Theria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00940000173288 ENSGT00940000173214 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT01030000235083 ENSGT00940000165996 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051 #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT01030000235083 ENSGT00940000165996 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 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#30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000161696.c.b ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00450000040303.d ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 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(ENSNLEG00000030453) #25 NUFIP1 (ENSNLEG00000002021) #26 TSC22D1 (ENSNLEG00000001960) #27 SERP2 (ENSNLEG00000029213) #28 SMIM2 (ENSNLEG00000018205) #29 LACC1 (ENSNLEG00000001935) #30 CCDC122 (ENSNLEG00000001927) #31 ENOX1 (ENSNLEG00000001817) #32 DNAJC15 (ENSNLEG00000035144) #33 ENSNLEG00000027236 ENSNLEG00000018241 ENSNLEG00000001705 #34 FAM216B (ENSNLEG00000033194) #35 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.a #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 156 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.o.a #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00450000040303.d ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00910000147882 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.a #22 ENSGT00390000006051.a.b.a.b.n #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00390000003628.b.c.b.a.a.a ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 357 LRRC63 (ENSRBIG00000028445) #13 ENSRBIG00000038896 LCP1 (ENSRBIG00000038337) #14 CPB2 (ENSRBIG00000032565) #15 ENSRBIG00000019806 ZC3H13 (ENSRBIG00000010463) #16 SIAH3 (ENSRBIG00000043429) #17 CBY2 (ENSRBIG00000038551) #18 ENSRBIG00000041417 ERICH6B (ENSRBIG00000029552) #19 COG3 (ENSRBIG00000030800) #20 SLC25A30 (ENSRBIG00000018540) #21 ENSRBIG00000039217 #22 GTF2F2 (ENSRBIG00000021582) #24 KCTD4 (ENSRBIG00000017539) #23 ENSRBIG00000042376 NUFIP1 (ENSRBIG00000029771) #26 ENSRBIG00000039378 ENSRBIG00000027001 TSC22D1 (ENSRBIG00000034232) #27 SERP2 (ENSRBIG00000036349) #28 SMIM2 (ENSRBIG00000043447) #29 ENSRBIG00000029281 ENSRBIG00000034025 LACC1 (ENSRBIG00000042070) #30 CCDC122 (ENSRBIG00000032610) #31 ENOX1 (ENSRBIG00000031124) #32 DNAJC15 (ENSRBIG00000003484) #33 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00450000040303.d ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00910000147882 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b.n #22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.a #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000163575 #25 ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00940000158106 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 180 ENSMNEG00000045220 #22 GTF2F2 (ENSMNEG00000033303) #24 KCTD4 (ENSMNEG00000025133) #23 GPALPP1 (ENSMNEG00000033610) #25 NUFIP1 (ENSMNEG00000033299) #26 ENSMNEG00000004676 ENSMNEG00000035585 TSC22D1 (ENSMNEG00000000209) #27 SERP2 (ENSMNEG00000042638) #28 SMIM2 (ENSMNEG00000042675) #29 LACC1 (ENSMNEG00000045105) #30 CCDC122 (ENSMNEG00000039888) #31 ENOX1 (ENSMNEG00000040967) #32 DNAJC15 (ENSMNEG00000039087) #33 EPSTI1 (ENSMNEG00000027227) #34 FAM216B (ENSMNEG00000040597) #35 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000008403.y.a.b ENSGT00530000063737 ENSGT00530000064011 ENSGT00950000183128.C ENSGT00940000157848 ENSGT00940000160477 ENSGT00390000011163.b ENSGT00940000158908 ENSGT00940000156521.b ENSGT00390000012412 ENSGT00940000154813 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000159887 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000154746.g ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.b #22 ENSGT00940000156116.C ENSGT00940000154656 ENSGT00940000158836 ENSGT00390000006996 ENSGT00910000147001 ENSGT00940000155729.m.a ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00730000111179.b ENSGT00940000159098 ENSGT00940000156540 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000159673 ENSGT00390000018691 ENSGT00940000156774 ENSGT00940000158220 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063737 ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.f.c.a ENSGT00530000064011 ENSGT00950000183128.C ENSGT00940000157848 ENSGT00940000160477 ENSGT00390000011163.b ENSGT00940000158908 ENSGT00940000156521.b ENSGT00390000012412 ENSGT00940000154813 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000159887 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000154746.g.a ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.b #22 ENSGT00940000154746.g.b ENSGT00940000156116.C ENSGT00940000154656 ENSGT00940000158836 ENSGT00390000006996 ENSGT00910000147001 ENSGT00940000155729.m.a ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00730000111179.b ENSGT00940000159098 ENSGT00940000156540 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000159673 ENSGT00390000018691 ENSGT00940000156774 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000008403.y.a.b ENSGT00530000063737 ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.f.c.a ENSGT00530000064011 ENSGT00950000183128.C ENSGT00940000157848 ENSGT00940000160477 ENSGT00390000011163.b ENSGT00940000158908 ENSGT00940000156521.b ENSGT00390000012412 ENSGT00940000154813 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000159887 ENSGT00940000154746.g.a ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.b #22 ENSGT00940000154746.g.b ENSGT00940000156116.C ENSGT00940000154656 ENSGT00940000158836 ENSGT00390000006996 ENSGT00910000147001 ENSGT00940000155729.m.a ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00730000111179.b ENSGT00940000159098 ENSGT00940000156540 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000159673 ENSGT00390000002407.d.e.a ENSGT00390000018691 Drill MODERN SPECIES 723 MAX (ENSMLEG00000042139) FNTB (ENSMLEG00000042597) RAB15 (ENSMLEG00000037890) GPX2 (ENSMLEG00000032611) CHURC1 (ENSMLEG00000032946) SPTB (ENSMLEG00000027497) PLEKHG3 (ENSMLEG00000036962) PPP1R36 (ENSMLEG00000031961) HSPA2 (ENSMLEG00000039096) ZBTB1 (ENSMLEG00000023254) ZBTB25 (ENSMLEG00000036039) MTHFD1 (ENSMLEG00000028622) ENSMLEG00000034143 #22 ESR2 (ENSMLEG00000036116) SYNE2 (ENSMLEG00000019474) SGPP1 (ENSMLEG00000029959) WDR89 (ENSMLEG00000023031) ENSMLEG00000034662 PPP2R5E (ENSMLEG00000006842) GPHB5 (ENSMLEG00000035742) RHOJ (ENSMLEG00000029154) KCNH5 (ENSMLEG00000042423) ENSMLEG00000018294 SYT16 (ENSMLEG00000042531) ENSMLEG00000031595 SNAPC1 (ENSMLEG00000036821) HIF1A (ENSMLEG00000032405) ENSMLEG00000032081 Macaca ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000008403.y.a.b ENSGT00530000063737 ENSGT00530000064011 ENSGT00950000183128.C ENSGT00940000157848 ENSGT00940000160477 ENSGT00390000011163.b ENSGT00940000158908 ENSGT00940000156521.b ENSGT00390000012412 ENSGT00940000154813 ENSGT00940000157501 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(ENSMMUG00000052269) #33 ENSMMUG00000056651 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000011864.o.a #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00450000040303.d ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00910000147882 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b.n #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00390000003628.b.c.b.a.a.a ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000011864.o.a #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00450000040303.d ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00910000147882 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b.n #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00390000003628.b.c.b.a.a.a ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Vervet Monkey MODERN SPECIES 22 NUDT15 (ENSCSAG00000017745) #7 SUCLA2 (ENSCSAG00000017747) #8 HTR2A (ENSCSAG00000017748) #9 ESD (ENSCSAG00000017750) #10 LRCH1 (ENSCSAG00000017752) #11 RUBCNL (ENSCSAG00000017755) #12 LRRC63 (ENSCSAG00000017757) #13 LCP1 (ENSCSAG00000017761) #14 CPB2 (ENSCSAG00000017762) #15 ZC3H13 (ENSCSAG00000017764) #16 SIAH3 (ENSCSAG00000017765) #17 CBY2 (ENSCSAG00000017766) #18 ERICH6B (ENSCSAG00000017768) #19 COG3 (ENSCSAG00000017769) #20 SLC25A30 (ENSCSAG00000017770) #21 TPT1 (ENSCSAG00000017773) #22 KCTD4 (ENSCSAG00000018607) #23 GTF2F2 (ENSCSAG00000017777) #24 ENSCSAG00000017778 NUFIP1 (ENSCSAG00000017779) #26 TSC22D1 (ENSCSAG00000017781) #27 SERP2 (ENSCSAG00000017782) #28 ENSCSAG00000017783 #29 LACC1 (ENSCSAG00000017785) #30 CCDC122 (ENSCSAG00000017787) #31 ENOX1 (ENSCSAG00000017789) #32 DNAJC15 (ENSCSAG00000017791) #33 EPSTI1 (ENSCSAG00000017797) #34 FAM216B (ENSCSAG00000017800) #35 TNFSF11 (ENSCSAG00000017803) #36 AKAP11 (ENSCSAG00000017811) #37 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000011864.o.a #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00450000040303.d ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00910000147882 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 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#23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00390000003628.b.c.b.a.a.a ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Olive baboon MODERN SPECIES 6 ENSPANG00000050620 HTR2A (ENSPANG00000022427) #9 ENSPANG00000010192 #10 LRCH1 (ENSPANG00000006286) #11 RUBCNL (ENSPANG00000012223) #12 LRRC63 (ENSPANG00000012865) #13 LCP1 (ENSPANG00000008557) #14 CPB2 (ENSPANG00000009473) #15 ZC3H13 (ENSPANG00000014127) #16 SIAH3 (ENSPANG00000012225) #17 CBY2 (ENSPANG00000017956) #18 ERICH6B (ENSPANG00000017954) #19 COG3 (ENSPANG00000012226) #20 ENSPANG00000047840 SLC25A30 (ENSPANG00000018184) #21 TPT1 (ENSPANG00000005716) #22 KCTD4 (ENSPANG00000004546) #23 GTF2F2 (ENSPANG00000023048) #24 ENSPANG00000048298 NUFIP1 (ENSPANG00000014890) #26 TSC22D1 (ENSPANG00000039281) #27 ENSPANG00000036191 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ENSSBOG00000009039 Mas night monkey MODERN SPECIES 928 ENSANAG00000020725 ATP1B4 (ENSANAG00000021106) LAMP2 (ENSANAG00000022316) CUL4B (ENSANAG00000037771) ENSANAG00000033714 C1GALT1C1 (ENSANAG00000019504) ENSANAG00000024009 ENSANAG00000022752 ENSANAG00000036624 GRIA3 (ENSANAG00000038407) ENSANAG00000034037 ENSANAG00000004172 XIAP (ENSANAG00000025926) STAG2 (ENSANAG00000031862) ENSANAG00000021441 ENSANAG00000024609 #22 SH2D1A (ENSANAG00000017592) TENM1 (ENSANAG00000034279) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b.o.b #22 Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b.o.b.a #22 Marmoset MODERN SPECIES 7 MRPS28 (ENSCJAG00000054615) HEY1 (ENSCJAG00000086337) STMN2 (ENSCJAG00000000485) ENSCJAG00000072795 IL7 (ENSCJAG00000000494) ZC2HC1A (ENSCJAG00000000495) PKIA (ENSCJAG00000082645) PEX2 (ENSCJAG00000000512) ZFHX4 (ENSCJAG00000000517) HNF4G (ENSCJAG00000000541) ENSCJAG00000045005 ENSCJAG00000085189 CRISPLD1 (ENSCJAG00000000549) PI15 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ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b.p #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00940000163575 #25 ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Marmoset MODERN SPECIES 4 ENSCJAG00000083868 ENSCJAG00000006505 ENSCJAG00000066704 ENSCJAG00000073426 ENSCJAG00000085434 KAT6A (ENSCJAG00000004274) ANK1 (ENSCJAG00000004219) NKX6-3 (ENSCJAG00000004205) GPAT4 (ENSCJAG00000045025) GINS4 (ENSCJAG00000011026) ENSCJAG00000066460 GOLGA7 (ENSCJAG00000080080) ENSCJAG00000081145 ENSCJAG00000080601 SFRP1 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#27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 1164 ENSCCAG00000021485 #22 Capuchin MODERN SPECIES 458 ENSCCAG00000032738 ENSCCAG00000023115 RTL8C (ENSCCAG00000019238) ENSCCAG00000007584 ENSCCAG00000018910 MOSPD1 (ENSCCAG00000021059) ENSCCAG00000020964 PABIR2 (ENSCCAG00000024121) ENSCCAG00000021817 #22 HPRT1 (ENSCCAG00000033007) PHF6 (ENSCCAG00000024236) ENSCCAG00000031175 ENSCCAG00000034760 GPC3 (ENSCCAG00000020598) Capuchin MODERN SPECIES 94 SUCLA2 (ENSCCAG00000036078) #8 ENSCCAG00000027774 HTR2A (ENSCCAG00000020537) #9 ENSCCAG00000025918 #10 LRCH1 (ENSCCAG00000036225) #11 RUBCNL (ENSCCAG00000023570) #12 LRRC63 (ENSCCAG00000024800) #13 LCP1 (ENSCCAG00000023585) #14 CPB2 (ENSCCAG00000030272) #15 ZC3H13 (ENSCCAG00000032728) #16 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#33 EPSTI1 (ENSMICG00000007681) #34 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00940000158106 Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 19 RNF17 (ENSOCUG00000007384) ATP12A (ENSOCUG00000007374) ENSOCUG00000017323 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ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 161 OPRK1 (ENSCLAG00000009850) ENSCLAG00000009340 RB1CC1 (ENSCLAG00000009807) ENSCLAG00000014346 ST18 (ENSCLAG00000011202) PCMTD1 (ENSCLAG00000009964) ENSCLAG00000014877 SNTG1 (ENSCLAG00000013065) SNAI2 (ENSCLAG00000011797) CLXN (ENSCLAG00000015811) UBE2V2 (ENSCLAG00000010839) MCM4 (ENSCLAG00000014363) PRKDC (ENSCLAG00000009459) SPIDR (ENSCLAG00000009550) ENSCLAG00000009679 ENSCLAG00000017747 #22 IQSEC3 (ENSCLAG00000011610) SLC6A12 (ENSCLAG00000016481) SLC6A13 (ENSCLAG00000012266) KDM5A (ENSCLAG00000012583) CCDC77 (ENSCLAG00000013123) ENSCLAG00000012835 B4GALNT3 (ENSCLAG00000010895) NINJ2 (ENSCLAG00000013545) WNK1 (ENSCLAG00000013684) RAD52 (ENSCLAG00000014602) USP18 (ENSCLAG00000016101) TUBA8 (ENSCLAG00000015397) ENSCLAG00000013601 MICAL3 (ENSCLAG00000012611) BID (ENSCLAG00000009563) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Squirrel MODERN SPECIES 391 TPT1 (ENSSTOG00000006931) #22 KCTD4 (ENSSTOG00000006919) #23 GTF2F2 (ENSSTOG00000006891) #24 ENSSTOG00000030346 ENSSTOG00000009146 NUFIP1 (ENSSTOG00000009128) #26 TSC22D1 (ENSSTOG00000026378) #27 ENSSTOG00000016149 ENSSTOG00000031098 #31 LACC1 (ENSSTOG00000011506) #30 ENSSTOG00000034353 ENSSTOG00000001840 #31 Alpin marmot MODERN SPECIES 52 SLCO1A2 (ENSMMMG00000016821) ENSMMMG00000016797 SLCO1C1 (ENSMMMG00000016753) PDE3A (ENSMMMG00000016739) AEBP2 (ENSMMMG00000016719) ENSMMMG00000016688 ENSMMMG00000016668 CAPZA3 (ENSMMMG00000016663) PLCZ1 (ENSMMMG00000016649) PIK3C2G (ENSMMMG00000016591) ENSMMMG00000016587 RERGL (ENSMMMG00000016585) LMO3 (ENSMMMG00000016566) MGST1 (ENSMMMG00000016562) SLC15A5 (ENSMMMG00000016558) ENSMMMG00000016555 #22 DERA (ENSMMMG00000016536) STRAP (ENSMMMG00000016527) EPS8 (ENSMMMG00000016503) PTPRO (ENSMMMG00000016376) RERG (ENSMMMG00000016349) ENSMMMG00000016344 PDE6H (ENSMMMG00000016340) ARHGDIB (ENSMMMG00000016330) ERP27 (ENSMMMG00000016318) MGP (ENSMMMG00000016309) ART4 (ENSMMMG00000016302) C12orf60 (ENSMMMG00000016300) SMCO3 (ENSMMMG00000016295) ENSMMMG00000016288 H2AJ (ENSMMMG00000016282) Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 NOG (ENSSVLG00005008960) C17orf67 (ENSSVLG00005008977) DGKE (ENSSVLG00005009005) TRIM25 (ENSSVLG00005009042) ENSSVLG00005009077 ENSSVLG00005009156 ENSSVLG00005009268 AKAP1 (ENSSVLG00005009345) MSI2 (ENSSVLG00005009431) CCDC182 (ENSSVLG00005009670) MRPS23 (ENSSVLG00005009697) CUEDC1 (ENSSVLG00005009757) VEZF1 (ENSSVLG00005009804) SRSF1 (ENSSVLG00005009909) DYNLL2 (ENSSVLG00005009962) ENSSVLG00005009988 #22 OR4D1 (ENSSVLG00005010018) OR4D2 (ENSSVLG00005010031) EPX (ENSSVLG00005010064) MKS1 (ENSSVLG00005010163) LPO (ENSSVLG00005010342) MPO (ENSSVLG00005010554) TSPOAP1 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squirrel MODERN SPECIES 13 ENSSVLG00005001657 #9 ENSSVLG00005001636 ENSSVLG00005001618 ENSSVLG00005001599 ENSSVLG00005001588 LRRC63 (ENSSVLG00005001547) #13 LCP1 (ENSSVLG00005001488) #14 CPB2 (ENSSVLG00005001440) #15 ZC3H13 (ENSSVLG00005001347) #16 SIAH3 (ENSSVLG00005001312) #17 CBY2 (ENSSVLG00005001296) #18 ENSSVLG00005001222 #20 SLC25A30 (ENSSVLG00005001187) #21 ENSSVLG00005001160 ENSSVLG00005001144 ENSSVLG00005001090 #22 KCTD4 (ENSSVLG00005001062) #23 ENSSVLG00005001046 #24 ENSSVLG00005001028 ENSSVLG00005001012 ENSSVLG00005000987 NUFIP1 (ENSSVLG00005000955) #26 TSC22D1 (ENSSVLG00005000900) #27 SERP2 (ENSSVLG00005000867) #28 LACC1 (ENSSVLG00005000824) #30 CCDC122 (ENSSVLG00005000800) #31 ENOX1 (ENSSVLG00005000776) #32 DNAJC15 (ENSSVLG00005000749) #33 EPSTI1 (ENSSVLG00005000671) #34 FAM216B (ENSSVLG00005000610) #35 ENSSVLG00005000585 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 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ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Equus ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.k #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Donkey MODERN SPECIES 2 NUDT15 (ENSEASG00005017157) #7 SUCLA2 (ENSEASG00005017152) #8 HTR2A (ENSEASG00005017150) #9 ENSEASG00005017144 #10 LRCH1 (ENSEASG00005017132) #11 RUBCNL (ENSEASG00005017123) #12 LRRC63 (ENSEASG00005034276) #13 LCP1 (ENSEASG00005017115) #14 CPB2 (ENSEASG00005017110) #15 ZC3H13 (ENSEASG00005017100) #16 SIAH3 (ENSEASG00005024437) #17 CBY2 (ENSEASG00005017097) #18 ENSEASG00005029663 #19 COG3 (ENSEASG00005017090) #20 ENSEASG00005017085 #21 TPT1 (ENSEASG00005017078) #22 KCTD4 (ENSEASG00005028559) #23 GTF2F2 (ENSEASG00005017062) #24 ENSEASG00005017051 NUFIP1 (ENSEASG00005017043) #26 TSC22D1 (ENSEASG00005017037) #27 ENSEASG00005031806 SERP2 (ENSEASG00005017029) #28 SMIM2 (ENSEASG00005030223) #29 LACC1 (ENSEASG00005017025) #30 ENSEASG00005017023 #31 ENOX1 (ENSEASG00005017017) #32 DNAJC15 (ENSEASG00005027017) #33 ENSEASG00005033429 EPSTI1 (ENSEASG00005017003) #34 FAM216B (ENSEASG00005016998) #35 Horse MODERN SPECIES 8 NUDT15 (ENSECAG00000010019) #7 SUCLA2 (ENSECAG00000011122) #8 HTR2A (ENSECAG00000024282) #9 ESD (ENSECAG00000024350) #10 LRCH1 (ENSECAG00000024376) #11 RUBCNL (ENSECAG00000016721) #12 LRRC63 (ENSECAG00000021952) #13 LCP1 (ENSECAG00000023009) #14 CPB2 (ENSECAG00000017329) #15 ZC3H13 (ENSECAG00000022843) #16 SIAH3 (ENSECAG00000025105) #17 CBY2 (ENSECAG00000000488) #18 ENSECAG00000033930 #19 COG3 (ENSECAG00000003080) #20 SLC25A30 (ENSECAG00000017334) #21 TPT1 (ENSECAG00000018348) #22 GTF2F2 (ENSECAG00000021923) #24 KCTD4 (ENSECAG00000005117) #23 GPALPP1 (ENSECAG00000009110) NUFIP1 (ENSECAG00000013295) #26 TSC22D1 (ENSECAG00000005195) #27 ENSECAG00000060045 ENSECAG00000040040 #28 SMIM2 (ENSECAG00000040685) #29 LACC1 (ENSECAG00000018885) #30 CCDC122 (ENSECAG00000020440) #31 ENOX1 (ENSECAG00000023538) #32 DNAJC15 (ENSECAG00000007757) #33 EPSTI1 (ENSECAG00000009543) #34 ENSECAG00000033495 ENSECAG00000050320 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Megabat MODERN SPECIES 4257 TPT1 (ENSPVAG00000003191) #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 22 DEFB1 (ENSRFEG00010014272) ENSRFEG00010014402 ENSRFEG00010014455 ENSRFEG00010014509 ENSRFEG00010014591 ENSRFEG00010014683 ENSRFEG00010014746 ENSRFEG00010014801 ENSRFEG00010014873 ENSRFEG00010014921 LHFPL6 (ENSRFEG00010014955) SIAH3 (ENSRFEG00010015030) #17 CBY2 (ENSRFEG00010015067) #18 COG3 (ENSRFEG00010015220) #20 SLC25A30 (ENSRFEG00010015316) #21 ENSRFEG00010015397 #22 GTF2F2 (ENSRFEG00010015746) #24 KCTD4 (ENSRFEG00010015792) #23 ENSRFEG00010015815 NUFIP1 (ENSRFEG00010016018) #26 ENSRFEG00010016066 TSC22D1 (ENSRFEG00010016081) #27 ENSRFEG00010016228 #28 SMIM2 (ENSRFEG00010016302) #29 LACC1 (ENSRFEG00010016430) #30 CCDC122 (ENSRFEG00010016478) #31 ENOX1 (ENSRFEG00010016570) #32 DNAJC15 (ENSRFEG00010016645) #33 EPSTI1 (ENSRFEG00010016685) #34 FAM216B (ENSRFEG00010016757) #35 TNFSF11 (ENSRFEG00010016778) #36 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 25 SKIC3 (ENSRFEG00010007614) ARSK (ENSRFEG00010007699) RFESD (ENSRFEG00010007874) SPATA9 (ENSRFEG00010007982) RHOBTB3 (ENSRFEG00010008077) GLRX (ENSRFEG00010008129) ELL2 (ENSRFEG00010008164) PCSK1 (ENSRFEG00010008222) CAST (ENSRFEG00010008436) ERAP1 (ENSRFEG00010009095) ENSRFEG00010009157 ERAP2 (ENSRFEG00010009185) LNPEP (ENSRFEG00010009269) LIX1 (ENSRFEG00010009323) ENSRFEG00010009355 ENSRFEG00010009543 #22 RGMB (ENSRFEG00010009568) CHD1 (ENSRFEG00010009657) ENSRFEG00010009740 FAM174A (ENSRFEG00010009753) ST8SIA4 (ENSRFEG00010009786) SLCO4C1 (ENSRFEG00010009830) SLCO6A1 (ENSRFEG00010009884) PAM (ENSRFEG00010010028) GIN1 (ENSRFEG00010010278) PPIP5K2 (ENSRFEG00010010456) MACIR (ENSRFEG00010010741) ENSRFEG00010010775 NUDT12 (ENSRFEG00010010948) EFNA5 (ENSRFEG00010011082) FBXL17 (ENSRFEG00010011260) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 23 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ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B.gb #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000159144.B.fb.b #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 Canidae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 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Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156013 ENSGT00390000007224.b ENSGT00390000016055 ENSGT00390000013073 ENSGT00940000159090 ENSGT00940000156815 ENSGT00500000044986 ENSGT00390000000537.r ENSGT00530000063252.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00390000008902 ENSGT00940000160634 ENSGT00940000156271 ENSGT00510000046985.h.a.id.a ENSGT00940000157860 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00940000159353 ENSGT00390000001844.a.a ENSGT00390000002429 ENSGT00950000182952.A.b ENSGT00940000154829 ENSGT00900000143813 ENSGT00940000153877.h.c.b.a.a ENSGT00940000157962.i ENSGT00390000007999 ENSGT00940000157806 ENSGT00890000139503 ENSGT00940000162802 ENSGT00870000136493.c ENSGT00940000161940 ENSGT00940000156324 Beluga whale MODERN SPECIES 111 RWDD2B (ENSDLEG00000008138) LTN1 (ENSDLEG00000008180) N6AMT1 (ENSDLEG00000008277) ADAMTS5 (ENSDLEG00000008340) ADAMTS1 (ENSDLEG00000008372) CYYR1 (ENSDLEG00000008395) ENSDLEG00000008429 APP (ENSDLEG00000008511) GABPA (ENSDLEG00000008802) ATP5J 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ENSGT00940000163575 #25 ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 4796 ENSDNOG00000044267 #22 STMND1 (ENSDNOG00000044643) RBM24 (ENSDNOG00000047488) CAP2 (ENSDNOG00000041209) FAM8A1 (ENSDNOG00000001150) NUP153 (ENSDNOG00000001153) KIF13A (ENSDNOG00000008378) ENSDNOG00000034807 Armadillo MODERN SPECIES 1505 CBY2 (ENSDNOG00000043420) #18 ENSDNOG00000038674 #19 ENSDNOG00000044520 COG3 (ENSDNOG00000006811) #20 SLC25A30 (ENSDNOG00000012057) #21 ENSDNOG00000000653 #22 ENSDNOG00000045540 #24 KCTD4 (ENSDNOG00000000779) #23 GPALPP1 (ENSDNOG00000032373) #25 NUFIP1 (ENSDNOG00000032481) #26 TSC22D1 (ENSDNOG00000045575) #27 ENSDNOG00000049080 ENSDNOG00000035109 LACC1 (ENSDNOG00000001688) #30 CCDC122 (ENSDNOG00000001686) #31 Armadillo MODERN SPECIES 3081 GSAP (ENSDNOG00000007203) ENSDNOG00000040281 PTPN12 (ENSDNOG00000031767) ENSDNOG00000003023 TMEM60 (ENSDNOG00000004243) ENSDNOG00000035710 PHTF2 (ENSDNOG00000013570) ENSDNOG00000047407 ENSDNOG00000037388 ENSDNOG00000030907 ENSDNOG00000044752 ENSDNOG00000049440 ENSDNOG00000038653 ENSDNOG00000041719 ENSDNOG00000032769 ENSDNOG00000048457 #22 ENSDNOG00000049495 GNAI1 (ENSDNOG00000037739) GNAT3 (ENSDNOG00000024709) CD36 (ENSDNOG00000016575) SEMA3C (ENSDNOG00000004152) ENSDNOG00000040700 ENSDNOG00000033964 HGF (ENSDNOG00000040861) CACNA2D1 (ENSDNOG00000017761) ENSDNOG00000006996 ENSDNOG00000038074 SEMA3E (ENSDNOG00000031661) SEMA3A (ENSDNOG00000005476) SEMA3D (ENSDNOG00000002492) Armadillo MODERN SPECIES 1814 DNAH11 (ENSDNOG00000014510) CDCA7L (ENSDNOG00000031310) RAPGEF5 (ENSDNOG00000034316) ENSDNOG00000017107 TOMM7 (ENSDNOG00000018461) ENSDNOG00000043299 KLHL7 (ENSDNOG00000001169) NUP42 (ENSDNOG00000048997) GPNMB (ENSDNOG00000005523) MALSU1 (ENSDNOG00000025603) IGF2BP3 (ENSDNOG00000013164) TRA2A (ENSDNOG00000039446) ENSDNOG00000033540 #22 CCDC126 (ENSDNOG00000048562) FAM221A (ENSDNOG00000013558) Armadillo MODERN SPECIES 1235 ENSDNOG00000047979 ENSDNOG00000036152 ENSDNOG00000041365 #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Hyrax MODERN SPECIES 11148 TPT1 (ENSPCAG00000016228) #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Elephant MODERN SPECIES 108 ENKUR (ENSLAFG00000015408) THNSL1 (ENSLAFG00000015412) MYO3A (ENSLAFG00000009248) GAD2 (ENSLAFG00000009255) ENSLAFG00000030960 ENSLAFG00000016457 ENSLAFG00000028353 PDSS1 (ENSLAFG00000017974) ABI1 (ENSLAFG00000017979) ACBD5 (ENSLAFG00000002908) MASTL (ENSLAFG00000030503) YME1L1 (ENSLAFG00000021743) ANKRD26 (ENSLAFG00000011946) PTCHD3 (ENSLAFG00000029781) RAB18 (ENSLAFG00000015582) ENSLAFG00000025535 ##22 MKX (ENSLAFG00000006126) ODAD2 (ENSLAFG00000016023) MPP7 (ENSLAFG00000010589) WAC (ENSLAFG00000006631) BAMBI (ENSLAFG00000029472) ENSLAFG00000014906 MAP3K8 (ENSLAFG00000013461) MTPAP (ENSLAFG00000013452) JCAD (ENSLAFG00000011422) SVIL (ENSLAFG00000012494) ZNF438 (ENSLAFG00000008654) ZEB1 (ENSLAFG00000009663) ARHGAP12 (ENSLAFG00000015897) KIF5B (ENSLAFG00000017365) ENSLAFG00000029631 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Microbat MODERN SPECIES 956 IFT88 (ENSMLUG00000013369) EEF1AKMT1 (ENSMLUG00000000302) ENSMLUG00000012089 ENSMLUG00000029730 LATS2 (ENSMLUG00000017711) ENSMLUG00000013297 SAP18 (ENSMLUG00000002852) ENSMLUG00000001913 MRPL57 (ENSMLUG00000029331) ZDHHC20 (ENSMLUG00000014089) MICU2 (ENSMLUG00000014095) FGF9 (ENSMLUG00000004365) ENSMLUG00000008825 ENSMLUG00000028116 ENSMLUG00000029624 ENSMLUG00000025758 ##22 ENSMLUG00000028741 CECR2 (ENSMLUG00000015021) SLC25A18 (ENSMLUG00000014874) ENSMLUG00000014876 BCL2L13 (ENSMLUG00000014528) BID (ENSMLUG00000030257) ENSMLUG00000011774 PEX26 (ENSMLUG00000009801) TUBA8 (ENSMLUG00000002951) USP18 (ENSMLUG00000005462) SOHLH2 (ENSMLUG00000005505) SPART (ENSMLUG00000012067) CCNA1 (ENSMLUG00000000332) RFXAP (ENSMLUG00000013270) ENSMLUG00000006399 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 12 PEX1 (ENSRFEG00010016704) RBM48 (ENSRFEG00010016637) ENSRFEG00010016484 ENSRFEG00010016424 ENSRFEG00010016374 ENSRFEG00010016075 CDK6 (ENSRFEG00010016022) SAMD9 (ENSRFEG00010015996) SAMD9L (ENSRFEG00010015978) VPS50 (ENSRFEG00010014985) CALCR (ENSRFEG00010014905) TFPI2 (ENSRFEG00010014830) GNG11 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(ENSPLOG00000015200) SUMF2 (ENSPLOG00000015147) CCT6A (ENSPLOG00000014865) ENSPLOG00000014811 PSPH (ENSPLOG00000014744) NIPSNAP2 (ENSPLOG00000014670) MRPS17 (ENSPLOG00000014605) ZNF713 (ENSPLOG00000014498) SEPTIN14 (ENSPLOG00000014348) ENSPLOG00000014261 ENSPLOG00000014152 ENSPLOG00000014102 SGF29 (ENSPLOG00000014051) leopard DUPLICATION leopard MODERN SPECIES 3 ENSPPRG00000004303 DDIT4L (ENSPPRG00000004016) ENSPPRG00000015419 PPP3CA (ENSPPRG00000014654) BANK1 (ENSPPRG00000009338) SLC39A8 (ENSPPRG00000007552) NFKB1 (ENSPPRG00000005244) MANBA (ENSPPRG00000002000) ENSPPRG00000000294 CISD2 (ENSPPRG00000024527) SLC9B1 (ENSPPRG00000024578) SLC9B2 (ENSPPRG00000018446) BDH2 (ENSPPRG00000013357) CENPE (ENSPPRG00000012778) TACR3 (ENSPPRG00000003966) ENSPPRG00000003687 ##22 CXXC4 (ENSPPRG00000002765) TET2 (ENSPPRG00000002345) PPA2 (ENSPPRG00000000625) ENSPPRG00000016640 ENSPPRG00000015602 INTS12 (ENSPPRG00000014557) GSTCD (ENSPPRG00000012754) NPNT (ENSPPRG00000010205) TBCK (ENSPPRG00000006296) ENSPPRG00000003078 GIMD1 (ENSPPRG00000002041) DKK2 (ENSPPRG00000001046) ENSPPRG00000000898 PAPSS1 (ENSPPRG00000022612) ENSPPRG00000022924 leopard MODERN SPECIES 16 C1orf141 (ENSPPRG00000004147) SLC35D1 (ENSPPRG00000003133) MIER1 (ENSPPRG00000002692) DNAI4 (ENSPPRG00000022534) DYNLT5 (ENSPPRG00000019016) SGIP1 (ENSPPRG00000017177) PDE4B (ENSPPRG00000011824) LEPR (ENSPPRG00000006910) LEPROT (ENSPPRG00000002176) DNAJC6 (ENSPPRG00000002001) ENSPPRG00000000962 ENSPPRG00000000367 JAK1 (ENSPPRG00000022662) RAVER2 (ENSPPRG00000023350) CACHD1 (ENSPPRG00000023686) ENSPPRG00000023862 ##22 UBE2U (ENSPPRG00000021247) ROR1 (ENSPPRG00000017823) ENSPPRG00000013850 PGM1 (ENSPPRG00000013727) EFCAB7 (ENSPPRG00000012738) ITGB3BP (ENSPPRG00000012409) ALG6 (ENSPPRG00000011811) FOXD3 (ENSPPRG00000014919) ATG4C (ENSPPRG00000009565) DOCK7 (ENSPPRG00000007918) ANGPTL3 (ENSPPRG00000013921) USP1 (ENSPPRG00000013661) KANK4 (ENSPPRG00000013316) L1TD1 (ENSPPRG00000011113) ENSPPRG00000011020 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Dog MODERN SPECIES 33 DNAI4 (ENSCAFG00845027932) TCTEX1D1 (ENSCAFG00845028056) SGIP1 (ENSCAFG00845028227) PDE4B (ENSCAFG00845028786) ENSCAFG00845029063 LEPR (ENSCAFG00845029124) LEPROT (ENSCAFG00845029345) DNAJC6 (ENSCAFG00845029438) AK4 (ENSCAFG00845029543) ENSCAFG00845004516 JAK1 (ENSCAFG00845004547) RAVER2 (ENSCAFG00845004615) ENSCAFG00845004661 CACHD1 (ENSCAFG00845004709) ENSCAFG00845004792 ENSCAFG00845004800 ##22 ENSCAFG00845004810 UBE2U (ENSCAFG00845004817) ROR1 (ENSCAFG00845004850) ENSCAFG00845004877 PGM1 (ENSCAFG00845004898) EFCAB7 (ENSCAFG00845004924) ITGB3BP (ENSCAFG00845004941) ALG6 (ENSCAFG00845004972) FOXD3 (ENSCAFG00845004983) ENSCAFG00845004987 ENSCAFG00845004990 ATG4C (ENSCAFG00845005004) DOCK7 (ENSCAFG00845005064) ANGPTL3 (ENSCAFG00845005144) USP1 (ENSCAFG00845005152) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 American mink MODERN SPECIES 25 AVPI1 (ENSNVIG00000019986) PI4K2A (ENSNVIG00000020017) MORN4 (ENSNVIG00000020040) HOGA1 (ENSNVIG00000020057) ANKRD2 (ENSNVIG00000020081) UBTD1 (ENSNVIG00000020107) MMS19 (ENSNVIG00000020128) ZDHHC16 (ENSNVIG00000020289) EXOSC1 (ENSNVIG00000020409) PGAM1 (ENSNVIG00000020444) RRP12 (ENSNVIG00000020453) ENSNVIG00000020615 ARHGAP19 (ENSNVIG00000020620) SLIT1 (ENSNVIG00000020673) LCOR (ENSNVIG00000020819) ENSNVIG00000020852 ##22 PIK3AP1 (ENSNVIG00000020853) TM9SF3 (ENSNVIG00000020907) TLL2 (ENSNVIG00000020943) OPALI (ENSNVIG00000020971) DNTT (ENSNVIG00000021063) BLNK (ENSNVIG00000021085) ZNF518A (ENSNVIG00000021174) CCNJ (ENSNVIG00000000041) CC2D2B (ENSNVIG00000000061) ENSNVIG00000000232 ENTPD1 (ENSNVIG00000000246) TCTN3 (ENSNVIG00000000329) ALDH18A1 (ENSNVIG00000000413) SORBS1 (ENSNVIG00000000477) PDLIM1 (ENSNVIG00000001856) Ferret MODERN SPECIES 284 ENSMPUG00000016707 ENSMPUG00000016708 ##22 ENSMPUG00000020126 TAFA2 (ENSMPUG00000016710) USP15 (ENSMPUG00000016712) MON2 (ENSMPUG00000016714) PPM1H (ENSMPUG00000016718) ENSMPUG00000016720 ENSMPUG00000020127 C12orf56 (ENSMPUG00000016721) KICS2 (ENSMPUG00000016723) SRGAP1 (ENSMPUG00000016725) RXYLT1 (ENSMPUG00000016726) AVPR1A (ENSMPUG00000016730) ENSMPUG00000016731 ENSMPUG00000016737 ENSMPUG00000016739 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 American black bear MODERN SPECIES 5323 ENSUAMG00000009935 ##22 ENSUAMG00000009942 Polar bear MODERN SPECIES 269 FAM167A (ENSUMAG00000021804) BLK (ENSUMAG00000021800) GATA4 (ENSUMAG00000021798) ENSUMAG00000021797 NEIL2 (ENSUMAG00000021796) FDFT1 (ENSUMAG00000021777) ENSUMAG00000021775 ENSUMAG00000021774 ENSUMAG00000021773 DEFB136 (ENSUMAG00000021771) DEFB135 (ENSUMAG00000021769) DEFB134 (ENSUMAG00000021767) ENSUMAG00000021765 ENSUMAG00000021763 ENSUMAG00000021759 ENSUMAG00000021755 ##22 ADAM29 (ENSUMAG00000021750) GLRA3 (ENSUMAG00000021724) HPGD (ENSUMAG00000021714) CEP44 (ENSUMAG00000021708) FBXO8 (ENSUMAG00000021704) SCRG1 (ENSUMAG00000021698) SAP30 (ENSUMAG00000021695) HMGB2 (ENSUMAG00000021691) GALNT7 (ENSUMAG00000021679) GALNTL6 (ENSUMAG00000021673) ENSUMAG00000021670 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Chacoan peccary MODERN SPECIES 104 ENSCWAG00000002578 ABCC11 (ENSCWAG00000002486) ABCC12 (ENSCWAG00000002352) PHKB (ENSCWAG00000002211) ITFG1 (ENSCWAG00000002149) NETO2 (ENSCWAG00000002107) DNAJA2 (ENSCWAG00000002085) GPT2 (ENSCWAG00000002047) ENSCWAG00000002014 ##22 ENSCWAG00000001992 MYLK3 (ENSCWAG00000001954) ORC6 (ENSCWAG00000001931) VPS35 (ENSCWAG00000001902) SHCBP1 (ENSCWAG00000001888) UQCRFS1 (ENSCWAG00000001869) VSTM2B (ENSCWAG00000001853) POP4 (ENSCWAG00000001837) PLEKHF1 (ENSCWAG00000001825) C19orf12 (ENSCWAG00000001799) CCNE1 (ENSCWAG00000001690) URI1 (ENSCWAG00000001670) ZNF536 (ENSCWAG00000001663) ENSCWAG00000001653 TSHZ3 (ENSCWAG00000001647) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Goat MODERN SPECIES 27 ENSCHIG00000005142 ENSCHIG00000025046 ENSCHIG00000009474 ENSCHIG00000019572 ENSCHIG00000011025 IFNE (ENSCHIG00000008081) MTAP (ENSCHIG00000014710) ENSCHIG00000018121 CDKN2A (ENSCHIG00000025939) CDKN2B (ENSCHIG00000025845) DMRTA1 (ENSCHIG00000023134) ENSCHIG00000018988 ELAVL2 (ENSCHIG00000025894) ENSCHIG00000006162 IZUMO3 (ENSCHIG00000018315) ENSCHIG00000003269 ##22 TUSC1 (ENSCHIG00000012670) ENSCHIG00000026276 CAAP1 (ENSCHIG00000017091) PLAA (ENSCHIG00000014920) LRRC19 (ENSCHIG00000024759) IFT74 (ENSCHIG00000009508) TEK (ENSCHIG00000013962) EQTN (ENSCHIG00000008768) IFNK (ENSCHIG00000016395) MOB3B (ENSCHIG00000011582) C9orf72 (ENSCHIG00000014755) LINGO2 (ENSCHIG00000013346) ENSCHIG00000006618 ENSCHIG00000024316 ENSCHIG00000020484 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.f #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT01100000263828.a.b ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000017955.c.d.b ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 Bos ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158615 ENSGT00530000063811.B ENSGT00950000183187.C ENSGT00390000008432.k ENSGT00940000156548 ENSGT00950000183143.c.a ENSGT00940000156430 ENSGT00940000158984 ENSGT00940000155049 ENSGT00390000003405 ENSGT00940000159009 ENSGT00550000075075 ENSGT00940000155403.a ENSGT00390000018635.d ENSGT00940000156133 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000156488 ENSGT00440000039754 ENSGT00390000017134 ENSGT00390000015813.g.c ENSGT00900000141107 ENSGT00390000008873 ENSGT01020000230438.C ENSGT00940000159434 ENSGT00940000163029 ENSGT00950000183200.A.a.b.b.d ENSGT00940000156871 ENSGT00990000203589.a.a ENSGT00940000154184.A ENSGT00940000158425 ENSGT00940000160048 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158615 ENSGT00530000063811.B ENSGT00950000183187.C ENSGT00390000008432.k ENSGT00940000156548 ENSGT00950000183143.c.a ENSGT00940000156430 ENSGT00940000158984 ENSGT00940000155049 ENSGT00390000003405 ENSGT00940000159009 ENSGT00550000075075 ENSGT00940000155403.a ENSGT00390000018635.d ENSGT00940000156133 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000156488 ENSGT00390000017134 ENSGT00390000015813.g.c ENSGT00900000141107 ENSGT00390000008873 ENSGT01020000230438.C ENSGT00940000159434 ENSGT00940000163029 ENSGT00950000183200.A.a.b.b.d ENSGT00940000156871 ENSGT00990000203589.a.a ENSGT00940000154184.A ENSGT00940000158425 ENSGT00940000160048 ENSGT00940000157699 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 8 FAM222A (ENSBIXG00005001698) MVK (ENSBIXG00005005272) ENSBIXG00005030844 UBE3B (ENSBIXG00005030833) KCTD10 (ENSBIXG00005030825) MYO1H (ENSBIXG00005030807) FOXN4 (ENSBIXG00005030787) ENSBIXG00005030776 ACACB (ENSBIXG00005030750) UNG (ENSBIXG00005030729) ALKBH2 (ENSBIXG00005030723) USP30 (ENSBIXG00005030700) SVOP (ENSBIXG00005030662) DAO (ENSBIXG00005030642) SSH1 (ENSBIXG00005030627) ENSBIXG00005030614 ##22 CORO1C (ENSBIXG00005030577) TMEM119 (ENSBIXG00005030566) ENSBIXG00005030553 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(ENSBTAG00000015526) SGSM1 (ENSBTAG00000006592) LHFPL7 (ENSBTAG00000006594) KIAA1671 (ENSBTAG00000044022) CRYBB3 (ENSBTAG00000001255) CRYBB2 (ENSBTAG00000004088) GRK3 (ENSBTAG00000000005) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158615 ENSGT00530000063811.B ENSGT00950000183187.C ENSGT00390000008432.k ENSGT00940000156548 ENSGT00950000183143.c.a ENSGT00940000156430 ENSGT00940000158984 ENSGT00940000155049 ENSGT00390000003405 ENSGT00940000159009 ENSGT00550000075075 ENSGT00940000155403.a ENSGT00390000018635.d ENSGT00940000156133 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000156488 ENSGT00440000039754 ENSGT00390000017134 ENSGT00940000166181 ENSGT00390000015813.g.c ENSGT00900000141107 ENSGT00390000008873 ENSGT01020000230438.C ENSGT00940000159434 ENSGT00950000183200.A.a.b.b.d ENSGT00940000156871 ENSGT00990000203589.a.a ENSGT00940000154184.A ENSGT00940000158425 ENSGT00940000160048 Domestic yak MODERN SPECIES 7 MVK (ENSBGRG00000026564) MMAB (ENSBGRG00000026572) UBE3B (ENSBGRG00000026580) KCTD10 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#21 ENSBBBG00000023536 ##22 KCTD4 (ENSBBBG00000023540) #23 GTF2F2 (ENSBBBG00000006155) #24 ENSBBBG00000023577 GPALPP1 (ENSBBBG00000023609) #25 NUFIP1 (ENSBBBG00000023623) #26 TSC22D1 (ENSBBBG00000023640) #27 SERP2 (ENSBBBG00000023651) #28 SMIM2 (ENSBBBG00000023658) #29 LACC1 (ENSBBBG00000023676) #30 CCDC122 (ENSBBBG00000023682) #31 ENOX1 (ENSBBBG00000023702) #32 DNAJC15 (ENSBBBG00000023717) #33 EPSTI1 (ENSBBBG00000023757) #34 FAM216B (ENSBBBG00000023767) #35 TNFSF11 (ENSBBBG00000023782) #36 American bison MODERN SPECIES 3351 TRPV4 (ENSBBBG00000007353) FAM222A (ENSBBBG00000011962) MVK (ENSBBBG00000011952) MMAB (ENSBBBG00000011902) UBE3B (ENSBBBG00000011878) KCTD10 (ENSBBBG00000011843) MYO1H (ENSBBBG00000011828) FOXN4 (ENSBBBG00000011774) ACACB (ENSBBBG00000011758) UNG (ENSBBBG00000011697) ALKBH2 (ENSBBBG00000002149) USP30 (ENSBBBG00000002147) SVOP (ENSBBBG00000011638) DAO (ENSBBBG00000011622) SSH1 (ENSBBBG00000011593) ENSBBBG00000007543 ##22 CORO1C (ENSBBBG00000002117) TMEM119 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ENSGT00390000000945 ENSGT00940000161008 ENSGT00390000002416 ENSGT00940000154046.b ENSGT00390000008092.a.k.a ENSGT00940000158028 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.h ##22 ENSGT00390000003453.a ENSGT00940000158828 ENSGT00390000018619 ENSGT00940000157242 ENSGT00940000159054 ENSGT00940000156325 ENSGT00550000074817 ENSGT00450000040296 ENSGT00530000064269 ENSGT00940000155244 ENSGT00940000155007 ENSGT00940000153558.b.i.b.a.a.g.b ENSGT00940000156806 ENSGT00390000006684 ENSGT00390000007535 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000016188 ENSGT00390000012082 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000016210 ENSGT00390000002564.a ENSGT00940000158864 ENSGT00390000001413.c ENSGT00940000156436 ENSGT00390000000860.b ENSGT00390000000945 ENSGT00940000161008 ENSGT00390000002416 ENSGT00940000154046.b ENSGT00390000008092.a.k.a ENSGT00940000158028 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.h ##22 ENSGT00390000003453.a ENSGT00940000158828 ENSGT00390000018619 ENSGT00940000157242 ENSGT00940000159054 ENSGT00940000156325 ENSGT00550000074817 ENSGT00450000040296 ENSGT00940000155244 ENSGT00940000155007 ENSGT00940000153558.b.i.b.a.a.h ENSGT00940000156806 ENSGT00390000006684 ENSGT00390000007535.b.a ENSGT01020000230598 Vaquita MODERN SPECIES 17 GALT (ENSPSNG00000000593) SIGMAR1 (ENSPSNG00000000502) ARID3C (ENSPSNG00000000474) DCTN3 (ENSPSNG00000000430) RPP25L (ENSPSNG00000000386) CNTFR (ENSPSNG00000000345) ENSPSNG00000000323 DNAI1 (ENSPSNG00000000264) FAM219A (ENSPSNG00000000206) C9orf24 (ENSPSNG00000000159) MYORG (ENSPSNG00000000126) NUDT2 (ENSPSNG00000000100) KIF24 (ENSPSNG00000003134) ENSPSNG00000003078 DCAF12 (ENSPSNG00000003034) ENSPSNG00000003019 ##22 UBAP2 (ENSPSNG00000002927) UBE2R2 (ENSPSNG00000002867) NOL6 (ENSPSNG00000002814) AQP3 (ENSPSNG00000002755) ENSPSNG00000002719 ENSPSNG00000002630 NFX1 (ENSPSNG00000002583) CHMP5 (ENSPSNG00000002557) BAG1 (ENSPSNG00000002526) B4GALT1 (ENSPSNG00000002474) SMU1 (ENSPSNG00000002392) ENSPSNG00000002376 APTX (ENSPSNG00000002301) TMEM215 (ENSPSNG00000002251) ENSPSNG00000002234 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000016188 ENSGT00390000012082 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000016210 ENSGT00390000002564.a ENSGT00940000158864 ENSGT00390000001413.c ENSGT00940000156436 ENSGT00390000000860.b ENSGT00390000000945 ENSGT00940000161008 ENSGT00390000002416 ENSGT00940000154046.b ENSGT00390000008092.a.k.a ENSGT00940000158028 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.h ##22 ENSGT00390000003453.a ENSGT00940000158828 ENSGT00390000018619 ENSGT00940000157242 ENSGT00940000153786.e.a.b.e.a ENSGT00940000159054 ENSGT00940000156325 ENSGT00550000074817 ENSGT00450000040296 ENSGT00940000155244 ENSGT00940000155007 ENSGT00940000153558.b.i.b.a.a.h ENSGT00940000156806 ENSGT00390000006684 ENSGT00390000007535.b.a Beluga whale MODERN SPECIES 50 IL11RA (ENSDLEG00000008108) SIGMAR1 (ENSDLEG00000008085) ARID3C (ENSDLEG00000008063) DCTN3 (ENSDLEG00000008051) RPP25L (ENSDLEG00000008042) CNTFR (ENSDLEG00000007948) ENHO (ENSDLEG00000007905) DNAI1 (ENSDLEG00000007879) FAM219A (ENSDLEG00000007874) C9orf24 (ENSDLEG00000007872) MYORG (ENSDLEG00000007868) NUDT2 (ENSDLEG00000007863) KIF24 (ENSDLEG00000007842) ENSDLEG00000007836 DCAF12 (ENSDLEG00000007833) ENSDLEG00000007831 ##22 UBAP2 (ENSDLEG00000007780) UBE2R2 (ENSDLEG00000007766) NOL6 (ENSDLEG00000007758) AQP3 (ENSDLEG00000007754) ENSDLEG00000007746 TFCP2 (ENSDLEG00000020960) ENSDLEG00000020958 ENSDLEG00000020955 NFX1 (ENSDLEG00000020947) CHMP5 (ENSDLEG00000020937) BAG1 (ENSDLEG00000020931) B4GALT1 (ENSDLEG00000020924) SMU1 (ENSDLEG00000020915) DNAJA1 (ENSDLEG00000020908) APTX (ENSDLEG00000020896) Narwhal DUPLICATION Narwhal MODERN SPECIES 312 SIGMAR1 (ENSMMNG00015018325) ENSMMNG00015018369 ARID3C (ENSMMNG00015018386) DCTN3 (ENSMMNG00015018419) RPP25L (ENSMMNG00015018545) CNTFR (ENSMMNG00015018571) ENSMMNG00015018615 DNAI1 (ENSMMNG00015018633) FAM219A (ENSMMNG00015018769) C9orf24 (ENSMMNG00015018846) MYORG (ENSMMNG00015018908) NUDT2 (ENSMMNG00015018921) KIF24 (ENSMMNG00015018952) ENSMMNG00015019055 DCAF12 (ENSMMNG00015019152) ENSMMNG00015019187 ##22 UBAP2 (ENSMMNG00015019218) UBE2R2 (ENSMMNG00015019308) NOL6 (ENSMMNG00015019353) AQP3 (ENSMMNG00015019451) ENSMMNG00015019480 ENSMMNG00015019525 NFX1 (ENSMMNG00015019641) CHMP5 (ENSMMNG00015019686) BAG1 (ENSMMNG00015019712) ENSMMNG00015019735 B4GALT1 (ENSMMNG00015019757) SMU1 (ENSMMNG00015019783) ENSMMNG00015019827 APTX (ENSMMNG00015019891) TMEM215 (ENSMMNG00015020032) Narwhal MODERN SPECIES 310 ACOT13 (ENSMMNG00015011208) TDP2 (ENSMMNG00015011165) KIAA0319 (ENSMMNG00015011029) ALDH5A1 (ENSMMNG00015010942) GPLD1 (ENSMMNG00015010888) MRS2 (ENSMMNG00015010842) DCDC2 (ENSMMNG00015010801) NRSN1 (ENSMMNG00015010781) HDGFL1 (ENSMMNG00015010748) PRL (ENSMMNG00015010715) SOX4 (ENSMMNG00015013347) CDKAL1 (ENSMMNG00015013320) E2F3 (ENSMMNG00015013298) MBOAT1 (ENSMMNG00015013281) ID4 (ENSMMNG00015013275) ENSMMNG00015013266 ##22 RNF144B (ENSMMNG00015013247) ENSMMNG00015013235 DEK (ENSMMNG00015013198) KDM1B (ENSMMNG00015013151) TPMT (ENSMMNG00015013119) ENSMMNG00015013110 NHLRC1 (ENSMMNG00015013102) KIF13A (ENSMMNG00015012910) NUP153 (ENSMMNG00015012788) FAM8A1 (ENSMMNG00015012765) CAP2 (ENSMMNG00015012703) RBM24 (ENSMMNG00015012652) STMND1 (ENSMMNG00015012629) ATXN1 (ENSMMNG00015012616) GMPR (ENSMMNG00015012605) Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Alpaca MODERN SPECIES 912 SEC63 (ENSVPAG00000011376) SCML4 (ENSVPAG00000011375) SOBP (ENSVPAG00000011373) ENSVPAG00000011372 ##22 PDSS2 (ENSVPAG00000011371) BEND3 (ENSVPAG00000011370) MTRES1 (ENSVPAG00000011369) ENSVPAG00000011368 QRSL1 (ENSVPAG00000011367) RTN4IP1 (ENSVPAG00000011366) CRYBG1 (ENSVPAG00000011365) ATG5 (ENSVPAG00000011364) PRDM1 (ENSVPAG00000011363) Arabian camel MODERN SPECIES 123 ENSCDRG00005008006 ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Tarsier MODERN SPECIES 5962 KCTD15 (ENSTSYG00000005133) ENSTSYG00000032742 ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 966 SPINK1 (ENSANAG00000023762) SCGB3A2 (ENSANAG00000023468) C5orf46 (ENSANAG00000037273) SPINK5 (ENSANAG00000034759) SPINK14 (ENSANAG00000029562) SPINK6 (ENSANAG00000037160) MARCOL (ENSANAG00000026951) SPINK13 (ENSANAG00000024157) SPINK7 (ENSANAG00000024041) ENSANAG00000037965 SPINK9 (ENSANAG00000017436) FBXO38 (ENSANAG00000025070) HTR4 (ENSANAG00000016946) ADRB2 (ENSANAG00000025525) SH3TC2 (ENSANAG00000019462) ENSANAG00000026413 ##22 ABLIM3 (ENSANAG00000036878) AFAP1L1 (ENSANAG00000024427) GRPEL2 (ENSANAG00000030295) PCYOX1L (ENSANAG00000020560) IL17B (ENSANAG00000020790) CSNK1A1 (ENSANAG00000021098) ARHGEF37 (ENSANAG00000025504) PPARGC1B (ENSANAG00000021830) PDE6A (ENSANAG00000035251) SLC26A2 (ENSANAG00000024045) TIGD6 (ENSANAG00000023656) HMGXB3 (ENSANAG00000021091) CSF1R (ENSANAG00000028025) ENSANAG00000027390 PDGFRB (ENSANAG00000036549) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Marmoset MODERN SPECIES 16 ARHGAP18 (ENSCJAG00000003308) LAMA2 (ENSCJAG00000003343) ENSCJAG00000079418 PTPRK (ENSCJAG00000003496) ENSCJAG00000083208 THEMIS (ENSCJAG00000003598) ENSCJAG00000070420 C6orf58 (ENSCJAG00000003611) SOGA3 (ENSCJAG00000048256) KIAA0408 (ENSCJAG00000003616) ENSCJAG00000022493 ECHDC1 (ENSCJAG00000003649) ENSCJAG00000084697 RNF146 (ENSCJAG00000056389) RSPO3 (ENSCJAG00000053376) ENSCJAG00000042779 ##22 CENPW (ENSCJAG00000038479) TRMT11 (ENSCJAG00000003686) HINT3 (ENSCJAG00000043717) ENSCJAG00000079710 NCOA7 (ENSCJAG00000003719) HEY2 (ENSCJAG00000056139) ENSCJAG00000085403 HDDC2 (ENSCJAG00000003773) ENSCJAG00000003786 RNF217 (ENSCJAG00000003808) ENSCJAG00000073808 NKAIN2 (ENSCJAG00000034582) TRDN (ENSCJAG00000003835) CLVS2 (ENSCJAG00000048309) ENSCJAG00000086822 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.i ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.i ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.i ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.i ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.i ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 104 ENSMNEG00000044241 ENSMNEG00000030366 CYP26A1 (ENSMNEG00000028946) CYP26C1 (ENSMNEG00000045176) EXOC6 (ENSMNEG00000043219) HHEX (ENSMNEG00000037100) KIF11 (ENSMNEG00000020591) ENSMNEG00000028830 IDE (ENSMNEG00000033204) MARCHF5 (ENSMNEG00000037845) CPEB3 (ENSMNEG00000045465) ENSMNEG00000030284 ENSMNEG00000033162 BTAF1 (ENSMNEG00000035134) TNKS2 (ENSMNEG00000036136) ENSMNEG00000029218 ##22 PPP1R3C (ENSMNEG00000040446) HECTD2 (ENSMNEG00000043171) PCGF5 (ENSMNEG00000041619) ENSMNEG00000031049 ANKRD1 (ENSMNEG00000045466) RPP30 (ENSMNEG00000033838) ENSMNEG00000011783 HTR7 (ENSMNEG00000038453) KIF20B (ENSMNEG00000030266) ENSMNEG00000016798 PANK1 (ENSMNEG00000005927) SLC16A12 (ENSMNEG00000032571) IFIT5 (ENSMNEG00000044200) IFIT3 (ENSMNEG00000028978) IFIT2 (ENSMNEG00000034947) Catarrhini DUPLICATION Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000000223 ENSGT01030000234614.B.a.a.a ENSGT00940000155591 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00910000147463 ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B ENSGT01030000235151 ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182858.B.b.a ENSGT00390000000223 ENSGT01030000234614.B.a.a.a ENSGT00940000155591 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B ENSGT01030000235151 ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b ENSGT00940000154254.a Pan ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182858.B.b.a ENSGT00390000000223 ENSGT01030000234614.B.a.a.a ENSGT00940000155591 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B ENSGT01030000235151 ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b ENSGT00940000154254.a Chimpanzee MODERN SPECIES 22 ENSPTRG00000049018 STOM (ENSPTRG00000021315) GSN (ENSPTRG00000021313) RAB14 (ENSPTRG00000021312) CNTRL (ENSPTRG00000021311) C5 (ENSPTRG00000021309) TRAF1 (ENSPTRG00000021307) PHF19 (ENSPTRG00000044184) PSMD5 (ENSPTRG00000021305) B3GALT9 (ENSPTRG00000046674) FBXW2 (ENSPTRG00000021304) ENSPTRG00000047009 MEGF9 (ENSPTRG00000021303) CDK5RAP2 (ENSPTRG00000021302) BRINP1 (ENSPTRG00000021301) ENSPTRG00000047705 ##22 TLR4 (ENSPTRG00000021299) TRIM32 (ENSPTRG00000021298) ASTN2 (ENSPTRG00000021297) ENSPTRG00000046834 PAPPA (ENSPTRG00000021296) ENSPTRG00000021295 TNC (ENSPTRG00000021294) TNFSF8 (ENSPTRG00000021293) TNFSF15 (ENSPTRG00000021292) TEX48 (ENSPTRG00000052346) TEX53 (ENSPTRG00000051173) TMEM268 (ENSPTRG00000021291) ATP6V1G1 (ENSPTRG00000021290) WHRN (ENSPTRG00000021289) AKNA (ENSPTRG00000021288) Bonobo MODERN SPECIES 22 ENSPPAG00000037253 ENSPPAG00000030402 STOM (ENSPPAG00000033707) GSN (ENSPPAG00000033077) RAB14 (ENSPPAG00000031759) CNTRL (ENSPPAG00000021663) C5 (ENSPPAG00000032861) TRAF1 (ENSPPAG00000041780) PHF19 (ENSPPAG00000041871) PSMD5 (ENSPPAG00000040526) B3GALT9 (ENSPPAG00000018320) FBXW2 (ENSPPAG00000030375) MEGF9 (ENSPPAG00000000986) CDK5RAP2 (ENSPPAG00000039121) BRINP1 (ENSPPAG00000032114) ENSPPAG00000042039 ##22 TLR4 (ENSPPAG00000031203) TRIM32 (ENSPPAG00000026037) ASTN2 (ENSPPAG00000030670) ENSPPAG00000022500 PAPPA (ENSPPAG00000031632) ENSPPAG00000043498 TNC (ENSPPAG00000033465) TNFSF8 (ENSPPAG00000043155) TNFSF15 (ENSPPAG00000027793) TEX48 (ENSPPAG00000010613) TEX53 (ENSPPAG00000004001) TMEM268 (ENSPPAG00000038943) ATP6V1G1 (ENSPPAG00000008393) WHRN (ENSPPAG00000039285) ENSPPAG00000015828 Gorilla MODERN SPECIES 22 ENSGGOG00000040156 STOM (ENSGGOG00000010215) GSN (ENSGGOG00000010202) RAB14 (ENSGGOG00000027624) CNTRL (ENSGGOG00000000954) C5 (ENSGGOG00000002285) TRAF1 (ENSGGOG00000002284) PHF19 (ENSGGOG00000002281) PSMD5 (ENSGGOG00000005709) B3GALT9 (ENSGGOG00000004852) FBXW2 (ENSGGOG00000007441) ENSGGOG00000025364 MEGF9 (ENSGGOG00000015277) CDK5RAP2 (ENSGGOG00000000178) BRINP1 (ENSGGOG00000005190) ENSGGOG00000042803 ##22 ENSGGOG00000043595 ENSGGOG00000037048 ENSGGOG00000042290 TRIM32 (ENSGGOG00000025006) ASTN2 (ENSGGOG00000038795) ENSGGOG00000039057 PAPPA (ENSGGOG00000007107) ENSGGOG00000026862 TNC (ENSGGOG00000010138) TNFSF15 (ENSGGOG00000010814) TEX48 (ENSGGOG00000042957) TEX53 (ENSGGOG00000036380) ENSGGOG00000024486 ATP6V1G1 (ENSGGOG00000041082) WHRN (ENSGGOG00000003758) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000000223 ENSGT00940000155591 ENSGT00940000155178 ENSGT00900000143673 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00910000147835 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00390000003140.B.i ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B.j.a ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b ENSGT00940000154254.a Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155591 ENSGT00900000143673 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00910000147835 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00390000003860.h.a.a ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00910000147463 ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B.i ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b ENSGT00940000154254.a ENSGT00390000012130 ENSGT00940000163466 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155591 ENSGT00900000143673 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00910000147835 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00390000003860.h.a.a.a ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00910000147463 ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B.i ENSGT00940000156654 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ENSGT00900000143673 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00940000170471.B.a.b.b ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00390000003140.B.i ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B.j.a ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT01100000263539.a.a.