Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT01030000234641.b.a.a #7	ENSGT00940000155737.b #8	ENSGT00940000157919 #9	ENSGT00390000009747 #10	ENSGT00940000155782 #11	ENSGT00940000160317 #12	ENSGT00390000014513 #13	ENSGT00940000160250 #14	ENSGT00940000155061.a.b #15	ENSGT00940000160968 #16	ENSGT00940000156925 #17	ENSGT00940000161801 #18	ENSGT01050000244965.a #19	ENSGT00730000111092 #20	ENSGT00950000183137.a #21	ENSGT00390000005639.a.b #22	ENSGT00390000001546 #23	ENSGT00390000002554 #24	ENSGT00940000157798 #25	ENSGT00390000007726.a.a #26	ENSGT00940000158796 #27	ENSGT00940000159518 #28	ENSGT00390000005029 #30	ENSGT00390000014031 #31	ENSGT00940000158515 #32	ENSGT00940000159672 #33	ENSGT00940000161756 #34	ENSGT00940000158698 #35	ENSGT00530000063555.B #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #37	ENSGT00950000183002.C
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01030000234641.b.a.a #7	ENSGT00940000155737.b #8	ENSGT00940000157919 #9	ENSGT00390000009747 #10	ENSGT00940000155782 #11	ENSGT00940000160317 #12	ENSGT00390000014513 #13	ENSGT00940000160250 #14	ENSGT00940000155061.a.b #15	ENSGT00940000160968 #16	ENSGT00940000156925 #17	ENSGT00940000161801 #18	ENSGT01050000244965.a #19	ENSGT00730000111092 #20	ENSGT00950000183137.a #21	ENSGT00390000005639.a.b #22	ENSGT00390000001546 #23	ENSGT00390000002554 #24	ENSGT00940000157798 #25	ENSGT00390000007726.a.a #26	ENSGT00940000158796 #27	ENSGT00940000159518 #28	ENSGT00390000005029 #30	ENSGT00390000014031 #31	ENSGT00940000158515 #32	ENSGT00940000159672 #33	ENSGT00940000161756 #34	ENSGT00940000158698 #35	ENSGT00530000063555.B #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #37	ENSGT00950000183002.C
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	14	SFXN2 (ENSOARG00020006982) #7	ARL3 (ENSOARG00020006754) #8	TRIM8 (ENSOARG00020006668) #9	SUFU (ENSOARG00020006428) #10	ACTR1A (ENSOARG00020006381) #11	MFSD13A (ENSOARG00020006356) #12	CUEDC2 (ENSOARG00020025536) #13	FBXL15 (ENSOARG00020025531) #14	PSD (ENSOARG00020025517) #15	NFKB2 (ENSOARG00020025505) #16	GBF1 (ENSOARG00020025489) #17	PITX3 (ENSOARG00020025475) #18	ELOVL3 (ENSOARG00020025469) #19	NOLC1 (ENSOARG00020025460) #20	PPRC1 (ENSOARG00020025416) #21	LDB1 (ENSOARG00020025397) #22	HPS6 (ENSOARG00020025382) #23	ARMH3 (ENSOARG00020025366) #24	KCNIP2 (ENSOARG00020025029) #25	OGA (ENSOARG00020024941) #26	NPM3 (ENSOARG00020024924) #27	FGF8 (ENSOARG00020024835) #28	ENSOARG00020024820 #29	FBXW4 (ENSOARG00020024790) #30	DPCD (ENSOARG00020024779) #31	POLL (ENSOARG00020024664) #32	BTRC (ENSOARG00020024573) #33	LBX1 (ENSOARG00020024551) #34	TLX1 (ENSOARG00020024541) #35	KAZALD1 (ENSOARG00020024525) #36	SFXN3 (ENSOARG00020024496) #37
