Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT01030000235083 ENSGT00940000165996 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 ENSGT00940000153313.B Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a 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#26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 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ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.a #22 ENSGT00390000006051.a.b.a.b.n #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00390000003628.b.c.b.a.a.a #27 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 357 LRRC63 (ENSRBIG00000028445) #13 ENSRBIG00000038896 LCP1 (ENSRBIG00000038337) #14 CPB2 (ENSRBIG00000032565) #15 ENSRBIG00000019806 ZC3H13 (ENSRBIG00000010463) #16 SIAH3 (ENSRBIG00000043429) #17 CBY2 (ENSRBIG00000038551) #18 ENSRBIG00000041417 ERICH6B (ENSRBIG00000029552) #19 COG3 (ENSRBIG00000030800) #20 SLC25A30 (ENSRBIG00000018540) #21 ENSRBIG00000039217 #22 GTF2F2 (ENSRBIG00000021582) #24 KCTD4 (ENSRBIG00000017539) #23 ENSRBIG00000042376 NUFIP1 (ENSRBIG00000029771) #26 ENSRBIG00000039378 ENSRBIG00000027001 #27 TSC22D1 (ENSRBIG00000034232) #28 SERP2 (ENSRBIG00000036349) #29 SMIM2 (ENSRBIG00000043447) #30 ENSRBIG00000029281 ENSRBIG00000034025 LACC1 (ENSRBIG00000042070) #31 CCDC122 (ENSRBIG00000032610) #32 ENOX1 (ENSRBIG00000031124) #33 DNAJC15 (ENSRBIG00000003484) #34 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00450000040303.d ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00910000147882 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b.n #22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.a #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000163575 #25 ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 ENSGT00940000153313.B ENSGT00940000158106 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 180 ENSMNEG00000045220 #22 GTF2F2 (ENSMNEG00000033303) #24 KCTD4 (ENSMNEG00000025133) #23 GPALPP1 (ENSMNEG00000033610) #25 NUFIP1 (ENSMNEG00000033299) #26 ENSMNEG00000004676 ENSMNEG00000035585 #27 TSC22D1 (ENSMNEG00000000209) #28 SERP2 (ENSMNEG00000042638) #29 SMIM2 (ENSMNEG00000042675) #30 LACC1 (ENSMNEG00000045105) #31 CCDC122 (ENSMNEG00000039888) #32 ENOX1 (ENSMNEG00000040967) #33 DNAJC15 (ENSMNEG00000039087) #34 EPSTI1 (ENSMNEG00000027227) #35 FAM216B (ENSMNEG00000040597) #36 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000008403.y.a.b ENSGT00530000063737 ENSGT00530000064011 ENSGT00950000183128.C ENSGT00940000157848 ENSGT00940000160477 ENSGT00390000011163.b ENSGT00940000158908 ENSGT00940000156521.b ENSGT00390000012412 ENSGT00940000154813 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000159887 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000154746.g ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.b #22 ENSGT00940000156116.C ENSGT00940000154656 ENSGT00940000158836 ENSGT00390000006996 ENSGT00910000147001 ENSGT00940000155729.m.a ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00730000111179.b ENSGT00940000159098 ENSGT00940000156540 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000159673 ENSGT00390000018691 ENSGT00940000156774 ENSGT00940000158220 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063737 ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.f.c.a ENSGT00530000064011 ENSGT00950000183128.C ENSGT00940000157848 ENSGT00940000160477 ENSGT00390000011163.b ENSGT00940000158908 ENSGT00940000156521.b ENSGT00390000012412 ENSGT00940000154813 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000159887 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000154746.g.a ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.b #22 ENSGT00940000154746.g.b ENSGT00940000156116.C ENSGT00940000154656 ENSGT00940000158836 ENSGT00390000006996 ENSGT00910000147001 ENSGT00940000155729.m.a ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00730000111179.b ENSGT00940000159098 ENSGT00940000156540 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000159673 ENSGT00390000018691 ENSGT00940000156774 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000008403.y.a.b ENSGT00530000063737 ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.f.c.a ENSGT00530000064011 ENSGT00950000183128.C ENSGT00940000157848 ENSGT00940000160477 ENSGT00390000011163.b ENSGT00940000158908 ENSGT00940000156521.b ENSGT00390000012412 ENSGT00940000154813 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000159887 ENSGT00940000154746.g.a ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.b #22 ENSGT00940000154746.g.b ENSGT00940000156116.C ENSGT00940000154656 ENSGT00940000158836 ENSGT00390000006996 ENSGT00910000147001 ENSGT00940000155729.m.a ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00730000111179.b ENSGT00940000159098 ENSGT00940000156540 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000159673 ENSGT00390000002407.d.e.a ENSGT00390000018691 Drill MODERN SPECIES 723 MAX (ENSMLEG00000042139) FNTB (ENSMLEG00000042597) RAB15 (ENSMLEG00000037890) GPX2 (ENSMLEG00000032611) CHURC1 (ENSMLEG00000032946) SPTB (ENSMLEG00000027497) PLEKHG3 (ENSMLEG00000036962) PPP1R36 (ENSMLEG00000031961) HSPA2 (ENSMLEG00000039096) ZBTB1 (ENSMLEG00000023254) ZBTB25 (ENSMLEG00000036039) MTHFD1 (ENSMLEG00000028622) ENSMLEG00000034143 #22 ESR2 (ENSMLEG00000036116) SYNE2 (ENSMLEG00000019474) SGPP1 (ENSMLEG00000029959) WDR89 (ENSMLEG00000023031) ENSMLEG00000034662 PPP2R5E (ENSMLEG00000006842) GPHB5 (ENSMLEG00000035742) RHOJ (ENSMLEG00000029154) KCNH5 (ENSMLEG00000042423) ENSMLEG00000018294 SYT16 (ENSMLEG00000042531) ENSMLEG00000031595 SNAPC1 (ENSMLEG00000036821) HIF1A (ENSMLEG00000032405) ENSMLEG00000032081 Macaca ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000008403.y.a.b ENSGT00530000063737 ENSGT00530000064011 ENSGT00950000183128.C ENSGT00940000157848 ENSGT00940000160477 ENSGT00390000011163.b ENSGT00940000158908 ENSGT00940000156521.b ENSGT00390000012412 ENSGT00940000154813 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000159887 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000154746.g ENSGT00390000006051.a.b.a.b.m.b #22 ENSGT00940000156116.C ENSGT00940000154656 ENSGT00940000158836 ENSGT00390000006996 ENSGT00910000147001 ENSGT00940000155729.m.a ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00730000111179.b ENSGT00940000159098 ENSGT00940000156540 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000159673 ENSGT00390000018691 ENSGT00940000156774 ENSGT00940000158220 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 520 FUT8 (ENSMNEG00000028412) ENSMNEG00000033909 MAX (ENSMNEG00000031473) FNTB (ENSMNEG00000034095) RAB15 (ENSMNEG00000016138) GPX2 (ENSMNEG00000025746) CHURC1 (ENSMNEG00000027897) SPTB (ENSMNEG00000043673) PLEKHG3 (ENSMNEG00000043889) ENSMNEG00000031421 PPP1R36 (ENSMNEG00000039768) HSPA2 (ENSMNEG00000034108) ZBTB1 (ENSMNEG00000032418) ZBTB25 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ENSGT00390000006051.a.b.a.b.n #22 Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES NEK7 (ENSMFAG00000042183) LHX9 (ENSMFAG00000037285) C1orf53 (ENSMFAG00000058672) ENSMFAG00000050075 DENND1B (ENSMFAG00000040708) ENSMFAG00000059753 CRB1 (ENSMFAG00000037248) ZBTB41 (ENSMFAG00000042390) ASPM (ENSMFAG00000044554) F13B (ENSMFAG00000038280) CFHR5 (ENSMFAG00000033730) ENSMFAG00000035708 CFH (ENSMFAG00000039896) KCNT2 (ENSMFAG00000030817) ENSMFAG00000039121 ENSMFAG00000031828 #22 ENSMFAG00000030333 B3GALT2 (ENSMFAG00000030327) CDC73 (ENSMFAG00000042168) RO60 (ENSMFAG00000016020) ENSMFAG00000058552 UCHL5 (ENSMFAG00000038349) RGS2 (ENSMFAG00000033433) RGS13 (ENSMFAG00000033037) RGS1 (ENSMFAG00000036716) RGS21 (ENSMFAG00000060899) RGS18 (ENSMFAG00000059808) SKP1 (ENSMFAG00000052365) BRINP3 (ENSMFAG00000045708) ENSMFAG00000060456 ENSMFAG00000048586 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 8 LRCH1 (ENSMFAG00000032767) #9 RUBCNL (ENSMFAG00000030648) #11 ENSMFAG00000037947 LRRC63 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ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a ENSGT00950000182805.a.a.a.b.i.a ENSGT00390000006051.a.b.a.b.o.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000161768.A.p ENSGT00390000012726 ENSGT00940000162451 ENSGT00940000163379.b ENSGT00940000157297 ENSGT00940000157996 ENSGT00390000014020 ENSGT00940000157196 ENSGT00940000160111 ENSGT00940000159999 ENSGT00390000008142.i ENSGT00940000153737.a ENSGT00940000161870 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00940000157481 ENSGT00940000160471 ENSGT00390000006696.ub.b ENSGT01030000234579.B.a ENSGT00950000182899.B.b ENSGT00940000155339 ENSGT00550000074964.i.a ENSGT00940000155145 ENSGT00940000154281.m.a.d ENSGT00390000002253.b ENSGT00940000156123.b ENSGT00710000106792 ENSGT00940000158743 ENSGT00950000182972.a.a.a.a.a ENSGT00950000182805.a.a.a.b.i.a ENSGT00390000006051.a.b.a.b.o.a #22 ENSGT00940000155920 ENSGT01030000234566.e.b.b.b ENSGT00940000161768.A.p ENSGT00390000012726 ENSGT00940000163379.b ENSGT00940000157297 ENSGT00940000157996 ENSGT00390000014020 ENSGT00940000157196 ENSGT00940000160111 ENSGT00940000159999 ENSGT00390000008142.i ENSGT00940000153737.a ENSGT00940000161870 ENSGT00940000156455 Capuchin MODERN SPECIES 232 GRIA3 (ENSCCAG00000026752) THOC2 (ENSCCAG00000021906) XIAP (ENSCCAG00000018624) STAG2 (ENSCCAG00000012376) ENSCCAG00000035450 ENSCCAG00000020008 ENSCCAG00000027691 ENSCCAG00000022375 #22 SH2D1A (ENSCCAG00000024336) TENM1 (ENSCCAG00000035988) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 85 ENSSBOG00000023048 ZBTB33 (ENSSBOG00000006501) TMEM255A (ENSSBOG00000014597) ATP1B4 (ENSSBOG00000033763) LAMP2 (ENSSBOG00000034449) CUL4B (ENSSBOG00000029478) MCTS1 (ENSSBOG00000031550) C1GALT1C1 (ENSSBOG00000019221) ENSSBOG00000035248 ENSSBOG00000029995 GRIA3 (ENSSBOG00000025046) THOC2 (ENSSBOG00000007245) XIAP (ENSSBOG00000032822) STAG2 (ENSSBOG00000030175) ENSSBOG00000021911 ENSSBOG00000019115 #22 SH2D1A (ENSSBOG00000031200) TENM1 (ENSSBOG00000031696) ENSSBOG00000033887 PRR32 (ENSSBOG00000019883) ENSSBOG00000020087 ENSSBOG00000035106 SMARCA1 (ENSSBOG00000020641) OCRL (ENSSBOG00000032679) ENSSBOG00000024330 APLN (ENSSBOG00000028355) ENSSBOG00000018313 XPNPEP2 (ENSSBOG00000030099) SASH3 (ENSSBOG00000012311) ZDHHC9 (ENSSBOG00000028077) ENSSBOG00000009039 Mas night monkey MODERN SPECIES 928 ENSANAG00000020725 ATP1B4 (ENSANAG00000021106) LAMP2 (ENSANAG00000022316) CUL4B (ENSANAG00000037771) ENSANAG00000033714 C1GALT1C1 (ENSANAG00000019504) ENSANAG00000024009 ENSANAG00000022752 ENSANAG00000036624 GRIA3 (ENSANAG00000038407) ENSANAG00000034037 ENSANAG00000004172 XIAP (ENSANAG00000025926) STAG2 (ENSANAG00000031862) ENSANAG00000021441 ENSANAG00000024609 #22 SH2D1A (ENSANAG00000017592) TENM1 (ENSANAG00000034279) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b.o.b #22 Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b.o.b.a #22 Marmoset MODERN SPECIES 7 MRPS28 (ENSCJAG00000054615) HEY1 (ENSCJAG00000086337) STMN2 (ENSCJAG00000000485) ENSCJAG00000072795 IL7 (ENSCJAG00000000494) 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ENSCCAG00000033207 PHLPP1 (ENSCCAG00000029981) BCL2 (ENSCCAG00000020452) KDSR (ENSCCAG00000023953) VPS4B (ENSCCAG00000023255) SERPINB5 (ENSCCAG00000030099) SERPINB12 (ENSCCAG00000006824) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000010170.a.b.c.e ENSGT00940000161696.c.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864.m.a #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b.p #22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 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1401 ENSOCUG00000038725 BRWD3 (ENSOCUG00000005170) ENSOCUG00000026656 ENSOCUG00000031557 ENSOCUG00000022541 ENSOCUG00000021400 TENT5D (ENSOCUG00000001367) ENSOCUG00000024762 TBX22 (ENSOCUG00000013685) ENSOCUG00000033641 ITM2A (ENSOCUG00000008651) GPR174 (ENSOCUG00000005049) ENSOCUG00000024395 P2RY10 (ENSOCUG00000014507) RTL3 (ENSOCUG00000025689) ENSOCUG00000024148 #22 CYSLTR1 (ENSOCUG00000016192) ENSOCUG00000021293 ENSOCUG00000014717 ENSOCUG00000014726 ENSOCUG00000023649 ATP7A (ENSOCUG00000014160) ENSOCUG00000036425 ENSOCUG00000039084 MAGT1 (ENSOCUG00000000203) ATRX (ENSOCUG00000007579) FGF16 (ENSOCUG00000007576) ENSOCUG00000035239 ENSOCUG00000016150 ENSOCUG00000001088 ENSOCUG00000031298 Rabbit MODERN SPECIES 18 ENSOCUG00000008755 DNAJB2 (ENSOCUG00000015157) PTPRN (ENSOCUG00000023622) ENSOCUG00000015175 DNPEP (ENSOCUG00000012477) DES (ENSOCUG00000000968) ENSOCUG00000014417 GMPPA (ENSOCUG00000024225) ASIC4 (ENSOCUG00000026600) CHPF (ENSOCUG00000011348) OBSL1 (ENSOCUG00000011145) INHA 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ENSOCUG00000029543 ZNF25 (ENSOCUG00000036910) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 161 OPRK1 (ENSCLAG00000009850) ENSCLAG00000009340 RB1CC1 (ENSCLAG00000009807) ENSCLAG00000014346 ST18 (ENSCLAG00000011202) PCMTD1 (ENSCLAG00000009964) ENSCLAG00000014877 SNTG1 (ENSCLAG00000013065) SNAI2 (ENSCLAG00000011797) CLXN (ENSCLAG00000015811) UBE2V2 (ENSCLAG00000010839) MCM4 (ENSCLAG00000014363) PRKDC (ENSCLAG00000009459) SPIDR (ENSCLAG00000009550) ENSCLAG00000009679 ENSCLAG00000017747 #22 IQSEC3 (ENSCLAG00000011610) SLC6A12 (ENSCLAG00000016481) SLC6A13 (ENSCLAG00000012266) KDM5A (ENSCLAG00000012583) CCDC77 (ENSCLAG00000013123) ENSCLAG00000012835 B4GALNT3 (ENSCLAG00000010895) NINJ2 (ENSCLAG00000013545) WNK1 (ENSCLAG00000013684) RAD52 (ENSCLAG00000014602) USP18 (ENSCLAG00000016101) TUBA8 (ENSCLAG00000015397) ENSCLAG00000013601 MICAL3 (ENSCLAG00000012611) BID (ENSCLAG00000009563) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Squirrel MODERN SPECIES 391 TPT1 (ENSSTOG00000006931) #22 KCTD4 (ENSSTOG00000006919) #23 GTF2F2 (ENSSTOG00000006891) #24 ENSSTOG00000030346 ENSSTOG00000009146 NUFIP1 (ENSSTOG00000009128) #26 TSC22D1 (ENSSTOG00000026378) #28 ENSSTOG00000016149 ENSSTOG00000031098 #32 LACC1 (ENSSTOG00000011506) #31 ENSSTOG00000034353 ENSSTOG00000001840 #32 Alpin marmot MODERN SPECIES 52 SLCO1A2 (ENSMMMG00000016821) ENSMMMG00000016797 SLCO1C1 (ENSMMMG00000016753) PDE3A (ENSMMMG00000016739) AEBP2 (ENSMMMG00000016719) ENSMMMG00000016688 ENSMMMG00000016668 CAPZA3 (ENSMMMG00000016663) PLCZ1 (ENSMMMG00000016649) PIK3C2G 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(ENSSVLG00005009962) ENSSVLG00005009988 #22 OR4D1 (ENSSVLG00005010018) OR4D2 (ENSSVLG00005010031) EPX (ENSSVLG00005010064) MKS1 (ENSSVLG00005010163) LPO (ENSSVLG00005010342) MPO (ENSSVLG00005010554) TSPOAP1 (ENSSVLG00005010724) ENSSVLG00005011318 RNF43 (ENSSVLG00005011418) HSF5 (ENSSVLG00005011732) MTMR4 (ENSSVLG00005011824) SEPTIN4 (ENSSVLG00005012070) TEX14 (ENSSVLG00005013457) RAD51C (ENSSVLG00005013902) PPM1E (ENSSVLG00005014119) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 9 RBAK (ENSSVLG00005024552) ENSSVLG00005024527 ENSSVLG00005024489 ENSSVLG00005024464 ZNF853 (ENSSVLG00005024451) INTS15 (ENSSVLG00005024423) ZDHHC4 (ENSSVLG00005024406) ENSSVLG00005024387 GRID2IP (ENSSVLG00005024088) KDELR2 (ENSSVLG00005024008) ENSSVLG00005023959 ENSSVLG00005023902 ENSSVLG00005023859 ENSSVLG00005023821 ENSSVLG00005023749 ENSSVLG00005023722 #22 ENSSVLG00005023658 ENSSVLG00005023588 ENSSVLG00005023562 ENSSVLG00005023524 ENSSVLG00005023482 BRAT1 (ENSSVLG00005023448) IQCE (ENSSVLG00005023327) TTYH3 (ENSSVLG00005023261) LFNG (ENSSVLG00005023177) GRIFIN (ENSSVLG00005023126) CHST12 (ENSSVLG00005023113) EIF3B (ENSSVLG00005023065) SNX8 (ENSSVLG00005023032) NUDT1 (ENSSVLG00005023006) ENSSVLG00005022976 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 13 ENSSVLG00005001657 #7 ENSSVLG00005001636 ENSSVLG00005001618 ENSSVLG00005001599 ENSSVLG00005001588 LRRC63 (ENSSVLG00005001547) #13 LCP1 (ENSSVLG00005001488) #14 CPB2 (ENSSVLG00005001440) #15 ZC3H13 (ENSSVLG00005001347) #16 SIAH3 (ENSSVLG00005001312) #17 CBY2 (ENSSVLG00005001296) #18 ENSSVLG00005001222 #20 SLC25A30 (ENSSVLG00005001187) #21 ENSSVLG00005001160 ENSSVLG00005001144 ENSSVLG00005001090 #22 KCTD4 (ENSSVLG00005001062) #23 ENSSVLG00005001046 #24 ENSSVLG00005001028 ENSSVLG00005001012 ENSSVLG00005000987 NUFIP1 (ENSSVLG00005000955) #26 TSC22D1 (ENSSVLG00005000900) #28 SERP2 (ENSSVLG00005000867) #29 LACC1 (ENSSVLG00005000824) #31 CCDC122 (ENSSVLG00005000800) #32 ENOX1 (ENSSVLG00005000776) #33 DNAJC15 (ENSSVLG00005000749) #34 EPSTI1 (ENSSVLG00005000671) #35 FAM216B (ENSSVLG00005000610) #36 ENSSVLG00005000585 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Common shrew MODERN SPECIES 2232 TPT1 (ENSSARG00000009319) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 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ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 Donkey MODERN SPECIES 2 NUDT15 (ENSEASG00005017157) SUCLA2 (ENSEASG00005017152) HTR2A (ENSEASG00005017150) #7 ENSEASG00005017144 #8 LRCH1 (ENSEASG00005017132) #9 RUBCNL (ENSEASG00005017123) #11 LRRC63 (ENSEASG00005034276) #13 LCP1 (ENSEASG00005017115) #14 CPB2 (ENSEASG00005017110) #15 ZC3H13 (ENSEASG00005017100) #16 SIAH3 (ENSEASG00005024437) #17 CBY2 (ENSEASG00005017097) #18 ENSEASG00005029663 #19 COG3 (ENSEASG00005017090) #20 ENSEASG00005017085 #21 TPT1 (ENSEASG00005017078) #22 KCTD4 (ENSEASG00005028559) #23 GTF2F2 (ENSEASG00005017062) #24 ENSEASG00005017051 NUFIP1 (ENSEASG00005017043) #26 TSC22D1 (ENSEASG00005017037) #28 ENSEASG00005031806 SERP2 (ENSEASG00005017029) #29 SMIM2 (ENSEASG00005030223) #30 LACC1 (ENSEASG00005017025) #31 ENSEASG00005017023 #32 ENOX1 (ENSEASG00005017017) #33 DNAJC15 (ENSEASG00005027017) #34 ENSEASG00005033429 EPSTI1 (ENSEASG00005017003) #35 FAM216B (ENSEASG00005016998) #36 Horse MODERN SPECIES 8 NUDT15 (ENSECAG00000010019) SUCLA2 (ENSECAG00000011122) HTR2A (ENSECAG00000024282) #7 ESD (ENSECAG00000024350) #8 LRCH1 (ENSECAG00000024376) #9 RUBCNL (ENSECAG00000016721) #11 LRRC63 (ENSECAG00000021952) #13 LCP1 (ENSECAG00000023009) #14 CPB2 (ENSECAG00000017329) #15 ZC3H13 (ENSECAG00000022843) #16 SIAH3 (ENSECAG00000025105) #17 CBY2 (ENSECAG00000000488) #18 ENSECAG00000033930 #19 COG3 (ENSECAG00000003080) #20 SLC25A30 (ENSECAG00000017334) #21 TPT1 (ENSECAG00000018348) #22 GTF2F2 (ENSECAG00000021923) #24 KCTD4 (ENSECAG00000005117) #23 GPALPP1 (ENSECAG00000009110) NUFIP1 (ENSECAG00000013295) #26 TSC22D1 (ENSECAG00000005195) #28 ENSECAG00000060045 ENSECAG00000040040 #29 SMIM2 (ENSECAG00000040685) #30 LACC1 (ENSECAG00000018885) #31 CCDC122 (ENSECAG00000020440) #32 ENOX1 (ENSECAG00000023538) #33 DNAJC15 (ENSECAG00000007757) #34 EPSTI1 (ENSECAG00000009543) #35 ENSECAG00000033495 ENSECAG00000050320 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 ENSGT00940000153313.B Megabat MODERN SPECIES 4257 TPT1 (ENSPVAG00000003191) #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 ENSGT00940000153313.B Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 22 DEFB1 (ENSRFEG00010014272) ENSRFEG00010014402 ENSRFEG00010014455 ENSRFEG00010014509 ENSRFEG00010014591 ENSRFEG00010014683 ENSRFEG00010014746 ENSRFEG00010014801 ENSRFEG00010014873 ENSRFEG00010014921 LHFPL6 (ENSRFEG00010014955) SIAH3 (ENSRFEG00010015030) #17 CBY2 (ENSRFEG00010015067) #18 COG3 (ENSRFEG00010015220) #20 SLC25A30 (ENSRFEG00010015316) #21 ENSRFEG00010015397 #22 GTF2F2 (ENSRFEG00010015746) #24 KCTD4 (ENSRFEG00010015792) #23 ENSRFEG00010015815 NUFIP1 (ENSRFEG00010016018) #26 ENSRFEG00010016066 TSC22D1 (ENSRFEG00010016081) #28 ENSRFEG00010016228 #29 SMIM2 (ENSRFEG00010016302) #30 LACC1 (ENSRFEG00010016430) #31 CCDC122 (ENSRFEG00010016478) #32 ENOX1 (ENSRFEG00010016570) #33 DNAJC15 (ENSRFEG00010016645) #34 EPSTI1 (ENSRFEG00010016685) #35 FAM216B (ENSRFEG00010016757) #36 TNFSF11 (ENSRFEG00010016778) #37 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 25 SKIC3 (ENSRFEG00010007614) ARSK (ENSRFEG00010007699) RFESD (ENSRFEG00010007874) SPATA9 (ENSRFEG00010007982) RHOBTB3 (ENSRFEG00010008077) GLRX (ENSRFEG00010008129) ELL2 (ENSRFEG00010008164) PCSK1 (ENSRFEG00010008222) CAST (ENSRFEG00010008436) ERAP1 (ENSRFEG00010009095) ENSRFEG00010009157 ERAP2 (ENSRFEG00010009185) LNPEP (ENSRFEG00010009269) LIX1 (ENSRFEG00010009323) ENSRFEG00010009355 ENSRFEG00010009543 #22 RGMB (ENSRFEG00010009568) CHD1 (ENSRFEG00010009657) ENSRFEG00010009740 FAM174A (ENSRFEG00010009753) ST8SIA4 (ENSRFEG00010009786) SLCO4C1 (ENSRFEG00010009830) SLCO6A1 (ENSRFEG00010009884) PAM (ENSRFEG00010010028) GIN1 (ENSRFEG00010010278) PPIP5K2 (ENSRFEG00010010456) MACIR (ENSRFEG00010010741) ENSRFEG00010010775 NUDT12 (ENSRFEG00010010948) EFNA5 (ENSRFEG00010011082) FBXL17 (ENSRFEG00010011260) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B.gb #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000159144.B.fb.b #28 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 Canidae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B.gb #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000159144.B.fb.b #28 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 76 ACP1 (ENSVVUG00000009341) ENSVVUG00000009333 TMEM18 (ENSVVUG00000009312) SNTG2 (ENSVVUG00000009013) TPO (ENSVVUG00000008985) PXDN (ENSVVUG00000008766) ENSVVUG00000008727 EIPR1 (ENSVVUG00000008674) TRAPPC12 (ENSVVUG00000008654) ADI1 (ENSVVUG00000008646) RNASEH1 (ENSVVUG00000008633) RPS7 (ENSVVUG00000008628) COLEC11 (ENSVVUG00000008618) ALLC (ENSVVUG00000008603) ENSVVUG00000008582 ENSVVUG00000008555 #22 ENSVVUG00000008545 RSAD2 (ENSVVUG00000008530) RNF144A (ENSVVUG00000008507) ID2 (ENSVVUG00000008464) KIDINS220 (ENSVVUG00000003457) MBOAT2 (ENSVVUG00000002534) ASAP2 (ENSVVUG00000002403) ITGB1BP1 (ENSVVUG00000002216) CPSF3 (ENSVVUG00000002194) IAH1 (ENSVVUG00000002169) ADAM17 (ENSVVUG00000002136) YWHAQ (ENSVVUG00000002125) TAF1B (ENSVVUG00000001641) GRHL1 (ENSVVUG00000001610) KLF11 (ENSVVUG00000001585) Red fox MODERN SPECIES 133 ENSVVUG00000028335 HTR2A (ENSVVUG00000028338) #7 ESD (ENSVVUG00000028341) #8 LRCH1 (ENSVVUG00000028344) #9 ENSVVUG00000028357 RUBCNL (ENSVVUG00000028362) #11 LRRC63 (ENSVVUG00000028383) #13 LCP1 (ENSVVUG00000028385) #14 CPB2 (ENSVVUG00000028393) #15 ZC3H13 (ENSVVUG00000028395) #16 SIAH3 (ENSVVUG00000028402) #17 CBY2 (ENSVVUG00000028403) #18 ENSVVUG00000028408 #19 COG3 (ENSVVUG00000028413) #20 SLC25A30 (ENSVVUG00000028417) #21 TPT1 (ENSVVUG00000028420) #22 GTF2F2 (ENSVVUG00000028424) #24 KCTD4 (ENSVVUG00000028428) #23 GPALPP1 (ENSVVUG00000028432) NUFIP1 (ENSVVUG00000028438) #26 TSC22D1 (ENSVVUG00000028447) #28 TSC22D1 (ENSVVUG00000028449) ENSVVUG00000028452 ENSVVUG00000028460 LACC1 (ENSVVUG00000028475) #31 CCDC122 (ENSVVUG00000028479) #32 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000016051.j.c #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B.gb #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000159144.B.fb.b #28 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 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(ENSNVIG00000001108) #36 TNFSF11 (ENSNVIG00000001142) #37 AKAP11 (ENSNVIG00000001185) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b.t ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000006051.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B.gb #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000159144.B.fb.b #28 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 Ursus ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b.t ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 ENSGT00390000006051.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B.gb #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 ENSGT00940000153313.B American black bear MODERN SPECIES 440 ENSUAMG00000025413 SIAH3 (ENSUAMG00000025414) #17 CBY2 (ENSUAMG00000025415) #18 COG3 (ENSUAMG00000025417) #20 SLC25A30 (ENSUAMG00000025420) #21 TPT1 (ENSUAMG00000025423) #22 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 17 MED4 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ENSGT00390000005130 #32 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 4796 ENSDNOG00000044267 #22 STMND1 (ENSDNOG00000044643) RBM24 (ENSDNOG00000047488) CAP2 (ENSDNOG00000041209) FAM8A1 (ENSDNOG00000001150) NUP153 (ENSDNOG00000001153) KIF13A (ENSDNOG00000008378) ENSDNOG00000034807 Armadillo MODERN SPECIES 1505 CBY2 (ENSDNOG00000043420) #18 ENSDNOG00000038674 #19 ENSDNOG00000044520 COG3 (ENSDNOG00000006811) #20 SLC25A30 (ENSDNOG00000012057) #21 ENSDNOG00000000653 #22 ENSDNOG00000045540 #24 KCTD4 (ENSDNOG00000000779) #23 GPALPP1 (ENSDNOG00000032373) #25 NUFIP1 (ENSDNOG00000032481) #26 TSC22D1 (ENSDNOG00000045575) #28 ENSDNOG00000049080 ENSDNOG00000035109 LACC1 (ENSDNOG00000001688) #31 CCDC122 (ENSDNOG00000001686) #32 Armadillo MODERN SPECIES 3081 GSAP (ENSDNOG00000007203) ENSDNOG00000040281 PTPN12 (ENSDNOG00000031767) ENSDNOG00000003023 TMEM60 (ENSDNOG00000004243) ENSDNOG00000035710 PHTF2 (ENSDNOG00000013570) ENSDNOG00000047407 ENSDNOG00000037388 ENSDNOG00000030907 ENSDNOG00000044752 ENSDNOG00000049440 ENSDNOG00000038653 ENSDNOG00000041719 ENSDNOG00000032769 ENSDNOG00000048457 #22 ENSDNOG00000049495 GNAI1 (ENSDNOG00000037739) GNAT3 (ENSDNOG00000024709) CD36 (ENSDNOG00000016575) SEMA3C (ENSDNOG00000004152) ENSDNOG00000040700 ENSDNOG00000033964 HGF (ENSDNOG00000040861) CACNA2D1 (ENSDNOG00000017761) ENSDNOG00000006996 ENSDNOG00000038074 SEMA3E (ENSDNOG00000031661) SEMA3A (ENSDNOG00000005476) SEMA3D (ENSDNOG00000002492) Armadillo MODERN SPECIES 1814 DNAH11 (ENSDNOG00000014510) CDCA7L (ENSDNOG00000031310) RAPGEF5 (ENSDNOG00000034316) ENSDNOG00000017107 TOMM7 (ENSDNOG00000018461) ENSDNOG00000043299 KLHL7 (ENSDNOG00000001169) NUP42 (ENSDNOG00000048997) GPNMB (ENSDNOG00000005523) MALSU1 (ENSDNOG00000025603) IGF2BP3 (ENSDNOG00000013164) TRA2A (ENSDNOG00000039446) ENSDNOG00000033540 #22 CCDC126 (ENSDNOG00000048562) FAM221A (ENSDNOG00000013558) Armadillo MODERN SPECIES 1235 ENSDNOG00000047979 ENSDNOG00000036152 ENSDNOG00000041365 #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.b #22 Hyrax MODERN SPECIES 11148 TPT1 (ENSPCAG00000016228) #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Elephant MODERN SPECIES 108 ENKUR (ENSLAFG00000015408) THNSL1 (ENSLAFG00000015412) MYO3A (ENSLAFG00000009248) GAD2 (ENSLAFG00000009255) ENSLAFG00000030960 ENSLAFG00000016457 ENSLAFG00000028353 PDSS1 (ENSLAFG00000017974) ABI1 (ENSLAFG00000017979) ACBD5 (ENSLAFG00000002908) MASTL (ENSLAFG00000030503) YME1L1 (ENSLAFG00000021743) ANKRD26 (ENSLAFG00000011946) PTCHD3 (ENSLAFG00000029781) RAB18 (ENSLAFG00000015582) ENSLAFG00000025535 ##22 MKX (ENSLAFG00000006126) ODAD2 (ENSLAFG00000016023) MPP7 (ENSLAFG00000010589) WAC (ENSLAFG00000006631) BAMBI (ENSLAFG00000029472) ENSLAFG00000014906 MAP3K8 (ENSLAFG00000013461) MTPAP (ENSLAFG00000013452) JCAD (ENSLAFG00000011422) SVIL (ENSLAFG00000012494) ZNF438 (ENSLAFG00000008654) ZEB1 (ENSLAFG00000009663) ARHGAP12 (ENSLAFG00000015897) KIF5B (ENSLAFG00000017365) ENSLAFG00000029631 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Microbat MODERN SPECIES 956 IFT88 (ENSMLUG00000013369) EEF1AKMT1 (ENSMLUG00000000302) ENSMLUG00000012089 ENSMLUG00000029730 LATS2 (ENSMLUG00000017711) ENSMLUG00000013297 SAP18 (ENSMLUG00000002852) ENSMLUG00000001913 MRPL57 (ENSMLUG00000029331) ZDHHC20 (ENSMLUG00000014089) MICU2 (ENSMLUG00000014095) FGF9 (ENSMLUG00000004365) ENSMLUG00000008825 ENSMLUG00000028116 ENSMLUG00000029624 ENSMLUG00000025758 ##22 ENSMLUG00000028741 CECR2 (ENSMLUG00000015021) SLC25A18 (ENSMLUG00000014874) ENSMLUG00000014876 BCL2L13 (ENSMLUG00000014528) BID (ENSMLUG00000030257) ENSMLUG00000011774 PEX26 (ENSMLUG00000009801) TUBA8 (ENSMLUG00000002951) USP18 (ENSMLUG00000005462) SOHLH2 (ENSMLUG00000005505) SPART (ENSMLUG00000012067) CCNA1 (ENSMLUG00000000332) RFXAP (ENSMLUG00000013270) ENSMLUG00000006399 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 12 PEX1 (ENSRFEG00010016704) RBM48 (ENSRFEG00010016637) ENSRFEG00010016484 ENSRFEG00010016424 ENSRFEG00010016374 ENSRFEG00010016075 CDK6 (ENSRFEG00010016022) SAMD9 (ENSRFEG00010015996) SAMD9L (ENSRFEG00010015978) VPS50 (ENSRFEG00010014985) CALCR (ENSRFEG00010014905) TFPI2 (ENSRFEG00010014830) GNG11 (ENSRFEG00010014793) GNGT1 (ENSRFEG00010014766) ENSRFEG00010014433 ENSRFEG00010014344 ##22 COL1A2 (ENSRFEG00010012884) CASD1 (ENSRFEG00010012815) ENSRFEG00010012740 SGCE (ENSRFEG00010012077) PEG10 (ENSRFEG00010011916) PPP1R9A (ENSRFEG00010011710) PON1 (ENSRFEG00010011514) PON2 (ENSRFEG00010011413) ASB4 (ENSRFEG00010011309) PDK4 (ENSRFEG00010011206) ENSRFEG00010011186 DYNC1I1 (ENSRFEG00010010978) SLC25A13 (ENSRFEG00010010892) ENSRFEG00010010866 ENSRFEG00010010788 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Cat MODERN SPECIES 252 DIAPH2 (ENSFCAG00000029591) NAP1L3 (ENSFCAG00000053543) ENSFCAG00000037948 ENSFCAG00000023574 ENSFCAG00000044982 ENSFCAG00000052791 ENSFCAG00000004582 ENSFCAG00000047441 DACH2 (ENSFCAG00000022761) CHM (ENSFCAG00000030652) POF1B (ENSFCAG00000031668) ZNF711 (ENSFCAG00000013317) APOOL (ENSFCAG00000033790) ENSFCAG00000051849 HDX (ENSFCAG00000005781) ENSFCAG00000039681 ##22 RPS6KA6 (ENSFCAG00000009130) CYLC1 (ENSFCAG00000012662) ENSFCAG00000048151 POU3F4 (ENSFCAG00000011964) ENSFCAG00000025360 SH3BGRL (ENSFCAG00000030770) ENSFCAG00000037632 BRWD3 (ENSFCAG00000022198) TENT5D (ENSFCAG00000031837) ENSFCAG00000018360 TBX22 (ENSFCAG00000002301) ITM2A (ENSFCAG00000007957) P2RY10 (ENSFCAG00000035535) CYSLTR1 (ENSFCAG00000024786) ENSFCAG00000022156 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 lion MODERN SPECIES 16 RCC1L (ENSPLOG00000018199) CASTOR2 (ENSPLOG00000018154) AUTS2 (ENSPLOG00000017305) GALNT17 (ENSPLOG00000017045) CALN1 (ENSPLOG00000016945) ENSPLOG00000016581 SBDS (ENSPLOG00000016501) TMEM248 (ENSPLOG00000016467) RABGEF1 (ENSPLOG00000016408) KCTD7 (ENSPLOG00000016310) TPST1 (ENSPLOG00000016253) CRCP (ENSPLOG00000016180) ASL (ENSPLOG00000015644) GUSB (ENSPLOG00000015513) VKORC1L1 (ENSPLOG00000015459) ENSPLOG00000015440 ##22 NUPR2 (ENSPLOG00000015402) CHCHD2 (ENSPLOG00000015372) PHKG1 (ENSPLOG00000015200) SUMF2 (ENSPLOG00000015147) CCT6A (ENSPLOG00000014865) ENSPLOG00000014811 PSPH (ENSPLOG00000014744) NIPSNAP2 (ENSPLOG00000014670) MRPS17 (ENSPLOG00000014605) ZNF713 (ENSPLOG00000014498) SEPTIN14 (ENSPLOG00000014348) ENSPLOG00000014261 ENSPLOG00000014152 ENSPLOG00000014102 SGF29 (ENSPLOG00000014051) leopard DUPLICATION leopard MODERN SPECIES 3 ENSPPRG00000004303 DDIT4L (ENSPPRG00000004016) ENSPPRG00000015419 PPP3CA (ENSPPRG00000014654) BANK1 (ENSPPRG00000009338) SLC39A8 (ENSPPRG00000007552) NFKB1 (ENSPPRG00000005244) MANBA (ENSPPRG00000002000) ENSPPRG00000000294 CISD2 (ENSPPRG00000024527) SLC9B1 (ENSPPRG00000024578) SLC9B2 (ENSPPRG00000018446) BDH2 (ENSPPRG00000013357) CENPE (ENSPPRG00000012778) TACR3 (ENSPPRG00000003966) ENSPPRG00000003687 ##22 CXXC4 (ENSPPRG00000002765) TET2 (ENSPPRG00000002345) PPA2 (ENSPPRG00000000625) ENSPPRG00000016640 ENSPPRG00000015602 INTS12 (ENSPPRG00000014557) GSTCD (ENSPPRG00000012754) NPNT (ENSPPRG00000010205) TBCK (ENSPPRG00000006296) ENSPPRG00000003078 GIMD1 (ENSPPRG00000002041) DKK2 (ENSPPRG00000001046) ENSPPRG00000000898 PAPSS1 (ENSPPRG00000022612) ENSPPRG00000022924 leopard MODERN SPECIES 16 C1orf141 (ENSPPRG00000004147) SLC35D1 (ENSPPRG00000003133) MIER1 (ENSPPRG00000002692) DNAI4 (ENSPPRG00000022534) DYNLT5 (ENSPPRG00000019016) SGIP1 (ENSPPRG00000017177) PDE4B (ENSPPRG00000011824) LEPR (ENSPPRG00000006910) LEPROT (ENSPPRG00000002176) DNAJC6 (ENSPPRG00000002001) ENSPPRG00000000962 ENSPPRG00000000367 JAK1 (ENSPPRG00000022662) RAVER2 (ENSPPRG00000023350) CACHD1 (ENSPPRG00000023686) ENSPPRG00000023862 ##22 UBE2U (ENSPPRG00000021247) ROR1 (ENSPPRG00000017823) ENSPPRG00000013850 PGM1 (ENSPPRG00000013727) EFCAB7 (ENSPPRG00000012738) ITGB3BP (ENSPPRG00000012409) ALG6 (ENSPPRG00000011811) FOXD3 (ENSPPRG00000014919) ATG4C (ENSPPRG00000009565) DOCK7 (ENSPPRG00000007918) ANGPTL3 (ENSPPRG00000013921) USP1 (ENSPPRG00000013661) KANK4 (ENSPPRG00000013316) L1TD1 (ENSPPRG00000011113) ENSPPRG00000011020 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Dog MODERN SPECIES 33 DNAI4 (ENSCAFG00845027932) TCTEX1D1 (ENSCAFG00845028056) SGIP1 (ENSCAFG00845028227) PDE4B (ENSCAFG00845028786) ENSCAFG00845029063 LEPR (ENSCAFG00845029124) LEPROT (ENSCAFG00845029345) DNAJC6 (ENSCAFG00845029438) AK4 (ENSCAFG00845029543) ENSCAFG00845004516 JAK1 (ENSCAFG00845004547) RAVER2 (ENSCAFG00845004615) ENSCAFG00845004661 CACHD1 (ENSCAFG00845004709) ENSCAFG00845004792 ENSCAFG00845004800 ##22 ENSCAFG00845004810 UBE2U (ENSCAFG00845004817) ROR1 (ENSCAFG00845004850) ENSCAFG00845004877 PGM1 (ENSCAFG00845004898) EFCAB7 (ENSCAFG00845004924) ITGB3BP (ENSCAFG00845004941) ALG6 (ENSCAFG00845004972) FOXD3 (ENSCAFG00845004983) ENSCAFG00845004987 ENSCAFG00845004990 ATG4C (ENSCAFG00845005004) DOCK7 (ENSCAFG00845005064) ANGPTL3 (ENSCAFG00845005144) USP1 (ENSCAFG00845005152) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 American mink MODERN SPECIES 25 AVPI1 (ENSNVIG00000019986) PI4K2A (ENSNVIG00000020017) MORN4 (ENSNVIG00000020040) HOGA1 (ENSNVIG00000020057) ANKRD2 (ENSNVIG00000020081) UBTD1 (ENSNVIG00000020107) MMS19 (ENSNVIG00000020128) ZDHHC16 (ENSNVIG00000020289) EXOSC1 (ENSNVIG00000020409) PGAM1 (ENSNVIG00000020444) RRP12 (ENSNVIG00000020453) ENSNVIG00000020615 ARHGAP19 (ENSNVIG00000020620) SLIT1 (ENSNVIG00000020673) LCOR (ENSNVIG00000020819) ENSNVIG00000020852 ##22 PIK3AP1 (ENSNVIG00000020853) TM9SF3 (ENSNVIG00000020907) TLL2 (ENSNVIG00000020943) OPALI (ENSNVIG00000020971) DNTT (ENSNVIG00000021063) BLNK (ENSNVIG00000021085) ZNF518A (ENSNVIG00000021174) CCNJ (ENSNVIG00000000041) CC2D2B (ENSNVIG00000000061) ENSNVIG00000000232 ENTPD1 (ENSNVIG00000000246) TCTN3 (ENSNVIG00000000329) ALDH18A1 (ENSNVIG00000000413) SORBS1 (ENSNVIG00000000477) PDLIM1 (ENSNVIG00000001856) Ferret MODERN SPECIES 284 ENSMPUG00000016707 ENSMPUG00000016708 ##22 ENSMPUG00000020126 TAFA2 (ENSMPUG00000016710) USP15 (ENSMPUG00000016712) MON2 (ENSMPUG00000016714) PPM1H (ENSMPUG00000016718) ENSMPUG00000016720 ENSMPUG00000020127 C12orf56 (ENSMPUG00000016721) KICS2 (ENSMPUG00000016723) SRGAP1 (ENSMPUG00000016725) RXYLT1 (ENSMPUG00000016726) AVPR1A (ENSMPUG00000016730) ENSMPUG00000016731 ENSMPUG00000016737 ENSMPUG00000016739 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 American black bear MODERN SPECIES 5323 ENSUAMG00000009935 ##22 ENSUAMG00000009942 Polar bear MODERN SPECIES 269 FAM167A (ENSUMAG00000021804) BLK (ENSUMAG00000021800) GATA4 (ENSUMAG00000021798) ENSUMAG00000021797 NEIL2 (ENSUMAG00000021796) FDFT1 (ENSUMAG00000021777) ENSUMAG00000021775 ENSUMAG00000021774 ENSUMAG00000021773 DEFB136 (ENSUMAG00000021771) DEFB135 (ENSUMAG00000021769) DEFB134 (ENSUMAG00000021767) ENSUMAG00000021765 ENSUMAG00000021763 ENSUMAG00000021759 ENSUMAG00000021755 ##22 ADAM29 (ENSUMAG00000021750) GLRA3 (ENSUMAG00000021724) HPGD (ENSUMAG00000021714) CEP44 (ENSUMAG00000021708) FBXO8 (ENSUMAG00000021704) SCRG1 (ENSUMAG00000021698) SAP30 (ENSUMAG00000021695) HMGB2 (ENSUMAG00000021691) GALNT7 (ENSUMAG00000021679) GALNTL6 (ENSUMAG00000021673) ENSUMAG00000021670 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Chacoan peccary MODERN SPECIES 104 ENSCWAG00000002578 ABCC11 (ENSCWAG00000002486) ABCC12 (ENSCWAG00000002352) PHKB (ENSCWAG00000002211) ITFG1 (ENSCWAG00000002149) NETO2 (ENSCWAG00000002107) DNAJA2 (ENSCWAG00000002085) GPT2 (ENSCWAG00000002047) ENSCWAG00000002014 ##22 ENSCWAG00000001992 MYLK3 (ENSCWAG00000001954) ORC6 (ENSCWAG00000001931) VPS35 (ENSCWAG00000001902) SHCBP1 (ENSCWAG00000001888) UQCRFS1 (ENSCWAG00000001869) VSTM2B (ENSCWAG00000001853) POP4 (ENSCWAG00000001837) PLEKHF1 (ENSCWAG00000001825) C19orf12 (ENSCWAG00000001799) CCNE1 (ENSCWAG00000001690) URI1 (ENSCWAG00000001670) ZNF536 (ENSCWAG00000001663) ENSCWAG00000001653 TSHZ3 (ENSCWAG00000001647) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Goat MODERN SPECIES 27 ENSCHIG00000005142 ENSCHIG00000025046 ENSCHIG00000009474 ENSCHIG00000019572 ENSCHIG00000011025 IFNE (ENSCHIG00000008081) MTAP (ENSCHIG00000014710) ENSCHIG00000018121 CDKN2A (ENSCHIG00000025939) CDKN2B (ENSCHIG00000025845) DMRTA1 (ENSCHIG00000023134) ENSCHIG00000018988 ELAVL2 (ENSCHIG00000025894) ENSCHIG00000006162 IZUMO3 (ENSCHIG00000018315) ENSCHIG00000003269 ##22 TUSC1 (ENSCHIG00000012670) ENSCHIG00000026276 CAAP1 (ENSCHIG00000017091) PLAA (ENSCHIG00000014920) LRRC19 (ENSCHIG00000024759) IFT74 (ENSCHIG00000009508) TEK (ENSCHIG00000013962) EQTN (ENSCHIG00000008768) IFNK (ENSCHIG00000016395) MOB3B (ENSCHIG00000011582) C9orf72 (ENSCHIG00000014755) LINGO2 (ENSCHIG00000013346) ENSCHIG00000006618 ENSCHIG00000024316 ENSCHIG00000020484 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864.f #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT01100000263828.a.b ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051.j #24 ENSGT00390000017955.c.d.b ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 Bos ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158615 ENSGT00530000063811.B ENSGT00950000183187.C ENSGT00390000008432.k ENSGT00940000156548 ENSGT00950000183143.c.a ENSGT00940000156430 ENSGT00940000158984 ENSGT00940000155049 ENSGT00390000003405 ENSGT00940000159009 ENSGT00550000075075 ENSGT00940000155403.a ENSGT00390000018635.d ENSGT00940000156133 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000156488 ENSGT00440000039754 ENSGT00390000017134 ENSGT00390000015813.g.c ENSGT00900000141107 ENSGT00390000008873 ENSGT01020000230438.C ENSGT00940000159434 ENSGT00940000163029 ENSGT00950000183200.A.a.b.b.d ENSGT00940000156871 ENSGT00990000203589.a.a ENSGT00940000154184.A ENSGT00940000158425 ENSGT00940000160048 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158615 ENSGT00530000063811.B ENSGT00950000183187.C ENSGT00390000008432.k ENSGT00940000156548 ENSGT00950000183143.c.a ENSGT00940000156430 ENSGT00940000158984 ENSGT00940000155049 ENSGT00390000003405 ENSGT00940000159009 ENSGT00550000075075 ENSGT00940000155403.a ENSGT00390000018635.d ENSGT00940000156133 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000156488 ENSGT00390000017134 ENSGT00390000015813.g.c ENSGT00900000141107 ENSGT00390000008873 ENSGT01020000230438.C ENSGT00940000159434 ENSGT00940000163029 ENSGT00950000183200.A.a.b.b.d ENSGT00940000156871 ENSGT00990000203589.a.a ENSGT00940000154184.A ENSGT00940000158425 ENSGT00940000160048 ENSGT00940000157699 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 8 FAM222A (ENSBIXG00005001698) MVK (ENSBIXG00005005272) ENSBIXG00005030844 UBE3B (ENSBIXG00005030833) KCTD10 (ENSBIXG00005030825) MYO1H (ENSBIXG00005030807) FOXN4 (ENSBIXG00005030787) ENSBIXG00005030776 ACACB (ENSBIXG00005030750) UNG (ENSBIXG00005030729) ALKBH2 (ENSBIXG00005030723) USP30 (ENSBIXG00005030700) SVOP (ENSBIXG00005030662) DAO (ENSBIXG00005030642) SSH1 (ENSBIXG00005030627) ENSBIXG00005030614 ##22 CORO1C (ENSBIXG00005030577) TMEM119 (ENSBIXG00005030566) ENSBIXG00005030553 SART3 (ENSBIXG00005030538) FICD (ENSBIXG00005030531) CMKLR1 (ENSBIXG00005030526) WSCD2 (ENSBIXG00005030520) ENSBIXG00005030513 PIWIL3 (ENSBIXG00005030504) SGSM1 (ENSBIXG00005030477) LHFPL7 (ENSBIXG00005030465) KIAA1671 (ENSBIXG00005030433) CRYBB3 (ENSBIXG00005030408) CRYBB2 (ENSBIXG00005030401) GRK3 (ENSBIXG00005030369) Cow MODERN SPECIES 8 TRPV4 (ENSBTAG00000000031) FAM222A (ENSBTAG00000050459) MVK (ENSBTAG00000005183) MMAB (ENSBTAG00000005178) UBE3B (ENSBTAG00000002698) KCTD10 (ENSBTAG00000002697) MYO1H (ENSBTAG00000002695) FOXN4 (ENSBTAG00000010847) ACACB (ENSBTAG00000022058) ALKBH2 (ENSBTAG00000019846) USP30 (ENSBTAG00000019845) SVOP (ENSBTAG00000018833) DAO (ENSBTAG00000018831) SSH1 (ENSBTAG00000018825) CORO1C (ENSBTAG00000007993) ENSBTAG00000023431 ##22 SELPLG (ENSBTAG00000031851) TMEM119 (ENSBTAG00000031849) ISCU (ENSBTAG00000011787) SART3 (ENSBTAG00000031846) FICD (ENSBTAG00000011771) CMKLR1 (ENSBTAG00000022039) WSCD2 (ENSBTAG00000013686) ENSBTAG00000054184 PIWIL3 (ENSBTAG00000015526) SGSM1 (ENSBTAG00000006592) LHFPL7 (ENSBTAG00000006594) KIAA1671 (ENSBTAG00000044022) CRYBB3 (ENSBTAG00000001255) CRYBB2 (ENSBTAG00000004088) GRK3 (ENSBTAG00000000005) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158615 ENSGT00530000063811.B ENSGT00950000183187.C ENSGT00390000008432.k ENSGT00940000156548 ENSGT00950000183143.c.a ENSGT00940000156430 ENSGT00940000158984 ENSGT00940000155049 ENSGT00390000003405 ENSGT00940000159009 ENSGT00550000075075 ENSGT00940000155403.a ENSGT00390000018635.d ENSGT00940000156133 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000156488 ENSGT00440000039754 ENSGT00390000017134 ENSGT00940000166181 ENSGT00390000015813.g.c ENSGT00900000141107 ENSGT00390000008873 ENSGT01020000230438.C ENSGT00940000159434 ENSGT00950000183200.A.a.b.b.d ENSGT00940000156871 ENSGT00990000203589.a.a ENSGT00940000154184.A ENSGT00940000158425 ENSGT00940000160048 Domestic yak MODERN SPECIES 7 MVK (ENSBGRG00000026564) MMAB (ENSBGRG00000026572) UBE3B (ENSBGRG00000026580) KCTD10 (ENSBGRG00000026589) MYO1H (ENSBGRG00000026594) FOXN4 (ENSBGRG00000026598) ACACB (ENSBGRG00000026733) UNG (ENSBGRG00000026811) ENSBGRG00000026812 ALKBH2 (ENSBGRG00000026813) USP30 (ENSBGRG00000026814) ENSBGRG00000026816 SVOP (ENSBGRG00000008549) DAO (ENSBGRG00000008709) SSH1 (ENSBGRG00000008960) ENSBGRG00000009875 ##22 CORO1C (ENSBGRG00000009932) ENSBGRG00000010188 TMEM119 (ENSBGRG00000010204) ENSBGRG00000010263 SART3 (ENSBGRG00000010444) FICD (ENSBGRG00000011172) CMKLR1 (ENSBGRG00000011229) WSCD2 (ENSBGRG00000011252) PIWIL3 (ENSBGRG00000011316) SGSM1 (ENSBGRG00000011610) LHFPL7 (ENSBGRG00000013603) ENSBGRG00000013651 ENSBGRG00000013693 CRYBB3 (ENSBGRG00000013971) CRYBB2 (ENSBGRG00000014130) Wild yak DUPLICATION Wild yak MODERN SPECIES 840 HTR2A (ENSBMUG00000012992) #7 ESD (ENSBMUG00000013017) #8 LRCH1 (ENSBMUG00000013162) #9 RUBCNL (ENSBMUG00000013349) #11 LRRC63 (ENSBMUG00000013390) #13 LCP1 (ENSBMUG00000013445) #14 ENSBMUG00000013466 CPB2 (ENSBMUG00000013516) #15 ZC3H13 (ENSBMUG00000013548) #16 SIAH3 (ENSBMUG00000013570) #17 CBY2 (ENSBMUG00000013573) #18 COG3 (ENSBMUG00000013643) #20 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ENSGT00390000006051.a.b.a.a.h ##22 ENSGT00390000003453.a ENSGT00940000158828 ENSGT00390000018619 ENSGT00940000157242 ENSGT00940000159054 ENSGT00940000156325 ENSGT00550000074817 ENSGT00450000040296 ENSGT00530000064269 ENSGT00940000155244 ENSGT00940000155007 ENSGT00940000153558.b.i.b.a.a.g.b ENSGT00940000156806 ENSGT00390000006684 ENSGT00390000007535 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000016188 ENSGT00390000012082 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000016210 ENSGT00390000002564.a ENSGT00940000158864 ENSGT00390000001413.c ENSGT00940000156436 ENSGT00390000000860.b ENSGT00390000000945 ENSGT00940000161008 ENSGT00390000002416 ENSGT00940000154046.b ENSGT00390000008092.a.k.a ENSGT00940000158028 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.h ##22 ENSGT00390000003453.a ENSGT00940000158828 ENSGT00390000018619 ENSGT00940000157242 ENSGT00940000159054 ENSGT00940000156325 ENSGT00550000074817 ENSGT00450000040296 ENSGT00940000155244 ENSGT00940000155007 ENSGT00940000153558.b.i.b.a.a.h ENSGT00940000156806 ENSGT00390000006684 ENSGT00390000007535.b.a ENSGT01020000230598 Vaquita MODERN SPECIES 17 GALT (ENSPSNG00000000593) SIGMAR1 (ENSPSNG00000000502) ARID3C (ENSPSNG00000000474) DCTN3 (ENSPSNG00000000430) RPP25L (ENSPSNG00000000386) CNTFR (ENSPSNG00000000345) ENSPSNG00000000323 DNAI1 (ENSPSNG00000000264) FAM219A (ENSPSNG00000000206) C9orf24 (ENSPSNG00000000159) MYORG (ENSPSNG00000000126) NUDT2 (ENSPSNG00000000100) KIF24 (ENSPSNG00000003134) ENSPSNG00000003078 DCAF12 (ENSPSNG00000003034) ENSPSNG00000003019 ##22 UBAP2 (ENSPSNG00000002927) UBE2R2 (ENSPSNG00000002867) NOL6 (ENSPSNG00000002814) AQP3 (ENSPSNG00000002755) ENSPSNG00000002719 ENSPSNG00000002630 NFX1 (ENSPSNG00000002583) CHMP5 (ENSPSNG00000002557) BAG1 (ENSPSNG00000002526) B4GALT1 (ENSPSNG00000002474) SMU1 (ENSPSNG00000002392) ENSPSNG00000002376 APTX (ENSPSNG00000002301) TMEM215 (ENSPSNG00000002251) ENSPSNG00000002234 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000016188 ENSGT00390000012082 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000016210 ENSGT00390000002564.a ENSGT00940000158864 ENSGT00390000001413.c ENSGT00940000156436 ENSGT00390000000860.b ENSGT00390000000945 ENSGT00940000161008 ENSGT00390000002416 ENSGT00940000154046.b ENSGT00390000008092.a.k.a ENSGT00940000158028 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.h ##22 ENSGT00390000003453.a ENSGT00940000158828 ENSGT00390000018619 ENSGT00940000157242 ENSGT00940000153786.e.a.b.e.a ENSGT00940000159054 ENSGT00940000156325 ENSGT00550000074817 ENSGT00450000040296 ENSGT00940000155244 ENSGT00940000155007 ENSGT00940000153558.b.i.b.a.a.h ENSGT00940000156806 ENSGT00390000006684 ENSGT00390000007535.b.a Beluga whale MODERN SPECIES 50 IL11RA (ENSDLEG00000008108) SIGMAR1 (ENSDLEG00000008085) ARID3C (ENSDLEG00000008063) DCTN3 (ENSDLEG00000008051) RPP25L (ENSDLEG00000008042) CNTFR (ENSDLEG00000007948) ENHO (ENSDLEG00000007905) DNAI1 (ENSDLEG00000007879) FAM219A (ENSDLEG00000007874) C9orf24 (ENSDLEG00000007872) MYORG (ENSDLEG00000007868) NUDT2 (ENSDLEG00000007863) KIF24 (ENSDLEG00000007842) ENSDLEG00000007836 DCAF12 (ENSDLEG00000007833) ENSDLEG00000007831 ##22 UBAP2 (ENSDLEG00000007780) UBE2R2 (ENSDLEG00000007766) NOL6 (ENSDLEG00000007758) AQP3 (ENSDLEG00000007754) ENSDLEG00000007746 TFCP2 (ENSDLEG00000020960) ENSDLEG00000020958 ENSDLEG00000020955 NFX1 (ENSDLEG00000020947) CHMP5 (ENSDLEG00000020937) BAG1 (ENSDLEG00000020931) B4GALT1 (ENSDLEG00000020924) SMU1 (ENSDLEG00000020915) DNAJA1 (ENSDLEG00000020908) APTX (ENSDLEG00000020896) Narwhal DUPLICATION Narwhal MODERN SPECIES 312 SIGMAR1 (ENSMMNG00015018325) ENSMMNG00015018369 ARID3C (ENSMMNG00015018386) DCTN3 (ENSMMNG00015018419) RPP25L (ENSMMNG00015018545) CNTFR (ENSMMNG00015018571) ENSMMNG00015018615 DNAI1 (ENSMMNG00015018633) FAM219A (ENSMMNG00015018769) C9orf24 (ENSMMNG00015018846) MYORG (ENSMMNG00015018908) NUDT2 (ENSMMNG00015018921) KIF24 (ENSMMNG00015018952) ENSMMNG00015019055 DCAF12 (ENSMMNG00015019152) ENSMMNG00015019187 ##22 UBAP2 (ENSMMNG00015019218) UBE2R2 (ENSMMNG00015019308) NOL6 (ENSMMNG00015019353) AQP3 (ENSMMNG00015019451) ENSMMNG00015019480 ENSMMNG00015019525 NFX1 (ENSMMNG00015019641) CHMP5 (ENSMMNG00015019686) BAG1 (ENSMMNG00015019712) ENSMMNG00015019735 B4GALT1 (ENSMMNG00015019757) SMU1 (ENSMMNG00015019783) ENSMMNG00015019827 APTX (ENSMMNG00015019891) TMEM215 (ENSMMNG00015020032) Narwhal MODERN SPECIES 310 ACOT13 (ENSMMNG00015011208) TDP2 (ENSMMNG00015011165) KIAA0319 (ENSMMNG00015011029) ALDH5A1 (ENSMMNG00015010942) GPLD1 (ENSMMNG00015010888) MRS2 (ENSMMNG00015010842) DCDC2 (ENSMMNG00015010801) NRSN1 (ENSMMNG00015010781) HDGFL1 (ENSMMNG00015010748) PRL (ENSMMNG00015010715) SOX4 (ENSMMNG00015013347) CDKAL1 (ENSMMNG00015013320) E2F3 (ENSMMNG00015013298) MBOAT1 (ENSMMNG00015013281) ID4 (ENSMMNG00015013275) ENSMMNG00015013266 ##22 RNF144B (ENSMMNG00015013247) ENSMMNG00015013235 DEK (ENSMMNG00015013198) KDM1B (ENSMMNG00015013151) TPMT (ENSMMNG00015013119) ENSMMNG00015013110 NHLRC1 (ENSMMNG00015013102) KIF13A (ENSMMNG00015012910) NUP153 (ENSMMNG00015012788) FAM8A1 (ENSMMNG00015012765) CAP2 (ENSMMNG00015012703) RBM24 (ENSMMNG00015012652) STMND1 (ENSMMNG00015012629) ATXN1 (ENSMMNG00015012616) GMPR (ENSMMNG00015012605) Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Alpaca MODERN SPECIES 912 SEC63 (ENSVPAG00000011376) SCML4 (ENSVPAG00000011375) SOBP (ENSVPAG00000011373) ENSVPAG00000011372 ##22 PDSS2 (ENSVPAG00000011371) BEND3 (ENSVPAG00000011370) MTRES1 (ENSVPAG00000011369) ENSVPAG00000011368 QRSL1 (ENSVPAG00000011367) RTN4IP1 (ENSVPAG00000011366) CRYBG1 (ENSVPAG00000011365) ATG5 (ENSVPAG00000011364) PRDM1 (ENSVPAG00000011363) Arabian camel MODERN SPECIES 123 ENSCDRG00005008006 ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Tarsier MODERN SPECIES 5962 KCTD15 (ENSTSYG00000005133) ENSTSYG00000032742 ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 966 SPINK1 (ENSANAG00000023762) SCGB3A2 (ENSANAG00000023468) C5orf46 (ENSANAG00000037273) SPINK5 (ENSANAG00000034759) SPINK14 (ENSANAG00000029562) SPINK6 (ENSANAG00000037160) MARCOL (ENSANAG00000026951) SPINK13 (ENSANAG00000024157) SPINK7 (ENSANAG00000024041) ENSANAG00000037965 SPINK9 (ENSANAG00000017436) FBXO38 (ENSANAG00000025070) HTR4 (ENSANAG00000016946) ADRB2 (ENSANAG00000025525) SH3TC2 (ENSANAG00000019462) ENSANAG00000026413 ##22 ABLIM3 (ENSANAG00000036878) AFAP1L1 (ENSANAG00000024427) GRPEL2 (ENSANAG00000030295) PCYOX1L (ENSANAG00000020560) IL17B (ENSANAG00000020790) CSNK1A1 (ENSANAG00000021098) ARHGEF37 (ENSANAG00000025504) PPARGC1B (ENSANAG00000021830) PDE6A (ENSANAG00000035251) SLC26A2 (ENSANAG00000024045) TIGD6 (ENSANAG00000023656) HMGXB3 (ENSANAG00000021091) CSF1R (ENSANAG00000028025) ENSANAG00000027390 PDGFRB (ENSANAG00000036549) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Marmoset MODERN SPECIES 16 ARHGAP18 (ENSCJAG00000003308) LAMA2 (ENSCJAG00000003343) ENSCJAG00000079418 PTPRK (ENSCJAG00000003496) ENSCJAG00000083208 THEMIS (ENSCJAG00000003598) ENSCJAG00000070420 C6orf58 (ENSCJAG00000003611) SOGA3 (ENSCJAG00000048256) KIAA0408 (ENSCJAG00000003616) ENSCJAG00000022493 ECHDC1 (ENSCJAG00000003649) ENSCJAG00000084697 RNF146 (ENSCJAG00000056389) RSPO3 (ENSCJAG00000053376) ENSCJAG00000042779 ##22 CENPW (ENSCJAG00000038479) TRMT11 (ENSCJAG00000003686) HINT3 (ENSCJAG00000043717) ENSCJAG00000079710 NCOA7 (ENSCJAG00000003719) HEY2 (ENSCJAG00000056139) ENSCJAG00000085403 HDDC2 (ENSCJAG00000003773) ENSCJAG00000003786 RNF217 (ENSCJAG00000003808) ENSCJAG00000073808 NKAIN2 (ENSCJAG00000034582) TRDN (ENSCJAG00000003835) CLVS2 (ENSCJAG00000048309) ENSCJAG00000086822 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.i ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.i ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.i ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.i ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.i ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 104 ENSMNEG00000044241 ENSMNEG00000030366 CYP26A1 (ENSMNEG00000028946) CYP26C1 (ENSMNEG00000045176) EXOC6 (ENSMNEG00000043219) HHEX (ENSMNEG00000037100) KIF11 (ENSMNEG00000020591) ENSMNEG00000028830 IDE (ENSMNEG00000033204) MARCHF5 (ENSMNEG00000037845) CPEB3 (ENSMNEG00000045465) ENSMNEG00000030284 ENSMNEG00000033162 BTAF1 (ENSMNEG00000035134) TNKS2 (ENSMNEG00000036136) ENSMNEG00000029218 ##22 PPP1R3C (ENSMNEG00000040446) HECTD2 (ENSMNEG00000043171) PCGF5 (ENSMNEG00000041619) ENSMNEG00000031049 ANKRD1 (ENSMNEG00000045466) RPP30 (ENSMNEG00000033838) ENSMNEG00000011783 HTR7 (ENSMNEG00000038453) KIF20B (ENSMNEG00000030266) ENSMNEG00000016798 PANK1 (ENSMNEG00000005927) SLC16A12 (ENSMNEG00000032571) IFIT5 (ENSMNEG00000044200) IFIT3 (ENSMNEG00000028978) IFIT2 (ENSMNEG00000034947) Catarrhini DUPLICATION Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000000223 ENSGT01030000234614.B.a.a.a ENSGT00940000155591 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00910000147463 ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B ENSGT01030000235151 ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182858.B.b.a ENSGT00390000000223 ENSGT01030000234614.B.a.a.a ENSGT00940000155591 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B ENSGT01030000235151 ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b ENSGT00940000154254.a Pan ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182858.B.b.a ENSGT00390000000223 ENSGT01030000234614.B.a.a.a ENSGT00940000155591 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B ENSGT01030000235151 ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b ENSGT00940000154254.a Chimpanzee MODERN SPECIES 22 ENSPTRG00000049018 STOM (ENSPTRG00000021315) GSN (ENSPTRG00000021313) RAB14 (ENSPTRG00000021312) CNTRL (ENSPTRG00000021311) C5 (ENSPTRG00000021309) TRAF1 (ENSPTRG00000021307) PHF19 (ENSPTRG00000044184) PSMD5 (ENSPTRG00000021305) B3GALT9 (ENSPTRG00000046674) FBXW2 (ENSPTRG00000021304) ENSPTRG00000047009 MEGF9 (ENSPTRG00000021303) CDK5RAP2 (ENSPTRG00000021302) BRINP1 (ENSPTRG00000021301) ENSPTRG00000047705 ##22 TLR4 (ENSPTRG00000021299) TRIM32 (ENSPTRG00000021298) ASTN2 (ENSPTRG00000021297) ENSPTRG00000046834 PAPPA (ENSPTRG00000021296) ENSPTRG00000021295 TNC (ENSPTRG00000021294) TNFSF8 (ENSPTRG00000021293) TNFSF15 (ENSPTRG00000021292) TEX48 (ENSPTRG00000052346) TEX53 (ENSPTRG00000051173) TMEM268 (ENSPTRG00000021291) ATP6V1G1 (ENSPTRG00000021290) WHRN (ENSPTRG00000021289) AKNA (ENSPTRG00000021288) Bonobo MODERN SPECIES 22 ENSPPAG00000037253 ENSPPAG00000030402 STOM (ENSPPAG00000033707) GSN (ENSPPAG00000033077) RAB14 (ENSPPAG00000031759) CNTRL (ENSPPAG00000021663) C5 (ENSPPAG00000032861) TRAF1 (ENSPPAG00000041780) PHF19 (ENSPPAG00000041871) PSMD5 (ENSPPAG00000040526) B3GALT9 (ENSPPAG00000018320) FBXW2 (ENSPPAG00000030375) MEGF9 (ENSPPAG00000000986) CDK5RAP2 (ENSPPAG00000039121) BRINP1 (ENSPPAG00000032114) ENSPPAG00000042039 ##22 TLR4 (ENSPPAG00000031203) TRIM32 (ENSPPAG00000026037) ASTN2 (ENSPPAG00000030670) ENSPPAG00000022500 PAPPA (ENSPPAG00000031632) ENSPPAG00000043498 TNC (ENSPPAG00000033465) TNFSF8 (ENSPPAG00000043155) TNFSF15 (ENSPPAG00000027793) TEX48 (ENSPPAG00000010613) TEX53 (ENSPPAG00000004001) TMEM268 (ENSPPAG00000038943) ATP6V1G1 (ENSPPAG00000008393) WHRN (ENSPPAG00000039285) ENSPPAG00000015828 Gorilla MODERN SPECIES 22 ENSGGOG00000040156 STOM (ENSGGOG00000010215) GSN (ENSGGOG00000010202) RAB14 (ENSGGOG00000027624) CNTRL (ENSGGOG00000000954) C5 (ENSGGOG00000002285) TRAF1 (ENSGGOG00000002284) PHF19 (ENSGGOG00000002281) PSMD5 (ENSGGOG00000005709) B3GALT9 (ENSGGOG00000004852) FBXW2 (ENSGGOG00000007441) ENSGGOG00000025364 MEGF9 (ENSGGOG00000015277) CDK5RAP2 (ENSGGOG00000000178) BRINP1 (ENSGGOG00000005190) ENSGGOG00000042803 ##22 ENSGGOG00000043595 ENSGGOG00000037048 ENSGGOG00000042290 TRIM32 (ENSGGOG00000025006) ASTN2 (ENSGGOG00000038795) ENSGGOG00000039057 PAPPA (ENSGGOG00000007107) ENSGGOG00000026862 TNC (ENSGGOG00000010138) TNFSF15 (ENSGGOG00000010814) TEX48 (ENSGGOG00000042957) TEX53 (ENSGGOG00000036380) ENSGGOG00000024486 ATP6V1G1 (ENSGGOG00000041082) WHRN (ENSGGOG00000003758) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000000223 ENSGT00940000155591 ENSGT00940000155178 ENSGT00900000143673 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00910000147835 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00390000003140.B.i ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B.j.a ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b ENSGT00940000154254.a Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155591 ENSGT00900000143673 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00910000147835 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00390000003860.h.a.a ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00910000147463 ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B.i ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b ENSGT00940000154254.a ENSGT00390000012130 ENSGT00940000163466 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155591 ENSGT00900000143673 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00910000147835 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00390000003860.h.a.a.a ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00910000147463 ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B.i ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b ENSGT00940000154254.a Macaca ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155591 ENSGT00900000143673 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00910000147835 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00390000003860.h.a.a.a ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B.i ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b ENSGT00940000154254.a ENSGT00390000012130 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155591 ENSGT00900000143673 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00940000170471.B.a.b.b ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00390000003140.B.i ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B.j.a ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT01100000263539.a.a.