Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT00940000159748 ENSGT01030000234629.A ENSGT00390000013354 ENSGT00940000156036 ENSGT00940000168539 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000168928 ENSGT00390000005023.a ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 #16 Amniota ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000180930 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 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NOL8 (ENSOCUG00000008053) CENPP (ENSOCUG00000007236) OGN (ENSOCUG00000009017) Rabbit MODERN SPECIES 20 ORYCUNV1R1540 (ENSOCUG00000032812) XPC (ENSOCUG00000011079) ORYCUNV1R1507 (ENSOCUG00000031825) ORYCUNV1R1638 (ENSOCUG00000035671) ORYCUNV1R1541 (ENSOCUG00000031125) ORYCUNV1R1632 (ENSOCUG00000033938) ORYCUNV1R1524 (ENSOCUG00000027158) CHCHD4 (ENSOCUG00000023806) TMEM43 (ENSOCUG00000011074) ENSOCUG00000011088 SLC6A6 (ENSOCUG00000001144) GRIP2 (ENSOCUG00000001145) CCDC174 (ENSOCUG00000008451) ENSOCUG00000039627 ENSOCUG00000015577 ENSOCUG00000025023 #22 FGD5 (ENSOCUG00000006961) NR2C2 (ENSOCUG00000006975) MRPS25 (ENSOCUG00000006984) RBSN (ENSOCUG00000006988) TRH (ENSOCUG00000006337) TMCC1 (ENSOCUG00000013071) PLXND1 (ENSOCUG00000013049) ENSOCUG00000029379 RHO (ENSOCUG00000013036) IFT122 (ENSOCUG00000013015) MBD4 (ENSOCUG00000013006) ENSOCUG00000012999 ENSOCUG00000023407 CAND2 (ENSOCUG00000009266) ENSOCUG00000031173 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a 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squirrel MODERN SPECIES 14 KCNA5 (ENSSVLG00005011478) NTF3 (ENSSVLG00005011507) #11 ANO2 (ENSSVLG00005011671) #12 VWF (ENSSVLG00005012648) #13 CD9 (ENSSVLG00005013052) #14 PLEKHG6 (ENSSVLG00005013449) #15 TNFRSF1A (ENSSVLG00005013664) #16 SCNN1A (ENSSVLG00005013781) ENSSVLG00005013962 LTBR (ENSSVLG00005014074) #17 CD27 (ENSSVLG00005014318) #18 TAPBPL (ENSSVLG00005014372) #19 VAMP1 (ENSSVLG00005014405) #20 MRPL51 (ENSSVLG00005014541) ENSSVLG00005014610 ENSSVLG00005014703 #22 ENSSVLG00005014899 NOP2 (ENSSVLG00005014954) CHD4 (ENSSVLG00005015376) LPAR5 (ENSSVLG00005018041) ACRBP (ENSSVLG00005018087) ING4 (ENSSVLG00005018357) ENSSVLG00005018564 PIANP (ENSSVLG00005018592) ENSSVLG00005018640 MLF2 (ENSSVLG00005018671) ENSSVLG00005018711 LAG3 (ENSSVLG00005018831) CD4 (ENSSVLG00005018976) GPR162 (ENSSVLG00005019129) P3H3 (ENSSVLG00005019312) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 5 LIPT1 (ENSSVLG00005014850) ENSSVLG00005014814 C2orf15 (ENSSVLG00005014789) TSGA10 (ENSSVLG00005014435) CRACDL 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NOTCH2 (ENSODEG00000000797) ENSODEG00000001721 Degu MODERN SPECIES 219 KCNA5 (ENSODEG00000019098) NTF3 (ENSODEG00000003025) #11 ENSODEG00000018854 ANO2 (ENSODEG00000002927) #12 VWF (ENSODEG00000002617) #13 CD9 (ENSODEG00000005241) #14 PLEKHG6 (ENSODEG00000005186) #15 TNFRSF1A (ENSODEG00000004861) #16 SCNN1A (ENSODEG00000004767) LTBR (ENSODEG00000004616) #17 CD27 (ENSODEG00000004529) #18 TAPBPL (ENSODEG00000004477) #19 VAMP1 (ENSODEG00000004453) #20 MRPL51 (ENSODEG00000004435) NCAPD2 (ENSODEG00000004156) #21 ENSODEG00000004114 #22 ENSODEG00000003579 ENSODEG00000003567 CHD4 (ENSODEG00000003114) ACRBP (ENSODEG00000002969) ING4 (ENSODEG00000002865) ZNF384 (ENSODEG00000002585) PIANP (ENSODEG00000002502) ENSODEG00000002475 COPS7A (ENSODEG00000002432) MLF2 (ENSODEG00000002383) ENSODEG00000002310 LAG3 (ENSODEG00000002278) ENSODEG00000002251 ENSODEG00000018791 GPR162 (ENSODEG00000003518) Degu MODERN SPECIES 95 ENSODEG00000005975 CYP7A1 (ENSODEG00000006021) UBXN2B (ENSODEG00000006103) BPNT2 (ENSODEG00000006152) PENK (ENSODEG00000002736) ENSODEG00000002751 SDR16C5 (ENSODEG00000002794) ENSODEG00000002863 PLAG1 (ENSODEG00000002880) LYN (ENSODEG00000002925) ENSODEG00000018874 TGS1 (ENSODEG00000002948) ENSODEG00000003120 XKR4 (ENSODEG00000003156) ENSODEG00000003202 ENSODEG00000018873 #22 ENSODEG00000002691 ENSODEG00000002737 ENSODEG00000002753 ENSODEG00000002823 ATP6V1H (ENSODEG00000002840) ENSODEG00000002936 OPRK1 (ENSODEG00000002988) NPBWR1 (ENSODEG00000019191) ENSODEG00000003047 ENSODEG00000003192 ENSODEG00000003208 ST18 (ENSODEG00000003288) PCMTD1 (ENSODEG00000003571) SNTG1 (ENSODEG00000003621) ENSODEG00000003654 Degu MODERN SPECIES 73 UPP2 (ENSODEG00000014593) CCDC148 (ENSODEG00000014894) ENSODEG00000020204 PKP4 (ENSODEG00000014779) DAPL1 (ENSODEG00000014464) TANC1 (ENSODEG00000014910) WDSUB1 (ENSODEG00000014178) BAZ2B (ENSODEG00000014127) ENSODEG00000015125 MARCHF7 (ENSODEG00000013942) CD302 (ENSODEG00000015670) LY75 (ENSODEG00000014691) ENSODEG00000014957 ITGB6 (ENSODEG00000013253) RBMS1 (ENSODEG00000013934) ENSODEG00000020118 #22 ENSODEG00000013723 PSMD14 (ENSODEG00000015872) TBR1 (ENSODEG00000013807) SLC4A10 (ENSODEG00000013195) DPP4 (ENSODEG00000013321) GCG (ENSODEG00000013560) FAP (ENSODEG00000013259) IFIH1 (ENSODEG00000013586) GCA (ENSODEG00000013215) KCNH7 (ENSODEG00000013646) FIGN (ENSODEG00000013392) GRB14 (ENSODEG00000013239) COBLL1 (ENSODEG00000013366) SLC38A11 (ENSODEG00000013030) ENSODEG00000012704 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n #22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 158 Ndufa9 (ENSJJAG00000007801) Kcna6 (ENSJJAG00000013867) Kcna1 (ENSJJAG00000006988) Ntf3 (ENSJJAG00000004637) #11 Ano2 (ENSJJAG00000004730) #12 Vwf (ENSJJAG00000023254) #13 Cd9 (ENSJJAG00000022710) #14 Plekhg6 (ENSJJAG00000022183) #15 Scnn1a (ENSJJAG00000021122) Ltbr (ENSJJAG00000020376) #17 Cd27 (ENSJJAG00000019993) #18 Tapbpl (ENSJJAG00000019548) #19 ENSJJAG00000019185 Mrpl51 (ENSJJAG00000018962) Ncapd2 (ENSJJAG00000017993) #21 ENSJJAG00000017186 #22 Iffo1 (ENSJJAG00000015968) ENSJJAG00000015505 Chd4 (ENSJJAG00000012394) Lpar5 (ENSJJAG00000010456) ENSJJAG00000010370 Ing4 (ENSJJAG00000009788) Zfp384 (ENSJJAG00000003875) Pianp (ENSJJAG00000000549) Cops7a (ENSJJAG00000010387) Mlf2 (ENSJJAG00000009196) ENSJJAG00000008935 Lag3 (ENSJJAG00000007735) Cd4 (ENSJJAG00000006130) Gpr162 (ENSJJAG00000004130) P3h3 (ENSJJAG00000002354) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n #22 Murinae DUPLICATION Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.j #22 Rat MODERN SPECIES 11 Tars1 (ENSRNOG00000019023) ENSRNOG00000069715 ENSRNOG00000030171 ENSRNOG00000032427 Npr3 (ENSRNOG00000019184) ENSRNOG00000030204 Sub1 (ENSRNOG00000067555) Zfr (ENSRNOG00000011627) Mtmr12 (ENSRNOG00000022929) Golph3 (ENSRNOG00000012186) Pdzd2 (ENSRNOG00000013140) Ftl1-ps14 (ENSRNOG00000065602) RGD1306502 (ENSRNOG00000022745) Drosha (ENSRNOG00000013451) Cdh6 (ENSRNOG00000013535) ENSRNOG00000067563 #22 AABR07008608.1 (ENSRNOG00000055439) Cdh9 (ENSRNOG00000033837) Cdh10 (ENSRNOG00000009771) ENSRNOG00000066871 ENSRNOG00000068443 Cdh12 (ENSRNOG00000026392) AABR07008724.1 (ENSRNOG00000019037) ENSRNOG00000068483 Cdh18 (ENSRNOG00000010535) Basp1 (ENSRNOG00000066065) Cwc15-ps3 (ENSRNOG00000025157) Myo10 (ENSRNOG00000010161) Zfp622 (ENSRNOG00000010589) AABR07008911.1 (ENSRNOG00000056969) Marchf11 (ENSRNOG00000024461) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.j #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.j #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.j #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.j #22 spretus MODERN SPECIES 2 Tenm2 (MGP_SPRETEiJ_G0017051) Wwc1 (MGP_SPRETEiJ_G0017050) Rars (MGP_SPRETEiJ_G0017049) Fbll1 (MGP_SPRETEiJ_G0017048) Pank3 (MGP_SPRETEiJ_G0017047) Slit3 (MGP_SPRETEiJ_G0017046) Spdl1 (MGP_SPRETEiJ_G0017045) Insyn2b (MGP_SPRETEiJ_G0017044) Dock2 (MGP_SPRETEiJ_G0017043) Foxi1 (MGP_SPRETEiJ_G0017042) Lcp2 (MGP_SPRETEiJ_G0017041) Kcnmb1 (MGP_SPRETEiJ_G0017040) Kcnip1 (MGP_SPRETEiJ_G0017039) MGP_SPRETEiJ_G0017038 Gabrp (MGP_SPRETEiJ_G0017037) MGP_SPRETEiJ_G0017036 #22 MGP_SPRETEiJ_G0017035 Tlx3 (MGP_SPRETEiJ_G0017034) Npm1 (MGP_SPRETEiJ_G0017033) Fgf18 (MGP_SPRETEiJ_G0017032) Smim23 (MGP_SPRETEiJ_G0017031) Fbxw11 (MGP_SPRETEiJ_G0017030) Stk10 (MGP_SPRETEiJ_G0017029) Efcab9 (MGP_SPRETEiJ_G0017028) Ubtd2 (MGP_SPRETEiJ_G0017027) Sh3pxd2b (MGP_SPRETEiJ_G0017026) MGP_SPRETEiJ_G0017025 Mpg (MGP_SPRETEiJ_G0017024) Nprl3 (MGP_SPRETEiJ_G0017023) Rhbdf1 (MGP_SPRETEiJ_G0017022) MGP_SPRETEiJ_G0017021 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.k #22 Rat MODERN SPECIES 13 Fmnl2 (ENSRNOG00000055567) Prpf40a (ENSRNOG00000004864) Arl6ip6 (ENSRNOG00000005074) Micos10-ps2 (ENSRNOG00000065751) Rprm (ENSRNOG00000005109) Galnt13 (ENSRNOG00000005335) ENSRNOG00000065543 Kcnj3 (ENSRNOG00000005369) Nr4a2 (ENSRNOG00000005600) Gpd2 (ENSRNOG00000033824) Galnt5 (ENSRNOG00000004645) Ermn (ENSRNOG00000021472) Cytip (ENSRNOG00000004772) Acvr1c (ENSRNOG00000004828) Acvr1 (ENSRNOG00000005033) Gapdh-ps1 (ENSRNOG00000071205) #22 Upp2 (ENSRNOG00000005341) Ccdc148 (ENSRNOG00000057740) Pkp4 (ENSRNOG00000005504) Dapl1 (ENSRNOG00000005743) ENSRNOG00000064239 Tanc1 (ENSRNOG00000025394) Wdsub1 (ENSRNOG00000005990) Baz2b (ENSRNOG00000056984) LOC100361645 (ENSRNOG00000031951) Marchf7 (ENSRNOG00000006241) Cd302 (ENSRNOG00000006623) Ly75 (ENSRNOG00000007012) Pla2r1 (ENSRNOG00000008129) Itgb6 (ENSRNOG00000008346) Rbms1 (ENSRNOG00000008482) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 188 Pamr1 (ENSCGRG00001023148) Fjx1 (ENSCGRG00001010732) Trim44 (ENSCGRG00001024631) ENSCGRG00001024835 Ldlrad3 (ENSCGRG00001024912) ENSCGRG00001017501 Prr5l (ENSCGRG00001018581) Traf6 (ENSCGRG00001019275) Rag1 (ENSCGRG00001002046) Rag2 (ENSCGRG00001011151) Iftap (ENSCGRG00001020974) ENSCGRG00001003416 ENSCGRG00001002351 ENSCGRG00001011370 Lrrc4c (ENSCGRG00001011183) ENSCGRG00001022153 #22 ENSCGRG00001002994 ENSCGRG00001023209 Ttc17 (ENSCGRG00001008891) Hsd17b12 (ENSCGRG00001024805) Alkbh3 (ENSCGRG00001014489) Gm13889 (ENSCGRG00001015067) Accs (ENSCGRG00001017403) Ext2 (ENSCGRG00001018610) Alx4 (ENSCGRG00001013158) Cd82 (ENSCGRG00001014213) Tspan18 (ENSCGRG00001014966) Trp53i11 (ENSCGRG00001015881) ENSCGRG00001016971 Syt13 (ENSCGRG00001017740) Chst1 (ENSCGRG00001010952) Golden Hamster MODERN SPECIES 721 ENSMAUG00000001414 #22 ENSMAUG00000016868 Bach2 (ENSMAUG00000016851) Gja10 (ENSMAUG00000020453) Casp8ap2 (ENSMAUG00000018512) ENSMAUG00000014080 Ankrd6 (ENSMAUG00000011054) Rragd (ENSMAUG00000021734) Gabrr1 (ENSMAUG00000019124) ENSMAUG00000017845 Pnrc1 (ENSMAUG00000012518) Rngtt (ENSMAUG00000021153) Cnr1 (ENSMAUG00000014040) Spaca1 (ENSMAUG00000010690) Akirin2 (ENSMAUG00000013076) Rars2 (ENSMAUG00000008929) Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1885 Kcna5 (ENSNGAG00000001282) Ntf3 (ENSNGAG00000023064) #11 Ano2 (ENSNGAG00000006568) #12 Vwf (ENSNGAG00000022403) #13 Cd9 (ENSNGAG00000014189) #14 ENSNGAG00000022639 Plekhg6 (ENSNGAG00000011808) #15 Tnfrsf1a (ENSNGAG00000019085) #16 Scnn1a (ENSNGAG00000019351) Ltbr (ENSNGAG00000022402) #17 Cd27 (ENSNGAG00000019654) #18 Tapbpl (ENSNGAG00000023020) #19 Vamp1 (ENSNGAG00000011610) #20 Mrpl51 (ENSNGAG00000022754) Ncapd2 (ENSNGAG00000021912) #21 ENSNGAG00000013476 #22 Iffo1 (ENSNGAG00000013363) Nop2 (ENSNGAG00000019010) Chd4 (ENSNGAG00000016920) Acrbp (ENSNGAG00000022774) Ing4 (ENSNGAG00000016704) Zfp384 (ENSNGAG00000011316) Pianp (ENSNGAG00000013944) Cops7a (ENSNGAG00000022873) Mlf2 (ENSNGAG00000016666) ENSNGAG00000021065 Lag3 (ENSNGAG00000009790) ENSNGAG00000022963 Gpr162 (ENSNGAG00000002840) P3h3 (ENSNGAG00000015076) Gnb3 (ENSNGAG00000023501) Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 922 Fgf1 (ENSNGAG00000023588) ENSNGAG00000011614 #22 Spry4 (ENSNGAG00000023023) Ndfip1 (ENSNGAG00000023008) ENSNGAG00000022512 Rnf14 (ENSNGAG00000011674) Pcdh12 (ENSNGAG00000010710) Dele1 (ENSNGAG00000018387) Pcdh1 (ENSNGAG00000015865) ENSNGAG00000014600 Arap3 (ENSNGAG00000023362) Fchsd1 (ENSNGAG00000019709) ENSNGAG00000018010 Hdac3 (ENSNGAG00000012179) ENSNGAG00000004201 Pcdhgc3 (ENSNGAG00000022970) Pcdhga11 (ENSNGAG00000011680) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 997 ENSNGAG00000000089 Sostdc1 (ENSNGAG00000000175) ENSNGAG00000017134 ENSNGAG00000013686 #22 Ankmy2 (ENSNGAG00000016932) Bzw2 (ENSNGAG00000015192) Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 722 Zfp949 (ENSNGAG00000024150) ENSNGAG00000011756 #22 Syncrip (ENSNGAG00000020647) Snx14 (ENSNGAG00000019697) Nt5e (ENSNGAG00000006974) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 500 Srek1ip1 (ENSNGAG00000021556) Shisal2b (ENSNGAG00000011993) Rgs7bp (ENSNGAG00000001316) Rnf180 (ENSNGAG00000010291) Htr1a (ENSNGAG00000010968) Ipo11 (ENSNGAG00000007024) Dimt1 (ENSNGAG00000024364) Kif2a (ENSNGAG00000017429) ENSNGAG00000021151 Zswim6 (ENSNGAG00000017421) ENSNGAG00000024020 Ndufaf2 (ENSNGAG00000021740) Ercc8 (ENSNGAG00000013684) Elovl7 (ENSNGAG00000024148) Depdc1b (ENSNGAG00000015994) ENSNGAG00000024358 #22 ENSNGAG00000009337 ENSNGAG00000010555 Primates DUPLICATION Primates DUPLICATION Primates ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT00910000146795 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT00910000146795 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A Vervet Monkey DUPLICATION Vervet Monkey MODERN SPECIES 2 KCNA1 (ENSCSAG00000019220) KCNA5 (ENSCSAG00000019221) NTF3 (ENSCSAG00000010965) #11 ANO2 (ENSCSAG00000010915) #12 VWF (ENSCSAG00000010786) #13 CD9 (ENSCSAG00000010749) #14 PLEKHG6 (ENSCSAG00000010727) #15 TNFRSF1A (ENSCSAG00000010687) #16 SCNN1A (ENSCSAG00000010676) LTBR (ENSCSAG00000010660) #17 CD27 (ENSCSAG00000010635) #18 TAPBPL (ENSCSAG00000010603) #19 ENSCSAG00000010592 #20 MRPL51 (ENSCSAG00000010565) NCAPD2 (ENSCSAG00000010550) #21 ENSCSAG00000010531 #22 IFFO1 (ENSCSAG00000010518) NOP2 (ENSCSAG00000010484) CHD4 (ENSCSAG00000010429) LPAR5 (ENSCSAG00000019222) ACRBP (ENSCSAG00000010413) ING4 (ENSCSAG00000010403) ZNF384 (ENSCSAG00000010379) PIANP (ENSCSAG00000010351) COPS7A (ENSCSAG00000010346) MLF2 (ENSCSAG00000010338) ENSCSAG00000010328 LAG3 (ENSCSAG00000010305) CD4 (ENSCSAG00000010263) GPR162 (ENSCSAG00000010255) P3H3 (ENSCSAG00000010242) Vervet Monkey MODERN SPECIES 15 ENSCSAG00000012474 RELL2 (ENSCSAG00000012463) FCHSD1 (ENSCSAG00000012453) ARAP3 (ENSCSAG00000012438) ENSCSAG00000000483 PCDH1 (ENSCSAG00000012421) DELE1 (ENSCSAG00000012414) PCDH12 (ENSCSAG00000012406) RNF14 (ENSCSAG00000012400) GNPDA1 (ENSCSAG00000012395) NDFIP1 (ENSCSAG00000012390) SPRY4 (ENSCSAG00000012384) FGF1 (ENSCSAG00000012382) ARHGAP26 (ENSCSAG00000012374) NR3C1 (ENSCSAG00000012355) ENSCSAG00000012347 #22 HMHB1 (ENSCSAG00000012344) YIPF5 (ENSCSAG00000012338) KCTD16 (ENSCSAG00000000482) PRELID2 (ENSCSAG00000012305) GRXCR2 (ENSCSAG00000012295) SH3RF2 (ENSCSAG00000012292) PLAC8L1 (ENSCSAG00000012285) LARS1 (ENSCSAG00000012280) ENSCSAG00000019715 RBM27 (ENSCSAG00000012270) POU4F3 (ENSCSAG00000012256) TCERG1 (ENSCSAG00000012253) GPR151 (ENSCSAG00000019716) PPP2R2B (ENSCSAG00000012240) STK32A (ENSCSAG00000012228) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 229 ENSGT00580000082664.b.a.b ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 241 ENSGT00580000082664.b.a.b ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 4 ENSPANG00000025325 SIGMAR1 (ENSPANG00000025324) ARID3C (ENSPANG00000025316) DCTN3 (ENSPANG00000032813) RPP25L (ENSPANG00000033963) CNTFR (ENSPANG00000025318) ENHO (ENSPANG00000011315) DNAI1 (ENSPANG00000025319) FAM219A (ENSPANG00000025320) C9orf24 (ENSPANG00000025321) MYORG (ENSPANG00000004832) NUDT2 (ENSPANG00000035572) KIF24 (ENSPANG00000025323) UBAP1 (ENSPANG00000025315) DCAF12 (ENSPANG00000025306) ENSPANG00000025164 #22 UBAP2 (ENSPANG00000025308) UBE2R2 (ENSPANG00000025309) NOL6 (ENSPANG00000025310) AQP3 (ENSPANG00000048614) ENSPANG00000025305 NFX1 (ENSPANG00000025304) ENSPANG00000031145 BAG1 (ENSPANG00000025295) SPINK4 (ENSPANG00000025296) B4GALT1 (ENSPANG00000025297) SMU1 (ENSPANG00000025298) ENSPANG00000025299 ENSPANG00000025300 APTX (ENSPANG00000025301) TMEM215 (ENSPANG00000004499) Olive baboon MODERN SPECIES 14 OR2A12 (ENSPANG00000038805) OR2A2 (ENSPANG00000046769) OR2A14 (ENSPANG00000036964) ENSPANG00000046917 ENSPANG00000050261 ENSPANG00000040450 ENSPANG00000038612 ARHGEF5 (ENSPANG00000016463) NOBOX (ENSPANG00000018829) ENSPANG00000045091 TPK1 (ENSPANG00000002884) ENSPANG00000042289 ENSPANG00000029439 ENSPANG00000047822 ENSPANG00000040234 ENSPANG00000014626 #22 CNTNAP2 (ENSPANG00000008720) ENSPANG00000046018 C7orf33 (ENSPANG00000007102) ENSPANG00000039378 ENSPANG00000034490 CUL1 (ENSPANG00000000866) EZH2 (ENSPANG00000018691) PDIA4 (ENSPANG00000017763) ZNF425 (ENSPANG00000021720) ZNF398 (ENSPANG00000046420) ENSPANG00000042111 ZNF783 (ENSPANG00000008719) ZNF777 (ENSPANG00000023421) ZNF746 (ENSPANG00000017316) KRBA1 (ENSPANG00000013260) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 609 ANO2 (ENSCATG00000031462) #12 VWF (ENSCATG00000015582) #13 CD9 (ENSCATG00000042280) #14 PLEKHG6 (ENSCATG00000036270) #15 TNFRSF1A (ENSCATG00000034361) #16 SCNN1A (ENSCATG00000044711) LTBR (ENSCATG00000033469) #17 CD27 (ENSCATG00000035274) #18 TAPBPL (ENSCATG00000045104) #19 ENSCATG00000041389 VAMP1 (ENSCATG00000037454) #20 ENSCATG00000040777 ENSCATG00000035721 MRPL51 (ENSCATG00000035810) NCAPD2 (ENSCATG00000040137) #21 ENSCATG00000044359 #22 IFFO1 (ENSCATG00000028701) ENSCATG00000006182 CHD4 (ENSCATG00000006345) LPAR5 (ENSCATG00000006398) ACRBP (ENSCATG00000034388) ING4 (ENSCATG00000030917) ZNF384 (ENSCATG00000008991) PIANP (ENSCATG00000035419) COPS7A (ENSCATG00000030189) MLF2 (ENSCATG00000040743) ENSCATG00000041394 LAG3 (ENSCATG00000042803) CD4 (ENSCATG00000038270) GPR162 (ENSCATG00000029723) P3H3 (ENSCATG00000040167) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT00910000146795 ENSGT01030000237444 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A Rhesus MODERN SPECIES 2 KCNA5 (ENSMMUG00000022887) ENSMMUG00000056181 NTF3 (ENSMMUG00000014646) #11 VWF (ENSMMUG00000022893) #13 ENSMMUG00000061974 CD9 (ENSMMUG00000004470) #14 PLEKHG6 (ENSMMUG00000000375) #15 TNFRSF1A (ENSMMUG00000000377) #16 SCNN1A (ENSMMUG00000020212) LTBR (ENSMMUG00000020213) #17 ENSMMUG00000053013 TAPBPL (ENSMMUG00000014265) #19 VAMP1 (ENSMMUG00000053354) #20 MRPL51 (ENSMMUG00000018676) NCAPD2 (ENSMMUG00000018677) #21 GAPDH (ENSMMUG00000018679) #22 IFFO1 (ENSMMUG00000018681) NOP2 (ENSMMUG00000018683) CHD4 (ENSMMUG00000018685) LPAR5 (ENSMMUG00000017619) ACRBP (ENSMMUG00000016983) ING4 (ENSMMUG00000016985) ZNF384 (ENSMMUG00000016990) PIANP (ENSMMUG00000050979) COPS7A (ENSMMUG00000009583) MLF2 (ENSMMUG00000012206) ENSMMUG00000050151 ENSMMUG00000039070 LAG3 (ENSMMUG00000056979) CD4 (ENSMMUG00000013202) GPR162 (ENSMMUG00000049147) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 471 ENSGT00390000008712 ENSGT00730000111116 ENSGT00940000156994 ENSGT00940000156972 ENSGT00940000161291 ENSGT00390000005372 ENSGT00940000160454 ENSGT00940000153173.b.a ENSGT00940000153979.A ENSGT00940000155518 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 990 SLC4A10 (ENSRROG00000035249) DPP4 (ENSRROG00000044466) GCG (ENSRROG00000040389) ENSRROG00000041536 FAP (ENSRROG00000037166) IFIH1 (ENSRROG00000030959) GCA (ENSRROG00000032090) ENSRROG00000021640 #22 KCNH7 (ENSRROG00000042455) ENSRROG00000013338 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1026 GCG (ENSRBIG00000037468) FAP (ENSRBIG00000038012) IFIH1 (ENSRBIG00000029188) GCA (ENSRBIG00000000271) ENSRBIG00000034718 #22 KCNH7 (ENSRBIG00000039134) ENSRBIG00000030858 FIGN (ENSRBIG00000031693) ENSRBIG00000029608 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 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ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT00910000146795 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT00910000146795 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Sooty mangabey MODERN SPECIES 235 INSC (ENSCATG00000035904) CALCB (ENSCATG00000041190) CALCA (ENSCATG00000027244) ENSCATG00000042154 CYP2R1 (ENSCATG00000039518) PDE3B (ENSCATG00000038221) PSMA1 (ENSCATG00000014932) COPB1 (ENSCATG00000040822) ENSCATG00000005978 RRAS2 (ENSCATG00000043382) SPON1 (ENSCATG00000031426) FAR1 (ENSCATG00000039474) PTH (ENSCATG00000011856) BTBD10 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ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 593 ANO2 (ENSMNEG00000032451) #12 VWF (ENSMNEG00000042662) #13 CD9 (ENSMNEG00000042314) #14 ENSMNEG00000019715 PLEKHG6 (ENSMNEG00000029942) #15 TNFRSF1A (ENSMNEG00000030151) #16 SCNN1A (ENSMNEG00000029812) LTBR (ENSMNEG00000030358) #17 CD27 (ENSMNEG00000007757) #18 TAPBPL (ENSMNEG00000013053) #19 ENSMNEG00000033079 VAMP1 (ENSMNEG00000006897) #20 ENSMNEG00000040627 MRPL51 (ENSMNEG00000032063) NCAPD2 (ENSMNEG00000038279) #21 GAPDH (ENSMNEG00000040437) #22 IFFO1 (ENSMNEG00000039291) ENSMNEG00000034027 CHD4 (ENSMNEG00000044776) LPAR5 (ENSMNEG00000011351) ACRBP (ENSMNEG00000042749) ING4 (ENSMNEG00000038607) ZNF384 (ENSMNEG00000029452) PIANP (ENSMNEG00000033631) COPS7A (ENSMNEG00000031298) MLF2 (ENSMNEG00000034081) ENSMNEG00000033214 LAG3 (ENSMNEG00000024032) CD4 (ENSMNEG00000043009) GPR162 (ENSMNEG00000041385) P3H3 (ENSMNEG00000028584) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT01030000240266 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821.n ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT00910000146795 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2549 NTF3 (ENSRROG00000011645) #11 ANO2 (ENSRROG00000039334) #12 VWF (ENSRROG00000042864) #13 CD9 (ENSRROG00000013322) #14 PLEKHG6 (ENSRROG00000041873) #15 TNFRSF1A (ENSRROG00000029169) #16 SCNN1A (ENSRROG00000044856) LTBR (ENSRROG00000041807) #17 CD27 (ENSRROG00000030539) #18 ENSRROG00000033196 TAPBPL (ENSRROG00000045610) #19 VAMP1 (ENSRROG00000035855) #20 ENSRROG00000033245 NCAPD2 (ENSRROG00000037510) #21 ENSRROG00000030690 #22 IFFO1 (ENSRROG00000039769) NOP2 (ENSRROG00000041019) CHD4 (ENSRROG00000042446) LPAR5 (ENSRROG00000018849) ACRBP (ENSRROG00000036460) ING4 (ENSRROG00000040119) ZNF384 (ENSRROG00000034990) PIANP (ENSRROG00000034978) COPS7A (ENSRROG00000041726) MLF2 (ENSRROG00000038823) ENSRROG00000044634 LAG3 (ENSRROG00000030083) CD4 (ENSRROG00000028161) GPR162 (ENSRROG00000042378) P3H3 (ENSRROG00000030746) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.b #22 Olive baboon MODERN SPECIES 19 KCNA5 (ENSPANG00000006640) NTF3 (ENSPANG00000018735) #11 VWF (ENSPANG00000026470) #13 CD9 (ENSPANG00000019524) #14 ENSPANG00000035005 PLEKHG6 (ENSPANG00000010167) #15 TNFRSF1A (ENSPANG00000025410) #16 SCNN1A (ENSPANG00000009143) ENSPANG00000013116 #17 ENSPANG00000047682 #17 CD27 (ENSPANG00000010690) #18 TAPBPL (ENSPANG00000017797) #19 VAMP1 (ENSPANG00000024944) #20 MRPL51 (ENSPANG00000044908) NCAPD2 (ENSPANG00000017213) #21 ENSPANG00000020757 #22 IFFO1 (ENSPANG00000006041) ENSPANG00000024426 CHD4 (ENSPANG00000025409) LPAR5 (ENSPANG00000011288) ACRBP (ENSPANG00000017796) ING4 (ENSPANG00000008024) ZNF384 (ENSPANG00000014845) PIANP (ENSPANG00000019209) COPS7A (ENSPANG00000010017) MLF2 (ENSPANG00000012265) ENSPANG00000001015 LAG3 (ENSPANG00000001016) CD4 (ENSPANG00000020297) GPR162 (ENSPANG00000014122) P3H3 (ENSPANG00000020167) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.b #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158947 ENSGT00950000183011.c.a.a ENSGT00950000182931.B.a.b ENSGT00390000008859.b.d.k.a.a ENSGT00940000156361.B ENSGT00940000157665 ENSGT00940000158083 ENSGT00940000155356 ENSGT00940000158175 ENSGT00940000157025 ENSGT00940000169252 ENSGT00940000160958 ENSGT00390000001969.a ENSGT00390000011648.b ENSGT00940000156496 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.b #22 ENSGT00940000158791 ENSGT00940000154955.f ENSGT00510000047030.xb.a.d ENSGT00940000155644 ENSGT00940000160965 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.a ENSGT00940000156024 ENSGT00950000183119.a.e.a.d.b ENSGT00390000000873.a.a ENSGT00940000159166 ENSGT00950000182852.B ENSGT00940000155343 ENSGT00940000158400 ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000160251.g Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3344 ENSRROG00000026617 ENSRROG00000035234 #22 LRIG2 (ENSRROG00000045450) SLC16A1 (ENSRROG00000045095) ENSRROG00000042524 TAFA3 (ENSRROG00000044261) PPM1J (ENSRROG00000042626) RHOC (ENSRROG00000035409) MOV10 (ENSRROG00000041135) CAPZA1 (ENSRROG00000038535) ST7L (ENSRROG00000036748) WNT2B (ENSRROG00000033069) CTTNBP2NL (ENSRROG00000031464) ENSRROG00000009633 KCND3 (ENSRROG00000034849) DDX20 (ENSRROG00000030608) INKA2 (ENSRROG00000024632) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 299 AMPD1 (ENSRBIG00000042678) DENND2C (ENSRBIG00000040882) BCAS2 (ENSRBIG00000036310) TRIM33 (ENSRBIG00000044424) SYT6 (ENSRBIG00000033598) OLFML3 (ENSRBIG00000037707) HIPK1 (ENSRBIG00000028252) DCLRE1B (ENSRBIG00000032633) AP4B1 (ENSRBIG00000041004) ENSRBIG00000028387 PTPN22 (ENSRBIG00000039476) RSBN1 (ENSRBIG00000038594) PHTF1 (ENSRBIG00000033612) MAGI3 (ENSRBIG00000030469) ENSRBIG00000032312 ENSRBIG00000033233 #22 LRIG2 (ENSRBIG00000032197) SLC16A1 (ENSRBIG00000029892) TAFA3 (ENSRBIG00000040034) PPM1J (ENSRBIG00000030076) RHOC (ENSRBIG00000040896) MOV10 (ENSRBIG00000040802) CAPZA1 (ENSRBIG00000015622) ST7L (ENSRBIG00000042439) WNT2B (ENSRBIG00000027268) CTTNBP2NL (ENSRBIG00000038104) ENSRBIG00000020563 KCND3 (ENSRBIG00000027724) DDX20 (ENSRBIG00000030629) INKA2 (ENSRBIG00000020811) RAP1A (ENSRBIG00000016227) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 228 ENSGT00580000082664.b.b ENSGT00940000153298.n.a.a.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 240 ENSGT00580000082664.b.b ENSGT00940000153298.n.a.a.b #22 Olive baboon MODERN SPECIES 16 UBD (ENSPANG00000041372) OR10C1 (ENSPANG00000037061) OR11A1 (ENSPANG00000040622) ENSPANG00000017571 OR5V1 (ENSPANG00000003458) OR14J1 (ENSPANG00000041457) ENSPANG00000013952 OR2J3 (ENSPANG00000019387) ENSPANG00000038289 OR2B3 (ENSPANG00000048715) OR2W1 (ENSPANG00000050377) ENSPANG00000042549 ZNF311 (ENSPANG00000047970) TRIM27 (ENSPANG00000006411) ENSPANG00000047616 ENSPANG00000043609 #22 ENSPANG00000038283 ENSPANG00000049126 SCAND3 (ENSPANG00000026311) GPX5 (ENSPANG00000009596) GPX6 (ENSPANG00000032181) ZSCAN12 (ENSPANG00000026498) ZKSCAN3 (ENSPANG00000008440) ZSCAN31 (ENSPANG00000020275) PGBD1 (ENSPANG00000016270) ZSCAN26 (ENSPANG00000026502) NKAPL (ENSPANG00000045195) ZKSCAN4 (ENSPANG00000026499) ZSCAN9 (ENSPANG00000013432) ENSPANG00000042263 ZKSCAN8 (ENSPANG00000007710) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a #22 Gibbon MODERN SPECIES 15 NTF3 (ENSNLEG00000003262) #11 ANO2 (ENSNLEG00000003269) #12 VWF (ENSNLEG00000003335) #13 CD9 (ENSNLEG00000003491) #14 PLEKHG6 (ENSNLEG00000003548) #15 TNFRSF1A (ENSNLEG00000034897) #16 ENSNLEG00000035453 ENSNLEG00000003663 #17 CD27 (ENSNLEG00000003696) #18 ENSNLEG00000032099 TAPBPL (ENSNLEG00000003709) #19 ENSNLEG00000030784 VAMP1 (ENSNLEG00000003714) #20 MRPL51 (ENSNLEG00000033120) NCAPD2 (ENSNLEG00000003743) #21 GAPDH (ENSNLEG00000003825) #22 IFFO1 (ENSNLEG00000004195) NOP2 (ENSNLEG00000004242) CHD4 (ENSNLEG00000004330) LPAR5 (ENSNLEG00000004406) ACRBP (ENSNLEG00000004414) ING4 (ENSNLEG00000004431) ZNF384 (ENSNLEG00000004506) PIANP (ENSNLEG00000032075) COPS7A (ENSNLEG00000004510) MLF2 (ENSNLEG00000004587) ENSNLEG00000004666 ENSNLEG00000004668 CD4 (ENSNLEG00000004671) GPR162 (ENSNLEG00000004700) P3H3 (ENSNLEG00000004705) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a #22 Orangutan MODERN SPECIES 3 KCNA1 (ENSPPYG00000004174) KCNA5 (ENSPPYG00000004176) NTF3 (ENSPPYG00000004178) #11 ANO2 (ENSPPYG00000004179) #12 VWF (ENSPPYG00000004180) #13 CD9 (ENSPPYG00000004181) #14 PLEKHG6 (ENSPPYG00000004182) #15 TNFRSF1A (ENSPPYG00000004183) #16 SCNN1A (ENSPPYG00000004184) LTBR (ENSPPYG00000039662) #17 CD27 (ENSPPYG00000029486) #18 TAPBPL (ENSPPYG00000004186) #19 VAMP1 (ENSPPYG00000004187) #20 MRPL51 (ENSPPYG00000025846) NCAPD2 (ENSPPYG00000004188) #21 GAPDH (ENSPPYG00000004189) #22 IFFO1 (ENSPPYG00000004190) ENSPPYG00000004191 CHD4 (ENSPPYG00000004192) LPAR5 (ENSPPYG00000004193) ACRBP (ENSPPYG00000004194) ING4 (ENSPPYG00000004195) ZNF384 (ENSPPYG00000004196) PIANP (ENSPPYG00000004197) COPS7A (ENSPPYG00000004198) MLF2 (ENSPPYG00000004199) ENSPPYG00000041549 LAG3 (ENSPPYG00000004201) CD4 (ENSPPYG00000004202) GPR162 (ENSPPYG00000038576) P3H3 (ENSPPYG00000004203) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a #22 Gorilla MODERN SPECIES 7 CD19 (ENSGGOG00000016827) RABEP2 (ENSGGOG00000008495) ENSGGOG00000008480 SH2B1 (ENSGGOG00000008472) TUFM (ENSGGOG00000014136) ATXN2L (ENSGGOG00000014112) EIF3C (ENSGGOG00000026919) ENSGGOG00000000809 ENSGGOG00000000807 NUPR1 (ENSGGOG00000000172) IL27 (ENSGGOG00000027232) APOBR (ENSGGOG00000001087) CLN3 (ENSGGOG00000015016) ENSGGOG00000022677 SBK1 (ENSGGOG00000000573) ENSGGOG00000022519 #22 ENSGGOG00000040086 ENSGGOG00000037385 XPO6 (ENSGGOG00000005609) ENSGGOG00000022579 ENSGGOG00000038647 KATNIP (ENSGGOG00000017086) GTF3C1 (ENSGGOG00000016666) IL21R (ENSGGOG00000041263) IL4R (ENSGGOG00000003023) NSMCE1 (ENSGGOG00000006501) KDM8 (ENSGGOG00000006500) ENSGGOG00000037200 ENSGGOG00000040712 HS3ST4 (ENSGGOG00000009681) ZKSCAN2 (ENSGGOG00000004769) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a #22 Chimpanzee MODERN SPECIES 7 ATP2A1 (ENSPTRG00000007941) SH2B1 (ENSPTRG00000007940) TUFM (ENSPTRG00000007939) ATXN2L (ENSPTRG00000007938) ENSPTRG00000044092 ENSPTRG00000051496 SULT1A2 (ENSPTRG00000034249) SGF29 (ENSPTRG00000007925) NUPR1 (ENSPTRG00000007926) IL27 (ENSPTRG00000007927) LAT (ENSPTRG00000034140) SPNS1 (ENSPTRG00000048927) NFATC2IP (ENSPTRG00000007945) CLN3 (ENSPTRG00000007930) SBK1 (ENSPTRG00000046337) ENSPTRG00000048258 #22 XPO6 (ENSPTRG00000007919) GSG1L (ENSPTRG00000007918) ENSPTRG00000046233 KATNIP (ENSPTRG00000007917) GTF3C1 (ENSPTRG00000007915) IL21R (ENSPTRG00000052817) IL4R (ENSPTRG00000007913) NSMCE1 (ENSPTRG00000007912) KDM8 (ENSPTRG00000007910) ENSPTRG00000044737 ENSPTRG00000048703 ENSPTRG00000047452 ENSPTRG00000046595 HS3ST4 (ENSPTRG00000045995) ZKSCAN2 (ENSPTRG00000007906) Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.c #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.c #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.c #22 Capuchin MODERN SPECIES 353 CCDC39 (ENSCCAG00000021606) TTC14 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(ENSSBOG00000032455) ENSSBOG00000024890 POGLUT2 (ENSSBOG00000019020) TEX30 (ENSSBOG00000021338) ENSSBOG00000018830 METTL21C (ENSSBOG00000025136) TPP2 (ENSSBOG00000019200) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.d.a.b #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 42 RPS13 (ENSSBOG00000031967) ENSSBOG00000029329 PLEKHA7 (ENSSBOG00000035289) C11orf58 (ENSSBOG00000024393) SOX6 (ENSSBOG00000032558) INSC (ENSSBOG00000010393) CALCB (ENSSBOG00000034921) ENSSBOG00000032369 CYP2R1 (ENSSBOG00000025157) ENSSBOG00000020446 PDE3B (ENSSBOG00000022041) ENSSBOG00000034107 COPB1 (ENSSBOG00000034691) ENSSBOG00000016009 RRAS2 (ENSSBOG00000031627) ENSSBOG00000014032 #22 SPON1 (ENSSBOG00000033038) ENSSBOG00000032346 PTH (ENSSBOG00000031787) ENSSBOG00000032795 BMAL1 (ENSSBOG00000031375) RASSF10 (ENSSBOG00000018129) TEAD1 (ENSSBOG00000016687) ENSSBOG00000014534 ENSSBOG00000024037 ENSSBOG00000028604 PARVA (ENSSBOG00000022244) ENSSBOG00000021582 ENSSBOG00000033370 MICAL2 (ENSSBOG00000016986) DKK3 (ENSSBOG00000026748) Capuchin MODERN SPECIES 450 LONRF2 (ENSCCAG00000023179) ENSCCAG00000025621 #22 ENSCCAG00000021996 Marmoset MODERN SPECIES 21 NTF3 (ENSCJAG00000000605) #11 ANO2 (ENSCJAG00000000606) #12 VWF (ENSCJAG00000000613) #13 CD9 (ENSCJAG00000000659) #14 PLEKHG6 (ENSCJAG00000000666) #15 TNFRSF1A (ENSCJAG00000000674) #16 SCNN1A (ENSCJAG00000000689) LTBR (ENSCJAG00000000706) #17 CD27 (ENSCJAG00000000719) #18 TAPBPL (ENSCJAG00000000722) #19 VAMP1 (ENSCJAG00000044254) #20 ENSCJAG00000046151 ENSCJAG00000065290 NCAPD2 (ENSCJAG00000007561) #21 ENSCJAG00000084549 ENSCJAG00000008234 #22 IFFO1 (ENSCJAG00000037676) NOP2 (ENSCJAG00000008179) CHD4 (ENSCJAG00000008114) LPAR5 (ENSCJAG00000083060) ACRBP (ENSCJAG00000008090) ING4 (ENSCJAG00000008004) ZNF384 (ENSCJAG00000007944) PIANP (ENSCJAG00000007910) COPS7A (ENSCJAG00000007835) MLF2 (ENSCJAG00000007681) ENSCJAG00000038843 LAG3 (ENSCJAG00000007657) CD4 (ENSCJAG00000007635) GPR162 (ENSCJAG00000044634) P3H3 (ENSCJAG00000007528) Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a.g #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.d.b.a #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a.g #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.d.b.a #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a.g #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.d.b.a #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 197 KCNA5 (ENSSBOG00000036379) NTF3 (ENSSBOG00000025798) #11 ANO2 (ENSSBOG00000031554) #12 VWF (ENSSBOG00000029305) #13 CD9 (ENSSBOG00000021142) #14 PLEKHG6 (ENSSBOG00000029167) #15 TNFRSF1A (ENSSBOG00000029812) #16 SCNN1A (ENSSBOG00000028462) LTBR (ENSSBOG00000031167) #17 CD27 (ENSSBOG00000023847) #18 ENSSBOG00000019610 TAPBPL (ENSSBOG00000025031) #19 VAMP1 (ENSSBOG00000017216) #20 MRPL51 (ENSSBOG00000028416) ENSSBOG00000029006 #21 ENSSBOG00000030439 #22 IFFO1 (ENSSBOG00000020913) NOP2 (ENSSBOG00000034622) CHD4 (ENSSBOG00000020782) LPAR5 (ENSSBOG00000016658) ACRBP (ENSSBOG00000020904) ING4 (ENSSBOG00000016889) ZNF384 (ENSSBOG00000020182) PIANP (ENSSBOG00000022052) COPS7A (ENSSBOG00000016629) ENSSBOG00000024104 ENSSBOG00000004230 Capuchin MODERN SPECIES 206 NR6A1 (ENSCCAG00000024096) NR5A1 (ENSCCAG00000024659) ADGRD2 (ENSCCAG00000033790) PSMB7 (ENSCCAG00000025367) NEK6 (ENSCCAG00000019309) LHX2 (ENSCCAG00000022112) DENND1A (ENSCCAG00000020125) CRB2 (ENSCCAG00000033115) STRBP (ENSCCAG00000027357) RABGAP1 (ENSCCAG00000024911) ENSCCAG00000033724 ZBTB26 (ENSCCAG00000003111) ZBTB6 (ENSCCAG00000020024) RC3H2 (ENSCCAG00000001404) PDCL (ENSCCAG00000019775) ENSCCAG00000013468 #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 274 CD27 (ENSANAG00000036800) #18 TAPBPL (ENSANAG00000017857) #19 VAMP1 (ENSANAG00000037847) #20 ENSANAG00000018367 ENSANAG00000021671 NCAPD2 (ENSANAG00000036586) #21 ENSANAG00000036575 #22 IFFO1 (ENSANAG00000016258) ENSANAG00000026027 CHD4 (ENSANAG00000035685) ACRBP (ENSANAG00000032730) ING4 (ENSANAG00000018382) ZNF384 (ENSANAG00000032088) PIANP (ENSANAG00000026580) COPS7A (ENSANAG00000037741) ENSANAG00000032919 ENSANAG00000035023 ENSANAG00000036949 ENSANAG00000034921 MLF2 (ENSANAG00000023951) PTMS (ENSANAG00000025029) LAG3 (ENSANAG00000027143) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.d.b.b #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.d.b.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.d.b.b #22 Capuchin MODERN SPECIES 187 KCNA5 (ENSCCAG00000032585) NTF3 (ENSCCAG00000037158) #11 ANO2 (ENSCCAG00000022139) #12 VWF (ENSCCAG00000029371) #13 CD9 (ENSCCAG00000035576) #14 PLEKHG6 (ENSCCAG00000024072) #15 TNFRSF1A (ENSCCAG00000036380) #16 SCNN1A (ENSCCAG00000024002) LTBR (ENSCCAG00000037636) #17 CD27 (ENSCCAG00000032627) #18 TAPBPL (ENSCCAG00000019333) #19 ENSCCAG00000030371 VAMP1 (ENSCCAG00000030242) #20 MRPL51 (ENSCCAG00000030846) ENSCCAG00000037395 #21 ENSCCAG00000036787 #22 IFFO1 (ENSCCAG00000031460) ENSCCAG00000037712 CHD4 (ENSCCAG00000009686) ACRBP (ENSCCAG00000019365) ING4 (ENSCCAG00000027875) ZNF384 (ENSCCAG00000032088) PIANP (ENSCCAG00000029227) ENSCCAG00000031566 COPS7A (ENSCCAG00000028279) DYRK4 (ENSCCAG00000030043) RAD51AP1 (ENSCCAG00000032881) C12orf4 (ENSCCAG00000020852) FGF6 (ENSCCAG00000033191) FGF23 (ENSCCAG00000022167) TIGAR (ENSCCAG00000022810) Marmoset MODERN SPECIES 7 IMPAD1 (ENSCJAG00000016573) ENSCJAG00000061141 ENSCJAG00000073997 FAM110B (ENSCJAG00000008657) ENSCJAG00000073685 UBXN2B (ENSCJAG00000008666) CYP7A1 (ENSCJAG00000008684) SDCBP (ENSCJAG00000008697) NSMAF (ENSCJAG00000008834) ENSCJAG00000070948 ENSCJAG00000082557 ENSCJAG00000052054 TOX (ENSCJAG00000008958) ENSCJAG00000051398 ENSCJAG00000072177 ENSCJAG00000044576 #22 ENSCJAG00000078019 CA8 (ENSCJAG00000008976) RAB2A (ENSCJAG00000009000) CHD7 (ENSCJAG00000009025) CLVS1 (ENSCJAG00000040445) ASPH (ENSCJAG00000009122) ENSCJAG00000073133 NKAIN3 (ENSCJAG00000067094) GGH (ENSCJAG00000009191) TTPA (ENSCJAG00000009205) YTHDF3 (ENSCJAG00000009217) ENSCJAG00000074156 CYP7B1 (ENSCJAG00000009244) ENSCJAG00000070972 ENSCJAG00000074189 Mas night monkey MODERN SPECIES 1113 GSDMC (ENSANAG00000028301) ENSANAG00000019986 #22 CYRIB (ENSANAG00000022149) ASAP1 (ENSANAG00000029467) ENSANAG00000025378 ADCY8 (ENSANAG00000034325) EFR3A (ENSANAG00000035079) OC90 (ENSANAG00000035842) HHLA1 (ENSANAG00000037286) KCNQ3 (ENSANAG00000034954) DNAAF11 (ENSANAG00000033459) TMEM71 (ENSANAG00000038216) ENSANAG00000035493 SLA (ENSANAG00000028835) TG (ENSANAG00000036910) CCN4 (ENSANAG00000027636) NDRG1 (ENSANAG00000033030) Primates ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b #22 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 164 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 221 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a #22 Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 695 IZUMO1R (ENSRBIG00000034661) GPR83 (ENSRBIG00000043352) MRE11 (ENSRBIG00000034693) ANKRD49 (ENSRBIG00000043961) ENSRBIG00000026350 C11orf97 (ENSRBIG00000041747) PIWIL4 (ENSRBIG00000039745) AMOTL1 (ENSRBIG00000043234) CWC15 (ENSRBIG00000030781) KDM4D (ENSRBIG00000029429) KDM4E (ENSRBIG00000035068) ENSRBIG00000023300 ENSRBIG00000036245 #22 ENSRBIG00000041837 ENDOD1 (ENSRBIG00000025792) ENSRBIG00000027014 SESN3 (ENSRBIG00000031220) FAM76B (ENSRBIG00000006024) CEP57 (ENSRBIG00000014037) MTMR2 (ENSRBIG00000028147) MAML2 (ENSRBIG00000001400) CCDC82 (ENSRBIG00000030883) JRKL (ENSRBIG00000029080) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 587 ZNF638 (ENSRBIG00000029826) DYSF (ENSRBIG00000039973) ENSRBIG00000039117 #22 SAMD5 (ENSRBIG00000039187) STXBP5 (ENSRBIG00000034499) ENSRBIG00000028345 ADGB (ENSRBIG00000033722) ENSRBIG00000031319 GRM1 (ENSRBIG00000030680) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3114 PDE8B (ENSRROG00000030744) ENSRROG00000040707 WDR41 (ENSRROG00000001190) OTP (ENSRROG00000020103) ENSRROG00000040410 AP3B1 (ENSRROG00000033567) ENSRROG00000032349 ENSRROG00000036497 #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 224 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 227 ENSGT00580000082664.b.a.a ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a #22 Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES 2 NTF3 (ENSMFAG00000029473) #11 ANO2 (ENSMFAG00000045036) #12 ENSMFAG00000047933 ENSMFAG00000061332 VWF (ENSMFAG00000039466) #13 CD9 (ENSMFAG00000034485) #14 PLEKHG6 (ENSMFAG00000032181) #15 TNFRSF1A (ENSMFAG00000042238) #16 SCNN1A (ENSMFAG00000035743) LTBR (ENSMFAG00000043569) #17 VAMP1 (ENSMFAG00000035441) #20 TAPBPL (ENSMFAG00000035334) #19 ENSMFAG00000051196 ENSMFAG00000051100 NCAPD2 (ENSMFAG00000036998) #21 ENSMFAG00000001880 #22 IFFO1 (ENSMFAG00000045145) NOP2 (ENSMFAG00000004333) CHD4 (ENSMFAG00000003188) LPAR5 (ENSMFAG00000064722) ACRBP (ENSMFAG00000005997) ING4 (ENSMFAG00000001174) ZNF384 (ENSMFAG00000037538) PIANP (ENSMFAG00000001518) COPS7A (ENSMFAG00000038467) MLF2 (ENSMFAG00000060388) ENSMFAG00000033048 CD4 (ENSMFAG00000041228) GPR162 (ENSMFAG00000037690) GNB3 (ENSMFAG00000029449) CDCA3 (ENSMFAG00000042353) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 3 ENSMFAG00000061715 ITGB6 (ENSMFAG00000002303) ENSMFAG00000045696 ENSMFAG00000060781 PLA2R1 (ENSMFAG00000041834) LY75 (ENSMFAG00000033999) CD302 (ENSMFAG00000038264) MARCHF7 (ENSMFAG00000032793) ENSMFAG00000002815 ENSMFAG00000058581 BAZ2B (ENSMFAG00000037367) WDSUB1 (ENSMFAG00000023412) TANC1 (ENSMFAG00000042358) DAPL1 (ENSMFAG00000029280) ENSMFAG00000061795 ENSMFAG00000043045 #22 PKP4 (ENSMFAG00000008546) CCDC148 (ENSMFAG00000038269) UPP2 (ENSMFAG00000003209) ENSMFAG00000058914 ACVR1 (ENSMFAG00000042305) ACVR1C (ENSMFAG00000042281) CYTIP (ENSMFAG00000043861) ERMN (ENSMFAG00000045944) GALNT5 (ENSMFAG00000036566) ENSMFAG00000059673 GPD2 (ENSMFAG00000031606) NR4A2 (ENSMFAG00000036654) ENSMFAG00000048164 ENSMFAG00000043008 ENSMFAG00000050325 Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.e #22 Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.e.a #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.e.a #22 Capuchin MODERN SPECIES 83 ESR2 (ENSCCAG00000029359) ENSCCAG00000034981 SYNE2 (ENSCCAG00000026686) ENSCCAG00000019506 SGPP1 (ENSCCAG00000034001) PPP2R5E (ENSCCAG00000037562) GPHB5 (ENSCCAG00000027509) RHOJ (ENSCCAG00000024987) KCNH5 (ENSCCAG00000034193) ENSCCAG00000025329 ENSCCAG00000018604 SYT16 (ENSCCAG00000026935) ENSCCAG00000022752 SNAPC1 (ENSCCAG00000034167) ENSCCAG00000028667 ENSCCAG00000025133 #22 PRKCH (ENSCCAG00000019880) TMEM30B (ENSCCAG00000009844) SLC38A6 (ENSCCAG00000035278) TRMT5 (ENSCCAG00000037835) MNAT1 (ENSCCAG00000034022) SIX4 (ENSCCAG00000022445) SIX1 (ENSCCAG00000021734) SIX6 (ENSCCAG00000034242) C14orf39 (ENSCCAG00000033742) PPM1A (ENSCCAG00000023707) DHRS7 (ENSCCAG00000025684) PCNX4 (ENSCCAG00000031427) LRRC9 (ENSCCAG00000027847) RTN1 (ENSCCAG00000029137) CCDC175 (ENSCCAG00000029109) Marmoset MODERN SPECIES 8 OXSM (ENSCJAG00000004087) ENSCJAG00000070184 LRRC3B (ENSCJAG00000071256) ENSCJAG00000077804 NEK10 (ENSCJAG00000004112) ENSCJAG00000079217 SLC4A7 (ENSCJAG00000004141) EOMES (ENSCJAG00000004263) ENSCJAG00000004272 AZI2 (ENSCJAG00000004276) ZCWPW2 (ENSCJAG00000004300) RBMS3 (ENSCJAG00000004312) ENSCJAG00000078451 TGFBR2 (ENSCJAG00000004363) GADL1 (ENSCJAG00000004395) ENSCJAG00000065510 #22 STT3B (ENSCJAG00000004428) ENSCJAG00000069679 OSBPL10 (ENSCJAG00000004447) GPD1L (ENSCJAG00000039489) ENSCJAG00000078219 CMTM8 (ENSCJAG00000011776) ENSCJAG00000078801 CMTM7 (ENSCJAG00000043564) CMTM6 (ENSCJAG00000040951) DYNC1LI1 (ENSCJAG00000011783) CNOT10 (ENSCJAG00000011843) ENSCJAG00000083351 ENSCJAG00000075858 TRIM71 (ENSCJAG00000011921) ENSCJAG00000075987 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.e.