Goat	MODERN SPECIES	18	SFXN2 (ENSCHIG00000005366) #7	ARL3 (ENSCHIG00000012000) #8	TRIM8 (ENSCHIG00000012123) #9	SUFU (ENSCHIG00000021986) #10	ACTR1A (ENSCHIG00000014540) #11	MFSD13A (ENSCHIG00000022237) #12	CUEDC2 (ENSCHIG00000010950) #13	FBXL15 (ENSCHIG00000017809) #14	PSD (ENSCHIG00000016284) #15	NFKB2 (ENSCHIG00000019967) #16	GBF1 (ENSCHIG00000006795) #17	PITX3 (ENSCHIG00000005050) #18	ELOVL3 (ENSCHIG00000020567) #19	NOLC1 (ENSCHIG00000016755) #20	PPRC1 (ENSCHIG00000011471) #21	LDB1 (ENSCHIG00000012111) #22	ENSCHIG00000016117	HPS6 (ENSCHIG00000002581) #23	ARMH3 (ENSCHIG00000021008) #24	KCNIP2 (ENSCHIG00000023969) #25	OGA (ENSCHIG00000012695) #26	ENSCHIG00000024055 #27	FGF8 (ENSCHIG00000016976) #28	FBXW4 (ENSCHIG00000018380) #30	DPCD (ENSCHIG00000020911) #31	POLL (ENSCHIG00000003400) #32	BTRC (ENSCHIG00000016955) #33	LBX1 (ENSCHIG00000023740) #34	TLX1 (ENSCHIG00000017143) #35	KAZALD1 (ENSCHIG00000020364) #36	SFXN3 (ENSCHIG00000007598) #37
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT01030000234641.b.a.a #7	ENSGT00940000155737.b #8	ENSGT00940000157919 #9	ENSGT00390000009747 #10	ENSGT00940000155782 #11	ENSGT00940000160317 #12	ENSGT00390000014513 #13	ENSGT00940000160250 #14	ENSGT00940000155061.a.b #15	ENSGT00940000160968 #16	ENSGT00940000156925 #17	ENSGT00940000161801 #18	ENSGT01050000244965.a #19	ENSGT00730000111092 #20	ENSGT00950000183137.a #21	ENSGT00390000005639.a.b #22	ENSGT00390000001546 #23	ENSGT00390000002554 #24	ENSGT00940000157798 #25	ENSGT00390000007726.a.a #26	ENSGT00940000158796 #27	ENSGT00940000159518 #28	ENSGT00390000005029 #30	ENSGT00390000014031 #31	ENSGT00940000158515 #32	ENSGT00940000159672 #33	ENSGT00940000161756 #34	ENSGT00940000158698 #35	ENSGT00530000063555.B #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #37	ENSGT00950000183002.C
Bos	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT01030000234641.b.a.a #7	ENSGT00940000155737.b #8	ENSGT00940000157919 #9	ENSGT00390000009747 #10	ENSGT00940000155782 #11	ENSGT00940000160317 #12	ENSGT00390000014513 #13	ENSGT00940000160250 #14	ENSGT00940000155061.a.b #15	ENSGT00940000160968 #16	ENSGT00940000156925 #17	ENSGT00940000161801 #18	ENSGT01050000244965.a #19	ENSGT00730000111092 #20	ENSGT00950000183137.a #21	ENSGT00390000005639.a.b #22	ENSGT00390000001546 #23	ENSGT00390000002554 #24	ENSGT00940000157798 #25	ENSGT00390000007726.a.a #26	ENSGT00940000158796 #27	ENSGT00940000159518 #28	ENSGT00390000005029 #30	ENSGT00390000014031 #31	ENSGT00940000158515 #32	ENSGT00940000159672 #33	ENSGT00940000161756 #34	ENSGT00940000158698 #35	ENSGT00530000063555.B #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #37	ENSGT00950000183002.C
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01030000234641.b.a.a #7	ENSGT00940000155737.b #8	ENSGT00940000157919 #9	ENSGT00390000009747 #10	ENSGT00940000155782 #11	ENSGT00940000160317 #12	ENSGT00390000014513 #13	ENSGT00940000160250 #14	ENSGT00940000155061.a.b #15	ENSGT00940000160968 #16	ENSGT00940000156925 #17	ENSGT00940000161801 #18	ENSGT01050000244965.a #19	ENSGT00730000111092 #20	ENSGT00950000183137.a #21	ENSGT00390000005639.a.b #22	ENSGT00390000001546 #23	ENSGT00390000002554 #24	ENSGT00940000157798 #25	ENSGT00390000007726.a.a #26	ENSGT00940000158796 #27	ENSGT00940000159518 #28	ENSGT00390000005029 #30	ENSGT00390000014031 #31	ENSGT00940000158515 #32	ENSGT00940000159672 #33	ENSGT00940000161756 #34	ENSGT00940000158698 #35	ENSGT00530000063555.B #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #37	ENSGT00950000183002.C