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b Crab-eating macaque MODERN SPECIES 6 CNTRL (ENSMFAG00000001166) C5 (ENSMFAG00000033951) TRAF1 (ENSMFAG00000031255) PHF19 (ENSMFAG00000033849) PSMD5 (ENSMFAG00000003663) B3GALT9 (ENSMFAG00000062661) FBXW2 (ENSMFAG00000039416) MEGF9 (ENSMFAG00000049040) ENSMFAG00000060455 CDK5RAP2 (ENSMFAG00000039120) ENSMFAG00000063472 BRINP1 (ENSMFAG00000003931) ENSMFAG00000065255 ENSMFAG00000058815 BCAS4 (ENSMFAG00000044405) ENSMFAG00000024336 ##22 ENSMFAG00000061498 TLR4 (ENSMFAG00000042896) ENSMFAG00000063989 ENSMFAG00000048412 ENSMFAG00000044594 TRIM32 (ENSMFAG00000012352) ENSMFAG00000061748 PAPPA (ENSMFAG00000041618) TNC (ENSMFAG00000001848) TNFSF8 (ENSMFAG00000032731) TNFSF15 (ENSMFAG00000000937) TEX48 (ENSMFAG00000036582) TEX53 (ENSMFAG00000035868) ENSMFAG00000052387 TMEM268 (ENSMFAG00000041867) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155853 ENSGT01030000234614.B.a.a.a ENSGT00940000155591 ENSGT00940000155178 ENSGT00940000155434 ENSGT00940000155670.d ENSGT00940000161076 ENSGT00950000183180.a.a ENSGT00390000013040 ENSGT00940000162230 ENSGT00930000151016 ENSGT00940000161177 ENSGT00950000183190.a.b.a.a.k ENSGT00390000003860.h.a.a.a ENSGT00940000158084 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 ENSGT00910000147463 ENSGT00940000160949 ENSGT00390000003140.B.i ENSGT00940000156654 ENSGT00390000016096 ENSGT00940000155188.A ENSGT00390000011719 ENSGT01060000248544.a.a.a.a ENSGT00520000058076 ENSGT00910000146849 ENSGT00390000011559 ENSGT00940000154399.a.a.b ENSGT00950000183002.B.b ENSGT00940000154254.a Olive baboon MODERN SPECIES 4 RAB14 (ENSPANG00000025819) CNTRL (ENSPANG00000025820) C5 (ENSPANG00000025822) PHF19 (ENSPANG00000025817) PSMD5 (ENSPANG00000025810) B3GALT9 (ENSPANG00000048962) FBXW2 (ENSPANG00000025813) MEGF9 (ENSPANG00000025814) CDK5RAP2 (ENSPANG00000025815) ENSPANG00000047206 ENSPANG00000050049 ENSPANG00000049720 ENSPANG00000034969 BRINP1 (ENSPANG00000025809) ENSPANG00000037035 ENSPANG00000039681 ##22 TLR4 (ENSPANG00000025800) TRIM32 (ENSPANG00000021111) ASTN2 (ENSPANG00000025801) PAPPA (ENSPANG00000025803) TNC (ENSPANG00000025804) TNFSF8 (ENSPANG00000025806) TNFSF15 (ENSPANG00000025807) TEX48 (ENSPANG00000031965) TEX53 (ENSPANG00000033507) TMEM268 (ENSPANG00000025799) ATP6V1G1 (ENSPANG00000025798) WHRN (ENSPANG00000025783) AKNA (ENSPANG00000025784) ORM1 (ENSPANG00000025785) ENSPANG00000041341 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 978 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.a ##22 ENSGT00940000160778 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3282 ENSRROG00000042828 ##22 TLR4 (ENSRROG00000032814) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 426 ENSRBIG00000000050 ENSRBIG00000029433 ##22 TLR4 (ENSRBIG00000026429) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159529 ENSGT00580000081628 ENSGT01030000234642.a.a ENSGT00390000015948.b ENSGT00390000009265 ENSGT00940000156270 ENSGT00940000161451 ENSGT00940000164104 ENSGT00520000055570.A.a ENSGT00940000159064 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00910000147716 ENSGT00940000155535 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 ENSGT00940000157814 ENSGT00940000158418 ENSGT00940000153232.a.a ENSGT00390000006729 ENSGT00940000158766 ENSGT00390000015483 ENSGT00940000161953 ENSGT00720000108851 ENSGT00940000158754 ENSGT00940000159040 ENSGT00910000147115 ENSGT00950000183067.a.b.b ENSGT00950000182850.a.a ENSGT00950000182936.a.b.a ENSGT00940000158962 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159529 ENSGT00580000081628 ENSGT01030000234642.a.a ENSGT00390000015948.b ENSGT00390000009265 ENSGT00940000156270 ENSGT00940000161451 ENSGT00940000164104.b ENSGT00520000055570.A.a ENSGT00940000159064 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00910000147716 ENSGT00940000155535 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 ENSGT00940000157814 ENSGT00940000158418 ENSGT00940000153232.a.a ENSGT00390000006729 ENSGT00940000158766 ENSGT00390000015483 ENSGT00940000161953 ENSGT00720000108851 ENSGT00940000158754 ENSGT00940000159040 ENSGT00910000147115 ENSGT00950000183067.a.b.b ENSGT00950000182850.a.a ENSGT00950000182936.a.b.a ENSGT00940000158962 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153352.B.a.b ENSGT00940000159529 ENSGT00580000081628 ENSGT01030000234642.a.a ENSGT00390000015948.b ENSGT00390000009265 ENSGT00940000156270 ENSGT00940000161451 ENSGT00940000164104.b ENSGT00520000055570.A.a ENSGT00940000159064 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 ENSGT00940000157814 ENSGT00940000158418 ENSGT00940000153232.a.a ENSGT00390000006729 ENSGT00940000158766 ENSGT00390000015483 ENSGT00940000161953 ENSGT00720000108851 ENSGT00940000158754 ENSGT00940000159040 ENSGT00910000147115 ENSGT00950000183067.a.b.b ENSGT00950000182850.a.a ENSGT00950000182936.a.b.a ENSGT00940000158962 Olive baboon MODERN SPECIES 2 DUSP5 (ENSPANG00000047281) SMC3 (ENSPANG00000020807) RBM20 (ENSPANG00000020808) PDCD4 (ENSPANG00000020809) BBIP1 (ENSPANG00000037854) SHOC2 (ENSPANG00000020801) ADRA2A (ENSPANG00000050114) ENSPANG00000030169 GPAM (ENSPANG00000020792) TECTB (ENSPANG00000020793) ACSL5 (ENSPANG00000020795) ZDHHC6 (ENSPANG00000020796) VTI1A (ENSPANG00000020798) ENSPANG00000032092 TCF7L2 (ENSPANG00000020799) ENSPANG00000011878 ##22 HABP2 (ENSPANG00000020791) NRAP (ENSPANG00000020790) CASP7 (ENSPANG00000020745) PLEKHS1 (ENSPANG00000020746) DCLRE1A (ENSPANG00000020747) NHLRC2 (ENSPANG00000020749) ADRB1 (ENSPANG00000017618) CCDC186 (ENSPANG00000020751) TDRD1 (ENSPANG00000020752) VWA2 (ENSPANG00000020743) AFAP1L2 (ENSPANG00000020708) ABLIM1 (ENSPANG00000020709) FHIP2A (ENSPANG00000020711) TRUB1 (ENSPANG00000020712) ENSPANG00000045420 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.a.b ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 19 ENSMFAG00000065587 DUSP5 (ENSMFAG00000002031) ENSMFAG00000063112 SMC3 (ENSMFAG00000003098) RBM20 (ENSMFAG00000036795) ENSMFAG00000063286 ENSMFAG00000049620 GPAM (ENSMFAG00000032340) TECTB (ENSMFAG00000036424) ACSL5 (ENSMFAG00000001207) ZDHHC6 (ENSMFAG00000041749) VTI1A (ENSMFAG00000048356) TCF7L2 (ENSMFAG00000043191) ENSMFAG00000056541 ENSMFAG00000060855 ENSMFAG00000019971 ##22 ENSMFAG00000061496 HABP2 (ENSMFAG00000037647) NRAP (ENSMFAG00000001231) CASP7 (ENSMFAG00000045136) DCLRE1A (ENSMFAG00000040983) PLEKHS1 (ENSMFAG00000001676) NHLRC2 (ENSMFAG00000038268) CCDC186 (ENSMFAG00000031702) TDRD1 (ENSMFAG00000043487) VWA2 (ENSMFAG00000022092) ABLIM1 (ENSMFAG00000046222) FHIP2A (ENSMFAG00000045717) TRUB1 (ENSMFAG00000062394) ATRNL1 (ENSMFAG00000003582) ENSMFAG00000048224 Vervet Monkey MODERN SPECIES 28 MXI1 (ENSCSAG00000005171) SMNDC1 (ENSCSAG00000005169) DUSP5 (ENSCSAG00000005165) SMC3 (ENSCSAG00000005160) RBM20 (ENSCSAG00000005155) PDCD4 (ENSCSAG00000005152) BBIP1 (ENSCSAG00000005150) SHOC2 (ENSCSAG00000005147) ADRA2A (ENSCSAG00000018455) GPAM (ENSCSAG00000005144) TECTB (ENSCSAG00000005141) ACSL5 (ENSCSAG00000005137) ZDHHC6 (ENSCSAG00000005132) VTI1A (ENSCSAG00000005129) TCF7L2 (ENSCSAG00000005123) ENSCSAG00000005116 ##22 HABP2 (ENSCSAG00000005111) NRAP (ENSCSAG00000005102) CASP7 (ENSCSAG00000005095) PLEKHS1 (ENSCSAG00000005092) DCLRE1A (ENSCSAG00000005090) NHLRC2 (ENSCSAG00000005083) ADRB1 (ENSCSAG00000018456) CCDC186 (ENSCSAG00000005078) TDRD1 (ENSCSAG00000005071) VWA2 (ENSCSAG00000005040) AFAP1L2 (ENSCSAG00000005016) ABLIM1 (ENSCSAG00000004943) FHIP2A (ENSCSAG00000004893) TRUB1 (ENSCSAG00000004891) ATRNL1 (ENSCSAG00000004885) Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000155242.m ENSGT00940000154606.`c.b ENSGT00910000147593 ENSGT00950000183584 ENSGT00940000155085.b ENSGT00440000040163 ENSGT01050000244848.B.a.b ENSGT00390000015252.g.a.b ENSGT00390000015252.h ENSGT00390000015252.g.a.a ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00510000047029.z.e.e.b.b ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 ENSGT00510000047029.z.e.e.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843 ENSGT00950000183118.A.c.b ENSGT00940000163063 ENSGT00410000029400.f ENSGT00940000165171 ENSGT00410000029400.e ENSGT00940000160311 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00940000154744.m.a ENSGT00390000003601.a Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 486 ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00510000047029.z.e.e.b.b ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 ENSGT00510000047029.z.e.e.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.b.b ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843.g Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 790 RTL5 (ENSRBIG00000007618) NHSL2 (ENSRBIG00000041684) ENSRBIG00000030563 ##22 ERCC6L (ENSRBIG00000036588) ENSRBIG00000032127 ENSRBIG00000039804 CITED1 (ENSRBIG00000034641) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160693 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000155242.m ENSGT00940000154606.`c.b ENSGT00910000147593 ENSGT00950000183584 ENSGT00940000155085.b ENSGT00440000040163 ENSGT01050000244848.B.a.b ENSGT00390000015252.g.a.b ENSGT00390000015252.h ENSGT00390000015252.g.a.a ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 ENSGT00510000047029.z.e.e.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843 ENSGT00950000183118.A.c.b ENSGT00940000163063 ENSGT00410000029400.f ENSGT00410000029400.e ENSGT00940000160311 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00940000154744.m.a ENSGT00390000003601.a ENSGT00910000146883.A Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160693 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000155242.m ENSGT00940000154606.`c.b ENSGT00910000147593 ENSGT00950000183584 ENSGT00940000155085.b ENSGT00440000040163 ENSGT01050000244848.B.a.b ENSGT00390000015252.g.a.b ENSGT00390000015252.h ENSGT00390000015252.g.a.a ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 ENSGT00510000047029.z.e.e.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843 ENSGT00950000183118.A.c.b ENSGT00550000074828.a.g.b.l ENSGT00410000029400.f ENSGT00940000165171 ENSGT00940000160311 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00940000154744.m.a ENSGT00390000003601.a ENSGT00910000146883.A Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00910000147480 ENSGT00940000160693 ENSGT00940000154442 ENSGT00940000159429 ENSGT00940000155242.m ENSGT00940000154606.`c.b ENSGT00950000183584 ENSGT00940000155085.b ENSGT00440000040163 ENSGT01050000244848.B.a.b ENSGT00390000015252.g.a.b ENSGT00390000015252.h ENSGT00390000015252.g.a.a ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 ENSGT00510000047029.z.e.e.