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.e.b #22 Capuchin MODERN SPECIES 928 B4GALT7 (ENSCCAG00000024518) TMED9 (ENSCCAG00000033883) ENSCCAG00000037643 #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 906 ENSANAG00000035233 ENSANAG00000036084 ENSANAG00000035834 ENSANAG00000038393 ENSANAG00000016721 ENSANAG00000038269 ENSANAG00000024839 KRBOX5 (ENSANAG00000027751) ENSANAG00000038261 ENSANAG00000024644 ENSANAG00000022403 #22 ENSANAG00000020429 ENSANAG00000037397 AHSP (ENSANAG00000010533) RUSF1 (ENSANAG00000027786) SLC5A2 (ENSANAG00000034352) TGFB1I1 (ENSANAG00000024534) ARMC5 (ENSANAG00000035888) COX6A2 (ENSANAG00000021157) ITGAX (ENSANAG00000016257) TRIM72 (ENSANAG00000030700) PYCARD (ENSANAG00000013955) ENSANAG00000021591 PRSS36 (ENSANAG00000035060) PRSS8 (ENSANAG00000034382) KAT8 (ENSANAG00000024175) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.f #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 472 GRIK5 (ENSANAG00000038058) ZNF574 (ENSANAG00000034608) POU2F2 (ENSANAG00000035824) DEDD2 (ENSANAG00000028365) ZNF526 (ENSANAG00000035364) GSK3A (ENSANAG00000035264) ERF (ENSANAG00000029577) CIC (ENSANAG00000025026) ENSANAG00000000178 PRR19 (ENSANAG00000035399) TMEM145 (ENSANAG00000022076) MEGF8 (ENSANAG00000028714) CNFN (ENSANAG00000028219) LIPE (ENSANAG00000019026) CXCL17 (ENSANAG00000034293) ENSANAG00000013269 #22 ENSANAG00000024195 CEACAM8 (ENSANAG00000030725) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.f #22 Marmoset MODERN SPECIES 6 ISY1 (ENSCJAG00000017419) CNBP (ENSCJAG00000017430) ENSCJAG00000083673 COPG1 (ENSCJAG00000017327) HMCES (ENSCJAG00000017396) H1-10 (ENSCJAG00000039596) EFCAB12 (ENSCJAG00000017314) MBD4 (ENSCJAG00000017293) IFT122 (ENSCJAG00000017213) ENSCJAG00000087235 ENSCJAG00000076224 RHO (ENSCJAG00000017195) ENSCJAG00000017209 PLXND1 (ENSCJAG00000005429) TMCC1 (ENSCJAG00000017178) ENSCJAG00000021040 #22 TRH (ENSCJAG00000047087) RBSN (ENSCJAG00000017163) MRPS25 (ENSCJAG00000017160) ENSCJAG00000058001 NR2C2 (ENSCJAG00000017131) FGD5 (ENSCJAG00000017099) C3orf20 (ENSCJAG00000017083) CCDC174 (ENSCJAG00000017045) GRIP2 (ENSCJAG00000017014) SLC6A6 (ENSCJAG00000016992) ENSCJAG00000079599 ENSCJAG00000042664 XPC (ENSCJAG00000016952) ENSCJAG00000087072 ENSCJAG00000072125 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 138 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 139 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b #22 Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.a #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.a #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 94 SMIM45 (ENSSBOG00000018953) CENPM (ENSSBOG00000031289) TNFRSF13C (ENSSBOG00000030226) SHISA8 (ENSSBOG00000031370) SREBF2 (ENSSBOG00000032953) CCDC134 (ENSSBOG00000030156) MEI1 (ENSSBOG00000026823) ENSSBOG00000024134 ENSSBOG00000024724 DESI1 (ENSSBOG00000023969) PMM1 (ENSSBOG00000035346) CSDC2 (ENSSBOG00000035590) POLR3H (ENSSBOG00000020652) ENSSBOG00000029050 ENSSBOG00000025096 ENSSBOG00000015322 #22 TEF (ENSSBOG00000024378) ZC3H7B (ENSSBOG00000034962) ENSSBOG00000022447 CHADL (ENSSBOG00000032007) L3MBTL2 (ENSSBOG00000028967) EP300 (ENSSBOG00000027132) RBX1 (ENSSBOG00000023412) XPNPEP3 (ENSSBOG00000034216) ENSSBOG00000029053 SLC25A17 (ENSSBOG00000022585) MCHR1 (ENSSBOG00000036058) MRTFA (ENSSBOG00000019487) SGSM3 (ENSSBOG00000027400) ADSL (ENSSBOG00000030059) TNRC6B (ENSSBOG00000029743) Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.a #22 Marmoset MODERN SPECIES 5 PREPL (ENSCJAG00000000754) SLC3A1 (ENSCJAG00000000766) ENSCJAG00000080387 PPM1B (ENSCJAG00000000781) LRPPRC (ENSCJAG00000000794) ABCG8 (ENSCJAG00000000833) ABCG5 (ENSCJAG00000000847) DYNC2LI1 (ENSCJAG00000000860) PLEKHH2 (ENSCJAG00000014373) C1GALT1C1L (ENSCJAG00000054433) THADA (ENSCJAG00000014464) ZFP36L2 (ENSCJAG00000014571) HAAO (ENSCJAG00000014593) OXER1 (ENSCJAG00000014607) MTA3 (ENSCJAG00000014614) ENSCJAG00000044469 #22 KCNG3 (ENSCJAG00000014695) COX7A2L (ENSCJAG00000061936) EML4 (ENSCJAG00000014719) ENSCJAG00000072265 PKDCC (ENSCJAG00000014835) ENSCJAG00000076545 SLC8A1 (ENSCJAG00000023118) THUMPD2 (ENSCJAG00000014891) TMEM178A (ENSCJAG00000040463) MAP4K3 (ENSCJAG00000014920) ENSCJAG00000041834 SOS1 (ENSCJAG00000015029) ENSCJAG00000015081 MORN2 (ENSCJAG00000040859) DHX57 (ENSCJAG00000015097) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.a #22 Capuchin MODERN SPECIES 13 ENSCCAG00000006343 ARG2 (ENSCCAG00000027237) PIGH (ENSCCAG00000035097) PLEKHH1 (ENSCCAG00000031526) TMEM229B (ENSCCAG00000016856) PLEK2 (ENSCCAG00000029270) EIF2S1 (ENSCCAG00000028622) ATP6V1D (ENSCCAG00000037989) PALS1 (ENSCCAG00000031683) FAM71D (ENSCCAG00000026161) ENSCCAG00000022214 GPHN (ENSCCAG00000020521) MSR1 (ENSCCAG00000034933) ENSCCAG00000037687 LRATD2 (ENSCCAG00000020357) ENSCCAG00000037347 #22 ENSCCAG00000031130 ENSCCAG00000018472 MYC (ENSCCAG00000032999) GSDMC (ENSCCAG00000021127) CYRIB (ENSCCAG00000032744) ASAP1 (ENSCCAG00000022593) ADCY8 (ENSCCAG00000029810) EFR3A (ENSCCAG00000019655) OC90 (ENSCCAG00000031064) HHLA1 (ENSCCAG00000036215) KCNQ3 (ENSCCAG00000028183) DNAAF11 (ENSCCAG00000031017) TMEM71 (ENSCCAG00000028721) PHF20L1 (ENSCCAG00000020490) SLA (ENSCCAG00000031926) Cebidae DUPLICATION Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.b.a.a #22 Marmoset MODERN SPECIES 2 YAP1 (ENSCJAG00000000627) CFAP300 (ENSCJAG00000000623) CEP126 (ENSCJAG00000000621) ANGPTL5 (ENSCJAG00000000619) ENSCJAG00000082031 TRPC6 (ENSCJAG00000000595) ENSCJAG00000058230 PGR (ENSCJAG00000000583) ARHGAP42 (ENSCJAG00000000566) ENSCJAG00000023196 ENSCJAG00000073241 CNTN5 (ENSCJAG00000000543) ENSCJAG00000078589 ENSCJAG00000068576 ENSCJAG00000073640 ENSCJAG00000023377 #22 ENSCJAG00000074342 ENSCJAG00000074166 ENSCJAG00000069774 JRKL (ENSCJAG00000043270) CCDC82 (ENSCJAG00000004365) MAML2 (ENSCJAG00000004359) MTMR2 (ENSCJAG00000004327) CEP57 (ENSCJAG00000004281) FAM76B (ENSCJAG00000040122) ENSCJAG00000004220 ENDOD1 (ENSCJAG00000039825) ENSCJAG00000072491 KDM4D (ENSCJAG00000023319) CWC15 (ENSCJAG00000040352) AMOTL1 (ENSCJAG00000004124) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.b.a.a #22 Capuchin MODERN SPECIES 282 ENSCCAG00000025352 DCAF8L1 (ENSCCAG00000024695) ENSCCAG00000025117 #22 ENSCCAG00000020805 ENSCCAG00000031811 IL1RAPL1 (ENSCCAG00000026068) NR0B1 (ENSCCAG00000032350) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 157 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.b.a.b #22 Marmoset MODERN SPECIES 20 HOXA2 (ENSCJAG00000008032) HOXA3 (ENSCJAG00000043202) HOXA4 (ENSCJAG00000008058) HOXA5 (ENSCJAG00000047690) HOXA6 (ENSCJAG00000077854) HOXA7 (ENSCJAG00000080800) HOXA9 (ENSCJAG00000038531) HOXA10 (ENSCJAG00000081224) HOXA11 (ENSCJAG00000008187) HOXA13 (ENSCJAG00000008192) EVX1 (ENSCJAG00000008197) ENSCJAG00000081981 ENSCJAG00000081017 HIBADH (ENSCJAG00000008204) ENSCJAG00000034676 ENSCJAG00000071766 #22 ENSCJAG00000072346 ENSCJAG00000070066 ENSCJAG00000041938 TAX1BP1 (ENSCJAG00000008245) JAZF1 (ENSCJAG00000048491) ENSCJAG00000069906 CREB5 (ENSCJAG00000042700) ENSCJAG00000076535 TRIL (ENSCJAG00000045826) CPVL (ENSCJAG00000008379) CHN2 (ENSCJAG00000008406) ENSCJAG00000085693 WIPF3 (ENSCJAG00000008466) SCRN1 (ENSCJAG00000047722) ENSCJAG00000052671 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.b.a.b #22 Capuchin MODERN SPECIES 325 WDR72 (ENSCCAG00000026897) ENSCCAG00000037326 #22 ONECUT1 (ENSCCAG00000027805) FAM214A (ENSCCAG00000032913) ARPP19 (ENSCCAG00000022191) MYO5A (ENSCCAG00000001972) ENSCCAG00000025828 ENSCCAG00000034030 ENSCCAG00000032533 MYO5C (ENSCCAG00000032934) GNB5 (ENSCCAG00000034924) ENSCCAG00000031947 MAPK6 (ENSCCAG00000026546) LEO1 (ENSCCAG00000025911) TMOD3 (ENSCCAG00000036997) ENSCCAG00000038068 TMOD2 (ENSCCAG00000022858) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.b.b #22 Marmoset MODERN SPECIES 20 ASB15 (ENSCJAG00000017456) ENSCJAG00000083655 IQUB (ENSCJAG00000017429) ENSCJAG00000080491 SLC13A1 (ENSCJAG00000044845) TAS2R16 (ENSCJAG00000021941) CADPS2 (ENSCJAG00000017339) FEZF1 (ENSCJAG00000017326) AASS (ENSCJAG00000017282) PTPRZ1 (ENSCJAG00000017225) ENSCJAG00000074556 FAM3C (ENSCJAG00000017203) WNT16 (ENSCJAG00000039822) CPED1 (ENSCJAG00000017180) ING3 (ENSCJAG00000017145) ENSCJAG00000046997 #22 TSPAN12 (ENSCJAG00000017120) KCND2 (ENSCJAG00000022123) ENSCJAG00000073110 ENSCJAG00000085674 ENSCJAG00000082231 ENSCJAG00000073402 ENSCJAG00000087352 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b #22 Gorilla MODERN SPECIES 16 GPR149 (ENSGGOG00000001655) DHX36 (ENSGGOG00000034937) ARHGEF26 (ENSGGOG00000009951) RAP2B (ENSGGOG00000041894) ENSGGOG00000039329 ENSGGOG00000039036 P2RY1 (ENSGGOG00000000031) MBNL1 (ENSGGOG00000009430) SUCNR1 (ENSGGOG00000004299) AADAC (ENSGGOG00000002253) AADACL2 (ENSGGOG00000008913) IGSF10 (ENSGGOG00000002875) P2RY13 (ENSGGOG00000014509) P2RY14 (ENSGGOG00000022809) GPR171 (ENSGGOG00000000612) ENSGGOG00000027217 #22 MED12L (ENSGGOG00000015584) CLRN1 (ENSGGOG00000000147) MINDY4B (ENSGGOG00000016678) SIAH2 (ENSGGOG00000014662) ERICH6 (ENSGGOG00000017013) ENSGGOG00000039079 SELENOT (ENSGGOG00000028291) EIF2A (ENSGGOG00000015391) SERP1 (ENSGGOG00000015388) TSC22D2 (ENSGGOG00000024379) ENSGGOG00000007109 RNF13 (ENSGGOG00000007103) ANKUB1 (ENSGGOG00000011489) COMMD2 (ENSGGOG00000003255) WWTR1 (ENSGGOG00000000214) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2112 ENSRROG00000016696 ZNF800 (ENSRROG00000040558) ENSRROG00000029281 #22 GCC1 (ENSRROG00000031945) ARF5 (ENSRROG00000041157) FSCN3 (ENSRROG00000042888) PAX4 (ENSRROG00000015595) SND1 (ENSRROG00000033020) LRRC4 (ENSRROG00000032151) LEP (ENSRROG00000033244) RBM28 (ENSRROG00000040747) PRRT4 (ENSRROG00000042520) IMPDH1 (ENSRROG00000045406) HILPDA (ENSRROG00000022886) GARIN1A (ENSRROG00000035800) GARIN1B (ENSRROG00000045564) CALU (ENSRROG00000039876) OPN1SW (ENSRROG00000035396) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.b #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.b #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 267 ENSANAG00000030190 ENSANAG00000029532 #22 OSBPL6 (ENSANAG00000021990) RBM45 (ENSANAG00000034660) ENSANAG00000023263 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.b #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a.f ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Bushbaby DUPLICATION Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 247 FUT9 (ENSOGAG00000008092) ENSOGAG00000025302 UFL1 (ENSOGAG00000004124) FHL5 (ENSOGAG00000016431) GPR63 (ENSOGAG00000031802) NDUFAF4 (ENSOGAG00000004311) KLHL32 (ENSOGAG00000004315) MMS22L (ENSOGAG00000004316) ENSOGAG00000026283 #22 POU3F2 (ENSOGAG00000024248) FBXL4 (ENSOGAG00000009292) FAXC (ENSOGAG00000015137) COQ3 (ENSOGAG00000015139) ENSOGAG00000015143 USP45 (ENSOGAG00000001114) ENSOGAG00000025707 CCNC (ENSOGAG00000001116) PRDM13 (ENSOGAG00000031927) MCHR2 (ENSOGAG00000008232) ENSOGAG00000027279 SIM1 (ENSOGAG00000009865) ASCC3 (ENSOGAG00000009875) Bushbaby MODERN SPECIES 226 KRTAP11-1 (ENSOGAG00000016317) TIAM1 (ENSOGAG00000004005) ENSOGAG00000029301 ENSOGAG00000014646 SCAF4 (ENSOGAG00000014653) ENSOGAG00000033329 HUNK (ENSOGAG00000010230) MIS18A (ENSOGAG00000017137) MRAP (ENSOGAG00000017139) URB1 (ENSOGAG00000017140) EVA1C (ENSOGAG00000009260) CFAP298 (ENSOGAG00000006008) SYNJ1 (ENSOGAG00000006010) PAXBP1 (ENSOGAG00000003344) C21orf62 (ENSOGAG00000027318) ENSOGAG00000032768 #22 OLIG2 (ENSOGAG00000026818) OLIG1 (ENSOGAG00000033584) ENSOGAG00000027625 IFNAR2 (ENSOGAG00000012668) IL10RB (ENSOGAG00000028739) IFNAR1 (ENSOGAG00000015030) ENSOGAG00000029748 IFNGR2 (ENSOGAG00000029006) TMEM50B (ENSOGAG00000000249) DNAJC28 (ENSOGAG00000015823) GART (ENSOGAG00000015814) SON (ENSOGAG00000027319) DONSON (ENSOGAG00000032566) CRYZL1 (ENSOGAG00000015836) ITSN1 (ENSOGAG00000015839) Bushbaby MODERN SPECIES 124 OR5K3 (ENSOGAG00000027773) OR5H2 (ENSOGAG00000025642) ENSOGAG00000026883 ENSOGAG00000028905 ENSOGAG00000027971 OR5AC2 (ENSOGAG00000012172) GABRR3 (ENSOGAG00000012170) RIOX2 (ENSOGAG00000012164) ENSOGAG00000012159 ENSOGAG00000030475 ARL6 (ENSOGAG00000000536) ENSOGAG00000000535 ENSOGAG00000033469 ENSOGAG00000029221 ENSOGAG00000033348 ENSOGAG00000030126 #22 NSUN3 (ENSOGAG00000001776) STX19 (ENSOGAG00000001774) ARL13B (ENSOGAG00000001771) PROS1 (ENSOGAG00000001770) ENSOGAG00000030999 ENSOGAG00000033367 ENSOGAG00000010941 EPHA3 (ENSOGAG00000013293) ENSOGAG00000028160 ENSOGAG00000029652 C3orf38 (ENSOGAG00000028975) ENSOGAG00000029395 ENSOGAG00000034600 CGGBP1 (ENSOGAG00000034139) HTR1F (ENSOGAG00000027352) Lemuriformes DUPLICATION Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.e #22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.e #22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 83 ENSPCOG00000022335 DLX6 (ENSPCOG00000018676) DLX5 (ENSPCOG00000024882) ENSPCOG00000016090 TAC1 (ENSPCOG00000021374) ENSPCOG00000025256 C1GALT1 (ENSPCOG00000015839) ENSPCOG00000018949 COL28A1 (ENSPCOG00000022435) MIOS (ENSPCOG00000011418) RPA3 (ENSPCOG00000022659) UMAD1 (ENSPCOG00000016044) GLCCI1 (ENSPCOG00000008498) ICA1 (ENSPCOG00000003590) NXPH1 (ENSPCOG00000018464) ENSPCOG00000018675 #22 Mouse lemur MODERN SPECIES 11 TDRD5 (ENSMICG00000017589) NPHS2 (ENSMICG00000002674) AXDND1 (ENSMICG00000002668) ENSMICG00000028572 SOAT1 (ENSMICG00000005177) ENSMICG00000028075 ENSMICG00000035049 ABL2 (ENSMICG00000003616) TOR3A (ENSMICG00000004404) FAM20B (ENSMICG00000043296) ANGPTL1 (ENSMICG00000002492) RALGPS2 (ENSMICG00000002482) TEX35 (ENSMICG00000031350) CLEC20A (ENSMICG00000042193) RASAL2 (ENSMICG00000016969) ENSMICG00000037292 #22 SEC16B (ENSMICG00000003111) BRINP2 (ENSMICG00000006000) ASTN1 (ENSMICG00000005992) PAPPA2 (ENSMICG00000005975) ENSMICG00000028635 COP1 (ENSMICG00000008564) TNR (ENSMICG00000045123) TNN (ENSMICG00000004867) MRPS14 (ENSMICG00000037413) CACYBP (ENSMICG00000004856) ENSMICG00000035798 RABGAP1L (ENSMICG00000004841) RC3H1 (ENSMICG00000003000) SERPINC1 (ENSMICG00000002980) ZBTB37 (ENSMICG00000002978) Lemuriformes DUPLICATION Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.f.a #22 Lemuriformes_a DUPLICATION Lemuriformes_a DUPLICATION Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.f.a.a.a #22 Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 746 OR8B4 (ENSPSMG00000001733) OR8B8 (ENSPSMG00000001735) ENSPSMG00000001747 OR8B12 (ENSPSMG00000001751) OR8A1 (ENSPSMG00000001759) PANX3 (ENSPSMG00000001765) TBRG1 (ENSPSMG00000001809) SIAE (ENSPSMG00000001847) SPA17 (ENSPSMG00000001864) NRGN (ENSPSMG00000001870) VSIG2 (ENSPSMG00000001874) ESAM (ENSPSMG00000001880) MSANTD2 (ENSPSMG00000001888) ENSPSMG00000001899 #22 ROBO3 (ENSPSMG00000001946) ROBO4 (ENSPSMG00000001965) DPEP2NB (ENSPSMG00000001972) HEPACAM (ENSPSMG00000001979) ENSPSMG00000001987 ENSPSMG00000001998 ENSPSMG00000002003 SLC37A2 (ENSPSMG00000002030) TMEM218 (ENSPSMG00000002050) PKNOX2 (ENSPSMG00000002082) FEZ1 (ENSPSMG00000002118) EI24 (ENSPSMG00000002170) STT3A (ENSPSMG00000002250) CHEK1 (ENSPSMG00000002459) ACRV1 (ENSPSMG00000002765) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 982 TWF1 (ENSPSMG00000015438) IRAK4 (ENSPSMG00000015376) PUS7L (ENSPSMG00000015334) ADAMTS20 (ENSPSMG00000015278) PRICKLE1 (ENSPSMG00000015162) ZCRB1 (ENSPSMG00000015075) ENSPSMG00000014935 YAF2 (ENSPSMG00000014763) GXYLT1 (ENSPSMG00000014624) ENSPSMG00000014587 #22 PDZRN4 (ENSPSMG00000014579) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 976 ENSPSMG00000014375 AMOT (ENSPSMG00000014395) LHFPL1 (ENSPSMG00000014402) RTL4 (ENSPSMG00000014410) ENSPSMG00000014418 #22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 410 TNIK (ENSPSMG00000016825) PLD1 (ENSPSMG00000016300) TMEM212 (ENSPSMG00000016184) FNDC3B (ENSPSMG00000016159) GHSR (ENSPSMG00000016081) TNFSF10 (ENSPSMG00000016074) NCEH1 (ENSPSMG00000016040) ECT2 (ENSPSMG00000015943) SPATA16 (ENSPSMG00000015748) ENSPSMG00000015718 #22 NLGN1 (ENSPSMG00000015706) NAALADL2 (ENSPSMG00000015690) TBL1XR1 (ENSPSMG00000015636) ENSPSMG00000015530 ENSPSMG00000015513 KCNMB2 (ENSPSMG00000015503) ENSPSMG00000015400 GPC5 (ENSPSMG00000015390) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 377 ENSPCOG00000015233 #22 TMTC2 (ENSPCOG00000005514) METTL25 (ENSPCOG00000018725) CCDC59 (ENSPCOG00000013658) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.f.a.a.b #22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 162 TUT4 (ENSPCOG00000007824) GPX7 (ENSPCOG00000014808) SHISAL2A (ENSPCOG00000018477) COA7 (ENSPCOG00000020312) ZYG11B (ENSPCOG00000025135) ZYG11A (ENSPCOG00000020864) ECHDC2 (ENSPCOG00000020898) SCP2 (ENSPCOG00000005361) PODN (ENSPCOG00000021758) SLC1A7 (ENSPCOG00000000052) CPT2 (ENSPCOG00000028785) CZIB (ENSPCOG00000028784) MAGOH (ENSPCOG00000003826) LRP8 (ENSPCOG00000024828) DMRTB1 (ENSPCOG00000021346) ENSPCOG00000011405 #22 GLIS1 (ENSPCOG00000025844) NDC1 (ENSPCOG00000016099) YIPF1 (ENSPCOG00000017844) DIO1 (ENSPCOG00000018795) IFT25 (ENSPCOG00000019800) LRRC42 (ENSPCOG00000019083) LDLRAD1 (ENSPCOG00000022857) TMEM59 (ENSPCOG00000003105) TCEANC2 (ENSPCOG00000013078) CDCP2 (ENSPCOG00000022595) CYB5RL (ENSPCOG00000020741) MRPL37 (ENSPCOG00000010897) SSBP3 (ENSPCOG00000024890) ACOT11 (ENSPCOG00000024394) FAM151A (ENSPCOG00000027508) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1220 ENSPSMG00000005085 ENSPSMG00000005083 #22 ZC3H15 (ENSPSMG00000005059) ITGAV (ENSPSMG00000004806) FAM171B (ENSPSMG00000004528) ZSWIM2 (ENSPSMG00000004498) CALCRL (ENSPSMG00000004480) TFPI (ENSPSMG00000004452) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.f.a.b #22 Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 271 MED14 (ENSPCOG00000016287) ENSPCOG00000013254 ENSPCOG00000027830 #22 ENSPCOG00000022654 #22 USP9X (ENSPCOG00000028687) DDX3X (ENSPCOG00000027628) NYX (ENSPCOG00000018457) ENSPCOG00000013948 CASK (ENSPCOG00000025249) ENSPCOG00000010714 ENSPCOG00000027023 MAOA (ENSPCOG00000022947) MAOB (ENSPCOG00000025423) NDP (ENSPCOG00000022161) EFHC2 (ENSPCOG00000016137) FUNDC1 (ENSPCOG00000017139) KDM6A (ENSPCOG00000028617) DIPK2B (ENSPCOG00000028661) ENSPCOG00000026336 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 271 MED14 (ENSPCOG00000016287) ENSPCOG00000013254 ENSPCOG00000027830 #22 ENSPCOG00000022654 #22 USP9X (ENSPCOG00000028687) DDX3X (ENSPCOG00000027628) NYX (ENSPCOG00000018457) ENSPCOG00000013948 CASK (ENSPCOG00000025249) ENSPCOG00000010714 ENSPCOG00000027023 MAOA (ENSPCOG00000022947) MAOB (ENSPCOG00000025423) NDP (ENSPCOG00000022161) EFHC2 (ENSPCOG00000016137) FUNDC1 (ENSPCOG00000017139) KDM6A (ENSPCOG00000028617) DIPK2B (ENSPCOG00000028661) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 530 GALC (ENSPSMG00000017660) GPR65 (ENSPSMG00000017596) KCNK10 (ENSPSMG00000017581) ENSPSMG00000017563 SPATA7 (ENSPSMG00000017508) PTPN21 (ENSPSMG00000017371) ZC3H14 (ENSPSMG00000016980) ENSPSMG00000016649 #22 EML5 (ENSPSMG00000016628) TTC8 (ENSPSMG00000016430) FOXN3 (ENSPSMG00000015904) EFCAB11 (ENSPSMG00000015847) TDP1 (ENSPSMG00000015801) KCNK13 (ENSPSMG00000015639) PSMC1 (ENSPSMG00000015625) NRDE2 (ENSPSMG00000015589) CALM1 (ENSPSMG00000015556) TTC7B (ENSPSMG00000015449) RPS6KA5 (ENSPSMG00000015265) ENSPSMG00000015193 ENSPSMG00000015182 GPR68 (ENSPSMG00000015179) CCDC88C 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lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 31 MEF2A (ENSMICG00000034803) LRRC28 (ENSMICG00000028987) TTC23 (ENSMICG00000007312) SYNM (ENSMICG00000007299) IGF1R (ENSMICG00000010119) ENSMICG00000010148 ENSMICG00000045619 ARRDC4 (ENSMICG00000037963) NR2F2 (ENSMICG00000035561) ENSMICG00000016758 RGMA (ENSMICG00000026641) CHD2 (ENSMICG00000000332) FAM174B (ENSMICG00000046366) ENSMICG00000044575 OCA2 (ENSMICG00000000034) ENSMICG00000027022 #22 GABRG3 (ENSMICG00000000033) GABRA5 (ENSMICG00000000032) GABRB3 (ENSMICG00000027069) ATP10A (ENSMICG00000001113) ENSMICG00000037691 UBE3A (ENSMICG00000027572) FAM135B (ENSMICG00000005212) COL22A1 (ENSMICG00000005224) KCNK9 (ENSMICG00000004397) ENSMICG00000037374 ENSMICG00000045662 TRAPPC9 (ENSMICG00000004399) CHRAC1 (ENSMICG00000042491) AGO2 (ENSMICG00000004427) PTK2 (ENSMICG00000004440) Mouse lemur MODERN SPECIES 169 ARX (ENSMICG00000044540) POLA1 (ENSMICG00000002524) PCYT1B (ENSMICG00000009068) PDK3 (ENSMICG00000009061) ENSMICG00000009517 EIF2S3B 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SPECIES 467 ENSRBIG00000043778 POT1 (ENSRBIG00000040275) GRM8 (ENSRBIG00000015208) ZNF800 (ENSRBIG00000035623) ENSRBIG00000015509 #22 GCC1 (ENSRBIG00000028126) ARF5 (ENSRBIG00000039868) FSCN3 (ENSRBIG00000037881) PAX4 (ENSRBIG00000032983) ENSRBIG00000027782 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.b #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT00910000146795 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Gibbon MODERN SPECIES 449 ENSNLEG00000031525 USP11 (ENSNLEG00000003207) CDK16 (ENSNLEG00000003184) UBA1 (ENSNLEG00000003096) RBM10 (ENSNLEG00000003018) NDUFB11 (ENSNLEG00000003004) RGN (ENSNLEG00000002955) JADE3 (ENSNLEG00000002888) RP2 (ENSNLEG00000031771) SLC9A7 (ENSNLEG00000002859) ENSNLEG00000033712 CHST7 (ENSNLEG00000002858) ZNF674 (ENSNLEG00000002837) KRBOX4 (ENSNLEG00000002829) ENSNLEG00000030246 ENSNLEG00000004194 #22 ENSNLEG00000030017 ENSNLEG00000035785 ENSNLEG00000034858 ENSNLEG00000031205 ENSNLEG00000027704 DIPK2B (ENSNLEG00000036003) KDM6A (ENSNLEG00000002537) ENSNLEG00000034223 FUNDC1 (ENSNLEG00000002513) ENSNLEG00000035492 ENSNLEG00000031843 ENSNLEG00000036235 ENSNLEG00000036149 MAOB (ENSNLEG00000002389) MAOA (ENSNLEG00000002271) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.b #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT00910000146795 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00510000046986.n.a.b ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.b #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00510000046986.n.a.b ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.b #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Pan ANCESTRAL SPECIES 31 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(ENSGGOG00000013906) ATP6AP2 (ENSGGOG00000000532) IMPDH (ENSGGOG00000040015) BCOR (ENSGGOG00000014889) ENSGGOG00000042064 #22 ENSGGOG00000039451 ENSGGOG00000028188 TSPAN7 (ENSGGOG00000013841) OTC (ENSGGOG00000011703) RPGR (ENSGGOG00000023793) SRPX (ENSGGOG00000007123) SYTL5 (ENSGGOG00000002396) CYBB (ENSGGOG00000007874) XK (ENSGGOG00000016059) LANCL3 (ENSGGOG00000024460) PRRG1 (ENSGGOG00000010895) CFAP47 (ENSGGOG00000039948) MAGEB16 (ENSGGOG00000003549) FAM47B (ENSGGOG00000001615) TMEM47 (ENSGGOG00000039748) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.b #22 Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 609 MAGED1 (ENSANAG00000010771) GSPT2 (ENSANAG00000031086) ENSANAG00000021376 #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 902 ENSANAG00000025786 #22 NUFIP1 (ENSANAG00000019736) ENSANAG00000023959 KCTD4 (ENSANAG00000018346) GTF2F2 (ENSANAG00000029406) ENSANAG00000037538 ENSANAG00000011705 ENSANAG00000023331 ENSANAG00000031206 SLC25A30 (ENSANAG00000027572) COG3 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(ENSCCAG00000029676) TMPRSS3 (ENSCCAG00000038076) TFF1 (ENSCCAG00000022303) TFF2 (ENSCCAG00000022205) TFF3 (ENSCCAG00000022195) ABCG1 (ENSCCAG00000022414) UMODL1 (ENSCCAG00000028529) ENSCCAG00000030168 #22 ZBTB21 (ENSCCAG00000037414) ENSCCAG00000029556 PRDM15 (ENSCCAG00000030489) RIPK4 (ENSCCAG00000029896) TMPRSS2 (ENSCCAG00000030906) MX1 (ENSCCAG00000025192) ENSCCAG00000020180 MX2 (ENSCCAG00000029612) FAM3B (ENSCCAG00000030600) BACE2 (ENSCCAG00000035482) ENSCCAG00000015027 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000006915.c.d ENSGT00940000160481 ENSGT01100000263506.b.a ENSGT00940000161604.a ENSGT00940000161713 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.j ENSGT00940000153525.h.d.b.a ENSGT00440000033895 ENSGT00940000163297.d ENSGT00940000161342.e ENSGT01090000260076.b.a ENSGT00940000161533.C ENSGT00940000161113 ENSGT00940000166486.e ENSGT00390000001700.a.b.a ENSGT00940000153298.n.p.a #22 ENSGT00390000005094 ENSGT00940000158347 ENSGT00940000159451 ENSGT00940000161952 ENSGT00940000160785 ENSGT00940000161221 ENSGT00530000063786.b ENSGT00940000162863 ENSGT00390000015219 ENSGT00950000183035.a.a ENSGT00950000182803.B.d.a.i.a ENSGT00940000156656 ENSGT00390000003197.i.b ENSGT00940000159460 ENSGT00940000164181 Dog MODERN SPECIES 144 RAB9B (ENSCAFG00845023869) ENSCAFG00845023955 ENSCAFG00845024075 SLC25A53 (ENSCAFG00845024107) ENSCAFG00845024140 ENSCAFG00845024204 ENSCAFG00845024263 FAM199X (ENSCAFG00845015897) ESX1 (ENSCAFG00845015935) ENSCAFG00845016080 IL1RAPL2 (ENSCAFG00845016119) NRK (ENSCAFG00845016215) SERPINA7 (ENSCAFG00845016407) ENSCAFG00845016460 PWWP3B (ENSCAFG00845016500) ENSCAFG00845016546 #22 RADX (ENSCAFG00845016635) RNF128 (ENSCAFG00845016725) TBC1D8B (ENSCAFG00845016942) ENSCAFG00845017120 CLDN2 (ENSCAFG00845017181) MORC4 (ENSCAFG00845017263) RBM41 (ENSCAFG00845017359) ENSCAFG00845017493 PIH1D3 (ENSCAFG00845017612) ENSCAFG00845017692 FRMPD3 (ENSCAFG00845017719) PRPS1 (ENSCAFG00845017825) TSC22D3 (ENSCAFG00845018025) MID2 (ENSCAFG00845018213) NCBP2L (ENSCAFG00845018480) Dingo MODERN SPECIES 347 SLC25A53 (ENSCAFG00020007000) ENSCAFG00020006998 ENSCAFG00020006993 ENSCAFG00020006988 FAM199X (ENSCAFG00020006986) ENSCAFG00020006982 ENSCAFG00020006980 ENSCAFG00020006976 ENSCAFG00020006969 ENSCAFG00020006962 SERPINA7 (ENSCAFG00020006955) ENSCAFG00020006950 PWWP3B (ENSCAFG00020006943) ENSCAFG00020006941 ENSCAFG00020006940 ENSCAFG00020006937 #22 RADX (ENSCAFG00020006912) RNF128 (ENSCAFG00020006883) TBC1D8B (ENSCAFG00020006806) RIPPLY1 (ENSCAFG00020006796) CLDN2 (ENSCAFG00020006782) MORC4 (ENSCAFG00020006778) RBM41 (ENSCAFG00020006764) ENSCAFG00020006752 DNAAF6 (ENSCAFG00020006746) ENSCAFG00020006744 FRMPD3 (ENSCAFG00020006712) ENSCAFG00020006709 ENSCAFG00020006708 ENSCAFG00020006695 NCBP2L (ENSCAFG00020006690) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 American mink MODERN SPECIES 132 ENSNVIG00000000181 #22 FAM81A (ENSNVIG00000000188) MYO1E (ENSNVIG00000000225) CCNB2 (ENSNVIG00000000283) RNF111 (ENSNVIG00000000316) ENSNVIG00000000355 ENSNVIG00000000361 SLTM (ENSNVIG00000000365) MINDY2 (ENSNVIG00000000373) ENSNVIG00000000402 ADA10 (ENSNVIG00000000408) LIPC (ENSNVIG00000000464) AL1A2 (ENSNVIG00000000690) AQP9 (ENSNVIG00000000811) GRL1A (ENSNVIG00000000834) MYZAP (ENSNVIG00000000857) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Arabian camel MODERN SPECIES 1 OR51E2 (ENSCDRG00005001263) ENSCDRG00005001272 OR51E1 (ENSCDRG00005001277) OR51D1 (ENSCDRG00005001280) TRIM68 (ENSCDRG00005001287) ENSCDRG00005001300 ENSCDRG00005001305 ENSCDRG00005001318 ENSCDRG00005001327 ENSCDRG00005001354 ENSCDRG00005001376 ENSCDRG00005001386 TRIM21 (ENSCDRG00005001404) RRM1 (ENSCDRG00005001431) STIM1 (ENSCDRG00005001504) ENSCDRG00005001763 #22 ENSCDRG00005001773 PGAP2 (ENSCDRG00005001795) NUP98 (ENSCDRG00005001857) CHRNA10 (ENSCDRG00005000126) ART1 (ENSCDRG00005000164) ART5 (ENSCDRG00005000179) ENSCDRG00005000213 ENSCDRG00005000233 RNF121 (ENSCDRG00005000310) ENSCDRG00005000432 NUMA1 (ENSCDRG00005000496) LAMTOR1 (ENSCDRG00005000668) LRRC51 (ENSCDRG00005000728) TOMT (ENSCDRG00005000758) ENSCDRG00005000800 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 165 ENSGT01090000263215 ENSGT00940000153298.n.p.