Glires ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000010170.a.b #7 ENSGT01050000244937.a.a #8 ENSGT00390000011864 #9 ENSGT00940000159528 #10 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #12 ENSGT00950000183097.a.a.b #13 ENSGT00940000159160 #14 ENSGT00730000111163 #15 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b #22 ENSGT00390000016051 #23 ENSGT00940000159552 #24 ENSGT00390000012569.b #25 ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 ENSGT00390000000693 #29 ENSGT00390000005130 #30 ENSGT00390000006788.a.b #31 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000010170.a.b #7 ENSGT01050000244937.a.a #8 ENSGT00390000011864 #9 ENSGT00940000159528 #10 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #12 ENSGT00950000183097.a.a.b #13 ENSGT00940000159160 #14 ENSGT00730000111163 #15 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b #22 ENSGT00390000016051 #23 ENSGT00940000159552 #24 ENSGT00390000012569.b #25 ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #29 ENSGT00390000005130 #30 ENSGT00390000006788.a.b #31 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b #7 ENSGT01050000244937.a.a #8 ENSGT00390000011864 #9 ENSGT00940000159528 #10 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #12 ENSGT00950000183097.a.a.b #13 ENSGT00940000159160 #14 ENSGT00730000111163 #15 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a 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ENSGT00390000006788.a.b #31 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b #7 ENSGT01050000244937.a.a #8 ENSGT00390000011864 #9 ENSGT00940000159528 #10 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #12 ENSGT00950000183097.a.a.b #13 ENSGT00940000159160 #14 ENSGT00730000111163 #15 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b #22 ENSGT00390000016051 #23 ENSGT00940000159552 #24 ENSGT00390000012569.b #25 ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #29 ENSGT00390000005130 #30 ENSGT00390000006788.a.b #31 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00940000158106 Murinae DUPLICATION Murinae DUPLICATION Murinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b #7 ENSGT01050000244937.a.a #8 ENSGT00390000011864 #9 ENSGT00940000159528 #10 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #12 ENSGT00950000183097.a.a.b #13 ENSGT00940000159160 #14 ENSGT00730000111163 #15 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.a #22 ENSGT00390000016051 #23 ENSGT00940000159552 #24 ENSGT00390000012569.b #25 ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #29 ENSGT00390000005130 #30 ENSGT00390000006788.a.b #31 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00940000158106 Mus ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b #7 ENSGT01050000244937.a.a #8 ENSGT00390000011864 #9 ENSGT00940000159528 #10 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#18 ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.a #22 ENSGT00390000016051 #23 ENSGT00940000159552 #24 ENSGT00390000012569.b #25 ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #29 ENSGT00390000005130 #30 ENSGT00390000006788.a.b #31 ENSGT00860000135855 #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b #7 ENSGT01050000244937.a.a #8 