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843 ENSGT00950000183118.A.c.b ENSGT00410000029400.e ENSGT00940000163063 ENSGT00410000029400.f ENSGT00940000160311 ENSGT00940000162554 ENSGT00940000154744.m.a ENSGT00390000003601.a ENSGT00910000146883.A ENSGT00390000008296.b.a.a.h Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 207 ENSGT00940000163191 ENSGT00950000182963.b.b ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 ENSGT00510000047029.z.e.e.a ENSGT00940000156837 ENSGT00390000005569.x.a.b.a ENSGT00530000063624.B ENSGT00940000157843 ENSGT00950000183118.A.c.b ENSGT00550000074828.a.g.b.l ENSGT00940000160311 ENSGT00410000029400.e ENSGT00410000029400.f ENSGT00940000163063 Drill MODERN SPECIES 106 RTL5 (ENSMLEG00000026223) NHSL2 (ENSMLEG00000032450) ENSMLEG00000031609 ##22 ERCC6L (ENSMLEG00000000190) ENSMLEG00000009764 ENSMLEG00000035471 CITED1 (ENSMLEG00000031289) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.a ##22 Gibbon MODERN SPECIES 449 ENSNLEG00000034741 ZMYM3 (ENSNLEG00000001252) NONO (ENSNLEG00000001278) ITGB1BP2 (ENSNLEG00000001428) ENSNLEG00000032761 TAF1 (ENSNLEG00000000934) ENSNLEG00000030598 ENSNLEG00000032518 OGT (ENSNLEG00000001038) ENSNLEG00000036058 CXCR3 (ENSNLEG00000001116) ENSNLEG00000029115 ENSNLEG00000001121 NHSL2 (ENSNLEG00000018118) RTL5 (ENSNLEG00000018851) ENSNLEG00000018852 ##22 PIN4 (ENSNLEG00000036320) ERCC6L (ENSNLEG00000036284) ENSNLEG00000018121 CITED1 (ENSNLEG00000018122) HDAC8 (ENSNLEG00000018123) PHKA1 (ENSNLEG00000018124) ENSNLEG00000018125 ENSNLEG00000029049 ENSNLEG00000034046 ENSNLEG00000029617 ENSNLEG00000018128 NAP1L2 (ENSNLEG00000019044) CDX4 (ENSNLEG00000001025) ENSNLEG00000034883 CHIC1 (ENSNLEG00000033690) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.j.b.b ##22 Gibbon MODERN SPECIES 20 GPATCH2 (ENSNLEG00000014201) ENSNLEG00000028800 SPATA17 (ENSNLEG00000014182) RRP15 (ENSNLEG00000031373) TGFB2 (ENSNLEG00000014141) LYPLAL1 (ENSNLEG00000032025) SLC30A10 (ENSNLEG00000014114) EPRS1 (ENSNLEG00000013988) BPNT1 (ENSNLEG00000013965) ENSNLEG00000031718 IARS2 (ENSNLEG00000013853) RAB3GAP2 (ENSNLEG00000013829) ENSNLEG00000031289 MARK1 (ENSNLEG00000013822) C1orf115 (ENSNLEG00000027698) ENSNLEG00000018321 ##22 ENSNLEG00000013814 MTARC2 (ENSNLEG00000013794) MTARC1 (ENSNLEG00000013779) HLX (ENSNLEG00000013773) DUSP10 (ENSNLEG00000035713) HHIPL2 (ENSNLEG00000013732) TAF1A (ENSNLEG00000013687) MIA3 (ENSNLEG00000013613) AIDA (ENSNLEG00000013583) BROX (ENSNLEG00000013533) FAM177B (ENSNLEG00000028293) DISP1 (ENSNLEG00000013511) SUSD4 (ENSNLEG00000000441) CAPN8 (ENSNLEG00000013334) CAPN2 (ENSNLEG00000013341) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156638 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156283 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000158473 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000156778 ENSGT00510000048701 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00390000014904 ENSGT00940000162477 ENSGT01030000234595.A.b ENSGT00730000111123 ENSGT00950000183204.b.b.b ENSGT00390000010101 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000153467.a.a ENSGT01050000244948.c.b ENSGT00390000013215 ENSGT00940000162004 ENSGT00940000161511 ENSGT00400000024448 ENSGT00390000002789 ENSGT00940000157628 ENSGT00440000035378.d ENSGT00390000008481 ENSGT00390000000280 ENSGT00940000158696 ENSGT00940000156512.b.b ENSGT00940000155621 ENSGT00390000011342.g Mouse lemur MODERN SPECIES 28 GINM1 (ENSMICG00000006295) PPIL4 (ENSMICG00000006287) ZC3H12D (ENSMICG00000044838) TAB2 (ENSMICG00000027001) UST (ENSMICG00000014507) SASH1 (ENSMICG00000014483) SAMD5 (ENSMICG00000038329) STXBP5 (ENSMICG00000013483) ADGB (ENSMICG00000037898) RAB32 (ENSMICG00000007163) ENSMICG00000027491 GRM1 (ENSMICG00000036398) SHPRH (ENSMICG00000009309) FBXO30 (ENSMICG00000004876) EPM2A (ENSMICG00000044558) ENSMICG00000034510 ##22 ENSMICG00000029904 ENSMICG00000036180 ENSMICG00000045997 STX11 (ENSMICG00000038317) SF3B5 (ENSMICG00000014922) PLAGL1 (ENSMICG00000026500) ZC2HC1B (ENSMICG00000048162) ENSMICG00000009831 LTV1 (ENSMICG00000009827) PHACTR2 (ENSMICG00000009825) FUCA2 (ENSMICG00000026320) PEX3 (ENSMICG00000037542) ADAT2 (ENSMICG00000045010) AIG1 (ENSMICG00000013596) HIVEP2 (ENSMICG00000030485) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000156638 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156283 ENSGT00940000161388 ENSGT00940000158473 ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000156778 ENSGT00510000048701 ENSGT00950000182906.b.a ENSGT00390000014904 ENSGT00940000162477 ENSGT01030000234595.A.b ENSGT00730000111123 ENSGT00950000183204.b.b.b ENSGT00390000010101 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000153467.a.a ENSGT01050000244948.c.b ENSGT00390000013215 ENSGT00940000162004 ENSGT00940000161511 ENSGT00400000024448 ENSGT00390000002789 ENSGT00940000157628 ENSGT00440000035378.d ENSGT00390000008481 ENSGT00390000000280 ENSGT00940000158696 ENSGT00940000156512.b.b ENSGT00940000155621 ENSGT00390000011342.g Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 633 TAB2 (ENSPCOG00000023142) UST (ENSPCOG00000021446) ENSPCOG00000001613 SASH1 (ENSPCOG00000023715) ENSPCOG00000009057 SAMD5 (ENSPCOG00000022350) ENSPCOG00000019164 ENSPCOG00000020600 ADGB (ENSPCOG00000018353) RAB32 (ENSPCOG00000017810) GRM1 (ENSPCOG00000020912) SHPRH (ENSPCOG00000015634) ENSPCOG00000013550 FBXO30 (ENSPCOG00000012566) EPM2A (ENSPCOG00000014015) ENSPCOG00000023257 ##22 ENSPCOG00000028156 ENSPCOG00000027930 ENSPCOG00000022104 SF3B5 (ENSPCOG00000013754) PLAGL1 (ENSPCOG00000016061) ZC2HC1B (ENSPCOG00000022298) PHACTR2 (ENSPCOG00000000394) FUCA2 (ENSPCOG00000025962) PEX3 (ENSPCOG00000020993) ADAT2 (ENSPCOG00000006342) AIG1 (ENSPCOG00000021161) HIVEP2 (ENSPCOG00000006027) ADGRG6 (ENSPCOG00000009023) VTA1 (ENSPCOG00000017670) NMBR (ENSPCOG00000016109) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 478 PDK1 (ENSPCOG00000009920) ITGA6 (ENSPCOG00000020776) DLX2 (ENSPCOG00000010310) DLX1 (ENSPCOG00000001925) METAP1D (ENSPCOG00000007127) HAT1 (ENSPCOG00000020715) SLC25A12 (ENSPCOG00000020183) ENSPCOG00000015276 CYBRD1 (ENSPCOG00000020446) ENSPCOG00000015109 ENSPCOG00000018843 DCAF17 (ENSPCOG00000017687) METTL8 (ENSPCOG00000028842) TLK1 (ENSPCOG00000024648) GORASP2 (ENSPCOG00000016452) ENSPCOG00000026228 ##22 GAD1 (ENSPCOG00000008936) ENSPCOG00000006630 SP5 (ENSPCOG00000020629) MYO3B (ENSPCOG00000024102) UBR3 (ENSPCOG00000027735) METTL5 (ENSPCOG00000011627) SSB (ENSPCOG00000023189) KLHL23 (ENSPCOG00000028044) CFAP210 (ENSPCOG00000006861) PPIG (ENSPCOG00000016588) FASTKD1 (ENSPCOG00000024955) KLHL41 (ENSPCOG00000018624) BBS5 (ENSPCOG00000027299) LRP2 (ENSPCOG00000008020) DHRS9 (ENSPCOG00000020628) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Tree shrew DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 6154 ENSTBEG00000005051 ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 1486 ENSTBEG00000013288 #21 ENSTBEG00000013539 ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.b.f ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT01060000249039 ENSGT00940000166021 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 Hystricomorpha DUPLICATION Hystricomorpha DUPLICATION Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.o.a ##22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 2 CDADC1 (ENSHGLG00000007415) MLNR (ENSHGLG00000006363) FNDC3A (ENSHGLG00000007427) ENSHGLG00000011200 ENSHGLG00000034874 ENSHGLG00000043759 RCBTB2 (ENSHGLG00000003102) ENSHGLG00000037766 RB1 (ENSHGLG00000003581) ENSHGLG00000012986 ENSHGLG00000013614 MED4 (ENSHGLG00000013271) NUDT15 (ENSHGLG00000037073) ENSHGLG00000006869 ENSHGLG00000006924 ENSHGLG00000019880 ##22 ENSHGLG00000044798 HTR2A (ENSHGLG00000041937) #7 ENSHGLG00000002764 #8 LRCH1 (ENSHGLG00000003678) #9 ENSHGLG00000005637 RUBCNL (ENSHGLG00000043639) #11 ENSHGLG00000043742 #13 LCP1 (ENSHGLG00000002813) #14 CPB2 (ENSHGLG00000003312) #15 ZC3H13 (ENSHGLG00000006309) #16 SIAH3 (ENSHGLG00000008529) #17 CBY2 (ENSHGLG00000009737) #18 ENSHGLG00000002801 #20 ENSHGLG00000043699 ENSHGLG00000003289 #21 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 5 ARL4A (ENSHGLG00000042225) ENSHGLG00000008880 ENSHGLG00000018338 ENSHGLG00000012865 ENSHGLG00000038287 ENSHGLG00000016417 DOCK4 (ENSHGLG00000014862) IMMP2L (ENSHGLG00000007468) ENSHGLG00000048809 LRRN3 (ENSHGLG00000045388) ENSHGLG00000037470 ENSHGLG00000044477 ENSHGLG00000040202 DNAJB9 (ENSHGLG00000036548) THAP5 (ENSHGLG00000040131) ENSHGLG00000047483 ##22 ENSHGLG00000016141 NRCAM (ENSHGLG00000006695) ENSHGLG00000048059 ENSHGLG00000011069 ENSHGLG00000047313 ENSHGLG00000046637 ENSHGLG00000042517 LAMB1 (ENSHGLG00000008431) DLD 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(ENSHGLG00000001080) KRT71 (ENSHGLG00000000999) KRT5 (ENSHGLG00000000726) ENSHGLG00000032385 ENSHGLG00000000900 ENSHGLG00000035448 KRT75 (ENSHGLG00000006710) ENSHGLG00000004925 KRT82 (ENSHGLG00000004031) KRT84 (ENSHGLG00000003736) ENSHGLG00000038440 ##22 ENSHGLG00000003099 ENSHGLG00000008240 ENSHGLG00000034498 ENSHGLG00000001966 ENSHGLG00000019830 MRPS35 (ENSHGLG00000001828) ENSHGLG00000041806 KLHL42 (ENSHGLG00000001724) ENSHGLG00000033021 ENSHGLG00000030460 ENSHGLG00000013014 CCDC91 (ENSHGLG00000010299) FAR2 (ENSHGLG00000017822) ENSHGLG00000039287 ERGIC2 (ENSHGLG00000007580) Hystricomorpha DUPLICATION Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.o.b.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.o.b.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.o.b.a ##22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 159 ENSCLAG00000008631 USP48 (ENSCLAG00000007619) RAP1GAP (ENSCLAG00000011156) ALPL (ENSCLAG00000007567) ECE1 (ENSCLAG00000012254) EIF4G3 (ENSCLAG00000016985) HP1BP3 (ENSCLAG00000016763) SH2D5 (ENSCLAG00000013408) DDOST (ENSCLAG00000012871) PINK1 (ENSCLAG00000008925) CDA (ENSCLAG00000009273) FAM43B (ENSCLAG00000009147) MUL1 (ENSCLAG00000007620) CAMK2N1 (ENSCLAG00000011210) VWA5B1 (ENSCLAG00000009213) ENSCLAG00000007802 ##22 UBXN10 (ENSCLAG00000007262) PLA2G2C (ENSCLAG00000010694) PLA2G2F (ENSCLAG00000012631) PLA2G2D (ENSCLAG00000011736) PLA2G5 (ENSCLAG00000015123) PLA2G2A (ENSCLAG00000011020) PLA2G2E (ENSCLAG00000010074) OTUD3 (ENSCLAG00000008710) TMCO4 (ENSCLAG00000007271) ENSCLAG00000010769 NBL1 (ENSCLAG00000010096) MICOS10 (ENSCLAG00000012759) CAPZB (ENSCLAG00000007637) SLC66A1 (ENSCLAG00000011607) ENSCLAG00000012341 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 14 PAMR1 (ENSHGLG00000007733) ENSHGLG00000038577 FJX1 (ENSHGLG00000038500) TRIM44 (ENSHGLG00000006623) ENSHGLG00000035280 LDLRAD3 (ENSHGLG00000009909) COMMD9 (ENSHGLG00000039189) PRR5L (ENSHGLG00000006197) TRAF6 (ENSHGLG00000010513) RAG1 (ENSHGLG00000020565) RAG2 (ENSHGLG00000020564) IFTAP (ENSHGLG00000007037) ENSHGLG00000044878 ENSHGLG00000041917 LRRC4C (ENSHGLG00000042650) ENSHGLG00000047607 ##22 ENSHGLG00000013322 TTC17 (ENSHGLG00000017796) HSD17B12 (ENSHGLG00000043869) ALKBH3 (ENSHGLG00000019437) C11orf96 (ENSHGLG00000035452) ACCS (ENSHGLG00000018000) ENSHGLG00000035834 ENSHGLG00000032198 ALX4 (ENSHGLG00000016699) ENSHGLG00000035148 CD82 (ENSHGLG00000035958) TSPAN18 (ENSHGLG00000036138) ENSHGLG00000018116 SLC35C1 (ENSHGLG00000041560) CRY2 (ENSHGLG00000013242) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a.o.b.b ##22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES ENSHGLG00000041227 ENSHGLG00000047622 ENSHGLG00000004180 MYCT1 (ENSHGLG00000003966) VIP (ENSHGLG00000003764) ENSHGLG00000003666 FBXO5 (ENSHGLG00000003460) ENSHGLG00000003375 ENSHGLG00000003207 RGS17 (ENSHGLG00000007180) ENSHGLG00000033230 ENSHGLG00000006115 Oprm1 (ENSHGLG00000005417) IPCEF1 (ENSHGLG00000004122) CNKSR3 (ENSHGLG00000003681) ENSHGLG00000039109 ##22 ENSHGLG00000050628 SCAF8 (ENSHGLG00000003619) ENSHGLG00000042832 TIAM2 (ENSHGLG00000002352) CLDN20 (ENSHGLG00000019987) TFB1M (ENSHGLG00000002028) ENSHGLG00000003642 ENSHGLG00000041973 ENSHGLG00000002921 ENSHGLG00000002878 ENSHGLG00000013195 ENSHGLG00000039368 ENSHGLG00000018953 ENSHGLG00000046919 TMEM242 (ENSHGLG00000041592) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 4 ENSHGLG00000018201 NSMCE4A (ENSHGLG00000013057) ENSHGLG00000035516 ENSHGLG00000014774 BTBD16 (ENSHGLG00000010643) ENSHGLG00000043818 ENSHGLG00000009809 HTRA1 (ENSHGLG00000011897) ENSHGLG00000014651 ENSHGLG00000045576 ENSHGLG00000041620 ENSHGLG00000014383 ENSHGLG00000047493 ENSHGLG00000011520 ENSHGLG00000044519 ENSHGLG00000039988 ##22 ENSHGLG00000033348 ENSHGLG00000014509 TM9SF3 (ENSHGLG00000012450) TLL2 (ENSHGLG00000013626) OPALIN (ENSHGLG00000042100) DNTT (ENSHGLG00000009905) BLNK (ENSHGLG00000012499) ZNF518A (ENSHGLG00000021043) CCNJ 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GNPTG (ENSHGLG00000001484) UNKL (ENSHGLG00000001586) UQCC4 (ENSHGLG00000001649) PERCC1 (ENSHGLG00000042238) CCDC154 (ENSHGLG00000001687) CLCN7 (ENSHGLG00000001793) ENSHGLG00000049637 ENSHGLG00000034352 ENSHGLG00000035369 ENSHGLG00000036303 ENSHGLG00000000262 ENSHGLG00000037206 GSC2 (ENSHGLG00000000434) ENSHGLG00000000570 DGCR2 (ENSHGLG00000001472) ENSHGLG00000034329 ##22 ENSHGLG00000033842 ENSHGLG00000003125 ENSHGLG00000001801 ENSHGLG00000003024 ENSHGLG00000000846 ENSHGLG00000019565 ENSHGLG00000039487 ENSHGLG00000041490 ENSHGLG00000035684 ENSHGLG00000005401 P2RX6 (ENSHGLG00000000605) ENSHGLG00000000929 ENSHGLG00000048508 THAP7 (ENSHGLG00000038188) LZTR1 (ENSHGLG00000000653) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864.y #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.a.p ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT01060000249039 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 ENSGT00940000153313.B ENSGT00940000158106 Guinea pig DUPLICATION Guinea pig MODERN SPECIES 6 MED4 (ENSCPOG00000039834) ENSCPOG00000015058 ENSCPOG00000038770 SUCLA2 (ENSCPOG00000014961) HTR2A (ENSCPOG00000038918) #7 ESD (ENSCPOG00000011089) #8 LRCH1 (ENSCPOG00000011077) #9 RUBCNL (ENSCPOG00000008458) #11 LCP1 (ENSCPOG00000001937) #14 CPB2 (ENSCPOG00000000649) #15 ZC3H13 (ENSCPOG00000000646) #16 SIAH3 (ENSCPOG00000033748) #17 CBY2 (ENSCPOG00000036575) #18 COG3 (ENSCPOG00000009924) #20 SLC25A30 (ENSCPOG00000031582) #21 ENSCPOG00000009278 ##22 KCTD4 (ENSCPOG00000009346) #23 GTF2F2 (ENSCPOG00000009342) #24 ENSCPOG00000026022 NUFIP1 (ENSCPOG00000005828) #26 TSC22D1 (ENSCPOG00000000560) #28 ENSCPOG00000031530 LACC1 (ENSCPOG00000011253) #31 CCDC122 (ENSCPOG00000003514) #32 ENOX1 (ENSCPOG00000020461) #33 DNAJC15 (ENSCPOG00000003485) #34 ENSCPOG00000040476 #35 TNFSF11 (ENSCPOG00000031600) #37 AKAP11 (ENSCPOG00000006094) DGKH (ENSCPOG00000006087) VWA8 (ENSCPOG00000006076) Guinea pig MODERN SPECIES 37 TGFA (ENSCPOG00000009755) ADD2 (ENSCPOG00000005697) FIGLA (ENSCPOG00000027561) CLEC4F (ENSCPOG00000036583) CD207 (ENSCPOG00000004920) VAX2 (ENSCPOG00000019567) ATP6V1B1 (ENSCPOG00000010441) ENSCPOG00000010451 TEX261 (ENSCPOG00000036856) NAGK (ENSCPOG00000013306) PAIP2B (ENSCPOG00000013310) ENSCPOG00000031084 ENSCPOG00000030713 DYSF (ENSCPOG00000010197) CYP26B1 (ENSCPOG00000006456) ENSCPOG00000033484 ##22 EXOC6B (ENSCPOG00000010694) SPR (ENSCPOG00000027095) EMX1 (ENSCPOG00000033088) SFXN5 (ENSCPOG00000031020) ENSCPOG00000026289 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IFIT5 (ENSCPOG00000008531) IFIT1B (ENSCPOG00000038041) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.b.f ##22 ENSGT00390000016051.u.b #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT00940000154415.