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 143 ENSGT01090000263215 ENSGT00940000153298.n.p.b #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 135 ENSGT01090000263215 ENSGT00940000153298.n.p.b #22 Equus ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT01090000263215 ENSGT00940000153298.n.p.b #22 Horse MODERN SPECIES 480 ENSECAG00000047785 ARHGEF9 (ENSECAG00000014934) AMER1 (ENSECAG00000004232) MTMR8 (ENSECAG00000009594) ENSECAG00000044480 ENSECAG00000046943 ZC4H2 (ENSECAG00000018089) ZC3H12B (ENSECAG00000020993) LAS1L 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ENSVVUG00000025445 #22 NNT (ENSVVUG00000025440) PAIP1 (ENSVVUG00000025408) CUNH5orf34 (ENSVVUG00000025400) TMEM267 (ENSVVUG00000025399) CCL28 (ENSVVUG00000025397) HMGCS1 (ENSVVUG00000025389) NIM1K (ENSVVUG00000025384) ZNF131 (ENSVVUG00000025370) ENSVVUG00000025369 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.b #22 Dingo MODERN SPECIES 138 RGS12 (ENSCAFG00020014622) HGFAC (ENSCAFG00020014624) DOK7 (ENSCAFG00020014626) LRPAP1 (ENSCAFG00020014629) ADRA2C (ENSCAFG00020014633) HMX1 (ENSCAFG00020014639) CPZ (ENSCAFG00020014642) TRMT44 (ENSCAFG00020014653) ENSCAFG00020014681 ACOX3 (ENSCAFG00020014686) HTRA3 (ENSCAFG00020014735) SH3TC1 (ENSCAFG00020014736) ABLIM2 (ENSCAFG00020014758) AFAP1 (ENSCAFG00020014815) SORCS2 (ENSCAFG00020014834) ENSCAFG00020014970 #22 GRPEL1 (ENSCAFG00020014974) TADA2B (ENSCAFG00020014977) ENSCAFG00020014980 TBC1D14 (ENSCAFG00020014982) KIAA0232 (ENSCAFG00020014988) BLOC1S4 (ENSCAFG00020015002) S100P (ENSCAFG00020015006) ENSCAFG00020015008 ENSCAFG00020015024 ENSCAFG00020015026 ENSCAFG00020015037 ENSCAFG00020015112 PPP2R2C (ENSCAFG00020015119) CRABP1 (ENSCAFG00020015129) ENSCAFG00020015137 Dog DUPLICATION Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 14 SPRY2 (ENSCAFG00845028431) ENSCAFG00845028507 ENSCAFG00845028540 ENSCAFG00845028564 ENSCAFG00845028573 ENSCAFG00845006476 SLITRK1 (ENSCAFG00845006513) ENSCAFG00845006551 ENSCAFG00845006574 ENSCAFG00845006596 ENSCAFG00845006620 SLITRK5 (ENSCAFG00845006790) ENSCAFG00845006931 ENSCAFG00845006956 ENSCAFG00845007169 ENSCAFG00845007227 #22 GPC6 (ENSCAFG00845007327) ENSCAFG00845007433 DCT (ENSCAFG00845007479) TGDS (ENSCAFG00845007622) GPR180 (ENSCAFG00845007777) SOX21 (ENSCAFG00845007844) ABCC4 (ENSCAFG00845008054) CLDN10 (ENSCAFG00845008850) DZIP1 (ENSCAFG00845008906) DNAJC3 (ENSCAFG00845009205) UGGT2 (ENSCAFG00845009495) ENSCAFG00845009831 ENSCAFG00845010209 OXGR1 (ENSCAFG00845019088) MBNL2 (ENSCAFG00845019234) Dog MODERN SPECIES 15 ENSCAFG00845024788 CNOT10 (ENSCAFG00845023808) TRIM71 (ENSCAFG00845023600) CCR4 (ENSCAFG00845023571) TMPPE (ENSCAFG00845023550) GLB1 (ENSCAFG00845023378) CRTAP (ENSCAFG00845023248) SUSD5 (ENSCAFG00845023061) FBXL2 (ENSCAFG00845022675) UBP1 (ENSCAFG00845022384) CLASP2 (ENSCAFG00845020608) SNRK (ENSCAFG00845020337) ENSCAFG00845020275 ENSCAFG00845020239 ENSCAFG00845020203 ENSCAFG00845020170 #22 ABHD5 (ENSCAFG00845020085) ENSCAFG00845019724 ENSCAFG00845019630 ENSCAFG00845019385 ZNF445 (ENSCAFG00845019305) ENSCAFG00845019227 ENSCAFG00845029250 NANP (ENSCAFG00845029217) NINL (ENSCAFG00845029110) GINS1 (ENSCAFG00845029067) ENSCAFG00845029035 ABHD12 (ENSCAFG00845028992) PYGB (ENSCAFG00845028916) ENTPD6 (ENSCAFG00845028707) VSX1 (ENSCAFG00845028643) Dog MODERN SPECIES ARFGEF3 (ENSCAFG00845006884) NHSL1 (ENSCAFG00845007489) HEBP2 (ENSCAFG00845007775) ENSCAFG00845007820 CCDC28A (ENSCAFG00845010054) ENSCAFG00845010111 ENSCAFG00845010165 ENSCAFG00845010329 ABRACL (ENSCAFG00845010575) HECA (ENSCAFG00845010601) TXLNB (ENSCAFG00845010652) CITED2 (ENSCAFG00845010679) ENSCAFG00845010804 ENSCAFG00845010818 ENSCAFG00845010915 ENSCAFG00845010927 #22 NMBR (ENSCAFG00845010954) GJE1 (ENSCAFG00845010994) VTA1 (ENSCAFG00845011029) ADGRG6 (ENSCAFG00845011283) ENSCAFG00845011718 HIVEP2 (ENSCAFG00845011748) ENSCAFG00845011773 AIG1 (ENSCAFG00845011826) ENSCAFG00845011947 ADAT2 (ENSCAFG00845011977) PEX3 (ENSCAFG00845012053) FUCA2 (ENSCAFG00845012120) PHACTR2 (ENSCAFG00845012219) ZC2HC1B (ENSCAFG00845012485) ENSCAFG00845012627 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 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ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821.g ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 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#16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821.g ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Dolphin MODERN SPECIES 3421 MRPL51 (ENSTTRG00000016086) NCAPD2 (ENSTTRG00000016088) #21 GAPDH (ENSTTRG00000016094) #22 IFFO1 (ENSTTRG00000016097) NOP2 (ENSTTRG00000016100) CHD4 (ENSTTRG00000016102) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 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ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Beluga whale MODERN SPECIES 23 KCNA5 (ENSDLEG00000006712) NTF3 (ENSDLEG00000006715) #11 ANO2 (ENSDLEG00000006729) #12 ENSDLEG00000006754 #12 VWF (ENSDLEG00000007022) #13 CD9 (ENSDLEG00000014732) #14 PLEKHG6 (ENSDLEG00000014777) #15 TNFRSF1A (ENSDLEG00000014826) #16 SCNN1A (ENSDLEG00000014848) LTBR (ENSDLEG00000014872) #17 CD27 (ENSDLEG00000014916) #18 TAPBPL (ENSDLEG00000014928) #19 VAMP1 (ENSDLEG00000014958) #20 MRPL51 (ENSDLEG00000014972) NCAPD2 (ENSDLEG00000014985) #21 GAPDH (ENSDLEG00000015049) #22 IFFO1 (ENSDLEG00000015074) NOP2 (ENSDLEG00000015109) CHD4 (ENSDLEG00000015142) LPAR5 (ENSDLEG00000015210) ENSDLEG00000015216 ING4 (ENSDLEG00000015223) ZNF384 (ENSDLEG00000015249) PIANP (ENSDLEG00000015302) COPS7A (ENSDLEG00000015324) MLF2 (ENSDLEG00000015348) LAG3 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P3H3 (ENSPSNG00000005493) Blue whale MODERN SPECIES 1 KCNA6 (ENSBMSG00010022492) KCNA1 (ENSBMSG00010022494) KCNA5 (ENSBMSG00010012135) NTF3 (ENSBMSG00010012141) #11 ANO2 (ENSBMSG00010012182) #12 VWF (ENSBMSG00010012312) #13 CD9 (ENSBMSG00010012380) #14 PLEKHG6 (ENSBMSG00010012458) #15 TNFRSF1A (ENSBMSG00010012591) #16 SCNN1A (ENSBMSG00010012651) LTBR (ENSBMSG00010012695) #17 CD27 (ENSBMSG00010012719) #18 TAPBPL (ENSBMSG00010012737) #19 VAMP1 (ENSBMSG00010012768) #20 ENSBMSG00010012842 GAPDH (ENSBMSG00010012883) #22 IFFO1 (ENSBMSG00010012925) ENSBMSG00010013081 ENSBMSG00010013094 CHD4 (ENSBMSG00010013201) LPAR5 (ENSBMSG00010013959) ACRBP (ENSBMSG00010014002) ING4 (ENSBMSG00010014218) ZNF384 (ENSBMSG00010014353) PIANP (ENSBMSG00010014495) COPS7A (ENSBMSG00010014553) MLF2 (ENSBMSG00010014597) PTMS (ENSBMSG00010014712) LAG3 (ENSBMSG00010014753) CD4 (ENSBMSG00010014905) GPR162 (ENSBMSG00010014987) Pecora ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 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CCDC150 (ENSEASG00005020257) GTF3C3 (ENSEASG00005020250) C2orf66 (ENSEASG00005029887) PGAP1 (ENSEASG00005020202) ANKRD44 (ENSEASG00005020169) ENSEASG00005020167 SF3B1 (ENSEASG00005020159) COQ10B (ENSEASG00005032559) ENSEASG00005020152 HSPE1 (ENSEASG00005034821) Equus ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q.g.b #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Donkey DUPLICATION Donkey DUPLICATION Donkey MODERN SPECIES 14 KCNA5 (ENSEASG00005038261) NTF3 (ENSEASG00005016993) #11 ANO2 (ENSEASG00005016961) #12 VWF (ENSEASG00005016355) #13 CD9 (ENSEASG00005016182) #14 PLEKHG6 (ENSEASG00005016179) #15 TNFRSF1A (ENSEASG00005016176) #16 SCNN1A (ENSEASG00005016173) LTBR (ENSEASG00005016171) #17 VAMP1 (ENSEASG00005037737) #20 ENSEASG00005036568 #18 TAPBPL (ENSEASG00005016162) #19 ENSEASG00005035678 MRPL51 (ENSEASG00005035991) NCAPD2 (ENSEASG00005016158) #21 ENSEASG00005016156 #22 IFFO1 (ENSEASG00005016154) NOP2 (ENSEASG00005016153) CHD4 (ENSEASG00005016150) LPAR5 (ENSEASG00005033413) ACRBP (ENSEASG00005025354) ING4 (ENSEASG00005016144) ZNF384 (ENSEASG00005016142) PIANP (ENSEASG00005016141) COPS7A (ENSEASG00005016138) MLF2 (ENSEASG00005016135) ENSEASG00005016131 LAG3 (ENSEASG00005016128) CD4 (ENSEASG00005016122) GPR162 (ENSEASG00005016119) P3H3 (ENSEASG00005016118) Donkey MODERN SPECIES 3 LYN (ENSEASG00005016369) TGS1 (ENSEASG00005016371) TMEM68 (ENSEASG00005016372) XKR4 (ENSEASG00005035480) RP1 (ENSEASG00005016381) SOX17 (ENSEASG00005028498) ENSEASG00005025388 ENSEASG00005035435 ENSEASG00005027512 ENSEASG00005035589 ENSEASG00005029551 LYPLA1 (ENSEASG00005020322) TCEA1 (ENSEASG00005020313) RGS20 (ENSEASG00005020310) ATP6V1H (ENSEASG00005020298) ENSEASG00005026860 #22 ENSEASG00005009805 OPRK1 (ENSEASG00005026342) NPBWR1 (ENSEASG00005020280) RB1CC1 (ENSEASG00005020230) ALKAL1 (ENSEASG00005020213) ST18 (ENSEASG00005020200) PCMTD1 (ENSEASG00005020195) SNTG1 (ENSEASG00005020185) PPDPFL (ENSEASG00005024997) ENSEASG00005009186 CLXN (ENSEASG00005009190) UBE2V2 (ENSEASG00005024827) MCM4 (ENSEASG00005009194) ENSEASG00005035234 ENSEASG00005037902 Donkey MODERN SPECIES 36 ENSEASG00005018021 ENSEASG00005025594 ENSEASG00005038050 ENSEASG00005017724 ENSEASG00005018527 ENSEASG00005031175 ENSEASG00005022377 AMER1 (ENSEASG00005022417) ASB12 (ENSEASG00005022418) ZC4H2 (ENSEASG00005002136) ZC3H12B (ENSEASG00005006995) LAS1L (ENSEASG00005006987) MSN (ENSEASG00005006981) VSIG4 (ENSEASG00005012887) HEPH (ENSEASG00005020500) ENSEASG00005020293 #22 ENSEASG00005033352 AR (ENSEASG00005005676) ENSEASG00005025864 ENSEASG00005033055 ENSEASG00005033037 YIPF6 (ENSEASG00005034308) STARD8 (ENSEASG00005007082) EFNB1 (ENSEASG00005037551) PJA1 (ENSEASG00005036564) NALF2 (ENSEASG00005012674) EDA (ENSEASG00005029641) AWAT2 (ENSEASG00005019750) OTUD6A (ENSEASG00005018639) ENSEASG00005008955 DGAT2L6 (ENSEASG00005008959) Horse MODERN SPECIES 27 KCNA5 (ENSECAG00000003033) ENSECAG00000028778 NTF3 (ENSECAG00000024611) #11 ANO2 (ENSECAG00000024617) #12 VWF (ENSECAG00000010778) #13 CD9 (ENSECAG00000003002) #14 PLEKHG6 (ENSECAG00000012373) #15 TNFRSF1A (ENSECAG00000016330) #16 SCNN1A (ENSECAG00000001443) LTBR (ENSECAG00000000458) #17 VAMP1 (ENSECAG00000014602) #20 CD27 (ENSECAG00000011126) #18 TAPBPL (ENSECAG00000012920) #19 ENSECAG00000040327 NCAPD2 (ENSECAG00000017796) #21 GAPDH (ENSECAG00000022051) #22 IFFO1 (ENSECAG00000010254) NOP2 (ENSECAG00000012639) CHD4 (ENSECAG00000022005) ACRBP (ENSECAG00000023343) LPAR5 (ENSECAG00000023339) ING4 (ENSECAG00000024784) ZNF384 (ENSECAG00000009490) PIANP (ENSECAG00000015893) COPS7A (ENSECAG00000015911) MLF2 (ENSECAG00000022587) ENSECAG00000042372 LAG3 (ENSECAG00000002971) CD4 (ENSECAG00000009049) ENSECAG00000054174 P3H3 (ENSECAG00000021815) Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.h #22 Donkey MODERN SPECIES 1 PRLR (ENSEASG00005014937) AGXT2 (ENSEASG00005014944) DNAJC21 (ENSEASG00005014955) RAD1 (ENSEASG00005014974) BRIX1 (ENSEASG00005014968) TTC23L (ENSEASG00005014976) RAI14 (ENSEASG00005014978) ENSEASG00005029203 C1QTNF3 (ENSEASG00005033612) AMACR (ENSEASG00005035206) SLC45A2 (ENSEASG00005014986) RXFP3 (ENSEASG00005014988) ADAMTS12 (ENSEASG00005015016) TARS1 (ENSEASG00005015075) NPR3 (ENSEASG00005015081) ENSEASG00005034914 #22 SUB1 (ENSEASG00005032129) ZFR (ENSEASG00005007104) MTMR12 (ENSEASG00005007107) GOLPH3 (ENSEASG00005023797) ENSEASG00005007126 ENSEASG00005037387 ENSEASG00005024236 ENSEASG00005025268 C5orf22 (ENSEASG00005007146) DROSHA (ENSEASG00005007149) ENSEASG00005035698 CDH6 (ENSEASG00005007155) ENSEASG00005023693 CDH9 (ENSEASG00005007157) CDH10 (ENSEASG00005007161) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000005848 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Microbat MODERN SPECIES 947 NR2C1 (ENSMLUG00000015807) NDUFA12 (ENSMLUG00000027131) KCNA5 (ENSMLUG00000015804) NTF3 (ENSMLUG00000012482) #11 ANO2 (ENSMLUG00000015973) #12 VWF (ENSMLUG00000015993) #13 CD9 (ENSMLUG00000006901) #14 PLEKHG6 (ENSMLUG00000014270) #15 TNFRSF1A (ENSMLUG00000014278) #16 SCNN1A (ENSMLUG00000014284) LTBR (ENSMLUG00000014294) #17 CD27 (ENSMLUG00000014298) #18 TAPBPL (ENSMLUG00000014300) #19 VAMP1 (ENSMLUG00000014307) #20 NCAPD2 (ENSMLUG00000014309) #21 ENSMLUG00000014320 #22 IFFO1 (ENSMLUG00000014327) NOP2 (ENSMLUG00000014333) CHD4 (ENSMLUG00000014343) LPAR5 (ENSMLUG00000013768) ACRBP (ENSMLUG00000025466) ING4 (ENSMLUG00000029523) ZNF384 (ENSMLUG00000013771) PIANP (ENSMLUG00000004845) COPS7A (ENSMLUG00000013776) MLF2 (ENSMLUG00000013779) PTMS (ENSMLUG00000013783) LAG3 (ENSMLUG00000013787) CD4 (ENSMLUG00000024020) GPR162 (ENSMLUG00000022349) P3H3 (ENSMLUG00000006754) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Felidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Cat MODERN SPECIES 238 KCNA5 (ENSFCAG00000009372) NTF3 (ENSFCAG00000006859) #11 ANO2 (ENSFCAG00000006860) #12 ENSFCAG00000034293 VWF (ENSFCAG00000006861) #13 CD9 (ENSFCAG00000034944) #14 PLEKHG6 (ENSFCAG00000006865) #15 TNFRSF1A (ENSFCAG00000006868) #16 SCNN1A (ENSFCAG00000006869) LTBR (ENSFCAG00000008592) #17 CD27 (ENSFCAG00000006870) #18 TAPBPL (ENSFCAG00000006871) #19 VAMP1 (ENSFCAG00000036228) #20 MRPL51 (ENSFCAG00000043270) NCAPD2 (ENSFCAG00000006873) #21 GAPDH (ENSFCAG00000006874) #22 IFFO1 (ENSFCAG00000029815) NOP2 (ENSFCAG00000006876) CHD4 (ENSFCAG00000006877) LPAR5 (ENSFCAG00000006878) ACRBP (ENSFCAG00000006879) ING4 (ENSFCAG00000006880) ZNF384 (ENSFCAG00000006882) PIANP (ENSFCAG00000024891) COPS7A (ENSFCAG00000043178) ENSFCAG00000032640 PTMS (ENSFCAG00000043997) LAG3 (ENSFCAG00000006886) CD4 (ENSFCAG00000004269) GPR162 (ENSFCAG00000024524) P3H3 (ENSFCAG00000004270) Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Tiger MODERN SPECIES 306 NTF3 (ENSPTIG00000013497) #11 ANO2 (ENSPTIG00000021152) #12 VWF (ENSPTIG00000017098) #13 CD9 (ENSPTIG00000015011) #14 PLEKHG6 (ENSPTIG00000010482) #15 ENSPTIG00000009056 #16 SCNN1A (ENSPTIG00000005994) LTBR (ENSPTIG00000005394) #17 ENSPTIG00000006690 CD27 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ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 lion MODERN SPECIES 7 KCNA1 (ENSPLOG00000014395) KCNA5 (ENSPLOG00000014421) NTF3 (ENSPLOG00000014447) #11 ANO2 (ENSPLOG00000014508) #12 VWF (ENSPLOG00000015265) #13 CD9 (ENSPLOG00000015832) #14 PLEKHG6 (ENSPLOG00000000617) #15 TNFRSF1A (ENSPLOG00000000829) #16 SCNN1A (ENSPLOG00000000874) LTBR (ENSPLOG00000000954) #17 CD27 (ENSPLOG00000001037) #18 TAPBPL (ENSPLOG00000001078) #19 VAMP1 (ENSPLOG00000001138) #20 MRPL51 (ENSPLOG00000001173) NCAPD2 (ENSPLOG00000001201) #21 GAPDH (ENSPLOG00000001339) #22 IFFO1 (ENSPLOG00000001507) NOP2 (ENSPLOG00000001635) CHD4 (ENSPLOG00000001912) LPAR5 (ENSPLOG00000002380) ACRBP (ENSPLOG00000002396) ING4 (ENSPLOG00000002451) ZNF384 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ENSGT00940000153298.n.q.k.a.a #22 ENSGT00580000082664.a.a ENSGT00940000153112.D.h.a.a.a.a Dingo DUPLICATION Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 288 ENSCAFG00020006444 ELMO1 (ENSCAFG00020006437) AOAH (ENSCAFG00020006420) ANLN (ENSCAFG00020006404) MATCAP2 (ENSCAFG00020006400) EEPD1 (ENSCAFG00020006388) SEPTIN7 (ENSCAFG00020006386) HERPUD2 (ENSCAFG00020006382) TBX20 (ENSCAFG00020006360) DPY19L2 (ENSCAFG00020006325) DPY19L1 (ENSCAFG00020006169) ENSCAFG00020006137 NPSR1 (ENSCAFG00020006115) BMPER (ENSCAFG00020006089) BBS9 (ENSCAFG00020005454) ENSCAFG00020005434 #22 ENSCAFG00020005429 NT5C3A (ENSCAFG00020005370) FKBP9 (ENSCAFG00020005057) ENSCAFG00020005048 ENSCAFG00020005039 KBTBD2 (ENSCAFG00020005032) AVL9 (ENSCAFG00020004955) LSM5 (ENSCAFG00020004946) ENSCAFG00020004937 PDE1C (ENSCAFG00020004721) PPP1R17 (ENSCAFG00020004652) ITPRID1 (ENSCAFG00020004648) NEUROD6 (ENSCAFG00020004640) ADCYAP1R1 (ENSCAFG00020004417) GHRHR (ENSCAFG00020004373) Dingo MODERN SPECIES 295 SMIM10L1 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SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.k.a.b #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.k.a.b #22 Dingo MODERN SPECIES 138 QDPR (ENSCAFG00020012248) CLRN2 (ENSCAFG00020012251) LAP3 (ENSCAFG00020012262) MED28 (ENSCAFG00020012266) FAM184B (ENSCAFG00020012270) ENSCAFG00020012281 MAEA (ENSCAFG00020012285) UVSSA (ENSCAFG00020012302) NKX1-1 (ENSCAFG00020012312) FAM53A (ENSCAFG00020012319) SLBP (ENSCAFG00020012334) TMEM129 (ENSCAFG00020012337) TACC3 (ENSCAFG00020012340) FGFR3 (ENSCAFG00020012349) LETM1 (ENSCAFG00020012352) ENSCAFG00020012359 #22 NSD2 (ENSCAFG00020012364) NELFA (ENSCAFG00020012377) C4orf48 (ENSCAFG00020012395) NAT8L (ENSCAFG00020012398) POLN (ENSCAFG00020012402) HAUS3 (ENSCAFG00020012427) MXD4 (ENSCAFG00020012430) ZFYVE28 (ENSCAFG00020012447) CFAP99 (ENSCAFG00020012449) RNF4 (ENSCAFG00020012490) FAM193A (ENSCAFG00020012546) TNIP2 (ENSCAFG00020012703) SH3BP2 (ENSCAFG00020012726) ADD1 (ENSCAFG00020012740) MFSD10 (ENSCAFG00020012765) Red fox MODERN SPECIES 17 FSTL4 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ENSCAFG00020013436 ENSCAFG00020013447 ENSCAFG00020013449 DST (ENSCAFG00020013702) BEND6 (ENSCAFG00020015862) ENSCAFG00020015866 ENSCAFG00020015868 KIAA1586 (ENSCAFG00020015871) ZNF451 (ENSCAFG00020015879) BAG2 (ENSCAFG00020015898) RAB23 (ENSCAFG00020015900) PRIM2 (ENSCAFG00020015903) ENSCAFG00020015907 KHDRBS2 (ENSCAFG00020015926) ENSCAFG00020015930 ENSCAFG00020015933 #22 ENSCAFG00020015940 LGSN (ENSCAFG00020015951) PTP4A1 (ENSCAFG00020015958) ENSCAFG00020015972 ENSCAFG00020015989 ENSCAFG00020016031 ENSCAFG00020016032 ENSCAFG00020016039 ENSCAFG00020016041 Dog MODERN SPECIES 11 PROB1 (ENSCAFG00845000748) SPATA24 (ENSCAFG00845000773) DNAJC18 (ENSCAFG00845000811) ECSCR (ENSCAFG00845000875) SMIM33 (ENSCAFG00845000957) UBE2D2 (ENSCAFG00845000981) CXXC5 (ENSCAFG00845001003) PSD2 (ENSCAFG00845001040) NRG2 (ENSCAFG00845001070) PURA (ENSCAFG00845001158) IGIP (ENSCAFG00845001175) ENSCAFG00845001205 PFDN1 (ENSCAFG00845001230) HBEGF (ENSCAFG00845001249) SLC4A9 (ENSCAFG00845001336) 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(ENSMPUG00000016908) #18 TAPBPL (ENSMPUG00000016907) #19 VAMP1 (ENSMPUG00000016905) #20 MRPL51 (ENSMPUG00000016904) NCAPD2 (ENSMPUG00000016901) #21 GAPDH (ENSMPUG00000016891) #22 IFFO1 (ENSMPUG00000016884) NOP2 (ENSMPUG00000016865) CHD4 (ENSMPUG00000016859) LPAR5 (ENSMPUG00000020129) ACRBP (ENSMPUG00000016855) ING4 (ENSMPUG00000016840) ZNF384 (ENSMPUG00000016838) PIANP (ENSMPUG00000016836) COPS7A (ENSMPUG00000016835) MLF2 (ENSMPUG00000016834) PTMS (ENSMPUG00000016830) ENSMPUG00000016828 LAG3 (ENSMPUG00000016825) CD4 (ENSMPUG00000016809) GPR162 (ENSMPUG00000016806) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b.j #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q.l #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873.b ENSGT00390000005023.