Wild yak	MODERN SPECIES	124	SFXN2 (ENSBMUG00000001395) #7	ARL3 (ENSBMUG00000001439) #8	TRIM8 (ENSBMUG00000001457) #9	SUFU (ENSBMUG00000001474) #10	ACTR1A (ENSBMUG00000001516) #11	MFSD13A (ENSBMUG00000001534) #12	CUEDC2 (ENSBMUG00000001561) #13	FBXL15 (ENSBMUG00000001578) #14	PSD (ENSBMUG00000001599) #15	NFKB2 (ENSBMUG00000001725) #16	GBF1 (ENSBMUG00000001789) #17	PITX3 (ENSBMUG00000001811) #18	ELOVL3 (ENSBMUG00000001815) #19	NOLC1 (ENSBMUG00000001853) #20	PPRC1 (ENSBMUG00000001946) #21	LDB1 (ENSBMUG00000001990) #22	HPS6 (ENSBMUG00000002004) #23	ARMH3 (ENSBMUG00000002100) #24	KCNIP2 (ENSBMUG00000002276) #25	OGA (ENSBMUG00000002507) #26	NPM3 (ENSBMUG00000002562) #27	FGF8 (ENSBMUG00000002582) #28	FBXW4 (ENSBMUG00000002636) #30	DPCD (ENSBMUG00000002662) #31	POLL (ENSBMUG00000002781) #32	BTRC (ENSBMUG00000002953) #33	TLX1 (ENSBMUG00000002998) #35	ENSBMUG00000003033 #36	SFXN3 (ENSBMUG00000003051) #37	PDZD7 (ENSBMUG00000003120)	LZTS2 (ENSBMUG00000003163)
Domestic yak	MODERN SPECIES	17	ARL3 (ENSBGRG00000007507) #8	TRIM8 (ENSBGRG00000007476) #9	SUFU (ENSBGRG00000007124) #10	ACTR1A (ENSBGRG00000006965) #11	MFSD13A (ENSBGRG00000026225) #12	CUEDC2 (ENSBGRG00000026208) #13	FBXL15 (ENSBGRG00000026204) #14	PSD (ENSBGRG00000026193) #15	NFKB2 (ENSBGRG00000026174) #16	GBF1 (ENSBGRG00000026160) #17	PITX3 (ENSBGRG00000026147) #18	ELOVL3 (ENSBGRG00000026140) #19	ENSBGRG00000026136	NOLC1 (ENSBGRG00000026111) #20	PPRC1 (ENSBGRG00000026069) #21	LDB1 (ENSBGRG00000026032) #22	HPS6 (ENSBGRG00000026028) #23	ARMH3 (ENSBGRG00000026018) #24	ENSBGRG00000026004	KCNIP2 (ENSBGRG00000025831) #25	OGA (ENSBGRG00000025769) #26	NPM3 (ENSBGRG00000025751) #27	FGF8 (ENSBGRG00000025705) #28	FBXW4 (ENSBGRG00000025687) #30	DPCD (ENSBGRG00000025670) #31	POLL (ENSBGRG00000025605) #32	BTRC (ENSBGRG00000025472) #33	LBX1 (ENSBGRG00000025446) #34	TLX1 (ENSBGRG00000025436) #35	KAZALD1 (ENSBGRG00000025398) #36	SFXN3 (ENSBGRG00000025373) #37
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT01030000234641.b.a.a #7	ENSGT00940000155737.b #8	ENSGT00940000157919 #9	ENSGT00390000009747 #10	ENSGT00940000155782 #11	ENSGT00940000160317 #12	ENSGT00390000014513 #13	ENSGT00940000160250 #14	ENSGT00940000155061.a.b #15	ENSGT00940000160968 #16	ENSGT00940000156925 #17	ENSGT00940000161801 #18	ENSGT01050000244965.a #19	ENSGT00730000111092 #20	ENSGT00950000183137.a #21	ENSGT00390000005639.a.b #22	ENSGT00390000001546 #23	ENSGT00390000002554 #24	ENSGT00940000157798 #25	ENSGT00390000007726.a.a #26	ENSGT00940000158796 #27	ENSGT00940000159518 #28	ENSGT00390000005029 #30	ENSGT00390000014031 #31	ENSGT00940000158515 #32	ENSGT00940000159672 #33	ENSGT00940000161756 #34	ENSGT00940000158698 #35	ENSGT00530000063555.B #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #37	ENSGT00950000183002.C