ENSGT00390000011864.db #9 ENSGT00940000159528 #10 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #12 ENSGT00950000183097.a.a.b #13 ENSGT00940000159160 #14 ENSGT00730000111163 #15 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.a #22 ENSGT00390000016051 #23 ENSGT00940000159552 #24 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ENSGT00860000135855 #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 spretus MODERN SPECIES 5 Sucla2 (MGP_SPRETEiJ_G0020399) #7 Htr2a (MGP_SPRETEiJ_G0020400) #8 Esd (MGP_SPRETEiJ_G0020401) #9 Lrch1 (MGP_SPRETEiJ_G0020402) #10 Rubcnl (MGP_SPRETEiJ_G0020403) #11 Lrrc63 (MGP_SPRETEiJ_G0020404) #12 Lcp1 (MGP_SPRETEiJ_G0020405) #13 Cpb2 (MGP_SPRETEiJ_G0020406) #14 Zc3h13 (MGP_SPRETEiJ_G0020407) #15 MGP_SPRETEiJ_G0020408 #16 Siah3 (MGP_SPRETEiJ_G0020409) #17 Cby2 (MGP_SPRETEiJ_G0020410) #18 MGP_SPRETEiJ_G0020411 #19 Cog3 (MGP_SPRETEiJ_G0020412) #20 Slc25a30 (MGP_SPRETEiJ_G0020413) #21 Tpt1 (MGP_SPRETEiJ_G0020414) #22 Gtf2f2 (MGP_SPRETEiJ_G0020415) #23 Kctd4 (MGP_SPRETEiJ_G0020416) #24 Gpalpp1 (MGP_SPRETEiJ_G0020417) #25 Nufip1 (MGP_SPRETEiJ_G0020418) #26 Tsc22d1 (MGP_SPRETEiJ_G0020419) #27 Serp2 (MGP_SPRETEiJ_G0020420) #28 MGP_SPRETEiJ_G0020421 #29 Ccdc122 (MGP_SPRETEiJ_G0020422) #30 Enox1 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SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 41 Foxa2 (ENSMSIG00000002945) Sstr4 (ENSMSIG00000002973) Thbd (ENSMSIG00000002989) Cd93 (ENSMSIG00000002996) ENSMSIG00000003019 ##22 Nxt1 (ENSMSIG00000003067) Gzf1 (ENSMSIG00000003080) Napb (ENSMSIG00000003094) Cstl1 (ENSMSIG00000003118) Cst11 (ENSMSIG00000003137) Cstdc1 (ENSMSIG00000003153) Cst12 (ENSMSIG00000003169) Cst8 (ENSMSIG00000003194) Cst13 (ENSMSIG00000003223) Cst9 (ENSMSIG00000003261) Cstdc2 (ENSMSIG00000003283) Cst3 (ENSMSIG00000003295) Steppe mouse MODERN SPECIES 2804 Msantd2 (ENSMSIG00000015172) Esam (ENSMSIG00000015194) Vsig2 (ENSMSIG00000015220) Nrgn (ENSMSIG00000015277) Spa17 (ENSMSIG00000015289) Siae (ENSMSIG00000015296) Tbrg1 (ENSMSIG00000015383) Panx3 (ENSMSIG00000015407) ENSMSIG00000015418 ##22 Or8a1 (ENSMSIG00000015428) Or8a1b (ENSMSIG00000015433) Or8b12 (ENSMSIG00000015446) Or8b12c (ENSMSIG00000015455) Or8b9 (ENSMSIG00000015471) Or8b8 (ENSMSIG00000015480) Or8b4 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(MGP_PahariEiJ_G0030542) #28 Lacc1 (MGP_PahariEiJ_G0030543) #29 Ccdc122 (MGP_PahariEiJ_G0030544) #30 Enox1 (MGP_PahariEiJ_G0030545) #31 MGP_PahariEiJ_G0030546 #32 Dnajc15 (MGP_PahariEiJ_G0030547) #33 Epsti1 (MGP_PahariEiJ_G0030548) #34 Fam216b (MGP_PahariEiJ_G0030549) #35 Tnfsf11 (MGP_PahariEiJ_G0030550) #36 Akap11 (MGP_PahariEiJ_G0030551) #37 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b #7 ENSGT01050000244937.a.a #8 ENSGT00390000011864 #9 ENSGT00940000159528 #10 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #12 ENSGT00950000183097.a.a.b #13 ENSGT00940000159160 #14 ENSGT00730000111163 #15 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b #22 ENSGT00390000016051 #23 ENSGT00940000159552 #24 ENSGT00390000012569.b.a #25 ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #29 ENSGT00390000005130 #30 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hamster chok1gshd MODERN SPECIES 3 Med4 (ENSCGRG00001018208) Nudt15 (ENSCGRG00001001521) SUCLA2 (ENSCGRG00001009190) #7 HTR2A (ENSCGRG00001000307) #8 ENSCGRG00001015731 #9 Lrch1 (ENSCGRG00001021051) #10 Rubcnl (ENSCGRG00001015225) #11 Lrrc63 (ENSCGRG00001021365) #12 Lcp1 (ENSCGRG00001021099) #13 Cpb2 (ENSCGRG00001000100) #14 Zc3h13 (ENSCGRG00001014490) #15 Siah3 (ENSCGRG00001022985) #17 Cby2 (ENSCGRG00001019775) #18 Cog3 (ENSCGRG00001023420) #20 Slc25a30 (ENSCGRG00001009475) #21 Tpt1 (ENSCGRG00001019454) #22 Gtf2f2 (ENSCGRG00001015200) #23 Kctd4 (ENSCGRG00001001160) #24 Gpalpp1 (ENSCGRG00001020996) #25 Nufip1 (ENSCGRG00001012209) #26 Tsc22d1 (ENSCGRG00001001346) #27 Serp2 (ENSCGRG00001003518) #28 Lacc1 (ENSCGRG00001020034) #29 Ccdc122 (ENSCGRG00001006861) #30 Enox1 (ENSCGRG00001014073) #31 Dnajc15 (ENSCGRG00001000292) #33 Epsti1 (ENSCGRG00001009306) #34 Fam216b (ENSCGRG00001000086) #35 Tnfsf11 (ENSCGRG00001013327) #36 Akap11 (ENSCGRG00001020906) #37 Dgkh (ENSCGRG00001012161) Golden Hamster MODERN SPECIES 642 Itm2b (ENSMAUG00000017281) Med4 (ENSMAUG00000021269) Nudt15 (ENSMAUG00000018405) Sucla2 (ENSMAUG00000008374) #7 Htr2a (ENSMAUG00000011880) #8 Esd (ENSMAUG00000021229) #9 Lrch1 (ENSMAUG00000001816) #10 Lrrc63 (ENSMAUG00000017212) #12 ENSMAUG00000017813 #13 Cpb2 (ENSMAUG00000011270) #14 ENSMAUG00000005243 Siah3 (ENSMAUG00000016684) #17 Cby2 (ENSMAUG00000021027) #18 Cog3 (ENSMAUG00000018785) #20 Slc25a30 (ENSMAUG00000012973) #21 Tpt1 (ENSMAUG00000014012) #22 Kctd4 (ENSMAUG00000005135) #24 Gtf2f2 (ENSMAUG00000018898) #23 Gpalpp1 (ENSMAUG00000021389) #25 Nufip1 (ENSMAUG00000021413) #26 ENSMAUG00000014274 Serp2 (ENSMAUG00000019897) #28 Lacc1 (ENSMAUG00000018912) #29 ENSMAUG00000013996 #30 Enox1 (ENSMAUG00000019233) #31 Dnajc15 (ENSMAUG00000009642) #33 Epsti1 (ENSMAUG00000018985) #34 Fam216b (ENSMAUG00000014549) #35 Tnfsf11 (ENSMAUG00000001005) #36 Akap11 (ENSMAUG00000016985) #37 Dgkh (ENSMAUG00000017457) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000012063 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ENSJJAG00000013253 Fut9 (ENSJJAG00000022594) ENSJJAG00000023083 Manea (ENSJJAG00000023182) ENSJJAG00000023315 ENSJJAG00000023379 Epha7 (ENSJJAG00000016879) ENSJJAG00000017184 ENSJJAG00000017512 ENSJJAG00000017791 ENSJJAG00000017896 #22 ENSJJAG00000018137 ENSJJAG00000018365 Map3k7 (ENSJJAG00000020494) ENSJJAG00000013324 Bach2 (ENSJJAG00000002786) Gja10 (ENSJJAG00000006111) ENSJJAG00000009996 ENSJJAG00000010339 Mdn1 (ENSJJAG00000015545) Lyrm2 (ENSJJAG00000020170) Ankrd6 (ENSJJAG00000021174) ENSJJAG00000022275 Rragd (ENSJJAG00000000282) ENSJJAG00000000713 Gabrr2 (ENSJJAG00000001074) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 25 ENSJJAG00000011543 #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 4 Med4 (ENSMOCG00000002608) Nudt15 (ENSMOCG00000003875) ENSMOCG00000011477 #7 Htr2a (ENSMOCG00000012645) #8 ENSMOCG00000016070 #9 Lrch1 (ENSMOCG00000017560) #10 Rubcnl (ENSMOCG00000003331) #11 Lrrc63 (ENSMOCG00000018528) #12 Lcp1 (ENSMOCG00000010746) #13 Cpb2 (ENSMOCG00000006393) #14 ENSMOCG00000001346 Siah3 (ENSMOCG00000009347) #17 Cby2 (ENSMOCG00000014959) #18 Cog3 (ENSMOCG00000002598) #20 Slc25a30 (ENSMOCG00000010410) #21 ENSMOCG00000016698 ##22 Gtf2f2 (ENSMOCG00000020515) #23 Kctd4 (ENSMOCG00000008795) #24 