Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b #22 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000014262 ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b Glires ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b #22 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000014262 ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b Rodentia ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b #22 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ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B Myomorpha DUPLICATION Myomorpha DUPLICATION Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b #22 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B Muroidea ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b #22 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b #22 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B ENSGT00940000158106 Murinae DUPLICATION Murinae DUPLICATION Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b #22 Rat DUPLICATION Rat DUPLICATION Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 6 Dnase1l3 (ENSRNOG00000009291) #7 Abhd6 (ENSRNOG00000008167) #8 Rpp14 (ENSRNOG00000039829) #9 Rpp14 (ENSRNOG00000063660) #10 Pxk (ENSRNOG00000008024) #11 Pdhb (ENSRNOG00000007895) #12 AABR07072440.1 (ENSRNOG00000033030) #13 ENSRNOG00000028821 #14 Kctd6 (ENSRNOG00000007817) #15 Acox2 (ENSRNOG00000007378) #16 Fam107a (ENSRNOG00000033261) #17 Fam3d (ENSRNOG00000007320) #18 ENSRNOG00000070952 #19 Cfap20dc (ENSRNOG00000007206) #20 Fhit (ENSRNOG00000064939) #21 Tpt1-ps2 (ENSRNOG00000070732) #22 Ptprg (ENSRNOG00000009419) #23 LOC103693281 (ENSRNOG00000063454) #24 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(ENSRNOG00000004831) ENSRNOG00000067243 Ano6 (ENSRNOG00000006995) Dbx2 (ENSRNOG00000006885) Nell2 (ENSRNOG00000006235) Tmem117 (ENSRNOG00000006068) ENSRNOG00000064416 Twf1 (ENSRNOG00000022507) Rat MODERN SPECIES 4 Tmem163 (ENSRNOG00000003769) Mgat5 (ENSRNOG00000003614) ENSRNOG00000066401 tuba1c-ps1 (ENSRNOG00000070079) Nckap5 (ENSRNOG00000021553) Lypd1 (ENSRNOG00000003453) Gpr39 (ENSRNOG00000021586) Slc35f5 (ENSRNOG00000003403) LOC100362110 (ENSRNOG00000030481) ##19 Actr3 (ENSRNOG00000003206) Dpp10 (ENSRNOG00000002595) LOC103690298 (ENSRNOG00000029868) Htr5b (ENSRNOG00000002549) Ccdc93 (ENSRNOG00000002514) Insig2 (ENSRNOG00000002478) Tpt1-ps1 (ENSRNOG00000069572) ##22 En1 (ENSRNOG00000056580) Marco (ENSRNOG00000049303) C1ql2 (ENSRNOG00000046863) Steap3 (ENSRNOG00000049471) C13h2orf76 (ENSRNOG00000045570) Dbi (ENSRNOG00000046889) Tmem37 (ENSRNOG00000047714) Sctr (ENSRNOG00000049766) Cfap221 (ENSRNOG00000056781) Tmem177 (ENSRNOG00000025484) Ptpn4 (ENSRNOG00000002625) Epb41l5 (ENSRNOG00000002538) Tmem185b (ENSRNOG00000067956) Ralb (ENSRNOG00000002440) Inhbb (ENSRNOG00000060237) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2421 Cd209g (ENSMSIG00000031055) ENSMSIG00000031053 #22 ENSMSIG00000031050 Evi5l (ENSMSIG00000031036) Lrrc8e (ENSMSIG00000031033) Map2k7 (ENSMSIG00000031016) Tgfbr3l (ENSMSIG00000031012) Snapc2 (ENSMSIG00000031008) Ctxn1 (ENSMSIG00000031007) Timm44 (ENSMSIG00000030996) Elavl1 (ENSMSIG00000030993) Ccl25 (ENSMSIG00000030978) Cers4 (ENSMSIG00000030972) Murinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.a ##22 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B ENSGT00940000158106 Mus ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.a ##22 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00860000135855 ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B Mus_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.a ##22 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00860000135855 ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B Ryukyu mouse MODERN SPECIES 5 Nudt15 (MGP_CAROLIEiJ_G0019503) Sucla2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019504) Htr2a (MGP_CAROLIEiJ_G0019505) Esd (MGP_CAROLIEiJ_G0019506) Lrch1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019507) Rubcnl (MGP_CAROLIEiJ_G0019508) Lrrc63 (MGP_CAROLIEiJ_G0019509) Lcp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019510) Cpb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019511) Zc3h13 (MGP_CAROLIEiJ_G0019512) Siah3 (MGP_CAROLIEiJ_G0019513) Cby2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019514) MGP_CAROLIEiJ_G0019515 Cog3 (MGP_CAROLIEiJ_G0019516) Slc25a30 (MGP_CAROLIEiJ_G0019517) Tpt1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019518) ##22 Gtf2f2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019519) Kctd4 (MGP_CAROLIEiJ_G0019520) Gpalpp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019521) Nufip1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019522) Tsc22d1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019523) Serp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019524) MGP_CAROLIEiJ_G0019525 Ccdc122 (MGP_CAROLIEiJ_G0019526) Enox1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019527) MGP_CAROLIEiJ_G0019528 Dnajc15 (MGP_CAROLIEiJ_G0019529) Epsti1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019530) Fam216b (MGP_CAROLIEiJ_G0019531) Tnfsf11 (MGP_CAROLIEiJ_G0019532) Akap11 (MGP_CAROLIEiJ_G0019533) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864.db ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.a ##22 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00860000135855 ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B Mouse MODERN SPECIES 5 Nudt15 (ENSMUSG00000033405) Sucla2 (ENSMUSG00000022110) Htr2a (ENSMUSG00000034997) Esd (ENSMUSG00000021996) Lrch1 (ENSMUSG00000068015) Rubcnl (ENSMUSG00000034959) Lrrc63 (ENSMUSG00000021997) Lcp1 (ENSMUSG00000021998) Cpb2 (ENSMUSG00000021999) Zc3h13 (ENSMUSG00000022000) Siah3 (ENSMUSG00000091722) Cby2 (ENSMUSG00000034913) Erich6b (ENSMUSG00000022002) Cog3 (ENSMUSG00000034893) Slc25a30 (ENSMUSG00000022003) Tpt1 (ENSMUSG00000060126) ##22 Gtf2f2 (ENSMUSG00000067995) Kctd4 (ENSMUSG00000046523) Gpalpp1 (ENSMUSG00000022008) Nufip1 (ENSMUSG00000022009) Tsc22d1 (ENSMUSG00000022010) Serp2 (ENSMUSG00000052584) Lacc1 (ENSMUSG00000044350) Ccdc122 (ENSMUSG00000034795) Enox1 (ENSMUSG00000022012) Dnajc15 (ENSMUSG00000022013) Epsti1 (ENSMUSG00000022014) Fam216b (ENSMUSG00000045655) Tnfsf11 (ENSMUSG00000022015) Akap11 (ENSMUSG00000022016) Dgkh (ENSMUSG00000034731) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864.db ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00520000061084 ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.a ##22 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00860000135855 ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B spretus MODERN SPECIES 5 Sucla2 (MGP_SPRETEiJ_G0020399) Htr2a (MGP_SPRETEiJ_G0020400) Esd (MGP_SPRETEiJ_G0020401) Lrch1 (MGP_SPRETEiJ_G0020402) Rubcnl (MGP_SPRETEiJ_G0020403) Lrrc63 (MGP_SPRETEiJ_G0020404) Lcp1 (MGP_SPRETEiJ_G0020405) Cpb2 (MGP_SPRETEiJ_G0020406) Zc3h13 (MGP_SPRETEiJ_G0020407) MGP_SPRETEiJ_G0020408 Siah3 (MGP_SPRETEiJ_G0020409) Cby2 (MGP_SPRETEiJ_G0020410) MGP_SPRETEiJ_G0020411 Cog3 (MGP_SPRETEiJ_G0020412) Slc25a30 (MGP_SPRETEiJ_G0020413) Tpt1 (MGP_SPRETEiJ_G0020414) ##22 Gtf2f2 (MGP_SPRETEiJ_G0020415) Kctd4 (MGP_SPRETEiJ_G0020416) Gpalpp1 (MGP_SPRETEiJ_G0020417) Nufip1 (MGP_SPRETEiJ_G0020418) Tsc22d1 (MGP_SPRETEiJ_G0020419) Serp2 (MGP_SPRETEiJ_G0020420) MGP_SPRETEiJ_G0020421 Ccdc122 (MGP_SPRETEiJ_G0020422) Enox1 (MGP_SPRETEiJ_G0020423) MGP_SPRETEiJ_G0020424 Dnajc15 (MGP_SPRETEiJ_G0020425) Epsti1 (MGP_SPRETEiJ_G0020426) Fam216b (MGP_SPRETEiJ_G0020427) Tnfsf11 (MGP_SPRETEiJ_G0020428) Akap11 (MGP_SPRETEiJ_G0020429) Steppe mouse MODERN SPECIES 2580 ENSMSIG00000020267 ##22 ENSMSIG00000020264 Wac (ENSMSIG00000020012) Rat MODERN SPECIES 6 Nudt15 (ENSRNOG00000025239) Sucla2 (ENSRNOG00000017481) Htr2a (ENSRNOG00000010063) Esd (ENSRNOG00000009512) Lrch1 (ENSRNOG00000009412) Rubcnl (ENSRNOG00000022760) Lrrc63 (ENSRNOG00000038291) Esco2-ps2 (ENSRNOG00000029520) Lcp1 (ENSRNOG00000010319) Cpb2 (ENSRNOG00000010935) Zc3h13 (ENSRNOG00000011237) Siah3 (ENSRNOG00000043061) Cby2 (ENSRNOG00000047413) Cog3 (ENSRNOG00000000155) Slc25a30 (ENSRNOG00000001052) Tpt1 (ENSRNOG00000001049) ##22 Gtf2f2 (ENSRNOG00000029316) Kctd4 (ENSRNOG00000050996) Gpalpp1 (ENSRNOG00000001037) Nufip1 (ENSRNOG00000001033) ENSRNOG00000070802 Tsc22d1 (ENSRNOG00000001030) Serp2 (ENSRNOG00000038228) Lacc1 (ENSRNOG00000022094) Ccdc122 (ENSRNOG00000042404) Enox1 (ENSRNOG00000047817) Dnajc15 (ENSRNOG00000009063) Epsti1 (ENSRNOG00000009471) Fam216b (ENSRNOG00000021943) Tnfsf11 (ENSRNOG00000071047) Akap11 (ENSRNOG00000009987) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 41 Foxa2 (ENSMSIG00000002945) Sstr4 (ENSMSIG00000002973) Thbd (ENSMSIG00000002989) Cd93 (ENSMSIG00000002996) ENSMSIG00000003019 ##22 Nxt1 (ENSMSIG00000003067) Gzf1 (ENSMSIG00000003080) Napb (ENSMSIG00000003094) Cstl1 (ENSMSIG00000003118) Cst11 (ENSMSIG00000003137) Cstdc1 (ENSMSIG00000003153) Cst12 (ENSMSIG00000003169) Cst8 (ENSMSIG00000003194) Cst13 (ENSMSIG00000003223) Cst9 (ENSMSIG00000003261) Cstdc2 (ENSMSIG00000003283) Cst3 (ENSMSIG00000003295) Steppe mouse MODERN SPECIES 2804 Msantd2 (ENSMSIG00000015172) Esam (ENSMSIG00000015194) Vsig2 (ENSMSIG00000015220) Nrgn (ENSMSIG00000015277) Spa17 (ENSMSIG00000015289) Siae (ENSMSIG00000015296) Tbrg1 (ENSMSIG00000015383) Panx3 (ENSMSIG00000015407) ENSMSIG00000015418 ##22 Or8a1 (ENSMSIG00000015428) Or8a1b (ENSMSIG00000015433) Or8b12 (ENSMSIG00000015446) Or8b12c (ENSMSIG00000015455) Or8b9 (ENSMSIG00000015471) Or8b8 (ENSMSIG00000015480) Or8b4 (ENSMSIG00000015494) Or8b35 (ENSMSIG00000015505) Or8b36 (ENSMSIG00000015512) Or8b37 (ENSMSIG00000015522) Or8b39 (ENSMSIG00000015543) Or8b101 (ENSMSIG00000015560) Or8b40 (ENSMSIG00000015567) Or8b41 (ENSMSIG00000015572) ENSMSIG00000015593 Shrew mouse MODERN SPECIES 21 MGP_PahariEiJ_G0030521 Sucla2 (MGP_PahariEiJ_G0030522) Htr2a (MGP_PahariEiJ_G0030523) Esd (MGP_PahariEiJ_G0030524) Lrch1 (MGP_PahariEiJ_G0030525) Rubcnl (MGP_PahariEiJ_G0030526) Lrrc63 (MGP_PahariEiJ_G0030527) Lcp1 (MGP_PahariEiJ_G0030528) Cpb2 (MGP_PahariEiJ_G0030529) Zc3h13 (MGP_PahariEiJ_G0030530) Siah3 (MGP_PahariEiJ_G0030531) Cby2 (MGP_PahariEiJ_G0030532) MGP_PahariEiJ_G0030533 Cog3 (MGP_PahariEiJ_G0030534) Slc25a30 (MGP_PahariEiJ_G0030535) Tpt1 (MGP_PahariEiJ_G0030536) ##22 Gtf2f2 (MGP_PahariEiJ_G0030537) Kctd4 (MGP_PahariEiJ_G0030538) Gpalpp1 (MGP_PahariEiJ_G0030539) Nufip1 (MGP_PahariEiJ_G0030540) Tsc22d1 (MGP_PahariEiJ_G0030541) Serp2 (MGP_PahariEiJ_G0030542) Lacc1 (MGP_PahariEiJ_G0030543) Ccdc122 (MGP_PahariEiJ_G0030544) Enox1 (MGP_PahariEiJ_G0030545) MGP_PahariEiJ_G0030546 Dnajc15 (MGP_PahariEiJ_G0030547) Epsti1 (MGP_PahariEiJ_G0030548) Fam216b (MGP_PahariEiJ_G0030549) Tnfsf11 (MGP_PahariEiJ_G0030550) Akap11 (MGP_PahariEiJ_G0030551) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b #22 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000012569.b.a ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B ENSGT00940000158106 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b #22 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000016051 ENSGT00390000012569.b.a ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B ENSGT00940000158106 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 3 Med4 (ENSCGRG00001018208) Nudt15 (ENSCGRG00001001521) SUCLA2 (ENSCGRG00001009190) HTR2A (ENSCGRG00001000307) ENSCGRG00001015731 Lrch1 (ENSCGRG00001021051) Rubcnl (ENSCGRG00001015225) Lrrc63 (ENSCGRG00001021365) Lcp1 (ENSCGRG00001021099) Cpb2 (ENSCGRG00001000100) Zc3h13 (ENSCGRG00001014490) Siah3 (ENSCGRG00001022985) Cby2 (ENSCGRG00001019775) Cog3 (ENSCGRG00001023420) Slc25a30 (ENSCGRG00001009475) Tpt1 (ENSCGRG00001019454) #22 