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b Crab-eating macaque MODERN SPECIES 6 CNTRL (ENSMFAG00000001166) C5 (ENSMFAG00000033951) TRAF1 (ENSMFAG00000031255) PHF19 (ENSMFAG00000033849) PSMD5 (ENSMFAG00000003663) B3GALT9 (ENSMFAG00000062661) FBXW2 (ENSMFAG00000039416) MEGF9 (ENSMFAG00000049040) ENSMFAG00000060455 CDK5RAP2 (ENSMFAG00000039120) ENSMFAG00000063472 BRINP1 (ENSMFAG00000003931) ENSMFAG00000065255 ENSMFAG00000058815 BCAS4 (ENSMFAG00000044405) ENSMFAG00000024336 ##22 ENSMFAG00000061498 TLR4 (ENSMFAG00000042896) ENSMFAG00000063989 ENSMFAG00000048412 ENSMFAG00000044594 TRIM32 (ENSMFAG00000012352) ENSMFAG00000061748 PAPPA (ENSMFAG00000041618) TNC (ENSMFAG00000001848) TNFSF8 (ENSMFAG00000032731) TNFSF15 (ENSMFAG00000000937) TEX48 (ENSMFAG00000036582) TEX53 (ENSMFAG00000035868) ENSMFAG00000052387 TMEM268 (ENSMFAG00000041867) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155853 ENSGT01030000234614.B.a.a.a ENSGT00940000155591 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00390000003860.h.a.a.a ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00910000147463 ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B.i ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b ENSGT00940000154254.a Olive baboon MODERN SPECIES 4 RAB14 (ENSPANG00000025819) CNTRL (ENSPANG00000025820) C5 (ENSPANG00000025822) PHF19 (ENSPANG00000025817) PSMD5 (ENSPANG00000025810) B3GALT9 (ENSPANG00000048962) FBXW2 (ENSPANG00000025813) MEGF9 (ENSPANG00000025814) CDK5RAP2 (ENSPANG00000025815) ENSPANG00000047206 ENSPANG00000050049 ENSPANG00000049720 ENSPANG00000034969 BRINP1 (ENSPANG00000025809) ENSPANG00000037035 ENSPANG00000039681 ##22 TLR4 (ENSPANG00000025800) TRIM32 (ENSPANG00000021111) ASTN2 (ENSPANG00000025801) PAPPA (ENSPANG00000025803) TNC (ENSPANG00000025804) TNFSF8 (ENSPANG00000025806) TNFSF15 (ENSPANG00000025807) TEX48 (ENSPANG00000031965) TEX53 (ENSPANG00000033507) TMEM268 (ENSPANG00000025799) ATP6V1G1 (ENSPANG00000025798) WHRN (ENSPANG00000025783) AKNA (ENSPANG00000025784) ORM1 (ENSPANG00000025785) ENSPANG00000041341 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 978 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3282 ENSRROG00000042828 ##22 TLR4 (ENSRROG00000032814) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 426 ENSRBIG00000000050 ENSRBIG00000029433 ##22 TLR4 (ENSRBIG00000026429) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159529 ENSGT00580000081628 ENSGT01030000234642.a.a ENSGT00390000015948.b ENSGT00390000009265 ENSGT00940000156270 ENSGT00940000161451 ENSGT00940000164104 ENSGT00520000055570.A.a ENSGT00940000159064 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00910000147716 ENSGT00940000155535 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 ENSGT00940000157814 ENSGT00940000158418 ENSGT00940000153232.a.a ENSGT00390000006729 ENSGT00940000158766 ENSGT00390000015483 ENSGT00940000161953 ENSGT00720000108851 ENSGT00940000158754 ENSGT00940000159040 ENSGT00910000147115 ENSGT00950000183067.a.b.b ENSGT00950000182850.a.a ENSGT00950000182936.a.b.a ENSGT00940000158962 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159529 ENSGT00580000081628 ENSGT01030000234642.a.a ENSGT00390000015948.b ENSGT00390000009265 ENSGT00940000156270 ENSGT00940000161451 ENSGT00940000164104.b ENSGT00520000055570.A.a ENSGT00940000159064 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00910000147716 ENSGT00940000155535 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 ENSGT00940000157814 ENSGT00940000158418 ENSGT00940000153232.a.a ENSGT00390000006729 ENSGT00940000158766 ENSGT00390000015483 ENSGT00940000161953 ENSGT00720000108851 ENSGT00940000158754 ENSGT00940000159040 ENSGT00910000147115 ENSGT00950000183067.a.b.b ENSGT00950000182850.a.a ENSGT00950000182936.a.b.a ENSGT00940000158962 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153352.B.a.b ENSGT00940000159529 ENSGT00580000081628 ENSGT01030000234642.a.a ENSGT00390000015948.b ENSGT00390000009265 ENSGT00940000156270 ENSGT00940000161451 ENSGT00940000164104.b ENSGT00520000055570.A.a ENSGT00940000159064 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 ENSGT00940000157814 ENSGT00940000158418 ENSGT00940000153232.a.a ENSGT00390000006729 ENSGT00940000158766 ENSGT00390000015483 ENSGT00940000161953 ENSGT00720000108851 ENSGT00940000158754 ENSGT00940000159040 ENSGT00910000147115 ENSGT00950000183067.a.b.b ENSGT00950000182850.a.a ENSGT00950000182936.a.b.a ENSGT00940000158962 Olive baboon MODERN SPECIES 2 DUSP5 (ENSPANG00000047281) SMC3 (ENSPANG00000020807) RBM20 (ENSPANG00000020808) PDCD4 (ENSPANG00000020809) BBIP1 (ENSPANG00000037854) SHOC2 (ENSPANG00000020801) ADRA2A (ENSPANG00000050114) ENSPANG00000030169 GPAM (ENSPANG00000020792) TECTB (ENSPANG00000020793) ACSL5 (ENSPANG00000020795) ZDHHC6 (ENSPANG00000020796) VTI1A (ENSPANG00000020798) ENSPANG00000032092 TCF7L2 (ENSPANG00000020799) ENSPANG00000011878 ##22 HABP2 (ENSPANG00000020791) NRAP (ENSPANG00000020790) CASP7 (ENSPANG00000020745) PLEKHS1 (ENSPANG00000020746) DCLRE1A (ENSPANG00000020747) NHLRC2 (ENSPANG00000020749) ADRB1 (ENSPANG00000017618) CCDC186 (ENSPANG00000020751) TDRD1 (ENSPANG00000020752) VWA2 (ENSPANG00000020743) AFAP1L2 (ENSPANG00000020708) ABLIM1 (ENSPANG00000020709) FHIP2A (ENSPANG00000020711) TRUB1 (ENSPANG00000020712) ENSPANG00000045420 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 19 ENSMFAG00000065587 DUSP5 (ENSMFAG00000002031) ENSMFAG00000063112 SMC3 (ENSMFAG00000003098) RBM20 (ENSMFAG00000036795) ENSMFAG00000063286 ENSMFAG00000049620 GPAM (ENSMFAG00000032340) TECTB (ENSMFAG00000036424) ACSL5 (ENSMFAG00000001207) ZDHHC6 (ENSMFAG00000041749) VTI1A 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NRAP (ENSCSAG00000005102) CASP7 (ENSCSAG00000005095) PLEKHS1 (ENSCSAG00000005092) DCLRE1A (ENSCSAG00000005090) NHLRC2 (ENSCSAG00000005083) ADRB1 (ENSCSAG00000018456) CCDC186 (ENSCSAG00000005078) TDRD1 (ENSCSAG00000005071) VWA2 (ENSCSAG00000005040) AFAP1L2 (ENSCSAG00000005016) ABLIM1 (ENSCSAG00000004943) FHIP2A (ENSCSAG00000004893) TRUB1 (ENSCSAG00000004891) ATRNL1 (ENSCSAG00000004885) Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000155242.m ENSGT00940000154606.`c.b ENSGT00910000147593 ENSGT00950000183584 ENSGT00940000155085.b ENSGT00440000040163 ENSGT01050000244848.B.a.b ENSGT00390000015252.g.a.b ENSGT00390000015252.h ENSGT00390000015252.g.a.a ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00510000047029.z.e.e.b.b ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 ENSGT00510000047029.z.e.e.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843 ENSGT00950000183118.A.c.b ENSGT00940000163063 ENSGT00410000029400.f ENSGT00940000165171 ENSGT00410000029400.e ENSGT00940000160311 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00940000154744.m.a ENSGT00390000003601.a Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 486 ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00510000047029.z.e.e.b.b ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 ENSGT00510000047029.z.e.e.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.b.b ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843.g Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 790 RTL5 (ENSRBIG00000007618) NHSL2 (ENSRBIG00000041684) ENSRBIG00000030563 ##22 ERCC6L (ENSRBIG00000036588) ENSRBIG00000032127 ENSRBIG00000039804 CITED1 (ENSRBIG00000034641) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160693 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000155242.m ENSGT00940000154606.`c.b ENSGT00910000147593 ENSGT00950000183584 ENSGT00940000155085.b ENSGT00440000040163 ENSGT01050000244848.B.a.b ENSGT00390000015252.g.a.b ENSGT00390000015252.h ENSGT00390000015252.g.a.a ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 ENSGT00510000047029.z.e.e.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843 ENSGT00950000183118.A.c.b ENSGT00940000163063 ENSGT00410000029400.f ENSGT00410000029400.e ENSGT00940000160311 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00940000154744.m.a ENSGT00390000003601.a ENSGT00910000146883.A Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160693 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000155242.m ENSGT00940000154606.`c.b ENSGT00910000147593 ENSGT00950000183584 ENSGT00940000155085.b ENSGT00440000040163 ENSGT01050000244848.B.a.b ENSGT00390000015252.g.a.b ENSGT00390000015252.h ENSGT00390000015252.g.a.a ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 ENSGT00510000047029.z.e.e.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843 ENSGT00950000183118.A.c.b ENSGT00550000074828.a.g.b.l ENSGT00410000029400.f ENSGT00940000165171 ENSGT00940000160311 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00940000154744.m.a ENSGT00390000003601.a ENSGT00910000146883.A Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00910000147480 ENSGT00940000160693 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000155242.m ENSGT00940000154606.`c.b ENSGT00950000183584 ENSGT00940000155085.b ENSGT00440000040163 ENSGT01050000244848.B.a.b ENSGT00390000015252.g.a.b ENSGT00390000015252.h ENSGT00390000015252.g.a.a ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 ENSGT00510000047029.z.e.e.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843 ENSGT00950000183118.A.c.b ENSGT00410000029400.e ENSGT00940000163063 ENSGT00410000029400.f ENSGT00940000160311 ENSGT00940000162554 ENSGT00940000154744.m.a ENSGT00390000003601.a ENSGT00910000146883.A ENSGT00390000008296.b.a.a.h Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 207 ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 ENSGT00510000047029.z.e.e.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843 ENSGT00950000183118.A.c.b ENSGT00550000074828.a.g.b.l ENSGT00940000160311 ENSGT00410000029400.e ENSGT00410000029400.f ENSGT00940000163063 Drill MODERN SPECIES 106 RTL5 (ENSMLEG00000026223) NHSL2 (ENSMLEG00000032450) ENSMLEG00000031609 ##22 ERCC6L (ENSMLEG00000000190) ENSMLEG00000009764 ENSMLEG00000035471 CITED1 (ENSMLEG00000031289) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 Gibbon MODERN SPECIES 449 ENSNLEG00000034741 ZMYM3 (ENSNLEG00000001252) NONO (ENSNLEG00000001278) ITGB1BP2 (ENSNLEG00000001428) ENSNLEG00000032761 TAF1 (ENSNLEG00000000934) ENSNLEG00000030598 ENSNLEG00000032518 OGT (ENSNLEG00000001038) ENSNLEG00000036058 CXCR3 (ENSNLEG00000001116) ENSNLEG00000029115 ENSNLEG00000001121 NHSL2 (ENSNLEG00000018118) RTL5 (ENSNLEG00000018851) ENSNLEG00000018852 ##22 PIN4 (ENSNLEG00000036320) ERCC6L (ENSNLEG00000036284) ENSNLEG00000018121 CITED1 (ENSNLEG00000018122) HDAC8 (ENSNLEG00000018123) PHKA1 (ENSNLEG00000018124) ENSNLEG00000018125 ENSNLEG00000029049 ENSNLEG00000034046 ENSNLEG00000029617 ENSNLEG00000018128 NAP1L2 (ENSNLEG00000019044) CDX4 (ENSNLEG00000001025) ENSNLEG00000034883 CHIC1 (ENSNLEG00000033690) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.b ##22 Gibbon MODERN SPECIES 20 GPATCH2 (ENSNLEG00000014201) ENSNLEG00000028800 SPATA17 (ENSNLEG00000014182) RRP15 (ENSNLEG00000031373) TGFB2 (ENSNLEG00000014141) LYPLAL1 (ENSNLEG00000032025) SLC30A10 (ENSNLEG00000014114) EPRS1 (ENSNLEG00000013988) BPNT1 (ENSNLEG00000013965) ENSNLEG00000031718 IARS2 (ENSNLEG00000013853) RAB3GAP2 (ENSNLEG00000013829) ENSNLEG00000031289 MARK1 (ENSNLEG00000013822) C1orf115 (ENSNLEG00000027698) ENSNLEG00000018321 ##22 ENSNLEG00000013814 MTARC2 (ENSNLEG00000013794) MTARC1 (ENSNLEG00000013779) HLX (ENSNLEG00000013773) DUSP10 (ENSNLEG00000035713) HHIPL2 (ENSNLEG00000013732) TAF1A (ENSNLEG00000013687) MIA3 (ENSNLEG00000013613) AIDA (ENSNLEG00000013583) BROX (ENSNLEG00000013533) FAM177B (ENSNLEG00000028293) DISP1 (ENSNLEG00000013511) SUSD4 (ENSNLEG00000000441) CAPN8 (ENSNLEG00000013334) CAPN2 (ENSNLEG00000013341) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156638 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156283 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000158473 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000156778 ENSGT00510000048701 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00390000014904 ENSGT00940000162477 ENSGT01030000234595.A.b ENSGT00730000111123 ENSGT00950000183204.b.b.b ENSGT00390000010101 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000153467.a.a ENSGT01050000244948.c.b ENSGT00390000013215 ENSGT00940000162004 ENSGT00940000161511 ENSGT00400000024448 ENSGT00390000002789 ENSGT00940000157628 ENSGT00440000035378.d ENSGT00390000008481 ENSGT00390000000280 ENSGT00940000158696 ENSGT00940000156512.b.b ENSGT00940000155621 ENSGT00390000011342.g Mouse lemur MODERN SPECIES 28 GINM1 (ENSMICG00000006295) PPIL4 (ENSMICG00000006287) ZC3H12D (ENSMICG00000044838) TAB2 (ENSMICG00000027001) UST (ENSMICG00000014507) SASH1 (ENSMICG00000014483) SAMD5 (ENSMICG00000038329) STXBP5 (ENSMICG00000013483) ADGB (ENSMICG00000037898) RAB32 (ENSMICG00000007163) ENSMICG00000027491 GRM1 (ENSMICG00000036398) SHPRH (ENSMICG00000009309) FBXO30 (ENSMICG00000004876) EPM2A (ENSMICG00000044558) ENSMICG00000034510 ##22 ENSMICG00000029904 ENSMICG00000036180 ENSMICG00000045997 STX11 (ENSMICG00000038317) SF3B5 (ENSMICG00000014922) PLAGL1 (ENSMICG00000026500) ZC2HC1B (ENSMICG00000048162) ENSMICG00000009831 LTV1 (ENSMICG00000009827) PHACTR2 (ENSMICG00000009825) FUCA2 (ENSMICG00000026320) PEX3 (ENSMICG00000037542) ADAT2 (ENSMICG00000045010) AIG1 (ENSMICG00000013596) HIVEP2 (ENSMICG00000030485) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000156638 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156283 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000158473 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000156778 ENSGT00510000048701 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00390000014904 ENSGT00940000162477 ENSGT01030000234595.A.b ENSGT00730000111123 ENSGT00950000183204.b.b.b ENSGT00390000010101 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000153467.a.a ENSGT01050000244948.c.b ENSGT00390000013215 ENSGT00940000162004 ENSGT00940000161511 ENSGT00400000024448 ENSGT00390000002789 ENSGT00940000157628 ENSGT00440000035378.d ENSGT00390000008481 ENSGT00390000000280 ENSGT00940000158696 ENSGT00940000156512.b.b ENSGT00940000155621 ENSGT00390000011342.g Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 633 TAB2 (ENSPCOG00000023142) UST (ENSPCOG00000021446) ENSPCOG00000001613 SASH1 (ENSPCOG00000023715) ENSPCOG00000009057 SAMD5 (ENSPCOG00000022350) ENSPCOG00000019164 ENSPCOG00000020600 ADGB (ENSPCOG00000018353) RAB32 (ENSPCOG00000017810) GRM1 (ENSPCOG00000020912) SHPRH (ENSPCOG00000015634) ENSPCOG00000013550 FBXO30 (ENSPCOG00000012566) EPM2A (ENSPCOG00000014015) ENSPCOG00000023257 ##22 ENSPCOG00000028156 ENSPCOG00000027930 ENSPCOG00000022104 SF3B5 (ENSPCOG00000013754) PLAGL1 (ENSPCOG00000016061) ZC2HC1B (ENSPCOG00000022298) PHACTR2 (ENSPCOG00000000394) FUCA2 (ENSPCOG00000025962) PEX3 (ENSPCOG00000020993) ADAT2 (ENSPCOG00000006342) AIG1 (ENSPCOG00000021161) HIVEP2 (ENSPCOG00000006027) ADGRG6 (ENSPCOG00000009023) VTA1 (ENSPCOG00000017670) NMBR (ENSPCOG00000016109) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 478 PDK1 (ENSPCOG00000009920) ITGA6 (ENSPCOG00000020776) DLX2 (ENSPCOG00000010310) DLX1 (ENSPCOG00000001925) METAP1D (ENSPCOG00000007127) HAT1 (ENSPCOG00000020715) SLC25A12 (ENSPCOG00000020183) ENSPCOG00000015276 CYBRD1 (ENSPCOG00000020446) ENSPCOG00000015109 ENSPCOG00000018843 DCAF17 (ENSPCOG00000017687) METTL8 (ENSPCOG00000028842) TLK1 (ENSPCOG00000024648) GORASP2 (ENSPCOG00000016452) ENSPCOG00000026228 ##22 GAD1 (ENSPCOG00000008936) ENSPCOG00000006630 SP5 (ENSPCOG00000020629) MYO3B (ENSPCOG00000024102) UBR3 (ENSPCOG00000027735) METTL5 (ENSPCOG00000011627) SSB (ENSPCOG00000023189) KLHL23 (ENSPCOG00000028044) CFAP210 (ENSPCOG00000006861) PPIG (ENSPCOG00000016588) FASTKD1 (ENSPCOG00000024955) KLHL41 (ENSPCOG00000018624) BBS5 (ENSPCOG00000027299) LRP2 (ENSPCOG00000008020) DHRS9 (ENSPCOG00000020628) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Tree shrew DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 6154 ENSTBEG00000005051 ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 1486 ENSTBEG00000013288 #21 ENSTBEG00000013539 ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.b.f ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT01060000249039 ENSGT00940000166021 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 Hystricomorpha DUPLICATION Hystricomorpha DUPLICATION Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.o.a ##22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 2 CDADC1 (ENSHGLG00000007415) MLNR (ENSHGLG00000006363) FNDC3A (ENSHGLG00000007427) ENSHGLG00000011200 ENSHGLG00000034874 ENSHGLG00000043759 RCBTB2 (ENSHGLG00000003102) ENSHGLG00000037766 RB1 (ENSHGLG00000003581) ENSHGLG00000012986 ENSHGLG00000013614 MED4 (ENSHGLG00000013271) NUDT15 (ENSHGLG00000037073) #7 ENSHGLG00000006869 #8 ENSHGLG00000006924 ENSHGLG00000019880 ##22 ENSHGLG00000044798 HTR2A (ENSHGLG00000041937) #9 ENSHGLG00000002764 #10 LRCH1 (ENSHGLG00000003678) #11 ENSHGLG00000005637 RUBCNL (ENSHGLG00000043639) #12 ENSHGLG00000043742 #13 LCP1 (ENSHGLG00000002813) #14 CPB2 (ENSHGLG00000003312) #15 ZC3H13 (ENSHGLG00000006309) #16 SIAH3 (ENSHGLG00000008529) #17 CBY2 (ENSHGLG00000009737) #18 ENSHGLG00000002801 #20 ENSHGLG00000043699 ENSHGLG00000003289 #21 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 5 ARL4A (ENSHGLG00000042225) ENSHGLG00000008880 ENSHGLG00000018338 ENSHGLG00000012865 ENSHGLG00000038287 ENSHGLG00000016417 DOCK4 (ENSHGLG00000014862) IMMP2L (ENSHGLG00000007468) ENSHGLG00000048809 LRRN3 (ENSHGLG00000045388) ENSHGLG00000037470 ENSHGLG00000044477 ENSHGLG00000040202 DNAJB9 (ENSHGLG00000036548) THAP5 (ENSHGLG00000040131) ENSHGLG00000047483 ##22 ENSHGLG00000016141 NRCAM (ENSHGLG00000006695) ENSHGLG00000048059 ENSHGLG00000011069 ENSHGLG00000047313 ENSHGLG00000046637 ENSHGLG00000042517 LAMB1 (ENSHGLG00000008431) DLD (ENSHGLG00000007297) SLC26A3 (ENSHGLG00000009948) CBLL1 (ENSHGLG00000005878) SLC26A4 (ENSHGLG00000015693) BCAP29 (ENSHGLG00000038167) ENSHGLG00000033753 ENSHGLG00000018976 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 31 ENSHGLG00000003080 ENSHGLG00000010477 ENSHGLG00000009403 ENSHGLG00000008708 ENSHGLG00000008051 ENSHGLG00000042871 ENSHGLG00000039806 ENSHGLG00000005875 ENSHGLG00000019153 SH2D1A (ENSHGLG00000003536) ENSHGLG00000019940 STAG2 (ENSHGLG00000002804) ENSHGLG00000002710 ENSHGLG00000050498 ENSHGLG00000033968 ENSHGLG00000038827 ##22 ENSHGLG00000049745 ENSHGLG00000004222 ENSHGLG00000020259 ENSHGLG00000003480 ENSHGLG00000048745 ENSHGLG00000003217 ENSHGLG00000002840 ENSHGLG00000020492 ENSHGLG00000035517 ENSHGLG00000039468 ENSHGLG00000035272 ENSHGLG00000049618 ENSHGLG00000000099 ENSHGLG00000032972 ENSHGLG00000000073 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 8 KRT76 (ENSHGLG00000001572) ENSHGLG00000034753 KRT1 (ENSHGLG00000001162) KRT73 (ENSHGLG00000001292) KRT72 (ENSHGLG00000001158) KRT74 (ENSHGLG00000001080) KRT71 (ENSHGLG00000000999) KRT5 (ENSHGLG00000000726) ENSHGLG00000032385 ENSHGLG00000000900 ENSHGLG00000035448 KRT75 (ENSHGLG00000006710) ENSHGLG00000004925 KRT82 (ENSHGLG00000004031) KRT84 (ENSHGLG00000003736) ENSHGLG00000038440 ##22 ENSHGLG00000003099 ENSHGLG00000008240 ENSHGLG00000034498 ENSHGLG00000001966 ENSHGLG00000019830 MRPS35 (ENSHGLG00000001828) ENSHGLG00000041806 KLHL42 (ENSHGLG00000001724) ENSHGLG00000033021 ENSHGLG00000030460 ENSHGLG00000013014 CCDC91 (ENSHGLG00000010299) FAR2 (ENSHGLG00000017822) ENSHGLG00000039287 ERGIC2 (ENSHGLG00000007580) Hystricomorpha DUPLICATION Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.o.b.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.o.b.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.o.b.a ##22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 159 ENSCLAG00000008631 USP48 (ENSCLAG00000007619) RAP1GAP (ENSCLAG00000011156) ALPL (ENSCLAG00000007567) ECE1 (ENSCLAG00000012254) EIF4G3 (ENSCLAG00000016985) HP1BP3 (ENSCLAG00000016763) SH2D5 (ENSCLAG00000013408) DDOST (ENSCLAG00000012871) PINK1 (ENSCLAG00000008925) CDA (ENSCLAG00000009273) FAM43B (ENSCLAG00000009147) MUL1 (ENSCLAG00000007620) CAMK2N1 (ENSCLAG00000011210) VWA5B1 (ENSCLAG00000009213) ENSCLAG00000007802 ##22 UBXN10 (ENSCLAG00000007262) PLA2G2C (ENSCLAG00000010694) PLA2G2F (ENSCLAG00000012631) PLA2G2D (ENSCLAG00000011736) PLA2G5 (ENSCLAG00000015123) PLA2G2A (ENSCLAG00000011020) PLA2G2E (ENSCLAG00000010074) OTUD3 (ENSCLAG00000008710) TMCO4 (ENSCLAG00000007271) ENSCLAG00000010769 NBL1 (ENSCLAG00000010096) MICOS10 (ENSCLAG00000012759) CAPZB (ENSCLAG00000007637) SLC66A1 (ENSCLAG00000011607) ENSCLAG00000012341 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 14 PAMR1 (ENSHGLG00000007733) ENSHGLG00000038577 FJX1 (ENSHGLG00000038500) TRIM44 (ENSHGLG00000006623) ENSHGLG00000035280 LDLRAD3 (ENSHGLG00000009909) COMMD9 (ENSHGLG00000039189) PRR5L (ENSHGLG00000006197) TRAF6 (ENSHGLG00000010513) RAG1 (ENSHGLG00000020565) RAG2 (ENSHGLG00000020564) IFTAP (ENSHGLG00000007037) ENSHGLG00000044878 ENSHGLG00000041917 LRRC4C (ENSHGLG00000042650) ENSHGLG00000047607 ##22 ENSHGLG00000013322 TTC17 (ENSHGLG00000017796) HSD17B12 (ENSHGLG00000043869) ALKBH3 (ENSHGLG00000019437) C11orf96 (ENSHGLG00000035452) ACCS (ENSHGLG00000018000) ENSHGLG00000035834 ENSHGLG00000032198 ALX4 (ENSHGLG00000016699) ENSHGLG00000035148 CD82 (ENSHGLG00000035958) TSPAN18 (ENSHGLG00000036138) ENSHGLG00000018116 SLC35C1 (ENSHGLG00000041560) CRY2 (ENSHGLG00000013242) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.o.b.b ##22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES ENSHGLG00000041227 ENSHGLG00000047622 ENSHGLG00000004180 MYCT1 (ENSHGLG00000003966) VIP (ENSHGLG00000003764) ENSHGLG00000003666 FBXO5 (ENSHGLG00000003460) ENSHGLG00000003375 ENSHGLG00000003207 RGS17 (ENSHGLG00000007180) ENSHGLG00000033230 ENSHGLG00000006115 Oprm1 (ENSHGLG00000005417) IPCEF1 (ENSHGLG00000004122) CNKSR3 (ENSHGLG00000003681) ENSHGLG00000039109 ##22 ENSHGLG00000050628 SCAF8 (ENSHGLG00000003619) ENSHGLG00000042832 TIAM2 (ENSHGLG00000002352) CLDN20 (ENSHGLG00000019987) TFB1M (ENSHGLG00000002028) ENSHGLG00000003642 ENSHGLG00000041973 ENSHGLG00000002921 ENSHGLG00000002878 ENSHGLG00000013195 ENSHGLG00000039368 ENSHGLG00000018953 ENSHGLG00000046919 TMEM242 (ENSHGLG00000041592) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 4 ENSHGLG00000018201 NSMCE4A (ENSHGLG00000013057) ENSHGLG00000035516 ENSHGLG00000014774 BTBD16 (ENSHGLG00000010643) ENSHGLG00000043818 ENSHGLG00000009809 HTRA1 (ENSHGLG00000011897) ENSHGLG00000014651 ENSHGLG00000045576 ENSHGLG00000041620 ENSHGLG00000014383 ENSHGLG00000047493 ENSHGLG00000011520 ENSHGLG00000044519 ENSHGLG00000039988 ##22 ENSHGLG00000033348 ENSHGLG00000014509 TM9SF3 (ENSHGLG00000012450) TLL2 (ENSHGLG00000013626) OPALIN (ENSHGLG00000042100) DNTT (ENSHGLG00000009905) BLNK (ENSHGLG00000012499) ZNF518A (ENSHGLG00000021043) CCNJ (ENSHGLG00000050258) CC2D2B (ENSHGLG00000014755) ENSHGLG00000046208 ENTPD1 (ENSHGLG00000015966) TCTN3 (ENSHGLG00000015851) ALDH18A1 (ENSHGLG00000008159) SORBS1 (ENSHGLG00000009457) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 11 ENSHGLG00000012374 Taf9 (ENSHGLG00000001559) ENSHGLG00000010414 ENSHGLG00000012045 TRAT1 (ENSHGLG00000013384) DZIP3 (ENSHGLG00000014321) CIP2A (ENSHGLG00000012233) ENSHGLG00000048292 ENSHGLG00000045200 HHLA2 (ENSHGLG00000014112) ENSHGLG00000012196 CD47 (ENSHGLG00000038154) ENSHGLG00000011661 ENSHGLG00000036947 ENSHGLG00000010700 ENSHGLG00000048665 ##22 ENSHGLG00000011469 ENSHGLG00000021267 CBLB (ENSHGLG00000014056) ENSHGLG00000011495 ENSHGLG00000032310 ENSHGLG00000050354 ENSHGLG00000013730 ENSHGLG00000042295 ENSHGLG00000011658 ENSHGLG00000049479 ENSHGLG00000032435 ENSHGLG00000019492 NFKBIZ (ENSHGLG00000019593) NXPE3 (ENSHGLG00000011899) CEP97 (ENSHGLG00000040290) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.p ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 15 GNPTG (ENSHGLG00000001484) UNKL (ENSHGLG00000001586) UQCC4 (ENSHGLG00000001649) PERCC1 (ENSHGLG00000042238) CCDC154 (ENSHGLG00000001687) CLCN7 (ENSHGLG00000001793) ENSHGLG00000049637 ENSHGLG00000034352 ENSHGLG00000035369 ENSHGLG00000036303 ENSHGLG00000000262 ENSHGLG00000037206 GSC2 (ENSHGLG00000000434) ENSHGLG00000000570 DGCR2 (ENSHGLG00000001472) ENSHGLG00000034329 ##22 ENSHGLG00000033842 ENSHGLG00000003125 ENSHGLG00000001801 ENSHGLG00000003024 ENSHGLG00000000846 ENSHGLG00000019565 ENSHGLG00000039487 ENSHGLG00000041490 ENSHGLG00000035684 ENSHGLG00000005401 P2RX6 (ENSHGLG00000000605) ENSHGLG00000000929 ENSHGLG00000048508 THAP7 (ENSHGLG00000038188) LZTR1 (ENSHGLG00000000653) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.y #10 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(ENSCPOG00000000646) #16 SIAH3 (ENSCPOG00000033748) #17 CBY2 (ENSCPOG00000036575) #18 COG3 (ENSCPOG00000009924) #20 SLC25A30 (ENSCPOG00000031582) #21 ENSCPOG00000009278 ##22 KCTD4 (ENSCPOG00000009346) #23 GTF2F2 (ENSCPOG00000009342) #24 ENSCPOG00000026022 NUFIP1 (ENSCPOG00000005828) #26 TSC22D1 (ENSCPOG00000000560) #27 ENSCPOG00000031530 LACC1 (ENSCPOG00000011253) #30 CCDC122 (ENSCPOG00000003514) #31 ENOX1 (ENSCPOG00000020461) #32 DNAJC15 (ENSCPOG00000003485) #33 ENSCPOG00000040476 #34 TNFSF11 (ENSCPOG00000031600) #36 AKAP11 (ENSCPOG00000006094) #37 DGKH (ENSCPOG00000006087) VWA8 (ENSCPOG00000006076) Guinea pig MODERN SPECIES 37 TGFA (ENSCPOG00000009755) ADD2 (ENSCPOG00000005697) FIGLA (ENSCPOG00000027561) CLEC4F (ENSCPOG00000036583) CD207 (ENSCPOG00000004920) VAX2 (ENSCPOG00000019567) ATP6V1B1 (ENSCPOG00000010441) ENSCPOG00000010451 TEX261 (ENSCPOG00000036856) NAGK (ENSCPOG00000013306) PAIP2B (ENSCPOG00000013310) ENSCPOG00000031084 ENSCPOG00000030713 DYSF (ENSCPOG00000010197) CYP26B1 (ENSCPOG00000006456) ENSCPOG00000033484 ##22 EXOC6B (ENSCPOG00000010694) SPR (ENSCPOG00000027095) EMX1 (ENSCPOG00000033088) SFXN5 (ENSCPOG00000031020) ENSCPOG00000026289 NOTO (ENSCPOG00000032457) SMYD5 (ENSCPOG00000013050) PRADC1 (ENSCPOG00000013054) ENSCPOG00000019869 FBXO41 (ENSCPOG00000013056) EGR4 (ENSCPOG00000012218) ALMS1 (ENSCPOG00000037862) ENSCPOG00000002231 ENSCPOG00000020957 ENSCPOG00000031401 Guinea pig MODERN SPECIES 15 TMEM26 (ENSCPOG00000039231) RHOBTB1 (ENSCPOG00000004867) ENSCPOG00000005402 ENSCPOG00000032292 CCDC6 (ENSCPOG00000013674) SLC16A9 (ENSCPOG00000000319) FAM13C (ENSCPOG00000004183) PHYHIPL (ENSCPOG00000030387) BICC1 (ENSCPOG00000015585) ENSCPOG00000024430 TFAM (ENSCPOG00000034116) UBE2D1 (ENSCPOG00000037622) ENSCPOG00000031595 IPMK (ENSCPOG00000000222) ZWINT (ENSCPOG00000009580) ENSCPOG00000021776 ##22 PCDH15 (ENSCPOG00000004846) MBL2 (ENSCPOG00000002383) DKK1 (ENSCPOG00000022199) ENSCPOG00000013634 CSTF2T (ENSCPOG00000004195) PRKG1 (ENSCPOG00000005830) A1CF (ENSCPOG00000009807) ENSCPOG00000014978 SGMS1 (ENSCPOG00000014981) ENSCPOG00000037619 KIF20B (ENSCPOG00000003302) PANK1 (ENSCPOG00000010351) SLC16A12 (ENSCPOG00000009338) IFIT5 (ENSCPOG00000008531) IFIT1B (ENSCPOG00000038041) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.b.f ##22 ENSGT00390000016051.u.b #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT00940000154415.