALG00010005776) CXXC4 (ENSGALG00010005768) TET2 (ENSGALG00010005756) Turkey MODERN SPECIES 24 ENSMGAG00000016688 ENSMGAG00000006061 ENSMGAG00000006097 ENSMGAG00000006108 ENSMGAG00000006149 ENSMGAG00000006126 SLC25A4 (ENSMGAG00000006211) ENSMGAG00000006201 SNX25 (ENSMGAG00000006165) ENSMGAG00000019600 ENSMGAG00000006292 ENSMGAG00000006271 ENSMGAG00000006217 ENSMGAG00000006316 #21 ENSMGAG00000006359 ENSMGAG00000006401 #22 ENSMGAG00000006404 ENSMGAG00000006479 ENSMGAG00000006495 ENSMGAG00000006502 ENSMGAG00000016260 ENSMGAG00000016258 ENSMGAG00000006504 ENSMGAG00000018663 ENSMGAG00000020453 ENSMGAG00000020804 ENSMGAG00000006585 ENSMGAG00000016724 ENSMGAG00000006733 ENSMGAG00000006745 ENSMGAG00000006747 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b.b ENSGT00940000161922.i.b.a ENSGT00940000158376 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ENSGT00390000014316.c.b.`b ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01040000240547 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.a ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000014316.c.b.`b ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b.f #21 ENSGT00940000153232.a.b.e #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 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ENSPCIG00000016947 ENSPCIG00000013679 ENSPCIG00000013700 DCTD (ENSPCIG00000013744) WWC2 (ENSPCIG00000010902) ENSPCIG00000013384 CDKN2AIP (ENSPCIG00000010826) ING2 (ENSPCIG00000010828) RWDD4 (ENSPCIG00000010832) ENSPCIG00000010836 TRAPPC11 (ENSPCIG00000010834) STOX2 (ENSPCIG00000010837) #22 ENPP6 (ENSPCIG00000031713) IRF2 (ENSPCIG00000021142) ENSPCIG00000032808 #21 ENSPCIG00000034000 #21 PRIMPOL (ENSPCIG00000025027) ENSPCIG00000025028 ACSL1 (ENSPCIG00000025030) HELT (ENSPCIG00000025033) SLC25A4 (ENSPCIG00000032887) CFAP97 (ENSPCIG00000013442) ENSPCIG00000007576 ENSPCIG00000030704 LRP2BP (ENSPCIG00000025036) ANKRD37 (ENSPCIG00000025037) UFSP2 (ENSPCIG00000025038) Wallaby MODERN SPECIES 8207 ENSMEUG00000010050 #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 5 VEGFC (ENSSHAG00000013634) NEIL3 (ENSSHAG00000007680) AGA (ENSSHAG00000006591) ENSSHAG00000021250 ENSSHAG00000018103 ENSSHAG00000028695 TENM3 (ENSSHAG00000015658) ENSSHAG00000027006 WWC2 (ENSSHAG00000013834) ENSSHAG00000013806 ENSSHAG00000013799 CDKN2AIP (ENSSHAG00000031412) ING2 (ENSSHAG00000025479) RWDD4 (ENSSHAG00000025756) TRAPPC11 (ENSSHAG00000001108) STOX2 (ENSSHAG00000009529) #22 ENPP6 (ENSSHAG00000024436) IRF2 (ENSSHAG00000025211) ENSSHAG00000027604 #21 PRIMPOL (ENSSHAG00000008875) ENSSHAG00000032064 ACSL1 (ENSSHAG00000007860) ENSSHAG00000030602 HELT (ENSSHAG00000004636) SLC25A4 (ENSSHAG00000020831) CFAP97 (ENSSHAG00000031623) SNX25 (ENSSHAG00000013443) LRP2BP (ENSSHAG00000026041) UFSP2 (ENSSHAG00000026246) ANKRD37 (ENSSHAG00000025335) C4orf47 (ENSSHAG00000012768) Eutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT01050000246068 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 236 ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 Sloth MODERN SPECIES 6092 STOX2 (ENSCHOG00000001970) #22 Armadillo MODERN SPECIES 4320 TENM3 (ENSDNOG00000002206) DCTD (ENSDNOG00000000721) WWC2 (ENSDNOG00000017252) ENSDNOG00000017257 ENSDNOG00000017259 CDKN2AIP (ENSDNOG00000046935) ING2 (ENSDNOG00000003916) RWDD4 (ENSDNOG00000015132) TRAPPC11 (ENSDNOG00000015134) ENSDNOG00000047151 STOX2 (ENSDNOG00000035487) #22 ENPP6 (ENSDNOG00000044618) ENSDNOG00000047773 IRF2 (ENSDNOG00000048203) ENSDNOG00000043542 CASP3 (ENSDNOG00000013931) #21 PRIMPOL (ENSDNOG00000006785) ENSDNOG00000006803 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 Elephant MODERN SPECIES 355 ASB5 (ENSLAFG00000014665) SPCS3 (ENSLAFG00000010193) VEGFC (ENSLAFG00000009460) NEIL3 (ENSLAFG00000014165) AGA (ENSLAFG00000005742) ENSLAFG00000029165 ENSLAFG00000015906 DCTD (ENSLAFG00000018439) WWC2 (ENSLAFG00000007253) ENSLAFG00000007255 ENSLAFG00000007256 CDKN2AIP (ENSLAFG00000009239) ING2 (ENSLAFG00000014542) ENSLAFG00000003031 TRAPPC11 (ENSLAFG00000003032) STOX2 (ENSLAFG00000012095) #22 ENPP6 (ENSLAFG00000012099) IRF2 (ENSLAFG00000000088) CASP3 (ENSLAFG00000010657) #21 PRIMPOL (ENSLAFG00000013253) ENSLAFG00000021902 Hyrax MODERN SPECIES 5659 STOX2 (ENSPCAG00000013408) #22 Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 16705 ENSETEG00000002223 #22 Tenrec MODERN SPECIES 6675 STOX2 (ENSETEG00000001569) #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT01050000246068 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT01050000246068 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Primates ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01040000240547 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01040000240547 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00910000147189 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158602 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00730000111223.j ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00910000147189 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00910000147597 ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194.c ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00730000111223.j ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00910000147189 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00910000147597 ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194.c ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00730000111223.j ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00910000147189 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00910000147597 ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00390000010285.c.ac ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194.c ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00730000111223.j ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00910000147189 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 Gorilla MODERN SPECIES 17 ASB5 (ENSGGOG00000009089) SPCS3 (ENSGGOG00000023323) ENSGGOG00000040176 NEIL3 (ENSGGOG00000016799) AGA (ENSGGOG00000007600) TENM3 (ENSGGOG00000011344) DCTD (ENSGGOG00000016412) ENSGGOG00000038808 WWC2 (ENSGGOG00000009849) CLDN22 (ENSGGOG00000043233) CLDN24 (ENSGGOG00000043794) CDKN2AIP (ENSGGOG00000022072) ING2 (ENSGGOG00000041782) RWDD4 (ENSGGOG00000011982) ENSGGOG00000036530 STOX2 (ENSGGOG00000013917) #22 IRF2 (ENSGGOG00000016559) ENSGGOG00000036205 CASP3 (ENSGGOG00000025155) #21 ENSGGOG00000011879 CENPU (ENSGGOG00000011892) ACSL1 (ENSGGOG00000009966) ENSGGOG00000041709 ENSGGOG00000001324 SLC25A4 (ENSGGOG00000010437) CFAP97 (ENSGGOG00000007515) SNX25 (ENSGGOG00000017161) LRP2BP (ENSGGOG00000002817) ANKRD37 (ENSGGOG00000004850) UFSP2 (ENSGGOG00000004851) C4orf47 (ENSGGOG00000027706) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00390000010285.c.ac ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194.c ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00730000111223.j ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00910000147189 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 Human MODERN SPECIES 16 SPATA4 (ENSG00000150628) ASB5 (ENSG00000164122) SPCS3 (ENSG00000129128) VEGFC (ENSG00000150630) NEIL3 (ENSG00000109674) AGA (ENSG00000038002) TENM3 (ENSG00000218336) DCTD (ENSG00000129187) WWC2 (ENSG00000151718) CLDN22 (ENSG00000177300) CLDN24 (ENSG00000185758) CDKN2AIP (ENSG00000168564) ING2 (ENSG00000168556) RWDD4 (ENSG00000182552) TRAPPC11 (ENSG00000168538) STOX2 (ENSG00000173320) #22 ENPP6 (ENSG00000164303) IRF2 (ENSG00000168310) CASP3 (ENSG00000164305) #21 PRIMPOL (ENSG00000164306) CENPU (ENSG00000151725) ACSL1 (ENSG00000151726) HELT (ENSG00000187821) SLC25A4 (ENSG00000151729) CFAP97 (ENSG00000164323) SNX25 (ENSG00000109762) LRP2BP (ENSG00000109771) ANKRD37 (ENSG00000186352) UFSP2 (ENSG00000109775) C4orf47 (ENSG00000205129) CCDC110 (ENSG00000168491) Pan ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00390000010285.c.ac ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00950000186328 ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194.c ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00730000111223.j ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00910000147189 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 Chimpanzee MODERN SPECIES 17 SPCS3 (ENSPTRG00000016615) VEGFC (ENSPTRG00000016616) NEIL3 (ENSPTRG00000016617) AGA (ENSPTRG00000016618) TENM3 (ENSPTRG00000016622) DCTD (ENSPTRG00000016624) ENSPTRG00000050006 WWC2 (ENSPTRG00000016626) ENSPTRG00000044853 CLDN22 (ENSPTRG00000016627) CLDN24 (ENSPTRG00000016628) CDKN2AIP (ENSPTRG00000016629) ING2 (ENSPTRG00000016631) RWDD4 (ENSPTRG00000016632) TRAPPC11 (ENSPTRG00000016633) STOX2 (ENSPTRG00000016634) #22 ENPP6 (ENSPTRG00000016636) IRF2 (ENSPTRG00000050798) ENSPTRG00000049340 CASP3 (ENSPTRG00000016640) #21 PRIMPOL (ENSPTRG00000016642) CENPU (ENSPTRG00000016643) ACSL1 (ENSPTRG00000016644) ENSPTRG00000047913 ENSPTRG00000044593 SLC25A4 (ENSPTRG00000016646) CFAP97 (ENSPTRG00000016647) SNX25 (ENSPTRG00000016649) LRP2BP (ENSPTRG00000016650) ANKRD37 (ENSPTRG00000016651) UFSP2 (ENSPTRG00000016652) Bonobo MODERN SPECIES 17 ASB5 (ENSPPAG00000034799) ENSPPAG00000035990 VEGFC (ENSPPAG00000043349) NEIL3 (ENSPPAG00000035318) AGA (ENSPPAG00000036906) TENM3 (ENSPPAG00000038117) DCTD (ENSPPAG00000022425) ENSPPAG00000037373 WWC2 (ENSPPAG00000040062) ENSPPAG00000021015 CLDN24 (ENSPPAG00000034097) CDKN2AIP (ENSPPAG00000040121) ING2 (ENSPPAG00000042163) RWDD4 (ENSPPAG00000041963) TRAPPC11 (ENSPPAG00000028586) STOX2 (ENSPPAG00000019640) #22 ENPP6 (ENSPPAG00000034444) IRF2 (ENSPPAG00000034580) CASP3 (ENSPPAG00000029792) #21 ENSPPAG00000038308 CENPU (ENSPPAG00000041105) ACSL1 (ENSPPAG00000035756) ENSPPAG00000043956 ENSPPAG00000040586 SLC25A4 (ENSPPAG00000037709) CFAP97 (ENSPPAG00000029614) SNX25 (ENSPPAG00000031176) LRP2BP (ENSPPAG00000042897) ANKRD37 (ENSPPAG00000034201) UFSP2 (ENSPPAG00000040151) C4orf47 (ENSPPAG00000022550) Orangutan MODERN SPECIES 17 SPATA4 (ENSPPYG00000015216) ASB5 (ENSPPYG00000015217) SPCS3 (ENSPPYG00000038635) VEGFC (ENSPPYG00000015219) NEIL3 (ENSPPYG00000040336) AGA (ENSPPYG00000015220) TENM3 (ENSPPYG00000029729) ENSPPYG00000015223 WWC2 (ENSPPYG00000015224) CLDN22 (ENSPPYG00000015225) CLDN24 (ENSPPYG00000015226) CDKN2AIP (ENSPPYG00000015228) ING2 (ENSPPYG00000015229) RWDD4 (ENSPPYG00000015230) TRAPPC11 (ENSPPYG00000015231) STOX2 (ENSPPYG00000015232) #22 ENPP6 (ENSPPYG00000015233) ENSPPYG00000033949 IRF2 (ENSPPYG00000036054) CASP3 (ENSPPYG00000037417) #21 PRIMPOL (ENSPPYG00000015237) CENPU (ENSPPYG00000015238) ACSL1 (ENSPPYG00000015239) ENSPPYG00000015241 SLC25A4 (ENSPPYG00000037131) ENSPPYG00000015242 CFAP97 (ENSPPYG00000015243) SNX25 (ENSPPYG00000015244) LRP2BP (ENSPPYG00000015245) ANKRD37 (ENSPPYG00000015246) UFSP2 (ENSPPYG00000015247) Gibbon MODERN SPECIES 22 ENSNLEG00000016805 VEGFC (ENSNLEG00000016806) NEIL3 (ENSNLEG00000016818) AGA (ENSNLEG00000016825) TENM3 (ENSNLEG00000010584) ENSNLEG00000033001 DCTD (ENSNLEG00000032116) WWC2 (ENSNLEG00000010629) CLDN22 (ENSNLEG00000018867) CLDN24 (ENSNLEG00000018868) CDKN2AIP (ENSNLEG00000010720) ENSNLEG00000033474 ING2 (ENSNLEG00000035063) RWDD4 (ENSNLEG00000034868) TRAPPC11 (ENSNLEG00000010773) STOX2 (ENSNLEG00000010803) #22 ENPP6 (ENSNLEG00000029143) IRF2 (ENSNLEG00000010848) ENSNLEG00000034282 CASP3 (ENSNLEG00000010895) #21 ENSNLEG00000010919 CENPU (ENSNLEG00000010967) ACSL1 (ENSNLEG00000011041) ENSNLEG00000028403 ENSNLEG00000011136 ENSNLEG00000011139 ENSNLEG00000033110 CFAP97 (ENSNLEG00000011148) ENSNLEG00000011147 LRP2BP (ENSNLEG00000011151) ANKRD37 (ENSNLEG00000033516) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158602 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00730000111223.j ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00910000147597 ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00910000147597 ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT00940000158376 ENSGT00910000147875 ENSGT00950000183192.a.a.y.b.b ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b.n #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00910000147597 ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT00940000158376 ENSGT00910000147875 ENSGT00950000183192.a.a.y.b.b ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b.n #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00910000147597 ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT00940000158376 ENSGT00910000147875 ENSGT00950000183192.a.a.y.b.b ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b.n #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00910000147597 ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Sooty mangabey MODERN SPECIES 272 VEGFC (ENSCATG00000040718) NEIL3 (ENSCATG00000033777) AGA (ENSCATG00000038636) ENSCATG00000024803 TENM3 (ENSCATG00000040062) DCTD (ENSCATG00000035278) CLDN22 (ENSCATG00000020839) WWC2 (ENSCATG00000036789) CLDN24 (ENSCATG00000005875) CDKN2AIP (ENSCATG00000018192) ENSCATG00000039580 ENSCATG00000030466 ING2 (ENSCATG00000038558) RWDD4 (ENSCATG00000034736) TRAPPC11 (ENSCATG00000004022) STOX2 (ENSCATG00000014156) #22 ENPP6 (ENSCATG00000037936) ENSCATG00000037804 ENSCATG00000029430 #21 PRIMPOL (ENSCATG00000038976) CENPU (ENSCATG00000042276) ACSL1 (ENSCATG00000028002) Drill MODERN SPECIES 1335 TENM3 (ENSMLEG00000033352) DCTD (ENSMLEG00000037100) WWC2 (ENSMLEG00000038028) CLDN22 (ENSMLEG00000027406) CLDN24 (ENSMLEG00000027914) CDKN2AIP (ENSMLEG00000034996) ENSMLEG00000031893 ENSMLEG00000028024 ING2 (ENSMLEG00000003125) RWDD4 (ENSMLEG00000031916) TRAPPC11 (ENSMLEG00000038322) STOX2 (ENSMLEG00000038095) #22 ENPP6 (ENSMLEG00000028275) IRF2 (ENSMLEG00000033644) CASP3 (ENSMLEG00000028788) #21 PRIMPOL (ENSMLEG00000044062) CENPU (ENSMLEG00000043104) ACSL1 (ENSMLEG00000041282) HELT (ENSMLEG00000039682) SLC25A4 (ENSMLEG00000015212) ENSMLEG00000021195 CFAP97 (ENSMLEG00000031537) SNX25 (ENSMLEG00000035243) LRP2BP (ENSMLEG00000038048) ANKRD37 (ENSMLEG00000032785) UFSP2 (ENSMLEG00000044359) C4orf47 (ENSMLEG00000039083) Olive baboon MODERN SPECIES 13 TENM3 (ENSPANG00000000764) ENSPANG00000045902 DCTD (ENSPANG00000018020) ENSPANG00000040899 ENSPANG00000050861 CLDN22 (ENSPANG00000006467) CLDN24 (ENSPANG00000004497) ENSPANG00000040919 ENSPANG00000048078 CDKN2AIP (ENSPANG00000024476) ENSPANG00000049160 ING2 (ENSPANG00000009492) RWDD4 (ENSPANG00000015801) TRAPPC11 (ENSPANG00000014290) ENSPANG00000049838 STOX2 (ENSPANG00000001074) #22 ENPP6 (ENSPANG00000009066) IRF2 (ENSPANG00000013763) CASP3 (ENSPANG00000023340) #21 PRIMPOL (ENSPANG00000007055) CENPU (ENSPANG00000020226) ACSL1 (ENSPANG00000013760) HELT (ENSPANG00000008749) SLC25A4 (ENSPANG00000022114) CFAP97 (ENSPANG00000021866) SNX25 (ENSPANG00000006290) LRP2BP (ENSPANG00000008049) ANKRD37 (ENSPANG00000021942) UFSP2 (ENSPANG00000009592) C4orf47 (ENSPANG00000000980) CCDC110 (ENSPANG00000031109) Macaca ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT00940000158376 ENSGT00910000147875 ENSGT00950000183192.a.a.y.b.b ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b.m.a #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00910000147597 ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 375 ASB5 (ENSMNEG00000034889) SPCS3 (ENSMNEG00000036272) VEGFC (ENSMNEG00000045119) NEIL3 (ENSMNEG00000036177) AGA (ENSMNEG00000037318) TENM3 (ENSMNEG00000030271) DCTD (ENSMNEG00000033220) WWC2 (ENSMNEG00000034065) CLDN22 (ENSMNEG00000042661) CDKN2AIP (ENSMNEG00000032207) ENSMNEG00000023135 ENSMNEG00000036223 ING2 (ENSMNEG00000045559) RWDD4 (ENSMNEG00000029331) TRAPPC11 (ENSMNEG00000043814) STOX2 (ENSMNEG00000044751) #22 ENPP6 (ENSMNEG00000035672) IRF2 (ENSMNEG00000034903) ENSMNEG00000018721 #21 PRIMPOL (ENSMNEG00000032646) CENPU (ENSMNEG00000034713) ACSL1 (ENSMNEG00000023458) HELT (ENSMNEG00000033885) SLC25A4 (ENSMNEG00000034329) ENSMNEG00000022238 CFAP97 (ENSMNEG00000034867) SNX25 (ENSMNEG00000030572) LRP2BP (ENSMNEG00000027242) ANKRD37 (ENSMNEG00000037694) UFSP2 (ENSMNEG00000012364) C4orf47 (ENSMNEG00000044226) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161627.a.a.a.a.b.a.a.b.a.a.a.a.a.a.a.b.b.b.d.a.a ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01100000263539.b.a.a.a.a.a.b.b.a.a.b.a.b.a.a.a.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.a ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b.n #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00910000147597 ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000170471.I.a.a.a ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 Rhesus MODERN SPECIES 15 ENSMMUG00000059103 ENSMMUG00000058974 TENM3 (ENSMMUG00000007240) DCTD (ENSMMUG00000000284) WWC2 (ENSMMUG00000015748) CLDN22 (ENSMMUG00000015745) CLDN24 (ENSMMUG00000030008) ENSMMUG00000055157 ENSMMUG00000049670 CDKN2AIP (ENSMMUG00000002004) ING2 (ENSMMUG00000008881) RWDD4 (ENSMMUG00000023650) TRAPPC11 (ENSMMUG00000023651) ENSMMUG00000053358 ENSMMUG00000049655 STOX2 (ENSMMUG00000004898) #22 ENPP6 (ENSMMUG00000016747) IRF2 (ENSMMUG00000015087) CASP3 (ENSMMUG00000012053) #21 PRIMPOL (ENSMMUG00000012175) CENPU (ENSMMUG00000012176) ACSL1 (ENSMMUG00000012177) ENSMMUG00000050213 ENSMMUG00000054060 HELT (ENSMMUG00000001081) ENSMMUG00000061064 SLC25A4 (ENSMMUG00000015472) CFAP97 (ENSMMUG00000015473) SNX25 (ENSMMUG00000003518) LRP2BP (ENSMMUG00000003519) ENSMMUG00000062057 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 15 AGA (ENSMFAG00000003729) ENSMFAG00000054145 ENSMFAG00000056147 ENSMFAG00000001427 DCTD (ENSMFAG00000034653) WWC2 (ENSMFAG00000033741) CLDN22 (ENSMFAG00000012673) CLDN24 (ENSMFAG00000008066) ENSMFAG00000064058 CDKN2AIP (ENSMFAG00000046173) ING2 (ENSMFAG00000032816) ENSMFAG00000052775 ENSMFAG00000000543 TRAPPC11 (ENSMFAG00000039616) ENSMFAG00000057408 STOX2 (ENSMFAG00000044376) #22 ENSMFAG00000049104 ENSMFAG00000058210 ENPP6 (ENSMFAG00000038701) IRF2 (ENSMFAG00000039751) CASP3 (ENSMFAG00000036969) #21 PRIMPOL (ENSMFAG00000000469) CENPU (ENSMFAG00000043328) ENSMFAG00000055773 ACSL1 (ENSMFAG00000033716) HELT (ENSMFAG00000039500) ENSMFAG00000050266 SLC25A4 (ENSMFAG00000032688) ENSMFAG00000064346 CFAP97 (ENSMFAG00000007379) SNX25 (ENSMFAG00000037789) Vervet Monkey MODERN SPECIES 26 SPCS3 (ENSCSAG00000003075) VEGFC (ENSCSAG00000003070) ENSCSAG00000003067 NEIL3 (ENSCSAG00000003064) AGA (ENSCSAG00000003060) ENSCSAG00000003051 TENM3 (ENSCSAG00000003045) DCTD (ENSCSAG00000003039) WWC2 (ENSCSAG00000003034) CLDN22 (ENSCSAG00000000096) CLDN24 (ENSCSAG00000000094) CDKN2AIP (ENSCSAG00000003030) ING2 (ENSCSAG00000003025) RWDD4 (ENSCSAG00000003024) TRAPPC11 (ENSCSAG00000003019) STOX2 (ENSCSAG00000003014) #22 ENPP6 (ENSCSAG00000003012) IRF2 (ENSCSAG00000003010) CASP3 (ENSCSAG00000003002) #21 PRIMPOL (ENSCSAG00000002998) CENPU (ENSCSAG00000002994) ACSL1 (ENSCSAG00000002990) ENSCSAG00000002985 HELT (ENSCSAG00000002982) SLC25A4 (ENSCSAG00000002980) CFAP97 (ENSCSAG00000002977) SNX25 (ENSCSAG00000002975) LRP2BP (ENSCSAG00000002972) ANKRD37 (ENSCSAG00000002969) UFSP2 (ENSCSAG00000002968) C4orf47 (ENSCSAG00000002963) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000158376 ENSGT00940000167225 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00730000111223.j ENSGT00940000153232.a.b.l #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2045 WWC2 (ENSRROG00000008042) CLDN22 (ENSRROG00000026507) CDKN2AIP (ENSRROG00000029416) ENSRROG00000041611 ING2 (ENSRROG00000032306) RWDD4 (ENSRROG00000035896) TRAPPC11 (ENSRROG00000045269) STOX2 (ENSRROG00000035129) #22 ENPP6 (ENSRROG00000022161) IRF2 (ENSRROG00000002645) ENSRROG00000044348 ENSRROG00000032729 #21 PRIMPOL (ENSRROG00000043287) CENPU (ENSRROG00000000140) ACSL1 (ENSRROG00000041468) HELT (ENSRROG00000034207) SLC25A4 (ENSRROG00000035238) CFAP97 (ENSRROG00000042997) SNX25 (ENSRROG00000034030) LRP2BP (ENSRROG00000042551) ANKRD37 (ENSRROG00000032992) UFSP2 (ENSRROG00000032232) C4orf47 (ENSRROG00000032521) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1685 ENSRBIG00000039333 TENM3 (ENSRBIG00000037111) DCTD (ENSRBIG00000044833) WWC2 (ENSRBIG00000040787) CDKN2AIP (ENSRBIG00000037956) ENSRBIG00000042448 ING2 (ENSRBIG00000010666) ENSRBIG00000005434 RWDD4 (ENSRBIG00000036803) TRAPPC11 (ENSRBIG00000033668) STOX2 (ENSRBIG00000027490) #22 ENPP6 (ENSRBIG00000025238) IRF2 (ENSRBIG00000039482) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223.hb ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b.o.a #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00910000147189 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223.hb ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234.z ENSGT00940000162234.y ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b.o.a #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00910000147189 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00390000006915.d ENSGT00940000158602 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223.hb ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b.o.a #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00910000147189 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 102 SPATA4 (ENSSBOG00000028949) ASB5 (ENSSBOG00000033408) SPCS3 (ENSSBOG00000019414) VEGFC (ENSSBOG00000033122) NEIL3 (ENSSBOG00000032601) AGA (ENSSBOG00000023573) TENM3 (ENSSBOG00000033110) DCTD (ENSSBOG00000015125) ENSSBOG00000026812 ENSSBOG00000024426 WWC2 (ENSSBOG00000016007) CDKN2AIP (ENSSBOG00000017285) ING2 (ENSSBOG00000028567) RWDD4 (ENSSBOG00000019970) TRAPPC11 (ENSSBOG00000001467) STOX2 (ENSSBOG00000022049) #22 ENPP6 (ENSSBOG00000025699) IRF2 (ENSSBOG00000023860) ENSSBOG00000020561 CASP3 (ENSSBOG00000022394) #21 PRIMPOL (ENSSBOG00000020714) CENPU (ENSSBOG00000028087) ENSSBOG00000022081 ACSL1 (ENSSBOG00000028991) HELT (ENSSBOG00000021368) SLC25A4 (ENSSBOG00000027664) CFAP97 (ENSSBOG00000026555) SNX25 (ENSSBOG00000017576) LRP2BP (ENSSBOG00000021810) ENSSBOG00000023318 UFSP2 (ENSSBOG00000023622) Capuchin MODERN SPECIES 365 STOX2 (ENSCCAG00000025743) #22 ENPP6 (ENSCCAG00000018542) IRF2 (ENSCCAG00000027111) ENSCCAG00000021322 ENSCCAG00000032330 #21 ENSCCAG00000025472 CENPU (ENSCCAG00000022339) ACSL1 (ENSCCAG00000034757) ENSCCAG00000025838 HELT (ENSCCAG00000008784) SLC25A4 (ENSCCAG00000034781) CFAP97 (ENSCCAG00000028043) SNX25 (ENSCCAG00000022976) LRP2BP (ENSCCAG00000036785) UFSP2 (ENSCCAG00000005498) ENSCCAG00000025140 Marmoset MODERN SPECIES 15 ENSCJAG00000053898 ENSCJAG00000040263 ENSCJAG00000054220 TENM3 (ENSCJAG00000005501) ENSCJAG00000070774 DCTD (ENSCJAG00000005526) ENSCJAG00000078649 WWC2 (ENSCJAG00000005554) CLDN22 (ENSCJAG00000005586) CLDN24 (ENSCJAG00000044314) CDKN2AIP (ENSCJAG00000005591) ING2 (ENSCJAG00000005602) ENSCJAG00000063903 RWDD4 (ENSCJAG00000045540) TRAPPC11 (ENSCJAG00000005616) STOX2 (ENSCJAG00000005690) #22 ENSCJAG00000085011 ENPP6 (ENSCJAG00000005711) IRF2 (ENSCJAG00000042693) ENSCJAG00000082734 CASP3 (ENSCJAG00000005740) #21 PRIMPOL (ENSCJAG00000005747) CENPU (ENSCJAG00000044593) ENSCJAG00000022314 ACSL1 (ENSCJAG00000005780) ENSCJAG00000084059 ENSCJAG00000086648 HELT (ENSCJAG00000005863) ENSCJAG00000086461 SLC25A4 (ENSCJAG00000076040) CFAP97 (ENSCJAG00000005867) Mas night monkey MODERN SPECIES 1220 TENM3 (ENSANAG00000029299) DCTD (ENSANAG00000026089) WWC2 (ENSANAG00000029107) ENSANAG00000031052 CDKN2AIP (ENSANAG00000024642) ING2 (ENSANAG00000035100) RWDD4 (ENSANAG00000028135) TRAPPC11 (ENSANAG00000023094) STOX2 (ENSANAG00000028743) #22 ENPP6 (ENSANAG00000032373) IRF2 (ENSANAG00000029650) CASP3 (ENSANAG00000025074) #21 ENSANAG00000028520 Tarsier MODERN SPECIES 2418 STOX2 (ENSTSYG00000008549) #22 ENPP6 (ENSTSYG00000005647) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01040000240547 Bushbaby MODERN SPECIES 176 SPATA4 (ENSOGAG00000012224) ASB5 (ENSOGAG00000012227) SPCS3 (ENSOGAG00000003825) VEGFC (ENSOGAG00000003828) NEIL3 (ENSOGAG00000012624) AGA (ENSOGAG00000015190) ENSOGAG00000032766 ENSOGAG00000024359 ENSOGAG00000005872 DCTD (ENSOGAG00000000583) WWC2 (ENSOGAG00000011913) CDKN2AIP (ENSOGAG00000026622) ING2 (ENSOGAG00000016707) RWDD4 (ENSOGAG00000016709) TRAPPC11 (ENSOGAG00000027550) STOX2 (ENSOGAG00000004800) #22 ENPP6 (ENSOGAG00000004801) IRF2 (ENSOGAG00000010966) CASP3 (ENSOGAG00000005985) #21 ENSOGAG00000031064 PRIMPOL (ENSOGAG00000001687) ACSL1 (ENSOGAG00000001689) HELT (ENSOGAG00000015934) ENSOGAG00000028514 SLC25A4 (ENSOGAG00000012904) ENSOGAG00000030937 SNX25 (ENSOGAG00000013059) LRP2BP (ENSOGAG00000013064) UFSP2 (ENSOGAG00000014660) C4orf47 (ENSOGAG00000014665) CCDC110 (ENSOGAG00000029342) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01040000240547 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 96 ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01040000240547 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 293 STOX2 (ENSPCOG00000022143) #22 ENPP6 (ENSPCOG00000020685) IRF2 (ENSPCOG00000015845) CASP3 (ENSPCOG00000020734) #21 CENPU (ENSPCOG00000026801) ACSL1 (ENSPCOG00000018988) HELT (ENSPCOG00000020612) ENSPCOG00000012638 SLC25A4 (ENSPCOG00000027766) CFAP97 (ENSPCOG00000003005) SNX25 (ENSPCOG00000023167) LRP2BP (ENSPCOG00000025080) ANKRD37 (ENSPCOG00000028288) UFSP2 (ENSPCOG00000020721) C4orf47 (ENSPCOG00000018395) ENSPCOG00000020811 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 934 TENM3 (ENSPSMG00000024532) ENSPSMG00000024534 DCTD (ENSPSMG00000024537) WWC2 (ENSPSMG00000024556) ENSPSMG00000024565 CDKN2AIP (ENSPSMG00000024567) ENSPSMG00000024569 ING2 (ENSPSMG00000024574) RWDD4 (ENSPSMG00000024594) TRAPPC11 (ENSPSMG00000024637) STOX2 (ENSPSMG00000024652) #22 ENPP6 (ENSPSMG00000024655) IRF2 (ENSPSMG00000024663) CASP3 (ENSPSMG00000024671) #21 PRIMPOL (ENSPSMG00000024702) CENPU (ENSPSMG00000024713) ACSL1 (ENSPSMG00000024862) HELT (ENSPSMG00000024925) SLC25A4 (ENSPSMG00000024929) CFAP97 (ENSPSMG00000024934) SNX25 (ENSPSMG00000024965) LRP2BP (ENSPSMG00000024973) ANKRD37 (ENSPSMG00000024978) UFSP2 (ENSPSMG00000024995) C4orf47 (ENSPSMG00000024999) CCDC110 (ENSPSMG00000025010) Mouse lemur MODERN SPECIES 5 WDR17 (ENSMICG00000001970) SPATA4 (ENSMICG00000001985) ASB5 (ENSMICG00000035551) SPCS3 (ENSMICG00000045665) VEGFC (ENSMICG00000031537) NEIL3 (ENSMICG00000009147) AGA (ENSMICG00000009153) ENSMICG00000035005 ENSMICG00000035656 ENSMICG00000035945 WWC2 (ENSMICG00000014921) CDKN2AIP (ENSMICG00000047516) ING2 (ENSMICG00000001324) RWDD4 (ENSMICG00000000687) TRAPPC11 (ENSMICG00000000688) STOX2 (ENSMICG00000015479) #22 ENPP6 (ENSMICG00000015491) IRF2 (ENSMICG00000015506) ENSMICG00000004809 #21 PRIMPOL (ENSMICG00000004817) CENPU (ENSMICG00000013084) ACSL1 (ENSMICG00000013092) HELT (ENSMICG00000013610) ENSMICG00000036935 SLC25A4 (ENSMICG00000006136) CFAP97 (ENSMICG00000010870) SNX25 (ENSMICG00000010874) LRP2BP (ENSMICG00000010882) ANKRD37 (ENSMICG00000010885) ENSMICG00000010888 C4orf47 (ENSMICG00000030821) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT01050000246068 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Tree shrew MODERN SPECIES 3918 STOX2 (ENSTBEG00000012273) #22 ENPP6 (ENSTBEG00000012366) Glires ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT01050000246068 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01040000240547 Pika MODERN SPECIES 3491 STOX2 (ENSOPRG00000005374) #22 ENPP6 (ENSOPRG00000005378) IRF2 (ENSOPRG00000005398) Rabbit MODERN SPECIES 11 ENSOCUG00000023661 NEIL3 (ENSOCUG00000001040) ENSOCUG00000022964 AGA (ENSOCUG00000002031) ENSOCUG00000022735 ENSOCUG00000028118 TENM3 (ENSOCUG00000007616) DCTD (ENSOCUG00000004708) WWC2 (ENSOCUG00000016984) ENSOCUG00000034698 ENSOCUG00000033632 CDKN2AIP (ENSOCUG00000005491) ING2 (ENSOCUG00000011812) RWDD4 (ENSOCUG00000025497) TRAPPC11 (ENSOCUG00000010179) STOX2 (ENSOCUG00000009718) #22 ENPP6 (ENSOCUG00000011944) IRF2 (ENSOCUG00000009229) CASP3 (ENSOCUG00000006627) #21 ENSOCUG00000003897 CENPU (ENSOCUG00000003903) ENSOCUG00000037500 ENSOCUG00000037022 ENSOCUG00000005617 HELT (ENSOCUG00000009448) SLC25A4 (ENSOCUG00000002594) CFAP97 (ENSOCUG00000002591) SNX25 (ENSOCUG00000012354) LRP2BP (ENSOCUG00000012365) ANKRD37 (ENSOCUG00000012369) UFSP2 (ENSOCUG00000012375) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT01050000246068 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263778 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 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ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263778 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b.g ENSGT00940000162234 ENSGT00940000161922.i.b.h ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263778 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b 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ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263778 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Spata4 (ENSCGRG00001012374) Asb5 (ENSCGRG00001013169) Spcs3 (ENSCGRG00001013944) Vegfc (ENSCGRG00001014310) Neil3 (ENSCGRG00001018596) Aga (ENSCGRG00001019108) Tenm3 (ENSCGRG00001021107) Dctd (ENSCGRG00001016053) Wwc2 (ENSCGRG00001016882) ENSCGRG00001015210 Cdkn2aip (ENSCGRG00001016194) Ing2 (ENSCGRG00001017801) Rwdd4a (ENSCGRG00001018945) Trappc11 (ENSCGRG00001018304) ENSCGRG00001003901 Stox2 (ENSCGRG00001013096) #22 Enpp6 (ENSCGRG00001013812) ENSCGRG00001014136 Irf2 (ENSCGRG00001014578) CASP 3 (ENSCGRG00001015469) #21 Primpol (ENSCGRG00001016107) Cenpu (ENSCGRG00001024299) Acsl1 (ENSCGRG00001012242) Helt (ENSCGRG00001013119) ENSCGRG00001003795 Slc25a4 (ENSCGRG00001007127) Cfap97 (ENSCGRG00001012133) Snx25 (ENSCGRG00001013747) Lrp2bp (ENSCGRG00001005458) Ankrd37 (ENSCGRG00001015273) Ufsp2 (ENSCGRG00001016637) Golden Hamster MODERN SPECIES 624 Spcs3 (ENSMAUG00000010908) Vegfc (ENSMAUG00000022111) ENSMAUG00000018923 ENSMAUG00000010963 ENSMAUG00000019767 Dctd (ENSMAUG00000015286) ENSMAUG00000018016 ENSMAUG00000020907 ENSMAUG00000019841 Cldn22 (ENSMAUG00000009702) Cldn24 (ENSMAUG00000022185) ENSMAUG00000019930 Ing2 (ENSMAUG00000012553) Rwdd4a (ENSMAUG00000001169) Trappc11 (ENSMAUG00000009056) Stox2 (ENSMAUG00000019263) #22 Enpp6 (ENSMAUG00000007201) Irf2 (ENSMAUG00000009382) Casp3 (ENSMAUG00000004837) #21 Cenpu (ENSMAUG00000006619) Acsl1 (ENSMAUG00000008881) Helt (ENSMAUG00000021096) Slc25a4 (ENSMAUG00000018790) Cfap97 (ENSMAUG00000014869) Snx25 (ENSMAUG00000013432) Lrp2bp (ENSMAUG00000008998) Ankrd37 (ENSMAUG00000019083) ENSMAUG00000015958 1700029J07Rik (ENSMAUG00000021203) Ccdc110 (ENSMAUG00000019990) Pdlim3 (ENSMAUG00000010651) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b.g ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263778 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 8 Spcs3 (ENSPEMG00000029258) Vegfc (ENSPEMG00000017806) Neil3 (ENSPEMG00000016548) Aga (ENSPEMG00000025796) ENSPEMG00000027794 ENSPEMG00000029482 Tenm3 (ENSPEMG00000017497) Dctd 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ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376.n ENSGT00940000158376.m ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT01050000246068 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000006915.d ENSGT00940000158602 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000158376.m ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 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ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 110 GPM6A (ENSCLAG00000017285) WDR17 (ENSCLAG00000016000) SPATA4 (ENSCLAG00000011629) ASB5 (ENSCLAG00000011261) SPCS3 (ENSCLAG00000015410) VEGFC (ENSCLAG00000013066) NEIL3 (ENSCLAG00000015661) AGA (ENSCLAG00000014580) TENM3 (ENSCLAG00000013736) DCTD (ENSCLAG00000012757) WWC2 (ENSCLAG00000012066) CDKN2AIP (ENSCLAG00000012072) ING2 (ENSCLAG00000014843) RWDD4 (ENSCLAG00000014148) TRAPPC11 (ENSCLAG00000016148) STOX2 (ENSCLAG00000015001) #22 ENPP6 (ENSCLAG00000012884) IRF2 (ENSCLAG00000015934) ENSCLAG00000014245 #21 PRIMPOL (ENSCLAG00000012642) CENPU (ENSCLAG00000011512) ACSL1 (ENSCLAG00000012854) HELT (ENSCLAG00000013564) SLC25A4 (ENSCLAG00000012368) CFAP97 (ENSCLAG00000013411) SNX25 (ENSCLAG00000012397) LRP2BP (ENSCLAG00000013468) ANKRD37 (ENSCLAG00000011545) UFSP2 (ENSCLAG00000012131) C4orf47 (ENSCLAG00000011416) CCDC110 (ENSCLAG00000011136) Degu MODERN SPECIES 155 TPD52 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ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263778 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b.e ENSGT00940000161922.i.b.f ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545.u ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b.y.a #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01040000240547 Alpin marmot MODERN SPECIES 17 SPATA4 (ENSMMMG00000012880) ASB5 (ENSMMMG00000012874) ENSMMMG00000012853 VEGFC (ENSMMMG00000012828) NEIL3 (ENSMMMG00000012802) AGA 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ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b.y.a #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263778 Squirrel MODERN SPECIES 154 ENSSTOG00000022358 ENSSTOG00000002858 ZNF488 (ENSSTOG00000015147) RBP3 (ENSSTOG00000023149) GDF2 (ENSSTOG00000028739) GDF10 (ENSSTOG00000025106) TENM3 (ENSSTOG00000012468) DCTD (ENSSTOG00000005462) WWC2 (ENSSTOG00000014261) ENSSTOG00000027326 ENSSTOG00000027686 CDKN2AIP (ENSSTOG00000027051) ING2 (ENSSTOG00000014291) ENSSTOG00000013086 TRAPPC11 (ENSSTOG00000013088) STOX2 (ENSSTOG00000016497) #22 ENPP6 (ENSSTOG00000016502) IRF2 (ENSSTOG00000003228) ENSSTOG00000003865 #21 PRIMPOL (ENSSTOG00000004912) CENPU (ENSSTOG00000034632) ACSL1 (ENSSTOG00000009009) HELT (ENSSTOG00000009054) SLC25A4 (ENSSTOG00000024682) CFAP97 (ENSSTOG00000010864) SNX25 (ENSSTOG00000013013) LRP2BP (ENSSTOG00000013024) ANKRD37 (ENSSTOG00000013029) UFSP2 (ENSSTOG00000013037) C4orf47 (ENSSTOG00000028227) ENSSTOG00000022515 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 231 TENM3 (ENSUPAG00010002250) DCTD (ENSUPAG00010002217) WWC2 (ENSUPAG00010002189) ENSUPAG00010002187 ENSUPAG00010002183 CDKN2AIP (ENSUPAG00010002169) ING2 (ENSUPAG00010002161) ENSUPAG00010002132 TRAPPC11 (ENSUPAG00010002107) STOX2 (ENSUPAG00010002101) #22 ENPP6 (ENSUPAG00010002074) IRF2 (ENSUPAG00010002037) ENSUPAG00010002027 ENSUPAG00010002010 CENPU (ENSUPAG00010001999) ACSL1 (ENSUPAG00010001148) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 ASB5 (ENSSVLG00005002993) ENSSVLG00005003064 ENSSVLG00005003081 VEGFC (ENSSVLG00005003095) NEIL3 (ENSSVLG00005003141) AGA (ENSSVLG00005003168) TENM3 (ENSSVLG00005003236) DCTD (ENSSVLG00005003300) WWC2 (ENSSVLG00005003319) ENSSVLG00005003361 ENSSVLG00005003376 CDKN2AIP (ENSSVLG00005003382) ING2 (ENSSVLG00005003400) RWDD4 (ENSSVLG00005003423) TRAPPC11 (ENSSVLG00005003499) ENSSVLG00005003590 #22 ENPP6 (ENSSVLG00005003610) IRF2 (ENSSVLG00005003630) ENSSVLG00005003654 CASP3 (ENSSVLG00005003677) #21 PRIMPOL (ENSSVLG00005003718) ENSSVLG00005003774 ACSL1 (ENSSVLG00005003813) ENSSVLG00005003842 HELT (ENSSVLG00005003859) SLC25A4 (ENSSVLG00005003887) CFAP97 (ENSSVLG00005003904) SNX25 (ENSSVLG00005003954) LRP2BP (ENSSVLG00005004014) ANKRD37 (ENSSVLG00005004043) UFSP2 (ENSSVLG00005004055) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263660 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263660 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A 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ENSGT01100000263660 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223.b ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000171084 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000154037.C.f ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00390000009223.b ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00390000011010.b.h.a.b ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00950000183164.E.c.b.a ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000154037.C.f ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Ursus ANCESTRAL SPECIES 160 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00390000016470.s.a.a ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000154037.C.f ENSGT00940000160388 ENSGT00950000182901.a.a.b.b.a.b.a.b.a.b.b ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b American black bear MODERN SPECIES 1994 STOX2 (ENSUAMG00000015489) #22 ENPP6 (ENSUAMG00000015496) Polar bear MODERN SPECIES 422 STOX2 (ENSUMAG00000013774) #22 ENPP6 (ENSUMAG00000013770) IRF2 (ENSUMAG00000013766) ENSUMAG00000013760 CASP3 (ENSUMAG00000013752) #21 PRIMPOL (ENSUMAG00000013748) CENPU (ENSUMAG00000013733) ACSL1 (ENSUMAG00000013147) ENSUMAG00000013062 ENSUMAG00000013055 SLC25A4 (ENSUMAG00000013049) CFAP97 (ENSUMAG00000013044) SNX25 (ENSUMAG00000013032) LRP2BP (ENSUMAG00000013025) ANKRD37 (ENSUMAG00000013023) UFSP2 (ENSUMAG00000013019) Giant Panda MODERN SPECIES 9 NEIL3 (ENSAMEG00000003715) AGA (ENSAMEG00000003696) ENSAMEG00000030313 TENM3 (ENSAMEG00000007908) ENSAMEG00000007878 DCTD (ENSAMEG00000028421) ENSAMEG00000019360 WWC2 (ENSAMEG00000008133) ENSAMEG00000019395 ENSAMEG00000031514 CDKN2AIP (ENSAMEG00000008216) ENSAMEG00000008262 ING2 (ENSAMEG00000008264) RWDD4 (ENSAMEG00000008268) TRAPPC11 (ENSAMEG00000008280) STOX2 (ENSAMEG00000008361) #22 ENPP6 (ENSAMEG00000008369) IRF2 (ENSAMEG00000008380) ENSAMEG00000026874 CASP3 (ENSAMEG00000008419) #21 PRIMPOL (ENSAMEG00000008468) CENPU (ENSAMEG00000008494) ACSL1 (ENSAMEG00000008506) ENSAMEG00000030230 HELT (ENSAMEG00000030990) SLC25A4 (ENSAMEG00000008743) CFAP97 (ENSAMEG00000008759) SNX25 (ENSAMEG00000005326) LRP2BP (ENSAMEG00000005311) ENSAMEG00000005304 UFSP2 (ENSAMEG00000005281) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000171084 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000154037.C.f ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Ferret MODERN SPECIES 221 ENSMPUG00000010979 TENM3 (ENSMPUG00000010987) ENSMPUG00000011004 DCTD (ENSMPUG00000011016) ENSMPUG00000011025 WWC2 (ENSMPUG00000011033) ENSMPUG00000019942 ENSMPUG00000019943 CDKN2AIP (ENSMPUG00000011042) ING2 (ENSMPUG00000011044) RWDD4 (ENSMPUG00000011048) TRAPPC11 (ENSMPUG00000011056) STOX2 (ENSMPUG00000011066) #22 ENPP6 (ENSMPUG00000011072) IRF2 (ENSMPUG00000011075) ENSMPUG00000011080 CASP3 (ENSMPUG00000011084) #21 PRIMPOL (ENSMPUG00000011092) CENPU (ENSMPUG00000011102) ACSL1 (ENSMPUG00000011108) ENSMPUG00000011119 HELT (ENSMPUG00000011138) SLC25A4 (ENSMPUG00000011147) CFAP97 (ENSMPUG00000011148) SNX25 (ENSMPUG00000011158) LRP2BP (ENSMPUG00000011166) ANKRD37 (ENSMPUG00000011195) UFSP2 (ENSMPUG00000011199) American mink MODERN SPECIES 30 ENSNVIG00000004562 TENM3 (ENSNVIG00000004576) ENSNVIG00000004609 DCTD (ENSNVIG00000004613) WWC2 (ENSNVIG00000004645) ENSNVIG00000004693 ENSNVIG00000004704 CDKN2AIP (ENSNVIG00000004709) ING2 (ENSNVIG00000004724) RWDD4 (ENSNVIG00000004735) TRAPPC11 (ENSNVIG00000004798) STOX2 (ENSNVIG00000004997) #22 ENPP6 (ENSNVIG00000005010) IRF2 (ENSNVIG00000005024) CASP3 (ENSNVIG00000005055) #21 PRIMPOL (ENSNVIG00000005096) CENPU (ENSNVIG00000005169) ACSL1 (ENSNVIG00000005210) ENSNVIG00000005622 HELT (ENSNVIG00000005628) SLC25A4 (ENSNVIG00000005642) CFAP97 (ENSNVIG00000005653) SNX25 (ENSNVIG00000005666) LRP2BP (ENSNVIG00000005813) ANKRD37 (ENSNVIG00000005829) UFSP2 (ENSNVIG00000005849) CD047 (ENSNVIG00000005884) Canidae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT00530000065303.l ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000171084 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263660 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT00530000065303.l ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000171084 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545.o ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263660 Dingo MODERN SPECIES 73 ENSCAFG00020002720 TENM3 (ENSCAFG00020002607) ENSCAFG00020002597 DCTD (ENSCAFG00020002572) WWC2 (ENSCAFG00020002263) ENSCAFG00020002247 ENSCAFG00020002243 CDKN2AIP (ENSCAFG00020002238) ING2 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ENSGT00390000015545.m ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00940000155186.r ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Tiger MODERN SPECIES 118 TRAPPC11 (ENSPTIG00000007311) STOX2 (ENSPTIG00000007032) #22 ENPP6 (ENSPTIG00000006942) IRF2 (ENSPTIG00000006758) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234.j ENSGT00940000162234.i ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545.m ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00940000155186.r ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 lion MODERN SPECIES 4 ASB5 (ENSPLOG00000012496) SPCS3 (ENSPLOG00000012719) VEGFC (ENSPLOG00000012772) NEIL3 (ENSPLOG00000012822) AGA (ENSPLOG00000012952) ENSPLOG00000013024 ENSPLOG00000013048 TENM3 (ENSPLOG00000013094) DCTD (ENSPLOG00000013305) WWC2 (ENSPLOG00000013387) ENSPLOG00000013818 CDKN2AIP (ENSPLOG00000013842) ING2 (ENSPLOG00000013944) RWDD4 (ENSPLOG00000013987) TRAPPC11 (ENSPLOG00000014085) STOX2 (ENSPLOG00000014268) #22 ENPP6 (ENSPLOG00000014451) IRF2 (ENSPLOG00000014506) CASP3 (ENSPLOG00000014571) #21 PRIMPOL (ENSPLOG00000014656) ENSPLOG00000014746 ACSL1 (ENSPLOG00000014911) ENSPLOG00000015185 HELT (ENSPLOG00000015248) SLC25A4 (ENSPLOG00000015336) CFAP97 (ENSPLOG00000015379) SNX25 (ENSPLOG00000015465) LRP2BP (ENSPLOG00000015855) ANKRD37 (ENSPLOG00000015977) UFSP2 (ENSPLOG00000016024) C4orf47 (ENSPLOG00000016128) leopard MODERN SPECIES 90 ENSPPRG00000010634 TENM3 (ENSPPRG00000010922) ENSPPRG00000020057 DCTD (ENSPPRG00000011092) WWC2 (ENSPPRG00000012093) ENSPPRG00000020260 ENSPPRG00000020276 CDKN2AIP (ENSPPRG00000012146) ING2 (ENSPPRG00000012156) ENSPPRG00000012348 TRAPPC11 (ENSPPRG00000013060) STOX2 (ENSPPRG00000013108) #22 ENPP6 (ENSPPRG00000014678) IRF2 (ENSPPRG00000014690) CASP3 (ENSPPRG00000014967) #21 ENSPPRG00000015036 PRIMPOL (ENSPPRG00000018254) CENPU (ENSPPRG00000018742) ACSL1 (ENSPPRG00000022163) HELT (ENSPPRG00000022396) SLC25A4 (ENSPPRG00000022414) CFAP97 (ENSPPRG00000024545) SNX25 (ENSPPRG00000024479) LRP2BP (ENSPPRG00000024361) ANKRD37 (ENSPPRG00000024337) UFSP2 (ENSPPRG00000024325) C4orf47 (ENSPPRG00000024313) Cat MODERN SPECIES 235 SPCS3 (ENSFCAG00000044774) ENSFCAG00000050236 VEGFC (ENSFCAG00000007996) NEIL3 (ENSFCAG00000004956) AGA (ENSFCAG00000022643) ENSFCAG00000042450 TENM3 (ENSFCAG00000022648) DCTD (ENSFCAG00000044388) WWC2 (ENSFCAG00000003067) ENSFCAG00000042875 ENSFCAG00000042436 CDKN2AIP (ENSFCAG00000026739) ING2 (ENSFCAG00000028949) RWDD4 (ENSFCAG00000024337) TRAPPC11 (ENSFCAG00000030217) STOX2 (ENSFCAG00000014995) #22 ENPP6 (ENSFCAG00000001574) IRF2 (ENSFCAG00000030144) CASP3 (ENSFCAG00000025408) #21 PRIMPOL (ENSFCAG00000027833) ACSL1 (ENSFCAG00000005085) ENSFCAG00000052999 CENPU (ENSFCAG00000005075) ENSFCAG00000026009 HELT (ENSFCAG00000025140) SLC25A4 (ENSFCAG00000037539) CFAP97 (ENSFCAG00000024414) SNX25 (ENSFCAG00000004803) LRP2BP (ENSFCAG00000004805) ANKRD37 (ENSFCAG00000027472) UFSP2 (ENSFCAG00000025060) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263660 Equus ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000169716 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 Donkey MODERN SPECIES 19 SPATA4 (ENSEASG00005022285) ASB5 (ENSEASG00005022280) SPCS3 (ENSEASG00005022278) VEGFC (ENSEASG00005022274) NEIL3 (ENSEASG00005022272) AGA (ENSEASG00005022270) ENSEASG00005018558 TENM3 (ENSEASG00005018486) ENSEASG00005024583 WWC2 (ENSEASG00005018450) ENSEASG00005035036 CDKN2AIP (ENSEASG00005018444) ING2 (ENSEASG00005034685) RWDD4 (ENSEASG00005018438) TRAPPC11 (ENSEASG00005018432) STOX2 (ENSEASG00005018429) #22 ENPP6 (ENSEASG00005018425) ENSEASG00005025603 IRF2 (ENSEASG00005018423) ENSEASG00005018420 ENSEASG00005018419 CASP3 (ENSEASG00005018416) #21 PRIMPOL (ENSEASG00005018412) CENPU (ENSEASG00005018407) ACSL1 (ENSEASG00005018398) HELT (ENSEASG00005035137) SLC25A4 (ENSEASG00005018390) CFAP97 (ENSEASG00005018387) SNX25 (ENSEASG00005018384) LRP2BP (ENSEASG00005018380) ENSEASG00005018376 Horse MODERN SPECIES 19 VEGFC (ENSECAG00000012133) ENSECAG00000054402 NEIL3 (ENSECAG00000009121) AGA (ENSECAG00000000085) ENSECAG00000051167 TENM3 (ENSECAG00000020433) DCTD (ENSECAG00000017516) WWC2 (ENSECAG00000017226) ENSECAG00000006075 ENSECAG00000017161 CDKN2AIP (ENSECAG00000015905) ING2 (ENSECAG00000015406) RWDD4 (ENSECAG00000011336) TRAPPC11 (ENSECAG00000015348) ENSECAG00000036009 STOX2 (ENSECAG00000012786) #22 ENPP6 (ENSECAG00000011627) IRF2 (ENSECAG00000007508) ENSECAG00000028316 CASP3 (ENSECAG00000022197) #21 PRIMPOL (ENSECAG00000020522) CENPU (ENSECAG00000016722) ACSL1 (ENSECAG00000008679) HELT (ENSECAG00000008629) SLC25A4 (ENSECAG00000020944) CFAP97 (ENSECAG00000019778) LRP2BP (ENSECAG00000010868) SNX25 (ENSECAG00000014326) ANKRD37 (ENSECAG00000010858) UFSP2 (ENSECAG00000009486) CCDC110 (ENSECAG00000000205) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263660 Megabat MODERN SPECIES 2363 STOX2 (ENSPVAG00000003479) #22 ENPP6 (ENSPVAG00000003482) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263660 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 22 VEGFC (ENSRFEG00010017460) NEIL3 (ENSRFEG00010017333) AGA (ENSRFEG00010017284) ENSRFEG00010017266 TENM3 (ENSRFEG00010017187) ENSRFEG00010017163 DCTD (ENSRFEG00010017093) ENSRFEG00010017067 WWC2 (ENSRFEG00010016991) ENSRFEG00010016974 ENSRFEG00010016958 CDKN2AIP (ENSRFEG00010016870) ING2 (ENSRFEG00010016836) RWDD4 (ENSRFEG00010016789) TRAPPC11 (ENSRFEG00010016462) STOX2 (ENSRFEG00010016438) #22 ENPP6 (ENSRFEG00010016393) IRF2 (ENSRFEG00010016324) CASP3 (ENSRFEG00010016238) #21 PRIMPOL (ENSRFEG00010016194) CENPU (ENSRFEG00010016006) ACSL1 (ENSRFEG00010015807) HELT (ENSRFEG00010015716) SLC25A4 (ENSRFEG00010015491) CFAP97 (ENSRFEG00010015438) LRP2BP (ENSRFEG00010015317) UFSP2 (ENSRFEG00010015247) SNX25 (ENSRFEG00010014703) C4orf47 (ENSRFEG00010014615) ENSRFEG00010014599 ENSRFEG00010014396 Microbat MODERN SPECIES 1039 STOX2 (ENSMLUG00000024441) #22 ENPP6 (ENSMLUG00000004841) IRF2 (ENSMLUG00000014246) CASP3 (ENSMLUG00000002451) #21 PRIMPOL (ENSMLUG00000016637) CENPU (ENSMLUG00000016652) ENSMLUG00000006341 HELT (ENSMLUG00000004406) SLC25A4 (ENSMLUG00000003712) CFAP97 (ENSMLUG00000000510) SNX25 (ENSMLUG00000006047) LRP2BP (ENSMLUG00000006054) ANKRD37 (ENSMLUG00000006061) UFSP2 (ENSMLUG00000006064) C4orf47 (ENSMLUG00000006074) ENSMLUG00000027378 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a.g ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263660 Suina ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a.g ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01100000263660 Pig MODERN SPECIES 6 AGA (ENSSSCG00000015772) ENSSSCG00000063491 ENSSSCG00000055184 ENSSSCG00000050308 ENSSSCG00000048815 TENM3 (ENSSSCG00000015774) DCTD (ENSSSCG00000015775) WWC2 (ENSSSCG00000021731) ENSSSCG00000033315 CLDN22 (ENSSSCG00000027901) ENSSSCG00000022456 CDKN2AIP (ENSSSCG00000015779) ING2 (ENSSSCG00000024555) RWDD4 (ENSSSCG00000015776) TRAPPC11 (ENSSSCG00000015777) STOX2 (ENSSSCG00000015780) #22 ENPP6 (ENSSSCG00000015781) IRF2 (ENSSSCG00000015782) PRIMPOL (ENSSSCG00000015786) CASP3 (ENSSSCG00000034012) #21 CENPU (ENSSSCG00000015785) ACSL1 (ENSSSCG00000015784) ENSSSCG00000053593 HELT (ENSSSCG00000038390) SLC25A4 (ENSSSCG00000015790) CFAP97 (ENSSSCG00000015791) SNX25 (ENSSSCG00000015789) LRP2BP (ENSSSCG00000015792) ANKRD37 (ENSSSCG00000015798) UFSP2 (ENSSSCG00000015793) C4orf47 (ENSSSCG00000015794) Chacoan peccary MODERN SPECIES 87 ASB5 (ENSCWAG00000002433) SPCS3 (ENSCWAG00000002459) VEGFC (ENSCWAG00000002469) NEIL3 (ENSCWAG00000002489) AGA (ENSCWAG00000002514) TENM3 (ENSCWAG00000002535) DCTD (ENSCWAG00000002557) WWC2 (ENSCWAG00000002574) ENSCWAG00000002638 ENSCWAG00000002644 ENSCWAG00000002647 CDKN2AIP (ENSCWAG00000002663) ING2 (ENSCWAG00000002669) RWDD4 (ENSCWAG00000002685) TRAPPC11 (ENSCWAG00000002715) ENSCWAG00000002776 #22 ENPP6 (ENSCWAG00000002789) IRF2 (ENSCWAG00000002803) ENSCWAG00000002822 CASP3 (ENSCWAG00000002835) #21 PRIMPOL (ENSCWAG00000002854) CENPU (ENSCWAG00000002898) ACSL1 (ENSCWAG00000002984) HELT (ENSCWAG00000003084) SLC25A4 (ENSCWAG00000003099) CFAP97 (ENSCWAG00000003117) SNX25 (ENSCWAG00000003154) LRP2BP (ENSCWAG00000003209) ANKRD37 (ENSCWAG00000003220) UFSP2 (ENSCWAG00000003232) C4orf47 (ENSCWAG00000003255) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a.g ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01040000240629 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a.g ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01040000240629 Arabian camel MODERN SPECIES 18 ASB5 (ENSCDRG00005021226) SPCS3 (ENSCDRG00005021218) VEGFC (ENSCDRG00005021212) NEIL3 (ENSCDRG00005021208) AGA (ENSCDRG00005021201) TENM3 (ENSCDRG00005016886) ENSCDRG00005016533 DCTD (ENSCDRG00005016433) WWC2 (ENSCDRG00005016343) ENSCDRG00005016322 ENSCDRG00005016304 CDKN2AIP (ENSCDRG00005016254) ING2 (ENSCDRG00005016228) RWDD4 (ENSCDRG00005016171) TRAPPC11 (ENSCDRG00005015900) STOX2 (ENSCDRG00005015820) #22 ENPP6 (ENSCDRG00005015776) IRF2 (ENSCDRG00005015715) CASP3 (ENSCDRG00005015657) #21 PRIMPOL (ENSCDRG00005015548) CENPU (ENSCDRG00005015460) ACSL1 (ENSCDRG00005015058) HELT (ENSCDRG00005014948) SLC25A4 (ENSCDRG00005014896) CFAP97 (ENSCDRG00005014860) SNX25 (ENSCDRG00005014527) LRP2BP (ENSCDRG00005014460) ANKRD37 (ENSCDRG00005014407) UFSP2 (ENSCDRG00005014346) C4orf47 (ENSCDRG00005014306) ENSCDRG00005014233 Alpaca MODERN SPECIES 297 DCTD (ENSVPAG00000005736) WWC2 (ENSVPAG00000005737) CDKN2AIP (ENSVPAG00000005741) ING2 (ENSVPAG00000005742) RWDD4 (ENSVPAG00000005743) TRAPPC11 (ENSVPAG00000005744) STOX2 (ENSVPAG00000005745) #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00910000148572 ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a.g ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01040000240629 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157057 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C4orf47 (ENSPSNG00000021067) Dolphin MODERN SPECIES 5185 STOX2 (ENSTTRG00000009414) #22 ENPP6 (ENSTTRG00000009403) IRF2 (ENSTTRG00000009391) Sperm whale MODERN SPECIES 12 KBTBD11 (ENSPCTG00005011654) ENSPCTG00005011610 ENSPCTG00005011559 DLGAP2 (ENSPCTG00005011309) ENSPCTG00005011277 TDRP (ENSPCTG00005011235) FBXO25 (ENSPCTG00005011146) ZNF596 (ENSPCTG00005011048) WWC2 (ENSPCTG00005010891) ENSPCTG00005010748 ENSPCTG00005010699 CDKN2AIP (ENSPCTG00005010634) ING2 (ENSPCTG00005010587) RWDD4 (ENSPCTG00005010517) TRAPPC11 (ENSPCTG00005010217) STOX2 (ENSPCTG00005010154) #22 ENPP6 (ENSPCTG00005010054) ENSPCTG00005010011 IRF2 (ENSPCTG00005009966) CASP3 (ENSPCTG00005009908) #21 PRIMPOL (ENSPCTG00005009848) CENPU (ENSPCTG00005009654) ACSL1 (ENSPCTG00005009490) HELT (ENSPCTG00005009377) SLC25A4 (ENSPCTG00005009344) CFAP97 (ENSPCTG00005009307) SNX25 (ENSPCTG00005008854) LRP2BP (ENSPCTG00005008755) ANKRD37 (ENSPCTG00005008722) UFSP2 (ENSPCTG00005008682) C20H4orf47 (ENSPCTG00005008647) Blue whale MODERN SPECIES 13 KBTBD11 (ENSBMSG00010019757) ARHGEF10 (ENSBMSG00010019800) ENSBMSG00010019918 CLN8 (ENSBMSG00010019945) DLGAP2 (ENSBMSG00010019985) ERICH1 (ENSBMSG00010020348) TDRP (ENSBMSG00010020369) FBXO25 (ENSBMSG00010020424) ZNF596 (ENSBMSG00010020519) WWC2 (ENSBMSG00010020554) ENSBMSG00010020629 CDKN2AIP (ENSBMSG00010020641) ING2 (ENSBMSG00010020653) ENSBMSG00010020668 TRAPPC11 (ENSBMSG00010020704) ENSBMSG00010020747 #22 ENPP6 (ENSBMSG00010020756) IRF2 (ENSBMSG00010020778) CASP3 (ENSBMSG00010020797) #21 PRIMPOL (ENSBMSG00010020827) CENPU (ENSBMSG00010020844) ENSBMSG00010020874 HELT (ENSBMSG00010020912) SLC25A4 (ENSBMSG00010020925) CFAP97 (ENSBMSG00010020941) SNX25 (ENSBMSG00010021055) LRP2BP (ENSBMSG00010021115) UFSP2 (ENSBMSG00010021139) C4orf47 (ENSBMSG00010021174) ENSBMSG00010021179 PDLIM3 (ENSBMSG00010021207) Pecora ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C 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(ENSCHYG00000024145) IRF2 (ENSCHYG00000024184) CASP3 (ENSCHYG00000008657) #21 PRIMPOL (ENSCHYG00000008693) CENPU (ENSCHYG00000008853) ACSL1 (ENSCHYG00000009253) HELT (ENSCHYG00000009820) SLC25A4 (ENSCHYG00000009889) CFAP97 (ENSCHYG00000009938) SNX25 (ENSCHYG00000010047) LRP2BP (ENSCHYG00000010327) ANKRD37 (ENSCHYG00000010411) UFSP2 (ENSCHYG00000010470) C4orf47 (ENSCHYG00000010642) ENSCHYG00000010735 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000161922.i.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a.g ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 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ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a.g ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01040000240629 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 18 VEGFC (ENSOARG00020025167) NEIL3 (ENSOARG00020025196) AGA (ENSOARG00020025240) TENM3 (ENSOARG00020025305) DCTD (ENSOARG00020025328) WWC2 (ENSOARG00020025347) ENSOARG00020025406 ENSOARG00020025411 ENSOARG00020025415 CDKN2AIP (ENSOARG00020025421) ING2 (ENSOARG00020025427) ENSOARG00020011624 ENSOARG00020011629 RWDD4 (ENSOARG00020011673) TRAPPC11 (ENSOARG00020011964) STOX2 (ENSOARG00020012344) #22 ENPP6 (ENSOARG00020012535) IRF2 (ENSOARG00020013042) CASP3 (ENSOARG00020013157) #21 PRIMPOL (ENSOARG00020013241) ACSL1 (ENSOARG00020013348) HELT (ENSOARG00020014117) SLC25A4 (ENSOARG00020014234) CFAP97 (ENSOARG00020014262) SNX25 (ENSOARG00020014331) LRP2BP (ENSOARG00020014866) 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(ENSBIXG00005015995) ENSBIXG00005015900 ENSBIXG00005015897 ENSBIXG00005015891 ENSBIXG00005015879 CDKN2AIP (ENSBIXG00005015874) ING2 (ENSBIXG00005015847) RWDD4 (ENSBIXG00005015843) TRAPPC11 (ENSBIXG00005015785) STOX2 (ENSBIXG00005015678) #22 ENPP6 (ENSBIXG00005007140) ENSBIXG00005006563 IRF2 (ENSBIXG00005015556) ENSBIXG00005015516 CASP3 (ENSBIXG00005007320) #21 PRIMPOL (ENSBIXG00005015465) ACSL1 (ENSBIXG00005015369) CENPU (ENSBIXG00005015004) HELT (ENSBIXG00005014969) ENSBIXG00005014957 CFAP97 (ENSBIXG00005006134) SNX25 (ENSBIXG00005014831) ANKRD37 (ENSBIXG00005002078) UFSP2 (ENSBIXG00005014724) C4orf47 (ENSBIXG00005014697) Cow MODERN SPECIES 19 SPCS3 (ENSBTAG00000014146) VEGFC (ENSBTAG00000014737) ENSBTAG00000054577 NEIL3 (ENSBTAG00000005825) AGA (ENSBTAG00000017085) ENSBTAG00000047749 TENM3 (ENSBTAG00000021133) DCTD (ENSBTAG00000020282) WWC2 (ENSBTAG00000012191) ENSBTAG00000052405 ENSBTAG00000051927 CDKN2AIP (ENSBTAG00000000957) ING2 (ENSBTAG00000047706) RWDD4 (ENSBTAG00000003081) TRAPPC11 (ENSBTAG00000007422) STOX2 (ENSBTAG00000008886) #22 ENPP6 (ENSBTAG00000011573) IRF2 (ENSBTAG00000010002) CASP3 (ENSBTAG00000015874) #21 PRIMPOL (ENSBTAG00000018863) ACSL1 (ENSBTAG00000004344) CENPU (ENSBTAG00000018864) HELT (ENSBTAG00000014704) SLC25A4 (ENSBTAG00000013208) CFAP97 (ENSBTAG00000013211) SNX25 (ENSBTAG00000010351) LRP2BP (ENSBTAG00000005094) ANKRD37 (ENSBTAG00000018453) UFSP2 (ENSBTAG00000018454) C27H4orf47 (ENSBTAG00000034430) CCDC110 (ENSBTAG00000017157) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000161381.f.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a ENSGT00940000153676.a ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000162234 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000158194 ENSGT00390000015545 ENSGT00390000006550 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 ENSGT00940000159063 ENSGT00940000153232.a.b #21 ENSGT00390000003901 ENSGT00390000015511 ENSGT00940000154508.a.a.g ENSGT00940000160388 ENSGT00940000154622.a.a ENSGT00390000010356 ENSGT00950000182856.a.a.b ENSGT00390000013490 ENSGT00940000154216.b ENSGT00940000157115 ENSGT00390000010980 ENSGT01040000240629 Wild yak MODERN SPECIES 1497 STOX2 (ENSBMUG00000001426) #22 ENPP6 (ENSBMUG00000001361) IRF2 (ENSBMUG00000001350) CASP3 (ENSBMUG00000001303) #21 ENSBMUG00000001277 ENSBMUG00000001268 Domestic yak DUPLICATION Domestic yak DUPLICATION Domestic yak MODERN SPECIES 20 ENSBGRG00000008875 NEIL3 (ENSBGRG00000008579) AGA (ENSBGRG00000008287) ENSBGRG00000008196 ENSBGRG00000008180 TENM3 (ENSBGRG00000007837) DCTD (ENSBGRG00000007650) WWC2 (ENSBGRG00000007531) ENSBGRG00000007420 ENSBGRG00000007343 ENSBGRG00000007321 ING2 (ENSBGRG00000007303) RWDD4 (ENSBGRG00000007035) TRAPPC11 (ENSBGRG00000020963) ENSBGRG00000020927 #22 ENSBGRG00000020882 #22 ENSBGRG00000020854 #22 ENPP6 (ENSBGRG00000020769) IRF2 (ENSBGRG00000020711) CASP3 (ENSBGRG00000020580) #21 PRIMPOL (ENSBGRG00000020486) CENPU (ENSBGRG00000020186) 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(ENSBGRG00000018853) LRP2BP (ENSBGRG00000018742) Domestic yak MODERN SPECIES 20 NEIL3 (ENSBGRG00000008579) AGA (ENSBGRG00000008287) ENSBGRG00000008196 ENSBGRG00000008180 TENM3 (ENSBGRG00000007837) DCTD (ENSBGRG00000007650) WWC2 (ENSBGRG00000007531) ENSBGRG00000007420 ENSBGRG00000007343 ENSBGRG00000007321 ING2 (ENSBGRG00000007303) RWDD4 (ENSBGRG00000007035) TRAPPC11 (ENSBGRG00000020963) ENSBGRG00000020927 #22 ENSBGRG00000020882 #22 ENSBGRG00000020854 #22 ENPP6 (ENSBGRG00000020769) IRF2 (ENSBGRG00000020711) CASP3 (ENSBGRG00000020580) #21 PRIMPOL (ENSBGRG00000020486) CENPU (ENSBGRG00000020186) ENSBGRG00000020136 ACSL1 (ENSBGRG00000019548) ENSBGRG00000019485 HELT (ENSBGRG00000019362) SLC25A4 (ENSBGRG00000019340) CFAP97 (ENSBGRG00000019269) SNX25 (ENSBGRG00000018853) LRP2BP (ENSBGRG00000018742) ANKRD37 (ENSBGRG00000018691) UFSP2 (ENSBGRG00000018438) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 1392 ENSGT00520000055589.d #22 ENSGT00940000158457 Common shrew MODERN SPECIES 5339 STOX2 (ENSSARG00000000909) #22 ENPP6 (ENSSARG00000000920) Hedgehog DUPLICATION Hedgehog MODERN SPECIES 14039 ENSEEUG00000012872 #22 Hedgehog MODERN SPECIES 6849 STOX2 (ENSEEUG00000012421) #22