Gtf2f2 (ENSCGRG00001015200) Kctd4 (ENSCGRG00001001160) Gpalpp1 (ENSCGRG00001020996) Nufip1 (ENSCGRG00001012209) Tsc22d1 (ENSCGRG00001001346) Serp2 (ENSCGRG00001003518) Lacc1 (ENSCGRG00001020034) Ccdc122 (ENSCGRG00001006861) Enox1 (ENSCGRG00001014073) Dnajc15 (ENSCGRG00001000292) Epsti1 (ENSCGRG00001009306) Fam216b (ENSCGRG00001000086) Tnfsf11 (ENSCGRG00001013327) Akap11 (ENSCGRG00001020906) Dgkh (ENSCGRG00001012161) Golden Hamster MODERN SPECIES 642 Itm2b (ENSMAUG00000017281) Med4 (ENSMAUG00000021269) Nudt15 (ENSMAUG00000018405) Sucla2 (ENSMAUG00000008374) Htr2a (ENSMAUG00000011880) Esd (ENSMAUG00000021229) Lrch1 (ENSMAUG00000001816) Lrrc63 (ENSMAUG00000017212) ENSMAUG00000017813 Cpb2 (ENSMAUG00000011270) ENSMAUG00000005243 Siah3 (ENSMAUG00000016684) Cby2 (ENSMAUG00000021027) Cog3 (ENSMAUG00000018785) Slc25a30 (ENSMAUG00000012973) Tpt1 (ENSMAUG00000014012) #22 Kctd4 (ENSMAUG00000005135) Gtf2f2 (ENSMAUG00000018898) Gpalpp1 (ENSMAUG00000021389) Nufip1 (ENSMAUG00000021413) ENSMAUG00000014274 Serp2 (ENSMAUG00000019897) Lacc1 (ENSMAUG00000018912) ENSMAUG00000013996 Enox1 (ENSMAUG00000019233) Dnajc15 (ENSMAUG00000009642) Epsti1 (ENSMAUG00000018985) Fam216b (ENSMAUG00000014549) Tnfsf11 (ENSMAUG00000001005) Akap11 (ENSMAUG00000016985) Dgkh (ENSMAUG00000017457) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000161772 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b #22 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000012569.b.a ENSGT00390000003758 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B ENSGT00940000158106 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 8 Ttf2 (ENSMOCG00000008415) Ptgfrn (ENSMOCG00000020768) Igsf3 (ENSMOCG00000005813) Atp1a1 (ENSMOCG00000006963) Mab21l3 (ENSMOCG00000016617) ENSMOCG00000020465 Nhlh2 (ENSMOCG00000007572) Casq2 (ENSMOCG00000014851) Vangl1 (ENSMOCG00000018281) Ngf (ENSMOCG00000021179) Tspan2 (ENSMOCG00000003591) Tshb (ENSMOCG00000006126) Sycp1 (ENSMOCG00000009622) Nr1h5 (ENSMOCG00000012316) Sike1 (ENSMOCG00000000516) ENSMOCG00000009367 #22 Csde1 (ENSMOCG00000018960) Nras (ENSMOCG00000022441) Ampd1 (ENSMOCG00000010785) Dennd2c (ENSMOCG00000009830) Bcas2 (ENSMOCG00000013157) Trim33 (ENSMOCG00000013853) Syt6 (ENSMOCG00000017004) Olfml3 (ENSMOCG00000001104) Hipk1 (ENSMOCG00000009217) Dclre1b (ENSMOCG00000014786) Ap4b1 (ENSMOCG00000002528) Chil6 (ENSMOCG00000000792) Dennd2d (ENSMOCG00000020692) Cept1 (ENSMOCG00000014223) Dram2 (ENSMOCG00000018158) Prairie vole MODERN SPECIES Akap5 (ENSMOCG00000021957) ENSMOCG00000005905 Zbtb1 (ENSMOCG00000006992) Ppp1r36 (ENSMOCG00000018162) Plekhg3 (ENSMOCG00000011351) Sptb (ENSMOCG00000005817) Fntb (ENSMOCG00000017411) Gpx2 (ENSMOCG00000017976) Rab15 (ENSMOCG00000018796) Max (ENSMOCG00000013047) ENSMOCG00000013818 Fut8 (ENSMOCG00000022113) Gm6657 (ENSMOCG00000015223) Gphn (ENSMOCG00000022692) ENSMOCG00000007706 ENSMOCG00000017766 #22 Garin2 (ENSMOCG00000019257) Pals1 (ENSMOCG00000021385) Atp6v1d (ENSMOCG00000001465) ENSMOCG00000003380 Plek2 (ENSMOCG00000013960) Tmem229b (ENSMOCG00000017579) Plekhh1 (ENSMOCG00000009101) Pigh (ENSMOCG00000017829) Arg2 (ENSMOCG00000019522) ENSMOCG00000020131 Rdh11 (ENSMOCG00000017818) Rdh12 (ENSMOCG00000012262) Zfyve26 (ENSMOCG00000015283) Rad51b (ENSMOCG00000021684) Zfp36l1 (ENSMOCG00000003189) Prairie vole MODERN SPECIES 84 ENSMOCG00000020138 ENSMOCG00000016285 ENSMOCG00000009387 Edem1 (ENSMOCG00000020129) Arl8b (ENSMOCG00000018769) Bhlhe40 (ENSMOCG00000014385) Itpr1 (ENSMOCG00000002247) Sumf1 (ENSMOCG00000014598) Setmar (ENSMOCG00000003026) Lrrn1 (ENSMOCG00000001702) Crbn (ENSMOCG00000019318) Trnt1 (ENSMOCG00000004539) Il5ra (ENSMOCG00000015311) Cntn4 (ENSMOCG00000013257) Cntn6 (ENSMOCG00000005399) ENSMOCG00000009333 #22 ENSMOCG00000016932 ENSMOCG00000020899 ENSMOCG00000002512 ENSMOCG00000021562 Cntn3 (ENSMOCG00000007453) ENSMOCG00000009808 Pdzrn3 (ENSMOCG00000015544) ENSMOCG00000000955 Gxylt2 (ENSMOCG00000001994) Shq1 (ENSMOCG00000017836) ENSMOCG00000006102 Prok2 (ENSMOCG00000016202) Gpr27 (ENSMOCG00000010723) Eif4e3 (ENSMOCG00000020297) Foxp1 (ENSMOCG00000013376) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 22 Nudt15 (ENSPEMG00000013922) Sucla2 (ENSPEMG00000020269) ENSPEMG00000024389 Htr2a (ENSPEMG00000019339) Esd (ENSPEMG00000019972) Lrch1 (ENSPEMG00000019644) Rubcnl (ENSPEMG00000008281) Lrrc63 (ENSPEMG00000020509) Lcp1 (ENSPEMG00000009810) Cpb2 (ENSPEMG00000021086) Zc3h13 (ENSPEMG00000021979) Siah3 (ENSPEMG00000028254) Cby2 (ENSPEMG00000020758) Cog3 (ENSPEMG00000020827) Slc25a30 (ENSPEMG00000022181) Tpt1 (ENSPEMG00000001813) #22 Gtf2f2 (ENSPEMG00000027889) Kctd4 (ENSPEMG00000006357) Gpalpp1 (ENSPEMG00000000218) Nufip1 (ENSPEMG00000023639) ENSPEMG00000012421 Tsc22d1 (ENSPEMG00000022760) ENSPEMG00000024909 Lacc1 (ENSPEMG00000011166) Ccdc122 (ENSPEMG00000013832) Enox1 (ENSPEMG00000009188) Dnajc15 (ENSPEMG00000017585) Epsti1 (ENSPEMG00000012785) Fam216b (ENSPEMG00000010168) Tnfsf11 (ENSPEMG00000026330) Akap11 (ENSPEMG00000017768) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 390 Cog3 (ENSNGAG00000011423) Slc25a30 (ENSNGAG00000006726) Tpt1 (ENSNGAG00000002203) #22 ENSNGAG00000001072 Kctd4 (ENSNGAG00000000924) Gtf2f2 (ENSNGAG00000012083) Gpalpp1 (ENSNGAG00000011284) Nufip1 (ENSNGAG00000010233) Tsc22d1 (ENSNGAG00000008524) ENSNGAG00000008318 Serp2 (ENSNGAG00000007577) Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 349 ENSJJAG00000000293 #22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 104 Ndufaf4 (ENSJJAG00000023657) Gpr63 (ENSJJAG00000013298) Fhl5 (ENSJJAG00000000636) Ufl1 (ENSJJAG00000006182) ENSJJAG00000010016 ENSJJAG00000013253 Fut9 (ENSJJAG00000022594) ENSJJAG00000023083 Manea (ENSJJAG00000023182) ENSJJAG00000023315 ENSJJAG00000023379 Epha7 (ENSJJAG00000016879) ENSJJAG00000017184 ENSJJAG00000017512 ENSJJAG00000017791 ENSJJAG00000017896 #22 ENSJJAG00000018137 ENSJJAG00000018365 Map3k7 (ENSJJAG00000020494) ENSJJAG00000013324 Bach2 (ENSJJAG00000002786) Gja10 (ENSJJAG00000006111) ENSJJAG00000009996 ENSJJAG00000010339 Mdn1 (ENSJJAG00000015545) Lyrm2 (ENSJJAG00000020170) Ankrd6 (ENSJJAG00000021174) ENSJJAG00000022275 Rragd (ENSJJAG00000000282) ENSJJAG00000000713 Gabrr2 (ENSJJAG00000001074) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 25 ENSJJAG00000011543 #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 4 Med4 (ENSMOCG00000002608) Nudt15 (ENSMOCG00000003875) ENSMOCG00000011477 Htr2a (ENSMOCG00000012645) ENSMOCG00000016070 Lrch1 (ENSMOCG00000017560) Rubcnl (ENSMOCG00000003331) Lrrc63 (ENSMOCG00000018528) Lcp1 (ENSMOCG00000010746) Cpb2 (ENSMOCG00000006393) ENSMOCG00000001346 Siah3 (ENSMOCG00000009347) Cby2 (ENSMOCG00000014959) Cog3 (ENSMOCG00000002598) Slc25a30 (ENSMOCG00000010410) ENSMOCG00000016698 ##22 Gtf2f2 (ENSMOCG00000020515) Kctd4 (ENSMOCG00000008795) ENSMOCG00000009812 Nufip1 (ENSMOCG00000008223) ENSMOCG00000018072 Serp2 (ENSMOCG00000022234) Lacc1 (ENSMOCG00000011112) Enox1 (ENSMOCG00000012930) ENSMOCG00000014539 Slitrk1 (ENSMOCG00000008123) ENSMOCG00000017655 ENSMOCG00000007797 ENSMOCG00000005944 Slitrk6 (ENSMOCG00000013923) ENSMOCG00000017964 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 17 Adra2b (ENSPEMG00000007923) Gpat2 (ENSPEMG00000008852) Fahd2a (ENSPEMG00000000091) Kcnip3 (ENSPEMG00000021898) Prom2 (ENSPEMG00000000045) ENSPEMG00000027287 Zfp661 (ENSPEMG00000010394) Mrps5 (ENSPEMG00000012667) Mal (ENSPEMG00000009328) Mall (ENSPEMG00000029281) Nphp1 (ENSPEMG00000021264) Mtln (ENSPEMG00000027381) Bub1 (ENSPEMG00000021304) Acoxl (ENSPEMG00000009101) Bcl2l11 (ENSPEMG00000029663) ENSPEMG00000021203 ##22 Spdye4c (ENSPEMG00000017180) Anapc1 (ENSPEMG00000029252) Mertk (ENSPEMG00000002990) Tmem87b (ENSPEMG00000001091) Fbln7 (ENSPEMG00000010454) Zc3h8 (ENSPEMG00000011068) Zc3h6 (ENSPEMG00000000918) Vinac1 (ENSPEMG00000004724) Ttl (ENSPEMG00000006748) Polr1b (ENSPEMG00000008619) Chchd5 (ENSPEMG00000010023) Slc20a1 (ENSPEMG00000010382) Ckap2l (ENSPEMG00000010844) Il1a (ENSPEMG00000011300) Il1b (ENSPEMG00000011618) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 126 ENSJJAG00000012033 ENSJJAG00000006493 Htr2a (ENSJJAG00000005538) Esd (ENSJJAG00000004979) Lrch1 (ENSJJAG00000000346) Rubcnl (ENSJJAG00000021497) Lcp1 (ENSJJAG00000021331) Cpb2 (ENSJJAG00000020705) Zc3h13 (ENSJJAG00000019971) ENSJJAG00000019522 Siah3 (ENSJJAG00000019440) Cby2 (ENSJJAG00000019147) Cog3 (ENSJJAG00000018271) Slc25a30 (ENSJJAG00000017335) ENSJJAG00000016940 ENSJJAG00000016541 ##22 Kctd4 (ENSJJAG00000012151) Gtf2f2 (ENSJJAG00000015891) Gpalpp1 (ENSJJAG00000015544) Nufip1 (ENSJJAG00000015369) ENSJJAG00000015078 Serp2 (ENSJJAG00000021557) ENSJJAG00000021469 Lacc1 (ENSJJAG00000021351) Ccdc122 (ENSJJAG00000021044) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 33 Wfikkn2 (ENSCGRG00001022356) Luc7l3 (ENSCGRG00001009809) ENSCGRG00001020484 Abcc3 (ENSCGRG00001010018) Cacna1g (ENSCGRG00001002871) Spata20 (ENSCGRG00001006141) Epn3 (ENSCGRG00001009708) Mycbpap (ENSCGRG00001004065) Rsad1 (ENSCGRG00001020971) Acsf2 (ENSCGRG00001006504) Chad (ENSCGRG00001017300) Lrrc59 (ENSCGRG00001003469) Eme1 (ENSCGRG00001012113) Mrpl27 (ENSCGRG00001018944) Xylt2 (ENSCGRG00001021636) ENSCGRG00001017654 ##22 ENSCGRG00001022011 Col1a1 (ENSCGRG00001020668) Sgca (ENSCGRG00001019141) H1f9 (ENSCGRG00001005718) Ppp1r9b (ENSCGRG00001012352) Samd14 (ENSCGRG00001002338) Pdk2 (ENSCGRG00001014853) Itga3 (ENSCGRG00001021353) Dlx3 (ENSCGRG00001022154) Dlx4 (ENSCGRG00001019843) Tac4 (ENSCGRG00001001077) ENSCGRG00001005107 Fam117a (ENSCGRG00001009494) Slc35b1 (ENSCGRG00001006734) Spop (ENSCGRG00001024062) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Mrps27 (ENSCGRG00001016241) Ptcd2 (ENSCGRG00001015289) Zfp366 (ENSCGRG00001006020) ENSCGRG00001003516 H2bl1 (ENSCGRG00001007283) Tnpo1 (ENSCGRG00001016580) Fcho2 (ENSCGRG00001013782) Tmem171 (ENSCGRG00001016096) Tmem174 (ENSCGRG00001011496) Foxd1 (ENSCGRG00001010743) Btf3 (ENSCGRG00001009745) ENSCGRG00001008466 Ankra2 (ENSCGRG00001014449) Utp15 (ENSCGRG00001013836) Arhgef28 (ENSCGRG00001018993) ENSCGRG00001017370 ##22 Enc1 (ENSCGRG00001009896) ENSCGRG00001021658 Hexb (ENSCGRG00001020320) Gfm2 (ENSCGRG00001022802) ENSCGRG00001012819 Fam169a (ENSCGRG00001021297) Gcnt4 (ENSCGRG00001008293) ENSCGRG00001008489 ENSCGRG00001014554 Ankrd31 (ENSCGRG00001018162) HMGCR (ENSCGRG00001016870) Cert1 (ENSCGRG00001020451) Polk (ENSCGRG00001013007) ENSCGRG00001012277 #12 Ankdd1b (ENSCGRG00001016471) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 11 Pik3r3 (ENSPEMG00000022142) Mast2 (ENSPEMG00000022608) Ipp (ENSPEMG00000023410) Tmem69 (ENSPEMG00000022999) Gpbp1l1 (ENSPEMG00000023022) Ccdc17 (ENSPEMG00000022313) Nasp (ENSPEMG00000011490) Akr1a1 (ENSPEMG00000015504) ENSPEMG00000022257 Mmachc (ENSPEMG00000026955) ENSPEMG00000000268 Tesk2 (ENSPEMG00000022010) Toe1 (ENSPEMG00000021892) Mutyh (ENSPEMG00000016657) Hpdl (ENSPEMG00000008997) ENSPEMG00000024772 ##22 Zswim5 (ENSPEMG00000023604) Urod (ENSPEMG00000021743) Hectd3 (ENSPEMG00000021103) Eif2b3 (ENSPEMG00000023218) Ptch2 (ENSPEMG00000012618) Btbd19 (ENSPEMG00000023770) Dynlt4 (ENSPEMG00000013222) Plk3 (ENSPEMG00000023420) ENSPEMG00000021333 ENSPEMG00000022449 Kif2c (ENSPEMG00000023831) Armh1 (ENSPEMG00000011612) Tmem53 (ENSPEMG00000022378) Rnf220 (ENSPEMG00000022794) Eri3 (ENSPEMG00000024037) Kangaroo rat MODERN SPECIES 320 Med4 (ENSDORG00000024480) Nudt15 (ENSDORG00000003751) Sucla2 (ENSDORG00000010319) Htr2a (ENSDORG00000029019) Esd (ENSDORG00000013997) Lrch1 (ENSDORG00000013992) ENSDORG00000024657 Rubcnl (ENSDORG00000014634) Lcp1 (ENSDORG00000000603) Cpb2 (ENSDORG00000000602) Zc3h13 (ENSDORG00000000600) Siah3 (ENSDORG00000024143) Cby2 (ENSDORG00000026204) Cog3 (ENSDORG00000002499) Slc25a30 (ENSDORG00000004865) Tpt1 (ENSDORG00000008518) #22 Kctd4 (ENSDORG00000003773) Gtf2f2 (ENSDORG00000002860) Gpalpp1 (ENSDORG00000003360) Nufip1 (ENSDORG00000003359) ENSDORG00000025839 Serp2 (ENSDORG00000028153) Lacc1 (ENSDORG00000015240) Ccdc122 (ENSDORG00000015236) Enox1 (ENSDORG00000001328) Dnajc15 (ENSDORG00000013550) Epsti1 (ENSDORG00000004992) Fam216b (ENSDORG00000007655) Tnfsf11 (ENSDORG00000026136) Dgkh (ENSDORG00000005024) Vwa8 (ENSDORG00000011298) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 25 CDC23 (ENSHGLG00000015847) GFRA3 (ENSHGLG00000005227) CDC25C (ENSHGLG00000046790) ENSHGLG00000048679 FAM53C (ENSHGLG00000042605) KDM3B (ENSHGLG00000004783) REEP2 (ENSHGLG00000041963) EGR1 (ENSHGLG00000048168) ETF1 (ENSHGLG00000004503) ENSHGLG00000005302 LRRTM2 (ENSHGLG00000017761) Ctnna1 (ENSHGLG00000007078) ENSHGLG00000020101 SIL1 (ENSHGLG00000013822) MATR3 (ENSHGLG00000004673) ENSHGLG00000039869 #22 PAIP2 (ENSHGLG00000035595) SLC23A1 (ENSHGLG00000007699) PROB1 (ENSHGLG00000049405) DNAJC18 (ENSHGLG00000005126) SMIM33 (ENSHGLG00000008582) ENSHGLG00000006931 STING1 (ENSHGLG00000032049) UBE2D2 (ENSHGLG00000004792) CXXC5 (ENSHGLG00000007092) PSD2 (ENSHGLG00000008076) NRG2 (ENSHGLG00000009431) PURA (ENSHGLG00000020698) CYSTM1 (ENSHGLG00000012358) ENSHGLG00000040081 ENSHGLG00000048922 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 20 BLZF1 (ENSHGLG00000003011) ENSHGLG00000050690 ENSHGLG00000040907 SLC19A2 (ENSHGLG00000001890) F5 (ENSHGLG00000002250) SELP (ENSHGLG00000001876) SELL (ENSHGLG00000048749) ENSHGLG00000002768 METTL18 (ENSHGLG00000020074) ENSHGLG00000018896 ENSHGLG00000019520 ENSHGLG00000036520 ENSHGLG00000021140 ENSHGLG00000038928 ENSHGLG00000019125 ENSHGLG00000020098 #22 ENSHGLG00000042460 GORAB (ENSHGLG00000042352) ENSHGLG00000035430 ENSHGLG00000015659 ENSHGLG00000015604 ENSHGLG00000004698 ENSHGLG00000017243 ENSHGLG00000048131 ENSHGLG00000017330 ENSHGLG00000048887 ENSHGLG00000036147 ENSHGLG00000008225 ENSHGLG00000007906 ENSHGLG00000045127 ENSHGLG00000046042 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Tarsier MODERN SPECIES 5133 CPB2 (ENSTSYG00000014440) ZC3H13 (ENSTSYG00000000992) SIAH3 (ENSTSYG00000028090) CBY2 (ENSTSYG00000002618) ERICH6B (ENSTSYG00000014169) COG3 (ENSTSYG00000004818) SLC25A30 (ENSTSYG00000011274) TPT1 (ENSTSYG00000003160) #22 KCTD4 (ENSTSYG00000001706) GTF2F2 (ENSTSYG00000001691) GPALPP1 (ENSTSYG00000006358) NUFIP1 (ENSTSYG00000006355) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Horse MODERN SPECIES 11 ENSECAG00000032479 SPOCK3 (ENSECAG00000024906) TLL1 (ENSECAG00000002251) CPE (ENSECAG00000009256) MSMO1 (ENSECAG00000010554) KLHL2 (ENSECAG00000010727) TMEM192 (ENSECAG00000014003) TRIM75 (ENSECAG00000036019) ENSECAG00000042254 ENSECAG00000014971 ENSECAG00000034596 ENSECAG00000042205 ENSECAG00000038371 TRIM61 (ENSECAG00000014985) ENSECAG00000030364 ENSECAG00000014997 #22 SMIM31 (ENSECAG00000040839) MARCHF1 (ENSECAG00000015012) TMA16 (ENSECAG00000015062) TKTL2 (ENSECAG00000002749) NPY5R (ENSECAG00000016236) NPY1R (ENSECAG00000016717) NAF1 (ENSECAG00000016738) ENSECAG00000003023 FSTL5 (ENSECAG00000000973) ENSECAG00000054288 ENSECAG00000029497 RAPGEF2 (ENSECAG00000006983) ENSECAG00000056262 C2H4orf45 (ENSECAG00000009815) FNIP2 (ENSECAG00000010321) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Microbat MODERN SPECIES 944 CDADC1 (ENSMLUG00000003033) ENSMLUG00000007659 FNDC3A (ENSMLUG00000002625) CYSLTR2 (ENSMLUG00000001386) ENSMLUG00000023372 RCBTB2 (ENSMLUG00000008378) LPAR6 (ENSMLUG00000029722) RB1 (ENSMLUG00000008336) ITM2B (ENSMLUG00000008317) ENSMLUG00000013512 SIAH3 (ENSMLUG00000029013) CBY2 (ENSMLUG00000010896) ENSMLUG00000026302 COG3 (ENSMLUG00000016157) SLC25A30 (ENSMLUG00000000506) ENSMLUG00000017709 #22 KCTD4 (ENSMLUG00000010523) ENSMLUG00000010505 ENSMLUG00000008692 NUFIP1 (ENSMLUG00000008916) ENSMLUG00000003971 