`b.f ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 2 NARS2 (ENSSVLG00005014874) GAB2 (ENSSVLG00005014816) USP35 (ENSSVLG00005014736) KCTD21 (ENSSVLG00005014693) ALG8 (ENSSVLG00005014631) NDUFC2 (ENSSVLG00005014553) THRSP (ENSSVLG00005014533) ENSSVLG00005014498 ENSSVLG00005014481 INTS4 (ENSSVLG00005014058) AAMDC (ENSSVLG00005013937) RSF1 (ENSSVLG00005013858) CLNS1A (ENSSVLG00005013729) AQP11 (ENSSVLG00005013502) PAK1 (ENSSVLG00005013431) ENSSVLG00005013294 ##22 GDPD4 (ENSSVLG00005013184) MYO7A (ENSSVLG00005012423) CAPN5 (ENSSVLG00005012247) B3GNT6 (ENSSVLG00005012209) ACER3 (ENSSVLG00005023904) TSKU (ENSSVLG00005023871) ENSSVLG00005023846 ENSSVLG00005023498 LRRC32 (ENSSVLG00005023371) EMSY (ENSSVLG00005023093) GVQW3 (ENSSVLG00005022970) THAP12 (ENSSVLG00005022917) WNT11 (ENSSVLG00005022863) UVRAG (ENSSVLG00005022785) DGAT2 (ENSSVLG00005022688) Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 ENSSVLG00005001915 TTC23 (ENSSVLG00005001983) SYNM (ENSSVLG00005002041) IGF1R (ENSSVLG00005002096) ENSSVLG00005002151 ENSSVLG00005002216 NR2F2 (ENSSVLG00005002243) ENSSVLG00005002275 RGMA (ENSSVLG00005002308) CHD2 (ENSSVLG00005002368) FAM174B (ENSSVLG00005002437) ST8SIA2 (ENSSVLG00005002459) SLCO3A1 (ENSSVLG00005002498) ENSSVLG00005002515 SV2B (ENSSVLG00005002536) ENSSVLG00005002572 ##22 ENSSVLG00005002584 AKAP13 (ENSSVLG00005002651) KLHL25 (ENSSVLG00005002784) AGBL1 (ENSSVLG00005002803) NTRK3 (ENSSVLG00005003033) MRPL46 (ENSSVLG00005003446) MRPS11 (ENSSVLG00005003465) DET1 (ENSSVLG00005003477) AEN (ENSSVLG00005003506) ISG20 (ENSSVLG00005003524) ACAN (ENSSVLG00005003652) ENSSVLG00005003827 ABHD2 (ENSSVLG00005003901) RLBP1 (ENSSVLG00005003928) FANCI (ENSSVLG00005004021) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 16 ENSSVLG00005012458 ENSSVLG00005012436 ENSSVLG00005012407 ENSSVLG00005012388 ENSSVLG00005012366 ENSSVLG00005012345 ENSSVLG00005012330 ENSSVLG00005012305 ENSSVLG00005012177 ENSSVLG00005012136 ENSSVLG00005012100 ENSSVLG00005012084 ENSSVLG00005012061 ENSSVLG00005012030 ENSSVLG00005012014 ENSSVLG00005011979 ##22 ENSSVLG00005011921 ENSSVLG00005011869 ENSSVLG00005011850 ENSSVLG00005011819 ENSSVLG00005011794 ENSSVLG00005011779 ENSSVLG00005011731 ENSSVLG00005011705 ENSSVLG00005011645 ENSSVLG00005011618 ENSSVLG00005011597 ENSSVLG00005011580 ENSSVLG00005011531 ENSSVLG00005011505 ENSSVLG00005011479 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.b.f ##22 ENSGT00390000016051.u.b #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00940000158106 Alpin marmot DUPLICATION Alpin marmot MODERN SPECIES 13 MED4 (ENSMMMG00000023156) NUDT15 (ENSMMMG00000023158) #7 SUCLA2 (ENSMMMG00000023163) #8 HTR2A (ENSMMMG00000023175) #9 ESD (ENSMMMG00000023189) #10 LRCH1 (ENSMMMG00000023214) #11 RUBCNL (ENSMMMG00000023314) #12 LRRC63 (ENSMMMG00000023317) #13 LCP1 (ENSMMMG00000023327) #14 CPB2 (ENSMMMG00000023337) #15 ZC3H13 (ENSMMMG00000023343) #16 SIAH3 (ENSMMMG00000023403) #17 CBY2 (ENSMMMG00000023405) #18 COG3 (ENSMMMG00000023415) #20 SLC25A30 (ENSMMMG00000023425) #21 ENSMMMG00000023427 ##22 ENSMMMG00000023432 #24 KCTD4 (ENSMMMG00000023434) #23 ENSMMMG00000023435 ENSMMMG00000023437 NUFIP1 (ENSMMMG00000023439) #26 TSC22D1 (ENSMMMG00000023448) #27 LACC1 (ENSMMMG00000023463) #30 CCDC122 (ENSMMMG00000023465) #31 ENSMMMG00000023467 ENOX1 (ENSMMMG00000023468) #32 EPSTI1 (ENSMMMG00000023471) #34 ENSMMMG00000023473 TNFSF11 (ENSMMMG00000023474) #36 AKAP11 (ENSMMMG00000023475) #37 DGKH (ENSMMMG00000023481) Alpin marmot MODERN SPECIES 5 NEB (ENSMMMG00000021921) RIF1 (ENSMMMG00000021851) TNFAIP6 (ENSMMMG00000021834) ENSMMMG00000021827 NMI (ENSMMMG00000021825) RBM43 (ENSMMMG00000021824) ENSMMMG00000021801 ENSMMMG00000021776 ENSMMMG00000021771 ENSMMMG00000021752 RND3 (ENSMMMG00000021746) MMADHC (ENSMMMG00000021733) LYPD6 (ENSMMMG00000021723) LYPD6B (ENSMMMG00000021702) KIF5C (ENSMMMG00000021654) ENSMMMG00000021646 ##22 EPC2 (ENSMMMG00000021637) ENSMMMG00000021627 ENSMMMG00000021626 ENSMMMG00000021615 ENSMMMG00000021598 ACVR2A (ENSMMMG00000021587) ZEB2 (ENSMMMG00000021492) GTDC1 (ENSMMMG00000021476) ENSMMMG00000021461 ARHGAP15 (ENSMMMG00000021442) KYNU (ENSMMMG00000021410) LRP1B (ENSMMMG00000021313) NXPH2 (ENSMMMG00000021251) SPOPL (ENSMMMG00000021248) HNMT (ENSMMMG00000021232) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 3 CACNB4 (ENSUPAG00010001584) ENSUPAG00010001737 NEB (ENSUPAG00010001764) RIF1 (ENSUPAG00010002377) TNFAIP6 (ENSUPAG00010004346) NMI (ENSUPAG00010004358) RBM43 (ENSUPAG00010004382) ENSUPAG00010004388 ENSUPAG00010004396 RND3 (ENSUPAG00010004413) MMADHC (ENSUPAG00010004432) LYPD6 (ENSUPAG00010004464) LYPD6B (ENSUPAG00010004479) KIF5C (ENSUPAG00010004496) EPC2 (ENSUPAG00010004529) ENSUPAG00010004532 ##22 ENSUPAG00010004533 MBD5 (ENSUPAG00010004537) ORC4 (ENSUPAG00010004557) ACVR2A (ENSUPAG00010004582) ENSUPAG00010004608 ZEB2 (ENSUPAG00010004644) GTDC1 (ENSUPAG00010004826) ARHGAP15 (ENSUPAG00010004846) KYNU (ENSUPAG00010004892) LRP1B (ENSUPAG00010004938) ENSUPAG00010005063 ENSUPAG00010005074 NXPH2 (ENSUPAG00010005088) SPOPL (ENSUPAG00010005093) HNMT (ENSUPAG00010005103) Squirrel DUPLICATION Squirrel MODERN SPECIES 102 SLC9A7 (ENSSTOG00000009492) CHST7 (ENSSTOG00000025227) ENSSTOG00000030183 DIPK2B (ENSSTOG00000002326) KDM6A (ENSSTOG00000001596) ENSSTOG00000007072 FUNDC1 (ENSSTOG00000025782) EFHC2 (ENSSTOG00000014917) NDP (ENSSTOG00000010960) MAOB (ENSSTOG00000004985) MAOA (ENSSTOG00000004958) GPR82 (ENSSTOG00000028760) GPR34 (ENSSTOG00000001566) CASK (ENSSTOG00000005927) NYX (ENSSTOG00000027262) ENSSTOG00000029381 ##22 DDX3X (ENSSTOG00000008094) USP9X (ENSSTOG00000000797) MED14 (ENSSTOG00000022333) CXorf38 (ENSSTOG00000005469) MPC1L (ENSSTOG00000026402) ENSSTOG00000031229 ATP6AP2 (ENSSTOG00000005456) BCOR (ENSSTOG00000003219) MID1IP1 (ENSSTOG00000027194) TSPAN7 (ENSSTOG00000012077) ENSSTOG00000019432 OTC (ENSSTOG00000004056) ENSSTOG00000022470 SRPX (ENSSTOG00000007767) ENSSTOG00000023192 Squirrel MODERN SPECIES 187 LMO3 (ENSSTOG00000005894) MGST1 (ENSSTOG00000007696) SLC15A5 (ENSSTOG00000008472) ENSSTOG00000019960 ##22 DERA (ENSSTOG00000026509) STRAP (ENSSTOG00000000951) EPS8 (ENSSTOG00000012019) PTPRO (ENSSTOG00000011996) RERG (ENSSTOG00000023505) ARHGDIB (ENSSTOG00000026777) PDE6H (ENSSTOG00000009094) ERP27 (ENSSTOG00000027017) MGP (ENSSTOG00000011249) ART4 (ENSSTOG00000011244) SMCO3 (ENSSTOG00000021116) ENSSTOG00000011228 H2AJ (ENSSTOG00000026866) ENSSTOG00000025951 GUCY2C (ENSSTOG00000000539) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 3930 HDX (ENSDNOG00000032839) ENSDNOG00000031307 ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT01030000235083 ENSGT00940000165996 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000163575 #25 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT01030000235083 ENSGT00940000165996 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000163575 #25 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Elephant MODERN SPECIES 239 ENSLAFG00000027647 SUCLA2 (ENSLAFG00000009678) #8 HTR2A (ENSLAFG00000015014) #9 ESD (ENSLAFG00000006901) #10 LRCH1 (ENSLAFG00000006893) #11 RUBCNL (ENSLAFG00000014959) #12 LRRC63 (ENSLAFG00000011144) #13 LCP1 (ENSLAFG00000009574) #14 CPB2 (ENSLAFG00000016759) #15 ENSLAFG00000016747 ENSLAFG00000026189 CBY2 (ENSLAFG00000011325) #18 ENSLAFG00000010158 #19 COG3 (ENSLAFG00000021400) #20 SLC25A30 (ENSLAFG00000001502) #21 ENSLAFG00000021740 ##22 KCTD4 (ENSLAFG00000009328) #23 GTF2F2 (ENSLAFG00000009325) #24 GPALPP1 (ENSLAFG00000013763) #25 NUFIP1 (ENSLAFG00000013760) #26 TSC22D1 (ENSLAFG00000014574) #27 SERP2 (ENSLAFG00000000162) #28 LACC1 (ENSLAFG00000016028) #30 CCDC122 (ENSLAFG00000008407) #31 ENOX1 (ENSLAFG00000004348) #32 DNAJC15 (ENSLAFG00000004343) #33 EPSTI1 (ENSLAFG00000016838) #34 FAM216B (ENSLAFG00000032301) #35 TNFSF11 (ENSLAFG00000011256) #36 ENSLAFG00000029763 #37 ENSLAFG00000005777 #37 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Glires ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 25 CDC23 (ENSHGLG00000015847) GFRA3 (ENSHGLG00000005227) CDC25C (ENSHGLG00000046790) ENSHGLG00000048679 FAM53C (ENSHGLG00000042605) KDM3B (ENSHGLG00000004783) REEP2 (ENSHGLG00000041963) EGR1 (ENSHGLG00000048168) ETF1 (ENSHGLG00000004503) ENSHGLG00000005302 LRRTM2 (ENSHGLG00000017761) Ctnna1 (ENSHGLG00000007078) ENSHGLG00000020101 SIL1 (ENSHGLG00000013822) MATR3 (ENSHGLG00000004673) ENSHGLG00000039869 ##22 PAIP2 (ENSHGLG00000035595) SLC23A1 (ENSHGLG00000007699) PROB1 (ENSHGLG00000049405) DNAJC18 (ENSHGLG00000005126) SMIM33 (ENSHGLG00000008582) ENSHGLG00000006931 STING1 (ENSHGLG00000032049) UBE2D2 (ENSHGLG00000004792) CXXC5 (ENSHGLG00000007092) PSD2 (ENSHGLG00000008076) NRG2 (ENSHGLG00000009431) PURA (ENSHGLG00000020698) CYSTM1 (ENSHGLG00000012358) ENSHGLG00000040081 ENSHGLG00000048922 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 20 BLZF1 (ENSHGLG00000003011) ENSHGLG00000050690 ENSHGLG00000040907 SLC19A2 (ENSHGLG00000001890) F5 (ENSHGLG00000002250) SELP (ENSHGLG00000001876) SELL (ENSHGLG00000048749) ENSHGLG00000002768 METTL18 (ENSHGLG00000020074) ENSHGLG00000018896 ENSHGLG00000019520 ENSHGLG00000036520 ENSHGLG00000021140 ENSHGLG00000038928 ENSHGLG00000019125 ENSHGLG00000020098 ##22 ENSHGLG00000042460 GORAB (ENSHGLG00000042352) ENSHGLG00000035430 ENSHGLG00000015659 ENSHGLG00000015604 ENSHGLG00000004698 ENSHGLG00000017243 ENSHGLG00000048131 ENSHGLG00000017330 ENSHGLG00000048887 ENSHGLG00000036147 ENSHGLG00000008225 ENSHGLG00000007906 ENSHGLG00000045127 ENSHGLG00000046042 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Kangaroo rat MODERN SPECIES 320 Med4 (ENSDORG00000024480) Nudt15 (ENSDORG00000003751) #7 Sucla2 (ENSDORG00000010319) #8 Htr2a (ENSDORG00000029019) #9 Esd (ENSDORG00000013997) #10 Lrch1 (ENSDORG00000013992) #11 ENSDORG00000024657 Rubcnl (ENSDORG00000014634) #12 Lcp1 (ENSDORG00000000603) #14 Cpb2 (ENSDORG00000000602) #15 Zc3h13 (ENSDORG00000000600) #16 Siah3 (ENSDORG00000024143) #17 Cby2 (ENSDORG00000026204) #18 Cog3 (ENSDORG00000002499) #20 Slc25a30 (ENSDORG00000004865) #21 Tpt1 (ENSDORG00000008518) ##22 Kctd4 (ENSDORG00000003773) #23 Gtf2f2 (ENSDORG00000002860) #24 Gpalpp1 (ENSDORG00000003360) Nufip1 (ENSDORG00000003359) #26 ENSDORG00000025839 Serp2 (ENSDORG00000028153) #28 Lacc1 (ENSDORG00000015240) #30 Ccdc122 (ENSDORG00000015236) #31 Enox1 (ENSDORG00000001328) #32 Dnajc15 (ENSDORG00000013550) #33 Epsti1 (ENSDORG00000004992) #34 Fam216b (ENSDORG00000007655) #35 Tnfsf11 (ENSDORG00000026136) #36 Dgkh (ENSDORG00000005024) Vwa8 (ENSDORG00000011298) Myomorpha DUPLICATION Myomorpha DUPLICATION Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.a ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 4 Med4 (ENSMOCG00000002608) Nudt15 (ENSMOCG00000003875) #7 ENSMOCG00000011477 #8 Htr2a (ENSMOCG00000012645) #9 ENSMOCG00000016070 #10 Lrch1 (ENSMOCG00000017560) #11 Rubcnl (ENSMOCG00000003331) #12 Lrrc63 (ENSMOCG00000018528) #13 Lcp1 (ENSMOCG00000010746) #14 Cpb2 (ENSMOCG00000006393) #15 ENSMOCG00000001346 Siah3 (ENSMOCG00000009347) #17 Cby2 (ENSMOCG00000014959) #18 Cog3 (ENSMOCG00000002598) #20 Slc25a30 (ENSMOCG00000010410) #21 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(ENSPEMG00000010454) Zc3h8 (ENSPEMG00000011068) Zc3h6 (ENSPEMG00000000918) Vinac1 (ENSPEMG00000004724) Ttl (ENSPEMG00000006748) Polr1b (ENSPEMG00000008619) Chchd5 (ENSPEMG00000010023) Slc20a1 (ENSPEMG00000010382) Ckap2l (ENSPEMG00000010844) Il1a (ENSPEMG00000011300) Il1b (ENSPEMG00000011618) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 126 ENSJJAG00000012033 ENSJJAG00000006493 Htr2a (ENSJJAG00000005538) #9 Esd (ENSJJAG00000004979) #10 Lrch1 (ENSJJAG00000000346) #11 Rubcnl (ENSJJAG00000021497) #12 Lcp1 (ENSJJAG00000021331) #14 Cpb2 (ENSJJAG00000020705) #15 Zc3h13 (ENSJJAG00000019971) #16 ENSJJAG00000019522 Siah3 (ENSJJAG00000019440) #17 Cby2 (ENSJJAG00000019147) #18 Cog3 (ENSJJAG00000018271) #20 Slc25a30 (ENSJJAG00000017335) #21 ENSJJAG00000016940 ENSJJAG00000016541 ##22 Kctd4 (ENSJJAG00000012151) #23 Gtf2f2 (ENSJJAG00000015891) #24 Gpalpp1 (ENSJJAG00000015544) Nufip1 (ENSJJAG00000015369) #26 ENSJJAG00000015078 Serp2 (ENSJJAG00000021557) #28 ENSJJAG00000021469 Lacc1 (ENSJJAG00000021351) #30 Ccdc122 (ENSJJAG00000021044) #31 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 390 Cog3 (ENSNGAG00000011423) #20 Slc25a30 (ENSNGAG00000006726) #21 Tpt1 (ENSNGAG00000002203) ##22 ENSNGAG00000001072 Kctd4 (ENSNGAG00000000924) #23 Gtf2f2 (ENSNGAG00000012083) #24 Gpalpp1 (ENSNGAG00000011284) Nufip1 (ENSNGAG00000010233) #26 Tsc22d1 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Cdhr1 (ENSRNOG00000013330) Gpr15lg (ENSRNOG00000043342) Ghitm (ENSRNOG00000013961) LOC100363043 (ENSRNOG00000062457) AABR07006367.1 (ENSRNOG00000005112) LOC120097457 (ENSRNOG00000039601) LOC120097456 (ENSRNOG00000067462) LOC120097423 (ENSRNOG00000065891) LOC120097531 (ENSRNOG00000065076) Eloa2l (ENSRNOG00000066342) Eloa-ps3 (ENSRNOG00000067867) Rat MODERN SPECIES 6 Dnase1l3 (ENSRNOG00000009291) Abhd6 (ENSRNOG00000008167) Rpp14 (ENSRNOG00000039829) Rpp14 (ENSRNOG00000063660) Pxk (ENSRNOG00000008024) Pdhb (ENSRNOG00000007895) AABR07072440.1 (ENSRNOG00000033030) ENSRNOG00000028821 Kctd6 (ENSRNOG00000007817) Acox2 (ENSRNOG00000007378) Fam107a (ENSRNOG00000033261) Fam3d (ENSRNOG00000007320) ENSRNOG00000070952 Cfap20dc (ENSRNOG00000007206) Fhit (ENSRNOG00000064939) Tpt1-ps2 (ENSRNOG00000070732) ##22 Ptprg (ENSRNOG00000009419) LOC103693281 (ENSRNOG00000063454) RGD1306063 (ENSRNOG00000039871) Fezf2 (ENSRNOG00000009206) Cadps (ENSRNOG00000008570) ENSRNOG00000068103 Synpr (ENSRNOG00000008203) Sntn (ENSRNOG00000027383) LOC100910341 (ENSRNOG00000070440) RGD1565725 (ENSRNOG00000070977) LOC102550375 (ENSRNOG00000027633) Thoc7 (ENSRNOG00000007701) Atxn7 (ENSRNOG00000007246) Psmd6 (ENSRNOG00000006751) Or2t6 (ENSRNOG00000063635) Rat MODERN SPECIES Ahi1 (ENSRNOG00000013969) Myb (ENSRNOG00000055858) Hbs1l (ENSRNOG00000014531) Aldh8a1 (ENSRNOG00000014907) Themis (ENSRNOG00000014979) ENSRNOG00000062873 Ptprk (ENSRNOG00000047605) ENSRNOG00000069014 Lama2 (ENSRNOG00000011134) AABR07000583.1 (ENSRNOG00000046438) Arhgap18 (ENSRNOG00000011245) LOC120097699 (ENSRNOG00000063903) AABR07004232.1 (ENSRNOG00000048904) L3mbtl3 (ENSRNOG00000011720) Samd3 (ENSRNOG00000039955) LOC100360791 (ENSRNOG00000033517) ##22 Tmem200a (ENSRNOG00000047783) Hmgb2-ps6 (ENSRNOG00000026462) ENSRNOG00000067501 Epb41l2 (ENSRNOG00000012346) Akap7 (ENSRNOG00000013202) Ccnb2-ps2 (ENSRNOG00000055111) Arg1 (ENSRNOG00000013304) Med23 (ENSRNOG00000013422) Enpp3 (ENSRNOG00000013791) Enpp1 (ENSRNOG00000013994) Ccn2 (ENSRNOG00000015036) Moxd1 (ENSRNOG00000015321) Stx7 (ENSRNOG00000015670) LOC108349831 (ENSRNOG00000068524) Taar9 (ENSRNOG00000026096) Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 17 Olr1877 (ENSRNOG00000070612) Olfr287 (ENSRNOG00000066134) Or10ad1 (ENSRNOG00000064488) Ccdc184 (ENSRNOG00000021945) Asb8 (ENSRNOG00000010099) Pfkm (ENSRNOG00000057988) Senp1 (ENSRNOG00000022260) Col2a1 (ENSRNOG00000058560) Tmem106c (ENSRNOG00000053269) Vdr (ENSRNOG00000054420) Hdac7 (ENSRNOG00000055597) Slc48a1 (ENSRNOG00000053196) Rapgef3 (ENSRNOG00000059961) Endou (ENSRNOG00000056446) Rpap3 (ENSRNOG00000053405) RGD1565798 (ENSRNOG00000002475) ##22 Pced1b (ENSRNOG00000022807) Amigo2 (ENSRNOG00000007032) Slc38a4 (ENSRNOG00000006653) Slc38a2 (ENSRNOG00000006305) Slc38a1 (ENSRNOG00000005291) RGD1564963 (ENSRNOG00000069806) Scaf11 (ENSRNOG00000005263) Arid2 (ENSRNOG00000004831) ENSRNOG00000067243 Ano6 (ENSRNOG00000006995) Dbx2 (ENSRNOG00000006885) Nell2 (ENSRNOG00000006235) Tmem117 (ENSRNOG00000006068) ENSRNOG00000064416 Twf1 (ENSRNOG00000022507) Rat MODERN SPECIES 4 Tmem163 (ENSRNOG00000003769) Mgat5 (ENSRNOG00000003614) ENSRNOG00000066401 tuba1c-ps1 (ENSRNOG00000070079) Nckap5 (ENSRNOG00000021553) Lypd1 (ENSRNOG00000003453) Gpr39 (ENSRNOG00000021586) Slc35f5 (ENSRNOG00000003403) LOC100362110 (ENSRNOG00000030481) Actr3 (ENSRNOG00000003206) Dpp10 (ENSRNOG00000002595) LOC103690298 (ENSRNOG00000029868) Htr5b (ENSRNOG00000002549) Ccdc93 (ENSRNOG00000002514) Insig2 (ENSRNOG00000002478) Tpt1-ps1 (ENSRNOG00000069572) ##22 En1 (ENSRNOG00000056580) Marco (ENSRNOG00000049303) C1ql2 (ENSRNOG00000046863) Steap3 (ENSRNOG00000049471) C13h2orf76 (ENSRNOG00000045570) Dbi (ENSRNOG00000046889) Tmem37 (ENSRNOG00000047714) Sctr (ENSRNOG00000049766) Cfap221 (ENSRNOG00000056781) Tmem177 (ENSRNOG00000025484) Ptpn4 (ENSRNOG00000002625) Epb41l5 (ENSRNOG00000002538) Tmem185b (ENSRNOG00000067956) Ralb (ENSRNOG00000002440) Inhbb (ENSRNOG00000060237) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2421 Cd209g (ENSMSIG00000031055) ENSMSIG00000031053 ##22 ENSMSIG00000031050 Evi5l (ENSMSIG00000031036) Lrrc8e (ENSMSIG00000031033) Map2k7 (ENSMSIG00000031016) Tgfbr3l (ENSMSIG00000031012) Snapc2 (ENSMSIG00000031008) Ctxn1 (ENSMSIG00000031007) Timm44 (ENSMSIG00000030996) Elavl1 (ENSMSIG00000030993) Ccl25 (ENSMSIG00000030978) Cers4 (ENSMSIG00000030972) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 41 Foxa2 (ENSMSIG00000002945) Sstr4 (ENSMSIG00000002973) Thbd (ENSMSIG00000002989) Cd93 (ENSMSIG00000002996) ENSMSIG00000003019 ##22 Nxt1 (ENSMSIG00000003067) Gzf1 (ENSMSIG00000003080) Napb (ENSMSIG00000003094) Cstl1 (ENSMSIG00000003118) Cst11 (ENSMSIG00000003137) Cstdc1 (ENSMSIG00000003153) Cst12 (ENSMSIG00000003169) Cst8 (ENSMSIG00000003194) Cst13 (ENSMSIG00000003223) Cst9 (ENSMSIG00000003261) Cstdc2 (ENSMSIG00000003283) Cst3 (ENSMSIG00000003295) Steppe mouse MODERN SPECIES 2804 Msantd2 (ENSMSIG00000015172) Esam (ENSMSIG00000015194) Vsig2 (ENSMSIG00000015220) Nrgn (ENSMSIG00000015277) Spa17 (ENSMSIG00000015289) Siae (ENSMSIG00000015296) Tbrg1 (ENSMSIG00000015383) Panx3 (ENSMSIG00000015407) ENSMSIG00000015418 ##22 Or8a1 (ENSMSIG00000015428) Or8a1b (ENSMSIG00000015433) Or8b12 (ENSMSIG00000015446) Or8b12c (ENSMSIG00000015455) Or8b9 (ENSMSIG00000015471) Or8b8 (ENSMSIG00000015480) Or8b4 (ENSMSIG00000015494) Or8b35 (ENSMSIG00000015505) Or8b36 (ENSMSIG00000015512) Or8b37 (ENSMSIG00000015522) Or8b39 (ENSMSIG00000015543) Or8b101 (ENSMSIG00000015560) Or8b40 (ENSMSIG00000015567) Or8b41 (ENSMSIG00000015572) ENSMSIG00000015593 Shrew mouse MODERN SPECIES 21 MGP_PahariEiJ_G0030521 #7 Sucla2 (MGP_PahariEiJ_G0030522) #8 Htr2a (MGP_PahariEiJ_G0030523) #9 Esd (MGP_PahariEiJ_G0030524) #10 Lrch1 (MGP_PahariEiJ_G0030525) #11 Rubcnl (MGP_PahariEiJ_G0030526) #12 Lrrc63 (MGP_PahariEiJ_G0030527) #13 Lcp1 (MGP_PahariEiJ_G0030528) #14 Cpb2 (MGP_PahariEiJ_G0030529) #15 Zc3h13 (MGP_PahariEiJ_G0030530) #16 Siah3 (MGP_PahariEiJ_G0030531) #17 Cby2 (MGP_PahariEiJ_G0030532) #18 MGP_PahariEiJ_G0030533 Cog3 (MGP_PahariEiJ_G0030534) #20 Slc25a30 (MGP_PahariEiJ_G0030535) #21 Tpt1 (MGP_PahariEiJ_G0030536) ##22 Gtf2f2 (MGP_PahariEiJ_G0030537) #24 Kctd4 (MGP_PahariEiJ_G0030538) #23 Gpalpp1 (MGP_PahariEiJ_G0030539) Nufip1 (MGP_PahariEiJ_G0030540) #26 Tsc22d1 (MGP_PahariEiJ_G0030541) #27 Serp2 (MGP_PahariEiJ_G0030542) #28 Lacc1 (MGP_PahariEiJ_G0030543) #30 Ccdc122 (MGP_PahariEiJ_G0030544) #31 Enox1 (MGP_PahariEiJ_G0030545) #32 MGP_PahariEiJ_G0030546 Dnajc15 (MGP_PahariEiJ_G0030547) #33 Epsti1 (MGP_PahariEiJ_G0030548) #34 Fam216b (MGP_PahariEiJ_G0030549) #35 Tnfsf11 (MGP_PahariEiJ_G0030550) #36 Akap11 (MGP_PahariEiJ_G0030551) #37 Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 349 ENSJJAG00000000293 ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 104 Ndufaf4 (ENSJJAG00000023657) Gpr63 (ENSJJAG00000013298) Fhl5 (ENSJJAG00000000636) Ufl1 (ENSJJAG00000006182) ENSJJAG00000010016 ENSJJAG00000013253 Fut9 (ENSJJAG00000022594) ENSJJAG00000023083 Manea (ENSJJAG00000023182) ENSJJAG00000023315 ENSJJAG00000023379 Epha7 (ENSJJAG00000016879) ENSJJAG00000017184 ENSJJAG00000017512 ENSJJAG00000017791 ENSJJAG00000017896 ##22 ENSJJAG00000018137 ENSJJAG00000018365 Map3k7 (ENSJJAG00000020494) ENSJJAG00000013324 Bach2 (ENSJJAG00000002786) Gja10 (ENSJJAG00000006111) ENSJJAG00000009996 ENSJJAG00000010339 Mdn1 (ENSJJAG00000015545) Lyrm2 (ENSJJAG00000020170) Ankrd6 (ENSJJAG00000021174) ENSJJAG00000022275 Rragd (ENSJJAG00000000282) ENSJJAG00000000713 Gabrr2 (ENSJJAG00000001074) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 25 ENSJJAG00000011543 ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 33 Wfikkn2 (ENSCGRG00001022356) Luc7l3 (ENSCGRG00001009809) ENSCGRG00001020484 Abcc3 (ENSCGRG00001010018) Cacna1g (ENSCGRG00001002871) Spata20 (ENSCGRG00001006141) Epn3 (ENSCGRG00001009708) Mycbpap (ENSCGRG00001004065) Rsad1 (ENSCGRG00001020971) Acsf2 (ENSCGRG00001006504) Chad (ENSCGRG00001017300) Lrrc59 (ENSCGRG00001003469) Eme1 (ENSCGRG00001012113) Mrpl27 (ENSCGRG00001018944) Xylt2 (ENSCGRG00001021636) ENSCGRG00001017654 ##22 ENSCGRG00001022011 Col1a1 (ENSCGRG00001020668) Sgca (ENSCGRG00001019141) H1f9 (ENSCGRG00001005718) Ppp1r9b (ENSCGRG00001012352) Samd14 (ENSCGRG00001002338) Pdk2 (ENSCGRG00001014853) Itga3 (ENSCGRG00001021353) Dlx3 (ENSCGRG00001022154) Dlx4 (ENSCGRG00001019843) Tac4 (ENSCGRG00001001077) ENSCGRG00001005107 Fam117a (ENSCGRG00001009494) Slc35b1 (ENSCGRG00001006734) Spop (ENSCGRG00001024062) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Mrps27 (ENSCGRG00001016241) Ptcd2 (ENSCGRG00001015289) Zfp366 (ENSCGRG00001006020) ENSCGRG00001003516 H2bl1 (ENSCGRG00001007283) Tnpo1 (ENSCGRG00001016580) Fcho2 (ENSCGRG00001013782) Tmem171 (ENSCGRG00001016096) Tmem174 (ENSCGRG00001011496) Foxd1 (ENSCGRG00001010743) Btf3 (ENSCGRG00001009745) ENSCGRG00001008466 Ankra2 (ENSCGRG00001014449) Utp15 (ENSCGRG00001013836) Arhgef28 (ENSCGRG00001018993) ENSCGRG00001017370 ##22 Enc1 (ENSCGRG00001009896) ENSCGRG00001021658 Hexb (ENSCGRG00001020320) Gfm2 (ENSCGRG00001022802) ENSCGRG00001012819 Fam169a (ENSCGRG00001021297) Gcnt4 (ENSCGRG00001008293) ENSCGRG00001008489 ENSCGRG00001014554 Ankrd31 (ENSCGRG00001018162) HMGCR (ENSCGRG00001016870) Cert1 (ENSCGRG00001020451) Polk (ENSCGRG00001013007) ENSCGRG00001012277 Ankdd1b (ENSCGRG00001016471) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 11 Pik3r3 (ENSPEMG00000022142) Mast2 (ENSPEMG00000022608) Ipp (ENSPEMG00000023410) Tmem69 (ENSPEMG00000022999) Gpbp1l1 (ENSPEMG00000023022) Ccdc17 (ENSPEMG00000022313) Nasp (ENSPEMG00000011490) Akr1a1 (ENSPEMG00000015504) ENSPEMG00000022257 Mmachc (ENSPEMG00000026955) ENSPEMG00000000268 Tesk2 (ENSPEMG00000022010) Toe1 (ENSPEMG00000021892) Mutyh (ENSPEMG00000016657) Hpdl (ENSPEMG00000008997) ENSPEMG00000024772 ##22 Zswim5 (ENSPEMG00000023604) Urod (ENSPEMG00000021743) Hectd3 (ENSPEMG00000021103) Eif2b3 (ENSPEMG00000023218) Ptch2 (ENSPEMG00000012618) Btbd19 (ENSPEMG00000023770) Dynlt4 (ENSPEMG00000013222) Plk3 (ENSPEMG00000023420) ENSPEMG00000021333 ENSPEMG00000022449 Kif2c (ENSPEMG00000023831) Armh1 (ENSPEMG00000011612) Tmem53 (ENSPEMG00000022378) Rnf220 (ENSPEMG00000022794) Eri3 (ENSPEMG00000024037) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Tarsier MODERN SPECIES 5133 CPB2 (ENSTSYG00000014440) #15 ZC3H13 (ENSTSYG00000000992) #16 SIAH3 (ENSTSYG00000028090) #17 CBY2 (ENSTSYG00000002618) #18 ERICH6B (ENSTSYG00000014169) #19 COG3 (ENSTSYG00000004818) #20 SLC25A30 (ENSTSYG00000011274) #21 TPT1 (ENSTSYG00000003160) ##22 KCTD4 (ENSTSYG00000001706) #23 GTF2F2 (ENSTSYG00000001691) #24 GPALPP1 (ENSTSYG00000006358) #25 NUFIP1 (ENSTSYG00000006355) #26 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Horse MODERN SPECIES 11 ENSECAG00000032479 SPOCK3 (ENSECAG00000024906) TLL1 (ENSECAG00000002251) CPE (ENSECAG00000009256) MSMO1 (ENSECAG00000010554) KLHL2 (ENSECAG00000010727) TMEM192 (ENSECAG00000014003) TRIM75 (ENSECAG00000036019) ENSECAG00000042254 ENSECAG00000014971 ENSECAG00000034596 ENSECAG00000042205 ENSECAG00000038371 TRIM61 (ENSECAG00000014985) ENSECAG00000030364 ENSECAG00000014997 ##22 SMIM31 (ENSECAG00000040839) MARCHF1 (ENSECAG00000015012) TMA16 (ENSECAG00000015062) TKTL2 (ENSECAG00000002749) NPY5R (ENSECAG00000016236) NPY1R (ENSECAG00000016717) NAF1 (ENSECAG00000016738) ENSECAG00000003023 FSTL5 (ENSECAG00000000973) ENSECAG00000054288 ENSECAG00000029497 RAPGEF2 (ENSECAG00000006983) ENSECAG00000056262 C2H4orf45 (ENSECAG00000009815) FNIP2 (ENSECAG00000010321) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Microbat MODERN SPECIES 944 CDADC1 (ENSMLUG00000003033) ENSMLUG00000007659 FNDC3A (ENSMLUG00000002625) CYSLTR2 (ENSMLUG00000001386) ENSMLUG00000023372 RCBTB2 (ENSMLUG00000008378) LPAR6 (ENSMLUG00000029722) RB1 (ENSMLUG00000008336) ITM2B (ENSMLUG00000008317) ENSMLUG00000013512 SIAH3 (ENSMLUG00000029013) #17 CBY2 (ENSMLUG00000010896) #18 ENSMLUG00000026302 COG3 (ENSMLUG00000016157) #20 SLC25A30 (ENSMLUG00000000506) #21 ENSMLUG00000017709 ##22 KCTD4 (ENSMLUG00000010523) #23 ENSMLUG00000010505 #24 ENSMLUG00000008692 NUFIP1 (ENSMLUG00000008916) #26 ENSMLUG00000003971 ENSMLUG00000011786 ENSMLUG00000027027 LACC1 (ENSMLUG00000003112) #30 CCDC122 (ENSMLUG00000009121) #31 ENOX1 (ENSMLUG00000000802) #32 DNAJC15 (ENSMLUG00000008684) #33 ENSMLUG00000015553 #34 FAM216B (ENSMLUG00000012282) #35 TNFSF11 (ENSMLUG00000008819) #36 AKAP11 (ENSMLUG00000026426) #37 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Pig MODERN SPECIES 13 ENSSSCG00000000194 TUBA1A (ENSSSCG00000061347) PRPH (ENSSSCG00000000195) TROAP (ENSSSCG00000023176) C1QL4 (ENSSSCG00000000197) DNAJC22 (ENSSSCG00000000198) SPATS2 (ENSSSCG00000000199) KCNH3 (ENSSSCG00000000203) MCRS1 (ENSSSCG00000000202) FAM186B (ENSSSCG00000000205) PRPF40B (ENSSSCG00000000204) FMNL3 (ENSSSCG00000025114) TMBIM6 (ENSSSCG00000029652) NCKAP5L (ENSSSCG00000000209) BCDIN3D (ENSSSCG00000040144) ENSSSCG00000000207 ##22 FAIM2 (ENSSSCG00000000206) AQP2 (ENSSSCG00000021193) ENSSSCG00000058738 AQP5 (ENSSSCG00000000211) ENSSSCG00000062534 AQP6 (ENSSSCG00000000212) ENSSSCG00000054254 RACGAP1 (ENSSSCG00000000217) ASIC1 (ENSSSCG00000000216) SMARCD1 (ENSSSCG00000000215) GPD1 (ENSSSCG00000000214) COX14 (ENSSSCG00000056361) CERS5 (ENSSSCG00000024932) LIMA1 (ENSSSCG00000032269) LARP4 (ENSSSCG00000028516) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Goat MODERN SPECIES 12 IRX1 (ENSCHIG00000017851) ADAMTS16 (ENSCHIG00000010517) ICE1 (ENSCHIG00000024007) MED10 (ENSCHIG00000020899) UBE2QL1 (ENSCHIG00000002861) NSUN2 (ENSCHIG00000019385) SRD5A1 (ENSCHIG00000012029) TENT4A (ENSCHIG00000017328) ENSCHIG00000025402 ADCY2 (ENSCHIG00000023502) CFAP90 (ENSCHIG00000025918) FASTKD3 (ENSCHIG00000018823) MTRR (ENSCHIG00000019340) ENSCHIG00000001904 SEMA5A (ENSCHIG00000013180) ENSCHIG00000019011 ##22 ATPSCKMT (ENSCHIG00000018299) CCT5 (ENSCHIG00000018198) CMBL (ENSCHIG00000023506) MARCHF6 (ENSCHIG00000017175) ROPN1L (ENSCHIG00000024633) ANKRD33B (ENSCHIG00000021552) DAP (ENSCHIG00000018806) CTNND2 (ENSCHIG00000013482) DNAH5 (ENSCHIG00000021054) ENSCHIG00000016462 TRIO (ENSCHIG00000016556) OTULINL (ENSCHIG00000000624) OTULIN (ENSCHIG00000021689) ANKH (ENSCHIG00000019071) FBXL7 (ENSCHIG00000011704) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Armadillo MODERN SPECIES 2697 ENSDNOG00000031473 ENSDNOG00000041981 ENSDNOG00000036944 COMMD8 (ENSDNOG00000049641) ATP10D (ENSDNOG00000004165) CORIN (ENSDNOG00000004189) NFXL1 (ENSDNOG00000037969) CNGA1 (ENSDNOG00000009673) NIPAL1 (ENSDNOG00000030760) TXK (ENSDNOG00000032218) TEC (ENSDNOG00000019174) SLAIN2 (ENSDNOG00000025559) SLC10A4 (ENSDNOG00000031934) ZAR1 (ENSDNOG00000018955) FRYL (ENSDNOG00000018958) ENSDNOG00000048297 ##22 OCIAD1 (ENSDNOG00000044168) OCIAD2 (ENSDNOG00000045678) CWH43 (ENSDNOG00000023671) ENSDNOG00000040162 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Artiodactyla_a DUPLICATION Artiodactyla_a DUPLICATION Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Pecora ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.f #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Yarkand deer MODERN SPECIES 23 NUDT15 (ENSCHYG00000024631) #7 ENSCHYG00000024543 #8 ENSCHYG00000024533 HTR2A (ENSCHYG00000024474) #9 ESD (ENSCHYG00000024416) #10 LRCH1 (ENSCHYG00000023877) #11 RUBCNL (ENSCHYG00000023615) #12 LRRC63 (ENSCHYG00000023437) #13 LCP1 (ENSCHYG00000023302) #14 CPB2 (ENSCHYG00000023124) #15 ZC3H13 (ENSCHYG00000022834) #16 SIAH3 (ENSCHYG00000022790) #17 CBY2 (ENSCHYG00000022728) #18 COG3 (ENSCHYG00000022568) #20 SLC25A30 (ENSCHYG00000022376) #21 ENSCHYG00000022199 ##22 ENSCHYG00000022164 KCTD4 (ENSCHYG00000022134) #23 GTF2F2 (ENSCHYG00000022073) #24 ENSCHYG00000021950 NUFIP1 (ENSCHYG00000021831) #26 TSC22D1 (ENSCHYG00000021718) #27 SERP2 (ENSCHYG00000021664) #28 LACC1 (ENSCHYG00000021511) #30 CCDC122 (ENSCHYG00000021466) #31 ENOX1 (ENSCHYG00000021225) #32 DNAJC15 (ENSCHYG00000021166) #33 EPSTI1 (ENSCHYG00000020957) #34 FAM216B (ENSCHYG00000020887) #35 TNFSF11 (ENSCHYG00000020756) #36 AKAP11 (ENSCHYG00000020568) #37 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.f #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Siberian musk deer MODERN SPECIES 70 HOMER1 (ENSMMSG00000018230) TENT2 (ENSMMSG00000018319) CMYA5 (ENSMMSG00000018378) ENSMMSG00000018450 MTX3 (ENSMMSG00000018473) THBS4 (ENSMMSG00000018524) ENSMMSG00000018594 ##22 SERINC5 (ENSMMSG00000018616) ENSMMSG00000018656 GNPNAT1 (ENSMMSG00000018679) STYX (ENSMMSG00000018735) PSMC6 (ENSMMSG00000018802) ERO1A (ENSMMSG00000018893) GPR137C (ENSMMSG00000018995) TXNDC16 (ENSMMSG00000019070) PTGER2 (ENSMMSG00000019132) ENSMMSG00000019166 SPG21 (ENSMMSG00000019185) MTFMT (ENSMMSG00000019272) SLC51B (ENSMMSG00000019303) RASL12 (ENSMMSG00000019343) KBTBD13 (ENSMMSG00000019390) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.f #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.f #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00940000158106 Goat MODERN SPECIES 3 SUCLA2 (ENSCHIG00000018699) #8 HTR2A (ENSCHIG00000016921) #9 ENSCHIG00000021306 #10 LRCH1 (ENSCHIG00000012630) #11 RUBCNL (ENSCHIG00000012197) #12 LRRC63 (ENSCHIG00000019710) #13 LCP1 (ENSCHIG00000007953) #14 CPB2 (ENSCHIG00000016819) #15 ZC3H13 (ENSCHIG00000020072) #16 SIAH3 (ENSCHIG00000022671) #17 CBY2 (ENSCHIG00000006466) #18 ENSCHIG00000022128 #19 COG3 (ENSCHIG00000021605) #20 ENSCHIG00000012507 ENSCHIG00000013965 #21 ENSCHIG00000014215 ##22 GTF2F2 (ENSCHIG00000027081) #24 KCTD4 (ENSCHIG00000006271) #23 ENSCHIG00000017887 NUFIP1 (ENSCHIG00000006835) #26 TSC22D1 (ENSCHIG00000012362) #27 SERP2 (ENSCHIG00000017254) #28 LACC1 (ENSCHIG00000023585) #30 CCDC122 (ENSCHIG00000005141) #31 ENOX1 (ENSCHIG00000021948) #32 ENSCHIG00000017754 DNAJC15 (ENSCHIG00000024974) #33 EPSTI1 (ENSCHIG00000023487) #34 FAM216B (ENSCHIG00000024226) #35 TNFSF11 (ENSCHIG00000015014) #36 AKAP11 (ENSCHIG00000013636) #37 Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 2 ENSOARG00020023334 ENSOARG00020023306 ANKFN1 (ENSOARG00020022964) NOG (ENSOARG00020022924) DGKE (ENSOARG00020022880) TRIM25 (ENSOARG00020022691) COIL (ENSOARG00020022586) SCPEP1 (ENSOARG00020022517) AKAP1 (ENSOARG00020022429) ENSOARG00020022409 ##22 MSI2 (ENSOARG00020022222) CCDC182 (ENSOARG00020022181) MRPS23 (ENSOARG00020022143) ENSOARG00020022026 VEZF1 (ENSOARG00020021959) SRSF1 (ENSOARG00020021866) DYNLL2 (ENSOARG00020021813) ENSOARG00020021804 ENSOARG00020021786 SV2B (ENSOARG00020021725) KLHL25 (ENSOARG00020021667) ENSOARG00020021655 AGBL1 (ENSOARG00020021438) ENSOARG00020021420 ENSOARG00020021409 Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 3 ADIPOR1 (ENSOARG00020019256) CYB5R1 (ENSOARG00020019116) ENSOARG00020019052 PKP1 (ENSOARG00020018922) ENSOARG00020018847 TMEM9 (ENSOARG00020018785) ASCL5 (ENSOARG00020018737) CACNA1S (ENSOARG00020017774) KIF21B (ENSOARG00020016471) ENSOARG00020016236 INAVA (ENSOARG00020016129) GPR25 (ENSOARG00020016093) CAMSAP2 (ENSOARG00020015923) DDX59 (ENSOARG00020015610) ZNF281 (ENSOARG00020015197) TCTP (ENSOARG00020015187) ##22 NR5A2 (ENSOARG00020015025) PTPRC (ENSOARG00020011696) ENSOARG00020011529 ATP6V1G3 (ENSOARG00020011480) NEK7 (ENSOARG00020011296) LHX9 (ENSOARG00020010919) C1orf53 (ENSOARG00020010810) RPS25 (ENSOARG00020010773) DENND1B (ENSOARG00020010407) ZBTB41 (ENSOARG00020022587) CFHR5 (ENSOARG00020022396) F13B (ENSOARG00020022314) ENSOARG00020022291 ENSOARG00020022251 ENSOARG00020022212 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 1 ITM2B (ENSOARG00020009664) MED4 (ENSOARG00020009593) ENSOARG00020009566 #7 ENSOARG00020009436 #8 HTR2A (ENSOARG00020009408) #9 ENSOARG00020009357 #10 LRCH1 (ENSOARG00020008711) #11 RUBCNL (ENSOARG00020008494) #12 LRRC63 (ENSOARG00020008408) #13 ENSOARG00020008359 #14 CPB2 (ENSOARG00020008064) #15 ZC3H13 (ENSOARG00020007937) #16 CBY2 (ENSOARG00020007846) #18 ENSOARG00020007819 SLC25A30 (ENSOARG00020007017) #20 TPT1 (ENSOARG00020006843) ##22 KCTD4 (ENSOARG00020006798) #23 GTF2F2 (ENSOARG00020006761) #24 ENSOARG00020006616 NUFIP1 (ENSOARG00020006417) #26 SERP2 (ENSOARG00020006397) #28 LACC1 (ENSOARG00020006292) #30 CCDC122 (ENSOARG00020006216) #31 ENSOARG00020006192 ENOX1 (ENSOARG00020006161) #32 ENSOARG00020006129 #33 EPSTI1 (ENSOARG00020006110) #34 FAM216B (ENSOARG00020006081) #35 TNFSF11 (ENSOARG00020006031) #36 AKAP11 (ENSOARG00020006005) #37 DGKH (ENSOARG00020005790) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.f #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT01100000263828.a.b ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000017955.c.d.b ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 American bison MODERN SPECIES 2981 FBXL2 (ENSBBBG00000004629) SUSD5 (ENSBBBG00000018613) ENSBBBG00000004605 ENSBBBG00000007097 GLB1 (ENSBBBG00000018565) CCR4 (ENSBBBG00000004569) TRIM71 (ENSBBBG00000018536) CNOT10 (ENSBBBG00000018519) ENSBBBG00000018446 DYNC1LI1 (ENSBBBG00000018433) CMTM6 (ENSBBBG00000004498) CMTM7 (ENSBBBG00000018392) CMTM8 (ENSBBBG00000018364) ENSBBBG00000018344 OSBPL10 (ENSBBBG00000007583) ENSBBBG00000018279 ##22 STT3B (ENSBBBG00000018253) ENSBBBG00000018206 GADL1 (ENSBBBG00000018198) TGFBR2 (ENSBBBG00000018112) Bos ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.f #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT01100000263828.a.b ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000017955.c.d.b ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.f #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT01100000263828.a.b ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000017955.c.d.b ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 3 ENSBIXG00005021596 SUCLA2 (ENSBIXG00005021655) #8 HTR2A (ENSBIXG00005021735) #9 ESD (ENSBIXG00005003676) #10 LRCH1 (ENSBIXG00005021912) #11 RUBCNL (ENSBIXG00005006830) #12 LRRC63 (ENSBIXG00005022158) #13 ENSBIXG00005022169 LCP1 (ENSBIXG00005022212) #14 CPB2 (ENSBIXG00005022273) #15 ZC3H13 (ENSBIXG00005022307) #16 SIAH3 (ENSBIXG00005003804) #17 CBY2 (ENSBIXG00005022348) #18 ENSBIXG00005022372 #19 COG3 (ENSBIXG00005022513) #20 ENSBIXG00005007690 ##22 KCTD4 (ENSBIXG00005003883) #23 GTF2F2 (ENSBIXG00005003886) #24 ENSBIXG00005022705 ENSBIXG00005022737 NUFIP1 (ENSBIXG00005022767) #26 TSC22D1 (ENSBIXG00005022881) #27 ENSBIXG00005022931 #28 ENSBIXG00005023019 SMIM2 (ENSBIXG00005003927) #29 LACC1 (ENSBIXG00005023079) #30 CCDC122 (ENSBIXG00005003936) #31 ENSBIXG00005023104 ENOX1 (ENSBIXG00005023147) #32 ENSBIXG00005023187 DNAJC15 (ENSBIXG00005023206) #33 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000162788 ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141.j ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.a ENSGT00940000161694 ENSGT00940000158705 ENSGT00940000159278 ENSGT00940000157600 ENSGT00390000002142 ENSGT00390000016453 ENSGT00390000008931 ENSGT00390000011262 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000159082.b ENSGT00900000141128 ENSGT00940000157335 ENSGT01100000263669 ENSGT00940000154417.a.b ENSGT00940000156356 ENSGT00390000002251 ENSGT00940000154065.a ENSGT00950000183151.a.a.b ENSGT00390000000932 ENSGT00950000183156.a.b.b.a ENSGT00390000008385 ENSGT00940000161356 ENSGT00390000001014 Wild yak MODERN SPECIES 639 FA2H (ENSBMUG00000022318) MLKL (ENSBMUG00000022327) RFWD3 (ENSBMUG00000022339) GLG1 (ENSBMUG00000022436) ENSBMUG00000022464 ##22 PDPR (ENSBMUG00000022490) ENSBMUG00000022565 AARS1 (ENSBMUG00000022631) DDX19B (ENSBMUG00000022675) ENSBMUG00000022686 ENSBMUG00000022688 ST3GAL2 (ENSBMUG00000022695) FCSK (ENSBMUG00000022710) COG4 (ENSBMUG00000022732) SF3B3 (ENSBMUG00000022752) IL34 (ENSBMUG00000022789) MTSS2 (ENSBMUG00000022815) ENSBMUG00000022821 ENSBMUG00000022832 Domestic yak DUPLICATION Domestic yak MODERN SPECIES 12 CFDP1 (ENSBGRG00000012860) BCAR1 (ENSBGRG00000013119) ENSBGRG00000013202 ENSBGRG00000013497 ENSBGRG00000013581 ZFP1 (ENSBGRG00000013658) LDHD (ENSBGRG00000013722) ENSBGRG00000014041 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##22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000015889.o.b.b ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338.s.a #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961.e #21 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000015889.o.b.b ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 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#34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000003338.s.a #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961.e #21 ENSGT00940000154194.kb.a ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000154185.g.a ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00390000000378.d.b.fb.b.b ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Narwhal MODERN SPECIES 315 ENSMMNG00015015349 #7 SUCLA2 (ENSMMNG00015015328) #8 HTR2A 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#21 ENSCDRG00005007988 ##22 GTF2F2 (ENSCDRG00005008284) #24 KCTD4 (ENSCDRG00005008352) #23 ENSCDRG00005008379 NUFIP1 (ENSCDRG00005008479) #26 TSC22D1 (ENSCDRG00005008565) #27 ENSCDRG00005008695 #28 LACC1 (ENSCDRG00005008895) #30 CCDC122 (ENSCDRG00005008954) #31 ENOX1 (ENSCDRG00005009033) #32 DNAJC15 (ENSCDRG00005009304) #33 EPSTI1 (ENSCDRG00005009378) #34 FAM216B (ENSCDRG00005009565) #35 TNFSF11 (ENSCDRG00005009599) #36 AKAP11 (ENSCDRG00005009691) #37 DGKH (ENSCDRG00005009915) Alpaca MODERN SPECIES 2527 CBY2 (ENSVPAG00000008481) #18 ENSVPAG00000008479 #19 COG3 (ENSVPAG00000008475) #20 ENSVPAG00000008472 ##22 KCTD4 (ENSVPAG00000008470) #23 GTF2F2 (ENSVPAG00000008468) #24 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b ##22 Artiodactyla_b DUPLICATION Artiodactyla_b DUPLICATION Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.f #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT01100000263828.a.b ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000017955.c.d.b ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.f #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT01100000263828.a.b ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000017955.c.d.b ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 Cow MODERN SPECIES 3 SUCLA2 (ENSBTAG00000006759) #8 HTR2A (ENSBTAG00000013498) #9 ESD (ENSBTAG00000003415) #10 LRCH1 (ENSBTAG00000002959) #11 RUBCNL (ENSBTAG00000013371) #12 LRRC63 (ENSBTAG00000015994) #13 ENSBTAG00000053178 LCP1 (ENSBTAG00000007079) #14 CPB2 (ENSBTAG00000007073) #15 ENSBTAG00000048402 ZC3H13 (ENSBTAG00000007067) SIAH3 (ENSBTAG00000051729) #17 CBY2 (ENSBTAG00000018580) #18 COG3 (ENSBTAG00000017907) #20 SLC25A30 (ENSBTAG00000016529) #21 TPT1 (ENSBTAG00000010156) ##22 KCTD4 (ENSBTAG00000019416) #23 GTF2F2 (ENSBTAG00000034495) #24 ENSBTAG00000045689 GPALPP1 (ENSBTAG00000009416) NUFIP1 (ENSBTAG00000009415) #26 TSC22D1 (ENSBTAG00000046664) #27 TSC22D1 (ENSBTAG00000047739) SERP2 (ENSBTAG00000051524) #28 LACC1 (ENSBTAG00000016691) #30 CCDC122 (ENSBTAG00000034753) #31 ENOX1 (ENSBTAG00000012434) #32 DNAJC15 (ENSBTAG00000034785) #33 EPSTI1 (ENSBTAG00000019054) #34 FAM216B (ENSBTAG00000003595) #35 TNFSF11 (ENSBTAG00000008924) #36 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 8 ENSOARG00020016639 C4orf33 (ENSOARG00020016691) SCLT1 (ENSOARG00020016794) JADE1 (ENSOARG00020017029) ENSOARG00020017302 ENSOARG00020017369 ENSOARG00020017509 LARP1B (ENSOARG00020017566) ENSOARG00020017919 ABHD18 (ENSOARG00020017983) MFSD8 (ENSOARG00020018143) PLK4 (ENSOARG00020018920) HSPA4L (ENSOARG00020019339) SLC25A31 (ENSOARG00020019464) INTU (ENSOARG00020019528) ENSOARG00020019704 ##22 FAT4 (ENSOARG00020019734) ANKRD50 (ENSOARG00020020018) RPS6KC1 (ENSOARG00020020099) ANGEL2 (ENSOARG00020020332) VASH2 (ENSOARG00020020502) FLVCR1 (ENSOARG00020020594) SPATA45 (ENSOARG00020020680) TATDN3 (ENSOARG00020020731) NSL1 (ENSOARG00020020998) ENSOARG00020021055 BATF3 (ENSOARG00020021075) GARIN4 (ENSOARG00020021112) ATF3 (ENSOARG00020021136) NENF (ENSOARG00020021272) PACC1 (ENSOARG00020021307) Cetacea DUPLICATION Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a.a ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a.a ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a.a ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a.a ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000162887 ENSGT00940000153582.b.a.a.b ENSGT00950000185059.b.a.a ENSGT00530000063872.A ENSGT00940000158229 ENSGT00940000155935 ENSGT00940000162167 ENSGT00940000159444 ENSGT00940000154972 ENSGT00940000161201 ENSGT00940000160946 ENSGT00390000017980.ob ENSGT00940000160515 ENSGT00940000153299.d.q.a ENSGT00940000164950 ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000154344.a ENSGT00940000153669.b.i ENSGT00940000157029 ENSGT00730000111366 ENSGT00390000012182 ENSGT00940000158388 ENSGT00940000163633 ENSGT00940000156803 ENSGT00950000182974.a.a.a.a ENSGT00390000007953 ENSGT00950000183189.a.b.b ENSGT00940000161248 ENSGT00950000183087.A.b.a.e ENSGT00940000160971 ENSGT00950000183375 Narwhal MODERN SPECIES 309 PNMA5 (ENSMMNG00015011762) ENSMMNG00015011751 ENSMMNG00015011709 NSDHL (ENSMMNG00015011668) CETN2 (ENSMMNG00015011652) GABRQ (ENSMMNG00015011628) GABRA3 (ENSMMNG00015011549) MAGEA10 (ENSMMNG00015011533) GABRE (ENSMMNG00015011487) PRRG3 (ENSMMNG00015011470) ENSMMNG00015011441 GPR50 (ENSMMNG00015019773) ENSMMNG00015019761 ENSMMNG00015019743 ENSMMNG00015019734 ENSMMNG00015019721 ##22 CD99L2 (ENSMMNG00015019669) ENSMMNG00015019648 ENSMMNG00015019626 MTM1 (ENSMMNG00015019552) MAMLD1 (ENSMMNG00015019528) ENSMMNG00015019479 TMEM185A (ENSMMNG00015019419) ENSMMNG00015019386 IDS (ENSMMNG00015019300) AFF2 (ENSMMNG00015019223) ENSMMNG00015019193 ENSMMNG00015019165 FMR1 (ENSMMNG00015019001) SLITRK2 (ENSMMNG00015018926) ENSMMNG00015018909 Beluga whale MODERN SPECIES GABRQ (ENSDLEG00000000048) ENSDLEG00000000072 GABRA3 (ENSDLEG00000000127) MAGEA10 (ENSDLEG00000000168) GABRE (ENSDLEG00000000191) PRRG3 (ENSDLEG00000000233) VMA21 (ENSDLEG00000000251) GPR50 (ENSDLEG00000000267) ENSDLEG00000000317 ENSDLEG00000000344 ENSDLEG00000000355 ##22 CD99L2 (ENSDLEG00000000368) MTMR1 (ENSDLEG00000000418) MTM1 (ENSDLEG00000000445) MAMLD1 (ENSDLEG00000000500) TMEM185A (ENSDLEG00000000557) CUNHXorf40A (ENSDLEG00000000594) IDS (ENSDLEG00000000599) AFF2 (ENSDLEG00000000636) ENSDLEG00000000683 FMR1 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ENSBMSG00010021410 GABRQ (ENSBMSG00010021381) GABRA3 (ENSBMSG00010021352) MAGEA10 (ENSBMSG00010021349) GABRE (ENSBMSG00010021334) CNGA2 (ENSBMSG00010021327) ENSBMSG00010021320 PRRG3 (ENSBMSG00010021314) ENSBMSG00010021304 GPR50 (ENSBMSG00010021296) ENSBMSG00010021290 ENSBMSG00010021279 ##22 CD99L2 (ENSBMSG00010021205) MTMR1 (ENSBMSG00010021156) MTM1 (ENSBMSG00010021136) MAMLD1 (ENSBMSG00010021125) ENSBMSG00010021094 ENSBMSG00010021092 ENSBMSG00010021087 ENSBMSG00010021082 ENSBMSG00010021076 ENSBMSG00010021070 ENSBMSG00010021048 ENSBMSG00010021038 IDS (ENSBMSG00010021024) ENSBMSG00010021009 ENSBMSG00010021002 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.a.b ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 8 GPI (ENSPCTG00005013183) KIAA0355 (ENSPCTG00005013477) ENSPCTG00005013668 LSM14A (ENSPCTG00005013769) ENSPCTG00005013917 KCTD15 (ENSPCTG00005013999) CHST8 (ENSPCTG00005014071) PEPD (ENSPCTG00005014153) CEBPG (ENSPCTG00005014307) CEBPA (ENSPCTG00005014331) SLC7A10 (ENSPCTG00005014353) LRP3 (ENSPCTG00005014474) WDR88 (ENSPCTG00005014581) GPATCH1 (ENSPCTG00005014911) RHPN2 (ENSPCTG00005014981) ENSPCTG00005015197 ##22 FAAP24 (ENSPCTG00005015251) CEP89 (ENSPCTG00005015339) SLC7A9 (ENSPCTG00005015420) TDRD12 (ENSPCTG00005015644) NUDT19 (ENSPCTG00005016540) RGS9BP (ENSPCTG00005016564) ANKRD27 (ENSPCTG00005016618) PDCD5 (ENSPCTG00005016856) DPY19L3 (ENSPCTG00005017005) ZNF507 (ENSPCTG00005017138) ENSPCTG00005017174 TSHZ3 (ENSPCTG00005017204) ZNF536 (ENSPCTG00005017245) URI1 (ENSPCTG00005017313) ENSPCTG00005017597 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.b ##22 Goat MODERN SPECIES 15 ENSCHIG00000008585 TMEM14A (ENSCHIG00000018513) TRAM2 (ENSCHIG00000014597) EFHC1 (ENSCHIG00000014186) PAQR8 (ENSCHIG00000004272) MCM3 (ENSCHIG00000020423) ENSCHIG00000008358 IL17A (ENSCHIG00000022239) PKHD1 (ENSCHIG00000021972) TFAP2B (ENSCHIG00000007665) TFAP2D (ENSCHIG00000023280) ENSCHIG00000008615 DEFB110 (ENSCHIG00000017625) DEFB114 (ENSCHIG00000020648) CRISP1 (ENSCHIG00000015225) ENSCHIG00000010083 ##22 ENSCHIG00000004238 PGK2 (ENSCHIG00000003650) CRISP3 (ENSCHIG00000012989) CRISP2 (ENSCHIG00000009328) RHAG (ENSCHIG00000019103) GLYATL3 (ENSCHIG00000019294) CENPQ (ENSCHIG00000021694) MMUT (ENSCHIG00000023231) PTCHD4 (ENSCHIG00000007711) OPN5 (ENSCHIG00000022101) ADGRF4 (ENSCHIG00000015162) ENSCHIG00000020762 CD2AP (ENSCHIG00000025885) TNFRSF21 (ENSCHIG00000026271) ADGRF1 (ENSCHIG00000024674) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 23 ENSOARG00020009798 ENSOARG00020009767 DHRS7 (ENSOARG00020009716) PCNX4 (ENSOARG00020009627) LRRC9 (ENSOARG00020009484) ENSOARG00020009459 RTN1 (ENSOARG00020009209) CCDC175 (ENSOARG00020009081) JKAMP (ENSOARG00020008977) L3HYPDH (ENSOARG00020008883) DAAM1 (ENSOARG00020008441) ENSOARG00020008342 ENSOARG00020008316 ENSOARG00020008270 ENSOARG00020008239 ENSOARG00020008208 ##22 DACT1 (ENSOARG00020008146) TIMM9 (ENSOARG00020007740) TOMM20L (ENSOARG00020021304) ARID4A (ENSOARG00020020842) PSMA3 (ENSOARG00020020746) ACTR10 (ENSOARG00020020638) ENSOARG00020020575 ARMH4 (ENSOARG00020020459) SLC35F4 (ENSOARG00020020338) ENSOARG00020020321 CCDC198 (ENSOARG00020020200) NAA30 (ENSOARG00020020150) AP5M1 (ENSOARG00020020008) EXOC5 (ENSOARG00020019509) OTX2 (ENSOARG00020019426) Siberian musk deer MODERN SPECIES 327 DNAI1 (ENSMMSG00000009628) ENHO (ENSMMSG00000009756) CNTFR (ENSMMSG00000009767) RPP25L (ENSMMSG00000009815) DCTN3 (ENSMMSG00000009836) ARID3C (ENSMMSG00000009901) SIGMAR1 (ENSMMSG00000009945) GALT (ENSMMSG00000009988) IL11RA (ENSMMSG00000010101) CCL27 (ENSMMSG00000010199) ENSMMSG00000010226 CCL19 (ENSMMSG00000010242) CCL21 (ENSMMSG00000010258) ENSMMSG00000010280 ENSMMSG00000010367 ENSMMSG00000011076 ##22 FRMD3 (ENSMMSG00000011114) ENSMMSG00000011319 IDNK (ENSMMSG00000011344) UBQLN1 (ENSMMSG00000011382) GKAP1 (ENSMMSG00000011458) KIF27 (ENSMMSG00000011568) C9orf64 (ENSMMSG00000011711) HNRNPK (ENSMMSG00000011741) RMI1 (ENSMMSG00000011782) SLC28A3 (ENSMMSG00000011792) NTRK2 (ENSMMSG00000011854) AGTPBP1 (ENSMMSG00000012012) ENSMMSG00000012129 GOLM1 (ENSMMSG00000012247) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.b ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.a.b ##22 Narwhal MODERN SPECIES 306 LAMB1 (ENSMMNG00015013160) ENSMMNG00015013081 NRCAM (ENSMMNG00015012839) ENSMMNG00015012715 PNPLA8 (ENSMMNG00015012688) SFRP4 (ENSMMNG00015012664) EPDR1 (ENSMMNG00015012643) STARD3NL (ENSMMNG00015012620) ENSMMNG00015012608 TRGV9 (ENSMMNG00015012603) AMPH (ENSMMNG00015012588) VPS41 (ENSMMNG00015012514) ENSMMNG00015012432 POU6F2 (ENSMMNG00015012404) YAE1 (ENSMMNG00015012376) ENSMMNG00015012353 ##22 RALA (ENSMMNG00015012334) CDK13 (ENSMMNG00015012288) MPLKIP (ENSMMNG00015012269) SUGCT (ENSMMNG00015012249) INHBA (ENSMMNG00015012234) GLI3 (ENSMMNG00015012212) C7orf25 (ENSMMNG00015012199) PSMA2 (ENSMMNG00015012176) ENSMMNG00015012161 HECW1 (ENSMMNG00015012084) STK17A (ENSMMNG00015012037) COA1 (ENSMMNG00015012011) BLVRA (ENSMMNG00015011986) POLM (ENSMMNG00015011889) AEBP1 (ENSMMNG00015011811) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.a.b.b ##22 Goat MODERN SPECIES 23 ATP6V0A4 (ENSCHIG00000024394) SVOPL (ENSCHIG00000025223) TRIM24 (ENSCHIG00000008442) AKR1D1 (ENSCHIG00000025030) CREB3L2 (ENSCHIG00000016029) ENSCHIG00000026275 ENSCHIG00000016216 PTN (ENSCHIG00000026987) CHRM2 (ENSCHIG00000003452) MTPN (ENSCHIG00000018464) ENSCHIG00000014580 FAM180A (ENSCHIG00000021088) SLC13A4 (ENSCHIG00000026548) STMP1 (ENSCHIG00000013880) NUP205 (ENSCHIG00000005292) ENSCHIG00000011732 ##22 CNOT4 (ENSCHIG00000010955) ENSCHIG00000016591 ENSCHIG00000003203 STRA8 (ENSCHIG00000016064) WDR91 (ENSCHIG00000014156) CYREN (ENSCHIG00000019318) TMEM140 (ENSCHIG00000025483) AGBL3 (ENSCHIG00000015475) CALD1 (ENSCHIG00000021959) BPGM (ENSCHIG00000015001) ENSCHIG00000008971 AKR1B1 (ENSCHIG00000012061) SLC35B4 (ENSCHIG00000017132) ENSCHIG00000017125 ENSCHIG00000025857 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.b ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.b ##22 Arabian camel MODERN SPECIES 204 ENSCDRG00005014803 ENSCDRG00005014840 SERTM2 (ENSCDRG00005014892) DCX (ENSCDRG00005014911) CAPN6 (ENSCDRG00005014954) PAK3 (ENSCDRG00005015076) CHRDL1 (ENSCDRG00005015526) RTL9 (ENSCDRG00005015853) AMMECR1 (ENSCDRG00005015903) TMEM164 (ENSCDRG00005016137) ACSL4 (ENSCDRG00005016247) KCNE5 (ENSCDRG00005016316) NXT2 (ENSCDRG00005016338) GUCY2F (ENSCDRG00005016402) ENSCDRG00005016513 ENSCDRG00005016532 ##22 IRS4 (ENSCDRG00005016572) COL4A5 (ENSCDRG00005016691) COL4A6 (ENSCDRG00005018191) ATG4A (ENSCDRG00005018854) PSMD10 (ENSCDRG00005018904) VSIG1 (ENSCDRG00005018997) ENSCDRG00005019013 MID2 (ENSCDRG00005019027) TSC22D3 (ENSCDRG00005019136) ENSCDRG00005019269 FRMPD3 (ENSCDRG00005019318) DNAAF6 (ENSCDRG00005019359) NUP62CL (ENSCDRG00005019369) RBM41 (ENSCDRG00005019384) MORC4 (ENSCDRG00005019413) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.b ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.b ##22 Vaquita MODERN SPECIES 20 LAMB1 (ENSPSNG00000004801) NRCAM (ENSPSNG00000005031) PNPLA8 (ENSPSNG00000005209) ENSPSNG00000005245 ENSPSNG00000005266 SFRP4 (ENSPSNG00000005311) EPDR1 (ENSPSNG00000005343) STARD3NL (ENSPSNG00000005380) ENSPSNG00000005418 TRGV9 (ENSPSNG00000005429) AMPH (ENSPSNG00000005476) VPS41 (ENSPSNG00000005623) POU6F2 (ENSPSNG00000005694) ENSPSNG00000005765 YAE1 (ENSPSNG00000005783) ENSPSNG00000005805 ##22 RALA (ENSPSNG00000005824) CDK13 (ENSPSNG00000005890) MPLKIP (ENSPSNG00000005962) SUGCT (ENSPSNG00000006038) INHBA (ENSPSNG00000006133) GLI3 (ENSPSNG00000006154) C7orf25 (ENSPSNG00000006173) PSMA2 (ENSPSNG00000006196) ENSPSNG00000006232 HECW1 (ENSPSNG00000006347) STK17A (ENSPSNG00000006610) ENSPSNG00000006640 BLVRA (ENSPSNG00000006663) POLM (ENSPSNG00000006694) AEBP1 (ENSPSNG00000006807) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063929.a.b ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00950000182962.b.a ENSGT00390000018883 ENSGT00940000157554 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 ENSGT01000000214440.A.a.b.a.a ENSGT00940000156115 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00390000010045.i ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000182978.B