`b.f ENSGT01070000253816.a.a.b #37 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 2 NARS2 (ENSSVLG00005014874) GAB2 (ENSSVLG00005014816) USP35 (ENSSVLG00005014736) KCTD21 (ENSSVLG00005014693) ALG8 (ENSSVLG00005014631) NDUFC2 (ENSSVLG00005014553) THRSP (ENSSVLG00005014533) ENSSVLG00005014498 ENSSVLG00005014481 INTS4 (ENSSVLG00005014058) AAMDC (ENSSVLG00005013937) RSF1 (ENSSVLG00005013858) CLNS1A (ENSSVLG00005013729) AQP11 (ENSSVLG00005013502) PAK1 (ENSSVLG00005013431) ENSSVLG00005013294 ##22 GDPD4 (ENSSVLG00005013184) MYO7A (ENSSVLG00005012423) CAPN5 (ENSSVLG00005012247) B3GNT6 (ENSSVLG00005012209) ACER3 (ENSSVLG00005023904) TSKU (ENSSVLG00005023871) ENSSVLG00005023846 ENSSVLG00005023498 LRRC32 (ENSSVLG00005023371) EMSY (ENSSVLG00005023093) GVQW3 (ENSSVLG00005022970) THAP12 (ENSSVLG00005022917) WNT11 (ENSSVLG00005022863) UVRAG (ENSSVLG00005022785) DGAT2 (ENSSVLG00005022688) Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 ENSSVLG00005001915 TTC23 (ENSSVLG00005001983) SYNM (ENSSVLG00005002041) IGF1R (ENSSVLG00005002096) ENSSVLG00005002151 ENSSVLG00005002216 NR2F2 (ENSSVLG00005002243) 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ENSSVLG00005011869 ENSSVLG00005011850 ENSSVLG00005011819 ENSSVLG00005011794 ENSSVLG00005011779 ENSSVLG00005011731 ENSSVLG00005011705 ENSSVLG00005011645 ENSSVLG00005011618 ENSSVLG00005011597 ENSSVLG00005011580 ENSSVLG00005011531 ENSSVLG00005011505 ENSSVLG00005011479 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000012063 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000006051.b.f ##22 ENSGT00390000016051.u.b #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 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(ENSMMMG00000023481) Alpin marmot MODERN SPECIES 5 NEB (ENSMMMG00000021921) RIF1 (ENSMMMG00000021851) TNFAIP6 (ENSMMMG00000021834) ENSMMMG00000021827 NMI (ENSMMMG00000021825) RBM43 (ENSMMMG00000021824) ENSMMMG00000021801 ENSMMMG00000021776 ENSMMMG00000021771 ENSMMMG00000021752 RND3 (ENSMMMG00000021746) MMADHC (ENSMMMG00000021733) LYPD6 (ENSMMMG00000021723) LYPD6B (ENSMMMG00000021702) KIF5C (ENSMMMG00000021654) ENSMMMG00000021646 ##22 EPC2 (ENSMMMG00000021637) ENSMMMG00000021627 ENSMMMG00000021626 ENSMMMG00000021615 ENSMMMG00000021598 ACVR2A (ENSMMMG00000021587) ZEB2 (ENSMMMG00000021492) GTDC1 (ENSMMMG00000021476) ENSMMMG00000021461 ARHGAP15 (ENSMMMG00000021442) KYNU (ENSMMMG00000021410) LRP1B (ENSMMMG00000021313) NXPH2 (ENSMMMG00000021251) SPOPL (ENSMMMG00000021248) HNMT (ENSMMMG00000021232) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.a.a ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 3 CACNB4 (ENSUPAG00010001584) ENSUPAG00010001737 NEB (ENSUPAG00010001764) RIF1 (ENSUPAG00010002377) TNFAIP6 (ENSUPAG00010004346) NMI (ENSUPAG00010004358) RBM43 (ENSUPAG00010004382) ENSUPAG00010004388 ENSUPAG00010004396 RND3 (ENSUPAG00010004413) MMADHC (ENSUPAG00010004432) LYPD6 (ENSUPAG00010004464) LYPD6B (ENSUPAG00010004479) KIF5C (ENSUPAG00010004496) EPC2 (ENSUPAG00010004529) ENSUPAG00010004532 ##22 ENSUPAG00010004533 MBD5 (ENSUPAG00010004537) ORC4 (ENSUPAG00010004557) ACVR2A (ENSUPAG00010004582) ENSUPAG00010004608 ZEB2 (ENSUPAG00010004644) GTDC1 (ENSUPAG00010004826) ARHGAP15 (ENSUPAG00010004846) KYNU (ENSUPAG00010004892) LRP1B (ENSUPAG00010004938) ENSUPAG00010005063 ENSUPAG00010005074 NXPH2 (ENSUPAG00010005088) SPOPL (ENSUPAG00010005093) HNMT (ENSUPAG00010005103) Squirrel DUPLICATION Squirrel MODERN SPECIES 102 SLC9A7 (ENSSTOG00000009492) CHST7 (ENSSTOG00000025227) ENSSTOG00000030183 DIPK2B (ENSSTOG00000002326) KDM6A (ENSSTOG00000001596) ENSSTOG00000007072 FUNDC1 (ENSSTOG00000025782) EFHC2 (ENSSTOG00000014917) NDP (ENSSTOG00000010960) MAOB (ENSSTOG00000004985) MAOA (ENSSTOG00000004958) GPR82 (ENSSTOG00000028760) GPR34 (ENSSTOG00000001566) CASK (ENSSTOG00000005927) NYX (ENSSTOG00000027262) ENSSTOG00000029381 ##22 DDX3X (ENSSTOG00000008094) USP9X (ENSSTOG00000000797) MED14 (ENSSTOG00000022333) CXorf38 (ENSSTOG00000005469) MPC1L (ENSSTOG00000026402) ENSSTOG00000031229 ATP6AP2 (ENSSTOG00000005456) BCOR (ENSSTOG00000003219) MID1IP1 (ENSSTOG00000027194) TSPAN7 (ENSSTOG00000012077) ENSSTOG00000019432 OTC (ENSSTOG00000004056) ENSSTOG00000022470 SRPX (ENSSTOG00000007767) ENSSTOG00000023192 Squirrel MODERN SPECIES 187 LMO3 (ENSSTOG00000005894) MGST1 (ENSSTOG00000007696) SLC15A5 (ENSSTOG00000008472) ENSSTOG00000019960 ##22 DERA (ENSSTOG00000026509) STRAP (ENSSTOG00000000951) EPS8 (ENSSTOG00000012019) PTPRO (ENSSTOG00000011996) RERG (ENSSTOG00000023505) ARHGDIB (ENSSTOG00000026777) PDE6H (ENSSTOG00000009094) ERP27 (ENSSTOG00000027017) MGP (ENSSTOG00000011249) ART4 (ENSSTOG00000011244) SMCO3 (ENSSTOG00000021116) ENSSTOG00000011228 H2AJ (ENSSTOG00000026866) ENSSTOG00000025951 GUCY2C (ENSSTOG00000000539) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 3930 HDX (ENSDNOG00000032839) ENSDNOG00000031307 ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT01030000235083 ENSGT00940000165996 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000163575 #25 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 ENSGT00940000153313.B Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT01030000235083 ENSGT00940000165996 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000163575 #25 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 ENSGT00940000153313.B Elephant MODERN SPECIES 239 ENSLAFG00000027647 SUCLA2 (ENSLAFG00000009678) HTR2A (ENSLAFG00000015014) #7 ESD (ENSLAFG00000006901) #8 LRCH1 (ENSLAFG00000006893) #9 RUBCNL (ENSLAFG00000014959) #11 LRRC63 (ENSLAFG00000011144) #13 LCP1 (ENSLAFG00000009574) #14 CPB2 (ENSLAFG00000016759) #15 ENSLAFG00000016747 ENSLAFG00000026189 CBY2 (ENSLAFG00000011325) #18 ENSLAFG00000010158 #19 COG3 (ENSLAFG00000021400) #20 SLC25A30 (ENSLAFG00000001502) #21 ENSLAFG00000021740 ##22 KCTD4 (ENSLAFG00000009328) #23 GTF2F2 (ENSLAFG00000009325) #24 GPALPP1 (ENSLAFG00000013763) #25 NUFIP1 (ENSLAFG00000013760) #26 TSC22D1 (ENSLAFG00000014574) #28 SERP2 (ENSLAFG00000000162) #29 LACC1 (ENSLAFG00000016028) #31 CCDC122 (ENSLAFG00000008407) #32 ENOX1 (ENSLAFG00000004348) #33 DNAJC15 (ENSLAFG00000004343) #34 EPSTI1 (ENSLAFG00000016838) #35 FAM216B (ENSLAFG00000032301) #36 TNFSF11 (ENSLAFG00000011256) #37 ENSLAFG00000029763 ENSLAFG00000005777 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 Glires ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000014262 #30 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00390000015396 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 ENSGT00940000153313.B Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 25 CDC23 (ENSHGLG00000015847) GFRA3 (ENSHGLG00000005227) CDC25C (ENSHGLG00000046790) ENSHGLG00000048679 FAM53C (ENSHGLG00000042605) KDM3B (ENSHGLG00000004783) REEP2 (ENSHGLG00000041963) EGR1 (ENSHGLG00000048168) ETF1 (ENSHGLG00000004503) ENSHGLG00000005302 LRRTM2 (ENSHGLG00000017761) Ctnna1 (ENSHGLG00000007078) ENSHGLG00000020101 SIL1 (ENSHGLG00000013822) MATR3 (ENSHGLG00000004673) ENSHGLG00000039869 ##22 PAIP2 (ENSHGLG00000035595) SLC23A1 (ENSHGLG00000007699) PROB1 (ENSHGLG00000049405) DNAJC18 (ENSHGLG00000005126) SMIM33 (ENSHGLG00000008582) ENSHGLG00000006931 STING1 (ENSHGLG00000032049) UBE2D2 (ENSHGLG00000004792) CXXC5 (ENSHGLG00000007092) PSD2 (ENSHGLG00000008076) NRG2 (ENSHGLG00000009431) PURA (ENSHGLG00000020698) CYSTM1 (ENSHGLG00000012358) ENSHGLG00000040081 ENSHGLG00000048922 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 20 BLZF1 (ENSHGLG00000003011) ENSHGLG00000050690 ENSHGLG00000040907 SLC19A2 (ENSHGLG00000001890) F5 (ENSHGLG00000002250) SELP (ENSHGLG00000001876) SELL (ENSHGLG00000048749) ENSHGLG00000002768 METTL18 (ENSHGLG00000020074) ENSHGLG00000018896 ENSHGLG00000019520 ENSHGLG00000036520 ENSHGLG00000021140 ENSHGLG00000038928 ENSHGLG00000019125 ENSHGLG00000020098 ##22 ENSHGLG00000042460 GORAB (ENSHGLG00000042352) ENSHGLG00000035430 ENSHGLG00000015659 ENSHGLG00000015604 ENSHGLG00000004698 ENSHGLG00000017243 ENSHGLG00000048131 ENSHGLG00000017330 ENSHGLG00000048887 ENSHGLG00000036147 ENSHGLG00000008225 ENSHGLG00000007906 ENSHGLG00000045127 ENSHGLG00000046042 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864 #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000163647 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 ENSGT00940000153313.B Kangaroo rat MODERN SPECIES 320 Med4 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DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 8 Ttf2 (ENSMOCG00000008415) Ptgfrn (ENSMOCG00000020768) Igsf3 (ENSMOCG00000005813) Atp1a1 (ENSMOCG00000006963) Mab21l3 (ENSMOCG00000016617) ENSMOCG00000020465 Nhlh2 (ENSMOCG00000007572) Casq2 (ENSMOCG00000014851) Vangl1 (ENSMOCG00000018281) Ngf (ENSMOCG00000021179) Tspan2 (ENSMOCG00000003591) Tshb (ENSMOCG00000006126) Sycp1 (ENSMOCG00000009622) Nr1h5 (ENSMOCG00000012316) Sike1 (ENSMOCG00000000516) ENSMOCG00000009367 ##22 Csde1 (ENSMOCG00000018960) Nras (ENSMOCG00000022441) Ampd1 (ENSMOCG00000010785) Dennd2c (ENSMOCG00000009830) Bcas2 (ENSMOCG00000013157) Trim33 (ENSMOCG00000013853) Syt6 (ENSMOCG00000017004) Olfml3 (ENSMOCG00000001104) Hipk1 (ENSMOCG00000009217) Dclre1b (ENSMOCG00000014786) Ap4b1 (ENSMOCG00000002528) Chil6 (ENSMOCG00000000792) Dennd2d (ENSMOCG00000020692) Cept1 (ENSMOCG00000014223) Dram2 (ENSMOCG00000018158) Prairie vole MODERN SPECIES Akap5 (ENSMOCG00000021957) ENSMOCG00000005905 Zbtb1 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ENSGT01070000253816.a.a.b #37 ENSGT00940000153313.B Ryukyu mouse MODERN SPECIES 5 Nudt15 (MGP_CAROLIEiJ_G0019503) Sucla2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019504) Htr2a (MGP_CAROLIEiJ_G0019505) #7 Esd (MGP_CAROLIEiJ_G0019506) #8 Lrch1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019507) #9 Rubcnl (MGP_CAROLIEiJ_G0019508) #11 Lrrc63 (MGP_CAROLIEiJ_G0019509) #13 Lcp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019510) #14 Cpb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019511) #15 Zc3h13 (MGP_CAROLIEiJ_G0019512) #16 Siah3 (MGP_CAROLIEiJ_G0019513) #17 Cby2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019514) #18 MGP_CAROLIEiJ_G0019515 Cog3 (MGP_CAROLIEiJ_G0019516) #20 Slc25a30 (MGP_CAROLIEiJ_G0019517) #21 Tpt1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019518) ##22 Gtf2f2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019519) #24 Kctd4 (MGP_CAROLIEiJ_G0019520) #23 Gpalpp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019521) Nufip1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019522) #26 Tsc22d1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019523) #28 Serp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019524) #29 MGP_CAROLIEiJ_G0019525 #31 Ccdc122 (MGP_CAROLIEiJ_G0019526) #32 Enox1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019527) #33 MGP_CAROLIEiJ_G0019528 Dnajc15 (MGP_CAROLIEiJ_G0019529) #34 Epsti1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019530) #35 Fam216b (MGP_CAROLIEiJ_G0019531) #36 Tnfsf11 (MGP_CAROLIEiJ_G0019532) #37 Akap11 (MGP_CAROLIEiJ_G0019533) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864.db #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00940000153655.A.a #19 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.a ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00860000135855 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 ENSGT00940000153313.B Mouse MODERN SPECIES 5 Nudt15 (ENSMUSG00000033405) Sucla2 (ENSMUSG00000022110) Htr2a (ENSMUSG00000034997) #7 Esd (ENSMUSG00000021996) #8 Lrch1 (ENSMUSG00000068015) #9 Rubcnl (ENSMUSG00000034959) #11 Lrrc63 (ENSMUSG00000021997) #13 Lcp1 (ENSMUSG00000021998) #14 Cpb2 (ENSMUSG00000021999) #15 Zc3h13 (ENSMUSG00000022000) #16 Siah3 (ENSMUSG00000091722) #17 Cby2 (ENSMUSG00000034913) #18 Erich6b (ENSMUSG00000022002) #19 Cog3 (ENSMUSG00000034893) #20 Slc25a30 (ENSMUSG00000022003) #21 Tpt1 (ENSMUSG00000060126) ##22 Gtf2f2 (ENSMUSG00000067995) #24 Kctd4 (ENSMUSG00000046523) #23 Gpalpp1 (ENSMUSG00000022008) Nufip1 (ENSMUSG00000022009) #26 Tsc22d1 (ENSMUSG00000022010) #28 Serp2 (ENSMUSG00000052584) #29 Lacc1 (ENSMUSG00000044350) #31 Ccdc122 (ENSMUSG00000034795) #32 Enox1 (ENSMUSG00000022012) #33 Dnajc15 (ENSMUSG00000022013) #34 Epsti1 (ENSMUSG00000022014) #35 Fam216b (ENSMUSG00000045655) #36 Tnfsf11 (ENSMUSG00000022015) #37 Akap11 (ENSMUSG00000022016) Dgkh (ENSMUSG00000034731) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000003338 ENSGT00390000010170.a.b ENSGT01050000244937.a.a #7 ENSGT00390000011864.db #8 ENSGT00940000159528 #9 ENSGT00940000160585 #11 ENSGT00710000106860 #13 ENSGT00950000183097.a.a.b #14 ENSGT00940000159160 #15 ENSGT00730000111163 #16 ENSGT00940000161772 #17 ENSGT00940000153137.a.b.b.a #18 ENSGT00520000061084 ENSGT00390000015682 #20 ENSGT00940000158961 #21 ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.a ##22 ENSGT00390000016051 #24 ENSGT00940000159552 #23 ENSGT00390000012569.b ENSGT00390000003758 #26 ENSGT00940000159144.B #28 ENSGT00940000162467.b #29 ENSGT00390000000693 #31 ENSGT00390000005130 #32 ENSGT00390000006788.a.b #33 ENSGT00860000135855 ENSGT00940000159907 #34 ENSGT00390000013820 #35 ENSGT00940000154512.a #36 ENSGT01070000253816.a.a.b #37 ENSGT00940000153313.B spretus MODERN SPECIES 5 Sucla2 (MGP_SPRETEiJ_G0020399) Htr2a (MGP_SPRETEiJ_G0020400) #7 Esd (MGP_SPRETEiJ_G0020401) #8 Lrch1 (MGP_SPRETEiJ_G0020402) #9 Rubcnl (MGP_SPRETEiJ_G0020403) #11 Lrrc63 (MGP_SPRETEiJ_G0020404) #13 Lcp1 (MGP_SPRETEiJ_G0020405) #14 Cpb2 (MGP_SPRETEiJ_G0020406) #15 Zc3h13 (MGP_SPRETEiJ_G0020407) #16 MGP_SPRETEiJ_G0020408 Siah3 (MGP_SPRETEiJ_G0020409) #17 Cby2 (MGP_SPRETEiJ_G0020410) #18 MGP_SPRETEiJ_G0020411 Cog3 (MGP_SPRETEiJ_G0020412) #20 Slc25a30 (MGP_SPRETEiJ_G0020413) #21 Tpt1 (MGP_SPRETEiJ_G0020414) ##22 Gtf2f2 (MGP_SPRETEiJ_G0020415) #24 Kctd4 (MGP_SPRETEiJ_G0020416) #23 Gpalpp1 (MGP_SPRETEiJ_G0020417) Nufip1 (MGP_SPRETEiJ_G0020418) #26 