Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234641.b.a.a #7 ENSGT00940000155737.b #8 ENSGT00940000157919 #9 ENSGT00390000009747 #10 ENSGT00940000155782 #11 ENSGT00940000160317 #12 ENSGT00390000014513 #13 ENSGT00940000160250 #14 ENSGT00940000155061.a.b #15 ENSGT00940000160968 #16 ENSGT00940000156925 #17 ENSGT00940000161801 #18 ENSGT01050000244965.a #19 ENSGT00730000111092.b #20 ENSGT00950000183137.a #21 ENSGT00390000005639.a.b #22 ENSGT00390000001546 #23 ENSGT00390000002554 #24 ENSGT00940000157798 #25 ENSGT00390000007726.a.a #26 ENSGT00940000158796 ENSGT00940000159518 #27 ENSGT00390000005029 #28 ENSGT00390000014031 #29 ENSGT00940000158515 #30 ENSGT00940000159672 #31 ENSGT00940000161756 #32 ENSGT00940000158698 #33 ENSGT00530000063555.B #34 ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #35 ENSGT00950000183002.C #36 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01030000234641.b.a.a #7 ENSGT00940000155737.b #8 ENSGT00940000157919 #9 ENSGT00390000009747 #10 ENSGT00940000155782 #11 ENSGT00940000160317 #12 ENSGT00390000014513 #13 ENSGT00940000160250 #14 ENSGT00940000155061.a.b #15 ENSGT00940000160968 #16 ENSGT00940000156925 #17 ENSGT00940000161801 #18 ENSGT01050000244965.a #19 ENSGT00730000111092.b #20 ENSGT00950000183137.a #21 ENSGT00390000005639.a.b #22 ENSGT00390000001546 #23 ENSGT00390000002554 #24 ENSGT00940000157798 #25 ENSGT00390000007726.a.a #26 ENSGT00940000158796 ENSGT00940000159518 #27 ENSGT00390000005029 #28 ENSGT00390000014031 #29 ENSGT00940000158515 #30 ENSGT00940000159672 #31 ENSGT00940000161756 #32 ENSGT00940000158698 #33 ENSGT00530000063555.B #34 ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #35 ENSGT00950000183002.C #36 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 192 SFXN2 (ENSCLAG00000001037) #7 ARL3 (ENSCLAG00000001055) #8 TRIM8 (ENSCLAG00000001092) #9 SUFU (ENSCLAG00000001257) #10 ACTR1A (ENSCLAG00000001321) #11 MFSD13A (ENSCLAG00000001530) #12 CUEDC2 (ENSCLAG00000001551) #13 FBXL15 (ENSCLAG00000001578) #14 PSD (ENSCLAG00000003741) #15 NFKB2 (ENSCLAG00000004104) #16 GBF1 (ENSCLAG00000004338) #17 PITX3 (ENSCLAG00000005073) #18 ELOVL3 (ENSCLAG00000005342) #19 NOLC1 (ENSCLAG00000001046) #20 PPRC1 (ENSCLAG00000001364) #21 LDB1 (ENSCLAG00000001555) #22 HPS6 (ENSCLAG00000001624) #23 ARMH3 (ENSCLAG00000001673) #24 KCNIP2 (ENSCLAG00000000954) #25 OGA (ENSCLAG00000001003) #26 FGF8 (ENSCLAG00000001075) #27 FBXW4 (ENSCLAG00000001132) #28 DPCD (ENSCLAG00000001147) #29 POLL (ENSCLAG00000001165) #30 BTRC (ENSCLAG00000001243) #31 LBX1 (ENSCLAG00000001298) #32 ENSCLAG00000001309 #33 ENSCLAG00000001318 #34 SFXN3 (ENSCLAG00000001996) #35 PDZD7 (ENSCLAG00000003178) #36 LZTS2 (ENSCLAG00000003292) #37 Degu MODERN SPECIES 83 ENSODEG00000006734 SUFU (ENSODEG00000007735) #10 ACTR1A (ENSODEG00000008379) #11 MFSD13A (ENSODEG00000008625) #12 CUEDC2 (ENSODEG00000007262) #13 FBXL15 (ENSODEG00000007513) #14 PSD (ENSODEG00000006424) #15 NFKB2 (ENSODEG00000007396) #16 ENSODEG00000006690 GBF1 (ENSODEG00000007076) #17 PITX3 (ENSODEG00000007162) #18 ELOVL3 (ENSODEG00000006606) #19 NOLC1 (ENSODEG00000006304) #20 ENSODEG00000006985 #21 ENSODEG00000009568 #21 LDB1 (ENSODEG00000009090) #22 HPS6 (ENSODEG00000007638) #23 ENSODEG00000019424 ARMH3 (ENSODEG00000007299) #24 ENSODEG00000010569 KCNIP2 (ENSODEG00000007199) #25 ENSODEG00000019634 OGA (ENSODEG00000008001) #26 NPM3 (ENSODEG00000006704) FGF8 (ENSODEG00000006423) #27 FBXW4 (ENSODEG00000007897) #28 DPCD (ENSODEG00000005983) #29 POLL (ENSODEG00000007469) #30 BTRC (ENSODEG00000008464) #31 LBX1 (ENSODEG00000006684) #32 ENSODEG00000006094 #33 Guinea pig MODERN SPECIES 11 SFXN2 (ENSCPOG00000014474) #7 ARL3 (ENSCPOG00000014473) #8 TRIM8 (ENSCPOG00000012305) #9 SUFU (ENSCPOG00000011097) #10 ACTR1A (ENSCPOG00000011090) #11 MFSD13A (ENSCPOG00000011087) #12 CUEDC2 (ENSCPOG00000032492) #13 FBXL15 (ENSCPOG00000021451) #14 PSD (ENSCPOG00000000156) #15 NFKB2 (ENSCPOG00000004847) #16 GBF1 (ENSCPOG00000004514) #17 PITX3 (ENSCPOG00000036365) #18 ELOVL3 (ENSCPOG00000014884) #19 NOLC1 (ENSCPOG00000004504) #20 PPRC1 (ENSCPOG00000032149) #21 LDB1 (ENSCPOG00000010311) #22 HPS6 (ENSCPOG00000006084) #23 ARMH3 (ENSCPOG00000031847) #24 KCNIP2 (ENSCPOG00000011918) #25 OGA (ENSCPOG00000000219) #26 NPM3 (ENSCPOG00000006301) FGF8 (ENSCPOG00000021533) #27 ENSCPOG00000032448 #28 DPCD (ENSCPOG00000005499) #29 POLL (ENSCPOG00000005493) #30 BTRC (ENSCPOG00000005488) #31 LBX1 (ENSCPOG00000025830) #32 TLX1 (ENSCPOG00000003194) #33 KAZALD1 (ENSCPOG00000015270) #34 SFXN3 (ENSCPOG00000000955) #35 ENSCPOG00000000952 #36