ENSMLUG00000011786 ENSMLUG00000027027 LACC1 (ENSMLUG00000003112) CCDC122 (ENSMLUG00000009121) ENOX1 (ENSMLUG00000000802) DNAJC15 (ENSMLUG00000008684) ENSMLUG00000015553 FAM216B (ENSMLUG00000012282) TNFSF11 (ENSMLUG00000008819) AKAP11 (ENSMLUG00000026426) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Pig MODERN SPECIES 13 ENSSSCG00000000194 TUBA1A (ENSSSCG00000061347) PRPH (ENSSSCG00000000195) TROAP (ENSSSCG00000023176) C1QL4 (ENSSSCG00000000197) DNAJC22 (ENSSSCG00000000198) SPATS2 (ENSSSCG00000000199) KCNH3 (ENSSSCG00000000203) MCRS1 (ENSSSCG00000000202) FAM186B (ENSSSCG00000000205) PRPF40B (ENSSSCG00000000204) FMNL3 (ENSSSCG00000025114) TMBIM6 (ENSSSCG00000029652) NCKAP5L (ENSSSCG00000000209) BCDIN3D (ENSSSCG00000040144) ENSSSCG00000000207 #22 FAIM2 (ENSSSCG00000000206) AQP2 (ENSSSCG00000021193) ENSSSCG00000058738 AQP5 (ENSSSCG00000000211) ENSSSCG00000062534 AQP6 (ENSSSCG00000000212) ENSSSCG00000054254 RACGAP1 (ENSSSCG00000000217) ASIC1 (ENSSSCG00000000216) SMARCD1 (ENSSSCG00000000215) GPD1 (ENSSSCG00000000214) COX14 (ENSSSCG00000056361) CERS5 (ENSSSCG00000024932) LIMA1 (ENSSSCG00000032269) LARP4 (ENSSSCG00000028516) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Goat MODERN SPECIES 12 IRX1 (ENSCHIG00000017851) ADAMTS16 (ENSCHIG00000010517) ICE1 (ENSCHIG00000024007) MED10 (ENSCHIG00000020899) UBE2QL1 (ENSCHIG00000002861) NSUN2 (ENSCHIG00000019385) SRD5A1 (ENSCHIG00000012029) TENT4A (ENSCHIG00000017328) ENSCHIG00000025402 ADCY2 (ENSCHIG00000023502) CFAP90 (ENSCHIG00000025918) FASTKD3 (ENSCHIG00000018823) MTRR (ENSCHIG00000019340) ENSCHIG00000001904 SEMA5A (ENSCHIG00000013180) ENSCHIG00000019011 #22 ATPSCKMT (ENSCHIG00000018299) CCT5 (ENSCHIG00000018198) CMBL (ENSCHIG00000023506) MARCHF6 (ENSCHIG00000017175) ROPN1L (ENSCHIG00000024633) ANKRD33B (ENSCHIG00000021552) DAP (ENSCHIG00000018806) CTNND2 (ENSCHIG00000013482) DNAH5 (ENSCHIG00000021054) ENSCHIG00000016462 TRIO (ENSCHIG00000016556) OTULINL (ENSCHIG00000000624) OTULIN (ENSCHIG00000021689) ANKH (ENSCHIG00000019071) FBXL7 (ENSCHIG00000011704) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b #22 Armadillo MODERN SPECIES 3930 HDX (ENSDNOG00000032839) ENSDNOG00000031307 #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT01030000235083 ENSGT00940000165996 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b #22 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000163575 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000011864 ENSGT00940000159528 ENSGT00940000160585 ENSGT00710000106860 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00940000159160 ENSGT00730000111163 ENSGT01030000235083 ENSGT00940000165996 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000006051.a.b.b #22 ENSGT00940000159552 ENSGT00390000016051 ENSGT00940000163575 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000162467.b ENSGT00390000000693 ENSGT00390000005130 ENSGT00390000006788.a.b ENSGT00940000159907 ENSGT00390000013820 ENSGT00940000154512.a ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B Elephant MODERN SPECIES 239 ENSLAFG00000027647 SUCLA2 (ENSLAFG00000009678) HTR2A (ENSLAFG00000015014) ESD (ENSLAFG00000006901) LRCH1 (ENSLAFG00000006893) RUBCNL (ENSLAFG00000014959) LRRC63 (ENSLAFG00000011144) LCP1 (ENSLAFG00000009574) CPB2 (ENSLAFG00000016759) ENSLAFG00000016747 ENSLAFG00000026189 CBY2 (ENSLAFG00000011325) ENSLAFG00000010158 COG3 (ENSLAFG00000021400) SLC25A30 (ENSLAFG00000001502) ENSLAFG00000021740 #22 KCTD4 (ENSLAFG00000009328) GTF2F2 (ENSLAFG00000009325) GPALPP1 (ENSLAFG00000013763) NUFIP1 (ENSLAFG00000013760) TSC22D1 (ENSLAFG00000014574) SERP2 (ENSLAFG00000000162) LACC1 (ENSLAFG00000016028) CCDC122 (ENSLAFG00000008407) ENOX1 (ENSLAFG00000004348) DNAJC15 (ENSLAFG00000004343) EPSTI1 (ENSLAFG00000016838) FAM216B (ENSLAFG00000032301) TNFSF11 (ENSLAFG00000011256) ENSLAFG00000029763 ENSLAFG00000005777