Tsc22d1 (MGP_SPRETEiJ_G0020419) #28 Serp2 (MGP_SPRETEiJ_G0020420) #29 MGP_SPRETEiJ_G0020421 #31 Ccdc122 (MGP_SPRETEiJ_G0020422) #32 Enox1 (MGP_SPRETEiJ_G0020423) #33 MGP_SPRETEiJ_G0020424 Dnajc15 (MGP_SPRETEiJ_G0020425) #34 Epsti1 (MGP_SPRETEiJ_G0020426) #35 Fam216b (MGP_SPRETEiJ_G0020427) #36 Tnfsf11 (MGP_SPRETEiJ_G0020428) #37 Akap11 (MGP_SPRETEiJ_G0020429) Steppe mouse MODERN SPECIES 2580 ENSMSIG00000020267 ##22 ENSMSIG00000020264 Wac (ENSMSIG00000020012) Rat MODERN SPECIES 6 Nudt15 (ENSRNOG00000025239) Sucla2 (ENSRNOG00000017481) Htr2a (ENSRNOG00000010063) #7 Esd (ENSRNOG00000009512) #8 Lrch1 (ENSRNOG00000009412) #9 Rubcnl (ENSRNOG00000022760) #11 Lrrc63 (ENSRNOG00000038291) #13 Esco2-ps2 (ENSRNOG00000029520) Lcp1 (ENSRNOG00000010319) #14 Cpb2 (ENSRNOG00000010935) #15 Zc3h13 (ENSRNOG00000011237) #16 Siah3 (ENSRNOG00000043061) #17 Cby2 (ENSRNOG00000047413) #18 Cog3 (ENSRNOG00000000155) #20 Slc25a30 (ENSRNOG00000001052) #21 Tpt1 (ENSRNOG00000001049) ##22 Gtf2f2 (ENSRNOG00000029316) #24 Kctd4 (ENSRNOG00000050996) #23 Gpalpp1 (ENSRNOG00000001037) Nufip1 (ENSRNOG00000001033) #26 ENSRNOG00000070802 Tsc22d1 (ENSRNOG00000001030) #28 Serp2 (ENSRNOG00000038228) #29 Lacc1 (ENSRNOG00000022094) #31 Ccdc122 (ENSRNOG00000042404) #32 Enox1 (ENSRNOG00000047817) #33 Dnajc15 (ENSRNOG00000009063) #34 Epsti1 (ENSRNOG00000009471) #35 Fam216b (ENSRNOG00000021943) #36 Tnfsf11 (ENSRNOG00000071047) #37 Akap11 (ENSRNOG00000009987) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b ##22 Rat DUPLICATION Rat DUPLICATION Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 7 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(ENSRNOG00000014979) ENSRNOG00000062873 Ptprk (ENSRNOG00000047605) ENSRNOG00000069014 Lama2 (ENSRNOG00000011134) AABR07000583.1 (ENSRNOG00000046438) Arhgap18 (ENSRNOG00000011245) LOC120097699 (ENSRNOG00000063903) AABR07004232.1 (ENSRNOG00000048904) L3mbtl3 (ENSRNOG00000011720) Samd3 (ENSRNOG00000039955) LOC100360791 (ENSRNOG00000033517) ##22 Tmem200a (ENSRNOG00000047783) Hmgb2-ps6 (ENSRNOG00000026462) ENSRNOG00000067501 Epb41l2 (ENSRNOG00000012346) Akap7 (ENSRNOG00000013202) Ccnb2-ps2 (ENSRNOG00000055111) Arg1 (ENSRNOG00000013304) Med23 (ENSRNOG00000013422) Enpp3 (ENSRNOG00000013791) Enpp1 (ENSRNOG00000013994) Ccn2 (ENSRNOG00000015036) Moxd1 (ENSRNOG00000015321) Stx7 (ENSRNOG00000015670) LOC108349831 (ENSRNOG00000068524) Taar9 (ENSRNOG00000026096) Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 17 Olr1877 (ENSRNOG00000070612) Olfr287 (ENSRNOG00000066134) Or10ad1 (ENSRNOG00000064488) Ccdc184 (ENSRNOG00000021945) Asb8 (ENSRNOG00000010099) Pfkm (ENSRNOG00000057988) Senp1 (ENSRNOG00000022260) Col2a1 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(ENSRNOG00000029868) Htr5b (ENSRNOG00000002549) Ccdc93 (ENSRNOG00000002514) Insig2 (ENSRNOG00000002478) Tpt1-ps1 (ENSRNOG00000069572) ##22 En1 (ENSRNOG00000056580) Marco (ENSRNOG00000049303) C1ql2 (ENSRNOG00000046863) Steap3 (ENSRNOG00000049471) C13h2orf76 (ENSRNOG00000045570) Dbi (ENSRNOG00000046889) Tmem37 (ENSRNOG00000047714) Sctr (ENSRNOG00000049766) Cfap221 (ENSRNOG00000056781) Tmem177 (ENSRNOG00000025484) Ptpn4 (ENSRNOG00000002625) Epb41l5 (ENSRNOG00000002538) Tmem185b (ENSRNOG00000067956) Ralb (ENSRNOG00000002440) Inhbb (ENSRNOG00000060237) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.c.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2421 Cd209g (ENSMSIG00000031055) ENSMSIG00000031053 ##22 ENSMSIG00000031050 Evi5l (ENSMSIG00000031036) Lrrc8e (ENSMSIG00000031033) Map2k7 (ENSMSIG00000031016) Tgfbr3l (ENSMSIG00000031012) Snapc2 (ENSMSIG00000031008) Ctxn1 (ENSMSIG00000031007) Timm44 (ENSMSIG00000030996) Elavl1 (ENSMSIG00000030993) Ccl25 (ENSMSIG00000030978) Cers4 (ENSMSIG00000030972) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.c.b.d ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 41 Foxa2 (ENSMSIG00000002945) Sstr4 (ENSMSIG00000002973) Thbd (ENSMSIG00000002989) Cd93 (ENSMSIG00000002996) ENSMSIG00000003019 ##22 Nxt1 (ENSMSIG00000003067) Gzf1 (ENSMSIG00000003080) Napb (ENSMSIG00000003094) Cstl1 (ENSMSIG00000003118) Cst11 (ENSMSIG00000003137) Cstdc1 (ENSMSIG00000003153) Cst12 (ENSMSIG00000003169) Cst8 (ENSMSIG00000003194) Cst13 (ENSMSIG00000003223) Cst9 (ENSMSIG00000003261) Cstdc2 (ENSMSIG00000003283) Cst3 (ENSMSIG00000003295) Steppe mouse MODERN SPECIES 2804 Msantd2 (ENSMSIG00000015172) Esam (ENSMSIG00000015194) Vsig2 (ENSMSIG00000015220) Nrgn (ENSMSIG00000015277) Spa17 (ENSMSIG00000015289) Siae (ENSMSIG00000015296) Tbrg1 (ENSMSIG00000015383) Panx3 (ENSMSIG00000015407) ENSMSIG00000015418 ##22 Or8a1 (ENSMSIG00000015428) Or8a1b (ENSMSIG00000015433) Or8b12 (ENSMSIG00000015446) Or8b12c (ENSMSIG00000015455) Or8b9 (ENSMSIG00000015471) Or8b8 (ENSMSIG00000015480) Or8b4 (ENSMSIG00000015494) Or8b35 (ENSMSIG00000015505) Or8b36 (ENSMSIG00000015512) Or8b37 (ENSMSIG00000015522) Or8b39 (ENSMSIG00000015543) Or8b101 (ENSMSIG00000015560) Or8b40 (ENSMSIG00000015567) Or8b41 (ENSMSIG00000015572) ENSMSIG00000015593 Shrew mouse MODERN SPECIES 21 MGP_PahariEiJ_G0030521 Sucla2 (MGP_PahariEiJ_G0030522) Htr2a (MGP_PahariEiJ_G0030523) #7 Esd (MGP_PahariEiJ_G0030524) #8 Lrch1 (MGP_PahariEiJ_G0030525) #9 Rubcnl (MGP_PahariEiJ_G0030526) #11 Lrrc63 (MGP_PahariEiJ_G0030527) #13 Lcp1 (MGP_PahariEiJ_G0030528) #14 Cpb2 (MGP_PahariEiJ_G0030529) #15 Zc3h13 (MGP_PahariEiJ_G0030530) #16 Siah3 (MGP_PahariEiJ_G0030531) #17 Cby2 (MGP_PahariEiJ_G0030532) #18 MGP_PahariEiJ_G0030533 Cog3 (MGP_PahariEiJ_G0030534) #20 Slc25a30 (MGP_PahariEiJ_G0030535) #21 Tpt1 (MGP_PahariEiJ_G0030536) ##22 Gtf2f2 (MGP_PahariEiJ_G0030537) #24 Kctd4 (MGP_PahariEiJ_G0030538) #23 Gpalpp1 (MGP_PahariEiJ_G0030539) Nufip1 (MGP_PahariEiJ_G0030540) #26 Tsc22d1 (MGP_PahariEiJ_G0030541) #28 Serp2 (MGP_PahariEiJ_G0030542) #29 Lacc1 (MGP_PahariEiJ_G0030543) #31 Ccdc122 (MGP_PahariEiJ_G0030544) #32 Enox1 (MGP_PahariEiJ_G0030545) #33 MGP_PahariEiJ_G0030546 Dnajc15 (MGP_PahariEiJ_G0030547) #34 Epsti1 (MGP_PahariEiJ_G0030548) #35 Fam216b (MGP_PahariEiJ_G0030549) #36 Tnfsf11 (MGP_PahariEiJ_G0030550) #37 Akap11 (MGP_PahariEiJ_G0030551) Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 349 ENSJJAG00000000293 ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 104 Ndufaf4 (ENSJJAG00000023657) Gpr63 (ENSJJAG00000013298) Fhl5 (ENSJJAG00000000636) Ufl1 (ENSJJAG00000006182) ENSJJAG00000010016 ENSJJAG00000013253 Fut9 (ENSJJAG00000022594) ENSJJAG00000023083 Manea (ENSJJAG00000023182) ENSJJAG00000023315 ENSJJAG00000023379 Epha7 (ENSJJAG00000016879) ENSJJAG00000017184 ENSJJAG00000017512 ENSJJAG00000017791 ENSJJAG00000017896 ##22 ENSJJAG00000018137 ENSJJAG00000018365 Map3k7 (ENSJJAG00000020494) ENSJJAG00000013324 Bach2 (ENSJJAG00000002786) Gja10 (ENSJJAG00000006111) ENSJJAG00000009996 ENSJJAG00000010339 Mdn1 (ENSJJAG00000015545) Lyrm2 (ENSJJAG00000020170) Ankrd6 (ENSJJAG00000021174) ENSJJAG00000022275 Rragd (ENSJJAG00000000282) ENSJJAG00000000713 Gabrr2 (ENSJJAG00000001074) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 25 ENSJJAG00000011543 ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 33 Wfikkn2 (ENSCGRG00001022356) Luc7l3 (ENSCGRG00001009809) ENSCGRG00001020484 Abcc3 (ENSCGRG00001010018) Cacna1g (ENSCGRG00001002871) Spata20 (ENSCGRG00001006141) Epn3 (ENSCGRG00001009708) Mycbpap (ENSCGRG00001004065) Rsad1 (ENSCGRG00001020971) Acsf2 (ENSCGRG00001006504) Chad (ENSCGRG00001017300) Lrrc59 (ENSCGRG00001003469) Eme1 (ENSCGRG00001012113) Mrpl27 (ENSCGRG00001018944) Xylt2 (ENSCGRG00001021636) ENSCGRG00001017654 ##22 ENSCGRG00001022011 Col1a1 (ENSCGRG00001020668) Sgca (ENSCGRG00001019141) H1f9 (ENSCGRG00001005718) Ppp1r9b (ENSCGRG00001012352) Samd14 (ENSCGRG00001002338) Pdk2 (ENSCGRG00001014853) Itga3 (ENSCGRG00001021353) Dlx3 (ENSCGRG00001022154) Dlx4 (ENSCGRG00001019843) Tac4 (ENSCGRG00001001077) ENSCGRG00001005107 Fam117a (ENSCGRG00001009494) Slc35b1 (ENSCGRG00001006734) Spop (ENSCGRG00001024062) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Mrps27 (ENSCGRG00001016241) Ptcd2 (ENSCGRG00001015289) Zfp366 (ENSCGRG00001006020) ENSCGRG00001003516 H2bl1 (ENSCGRG00001007283) Tnpo1 (ENSCGRG00001016580) Fcho2 (ENSCGRG00001013782) Tmem171 (ENSCGRG00001016096) Tmem174 (ENSCGRG00001011496) Foxd1 (ENSCGRG00001010743) Btf3 (ENSCGRG00001009745) ENSCGRG00001008466 Ankra2 (ENSCGRG00001014449) Utp15 (ENSCGRG00001013836) Arhgef28 (ENSCGRG00001018993) ENSCGRG00001017370 ##22 Enc1 (ENSCGRG00001009896) ENSCGRG00001021658 Hexb (ENSCGRG00001020320) Gfm2 (ENSCGRG00001022802) ENSCGRG00001012819 Fam169a (ENSCGRG00001021297) Gcnt4 (ENSCGRG00001008293) ENSCGRG00001008489 ENSCGRG00001014554 Ankrd31 (ENSCGRG00001018162) HMGCR (ENSCGRG00001016870) Cert1 (ENSCGRG00001020451) Polk (ENSCGRG00001013007) ENSCGRG00001012277 Ankdd1b (ENSCGRG00001016471) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b.d ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 11 Pik3r3 (ENSPEMG00000022142) Mast2 (ENSPEMG00000022608) Ipp (ENSPEMG00000023410) Tmem69 (ENSPEMG00000022999) Gpbp1l1 (ENSPEMG00000023022) Ccdc17 (ENSPEMG00000022313) Nasp (ENSPEMG00000011490) Akr1a1 (ENSPEMG00000015504) ENSPEMG00000022257 Mmachc (ENSPEMG00000026955) ENSPEMG00000000268 Tesk2 (ENSPEMG00000022010) Toe1 (ENSPEMG00000021892) Mutyh (ENSPEMG00000016657) Hpdl (ENSPEMG00000008997) ENSPEMG00000024772 ##22 Zswim5 (ENSPEMG00000023604) Urod (ENSPEMG00000021743) Hectd3 (ENSPEMG00000021103) Eif2b3 (ENSPEMG00000023218) Ptch2 (ENSPEMG00000012618) Btbd19 (ENSPEMG00000023770) Dynlt4 (ENSPEMG00000013222) Plk3 (ENSPEMG00000023420) ENSPEMG00000021333 ENSPEMG00000022449 Kif2c (ENSPEMG00000023831) Armh1 (ENSPEMG00000011612) Tmem53 (ENSPEMG00000022378) Rnf220 (ENSPEMG00000022794) Eri3 (ENSPEMG00000024037) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Tarsier MODERN SPECIES 5133 CPB2 (ENSTSYG00000014440) #15 ZC3H13 (ENSTSYG00000000992) #16 SIAH3 (ENSTSYG00000028090) #17 CBY2 (ENSTSYG00000002618) #18 ERICH6B (ENSTSYG00000014169) #19 COG3 (ENSTSYG00000004818) #20 SLC25A30 (ENSTSYG00000011274) #21 TPT1 (ENSTSYG00000003160) ##22 KCTD4 (ENSTSYG00000001706) #23 GTF2F2 (ENSTSYG00000001691) #24 GPALPP1 (ENSTSYG00000006358) #25 NUFIP1 (ENSTSYG00000006355) #26 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Horse MODERN SPECIES 11 ENSECAG00000032479 SPOCK3 (ENSECAG00000024906) TLL1 (ENSECAG00000002251) CPE (ENSECAG00000009256) MSMO1 (ENSECAG00000010554) KLHL2 (ENSECAG00000010727) TMEM192 (ENSECAG00000014003) TRIM75 (ENSECAG00000036019) ENSECAG00000042254 ENSECAG00000014971 ENSECAG00000034596 ENSECAG00000042205 ENSECAG00000038371 TRIM61 (ENSECAG00000014985) ENSECAG00000030364 ENSECAG00000014997 ##22 SMIM31 (ENSECAG00000040839) MARCHF1 (ENSECAG00000015012) TMA16 (ENSECAG00000015062) TKTL2 (ENSECAG00000002749) NPY5R (ENSECAG00000016236) NPY1R (ENSECAG00000016717) NAF1 (ENSECAG00000016738) ENSECAG00000003023 FSTL5 (ENSECAG00000000973) ENSECAG00000054288 ENSECAG00000029497 RAPGEF2 (ENSECAG00000006983) ENSECAG00000056262 C2H4orf45 (ENSECAG00000009815) FNIP2 (ENSECAG00000010321) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Microbat MODERN SPECIES 944 CDADC1 (ENSMLUG00000003033) ENSMLUG00000007659 FNDC3A (ENSMLUG00000002625) CYSLTR2 (ENSMLUG00000001386) ENSMLUG00000023372 RCBTB2 (ENSMLUG00000008378) LPAR6 (ENSMLUG00000029722) RB1 (ENSMLUG00000008336) ITM2B (ENSMLUG00000008317) ENSMLUG00000013512 SIAH3 (ENSMLUG00000029013) #17 CBY2 (ENSMLUG00000010896) #18 ENSMLUG00000026302 COG3 (ENSMLUG00000016157) #20 SLC25A30 (ENSMLUG00000000506) #21 ENSMLUG00000017709 ##22 KCTD4 (ENSMLUG00000010523) #23 ENSMLUG00000010505 #24 ENSMLUG00000008692 NUFIP1 (ENSMLUG00000008916) #26 ENSMLUG00000003971 ENSMLUG00000011786 ENSMLUG00000027027 LACC1 (ENSMLUG00000003112) #31 CCDC122 (ENSMLUG00000009121) #32 ENOX1 (ENSMLUG00000000802) #33 DNAJC15 (ENSMLUG00000008684) #34 ENSMLUG00000015553 #35 FAM216B (ENSMLUG00000012282) #36 TNFSF11 (ENSMLUG00000008819) #37 AKAP11 (ENSMLUG00000026426) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Pig MODERN SPECIES 13 ENSSSCG00000000194 TUBA1A (ENSSSCG00000061347) PRPH (ENSSSCG00000000195) TROAP (ENSSSCG00000023176) C1QL4 (ENSSSCG00000000197) DNAJC22 (ENSSSCG00000000198) SPATS2 (ENSSSCG00000000199) KCNH3 (ENSSSCG00000000203) MCRS1 (ENSSSCG00000000202) FAM186B (ENSSSCG00000000205) PRPF40B (ENSSSCG00000000204) FMNL3 (ENSSSCG00000025114) TMBIM6 (ENSSSCG00000029652) NCKAP5L (ENSSSCG00000000209) BCDIN3D (ENSSSCG00000040144) ENSSSCG00000000207 ##22 FAIM2 (ENSSSCG00000000206) AQP2 (ENSSSCG00000021193) ENSSSCG00000058738 AQP5 (ENSSSCG00000000211) ENSSSCG00000062534 AQP6 (ENSSSCG00000000212) ENSSSCG00000054254 RACGAP1 (ENSSSCG00000000217) ASIC1 (ENSSSCG00000000216) SMARCD1 (ENSSSCG00000000215) GPD1 (ENSSSCG00000000214) COX14 (ENSSSCG00000056361) CERS5 (ENSSSCG00000024932) LIMA1 (ENSSSCG00000032269) LARP4 (ENSSSCG00000028516) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000006051.a.b.b ##22 Goat MODERN SPECIES 12 IRX1 (ENSCHIG00000017851) ADAMTS16 (ENSCHIG00000010517) ICE1 (ENSCHIG00000024007) MED10 (ENSCHIG00000020899) UBE2QL1 (ENSCHIG00000002861) NSUN2 (ENSCHIG00000019385) SRD5A1 (ENSCHIG00000012029) TENT4A (ENSCHIG00000017328) ENSCHIG00000025402 ADCY2 (ENSCHIG00000023502) CFAP90 (ENSCHIG00000025918) FASTKD3 (ENSCHIG00000018823) MTRR (ENSCHIG00000019340) ENSCHIG00000001904 SEMA5A (ENSCHIG00000013180) ENSCHIG00000019011 ##22 ATPSCKMT (ENSCHIG00000018299) CCT5 (ENSCHIG00000018198) CMBL (ENSCHIG00000023506) MARCHF6 (ENSCHIG00000017175) ROPN1L (ENSCHIG00000024633) ANKRD33B (ENSCHIG00000021552) DAP (ENSCHIG00000018806) CTNND2 (ENSCHIG00000013482) DNAH5 (ENSCHIG00000021054) ENSCHIG00000016462 TRIO (ENSCHIG00000016556) OTULINL (ENSCHIG00000000624) OTULIN (ENSCHIG00000021689) ANKH (ENSCHIG00000019071) FBXL7 (ENSCHIG00000011704)