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Ursus ANCESTRAL SPECIES 351 ENSGT00940000180930 ENSGT00940000153298.n.q.l #22 ENSGT00510000046803.b.b American black bear MODERN SPECIES 236 ENSUAMG00000022690 #12 VWF (ENSUAMG00000022599) #13 CD9 (ENSUAMG00000022552) #14 PLEKHG6 (ENSUAMG00000022549) #15 TNFRSF1A (ENSUAMG00000022547) #16 ENSUAMG00000022546 ENSUAMG00000022545 ENSUAMG00000022544 #17 ENSUAMG00000022543 #17 CD27 (ENSUAMG00000022542) #18 TAPBPL (ENSUAMG00000022541) #19 VAMP1 (ENSUAMG00000022540) #20 MRPL51 (ENSUAMG00000022539) ENSUAMG00000022537 GAPDH (ENSUAMG00000022520) #22 ENSUAMG00000022518 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 1980 ENSAMEG00000026592 #22 Giant Panda MODERN 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Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.l.g #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.l.g #22 Dingo MODERN SPECIES 347 ENSCAFG00020008757 ZNF711 (ENSCAFG00020008733) POF1B (ENSCAFG00020008592) CHM (ENSCAFG00020008573) ENSCAFG00020008551 ENSCAFG00020008549 DACH2 (ENSCAFG00020008532) KLHL4 (ENSCAFG00020008498) ENSCAFG00020008484 ENSCAFG00020008461 ENSCAFG00020008456 NAP1L3 (ENSCAFG00020008423) ENSCAFG00020008407 ENSCAFG00020008403 ENSCAFG00020008379 ENSCAFG00020008310 #22 ENSCAFG00020008305 DIAPH2 (ENSCAFG00020008109) ENSCAFG00020008028 ENSCAFG00020008007 ENSCAFG00020008000 ENSCAFG00020007977 ENSCAFG00020007945 ENSCAFG00020007941 ENSCAFG00020007938 ENSCAFG00020007908 PCDH19 (ENSCAFG00020007882) ENSCAFG00020007874 TNMD (ENSCAFG00020007869) TSPAN6 (ENSCAFG00020007783) SRPX2 (ENSCAFG00020007764) Canidae DUPLICATION Canidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 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(ENSCAFG00020011792) ADAM29 (ENSCAFG00020011928) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.l.h.b #22 Red fox MODERN SPECIES 25 ONECUT2 (ENSVVUG00000014932) ST8SIA3 (ENSVVUG00000014931) ENSVVUG00000014923 WDR7 (ENSVVUG00000014912) TXNL1 (ENSVVUG00000014906) TCF4 (ENSVVUG00000014890) CCDC68 (ENSVVUG00000014885) RAB27B (ENSVVUG00000014878) ENSVVUG00000014874 ENSVVUG00000014866 CUNH18orf54 (ENSVVUG00000014859) CUNH18orf54 (ENSVVUG00000014854) STARD6 (ENSVVUG00000014848) POLI (ENSVVUG00000014845) MBD2 (ENSVVUG00000014700) ENSVVUG00000014674 #22 DCC (ENSVVUG00000014667) ENSVVUG00000014654 MEX3C (ENSVVUG00000014636) SMAD4 (ENSVVUG00000014609) ELAC1 (ENSVVUG00000014595) ME2 (ENSVVUG00000014587) MRO (ENSVVUG00000014571) MC2R (ENSVVUG00000014566) MC5R (ENSVVUG00000014564) RNMT (ENSVVUG00000014550) FAM210A (ENSVVUG00000014540) LDLRAD4 (ENSVVUG00000014523) ENSVVUG00000014500 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.l.h.b #22 Dog MODERN SPECIES 35 ENSCAFG00845002447 ACBD6 (ENSCAFG00845002431) LHX4 (ENSCAFG00845002410) QSOX1 (ENSCAFG00845002288) ENSCAFG00845002252 CEP350 (ENSCAFG00845002165) TOR1AIP1 (ENSCAFG00845002082) ENSCAFG00845002008 ENSCAFG00845001988 ENSCAFG00845001973 ENSCAFG00845001949 ENSCAFG00845001932 ENSCAFG00845001892 CENPF (ENSCAFG00845001752) PTPN14 (ENSCAFG00845001665) ENSCAFG00845001638 #22 SMYD2 (ENSCAFG00845001630) PROX1 (ENSCAFG00845001606) RPS6KC1 (ENSCAFG00845001399) ANGEL2 (ENSCAFG00845001293) VASH2 (ENSCAFG00845001231) ENSCAFG00845001182 FLVCR1 (ENSCAFG00845001151) ENSCAFG00845001121 TATDN3 (ENSCAFG00845003857) ENSCAFG00845003831 NSL1 (ENSCAFG00845003808) BATF3 (ENSCAFG00845003785) ENSCAFG00845003779 GARIN4 (ENSCAFG00845003772) ATF3 (ENSCAFG00845003749) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Tenrec MODERN SPECIES 1331 ENSETEG00000013743 NCAPD2 (ENSETEG00000013744) #21 GAPDH (ENSETEG00000013749) #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Elephant DUPLICATION Elephant MODERN SPECIES 108 KCNA5 (ENSLAFG00000007935) ENSLAFG00000028245 NTF3 (ENSLAFG00000002319) #11 ANO2 (ENSLAFG00000002320) #12 VWF (ENSLAFG00000002327) #13 CD9 (ENSLAFG00000027050) #14 PLEKHG6 (ENSLAFG00000021440) #15 TNFRSF1A (ENSLAFG00000017153) #16 SCNN1A (ENSLAFG00000000723) LTBR (ENSLAFG00000029559) #17 CD27 (ENSLAFG00000021608) #18 TAPBPL (ENSLAFG00000016109) #19 VAMP1 (ENSLAFG00000002104) #20 MRPL51 (ENSLAFG00000002106) NCAPD2 (ENSLAFG00000016117) #21 ENSLAFG00000002780 #22 IFFO1 (ENSLAFG00000002782) NOP2 (ENSLAFG00000002784) CHD4 (ENSLAFG00000022842) LPAR5 (ENSLAFG00000022468) ACRBP (ENSLAFG00000008377) ING4 (ENSLAFG00000008379) ZNF384 (ENSLAFG00000008381) PIANP (ENSLAFG00000025728) COPS7A (ENSLAFG00000004634) MLF2 (ENSLAFG00000013649) LAG3 (ENSLAFG00000032271) CD4 (ENSLAFG00000029166) GPR162 (ENSLAFG00000022632) P3H3 (ENSLAFG00000006551) GNB3 (ENSLAFG00000006559) Elephant MODERN SPECIES 49 RFT1 (ENSLAFG00000002792) PRKCD (ENSLAFG00000015864) TKT (ENSLAFG00000005325) DCP1A (ENSLAFG00000005837) CACNA1D (ENSLAFG00000022132) CHDH (ENSLAFG00000021479) ENSLAFG00000021630 IL17RB (ENSLAFG00000011145) ACTR8 (ENSLAFG00000001366) LRTM1 (ENSLAFG00000014120) CACNA2D3 (ENSLAFG00000014102) WNT5A (ENSLAFG00000002683) ENSLAFG00000032538 ENSLAFG00000018319 CCDC66 (ENSLAFG00000011093) ENSLAFG00000026000 #22 TASOR (ENSLAFG00000011103) ARHGEF3 (ENSLAFG00000001382) IL17RD (ENSLAFG00000012520) HESX1 (ENSLAFG00000032415) APPL1 (ENSLAFG00000014294) ASB14 (ENSLAFG00000014301) DNAH12 (ENSLAFG00000014308) PDE12 (ENSLAFG00000002821) ARF4 (ENSLAFG00000006203) DENND6A (ENSLAFG00000003914) SLMAP (ENSLAFG00000000245) FLNB (ENSLAFG00000006278) DNASE1L3 (ENSLAFG00000006296) ABHD6 (ENSLAFG00000016818) RPP14 (ENSLAFG00000031481) Hyrax MODERN SPECIES 212 NCAPD2 (ENSPCAG00000006779) #21 GAPDH (ENSPCAG00000006928) #22 IFFO1 (ENSPCAG00000006972) NOP2 (ENSPCAG00000007033) CHD4 (ENSPCAG00000007120) Theria DUPLICATION Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2972 ENSMSIG00000000838 ##22 Etaa1 (ENSMSIG00000000849) C1d (ENSMSIG00000000910) Dnaaf10 (ENSMSIG00000000934) ENSMSIG00000000962 ENSMSIG00000000988 ENSMSIG00000001023 Plek (ENSMSIG00000001053) Fbxo48 (ENSMSIG00000001105) Egfr (ENSMSIG00000001122) ENSMSIG00000001156 ENSMSIG00000001187 Steppe mouse MODERN SPECIES 2824 ENSMSIG00000026087 Emc2 (ENSMSIG00000026075) Eif3e (ENSMSIG00000026057) ENSMSIG00000026050 ##22 Rspo2 (ENSMSIG00000026035) Angpt1 (ENSMSIG00000026004) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Degu MODERN SPECIES 141 SLC48A1 (ENSODEG00000003853) RAPGEF3 (ENSODEG00000003613) ENDOU (ENSODEG00000003517) RPAP3 (ENSODEG00000003489) PCED1B (ENSODEG00000003479) ENSODEG00000018996 AMIGO2 (ENSODEG00000018958) ENSODEG00000003462 ENSODEG00000003450 SLC38A2 (ENSODEG00000003379) SLC38A1 (ENSODEG00000003269) SCAF11 (ENSODEG00000003223) ENSODEG00000019076 ENSODEG00000004013 ARID2 (ENSODEG00000003976) ENSODEG00000003928 ##22 ENSODEG00000018973 ENSODEG00000018965 ENSODEG00000003909 ANO6 (ENSODEG00000003814) NELL2 (ENSODEG00000003669) TMEM117 (ENSODEG00000003583) ENSODEG00000003529 ENSODEG00000018930 PUS7L (ENSODEG00000003484) ADAMTS20 (ENSODEG00000003382) PRICKLE1 (ENSODEG00000003320) PPHLN1 (ENSODEG00000003297) ENSODEG00000003268 ENSODEG00000003254 YAF2 (ENSODEG00000004846) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 15 TRIM23 (ENSSVLG00005004375) TRAPPC13 (ENSSVLG00005004304) SGTB (ENSSVLG00005012822) ENSSVLG00005012778 NLN (ENSSVLG00005012726) ERBIN (ENSSVLG00005012390) SREK1 (ENSSVLG00005012169) ENSSVLG00005012082 ENSSVLG00005012037 ##22 MAST4 (ENSSVLG00005010486) CD180 (ENSSVLG00005010276) ENSSVLG00005010238 ENSSVLG00005010209 ENSSVLG00005010183 PIK3R1 (ENSSVLG00005010056) ENSSVLG00005010000 ##22 SLC30A5 (ENSSVLG00005009911) CCNB1 (ENSSVLG00005009823) CENPH (ENSSVLG00005009762) ENSSVLG00005009714 CDK7 (ENSSVLG00005009632) CCDC125 (ENSSVLG00005009466) ENSSVLG00005009362 RAD17 (ENSSVLG00005009140) MARVELD2 (ENSSVLG00005008937) OCLN (ENSSVLG00005008798) ENSSVLG00005008740 ENSSVLG00005008651 CRHBP (ENSSVLG00005008579) S100Z (ENSSVLG00005008555) ENSSVLG00005008549 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 15 RAD17 (ENSSVLG00005009140) ENSSVLG00005009362 CCDC125 (ENSSVLG00005009466) CDK7 (ENSSVLG00005009632) ENSSVLG00005009714 CENPH (ENSSVLG00005009762) CCNB1 (ENSSVLG00005009823) SLC30A5 (ENSSVLG00005009911) ENSSVLG00005010000 ##22 PIK3R1 (ENSSVLG00005010056) ENSSVLG00005010183 ENSSVLG00005010209 ENSSVLG00005010238 CD180 (ENSSVLG00005010276) MAST4 (ENSSVLG00005010486) ENSSVLG00005012037 ##22 ENSSVLG00005012082 SREK1 (ENSSVLG00005012169) ERBIN (ENSSVLG00005012390) NLN (ENSSVLG00005012726) ENSSVLG00005012778 SGTB (ENSSVLG00005012822) TRAPPC13 (ENSSVLG00005004304) TRIM23 (ENSSVLG00005004375) PPWD1 (ENSSVLG00005004415) CENPK (ENSSVLG00005004475) ADAMTS6 (ENSSVLG00005004515) CWC27 (ENSSVLG00005004548) SREK1IP1 (ENSSVLG00005004571) SHISAL2B (ENSSVLG00005004593) RGS7BP (ENSSVLG00005004610) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 248 F13B (ENSUPAG00010002536) ENSUPAG00010002568 ZBTB41 (ENSUPAG00010002609) CRB1 (ENSUPAG00010002619) DENND1B (ENSUPAG00010002659) C1orf53 (ENSUPAG00010002739) LHX9 (ENSUPAG00010002748) NEK7 (ENSUPAG00010002784) ATP6V1G3 (ENSUPAG00010002806) PTPRC (ENSUPAG00010002835) NR5A2 (ENSUPAG00010006584) ENSUPAG00010006611 ##22 ZNF281 (ENSUPAG00010006619) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 724 NTF3 (ENSRBIG00000034368) #11 ANO2 (ENSRBIG00000033075) #12 VWF (ENSRBIG00000037765) #13 CD9 (ENSRBIG00000041088) #14 PLEKHG6 (ENSRBIG00000035904) #15 TNFRSF1A (ENSRBIG00000043065) #16 SCNN1A (ENSRBIG00000029623) LTBR (ENSRBIG00000032304) #17 CD27 (ENSRBIG00000028838) #18 TAPBPL (ENSRBIG00000043531) #19 ENSRBIG00000034062 VAMP1 (ENSRBIG00000037948) #20 ENSRBIG00000029955 ENSRBIG00000029250 NCAPD2 (ENSRBIG00000041534) #21 ENSRBIG00000042567 ##22 IFFO1 (ENSRBIG00000032577) ENSRBIG00000044511 ENSRBIG00000033304 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Beluga whale MODERN SPECIES 36 RNF24 (ENSDLEG00000019164) PANK2 (ENSDLEG00000019076) MAVS (ENSDLEG00000019055) ENSDLEG00000019048 AP5S1 (ENSDLEG00000019043) CDC25B (ENSDLEG00000019007) CENPB (ENSDLEG00000018997) SPEF1 (ENSDLEG00000018962) CUNH20orf27 (ENSDLEG00000018952) ENSDLEG00000018893 SIGLEC1 (ENSDLEG00000018732) ENSDLEG00000018103 ENSDLEG00000018030 ENSDLEG00000017544 ENSDLEG00000017473 ENSDLEG00000017400 ##22 ATRN (ENSDLEG00000016980) DNAAF9 (ENSDLEG00000015321) SLC4A11 (ENSDLEG00000014943) ENSDLEG00000014901 ENSDLEG00000014890 DDRGK1 (ENSDLEG00000014873) LZTS3 (ENSDLEG00000014855) FASTKD5 (ENSDLEG00000014849) UBOX5 (ENSDLEG00000014837) AVP (ENSDLEG00000014830) OXT (ENSDLEG00000014822) MRPS26 (ENSDLEG00000014812) GNRH2 (ENSDLEG00000014803) PTPRA (ENSDLEG00000014710) VPS16 (ENSDLEG00000014501) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 31 RFTN2 (ENSCHYG00000013201) MARS2 (ENSCHYG00000013177) BOLL (ENSCHYG00000012765) PLCL1 (ENSCHYG00000012427) ENSCHYG00000012371 SATB2 (ENSCHYG00000012100) ENSCHYG00000011965 C2orf69 (ENSCHYG00000011903) TYW5 (ENSCHYG00000011850) MAIP1 (ENSCHYG00000011759) ENSCHYG00000011736 SPATS2L (ENSCHYG00000011390) KCTD18 (ENSCHYG00000011325) SGO2 (ENSCHYG00000011236) AOX1 (ENSCHYG00000010517) ENSCHYG00000010452 ##22 ENSCHYG00000010410 ENSCHYG00000009851 ENSCHYG00000009654 BZW1 (ENSCHYG00000009251) ENSCHYG00000004999 CLK1 (ENSCHYG00000004911) PPIL3 (ENSCHYG00000004901) NIF3L1 (ENSCHYG00000004879) ORC2 (ENSCHYG00000004839) HYCC2 (ENSCHYG00000004790) ENSCHYG00000004767 CFLAR (ENSCHYG00000004722) CASP8 (ENSCHYG00000004683) FLACC1 (ENSCHYG00000004659) TRAK2 (ENSCHYG00000004632) Yarkand deer MODERN SPECIES 31 FARSB (ENSCHYG00000022658) ENSCHYG00000022621 MOGAT1 (ENSCHYG00000022580) ACSL3 (ENSCHYG00000022341) KCNE4 (ENSCHYG00000022309) SCG2 (ENSCHYG00000022276) AP1S3 (ENSCHYG00000022169) WDFY1 (ENSCHYG00000022020) MRPL44 (ENSCHYG00000021987) SERPINE2 (ENSCHYG00000021898) FAM124B (ENSCHYG00000021856) CUL3 (ENSCHYG00000021376) CCDC195 (ENSCHYG00000021314) DOCK10 (ENSCHYG00000020928) NYAP2 (ENSCHYG00000020801) ENSCHYG00000020734 ##22 ENSCHYG00000020698 IRS1 (ENSCHYG00000020656) ENSCHYG00000020613 RHBDD1 (ENSCHYG00000020452) COL4A4 (ENSCHYG00000018791) ENSCHYG00000018528 ENSCHYG00000017266 TM4SF20 (ENSCHYG00000017177) AGFG1 (ENSCHYG00000016822) ENSCHYG00000016720 ENSCHYG00000016686 ENSCHYG00000016605 ENSCHYG00000016581 SCYGR8 (ENSCHYG00000016560) CCL20 (ENSCHYG00000016439) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1183 COPB2 (ENSMMSG00000007584) RBP2 (ENSMMSG00000007546) RBP1 (ENSMMSG00000007523) NMNAT3 (ENSMMSG00000007475) CLSTN2 (ENSMMSG00000007374) TRIM42 (ENSMMSG00000007340) SLC25A36 (ENSMMSG00000007138) SPSB4 (ENSMMSG00000007102) ENSMMSG00000007071 PXYLP1 (ENSMMSG00000006978) RASA2 (ENSMMSG00000006905) RNF7 (ENSMMSG00000006837) GRK7 (ENSMMSG00000006798) ENSMMSG00000006771 ENSMMSG00000006756 ENSMMSG00000006733 ##22 TFDP2 (ENSMMSG00000006589) GK5 (ENSMMSG00000006474) XRN1 (ENSMMSG00000006235) ATR (ENSMMSG00000006162) PLS1 (ENSMMSG00000006112) TRPC1 (ENSMMSG00000006046) PCOLCE2 (ENSMMSG00000005995) PAQR9 (ENSMMSG00000005982) U2SURP (ENSMMSG00000005820) CHST2 (ENSMMSG00000005775) SLC9A9 (ENSMMSG00000005673) DIPK2A (ENSMMSG00000005617) PLOD2 (ENSMMSG00000005367) PLSCR4 (ENSMMSG00000005249) ENSMMSG00000005202 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000153832.f.y.d.a.a.b ENSGT00940000153832.f.x.b.a ENSGT00940000155811 ENSGT00940000157033 ENSGT00550000074930 ENSGT00940000155040.b ENSGT00940000157777 ENSGT00940000157998 ENSGT00530000063626.b ENSGT00390000001285 ENSGT00950000183039.A ENSGT00530000063539.a.v ENSGT00940000156088 ENSGT00940000157212.B ENSGT00940000159679 ENSGT00940000153298.m.a ##22 ENSGT00940000155323.a ENSGT00550000074846.`b ENSGT00950000182955.a.b.b ENSGT00390000002848 ENSGT00940000155870.b ENSGT00940000158267 ENSGT00940000164528 ENSGT00940000155915 ENSGT00950000183062.a.a.b ENSGT00940000156242 ENSGT00390000013995.b.b ENSGT00940000173599 ENSGT00730000111061.p ENSGT00390000016228 ENSGT00940000157529 Wild yak MODERN SPECIES 105 ENSBMUG00000006429 ENSBMUG00000006433 CNOT2 (ENSBMUG00000006457) KCNMB4 (ENSBMUG00000006472) ENSBMUG00000006480 PTPRB (ENSBMUG00000006695) PTPRR (ENSBMUG00000007089) CPNE8 (ENSBMUG00000007243) ENSBMUG00000007251 ##22 KIF21A (ENSBMUG00000007479) ENSBMUG00000007814 ABCD2 (ENSBMUG00000007818) Domestic yak MODERN SPECIES 24 ENSBGRG00000023408 ENSBGRG00000023471 ENSBGRG00000007422 YEATS4 (ENSBGRG00000007500) FRS2 (ENSBGRG00000007705) CCT2 (ENSBGRG00000007901) LRRC10 (ENSBGRG00000008156) ENSBGRG00000008385 RAB3IP (ENSBGRG00000008446) MYRFL (ENSBGRG00000008765) CNOT2 (ENSBGRG00000009161) KCNMB4 (ENSBGRG00000009357) PTPRB (ENSBGRG00000009450) PTPRR (ENSBGRG00000011534) CPNE8 (ENSBGRG00000012044) ENSBGRG00000012374 ##22 KIF21A (ENSBGRG00000012509) ABCD2 (ENSBGRG00000014998) C12orf40 (ENSBGRG00000015186) SLC2A13 (ENSBGRG00000015360) LRRK2 (ENSBGRG00000015531) ENSBGRG00000016248 ENSBGRG00000016370 CNTN1 (ENSBGRG00000016476) ENSBGRG00000017368 PDZRN4 (ENSBGRG00000017386) GXYLT1 (ENSBGRG00000017528) YAF2 (ENSBGRG00000017721) PPHLN1 (ENSBGRG00000017994) ENSBGRG00000018534 ENSBGRG00000018622 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 19 CFAP36 (ENSOARG00020000353) PPP4R3B (ENSOARG00020000304) PNPT1 (ENSOARG00020000229) EFEMP1 (ENSOARG00020000199) CCDC85A (ENSOARG00020003231) FANCL (ENSOARG00020003084) ENSOARG00020003034 ENSOARG00020003018 BCL11A (ENSOARG00020002953) PAPOLG (ENSOARG00020002875) REL (ENSOARG00020002832) PUS10 (ENSOARG00020002818) PEX13 (ENSOARG00020002802) SANBR (ENSOARG00020002778) MRPL19 (ENSOARG00020002714) ENSOARG00020002681 ##22 ENSOARG00020002672 EVA1A (ENSOARG00020002662) SEPTIN10 (ENSOARG00020002613) CCDC138 (ENSOARG00020002474) RANBP2 (ENSOARG00020002287) ENSOARG00020002071 ENSOARG00020001948 SLC5A7 (ENSOARG00020001925) ST6GAL2 (ENSOARG00020001914) ENSOARG00020001906 UXS1 (ENSOARG00020001860) ECRG4 (ENSOARG00020001846) NCK2 (ENSOARG00020001838) TTL (ENSOARG00020001816) POLR1B (ENSOARG00020001752) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Horse MODERN SPECIES 30 TGS1 (ENSECAG00000019399) TMEM68 (ENSECAG00000000568) XKR4 (ENSECAG00000006978) RP1 (ENSECAG00000007686) ENSECAG00000043138 ENSECAG00000051067 MRPL15 (ENSECAG00000012110) LYPLA1 (ENSECAG00000016530) ENSECAG00000052889 TCEA1 (ENSECAG00000013436) ENSECAG00000050151 RGS20 (ENSECAG00000018510) ENSECAG00000044966 ATP6V1H (ENSECAG00000024159) OPRK1 (ENSECAG00000014442) ENSECAG00000047787 ##22 NPBWR1 (ENSECAG00000005077) RB1CC1 (ENSECAG00000017579) ALKAL1 (ENSECAG00000039026) ENSECAG00000058919 ENSECAG00000053325 PCMTD1 (ENSECAG00000022204) ENSECAG00000053013 PXDNL (ENSECAG00000022817) ENSECAG00000019962 SNTG1 (ENSECAG00000000087) ENSECAG00000000401 ENSECAG00000056104 ENSECAG00000051290 PPDPFL (ENSECAG00000040755) SNAI2 (ENSECAG00000010120) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 5 RIMS2 (ENSRFEG00010020235) DCAF13 (ENSRFEG00010020165) ENSRFEG00010020145 CTHRC1 (ENSRFEG00010020112) FZD6 (ENSRFEG00010020069) BAALC (ENSRFEG00010020012) ATP6V1C1 (ENSRFEG00010019958) ENSRFEG00010019866 KLF10 (ENSRFEG00010019834) ODF1 (ENSRFEG00010019798) UBR5 (ENSRFEG00010019728) RRM2B (ENSRFEG00010019621) NCALD (ENSRFEG00010019578) GRHL2 (ENSRFEG00010019555) ENSRFEG00010019533 ENSRFEG00010019510 ##22 ENSRFEG00010019469 ZNF706 (ENSRFEG00010019443) YWHAZ (ENSRFEG00010019368) PABPC1 (ENSRFEG00010018981) SNX31 (ENSRFEG00010018757) ANKRD46 (ENSRFEG00010018712) RNF19A (ENSRFEG00010018669) SPAG1 (ENSRFEG00010018396) ENSRFEG00010018329 FBXO43 (ENSRFEG00010018248) RGS22 (ENSRFEG00010017161) ENSRFEG00010017088 VPS13B (ENSRFEG00010016767) OSR2 (ENSRFEG00010016629) STK3 (ENSRFEG00010016550) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 leopard MODERN SPECIES 100 VIPR2 (ENSPPRG00000008355) DYNC2I1 (ENSPPRG00000009013) ESYT2 (ENSPPRG00000010108) NCAPG2 (ENSPPRG00000012938) ENSPPRG00000013187 DNAJB6 (ENSPPRG00000014279) UBE3C (ENSPPRG00000018222) ENSPPRG00000018523 ENSPPRG00000019502 LMBR1 (ENSPPRG00000000213) RNF32 (ENSPPRG00000000886) SHH (ENSPPRG00000001063) ENSPPRG00000001410 ENSPPRG00000001556 ##22 ENSPPRG00000001926 ENSPPRG00000002064 EN2 (ENSPPRG00000002234) INSIG1 (ENSPPRG00000002510) HTR5A (ENSPPRG00000002723) PAXIP1 (ENSPPRG00000003450) DPP6 (ENSPPRG00000006688) ENSPPRG00000007943 XRCC2 (ENSPPRG00000008124) CCT8L2 (ENSPPRG00000016812) KMT2C (ENSPPRG00000010608) GALNT11 (ENSPPRG00000011292) GALNTL5 (ENSPPRG00000012696) PRKAG2 (ENSPPRG00000017828) RHEB (ENSPPRG00000018707) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 American mink MODERN SPECIES 22 TSN19 (ENSNVIG00000000703) LRRIQ1 (ENSNVIG00000000618) ALX1 (ENSNVIG00000000603) RASSF9 (ENSNVIG00000000592) NEUT (ENSNVIG00000000561) MGT4C (ENSNVIG00000000536) ENSNVIG00000000519 C12orf50 (ENSNVIG00000000495) C12orf29 (ENSNVIG00000000481) CEP290 (ENSNVIG00000000345) TMTC3 (ENSNVIG00000000330) ENSNVIG00000000305 DUSP6 (ENSNVIG00000000281) POC1B (ENSNVIG00000000231) ATP2B1 (ENSNVIG00000000007) ENSNVIG00000023933 ##22 CCER1 (ENSNVIG00000023927) EPYC (ENSNVIG00000023926) KERA (ENSNVIG00000023924) LUM (ENSNVIG00000023923) DCN (ENSNVIG00000023917) BTG1 (ENSNVIG00000023913) EEA1 (ENSNVIG00000023904) ENSNVIG00000023902 ENSNVIG00000023900 ENSNVIG00000023897 ENSNVIG00000023894 SOCS2 (ENSNVIG00000023891) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Red fox MODERN SPECIES 98 TRAM1L1 (ENSVVUG00000008075) ENSVVUG00000008040 ENSVVUG00000008039 ENSVVUG00000008001 ENSVVUG00000007997 ENSVVUG00000007981 NDST4 (ENSVVUG00000007972) UGT8 (ENSVVUG00000007954) ARSJ (ENSVVUG00000007950) CAMK2D (ENSVVUG00000007922) ENSVVUG00000005739 ENSVVUG00000002513 LARP7 (ENSVVUG00000002274) ZGRF1 (ENSVVUG00000002203) ENSVVUG00000002181 ENSVVUG00000002176 ##22 NDUFA1 (ENSVVUG00000002163) ALPK1 (ENSVVUG00000002069) TIFA (ENSVVUG00000002050) AP1AR (ENSVVUG00000002032) ENSVVUG00000002024 ENSVVUG00000001983 PITX2 (ENSVVUG00000001959) ENSVVUG00000001947 ENPEP (ENSVVUG00000001907) ENSVVUG00000001891 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 326 CNOT10 (ENSCAFG00020001836) TRIM71 (ENSCAFG00020002354) CCR4 (ENSCAFG00020002363) GLB1 (ENSCAFG00020002368) TMPPE (ENSCAFG00020002374) CRTAP (ENSCAFG00020002375) ENSCAFG00020002378 ENSCAFG00020002380 ENSCAFG00020002387 FBXL2 (ENSCAFG00020002395) UBP1 (ENSCAFG00020002404) CLASP2 (ENSCAFG00020002594) SNRK (ENSCAFG00020005597) ANO10 (ENSCAFG00020005621) ENSCAFG00020005627 ENSCAFG00020005630 ##22 ABHD5 (ENSCAFG00020005633) ENSCAFG00020005662 TOPAZ1 (ENSCAFG00020005672) TCAIM (ENSCAFG00020005698) ZNF445 (ENSCAFG00020005703) ENSCAFG00020005711 ENSCAFG00020005712 ENSCAFG00020005719 NINL (ENSCAFG00020005723) GINS1 (ENSCAFG00020005786) ENSCAFG00020005810 PYGB (ENSCAFG00020005902) ENTPD6 (ENSCAFG00020005916) VSX1 (ENSCAFG00020005925) ACSS1 (ENSCAFG00020005947) Dingo MODERN SPECIES 271 RABGAP1L (ENSCAFG00020017104) RC3H1 (ENSCAFG00020017112) SERPINC1 (ENSCAFG00020017142) ZBTB37 (ENSCAFG00020017191) DARS2 (ENSCAFG00020017227) CENPL (ENSCAFG00020017339) KLHL20 (ENSCAFG00020017347) ANKRD45 (ENSCAFG00020017352) TEX50 (ENSCAFG00020017355) ENSCAFG00020017360 PRDX6 (ENSCAFG00020017363) ENSCAFG00020017364 ENSCAFG00020017375 TNFSF18 (ENSCAFG00020017381) ENSCAFG00020017383 ENSCAFG00020017386 ##22 ENSCAFG00020017389 ENSCAFG00020017391 FASLG (ENSCAFG00020017393) SUCO (ENSCAFG00020017469) C1orf105 (ENSCAFG00020018674) PIGC (ENSCAFG00020018676) ENSCAFG00020018678 DNM3 (ENSCAFG00020018810) METTL13 (ENSCAFG00020021213) VAMP4 (ENSCAFG00020021237) MYOC (ENSCAFG00020021241) PRRC2C (ENSCAFG00020021350) FMO4 (ENSCAFG00020022037) FMO1 (ENSCAFG00020022043) FMO2 (ENSCAFG00020022048) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000026741 CCIN (ENSSHAG00000007165) CLTA (ENSSHAG00000024140) GNE (ENSSHAG00000008041) RNF38 (ENSSHAG00000022975) MELK (ENSSHAG00000010319) PAX5 (ENSSHAG00000012375) ENSSHAG00000014234 ZCCHC7 (ENSSHAG00000014544) GRHPR (ENSSHAG00000015897) ZBTB5 (ENSSHAG00000015981) POLR1E (ENSSHAG00000021869) FBXO10 (ENSSHAG00000016176) ENSSHAG00000016364 ENSSHAG00000030934 ENSSHAG00000027500 ##22 FRMPD1 (ENSSHAG00000016751) TRMT10B (ENSSHAG00000016905) EXOSC3 (ENSSHAG00000024727) ENSSHAG00000016975 ENSSHAG00000017042 ENSSHAG00000027920 SHB (ENSSHAG00000027399) ALDH1B1 (ENSSHAG00000014168) ENSSHAG00000014227 ENSSHAG00000009588 ENSSHAG00000014496 ENSSHAG00000014857 ENSSHAG00000029355 ENSSHAG00000015254 TMOD1 (ENSSHAG00000015336) Opossum MODERN SPECIES 2 ST18 (ENSMODG00000009635) ENSMODG00000025613 RB1CC1 (ENSMODG00000009612) NPBWR1 (ENSMODG00000009573) OPRK1 (ENSMODG00000009510) ENSMODG00000040801 ATP6V1H (ENSMODG00000009431) ENSMODG00000024926 RGS20 (ENSMODG00000009398) ENSMODG00000009389 LYPLA1 (ENSMODG00000009367) MRPL15 (ENSMODG00000009360) ENSMODG00000024927 ENSMODG00000027805 ENSMODG00000009188 ENSMODG00000044310 ##22 XKR4 (ENSMODG00000025611) TMEM68 (ENSMODG00000009183) TGS1 (ENSMODG00000009174) LYN (ENSMODG00000009142) RPS20 (ENSMODG00000045434) MOS (ENSMODG00000024929) PLAG1 (ENSMODG00000043175) ENSMODG00000024930 SDR16C5 (ENSMODG00000009095) ENSMODG00000009075 PENK (ENSMODG00000049693) ENSMODG00000038941 BPNT2 (ENSMODG00000008961) FAM110B (ENSMODG00000008907) UBXN2B (ENSMODG00000008866) Theria DUPLICATION Theria DUPLICATION Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A Kangaroo rat MODERN SPECIES 388 D6Wsu163e (ENSDORG00000024396) ENSDORG00000030145 Akap3 (ENSDORG00000015855) Ndufa9 (ENSDORG00000001278) Kcna6 (ENSDORG00000005125) Kcna1 (ENSDORG00000012602) Ntf3 (ENSDORG00000029285) #11 Ano2 (ENSDORG00000025195) #12 Vwf (ENSDORG00000026775) #13 Cd9 (ENSDORG00000013724) #14 Plekhg6 (ENSDORG00000006748) #15 Scnn1a (ENSDORG00000003134) Vamp1 (ENSDORG00000015989) #20 Mrpl51 (ENSDORG00000028160) Ncapd2 (ENSDORG00000015992) #21 ENSDORG00000027336 ##22 Chd4 (ENSDORG00000001847) Lpar5 (ENSDORG00000026918) Ing4 (ENSDORG00000015718) Zfp384 (ENSDORG00000015720) Pianp (ENSDORG00000024889) ENSDORG00000025741 ENSDORG00000015958 ENSDORG00000024725 Lag3 (ENSDORG00000001547) Gpr162 (ENSDORG00000019800) P3h3 (ENSDORG00000011727) Gnb3 (ENSDORG00000016512) Cdca3 (ENSDORG00000013173) Usp5 (ENSDORG00000013174) Tpi1 (ENSDORG00000013175) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A Muroidea ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00950000182825.B ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 289 Ntf3 (ENSCGRG00001015283) #11 Ano2 (ENSCGRG00001013479) #12 Vwf (ENSCGRG00001000364) #13 Cd9 (ENSCGRG00001022703) #14 ENSCGRG00001015575 Plekhg6 (ENSCGRG00001021507) #15 Tnfrsf1a (ENSCGRG00001021062) #16 Scnn1a (ENSCGRG00001020304) Ltbr (ENSCGRG00001015407) #17 ENSCGRG00001013937 Cd27 (ENSCGRG00001009970) #18 ENSCGRG00001020124 #19 Vamp1 (ENSCGRG00001014055) #20 ENSCGRG00001010566 Ncapd2 (ENSCGRG00001002247) #21 ENSCGRG00001006857 ##22 Iffo1 (ENSCGRG00001000162) Nop2 (ENSCGRG00001020970) Chd4 (ENSCGRG00001020662) Lpar5 (ENSCGRG00001014775) Acrbp (ENSCGRG00001017982) Ing4 (ENSCGRG00001016033) Zfp384 (ENSCGRG00001013065) Pianp (ENSCGRG00001015100) Cops7a (ENSCGRG00001014256) Mlf2 (ENSCGRG00001010430) Ptms (ENSCGRG00001001584) Lag3 (ENSCGRG00001022458) Cd4 (ENSCGRG00001013261) Gpr162 (ENSCGRG00001003162) P3h3 (ENSCGRG00001000528) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 188 Trim69 (ENSCGRG00001016620) Terb2 (ENSCGRG00001009237) Sord (ENSCGRG00001006100) Duox2 (ENSCGRG00001024853) Duoxa2 (ENSCGRG00001002266) Duoxa1 (ENSCGRG00001023908) Duox1 (ENSCGRG00001021686) Shf 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ENSCGRG00001023989 ENSCGRG00001018958 ENSCGRG00001014391 ##22 Celf4 (ENSCGRG00001018085) AW554918 (ENSCGRG00001004328) Tpgs2 (ENSCGRG00001016331) Fhod3 (ENSCGRG00001001610) Elp2 (ENSCGRG00001007789) Slc39a6 (ENSCGRG00001014525) Rprd1a (ENSCGRG00001013116) 2700062C07Rik (ENSCGRG00001016462) Galnt1 (ENSCGRG00001009490) Ino80c (ENSCGRG00001023869) Zfp24 (ENSCGRG00001022125) Zfp35 (ENSCGRG00001021560) ENSCGRG00001000297 Zfp397 (ENSCGRG00001023645) Mapre2 (ENSCGRG00001018790) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 144 Gdf3 (ENSCGRG00001012294) Apobec1 (ENSCGRG00001011130) Aicda (ENSCGRG00001009654) Mfap5 (ENSCGRG00001004460) ENSCGRG00001000042 ##22 Rimklb (ENSCGRG00001022642) Phc1 (ENSCGRG00001019563) M6pr (ENSCGRG00001016862) Klrg1 (ENSCGRG00001016252) ENSCGRG00001014902 ENSCGRG00001011744 ENSCGRG00001005252 A2m (ENSCGRG00001019386) Iqsec3 (ENSCGRG00001017723) Slc6a12 (ENSCGRG00001014552) Slc6a13 (ENSCGRG00001010837) Usp18 (ENSCGRG00001008570) Tuba8 (ENSCGRG00001006489) Pex26 (ENSCGRG00001000447) Mical3 (ENSCGRG00001021782) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Ankrd37 (ENSCGRG00001015273) Lrp2bp (ENSCGRG00001005458) Snx25 (ENSCGRG00001013747) Cfap97 (ENSCGRG00001012133) Slc25a4 (ENSCGRG00001007127) ENSCGRG00001003795 Helt (ENSCGRG00001013119) Acsl1 (ENSCGRG00001012242) Cenpu (ENSCGRG00001024299) Primpol (ENSCGRG00001016107) CASP 3 (ENSCGRG00001015469) Irf2 (ENSCGRG00001014578) ENSCGRG00001014136 Enpp6 (ENSCGRG00001013812) Stox2 (ENSCGRG00001013096) ENSCGRG00001003901 ##22 Trappc11 (ENSCGRG00001018304) Rwdd4a (ENSCGRG00001018945) Ing2 (ENSCGRG00001017801) Cdkn2aip (ENSCGRG00001016194) ENSCGRG00001015210 Wwc2 (ENSCGRG00001016882) Dctd (ENSCGRG00001016053) Tenm3 (ENSCGRG00001021107) Aga (ENSCGRG00001019108) Neil3 (ENSCGRG00001018596) Vegfc (ENSCGRG00001014310) Spcs3 (ENSCGRG00001013944) Asb5 (ENSCGRG00001013169) Spata4 (ENSCGRG00001012374) Wdr17 (ENSCGRG00001010983) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 80 Fam163a (ENSMOCG00000020187) Tor1aip2 (ENSMOCG00000014435) ENSMOCG00000006601 Tor1aip1 (ENSMOCG00000016290) ENSMOCG00000009954 Cep350 (ENSMOCG00000016460) Qsox1 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Cdkn2b (ENSMOCG00000015669) ENSMOCG00000013892 Mtap (ENSMOCG00000012400) ENSMOCG00000003644 ENSMOCG00000004406 ENSMOCG00000003427 ENSMOCG00000004176 Klhl9 (ENSMOCG00000003966) ENSMOCG00000022936 ENSMOCG00000002912 ENSMOCG00000003333 ENSMOCG00000003596 Prairie vole MODERN SPECIES 7 Gatc (ENSMOCG00000005051) Triap1 (ENSMOCG00000005593) ENSMOCG00000006758 Msi1 (ENSMOCG00000002286) Pla2g1b (ENSMOCG00000010330) Sirt4 (ENSMOCG00000016396) Pxn (ENSMOCG00000014430) ENSMOCG00000012309 Gcn1 (ENSMOCG00000000746) Rab35 (ENSMOCG00000019999) Bicdl1 (ENSMOCG00000019402) Cit (ENSMOCG00000012761) Prkab1 (ENSMOCG00000006183) Tmem233 (ENSMOCG00000002502) Ccdc60 (ENSMOCG00000011345) ENSMOCG00000007613 ##22 Hspb8 (ENSMOCG00000009705) Srrm4 (ENSMOCG00000006737) Suds3 (ENSMOCG00000001519) Taok3 (ENSMOCG00000015684) ENSMOCG00000001486 Vsig10 (ENSMOCG00000014068) Wsb2 (ENSMOCG00000021973) Rfc5 (ENSMOCG00000013450) Ksr2 (ENSMOCG00000016878) Nos1 (ENSMOCG00000000970) Fbxo21 (ENSMOCG00000011172) Tesc (ENSMOCG00000013995) Fbxw8 (ENSMOCG00000020447) Rnft2 (ENSMOCG00000022819) Spring1 (ENSMOCG00000013278) Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 84 Kcna5 (ENSMOCG00000002810) ENSMOCG00000015356 Ntf3 (ENSMOCG00000001488) #11 Ano2 (ENSMOCG00000000380) #12 Vwf (ENSMOCG00000005320) #13 Cd9 (ENSMOCG00000022019) #14 Plekhg6 (ENSMOCG00000006971) #15 Tnfrsf1a (ENSMOCG00000013868) #16 Scnn1a (ENSMOCG00000000794) Ltbr (ENSMOCG00000015975) #17 Cd27 (ENSMOCG00000017717) #18 Tapbpl (ENSMOCG00000000244) #19 Vamp1 (ENSMOCG00000019201) #20 Mrpl51 (ENSMOCG00000013685) ENSMOCG00000000297 #21 ENSMOCG00000000471 ##22 Iffo1 (ENSMOCG00000003850) Nop2 (ENSMOCG00000017237) Chd4 (ENSMOCG00000020624) Lpar5 (ENSMOCG00000021762) Acrbp (ENSMOCG00000017657) Ing4 (ENSMOCG00000010335) Zfp384 (ENSMOCG00000022768) Pianp (ENSMOCG00000012046) Cops7a (ENSMOCG00000018184) ENSMOCG00000000196 Ptms (ENSMOCG00000011411) Lag3 (ENSMOCG00000016856) Cd4 (ENSMOCG00000007576) Gpr162 (ENSMOCG00000018395) P3h3 (ENSMOCG00000014085) Prairie vole MODERN SPECIES 102 Atp6v1c1 (ENSMOCG00000003343) Baalc (ENSMOCG00000016406) Fzd6 (ENSMOCG00000018634) Cthrc1 (ENSMOCG00000003229) ENSMOCG00000001296 Slc25a32 (ENSMOCG00000014663) Dcaf13 (ENSMOCG00000011609) ENSMOCG00000017431 Rims2 (ENSMOCG00000001988) Dcstamp (ENSMOCG00000005844) Dpys (ENSMOCG00000003058) Lrp12 (ENSMOCG00000018668) ENSMOCG00000019475 ##22 Zfpm2 (ENSMOCG00000013738) ENSMOCG00000018803 Abra (ENSMOCG00000011808) Angpt1 (ENSMOCG00000015180) Rspo2 (ENSMOCG00000017286) Eif3e (ENSMOCG00000014831) Emc2 (ENSMOCG00000004849) Tmem74 (ENSMOCG00000003138) Trhr (ENSMOCG00000020887) Nudcd1 (ENSMOCG00000001394) Eny2 (ENSMOCG00000012387) Pkhd1l1 (ENSMOCG00000020807) Ebag9 (ENSMOCG00000008680) Sybu (ENSMOCG00000008712) ENSMOCG00000008423 Prairie vole MODERN SPECIES 357 Bpifa2 (ENSMOCG00000020017) Bpifa3 (ENSMOCG00000007021) Bpifa1 (ENSMOCG00000022067) Bpifa5 (ENSMOCG00000015053) Bpifb1 (ENSMOCG00000011657) Bpifb5 (ENSMOCG00000002643) Cdk5rap1 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ENSPEMG00000025965 Cd27 (ENSPEMG00000012177) #18 ENSPEMG00000028083 Tapbpl (ENSPEMG00000003668) #19 Vamp1 (ENSPEMG00000006934) #20 Mrpl51 (ENSPEMG00000008667) Ncapd2 (ENSPEMG00000016112) #21 ENSPEMG00000001195 ##22 Iffo1 (ENSPEMG00000008539) Nop2 (ENSPEMG00000013138) Chd4 (ENSPEMG00000010290) Lpar5 (ENSPEMG00000019056) Acrbp (ENSPEMG00000010165) Ing4 (ENSPEMG00000018496) Zfp384 (ENSPEMG00000016282) Pianp (ENSPEMG00000013120) Cops7a (ENSPEMG00000002860) Mlf2 (ENSPEMG00000013094) ENSPEMG00000016593 Lag3 (ENSPEMG00000018743) ENSPEMG00000024347 Gpr162 (ENSPEMG00000017095) P3h3 (ENSPEMG00000011450) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 330 ENSPEMG00000012067 ##22 Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A Murinae DUPLICATION Murinae DUPLICATION Murinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A Mus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Mus_B DUPLICATION Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.a ##22 Mouse MODERN SPECIES 17 Smad1 (ENSMUSG00000031681) Mmaa (ENSMUSG00000037022) 1700011L22Rik (ENSMUSG00000031682) Zfp827 (ENSMUSG00000071064) Lsm6 (ENSMUSG00000031683) Slc10a7 (ENSMUSG00000031684) Rbmxl1 (ENSMUSG00000037070) Pou4f2 (ENSMUSG00000031688) Ttc29 (ENSMUSG00000037101) Ednra (ENSMUSG00000031616) Tmem184c (ENSMUSG00000031617) Prmt9 (ENSMUSG00000037134) Arhgap10 (ENSMUSG00000037148) Nr3c2 (ENSMUSG00000031618) Iqcm (ENSMUSG00000031620) Gm10358 (ENSMUSG00000110469) ##22 Rasd2 (ENSMUSG00000034472) Mcm5 (ENSMUSG00000005410) Hmox1 (ENSMUSG00000005413) Tom1 (ENSMUSG00000042870) Hmgxb4 (ENSMUSG00000034518) Isx (ENSMUSG00000031621) Large1 (ENSMUSG00000004383) F2rl3 (ENSMUSG00000050147) Sin3b (ENSMUSG00000031622) Nwd1 (ENSMUSG00000048148) Tmem38a (ENSMUSG00000031791) Smim7 (ENSMUSG00000044600) Med26 (ENSMUSG00000045248) Slc35e1 (ENSMUSG00000019731) Cherp (ENSMUSG00000052488) Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.a ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3024 ENSMSIG00000005560 ##22 ENSMSIG00000005551 Uggt1 (ENSMSIG00000005383) Neurl3 (ENSMSIG00000005348) Arid5a (ENSMSIG00000005133) Kansl3 (ENSMSIG00000004959) Fer1l5 (ENSMSIG00000004804) ENSMSIG00000004755 Cnnm4 (ENSMSIG00000004737) ENSMSIG00000004727 Ankrd23 (ENSMSIG00000004650) Ankrd39 (ENSMSIG00000004625) Sema4c (ENSMSIG00000004577) ENSMSIG00000004554 Fam178b (ENSMSIG00000004445) ENSMSIG00000004406 Mus_B DUPLICATION Mus_B DUPLICATION Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.b.a.a ##22 Mouse MODERN SPECIES 5 Il3ra (ENSMUSG00000068758) Or2t1 (ENSMUSG00000072707) Or2t6 (ENSMUSG00000052417) Psmd6 (ENSMUSG00000021737) Atxn7 (ENSMUSG00000021738) Thoc7 (ENSMUSG00000053453) Gm11100 (ENSMUSG00000079357) Cdhr18 (ENSMUSG00000084902) Sntn (ENSMUSG00000044772) Synpr (ENSMUSG00000056296) Cadps (ENSMUSG00000054423) Fezf2 (ENSMUSG00000021743) Gm49355 (ENSMUSG00000114378) 3830406C13Rik (ENSMUSG00000033111) PTPRG (ENSMUSG00000121513) Gm3839 (ENSMUSG00000097148) ##22 Fhit (ENSMUSG00000060579) Cfap20dc (ENSMUSG00000021747) Fam3d (ENSMUSG00000021749) Fam107a (ENSMUSG00000021750) Acox2 (ENSMUSG00000021751) Kctd6 (ENSMUSG00000021752) Pdhb (ENSMUSG00000021748) Pxk (ENSMUSG00000033885) Rpp14 (ENSMUSG00000023156) Abhd6 (ENSMUSG00000025277) Dnase1l3 (ENSMUSG00000025279) Gm45521 (ENSMUSG00000109649) Flnb (ENSMUSG00000025278) Gm10128 (ENSMUSG00000063277) Gm10338 (ENSMUSG00000094706) Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.b.a.a ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3264 Ube2f (ENSMSIG00000025282) ENSMSIG00000025346 Rbm44 (ENSMSIG00000025367) Lrrfip1 (ENSMSIG00000025383) ENSMSIG00000025514 Prlh (ENSMSIG00000025590) Mlph (ENSMSIG00000025599) Col6a3 (ENSMSIG00000025643) ENSMSIG00000025965 Cops8 (ENSMSIG00000025975) Ackr3 (ENSMSIG00000025992) Iqca (ENSMSIG00000026003) Asb18 (ENSMSIG00000026105) Gbx2 (ENSMSIG00000026131) Agap1 (ENSMSIG00000026135) ENSMSIG00000026271 ##22 Sh3bp4 (ENSMSIG00000026285) Arl4c (ENSMSIG00000026322) ENSMSIG00000026330 ENSMSIG00000026335 Spp2 (ENSMSIG00000026338) Trpm8 (ENSMSIG00000026361) Hjurp (ENSMSIG00000026452) ENSMSIG00000026481 Mroh2a (ENSMSIG00000026486) Ugt1a1 (ENSMSIG00000026581) Dnajb3 (ENSMSIG00000026596) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00950000182825.B ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904.e.a ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00950000182825.B ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904.e.a ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00940000168330 ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2453 Plekhg6 (ENSMSIG00000007258) #15 Tnfrsf1a (ENSMSIG00000007222) #16 Scnn1a (ENSMSIG00000007175) Ltbr (ENSMSIG00000007137) #17 ENSMSIG00000007122 Cd27 (ENSMSIG00000007002) #18 Tapbpl (ENSMSIG00000006978) #19 Vamp1 (ENSMSIG00000006906) #20 Mrpl51 (ENSMSIG00000006876) Ncapd2 (ENSMSIG00000006811) #21 ENSMSIG00000006759 ##22 Iffo1 (ENSMSIG00000006668) Nop2 (ENSMSIG00000006620) Chd4 (ENSMSIG00000006341) Lpar5 (ENSMSIG00000006314) Acrbp (ENSMSIG00000006066) Ing4 (ENSMSIG00000005976) Zfp384 (ENSMSIG00000005490) Pianp (ENSMSIG00000005454) Cops7a (ENSMSIG00000005376) Steppe mouse MODERN SPECIES 3257 ENSMSIG00000011119 ENSMSIG00000011113 ##22 ENSMSIG00000011080 Pou3f2 (ENSMSIG00000011067) Fbxl4 (ENSMSIG00000011047) Faxc (ENSMSIG00000010979) Coq3 (ENSMSIG00000010952) Pnisr (ENSMSIG00000010869) Usp45 (ENSMSIG00000010762) Tstd3 (ENSMSIG00000010751) Ccnc (ENSMSIG00000010655) Prdm13 (ENSMSIG00000010623) ENSMSIG00000010612 Mouse MODERN SPECIES 15 Kcna5 (ENSMUSG00000045534) Ntf3 (ENSMUSG00000049107) #11 Ano2 (ENSMUSG00000038115) #12 Vwf (ENSMUSG00000001930) #13 Cd9 (ENSMUSG00000030342) #14 Plekhg6 (ENSMUSG00000038167) #15 Tnfrsf1a (ENSMUSG00000030341) #16 Scnn1a (ENSMUSG00000030340) Ltbr (ENSMUSG00000030339) #17 Tuba3a (ENSMUSG00000067702) Cd27 (ENSMUSG00000030336) #18 Tapbpl (ENSMUSG00000038213) #19 Vamp1 (ENSMUSG00000030337) #20 Mrpl51 (ENSMUSG00000030335) Ncapd2 (ENSMUSG00000038252) #21 Gapdh (ENSMUSG00000057666) ##22 Iffo1 (ENSMUSG00000038271) Nop2 (ENSMUSG00000038279) Chd4 (ENSMUSG00000063870) Lpar5 (ENSMUSG00000067714) Acrbp (ENSMUSG00000072770) Ing4 (ENSMUSG00000030330) Zfp384 (ENSMUSG00000038346) Pianp (ENSMUSG00000030329) Cops7a (ENSMUSG00000030127) Mlf2 (ENSMUSG00000030120) Ptms (ENSMUSG00000030122) Lag3 (ENSMUSG00000030124) Cd4 (ENSMUSG00000023274) Gpr162 (ENSMUSG00000038390) P3h3 (ENSMUSG00000023191) Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.b.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.b.b ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 3380 Slc25a38 (ENSMSIG00000002254) ENSMSIG00000002215 Rpsa (ENSMSIG00000002112) Mobp (ENSMSIG00000026540) ENSMSIG00000026519 Myrip (ENSMSIG00000026454) ENSMSIG00000026436 Entpd3 (ENSMSIG00000026423) Rpl14 (ENSMSIG00000026415) ENSMSIG00000026396 Ctnnb1 (ENSMSIG00000026366) Ulk4 (ENSMSIG00000023580) Trak1 (ENSMSIG00000023343) Cck (ENSMSIG00000023310) Lyzl4 (ENSMSIG00000023296) ENSMSIG00000023284 ##22 Vipr1 (ENSMSIG00000023239) Ss18l2 (ENSMSIG00000023200) Nktr (ENSMSIG00000023148) Zfp651 (ENSMSIG00000023124) Klhl40 (ENSMSIG00000023110) Hhatl (ENSMSIG00000023088) Ccdc13 (ENSMSIG00000023071) Higd1a (ENSMSIG00000023055) Ackr2 (ENSMSIG00000023045) Cyp8b1 (ENSMSIG00000023040) Gask1a (ENSMSIG00000023006) Pomgnt2 (ENSMSIG00000023000) Snrk (ENSMSIG00000022916) Ano10 (ENSMSIG00000022790) Abhd5 (ENSMSIG00000022728) Steppe mouse MODERN SPECIES 46 Ttc19 (ENSMSIG00000018495) ENSMSIG00000018478 Ncor1 (ENSMSIG00000017542) Pigl (ENSMSIG00000017496) ENSMSIG00000017486 ENSMSIG00000017479 Trpv2 (ENSMSIG00000017440) Lrrc75a (ENSMSIG00000017410) Mmgt2 (ENSMSIG00000017400) Zfp287 (ENSMSIG00000017280) ENSMSIG00000017266 Zfp286 (ENSMSIG00000017187) Fbxw10 (ENSMSIG00000016995) Tvp23b (ENSMSIG00000016977) Cdrt4 (ENSMSIG00000016960) ENSMSIG00000016949 ##22 Tekt3 (ENSMSIG00000016911) Pmp22 (ENSMSIG00000016837) ENSMSIG00000016830 ENSMSIG00000016811 ENSMSIG00000016798 ENSMSIG00000016790 ENSMSIG00000016785 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 15 C5h9orf152 (ENSRNOG00000012068) Akap2 (ENSRNOG00000011504) Ptpn3 (ENSRNOG00000011425) Epb41l4b (ENSRNOG00000056550) Frrs1l (ENSRNOG00000043103) Tmem245 (ENSRNOG00000026271) Ctnnal1 (ENSRNOG00000010593) Abitram (ENSRNOG00000010532) Elp1 (ENSRNOG00000016725) Actl7a (ENSRNOG00000016641) Actl7b (ENSRNOG00000016621) AABR07048312.1 (ENSRNOG00000029600) Klf4 (ENSRNOG00000016299) Rad23b (ENSRNOG00000016137) ENSRNOG00000063835 ENSRNOG00000066746 ##22 ENSRNOG00000067901 Zfp462 (ENSRNOG00000032048) LOC120103152 (ENSRNOG00000034161) ENSRNOG00000065525 LOC685311 (ENSRNOG00000065946) RGD1564956 (ENSRNOG00000017640) Tmem38b (ENSRNOG00000028063) Tal2 (ENSRNOG00000028082) Fktn (ENSRNOG00000028129) LOC100360453 (ENSRNOG00000033177) Fsd1l (ENSRNOG00000059876) Slc44a1 (ENSRNOG00000055089) Abca1 (ENSRNOG00000018126) AABR07048271.1 (ENSRNOG00000033271) Nipsnap3a (ENSRNOG00000010332) Rat MODERN SPECIES 14 Kcna5 (ENSRNOG00000019719) Ntf3 (ENSRNOG00000019716) #11 Ano2 (ENSRNOG00000023561) #12 Vwf (ENSRNOG00000019689) #13 Cd9 (ENSRNOG00000019556) #14 ENSRNOG00000064217 Plekhg6 (ENSRNOG00000019528) #15 Tnfrsf1a (ENSRNOG00000031312) #16 Scnn1a (ENSRNOG00000019368) Ltbr (ENSRNOG00000019264) #17 Tuba3b (ENSRNOG00000031707) Cd27 (ENSRNOG00000027466) #18 Vamp1 (ENSRNOG00000019219) #20 Mrpl51 (ENSRNOG00000019165) Ncapd2 (ENSRNOG00000055300) #21 LOC108351137 (ENSRNOG00000018630) ##22 Iffo1 (ENSRNOG00000018533) Nop2 (ENSRNOG00000018453) Chd4 (ENSRNOG00000018309) Lpar5 (ENSRNOG00000021401) Ing4 (ENSRNOG00000023363) Acrbp (ENSRNOG00000017399) ENSRNOG00000066393 Zfp384 (ENSRNOG00000017066) Pianp (ENSRNOG00000017052) Cops7a (ENSRNOG00000016778) Mlf2 (ENSRNOG00000016589) AC115420.4 (ENSRNOG00000060308) Ptms (ENSRNOG00000060098) Lag3 (ENSRNOG00000021334) ENSRNOG00000071219 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.b ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 11 Kcna1 (MGP_PahariEiJ_G0022647) Kcna5 (MGP_PahariEiJ_G0022646) Ntf3 (MGP_PahariEiJ_G0022645) #11 Ano2 (MGP_PahariEiJ_G0022644) #12 Vwf (MGP_PahariEiJ_G0022643) #13 Cd9 (MGP_PahariEiJ_G0022642) #14 Plekhg6 (MGP_PahariEiJ_G0022641) #15 Tnfrsf1a (MGP_PahariEiJ_G0022640) #16 Scnn1a (MGP_PahariEiJ_G0022639) Ltbr (MGP_PahariEiJ_G0022638) #17 Cd27 (MGP_PahariEiJ_G0022637) #18 Tapbpl (MGP_PahariEiJ_G0022636) #19 Vamp1 (MGP_PahariEiJ_G0022635) #20 Mrpl51 (MGP_PahariEiJ_G0022634) Ncapd2 (MGP_PahariEiJ_G0022633) #21 MGP_PahariEiJ_G0022632 ##22 Iffo1 (MGP_PahariEiJ_G0022631) MGP_PahariEiJ_G0022630 Chd4 (MGP_PahariEiJ_G0022629) Lpar5 (MGP_PahariEiJ_G0022628) Acrbp (MGP_PahariEiJ_G0022627) Ing4 (MGP_PahariEiJ_G0022626) Zfp384 (MGP_PahariEiJ_G0022625) Pianp (MGP_PahariEiJ_G0022624) Cops7a (MGP_PahariEiJ_G0022623) MGP_PahariEiJ_G0022622 MGP_PahariEiJ_G0022621 Lag3 (MGP_PahariEiJ_G0022620) MGP_PahariEiJ_G0022619 Gpr162 (MGP_PahariEiJ_G0022618) P3h3 (MGP_PahariEiJ_G0022617) Rat MODERN SPECIES 11 Dbt (ENSRNOG00000015029) Lrrc39 (ENSRNOG00000015117) Trmt13 (ENSRNOG00000015140) Sass6 (ENSRNOG00000015211) Hiat1-ps1 (ENSRNOG00000015502) Agl (ENSRNOG00000016214) Frrs1 (ENSRNOG00000016351) Palmd (ENSRNOG00000058609) 4930455H04Rik (ENSRNOG00000070759) AABR07013057.1 (ENSRNOG00000060159) AABR07013065.1 (ENSRNOG00000055846) Plppr4 (ENSRNOG00000016872) Plppr5 (ENSRNOG00000016878) Snx7 (ENSRNOG00000017077) Dpyd (ENSRNOG00000017105) AABR07013086.1 (ENSRNOG00000023365) ##22 Ptbp2 (ENSRNOG00000010827) Rwdd3 (ENSRNOG00000029893) Tlcd4 (ENSRNOG00000025160) Alg14 (ENSRNOG00000011528) Cnn3 (ENSRNOG00000011559) Slc44a3 (ENSRNOG00000011723) ENSRNOG00000063273 F3 (ENSRNOG00000011800) Abcd3 (ENSRNOG00000011929) Arhgap29 (ENSRNOG00000012563) Gclm (ENSRNOG00000013409) Dnttip2 (ENSRNOG00000025025) Bcar3 (ENSRNOG00000013737) Fnbp1l (ENSRNOG00000013798) Pde5a (ENSRNOG00000014443) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 33 Fshb (ENSMSIG00000015133) ENSMSIG00000015115 Arl14ep (ENSMSIG00000015063) Mpped2 (ENSMSIG00000015026) ENSMSIG00000015003 ##22 ENSMSIG00000014903 ENSMSIG00000014856 Immp1l (ENSMSIG00000014838) Elp4 (ENSMSIG00000014816) Pax6 (ENSMSIG00000014511) ENSMSIG00000014497 Them7 (ENSMSIG00000014482) Wt1 (ENSMSIG00000014372) ENSMSIG00000014324 ENSMSIG00000014312 Eif3m (ENSMSIG00000014235) ENSMSIG00000014230 ENSMSIG00000014200 Rat MODERN SPECIES 7 Casp3 (ENSRNOG00000010475) Primpol (ENSRNOG00000022320) Cenpu (ENSRNOG00000022261) Acsl1 (ENSRNOG00000010633) AABR07005806.1 (ENSRNOG00000057653) Helt (ENSRNOG00000010785) Slc25a4 (ENSRNOG00000010830) Cfap97 (ENSRNOG00000032192) Snx25 (ENSRNOG00000011116) Lrp2bp (ENSRNOG00000011178) Ankrd37 (ENSRNOG00000031335) Ufsp2 (ENSRNOG00000012087) C16h4orf47 (ENSRNOG00000038819) Ccdc110 (ENSRNOG00000045697) Pdlim3 (ENSRNOG00000012658) AABR07025010.1 (ENSRNOG00000033057) ##22 Sorbs2 (ENSRNOG00000013391) Tlr3 (ENSRNOG00000021726) Fam149a (ENSRNOG00000021693) Cyp4v3 (ENSRNOG00000042426) Klkb1 (ENSRNOG00000014118) F11 (ENSRNOG00000013684) Mtnr1a (ENSRNOG00000028744) Fat1 (ENSRNOG00000030954) Adam34l (ENSRNOG00000056277) Adam34 (ENSRNOG00000038743) AABR07025818.1 (ENSRNOG00000052883) Adam26a (ENSRNOG00000068728) AABR07025819.1 (ENSRNOG00000038744) Zfp42 (ENSRNOG00000067356) Triml2 (ENSRNOG00000028299) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2845 Rnf185 (ENSMSIG00000003936) ENSMSIG00000003911 Pla2g3 (ENSMSIG00000003865) Inpp5j (ENSMSIG00000003757) Selenom (ENSMSIG00000003733) Smtn (ENSMSIG00000003334) ENSMSIG00000003292 ENSMSIG00000003275 Morc2a (ENSMSIG00000003158) Osbp2 (ENSMSIG00000003063) ENSMSIG00000003026 ENSMSIG00000003003 Dusp18 (ENSMSIG00000002994) Slc35e4 (ENSMSIG00000002976) Tcn2 (ENSMSIG00000002908) ENSMSIG00000002894 ##22 4930556J24Rik (ENSMSIG00000002859) Pes1 (ENSMSIG00000002758) Gal3st1 (ENSMSIG00000002697) Sec14l4 (ENSMSIG00000002672) ENSMSIG00000002649 Mtfp1 (ENSMSIG00000002619) Sec14l2 (ENSMSIG00000002585) ENSMSIG00000002570 Rnf215 (ENSMSIG00000002532) Ccdc157 (ENSMSIG00000002493) Sf3a1 (ENSMSIG00000002366) Tbc1d10a (ENSMSIG00000002229) Castor1 (ENSMSIG00000002199) Osm (ENSMSIG00000002174) Lif (ENSMSIG00000002129) Steppe mouse MODERN SPECIES 3295 ENSMSIG00000006271 ENSMSIG00000006258 ##22 ENSMSIG00000006202 Celf4 (ENSMSIG00000005335) Steppe mouse MODERN SPECIES 3294 Rab39 (ENSMSIG00000003361) ENSMSIG00000003120 Npat (ENSMSIG00000003045) Atm (ENSMSIG00000002482) 4930550C14Rik (ENSMSIG00000002342) Poglut3 (ENSMSIG00000002258) Exph5 (ENSMSIG00000002225) ENSMSIG00000002169 ENSMSIG00000002160 Ddx10 (ENSMSIG00000002113) ENSMSIG00000002094 AI593442 (ENSMSIG00000002076) ENSMSIG00000002067 Zc3h12c (ENSMSIG00000023596) Rdx (ENSMSIG00000023566) ENSMSIG00000023562 ##22 Fdx1 (ENSMSIG00000023526) Steppe mouse MODERN SPECIES 2330 Ugt2b34 (ENSMSIG00000003246) ENSMSIG00000003208 ENSMSIG00000003201 ##22 Ythdc1 (ENSMSIG00000002806) Tmprss11e (ENSMSIG00000002742) Tmprss11b (ENSMSIG00000002680) Rat MODERN SPECIES 4 Ncstn (ENSRNOG00000005355) Nhlh1 (ENSRNOG00000005166) Vangl2 (ENSRNOG00000004889) Slamf6 (ENSRNOG00000038286) Cd84 (ENSRNOG00000022884) Slamf1 (ENSRNOG00000059073) Cd48 (ENSRNOG00000004737) ENSRNOG00000062700 Slamf7 (ENSRNOG00000023209) Ly9 (ENSRNOG00000025069) Cd244 (ENSRNOG00000064255) Cd244 (ENSRNOG00000068754) Itln1 (ENSRNOG00000004678) LOC100359583 (ENSRNOG00000025731) F11r (ENSRNOG00000004414) ENSRNOG00000068856 ##22 Arhgap30 (ENSRNOG00000004192) Tstd1 (ENSRNOG00000004255) Nectin4 (ENSRNOG00000004029) Klhdc9 (ENSRNOG00000004022) Nit1 (ENSRNOG00000003881) Dedd (ENSRNOG00000003779) Pfdn2 (ENSRNOG00000066932) Ufc1 (ENSRNOG00000003706) Usp21 (ENSRNOG00000038347) B4galt3 (ENSRNOG00000003551) Adamts4 (ENSRNOG00000003538) Ppox (ENSRNOG00000003567) Ndufs2 (ENSRNOG00000038372) Fcer1g (ENSRNOG00000024159) Apoa2 (ENSRNOG00000003500) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 12 ENSMOCG00000020653 Anapc10 (ENSMOCG00000017245) Abce1 (ENSMOCG00000013213) Otud4 (ENSMOCG00000012639) Smad1 (ENSMOCG00000002828) Mmaa (ENSMOCG00000000542) 1700011L22Rik (ENSMOCG00000010556) Zfp827 (ENSMOCG00000020399) ENSMOCG00000002657 Lsm6 (ENSMOCG00000020049) Slc10a7 (ENSMOCG00000007838) ENSMOCG00000017327 Pou4f2 (ENSMOCG00000014811) Ttc29 (ENSMOCG00000010925) ENSMOCG00000018841 ENSMOCG00000010337 ##22 Ednra (ENSMOCG00000017745) ENSMOCG00000016788 Rasd2 (ENSMOCG00000014090) Hmox1 (ENSMOCG00000005130) Tom1 (ENSMOCG00000010687) Hmgxb4 (ENSMOCG00000005178) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 11 PCOLCE2 (ENSRFEG00010005148) PAQR9 (ENSRFEG00010005166) U2SURP (ENSRFEG00010005180) ENSRFEG00010005199 CHST2 (ENSRFEG00010005206) SLC9A9 (ENSRFEG00010005221) DIPK2A (ENSRFEG00010005250) ENSRFEG00010005260 PLOD2 (ENSRFEG00010005288) PLSCR4 (ENSRFEG00010005346) ENSRFEG00010005376 PLSCR1 (ENSRFEG00010005408) PLSCR5 (ENSRFEG00010005460) ZIC4 (ENSRFEG00010005534) ZIC1 (ENSRFEG00010005593) ENSRFEG00010005605 ##22 AGTR1 (ENSRFEG00010005628) CPB1 (ENSRFEG00010005647) CPA3 (ENSRFEG00010005703) ENSRFEG00010005735 GYG1 (ENSRFEG00010005772) HLTF (ENSRFEG00010005836) HPS3 (ENSRFEG00010006011) CP (ENSRFEG00010006210) ENSRFEG00010006508 TM4SF18 (ENSRFEG00010007025) TM4SF1 (ENSRFEG00010007070) TM4SF4 (ENSRFEG00010007100) WWTR1 (ENSRFEG00010007131) COMMD2 (ENSRFEG00010007155) ANKUB1 (ENSRFEG00010007185) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 20 ISG20 (ENSRFEG00010008901) AEN (ENSRFEG00010008945) DET1 (ENSRFEG00010008995) MRPS11 (ENSRFEG00010009068) MRPL46 (ENSRFEG00010009099) NTRK3 (ENSRFEG00010009240) AGBL1 (ENSRFEG00010009486) KLHL25 (ENSRFEG00010009518) AKAP13 (ENSRFEG00010009623) SV2B (ENSRFEG00010010164) SLCO3A1 (ENSRFEG00010010224) ST8SIA2 (ENSRFEG00010010423) FAM174B (ENSRFEG00010010589) CHD2 (ENSRFEG00010010750) RGMA (ENSRFEG00010011018) ENSRFEG00010011043 ##22 MCTP2 (ENSRFEG00010011139) NR2F2 (ENSRFEG00010011894) ARRDC4 (ENSRFEG00010012007) ENSRFEG00010012055 ENSRFEG00010012112 IGF1R (ENSRFEG00010012281) SYNM (ENSRFEG00010012407) TTC23 (ENSRFEG00010012513) LRRC28 (ENSRFEG00010012612) MEF2A (ENSRFEG00010012816) LYSMD4 (ENSRFEG00010013232) ADAMTS17 (ENSRFEG00010013302) CERS3 (ENSRFEG00010013357) LINS1 (ENSRFEG00010013393) ASB7 (ENSRFEG00010013431) Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 8 ENSRFEG00010011446 UBE2E2 (ENSRFEG00010011378) ENSRFEG00010011222 NKIRAS1 (ENSRFEG00010011183) ENSRFEG00010011144 NR1D2 (ENSRFEG00010011056) THRB (ENSRFEG00010010882) RARB (ENSRFEG00010010823) TOP2B (ENSRFEG00010010294) NGLY1 (ENSRFEG00010010150) OXSM (ENSRFEG00010010038) LRRC3B (ENSRFEG00010010014) ENSRFEG00010010003 NEK10 (ENSRFEG00010009104) SLC4A7 (ENSRFEG00010008194) ENSRFEG00010008101 ##22 EOMES (ENSRFEG00010007965) CMC1 (ENSRFEG00010007886) AZI2 (ENSRFEG00010007841) ZCWPW2 (ENSRFEG00010007754) RBMS3 (ENSRFEG00010007564) TGFBR2 (ENSRFEG00010007495) GADL1 (ENSRFEG00010007234) STT3B (ENSRFEG00010007149) OSBPL10 (ENSRFEG00010007069) GPD1L (ENSRFEG00010007017) CMTM8 (ENSRFEG00010006920) CMTM6 (ENSRFEG00010006857) DYNC1LI1 (ENSRFEG00010006794) CNOT10 (ENSRFEG00010006629) TRIM71 (ENSRFEG00010006548) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 1 NTN4 (ENSRFEG00010019959) SNRPF (ENSRFEG00010019886) CCDC38 (ENSRFEG00010019857) AMDHD1 (ENSRFEG00010019814) HAL (ENSRFEG00010019753) LTA4H (ENSRFEG00010019582) ELK3 (ENSRFEG00010019517) CDK17 (ENSRFEG00010019452) CFAP54 (ENSRFEG00010018994) NEDD1 (ENSRFEG00010018827) ENSRFEG00010018650 ENSRFEG00010018608 ENSRFEG00010018576 APAF1 (ENSRFEG00010018386) ENSRFEG00010018331 ENSRFEG00010018324 ##22 ANKS1B (ENSRFEG00010017872) ENSRFEG00010017816 BLTP3B (ENSRFEG00010017660) ACTR6 (ENSRFEG00010017580) SCYL2 (ENSRFEG00010017358) SLC17A8 (ENSRFEG00010017004) NR1H4 (ENSRFEG00010016901) GAS2L3 (ENSRFEG00010016827) ANO4 (ENSRFEG00010016021) SLC5A8 (ENSRFEG00010015766) UTP20 (ENSRFEG00010015715) ARL1 (ENSRFEG00010015513) ENSRFEG00010015420 MYBPC1 (ENSRFEG00010013747) CHPT1 (ENSRFEG00010013493) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000160453 #19 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 3295 ENSDNOG00000005799 ENSDNOG00000045836 LRRCC1 (ENSDNOG00000011333) E2F5 (ENSDNOG00000009802) ENSDNOG00000009828 CA13 (ENSDNOG00000032060) CA1 (ENSDNOG00000014903) ENSDNOG00000043023 CA3 (ENSDNOG00000044877) CA2 (ENSDNOG00000043973) ENSDNOG00000049521 ##22 PSKH2 (ENSDNOG00000011495) ATP6V0D2 (ENSDNOG00000008447) WWP1 (ENSDNOG00000019937) RMDN1 (ENSDNOG00000046346) CPNE3 (ENSDNOG00000014867) MMP16 (ENSDNOG00000015771) RIPK2 (ENSDNOG00000038605) OSGIN2 (ENSDNOG00000039511) NBN (ENSDNOG00000010843) DECR1 (ENSDNOG00000043391) CALB1 (ENSDNOG00000044661) ENSDNOG00000039191 TMEM64 (ENSDNOG00000004256) ENSDNOG00000018952 NECAB1 (ENSDNOG00000016197) Armadillo MODERN SPECIES 508 ENSDNOG00000035788 #13 CD9 (ENSDNOG00000006191) #14 PLEKHG6 (ENSDNOG00000006637) #15 TNFRSF1A (ENSDNOG00000006656) #16 SCNN1A (ENSDNOG00000036126) LTBR (ENSDNOG00000047421) #17 CD27 (ENSDNOG00000035400) #18 TAPBPL (ENSDNOG00000035668) #19 VAMP1 (ENSDNOG00000001131) #20 MRPL51 (ENSDNOG00000001127) NCAPD2 (ENSDNOG00000001128) #21 ENSDNOG00000038191 ##22 IFFO1 (ENSDNOG00000036248) NOP2 (ENSDNOG00000001133) CHD4 (ENSDNOG00000001134) LPAR5 (ENSDNOG00000045302) ACRBP (ENSDNOG00000042457) ING4 (ENSDNOG00000041413) ZNF384 (ENSDNOG00000003936) PIANP (ENSDNOG00000037888) COPS7A (ENSDNOG00000001998) ENSDNOG00000000758 PTMS (ENSDNOG00000024120) LAG3 (ENSDNOG00000002426) CD4 (ENSDNOG00000002205) GPR162 (ENSDNOG00000039746) P3H3 (ENSDNOG00000036097) Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2813 ENSDNOG00000035447 ENSDNOG00000034525 ENSDNOG00000035854 KIF21A (ENSDNOG00000016343) ENSDNOG00000040272 ##22 ABCD2 (ENSDNOG00000049146) C12orf40 (ENSDNOG00000005525) SLC2A13 (ENSDNOG00000040772) Armadillo MODERN SPECIES 910 ENSDNOG00000041180 ##22 PBX2 (ENSDNOG00000042174) AGER (ENSDNOG00000034611) RNF5 (ENSDNOG00000033018) AGPAT1 (ENSDNOG00000031697) ENSDNOG00000024209 ATF6B (ENSDNOG00000042135) PRRT1 (ENSDNOG00000039982) TNXB (ENSDNOG00000044250) CYP21A2 (ENSDNOG00000043254) ENSDNOG00000048858 STK19 (ENSDNOG00000036273) DXO (ENSDNOG00000038155) SKIC2 (ENSDNOG00000037590) ENSDNOG00000041886 ENSDNOG00000042923 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2096 NKAIN3 (ENSDNOG00000001766) GGH (ENSDNOG00000040880) TTPA (ENSDNOG00000046523) YTHDF3 (ENSDNOG00000037156) ENSDNOG00000033171 ##22 BHLHE22 (ENSDNOG00000004738) CYP7B1 (ENSDNOG00000004741) Armadillo MODERN SPECIES 1706 ENSDNOG00000046127 ##22 ENSDNOG00000044037 ENSDNOG00000038180 ENSDNOG00000049419 ENSDNOG00000037749 ALCAM (ENSDNOG00000013819) CBLB (ENSDNOG00000004663) Marsupialia DUPLICATION Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 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ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01050000246306 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.g ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01050000246306 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 18 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ENSGT00940000160226 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000159310 ENSGT00390000001680 ENSGT00940000156046 ENSGT00530000063822.a.a ENSGT00940000155379 ENSGT00940000154234.a ENSGT00390000016768 ENSGT00440000034605 ENSGT00940000160574 ENSGT00390000006218 ENSGT00530000063981.b ENSGT00940000155426 ENSGT00390000008679 ENSGT00390000012559 ENSGT00390000013149.g.a ENSGT00940000153298.m.b.a.a.h.a ##22 ENSGT00940000157405 ENSGT00390000010991 ENSGT00390000006196 ENSGT00940000154860 ENSGT00940000157226 ENSGT00390000016821 ENSGT00940000164760 ENSGT00940000161101 ENSGT00940000156620 ENSGT00940000159662 ENSGT00940000158481 ENSGT00940000157667 ENSGT00390000017249 ENSGT00940000159837 ENSGT00940000160226 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000159310 ENSGT00390000001680 ENSGT00940000156046 ENSGT00530000063822.a.a ENSGT00940000155379 ENSGT00940000154234.a ENSGT00390000016768 ENSGT00440000034605 ENSGT00940000160574 ENSGT00390000006218 ENSGT00530000063981.b ENSGT00940000155426 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Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.h.b ##22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.h.b ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.h.b ##22 koala MODERN SPECIES 104 RECK (ENSPCIG00000014867) ENSPCIG00000014862 ENSPCIG00000014863 CCIN (ENSPCIG00000014861) CLTA (ENSPCIG00000014859) GNE (ENSPCIG00000014854) ENSPCIG00000014848 RNF38 (ENSPCIG00000014839) MELK (ENSPCIG00000014826) PAX5 (ENSPCIG00000014813) ZCCHC7 (ENSPCIG00000014809) GRHPR (ENSPCIG00000014804) POLR1E (ENSPCIG00000014798) FBXO10 (ENSPCIG00000014795) ENSPCIG00000035940 ENSPCIG00000032470 ##22 ENSPCIG00000037145 TRMT10B (ENSPCIG00000014749) EXOSC3 (ENSPCIG00000014744) ENSPCIG00000014737 DCAF10 (ENSPCIG00000014733) ENSPCIG00000034779 SHB (ENSPCIG00000006737) ENSPCIG00000006739 IGFBPL1 (ENSPCIG00000006741) ENSPCIG00000006744 TDRD7 (ENSPCIG00000011622) TMOD1 (ENSPCIG00000015787) TSTD2 (ENSPCIG00000015792) NCBP1 (ENSPCIG00000015800) XPA (ENSPCIG00000015811) Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.g ##22 ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a #11 ENSGT00940000155840.C #12 ENSGT00940000155810 #13 ENSGT00940000155083.b #14 ENSGT00940000161250 #15 ENSGT00940000159540 #16 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000162178 #17 ENSGT00510000049297 #18 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.g ##22 ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01050000246306 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil MODERN SPECIES 3 SWT1 (ENSSHAG00000009241) IVNS1ABP (ENSSHAG00000010210) HMCN1 (ENSSHAG00000014526) ENSSHAG00000015244 TPR (ENSSHAG00000015305) ODR4 (ENSSHAG00000015497) PDC (ENSSHAG00000015671) PTGS2 (ENSSHAG00000016171) PLA2G4A (ENSSHAG00000016618) ENSSHAG00000005427 ENSSHAG00000030508 ENSSHAG00000031269 BRINP3 (ENSSHAG00000007307) ENSSHAG00000027804 RGS18 (ENSSHAG00000006527) ENSSHAG00000029586 ##22 RGS21 (ENSSHAG00000022729) RGS1 (ENSSHAG00000025712) ENSSHAG00000023026 RGS2 (ENSSHAG00000021123) UCHL5 (ENSSHAG00000030758) RO60 (ENSSHAG00000027682) GLRX2 (ENSSHAG00000031431) CDC73 (ENSSHAG00000013464) B3GALT2 (ENSSHAG00000026757) ENSSHAG00000000199 ENSSHAG00000025160 KCNT2 (ENSSHAG00000007306) ENSSHAG00000003041 F13B (ENSSHAG00000001242) ASPM (ENSSHAG00000003389) Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000021434 ENSSHAG00000005908 TNFRSF17 (ENSSHAG00000024421) SNX29 (ENSSHAG00000008175) ENSSHAG00000027355 SHISA9 (ENSSHAG00000027430) ENSSHAG00000025972 ERCC4 (ENSSHAG00000011596) MRTFB (ENSSHAG00000000780) PARN (ENSSHAG00000008493) BFAR (ENSSHAG00000009290) ENSSHAG00000009421 ENSSHAG00000010261 TXNDC11 (ENSSHAG00000010572) SNN (ENSSHAG00000023754) ENSSHAG00000030911 ##22 LITAF (ENSSHAG00000021684) ENSSHAG00000013004 RMI2 (ENSSHAG00000030487) ENSSHAG00000023877 ENSSHAG00000031517 CLEC16A (ENSSHAG00000001870) CIITA (ENSSHAG00000006475) TVP23A (ENSSHAG00000025041) NUBP1 (ENSSHAG00000008299) TEKT5 (ENSSHAG00000026102) EMP2 (ENSSHAG00000027677) ENSSHAG00000010436 GRIN2A (ENSSHAG00000008553) HAPSTR1 (ENSSHAG00000010529) USP7 (ENSSHAG00000012123) Tasmanian devil MODERN SPECIES 4 ENSSHAG00000026667 ENSSHAG00000027811 KCNA1 (ENSSHAG00000031762) KCNA5 (ENSSHAG00000011548) NTF3 (ENSSHAG00000006721) #11 ANO2 (ENSSHAG00000030277) #12 ENSSHAG00000026710 VWF (ENSSHAG00000012094) #13 CD9 (ENSSHAG00000013749) #14 PLEKHG6 (ENSSHAG00000014065) #15 SCNN1A (ENSSHAG00000014354) LTBR (ENSSHAG00000028116) #17 ENSSHAG00000014740 #18 ENSSHAG00000029190 NCAPD2 (ENSSHAG00000014814) #21 ENSSHAG00000014953 ##22 IFFO1 (ENSSHAG00000027937) ENSSHAG00000031410 ENSSHAG00000015079 ENSSHAG00000015251 LPAR5 (ENSSHAG00000015208) ING4 (ENSSHAG00000015278) ZNF384 (ENSSHAG00000025785) PIANP (ENSSHAG00000015440) COPS7A (ENSSHAG00000015469) MLF2 (ENSSHAG00000028020) ENSSHAG00000024269 ENSSHAG00000015690 ENSSHAG00000015840 GPR162 (ENSSHAG00000015934) P3H3 (ENSSHAG00000015960) Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000001596 ENSSHAG00000029226 ENSSHAG00000031027 ENSSHAG00000028474 ENSSHAG00000001742 ENSSHAG00000028143 ENSSHAG00000020497 ENSSHAG00000030532 ENSSHAG00000029933 ENSSHAG00000029047 ENSSHAG00000000711 ENSSHAG00000023979 ENSSHAG00000000512 ENSSHAG00000022856 ENSSHAG00000002869 ENSSHAG00000032276 ##22 ENSSHAG00000000737 ENSSHAG00000029330 ENSSHAG00000025024 ENSSHAG00000026767 ENSSHAG00000002215 ENSSHAG00000003519 ENSSHAG00000032350 ENSSHAG00000027676 ENSSHAG00000001292 ENSSHAG00000001988 ENSSHAG00000002528 ENSSHAG00000002181 ENSSHAG00000029203 ENSSHAG00000028329 ENSSHAG00000028301 Tasmanian devil MODERN SPECIES 3 ENSSHAG00000018282 ENSSHAG00000018287 ENSSHAG00000018326 C1orf116 (ENSSHAG00000030831) ENSSHAG00000026664 PFKFB2 (ENSSHAG00000029947) ENSSHAG00000027732 ENSSHAG00000018568 ENSSHAG00000018654 ENSSHAG00000027565 ENSSHAG00000002879 ENSSHAG00000029606 ENSSHAG00000027282 ENSSHAG00000027916 PLXNA2 (ENSSHAG00000007314) ENSSHAG00000031566 ##22 CAMK1G (ENSSHAG00000009646) LAMB3 (ENSSHAG00000010013) G0S2 (ENSSHAG00000024852) HSD11B1 (ENSSHAG00000028213) TRAF3IP3 (ENSSHAG00000011020) C1orf74 (ENSSHAG00000029419) IRF6 (ENSSHAG00000001714) UTP25 (ENSSHAG00000030819) SYT14 (ENSSHAG00000026173) SERTAD4 (ENSSHAG00000026265) HHAT (ENSSHAG00000006396) KCNH1 (ENSSHAG00000029794) RCOR3 (ENSSHAG00000014006) TRAF5 (ENSSHAG00000014289) RD3 (ENSSHAG00000020730) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Wallaby MODERN SPECIES 1054 ENSMEUG00000015225 #19 ENSMEUG00000015238 #18 VAMP1 (ENSMEUG00000015246) #20 MRPL51 (ENSMEUG00000015252) NCAPD2 (ENSMEUG00000015256) #21 GAPDH (ENSMEUG00000015273) ##22 IFFO1 (ENSMEUG00000015279) NOP2 (ENSMEUG00000015287) CHD4 (ENSMEUG00000015294) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 koala MODERN SPECIES 256 ENSPCIG00000018462 NIPAL4 (ENSPCIG00000018461) ENSPCIG00000031610 FNDC9 (ENSPCIG00000018459) ENSPCIG00000018455 ITK (ENSPCIG00000030175) MED7 (ENSPCIG00000030172) ENSPCIG00000034280 ENSPCIG00000005949 ENSPCIG00000005948 SGCD (ENSPCIG00000005944) ENSPCIG00000019224 ENSPCIG00000029208 ENSPCIG00000004563 ##22 MRPL22 (ENSPCIG00000019225) GEMIN5 (ENSPCIG00000019228) CNOT8 (ENSPCIG00000030984) ENSPCIG00000035769 FAXDC2 (ENSPCIG00000019237) LARP1 (ENSPCIG00000019242) HAND1 (ENSPCIG00000019244) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 1278 ENSDNOG00000048872 ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Horse MODERN SPECIES 26 ENSECAG00000047290 ENSECAG00000009794 CD34 (ENSECAG00000024973) PLXNA2 (ENSECAG00000001716) CAMK1G (ENSECAG00000014588) G0S2 (ENSECAG00000003535) LAMB3 (ENSECAG00000008204) HSD11B1 (ENSECAG00000019243) TRAF3IP3 (ENSECAG00000011355) C5H1orf74 (ENSECAG00000003211) IRF6 (ENSECAG00000007482) UTP25 (ENSECAG00000022381) SYT14 (ENSECAG00000017972) SERTAD4 (ENSECAG00000015692) HHAT (ENSECAG00000013905) ENSECAG00000030219 ##22 ENSECAG00000060378 ENSECAG00000055405 KCNH1 (ENSECAG00000000431) RCOR3 (ENSECAG00000013308) TRAF5 (ENSECAG00000007165) RD3 (ENSECAG00000037071) SLC30A1 (ENSECAG00000003051) ENSECAG00000029157 NEK2 (ENSECAG00000020920) LPGAT1 (ENSECAG00000013187) INTS7 (ENSECAG00000018806) DTL (ENSECAG00000011878) ENSECAG00000046910 PPP2R5A (ENSECAG00000007665) PACC1 (ENSECAG00000018726) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Squirrel MODERN SPECIES 80 ENSSTOG00000034900 HCN1 (ENSSTOG00000008842) MRPS30 (ENSSTOG00000015844) FGF10 (ENSSTOG00000023167) NNT (ENSSTOG00000011209) PAIP1 (ENSSTOG00000011203) C5orf34 (ENSSTOG00000011197) ENSSTOG00000016333 CCL28 (ENSSTOG00000005720) HMGCS1 (ENSSTOG00000005698) NIM1K (ENSSTOG00000025018) ZNF131 (ENSSTOG00000015383) ZNF622 (ENSSTOG00000000623) RETREG1 (ENSSTOG00000024173) MYO10 (ENSSTOG00000004826) ENSSTOG00000024457 ##22 CDH18 (ENSSTOG00000012038) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Degu MODERN SPECIES 256 DEF8 (ENSODEG00000003777) ENSODEG00000003697 DBNDD1 (ENSODEG00000003664) GAS8 (ENSODEG00000003436) ENSODEG00000003363 ENSODEG00000003885 JPH3 (ENSODEG00000003822) ZCCHC14 (ENSODEG00000003749) ENSODEG00000003687 FBXO31 (ENSODEG00000003564) FOXL1 (ENSODEG00000003524) MTHFSD (ENSODEG00000003482) FOXF1 (ENSODEG00000003466) IRF8 (ENSODEG00000005035) ENSODEG00000005014 ENSODEG00000005004 ##22 ENSODEG00000004994 EMC8 (ENSODEG00000004987) C16orf74 (ENSODEG00000004976) GINS2 (ENSODEG00000004957) GSE1 (ENSODEG00000004855) CIBAR2 (ENSODEG00000004799) KIAA0513 (ENSODEG00000004724) ZDHHC7 (ENSODEG00000004683) CRISPLD2 (ENSODEG00000004620) USP10 (ENSODEG00000004533) KLHL36 (ENSODEG00000004503) COTL1 (ENSODEG00000004482) MEAK7 (ENSODEG00000004440) ATP2C2 (ENSODEG00000005743) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3425 Bdp1 (ENSMSIG00000028772) Mccc2 (ENSMSIG00000028762) Cartpt (ENSMSIG00000028754) Map1b (ENSMSIG00000028737) Mrps27 (ENSMSIG00000028728) Ptcd2 (ENSMSIG00000028722) Zfp366 (ENSMSIG00000028719) ENSMSIG00000028710 ENSMSIG00000028708 H2bl1 (ENSMSIG00000028702) Tnpo1 (ENSMSIG00000028677) Fcho2 (ENSMSIG00000028641) Tmem171 (ENSMSIG00000028636) Tmem174 (ENSMSIG00000028632) ENSMSIG00000028625 ENSMSIG00000028624 ##22 ENSMSIG00000028622 ENSMSIG00000028616 ENSMSIG00000028609 Ankra2 (ENSMSIG00000028570) Utp15 (ENSMSIG00000028561) ENSMSIG00000028558 Arhgef28 (ENSMSIG00000028543) Enc1 (ENSMSIG00000028530) Hexb (ENSMSIG00000028524) Gfm2 (ENSMSIG00000028449) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 14 Sctr (ENSMOCG00000002265) Cfap221 (ENSMOCG00000019701) Tmem177 (ENSMOCG00000020308) Ptpn4 (ENSMOCG00000019512) Epb41l5 (ENSMOCG00000014769) Ralb (ENSMOCG00000014139) Inhbb (ENSMOCG00000023014) Gli2 (ENSMOCG00000015946) Tfcp2l1 (ENSMOCG00000016470) Clasp1 (ENSMOCG00000004583) Nifk (ENSMOCG00000001962) Tsn (ENSMOCG00000013248) ENSMOCG00000018277 ENSMOCG00000010878 ENSMOCG00000019760 ENSMOCG00000000633 ##22 ENSMOCG00000010740 ENSMOCG00000001250 Cdh20 (ENSMOCG00000014345) Rnf152 (ENSMOCG00000020478) Pign (ENSMOCG00000011826) Relch (ENSMOCG00000015326) Tnfrsf11a (ENSMOCG00000001050) Zcchc2 (ENSMOCG00000021627) Phlpp1 (ENSMOCG00000011825) Bcl2 (ENSMOCG00000015172) Kdsr (ENSMOCG00000007564) Vps4b (ENSMOCG00000001006) Taf1a (ENSMOCG00000017898) Zp3r (ENSMOCG00000013017) C4bp (ENSMOCG00000002177) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 107 ENSPEMG00000024153 ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Opossum DUPLICATION Opossum MODERN SPECIES 7 KCNA6 (ENSMODG00000018007) ENSMODG00000028583 KCNA1 (ENSMODG00000024850) KCNA5 (ENSMODG00000024849) NTF3 (ENSMODG00000018011) #11 ANO2 (ENSMODG00000018017) #12 ENSMODG00000018053 #14 PLEKHG6 (ENSMODG00000018054) #15 ENSMODG00000018056 #16 ENSMODG00000037213 ENSMODG00000048629 LTBR (ENSMODG00000018059) #17 ENSMODG00000018060 #18 MRPL51 (ENSMODG00000018063) NCAPD2 (ENSMODG00000018064) #21 ENSMODG00000018066 ##22 ENSMODG00000018067 NOP2 (ENSMODG00000018077) CHD4 (ENSMODG00000018094) LPAR5 (ENSMODG00000018099) ENSMODG00000018101 ING4 (ENSMODG00000018103) ZNF384 (ENSMODG00000018105) PIANP (ENSMODG00000018107) COPS7A (ENSMODG00000018110) MLF2 (ENSMODG00000018113) ENSMODG00000018136 CD4 (ENSMODG00000027359) GPR162 (ENSMODG00000040272) P3H3 (ENSMODG00000018141) GNB3 (ENSMODG00000018145) Opossum MODERN SPECIES 3 EXOSC8 (ENSMODG00000040252) ALG5 (ENSMODG00000010043) ENSMODG00000010017 ENSMODG00000009995 SERTM1 (ENSMODG00000024121) ENSMODG00000041669 CCNA1 (ENSMODG00000009993) SPART (ENSMODG00000009980) ENSMODG00000009974 DCLK1 (ENSMODG00000009947) MAB21L1 (ENSMODG00000024122) NBEA (ENSMODG00000009914) ENSMODG00000039285 ENSMODG00000024124 RFC3 (ENSMODG00000009764) ENSMODG00000017351 ##22 ENSMODG00000045424 STARD13 (ENSMODG00000009691) KL (ENSMODG00000009636) PDS5B (ENSMODG00000009630) ENSMODG00000009531 ENSMODG00000042297 N4BP2L1 (ENSMODG00000009524) ENSMODG00000009516 ZAR1L (ENSMODG00000009462) FRY (ENSMODG00000009454) RXFP2 (ENSMODG00000009382) ENSMODG00000045047 B3GLCT (ENSMODG00000009353) HSPH1 (ENSMODG00000009347) ENSMODG00000009305 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 1908 ENSTBEG00000000670 #19 VAMP1 (ENSTBEG00000000808) #20 MRPL51 (ENSTBEG00000000936) NCAPD2 (ENSTBEG00000000988) #21 GAPDH (ENSTBEG00000001510) ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 287 NTF3 (ENSUPAG00010013302) #11 ANO2 (ENSUPAG00010013264) #12 VWF (ENSUPAG00010013201) #13 CD9 (ENSUPAG00010013184) #14 PLEKHG6 (ENSUPAG00010013161) #15 TNFRSF1A (ENSUPAG00010013146) #16 SCNN1A (ENSUPAG00010013073) LTBR (ENSUPAG00010013063) #17 CD27 (ENSUPAG00010013052) #18 TAPBPL (ENSUPAG00010013043) #19 VAMP1 (ENSUPAG00010013015) #20 MRPL51 (ENSUPAG00010013007) NCAPD2 (ENSUPAG00010012965) #21 ENSUPAG00010012916 ##22 IFFO1 (ENSUPAG00010012871) NOP2 (ENSUPAG00010012834) CHD4 (ENSUPAG00010012693) LPAR5 (ENSUPAG00010012680) ACRBP (ENSUPAG00010012647) ING4 (ENSUPAG00010012637) ZNF384 (ENSUPAG00010012380) PIANP (ENSUPAG00010012361) COPS7A (ENSUPAG00010012353) ENSUPAG00010012348 MLF2 (ENSUPAG00010012341) ENSUPAG00010012331 LAG3 (ENSUPAG00010012322) CD4 (ENSUPAG00010012311) GPR162 (ENSUPAG00010012307) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 5 SNRNP27 (ENSSVLG00005016010) ENSSVLG00005015884 ANXA4 (ENSSVLG00005015817) AAK1 (ENSSVLG00005022357) ENSSVLG00005022342 NFU1 (ENSSVLG00005022277) GFPT1 (ENSSVLG00005022235) ENSSVLG00005022183 ANTXR1 (ENSSVLG00005022150) GKN1 (ENSSVLG00005022077) GKN2 (ENSSVLG00005021978) ENSSVLG00005021937 BMP10 (ENSSVLG00005021912) ARHGAP25 (ENSSVLG00005021763) PROKR1 (ENSSVLG00005021730) ENSSVLG00005021708 ##22 APLF (ENSSVLG00005021663) FBXO48 (ENSSVLG00005021637) PLEK (ENSSVLG00005021563) CNRIP1 (ENSSVLG00005021502) PPP3R1 (ENSSVLG00005021432) PNO1 (ENSSVLG00005021413) DNAAF10 (ENSSVLG00005021285) C1D (ENSSVLG00005021246) ETAA1 (ENSSVLG00005021110) MEIS1 (ENSSVLG00005020894) ENSSVLG00005020854 SPRED2 (ENSSVLG00005020765) ACTR2 (ENSSVLG00005020565) ENSSVLG00005020476 CEP68 (ENSSVLG00005020379) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Prlr (ENSCGRG00001006147) Spef2 (ENSCGRG00001023075) Il7r (ENSCGRG00001016104) Capsl (ENSCGRG00001008670) Lmbrd2 (ENSCGRG00001023603) Skp2 (ENSCGRG00001022106) Nadk2 (ENSCGRG00001022039) Ranbp3l (ENSCGRG00001024211) Slc1a3 (ENSCGRG00001011815) ENSCGRG00001008847 Nipbl (ENSCGRG00001024039) Cplane1 (ENSCGRG00001023647) Nup155 (ENSCGRG00001023185) Wdr70 (ENSCGRG00001024618) Gdnf (ENSCGRG00001024149) ENSCGRG00001024626 ##22 ENSCGRG00001024378 Egflam (ENSCGRG00001023724) Lifr (ENSCGRG00001003293) Osmr (ENSCGRG00001017859) Rictor (ENSCGRG00001009015) Fyb (ENSCGRG00001022410) C9 (ENSCGRG00001021695) Dab2 (ENSCGRG00001021141) ENSCGRG00001012741 ENSCGRG00001008646 ENSCGRG00001020504 Ptger4 (ENSCGRG00001020213) Ttc33 (ENSCGRG00001019815) Prkaa1 (ENSCGRG00001001697) ENSCGRG00001012869 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 22 Dgkh (ENSPEMG00000020442) Vwa8 (ENSPEMG00000016456) Rgcc (ENSPEMG00000013380) Naa16 (ENSPEMG00000021265) Mtrf1 (ENSPEMG00000020982) Kbtbd7 (ENSPEMG00000015250) Wbp4 (ENSPEMG00000021764) Elf1 (ENSPEMG00000021551) ENSPEMG00000001486 Cnmd (ENSPEMG00000001366) Pcdh8 (ENSPEMG00000002218) Olfm4 (ENSPEMG00000018107) ENSPEMG00000008810 Pcdh17 (ENSPEMG00000029088) ENSPEMG00000012614 ENSPEMG00000008782 ##22 Diaph3 (ENSPEMG00000013687) Tdrd3 (ENSPEMG00000004287) Pcdh20 (ENSPEMG00000000491) Pcdh9 (ENSPEMG00000019867) ENSPEMG00000028743 Spertl (ENSPEMG00000020149) ENSPEMG00000025539 Klhl1 (ENSPEMG00000019703) ENSPEMG00000026815 Dach1 (ENSPEMG00000019832) ENSPEMG00000025061 Bora (ENSPEMG00000024902) Dis3 (ENSPEMG00000019729) Pibf1 (ENSPEMG00000020121) Klf5 (ENSPEMG00000019820) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Rat MODERN SPECIES 4 Edem3 (ENSRNOG00000028358) Niban1 (ENSRNOG00000002403) ENSRNOG00000064602 Rnf2 (ENSRNOG00000002454) Trmt1l (ENSRNOG00000002580) Swt1 (ENSRNOG00000032258) Ivns1abp (ENSRNOG00000002618) Hmcn1 (ENSRNOG00000028627) Prg4 (ENSRNOG00000002385) Tpr (ENSRNOG00000002394) Odr4 (ENSRNOG00000002473) Pdc (ENSRNOG00000002517) Ptgs2 (ENSRNOG00000002525) ENSRNOG00000066166 Pla2g4a (ENSRNOG00000002657) Gapdh-ps17 (ENSRNOG00000022174) ##22 Brinp3 (ENSRNOG00000002811) Rgs18 (ENSRNOG00000003959) ENSRNOG00000065694 Rgs21 (ENSRNOG00000056369) Rgs1 (ENSRNOG00000003895) Rgs13 (ENSRNOG00000003888) Rgs2 (ENSRNOG00000003687) ENSRNOG00000070924 Uchl5 (ENSRNOG00000003545) Ro60 (ENSRNOG00000003434) Glrx2 (ENSRNOG00000003385) B3galt2 (ENSRNOG00000003251) Cdc73 (ENSRNOG00000003258) LOC108352643 (ENSRNOG00000068606) Kcnt2 (ENSRNOG00000013312) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 186 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 Hedgehog MODERN SPECIES 490 ENSEEUG00000011280 #21 GAPDH (ENSEEUG00000011444) ##22 IFFO1 (ENSEEUG00000011508) NOP2 (ENSEEUG00000011692) ENSEEUG00000011777 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Narwhal MODERN SPECIES 313 KCNA1 (ENSMMNG00015014253) KCNA5 (ENSMMNG00015014257) NTF3 (ENSMMNG00015014262) #11 ANO2 (ENSMMNG00015014305) #12 VWF (ENSMMNG00015014423) #13 CD9 (ENSMMNG00015014479) #14 PLEKHG6 (ENSMMNG00015014516) #15 TNFRSF1A (ENSMMNG00015014562) #16 SCNN1A (ENSMMNG00015014598) LTBR (ENSMMNG00015014642) #17 CD27 (ENSMMNG00015014673) #18 TAPBPL (ENSMMNG00015014697) #19 VAMP1 (ENSMMNG00015014734) #20 MRPL51 (ENSMMNG00015014780) NCAPD2 (ENSMMNG00015014856) #21 GAPDH (ENSMMNG00015014916) ##22 IFFO1 (ENSMMNG00015014957) NOP2 (ENSMMNG00015014983) CHD4 (ENSMMNG00015015036) ACRBP (ENSMMNG00015015110) ING4 (ENSMMNG00015015173) ZNF384 (ENSMMNG00015015269) PIANP (ENSMMNG00015015305) COPS7A (ENSMMNG00015015318) MLF2 (ENSMMNG00015015337) PTMS (ENSMMNG00015015353) LAG3 (ENSMMNG00015015366) CD4 (ENSMMNG00015015391) GPR162 (ENSMMNG00015015414) P3H3 (ENSMMNG00015015434) GNB3 (ENSMMNG00015015448) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Cow MODERN SPECIES 24 KCNA5 (ENSBTAG00000007553) NTF3 (ENSBTAG00000010223) #11 ANO2 (ENSBTAG00000012246) #12 ENSBTAG00000011758 VWF (ENSBTAG00000012265) #13 CD9 (ENSBTAG00000014764) #14 PLEKHG6 (ENSBTAG00000004208) #15 TNFRSF1A (ENSBTAG00000004211) #16 SCNN1A (ENSBTAG00000002631) LTBR (ENSBTAG00000015312) #17 CD27 (ENSBTAG00000014725) #18 TAPBPL (ENSBTAG00000014728) #19 VAMP1 (ENSBTAG00000014603) #20 MRPL51 (ENSBTAG00000014729) NCAPD2 (ENSBTAG00000014730) #21 GAPDH (ENSBTAG00000014731) ##22 IFFO1 (ENSBTAG00000030369) NOP2 (ENSBTAG00000014733) CHD4 (ENSBTAG00000014734) LPAR5 (ENSBTAG00000004541) ACRBP (ENSBTAG00000034246) ING4 (ENSBTAG00000017064) ZNF384 (ENSBTAG00000017072) PIANP (ENSBTAG00000001099) COPS7A (ENSBTAG00000011111) MLF2 (ENSBTAG00000014931) PTMS (ENSBTAG00000018451) LAG3 (ENSBTAG00000034295) ENSBTAG00000051680 CD4 (ENSBTAG00000003255) GPR162 (ENSBTAG00000034385) Laurasiatheria_b DUPLICATION Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c ##22 Caniformia DUPLICATION Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.a ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.a ##22 Dingo MODERN SPECIES 343 PHF20 (ENSCAFG00020005691) SCAND1 (ENSCAFG00020005777) ENSCAFG00020005787 EPB41L1 (ENSCAFG00020005807) AAR2 (ENSCAFG00020005856) ENSCAFG00020005862 ENSCAFG00020005865 ENSCAFG00020005870 ENSCAFG00020005874 ENSCAFG00020005881 RAB5IF (ENSCAFG00020005885) SLA2 (ENSCAFG00020005890) ENSCAFG00020005893 DSN1 (ENSCAFG00020005917) SOGA1 (ENSCAFG00020005922) ENSCAFG00020005973 ##22 TLDC2 (ENSCAFG00020005977) SAMHD1 (ENSCAFG00020006094) RBL1 (ENSCAFG00020012391) ENSCAFG00020012444 ENSCAFG00020012473 RPN2 (ENSCAFG00020012479) GHRH (ENSCAFG00020012483) MANBAL (ENSCAFG00020012487) SRC (ENSCAFG00020012489) BLCAP (ENSCAFG00020012493) NNAT (ENSCAFG00020012495) CTNNBL1 (ENSCAFG00020012512) VSTM2L (ENSCAFG00020012514) TTI1 (ENSCAFG00020012517) RPRD1B (ENSCAFG00020012523) Dog MODERN SPECIES 17 ENSCAFG00845025102 ENSCAFG00845025152 ENSCAFG00845025275 CCDC115 (ENSCAFG00845025350) PALLD (ENSCAFG00845025456) CBR4 (ENSCAFG00845026026) ENSCAFG00845026075 ENSCAFG00845026158 ENSCAFG00845026241 SH3RF1 (ENSCAFG00845026368) NEK1 (ENSCAFG00845026873) CLCN3 (ENSCAFG00845028065) HPF1 (ENSCAFG00845028301) MFAP3L (ENSCAFG00845028385) AADAT (ENSCAFG00845028500) ENSCAFG00845028616 ##22 ENSCAFG00845028629 GALNTL6 (ENSCAFG00845016564) ENSCAFG00845016810 ENSCAFG00845016838 ENSCAFG00845016982 HMGB2 (ENSCAFG00845017050) SAP30 (ENSCAFG00845017098) SCRG1 (ENSCAFG00845017141) HAND2 (ENSCAFG00845017182) FBXO8 (ENSCAFG00845017782) CEP44 (ENSCAFG00845017832) HPGD (ENSCAFG00845018083) GLRA3 (ENSCAFG00845018265) ADAM29 (ENSCAFG00845018395) ENSCAFG00845018425 Red fox MODERN SPECIES 44 ENSVVUG00000017274 ENSVVUG00000017279 RBFOX1 (ENSVVUG00000017311) TMEM114 (ENSVVUG00000017347) METTL22 (ENSVVUG00000017351) ABAT (ENSVVUG00000017363) ENSVVUG00000017369 TMEM186 (ENSVVUG00000017371) PMM2 (ENSVVUG00000017372) CARHSP1 (ENSVVUG00000017377) USP7 (ENSVVUG00000017390) HAPSTR1 (ENSVVUG00000017458) GRIN2A (ENSVVUG00000017527) ENSVVUG00000017825 ENSVVUG00000017828 ENSVVUG00000017831 ##22 ENSVVUG00000017834 EMP2 (ENSVVUG00000017836) TEKT5 (ENSVVUG00000017841) NUBP1 (ENSVVUG00000017845) TVP23A (ENSVVUG00000017853) CIITA (ENSVVUG00000017857) CLEC16A (ENSVVUG00000017880) SOCS1 (ENSVVUG00000017915) ENSVVUG00000017918 ENSVVUG00000017923 ENSVVUG00000017927 LITAF (ENSVVUG00000017969) SNN (ENSVVUG00000017985) TXNDC11 (ENSVVUG00000018015) ZC3H7A (ENSVVUG00000018163) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.b ##22 American mink MODERN SPECIES 11 POLR3A (ENSNVIG00000003446) DLG5 (ENSNVIG00000003623) KCNMA1 (ENSNVIG00000003936) LRMDA (ENSNVIG00000007862) ZNF503 (ENSNVIG00000007904) COMTD1 (ENSNVIG00000007928) VDAC2 (ENSNVIG00000007976) SAMD8 (ENSNVIG00000008018) DUSP13 (ENSNVIG00000008093) DUSP29 (ENSNVIG00000008146) KAT6B (ENSNVIG00000008156) ENSNVIG00000008395 ADK (ENSNVIG00000008422) AP3M1 (ENSNVIG00000008511) VCL (ENSNVIG00000008540) ENSNVIG00000008639 ##22 UROK (ENSNVIG00000008659) CAMK2G (ENSNVIG00000008742) NDST2 (ENSNVIG00000009010) ZSWIM8 (ENSNVIG00000009105) CHCHD1 (ENSNVIG00000009208) ENSNVIG00000009223 FUT11 (ENSNVIG00000009230) ENSNVIG00000009237 SYNPO2L (ENSNVIG00000009281) MYOZ1 (ENSNVIG00000009286) USP54 (ENSNVIG00000009315) PPP3CB (ENSNVIG00000009379) MSS51 (ENSNVIG00000009507) ANXA7 (ENSNVIG00000009547) CFAP70 (ENSNVIG00000009593) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.b ##22 Dog MODERN SPECIES 29 RAPGEF4 (ENSCAFG00845028929) MAP3K20 (ENSCAFG00845029200) ENSCAFG00845029341 SP3 (ENSCAFG00845029530) OLA1 (ENSCAFG00845029594) SP9 (ENSCAFG00845029658) CIR1 (ENSCAFG00845015697) SCRN3 (ENSCAFG00845015754) GPR155 (ENSCAFG00845015821) ENSCAFG00845015883 WIPF1 (ENSCAFG00845016036) CHRNA1 (ENSCAFG00845016336) CHN1 (ENSCAFG00845017147) ATF2 (ENSCAFG00845017708) ATP5MC3 (ENSCAFG00845018248) ENSCAFG00845018368 ##22 LNPK (ENSCAFG00845018510) EVX2 (ENSCAFG00845018704) HOXD13 (ENSCAFG00845018741) HOXD12 (ENSCAFG00845018775) ENSCAFG00845018802 HOXD9 (ENSCAFG00845018856) HOXD10 (ENSCAFG00845019028) HOXD4 (ENSCAFG00845019072) HOXD3 (ENSCAFG00845019275) HOXD1 (ENSCAFG00845019313) MTX2 (ENSCAFG00845019381) HNRNPA3 (ENSCAFG00845019864) NFE2L2 (ENSCAFG00845020022) AGPS (ENSCAFG00845020190) TTC30A (ENSCAFG00845020493) Laurasiatheria_b DUPLICATION Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Microbat MODERN SPECIES 1214 ENSMLUG00000023940 ENSMLUG00000027149 ##22 ENSMLUG00000014756 LRRTM4 (ENSMLUG00000014201) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 1 NDUFA12 (ENSRFEG00010000814) KCNA5 (ENSRFEG00010000848) NTF3 (ENSRFEG00010000870) #11 ANO2 (ENSRFEG00010000920) #12 VWF (ENSRFEG00010001025) #13 CD9 (ENSRFEG00010001199) #14 PLEKHG6 (ENSRFEG00010001287) #15 TNFRSF1A (ENSRFEG00010001395) #16 SCNN1A (ENSRFEG00010001487) VAMP1 (ENSRFEG00010001570) #20 LTBR (ENSRFEG00010001600) #17 CD27 (ENSRFEG00010001691) #18 TAPBPL (ENSRFEG00010001724) #19 MRPL51 (ENSRFEG00010001755) NCAPD2 (ENSRFEG00010001784) #21 ENSRFEG00010001850 ##22 IFFO1 (ENSRFEG00010001885) NOP2 (ENSRFEG00010001957) CHD4 (ENSRFEG00010002190) LPAR5 (ENSRFEG00010002641) ACRBP (ENSRFEG00010002675) ING4 (ENSRFEG00010002769) ZNF384 (ENSRFEG00010002854) PIANP (ENSRFEG00010002897) ENSRFEG00010002934 COPS7A (ENSRFEG00010002955) MLF2 (ENSRFEG00010002982) PTMS (ENSRFEG00010003014) LAG3 (ENSRFEG00010003036) CD4 (ENSRFEG00010003064) GPR162 (ENSRFEG00010003086) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 78 ENSVVUG00000029152 ENSVVUG00000029151 ENSVVUG00000029148 ENSVVUG00000029147 ENSVVUG00000029146 ENSVVUG00000029144 ##22 TDRD3 (ENSVVUG00000029140) DIAPH3 (ENSVVUG00000028837) ENSVVUG00000028816 PCDH17 (ENSVVUG00000028814) ENSVVUG00000028813 ENSVVUG00000028807 ENSVVUG00000028805 ENSVVUG00000028804 ENSVVUG00000028792 ENSVVUG00000028790 OLFM4 (ENSVVUG00000028777) PCDH8 (ENSVVUG00000028776) CNMD (ENSVVUG00000028772) SUGT1 (ENSVVUG00000028767) ELF1 (ENSVVUG00000028763) Red fox MODERN SPECIES 31 MAP3K3 (ENSVVUG00000005830) TACO1 (ENSVVUG00000005809) ENSVVUG00000005807 DCAF7 (ENSVVUG00000005804) KCNH6 (ENSVVUG00000005784) ENSVVUG00000005759 ACE (ENSVVUG00000005728) CYB561 (ENSVVUG00000005723) TANC2 (ENSVVUG00000005635) MARCHF10 (ENSVVUG00000005620) MRC2 (ENSVVUG00000005555) TLK2 (ENSVVUG00000005522) ENSVVUG00000005506 EFCAB3 (ENSVVUG00000005501) ENSVVUG00000005455 ENSVVUG00000005452 ##22 ITGB3 (ENSVVUG00000005435) MYL4 (ENSVVUG00000005422) CDC27 (ENSVVUG00000005408) ENSVVUG00000005406 KANSL1 (ENSVVUG00000005395) MAPT (ENSVVUG00000005337) ENSVVUG00000005327 CRHR1 (ENSVVUG00000005211) ARL17A (ENSVVUG00000005175) NSF (ENSVVUG00000005154) ENSVVUG00000005141 WNT9B (ENSVVUG00000005120) GOSR2 (ENSVVUG00000005103) LYZL6 (ENSVVUG00000005096) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.b ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 2 BACE1 (ENSRFEG00010009508) RNF214 (ENSRFEG00010009434) PCSK7 (ENSRFEG00010009375) ENSRFEG00010009353 SIDT2 (ENSRFEG00010009244) PAFAH1B2 (ENSRFEG00010009155) ENSRFEG00010009106 SIK3 (ENSRFEG00010008977) APOA1 (ENSRFEG00010008873) ENSRFEG00010008809 APOA4 (ENSRFEG00010008766) ENSRFEG00010008710 APOA5 (ENSRFEG00010008677) ZNF259 (ENSRFEG00010008540) BUD13 (ENSRFEG00010008489) ENSRFEG00010008409 ##22 ENSRFEG00010008357 CADM1 (ENSRFEG00010007749) NXPE1 (ENSRFEG00010007603) REXO2 (ENSRFEG00010007459) ENSRFEG00010007427 RBM7 (ENSRFEG00010007375) C11orf71 (ENSRFEG00010007332) NNMT (ENSRFEG00010007304) ZBTB16 (ENSRFEG00010007284) HTR3A (ENSRFEG00010007230) HTR3B (ENSRFEG00010007133) USP28 (ENSRFEG00010006791) ZW10 (ENSRFEG00010015705) TMPRSS5 (ENSRFEG00010014953) DRD2 (ENSRFEG00010014855) Platypus MODERN SPECIES 87 ENSOANG00000043479 ENSOANG00000014697 ENSOANG00000051292 FGF6 (ENSOANG00000020755) C12orf4 (ENSOANG00000039330) ENSOANG00000011973 ENSOANG00000002548 AKAP3 (ENSOANG00000042546) NDUFA9 (ENSOANG00000015719) KCNA6 (ENSOANG00000014376) KCNA1 (ENSOANG00000008085) KCNA5 (ENSOANG00000044609) NTF3 (ENSOANG00000001146) #11 ANO2 (ENSOANG00000036505) #12 VWF (ENSOANG00000040443) #13 GAPDH (ENSOANG00000004492) #22 CD9 (ENSOANG00000048710) #14 ENSOANG00000038811 #15 ENSOANG00000044825 #16 SCNN1A (ENSOANG00000001688) ENSOANG00000039739 #17 ENSOANG00000007602 #19 ENSOANG00000038559 #20 MRPL51 (ENSOANG00000003012) NCAPD2 (ENSOANG00000003013) #21 ENSOANG00000043432 NOP2 (ENSOANG00000047605) CHD4 (ENSOANG00000015700) LPAR5 (ENSOANG00000050733) ENSOANG00000037768 ING4 (ENSOANG00000036657) Sauria ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000180930 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00990000212708 ENSGT00390000005023.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000001745 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000160920 ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000171511 ENSGT00950000183106.a.b ENSGT00940000157383 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000168148 ENSGT00440000033697 ENSGT01090000260044.D.i ENSGT00940000153255 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000180930 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00990000212708 ENSGT00390000005023.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000168928 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 tuatara MODERN SPECIES 1253 KIF21B (ENSSPUG00000015766) ENSSPUG00000015502 ENSSPUG00000015490 TRIM45 (ENSSPUG00000015481) VTCN1 (ENSSPUG00000015444) SCNN1A (ENSSPUG00000015425) VAMP1 (ENSSPUG00000015408) #20 MRPL51 (ENSSPUG00000015396) ENSSPUG00000015391 NCAPD2 (ENSSPUG00000015362) #21 GAPDH (ENSSPUG00000015279) #22 IFFO1 (ENSSPUG00000015263) NOP2 (ENSSPUG00000015240) CHD4 (ENSSPUG00000015131) LPAR5 (ENSSPUG00000015098) ENSSPUG00000014998 ING4 (ENSSPUG00000014965) ZNF384 (ENSSPUG00000014935) COPS7A (ENSSPUG00000014867) MLF2 (ENSSPUG00000014850) ENSSPUG00000014840 GNB3 (ENSSPUG00000014719) ENSSPUG00000014712 USP5 (ENSSPUG00000014695) TPI1 (ENSSPUG00000014685) LRRC23 (ENSSPUG00000014664) Episquamata ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01050000244815.B.a.b ENSGT00940000160920 ENSGT00940000154273.a ENSGT00950000183106.a.b ENSGT00940000157383 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000168148 ENSGT00440000033697 ENSGT01100000263477.C ENSGT01090000260044.D.i.a.a ENSGT00940000153255 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00990000212708 ENSGT00390000005023.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00990000211157 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156687.g.e ENSGT01050000244815.B.a.b ENSGT00940000160920 ENSGT00940000154273.a ENSGT00950000183106.a.b ENSGT00940000157383 ENSGT00940000156657 ENSGT00440000033697 ENSGT01100000263477.C ENSGT01090000260044.D.i.a.a ENSGT00940000153255 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00990000211157 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Elapidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00440000033697 ENSGT01090000260044.D.i.a.a.b ENSGT00940000153255 ENSGT01090000260044.D.i.a.b ENSGT00940000160952 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033.e ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000168928 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT01030000236833 Indian cobra MODERN SPECIES 1 CLCN1 (ENSNNAG00000007371) ENSNNAG00000015703 ENSNNAG00000015688 ENSNNAG00000015679 ENSNNAG00000015647 ENSNNAG00000015627 ENSNNAG00000015536 ENSNNAG00000015502 ENSNNAG00000015497 ENSNNAG00000015489 ENSNNAG00000015485 SCNN1A (ENSNNAG00000015407) VAMP1 (ENSNNAG00000015372) #20 MRPL51 (ENSNNAG00000015367) NCAPD2 (ENSNNAG00000015351) #21 GAPDH (ENSNNAG00000015325) #22 IFFO1 (ENSNNAG00000015319) NOP2 (ENSNNAG00000015292) CHD4 (ENSNNAG00000014801) LPAR5 (ENSNNAG00000014754) ENSNNAG00000014724 ENSNNAG00000014716 ENSNNAG00000014706 ZNF384 (ENSNNAG00000014615) COPS7A (ENSNNAG00000014570) MLF2 (ENSNNAG00000014552) ENSNNAG00000014534 ENSNNAG00000014513 GPR162 (ENSNNAG00000014481) P3H3 (ENSNNAG00000014400) GNB3 (ENSNNAG00000014368) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT01090000260044.D.i.a.a.a ENSGT01090000260044.D.i.a.b ENSGT00940000160952 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033.e ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000168928 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000168539 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT01090000260044.D.i.a.a.a ENSGT01090000260044.D.i.a.b ENSGT00940000160952 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033.e ENSGT00940000156904 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000159873 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000168928 ENSGT00390000017213.A ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000168539 Eastern brown snake MODERN SPECIES 59 ENSPTXG00000017330 ENSPTXG00000017333 ENSPTXG00000017335 ENSPTXG00000017337 SCNN1A (ENSPTXG00000017340) VAMP1 (ENSPTXG00000017350) #20 MRPL51 (ENSPTXG00000017351) NCAPD2 (ENSPTXG00000017352) #21 GAPDH (ENSPTXG00000017354) #22 IFFO1 (ENSPTXG00000017355) NOP2 (ENSPTXG00000017361) 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ENSACAG00000042900 ENSACAG00000038456 ENSACAG00000006850 ENSACAG00000045492 ENSACAG00000034747 ENSACAG00000035988 ENSACAG00000006704 VAMP1 (ENSACAG00000006678) #20 MRPL51 (ENSACAG00000042185) NCAPD2 (ENSACAG00000006580) #21 GAPDH (ENSACAG00000006502) #22 IFFO1 (ENSACAG00000006451) NOP2 (ENSACAG00000006397) CHD4 (ENSACAG00000006231) LPAR5 (ENSACAG00000006228) ENSACAG00000006209 ING4 (ENSACAG00000006150) ZNF384 (ENSACAG00000006099) PIANP (ENSACAG00000006078) Laterata ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000186294 ENSGT01050000244815.B.a.b ENSGT00940000160920 ENSGT00940000154273.a ENSGT00950000183106.a.b ENSGT00940000157383 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000168148 ENSGT00440000033697 ENSGT01100000263477.C ENSGT01090000260044.D.i.a.a ENSGT00940000160952 ENSGT00940000161390 #20 ENSGT00390000018821 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00390000000826 ENSGT00940000159033 ENSGT00940000156904 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Japanese quail MODERN SPECIES ENSCJPG00005016702 MAN1A2 (ENSCJPG00005016703) CD86 (ENSCJPG00005016704) CASR (ENSCJPG00005016705) CSTB (ENSCJPG00005016706) MIX23 (ENSCJPG00005016707) FAM162A (ENSCJPG00005016708) KPNA1 (ENSCJPG00005016710) FBXO40 (ENSCJPG00005016711) TAPBPL (ENSCJPG00005016712) #19 SCNN1A (ENSCJPG00005016713) VAMP1 (ENSCJPG00005016714) #20 MRPL51 (ENSCJPG00005016715) NCAPD2 (ENSCJPG00005016716) #21 ENSCJPG00005016718 GAPDH (ENSCJPG00005016719) #22 IFFO1 (ENSCJPG00005016720) ENSCJPG00005016725 CHD4 (ENSCJPG00005016726) LPAR5 (ENSCJPG00005016728) ACRBP (ENSCJPG00005016729) ING4 (ENSCJPG00005016730) ZNF384 (ENSCJPG00005016731) PIANP (ENSCJPG00005016732) COPS7A (ENSCJPG00005016746) MLF2 (ENSCJPG00005016747) ENSCJPG00005016749 ENSCJPG00005016750 ENSCJPG00005016751 GPR162 (ENSCJPG00005016752) P3H3 (ENSCJPG00005016753) Anatidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000018717.b.a.b ENSGT00940000155444 ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 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