ENSGT00910000147719.b ENSGT00390000006051.a.a.b ##22 ENSGT01060000248589.D ENSGT00390000012569.a ENSGT00390000006264 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00390000003312 ENSGT00390000010888.c.a.b ENSGT00940000157582.c ENSGT00940000155543 ENSGT00940000156139 ENSGT00940000162094 ENSGT00390000002144.e.a ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00940000156761 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000157833 Beluga whale MODERN SPECIES 51 CD164L2 (ENSDLEG00000013628) GPR3 (ENSDLEG00000013622) WASF2 (ENSDLEG00000013613) AHDC1 (ENSDLEG00000013602) FGR (ENSDLEG00000013542) IFI6 (ENSDLEG00000013516) FAM76A (ENSDLEG00000013491) ENSDLEG00000013481 PPP1R8 (ENSDLEG00000013472) THEMIS2 (ENSDLEG00000013466) ENSDLEG00000013454 SMPDL3B (ENSDLEG00000013442) XKR8 (ENSDLEG00000013433) EYA3 (ENSDLEG00000013376) ENSDLEG00000013366 ENSDLEG00000013354 ##22 PTAFR (ENSDLEG00000013349) DNAJC8 (ENSDLEG00000013340) ATPIF1 (ENSDLEG00000013329) SESN2 (ENSDLEG00000013321) MED18 (ENSDLEG00000013313) ENSDLEG00000013302 PHACTR4 (ENSDLEG00000013189) RCC1 (ENSDLEG00000013058) ENSDLEG00000013043 ENSDLEG00000013017 RAB42 (ENSDLEG00000012981) TAF12 (ENSDLEG00000012969) GMEB1 (ENSDLEG00000012947) YTHDF2 (ENSDLEG00000012942) OPRD1 (ENSDLEG00000012901) Narwhal MODERN SPECIES 304 CD164L2 (ENSMMNG00015005349) GPR3 (ENSMMNG00015005327) WASF2 (ENSMMNG00015005306) AHDC1 (ENSMMNG00015005285) FGR (ENSMMNG00015005239) IFI6 (ENSMMNG00015005200) FAM76A (ENSMMNG00015005176) ENSMMNG00015005158 PPP1R8 (ENSMMNG00015005107) THEMIS2 (ENSMMNG00015013027) ENSMMNG00015012999 SMPDL3B (ENSMMNG00015012953) XKR8 (ENSMMNG00015012929) EYA3 (ENSMMNG00015012893) ENSMMNG00015012858 ENSMMNG00015012849 ##22 DNAJC8 (ENSMMNG00015012830) ATP5IF1 (ENSMMNG00015012814) SESN2 (ENSMMNG00015012796) MED18 (ENSMMNG00015012782) ENSMMNG00015012774 PHACTR4 (ENSMMNG00015012730) RCC1 (ENSMMNG00015012687) TRNAU1AP (ENSMMNG00015012660) RAB42 (ENSMMNG00015012631) ENSMMNG00015012619 GMEB1 (ENSMMNG00015012601) YTHDF2 (ENSMMNG00015012587) OPRD1 (ENSMMNG00015012577) EPB41 (ENSMMNG00015012190) TMEM200B (ENSMMNG00015012047) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.b ##22 Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 260 PRKCH (ENSMMSG00000009730) TMEM30B (ENSMMSG00000009710) SLC38A6 (ENSMMSG00000009590) ENSMMSG00000009538 MNAT1 (ENSMMSG00000009474) SIX4 (ENSMMSG00000009423) SIX1 (ENSMMSG00000009394) SIX6 (ENSMMSG00000009370) C14orf39 (ENSMMSG00000009270) PPM1A (ENSMMSG00000009198) DHRS7 (ENSMMSG00000009154) PCNX4 (ENSMMSG00000009088) LRRC9 (ENSMMSG00000008836) RTN1 (ENSMMSG00000008540) ENSMMSG00000008471 ENSMMSG00000008459 ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1153 NUP62CL (ENSMMSG00000017359) RBM41 (ENSMMSG00000017322) ENSMMSG00000017302 ENSMMSG00000017272 MORC4 (ENSMMSG00000017246) CLDN2 (ENSMMSG00000017231) RIPPLY1 (ENSMMSG00000017171) TBC1D8B (ENSMMSG00000017037) RNF128 (ENSMMSG00000016956) RADX (ENSMMSG00000016783) ENSMMSG00000016752 ##22 ENSMMSG00000016661 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.b ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 19 LUM (ENSOARG00020009658) KERA (ENSOARG00020009608) EPYC (ENSOARG00020009542) CCER1 (ENSOARG00020009520) ENSOARG00020009475 ATP2B1 (ENSOARG00020008845) POC1B (ENSOARG00020008549) DUSP6 (ENSOARG00020008467) ENSOARG00020008432 KITLG (ENSOARG00020008140) TMTC3 (ENSOARG00020008061) ENSOARG00020008023 C3H12orf29 (ENSOARG00020007796) C12orf50 (ENSOARG00020007620) MGAT4C (ENSOARG00020007579) ENSOARG00020007547 ##22 NTS (ENSOARG00020007471) RASSF9 (ENSOARG00020007430) ALX1 (ENSOARG00020007379) TSPAN19 (ENSOARG00020007275) SLC6A15 (ENSOARG00020007201) TMTC2 (ENSOARG00020015711) CCDC59 (ENSOARG00020015621) PPFIA2 (ENSOARG00020009934) ACSS3 (ENSOARG00020009124) LIN7A (ENSOARG00020009053) MYF5 (ENSOARG00020009026) MYF6 (ENSOARG00020008989) MYF6 (ENSOARG00020008943) PTPRQ (ENSOARG00020008080) PPP1R12A (ENSOARG00020005817) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.b ##22 American bison DUPLICATION American bison MODERN SPECIES 665 ENSBBBG00000017070 ##22 American bison MODERN SPECIES 3209 ENSBBBG00000019984 ENSBBBG00000005110 ENSBBBG00000019997 CFDP1 (ENSBBBG00000020005) BCAR1 (ENSBBBG00000020065) ENSBBBG00000020084 ENSBBBG00000020094 ENSBBBG00000007468 ZFP1 (ENSBBBG00000020103) LDHD (ENSBBBG00000020110) ZNRF1 (ENSBBBG00000020128) WDR59 (ENSBBBG00000020161) FA2H (ENSBBBG00000020178) MLKL (ENSBBBG00000020199) RFWD3 (ENSBBBG00000005452) ENSBBBG00000020210 ##22 GLG1 (ENSBBBG00000009077) PDPR (ENSBBBG00000020320) ENSBBBG00000000652 AARS1 (ENSBBBG00000000620) ENSBBBG00000000611 DDX19B (ENSBBBG00000020441) ST3GAL2 (ENSBBBG00000005535) ENSBBBG00000020499 ENSBBBG00000020512 COG4 (ENSBBBG00000020575) SF3B3 (ENSBBBG00000020606) IL34 (ENSBBBG00000020633) MTSS2 (ENSBBBG00000005568) VAC14 (ENSBBBG00000007054) VSTM2B (ENSBBBG00000020832) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 leopard MODERN SPECIES 554 ENSPPRG00000011783 ##22 Tiger MODERN SPECIES 153 ENSPTIG00000012531 EMCN (ENSPTIG00000012336) PPP3CA (ENSPTIG00000007016) BANK1 (ENSPTIG00000020233) SLC39A8 (ENSPTIG00000016943) NFKB1 (ENSPTIG00000013951) ENSPTIG00000003747 MANBA (ENSPTIG00000010981) UBE2D3 (ENSPTIG00000006732) CISD2 (ENSPTIG00000006007) SLC9B1 (ENSPTIG00000021212) SLC9B2 (ENSPTIG00000016010) BDH2 (ENSPTIG00000014878) CENPE (ENSPTIG00000022071) TACR3 (ENSPTIG00000022047) ENSPTIG00000022032 ##22 CXXC4 (ENSPTIG00000021964) TET2 (ENSPTIG00000021334) PPA2 (ENSPTIG00000017640) ENSPTIG00000017051 ENSPTIG00000015847 INTS12 (ENSPTIG00000008665) GSTCD (ENSPTIG00000006784) NPNT (ENSPTIG00000017103) TBCK (ENSPTIG00000011334) ENSPTIG00000008163 GIMD1 (ENSPTIG00000007315) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Dingo MODERN SPECIES 347 ARMCX6 (ENSCAFG00020007350) ARMCX3 (ENSCAFG00020007346) ARMCX2 (ENSCAFG00020007343) ENSCAFG00020007332 ENSCAFG00020007326 ZMAT1 (ENSCAFG00020007319) ENSCAFG00020007318 BEX5 (ENSCAFG00020007314) ENSCAFG00020007291 ENSCAFG00020007236 ENSCAFG00020007231 ENSCAFG00020007227 ENSCAFG00020007216 ARMCX5 (ENSCAFG00020007214) GPRASP1 (ENSCAFG00020007196) ENSCAFG00020007195 ##22 ENSCAFG00020007187 ENSCAFG00020007169 ENSCAFG00020007164 ENSCAFG00020007156 ENSCAFG00020007152 ENSCAFG00020007134 ENSCAFG00020007128 ENSCAFG00020007123 TCEAL7 (ENSCAFG00020007121) BEX3 (ENSCAFG00020007120) ENSCAFG00020007117 ENSCAFG00020007092 ENSCAFG00020007084 TCEAL1 (ENSCAFG00020007078) MORF4L2 (ENSCAFG00020007074) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000006051.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B.gb #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000159144.B.fb.b #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000010146 ENSGT00940000155665.j ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000156209 ENSGT00940000160185 ENSGT00940000156301 ENSGT00940000155190 ENSGT00390000018600 ENSGT00730000111209 ENSGT00390000006503.a ENSGT00940000158755 ENSGT00940000154568 ENSGT00940000157092 ENSGT00940000158648 ENSGT00940000157568 ENSGT00390000006051.a.a ##22 ENSGT00940000162256 ENSGT00940000153947.B ENSGT00940000155542.b ENSGT00390000015466 ENSGT00390000004336 ENSGT00940000153733.B ENSGT01100000264156.a ENSGT00530000063000.a.a.a ENSGT00940000156746 ENSGT00940000155661 ENSGT00910000144243 ENSGT00940000158468 ENSGT01050000244818.t ENSGT00940000155136 ENSGT00940000157668 American mink MODERN SPECIES 57 IL23R (ENSNVIG00000010999) ENSNVIG00000010983 SLC35D1 (ENSNVIG00000010971) MIER1 (ENSNVIG00000010880) DNAI4 (ENSNVIG00000010851) DYNLT5 (ENSNVIG00000010848) SGIP1 (ENSNVIG00000010770) PDE4B (ENSNVIG00000010683) LEPR (ENSNVIG00000010636) LEPROT (ENSNVIG00000010602) AUXI (ENSNVIG00000010505) ENSNVIG00000010479 JAK1 (ENSNVIG00000010400) RAVER2 (ENSNVIG00000010354) CACHD1 (ENSNVIG00000010295) ENSNVIG00000010284 ##22 UBE2U (ENSNVIG00000010241) ROR1 (ENSNVIG00000010206) ENSNVIG00000010195 PGM1 (ENSNVIG00000010153) EFCAB7 (ENSNVIG00000010114) ITGB3BP (ENSNVIG00000010096) ALG6 (ENSNVIG00000010061) ENSNVIG00000010049 ATG4C (ENSNVIG00000010028) ANGPTL3 (ENSNVIG00000010008) DOCK7 (ENSNVIG00000009659) USP1 (ENSNVIG00000009582) KANK4 (ENSNVIG00000009550) L1TD1 (ENSNVIG00000009541) PATJ (ENSNVIG00000009197) Ferret MODERN SPECIES 254 MIER1 (ENSMPUG00000000774) DNAI4 (ENSMPUG00000000772) DYNLT5 (ENSMPUG00000000770) SGIP1 (ENSMPUG00000000764) PDE4B (ENSMPUG00000000760) ENSMPUG00000000757 ENSMPUG00000000756 LEPR (ENSMPUG00000000734) LEPROT (ENSMPUG00000000726) DNAJC6 (ENSMPUG00000000723) ENSMPUG00000000722 ENSMPUG00000000721 JAK1 (ENSMPUG00000000719) RAVER2 (ENSMPUG00000000717) CACHD1 (ENSMPUG00000000715) ENSMPUG00000018475 ##22 UBE2U (ENSMPUG00000000712) ROR1 (ENSMPUG00000000709) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b.t #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000006051.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B.gb #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000159144.B.fb.b #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Ursus ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b.t #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000006051.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B.gb #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00940000158106 American black bear MODERN SPECIES 2528 ENSUAMG00000014720 ##22 Polar bear DUPLICATION Polar bear MODERN SPECIES 297 MED4 (ENSUMAG00000017955) NUDT15 (ENSUMAG00000017950) #7 SUCLA2 (ENSUMAG00000017396) #8 HTR2A (ENSUMAG00000017217) #9 ESD (ENSUMAG00000017188) #10 LRCH1 (ENSUMAG00000017098) #11 RUBCNL (ENSUMAG00000017084) #12 LRRC63 (ENSUMAG00000017071) #13 LCP1 (ENSUMAG00000016365) #14 CPB2 (ENSUMAG00000016276) #15 ZC3H13 (ENSUMAG00000016220) #16 SIAH3 (ENSUMAG00000016203) #17 CBY2 (ENSUMAG00000016197) #18 COG3 (ENSUMAG00000016186) #20 SLC25A30 (ENSUMAG00000016178) #21 ENSUMAG00000016169 ##22 KCTD4 (ENSUMAG00000016155) #23 GTF2F2 (ENSUMAG00000016150) #24 ENSUMAG00000016139 ENSUMAG00000016137 NUFIP1 (ENSUMAG00000016131) #26 TSC22D1 (ENSUMAG00000016120) #27 ENSUMAG00000016116 LACC1 (ENSUMAG00000016088) #30 CCDC122 (ENSUMAG00000016081) #31 ENOX1 (ENSUMAG00000016041) #32 DNAJC15 (ENSUMAG00000016026) #33 ENSUMAG00000016020 EPSTI1 (ENSUMAG00000016009) #34 FAM216B (ENSUMAG00000015984) #35 TNFSF11 (ENSUMAG00000015977) #36 Polar bear MODERN SPECIES 112 ZBTB38 (ENSUMAG00000014585) RASA2 (ENSUMAG00000013878) RNF7 (ENSUMAG00000013758) GRK7 (ENSUMAG00000013754) ATP1B3 (ENSUMAG00000013750) TFDP2 (ENSUMAG00000013741) GK5 (ENSUMAG00000013679) XRN1 (ENSUMAG00000013625) ATR (ENSUMAG00000013217) PLS1 (ENSUMAG00000013168) ##14 TRPC1 (ENSUMAG00000012988) PCOLCE2 (ENSUMAG00000012927) PAQR9 (ENSUMAG00000012908) SLC9A9 (ENSUMAG00000012650) DIPK2A (ENSUMAG00000012620) ENSUMAG00000012607 ##22 PLOD2 (ENSUMAG00000012593) ENSUMAG00000012591 PLSCR4 (ENSUMAG00000012588) ENSUMAG00000012575 ENSUMAG00000012573 ENSUMAG00000012556 PLSCR1 (ENSUMAG00000012545) PLSCR5 (ENSUMAG00000012531) ENSUMAG00000012515 ZIC4 (ENSUMAG00000012491) ZIC1 (ENSUMAG00000012488) AGTR1 (ENSUMAG00000012460) CPB1 (ENSUMAG00000012435) CPA3 (ENSUMAG00000012432) GYG1 (ENSUMAG00000012408) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a ##22 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES ENSRFEG00010002419 ENSRFEG00010002443 SMIM10 (ENSRFEG00010002449) MOSPD1 (ENSRFEG00010002471) ENSRFEG00010002489 PABIR2 (ENSRFEG00010002506) ENSRFEG00010002534 PLAC1 (ENSRFEG00010002539) ENSRFEG00010002561 PHF6 (ENSRFEG00010002588) ENSRFEG00010002632 CCDC160 (ENSRFEG00010002644) ENSRFEG00010000093 GPC3 (ENSRFEG00010000103) GPC4 (ENSRFEG00010000107) ENSRFEG00010000112 ##22 HS6ST2 (ENSRFEG00010000116) ENSRFEG00010000123 ENSRFEG00010000125 ENSRFEG00010000130 ENSRFEG00010000134 MBNL3 (ENSRFEG00010000151) RAP2C (ENSRFEG00010000172) FRMD7 (ENSRFEG00010000183) STK26 (ENSRFEG00010000239) IGSF1 (ENSRFEG00010000369) ARHGAP36 (ENSRFEG00010000484) ENOX2 (ENSRFEG00010000534) ##32 ENSRFEG00010000558 RBMX2 (ENSRFEG00010000565) GPR119 (ENSRFEG00010000577) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 6 GRIK5 (ENSRFEG00010017406) ZNF574 (ENSRFEG00010017506) POU2F2 (ENSRFEG00010017530) DEDD2 (ENSRFEG00010017687) ZNF526 (ENSRFEG00010017756) GSK3A (ENSRFEG00010017776) ERF (ENSRFEG00010017899) CIC (ENSRFEG00010017983) PAFAH1B3 (ENSRFEG00010018154) PRR19 (ENSRFEG00010018186) TMEM145 (ENSRFEG00010018204) MEGF8 (ENSRFEG00010018262) CNFN (ENSRFEG00010018318) LIPE (ENSRFEG00010018364) CXCL17 (ENSRFEG00010018405) ENSRFEG00010018437 ##22 ENSRFEG00010018459 ENSRFEG00010018708 ENSRFEG00010019285 TEX101 (ENSRFEG00010019311) ENSRFEG00010019388 LYPD3 (ENSRFEG00010019417) PHLDB3 (ENSRFEG00010019485) ETHE1 (ENSRFEG00010019545) ZNF575 (ENSRFEG00010019651) XRCC1 (ENSRFEG00010019683) ENSRFEG00010019804 IRGQ (ENSRFEG00010019907) ZNF576 (ENSRFEG00010019936) ZNF428 (ENSRFEG00010019964) CADM4 (ENSRFEG00010020024) Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 14 SLC25A24 (ENSRFEG00010016692) VAV3 (ENSRFEG00010016572) NTNG1 (ENSRFEG00010016421) PRMT6 (ENSRFEG00010016394) ENSRFEG00010016333 RNPC3 (ENSRFEG00010016250) COL11A1 (ENSRFEG00010015997) OLFM3 (ENSRFEG00010015862) ENSRFEG00010015836 S1PR1 (ENSRFEG00010015818) ENSRFEG00010015759 DPH5 (ENSRFEG00010015664) SLC30A7 (ENSRFEG00010015610) EXTL2 (ENSRFEG00010015523) VCAM1 (ENSRFEG00010015274) ENSRFEG00010015244 ##22 ENSRFEG00010015212 CDC14A (ENSRFEG00010014799) RTCA (ENSRFEG00010014672) DBT (ENSRFEG00010014585) LRRC39 (ENSRFEG00010014535) TRMT13 (ENSRFEG00010014448) SASS6 (ENSRFEG00010014191) MFSD14A (ENSRFEG00010013748) AGL (ENSRFEG00010013139) ENSRFEG00010013117 FRRS1 (ENSRFEG00010013043) PALMD (ENSRFEG00010012941) PLPPR4 (ENSRFEG00010012804) PLPPR5 (ENSRFEG00010012607) SNX7 (ENSRFEG00010012379) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 4 ODC1 (ENSRFEG00010008653) HPCAL1 (ENSRFEG00010008686) ENSRFEG00010008723 CYS1 (ENSRFEG00010008838) KLF11 (ENSRFEG00010008867) GRHL1 (ENSRFEG00010008922) ENSRFEG00010009191 TAF1B (ENSRFEG00010009242) YWHAQ (ENSRFEG00010009419) ADAM17 (ENSRFEG00010009462) IAH1 (ENSRFEG00010009506) CPSF3 (ENSRFEG00010009573) ITGB1BP1 (ENSRFEG00010009640) ASAP2 (ENSRFEG00010009716) ENSRFEG00010009824 ENSRFEG00010009833 ##22 MBOAT2 (ENSRFEG00010009854) KIDINS220 (ENSRFEG00010009917) ENSRFEG00010010062 RNF144A (ENSRFEG00010010097) RSAD2 (ENSRFEG00010010140) CMPK2 (ENSRFEG00010010183) ENSRFEG00010010195 SOX11 (ENSRFEG00010010241) DCDC2C (ENSRFEG00010010389) ALLC (ENSRFEG00010010543) COLEC11 (ENSRFEG00010010705) RPS7 (ENSRFEG00010010903) RNASEH1 (ENSRFEG00010010966) ADI1 (ENSRFEG00010010993) TRAPPC12 (ENSRFEG00010011041) Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 207 ENSRROG00000026715 ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 85 ENSSBOG00000021911 STAG2 (ENSSBOG00000030175) XIAP (ENSSBOG00000032822) THOC2 (ENSSBOG00000007245) GRIA3 (ENSSBOG00000025046) ENSSBOG00000029995 ENSSBOG00000035248 C1GALT1C1 (ENSSBOG00000019221) MCTS1 (ENSSBOG00000031550) CUL4B (ENSSBOG00000029478) LAMP2 (ENSSBOG00000034449) ATP1B4 (ENSSBOG00000033763) TMEM255A (ENSSBOG00000014597) ZBTB33 (ENSSBOG00000006501) ENSSBOG00000023048 ENSSBOG00000019000 ##22 RHOXF1 (ENSSBOG00000035324) NKAP (ENSSBOG00000025492) AKAP14 (ENSSBOG00000035335) NDUFA1 (ENSSBOG00000035375) RNF113A (ENSSBOG00000017704) UPF3B (ENSSBOG00000019740) ENSSBOG00000019969 SEPTIN6 (ENSSBOG00000024143) NKRF (ENSSBOG00000021175) UBE2A (ENSSBOG00000032134) STEEP1 (ENSSBOG00000024579) SLC25A43 (ENSSBOG00000019634) ENSSBOG00000030322 PGRMC1 (ENSSBOG00000020615) CT47C1 (ENSSBOG00000028868) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 68 CELF4 (ENSPSMG00000002891) KIAA1328 (ENSPSMG00000003009) ENSPSMG00000003089 ENSPSMG00000003146 FHOD3 (ENSPSMG00000003326) MOCOS (ENSPSMG00000003455) ELP2 (ENSPSMG00000003603) SLC39A6 (ENSPSMG00000003832) RPRD1A (ENSPSMG00000003867) C18orf21 (ENSPSMG00000003890) GALNT1 (ENSPSMG00000004029) INO80C (ENSPSMG00000004147) ENSPSMG00000004159 ##22 ZNF396 (ENSPSMG00000004166) ZNF24 (ENSPSMG00000004182) ENSPSMG00000004194 ENSPSMG00000004205 ZNF397 (ENSPSMG00000004250) MAPRE2 (ENSPSMG00000004357) DTNA (ENSPSMG00000004738) ENSPSMG00000004976 NOL4 (ENSPSMG00000005054) ENSPSMG00000005080 ENSPSMG00000005088 KLHL14 (ENSPSMG00000005104) ENSPSMG00000005107 GAREM1 (ENSPSMG00000005116) MEP1B (ENSPSMG00000005133) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.a ##22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 11 ENSOCUG00000031550 NEK1 (ENSOCUG00000016756) CLCN3 (ENSOCUG00000006220) HPF1 (ENSOCUG00000026923) ENSOCUG00000036380 MFAP3L (ENSOCUG00000011514) AADAT (ENSOCUG00000011526) GALNTL6 (ENSOCUG00000000888) ENSOCUG00000038954 ENSOCUG00000031901 GALNT7 (ENSOCUG00000011080) ENSOCUG00000000074 SAP30 (ENSOCUG00000010418) SCRG1 (ENSOCUG00000000616) ENSOCUG00000016256 ENSOCUG00000023773 ##22 FBXO8 (ENSOCUG00000008888) CEP44 (ENSOCUG00000013963) ENSOCUG00000026425 HPGD (ENSOCUG00000016289) GLRA3 (ENSOCUG00000017638) ENSOCUG00000013889 ENSOCUG00000007714 ENSOCUG00000037142 GPM6A (ENSOCUG00000007631) WDR17 (ENSOCUG00000015110) SPATA4 (ENSOCUG00000013569) ASB5 (ENSOCUG00000012592) ENSOCUG00000029741 ENSOCUG00000012211 VEGFC (ENSOCUG00000017884) Rabbit MODERN SPECIES 2 ENSOCUG00000034609 ENSOCUG00000024909 ENSOCUG00000000089 SLC25A46 (ENSOCUG00000012366) TMEM232 (ENSOCUG00000009594) MAN2A1 (ENSOCUG00000003404) PJA2 (ENSOCUG00000011136) ENSOCUG00000035509 ENSOCUG00000032654 ENSOCUG00000010918 ENSOCUG00000012609 EFNA5 (ENSOCUG00000016107) ENSOCUG00000035176 ENSOCUG00000037124 ENSOCUG00000025766 ENSOCUG00000024359 ##22 NUDT12 (ENSOCUG00000017632) ENSOCUG00000022102 MACIR (ENSOCUG00000022010) PPIP5K2 (ENSOCUG00000001610) GIN1 (ENSOCUG00000025993) PAM (ENSOCUG00000001598) SLCO6A1 (ENSOCUG00000003393) SLCO4C1 (ENSOCUG00000016948) ENSOCUG00000027390 ENSOCUG00000035604 ST8SIA4 (ENSOCUG00000007922) FAM174A (ENSOCUG00000007657) ENSOCUG00000031872 CHD1 (ENSOCUG00000004434) ENSOCUG00000029913 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 4 ENSHGLG00000019589 ENSHGLG00000018465 ENSHGLG00000033052 ENSHGLG00000008955 ENSHGLG00000036537 CSTF2T (ENSHGLG00000015478) ENSHGLG00000021086 ENSHGLG00000007097 DKK1 (ENSHGLG00000003778) MBL2 (ENSHGLG00000003224) ENSHGLG00000050306 PCDH15 (ENSHGLG00000007425) ENSHGLG00000019528 ENSHGLG00000049296 ENSHGLG00000018770 ENSHGLG00000001334 ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Rabbit MODERN SPECIES 11 ENSOCUG00000029647 ENSOCUG00000027235 ENSOCUG00000027630 MTMR7 (ENSOCUG00000008372) VPS37A (ENSOCUG00000008363) ENSOCUG00000014589 ZDHHC2 (ENSOCUG00000014585) MICU3 (ENSOCUG00000000277) ENSOCUG00000025641 MSR1 (ENSOCUG00000014197) ENSOCUG00000031028 TUSC3 (ENSOCUG00000003212) ENSOCUG00000022744 UNC5D (ENSOCUG00000017691) ENSOCUG00000034668 ENSOCUG00000024371 ##22 ENSOCUG00000024073 TTI2 (ENSOCUG00000008740) MAK16 (ENSOCUG00000008735) FUT10 (ENSOCUG00000000857) NRG1 (ENSOCUG00000005836) ENSOCUG00000030626 WRN (ENSOCUG00000012620) PURG (ENSOCUG00000022003) TEX15 (ENSOCUG00000017093) ENSOCUG00000014028 ENSOCUG00000005230 ENSOCUG00000005223 GSR (ENSOCUG00000017234) SMIM18 (ENSOCUG00000039471) GTF2E2 (ENSOCUG00000016020) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 160 ENSPSMG00000010602 ##22 ENSPSMG00000010607 ARPP21 (ENSPSMG00000010695) PDCD6IP (ENSPSMG00000010779) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.h.b ##22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 27 GSR (ENSCSAG00000015834) UBXN8 (ENSCSAG00000015827) PPP2CB (ENSCSAG00000015823) TEX15 (ENSCSAG00000015819) PURG (ENSCSAG00000015815) WRN (ENSCSAG00000015810) ENSCSAG00000018530 NRG1 (ENSCSAG00000015800) FUT10 (ENSCSAG00000015793) TTI2 (ENSCSAG00000015786) RNF122 (ENSCSAG00000015784) DUSP26 (ENSCSAG00000015780) UNC5D (ENSCSAG00000015773) ENSCSAG00000015761 KCNU1 (ENSCSAG00000015733) ENSCSAG00000015693 ##22 ZNF703 (ENSCSAG00000015685) ERLIN2 (ENSCSAG00000015667) ENSCSAG00000018532 PLPBP (ENSCSAG00000015619) ADGRA2 (ENSCSAG00000015581) BRF2 (ENSCSAG00000015533) RAB11FIP1 (ENSCSAG00000015528) GOT1L1 (ENSCSAG00000015519) ADRB3 (ENSCSAG00000015507) ENSCSAG00000015504 ASH2L (ENSCSAG00000015493) STAR (ENSCSAG00000015488) LSM1 (ENSCSAG00000015485) BAG4 (ENSCSAG00000015482) DDHD2 (ENSCSAG00000015470) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 7119 ENSTBEG00000008371 ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Rabbit MODERN SPECIES 18 HOXD13 (ENSOCUG00000029547) EVX2 (ENSOCUG00000032776) LNPK (ENSOCUG00000008962) ATP5MC3 (ENSOCUG00000012164) ATF2 (ENSOCUG00000012156) CHN1 (ENSOCUG00000008134) CHRNA1 (ENSOCUG00000024814) ENSOCUG00000005696 ENSOCUG00000036607 GPR155 (ENSOCUG00000003683) SCRN3 (ENSOCUG00000011499) CIR1 (ENSOCUG00000029298) ENSOCUG00000037146 OLA1 (ENSOCUG00000003574) SP3 (ENSOCUG00000026678) ENSOCUG00000030823 ##22 CDCA7 (ENSOCUG00000001759) ENSOCUG00000030479 MAP3K20 (ENSOCUG00000015053) ENSOCUG00000020911 RAPGEF4 (ENSOCUG00000015032) PDK1 (ENSOCUG00000000408) ITGA6 (ENSOCUG00000000403) DLX1 (ENSOCUG00000003707) METAP1D (ENSOCUG00000003700) HAT1 (ENSOCUG00000005313) SLC25A12 (ENSOCUG00000012066) DYNC1I2 (ENSOCUG00000009944) CYBRD1 (ENSOCUG00000014820) DCAF17 (ENSOCUG00000013882) METTL8 (ENSOCUG00000011653) Pika MODERN SPECIES 8079 ENSOPRG00000016085 ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 69 Tmem164 (ENSJJAG00000000642) ENSJJAG00000021750 Acsl4 (ENSJJAG00000019922) Kcne1l (ENSJJAG00000010943) ENSJJAG00000000326 Gucy2f (ENSJJAG00000013450) Irs4 (ENSJJAG00000019173) Col4a5 (ENSJJAG00000016139) Col4a6 (ENSJJAG00000009572) ENSJJAG00000016735 ENSJJAG00000024402 Vsig1 (ENSJJAG00000023660) Mid2 (ENSJJAG00000013524) ENSJJAG00000019295 ENSJJAG00000007049 ENSJJAG00000002094 ##22 ENSJJAG00000012647 Frmpd3 (ENSJJAG00000010591) ENSJJAG00000024096 Nup62cl (ENSJJAG00000020606) Rbm41 (ENSJJAG00000010415) Morc4 (ENSJJAG00000023626) Cldn2 (ENSJJAG00000011051) ENSJJAG00000020964 Tbc1d8b (ENSJJAG00000011087) Rnf128 (ENSJJAG00000016014) ENSJJAG00000015393 Serpina7 (ENSJJAG00000024168) ENSJJAG00000005280 Il1rapl2 (ENSJJAG00000011451) ENSJJAG00000024026 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 3340 ENSMSIG00000020679 Htr2a (ENSMSIG00000020690) #9 Esd (ENSMSIG00000020709) #10 Lrch1 (ENSMSIG00000020905) #11 ENSMSIG00000021013 Rubcnl (ENSMSIG00000021027) #12 Lrrc63 (ENSMSIG00000021056) #13 Lcp1 (ENSMSIG00000021079) #14 Cpb2 (ENSMSIG00000021306) #15 Zc3h13 (ENSMSIG00000021317) #16 Siah3 (ENSMSIG00000021424) #17 Cby2 (ENSMSIG00000021441) #18 ENSMSIG00000021463 Cog3 (ENSMSIG00000021489) #20 ENSMSIG00000021594 #21 ENSMSIG00000021620 ##22 Gtf2f2 (ENSMSIG00000021660) #24 ENSMSIG00000021679 Kctd4 (ENSMSIG00000021688) #23 Gpalpp1 (ENSMSIG00000021703) Nufip1 (ENSMSIG00000021714) #26 Tsc22d1 (ENSMSIG00000021724) #27 ENSMSIG00000021792 #28 Lacc1 (ENSMSIG00000021816) #30 Ccdc122 (ENSMSIG00000021826) #31 Enox1 (ENSMSIG00000021850) #32 ENSMSIG00000021990 ENSMSIG00000022012 ENSMSIG00000022018 #33 Steppe mouse MODERN SPECIES 2488 Sgo1 (ENSMSIG00000027942) Kat2b (ENSMSIG00000027955) Pp2d1 (ENSMSIG00000027969) Rab5a (ENSMSIG00000027974) ENSMSIG00000027979 ##22 Efhb (ENSMSIG00000027980) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 21 KDM6A (ENSMMMG00000011674) DUSP21 (ENSMMMG00000011667) ENSMMMG00000011659 FUNDC1 (ENSMMMG00000011627) ENSMMMG00000011619 ENSMMMG00000011611 EFHC2 (ENSMMMG00000011586) NDP (ENSMMMG00000011581) MAOB (ENSMMMG00000011245) MAOA (ENSMMMG00000011225) ENSMMMG00000011202 GPR82 (ENSMMMG00000011172) GPR34 (ENSMMMG00000011165) CASK (ENSMMMG00000010916) ENSMMMG00000010906 ENSMMMG00000010902 ##22 DDX3X (ENSMMMG00000010865) USP9X (ENSMMMG00000010802) MED14 (ENSMMMG00000010703) MPC1L (ENSMMMG00000010695) ENSMMMG00000010690 ATP6AP2 (ENSMMMG00000010656) BCOR (ENSMMMG00000010519) TSPAN7 (ENSMMMG00000010451) ENSMMMG00000010431 OTC (ENSMMMG00000010392) ENSMMMG00000010133 SRPX (ENSMMMG00000010108) SYTL5 (ENSMMMG00000010054) ENSMMMG00000010049 DYNLT3 (ENSMMMG00000010004) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 13 ENSHGLG00000033433 ENSHGLG00000034843 ENSHGLG00000038321 ENSHGLG00000041675 ENSHGLG00000047825 ENSHGLG00000004866 ENSHGLG00000047118 LRRCC1 (ENSHGLG00000007603) ENSHGLG00000005836 ENSHGLG00000049225 CA13 (ENSHGLG00000010003) ENSHGLG00000043682 CA1 (ENSHGLG00000008038) CA3 (ENSHGLG00000034708) CA2 (ENSHGLG00000005638) ENSHGLG00000002610 ##22 PSKH2 (ENSHGLG00000005049) ATP6V0D2 (ENSHGLG00000014042) SLC7A13 (ENSHGLG00000013058) ENSHGLG00000021351 ENSHGLG00000016454 RMDN1 (ENSHGLG00000018375) ENSHGLG00000021216 ENSHGLG00000016017 CNGB3 (ENSHGLG00000018352) ENSHGLG00000015426 ENSHGLG00000030768 ENSHGLG00000010724 ENSHGLG00000032446 ENSHGLG00000034863 ENSHGLG00000046598 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 26 Azin2 (ENSHGLG00000012721) ENSHGLG00000041971 RNF19B (ENSHGLG00000013889) TMEM54 (ENSHGLG00000014726) HPCA (ENSHGLG00000016020) ENSHGLG00000050565 S100PBP (ENSHGLG00000011714) ENSHGLG00000013843 ENSHGLG00000034034 KIAA1522 (ENSHGLG00000012126) SYNC (ENSHGLG00000012338) RBBP4 (ENSHGLG00000011878) ENSHGLG00000042010 ZBTB8A (ENSHGLG00000011153) ZBTB8B (ENSHGLG00000010541) ENSHGLG00000020807 ##22 BSDC1 (ENSHGLG00000010987) TSSK3 (ENSHGLG00000011818) ENSHGLG00000011634 MARCKSL1 (ENSHGLG00000014902) ENSHGLG00000014849 ENSHGLG00000036290 LCK (ENSHGLG00000014704) FAM167B (ENSHGLG00000044305) EIF3I (ENSHGLG00000045598) TMEM234 (ENSHGLG00000011652) DCDC2B (ENSHGLG00000011118) ENSHGLG00000038406 CCDC28B (ENSHGLG00000012406) TXLNA (ENSHGLG00000011869) KPNA6 (ENSHGLG00000011028) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 1 CHIC2 (ENSHGLG00000016294) ENSHGLG00000037646 LNX1 (ENSHGLG00000017095) FIP1L1 (ENSHGLG00000018937) SCFD2 (ENSHGLG00000008861) ENSHGLG00000035001 RASL11B (ENSHGLG00000018686) ENSHGLG00000048480 USP46 (ENSHGLG00000018346) ENSHGLG00000015649 SPATA18 (ENSHGLG00000040259) ENSHGLG00000038499 ENSHGLG00000040271 ENSHGLG00000017366 ENSHGLG00000031874 ENSHGLG00000021184 ##22 CWH43 (ENSHGLG00000017904) ENSHGLG00000033110 ENSHGLG00000009214 OCIAD1 (ENSHGLG00000005766) ENSHGLG00000007948 ENSHGLG00000045336 ENSHGLG00000039998 SLC10A4 (ENSHGLG00000013563) ENSHGLG00000000325 SLAIN2 (ENSHGLG00000019447) ENSHGLG00000043919 ENSHGLG00000042797 TEC (ENSHGLG00000015780) ENSHGLG00000013808 NIPAL1 (ENSHGLG00000044376) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 3 ENSHGLG00000032079 OR13F1 (ENSHGLG00000005682) OR13C4 (ENSHGLG00000047893) OR13C3 (ENSHGLG00000020079) ENSHGLG00000049175 ENSHGLG00000004704 OR13D1 (ENSHGLG00000020669) ENSHGLG00000034042 ENSHGLG00000047217 ABCA1 (ENSHGLG00000011444) SLC44A1 (ENSHGLG00000005616) FSD1L (ENSHGLG00000009018) FKTN (ENSHGLG00000018225) TAL2 (ENSHGLG00000045987) TMEM38B (ENSHGLG00000046627) ENSHGLG00000035524 ##22 ZNF462 (ENSHGLG00000038476) ENSHGLG00000012147 RAD23B (ENSHGLG00000050281) ENSHGLG00000004266 ENSHGLG00000048617 ENSHGLG00000050898 ENSHGLG00000045183 ENSHGLG00000020431 ACTL7A (ENSHGLG00000020244) ELP1 (ENSHGLG00000005246) ABITRAM (ENSHGLG00000032426) CTNNAL1 (ENSHGLG00000017742) TMEM245 (ENSHGLG00000005520) FRRS1L (ENSHGLG00000005022) EPB41L4B (ENSHGLG00000013577) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Tarsier MODERN SPECIES 6532 ENSTSYG00000030205 ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Marmoset MODERN SPECIES 16 ENSCJAG00000070960 MCHR2 (ENSCJAG00000001474) SIM1 (ENSCJAG00000001495) ASCC3 (ENSCJAG00000001507) ENSCJAG00000001550 GRIK2 (ENSCJAG00000001552) ENSCJAG00000073079 ENSCJAG00000062395 HACE1 (ENSCJAG00000001597) LIN28B (ENSCJAG00000001671) BVES (ENSCJAG00000001683) POPDC3 (ENSCJAG00000001700) ENSCJAG00000071190 PREP (ENSCJAG00000001710) ENSCJAG00000074740 ENSCJAG00000085831 ##22 ATG5 (ENSCJAG00000006306) ENSCJAG00000079207 PRDM1 (ENSCJAG00000006332) ENSCJAG00000074624 CRYBG1 (ENSCJAG00000006246) ENSCJAG00000079990 RTN4IP1 (ENSCJAG00000006218) QRSL1 (ENSCJAG00000006200) ENSCJAG00000058620 ENSCJAG00000073856 MTRES1 (ENSCJAG00000046921) BEND3 (ENSCJAG00000039628) ENSCJAG00000080202 PDSS2 (ENSCJAG00000006153) ENSCJAG00000076519 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Capuchin MODERN SPECIES 122 PRM1 (ENSCCAG00000029651) ENSCCAG00000032488 ENSCCAG00000025130 LITAF (ENSCCAG00000026168) SNN (ENSCCAG00000014994) TXNDC11 (ENSCCAG00000036450) ZC3H7A (ENSCCAG00000030033) ENSCCAG00000025197 TNFRSF17 (ENSCCAG00000025396) ENSCCAG00000035152 ENSCCAG00000035229 SNX29 (ENSCCAG00000022522) SNRPD2 (ENSCCAG00000012011) CPPED1 (ENSCCAG00000027496) SHISA9 (ENSCCAG00000025895) ENSCCAG00000024487 ##22 ERCC4 (ENSCCAG00000033234) MRTFB (ENSCCAG00000036874) ENSCCAG00000023403 PARN (ENSCCAG00000030367) BFAR (ENSCCAG00000032273) PLA2G10 (ENSCCAG00000035143) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000158473 ENSGT00390000007046.b.a.a.x ENSGT00530000063408.A ENSGT00390000012818.o.a.a.a.a ENSGT00940000156778 ENSGT00510000048701 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00390000014904 ENSGT00940000162477 ENSGT01030000234595.A.b ENSGT00730000111123 ENSGT00950000183204.b.b.b ENSGT00390000010101 ENSGT00940000153467.a.a ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 ENSGT01050000244948.c.b ENSGT00390000013215 ENSGT00940000162004 ENSGT00940000161511 ENSGT00400000024448 ENSGT00390000002789 ENSGT00940000157628 ENSGT00910000147304 ENSGT00440000035378.d ENSGT00390000008481 ENSGT00390000000280 ENSGT00940000158696 ENSGT00960000186920 ENSGT00940000156512.b.b ENSGT00940000155621 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000158473 ENSGT00390000007046.b.a.a.x ENSGT00530000063408.A ENSGT00390000012818.o.a.a.a.a ENSGT00940000156778 ENSGT00510000048701 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00390000014904 ENSGT00940000162477 ENSGT01030000234595.A.b ENSGT00730000111123 ENSGT00950000183204.b.b.b ENSGT00390000010101 ENSGT00940000153467.a.a ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 ENSGT01050000244948.c.b ENSGT00390000013215 ENSGT00940000162004 ENSGT00940000161511 ENSGT00400000024448 ENSGT00390000002789 ENSGT00940000157628 ENSGT00910000147304 ENSGT00440000035378.d ENSGT00390000008481 ENSGT00390000000280 ENSGT00940000158696 ENSGT00940000156512.b.b ENSGT00940000155621 ENSGT00390000011342 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007046.b.a.a.x ENSGT00530000063408.A ENSGT00390000012818.o.a.a.a.a ENSGT00940000156778 ENSGT00510000048701 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00390000012351.p ENSGT00390000014904 ENSGT00940000162477 ENSGT01030000234595.A.b ENSGT00730000111123 ENSGT00950000183204.b.b.b ENSGT00390000010101 ENSGT00940000154668.ab.b ENSGT00940000153467.a.a ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 ENSGT01050000244948.c.b ENSGT00390000013215 ENSGT00940000162004 ENSGT00940000161511 ENSGT00400000024448 ENSGT00390000002789 ENSGT00940000157628 ENSGT00440000035378.d ENSGT00390000008481 ENSGT00390000000280 ENSGT00940000158696 ENSGT00940000156512.b.b ENSGT00940000155621 ENSGT00390000011342 ENSGT01090000260098.A Gorilla DUPLICATION Gorilla MODERN SPECIES 19 ENSGGOG00000039154 UST (ENSGGOG00000043927) ENSGGOG00000040431 SASH1 (ENSGGOG00000010058) ENSGGOG00000025705 STXBP5 (ENSGGOG00000016875) ENSGGOG00000042600 ADGB (ENSGGOG00000001069) ENSGGOG00000003558 GRM1 (ENSGGOG00000015005) SHPRH (ENSGGOG00000023119) FBXO30 (ENSGGOG00000005928) EPM2A (ENSGGOG00000041932) ENSGGOG00000024109 UTRN (ENSGGOG00000015290) ENSGGOG00000027434 ##22 ENSGGOG00000028369 ##22 STX11 (ENSGGOG00000011132) SF3B5 (ENSGGOG00000001537) PLAGL1 (ENSGGOG00000016889) ZC2HC1B (ENSGGOG00000027716) ENSGGOG00000023002 LTV1 (ENSGGOG00000027901) ENSGGOG00000037298 ENSGGOG00000041769 PHACTR2 (ENSGGOG00000001050) ENSGGOG00000011262 PEX3 (ENSGGOG00000016184) ADAT2 (ENSGGOG00000016178) AIG1 (ENSGGOG00000003361) HIVEP2 (ENSGGOG00000016466) Gorilla MODERN SPECIES 19 UST (ENSGGOG00000043927) ENSGGOG00000040431 SASH1 (ENSGGOG00000010058) ENSGGOG00000025705 STXBP5 (ENSGGOG00000016875) ENSGGOG00000042600 ADGB (ENSGGOG00000001069) ENSGGOG00000003558 GRM1 (ENSGGOG00000015005) SHPRH (ENSGGOG00000023119) FBXO30 (ENSGGOG00000005928) EPM2A (ENSGGOG00000041932) ENSGGOG00000024109 UTRN (ENSGGOG00000015290) ENSGGOG00000027434 ##22 ENSGGOG00000028369 ##22 STX11 (ENSGGOG00000011132) SF3B5 (ENSGGOG00000001537) PLAGL1 (ENSGGOG00000016889) ZC2HC1B (ENSGGOG00000027716) ENSGGOG00000023002 LTV1 (ENSGGOG00000027901) ENSGGOG00000037298 ENSGGOG00000041769 PHACTR2 (ENSGGOG00000001050) ENSGGOG00000011262 PEX3 (ENSGGOG00000016184) ADAT2 (ENSGGOG00000016178) AIG1 (ENSGGOG00000003361) HIVEP2 (ENSGGOG00000016466) ADGRG6 (ENSGGOG00000002626) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007046.b.a.a.x ENSGT00530000063408.A ENSGT00390000012818.o.a.a.a.a ENSGT00940000156778 ENSGT00510000048701 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00390000012351.p ENSGT00390000014904 ENSGT00940000162477 ENSGT01030000234595.A.b ENSGT00730000111123 ENSGT00950000183204.b.b.b ENSGT00390000010101 ENSGT00940000154668.ab.b ENSGT00940000153467.a.a ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 ENSGT01050000244948.c.b ENSGT00390000013215 ENSGT00940000162004 ENSGT00940000161511 ENSGT00400000024448 ENSGT00390000002789 ENSGT00940000157628 ENSGT00440000035378.d ENSGT00390000008481 ENSGT00390000000280 ENSGT00940000158696 ENSGT00940000156512.b.b ENSGT00940000155621 ENSGT00390000011342 ENSGT01090000260098.A Pan ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007046.b.a.a.x ENSGT00530000063408.A ENSGT00390000012818.o.a.a.a.a ENSGT00940000156778 ENSGT00510000048701 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00390000012351.p ENSGT00390000014904 ENSGT00940000162477 ENSGT01030000234595.A.b ENSGT00730000111123 ENSGT00950000183204.b.b.b ENSGT00390000010101 ENSGT00940000154668.ab.b ENSGT00940000153467.a.a ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 ENSGT01050000244948.c.b ENSGT00390000013215 ENSGT00940000162004 ENSGT00940000161511 ENSGT00400000024448 ENSGT00390000002789 ENSGT00940000157628 ENSGT00910000148719 ENSGT00440000035378.d ENSGT00390000008481 ENSGT00390000000280 ENSGT00940000158696 ENSGT00940000156512.b.b ENSGT00940000155621 ENSGT00390000011342 Chimpanzee MODERN SPECIES 19 UST (ENSPTRG00000018689) ENSPTRG00000051412 SASH1 (ENSPTRG00000018688) SAMD5 (ENSPTRG00000029379) STXBP5 (ENSPTRG00000018687) ENSPTRG00000046391 ENSPTRG00000042108 ADGB (ENSPTRG00000018686) RAB32 (ENSPTRG00000018685) GRM1 (ENSPTRG00000018684) SHPRH (ENSPTRG00000018683) FBXO30 (ENSPTRG00000018682) EPM2A (ENSPTRG00000018681) ENSPTRG00000052013 UTRN (ENSPTRG00000018680) ENSPTRG00000048343 ##22 STX11 (ENSPTRG00000052377) SF3B5 (ENSPTRG00000018676) PLAGL1 (ENSPTRG00000018675) ZC2HC1B (ENSPTRG00000018674) ENSPTRG00000044606 LTV1 (ENSPTRG00000018673) ENSPTRG00000047677 PHACTR2 (ENSPTRG00000018672) FUCA2 (ENSPTRG00000018671) PEX3 (ENSPTRG00000018670) ADAT2 (ENSPTRG00000018669) AIG1 (ENSPTRG00000018666) HIVEP2 (ENSPTRG00000018665) ADGRG6 (ENSPTRG00000018663) VTA1 (ENSPTRG00000018662) Bonobo MODERN SPECIES 19 ZC3H12D (ENSPPAG00000041304) TAB2 (ENSPPAG00000030235) ENSPPAG00000028432 UST (ENSPPAG00000027785) SASH1 (ENSPPAG00000029791) STXBP5 (ENSPPAG00000033851) ENSPPAG00000028369 ADGB (ENSPPAG00000031064) RAB32 (ENSPPAG00000028297) GRM1 (ENSPPAG00000042992) SHPRH (ENSPPAG00000031038) FBXO30 (ENSPPAG00000041370) ENSPPAG00000040864 ENSPPAG00000038106 UTRN (ENSPPAG00000001385) ENSPPAG00000028739 ##22 STX11 (ENSPPAG00000001921) ENSPPAG00000033447 SF3B5 (ENSPPAG00000012940) PLAGL1 (ENSPPAG00000039736) ZC2HC1B (ENSPPAG00000035140) ENSPPAG00000039717 LTV1 (ENSPPAG00000015213) PHACTR2 (ENSPPAG00000040531) ENSPPAG00000041752 FUCA2 (ENSPPAG00000037381) PEX3 (ENSPPAG00000028165) ADAT2 (ENSPPAG00000033931) AIG1 (ENSPPAG00000028952) HIVEP2 (ENSPPAG00000043727) ADGRG6 (ENSPPAG00000029546) Gibbon MODERN SPECIES 18 ENSNLEG00000029172 TAB2 (ENSNLEG00000015304) ENSNLEG00000035419 UST (ENSNLEG00000015303) SASH1 (ENSNLEG00000015293) SAMD5 (ENSNLEG00000019308) ENSNLEG00000028952 STXBP5 (ENSNLEG00000015270) ADGB (ENSNLEG00000015247) ENSNLEG00000032453 GRM1 (ENSNLEG00000015230) SHPRH (ENSNLEG00000015208) FBXO30 (ENSNLEG00000015206) EPM2A (ENSNLEG00000015203) UTRN (ENSNLEG00000015156) ENSNLEG00000036103 ##22 STX11 (ENSNLEG00000015154) SF3B5 (ENSNLEG00000019307) PLAGL1 (ENSNLEG00000015144) ZC2HC1B (ENSNLEG00000015138) ENSNLEG00000032026 LTV1 (ENSNLEG00000015128) PHACTR2 (ENSNLEG00000015105) FUCA2 (ENSNLEG00000015089) PEX3 (ENSNLEG00000015077) ADAT2 (ENSNLEG00000015075) ENSNLEG00000015073 ENSNLEG00000032448 HIVEP2 (ENSNLEG00000015066) ADGRG6 (ENSNLEG00000015064) VTA1 (ENSNLEG00000015053) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 979 ENSGT00940000153467.a.a ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1454 ENSRBIG00000021097 ENSRBIG00000031117 ENSRBIG00000038241 ENSRBIG00000043481 ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 703 ENSRROG00000037601 ENSRROG00000034678 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158821 ENSGT00390000016548 ENSGT00940000155446 ENSGT01000000215577 ENSGT00940000155152 ENSGT00390000008856.j ENSGT00550000075080 ENSGT00560000077332 ENSGT00940000154967.b ENSGT00940000154386.ob.c.a ENSGT00940000154386.ob.d ENSGT00940000163274.c.b ENSGT00940000163274.d ENSGT00910000148101 ENSGT00940000158746 ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 ENSGT00940000155117.f.a ENSGT00390000001114 ENSGT00940000162420 ENSGT00390000006200 ENSGT00940000155195 ENSGT00940000157937 ENSGT00940000158520 ENSGT00940000157316 ENSGT00940000161004 ENSGT00940000161034 ENSGT01030000239475 ENSGT00940000156099 ENSGT00550000074912.i.a ENSGT00960000186989 ENSGT00900000141074.e.a.b.a.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 113 ENSMNEG00000037503 ENSMNEG00000040457 DENND1B (ENSMNEG00000039471) ENSMNEG00000039736 CRB1 (ENSMNEG00000043019) ENSMNEG00000039017 ZBTB41 (ENSMNEG00000042671) ASPM (ENSMNEG00000041245) F13B (ENSMNEG00000029958) CFHR5 (ENSMNEG00000030178) CFHR4 (ENSMNEG00000014337) ENSMNEG00000044461 CFH (ENSMNEG00000041848) ENSMNEG00000034751 KCNT2 (ENSMNEG00000032893) ENSMNEG00000003651 ##22 B3GALT2 (ENSMNEG00000001938) CDC73 (ENSMNEG00000037129) GLRX2 (ENSMNEG00000041663) RO60 (ENSMNEG00000039348) UCHL5 (ENSMNEG00000039813) RGS2 (ENSMNEG00000033424) RGS13 (ENSMNEG00000040797) RGS1 (ENSMNEG00000037986) RGS21 (ENSMNEG00000037603) RGS18 (ENSMNEG00000037597) ENSMNEG00000028364 BRINP3 (ENSMNEG00000037397) ENSMNEG00000041184 ENSMNEG00000037337 ENSMNEG00000042193 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159457 ENSGT00940000160882 ENSGT00940000156725 ENSGT00940000158821 ENSGT00390000016548 ENSGT00940000155446 ENSGT00940000155152 ENSGT00940000176164 ENSGT00550000075080 ENSGT00560000077332 ENSGT00940000154967.b ENSGT00940000154386.ob.c.a ENSGT00940000154386.ob.d ENSGT00940000163274.d ENSGT00940000158746 ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 ENSGT00940000155117.f.a ENSGT00390000001114 ENSGT00940000162420 ENSGT00390000006200 ENSGT00940000155195 ENSGT00940000157937 ENSGT00940000158520 ENSGT00940000157316 ENSGT00940000161004 ENSGT00940000161034 ENSGT00940000156099 ENSGT01030000234606.b ENSGT00390000010743.a ENSGT00940000156236 ENSGT00390000012568 Rhesus MODERN SPECIES NR5A2 (ENSMMUG00000016188) PTPRC (ENSMMUG00000000009) ATP6V1G3 (ENSMMUG00000011992) NEK7 (ENSMMUG00000021649) LHX9 (ENSMMUG00000012259) C1H1orf53 (ENSMMUG00000060620) DENND1B (ENSMMUG00000013962) CRB1 (ENSMMUG00000012322) ENSMMUG00000055405 ZBTB41 (ENSMMUG00000058395) ASPM (ENSMMUG00000000245) F13B (ENSMMUG00000000244) CFHR5 (ENSMMUG00000000243) CFH (ENSMMUG00000045497) KCNT2 (ENSMMUG00000021082) ENSMMUG00000056654 ##22 B3GALT2 (ENSMMUG00000022648) CDC73 (ENSMMUG00000022647) GLRX2 (ENSMMUG00000022645) ENSMMUG00000065201 RO60 (ENSMMUG00000022643) UCHL5 (ENSMMUG00000022641) RGS2 (ENSMMUG00000049590) RGS13 (ENSMMUG00000059086) RGS1 (ENSMMUG00000003486) RGS21 (ENSMMUG00000052426) RGS18 (ENSMMUG00000013995) BRINP3 (ENSMMUG00000010110) ENSMMUG00000059986 ENSMMUG00000055981 PLA2G4A (ENSMMUG00000021423) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 Olive baboon MODERN SPECIES NEK7 (ENSPANG00000015264) LHX9 (ENSPANG00000021346) C1orf53 (ENSPANG00000025040) DENND1B (ENSPANG00000010604) CRB1 (ENSPANG00000006812) ENSPANG00000043489 ZBTB41 (ENSPANG00000012545) ASPM (ENSPANG00000018539) F13B (ENSPANG00000021908) CFHR5 (ENSPANG00000012829) CFH (ENSPANG00000012544) KCNT2 (ENSPANG00000006548) ENSPANG00000048972 ENSPANG00000039696 ENSPANG00000037027 ENSPANG00000004629 ##22 ENSPANG00000041853 ENSPANG00000039937 ENSPANG00000033273 ENSPANG00000044682 CDC73 (ENSPANG00000003571) B3GALT2 (ENSPANG00000017876) GLRX2 (ENSPANG00000033373) RO60 (ENSPANG00000000341) UCHL5 (ENSPANG00000021345) RGS2 (ENSPANG00000020299) RGS13 (ENSPANG00000038097) RGS1 (ENSPANG00000047099) RGS21 (ENSPANG00000044445) RGS18 (ENSPANG00000044600) ENSPANG00000040742 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000157044.i.b ENSGT00390000001752.ab.b ENSGT00940000157044.i.a.a ENSGT01100000263507.D.a.b.a.b ENSGT00940000157044.j ENSGT00390000001752.`b ENSGT00950000183122.B ENSGT00390000014189 ENSGT00390000006030.d.a.b ENSGT00940000154540.a.b ENSGT00940000161327 ENSGT00390000006051.a.a.i ##22 ENSGT00940000154540.a.a ENSGT00940000153883.b ENSGT00390000008135 ENSGT00510000047059.l ENSGT00940000159212.a ENSGT00940000156014 ENSGT00940000154823 ENSGT00390000006208.a ENSGT00940000157317 ENSGT00940000162266 ENSGT00940000160014 ENSGT00910000147828 ENSGT00940000160349 ENSGT00940000159414 ENSGT00910000147424 Drill MODERN SPECIES 1099 ENSMLEG00000032097 GUSB (ENSMLEG00000030233) ENSMLEG00000027273 ENSMLEG00000030639 ASL (ENSMLEG00000041353) CRCP 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Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 17 LRRC63 (ENSCJAG00000016849) #13 LCP1 (ENSCJAG00000016813) #14 CPB2 (ENSCJAG00000016797) #15 ZC3H13 (ENSCJAG00000016756) #16 SIAH3 (ENSCJAG00000023214) #17 CBY2 (ENSCJAG00000042308) #18 ERICH6B (ENSCJAG00000073347) #19 COG3 (ENSCJAG00000019251) #20 SLC25A30 (ENSCJAG00000043939) #21 ENSCJAG00000080500 ENSCJAG00000019229 ##22 KCTD4 (ENSCJAG00000056150) #23 GTF2F2 (ENSCJAG00000019220) #24 GPALPP1 (ENSCJAG00000019204) #25 NUFIP1 (ENSCJAG00000019195) #26 ENSCJAG00000070699 ENSCJAG00000072132 TSC22D1 (ENSCJAG00000019808) #27 ENSCJAG00000078472 SERP2 (ENSCJAG00000075831) #28 SMIM2 (ENSCJAG00000017548) #29 LACC1 (ENSCJAG00000017549) #30 CCDC122 (ENSCJAG00000017551) #31 ENOX1 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#28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00940000158106 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1344 NEK3 (ENSPSMG00000008976) CKAP2 (ENSPSMG00000008991) VPS36 (ENSPSMG00000009017) THSD1 (ENSPSMG00000009046) ESD (ENSPSMG00000009079) #10 LRCH1 (ENSPSMG00000009147) #11 RUBCNL (ENSPSMG00000009198) #12 LRRC63 (ENSPSMG00000009229) #13 LCP1 (ENSPSMG00000009256) #14 CPB2 (ENSPSMG00000009268) #15 ZC3H13 (ENSPSMG00000009290) #16 SIAH3 (ENSPSMG00000009299) #17 CBY2 (ENSPSMG00000009306) #18 COG3 (ENSPSMG00000009350) #20 SLC25A30 (ENSPSMG00000009362) #21 ENSPSMG00000009392 ##22 GTF2F2 (ENSPSMG00000009413) #24 KCTD4 (ENSPSMG00000009417) #23 ENSPSMG00000009433 NUFIP1 (ENSPSMG00000009451) #26 TSC22D1 (ENSPSMG00000009498) #27 SERP2 (ENSPSMG00000009504) #28 Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka 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Coquerels sifaka MODERN SPECIES 350 EMX1 (ENSPCOG00000021905) SPR (ENSPCOG00000007624) EXOC6B (ENSPCOG00000014201) CYP26B1 (ENSPCOG00000014259) DYSF (ENSPCOG00000023137) ZNF638 (ENSPCOG00000015676) PAIP2B (ENSPCOG00000014555) NAGK (ENSPCOG00000016475) TEX261 (ENSPCOG00000014930) ANKRD53 (ENSPCOG00000015426) ATP6V1B1 (ENSPCOG00000017795) VAX2 (ENSPCOG00000027713) CD207 (ENSPCOG00000008642) FIGLA (ENSPCOG00000020922) ADD2 (ENSPCOG00000026789) ENSPCOG00000013177 ##22 ENSPCOG00000021128 TGFA (ENSPCOG00000014954) ENSPCOG00000018627 TIA1 (ENSPCOG00000013271) ENSPCOG00000009015 ENSPCOG00000015318 ENSPCOG00000020248 ENSPCOG00000022334 C2orf42 (ENSPCOG00000008592) PCBP1 (ENSPCOG00000026934) ASPRV1 (ENSPCOG00000026539) MXD1 (ENSPCOG00000024341) ENSPCOG00000028451 ENSPCOG00000028524 ANXA4 (ENSPCOG00000019715) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Rodentia DUPLICATION Rodentia DUPLICATION Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b.e.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b.e.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b.e.a ##22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 2 HTR2A (ENSHGLG00000041937) #9 ENSHGLG00000002764 #10 LRCH1 (ENSHGLG00000003678) #11 ENSHGLG00000005637 RUBCNL (ENSHGLG00000043639) #12 ENSHGLG00000043742 #13 LCP1 (ENSHGLG00000002813) #14 CPB2 (ENSHGLG00000003312) #15 ZC3H13 (ENSHGLG00000006309) #16 SIAH3 (ENSHGLG00000008529) #17 CBY2 (ENSHGLG00000009737) #18 ENSHGLG00000002801 #20 ENSHGLG00000043699 ENSHGLG00000003289 #21 ENSHGLG00000003878 ENSHGLG00000005278 ##22 ENSHGLG00000007884 #24 KCTD4 (ENSHGLG00000008886) #23 ENSHGLG00000041102 NUFIP1 (ENSHGLG00000046882) #26 TSC22D1 (ENSHGLG00000009007) #27 ENSHGLG00000038690 ENSHGLG00000048136 SERP2 (ENSHGLG00000018907) #28 ENSHGLG00000045625 LACC1 (ENSHGLG00000019316) #30 CCDC122 (ENSHGLG00000016595) #31 ENOX1 (ENSHGLG00000013344) #32 ENSHGLG00000037702 DNAJC15 (ENSHGLG00000005490) #33 ENSHGLG00000007301 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 24 ENSHGLG00000002065 ENSHGLG00000001355 ACAD8 (ENSHGLG00000001428) ENSHGLG00000049167 NCAPD3 (ENSHGLG00000002731) ENSHGLG00000001260 JAM3 (ENSHGLG00000033528) IGSF9B (ENSHGLG00000003593) ENSHGLG00000043160 SPATA19 (ENSHGLG00000002136) OPCML (ENSHGLG00000003009) NTM (ENSHGLG00000001943) ENSHGLG00000047098 ENSHGLG00000047810 SNX19 (ENSHGLG00000001442) ENSHGLG00000046892 ##22 ENSHGLG00000008009 ADAMTS15 (ENSHGLG00000007880) ADAMTS8 (ENSHGLG00000014104) ZBTB44 (ENSHGLG00000002173) ST14 (ENSHGLG00000003891) APLP2 (ENSHGLG00000000778) ENSHGLG00000039165 ENSHGLG00000039419 PRDM10 (ENSHGLG00000001106) NFRKB (ENSHGLG00000001116) TMEM45B (ENSHGLG00000043546) ENSHGLG00000019753 BARX2 (ENSHGLG00000001919) ENSHGLG00000036717 ARHGAP32 (ENSHGLG00000001433) Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 17 TMEM140 (ENSHGLG00000043264) CYREN (ENSHGLG00000049991) WDR91 (ENSHGLG00000004516) STRA8 (ENSHGLG00000005005) ENSHGLG00000006398 CNOT4 (ENSHGLG00000011533) NUP205 (ENSHGLG00000016088) STMP1 (ENSHGLG00000046204) SLC13A4 (ENSHGLG00000004963) FAM180A (ENSHGLG00000005791) MTPN (ENSHGLG00000042267) ENSHGLG00000035315 ENSHGLG00000037486 ENSHGLG00000008188 CHRM2 (ENSHGLG00000009212) ENSHGLG00000009445 ##22 ENSHGLG00000010704 PTN (ENSHGLG00000035687) DGKI (ENSHGLG00000012937) CREB3L2 (ENSHGLG00000018828) AKR1D1 (ENSHGLG00000014279) ENSHGLG00000043652 TRIM24 (ENSHGLG00000005195) SVOPL (ENSHGLG00000005360) ATP6V0A4 (ENSHGLG00000006131) KIAA1549 (ENSHGLG00000009787) ENSHGLG00000005299 ZC3HAV1 (ENSHGLG00000006700) TTC26 (ENSHGLG00000009066) ENSHGLG00000047005 UBN2 (ENSHGLG00000005428) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 4 CDK1 (ENSHGLG00000032747) RHOBTB1 (ENSHGLG00000003590) TMEM26 (ENSHGLG00000034884) CABCOCO1 (ENSHGLG00000006002) ENSHGLG00000041127 ARID5B (ENSHGLG00000004939) ENSHGLG00000003838 ENSHGLG00000000372 ENSHGLG00000003191 ENSHGLG00000017102 ENSHGLG00000017121 ENSHGLG00000049656 ENSHGLG00000037220 ENSHGLG00000016644 ENSHGLG00000019280 ENSHGLG00000016681 ##22 PBLD (ENSHGLG00000011042) HNRNPH3 (ENSHGLG00000011321) RUFY2 (ENSHGLG00000011743) DNA2 (ENSHGLG00000012094) SLC25A16 (ENSHGLG00000034726) ENSHGLG00000036289 CCAR1 (ENSHGLG00000012835) ENSHGLG00000037043 STOX1 (ENSHGLG00000013313) DDX50 (ENSHGLG00000013466) DDX21 (ENSHGLG00000038462) ENSHGLG00000033477 ENSHGLG00000043847 ENSHGLG00000014362 ZNF365 (ENSHGLG00000044328) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 4 MGMT (ENSHGLG00000014053) ENSHGLG00000039917 ENSHGLG00000021135 ENSHGLG00000046544 PTPRE (ENSHGLG00000015895) CLRN3 (ENSHGLG00000010190) FOXI2 (ENSHGLG00000010615) NPS (ENSHGLG00000011458) ENSHGLG00000046538 ENSHGLG00000017202 ENSHGLG00000015801 ENSHGLG00000043292 ENSHGLG00000017225 ENSHGLG00000004128 ADAM12 (ENSHGLG00000014915) ENSHGLG00000043454 ##22 FANK1 (ENSHGLG00000009806) DHX32 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(ENSHGLG00000003387) TMEM154 (ENSHGLG00000049888) TIGD4 (ENSHGLG00000040305) ARFIP1 (ENSHGLG00000033720) FHDC1 (ENSHGLG00000001200) ENSHGLG00000001732 ##22 TRIM2 (ENSHGLG00000003722) ENSHGLG00000000557 TMEM131L (ENSHGLG00000000627) ENSHGLG00000041578 RNF175 (ENSHGLG00000002735) SFRP2 (ENSHGLG00000000424) ENSHGLG00000000590 ENSHGLG00000036366 ENSHGLG00000002366 ENSHGLG00000010456 ENSHGLG00000000766 ENSHGLG00000033933 ENSHGLG00000002060 ENSHGLG00000050054 ENSHGLG00000046367 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b.e.b ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 345 Dusp10 (ENSDORG00000010908) ENSDORG00000003656 ENSDORG00000027102 Hhipl2 (ENSDORG00000029474) Taf1a (ENSDORG00000016042) ENSDORG00000000970 Aida (ENSDORG00000000982) Brox (ENSDORG00000024726) Disp1 (ENSDORG00000001710) Tlr5 (ENSDORG00000027996) Susd4 (ENSDORG00000012702) ENSDORG00000012704 Capn8 (ENSDORG00000012143) Capn2 (ENSDORG00000013919) Trp53bp2 (ENSDORG00000013922) ENSDORG00000024350 ##22 ENSDORG00000024805 ENSDORG00000004350 Fcgr1 (ENSDORG00000016350) H2bc18 (ENSDORG00000028945) ENSDORG00000029688 ENSDORG00000028205 ENSDORG00000025650 ENSDORG00000028881 ENSDORG00000028335 H2ac20 (ENSDORG00000024205) H2ac21 (ENSDORG00000024245) Bola1 (ENSDORG00000016364) Sv2a (ENSDORG00000016365) Sf3b4 (ENSDORG00000016366) Mtmr11 (ENSDORG00000016368) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b.f ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b.f ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 372 ENSDORG00000006362 Nfib (ENSDORG00000004277) Zdhhc21 (ENSDORG00000026832) Cer1 (ENSDORG00000014454) ENSDORG00000023435 Frem1 (ENSDORG00000014455) Ttc39b (ENSDORG00000014589) ENSDORG00000024125 ENSDORG00000004905 Psip1 (ENSDORG00000004907) Ccdc171 (ENSDORG00000005630) Bnc2 (ENSDORG00000008840) ENSDORG00000028767 Sh3gl2 (ENSDORG00000000622) ENSDORG00000027313 ##22 ENSDORG00000024977 ENSDORG00000025399 Saxo1 (ENSDORG00000026559) Haus6 (ENSDORG00000026577) ENSDORG00000014197 Dennd4c (ENSDORG00000012055) ENSDORG00000012057 Acer2 (ENSDORG00000002403) Slc24a2 (ENSDORG00000015412) ENSDORG00000027266 ENSDORG00000028514 Focad (ENSDORG00000006921) Hacd4 (ENSDORG00000006925) Klhl9 (ENSDORG00000028408) Mtap (ENSDORG00000012074) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.b.f ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT01060000249039 ENSGT00940000166021 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.b.f ##22 ENSGT00390000016051.u.b #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT00940000154415.`b.f ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.b.f ##22 ENSGT00390000016051.u.b #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00940000158106 ENSGT00390000006601 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 219 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.b.f ##22 ENSGT00390000016051.u.b #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT01060000249039 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 515 SIAH3 (ENSUPAG00010007260) #17 CBY2 (ENSUPAG00010007270) #18 COG3 (ENSUPAG00010007301) #20 SLC25A30 (ENSUPAG00010007378) #21 ENSUPAG00010007395 ENSUPAG00010007406 ENSUPAG00010007415 ##22 ENSUPAG00010007438 #24 KCTD4 (ENSUPAG00010007442) #23 ENSUPAG00010007460 NUFIP1 (ENSUPAG00010007465) #26 Hystricomorpha DUPLICATION Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000003338 #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864.y #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.b.f.a ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000166021 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b.f.