Cow	MODERN SPECIES	18	SFXN2 (ENSBTAG00000004321) #7	ARL3 (ENSBTAG00000004318) #8	TRIM8 (ENSBTAG00000021071) #9	SUFU (ENSBTAG00000021068) #10	ACTR1A (ENSBTAG00000021067) #11	MFSD13A (ENSBTAG00000021065) #12	CUEDC2 (ENSBTAG00000002501) #13	FBXL15 (ENSBTAG00000002500) #14	PSD (ENSBTAG00000003580) #15	NFKB2 (ENSBTAG00000006017) #16	GBF1 (ENSBTAG00000006014) #17	PITX3 (ENSBTAG00000015702) #18	ELOVL3 (ENSBTAG00000015700) #19	NOLC1 (ENSBTAG00000007435) #20	PPRC1 (ENSBTAG00000007427) #21	LDB1 (ENSBTAG00000005780) #22	HPS6 (ENSBTAG00000021942) #23	ARMH3 (ENSBTAG00000013120) #24	KCNIP2 (ENSBTAG00000016343) #25	OGA (ENSBTAG00000016336) #26	NPM3 (ENSBTAG00000016335) #27	FGF8 (ENSBTAG00000001530) #28	ENSBTAG00000053939	FBXW4 (ENSBTAG00000003579) #30	DPCD (ENSBTAG00000003578) #31	POLL (ENSBTAG00000003576) #32	BTRC (ENSBTAG00000007476) #33	LBX1 (ENSBTAG00000002261) #34	TLX1 (ENSBTAG00000011080) #35	KAZALD1 (ENSBTAG00000011489) #36	SFXN3 (ENSBTAG00000005015) #37
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	18	SFXN2 (ENSBIXG00005013232) #7	ARL3 (ENSBIXG00005013209) #8	TRIM8 (ENSBIXG00005013186) #9	SUFU (ENSBIXG00005013143) #10	ACTR1A (ENSBIXG00005001499) #11	MFSD13A (ENSBIXG00005013036) #12	CUEDC2 (ENSBIXG00005012994) #13	FBXL15 (ENSBIXG00005012972) #14	PSD (ENSBIXG00005012950) #15	NFKB2 (ENSBIXG00005012914) #16	GBF1 (ENSBIXG00005012824) #17	PITX3 (ENSBIXG00005012731) #18	ELOVL3 (ENSBIXG00005001400) #19	NOLC1 (ENSBIXG00005005482) #20	PPRC1 (ENSBIXG00005012646) #21	LDB1 (ENSBIXG00005012537) #22	HPS6 (ENSBIXG00005000333) #23	ARMH3 (ENSBIXG00005012509) #24	KCNIP2 (ENSBIXG00005012451) #25	OGA (ENSBIXG00005001256) #26	NPM3 (ENSBIXG00005012095) #27	FGF8 (ENSBIXG00005012077) #28	FBXW4 (ENSBIXG00005012014) #30	ENSBIXG00005001225	DPCD (ENSBIXG00005011989) #31	POLL (ENSBIXG00005000418) #32	BTRC (ENSBIXG00005011868) #33	LBX1 (ENSBIXG00005011727) #34	TLX1 (ENSBIXG00005001152) #35	KAZALD1 (ENSBIXG00005011702) #36	SFXN3 (ENSBIXG00005011674) #37
American bison	MODERN SPECIES	3316	ARL3 (ENSBBBG00000022525) #8	TRIM8 (ENSBBBG00000022513) #9	SUFU (ENSBBBG00000022501) #10	ACTR1A (ENSBBBG00000022481) #11	MFSD13A (ENSBBBG00000005916) #12	CUEDC2 (ENSBBBG00000022416) #13	FBXL15 (ENSBBBG00000022406) #14	PSD (ENSBBBG00000022390) #15	ENSBBBG00000022351	NFKB2 (ENSBBBG00000005894) #16	GBF1 (ENSBBBG00000022275) #17	PITX3 (ENSBBBG00000022213) #18	ELOVL3 (ENSBBBG00000022200) #19	NOLC1 (ENSBBBG00000005854) #20	PPRC1 (ENSBBBG00000007281) #21	LDB1 (ENSBBBG00000005829) #22	HPS6 (ENSBBBG00000022074) #23	ARMH3 (ENSBBBG00000007684) #24	KCNIP2 (ENSBBBG00000022027) #25	OGA (ENSBBBG00000005781) #26	NPM3 (ENSBBBG00000021685) #27	FGF8 (ENSBBBG00000005761) #28	FBXW4 (ENSBBBG00000021667) #30	DPCD (ENSBBBG00000021651) #31	POLL (ENSBBBG00000021635) #32	BTRC (ENSBBBG00000021525) #33	LBX1 (ENSBBBG00000021437) #34	TLX1 (ENSBBBG00000021434) #35	KAZALD1 (ENSBBBG00000021426) #36	SFXN3 (ENSBBBG00000021411) #37	PDZD7 (ENSBBBG00000021381)