ENSMOCG00000009812 #25 Nufip1 (ENSMOCG00000008223) #26 ENSMOCG00000018072 Serp2 (ENSMOCG00000022234) #28 Lacc1 (ENSMOCG00000011112) #29 Enox1 (ENSMOCG00000012930) #31 ENSMOCG00000014539 Slitrk1 (ENSMOCG00000008123) ENSMOCG00000017655 ENSMOCG00000007797 ENSMOCG00000005944 Slitrk6 (ENSMOCG00000013923) ENSMOCG00000017964 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 17 Adra2b (ENSPEMG00000007923) Gpat2 (ENSPEMG00000008852) Fahd2a (ENSPEMG00000000091) Kcnip3 (ENSPEMG00000021898) Prom2 (ENSPEMG00000000045) ENSPEMG00000027287 Zfp661 (ENSPEMG00000010394) Mrps5 (ENSPEMG00000012667) Mal (ENSPEMG00000009328) Mall (ENSPEMG00000029281) Nphp1 (ENSPEMG00000021264) Mtln (ENSPEMG00000027381) Bub1 (ENSPEMG00000021304) Acoxl (ENSPEMG00000009101) Bcl2l11 (ENSPEMG00000029663) ENSPEMG00000021203 ##22 Spdye4c (ENSPEMG00000017180) Anapc1 (ENSPEMG00000029252) Mertk (ENSPEMG00000002990) Tmem87b (ENSPEMG00000001091) Fbln7 (ENSPEMG00000010454) Zc3h8 (ENSPEMG00000011068) Zc3h6 (ENSPEMG00000000918) Vinac1 (ENSPEMG00000004724) Ttl (ENSPEMG00000006748) Polr1b (ENSPEMG00000008619) Chchd5 (ENSPEMG00000010023) Slc20a1 (ENSPEMG00000010382) Ckap2l (ENSPEMG00000010844) Il1a (ENSPEMG00000011300) Il1b (ENSPEMG00000011618) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 126 ENSJJAG00000012033 ENSJJAG00000006493 Htr2a (ENSJJAG00000005538) #8 Esd (ENSJJAG00000004979) #9 Lrch1 (ENSJJAG00000000346) #10 Rubcnl (ENSJJAG00000021497) #11 Lcp1 (ENSJJAG00000021331) #13 Cpb2 (ENSJJAG00000020705) #14 Zc3h13 (ENSJJAG00000019971) #15 ENSJJAG00000019522 Siah3 (ENSJJAG00000019440) #17 Cby2 (ENSJJAG00000019147) #18 Cog3 (ENSJJAG00000018271) #20 Slc25a30 (ENSJJAG00000017335) #21 ENSJJAG00000016940 ENSJJAG00000016541 ##22 Kctd4 (ENSJJAG00000012151) #24 Gtf2f2 (ENSJJAG00000015891) #23 Gpalpp1 (ENSJJAG00000015544) #25 Nufip1 (ENSJJAG00000015369) #26 ENSJJAG00000015078 Serp2 (ENSJJAG00000021557) #28 ENSJJAG00000021469 Lacc1 (ENSJJAG00000021351) #29 Ccdc122 (ENSJJAG00000021044) #30 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 33 Wfikkn2 (ENSCGRG00001022356) Luc7l3 (ENSCGRG00001009809) ENSCGRG00001020484 Abcc3 (ENSCGRG00001010018) Cacna1g (ENSCGRG00001002871) Spata20 (ENSCGRG00001006141) Epn3 (ENSCGRG00001009708) Mycbpap (ENSCGRG00001004065) Rsad1 (ENSCGRG00001020971) Acsf2 (ENSCGRG00001006504) Chad (ENSCGRG00001017300) Lrrc59 (ENSCGRG00001003469) Eme1 (ENSCGRG00001012113) Mrpl27 (ENSCGRG00001018944) Xylt2 (ENSCGRG00001021636) ENSCGRG00001017654 ##22 ENSCGRG00001022011 Col1a1 (ENSCGRG00001020668) Sgca (ENSCGRG00001019141) H1f9 (ENSCGRG00001005718) Ppp1r9b (ENSCGRG00001012352) Samd14 (ENSCGRG00001002338) Pdk2 (ENSCGRG00001014853) Itga3 (ENSCGRG00001021353) Dlx3 (ENSCGRG00001022154) Dlx4 (ENSCGRG00001019843) Tac4 (ENSCGRG00001001077) ENSCGRG00001005107 Fam117a (ENSCGRG00001009494) Slc35b1 (ENSCGRG00001006734) Spop (ENSCGRG00001024062) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Mrps27 (ENSCGRG00001016241) Ptcd2 (ENSCGRG00001015289) Zfp366 (ENSCGRG00001006020) ENSCGRG00001003516 H2bl1 (ENSCGRG00001007283) Tnpo1 (ENSCGRG00001016580) Fcho2 (ENSCGRG00001013782) Tmem171 (ENSCGRG00001016096) Tmem174 (ENSCGRG00001011496) Foxd1 (ENSCGRG00001010743) 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