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000155175.A ENSGT00940000156877 ENSGT00950000183174.B.b ENSGT00390000011709 ENSGT00390000006601 ENSGT00940000158106 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.b.f.a ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT01060000249039 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 337 ENSODEG00000018539 ##22 ANKRD60 (ENSODEG00000000066) RAB22A (ENSODEG00000000054) ENSODEG00000018508 VAPB (ENSODEG00000000035) STX16 (ENSODEG00000000389) NPEPL1 (ENSODEG00000000364) ENSODEG00000018581 ENSODEG00000000331 ENSODEG00000000317 ENSODEG00000000305 ENSODEG00000000250 ENSODEG00000000198 TUBB1 (ENSODEG00000000178) ATP5F1E (ENSODEG00000000169) ENSODEG00000000152 Degu MODERN SPECIES 94 NR1I2 (ENSODEG00000005572) ENSODEG00000004782 CFAP91 (ENSODEG00000005123) ENSODEG00000006002 POPDC2 (ENSODEG00000005758) PLA1A (ENSODEG00000005508) ADPRH (ENSODEG00000004755) TIMMDC1 (ENSODEG00000005407) POGLUT1 (ENSODEG00000005210) TMEM39A (ENSODEG00000004969) ARHGAP31 (ENSODEG00000004451) B4GALT4 (ENSODEG00000005576) UPK1B (ENSODEG00000005396) IGSF11 (ENSODEG00000008011) LSAMP (ENSODEG00000007426) ENSODEG00000019068 ##22 GAP43 (ENSODEG00000004475) ZBTB20 (ENSODEG00000004778) TIGIT (ENSODEG00000004692) DRD3 (ENSODEG00000005699) ENSODEG00000019158 ENSODEG00000005189 CCDC191 (ENSODEG00000006457) ZDHHC23 (ENSODEG00000005099) GRAMD1C (ENSODEG00000005444) ENSODEG00000005346 ENSODEG00000004989 ENSODEG00000004858 ENSODEG00000006125 SIDT1 (ENSODEG00000005906) ENSODEG00000005660 Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 163 RGCC (ENSODEG00000005723) VWA8 (ENSODEG00000006290) ENSODEG00000005696 ENSODEG00000019364 ENSODEG00000019318 ENSODEG00000006776 DGKH (ENSODEG00000006365) AKAP11 (ENSODEG00000006558) #37 ENSODEG00000007562 #14 CPB2 (ENSODEG00000005426) #15 ZC3H13 (ENSODEG00000005178) #16 SIAH3 (ENSODEG00000006861) #17 CBY2 (ENSODEG00000007190) #18 COG3 (ENSODEG00000006373) #20 SLC25A30 (ENSODEG00000005522) #21 ENSODEG00000005658 ##22 GTF2F2 (ENSODEG00000006595) #24 KCTD4 (ENSODEG00000019362) #23 ENSODEG00000006647 ENSODEG00000005907 ENSODEG00000006393 NUFIP1 (ENSODEG00000006473) #26 ENSODEG00000005705 ENSODEG00000006384 SERP2 (ENSODEG00000007267) #28 ENSODEG00000005627 LACC1 (ENSODEG00000005776) #30 CCDC122 (ENSODEG00000005141) #31 ENOX1 (ENSODEG00000005302) #32 ENSODEG00000019241 ENSODEG00000006181 #33 Degu MODERN SPECIES 486 ENSODEG00000018612 ##22 ENSODEG00000000566 Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 56 ENSODEG00000006445 ETV1 (ENSODEG00000009379) ENSODEG00000019257 DGKB (ENSODEG00000006018) MEOX2 (ENSODEG00000006924) CRPPA (ENSODEG00000007022) ENSODEG00000005934 SOSTDC1 (ENSODEG00000005958) LRRC72 (ENSODEG00000006632) ANKMY2 (ENSODEG00000008716) BZW2 (ENSODEG00000007505) ENSODEG00000007541 AGR2 (ENSODEG00000006586) ENSODEG00000008143 AHR (ENSODEG00000006823) ENSODEG00000019583 ##22 SNX13 (ENSODEG00000007084) ENSODEG00000007366 PRPS1L1 (ENSODEG00000019429) ENSODEG00000007765 TWIST1 (ENSODEG00000008450) FERD3L (ENSODEG00000019445) POLR1F (ENSODEG00000007222) ENSODEG00000006740 MACC1 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SPECIES 228 TRAT1 (ENSODEG00000005139) DZIP3 (ENSODEG00000004949) CIP2A (ENSODEG00000004774) MYH15 (ENSODEG00000004613) ENSODEG00000005470 ENSODEG00000019189 IFT57 (ENSODEG00000005424) ENSODEG00000005329 BBX (ENSODEG00000005151) ENSODEG00000019157 ENSODEG00000005074 ENSODEG00000005023 ENSODEG00000005010 ENSODEG00000019090 ##22 CBLB (ENSODEG00000005613) ALCAM (ENSODEG00000005450) Degu MODERN SPECIES 174 CHRM3 (ENSODEG00000018767) ENSODEG00000001479 DIP2C (ENSODEG00000001215) LARP4B (ENSODEG00000001109) ENSODEG00000000996 ENSODEG00000000962 ENSODEG00000018642 IDI1 (ENSODEG00000000876) ENSODEG00000018637 WDR37 (ENSODEG00000000667) ADARB2 (ENSODEG00000000345) PFKP (ENSODEG00000001414) PITRM1 (ENSODEG00000001019) ENSODEG00000018627 ##22 ENSODEG00000000895 ENSODEG00000001314 UPF2 (ENSODEG00000001290) PROSER2 (ENSODEG00000001252) ECHDC3 (ENSODEG00000001170) USP6NL (ENSODEG00000001090) ENSODEG00000001039 CELF2 (ENSODEG00000000887) Degu MODERN SPECIES 328 ENSODEG00000004697 ENSODEG00000004775 ENSODEG00000004768 ##22 METTL7B (ENSODEG00000004695) ITGA7 (ENSODEG00000004568) ENSODEG00000004837 CD63 (ENSODEG00000004741) ENSODEG00000004712 GDF11 (ENSODEG00000004691) ENSODEG00000004608 ENSODEG00000004596 DNAJC14 (ENSODEG00000004548) ENSODEG00000004534 MMP19 (ENSODEG00000004495) PYM1 (ENSODEG00000004289) DGKA (ENSODEG00000004252) PMEL (ENSODEG00000004214) CDK2 (ENSODEG00000003907) Degu MODERN SPECIES 130 ENSODEG00000009039 MLPH (ENSODEG00000009468) PRLH (ENSODEG00000010289) ENSODEG00000010103 ENSODEG00000011179 RBM44 (ENSODEG00000011354) ENSODEG00000009348 ENSODEG00000008602 SCLY (ENSODEG00000009146) ESPNL (ENSODEG00000008795) KLHL30 (ENSODEG00000010555) ERFE (ENSODEG00000009273) ILKAP (ENSODEG00000009636) HES6 (ENSODEG00000009169) PER2 (ENSODEG00000008617) ENSODEG00000019644 ##22 TRAF3IP1 (ENSODEG00000009879) ASB1 (ENSODEG00000009233) TWIST2 (ENSODEG00000019629) ENSODEG00000009580 ENSODEG00000009986 ENSODEG00000019773 ENSODEG00000008649 OTOS (ENSODEG00000009723) ENSODEG00000019717 ENSODEG00000019706 GPC1 (ENSODEG00000010463) ANKMY1 (ENSODEG00000012472) DUSP28 (ENSODEG00000008939) RNPEPL1 (ENSODEG00000009147) CAPN10 (ENSODEG00000008893) Degu MODERN SPECIES 156 ENSODEG00000018993 ENSODEG00000018991 ENSODEG00000004125 ENSODEG00000004144 ENSODEG00000019143 SLC33A1 (ENSODEG00000004913) GMPS (ENSODEG00000005062) ENSODEG00000005195 ENSODEG00000005266 ENSODEG00000006147 KCNAB1 (ENSODEG00000006185) SSR3 (ENSODEG00000006236) TIPARP (ENSODEG00000003454) ENSODEG00000003611 CCNL1 (ENSODEG00000003645) ENSODEG00000019034 ##22 ENSODEG00000003686 VEPH1 (ENSODEG00000003728) PTX3 (ENSODEG00000003883) SHOX2 (ENSODEG00000003934) RSRC1 (ENSODEG00000003974) MLF1 (ENSODEG00000004264) ENSODEG00000004275 GFM1 (ENSODEG00000004316) LXN (ENSODEG00000004470) RARRES1 (ENSODEG00000004496) ENSODEG00000003386 MFSD1 (ENSODEG00000003463) ENSODEG00000003705 ENSODEG00000003766 ENSODEG00000003786 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 112 SLC25A3 (ENSCLAG00000007243) TMPO (ENSCLAG00000007244) ENSCLAG00000007083 NEDD1 (ENSCLAG00000013064) CFAP54 (ENSCLAG00000008151) CDK17 (ENSCLAG00000012821) ELK3 (ENSCLAG00000014957) Lta4h (ENSCLAG00000011828) HAL (ENSCLAG00000009969) AMDHD1 (ENSCLAG00000010790) CCDC38 (ENSCLAG00000008219) ENSCLAG00000007200 NTN4 (ENSCLAG00000014781) USP44 (ENSCLAG00000010934) ENSCLAG00000009110 ENSCLAG00000018027 ##22 VEZT (ENSCLAG00000011358) FGD6 (ENSCLAG00000010121) NR2C1 (ENSCLAG00000007935) NDUFA12 (ENSCLAG00000004709) TMCC3 (ENSCLAG00000007987) CEP83 (ENSCLAG00000007562) PLXNC1 (ENSCLAG00000015691) CRADD (ENSCLAG00000015937) SOCS2 (ENSCLAG00000007099) MRPL42 (ENSCLAG00000005421) UBE2N (ENSCLAG00000005227) ENSCLAG00000012848 ENSCLAG00000011699 EEA1 (ENSCLAG00000006113) ENSCLAG00000005133 Hystricomorpha DUPLICATION Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b.f.b.a ##22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 23 USP39 (ENSHGLG00000015846) SFTPB (ENSHGLG00000016430) ENSHGLG00000033431 ATOH8 (ENSHGLG00000013394) ST3GAL5 (ENSHGLG00000015817) ENSHGLG00000050264 ENSHGLG00000006334 PTCD3 (ENSHGLG00000007937) IMMT (ENSHGLG00000004647) ENSHGLG00000049882 MRPL35 (ENSHGLG00000042289) REEP1 (ENSHGLG00000033995) ENSHGLG00000009499 KDM3A (ENSHGLG00000008133) CHMP3 (ENSHGLG00000007476) ENSHGLG00000020192 ##22 RNF103 (ENSHGLG00000006072) RMND5A (ENSHGLG00000034710) ENSHGLG00000033472 ENSHGLG00000048608 ENSHGLG00000004771 ENSHGLG00000038505 ENSHGLG00000037617 ENSHGLG00000042877 SMYD1 (ENSHGLG00000050629) FABP1 (ENSHGLG00000050149) ENSHGLG00000050979 ENSHGLG00000010289 ENSHGLG00000007187 ENSHGLG00000006125 ENSHGLG00000005434 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 11 ENSHGLG00000007697 ENSHGLG00000045486 ENSHGLG00000042376 ENSHGLG00000033444 ENSHGLG00000012306 ENSHGLG00000049181 ENSHGLG00000045303 MINA (ENSHGLG00000003242) ENSHGLG00000034916 CRYBG3 (ENSHGLG00000001387) ARL6 (ENSHGLG00000048582) EPHA6 (ENSHGLG00000012887) ENSHGLG00000047628 ENSHGLG00000045668 NSUN3 (ENSHGLG00000006224) ENSHGLG00000043587 ##22 ARL13B (ENSHGLG00000003881) STX19 (ENSHGLG00000047716) ENSHGLG00000047498 PROS1 (ENSHGLG00000042539) ENSHGLG00000038748 EPHA3 (ENSHGLG00000003586) ENSHGLG00000041404 C3orf38 (ENSHGLG00000002435) ENSHGLG00000037445 ZNF654 (ENSHGLG00000001844) CGGBP1 (ENSHGLG00000034659) ENSHGLG00000042763 ENSHGLG00000032052 ENSHGLG00000001380 ENSHGLG00000047444 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b.f.b.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b.f.b.a ##22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 109 KATNAL2 (ENSCLAG00000013657) ENSCLAG00000011621 ST8SIA5 (ENSCLAG00000012639) LOXHD1 (ENSCLAG00000011718) RNF165 (ENSCLAG00000009534) C18orf25 (ENSCLAG00000008611) HAUS1 (ENSCLAG00000012155) ATP5F1A (ENSCLAG00000014431) ENSCLAG00000015055 PSTPIP2 (ENSCLAG00000011006) EPG5 (ENSCLAG00000009230) SIGLEC15 (ENSCLAG00000007394) SLC14A1 (ENSCLAG00000007299) SLC14A2 (ENSCLAG00000012015) SETBP1 (ENSCLAG00000010509) ENSCLAG00000008619 ##22 SYT4 (ENSCLAG00000008440) RIT2 (ENSCLAG00000007553) PIK3C3 (ENSCLAG00000014762) CELF4 (ENSCLAG00000008344) KIAA1328 (ENSCLAG00000009322) TPGS2 (ENSCLAG00000008336) FHOD3 (ENSCLAG00000010998) MOCOS (ENSCLAG00000009228) ELP2 (ENSCLAG00000011638) SLC39A6 (ENSCLAG00000010738) RPRD1A (ENSCLAG00000009020) C18orf21 (ENSCLAG00000007835) GALNT1 (ENSCLAG00000013698) INO80C (ENSCLAG00000012094) ZNF396 (ENSCLAG00000009022) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b.f.b.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 30 ENSHGLG00000005579 ENSHGLG00000034276 ENSHGLG00000049146 ENSHGLG00000018789 ENSHGLG00000031955 ENSHGLG00000040680 ENSHGLG00000044562 ENSHGLG00000039247 ENSHGLG00000035614 ENSHGLG00000033604 ENSHGLG00000041015 ENSHGLG00000040100 ENSHGLG00000044692 ENSHGLG00000033471 ENSHGLG00000048245 ENSHGLG00000035594 ##22 ENSHGLG00000047954 ENSHGLG00000046577 ENSHGLG00000005627 ENSHGLG00000005138 ENSHGLG00000047943 ENSHGLG00000046713 ENSHGLG00000003513 ENSHGLG00000050212 ENSHGLG00000037447 ENSHGLG00000001150 ENSHGLG00000043419 ENSHGLG00000037239 ENSHGLG00000039108 ENSHGLG00000042124 ENSHGLG00000034006 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 944 DLEU7 (ENSMLUG00000028199) ENSMLUG00000016558 FAM124A (ENSMLUG00000000843) ENSMLUG00000029387 INTS6 (ENSMLUG00000000852) WDFY2 (ENSMLUG00000016015) ENSMLUG00000017485 ENSMLUG00000017495 CCDC70 (ENSMLUG00000024144) ##18 ATP7B (ENSMLUG00000012070) ALG11 (ENSMLUG00000028693) ENSMLUG00000027805 ENSMLUG00000000132 VPS36 (ENSMLUG00000000128) THSD1 (ENSMLUG00000003833) ENSMLUG00000022837 ##22 ENSMLUG00000027304 ENSMLUG00000029270 SLC25A15 (ENSMLUG00000008471) MRPS31 (ENSMLUG00000008416) ENSMLUG00000024202 ENSMLUG00000014595 ENSMLUG00000023120 ENSMLUG00000007752 COG6 (ENSMLUG00000015423) ENSMLUG00000009265 ZC3H13 (ENSMLUG00000006920) #16 CPB2 (ENSMLUG00000006959) #15 LCP1 (ENSMLUG00000014393) #14 ENSMLUG00000009728 #13 RUBCNL (ENSMLUG00000007642) #12 Microbat MODERN SPECIES 1158 MLLT3 (ENSMLUG00000003947) FOCAD (ENSMLUG00000003955) HACD4 (ENSMLUG00000003980) IFNB1 (ENSMLUG00000008021) KLHL9 (ENSMLUG00000007175) ENSMLUG00000026947 ENSMLUG00000027734 ENSMLUG00000023736 ENSMLUG00000030465 ENSMLUG00000027612 ENSMLUG00000028931 ENSMLUG00000024850 ENSMLUG00000027376 IFNE (ENSMLUG00000010970) MTAP (ENSMLUG00000014410) ENSMLUG00000030508 ##22 ENSMLUG00000024291 CDKN2A (ENSMLUG00000029865) CDKN2B (ENSMLUG00000007025) ENSMLUG00000030162 Microbat MODERN SPECIES 1039 C4orf47 (ENSMLUG00000006074) ENSMLUG00000027378 PDLIM3 (ENSMLUG00000014354) SORBS2 (ENSMLUG00000014357) TLR3 (ENSMLUG00000012567) ENSMLUG00000025214 ENSMLUG00000030239 ENSMLUG00000024439 ENSMLUG00000027737 ENSMLUG00000023315 ENSMLUG00000023777 ENSMLUG00000015604 KLKB1 (ENSMLUG00000015612) ENSMLUG00000026748 FAT1 (ENSMLUG00000007041) ENSMLUG00000024364 ##22 ZFP42 (ENSMLUG00000001489) TRIML2 (ENSMLUG00000015729) TRIML1 (ENSMLUG00000015735) FRG1 (ENSMLUG00000023179) ASAH1 (ENSMLUG00000010191) PCM1 (ENSMLUG00000010095) ENSMLUG00000029429 FGL1 (ENSMLUG00000007896) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 1338 ENSAMEG00000030702 ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1124 ENSAMEG00000029908 ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1350 ENSAMEG00000028446 ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Ferret MODERN SPECIES 306 ENSMPUG00000019439 ENSMPUG00000000088 MAGEB18 (ENSMPUG00000019440) ENSMPUG00000000089 ##22 ARX (ENSMPUG00000000092) POLA1 (ENSMPUG00000000097) PCYT1B (ENSMPUG00000000100) ENSMPUG00000000102 PDK3 (ENSMPUG00000000104) ENSMPUG00000000105 EIF2S3B (ENSMPUG00000000106) KLHL15 (ENSMPUG00000000107) CXorf58 (ENSMPUG00000000108) ENSMPUG00000000109 SAT1 (ENSMPUG00000000112) ACOT9 (ENSMPUG00000000113) PRDX4 (ENSMPUG00000000116) PTCHD1 (ENSMPUG00000000120) ENSMPUG00000019441 American mink MODERN SPECIES 359 IL1RAPL1 (ENSNVIG00000017584) ENSNVIG00000017684 MAGEB3 (ENSNVIG00000017690) ENSNVIG00000017697 NR0B1 (ENSNVIG00000017718) CX021 (ENSNVIG00000017738) ENSNVIG00000017746 ##22 ENSNVIG00000017779 ENSNVIG00000018001 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 18 ITM2B (ENSMMSG00000013606) MED4 (ENSMMSG00000013569) ENSMMSG00000013552 #7 SUCLA2 (ENSMMSG00000013529) #8 HTR2A (ENSMMSG00000013507) #9 ENSMMSG00000013450 #10 LRCH1 (ENSMMSG00000013375) #11 RUBCNL (ENSMMSG00000013269) #12 LRRC63 (ENSMMSG00000013232) #13 ENSMMSG00000013171 #14 CPB2 (ENSMMSG00000013091) #15 ZC3H13 (ENSMMSG00000013066) #16 SIAH3 (ENSMMSG00000013046) #17 CBY2 (ENSMMSG00000013010) #18 COG3 (ENSMMSG00000012900) #20 ENSMMSG00000012847 ##22 KCTD4 (ENSMMSG00000012832) #23 GTF2F2 (ENSMMSG00000012809) #24 ENSMMSG00000012733 NUFIP1 (ENSMMSG00000012687) #26 TSC22D1 (ENSMMSG00000012637) #27 SERP2 (ENSMMSG00000012621) #28 SMIM2 (ENSMMSG00000020679) #29 LACC1 (ENSMMSG00000020655) #30 CCDC122 (ENSMMSG00000020615) #31 ENOX1 (ENSMMSG00000020590) #32 DNAJC15 (ENSMMSG00000020566) #33 EPSTI1 (ENSMMSG00000020457) #34 FAM216B (ENSMMSG00000020436) #35 TNFSF11 (ENSMMSG00000020387) #36 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338.s.a #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.b ##22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000015889.o.b.b ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000014262 #29 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Blue whale MODERN SPECIES 9 MED4 (ENSBMSG00010015472) ENSBMSG00010015507 SUCLA2 (ENSBMSG00010015547) #8 HTR2A (ENSBMSG00010015606) #9 ESD (ENSBMSG00010015643) #10 LRCH1 (ENSBMSG00010015742) #11 RUBCNL (ENSBMSG00010016070) #12 LRRC63 (ENSBMSG00010016199) #13 LCP1 (ENSBMSG00010016266) #14 CPB2 (ENSBMSG00010016357) #15 ENSBMSG00010016462 SIAH3 (ENSBMSG00010016505) #17 CBY2 (ENSBMSG00010016528) #18 COG3 (ENSBMSG00010016549) #20 SLC25A30 (ENSBMSG00010016571) #21 ENSBMSG00010016609 ##22 GTF2F2 (ENSBMSG00010016687) #24 KCTD4 (ENSBMSG00010016717) #23 ENSBMSG00010016736 ENSBMSG00010016755 NUFIP1 (ENSBMSG00010016807) #26 TSC22D1 (ENSBMSG00010016870) #27 SERP2 (ENSBMSG00010016922) #28 SMIM2 (ENSBMSG00010016954) #29 LACC1 (ENSBMSG00010016991) #30 ENSBMSG00010017009 #31 ENOX1 (ENSBMSG00010017029) #32 ENSBMSG00010017093 ENSBMSG00010017116 #33 ENSBMSG00010017150 EPSTI1 (ENSBMSG00010017177) #34 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338.s.a #7 ENSGT00390000010170.a.b #8 ENSGT01050000244937.a.a #9 ENSGT00390000011864 #10 ENSGT00940000159528 #11 ENSGT00940000160585 #12 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.b ##22 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000015889.o.b.b ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT00940000154512.a #35 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 Sperm whale DUPLICATION Sperm whale DUPLICATION Sperm whale MODERN SPECIES ENSPCTG00005000023 ENSPCTG00005000022 ENSPCTG00005000021 ENSPCTG00005000020 ENSPCTG00005000019 ENSPCTG00005000018 ENSPCTG00005000017 ENSPCTG00005000016 ENSPCTG00005000015 ENSPCTG00005000014 ENSPCTG00005000013 ENSPCTG00005000012 ENSPCTG00005000011 ENSPCTG00005000010 ENSPCTG00005000009 ENSPCTG00005000008 ##22 ENSPCTG00005000007 ENSPCTG00005000006 ENSPCTG00005000005 ENSPCTG00005000004 ENSPCTG00005000003 ENSPCTG00005000002 Sperm whale MODERN SPECIES 834 ENSPCTG00005014305 ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 4 ENSPCTG00005017963 #7 SUCLA2 (ENSPCTG00005018015) #8 HTR2A (ENSPCTG00005018130) #9 ESD (ENSPCTG00005018195) #10 LRCH1 (ENSPCTG00005018266) #11 ENSPCTG00005018927 RUBCNL (ENSPCTG00005019002) #12 LRRC63 (ENSPCTG00005019334) #13 LCP1 (ENSPCTG00005019437) #14 CPB2 (ENSPCTG00005019480) #15 ZC3H13 (ENSPCTG00005019642) #16 SIAH3 (ENSPCTG00005019682) #17 CBY2 (ENSPCTG00005019720) #18 COG3 (ENSPCTG00005019832) #20 SLC25A30 (ENSPCTG00005019936) #21 TPT1 (ENSPCTG00005020016) ##22 GTF2F2 (ENSPCTG00005020225) #24 KCTD4 (ENSPCTG00005020248) #23 ENSPCTG00005020258 GPALPP1 (ENSPCTG00005020323) NUFIP1 (ENSPCTG00005020401) #26 ENSPCTG00005020454 TSC22D1 (ENSPCTG00005020590) #27 SERP2 (ENSPCTG00005020663) #28 LACC1 (ENSPCTG00005020691) #30 CCDC122 (ENSPCTG00005020708) #31 ENOX1 (ENSPCTG00005020727) #32 DNAJC15 (ENSPCTG00005004158) #33 EPSTI1 (ENSPCTG00005004170) #34 FAM216B (ENSPCTG00005004201) #35 ENSPCTG00005004218 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 808 NMT2 (ENSDNOG00000041097) RPP38 (ENSDNOG00000040314) ACBD7 (ENSDNOG00000016935) ENSDNOG00000010720 ENSDNOG00000043519 ##22 MEIG1 (ENSDNOG00000010602) DCLRE1C (ENSDNOG00000007426) ENSDNOG00000014532 HSPA14 (ENSDNOG00000043841) MSANTD7 (ENSDNOG00000042607) ENSDNOG00000003775 ENSDNOG00000049129 Armadillo MODERN SPECIES 516 ENSDNOG00000042080 ##22 Armadillo MODERN SPECIES 1106 ENSDNOG00000038515 ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.b ##22 Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 2899 ENSETEG00000003091 ##22 Tenrec MODERN SPECIES 13922 ENSETEG00000018863 ##22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000010316 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051 #22 ENSGT00390000016051.bb.a #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00940000158106 ENSGT00390000006601 Marsupialia_b DUPLICATION Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.c #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.c #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.c #22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 35 PCK1 (ENSVURG00010018520) ENSVURG00010018530 RBM38 (ENSVURG00010018536) RAE1 (ENSVURG00010018539) SPO11 (ENSVURG00010018551) BMP7 (ENSVURG00010018589) TFAP2C (ENSVURG00010018603) RTF2 (ENSVURG00010018611) ENSVURG00010018623 CASS4 (ENSVURG00010018629) CSTF1 (ENSVURG00010018632) AURKA (ENSVURG00010018636) FAM210B (ENSVURG00010018643) MC3R (ENSVURG00010018648) CBLN4 (ENSVURG00010018658) ENSVURG00010018660 #22 DOK5 (ENSVURG00010018666) PFDN4 (ENSVURG00010018680) CYP24A1 (ENSVURG00010018690) ENSVURG00010018716 ZNF217 (ENSVURG00010018725) ENSVURG00010018729 TSHZ2 (ENSVURG00010018738) ZFP64 (ENSVURG00010018745) SALL4 (ENSVURG00010018759) ATP9A (ENSVURG00010018777) NFATC2 (ENSVURG00010018804) KCNG1 (ENSVURG00010018813) MOCS3 (ENSVURG00010018816) DPM1 (ENSVURG00010018817) ADNP (ENSVURG00010018827) Common wonbat MODERN SPECIES 34 ATXN1 (ENSVURG00010002666) GMPR (ENSVURG00010002686) MYLIP (ENSVURG00010002708) DTNBP1 (ENSVURG00010002784) ENSVURG00010002836 ENSVURG00010002848 RNF182 (ENSVURG00010002887) ENSVURG00010002910 RANBP9 (ENSVURG00010002990) NOL7 (ENSVURG00010002999) SIRT5 (ENSVURG00010003015) GFOD1 (ENSVURG00010003031) TBC1D7 (ENSVURG00010003062) PHACTR1 (ENSVURG00010003127) ENSVURG00010003188 ENSVURG00010003192 #22 EDN1 (ENSVURG00010003200) ENSVURG00010003205 HIVEP1 (ENSVURG00010003228) ADTRP (ENSVURG00010003248) ENSVURG00010003261 TMEM170B (ENSVURG00010003293) NEDD9 (ENSVURG00010003338) SMIM13 (ENSVURG00010003370) ELOVL2 (ENSVURG00010003383) GCM2 (ENSVURG00010003423) MAK (ENSVURG00010003434) TMEM14C (ENSVURG00010003464) PAK1IP1 (ENSVURG00010003476) ENSVURG00010003495 GCNT2 (ENSVURG00010003537) Wallaby MODERN SPECIES 3882 ENSMEUG00000004527 #22 Marsupialia_b DUPLICATION Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000010316 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.d.a #22 ENSGT00390000016051.bb.a #24 ENSGT00390000016051.cb #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00940000158106 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00530000064199 ENSGT00390000010316 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.d.a #22 ENSGT00390000016051.bb.a #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00940000158106 ENSGT00390000006601 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00530000064199 ENSGT00390000010316.e ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.d.a #22 ENSGT00390000016051.bb.a.a #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #27 ENSGT00940000162467.b #28 ENSGT00390000000693 #30 ENSGT00390000005130 #31 ENSGT00390000006788.a.b #32 ENSGT00940000159907 #33 ENSGT00390000013820 #34 ENSGT01070000253816.a.a.b #36 ENSGT00940000153313.B #37 ENSGT00940000158106 ENSGT00390000006601 koala MODERN SPECIES 7 CFLAR (ENSPCIG00000019111) ENSPCIG00000019113 HYCC2 (ENSPCIG00000019013) ORC2 (ENSPCIG00000034597) NIF3L1 (ENSPCIG00000019334) PPIL3 (ENSPCIG00000019339) CLK1 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#21 ENSVURG00010009218 #22 ENSVURG00010009253 #24 KCTD4 (ENSVURG00010009263) #23 ENSVURG00010009277 ENSVURG00010009282 #26 ENSVURG00010009327 LACC1 (ENSVURG00010009356) #30 CCDC122 (ENSVURG00010009366) #31 ENOX1 (ENSVURG00010009418) #32 DNAJC15 (ENSVURG00010009445) #33 EPSTI1 (ENSVURG00010009463) #34 TNFSF11 (ENSVURG00010009490) #36 AKAP11 (ENSVURG00010009504) #37 DGKH (ENSVURG00010009526) VWA8 (ENSVURG00010009546) RGCC (ENSVURG00010009578) Tasmanian devil MODERN SPECIES 2 NDUFB3 (ENSSHAG00000013520) HYCC2 (ENSSHAG00000013139) ORC2 (ENSSHAG00000012779) NIF3L1 (ENSSHAG00000012698) ENSSHAG00000025622 CLK1 (ENSSHAG00000012465) ENSSHAG00000012368 ENSSHAG00000011752 ENSSHAG00000011001 #15 ZC3H13 (ENSSHAG00000010568) #16 SIAH3 (ENSSHAG00000008837) #17 CBY2 (ENSSHAG00000008208) #18 ENSSHAG00000005964 #19 COG3 (ENSSHAG00000005057) #20 ENSSHAG00000003644 #21 ENSSHAG00000001545 #22 ENSSHAG00000031130 #24 KCTD4 (ENSSHAG00000025523) #23 ENSSHAG00000003663 ENSSHAG00000002127 #26 ENSSHAG00000029832 ENSSHAG00000023950 ENSSHAG00000015643 #30 CCDC122 (ENSSHAG00000022118) #31 ENOX1 (ENSSHAG00000012702) #32 DNAJC15 (ENSSHAG00000011722) #33 ENSSHAG00000010849 #34 TNFSF11 (ENSSHAG00000001297) #36 AKAP11 (ENSSHAG00000022883) #37 DGKH (ENSSHAG00000001014) ENSSHAG00000022714 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.d.b #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.d.b #22 Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.b ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b.b ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b.a ENSGT01100000263532.C.c.b ENSGT00940000155850.fb ENSGT00940000159964 ENSGT00950000183140.a.b ENSGT00940000157618 ENSGT00940000156791 ENSGT00680000100059 ENSGT00940000157883.a.b.e.a ENSGT00940000162151 ENSGT00390000010116 ENSGT00940000156112 ENSGT00390000006051.d.b.a.a #22 ENSGT00950000182892.a.a.b ENSGT00940000153147.o.a ENSGT00950000182919.C.k.a ENSGT00940000161892 ENSGT00940000160027 ENSGT00940000157270 ENSGT00940000161653 ENSGT00940000161503 ENSGT00940000158266 ENSGT00940000161308 ENSGT00940000159938 ENSGT00940000161457 ENSGT00940000161025 ENSGT00940000173501 ENSGT00390000001859 koala MODERN SPECIES 40 ENSPCIG00000011290 ENSPCIG00000011294 ENSPCIG00000035928 ENSPCIG00000011306 ENSPCIG00000025366 ENSPCIG00000025368 FKBP7 (ENSPCIG00000025369) PJVK (ENSPCIG00000025370) PRKRA (ENSPCIG00000025371) OSBPL6 (ENSPCIG00000025378) ENSPCIG00000025391 RBM45 (ENSPCIG00000025402) PDE11A (ENSPCIG00000025405) ENSPCIG00000025413 AGPS (ENSPCIG00000025418) ENSPCIG00000025432 #22 NFE2L2 (ENSPCIG00000025438) ENSPCIG00000025443 ENSPCIG00000035345 ENSPCIG00000034180 MTX2 (ENSPCIG00000006277) HOXD1 (ENSPCIG00000026501) HOXD4 (ENSPCIG00000026503) HOXD3 (ENSPCIG00000026502) HOXD8 (ENSPCIG00000029145) HOXD9 (ENSPCIG00000033878) HOXD10 (ENSPCIG00000029143) ENSPCIG00000034132 HOXD12 (ENSPCIG00000029141) HOXD13 (ENSPCIG00000029140) EVX2 (ENSPCIG00000029139) Common wonbat MODERN SPECIES 1018 ENSVURG00010018694 ENSVURG00010018699 ENSVURG00010018702 ENSVURG00010018707 ENSVURG00010018717 ENSVURG00010018731 FKBP7 (ENSVURG00010018739) PJVK (ENSVURG00010018750) PRKRA (ENSVURG00010018771) OSBPL6 (ENSVURG00010018808) RBM45 (ENSVURG00010018862) ENSVURG00010018867 PDE11A (ENSVURG00010018883) ENSVURG00010018908 AGPS (ENSVURG00010018947) ENSVURG00010019089 #22 NFE2L2 (ENSVURG00010019096) ENSVURG00010019105 ENSVURG00010019134 ENSVURG00010019141 HOXD1 (ENSVURG00010019147) HOXD3 (ENSVURG00010019148) HOXD4 (ENSVURG00010019150) HOXD8 (ENSVURG00010019156) HOXD9 (ENSVURG00010019159) HOXD10 (ENSVURG00010019165) ENSVURG00010019168 HOXD12 (ENSVURG00010019173) HOXD13 (ENSVURG00010019176) EVX2 (ENSVURG00010019179) LNPK (ENSVURG00010019192) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.d.b.a.b #22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1066 CFAP95 (ENSVURG00010007235) PTAR1 (ENSVURG00010007243) APBA1 (ENSVURG00010007265) ENTREP1 (ENSVURG00010007290) TJP2 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